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JP6464255B2 - 二重特異性t細胞活性化抗原結合分子 - Google Patents

二重特異性t細胞活性化抗原結合分子 Download PDF

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Description

発明の分野
本発明は、概して、T細胞を活性化させるための二重特異性抗原結合分子に関する。加えて、本発明は、このような二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチドと、このようなポリヌクレオチドを含むベクター及び宿主細胞とに関する。本発明は更に、本発明の二重特異性抗原結合分子を生成する方法と、このような二重特異性抗原結合分子を疾患の治療に使用する方法とに関する。
個々の細胞又は特定の細胞型の選択的破壊は、しばしば様々な臨床設定において望ましい。例えば、健常な細胞と組織を無傷のまま損傷を与えずに残しながら、腫瘍細胞を特異的に破壊することはがん治療の主要目的である。
これを達成する魅力的な方法は、腫瘍に対する免疫応答を誘導することにより、ナチュラルキラー(NK)細胞又は細胞傷害性Tリンパ球(CTL)のような免疫エフェクター細胞に、腫瘍細胞を攻撃させて破壊させることである。CTLは、免疫系の最も強力なエフェクター細胞を構成するが、しかしそれらは従来の治療抗体のFcドメインによって媒介されるエフェクター機構によって活性化することができない。
これに関し、標的細胞上の表面抗原に一の「アーム」で結合し、T細胞受容体(TCR)複合体の活性化インバリアント成分に第2の「アーム」で結合するように設計された二重特異性抗体が、近年注目を浴びている。このような抗体がその標的の両方に同時結合することにより、標的細胞とT細胞との間に一時的な相互作用が生じ、これは何れかの傷害性T細胞を活性化させ、続いて標的細胞を溶解させる。従って、免疫応答は、標的細胞に再指向(re−direct)され、CTLの正常なMHC制限活性化がそうであるように、標的細胞によるペプチド抗原の提示又はT細胞の特異性とは無関係である。このような観点から、標的細胞がそれに対して二重特異性抗体を提示するとき、すなわち免疫シナプスが模倣されるときにのみ、CTLが活性化されることが重要である。特に望ましいのは、標的細胞の効率のよい溶解を引き起こすために、リンパ球のプレコンディショニング又は同時刺激を必要としない二重特異性抗体である。
幾つかの二重特異性抗体フォーマットが開発され、T細胞媒介性免疫療法に対するそれらの適合性が検討された。これらの中でも、いわゆるBiTE(二重特異性T細胞結合体)分子は、きわめて詳細な特徴付けが済んでおり、臨床の分野で既に何らかの有望さを示している(Nagorsen and Baeuerle, Exp Cell Res 317, 1255-1260 (2011)に掲載)。BiTEは、2つのscFv分子が柔軟なリンカーによって融合されているタンデムscFv分子である。T細胞結合体について評価された更なる二重特異性フォーマットには、ダイアボディ(Holliger et al., Prot Eng 9, 299-305 (1996))及びその誘導体、例えばタンデム型ダイアボディ(Kipriyanov et al., J Mol Biol 293, 41-66 (1999))が含まれる。更に最近の開発は、ダイアボディフォーマットに基づくが、更なる安定性のためにC末端ジスルフィド架橋を特徴とする、いわゆるDART(二重親和性再標的化)分子である(Moore et al., Blood 117, 4542-51 (2011))。全体がハイブリッドマウス/ラットIgG分子であり、また現在臨床試験において評価されつつあるいわゆるトリオマブ(triomab)は大きなサイズのフォーマットを表している(Seimetz et al., Cancer Treat Rev 36, 458-467 (2010)に総説される)。
開発されている種々のフォーマットは、免疫療法におけるT細胞の再指向及び活性化により大きな可能性を示すものである。しかしながら、そのために適した二重特異性抗体を生成するというタスクは決して簡単はなく、抗体の有効性、毒性、実現可能性、及び生産可能性に関して克服されなければならない複数の困難性を伴っている。
例えば、BiTE分子などの小さな構築物は、効果的にエフェクター細胞及び標的細胞を架橋することができるが、血清半減期が非常に短いため、連続注入によって患者に投与する必要がある。一方、IgG−様フォーマットは、半減期が長いという大きな利点を有するが、IgG分子に固有の天然エフェクター機能に関連付けられる毒性を欠点として有する。これらの免疫原性は、治療法開発の成功にとって、特に非ヒトフォーマットのIgG様二重特異性抗体の、別の好ましくない特徴を構成する。最後に、二重特異性抗体の一般的開発においてこれまで主に問題であったのは、臨床的に十分な量及び純度で二重特異性抗体構築物を生産することで、これは、同時発現した際に異なる特異性の抗体重鎖と軽鎖とを誤って対にしてしまうことにより、正しく構築された構築物の収率が低減し、所望の二重特異性抗体の分離が困難な複数の非機能性副生成物が生じることに起因している。
二重特異性抗体における鎖会合の問題を克服するために、異なるアプローチがとられている(例えば、Klein et al., mAbs 6, 653-663 (2012)参照)。例えば、「ノブ・イン・ホール(knobs-into-hole)」戦略は、接触界面を改変するためにCH3ドメインに突然変異を導入することにより、2つの異なる抗体重鎖の対形成を強制することを目的とする。1つの鎖において、嵩高いアミノ酸が短い側鎖を有するアミノ酸によって置換され、「ホール(hole)」を形成する。逆に、大きな側鎖を有するアミノ酸は、他のCH3ドメインに導入されて「ノブ」を形成する。これらの2つの重鎖(及び両方の重鎖に適切でなければならない2つの同一の軽鎖)を共発現することにより、ヘテロダイマー(「ノブ−ホール」)対ホモダイマー(「ホール−ホール」又は「ノブ−ノブ」)が観察されている(Ridgway, J.B., et al., Protein Eng. 9 (1996) 617-621;及び国際公開第96/027011号)。ヘテロ二量体のパーセンテージは、ファージディスプレイアプローチ及びヘテロダイマーを安定化させるためのジスルフィド架橋の導入を用いて2つのCH3ドメインの相互作用表面を再構築することによって更に増加させることができた(Merchant, A.M., et al., Nature Biotech. 16 (1998) 677-681; Atwell, S., et al., J. Mol. Biol. 270 (1997) 26−35)。ノブ・ツー・ホール技術の新しいアプローチは、例えば欧州特許第1870459(A1)号に記載されている。
しかしながら、「ノブ・イン・ホール」戦略は、異なる標的抗原への結合のための異なる軽鎖を含む二重特異性抗体において生じる重鎖−軽鎖の誤対合の問題を解決しない。
重鎖−軽鎖の誤対合を防止するための戦略は、二重特異性抗体の結合アームの一つの重鎖と軽鎖の間でドメインを交換することである(国際公開第2009/080251号、国際公開第2009/080252号、国際公開第2009/080253号、国際公開第2009/080254号及びSchaefer, W. et al, PNAS, 108 (2011) 11187-11191(ドメイン交差を有する二重特異性IgG抗体に関連する)を参照)。
二重特異性抗体(国際公開第2009/080252号、Schaefer, W. et al, PNAS, 108 (2011) 11187-11191もまた参照のこと)の結合アームの一つにおいて、重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLを交換することにより、第1の抗原に対する軽鎖の第2の抗原に対する誤った重鎖との誤対合により生ずる副生成物を(このようなドメイン交換のないアプローチと比較して)明らかに減少させる。それにもかかわらず、これらの抗体調製物は、副生成物を完全に含まないわけではない。主な副生成物は、Bence Jones型の相互作用に基づいている(Schaefer, W. et al, PNAS, 108 (2011) 11187-11191;補足の図S1I)。従って、このような副生成物の更なる減少は、例えばこのような二重特異性抗体の収率を改善するのに所望される。
T細胞媒介性免疫療法のための現在利用可能な二重特異性抗体に関連した困難及び欠点を考慮すると、そのような分子の新規な改良されたフォーマットが依然として必要とされている。本発明は、良好な有効性及び生産可能性を低毒性及び好ましい薬物動態的特性と組み合わせた、T細胞の活性化と再指向のために設計された二重特異性抗原結合分子を提供する。
発明の要旨
本発明によれば、望ましくない副生成物、特にそれらの結合アームの一つにおいてVH/VLドメイン交換を有する二重特異性抗体に生じるBence Jones型副生成物と比較した所望の二重特異性抗体の比は、CH1及びCLドメイン中の特定のアミノ酸位置に反対の電荷を有する荷電アミノ酸の導入によって改善され得る。
従って、第1の態様において、本発明は、
(a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
(b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、第1の抗原は活性化T細胞抗原であり、かつ第2の抗原は標的細胞抗原であり、又は第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原であり;かつ
i)a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に置換され、かつ
a)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換され;又は
ii)b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に置換され、かつ
b)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
本発明によれば、第2のFab分子は、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変領域が交換されるクロスオーバーFab分子である。特定の実施態様において、第1の(そして、もしあれば第3の)Fab分子は従来型のFab分子である。更なる特定の実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合することができる1つ以下のFab分子が、T細胞を活性化する二重特異性抗原結合分子に存在する(すなわち、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は活性化T細胞抗原に一価の結合を提供する)。
特定の実施態様において、第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原である。より特異的な実施態様において、活性化T細胞抗原はCD3、具体的にはCD3イプシロンである。一実施態様において、標的細胞抗原はCD20である。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の一実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)置換され、かつ
a)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
更なる実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に置換され、かつa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
更に別の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、並びに、a)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)、又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
特定の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
別の特定の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
一実施態様において、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、
(a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
(b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
を含み、
ここで、第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原であり;
ここで、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、並びに、a)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)、又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の別の実施態様において、b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)置換され、かつ
b)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
更なる実施態様において、b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に置換され、かつb)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
更に別の実施態様において、b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、並びに、b)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)、又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
一実施態様において、b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにb)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
別の実施態様において、b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにb)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
幾つかの実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子を更に含む。
特定の実施態様において、第3のFab分子は第1のFab分子と同一である。これらの実施態様において、従って、第3のFab分子は第1のFab分子と同じアミノ酸置換を含む。第1のFab分子と同様に、第3のFab分子は特に従来型のFab分子である。
第3のFab分子が存在する場合、特定の実施態様では、第1及び第3のFab分子は標的細胞抗原に特異的に結合し、第2のFab分子は活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンに特異的に結合する。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の幾つかの実施態様において、a)の第1のFab分子及びb)の第2のFab分子は、任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合している。特定の実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端で第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。別の実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端で第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。(i)第2のFab分子がFab重鎖のC末端で第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しているか、又は(ii)第1のFab分子がFab重鎖のC末端で第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しているかのどちらかである実施態様において、更に、Fab分子のFab軽鎖及び第2のFab分子のFab軽鎖を任意選択的にペプチドリンカーを介して互いに融合させることができる。
特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメインを更に含む。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、異なる立体配置(configuration)を有することができ、すなわち、第1、第2(及び任意選択的に第3)のFab分子は、互いに、及び異なる方法でFcドメインに融合し得る。それらの成分は、直接的に、又は好ましくは、一又は複数の適切なペプチドリンカーを介して互いに融合し得る。融合がFcドメインのサブユニットのN末端に対してである場合、それは典型的には免疫グロブリンヒンジ領域を介して行われる。
一実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。そのような実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端で、第2のFab分子のFab重鎖のN末端又はFcドメインのサブユニットの他の1つのN末端に融合し得る。
一実施態様において、第1及び第2のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している。この実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、免疫グロブリン分子を含み、ここで、Fabアームの1つにおいて、重鎖及び軽鎖の可変領域VH及びVLが互いに交換/置換される(図1A、D参照)。
別の実施態様において、第3のFab分子は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。そのような特定の実施態様において、第2及び第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合し、かつ第1のFab分子はFab重鎖のC末端で第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。この実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、免疫グロブリン分子を含み、ここで、Fabアームの1つにおいて、重鎖及び軽鎖の可変領域VH及びVLが互いに交換/置換され、かつ付加的な(従来型の)Fab分子が前記FabアームにN末端融合されている(図1B、E参照)。別のそのような実施態様において、第1及び第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合し、かつ第2のFab分子はFab重鎖のC末端で第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。この実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、免疫グロブリンFabアームの1つにN末端に融合した付加的なFab分子を有する免疫グロブリン分子を含み、該付加的Fab分子において、重鎖及び軽鎖の可変領域VH及びVLが互いに交換/置換されている(図1C、F参照)。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の異なる立体配置の全てにおいて、本明細書に記載のアミノ酸置換は、第1の及び(存在する場合)第3のFab分子のCH1及びCLドメインにおいて、又は第2のFab分子のCH1及びCLドメインにおいてのどちらかに存在しうる。好ましくは、それらは、第1の及び(存在する場合)第3のFab分子のCH1及びCLドメインに存在する。本発明の概念に従って、本明細書に記載のアミノ酸置換が第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子において行われる場合、そのようなアミノ酸置換は第2のFab分子において行われない。逆に、本明細書に記載のアミノ酸置換が第2のFab分子において行われる場合、そのようなアミノ酸置換は第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子において行われない。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の特定の実施態様において、特に、本明細書に記載のアミノ酸置換が第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子において行われる場合、第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子の定常ドメインCLはκアイソタイプである。本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の他の実施態様において、特に、本明細書に記載のアミノ酸置換が第2のFab分子において行われる場合、第2のFab分子の定常ドメインCLはκアイソタイプである。幾つかの実施態様において、第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子の定常ドメインCL及び第2のFab分子の定常ドメインCLはκアイソタイプである。
特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる免疫グロブリン分子は、IgGクラスの免疫グロブリンである。更により特定の実施態様において、免疫グロブリンは、IgGサブクラスの免疫グロブリンである。別の実施態様において、免疫グロブリンは、IgGサブクラスの免疫グロブリンである。
特定の実施態様において、本発明は、
a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
c)第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子;及び
d)安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンであり;
c)の第3のFab分子は、a)の第1のFab分子と同一であり;
ここで、a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)又はアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;
ここで、
(i)a)の第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でb)の第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつb)の第2のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合しているか、又は
(ii)b)の第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端でa)の第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している。
更により特定の実施態様において、本発明は、
a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
c)第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子;及び
d)安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンであり;
c)の第3のFab分子は、a)の第1のFab分子と同一であり;
ここで、a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;
ここで、a)の第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でb)の第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつb)の第2のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している。
更なる実施態様において、本発明は、
a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;及び
c)安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、
(i)第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンであり;又は
(ii)第2の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第1の抗原は活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンであり;
ここで、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)又はアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;
ここで、a)の第1のFab分子及びb)の第2のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でc)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している。
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の特定の実施態様において、FcドメインはIgGのFcドメインである。特定の実施態様において、FcドメインはIgGのFcドメインである。別の特定の実施態様において、FcドメインはIgGのFcドメインである。更により特定の実施態様において、Fcドメインはアミノ酸置換S228P(Kabatの番号付け)を含むIgGのFcドメインである。特定の実施態様において、FcドメインはヒトFcドメインである。
特定の実施態様において、Fcドメインは、第1及び第2のFcドメインサブユニットの会合を促進する修飾を含む。特定のこのような実施形態において、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインのアミノ酸残基は、より大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置換され、それにより第2のサブユニットのCH3ドメイン内の空洞内に配置可能である第1のサブユニットのCH3ドメイン内に隆起を生成し、かつFcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメイン中のアミノ酸残基は、より小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置換され、それにより第1のサブユニットのCH3ドメイン内の隆起が配置可能である第2のサブユニットのCH3ドメイン内に空洞を生成する。
特定の実施態様において、Fcドメインは、天然のIgG1 Fcドメインと比較して、Fc受容体に対する低下した結合親和性及び/又は低下したエフェクター機能を示す。特定の実施態様において、Fcドメインは、操作されていないFcドメインと比較して、Fc受容体への低下した結合親和性及び/又は低下したエフェクター機能を有するように操作される。一実施態様において、Fcドメインは、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低下させる一又は複数のアミノ酸置換を含む。一実施態様において、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低下させるFcドメイン中の一又は複数のアミノ酸置換は、L234、L235及びP329(KabatのEUインデックス番号付け)の群から選択される一又は複数の位置においてである。特定の実施態様では、Fcドメインの各サブユニットは、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低下させる3つのアミノ酸置換を含んでおり、該アミノ酸置換はL234A、L235A及びP329G(KabatのEUインデックス番号付け)である。一つのそのような実施態様において、FcドメインはIgG Fcドメインであり、特にヒトIgG Fcドメインである。他の実施態様では、Fcドメインの各サブユニットは、Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低下させる2つのアミノ酸置換を含んでおり、該アミノ酸残基はL235E及びP329Gである(KabatのEUインデックス番号付け)。一つのそのような実施態様において、FcドメインはIgG Fcドメインであり、特にヒトIgG Fcドメインである。一実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、IgG Fcドメインであり、アミノ酸置換L235E及びS228P(SPLE)(KabatのEUインデックス番号付け)を含む。
一実施態様において、Fc受容体はFcγ受容体である。一実施態様において、Fc受容体はヒトFc受容体である。一実施態様において、Fc受容体は活性化Fc受容体である。特定の実施態様において、Fc受容体は、FcγRIIa、FcγRI、及び/又はFcγRIIIaである。一実施態様において、エフェクター機能は抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)である。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の特定の実施態様において、活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンに特異的に結合するFab分子は、配列番号4の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号5の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3、配列番号8の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2及び配列番号10の軽鎖CDR3を含む。更により特定の実施態様において、活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンに特異的に結合するFab分子は、配列番号3のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び配列番号7のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる第2のFab分子は、CD3、より具体的にはCD3イプシロンに特異的に結合し、配列番号4の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号5の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3、配列番号8の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2及び配列番号10の軽鎖CDR3を含む。更により特定の実施態様において、前記第2のFab分子は、配列番号3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の更に特定の実施態様において、標的細胞抗原、特にCD20に特異的に結合するFab分子は、配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号47の重鎖CDR2、配列番号48の重鎖CDR3、配列番号49の軽鎖CDR1、配列番号50の軽鎖CDR2及び配列番号51の軽鎖CDR3を含む。更により特定の実施態様において、標的細胞抗原、特にCD20に特異的に結合するFab分子は、配列番号30のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び配列番号31のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。1つの特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子はCD20に特異的に結合し、配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号47の重鎖CDR2、配列番号48の重鎖CDR3、配列番号49の軽鎖CDR1、配列番号50の軽鎖CDR2及び配列番号51の軽鎖CDR3を含む。更により特定の実施態様において、第1の(及び存在する場合は第3の)Fab分子は、配列番号30のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号31のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
特定の態様において、本発明は、
a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
c)第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子;及び
d)安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、
(i)第1の抗原はCD20であり、かつ第2の抗原はCD3、具体的にはCD3イプシロンであり;
(ii)a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれ、配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号47の重鎖CDR2、配列番号48の重鎖CDR3、配列番号49の軽鎖CDR1、配列番号50の軽鎖CDR2及び配列番号51の軽鎖CDR3を含み、かつb)の第2のFab分子は、配列番号4の重鎖CDR1、配列番号5の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3、配列番号8の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2及び配列番号10の軽鎖CDR3を含み;
(iii)a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)又はアルギニン(R)によって、特にアルギニン(R)によって(Kabatによる番号付け)置換され、並びにa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;
(iv)a)の第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でb)の第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつb)の第2のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している。
更なる態様において、本発明は、
a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
c)第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子;及び
d)安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、
(i)第1の抗原はCD20であり、かつ第2の抗原はCD3、具体的にはCD3イプシロンであり;
(ii)a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれ、配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号47の重鎖CDR2、配列番号48の重鎖CDR3、配列番号49の軽鎖CDR1、配列番号50の軽鎖CDR2及び配列番号51の軽鎖CDR3を含み、かつb)の第2のFab分子は、配列番号4の重鎖CDR1、配列番号67の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3、配列番号68の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2及び配列番号10の軽鎖CDR3を含み;
(iii)a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)又はアルギニン(R)によって、特にアルギニン(R)によって(Kabatによる番号付け)置換され、並びにa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;
(iv)a)の第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でb)の第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつb)の第2のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している。
本発明の別の態様によれば、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子をコードする単離されたポリヌクレオチド(1つ又は複数)が提供される。本発明は更に、本発明の単離されたポリヌクレオチド(1つ又は複数)を含む一又は複数の発現ベクター及び本発明の単離されたポリヌクレオチド(1つ又は複数)又は発現ベクター(1つ又は複数)を含む宿主細胞を提供する。幾つかの実施態様において、宿主細胞は真核細胞、特に哺乳動物細胞である。
別の態様において、a)本発明の宿主細胞を、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の発現に適した条件下で培養する工程、及びb)T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を回収する工程を含む、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を生成する方法が提供される。本発明はまた、本発明の方法によって生成されたT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を包含する。
本発明は更に、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子及び薬学的に許容可能な担体を含む薬学的組成物を提供する。
本発明には、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子及び薬学的組成物を使用する方法も包含される。本発明の一態様では、医薬としての使用のための本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又は薬学的組成物が提供される。一態様では、治療を必要とする個体の疾患の治療における使用のための、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又は薬学的組成物が提供される。特定の一実施態様において、疾患はがんである。
更に、治療を必要とする個体の疾患を治療するための医薬の製造のための、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の使用と;個体に対し、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む組成物の治療的有効量を、薬学的に許容可能な形態で投与することを含む、前記個体の疾患の治療方法とが提供される。特定の一実施態様において、疾患はがんである。上記実施態様のいずれにおいても、個体は好ましくは哺乳動物、特にヒトである。
本発明は、T細胞、特に細胞傷害性T細胞の存在下において、標的細胞に本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を接触させることを含む、標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を誘導する方法も提供する。
