JP2001037494A - 変異型イソプロピルマレートシンターゼをコードするdna、l−ロイシン生産性微生物、および、l−ロイシンの製造法 - Google Patents
変異型イソプロピルマレートシンターゼをコードするdna、l−ロイシン生産性微生物、および、l−ロイシンの製造法Info
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Abstract
し、そして安価かつ効率的なL−ロイシンの製造法を提
供する。 【解決手段】 L−ロイシン生産能を有し、かつL−ロ
イシンによる阻害が解除されたα−イソプロピルリンゴ
酸シンターゼをコードするDNAにより形質転換された
微生物を培地で培養し、該培地中にL−ロイシンを生成
蓄積せしめ、該培地からL−ロイシンを採取することに
よって、L−ロイシンを製造する。
Description
ロピルマレートシンターゼをコードするDNAに関す
る。また、本発明は、変異型α−イソプロピルマレート
シンターゼを有するL−ロイシン生産性微生物およびそ
れを用いたL−ロイシンの製造法に関する。L−ロイシ
ンは、食品及び飼料用の栄養添加物、医療、製薬及び化
学工業における試薬、あるいはリジンのような他のアミ
ノ酸の製造に用いられる微生物の成長因子として用いら
れる必須アミノ酸である。
バクテリウム属、コリネバクテリウム属またはセラチア
属に属するL−ロイシン生産菌またはそれらの変異株を
用いた発酵法により製造されている(アミノ酸発酵、学
会出版センター、397〜422頁、1986年)。最
も高いレベルでL−ロイシンを蓄積するのは、ブレビバ
クテリウム・フラバム VKPM B-2736である。この株は、
研究用ファーメンターで、スクロース含有培地を用いた
72時間の醗酵で、L−ロイシンを26g/Lまで生産
する(USSR発明者証第1394711号)。また、
ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム34株は、
グルコースを含む培地でL−ロイシンを34g/Lまで
生産する(Appl. Environ. Microbiol., 51, p.1024 (1
986))。
産性はかなり高まってはいるが、今後のL−ロイシンの
需要の一層の増大に応えるためには、さらに安価かつ効
率的な製造法の開発が求められている。
属に属する微生物は、その増殖速度の速さ並びに遺伝子
解析の進み方、遺伝子材料の豊富さ等から優れたL−ロ
イシン生産菌として利用される可能性を有しているが、
エシェリヒア属細菌によるL−ロイシン生産の報告は少
ない。L−ロイシン生産性を有するエシェリヒア属細菌
としては、β−チエニルアラニン耐性を有する微生物、
β−チエニルアラニン耐性及びβ−ヒドロキシロイシン
耐性を有する微生物(以上、特公昭62-34397号公報)、
4−アザロイシン耐性又は5,5,5−トリフルオロロ
イシン耐性を有する微生物(特開平8-70879号公報)が
知られている。しかし、L−ロイシン耐性を有するエシ
ェリヒア属細菌及びエシェリヒア属細菌におけるL−ロ
イシン耐性とL−ロイシン生産性との関係については知
られていない。
ら、L−ロイシン生産能に優れた微生物を提供し、そし
て、安価かつ効率的なL−ロイシンの製造法を提供する
ことを課題とする。
を解決するために鋭意研究を重ねた結果、α−イソプロ
ピルマレートシンターゼ(以下、IPMSと略す)のL
−ロイシンによる阻害の解除が、L−ロイシン生産性に
寄与することを見出し、本発明を完成するに至った。
(B)のタンパク質をコードするDNA(以下、本発明
のDNAともいう)を提供する。 (A)配列番号2に示すアミノ酸配列において、下記
(a)〜(e)から選ばれる置換を有するアミノ酸配列
を有するタンパク質。 (a)482位のスレオニン残基の他のアミノ酸残基へ
の置換。 (b)386位のグルタミン酸残基の他のアミノ酸残基
への置換。 (c)428位のプロリン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (d)479位のグリシン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (e)462位のグリシン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (B)(A)のタンパク質のアミノ酸配列において、1
若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入若しくは付
加されたアミノ酸配列からなるタンパク質であって、I
PMS活性を有し且つその活性のL−ロイシンによる阻
害が(A)のタンパク質と同等に解除されているタンパ
ク質。
が下記(a’)〜(e’)から選ばれる置換であるもの
である。 (a’)482位のスレオニン残基のイソロイシン残基
