JP2005531307A - 変化した免疫原性を有するスブチラーゼ及びスブチラーゼ変異体 - Google Patents
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Abstract
Description
WO00/26230及びWO01/83559は、親タンパク質と比較して免疫原性が減少したタンパク質変異体を選択する2つの異なる方法を開示している。
WO99/38978は、IgE結合部位を修飾することによりアレルゲンを修飾してアレルギー性を低くする方法を開示している。
WO99/53038は、ヒトにおいてより低いアレルギー反応を示す突然変異タンパク質、及びこのようなタンパク質を構成、同定及び製造する方法を開示している。
WO00/22103は、免疫反応が減少したポリペプチドを開示し、WO01/83559は、修飾された免疫原性を有するタンパク質変異体を開示している。
位置164のXaa残基、位置175のXaa残基及び位置241のXaa残基が、以下の組合せの1つである:
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であるか、
又は
b)位置164のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であるか、
又は
c)位置164のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、H、F、Y、W又は不存在である、
スブチラーゼが提供される。
本発明の第四の態様によれば、前記DNA配列を含むベクターが提供される。
本発明の第五の態様によれば、前記ベクターを含む宿主細胞が提供される。
本発明の第六の態様によれば、本発明のスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体を含む組成物が提供される。
本発明に関連して、用語「スブチラーゼ」とは、Siezen等、Protein Engng.4(1991)719-737及びSiezen等、Protein Science 6(1997)501-523に記載されているサブグループのセリンプロテアーゼである。
用語「親」は、本発明に関連して、タンパク質変異体を生成するために修飾されるタンパク質を意味する。親タンパク質は、天然(野生型)ポリペプチド、又はいずれかの好適な手段により調製された変異体であることができる。例えば、親タンパク質は、天然ポリペプチドの、一つ以上のアミノ酸残基の置換、化学的修飾、欠失又はトランケーションによるか、アミノ酸配列に対する一つ以上のアミノ酸残基の付加又は挿入により修飾された天然タンパク質の変異体であることができる。したがって、用語「親スブチラーゼ」は、スブチラーゼ変異体を生成するために修飾されるスブチラーゼを意味する。
用語「修飾(単一又は複数)」又は「修飾された」とは、本発明に関連して、タンパク質の化学的修飾だけでなく、タンパク質をコードするDNAの遺伝子操作を含むことを意味する。修飾(単一又は複数)は、意図するアミノ酸(単一又は複数)におけるか又はそこでの、アミノ酸側鎖(単一又は複数)の置き換え(単一又は複数)、置換(単一又は複数)、欠失(単一又は複数)及び/又は挿入であることができる。したがって、用語「修飾されたタンパク質」、例えば、「修飾されたスブチラーゼ」は、親タンパク質と比較して修飾(単一又は複数)を含むタンパク質を意味する。
位置又はアミノ酸との関連で使用される用語「欠失」又は「欠失された」は、本発明に関連して、特定の位置におけるアミノ酸が欠失されたか、又はそれが不存在であることを意味する。
位置又はアミノ酸との関連で使用される用語「置換」又は「置換された」とは、本発明に関連して、特定の位置におけるアミノ酸が、別のアミノ酸により置き換えられていることか、又は特定のタンパク質、例えば、タンパク質配列の一つとは異なるアミノ酸が存在することを意味する。
配列番号:1'
用語「配列番号:1'」は、本発明の関連において、Xaa残基が、
位置3ではS又はTであり、
位置4ではV又はIであり、
位置27ではK又はRであり、
位置55ではG、A、V、L、I、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置74ではN又はDであり、
位置85ではS又はNであり、
位置97ではS又はDであり、
位置101ではS又はAであり、
位置102ではV、N、Y又はIであり、
位置121ではN又はSであり、
位置157ではG、D又はSであり、
位置188ではA又はPであり、
位置193ではV又はMであり、
位置199ではV又はIであり、
位置211ではL又はDであり、
位置216ではM又はSであり、
位置230ではQ又はHであり、
位置239ではQ又はRであり、
位置242ではN又はDであり、
位置246ではN又はKであり、
位置268ではT又はAであり、
位置164のXaa残基、位置175のXaa残基及び位置241のXaa残基が、以下の組合せの1つである:
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であるか、
又は
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であるか、
又は
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、H、F、Y、W又は不存在である、
配列番号:1による配列の略語として使用される。
アミノ酸について、周知の3文字及び1文字略語が使用される(例えば、Creighton TE(1993),Proteins;Structures and Molecular Properties(構造及び分子特性)、第2版、W.H.Freeman and Company、図1.1、第3頁参照)。略語「X」又は「Xaa」は、任意のアミノ酸について使用される。本発明に関連して、略語「aa」は、「アミノ酸」について使用される。
