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TW201718029A - 突變介白素-２多肽 - Google Patents

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TW201718029A
TW201718029A TW106101987A TW106101987A TW201718029A TW 201718029 A TW201718029 A TW 201718029A TW 106101987 A TW106101987 A TW 106101987A TW 106101987 A TW106101987 A TW 106101987A TW 201718029 A TW201718029 A TW 201718029A
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彼德 布恩克
葛舒博 安 費摩瑟
斯洛維亞 海特
湯瑪士 哈福
羅夫 荷斯
克里斯汀 克萊
依哈德 摩斯那
薇樂莉Ｇ 尼可里尼
帕伯羅 優瑪那
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羅齊克雷雅公司
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Abstract

本發明概言之係關於對於IL-2受體之α-亞單位展現減小親和力之突變介白素-2多肽，其用作免疫治療劑。此外，本發明係關於包括該等突變IL-2多肽之免疫偶聯物，編碼該等突變IL-2多肽或免疫偶聯物之多核苷酸分子，及包括該等多核苷酸分子之載體及宿主細胞。本發明進一步關於產生該等突變IL-2多肽或免疫偶聯物之方法，包括其之醫藥組合物，及其用途。

Description

突變介白素-2多肽
本發明概言之係關於突變介白素-2多肽。更特定而言，本發明涉及用作免疫治療劑之展現改良性質之突變IL-2多肽。此外，本發明係關於包括該等突變IL-2多肽之免疫偶聯物、編碼該等突變IL-2多肽或免疫偶聯物之多核苷酸分子及包括該等多核苷酸分子之載體及宿主細胞。本發明進一步係關於產生該等突變IL-2多肽或免疫偶聯物之方法、包括其之醫藥組合物及其用途。
介白素-2(IL-2)亦稱為T細胞生長因子(TCGF)，其係在淋巴細胞生成、存活及體內穩態中發揮重要作用之15.5kDa球形糖蛋白。其具有133個胺基酸之長度且由4個形成對於其功能不可缺少之四級結構的反平行、兩性α-螺旋狀物組成(Smith,Science 240,1169-76(1988)；Bazan,Science 257,410-413(1992))。發現來自不同物種之IL-2序列具有以下NCBI RefSeq編號：NP000577(人類)、NP032392(小鼠)、NP446288(大鼠)或NP517425(黑猩猩)。
IL-2藉由與IL-2受體(IL-2R)結合來調介其作用，該等IL-2受體係由至多三個個別亞單位組成，該三個個別亞單位之不同締合可產生對於IL-2具有不同親和力之受體形式。α(CD25)、β(CD122)及γ(γc,CD132)亞單位之締合產生關於IL-2之三聚、高親和力受體。由β亞單位及γ亞單位組成之二聚IL-2受體稱為中間親和力IL-2R。α亞單位形成單體低親和力IL-2受體。儘管二聚中間親和力IL-2受體結合IL-2之 親和力係三聚高親和力受體之約1/100，但二聚及三聚IL-2受體變體皆能夠藉由IL-2結合來傳輸信號(Minami等人，Annu Rev Immunol 11,245-268(1993))。因此，α-亞單位CD25對於IL-2信號傳導而言並不重要。其賦予結合其受體之高親和力，而β亞單位CD122及γ-亞單位對於信號轉導而言至關重要(Krieg等人，Proc Natl Acad Sci 107,11906-11(2010))。包含CD25之三聚IL-2受體由(靜止)CD4+叉頭框蛋白P3(FoxP3)+調節T(Treg)細胞表現。其亦短暫地在習用活化T細胞上誘導，而在靜止狀態中，該等細胞僅表現二聚IL-2受體。Treg細胞在活體內持續表現最高程度之CD25(Fontenot等人，Nature Immunol 6,1142-51(2005))。
IL-2主要由活化T細胞、尤其CD4+輔助T細胞合成。其刺激T細胞之增殖及分化，誘導細胞毒性T淋巴細胞(CTL)之生成及周邊血淋巴細胞至細胞毒性細胞及淋巴因子活化之殺手(LAK)細胞之分化，促進細胞因子及溶細胞分子由T細胞表現，促進B細胞之增殖及分化並促進藉由B細胞合成免疫球蛋白，並刺激天然殺手(NK)細胞之生成、增殖及活化(例如，參見Waldmann,Nat Rev Immunol 6,595-601(2009)；Olejniczak及Kasprzak，Med Sci Monit 14,RA179-89(2008)；Malek,Annu Rev Immunol 26,453-79(2008))。
其能夠在活體內擴展淋巴細胞群體並增加該等細胞之效應子功能，此賦予IL-2抗腫瘤效應，從而使得IL-2免疫療法成為用於某些轉移性癌症之有吸引力的治療選擇。因此，已證實高劑量IL-2治療可用於患有轉移性腎細胞上皮癌及惡性黑素瘤之患者。
然而，IL-2在免疫反應中具有雙重功能，其不僅調介效應子細胞之擴增及活性，且亦在維持周邊免疫耐受性方面至關重要。
周邊自身耐受性之主要機制係T細胞中之IL-2誘導之活化誘導之細胞死亡(AICD)。AICD係全活化T細胞經由結合細胞表面表現之死亡 受體(例如CD95(亦稱為Fas)或TNF受體)發生程式化細胞死亡的過程。在經由T細胞受體(TCR)/CD3複合物使用抗原再刺激在增殖期間表現高親和力IL-2受體(在先前暴露於IL-2之後)之抗原活化之T細胞時，誘導Fas配體(FasL)及/或腫瘤壞死因子(TNF)之表現，從而使得細胞易於發生Fas調介之細胞凋亡。此過程具有IL-2依賴性(Lenardo,Nature 353,858-61(1991))並經由STAT5調介。藉由T淋巴細胞中之AICD過程，不僅可確立自身抗原之耐受性，且亦可確立明顯並非宿主之構成部分之持久性抗原(例如腫瘤抗原)之耐受性。
另外，IL-2亦涉及維持亦稱為阻抑性T細胞之周邊CD4+ CD25+調節T(Treg)細胞(Fontenot等人，Nature Immunol 6,1142-51(2005)；D'Cruz及Klein,Nature Immunol 6,1152-59(2005)；Maloy及Powrie,Nature Immunol 6,1171-72(2005))。其經由細胞-細胞接觸且藉由抑制T細胞幫助及活化、或經由釋放免疫阻抑性細胞因子(例如IL-10或TGF-β)來阻抑效應子T細胞破壞其(自身)靶。Treg細胞之消耗展示可增強IL-2誘導之抗腫瘤免疫性(Imai等人，Cancer Sci 98,416-23(2007))。
因此，IL-2並不適用於抑制腫瘤生長，此乃因在IL-2存在下所生成之CTL可自我識別腫瘤並發生AICD或免疫反應可由IL-2依賴性Treg細胞抑制。
關於IL-2免疫療法之另一關注問題係由重組人類IL-2治療產生之副作用。接受高劑量IL-2治療之患者通常經歷嚴重心血管、肺、腎、肝、胃腸道、神經、皮膚、血液及全身性不良事件，此需要強化監測及住院管控。大部分該等副作用可藉由以下現象予以闡釋：發生所謂的血管(或毛細血管)滲漏症候群(VLS)、血管滲透性發生病理學增加而導致多個器官中液體外滲(例如，引起肺及皮膚水腫及肝細胞損傷)及血管內體液枯竭(引起血壓降低及心率代償性升高)。除戒斷IL-2外 並無關於VLS之治療方法。已在患者中測試低劑量IL-2方案來避免VLS，然而，此係在次佳治療結果之代價下。據信，VLS係由自IL-2活化之NK細胞釋放諸如腫瘤壞死因子(TNF)-α等促發炎細胞因子引起，然而，最近證實，IL-2-誘導之肺水腫係自IL-2與肺內皮細胞之直接結合引起，該等肺內皮細胞表現低至中間程度之功能αβγ IL-2受體(Krieg等人，Proc Nat Acad Sci USA 107,11906-11(2010))。
已採用若干方式來克服該等與IL-2免疫療法有關之問題。舉例而言，已發現，IL-2與某些抗IL-2單株抗體之組合在活體內增強IL-2之治療效應(Kamimura等人，J Immunol 177,306-14(2006)；Boyman等人，Science 311,1924-27(2006))。在一替代方式中，IL-2以各種方式發生突變以減小其毒性及/或增加其效能。Hu等人(Blood 101,4853-4861(2003)，美國專利公開案第2003/0124678號)藉由色胺酸取代IL-2之38位中之精胺酸殘基以消除IL-2之血管滲透性活性。Shanafelt等人(Nature Biotechnol 18,1197-1202(2000))使天門冬醯胺酸88突變成精胺酸以較NK細胞增強T細胞之選擇性。Heaton等人(Cancer Res 53,2597-602(1993)；美國專利第5,229,109號)引入兩個突變Arg38Ala及Phe42Lys以減小促發炎細胞因子自NK細胞之分泌。Gillies(美國公開案第2007/0036752號)取代了IL-2中有助於中間親和力IL-2受體之親和力之三個殘基(Asp20Thr、Asn88Arg及Gln126Asp)以減小VLS。Gillies等人(WO 2008/0034473)亦藉由胺基酸取代Arg38Trp及Phe42Lys使IL-2與CD25之界面發生突變以減小與CD25之相互作用及Treg細胞之活化，從而增強效能。出於相同目的，Wittrup等人(WO 2009/061853)產生IL-2突變，該等IL-2突變具有對於CD25之增強親和力，但並不活化受體，由此用作拮抗劑。所引入之突變旨在破壞與受體之β-及/或γ亞單位之相互作用。
然而，尚無已知IL-2突變展示能克服所有上述與IL-2免疫療法有 關之問題，亦即由VLS誘導引起之毒性、由AICD誘導引起之腫瘤耐受性及由Treg細胞活化引起之免疫阻抑。因此，業內仍需要進一步增強IL-2蛋白之治療用途。
本發明部分地基於以下認識：IL-2與三聚、高親和力IL-2受體之α-亞單位之相互作用會引起與IL-2免疫療法有關之問題。
因此，在第一態樣中，本發明提供包括第一胺基酸突變之突變介白素-2(IL-2)多肽，該第一胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽與高親和力IL-2受體之親和力並保留突變IL-2多肽與中間親和力IL-2受體之親和力(各自皆與野生型IL-2多肽相比)。在一實施例中，該第一胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基72之位置處。在一實施例中，該第一胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一更具體實施例中，該第一胺基酸突變係胺基酸取代L72G。在某些實施例中，突變IL-2多肽包括第二胺基酸突變，該第二胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽與高親和力IL-2受體之親和力並保留突變IL-2多肽與中間親和力IL-2受體之親和力(各自皆與野生型IL-2多肽相比)。在一實施例中，該第二胺基酸突變位於位於選自對應於人類IL-2之殘基35、38、42、43及45之位置的位置處。在一具體實施例中，該第二胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42之位置處。在一更具體實施例中，該第二胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R及F42K。在一甚至更具體實施例中，該第二胺基酸突變係胺基酸取代F42A。在某些實施例中，突變介白素-2多肽包括第三胺基酸突變，該第三胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽與高親和力IL-2受體之親和力並保留突變IL-2多肽與中間親和力IL-2受體之親和力(各自皆與野生型IL-2多 肽相比)。在一特定實施例中，突變介白素-2多肽包括三個胺基酸突變，該三個胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽與高親和力IL-2受體之親和力並保留突變IL-2多肽與中間親和力IL-2受體之親和力(各自皆與野生型IL-2多肽相比)，其中該三個胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42、45及72之位置處。在一實施例中，該三個胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R、Y45K、L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一具體實施例中，該三個胺基酸突變係胺基酸取代F42A、Y45A及L72G。在某些實施例中，突變介白素-2多肽進一步包括胺基酸突變，該胺基酸突變消除對應於人類IL-2之殘基3之位置處IL-2之O-糖基化位點。在一實施例中，該消除對應於人類IL-2之殘基3之位置處IL-2之O-糖基化位點的胺基酸突變係如下胺基酸取代：其選自T3A、T3G、T3Q、T3E、T3N、T3D、T3R、T3K及T3P之群。在一具體實施例中，消除對應於人類IL-2之殘基3之位置處IL-2之O-糖基化位點的胺基酸突變係T3A。在某些實施例中，突變IL-2多肽基本上係全長IL-2分子，尤其係人類全長IL-2分子。
本發明進一步提供與非IL-2部分連接之突變介白素-2多肽。在某些實施例中，該非IL-2部分係靶向部分。在某些實施例中，該非IL-2部分係抗原結合部分。在一實施例中，該抗原結合部分係抗體。在另一實施例中，該抗原結合部分係抗體片段。在一更具體實施例中，該抗原結合部分選自Fab分子及scFv分子。在一特定實施例中，該抗原結合部分係Fab分子。在另一實施例中，該抗原結合部分係scFv分子。在特定實施例中，突變IL-2多肽與第一及第二非IL-2部分連接。在一該實施例中，突變介白素-2多肽與該第一非IL-2部分共用羧基末 端肽鍵且與該第二非IL-2部分共用胺基末端肽鍵。在一實施例中，該抗原結合部分係免疫球蛋白分子。在一更具體實施例中，該抗原結合部分係IgG種類、尤其IgG1亞類免疫球蛋白分子。在某些實施例中，該抗原結合部分針對呈現於腫瘤細胞或腫瘤細胞環境中之抗原，尤其係選自以下之群之抗原：成纖維細胞活化蛋白(FAP)、腱糖蛋白-C之A1結構域(TNC A1)、腱糖蛋白-C之A2結構域(TNC A2)、纖維連接蛋白之額外結構域B(EDB)、癌胚抗原(CEA)及黑素瘤相關之硫酸軟骨素蛋白多糖(MCSP)。
本發明亦提供免疫偶聯物，其包括本文所述之突變IL-2多肽及抗原結合部分。在本發明之免疫偶聯物之一實施例中，突變IL-2多肽與該抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵。在特定實施例中，免疫偶聯物包括第一及第二抗原結合部分。在一該實施例中，本發明之免疫偶聯物中所包括之突變IL-2多肽與第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵，且第二抗原結合部分與i)突變IL-2多肽或ii)該第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵。在一實施例中，本發明之免疫偶聯物中所包括之抗原結合部分係抗體，在另一實施例中，該抗原結合部分係抗體片段。在一具體實施例中，該抗原結合部分選自Fab分子及scFv分子。在一特定實施例中，該抗原結合部分係Fab分子。在另一特定實施例中，該抗原結合部分係免疫球蛋白分子。在一更具體實施例中，該抗原結合部分係IgG種類、尤其IgG1亞類免疫球蛋白分子。在某些實施例中，該抗原結合部分針對呈現於腫瘤細胞或腫瘤細胞環境中之抗原，尤其係選自以下之群之抗原：成纖維細胞活化蛋白(FAP)、腱糖蛋白-C之A1結構域(TNC A1)、腱糖蛋白-C之A2結構域(TNC A2)、纖維連接蛋白之額外結構域B(EDB)、癌胚抗原(CEA)及黑素瘤相關之硫酸軟骨素蛋白多糖(MCSP)。
本發明進一步提供編碼本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物之經 分離多核苷酸、包括該等多核苷酸之表現載體及包括該等多核苷酸或表現載體之宿主細胞。
亦提供產生本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物、包括本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物及醫藥上可接受之載劑之醫藥組合物的方法，及使用本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物之方法。
特定而言，本發明涵蓋用於治療有需要之個體之疾病之本文所述的突變IL-2多肽或免疫偶聯物。在一特定實施例中，該疾病係癌症。在一特定實施例中，該個體係人類。
本發明亦涵蓋本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物在製造用於治療有需要之個體之疾病之藥劑中的用途。
進一步提供治療個體之疾病之方法，其包括向該個體投與治療有效量之包括本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物之組合物。該疾病較佳係癌症。
亦提供刺激個體之免疫系統之方法，其包括向該個體投與有效量之包括本文所述呈醫藥上可接受形式之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之組合物。
圖1包括突變IL-2多肽之Fab-IL-2-Fab(A)及IgG-IL-2(B)免疫偶聯物格式之示意性代表圖。
圖2裸露IL-2野生型構築體之純化。(A)野生型裸露IL-2之His標籤純化之層析圖；(B)純化蛋白之SDS PAGE(8-12% Bis-Tris(NuPage,Invitrogen)，MES運行緩衝液)。
圖3裸露IL-2野生型構築體之純化。(A)野生型IL-2之尺寸排除層析之層析圖；(B)純化蛋白之SDS PAGE(8-12% Bis-Tris(NuPage,Invitrogen)，MES運行緩衝液)。
圖4在Superdex 75,10/300 GL上測得之野生型IL-2之分析型尺寸 排除層析。池1包括74%之23kDa物種及26%之20kDa物種，池2包括40%之22kDa物種及60%之20kDa物種。
圖5裸露IL-2四重突變構築體之純化。(A)IL-2四重突變之His標籤純化之層析圖；(B)純化蛋白之SDS PAGE(8-12% Bis-Tris(NuPage,Invitrogen)，MES運行緩衝液)。
圖6裸露IL-2四重突變構築體之純化。(A)IL-2四重突變之尺寸排除層析之層析圖；(B)純化蛋白之SDS PAGE(8-12% Bis-Tris(NuPage,Invitrogen)，MES運行緩衝液)。
圖7在Superdex 75,10/300 GL上測得之IL-2四重突變之分析型尺寸排除層析(池2，20kDa)。
圖8包括野生型或四重突變IL-2之靶向FAP、基於29B11之Fab-IL-2-Fab對於IL-2R及人類FAP之同時結合。(A)SPR分析之設置；(B)SPR感測圖譜。
圖9包括野生型或突變IL-2之靶向FAP、基於4G8之Fab-IL-2-Fab與普留淨注射劑相比在溶液中對於NK92細胞之IFN-γ釋放的誘導。
圖10包括野生型或突變IL-2之靶向FAP且基於4G8之Fab-IL-2-Fab與普留淨注射劑相比在溶液中對於分離NK細胞(底部)之增殖的誘導。
圖11包括野生型或突變IL-2之靶向FAP、基於4G8之Fab-IL-2-Fab與普留淨注射劑相比在溶液中對於活化CD3+ T細胞之增殖的誘導。
圖12包括野生型或突變IL-2之靶向FAP、基於4G8之Fab-IL-2-Fab與普留淨注射劑相比在溶液中對於過度刺激T細胞中活化誘導之細胞死亡(AICD)的誘導。
圖13包括野生型或四重突變IL-2之靶向FAP、基於4G8之Fab-IL-2-Fab與普留淨注射劑相比在溶液中之磷酸-STAT5 FACS分析。(A)調節T細胞(CD4+CD25+FOXP3+)；(B)CD8+ T細胞(CD3+CD8+)；(C)CD4+ T細胞(CD4+CD25-CD127+)；(D)NK細胞(CD3-CD56+)。
圖14靶向FAP、基於28H1之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之純化。(A)蛋白質G管柱之洗脫特徵曲線。(B)Superdex 200尺寸排除管柱之洗脫特徵曲線。(C)使用非還原及還原試樣之終產物之Novex Tris-甘胺酸4-20% SDS-PAGE。
圖15基於4G8、靶向FAP之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之純化。(A)蛋白質A管柱之洗脫特徵曲線。(B)Superdex 200尺寸排除管柱之洗脫特徵曲線。(C)使用非還原及還原試樣之終產物之NuPAGE Novex Bis-Tris Mini凝膠(Invitrogen)，MOPS運行緩衝液。
圖16 MHLG1 KV9靶向MCSP之Fab-IL2QM-Fab免疫偶聯物之純化。(A)蛋白質A管柱之洗脫特徵曲線，B)Superdex 200尺寸排除管柱之洗脫特徵曲線。(C)使用非還原及還原試樣之終產物之NuPAGE Novex Bis-Tris Mini凝膠，Invitrogen，MOPS運行緩衝液。
圖17 Fab-IL-2-Fab構築體與HEK 293-人類FAP細胞之靶結合。
圖18 Fab-IL-2-Fab構築體與HEK 293-人類FAP細胞之靶結合。
圖19在HEK 293-人類DPPIV及HEK 293模擬轉染之細胞中測得之Fab-IL-2-Fab構築體之結合特異性。特異性DPPIV(CD26)抗體之結合展示於右側。
圖20在Fab-IL-2-Fab構築體與GM05389成纖維細胞中之FAP結合時FAP內在化之分析。
圖21溶液中NK92細胞之IL-2誘導之IFN-γ釋放。
圖22溶液中NK92細胞之IL-2誘導之IFN-γ釋放。
圖23溶液中NK92細胞之IL-2誘導之增殖。
圖24在溶液中使用PBMC實施之STAT5磷酸化分析中對於Fab-IL-2-Fab純系28H1對29B11對4G8之評價。(A)NK細胞(CD3-CD56+)；(B)CD8+ T細胞(CD3+CD8+)；(C)CD4+ T細胞(CD3+CD4+CD25-CD127+)；(D)調節T細胞(CD4+CD25+FOXP3+)。
圖25靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物在人類腎細胞腺上皮癌細胞系ACHN中之效能。
圖26靶向FAP之4G8 FAP-IL-2 qm-Fab及28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物在小鼠劉易斯肺上皮癌細胞系LLC1中之效能。
圖27靶向FAP之28H1 Fab-IL-2 wt-Fab及28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物在小鼠劉易斯肺上皮癌細胞系LLC1中之效能。
圖28使用媒劑對照(A)或9μg/g wt IL-2(B)或qm IL-2(C)治療之小鼠之肺之低放大倍率圖(100x)。使用9μg/g wt IL-2治療之小鼠之肺展示血管中心單核細胞浸潤轉移至肺泡腔中。亦存在水腫及出血。在使用qm IL-2治療之小鼠中在少數血管周圍發現邊緣浸潤。
圖29圖28中所展示肺之較高放大倍率圖(200x)。血管中及血管周圍單核細胞之邊緣化及浸潤在使用wt IL-2治療之小鼠(A)中較使用qm IL-2治療之小鼠(B及C)中更為嚴重。
圖30使用媒劑對照(A)或9μg/g wt IL-2(B)或qm IL-2(C)治療之小鼠之肝之低放大倍率圖(100x)。在使用wt IL-2治療之小鼠中看到血管中心浸潤。
圖31在與不同IL-2野生型(wt)及四重突變(qm)製劑一起培育24(A)或48小時(B)時NK92細胞之IFN-γ分泌。
圖32在與不同IL-2野生型(wt)及四重突變(qm)製劑一起培育48小時時NK92細胞之增殖。
圖33在與不同IL-2野生型(wt)及四重突變(qm)製劑一起培育48小時時NK92細胞之增殖。
圖34在與不同靶向FAP之28H1 IL-2免疫偶聯物或普留淨注射劑一起培育4(A)、5(B)或6(C)天時NK細胞之增殖。
圖35在與不同靶向FAP之28H1 IL-2免疫偶聯物或普留淨注射劑一起培育4(A)、5(B)或6(C)天時CD4 T細胞之增殖。
圖36在與不同靶向FAP之28H1 IL-2免疫偶聯物或普留淨注射劑一起培育4(A)、5(B)或6(C)天時CD8 T細胞之增殖。
圖37在與不同IL-2免疫偶聯物或普留淨注射劑一起培育6天時NK細胞(A)、CD4 T細胞(B)及CD8 T細胞(C)之增殖。
圖38在與普留淨注射劑、室內產生之野生型IL-2及四重突變IL-2一起培育30min之後NK細胞(A)、CD8 T細胞(B)、CD4 T細胞(C)及調節T細胞(D)中之STAT磷酸化。
圖39在與普留淨注射劑、包括野生型IL-2之IgG-IL-2或包括四重突變IL-2之IgG-IL-2一起培育30min之後NK細胞(A)、CD8 T細胞(B)、CD4 T細胞(C)及調節T細胞(D)中之STAT磷酸化。
圖40在投與(在7天內每天一次)不同劑量之包括野生型或四重突變IL-2之IL-2免疫偶聯物之後Black 6小鼠的存活率。
圖41在單一靜脈內投與包括野生型(wt)或四重突變(qm)IL-2之靶向FAP之(A)及非靶向(B)IgG-IL-2構築體之後，IL-2免疫偶聯物的血清濃度。
圖42在單一靜脈內投與包括野生型(wt)或四重突變(qm)IL-2之非靶向Fab-IL-2-Fab構築體之後，IL-2免疫偶聯物之血清濃度。
圖43四重突變IL-2之純化。(A)固定金屬離子層析；(B)尺寸排除層析；(C)非還原條件下之SDS PAGE(NuPAGE Novex Bis-Tris凝膠(Invitrogen)，MES運行緩衝液)；(D)分析型尺寸排除層析(Superdex 75 10/300 GL)。
圖44在與不同IL-2免疫偶聯物一起培育6天之後預活化CD8(A)及CD4(B)T細胞之增殖。
圖45在與不同IL-2免疫偶聯物一起培育6天並使用抗Fas抗體過夜處理之後CD3+ T細胞之活化誘導之細胞死亡。
圖46靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2四重突變(qm)免疫偶聯物之 純化。A)蛋白質A親和層析步驟之洗脫特徵曲線。B)尺寸排除層析步驟之洗脫特徵曲線。C)最終產物之分析型SDS-PAGE(NuPAGE Novex Bis-Tris Mini凝膠，Invitrogen，MOPS運行緩衝液)。D)最終產物之分析型尺寸排除層析，Superdex 200管柱(97%單體含量)。
圖47靶向FAP、基於28H1之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物之純化。A)蛋白質A親和層析步驟之洗脫特徵曲線。B)尺寸排除層析步驟之洗脫特徵曲線。C)最終產物之分析型SDS-PAGE(還原：NuPAGE Novex Bis-Tris Mini凝膠，Invitrogen，MOPS運行緩衝液；非還原：NuPAGE Tris-乙酸鹽，Invitrogen，Tris-乙酸鹽運行緩衝液)。D)最終產物之分析型尺寸排除層析，Superdex 200管柱(100%單體含量)。
圖48與相應Fab-IL-2 qm-Fab構築體相比，靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物與表現於穩定轉染HEK 293細胞上之人類FAP之結合，如藉由FACS所量測。
圖49與基於28H1之Fab-IL-2 qm-Fab構築體相比，在溶液中藉由靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物誘導之NK92細胞中之干擾素(IFN)-γ釋放。
圖50與基於28H1之Fab-IL-2-Fab及Fab-IL-2 qm-Fab構築體以及普留淨注射劑相比，在溶液中使用靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物刺激20min之後不同細胞類型中磷酸化STAT5之FACS檢測。A)NK細胞(CD3-CD56+)；B)CD8+ T細胞(CD3+CD8+)；C)CD4+ T細胞(CD3+CD4+CD25-CD127+)；D)調節T細胞(CD4+CD25+FOXP3+)。
定義
除非下文另有定義，否則本文所用之術語具有業內通用含義。
除非另有所述，否則本文所用之術語「介白素-2」或「IL-2」係指來自任一脊椎動物來源之任一原始IL-2，該脊椎動物來源包含哺乳 動物，例如靈長類動物(例如人類)及齧齒類動物(例如，小鼠及大鼠)。該術語涵蓋未處理IL-2以及在細胞處理中產生之任一形式的IL-2。該術語亦涵蓋天然存在之IL-2變體，例如剪接變體或等位基因變體。實例性人類IL-2之胺基酸序列展示於SEQ ID NO：1中。未處理人類IL-2另外包括具有SEQ ID NO：272之序列之N末端20胺基酸信號肽，該N末端20胺基酸信號肽不存在於成熟IL-2分子中。
本文所用之術語「IL-2突變」或「突變IL-2多肽」意欲涵蓋各種形式之IL-2分子(包含全長IL-2、截短形式之IL-2及IL-2(例如)藉由融合或化學偶聯連接至另一分子之形式)的任一突變形式。在用於提及IL-2時，「全長」意指成熟、天然長度之IL-2分子。舉例而言，全長人類IL-2係指具有133個胺基酸之分子(例如，參見SEQ ID NO：1)。各種形式之IL-2突變之特徵在於具有至少一個影響IL-2與CD25之相互作用的胺基酸突變。此突變可涉及通常位於該位置處之野生型胺基酸殘基之取代、缺失、截短或修飾。較佳藉由胺基酸取代來獲得突變。除非另有所述，否則IL-2突變在本文中可稱為IL-2突變肽序列、IL-2突變多肽、IL-2突變蛋白或IL-2突變類似物。
在本文中根據SEQ ID NO：1中所展示之序列來指定各種形式之IL-2。在本文中可使用各種名稱來表示相同突變。舉例而言，在位置42處自苯基丙胺酸至丙胺酸之突變可表示為42A、A42、A42、F42A或Phe42Ala。
本文所用之術語「胺基酸突變」意欲涵蓋胺基酸取代、缺失、插入及修飾。在最終構築體中可獲得取代、缺失、插入及修飾之任一組合，前提係最終構築體擁有期望特性，例如，與CD25之結合有所減小。胺基酸序列缺失及插入包含胺基酸之胺基-及/或羧基末端缺失及插入。末端缺失之實例係全長人類IL-2之位置1中丙胺酸殘基之缺失。較佳胺基酸突變係胺基酸取代。出於改變(例如)IL-2多肽之結合 特性之目的，非保守胺基酸取代(亦即使用另一具有不同結構及/或化學性質之胺基酸代替一個胺基酸)尤佳。較佳胺基酸取代包含藉由親水性胺基酸代替疏水性胺基酸。胺基酸取代包含藉由以下胺基酸進行代替：非天然存在之胺基酸或20種標準胺基酸之天然存在之胺基酸衍生物(例如4-羥基脯胺酸、3-甲基組胺酸、鳥胺酸、高絲胺酸、5-羥基離胺酸)。可使用業內熟知之基因或化學方法生成胺基酸突變。基因方法可包含定點誘變、PCR、基因合成及諸如此類。預計亦可使用藉由除基因改造外之方法來改變胺基酸之側鏈基團的方法，例如化學修飾。
如本文所使用，「野生型」形式之IL-2係如下IL-2形式：其在其他方面與突變IL-2多肽相同，只是野生型形式在突變IL-2多肽之每一胺基酸位置處具有野生型胺基酸。舉例而言，若IL-2突變係全長IL-2(亦即IL-2並不融合或偶聯至任一其他分子)，則此突變之野生型形式係全長原始IL-2。若IL-2突變係介於IL-2及在IL-2下游編碼之另一多肽(例如抗體鏈)之間的融合體，則此IL-2突變之野生型形式係具有融合至相同下游多肽之野生型胺基酸序列的IL-2。另外，若IL-2突變係IL-2之截短形式(IL-2之非截短部分內之突變或修飾序列)，則此IL-2突變之野生型形式類似地係具有野生型序列之截短IL-2。出於比較各種形式IL-2突變與相應野生型形式IL-2之IL-2受體結合親和力或生物活性的目的，術語野生型涵蓋包括一或多個與天然存在之原始IL-2相比並不影響IL-2受體結合之胺基酸突變的IL-2形式，該胺基酸突變係(例如)在對應於人類IL-2之殘基125之位置處將半胱胺酸取代為丙胺酸。在一些實施例中，出於本發明目的，野生型IL-2包括胺基酸取代C125A(參見SEQ ID NO：3)。在本發明之某些實施例中，與突變IL-2多肽進行比較之野生型IL-2多肽包括SEQ ID NO：1之胺基酸序列。在其他實施例中，與突變IL-2多肽進行比較之野生型IL-2多肽包括SEQ ID NO：3之胺基酸序列。
除非另有所述，否則本文所用之術語「CD25」或「IL-2受體之α-亞單位」係指來自任一脊椎動物來源之任一原始CD25，該脊椎動物來源包含哺乳動物，例如靈長類動物(例如人類)及齧齒類動物(例如，小鼠及大鼠)。該術語涵蓋「全長」未處理CD25以及自處理細胞產生之任一形式的CD25。該術語亦涵蓋CD25之天然存在之變體，例如，剪接變體或等位基因變體。在某些實施例中，CD25係人類CD25。實例性人類CD25之胺基酸序列(具有信號序列Avi標籤及His標籤)展示於SEQ ID NO：278中。
本文所用之術語「高親和力IL-2受體」係指異源三聚體形式之IL-2受體，其由受體γ-亞單位(亦稱為常見細胞因子受體γ-亞單位、γc或CD132)、受體β-亞單位(亦稱為CD122或p70)及受體α-亞單位(亦稱為CD25或p55)組成。與之相比，術語「中間親和力IL-2受體」係指僅包含γ-亞單位及β-亞單位而沒有α-亞單位之IL-2受體(關於綜述，例如參見Olejniczak及Kasprzak,Med Sci Monit 14,RA179-189(2008))。
「親和力」係指分子之單一結合位點(例如，受體)與其結合配偶體(例如，配體)間之非共價相互作用的總強度。除非另有所述，否則本文所用之「結合親和力」係指反映結合對之成員(例如，受體與配體)間之1：1相互作用的固有結合親和力。分子X對於其配偶體Y之親和力通常可由解離常數(KD)表示，解離常數係解離速率常數與締合速率常數(分別為koff及kon)之比率。因此，等效親和力可包括不同速率常數，只要速率常數之比率保持相同即可。可藉由業內已知之已充分確立之方法(包含彼等闡述於本文中者)來量測親和力。
突變或野生型IL-2多肽對於各種形式IL-2受體之親和力可根據實例中所示之方法藉由表面電漿共振(SPR)使用標準儀錶(例如BIAcore儀器(GE Healthcare))測得，且受體亞單位(例如)可藉由重組表現獲得 (例如，參見Shanafelt等人，Nature Biotechnol 18,1197-1202(2000))。另一選擇為，可使用已知表現一種受體形式或另一受體形式之細胞系評估IL-2突變對於不同形式IL-2受體的結合親和力。用於量測結合親和力之具體說明性及實例性實施例闡述於下文中。
「調節T細胞」或「Treg細胞」意指可阻抑其他T細胞之反應之特殊類型CD4+ T細胞。Treg細胞之特徵在於IL-2受體之α-亞單位(CD25)及轉錄因子叉頭框蛋白P3(FOXP3)之表現(Sakaguchi,Annu Rev Immunol 22,531-62(2004))，且在誘導及維持對於抗原(包含彼等由腫瘤表現者)之周邊自身耐受性發揮關鍵作用。Treg細胞之功能及其阻抑特性之產生及誘導需要IL-2。
本文所用之術語「效應子細胞」係指調介IL-2之細胞毒性效應之淋巴細胞群體。效應子細胞包含效應子T細胞，例如CD8+細胞毒性T細胞、NK細胞、淋巴因子活化之殺手(LAK)細胞及巨噬細胞/單核細胞。
本文所用之術語「抗原結合部分」係指特異性結合至抗原決定簇之多肽分子。在一實施例中，抗原結合部分能夠使其所附接之實體(例如細胞因子或第二抗原結合部分)針對靶位點(例如具有抗原決定簇之特定類型之腫瘤細胞或腫瘤間質)。抗原結合部分包含在本文中進一步定義之抗體及其片段。較佳抗原結合部分包含抗體之抗原結合結構域，包括抗體重鏈可變區域及抗體輕鏈可變區域。在某些實施例中，抗原結合部分可包含在本文中進一步定義且業內已知之抗體恆定區域。有用重鏈恆定區域包含5種同種型：α、δ、ε、γ或μ中之任一者。有用輕鏈恆定區域包含兩種同種型：κ及λ中之任一者。
「特異性結合」意指該結合對抗原具有選擇性且可區別於不需要之相互作用或非特異性相互作用。抗原結合部分與特定抗原決定簇結合之能力可經由酶聯免疫吸附分析(ELISA)或熟習此項技術者熟知 之其他技術(例如表面電漿共振技術，(在BIAcore儀器上分析)(Liljeblad等人，Glyco J 17,323-329(2000))及傳統結合分析(Heeley,Endocr Res 28,217-229(2002)))來量測。
本文所用之術語「抗原決定簇」與「抗原」及「表位」同義，且係指多肽大分子上抗原結合部分結合形成抗原結合部分-抗原複合物之位點(例如胺基酸之鄰近序列段或由非鄰近胺基酸之不同區域構成之構象組態)。有用抗原決定簇可發現於(例如)腫瘤細胞之表面上、病毒感染細胞之表面上、其他病變細胞之表面上、游離於血清中及/或細胞外基質(ECM)中。
本文所用之術語「多肽」係指由藉由醯胺鍵(亦稱為肽鍵)線性連接之單體(胺基酸)構成之分子。術語「多肽」係指兩個或更多個胺基酸之任一鏈，且並不係指產物之具體長度。因此，肽、二肽、三肽、寡肽、「蛋白質」、「胺基酸鏈」或用於係指兩個或更多個胺基酸之鏈之任一其他術語包含於「多肽」之定義內，且術語「多肽」可用於代替該等術語中之任一者或可互換使用。術語「多肽」亦意欲係指多肽之表現後修飾之產物，該等表現後修飾包含但不限於糖基化、乙醯化、磷酸化、醯胺化、衍生(藉由已知保護/封阻基團)、溶蛋白性裂解或修飾(藉由非天然存在之胺基酸)。多肽可衍生自天然生物來源或藉由重組技術產生，但未必自指定核酸序列轉譯。其可以任一方式生成，包含藉由化學合成。本發明之多肽之尺寸可為約3個或更多個、5個或更多個、10個或更多個、20個或更多個、25個或更多個、50個或更多個、75個或更多個、100i個或更多個、200個或更多個、500個或更多個、1,000個或更多個或2,000或更多個胺基酸。多肽可具有界定之三維結構，但其未必具有該結構。具有界定之三維結構之多肽稱為摺疊多肽，且並不擁有界定之三維結構而是可採用大量不同構象之多肽稱為非摺疊多肽。
「分離」多肽或其變體或衍生物欲指並不處於其天然環境中之多肽。並不需要特定程度之純化。舉例而言，分離多肽可自其原始或天然環境中取出。出於本發明目的，將表現於宿主細胞中之重組產生之多肽及蛋白質視為分離形式，如同藉由任一適宜技術分離、分級分離或部分地或實質上純化之原始或重組多肽。
對於參考多肽序列而言，「胺基酸序列一致性百分比(%)」定義為在比對序列並引入空位(若需要)以達到最大序列一致性百分比後候選序列中與參考多肽序列中之胺基酸殘基一致之胺基酸殘基的百分比，且不將任何保守取代視為序列一致性之一部分。出於測定胺基酸序列一致性百分比目的之比對可以熟習此項技術者所熟知之各種方式來達成，例如使用可公開獲得之電腦軟體，例如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體。彼等熟習此項技術者可確定用於比對序列之適當參數，包含在所比較序列之全長範圍內達成最大比對所需要之任何算法。然而，對於本文目的而言，核酸序列一致性百分比值係使用序列比較電腦程式ALIGN-2來生成。ALIGN-2序列比較電腦程式係藉由Genentech公司編輯，且原始碼與用戶文件已一起編入美國版權局，Washington D.C.,20559，其中其以美國版權註冊號TXU510087註冊。ALIGN-2程式可通過Genentech公司，South San Francisco,California公開獲得，或可自原始碼編譯。所編譯ALIGN-2程式應適於在UNIX操作系統(包含數位UNIX V4.0D)上使用。所有序列比較參數皆由ALIGN-2程式設定且並不改變。當使用ALIGN-2進行胺基酸序列比較時，給定胺基酸序列A相對於(to)、與(with)或對(against)給定胺基酸序列B之胺基酸序列一致性百分比(另一選擇為，可表達為相對於、與或對給定胺基酸序列B給定胺基酸序列A所具有或包括之一定胺基酸序列一致性百分比)如下所述來計算：100乘以分數X/Y 其中X係在A與B之程式比對中由序列比對程式ALIGN-2評定為一致性匹配之胺基酸殘基數，且其中Y係B中胺基酸殘基之總數。應瞭解，在胺基酸序列A之長度不等於胺基酸序列B之長度時，A相對於B之胺基酸序列一致性百分比不等於B相對於A之胺基酸序列一致性百分比。除非另外明確說明，否則本文所用之所有胺基酸序列一致性百分比值皆如前面緊接段落中所述使用ALIGN-2電腦程式來獲得。
術語「多核苷酸」係指分離核酸分子或構築體，例如信使RNA(mRNA)、病毒源性RNA或質粒DNA(pDNA)。多核苷酸可包括習用磷酸二酯鍵或非習用鍵(例如醯胺鍵，例如發現於肽核酸(PNA)中者)。術語「核酸分子」係指存在於多核苷酸中之任一或多個核酸區段，例如DNA或RNA片段。
「分離」核酸分子或多核苷酸欲指已自其原始環境取出之核酸分子、DNA或RNA。舉例而言，出於本發明目的，將載體中所含編碼治療性多肽之重組多核苷酸視為分離形式。經分離多核苷酸之其他實例包含維持於異源性宿主細胞中之重組多核苷酸或存於溶液中之純化(部分地或實質上)多核苷酸。經分離多核苷酸包含通常含有多核苷酸分子之細胞中所含之多核苷酸分子，但該多核苷酸分子存在於染色體外或存在於與其天然染色體位置不同之染色體位置處。分離RNA分子包含本發明之活體內或活體外RNA轉錄物、以及正鏈及負鏈形式及雙鏈形式。本發明之經分離多核苷酸或核酸進一步包含以合成方式產生之該等分子。此外，多核苷酸或核酸可為或可包含調節要素，例如啟動子、核糖體結合位點、或轉錄終止子。