への置換。 (b’)386位のグルタミン酸残基のリジン残基への
置換。 (c’)428位のプロリン残基のロイシン残基への置
換。 (d’)479位のグリシン残基のシステイン残基への
置換。 (e’)462位のグリシン残基のアスパラギン酸残基
への置換。
号1に示す塩基配列において下記(i)〜(v)から選
ばれる変異を有する塩基配列を有するものが挙げられ
る。 (i)1445位のシトシンのチミンへの変異。 (ii)1156位のグアニンのアデニンへの変異。 (iii)1283位のシトシンのチミンへの変異。 (iv)1435位のグアニンのチミンへの変異。 (v)1385位のグアニンのアデニン残基への変異。
質転換され、かつL−ロイシン生産能を有する微生物
(以下、本発明の微生物ともいう)を提供する。また、
本発明の微生物は、好ましくは、エシェリヒア属細菌で
あり、より好ましくは、エシェリヒア・コリ(E. coli)
である。
で培養し、該培地中にL−ロイシンを生成蓄積せしめ、
該培地からL−ロイシンを採取することを特徴とするL
−ロイシンの製造法を提供する。
において、コードされるIPMSのL−ロイシンによる
フィードバック阻害が解除される変異を有するものであ
る。
ードバック阻害が解除される」とは、そのフィードバッ
ク阻害の程度が低下していることを意味する。フィード
バック阻害の程度の低下は、L−ロイシンの存在による
IPMS活性の低下を測定し、野生株または親株と比較
することによって評価することができる。
来のもの、特にE. coli由来のIPMSが挙げられる。
また、IPMSのL−ロイシンによるフィードバック阻
害を解除する変異としては、配列番号2に記載されるI
PMSのアミノ酸配列中の以下の置換が挙げられる。 (a)482位のスレオニン残基の他のアミノ酸残基へ
の置換。 (b)386位のグルタミン酸残基の他のアミノ酸残基
への置換。 (c)428位のプロリン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (d)479位のグリシン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (e)462位のグリシン残基の他のアミノ酸残基への
置換。
である。 (a’)482位のスレオニン残基のイソロイシン残基
への置換。 (b’)386位のグルタミン酸残基のリジン残基への
置換。 (c’)428位のプロリン残基のロイシン残基への置
換。 (d’)479位のグリシン残基のシステイン残基への
置換。 (e’)462位のグリシン残基のアスパラギン酸残基
への置換。
は、エシェリヒア属細菌由来のIPMSをコードするも
のが挙げられ、より具体的には配列番号2に示すアミノ
酸配列をコードするDNAが挙げられ、さらに具体的に
は配列番号1に示す塩基配列が挙げられる。これらの配
列において、上記アミノ酸残基の置換を起こすような塩
基配列の変異を有するものが、本発明のDNAに含まれ
る。なお、置換されたアミノ酸残基に対応するコドン
は、そのアミノ酸残基をコードするものであれば種類は
特に問わない。
号1に示す塩基配列において下記(i)〜(v)から選
ばれる変異を有する塩基配列を有するものが挙げられ
る。 (i)1445位のシトシンのチミンへの変異。 (ii)1156位のグアニンのアデニンへの変異。 (iii)1283位のシトシンのチミンへの変異。 (iv)1435位のグアニンのチミンへの変異。 (v)1385位のグアニンのアデニン残基への変異。
PMSの配列がわずかに相異することが予想されるが、
このような酵素の活性に関与しない位置でのアミノ酸残
基の置換、欠失あるいは挿入を有するものをコードする
DNAも本発明のDNAに含まれる。すなわち、上記変
異型IPMSのアミノ酸配列において、1若しくは数個
のアミノ酸が欠失、置換、挿入若しくは付加されたアミ
ノ酸配列からなるタンパク質であって、IPMS活性を
有し且つその活性のL−ロイシンによる阻害が上記変異
型IPMSと同等に解除されているタンパク質をコード
するDNAも、本発明の変異型IPMSをコードするD
NAに包含される。このようなDNAには、上記のよう
なアミノ酸の欠失、置換、挿入又は付加には、IPMS
を保持する微生物の個体差、種や属の違いに基づく場合
などの天然に生じ得る変異を有するもの(mutant又はva
riant)も含まれる。
S遺伝子を含有するDNAの供与菌としては、好ましくは
エシェリヒア属に属する微生物が挙げられる。具体的に
はナイトハルトらの著書(Neidhardt, F.C. et.al., Es
cherichia coliand Salmonella Typhimurium, American
Society for Microbiology, Washington D.C., 1208,
table 1)にあげられるものが利用できる。例えば、E.
