RU2209246C2 - Малая субъединица изозима iii и изозим iii синтетазы ацетогидроксикислот из escherichia coli, фрагмент днк (варианты), штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-валина (варианты) и способ получения l-валина - Google Patents
Малая субъединица изозима iii и изозим iii синтетазы ацетогидроксикислот из escherichia coli, фрагмент днк (варианты), штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-валина (варианты) и способ получения l-валина Download PDFInfo
- Publication number
- RU2209246C2 RU2209246C2 RU2000101678/13A RU2000101678A RU2209246C2 RU 2209246 C2 RU2209246 C2 RU 2209246C2 RU 2000101678/13 A RU2000101678/13 A RU 2000101678/13A RU 2000101678 A RU2000101678 A RU 2000101678A RU 2209246 C2 RU2209246 C2 RU 2209246C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- valine
- escherichia coli
- residue
- amino acid
- dna
- Prior art date
Links
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 title claims abstract description 173
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 title claims abstract description 39
- 239000012634 fragment Substances 0.000 title claims abstract description 28
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 23
- 108010044467 Isoenzymes Proteins 0.000 title claims abstract description 17
- 108010000700 Acetolactate synthase Proteins 0.000 title claims abstract description 12
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims abstract description 89
- 229960004295 valine Drugs 0.000 claims abstract description 85
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims abstract description 16
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims abstract description 15
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N aspartic acid group Chemical group N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 claims abstract description 14
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims abstract description 13
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims abstract description 11
- 125000003607 serino group Chemical class [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 claims abstract description 11
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims abstract description 11
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 10
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M Pyruvate Chemical compound CC(=O)C([O-])=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims abstract description 10
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims abstract description 10
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims abstract description 9
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 claims abstract description 9
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 claims abstract description 9
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 9
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims abstract description 9
- TYEYBOSBBBHJIV-UHFFFAOYSA-N 2-oxobutanoic acid Chemical compound CCC(=O)C(O)=O TYEYBOSBBBHJIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 7
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 claims abstract description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 7
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 claims abstract description 6
- VUQLHQFKACOHNZ-UHFFFAOYSA-N 2-Aceto-2-hydroxybutanoate Chemical compound CCC(O)(C(C)=O)C(O)=O VUQLHQFKACOHNZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 5
- WTLNOANVTIKPEE-UHFFFAOYSA-N 2-acetyloxypropanoic acid Chemical compound OC(=O)C(C)OC(C)=O WTLNOANVTIKPEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims abstract description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims abstract description 5
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims abstract description 4
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims abstract description 4
- 125000000613 asparagine group Chemical class N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 claims abstract description 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 29
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 26
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 25
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 claims description 13
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 12
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 claims description 3
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 16
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 abstract description 8
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 6
- 238000002955 isolation Methods 0.000 abstract description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 abstract 1
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 68
- 101150077793 ilvH gene Proteins 0.000 description 34
- 102100027328 2-hydroxyacyl-CoA lyase 2 Human genes 0.000 description 30
- 101710103719 Acetolactate synthase large subunit Proteins 0.000 description 30
- 101710182467 Acetolactate synthase large subunit IlvB1 Proteins 0.000 description 30
- 101710171176 Acetolactate synthase large subunit IlvG Proteins 0.000 description 30
- 101710176702 Acetolactate synthase small subunit Proteins 0.000 description 30
- 101710147947 Acetolactate synthase small subunit 1, chloroplastic Proteins 0.000 description 30
- 101710095712 Acetolactate synthase, mitochondrial Proteins 0.000 description 30
- 101710196435 Probable acetolactate synthase large subunit Proteins 0.000 description 30
- 101710181764 Probable acetolactate synthase small subunit Proteins 0.000 description 30
- 101710104000 Putative acetolactate synthase small subunit Proteins 0.000 description 30
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 19
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 14
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 10
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 10
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 9
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Chemical compound CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 7
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 7
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 7
- 101150043028 ilvD gene Proteins 0.000 description 7
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150105723 ilvD1 gene Proteins 0.000 description 6
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 6
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 6
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 6
- 229940076788 pyruvate Drugs 0.000 description 6
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 5
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- 235000019454 L-leucine Nutrition 0.000 description 5
- 239000004395 L-leucine Substances 0.000 description 5
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 5
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 5
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 5
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 5
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L Calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 4
- 229930182844 L-isoleucine Natural products 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 108010006873 Threonine Dehydratase Proteins 0.000 description 4
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 4
- 101150020087 ilvG gene Proteins 0.000 description 4
- 101150015635 ilvI gene Proteins 0.000 description 4
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 4
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 4
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 108010030074 endodeoxyribonuclease MluI Proteins 0.000 description 3
- 101150099953 ilvE gene Proteins 0.000 description 3
- 101150003892 ilvM gene Proteins 0.000 description 3
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 3
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 3
- 101150028074 2 gene Proteins 0.000 description 2
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 2
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 2
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000702191 Escherichia virus P1 Species 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000607720 Serratia Species 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 2
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- -1 glucose and sucrose Chemical class 0.000 description 2
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 2
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 2
- AGBQKNBQESQNJD-UHFFFAOYSA-M lipoate Chemical compound [O-]C(=O)CCCCC1CCSS1 AGBQKNBQESQNJD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 235000019136 lipoic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 2
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 229960002663 thioctic acid Drugs 0.000 description 2
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 description 2
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 2
- UKAUYVFTDYCKQA-UHFFFAOYSA-N -2-Amino-4-hydroxybutanoic acid Natural products OC(=O)C(N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMVYERAUBSAVAX-UHFFFAOYSA-N 1-nitro-1-nitrosoguanidine Chemical compound NC(=N)N(N=O)[N+]([O-])=O HMVYERAUBSAVAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000186361 Actinobacteria <class> Species 0.000 description 1
- 108700028939 Amino Acyl-tRNA Synthetases Proteins 0.000 description 1
- 102000052866 Amino Acyl-tRNA Synthetases Human genes 0.000 description 1
- 101000787278 Arabidopsis thaliana Valine-tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2 Proteins 0.000 description 1
- 101000787296 Arabidopsis thaliana Valine-tRNA ligase, mitochondrial 1 Proteins 0.000 description 1
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 1
- 241000186146 Brevibacterium Species 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 241000186031 Corynebacteriaceae Species 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- 101000787280 Dictyostelium discoideum Probable valine-tRNA ligase, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 108700016168 Dihydroxy-acid dehydratases Proteins 0.000 description 1
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 1
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N L-homoserine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N N-formyl-L-phenylalanine Chemical compound O=CN[C@H](C(=O)O)CC1=CC=CC=C1 NSTPXGARCQOSAU-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- IOVCWXUNBOPUCH-UHFFFAOYSA-N Nitrous acid Chemical compound ON=O IOVCWXUNBOPUCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000013625 Valine-tRNA Ligase Human genes 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 1
- 238000005273 aeration Methods 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000006696 biosynthetic metabolic pathway Effects 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000009615 deamination Effects 0.000 description 1
- 238000006481 deamination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L dipotassium hydrogen phosphate Chemical compound [K+].[K+].OP([O-])([O-])=O ZPWVASYFFYYZEW-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 235000011187 glycerol Nutrition 0.000 description 1
- 101150095957 ilvA gene Proteins 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 229910000358 iron sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L iron(2+) sulfate (anhydrous) Chemical compound [Fe+2].[O-]S([O-])(=O)=O BAUYGSIQEAFULO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 229940099596 manganese sulfate Drugs 0.000 description 1
- 239000011702 manganese sulphate Substances 0.000 description 1
- 235000007079 manganese sulphate Nutrition 0.000 description 1
- SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L manganese(II) sulfate Chemical compound [Mn+2].[O-]S([O-])(=O)=O SQQMAOCOWKFBNP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 1
- 231100000707 mutagenic chemical Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 229910017464 nitrogen compound Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002830 nitrogen compounds Chemical class 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229960000344 thiamine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 235000019190 thiamine hydrochloride Nutrition 0.000 description 1
- 239000011747 thiamine hydrochloride Substances 0.000 description 1
- DPJRMOMPQZCRJU-UHFFFAOYSA-M thiamine hydrochloride Chemical compound Cl.[Cl-].CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N DPJRMOMPQZCRJU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000017105 transposition Effects 0.000 description 1
- ACWBQPMHZXGDFX-QFIPXVFZSA-N valsartan Chemical compound C1=CC(CN(C(=O)CCCC)[C@@H](C(C)C)C(O)=O)=CC=C1C1=CC=CC=C1C1=NN=NN1 ACWBQPMHZXGDFX-QFIPXVFZSA-N 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/08—Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
Изобретение относится к способу получения L-валина. Выращивают штамм E. coli, содержащий ДНК, кодирующую изозим III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia coli в питательной среде, обеспечивающей продукцию и накопление L-валина в питательной среде, и выделения L-валина из питательной среды. Изозим III синтетазы не ингибируется L-валином и обладает каталитической активностью в двух реакциях: реакции синтеза α-ацетолактата из пирувата и реакции синтеза α-ацето-α-гидроксибутирата из α-кетобутирата и пирувата. Изозим III в малой субъединице содержит мутацию в положении 17 с заменой серина на фенилаланин, или в положении 29 с заменой аспарагинового остатка на лизин или тирозин, или мутацию, приводящую к делеции С-концевого участка, начиная с аминокислоты в положении 91, или к замене глицинового остатка в положении 14 на остаток аспаргиновой кислоты. Последовательности приведены в описании. Штаммы E. coli содержат соответствующие фрагменты ДНК. Изобретение позволяет повысить экспрессию L-валина. 9 с.п. ф-лы, 2 ил., 4 табл.