具有與本發明參考核苷酸序列至少(例如)95%「一致」之核苷酸序列的核酸或多核苷酸欲指，除去按參考核苷酸序列之每100個核苷酸計該多核苷酸序列可包含至多5處點突變外，該多核苷酸之核苷酸序列與參考序列一致。換言之，為獲得具有與參考核苷酸序列至少 95%一致之核苷酸序列的多核苷酸，參考序列中至多有5%核苷酸可缺失或使用另一核苷酸取代，或可將數量為至多佔參考序列全部核苷酸5%之核苷酸插入參考序列中。參考序列之該等變化可發生在參考核苷酸序列之5'或3'末端位置或彼等末端位置間之任何地方，其個別地散佈於參考序列中之殘基中或散佈於參考序列內之一或多個鄰近基團中。作為實際情況，可使用已知電腦程式(例如上文針對多肽所論述者(例如ALIGN-2))按慣例確定任一特定多核苷酸分子序列與本發明核苷酸序列是否為至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致。
術語「表現序列盒」係指以重組或合成方式生成之具有一系列允許轉錄靶細胞中之特定核酸之指定核酸要素的多核苷酸。重組表現序列盒可納入質粒、染色體、線粒體DNA、質體DNA、病毒或核酸片段中。通常，表現載體之重組表現序列盒部分較其他序列尤其包含擬轉錄核酸序列及啟動子。在某些實施例中，本發明之表現序列盒包括編碼本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物或其片段之多核苷酸序列。
術語「載體」或「表現載體」與「表現構築體」同義，且係指用於引入在靶細胞中與其可操作關聯之特定基因並引導該特定基因之表現的DNA分子。該術語包含呈自我複製核酸結構形式之載體以及納入引入其之宿主細胞之基因組中的載體。本發明之表現載體包括表現序列盒。表現載體容許轉錄大量穩定mRNA。表現載體位於靶細胞內部後，藉由細胞轉錄及/或轉譯機制來產生由基因編碼之核糖核酸分子或蛋白質。在一實施例中，本發明之表現載體包括含有編碼本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物或其片段之多核苷酸序列的表現序列盒。
術語「人工」係指合成組合物、或衍生自非宿主細胞之組合 物，例如以化學方式合成之寡核苷酸。
術語「宿主細胞」、「宿主細胞系」及「宿主細胞培養物」可互換使用且係指引入外源性核酸之細胞(包含該等細胞之子代)。宿主細胞包含「轉化體」及「轉化細胞」，其包含原代轉化細胞及與傳代數量無關之自其衍生之子代。子代與親代細胞之核酸含量可能並不完全相同，但可含有突變。本文包含經篩選或選擇用於原始轉化細胞中之具有相同功能或生物活性的突變子代。
術語「抗體」在本文中係以最廣泛意義使用且涵蓋各種抗體結構，包含但不限於單株抗體、多株抗體、多特異性抗體(例如，雙特異性抗體)及抗體片段，只要其展現期望抗原結合活性即可。
術語「全長抗體」、「完整抗體」及「全抗體」在本文中可互換使用，其係指具有實質上與原始抗體結構類似之結構或具有含有如本文所定義Fc區域之重鏈的抗體。
「抗體片段」係指除完整抗體外之分子，其包括完整抗體中結合完整抗體所結合之抗原的一部分。抗體片段之實例包含但不限於Fv、Fab、Fab'、Fab'-SH、F(ab')2、雙特異性抗體、直鏈抗體、單鏈抗體分子(例如scFv)及自抗體片段形成之多特異性抗體。關於某些抗體片段之綜述，參見Hudson等人Nat Med 9,129-134(2003)。關於scFv片段之綜述，例如參見Plückthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies，第113卷，Rosenburg及Moore編輯，Springer-Verlag,New York，第269-315頁(1994)；亦參見WO 93/16185及美國專利第5,571,894號及第5,587,458號。關於包括補救受體結合表位殘基且具有增加之活體內半衰期之Fab及F(ab')2片段的論述，參見美國專利第5,869,046號。雙鏈抗體係具有兩個抗原結合位點之可為二價或雙特異性之抗體片段。例如，參見EP 404,097；WO 1993/01161；Hudson等人，Nat Med 9,129-134(2003)；及Hollinger等人，Proc. Natl.Acad.Sci.USA 90,6444-6448(1993)。三鏈抗體及四鏈抗體亦闡述於Hudson等人，Nat Med 9,129-134(2003)中。可藉由各種技術來製備抗體片段，包含但不限於溶蛋白性消化完整抗體以及藉由重組宿主細胞(例如大腸桿菌(E.coli)或噬菌體)來產生，如本文所述。
術語「免疫球蛋白分子」係指具有天然存在之抗體結構之蛋白質。舉例而言，IgG類免疫球蛋白係約150,000道爾頓(dalton)之異源四聚體糖蛋白，其由二硫鍵鍵結之兩條輕鏈及兩條重鏈構成。自N末端至C末端，每一重鏈依次具有可變區域(VH)(亦稱為可變重鏈結構域或重鏈可變結構域)及三個恆定結構域(CH1、CH2及CH3，亦稱為重鏈恆定區域)。類似地，自N末端至C末端，每一輕鏈依次具有可變區域(VL)(亦稱為可變輕鏈結構域或輕鏈可變結構域)及恆定輕鏈(CL)結構域(亦稱為輕鏈恆定區域)。可將免疫球蛋白之重鏈指定為5個種類中之一者，稱為α型(IgA)、δ型(IgD)、ε型(IgE)、γ型(IgG)或μ型(IgM)，其中之一些可進一步分為亞類，例如γ1型(IgG1)、γ2型(IgG2)、γ3型(IgG3)、γ4型(IgG4)、α1型(IgA1)及α2型(IgA2)。基於免疫球蛋白之恆定結構域之胺基酸序列，可將該免疫球蛋白之輕鏈指定為兩個類型中之一者，稱為κ型及λ型。免疫球蛋白基本上由經由免疫球蛋白鉸鏈區域連接之兩個Fab分子及Fc結構域組成。
術語「抗原結合結構域」係指如下抗體部分：其包括特異性結合至抗原之一部分或全部並與之互補的區域。抗原結合結構域可藉由(例如)一或多個抗體可變結構域(亦稱為抗體可變區域)來提供。較佳地，抗原結合結構域包括抗體輕鏈可變區域(VL)及抗體重鏈可變區域(VH)。
術語「可變區域」或「可變結構域」係指抗體重鏈或輕鏈中參與使抗體與抗原結合之結構域。原始抗體之重鏈及輕鏈之可變結構域(分別係VH及VL)通常具有類似結構，其中每一結構域皆包括4個保守 框架區域(FR)及三個超變區域(HVR)。例如，參見Kindt等人，Kuby Immunology，第6版，W.H.Freeman and Co.，第91頁(2007)。單一VH或VL結構域可足以賦予抗原結合特異性。
本文所用之術語「超變區域」或「HVR」係指抗體可變結構域區域中序列具有超變性及/或形成結構上經界定之環(「超變環」)中的每一者。通常，原始四鏈抗體包括6個HVR；三個位於VH中(H1、H2、H3)，且三個位於VL中(L1、L2、L3)。HVR通常包括來自超變環及/或來自「互補決定區域」(CDR)之胺基酸殘基，後者具有最高序列可變性及/或涉及抗原識別。除VH中之CDR1外，CDR通常包括形成超變環之胺基酸殘基。超變區域(HVR)亦稱為「互補決定區域」(CDR)，且該等術語在本文中可互換用於提及可變區域中形成抗原結合區域之部分。此特定區域已由Kabat等人，U.S.Dept.of Health and Human Services,Sequences of Proteins of Immunological Interest(1983)及Chothia等人，J.Mol.Biol.196：901-917(1987)闡述，其中該等定義在彼此進行比較時包含胺基酸殘基之重疊或子集。然而，涉及抗體CDR或其變體之各定義的應用意欲涵蓋於本文所定義及使用之術語的範圍內。涵蓋由每一上述引用之參考文獻定義之CDR的適當胺基酸殘基以比較方式闡述於下表1中。涵蓋特定CDR之精確殘基數會隨CDR之序列及尺寸而改變。給定抗體可變區域胺基酸序列，彼等熟習此項技術者可以常規方式確定哪些殘基包括特定CDR。
1表1中所有CDR定義之編號係根據Kabat等人(參見下文)所述編號規定 進行。
2如表1中所使用，具有小寫字母「b」之「AbM」係指由Oxford Molecular之「AbM」抗體模型構建軟體定義之CDR。
Kabat等人亦定義適用於任何抗體之用於可變區域序列之編號系統。熟習此項技術者可明確地將此「Kabat編號」系統指定給任何可變區域序列，除序列本身外不依賴於任何實驗數據。如本文所使用，「Kabat編號」係指Kabat等人，U.S.Dept.of Health and Human Services，「Sequence of Proteins of Immunological Interest」(1983)闡述之編號系統。除非另外指定，否則提及抗體可變區域中特定胺基酸殘基位置之編號係根據Kabat編號系統獲得。
序列表之多肽序列(亦即，SEQ ID NO：23、25、27、29、31、33等)並不根據Kabat編號系統進行編號。然而，熟習此項技術者熟知將序列表之序列編號轉化成Kabat編號。
「框架」或「FR」係指除超變區域(HVR)殘基外之可變結構域殘基。可變結構域之FR通常由4個FR結構域：FR1、FR2、FR3及FR4組成。因此，HVR及FR序列通常出現於VH(或VL)中之下列序列中：FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
抗體「種類」係指重鏈所擁有之恆定結構域或恆定區域之類型。存在5大類抗體：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM，且該等種類中之若干種可進一步分成亞類(同種型)，例如，IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。對應於不同種類之免疫球蛋白之重鏈恆定結構域分別稱為α、δ、ε、γ及μ。
術語「Fc區域」在本文中用於定義免疫球蛋白重鏈中含有恆定區域之至少一部分的C-末端區域。該術語包含原始序列Fc區域及變體Fc區域。儘管IgG重鏈之Fc區域的邊界會稍有變化，但通常將人類IgG重鏈Fc區域定義為自Cys226、或自Pro230延伸至該重鏈之羧基末端。 然而，Fc區域之C-末端離胺酸(Lys447)可存在或可不存在。
「促進異源二聚化之修飾」係多肽(例如免疫球蛋白重鏈)之肽主鏈或轉譯後修飾中可減小或防止多肽與相同多肽締合形成同源二聚體之操作。本文所用之促進異源二聚化之修飾尤其包含對於期望形成二聚體之兩個多肽中之每一者作出的單獨修飾，其中該等修飾彼此互補以促進兩個多肽之締合。舉例而言，促進異源二聚化之修飾可改變期望形成二聚體之多肽中之一者或兩者的結構或電荷，從而使其分別以空間或靜電有利之方式進行締合。異源二聚化發生於兩個不同多肽之間，例如融合至重鏈中每一者之其他免疫偶聯物組份(例如IL-2多肽)並不相同之兩個免疫球蛋白重鏈。在本發明之免疫偶聯物中，促進異源二聚化之修飾存在於免疫球蛋白分子之重鏈、具體而言Fc結構域中。在一些實施例中，促進異源二聚化之修飾包括胺基酸突變，具體而言係胺基酸取代。在一特定實施例中，促進異源二聚化之修飾包括兩個免疫球蛋白重鏈中每一者中之單獨胺基酸突變，具體而言係胺基酸取代。
術語「效應子功能」在用於提及抗體時係指彼等歸因於抗體之Fc區域之生物活性，其隨抗體同種型而有所變化。抗體效應子功能之實例包含：Clq結合及補體依賴性細胞毒性(CDC)、Fc受體結合、抗體依賴性細胞調介之細胞毒性(ADCC)、抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)、細胞因子分泌、細胞表面受體(例如B細胞受體)之下調及B細胞活化。
「活化Fc受體」係在由抗體之Fc區域結合後引發刺激具有受體之細胞實施效應子功能之信號傳導事件的Fc受體。活化Fc受體包含FcγRIIIa(CD16a)、FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32)及FcαRI(CD89)。
本文所用之術語「改造(engineer、engineered、engineering)」視為包含天然存在之多肽或重組多肽或其片段之肽主鏈或轉譯後修飾的 任一操作。改造包含胺基酸序列之修飾、糖基化型式之修飾或個別胺基酸之側鏈基團之修飾以及該等方式之組合。
本文所用之術語「免疫偶聯物」係指包含至少一個IL-2部分及至少一個抗原結合部分之多肽分子。在某些實施例中，免疫偶聯物包括至少一個IL-2部分及至少兩個抗原結合部分。本發明之特定免疫偶聯物基本上由藉由一或多個鏈接序列連結之一個IL-2部分與兩個抗原結合部分組成。抗原結合部分可藉由本文所述之各種相互作用及各種組態連結至IL-2部分。
本文所用之術語「對照抗原結合部分」係指游離於其他抗原結合部分及效應子部分存在之抗原結合部分。舉例而言，在比較本發明之Fab-IL2-Fab免疫偶聯物與對照抗原結合部分時，該對照抗原結合部分係游離Fab，其中該Fab-IL2-Fab免疫偶聯物及該游離Fab分子皆可特異性結合至相同抗原決定簇。
如本文所使用，關於抗原結合部分等之術語「第一」及「第二」用於便於區分一個以上之每一類部分。除非明確闡述，否則該等術語之應用並不意欲賦予免疫偶聯物之特定順序或取向。
藥劑之「有效量」係指在投與該藥劑之細胞或組織中產生生理學變化所需之量。
藥劑(例如，醫藥組合物)之「治療有效量」係指在所需時間內以所需劑量有效達成期望治療或預防結果之量。舉例而言，治療有效量之藥劑會消除、降低、延遲、最小化或防止疾病之不良效應。
「個體」(individual或subject)係哺乳動物。哺乳動物包含但不限於家養動物(例如，牛、綿羊、貓、狗及馬)、靈長類動物(例如，人類及非人類靈長類動物，例如猴子)、兔及齧齒類動物(例如，小鼠及大鼠)。較佳地，個體係人類。
術語「醫藥組合物」係指如下製劑：其呈現形式允許其中所含 活性成份之生物活性有效，且不含對投與該組合物之個體具有不可接受毒性的其他組份。
「醫藥上可接受之載劑」係指醫藥組合物中除活性成份外對個體無毒之成份。醫藥上可接受之載劑包含但不限於緩衝劑、賦形劑、穩定劑或防腐劑。
如本文所使用，「治療」(及其語法變體，例如「treat」或「treating」)係指欲改變所治療個體之疾病之自然過程的臨床幹預，且可出於預防性目的或在臨床病理學過程期間實施。治療之期望效應包含但不限於防止疾病發生或復發、減輕症狀、減弱疾病之任何直接或間接病理結果、防止轉移、降低疾病進展速率、改善或緩和疾病狀態及緩解或改良預後。在一些實施例中，使用本發明抗體來延遲疾病發生或減緩疾病進展。
實施例之詳細闡述
本發明旨在提供具有用於免疫療法之改良性質的突變IL-2多肽。特定而言，本發明旨在消除IL-2之導致毒性但對於IL-2之效能而言並非必需之藥理學性質。如上所述，IL-2受體之不同形式係由不同亞單位組成且展現對於IL-2之不同親和力。由β受體亞單位及γ受體亞單位組成之中間親和力IL-2受體表現於靜止效應子細胞上且足以用於IL-2信號傳導。高親和力IL-2受體另外包括受體之α-亞單位，其主要表現於調節T(Treg)細胞以及活化效應子細胞上，其中其與IL-2結合可分別促進Treg細胞調介之免疫阻抑或活化誘導之細胞死亡(AICD)。因此，不期望受限於理論，減小或消除IL-2對於IL-2受體之α-亞單位之親和力應會減少以下情形：藉由調節T細胞引起IL-2誘導之效應子細胞功能下調及藉由AICD過程產生腫瘤耐受性。另一方面，維持對於中間親和力IL-2受體之親和力應會保留藉由IL-2來誘導諸如NK細胞及T細胞等效應子細胞之增殖及活化。
業內已存在若干IL-2突變，然而，發明者已發現尤其適於賦予IL-2用於免疫療法之期望特性之IL-2多肽的新穎胺基酸突變及其組合。
在第一態樣中，本發明提供包括胺基酸突變之突變介白素-2(IL-2)多肽，該胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力且保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力(各自皆與野生型IL-2多肽相比)。
對於CD25之親和力有所降低之人類IL-2(hIL-2)突變可(例如)藉由胺基酸位置35、38、42、43、45或72或其組合處之胺基酸取代生成。實例性胺基酸取代包含K35E、K35A、R38A、R38E、R38N、R38F、R38S、R38L、R38G、R38Y、R38W、F42L、F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、K43E、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R、Y45K、L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。本發明之特定IL-2突變包括對應於人類IL-2之殘基42、45或72之胺基酸位置處之突變或其組合。該等突變對於中間親和力IL-2受體展現實質上類似之結合親和力，且對於IL-2受體之α-亞單位及高親和力IL-2受體具有實質上減小之親和力(與IL-2突變之野生型形式相比)。
有用突變之其他特性可包含能夠誘導具有IL-2受體之T及/或NK細胞之增殖，能夠誘導具有IL-2受體之T及/或NK細胞中之IL-2信號傳導，能夠藉由NK細胞生成作為二級細胞因子之干擾素(IFN)-γ，減小誘導藉由周邊血單核細胞(PBMC)產生二級細胞因子-尤其IL-10及TNF-α之能力，減小活化調節T細胞之能力，減小誘導T細胞中之細胞凋亡之能力，及減小活體內之毒性特徵。
在本發明之一實施例中，胺基酸突變(其消除或減小突變IL-2多 肽對於高親和力IL-2受體之親和力並保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力)位於對應於人類IL-2之殘基72之位置處。在一實施例中，該胺基酸突變係胺基酸取代。在一實施例中，該胺基酸取代係選自以下之群：L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一更具體實施例中，該胺基酸突變係胺基酸取代L72G。
在一特定態樣中，本發明提供包括第一及第二胺基酸突變之突變IL-2多肽，該第一及第二胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力並保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力。在一實施例中，該第一胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基72之位置處。在一實施例中，該第一胺基酸突變係胺基酸取代。在一具體實施例中，該第一胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一甚至更具體實施例中，該胺基酸取代係L72G。該第二胺基酸突變位於與該第一胺基酸突變不同之位置處。在一實施例中，該第二胺基酸突變位於選自對應於人類IL-2之殘基35、38、42、43及45之位置的位置處。在一實施例中，該第二胺基酸突變係胺基酸取代。在一具體實施例中，該胺基酸取代係選自以下之群：K35E、K35A、R38A、R38E、R38N、R38F、R38S、R38L、R38G、R38Y、R38W、F42L、F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、K43E、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R及Y45K。在一特定實施例中，該第二胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42或45之位置處。在一具體實施例中，該第二胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R及 Y45K。在一更具體實施例中，該第二胺基酸突變係胺基酸取代F42A或Y45A。在一更特定實施例中，該第二胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42之位置處。在一具體實施例中，該第二胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R及F42K。在一更具體實施例中，該胺基酸取代係F42A。在另一實施例中，該第二胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基45之位置處。在一具體實施例中，該第二胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R及Y45K。在一更具體實施例中，該胺基酸取代係Y45A。在某些實施例中，突變IL-2多肽包括第三胺基酸突變，該第三胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力並保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力(各自皆與野生型IL-2多肽相比)。該第三胺基酸突變位於與該第一及第二胺基酸突變不同之位置處。在一實施例中，該第三胺基酸突變位於選自對應於人類IL-2之殘基35、38、42、43及45之位置之位置處。在一較佳實施例中，該第三胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42或45之位置處。在一實施例中，該第三胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42之位置處。在另一實施例中，該第三胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基45之位置處。在一實施例中，該第三胺基酸突變係胺基酸取代。在一具體實施例中，該胺基酸取代係選自以下之群：K35E、K35A、R38A、R38E、R38N、R38F、R38S、R38L、R38G、R38Y、R38W、F42L、F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、K43E、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R及Y45K。在一更具體實施例中，該胺基酸取代係選自以下之群：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、Y45A、Y45G、Y45S、 Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R及Y45K。在一甚至更具體實施例中，該胺基酸取代係F42A或Y45A。在一實施例中，該胺基酸取代係F42A。在另一實施例中，該胺基酸取代係Y45A。在某些實施例中，突變IL-2多肽並不包括位於對應於人類IL-2之殘基38之位置處的胺基酸突變。
在本發明之一甚至更特定態樣中，提供包括三個胺基酸突變之突變IL-2多肽，該三個胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力但保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力。在一實施例中，該三個胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42、45及72之位置處。在一實施例中，該三個胺基酸突變係胺基酸取代。在一實施例中，該三個胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R、Y45K、L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一具體實施例中，該三個胺基酸突變係胺基酸取代F42A、Y45A及L72G。
在某些實施例中，該胺基酸突變可將突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力減小至先前之至少1/5，具體而言減小至先前之至少1/10，更具體而言減小至先前之至少1/25。在存在一個以上之胺基酸突變(其減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力)之實施例中，該等胺基酸突變之組合可將突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力減小至先前之至少1/30、至少1/50或甚至至少1/100。在一實施例中，該胺基酸突變或胺基酸突變之組合消除突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力，從而藉由下文所述之表面電漿共振檢測不到結合。
在IL-2突變展現其對於中間親和力IL-2受體之親和力比IL-2突變 之野生型形式高約70%時，達成對於中間親和力受體之實質上類似之結合，亦即保留突變IL-2多肽對於該受體之親和力。本發明之IL-2突變可展現大於約80%及甚至大於約90%之該親和力。
發明者發現，減小IL-2對於IL-2受體之α-亞單位之親和力以及消除IL-2之O-糖基化會產生具有改良性質的IL-2蛋白。舉例而言，在突變IL-2多肽表現於諸如CHO或HEK細胞等哺乳動物細胞中時，消除O-糖基化位點會產生更均質產物。
因此，在某些實施例中，本發明之突變IL-2多肽包括其他胺基酸突變，該其他胺基酸突變消除IL-2在對應於人類IL-2之殘基3之位置處之O-糖基化位點。在一實施例中，該其他胺基酸突變(其消除IL-2在對應於人類IL-2之殘基3之位置處之O-糖基化位點)係胺基酸取代。實例性胺基酸取代包含T3A、T3G、T3Q、T3E、T3N、T3D、T3R、T3K及T3P。在一具體實施例中，該其他胺基酸突變係胺基酸取代T3A。
在某些實施例中，突變IL-2多肽基本上係全長IL-2分子。在某些實施例中，突變IL-2多肽係人類IL-2分子。在一實施例中，突變IL-2多肽包括具有至少一個胺基酸突變之SEQ ID NO：1之序列，與包括沒有該突變之SEQ ID NO：1之IL-2多肽相比，該胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力但保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力。在另一實施例中，突變IL-2多肽包括具有至少一個胺基酸突變之SEQ ID NO：3之序列，與包括沒有該突變之SEQ ID NO：3之IL-2多肽相比，該胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力但保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力。
在一具體實施例中，突變IL-2多肽可引發選自由以下組成之群之細胞反應中之一或多者：活化T淋巴細胞中之增殖、活化T淋巴細胞 中之分化、細胞毒性T細胞(CTL)活性、活化B細胞中之增殖、活化B細胞中之分化、天然殺手(NK)細胞中之增殖、NK細胞中之分化、藉由活化T細胞或NK細胞進行之細胞因子分泌及NK/淋巴細胞活化之殺手細胞(LAK)抗腫瘤細胞毒性。
在一實施例中，與野生型IL-2多肽相比，突變IL-2多肽減小誘導調節T細胞中之IL-2信號傳導之能力。在一實施例中，與野生型IL-2多肽相比，突變IL-2多肽在T細胞中誘導較少活化誘導之細胞死亡(AICD)。在一實施例中，與野生型IL-2多肽相比，突變IL-2多肽具有減小之活體內毒性特徵。在一實施例中，與野生型IL-2多肽相比，突變IL-2多肽具有延長之血清半衰期。
本發明之特定突變IL-2多肽在對應於人類IL-2之殘基3、42、45及72之位置處包括4個胺基酸取代。特異性胺基酸取代係T3A、F42A、Y45A及L72G。如隨附實例中所示，該四重突變IL-2多肽展現以下特性：對於CD25並無可檢測結合，在T細胞中誘導細胞凋亡之能力有所減小，在Treg細胞中誘導IL-2信號傳導之能力有所減小，且活體內毒性特徵有所減小。然而，其依然能夠活化效應子細胞中之IL-2信號傳導，誘導效應子細胞之增殖，及藉由NK細胞生成作為二級細胞因子之IFN-γ。
另外，如實例中所述，該突變IL-2多肽具有其他有利性質，例如減小之表面疏水性、良好穩定性及良好表現產量。出人意料地，與野生型IL-2相比，該突變IL-2多肽亦提供延長之血清半衰期。
本發明之IL-2突變除在IL-2中與CD25或糖基化位點形成IL-2界面之區域具有突變外，其亦可在該等區域外部之胺基酸序列中具有一或多個突變。人類IL-2中之該等其他突變可提供諸如增加之表現或穩定性等其他優點。舉例而言，位置125處之半胱胺酸可經中性胺基酸(例如絲胺酸、丙胺酸、蘇胺酸或纈胺酸)代替，從而分別得到C125S IL- 2、C125A IL-2、C125T IL-2或C125V IL-2，如美國專利第4,518,584號中所述。如其中所述，亦可缺失IL-2之N末端丙胺酸殘基以得到諸如des-A1 C125S或des-A1 C125A等突變。另一選擇為或連同一起，IL-2突變可包含如下突變：通常存在於野生型人類IL-2之位置104處之甲硫胺酸由諸如丙胺酸等中性胺基酸代替(參見美國專利第5,206,344號)。所得突變(例如，des-A1 M104A IL-2、des-A1 M104A C125S IL-2、M104A IL-2、M104A C125A IL-2、des-A1 M104A C125A IL-2或M104A C125S IL-2，該等突變及其他突變可參見美國專利第5,116,943號及Weiger等人，Eur J Biochem 180,295-300(1989))可連同本發明之特定IL-2突變一起使用。
因此，在某些實施例中，本發明之突變IL-2多肽在對應於人類IL-2之殘基125之位置處包括其他胺基酸突變。在一實施例中，該其他胺基酸突變係胺基酸取代C125A。
熟習此項技術者能夠確定可提供用於本發明目的之其他優點之其他突變。舉例而言，應瞭解，IL-2序列中減小或消除IL-2對於中間親和力IL-2受體之親和力之胺基酸突變(例如D20T、N88R或Q126D，例如參見US 2007/0036752)可能並不適於包含於本發明之突變IL-2多肽中。
在一實施例中，本發明之突變IL-2多肽包括選自以下之群之序列：SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：11、SEQ ID NO：15及SEQ ID NO：19。在一具體實施例中，本發明之突變IL-2多肽包括SEQ ID NO：15或SEQ ID NO：19之序列。在一甚至更具體實施例中，突變IL-2多肽包括SEQ ID NO：19之序列。
本發明之突變IL-2多肽尤其用於諸如具有IL-2之免疫偶聯物等IL-2融合蛋白的情形中。該等融合蛋白包括融合至非IL-2部分之本發明之突變IL-2多肽。非IL-2部分可為合成或天然蛋白或其一部分或變 體。實例性非IL-2部分包含白蛋白或抗體結構域(例如免疫球蛋白之Fc結構域或抗原結合結構域)。
具有IL-2之免疫偶聯物係包括抗原結合部分及IL-2部分之融合蛋白。其藉由使IL-2(例如)直接靶向腫瘤微環境中來顯著增加IL-2療法之效能。根據本發明，抗原結合部分可為具有諸如抗原特異性結合親和力等生物功能之全抗體或免疫球蛋白或其一部分或變體。
免疫偶聯物療法之益處顯而易見。舉例而言，免疫偶聯物之抗原結合部分識別腫瘤特異性表位並使免疫偶聯物分子靶向腫瘤位點。因此，可將高濃度之IL-2遞送至腫瘤微環境中，由此使用較非偶聯IL-2所需低得多劑量之免疫偶聯物引起本文所述各種免疫效應子細胞之活化及增殖。另外，因施加呈免疫偶聯物形式之IL-2容許細胞因子本身之劑量較低，故限制了發生IL-2之不期望副作用之可能，且藉助免疫偶聯物使IL-2靶向機體中之特異性位點亦可減小全身性暴露並由此使得副作用小於使用非偶聯IL-2所獲得者。此外，與非偶聯IL-2相比免疫偶聯物之增加之循環半衰期有助於免疫偶聯物之效能。然而，IL-2免疫偶聯物之此特性可另外加重IL-2分子之潛在副作用：因相對於非偶聯IL-2，IL-2免疫偶聯物在血流中之循環半衰期顯著更長，故融合蛋白分子之IL-2或其他部分活化通常存在於脈管系統中之組份之可能性有所增加。相同關注問題亦適用於其他融合蛋白，該等其他融合蛋白含有融合至諸如Fc或白蛋白等另一部分之IL-2從而使得IL-2在循環中之半衰期有所延長。因此，包括本發明之突變IL-2多肽且與IL-2之野生型形式相比具有減小毒性之免疫偶聯物尤其有利。
因此，本發明進一步提供如上所述連接至至少一個非IL-2部分之突變IL-2多肽。在一實施例中，突變IL-2多肽及非IL-2部分形成融合蛋白，亦即突變IL-2多肽與非IL-2部分共用肽鍵。在一實施例中，突變IL-2多肽連接至第一及第二非IL-2部分。在一實施例中，突變IL-2 多肽與第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵，且第二抗原結合部分與i)突變IL-2多肽或ii)第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵。在一具體實施例中，突變IL-2多肽與該第一非IL-2部分共用羧基末端肽鍵且與該第二非IL-2部分共用胺基末端肽鍵。在一實施例中，該非IL-2部分係靶向部分。在一特定實施例中，該非IL-2部分係抗原結合部分(由此與突變IL-2多肽形成免疫偶聯物，如下文中更詳細闡述)。在某些實施例中，抗原結合部分係抗體或抗體片段。在一實施例中，抗原結合部分係全長抗體。在一實施例中，抗原結合部分係免疫球蛋白分子、尤其IgG種類免疫球蛋白分子、更特定而言IgG1亞類免疫球蛋白分子。在一該實施例中，突變IL-2多肽與免疫球蛋白重鏈中之一者共用胺基末端肽鍵。在另一實施例中，抗原結合部分係抗體片段。在一些實施例中，該抗原結合部分包括抗體中包括抗體重鏈可變區域及抗體輕鏈可變區域之抗原結合結構域。在一更具體實施例中，抗原結合部分係Fab分子或scFv分子。在一特定實施例中，抗原結合部分係Fab分子。在另一實施例中，抗原結合部分係scFv分子。在一實施例中，該抗原結合部分針對呈現於腫瘤細胞或腫瘤細胞環境中之抗原。在一較佳實施例中，該抗原係選自以下之群：成纖維細胞活化蛋白(FAP)、腱糖蛋白-C之A1結構域(TNC A1)、腱糖蛋白-C之A2結構域(TNC A2)、纖維連接蛋白之額外結構域B(EDB)、癌胚抗原(CEA)及黑素瘤相關之硫酸軟骨素蛋白多糖(MCSP)。在突變IL-2多肽連接至一個以上之抗原結合部分(例如第一及第二抗原結合部分)之情形下，每一抗原結合部分皆可獨立地選自各種形式之抗體及抗體片段。舉例而言，第一抗原結合部分可為Fab分子且第二抗原結合部分可為scFv分子。在一具體實施例中，該第一及該第二抗原結合部分中之每一者皆係scFv分子或該第一及該第二抗原結合部分中之每一者皆係Fab分子。在一特定實施例中，該第一及該第二抗原結合部分中之 每一者皆係Fab分子。同樣，在突變IL-2多肽連接至一個以上之抗原結合部分(例如第一及第二抗原結合部分)之情形下，可獨立地選擇該等抗原結合部分中之每一者所針對之抗原。在一實施例中，該第一及該第二抗原結合部分針對不同抗原。在另一實施例中，該第一及該第二抗原結合部分針對相同抗原。如上所述，抗原尤其係呈現於腫瘤細胞或腫瘤細胞環境中之抗原，更特定而言係選自以下之群之抗原：成纖維細胞活化蛋白(FAP)、腱糖蛋白-C之A1結構域(TNC A1)、腱糖蛋白-C之A2結構域(TNC A2)、纖維連接蛋白之額外結構域B(EDB)、癌胚抗原(CEA)及黑素瘤相關之硫酸軟骨素蛋白多糖(MCSP)。抗原結合區可進一步單獨或組合納入本文所述與免疫偶聯物之抗原結合結構域有關之任一特徵。
免疫偶聯物
在一特定態樣中，本發明提供包括突變IL-2多肽(其包括一或多個胺基酸突變，該胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力並保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力)及至少一個抗原結合部分之免疫偶聯物。在本發明之一實施例中，胺基酸突變(其消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力並保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力)位於選自對應於人類IL-2之殘基42、45及72之位置的位置處。在一實施例中，該胺基酸突變係胺基酸取代。在一實施例中，該胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R、Y45K、L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K，更具體而言係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、Y45A及L72G。在一實施例中，胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基42之位置處。在一具體實施例 中，該胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R及F42。在一甚至更具體實施例中，該胺基酸取代係F42A。在另一實施例中，胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基45之位置處。在一具體實施例中，該胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R及Y45K。在一甚至更具體實施例中，該胺基酸取代係Y45A。在另一實施例中，胺基酸突變位於對應於人類IL-2之殘基72之位置處。在一具體實施例中，該胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一甚至更具體實施例中，該胺基酸取代係L72G。在某些實施例中，本發明之突變IL-2多肽在對應於人類IL-2之殘基38之位置處並不包括胺基酸突變。在一特定實施例中，包括於本發明之免疫偶聯物中之突變IL-2多肽至少包括第一及第二胺基酸突變，該第一及第二胺基酸突變消除或減小突變IL-2多肽對於IL-2受體之α-亞單位之親和力並保留突變IL-2多肽對於中間親和力IL-2受體之親和力。在一實施例中，該第一及第二胺基酸突變位於選自對應於人類IL-2之殘基42、45及72之位置之兩個位置處。在一實施例中，該第一及第二胺基酸突變係胺基酸取代。在一實施例中，該第一及第二胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、F42K、Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45R、Y45K、L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R及L72K。在一特定實施例中，該第一及第二胺基酸突變係選自以下之群之胺基酸取代：F42A、Y45A及L72G。突變IL-2多肽可進一步單獨或組合納入前文段落中所述與本發明之突變IL-2多肽有關之任一特徵。在一實施例中，該突變IL-2多肽與免疫偶聯物中所包 括之該抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵，亦即該免疫偶聯物係融合蛋白。在某些實施例中，該抗原結合部分係抗體或抗體片段。在一些實施例中，該抗原結合部分包括抗體中包括抗體重鏈可變區域及抗體輕鏈可變區域之抗原結合結構域。抗原結合區可單獨或組合納入上文或下文所述與抗原結合結構域有關之任一特徵。
免疫偶聯物格式
尤其適宜之免疫偶聯物格式闡述於PCT公開案第WO 2011/020783號中，其全部內容以引用方式併入本文中。該等免疫偶聯物包括至少兩個抗原結合結構域。因此，在一實施例中，本發明之免疫偶聯物包括至少本文所述之第一突變IL-2多肽及至少第一及第二抗原結合部分。在一特定實施例中，該第一及第二抗原結合部分獨立地選自由以下組成之群：Fv分子、尤其scFv分子及Fab分子。在一具體實施例中，該第一突變IL-2多肽與該第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵且該第二抗原結合部分與i)第一突變IL-2多肽或ii)第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵。在一特定實施例中，免疫偶聯物基本上由藉由一或多個鏈接序列連結之第一突變IL-2多肽與第一及第二抗原結合部分組成。該等格式之優點在於其以高親和力結合靶抗原(例如腫瘤抗原)，但僅係對於IL-2受體之單體結合，由此避免使免疫偶聯物靶向在除靶位點外之位置處之具有免疫細胞之IL-2受體。在一特定實施例中，第一突變IL-2多肽與第一抗原結合部分共用羧基末端肽鍵且進一步與第二抗原結合部分共用胺基末端肽鍵。在另一實施例中，第一抗原結合部分與第一突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，且進一步與第二抗原結合部分共用胺基末端肽鍵。在另一實施例中，第一抗原結合部分與第一突變IL-2多肽共用胺基末端肽鍵，且進一步與第二抗原結合部分共用羧基末端肽。在一特定實施例中，突變IL-2多肽與第一重鏈可變區域共用羧基末端肽鍵且進一步與第二重鏈可變區 域共用胺基末端肽鍵。在另一實施例中，突變IL-2多肽與第一輕鏈可變區域共用羧基末端肽鍵且進一步與第二輕鏈可變區域共用胺基末端肽鍵。在另一實施例中，第一重鏈或輕鏈可變區域藉由羧基末端肽鍵連結至第一突變IL-2多肽且進一步藉由胺基末端肽鍵連結至第二重鏈或輕鏈可變區域。在另一實施例中，第一重鏈或輕鏈可變區域藉由胺基末端肽鍵連結至第一突變IL-2多肽且進一步藉由羧基末端肽鍵連結至第二重鏈或輕鏈可變區域。在一實施例中，突變IL-2多肽與第一Fab重鏈或輕鏈共用羧基末端肽鍵且進一步與第二Fab重鏈或輕鏈共用胺基末端肽鍵。在另一實施例中，第一Fab重鏈或輕鏈與第一突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵且進一步與第二Fab重鏈或輕鏈共用胺基末端肽鍵。在其他實施例中，第一Fab重鏈或輕鏈與第一突變IL-2多肽共用胺基末端肽鍵且進一步與第二Fab重鏈或輕鏈共用羧基末端肽鍵。在一實施例中，免疫偶聯物至少包括如下第一突變IL-2多肽：其與一或多個scFv分子共用胺基末端肽鍵且進一步與一或多個scFv分子共用羧基末端肽鍵。