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子(TCB)の例示的立体配置。(A、D)「1+1 CrossMab」分子の図。(B、E)別の順序でCrossfab及びFab成分(「反転型」)を有する(「2+1 IgG Crossfab」分子の図。(C、F)「2+1 IgG Crossfab」分子の図。(G、K)別の順序でCrossfab及びFab成分(「反転型」)を有する(「1+1 IgG Crossfab」分子の図。(H、L)「1+1 IgG Crossfab」分子の図。(I、M)2つのCrossFabを有する「2+1 IgG Crossfab」分子の図。(J、N)2つのCrossFab並びに別の順序でCrossfab及びFab成分(「反転型」)を有する「2+1 IgG Crossfab」分子の図。(O、S)「Fab−Crossfab」分子の図。(P、T)「Crossfab−Fab」分子の図。(Q、U)「(Fab)−Crossfab」分子の図。(R、V)「Crossfab−(Fab)」分子の図。(W、Y)「Fab−(Crossfab)」分子の図。(X、Z)「(Crossfab)−Fab」分子の図。黒い点:ヘテロ二量体化を促すFcドメイン内の任意選択的修飾。++、−−:CH及びCLドメインに導入された反対の電荷のアミノ酸。 実施例1で調製されたTCBの図。(A)電荷修飾を有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にCH1/CL交換)、(B)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)、(C)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)、(D)電荷修飾を有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換)、(E)電荷修飾を有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH−CH1/VL−CL交換)、(F)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD20結合剤中にVH/VL交換、CD3結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;KK=123K、124K)、(G)電荷修飾及びFc領域におけるDDKK突然変異を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)、(H)電荷修飾を有する「1+1 CrossMab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)、(I)電荷修飾を有する「1+1 CrossMab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K、異なるCD20結合剤)、(J)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、E=213E;R=123R)、(K)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤におけるVH/VL交換及び電荷修飾)。 (A−I、N、O)実施例1で調製されたTCBのCE−SDS分析(最終精製調製物)。(A)図2Aに示される分子「A」の電気泳動図、(B)図2Bに示される分子「B」の電気泳動図、(C)図2Cに示される分子「C」の電気泳動図、(D)図2Dに示される分子「D」の電気泳動図、(E)図2Eに示される分子「E」の電気泳動図、(F)図2Fに示される分子「F」の電気泳動図、(G)図2Gに示される分子「G」の電気泳動図、(H)図2Hに示される分子「H」の電気泳動図、(I)図2Iに示される分子「I」の電気泳動図、(N)図2Jに示される分子「J」の電気泳動図、(O)図2Kに示される分子「K」の電気泳動図。レーンA=非還元、レーンB=還元。(J−L、P、Q)第1精製工程(プロテインA親和性クロマトグラフィー)後の実施例1で調製したTCBのSDS−PAGE分析。(J)4−12%Bis−Tris SDS−PAGE、非還元;レーン1=マーカー(Mark 12、未染色標準物質、Invitrogen);レーン2−11=分子BのプロテインA親和性クロマトグラフィーからの画分、(K)3−8%トリス・酢酸SDS−PAGE、非還元;レーン1=マーカー(HiMark、Invitrogen);レーン2−12=分子CのプロテインA親和性クロマトグラフィーからの画分、(L)4−12%Bis−Tris SDS−PAGE、非還元;レーン1=マーカー(Mark 12、未染色標準物質、Invitrogen);レーン2−14=分子DのプロテインA親和性クロマトグラフィーからの画分、(P)4−12%Bis/Tris SDS PAGE、非還元。レーン1=マーカー(Mark 12、Invitrogen);レーン2−10=分子JのプロテインA親和性クロマトグラフィーからの画分、(Q)4−12%Bis/Tris SDS PAGE、非還元;レーン1=マーカー(Mark 12、Invitrogen);レーン2−12=分子KのプロテインA親和性クロマトグラフィーからの画分。(M)実施例1で調製したTCBの分取サイズ排除クロマトグラフィー(SEC;第1精製工程)、(分子A(第1のSEC工程)、B及びD、示される通り)。 電荷修飾(「電荷残基」)を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(「CD20 TCB」)のCD3及びCD20結合(実施例1を参照)。 ヒトPBMCとの22時間のインキュベーションにより電荷修飾(「電荷残基」)を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(「CD20 TCB」)によって誘導された腫瘍細胞溶解(実施例1を参照)。 電荷修飾(「電荷残基」)を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(「CD20 TCB」)によって誘導されるCD20発現腫瘍標的細胞(Nalm−6)のT細胞媒介性死滅に対するCD8 T細胞(A)又はCD4T細胞(B)の活性化(実施例1を参照)。 電荷修飾(「電荷残基」)を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(「CD20 TCB」)によって誘導されるCD20発現腫瘍標的細胞(Z−138)のT細胞媒介性死滅の際のCD8+T細胞(A)又はCD4T細胞(B)の活性化(実施例1を参照)。 電荷修飾(「電荷残基」)を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(「CD20 TCB」)とのインキュベーションによる健常なヒトの全血におけるB細胞枯渇;24時間のアッセイ(実施例1を参照)。 (「電荷残基」)を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(「CD20 TCB」)によって誘導される健常なヒトの全血におけるCD20発現B細胞のT細胞媒介性死滅の際のCD8+T細胞(A)又はCD4T細胞(B)の活性化(実施例1を参照)。 ヒトCD20(A)及びCD3発現(B)標的細胞への抗CD20/抗CD3 TCB(図2Bに示す分子「B」)の結合。 ヒト及びカニクイザルCD20及びCD3発現標的細胞への抗CD20/抗CD20 TCB(図2Bに示す分子「B」)の結合。(A)B細胞、(B)CD4 T細胞、(C)CD8 T細胞。 異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによって媒介される腫瘍細胞溶解。 異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによって媒介される腫瘍細胞溶解及びその後のT細胞活性化。(A−C)3つの異なるヒトドナー由来のPBMCエフェクター細胞によるZ138腫瘍標的細胞の溶解。(D)示されたDLBCL腫瘍細胞株のパネルの溶解。 異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによって媒介されるヒト全血におけるB細胞枯渇。 Jurkat−NFATレポーターアッセイを用いたCD3下流シグナル伝達の強度の定量化によって評価される、異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによるT細胞の活性化。 NOGマウスのまばらなサンプリングデータからの抗CD20/抗CD3 TCB抗体(図2Bに示す分子「B」)の0.5mg/kg i.v.のボーラス投与薬物動態パラメーター。 完全ヒト化NOGマウスにおける抗CD20/抗CD3 TCB抗体(図2Bに示す分子「B」)のB細胞枯渇活性を評価するための試験デザインの模式図。 (B)抗CD20/抗CD3 TCB抗体(図2Bに示す分子「B」)又は(A)ビヒクル対照で処置した完全ヒト化NOGマウスの血液中のB細胞及びT細胞頻度の速度論。D0、D7:治療用注射の日。 完全ヒト化マウスにおけるビヒクル(黒色の棒)又は抗CD20/抗CD3 TCB抗体(図2Bに示される分子「B」)(白棒)注射後3日目(D3)及び10日目(D10)の末梢T細胞における異なる表面マーカーの発現の分析。 試験終了時(最初の治療用注射後のD10)にビヒクル(黒棒)又は抗CD20/抗CD3 TCB抗体(図2Bに示す分子「B」)(白棒)で処置された完全ヒト化マウスの脾臓におけるB細胞頻度(A)、T細胞頻度(B)及びT細胞上の表面マーカー発現(C)の分析。 huPBMCを移植されたNOGマウスのWSU−DLCL2モデルにおける抗CD20/抗CD3 TCB抗体(図2Bに示す分子「B」)(0.5mg/kg、1週間に1回)の抗腫瘍活性。 実施例2で調製した「2+1 IgG CrossFab、反転型」分子の図。(1)電荷修飾を有しない分子、(2)BCMAに特異的に結合するFab分子のCH1及びCLドメインに電荷修飾を有する分子(EE=147E、213E;KK=123K、124K)。 実施例2で使用した「2+1 IgG CrossFab、反転型」分子のCE−SDS分析(レーンA=非還元、レーンB=還元、レーンAのピークの表)。異なる精製方法(プロテインA親和性クロマトグラフィー(PA)、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)、陽イオン交換クロマトグラフィー(cIEX)、及び最終サイズ排除クロマトグラフィー工程(re−SEC))を電荷修飾を有しない分子(83A10−TCB)及び電荷修飾を有する分子(83A10−TCBcv)に適用した。 プロテインA親和性クロマトグラフィー(PA)及びサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)精製工程の後に1対1(H2H)の比較で行った、実施例2で使用した「2+1 IgG CrossFab、反転型」分子のCE−SDS分析(レーンA=非還元、レーンB=還元、レーンAのピークの表)。 BCMA陽性多発性骨髄腫細胞株に対する抗BCMA/抗CD3 T細胞二重特異性抗体の結合のフローサイトメトリー分析。(A)H929細胞及びMKN45細胞上の83A10−TCB、(B)H929細胞及びMKN45細胞上の83A10−TCBcv、(C)H929細胞上での83A10−TCBと83A10−TCBcvとの比較。 LDH放出によって測定した抗BCMA/抗CD3 TCB抗体((A)83A10−TCB、(B)83A10−TCBcv)によるBCMA陽性H929骨髄腫細胞の死滅。 実施例3で調製されたTCBの図。(A)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、Her2結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)、(B)電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、Her2結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)。 実施例3で調製されたTCBのCE−SDS分析(最終精製調製物)。(A)図27Aに示すHer2 TCBの電気泳動図、(B)図27Bに示すHer3 TCBの電気泳動図。レーンA=非還元、レーンB=還元。 FACSによって決定された、Her2 TCB(A)及びHer3 TCB(B)の細胞への結合。フローサイトメトリーで測定したJurkat細胞(左)上のヒトCD3又はKPL−4細胞(右)上のヒトHer2(A)若しくはHer3(B)に対するHer2 TCB分子の結合の蛍光強度の中央値。描かれているのは、トリプリケート(triplicate)に基づく、SDを含む蛍光値の中央値である。 Her3 TCBによるT細胞活性化。ヒトPBMCエフェクター細胞、KPL−4標的細胞及び漸増濃度のHer3 TCBの同時インキュベーションの際に、CD69陽性CD8T細胞のパーセンテージを48時間後にFACSによって測定した。示されているのはSDを伴うトリプリケートである。 発光によって測定される、5時間後のCD3を介したJurkat細胞の活性化。KPL4腫瘍細胞をJurkat−NFATレポーター細胞(E:T 5:1(A)又は2.5:1(B))及び漸増濃度のHer2 TCB(A)又はHer3 TCB(B)とインキュベートする際に、Jurkatの活性化が、5時間後の相対発光シグナル(RLUS)によって測定された。EC50値がGraph Pad Prism(34.4pM(A)及び22pM(B))により算出された。示されるのはトリプリケートの平均値であり、エラーバーはSDを示す。 (A、B)Her2陽性KPL4、N87、T47D又はMDA−MB−231標的細胞をヒトPBMCエフェクター細胞(E:T 10:1)及び漸増濃度のHer2 TCB分子と共に25時間(A)又は46時間(B)にわたってインキュベートした際に、LDH放出によって測定された腫瘍細胞溶解。示されるのはトリプリケートの平均値であり、エラーバーはSDを示す。EC50値は、GraphPadPrismにより算出した:7.5pM(KPL4細胞)、25.6pM(N87細胞)、30.6pM(T47D細胞)、及び59.9pM(MDA−MB−231細胞)。(C)Her3陽性KPL4標的細胞を、ヒトPBMCエフェクター細胞(E:T 10:1)及び漸増濃度のHer3 TCB分子と共に24時間又は48時間にわたって示されるようにインキュベートした際に、LDH放出によって測定された腫瘍細胞溶解。示されるのはトリプリケートの平均値であり、エラーバーはSDを示す。EC50値はGraphPadPrismにより算出した:2.54pM(24時間)及び0.53pM(48時間)。 カスパーゼ(Caspase)3/7活性(発光)によって決定されるHer3 TCBによって誘導される腫瘍細胞溶解。示されるのは、PBMC(E:T=10:1)と異なる濃度のHer3 TCBとの6.5時間の同時インキュベーションの後に、示されるようにKPL−4−カスパーゼ−3/7 GloSensor標的細胞におけるカスパーゼ3/7活性の結果として測定された相対発光シグナルである。示されているのはSDを伴うトリプリケートである。EC50値はGraphPadPrismにより算出した:0.7pM. 実施例4で調製されたTCBの図。(A)電荷修飾を有する「(Fab)−CrossFab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、MCSP結合剤中に電荷修飾、EE=147E、213E;RK=123R、124K)、(B)電荷修飾を有しない「(Fab)−CrossFab」(CD3結合剤中にVH/VL交換)。 実施例4で調製された電荷修飾を有するTCBのCE−SDS分析(最終精製調製物)。図34Aに示す(Fab)2−XFab−LC007cvの電気泳動図。レーンA=非還元、レーンB=還元。 フローサイトメトリーで測定したMV−3細胞(左)上のヒトMCSP又はJurkat細胞(右)上のヒトCD3に対するTCB分子の結合の蛍光強度の中央値。描かれているのは、トリプリケート(triplicate)に基づく、SDを含む蛍光値の中央値である。 ヒトMCSP陽性MV−3細胞をヒトPBMCエフェクター細胞(E:T 10:1)及び漸増濃度のTCB分子と共に24時間又は48時間にわたってインキュベートした際に、LDH放出によって測定された腫瘍細胞溶解。示されるのはトリプリケートの平均値であり、エラーバーはSDを示す。
定義
本明細書の用語は、以下で特に定義されない限り、当該技術分野で一般に使用されるように使用される。
本明細書において使用される用語「抗原結合分子」は、その最も広い意味において、抗原決定基に特異的に結合する分子を指す。抗原結合分子の例は、免疫グロブリン及び誘導体、例えば、その断片である。
用語「二重特異性」とは、抗原結合分子が少なくとも二つの異なる抗原決定基に特異的に結合することができることを意味する。一般的に、二重特異性抗原結合分子は、各々が異なる抗原決定基に特異的な二つの抗原結合部位を含む。特定の実施態様では、二重特異性抗原結合分子は、二つの抗原決定基、特に二つの別個の細胞上に発現した二つの抗原決定基に同時に結合することができる。
本明細書において使用される用語「価」は、抗原結合分子内における特定数の抗原結合部位の存在を意味する。従って、「抗原に結合する一価」という表現は、抗原結合分子内において、抗原に特異的な一つの(且つ一つを超えない)抗原結合部位の存在を意味する。
「抗原結合部位」は、抗原との相互作用を提供する抗原結合分子の部位、すなわち、一又は複数のアミノ酸残基を指す。例えば、抗体の抗原結合部位は、相補性決定領域(CDR)由来のアミノ酸残基を含む。天然免疫グロブリン分子は、一般に二つの抗原結合部位を有し、Fab分子は一般に単一の抗原結合部位を有する。
本明細書で使用される「抗原結合部分」は、抗原決定基に特異的に結合するポリペプチド分子を指す。一実施態様では、抗原結合部分は、それが結合するエンティティ(例えば、第2の抗原結合部分)を標的部位へ、例えば特定の型の腫瘍細胞又は抗原決定基を有する腫瘍間質へと直接方向付けることができる。別の実施態様では、抗原結合部分は、その標的抗原、例えばT細胞受容体複合抗原を通してシグナル伝達を活性化することができる。抗原結合部分には、抗体及びその断片が含まれる。これについては後述する。特定の抗原結合部分には、抗体重鎖可変領域及び抗体軽鎖可変領域を含む、抗体の抗原結合ドメインが含まれる。特定の実施態様では、抗原結合部分は、本明細書で更に定義し、且つ当該技術分野において既知であるように、抗体定常領域を含むことができる。有用な重鎖定常領域は、五つのアイソタイプ:α、δ、ε、γ、又はμの何れかを含む。有用な軽鎖定常領域は、二つのアイソタイプ:κ及びλの何れかを含む。
本明細書において使用される用語「抗原決定基」は、「抗原」及び「エピトープ」と同義であり、抗原結合部分が結合し、抗原結合部分−抗原複合体を形成するポリペプチド巨大分子上の部位(例えば、アミノ酸の連続的広がり又は非連続的アミノ酸の異なる領域から形成される立体構造)を指す。有用な抗原決定基は、例えば、腫瘍細胞の表面に、ウイルス感染細胞の表面に、他の疾患細胞の表面に、免疫細胞の表面に、血清中に遊離した状態で、及び/又は細胞外基質(ECM)に見出すことができる。特に断らない限り、本明細書において抗原と呼ばれるたんぱく質(例えば、CD3)は、霊長類(例えばヒト)及びげっ歯類(例えば、マウス、ラット)などの哺乳動物を含む任意の脊椎動物源由来のタンパク質の任意の天然型を指す。特定の実施態様では、抗原はヒトタンパク質である。本明細書において特定のタンパク質が言及される場合、その用語は「完全長」の未処理のタンパク質と、細胞内での処理により得られる任意の形態のタンパク質とを包含する。その用語はまた、天然に存在するタンパク質の変異体、例えば、スプライス変異体又は対立遺伝子変異体を包含する。抗原として有用な例示的なヒトタンパク質は、CD3、具体的にはCD3のイプシロンサブユニットである(ヒト配列についてはUniProt番号P07766(バージョン130)、NCBI RefSeq番号Np_000724.1、配列番号1;又はカニクイザル[Macaca fascicularis]配列についてはUniProt番号Q95LI5(バージョン49)、NCBI GenBank番号BAB71849.1、配列番号2を参照)。特定の実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、様々な種由来のCD3又は標的細胞抗原の中で保存された、CD3又は標的細胞抗原のエピトープに結合する。
「特異的に結合」とは、結合が、抗原について選択的であり、望ましくない相互作用又は非特異的相互作用とは区別可能であることを意味する。特定の抗原決定基に結合する抗原結合部分の能力は、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)又は当業者によく知られている他の技術、例えば表面プラズモン共鳴(SPR)技術(BIAcore機器で解析される)(Liljeblad,et al.,Glyco.J.17:323-329(2000))及び伝統的な結合アッセイ(Heeley,R.P.,Endocr.Res.28:217-229(2002))の何れかによって測定することができる。一実施態様では、無関係のタンパク質への抗原結合部分の結合の程度は、例えばSPRにより測定される場合、抗原に対する抗原結合部分の結合の約10%未満である。特定の実施態様では、抗原に結合する抗原結合部分、又は抗原結合部分を含む抗原結合分子は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、又は≦0.001nM(例えば、10−8M以下、例えば10−8M〜10−13M、例えば、10−9M〜10−13M)の解離定数(K)を有する。
「親和性」とは、分子(例えば、受容体)の単一結合部位とその結合パートナー(例えば、リガンド)との間の非共有相互作用の総和の強度を指す。本明細書では、特に明記しない限り、「結合親和性」は、結合対(例えば、抗原結合部分と抗原、又は受容体とそのリガンド)のメンバー間の1:1の相互作用を反映する固有の結合親和性を指す。分子Xの、そのパートナーYに対する親和性は、通常、解離定数(K)によって表される。この解離定数(K)は、解離速度定数と会合速度定数(それぞれ、koff及びkon)の比である。従って、等価な親和性は、速度定数の比が同じままである限り、異なる速度定数を含みうる。親和性は、本明細書に記載したものを含む、当該技術分野で既知の十分に確立された方法によって測定することができる。親和性を測定するための特定の方法は、表面プラズモン共鳴(SPR)である。
例えばFc受容体への結合減少といった「結合減少」は、例えばSPRによって測定されるように、各相互作用に対する親和性の減少を指す。明確に示すために、用語はゼロ(又は分析方法の検出限界を下回る値)への親和性の減少、すなわち相互作用の完全な消失も含む。逆に、「結合増大」は、各相互作用に対する親和性の増大を指す。
本明細書で使用する「活性化T細胞抗原」は、抗原結合分子との相互作用によりT細胞活性化を誘導することが可能である、Tリンパ球、特に細胞傷害性Tリンパ球の表面に発現する抗原決定基を意味する。具体的には、活性化T細胞抗原と抗原結合分子との相互作用は、T細胞受容体複合体のシグナル伝達カスケードを誘発することにより、T細胞活性化を誘導することができる。特定の実施態様において、T細胞抗原は、CD3、具体的にはCD3のイプシロンサブユニットである(ヒト配列についてはUniProt番号P07766(バージョン130)、NCBI RefSeq番号Np_000724.1、配列番号1;又はカニクイザル[Macaca fascicularis]配列についてはUniProt番号Q95LI5(バージョン49)、NCBI GenBank番号BAB71849.1、配列番号2を参照)。
本明細書で使用される「T細胞活性化」は、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞傷害性エフェクター分子の放出、細胞傷害活性、及び活性化マーカーの発現から選択される、Tリンパ球、特に細胞傷害性Tリンパ球の一又は複数の細胞応答を指す。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、T細胞活性化を誘導することができる。T細胞活性化を測定するために適切なアッセイは、本明細書において記載される技術分野で既知である。
本明細書において使用される「標的細胞抗原」は、標的細胞、例えばがん細胞又は腫瘍間質の細胞といった腫瘍内細胞の表面に提示される抗原決定基を指す。特定の実施態様において、標的細胞抗原はCD20、特にヒトCD20である(UniProt番号P11836を参照)。
本明細書で使用されるように、Fab分子などに関して「第1」、「第2」又は「第3」という用語は、部分の各種類が2つ以上存在する場合、便宜上区別するために使用される。このような用語の使用は、明瞭に述べているのでない限り、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の特定の順序又は方向を付与することを意図しているのではない。
「Fab分子」は、免疫グロブリンの、重鎖(「Fab重鎖」)のVH及びCH1ドメインと、軽鎖(「Fab軽鎖」)のVL及びCLドメインとからなるタンパク質を指す。
「融合した」とは、複数の成分(例えば、Fab分子及びFcドメインサブユニット)が、直接又は一又は複数のペプチドリンカーを介して、ペプチド結合により結合していることを意味する。
本明細書において使用される用語「一本鎖」は、ペプチド結合により線形に結合したアミノ酸モノマーを含む分子を指す。特定の実施態様では、抗原結合部分の一つは、一本鎖Fab分子、すなわちFab軽鎖とFab重鎖とがペプチドリンカーにより接続されて一本のペプチド鎖を形成しているFab分子である。このような特定の一実施態様では、一本鎖Fab分子においてFab軽鎖のC末端がFab重鎖のN末端に接続している。
「クロスオーバー」Fab分子(「Crossfab」とも表記される)は、Fab重鎖及び軽鎖の可変ドメインが交換されている(すなわち、互いに置換されている)Fab分子を意味し、すなわち、クロスオーバーFab分子は、軽鎖可変ドメインVLと重鎖定常ドメイン1 CH1(N末端からC末端方向にVL−CH1)からなるペプチド鎖、及び重鎖可変ドメインVHと軽鎖定常ドメインCL(N末端からC末端方向にVH−CL)からなるペプチド鎖を含む。明確にするために、Fab軽鎖とFab重鎖の可変ドメインが交換されているクロスオーバーFab分子において、重鎖定常ドメイン1 CH1を含むペプチド鎖を、本明細書ではクロスオーバーFab分子の「重鎖」と呼ぶ。
これに対して、「従来の」Fab分子とは、その天然フォーマットにおけるFab分子、すなわち重鎖可変ドメインと定常ドメイン(N末端からC末端方向にVH−CH1)からなる重鎖、及び軽鎖可変ドメインと定常ドメイン(N末端からC末端方向にVL−CL)からなる軽鎖を含むFab分子を意味する。
用語「免疫グロブリン分子」は、天然に存在する抗体の構造を有するタンパク質を指す。例えば、IgGクラスの免疫グロブリンは、ジスルフィド結合している二つの軽鎖と二つの重鎖からなる約150000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。N末端からC末端に、各重鎖は可変重鎖ドメイン又は重鎖可変領域とも呼ばれる可変ドメイン(VH)を有し、その後に重鎖定常領域とも呼ばれる3つの定常ドメイン(CH1、CH2及びCH3)が続いている。同様に、N末端からC末端に、各軽鎖は可変軽鎖ドメイン又は軽鎖可変領域とも呼ばれる可変ドメイン(VL)を有し、その後に軽鎖定常領域とも呼ばれる定常軽鎖(CL)ドメインが続いている。免疫グロブリンの重鎖は、α(IgA)、δ(IgD)、ε(IgE)、γ(IgG)、又はμ(IgM)と呼ばれる五つの種類のうちの一つに割当てることができ、それらの幾つかは更にサブタイプ、例えばγ(IgG)、γ(IgG)、γ(IgG)、γ(IgG)、α(IgA)及びα(IgA)に分けられる。免疫グロブリンの軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ(κ)とラムダ(λ)と呼ばれる、2つのタイプの何れかに割り当てることができる。免疫グロブリンは、基本的に、免疫グロブリンのヒンジ領域を介して結合された二つのFab分子とFcドメインからなる。
用語「抗体」は最も広い意味で用いられ、様々な抗体構造を包含し、限定されないが、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、及び所望の抗原結合活性を示す限りにおいて抗体断片を含む。
「抗体断片」は、インタクトな抗体の抗原に結合する部分を含む、インタクトな抗体以外の分子を指す。抗体断片の例には、限定されないが、Fv、Fab、Fab’、Fab’−SHは、F(ab’)、ダイアボディ、直鎖状抗体、一本鎖抗体分子(例えばscFv)、及び単一ドメイン抗体が含まれる。特定の抗体断片の総説については、 Hudson et al. Nat. Med. 9:129-134 (2003)を参照。scFv断片の総説については、例えば、Pluckthuen, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., (Springer-Verlag, New York), pp. 269-315 (1994)を参照;また、国際公開第93/16185号;及び米国特許第5571894号及び第5587458号も参照。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、かつインビボ半減期を増加させたFab及びF(ab’)断片の議論については、米国特許第5869046号を参照のこと。ダイアボディは2価又は二重特異性でありうる二つの抗原結合部位を有する抗体断片である。例えば、欧州特許第404097号;国際公開第1993/01161号; Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003);及びHollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993)を参照。トリアボディ及びテトラボディもHudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003)に記載されている。単一ドメイン抗体は、抗体の重鎖可変ドメインのすべて又は一部、又は軽鎖可変ドメインのすべて又は一部を含む抗体断片である。ある実施態様において、単一ドメイン抗体は、ヒト単一ドメイン抗体である(Domantis、Inc.、Waltham、MA;例えば、米国特許第6248516(B1)号を参照)。抗体断片は様々な技術で作成することができ、限定されないが、本明細書に記載するように、インタクトな抗体のタンパク分解、並びに組換え宿主細胞(例えば、大腸菌又はファージ)による生産を含む。
用語「抗原結合ドメイン」は、抗原の一部又は全部に結合し、かつ抗原の一部又は全部に相補的な領域を含む抗体の部分を指す。抗原結合ドメインは、例えば、一又は複数の抗体可変ドメイン(抗体可変領域とも呼ばれる)により提供される。特に、抗原結合ドメインは、抗体軽鎖可変ドメイン(VL)及び抗体重鎖可変ドメイン(VH)を含む。
用語「可変領域」又は「可変ドメイン」は、抗体の抗原への結合に関与する抗体の重鎖又は軽鎖のドメインを指す。通常、天然型抗体の重鎖及び軽鎖の可変ドメイン(それぞれVH及びVL)は、各々が四つの保存されたフレームワーク領域(FR)と三つの超可変領域(HVR)とを含む類似構造を有する。例えば、Kindt et al., Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., 頁91 (2007)を参照されたい。抗原結合特異性を付与するには、単一のVH又はVLドメインで十分である。
本明細書で使用される用語「超可変領域」又は「HVR」は、配列が超可変であるか、及び/又は構造的に定義されたループ(「超可変ループ」)を形成する抗体可変ドメインの各領域を指す。一般的に、天然型4鎖抗体は、VHに3つ(H1、H2、H3)、及びVLに3つ(L1、L2、L3)、計6つのHVRを含む。HVRは、一般的に超可変ループ由来及び/又は「相補性決定領域」(CDR)由来のアミノ酸残基を含み、後者は、最高の配列可変性を有し、及び/又は抗原認識に関与している。VHのCDR1の例外を除いて、CDRは一般的に超可変ループを形成するアミノ酸残基を含む。超可変領域(HVR)は、「相補性決定領域」(CDR)とも呼ばれ、これらの用語は、抗原結合領域を形成する可変領域の部分に言及して本明細書では交換可能に使用される。この特定の領域は、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991) 及びChothia et al., J Mol Biol 196:901-917 (1987)に記載されており、その定義には、互いに比較されたときのアミノ酸残基の重複又はサブセットが含まれる。それでも、抗体又はその変異体のCDRに言及して何れかの定義が適用される場合、本明細書において定義及び使用される用語の範囲に含まれることが意図されている。上記文献の各々により定義されるCDRを包含する適切なアミノ酸残基を比較として以下の表Aに明記した。特定のCDRを包含する正確な残基数は、CDRの配列及び大きさに応じて変化するであろう。当業者であれば、抗体の可変領域のアミノ酸配列を前提として、いずれの残基が特定のCDRを含むかを、常套的に決定することができる。本明細書に示されるCDR配列は、一般的にKabatの定義に従う。
Kabatらは、あらゆる抗体に適用可能な可変領域配列の番号付けシステムも定義した。当業者であれば、配列自体を超える実験データに頼らなくとも、この「Kabatの番号付け」のシステムをあらゆる可変領域配列に明確に割り当てることができる。可変領域配列に関連して本明細書で使用される「Kabatの番号付け」とは、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)に記載の番号付けシステムを指す。特に断らない限り、抗体可変領域内における特定のアミノ酸残基の位置の番号付けへの言及は、Kabat番号付けシステムに従っている。
本明細書中で使用されるように、重鎖及び軽鎖のすべての定常領域及びドメインのアミノ酸位置は、Kabat, et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)に記載され、本明細書では「Kabatによる番号付け」又は「Kabat番号付け」と呼ばれるKabat番号付けシステムに従って番号付けされる。具体的には、Kabat番号付けシステム(Kabat, et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)の647-660頁を参照)がκ及びλアイソタイプの軽鎖定常ドメインCLに使用され、重鎖定常ドメイン(CH1、Hinge、CH2及びCH3)にはKabatのEUインデックス番号付けシステム(661−723頁を参照)が使用されており、この場合「KabatのEUインデックスによる番号付け」を参照することにより本明細書において更に明確にされる。
配列リストのポリペプチド配列は、Kabat番号付けシステムに従って番号付けされている。しかしながら、配列リストの番号付けをKabat番号付けに変換することは
当業者の通常の技術の範囲内である。
「フレームワーク」又は「FR」は、超可変領域(HVR)残基以外の可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのFRは、一般に4つのFRドメイン:FR1、FR2、FR3、及びFR4からなる。従って、HVR及びFR配列は一般的にVH(又はVL)の以下の配列に現れる:FR1−H1(L1)−FR2−H2(L2)−FR3−H3(L3)−FR4。
抗体又は免疫グロブリンの「クラス」は、その重鎖が保有する定常ドメイン又は定常領域のタイプを指す。抗体の五つの主要なクラス、すなわちIgA、IgD、IgE、IgG及びIgMがあり、これらの幾つかは、更にサブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG、IgG、IgG、IgG、IGA、及びIgAに分けることができる。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、及びμと呼ばれる。
本明細書の用語「Fcドメイン」又は「Fc領域」は、定常領域の少なくとも一部を含む、免疫グロブリン重鎖のC末端領域を定義するために使用される。この用語は、天然配列Fc領域と変異体Fc領域を含む。IgG重鎖のFc領域の境界はわずかに変化しうるが、通常、ヒトIgG重鎖Fc領域はCys226又はPro230から重鎖のカルボキシル末端まで延びると定義される。しかしながら、宿主細胞によって生成される抗体は、重鎖のC末端からの一又は複数の、特に1つ又は2つのアミノ酸の翻訳後切断を受け得る。従って、全長重鎖をコードする特異的核酸分子の発現によって宿主細胞によって生成される抗体は、全長重鎖を含み得るか、又は全長重鎖の切断型変異体(本明細書において「切断型変異体重鎖」とも称する)を含み得る。これは、重鎖の最後の2つのC末端アミノ酸がグリシン(G446)及びリジン(K447)(KabatのEUインデックスによる番号付け)である場合があり得る。従って、Fc領域のC末端リジン(Lys447)、又はC末端グリシン(Gly446)及びリジン(K447)は存在しても存在しなくてもよい。Fcドメイン(又は本明細書に定義されるFcドメインのサブユニット)を含む重鎖のアミノ酸配列は、特に断らない限り、C末端グリシン−リジンジペプチドを含まずに本明細書に示される。本発明の一実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる、本明細書に明記されるFcドメインのサブユニットを含む重鎖は、付加的なC末端グリシン−リジンジペプチド(G446及びK447、KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。本発明の一実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる、本明細書に記載のFcドメインのサブユニットを含む重鎖は、付加的なC末端グリシン残基(G446、KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。本明細書に記載の薬学的組成物などの本発明の組成物は、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の集団を含む。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の集団は、全長重鎖を有する分子及び切断型変異体重鎖を有する分子を含み得る。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の集団は、全長重鎖を有する分子及び切断型変異体重鎖を有する分子の混合物からなり得、ここではT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%又は少なくとも90%が切断型変異体重鎖を有する。本発明の一実施態様において、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の集団を含む組成物は、付加的なC末端グリシン−リジンジペプチド(G446及びK447、KabatのEUインデックスによる番号付け)を有する本明細書に記載のFcドメインのサブユニットを含む重鎖を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む。本発明の一実施態様において、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の集団を含む組成物は、付加的なC末端グリシン残基(G446、KabatのEUインデックスによる番号付け)を有する本明細書に記載のFcドメインのサブユニットを含む重鎖を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む。本発明の一実施態様において、そのような組成物は、本明細書に記載のFcドメインのサブユニットを含む重鎖を含む分子;付加的なC末端グリシン残基(G446、KabatのEUインデックスによる番号付け)を有する本明細書に記載のFcドメインのサブユニットを含む重鎖を含む分子;及び付加的なC末端グリシン−リジンジペプチド(G446、KabatのEUインデックスによる番号付け)を有する本明細書に記載のFcドメインのサブユニットを含む重鎖を含む分子からなるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の集団を含む。特に断らない限り、Fc領域又は定常領域内のアミノ酸残基の番号付けは、Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991に記載されるように、EUインデックスとも呼ばれるEU番号付けシステムに従う(上記を参照)。本明細書において使用されるFcドメインの「サブユニット」は、二量体Fcドメインを形成する二つのポリペプチドの一方、すなわち、免疫グロブリン重鎖のC末端定常領域を含み、安定な自己会合能を有するポリペプチドを指す。例えば、IgG Fcドメインのサブユニットは、IgG CH2及びIgG CH3定常ドメインを含む。
「Fcドメインの第1及び第2のサブユニットの会合を促す修飾」とは、Fcドメインのサブユニットを含むポリペプチドの、同一のポリペプチドとの会合結合によるホモダイマーの形成を低減又は抑制する、ペプチド骨格の操作又はFcドメインサブユニットの翻訳後修飾である。本明細書において使用される会合を促す修飾には、特に、会合することが望ましい二つのFcドメインサブユニット(すなわち、Fcドメインの第1及び第2のサブユニット)の各々に対して行われる別々の修飾が含まれ、これらの修飾は、二つのFcドメインサブユニットの会合を促進するために互いに相補的である。例えば、会合を促す修飾は、Fcドメインサブユニットの一方又は両方の構造又は電荷を変化させることにより、それらの会合を、それぞれ立体的に又は静電的に好ましいものにすることができる。このように、(ヘテロ)二量体化は、第1のFcドメインサブユニットを含むポリペプチドと、第2のFcドメインサブユニットを含むポリペプチドとの間で起こり、これらのポリペプチドは、サブユニットの各々に融合した更なる成分(例えば、抗原結合部分)が同じでないという意味で非同一であり得る。幾つかの実施態様では、会合を促す修飾は、Fcドメイン中にアミノ酸変異、特にアミノ酸置換を含む。特定の実施態様では、会合を促す修飾は、Fcドメインの二つのサブユニットの各々における別々のアミノ酸変異、特にアミノ酸置換を含む。
用語「エフェクター機能」は、抗体のアイソタイプにより変わる、抗体のFc領域に起因する生物学的活性を指す。抗体エフェクター機能の例には、C1q結合及び補体依存性細胞傷害(CDC)、Fc受容体結合、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞貪食(ADCP)、サイトカイン分泌、抗原提示細胞による免疫複合体媒介抗原取り込み、細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体)のダウンレギュレーション、及びB細胞の活性化が含まれる。
本明細書において使用される「改変する、改変された、改変」などの用語は、ペプチド骨格の何れかの操作、又は天然に存在するポリペプチド又は組換えポリペプチド又はその断片の翻訳後修飾を含むと考慮される。改変には、アミノ酸配列、グリコシル化パターン、又は個々のアミノ酸の側鎖基の修飾と、このような手法の組合せが含まれる。
本明細書で使用される用語「アミノ酸変異」は、アミノ酸の置換、欠失、挿入、及び修飾を包含することを意図している。置換、欠失、挿入、及び修飾のあらゆる組み合わせは、最終的な構築物が所望の特性、例えば、Fc受容体に対する結合の低減、又は別のペプチドとの会合の増大を保持することを前提に、最終的な構築物に到達するために行うことができる。アミノ酸配列の欠失及び挿入には、アミノ末端及び/又はカルボキシ末端の欠失、並びにアミノ酸の挿入が含まれる。特定のアミノ酸変異はアミノ酸の置換である。Fc領域の結合特性などを変更する目的で、非保存的アミノ酸置換、すなわち、一のアミノ酸を、異なる構造及び/又は化学特性を有する別のアミノ酸で置換することは、特に好ましい。アミノ酸置換には、20の標準のアミノ酸(例えば、4−ヒドロキシプロリン、3−メチルヒスチジン、オルニチン、ホモセリン、5−ヒドロキシリジン)の天然に存在するアミノ酸誘導体又は天然に存在しないアミノ酸による置換が含まれる。アミノ酸変異体は、当該技術分野で周知の遺伝学的方法又は化学的方法を用いて生成することができる。遺伝学的方法は、部位特異的変異原性、PCR、遺伝子合成などを含みうる。遺伝学的改変以外の方法、例えば化学的修飾によるアミノ酸の側鎖基の変更方法も有用でありうると考えられる。本明細書では、同じアミノ酸変異を示すために、種々の表記が使用される。例えば、Fcドメインの位置329におけるプロリンからグリシンへの置換は、329G、G329、G329、P329G、又はPro329Glyとして示される。
本明細書において使用される用語「ポリペプチド」は、アミノ結合(ペプチド結合としても知られる)により線形に結合したモノマー(アミノ酸)からなる分子を指す。用語「ポリペプチド」は、二つ以上のアミノ酸の任意の鎖を指し、特異的な長さの生成物を指すのではない。従って、ペプチド、ジペプチド、トリペプチド、オリゴペプチド、「タンパク質」、「アミノ酸鎖」、又は二つ以上のアミノ酸の鎖を指す他のいずれの用語も「ポリペプチド」の定義に含まれ、用語「ポリペプチド」は、これら用語の何れかの代わりに、又は何れかと交換可能に、使用することができる。用語「ポリペプチド」は、ポリペプチドの発現後修飾の成果を指すことも意図しており、このような成果には、限定されないが、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、既知の保護基/ブロッキング基による誘導体化、タンパク分解的切断、又は天然に存在しないアミノ酸による修飾が含まれる。ポリペプチドは、天然の生物学的供給源から得られるか、又は組換え技術により生成されるが、必ずしも指定の核酸配列から翻訳されるものではない。ポリペプチドは、化学合成を含むあらゆる手法で生成されてよい。本発明のポリペプチドは、約3以上、5以上、10以上、20以上、25以上、50以上、75以上、100以上、200以上、500以上、1000以上、又は2000以上の大きさのアミノ酸からなってよい。ポリペプチドは、規定された三次元構造を有することができるが、必ずしもそのような構造を有するものではない。既定の三次元構造を有するポリペプチドは、折り畳まれていると言われ、既定の三次元構造を有さず、多数の異なる形態をとりうるポリペプチドは折り畳まれていないと言われる。
「単離された」ポリペプチド若しくは変異体、又はその誘導体は、その自然の環境にない目的のポリペプチドである。特定のレベルのどのような精製も必要でない。例えば、単離されたポリペプチドは、その天然又は自然の環境から除去することができる。宿主細胞に発現される、組換えにより生成されたポリペプチド及びタンパク質を、任意の適切な技術により分離、画分化、又は部分的若しくは実質的に精製された天然又は組換えポリペプチドのように、本発明のために単離することが考慮される。
参照ポリペプチド配列に対する「アミノ酸配列同一性パーセント(%)」は、最大の配列同一性パーセントを得るように配列を整列させ、必要に応じてギャップを導入した後の、いかなる保存的置換も配列同一性の一部とみなさない、参照ポリペプチドのアミノ酸残基と同一である候補配列のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアラインメントは、当分野の技術の範囲内にある種々の方法、例えばBLAST、BLAST−2、ALIGN、又はMegalign(DNASTAR)ソフトウェアのような公的に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用して達成することができる。当業者であれば、比較する配列の全長にわたって最大のアライメントを達成するのに必要な任意のアルゴリズムを含めた、配列を整列させるための適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書において、アミノ酸配列同一性%の値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN−2を使用して生成される。ALIGN−2配列比較コンピュータプログラムは、ジェネンテック社によって著作され、ソースコードは米国著作権庁、ワシントンD.C.,20559に使用者用書類とともに提出され、米国著作権登録番号TXU510087で登録されている。また、ALIGN−2は、ジェネンテック社(South San Francisco、California)から公的に入手可能であり、又はそのソースコードからコンパイルしてもよい。ALIGN−2プログラムは、デジタルUNIX(登録商標)のV4.0Dを含めたUNIX(登録商標)オペレーティングシステムでの使用のためにコンパイルされる。すべての配列比較パラメータは、ALIGN−2プログラムによって設定されて変動しない。アミノ酸配列比較にALIGN−2が用いられる状況では、所与のアミノ酸配列Aの、所与のアミノ酸配列Bとの、又はそれに対する%アミノ酸配列同一性(或いは、所与のアミノ酸配列Bと、又はそれに対して特定の%アミノ酸配列同一性を有する又は含む所与のアミノ酸配列Aと言うこともできる)は次のように計算される:
分率X/Yの100倍
ここで、Xは配列アラインメントプログラムALIGN−2により、そのプログラムのA及びBのアラインメントにおいて完全に一致するとされたアミノ酸残基の数であり、YはBの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Aの長さがアミノ酸配列Bの長さと異なる場合、AのBに対する%アミノ酸配列同一性は、BのAに対する%アミノ酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。特に断らない限り、本明細書で使用されるすべての%アミノ酸配列同一性値は、ALIGN−2コンピュータプログラムを使用して、直前の段落で説明したように得られる。
用語「ポリヌクレオチド」は、単離された核酸分子又は構築物、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)、ウイルス由来のRNA、又はプラスミド DNA(pDNA)を指す。ポリヌクレオチドは、一般的なホスホジエステル結合又は非一般的結合(例えば、ペプチド核酸(PNA)に見られるようなアミド結合)を含みうる。用語「核酸分子」は、ポリヌクレオチド中に存在する、任意の一又は複数の核酸セグメント、例えばDNA又はRNA断片を指す。
「単離された」核酸分子又はポリヌクレオチドは、その天然環境から除去された目的の核酸分子、DNA又はRNAである。例えば、ベクターに含有されるポリペプチドをコードする組換えポリヌクレオチドを、本発明の目的のために単離することが考慮される。単離されたポリヌクレオチドの更なる例には、異種宿主細胞内に維持される組換えポリヌクレオチド、又は溶液中の精製された(部分的に又は実質的に)ポリヌクレオチドが含まれる。単離されたポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチド分子を通常含む細胞に含まれるポリヌクレオチド分子を含むが、そのポリヌクレオチド分子は、染色体外又はその自然の染色体上の位置とは異なる染色体位置に存在している。単離されたRNA分子は、本発明のインビボ又はインビトロRNA転写物、並びにプラス及びマイナス鎖形態、及び二本鎖形態を含む。本発明の単離されたポリヌクレオチド又は核酸は、更に、合成により生成されたそのような分子を含む。加えて、ポリヌクレオチド又は核酸は、プロモーター、リボソーム結合部位、又は転写ターミネーターといった制御要素を含んでも含まなくてもよい。
少なくとも、例えば、本発明の参照ヌクレオチド配列と少なくとも例えば95%「同一」であるヌクレオチド配列を有する核酸又はポリヌクレオチドにより、ポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が参照配列と、ポリヌクレオチド配列が参照ヌクレオチド配列のそれぞれ100のヌクレオチドにつき最大5ポイントの変異を含んでよいという点以外は同一であることが意図される。換言すれば、参照ヌクレオチド配列と少なくとも95%同一であるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを得るために、参照配列中最大5%のヌクレオチドが削除又は別のヌクレオチドで置換されてよいか、又は参照配列に含まれるすべてのヌクレオチドの最大5%まで複数のヌクレオチドが参照配列に挿入されてよい。参照配列のこのような変更は、参照ヌクレオチド配列の5’又は3’末端の位置で、又はこれら末端の間の何れかで、参照配列に含まれる残基中において個々に散在して、又は参照配列内部の一又は複数の連続する群において、発生してよい。特定の事項として、何れか特定のポリヌクレオチド配列が、本発明のヌクレオチド配列と少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%又は99%同一であるかどうかは、ポリペプチドについて上述したもの(例えばALIGN−2)などの既知のコンピュータープログラムを用いて常套的に決定することができる。
用語「発現カセット」は、組換えにより又は合成により、標的細胞内の一連の特定の核酸の転写を許可する特定の核酸要素を用いて生成されたポリヌクレオチドを指す。組換え発現カセットは、プラスミド、染色体、ミトコンドリアDNA、プラスチドDNA、ウイルス、又は核酸断片中に取り込むことができる。典型的には、発現ベクターの組換え発現カセット部分には、他の配列の中でも、転写される核酸配列及びプロモーターが含まれる。特定の実施態様では、本発明の発現カセットは、本発明の二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチド配列又はその断片を含む。
用語「ベクター」又は「発現ベクター」は、「発現構築物」と同義であり、標的細胞内においてそれが作用可能に結合する特定の遺伝子を導入しその発現を誘導するために使用されるDNA分子を指す。この用語は、自己複製核酸構造としてのベクター、並びにそれが導入された宿主細胞のゲノムに組み込まれたベクターを含む。本発明の発現ベクターは、発現カセットを含む。発現ベクターは、大量の安定なmRNAの転写を可能にする。発現ベクターが標的細胞内部に入ると、遺伝子によってコードされるリボ核酸分子又はタンパク質が、細胞転写及び/又は翻訳機械により生成される。一実施態様では、本発明の発現ベクターは、本発明の二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチド配列又はその断片を含む発現カセットを含む。
用語「宿主細胞」、「宿主細胞株」及び「宿主細胞培養」は、互換的に使用され、外因性の核酸が導入された細胞を指し、そのような細胞の子孫を含む。宿主細胞は、「形質転換体」及び「形質転換された細胞」を含み、それには、継代の数に関係なく、それに由来する初代形質転換細胞及び子孫が含まれる。子孫は親細胞と核酸含量が完全に同一ではないかもしれないが、突然変異が含まれる場合がある。本明細書には、最初に形質転換された細胞においてスクリーニング又は選択されたものと同じ機能又は生物活性を有する変異型子孫が本含まれる。宿主細胞は、本発明の二重特異性抗原結合分子を生成するために使用することができる何れかの種類の細胞系である。宿主細胞は、培養細胞、例えば幾つか例を挙げると、CHO細胞、BHK細胞、NS0細胞、SP2/0細胞、YO骨髄腫細胞、P3X63マウス骨髄腫細胞、PER細胞、PER.C6細胞、又はハイブリドーマ細胞といった哺乳動物の培養細胞、酵母細胞、昆虫細胞、及び植物細胞を含み、更には、トランスジェニック動物、トランスジェニック植物、又は培養された植物若しくは動物組織内部に含まれる細胞も含む。
「活性化Fc受容体」は、抗体のFcドメインの結合に続いて、エフェクター機能を実行するように受容体保有細胞を刺激するシグナル伝達現象を生じさせるFc受容体である。ヒト活性化Fc受容体には、FcγRIIIa(CD16a)、FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32)、及びFcαRI(CD89)が含まれる。
抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)は、免疫エフェクター細胞により抗体でコートされた標的細胞の溶解を招く免疫機構である。標的細胞は、Fc領域を含む抗体又はその誘導体が通常Fc領域に対するN末端であるタンパク質部分を介して特異的に結合する細胞である。本明細書で使用される用語「ADCCの低下」は、標的細胞を囲む媒質中の所定の抗体濃度において、上記に定義したADCCの機構により所定の時間内に溶解する標的細胞の数、及び/又は、ADCCの機構により所定の時間内に所定の数の標的細胞を溶解させるために必要な、標的細胞を囲む媒質中の抗体濃度の上昇の何れかと定義される。ADCCの低下は、同じ標準的な生成、精製、製剤化、及び貯蔵方法(当業者に既知の)を用いて、但し改変されていない、同じ型の宿主細胞により生成される同じ抗体により媒介されるADCCと相対的なものである。例えば、そのFcドメインにADCCを低下させるアミノ酸置換を含む抗体により媒介されるADCCの低下は、このアミノ酸置換をFcドメインに含まない同じ抗体によって媒介されるADCCと比較される。ADCCを測定するための適切なアッセイは、当該技術分野でよく知られている(例えば、国際公開第2006/082515号又は同第2012/130831号参照)。
「有効量の」薬剤は、それが投与される細胞又は組織中に生理的変化をもたらすために必要な量を指す。
薬剤、例えば、薬学的組成物の「治療的有効量」とは、所望の治療的又予防的結果を達成するために必要な用量及び期間での、有効な量を指す。治療的有効量の薬剤は、疾患の有害作用を、例えば、排除する、低下させる、遅延させる、最小化する、又は防止する。
「個体」又は「被験体」とは、哺乳動物である。哺乳動物には、限定されないが、家畜動物(例えば、ウシ、ヒツジ、ネコ、イヌ、ウマ)、霊長類(例えば、ヒト、及びサルなどの非ヒト霊長類)、ウサギ、げっ歯類(例えば、マウス及びラット)が含まれる。特に、個体又は被験体はヒトである。
用語「薬学的組成物」は、その中に有効で含有される活性成分の生物学的活性を許容するような形態であって、製剤が投与される被験体にとって許容できない毒性を有する他の成分を含まない調製物を指す。
「薬学的に許容可能な担体」は、被験体に非毒性である、有効成分以外の薬学的組成物の成分を指す。薬学的に許容可能な担体には、限定されないが、緩衝剤、賦形剤、安定剤、又は保存剤が含まれる。
本明細書で用いられる場合、「治療」(及び「治療する(treat)」又は「治療している(treating)」など文法上の変形)は、治療されている個体の疾患の自然経過を変えようと試みる臨床的介入を指し、予防のために、又は臨床病理の過程において実行できる。治療の望ましい効果には、限定されないが、疾患の発症又は再発を予防すること、症状の緩和、疾患の直接的又は間接的な病理学的帰結の縮小、転移を予防すること、疾患の進行の速度を遅らせること、疾患状態の改善又は緩和、及び寛解又は予後の改善が含まれる。幾つかの実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、疾患の発症を遅延させるか又は疾患の進行を遅らせるために使用される。
「添付文書」という用語は、治療製品の商品包装に通例含まれる説明書を指すのに用いられ、適応症、用法、用量、投与、併用療法、当該治療製品の使用に関する禁忌及び/又は注意事項についての情報を含む。
実施態様の詳細な説明
本発明は、特に(例えば、純度、収率に関して)改善された生産性を有する治療用途に好ましい特性を有するT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供する。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれるFab分子のアミノ酸置換は、それらの結合アームの1つ(又は2つ以上の抗原結合Fab分子を含む分子の場合にはそれ以上)においてVH/VL交換を有するFabベースの二重/多特異的抗原結合分子の生成において生じ得る、非適合重鎖(Bence−Jones型副生成物)との軽鎖の誤対合を減少させるのに特に有効である(全体が参照により本明細書に組み込まれる、PCT出願番号PCT/EP2015/057165号、特にその中の実施例も参照)。
本発明の第1の態様は、
a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されているもの;
を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供し、
ここで、第1の抗原は活性化T細胞抗原であり、かつ第2の抗原は標的細胞抗原であり、又は第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原であり;かつ
ここで、
i)a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸が正に荷電したアミノ酸(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ
a)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸が負に荷電したアミノ酸(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;又は
ii)b)の第2のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸が正に荷電したアミノ酸(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ
b)の第2のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸が負に荷電したアミノ酸(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
本発明によれば、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、i)及びii)に記載された修飾の両方を含まない。第2のFab分子の定常ドメインCL及びCH1は、互いに置換されない(すなわち、交換されないままである)。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の一実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)置換され、かつa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
更なる実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立に置換され、かつa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
特定の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)によって独立に(好ましい一実施態様において、リジン(K)又はアルギニン(R)によって独立に)(Kabatによる番号付け)置換され、並びに、a)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)、又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって独立に置換される。
より特定の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がリジン(K)又はアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
更により特定の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がアルギニン(R)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換される。
特定の実施態様において、a)の第1のFab分子の定常ドメインCLはκアイソタイプのものである。
あるいは、上記実施態様によるアミノ酸置換は、a)の第1のFab分子の定常ドメインCL及び定常ドメインCH1の代わりに、b)の第2のFab分子の定常ドメインCL及び定常ドメインCH1において行うことができる。特定の実施態様において、b)の第2のFab分子の定常ドメインCLはκアイソタイプのものである。
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子を更に含み得る。特定の実施態様において、前記第3のFab分子は第1のFab分子と同一である。これらの実施態様において、上記実施態様によるアミノ酸置換は、第1のFab分子及び第3のFab分子のそれぞれの定常ドメインCL及び定常ドメインCH1において行われるであろう。あるいは、上記実施態様によるアミノ酸置換は、第1のFab分子及び第3のFab分子の定常ドメインCL及び定常ドメインCH1でなく、b)の第2のFab分子の定常ドメインCL及び定常ドメインCH1において行うことができる。
特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメインを更に含む。
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のフォーマット
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の成分は、様々な立体配置で互いに融合することができる。例示的な立体配置を図1に示す。
特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、安定に結合することができる第1及び第2のサブユニットからなるFcドメインを含む。
幾つかの実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。
一つのそのような実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端で第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。このような特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1及び第2のFab分子、第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端においてFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。そのような立体配置は図1G及び図1Kに模式的に示されている。任意選択的に、第1のFab分子のFab軽鎖と第2のFab分子のFab軽鎖は更に互いに融合していてよい。
別のそのような実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。このような特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1及び第2のFab分子、第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第1及び第2のFab分子はそれぞれ、Fab重鎖のC末端においてFcドメインのサブユニットのうちの一つのN末端に融合している。そのような立体配置は図1A及び図1Dに模式的に示されている。第1及び第2のFab分子は、直接又はペプチドリンカーを介してFcドメインに融合することができる。特定の実施態様において、第1及び第2のFab分子はそれぞれ、免疫グロブリンヒンジ領域を介してFcドメインに融合している。特定の実施態様において、免疫グロブリンヒンジ領域は、特にFcドメインがIgG FcドメインであるヒトIgGヒンジ領域である。
一実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。
一つのそのような実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端で第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。このような特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1及び第2のFab分子、第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端においてFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。そのような立体配置は図1H及び図1Lに模式的に示されている。任意選択的に、第1のFab分子のFab軽鎖と第2のFab分子のFab軽鎖は更に互いに融合していてよい。
Fab分子は、直接、又は一以上のアミノ酸、典型的には約2〜20個のアミノ酸を含むペプチドリンカーを介して、Fcドメインへ又はお互いに融合し得る。ペプチドリンカーは当分野において既知であり、本願明細書に記載される。適切な非免疫原性ペプチドリンカーには、例えば、(GS)、(SG、(GS)又は(SGペプチドリンカーが含まれる。「n」は通常は1〜10、典型的には2〜4の数である。一実施態様において、前記ペプチドリンカーは、少なくとも5アミノ酸の長さ、一実施態様では5〜100アミノ酸の長さ、さらなる実施態様では10〜50アミノ酸の長さを有する。一実施態様において、前記ペプチドリンカーは(GxS)又は(GxS)であり、ここでG=グリシン、S=セリン、及び(x=3、n=3、4、5又は6、及びm=0、1、2又は3)又は(x=4、n=2、3、4又は5及びm=0、1、2又は3)、一実施態様において、x=4及びn=2又は3、更なる実施態様において、x=4及びn=2である。一実施態様において、前記ペプチドリンカーは(GS)である。第1及び第2のFab分子のFab軽鎖を互いに融合させるための特定の適切なペプチドリンカーは(GS)である。第1及び第2のFab分子のFab重鎖を連結するために適した例示的ペプチドリンカーは配列(D)−(GS)(配列番号11及び12)である。付加的に、リンカーは免疫グロブリンヒンジ領域(の一部)を含むことができる。特にFab分子がFcドメインのサブユニットのN末端に融合している場合には、免疫グロブリンヒンジ領域又はその一部を介して、付加的なペプチドリンカーを用いて又は用いずに、融合することができる。
標的細胞抗原に特異的に結合することができる単一の抗原結合部分(Fab分子など)を有するT細胞活性化二重特異性抗原結合分子(例えば、図1A、D、G、H、K、Lに示される)は、特に高親和性抗原結合部分の結合に続いて標的細胞抗原の内部移行が予想される場合に有用である。このような場合、標的細胞抗原に特異的な2つ以上の抗原結合部分の存在は、標的細胞抗原の内部移行を亢進し、それによりその利用可能性を低下させる可能性がある。
他の多くのケースにおいては、しかしながら、例えば、標的部位への標的化を最適化するために又は標的細胞抗原の架橋を可能にするために、標的細胞抗原に特異的な2つ以上の抗原結合部分(Fab分子など)を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を有することが有利であろう(図1B、1C、1E、1F、1I、1J、1M又は1Nに示す例を参照)。
従って、特定の実施態様において、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子を更に含む。第1の抗原は、好ましくは標的細胞抗原である。一実施態様では、第3のFab分子は従来のFab分子である。一実施態様において、第3のFab分子は、第1のFab分子と同一である(すなわち、第1及び第3のFab分子は、同じ重鎖及び軽鎖アミノ酸配列を含み、ドメインの同じ配置を有する(すなわち、従来型又は交差型))。特定の実施態様において、第2のFab分子は、活性化T細胞抗原、具体的にはCD3に特異的に結合し、第1及び第3のFab分子は標的細胞抗原に特異的に結合する。
代替的な実施態様において、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第2の抗原に特異的に結合する第3のFab分子を更に含む。これらの実施態様において、第2の抗原は、好ましくは標的細胞抗原である。一つのそのような実施態様において、第3のFab分子はクロスオーバーFab分子(Fab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子)である。一つのそのような実施態様において、第3のFab分子は、第2のFab分子と同一である(すなわち、第2及び第3のFab分子は、同じ重鎖及び軽鎖アミノ酸配列を含み、ドメインの同じ配置を有する(すなわち、従来型又は交差型))。一つのそのような実施態様において、第1のFab分子は、活性化T細胞抗原、具体的にはCD3に特異的に結合し、第2及び第3のFab分子は標的細胞抗原に特異的に結合する。
一実施態様において、第3のFab分子は、Fab重鎖のC末端でFcドメインの第1又は第2のサブユニットのN末端に融合している。
特定の実施態様において、第2及び第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合し、かつ第1のFab分子はFab重鎖のC末端で第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。このような特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、基本的に、第1、第2及び第3のFab分子、第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端においてFcドメインの第1のサブユニットのN末端に融合しており、第3のFab分子はFab重鎖のC末端においてFcドメインの第2のサブユニットのN末端に融合している。そのような立体配置は、図1B及び1E(特定の実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子であり、好ましくは第1のFab分子と同一である)並びに図1I及び1M(代替的な実施態様において、第3のFab分子はクロスオーバーFab分子、好ましくは第2のFab分子と同一である)に模式的に示されている。第2及び第3のFab分子は、直接又はペプチドリンカーを介してFcドメインに融合することができる。特定の実施態様において、第2及び第3のFab分子はそれぞれ、免疫グロブリンヒンジ領域を介してFcドメインに融合している。特定の実施態様において、免疫グロブリンヒンジ領域は、特にFcドメインがIgG FcドメインであるヒトIgGヒンジ領域である。任意選択的に、第1のFab分子のFab軽鎖と第2のFab分子のFab軽鎖は更に互いに融合していてよい。
別の実施態様において、第1及び第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合し、かつ第2のFab分子はFab重鎖のC末端で第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。このような特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、基本的に、第1、第2及び第3のFab分子、第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端においてFcドメインの第1のサブユニットのN末端に融合しており、第3のFab分子はFab重鎖のC末端においてFcドメインの第2のサブユニットのN末端に融合している。そのような立体配置は、図1C及び1F(特定の実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子であり、好ましくは第1のFab分子と同一である)並びに図1J及び1N(代替的な実施態様において、第3のFab分子はクロスオーバーFab分子、好ましくは第2のFab分子と同一である)に模式的に示されている。第1及び第3のFab分子は、直接又はペプチドリンカーを介してFcドメインに融合することができる。特定の実施態様において、第1及び第3のFab分子はそれぞれ、免疫グロブリンヒンジ領域を介してFcドメインに融合している。特定の実施態様において、免疫グロブリンヒンジ領域は、特にFcドメインがIgG FcドメインであるヒトIgGヒンジ領域である。任意選択的に、第1のFab分子のFab軽鎖と第2のFab分子のFab軽鎖は更に互いに融合していてよい。
Fab分子がFab重鎖のC末端で免疫グロブリンヒンジ領域を介してFcドメインの各サブユニットのN末端に融合したT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の立体配置において、2つのFab分子、ヒンジ領域及びFcドメインは本質的に免疫グロブリン分子を形成する。特定の実施態様において、免疫グロブリン分子は、IgGクラスの免疫グロブリンである。更により特定の実施態様において、免疫グロブリンは、IgGサブクラスの免疫グロブリンである。別の実施態様において、免疫グロブリンは、IgGサブクラスの免疫グロブリンである。更に特定の実施態様では、免疫グロブリンはヒト免疫グロブリンである。他の実施態様において、免疫グロブリンは、キメラ免疫グロブリン又はヒト化免疫グロブリンである。
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の幾つかにおいては、第1のFab分子のFab軽鎖と第2のFab分子のFab軽鎖とが、任意選択的にペプチドリンカーを介して、互いに融合している。第1及び第2のFab分子の立体配置に依存して、第1のFab分子のFab軽鎖は、そのC末端において、第2のFab分子のFab軽鎖のN末端に融合しうる、又は第2のFab分子のFab軽鎖は、そのC末端において、第1のFab分子のFab軽鎖のN末端に融合しうる。第1及び第2のFab分子のFab軽鎖の融合は更に、マッチしないFab重鎖とFab軽鎖の誤対合を低減し、また本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の幾つかの発現に必要なプラスミドの数を低減する。
特定の実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第2のFab分子のFab軽鎖可変領域が第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次にFcドメインサブユニットとカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(2)−CH1(2)−CH2−CH3(−CH4))と、第1のFab分子のFab重鎖がFcドメインサブユニットとカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VH(1)−CH1(1)−CH2−CH3(−CH4))とを含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。特定の実施態様において、ポリペプチドは、例えばジスルフィド結合によって共有結合される。
幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第2のFab分子のFab軽鎖可変領域が第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次に第1のFab分子のFab重鎖とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次にFcドメインサブユニットとカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(2)−CH1(2)−VH(1)−CH1(1)−CH2−CH3(−CH4))を含む。他の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第1のFab分子のFab重鎖が第2のFab分子のFab軽鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次にFcドメインサブユニットとカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VH(1)−CH1(1)−VL(2)−CH1(2)−CH2−CH3(−CH4)を含む。
これらの実施態様の幾つかにおいて、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有する、第2のFab分子のクロスオーバーFab軽鎖ポリペプチドを含む。これらの実施態様の他のものにおいて、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab軽鎖可変領域が、第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチドとカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(2)−CH1(2)−VL(1)−CL(1))、又は、第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチドが、第2のFab分子のFab重鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab軽鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(1)−CL(1)−VH(2)−CL(2))を必要に応じて含む。
これらの実施態様によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、(i)Fcドメインサブユニットポリペプチド(CH2−CH3(−CH4))、又は(ii)第3のFab分子のFab重鎖が、カルボキシ末端ペプチド結合を、Fcドメインのサブユニット(VH(3)−CH1(3)−CH2−CH3(−CH4))及び第3のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(3)−CL(3))と共有するポリペプチドを含みうる。特定の実施態様において、ポリペプチドは、例えばジスルフィド結合によって共有結合される。
幾つかの実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端で第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。特定のそのような実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子はFcドメインを含まない。特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1及び第2のFab分子、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。そのような立体配置は図1O及び図1Sに模式的に示されている。
他の実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端で第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。特定のそのような実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子はFcドメインを含まない。特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1及び第2のFab分子、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。そのような立体配置は図1P及び図1Tに模式的に示されている。
幾つかの実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に第3のFab分子を含み、ここで前記第3のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。特定のそのような実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子である。他のそのような実施態様において、前記第3のFab分子は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。特定のこのような実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1、第2及び第3のFab分子、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第3のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。そのような立体配置は図1Q及び図1Uに模式的に示されている.(特定の実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子であり、好ましくは第1のFab分子と同じである)。
幾つかの実施態様において、第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に第3のFab分子を含み、ここで前記第3のFab分子は、Fab重鎖のN末端において、第2のFab分子のFab重鎖のC末端に融合している。特定のそのような実施態様において、前記第3のFab分子は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。他のそのような実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子である。特定のこのような実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1、第2及び第3のFab分子、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第3のFab分子は、Fab重鎖のN末端において、第2のFab分子のFab重鎖のC末端に融合している。そのような立体配置は図1W及び図1Yに模式的に示されている.(特定の実施態様において、第3のFab分子はクロスオーバーFab分子であり、好ましくは第2のFab分子と同じである)。
幾つかの実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に第3のFab分子を含み、ここで前記第3のFab分子は、Fab重鎖のN末端において、第1のFab分子のFab重鎖のC末端に融合している。特定のそのような実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子である。他のそのような実施態様において、前記第3のFab分子は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。特定のこのような実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1、第2及び第3のFab分子、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第3のFab分子は、Fab重鎖のN末端において、第1のFab分子のFab重鎖のC末端に融合している。そのような立体配置は図1R及び図1Vに模式的に示されている.(特定の実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子であり、好ましくは第1のFab分子と同じである)。
幾つかの実施態様において、第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に第3のFab分子を含み、ここで前記第3のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。特定のそのような実施態様において、前記第3のFab分子は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。他のそのような実施態様において、第3のFab分子は従来のFab分子である。特定のこのような実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、本質的に、第1、第2及び第3のFab分子、及び任意選択的に一又は複数のペプチドリンカーからなり、ここで第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合しており、第3のFab分子は、Fab重鎖のC末端において、第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合している。そのような立体配置は図1X及び図1Zに模式的に示されている.(特定の実施態様において、第3のFab分子はクロスオーバーFab分子であり、好ましくは第1のFab分子と同じである)。
特定の実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第1のFab分子のFab重鎖が第2のFab分子のFab軽鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有する(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)ポリペプチド(VH(1)−CH1(1)−VL(2)−CH1(2))を含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。
特定の実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第2のFab分子のFab軽鎖可変領域が第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次に第1のFab分子のFab重鎖とカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(2)−CH1(2)−VH(1)−CH1(1))を含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。
特定の実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第3のFab分子のFab重鎖が第1のFab分子のFab重鎖とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab軽鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有する(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)ポリペプチド(VH(3)−CH1(3)−VH(1)−CH1(1)−VL(2)−CH1(2))を含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。幾つかの実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は第3のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(3)−CL(3))を更に含む。
特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第2のFab分子のFab軽鎖可変領域が第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次に第1のFab分子のFab重鎖とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第3のFab分子のFab重鎖とカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(2)−CH1(2)−VH(1)−CH1(1)−VH(3)−CH1(3))を含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。幾つかの実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は第3のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(3)−CL(3))を更に含む。
特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第1のFab分子のFab重鎖が第2のFab分子のFab軽鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次に第3のFab分子のFab軽鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第3のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有する(すなわち、第3のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)ポリペプチド(VH(1)−CH1(1)−VL(2)−CH1(2)−VL(3)−CH1(3))を含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第3のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第3のFab分子のFab軽鎖定常領域と共有する(VH(3)−CL(3))ポリペプチドを含む。