Description
Изобретение относится к способу получения L-валина методом ферментации и касается, в частности, ДНК, кодирующей изозим III синтетазы ацетогидроксикислот, нечувствительной к ретроингибированию L-валином, микроорганизма, содержащего эту ДНК, и способа получения L-валина с помощью такого микроорганизма.
ПРЕДПОСЫЛКИ СОЗДАНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Известны способы получения L-валина методом ферментации с использованием микроорганизмов, принадлежащих главным образом к роду Brevibacterium. Corynebacterium или Serratia или их мутантов, продуцирующих L-валин или L-лейцин (Amino Acid Fermentation, Japan Scientific Society's press, pp.397-422, 1986). И хотя применяемые в настоящее время методы позволяют значительно увеличить производство этих аминокислот, разработка более продуктивных, рентабельных методов требуется для того, чтобы удовлетворить растущую потребность в L-валине и L-лейцине в будущем.
Известны способы получения L-валина методом ферментации с использованием микроорганизмов, принадлежащих главным образом к роду Brevibacterium. Corynebacterium или Serratia или их мутантов, продуцирующих L-валин или L-лейцин (Amino Acid Fermentation, Japan Scientific Society's press, pp.397-422, 1986). И хотя применяемые в настоящее время методы позволяют значительно увеличить производство этих аминокислот, разработка более продуктивных, рентабельных методов требуется для того, чтобы удовлетворить растущую потребность в L-валине и L-лейцине в будущем.
В качестве примера бактерий, отличных от указанных выше и использующихся для производства L-валина, можно привести принадлежащий к роду Escherichia coli продуцент L-валина, требующий для роста липоевую кислоту и/или лишенный активности Н+-АТФазы. Таким же примером является бактерия, принадлежащая к роду Escherichia coli и обладающая вышеуказанными характеристиками, в которую введен оперон ilvGMEDA, экпрессирующий гены ilvG, ilvM, ilvE и ilvD и не экспрессирующий треонин дезаминазу (WO96/06926).
Последняя стадия биосинтеза L-валина осуществляется под действием группы ферментов, кодируемых опероном ilvGMEDA. Оперон ilvGMEDA состоит из генов iLvG, ilvM, ilvE, ilvD и ilvA, которые кодируют большую и малую субъединицы изозима II синтетазы ацетогидроксикислот, трансаминазы, дегидратазы дигидроксикислот и треонин дезаминазы соответственно. Среди этих ферментов синтетаза ацетогидроксикислот, трансаминаза и дегидратаза дигидроксикислот катализируют реакцию синтеза L-валина из пирувиновой кислоты и L-изолейцина из 2-кетомаслянной кислоты, а треонин дезаминаза катализирует дезаминирование L-треонина в 2-кетомаслянную кислоту, которое является стадией, лимитирующей скорость биосинтеза L-изолейцина. При этом экспрессия оперона ilvGMEDA контролируется (ослабевает) L-валином, L-изолейцином и/или L-лейцином.
В качестве синтетазы ацетогидроксикислот, имеющей отношение к биосинтезу L-валина, кроме изозима II (здесь и далее упоминающегося как AHAS II) известен изозим III (здесь и далее упоминающийся как AHAS III). AHAS III кодируется опероном ilvH, состоящим из гена ilvI, кодирующего большую (каталитическую) субъединицу, и гена ilvH, кодирующего малую (регуляторную) субъединицу. AHAS III подвергается ретроингибированию L-валином.
Кроме того, известно, что ген ilvH, клонированный из мутантной Escherichia coli, устойчивой к L-валину, содержит мутацию, приводящую к аминокислотной замене 14Gly на Asp (Vyazmensky, M. et al., Biochemistry, 35, 10339-10346(1996)). Более того, известна мутация ilvH612, затрагивающая AHAS III (De Felice et al. , J.Bacteriol., 120, 1058-1067 (1974)). Ген ilvH в опероне ilvIH штамма Escherichia coli MI262 (Guardiola et al., J.Bacteriol., 120, 536-538(1974); De Felice et al., J.Bacteriol., 120, 1068-1077 (1974)) содержит двойную мутацию, приводящую к замене 29Asn на Lys и замене 92Gln на стоп-кодон (TAG).
Как описано выше, кодирующая AHAS II ДНК была использована для создания продуцента L-валина, в то время как об AHAS III упоминаний в литературе нет.
ИЗЛОЖЕНИЕ СУТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Целью настоящего изобретения, с вышеупомянутых позиций, является приготовление ДНК, кодирующей AHAS III, не подверженной ретроингибированию L-валином, микроорганизма, содержащего эту ДНК, и способа получения L-валина с использованием такой бактерии.
Целью настоящего изобретения, с вышеупомянутых позиций, является приготовление ДНК, кодирующей AHAS III, не подверженной ретроингибированию L-валином, микроорганизма, содержащего эту ДНК, и способа получения L-валина с использованием такой бактерии.
В результате тщательного исследования с целью получения описанных выше объектов авторы установили, что продукция L-валина повышается в том случае, когда ДНК, кодирующая устойчивую к L-валину AHAS III и выделенная из мутантнов, устойчивых к L-валину, вводилась в Escherichia coli. Так было выполнено настоящее изобретение.
Таким образом, настоящее изобретение включает следующие элементы:
1). Малая субъединица изозима III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia coli, содержащая мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No: 2), или одновременно две мутации, приводящие к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина и к замене аминокислотного остатка, соответствующего глициновому остатку в положении 14, на остаток аспарагиновой кислоты в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2);
2). Фрагмент ДНК, кодирующий малую субъединицу изозима III синтетазы ацетогидроксикислот по п.1);
3). Изозим III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia соli, который не ингибируется L-валином и обладает каталитической активностью в двух реакциях: реакции синтеза α-ацетолактата из пирувата и реакции синтеза α-ацето-α-гидроксибутирата из α-кетобутирата и пирувата; и в котором малая субъединица содержит мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина, или мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего аспарагиновому остатку в положении 29, на остаток лизина или тирозина, или мутацию, приводящую к делеции С-концевого участка, начиная с аминокислоты в положении 91 в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2), или комбинацию двух или более мутаций, выбранных из группы описанных выше мутаций, и мутации, приводящей к замене аминокислотного остатка, соответствующего глициновому остатку в положении 14 на остаток аспарагиновой кислоты в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2);
4). Фрагмент ДНК, кодирующий изозим III синтетазы ацетогидроксикислот по п.3);
5). Штамм бактерии Escherichia coli, содержащий фрагмент ДНК по п.2) в хромосомной ДНК или на плазмиде, находящейся в штамме указанной бактерии, и обладающий способностью к продукции L-валина;
6). Штамм бактерии по п.5), в котором экспрессия указанного фрагмента ДНК в штамме бактерии повышена за счет помещения указанного фрагмента ДНК под контроль сильного промотора или за счет увеличения количества копий указанного фрагмента ДНК;
7). Штамм бактерии Escherichia соli, содержащий фрагмент ДНК по п.4) в хромосомной ДНК или на плазмиде, находящейся в штамме указанной бактерии, и обладающий способностью к продукции L-валина;
8). Штамм бактерии по п.7), в котором экспрессия указанного фрагмента ДНК в штамме бактерии повышена за счет помещения указанного фрагмента ДНК под контроль сильного промотора или за счет увеличения количества копий указанного фрагмента ДНК;
9). Способ получения L-валина, включающий в себя стадии выращивания штамма бактерии по любому из пп. 6)-8) в питательной среде, обеспечивающей продукцию и накопление L-валина в питательной среде, и выделения L-валина из питательной среды.
