JP6255344B2 - サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子を阻害することによって真菌類及び卵菌類を防除するためのRNAi - Google Patents
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Description
・ 転写(転写遺伝子サイレンシングに関するTGS);
・ メッセンジャーRNAの分解(転写後遺伝子サイレンシングに関するPTGS);
・ miRNA経路;
・ 翻訳。
(i)真菌遺伝子又は卵菌遺伝子の少なくとも18の連続するヌクレオチドと実質的に同一である配列を含んでいる第1鎖;及び、
(ii)前記第1鎖と実質的に相補的である配列を含んでいる第2鎖;
を含んでいるdsRNA分子を提供し、ここで、前記真菌遺伝子又は卵菌遺伝子は、サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子である。
(i)真菌遺伝子又は卵菌遺伝子の少なくとも18の連続するヌクレオチドと実質的に同一である配列を含んでいる第1鎖;及び、
(ii)前記第1鎖と実質的に相補的である配列を含んでいる第2鎖;
を含んでいるdsRNA分子を提供し、ここで、前記真菌遺伝子又は卵菌遺伝子は、以下のものからなるリストから選択される:
(a) 以下の配列識別番号に示されている配列を含んでいるポリヌクレオチド:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43;
(b) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44;
(c) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリヌクレオチドと少なくとも70%(好ましくは、少なくとも80%、さらに好ましくは、少なくとも90%、一層さらに好ましくは、少なくとも95%)の配列同一性を有するポリヌクレオチド:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43;
(d) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリペプチドと少なくとも70%(好ましくは、少なくとも80%、さらに好ましくは、少なくとも90%、一層さらに好ましくは、少なくとも95%)の配列同一性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44:
(e) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリヌクレオチドと緊縮条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43;
及び、
(f) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリペプチドと少なくとも70%の配列同一性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと緊縮条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44。
KTUPLE=1、TOPDIAG=5、WINDOW=5、PAIRGAP=3、GAPOPEN=10、GAPEXTEND=0.05、GAPDIST=8、MAXDIV=40、MATRIX=GONNET、ENDGAPS(OFF)、NOPGAP、NOHGAP。
KTUPLE=2、TOPDIAGS=4、PAIRGAP=5、DNAMATRIX:IUB、GAPOPEN=10、GAPEXT=5、MAXDIV=40、TRANSITIONS:負荷無(unweighted)。
・ 植物細胞内で機能性を有するプロモーター調節配列(これは、以下のDNA配列に作動可能に連結されている);
・ 転写されたときに、センス配列及び少なくとも部分的に相補的であるアンチセンス配列を少なくとも含んでいるRNA分子を生成させるDNA配列〔ここで、該センス配列は、標的遺伝子(即ち、本発明の意味においては、サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子)の少なくとも18の連続するヌクレオチドと実質的に同一である配列を含んでおり、及び、該アンチセンス配列は、該センス配列に実質的に相補的である配列を含んでいる〕;
及び、
・ 場合により、ターミネーター調節配列;
を含んでいる。
・ 植物細胞内で機能性を有する2つのプロモーター調節配列(ここで、第1のプロモーター調節配列は、転写されたときにセンス配列を少なくとも含んでいるRNA分子を生成させるDNA配列に作動可能に連結されており、及び、第2のプロモーター調節配列は、転写されたときに該センス配列と部分的に相補的であるアンチセンス配列を少なくとも含んでいるRNA分子を生成させるDNA配列に作動可能に連結されており、ここで、該センス配列は、標的遺伝子の少なくとも18の連続するヌクレオチドと実質的に同一である配列を含んでいる);
及び、
・ 場合により、ターミネーター調節配列;
を含んでいる。
・ 第1のプロモーター(これは、以下の2本鎖DNA配列に作動可能に連結されている);
・ 2本鎖DNA配列〔ここで、一方の鎖は、該第1のプロモーターの制御下で転写されたときに、少なくともセンス配列(ここで、該センス配列は、標的遺伝子の少なくとも18の連続するヌクレオチドと実質的に同一である)と場合によりターミネーター調節配列を含んでいるRNA分子を生成させ、及び、第2鎖は、該第2のプロモーターの制御下で転写されたときに、少なくともアンチセンス配列(ここで、該アンチセンス配列は、該センス配列と部分的に相補的である)と場合によりターミネーター調節配列を含んでいるRNA分子を生成させる〕;
及び、
・ 第2のプロモーター(これは、該第1のプロモーターと反対方向にある);
を含んでいる構築物として構成され得る。
・ 該組成物のうちの1種類を含んでいる液体を当該植物の地上部に噴霧すること;
・ 散粉すること、粒剤又は粉剤を土壌中に混和すること、当該植物の周囲に噴霧すること、及び、樹木の場合には、注入すること又は塗りつけること;
・ 該組成物のうちの1種類を含んでいる植物保護混合物を用いて当該植物の種子にコーティング又はフィルムコーティングを施すこと;
などのさまざまな処理方法を用いて、本発明の対象である殺有害生物剤組成物を施用することが可能であるということを意味するものと理解される。
・ 茎葉処理では、0.0001〜10,000g/ha、好ましくは、0,0001〜1000g/ha、さらに好ましくは、0.001〜300g/haである;灌注又は滴下施用の場合、特に、ロックウール又はパーライトなどの不活性底土を用いる限り、該薬量は低減させることも可能である;
・ 種子処理では、種子100kg当たり0.0001〜200g、好ましくは、種子100kg当たり0.001〜150gである;
・ 土壌処理では、0.0001〜10,000g/ha、好ましくは、0.001〜5,000g/haである。
(i) 植物細胞を本発明によるキメラ遺伝子を用いて形質転換させる段階;
(ii) そのように形質転換された細胞を該構築物の転写を可能とする条件下に置く段階;
(iii) 該細胞を該病原体と接触させる段階;
を含んでいる。
(i) 植物細胞を本発明によるキメラ遺伝子を用いて形質転換させる段階;
(ii) そのように形質転換された細胞を該構築物の転写を可能とする条件下に置く段階;
(iii) 該細胞を該病原体と接触させる段階;
を含んでいる。
(i) 植物細胞を本発明によるキメラ遺伝子を用いて形質転換させる段階;
(ii) そのように形質転換された細胞を該構築物の転写を可能とする条件下に置く段階;
(iii) 該細胞を該病原体と接触させる段階;
を含んでおり、その際、当該植物は、ダイズ植物、ナタネ植物、イネ植物又はジャガイモ植物である。