其他尤其適宜之免疫偶聯物格式包括免疫球蛋白分子作為抗原結合部分。在一該實施例中，免疫偶聯物包括至少一個本文所述之突變IL-2多肽及免疫球蛋白分子、尤其IgG分子、更特定而言IgG1分子。在一實施例中，免疫偶聯物包括不超過一個突變IL-2多肽。在一實施例中，免疫球蛋白分子係人類免疫球蛋白分子。在一實施例中，突變IL-2多肽與免疫球蛋白分子共用胺基-或羧基末端肽鍵。在一實施例中，免疫偶聯物基本上由藉由一或多個鏈接序列連結之突變IL-2多肽及免疫球蛋白分子、尤其IgG分子、更特定而言IgG1分子組成。在一具體實施例中，突變IL-2多肽在其胺基末端胺基酸處連結至免疫球蛋白重鏈中之一者之羧基末端胺基酸。在某些實施例中，免疫球蛋白分子在Fc結構域中包括兩個不同免疫球蛋白重鏈之促進異源二聚化 之修飾。人類IgG Fc結構域之兩個多肽鏈之間最廣泛蛋白質-蛋白質相互作用之位點位於Fc結構域的CH3結構域中。因此，在一實施例中，該修飾位於Fc結構域之CH3結構域中。在一具體實施例中，該修飾係凸起與孔洞(knob-into-hole)修飾，包括位於一個免疫球蛋白重鏈中之凸起修飾及位於另一免疫球蛋白重鏈中之孔洞修飾。凸起與孔洞技術闡述於(例如)US 5,731,168；US 7,695,936；Ridgway等人，Prot Eng 9,617-621(1996)及Carter,J Immunol Meth 248,7-15(2001)中。通常，該方法涉及在第一多肽之界面處引入隆凸(「凸起」)且在第二多肽之界面處引入相應空腔(「孔洞」)，從而該隆凸可位於空腔中以促進異源二聚體形成並防止同源二聚體形成。藉由使用較大側鏈(例如酪胺酸或色胺酸)代替來自第一多肽界面之較小胺基酸側鏈來構築體隆凸。藉由使用較小胺基酸側鏈(例如丙胺酸或蘇胺酸)代替較大胺基酸側鏈來在第二多肽之界面上產生尺寸與隆凸相同或類似之補償性空腔。隆凸及空腔可藉由改變編碼多肽之核酸(例如藉由位點特異性誘變或藉由肽合成)來製得。在一具體實施例中，凸起修飾在兩個免疫球蛋白重鏈中之一者中包括胺基酸取代T366W，且孔洞修飾在兩個免疫球蛋白重鏈中之另一者中包括胺基酸取代T366S、L368A及Y407V。在另一具體實施例中，包括凸起修飾之免疫球蛋白重鏈另外包括胺基酸取代S354C，且包括孔洞修飾之免疫球蛋白重鏈另外包括胺基酸取代Y349C。引入該兩個半胱胺酸殘基會在兩個重鏈之間形成二硫橋鍵，從而進一步穩定二聚體(Carter,J Immunol Methods 248,7-15(2001))。
在一特定實施例中，突變IL-2多肽連結至包括凸起修飾之免疫球蛋白重鏈之羧基末端胺基酸。
在一替代實施例中，兩個不同多肽鏈之促進異源二聚化之修飾包括調介靜電牽引效應之修飾，例如在PCT公開案WO 2009/089004中 所述。通常，此方法涉及藉由帶電胺基酸殘基代替兩個多肽鏈之界面處之一或多個胺基酸殘基，從而同源二聚體形成變得靜電不利而異源二聚化變得靜電有利。
Fc結構域賦予免疫偶聯物有利之藥物代謝動力學性質，包含長血清半衰期(其有助於在靶組織中充分積累)及有利之組織-血液分佈比率。然而，同時，其可引起免疫偶聯物針對表現Fc受體之細胞而非具有較佳抗原之細胞之不期望靶向。另外，共活化Fc受體信號傳導路徑可導致細胞因子釋放，此與免疫偶聯物之IL-2多肽及長半衰期一起引起細胞因子受體之過度活化並在全身性投與時引起嚴重副作用。與此情形一致，已闡述習用IgG-IL-2免疫偶聯物與輸注反應有關(例如，參見King等人，J Clin Oncol 22,4463-4473(2004))。
因此，在某些實施例中，本發明之免疫偶聯物中所包括之免疫球蛋白分子經改造以對於Fc受體具有減小之結合親和力。在一該實施例中，免疫球蛋白在其Fc結構域中包括一或多個減小免疫偶聯物對於Fc受體之結合親和力之胺基酸突變。通常，相同之一或多個胺基酸突變存在於兩個免疫球蛋白重鏈中之每一者中。在一實施例中，該胺基酸突變將免疫偶聯物對於Fc受體之結合親和力減小至先前之至少1/2、至少1/5或至少1/10。在存在一個以上減小免疫偶聯物對於Fc受體之結合親和力之胺基酸突變之實施例中，該等胺基酸突變之組合可將Fc結構域對於Fc受體之結合親和力減小至先前之至少1/10、至少1/20或甚至至少1/50。在一實施例中，與包括未改造免疫球蛋白分子之免疫偶聯物相比，包括改造免疫球蛋白分子之免疫偶聯物展現小於20%、尤其小於10%、更特定而言小於5%之對於Fc受體之結合親和力。在一實施例中，Fc受體係活化Fc受體。在一具體實施例中，Fc受體係Fcγ受體、更具體而言FcγRIIIa、FcγRI或FcγRIIa受體。較佳地，對於該等受體中之每一者之結合有所減小。在一些實施例中，對於補 體組份之結合親和力、對於Clq之特異性結合親和力亦有所減小。在一實施例中，對於新生Fc受體(FcRn)之結合親和力並不減小。在免疫球蛋白(或包括該免疫球蛋白之免疫偶聯物)展現非改造形式免疫球蛋白(或包括該非改造形式免疫球蛋白之免疫偶聯物)對於FcRn之結合親和力的大於約70%時，達成對於FcRn之實質上類似結合，亦即保留免疫球蛋白對於該受體之結合親和力。免疫球蛋白或包括該免疫球蛋白之免疫偶聯物可展現大於約80%及甚至大於約90%之該親和力。在一實施例中，胺基酸突變係胺基酸取代。在一實施例中，免疫球蛋白在免疫球蛋白重鏈之位置P329(Kabat編號)處包括胺基酸取代。在一更具體實施例中，胺基酸取代係P329A或P329G、尤其P329G。在一實施例中，免疫球蛋白在選自免疫球蛋白重鏈之S228、E233、L234、L235、N297及P331之位置處包括另一胺基酸取代。在一更具體實施例中，另一胺基酸取代係S228P、E233P、L234A、L235A、L235E、N297A、N297D或P331S。在一特定實施例中，免疫球蛋白在免疫球蛋白重鏈之P329、L234及L235之位置處包括胺基酸取代。在一更特定實施例中，免疫球蛋白包括胺基酸突變L234A、L235A及P329G(LALA P329G)。胺基酸取代之此組合幾乎完全消除人類IgG分子之Fcγ受體結合，且由此降低包含抗體依賴性細胞調介之細胞毒性(ADCC)在內之效應子功能。
在某些實施例中，免疫偶聯物包括一或多個位於突變IL-2多肽與抗原結合部分之間之溶蛋白性裂解位點。
免疫偶聯物之組份(例如抗原結合部分及/或突變IL-2多肽)可直接連接或經由各種鏈接、尤其包括一或多個胺基酸、通常約2-20個胺基酸之肽鏈接連接，該等鏈接闡述於本文中或在業內已知。適宜之非免疫原性鏈接肽包含(例如)(G4S)n、(SG4)n或G4(SG4)n鏈接肽，其中n通常係介於1與10之間、通常介於2與4之間之數值。
抗原結合部分
本發明之免疫偶聯物之抗原結合部分通常係多肽分子，該多肽分子與特異性抗原決定簇結合且能夠使其所附接之實體(例如突變IL-2多肽或第二抗原結合部分)針對靶位點，例如針對特定類型之具有抗原決定簇之腫瘤細胞或腫瘤間質。免疫偶聯物可與發現於(例如)腫瘤細胞之表面上、病毒感染細胞之表面上、其他病變細胞之表面上、游離於血清中及/或細胞外基質(ECM)中之抗原決定簇結合。
腫瘤抗原之非限制性實例包含MAGE、MART-1/Melan-A、gp100、二肽基肽酶IV(DPPIV)、腺苷去胺酶結合蛋白(ADAbp)、親環素b、結腸直腸相關抗原(CRC)-C017-1A/GA733、癌胚抗原(CEA)及其免疫原性表位CAP-1及CAP-2、etv6、aml1、前列腺特異性抗原(PSA)及其免疫原性表位PSA-1、PSA-2及PSA-3、前列腺特異性膜抗原(PSMA)、T細胞受體/CD3-ζ鏈、腫瘤抗原之MAGE家族(例如，MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A5、MAGE-A6、MAGE-A7、MAGE-A8、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A11、MAGE-A12、MAGE-Xp2(MAGE-B2)、MAGE-Xp3(MAGE-B3)、MAGE-Xp4(MAGE-B4)、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-C4、MAGE-C5)、腫瘤抗原之GAGE家族(例如，GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7、GAGE-8、GAGE-9)、BAGE、RAGE、LAGE-1、NAG、GnT-V、MUM-1、CDK4、酪胺酸酶、p53、MUC家族、HER2/neu、p21ras、RCAS1、α-甲胎蛋白、E-鈣黏著素、α-連環蛋白、β-連環蛋白及γ-連環蛋白、p120ctn、gp100 Pme1117、PRAME、NY-ESO-1、cdc27、腺瘤性結腸息肉病蛋白(APC)、胞襯蛋白、連接蛋白37、獨特型Ig、p15、gp75、GM2及GD2神經節苷脂、病毒產物(例如人類乳頭瘤病毒蛋白)、腫瘤抗原之Smad家族、lmp-1、P1A、EBV編碼之核抗原(EBNA)-1、腦糖 原磷酸化酶、SSX-1、SSX-2(HOM-MEL-40)、SSX-1、SSX-4、SSX-5、SCP-1及CT-7及c-erbB-2。
病毒抗原之非限制性實例包含流感病毒血凝素、愛潑斯坦-巴爾病毒LMP-1(Epstein-Barr virus LMP-1)、C型肝炎病毒E2糖蛋白、HIV gp160及HIV gp120。
ECM抗原之非限制性實例包含共結合蛋白聚糖、類肝素酶、整合素、骨橋蛋白、連結物、鈣黏著素、層黏連蛋白、層黏連蛋白類型EGF、凝集素、纖維連接蛋白、諾池蛋白(notch)、腱糖蛋白及基質蛋白酶。
本發明之免疫偶聯物可與細胞表面抗原之下列特定非限制性實例結合：FAP、Her2、EGFR、IGF-1R、CD2(T細胞表面抗原)、CD3(與TCR有關之異源多聚體)、CD22(B細胞受體)、CD23(低親和力IgE受體)、CD30(細胞因子受體)、CD33(骨髓細胞表面抗原)、CD40(腫瘤壞死因子受體)、IL-6R(IL6受體)、CD20、MCSP及PDGFβR(β血小板源生長因子受體)。
在一實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個或更多個抗原結合部分，其中該等抗原結合部分中之每一者皆特異性結合至相同抗原決定簇。在另一實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個或更多個抗原結合部分，其中該等抗原結合部分中之每一者特異性結合至不同抗原決定簇。
抗原結合部分可為保留對於抗原決定簇之特異性結合之任一類抗體或其片段。抗體片段包含但不限於VH片段、VL片段、Fab片段、F(ab')2片段、scFv片段、Fv片段、微抗體、雙抗體、三抗體及四抗體(例如，參見Hudson及Souriau，Nature Med 9,129-134(2003))。
尤其適宜之抗原結合部分闡述於PCT公開案第WO 2011/020783號中，其全部內容以引用方式併入本文中。
在一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於纖維連接蛋白之額外結構域B(EDB)具有特異性之抗原結合部分。在另一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個可與單株抗體L19競爭結合至EDB之表位之抗原結合部分。例如，參見PCT公開案WO 2007/128563 A1(其全部內容以引用方式併入本文中)。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中衍生自L19單株抗體之第一Fab重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與衍生自L19單株抗體之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中衍生自L19單株抗體之第一Fab輕鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與衍生自L19單株抗體之第二Fab輕鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中衍生自L19單株抗體之第一scFv與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與衍生自L19單株抗體之第二scFv共用羧基末端肽鍵。
在一更具體實施例中，免疫偶聯物包括SEQ ID NO：199或保留功能性之其變體之多肽序列。在另一實施例中，免疫偶聯物包括衍生自L19單株抗體之Fab輕鏈。在一更具體實施例中，免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：201或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一實施例中，免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：199及SEQ ID NO：201或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，多肽(例如)由二硫鍵共價連接。
在一實施例中，本發明之免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於腱糖蛋白之A1結構域(TNC-A1)具有特異性之抗原結合部分。在另一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多 個可與單株抗體F16競爭結合至TNC-A1之表位之抗原結合部分。例如，參見PCT公開案WO 2007/128563 A1(其全部內容以引用方式併入本文中)。在一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於腱糖蛋白之A1及/或A4結構域(TNC-A1或TNC-A4或TNC-A1/A4)具有特異性之抗原結合部分。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於腱糖蛋白之A1結構域具有特異性之第一Fab重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於腱糖蛋白之A1結構域具有特異性之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於腱糖蛋白之A1結構域具有特異性之第一Fab輕鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於腱糖蛋白之A1結構域具有特異性之第二Fab輕鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於腱糖蛋白之A1結構域具有特異性之第一scFv與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於腱糖蛋白之A1結構域具有特異性之第二scFv共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於TNC-A1具有特異性之免疫球蛋白重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵。
在一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：33或SEQ ID NO：35或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區域序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：29或SEQ ID NO：31或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區域序列。在一更具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：33或SEQ ID NO：35或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之重鏈可變區 域序列，且包括與SEQ ID NO：29或SEQ ID NO：31或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之輕鏈可變區域序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由與SEQ ID NO：34或SEQ ID NO：36至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由SEQ ID NO：34或SEQ ID NO：36之多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由與SEQ ID NO：30或SEQ ID NO：32至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由SEQ ID NO：30或SEQ ID NO：32之多核苷酸序列編碼。
在一具體實施例中，免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：203或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：205或SEQ ID NO：215或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：207或SEQ ID NO：237或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在一更具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：205及SEQ ID NO：207或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：215及SEQ ID NO：237或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、 95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：204至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：204之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：206或SEQ ID NO：216至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：206或SEQ ID NO：216之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：208或SEQ ID NO：238至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：208或SEQ ID NO：238之多核苷酸序列編碼之多肽序列。
在一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於腱糖蛋白之A2結構域(TNC-A2)具有特異性之抗原結合部分。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於腱糖蛋白之A2結構域具有特異性之第一Fab重鏈與IL突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該IL突變IL-2多肽繼而與對於腱糖蛋白之A2結構域具有特異性之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於腱糖蛋白之A2結構域具有特異性之第一Fab輕鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於腱糖蛋白之A2結構域具有特異性之第二Fab輕鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於TNC-A2具有特異性之免疫球蛋白重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵。
在一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與選自以 下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列：SEQ ID NO：27、SEQ ID NO：159、SEQ ID NO：163、SEQ ID NO：167、SEQ ID NO：171、SEQ ID NO：175、SEQ ID NO：179、SEQ ID NO：183及SEQ ID NO：187或保留功能性之其變體。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列：SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：157、SEQ ID NO：161、SEQ ID NO：165、SEQ ID NO：169、SEQ ID NO：173、SEQ ID NO：177、SEQ ID NO：181及SEQ ID NO：185或保留功能性之其變體。在一更具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列：SEQ ID NO：27、SEQ ID NO：159、SEQ ID NO：163、SEQ ID NO：167、SEQ ID NO：171、SEQ ID NO：175、SEQ ID NO：179、SEQ ID NO：183及SEQ ID NO：187或保留功能性之其變體，且包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列：SEQ ID NO：23、SEQ ID NO：25、SEQ ID NO：157、SEQ ID NO：161、SEQ ID NO：165、SEQ ID NO：169、SEQ ID NO：173、SEQ ID NO：177、SEQ ID NO：181及SEQ ID NO：185或保留功能性之其變體。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：160、SEQ ID NO：164、SEQ ID NO：168、SEQ ID NO：172、SEQ ID NO：176、SEQ ID NO：180、SEQ ID NO：184及SEQ ID NO：188。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈 可變區域序列由選自以下之群的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：160、SEQ ID NO：164、SEQ ID NO：168、SEQ ID NO：172、SEQ ID NO：176、SEQ ID NO：180、SEQ ID NO：184及SEQ ID NO：188。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：158、SEQ ID NO：162、SEQ ID NO：166、SEQ ID NO：170、SEQ ID NO：174、SEQ ID NO：178、SEQ ID NO：182及SEQ ID NO：186。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由選自以下之群的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：158、SEQ ID NO：162、SEQ ID NO：166、SEQ ID NO：170、SEQ ID NO：174、SEQ ID NO：178、SEQ ID NO：182及SEQ ID NO：186。
在一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列：SEQ ID NO：241、SEQ ID NO：243及SEQ ID NO：245或保留功能性之其變體。在另一實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列：SEQ ID NO：247、SEQ ID NO：249及SEQ ID NO：251或保留功能性之其變體。在一更具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列：SEQ ID NO：241、SEQ ID NO：243及SEQ ID NO：245或保留功能性之其變體，且包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列：SEQ ID NO：247、SEQ ID NO：249及SEQ ID NO：251或保留功能性之其變 體。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：241及SEQ ID NO：249或SEQ ID NO：251或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：243及SEQ ID NO：247或SEQ ID NO：249或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：245及SEQ ID NO：247或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：242、SEQ ID NO：244及SEQ ID NO：246。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由選自以下之群之多核苷酸序列編碼之多肽序列：SEQ ID NO：242、SEQ ID NO：244及SEQ ID NO：246。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：248、SEQ ID NO：250及SEQ ID NO：252。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由選自以下之群之多核苷酸序列編碼之多肽序列：SEQ ID NO：248、SEQ ID NO：250及SEQ ID NO：252。
在一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於成纖維細胞活化蛋白(FAP)具有特異性之抗原結合部分。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於FAP具有特異性之第一Fab重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於FAP具有特異性之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在另一 實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於FAP具有特異性之第一Fab輕鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於FAP具有特異性之第二Fab輕鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中FAP對於具有特異性之免疫球蛋白重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵。
在一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與選自由以下組成之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列：SEQ ID NO：41、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：47、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：79、SEQ ID NO：83、SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：103、SEQ ID NO：107、SEQ ID NO：111、SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：119、SEQ ID NO：123、SEQ ID NO：127、SEQ ID NO：131、SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：139、SEQ ID NO：143、SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：151及SEQ ID NO：155或保留功能性之其變體。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與選自由以下組成之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列：SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：49、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：57、SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：73、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：97、SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：105、SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：113、SEQ ID NO：117、SEQ ID NO：121、SEQ ID NO：125、SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：133、SEQ ID NO：137、SEQ ID NO：141、SEQ ID NO：145、SEQ ID NO：149及SEQ ID NO： 153或保留功能性之其變體。在一更具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與選自由以下組成之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列：SEQ ID NO：41、SEQ ID NO：45、SEQ ID NO：47、SEQ ID NO：51、SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：63、SEQ ID NO：67、SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：79、SEQ ID NO：83、SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：103、SEQ ID NO：107、SEQ ID NO：111、SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：119、SEQ ID NO：123、SEQ ID NO：127、SEQ ID NO：131、SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：139、SEQ ID NO：143、SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：151及SEQ ID NO：155或保留功能性之其變體，且包括與選自由以下組成之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列：SEQ ID NO：37、SEQ ID NO：39、SEQ ID NO：43、SEQ ID NO：49、SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：57、SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：65、SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：73、SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：89、SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：97、SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：105、SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：113、SEQ ID NO：117、SEQ ID NO：121、SEQ ID NO：125、SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：133、SEQ ID NO：137、SEQ ID NO：141、SEQ ID NO：145、SEQ ID NO：149及SEQ ID NO：153或保留功能性之其變體。在一實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括SEQ ID NO：41之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：39之輕鏈可變區域序列。在一實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括SEQ ID NO：51之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：49之輕鏈可變區域序列。在一實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括SEQ ID NO：111之重鏈可變區域 序列及SEQ ID NO：109之輕鏈可變區域序列。在一實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括SEQ ID NO：143之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：141之輕鏈可變區域序列。在一實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括SEQ ID NO：151之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：149之輕鏈可變區域序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由與選自由以下組成之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：42、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：52、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：72、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：80、SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：96、SEQ ID NO：100、SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：108、SEQ ID NO：112、SEQ ID NO：116、SEQ ID NO：120、SEQ ID NO：124、SEQ ID NO：128、SEQ ID NO：132、SEQ ID NO：136、SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：144、SEQ ID NO：148、SEQ ID NO：152及SEQ ID NO：156。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由選自由以下組成之群的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：42、SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：52、SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：64、SEQ ID NO：68、SEQ ID NO：72、SEQ ID NO：76、SEQ ID NO：80、SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：88、SEQ ID NO：92、SEQ ID NO：96、SEQ ID NO：100、SEQ ID NO：104、SEQ ID NO：108、SEQ ID NO：112、SEQ ID NO：116、SEQ ID NO：120、SEQ ID NO：124、SEQ ID NO：128、SEQ ID NO：132、SEQ ID NO：136、SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：144、SEQ ID NO：148、SEQ ID NO：152及SEQ ID NO：156。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序 列由與選自由以下組成之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：50、SEQ ID NO：54、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：74、SEQ ID NO：78、SEQ ID NO：82、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：98、SEQ ID NO：102、SEQ ID NO：106、SEQ ID NO：110、SEQ ID NO：114、SEQ ID NO：118、SEQ ID NO：122、SEQ ID NO：126、SEQ ID NO：130、SEQ ID NO：134、SEQ ID NO：138、SEQ ID NO：142、SEQ ID NO：146、SEQ ID NO：150及SEQ ID NO：154。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由選自由以下組成之群的多核苷酸序列編碼：SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：50、SEQ ID NO：54、SEQ ID NO：58、SEQ ID NO：62、SEQ ID NO：66、SEQ ID NO：70、SEQ ID NO：74、SEQ ID NO：78、SEQ ID NO：82、SEQ ID NO：86、SEQ ID NO：90、SEQ ID NO：94、SEQ ID NO：98、SEQ ID NO：102、SEQ ID NO：106、SEQ ID NO：110、SEQ ID NO：114、SEQ ID NO：118、SEQ ID NO：122、SEQ ID NO：126、SEQ ID NO：130、SEQ ID NO：134、SEQ ID NO：138、SEQ ID NO：142、SEQ ID NO：146、SEQ ID NO：150及SEQ ID NO：154。