1). Малая субъединица изозима III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia coli, содержащая мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No: 2), или одновременно две мутации, приводящие к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина и к замене аминокислотного остатка, соответствующего глициновому остатку в положении 14, на остаток аспарагиновой кислоты в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2);
2). Фрагмент ДНК, кодирующий малую субъединицу изозима III синтетазы ацетогидроксикислот по п.1);
3). Изозим III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia соli, который не ингибируется L-валином и обладает каталитической активностью в двух реакциях: реакции синтеза α-ацетолактата из пирувата и реакции синтеза α-ацето-α-гидроксибутирата из α-кетобутирата и пирувата; и в котором малая субъединица содержит мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина, или мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего аспарагиновому остатку в положении 29, на остаток лизина или тирозина, или мутацию, приводящую к делеции С-концевого участка, начиная с аминокислоты в положении 91 в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2), или комбинацию двух или более мутаций, выбранных из группы описанных выше мутаций, и мутации, приводящей к замене аминокислотного остатка, соответствующего глициновому остатку в положении 14 на остаток аспарагиновой кислоты в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2);
4). Фрагмент ДНК, кодирующий изозим III синтетазы ацетогидроксикислот по п.3);
5). Штамм бактерии Escherichia coli, содержащий фрагмент ДНК по п.2) в хромосомной ДНК или на плазмиде, находящейся в штамме указанной бактерии, и обладающий способностью к продукции L-валина;
6). Штамм бактерии по п.5), в котором экспрессия указанного фрагмента ДНК в штамме бактерии повышена за счет помещения указанного фрагмента ДНК под контроль сильного промотора или за счет увеличения количества копий указанного фрагмента ДНК;
7). Штамм бактерии Escherichia соli, содержащий фрагмент ДНК по п.4) в хромосомной ДНК или на плазмиде, находящейся в штамме указанной бактерии, и обладающий способностью к продукции L-валина;
8). Штамм бактерии по п.7), в котором экспрессия указанного фрагмента ДНК в штамме бактерии повышена за счет помещения указанного фрагмента ДНК под контроль сильного промотора или за счет увеличения количества копий указанного фрагмента ДНК;
9). Способ получения L-валина, включающий в себя стадии выращивания штамма бактерии по любому из пп. 6)-8) в питательной среде, обеспечивающей продукцию и накопление L-валина в питательной среде, и выделения L-валина из питательной среды.
Ниже настоящее изобретение будет описано более детально.
Исходной ДНК согласно настоящему изобретению является ДНК, кодирующая малую субъединицу AHAS III, проявляющую активность синтетазы ацетогидроксикислот и не подверженную ретроингибированию L-валином в комплексе с большой субъединицей. Под активностью синтетазы ацетогидроксикислот в данном случае подразумевается каталитическая активность в двух реакциях: реакции синтеза α-ацетолактата из пирувата и реакции синтеза α-ацето-α-гидроксибутирата из α-кетобутирата и пирувата. Последовательность малой субъединицы AHAS III из Escherichia coli приведена в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2).
Вышеупомянутые мутации выбраны из мутации, приводящей к замене серинового аминокислотного остатка в положении 17 на другой аминокислотный остаток в последовательности 2 (SEQ ID No:2) или обеих мутаций, приводящих к замене серинового аминокислотного остатка в положении 17 на другой аминокислотный остаток и глицинового аминокислотного остатка в положении 14 на другой аминокислотный остаток в последовательности 2 (SEQ ID No:2). Предпочтительным примером мутации аминокислотного остатка, соответствующего серину в положении 17, является замена остатка серина остатком фенилаланина, а для аминокислотного остатка, соответствующего глицину в положении 14? - замена остатка глицина остатком аспарагановой кислоты.
Второй ДНК согласно настоящему изобретению является ДНК, кодирующая AHAS III, не подверженную ингибированию L-валином и обладающую каталитической активностью в двух реакциях: реакции синтеза α-ацетолактата из пирувата и реакции синтеза α-ацето-α-гидроксибутирата из α-кетобутирата и пирувата. ДНК кодирует как большую, так и малую субъединицы AHAS III совместно.
Малая субъединица содержит мутацию, приводящую к замене серинового аминокислотного остатка в положении 17 на другой аминокислотный остаток, или мутацию, приводящую к замене аспарагинового аминокислотного остатка в положении 29 на другой аминокислотный остаток, или мутацию, приводящую к делеции С-концевого участка, начиная с аминокислоты в положении 91 в последовательности 2 (SEQ ID No:2), или комбинацию двух или более мутаций, выбранных из группы описанных выше мутаций, и мутации, приводящей к замене глицинового аминокислотного остатка в положении 14 на другой аминокислотный остаток в последовательности 2 (SEQ ID No:2). Малая субъединица AHAS III, которая содержит эти мутации, здесь и далее упоминается как мутантная малая субъединица AHAS III. Предпочтительным примером мутации аминокислотного остатка, соответствующего серину в положении 17, является замена остатка серина остатком фенилаланина, для аминокислотного остатка, соответствующего аспарагиновой кислоте в положении 29, - замена остатка аспарагиновой кислоты остатком лизина или тирозина, а для аминокислотного остатка, соответствующего глицину в положении 14, - замена остатка глицина остатком аспарагиновой кислоты.
ДНК согласно настоящему изобретению была получена из мутантного штамма Escherichia coli, устойчивого к L-валину. Однако она может быть получена введением указанной мутации (мутаций) в ДНК, кодирующую нативную AHAS III, методом сайт-направленного мутагенеза. AHAS III кодируется опероном ilvH. Оперон ilvH может быть получен, например, амплификацией фрагмента ДНК из Escherichia coli (матрицы), протяженного от промотора до 3'-конца гена ilvH, методом ПЦР с использованием затравок, последовательность которых приведена в списке последовательностей под 3.
Нуклеотидная последовательность оперона ilvH известна (Genbank/EMBL/DDBJ accession X55034). Нуклеотидная последовательность кодирующего участка ilvH показана в списке последовательностей под 1 (SEQ IDNo:1).
Мутантная малая субъединица AHAS III, кодирующая ДНК согласно настоящему изобретению, может иметь последовательность аминокислот, которая содержит замены, делеции, вставки, дополнения или инверсии одной или нескольких аминокислот так же, как и упомянутые выше мутации, приводящие к тому, что мутантная малая субъединица проявляет активность синтетазы ацетогидроксикислот и не подвергается ретроингибированию L-валином в комплексе с большой субъединицей.
ДНК, кодирующая по существу такой же белок, как и описанная выше мутантная малая субъединица, получается путем модификации нуклеотидной последовательности, например, методом сайт-направленного мутагенеза таким образом, что один или несколько остатков аминокислот в заданных местах подвергаются замене, делеции, вставке, дополнению или инверсии. ДНК, модифицированная описанным выше способом, может быть получена с помощью общеизвестных методов получения мутаций. Методами получения мутаций являются обработка in vitro ДНК, кодирующей малую субъединицу, с помощью, например, гидроксиламина, а также обработка бактерии, принадлежащей к роду Escherichia coli и содержащей ДНК, кодирующую малую субъединицу, с помощью мутагена, такого как N-метил-N'-нитро-N-нитрозогуанидин и азотистой кислоты, обычно используемых для получения мутаций, или обработка ультрафиолетовым облучением.