(1) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)に由来する殺虫性結晶タンパク質又はその殺虫活性を示す一部分、例えば、クリックモアら「Crickmore et al. (1998, Microbiology and Molecular Biology Reviews, 62:807−813」によって記載され、クリックモアら「Crickmore et al. (2005)」によって、オンライン「http://www.lifesci.sussex.ac.uk/Home/Neil_Crickmore/Bt/」上で「バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)毒素命名法」において更新された殺虫性結晶タンパク質又はその殺虫活性を示す一部分、例えば、Cryタンパク質類(Cry1Ab、Cry1Ac、Cry1B、Cry1C、Cry1D、Cry1F、Cry2Ab、Cry3Aa、又は、Cry3Bb)のタンパク質若しくはその殺虫活性を示す一部分(例えば、EP−A 1999141、及び、WO 2007/107302)、又は、例えば米国特許出願第12/249,016に記載されている合成遺伝子によってコードされているタンパク質;又は、
(2) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)に由来する第2の別の結晶タンパク質又はその一部分の存在下において殺虫活性を示す、バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)に由来する結晶タンパク質又はその一部分、例えば、Cry34結晶タンパク質とCry35結晶タンパク質で構成されているバイナリートキシン(Nat. Biotechnol. 2001, 19, 668−72; Applied Environm. Microbiol. 2006, 71, 1765−1774)、又は、Cry1A若しくはCry1Fタンパク質とCry2Aa若しくはCry2Ab若しくはCry2Aeタンパク質で構成されているバイナリートキシン(米国特許出願第12/214,022号、及び、EP−A 2300618);又は、
(3) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)に由来する種々の殺虫性結晶タンパク質の一部分を含んでいる殺虫性ハイブリッドタンパク質、例えば、上記(1)のタンパク質のハイブリッド、又は、上記(2)のタンパク質のハイブリッド、例えば、トウモロコシイベントMON89034で産生されるCry1A.105タンパク質(WO 2007/027777);又は、
(4) 上記(1)〜(3)のいずれか1つのタンパク質において、標的昆虫種に対するさらに強い殺虫活性を得るために、及び/又は、影響を受ける標的昆虫種の範囲を拡大するために、及び/又は、クローニング若しくは形質転換に際してコード化DNA中に導入された変化に起因して、幾つかのアミノ酸(特に、1〜10のアミノ酸)が別のアミノ酸で置き換えられていているもの、例えば、トウモロコシイベントMON863若しくはMON88017におけるCry3Bb1タンパク質又はトウモロコシイベントMIR604におけるCry3Aタンパク質;又は、
(5) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)又はバシルス・セレウス(Bacillus cereus)に由来する殺虫性分泌タンパク質又はその殺虫活性を示す一部分、例えば、「http://www.lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/vip.html」において挙げられている栄養生長期殺虫性タンパク質(vegetative insecticidal protein)(VIP)、例えば、VIP3Aaタンパク質類のタンパク質;又は、
(6) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)又はバシルス・セレウス(Bacillus cereus)に由来する第2の分泌タンパク質の存在下において殺虫活性を示す、バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)又はバシルス・セレウス(Bacillus cereus)に由来する分泌タンパク質、例えば、VIP1Aタンパク質とVIP2Aタンパク質で構成されているバイナリートキシン(WO 94/21795);又は、
(7) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)又はバシルス・セレウス(Bacillus cereus)に由来する種々の分泌タンパク質の一部分を含んでいる殺虫性ハイブリッドタンパク質、例えば、上記(1)のタンパク質のハイブリッド、又は、上記(2)のタンパク質のハイブリッド;又は、
(8) 上記(5)〜(7)のいずれか1つのタンパク質において、標的昆虫種に対するさらに強い殺虫活性を得るために、及び/又は、影響を受ける標的昆虫種の範囲を拡大するために、及び/又は、クローニング若しくは形質転換に際してコード化DNA中に導入された変化(それでも、まだ、殺虫性タンパク質をコードしている)に起因して、幾つかのアミノ酸(特に、1〜10のアミノ酸)が別のアミノ酸で置き換えられていているもの、例えば、ワタイベントCOT102におけるVIP3Aaタンパク質;又は、
(9) バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)に由来する結晶タンパク質の存在下において殺虫活性を示す、バシルス・ツリンギエンシス(Bacillus thuringiensis)又はバシルス・セレウス(Bacillus cereus)に由来する分泌タンパク質、例えば、VIP3とCry1A若しくはCry1Fで構成されているバイナリートキシン(米国特許出願第61/126083号、及び、米国特許出願第61/195019号)、又は、VIP3タンパク質とCry2Aaタンパク質若しくはCry2Abタンパク質若しくはCry2Aeタンパク質で構成されているバイナリートキシン(米国特許出願第12/214,022号、及び、EP−A 2300618);又は、
(10) 上記(9)のタンパク質において、標的昆虫種に対するさらに強い殺虫活性を得るために、及び/又は、影響を受ける標的昆虫種の範囲を拡大するために、及び/又は、クローニング若しくは形質転換に際してコード化DNA中に導入された変化(それでも、まだ、殺虫性タンパク質をコードしている)に起因して、幾つかのアミノ酸(特に、1〜10のアミノ酸)が別のアミノ酸で置き換えられていているもの。
(1) 植物細胞内又は植物内におけるポリ(ADP−リボース)ポリメラーゼ(PARP)遺伝子の発現及び/又は活性を低減させることが可能な導入遺伝子を含んでいる植物(WO 00/04173、WO /2006/045633、EP−A 1807519又はEP−A 2018431に記述されている);
(2) 植物又は植物細胞のPARGコード化遺伝子の発現及び/又は活性を低減させることが可能なストレス耐性を強化する導入遺伝子を含んでいる植物(例えば、WO 2004/090140などに記述されている);
(3) ニコチンアミダーゼ、ニコチン酸ホスホリボシルトランスフェラーゼ、ニコチン酸モノヌクレオチドアデニルトランスフェラーゼ、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドシンテターゼ又はニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼを包含するニコチンアミドアデニンジヌクレオチドサルベージ合成経路の植物機能性酵素(plant−functional enzyme)をコードするストレス耐性を強化する導入遺伝子を含んでいる植物(例えば、EP−A 1794306、WO 2006/133827、WO 2007/107326、EP−A 1999263又はWO 2007/107326などに記述されている)。