アミノ酸(単一又は複数)の欠失、挿入及び/又は置換の説明に際して、以下の命名法を、本発明において使用する:
最初のアミノ酸(単一又は複数)、位置(単一又は複数)、欠失/挿入された/置換アミノ酸(単一又は複数)
Gly195Glu又はG195E
として示され、同じ位置でのグリシンの欠失は:
Gly195*又はG195*
として示され、リジン等の追加のアミノ酸残基の挿入は:
Gly195GlyLys又はG195GK
として示される。
位置36におけるアスパラギン酸の挿入については、
*36Asp又は*36D
と示される。
複突然変異は、+により分離される。すなわち、
Arg170Tyr+Gly195Glu又はR170Y+G195E
は、位置170及び位置195において突然変異があり、それぞれアルギニン及びグリシンに対してそれぞれチロシン及びグルタミン酸が置換していることを表す。
本発明は、位置57が、位置:170、181及び247のうちの少なくとも一つにおける修飾と組み合わせて修飾されているスブチラーゼ変異体に関し、及び配列番号:1'のスブチラーゼに関する。本発明者等は、前記スブチラーゼ変異体及びスブチラーゼが、それぞれ親スブチラーゼ及びSavinaseと比較して変化した免疫原性を有することを見出した。
又は
又は
又は
又は
又は
又は
又は
又は
又は
また、本発明の一実施態様によれば、本発明のスブチラーゼは、ループに挿入、すなわち、位置33〜42、位置93〜101、位置123〜130、位置151〜167、位置175〜189、位置196〜198又は位置212〜213のうちの一つ以上において挿入を含んでいてもよい。
上記したように、スブチラーゼは、Siezen等、Protein Engng.4(1991)719-737及びSiezen等、Protein Science 6(1997)501-523によるセリンプロテアーゼのサブグループを構成している。スブチラーゼは、これまでSubtilisin 様プロテアーゼと称されていたセリンプロテアーゼの170超アミノ酸配列の相同性分析により定義される。スブチラーゼは、6種類、すなわち、Subtilisin科、Thermitase科、Proteinase K科、Lantibioticペプチダーゼ科、Kexin科、Pyrolysin科に分類される。Subtilisin科は、さらに3種類、すなわち、I-S1(「真の」スブチリシン)、I-S2(高アルカリプロテアーゼ)及び細胞内スブチリシンに分類される。酵素の定義又は分類は、異なったり又は変更してもよいが、本発明の関連においては、上記したスブチラーゼのサブ分類又はサブグループへの分類は、Siezen等、Protein Engng.4(1991)719-737及びSiezen等、Protein Science 6(1997)501-523に記載のものである。
本発明の親スブチラーゼ及び/又はスブチラーゼは、自然源から単離したスブチラーゼ、すなわち、野生型スブチラーゼであるか、又は続いての修飾がスブチラーゼの特徴を保持しながらなされた自然源から単離されたスブチラーゼであることができる。親スブチラーゼであることができるこのようなスブチラーゼ変異体としては、例えば、EP130756、EP214435、WO87/04461、WO87/05050、EP251446、EP260105、WO88/08028、WO88/08033、WO89/06279、WO91/00345、EP525610及びWO94/02618に開示されているものなどがある。
また、本発明の親スブチラーゼ及び/又はスブチラーゼは、ProteinaseKファミリーに属すもの、例えば、プロテアーゼKでもよい。
親スブチラーゼとして使用することができるスブチラーゼの他の例として、EP503346、EP610808及びWO95/27049に記載のようなPD498(WO93/24623)、アクアリシン、プロテアーゼTW7、プロテアーゼTW3、高アルカリプロテアーゼなどがある。
異なるプロテアーゼ対間の配列の同一性は、以下のとおりである:
スブチラーゼ及びスブチラーゼ変異体の活性は、「Methods of Enzymatic Analysis(酵素分析法)」、第3版、1984、Verlag Chemie,Weinheim,第5巻に記載の方法で求めることができる。
本発明者等は、本発明のスブチラーゼ変異体及びスブチラーゼは、それぞれ親スブチラーゼ及びSavinaseに対して変化した免疫原性を有していることを見出した。
本発明において、「免疫反応」とは、4種の標準的な反応(Coombs&GellによるタイプI、II、III及びIV)のいずれかによる免疫系を含む化合物に対する生体の応答を意味する。これに対して、本発明に関連して使用される化合物についての用語「免疫原性」は、ヒトを含む動物における免疫反応を誘発するこの化合物の能力を意味する。
本発明の関連において、アレルゲン性は、Balb/Cマウスにおいて発生したIgE反応として測定されなければならない。これは、マウスを、週一回、20週間にわたって、0.9%(wt/vol)NaCl(対照群)50マイクロリットル、又はタンパク質10マイクログラムを含有する0.9%(wt/vol)NaCl 50マイクロリットルで皮下免疫化し、血清を目から一週間おきに、次の免疫化の前に採取し、その後、IgEレベルを、マウスIgEに特異的なELISAを用いて求めることによっておこなう。
本発明のスブチラーゼ変異体及び/又はスブチラーゼは、例えば、突然変異及び/又は化学接合により、さらに修飾できる。この目的は、アレルゲン性をさらに減少すること、又は酵素のの性能、安定性、熱安定性又はいずれかの他の特徴を高めることでよい。
本発明のスブチラーゼ変異体及び/又はスブチラーゼは、化学的に修飾してもよい。当業者に公知の方法を使用して、前記酵素を化学修飾してもよい。