ДНК, кодирующая по существу такой же белок, как и мутантная малая субъединица AHAS III, получается экспрессией ДНК, содержащей описанную выше мутацию в большом числе копий в соответствующей клетке, исследованием устойчивости к L-валину и отбором ДНК, увеличивающей эту устойчивость. Также общеизвестно, что аминокислотная последовательность белка и кодирующая его нуклеотидная последовательность могут слегка различаться в зависимости от штамма, мутанта или варианта, и вследствие этого ДНК, кодирующая по существу такой же белок, может быть получена из устойчивых к L-валину видов, штаммов, мутантов и вариантов, принадлежащих к роду Escherichia.
А именно ДНК, кодирующая по существу такой же белок, как и мутантная малая субъединица, может быть получена путем выделения ДНК, которая гибридизуется в жестких условиях с ДНК, имеющей, например, нуклеотидную последовательность, показанную в списке последовательностей под 1 (SEQ ID No:l), и которая кодирует белок, обладающий активностью синтетазы ацетогидроксикислот, из бактерии, принадлежащей к роду Escherichia, подвергнутой обработке с целью получения мутации, или дикого мутанта, или варианта бактерии, принадлежащей к роду Escherichia. Термин "жесткие условия", упомянутый здесь, обозначает условия, при которых происходит так называемая специфическая гибридизация, а неспецифический гибрид не образуется. В численном виде такие условия трудно отразить. Однако, к примеру, строгие условия включают в себя условия, при которых гибридизуются ДНК с высокой степенью гомологии, например ДНК с гомологией не менее 70% гибридизуются, а ДНК с гомологией менее 70% не гибридизуются.
Штамм бактерии согласно настоящему изобретению содержит первую или вторую ДНК согласно настоящему изобретению и обладает способностью к продукции L-валина. Круг бактерий не ограничен особым образом при условии, что в бактерии присутствует биосинтетический путь L-валина, в котором принимает участие синтетаза ацетогидроксикислот. Примерами таких бактерий являются бактерии, принадлежащие к роду Escherichia, к роду Serratia, коринеформные бактерии. Конкретным примером бактерий, принадлежащих к роду Escherichia, является Escherichia coli.
Примерами методов введения ДНК согласно настоящему изобретению в бактерии являются, например, метод, в котором бактерия трансформируется плазмидой, содержащей ДНК согласно настоящему изобретению, а также метод, в котором ДНК согласно настоящему изобретению интегрирована в хромосомную ДНК бактерии с использованием гомологичной рекомбинации или подобным методом.
Предпочтительным является усиленная экспрессия ДНК согласно настоящему изобретению. Усиление экспрессии достигается помещением ДНК согласно настоящему изобретению под контроль сильного промотора или увеличением числа копий ДНК. Сильными промоторами являются, например, lac промотор, trp промотор, trc промотор, tac промотор, PR промотор, PL промотор фага лямбда, tet промотор, amyЕ промотор и spac промотор. Также возможно увеличить число копий ДНК согласно настоящему изобретению поддержанием ее многокопийного вектора или введением множественного числа копий ДНК в хромосомную ДНК. Примерами многокопийных векторов являются pBR322, pTWV228, pMW119 и pUC19 или подобные им.
Для введения вектора, содержащего ДНК согласно настоящему изобретению, в бактерию-хозяина может быть применен любой известный метод трансформации. Например, метод обработки клеток-реципиентов хлоридом кальция с целью повышения их проницаемости для ДНК, сообщенный для Escherichia coli К-12 (см. Mandel, M. and Higa, A., J.Mol.Biol, 53, 159 (1970)), а также метод приготовления компетентных клеток из клеток находящихся в фазе роста с последующим введением ДНК в них, описанный для Bacillus subtilis (см. Duncan, C.H., Wilson, G. A. and Young, F.E., Gene, 1, 153 (1977)). В дополнение к этому, также применим метод превращения клеток-реципиентов ДНК в протопласты или сферопласты, которые могут легко захватывать рекомбинантную ДНК с последующим включением ее внутрь клетки, который применим, как известно, к Bacillus subtilis, актиномицетам и дрожжам (Chang, S. and Choen, S.N.. Molec.Gen.Genet, 168, 111 (1979); Bibb, M.J., Ward. J.M. Hopwood, O.A., Nature, 274, 398 (1978); Hinnen, A., Hicks, J.B. and Fink, G.R., Proc.Natl.Sci.USA. 75, 1929 (1978)), или метод трансформации, использовавшийся для воплощения настоящего изобретения, с использованием электрических импульсов (ссылка на выложенную патентную заявку Японии 2-207791).
Подходящим методом введения ДНК согласно настоящему изобретению в хромосомную ДНК бактерии является метод, использующий линеаризованную ДНК и плазмиду, содержащую чувствительный к температуре начальный участок репликации. В качестве альтернативы ДНК согласно настоящему изобретению может быть введена в бактерию из бактерии, содержащей ДНК согласно настоящему изобретению в хромосомной ДНК, методом трансдукции.
С целью введения множественных копий ДНК согласно настоящему изобретению в хромосомную ДНК бактерии осуществляется гомологичная рекомбинация с использованием последовательности, чьи множественные копии присутствуют к хромосомной ДНК в качестве мишени. В качестве последовательностей, чьи множественные копии существуют в хромосомной ДНК, могут быть использованы повторы ДНК, инвертированные повторы, присутствующие на концах транспозируемого элемента. Также, как описано в выложенной патентной заявке Японии 2-109985, возможно вставить ДНК согласно настоящему изобретению в транспозон и индуцировать его транспозицию для того, чтобы ввести множественные копии ДНК в хромосомную ДНК.
Бактерией, в которую вводится ДНК согласно настоящему изобретению, может быть как бактерия, приобретшая способность к продукции L-валина после введения ДНК согласно настоящему изобретению, так и бактерия, обладавшая способностью к продукции L-валина изначально.
Примером бактерии, обладающей способностью к продукции L-валина, является, например, Escherichia coli VL1970 (патент США 5658766). В дополнение к этому, преимущественно используются в качестве продуцентов L-валина бактерия, описанная в патенте WO96/06926, принадлежащая к роду Escherichia и требующая для роста липоевую кислоту и/или лишенная активности H+-АТРазы, или принадлежащая к роду Escherichia бактерия, включающая оперон ilvGMEDA, экспрессирующий по крайней мере гены ilvG, ilvM, ilvE и ilvD. Ввиду того, что экспрессия оперона ilvGMEDA подвержена негативному контролю (аттенуации) под действием L-валина, L-изолейцина и/или L-лейцина, предпочтительно, чтобы участок, существенно важный для ослабления экспрессии, был удален или мутирован с целью утраты чувствительности к подавлению экспрессии произведенным L-валином. Другой подход предполагает введение мутаций (IleS или ValS), влияющих на аминоацил-тРНК синтетазу, имеющую пониженное сродство (повышенную Км) к соответствующим аминокислотам. Кроме того, предпочтительно использовать оперон, который не экспрессирует активную треонин дезаминазу.
Escherichia coli VL1970, содержащая мутацию IleS 17, которая нарушает чувствительность к аттенуации, как описано выше, депонирована в депозитарий Российской Государственной коллекции промышленных микроорганизмов (ВКПМ), ГНИИгенетика (113545, Россия, Москва, 1-й Дорожный проезд, д.1) под номером ВКПМ В-4411.
Методы для осуществления, например, гибридизации, ПЦР, приготовление ДНК плазмид, расщепления и лигирования ДНК, трансформации описаны (Sambrook, J., Fritsche, E. F. , Maniatis, Т., Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1.21 (1989)).
Продукция L-валина может быть осуществлена путем выращивания бактерии, обладающей способностью к продукции L-валина, в питательной среде, обеспечивающей продукцию L-валина и его накопление в питательной среде, выделение L-валина из питательной среды.
