ES2642512T3

ES2642512T3 - Anticuerpos monoclonales optimizados contra el inhibidor de la ruta del factor tisular (TFPI)

Info

Publication number: ES2642512T3
Application number: ES11751244.2T
Authority: ES
Inventors: Peter Scholz; Zhuozhi Wang; Junliang Pan; Joanna Grudzinska; Christian Votsmeier; Jan Tebbe; Jörg BIRKENFELD; Nina Wobst; Simone BRÜCKNER; Susanne Steinig
Original assignee: Bayer Healthcare LLC
Current assignee: Bayer Healthcare LLC
Priority date: 2010-03-01
Filing date: 2011-03-01
Publication date: 2017-11-16
Anticipated expiration: 2031-03-01
Also published as: WO2011109452A1; NZ702494A; CN102939098A; KR101903931B1; US20120108796A1; PL3345615T3; ME03578B; MY174760A; ECSP19025350A; JP2019089807A; CL2017003218A1; EA032189B1; MX2012010198A; CN102939098B; KR101974980B1; RS59830B1; NZ602115A; US20120329996A1; CU20120126A7; CN105001335B

Description

Anticuerpos monoclonales optimizados contra el inhibidor de la ruta del factor tisular (TFPI)

Presentación del listado de secuencias

El listado de secuencias asociado a la presente solicitud está registrado en formato electrónico en EFS-Web.

Campo de las realizaciones

Se proporcionan anticuerpos monoclonales aislados y fragmentos de los mismos que se unen al inhibidor de la ruta del factor tisular (TFPI, tissue factor pathway inhibitor) humano

Antecedentes

La coagulación de la sangre es un proceso en el que la sangre forma coágulos estables para detener la hemorragia. El proceso implica una serie de proenzimas y procofactores (o “factores de coagulación”) circulantes en la sangre. Dichas proenzimas y procofactores interactúan a través de diversas rutas a través de las cuales se convierten, ya sea secuencial o simultáneamente, a la forma activada. En última instancia, el proceso tiene como resultado la activación de protrombina en trombina a través del Factor X activado (FXa) en presencia del Factor Va, calcio iónico y plaquetas. La trombina activada, a su vez, induce la agregación plaquetaria y convierte fibrinógeno en fibrina, que es reticulado después mediante el Factor XIII activado (FXIIIa) para formar un coágulo.

El proceso que conduce a la activación del Factor X puede tener lugar a través de dos rutas distintas: la ruta de activación por contacto (lo que se conocía anteriormente como la ruta intrínseca” y la ruta del factor tisular (lo que se conocía anteriormente como la ruta extrínseca). Antes se pensaba que la cascada de coagulación consistía en dos rutas de igual importancia unidas en una ruta común. Actualmente, se sabe que la ruta principal para la iniciación de la coagulación de la sangre es la ruta del factor tisular.

El factor tisular (TF) puede activar el Factor X en combinación con el Factor VII activado (FVIIa). El complejo del Factor VIIa y su co-factor esencial, TF, es un potente iniciador de la cascada de coagulación.

El inhibidor de la ruta del factor tisular ("TFPI") controla negativamente la ruta de factor tisular de la coagulación. TFPI es un inhibidor del complejo FVIIa/TF de retroalimentación dependiente de FXa, natural. Es un miembro de los inhibidores de serin-proteasa de tipo Kunitz multivalentes. Fisiológicamente, TFPI se une al Factor X activado (FXa) para formar un complejo heterodimérico, que interactúa posteriormente con el complejo FVIIa/TF para inhibir su actividad, apagando así la ruta de coagulación del factor tisular. En principio, el bloqueo de la actividad de TFPI puede restaurar la actividad de FXa y FVIIa/T-f prolongado así la duración de la acción de la ruta del factor tisular y ampliando la generación de FXa, que es el defecto habitual de la hemofilia A y B.

De hecho, parte de las pruebas experimentales preliminares ha indicado que el bloqueo de la actividad de TFPI mediante anticuerpos contra TFPI normaliza el tiempo de coagulación prolongado y acorta el tiempo de hemorragia. Por ejemplo, Nordfang y col. demostraron que se normalizaba el tiempo de protrombina diluido prolongado del plasma hemofílico tras el tratamiento del plasma con anticuerpos para TFPI (Thromb. Haemost., 1991, 66(4): 464467). De manera similar, Erhardtsen y col. demostraron que el tiempo de hemorragia en un modelo de conejo con hemofilia A se acortaba significativamente mediante anticuerpos anti-TFPI (Blood Coagulation y Fibrinolysis, 1995, 6: 388-394). Estos estudios señalan que la inhibición de TFPI mediante anticuerpos anti-TFPI puede ser útil para el tratamiento de hemofilia A o B. En estos estudios se empleó únicamente anticuerpo anti-TFPI policlonal.

Mediante el uso de técnicas del hibridoma, se prepararon e identificaron anticuerpos monoclonales contra TFPI humano recombinante (rhTFPI). Véase Yang y col., Chin. Med. J., 1998, 111(8): 718-721. Se sometió a ensayo el efecto del anticuerpo monoclonal sobre el tiempo de protrombina diluido (PT) y el tiempo de tromboplastina parcial activado (APTT). Los experimentos demostraron que el anticuerpo monoclonal anti-TFPI acortaba el tiempo de coagulación de tromboplastina diluido de plasma con deficiencia en Factor IX. Esto señala que la ruta del factor tisular desempeña un importante papel no solamente en la coagulación fisiológica, sino también en la hemorragia de la hemofilia (Yang y col., Hunan Yi Ke Da Xue Xue Bao, 1997, 22(4): 297-300).

Por consiguiente, los anticuerpos específicos para TFPI son necesarios para tratar enfermedades hematológicas y cáncer.

Generalmente, se han generado anticuerpos terapéuticos para enfermedades humanas por ingeniería genética para crear anticuerpos totalmente humanos o humanizados, quiméricos, murinos. Se ha demostrado que los anticuerpos monoclonales murinos tienen un uso limitado como agentes terapéuticos dada su corta semi-vida en suero, la incapacidad para desencadenar funciones efectoras humanas y la producción de anticuerpos anti-ratón humanos (Brekke y Sandlie, "Therapeutic Antibodies for Human Diseases at the Dawn de the Twenty-first Century," Nature 2, 53, 52-62, Jan. 2003). Se ha demostrado que los anticuerpos quiméricos dan lugar a respuestas de anticuerpo antiquimérico humano. Los anticuerpos humanizados minimizan además el componente ratón de los anticuerpos. Sin embargo, un anticuerpo completamente humano evita la inmunogenicidad asociada con elementos murinos

completamente. Por lo tanto, existe la necesidad de desarrollar anticuerpos completamente humanos para evitar la inmunogenicidad asociada con otras formas de anticuerpos monoclonales obtenidos por ingeniería genética. En particular, el tratamiento profiláctico crónico, como el que sería necesario para tratar la hemofilia, con un anticuerpo monoclonal anti-TFPI presenta un alto riesgo de desarrollar una respuesta inmune a la terapia si se utiliza un anticuerpo con un componente murino o de origen murino debido a la frecuente dosificación requerida y la larga duración de la terapia. Por ejemplo, la terapia de anticuerpo para hemofilia A puede requerir una dosificación semanal de por vida para un paciente. Esto supondría un desafío continuo para el sistema inmune. Por lo tanto, existe la necesidad de contar con un anticuerpo completamente humano para terapia de anticuerpo contra la hemofilia y las deficiencias o los defectos genéticos y adquiridos en la coagulación.

Se han fabricado anticuerpos terapéuticos por tecnología del hibridoma descrita por Koehler y Milstein en "Continuous Cultures de Fused Cells Secreting Antibody de Predefined Specificity," Nature 256, 495-497 (1975). También se pueden fabricar anticuerpos completamente humanos por recombinación en procariotas y eucariotas. Para un anticuerpo terapéutico es preferente la producción recombinante de un anticuerpo en una célula huésped en lugar de la producción del hibridoma. La producción recombinante supone las ventajas de una mayor consistencia de producto, un nivel de producción probablemente más alto y una fabricación controlada que reduce al mínimo o elimina la presencia de proteínas de origen animal. Por estas razones es deseable contar con un anticuerpo anti-TFPI monoclonal producido por recombinación.

Asimismo, dado que TFPI se une a Factor X activado (FXa) con una alta afinidad, un anticuerpo anti-TFPI eficaz debería tener una afinidad comparable. Por tanto, es deseable contar con un anticuerpo anti-TFPI que tenga una alta afinidad de unión que pueda competir con la unión de TFPI/FXa.

Sumario

Se proporcionan anticuerpos monoclonales para el inhibidor de la ruta del factor tisular humano (TFPI). Se proporcionan asimismo moléculas de ácido nucleico aisladas que los codifican. Se describen también composiciones farmacéuticas que comprenden los anticuerpos monoclonales anti-TFPI y procedimientos de tratamiento de deficiencias o defectos genéticos o adquiridos de la coagulación, tales como hemofilia A y B. Se describen asimismo procedimientos para acortar el tiempo de hemorragia administrando un anticuerpo monoclonal anti-TFPI a un paciente que lo necesita. Se proporcionan también procedimientos para producir un anticuerpo monoclonal que se une a TFPI humano de acuerdo con la presente invención.

En algunas realizaciones, los anticuerpos monoclonales para TFPI proporcionados han sido optimizados por ejemplo para que tengan una mayor afinidad o una mayor actividad funcional.

Breve descripción de los dibujos

La Figura 1 representa un gráfico de barras en el que se ilustran variantes 2A8 seleccionadas con sustituciones de aminoácido simples que fueron más potentes para acortar el tiempo de coagulación en plasma de hemofilia A humano aplicando un ensayo dPT.

La Figura 2 representa un gráfico en el que se muestra el efecto de anticuerpos anti-TFPI mutados con un solo aminoácido seleccionado en el tiempo de coagulación de sangre hemofílica humana inducida con anticuerpo anti-factor VIII.

La Figura 3 representa un gráfico en el que se muestra que 4B7-D62R tiene mucha más potencia para acortar el tiempo de coagulación en sangre con hemofilia A inducida con anticuerpo humana en comparación con el anticuerpo 4B7 parental y en un menor grado, en comparación con sustituciones de un solo aminoácido dentro de 2A8.

La Figura 4 representa dos gráficos en los que se muestra la supervivencia de ratones con hemofilia A tratados con el anticuerpo 2A8 parental y la variante de 2A8 que tiene sustituciones de múltiples aminoácidos (A200) dependiendo de la dosis en comparación con el ratón IgG1 de control (CTX IgG1).

La Figura 5 representa un gráfico en el que se demuestra que una variante 2A8 potenció la coagulación en plasma con hemofilia C humano (deficiente en FXI) dependiendo de la dosis y sus efectos fueron comparables con los de FVIIa recombinante.

Descripción detallada

Definiciones

La expresión "inhibidor de la ruta del factor tisular" o "TFPI", tal como se utiliza en el presente documento, se refiere a cualquier variante, isoforma y especie homóloga de TFPI humano expresado de forma natural por las células. En una realización preferente de la invención, la unión de un anticuerpo de la invención a TFPI reduce el tiempo de coagulación de la sangre.

Tal como se utiliza en el presente documento, un “anticuerpo” se refiere a un anticuerpo entero o cualquier fragmento de unión a antígeno (es decir, “porción de unión a antígeno”) o cadena simple del mismo. El término incluye una molécula de inmunoglobulina de longitud completa (p.ej., un anticuerpo IgG) de origen natural o formado por procesos de recombinación del fragmento del gen de inmunoglobulina normal o una porción inmunológicamente activa de una molécula de inmunoglobulina, como por ejemplo un fragmento de anticuerpo, que retiene la actividad de unión específica. Independientemente de la estructura, un fragmento de anticuerpo se une con el mismo antígeno que es reconocido por un anticuerpo de longitud completa. Por ejemplo, un fragmento de anticuerpo monoclonal anti-TFPI se une a un epítopo de TFPI. La función de unión a antígeno de un anticuerpo puede ser realizada por fragmentos de un anticuerpo de longitud completa. Entre los ejemplos de fragmentos de unión que abarca la expresión “porción de unión a antígeno” de un anticuerpo se incluyen (i) un fragmento Fab, un fragmento monovalente que consiste en los dominios VL, VH, CL y CH1; (ii) un fragmento F(ab')2, un fragmento bivalente que comprende dos fragmentos Fab unidos por un puente disulfuro en la región bisagra; (iii) un fragmento Fd que consiste en los dominios VH y CH1; (iv) un fragmento Fv que consiste en los dominios VL y VH de un solo brazo de un anticuerpo, (v) un fragmento dAb (Ward y col., (1989) Nature 341:544-546), que consiste en un dominio VH; (vi) una región determinante de complementariedad aislada (CDR); (vii) minicuerpos, diacuerpos, triacuerpos, tetracuerpos y cuerpos kappa (véase, p.ej. Ill y col., Protein Eng 1997;10:949-57); (viii) IgG de camello; y (ix) IgNAR. Asimismo, aunque los dos dominios del fragmento FV, VL y VH, están codificados por genes por separado, se pueden unir aplicando procedimientos recombinantes mediante un engarce sintético que da cabida a su fabricación como una cadena de proteína simple en la que las regiones VL y VH se emparejan para formar moléculas monovalentes (conocidas como cadena simple Fv (scFv); Véase p.ej., Bird y col. (1988) Science 242:423-426; y Huston y col (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. EE.UU 85:5879-5883). Se pretende que dichos anticuerpos de cadena simple queden abarcados también dentro de la expresión “porción de unión a antígeno” de un anticuerpo. Dichos fragmentos de anticuerpo se obtienen aplicando técnicas convencionales conocidas entre las personas especializadas en la técnica y los fragmentos se analizan en cuanto a su utilidad de la misma manera que los anticuerpos intactos.