共有的バイオ接合の調整についての化学反応について、「Bioconjugate Techniques(バイオ接合法)」,Hermanson,G.T.(1996),Academic Press社に記載されている。
化学的接合には、タンパク質は、活性又は活性化ポリマーとともにインキュベーションした後、未反応ポリマーから分離する必要がある。これは、溶液でおこなった後精製してもよいし、異なる反応環境及び洗浄に容易にあてることができる固定化タンパク質を用いておこなうのが都合がよい。
高分子をヒドロキシ基に連結するのは、水中で実施しなければならないので一般的に極めて困難である。通常、加水分解は、ヒドロキシル基との反応よりも優勢である。
ポリペプチド鎖におけるアクセシブルなアルギニン残基は、2つのビシニルカルボニル基を含む基により標的とされることができる。
トシレートは、メシレートよりも反応性があるが、安定性が小さく、PEG、ジオキサン及びスルホン酸に分解する(Zalipsky,(1995),Bioconjugate Chem.,6,150 165)。また、エポキシドは、アミン結合を生成するのに使用できるが、上記した基よりも反応性がはるかに小さい。
さらに、イソシアネートとイソチオシアネートを用いて、それぞれ尿素及びチオ尿素を得る。
無水コハク酸との反応から得られるPEGスクシネートも、使用することができる。ここで構成したエステル基は、接合体をより加水分解しやすくする(米国特許第5,122,614号(1992)、Zalipsky)。この基は、N-ヒドロキシスクシンイミドで活性化できる。
芳香族アミンにPEGを連結した後にジアゾ化することにより、極めて反応性のあるジアゾニウム塩を生じ、これは、ペプチドとインサイチュ反応することができる。また、アミド結合は、PEGのアズラクトン誘導体を反応させることにより得ることもでき(米国特許第5,321,095号,(1994),Greenwald,R.B.)、したがって追加のアミド結合が導入される。
また、PEGは、カルバメート結合を有する酵素のアミノ基にも結合できる(WO95/11924,Greenwald等)。また、リシン残基は、主鎖として使用することもできる。
特定の実施態様によれば、活性化ポリマーは、メチルPEGである。メチルPEGは、WO90/13590に記載のようにしてN-スクシンイミジルカーボネートにより活性化されたものである。カップリングは、アルカリ条件で高収量で実施できる。
本発明のスブチラーゼ変異体及びスブチラーゼは、当該技術分野において公知のいずれかの方法により産生でき、また、本発明は、本発明のスブチラーゼ変異体又はスブチラーゼをコードする核酸、前記核酸を含むDNA構築物及び前記核酸配列を含む宿主細胞に関する。
典型的には、親タンパク質を部位特異的突然変異させ、発現ベクター、宿主細胞等に導入することにより、タンパク質変異体を製造できる。親タンパク質は、ポリペプチドを産生する株又は発現ライブラリーからクローニングできる。すなわち、親タンパク質は、ゲノムDNAから単離するか、又はcDNAから調製するか、又はそれらの組み合わせから得ることができる。
本発明のスブチラーゼ又はスブチラーゼ変異体をコードする核酸配列を含む組み換え発現ベクターは、組み換えDNA法に附するのが都合がよいことがあり、且つ核酸配列の発現を生じることがあるいずれかのベクターである。
本発明の組換えベクターは、ベクターが当該宿主細胞において複製できるようにするDNA配列をさらに含んでいてもよい。
本発明の酵素をコードする核酸配列の複数のコピーを、宿主細胞に挿入して核酸配列の発現を増幅することができる。核酸配列の安定な増幅は、配列の少なくとも一つの追加のコピーを、当該技術分野において周知の方法を用いて宿主細胞ゲノムに組み込み、形質転換物を選択することにより得ることができる。
宿主細胞中に導入される、本発明のスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体をコードするDNA配列は、宿主細胞に対して相同であっても、又は非相同であっても良い。宿主細胞に対して相同である場合、すなわち天然において宿主細胞により産生される場合、それは、典型的には、もう1つのプロモーター配列、又は適用できるなら、その天然の環境においてよりも、別の分泌シグナル配列及び/又はターミネーター配列に作用可能に接続される。用語「相同」とは、当該宿主生物に対して生来の酵素をコードするDNA配列を含むことが意図される。用語「非相同」とは天然において宿主細胞により発現されないDNA配列を含むことが意図される。従って、DNA配列は、もう1つの生物由来のものでもよいし、又は合成配列でもよい。
E.coli等の細菌においてスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体を発現するとき、酵素は、典型的には不溶性粒質物(封入体として知られている)として細胞質に保持されてもよいし、細菌性分泌配列により細胞周辺腔に向けられてもよい。前者の場合、細胞が溶解され、そして粒質物が回収され、そして変性され、この後、酵素は変性剤を希釈することによってリフォールディングされる。後者の場合、酵素は、例えば音波処理又は浸透ショックにより細胞を破壊することにより細胞周辺腔の内容物を放出することにより、細胞周辺腔から回収できる。
本発明の酵素を発現するためには、本発明の酵素をコードする核酸配列を含むベクターで形質転換又はトランスフェクションした上記した宿主細胞を、典型的には所望の分子を産生できる条件下で好適な栄養培地で培養し、その後、これらを、細胞又は培養液から回収する。
本発明の酵素は、クロマトグラフィー(例えば、イオン交換、親和性、疎水性、クロマトフォーカシング及びサイズ排除クロマトグラフィー)、電気泳動法(例えば、分離等電点電気泳動法(IEF)、分別溶解性(例えば、硫酸アンモニウム沈殿)、又は抽出を含む当該技術分野において公知の種々の方法により精製できるが(例えば、Protein Purification,J-C Janson及びLars Ryden編者,VCH Publishers,ニューヨーク、1989参照)、これらには限定されない。