В настоящем изобретении выращивание, накопление и очистка L-валина из среды и тому подобное могут быть осуществлены способом, подобным традиционным методам ферментации, в которых аминокислота производится с использованием микроорганизма. Среда, используемая для выращивания, может быть или синтетической, или натуральной при условии, что в эту среду входят источники углерода и азота, минеральные вещества и, если необходимо, соответствующие количества питательных веществ, необходимых для роста микроорганизма. В качестве источников углерода могут включаться различные углеводы, такие как глюкоза и сахароза, и различные органические кислоты. В зависимости от формы ассимиляции используемого микроорганизма может быть использован спирт, включая этанол и глицерин. В качестве источников азота используются различные соли аммония, такие как сульфат аммония и аммиак, другие соединения азота, такие как амины, природные источники азота, такие как пептон, гидролизат соевых бобов и ферментолизат биомассы микроорганизмов. В качестве минеральных веществ используются монофосфат калия, сульфат магния, хлорид натрия, сульфат железа, сульфат марганца, карбонат кальция и подобные соединения.
Выращивание осуществляется предпочтительно в аэробных условиях, таких как встряхивание культуры, и аэрация и перемешивание культуры при температуре от 20 до 40oС, предпочтительно от 30 до 38oС. рН среды обычно находится между 5 и 9. предпочтительно между 6.5 и 7.2. рН среды может быть отрегулировано с помощью аммиака, карбоната кальция, различных кислот, оснований и буферов. Обычно от 1 до 3 дней выращивания приводят к накоплению L-валина в жидкой среде.
После выращивания твердые компоненты, такие как клетки, могут быть отделены от жидкой среды с помощью центрифугирования и фильтрации на мембране, затем целевой L-валин может быть собран и очищен с помощью методов ионного обмена, концентрирования и кристаллизации.
ПОЯСНЕНИЯ К ФИГУРАМ
На фиг.1 показаны ПЦР-затравки для получения мутантного гена ilvH, содержащего только одну мутацию 14Gly на Asp;
На фиг.2 показаны ПЦР-затравки для получения мутантного гена ilvH, содержащего только одну мутацию 17Ser на Phe.
На фиг.1 показаны ПЦР-затравки для получения мутантного гена ilvH, содержащего только одну мутацию 14Gly на Asp;
На фиг.2 показаны ПЦР-затравки для получения мутантного гена ilvH, содержащего только одну мутацию 17Ser на Phe.
НАИЛУЧШИЙ СПОСОБ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение описывается следующими примерами:
<1> Штамм E.coli W3350, устойчивый к L-валину.
Настоящее изобретение описывается следующими примерами:
<1> Штамм E.coli W3350, устойчивый к L-валину.
Мутант, устойчивый к L-валину, был отобран на минимальной среде, содержащей 0.1 мг/мл L-валина, из штамма E.coli W3350 дикого типа. Полученный таким образом мутант W3350 Val0.1 R устойчив к L-валину в концентрации не выше чем 1 мг/мл.
Затем в этот мутант W3350 Val0.1 R методом трансдукции Р1 был введен оперон лейцина (leuABCD), в который был вставлен транспозон Тn10 (lеu::Тn10). Из трансдуктанта W3350 Val0.1 R leu::Tn10 был выведен штамм с двойной мутацией, который рос на минимальной среде, содержащей 20 мг/мл L-валина и 0.05 мг/мл L-лейцина.
<2>Получение штамма VL1991, продуцирующего L-валин.
В E.coli VL1970 (ВКПМ В-4411, патент США 5658766) был введен ген, участвующий в образовании устойчивости к высокой концентрации треонина (более 40 мг/мл) или гомосерина (более 5 мг/мл), который был выделен из штамма В3996, содержащего мутацию (rhtA23), вызывающую такую устойчивость (патент США 5705371). Таким образом был получен штамм VL1971.
Затем гены утилизации сахарозы из E.coli VL478 были введены в VL1971 методом трансдукции с использованием фага Р1 для получения VL1972. Далее из VL1972 был получен спонтанный мутант VL1991, который рос быстрее, чем родительский штамм.
<3> Введение устойчивости к L-валину в штамм VL1991.
Мутации, содержавшиеся в упомянутом выше штамме с двойной мутацией, были введены в VL1991 методом трансдукции фагом Р1. Спонтанный мутант с фенотипом Leu+ был отобран среди трансдуктантов. Мутант был обозначен как VL1997. Затем ген ilvD с интегрированным в него Тn10 (ilvD::Tn10) был введен в VL1997 методом трансдукции Р1 для получения VL1997 ilvD::Тn10. После этого VL1997 ilvD: : Тn10 был трансдуцирован опероном ilvGMEDA из E.coli штамма В. Из полученного таким образом VL1998 был отобран спонтанный мутант VL1999, который рос быстрее, чем родительский штамм.
<4> Штамм VL1999/pVL715, продуцирующий L-валин.
Штамм VL1999 был трансформирован плазмидой pVL715 для получения продуцирующего L-валин рекомбинантного штамма VL1999/pVL715. Плазмида pVL715 была сконструирована следующим образом. BamHI-XmaIII фрагмент ДНК, содержащий гены ilv (ilvGMEDAYC), был выщеплен из содержащей эти гены плазмиды pVR12 (Гаврилова и др.. Биотехнология, 4, 5, 600-608(1988)), и впоследствии введен в pAYC32, производную RSF1010 (Chistoserdov and Tsygankov, Plasmid, 1986, 16, 161-167), с заменой BamHI-XmaIII фрагмента ДНК плазмиды pAYC32 с получением плазмиды pVS712. Затем была получена плазмида pVL715, супресируюшая мутацию valS91, оказывающую влияние на валил-тРНК синтетазу (патент США 5658766), из плазмиды pVS712 следующим образом. Плазмида pVS712 была введена в мутант valS91. Полученный штамм ValS91/pVS712 сохранял ауксотрофность по валину как штамм-реципиент. Затем были отобраны ревертанты, способные к росту на минимальной среде, не содержащей валин. В некоторых из них эта способность была определена мутацией в генах ilvGMEDAYC. содержащихся в плазмиде pVS712. Из одного из ревертантов была выделена плазмида pVL715. В штаммах, содержащих pVL715, по крайней мере активность AHAS была увеличена в сравнении с штаммами, содержащими pVS712.
<5> Выявление мутаций, придающих устойчивость к L-валину.
Ген ilvH из W3550 Val0.1 R и VL1997 был клонирован, и его нуклеотидная последовательность была определена. Клонирование гена ilvH было осуществлено амплификацией фрагмента ДНК от области промотора до 3'-конца гена ilvH методом ПЦР с использованием затравок, нуклеотидная последовательность которых приведена в списке последовательностей под номерами 3 и 4 (SEQ ID No.3 and 4). Условия ПЦР: 94oС - 60 сек, 48oС - 30 сек, 72oС - 90 сек, 30 циклов. Амплифицированный ген ilvH был обработан фрагментом Кленова и клонирован в вектор pUC19 по сайту рестрикции Hinc II с получением pILVIH1 и pILVIH1,2. Подобным образом нативный оперон ilvH из штамма W3550 был клонирован в pUC19 с получением pILVIH.
Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей выявил, что мутантный оперон ilvH из W3550 Val0.1 R содержит замену С на Т в позиции 50 и что VL1997 содержит две замены: С на Т в позиции 50 и G на А в позиции 41 в последовательности SEQ ID No. l. Эти мутации вызывают аминокислотные замены 17Ser на Phe и 14Gly на Asp. Мутации 17Ser на Phe и 14Gly на Asp могут быть названы как мутации ilvH1 и ilvH2 соответственно. Гены ilvH, содержащие одну или обе эти мутации, обозначены как ilvH1, ilvH2 и ilvH 1,2 соответственно.
<6> Разделение мутации ilvH1 и мутации ilvH2 из мутантного гена ilvH1,2.
С целью оценки влияния каждой мутации ilvH 1,2 эти мутации были разделены сайт-направленным мутагенезом с использованием ПЦР.
Для получения мутантного гена ilvH, содержащего только одну мутацию 14Gly на Asp, был использован тот факт, что эта мутация приводит к образованию единичного сайта рестрикции MluI (фиг.1). Затем были синтезированы две затравки с нуклеотидными последовательностями SEQ IN No.5 и 6.