Además, se contempla la posibilidad de que un mimético de anticuerpo quede abarcado en el fragmento de unión a antígeno. La expresión “mimético de anticuerpo” o el término “mimético”, tal como se utilizan en el presente documento significan una proteína que presenta una unión similar a un anticuerpo, pero que es un anticuerpo alternativo más pequeño o una proteína que no es anticuerpo. Dichos miméticos de anticuerpo pueden estar comprendidos en un armazón. El término “armazón” se refiere a una plataforma de polipéptido para la obtención por ingeniería genética de nuevos productos con funciones y características adaptadas.

Tal como se utiliza en el presente documento, las expresiones "inhibe la unión " y "bloquea la unión " (p.ej., al referirse a la inhibición/bloqueo de la unión de un ligando TFPI a TFPI) se utilizan indistintamente y abarcan la inhibición o bloqueo tanto parcial como completa. Se pretende asimismo que inhibición y bloqueo incluyan cualquier descenso medible en la afinidad de unión de TFPI en un sustrato fisiológico cuando entra en contacto con un anticuerpo anti-TFPI en comparación con TFPI que no entra en contacto con un anticuerpo anti-TFPI, p.ej., el bloqueo de la interacción de TFPI con el factor Xa o el bloqueo de la interacción de un complejo TFPI-factor Xa con factor tisular, factor VIIa o el complejo de factor tisular /factor VIIa en al menos aproximadamente 10 %, 20 %, 30 %, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, o 100%.

Las expresiones "anticuerpo monoclonal " o "composición de anticuerpo monoclonal", tal como se utilizan en el presente documento, se refieren a una preparación de moléculas de anticuerpo de una sola composición molecular. Una composición de anticuerpo monoclonal despliega una sola especificidad de unión y afinidad para un epítopo en particular. Por consiguiente, el término “anticuerpo monoclonal humano” se refiere a anticuerpos que despliegan una sola especificidad de unión que tienen regiones variables y constantes derivadas de secuencias de inmunoglobulina de línea germinal humana. Los anticuerpos humanos de la invención pueden incluir restos de aminoácidos no codificados por secuencias de inmunoglobulina de línea germinal humana (p.ej. mutaciones incluidas aleatoriamente

o mutagénesis específica de sitio in vitro o por mutación somática in vivo).

Se pretende que “anticuerpo aislado”, tal como se utiliza en el presente documento, se refiera a un anticuerpo que está sustancialmente desprovisto de otros anticuerpos que tienen diferentes especificidades de antígeno (p.ej. un anticuerpo aislado que se une a un TFPI está sustancialmente desprovisto de anticuerpos que se unen a antígenos distintos a TFPI). Sin embargo, un anticuerpo aislado que se une a un epítopo, isoforma o variante de TFPI humano puede tener reactividad cruzada con otros antígenos relacionados, p.ej. de otras especies (p.ej. homólogos de especies TFPI). Es más, un anticuerpo aislado puede estar sustancialmente desprovisto de otro material celular y/o sustancias químicas.

Tal como se utiliza en el presente documento, "unión específica" se refiere a la unión de anticuerpo a un antígeno determinado previamente. Normalmente, el anticuerpo se une con una afinidad de al menos aproximadamente 105 M-1 y se une con el antígeno pre-determinado con una afinidad que es superior, por ejemplo al menos el doble, que su afinidad para la unión con un antígeno irrelevante (p.ej., BSA, caseína) distinto al antígeno determinado previamente o un antígeno íntimamente relacionado. Las frases “un anticuerpo que reconoce un antígeno” y “un anticuerpo específico para un antígeno” se utilizan indistintamente en el presente documento con la expresión “un anticuerpo que se une específicamente a un antígeno”

Tal como se utiliza en el presente documento, la expresión "alta afinidad" para un anticuerpo IgG se refiere a una afinidad de unión de al menos aproximadamente 107M-1, en algunas realizaciones, al menos aproximadamente 108M-1, en algunas realizaciones, al menos aproximadamente 109M-1, 1010M-1, 1011M-1 o más, p.ej., hasta 1013M-1 o más. Sin embargo, la unión de “alta afinidad” puede variar para otros isotipos del anticuerpo. Por ejemplo, la unión de “alta afinidad” para un isotipo IgM se refiere a una afinidad de unión de al menos aproximadamente 1,0 x 107M-1. Tal como se utiliza en el presente documento, "isotipo" se refiere a la clase de anticuerpo (p.ej., IgM o IgG1) que está codificada por genes de región constante de cadena pesada.

"Región determinante de complementariedad" o "CDR" se refiere a una de las tres regiones hipervariables dentro de la región variable de una cadena pesada o la región variable de la cadena ligera de una molécula de anticuerpo que forman una superficie de unión a antígeno N-terminal que es complementaria para la estructura tridimensional del antígeno unido. Procedentes del término N de una cadena pesada o ligera, estas regiones determinantes de complementariedad se representan "CDR1," "CDR2," y "CDR3," respectivamente. Las CDR participan en la unión antígeno-anticuerpo y la CDR3 comprende una región única específica para la unión antígeno-anticuerpo. Un sitio de unión a antígeno, por tanto, puede incluir seis CDR, que comprenden las regiones CDR desde cada región V pesada y ligera

Tal como se utiliza en el presente documento, "sustituciones conservadoras" se refiere a modificaciones de un polipéptido que implican la sustitución de uno o más aminoácidos por aminoácidos que tienen propiedades bioquímicas similares que no tienen como resultado ninguna pérdida de la función biológica o bioquímica del polipéptido. Una “sustitución de aminoácido conservadora” es aquella en la que el resto aminoácido se reemplaza por un resto de aminoácido que tiene una cadena lateral similar. En la técnica se han definido familias de restos de aminoácidos que tienen cadenas laterales similares. Dichas familias incluyen aminoácidos con cadenas laterales básicas (p.ej., lisina, arginina, histidina), cadenas laterales ácidas (p.ej., ácido aspártico, ácido glutámico), cadenas laterales polares sin carga (p.ej., glicina, asparagina, glutamina, serina, treonina, tirosina, cisteína), cadenas laterales no polares (p.ej., alanina, valina, leucina, isoleucina, prolina, fenilalanina, metionina, triptofano), cadenas laterales beta-ramificadas (p.ej., treonina, valina, isoleucina) y cadenas laterales aromáticas (p.ej., tirosina, fenilalanina, triptofano, histidina). Se prevé que los anticuerpos de la presente invención puedan tener sustituciones de aminoácido conservadoras y retengan todavía su actividad.

En cuanto a los ácidos nucleicos y polipéptidos, la expresión “homología sustancial” indica que dos ácidos nucleicos

o dos polipéptidos o secuencias designadas de los mismos, cuando se alinean y comparan óptimamente, son idénticos, con las inserciones o deleciones de nucleótidos o aminoácidos apropiadas, en al menos aproximadamente 80% de los nucleótidos o aminoácidos, normalmente al menos aproximadamente 85%, preferentemente aproximadamente 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, o 95 %, más preferentemente al menos aproximadamente 96 %, 97 %, 98 %, 99 %, 99,1 %, 9,.2 %, 99,3 %, 99,4 %, o 99,5 % de los nucleótidos o aminoácidos. Alternativamente, existe una homología sustancial para los ácidos nucleicos cuando los segmentos se hibriden en condiciones de hibridación selectivas para el complemento de la cadena. La invención incluye secuencias de ácido nucleico y secuencias de polipéptido que tienen una sustancial homología con las secuencias de ácido nucleico específicas y las secuencias de aminoácido que se citan en el presente documento.

El porcentaje de identidad entre dos secuencias está en función del número de porciones idénticas compartidas por las secuencias (es decir, % de homología = nº de posiciones idénticas / total de nº de posiciones x 100), teniendo en cuenta el número de huecos y la longitud de cada hueco que hay que introducir para un alineamiento óptimo de las dos secuencias. La comparación de las secuencias y la determinación del porcentaje de identidad entre las dos secuencias se puede realizar aplicando un algoritmo matemático, como por ejemplo, pero sin limitación, el módulo AlignX™ de VectorNTI™ (Invitrogen Corp., Carlsbad, CA). Para AlignX™, los parámetros por defecto de alineamiento múltiple son: penalización de apertura de hueco: 10; penalización de extensión de hueco: 0,05; intervalo de penalización de separación de hueco: 8; % de identidad por retardo en la alineación: 40. (para más detalles consultar http://www.invitrogen.com/site/us/en/home/LINNEA-Online-Guides/LINNEA-Communities/Vector-NTI-Community/Sequence-analysis-and-data-management-software-for-PCs/AlignX-Module-for-Vector-NTIAdvance.reg.us.html).

Otro procedimiento para determinar el mejor emparejamiento global entre una secuencia buscada (una secuencia de la presente invención) y una secuencia objeto, también denominada alineamiento de secuencia global, se puede determinar utilizando el programa informático CLUSTALW (Thompson y col., Nucleic Acids Research, 1994, 2(22): 4673-4680), que se basa en el algoritmo de Higgins y col., (Computer Applications in the Biosciences (CABIOS), 1992, 8(2): 189-191). En un alineamiento de secuencia, la secuencia buscada y la secuencia objeto son ambas secuencias de ADN. El resultado de dicho alineamiento de secuencia global está en porcentaje de identidad. Los parámetros preferentes utilizados en un alineamiento CLUSTALW de secuencias de ADN para calcular el porcentaje de identidad a través de alineamientos de pares son: Matriz = IUB, k-tupla = 1, Número de diagonales superiores = 5, Penalización de hueco = 3, Penalización de apertura de hueco = 10, Penalización de extensión de hueco = 0,1. Para alineamientos múltiples, son preferentes los siguientes parámetros CLUSTALW: Penalización de apertura de hueco = 10, Parámetro de extensión de hueco = 0,05; Intervalo de penalización de separación de hueco = 8; % de identidad para alineamiento = 40.

Los ácidos nucleicos pueden estar presentes en células enteras, en un lisado celular o en forma parcialmente pura o sustancialmente pura. Un ácido nucleico está “aislado” o “queda sustancialmente puro” cuando se ha purificado eliminado todas los demás componentes celulares con los que está asociado normalmente en el entorno natural. Para aislar un ácido nucleico, se pueden utilizar las técnicas convencionales, como puedan ser las citadas a continuación: tratamiento alcalino/SDS, bandas CsCl, cromatografía de columna, electroforesis sobre gel de agarosa y otros conocidos dentro de la técnica.

Anticuerpos monoclonales optimizados para alta afinidad y actividad funcional

En un estudio anterior descrito en WO2010/017196, se identificaron varios anticuerpos anti-TFPI. Dichos anticuerpos anti-TFPI se pueden optimizar además, por ejemplo, mejorando su afinidad y actividad de bloqueo para TFPI. Dicha optimización se puede realizar por ejemplo aplicando mutagénesis por saturación de sitio de las regiones determinantes de complementariedad (CDR) o restos en íntima proximidad con las CDR, es decir aproximadamente 3 o 4 restos adyacentes a las CDR, de los anticuerpos.

Se proporcionan también anticuerpos monoclonales que tienen una mayor afinidad o una alta afinidad para TFPI. En algunas realizaciones los anticuerpos anti-TFPI tienen una afinidad de unión de al menos aproximadamente 107M-1, en algunas realizaciones, al menos aproximadamente 108M-1, en algunas realizaciones, al menos aproximadamente 109M-1, 1010M-1, 1011M-1 o más, p.ej., hasta 1013M-1 o más.

Se utilizó mutagénesis por saturación de sitio en las CDR o adyacente a ellas de dos anticuerpos parentales anti-TFPI, designados en el presente documento 2A8 y 4B7, para optimizar los anticuerpos en cuanto a la afinidad y la actividad funcional. Se contempla asimismo que se pueda llevar a cabo la misma optimización en cualquiera de los anticuerpos descritos en la anterior PCT/US2009/052702.

La mutagénesis por saturación de sitio de las CDR se puede realizar en los anticuerpos anti-TFPI. Para 2A8, las CDR en la cadena pesada presentada en SEQ ID NO: 1 corresponde a los restos FTFRSYGMS (restos 27 a 35), SIRGSSSSTYYADSVKG (restos 50 a 66) y KYRYWFDY (restos 99 a 106). Para 2A8 la cadena ligera presentada en SEQ ID NO: 2, las CDR corresponden a los restos SGDNLRNYYAH (restos 23 a 33), YYDNNRPS (restos 48 a 55) y QSWDDGVPV (restos 88 a 96). Para 4B7, las CDR en la cadena pesada presentada en SEQ ID NO: 3 corresponden a los restos DSVSSNSAAWS (restos 27 a 37), IIYKRSKWYNDYAVSVKS (restos 52 a 70) y WHSDKHWGFDY (restos 102 a 112). Para 4B7, la cadena ligera presentada en SEQ ID NO: 4, las CDR corresponden a los restos RSSQSLVFSDGNTYLN (restos 24 a 39), KGSNRAS (restos 55 a 61) y QQYDSYPLT (restos 94 a 102) de SEQ ID NO: 4. Se puede introducir una modificación en cualquiera de las seis CDR individualmente o se pueden introducir combinaciones de modificaciones. Asimismo, se pueden introducir dos o más modificaciones en una sola CDR. En otras variantes desveladas, se pueden introducir también modificaciones en íntima proximidad a las CDR, por ejemplo aproximadamente 3 o 4 restos a cada lado de cada CDR.