また、本発明は、本発明のスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体を含む組成物に関する。例えば、スブチラーゼ/スブチラーゼ変異体は、パーソナルケア用組成物、例えば、シャンプー、固形石けん、化粧水、スキンクリーム、毛染剤、練り歯磨き粉、コンタクトレンズ、化粧品、洗面用化粧品、又は織物の処理、食品、例えば、パン焼き又は食料の製造に使用される組成物、又は清浄目的のための組成物、例えば、洗剤、食器洗い組成物のため、又は硬質表面を清浄にするための組成物において使用できる。
本発明のスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体は、例えば、洗剤組成物に使用できる。これは、無塵顆粒、安定化液体、又は保護酵素の形態において洗浄組成物中に含まれていてよい。無塵顆粒は、例えば米国第4,106,991号及び第4,661,452号に開示されているようにして製造でき、そして必要に応じて当該技術分野において公知の方法によりコーティングされていてよい。ワキシーコーティング材としては、例えば、1000〜20000の平均分子量を有するポリ(エチレンオキサイド)製品(ポリエチレングリコール、PEG);16〜50個のエチレンオキサイド単位を有するエトキシル化ノニルフェノール;アルコールにおいて12〜20個の炭素原子を含み、且つ15〜80個のエチレンオキサイド単位のあるエトキシル化脂肪アルコール;脂肪アルコール;脂肪酸;並びに脂肪酸のモノ-、ジ-及びトリ-グリセリドがある。
洗剤は、1〜65%の洗浄ビルダー又は錯化剤、例えば、ゼオライト、ジホスフェート、トリホスフェート、ホスホネート、シトレート、ニトリロ三酢酸(NTA)、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)、ジエチレントリアミン五酢酸(DTMPA)、アルキル-又はアルケニルコハク酸、可溶性シリケート又は層状シリケート(例えばHoechst由来のSKS-6)を含有できる。洗剤は、ビルダー未添加、すなわち、実質的に洗剤ビルダーを含有していなくてもよい。
洗剤は、過酸形成漂白活性剤、例えば、テトラアセチルエチレンジアミン(TAED)又はノナノイルオキシベンゼンスルホネート(NOBS)と組合せてよい、過硼酸塩又は過炭酸塩等のH2O2源を含む漂白系を含有することができる。別法として、漂白系は、例えば、アミド、イミド又はスルホン型の過オキシ酸を含んでいてもよい。
また、洗剤は、他の通常の洗剤成分、例えば、布帛コンディショナー、例えば粘土、発泡促進剤、泡立て抑制剤、防錆剤、土壌懸濁剤、防土壌再付着剤、染料、殺菌剤、光学増白剤、又は香料も含有できる。
pH(使用濃度で水溶液で測定)は、通常中性又はアルカリ性、例えば、7〜11の範囲である。
さらに、本発明のスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体も、食器洗い洗剤に使用してもよい。
食器洗い洗剤組成物は、典型的にはアニオン性、非イオン性、カチオン性、両性又はこれらの種類の混合物であることができる界面活性剤を含む。洗剤は、低〜非泡形成エトキシル化プロポキシル化直鎖アルコール類等の非イオン性界面活性剤を0〜90%の量で含有してもよい。
洗剤組成物は、無機型及び/又は有機型の洗剤ビルダー塩を含有してもよい。洗剤ビルダーは、さらにリン含有型及び非リン含有型に分類できる。洗剤組成物は、通常1〜90%の洗剤ビルダーを含有する。
他の好適な有機ビルダーとしては、ビルダー性を有することが知られているより高い分子量のポリマー及びコポリマー、例えば、適切なポリアクリル酸、ポリマレイン酸及びポリアクリル酸/ポリマレイン酸共重合体及びそれらの塩があげられる。
また、食器洗い洗剤組成物は、他の通常の洗剤成分、例えば、解こう剤、フィラー材料、泡抑制剤、防錆剤、土壌懸濁剤、金属イオン封鎖剤、土壌再付着防止剤、脱水剤、染料、殺菌剤、蛍光剤、増粘剤及び香料も含有することができる。
EP518719、EP518720、EP518721、EP516553、EP516554、EP516555、GB2200132、DE3741617、DE3727911、DE4212166、DE4137470、DE3833047、WO93/17089、DE4205071、WO52/09680、WO93/18129、WO93/04153、WO92/06157、WO92/08777、EP429124、WO93/21299、US5141664、EP561452、EP561446、GB2234980、WO93/03129、EP481547、EP530870、EP533239、EP554943、EP346137、US5112518、EP318204、EP318279、EP271155、EP271156、EP346136、GB2228945、CA2006687、WO93/25651、EP530635、EP414197、US5240632。
本発明のスブチラーゼ及び/又はスブチラーゼ変異体のための別の有用な用途分野は、エンドユーザーがタンパク質と密着するパーソナルケア分野、及びアレルギー性の問題が実験装置でみられたパーソナルケア分野である(Kelling等、J.All.Clin.Imm.,1998,Vol.101,pp.179-187及びJohnston等、Hum.Exp.Toxicol.,1999,Vol.18,p.527)。
さらに意図するものとして、オーラルケア製品、例えば、歯磨剤、マウスウォッシュ、チューイングガムがある。