coli K-12株、JM109株、MC1061株などがあげられる。I
PMS遺伝子を含有するDNAの供与菌として野生株を用
いた場合、野生型のIPMS遺伝子を含むDNAが取得で
きる。
調製例について述べる。まず、野生型のIPMS遺伝子
をもつE. coli例えばK-12株を培養して培養物を得る。
上記微生物を培養するには、通常の固体培養法で培養し
ても良いが、集菌の際の効率を考慮すると液体培養法を
採用して培養するのが好ましい。また、培地としては、
例えば酵母エキス、ペプトン、肉エキス、コーンスティ
ープリカーまたは大豆もしくは小麦の浸出液等の1種類
以上の窒素源に、リン酸第1カリウム、リン酸第2カリ
ウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、塩化マグネ
シウム、塩化第2鉄、硫酸第2鉄または硫酸マンガン等
の無機塩類の1種以上を添加し、更に必要に応じて糖質
原料、ビタミン等を適宜添加した物が用いられる。な
お、培地の初発pHは、6〜8に調整するのが適当であ
る。また培養は30〜42℃、好ましくは37℃前後で
4〜24時間、通気攪拌深部培養、振盪培養または静置
培養等により行う。
3,000 r.p.m.で5分間遠心分離してE. coli K-12株の菌
体を得る。この菌体より、例えば斎藤、三浦の方法(Bi
ochem. Biophys. Acta., 72, 619, (1963))、K. S. Ki
rbyの方法(Biochem. J., 64,405, (1956))等の方法に
より染色体DNAを得ることができる。
S遺伝子を単離するために、染色体DNAライブラリー
を作製する。まず、染色体DNAを適当な制限酵素で部
分分解して種々の断片混合物を得る。切断反応時間等を
調節して切断の程度を調節すれば、幅広い種類の制限酵
素が使用できる。例えば、Sau3AIを、温度30℃以上、
好ましくは37℃、酵素濃度1〜10ユニット/mlで様
々な時間(1分〜2時間)染色体DNAに作用させてこ
れを消化する。
エシェリヒア属細菌細胞内で自律複製可能なベクターDN
Aに連結し、組換えDNAを作製する。具体的には、染
色体DNAの切断に用いた制限酵素Sau3AIと相補的な
末端塩基配列を生じさせる制限酵素、例えばBamHIを、
温度30℃以上、酵素濃度1〜100ユニット/mlの条件
下で1時間以上、好ましくは1〜3時間、ベクターDN
Aに作用させてこれを完全消化し、切断開裂する。次い
で、上記のようにして得た染色体DNA断片混合物と切
断開裂されたベクターDNAを混合し、これにDNAリ
ガーゼ、好ましくはT4DNAリガーゼを、温度4〜1
6℃、酵素濃度1〜100ユニット/mlの条件下で1時
間以上、好ましくは4〜24時間作用させて組換えDN
Aを得る。
ヒア属の微生物、例えば大腸菌K-12株、好ましくはJE76
27 株(ponB704, dacB12, pfv+, tonA2, dapA, lysA, s
tr,malA38, metB1, ilvH611, leuA371, proA3, lac-3,
tsx-76)のようなIPMS欠損変異株を形質転換して染
色体DNAライブラリーを作製する。この形質転換は
D. M. Morrisonの方法(Methods in Enzymology 68, 32
6 (1979))あるいは受容菌細胞を塩化カルシウムで処理
してDNAの透過性を増す方法(Mandel, M.and Higa,
A., J. Mol. Biol., 53, 159(1970))等により行うこと
ができる。なお、JE7627株は国立遺伝学研究所(日本国
静岡県三島市)より入手可能である。
ら、IPMS活性が増大した株あるいはIPMS遺伝子
欠損に起因する栄養要求性が相補された株よりIPMS
遺伝子の組換えDNAをもつ菌株を得る。例えば、IP
MS欠損変異株はL−ロイシン要求性であるので、IP
MS欠損変異株を宿主に用いた場合は、L−ロイシンを
含有しない培地上で生育可能となった菌株を単離し、該
菌株から組換えDNAを回収することにより、IPMS
遺伝子を含有するDNA断片を得ることができる。
もつ候補株が、実際に IPMS遺伝子がクローニング