在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列：SEQ ID NO：209、SEQ ID NO：211、SEQ ID NO：213、SEQ ID NO：217、SEQ ID NO：219、SEQ ID NO：221、SEQ ID NO：223、SEQ ID NO：225、SEQ ID NO：227及SEQ ID NO：229或保留功能性之其變體。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、 97%、98%、99%或100%一致的多肽序列：SEQ ID NO：231、SEQ ID NO：233、SEQ ID NO：235及SEQ ID NO：239或保留功能性之其變體。在一更具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：211或SEQ ID NO：219或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列且包括與SEQ ID NO：233或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列：SEQ ID NO：209、SEQ ID NO：221、SEQ ID NO：223、SEQ ID NO：225、SEQ ID NO：227及SEQ ID NO：229或保留功能性之其變體，且包括與SEQ ID NO：231或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：213及SEQ ID NO：235或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：217及SEQ ID NO：239或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：219及SEQ ID NO：233或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：221及SEQ ID NO：231或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：223及SEQ ID NO：231或保 留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：225及SEQ ID NO：231或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：227及SEQ ID NO：231或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：229及SEQ ID NO：231或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括兩個與SEQ ID NO：211及SEQ ID NO：233或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列：SEQ ID NO：297、SEQ ID NO：301及SEQ ID NO：315或保留功能性之其變體。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列：SEQ ID NO：299、SEQ ID NO：303及SEQ ID NO：317或保留功能性之其變體。在一更具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：297或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：299或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；及與SEQ ID NO：233或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致 之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：301或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：303或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；及與SEQ ID NO：231或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：315或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：317或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；及與SEQ ID NO：233或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：210、SEQ ID NO：212、SEQ ID NO：214、SEQ ID NO：218、SEQ ID NO：220、SEQ ID NO：222、SEQ ID NO：224、SEQ ID NO：226、SEQ ID NO：228及SEQ ID NO：230。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由選自以下之群之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：210、SEQ ID NO：212、SEQ ID NO：214、SEQ ID NO：218、SEQ ID NO：220、SEQ ID NO：222、SEQ ID NO：224、SEQ ID NO：226、SEQ ID NO：228及SEQ ID NO：230。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：232、SEQ ID NO：234、SEQ ID NO：236及SEQ ID NO：240。在另一具體實施例中，免 疫偶聯物包括由選自以下之群之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：232、SEQ ID NO：234、SEQ ID NO：236及SEQ ID NO：240。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：298、SEQ ID NO：302及SEQ ID NO：316。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由選自以下之群之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：298、SEQ ID NO：302及SEQ ID NO：316。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與選自以下之群之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：300、SEQ ID NO：304及SEQ ID NO：318。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由選自以下之群之多核苷酸序列編碼的多肽序列：SEQ ID NO：300、SEQ ID NO：304及SEQ ID NO：318。
在一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於黑素瘤硫酸軟骨素蛋白多糖(MCSP)具有特異性之抗原結合部分。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於MCSP具有特異性之第一Fab重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於MCSP具有特異性之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於MCSP具有特異性之第一Fab輕鏈與IL-2分子共用羧基末端肽鍵，該IL-2分子繼而與對於MCSP具有特異性之第二Fab輕鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於MCSP具有特異性之免疫球蛋白重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵。
在一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：189或SEQ ID NO：193或保留功能性之其變體之序列至少約 80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：191或SEQ ID NO：197或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列。在一更具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：189或SEQ ID NO：193或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列，且包括與SEQ ID NO：191或SEQ ID NO：197或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列。在一更具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：189之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列，且包括與SEQ ID NO：191之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：193之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列，且包括與SEQ ID NO：191之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由與SEQ ID NO：190或SEQ ID NO：194之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由SEQ ID NO：190或SEQ ID NO：194之多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由與SEQ ID NO：192或SEQ ID NO：198之序列至少約80%、85%、 90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由SEQ ID NO：192或SEQ ID NO：198之多核苷酸序列編碼。
在一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：253或SEQ ID NO：257或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與保留功能性之SEQ ID NO：255或SEQ ID NO：261或其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在一更具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：253或SEQ ID NO：257或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列，且包括與SEQ ID NO：255或SEQ ID NO：261或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：253或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列，且包括與SEQ ID NO：255或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：257或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列，且包括與SEQ ID NO：255或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：254或SEQ ID NO：258之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例 中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：254或SEQ ID NO：258之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：256或SEQ ID NO：262之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：256或SEQ ID NO：262之多核苷酸序列編碼之多肽序列。
在一實施例中，免疫偶聯物包括至少一個、通常兩個或更多個對於癌胚抗原(CEA)具有特異性之抗原結合部分。
在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於CEA具有特異性之第一Fab重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於CEA具有特異性之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在另一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於CEA具有特異性之第一Fab重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵，該突變IL-2多肽繼而與對於CEA具有特異性之第二Fab重鏈共用羧基末端肽鍵。在一實施例中，免疫偶聯物包括如下多肽序列：其中對於CEA具有特異性之免疫球蛋白重鏈與突變IL-2多肽共用羧基末端肽鍵。在一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：313或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：311或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列。在一更具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分包括與SEQ ID NO：313或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的重鏈可變區域序列，且包括與SEQ ID NO：311或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、 95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的輕鏈可變區域序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由與SEQ ID NO：314之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之重鏈可變區域序列由SEQ ID NO：314的多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由與SEQ ID NO：312之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致的多核苷酸序列編碼。在另一具體實施例中，免疫偶聯物之抗原結合部分之輕鏈可變區域序列由SEQ ID NO：312的多核苷酸序列編碼。
在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：319或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：321或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列。在另一具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：323或保留功能性之其變體之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的多肽序列。在一更具體實施例中，本發明之免疫偶聯物包括與SEQ ID NO：319或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；與SEQ ID NO：321或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；及與SEQ ID NO：323或保留功能性之其變體至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：320之序 列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：320之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：322之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：322之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由與SEQ ID NO：324之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多核苷酸序列編碼之多肽序列。在另一具體實施例中，免疫偶聯物包括由SEQ ID NO：324之多核苷酸序列編碼之多肽序列。
本發明之抗原結合部分包含彼等具有與SEQ ID NO 23-261(奇數)、297-303(奇數)、311及313(包含其功能片段或變體)中所示之肽序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之序列者。本發明亦涵蓋包括SEQ ID NO 23-261(奇數)、297-303(奇數)、311及313之序列且具有保守胺基酸取代之抗原結合部分。
多核苷酸
本發明進一步提供編碼本文所述之突變IL-2多肽或包括突變IL-2多肽之免疫偶聯物之經分離多核苷酸。
本發明之多核苷酸包含彼等與SEQ ID NO 2、4、5、6、8、9、10、12、13、14、16、17、18、20、21、22、24-262(奇數)、293-296及298-324(奇數)(包含其功能片段或變體)中所示之序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致者。
編碼未連接至非IL-2部分之突變IL-2多肽之多核苷酸通常表示為編碼整個多肽之單一多核苷酸。
在一實施例中，本發明係關於編碼突變IL-2多肽之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼SEQ ID NO：7、11、15或19之突變IL-2序列之序列。本發明亦涵蓋編碼突變IL-2多肽之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼SEQ ID NO：7、11、15或19之突變IL-2多肽且具有保守胺基酸取代之序列。
在另一實施例中，本發明係關於編碼突變IL-2多肽之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括與選自以下之群之核苷酸序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之序列：SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：293、SEQ ID NO：294、SEQ ID NO：295及SEQ ID NO：296。在另一實施例中，本發明係關於編碼突變IL-2多肽之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括選自以下之群之核苷酸序列：SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：293、SEQ ID NO：294、SEQ ID NO：295及SEQ ID NO：296。在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括與選自以下之群之核苷酸序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之核酸序列：SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：293、SEQ ID NO：294、SEQ ID NO：295及SEQ ID NO：296。在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核 苷酸，其中該多核苷酸包括選自以下之群之核酸序列：SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9、SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13、SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17、SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21、SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：293、SEQ ID NO：294、SEQ ID NO：295及SEQ ID NO：296。
本發明之編碼免疫偶聯物之多核苷酸可表示為編碼整個免疫偶聯物之單一多核苷酸或表示為多個(例如，兩個或更多個)共表現之多核苷酸。藉由共表現之多核苷酸編碼之多肽可經由(例如)二硫鍵或其他方式進行締合以形成功能免疫偶聯物。舉例而言，抗原結合部分之重鏈部分可由來自包括抗原結合部分之輕鏈部分及突變IL-2多肽之免疫偶聯物部分的單獨多核苷酸編碼。在共表現時，重鏈多肽與輕鏈多肽締合形成抗原結合部分。另一選擇為，在另一實例中，抗原結合部分之輕鏈部分可由與來自包括抗原結合部分之重鏈部分及突變IL-2多肽之免疫偶聯物部分的單獨多核苷酸編碼。在一實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼包括突變IL-2多肽及抗原結合部分之免疫偶聯物之片段。在一實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼抗原結合部分之重鏈及突變IL-2多肽。在另一實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼抗原結合部分之輕鏈及突變IL-2多肽。
在一具體實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼包括至少一個突變IL-2多肽及至少一個、較佳地兩個或更多個抗原結合部分之免疫偶聯物片段，其中第一突變IL-2多肽與第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵且第二抗原結合部分與第一突變IL-2多肽或第一抗原結合部分共用胺基-或羧基末端肽鍵。在一實施例中，抗原結合部分獨立地選自由以下組成之群：Fv分子、尤其scFv分子及Fab分子。在另一具體實施例中，多核苷酸編碼抗原結合部分中之兩者之重鏈及一個突變IL-2多肽。在另一具體實施例中，多核苷酸編碼抗原結合部 分中之兩者之輕鏈及一個突變IL-2多肽。在另一具體實施例中，多核苷酸編碼抗原結合部分中之一者之一個輕鏈、第二抗原結合部分之一個重鏈及一個突變IL-2多肽。
在另一具體實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼免疫偶聯物之片段，其中該多核苷酸編碼兩個Fab分子之重鏈及突變IL-2多肽。在另一具體實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼免疫偶聯物之片段，其中該多核苷酸編碼兩個Fab分子之輕鏈及突變IL-2多肽。在另一具體實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼免疫偶聯物之片段，其中該多核苷酸編碼一個Fab分子之重鏈、第二Fab分子之輕鏈及突變IL-2多肽。
在一實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼如下免疫偶聯物：其包括至少一個在其胺基-及羧基末端胺基酸處連結至一或多個scFv分子之突變IL-2多肽。
在一實施例中，本發明之經分離多核苷酸編碼免疫偶聯物之片段，其中該多核苷酸編碼免疫球蛋白分子、尤其IgG分子、更特定而言IgG1分子之重鏈及突變IL-2多肽。在一更具體實施例中，經分離多核苷酸編碼免疫球蛋白分子之重鏈及突變IL-2多肽，其中該突變IL-2多肽與免疫球蛋白重鏈共用胺基末端肽鍵。
在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼以下中所示之可變區域序列之序列：SEQ ID NO：23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、231、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、 173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、311或313。在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼以下中所示之多肽序列之序列：SEQ ID NO：199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、297、299、301、303、315、317、319、321或323。在另一實施例中，本發明進一步係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括與以下中所示之核苷酸序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之序列：SEQ ID NO：24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、298、300、302、304、312、314、316、318、320、322或324。在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括以下中所示之核酸序列：SEQ ID NO：24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、 124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、298、300、302、304、312、314、316、318、320、322或324。在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼與以下之胺基酸序列至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之可變區域序列之序列：SEQ ID NO：23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、231、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、311或313。在另一實施例中，本發明係關於編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼與以下之胺基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%一致之多肽序列之序列：SEQ ID NO：199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、297、299、301、303、315、317、319、321或323。本發明涵蓋編碼免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼以下之可變區域序列且具有保守胺基酸取代之序列：SEQ ID NO：23、25、27、29、31、 33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、231、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、311或313。本發明亦涵蓋編碼本發明之免疫偶聯物或其片段之經分離多核苷酸，其中該多核苷酸包括編碼以下之多肽序列且具有保守胺基酸取代之序列：SEQ ID NO：199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、297、299、301、303、315、317、319、321或323。
在某些實施例中，多核苷酸或核酸係DNA。在其他實施例中，本發明之多核苷酸係(例如)呈信使RNA(mRNA)形式之RNA。本發明之RNA可為單鏈或雙鏈。
重組方法
本發明之突變IL-2多肽可藉由缺失、取代、插入或改良使用業內熟知之基因或化學方法製得。基因方法可包含編碼DNA序列之位點特異性誘變、PCR、基因合成及諸如此類。可(例如)藉由測序來證實正確之核苷酸變化。就此而言，原始IL-2之核苷酸序列已由Taniguchi等人進行闡述(Nature 302,305-10(1983))，且編碼人類IL-2之核酸可自公共存儲機構(例如美國典型培養物保藏中心(American Type Culture Collection)(Rockville MD))獲得。原始人類IL-2之序列展示於SEQ ID NO：1中。取代或插入可涉及天然以及非天然胺基酸殘基。胺基酸改良包含化學改良之熟知方法，例如增加糖基化位點或碳水化合物附接 及諸如此類。
本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物可(例如)藉由固態肽合成或重組產生獲得。對於重組產生而言，將一或多個如上所述編碼該突變IL-2多肽或免疫偶聯物(片段)之多核苷酸分離並插入至一或多個載體中以在宿主細胞中進一步選殖及/或表現。可易於使用習用程序分離並測序該多核苷酸。在一實施例中，提供包括本發明之多核苷酸中之一或多者之載體、較佳地表現載體。可使用彼等熟習此項技術者熟知之方法構築體表現載體，該等表現載體含有突變IL-2多肽或免疫偶聯物(片段)之編碼序列以及適當轉錄/轉譯控制信號。該等方法包含活體外重組DNA技術、合成技術及活體內重組/基因重組。例如，參見闡述於以下文獻中之技術：Maniatis等人，MOLECULAR CLONING：A LABORATORY MANUAL,Cold Spring Harbor Laboratory,N.Y.(1989)；及Ausubel等人，CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY,Greene Publishing Associates and Wiley Interscience,N.Y(1989)。表現載體可為質粒、病毒之一部分，或可為核酸片段。表現載體包含表現序列盒，在該表現序列盒中，編碼IL-2突變或免疫偶聯物(片段)之多核苷酸(亦即編碼區域)經選殖與啟動子及/或其他轉錄或轉譯控制要素可操作締合。如本文中所使用，「編碼區域」係由轉譯成胺基酸之密碼子組成之核酸部分。儘管「終止密碼子」(TAG、TGA或TAA)並不轉譯成胺基酸，但其可視為編碼區域之一部分(若存在)，但任一毗鄰序列(例如啟動子、核糖體結合位點、轉錄終止子、內含子、5'及3'非轉譯區域及諸如此類)並不編碼區域之一部分。兩個或更多個編碼區域可存在於單一多核苷酸構築體中(例如位於單一載體上)或單獨多核苷酸構築體中(例如位於單獨(不同)載體上)。另外，任一載體皆可含有單一編碼區域，或可包括兩個或更多個編碼區域，舉例而言，本發明之載體可編碼一或多個多蛋白，該一或多個多蛋白 以後轉譯或共轉譯方式經由溶蛋白性裂解分離成最終蛋白質。此外，本發明之載體、多核苷酸或核酸可編碼異源性編碼區域，該等異源性編碼區域融合或並不融合至編碼本發明之多肽或其變體或衍生物之第一或第二多核苷酸。異源性編碼區域包含但不限於特定要素或基序，例如分泌信號肽或異源性功能結構域。可操作締合係如下情形：以與基因產物之表現處於調節序列之影響或控制下之方式使用於基因產物之編碼區域(例如多肽)與一或多個調節序列進行締合。兩個DNA片段(例如多肽編碼區域及與其有關之啟動子)在以下情形下為「可操作締合」：誘導啟動子功能會引起編碼期望基因產物之mRNA之轉錄，且兩個DNA片段間之鏈接性質並不干擾表現調節序列引導基因產物表現之能力或干擾DNA模板轉錄之能力。因此，若啟動子能夠實現編碼多肽之核酸之轉錄，則啟動子區域與該核酸可操作地締合。啟動子可為僅在預定細胞中引導DNA之實質性轉錄之細胞特異性啟動子。除啟動子外，其他轉錄控制要素(例如增強子、操作子、抑制子及轉錄終止子信號)可與多核苷酸可操作地締合以引導細胞特異性轉錄。適宜啟動子及其他轉錄控制區域揭示於本文中。各種轉錄控制區域已為彼等熟習此項技術者所習知。該等轉錄控制區域包含但不限於在脊椎動物細胞中發揮作用之轉錄控制區域，例如但不限於來自巨細胞病毒(例如立即早期啟動子，與內含子-A連結)、猿猴病毒40(例如早期啟動子)及反轉錄病毒(例如Rous肉瘤病毒)之啟動子及增強子區段。其他轉錄控制區域包含彼等衍生自脊椎動物基因者(例如肌動蛋白、熱激蛋白、牛生長激素及兔β-珠蛋白)、以及能夠控制真核細胞中之基因表現之其他序列。其他適宜轉錄控制區域包含組織特異性啟動子及增強子以及誘導型啟動子(例如誘導型啟動子四環素)。類似地，各種轉譯控制要素已為彼等熟習此項技術者所習知。該等轉譯控制要素包含但不限於核糖體結合位點、轉譯起始及終止密碼子及衍生自病毒系統之 要素(尤其內核糖體進入位點或IRES，亦稱為CITE序列)。表現序列盒亦可包含其他特徵，例如複製起點及/或染色體整合要素(例如反轉錄病毒長末端重複(LTR)或腺相關病毒(AAV)反轉末端重複(ITR))。
本發明之多核苷酸及核酸編碼區域可與編碼分泌或信號肽(其引導由本發明之多核苷酸編碼之多肽之分泌)之其他編碼區域進行締合。舉例而言，若期望突變IL-2多肽之分泌，則可將編碼信號序列之DNA置於編碼突變IL-2之成熟胺基酸之核酸的上游。此同樣適用於本發明之免疫偶聯物或其片段。根據信號假說，由哺乳動物細胞分泌之蛋白質具有信號肽或分泌前導序列，一旦在粗糙內質網中輸出生長蛋白鏈，則該信號肽或分泌前導序列自成熟蛋白質發生裂解。彼等熟習此項技術者應瞭解，由脊椎動物細胞分泌之多肽通常具有融合至多肽之N-末端之信號肽，該信號肽自轉譯之多肽發生裂解而產生分泌或「成熟」形式之多肽。舉例而言，使用多肽之N-末端處之具有20個胺基酸之信號序列轉譯人類IL-2，該信號序列隨後裂解產生具有133個胺基酸之成熟人類IL-2。在某些實施例中，使用原始信號肽(例如IL-2信號肽或免疫球蛋白重鏈或輕鏈信號肽)，或使用依然能夠引導可操作地與該序列締合之多肽之分泌之該序列的功能衍生物。另一選擇為，可使用異源性哺乳動物信號肽或其功能衍生物。舉例而言，野生型前導序列可經人類組織纖維蛋白溶酶原激活劑(TPA)或小鼠β-葡萄糖苷酸酶之前導序列取代。分泌信號肽之實例性胺基酸及多核苷酸序列顯示於SEQ ID NO 236-273中。
在編碼多核苷酸之IL-2突變或免疫偶聯物(片段)之內部或末端處可包含編碼短蛋白質序列之DNA，該短蛋白質序列可用於促進後續純化(例如組胺酸標籤)或有助於標記IL-2突變或免疫偶聯物。
在另一實施例中，提供包括一或多個本發明之多核苷酸之宿主細胞。在某些實施例中，提供包括一或多個本發明之載體之宿主細 胞。多核苷酸及載體可單獨或組合納入本文所述分別與多核苷酸及載體有關之特徵中之任一者。在一該實施例中，宿主細胞包括(例如，已轉化或轉染)含有多核苷酸之載體，該多核苷酸編碼包括本發明中之突變IL-2多肽之胺基酸序列。本文所用之術語「宿主細胞」係指可經改造而生成本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物或其片段之任一類細胞系統。適於複製突變IL-2多肽或免疫偶聯物並支持其表現之宿主細胞已為業內所熟知。該等細胞可視需要經特定表現載體轉染或轉導，且可生長大量含有載體之細胞用於接種大規模發酵罐以獲得足量用於臨床應用之IL-2突變或免疫偶聯物。適宜宿主細胞包含原核微生物(例如大腸桿菌)或各種真核細胞(例如中國倉鼠卵巢細胞(CHO)、昆蟲細胞或諸如此類)。舉例而言，多肽可在細菌中產生，尤其在不需要糖基化時。表現之後，可以可溶性部分形式自細菌細胞漿液分離多肽且可進一步純化。除原核生物外，真核微生物(例如絲狀真菌或酵母)係用於編碼多肽之載體之適宜選殖或表現宿主，包含糖基化路徑已進行「人類化」以產生具有部分地或完全人類糖基化型式之多肽之真菌及酵母菌株。參見Gerngross,Nat Biotech 22,1409-1414(2004)及Li等人，Nat Biotech 24,210-215(2006)。用於表現(糖基化)多肽之適宜宿主細胞亦衍生自多細胞有機體(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包含植物及昆蟲細胞。已鑑別出可連同昆蟲細胞一起使用、尤其用於轉染草地貪夜蛾(Spodoptera frugiperda)細胞之諸多杆狀病毒菌株。植物細胞培養物亦可用作宿主。例如，參見美國專利第5,959,177號、第6,040,498號、第6,420,548號、第7,125,978號及第6,417,429號(闡述用於在轉基因植物中產生抗體之PLANTIBODIESTM技術)。脊椎動物細胞亦可用作宿主。舉例而言，可使用適於在懸浮液中生長之哺乳動物細胞系。有用哺乳動物宿主細胞系之其他實例係經SV40(COS-7)轉化之猴腎CV1細胞系、人類胚腎細胞系(293或293T 細胞，如(例如)Graham等人，J Gen Virol 36,59(1977)中所述)、幼倉鼠腎細胞(BHK)、小鼠支持細胞(TM4細胞，如(例如)Mather,Biol Reprod 23,243-251(1980)中所述)、猴腎細胞(CV1)、非洲綠猴腎細胞(VERO-76)、人類子宮頸上皮癌細胞(HELA)、犬腎細胞(MDCK)、布法羅大鼠(buffalo rat)肝細胞(BRL 3A)、人類肺細胞(W138)、人類肝細胞(Hep G2)、小鼠乳房腫瘤細胞(MMT 060562)、TRI細胞(如(例如)Mather等人，Annals N.Y.Acad Sci 383,44-68(1982)中所述)、MRC 5細胞及FS4細胞。其他有用哺乳動物宿主細胞系包含中國倉鼠卵巢(CHO)細胞，包含dhfr- CHO細胞(Urlaub等人，Proc Natl Acad Sci USA 77,4216(1980))；及骨髓瘤細胞系，例如YO、NS0、P3X63及Sp2/0。關於適於蛋白質產生之某些哺乳動物宿主細胞系之綜述，例如參見Yazaki及Wu，Methods in Molecular Biology，第248卷(B.K.C.Lo編輯，Humana Press,Totowa,NJ)，第255-268頁(2003)。宿主細胞包含培養細胞(僅舉幾個為例，例如哺乳動物培養細胞、酵母細胞、昆蟲細胞、細菌細胞及植物細胞)，但亦包含包括於轉基因動物、轉基因植物或培養植物或動物組織內之細胞。在一實施例中，宿主細胞係真核細胞、較佳地哺乳動物細胞，例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、人類胚胎腎(HEK)細胞或淋巴細胞(例如，Y0、NS0、Sp20細胞)。
業內已知在該等系統中表現外源基因之標準技術。表現融合至抗原結合結構域(例如抗體)之重鏈或輕鏈之突變-IL-2多肽之細胞可經改造以亦表現其他抗體鏈，從而表現之突變IL-2融合產物係具有重鏈及輕鏈之抗體。
在一實施例中，提供產生本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之方法，其中該方法包括在適於表現突變IL-2多肽或免疫偶聯物之條件下培養包括編碼本文所提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物之多核苷酸之宿主細胞，及視需要自該宿主細胞(或宿主細胞培養基)回收該突變IL- 2多肽或免疫偶聯物。
在本發明之某些實施例中，突變IL-2多肽連接至至少一個非IL-2部分。在突變IL-2多肽區段連接至一或多個諸如多肽、蛋白質、碳水化合物、脂質、核酸、多核苷酸等分子或該等分子之組合分子(例如糖蛋白、糖脂等)之情形下，可製得IL-2突變。突變IL-2多肽亦可連接至有機部分、無機部分或醫藥藥物。如本文所使用，醫藥藥物係含有約5,000道爾頓或更小分子量化合物之有機物。突變IL-2多肽亦可連接至包含治療化合物之任一生物藥劑，例如抗腫瘤劑、抗微生物劑、激素、免疫調節劑、抗發炎劑及諸如此類。亦包含放射性同位素，例如彼等用於成像以及用於療法者。
突變IL-2多肽亦可連接至多個相同類型分子或一種以上類型之分子。在某些實施例中，連接至IL-2之分子可賦予使IL-2靶向動物中之特定組織或細胞之能力，且在本文中稱為「靶向部分」。在該等實施例中，靶向部分可對於靶組織或細胞中之配體或受體具有親和力，由此將IL-2引導至靶組織或細胞。在一特定實施例中，靶向部分將IL-2引導至腫瘤。靶向部分包含(舉例而言)對於細胞表面或細胞內蛋白、生物受體之配體及諸如此類具有特異性之抗原結合部分(例如抗體及其片段)。該等抗原結合部分可對於腫瘤相關之抗原(例如本文所述者)具有特異性。