本発明のスブチラーゼ変異体及び/又はスブチラーゼは、食品又は飼料に使用することもできる。例えば、前記スブチラーゼ変異体/スブチラーゼは、パン生地のグルテン相を調整するのに使用することができる。例えば、強力粉を、プロテアーゼで軟化できる。別の例は、未麦芽穀類による醸造及び/又は窒素含量を制御するために、前記スブチラーゼ/スブチラーゼ変異体が使用できる、醸造産業におけるものである。
動物飼料産業では、前記スブチラーゼ変異体及び/又はスブチラーゼを、いわば、動物の消化系を拡張するのに使用することができる。
材料
ELISA試薬:
ホースラディシュペルオキシダーゼ標識ブタ抗-ウサギ-Ig(Dako,DK,P217,希釈度=1:1000)
マウス抗-ラットIgE(Serotec MCA193;希釈度=1:200)
ビオチン標識マウス抗-ラットIgG1モノクローナル抗体(Zymed03-9140;希釈度=1:1000)
ストレプトアビジン-ホースラディシュペルオキシダーゼ(Kirkegard&Perry 14-30-00;希釈度=1:1000)
OPD:o-フェニレン-ジアミン(Kementec cat no.4260)
従来の手段により調製されたウサギ抗SavinaseポリクローナルIgG
従来の手段により調製されたラット抗-SavinaseポリクローナルIgE
-PBS(pH7.2(1リットル))
NaCl 8.00g
KCl 0.20g
K2HPO4 1.04g
KH2PO4 0.32g
-スクシニル-アラニン-アラニン-プロリン-フェニルアラニン-パラニトロ-アニリド(Suc-AAPF-pNP)Sigma no.S-7388、Mw624.6g/モル
ELISAによる皮下注射マウスモデルにおける特異的IgEの濃度の測定
タンパク質の皮下注射に反応して産生されるマウスにおける特異的IgE血清抗体の相対濃度が、以下の手順により3層サンドイッチELISAにより測定される:
1)ELISAプレートに、10マイクログラムのラット抗-マウスIgE(Serotech MCA419;希釈度=1:100)緩衝液1(50マイクロリットル/ウェル)をコーティングし、4℃で一晩インキュベーションした。
2)プレートを空にし、2(wt/v)%のスキムミルク、PBSで、室温で少なくとも1/2時間ブロックした(200マイクロリットル/ウェル)。穏やかに震盪した。プレートを、0.05(v/v)%Tween20、PBSで3回洗浄した。
4)スブチラーゼ又はスブチラーゼ変異体を、0.05(v/v)%Tween20、0.5(wt/v)%スキムミルク、PBSで希釈して適切なタンパク質濃度とした。50マイクロリットル/ウエルを、室温で30分間インキュベーションした。穏やかに震盪した。プレートを、0.05(v/v)%Tween20、PBSで3回洗浄した。
6)ホースラディシュペルオキシダーゼ接合抗-plg-抗体を、0.05(v/v)%Tween20、0.5(wt/v)%スキムミルク、PBSで希釈した。50マイクロリットル/ウエルを、室温で30分間インキュベーションした。穏やかに震盪した。プレートを、0.05(v/v)%Tween20、PBSで3回洗浄した。
8)溶液は、使用直前に作製し、10分間インキュベーションした。
9)50マイクロリットル/ウェル
10)2N H4SO450マイクロリットル/ウェルを添加することにより、反応を停止した。
11)プレートを、492nmで、620nmを基準として読み取った。
タンパク質の鼻腔内投与に反応して産生されるマウスにおける特異的IgE血清抗体の相対濃度が、以下の手順により3層サンドイッチELISAにより測定される:
1)ELISAプレート(Nunc Maxisorp)に、100マイクロリットル/ウェルラット抗-マウスIgE 重鎖(HD-212-85-IgE3(0.05M カーボネート緩衝液pH9.6において、希釈度=1:100))を、コーティングした。4℃で一晩インキュベーションした。
2)プレートを空にし、0.15M PBS緩衝液pH7.5において、200マイクロリットル/ウェルの2%のスキムミルクで、4℃で1時間ブロックした。プレートを、0.05%Tween20を含有する0.15M PBS緩衝液で3回洗浄した。
4)0.5%スキムミルク及び0.05%Tween20を含有する0.15M PBS緩衝液でタンパク質1マイクログラム/mlに希釈したスブチラーゼ又はスブチラーゼ変異体100マイクロリットル/ウェルを、プレートに添加した。プレートを、4℃で1時間インキュベーションした。プレートを、0.05%Tween20を含有する0.15M PBS緩衝液で3回洗浄した。
6)0.5%スキムミルク及び0.05%Tween20を含有する0.15M PBS緩衝液で1:1000希釈したペルオキシダーゼで接合したブタ抗-ウサギIg 100マイクロリットル/ウエルを、プレートに添加した。4℃で1時間インキュベーションした。プレートを、0.05%Tween20を含有する0.15M PBS緩衝液で3回洗浄した。
7)250マイクロリットル/ウェルの0.1Mクエン酸/リン酸緩衝液(pH5.0)を、プレートに添加した。約1分間、インキュベーションした。プレートを、空にした。
9)150マイクロリットル/ウェルの1M H2SO4を添加することにより、反応を停止した。
10)プレートを、490nmで、620nmを基準として読み取った。
例えば、Sambrook等(1989),Molecular Cloning.A Laboratory Manual,Cold Spring Harbour,NYに記載されているようにして、対応の核酸配列の部位特異的突然変異により、Savinase/スブチラーゼ変異体を得た。
CovaLinkプレートの活性化:
アセトンに10mg/mlの塩化シアヌルを添加することにより調製した新鮮な原液を、攪拌しながら、PBSで希釈して1mg/mlの最終濃度とし、直ちに等分してCovaLink NH2プレート(Nunc)(100マイクロリットル/ウェル)に添加し、室温で5分間インキュベーションした。PBSで3回洗浄した後、プレートを、50℃で30分間乾燥し、シールテープでシールし、室温で3週間、プラスチックバッグに保存する。