特定の実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、第3のFab分子のFab軽鎖可変領域が、第3のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第3のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次に第2のFab分子のFab軽鎖可変領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し、これが次に第2のFab分子のFab重鎖定常領域とカルボキシ末端ペプチド結合を共有し(すなわち、第2のFab分子が、重鎖可変領域が軽鎖可変領域により置換されているクロスオーバーFab重鎖を含む)、これが次に第1のFab分子のFab重鎖とカルボキシ末端ペプチド結合を共有するポリペプチド(VL(3)−CH1(3)−VL(2)−CH1(2)−VH(1)−CH1(1))を含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第2のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第2のFab分子のFab軽鎖定常領域(VH(2)−CL(2))と、及び第1のFab分子のFab軽鎖ポリペプチド(VL(1)−CL(1))と共有するポリペプチドを含む。幾つかの実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は更に、第3のFab分子のFab重鎖可変領域が、カルボキシ末端ペプチド結合を、第3のFab分子のFab軽鎖定常領域と共有する(VH(3)−CL(3))ポリペプチドを含む。
上記実施態様のいずれによっても、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子(例えば、Fab分子、Fcドメイン)の成分は、直接融合するか、又は様々なリンカー、特に一又は複数のアミノ酸、典型的には約2〜20個のアミノ酸を含むペプチドリンカーを介して融合する。このようなリンカーは本明細書に記載されているか、又は当該技術分野で既知である。適切な非免疫原性ペプチドリンカーには、例えば、(GS),(SG,(GS)又はG(SGペプチドリンカーが含まれ、ここでnは通常1〜10、典型的には2〜4の整数である。
Fcドメイン
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、免疫グロブリン分子の重鎖ドメインを含む一対のポリペプチド鎖からなる。例えば、免疫グロブリンG(IgG)分子のFcドメインはダイマーであり、その各サブユニットはCH2及びCH3 IgG重鎖定常ドメインを含む。Fcドメインの二つのサブユニットは、互いに安定に結合することができる。一実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、一を超えないFcドメインを含む。
本発明による一実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインはIgG Fcドメインである。特定の実施態様では、FcドメインはIgG Fcドメインである。別の実施態様では、FcドメインはIgGのFcドメインである。更に特定の実施態様では、Fcドメインは、S228(カバット番号付け)の位置にアミノ酸置換を、特にアミノ酸置換S228Pを含む、IgG Fcドメインである。このアミノ酸置換は、IgG抗体のインビボでのFabアーム交換を低減する(Stubenrauch et al., Drug Metabolism and Disposition 38, 84-91 (2010)を参照)。更に特定の実施態様では、Fcドメインはヒトである。ヒトIgG Fc領域の例示的な配列は配列番号13に与えられる。
ヘテロ二量体化を促すFcドメインの修飾
本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、Fcドメインの二つのサブユニットの一方又は他方に融合した異なるFab分子を含み、従ってFcドメインの二つのサブユニットは、通常二つの非同一なポリペプチド鎖に含まれている。これらのポリペプチドの組換え同時発現とそれに続く二量体化は、二つのポリペプチドの複数の可能な組合わせをもたらす。従って、組換え生成におけるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の収率及び純度を改善するために、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメイン内に所望のポリペプチドの会合を促す修飾を導入することが有利であろう。
すなわち、特定の実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、Fcドメインの第1及び第2のサブユニットの会合を促す修飾を含んでいる。ヒトIgG Fcドメインの二つのサブユニット間においてタンパク質−タンパク質相互作用が最大である部位は、FcドメインのCH3ドメインである。従って、一実施態様では、前記修飾はFcドメインのCH3ドメイン内で行われる。
ヘテロ二量体化を強制するために、FcドメインのCH3ドメインにおける修飾のための幾つかのアプローチが存在し、例えば、国際公開第96/27011号、国際公開第98/050431号、欧州特許第1870459号、国際公開第2007/110205号、国際公開第2007/147901号、国際公開第2009/089004号、国際公開第2010/129304号、国際公開第2011/90754号、国際公開第2011/143545号、国際公開第2012058768号、国際公開第2013157954号、国際公開第2013096291号に記載される。典型的には、このようなアプローチのすべてにおいて、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメイン及びFcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインは、相補的な様式で両方とも操作され、各CH3ドメイン(又はそれを含む重鎖)はもはやそれ自身とホモ二量体化することができないが、相補的に操作された他のCH3ドメインとヘテロ二量体化するように強制される(第1及び第2のCH3ドメインはヘテロ二量体化し、2つの第1又は2つの第2のCH3ドメインの間にホモ二量体は形成されないように)。本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子において、軽鎖の誤対合及びBence Jones型副生成物を減少させる、改良された重鎖ヘテロ二量体化のためのこれらの異なるアプローチは、重鎖軽鎖修飾(1つの結合アームにおけるVH及びVL交換/置換並びにCH1/CL界面における反対の電荷を有する荷電アミノ酸の置換の導入)と組み合わせた異なる選択肢として検討されている。
特定の一実施態様では、Fcドメインの第1及び第2のサブユニットの会合を促進する前記修飾はいわゆる「ノブ−イントゥ−ホール(knob−into−hole)」修飾であり、Fcドメインの二つのサブユニットの一方に「ノブ」修飾を、Fcドメインの二つのサブユニットの他方に「ホール」修飾を含んでいる。
ノブ−イントゥ−ホール技術は、例えば、米国特許第5731168号;同第7695936号; Ridgway et al., Prot Eng 9, 617-621 (1996)及びCarter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)に記載されている。通常、方法は、隆起がそれに対応する空洞内に位置できるように、第1のポリペプチドの接触面に隆起(「ノブ」)を、及び第2のポリペプチドの接触面に対応する空洞を、それぞれ導入することにより、ヘテロ二量体形成を促進し、且つホモ二量体形成を妨害することを伴う。隆起は、第1のポリペプチドの接触面由来の小さなアミノ酸側鎖を大きな側鎖(例えば、チロシン又はトリプトファン)で置き換えることにより構築される。隆起と同じか又は同様のサイズの相補的空洞は、大きなアミノ酸側鎖を小さいもの(例えばアラニン又はスレオニン)で置き換えることにより、第2のポリペプチドの接触面に作り出される。
このように、特定の実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおいて、アミノ酸残基がそれよりも大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置換され、それにより、第1のサブユニットのCH3ドメイン内部に、第2のサブユニットのCH3ドメイン内部の空洞内に配置可能な隆起が生成され、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおいて、アミノ酸残基がそれよりも小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置換され、それにより、第2のサブユニットのCH3ドメイン内部に、第1のサブユニットのCH3ドメイン内部の隆起を配置可能な空洞が生成される。
好ましくは、より大きな側鎖体積を有する前記アミノ酸残基は、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)及びトリプトファン(W)からなる群から選択される。
好ましくは、より小さな側鎖容積を有する前記アミノ酸残基は、アラニン(A)、セリン(S)、トレオニン(T)及びバリン(V)からなる群から選択される。
隆起と空洞は、ポリペプチドをコードする核酸を、例えば部位特異的突然変異誘発により、又はペプチド合成により、変化させることにより作り出すことができる。
特定の実施態様では、Fcドメインの第1のサブユニット(「ノブ」サブユニット)のCH3ドメインにおいて、366位のスレオニン残基がトリプトファン残基で置換され(T366W)、Fcドメインの第2のサブユニット(「ホール」サブユニット)のCH3ドメインにおいて、407位のチロシン残基がバリン残基で置換される(Y407V)。一実施態様では、Fcドメインの第2のサブユニットにおいて更に、366位のスレオニン残基がセリン残基で置換され(T366S)、368位のロイシン残基がアラニン残基で置換される(L368A)(KabatのEUインデックスによる番号付け)。
また更なる実施態様ではFcドメインの第1のサブユニットにおいて更に、354位のセリン残基がシステイン残基で置換され(S354C)又は356位のグルタミン酸残基がシステイン残基(E356C)で置換され、Fcドメインの第2のサブユニットにおいて更に、349位のチロシン残基がシステイン残基で置換される(Y349C)(KabatのEUインデックスによる番号付け)。これらの2つのシステイン残基の導入は、Fcドメインの2つのサブユニット間のジスルフィド架橋の形成をもたらし、更に二量体を安定化させる(Carter, J Immunol Methods 248, 7-15 (2001))。
特定の実施態様において、Fcドメインの第1のサブユニットは、アミノ酸置換S354C及びT366Wを含み、Fcドメインの第2のサブユニットは、アミノ酸置換Y349C、T366S、L368A及びY407V(KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。
特定の実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、Fcドメインの第1のサブユニット(「ノブ」修飾を含む)に(所望により標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子を介して)融合される。理論に縛られることを望まないが、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子をFcドメインのノブ含有サブユニットに融合させることにより、活性化T細胞抗原に結合する2つのFab分子を含む抗原結合分子の生成を(更に)最小限に抑えることができる(2つのノブ含有ポリペプチドの立体的衝突)。
ヘテロ二量体化を強制するためのCH3修飾の他の技術は、本発明による代替案として考えられており、例えば、国際公開第96/27011号、国際公開第98/050431号、欧州特許第1870459号、国際公開第2007/110205号、国際公開第2007/147901号、国際公開第2009/089004号、国際公開第2010/129304号、国際公開第2011/90754号、国際公開第2011/143545号、国際公開第2012/058768号、国際公開第2013/157954号、国際公開第2013/096291号に記載される。
一実施態様において、欧州特許第1870459(A1)号に記載されているヘテロ二量化アプローチが代替的に使用される。このアプローチは、Fcドメインの2つのサブユニット間のCH3/CH3ドメイン界面における特定のアミノ酸位置に反対の電荷を有する荷電アミノ酸の導入に基づく。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の好ましい一実施態様は、(Fcドメインの)2つのCH3ドメインのうちの1つにおけるアミノ酸変異R409D;K370E及びFcドメインのCH3ドメインの他方におけるアミノ酸変異D399K;E357K(KabatのEUインデックスによる番号付け)である。
別の実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異T366W、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異T366S、L368A、Y407V、更にFcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異R409D;K370E、及びFcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異D399K;E357K(KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。
別の実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異S354C、T366W、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異Y349C、T366S、L368A、Y407Vを含み、又は前記T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異Y349C、T366W、及びFcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異S354C、T366S、L368A、Y407V、更にFcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異R409D;K370E、及びFcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおけるアミノ酸変異D399K;E357K(全ての番号はKabatのEUインデックスによる)を含む。
一実施態様において、国際公開第2013/157953号に記載されているヘテロ二量化アプローチが代替的に使用される。一実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸突然変異T366Kを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸突然変異L351D(KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。更なる実施態様において、第1のCH3ドメインは、更なるアミノ酸変異L351Kを含む。更なる実施態様では、第2のCH3ドメインは、Y349E、Y349D及びL368E(好ましくはL368E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)から選択されるアミノ酸変異を更に含む。
一実施態様において、国際公開第2012/058768号に記載されているヘテロ二量化アプローチが代替的に使用される。一実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸変異L351Y、Y407Aを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸変異T366A、K409Fを含む。更なる実施態様では、第2のCH3ドメインは、T411、D399、S400、F405、N390、又はK392の位置に、a)T411N、T411R、T411Q、T411K、T411D、T411E又はT411W、b)D399R、D399W、D399Y又はD399K、c)S400E、S400D、S400R、又はS400K、d)F405I、F405M、F405T、F405S、F405V又はF405W、e)N390R、N390K又はN390D、f)K392V、K392M、K392R、K392L、K392F又はK392E(KabatのEUインデックスによる番号付け)から選択される更なるアミノ酸変異を含む。更なる実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸変異L351Y、Y407Aを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸変異T366V、K409Fを含む。更なる実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸変異Y407Aを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸変異T366A、K409Fを含む。更なる実施態様において、第2のCH3ドメインは、アミノ酸変異K392E、T411E、D399R及びS400R(KabatのEUインデックスによる番号付け)を更に含む。
一実施態様において、例えば368及び409からなる群から選択される位置(KabatのEUインデックスによる番号付け)にアミノ酸修飾を有する、国際公開第2011/143545号に記載されるヘテロ二量体化アプローチが代替的に使用される。
一実施態様において、上述したノブ−イントゥ−ホール技術を使用する、国際公開第2011/090762号に記載されるヘテロ二量体化アプローチが代替的に使用される。一実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸変異T366Wを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸変異Y407Aを含む。一実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸突然変異T366Yを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸突然変異Y407T(KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。
一実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子又はそのFcドメインはIgGサブクラスであり、国際公開第2010/129304号パンフレットに記載されるヘテロ二量体化アプローチが代替的に使用される。
代替的な実施態様では、Fcドメインの第1及び第2のサブユニットの会合を促す修飾は、例えば、PCT刊行物国際公開第2009/089004号に記載されているような静電ステアリング効果を媒介する修飾を含む。通常、この方法は、ホモ二量体形成が静電的に望ましくなくなり、ヘテロ二量体化が静電的に望ましくなるような、荷電アミノ酸残基による二つのFcドメインサブユニットの接触面における一又は複数のアミノ酸残基の置き換えを伴う。そのような実施態様の1つにおいて、第1のCH3ドメインは、K392又はN392の負に荷電したアミノ酸(例えば、グルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)とのアミノ酸置換、好ましくはK392D又はN392Dを含み、第2のCH3ドメインは、D399、E356、D356又はE357の正に荷電したアミノ酸(例えば、リジン(K)又はアルギニン(R))とのアミノ酸置換、好ましくはD399K、E356K、D356K、又はE357K、より好ましくはD399K及びE356Kを含む。更なる実施態様において、第1のCH3ドメインは、K409又はR409の負に荷電したアミノ酸(例えば、グルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D))とのアミノ酸置換、好ましくはK409D又はR409Dを更に含む。更なる実施態様において、第1のCH3ドメインは、K439及び/又はK370の負に荷電したアミノ酸(例えば、グルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D))とのアミノ酸置換を更に含む(全ての番号はKabatのEUインデックスによる)。
更に別の実施態様において、国際公開第2007/147901号に記載されているヘテロ二量化アプローチが代替的に使用される。一実施態様において、第1のCH3ドメインはアミノ酸突然変異K253E、D282K、及びK322Dを含み、第2のCH3ドメインはアミノ酸突然変異D239K、E240K、及びK292Dを含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。
更に別の実施態様において、国際公開第2007/110205号に記載されているヘテロ二量化アプローチが代替的に使用される。
一実施態様において、Fcドメインの第1のサブユニットは、アミノ酸置換K392D及びK409Dを含み、Fcドメインの第2のサブユニットは、アミノ酸置換D356K及びD399K(Kabat EUインデックスによる番号付け)を含む。
Fc受容体結合及び/又はエフェクター機能を低下させるFcドメインの修飾
Fcドメインは、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子に望ましい薬物動態特性を付与し、そのような薬物動態特性には、標的組織中への良好な蓄積に貢献する長い血清半減期、及び望ましい組織−血液分布比が含まれる。しかし、同時に、好適な抗原保有細胞に対するよりもむしろFc受容体を発現する細胞に対するT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の所望されない標的化を導く。更に、Fc受容体シグナル伝達経路の同時活性化はサイトカイン放出につながる可能性があり、抗原結合部分の長い半減期とT細胞活性化特性が組み合わさって、サイトカイン受容体の過剰な活性化及び全身投与の際に重篤な副作用をもたらす。T細胞以外の(Fc受容体保有)免疫細胞の活性化は、例えばNK細胞によるT細胞の破壊の可能性により、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の有効性を更に低下させることすらある。
従って、特定の実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、天然のIgG Fcドメインと比較した場合に、Fc受容体に対する結合親和性の低下及び/又はエフェクター機能の低下を呈する。このような一実施態様では、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)は、天然のIgG Fcドメイン(又は天然のIgG Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)と比較して、50%未満、好ましくは20%未満、更に好ましくは10%未満、及び最も好ましくは5%未満の、Fc受容体への結合親和性を呈する、及び/又は、天然のIgG Fcドメイン(又は天然のIgG Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)と比較して、50%未満、好ましくは20%未満、更に好ましくは10%未満、及び最も好ましくは5%未満の、エフェクター機能を呈する。一実施態様では、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)は、Fc受容体に実質的に結合しない、及び/又はエフェクター機能を誘導しない。特定の一実施態様では、Fc受容体はFcγ受容体である。一実施態様では、Fc受容体はヒトFc受容体である。一実施態様では、Fc受容体は活性化Fc受容体である。特定の一実施態様では、Fc受容体は活性化ヒトFcγ受容体であり、具体的にはヒトFcγRIIIa、FcγRI又はFcγRIIa、更に具体的にはヒトFcγRIIIaである。一実施態様では、エフェクター機能は、CDC、ADCC、ADCP、及びサイトカイン分泌の群から選択される一又は複数である。特定の一実施態様では、エフェクター機能はADCCである。一実施態様では、Fcドメインは、天然IgG Fcドメインと比較して実質的に同様の、新生児Fc受容体(FcRn)に対する結合親和性を呈する。実質的に同様のFcRnに対する結合親和性は、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)が、天然IgG Fcドメイン(又は天然IgG Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)の約70%、特に約80%、更には特に約90%を上回るFcRnに対する結合親和性を呈するとき、達成される。
特定の実施態様において、Fcドメインは、操作されていないFcドメインと比較して、Fc受容体への低下した結合親和性及び/又は低下したエフェクター機能を有するように操作される。特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、FcドメインのFc受容体に対する結合親和性及び/又はエフェクター機能を低下させる一又は複数のアミノ酸変異を含む。典型的には、同じ一又は複数のアミノ酸変異がFcドメインの二つのサブユニットの各々に存在する。一実施態様では、アミノ酸変異はFcドメインのFc受容体に対する結合親和性を低下させる。一実施態様では、アミノ酸変異は、FcドメインのFc受容体に対する結合親和性を、少なくとも2分の1、少なくとも5分の1、又は少なくとも10分の1に低下させる。FcドメインのFc受容体に対する結合親和性を低下させる複数のアミノ酸変異が存在する一実施態様では、これらアミノ酸変異の組合せにより、FcドメインのFc受容体に対する結合親和性が、少なくとも10分の1、少なくとも20分の1、又は少なくとも50分の1にまで低下する。一実施態様では、改変されたFcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、改変されていないFcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子と比較して、20%未満、特に10%未満、更には5%未満のFc受容体に対する結合親和性を呈する。特定の一実施態様では、Fc受容体はFcγ受容体である。幾つかの実施態様では、Fc受容体はヒトFc受容体である。幾つかの実施態様では、Fc受容体は活性化Fc受容体である。特定の一実施態様では、Fc受容体は活性化ヒトFcγ受容体であり、具体的にはヒトFcγRIIIa、FcγRI又はFcγRIIa、更に具体的にはヒトFcγRIIIaである。好ましくは、これら受容体の各々への結合は低減する。幾つかの実施態様では、補体成分に対する結合親和性、特にC1qに対する結合親和性も低減する。一実施態様では、新生児Fc受容体(FcRn)に対する結合親和性は低減しない。FcRnに対する実質的に同様の結合、すなわち、前記受容体に対するFcドメインの結合親和性の保存は、Fcドメイン(又は前記Fcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)がFcドメインの改変されていない形態(又はFcドメインの前記改変されていない形態を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)の約70%を上回るFcRnに対する結合親和性を呈するとき、達成される。Fcドメイン、又は前記Fcドメインを含む本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、このような親和性の約80%、及び場合によっては約90%を上回る親和性を呈しうる。特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、改変されていないFcドメインと比較してエフェクター機能が低下するように改変される。エフェクター機能の低下は、限定しないが、補体依存性細胞傷害(CDC)の低減、抗体依存性T細胞媒介性細胞傷害(ADCC)の低減、抗体依存性細胞貪食(ADCP)の低減、サイトカイン分泌の低減、抗原提示細胞による免疫複合体媒介性抗原取り込みの低減、NK細胞に対する結合の低減、マクロファージに対する結合の低減、単球に対する結合の低減、多形核細胞に対する結合の低減、アポトーシスを誘導する直接的シグナル伝達の低減、標的結合抗体の架橋の低減、樹状細胞成熟の低減、又はT細胞プライミングの低減のうちの一又は複数を含むことができる。一実施態様では、エフェクター機能の低下は、CDCの低減、ADCCの低減、ADCPの低減、及びサイトカイン分泌の低下からなる群より選択される一又は複数である。特定の一実施態様では、エフェクター機能の低下はADCCの低減である。一実施態様では、低減したADCCは、改変されていないFcドメイン(又は改変されていないFcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子)によって誘導されるADCCの20%未満である。
一実施態様では、FcドメインのFc受容体に対する結合親和性及び/又はエフェクター機能を低下させるアミノ酸の変異は、アミノ酸置換である。一実施態様では、Fcドメインは、E233、L234、L235、N297、P331及びP329(KabatのEUインデックスによる番号付け)の群から選択される位置にアミノ酸置換を含む。具体的な実施態様では、Fcドメインは、L234、L235及びP329(KabatのEUインデックスによる番号付け)の群から選択される位置にアミノ酸置換を含む。幾つかの実施態様では、Fcドメインは、アミノ酸置換L234A及びL235A(KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む。そのような1つの実施態様において、FcドメインはIgG Fcドメインであり、特にヒトIgG Fcドメインである。一実施態様では、FcドメインはP329の位置にアミノ酸置換を含む。具体的な実施態様では、アミノ酸置換はP329A又はP329G、特にP329Gである(KabatのEUインデックスによる番号付け)。一実施態様では、Fcドメインは、P329の位置にアミノ酸置換を、更にE233、L234、L235、N297及びP331から選択される位置にアミノ酸置換を含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。具体的な実施態様では、更なるアミノ酸置換は、E233P、L234A、L235A、L235E、N297A、N297D又はP331Sである。特定の実施態様では、Fcドメインは、P329、L234及びL235の位置にアミノ酸置換を含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。更に特定の実施態様では、Fcドメインは、アミノ酸置換L234A、L235A及びP329G(「P329G LALA」)を含む。1つのそのような実施態様において、FcドメインはIgG Fcドメインであり、特にヒトIgG Fcドメインである。アミノ酸置換の「P329G LALA」の組合せは、参照によりその全体が本明細書に取り込まれる国際公開第2012/130831号に記載のように、ヒトIgG FcドメインのFcγ受容体(並びに補体)結合をほぼ完全に無効にする。国際公開第2012/130831号には、このような変異Fcドメインを調製する方法、及びFc受容体結合又はエフェクター機能といったその特性を決定する方法も記載されている。
IgG抗体は、IgG抗体と比較して、Fc受容体に対する結合親和性の低下及びエフェクター機能の低下を呈する。よって、幾つかの実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFcドメインは、IgG Fcドメイン、特にヒトIgGFcドメインである。一実施態様では、IgG Fcドメインは、S228の位置におけるアミノ酸置換、具体的にはアミノ酸置換S228Pを含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。Fc受容体に対するその結合親和性及び/又はそのエフェクター機能を更に低下させるために、一実施態様では、IgG Fcドメインは、L235の位置におけるアミノ酸置換、具体的にはアミノ酸置換L235Eを含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。別の実施態様では、IgG Fcドメインは、P329の位置におけるアミノ酸置換、具体的にはアミノ酸置換P329Gを含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。特定の実施態様では、IgG Fcドメインは、S228、L235及びP329の位置におけるアミノ酸置換、具体的にはアミノ酸置換S228P、L235E及びP329Gを含む(KabatのEUインデックスによる番号付け)。このようなIgG Fcドメインの変異及びそれらのFcγ受容体結合特性は、国際公開第2012/130831号に記載されており、これは参照によりその全体が本明細書に取り込まれる。
特定の実施態様では、天然のIgG Fcドメインと比較してFc受容体に対する結合親和性の低下及び/又はエフェクター機能の低下を呈するFcドメインは、アミノ酸置換L234A、L235A及び任意選択的にP329Gを含むヒトIgG Fcドメインであるか、又はアミノ酸置換S228P、L235E及び任意選択的にP329Gを含むヒトIgG Fcドメインである(KabatのEUインデックスによる番号付け)。
特定の実施態様ではFcドメインのNグリコシル化は排除されている。このような一実施態様では、FcドメインはN297の位置におけるアミノ酸置換、具体的にはアスパラギンをアラニン(N297A)又はアスパラギン酸(N297D)により置き換えるアミノ酸置換を含む。
本明細書及び国際公開第2012/130831号において記載されるFcドメインに加えて、Fc受容体結合及び/又はエフェクター機能の低下を有するFcドメインは、Fcドメイン残基238、265、269、270、297、327及び329の一又は複数の置換を有するものも含む(米国特許第6737056号)(KabatのEUインデックスによる番号付け)。そのようなFc変異体は、残基265及び297のアラニンへの置換を有するいわゆる「DANA」Fc突然変異体を含めた、アミノ酸位置265、269、270、297、及び327のうちの2つ以上において置換を有するFc突然変異体を含む(米国特許第7332581号)。
変異Fcドメインは、当該技術分野で周知の遺伝学的又は化学的方法を用いたアミノ酸の削除、置換、挿入、又は修飾により調製することができる。遺伝学的方法は、コード化DNA配列の部位特異的突然変異、PCR、遺伝子合成などを含みうる。正確なヌクレオチドの変化は、例えば配列決定により検証することができる。
Fc受容体に対する結合は、例えばELISAにより、又はBIAcore器具(GE Healthcare)のような標準の器具類を用いた表面プラズモン共鳴(SPR)により容易に決定することができ、このようなFc受容体は組換え発現により得ることができる。このような適切な結合アッセイは本明細書に記載される。代替的に、Fcドメイン、又はFcドメインを含む細胞活性化二重特異性抗原結合分子のFc受容体に対する結合親和性は、特定のFc受容体を発現することが知られている細胞株、例えばFcγIIIa受容体を発現するNK細胞を用いて評価してもよい。
Fcドメイン、又はFcドメインを含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子のエフェクター機能は、当該技術分野で既知の方法により測定することができる。ADCCを測定するための適切なアッセイは本明細書に記載される。目的の分子のADCC活性を評価するためのインビトロアッセイの他の例が、米国特許第5500362号;Hellstrom et al. Proc Natl Acad Sci USA 83, 7059-7063 (1986)及びHellstrom et al., Proc Natl Acad Sci USA 82, 1499-1502 (1985);米国特許第5821337号; Bruggemann et al., J Exp Med 166, 1351-1361 (1987)に記載されている。あるいは、非放射性アッセイ法を用いてもよい(例えばフローサイトメトリー用のACTITM非放射性細胞傷害性アッセイ(CellTechnology、Inc. Mountain View、CA;及びCytoTox96(登録商標)非放射性細胞傷害性アッセイ(Promega、Madison、WI)参照)。このようなアッセイに有用なエフェクター細胞には、末梢血単核細胞(PBMC)及びナチュラルキラー(NK)細胞が含まれる。或いは又は加えて、目的の分子のADCC活性は、Clynes et al., PNAS USA 95:652-656 (1998)に開示されるように、例えば動物モデルにおいて、インビボで評価することができる。
幾つかの実施態様では、補体成分に対するFcドメインの結合、特にC1qに対する結合が低減する。従って、Fcドメインがエフェクター機能が低下するように改変されている幾つかの実施態様では、前記エフェクター機能の低下はCDCの低下を含む。C1q結合アッセイは、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子がC1qに結合できるかどうか、それによりCDC活性を有するかどうかを決定するために実行される。例えば、国際公開第2006/029879号及び国際公開第2005/100402号のC1q及びC3c結合ELISAを参照。補体活性化を評価するために、CDCアッセイを行うことができる(例えば、Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996); Cragg, et al., Blood 101:1045-1052 (2003);及びCragg, and Glennie, Blood 103:2738-2743 (2004)を参照)。
抗原結合部分
本発明の抗原結合分子は二重特異性であり、すなわち二つの異なる抗原決定基に特異的に結合することができる少なくとも二つの抗原結合部分を含む。本発明によれば、抗原結合部分はFab分子(すなわち、各々が可変及び定常ドメインを含む重鎖と軽鎖とからなる抗原結合ドメイン)である。一実施態様では、前記Fab分子はヒトである。別の実施態様では、前記Fab分子はヒト化されている。また別の実施態様では、前記Fab分子はヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインを含む。
抗原結合部分の少なくとも一つはクロスオーバーFab分子である。このような修飾は、異なるFab分子由来の重鎖と軽鎖との誤対合を減少させ、それにより組換え生成において本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の収率及び純度を向上させる。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分に有用な特定のクロスオーバーFab分子では、Fab軽鎖とFab重鎖の可変ドメイン(それぞれVLとVH)が交換されている。しかし、このドメイン交換であっても、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の調製は、誤対合された重鎖と軽鎖との間のいわゆるBence Jones型相互作用のために、ある種の副生成物を含むことがある(Schaefer et al, PNAS, 108 (2011) 11187-11191を参照)。異なるFab分子からの重鎖及び軽鎖の誤対合を更に減少させ、従って本発明による所望のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の純度及び収率を増加させるために、反対の電荷を有する荷電アミノ酸が、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子又は活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子の何れかのCH1及びCLドメインの特定のアミノ酸位置に導入される。電荷修飾は、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる従来のFab分子(例えば、図1A−C、G−Jに示されるようなもの)、又はT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれるクロスオーバーFab分子(例えば、図1D−F、K−Nに示されているようなもの)の何れかで行われる(但し、両方ではない)。特定の実施態様において、電荷修飾は、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子(特定の実施態様では標的細胞抗原に特異的に結合する)に含まれる従来のFab分子において行われる。
本発明による特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、標的細胞抗原、特に腫瘍細胞抗原、及び活性化T細胞抗原、具体的にはCD3に同時結合することができる。一実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、標的細胞抗原と活性化T細胞抗原に同時結合することにより、T細胞と標的細胞を架橋することができる。更に特定の実施態様では、このような同時結合は、標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を引き起こす。一実施態様では、このような同時結合は、T細胞の活性化を引き起こす。他の実施態様では、このような同時結合は、増殖、分化、サイトカイン分泌、細胞傷害性エフェクター分子放出、細胞傷害性活性化、及び活性化マーカーの発現から選択される、Tリンパ球、特に細胞傷害性Tリンパ球の細胞応答を引き起こす。一実施態様では、標的細胞への同時結合を含まないT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の活性化T細胞抗原、具体的にはCD3に対する結合は、T細胞の活性化を引き起こさない。
一実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、T細胞の細胞傷害性活性を標的細胞へと再指向することができる。特定の一実施態様では、前記再指向は、標的細胞によるMHC媒介性ペプチド抗原の提示及び/又はT細胞の特異性と無関係である。
特に、本発明の実施態様の何れかによるT細胞は、細胞傷害性T細胞である。幾つかの実施態様では、T細胞はCD4又はCD8 T細胞、特にCD8 T細胞である。
活性化T細胞抗原結合Fab分子
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、活性化T細胞抗原(本明細書では「活性化T細胞抗原結合Fab分子」とも呼ばれる)に特異的に結合する少なくとも1つのFab分子を含む。特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、最大で一つの、活性化T細胞抗原に特異的に結合することができるFab分子(又は他のFab分子)を含む。一実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、活性化T細胞抗原に対する一価の結合を提供する。
特定の実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。
そのような実施態様において、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、従来のFab分子である。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれる標的細胞抗原に特異的に結合する二つ以上のFab分子が存在する実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子は好ましくはクロスオーバーFab分子であり、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、従来のFab分子である。
代替の実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、従来のFab分子である。そのような実施態様において、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。
特定の実施態様では、活性化T細胞抗原はCD3、特にヒトCD3(配列番号1)又はカニクイザルCD3(配列番号2)、最も具体的にはヒトCD3である。特定の実施態様では、活性化T細胞抗原結合Fab分子は、ヒト及びカニクイザルのCD3に交差反応性(すなわち、特異的に結合する)である。幾つかの実施態様において、活性化T細胞抗原はCD3のイプシロンサブユニット(CD3イプシロン)である。