突變IL-2多肽可以基因方式融合至另一多肽(例如單鏈抗體或抗體重鏈或輕鏈(之一部分))，或可以化學方式偶聯至另一分子。突變IL-2多肽與抗體重鏈之一部分之融合闡述於實例中。可設計作為突變IL-2多肽與另一多肽間之融合體之IL-2突變，從而IL-2序列直接融合至多肽或經由鏈接序列間接融合至多肽。鏈接之組成長度可根據業內熟知之方法確定且可測試其效能。IL-2與抗體重鏈間之鏈接序列之實例可參見(例如)SEQ ID NO 209、211、213等中所示之序列。亦可包 含其他序列以納入裂解位點來分離融合體之個體組份(若需要)，例如內肽酶識別序列。此外，IL-2突變或其融合蛋白亦可以化學方式使用業內熟知之多肽合成方法來合成(例如Merrifield固相合成)。可使用熟知之化學偶聯方法以化學方式將突變IL-2多肽偶聯至其他分子(例如另一多肽)。業內熟知之雙功能交聯試劑(例如同源功能及異源功能交聯試劑)可用於此目的。所用交聯試劑之類型取決於擬偶合至IL-2之分子之性質且可易於由彼等熟習此項技術者鑑別。另一選擇為或此外，突變IL-2及/或其意欲偶聯之分子可以化學方式進行衍生從而二者可在業內亦熟知之單獨反應中進行偶聯。
在某些實施例中，突變IL-2多肽連接至一或多個至少包括能夠結合抗原決定簇之抗體可變區域之抗原結合部分(亦即免疫偶聯物之一部分)。可變區域可形成天然或非天然存在之抗體及其片段之一部分並衍生自該等天然或非天然存在之抗體及其片段。產生多株抗體及單株抗體之方法已為業內所熟知(例如，參見Harlow及Lane，「Antibodies,a laboratory manual」,Cold Spring Harbor Laboratory,1988)。非天然存在之抗體可使用固相肽合成來構築體，可以重組方式產生(例如，如美國專利第4,186,567號中所述)或可(例如)藉由篩選包括可變重鏈及可變輕鏈之組合文庫獲得(例如，參見頒予McCafferty之美國專利第5,969,108號)。免疫偶聯物、抗原結合部分及其產生方法亦詳細闡述於PCT公開案第WO 2011/020783號中，其全部內容以引用方式併人本文中。
抗體、抗體片段、抗原結合結構域或可變區域之任一動物物種皆可連接至突變IL-2多肽。用於本發明中之非限制性抗體、抗體片段、抗原結合結構域或可變區域可來自鼠類動物、靈長類動物或人類來源。若突變IL-2/抗體偶聯物或融合體意欲用於人類應用，則可使用嵌合形式之抗體，其中抗體之恆定區域來自人類。人類化或完全人類 形式之抗體亦可根據業內熟知之方法來製備(例如，參見頒予Winter之美國專利第5,565,332號)。可藉由各種方法來達成人類化，包含但不限於(a)將非人類(例如，供體抗體)CDR接枝於保留或不保留關鍵性框架殘基之人類(例如接受者抗體)框架及恆定區域(例如彼等對於保留良好抗原結合親和力或抗體功能較為重要者)，(b)僅將非人類特異性決定區域(SDR或a-CDR；對於抗體-抗原相互作用較為關鍵之殘基)接枝於人類框架及恆定區域上，或(c)移植整個非人類可變結構域，但使用人類樣部分藉由代替表面殘基將其「覆蓋」。人類化抗體及其製備方法參見(例如)Almagro及Fransson，Front Biosci 13,1619-1633(2008)中，且進一步闡述於(例如)以下文獻中：Riechmann等人，Nature 332,323-329(1988)；Queen等人，Proc Natl Acad Sci USA 86,10029-10033(1989)；美國專利第5,821,337號、第7,527,791號、第6,982,321號及第7,087,409號；Jones等人，Nature 321,522-525(1986)；Morrison等人，Proc Natl Acad Sci 81,6851-6855(1984)；Morrison及Oi,Adv Immunol 44,65-92(1988)；Verhoeyen等人，Science 239,1534-1536(1988)；Padlan,Molec Immun 31(3),169-217(1994)；Kashmiri等人，Methods 36,25-34(2005)(闡述SDR(a-CDR)接枝)；Padlan,Mol Immunol 28,489-498(1991)(闡述「表面重修」)；Dall'Acqua等人，Methods 36,43-60(2005)(闡述「FR重排」)；及Osbourn等人，Methods 36,61-68(2005)及Klimka等人，Br J Cancer 83,252-260(2000)(闡述FR重排之「引導選擇」方式)。可使用業內已知之各種技術產生人類抗體及人類可變區域。人類抗體概述於van Dijk及van de Winkel，Curr Opin Pharmacol 5,368-74(2001)及Lonberg,Curr Opin Immunol 20,450-459(2008)中。人類可變區域可形成藉由雜交瘤方法製得之人類單株抗體之一部分並衍生自該人類單株抗體(例如，參見Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications，第51-63頁(Marcel Dekker公司，New York,1987))。亦可藉由以下方式來製備人類抗體及人類可變區域：將免疫原投與已進行修飾而因應抗原激發產生具有人類可變區域之完整人類抗體或完整抗體之轉基因動物(例如，參見Lonberg,Nat Biotech 23,1117-1125(2005))。亦可藉由分離選自人類源噬菌體顯示文庫之Fv純系可變區域序列來生成人類抗體及人類可變區域(例如，參見Hoogenboom等人，Methods in Molecular Biology 178,1-37(O'Brien等人編輯，Human Press,Totowa,NJ,2001)；及McCafferty等人，Nature 348,552-554；Clackson等人，Nature 352,624-628(1991))。噬菌體通常顯示呈單鏈Fv(scFv)片段或Fab片段形式之抗體片段。藉由噬菌體顯示製備用於免疫偶聯物之抗原結合部分之詳細闡述可參見PCT公開案第WO 2011/020783號所隨附的實例中。
在某些實施例中，根據(例如)PCT公開案第WO 2011/020783號(參見與親和力成熟相關之實例)或美國專利申請公開案第2004/0132066號(其全部內容以引用方式併入本文中)中所揭示之方法，改造用於本發明中之抗原結合部分以具有增強之結合親和力。可經由酶聯免疫吸附分析(ELISA)或熟習此項技術者熟知之其他技術(例如表面電漿共振技術(在BIACORE T100系統上分析)(Liljeblad等人，Glyco J 17,323-329(2000))及傳統結合分析(Heeley,Endocr Res 28,217-229(2002)))來量測本發明之免疫偶聯物結合特異性抗原決定簇之能力。可使用競爭分析鑑別與參考抗體競爭結合特定抗原之抗體、抗體片段、抗原結合結構域或可變結構域，例如與L19抗體競爭結合纖維連接蛋白之額外結構域B(EDB)之抗體。在某些實施例中，此一競爭抗體結合藉由參考抗體結合之相同表位(例如線性或構象表位)。定位抗體所結合之表位之詳細實例性方法提供於Morris(1996)「Epitope Mapping Protocols」,Methods in Molecular Biology第66卷(Humana Press, Totowa,NJ)中。在實例性競爭分析中，將固定抗原(例如EDB)在如下溶液中培育：其包括結合抗原之第一標記抗體(例如L19抗體)及第二未標記抗體(測試其與第一抗體競爭結合抗原之能力)。第二抗體可存在於雜交瘤上清液中。作為對照，將固定抗原在包括第一標記抗體但並不包括第二未標記抗體之溶液中培育。在允許第一抗體與抗原結合之條件下培育之後，去除過量之未結合抗體，且量測與固定抗原締合之標記之量。若與固定抗原締合之標記之量相對於對照試樣在測試試樣中實質上有所減小，則此表明第二抗體與第一抗體競爭結合抗原。參見Harlow及Lane(1988)Antibodies：A Laboratory Manual ch.14(Cold Spring Harbor實驗室，Cold Spring Harbor,NY)。
可期望本發明之IL-2突變或免疫偶聯物之另一化學改良。舉例而言，可藉由偶聯至實質上直鏈聚合物(例如聚乙二醇(PEG)或聚丙二醇(PPG))來改良免疫原性及短半衰期之問題(例如，參見WO 87/00056)。
可藉由業內已知之技術來純化如本文所述製得之IL-2突變及免疫偶聯物，例如高效液相層析、離子交換層析、凝膠電泳、親和層析、尺寸排除層析及諸如此類。用於純化特定蛋白質之實際條件部分地取決於諸如靜電荷、疏水性、親水性等因素，且為彼等熟習此項技術者所易知。對於親和層析純化而言，可使用結合突變IL-2多肽或免疫偶聯物之抗體、配體、受體或抗原。舉例而言，可使用特異性結合突變IL-2多肽之抗體。對於本發明之免疫偶聯物之親和層析純化而言，可使用具有蛋白質A或蛋白質G之基質。舉例而言，可基本上如實例中所述連續使用蛋白質A或G親和層析及尺寸排除層析來分離免疫偶聯物。可藉由各種熟知分析方法中之任一者來測定突變IL-2多肽及其融合蛋白之純度，包含凝膠電泳、高壓液相層析及諸如此類。舉例而言，如實例中所述表現之重鏈融合蛋白展示為完整蛋白質並進行適當 組合，如藉由還原SDS-PAGE所示(例如，參見圖14)。兩個條帶係在大約Mr 25,000及Mr 60,000(對應於免疫球蛋白輕鏈及重鏈/IL-2融合蛋白之預計分子量)下拆分。
分析
可藉由業內已知之各種分析針對物理/化學性質及/或生物活性對本文所提供之突變IL-2多肽及免疫偶聯物進行鑑別、篩選或描述。
親和力分析
可根據實例中所示之方法藉由表面電漿共振(SPR)使用標準設備(例如BIAcore儀器(GE Healthcare))來測定突變或野生型IL-2多肽對於各種形式IL-2受體之親和力，且受體亞單位(例如)可藉由重組表現獲得(例如，參見Shanafelt等人，Nature Biotechnol 18,1197-1202(2000))。可藉由將亞單位中之每一者融合至藉由凸起與孔洞技術修飾之抗體Fc結構域單體來生成重組IL-2受體β/γ-亞單位異源二聚體(例如，參見美國專利第5,731,168號)以促進適當受體亞單位/Fc融合蛋白之異源二聚化(參見SEQ ID NO 102及103)。另一選擇為，可使用已知表現一種受體形式或另一受體形式之細胞系評估IL-2突變對於不同形式IL-2受體之結合親和力。用於量測結合親和力之具體說明性及實例性實施例闡述於下文及下列實例中。根據一實施例，藉由表面電漿共振使用BIACORE® T100機器(GE Healthcare)在25℃下使用固定於CM5晶片上之IL-2受體來量測KD。簡言之，根據供應商說明書，使用N-乙基-N'-(3-二甲基胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)來活化羧甲基化之右旋糖酐生物感測器晶片(CM5,GE Healthcare)。使用10mM乙酸鈉(pH 5.5)將重組IL-2受體稀釋至0.5-30μg/ml，然後以10μl/分鐘之流速注射以達成大約200-1000(對於IL-2R α-亞單位而言)或500-3000(對於IL-2R βγ凸起與孔洞異源二聚體而言)反應單位(RU)之偶合蛋白。注射IL-2受體之後，注射1M乙醇胺以封 阻未反應基團。對於動力學量測而言，在25℃下以大約30μl/min之流速在HBS-EP+(GE Healthcare，10mM HEPES，150mM NaCl，3mM EDTA，0.05%表面活性劑P20，pH 7.4)中注射突變IL-2多肽或免疫偶聯物之三倍連續稀釋液(介於約0.3nM至300nM之間)。使用簡單一對一Langmuir結合模型(BIACORE ® T100，評估軟體，版本1.1.1)藉由同時擬合締合及解離感測圖譜來計算締合速率(kon)及解離速率(koff)。平衡解離常數(KD)按比率koff/kon進行計算。例如，參見Chen等人，J.Mol Biol 293,865-881(1999)。
可容易地(例如)藉由ELISA或藉由表面電漿共振(SPR)使用標準設備(例如BIAcore儀器(GE Healthcare))來測定本發明之免疫偶聯物與Fc受體之結合，且Fc受體(例如)可藉由重組表現獲得。另一選擇為，可使用已知表現特定Fc受體之細胞系(例如表現FcγIIIa受體之NK細胞)來評估Fc結構域或包括Fc結構域之免疫偶聯物對於Fc受體之結合親和力。根據一實施例，藉由表面電漿共振使用BIACORE® T100機器(GE Healthcare)在25℃下使用固定於CM5晶片上之Fc受體來量測KD。簡言之，根據供應商說明書，使用N-乙基-N'-(3-二甲基胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基琥珀醯亞胺(NHS)來活化羧甲基化之右旋糖酐生物感測器晶片(CM5,GE Healthcare)。使用10mM乙酸鈉(pH 5.5)將重組Fc受體稀釋至0.5-30μg/ml，然後以10μl/分鐘之流速注射以達成大約100-5000個反應單位(RU)之偶聯蛋白。注射Fc受體之後，注射1M乙醇胺以封阻未反應基團。對於動力學量測而言，在25℃下以大約30-50μl/min之流速在HBS-EP+(GE Healthcare，10mM HEPES，150mM NaCl，3mM EDTA，0.05%表面活性劑P20，pH 7.4)中注射免疫偶聯物之三倍至五倍連續稀釋液(介於約0.01nM至300nM之間)。使用簡單一對一Langmuir結合模型(BIACORE ® T100，評估軟體，版本1.1.1)藉由同時擬合締合及解離感測圖譜來計算締合速 率(kon)及解離速率(koff)。平衡解離常數(KD)按比率koff/kon進行計算。例如，參見Chen等人，J.Mol Biol 293,865-881(1999)。
活性分析
可藉由分析發生於受體結合下游之免疫活化之效應來間接量測IL-2突變結合IL-2受體之能力。
在一態樣中，提供鑑別具有生物活性之突變IL-2多肽之分析。生物活性可包含(例如)：能夠誘導具有IL-2受體之T及/或NK細胞之增殖，能夠誘導具有IL-2受體之T及/或NK細胞中之IL-2信號傳導，能夠藉由NK細胞生成作為二級細胞因子之干擾素(IFN)-γ，減小誘導藉由周邊血單核細胞(PBMC)產生二級細胞因子-尤其IL-10及TNF-α之能力，減小誘導T細胞中之細胞凋亡之能力，能夠誘導腫瘤消退及/或改良存活率，及減小活體內之毒性特徵、尤其減小血管滲透性。亦提供在活體內及/或在活體外具有該生物活性之突變IL-2多肽。
在某些實施例中，測試本發明之突變IL-2多肽之該生物活性。業內熟知測定IL-2之生物活性之各種方法，且許多該等方法之細節亦揭示於該等方法之隨附實例中。實例提供用於測試本發明之IL-2突變藉由NK細胞生成IFN-γ之能力之適宜分析。將培養之NK細胞與本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物一起培育，且隨後藉由ELISA量測培養基中之IFN-γ濃度。
IL-2誘導之信號傳導會誘導若干信號傳導路徑，且涉及JAK(Janus激酶)及STAT(信號轉導子及轉錄活化劑)信號傳導分子。IL-2與受體β-及γ-亞單位之相互作用引起受體及JAK1與JAK3之磷酸化，JAK1與JAK3分別與β-及γ亞單位有關。STAT5然後與磷酸化受體締合且本身在關鍵酪胺酸殘基上磷酸化。此導致STAT5與受體解離，STAT5發生二聚化且STAT5二聚體移位至細胞核，在此STAT5二聚體促進靶基因之轉錄。因此，可(例如)藉由量測STAT5之磷酸化來評價 突變IL-2多肽經由IL-2受體誘導信號傳導之能力。此方法之細節揭示於實例中。使用本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物處理PBMC且藉由流式細胞術測定磷酸化STAT5之含量。
可藉由以下方式來量測T細胞或NK細胞因應IL-2之增殖：將自血液分離之T細胞或NK細胞與本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物一起培育，隨後測定經處理細胞之裂解物中之ATP含量。在處理之前，可使用植物血球凝集素(PHA-M)預刺激T細胞。實例中所述之此分析容許靈敏地量化活細胞之數量，然而，業內已知多種適宜之替代分析(例如[3H]-胸苷納入分析、Cell Titer Glo ATP分析、Alamar Blue分析、WST-1分析、MTT分析)。
用於測定T細胞之細胞凋亡及AICD之分析亦提供於實例中，其中在將T細胞與本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物一起培育之後使用誘導細胞凋亡之抗體處理T細胞，且藉由磷脂醯基絲胺酸/膜聯蛋白暴露之流式細胞術檢測來量化細胞凋亡性細胞。業內已知其他分析。
可在業內已知之各種動物腫瘤模型中評價突變IL-2對於腫瘤生長及存活率之效應。舉例而言，可將人類癌細胞系之異種移植物植入免疫缺陷型小鼠中，並使用本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物處理，如實例中所述。
可基於死亡率、生活觀察(不良效應之可見症狀，例如行為、體重、體溫)及臨床與解剖病理學(例如血液化學值量測及/或組織病理學分析)來測定本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物在活體內之毒性。
可在預處理血管滲透性動物模型中檢驗藉由使用IL-2進行處理誘導之血管滲透性。一般而言，將本發明之IL-2突變或免疫偶聯物投與適宜動物(例如小鼠)，且隨後向動物注射血管滲漏報導子分子，血管滲漏報導子分子自脈管系統之散佈反映了血管滲透性之程度。血管滲漏報導子分子較佳地足夠大以展現使用用於預處理之野生型形式IL-2 之滲透性。血管滲漏報導子分子之實例可為血清蛋白，例如白蛋白或免疫球蛋白。舉例而言，較佳地使用放射性同位素以可檢測方式標記血管滲漏報導子分子以促進分子組織分佈之定量測定。可針對各種內部身體器官(例如肝、肺及諸如此類)、以及腫瘤(包含異種移植之腫瘤)中之任一者中存在之血管來量測血管滲透性。肺係用於量測全長IL-2突變之血管滲透性之較佳器官。
組合物、調配物及投與途徑
在另一態樣中，本發明提供(例如)用於下文治療方法中之任一者之醫藥組合物，其包括本文所提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物中之任一者。在一實施例中，醫藥組合物包括本文所提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物中之任一者及醫藥上可接受之載劑。在另一實施例中，醫藥組合物包括本文所提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物中之任一者及至少一種其他治療劑(例如，如下所述)。
進一步提供產生呈適於在活體內投與之形式之本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之方法，該方法包括(a)獲得本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物，及(b)將該突變IL-2多肽或免疫偶聯物與至少一種醫藥上可接受之載劑一起調配，藉此調配突變IL-2多肽或免疫偶聯物之製劑以用於在活體內投與。
本發明之醫藥組合物包括治療有效量之一或多種溶解或分散於醫藥上可接受之載劑中之突變IL-2多肽或免疫偶聯物。片語「醫藥或藥理學可接受」係指如下分子實體及組合物：在視需要投與諸如人類等動物時在所用劑量及濃度下通常對接受者無毒，亦即並不產生不良、過敏或其他不適反應。彼等熟習此項技術者根據本揭示內容已知含有至少一種突變IL-2多肽或免疫偶聯物及視需要其他活性成份之醫藥組合物之製備，如藉由Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing公司，1990(以引用方式併入本文中)所例示。另 外，對於動物(例如，人類)投與而言，應理解，製劑應符合FDA Office of Biological Standards或其他國家中之相應當局所需之無菌性、致熱原性、一般安全性及純度標準。較佳組合物係凍乾之調配物或水溶液。實例性IL-2組合物闡述於美國專利第4,604,377號及第4,766,106號中。本文所用之術語「醫藥上可接受之載劑」包含如熟習此項技術者已知之任一及所有溶劑、緩衝劑、分散介質、包衣、表面活性劑、抗氧化劑、防腐劑(例如，抗細菌劑、抗真菌劑)、等滲劑、吸收延遲劑、鹽、防腐劑、蛋白質、藥物、藥物穩定劑、聚合物、凝膠、黏合劑、賦形劑、崩解劑、潤滑劑、甜味劑、矯味劑、染料、該等類似材料及其組合(例如，參見Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing公司，1990，第1289-1329頁，其以引用方式併入本文中)。除任何與活性成份不相容之習用載劑外，本發明涵蓋其於治療或醫藥組合物中之用途。
端視組合物欲以固體、液體抑或氣溶膠形式投與、及組合物是否需要無菌來以注射形式用於該等投與途徑，組合物可包括不同類型之載劑。本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物(及任一其他治療劑)可以熟習此項技術者已知之以下方法投與：靜脈內、皮內、動脈內、腹膜腔內、病灶內、顱內、關節內、前列腺內、脾內、腎內、胸膜內、氣管內、鼻內、玻璃體內、陰道內、直腸內、瘤內、肌內、腹膜腔內、皮下、結膜下、胞膜內、經黏膜、心包內、臍內、眼內、經口、局部(topically、locally)、藉由吸入(例如氣溶膠吸入)、注射、輸注、連續輸注、直接局部灌注浸浴靶細胞、經由導管、經由灌洗、乳霜、脂質組合物(例如脂質體)或藉由其他方法或上述方法之任一組合(例如，參見Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing公司，1990，其以引用方式併入本文中)。非經腸投與、特定而言靜脈內注射最常用於投與諸如本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯 物等多肽分子。
非經腸組合物包含經設計用於藉由注射投與者，例如經皮下、皮內、病灶內、靜脈內、動脈內、肌內、鞘內或腹膜腔內注射。對於注射而言，本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物可調配在水溶液中，較佳調配在諸如漢克氏溶液(Hanks' solution)、林格氏溶液(Ringer's solution)或生理鹽水緩衝劑等生理相容緩衝劑中。該溶液可含有調配劑，諸如懸浮劑、穩定劑及/或分散劑。或者，突變IL-2多肽及免疫偶聯物可呈粉末形式，在使用前使用適宜媒劑(例如滅菌無熱原水)構成。藉由將所需量之本發明之IL-2多肽或免疫偶聯物與(視需要)下文列示之各種其他成份一起納入適當溶劑中來製備滅菌可注射溶液。例如經由滅菌過濾膜過濾可輕易達成滅菌性。通常，分散液係由各種經滅菌活性成份納入含有基本分散介質及/或其他成份之滅菌媒劑中製備。在用於製備滅菌可注射溶液、懸浮液或乳液之滅菌粉末之情形，較佳製備方法為真空乾燥或冷凍乾燥技術，其由先前經滅菌過濾之液體介質產生活性成份及任何其他所欲成份之粉末。若需要，液體介質應經適當緩衝，且在注射之前先使用足夠鹽水或葡萄糖使液體稀釋劑成為等滲。組合物在製造及儲存條件下必須穩定，且必須防止諸如細菌及真菌等微生物之污染作用。應瞭解，內毒素污染應保持最小在安全量，例如小於0.5ng/mg蛋白質。適宜醫藥上可接受之載劑包含(但不限於)：緩衝劑，例如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；抗氧化劑，包含抗壞血酸及甲硫胺酸；防腐劑(例如氯化十八烷基二甲基苄基銨；氯化六甲雙銨(hexamethonium chloride)；氯化苄烷銨(benzalkonium chloride)；氯化苯銨松寧(benzethonium chloride)；苯酚；丁醇或苄醇；對羥基苯甲酸烷基酯，例如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯；兒茶酚；間苯二酚；環己醇；3-戊醇；及間甲酚)；低分子量(少於約10個殘基)多肽；蛋白質，例如血清白蛋白、明 膠或免疫球蛋白；親水性聚合物，例如聚乙烯吡咯啶酮；胺基酸，例如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺酸、組胺酸、精胺酸或離胺酸；單糖、雙糖及其他碳水化合物，包含葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，例如EDTA；糖，例如蔗糖、甘露糖醇、海藻糖或山梨醇；鹽形成抗衡離子，例如鈉；金屬錯合物(例如Zn-蛋白質錯合物)；及/或非離子型表面活性劑，例如聚乙二醇(PEG)。水性注射懸浮液可含有增加懸浮液黏度之化合物，例如羧甲基纖維素鈉、山梨醇、右旋糖酐或諸如此類。視需要，懸浮液亦可含有適宜穩定劑或增加該等化合物溶解性之劑以能夠製備高濃度溶液。另外，該等活性化合物之懸浮液可製備成適宜之油性注射懸浮液。適宜之親脂性溶劑或媒劑包含脂肪油(例如芝麻油)或合成脂肪酸酯(例如油酸乙酯或甘油三酯)或脂質體。
活性成份可裝入分別(例如)藉由凝聚技術或藉由界面聚合製得之微膠囊中，例如，羥甲基纖維素或明膠微膠囊及聚(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊，此等系統呈膠體藥物遞送系統(例如，脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米顆粒及奈米膠囊)或粗滴乳液形式。該等技術揭示於Remington's Pharmaceutical Sciences(第18版，Mack Printing公司，1990)中。可製備緩釋製劑。緩釋製劑之適宜實例包含含有多肽之固體疏水性聚合物之半滲透性基質，該等基質係呈成形物件形式，例如膜或微膠囊。在特定實施例中，可藉由在組合物中使用延遲吸收之藥劑(例如，單硬脂酸鋁、明膠或其組合)來延長吸收可注射組合物。
除上述組合物外，免疫偶聯物亦可調配成儲積製劑。該等長效調配物可藉由植入(例如，經皮下或肌內)或藉由肌內注射投與。因此，舉例而言，突變IL-2多肽及免疫偶聯物可使用適宜聚合或疏水性材料(例如作為存於可接受油中之乳液)或離子交換樹脂調配，或作為微溶衍生物(例如，微溶鹽)。
可藉助習用混合、溶解、乳化、囊封、包埋或凍乾過程來製造 包括本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物之醫藥組合物。醫藥組合物可以習用方式使用一或多種生理上可接受且有利於將蛋白質處理成可用於醫藥之製劑的載劑、稀釋劑、賦形劑或輔助劑加以調配。適當調配物端視所選投與途徑而定。
可將突變IL-2多肽及免疫偶聯物調配成游離酸或鹼、中性或鹽形式之組合物。醫藥上可接受之鹽係實質上維持游離酸或鹼之生物活性之鹽。該等鹽包含酸加成鹽，例如，彼等使用蛋白組合物之游離胺基形成者，或使用無機酸(例如，鹽酸或磷酸)或有機酸(例如，乙酸、草酸、酒石酸或苦杏仁酸)形成者。使用游離羧基形成之鹽亦可衍生自諸如氫氧化鈉、氫氧化鉀、氫氧化銨、氫氧化鈣或氫氧化鐵等無機鹼或諸如異丙胺、三甲胺、組胺酸或普魯卡因(procaine)等有機鹼。醫藥鹽往往較相應游離鹼形式更易溶於水性及其他質子溶劑中。
治療方法及組合物
本文所提供突變IL-2多肽及免疫偶聯物中之任一者皆可用於治療方法中。本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物可作為免疫治療劑(例如)用於治療癌症。
為用於治療方法中，以與良好醫學實踐一致之方式來調配、投用及投與本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物。在此方面，需考慮之因素包含所治療之特定病症、所治療之特定哺乳動物、個體患者之臨床病狀、病症起因、藥劑之遞送位點、投與方法、投與時間安排及從業醫師已知之其他因素。
本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物可用於治療刺激宿主之免疫系統有益之疾病狀態，尤其係期望增強細胞免疫反應之病狀。該等病狀可包含宿主免疫反應不足或缺失之疾病狀態。可投與本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之疾病狀態包括(例如)細胞免疫反應係用於特異性免疫性之關鍵機制的腫瘤或感染。可使用本發明之IL-2突變之具 體疾病狀態包含癌症(例如腎細胞上皮癌或黑素瘤)、具體而言HIV-陽性患者、免疫阻抑患者中之免疫缺陷、慢性感染及諸如此類。本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物可自身或以任一適宜醫藥組合物形式投與。
在一態樣中，提供本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物用作藥劑。在其他態樣中，提供本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物用於治療疾病。在某些實施例中，提供本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物用於治療方法中。在一個實施例中，本發明提供本文所述的突變IL-2多肽或免疫偶聯物用於治療有需要個體之疾病。在某些實施例中，本發明提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物用於一種治療患有疾病之個體之方法，該方法包括向該個體投與治療有效量之突變IL-2多肽或免疫偶聯物。在某些實施例中，擬治療之疾病係增殖性病症。在一個較佳實施例中，該疾病係癌症。在某些實施例中，該方法進一步包括向該個體投與治療有效量之至少一種其他治療劑，例如抗癌劑，若擬治療之疾病係癌症。在其他實施例中，本發明提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物用於刺激免疫系統。在某些實施例中，本發明提供突變IL-2多肽或免疫偶聯物用於一種刺激個體之免疫系統之方法，其包括向該個體投與有效量之突變IL-2多肽或免疫偶聯物以刺激免疫系統。根據上述實施例中之任一者，「個體」係哺乳動物，較佳係人類。根據上述實施例中之任一者，「刺激免疫系統」可包含以下之任一者或多者：普遍增加免疫功能、增加T細胞功能、增加B細胞功能、恢復淋巴細胞功能、增加IL-2受體之表現、增加T細胞反應性、增加天然殺手細胞活性或淋巴因子活化之殺手(LAK)細胞活性，及諸如此類。
在另一態樣中，本發明提供本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之用途，用於製造或製備治療有需要個體之疾病之藥劑。在一個實施例中，該藥劑用於一種治療疾病之方法，該方法包括向患有疾病之個 體投與治療有效量之該藥劑。在某些實施例中，擬治療之疾病係增殖性病症。在一個較佳實施例中，該疾病係癌症。在一個該實施例中，該方法進一步包括向該個體投與治療有效量之至少一種其他治療劑，例如抗癌劑，若擬治療之疾病係癌症。在另一實施例中，該藥劑用於刺激免疫系統。在另一實施例中，該藥劑用於一種刺激個體之免疫系統之方法中，該方法包括向該個體投與有效量之該藥劑以刺激免疫系統。根據上述實施例中之任一者，「個體」可為哺乳動物，較佳係人類。根據上述實施例中之任一者，「刺激免疫系統」可包含以下之任一者或多者：普遍增加免疫功能、增加T細胞功能、增加B細胞功能、恢復淋巴細胞功能、增加IL-2受體之表現、增加T細胞反應性、增加天然殺手細胞活性或淋巴因子活化之殺手(LAK)細胞活性，及諸如此類。
在另一態樣中，本發明提供治療個體之疾病之方法，該方法包括向該個體投與治療有效量之本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物。在一實施例中，向該個體投與組合物，該組合物包括呈醫藥上可接受之形式之本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物。在某些實施例中，擬治療疾病係增殖性病症。在一較佳實施例中，該疾病係癌症。在某些實施例中，該方法進一步包括向該個體投與治療有效量之至少一種其他治療劑(例如，若該擬治療疾病係癌症，則該其他治療劑為抗癌藥)。在另一態樣中，本發明提供刺激個體之免疫系統之方法，該方法包括向該個體投與有效量之突變IL-2多肽或免疫偶聯物以刺激免疫系統。根據上述實施例中之任一者，「個體」可為哺乳動物，較佳係人類。根據上述實施例中之任一者，「刺激免疫系統」可包含以下中之任一者或多者：普遍增加免疫功能、增加T細胞功能、增加B細胞功能、恢復淋巴細胞功能、增加IL-2受體之表現、增加T細胞反應性、增加天然殺手細胞活性或淋巴因子活化之殺手(LAK)細胞活性及 諸如此類。
應理解，可使用本發明之免疫偶聯物代替突變IL-2多肽或與該突變IL-2多肽一起來實施上述治療方法中之任一者。
在某些實施例中，擬治療疾病係增殖性病症，較佳係癌症。癌症之非限制性實例包含膀胱癌、腦癌、頭頸癌、胰腺癌、肺癌、乳癌、卵巢癌、子宮癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、食道癌、結腸癌、結腸直腸癌、直腸癌、胃癌、前列腺癌、血癌、皮膚癌、鱗狀細胞上皮癌、骨癌及腎癌。可使用本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物治療之其他細胞增殖病症包含但不限於位於以下中之贅瘤：腹部、骨、乳腺、消化系統、肝、胰腺、腹膜、內分泌腺(腎上腺、甲狀旁腺、垂體、睾丸、卵巢、胸腺、甲狀腺)、眼睛、頭頸部、神經系統(中樞及周圍)、淋巴系統、骨盆、皮膚、軟組織、脾、胸腔區及泌尿生殖系統。亦包含癌前期病狀或病變及癌症轉移。在某些實施例中，癌症選自由以下組成之群：腎細胞癌、皮膚癌、肺癌、結腸直腸癌、乳癌、腦癌、頭頸癌。類似地，亦可藉由本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物來治療其他細胞增殖病症。該等細胞增殖病症之實例包含但不限於高丙種球蛋白血症、淋巴組織增殖性病症、副蛋白血症、紫癜、結節病、賽雜瑞氏症候群(Sezary Syndrome)、瓦爾登斯特倫氏巨球蛋白血症(Waldenstron's Macroglobulinemia)、高歇氏病(Gaucher's Disease)、組織細胞增多病及位於上述列示之器官系統中之除贅瘤外之任何其他細胞增殖疾病。在另一實施例中，該疾病係關於自體免疫、移植排斥、創傷後免疫反應及感染性疾病(例如HIV)。更具體而言，突變IL-2多肽及免疫偶聯物可用於消除涉及免疫細胞介導之病症(包含淋巴瘤、自體免疫、移植排斥、移植物抗宿主疾病、缺血及中風)之細胞。熟習此項技術者易於認識到，在許多情形下，突變IL-2多肽或免疫偶聯物不能治癒疾病，而僅可提供部分益處。在一些實施例中，具 有一些益處之生理學變化亦視為治療有益。因此，在一些實施例中，突變IL-2多肽或免疫偶聯物之提供生理學變化之量視為「有效量」或「治療有效量」。需要治療之個體(subject、individual)或患者通常係哺乳動物，更具體而言係人類。
本發明之免疫偶聯物亦用作診斷試劑。可易於藉由使用對於IL-2多肽具有特異性之二級抗體來檢測免疫偶聯物與抗原決定簇之結合。在一實施例中，二級抗體及免疫偶聯物促進了免疫偶聯物與位於細胞或組織表面上之抗原決定簇之結合之檢測。
在一些實施例中，將有效量之本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物投與細胞。在其他實施例中，將治療有效量之本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物投與個體以用於治療疾病。
為預防或治療疾病，本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之適當劑量(在單獨使用或與一或多種其他治療劑組合使用時)取決於以下因素：擬治療疾病之類型、投與途徑、患者之體重、多肽類型(例如非偶聯IL-2或免疫偶聯物)、疾病之嚴重程度及病程、投與抗體係用於預防目的抑或治療目的、先前或同時之治療幹預、患者之臨床史及對於突變IL-2多肽或免疫偶聯物之反應及主治醫師之決定。。在任一情形下，負責投與之執業醫師將決定組合物中活性成份之濃度及用於各個體之適當劑量。本文涵蓋各種投藥方案，包含但不限於單一投與或在各個時間點多次投與、濃注投與及脈衝輸注。
非偶聯IL-2之單一投與可投與介於約50,000IU/kg至約1,000,000IU/kg之間或更高、更通常約600,000IU/kg之IL-2。此可每天重複若干次(例如2-3次)並保持若干天(例如連續約3-5天)，且然後可在停藥期(例如，約7-14天)之後重複一或多次。因此，治療有效量可包括僅單一投與或在一定時間內之多個投與(例如在約10-20天時間內約20-30次個別投與，每次給予約600,000IU/kg之IL-2)。在以免疫偶聯物之形式 投與時，治療有效之突變IL-2多肽可低於非偶聯突變IL-2多肽。
類似地，免疫偶聯物適於一次性地或經一系列治療投與患者。端視疾病之類型及嚴重程度而定，無論(例如)藉由一或多次分開投與抑或藉由連續輸注，投與患者之免疫偶聯物之初始候選劑量為約1μg/kg至15mg/kg(例如0.1mg/kg-10mg/kg)。端視上文所提及之因素而定，一種典型日劑量可介於約1μg/kg至100mg/kg之間或更高。經若干天或更長時間重複投與時，端視病狀而定，治療通常持續至對疾病症狀之期望阻抑出現為止。免疫偶聯物之一實例性劑量範圍為約0.005mg/kg至約10mg/kg。在其他非限制性實例中，每次投與之劑量亦可包括約1微克/kg/體重、約5微克/kg/體重、約10微克/kg/體重、約50微克/kg/體重、約100微克/kg/體重、約200微克/kg/體重、約350微克/kg/體重、約500微克/kg/體重、約1毫克/kg/體重、約5毫克/kg/體重、約10毫克/kg/體重、約50毫克/kg/體重、約100毫克/kg/體重、約200毫克/kg/體重、約350毫克/kg/體重、約500毫克/kg/體重至約1000mg/kg/體重或更高及其中衍生之任一範圍。在來自本文所列示數值之衍生範圍之非限制性實例中，基於上述數值，可投與約5mg/kg/體重至約100mg/kg/體重、約5微克/kg/體重至約500毫克/kg/體重等之範圍。因此，可向患者投與一或多個約0.5mg/kg、2.0mg/kg、5.0mg/kg或10mg/kg(或其任一組合)之劑量。可間歇性地投與該等劑量，例如每週或每三週(例如，從而患者接受約兩個至約二十個或(例如)約六個劑量之免疫偶聯物)。可先投與較高負荷劑量，隨後投與一或多個較低劑量。然而，可使用其它劑量方案。此療法之進展可藉由習用技術及分析容易地加以監測。
本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物通常以有效達成預期目的之量使用。為用於治療或預防病狀，本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物或其醫藥組合物應以治療有效量投與或應用。治療有效量之確定為 彼等熟習此項技術者所熟知，尤其可根據本文所提供之詳細揭示內容確定。
對於全身性投與而言，最初可自活體外分析(例如細胞培養物分析)來估計治療有效劑量。然後可將劑量調配用於動物模型中以達成循環濃度範圍，該循環濃度範圍包含在細胞培養物中測定之IC50。該資訊可用於更準確地確定用於人類之劑量。
亦可自活體內數據(例如，動物模型)使用業內熟知之技術來估計初始劑量。熟習此項技術者可易於基於動物數據來優化在人類中之投與。
可個別地調節劑量量及間隔以提供足以維持治療效應之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之血漿濃度。用於藉由注射投與之常用患者劑量介於約0.1mg/kg/日至50mg/kg/日、通常約0.5mg/kg/日至1mg/kg/日之間。可藉由每天投與多個劑量來達成治療有效之血漿濃度。可(例如)藉由HPLC來量測血漿濃度。
在局部投與或選擇性攝取之情形下，免疫偶聯物之有效局部濃度可與血漿濃度無關。熟習此項技術者能夠無需過多實驗即優化治療有效之局部劑量。
本文所述突變IL-2多肽或免疫偶聯物之治療有效之劑量通常提供治療益處且不會引起實質性毒性。可藉由標準醫藥程序在細胞培養物或實驗動物中測定IL-2突變或免疫偶聯物之毒性及治療效能(例如，參見實例8及9)。可使用細胞培養分析及動物研究來測定LD50(對50%群體致死之劑量)及ED50(對50%群體治療有效之劑量)。毒性及治療效應之間之劑量比率即為治療指數，其可表示為比率LD50/ED50。展現較大治療指數之IL-2突變及免疫偶聯物較佳。在一實施例中，本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物展現較高治療指數。自細胞培養分析及動物研究獲得之數據可用於調配用於人類之劑量範圍。該劑量較佳地 在具有極低毒性或無毒性之循環濃度(包含ED50)的範圍內。該劑量端視例如以下各種要素可在此範圍內有所變化：所用劑型、所用投與途徑、個體之身體狀況及諸如此類。各醫師可根據患者病狀來選擇確切調配物、投與途徑及劑量。(例如，參見Fingl等人，1975，The Pharmacological Basis of Therapeutics，第1章第1頁，其全部內容以引用方式併入本文中)。
使用本發明之IL-2突變或免疫偶聯物治療患者之主治醫師知曉因毒性、器官功能障礙及諸如此類而終止、間斷或調節投與之方式及時間。反之，若臨床反應不夠(排除毒性)，則主治醫師亦應知曉調節治療至更高程度。在所關注病症之管控中所投與劑量之數量級應隨擬治療病狀之嚴重程度、投與途徑及諸如此類而有所變化。舉例而言，病狀之嚴重程度可部分地藉由標準預測評估方法來評估。另外，該劑量且(可能)劑量頻率亦應根據個體患者之年齡、體重及反應而有所變化。