Brevemente, se introdujeron modificaciones de aminoácido simples y/o múltiples para optimizar, p.ej. mejorar la afinidad y se analizaron de los anticuerpos parentales 2A8 y 4B7. En primer lugar, se introdujeron modificaciones de aminoácido en las seis CDR o adyacentes a las CDR de cada anticuerpo seguido de análisis de las propiedades de unión a TFPI. Se seleccionaron las modificaciones que aumentaron la señal de unión a TFPI para combinarlas con una o más modificaciones más y se analizaron en cuanto a un mayor aumento de la señal de unión. Después de cada análisis, se utilizaron las variantes de anticuerpo seleccionadas para medir su afinidad a TFPI y la actividad de bloqueo de la actividad de TFPI y el acortamiento del tiempo de coagulación Por lo tanto, en algunas realizaciones, se proporciona un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano que tiene una mayor afinidad para TFPI en comparación con los anticuerpos parentales sin modificar. Asimismo, en algunas realizaciones, se proporciona un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano que tiene una mayor actividad de bloqueo de TFPI en comparación con los anticuerpos parentales sin modificar. En algunas realizaciones, se proporciona un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor humano de la ruta del factor tisular humano que tiene un tiempo de coagulación acortado en comparación con los anticuerpos parenterales sin modificar.

En algunas realizaciones, se introdujeron modificaciones de aminoácido adicionales para reducir la divergencia desde la secuencia de línea germinal. En otras realizaciones, se introdujeron modificaciones de aminoácido para facilitar la producción de anticuerpo para procedimientos de producción a gran escala.

El anticuerpo puede ser específico de especie o puede tener una reacción cruzada con múltiples especies. En algunas realizaciones, el anticuerpo puede reaccionar específicamente o tener una reacción cruzada con TFPI de ser humano, ratón, rata, conejo, cobaya, mono, cerdo, perro, gato y otras especies de mamífero.

El anticuerpo puede ser cualquiera de las distintas clases de anticuerpos, como por ejemplo, sin limitación, un anticuerpo IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgA secretor, IgD e IgE.

En una realización, se proporciona un anticuerpo monoclonal completamente humano aislado para un inhibidor de la ruta del factor tisular.

En otra realización, se proporciona un anticuerpo monoclonal completamente humano aislado para dominio 2 de Kunitz de inhibidor de la ruta del factor tisular humano.

Variantes 2A8

Por consiguiente, en algunas realizaciones, se proporciona un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que el anticuerpo comprende una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 1, en la que dicha secuencia de aminoácidos comprende una o más modificaciones de aminoácidos, tal como se definen en las reivindicaciones.

Las sustituciones están localizadas en las CDR de la cadena pesada de 2A8.

En algunas variantes desveladas, la sustitución de la cadena pesada de 2A8 está en una posición seleccionada entre S31, G33, S35, I51, S54, S55, K99 y F104. En algunas variantes, la sustitución de la cadena pesada de 2A8 puede incluir también una posición seleccionada entre Q1, R30, M34, S50, R52 y S56. Por ejemplo, la sustitución se puede seleccionar entre Q1E, R30S, S31P, S31V, G33A, G33K, G33P, M34I, M34K, S35L, S35D, S50A, I51D, I51E, R52S, S54F, S54D, S55A, S55G, S55R, S56G, K99V, K99L y F104Y. Asimismo, en algunas variantes, el anticuerpo puede comprender dos o más sustituciones seleccionadas entre Q1E, R30S, S31P, S31V, G33A, G33K, G33P, M34I, M34K, S35L, S35D, S50A, I51D, I51E, R52S, S54F, S54D, S55A, S55G, S55R, S56G, K99V, K99L y F104Y.

En algunas variantes, la cadena pesada de 2A8 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO :1: S31V+I51D+S54F+K99V; G33P+S35D+S54F+K99L; S35D+I51D+S55R+K99V; S35L+S54F+K99V; S31V+G33P+S35D; S35D+I51D+K99L; S31V+I51D+S55R+K99L; S31V+S35D+I51D+K99V; G33P+I51D+S54F; I51D+S54F+K99L; S35D+K99L; S31V+G33P+I51D+S54F+K99V; S35D+I51E+S55R+K99L; S31V+K99V; S31V+I51E+S55R+K99V; S35D+S55R+K99L; S31V+S54F+K99L; S31V+I51D+S55R+K99V; S31V+S35D+S55R; S31V+S35D; S31V+I51D+S55R; S35D+S54F+S55R+K99L; S31V+S35D+S54F S31V+S35L+I51D+S54F+K99V; y S31V+S35L+I51E+S54F+K99V.

En algunas variantes, la cadena pesada de 2A8 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO: 1: G33A+S35D+S55R+K99L; G33P+I51D+S54F; G33P+S35D+S54F+K99L; I51D+S54F+K99L; M34I+S35D+S55R+K99L; M34K+S35D+S55R+K99L; Q1E+R30S+S35D+S55G+S56G+K99L; Q1E+R30S+S35D+S55R+S56G+K99L; Q1E+S31V +S50A+I51D+S55R+S56G+K99V; Q1E+S35D+S55R+K99L; R30S+S31V+I51D+S55R+K99V; R30S+S35D+S55R+K99L; S31V+G33A+I51D+S55R+K99V; S31V+G33P+I51D+S54F+K99V; S31V+G33P+S35D; S31V+I51D+R52S+S55R+K99V; S31V+I51D+S54F+K99V; S31V+I51D+S55R; S31V+I51D+S55R+K99L; S31V+I51D+S55R+K99V; S31V+I51D+S55R+S56G+K99V; S31V+I51E+S55R+K99V; S31V+K99V; S31V+S35D; S31V+S35D+I51D+K99V; S31V+S35D+S54F; S31V+S35D+S55R; S31V+S35L+I51D+S54F+K99V; S31V+S35L+I51E+S54F+K99V; S31V+S50A+I51D+S55R+K99V; S31V+S54F+K99L; S35D+I51D+K99L; S35D+I51D+S55R+K99V; S35D+I51E+S55R+K99L; S35D+K99L; S35D+R52S+K99L; S35D+R52S+S55R+K99L; S35D+S50A+K99L; S35D+S50A+S55R+K99L; S35D+S54F+S55R+K99L; S35D+S55G+K99L; S35D+S55R+K99L; S35D+S55R+S56G+K99L; S35D+S56G+K99L; y S35L+S54F+K99V.

En algunas variantes desveladas, la cadena pesada de 2A8 tiene una o más deleciones. En algunas variantes, las deleciones están localizadas en las CDR de la cadena pesada de 2A8. En otras realizaciones, las deleciones están localizadas fuera de las CDR de la cadena pesada de 2A8. En algunas variantes, por ejemplo, la deleción está en una posición seleccionada entre I51, S56 y S57.

Se proporciona asimismo un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que el anticuerpo comprende una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en la SEQ ID NO: 2, en la que la secuencia de aminoácidos comprende una o más modificaciones de aminoácido, tal como se definen en las reivindicaciones.

Las sustituciones están localizadas en las CDR de la cadena ligera de 2A8.

En algunas variantes desveladas en el presente documento, la sustitución de la cadena ligera de 2A8 está en una posición seleccionada entre A32, Y48, N51, N52, P54, D91, D92 y V96. En algunas variantes, la sustitución de la cadena ligera de 2A8 puede incluir también una posición seleccionada entre D1, I2, A13, S21, N26, R28, N29, H33, Y49, G56, E80, S89, G93, V94 y P95. Por ejemplo, la sustitución se puede seleccionar entre D1S, I2Y, A13S, S21T, N26A, R28P, N29K, A32N, H33Y, Y48F, Y49R, N51S, N51V, N52G, P54L,G56D, E80M, S89A, D91L, D91R, D91W, D91K, D92S, D92T, G93S, V94T, P95V, P95A, V96G, V96M y V96W. Asimismo, en algunas variantes, el anticuerpo puede comprender dos o más sustituciones seleccionadas entre D1S, I2Y, A13S, S21T, N26A, R28P, N29K, A32N, H33Y, Y48F, Y49R, N51S, N51V, N52G, P54L, G56D, E80M, S89A, D91L, D91R, D91W, D91K, D92S, D92T, G93S, V94T, P95V, P95A, V96G, V96M y V96W.

En algunas realizaciones, la cadena ligera de 2A8 tiene las siguientes sustituciones en relación con la SEQ ID NO:

2: Y48F+N51V; Y48F+N52G; Y48F+D91K; Y48F+D91L+V96W; Y48F+D91W; Y48F+N52G+D91L+V96W; Y48F+N51V+V96W; D91L+V96W; Y48F+N51V+D91W; Y48F+N51V+D91L+V96W; N51V+D91W; Y48F+N51V+G56D+V96W; Y48F+N51V+D91L; y N51V+D91K.

En algunas variantes, la cadena ligera de 2A8 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO:2: A13S+Y48F+N51V+D91W; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+N29K+Y48F+E80M+D91L+D92S+V94T+V96W; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+N29K+Y48F+N51S+E80M+D91L+D92S+V94T+V96W; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+N29K+Y48F+N51V+E80M+D91W; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+N29K+Y48F+N51V+E80M+S89A+D91W+D92S+G93S+V 94T; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+N29K+Y48F+Y49R+N51S+E80M+D91L+D92S+V94T+V9 6W; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+Y48F+N51V+E80M+D91W; D1S+I2Y+A13S+S21T+R28P+Y48F+N51V+E80M+S89A+D91W+D92S+G93S+V94T; D1S+Y48F+N51V+D91W; D91L+V96W; H33Y+Y48F+N51V+D91W; I2Y+Y48F+N51V+D91W; N26A+Y48F+N51V+D91W; N29K+Y48F+N51V+D91W; N51V+D91K; N51V+D91W; R28P+Y48F+N51V+D91W; S21T+Y48F+N51V+D91W; Y48F+D91K; Y48F+D91L+D92S+V96W; Y48F+D91L+G93S+V96W; Y48F+D91L+P95V+V96W; Y48F+D91L+V94T+V96W; Y48F+D91L+V96W; Y48F+D91W; Y48F+N51S+D91L+V96W; Y48F+N51V; Y48F+N51V+D91L; Y48F+N51V+D91L+V96W; Y48F+N51V+D91W; Y48F+N51V+D91W+D92S; Y48F+N51V+D91W+G93S; Y48F+N51V+D91W+P95V; Y48F+N51V+D91W+V94T; Y48F+N51V+E80M+D91W; Y48F+N51V+G56D+V96W; Y48F+N51V+S89A+D91W; Y48F+N51V+S89A+D91W+D92S+G93S+V94T+P95A; Y48F+N51V+V96W; Y48F+N52G; Y48F+N52G+D91L+V96W; y Y48F+S89A+D91L+V96W.

Se proporciona también un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que el anticuerpo comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 1, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena pesada comprende una o más modificaciones de aminoácido; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 2, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena ligera comprende una o más modificaciones de aminoácido, tal como se define en las reivindicaciones. Anteriormente, se han dado otros ejemplos de modificaciones que se pueden incorporar.

En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 5, 6, 7, 8, 9, 10y11.

En algunas variantes el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 12, 13, 14, 15, 16, 17 y 18.

En algunas variantes desveladas en el presente documento, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 5, 6, 7, 8, 9, 10 y 11; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 12, 13, 14, 15, 16, 17 y 18. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 5; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 12. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 6; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 13. En algunas realizaciones, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 7; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 14. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 8; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 15. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 9; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 16. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 10; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 17. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 11; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 18.

Variantes 4B7

Se describe también en el presente documento un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que dicho anticuerpo comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 3 que comprende una o más modificaciones de aminoácido. En algunas variantes, la modificación de la cadena pesada de 4B7 es una sustitución, una inserción o una deleción.

En algunas variantes, las sustituciones están localizadas en las CDR de la cadena pesada de 4B7. En otras variantes, las sustituciones están localizadas fuera de las CDR de la cadena pesada de 4B7.

En algunas variantes, la sustitución de la cadena pesada de 4B7 está en una posición seleccionada entre S30, N32, S57, K58, N61, D62, H103, H107, G109 y Y112. En algunas variantes, la sustitución de la cadena pesada de 4B7 puede incluir también una posición seleccionada entre Q1, S37, G44, I53 y K55. Por ejemplo, la sustitución se puede seleccionar entre Q1E, S30R, N32D, N32E, S33G, S37N, G44S, I53T, K55Y, S57K, S57R, K58M, N61G, N61T, D62I, D62R, D62Q, D62L, D62S, D62V, D62N, D62K, H103D, H103G, H107M, G109A y Y112D. Asimismo, en algunas variantes, el anticuerpo puede comprender dos o más sustituciones seleccionadas entre Q1E, S30R, N32D, N32E, S33G, S37N, G44S, I53T, K55Y, S57K, S57R, K58M, N61G, N61T, D62I, D62R, D62Q, D62L, D62S, D62V, D62N, D62K, H103D, H103G, H107M, G109A y Y112D.