(1) 野生型の植物細胞又は植物において合成された澱粉と比較して、その物理化学的特性〔特に、アミロース含有量若しくはアミロース/アミロペクチン比、枝分かれ度、平均鎖長、側鎖分布、粘性挙動、ゲル化強度(gelling strength)、澱粉粒径及び/又は澱粉粒子形態〕が変えられていて、特定の用途により適した変性澱粉を合成するトランスジェニック植物。変性澱粉を合成する該トランスジェニック植物は、例えば、EP−A 0571427、WO 95/04826、EP−A 0719338、WO 96/15248、WO 96/19581、WO 96/27674、WO 97/11188、WO 97/26362、WO 97/32985、WO 97/42328、WO 97/44472、WO 97/45545、WO 98/27212、WO 98/40503、WO 99/58688、WO 99/58690、WO 99/58654、WO 00/08184、WO 00/08185、WO 00/08175、WO 00/28052、WO 00/77229、WO 01/12782、WO 01/12826、WO 02/101059、WO 03/071860、WO 04/056999、WO 05/030942、WO 2005/030941、WO 2005/095632、WO 2005/095617、WO 2005/095619、WO 2005/095618、WO 2005/123927、WO 2006/018319、WO 2006/103107、WO 2006/108702、WO 2007/009823、WO 00/22140、WO 2006/063862、WO 2006/072603、WO 02/034923、WO 2008/017518、WO 2008/080630、WO 2008/080631、EP 07090007.1、WO 2008/090008、WO 01/14569、WO 02/79410、WO 03/33540、WO 2004/078983、WO 01/19975、WO 95/26407、WO 96/34968、WO 98/20145、WO 99/12950、WO 99/66050、WO 99/53072、US 6,734,341、WO 00/11192、WO 98/22604、WO 98/32326、WO 01/98509、WO 01/98509、WO 2005/002359、US 5,824,790、US 6,013,861、WO 94/04693、WO 94/09144、WO 94/11520、WO 95/35026、WO 97/20936、WO 2010/012796、WO 2010/003701に開示されている;
(2) 非澱粉炭水化物ポリマーを合成するか又は遺伝子組換えがなされていない野生型植物と比較して改変された特性を有する非澱粉炭水化物ポリマーを合成するトランスジェニック植物。その例は、ポリフルクトース(特に、イヌリン型及びレバン型のポリフルクトース)を産生する植物(EP−A 0663956、WO 96/01904、WO 96/21023、WO 98/39460及びWO 99/24593に開示されている)、α−1,4−グルカン類を産生する植物(WO 95/31553、US 2002031826、US 6,284,479、US 5,712,107、WO 97/47806、WO 97/47807、WO 97/47808及びWO 00/14249に開示されている)、α−1,6−分枝 α−1,4−グルカン類を産生する植物(WO 00/73422に開示されている)、及び、アルテルナンを産生する植物(WO 00/47727、WO 00/73422、EP 06077301.7、US 5,908,975及びEP−A 0728213などに開示されている)である;
(3) ヒアルロナンを産生するトランスジェニック植物(例えば、WO 2006/032538、WO 2007/039314、WO 2007/039315、WO 2007/039316、JP−A 2006−304779及びWO 2005/012529などに開示されている)。
(a) 改変された形態のセルロースシンターゼ遺伝子を含んでいる植物(例えば、ワタ植物)(WO 98/00549に記述されている);
(b) 改変された形態のrsw2相同核酸又はrsw3相同核酸を含んでいる植物(例えば、ワタ植物)(WO 2004/053219に記述されている);
(c) スクロースリン酸シンターゼの発現が増大している植物(例えば、ワタ植物)(WO 01/17333に記述されている);
(d) スクロースシンターゼの発現が増大している植物(例えば、ワタ植物)(WO 02/45485に記述されている);
(e) 繊維細胞に基づいた原形質連絡のゲーティングのタイミングが(例えば、繊維選択的β−1,3−グルカナーゼのダウンレギュレーションを介して)改変されている植物(例えば、ワタ植物)(WO 2005/017157に記述されているか、又は、WO 2009/143995に記述されている);
(f) 反応性が(例えば、nodCを包含するN−アセチルグルコサミントランスフェラーゼ遺伝子の発現及びキチンシンターゼ遺伝子の発現を介して)改変されている繊維を有する植物(例えば、ワタ植物)(WO 2006/136351に記述されている)。
(a) オレイン酸含有量が高いオイルを産生する植物(例えば、ナタネ植物)(例えば、US 5,969,169、US 5,840,946、US 6,323,392又はUS 6,063,947などに記載されている);
(b) リノレン酸含有量が低いオイルを産生する植物(例えば、ナタネ植物)(US 6,270,828、US 6,169,190又はUS 5,965,755に記載されている);
(c) 飽和脂肪酸のレベルが低いオイルを産生する植物(例えば、ナタネ植物)(例えば、US 5,434,283又は米国特許出願第12/668303号などに記載されている)。
− 申請: 当該申請の識別番号。形質転換イベントについての技術的な記述は、APHISから(例えば、APHISのウェブサイトにおいて、該申請番号を参照することによって)入手可能な個々の申請書類の中に見いだすことができる。それらの記述は、参照によって本明細書中に組み入れる。
− 申請の拡張: 拡張が請求されている、先の申請についての言及。
− 会社: 当該申請を提出している事業体の名称。
− 規制物: 関連する植物種。
− トランスジェニック表現型: 形質転換イベントによって植物に付与された形質。
− 形質転換イベント又はライン: 規制除外が請求されている1つ又は複数のイベント(場合により、ラインとも称される)の名称。
− APHIS文書: APHISに請求することが可能な、申請に関してAPHISによって刊行されている種々の文書。
、WO01/041558又はUS−A 2003−188347に記載されている);イベントRT73(ナタネ、除草剤耐性、寄託されていない、WO02/036831又はUS−A 2008−070260に記載されている);イベントT227−1(テンサイ、除草剤耐性、寄託されていない、WO02/44407又はUS−A 2009−265817に記載されている);イベントT25(トウモロコシ、除草剤耐性、寄託されていない、US−A 2001−029014又はWO01/051654に記載されている);イベントT304−40(ワタ、昆虫防除−除草剤耐性、ATCC PTA−8171として寄託されている、US−A 2010−077501又はWO2008/122406に記載されている);イベントT342−142(ワタ、昆虫防除、寄託されていない、WO2006/128568に記載されている);イベントTC1507(トウモロコシ、昆虫防除−除草剤耐性、寄託されていない、US−A 2005−039226又はWO2004/099447に記載されている);イベントVIP1034(トウモロコシ、昆虫防除−除草剤耐性、ATCC PTA−3925として寄託されている、WO03/052073に記載されている)、イベント32316(トウモロコシ、昆虫防除−除草剤耐性、PTA−11507として寄託されている、WO2011/084632に記載されている)、イベント4114(トウモロコシ、昆虫防除−除草剤耐性、PTA−11506として寄託されている、WO2011/084621に記載されている)。
・ うどんこ病(powdery mildew disease)、例えば、
ブルメリア(Blumeria)病、例えば、ブルメリア・グラミニス(Blumeria graminis)に起因するもの;
ポドスファエラ(Podosphaera)病、例えば、ポドスファエラ・レウコトリカ(Podosphaera leucotricha)に起因するもの;
スファエロテカ(Sphaerotheca)病、例えば、スファエロテカ・フリギネア(Sphaerotheca fuliginea)に起因するもの;
ウンシヌラ(Uncinula)病、例えば、ウンシヌラ・ネカトル(Uncinula necator)に起因するもの;
・ さび病(rust disease)、例えば、
ギムノスポランギウム(Gymnosporangium)病、例えば、ギムノスポランギウム・サビナエ(Gymnosporangium sabinae)に起因するもの;
ヘミレイア(Hemileia)病、例えば、ヘミレイア・バスタトリクス(Hemileia vastatrix)に起因するもの;
ファコプソラ(Phakopsora)病、例えば、ファコプソラ・パキリジ(Phakopsora pachyrhizi)又はファコプソラ・メイボミアエ(Phakopsora meibomiae)に起因するもの;