突變IL-2多肽或包括該多肽之免疫偶聯物之最大治療劑可分別自彼等用於野生型IL-2或包括野生型IL-2之免疫偶聯物者有所增加。
其他藥劑及治療
本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物可與療法中之一或多種其他藥劑組合投與。舉例而言，本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物可與至少一種其他治療劑共投與。術語「治療劑」涵蓋投與用以治療需要治療之個體之症狀或疾病之任一藥劑。該其他治療劑可包括適用於所治療特定指徵之任一活性成份，較佳係彼等具有並不不利地彼此影響之互補活性者。在某些實施例中，其他治療劑係免疫調節藥劑、細胞生長抑制劑、細胞黏著之抑制劑、細胞毒性劑、細胞凋亡之活化劑或增加細胞對於細胞凋亡誘導劑之敏感性之藥劑。在一特定實施例中，其他治療劑係抗癌藥，例如微管破壞劑、抗代謝物、拓撲異構酶抑制 劑、DNA嵌入劑、烷基化劑、激素療法、激酶抑制劑、受體拮抗劑、腫瘤細胞凋亡之活化劑或抗血管生成劑。
該等其他藥劑適於以對欲達成目的有效之量以組合形式存在。該等其他藥劑之有效量取決於突變IL-2多肽或免疫偶聯物之量、病症或治療之類型及上文論述之其他因素。通常以與本文所述相同之劑量及投與途徑或以本文所述劑量之約1%至99%或以根據經驗/在臨床上確定為合適之任一劑量及任一途徑來使用突變IL-2多肽及免疫偶聯物。
上文提及之該等組合療法涵蓋組合投與(其中兩種或更多種治療劑包含於相同或分開之組合物中)及分開投與(在此情形下，本發明之突變IL-2多肽或免疫偶聯物之投與可在投與其他治療劑及/或佐劑之前、同時及/或之後進行)。本發明之突變IL-2多肽及免疫偶聯物亦可與放射療法組合使用。
製品
在本發明之另一態樣中，提供含有用於治療、預防及/或診斷上述病症之材料之製品。該製品包括容器及位於該容器上或與該容器相連之標記或包裝插頁。適宜容器包含(例如)瓶、小瓶、注射器、IV溶液袋等。該等容器可自各種材料(例如玻璃或塑膠)形成。該容器容納自身或與另一組合物組合時可有效治療、預防及/或診斷病狀之組合物，且可具有無菌存取通道(例如，該容器可為靜脈內溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿之塞子的小瓶)。組合物中之至少一種活性劑係本發明之突變IL-2多肽。標記或包裝插頁指明該組合物係用於治療所選病狀。另外，該製品可包括(a)含有組合物之第一容器，其中該組合物包括本發明之突變IL-2多肽；及(b)含有組合物之第二容器，其中該組合物包括另一細胞毒性劑或其他治療劑。本發明之此實施例中之製品可進一步包括包裝插頁，該包裝插頁指明該組合物可用於治療 特定病狀。另一選擇為或另外，該製品可進一步包括第二(或第三)容器，該容器包括醫藥上可接受之緩衝液，例如抑菌性注射用水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液及右旋糖溶液。其可進一步包含自商業及使用者角度考慮所期望之其他材料，包含其他緩衝液、稀釋劑、過濾器、針及注射器。
應理解，上述製品中之任一者可包含本發明之免疫偶聯物來代替或與突變IL-2多肽相組合。
實例
下文為本發明之方法及組合物之實例。應理解，考慮上文提供之一般說明，可實踐各種其他實施例。
實例1 一般方法 重組DNA技術
使用標準方法來處理DNA，如Sambrook等人，Molecular cloning：A laboratory manual；Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,New York,1989中所述。根據製造商說明書來使用分子生物學試劑。關於人類免疫球蛋白輕鏈及重鏈之核苷酸序列之一般資訊在以下文獻中給出：Kabat,E.A.等人，(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，NIH公開案第91-3242號。
DNA測序
藉由雙鏈測序來測定DNA序列。
基因合成
所需之期望基因區段係藉由PCR使用適當模板來生成，或藉由Geneart AG(Regensburg，德國)、自合成寡核苷酸及PCR產物藉由自動基因合成來合成。在沒有精確基因序列可用之情形下，基於來自最近同源物之序列來設計寡核苷酸引物，且藉由RT-PCR自源自適當組 織之RNA來分離基因。singular將側接有獨特限制性內切酶裂解位點之基因區段選殖至標準選殖/測序載體中。自轉化之細菌純化質粒DNA並藉由UV光譜測定濃度。藉由DNA測序來證實亞選殖基因片段之DNA序列。使用適宜限制性位點來設計基因區段以容許亞選殖於各別表現載體中。所有構築體經設計具有編碼前導肽之5'-端DNA序列，該前導肽用於靶向真核細胞中進行分泌之蛋白質。SEQ ID NO 263-273給出實例性前導肽及編碼其之多核苷酸序列。
IL-2R βγ亞單位-Fc融合體及IL-2R α亞單位Fc融合體之製備
為研究IL-2受體結合親和力，生成表現異源二聚體IL-2受體之工具；使IL-2受體之β-亞單位融合至Fc分子，使用「凸起與孔洞」技術(Merchant等人，Nat Biotech.16,677-681(1998))改造該Fc分子以發生異源二聚合(Fc(孔洞))(參見SEQ ID NO 274及275)。然後使IL-2受體之γ-亞單位融合至Fc(凸起)變體(參見SEQ ID NO 276及277)，使該Fc(凸起)變體與Fc(孔洞)進行異源二聚合。然後使用此異源二聚體Fc-融合蛋白作為受質來分析IL-2/IL-2受體相互作用。將IL-2R α-亞單位表示為具有AcTev裂解位點及Avi His標籤之單體鏈(SEQ ID NO 278及279)。使各別IL-2R亞單位在具有血清(對於IL-2R βγ亞單位構築體而言)及無血清(對於α-亞單位構築體而言)之HEK EBNA 293中瞬時表現。在蛋白質A(GE Healthcare)中、隨後使用尺寸排除層析(GE Healthcare,Superdex 200)來純化IL-2R βγ亞單位構築體。經由His標籤在NiNTA管柱(Qiagen)上、隨後使用尺寸排除層析(GE Healthcare,Superdex 75)來純化IL-2R α-亞單位。
免疫偶聯物之製備
關於Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物之製備及純化(包含抗原結合部分之生成及親和力成熟)之細節可參見PCT公開案第WO 2011/020783號(其全部內容以引用方式併入本文中)之隨附實例。如其中所述，藉由噬 菌體顯示生成針對FAP之各種抗原結合結構域，包含下列實例中所用之表示為4G8、3F2、28H1、29B11、14B3及4B9者。純系28H1係基於親代純系4G8之親和力成熟抗體，而純系29B11、14B3及4B9係基於親代純系3F2之親和力成熟抗體。本文所用之表示為MHLG1 KV9之抗原結合結構域針對MCSP。
下列實例中所使用之包括野生型IL-2之免疫偶聯物之序列亦可參見PCT公開案第WO 2011/020783號。下列實例中所使用之對應於包括四重突變IL-2之免疫偶聯物之序列係：4G8：SEQ ID NO 211及233；3F2：SEQ ID NO 209及231：28H1：SEQ ID NO 219及233；29B11：SEQ ID NO 221及231；14B3：SEQ ID NO 229及231；4B9：SEQ ID NO 227及231；MHLG1-KV9：SEQ ID NO 253及255。藉由基因合成及/或典型分子生物學技術來生成DNA序列並選殖至哺乳動物表現載體(一個表現載體用於輕鏈/IL-2融合蛋白且一個表現載體用於重鏈/IL-2融合蛋白)中，使該等DNA序列處於MPSV啟動子之控制下並位於合成polyA位點上游，每一載體皆攜帶EBV OriP序列。藉由使用磷酸鈣轉染共轉染指數生長之HEK293-EBNA細胞與哺乳動物表現載體來產生應用於下文實例中之免疫偶聯物。另一選擇為，藉由聚乙烯亞胺(PEI)使用各別表現載體來轉染在懸浮液中生長之HEK293細胞。另一選擇為，將穩定轉染之CHO細胞池或CHO細胞純系用於無血清培養基中之產生。儘管可藉由親和層析使用蛋白質A基質來純化包括野生型或(四重)突變IL-2之基於4G8、靶向FAP之Fab-IL-2-Fab構築體，但藉由親和層析在蛋白質G基質上以小規模來純化親和力成熟之基於28H1、靶向FAP之Fab-IL-2-Fab構築體。
簡言之，藉由一個親和步驟(蛋白質G)、隨後使用尺寸排除層析(Superdex 200,GE Healthcare)自細胞上清液純化靶向FAP之28H1 Fab-IL-2-Fab(包括野生型或(四重)突變IL-2)。在20mM磷酸鈉、20mM檸 檬酸鈉(pH 7.5)中平衡蛋白質G管柱，裝載上清液，且使用20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉(pH 7.5)洗滌管柱。使用8.8mM甲酸(pH 3)洗脫Fab-IL-2-Fab。彙集洗脫部分並藉由尺寸排除層析在以下最終調配物緩衝液中精製：25mM磷酸鉀、125mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 6.7)。在下文中給出純化及分析之實例性結果。
藉由由使用蛋白質A之一個親和步驟、隨後使用尺寸排除層析(Superdex 200,GE Healthcare)組成之類似方法來純化靶向FAP之3F2 Fab-IL-2-Fab或4G8 Fab-IL-2-Fab(包括野生型或(四重)突變IL-2)。在20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉(pH 7.5)中平衡蛋白質A管柱，裝載上清液，且使用20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、500mM氯化鈉(pH 7.5)洗滌管柱，隨後使用13.3mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、500mM氯化鈉(pH 5.45)洗滌。視需要使用10mM MES、50mM氯化鈉(pH 5)實施第三洗滌。使用20mM檸檬酸鈉、100mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 3)洗脫Fab-IL-2-Fab。彙集洗脫部分並藉由尺寸排除層析在以下最終調配物緩衝液中精製：25mM磷酸鉀、125mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 6.7)。下文給出所選構築體之實例性詳細純化程序及結果。
基於FAP-抗體4G8、4B9及28H1來生成靶向FAP之IgG-IL-2 qm融合蛋白，其中一個單一IL-2四重突變(qm)融合至一個異源二聚體重鏈之C-末端，如圖1B中所展示。經由二價抗體Fab區域來靶向選擇性表現FAP之腫瘤間質(抗體親抗原性效應)。藉由應用凸起與孔洞技術來達成異源二聚化以使得存在單一IL-2四重突變。為將同源二聚體IgG-細胞因子融合體之生成降至最低，經由G4-(SG4)2-或(G4S)3鏈接來將細胞因子融合至含有凸起之IgG重鏈之C-末端(其中缺失C-末端Lys殘基)。抗體-細胞因子融合體具有IgG樣性質。為減小FcγR結合/效應子功能並防止FcR共活化，將P329G L234A L235A(LALA)突變引入Fc結 構域中。該等免疫偶聯物之序列在以下中給出：SEQ ID NO 297、299及233(28H1)；SEQ ID NO 301、303及231(4B9)；及SEQ ID NO 315、317及233(4G8)。此外，生成靶向CEA之IgG-IL-2 qm融合蛋白及對照DP47GS非靶向IgG-IL-2 qm融合蛋白(其中IgG並不與指定靶結合)。該等免疫偶聯物之序列在SEQ ID NO 305、307及309(DP47GS)及SEQ ID NO 319、321及323(CH1A1A)中給出。
藉由HEK293 EBNA細胞中之瞬時表現來生成IgG-IL-2構築體且基本上如上文針對Fab-IL-2-Fab構築體所述進行純化。簡言之，藉由在20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉(pH 7.5)中平衡之使用蛋白質A(HiTrap ProtA,GE Healthcare)之一個親和步驟來純化IgG-IL-2融合蛋白。裝載上清液之後，首先使用20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉(pH 7.5)洗滌管柱，且隨後使用13.3mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、500mM氯化鈉(pH 5.45)洗滌。使用20mM檸檬酸鈉、100mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 3)洗脫IgG-細胞因子融合蛋白。中和該等部分並彙集，且藉由尺寸排除層析(HiLoad 16/60 Superdex 200,GE Healthcare)在最終調配物緩衝液：25mM磷酸鉀、125mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 6.7)中純化。下文給出所選構築體之實例性詳細純化程序及結果。藉由使用根據胺基酸序列計算之莫耳消光係數量測280nm下之光學密度(OD)來測定純化蛋白質試樣中之蛋白質濃度。藉由SDS-PAGE在存在及不存在還原劑(5mM 1,4-二硫蘇糖醇)來分析免疫偶聯物之純度及分子量並使用考馬斯藍(Coomassie blue)(SimpleBlueTM SafeStain,Invitrogen)染色。根據製造商說明書使用NuPAGE® Pre-Cast凝膠系統(Invitrogen)(4-20% Tris-甘胺酸凝膠或3-12% Bis-Tris)。使用Superdex 200 10/300GL分析型尺寸排除管柱(GE Healthcare)在2mM MOPS、150mM NaCl、0.02% NaN3之pH 7.3運行緩衝液中於25℃下分析免疫偶聯物試樣之聚集物含量。
FAP結合親和力
藉由表面電漿共振(SPR)在Biacore機器上來測定作為抗原結合部分用於該等實例中之裂解Fab片段之FAP結合活性。簡言之，將抗His抗體(Penta-His,Qiagen 34660)固定於CM5晶片上以捕獲10nM人類、鼠類或短尾猴FAP-His(20s)。溫度為25℃且使用HBS-EP作為緩衝液。Fab分析物濃度為自100nM直至0.41nM(一式兩份)且流速為50μl/min(締合：300s，解離：600s(4B9,14B3,29B11,3F2)或1200s(28H1,4G8)，再生：60s，10mM甘胺酸，pH 2)。基於1：1結合模型實施擬合，RI=0，Rmax=局部(因捕獲格式)。表2給出藉由SPR測得之單價親和力。
使用靶向IL-2免疫偶聯物之生物活性分析
與市售IL-2(普留淨注射劑(Proleukin)，Novartis,Chiron)相比，在若干細胞分析中研究包括野生型或(四重)突變IL-2之靶向FAP或MCSP之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物及靶向FAP之IgG-IL-2免疫偶聯物的生物活性。
NK細胞之IFN-γ釋放(在溶液中)
將IL-2饑餓之NK92細胞(100000個細胞/孔，存於96-U孔板中)與不同濃度之IL-2免疫偶聯物(包括野生型或(四重)突變IL-2)在NK培養基(來自Invitrogen之補充有以下之MEMα(編號：22561-021)：10% FCS、10%馬血清、0.1mM 2-巰基乙醇、0.2mM肌醇及0.02mM葉酸)中一起培育24h。收穫上清液且使用來自Becton Dickinson之抗人類IFN-γ ELISA套組II(編號：550612)分析IFN-γ釋放。將普留淨注射劑(Novartis)用作細胞之IL-2調介之活化之陽性對照。
NK細胞增殖
將來自健康志願者之血液吸收於含有肝素之注射器中並分離PBMC。使用來自Miltenyi Biotec之人類NK細胞分離套組II(編號：130-091-152)自PBMC分離未受損人類NK細胞。藉由流式細胞術檢查細胞之CD25表現。對於增殖分析而言，將20000個分離之人類NK細胞在37℃、5% CO2下於加濕培育器中在不同IL-2免疫偶聯物(包括野生型或(四重)突變IL-2)存在下培育2天。將普留淨注射劑(Novartis)用作對照。2天後，使用來自Promega之CellTiter-Glo發光細胞存活力分析(編號：G7571/2/3)量測細胞裂解物之ATP含量。計算生長之百分比，其中將最高普留淨注射劑濃度設定為100%增殖且將沒有IL-2刺激之未處理細胞設定為0%增殖。
STAT5磷酸化分析
將來自健康志願者之血液吸收於含有肝素之注射器中並分離PBMC。使用包括野生型或(四重)突變IL-2之IL-2免疫偶聯物在指定濃度下或使用普留淨注射劑(Novartis)作為對照來處理PBMC。在37℃下培育20min後，使用預熱之Cytofix緩衝液(Becton Dickinson編號：554655)將PBMC在37℃下固定10min，隨後使用Phosflow Perm緩衝液III(Becton Dickinson編號：558050)在4℃下透化30min。使用含有 0.1% BSA之PBS將細胞洗滌兩次，然後使用流式細胞術抗體之混合物實施FACS染色以用於檢測不同細胞群體及STAT5之磷酸化。使用來自Becton Dickinson之具有HTS之FACSCantoII分析試樣。
將NK細胞定義為CD3-CD56+，將CD8陽性T細胞定義為CD3+CD8+，將CD4陽性T細胞定義為CD4+CD25-CD127+且將Treg細胞定義為CD4+CD25+FoxP3+。
T細胞之增殖及AICD
將來自健康志願者之血液吸收於含有肝素之注射器中並分離PBMC。使用來自Miltenyi Biotec之Pan T細胞分離套組II(編號：130-091-156)分離未受損T細胞。使用1μg/ml PHA-M(Sigma Aldrich編號：L8902)將T細胞預刺激16h，然後再經5天向洗滌細胞中添加普留淨注射劑或包括野生型或(四重)突變IL-2之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物。5天後，使用來自Promega之CellTiter-Glo發光細胞存活力分析(編號：G7571/2/3)量測細胞裂解物之ATP含量。計算相對增殖，其中將最高普留淨注射劑濃度設定為100%增殖。
藉由膜聯蛋白V(Annexin-V-FLUOS染色套組，Roche Applied Science)及碘化丙錠(PI)染色細胞之流式細胞術分析(FACSCantoII,BD Biosciences)來分析T細胞之磷脂醯絲胺酸(PS)暴露及細胞死亡。為誘導活化誘導之細胞死亡(AICD)，在16h PHA-M及5天Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物處理之後，使用誘導細胞凋亡之抗Fas抗體(Millipore clone Ch11)將T細胞處理16h。根據製造商說明書實施膜聯蛋白V染色。簡言之，使用結合之Ann-V緩衝液(1x儲備液：0.01M Hepes/NaOH pH 7.4,0.14M NaCl,2.5mM CaCl2)洗滌細胞並在室溫下於黑暗中使用Annexin V FITC(Roche)染色15min。在結合Ann-V之緩衝液中再次洗滌細胞，然後添加含有PI(0.3μg/ml)之200μl/孔結合Ann-V之緩衝液。立即藉由流式細胞術分析細胞。
與表現FAP之細胞之結合
藉由FACS量測靶向FAP之IgG-IL-2 qm及Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物與表現於穩定轉染HEK293細胞上之人類FAP之結合。簡言之，將250 000個細胞/孔與指定濃度之免疫偶聯物在4℃下於圓底96-孔板中一起培育30min，並使用PBS/0.1% BSA洗滌一次。在4℃下培育30min之後，利用與FITC偶聯之山羊抗人類F(ab')2特異性AffiniPure F(ab')2片段(Jackson Immuno Research實驗室，編號：109-096-097，工作溶液：1：20，稀釋於PBS/0.1% BSA中，新製)使用FACS CantoII(FACS Diva軟體)檢測結合之免疫偶聯物。
藉由FACS對於結合時FAP內在化之分析
對於業內已知之若干FAP抗體而言，將其闡述為可在結合時誘導FAP內在化(例如在以下文獻中所述：Baum等人，J Drug Target 15,399-406(2007)；Bauer等人，Journal of Clinical Oncology,2010 ASCO Annual Meeting Proceedings(會後版本)，第28卷(5月20日之增刊)，摘要編號：13062(2010)；Ostermann等人，Clin Cancer Res 14,4584-4592(2008))。因此，分析Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物之內在化性質。簡言之，將在具有15% FCS之EMEM培養基中培養之GM05389細胞(人類肺成纖維細胞)分離，洗滌，計數，檢查存活力並以2 x 105個細胞/孔之密度接種於12-孔板中。第二天，在冷培養基中稀釋靶向FAP之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物並使其在冰上經30min結合至細胞表面。使用冷PBS洗滌掉過量之未結合抗體，且將細胞進一步在37℃下於0.5ml完全預熱培養基中培育指定時間。在達到不同時間點時，將細胞轉移至冰上，使用冷PBS洗滌一次並與二級抗體(與FITC偶聯之山羊抗人類F(ab')2特異性AffiniPure F(ab')2片段，Jackson Immuno Research實驗室編號：109-096-097，1：20稀釋液)一起在4℃下培育30min。然後使用PBS/0.1% BSA將細胞洗滌兩次，轉移至96-孔板上，在4℃、400×g 下離心4min且藉由渦旋再懸浮細胞沈澱物。使用100μl 2% PFA固定細胞。對於FACS量測而言，將細胞再懸浮於200μl/試樣之PBS/0.1% BSA中並使用FACS CantoII(FACS Diva軟體)中之板方案量測。
實例2
設計包括下列突變中之一或多者之IL-2之突變形式(與SEQ ID NO：1中所示之野生型IL-2序列相比)：
1.T3A-預定O-糖基化位點之基因剔除
2.F42A-IL-2/IL-2R α相互作用之基因剔除
3.Y45A-IL-2/IL-2R α相互作用之基因剔除
4.L72G-IL-2/IL-2R α相互作用之基因剔除
5.C125A-避免二硫橋接之IL-2二聚體之先前所述突變
包括所有突變1-4之突變IL-2多肽在本文中表示為IL-2四重突變(qm)。其可進一步包括突變5(參見SEQ ID NO：19)。
在IL-2 qm多肽或免疫偶聯物表現於諸如CHO或HEK293細胞等真核細胞中時，除經設計以干擾與CD25之結合之三種突變F42A、Y45A及L72G外，選擇T3A突變來消除O-糖基化位點並獲得具有較高均質性及純度之蛋白質產物。
出於純化目的，在經由VD序列連接之C-末端處引入His6標籤。為加以對比，生成IL-2之非突變類似形式，其僅含有C145A突變以避免不期望分子間二硫鍵橋(SEQ ID NO：3)。無信號序列之各別分子量為16423 D(對於裸露IL-2而言)及16169 D(對於裸露IL-2 qm而言)。在無血清培養基(F17培養基)中之HEK EBNA細胞中轉染具有His標籤之野生型及四重突變IL-2。藉由交叉流對過濾之上清液實施緩衝液交換，然後將其裝載於NiNTA Superflow柱(5ml,Qiagen)上。使用洗滌緩衝液：20mM磷酸鈉、0.5M氯化鈉(pH 7.4)洗滌管柱並使用洗脫緩衝液：20mM磷酸鈉、0.5M氯化鈉、0.5M咪唑(pH 7.4)洗脫。裝載 後，使用8管柱體積(CV)洗滌緩衝液、10CV 5%洗脫緩衝液(對應於25mM咪唑)洗滌管柱，然後使用至0.5M咪唑之梯度洗脫。藉由尺寸排除層析在HiLoad 16/60 Superdex75(GE Healthcare)管柱上於2mM MOPS、150mM氯化鈉、0.02%疊氮化鈉(pH 7.3)中精製彙集之洗脫物。圖2展示野生型裸露IL-2之His標籤純化之層析圖。池1係自部分78-85製得，池2係自部分86-111製得。圖3展示野生型IL-2之尺寸排除層析之層析圖，對於每一池而言，皆彙集部分12至14。圖4展示野生型IL-2之分析型尺寸排除層析，如在Superdex 75,10/300 GL(GE Healthcare)管柱上於2mM MOPS、150mM氯化鈉、0.02%疊氮化鈉(pH 7.3)中所測定。池1及2含有約22kDa及20kDa之2種蛋白質。池1具有較多之大蛋白，且池2具有較多之小蛋白，據推測此差異係由O-糖基化差異所致。池1之產量為約0.5mg/L上清液且池2之產量為約1.6mg/L上清液。圖5展示四重突變IL-2之His標籤純化之層析圖。池1係自部分59-91製得，池2係自部分92-111製得。圖6展示四重突變IL-2之尺寸排除層析之層析圖，此處池2僅保留部分12至14。圖7展示四重突變IL-2之分析型尺寸排除層析，如在Superdex 75,10/300 GL(GE Healthcare)管柱上於2mM MOPS、150mM氯化鈉、0.02%疊氮化鈉(pH 7.3)中所測定。用於裸露四重突變IL-2之製劑僅含有一種20kD之蛋白質。此蛋白質具有O-糖基化位點基因剔除。將野生型及四重突變裸露IL-2在-80℃下冷凍儲存。產量為約0.9mg/L上清液。
如上所述藉由固定金屬離子親和層析(IMAC)及隨後之尺寸排除層析(SEC)來純化第二批加有His標籤之四重突變IL-2。用於IMAC之緩衝液為50mM Tris、20mM咪唑、0.5M NaCl(pH 8)(用於管柱平衡及洗滌)及50mM Tris、0.5M咪唑、0.5M NaCl(pH 8)(用於洗脫)。用於SEC及最終調配物緩衝液之緩衝液為20mM組胺酸、140mM NaCl(pH 6)。圖43展示該純化之結果。產量為2.3ml/L上清液。
隨後，藉由表面電漿共振(SPR)測定對於IL-2R βγ異源二聚體及IL-2R α-亞單位之親和力。簡言之，將配體-人類IL-2R α-亞單位(Fc2)或人類IL2-R β凸起γ孔洞異源二聚體(Fc3)固定於CM5晶片上。隨後，在25℃下於HBS-EP緩衝液中以300nM直至1.2nM(1：3稀釋)範圍內之濃度將裸露野生型(池1及2)或四重突變IL-2及普留淨注射劑(Novartis/Chiron)施加至晶片上作為分析物。流速為30μl/min且應用下列條件：締合：180s，解離：300s，且再生：2×30s、3M MgCl2(對於IL2-R β凸起γ孔洞異源二聚體而言)，10s、50mM NaOH(對於IL-2R α-亞單位而言)。應用1：1結合以進行擬合(對於IL-2R βγ而言，1：1結合，RI≠0，Rmax=局部，表觀KD；對於IL-2R α而言，1：1結合，RI=0，Rmax=局部)。表3展示人類野生型及四重突變IL-2以及普留淨注射劑與IL-2R βγ及IL-2R α-亞單位之結合之各別KD值。
數據展示，裸露IL-2四重突變展示期望行為且損失對於IL-2R α-亞單位之結合，而對於IL-2R βγ之結合得以保留且在各別野生型IL-2構築體及普留淨注射劑中相當。野生型IL-2之池1及2間之差異很可能歸因於O-糖基化差異。在IL-2四重突變中藉由引入T23A突變來克服此可變性及異質性。
實例3
使用抗FAP抗體4G8作為靶向結構域模型將三種突變F42A、Y45A及L72G及突變T3A引入Fab-IL-2-Fab格式中(圖1A)作為單一突變：1)4G8 IL-2 T3A，2)4G8 IL-2 F42A，3)4G8 IL-2 Y45A，4)4G8 IL-2 L72G，或其在Fab-IL-2 mt-Fab構築體中組合為：5)三重突變F42A/Y45A/L72G，或組合為：6)四重突變T3A/F42A/Y45A/L72G以亦鈍化O-糖基化位點。基於4G8之Fab-IL-2 wt-Fab用於對比。所有構築體皆含有C145A突變以避免二硫橋接之IL-2二聚體。在HEK 293細胞中表現不同Fab-IL 2-Fab構築體，且如上所述經由如上文所指定之蛋白質A及尺寸排除層析進行純化。隨後，藉由表面電漿共振(SPR)(Biacore)使用重組IL-2R βγ異源二聚體及單體IL-2R α-亞單位在下列條件下測定所選IL 2變體對於人類及鼠類IL 2R βγ異源二聚體及對於人類及鼠類IL-2R α-亞單位之親和力：以兩個密度固定IL-2R α-亞單位且使用具有較高固定能力之流動單元用於已失去對CD25之結合之突變。使用下列條件：化學固定：人類IL-2R βγ異源二聚體1675RU；小鼠IL-2R βγ異源二聚體5094RU；人類IL-2R α-亞單位1019RU；人類IL-2R α-亞單位385RU，鼠類IL-2R α-亞單位1182RU；鼠類IL-2R α-亞單位378RU，溫度：25℃，分析物：4G8 Fab-IL 2變體-Fab構築體，3.1nM至200nM，流速：40μl/min，締合：180s，解離：180s，再生：10mM甘胺酸，pH 1.5，60s，40μl/min。擬合：兩狀態反應模型(構型變化)，RI=0，Rmax=局部。表4中給出動力學分析之結果。
藉由SPR展示對於IL 2R βγ異源二聚體及FAP之同時結合。簡言之，將人類IL 2R βγ凸起與孔洞構築體以化學方式固定於CM5晶片上且經90s捕獲10nM Fab-IL-2-Fab構築體。人類FAP以200nM直至0.2nM之濃度用作分析物。條件如下：溫度：25℃，緩衝液：HBS-EP，流速：30μl/min，締合：90s，解離：120s。使用10mM甘胺酸(pH 2)經60s進行再生。使用1：1結合模型實施擬合，RI≠0，Rmax=整體。SPR橋接分析展示，Fab-IL-2-Fab構築體(呈野生型及四重突變形式，且基於親和力成熟FAP結合物28H1或親代3F2或4G8抗體)能夠同時以10nM之濃度結合固定於晶片上之IL 2R βγ異源二聚體以及用作分析物之人類 FAP(圖8)。所測得之親和力展示於表5中。
總而言之，SPR數據展示，i)T3A突變並不影響對於CD25之結合，ii)三種突變F42A、Y45A及L72G並不影響對於IL 2R βγ異源二聚體之親和力，但其以如下順序減小對於CD25之親和力：wt=T3A>Y45A(約1/5)>L72G(約1/10)>F42A(約1/33)；iii)具有或不具有O-糖基化位點突變T3A之三種突變F42A、Y45A及L72G之組合使得完全損失CD25結合，如在SPR條件下所測定，iv)儘管人類IL-2對於鼠類IL-2R βγ異源二聚體及IL-2R α-亞單位之親和力與人類IL-2受體相比減小至先前之大約1/10，但所選突變並不影響對於鼠類IL-2R βγ異源二聚體之親和力，但相應地消除對於鼠類IL-2R α-亞單位之結合。此表明小鼠代表研究IL-2突變之藥理學及毒理學效應之有效模型，但總體而言IL-2在齧齒類動物中展現之毒性小於在人類中。
除損失O-糖基化外，4種突變T3A、F42A、Y45A、L72G之組合之一個其他優點為IL-2四重突變具有較低表面疏水性，此乃因表面暴露之疏水性殘基(例如苯基丙胺酸、酪胺酸或白胺酸)交換為丙胺酸。藉由動態光散射來分析聚集溫度展示，包括野生型或四重突變IL-2之靶向FAP之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物之聚集溫度處於相同範圍內：約57-58℃(對於3F2親代Fab-IL-2-Fab及親和力成熟29B11 3F2衍生物而言)；且該溫度範圍為62-63℃(對於4G8親代Fab-IL-2-Fab及親和力成熟28H1、4B9及14B3 4G8衍生物而言)，此表明4種突變之組合對於蛋白質穩定性並無負面影響。為支持所選IL-2四重突變之有利性質，瞬時表現產量表明，Fab-IL-2 qm-Fab格式中之四重突變所產生之表現產量甚至可高於彼等針對各別Fab-IL-2 wt-Fab構築體所觀察者。最後，藥物代謝動力學分析展示，基於4G8之Fab-IL-2 qm-Fab及Fab-IL-2 wt-Fab具有相當之PK性質(參見下文之實例9)。基於該等數據及下文實例4中所述之細胞數據，選擇四重突變T3A、F42A、Y45A、L72G作為理想突變組合來消除靶向Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物中IL-2之CD25結 合。
實例4
隨後在細胞分析中測試基於4G8、靶向FAP之Fab-IL 2-Fab免疫偶聯物(包括野生型IL-2或單一突變4G8 IL-2 T3A、4G8 IL-2 F42A、4G8 IL-2 Y45A、4G8 IL-2 L72G或各別三重(F42A/Y45A/L72G)或四重突變(T3A/F42A/Y45A/L72G)IL-2)以與上述普留淨注射劑進行對比。
在將NK細胞系NK92與該等構築體一起培育之後，量測IL-2誘導之IFN-γ釋放(圖9)。NK92細胞在其表面上表現CD25。結果展示，包括野生型IL-2之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物誘導IFN-γ釋放之功效小於普留淨注射劑，如可自Fab-IL-2 wt-Fab對於IL-2R βγ異源二聚體之親和力約為普留淨注射劑之1/10所預計。在引入干擾CD25結合之單一突變以及干擾IL-2三重突變中之CD25結合之三種突變之組合時，可產生在方法誤差內在功效及IFN-γ釋放之絕對誘導方面與野生型IL-2構築體相當之Fab-IL-2-Fab構築體。
隨後，在增殖分析中評價Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物對於分離人類NK細胞之增殖之誘導(Cell Titer Glo,Promega)(圖10)。與NK92細胞相 比，新分離之NK細胞並不表現CD25(或僅表現極低量)。結果展示，包括野生型IL-2之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物誘導NK細胞增殖之功效為普留淨注射劑之1/10，如可自Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物對於IL-2R βγ異源二聚體之親和力約為普留淨注射劑之1/10所預計。在引入干擾CD25結合之單一突變以及干擾IL-2三重突變中之CD25之三種突變之組合時，可產生在功效及增殖之絕對誘導方面與野生型IL-2構築體相當之Fab-IL-2-Fab構築體；針對Fab-IL-2-Fab三種突變所觀察之功效僅具有極小變化。在第二實驗中，在與不同量之普留淨注射劑及Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物一起培育之後，評價PHA活化T細胞之增殖之誘導(圖11)。因活化T細胞表現CD25，故在與包括IL-2單一突變F42A、L72G或Y45A之免疫偶聯物一起培育時可觀察到T細胞增殖明顯減小；其中F42A展示最大程度之減小，隨後依次為L72G及Y45A，而在使用Fab-IL-2 wt-Fab或Fab-IL-2(T3A)-Fab時，與普留淨注射劑相比活化幾乎保留。該等數據反映了對於CD25之親和力之減小，如藉由SPR所測定(上文實例)。IL-2三重突變中干擾CD25結合之三種突變之組合產生免疫偶聯物，其明顯使得溶液中T細胞增殖之誘導減少。根據該等發現，量測T細胞之細胞死亡，如在過度刺激(藉由以下來誘導：使用1μg/ml PHA實施16h之第一刺激，使用普留淨注射劑或各別Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物實施5天之第二刺激，隨後使用1μg/ml PHA實施第三刺激)之後藉由Annexin V/PI染色所測定。在此設置中，觀察到使用包括干擾CD25結合之IL-2單一突變F42A、L72G及Y45A之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物時，過度刺激之T細胞中之活化誘導之細胞死亡(AICD)大大減小，其中F42A及L72G展示最大程度之減小，此與藉由包括IL-2三重突變之免疫偶聯物中之三種突變之組合達成的減小類似(圖12)。在最後一組實驗中，研究與Fab-IL-2 wt-Fab及普留淨注射劑相比Fab-IL-2 qm-Fab對於人類NK細胞、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞及 來自人類PBMC之Treg細胞中之STAT5磷酸化誘導之效應(圖13)。對於不展示或展示極低CD25表現(此意味著IL-2R信號傳導係經由IL-2R βγ異源二聚體調介)之NK細胞及CD8+ T細胞而言，結果展示，包括野生型IL-2之Fab-IL-2-Fab格式誘導STAT5磷酸化之功效約為普留淨注射劑之1/10，且Fab-IL-2 qm-Fab與Fab-IL-2 wt-Fab構築體相當。對於展示在刺激時CD25快速上調之CD4+ T細胞而言，Fab-IL-2 qm-Fab之功效小於Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物，但仍展示在飽和濃度下對於IL-2R信號傳導具有相當之誘導。與之相比，在Treg細胞中，Fab-IL-2 qm-Fab之功效顯著小於Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物，此乃因Treg細胞上之CD25表現較高且由此Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物對於Treg細胞上之CD25之結合親和力較高。因消除了Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物中之CD25結合，故僅在經由IL-2R βγ異源二聚體在CD25-陰性效應子細胞上活化IL-2R信號傳導之濃度下，經由IL-2R βγ異源二聚體來活化Treg細胞中之IL-2信號傳導。總而言之，此處闡述之IL-2四重突變能夠經由IL-2R βγ異源二聚體活化IL-2R信號傳導，但既不會產生AICD且亦不會較其他效應子細胞優先刺激Treg細胞。
實例5
基於實例2及3中所述之數據，生成基於純系28H1或29B11之親和力成熟、靶向FAP之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物並如上文在一般方法部分中所述進行純化。更詳細而言，藉由一個親和步驟(蛋白質G)、隨後使用尺寸排除層析(Superdex 200)來純化靶向FAP之28H1靶向Fab-IL-2 qm-Fab。在PBS中實施管柱平衡且將來自穩定CHO池(CDCHO培養基)之上清液裝載於蛋白質G管柱(GE Healthcare)上，使用PBS洗滌管柱且隨後使用2.5mM HCl洗脫試樣，且立即使用10x PBS中和該等部分。在最終調配物緩衝液：25mM磷酸鈉、125mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 6.7)中於Superdex 200管柱上實施尺寸排除層析。圖14 展示來自純化之洗脫特徵曲線及產物之SDS-PAGE(NuPAGE Novex Bis-Tris Mini凝膠，4-20%，Invitrogen，MOPS運行緩衝液，還原及非還原)分析表徵結果。考慮到28H1 Fab片段對於蛋白質G及蛋白質A具有低結合能力，其他捕獲步驟可得到較高產量。
藉由一個親和步驟(蛋白質A)、隨後使用尺寸排除層析(Superdex 200)來純化靶向FAP之4G8、3F2及29B11 Fab-IL-2 qm-Fab及靶向MCSP之MHLG1 KV9 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。在20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉(pH 7.5)中實施管柱平衡且將上清液裝載於蛋白質A管柱上。在20mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉(pH 7.5)中實施第一洗滌，隨後實施第二洗滌：13.3mM磷酸鈉、20mM檸檬酸鈉、500mM氯化鈉(pH 5.45)。在20mM檸檬酸鈉、100mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 3)中洗脫Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。在最終調配物緩衝液：25mM磷酸鉀、125mM氯化鈉、100mM甘胺酸(pH 6.7)中實施尺寸排除層析。圖15展示4G8 Fab-IL-2 qm-Fab之純化之洗脫特徵曲線及產物之SDS-PAGE(NuPAGE Novex Bis-Tris Mini凝膠，4-20%，Invitrogen，MOPS運行緩衝液，還原及非還原)分析表徵結果，且圖16展示MHLG1 KV9 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之結果。
