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JP2003512821A - 外来性遺伝子の転写調節方法 - Google Patents

外来性遺伝子の転写調節方法

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Publication number
JP2003512821A
JP2003512821A JP2001528606A JP2001528606A JP2003512821A JP 2003512821 A JP2003512821 A JP 2003512821A JP 2001528606 A JP2001528606 A JP 2001528606A JP 2001528606 A JP2001528606 A JP 2001528606A JP 2003512821 A JP2003512821 A JP 2003512821A
Authority
JP
Japan
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gene
promoter
nitrogen
expression
organism
Prior art date
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Pending
Application number
JP2001528606A
Other languages
English (en)
Inventor
ルイ−フィリップ ヴェジナ
マーク−アンドレ ダオー
Original Assignee
メディカゴ インコーポレイテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by メディカゴ インコーポレイテッド filed Critical メディカゴ インコーポレイテッド
Publication of JP2003512821A publication Critical patent/JP2003512821A/ja
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    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、遺伝的に改変された生物における導入遺伝子の転写調節の方法に関するものである。さらに詳しくは、本発明は、その活性が窒素の存在によって調節される促進配列の制御下に有益な遺伝子のコード配列を保有する発現ベクターの利用に関するものである。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】
【発明の背景】
(a)発明の分野 本発明は、遺伝子修飾された生物における導入遺伝子の転写を調節する方法に
関するものである。より具体的には、本発明は、その活性が窒素の存在により調
節される促進配列の転写制御下に有益遺伝子のコード配列を含む発現ベクターの
利用に関するものである。好ましくは、これらのコンストラクトは、無機窒素の
欠乏によって成長が損なわれことのないトランスジェニックのマメ科植物（例え
ば、大豆、アルファルファ、クローバー、ミヤコグサ、豆、エンドウ、ピーナッ
ツ）に用いられ、その発現誘導は、好適な窒素源の添加により発生過程のいかな
る時でも実施し得る。広汎な観点から、本発明は、生物がこの窒素誘導物質を欠
いても十分に成長できるという条件で、任意に得られた導入遺伝子の任意の窒素
源の添加による発現を誘導するために使用でき、植物界における例としてアオウ
キクサ（少数の外花穎）は、窒素源として硝酸塩またはアンモニウムのいずれか
で成長するために順応でき；したがって、トランスジェニックのアオウキクサは
、カセットがアンモニウムの添加により発現を生ずる生来の遺伝子からのプロモ
ーターを含むという条件で、単一の窒素源としての硝酸塩およびアンモニウムの
添加により誘発された導入遺伝子の発現において成長できると考えられる。この
様に、本発明は、種々の窒素誘導物質の添加により任意の生物におけるトランス
ジェニック形質の発現を調節する手段を提供する。 (b)先行技術の説明 窒素は、生命に不可欠な分子である。全ての生命体は、アミノ酸、タンパク質
のビルディングブロック、ヌクレオチド、核酸のビルディングブロックを合成す
るために窒素を必要とする。硝酸アンモニウムは、化学肥料の形態で穀物に供さ
れる無機窒素の好ましい形体である。硝酸塩の窒素は、先ず亜硝酸塩に還元され
、次いで大抵の草木植物に共通する代謝経路の活動によりアンモニウムに還元さ
れる。種に依存して、吸収された硝酸塩の一部または全てが、アンモニウムに還
元される前に木質部を介して葉の細胞に移動する。アンモニウムまたは他の窒素
還元体はまた、根の組織により吸収されが（通常は低率であるが）、しかしそれ
らの同化作用は還元を必要としない。これらの新たに吸収されたアンモニウムま
たはアンモニウム含有分子は、アミノ酸と他の窒素分子を介して循環するアンモ
ニウムにより形成される細胞中の内在性プールに合流する。幾つかの種では、簡
単には硝酸塩の窒素を代謝しないので、単一の窒素源として硝酸塩に依存するこ
とができなく；多くの針葉樹の種類は、この後者の範疇に入る。多くの豆科植物
および他の共生植物種は、植物界において第３の大きな分類の窒素ユーザーを形
成する。すなわちそれらは、ガス状窒素を固定化できる微生物との代謝協力を形
成する。この還元された窒素は、植物の成長のために効率的に用いられ、したが
って、これらの穀物は、土壌中の無機窒素の利用に依存することなく発育できる
。
【０００２】 多くの微生物および野生植物種は、広汎に窒素源の利用に適合し、他の成長環
境で利用できる場合は、専一的にまた、効率的に利用できる窒素が１分子も無い
状態で生命サイクルを完了することができる。たいていの同化作用経路に関して
、窒素同化作用は、細胞中で堅固に調節されている。１例として、硝酸塩のアン
モニウムへの還元に関与する硝酸塩リダクターゼ（NaR）および亜硝酸塩リダク
ターゼ（NiR）をコードする遺伝子の発現は、種々の微生物種および植物種にお
いて広汎に記載さている（レビューとしてMiflin and Kea, Books 5 and 12, in
The Biochemistryof plantsを参照）。硝酸塩は、NaRおよびNiR発現の制御に関
与する唯一の調節分子ではないが、その存在は、最終的にこれらの遺伝子の持続
的な転写および翻訳を導くトランスダクションのカスケードを開始するのに必須
である。無機窒素を欠く状態で成長する際に、NaRおよびNiR遺伝子の発現は、豆
科植物において抑制されることが示されている。
【０００３】 NiRプロモーターは、幾つかの植物種において特性化されている（Back et al.