された組換えDNAを保持するかどうかを確認するに
は、候補株から細胞抽出液を調製し、それより粗酵素液
を調製してIPMS活性が増大していることを確認する
ことにより達成できる。IPMSの酵素活性測定法は、
Kohlhawらの方法(J. Biol. Chem., 244, 2218(1969))
により行うことができる。
含有するDNAがベクターDNAに挿入された組換えD
NAを、例えば P. Guerry らの方法(J. Bacteriol.,
116,1064, (1973))、D. B. Clewell の方法(J. Bacte
riol., 110, 667(1972))などにより単離することがで
きる。
にIPMS遺伝子を有する株から、斎藤、三浦の方法等
により染色体DNAを調製し、ポリメラーゼチェインリ
アクション法(PCR:polymerase chain reaction;
White, T.J. et al, TrendsGenet., 5, 185(1989)参
照)により、IPMS遺伝子を増幅することによっても
行える。増幅反応に用いるDNAプライマーは、IPM
S遺伝子の全領域あるいは一部領域を含有するDNA二
重鎖の両3’末端に相補するものを用いる。IPMS遺
伝子の一部領域だけを増幅した場合には、該DNA断片
をプライマーとして全領域を含むDNA断片を染色体D
NAライブラリーよりスクリーニングする必要がある。
IPMS遺伝子の全領域を増幅した場合には、増幅され
たIPMS遺伝子を含有するDNA断片を含むPCR反
応液をアガロースゲル電気泳動に供した後、目的のDN
A断片を抽出することによって IPMS遺伝子を含有
するDNA断片を回収できる。
iにおいて既知となっている配列(EMBL accession numb
er No. D10483又はNo. AE000117)を基にして適宜作成
すればよいが、具体的には、IPMS遺伝子をコードす
る1572塩基からなる領域を増幅できるプライマーが好ま
しい。プライマーDNAの合成は、ホスホアミダイト法
(Tetrahedron Letters, 22, 1859(1981)参照)等の常
法により、市販のDNA合成装置(例えば、Applied Bi
osystems社製DNA合成機 model 380B等)を用いて行
うことができる。また、PCR反応は、市販のPCR反応
装置(宝酒造(株)製DNAサーマルサイクラー PJ200
0型等)を使用し、TaqDNAポリメラーゼ(宝酒造(株)
より供給されている)を用い、供給者により指定された
方法に従って行うことができる。
は、エシェリヒア属細菌細胞内において自律複製可能な
ベクターDNAに接続し、エシェリヒア属細菌細胞に導
入することによって、IPMS遺伝子への変異の導入な
どの操作がしやすくなる。用いられるベクターDNAと
形質転換法、さらに IPMS遺伝子の存在の確認方法
は上述した方法と同じである。
としては、Hertberg, K.M. et al.,Gene, 8, 135-152(1
980)、Davis, M.G. et al., J. Bacteriol., 129, 1078
-1090(1977)などがある。
IPMSを有する微生物を変異処理し、変異型IPMS
を生産する変異株を創成した後、該変異株から変異型遺
伝子を取得する場合の、変異型遺伝子の取得にも用いる
ことができる。
残基の置換、挿入および欠失等の変異を実施する方法と
しては、リコンビナントPCR法(Higuchi, R., 61, i
n PCR Technology (Erlich, H.A.Eds., Stockton press
(1989)))、部位特異的変異法(Kramer, W. and Frits,
H.J., Meth. in Enzymol., 154, 350(1987)); Kunkel,
T.A. et.al., Meth. in Enzymol., 154, 367(1987))
などがある。これらの方法を用いると、目的部位に目的
の変異を起こすことができる。
れば、目的部位への変異、あるいはランダムな変異を導
入することができる。
PMS遺伝子を直接ヒドロキシルアミンで処理する方法
(Hashimoto, T. and Sekiguchi, M., J. Bacteriol.,