プッシニア(Puccinia)病、例えば、プッシニア・レコンジテ(Puccinia recondite)、プッシニア・グラミニス(Puccinia graminis)又はプッシニア・ストリイホルミス(Puccinia striiformis)に起因するもの;
ウロミセス(Uromyces)病、例えば、ウロミセス・アペンジクラツス(Uromyces appendiculatus)に起因するもの;
・ 卵菌類による病害(Oomycete disease)、例えば、
アルブゴ(Albugo)病、例えば、アルブゴ・カンジダ(Albugo candida)に起因するもの;
ブレミア(Bremia)病、例えば、ブレミア・ラクツカエ(Bremia lactucae)に起因するもの;
ペロノスポラ(Peronospora)病、例えば、ペロノスポラ・ピシ(Peronospora pisi)又はペロノスポラ・ブラシカエ(P. brassicae)に起因するもの;
フィトフトラ(Phytophthora)病、例えば、フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophthora infestans)に起因するもの;
プラスモパラ(Plasmopara)病、例えば、プラスモパラ・ビチコラ(Plasmopara viticola)に起因するもの;
プセウドペロノスポラ(Pseudoperonospora)病、例えば、プセウドペロノスポラ・フムリ(Pseudoperonospora humuli)又はプセウドペロノスポラ・クベンシス(Pseudoperonospora cubensis)に起因するもの;
ピシウム(Pythium)病、例えば、ピシウム・ウルチムム(Pythium ultimum)に起因するもの;
・ 葉斑点性、葉汚斑性及び葉枯れ性の病害(leafspot, leaf blotch and leaf blight disease)、例えば、
アルテルナリア(Alternaria)病、例えば、アルテルナリア・ソラニ(Alternaria solani)に起因するもの;
セルコスポラ(Cercospora)病、例えば、セルコスポラ・ベチコラ(Cercospora beticola)に起因するもの;
クラジオスポルム(Cladiosporum)病、例えば、クラジオスポリウム・ククメリヌム(Cladiosporium cucumerinum)に起因するもの;
コクリオボルス(Cochliobolus)病、例えば、コクリオボルス・サチブス(Cochliobolus sativus)(分生子形態:Drechslera、異名:Helminthosporium)又はコクリオボルス・ミヤベアヌス(Cochliobolus miyabeanus)に起因するもの;
コレトトリクム(Colletotrichum)病、例えば、コレトトリクム・リンデムタニウム(Colletotrichum lindemuthanium)に起因するもの;
シクロコニウム(Cycloconium)病、例えば、シクロコニウム・オレアギヌム(Cycloconium oleaginum)に起因するもの;
ジアポルテ(Diaporthe)病、例えば、ジアポルテ・シトリ(Diaporthe citri)に起因するもの;
エルシノエ(Elsinoe)病、例えば、エルシノエ・ファウセッチイ(Elsinoe fawcettii)に起因するもの;
グロエオスポリウム(Gloeosporium)病、例えば、グロエオスポリウム・ラエチコロル(Gloeosporium laeticolor)に起因するもの;
グロメレラ(Glomerella)病、例えば、グロメレラ・シングラタ(Glomerella cingulata)に起因するもの;
グイグナルジア(Guignardia)病、例えば、グイグナルジア・ビドウェリ(Guignardia bidwelli)に起因するもの;
レプトスファエリア(Leptosphaeria)病、例えば、レプトスファエリア・マクランス(Leptosphaeria maculans)、レプトスファエリア・ノドルム(Leptosphaeia nodorum)に起因するもの;
マグナポルテ(Magnaporthe)病、例えば、マグナポルテ・グリセア(Magnaporthe grisea)に起因するもの;
ミコスファエレラ(Mycosphaerella)病、例えば、ミコスファエレラ・グラミニコラ(Mycosphaerella graminicola)、ミコスファエレラ・アラキジコラ(Mycosphaerella arachidicola)、ミコスファエレラ・フィジエンシス(Mycosphaerella fijiensis)に起因するもの;
ファエオスファエリア(Phaeosphaeria)病、例えば、ファエオスファエリア・ノドルム(Phaeosphaeria nodorum)に起因するもの;
ピレノホラ(Pyrenophora)病、例えば、ピレノホラ・テレス(Pyrenophora teres)又はピレノホラ・トリチシ・レペンチス(Pyrenophora tritici repentis)に起因するもの;
ラムラリア(Ramularia)病、例えば、ラムラリア・コロ−シグニ(Ramularia collo−cygni)又はラムラリア・アレオラ(Ramularia areola)に起因するもの;
リンコスポリウム(Rhynchosporium)病、例えば、リンコスポリウム・セカリス(Rhynchosporium secalis)に起因するもの;
セプトリア(Septoria)病、例えば、セプトリア・アピイ(Septoria apii)又はセプトリア・リコペルシシ(Septoria lycopersici)に起因するもの;
チフラ(Typhula)病、例えば、チフラ・インカルナタ(Typhula incarnata)に起因するもの;
ベンツリア(Venturia)病、例えば、ベンツリア・イナエクアリス(Venturia inaequalis)に起因するもの;
・ 根、葉鞘及び茎の病害(root, sheath and stem disease)、例えば、
コルチシウム(Corticium)病、例えば、コルチシウム・グラミネアルム(Corticium graminearum)に起因するもの;
フサリウム(Fusarium)病、例えば、フサリウム・オキシスポルム(Fusarium oxysporum)に起因するもの;
ガエウマンノミセス(Gaeumannomyces)病、例えば、ガエウマンノミセス・グラミニス(Gaeumannomyces graminis)に起因するもの;
リゾクトニア(Rhizoctonia)病、例えば、リゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani)に起因するもの;
サロクラジウム(Sarocladium)病、例えば、サロクラジウム・オリザエ(Sarocladium oryzae)に起因するもの;
スクレロチウム(Sclerotium)病、例えば、スクレロチウム・オリザエ(Sclerotium oryzae)に起因するもの;
タペシア(Tapesia)病、例えば、タペシア・アクホルミス(Tapesia acuformis)に起因するもの;
チエラビオプシス(Thielaviopsis)病、例えば、チエラビオプシス・バシコラ(Thielaviopsis basicola)に起因するもの;
・ 穂の病害(ear and panicle disease)、例えば、
アルテルナリア(Alternaria)病、例えば、アルテルナリア属種(Alternaria spp.)に起因するもの;
アスペルギルス(Aspergillus)病、例えば、アスペルギルス・フラブス(Aspergillus flavus)に起因するもの;
クラドスポリウム(Cladosporium)病、例えば、クラドスポリウム属種(Cladosporium spp.)に起因するもの;
クラビセプス(Claviceps)病、例えば、クラビセプス・プルプレア(Claviceps purpurea)に起因するもの;
フサリウム(Fusarium)病、例えば、フサリウム・クルモルム(Fusarium culmorum)に起因するもの;
ジベレラ(Gibberella)病、例えば、ジベレラ・ゼアエ(Gibberella zeae)に起因するもの;
モノグラフェラ(Monographella)病、例えば、モノグラフェラ・ニバリス(Monographella nivalis)に起因するもの;
・ 黒穂病(smut and bunt disease)、例えば、
スファセロテカ(Sphacelotheca)病、例えば、スファセロテカ・レイリアナ(Sphacelotheca reiliana)に起因するもの;