幾つかの実施態様では、活性化T細胞抗原結合Fab分子は、CD3、具体的にはCD3イプシロンに特異的に結合し、配列番号4、配列番号5及び配列番号6からなる群より選択される少なくとも一つの重鎖相補性決定領域(CDR)と、配列番号8、配列番号9、配列番号10からなる群より選択される少なくとも一つの軽鎖CDRとを含んでいる。
一実施態様において、CD3結合Fab分子は、配列番号4の重鎖CDR1、配列番号5の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3を含む重鎖可変領域と、配列番号8の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2、及び配列番号10の軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域とを含む。
別の実施態様において、CD3結合Fab分子は、配列番号4の重鎖CDR1、配列番号67の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3を含む重鎖可変領域と、配列番号68の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2、及び配列番号10の軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域とを含む。
一実施態様では、CD3結合Fab分子は、配列番号3と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一である重鎖可変領域配列と、配列番号7と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一である軽鎖可変領域配列とを含んでいる。
一実施態様において、CD3結合Fab分子は、配列番号3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域と、配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域とを含んでいる。
一実施態様において、CD3結合Fab分子は、配列番号3の重鎖可変領域配列と、配列番号7の軽鎖可変領域配列とを含んでいる。
標的細胞抗原結合Fab分子
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、標的細胞抗原(本明細書では「標的細胞抗原結合Fab分子」とも呼ばれる)に特異的に結合する少なくとも1つのFab分子を含む。特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、標的細胞抗原に特異的に結合する2つのFab分子を含む。このような特定の実施態様では、これらのFab分子の各々は、同じ抗原決定基に特異的に結合する。更により特定の実施態様では、これらのFab分子はすべて同一であり、すなわち、それらが本明細書に記載のCH1及びCLドメインに同じアミノ酸置換(存在する場合)を含む同じアミノ酸配列を含む。一実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、標的細胞抗原に特異的に結合する免疫グロブリン分子を含む。一実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、標的細胞抗原に特異的に結合する、最大で2つのFab分子を含む。
特定の実施態様において、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子(単数又は複数)は、従来のFab分子である。そのような実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子(単数又は複数)は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。
代替的実施態様において、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子(単数又は複数)は本明細書に記載されるクロスオーバーFab分子、すなわちFab重鎖及び軽鎖の可変ドメインVH及びVLが互いに交換/置換されているFab分子である。そのような実施態様において、活性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、従来のFab分子である。
標的細胞抗原結合Fab分子は、特異的抗原決定基に結合し、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を標的部位、例えば抗原決定基を保持する特定の型の腫瘍細胞に指向することができる。
特定の実施態様では、標的細胞抗原結合Fab分子は、細胞表面抗原に特異的に結合する。
特定の実施態様では、標的細胞抗原結合Fab分子は、病状に関連付けられる抗原、例えば、腫瘍細胞又はウイルス感染細胞上に現れる抗原に指向される。適切な標的細胞抗原は、細胞表面抗原、例えば、限定されないが、細胞表面受容体である。特定の実施態様では、標的細胞抗原はヒト抗原である。例示的な標的細胞抗原には、CD20、Her2、Her3、MCSP(メラノーマ関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン、コンドロイチン硫酸プロテオグリカン4としても知られる)、又はBCMA(ヒトB細胞成熟標的、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー17(UniProt Q02223)としても知られる)を含む。
特定の実施態様では、標的細胞抗原はCD20、特にヒトCD20である。一実施態様において、標的細胞抗原はCD20であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号47の重鎖CDR2、及び配列番号48の重鎖CDR3を含む重鎖可変領域と、配列番号49の軽鎖CDR1、配列番号50の軽鎖CDR2及び配列番号51の軽鎖CDR3を含む軽鎖可変領域とを含む。更なる実施態様において、標的細胞抗原はCD20であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号30の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である重鎖可変領域と、配列番号31の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である軽鎖可変領域とを含む。なお更なる実施形態において、標的細胞抗原はCD20であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号30の重鎖可変領域配列と、配列番号31の軽鎖可変領域配列とを含んでいる。特定の実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号18の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号19の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号20の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、及び配列番号21の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチドを含む。更なる特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号18のポリペプチド配列、配列番号19のポリペプチド配列、配列番号20のポリペプチド配列、及び配列番号21のポリペプチド配列を含む。別の実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号32の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号19の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号20の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、及び配列番号21の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチドを含む。更なる実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号32のポリペプチド配列、配列番号19のポリペプチド配列、配列番号20のポリペプチド配列、及び配列番号21のポリペプチド配列を含む。更に別の実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号36の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号37の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号38の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、及び配列番号39の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチドを含む。更なる実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号36のポリペプチド配列、配列番号37のポリペプチド配列、配列番号38のポリペプチド配列、及び配列番号39のポリペプチド配列を含む。更なる実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号40の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号41の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号20の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、及び配列番号21の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチドを含む。更なる実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号40のポリペプチド配列、配列番号41のポリペプチド配列、配列番号20のポリペプチド配列、及び配列番号21のポリペプチド配列を含む。
他の実施態様では、標的抗原はHer2、特にヒトHer2である。一実施態様において、標的細胞抗原はHer2であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号61の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である重鎖可変領域と、配列番号62の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である軽鎖可変領域とを含む。更なる実施形態において、標的細胞抗原はHer2であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号61の重鎖可変領域配列と、配列番号62の軽鎖可変領域配列とを含んでいる。一実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号21の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号52の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号53の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、及び配列番号54の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチドを含む。更なる実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号21のポリペプチド配列、配列番号52のポリペプチド配列、配列番号53のポリペプチド配列、及び配列番号54のポリペプチド配列を含む。
他の実施態様では、標的抗原はHer3、特にヒトHer3である。一実施態様において、標的細胞抗原はHer3であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号63の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である重鎖可変領域と、配列番号64の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である軽鎖可変領域とを含む。更なる実施形態において、標的細胞抗原はHer3であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号63の重鎖可変領域配列と、配列番号64の軽鎖可変領域配列とを含んでいる。一実施態様において、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号21の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号55の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、配列番号56の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド、及び配列番号57の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチドを含む。更なる実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、配列番号21のポリペプチド配列、配列番号55のポリペプチド配列、配列番号56のポリペプチド配列、及び配列番号57のポリペプチド配列を含む。
他の実施態様において、標的抗原はメラノーマ関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)、特にヒトMCSPである。一実施態様において、標的細胞抗原はMCSPであり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号65の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である重鎖可変領域と、配列番号66の配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、又は99%同一である軽鎖可変領域とを含む。更なる実施形態において、標的細胞抗原はHer2であり、前記標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子は、配列番号65の重鎖可変領域配列と、配列番号66の軽鎖可変領域配列とを含んでいる。
幾つかの実施態様において、標的抗原はBCMAである。他の実施態様において、標的細胞抗原はBCMAではない。
ポリヌクレオチド
本発明は更に、本明細書に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子をコードする単離されたポリヌクレオチド又はその断片を含む。幾つかの実施態様において、前記断片は抗原結合断片である。
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチドは、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子全体をコードする単一のポリヌクレオチドとして、又は同時発現される複数(例えば、二つ以上)のポリヌクレオチドとして発現されうる。同時発現されるポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチドは、例えばジスルフィド結合又は他の手段を介して会合し、機能的T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を形成することができる。例えば、Fab分子の軽鎖部分は、Fab分子の重鎖部分、Fcドメインサブユニット、及び任意選択的に別のFab分子(の一部)を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の部分とは別のポリヌクレオチドによってコードされうる。同時発現されるとき、重鎖ポリペプチドは軽鎖ポリペプチドと会合してFab分子を形成するであろう。別の例では、二つのFcドメインサブユニットの一方び任意選択的に一又は複数のFab分子(の一部)を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の部分は、二つのFcドメインサブユニットの他方及び任意選択的にFab分子(の一部)を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の部分とは別のポリヌクレオチドによってコードされうる。同時発現されるとき、Fcドメインサブユニットは会合してFcドメインを形成する。
幾つかの実施態様では、単離されたポリヌクレオチドは、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子全体を本明細書に鬼才のようにコードする。他の実施態様では、単離されたポリヌクレオチドは、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に含まれるポリヌクレオチドを、本明細書に記載のようにコードする。
特定の実施態様では、ポリヌクレオチド又は核酸はDNAである。他の実施態様では、本発明のポリヌクレオチドは、例えばメッセンジャーRNA(mRNA)の形態の、RNAである。本発明のRNAは一本鎖又は二本鎖である。
組換え法
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、例えば、固相ペプチド合成(例えばメリフィールド固相合成)又は組換え生成によって得ることができる。組換え生成のために、例えば上述したように、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子(断片)をコードする一又は複数のポリヌクレオチドが単離され、宿主細胞内での更なるクローニング及び/又は発現のために一又は複数のベクターに挿入される。このようなポリヌクレオチドは、一般的な手順を使用して容易に単離され配列決定されうる。一実施態様において、本発明のポリヌクレオチドの一又は複数を含むベクタ−、好ましくは発現ベクターが提供される。当業者によく知られている方法は、適切な転写/翻訳制御シグナルとともに、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子(断片)のコード配列を含む発現ベクターを構築するために使用することができる。これらの方法は、インビトロでの組換えDNA技術、合成技術及びインビボでの組換え/遺伝子組換えを含む。例えば、Maniatis et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (1989);及びAusubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y (1989)に記載される技術を参照。発現ベクターはプラスミド、又はウイルスの一部とすることができるか、又は核酸断片でよい。発現ベクターは、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子(断片)(すなわち、コード領域)をコードするポリヌクレオチドが、プロモーター及び/又は他の転写又は翻訳制御エレメントと作動可能に結合するようにクローニングされる発現カセットを含む。本発明で使用される場合、「コード領域」は、アミノ酸に翻訳されるコドンからなる核酸の一部である。「終止コドン」(TAG、TGA、又はTAA)はアミノ酸に翻訳されないが、存在する場合にはコード領域の一部と考えられ、しかし、任意の隣接配列、例えばプロモーター、リボソーム結合部位、転写ターミネーター、イントロン、5’及び3’非翻訳領域などはコード領域の一部ではない。二つ以上のコード領域が、単一のポリヌクレオチド構築物、例えば単一のベクター上に、又は別々のポリヌクレオチド構築物の中に、例えば別の(異なる)ベクター上に存在することができる。更に、任意のベクターは、単一のコード領域を含んでいてもよいし、二つ以上のコード領域を含んでいてもよく、例えば本発明のベクターは、タンパク質分解性切断を介して、翻訳後又は翻訳と同時に最終タンパク質中に分離された一又は複数のポリペプチドをコードしてもよい。加えて、本発明のベクター、ポリヌクレオチド、又は核酸は、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子(断片)、又はその変異体若しくは誘導体をコードするポリヌクレオチドに融合又は非融合された異種コード領域をコードしうる。異種コード領域は、限定しないが、特殊化要素又はモチーフ、例えば分泌シグナルペプチド又は異種機能ドメインを含む。作動可能に結合とは、ポリペプチドなどの遺伝子産物のコード領域が、制御配列の影響下又は制御下において遺伝子産物の発現を配置するように、一又は複数の制御配列と結合するときである。(ポリペプチドコード領域及びそれに結合するプロモーターのような)二つのDNA断片は、プロモーター機能の誘導が所望の遺伝子産物をコードするmRNAの転写をもたらす場合、及び二つのDNA断片間の連結の性質が、遺伝子産物の発現を導く発現制御配列の能力を妨げないか又は転写されるべきDNA鋳型の能力を妨げない場合、「作動可能に結合している」。従って、プロモーター領域は、プロモーターがその核酸の転写をもたらすことができる場合にポリペプチドをコードする核酸に作動可能に結合される。プロモーターは所定の細胞においてのみDNAの実質的な転写を導く細胞特異的プロモーターであってもよい。プロモーターの他に他の転写制御エレメント、例えばエンハンサー、オペレーター、リプレッサー、及び転写終結シグナルが、細胞特異的転写を導くポリヌクレオチドと作動可能に結合することができる。適切なプロモーター及び他の転写制御領域は本明細書に開示されている。種々の転写制御領域が当業者に知られている。これらには、限定されないが、脊椎動物細胞において機能する転写制御領域、例えば、限定されないが、サイトメガロウイルス由来のプロモーター及びエンハンサーセグメント(例えばイントロン−Aと連動した即初期プロモーター)、サルウイルス40(例えば初期プロモーター)、及びレトロウイルス(例えばラウス肉腫ウイルスなど)が含まれる。他の転写制御領域は、脊椎動物の遺伝子、例えばアクチン、熱ショックタンパク質、ウシ成長ホルモン及びウサギ−αグロビン、並びに、真核細胞における遺伝子発現を制御することができる他の配列に由来するものを含む。更なる適切な転写制御領域は、組織特異的プロモーター及びエンハンサー並びに誘導性プロモーター(例えば、プロモーター誘導性テトラサイクリン)を含む。同様に、種々の翻訳制御エレメントが当業者に知られている。これらには、限定されないが、リボソーム結合部位、翻訳開始及び終結コドン、及びウイルス系由来の要素(特に、配列内リボソーム進入部位、又はCITE配列とも呼ばれるIRES)が含まれる。発現カセットはまた、例えば、複製起点、及び/又はレトロウイルスの長い末端反復配列(LTR)又はアデノ随伴ウイルス(AAV)の末端反転型配列(ITR)など染色体組み込み要素といった他の特徴を含んでいてもよい。
本発明のポリヌクレオチド及び核酸コード領域は、本発明のポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチドの分泌を指示する分泌ペプチド又はシグナルペプチドをコードする更なるコード領域と結合させることができる。例えば、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の分泌が望まれる場合、シグナル配列をコードするDNAが、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又はその断片をコードする核酸の上流に配置されうる。シグナル仮説によると、哺乳類細胞によって分泌されるタンパク質はシグナルペプチド又は分泌リーダー配列を有し、これは粗面小胞体上で成長するタンパク質鎖の排出が開始されると成熟タンパク質から切断される。当業者は、脊椎動物細胞によって分泌されるポリペプチドが通常、ポリペプチドの分泌型又は「成熟」型を生成するために翻訳されたポリペプチドから切断されるポリペプチドのN末端に融合したシグナルペプチドを有することを認識している。特定の実施態様では、天然のシグナルペプチド、例えば免疫グロブリン重鎖又は軽鎖シグナルペプチド又は作動可能に結合しているポリペプチドの分泌を指示する能力を保持するその配列の機能的誘導体が使用される。或いは、異種哺乳動物シグナルペプチド、又はその機能的誘導体を使用することができる。例えば、野生型リーダー配列は、ヒト組織プラスミノーゲン活性化因子(TPA)又はマウスβ−グルクロニダーゼのリーダー配列で置換されてもよい。
後の精製を容易にするため又はT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の標識化における補助のために使用されうる短タンパク質配列(例えば、ヒスチジンタグ)をコードするDNAは、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子(断片)をコードするポリヌクレオチドの中又は末端に含まれうる。
更なる実施態様では、本発明の一又は複数のポリヌクレオチドを含む宿主細胞が提供される。特定の実施態様では、本発明の一又は複数のベクターを含む宿主細胞が提供される。ポリヌクレオチド及びベクターは、ポリヌクレオチド及びベクターそれぞれに関連して本明細書に記載される特徴の何れかを単独で又は組み合わせて組み込むことができる。そのような一実施態様において、宿主細胞は、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子(の一部)をコードするポリヌクレオチドを含むベクターを含む(例えば該ベクターで形質転換又はトランスフェクトされている)。本明細書で使用される場合、「宿主細胞」なる用語は、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又はその断片を生成するよう改変できる何れかの種類の細胞系を指す。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の複製及び発現の補助に適切な宿主細胞は当分野でよく知られている。このような細胞は特定の発現ベクターで適切にトランスフェクト又は形質導入することができ、大量のベクター含有細胞を、臨床利用のための十分な量のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を得るために、大規模発酵槽での播種用に増殖させることができる。適切な宿主細胞は、原核生物微生物、例えば大腸菌、又は様々な真核生物細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、昆虫細胞などを含む。例えば、特に、グリコシル化が必要でない場合には、ポリペプチドは細菌中で生成することができる。発現の後、ポリペプチドは可溶性画分において細菌の細胞ペーストから単離され得、更に精製することができる。原核生物に加えて、糸状菌又は酵母菌のような真核微生物は、菌類や酵母菌株を含むポリペプチドをコードするベクターのための適切なクローニング宿主又は発現宿主であり、そのグリコシル化経路は「ヒト化」されており、部分的又は完全なヒトのグリコシル化パターンを有するポリペプチドの生成をもたらす。Gerngross, Nat Biotech 22, 1409-1414 (2004)、及びLi et al., Nat Biotech 24, 210-215 (2006)を参照。(グリコシル化)ポリペプチドの発現に適した宿主細胞はまた、多細胞生物(無脊椎動物と脊椎動物)から派生している。無脊椎動物細胞の例としては、植物及び昆虫細胞が挙げられる。多数のバキュロウイルス株が同定されており、これらは特にヨトウガ細胞のトランスフェクションのために、昆虫細胞と併せて使用することができる。植物細胞培養を宿主として利用することができる。例えば、米国特許第5959177号、第6040498号、第6420548号、第7125978号及び第6417429号(トランスジェニック植物における抗体生成に関するPLANTIBODIESTM技術を記載)を参照。脊椎動物細胞も宿主として用いることができる。例えば、懸濁液中で増殖するように適合されている哺乳動物細胞株は有用でありうる。有用な哺乳動物宿主細胞株の他の例は、SV40(COS−7)で形質転換されたサル腎臓CV1株、ヒト胚腎臓株(Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 (1977)に記載された293細胞又は293T細胞)、ベビーハムスター腎臓細胞(BHK)、マウスのセルトリ細胞(例えば、Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980)に記載されるTM4細胞)、サル腎細胞(CV1)、アフリカミドリザル腎細胞(VERO−76)、ヒト子宮頚癌細胞(HELA)、イヌ腎臓細胞(MDCK)、バッファローラット肝臓細胞(BRL 3A)、ヒト肺細胞(W138)、ヒト肝細胞(HepG2)、マウス乳腺腫瘍細胞(MMT060562)、(例えばMather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)に記載される)TRI細胞、MRC5細胞、及びFS4細胞である。他の有用な哺乳動物宿主細胞株は、dhfr−CHO細胞(Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980))を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞;及びYO、NS0、P3X63及びSp2/0などの骨髄腫細胞株を含む。タンパク質生成に適した特定の哺乳動物宿主細胞系の総説については、例えば、Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ), pp. 255-268 (2003)を参照。宿主細胞は、培養細胞、例えば幾つか挙げると、哺乳動物の培養細胞、酵母細胞、昆虫細胞、細菌細胞及び植物細胞、並びにトランスジェニック動物、トランスジェニック植物又は培養植物又は動物組織内部に含まれる細胞を含む。一実施態様において、宿主細胞は、真核生物細胞、好ましくは哺乳動物細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、ヒト胎児腎臓(HEK)細胞、又はリンパ系細胞(例えば、Y0、NS0、Sp20細胞)である。
これらの系において外来遺伝子を発現する標準的な技術が当技術分野で知られている。抗体などの抗原結合ドメインの重鎖又は軽鎖を含むポリペプチドを発現する細胞は、発現された生成物が重鎖及び軽鎖の両方を有する抗体であるように、抗体鎖の他方を発現するように改変することができる。
一実施態様において、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を生成する方法が提供され、この方法は、本明細書に与えられるように、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の発現に適した条件下で、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を培養し、宿主細胞(又は宿主細胞培地)からT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を回収することを含む。
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の成分は、通常互いに融合している。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、その成分が互いに直接的に、又はリンカー配列を介して間接的に融合するように、設計することができる。リンカーの組成及び長さは、当該技術分野で周知の方法に従って決定することができ、有効性について試験することができる。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の異なる成分間のリンカー配列の例は、本明細書に提供される配列に見出される。必要に応じて、融合の個々の成分を分離するための切断部位を取り込むために、追加的配列、例えばエンドペプチダーゼ認識配列も含めることができる。
特定の実施態様では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の一又は複数の抗原結合部分は、抗原決定基に結合することができる抗体可変領域を少なくとも含む。可変領域は、天然に又は非天然に存在する抗体及びその断片の一部を形成することができ、且つそのような抗体及び断片から誘導することができる。ポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体を生成する方法は、当該技術分野で周知である(例えば、Harlow and Lane, 「Antibodies, a laboratory manual」, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988)。非天然に存在する抗体は、固相−ペプチド合成を使用して構築されるか、組換え的に生成されるか(例えば米国特許第4186567号に記載のように)、又は例えば可変重鎖及び可変軽鎖を含むコンビナトリアルライブラリーのスクリーニング(例えばMcCaffertyの米国特許第5969108号を参照)によって得ることができる。
あらゆる動物種の抗体、抗体断片、抗原結合ドメイン又は可変領域を、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に用いることができる。本発明において有用な非限定的抗体、抗体断片、抗原結合ドメイン又は可変領域は、マウス、霊長類、又はヒト起源のものでありうる。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子がヒトでの使用を意図する場合、定常領域がヒトに由来する抗体のキメラ形態を使用することができる。ヒト化又は完全ヒト形態の抗体も、当分野でよく知られている方法に従って調製されうる(例えばWinterの米国特許第5565332号を参照)。ヒト化は、様々な方法によって達成することができ、それらの方法には、限定されないが、(a)非ヒト(例えば、ドナー抗体)のCDRを、重要なフレームワーク残基(例えば、良好な抗原結合親和性又は抗体機能を維持するために重要であるもの)の保持を伴う又は伴わないヒト(例えば、レシピエント抗体)のフレームワーク領域及び定常領域の上に移植すること、(b)非ヒト特異性決定領域(SDR又はa−CDR;抗体−抗原相互作用に重要な残基)のみをヒトフレームワーク領域及び定常領域上に移植すること、又は(c)非ヒト可変ドメイン全体を移植するが、表面残基の置換によってヒト様切片で「覆い隠す」ことが含まれる。ヒト化抗体及びそれらの製造方法は、例えば、Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)に総説され、更に、例えばRiechmann et al., Nature 332, 323-329 (1988); Queen et al., Proc Natl Acad Sci USA 86, 10029-10033 (1989);米国特許第5821337号、同第7527791号、同第6982321号、及び同第7087409号; Jones et al., Nature 321, 522-525 (1986); Morrison et al., Proc Natl Acad Sci 81, 6851-6855 (1984); Morrison and Oi, Adv Immunol 44, 65-92 (1988); Verhoeyen et al., Science 239, 1534-1536 (1988); Padlan, Molec Immun 31(3), 169-217 (1994); Kashmiri et al., Methods 36, 25-34 (2005) (SDR(a−CDR)移植を記述する); Padlan, Mol Immunol 28, 489-498 (1991) (「リサーフェシング」を記述する); Dall'Acqua et al., Methods 36, 43-60 (2005) (「FRシャッフリング」を記述する);及びOsbourn et al., Methods 36, 61-68 (2005)及びKlimka et al., Br J Cancer 83, 252-260 (2000)(FRシャッフリングへの「誘導選択」アプローチを記述する)に記載されている。ヒト抗体及びヒト可変領域は、当技術分野において既知の様々な技術を用いて生産することができる。ヒト抗体は一般的にvan Dijk and van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5: 368-74 (2001)及びLonberg, Curr. Opin. Immunol. 20:450-459 (2008)に記載されている。ヒト可変領域は、ハイブリドーマ法によって作製されたヒトモノクローナル抗体の一部を形成することができ、且つそのような抗体から誘導することができる(例えば、Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)を参照)。ヒト抗体及びヒト可変領域は、抗原チャレンジに応答して、インタクトなヒト抗体又はヒト可変領域を持つインタクトな抗体を生成するように修飾されたトランスジェニック動物に、免疫原を投与することにより調製することができる(例えば、Lonberg, Nat Biotech 23, 1117-1125 (2005)を参照)。ヒト抗体及びヒト可変領域はまた、ヒト由来のファージディスプレイライブラリーから選択されたFvクローン可変領域配列を単離することによって生成することができる(例えば、Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178, 1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001);及びMcCafferty et al., Nature 348, 552-554; Clackson et al., Nature 352, 624-628 (1991))。ファージは、通常、抗体断片を、単鎖Fv(scFv)断片、又はFab断片として表示する。
特定の実施態様では、本発明において有用な抗原結合部分は、例えば米国特許出願公開第2004/0132066号(この全内容を出典明記によってここに援用する)に開示される方法に従い、増強された結合親和性を有するように改変される。特定の抗原決定基に結合する本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の能力は、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)又は当業者によく知られている他の技術、例えば表面プラズモン共鳴技術(BIAcoreT100システムで解析される)(Liljeblad,et al.,Glyco.J.17:323-329(2000))及び古典的な結合アッセイ(Heeley,R.P.,Endocr.Res.28:217-229(2002))によって測定することができる。競合アッセイを、特定の抗原への結合について参照抗体と競合する抗体、抗体断片、抗原結合ドメイン又は可変ドメインを同定するため、例えばCD3への結合についてV9抗体と競合する抗体を同定するために使用することができる。特定の実施態様では、このような競合する抗体は、参照抗体によって結合される同じエピトープ(例えば直鎖状又は立体構造エピトープ)に結合する。抗体が結合するエピトープをマッピングするための典型的な方法の詳細が、Morris (1996) “Epitope Mapping Protocols," in Methods in Molecular Biology vol. 66 (Humana Press, Totowa, NJ)に提供されている。例示的な競合アッセイにおいて、固定化抗原(例えばCD3)は、抗原に結合する第一の標識された抗体(例えばV9抗体、米国特許第6054297号に記載)、及び抗原への結合について第一の抗体と競合するその能力について試験されている第二の未標識抗体を含む溶液中でインキュベートされる。第二抗体はハイブリドーマ上清中に存在してもよい。対照として、固定化抗原が、第一の標識された抗体を含むが第二の未標識抗体は含まない溶液中でインキュベートされる。第一の抗体の抗原への結合を許容する条件下でインキュベートした後、過剰な未結合抗体が除去され、固定化された抗原に結合した標識の量が測定される。固定化抗原に結合した標識の量が、対照試料と比較して試験試料中で実質的に減少している場合、それは、第二抗体が、抗原への結合において第一の抗体と競合していることを示している。Harlow and Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual ch.14 (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY)を参照。
本明細書で記載のように調製されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、当分野で知られている技術、例えば高速液体クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、親和性クロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィーなどによって精製されうる。特定のタンパク質を精製するために使用される実際の条件は、一部には正味荷電、疎水性、親水性などの要因に依存し、当業者に明瞭であろう。親和性クロマトグラフィー精製では、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子が結合する抗体、リガンド、受容体又は抗原が使用されうる。例えば、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の親和性クロマトグラフィー精製では、プロテインA又はプロテインGを伴うマトリックスが使用されうる。逐次的なプロテインA又はG親和性クロマトグラフィー及びサイズ排除クロマトグラフィーが、基本的に実施例に記載されるようにT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を単離するために使用されうる。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の純度は、ゲル電気泳動、高圧液体クロマトグラフィーなどを含む様々な周知の分析方法の何れかによって決定されうる。例えば、実施例に記載されるように発現される重鎖融合タンパク質は、還元SDS−PAGEで実証されるようにインタクトで、正しく会合していると示された(例えば図3を参照)。3つのバンドはおよそ分子量25000、分子量50000及び分子量75000で分離され、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の軽鎖、重鎖及び重鎖/軽鎖融合タンパク質の予測された分子量に対応する。
アッセイ
本明細書で提供されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、同定され、当技術分野で公知の様々なアッセイによってその物理的/化学的性質及び/又は生物学的活性についてスクリーニングされ、又は特徴づけることができる。
親和性アッセイ
Fc受容体又は標的抗原に対するT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の親和性を、実施例に規定される方法に従い、BIAcore機器(GE Healthcare)のような標準的器具類と、受容体又は組み換え発現により得られるもののような標的タンパク質とを用いて、プラズモン共鳴アッセイ(SPR)により決定することができる。代替的に、異なる受容体又は標的抗原に対するT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の結合は、特定の受容体又は標的抗原を発現する細胞株を用いて、例えばフローサイトメトリー(FACS)により、評価することができる。結合親和性を測定するための特定の説明的で例示的な実施態様は、後述及び以下の実施例に記載されている。
一実施態様によれば、Kは25℃でBIACORE(登録商標)T100装置(GEヘルスケア)を使用して表面プラズモン共鳴によって測定される。