159,1039(1984))がある。また、IPMS遺伝子を保有
する微生物を紫外線照射する方法またはN−メチル−N'
−ニトロソグアニジンもしくは亜硝酸などの化学薬剤処
理による方法を用いてもよい。これらの方法によれば、
ランダムに変異を導入できる。
PMS遺伝子を含有するDNA断片とベクターDNAか
らなる組換えDNAを、直接ヒドロキシルアミン等で変
異処理し、これで例えば E. coli W3110 株を形質転換
する。次にL−ロイシンのアナログである、4−アザ−
D,L−ロイシンまたは3−ヒドロキシ−D,L−ロイ
シンを含む最少培地、例えばM9に形質転換株を培養す
る。野生型のIPMS遺伝子を含有する組換えDNAを
保持する株は、その組換えDNAにより発現されるIP
MSがL−ロイシンのアナログにより阻害されるため
に、L−ロイシンの合成が出来なくなり生育が抑えられ
る。これに対し、L−ロイシンによる阻害の解除された
IPMS遺伝子を含有する組換えDNAを保持する株
は、同組換えDNA中のIPMS遺伝子にコードされる
変異酵素がL−ロイシンのアナログによる阻害を受けな
いので、L−ロイシンのアナログが添加された最少培地
上での生育が可能になるはずである。この現象を利用
し、生育が、L−ロイシンのアナログに耐性となってい
る株、すなわち阻害の解除された変異型IPMS遺伝子
を含有する組換えDNAを保持する株を選択することが
できる。
えDNAとして適当な宿主微生物に導入し、発現させる
ことによりフィードバック阻害が解除されたIPMSを
保有する微生物を取得できる。宿主としては、エシェリ
ヒア属に属する微生物が好ましく、例えば大腸菌(E. c
oli)が挙げられる。
伝子断片を取り出し、他のベクターDNAに挿入したも
のを使用してもよい。本発明において用いることのでき
ることのできるベクターDNAとしては、プラスミドベ
クターDNAが好ましく、例えばpUC19、pUC18、pBR32
2、pHSG299、pHSG298、pHSG399、pHSG398、RSF1010、pM
W119、pMW118、pMW219、pMW218等が挙げられる。他にも
ファージDNAのベクターも利用できる。
率的に実施するために、変異型IPMSをコードするD
NA配列の上流に、lac、trp、PL等の微生物内
で働く他のプロモーターを連結してもよく、IPMS遺
伝子に含まれるプロモーターをそのまま、あるいは増幅
して用いてもよい。
複製可能なベクターDNAに挿入したものを宿主に導入
し、プラスミドのように染色体外DNAとして宿主に保
持させてもよいが、変異型遺伝子を、トランスダクショ
ン、トランスポゾン(Berg,D.E. and Berg, C.M., Bio/
Technol., 1, 417(1983))、Muファージ(特開平2−
109985号公報)または相同性組換え(Experiment
s in Molecular Genetics, Cold Spring Harbor Lab.(1
972))を用いた方法で宿主微生物の染色体に組み込んで
もよい。
れ、かつL−ロイシン生産能を有する微生物である。
方法により行うことができる。例えば、本発明DNAを
含む断片を、宿主(形質転換される微生物)で機能する
ベクターと連結して組換えDNAを作成し、これを宿主
に導入することによって行うことができる。ベクター
は、宿主に合わせて適切に選択される。組換えDNAの
導入は、これまでに報告されている方法に従って行うこ
とができる。例えば、エシェリヒア・コリK-12について
報告されているような、受容菌細胞を塩化カルシウムで
処理してDNAの透過性を増す方法(Mandel, M. and H
iga, A., J. Mol.Biol., 53, 159 (1970))があり、バ
チルス・ズブチリスについて報告されているような、増
殖段階の細胞からコンピテントセルを調製してDNAを
導入する方法(Duncan, C.H., Wilson, G.A. and Youn
g, F.E., Gene, 1, 153 (1977))がある。あるいは、バ
チルス・ズブチリス、放線菌類及び酵母について知られ
ているような、DNA受容菌の細胞を、組換えDNAを