活性化CovaLink NH2プレートに、PBSに添加した所望のタンパク質(5マイクログラム/ml)100マイクロリットルを、4℃で一晩コーティングした後、2(wt/v)%スキムミルク、PBSとともに、室温で30分間インキュベーションし、0.05(v/v)%Tween20、PBSで4回洗浄した。
Suc-Ala-Ala-Pro-Phe-pNaでの分析:
プロテアーゼは、ペプチドと、p-ニトロアミンとの間の結合を開裂して、405nmで目に見える黄色の吸収が得られる。簡単に述べると、suc-AAPF-pNa100mgを、ジメチルスルホキシド(DMSO)1mlに溶解する。この100マイクロリットルを、ブリトン-ロビンソン緩衝液、pH8.3で希釈して10mlとし、プロテアーゼ用の基質として使用する。反応は、動力学的に分光光度計で検出する。
CovaLink NH2プレートを、マウス抗-ラットIgEモノクローナル抗体でコーティングし、続いて抗体を抗-Savinase特異的ラットポリクローナルIgEで飽和することにより、スブチラーゼ/スブチラーゼ変異体が抗-Savinase抗体に結合する能力を、Savinaseと比較した。プレートを、抗原、すなわち、Savinase(対照)、結合能を試験するスブチラーゼ(例えば、スブチラーゼ変異体を発現するスブチラーゼライブラリー)とともに、インキュベーションした。抗野生型Savinaseポリクローナルウサギ抗血清とともにインキュベーションすることにより、結合抗原の量を測定した。
「主鎖プロテアーゼ」インヒビターを、ウエルに固定化し、過剰のタンパク質変異体及び標識抗体とともにインキュベーションした。結合抗体のレベルを、測定する。
試料25マイクロリットル及び抗-Savinase抗体25マイクロリットル(両方とも、0.05(v/v)%Tween20、0.5%(wt/v)スキムミルク含有PBSで希釈)を、塗布ウエルに添加し、室温でインキュベーション(30分間)する。上清を除去し、ウエルを、0.05(v/v)%Tween20、PBSで3回洗浄する。
別個の試料を官能性について分析し、2つの値を比較する。
所望のタンパク質変異体は、結合抗体レベルが少なくとも2回高く、又は少なくとも2回低く(少なくとも2のデルタ抗体結合値)を示し、同時に、「主鎖タンパク質」と同様な官能性を示す。
エピトープ配列及びパターンを、以前にWO01/83559の実施例1に記載されているようにして決定した。
膜タンパク質の一部分としてのランダムヘキサ-、ノナ-又はドデカペプチドを発現するファージの高多様性ライブラリー(1012)を、精製特異的ウサギIgG並びに精製ラット及びマウスIgG1抗体及びIgE抗体を結合する能力についてスクリーニングした。ファージライブラリーを、従来技術にしたがって得た(WO9215679を参照;引用することにより本明細書の内容とする)。
潜在的IgEエピトープに最も関与していると思われることが判明したアミノ酸位置(一般的に、これらは、少なくとも3つのIgEエピトープに潜在的に関与していることが判明したアミノ酸であった)を、Savinaseの3D構造に手動で局在化させた(Protein Data Bank entry 1SVN;Betzel,C.,Klupsch,S.,Papendorf,G.,Hastrup,S.,Branner,S.,Wilson,K.S.:Crystal structure of the alkaline proteinase Savinase from Bacillus lentus at 1.4Å resolution(1.4Å解像度でのバチルスレンツス由来のアルカリ性プロテイナーゼSavinaseの結晶構造).J Mol Biol 223 pp.427(1992))。この際には、適切なソフトウエア(例えば、SwissProt Pdb Viewer,WebLite Viewer)を、使用した。
・領域1:P14、A15、R19、G20、T22、A272、R275
・領域2:A48、F50、P52、E54、P55、S57、D60、G61、K94、V104,Q109
・領域3:P129、S130、E136、N140、S161、Y167、R170、A172、D181、R186、A194、G195、L196、R247、T260、L262
・位置P39及びN218は、独立している。
アミノ酸が、構造及び酵素活性関連の事柄に基づいてエピトープタンパク質工学について選択された。このことは、3D解析、又は酵素の活性及び/又は安定性についての有利な効果を与える他のタンパク質工学概念からの経験により示唆された位置が優先されたことを意味する。
・領域1:A15、R19、R275
・領域2:S57
・領域3:E136、N140、Y167、R170、A172、D181、R186、A194、G195、R247、T260、L262
・位置N218
にある。
有望な変異体の同定を、Bacillus sppにおいて発現した例3の酵素活性変異体の抗体結合能の変化を評価することにより実施した。
デルタ結合値が少なくとも2.0であるスブチラーゼ変異体と、それらの抗体結合能を、表4に示す。
マウスを、週一回、20週間にわたって、0.9%(wt/vol)NaCl(対照群)50マイクロリットル、又はタンパク質10マイクログラムを含有する0.9%(wt/vol)NaCl 50マイクロリットルで皮下免疫化した。各群のマウスには、デンマーク国リュ、Bomholdtgaard社から購入した雌Balb/Cマウス10匹(約20グラム)が含まれていた。血液試料(100マイクロリットル)を、次の免疫化の前に1週間おきに目から採取した。血清を、血液凝固及び遠心分離により得た。