, 1991, Plant Molecular Biology 17:9-18; Sanderra, 1995, Plant Molecular
Biology 27:165-177）。これらのプロモーターの誘導性は、トランスジェニッ
ク植物におけるマーカー遺伝子を用いて特性化されており、硝酸塩の利用が、完
全な転写活性にとって必要であることがそこで示されている。
【０００４】 他の窒素源に関する同化作用の経路も記載されており、幾つかのこれらの経路
に関与する遺伝子プロモーターも確認されている。
【０００５】 微生物の遺伝子形質転換は、有用な組換え分子を生産するために15年以上もの
間利用されており、医薬品産業、化粧品産業、皮膚薬産業における利用が現在も
開発され続けている。この一般的な概念を複雑な真核生物に対し適合させるため
に必要とされる技術の開発により、この技術はこの10年間で微生物から植物およ
び動物へと拡大された。基本的には、有益なタンパク質をコードする遺伝子、ま
たは有益な分子に導く代謝経路の修飾に係る酵素をコードする遺伝子は、cis-お
よびトランス-作用の調節配列に適切な様式にて結合され、標的細胞に転移され
、その分子機構に（一時的または安定な様式にて）取込まれる。次いで、トラン
スジェニック細胞、またはトランスジェニック細胞から再生された組織または器
官は、導入遺伝子の転写および翻訳を実行し、したがって有益なタンパク質を蓄
積でき、または有益な酵素活性により新しい代謝反応を実行できる。
【０００６】 台頭しつつある分子農業産業（動物または穀物における組換え分子の生産）は
、今世紀最も有望な産業の１つである。安全かつ再生可能な分子工場を提供する
ことはその産業の将来性を保証する。現在開発されている応用の中には、治療用
および診断用の低価格モノクローナル抗体の生産、無限量のホルモン類、サイト
カイン類、およびその他の慢性または致死的疾病治療用の生物活性分子の生産、
種々の血液成分に替わる生体安全代替物の生産、食品およびパルプ産業に関する
無限量の加工酵素の生産、廃棄物処理用の低コスト酵素の生産、化粧品産業に係
る安全な生体活性分子の生産がある。
【０００７】 この技術の適用に対する限界は、多くはトランスジェニック生物が十分量の組
換え産物を蓄積できないことに起因し、それは転写率の低さ、メッセンジャーの
不適当なスプライシング、外来性RNAの不安定性、翻訳率の低さ、組換えタンパ
ク質の内因性プロテアーゼの作用に対する過敏性または組換え生物の外来性タン
パク質に対する過敏性の結果から生じ、これらは不適当で限定された発育、また
は最悪の場合には宿主生物に対する強い有害作用を引き起こす結果なる。利ざや
が狭い場合、または残留物の処理および/または廃棄が生物安全性問題または環
境問題を引き起こす場合、生産レベルの不十分さが応用開発に直接的影響を与え
る。このように、所望の組換え製品の蓄積レベルの改善は、分子農業の多くの応
用分野における商業化を保証する重要な要因の１つと思われる。
【０００８】 誘導性プロモーターの使用が提案され、幾つかの場合において、全ての上記因
子の組み合わされた作用と対抗するために用いられ成功している。強力な誘導性
プロモーターは、短期転写速度の高速化を生じさせることができ、その結果とし
て外来性のmRNAおよび転写産物の一時的蓄積を増大させることになる。その結果
、発現の誘導性が十分に同調されたタンパク質回収方法と組み合わされた場合、
得られた単位当たりの収量は、構成的発現を使用した場合よりも高くなる。
【０００９】 誘導性プロモーターを含んでいる複数の発現カセットが微生物生産システム用
に開発され、その幾つかは研究目的のために現在利用できる。幾つかの誘導性プ
ロモーターは、現在植物（傷害誘導性）または動物（哺乳類の乳腺細胞への特異
性、PPL）システムに使用されているが、硝酸塩などの低コストおよび生物安全
性の化学誘導物質を用いている報告はない。
【００１０】 遺伝的に改変された生物において、導入遺伝子の転写を調節する方法を提供す
ることが大いに望まれている。
【００１１】
【発明の概要】
本発明の目的の１つは、遺伝的に改変された生物において、導入遺伝子の転写
を調節する方法を提供することである。
【００１２】 本発明の他の目的は、その活性が窒素の存在により調節される促進配列の転写
制御下に有益な遺伝子のコード配列を含む発現ベクターの利用を提供することで
ある。
【００１３】 本発明は、植物における外来性遺伝子の発現制御に関する窒素誘導性発現カセ
ットの利用に関するものである。cis-作用配列が有益な遺伝子のオープンリーデ
ィングフレームに適切に連結された場合に、その転写が特定の窒素源の添加によ
り制御できるような調節配列を単離することが可能であることを以下の説明によ
り示す。
【００１４】 本発明の１つの態様において、目的のシステムは、トランスジェニック植物が
硝酸塩の無い培地で維持された場合に硝酸塩誘導性プロモーターを含むコンスト
ラクトが生長期間中低い転写を維持し、従ってトランスジェニック形質からの干
渉がない植物バイオマスの発育を可能にすることを目的として、豆科植物種を用
いる。発育培地に硝酸塩を添加すると、翌日以降バイオマスの比較的大きな割合
で転写が誘導される。次いで所望の組換え産物の回収を最大限にするために、誘
導時間およびタンパク質の蓄積の最適化がなされる。
【００１５】 以下の説明は、本発明が硝酸塩を枯渇したトランスジェニック豆科植物の硝酸
塩誘導に容易に適応できることを明確にするが、この一般概念が他の生産システ
ムの開発にも適用でき、微生物、動植物界における広汎な種類の窒素同化作用シ
ステムの利益を生み出すことに留意されたい。
【００１６】 本発明の他の１つの態様において、窒素誘導性はまた、共生協同によっては窒
素固定を実行しないが、種々の窒素源（還元または酸化された）を発育のために
使用でき、したがって、生育環境における１つの窒素基質の欠如によりそれらの
窒素同化作用経路のうちの１つが不活性であっても十分に発育能力を有する生物
においてタンパク質産生を最大限にするために使用できる。このような生物にお