容易に取り込むプロトプラストまたはスフェロプラスト
の状態にして組換えDNAをDNA受容菌に導入する方
法(Chang, S. and Choen, S.N., Molec. Gen. Genet.,
168, 111 (1979); Bibb, M.J., Ward, J.M. and Hopwo
od, O.A., Nature, 274, 398 (1978); Hinnen,A., Hick
s, J.B. and Fink, G.R., Proc. Natl. Acad. Sci. US
A, 75 1929 (1978))も応用できる。また、電気パルス
法(特開平2−207791号公報参照)も使用でき
る。この導入法は、宿主に合わせて適切に選択される。
具体的には、上記<1>(2)において説明したような
ベクター及び方法が挙げられる。
を有する」とは、培地中にL−ロイシンを蓄積すること
を意味し、好ましくは、培地からのL−ロイシンの採取
が容易な量で蓄積することを意味する。
ア属細菌である。エシェリヒア属細菌として具体的に
は、エシェリヒア・コリが挙げられる。L−ロイシン生
産能を有するエシェリヒア属細菌としては、例えば特公
昭62-34397号公報、特開平8-70879号公報に記載される
ようなβ−2−チエニルアラニン、3−ヒドロキシロイ
シン、4−アザロイシン及び5,5,5−トリフルオロ
ロイシン等のロイシンアナログに対する耐性を有するも
のや、WO96/06926号国際公開パンフレットに記載される
ような遺伝子組換え技術によって育種されるもの等が挙
げられる。
ンは、L−バリン生合成系の最終中間体(2−ケトイソ
吉草酸)から分岐するL−ロイシン固有の生合成経路を
通って生合成される。エシェリヒア属細菌では、L−バ
リン生合成の最終段階の反応はilvGMEDAオペロ
ンによってコードされている酵素群によって、L−ロイ
シン固有の生合成反応はleuABCDオペロンによっ
てコードされている酵素群によって、それぞれ行われて
いる。
euB、leuC及びleuDの各遺伝子を有してお
り、leuAがIPMS、leuBがβ−イソプロピル
マレートデヒドロゲナーゼ、leuC及びleuDがα
−イソプロピルマレートイソメラーゼをコードしてい
る。これらの酵素のうち、IPMSはα−ケトイソ吉草
酸からα−イソプロピルリンゴ酸への合成反応を、α−
イソプロピルマレートイソメラーゼはα−イソプロピル
リンゴ酸からβ−イソプロピルリンゴ酸への異性化反応
を、β−イソプロピルマレートデヒドロゲナーゼはβ−
イソプロピルリンゴ酸からL−ロイシン生合成の最終中
間体であるα−ケトイソカプロン酸への脱水素反応を、
各々触媒する。
ち律速段階であるのは、α−ケトイソ吉草酸からα−イ
ソプロピルリンゴ酸への合成反応であり、この反応を触
媒するIPMSは、L−ロイシンによるフィードバック
阻害を受ける。従って、このフィードバック阻害が解除
されたIPMSをコードするDNAによる形質転換によ
り、微生物にL−ロイシン生産能を付与したり、微生物
のL−ロイシン生産能を向上できる。
通常の突然変異処理又は遺伝子工学的手法により、L−
ロイシン生合成に関与する酵素の活性を増強してもよ
い。そのような酵素の活性の増強は、例えば、ilvG
MEDAオペロン又は/及びleuABCDオペロン、
又はこれらの一部を有するDNA断片をプラスミド、フ
ァージ又はトランスポゾンに挿入し、得られる組換えD
NAをエシェリヒア属細菌に導入することによって行う
ことができる。
ついては、Nucleic Acid Res., 20,3305-3308 (1992)に
記載されており、全塩基配列はデータベース(DDBJ acc
ession no. D10483、DDBJのインターネットアドレス:h
ttp://www.ddbj.nig.ac.jp)に登録されている。leu
ABCDオペロンは、これらに記載されている配列を基
に作製したオリゴヌクレオチドをプライマーとし、エシ
ェリヒア属細菌染色体DNAを鋳型とするPCR(ポリ
メラーゼ・チェイン・リアクション、White,T.J. et a
l.; Trends Genet., 5, 185 (1989)参照)によって、l