En algunas variantes, la cadena pesada de 4B7 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO: 3:

N32D+D62Q+H107M+Y112D; N32D+D62R+H103D+H107M+Y112D; N32D+D62R+H107M+Y112D; N32D+D62R+Y112D; D62Q+Y112D; D62R+Y112D; D62R+H107M+Y112D; N32D+D62Q+Y112D; N32D+D62R+H107M; N32D+D62S+H107M+Y112D; D62Q+H107M+Y112D; N32D+D62R+H103D; D62S+H107M+Y112D; S30R+S57K; N61G+D62V; y K58M+D62N. En algunas variantes, la cadena pesada de 4B7 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO: 3: D62Q+H107M+Y112D; D62Q+Y112D; D62R+H107M+Y112D; D62R+Y112D; D62S+H107M+Y112D; N32D+D62K+Y112D; N32D+D62Q+H107M+Y112D; N32D+D62Q+Y112D; N32D+D62R+H103D; N32D+D62R+H103D+H107M+Y112D; N32D+D62R+H107M; N32D+D62R+H107M+Y112D; N32D+D62R+Y112D; N32D+D62S+H107M+Y112D; N32D+G44S+D62R+Y112D; N32D+I53T+D62Q+Y112D; N32D+I53T+D62R+Y112D; N32D+K55Y+D62Q+Y112D; N32D+K55Y+D62R+Y112D; N32D+S37N+D62R+Y112D; Q1E+N32D+D62R+Y112D; Q1E+N32D+G44S+K55Y+D62R+Y112D; N32D+G44S+K55Y+D62R+Y112D; S30R+S57K; N61G+D62V; y K58M+D62N.

Se proporciona asimismo un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que dicho anticuerpo comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 4 que comprende una o más modificaciones de aminoácido. En algunas variantes, la modificación de la cadena ligera de 4B7 se seleccionada entre una sustitución, una inserción o una deleción.

En algunas variantes, las sustituciones están localizadas en las CDR de la cadena ligera de 4B7. En otras variantes, las sustituciones están localizadas fuera de las CDR de la cadena ligera de 4B7.

En algunas variantes, la sustitución de la cadena ligera de 4B7 está en una posición seleccionada entre F31, S32, D33, N35, Y37, Y54, G56, S57, S61 y D97. En algunas variantes, la sustitución de la cadena ligera de 4B7 puede incluir también una posición seleccionada entre M4, V30, T36, N39, L42, K44, Q50, L51, K55, A60 y S98. Por ejemplo, la sustitución se puede seleccionar entre M4I, M4L, V30L, F31I, F31M, F31Y, F31H, S32L, S32R, S32Y, D33F, D33R, N35I, N35L, N35T, N35V, T36N, Y37F, N39D, L42Q, K44R, Q50R, L51R, Y54F, K55L, G56D, G56A, G56V, S57Y, A60D, S61C, D97M, D97T y S98H. Asimismo, en algunas variantes, el anticuerpo puede comprender dos o más sustituciones seleccionadas entre M4I, M4L, V30L, F31I, F31M, F31Y, S32L, S32R, S32Y, D33F, D33R, N35I, N35L, N35T, N35V, T36N, Y37F, N39D, L42Q, K44R, Q50R, Y54F, K55L, G56D, G56A, G56V, S57Y, A60D, S61C, D97M, D97T y S98H.

En algunas variantes, la cadena ligera de 4B7 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO: 4: S32R+N35T; S32R+N35T+D97T; S32R+D33F+N35I; S32R+D33F+N35I+D97T; S32R+D33F+N35T; S32R+D33F; S32R+D33R+N35I; S32R+D33R+N35I+D97T; S32R+D33R; S32R+D33R+N35T; N35T+D97T; D33F+N35I; D33F+N35I+D97T; D33F+N35T+Y37F; D33R+N35I; D33R+N35I+D97T; D33R+N35T; F31I+S32R+N35I+D97T; F31I+S32R+D33F+N35I+D97T; F31I+S32R+D33F+N35T; F31I+S32R+D33R+N35I+D97T; F31I+N35I; F31I+D33F+N35I; F31I+D33F+N35I+D97T; F31I+D33R+N35I; F31I+D33R; F31M+S32L+D33R+N35I+D97T; F31M+S32R+D33F+N35I; F31M+S32R+D33F+N35I+D97T; F31M+S32R+D33F+D97T; F31M+S32R+D33R+N35I; F31M+S32R+D33R+N35I+D97T; F31M+S32R+D33R; F31M+S32R+D33R+N35T; F31M+D33F+N35I; F31M+D33F; F31M+D33F+N35T; F31M+D33R+N35I; F31M+D33R; S32R+N35I; F31M+D33F+N35T+Y37F; N35V+G56D; N35L+G56A; y D33F+Y54F.

En algunas variantes, la cadena ligera de 4B7 tiene las siguientes sustituciones en relación con SEQ ID NO: 4: D33F+N35I; D33F+N35I+D97T; D33F+N35T+Y37F; D33R+N35I; D33R+N35I+D97T; D33R+N35T; F31H+S32R+D33F+N35I+D97T; F31I+D33F+N35I; F31I+D33F+N35I+D97T; F31I+D33F+N35I+K44R; F31I+D33F+N35I+L42Q; F31I+D33F+N35I+S98H; F31I+D33F+N35I+T36N; F31I+D33R; F31I+D33R+N35I; F31I+N35I; F31I+S32R+D33F+N35I+D97T; F31I+S32R+D33F+N35T; F31I+S32R+D33R+N35I+D97T; F31I+S32R+N35I+D97T; F31M+D33F; F31M+D33F+N35I; F31M+D33F+N35T; F31M+D33F+N35T+Y37F; F31M+D33R; F31M+D33R+N35I; F31M+S32L+D33R+N35I+D97T; F31M+S32R+D33F+D97T; F31M+S32R+D33F+N35I; F31M+S32R+D33F+N35I+D97T; F31M+S32R+D33R; F31M+S32R+D33R+N35I; F31M+S32R+D33R+N35I+D97T; F31M+S32R+D33R+N35T; F31Y+S32R+D33F+N35I+D97T; M4I+S32R+D33F+N35I+D97T; M4L+S32R+D33F+N35I+D97T; N35T+D97T; S32R+D33F; S32R+D33F+N35I; S32R+D33F+N35I+A60D+D97T; S32R+D33F+N35I+D97T; S32R+D33F+N35I+D97T+S98H; S32R+D33F+N35I+G56V+D97T; S32R+D33F+N35I+K44R+D97T; S32R+D33F+N35I+K55L+D97T;

S32R+D33F+N35I+L42Q+D97T; S32R+D33F+N35I+L51R+D97T; S32R+D33F+N35I+N39D+D97T; S32R+D33F+N35I+Q50R+D97T; S32R+D33F+N35I+T36N+D97T; S32R+D33F+N35T; S32R+D33R; S32R+D33R+N35I; S32R+D33R+N35I+D97T; S32R+D33R+N35T; S32R+N35I; S32R+N35T; S32R+N35T+D97T; V30L+F31I+D33F+N35I; V30L+S32R+D33F+N35I+D97T; V30L+S32R+D33F+N35I+T36N+D97T; V30L+S32R+N35I+T36N; N35V+G56D; N35L+G56A; y D33F+Y54F.

Se proporciona también un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que dicho anticuerpo comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO:3, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena pesada comprende una o más modificaciones de aminoácido; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO:4, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena ligera comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir.

En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 y 26.

En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33 y 34.

En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 y 26; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada entre SEQ ID NO: 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33 y 34. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 19; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 27. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 20; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 28. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 21; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 29. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 22; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 30. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 23; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 31. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 24; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 32. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 25; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 33. En algunas variantes, el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 26; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 34.

Combinaciones de variantes 2A8/4B7

Se desvela también que el anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano puede comprender combinaciones de las cadenas pesada y ligera de 2A8 y 4B7.

Por consiguiente, en el presente documento se desvela un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que dicho anticuerpo comprende: a) una cadena pesada de 2A8 que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 1, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena pesada comprende una o más modificaciones de aminoácido; y b) una cadena ligera de 4B7 que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO:4, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena ligera comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir

Se proporciona también un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que dicho anticuerpo comprende: a) una cadena pesada de 4B7 que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 3, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena pesada comprende una o más modificaciones de aminoácido; y b) una cadena ligera de 2A8 que comprende una secuencia

de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 2, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena ligera comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir.

Asimismo, se desvela un anticuerpo monoclonal aislado que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que dicho anticuerpo comprende: a) una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO: 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 y 26; y b) una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEQ ID NO:12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33 y 34.

Ácidos nucleicos, vectores y células huésped

Se proporcionan también moléculas de ácido nucleico aisladas que codifican cualquiera de los anticuerpos monoclonales antes descritos.

Por lo tanto, se proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que codifica un anticuerpo que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en la que el anticuerpo comprende una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 1, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena pesada comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir.

Se proporciona también una molécula de ácido nucleico aislada que codifica un anticuerpo que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en la que el anticuerpo comprende una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 2, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena ligera comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir.

Se proporciona también una molécula de ácido nucleico aislada que codifica un anticuerpo que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en la que el anticuerpo comprende una cadena pesada que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 3, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena pesada comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir.

Se proporciona también una molécula de ácido nucleico aislada que codifica un anticuerpo que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en la que el anticuerpo comprende una cadena ligera que comprende una secuencia de aminoácidos presentada en SEQ ID NO: 4, en la que dicha secuencia de aminoácidos de cadena ligera comprende una o más modificaciones de aminoácido. Anteriormente, se han dado ejemplos de las modificaciones que se pueden introducir.

Asimismo, se proporcionan también vectores que comprenden las moléculas de ácido nucleico aisladas que codifican cualquiera de los anticuerpos monoclonales antes descritos y células huésped que comprenden dichos vectores.

Procedimientos para preparar anticuerpos para TFPI

El anticuerpo monoclonal se puede producir por recombinación por expresión de una secuencia de nucleótidos que codifica las regiones variables del anticuerpo monoclonal de acuerdo con las realizaciones de la invención en una célula huésped. Con la ayuda de un vector de expresión, se puede transfectar y expresar un ácido nucleico que contiene la secuencia de nucleótidos en una célula huésped adecuada para la producción. Por consiguiente, se proporciona también un procedimiento para producir un anticuerpo monoclonal que se une a TFPI humano que comprende:

(a) transfección de una molécula de ácido nucleico que codifica un anticuerpo monoclonal de la invención en una célula huésped.

b) cultivo de la célula huésped para expresar el anticuerpo monoclonal en la célula huésped y, opcionalmente,

c) aislamiento y purificación del anticuerpo monoclonal producido, en el que la molécula de ácido nucleico comprende una secuencia de nucleótidos que codifica el anticuerpo monoclonal de la presente invención.

En un ejemplo, para expresar los anticuerpos o los fragmentos de anticuerpo de los mismos, se insertan los ADN que codifican cadenas ligeras o pesadas parciales o de longitud completa obtenidas a través de técnicas de biología molecular convencionales en vectores de expresión, de manera que los genes quedan operativamente unidos a secuencias de control de transcripción y traducción. En este contexto, se pretende que el término “operativamente unidos” signifique que un gen de anticuerpo se liga a un vector de manera que las secuencias de control de transcripción y de traducción dentro del vector cumplen su función de regular la transcripción y traducción del gen de anticuerpo. El vector de expresión y las secuencias de control de expresión se seleccionan para que se sean compatibles con la célula huésped de expresión utilizada. El gen de la cadena ligera del anticuerpo y el gen de la

cadena pesada del anticuerpo se pueden insertar en vectores por separado o, más normalmente, ambos genes se insertan en el mismo vector de expresión. Los genes del anticuerpo se insertan en el vector de expresión a través de métodos convencionales (p.ej. ligación de sitios de restricción complementarios en el fragmento del gen del anticuerpo y el vector, o ligación de extremos romos, si no están presentes sitios de restricción). Las regiones variables de cadena ligera y pesada de los anticuerpos descritos en el presente documento se pueden utilizar para crear genes de anticuerpo de longitud completa de cualquier isotipo de anticuerpo insertándolos en los vectores de expresión que codifican ya las regiones constante de cadena pesada y constante de cadena ligera de isotipo deseado, de manera que el segmento VH se une operativamente al (los) segmento(s) CH dentro del vector y el segmento VL se une operativamente al segmento CL dentro del vector. De forma adicional o alternativa, el vector de expresión recombinante puede codificar un péptido de señal que facilita la secreción de la cadena de anticuerpo desde una célula huésped. El gen de cadena de anticuerpo se puede clonar en un vector, de manera que el péptido de señal se une en fase de lectura al término amino del gen de cadena de anticuerpo. El péptido de señal puede ser un péptido de señal de inmunoglobulina o un péptido de señal heterólogo (es decir, un péptido de señal de una proteína que no es inmunoglobulina).

Además de los genes que codifican la cadena de anticuerpo, los vectores de expresión recombinante de la invención llevan secuencias reguladoras que controlan la expresión de los genes de cadena de anticuerpo en una célula huésped. Se pretende que la expresión “secuencia reguladora” incluya promotores, potenciadores y otros elementos de control de la expresión (p.ej., señales de poliadenilación) que controlan la transcripción o traducción de los genes de cadena de anticuerpo. Dichas secuencias reguladoras se describen por ejemplo en Goeddel; Gene Expression Technology. Procedimientos in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, Calif. (1990). Las personas especializadas en la técnica podrán apreciar que el diseño del vector de expresión, incluyendo la sección de secuencias reguladoras puede depender de factores como puedan ser la selección de la célula huésped que se ha de transformar, el nivel de expresión de proteína deseado, etc. Entre los ejemplos de secuencias reguladoras para expresión de célula huésped de mamífero se incluyen elementos virales que dirigen altos niveles de expresión de proteína en células de mamífero, como por ejemplo promotores y/o potenciadores derivados de citomegalovirus (VMV), virus de simio 40 (SV40), adenovirus (p.je., el promotor mayor tardío de adenovirus (AdMLP)) y polioma. Alternativamente, se pueden utilizar secuencias reguladoras no virales, tales como promotor ubiquitina o promotor ßglobina.