いて有益な遺伝子の発現を駆動するために、この不活性経路のいかなる遺伝子の
転写をも制御するカセットは、それまで欠如していた窒素化合物の添加によりト
ランスジェニック形質の誘導発現を可能にする。１例として、アオウキクサは、
硝酸塩またはアンモニウムに対して別途に発育できる植物であり；本発明は、硝
酸塩発育のトランスジェニックアオウキクサ植物に対して誘導を行うことのでき
るような有益な遺伝子に適切に結合したアンモニウム誘導性プロモーターを保有
する発現カセットを開発するために利用できる。
【００１７】 本発明によれば、トランスジェニック生物における外来性遺伝子の転写を調節
する方法であって、以下のステップ： a) 少なくとも、配列番号1から13とその機能的断片および誘導体からなる群よ
り選択される配列を有する窒素誘導性プロモーター、および遺伝子のORFからな
る発現コンストラクトであって、前記プロモーターは前記遺伝子の発現が操作可
能であるように前記遺伝子に位置付けられている発現コンストラクトを用いてト
ランスジェニック生物を調製すること、 を含む方法が提供される。
【００１８】 本発明の好ましい実施形態によれば、この方法は、窒素誘導物質の添加または
除去により前記遺伝子の転写発現を調節するステップをさらに含んでもよい。
【００１９】 本発明の好ましい実施形態によれば、トランスジェニック生物における外来性
遺伝子の転写を調節する方法であって： a) 少なくとも、cis-作用配列を持つかまたは持たない窒素誘導性プロモーター
、遺伝子のORF、およびその3'端のポリアデニル化シグナル末端部位からなる発
現コンストラクトであって、前記プロモーターは前記遺伝子の発現が操作可能で
あるように前記遺伝子に位置付けら、窒素誘導物質の添加または除去によって前
記遺伝子の転写発現を調節している発現コンストラクトを調製し； b) ステップa)のコンストラクトを、前記生物に適したトランスフェクションベ
クターにサブクローニングし； c) 前記生物のDNAまたはその細胞中に前記ベクターを導入し；そして d) 適切な培地においてトランスジェニック体（transgenicity）を選択するこ
と、 を含む方法が提供される。
【００２０】 本発明の好ましい実施形態によれば、この方法は、さらに以下のステップ： e) ベクターを、適切なアクロバクテリウム・ツメファシエンス（Agrobacteriu
m tumefaciens）株に導入し； f) T-DNAを植物細胞に導入するためにステップa)のアクロバクテリウム株を使
用し； g) 適切な培地において前記植物細胞のトランスジェニック体を選択し； h) 前記トランスジェニック細胞から胚または小植物を再生させ；そして i) 前記の再生胚から成熟植物を成長させる、 ことを含むことができる。
【００２１】 本発明の好ましい実施形態によれば、cis-作用配列がアルファルファの発現性
Nir遺伝子の5'端上流領域から単離できる。
【００２２】 本発明の好ましい実施形態によれば、プロモーターが配列番号1から13に記載
された配列とその機能的断片および誘導体を有する。
【００２３】 本発明の好ましい実施形態によれば、生物が植物、より好ましくは双子葉植物
である。
【００２４】 本発明の好ましい実施形態によれば、生物がアルファルファまたはタバコであ
る。
【００２５】 本発明の好ましい実施形態によれば、窒素誘導物質が硝酸塩である。
【００２６】 本発明の好ましい実施形態によれば、DNA導入方法が、DNAボンバードメント、
エレクトロポーレーション、PEG介在性DNAＡ導入およびウィスカーを含む任意の
好適な導入方法である。
【００２７】 本発明の好ましい実施形態によれば、発現コンストラクトが少なくとも窒素誘
導性プロモーター、および少なくとも１つのcis-またはトランス-作用エレメン
トを含む。
【００２８】 本発明の好ましい実施形態によれば、生物が植物、真菌、細菌、酵母および動
物である。
【００２９】 本発明の好ましい実施形態によれば、プロモーターまたはcis-作用配列が窒素
同化経路に関与する任意の遺伝子の5'上流領域から単離される。
【００３０】 本発明の好ましい実施形態によれば、プロモーターまたはcis-作用配列が所与
の窒素源の利用性によってその転写が調節される任意の遺伝子の5'上流領域から
単離される。
【００３１】 本発明の好ましい実施形態によれば、プロモーターまたはcis-作用配列が任意
の生物環境への窒素源の添加またはその環境からの窒素源の除去によってその転
写活性が調節される任意の配列である。
【００３２】 本発明の好ましい実施形態によれば、プロモーターまたはcis-作用配列を単離
する生物が任意の植物、真菌、酵母、細菌または動物である。
【００３３】 本発明の好ましい実施形態によれば、トランスジェニック生物における外来性
遺伝子の転写を促進するプロモーターであって、前記遺伝子発現のためのcis-作
用配列を持つかまたは持たず、そして窒素誘導物質の添加または除去によって前
記遺伝子の転写発現を調節するように調整されている窒素誘導性プロモーターが
提供される。
【００３４】 好ましくは、前記プロポーターが配列番号1から13とその機能的断片および誘
導体からなる群より選択される配列を有する。
【００３５】 本発明の好ましい実施形態によれば、トランスジェニック生物における外来性
遺伝子の発現を可能とし、プロモーターと組み合わせて使用されるターミネータ
ーであって、前記遺伝子の3'端への挿入のためのポリアデニル化シグナル末端部
位を有し、前記遺伝子および前記プロモーターに対して操作可能に位置付けられ
、それによって前記遺伝子の発現を可能としているターミネーターが提供される
。
【００３６】 好ましくは、ターミネーターが、配列番号14から16とその機能的断片および誘
導体からなる群より選択される配列を有する。
【００３７】 本発明の目的のために、次の用語が下記に定義される。
【００３８】 「機能的断片またはその誘導体」という表現は、配列番号1から16の任意の誘
導体または断片を意味するものであって、それらは配列番号1から13に記載され