Fc部分とFc受容体との相互作用を分析するために、Hisタグ付組換えFc受容体が、CM5チップ上に固定化された抗ペンタHis抗体(Qiagen社)によって捕捉され、二重特異性構築物は分析物として使用される。簡潔には、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ(CM5,GE Healthcare)を、提供者の指示書に従ってN−エチル−N’−(3−ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド塩酸塩(EDC)及びN−ヒドロキシスクシニミド(NHS)で活性化する。抗ペンタ−His抗体を、10mM酢酸ナトリウム(pH5.0)で40μg/mlに希釈した後、結合したタンパク質のおよそ6500反応単位(RU)を達成するために5μl/分の流速で注入する。リガンドの注入後、未反応群をブロックするために1Mのエタノールアミンを注入する。その後、Fc受容体を4又は10nMで60秒間捕捉する。反応速度測定のため、二重特異性構築物の4倍段階希釈(500nMから4000nM)が、HBS−EP(GE Healthcare、10mMのHEPES、150mMのNaCl、3mMのEDTA、0.05%界面活性剤P20、pH7.4)中で25℃で約30μl/分の流量で120秒間注入される。
標的抗原に対する親和性を決定するため、二重特異性構築物は、抗ペンタHis抗体について記載したように、活性化CM5センサーチップ表面に固定化されている抗ヒトFab特異的抗体(GE Healthcare)により捕捉される。結合したタンパク質の最終的な量は約12000RUである。二重特異性構築物は300nMで90秒間で捕捉される。標的抗原は、30μlの/分の流速で250〜1000nMの濃度範囲で180秒間フローセルを通過する。解離は180秒間モニターされる。
バルクの屈折率の差は、参照フローセル上で得られた応答を差し引くことにより補正される。定常状態応答を用いて、ラングミュア結合等温線の非線形曲線フィッティングによって解離定数Kを導出した。会合センサーグラム及び解離センサーグラムを同時にフィットさせることによる単純一対一ラングミュア結合モデル(simple one-to-one Langmuir binding model)(BIACORE(登録商標)T100 Evaluationソフトウェアバージョン1.1.1)を用いて、会合速度(kon)と解離速度(koff)を算出する。平衡解離定数(K)はkoff/kon比として算出される。例えば、Chen et al., J Mol Biol 293, 865-881 (1999)を参照。
活性のアッセイ
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の生物活性は、実施例に記載される様々なアッセイにより測定することができる。生物学的活性は、例えばT細胞の増殖の誘導、T細胞におけるシグナル伝達の誘導、T細胞における活性化マーカーの発現の誘導、T細胞によるサイトカイン分泌の誘導、腫瘍細胞などの標的細胞の溶解の誘導、及び腫瘍退縮の誘導及び/又は生存の改善を含み得る。
組成物、製剤、及び投与の経路
更なる態様において、本発明は、例えば下記の治療法の何れかに使用される、本明細書で提供されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の何れかを含む薬学的組成物を提供する。一実施態様では、薬学的組成物は、本明細書で提供されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の何れかと、薬学的に許容可能な担体とを含む。別の実施態様では、薬学的組成物は、本明細書に提供されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の何れか及び少なくとも一つの付加的治療剤、例えば下記のものを含む。
更に提供されるのは、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子をインビボ投与に適した形態で生成する方法であって、該方法は、(a)本発明による二T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を得ること、及び(b)T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を、少なくとも1つの薬学的に許容可能な担体で製剤化することを含み、これにより、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の調製物がインビボ投与用に製剤化される。
本発明の薬学的組成物は、薬学的に許容可能な担体中に溶解又は分散された治療的に有効な量の一又は複数のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む。「薬学的に又は薬理学的許容可能な」なる語句は、用いられる投与量及び濃度ではレシピエントに一般的に非毒性であり、すなわち、例えばヒトなどの動物に適宜投与された時に、有害な、アレルギー性の又は他の望まない応答をもたらさない分子実体及び組成物を指す。少なくとも一つのT細胞活性化二重特異性抗原結合分子と、任意選択的に付加的活性成分を含有する薬学的組成物の調製物は、本開示に照らして当業者によく知られており、Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990に例示され、出典明記によってここに援用する。更に、動物(例えば、ヒト)投与では、FDA生物学的基準局(FDA Office of Biological Standards)又は他の国の対応当局によって要求されるように、調製物が無菌性、発熱原性、一般的安全性及び純度基準を満たさなければならないことが理解される。好ましい組成物は、凍結乾燥製剤又は水溶液である。本明細書で使用される「薬学的に許容可能な担体」は、当業者に知られているありとあらゆる溶剤、緩衝液、分散媒、コーティング、界面活性剤、抗酸化剤、保存剤(例えば、抗菌剤、抗真菌剤)、等張剤、吸収遅延剤、塩、保存剤、抗酸化剤、タンパク質、薬物、薬物安定剤、ポリマー、ゲル、結合剤、賦形剤、崩壊剤、潤滑剤、甘味剤、香味剤、色素、同様な物質及びその組合せを含む(例えばRemingtonのPharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990, pp. 1289-1329を参照(出典明記によってここに援用する))。いずれの一般的な担体も、活性成分と不適合でない限り、治療的又は薬学的組成物におけるその使用が考慮される。
組成物は、それが固体、液体、又はエアロゾルの形態で投与されるかどうかに応じて、及びそれが注射のような投与経路のために無菌である必要があるかどうかに応じて、異なる種類の担体を含むことができる。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子(及び何れかの追加の治療剤)は、当業者に知られているように、静脈内に、皮内に、動脈内に、腹腔内に、病巣内に、頭蓋内に、関節内に、前立腺内に、脾臓内に、腎内に、胸膜内に、気管内に、鼻腔内に、硝子体内に、腟内に、直腸内に、腫瘍内に、筋肉内に、腹腔内に、皮下に、結膜下に、小胞内に、粘膜に、心膜内に、臍内に、眼球内に、経口で、局所的に、局在的に、吸入によって(例えば、エアロゾル吸入)、注射によって、注入によって、持続注入によって、標的細胞を浸す限局灌流によって直接、カテーテルによって、洗浄(lavage)によって、クリームにおいて、液体組成物(例えばリポソーム)において、又は他の方法によって、又は前述の何れかの組合せによって投与されうる(例えば、Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990を参照(出典明記によってここに援用する))。非経口投与、特に静脈内注入が、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子のようなポリペプチド分子を投与するために最も一般的に使用される。
非経口組成物は、注射、例えば皮下、皮内、病巣内、静脈内、動脈内、筋肉内、くも膜下腔内又は腹腔内注射による投与のために設計されたものを含む。注射では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、水溶液中、好ましくは生理学的適合した緩衝液、例えばHanks液、Ringer液、又は生理学的緩衝生理食塩水中に製剤化されうる。溶液は、懸濁、安定及び/又は分散剤などのフォーミュラトリー剤を含みうる。代替的には、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、使用前は、適切なビヒクル、例えば滅菌ピロゲンを含まない水を用いた組成に適した粉末形態であってもよい。無菌の注射可能な溶液は、必要量の本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を、必要に応じて以下に列挙する他の様々な成分を含む適切な溶媒中に取り込むことにより調製される。滅菌状態は、例えば、滅菌濾過膜を通して濾過することにより、達成することができる。通常、分散液は、基本的な分散媒体及び/又は他の成分を含有する滅菌ビヒクル中に、滅菌された様々な活性成分を取り込むことにより調製される。無菌の注射可能な溶液、懸濁液、又は乳濁液を調製するための無菌の粉末の場合、好ましい調製方法は、その直前の滅菌濾過された液体媒質から活性成分の粉末と任意の所望の追加的成分とを生む真空乾燥又は凍結乾燥技術である。液体媒質は、必要であれば適切にバッファーリングされなければならず、十分な食塩水又はグルコースを注射される前に、液体はまず希釈されて等張性にされる。組成物は、製造及び貯蔵条件下で安定でなければならず、細菌及び真菌といった微生物の汚染作用から保護されなければならない。エンドトキシンの汚染が安全レベル、例えばタンパク質1mgあたり0.5ng未満で最小限に保たれなければならない。薬学的に許容可能な適切な担体としては、限定されないが;リン酸塩、クエン酸塩及び他の有機酸のような緩衝液;アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(例えば、オクタデシルジメチオルベンジルアンモニウムクロライド;ヘキサメトニウムクロライド;塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、フェノール、ブチル又はベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えば、メチル又はプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;及びm−クレゾール);低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリジン;マンノサッカライド、ジサッカライド、及びグルコース、マンノース又はデキストリンを含む他の炭水化物;キレート剤、例えば、EDTA;糖、例えば、スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトール;塩形成対イオン、例えば、ナトリウム;金属錯体(例えば、Zn−タンパク質錯体);及び/又はポリエチレングリコール(PEG)等の非イオン性界面活性剤が挙げられる。水性注射懸濁液には、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、デキストランなどの懸濁液の粘度を上昇させる化合物が含有されていてよい。任意選択的に、懸濁液は、適切な安定剤、又は化合物の溶解度を上昇させて高濃度の溶液の調製を可能にする薬剤も含有することができる。加えて、活性化合物の懸濁液は、適切な油性注射懸濁液として調製することができる。適切な親油性溶媒又はビヒクルには、ごま油のような脂肪油、又はエチルクリート若しくはトリグリセリドのような合成脂肪酸エステルが含まれる。
活性成分は、例えばコアセルベーション技術又は界面重合法によって調製されたマイクロカプセル、例えばそれぞれヒドロキシメチルセルロースマイクロカプセル又はゼラチン−マイクロカプセル及びポリ−(メチルメタクリレート(methylmethacylate))マイクロカプセルに、コロイド薬物送達システム(例えばリポソーム、アルブミンミクロスフィア、ミクロエマルジョン、ナノ粒子、及びナノカプセル)に、又はマクロエマルジョンに封入することができる。これらの技術は、RemingtonのPharmaceutical Sciences(18th Ed. Mack Printing Company, 1990)に開示されている。徐放性製剤を調製することができる。徐放性製剤の適切な例は、ポリペプチドを含有する固体疎水性ポリマーの半透性マトリクスを含み、そのマトリックスが成形品、例えばフィルム又はマイクロカプセルの形態である。特定の実施態様では、注射可能な組成物の吸収を、例えばモノステアリン酸アルミニウム、ゼラチン、又はそれらの組合せといった吸収を遅延させる薬剤を組成物に使用することにより持続させることができる。
先に記載した組成物に加えて、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子をデポー製剤として製剤化することもできる。このような長時間作用型の製剤は、注入(例えば、皮下若しくは筋肉内)により、又は筋肉内注射により投与することができる。従って、例えば、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、適切なポリマー性若しくは疎水性物質(例えば、許容可能なオイル中の乳濁液としての)又はイオン交換樹脂を用いて、又は難溶性の誘導体として、例えば難溶性の塩として製剤化することができる。
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む薬学的組成物は、通常の混合、溶解、乳化、カプセル化、封入、又は凍結乾燥方法により製造することができる。薬学的組成物は、薬剤的使用可能な調製物へのタンパク質の加工を容易にする一又は複数の薬学的に許容可能な担体、希釈剤、賦形剤又は補助剤を使用して、一般的な方法において製剤化されうる。適当な製剤は、選択される投与経路によって決定する。
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、遊離酸又は塩基、中性又は塩形態の組成物に製剤化されうる。薬学的に許容可能な塩は、遊離酸又は塩基の生物学的活性を実質的に保った塩である。これらには、酸付加塩、例えば、タンパク質性組成物の遊離アミノ基で形成されたもの、又は例えば塩酸若しくはリン酸といった無機酸、又は酢酸、シュウ酸、酒石酸若しくはマンデル酸といった有機酸で形成されたものが含まれる。また、遊離カルボキシル基で形成される塩は、例えばナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、又は水酸化第二鉄といった無機塩基;又はイソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、又はプロカインといった有機塩基から誘導することができる。薬学的塩は、対応する遊離塩基形態より、水性及び他のプロトン性溶媒に溶け易い。
治療的方法及び組成物
本明細書において提供されるいずれのT細胞活性化二重特異性抗原結合分子も、治療法に使用することができる。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、例えばがんの治療において、免疫療法薬剤として使用することができる。
治療法での使用のために、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、良好な医療行為と一致する様式で製剤化され、投薬され、投与されるであろう。この観点において考慮すべき要因は、治療される特定の障害、治療される特定の患者、個々の患者の臨床状態、障害の原因、薬剤送達部位、投与方法、投与日程及び医療従事者が知る他の要因を包含する。
一態様では、医薬としての使用のための本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子が提供される。更なる態様では、疾患の治療において使用される本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子が提供される。特定の実施態様では、治療法において使用される本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子が提供される。一実施態様では、本発明は、それを必要とする個体の疾患の治療に使用される、本明細書に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供する。特定の実施態様では、本発明は、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の治療的有効量を個体に投与することを含む、疾患を有する個体の治療法において使用されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供する。特定の実施態様では、治療される疾患は増殖性疾患である。特定の実施態様では、疾患はがんである。特定の実施態様では、方法は更に、個体に対して少なくとも一つの付加的治療剤、例えば、治療される疾患ががんであれば抗がん剤の治療的有効量を投与することを含む。更なる実施態様では、本発明は、標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解の誘導に使用される、本明細書に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供する。特定の実施態様では、本発明は、個体に対し、標的細胞の溶解を誘導するためにT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の有効量を投与することを含む、個体の標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を誘導する方法に使用されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を提供する。上記実施態様の何れかによる「個体」は、哺乳動物、好ましくはヒトである。
更なる態様では、本発明は、医薬の製造又は調製における本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の使用を提供する。一実施態様では、医薬は、それを必要とする個体の疾患の治療を目的とするものである。更なる実施態様において、本医薬は、疾患を有する個体に対し、医薬の治療的有効量を投与することを含む、疾患を治療する方法で使用するためのものである。特定の実施態様では、治療される疾患は増殖性疾患である。特定の一実施態様では、疾患はがんである。一実施態様では、方法は更に、個体に対し、少なくとも一つの付加的治療剤、例えば、治療される疾患ががんであれば抗がん剤の治療的有効量を投与することを含む。更なる実施態様では、医薬は、標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を誘導するためのものである。また更なる実施態様では、医薬は、個体に対し、標的細胞の溶解を誘導するために医薬の有効量を投与することを含む、個体の標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を誘導する方法における使用を目的とする。上記実施態様の何れかによる「個体」は、哺乳動物、好ましくはヒトとすることができる。
更なる態様において、本発明は、疾患を治療する方法を提供する。一実施態様では、方法は、そのような疾患を有する個体に対し、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の治療的有効量を投与することを含む。一実施態様では、薬学的に許容可能な形態の本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む組成物が、前記個体に対して投与される。特定の実施態様では、治療される疾患は増殖性疾患である。特定の実施態様では、疾患はがんである。特定の実施態様では、方法は更に、個体に対して少なくとも一つの付加的治療剤、例えば、治療される疾患ががんであれば抗がん剤の治療的有効量を投与することを含む。上記実施態様の何れかによる「個体」は、哺乳動物、好ましくはヒトとすることができる。
更なる態様では、本発明は、標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を誘導する方法を提供する。一実施態様では、方法は、T細胞、特に細胞傷害性T細胞の存在下において、標的細胞に本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を接触させることを含む。更なる態様において、個体の標的細胞、特に腫瘍細胞の溶解を誘導する方法が提供される。このような一実施態様では、方法は、標的細胞の溶解を誘導するために、個体に対してT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の有効量を投与することを含む。一実施態様において、「個体」はヒトである。
特定の実施態様では、治療される疾患は増殖性疾患、特にがんである。がんの非限定的な例には、前立腺がん、脳のがん、頭部及び頸部のがん、膵臓がん、肺がん、乳がん、卵巣がん、子宮がん、子宮頚がん、子宮内膜がん、食道がん、結腸がん、結腸直腸がん、直腸がん、胃がん、前立腺がん、血液がん、皮膚がん、扁平上皮癌、骨のがん、及び腎臓がんが含まれる。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を用いて治療することができる他の細胞増殖性疾患には、限定されないが、腹部、骨、乳房、消化器系、肝臓、膵臓、腹膜、内分泌腺(副腎、副甲状腺、下垂体、睾丸、卵巣、胸腺、甲状腺)、眼、頭部及び頸部、神経系(中枢及び末梢)、リンパ系、骨盤、皮膚、軟組織、脾臓、胸部、及び泌尿生殖器系に位置する腫瘍が含まれる。前がん性の状態又は病変及びがん転移も含まれる。特定の実施態様では、がんは、腎細胞がん、皮膚がん、肺がん、結腸直腸がん、乳がん、脳のがん、頭部及び頸部のがんからなる群より選択される。当業者は、多くの場合T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は治癒をもたらさず、部分的恩恵を提供するだけであることを認識する。幾つかの実施態様では、幾つかの恩恵を有する生理的変化も治療的に有益と考えられる。従って、幾つかの実施態様では、生理的変化をもたらすT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の量は、「有効量」又は「治療的有効量」と考えられる。治療を必要とする被検体、患者、又は個体は、典型的には哺乳動物であり、具体的にはヒトである。
幾つかの実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の有効量が細胞に投与される。他の実施態様では、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の治療的有効量が、疾患の治療のために個体に投与される。
疾患の予防又は治療のために、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の適切な容量は(単独で使用されるか、或いは一又は複数の他の付加的治療剤との組み合わせで使用されるときの)、治療される疾患の種類、投与経路、患者の体重、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の種類、疾患の重症度及び経過、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子が予防又は治療いずれの目的で投与されるか、直前又は同時に行われる治療的介入、患者の病歴及びT細胞活性化二重特異性抗原結合分子に対する応答、並びに主治医の裁量によって決定される。何れの場合も、投与に責任のある実践者が、個々の被験体に対し、組成物中の活性成分の濃度及び適切な用量を決定するだろう。限定されないが、様々な時点にわたる、単一又は複数回投与、ボーラス投与、パルス注入を含む様々な投与スケジュールが本明細書で考慮される。
T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、患者に対して、単回、又は一連の治療にわたって適切に投与される。疾患の種類及び重症度に応じて、例えば一回以上の別個の投与によるか、連続注入によるかに関わらず、約1μg/kg〜15mg/kg(例えば0.1mg/kg〜10mg/kg)のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子が患者への投与のための初期候補用量となりうる。一つの典型的な一日あたり用量は、上記要因に応じて約1μg/kg〜100mg/kg又はそれ以上の範囲である。数日以上にわたる反復投与に関しては、状態に応じて、治療は一般に疾患症状の望まれる抑制が起こるまで持続されるであろう。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の一つの例示的用量は、約0.005 mg/kg〜約10mg/kgであろう。他の非限定的な例では、用量はまた、投与あたり約1マイクログラム/kg/体重から、約5マイクログラム/kg/体重、約10マイクログラム/kg/体重、約50マイクログラム/kg/体重、約100マイクログラム/kg/体重、約200マイクログラム/kg/体重、約350マイクログラム/kg/体重、約500マイクログラム/kg/体重、約1ミリグラム/kg/体重、約5ミリグラム/kg/体重、約10ミリグラム/kg/体重、約50ミリグラム/kg/体重、約100ミリグラム/kg/体重、約200ミリグラム/kg/体重、約350ミリグラム/kg/体重、約500ミリグラム/kg/体重、約1000mg/kg/体重まで又はそれ以上、及びその中で導きだされる何れかの範囲を含む。本明細書に列挙される数字から導かれる範囲の非限定的な例では、上記の数字に基づいて、約5mg/kg/体重から約100mg/kg/体重、約5マイクログラム/kg/体重から約500ミリグラム/kg/体重などが投与されうる。従って、約0.5mg/kg、2.0mg/kg、5.0mg/kg又は10mg/kgの一又は複数の用量(又はこれらの何れかの組み合わせ)を患者に投与してよい。このような用量は断続的に、例えば毎週又は3週毎(例えば患者が約2〜約20投与量、又は例えば約6投与量のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を受けるように)投与してよい。初期の高負荷用量の後、一又は複数の低用量を投与してよい。しかしながら、他の用量用法も有用でありうる。この治療法の進行は、従来の技術及びアッセイにより容易にモニタリングされる。
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は一般的に、意図した目的を達成するために有効な量において使用されるだろう。疾患状態を治療又は防止するための使用では、発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又はその薬学的組成物は、治療的に有効な量において投与又は適用される。治療的に有効な量の決定は、特にここに提供される詳細な開示の考慮のもと、十分に当業者の能力の範囲内である。
全身投与の場合、治療的に有効な用量は、まずは細胞培養アッセイのようなインビトロアッセイに基づいて推定することができる。次いで用量を、細胞培養物において決定されるIC50を含む循環濃度範囲を達成するために、動物モデルにおいて製剤化することができる。このような情報は、ヒトにおいて有用な用量を更に正確に決定するために使用することができる。
初期投与量は、インビボデータ、例えば動物モデルから、当該技術分野で周知の技術を用いて推定することもできる。当業者であれば、動物データに基づいて、ヒトへの投与を容易に最適化することができるであろう。
投与の量及び間隔は、治療効果を維持するために十分なT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の血漿レベルを提供するために個別に調整される。注射による投与のための通常の患者への投与量は、約0.1〜50mg/kg/日、典型的には約0.5〜1mg/kg/日にわたる。治療的に有効な血漿レベルは、毎日複数の用量を投与することにより達成することができる。血漿中のレベルは、例えばHPLCにより測定することができる。
局所投与又は選択的取り込みの場合、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の有効な局所濃度は血漿濃度に関連していなくともよい。当業者であれば、過度の実験をしなくとも、治療的に有効な局所投与量を最適化することができるであろう。
治療的に有効な用量のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は一般的に、実質的な毒性をもたらすことなく治療効果を提供するだろう。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の毒性及び治療効果は、細胞培養又は実験動物において標準的な標準の薬学的手順によって決定できる。LD50(集団の50%に致命的な用量)及びED50(集団の50%において治療的に有効な用量)を決定するために、細胞培養アッセイ及び動物試験を使用することができる。毒性と治療効果との用量比が治療指数であり、比LD50/ED50と表現することができる。大きな治療指数を呈するT細胞活性化二重特異性抗原結合分子が好ましい。一実施態様では、本発明によるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、高い治療指数を呈する。細胞培養アッセイ及び動物試験から得られたデータは、ヒトにおける使用に適した一定範囲の投与量の製剤化に使用することができる。投与量は、好ましくは、毒性を殆ど又は全く伴わないED50を含む、一定範囲の循環濃度内にある。投与量は、種々の要因、例えば、用いられる投与形態、使用される投与経路、被験体の状態などに応じてこの範囲内で変動しうる。正確な製剤、投与経路、及び用量は、患者の状態を考慮して個々の医師により選択されうる(例えば、Fingl et al., 1975, in:ThePharmacological Basis of Therapeutics, Ch. 1, p. 1を参照。この文献は参照により本明細書に包含される)。
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を用いて治療される患者の主治医には、毒性、器官不全などにより、いつ及びどのようにして投与を終了、中断、又は調整するかが分かるであろう。逆に、主治医は、臨床応答が十分でなかった場合には(毒性なしで)、治療レベルを上げるように調整することも分かっているであろう。対象となる障害の管理において投与される用量の大きさは、治療される状態の重症度、投与経路などによって変動する。例えば、状態の重症度は、部分的には標準の予後評価方法により評価される。更に、用量及び恐らくは投薬回数も、個々の患者の年齢、体重、及び応答により変動する。
その他の薬剤及び治療
本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、療法において、一又は複数の他の薬剤との組み合わせで投与される。例えば、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、少なくとも一つの追加的治療剤と共投与される。用語「治療剤」は、症状又は疾患を治療するために、そのような治療を必要とする個体に投与されるあらゆる薬剤を包含する。このような付加的治療剤は、治療されている特定の兆候に適したあらゆる活性成分、好ましくは、互いに打ち消し合うことのない相補的活性を有する活性成分を含む。特定の実施態様では、付加的治療剤は、免疫調節剤、細胞増殖抑制剤、細胞接着の阻害剤、細胞傷害性剤、細胞アポトーシスの活性剤、又はアポトーシス誘導因子に対する細胞の感受性を増大させる薬剤である。特定の実施態様では、追加的治療剤は、抗がん剤、例えば微小管破壊因子、抗代謝剤、トポイソメラーゼ阻害剤、DNAインターカレーター、アルキル化剤、ホルモン療法、キナーゼ阻害剤、受容体アンタゴニスト、腫瘍細胞アポトーシスの活性化因子、又は抗血管新生剤である。
このような他の薬剤は、好適には、意図した目的に有効な量で組み合わされて存在する。このような他の薬剤の有効量は、使用されるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の量、障害又は治療の種類、及び上記他の要因によって決まる。T細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、一般的に、本明細書に記載されるものと同じ用量及び投与経路において、又は本明細書に記載された用量の1%〜99%で、又は経験的に/臨床的に妥当であると決定された任意の用量及び任意の経路により使用される。
上記のこうした併用療法は、併用投与(二つ以上の治療剤が、同一又は別々の組成物に含まれている)、及び本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の投与が、付加的治療剤及び/又はアジュバントの投与の前、投与と同時、及び/又は投与の後に起きうる分離投与を包含する。本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子は、放射線療法と組み合わせて使用することもできる。
製造品
本発明の別の態様では、上述した障害の治療、予防、及び/又は診断に有用な材料を含む製造品が提供される。製造品は、容器と容器上又は容器に付随するラベル又は添付文書を含む。好適な容器は、例としてボトル、バイアル、シリンジ、IV輸液バッグなどを含む。容器はガラス又はプラスチックなどの様々な材料から形成されうる。容器は、症状の治療、予防、及び/又は診断に有効な、単独の又はその他の組成物と併用される化合物を収容し、無菌のアクセスポートを有することができる(例えば、容器は皮下注射針により穿孔可能なストッパーを有する静脈内溶液のバッグ又はバイアルであってよい)。組成物中の少なくとも一つの活性な薬剤は、本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子である。ラベル又は添付文書は、組成物が特定の症状の治療のために使用されることを示している。更に、製造品は、(a)本発明のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を包含する組成物を中に含む第一の容器;及び(b)更なる細胞障害性又はその他の治療的薬剤を中に含む組成物を含む第2の容器を含みうる。本発明の本実施態様における製造品は、組成物が特定の疾患を治療するために使用できることを示す添付文書を更に含んでいてもよい。或いは、又は加えて、製造品は、薬学的に許容可能な緩衝液、例えば注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝化塩水、リンガー溶液及びデキストロース溶液を含む第二(又は第三)の容器を更に含んでもよい。これは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、及びシリンジを含む、商業的に及びユーザーの立場から望まれる他の物質を更に含んでもよい。
以下は、本発明の方法及び組成物の実施例である。上に提供された一般的な説明を前提として、他の様々な実施態様が実施されうることが理解される。
一般的方法
組換えDNA技術
Sambrook et al., Molecular cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989に既述されるように、標準的な方法がDNAを操作するために使用された。分子生物学的試薬を、製造元の指示に従って使用した。ヒト免疫グロブリンの軽鎖及び重鎖のヌクレオチド配列に関する一般情報は以下に与えられている: Kabat, E.A. et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, 第5版、NIH出版番号91-3242。
DNA配列決定
DNA配列は、二本鎖配列決定により決定された。
遺伝子合成
所望の遺伝子セグメントは、必要に応じて、適切なテンプレートを用いてPCRによって生成するか、又は自動化された遺伝子合成による合成オリゴヌクレオチド及びPCR生成物からGeneart AG(Regensburg、Germany)により合成した。正確な遺伝子配列が入手可能でない場合、最も近いホモログ由来の配列に基づいてオリゴヌクレオチドプライマーを設計し、適切な組織を起源とするRNAからRT−PCRによって遺伝子を単離した。特異的な制限エンドヌクレアーゼ切断部位に隣接する遺伝子セグメントを、標準のクローニング/シーケンシングベクター中にクローニングした。形質転換した細菌からプラスミドDNAを精製し、UV分光法により濃度を決定した。サブクローニングされた遺伝子断片のDNA配列を、DNA配列決定によって確認した。遺伝子セグメントは、それぞれの発現ベクター中へのサブクローニングを可能にする適切な制限部位を用いて設計された。すべての構築物は、真核細胞内の分泌のためにタンパク質を標的とするリーダーペプチドをコードする5’末端DNA配列を含むように設計された。
実施例1
電荷修飾を有する及び有しないT細胞二重特異性(TCB)抗体の調製(抗CD20/抗CD3)
以下の分子がこの実施例で調製され、その模式図を図2に示す:
A.電荷修飾を有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にCH1/CL交換)(図2A、配列番号14−17)
B.電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾)(図2B、配列番号18−21)
C.電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾)(図2C、配列番号32、19−21)
D.電荷修飾を有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換)(図2D、配列番号33、15、17、21)
E.電荷修飾を有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH−CH1/VL−CL交換)(図2E、配列番号34、15、17、35)
F.電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD20結合剤中にVH/VL交換、CD3結合剤中に電荷修飾)(図2F、配列番号36−39)
G.電荷修飾及びFc領域におけるDDKK突然変異を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾)(図2G、配列番号40、41、20、21)
H.電荷修飾を有する「1+1 CrossMab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾)(図2H、配列番号42、43、20、21)
I.電荷修飾を有する「1+1 CrossMab」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾、異なるCD20結合剤、異なるCD20結合剤)(図2I、配列番号43−45、21)
J.電荷修飾213E、123Rを有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換、CD20結合剤中に電荷修飾)(図2J、配列番号69−71、21)
K.電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」(CD3結合剤中にVH/VL交換及び電荷修飾)(図2K、配列番号15、17、72、73)
重鎖及び軽鎖DNA配列の可変領域を、それぞれのレシピエント哺乳動物発現ベクター中に予め挿入された定常重鎖又は定常軽鎖とインフレームでサブクローニングした。タンパク質の発現はMPSVプロモーターによって駆動され、合成ポリAシグナル配列は、CDSの3’末端に位置する。加えて、各ベクターはEBV OriP配列を含む。
分子は、ポリエチレンイミン(PEI)を使用して懸濁液中で増殖するHEK293−EBNA細胞に哺乳動物発現ベクターをコトランスフェクトすることにより生成された。細胞は、対応する発現ベクターを1:2:1:1の比で用いて(A:「ベクター重鎖(VH−CH1−VH−CL−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VL−CL)」:「ベクター重鎖(VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VL−CH1)」;B、D、G、J、K:「ベクター重鎖(VH−CH1−VL−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VL−CL)」:「ベクター重鎖(VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VH−CL)」:C:「ベクター重鎖(VL−CH1−VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VL−CL)」:「ベクター重鎖(VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VH−CL)」:E:「ベクター重鎖(VH−CH1−VL−CL−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VL−CL)」:「ベクター重鎖(VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VH−CH1)」:F:「ベクター重鎖(VL−CH1−VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VH−CL)」:「ベクター重鎖(VL−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VH−CH1)」)トランスフェクトされ、又は1:1:1:1の比で用いて(H、I:「ベクター重鎖(VL−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VL−CL)」:「ベクター重鎖(VH−CH1−CH2−CH3)」:「ベクター軽鎖(VH−CL)」)トランスフェクトされた。
トランスフェクションのために、HEK293 EBNA細胞を、6mMのL−グルタミン及び250mg/lのG418を含む無血清のExcell培養液中で懸濁状態で培養した。600mlのチューブスピンフラスコ(最大作業容量400ml)内での生成のために、6億個のHEK293 EBNA細胞をトランスフェクションの24時間前に播種した。トランスフェクションのため、細胞を、210×gで5分間遠心分離し、上清を20mlの予め温めたCD CHO培地で置換した。発現ベクターを20mlのCD CHO培地中で最終的に400μgのDNAの量まで混合する。1080μlのPEI溶液(2.7μg/ml)を加えた後、混合物を15秒間ボルテックスし、その後室温で10分間インキュベートした。その後細胞を、DNA/PEI溶液と混合し、600mlのチューブスピンフラスコに移し、5%CO雰囲気のインキュベーター内において37℃で3時間インキュベートした。インキュベーション後、360mlのExcell+6mMのL−グルタミン+5g/LのPepsoy+1.0mMのVPA培地を加え、細胞を24時間培養した。トランスフェクションの1日後、7%のFeed 1(Lonza)を添加した。7日後、3600×gで20〜30分間の遠心分離(Sigma 8K遠心分離機)によって培養物の上清を精製のために収集し、溶液を滅菌濾過し(0.22mmのフィルター)、最終濃度0.01%w/vのアジ化ナトリウムを加えた。溶液を4℃で維持した。
培養培地中の構築物の濃度は、プロテインA−HPLCによって決定した。分離の基礎は、pH8.0でのプロテインAに対するFc含有分子の結合及びpH2.5からの段階的溶出であった。2つの移動相があった。これらは異なるpH(8及び2.5)に調整した以外は同じであるトリス(10mM)−グリシン(50mM)−NaCl(100mM)緩衝液であった。カラム本体は、POROS 20Aを充填した約63μlの内部容量を有するUpchurch 2×20mmプレカラムであった。平衡化された物質上に100μlの各試料を0.5ml/分の流速で注入した。0.67分後、試料をpH2.5までのpHステップで溶出した。定量は、280nm吸光度の測定及び16〜166mg/lのヒトIgG1の濃度範囲を有する標準曲線を用いた計算によって行った。