Además de los genes de cadena de anticuerpo y las secuencias reguladoras, los vectores de expresión recombinante pueden llevar secuencias adicionales, como por ejemplo secuencias que regulan la replicación del vector en células huésped (p.ej., orígenes de replicación) y genes marcadores seleccionables. El gen marcador seleccionable facilita la selección de células huésped en las que se ha introducido el vector (véase, p.ej., las patentes estadounidenses Nos. 4.399.216, 4.634.665 y 5.179.017, todas ellas de Axel y col.). Por ejemplo, normalmente, el gen marcador seleccionable confiere resistencia a los fármacos, como por ejemplo G418, higromicina o metotrexato, en una célula huésped en la que se ha introducido el vector. Entre los ejemplos de genes marcadores seleccionables se incluyen gen de dihidrofolato reductasa (DHFR) (para su uso en células huésped dhfr con selección/amplificación con metotrexato) y el gen neo (para selección de G418).

Para la expresión de las cadenas ligera y pesada, se transfecta(n) el (los) vectores de expresión que codifican las cadenas ligera y pesada en una célula huésped a través de técnicas convencionales. Se pretende que las distintas formas del término “transfección” abarquen una amplia gama de las técnicas utilizadas habitualmente para introducir un ADN exógeno en una célula huésped procariota o eucariota, p.ej. electroporación, precipitación de fosfato cálcico, transfección DEAE-dextrano y similares. Aunque es teóricamente posible expresar los anticuerpos de la invención tanto en células huésped procariotas como eucariotas, la expresión de anticuerpos en células eucariotas, sobre todo preferentemente en células huésped de mamífero, es de preferencia sobre todo ya que dichas células eucariotas, y en particular las células de mamífero, presentan una mayor probabilidad de ensamblarse y secretar un anticuerpo apropiadamente plegado e inmunológicamente activo que las células procariotas.

Entre los ejemplos de células huésped de mamífero para expresar anticuerpos recombinantes se incluyen células de ovario de hámster chino (células CHO) (que incluyen células dhfr-CHO, descritas en Urlaub y Chasin, (1980) Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 77:4216-4220, utilizadas con un marcador seleccionable DHFR, p.ej., tal como se describe en R. J. Kaufman y P. A. Sharp (1982) Mol. Biol. 159:601-621), células de mieloma NSO, células COS, células HKB11 y células SP2. Cuando los vectores de expresión recombinante que codifican genes de anticuerpo se introducen en células huésped de mamífero, se producen los anticuerpos por cultivo de las células huésped durante un período de tiempo suficiente para dar cabida a la expresión del anticuerpo en las células huésped o la secreción del anticuerpo al medio de cultivo en el que se cultivan las células huésped. Los anticuerpos se pueden recuperar del medio de cultivo utilizando procedimientos de purificación de proteínas convencionales, tales como ultrafiltración, cromatografía de exclusión de tamaño, cromatografía de intercambio iónico y centrifugación.

Uso de secuencias de anticuerpo parciales para expresar anticuerpos intactos

Los anticuerpos interactúan con antígenos diana predominantemente a través de restos de aminoácido que están localizados en seis CDR de cadena pesada y ligera. Por esta razón, las secuencias de aminoácido dentro de las CDR son más diversas entre anticuerpos individuales que las secuencias fuera de las CDR. Dado que las secuencias de CCDR son responsables de la mayoría de las interacciones anticuerpo-antígeno, es posible expresar

anticuerpos recombinantes que imitan las propiedades de anticuerpos de origen natural específicos construyendo vectores de expresión que incluyen secuencias de CDR a partir del anticuerpo de origen natural específico injertado en secuencias de armazón a partir de un anticuerpo diferente con diferentes propiedades (véase, p.ej., Riechmann,

L. y col., 1998, Nature 332:323-327; Jones, P. y col., 1986, Nature 321:522-525; y Queen, C. y col., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 86:10029-10033). Dichas secuencias de armazón se pueden obtener a partir de bases de datos de ADN públicas que incluyen secuencias del gen del anticuerpo de línea germinal. Dichas secuencias de línea germinal diferirán de las secuencias del gen del anticuerpo maduras, ya que no incluirán genes variables completamente ensamblados, que se forman por unión V(D)J durante la maduración de linfocitos B. No es necesario obtener la secuencia de ADN entera de un anticuerpo en particular pare recrear un anticuerpo recombinante intacto que tenga propiedades de unión similares a las del anticuerpo original (véase WO 99/45962). La secuencia de cadena pesada y ligera parcial que se extiende a las regiones CDR es normalmente suficiente para este fin. La secuencia parcial se utiliza para determinar qué variable de línea germinal y segmentos de gen unidos han contribuido a los genes variables del anticuerpo recombinado. La secuencia de línea germinal se utiliza entonces para rellenar las porciones que faltan den las regiones variables. Las secuencias líderes de cadena ligera y pesada se dividen durante la maduración de proteína y no contribuyen a las propiedades del anticuerpo final. Por esta razón, es necesario utilizar la secuencia líder de línea germinal correspondiente para las construcciones de expresión. Para añadir las secuencias que faltan, se pueden combinar secuencias de ADNc clonadas con oligonucleótidos sintéticos por ligación o por amplificación por PCR. Alternativamente, se puede sintetizar la región variable completa como un conjunto de oligonucleótidos cortos solapados y combinados por amplificación PCR, para crear un clon de la región variable completamente sintético. Este proceso tiene ciertas ventajas como son la eliminación o inclusión de sitios de restricción en particular, o la optimización de codones en particular.

Las secuencias de nucleótidos de los trascritos de cadena pesada y ligera se utilizan para diseñar un conjunto solapado de oligonucleótidos sintéticos para crear secuencias V sintéticas con idénticas capacidades de codificación de aminoácido que las secuencias naturales. Las secuencias de cadena pesada y ligera sintéticas pueden diferir de las secuencias naturales. Por ejemplo, se interrumpen las cadenas de bases de nucleótidos repetidas para facilitar la síntesis de oligonucleótidos y la amplificación PCR; se incorporan los sitios de iniciación de la traducción óptimos de acuerdo con las reglas de Kozak (Kozak, 1991, J. Biol. Chem. 266:19867-19870); y se obtienen por ingeniería genética sitios de restricción corriente arriba o corriente abajo de los sitios de iniciación de la traducción.

Para las regiones variables tanto de cadena pesada como ligera, las secuencias de cadena de codificación optimizadas, y las correspondientes no codificantes, se descomponen en secciones de 30-50 nucleótidos aproximadamente en el punto medio del oligonucleótido no codificante correspondiente. Por lo tanto, para cada cadena, se pueden ensamblar los oligonucleótidos en conjuntos de doble cadena solapados que extienden los segmentos de 150-400 nucleótidos. Las agrupaciones se utilizan después como matrices para producir productos de amplificación PCR de 150-400 nucleótidos. Normalmente, se descompondrá un conjunto de oligonucleótidos de una sola región variable en dos agrupaciones que se amplifican por separado para generar dos productos PCR solapados. Estos productos solapados se combinan después por amplificación PCR para formar una región variable completa. Puede ser también deseable incluir un fragmento solapado de la región constante de cadena pesada o ligera en la amplificación PCR para generar fragmentos que se pueden clonar fácilmente en construcciones de vector de expresión.

A continuación, se combinan las regiones variables de cadena pesada y ligera reconstruidas con las secuencias promotora, de iniciación de la traducción, región constante, 3’ sin traducir, poliadenilación y terminación de transcripción clonadas para formar construcciones de vector de expresión. Las construcciones de expresión de cadena pesada y ligera pueden combinarse en un solo vector, co-transfectarse, transfectarse en serie o transfectarse por separado en células huésped que se funden después para formar una célula huésped que expresa ambas cadenas.

Por tanto, en otro aspecto, las características estructurales del anticuerpo anti-TFPI humano se utilizan para crear anticuerpos anti-TFPI humanos estructuralmente relacionados que retienen la función de unión a TFPI. Más específicamente, se pueden combinar una o más CDR de las regiones de cadena pesada y ligera específicamente identificadas de los anticuerpos monoclonales de la invención por recombinación con regiones armazón y CDR humanas para crear anticuerpos anti-TFPI humanos obtenidos por ingeniería-recombinación adicionales de la invención.

Composiciones farmacéuticas

Se proporcionan asimismo composiciones farmacéuticas que comprenden cantidades terapéuticamente eficaces de un anticuerpo monoclonal anti-TFPI y un vehículo farmacéuticamente aceptable. “Vehículo farmacéuticamente aceptable” es una sustancia que se puede añadir al principio activo para facilitar la formulación y estabilización de la preparación y que no causa ningún efecto toxicológico adverso significativo al paciente. Entre los ejemplos de dichos vehículos se incluyen los conocidos entre las personas especializadas en la técnica, como agua, azúcares como maltosa o sacarosa, albúmina, sales como cloruro sódico, etc. En Remington's Pharmaceutical Sciences de E. W. Martin, por ejemplo, se describen otros vehículos. Dichas composiciones contendrán una cantidad terapéuticamente eficaz de al menos un anticuerpo monoclonal anti-TFPI.

Entre los vehículos farmacéuticamente aceptables se incluyen soluciones o dispersiones acuosas estériles y polvos estériles para su preparación extemporánea de soluciones o dispersiones inyectables estériles. El uso de dichos medios y agentes para sustancias farmacéuticamente activas es conocido en la técnica. Preferentemente, se formula la composición para inyección parenteral. La composición se puede formular como una solución, una microemulsión, un liposoma u otras estructuras ordenadas adecuadas para una alta concentración de fármaco. El vehículo puede ser un disolvente o un medio de dispersión, por ejemplo, con contenido en agua, etanol, poliol (por ejemplo, glicerol, propilen glicol y polietilen glicol líquido, y similares), y mezclas adecuadas de los mismos. En algunos casos, incluirá agentes isotónicos como por ejemplo azúcares, polialcoholes como manitol, sorbitol o cloruro sódico en la composición.

Las soluciones inyectables estériles se pueden preparar incorporando el compuesto activo en la cantidad requerida en un disolvente adecuado con uno o una combinación de los ingredientes que se han enumerado, según se requiera, seguido de la microfiltración para esterilización. Generalmente, se preparan dispersiones incorporando el compuesto activo en un vehículo estéril que contiene un medio de dispersión básico y los demás ingredientes necesarios entre los que se han enumerado. En el caso de polvos estériles para la preparación de soluciones inyectables estériles, algunos métodos de preparación consisten en secado al vacío y deshidrogecongelación (liofilización) que producen un polvo del ingrediente activo además de un ingrediente deseado adicional a partir de una solución previamente filtrada para esterilización del mismo.

Usos farmacéuticos

El anticuerpo monoclonal se puede utilizar para fines terapéuticos para tratar deficiencias o defectos genéticos y adquiridos en la coagulación. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales en las realizaciones que se han descrito se pueden utilizar para bloquear la interacción de TFPI con FXa o para prevenir la inhibición dependiente de TFPI de la actividad TF/FVIIa. Asimismo, se puede emplear el anticuerpo monoclonal también para restaurar la generación activada por TF/FVIIa de FXa para evitar la insuficiencia de la amplificación de FXa dependiente de FVII o FIX.

Los anticuerpos monoclonales tienen un uso terapéutico en el tratamiento de trastornos de hemostasia como trombocitopenia, trastornos plaquetarios y trastornos hemorrágicos (p.ej. hemofilia A, hemofilia B y hemofilia C). Dichos trastornos se pueden tratar administrando una cantidad terapéuticamente eficaz de un anticuerpo monoclonal anti-TFPI a un paciente que lo necesita. Los anticuerpos monoclonales también tienen un uso terapéutico en el tratamiento de hemorragias incontroladas en indicaciones como traumatismo e ictus hemorrágico. Por tanto, se proporciona también un procedimiento para acortar el tiempo de hemorragia que comprende la administración de una cantidad terapéuticamente eficaz de un anticuerpo monoclonal anti-TFPI de la invención a un paciente que lo necesita.

Los anticuerpos se pueden utilizar como monoterapia o en combinación con otras terapias para abordar un trastorno hemostático. Por ejemplo, se cree que la co-administración de uno o más anticuerpos de la invención con un factor coagulante como factor VIIa, factor VIII o factor IX es útil para el tratamiento de hemofilia. En una realización, se proporciona un procedimiento para tratar deficiencias o defectos genéticos y adquiridos en la coagulación que comprende la administración de (a) una primera cantidad de un anticuerpo monoclonal que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano y (b) una segunda cantidad del factor VIII o factor IX, en el que dichas primera y segunda cantidades son eficaces en conjunto para tratar dichas deficiencias o defectos. En otra realización, se proporciona un procedimiento para tratar deficiencias o defectos genéticos y adquiridos en la coagulación que comprende la administración de (a) una primera cantidad de un anticuerpo monoclonal que se une a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano y (b) una segunda cantidad de factor VIII o factor IX, en el que dichas primera y segunda cantidades son eficaces en conjunto para tratar dichas deficiencias o defectos y, además, en el que el factor VII no se co-administra. La invención incluye también una composición farmacéutica que comprende una cantidad terapéuticamente eficaz de la combinación de un anticuerpo monoclonal de la invención y factor VIII o factor IX, en la que la composición no contiene factor VII. "Factor VII" incluye factor VII y factor VIIa. Es probable que estas terapias de combinación reduzcan la frecuencia de infusión necesaria del factor de coagulación. Se entiende por co-administración o terapia de combinación la administración de dos fármacos terapéuticos formulados cada uno de ellos por separado o formulados combinados en una composición y, si se formulan por separado, administrados aproximadamente al mismo tiempo o en momentos diferentes, pero a lo largo del mismo período terapéutico.