る本発明のプロモーターまたは配列番号14から16に記載される本発明のターミネ
ーターとして外来性遺伝子の同一レベルの発現を可能にする。
【００３９】
【発明の詳しい説明】
以下は、レポーター遺伝子の発現を調節できるトランスジェニックタバコおよ
びアルファルファ系統を発生させるために使用される方法の詳細な説明である。
本発明の範囲内を維持しながら、その方法に様々なバリエーションを加えること
によって、窒素誘導性プロモーターを単離でき、それらを植物での発現に使用さ
れるコンストラクトのORFsに結合でき、このコンストラクトの各種cis-およびト
ランス-作用エレメントが使用され空間的に配置でき、窒素による誘導が証明さ
れ、そして利用され得ることを銘記すべきである。
【００４０】 この実施形態において、最初にNiR cDNA鎖を、植物NiRのコンセンサス配列か
ら推測されたプライマーを用いたRT-PCRによってアルファルファから単離した。
次いでこのcDNAストレッチを、上流/下流のゲノムウォーキングを実施するため
に用いた。NiRプロモーター領域および欠失体、5'UTRおよびNiRターミネーター
を、レポーター遺伝子GUSの転写および終結を制御するために機能的に位置付け
た。Desgagnesら（1995, Plant Cell Tissue Organ Cult. 42:129-140）に記載
されるように、これらのコンストラクトを、タバコ葉およびアルファルファ葉へ
のDNAボンバードメントのための、またはアグロバクテリウム介在性DNA導入のた
めの好適な発現ベクターに挿入した。これら２つのDNA導入方法は、レポーター
遺伝子発現が成長培地において硝酸塩の添加または除去により調節できることを
証明するために用いられた。材料と方法 生物材料： 大腸菌株DH5-αを、全てのクローニングステップを実施するために用いた。冷
却抵抗性アルファルファ遺伝子型11.9を、A. tumefaciens感染を用いる安定な形
質転換を含む全ての実験用に用いた（Desgagnes et al., 1995, Plant Cell Tis
sue Organ Cult. 42:129-140）。 トータルRNAの単離： de Vriesら（1988, B6ページ1, In: Gevin SB and Shilperoot RA editors, P
lant Molecular Biology Manual, Dordrecht: Kluwer Academic Publisher）に
実質的に記載されているホットフェノール法を用いてトータルRNAを抽出した。
RT-PCR： 葉のトータルmRNAから、１つの豊富なNiR mRNA分子種に対応するDNA断片を作
成するためにRT-PCRを使用した。最初に、5種の一般的なNiR ORFs、すなわち、G
enBank配列#AB006032（シロイヌナズナのNiR mRNA）、#X66145（タバコの部分的
Nir mRNA）、#U10419（豆完全長Nir cds）、#X07568（Spinach NiR mRNA）、お
よび#U90429（グリシンmax Nir完全長ｃｄｓ）から1つの保存領域を同定した。
変性オリゴヌクレオチドを2つの保存領域、すなわちコード鎖の5'端のNir5・5'
GATATTGATGTTAGACTCAAGTGGC 3'（配列番号17）、および3'端のNir3-5' CACYSATT
CCACTTCCTWGGC 3'（配列番号18）から推定した。1×M-MLV-RT緩衝液（50 mMトリ
ス-HCl pH 8.3、75 mM KCl、3mM MgCl2）中の１μgの葉トータルRNA、4 mM dNTP
（各1 mM）、5μMの無作為ヘキサマープライマーを用いて、逆転写反応を、最初
200単位のN-MLV逆転写酵素（RT）により37℃1時間行なった。1×PCR緩衝液（20
mMトリス-HCl pH 8.4、50 mM KCl、2mM MgCl2）中の2.5単位のTaq DNAポリメラ
ーゼ、2μM Nir5プライマー、2μM Nir3プライマー、800μM cNTPs（各200μM）
を用いて、PCR反応をPerkin Elmer Cetus GenAmP PCRシステム9600（EG&G, Well
esley, MA）にて実施した。用いたサイクルプログラムは：始めに94℃4分を行い
、次いで94℃で1分、55℃で30秒、72℃で3分を30サイクル行った。また72℃で7
分の伸長期間をプログラムに含めた。 DNA塩基配列決定： DNA塩基配列決定は、Sangerら(1977, P.N.A.S. USA, 74:5643-5647)により記
載されたとおり実施した。 ゲノムウォーキング： RT-PCR反応からクローン化したアルファルファNir cDNA断片の上流ウォーキン
グは、Clontech Labiratories（カリフォルニア州パルアルト）（カタログ番号1
807-1）のUniversal Genome Walkerキットを用いて実施した。コード配列の上流
配列を増幅するために用いNiR特異的カスタムプライマーは： Nir1106r-5' TTGTCACATCAGCACATCCGTCTTTGC 3'（配列番号19）および Nir1061r-5' TCGCCAAGTATCTTGTTTGAGCACTTG 3'（配列番号20） である。
【００４１】 増幅された3775 bp断片を、次の分析のためにpGEM-T easy vector（Promega社
、ウィスコンシン州マジソン）（カタログ番号1360）にサブクローニングした。
得られたプラスミドをpGNir4cと命名した。
【００４２】 下流ウォーキングは、以下のNiR特異的プライマーを用いて上流ウォーキング
と同様に実施した： Nir1c-5' ATGTCTTCCTTCTCAGTACGTTTCCTC 3'（配列番号28）および Nir138c-5' CAAGTTGATGCATCAAGGTGGGAGCCTAGA 3'（配列番号29）。
【００４３】 増幅された3508 bp断片を、次の分析のためにpGEM-T easy vector（Promega社