如上文在一般方法部分中所述生成基於FAP-抗體4G8、4B9及28H1之靶向FAP之IgG-IL-2 qm融合蛋白及對照DP47GS非靶向IgG-IL-2 qm融合蛋白。圖46及47展示對於基於4G8及28H1之構築體而言純化之各別層析圖及洗脫特徵曲線(A,B)以及最終純化構築體之分析型SDS-PAGE及尺寸排除層析(C,D)。瞬時表現產量為42mg/L(對於基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物而言)及20mg/L(對於基於28H1之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物而言)。
與相應未修飾IgG抗體相比，藉由表面電漿共振(SPR)在Biacore機器上測定基於4G8及28H1抗FAP抗體之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物之 FAP結合活性。簡言之，將抗His抗體(Penta-His,Qiagen 34660)固定於CM5晶片上以捕獲10nM加有His標籤之人類FAP(20s)。溫度為25℃且使用HBS-EP作為緩衝液。分析物濃度為50nM直至0.05nM且流速為50μl/min(締合：300s，解離：900s，再生：60s，使用10mM甘胺酸(pH 2))。基於1：1結合模型實施擬合，RI=0，Rmax=局部(因捕獲格式)。表7給出估計之表觀二價親和力(pM抗體親抗原性)，如藉由SPR使用1：1結合(RI=0，Rmax=局部)擬合所測得。
數據展示，在方法誤差內，與相應未修飾抗體相比，對於人類FAP之親和力得以保留(對於基於28H1之免疫偶聯物而言)或僅略有降低(對於基於4G8之免疫偶聯物而言)。
實例6
藉由表面電漿共振(SPR)使用重組IL-2R βγ異源二聚體在下列條件下測定靶向FAP之親和力成熟、基於28H1及29B11之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物(各包括野生型或四重突變IL-2)及基於3F2之Fab-IL-2 wt-Fab對於人類、鼠類及短尾猴IL-2R βγ異源二聚體的親和力：配體：固定於CM5晶片上之人類、鼠類及短尾猴IL-2R β凸起γ孔洞異源二聚體，分析物：28H1或29B11 Fab-IL-2-Fab(包括野生型或四重突變IL-2)，3F2 Fab-IL-2-Fab(包括野生型IL-2)，溫度：25℃或37℃，緩衝液：HBS-EP，分析物濃度：200nM直至2.5nM，流速：30μl/min，締合：300s，解離：300s，再生：60s，3M MgCl2，擬合：1：1結合， RI≠0，Rmax=整體。藉由表面電漿共振(SPR)使用重組單體IL-2R α-亞單位在下列條件下測定靶向FAP之親和力成熟、基於28H1及29B11之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物(各含有野生型或四重突變IL-2)及基於3F2之Fab-IL-2 wt-Fab人類、鼠類及短尾猴IL-2R α-亞單位之親和力：配體：固定於CM5晶片上之人類、鼠類及短尾猴IL-2R α-亞單位，分析物：28H1或29B11 Fab-IL-2-Fab(包括野生型或突變IL-2)，3F2 Fab-IL-2-Fab(包括野生型IL-2)，溫度：25℃或37℃，緩衝液：HBS-EP，分析物濃度：25nM直至0.3nM，流速：30μl/min，締合：120s，解離：600s，再生：無，擬合：1：1結合，RI=0，Rmax=整體。
表8中給出使用IL-2R βγ異源二聚體之動力學分析之結果。
鑒於人類IL-2對於人類IL 2R βγ異源二聚體之親和力如本文所述為約1nM，故Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物(包括野生型或四重突變IL-2)皆具有介於6nM與10nM之間之較小親和力，如上文針對裸露IL-2所示，對於鼠類IL-2R之親和力約為對於人類及短尾猴IL-2R之親和力之1/10。
表9中給出使用IL-2R α-亞單位之動力學分析之結果。在所選條件下，包括IL-2四重突變之免疫偶聯物對於人類、鼠類或短尾猴IL- 2R α-亞單位並無可檢測之結合。
藉由表面電漿共振(SPR)使用重組IL-2R βγ異源二聚體在下列條件下測定包括野生型或四重突變IL-2之靶向MCSP之MHLG1-KV9 Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物對於人類IL-2R βγ異源二聚體之親和力：將人類IL-2R β凸起γ孔洞異源二聚體固定於CM5晶片上(1600RU)。在25℃下於HBS-P緩衝液中使用MHLG1-KV9 Fab-IL-2 wt-Fab及Fab-IL-2 qm-Fab作為分析物。對於IL-2R βγ而言，分析物濃度為300nM直至0.4nM(1：3稀釋液)且流速為30μl/min(締合時間：180s，解離時間：300s)。對於IL-2R βγ而言，使用3M MgCl2經2x30s進行再生。對於IL-2R βγ而言，使用1：1結合來擬合數據，RI≠0，Rmax=局部。
藉由表面電漿共振(SPR)使用重組單體IL-2R α-亞單位在下列條件下測定包括野生型或四重突變IL-2之靶向MCSP之MHLG1-KV9 Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物對於人類IL-2R α-亞單位之親和力：將人類IL-2R α-亞單位固定於CM5晶片上(190RU)。在25℃下於HBS-P緩衝液中使用MHLG1-KV9 Fab-IL-2 wt-Fab及Fab-IL-2 qm-Fab作為分析物。對於IL-2R α而言，分析物濃度為33.3nM直至0.4nM(1：3稀釋液)且流速為 30μl/min(締合時間：180s，解離時間：300s)。對於IL-2R α而言，使用50mM NaOH經10s進行再生。對於IL-2R α而言，使用1：1結合來擬合數據，RI=0，Rmax=整體。
數據證實，與包括野生型IL-2之免疫偶聯物相比，靶向MCSP之MHLG1-KV9 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物對於IL-2R βγ受體具有保留之親和力，而消除對於CD25之結合親和力。
隨後，藉由表面電漿共振(SPR)測定基於4G8及28H1之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物對於IL-2R βγ異源二聚體及IL-2R α-亞單位之親和力以直接與Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物格式進行對比。簡言之，將配體-人類IL-2R α-亞單位或人類IL-2R βγ異源二聚體固定於CM5晶片上。隨後，在25℃下於HBS-EP緩衝液中以介於300nM直至1.2nM(1：3稀釋液)間之濃度將基於4G8及28H1之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物或基於4G8及28H1之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物施加至晶片上作為分析物。流速為30μl/min且應用下列條件：締合：180s，解離：300s，及再生：2×30s，使用3M MgCl2(對於IL-2R βγ異源二聚體而言)；10s，使用50mM NaOH(對於IL-2R α-亞單位而言)。應用1：1結合以進行擬合(對於IL-2R βγ而言，1：1結合，RI≠0，Rmax=局部，表觀KD；對於IL-2R α而言，1：1結合，RI=0，Rmax=局部)。
表11中給出各別KD值。
數據展示，基於4G8及28H1之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物至少以與Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物同樣有效之親和力與IL-2R βγ異源二聚體結合，但其因引入干擾CD25結合之突變而並不結合IL-2R α-亞單位。與相應Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物相比，IgG-IL-2 qm融合蛋白之親和力在方法誤差內似乎略有增強。
實例7
在第一組實驗中，藉由FACS證實，包括野生型或突變IL-2之靶向FAP之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物能夠與表現人類FAP之HEK 293-FAP細胞結合(圖17)，且IL-2四重突變並不影響與表現FAP之細胞之結合(圖18)。
特定而言，該等結合實驗展示，與基於親代FAP結合物3F2(29B11,14B3,4B9)及4G8(28H1)之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物相比，基於親和力成熟FAP結合物28H1、29B11、14B3及4B9之Fab-IL-2 qm- Fab對於HEK 293-FAP靶細胞展示優良之絕對結合(圖17)，同時保留高特異性且對於使用DPPIV(FAP之接近同源物)轉染之HEK 293細胞或HEK 293模擬轉染之細胞並無結合。為加以對比，使用小鼠抗人類CD26-PE DPPIV抗體純系M-A261(BD Biosciences，編號：555437)作為陽性對照(圖19)。內在化性質之分析展示，Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物之結合不會誘導FAP內在化(圖20)。
在另一實驗中，藉由FACS量測靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm及Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物與表現於穩定轉染HEK293細胞上之人類FAP之結合。結果展示於圖48中。數據展示，IgG-IL-2 qm免疫偶聯物以0.9nM之EC50值與表現FAP之細胞結合，此與相應基於4G8之Fab-IL-2 qm-Fab構築體(0.7nM)相當。
隨後在細胞分析中測試包括野生型IL-2或四重突變之親和力成熟抗FAP Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物以與上文實例中所述之普留淨注射劑進行對比。
在將NK細胞系NK92與該等免疫偶聯物一起培育24h之後，藉由ELISA在上清液中量測IL-2誘導之IFN-γ釋放(圖21)。NK92細胞在其表面上表現CD25。結果展示，包括野生型IL-2之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物誘導IFN-γ釋放之功效小於普留淨注射劑，如可自Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物對於IL-2R βγ異源二聚體之親和力約為普留淨注射劑之1/10所預計。儘管實際上NK92細胞表現一些CD25，但Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物與各別野生型構築體對於所選純系在功效及IFN-γ釋放之絕對誘導方面完全旗鼓相當。然而，可觀察到，29B11 Fab-IL-2 qm-Fab所誘導之細胞因子釋放小於29B11 Fab-IL-2 wt-Fab以及28H1及4G8構築體，因此觀察到Fab-IL-2 qm-Fab較Fab-IL-2 wt-Fab僅具有較小功效變化。
此外，在NK92細胞中之IFN-γ釋放分析中，對靶向MCSP、基於 之MHLG1-KV9 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物與基於28H1及29B11之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物進行比較。圖22展示，靶向MCSP、基於之MHLG1-KV9 Fab-IL-2 qm-Fab與靶向FAP之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物在誘導IFN-γ釋放方面完全旗鼓相當。
隨後，在增殖分析中藉由ATP量測使用CellTiter Glo(Promega)來評價在3天時間內IL-2對於NK92細胞之增殖之誘導(圖23)。考慮到NK92細胞表現較低量之CD25，可在增殖分析中檢測包括野生型IL-2之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物及包括四重突變IL-2之免疫偶聯物間之差異，然而，在飽和條件下，二者皆達成類似之增殖之絕對誘導。
在另一實驗中，研究對於人類NK細胞、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞及來自人類PBMC之Treg細胞而言28H1親和力成熟、針對FAP之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物與28H1 Fab-IL-2 wt-Fab及普留淨注射劑相比對於STAT5磷酸化誘導之效應(圖24)。對於不展示或展示極低CD25表現(此意味著IL-2R信號傳導係經由IL-2R βγ異源二聚體調介)之NK細胞及CD8+ T細胞而言，結果展示，包括野生型IL-2之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物誘導IFN-γ釋放之功效約為普留淨注射劑之1/10，且Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之功效僅略小於Fab-IL-2 wt-Fab構築體。對於展示在刺激時CD25快速上調之CD4+ T細胞而言，Fab-IL-2 qm-Fab之功效顯著小於Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物，但仍展示在飽和濃度下對於IL-2R信號傳導具有相當之誘導。與之相比，在Treg細胞中，Fab-IL-2 qm-Fab之功效顯著小於Fab-IL-2 wt-Fab構築體，此乃因Treg細胞上之CD25表現較高且由此Fab-IL-2 wt-Fab構築體對於Treg細胞上之CD25之結合親和力較高。因消除了Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物中之CD25結合，故僅在經由IL-2R βγ異源二聚體在CD25陰性效應子細胞上活化IL-2R信號傳導之濃度下，經由IL-2R βγ異源二聚體來活化Treg細胞中之IL-2信號傳導。表13中給出各別pM EC50值。
在另一組實驗中，在若干細胞分析中研究靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm及Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之生物活性。
研究靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm及基於28H1之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物對於之NK92細胞之IFN-γ釋放之誘導，如藉由IL-2R βγ信號傳導之活化所誘導。圖49展示，靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物與親和力成熟、基於28H1之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物在誘導IFN-γ釋放方面同等有效。
亦研究對於人類NK細胞、CD4+ T細胞、CD8+ T細胞及來自人類PBMC之Treg細胞而言靶向FAP、基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物與基於28H1之Fab-IL-2 wt-Fab及Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物以及普留淨注射劑相比對於STAT5磷酸化誘導的效應。該等實驗之結果展示於圖50中。對於NK細胞及CD8+ T細胞而言，基於4G8之gG-IL-2 qm免疫偶聯物誘導STAT5磷酸化之功效為普留淨注射劑之1/10以下，但功效略小於基於28H1之Fab-IL-2 wt-Fab及Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。對於CD4+ T細胞而言，基於4G8之IgG-IL-2 qm免疫偶聯物之功效小於28H1 Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物，但功效略小於28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物，且仍展示在飽和濃度下之IL-2R信號傳導誘導與普留淨注射劑及28H1 Fab-IL-2 wt-Fab相當。與之相比，在Treg細胞中，基於4G8之IgG-IL-2 qm及28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之功效顯著小於Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物。
總而言之，此處闡述之IL-2四重突變能夠經由與野生型IL-2類似之IL-2R βγ異源二聚體活化IL-2R信號傳導，但不會較其他效應子細胞優先刺激Treg細胞。
實例8
在活體內評估靶向FAP之Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物之抗腫瘤效應以與ACHN異種移植物及LLC1同系模型中之靶向FAP之Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物進行對比。所有靶向FAP之Fab-IL-2-Fab免疫偶聯物(包括野生型或四重突變IL-2)皆識別鼠類FAP以及鼠類IL-2R。儘管SCID-人類FcγRIII轉基因小鼠中之ACHN異種移植物模型對於IHC中之FAP具有較強陽性，但其係免疫妥協模型且僅可反映藉由NK細胞及/或巨噬細胞/單核細胞調介之免疫效應子機制，但缺乏T細胞調介之免疫性且由此不能反映AICD或經由Treg細胞調介之效應。與之相比，完全免疫活性小鼠中之同系LLC1模型亦可反映適應性T細胞調介之免疫效應子機制，但在鼠類間質中展示相當低之FAP表現。該等模型中之每一者由此部分地反映人類腫瘤中所遇到之情形。
ACHN腎細胞上皮癌異種移植物模型
使用經腎內注射至SCID-人類FcγRIII轉基因小鼠中之人類腎細胞腺上皮癌細胞系ACHN來測試靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。ACHN細胞最初係自ATCC(美國典型培養物保藏中心(American Type Culture Collection))獲得且擴增之後寄存於Glycart內部細胞庫中。在37℃、5% CO2、水飽和氣氛下於含有10% FCS之DMEM中培養ACHN細胞。活體外第18代細胞係以98.4%之存活力用於腎內注射。在麻醉SCID小鼠之右脅腹及腹膜壁獲得小切口(2cm)。將50μl細胞懸浮液(1 x 106個ACHN細胞，存於AimV培養基中)在囊下2mm處注射至腎中。使用夾子將皮膚傷口及腹膜壁封閉。根據既定導則(GV-Solas；Felasa；TierschG)，將雌性SCID-FcγRIII小鼠 (GLYCART-RCC)(在實驗開始時為8-9週齡(在RCC飼餵，瑞士))維持於無特定病原體條件下且實施12h光/12h黑暗之日循環。實驗研究方案已經地方政府檢查且批准(P 2008016)。運抵後，將動物供養一週以適應新環境並進行觀察。定期實施連續健康監測。在研究之第0天經腎內向小鼠注射1 x 106個ACHN細胞，將其隨機化並稱重。在腫瘤細胞注射後一週時，在三週內每週三次經靜脈內向小鼠注射4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab。經靜脈內向所有小鼠注射200μl適當溶液。向媒劑組中之小鼠注射PBS且向治療組注射4G8 Fab-IL-2 wt-Fab或4G8 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。為在每200μl中獲得適當量之免疫偶聯物，視需要使用PBS稀釋儲備液。圖25展示與媒劑組相比在增強中值存活期方面之4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物調介之優良效能，其中4G8 Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物在效能方面優於4G8 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。
LLC1劉易斯(Lewis)肺上皮癌同系模型
使用經靜脈內注射至Black 6小鼠中之小鼠劉易斯肺上皮癌細胞系LLC1來測試靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 qm-Fab及28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。最初自ATCC獲得LLC1劉易斯肺上皮癌細胞且擴增之後寄存於Glycart內部細胞庫中。在37℃、5% CO2、水飽和氣氛下於含有10% FCS之DMEM(Gibco)中以常規方式培養腫瘤細胞系。以 97.9%之存活力將傳代10用於移植。在200μl Aim V細胞培養基(Gibco)中經靜脈內將2 x 105個細胞/動物注射至尾靜脈中。根據既定導則(GV-Solas；Felasa；TierschG)，將Black 6小鼠(Charles River，德國)(在實驗開始時為8-9週齡)維持於無特定病原體條件下且實施12h光/12h黑暗之日循環。實驗研究方案已經地方政府檢查且批准(P 2008016)。運抵後，將動物供養一週以適應新環境並進行觀察。定期實施連續健康監測。在研究之第0天經靜脈內向小鼠注射2 x 105個LLC1細胞，將其隨機化並稱重。在腫瘤細胞注射後一週時，在三週內每週三次經靜脈內向小鼠注射4G8 Fab-IL-2 qm-Fab或28H1 Fab-IL-2 qm-Fab。經靜脈內向所有小鼠注射200μl適當溶液。向媒劑組中之小鼠注射PBS且向治療組注射4G8 Fab-IL-2 qm-Fab或28H1 Fab-IL-2 qm-Fab構築體。為在每200μl中獲得適當量之免疫偶聯物，視需要使用PBS稀釋儲備液。圖26展示與媒劑組相比在增強中值存活期方面之4G8 Fab-IL-2 qm-Fab或親和力成熟28H1 Fab-IL-2 qm-Fab構築體調介之優良效能。
在另一實驗中，在經靜脈內注射至Black 6小鼠中之相同小鼠劉易斯肺上皮癌細胞系LLC1中測試靶向FAP之28H1 Fab-IL-2 wt-Fab及28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。以94.5%之存活力將傳代9用於移植。在200μl Aim V細胞培養基(Gibco)中經靜脈內將2 x 105個細胞/動物注射至尾靜脈中。在研究之第0天經靜脈內向小鼠注射2 x 105個 LLC1細胞，將其隨機化並稱重。在腫瘤細胞注射後一週時，在三週內每週三次經靜脈內向小鼠注射28H1 Fab-IL-2 wt-Fab或28H1 Fab-IL-2 qm-Fab。經靜脈內向所有小鼠注射200μl適當溶液。向媒劑組中之小鼠注射PBS且向治療組注射28H1 Fab-IL-2 wt-Fab或28H1 Fab-IL-2 qm-Fab構築體。為在每200μl中獲得適當量之免疫偶聯物，視需要使用PBS稀釋儲備液。圖27展示與媒劑組相比在增強中值存活期方面之28H1 Fab-IL-2 wt-Fab及28H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物調介之優良效能，其中28H1 Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物在效能方面略優於8H1 Fab-IL-2 qm-Fab免疫偶聯物。
實例9
隨後在7天靜脈內毒性及毒性動力學研究中於Black 6小鼠中對基於4G8、靶向FAP之Fab-IL-2 qm-Fab與基於4G8、靶向FAP之Fab-IL-2 wt-Fab免疫偶聯物進行比較。表15展示毒性及毒性動力學研究之研究設計。
此研究之目的在於表徵及比較在經7天對無腫瘤雄性小鼠實施一次日靜脈內投與後靶向FAP之4G8 Fab-IL2-Fab野生型(wt)介白素-2(IL-2)及靶向FAP之G48 Fab-IL-2-Fab四重突變IL-2(qm)的毒性及毒性動力學特徵。對於此研究而言，向5只雄性小鼠/組之5個組中經靜脈內投與0(媒劑對照)、4.5μg/g/日或9μg/g/日wt IL-2或4.5μg/g/日或9μg/g/日qm IL-2。向6只雄性小鼠/組之其他4個組中投與4.5μg/g/日或9μg/g/日wt IL-2或4.5μg/g/日或9μg/g/日qm IL-2以評價毒性動力學。因在給予4.5μg/g/日及9μg/g/日wt IL-2之動物中觀察到臨床體徵，故將研究持續時間自7天變為5天。基於死亡率、生活觀察、體重及臨床與解剖病理學來評價毒性。在不同時間點自毒性動力學組中之動物收集血液用於毒性動力學分析。毒性動力學數據展示，使用IL-2或qm IL-2治療之小鼠具有可量測之血漿濃度直至最後出血時間為止，此表明在整個治療持續時間內小鼠皆暴露於各別化合物。第1天之AUC0-inf值顯示wt IL-2及qm IL-2在兩個劑量值下之暴露相當。在第5天獲得稀疏試樣且展示與第1天相等之血漿濃度，此表明在投用任一化合物5天之後並未出現積累。更詳細而言，觀察到下列發現。
毒性動力學
表16匯總了靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 qm-Fab及靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 wt-Fab之平均血漿毒性動力學參數，如藉由WinNonLin版本5.2.1及商業κ-特異性ELISA(Human Kappa ELISA Quantitation Set，Bethyl實驗室)所測定。
下文給出個體血清濃度：
該等數據展示，4G8 Fab-IL-2 qm-Fab及4G8 Fab-IL-2 wt-Fab皆展示相當之藥物代謝動力學性質，其中4G8 Fab-IL-2 qm-Fab之暴露略高。
死亡率
在9μg/g靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中，在第5天屍體剖檢之前在一隻動物中出現治療相關之死亡率。在死亡之前發現活動減退、冷皮膚及弓背姿勢。此動物可能因伴有水腫及出血之肺中細胞浸潤以及顯著骨髓壞死而死亡。死亡率匯總於表17中。
臨床觀察
在給予4.5μg/g/日及9μg/g/日wt IL-2之動物中觀察到活動減退、冷皮膚及弓背姿勢。臨床觀察匯總於表18中。
體重
在治療給予4.5μg/g/日及9μg/g/日(分別為9%及11%)wt IL-2之動 物5天之後觀察到體重具有中等降低。在治療給予4.5μg/g/日或9μg/g/日(分別為2%及1%)qm IL-2之動物5天之後觀察到體重略有降低。在媒劑對照中治療5天之後亦觀察到體重具有中等(9%)降低。然而，若排除潛在離群值(3號動物)，則百分比降低為5%。媒劑組中之體重損失可歸因於壓力。
血液學
在給予4.5μg/g/日(約2/9)及9μg/g/日(約1/11)4G8 Fab-IL-2 wt-Fab之動物中觀察到減少之血小板計數，此與該等動物骨髓中之減少之巨核細胞以及脾及肺中之全身性消耗效應(纖維蛋白)有關(參見下文之組織病理學部分)。該等發現表明，減少之血小板可能係由於消耗與產生降低/骨髓擁擠(由於IL-2之直接或間接效應使得淋巴細胞/骨髓樣細胞產生增加所致)之組合效應。
與化合物投與具有不明確關係之血液學發現包括與媒劑對照組之平均值相比絕對淋巴細胞計數隨4G8 Fab-IL-2 wt-Fab(4.5μg/g(約1/5)及9μg/g(約1/3))而降低。該等發現缺乏明顯之劑量依賴性，但將視為與生活觀察中所注意到之壓力或化合物之誇大藥理學有關之繼發效應(淋巴細胞遷移至組織中)。並無因投與4G8 Fab-IL-2 qm-Fab產生之治療相關之血液學變化。少數孤立之血液學發現在統計學上與其各別對照不同。然而，該等發現不足以展現病理學相關性。
眼觀病理學及組織病理學
治療相關之眼觀發現包含，在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組之5/5及4/5小鼠中分別發現脾增大，且在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab治療組二者之1/5小鼠中發現脾增大。
在給予4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab之組中，在肺、骨髓、肝、脾及胸腺中存在治療相關之組織病理學發現，其中發病率、嚴重程度等級或變化性質有所 不同，如下文所報告。肺中之治療相關之組織病理學發現包括，在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組之5/5小鼠中發現輕微至顯著之單核細胞浸潤且在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組之5/5小鼠中發現邊緣性單核細胞浸潤。單核細胞浸潤包括淋巴細胞(發現其中之一些具有細胞質顆粒)以及反應性巨噬細胞。該等細胞最經常注意到具有血管中心模式(vasocentric pattern)，同時經常在肺中之血管內注意到邊緣化。亦注意到該等細胞環繞血管，但在更嚴重情形下，該模式更具擴散性。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組之5/5小鼠中看到邊緣至輕微之出血，且在9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組之2/5小鼠中看到邊緣出血。儘管最通常在血管周圍發現出血，但在更嚴重情形下，在肺泡腔中發現出血。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之5/5小鼠中發現輕微至中等水腫且在9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中之5/5小鼠中發現邊緣水腫。儘管通常在血管周圍看到水腫，但在更嚴重情形下，亦在肺泡腔中發現水腫。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之2/5及5/5小鼠中分別發現邊緣細胞變性及核破裂且包括浸潤性或反應性白細胞變性。使用MSB染色之所選動物對於4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組二者中動物之肺內發現之纖維蛋白呈現陽性，此部分地與在該等動物中發現之血小板減少相關。
骨髓中治療相關之變化包含在4.5μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組之5/5小鼠及2/5小鼠中及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組之5/5小鼠及2/5小鼠中分別具有邊緣至輕微增加的總骨髓細胞性。此可藉由該等組中增加之邊緣至中等淋巴細胞-骨髓細胞增生來描述，如部分地藉由骨髓及竇內CD3陽性T細胞(具體而言係T-淋巴細胞，藉由使用pan-T細胞標記物CD3在所選動物上實施之免疫組織化學來證實)之數量增加所證實。在兩個4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中具有中等CD3陽性T細胞增加且在兩個4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中具有邊緣至輕微之CD3陽性T細胞增加。在4.5μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之2/5小鼠及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之5/5小鼠中觀察到巨核細胞之邊緣至輕微降低，且在4.5μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之3/5小鼠及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之5/5小鼠中發現紅血球前體之邊緣至中等降低。在4.5(微小)μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之1/5小鼠及9(輕微至顯著)μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之5/5小鼠中發現骨髓壞死。骨髓中巨核細胞之數量減小與血小板減少相關，該血小板減少可能由骨髓之直接擁擠(藉由增加之淋巴細胞/骨髓樣前體及/或骨髓壞死引起)及/或血小板消耗(由各種組織(參見脾及肺)中之發炎引起)引起。在骨髓中發現之紅血球前體減少並不與周邊血血液學發現相關，該等周邊血血液學發現可能由瞬時效應(在周邊血之前之骨髓中看到)及周邊紅血球之較長半衰期(與血小板相比)引起。骨髓中骨髓壞死之機制可為繼發性，其係由於骨髓腔之明顯過度擁擠(由於淋巴細胞/骨髓樣細胞之產生及生長)、細胞因子自增殖細胞類型之全身性或局部釋放(此可能與缺氧之局部影響或化合物之其他藥理學效應有關)。
在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組之5/5小鼠中，肝中之治療相關之發現包括輕微至中等之原發性血管中心單核細胞浸潤及邊緣至輕微之單一細胞壞死。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中之2/5及4/5小鼠中分別看到邊緣單一細胞壞死。單核細胞浸潤主要包括最經常於中心及門脈血管內注意到之血管中心性以及邊緣性之淋巴細胞(具體而言係T-淋巴細胞，藉由使用pan-T細胞標記物CD3在所選動物上實施之免疫組織化學證實)。用於F4/80免疫組織化學染色之所選動物顯示，在9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組之整個肝竇中巨噬細胞/庫普弗細胞(Kupffer cell)之數量及尺寸 有所增加(活化)。
脾中治療相關之發現包括中等至顯著之淋巴增生/浸潤及輕微至中等之巨噬細胞增生/浸潤(在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中之5/5小鼠中)，及輕微至中等之淋巴增生/浸潤及邊緣至輕微之巨噬細胞增生/浸潤(在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中之5/5小鼠中)。9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及4G8 Fab-IL-2 qm-Fab之免疫組織化學展示使用pan-T細胞標記物CD3以及巨噬細胞標記物F4/80之不同模式。對於9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab而言，T細胞及巨噬細胞免疫反應性之模式主要保留於紅髓區域內，此乃因初級卵泡之結構因淋巴細胞裂解及壞死而改變(如下所述)。對於9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab而言，特殊染色展示與媒劑對照類似之模式，但具有動脈周圍淋巴鞘(periarteriolar lymphoid sheath,PALS)白髓擴張(因T細胞群體)及較大之經擴張紅髓區域。在紅髓內亦具有T細胞及巨噬細胞陽性，其中具有與媒劑對照組類似之模式但有所擴展。該等發現與增大脾之眼觀發現相關。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中，分別在3/5小鼠中發現邊緣壞死且在5/5小鼠中發現邊緣至輕微之壞死。壞死通常位於初級卵泡區域附近，且在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中使用MSB染色之所選動物對於纖維蛋白呈現陽性，此部分地與該等動物中發現之減少之血小板相關。在4.5μg/g(微小至輕微)及9μg/g(中等至顯著)4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中看到淋巴細胞裂解。
胸腺中治療相關之發現包含4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組及4.5ug/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中淋巴細胞之微小至輕微之增加。在4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中皮質及髓質個別地並不明顯，但9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中所選動物之pan T細胞標記物(CD3)之免疫組織化學展示對於胸腺內之大部分細胞呈現強烈陽性。胸腺中之增加之淋巴細胞可視為兩種化合物之直接 藥物代謝動力學效應，其中IL-2誘導自骨髓遷移至胸腺(T細胞)之淋巴細胞發生增殖以進一步分化及選殖擴增。此出現於所有組中，9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab除外，其可能為瞬時效應。在4.5μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中具有輕微淋巴細胞裂解，且在9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中具有中等至顯著之淋巴細胞裂解。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組二者中發現中等淋巴缺失。儘管該等發現似乎在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中更為明顯，但將該等動物闡述為在第5天處於瀕死狀態，且輕微至顯著之淋巴細胞裂解以及中等淋巴缺失可與此生活觀察相關(由不良物理條件引起之壓力相關之效應)。
肝中與化合物投與具有不明確關係之組織病理學發現包括，在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中之5/5小鼠中發現隨機分散於整個肝內之小灶/微小肉芽腫之邊緣混合細胞(淋巴細胞及巨噬細胞)浸潤/活化。此邊緣變化亦於媒劑對照組中看到但具有較小發病率及嚴重程度。在9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組之5/5小鼠中看到邊緣至輕微之胃腺膨脹及萎縮，且在3/5小鼠中看到邊緣回腸絨毛萎縮。此發現最有可能歸因於在該等小鼠中看到之不良物理條件(例如減小之體重)，尤其在9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab組中於生活觀察中所發現。
注射位點發現包含混合細胞浸潤、血管周圍水腫及肌變性，在媒劑對照、9μg/g 4G8 Fab-IL-2 wt-Fab及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中皆發現肌變性。一隻動物具有表皮壞死。該等發現並不歸因於治療本身，而是歸因於尾部之日靜脈內注射及處理。另一動物具有與肌變性及肌再生有關之骨骼肌之巨噬細胞浸潤(發現於肺組織組織學部分中，可能由慢性損傷引起)且並不歸因於治療。在4.5μg/g及9μg/g 4G8 Fab-IL-2 qm-Fab組中之3/5及4/5小鼠中分別看到邊緣淋巴缺失且最可能歸因於隨著小鼠變老在胸腺中看到之正常生理學變化(亦以類 似發病率(4/5小鼠)及嚴重程度在媒劑對照動物中看到)。
總而言之，在長達5天內以4.5μg/g/日或9μg/g/日之劑量在雄性小鼠中日靜脈內投與4G8 Fab-IL-2 wt-Fab或4G8 Fab-IL-2 qm-Fab會對於兩種化合物而言產生類似之治療相關之組織學發現。然而，在使用靶向FAP之4G8 Fab-IL-2 wt-Fab時在以下組織中之發現通常更為普遍且更加嚴重：肺(圖28及29)(由淋巴細胞及反應性巨噬細胞構成之單核細胞浸潤、出血及水腫)、骨髓(淋巴-骨髓增生及增加細胞性)、肝(圖30)(單一細胞壞死、庫普弗細胞/巨噬細胞之數量及活化增加)、脾(眼觀放大、巨噬細胞及淋巴細胞浸潤/增生)及胸腺(增加之淋巴細胞)。此外，肺、脾、骨髓及胸腺中之死亡率、淋巴細胞裂解、壞死或細胞變性、以及骨髓中之減小之巨核細胞及紅血球及周邊血中之減小之血小板僅在給予wt IL-2之動物中看到。基於臨床及解剖病理學發現以及臨床觀察及兩種化合物之同等全身性暴露，此研究條件下之qm IL-2在5個劑量後所展現之全身性毒性顯著小於wt IL-2。
實例10 藉由野生型及四重突變IL-2來誘導NK細胞IFN-γ分泌
將NK-92細胞饑餓2h，然後以100000個細胞/孔接種至96孔-F底板中。將IL-2構築體滴加於接種之NK-92細胞上。24h或48h之後，將板離心，然後收集上清液以使用商業IFN-γ ELISA(BD編號：550612)測定人類IFN-γ之量。