チレチア(Tilletia)病、例えば、チレチア・カリエス(Tilletia caries)に起因するもの;
ウロシスチス(Urocystis)病、例えば、ウロシスチス・オクルタ(Urocystis occulta)に起因するもの;
ウスチラゴ(Ustilago)病、例えば、ウスチラゴ・ヌダ(Ustilago nuda)に起因するもの;
・ 果実の腐敗性及び黴性の病害(fruit rot and mould disease)、例えば、
アスペルギルス(Aspergillus)病、例えば、アスペルギルス・フラブス(Aspergillus flavus)に起因するもの;
ボトリチス(Botrytis)病、例えば、ボトリチス・シネレア(Botrytis cinerea)に起因するもの;
ペニシリウム(Penicillium)病、例えば、ペニシリウム・エキスパンスム(Penicillium expansum)に起因するもの;
リゾプス(Rhizopus)病、例えば、リゾプス・ストロニフェル(Rhizopus stolonifer)に起因するもの;
スクレロチニア(Sclerotinia)病、例えば、スクレロチニア・スクレロチオルム(Sclerotinia sclerotiorum)に起因するもの;
ベルチシリウム(Verticilium)病、例えば、ベルチシリウム・アルボアトルム(Verticilium alboatrum)に起因するもの;
・ 種子及び土壌が媒介する腐朽性、黴性、萎凋性、腐敗性及び苗立ち枯れ性の病害(seed and soilborne decay, mould, wilt, rot and damping−off disease)、
アルテルナリア(Alternaria)病、例えば、アルテルナリア・ブラシシコラ(Alternaria brassicicola)に起因するもの;
アファノミセス(Aphanomyces)病、例えば、アファノミセス・エウテイケス(Aphanomyces euteiches)に起因するもの;
アスコキタ(Ascochyta)病、例えば、アスコキタ・レンチス(Ascochyta lentis)に起因するもの;
アスペルギルス(Aspergillus)病、例えば、アスペルギルス・フラブス(Aspergillus flavus)に起因するもの;
クラドスポリウム(Cladosporium)病、例えば、クラドスポリウム・ヘルバルム(Cladosporium herbarum)に起因するもの;
コクリオボルス(Cochliobolus)病、例えば、コクリオボルス・サチブス(Cochliobolus sativus)(分生子形態:Drechslera、Bipolaris 異名:Helminthosporium)に起因するもの;
コレトトリクム(Colletotrichum)病、例えば、コレトトリクム・ココデス(Colletotrichum coccodes)に起因するもの;
フサリウム(Fusarium)病、例えば、フサリウム・クルモルム(Fusarium culmorum)に起因するもの;
ジベレラ(Gibberella)病、例えば、ジベレラ・ゼアエ(Gibberella zeae)に起因するもの;
マクロホミナ(Macrophomina)病、例えば、マクロホミナ・ファセオリナ(Macrophomina phaseolina)に起因するもの;
モノグラフェラ(Monographella)病、例えば、モノグラフェラ・ニバリス(Monographella nivalis)に起因するもの;
ペニシリウム(Penicillium)病、例えば、ペニシリウム・エキスパンスム(Penicillium expansum)に起因するもの;
ホマ(Phoma)病、例えば、ホマ・リンガム(Phoma lingam)に起因するもの;
ホモプシス(Phomopsis)病、例えば、ホモプシス・ソジャエ(Phomopsis sojae)に起因するもの;
フィトフトラ(Phytophthora)病、例えば、フィトフトラ・カクトルム(Phytophthora cactorum)に起因するもの;
ピレノホラ(Pyrenophora)病、例えば、ピレノホラ・グラミネア(Pyrenophora graminea)に起因するもの;
ピリクラリア(Pyricularia)病、例えば、ピリクラリア・オリザエ(Pyricularia oryzae)に起因するもの;
ピシウム(Pythium)病、例えば、ピシウム・ウルチムム(Pythium ultimum)に起因するもの;
リゾクトニア(Rhizoctonia)病、例えば、リゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani)に起因するもの;
リゾプス(Rhizopus)病、例えば、リゾプス・オリザエ(Rhizopus oryzae)に起因するもの;
スクレロチウム(Sclerotium)病、例えば、スクレロチウム・ロルフシイ(Sclerotium rolfsii)に起因するもの;
セプトリア(Septoria)病、例えば、セプトリア・ノドルム(Septoria nodorum)に起因するもの;
チフラ(Typhula)病、例えば、チフラ・インカルナタ(Typhula incarnata)に起因するもの;
ベルチシリウム(Verticillium)病、例えば、ベルチシリウム・ダーリアエ(Verticillium dahliae)に起因するもの;
・ 腐乱性病害、開花病及び枯れ込み性病害(canker, broom and dieback disease)、例えば、
ネクトリア(Nectria)病、例えば、ネクトリア・ガリゲナ(Nectria galligena)に起因するもの;
・ 枯損性病害(blight disease)、例えば、
モニリニア(Monilinia)病、例えば、モニリニア・ラキサ(Monilinia laxa)に起因するもの;
・ 葉水泡性病害又は縮葉病(leaf blister or leaf curl disease)、例えば、
エキソバシジウム(Exobasidium)病、例えば、エキソバシジウム・ベキサンス(Exobasidium vexans)に起因するもの;
タフリナ(Taphrina)病、例えば、タフリナ・デホルマンス(Taphrina deformans)に起因するもの;
・ 木本植物の衰退性病害(decline disease of wooden plant)、例えば、
エスカ(Esca)病、例えば、ファエオモニエラ・クラミドスポラ(Phaeomoniella clamydospora)に起因するもの;
ユーティパダイバック病(Eutypa dyeback)、例えば、ユーティパ・ラタ(Eutypa lata)に起因するもの;
ガノデルマ(Ganoderma)病、例えば、ガノデルマ・ボニネンセ(Ganoderma boninense)に起因するもの;
リギドポルス(Rigidoporus)病、例えば、リギドポルス・リグノスス(Rigidoporus lignosus)に起因するもの;
・ 花及び種子の病害、例えば、
ボトリチス(Botrytis)病、例えば、ボトリチス・シネレア(Botrytis cinerea)に起因するもの;
・ 塊茎の病害、例えば、
リゾクトニア(Rhizoctonia)病、例えば、リゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani)に起因するもの;
ヘルミントスポリウム(Helminthosporium)病、例えば、ヘルミントスポリウム・ソラニ(Helminthosporium solani)に起因するもの;
・ 根瘤病(club root diseases)、例えば、
プラスモジオホラ(Plasmodiophora)病、例えば、プラスモジオホラ・ブラシカエ(Plamodiophora brassicae)に起因するもの;
・ 例えば以下のものなどの細菌性微生物に起因する病害:
キサントモナス属各種(Xanthomonas species)、例えば、キサントモナス・カムペストリス pv.オリザエ(Xanthomonas campestris pv. oryzae);
シュードモナス属各種(Pseudomonas species)、例えば、シュードモナス・シリンガエ pv.ラクリマンス(Pseudomonas syringae pv. lachrymans);
エルウィニア属各種(Erwinia species)、例えば、エルウィニア・アミロボラ(Erwinia amylovora)。