、ウィスコンシン州マジソン）（カタログ番号1360）にサブクローニングした。
得られたプラスミドをpGN3'1と命名した。 発現カセットおよびベクターの構築： GUSレポーター遺伝子を用いて発現分析用カセットを以下のとおりに構築した
。プロモーターの無いGUSカセットは、pBl101をHindIIIおよびEcoRIで消化し、p
UC19のポリクローニング部位のHindIIIおよびEcoRI部位に挿入した。得られたプ
ラスミドをpBl201と命名し、次のコンストラクト構築のために使用した。Nir上
流配列を、上流位置のプライマーとしてUniversal Genome WalkerキットのAP2プ
ライマー、またSmaI制限部位で終結するカスタムデザイン化された下流プライマ
ーのいずれかを用いてPCR増幅した。4プライマーは、遺伝子の5'UTR領域（Nir51
r-Sma-5' TTCTCCCGGGGACGAGAGATGGATGGT 3'（配列番号21））、トランジットペ
プチドコード配列の末端部（Nir51r-Sma-5' TTCTCCCGGGGGACGAGAGATGGATGGT 3'
（配列番号22））、トランジットペプチドコード配列後の50 bp（Nir103r-Sma-5
' TTCTCCCGGGGTTGAA-ACAGGTGCAACTGA 3'（配列番号23））、およびトランジット
ペプチドコード配列後の100 pb（Nir158r-Sma-5' TTCTCCCGGGTAACCATCTTTTTCCTC
A 3'(配列番号24)）のいずれかに位置付けされる。増幅は、テンプレートとして
pGNir4cプラスミドを用いた標準的条件下で行なった。
【００４４】 Nirプロモーターの5'欠失体を作成するため、増幅断片を特異的制限酵素によ
り消化した。AP2およびNir-23r-Smaプライマーを用いて事前に増幅した断片をXm
aIで消化し、Xmalで事前に消化したpBl1201に挿入することによりpNlr3k-23を作
成した。用いた下流プライマーが、それぞれNir51r-Sma、Nir103r-SmaおよびNir
158r-Smaであることを除き、同様の方法によってpNir3k51、pNir3k103、pNir3k1
58プラスミドを作成した。SmalおよびBamH1で事前消化したpBl201に挿入されたA
P2-Nir-23-Sma増幅断片をSmal-Bglll消化してNir2.2k-23を作成した。用いた下
流プライマーが、それぞれNir51r-Sma、Nir103r-SmaおよびNir158r-Smaであるこ
とを除き、同一の方法によってpNir2.2k51、pNir2.2k103、pNir2.2k158プラスミ
ドを作成した。挿入物の正確さと方向性は、制限酵素による消化により確認した
。これらの欠失断片は、pBl201におけるGUSレポーター遺伝子の5'端に連結し、D
NAボンバードメントを用いた一時的発現試験に使用した。適切な欠失断片を同定
し、それらを、pBl101（Clonetech社）などのバイナリー植物発現ベクターにサ
ブクローニングした。
【００４５】 NiRプロモーターに加えてGUS遺伝子下流のNiRターミネーターを含有するカセ
ットの構築のために、以下のNiR特異的プライマーを使用した： Nir2514C-Sac-5' AGAAGAGCTCAGTATATAGGTATTTGGTGA 3'（配列番号30）、 Nir2728c-Sac -5' AGAAGAGCTCTTGTACATTTGGATAAGTCA 3'（配列番号31）、 Nir3029r-Eco-5' AGAAGAATTCGTTTTCCCGATACTTCAACT 3'（配列番号32）。
【００４６】 617 bpターミネーター断片をプライマーNir2514c-SacおよびNir3029r-Ecoを用
いてPCR増幅し、503 bpターミネーター断片をプライマーNir2728c-SacおよびNir
3029r-Ecoを用いてPCR増幅した。得られた断片をSacIおよびEcoRIにより消化し
、SacIとEcoRI部位との間のNOSターミネーターの欠失後、NiR-GUSコンストラク
トを含むプラスミドに挿入した。
【００４７】 これらの組換えプラスミドを、下記のA.ツメファシエンス感染を介する安定な
組込みのために用いた。 アグロバクテリウム媒介性DNA導入およびトランスジェニックアルファルファ系
統の再生： 組換えプラスミドを、Khoudiら(1997, Gene 197:343-351)記載のエレクトロポ
ーレーションにより、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium
tumefaciens)株LBA4404に導入した。次いで、選択したアグロバクテリウム株を
、選択圧（カナマイシン）の不在下で、遺伝子型C5-1からのリーフディスクと共
に4日間共培養した。この培養期間後、リーフディスクを洗浄し増殖させ、次い
でB5H培地上にカルスを形成させた。次にカルスを、胚誘導のためのSH培地上に2
1日間移し、胚発生用のBOi2Y上で28日間培養した。魚雷型胚をBOi2Yから除いて
再生用のMS培地に入れた。カナマイシンは、共培養時を除いて全培養培地および
MS上の再生時に添加した。この方法は、Desgagnesら(1995, Plant Cell Tissue
Organ Cult. 42:129-140)に詳細に記載されている。根づいた植物を温室で完全
に成長させた。導入遺伝子の組み込みは、ゲノムDNAからNiR-GUS断片をPCR増幅
することにより確認した。用いたプライマーは： Nir-102c-5' CACACTTCTTCACTCACCTCTCAA 3'（配列番号25）、 Nir-2016c-5' ATCTAGGAGGGGCAGACATTG 3'（配列番号26）、 GUS228r-5' TCGGTATAAAGACTTCGCGCTGAT 3'（配列番号27）である。 アグロバクテリウム媒介性DNA導入およびトランスジェニックタバコ系統の再生