測試野生型IL-2之兩份不同室內製劑(很可能其O-糖基化特徵略有不同，參見實例2)、市售野生型IL-2(普留淨注射劑)及室內製得之四重突變IL-2(第一批)。
圖31顯示，四重突變IL-2與商業獲得(普留淨注射劑)或室內產生之野生型IL-2在24小時(A)或48小時(B)內在誘導NK細胞之IFN-γ分泌方面同等有效。
實例11 藉由野生型及四重突變IL-2來誘導NK細胞增殖
將NK-92細胞饑餓2h，然後以10000個細胞/孔接種至96孔-黑色F透明底板中。將IL-2構築體滴加於接種之NK-92細胞上。48h之後，量測ATP含量以使用來自Promega之「CellTiter-Glo Luminescent Cell Viability Assay」套組根據製造商說明書測定活細胞數量。
測試與實例10中相同之IL-2製劑。
圖32展示所有測試分子皆能夠誘導NK細胞增殖。在低濃度(<0.01nM)下，四重突變IL-2之活性略小於室內產生之野生型IL-2，且所有室內製劑之活性皆小於在商業上獲得之野生型IL-2(普留淨注射劑)。
在第二實驗中，測試下列IL-2製劑：野生型IL-2(池2)、四重突變IL-2(第一批及第二批)。
圖33展示，所有測試分子在誘導NK細胞增殖方面之活性基本類似，其中在最低濃度下兩種突變IL-2製劑之活性僅略小於野生型IL-2製劑。
實例12 藉由包括野生型或四重突變IL-2之免疫偶聯物來誘導人類PBMC增殖
使用Histopaque-1077(Sigma Diagnostics公司，St.Louis,MO，美國)製備周邊血單核細胞(PBMC)。簡言之，將來自健康志願者之靜脈血汲取至肝素化注射器中。使用無鈣且無鎂之PBS以2：1稀釋血液，並在Histopaque-1077上分層。將梯度在450×g及室溫(RT)下無間斷離心30min。收集含有PBMC之中間相並使用PBS洗滌三次(350×g，隨後300×g，10min，在室溫下)。
隨後，在37℃下使用40nM CFSE(羧基螢光素琥珀醯亞胺酯)經15min來標記PBMC。使用20ml培養基洗滌細胞，然後在37℃下經30 min回收標記之PBMC。洗滌細胞，計數，且將100000個細胞接種至96-孔-U底板中。將預稀釋之普留淨注射劑(實施野生型IL-2)或IL2-免疫偶聯物滴加於培育指定時間點之接種細胞上。4-6天之後，洗滌細胞，對適當細胞表面標記物染色，並藉由FACS使用BD FACSCantoII進行分析。將NK細胞定義為CD3-/CD56+，將CD4 T細胞定義為CD3+/CD8-，且將CD8 T細胞定義為CD3+/CD8+。
圖34展示在與不同靶向FAP之28H1 IL-2免疫偶聯物一起培育4(A)、5(B)或6(C)天之後NK細胞之增殖。所有測試構築體皆以濃度依賴性方式誘導NK細胞增殖。在較低濃度下普留淨注射劑之有效性高於免疫偶聯物，然而，此差異在較高濃度下不再存在。在較早時間點(第4天)，IgG-IL2構築體之功效似乎略高於Fab-IL2-Fab構築體。在較晚時間點(第6天)，所有構築體皆具有同等效能，其中Fab-IL2 qm-Fab構築體在低濃度下之功效最小。
圖35展示在與不同靶向FAP之28H1 IL-2免疫偶聯物一起培育4(A)、5(B)或6(C)天之後CD4 T細胞之增殖。所有測試構築體皆以濃度依賴性方式誘導CD4 T細胞增殖。普留淨注射劑之活性高於免疫偶聯物，且包括野生型IL-2之免疫偶聯物之功效略高於包括四重突變IL-2者。對於NK細胞而言，Fab-IL2 qm-Fab構築體具有最低活性。最可能地，增殖CD4 T細胞部分地至少對於野生型IL-2構築體而言係調節T細胞。
圖36展示在與不同靶向FAP之28H1 IL-2免疫偶聯物一起培育4(A)、5(B)或6(C)天之後CD8 T細胞之增殖。所有測試構築體皆以濃度依賴性方式誘導CD8 T細胞增殖。普留淨注射劑之活性高於免疫偶聯物，且包括野生型IL-2之免疫偶聯物之功效略高於包括四重突變IL-2者。對於NK細胞及CD4 T細胞而言，Fab-IL2 qm-Fab構築體具有最低活性。
圖37繪示另一實驗之結果，其中對包括野生型或四重突變IL-2之靶向FAP之28H1 IgG-IL-2及普留淨注射劑進行比較。培養時間為6天。如圖中所展示，所有三種IL-2構築體皆以劑量依賴性方式誘導NK(A)及CD8 T細胞(C)增殖且具有類似功效。對於CD4 T細胞(B)而言，IgG-IL2 qm免疫偶聯物具有較低活性(尤其在中等濃度下)，此可能歸因於其缺乏對於作為CD4 T細胞子組之CD25陽性(包含調節)T細胞之活性。
實例13 野生型及四重突變IL-2之效應子細胞活化(pSTAT5分析)
如上所述來製備PBMC。將500000個PBMC/孔接種至96-孔-U底板中並在37℃下於含有10% FCS及1% Glutamax(Gibco)之RPMI培養基中靜置45min。然後，將PBMC與普留淨注射劑、室內產生之野生型IL-2或四重突變IL-2於指定濃度下在37℃下一起培育20min以誘導STAT5之磷酸化。隨後，將細胞立即在37℃下固定(BD Cytofix緩衝液)10min並洗滌一次，隨後在4℃下經30min實施透化步驟(BD Phosflow Perm緩衝液III)。然後，使用PBS/0.1% BSA洗滌細胞並使用FACS抗體混合物染色以在室溫下於黑暗中經30min檢測NK細胞(CD3-/CD56+)、CD8+ T細胞(CD3+/CD8+)、CD4+ T細胞(CD3+/CD4+/CD25-/CD127+)或Treg細胞(CD4+/CD25+/CD127-/FoxP3+)以及pSTAT5。使用PBS/0.1% BSA將細胞洗滌兩次並再懸浮於2% PFA中，然後實施流式細胞分析(BD FACSCantoII)。
圖38展示在與普留淨注射劑、室內產生之野生型IL-2(池2)及四重突變IL-2(第1批)一起培育30min之後NK細胞(A)、CD8 T細胞(B)、CD4 T細胞(C)及調節T細胞(D)中之STAT磷酸化。所有三種IL-2製劑在誘導NK以及CD8 T細胞中之STAT磷酸化方面同等有效。在CD4 T細胞及調節T細胞(更為顯著)中，四重突變IL-2之活性低於野生型IL-2製 劑。
實例14 野生型及四重突變IgG-IL-2之效應子細胞活化(pSTAT5分析)
實驗條件如上所述(參見實例13)。
圖39展示在與普留淨注射劑、包括野生型IL-2之IgG-IL-2或包括四重突變IL-2之IgG-IL-2一起培育30min之後NK細胞(A)、CD8 T細胞(B)、CD4 T細胞(C)及調節T細胞(D)中之STAT磷酸化。在所有細胞類型中，普留淨注射劑誘導STAT磷酸化之功效高於IgG-IL-2免疫偶聯物。IgG-IL-2野生型及四重突變構築體在NK以及CD8 T細胞中同等有效。在CD4 T細胞及調節T細胞(更為顯著)中，IgG-IL-2四重突變之活性低於IgG-IL-2野生型免疫偶聯物。
實例15 靶向FAP之Fab-IL2 wt-Fab及Fab-IL2 qm-Fab免疫偶聯物之最大耐受劑量(MTD)
在無腫瘤免疫活性Black 6小鼠中，測試包括野生型(wt)或四重突變(qm)IL-2之靶向FAP之Fab-IL2-Fab免疫偶聯物之增加的劑量。
根據既定導則(GV-Solas；Felasa；TierschG)，將雌性Black 6小鼠(Charles River，德國)(在實驗開始時為8-9週齡)維持於無特定病原體條件下且實施12h光/12h黑暗之日循環。實驗研究方案已經地方政府檢查且批准(P 2008016)。運抵後，將動物供養一週以適應新環境並進行觀察。定期實施連續健康監測。
在7天內每天一次向小鼠經靜脈內注射4G8 Fab-IL2 wt-Fab(以60μg/小鼠、80μg/小鼠及100μg/小鼠之劑量)或4G8 Fab-IL2 qm-Fab(以100μg/小鼠、200μg/小鼠、400μg/小鼠、600μg/小鼠及1000μg/小鼠之劑量)。經靜脈內向所有小鼠注射200μl適當溶液。為在每200μl中獲得適當量之免疫偶聯物，視需要使用PBS稀釋儲備液。
圖40展示，Fab-IL2 qm-Fab之MTD(最大耐受劑量)為Fab-IL2 wt-Fab之10倍，亦即Fab-IL2 qm-Fab之600μg/小鼠日(7天內)對Fab-IL2 wt-Fab之60μg/小鼠日(7天內)。
實例16 單一劑量之靶向FAP及非靶向之IgG-IL2 wt及qm之藥物代謝動力學
在無腫瘤免疫活性129小鼠中實施包括野生型或四重突變IL-2之靶向FAP之IgG-IL2免疫偶聯物及包括野生型或四重突變IL-2之非靶向IgG-IL2免疫偶聯物的單一劑量藥物代謝動力學(PK)研究。
根據既定導則(GV-Sblas；Felasa；TierschG)，將雌性129小鼠(Harlan，英國)(在實驗開始時為8-9週齡)維持於無特定病原體條件下且實施12h光/12h黑暗之日循環。實驗研究方案已經地方政府檢查且批准(P 2008016)。運抵後，將動物供養一週以適應新環境並進行觀察。定期實施連續健康監測。
經靜脈內向小鼠注射一次靶向FAP之28H1 IgG-IL2 wt(2.5mg/kg)或28H1 IgG-IL2 qm(5mg/kg)或非靶向DP47GS IgG-IL2 wt(5mg/kg)或DP47GS IgG-IL2 qm(5mg/kg)。經靜脈內向所有小鼠注射200μl適當溶液。為在每200μl中獲得適當量之免疫偶聯物，視需要使用PBS稀釋儲備液。
在第1、8、24、48、72、96h時對小鼠實施取血；且此後在3週內每2天實施取血。提取血清並儲存於-20℃下直至ELISA分析為止。使用ELISA測定血清中之免疫偶聯物濃度以量化IL2-免疫偶聯物抗體(Roche-Penzberg)。使用405nm之量測波長及492nm之參考波長量測吸收(VersaMax可調微量板讀數儀，Molecular Devices)。
圖41展示該等IL-2免疫偶聯物之藥物代謝動力學。靶向FAP(A)及非靶向(B)之IgG-IL2 qm構築體二者之血清半衰期(約30h)皆長於相應IgG-IL2 wt構築體(約15h)。
實例17 單一劑量之非靶向Fab-IL2 wt-Fab及Fab-IL2 qm-Fab之藥物代謝動力學
在無腫瘤免疫活性129小鼠中實施包括野生型或四重突變IL-2之非靶向Fab-IL2-Fab免疫偶聯物之單一劑量藥物代謝動力學(PK)研究。
根據既定導則(GV-Solas；Felasa；TierschG)，將雌性129小鼠(Harlan，英國)(在實驗開始時為8-9週齡)維持於無特定病原體條件下且實施12h光/12h黑暗之日循環。實驗研究方案已經地方政府檢查且批准(P 2008016)。運抵後，將動物供養一週以適應新環境並進行觀 察。定期實施連續健康監測。
經靜脈內向小鼠注射一次DP47GS Fab-IL2 wt-Fab(以65nmol/kg之劑量)或DP47GS Fab-IL2 qm-Fab(以65nM/kg之劑量)。經靜脈內向所有小鼠注射200μl適當溶液。為在每200μl中獲得適當量之免疫偶聯物，視需要使用PBS稀釋儲備液。
在第0.5、1、3、8、24、48、72、96小時時對小鼠實施取血且此後在3週內每2天實施取血。提取血清並儲存於-20℃下直至ELISA分析為止。使用ELISA測定血清中之免疫偶聯物濃度以量化IL2-免疫偶聯物抗體(Roche-Penzberg)。使用405nm之量測波長及492nm之參考波長量測吸收(VersaMax可調微量板讀數儀，Molecular Devices)。
圖42展示該等IL-2免疫偶聯物之藥物代謝動力學。Fab-IL2-Fab wt及qm構築體具有大約3-4h之血清半衰期。包括野生型或四重突變IL-2之構築體間之血清半衰期差異在Fab-IL2-Fab構築體中之明顯程度小於IgG樣免疫偶聯物(其本身具有較長半衰期)。
實例18 IL-2活化之PBMC之活化誘導之細胞死亡
使用存於RPMI1640(具有10% FCS及1%麩醯胺酸)中之1μg/ml PHA-M將來自健康供體之新分離PBMC預活化過夜。預活化之後，收 穫PBMC，使用存於PBS中之40nM CFSE標記，並以100 000個細胞/孔接種於96-孔板中。使用不同濃度之IL-2免疫偶聯物(4B9 IgG-IL-2 wt、4B9 IgG-IL-2 qm、4B9 Fab-IL-2 wt-Fab及4B9 Fab-IL-2 qm-Fab)刺激預活化之PBMC。實施IL-2處理6天後，使用0.5μg/ml活化抗Fas抗體過夜處理PBMC。6天之後，藉由CFSE稀釋分析CD4(CD3+CD8-)及CD8(CD3+CD8+)T細胞之增殖。藉由針對CD3+ Annexin V陰性活細胞進行選通來測定在抗Fas處理之後活T細胞之百分比。
如圖44中所展示，所有構築體皆誘導預活化T細胞之增殖。在低濃度下，包括野生型IL-2 wt之構築體之活性高於包括IL-2 qm之構築體。IgG-IL-2 wt、Fab-IL-2 wt-Fab及普留淨注射劑具有類似活性。Fab-IL-2 qm-Fab之活性略小於IgG-IL-2 qm。包括野生型IL-2之構築體對於CD4 T細胞之活性高於CD8 T細胞，此最可能歸因於調節T細胞之活化。包括四重突變IL-2之構築體對於CD8及CD4 T細胞具有類似活性。
如圖45中所展示，使用高濃度野生型IL-2刺激之T細胞對於抗Fas誘導之細胞凋亡之敏感性高於使用四重突變IL-2處理的T細胞。
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儘管出於理解清晰性之目的藉由闡釋及實例方式略微詳細地闡述了前文之發明，但不應將說明及實例解釋為限制本發明範圍。本文所引用所有專利及科學文獻之全部揭示內容明確地以引用方式併入本文中。
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<213> 人工序列
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<223> 19G1 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
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<211> 605
<212> PRT
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<212> DNA
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<220>
<223> 20G8 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
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<211> 605
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<213> 人工序列
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<213> 人工序列
<220>
<223> 2B10 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 242
<210> 243
<211> 613
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> C3B6 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 243
<210> 244
<211> 1839
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> C3B6 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 244
<210> 245
<211> 613
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 6A12 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 245
<210> 246
<211> 1839
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 6A12 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 246
<210> 247
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 2B10輕鏈
<400> 247
<210> 248
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 2B10輕鏈
<400> 248
<210> 249
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> D1A2輕鏈
<400> 249
<210> 250
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> D1A2輕鏈
<400> 250
<210> 251
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> O7D8輕鏈
<400> 251
<210> 252
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> O7D8輕鏈
<400> 252
<210> 253
<211> 615
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> MHLG1 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 253
<210> 254
<211> 1845
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> MHLG1 Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 254
<210> 255
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> KV9輕鏈
<400> 255
<210> 256
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> KV9輕鏈
<400> 256
<210> 257
<211> 615
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> MHLG Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 257
<210> 258
<211> 1845
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> MHLG Fab-IL2 qm-Fab(重鏈細胞因子融合構築體)
<400> 258
<210> 259
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> KV1輕鏈
<400> 259
<210> 260
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> KV1輕鏈
<400> 260
<210> 261
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> KV7輕鏈
<400> 261
<210> 262
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> KV7輕鏈
<400> 262
<210> 263
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 263
<210> 264
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 264
<210> 265
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 265
<210> 266
<211> 22
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 266
<210> 267
<211> 66
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 267
<210> 268
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 268
<210> 269
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 269
<210> 270
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 270
<210> 271
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 271
<210> 272
<211> 20
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 272
<210> 273
<211> 60
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 前導序列
<400> 273
<210> 274
<211> 466
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人類IL-2R-β-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 274
<210> 275
<211> 1401
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人類IL-2R-β-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 275
<210> 276
<211> 492
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人類IL-2R-β-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 276
<210> 277
<211> 1479
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人類IL-2R-γ-Fc(凸起)融合蛋白
<400> 277
<210> 278
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人類IL-2Rα亞單位+Avi標籤+His標籤
<400> 278
<210> 279
<211> 660
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 人類IL-2Rα亞單位+Avi標籤+His標籤
<400> 279
<210> 280
<211> 473
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 鼠類IL-2R-β-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 280
<210> 281
<211> 1422
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 鼠類IL-2R-β-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 281
<210> 282
<211> 500
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 鼠類IL-2R-γ-Fc(凸起)融合蛋白
<400> 282
<210> 283
<211> 1503
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 鼠類IL-2R-γ-Fc(凸起)融合蛋白
<400> 283
<210> 284
<211> 213
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 鼠類IL-2Rα亞單位+Avi標籤+His標籤
<400> 284
<210> 285
<211> 642
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 鼠類IL-2Rα亞單位+Avi標籤+His標籤
<400> 285
<210> 286
<211> 480
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 短尾猴IL-2R-β-Fc(凸起)融合蛋白+Avi標籤
<400> 286
<210> 287
<211> 1443
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 短尾猴IL-2R-β-Fc(凸起)融合蛋白+Avi標籤
<400> 287
<210> 288
<211> 489
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 短尾猴IL-2R-γ-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 288
<210> 289
<211> 1470
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 短尾猴IL-2R-γ-Fc(孔洞)融合蛋白
<400> 289
<210> 290
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 短尾猴IL-2Rα亞單位+Avi標籤+His標籤
<400> 290
<210> 291
<211> 654
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 短尾猴IL-2Rα亞單位+Avi標籤+His標籤
<400> 291
<210> 292
<211> 399
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 野生型IL-2(C125A)(4)
<400> 292
<210> 293
<211> 399
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> IL-2突變L72G(C125A)(4)
<400> 293
<210> 294
<211> 399
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> IL-2突變L72G/F42A(C125A)(4)
<400> 294
<210> 295
<211> 399
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> IL-2三重突變F42A/Y45A/L72G(C125A)(4)
<400> 295
<210> 296
<211> 399
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> IL-2四重突變T3A/F42A/Y45A/L72G(C125A)(4)
<400> 296
<210> 297
<211> 593
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 28H1 Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 297
<210> 298
<211> 1779
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 28H1 Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 298
<210> 299
<211> 446
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 28H1 Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 299
<210> 300
<211> 1338
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 28H1 Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 300
<210> 301
<211> 594
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 4B9 Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 301
<210> 302
<211> 1782
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 4B9 Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 302
<210> 303
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 4B9 Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 303
<210> 304
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 4B9 Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 304
<210> 305
<211> 592
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47GS Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 305
<210> 306
<211> 1776
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47GS Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 306
<210> 307
<211> 445
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47GS Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 307
<210> 308
<211> 133 5
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47GS Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 308
<210> 309
<211> 215
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47GS輕鏈
<400> 309
<210> 310
<211> 645
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> DP47GS輕鏈
<400> 310
<210> 311
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A；VL
<400> 311
<210> 312
<211> 324
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A；VL
<400> 312
<210> 313
<211> 121
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A；VH
<400> 313
<210> 314
<211> 363
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A；VH
<400> 314
<210> 315
<211> 594
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 4G8 Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 315
<210> 316
<211> 1782
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 4G8 Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 316
<210> 317
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 4G8 Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 317
<210> 318
<211> 1341
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 4G8 Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 318
<210> 319
<211> 600
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 319
<210> 320
<211> 1800
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A Fab重鏈-Fc(凸起)-IL-2 qm
<400> 320
<210> 321
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A重鏈-Fc(孔洞)
<400> 321
<210> 322
<211> 1353
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A Fab重鏈-Fc(孔洞)
<400> 322
<210> 323
<211> 215
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A 輕鏈
<400> 323
<210> 324
<211> 645
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> CH1A1A輕鏈
<400> 324

Claims (21)

  1. 一種免疫偶聯物，其包含突變IL-2多肽及抗原結合部分，其中該突變IL-2多肽為包含胺基酸取代F42A、Y45A及L72G之人類IL-2分子，其編碼係相對於SEQ ID NO：1之人類IL-2序列；及其中該抗原結合部分為對成纖維細胞活化蛋白(FAP)具專一性之IgG1亞類免疫球蛋白分子，其包含(i)SEQ ID NO：41之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：39之輕鏈可變區域序列；(ii)SEQ ID NO：51之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：49之輕鏈可變區域序列；(iii)SEQ ID NO：111之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：109之輕鏈可變區域序列；(iv)SEQ ID NO：143之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：141之輕鏈可變區域序列；或(v)SEQ ID NO：151之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：149之輕鏈可變區域序列。
  2. 如請求項1之免疫偶聯物，其中該突變IL-2多肽進一步包含胺基酸取代T3A及/或胺基酸取代C125A。
  3. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其中該突變IL-2多肽包含SEQ ID NO：19之序列。
  4. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其中該突變IL-2多肽以其胺基末端胺基酸與該免疫球蛋白重鏈之一的羧基末端胺基酸連結。
  5. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其中該免疫偶聯物包含不超過一個突變IL-2多肽。
  6. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其中該IgG1亞類免疫球蛋白分子在Fc結構域中包括促進兩個不同免疫球蛋白重鏈異源二聚化之修飾。
  7. 如請求項6之免疫偶聯物，其中該修飾係凸起與孔洞(knob-into-hole)修飾，包括位於一個免疫球蛋白重鏈中之凸起修飾及位於 另一免疫球蛋白重鏈中之孔洞修飾。
  8. 如請求項7之免疫偶聯物，其中該凸起修飾包括位於兩個免疫球蛋白重鏈中之一個之胺基酸取代T366W，及該孔洞修飾位於兩個免疫球蛋白重鏈中另一個之胺基酸取代T366S、L368A及Y407V。
  9. 如請求項8之免疫偶聯物，其中該包括凸起修飾之免疫球蛋白重鏈另外包含胺基酸取代S354C，及該包括孔洞修飾之免疫球蛋白重鏈另外包含胺基酸取代Y349C。
  10. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其中該IgG1分子在其Fc結構域中包括減少該免疫偶聯物對FcγRIIIa、FcγRI或FcγRIIa受體之結合親和力之一或多個胺基酸突變。
  11. 如請求項10之免疫偶聯物，其中該IgG1分子包括胺基酸突變L234A、L235A及P329G。
  12. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其包含(i)與SEQ ID NO：297至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列、與SEQ ID NO：299至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列及與SEQ ID NO：233至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；(ii)與SEQ ID NO：301至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列、與SEQ ID NO：303至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列及與SEQ ID NO：231至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列；或(iii)與SEQ ID NO：315至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列、與SEQ ID NO：317至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、 98%、99%或100%一致之多肽序列及與SEQ ID NO：233至少約80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之多肽序列。
  13. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其中該對FAP具專一性之IgG1分子包括SEQ ID NO：111之重鏈可變區域序列及SEQ ID NO：109之輕鏈可變區域序列。
  14. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其包括SEQ ID NO：301之多肽序列、SEQ ID NO：303之多肽序列及SEQ ID NO：231之多肽序列。
  15. 如請求項1或2之免疫偶聯物，其基本上由藉由鏈接序列連結之突變IL-2多肽及IgG1分子所組成。
  16. 一種經分離之多核苷酸，其編碼如請求項1至15中任一項之免疫偶聯物。
  17. 一種宿主細胞，其包括如請求項16之多核苷酸。
  18. 一種產生包含突變IL-2多肽及抗原結合部分之免疫偶聯物之方法，其包括在適於表現該免疫偶聯物之條件下培養如請求項17之宿主細胞。
  19. 一種免疫偶聯物，其係藉由如請求項18之方法產生。
  20. 一種醫藥組合物，其包括如請求項1至15或19中任一項之免疫偶聯物及醫藥上可接受之載劑。
  21. 一種如請求項1至15或19中任一項之免疫偶聯物之用途，其用以製造用於治療有需要個體之癌症之藥劑。
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