マウス鼻腔内(MINT)モデル(Robinson等、Fund.Appl.Toxicol.34,pp.15-24,1996)。マウスに、実験の第1日目及び第3日目、及びそれから一週間に一回、6週間にわたってタンパク質を鼻腔内投与した。血液試料を、実験開始後15日目、31日目及び45日目に採取した。続いて、血清を、IgG1レベル又はIgEレベルについて分析した。
以下の例に、標記の条件下でおこなった多数の洗浄試験から得た結果を示す。
洗剤は、洗剤溶液を作製し、それを電子レンジにおいて85℃で5分間加熱することにより不活性化した市販の洗剤である。pHは、現状の洗剤溶液におけるpHの「そのまま」であり、調整しない。水の硬度は、CaCl2・2H2O;MgCl2・6H2O;NaHCO3(Ca2+:Mg2+:HCO3 -=2:1:6)を添加することにより、ミリQ水に調整した。
1)不活性化市販Tide粉末1g/リットル、30℃、12分洗浄、6dH
2)不活性化市販Tide液1.5g/リットル、30℃、12分洗浄、6dH
試験物質は、血液/ミルク/カーボンブラックで汚したポリエステル/綿材料見本である。
R変異体:変異体で洗浄した試験材料の反射率
Rブランク:酵素で洗浄しなかった試験材料の反射率
Δ反射率:R変異体-Rブランク
Δ反射率が高いほど、洗浄性能がよい。Δ反射率は、投与量酵素5nMについて算出する。
表9は、マウスにおいて最低のアレルギー性(IgE産生の観点から)を示す4種のスブチラーゼ変異体のTide粉末洗浄剤における洗浄性能の結果を表す。
Claims (40)
- 位置57が、位置:170、181及び247のうちの少なくとも一つにおける修飾と組み合わせて修飾されている、スブチラーゼ変異体。
- 前記位置57における修飾が、欠失、又は残基:P、K、L、A、W、R、H、C、D、Iの一つへの置換である、請求項1に記載の変異体。
- 前記位置170における修飾が、欠失、又は残基:C、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、W、Y、A、L、E、D、K、Hのうちの一つへの置換である、請求項1又は2に記載の変異体。
- 前記位置181における修飾が、欠失、又は残基:A、C、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、Y、E、Wのうちの一つへの置換である、請求項1〜3のいずれか1項に記載の変異体。
- 前記位置247における修飾が、欠失、又は残基:A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yのうちの一つへの置換である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の変異体。
- 前記変異体が、X57P、K、L、A、W、R、H、C、D、I+X170C、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、W、Y、A、L、E、D、K、Hである、請求項2及び3の変異体。
- 前記変異体が、X57P、K、L、A、W、R、H、C、D、I+X181A、C、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、Y、E、Wである、請求項2及び4の変異体。
- 前記変異体が、X57P、K、L、A、W、R、H、C、D、I+X247A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yである、請求項2及び5の変異体。
- 前記変異体が、X57P、K、L、A、W、R、H、C、D、I+X170C、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、W、Y、A、L、E、D、K、H+X247A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yである、請求項2、3及び5の変異体。
- 前記変異体が、X57P、K、L、A、W、R、H、C、D、I+X181A、C、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、Y、E、W+X247A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yである、請求項2、4及び5の変異体。
- 前記変異体が、X57P+X170F、X57P+X170L、X57P+X181N、X57P+X247E、X57P+X247H、X57P+X247K、X57P+X247Q、X57P+X170F+X247E、X57P+X170F+X247H、X57P+X170F+X247K、X57P+X170F+X247Q、X57P+X170L+X247E、X57P+X170L+X247H、X57P+X170L+X247K、X57P+X170L+X247Q、X57P+X181N+X247E、X57P+X181N+X247H、X57P+X181N+X247K、X57P+X181N+X247Qのうちの一つである、請求項1〜5のいずれかの変異体。
- 前記修飾が、スブチリシンにおいてなされている、請求項1〜11のいずれか1項に記載の変異体。
- 前記修飾が、I-S1型のスブチラーゼにおいてなされている、請求項1〜12のいずれか1項に記載の変異体。
- 前記スブチラーゼが、スブチリシンBPN’、スブチリシンアミロサッカリタス、スブチリシン168、スブチリシンメセンテリコペプチダーゼ、スブチリシンCarlsberg及びスブチリシンDYからなる群から選択されたものである、請求項13に記載の変異体。
- 前記修飾が、I-S2型のスブチラーゼにおいてなされている、請求項1〜12のいずれか1項に記載の変異体。
- 前記スブチラーゼが、スブチリシン309、スブチリシン147、スブチリシンPB92、BLAP及びK16からなる群から選択されたものである、請求項15に記載の変異体。
- 請求項1〜16のいずれかに記載のスブチラーゼ変異体をコードするDNA配列。
- 請求項17のDNA配列を含むベクター。