： 組換えプラスミドを、Khoudiら(1997, Gene 197:343-351)に記載されるエレク
トロポーレーションにより、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacte
rium tumefaciens)株LBA4404に導入した。次いで、選択した株を選択圧カナマ
イシンの不在下、リーフディスクと共に２日間共培養した。この期間後、外植体
を選択培地（カナマイシンを有するMS）に移した。外植体をこの培地に３週間維
持し、トランスフェクションした細胞のカルスおよび根を形成させた。カナマイ
シン耐性根を根付かせるためのMS培地に移した。根付いた小植物を温室で完全に
成長させた。導入遺伝子の組み込みは、ゲノムDNAからNiR-GUS断片をPCR増幅す
ることにより確認した。用いたプライマーは： Nir-102c-5' CACACTTCTTCACTCACCTCTCAA 3'（配列番号25）、 Nir-2016c-5' ATCTAGGAGGGGCAGACATTG 3'（配列番号26）、 GUS228r-5' TCGGTATAAAGACTTCGCGCTGAT 3'（配列番号27）である。 硝酸塩誘導： トランスジェニックおよび非トランスジェニックのタバコおよびアルファルフ
ァは、硝酸塩無しのバーミキュラート培地で成長した。鉱物バランスは、硝酸塩
無しのHoagland溶液（Hoagland and Vamon, 1950, Circular 347, California A
gr. Exp. Stat. バークレー）を繰返し添加することにより維持した。硝酸塩誘
導は、5gL-1濃度の20-20-20施肥剤、または別途に40 mM硝酸塩で補足したHoagla
nd溶液で植物を水栽培することにより実施した。 タバコ葉におけるNiRプロモーター活性： NiR由来のプロモーターを、GUSレポーター遺伝子の上流に転写および翻訳融合
させて位置付けた。ここで分析されたNiRプロモーターの5'欠失体は、(1)コード
領域の開始ATGの上流2813 bpを含む推定の完全長プロモーター、(2)プロモータ
ーの1905 bp型、および(3)プロモーターのより短い1111 bp型である。プロモー
ターの3'端をGUSコード領域の5'端に融合させ、転写および翻訳融合を形成した
。分析された翻訳融合は、(1)NiRクロロプラストトランジットペプチド、(2)NiR
からの17アミノ酸を追加したNiRトランジットペプチド、および(3)NiRからの36
アミノ酸を追加したNiRトランジットペプチドを含むβ-グルクロニダーゼの産生
を可能にした。タバコ植物に導入されたNiRプロモーターの5'および3'欠失体の1
2とおりの組み合わせを図1に示す。
【００４８】 アグロバクテリウム媒介性トランスフェクション法（Khoudiら, 1997, Gene 1
97:343-351）を用いて遺伝子コンストラクトをタバコ植物に導入した。トランス
ジェニック植物を発育室に移し、硝酸塩施肥前後のβ-グルクロニダーゼ含量を
分析した。図1は、小植物の第1番目の拡張葉（expanded leaf）で測定されたβ-
グルクロニダーゼ活性の平均レベルを示す。
【００４９】 NiR由来プロモーターの全てが硝酸塩誘導の反応性を示した。プロモーターの
切断に係らずβ-グルクロニダーゼ発現の5〜10倍の範囲での増大が一般に観測さ
れ、開始ATGの最初の1.1 kb上流内に重要な硝酸塩反応エレメントが含まれてい
ることを示している。NiRプロモーターの5'欠失体、3'欠失体双方ともβ-グルク
ロニダーゼ活性の重大な変更を引き起こした。GUS発現の最高レベルは、2.8 kb
プロモーターによって得られたが、このことは、葉のNiR発現レベルにとっては
るかに上流領域が調節的な役割を有していることを示している。
【００５０】 GUSコード領域に対するプロモーターの翻訳融合は、プロモーターの5'端の伸
長に依存して様々な発現レベルを生じた。しかし、最短の融合（β-グルクロニ
ダーゼのアミノ末端に融合した17 a.a. NiRトランジットペプチドを含む）は、
常に3種の5'末端切断物すべてに対して最高レベルの活性を示した。この短い翻
訳融合と上流プロモーター領域の最長伸長との組合せは、最強のプロモーター（
3 kb + 50）をもたらした。誘導をかけた場合、この特定のコンストラクトは35S
-GUS-NOSコンストラクトによって得られたGUS発現の13倍以上のレベルを生じさ
せた。
【００５１】 プロモーターの最長5'伸長を考慮すると、GUS遺伝子（3kb-5）への転写融合は
、短い翻訳融合（3kb + 50）より7倍以上も効果が低い。しかし、誘導状態では3
kb-5プロモーター欠失を有する植物におけるGUS発現レベルは、35S-GUS-NOS植物
において見られたものよりも1.8倍高い。
【００５２】 以上の結果を合わせると、アルファルファNiR遺伝子の上流配列は、タバコ葉
にある外来性遺伝子の高率の誘導発現を駆動する能力を有することが明らかに示
される。 NiRターミネーターの効率： レポーター遺伝子GUSの転写および終結を駆動するために機能的に位置付けら
れた3'UTR配列およびターミネーター（配列番号15、16）と共に、プロモーターN
iRと欠失体（配列番号2、3、5、6）、35Sからなるコンストラクトを用いて、タ
バコ葉を形質転換した。成長、硝酸塩誘導およびGUS活性の測定は、図1に示すよ
うに各々の実験ごとに実施した。図2に示した結果は、NiRのターミネーター配列
が翻訳可能なメッセンジャーRNAへと翻訳を集結させることを示している。 アルファルファ葉におけるNiRプロモーター活性： Desgagnesら(1995, Plant Cell Tissue Organ Cult. 42:129-140)のアグロバ
クテリウム媒介性トランスフェクション法を用いて、図3に示した遺伝子コンス
トラクトを含むトランスジェニックアルファルファ植物を得た。in vivo植物を
発育室に移し、正常な植物成長を行なわせた。各トランスジェニック系統の切断