euABCDオペロンを含むDNA断片を増幅すること
によって取得できる。また、leuABCDオペロン
は、前記文献に記載されている配列を基に作製したオリ
ゴヌクレオチドプローブを用いたハイブリダイゼーショ
ンによりエシェリヒア属細菌染色体DNAライブラリー
をスクリーニングすることによっても、取得することが
できる。
配列及び該オペロンの上流域の塩基配列は、それぞれ N
ucleic Acid Res., 15, 2137-2155 (1987)及び Gene, 9
7, 21-27 (1991)に記載されている。ilvGMEDA
オペロンは、これらに記載されている配列を基に作製し
たプローブ又はプライマーを用いたPCR又はハイブリ
ダイゼーションによって取得することができる。尚、i
lvGMEDAオペロンの取得にエシェリヒア・コリK-
12株又はその誘導体を用いる場合には、アセトヒドロキ
シ酸シンターゼ活性が回復するように、ilvG遺伝子
の復帰変異株を用いることが好ましい。ilvGMED
Aオペロンの取得法及びトランスポゾンを用いて該オペ
ロンをエシェリヒア属細菌細胞内で増幅する方法は、そ
れぞれWO96/06926国際公開パンフレット、フランス特許
公開第2627508号に詳細に記載されている。
培養し、該培地中にL−ロイシンを生成蓄積せしめ、該
培地からL−ロイシンを採取することにより、L−ロイ
シンを効率よく製造することができる。
菌の培養および培養液からのL−ロイシンの採取、精製
等は、従来の微生物を用いた発酵法によるアミノ酸の製
造法と同様にして行えばよい。培養に使用する培地とし
ては、炭素源、窒素源、無機物を含有し、必要があれば
使用菌株が生育に要求する栄養源を適当量含有するする
ものであれば、合成培地でも天然培地でもよい。炭素源
としては、グルコースやシュークロースをはじめとする
各種炭水化物、各種有機酸があげられる。また使用する
微生物の資化性によってはエタノールやグリセロール等
のアルコールを用いることが出来る。窒素源としては、
アンモニアや、硫酸アンモニウム等の各種のアンモニウ
ム塩類や、アミン類その他の窒素化合物や、ペプトン、
大豆加水分解物、発酵菌体分解物等の天然窒素源を用い
ることが出来る。無機物としては、燐酸一カリウム、硫
酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マ
ンガン、炭酸カルシウム等が用いられる。
的条件下で行うことが好ましく、培養温度は20〜40
℃で、好ましくは30〜38℃の範囲で行う。培地のp
Hは通常5〜9の範囲であり、6.5〜7.2の範囲が
好ましい。培地のpHは、アンモニア、炭酸カルシウ
ム、各種酸、各種塩基、緩衝液などによって調整するこ
とができる。通常、1〜3日の培養によって、培養液中
にL−ロイシンが蓄積する。
を遠心分離や膜分離法で除去し、イオン交換法、濃縮
法、晶析法等によってL−ロイシンを採取、精製するこ
とが出来る。
イシンによる阻害が解除されたIPMSをコードするD
NAは、L−ロイシン生産微生物育種に利用することが
できる。このDNAで形質転換された微生物を用いるこ
とによって、効率よくL−ロイシンを製造することがで
きる。
に説明する。
得 <1>L−ロイシン生産株の取得 エシェリヒア・コリ(E. coli)のL−ロイシン生産株
を、標準的な研究用野生株E. coli K-12から以下のよう
な選択により得た。E. coli K-12の細胞を、2 mg/mlの
N−メチル−N’−ニトロ−N−ニトロソグアニジンを
含む変異原溶液により、37℃で30分間処理した。次い
で、細胞を0.8% NaCl溶液で2回洗浄し、1 mg/mlのL−
ロイシンアナログ(4−アザロイシン)を含むM9寒天培
地ディッシュに塗沫した。37℃でのインキュベーション
で5日後に生じたコロニーを選び取り、そしてそれらの
ロイシン生産能を評価した。No.9、No.68、N
o.58、No.55及びNo.15の株がL−ロイシ
ンを生産した。
遺伝子の取得 得られたロイシン生産性変異株No.55及び野生株E.
coli K-12のleuA遺伝子を、欠陥バクテリオファージMu
d5005を用いるin vivoクローニング法(Groisman, E.