分泌タンパク質は、プロテインA親和性クロマトグラフィーを用いた親和性クロマトグラフィー、続いてサイズ排除クロマトグラフィー工程によって細胞培養上清から精製した。親和性クロマトグラフィーのために、25mMの20mMリン酸ナトリウム、20mMのクエン酸ナトリウム、pH7.5で平衡化したHiTrap ProteinA HPカラム(CV=5mL、GE Healthcare)に上清をロードした。非結合タンパク質は、少なくとも10カラム容量の20mMリン酸ナトリウム、20mMクエン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム、pH7.5で洗浄し、続いて6カラム容量の10mMリン酸ナトリウム、20mMクエン酸ナトリウム、0.5M塩化ナトリウム、pH5.45を用いた追加の洗浄工程により除去した。次いで、カラムを20mlの10mMのMES、100mM塩化ナトリウム、pH5.0で洗浄し、標的タンパク質は、6カラム容量の20mMクエン酸ナトリウム、100mM塩化ナトリウム、100mMグリシン、pH3.0で溶出した。タンパク質溶液を、1/10の0.5Mリン酸ナトリウム(pH8.0)を加えることにより中和させた。標的タンパク質を、濃縮し、濾過した後、20mMヒスチジン、140mM塩化ナトリウム、0.01%のTween−20、pH6.0で平衡化したHiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)にロードした。分子Aは、100%の最終モノマー含量を達成するために、追加の分取サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)工程によって精製しなければならなかった。従って、第1のサイズ排除工程からのモノマー含量の高い画分をプールし、濃縮し、再びHiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)にロードした。この追加の精製工程は、他の分子については必要ではなかった(副生成物プロファイルに依存するが、画分の貯留、従って第1のサイズ排除クロマトグラフィー後の回収はこれらの分子について異なっていた)。
分子の純度及び分子量は、還元剤の非存在下でのSDS−PAGEによる第1精製工程(プロテインA親和性クロマトグラフィー)及びクーマシー(SimpleBlueTM SafeStain、Invitrogen)での染色後に分析した。製造元の指示(4−12%のTris−Acetateゲル又は4−12%のBis−Tris)に従って、NuPAGE(登録商標)Pre−Castゲルシステム(Invitrogen、USA)を使用した。
精製されタンパク質試料のタンパク質濃度を、アミノ酸配列に基づいて計算されたモル吸光係数を用いて、280nmにおける光学濃度(OD)を測定することにより決定した。
最終精製工程後に分子の純度及び分子量が、還元剤の存在下及び非存在下において、CE−SDS分析により分析された。Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper lifescience)を、製造元の指示に従って使用した。2μgの試料を分析に使用した。
抗体試料の凝集物含有量を、25mMのKHPO、125mMのNaCl、200mMのL−アルギニン一塩酸塩、0.02%(w/v)のNaN(pH6.7、25℃のランニング緩衝液)中において、TSKgel G3000 SW XL分析用サイズ排除カラム(Tosoh)を用いて分析した。
全ての分子は、(上記のように、追加のSEC工程に供された分子Aを除いて)同じ方法に従って生成され精製された。
分子Aは、最初の分取サイズ排除クロマトグラフィーの後に高い凝集物含有量を示した。この精製工程後の凝集物の含有量は、高分子量不純物とモノマー画分とのベースライン分離がなかったために決定できなかった。100%のモノマー物質を得るためには、追加の分取サイズ排除クロマトグラフィー工程が必要であった。分子Bは、1回の分取サイズ排除クロマトグラフィーの後に100%モノマーであった。
上清中の濃度は分子Aの方が高かったが、最終収率は(高い凝集物含有量に起因して)分子Bよりも2.3倍低かった(表2)。
CE−SDS分析によって示される最終純度は、分子Aよりも分子Bのほうが高かった(表3、図3A及びB)。図3M及び3Nは、分子Aが分子Bと比較して広いピークを有するSEC精製工程(分取SEC)のクロマトグラムを示しており、SECにロードされた分子Aの調製物は均一ではなく、他方分子Bの調製物は大部分モノマー性であることを示している。
分子Cは高力価で生成することができたが、分子Bと比較して、適用されたクロマトグラフィー法により完全に除去することができなかった高含有量の副生成物に起因して、最終回収率は低かった(表2;表3;図3B及びJ、並びに図3C及びK)。図3B及び3Kに示すように、プロテインA精製工程後のSDS−PAGE分析は分子Bの副生成物を示さなかったが、一方分子Cの調製物は100kDaの見かけの分子量で現れる幾つかの副生成物を含有している。
分子Dは、抗CD20 Fab中に荷電残基が存在しない場合にのみ、分子Bとは異なる。この分子は、高力価で一時的に生成することもできるが、分子Cについて既に記載したように、分析SECで示される最終品質(分子Dについては98%のモノマーに対して、分子Bについては100%のモノマー)及び回収率は副生成物の高い含有量に起因して分子Bよりも低かった(表2;表3;図3B及びJ並びに図3D及びL)。図3J及び3Lに示すように、プロテインA精製工程後のSDS−PAGE分析は分子Bの副生成物を示さなかったが、一方分子Dの調製物は66kDa及び40kDaの見かけの分子量で現れる幾つかの副生成物を含有している。図3N及び3Oは、分子Dが分子Bと比較して広いピークを有するSEC精製工程(分取SEC)のクロマトグラムを示しており、SECにロードされた分子Dの調製物は均一ではなく、他方分子Bの調製物は大部分モノマー性であることを示している。
また、分子Eの生成物の力価は高かったが、分析用SEC及びキャピラリー電気泳動によって示されるように(表2;表3;図3E)、最終生成物は依然として低分子量不純物を含有していた。
分子Bとは対照的に、分子Fは腫瘍標的結合部分のFab上でVH−VL交換を有するが、電荷修飾は抗CD3 Fabに導入されている。この分子は高力価でも生産することができたが、最終回収率は副生成物に起因して低かった。抗CD20/抗CD3 TCBについては、抗CD20 Fabにおいて電荷修飾を有するフォーマットが、生成及び精製に関して好ましい。
分子Gは、「ノブ−イントゥ−ホール」変異を置き換える、Fc領域における電荷修飾を有する分子である(「DD」=K392D;K409D;(Fcドメインのサブユニットの1つにおいて)、「KK」=D356K;D399K(Fcドメインの他方のサブユニットにおいて)(EUの番号付け))。二重特異性分子の生成は、1つの重鎖に2つのアスパラギン酸残基を導入し、第2の重鎖に2つのリジン残基を導入することによって促進される(図2G)。この分子は高力価で生成することができたが、分析用SEC及びキャピラリー電気泳動によって示されるように、最終生成物は依然として幾つかの高分子量及び低分子量不純物を有しており(表2;表3)、一方「ノブ−イントゥ−ホール」変異を保有する同じ分子(分子B)については、副生成物を完全に除去することができた。
分子Iは、CD20結合剤において分子Hと異なり、分子Hと比較して最終分取サイズ排除クロマトグラフィー後に高い凝集物含有量を示した。CE−SDS分析によって示される最終純度は、分子Iよりも分子Hのほうが高かった(表3、図3H及びI)。また、分子Hの回収率は、分子Iの回収率よりも40%高かった(表2)。この結果は、分子の品質がT細胞二重特異性フォーマットで使用される抗体にも依存することを示している。
分子J及び分子Kの生成物は、良好な収率をもたらした良好な初期力価を有していた。しかし、両方の分子について約20%の最終回収率は、分子Bで達成された48%を大幅に下回っていた(表2)。両方の分子は、>99%のモノマー含有量を有する最終品質で類似している(表2)。非還元CE−SDSの純度は、分子J(これは、CLドメインの124位及びCH1ドメインの147位で電荷修飾を欠いている)についてはほぼ99%であり、90%である分子K(電荷修飾を有しCD3結合剤中にVL−VH交換を有する)より良好である(表3、図3N及び3O)。分子Jは、親和性クロマトグラフィー後の濃縮工程中に一部沈殿を示した。分子Kは、CD20結合FabよりむしろCD3結合CrossFabにおいて電荷修飾を有する。これは、CE−SDSによって示されるように、最終品質に影響を及ぼす(表3、図30)。品質の違いは、SDS−Pageの最初の精製工程後にほとんど見ることができる(図3P、3Q)。分子Kは、分子Jよりも150kDa及び70kDa(半分の分子及び構築物はおそらく軽鎖を失っている)でより多くの副生成物を含有する。両方の分子は、分子Bと同様の熱安定性を有する(表4)。
抗CD20/抗CD3 TCBについては、抗CD20 Fab上に電荷修飾を有する「反転型」バージョン(分子B)は、最も高い回収率及び最終品質で生成することができるフォーマットである。
LC−MS分析による分子量確認
脱グリコシル化
分子の均一な調製を確認するために、最終のタンパク質溶液をLC−MS分析によって分析した。糖によって導入された不均一性を除去するために、構築物をPNGaseFで処理した。この目的のために、タンパク質溶液のpHを、濃度0.5mg/mlのタンパク質20μgに2μlの2MのTrisを加えることによってpH7.0に調整した。0.8μgのPNGaseFを添加し、37℃で12時間インキュベートした。
LC−MS分析−オンライン検出
LC−MS法は、TOF 6441質量分析計(Agilent)に連結されたAgilent HPLC 1200で行った。クロマトグラフィー分離はMacherey Nagel Polystyreneカラム;RP1000−8(8μm粒子サイズ、4.6×250mm;カタログ番号719510)で行った。溶離液Aは5%アセトニトリル及び0.05%(v/v)ギ酸の水溶液であり、溶離液Bは95%アセトニトリル、5%水及び0.05%ギ酸であった。流速は1ml/分であり、分離は40℃で、前に記載した処理で得られた6μg(15μl)のタンパク質試料を用いて行った。
最初の4分間、質量分析計の塩汚染を防ぐために、溶出液は廃棄物へ送られた。ESI源は、12l/分の乾燥ガス流、350℃の温度及び60psiのネブライザー圧力で運転していた。MSスペクトルは、陽イオンモードで、380Vのフラグメンター電圧及び700〜3200m/zの質量範囲を用いて取得した。MSデータは、計器のソフトウェアによって4〜17分で取得される。
分子Aの調製物は、誤対合した軽鎖及び微量の遊離又は連結した軽鎖を有する約10−15%の分子を有していた。分子Bの調製物は、2つのCD3軽鎖を含む微量の分子を有していた。遊離軽鎖や連結軽鎖などの不純物は検出できなかった(表2)。
静的光散乱による熱安定性
熱安定性は、静的光散乱(SLS)によって及び適用された温度ストレスに応答する内因性タンパク質の蛍光を測定することによってモニターした。
1mg/mlのタンパク質濃度を有する30μgの濾過されたタンパク質試料を、Optim2(Avacta Analytical Ltd;GB)に二通りに適用した。温度を25℃から85℃まで0.1℃/分で上昇させ、半径及び全散乱強度を収集した。固有のタンパク質蛍光の測定のために、試料を295nmで励起し、発光を266と473nmの間で収集した。
全ての分子について熱安定性を測定した。結果を表4に示す。温度勾配を適用した後に動的光散乱によって測定された凝集温度(TAgg)及びタンパク質蛍光によって測定された融解温度(T)は54−58℃の範囲のTAgg及び56−60℃の範囲のTを有する全ての分子に匹敵した(表4)。
抗CD3/抗CD20 TCB抗体のCD3及びCD20への結合
ヒトCD3発現Jurkat細胞を用いて、電荷残基を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 T細胞二重特異性(TCB)抗体(上記の分子「A」及び「B」)のCD3への結合を測定した。CD20への結合は、ヒトCD20発現Z−138細胞を用いて測定した。懸濁細胞を回収し、PBSで1回洗浄し、Vicellを用いて生存率及び細胞密度を決定した。懸濁細胞を2×10細胞/mlでFACS緩衝液に再懸濁した。100μlの細胞懸濁液を96穴丸底プレートに播種した。各工程は4℃で行った。プレートを360×gで5分間遠心分離し、上清を除去した。抗体希釈液をPBS/0.1%BSA中で調製した。30μlの希釈抗CD3/抗CD20 TCB抗体又はFACS緩衝液をウェルに添加し、細胞を4℃で30分間インキュベートした。インキュベーション後、1ウェルあたり120μlのFACS緩衝液を添加し、プレートを350xgで5分間遠心分離し、上清を除去した。洗浄工程を1回繰り返した。プレートレイアウトに示されているように、30μlの予め希釈した二次抗体をウェルごとに添加した。プレートを4℃で更に30分間インキュベートした。インキュベーション後、1ウェルあたり120μlのFACS緩衝液を添加し、プレートを350xgで5分間遠心分離し、上清を除去した。洗浄工程は、この1回の洗浄工程の直後に固定されたJurkat細胞を含むプレートを除き、全てのプレートについて1回繰り返された。1ウェルあたり100μlのBD固定化緩衝液(#BD Biosciences、554655)を用いて細胞を4℃で20−30分間固定した。細胞をBD FACS CantoIIを用いたFACS測定のために80μl/ウェルのFACS緩衝液に再懸濁した。
この実験の結果を図4に示す。
抗CD3/抗CD20 TCB抗体によって誘導されたCD20発現腫瘍標的細胞のT細胞媒介性死滅時の腫瘍細胞溶解とCD4及びCD8T細胞活性化
Z−138及びNalm−6腫瘍細胞について、電荷修飾を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 TCB抗体(上記の分子「A」及び「B」)によって誘導された標的細胞のT細胞媒介性死滅及びT細胞の活性化を評価した。ヒトPBMCをエフェクターとして使用し、二重特異性抗体とのインキュベーションの22時間後に死滅並びにT細胞活性化を検出した。簡潔には、標的細胞を回収し、洗浄し、丸底96ウェルプレートを用いて30,000細胞/ウェルの密度で蒔いた。末梢血単核細胞(PBMC)は、健常なヒトドナーからの新鮮な血液のHistopaque密度遠心分離によって調製した。新鮮血を滅菌PBSで希釈し、Histopaqueグラジエント上に重ねた(Sigma、H8889)。遠心分離(450xg、30分間、室温)後、PBMC含有相間の上の血漿を棄て、PBMCを新しいFalconチューブに移し、その後50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離(400xg、10分間、室温)し、上清を棄て、PBMCペレットを滅菌PBSを用いて2回洗浄した(遠心分離工程:350xg、10分間)。その結果得られたPBMCの集団を自動カウントし(ViCell)、細胞インキュベーター内において(37℃、5%CO)10%のFCS及び1%のL−アラニル−L−グルタミン(Biochrom、K0302)を含有するRPMI1640培地中に、更なる使用まで(24時間以内)貯蔵した。死滅アッセイのために、指示された濃度で(1000pM〜0.1pMの範囲で3通りに)抗体を添加した。最終E:T比6:1でPBMCを標的細胞に添加した。インキュベーション後、プレートを420xgで4分間遠心分離し、LDH検出のために50μl/ウェルを新しい96平底プレートに移した。LDH検出は、細胞毒性検出キット(Roche#11644793001)を製造者の指示に従って使用して行った。残りの細胞を0.1%BSAを含むPBSで洗浄した。CD8(APCCy7抗ヒトCD8、Biolegend#301016)、CD4(FITC抗ヒトCD4、Biolegend#300506)、CD69(BV421抗ヒトCD69、Biolegendの#310930)及びCD25(PECy7抗ヒトCD25、Biolegend#302612)の表面染色を供給者の指示に従って行った。4℃で30分後、細胞を0.1%BSAを含む150μl/ウェルのPBSで2回洗浄し、100μl/ウェルの2%PFAを用いて固定した。測定は、BD FACS CantoIIを用いて行った。
この実験の結果を図5、6及び7に示す。両方の分子は、腫瘍細胞溶解及びT細胞活性化に関して同等の活性を示す。
ヒト全血中の抗CD3/抗CD20 TCB抗体によって誘導された健常ヒトB細胞のT細胞媒介死滅時のB細胞枯渇とCD4+及びCD8+T細胞活性化
健常ドナーからのヒト全血を、示された濃度で(50000pM〜1pMの範囲で3通りに)、電荷修飾を有する又は有しない抗CD3/抗CD20 TCB抗体(上記の分子「A」及び「B」)とともにインキュベートした。22時間後、血液を混合し、35μlを、CD8(APCCy7抗ヒトCD8、Biolegend#301016)、CD4(FITC抗ヒトCD4、Biolegend#300506)、CD69(BV421抗ヒトCD69 Biolegend#310930)、CD25(PECy7抗ヒトCD25、Biolegend#302612)、CD22(APC抗ヒトCD22、Biolegend#302510)及びCD45(PerCPCy5.5抗ヒトCD45、Biolegend#304028)を含有する20μlのFACS抗体混合物を用いた染色のために収集した。室温で15分間インキュベートした後、血液をFACS Lysing溶液(BD、#349202)で固定し、フローサイトメトリーで分析した。B細胞枯渇を、B細胞数とCD4+T細胞数との比に基づいて計算し、未処理サンプルを0%B細胞枯渇に設定した。
この実験の結果を図8及び9に示す。両方の分子は、全血におけるB細胞枯渇及びT細胞活性化に関して同等の活性を示す。
ヒトCD20及びCD3発現標的細胞に対する抗CD3/抗CD20 TCB抗体の結合
上記の分子「B」として示される抗CD3/抗CD20 TCB抗体の結合を、ヒトCD20発現びまん性大細胞型B細胞性リンパ腫(DLBCL)細胞株(WSU DLCL2、0.5−1x10CD20結合部位)及びCD3発現不死化Tリンパ細胞株(Jurkat)に対して試験した。簡潔には、細胞を回収し、計数し、生存率を確認し、FACS緩衝液(PBS 0.1%BSA)中に1.5×10細胞/mlで再懸濁した。100μlの細胞懸濁液(0.15x10個の細胞を含有)を、漸増濃度のCD20 TCB(50pM−200nM)と共に丸底96ウェルプレート中で30分間4℃でインキュベートし、冷PBS 0.1%BSAで2回洗浄し、希釈されたPE−コンジュゲートAffiniPure F(ab’)2断片ヤギ抗ヒトIgG Fcγ断片特異的二次抗体(Jackson Immuno Research Lab PE #109−116−170)と共に更に30分間4℃で再インキュベートし、冷PBS 0.1%BSAで2回洗浄し、2%PFAの添加により固定し、FSC/SSCゲーティングにより分析から死細胞を除外してFACS CantoII(Software FACS Diva)を用いてFACSにより分析した。
結果を図10A(WSU DLCL2細胞への結合)及び図10B(Jurkat細胞への結合)に示す。結合曲線及び結合に関連するEC50値をGraphPadPrism5を用いて計算した。EC50値は0.98nM(CD20発現WSU DLCL2細胞への二価結合)及び約12.5nM(CD3発現Jurkat細胞への一価結合)であった。
ヒト及びカニクイザルCD20及びCD3発現標的細胞に対する抗CD3/抗CD20 TCB抗体の結合
ヒト及びカニクイザルCD20発現B細胞並びにCD3発現CD4及びCD8 T細胞への結合を評価することにより、上記の分子「B」として示される抗CD3/抗CD20 TCB抗体の交差反応性を評価した。簡潔には、健常ドナーからのヘパリン処理されたヒト及びカニクイザルの血液を、密度遠心分離によってPBMCを単離するために使用した。単離されたPBMCはカウントされ、生存率をチェックされて、FACS緩衝液(100μlのPBS 0.1%のBSA)中、1mlあたり4x10個の細胞で再懸濁された。100μlの細胞懸濁液(0.4×10細胞を含む)を96ウェルのU底プレートに播種し、遠心分離した(420×g、4分)。上清を除去した後、PBMCを漸増濃度のCD20 TCB−AlexaFlour488(200pM−200nM)とともに4℃で30分間インキュベートし、冷PBS 0.1%BSAで2回洗浄し、ヒト/カニクイザル交差反応性抗体:抗CD19(社内、クローン8B8)−AlexaFluor647、抗CD4(BD、#552838、クローンL200)−PerCPCy5.5及び抗CD8(BD、#555367、クローンRPA−T8)−PEとともに更に30分間4℃で再インキュベートした。30分後、PBMCを冷PBS 0.1%BSAで2回洗浄し、FACS溶解溶液(BD、#349202)で処理した後、FACS CantoII(Software FACS Diva)を用いてFACS分析を行った。GraphPadPrism5を用いて結合曲線を得た。
結果を図11A(ヒト及びカニクイザルB細胞への結合)、図11B(ヒト及びカニクイザルCD4T細胞への結合)及び図11C(ヒト及びカニクイザルCD8 T細胞への結合)に示す。GraphPadPrism5を用いて計算したCD20発現B細胞への結合に関連するEC50値は、4.8nM(ヒトB細胞)及び3.3nM(カニクイザルB細胞)であった。
異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによって媒介される腫瘍細胞溶解
異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマット(上記の分子「B」、「A」「C」及び「H」)によって媒介される腫瘍細胞溶解を、Z138細胞(マントル細胞リンパ腫、0.06−0.23×10個のCD20結合部位)で評価した。ヒトPBMCをエフェクターとして使用し、異なる二重特異性抗体フォーマットとのインキュベーションの21〜24時間で腫瘍溶解が検出された。簡潔には、標的細胞を回収し、洗浄し、U底96ウェルプレートを用いて50000細胞/ウェルの密度で蒔いた。末梢血単核細胞(PBMC)は、健常なヒトの血液のHistopaque密度遠心分離によって調製した。新鮮血を滅菌PBSで希釈し、Histopaqueグラジエント上に重ねた(Sigma、H8889)。遠心分離(450xg、30分間、室温、ブレーキ無し)後、PBMC含有相間上の血漿を棄て、PBMCを新しいファルコンチューブに移し、その後50mlのPBSで満たした。混合物を遠心分離(350xg、10分間、室温)し、上清を棄て、PBMCペレットを滅菌PBSを用いて洗浄した(300xg、10分間)。その結果得られたPBMCの集団を自動カウントし(ViCell)、細胞インキュベーター内において、37℃、5%COで10%のFCS及び1%のL−アラニル−L−グルタミン(Biochrom、K0302)を含有するRPMI1640培地中に、更なる使用まで(24時間以内)保管した。腫瘍溶解アッセイのために、抗体を示された濃度で(0.1pM〜1nMの範囲で3通りに)抗体を添加した。最終E:T比6:1でPBMCを標的細胞に添加した。37℃、5%COでの21〜24時間のインキュベーション後に、アポトーシス/壊死細胞により細胞上清中に放出されたLDHの定量によって(LDH検出キット、Roche Applied Science、#11 644 793 001)、腫瘍細胞溶解を評価した。標的細胞の最大溶解(=100%)が、1%Triton X−100と共になされた標的細胞のインキュベーションにより達成された。最小溶解(=0%)は、二重特異性構築物なしでエフェクター細胞と共にコインキュベートした標的細胞を指す。
図12は、異なるCD20 TCB抗体フォーマットが、CD20+標的細胞の強力で標的特異的な溶解を誘導することを示す。パネルAは、「CD20 TCB_2+1_電荷あり、反転型」(上記の分子「B」)が「CD20 TCB_2+1_電荷なし、反転型」(上記の分子「A」)に匹敵する活性を示し、どちらも「CD20 TCB_1+1_電荷あり」フォーマット(上記の分子「H」)よりも強力であることを示している。パネルBは、「CD20 TCB_2+1_電荷あり、反転型」(上記の分子「B」)が「CD20 TCB_2+1_電荷あり、古典型」フォーマット(上記の分子「C」)よりも強力であることを示している。GraphPadPrism5を用いて計算された死滅アッセイに関するEC50値を表5に示す。
異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによって媒介される腫瘍細胞溶解及びその後のT細胞活性化
3種の異なる健常ドナー由来のヒトPBMCを用いて、異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマット(上記の分子「B」及び「H」)によって媒介される腫瘍細胞溶解を更にZ138細胞(マントル細胞リンパ腫)において並びにDLBCL株(OCI Ly−18(0.06−0.2×10個のCD20結合部位)、Ramos(0.1−0.4×10個のCD20結合部位)、SU−DHL−5(0.13−0.21×10個のCD20結合部位)、SU−DHL−8(アッセイの検出限界未満のCD20結合部位)、Toledo(0.02×10個のCD20結合部位)及びU2932(0.09−0.4×10個のCD20結合部位)細胞株を含む)の広範なパネルにおいて評価した。腫瘍細胞回収、PBMC単離及びアッセイ条件は、前の実施例に記載したものと同一であった。図13A〜Cに示すアッセイのE:T比は6:1であり、図13Dに示すアッセイでは3:1であった。37℃、5%COでの21時間のインキュベーション後に、アポトーシス/壊死細胞により細胞上清中に放出されたLDHの定量によって(LDH検出キット、Roche Applied Science、#11 644 793 001)、腫瘍細胞溶解を評価した。腫瘍細胞溶解時に生じるT細胞活性化の評価のために、PBMCを丸底96ウェルプレートに移し、400xgで5分間遠心分離し、0.1%BSAを含むPBSで2回洗浄した。CD8(APCCy7抗ヒトCD8、Biolegend#301016)、CD4(FITC抗ヒトCD4、Biolegend#300506)及びCD25(PECy7抗ヒトCD25、Biolegend#302612)の表面染色を供給者の指示に従って行った。細胞を、0.1%のBSAを含有する150μl/ウェルのPBSを用いて2回洗浄し、2%PFA又はFACS溶解溶液(BD、#349202)を用いて固定した。試料をBD FACS CantoIIで分析した。
図13は、異なるドナー由来のPBMCを用いた腫瘍細胞溶解(パネルA、D)及びT細胞活性化(パネルB、C)の両方の検出によって評価されるように、「CD20 TCB_2+1_電荷あり、反転型」抗体フォーマット(上記の分子「B」)は、「CD20 TCB_1+1」抗体フォーマット(上記の分子「H」)よりも強力であることを示している。Z138細胞の腫瘍溶解及びT細胞活性化に関連するEC50値を表6aに示す。DLBCL細胞株のパネルの腫瘍溶解アッセイに関連するEC50値を表6bに示す。EC50値はGraphPadPrism5を用いて計算した。
異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットによって媒介されるヒト全血におけるB細胞枯渇
異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマット(上記の分子「B」及び「H」)及びオビヌツズマブによって媒介される正常なB細胞枯渇を、健常ボランティアからの新鮮なヒト血液を用いて更に評価した。簡潔に述べると、新鮮な血液をヘパリン含有シリンジに採取した。血液アリコート(180μL/ウェル)を、TCB又は抗体希釈液(10μL/ウェル+10μL/ウェルのPBS)を補充した96穴のウェルプレートに入れ、加湿した細胞インキュベーター内で37℃、5%CO下で24時間インキュベートした。インキュベーション後、血液をピペットで上下に混合し、35μL血液アリコートを96ウェルU底プレートに移し、フローサイトメトリー用に全部で55μLの容量の蛍光抗CD45(APC、Biolegend、#304037)抗CD4(PerCPCy5.5、BD、#552838)、抗CD8(APCCy7、Biolegend、#301016)、抗CD19(PE、Biolegend、#302208)、抗CD25(PECy7、Biolegend、#302612)及び抗CD69(BV421、Biolegend、#310930)と共にインキュベートした。室温(暗所)で15分間インキュベートした後、フローサイトメトリーの前に赤血球を枯渇させ、細胞を固定するために、180μL/ウェルのFACS溶解溶液(BD Biosciences)を添加した。
図14は、CD20 TCB_2+1_電荷あり、反転型(分子B)は、オビヌツズマブ(Gazyva)及びCD20 TCB_1+1_電荷あり(分子H)の双方よりも正常なB細胞を枯渇させる点において強力であることを示す。
Jurkat−NFATレポーターアッセイを用いたCD3下流シグナル伝達の強度の定量化によって評価されるT細胞の活性化
CD20発現腫瘍標的細胞とJurkat−NFATレポーター細胞(NFATプロモーターを有するCD3発現ヒト急性リンパ性白血病レポーター細胞株、GloResponse Jurkat NFAT−RE−luc2P、Promega #CS176501)の共培養を用いて、T細胞架橋及びその後のT細胞活性化を誘導する異なる抗CD20/抗CD3 TCB抗体フォーマットの能力を評価した。CD20抗原(腫瘍細胞上で発現される)及びCD3抗原(Jurkat−NFATレポーター細胞上で発現される)に対する抗CD20/抗CD3 TCBの同時結合の際に、NFATプロモーターが活性化され、活性ホタルルシフェラーゼの発現へと導く。発光シグナルの強度(ルシフェラーゼ基質の添加時に得られる)は、CD3の活性化及びシグナル伝達の強度に比例する。Jurkat−NFATレポーター細胞は懸濁液中で増殖し、RPMI1640、2μg/lグルコース、2g/lのNaHCO、10%FCS、25mMのHEPES、2mMのL−グルタミン、1xNEAA、1×ピルビン酸ナトリウム、200μg/mlのハイグロマイシン中、0.1−0.5mio細胞/mlで培養された。アッセイのために、腫瘍標的細胞(Z138)を回収し、ViCellを用いて生存率を決定した。50μl/ウェルの希釈抗体又は培地(対照用)を標的細胞に添加した。平底白い壁96ウェルプレート(#655098、Greiner bio−one)に20000細胞/ウェルを蒔いた。続いて、Jurkat−NFATレポーター細胞を回収し、ViCellを用いて生存率を評価した。ハイグロマイシンBを含まない細胞培養培地中に2mio細胞/mlで細胞を再懸濁し、0.1×10細胞/ウェル(50μl/ウェル)で腫瘍細胞に添加し、5:1の最終E:T及び1ウェル当たり100μlの最終容量を得た。細胞を加湿インキュベーター内で37℃で6時間インキュベートした。インキュベーション時間の終了時に、100μl/ウェルのONE−Glo溶液(ウェルあたり1:1のONE−Glo及びアッセイ培地容量)をウェルに添加し、暗所で室温で10分間インキュベートした。発光は、WALLAC Victor3 ELISAリーダー(PerkinElmer2030)を用いて、検出時間として5秒/ウェルで検出した。
図15は、「CD20 TCB_2+1_電荷あり、反転型」(分子B)は「CD20 TCB_1+1」(分子H)よりも強いT細胞活性化及びCD3の下流のシグナル伝達をもたらすことを示す。
健常NOGマウスにおける抗CD20/抗CD3 TCBの単回投与薬物動態(PK)
有効性試験(図16)中の抗CD20/抗CD3 TCB分子「B」(以下、「CD20 TCB」と呼ぶ)の曝露を評価するために、単回投与薬物動態試験(SDPK)を実施した。0.5mg/kgのi.v.ボーラス投与をNOGマウスに投与し、薬物動態評価のために選択した時点で血液試料を採取した。CD20 TCBの総濃度を測定するために、一般的なイムノアッセイを使用した。CD20 TCBの標準曲線の較正範囲は0.78〜50ng/mlであった(ここでは15ng/mlが定量の下限値(LLOQ)である)。
10日間のベータ半減期(非区画分析)及び8mL/d/kgのクリアランス(2区画モデル)で二相性低下が観察された。半減期とクリアランスは、正常な非標的IgGと比較して予想通りであった(表9)。
Pharsight LtdのPhoenix v6.2をPK解析、モデリング、シミュレーションに使用した。
インビボでの抗CD20/抗CD3 TCBのB細胞枯渇活性
CD20 TCBの末梢B細胞枯渇活性を、完全ヒト化NOD/Shi−scid/IL−2Rγnull(NOG)マウスで試験した。
循環ヒトB細胞及びT細胞の生理学的レベルを有する14週齢の完全ヒト化NOGマウス(Hayakawa J. et al. (2009),Stem Cells 27(1), 175-182)を、ビヒクル(n=7)又はCD20 TCB(n=6)の何れかで1週間に1回静脈内(i.v.)投与される0.5mg/kgの用量で処置した。図17の試験デザインに示されるように、マウスは、B細胞及びT細胞分析のために、最初の治療用注射の1日後と3日後(D1、D3)及び2回目の注射の3日後(D10)に採血され、その時点で試験が終了した。後者の時点で、B細胞及びT細胞分析のために脾臓も採取した。循環B細胞及びT細胞のカウントのためのベースライン基準として、治療用注射の4日前(D−4)にマウスをスクリーニングした。図18は、異なる時点でのビヒクル(左パネル)及びCD20 TCB(右パネル)処置マウスの血液におけるエクスビボフローサイトメトリーによって分析されたB細胞及びT細胞数を示す。結果は、循環B細胞がCD20 TCB注射の1日後に既に非常に効率的に枯渇しており、その数は試験期間全体にわたって検出できなかったことを実証している。対照的に、循環T細胞数は、治療用注射後にD1で一時的に低下し、D3でベースラインレベルに戻り、試験期間全体にわたって安定したままであった。また最初の治療用注射後のD3及びD10での処置マウスの血液中において、T細胞活性化状態を異なるT細胞表面マーカー及び増殖マーカーKi67を用いたエクスビボフローサイトメトリーにより分析した(図19)。CD20 TCB処置マウス由来のT細胞は、ビヒクル対照からのT細胞と比較して、CD4及びCD8 T細胞区画の両方における活性化マーカーCD25、4−1BB、PD−1及びグランザイム−B(GZB)のアップレギュレーションにより、治療用注射後のD3で活性化表現型を示した(上のパネル)。処置マウス由来のT細胞も、より高いレベルの増殖マーカーKi67を発現した。最初の治療用注射後のD10では、T細胞活性化マーカーの大部分は、GZB及びPD−1を除いてベースラインレベルに戻っていたが、これらはビヒクル対照と比較して依然としてより高いレベルで発現していた。
図20は、試験終了時(D10)にビヒクル及びCD20 TCB処置マウスの脾臓で行ったB細胞及びT細胞分析の結果を示す。CD20 TCB処置は、この二次リンパ器官においても非常に効率的なB細胞枯渇を媒介したが(図20A)、T細胞数はビヒクル対照に匹敵するレベルを示した(図20B)。T細胞活性化状態(図20C)は血液中で観察されたものと同様であり、ビヒクル対照と比較して処置マウスの脾臓T細胞においてGZB及びPD−1の発現が高かった。
全体として、これらの結果は、CD20 TCB処置は、治療用注射の1日後に既に末梢B細胞の非常に効率的な枯渇を媒介することができ、治療終了後(第2の治療用注射の3日後)にB細胞が検出されない状態を保つことを実証している。B細胞もまた、処置されたマウスの脾臓において効率的に枯渇される。B細胞枯渇活性は、未処置の対照と比較してより高いレベルで発現したままであるGZB及びPD−1活性化マーカーを除き、治療用注射の3日後にベースラインレベルに戻る処置動物の血液中の一過性T細胞活性化と並行している。
WSU−DLCL2モデルにおける抗CD20/抗CD3 TCBの抗腫瘍活性
ヒトびらん大B細胞リンパ腫細胞株WSU−DLCL2を保有し、ヒト末梢単核細胞(PBMC)を移植されたNOGマウスでCD20 TCBの抗腫瘍活性を試験した。簡潔に述べると、メスNOGマウスに、1.5×10個のWSU−DLCL2細胞(元々は欧州細胞コレクションから得られたもの)を皮下(s.c.)注射した。平均腫瘍体積が200mmに達したとき、マウスは、供給源ヒトT細胞としてヒトPBMC(マウスあたり10×10細胞)の腹腔内注射を受けた。2日後、マウスに、1週間に1回投与される0.5mg/kgの用量でCD20 TCB療法i.v.を投与した。図21に示すように、CD20 TCBは強力な抗腫瘍活性を示し、試験終了時(34日目)にほぼ完全な腫瘍退縮が観察された。
実施例2
電荷修飾を有する又は有しない「2+1 IgG CrossFab、反転型」T細胞二重特異性抗体(抗BCMA/抗CD3)の調製
この実施例で調製した分子の模式図を図22に示す。電荷修飾を有しない抗BCMA/抗CD3「2+1 IgG CrossFab、反転型」分子(この例では「83A10−TCB」と称する)は、配列番号22〜25のアミノ酸配列を含み、電荷修飾を有する抗BCMA/抗CD3「2+1 IgG CrossFab、反転型」分子(この例では「83A10−TCBcv」と称する)は、配列番号26〜29のアミノ酸配列を含む。
BCMAxCD3二重特異性抗体ベクターの作製のために、IgG1由来二重特異性分子は、2つの異なる抗原決定基CD3及びBCMAに特異的に結合することができる少なくとも2つの抗原結合部分からなる。抗原結合部分は重鎖及び軽鎖(それぞれ可変領域及び定常領域を含む)からなるFab断片である。Fab断片の少なくとも1つは、VHとVLが交換された「Crossfab」断片であった。Fab断片内のVHとVLの交換は、異なる特異性のFab断片が同一のドメイン配置を有しないことを保証する。二重特異性分子の設計は、CD3については1価であり、1つのFab断片が内部CrossFab(2+1)のN末端に融合したBCMAについては2価であった。二重特異性分子は、分子がより長い半減期を有するためにFc部分を含んだ。分子は、ポリエチレンイミン(PEI)を使用して懸濁液中で増殖するHEK293 EBNA細胞に哺乳動物発現ベクターをコトランスフェクトすることにより生成された。2+1 CrossFab−IgG構築物の調製のために、細胞は対応する発現ベクターを1:2:1:1(「ベクターFc(ノブ)」:「ベクター軽鎖」:「ベクター軽鎖CrossFab」:「ベクター重鎖−CrossFab」)の比でトランスフェクトされた。
二重特異性抗体については、一方の結合アーム「Crossfab」に置換/交換を導入すると副生成物が明らかに減少するが、調製物は副生成物が完全には無いわけではない(国際公開第2009/080252号及びSchaefer, W. et al, PNAS, 108 (2011) 11187-1191に詳述される)。従って、第1の抗原に対する軽鎖の第2の抗原に対する誤った重鎖とのミスマッチによって引き起こされる副産物を更に低減し、二重特異性抗体の収率を改善するために、a)124位のアミノ酸が、リジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立して(1つの好ましい実施態様では、リジン(K)、アルギニン(R)によって独立して)置換される第1の軽鎖の定常ドメインCLにおいて、及びa)147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(Kabatによる番号付け)によって独立して置換される第1の重鎖の定常ドメインCH1において;又はii)b)124位のアミノ酸が、リジン(K)、アルギニン(R)又はヒスチジン(H)(Kabatによる番号付け)によって独立して(1つの好ましい実施態様では、リシン(K)、アルギニン(R)によって独立して)置換される第2の軽鎖の定常ドメインCLにおいて、及びb)147位のアミノ酸又は213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)又はアスパラギン酸(D)(Kabatによる番号付け)によって独立して置換される第2の重鎖の定常ドメインCH1においてCH1ドメイン及びCLドメインの特定のアミノ酸位置に反対の電荷を有する荷電アミノ酸の置換を導入することによって、分子にさらなるアプローチが適用される。
二重特異性抗体の生成のために、ポリエチレンイミン(PEI)を用いて懸濁培養したHEK293−EBNA細胞中のそれぞれの哺乳動物発現ベクターの一過性同時トランスフェクションにより二重特異性抗体を発現させた。トランスフェクションの1日前に、HEK293−EBNA細胞を、6mMのL−グルタミンを補充したEx−Cell培地に1.5Mio生存細胞/mLで播種した。最終産物量の各mLについて、2.0Mio生存細胞を遠心分離した(210×gで5分間)。上清を吸引し、細胞を100μLのCD CHO培地に再懸濁した。100μLのCD CHO培地中に1μgのDNA(比率は重鎖:修飾重鎖:軽鎖:修飾軽鎖=1:1:2:1)を混合することにより、最終産物量の各mLについてのDNAを調製した。0.27μLのPEI溶液(1mg/mL)の添加後、混合物を15秒間ボルテックスし、室温で10分間放置した。10分後、再懸濁した細胞とDNA/PEI混合物を一緒にし、振盪装置(37℃、5%CO)に入れた適切な容器に移した。3時間のインキュベーション時間後、6mMのL−グルタミン、1.25mMのバルプロ酸及び12.5%のPepsoy(50g/L)を補充した800μLのEx−細胞培地を最終産物量1mLごとに添加した。24時間後、70μLのFeed(SF40、Lonza)を最終産物量1mLごとに添加した。7日後又は細胞生存率が70%以下である時に、細胞を遠心分離及び滅菌濾過によって上清から分離した。抗体は、陽イオン交換クロマトグラフィー及びサイズ排除クロマトグラフィーとする親和性工程と1つ又は2つの研磨工程(polishing step)によって精製された。必要な場合には、追加の研磨工程を用いた。
親親和性工程のために、6CVの20mMリン酸ナトリウム、20mMクエン酸ナトリウム、pH7.5で平衡化したプロテインAカラム(HiTrap Protein A FF、5mL、GE Healthcare)に上清をロードした。同じ緩衝液による洗浄工程の後、20mMリン酸ナトリウム、100mM塩化ナトリウム、100mMグリシン、pH3.0を用いた段階的溶出によって、抗体をカラムから溶出させた。所望の抗体を含む画分を0.5Mリン酸ナトリウム(pH8.0)(1:10)で直ちに中和し、プールし、遠心分離により濃縮した。濃縮物を滅菌濾過し、更に陽イオン交換クロマトグラフィー及び/又はサイズ排除クロマトグラフィーにより処理した。
陽イオン交換クロマトグラフィー工程のために、濃縮タンパク質を親和性工程のために使用される溶出緩衝液で1:10に希釈し、カチオン交換カラム(Poros 50 HS、Applied Biosystems)にロードした。平衡緩衝液及び洗浄緩衝液、それぞれ20mMリン酸ナトリウム、20mMクエン酸ナトリウム、20mMのTRIS、pH5.0及び20mMリン酸ナトリウム、20mMクエン酸ナトリウム、20mMのTRIS、100mM塩化ナトリウムpH5.0で2回洗浄した後、タンパク質を、20mMのリン酸ナトリウム、20mMのクエン酸ナトリウム、20mMのTRIS、100mMの塩化ナトリウム、pH8.5を用いた勾配により溶出した。所望の抗体を含有する画分をプールし、遠心分離により濃縮し、滅菌濾過し、更にサイズ排除工程で処理した。
サイズ排除工程のために、濃縮タンパク質を、XK16/60 HiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)に注入し、20mMヒスチジン、140mM塩化ナトリウム、pH6.0をTween20を含めて又は含めないで製剤緩衝液として注入した。モノマーを含む画分をプールし、遠心分離により濃縮し、滅菌バイアルに滅菌濾過した。
抗体濃度の決定は、抗体の0.1%溶液の吸光度の理論値を用いて、280nmでの吸光度を測定することにより行った。この値は、アミノ酸配列に基づいており、GPMAWソフトウェア(Lighthouseデータ)によって計算された。
最終タンパク質調製物の純度及びモノマー含量は、25mMリン酸カリウム、125mM塩化ナトリウム、200mMのL−アルギニン一塩酸塩、0.02%(w/v)アジ化ナトリウム、pH6.7緩衝液中で、CE−SDS(Caliper LabChip GXIIシステム(Caliper Life Sciences))、HPLC(TSKgel G3000 SW XL分析用サイズ排除カラム(Tosoh)により決定された。
最終タンパク質調製物の分子量を確認し、最終タンパク質溶液の分子の均一な調製を確認するために、液体クロマトグラフィー質量分析(LC−MS)を使用した。脱グリコシル化工程が最初に行われた。糖によって導入された不均一性を除去するために、構築物をPNGaseF(ProZyme)で処理した。従って、タンパク質溶液のpHを、濃度0.5mg/mlのタンパク質20μgに2μlの2MのTrisを加えることによってpH7.0に調整した。0.8μgのPNGaseFを添加し、37℃で12時間インキュベートした。その後、LC−MSオンライン検出を行った。LC−MS法は、TOF 6441質量分析計(Agilent)に連結されたAgilent HPLC 1200で行った。クロマトグラフィー分離はMacherey Nagel Polystyreneカラム;RP1000−8(8μm粒子サイズ、4.6×250mm;カタログ番号719510)で行った。溶離液Aは5%アセトニトリル及び0.05%(v/v)ギ酸の水溶液であり、溶離液Bは95%アセトニトリル、5%水及び0.05%ギ酸であった。流速は1ml/分であり、分離は40℃で、前に記載した処理で得られた6μg(15μl)のタンパク質試料を用いて行った。