配列識別番号1: アスペルギルス・クラバツス(Aspergillus clavatus)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号2: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号3: アスペルギルス・フミガツス(Aspergillus fumigatus)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号4: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号5: ボトリチス・シネレア(Botrytis cinerea)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号6: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号7: フサリウム・グラミネアルム(Fusarium graminearum)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号8: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号9: フサリウム・オキシスポルム(Fusarium oxysporum)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号10: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号11: フサリウム・ベルチシロイデス(Fusarium verticilloides)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号12: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号13: フサリウム・ベルチシロイデス(Fusarium verticilloides)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号14: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号15: ミコスファエレラ・フィジエンシス(Mycosphaerella fijiensis)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号16: 上記核酸配列によってコードされるポリペプチド;
配列識別番号17: マグナポルテ・グリセア(Magnaporthe grisea)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号18: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号19: モノリオフトラ・ペルニシオサ(Monoliophthora perniciosa)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号20: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号21: プッシニア・グラミニス(Puccinia graminis)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号22: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号23: フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophthora infestans)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号24: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号25: フィトフトラ・ラモルム(Phytophthora ramorum)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号26: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号27: フィトフトラ・ソジャエ(Phytophthora sojae)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号28: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号29: ピレノホラ・トリチシ−レペンチス(Pyrenophora tritici−repentis)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号30: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号31: スクレロチニア・スクレロチオルム(Sclerotinia sclerotiorum)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号32: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号33: トリコデルマ・レエセイ(Trichoderma reesei)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号34: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号35: ウスチラゴ・マイジス(Ustilago maydis)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号36: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号37: ベルチシリウム・アルボ−アトルム(Verticillium albo−atrum)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号38: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号39: ミコスファエレラ・グラミニコラ(Mycosphaerella graminicola)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号40: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号41: フサリウム・モニリホルム(Fusarium moniliform)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号42: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号43: クラビセプス・プルプレア(Claviceps purpurea)に由来するサッカロピンデヒドロゲナーゼ(LYS1);
配列識別番号44: 上記核酸配列によってコードされるタンパク質;
配列識別番号45: プライマー SACdh_Pi_T7_F;
配列識別番号46: プライマー SACdh_Pi_T7_R;
配列識別番号47: プライマー Actin forward;
配列識別番号48: プライマー Actin reverse;
配列識別番号49: プライマー β−Tub forward;
配列識別番号50: プライマー β−Tub reverse;
配列識別番号51: プライマー SACdh forward;
配列識別番号52: プライマー SACdh reverse;
配列識別番号53: プライマー pBINB33−1;
配列識別番号54: プライマー pBINB33−2;
配列識別番号55: プライマー SacdhPI R;
配列識別番号56: プライマー SacdhPI F;
配列識別番号57: プライマー LYS1 Pot 117−F;
配列識別番号58: プライマー LYS1 Pot 117−R。
アッセイは、モンペリエにあるCIRAD(Centre de cooperation internationale en recherche agronomique pour le developpement)の植物病理学研究室のコレクションに由来するマグナポルテ・グリセア(Magnaporthe grisea)野生型系統P1.2を用いて実施した。培養に関する条件、コメ−寒天培地の組成、維持管理及び胞子形成、並びに、プロトプラストの調製に関しては、「Silue et al. (1998)」に記載されている。