物をバーミキュライト中で発育させ、硝酸塩の無いHoagland培地を用いて施肥し
た。2週間後、根をニトラジン（Nitragin）(LiphaTech社、ウィスコンシン州ミ
ルウォーキー)でインキュベートした。インキュベーションのの2週間後、根に小
結節が発現し、小結節の発現した植物を少なくとももう1週間植物の成長を続け
させてからβ-グルクロニダーゼ活性（誘導前）の蛍光定量測定を実施した。測
定後、40 mmol KNO3を含むHoagland培地を用いてその植物に給水した。誘導2日
後、葉のβ-グルクロニダーゼ活性を測定し、アルファルファ葉におけるNiRプロ
モーターの硝酸塩誘導性を評価した。結果を図3に示す。この結果により小結節
の発現したアルファルファ植物に硝酸塩を添加するとプロモーターNiRがGUSレポ
ーター遺伝子の発現を誘導することが示される。この最後の一連の結果を合わせ
ると、大気窒素の固定を窒素同化に置き換える際に、アルファルファ植物におい
て外来性遺伝子の発現を正方向に調節するためにNiRプロモーターを誘導的に使
用し得ることが示される。
【００５３】 本発明は、その具体的な実施形態に関連させて記載したが、さらなる改変が可
能であることは理解されよう。また、本出願は、一般に、本発明の原理に従う変
化、利用または改造を含むことを意図し、本発明が関係する技術内で知られた、
または通例の実施内で生じるような前記の本質的な特徴に適用でき、また添付の
特許請求の範囲内に従って本発明の開示からの逸脱を含むものである。
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図１】 植物の硝酸施肥前（空欄）および施肥後（記入欄）のトランスジェニックタバ
コ植物の葉におけるプロモーターNir（配列番号2から13）およびターミネーター
NOSを用いたGUS発現レベルを示す。方法に記載されるように、タバコ植物は、GU
Sレポーター遺伝子の転写および終結を制御するように機能的に位置付けされた
アルファルファNiRプロモーターおよびNOSターミネーターの完全長および欠失体
により形質変換された。GUS活性を硝酸塩による誘導前後にJeffersonら（1987,
EMBO J. 13:3901-3907）に従って測定した。
【図２】 植物の硝酸施肥前（空欄）および施肥後（記入欄）のトランスジェニックタバ
コ植物の葉におけるプロモーターNir（配列番号2、3、5-6）およびターミネータ
ーNir（配列番号15-16）を用いたGUS発現レベルを示す。材料および方法に記載
されるように、タバコ植物はGUSレポーター遺伝子の転写および終結を制御する
ように機能的に位置付けされたアルファルファNiRプロモーターおよびＮiRター
ミネーターの完全長および欠失体により形質変換された。GUS活性を硝酸塩によ
る誘導前後にJeffersonら（1987, EMBO J. 13:3901-3907）に従って測定した。
【図３】 硝酸施肥前（空欄）および施肥後（記入欄）の小結節が形成されたトランスジ
ェニックアルファルファ植物の葉におけるプロモーターNirおよびターミネータ
ーNOSを用いたGUS発現レベルを示す。アルファルファ遺伝子型11.9は、Khoudiら
（1997, Gene 197:343-351）により記載されるように、レポーター遺伝子GUSの
発現を駆動するように機能的に位置付けされたコンストラクトGC2-E、GC2-B、DC
1-Dおよび35Sにより形質転換された。再生後、トランスジェニック植物は無菌の
バーミキュライトに移されて、リゾビウム株のバルザック（Balzac）（Nitragin
）を接種された。植物は硝酸塩の無いHoagland溶液を繰返し添加して３週間成長
させ；次いでJeffersonら（1987, EMBO J. 13:3901-3907）により記載されるよ
うに、GUS活性を最初の完全に広がった葉で測定した。次に、植物を40mM硝酸塩
で2日間施肥した。GUS活性を最初の完全に広がった葉で再度測定した。ここに示
されたデータは、硝酸塩誘導前後の間のGUS特異的活性の比率である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ，ＭＬ， ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，ＧＭ，Ｋ Ｅ，ＬＳ，ＭＷ，ＭＺ，ＳＤ，ＳＬ，ＳＺ，ＴＺ，ＵＧ ，ＺＷ)，ＥＡ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ， ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ)，ＡＥ，ＡＧ，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ， ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，ＢＺ，Ｃ Ａ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＲ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＤＭ ，ＤＺ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＤ，ＧＥ，ＧＨ， ＧＭ，ＨＲ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ，ＩＳ，ＪＰ，Ｋ Ｅ，ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＡ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ， ＭＷ，ＭＸ，ＭＺ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，Ｒ Ｕ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ，ＴＭ ，ＴＲ，ＴＴ，ＴＺ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＳ，ＵＺ，ＶＮ， ＹＵ，ＺＡ，ＺＷ Ｆターム(参考） 2B030 AA02 AB03 AD20 CA06 CA17 CA19 CD03 CD07 CD09 4B024 AA08 AA20 CA01 DA01 FA02