En algunas realizaciones, se puede utilizar uno o más de los anticuerpos descritos en el presente documento en combinación para abordar un trastorno hemostático. Por ejemplo, se cree que la co-administración de dos o más de los anticuerpos descritos en el presente documento es útil para tratar hemofilia u otros trastornos hemostáticos.

Las composiciones farmacéuticas se pueden administrar por vía parenteral a pacientes que padecen de hemofilia A

o B, con una pauta y frecuencia que puede variar dependiendo de la gravedad del episodio hemorrágico o, en el caso de terapia profiláctica, según la gravedad de la deficiencia de coagulación del paciente.

Las composiciones se pueden administrar a pacientes que lo necesiten como un bolo o por infusión continua. Por ejemplo, la administración en bolo de un anticuerpo de la invención presente como un fragmento Fab puede ser una cantidad comprendida entre 0,0025 y 100 mg/kg peso corporal, entre 0,025 y 0,25 mg/kg, entre 0,010 y 0,10 mg/kg o 0,10-0,50 mg/kg, Para infusión continua, se puede administrar un anticuerpo de la invención presente como un

fragmento Fab a entre 0,001 y 100 mg/kg peso corporal/minuto, entre 0,0125 y 1,25 mg/kg/min., entre 0,010 y 0,75 mg/kg/min., entre 0,010 y 1,0 mg/kg/min o 0,10-0,50 mg/kg/min. durante un período de 1-24 horas, 1-12 horas, 2-12 horas, 6-12 horas, 2-8 horas, o 1-2 horas. Para la administración de un anticuerpo de la invención presente como un anticuerpo de longitud completa (con regiones constantes completas), las cantidades de dosis pueden ser aproximadamente 1-10 mg/kg peso corporal, 2-8 mg/kg, o 5-6 mg/kg. Dichos anticuerpos de longitud completa se administrarán normalmente por infusión a lo largo de un período de treinta minutos a tres horas. La frecuencia de la administración dependerá de la gravedad de la afección. La frecuencia oscilará entre tres veces a la semana y una vez cada dos semanas a seis meses.

Adicionalmente, las composiciones se pueden administrar a los pacientes a través de una inyección subcutánea. Por ejemplo, se puede administrar una dosis de 10 a 100 mg de anticuerpo anti-TFPI a pacientes por inyección subcutánea una vez a la semana, dos veces a la semana o mensualmente.

Tal como se utiliza en el presente documento, "cantidad terapéuticamente eficaz" significa una cantidad de un anticuerpo monoclonal anti-TFPI o la combinación de dicho anticuerpo y factor VIII o factor IX que se necesita para aumentar de manera eficaz el tiempo de coagulación in vivo o causar de otro modo un beneficio medible in vivo a un paciente que lo necesita. La cantidad precisa dependerá de una serie de factores, entre los que se incluyen sin limitarse a ellos, los componentes y las características físicas de la composición terapéutica, la población del paciente objeto del tratamiento, consideraciones sobre cada paciente individual, y similares y pueden ser determinadas por las personas especializadas en la técnica.

Ejemplos

Ejemplo 1. Clonación, expresión y cuantificación de los niveles de expresión de anticuerpo

Se subclonaron la cadena pesada y ligera de los Fab 2A8 y 4B7 de tipo silvestre que llevan la marca c-myc y hexahistidina en el término C de la cadena pesada en vector de expresión bacteriano pET28a (Novagen/Merck Chemicals Ltd., Nottingham, RU) y se transformaron en células Top10F' (Invitrogen GmbH, Karlsruhe, Alemania). Alternativamente, se pueden utilizar otros vectores de expresión bacteriana (p.ej. sistema de vector pQE, Qiagen GmbH, Hilden, Alemania) y cepas (p.ej. DH5α, Invitrogen GmbH, Karlsruhe, Alemania). Se generaron variantes por oligo-mutagénesis dirigida a sitio convencional y se confirmaron por secuenciación de ADN. En particular, se modificaron los restos de aminoácido dentro o alrededor de regiones determinantes complementarias dentro de la cadena pesada y/o la cadena ligera.

Para poder usar los anticuerpos de tipo silvestre o mutante como competidores, se eliminaron o se sustituyeron las marcas de epítopo localizadas en el término C de la cadena pesada empleando técnicas basadas en PCR normales. En particular, para 4B7, la marca c-myc se cambió por una marca de epítopo hemaglutinina (HA) para todas las variantes analizadas. En cambio, 4B7 de tipo silvestre o las variantes utilizadas como competidores llevaron una marca c-myc. En el caso de 2A8, la marca de epítopo c-myc o bien fue sustituida por marca HA o bien fue suprimida, con el resultado de una variante que solamente presentó una marca de epítopo 6x histidina en su término C.

Para la expresión, se transformaron variantes en la cepa Escherichia coli BL21starDE3 (Invitrogen, C6010-03), se inocularon en un cultivo durante toda la noche en medio LB que contenía canamicina (30 µg/ml) y se incubaron a 37 °C durante 18 horas. Se generaron los cultivos de expresión inoculando el cultivo de toda la noche en medio LB nuevo 1:20 con canamicina (30 µg/ml). Al cabo de 6 horas, se añadió 1 mM isopropil-b-D-1-tiogalactopiranosida (Roth, 2316.5) para inducir la expresión de anticuerpo y se incubaron los cultivos durante 18 horas más a 30 °C. Alternativamente, se inocularon los cultivos 1:20 en el medio de autoinducción Overnight Express TB (Merck, 71491) y se incubó a 30 °C durante 24 horas.

Para cuantificar los niveles de expresión, se empleó un enfoque ELISA. Brevemente, se incubaron placas MTP (Nunc maxisorp negro, 460518) con un anticuerpo específico de Fab (Sigma, I5260), diluido en tampón de revestimiento (Candor Bioscience GmbH, 121500) a 4°C durante toda la noche, se lavaron con PBST (solución salina tamponada con fosfato: 137 mM NaCl, Merck 1.06404.5000; 2,7 mM KC1, Merck 1.04936.1000; 10 mM Na2HPO4, Merck 1.06586.2500, 1,8 mM KH2PO4, Merck 1.04871.5000; que contenía 0,05 % Tween 20 Acros Organics, 233360010), se bloquearon con 2 % leche en PBST durante 1 h a temperatura ambiente y se volvieron a lavar. Se diluyeron los cultivos en 0,25 % leche desnatada (Fluka analytical, 70166) en PBS y se unieron a las placas MTP durante 1 h a temperatura ambiente. Después del lavado con PBST, se incubaron los anticuerpos capturados con anticuerpo anti-Fab acoplado con HRP (Sigma, A0293) y se detectó por incubación de la placa con 10 µM de sustrato rojo amplex (Invitrogen, A12222) durante 10 a 30 minutos a temperatura ambiente en oscuridad, seguido de medida de la fluorescencia. Se normalizaron los niveles de expresión después de determinar la concentración en relación con el anticuerpo purificado de tipo silvestre (2A8 o 4B7).

Ejemplo 2. Determinación de la actividad y la reactividad cruzada entre especies de variantes de anticuerpo generadas

Para determinar la actividad de las variantes de anticuerpo mutadas sobre TFPI humano o de ratón (American Diagnostica, 4900B y R&D Systems, 2975-P1, respectivamente) se utilizó un formato de ensayo ELISA en equilibrio

o competitivo. Brevemente, se revistieron placas MTP (Mesoscale Discovery, L21XA-4 o Nunc maxisorp negro,

460518) con 0,04-2 µg/ml de TFPI humano o de ratón diluido en solución salina tamponada con fosfato (PBS) o en tampón de revestimiento (Candor Bioscience GmbH, 121500), respectivamente y se incubaron durante toda la noche a 4 °C. Después de lavado, se bloquearon las placas con 3 % de albúmina de suero bovino (Sigma, A4503) en PBST durante 1 hora a temperatura ambiente y se repitió la etapa de lavado. Para la unión de los anticuerpos, se 5 añadieron 10-25 µl de los sobrenadantes de cultivo normalizados a su nivel de expresión de anticuerpo correspondiente (si no se indica de otra forma) a las placas, durante 1 hora a temperatura ambiente, seguido de lavado con PBST. A continuación, se detectaron el tipo silvestre y las variantes unidos con un anticuerpo específico de marca de epítopo o se incluyó una etapa de competición. Para la competición, se añadieron 50-300 nM de competidor o antígeno libre y se incubó durante entre 20 minutos y 24 horas a temperatura ambiente. Después de 10 lavado, se detectaron las variantes restantes con un anticuerpo específico de marca de epítopo acoplado a peroxidasa de rábano rusticano (Biomol, anti-c-myc A190-105P para variantes 2A8 y anti-HA A190-108P para variantes 4B7) o con un anticuerpo anti-myc (Sigma, C3956) o un anticuerpo anti-HA (Sigma, H6908) que se marcó previamente con un reactivo sulfo-NHS de acuerdo con las instrucciones del fabricante para detección electrolumininiscente (Mesoscale Discovery, R91AN-1). Para la detección de señal en placas maxisorp, se

15 añadieron 10 µM de sustrato rojo amplex (Invitrogen, A12222) y se incubó durante 10 a 30 minutos a temperatura ambiente en la oscuridad seguido de medida de la fluorescencia. Para la detección en placas MSD, se diluyó tampón T de lectura MSD 2x en H2O (Mesoscale Discovery, R92TC-1), se añadió a las placas y se detectó la señal de electroquimioluminiscencia a 620 nm utilizando un generador de imágenes Mesoscale Discovery Sector 6000.

Ejemplo 3. Sustituciones simples y múltiples de aminoácido

20 En la Tabla 1 se proporcionan varios ejemplos de sustituciones de aminoácido simples introducidas en la cadena pesada o ligera de 2A8. Se analizó el nivel de expresión de las variantes por cuadruplicado en ELISA de cuantificación. Después de la normalización hasta el nivel de expresión correspondiente, se analizó el comportamiento por cuadruplicado en la prueba ELISA competitiva sobre TFPI humano y murino y se determinó las relaciones entre la variante y el tipo silvestre (wt). Se calcularon los errores por propagación de error desde las

25 desviaciones típicas.

Tabla 1. Análisis de sustituciones de aminoácido simples dentro de 2A8.

hTFPI: mTFPI

variantes 2A8: variante/tipo silvestre error variante/tipo silvestre error

HC_S31P: 3,6 0,5 2,4 0,3

HC_S31V: 9,7 1,1 7,4 4,1

HC_G33K: 1,8 0,2 0,7 0,1

HC_G33P: 5,1 0,6 2,9 0,4

HC_S35L: 1,7 0,1 1,5 0,2

HC_S35D: 4,3 0,6 2,6 0,6

HC_I51D: 3,9 0,3 1,4 0,2

HC_I151E: 7,3 0,6 0,7 0,1

HC_S54F: 6,5 0,6 3,1 0,6

HC_S54D: 1,7 0,2 1,2 0,2

HC_S55A: 2,0 0,3 1,2 0,2

HC_S55R: 4,4 1,1 2,1 0,3

HC_K99V: 7,5 0,9 3,9 0,5

HC_K99L: 13,5 1,4 10,8 2,8

HC_F104Y: 2,0 0,3 1,5 0,2

LC_A32N: 3,5 0,4 2,0 0,3

LC_Y48F: 4,6 0,6 3,2 0,7

LC_N51V: 4,4 0,4 2,0 0,4

LC_N52G: 3,4 0,5 1,5 0,2

LC_P54L: 5,3 0,8 2,7 0,5

(continuación)

hTFPI: mTFPI

variantes 2A8: variante/tipo silvestre error variante/tipo silvestre error

LC_D91L: 4,2 0,3 1,6 0,5

LC_D91R: 3,1 0,5 2,0 0,3

LC_D91W: 7,4 0,7 4,0 0,7

LC_D91K: 3,5 0,4 1,4 0,2

LC_D92S: 3,8 0,5 2,6 0,3

LC_D92T: 2,6 0,4 1,2 0,2

LC_V96G: 3,2 0,4 1,2 0,2

LC_V96M: 3,5 0,5 1,5 0,2

LC_V96W: 4,0 0,4 4,3 0,6

HC_S31P: 3,6 0,5 2,4 0,3

HC_S31V: 9,7 1,1 7,4 4,1

HC_G33K: 1,8 0,2 0,7 0,1

HC_G33P: 5,1 0,6 2,9 0,4

HC_S35L: 1,7 0,1 1,5 0,2

HC_S35D: 4,3 0,6 2,6 0,6

HC_I51D: 3,9 0,3 1,4 0,2

HC_I51E: 7,3 0,6 0,7 0,1

HC_S54F: 6,5 0,6 3,1 0,6

HC_S54D: 1,7 0,2 1,2 0,2

HC_S55A: 2,0 0,3 1,2 0,2

HC_S55R: 4,4 1,1 2,1 0,3

HC_K99V: 7,5 0,9 3,9 0,5

HC_K99L: 13,5 1,4 10,8 2,8

HC_F104Y: 2,0 0,3 1,5 0,2

LC_A32N: 3,5 0,4 2,0 0,3

LC_Y48F: 4,6 0,6 3,2 0,7

LC_N51V: 4,4 0,4 2,0 0,4

LC_N52G: 3,4 0,5 1,5 0,2

LC_P54L: 5,3 0,8 2,7 0,5

LC_D91L: 4,2 0,3 1,6 0,5

LC_D91R: 3,1 0,5 2,0 0,3

LC_D91W: 7,4 0,7 4,0 0,7

LC_D91K: 3,5 0,4 1,4 0,2

LC_D92S: 3,8 0,5 2,6 0,3

LC_D92T: 2,6 0,4 1,2 0,2

LC_V96G: 3,2 0,4 1,2 0,2

(continuación)

hTFPI: mTFPI

variantes 2A8: variante/tipo silvestre error variante/tipo silvestre error

LC_V96M: 3,5 0,5 1,5 0,2

LC_V96W: 4,0 0,4 4,3 0,6

En la Tabla 2 se dan algunos ejemplos de sustituciones de aminoácido combinadas dentro de anticuerpos TFPI 2A8. Si bien en la Tabla 2 no se proporcionan todas las combinaciones, se contempla que el anticuerpo TFPI pueda 5 comprender cualquier combinación de las modificaciones proporcionadas. Se analizó el nivel de expresión de las variantes por cuadruplicado por ELISA de cuantificación. Si no se indica de otro modo, se normalizaron las variantes al nivel de expresión correspondiente y se analizó el comportamiento por cuadruplicado por ELISA competitiva sobre TFPI humano y murino seguido del cálculo de las relaciones entre la variante y la referencia (HC_K99L). Los valores se marcan "#" cuando se analizó el comportamiento de la variante sin previa normalización y se normalizaron las

10 relaciones entre las variantes y la referencia al nivel de expresión dividiendo la señal de ensayo por el nivel de expresión. En los casos en los que se utilizó una referencia diferente en ELISA competitiva y se analizaron las variantes sin normalización previa, los valores fueron marcados con “*”. Para estas variantes, el valor enumerado en la tabla fue calculado multiplicando las relaciones variante/referencia alternativa por referencia alternativa/HC_K99L. Se calcularon los errores por propagación de error desde desviaciones típicas.