マグナポルテ・グリセア(Magnaporthe grisea)サッカロピンデヒドロゲナーゼ(SACdh)遺伝子配列Lys−1(MGG_01359.6:1426bp)は、「Broad Institute」(http://www.broadinstitute.org/)から入手した。ヌクレオチド(301〜626)を含んでいる約325bpの領域をdsRNAに対して選択し、「Geneart company」によって合成し、プラスミドにクローン化した。
フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophthora infestans)系統PT78を、暗所で、9cmのペトリ皿の中のエンドウマメ寒天培地(125g/Lの茹でて粉砕したエンドウマメ、20g/Lの寒天、100mg/Lのカルベニシリン)の上で、21℃でインビトロ培養した。15日毎に、新しい培地に菌糸体の4つの5mm立方体プラグを用いて接種した。
フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophthora infestans)サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子配列Lys−1(PITG_03530:3020bp)は、「Broad Institute」のフィトフトラ・インフェスタンス(P.infestans)データベースから入手した。ヌクレオチド(2251〜2750)を含んでいる、BLOCKit RNAi designer ソフトウェア(Invitrogen)に従って最良のsiRNAを提供する領域約500bpを、「Geneart company」によって合成し、プラスミド0920357_SacDH_Pi_pMAにクローン化した。
cDNAの合成及びリアルタイムRT−PCRに対して充分な量のRNAを生成させるために、48ウェルプレートの幾つかのウェルを被験dsRNAの1濃度に対してプールした:72時間時点に対して10ウェル、96時間時点に対して6ウェル、120時間時点に対して3ウェル。
(a) 植物発現ベクターIR 47−71の調製
プラスミドpBinARは、以下のように構築された、バイナリーベクタープラスミドpBin19(Bevan, 1984)の誘導体である: カリフラワーモザイクウイルスの35Sプロモーターのヌクレオチド(6909−7437)を含んでいる長さ529bpのフラグメントをプラスミドpDH51(Pietrzak et al, 1986)からEcoR IKpn I フラグメントとして単離し、pUC18のポリリンカーのEcoR I制限部位とKpn I制限部位の間に結紮した。このようにして、プラスミドpUC18−35Sを形成させた。制限酵素Hind III及び制限酵素Pvu IIを使用して、TiプラスミドpTiACHδ(Gielen et al, 1984)のT−DNAのオクトピンシンターゼ遺伝子(遺伝子3)(ヌクレオチド(11749−11939))のポリアデニル化シグナル(3’末端)を含んでいる長さ192bpのフラグメントを、プラスミドpAGV40(Herrera−Estrella et al, 1983)から単離した。Sph IリンカーをPvu Il制限部位に加えた後、該フラグメントをpUC18−35SのSph I制限部位とHind III制限部位の間に結紮した。これにより、pA7が得られた。ここで、35SプロモーターとOcsターミネーターを含んでいるポリリンカー全体を、EcoR IとHind IIIを用いて除去し、適切に切断されたベクターpBin19の中に結紮した。これにより、植物発現ベクターpBinARが得られた(Hofgen and Willmitzer, 1990)。
pBINB33−1: 5’−TCG ACA GGC CTG GAT CCT TAA TTA AAC TAG TCT CGA GGA GCT CGG TAC−3’;
pBINB33−2: 5’−CGA GCT CCT CGA GAC TAG TTT AAT TAA GGA TCC AGG CCT G−3’。
サッカロピンデヒドロゲナーゼ配列(PITG_03530:3020bp)は、フィトフトラ・インフェスタンス(P.infestans) ORF Prot V1データベースから入手した。BLOCKit RNAi designer ソフトウェア(Invitrogen)に従って最良のsiRNAを提供する領域約500bpを、「Geneart company」によって合成した。
スクレロチニア・スクレロチオルム(S.sclerotiorum)Lys1コード配列の351bpの領域(サッカロピンデヒドロゲナーゼ SS1G_06166.1)を「Geneart company(pEPA293)」によって合成し、pHannibalベクター(Wesley et al., 2001)への2段階クローン化を実施するようにデザインされた内部(XbaI、HindIII)制限部位及び外部(XhoI、KpnI)制限部位によってフランキングさせた。その中間体プラスミドは、pHannibal PdKイントロンによって隔てられ且つカリフラワーモザイクウイルス(CaMV)35SプロモーターとOCSターミネーターによって調節されるLys1遺伝子フラグメントの2つの逆方向コピーを有していた。
ファコプソラ・パキリジ(Phakopsora pachirizi)Lys1 E.S.T.(サッカロピンデヒドロゲナーゼ PHAPC_EH247326.1)の364bp領域を「Geneart company(pCED42)」によって合成し、pHannibalベクター(Wesley et al., 2001)への2段階クローン化を実施するようにデザインされた内部(XbaI、HindIII)制限部位及び外部(XhoI、KpnI)制限部位によってフランキングさせた。その中間体プラスミドは、pHannibal PdKイントロンによって隔てられ且つカリフラワーモザイクウイルス(CaMV)35SプロモーターとOCSターミネーターによって調節されるLys1遺伝子フラグメントの2つの逆方向コピーを有していた。
Rocha−Sosaら(1989)によって記載されているように、ジャガイモ(Solanum tuberosum)に由来するパタチン遺伝子B33のプロモーターの制御下にサッカロピンデヒドロゲナーゼに対するコーディング核酸配列を含んでいる植物発現ベクターpEPA262を使用し、アグロバクテリウム(Agrobacterium)を介してジャガイモ植物を形質転換させた。プラスミドpEPA262を用いて形質転換されたトランスジェニックジャガイモ植物は、「537 ES」と命名した。
pART27から誘導されたプラスミドを、エレクトロポレーションによって、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)系統LBA4404(Invitrogen Electromax)に導入した。次いで、得られた細菌系統を、Clough & Bent(PlantJ 1998)によって記載されているように、アラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)Col−0又はシロイヌナズナ(Wassileskija)植物のフローラルディップフィルトレーション(floral dip infiltration)法に使用した。
pFCO31から誘導されたプラスミドを、エレクトロポレーションによって、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)系統LBA4404(Invitrogen Electromax)に導入した。次いで、得られた細菌系統を、以下に記載されているように、ダイズの形質転換に使用した。
ファコプソラ・パキリジ(Phakopsora pachirizi)Lys1に対するdsRNAを発現するダイズ植物を、温室の中の7.5cmポットで成育させた(28.5℃、湿度50%、14時間明期)。恒温器の中で、植物に分生子懸濁液(50mL;10〜15×104胞子/mL[胞子は、接種源としての役目を果たす人為的に感染させたダイズ植物から得た];55cm×34cm×5cmの寸法を有するトレイ1つ当たり、15のポットを含んでいる)を噴霧した。その懸濁液は、0.033%のTween20を含んでいる。均一に確実に接種するためには、多方向噴霧が必要である。次いで、植物を、極めて高い湿度(90%から飽和まで)のもと、約25℃(昼間)及び約20℃(夜間)で、4日間インキュベートする。この期間が経過した後、植物を標準的な成育条件に戻す。アジアダイズさび病の発生について、一定の間隔で評価して、病害の発生及び症状の重症度に関する動力学を追跡する。アジアダイズさび病を用いた全ての実験は、L2安全レベル培養チャンバー又はHCB要件に従う恒温器の中で実施する。