A. et al., J. Bactriol., 168, 357(1986))によりク
ローニングした。次いで、クローニングしたleuA遺伝子
の、オーバーラップする複数の断片を、表1に示すDN
Aプライマー(LeuA1及びLeuA2、LeuA3及びLeuA4、LeuA
5及びLeuA6、LeuA7及びLeuA8、LeuA9及びLeuA10)を用
いるPCRによって増幅した。
ングなしで、No.9、No.68、No.58および
No.15の各株の染色体からのleuA遺伝子の増幅に用
いた。断片の塩基配列はジデオキシチェーンターミネー
ション法で決定した。
o.55およびNo.15の各株由来のleuA遺伝子は、
表2に示す変異を有していた。
ンモニウム、0.2%リン酸二水素カリウム、0.1%硫酸マグ
ネシウム、2.5%チョークおよび0.1 mg/mlチアミンを含
む培地中32℃で10時間増殖させた。超音波処理および硫
安沈殿により無細胞抽出液を得、これを酵素調製物とし
て用いた。IPMS比活性は、Kohlhawらの方法(J.Bio
l. Chem., 244, 2218(1969))により測定した。I
50は、酵素活性の50%阻害を生じるロイシン濃度であ
る。L−ロイシン生産は、上記の培地中で48時間培養
した後に測定した。
52 (1954))に対して、ロイシン生産株No.9、No.
68、No.58、No.55およびNo.15並びに
E. coli K-12で増殖させたP1ファージにより形質導入
を行った。leu+形質導入体が得られ、L−ロイシン生産
能について試験した。結果を表3に示す。
供され、また、安価かつ効率的なL−ロイシンの製造法
が提供される。
Claims (7)
- 【請求項1】 以下の(A)又は(B)のタンパク質を
コードするDNA。 (A)配列番号2に示すアミノ酸配列において、下記
(a)〜(e)から選ばれる置換を有するアミノ酸配列
を有するタンパク質。 (a)482位のスレオニン残基の他のアミノ酸残基へ
の置換。 (b)386位のグルタミン酸残基の他のアミノ酸残基
への置換。 (c)428位のプロリン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (d)479位のグリシン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (e)462位のグリシン残基の他のアミノ酸残基への
置換。 (B)(A)のタンパク質のアミノ酸配列において、1
若しくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入若しくは付
加されたアミノ酸配列からなるタンパク質であって、α
−イソプロピルマレートシンターゼ活性を有し且つその
活性のL−ロイシンによる阻害が(A)のタンパク質と
同等に解除されているタンパク質。 - 【請求項2】 前記置換が下記(a’)〜(e’)から
選ばれる置換である請求項1記載のDNA。 (a’)482位のスレオニン残基のイソロイシン残基
への置換。 (b’)386位のグルタミン酸残基のリジン残基への
置換。 (c’)428位のプロリン残基のロイシン残基への置
換。 (d’)479位のグリシン残基のシステイン残基への
置換。 (e’)462位のグリシン残基のアスパラギン酸残基
への置換。 - 【請求項3】 配列番号1に示す塩基配列において下記
(i)〜(v)から選ばれる変異を有する塩基配列を有
する請求項2記載のDNA。 (i)1445位のシトシンのチミンへの変異。 (ii)1156位のグアニンのアデニンへの変異。 (iii)1283位のシトシンのチミンへの変異。 (iv)1435位のグアニンのチミンへの変異。 (v)1385位のグアニンのアデニン残基への変異。 - 【請求項4】 請求項1〜3のいずれか一項に記載のD
NAにより形質転換され、かつL−ロイシン生産能を有
する微生物。 - 【請求項5】 エシェリヒア属細菌である請求項4記載
の微生物。 - 【請求項6】 エシェリヒア・コリである請求項5記載
の微生物。 - 【請求項7】 請求項4〜6のいずれか一項に記載の微
生物を培地で培養し、該培地中にL−ロイシンを生成蓄
積せしめ、該培地からL−ロイシンを採取することを特
徴とするL−ロイシンの製造法。
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