С использованием этих затравок была подвергнута амплификации плазмида pILVIH1,2, содержащая клонированный ген ilvH1,2. Таким образом был получен линейный фрагмент ДНК размером около 5 т.п.н. с сайтами рестрикции MluI на концах. Этот продукт ПЦР был обработан MluI с последующим лигированием с получением кольцевой плазмиды pILVIH2, содержащей только заданную мутацию. Это было подтверждено также и анализом нуклеотидной последовательности.
Для получения мутантного гена ilvH, содержащего только одну мутацию 17Ser на Phe, были синтезированы две затравки с нуклеотидными последовательностями SEQ IN No.7 и 8 (фиг.2).
С использованием этих затравок была подвергнута амплификации плазмида pILVIH, содержащая нативный оперон ilvIH. Полученный продукт ПЦР содержал сайты рестрикции StuI на концах, образованные в результате замены кодона АТА, кодирующего изолейцин, на адекватный ему кодон АТТ. Фрагмент был обработан StuI и лигирован с образованием кольцевой плазмиды pILVIPH1', содержащей заново введенную точечную мутацию 17Ser на Phe. Это было подтверждено анализом нуклеотидной последовательности гена ilvHl в плазмиде.
<7> Выявление других мутаций, придающих устойчивость к L-валину.
Гены ilvH из двух полученных описанным выше способом из Е. coli W3350 мутантов, устойчивых к L-валину, были клонированы, и их нуклеотидная последовательность определена. В результате было выявлено, что в одном мутанте причиной является замена Т на А в позиции 85 последовательности SEQ ID No. 1 и замена А на С в позиции 87 последовательности SEQ ID No. 1 в другом. Эти мутации вызывают замену 29Asn на Туг и Lys соответственно. Мутации 29Asn на Туг и 29Asn на Lys могут быть названы как ilvIH3 и ilvIH4 соответственно. Опероны ilvIH с этими мутациями были клонированы в pUC19 для получения pILVIH3 и pILVIH4 соответственно.
Подобным методом был клонирован в pUC19 оперон pILVIH из E.coli MI262 (IlvI-, IlvB-, IlvG-), полученной из E.coli Genetic Stock Center, которая имеет известные мутации в AHAS III, ilvH612 (Guardiola et al., J.Bacteriol., 120, 536-538(1974); De Felice et al., J.Bacteriol., 120, 1068-1077 (1974)) с целью получения pILVIH262. Ген ilvH в опероне в pILVIH262 содержит мутации (ilvH612): С на А в позиции 87 последовательности SEQ ID No.l и С на Т в позиции 274 последовательности SEQ ID No.l. Вследствие этих мутаций происходит замена 29Asn на Lys, a 92Gin на стоп-кодон (TAG) соответственно. Кстати, ген ilvI в опероне ilvIH из MI262 содержит мутацию (ilvl614), вследствие которой продукт экспрессии гена ilvI не обладает энзиматической активностью. BamHI фрагмент плазмиды pILVIH262, содержащий мутировавший ген ilvl, был замещен BamHI фрагментом, содержащим нативный ген ilvI из pILVIH, для получения pILVIH612.
<8> Введение гена ilvH1 в нативный штамм E.coli.
Мутантный ген ilvH1 был введен в хромосому штамма E.coli W3350 с использованием описанного выше метода (Parker and Marinus, Gene, 73, 531-535 (1998)). Так был получен штамм W3350 ilvH1. Доказано, что этот штамм обладает устойчивостью к L-валину в концентрации до 1 мг/мл, что соответствует такому же уровню устойчивости, как и для штамма W3350 Val0.1 R.
Таким образом, анализ последовательности гена ilvHl и мутации ilvHI, которая была отделена от мутации ilvH2 в мутанте ilvHl,2 методом сайт-направленного мутагенеза, подтвердил точечную мутацию 17Ser на Phe, вызывающую у клеток устойчивость низкого уровня к L-валину.
<9> Влияние различных мутаций в ilvH на устойчивость AHAS III к ингибированию L-валином.
Мутации ilvHl (17Ser на Phe), ilvH2 (14Gly на Asp), ilvH3 (29Asn на Lys), ilvH4 (29Asn на Туr) и ilvH612 (29Asn на Lys 92Gln на стоп-кодон TAG) придают ферменту AHAS III устойчивость к ингибированию L-валином следующим образом. А именно штамм E.coli MI262, лишенный активности AHAS, после введения плазмид, содержащих различные гены ilvH, проявлял активность с различным уровнем устойчивости к L-валину (таблица 1). Видно, что AHAS из штаммов, содержащих плазмиды pILVIH2 и pILVIH612, проявляет наивысший уровень устойчивости к L-валину.
<10> Влияние различных мутаций ilvH на продукцию L-валина.
Было изучено влияние различных мутаций ilvH на продукцию L-валина. Мутации были введены в хромосому штаммов VL1970 и VL1999/pVL715. Кстати, штамм W3350 - родительский по отношению к штаммам VL1970 и VL1999 - не экспрессирует активную синтетазу II ацетогидроксикислот ввиду того, что родительский штамм содержит мутацию, приводящую к сдвигу рамки считывания в гене ilvG. С другой стороны, штаммы VL1970 и VL1999 экспрессируют активную AHAS II.
После введения различных мутаций ilvH в штамм VL1970 были получены новые штаммы VL1970 ilvH1, VL1970 ilvH1,2, VL1970 ilvH3, VL1970 ilvH4, VL1970 ilvH612. Кроме того, после введения различных мутаций ilvH в штамм VL1999/pVL715 были получены новые штаммы VL1999 ilvHl,2/pVL715, VL1999 ilvH3/pVL715, VL1999 ilvH612/pVL715. Каждый из этих штаммов вместе с соответствующими родительскими штаммами выращивался при 37oС в течение 18 часов в питательном бульоне, затем 0.3 мл полученной культуры были пересажены в 3 мл среды для ферментации следующего состава в пробирках (20•200 мм) и выращивались при 37oС в течение 72 часов в качалке (250 об/мин). После выращивания количество накопленного в среде L-валина и поглощение среды при 560 нм определялись с помощью известных методов.
Результаты представлены в таблице 2 и таблице 3. В этих таблицах ilvH+ обозначает нативный ген ilvH.
Состав среды для ферментации, г/л:
Глюкоза - 80
(NH4)2SO4 - 22
K2HPO4 - 2
NaCl - 0,8
MgSO4•7H2O - 0,8
FeSO4•7H2O - 0,02
MnSO4•5H2O - 0,02
Тиамин гидрохлорид - 0,2
Дрожжевой экстракт (Sigma) - 1,0
СаСО3 - 30
(СаСО3 был предварительно отдельно стерилизован)
Из таблиц 2 и 3 видно, что введение описанных выше мутаций в ilvH повышает продукцию L-валина соответствующих штаммов - продуцентов валина. Также, комбинация мутаций ilvH1 и ilvH2 дает лучший результат.
Глюкоза - 80
(NH4)2SO4 - 22
K2HPO4 - 2
NaCl - 0,8
MgSO4•7H2O - 0,8
FeSO4•7H2O - 0,02
MnSO4•5H2O - 0,02
Тиамин гидрохлорид - 0,2
Дрожжевой экстракт (Sigma) - 1,0
СаСО3 - 30
(СаСО3 был предварительно отдельно стерилизован)
Из таблиц 2 и 3 видно, что введение описанных выше мутаций в ilvH повышает продукцию L-валина соответствующих штаммов - продуцентов валина. Также, комбинация мутаций ilvH1 и ilvH2 дает лучший результат.
Производные плазмиды pUC19 с опероном ilvIH, содержащим различные мутации в гене ilvH, были введены в штамм W3350. Штамм W3350 не экспрессирует активный AHAS II ввиду того, что в нем присутствует мутация, вызывающая сдвиг рамки считывания в гене ilvG. Из таблицы 4 видно, что полученные трансформанты продуцируют L-валин, а наиболее продуктивен штамм, содержащий плазмиду pILVIH1,2.
Ранее авторы настоящего изобретения заметили, что в течение ферментации с целью получения L-валина активность AHAS в клетках-продуцентах постепенно уменьшается. Было показано, что период полураспада для AHAS III при 45oС составляет 144 мин, а для AHAS II - 44 мин (Alexander-Caudle et al., J.Bacteriol. 172, 3060-3065 (1990)). Можно предположить, что такая увеличенная термостабильность AHAS III отражает общую повышенную стабильность фермента. Вследствие этого можно полагать, что AHAS III, устойчивая к L-валину, дает положительный эффект в продукции L-валина из-за повышенной стабильности в сравнении с AHAS II.