最初の4分間、溶離液は、塩分汚染から質量分析計を保護するために廃棄物に送られた。ESI源は、12l/分の乾燥ガス流、350℃の温度及び60psiのネブライザー圧力で運転していた。MSスペクトルは、陽イオンモードで、380Vのフラグメンター電圧及び700〜3200m/zの質量範囲を用いて取得した。MSデータは、計器のソフトウェアによって4〜17分で取得された。
図23は、83A10−TCB及び83A10−TCBcv抗体の異なる精製方法後の最終タンパク質調製物のCE−SDS(非還元)グラフを示す。83A10−TCB抗体に適用されたプロテインA(PA)親和性クロマトグラフィー及びサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)精製工程により、純度<30%、モノマー含量82.8%を得た。(A)の最終タンパク質調製物に陽イオン交換クロマトグラフィー(cIEX)及び最終サイズ排除クロマトグラフィー(re−SEC)工程を含む追加の精製工程を適用した場合、純度は93.4%に増加したが、モノマー含量は同じままであり、収率は0.42mg/Lに有意に減少した。しかしながら、83A10抗BCMA Fab CL−CH1、すなわち83A10−TCBcv抗体に特異的な電荷修飾を適用した場合、PA+cIEX+SEC精製工程を適用しても(C)、追加の再SEC精製工程を含むにもかかわらず、生産/精製プロファイルは7.9倍低い収率及び17.2%より低いモノマー含量を示す(B)と比較して、95.3%の純度、100%のモノマー含量及び最大3.3mg/Lの収率によって示されるように、TCB分子の優れた生成/精製プロファイルを既に観察することができた。
次いで、83A10−TCB対83A10−TCBcv抗体の生成/精製プロフィールを比較するために1対1の(head−to−head)生産が実施され、抗体に適用されたCL−CH1電荷修飾の利点を更に評価した。図24に示すように、83A10−TCB及び83A10−TCBcv抗体の特性を並べて測定し、1)PA親和性クロマトグラフィーのみ(A、B)、2)PA親和性クロマトグラフィー、次いでSEC(C、D)及び3)PA親和性クロマトグラフィー、次いでSEC及び再SEC(E、F)の各精製工程後に比較した。83A10−TCB及び83A10−TCBcv抗体のそれぞれの精製方法後の最終タンパク質溶液のCE−SDS(非還元)グラフを図24に示す。図24A及び24Bに示すように、TCB抗体に電荷変異体を適用することによる改善は、PA親和性クロマトグラフィーのみによる精製後に既に観察された。この1対1の試験では、83A10−TCB抗体に適用されたPA親和性クロマトグラフィー精製工程は、61.3%の純度、26.2mg/Lの収率及び63.7%のモノマー含量をもたらした(24A)。比較すると、83A10−TCBcv抗体をPA親和性クロマトグラフィーにより精製すると、81.0%のより良好な純度、51.5mg/Lのより良好な収率及び68.2%のモノマー含量となりすべての特性が改善された(24B)。図24A及び24Bに見られるように、最終的なタンパク質調製物にさらなるSEC精製工程を適用すると、最大91.0%及び83.9%のそれぞれ改善された純度とモノマー含量を有し、10.3mg/Lの収率である83A10−TCBcvと比較して、83A10−TCBは69.5%の純度、14.1mg/Lの収率及び74.7%のモノマー含量が得られた。この特定の実験では、83A10−TCBcvについてその収率は83A10−TCBの収率よりわずかに少なかった(すなわち27%少ない)にも関わらず、正しい分子のパーセンテージはLC−MSにより測定すると83A10−TCBcvの方が83A10−TCBよりもそれぞれ90%対40〜60%とはるかに良好であった。第3の1対1の比較では、図24C及び24Dからの83A10−TCB及び83A10−TCBcv最終タンパク質調製物を、PA親和性クロマトグラフィー精製工程のみの後の別の精製バッチからのそれぞれの最終タンパク質調製物(同じ生成物)約1L(等量)とプールした。次いで、プールされたタンパク質調製物をcIEX及びSEC精製方法により更に精製した。図24E及び24Fに示すように、電荷変異体を有しないTCB抗体と比較した場合、電荷変異体を有するTCB抗体の生成/精製プロファイルの改善が一貫して観察された。83A10−TCB抗体を精製するために複数の精製方法の工程(すなわち、PA +/− SEC+cIEX+SEC)を使用した後では、わずか43.1%の純度に達し、98.3%のモノマー含量を達成することができたが、収率は損なわれ、0.43mg/Lに減少した。LC−MSによって測定された正しい分子のパーセンテージは60〜70%と依然として良好ではなかった。最終的に、最終タンパク質調製物の品質は、インビトロでの使用のためには許容できなかった。全く対照的に、83A10−TCBcv抗体に同じ時間的順序の同じ複数の精製工程を適用した場合、LC−MSによって測定すると96.2%の純度及び98.9%のモノマー含量並びに95%の正しい分子を得た。しかしながら、収率はまた、cIEX精製工程の後に0.64mg/Lに大きく減少した。結果は、83A10−TCBcv抗体では、2つの標準精製工程、すなわちPA親和性クロマトグラフィー及びSECの後においてのみより良好な純度、より高いモノマー含量、正確な分子のより高いパーセンテージ及びより良好な収率を達成することができるが(図24D)、一方83A10−TCBでは追加の精製工程が適用されたとしてもこのような特性は達成できなかった(図24E)ことを示している。
表10は、PA精製工程後に83A10−TCVcvと比較した83A10−TCBの特性をまとめたものである。表11は、PA及びSEC精製工程後に83A10−TCVcvと比較した83A10−TCBの特性をまとめたものである。表12は、PA及びSECプラスPA単独、次いでcIEX及び再SEC精製工程の後に83A10−TCVcvと比較した83A10−TCBの特性をまとめたものである。表10〜12では、太字の値は、83A10−TCB対83A10−TCVcvの比較で優れた特性を強調している。代表とはなり得ない1つの例外を除いて、3つの1対1の比較実験から得られたすべての生成/精製パラメーター及び値は、83A10−TCBと比較して83A10−TCBcvの方が優れていた。全体的な結果は、TCB抗体にCL−CH1電荷修飾を適用することによって生成/精製の特徴における利点を達成することができ、非常に良好な現像特性を有する既に高品質のタンパク質調製物を達成するためには、2つの精製工程(すなわち、PA親和性クロマトグラフィー及びSEC)のみが必要であったことを明らかに実証している。
BCMA陽性多発性骨髄腫細胞株に対する抗BCMA/抗CD3 T細胞二重特異性抗体の結合(フローサイトメトリー)
抗BCMA/抗CD3 TCB抗体(83A10−TCB、13A4−TCBcv)を、BCMA発現NCI−H929細胞(ATCC(登録商標)CRL−9068TM)上のヒトBCMAへの結合についてフローサイトメトリーにより分析した。MKN45(BCMAを発現しないヒト胃腺癌細胞株)を陰性対照として使用した。簡潔には、培養細胞を回収し、計数し、細胞生存率をViCellを用いて評価した。次いで、生存可能な細胞を、BSA含有FACS染色緩衝液(BD Biosciences)中、1mlあたり2×10細胞に調整した。この細胞懸濁液100μlを丸底96ウェルプレートにウェルごとに更に分注し、30μlの抗BCMA抗体又は対応するIgG対照と4℃で30分間インキュベートした。すべての抗BCMA/抗CD3 TCB抗体(及びTCB対照)を滴定し、1〜300nMの最終濃度範囲で分析した。その後、細胞を遠心分離し(5分間、350×g)、120μl/ウェルのFACS Stain Buffer(BD Biosciences)で洗浄し、再懸濁し、4℃で更に30分間、蛍光色素結合PE結合AffiniPure F(ab’)2断片ヤギ抗ヒトIgG Fc断片特異的(Jackson Immuno Research Lab;109−116−170)とインキュベートした。次いで、細胞をStain Buffer(BD Biosciences)で2回洗浄し、1ウェルあたり100μlのBD固定緩衝液(#BD Biosciences、554655)を用いて4℃で20分間固定し、120μlのFACS緩衝液に再懸濁し、BD FACS CantoIIを用いて分析した。図25に示すように、抗BCMA/抗CD3 TCB抗体の平均蛍光強度を抗体濃度の関数としてプロットした;(A)H929細胞及びMKN45細胞における83A10−TCB、(B)H929細胞及びMKN45細胞における83A10−TCBcv。適用できる場合、Prism GraphPad(LaJolla、CA、USA)を用いてEC50を計算し、83A10−TCB及び83A10−TCBcvのH929細胞への結合の最大結合の50%に達するのに必要な抗体濃度を示すEC50値を表13にまとめた。図25Cは、83A10−TCB及び83A10−TCBcvが、H929細胞に濃度依存的に同様の効力で結合することを示す。このような結果は、83A10−TCB及び83A10−TCBcv分子が、それぞれのVL及びVH可変ドメイン上で同一のCDR配列を共有することから予想される。DP47−TCB対照抗体は、蛍光強度中央値の増加の欠如によって測定されるように、BCMA陽性H929骨髄腫細胞に結合しなかった。第2の1対1の比較実験において、83A10−TCB及び83A10−TCBcvを、BCMA陽性H929細胞への結合及びBCMA/CD3陰性MKN45細胞への結合の欠如について評価した。図25Dに示されるように、83A10−TCB及び83A10−TCBcvが、BCMA陽性H929細胞に濃度依存的に同様の効力で結合することを示す。この第2の実験についての83A10−TCB及び83A10−TCBcvのH929細胞への結合に関するEC50値を表14に要約する。
抗BCMA/抗CD3 T細胞二重特異性抗体によって誘導されたBCMA高発現H929骨髄腫細胞の再指向されたT細胞細胞傷害性(LDH放出アッセイ)
抗BCMA/抗CD3 TCB抗体もまた、抗原結合部分の細胞上でのBCMAへの結合を介して構築物を架橋する際の、BCMA高発現骨髄腫細胞におけるT細胞媒介性アポトーシスを誘導する可能性について分析された。簡潔には、ヒトBCMA発現H929多発性骨髄腫標的細胞を細胞解離緩衝液で回収し、洗浄し、10%ウシ胎仔血清(Invitrogen)を補充したRPMIに再懸濁した。1ウェルあたり約30,000個の細胞を丸底96ウェルプレートに播種し、抗体構築物のそれぞれの希釈物を所望の最終濃度で添加した(3通り);最終濃度は0.1pM〜10nMの範囲である。適切な比較のために、すべてのTCB構築物及び対照を同じモル濃度に調整した。ヒト全T細胞(エフェクター)をウェルに添加して、5:1の最終エフェクター:標的(E:T)比を得た。ヒトPBMCをエフェクター細胞として使用した場合、最終的なE:T比は10:1を使用した。陰性対照群は、エフェクター又は標的細胞のみによって表された。ヒトパンT細胞の活性化の陽性対照として、1μg/mlのPHA−M(Sigma #L8902)を用いた。正規化のために、H929 MM標的細胞の最大溶解(=100%)を、1%のTriton X−100の最終濃度で標的細胞をインキュベートし、細胞死を誘導することによって決定した。最小限の溶解(=0%)は、エフェクター細胞のみと同時インキュベートした標的細胞、すなわち、T細胞二重特異性抗体を全く含まない標的細胞によって表された。37℃、5%COで20〜24時間インキュベートした後、アポトーシス/壊死性骨髄腫標的細胞から上清中へのLDH放出を、LDH検出キット(Roche Applied Science)を用いて製造者の指示に従って測定した。LDH放出のパーセンテージを、抗BCMA/抗CD3 T細胞二重特異性抗体の濃度に対して濃度応答曲線でプロットした。適用できる場合、EC50値をPrismソフトウェア(GraphPad)を用いて測定し、最大LDH放出の50%をもたらすTCB抗体濃度として決定した。図26に示すように、抗BCMA/抗CD3 TCB抗体((A、B)83A10−TCB、(C、D)83A10−TCBcv)は、LDH放出によって測定されるようにBCMA陽性H929骨髄腫細胞の濃度依存的死滅を誘導した。H929細胞の死滅は、BCMA陽性標的細胞に結合しないDP47−TCB対照抗体が、1nM(A)の最高濃度でさえ、LDH放出を誘導しなかったので特異的であった。83A10−TCB(A、B)及び83A10−TCBcv(C、実験1)については、Prism(GraphPad)統計ソフトウェアを使用してEC50値を測定できなかったが、EC50値の大きさは、非荷電TCB分子及び荷電TCB分子の両方について、低いピコモル範囲の効力とおよそ推定することができた。第2の実験では、再指向されたT細胞死滅アッセイにおいて83A10−TCBcvの効果を評価し、EC50値を1.5pMまで測定することができた。著者らは、わずかに低いEC50値(わずかに優れた効力)は、血液ドナーの変動性に起因する可能性があることを排除することはできなかった。しかしながら、H929細胞を死滅させる効力の大きさは、確実に低いピコモル濃度の範囲であった。全体的な結果は、83A10−TCB(電荷変異体なし)対83A10−TCBcv(電荷変異体あり)が細胞ベースのアッセイにおいて類似の生物学的特性を示すことを示唆している。
実施例3
電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab、反転型」T細胞二重特異性抗体(抗Her2/抗CD3)及び電荷修飾を有する「2+1 IgG CrossFab」T細胞二重特異性抗体(抗Her3/抗CD3)の調製
この実施例で調製した分子の模式図を図27に示す。電荷修飾を有する抗Her2/抗CD3「2+1 IgG CrossFab、反転型」分子(この例では「Her2 TCB」と称する)は、配列番号21,52,53及び54のアミノ酸配列を含む。電荷修飾を有する抗Her3/抗CD3「2+1 IgG CrossFab」分子(この例では「Her3 TCB」と称する)は、配列番号21,55,56及び57のアミノ酸配列を含む。
分子を調製し、精製し、上記の実施例1に記載のように(単一の分取SEC工程を用いて)分析した。
両方の分子を、分析用サイズ排除クロマトグラフィー及びCE−SDSによって示される高い最終品質で精製することができた(表16,17)。この調製物におけるHer2 TCBの回収率はHer3 TCBと比較して低かったが、タンパク質は2つの精製工程(プロテインA及びSEC)の後にほぼ純粋であった。CE−SDS分析は、約164kDaで1.18%の低分子量不純物のみを示す(表17)。187.28kDaで検出された種は、Fcドメイン上のN結合グリコシル化を伴わない標的分子に対応する(この種は、真核細胞での生産後にヒトIgGについてCE−SDSによって一般的に検出される)。
Her3 TCBは良好な回収率で精製することができた。最終品質は、最終モノマー含量を比較するとHer2 TCBよりも優れていた。また、192.05kDaで検出されたピークが非グリコシル化Fc種に対応すると仮定すると、CE−SDSは100%標的タンパク質を示す。
両方の調製物について、遊離軽鎖(予想される分子量25kDa)などの生成物関連の低分子量不純物、1つの軽鎖上にCH1−CL交換のみを導入することにより起こりうる二量体化軽鎖は(50kDaで予想される分子量)又は欠失又は非共有結合した軽鎖を有する分子(125kDa、150kDa又は175kDaで予想される分子量)が、CE−SDS又は分析用サイズ排除クロマトグラフィーによって検出されている。
Her2 TCB及びHer3 TCBの細胞への結合
Jurkat懸濁細胞を回収し、FACS緩衝液(PBS+0.1%BSA)で1回洗浄し、生存率をViCellで決定した。
接着性KPL−4腫瘍細胞(J.Kurebayashi、川崎医科大学、日本により提供)をCell Dissociation Buffer(Gibco Invitrogen)で回収し、FACS緩衝液で1回洗浄した後、ViCellで生存率を測定した。
丸底96ウェルプレートのウェルあたり0.2百万個の細胞を蒔き、プレートを400gで4分間遠心分離した。次いで、FACS緩衝液中の1ウェル当たり25μlのTCB希釈物を細胞に添加した。細胞を冷蔵庫で30分間インキュベートした。その後、ウェル当たり150μlのFACS緩衝液で細胞を2回洗浄した。
25μlの適切に希釈した二次抗体(FITC結合AffiniPure F(ab’)断片、ヤギ抗ヒトIgG、F(ab’)断片特異的、Jackson ImmunoResearch)を1ウェル当たりに加え、プレートを暗所で4℃で更に30分間染色した。
プレートをウェルあたり150μlのFACS緩衝液で2回洗浄し、150μlのFACS緩衝液に再懸濁した。分析は、FACS Diva Softwareを備えたBD FACS CantoIIを用いて行った。蛍光強度中央値(MFI)をTCB分子の濃度に対してプロットした。
図29に示すように、両方のTCBは、細胞上のそれぞれの標的抗原に対する濃度依存性の良好な結合を示す。
Her3 TCBによって誘導された、ヒト腫瘍細胞のT細胞媒介性溶解後の、ヒトCD8 Tエフェクター細胞の活性化
10:1のエフェクター対標的比(E:T)及び48時間のインキュベーション時間を用いて、Her3 TCBを用いた古典的腫瘍細胞溶解実験(以下に記載する)のCD8+Tエフェクター細胞を、CD69陽性細胞のパーセンテージについて評価した。
簡潔には、インキュベーション後、PBMCを丸底96ウェルプレートに移し、350xgで5分間遠心分離し、0.1%のBSAを含有するPBSで2回洗浄した。CD8(Biolegend#300908)及びCD69(BioLegend#310904)の表面染色を、供給者の指示に従って実施した。細胞を0.1%BSAを含む150μl/ウェルのPBSで2回洗浄し、100μl/ウェルの2%PFAを用いて4℃で20分間固定した。遠心分離後、試料を200μl/ウェルのPBS 0.1%BSAに再懸濁し、FACS CantoII(ソフトウェアFACS Diva)で分析した。
図30に示すように、Her3 TCBは、それぞれの標的部分を介してT細胞及び腫瘍細胞(KPL−4)の架橋を誘発し、T細胞の活性化を濃度依存的に誘導する。
Jurkat−NFAT活性化アッセイ
腫瘍抗原陽性標的細胞(KPL−4)とJurkat−NFATレポーター細胞(NFATプロモーターを有するCD3発現ヒト急性リンパ性白血病レポーター細胞株、GloResponse Jurkat NFAT−RE−luc2P、Promega #CS176501)の共培養を用いて、T細胞架橋及びその後のT細胞活性化を誘導するHer2 TCB及びHer3 TCBの能力を評価した。ヒトHer2、ヒトHer3、抗原(腫瘍細胞上で発現される)及びCD3抗原(Jurkat−NFATレポーター細胞上で発現される)に対するTCB分子の同時結合の際に、NFATプロモーターが活性化され、活性ホタルルシフェラーゼの発現へと導く。発光シグナルの強度(ルシフェラーゼ基質の添加時に得られる)は、CD3の活性化及びシグナル伝達の強度に比例する。
アッセイのために、KPL−4ヒト腫瘍細胞をCell Dissociation Buffer(Gibco Invitrogen)を用いて回収し、ViCellを用いて生存率を測定した。平底の白い壁の96ウェルプレート(Greiner bio−one)に20000細胞/ウェルを播種し、希釈したTCB又は培地(対照用)を添加した。続いて、Jurkat−NFATレポーター細胞を回収し、ViCellを用いて生存率を評価した。細胞を細胞培養培地に再懸濁し、腫瘍細胞に添加して、示したように2.5:1(Her2 TCBについて)又は5:1(Her3 TCBについて)の最終E:T及び100μl/ウェルの最終体積を得た。細胞を加湿インキュベーター内で37℃で5時間インキュベートした。インキュベーション時間の終了時に、100μl/ウェルのONE−Glo溶液(Promega、#E6120)(ウェルあたり1:1のONE−Glo及びアッセイ培地容量)をウェルに添加し、暗所で室温で10分間インキュベートした。発光は、WALLAC Victor3 ELISAリーダー(PerkinElmer2030)を用いて、検出時間として5秒/ウェルで検出した。
図31に示すように、両方のTCB分子がCD3を介してT細胞架橋を誘導し、続いてT細胞活性化を誘導する。Her3 TCBは、KPL−4細胞に対して若干強力であり、このことはこれらの標的細胞上のHer2よりも高いレベルのHer3によって説明され得る。
Her2 TCB及びHer3 TCBによって誘導される腫瘍細胞溶解
各TCB分子によって誘導されたHer2又はHer3発現腫瘍標的細胞の腫瘍細胞溶解を、エフェクターとしてヒト末梢血単核細胞(PBMC)を用いて10:1のE:Tで評価した。腫瘍細胞溶解は、示されるように、TCBとのインキュベーションの24時間後及び48時間後に、上清中に放出されたLDHを測定することによって決定した。
ヒトPBMCを新鮮な血液又はバフィーコートから単離した。簡潔には、血液をPBSで2:1(新鮮な血液)又は3:1(バフィーコート)に希釈した。約30mlの血液/PBS混合物をHistopaque(Sigma)15ml上に層状にし、RTでブレーキを掛けずに450xgで30分間遠心分離した。リンパ球を、10mlのピペットを用いて、PBSを含む50mlチューブに集めた。チューブをPBSで50mlまで満たし、350gで10分間遠心分離した。上清を捨て、ペレットを50mlのPBSに再懸濁し、300xgで10分間遠心分離した。洗浄工程を1回繰り返した。細胞を10%FCS及び1%GlutaMax(Life Technologies)を含有するRPMIに再懸濁し、インキュベーター中で37℃、5%COでアッセイ開始まで(24時間を超えない)保存した。
標的細胞をトリプシン/EDTAにより回収し、洗浄し、平底96ウェルプレートを用いて30,000細胞/ウェルの密度で蒔いた。細胞を加湿インキュベーター中で一晩接着させた。アッセイの日に、アッセイプレートを350xgで5分間遠心分離し、培地を吸引した。100μl/ウェルのアッセイ培地を添加した。
TCBを指示濃度(Her3 TCBについては0.001pM〜1nM、Her2 TCBについては0.01pM〜100nMの範囲で3通り)で添加した。最終E:T比10:1でPBMCを標的細胞に添加した。24時間及び48時間のインキュベーション後に、アポトーシス/壊死細胞により細胞上清中に放出されたLDH(乳酸脱水素酵素)の定量によって(LDH検出キット、Roche Applied Science、#11 644 793 001)、標的細胞の死滅を評価した。標的細胞の最大溶解(=100%)が、1%のTriton X−100と共になされた標的細胞のインキュベーションにより達成された。最小溶解(=0%)は、二重特異性抗体なしでエフェクター細胞と共にコインキュベートした標的細胞を指す。EC50値はGraphPadPrism5を用いて計算した。
別の実験では、マイクロプレートリーダー(ウェルあたり5秒の読み取り時間)で発光を測定することにより、6.5時間後にカスパーゼ3/7活性によって腫瘍細胞溶解を測定した。
カスパーゼ3/7活性の測定のために、KPL−4−カスパーゼ−3/7 GloSensor標的細胞(GloSensorプラスミドで安定にトランスフェクトされたKPL−4細胞)を上記のように回収した。PBSで1回洗浄した後、アッセイ培地(RPMI1640,2%FCS、1%Glutamax)中で濃度を0.3×10細胞/mlに調整し、2%v/vのGloSensor cAMP Reagent(Promega)と混合した。この標的細胞懸濁液100μl(=30,000細胞)を、白壁の96平底底プレートの各ウェルに移した。
末梢血単核細胞(PBMC)は、上述されるように、健常なヒトドナーから得られた濃縮されたリンパ球製剤(バフィーコート)のHistopaque密度遠心分離によって調製した。腫瘍細胞溶解アッセイは、本質的に上記のように実施された。
図32C及び図33に示される結果は、Her3 TCB分子が、KPL−4腫瘍細胞の強力かつ濃度依存的なアポトーシス及び溶解を誘導することを示している。
図32A及びBに示されているHer2 TCBについても同じことが当てはまり、腫瘍細胞の有意な濃度依存性溶解を経時的に示している。それによって、死滅のEC50は、それぞれの標的細胞上のHer2の発現レベルに依存するように見える。発現レベルが高いほど、Her2 TCBによる腫瘍細胞死滅は良好である。
実施例4
電荷修飾を有する又は有しない「(Fab)−CrossFab」T細胞二重特異性抗体(抗MCSP/抗CD3)の調製
この実施例で調製した分子の模式図を図34に示す。MCSP結合剤に電荷修飾を有する抗MCSP/抗CD3「(Fab)−CrossFab」分子(この実施例では「(Fab)2−XFab−LC007cv」と称する)は、配列番号58,59及び60のアミノ酸配列を含む。電荷修飾を有しない抗MCSP/抗CD3「(Fab)−CrossFab」分子(この実施例では「(Fab)2−XFab」と称する)は、電荷修飾を有しない対応するアミノ酸配列を含む。
以下の適応により、分子を調製し、精製し、上記の実施例1に記載のように分析した。
これらの分子の生成のために、HEK293−EBNA細胞を対応する発現ベクターで1:2:1の比(「ベクター重鎖」:「ベクター軽鎖抗MSCP Fab」:「ベクター軽鎖抗CD3 Fab」)でトランスフェクションした。
培養培地中の構築物の濃度は、実施例1に記載したように、pH8.0でのプロテインAへのCH1ドメインの部分の結合及びpH2.5からの段階的溶出に基づいて、プロテインA−HPLCによって決定した。
分泌タンパク質は、CH1に結合する親和性クロマトグラフィーを用いた親和性クロマトグラフィー、続いてサイズ排除クロマトグラフィー工程によって細胞培養上清から精製した。
親和性クロマトグラフィーのために、5mlの50mMのTris、100mMグリシン、150mMのNaCl pH8.0で平衡化したHiTrap KappaSelectカラム(CV=5mL、GE Healthcare)に上清をロードした。少なくとも10カラム容量の50mMのTris、100mMグリシン、150mMのNaCl pH8.0で洗浄することにより、未結合タンパク質を除去した。標的タンパク質を、50mMトリス、100mMグリシン、150mMのNaCl pH2.0までの10カラム容量勾配で溶出した。タンパク質溶液を、1/40の2MのTris pH8.0を加えることにより中和させた。標的タンパク質を、濃縮し、濾過した後、20mMヒスチジン、140mM塩化ナトリウム、0.01%のTween−20、pH6.0で平衡化したHiLoad Superdex 200カラム(GE Healthcare)にロードする。
両方の分子を同じ方法で生成し精製した。電荷修飾を有しない分子(「(Fab)2−XFab」と比較して、電荷を有する分子の力価は10倍低かった。それにもかかわらず、最終の回収率は、2つの抗MCSP Fab(「(Fab)2−XFab−LC007cv」における電荷修飾を有する分子について約2倍高かった(表18)。(Fab)2−XFab−LC007cv分子は、サイズ排除クロマトグラフィーにより示される95.8%の最終モノマー含量及びCE−SDS分析によって証明された94.33%の最終純度に精製することができた。
電荷修飾を有する又は有しない「(Fab)−CrossFab」T細胞二重特異性抗体(抗MCSP/抗CD3)の細胞結合
Jurkat−NFAT懸濁細胞を回収し、FACS緩衝液(PBS+0.1%BSA)で1回洗浄し、生存率をViCellで決定した。
接着性MV−3腫瘍細胞をCell Dissociation Buffer(Gibco Invitrogen)で回収し、FACS緩衝液で1回洗浄した後、ViCellで生存率を測定した。
丸底96ウェルプレートのウェルあたり0.2百万個の細胞を蒔き、プレートを400×gで4分間遠心分離した。次いで、FACS緩衝液中の1ウェル当たり25μlの一次抗体希釈物を細胞に添加した。細胞を冷蔵庫で30分間インキュベートした。その後、ウェル当たり150μlのFACS緩衝液で細胞を2回洗浄した。
25μlの希釈した二次抗体(FITC結合AffiniPure F(ab’)断片、ヤギ抗ヒトIgG、F(ab’)断片特異的、Jackson ImmunoResearch)を1ウェル当たりに加え、プレートを暗所で4℃で更に30分間染色した。
プレートをウェルあたり150μlのFACS緩衝液で2回洗浄し、150μlのFACS緩衝液に再懸濁した。分析は、FACS Diva Softwareを備えたBD FACS CantoIIを用いて行った。蛍光強度中央値(MFI)をTCB分子の濃度に対してプロットした。
図36に示すように、(Fab)2−XFAb−LC007cv分子は、MV−3上のヒトMCSP及びJurkat細胞上のヒトCD3に対する濃度依存的結合を示す。電荷修飾を有しない(Fab)2−XFab分子は、(Fab)2−XFAb−LC007cvと同等のヒトMCSPへの結合を示す((Fab)2−XFAb−LC007cvについて2.3nMのEC50結合対(Fab)2−XFabについてEC50は1.5nM)。
電荷修飾を有する又は有しない「(Fab)−CrossFab」T細胞二重特異性抗体(抗MCSP/抗CD3)によって媒介される腫瘍細胞溶解
MCSP TCB分子によって誘導されたMCSP発現MV−3腫瘍標的細胞の腫瘍細胞溶解はエフェクターとしてPBMCを用いて10:1のE:Tで評価した。腫瘍細胞溶解は、TCBとのインキュベーションの24時間後及び48時間後に、上清中に放出されたLDHを測定することによって決定した。
簡潔には、標的細胞をトリプシン/EDTAにより回収し、洗浄し、平底96ウェルプレートを用いて25,000細胞/ウェルの密度で蒔いた。細胞を加湿インキュベーター中で一晩接着させた。アッセイの日に、アッセイプレートを350xgで5分間遠心分離し、培地を吸引した。100μl/ウェルのアッセイ培地を添加した。
末梢血単核細胞(PBMC)を新鮮な血液から単離した。簡単には、血液をPBSで2:1に希釈した。約30mlの血液/PBS混合物をHistopaque(Sigma)15ml上に層状にし、ブレーキを掛けずに450xgで30分間遠心分離した。リンパ球を、10mlのピペットを用いて、PBSを含む50mlチューブに集めた。チューブをPBSで50mlまで満たし、350×gで10分間遠心分離した。上清を捨て、ペレットを50mlのPBSに再懸濁し、300xgで10分間遠心分離した。洗浄工程を1回繰り返した。細胞を10%FCS及び1%GlutaMax(Life Technologies)を含有するRPMIに再懸濁し、インキュベーター中で37℃、5%COでアッセイ開始まで(24時間を超えない)保存した。
死滅アッセイのために、指示された濃度で(0.04pM〜10nMの範囲で3通りに)TCB分子を添加した。最終E:T比10:1でPBMCを標的細胞に添加した。24時間及び48時間のインキュベーション後に、アポトーシス/壊死細胞により細胞上清中に放出されたLDH(乳酸脱水素酵素)の定量によって(LDH検出キット、Roche Applied Science、#11 644 793 001)、標的細胞の死滅を評価した。標的細胞の最大溶解(=100%)が、1%のTriton X−100と共になされた標的細胞のインキュベーションにより達成された。最小溶解(=0%)は、二重特異性抗体なしでエフェクター細胞と共にコインキュベートした標的細胞を指す。EC50値はGraphPadPrism5を用いて計算した。
図37に示すように、両方の分子は、hMCSP発現標的細胞の濃度依存的溶解を示す。(Fab)2−XFAb−LC007cv分子(24時間後にEC50は2.8pM及び48時間後に8.6pM)の効力は、電荷修飾を有しない(Fab)2−XFab分子の効力(24時間後にEC50は5.9pM、48時間後に4.8pM)に匹敵する。
* * *
前述の発明は理解を明確にするために例示及び実施例によってある程度詳細に説明されているが、説明及び実施例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書に引用されるすべての特許及び科学文献の開示内容は、その全体が出典明示により援用される。

Claims (31)

  1. a)第1の抗原に特異的に結合する第1のFab分子;
    b)第2の抗原に特異的に結合する第2のFab分子であって、Fab軽鎖及びFab重鎖の可変ドメインVL及びVHが互いに置換されている、第2のFab分子
    c)第1の抗原に特異的に結合する第3のFab分子;及び
    d)安定した会合が可能な第1及び第2のサブユニットからなるFcドメイン;
    を含むT細胞活性化二重特異性抗原結合分子であって、
    ここで、第1の抗原は標的細胞抗原であり、かつ第2の抗原は活性化T細胞抗原、具体的にはCD3、より具体的にはCD3イプシロンであり;
    c)の第3のFab分子は、a)の第1のFab分子と同一であり;
    a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCLにおいて、124位のアミノ酸がリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、かつ123位のアミノ酸がアルギニン(R)又はリジン(K)(Kabatによる番号付け)によって置換され、並びにa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子の定常ドメインCH1において、147位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され、かつ213位のアミノ酸がグルタミン酸(E)(KabatのEUインデックスによる番号付け)によって置換され;且つFcドメインがIgG Fcドメインであり、
    Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおいて、アミノ酸残基がそれよりも大きな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置換され、それにより、第1のサブユニットのCH3ドメイン内部に、第2のサブユニットのCH3ドメイン内部の空洞内に配置可能な隆起が生成され、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおいて、アミノ酸残基がそれよりも小さな側鎖体積を有するアミノ酸残基で置換され、それにより、第2のサブユニットのCH3ドメイン内部に、第1のサブユニットのCH3ドメイン内部の隆起を配置可能な空洞が生成され、
    (i)a)の第1のFab分子は、Fab重鎖のC末端でb)の第2のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつb)の第2のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合しているか、又は
    (ii)b)の第2のFab分子は、Fab重鎖のC末端でa)の第1のFab分子のFab重鎖のN末端に融合し、かつa)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子はそれぞれFab重鎖のC末端でd)のFcドメインのサブユニットの1つのN末端に融合している、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  2. CD3に特異的に結合するFab分子が、配列番号4の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号5の重鎖CDR2、配列番号6の重鎖CDR3、配列番号8の軽鎖CDR1、配列番号9の軽鎖CDR2、及び配列番号10の軽鎖CDR3を含む、請求項1に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  3. 性化T細胞抗原に特異的に結合するFab分子が配列番号3のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び配列番号7のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項1又は2に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  4. 標的細胞抗原がCD20であり、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子が配列番号46の重鎖相補性決定領域(CDR)1、配列番号47の重鎖CDR2、配列番号48の重鎖CDR3、配列番号49の軽鎖CDR1、配列番号50の軽鎖CDR2、及び配列番号51の軽鎖CDR3を含む、請求項1〜の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  5. 標的細胞抗原がCD20であり、標的細胞抗原に特異的に結合するFab分子が配列番号30のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び配列番号31のアミノ酸配列と少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項1〜の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  6. a)の第1のFab分子及びc)の第3のFab分子がそれぞれ、配列番号30のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域、及び配列番号31のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項1〜5の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  7. b)の第2のFab分子が、配列番号3のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域及び配列番号7のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む、請求項1〜6の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  8. FcドメインがIgG又はIgG Fcドメインである、請求項1〜7の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  9. FcドメインがヒトFcドメインである、請求項1〜8の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  10. より大きな側鎖体積を有する前記アミノ酸残基が、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、及びトリプトファン(W)からなる群から選択され、より小さな側鎖容積を有する前記アミノ酸残基が、アラニン(A)、セリン(S)、トレオニン(T)、及びバリン(V)からなる群から選択される、請求項1〜9の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  11. Fcドメインの第1のサブユニットのCH3ドメインにおいて、366位のスレオニン残基がトリプトファン残基で置換され(T366W)、Fcドメインの第2のサブユニットのCH3ドメインにおいて、407位のチロシン残基がバリン残基で置換され(Y407V)、任意選択的にFcドメインの第2のサブユニットにおいて更に366位のスレオニン残基がセリン残基で置換され(T366S)、368位のロイシン残基がアラニン残基で置換される(L368A)(KabatのEUインデックスによる番号付け)、請求項1〜10の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  12. Fcドメインの第1のサブユニットにおいて更に、354位のセリン残基がシステイン残基で置換され(S354C)又は356位のグルタミン酸残基がシステイン残基(E356C)で置換され、Fcドメインの第2のサブユニットにおいて更に、349位のチロシン残基がシステイン残基で置換される(Y349C)(KabatのEUインデックスによる番号付け)、請求項1〜11の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  13. Fcドメインの第1のサブユニットが、アミノ酸置換S354C及びT366Wを含み、Fcドメインの第2のサブユニットが、アミノ酸置換Y349C、T366S、L368A、及びY407V(KabatのEUインデックスによる番号付け)を含む、請求項1〜12の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  14. Fcドメインが、天然のIgG Fcドメインと比較した場合に、Fc受容体に対する結合親和性の低下及び/又はエフェクター機能の低下を呈する、請求項1〜13の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  15. FcドメインがFc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低下させる一又は複数のアミノ酸置換を含む、請求項1〜14の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  16. 前記一又は複数のアミノ酸置換がL234、L235及びP329(KabatのEUインデックス番号付け)の群から選択される一又は複数の位置においてである、請求項1〜15の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  17. Fcドメインの各サブユニットが活性化Fc受容体への結合及び/又はエフェクター機能を低下させる3つのアミノ酸置換を含んでおり、前記アミノ酸置換がL234A、L235A、及びP329G(KabatのEUインデックス番号付け)である、請求項1〜16の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  18. Fc受容体がFcγ受容体である、請求項1〜17の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  19. エフェクター機能が抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)である、請求項1〜18の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子。
  20. 請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子をコードする一又は複数の単離されたポリヌクレオチド。
  21. 請求項20に記載のポリヌクレオチドを含む一又は複数のベクター、具体的には発現ベクター。
  22. 請求項20に記載のポリヌクレオチド又は請求項21に記載のベクターを含む宿主細胞。
  23. a)請求項22に記載の宿主細胞を、T細胞活性化二重特異性抗原結合分子の発現に適した条件下で培養する工程、及びb)T細胞活性化二重特異性抗原結合分子を回収する工程を含む、請求項1に記載され、CD3及び標的細胞抗原に特異的に結合することができるT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を生成する方法。
  24. 請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子及び薬学的に許容可能な担体を含む薬学的組成物。
  25. 医薬としての使用のための、請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又は請求項24に記載の薬学的組成物。
  26. 必要とする個体における疾患の治療における使用のための、請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又は請求項24に記載の薬学的組成物。
  27. 疾患ががんである、請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子又は請求項26に記載の薬学的組成物。
  28. 必要とする個体における疾患の治療のための医薬の製造のための、請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子の使用。
  29. 個体における疾患を治療するための医薬であって、請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子を含む組成物の治療的有効量を薬学的に許容可能な形態で含む、医薬
  30. 前記疾患ががんである、請求項29に記載の医薬
  31. 標的細胞の溶解を誘導するための薬剤であって、1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子標的細胞を含み標的細胞がT細胞の存在下で請求項1〜19の何れか一項に記載のT細胞活性化二重特異性抗原結合分子と接触させられる薬剤
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