Claims (21)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 トランスジェニック生物における外来性遺伝子の転写を調節
    する方法であって、以下のステップ： a) 少なくとも、配列番号1から13とその機能的断片および誘導体からなる群よ
    り選択される配列を有する窒素誘導性プロモーター、および遺伝子のORFからな
    る発現コンストラクトであって、前記プロモーターは前記遺伝子の発現が操作可
    能であるように前記遺伝子に位置付けられている発現コンストラクトを用いてト
    ランスジェニック生物を調製すること、 を含む方法。
  2. 【請求項２】 窒素誘導物質の添加または除去によって前記遺伝子の転写発
    現を調節するステップをさらに含む請求項１の方法。
  3. 【請求項３】 トランスジェニック生物における外来性遺伝子の転写を調節
    する方法であって： a) 少なくとも、cis-作用配列を持つかまたは持たない窒素誘導性プロモーター
    、遺伝子のORF、およびその3'端のポリアデニル化シグナル末端部位からなる発
    現コンストラクトであって、前記プロモーターは前記遺伝子の発現が操作可能で
    あるように前記遺伝子に位置付けら、窒素誘導物質の添加または除去によって前
    記遺伝子の転写発現を調節している発現コンストラクトを調製し； b) ステップa)のコンストラクトを、前記生物に適したトランスフェクションベ
    クターにサブクローニングし； c) 前記生物のDNAまたはその細胞中に前記ベクターを導入し；そして d) 適切な培地においてトランスジェニック体（transgenicity）を選択するこ
    と、 を含む方法。
  4. 【請求項４】 前記生物が植物である請求項３の方法。
  5. 【請求項５】 さらに以下のステップ： e) ベクターを、適切なアクロバクテリウム・ツメファシエンス（Agrobacteriu
    m tumefaciens）株に導入し； f) T-DNAを植物細胞に導入するためにステップa)のアクロバクテリウム株を使
    用し； g) 適切な培地において前記植物細胞のトランスジェニック体を選択し； h) 前記トランスジェニック細胞から胚または小植物を再生させ；そして i) 前記の再生胚から成熟植物を成長させる、 ことを含む請求項４の方法。
  6. 【請求項６】 cis-作用配列がアルファルファの発現性Nir遺伝子の5'上流
    領域から単離された配列である請求項３の方法。
  7. 【請求項７】 プロモーターが配列番号1から13に記載された配列とその機
    能的断片および誘導体を有する請求項３の方法。
  8. 【請求項８】 生物が植物、真菌、細菌、酵母および動物からなる群より選
    択される請求項１の方法。
  9. 【請求項９】 植物が双子葉植物（dicot）である請求項８の方法。
  10. 【請求項１０】 双子葉植物がアルファルファまたはタバコである請求項９
    の方法。
  11. 【請求項１１】 窒素誘導物質が硝酸塩である請求項２の方法。
  12. 【請求項１２】 DNA導入方法が、DNAボンバードメント、エレクトロポーレ
    ーション、PEG介在性DNA導入およびウィスカーを含む任意の好適な導入方法であ
    る請求項３の方法。
  13. 【請求項１３】 発現コンストラクトが少なくとも窒素誘導性プロモーター
    、および少なくとも一つのcis-またはトランス-作用エレメントを含む請求項３
    の方法。
  14. 【請求項１４】 プロモーターまたはcis-作用配列が窒素同化経路に関与す
    る任意の遺伝子の5'上流領域から単離される請求項３の方法。
  15. 【請求項１５】 プロモーターまたはcis-作用配列が、窒素源の利用性によ
    ってその転写が調節される任意の遺伝子の5'上流領域から単離される請求項３の
    方法。
  16. 【請求項１６】 プロモーターまたはcis-作用配列が、任意の生物環境への
    窒素源の添加またはその環境からの窒素源の除去によってその転写活性が調節さ
    れる任意の配列である請求項３の方法。
  17. 【請求項１７】 プロモーターまたはcis-作用配列を単離する生物が任意の
    植物、真菌、酵母、細菌または動物である請求項３の方法。
  18. 【請求項１８】 トランスジェニック生物における外来性遺伝子の転写を促
    進するプロモーターであって、前記遺伝子の発現のためのcis-作用配列を持つか
    または持たず、そして窒素誘導物質の添加または除去によって前記遺伝子の転写
    発現を調節するように調整されている窒素誘導性プロモーターを含むプロモータ
    ー。
  19. 【請求項１９】 前記プロモーターが、配列番号1から13とその機能的断片
    および誘導体からなる群より選択される配列を有する請求項18のプロモーター。
  20. 【請求項２０】 トランスジェニック生物における外来性遺伝子の発現を可
    能とし、プロモーターと組み合わせて使用されるターミネーターであって、前記
    遺伝子の3'端への挿入のためのポリアデニル化シグナル末端部位を有し、前記遺
    伝子および前記プロモーターに対して操作可能に位置づけられ、それによって前
    記遺伝子の発現を可能としているターミネーター。
  21. 【請求項２１】 前記ターミネーターが、配列番号14から16とその機能的断
    片および誘導体からなる群より選択される配列を有する請求項20のターミネータ
    ー。
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