野生型スクレロチニア・スクレロチオルム(S.sclerotiorum)分離株1980真菌及びpac1突然変異株(Rollins,2003)真菌の発生について、全植物アッセイ(whole plant assay)で調査した。スクレロチニア・スクレロチオルム(S.sclerotiorum)は、ジャガイモデキストロース寒天(PDA、ジャガイモ 200g/L、グルコース 20g/L、寒天 18g/L)の上で4℃で貯蔵した。当該真菌は、PDAを含んでいるペトリ皿の中で、菌糸体のプラグを中心に置くことによって培養し、21℃の静的条件下に4日間維持した。4週齢のシロイヌナズナ(Arabidopsis)の野生型及びトランスジェニック植物に、植物の中心の真菌コロニーの活発に増殖している縁から切り取った直径12mmの寒天−菌糸体プラグを用いて接種した。接種された植物は、生育箱の中で、蛍光白色光を用いた34mmol m−2s−1の光度を有する明期12時間の下、相対湿度100%で21℃に維持し、12時間毎にモニターして、真菌の発生について観察した。病徴は、感染した葉の数並びに病斑の長さ及び幅によってモニターした。
Claims (18)
- (i)真菌サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子又は卵菌サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子の少なくとも18の連続するヌクレオチドと実質的に同一である配列を含んでいる第1鎖;及び、
(ii)前記第1鎖と実質的に相補的である配列を含んでいる第2鎖;
を含むdsRNA分子、
を含む、植物病原体の防除のための組成物。 - 前記真菌遺伝子又は卵菌遺伝子が、サッカロピンデヒドロゲナーゼ活性を有するポリペプチドをコードし、かつ以下のものからなる群から選択される、請求項1に記載の組成物:
(a) 以下の配列識別番号に示されている配列を含んでいるポリヌクレオチド:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43;
(b) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44;
(c) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリヌクレオチドと少なくとも90%の配列同一性を有するポリヌクレオチド:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43;
(d) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリペプチドと少なくとも90%の配列同一性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチド:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44:
(e) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリヌクレオチドと緊縮条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド:1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43;及び、
(f) 以下の配列識別番号に示されている配列を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと緊縮条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド:2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44。 - 前記(c)のポリヌクレオチドが、配列識別番号1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41又は43に示されている配列を有するポリヌクレオチドと少なくとも95%の配列同一性を有する、請求項2に記載の組成物。
- 前記(d)のポリヌクレオチドが、配列識別番号2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42又は44に示されている配列を有するポリペプチドと少なくとも95%の配列同一性を有するポリペプチドをコードする、請求項2又は3に記載の組成物。
- 農業上許容される支持体、担体、増量剤及び/又は界面活性剤をさらに含んでいることを特徴とする、請求項1〜4のいずれか1項に記載の組成物。
- 植物薬的化合物又は植物成長促進性化合物をさらに含んでいる、請求項1〜5のいずれか1項に記載の組成物。
- 少なくとも1のDNA配列を含み、さらに、5’位と場合により3’位に異種調節要素を含んでいる遺伝子構築物であって、該DNA配列が請求項1〜4のいずれか1項に定義されたdsRNA分子を形成し得ることを特徴とする前記遺伝子構築物を含む、植物細胞を形質転換するための組成物。
- 前記遺伝子構築物がクローニングベクター及び/又は発現ベクターに含まれていることを特徴とする、請求項7に記載の組成物。
- 少なくとも請求項1〜4のいずれか1項に定義されたdsRNA分子を発現することが可能な、トランスジェニック植物細胞。
- 請求項9に記載のトランスジェニック植物細胞を含んでいる、トランスジェニック植物、トランスジェニック種子又はそれらの一部分。
- 前記植物がダイズ植物、ナタネ植物、イネ植物又はジャガイモ植物である、請求項9に記載のトランスジェニック植物細胞又は請求項10に記載のトランスジェニック植物、トランスジェニック種子若しくはそれらの一部分。
- 真菌サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子又は卵菌サッカロピンデヒドロゲナーゼ遺伝子を阻害するdsRNAを発現することが可能なトランスジェニック植物細胞を生成させる方法であって、植物細胞を、少なくとも1のDNA配列を含み、さらに、5’位と場合により3’位に異種調節要素を含んでいる遺伝子構築物であって、該DNA配列が請求項1〜4のいずれか1項に定義されたdsRNA分子を形成し得ることを特徴とする前記遺伝子構築物を用いて形質転換させる段階を含んでいる、前記方法。
- 植物病原体(特に、真菌又は卵菌)を防除する方法であって、該病原体に請求項1〜6のいずれか1項に記載の組成物を与えることを含む、前記方法。
- 植物病原体(特に、真菌又は卵菌)を防除する方法であって、請求項1〜6のいずれか1項に記載の組成物を植物がそこで成育しているか若しくは成育することが可能な土壌、植物の葉及び/若しくは果実又は植物の種子に施用することを特徴とする、前記方法。
- 植物病原体(特に、真菌又は卵菌)を防除する方法であって、該植物病原体の宿主植物に請求項9に記載の形質転換植物細胞を与えることを含む、前記方法。
- 植物病原体の遺伝子の発現を阻害する方法であって、以下の:
(i) 植物細胞を、少なくとも1のDNA配列を含み、さらに、5’位と場合により3’位に異種調節要素を含んでいる遺伝子構築物であって、該DNA配列が請求項1〜4のいずれか1項に定義されたdsRNA分子を形成し得ることを特徴とする前記遺伝子構築物を用いて形質転換させる段階;
(ii) そのように形質転換された細胞を該構築物の転写を可能とする条件下に置く段階;
(iii) 該細胞を該植物病原体と接触させる段階;
を含んでいる、前記方法。 - 前記植物病原体が、マグナポルテ・グリセア(Magnaporthe grisea)、フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophthora infestans)、スクレロチニア・スクレロチオルム(Sclerotinia sclerotiorum)又はファコプソラ・パキリジ(Phakopsora pachyrhizi)である、請求項12〜16のいずれか1項に記載の方法。
- 前記植物が、ダイズ植物、ナタネ植物、イネ植物又はジャガイモ植物である、請求項12〜17のいずれか1項に記載の方法。
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