Список последовательностей нуклеотидов приведен в конце описания.
Claims (9)
1. Малая субъединица изозима III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia coli, содержащая мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No: 2), или одновременно две мутации, приводящие к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина и к замене аминокислотного остатка, соответствующего, глициновому остатку в положении 14, на остаток аспарагиновой кислоты в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2).
2. Фрагмент ДНК, кодирующий малую субъединицу изозима III синтетазы ацетогидроксикислот по п.1.
3. Изозим III синтетазы ацетогидроксикислот из Escherichia coli, который не ингибируется L-валином и обладает каталитической активностью в двух реакциях: реакции синтеза α-ацетолактата из пирувата и реакции синтеза α-ацето-α-гидроксибутирата из α-кетобутирата и пирувата; и в котором малая субъединица содержит мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего сериновому остатку в положении 17, на остаток фенилаланина, или мутацию, приводящую к замене аминокислотного остатка, соответствующего аспарагиновому остатку в положении 29, на остаток лизина или тирозина, или мутацию, приводящую к делеции С-концевого участка, начиная с аминокислоты в положении 91 в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2), или комбинацию двух или более мутаций, выбранных из группы описанных выше мутаций, и мутации, приводящей к замене аминокислотного остатка, соответствующего глициновому остатку в положении 14, на остаток аспарагиновой кислоты в последовательности, приведенной в списке последовательностей под 2 (SEQ ID No:2).
4. Фрагмент ДНК, кодирующий изозим III синтетазы ацетогидроксикислот по п.3.
5. Способ получения L-валина, включающий в себя стадии выращивания штамма бактерии Escherichia coli, содержащего фрагмент ДНК по п.2 или 4 в хромосомной ДНК или на плазмиде, находящейся в штамме указанной бактерии, и обладающего способностью к продукции L-валина, в питательной среде, обеспечивающей продукцию и накопление L-валина, и выделения L-валина из питательной среды.
6. Штамм бактерии Escherichia coli VL1999ilvHl, 2/pVL715, содержащий фрагмент ДНК по п.2 в хромосомной ДНК и обладающий способностью к продукции L-валина.
7. Штамм бактерии Escherichia coli VL1999ilvH3/pVL715, содержащий фрагмент ДНК по п.4 в хромосомной ДНК и обладающий способностью к продукции L-валина.
8. Штамм бактерии Escherichia coli W3350/pILV1999ilvIHl,2, содержащий фрагмент ДНК по п.2 на плазмиде и обладающий способностью к продукции L-валина.
9. Штамм бактерии Escherichia coli W3350/pILV1999ilvH3, содержащий фрагмент ДНК по п.4 на плазмиде и обладающий способностью к продукции L-валина.
Priority Applications (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2000101678/13A RU2209246C2 (ru) | 2000-01-26 | 2000-01-26 | Малая субъединица изозима iii и изозим iii синтетазы ацетогидроксикислот из escherichia coli, фрагмент днк (варианты), штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-валина (варианты) и способ получения l-валина |
US09/761,782 US6737255B2 (en) | 2000-01-26 | 2001-01-18 | Mutant ilvH gene and method for producing L-valine |
JP2001011229A JP2001231584A (ja) | 2000-01-26 | 2001-01-19 | 変異型ilvH遺伝子及びL−バリンの製造法 |
FR0101070A FR2804971B1 (fr) | 2000-01-26 | 2001-01-26 | Adn codant une acetohydroxyacide synthase, bacterie le contenant et procede de production de l-valine par culture de cette bacterie |
CNB011033312A CN1182246C (zh) | 2000-01-26 | 2001-01-31 | 突变体ilvH基因和制备L-缬氨酸的方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2000101678/13A RU2209246C2 (ru) | 2000-01-26 | 2000-01-26 | Малая субъединица изозима iii и изозим iii синтетазы ацетогидроксикислот из escherichia coli, фрагмент днк (варианты), штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-валина (варианты) и способ получения l-валина |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2000101678A RU2000101678A (ru) | 2002-10-20 |
RU2209246C2 true RU2209246C2 (ru) | 2003-07-27 |
Family
ID=20229713
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2000101678/13A RU2209246C2 (ru) | 2000-01-26 | 2000-01-26 | Малая субъединица изозима iii и изозим iii синтетазы ацетогидроксикислот из escherichia coli, фрагмент днк (варианты), штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-валина (варианты) и способ получения l-валина |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US6737255B2 (ru) |
JP (1) | JP2001231584A (ru) |
CN (1) | CN1182246C (ru) |
FR (1) | FR2804971B1 (ru) |
RU (1) | RU2209246C2 (ru) |
Families Citing this family (24)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2144564C1 (ru) * | 1998-10-13 | 2000-01-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | ФРАГМЕНТ ДНК rhtB, КОДИРУЮЩИЙ СИНТЕЗ БЕЛКА RhtB, ПРИДАЮЩЕГО УСТОЙЧИВОСТЬ К L-ГОМОСЕРИНУ БАКТЕРИЯМ ESCHERICHIA COLI, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ |
US20060040364A1 (en) * | 1998-10-13 | 2006-02-23 | Livshits Vitaly A | DNA coding for a protein which imparts L-homoserine resistance to Escherichia coli bacterium, and a method for producing L-amino acids |
RU2175351C2 (ru) * | 1998-12-30 | 2001-10-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | Фрагмент днк из escherichia coli, определяющий повышенную продукцию l-аминокислот (варианты), и способ получения l-аминокислот |
RU2212447C2 (ru) * | 2000-04-26 | 2003-09-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | Штамм escherichia coli - продуцент аминокислоты (варианты) и способ получения аминокислот (варианты) |
RU2208640C2 (ru) * | 2000-07-06 | 2003-07-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АРГИНИНА, ШТАММ Escherichia coli - ПРОДУЦЕНТ L-АРГИНИНА |
RU2229513C2 (ru) * | 2001-11-23 | 2004-05-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | Способ получения l-аминокислот, штамм escherichia coli - продуцент l-аминокислоты (варианты) |
EP1491634A1 (en) * | 2003-06-26 | 2004-12-29 | Degussa AG | Feedback resistant acetohydroxy acid synthetase mutants |
US7300776B2 (en) * | 2004-04-26 | 2007-11-27 | Ajinomoto Co., Inc. | L-amino acid-producing bacterium and a method for producing L-amino acid |
RU2315807C2 (ru) * | 2004-09-10 | 2008-01-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ НОРЛЕЙЦИНА И НОРВАЛИНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Escherichia, В КОТОРОЙ ВСЕ СИНТАЗЫ АЦЕТОГИДРОКСИКИСЛОТ ИНАКТИВИРОВАНЫ |
RU2355763C2 (ru) * | 2006-09-13 | 2009-05-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | Мутантная ацетолактатсинтаза и способ продукции разветвленных l-аминокислот |