15 Tabla 2. Ejemplo de sustituciones de aminoácido múltiples dentro de 2A8.

2A8 HC: 2A8 LC hTFPI mTFPI

Q1: R30 S31 G33 M34 S35 S50 151 R52 S54 S55 S56 K99 D01 I12 A13 S21 N26 R28 N29 H33 Y48 Y49 N51 N52 G56 E80 S89 D91 D92 G93 V94 P95 V96 Variante_HC_K99L erro Variante_HC_K99L error

V: D F V F V 8,1# 0,4 2,2# 0,4

P: D F L F G 6,2# 1,4 2,3# 0,8

D
D: R V F V 8,0# 0,5 2,7# 0,4

L: F V F K 5,0# 0,6 3,1# 0,5

V: P D F L W 22,5 # 1,6 5,9# 1,3

D
D: L F W 0,8# 0,1 0,2# 0,0

V: D R L F G L W 0,4# 0,1 0,1# 0,0

V: D D V F K 0,6# 0,0 0,1# 0,0

P: D F F V W 0,6 0,2 0,4 0,1

D: F L W 6,2 1,6 5,3 1,2

V: D F F L W 5,4 1,6 4,2 1,0

D: L L W 7,1 1,9 5,4 1,3

V: P D F V F V W 6,6 0,7 5,9 0,9

D: E R L F V L W 10,4 1,3 8,0 1,6

V
V
V: W 6,7 0,9 5,6 1,0

(continuación)

2A8 HC

2A8 LC

hTFPI

mTFPI

Q1R30S31G33M34S35S50151R52S54S55S56K99D01I12A13S21N26R28N29H33Y48Y49N51N52G56E80S89D91D92G93V94P95V96

Variante_HC_K99L

erro

Variante_HC_K99L

error

V: E R V F L W 9,2 1,0 7,0 1,9

D: L F V D W 18,8 2,1 18,7 2,6

V: F L V 16,3 1,8 15,7 2,6

V: P D F V L 12,2 1,1 11,7 2,2

D: R L F V L W 17,8 2,1 13,4 5,4

V: D R F V L W 8,7 0,9 8,2 3,9

V: D F V 7,5 0,9 7,2 1,9

V: D R F V L 8,4 0,9 6,5 1,4

D: F R L L W 14,9 1,6 12,1 4,8

V: L D F V V K 8,6 1,0 8,2 1,4

V: L E F V V K 4,9 0,6 3,9 0,7

D: L 3,9 0,7 4,5 0,7

D: L F L W 18,8 1,7 18,2 3,4

V: D R V F L W 16,4 1,5 11,9 4,0

D: R L F V W 19,7 2,2 17,4 3,8

D: R L S F V W 21,9* 5,3 22,0* 8,9

D: R L Y F V W 18,7* 4,2 19,0* 6,8

D: R L S F V W 20,1* 6,2 19,9* 7,4

D: R L T F V W 19,5* 4,5 18,8* 6,6

D: R L A F V W 4,1* 1,1 4,1* 1,5

D: R L P F V W 22,0* 5,7 23,2* 9,1

D: R L K F V W 20,0* 5,8 18,9* 7,1

D: R L Y F V W 14,0* 3,4 11,2* 4,4

D: R L F V M W 23,1* 5,5 21,2* 7,5

D: R L F V A W 18,6* 5,0 18,2* 6,8

D: R L F V W S 23,9* 6,3 22,8* 7,6

(continuación)

2A8 HC

2A8 LC

hTFPI

mTFPI

Variante_HC_K99L

erro

Variante_HC_K99L

error

D

R

L

F

V

W

S

17,0*

4,0

16,5*

5,9

D

R

L

F

V

W

T

22,8*

6,4

19,9*

8,0

D

R

L

F

V

W

V

15,7*

3,9

13,7*

5,1

D

R

L

F

V

A

W

S

T

A

10,9*

3,1

9,0*

4,0

E D

R

L

F

V

W

20,9*

5,3

20,3*

7,4

S D

R

L

F

V

W

17,9*

4,5

19,1*

6,9

A D

R

L

F

V

16,0*

3,6

14,7*

5,2

1 D

R

L

F

V

19,6*

4,9

18,1*

6,8

K D

R

L

F

V

11,2*

2,8

11,6*

4,1

D A

R

L

F

V

10,9*

2,8

12,6*

4,4

D

S

R

L

F

V

10,1*

2,7

7,9*

2,7

D

R

G

L

F

V

21,4*

5,2

18,7*

7,2

E S D

R

G

L

S

Y

S

T

P

K

F

V

W

A

V

S

T

18,3*

4,6

13,3*

4,3

E S D

R

G

L

F

V

11,9*

2,1

9,3*

2,9

D

R

L

S

Y

S

T

P

K

F

V

W

A

V

S

T

21,4*

3,6

16,8*

5,8

E S D

R

G

L

S

Y

S

T

P

F

V

W

A

V

S

T

18,8*

4,4

12,3*

3,5

E S D

R

G

L

S

Y

S

T

P

K

F

V

19,8*

3,3

15,5*

4,8

E S D

R

G

L

S

Y

S

T

P

F

V

18,7*

3,4

15,1*

4,6

D

L

F

S

L

V 19,9*

4,0

20,3*

5,7

D

L

F

A

L

V

4,4*

1,3

6,1*

1,7

D

L

F

L

S

W 20,7*

4,1

20,5*

6,7

D

L

F

L

S

W 14,2*

2,7

15,6*

4,2

D

L

F

L

T

W 18,6*

4,0

19,3*

5,4

D

L

F

L

V

W 10,2*

2,1

13,6*

4,6

D A

L

F

L

W

4,0*

0,9

4,6*

1,3

D

S

L

F

L

W

3,9*

1,2

3,0*

1,0

D

G

L

F

L

W 18,1*

4,3

18,2*

5,8

(continuación)

2A8 HC: 2A8 LC hTFPI mTFPI

D: G L F L W 17,8* 4,2 16,9* 5,0

E: S D G G L F L W 13,6* 2,8 10,6* 3,6

S: V D R V F L W 13,5* 2,8 6,5* 3,3

V: A D R V F L W 9,0* 2,0 4,7* 2,3

V: A D R V F L W 16,6* 3,8 9,3* 4,3

V: D S R V F L W 11,7* 2,9 7,9* 4,6

V: D R G V F L W 16,2* 3,9 12,1* 6,0

E: V A D R G V F L W 12,1* 2,8 7,7* 3,8

V: D R V S Y S T P K F R S M L S T W 2,2* 0,9 2,4* 1,4

E: V A D R G V S Y S T P K F S M L S T W 11,4* 2,7 7,1* 3,6

E: V A D R G V S Y S T P K F M L S T W 9,8* 2,5 5,9* 2,0

V: D R V S Y S T P K F S M L S T W 19,6* 3,5 21,4* 9,6

V: D R V S Y S T P K F M L S T W 18,0* 4,9 15,4* 7,6

En la Tabla 3 se dan varios ejemplos de sustituciones simples y/o dobles de aminoácido introducidas en la cadena pesada y/o ligera de 4B7. Se analizó el nivel de expresión de las variantes por cuadruplicado en la prueba ELISA de cuantificación. Después de la normalización al nivel de expresión correspondiente, se analizó el comportamiento por cuadruplicado en ELISA competitiva sobre TFPI humano y en ELISA en equilibro sobre TFPI murino seguido de la determinación de las relaciones entre las variables y el tipo silvestre. Los errores se calcularon por propagación de error desde desviaciones típicas.

Tabla 3. Análisis de sustituciones simples o dobles de aminoácido dentro de 4B7

hTFPI: mTFPI

variantes 4B7: variante/tipo silvestre error variante/tipo silvestre error

HC_N32D: 3,8 0,7 6,0 2,9

HC_N32E: 3,2 1,0 2,1 0,3

HC_S33G: 1,5 0,3 6,5 1,2

HC_S57K: 1,7 0,4 6,5 1,1

HC_S57R: 2,0 0,4 6,6 1,4

HC_D62I: 9,8 1,6 44,4 11,6

HC_D62R: 32,3 4,5 230,2 34,1

HC_D62L: 6,8 1,2 22,9 6,1

(continuación)

hTFPI: mTFPI

variantes 4B7: variante/tipo silvestre error variante/tipo silvestre error

HC_D62Q: 20,6 2,8 142,5 28,0

HC_D62S: 29,3 4,3 146,5 40,4

HC_H103D: 2,4 0,4 12,9 2,0

HC_H103G: 1,4 0,3 10,7 2,0

HC_Y112D: 2,9 0,6 5,7 1,3

LC_S32R: 4,2 0,7 7,8 1,5

LC_S32Y: 2,0 0,4 6,7 1,2

LC_D33F: 5,3 1,3 7,0 2,6

LC_D33R: 3,6 0,7 7,2 1,9

LC_N35I: 3,6 0,7 7,1 1,5

LC_N35L: 2,1 1,0 6,0 1,3

LC_N35T: 5,4 1,0 3,4 1,1

LC_Y37F: 3,6 0,7 1,9 0,6

LC_S57Y: 1,6 0,4 2,2 0,4

LC_S61C: 3,1 0,5 15,3 4,2

LC_D97M: 2,4 0,5 1,3 0,4

LC_D97T: 1,8 0,3 5,5 1,6

HC_N61G: 2,2 0,5 1,4 0,3

HC_D62V: 31,9 5,6 95,0 20,4

HC_D62N: 52,3 9,5 146,4 28,9

HC_H107M: 8,1 1,6 5,6 1,7

LC_F31I: 9,1 2,1 23,6 4,3

LC_F31M: 1,7 0,4 1,3 0,4

LC_N35V LC_G56D: 1,9 0,4 8,2 1,7

LC_N35L LC_G56A: 3,1 0,7 6,9 1,6

LC_D33F LC_Y54F: 4,3 0,9 7,9 1,9

HC_S30R HC_S57K: 1,6 0,3 6,6 1,1

HC_N61G HC_D62V: 8,0 1,1 31,1 9,1

HC_H107M LC_F31I: 3,7 0,7 9,2 2,7

HC_G109A LC_D33R: 3,8 0,6 8,0 1,3

HC_N61T LC_G167C: 2.8 0,4 6,4 1,6

HC_K58M HC_D62N: 6.6 1,2 15,2 4,5

En la Tabla 4 se dan algunos ejemplos de combinaciones de sustituciones de aminoácido dentro de anticuerpos TFPI 4B7. Si bien en la Tabla 4 no se proporcionan todas las combinaciones, se contempla que el anticuerpo TFPI pueda comprender cualquier combinación de las modificaciones proporcionadas. Se analizó el nivel de expresión de las variantes por cuadruplicado por ELISA de cuantificación. Si no se indica de otro modo, se normalizaron las variantes al nivel de expresión correspondiente y se analizó el comportamiento por cuadruplicado por ELISA competitiva sobre TFPI humano y murino seguido del cálculo de las relaciones entre la variante y la referencia (HC_D62R). En los casos en los que se utilizó una referencia diferente y se analizaron las variantes sin

normalización previa, los valores fueron marcados con “*”. Para estas variantes, el valor enumerado en la tabla fue calculado multiplicando las relaciones variante/referencia alternativa por referencia alternativa/HC_D62R. Se calcularon los errores por propagación de error desde desviaciones típicas. nb: no se detectó unión en las condiciones de ensayo utilizadas.

Tabla 4. Ejemplo de sustituciones de aminoácido múltiples dentro de 4B7.