- 請求項18のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項1〜16のいずれかに記載のスブチラーゼ変異体を含む組成物。
- 洗浄組成物である、請求項20に記載の組成物。
- パーソナルケア組成物である、請求項20に記載の組成物。
- 配列番号:1のスブチラーゼにおいて、Xaa残基が、
位置3ではS又はTであり、
位置4ではV又はIであり、
位置27ではK又はRであり、
位置55ではG、A、V、L、I、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置74ではN又はDであり、
位置85ではS又はNであり、
位置97ではS又はDであり、
位置99ではS、G又はRであり、
位置101ではS又はAであり、
位置102ではV、N、Y又はIであり、
位置121ではN又はSであり、
位置157ではG、D又はSであり、
位置188ではA又はPであり、
位置193ではV又はMであり、
位置199ではV又はIであり、
位置211ではL又はDであり、
位置216ではM又はSであり、
位置226ではA又はVであり、
位置230ではQ又はHであり、
位置239ではQ又はRであり、
位置242ではN又はDであり、
位置246ではN又はKであり、
位置268ではT又はAであり、
位置164のXaa残基、位置175のXaa残基及び位置241のXaa残基が、以下の組合せの1つである:
a)位置164のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であるか、
又は
b)位置164のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であるか、
又は
c)位置164のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置175のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在であり、
位置241のXaaは、G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、H、F、Y、W又は不存在である、
スブチラーゼ。 - 位置55におけるXaa残基が、残基:P、K、L、A、W、R、H、C、D、Iのうちの一つである、請求項23に記載のスブチラーゼ。
- 位置164におけるXaa残基が、残基:G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、D、N、E、Q、K、H、F、Y、W又は不存在のうちの一つである、請求項23及び24のいずれかに記載のスブチラーゼ。
- 位置175におけるXaa残基が、残基:G、A、V、L、I、S、T、C、M、P、N、E、Q、K、R、H、F、Y、W又は不存在のうちの一つである、請求項23〜25のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 位置241におけるXaa残基が、残基:A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yのうちの一つである、請求項23〜26のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 位置55におけるXaa残基が、残基:P、K、L、A、W、R、H、C、D、Iのうちの一つであり、位置164におけるXaaが、残基:C、F、G、I、M、N、P、Q、S、T、V、W、Y、A、L、E、D、K、Hのうちの一つであり、位置241におけるXaaが、残基:A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yのうちの一つである、請求項23〜27のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 位置55におけるXaa残基が、残基:P、K、L、A、W、R、H、C、D、Iのうちの一つであり、位置175におけるXaaが、残基:A、C、F、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、R、S、T、V、Y、E、Wのうちの一つであり、Xaa位置241が、残基:A、C、D、E、G、H、I、K、L、M、N、P、Q、S、T、V、F、Yのうちの一つである、請求項23〜28のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 位置55のXaa残基が、Pであり、位置164のXaaが、Lである、請求項23〜29のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 位置55のXaa残基が、Pであり、位置164のXaaが、Lであり、位置241のXaaが、Qである、請求項23〜29のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 前記スブチラーゼが、スブチリシンである、請求項23〜31のいずれか1項に記載のスブチラーゼ。
- 前記スブチリシンが、I-S1型である、請求項32に記載のスブチラーゼ。
- 前記スブチリシンが、I-S2型である、請求項32に記載のスブチラーゼ。
- 請求項23〜34のいずれかに記載のスブチラーゼをコードするDNA配列。
- 請求項35のDNA配列を含むベクター。
- 請求項36のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項23〜34のいずれかに記載のスブチラーゼを含む組成物。
- 洗浄組成物である、請求項38に記載の組成物。
- パーソナルケア組成物である、請求項38に記載の組成物。
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