KR100832740B1 (ko) * | 2007-01-17 | 2008-05-27 | 한국과학기술원 | 분지쇄 아미노산 생성능이 개선된 변이 미생물 및 이를이용한 분지쇄 아미노산의 제조방법 |
CN101962664A (zh) * | 2010-11-02 | 2011-02-02 | 天津科技大学 | 一种高效生产l-缬氨酸的发酵工艺 |
WO2017194696A1 (en) | 2016-05-12 | 2017-11-16 | Danmarks Tekniske Universitet | Bacterial cells with improved tolerance to isobutyric acid |
JP7447810B2 (ja) | 2018-05-23 | 2024-03-12 | 味の素株式会社 | 腸内細菌科を用いたトリペプチドγ-GLU-VAL-GLYの製造方法 |
JP6604584B1 (ja) | 2018-12-12 | 2019-11-13 | 株式会社Co2資源化研究所 | バリン生成能が向上したヒドロゲノフィラス属細菌遺伝子組換え体 |
CN113278655B (zh) | 2020-05-13 | 2022-05-17 | 安徽华恒生物科技股份有限公司 | 生产l-缬氨酸的重组微生物及构建方法、应用 |
CN113278641B (zh) | 2020-05-27 | 2022-06-21 | 安徽华恒生物科技股份有限公司 | 生产l-缬氨酸的重组大肠杆菌、其构建方法及其应用 |
CN113278568B (zh) | 2020-05-27 | 2022-10-21 | 安徽华恒生物科技股份有限公司 | 生产l-缬氨酸的重组大肠杆菌及其应用 |
CN117304283A (zh) | 2022-06-22 | 2023-12-29 | 安徽华恒生物科技股份有限公司 | 一种mreC突变体及其在L-缬氨酸发酵生产中的应用 |
CN118895260B (zh) * | 2023-05-04 | 2025-06-27 | 安徽华恒生物科技股份有限公司 | 一种乙酰乳酸合酶突变体及其在制备l-异亮氨酸中的应用 |
CN116555151B (zh) * | 2023-07-04 | 2023-10-17 | 黑龙江伊品生物科技有限公司 | 产l-缬氨酸工程菌及构建方法与应用 |
CN116555153B (zh) * | 2023-07-04 | 2023-09-29 | 黑龙江伊品生物科技有限公司 | 一种用于生产l-缬氨酸的大肠杆菌的构建方法与应用 |
WO2025007767A1 (zh) * | 2023-07-04 | 2025-01-09 | 黑龙江伊品生物科技有限公司 | 产l-缬氨酸工程菌及构建方法与应用 |
CN116555152B (zh) * | 2023-07-04 | 2023-10-20 | 黑龙江伊品生物科技有限公司 | 大肠杆菌及其构建方法与在生产l-缬氨酸中的应用 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0477000A2 (en) * | 1990-09-18 | 1992-03-25 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Process for producing L-valine |
US5188948A (en) * | 1987-04-16 | 1993-02-23 | Ajinomoto Co., Inc. | Process for producing L-valine by fermentation |
US5658766A (en) * | 1991-05-30 | 1997-08-19 | Ajinomoto Co., Inc. | Strains of Escherichia coli which produce isoleucine or valine and a method for their production |
RU2144564C1 (ru) * | 1998-10-13 | 2000-01-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | ФРАГМЕНТ ДНК rhtB, КОДИРУЮЩИЙ СИНТЕЗ БЕЛКА RhtB, ПРИДАЮЩЕГО УСТОЙЧИВОСТЬ К L-ГОМОСЕРИНУ БАКТЕРИЯМ ESCHERICHIA COLI, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ |
Family Cites Families (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2748418B2 (ja) | 1988-08-03 | 1998-05-06 | 味の素株式会社 | 組換えdna、該組換えdnaを有する微生物 |
US5705371A (en) | 1990-06-12 | 1998-01-06 | Ajinomoto Co., Inc. | Bacterial strain of escherichia coli BKIIM B-3996 as the producer of L-threonine |
JPH03501682A (ja) | 1988-10-25 | 1991-04-18 | 味の素株式会社 | L‐トレオニン生産者としてのエシェリキア・コリbkiim b‐3996菌株 |
US5976843A (en) | 1992-04-22 | 1999-11-02 | Ajinomoto Co., Inc. | Bacterial strain of Escherichia coli BKIIM B-3996 as the producer of L-threonine |
DE3942947A1 (de) | 1989-12-23 | 1991-06-27 | Forschungszentrum Juelich Gmbh | Verfahren zur herstellung von l-isoleucin und dafuer geeignete mikroorganismen und rekombinante dna |
US6132999A (en) | 1992-09-21 | 2000-10-17 | Ajinomoto Co., Inc. | L-threonine-producing microbacteria and a method for the production of L-threonine |
JP3709564B2 (ja) | 1994-08-30 | 2005-10-26 | 味の素株式会社 | L−バリン及びl−ロイシンの製造法 |
-
2000
- 2000-01-26 RU RU2000101678/13A patent/RU2209246C2/ru active
-
2001
- 2001-01-18 US US09/761,782 patent/US6737255B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-01-19 JP JP2001011229A patent/JP2001231584A/ja not_active Withdrawn
- 2001-01-26 FR FR0101070A patent/FR2804971B1/fr not_active Expired - Lifetime
- 2001-01-31 CN CNB011033312A patent/CN1182246C/zh not_active Expired - Lifetime
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5188948A (en) * | 1987-04-16 | 1993-02-23 | Ajinomoto Co., Inc. | Process for producing L-valine by fermentation |
EP0477000A2 (en) * | 1990-09-18 | 1992-03-25 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Process for producing L-valine |
US5521074A (en) * | 1990-09-18 | 1996-05-28 | Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. | Process for producing L-valine |
US5658766A (en) * | 1991-05-30 | 1997-08-19 | Ajinomoto Co., Inc. | Strains of Escherichia coli which produce isoleucine or valine and a method for their production |
RU2144564C1 (ru) * | 1998-10-13 | 2000-01-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" | ФРАГМЕНТ ДНК rhtB, КОДИРУЮЩИЙ СИНТЕЗ БЕЛКА RhtB, ПРИДАЮЩЕГО УСТОЙЧИВОСТЬ К L-ГОМОСЕРИНУ БАКТЕРИЯМ ESCHERICHIA COLI, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN1182246C (zh) | 2004-12-29 |
FR2804971B1 (fr) | 2004-04-23 |
CN1310233A (zh) | 2001-08-29 |
FR2804971A1 (fr) | 2001-08-17 |
US6737255B2 (en) | 2004-05-18 |
JP2001231584A (ja) | 2001-08-28 |
US20020037562A1 (en) | 2002-03-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2209246C2 (ru) | Малая субъединица изозима iii и изозим iii синтетазы ацетогидроксикислот из escherichia coli, фрагмент днк (варианты), штамм бактерии escherichia coli - продуцент l-валина (варианты) и способ получения l-валина | |
JP3106501B2 (ja) | L−リジンの製造法 | |
JP4035855B2 (ja) | L−リジンの製造法 | |
EP1479775B1 (en) | Process for producing l-threonine with the use of bacterium beloniging to the genus escherichia | |
JP4075087B2 (ja) | L−リジンの製造法 | |
US7186531B2 (en) | L-threonine producing bacterium belonging to the genus Escherichia and method for producing L-threonine | |
US7223572B1 (en) | Methylophilus methylotrophus having enhanced dihydrodipicolinate synthase and/or aspartokinase activity for L-amino acid production | |
JP4380305B2 (ja) | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 | |
JP5087362B2 (ja) | エシェリヒア属細菌を用いたl−アミノ酸の製造法 | |
JP7222098B2 (ja) | 変異型ホモセリンデヒドロゲナーゼ及びそれを用いたホモセリンまたはホモセリン由来l-アミノ酸の生産方法 | |
CN103555721B (zh) | 改进的启动子和用其产生l-赖氨酸的方法 | |
JP2001037494A (ja) | 変異型イソプロピルマレートシンターゼをコードするdna、l−ロイシン生産性微生物、および、l−ロイシンの製造法 | |
JP2001136991A (ja) | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 | |
CN1288058A (zh) | 编码pgi基因的新核苷酸序列 | |
KR100815041B1 (ko) | 아미노산 생산의 대사 공학 | |
US20050106688A1 (en) | Method for producing L-amino acid | |
KR20220110992A (ko) | 프리페네이트 탈수 효소 (Prephenate dehydratase) 변이체 및 이를 이용한 분지쇄 아미노산 생산 방법 | |
US7220572B2 (en) | Method for producing L-leucine | |
JP3975470B2 (ja) | 発酵法によるl−イソロイシンの製造法 | |
EP1689876B1 (en) | L-threonine producing bacterium belonging to the genus escherichia and method for producing l-threonine | |
WO2011016301A1 (ja) | ビブリオ属細菌を用いたl-リジンの製造法 | |
EP2397545B1 (en) | Method for producing amino acid | |
JP4152320B2 (ja) | アミノ酸の製造法 | |
JP4582573B2 (ja) | ピルビン酸の製造方法及びl−バリンの製造方法 | |
KR20220107795A (ko) | aroG 알돌라아제 (Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase) 변이체 및 이를 이용한 분지쇄 아미노산 생산 방법 |