HC 4B7: LC 4B7 hTFPI mTFPI

Q1: N32 S37 G44 153 K55 D62 H103 H107 Y112 M4 V30 F31 S32 D33 N35 136 Y37 N39 l_42 K44 Q50 151 K55 G56 A60 097 S98 variante/HC_D62R error variante/HC_D62R error

D: R D R I 26,1 2,2 30,1 4,3

D: R M D I R I T 18,2 3,6 8,7 1,4

D: R D R I 22,9 2,5 19,5 3,2

D: S M D R R T 19,6 1,9 20,3 3,2

D: R D I R 13,6 1,4 14,6 2,4

R: M D F I 20,0 3,4 36,6 9,8

D: R D F I T 25,5 1,7 15,9 2,6

D: R D I F I T 23,3 3,1 11,9 2,2

R: M D M F 24,2 1,8 31,3 5,0

R: M D I R I 22,0 2,2 35,4 5,0

D: R D M D R T 14,0 1,7 18,4 2,7

D: Q D M R F I 20,8 1,6 15,8 2,1

D: R D R F I 29,7 2,2 42,0 5,9

D: R M D R F T 29,2 1,9 44,1 7,2

D: Q M D R T 23,7 1,4 18,8 3,2

D: Q M D R T 25,0 2,0 27,1 5,0

D: R M R R I 12,9 1,4 16,1 2,4

D: R M D I R I 29,8 2,9 43,0 7,0

D: R D M R R I 15,8 1,0 11,2 2,0

R: D F I 20,3 1,5 20,8 3,6

D: R M D I R 30,1 1,6 27,9 6,9

D: R M D M L R I T 32,2 3,1 26,7 4,5

D: R M D M F I 28,4 2,2 46,8 7,6

D: Q M D M R F I T 19,0 1,8 12,0 2,9

(continuación)

HC 4B7: LC 4B7 hTFPI mTFPI

D: R D T T 26,0 3,2 9,5 2,9

D: R M D M R 26,9 2,9 24,6 4,7

D: R M D M R I 21,3 1,8 23,0 8,6

D: R M D M F T 29,9 2,2 34,3 5,6

Q: D R F I 23,6 1,9 38,1 5,7

D: Q D R R I 21,4 1,5 23,5 4,4

D: R M D I I 28,8 2,6 30,0 5,2

D: Q M D R F I 24,7 4,2 46,6 6,2

D: Q D I F I 22,4 3,0 14,0 5,6

R: M D M F I 30,9 3,0 47,0 7,9

D: Q M D I R R I T 20,2 1,7 11,5 1,9

R: M D T T 20,1 2,1 19,4 3,4

D: R M D M R R 18,6 1,4 13,9 2,1

D: R M D I R F I T 28,7 3,2 20,6 5,0

D: R D M D R 17,7 1,4 16,0 2,9

D: Q D R R I T 17,2 1,0 13,4 1,9

R: M D R F I 24,1 2,5 50,3 6,6

D: R M D I R F T 29,5 2,9 19,7 3,5

D: Q M D R R 24,9 2,3 24,7 3,2

D: R M D M R R I T 16,9 1,5 9,6 1,7

D: R M D R T T 27,7 2,5 15,8 2,5

D: R M D M R F T 21,9 1,7 16,5 3,7

D: R M D M R R T 17,0 2,1 18,7 2,5

S: M D R F I 18,2 3,5 31,7 5,7

R: M D I R F I T 20,4 2,5 18,2 2,6

(continuación)

HC 4B7: LC 4B7 hTFPI mTFPI

D: O M D M F T F 19,4 3,2 35,3 5,6

D: R D R R 14,8 2,7 7,2 1,3

D: R M D F T F 35,7 4,3 57,5 9,1

D: Q M D I 22,2 1,6 16,4 2,5

D: O M D R F 23,2 1,7 16,9 3,8

D: R M D R 25,3 2,6 20,3 2,6

O: M D F I 22,7 1,4 31,7 5,1

D: R M D R I T 29,1 1,8 28,1 4,9

D: R M D R T 25,3 2,8 29,3 4,8

D: R M D R T 28,2 2,7 29,3 4,5

D: R D R F I T 26,2 2,9 40,0 6,1

D: R M D M R F I 27,0 1,5 32,3 4,9

R: D R F I 21,9 2,0 39,9 5,9

D: R D L R F I T 21,3* 6,7 23,9* 4,7

D: R D I R F I T 19,3* 5,3 12* 2,8

D: R D L R F I T 26,1* 7,6 42,2* 10,1

D: R D H R F I T 22,1* 6,8 15,2* 3,2

D: R D Y R F I T 27,9* 9,8 39,7* 10,4

D: R D R F I D T 25,2* 7,6 35,4* 8,8

D: R D R F I D T 1,3* 0,5 nb 0,0

D: R D R F I Q T 26,9* 7,6 43* 10,5

D: R D R F I R T 26* 8,1 40,1* 9,1

D: R D R F I R T 25,9* 7,4 39,4* 10,4

D: R D R F I R T 11,2* 3,6 5,2* 1,5

D: R D R F I L T 7,8* 2,0 nb 0,0

D: R D R F I V T 12,1* 3,4 nb 0,0

(continuación)

HC 4B7: LC 4B7 hTFPI mTFPI

D: R D R F I D T 19,1* 6,2 14,3* 3,6

D: R D R F I T H 17,9* 5,3 7,1* 1,7

F: D R D R F I T 26,7* 9,0 39,8* 8,9

D
D: R D R F I T 1,9* 0,7 nb 0,0

D: S R D R F I T 26,5* 8,1 41,5* 10,2

D: T R D R F I T 19,6* 6,0 8,3* 2,3

D: Y R D R F I T 25,6* 8,5 42,8* 10,4

D: K D R F I T 22,7* 7,1 38,8* 8,8

D: Q D R F I T 23,2* 7,0 40* 8,8

F: D S Y R D L R F I D T 20,4* 5,3 29,4* 6,3

D: R D L R F I D T 23,9* 4,9 28,4* 8,2

F: D S Y R D R F I T 26,3* 4,8 45,1* 9,6

D: Q D I I F I 22,9* 8,0 24,6* 12,8

D: O D I F I D 27,3* 8,9 46,3* 23,5

D: Q D I F I Q 21,4* 6,9 16,7* 8,9

D: Q D I F I R 22,8* 7,9 18,5* 9,6

D: Q D I F I T 14,4* 4,2 4,6* 2,5

D: Q D I F I H 13,5* 4,8 nb 0,0

D: T Q D I F I 5,7* 1,5 nb 0,0

D: Y Q D I F I 25,6* 9,0 26,2* 13,3

E: D S Y R D L R I D 23* 5,0 9,9* 3,3

D: R D L R I D 25* 4,3 7* 4,2

E: D S Y R D R I 22,6* 3,9 25,5* 5,8

Ejemplo 4. Purificación de anticuerpos

Se recogieron células por centrifugación a 9000 rpm durante 30 min a 4 °C y se almacenaron a -20 °C. Se intercambió-tamponó el sobrenadante con tampón A (50 mM NaH2PO4, 300 mM NaCl, 10 mM imidazol pH 8,0), se concentró y se purificó aplicando un procedimiento de purificación en dos etapas. Brevemente, se cargaron 100 ml de sobrenadante concentrado en una columna de superflujo de 5 ml Ni-NTA (Qiagen, 1018142) se lavó primero con

5 x volúmenes de columna de tampón A seguido de 5 x volúmenes de columna de tampón B al 4,3 % (50 mM NaH2PO4 300 mM NaCl, 250 mM imidazol pH 8,0) y se eluyó con 7 volúmenes de tampón B. Se combinan las fracciones y se dializaron en PBS. En una segunda etapa de purificación se incubaron los anticuerpos purificados con Ni-NTA con una matriz de afinidad específica de cadena ligera, es decir, selección de captura lambda o kappa (BAC 0849.010 y BAC 0833.10, respectivamente) para 2A8 y 4B7, respectivamente. Tras la incubación a 4 °C durante toda la noche, se cargó la matriz en una columna, se lavó con 5 volúmenes de PBS, 5 volúmenes de 500 mM de arginina 100 mM NaH2PO4, 100 mM NaCl pH 6,0 y de nuevo 5 volúmenes de PBS. Se eluyeron los anticuerpos con 6 volúmenes de 100 mM glicina pH 3,0 seguido de 3 volúmenes de 100 mM glicina pH 2,0 en 1/10 del volumen total de 1M HEPES pH 7,5 para neutralizar los eluatos. Finalmente, se dializaron los eluatos en PBS durante toda la noche a 4 °C. Se analizaron los anticuerpos purificados por SDS-PAGE y espectrometría de masa.

Ejemplo 5. Medida de la afinidad de la unión de anticuerpo a TFPI utilizando resonancia de plasmon superficial (Biacore)

Se inmovilizó TFPI humano o de ratón en la superficie para análisis. Se utilizaron chips CM5 y un kit de acoplamiento de amina (GE HealthCare) para la inmovilización del ligando de acuerdo con las instrucciones del fabricante. La cantidad de TFPI inmovilizada fue aproximadamente 70 UR para adaptarse a la masa de anticuerpo que podría generar RMax de 100 UR. Los anticuerpos anti-TFPI parentales y madurados con afinidad estaban en la fase móvil. Se llevó a cabo la determinación de afinidad con al menos cinco concentraciones diferentes (0,1, 0,4, 1,6, 6,4 y 25 nM) de los anticuerpos modificados.

Al analizar las variantes de anticuerpo que contienen mutaciones simples en regiones CDR, los autores de la invención identificaron muchos clones que tenían una señal superior en el ensayo de unión ELISA. Se purificaron clones seleccionados y se analizó su afinidad para TFPI humano o de ratón utilizando Biacore. Tal como se muestra en la Tabla 5 y la Tabla 6, estos clones tienen una afinidad superior para TFPI que la de los anticuerpos parentales 2A8 o 4B7. Aunque algunos de los mutantes 2A8 tienen una velocidad de asociación más lenta (ka) que el anticuerpo parental 2A8, todos estos mutantes tienen una velocidad de disociación mucho más lenta (kd) que 2A8. En general, estas mutaciones simples aumentan la afinidad de 2A8 en el intervalo de 1,47 veces más a 7,22 veces más en TFPI humano y 1,71 veces más a 7,20 veces más en TFPI de ratón. Cuando se analizaron las variantes 4B7, la mutación D62R en el dominio CDR2 de cadena pesada aumentó significativamente la señal. Este clon fue seleccionado para medir la afinidad. Tal como se muestra en la Tabla 5 y en la Tabla 6, ésta sola mutación aumenta la afinidad de 4B7 para TFPI humano de 11,1 nM a 58,2 pM, una mejora de 191 veces más. La velocidad de disociación lenta (kd) de 4B7HcD62R contribuye principalmente a su mejora de afinidad de 8,40 x 10-3 /s de 4B7 a 1,65 x 10-4 de 4B7HcD62R, una mejora de aproximadamente 50 veces más. De manera similar, esta mutación aumenta la afinidad de 4B7 a una TFPI de ratón de 58,6 nM a 427 pM, una mejora de 137 veces más.

Tabla 5. Afinidad de variantes 2A8 o 4B7 seleccionadas (mutación simple) en TFPI humano

Muestra: Clon ka (1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora

2A8-1 2A8-2 2A8-3 2A8-4 2A8-6 2A8-7 2A8-8 2A8-9 2A8-10 2A8-11 2A8-12 2A8-13 2A8-14 2A8-15 2A8-16 2A8-17: HC_G33P HC_S31P HC_S31V HC_S35D HC_I51E HC_S54F HC_S55R HC_K99L HC_K99V LC_A32N HC_I51D LC_N51V LC_Y48F LC_D91K LC_D91L LC_D91W 2,71E+06 2,91E+06 3,84E+06 4,01E+06 1,29E+06 2,81E+06 4,30E+06 2,60E+06 2,55E+06 2,70E+06 3,61E+06 4,26E+06 2,64E+06 4,33E+06 4,41E+06 3,86E+06 2,24E-03 3,33E-03 1,43E-03 3,80E-03 1,62E-03 2,04E-03 3,94E-03 8,03E-04 2,54E-03 4,10E-03 4,95E-03 2,20E-03 3,00E-03 2,09E-03 4,40E-03 4,32E-03 8,27E-10 1,15E-09 3,73E-10 9,50E-10 1,26E-09 7,27E-10 9,17E-10 3,09E-10 9,95E-10 1,52E-09 1,37E-09 5,18E-10 1,14E-09 4,82E-10 9,99E-10 1,12E-09 2,70 1,95 6,00 2,35 1,78 3,08 2,44 7,22 2,25 1,47 1,63 4,32 1,97 4,64 2,24 2,00

(continuación)

Muestra: Clon ka (1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora

2A8-20: 2A8wt 3,13E+06 7,00E-03 2,24E-09 1,00

4B7HcD62R: HC_D62R 2,83E+06 1,65E-04 5,82E-11 190,83

4B7: 4B7wt 7,56E+05 8,40E-03 1,11E-08 1,00

Tabla 6, Afinidad de variantes 2A8 y 4B7 seleccionadas (mutación simple) en TFPI de ratón

Muestra: Clon ka (1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora

2A8-1 2A8-2 2A8-3 2A8-4 2A8-7 2A8-9 2A8-17 2A8wt 4B7HcD62R 4B7wt: HC_G33P HC_S31P HC_S31V HC_S35D HC_S54F HC_K99L LC_D91W 2A8wt HC_D62R 4B7wt 9,12E+05 1,53E+06 3,39E+06 1,25E+06 8,84E+05 1,56E+06 2,86E+06 1,47E+06 8,58E+06 2,18E+06 1,45E-03 3,16E-03 2,02E-03 2,46E-03 1,83E-03 7,59E-04 2,32E-03 5,17E-03 3,67E-03 1,28E-01 1,59E-09 2,06E-09 5,95E-10 1,98E-09 2,07E-09 4,88E-10 8,14E-10 3,51E-09 4,27E-10 5,86E-08 2,21 1,71 5,91 1,78 1,69 7,20 4,32 1,00 137,00 1,00

5 A continuación se investigó la afinidad de unión de varias mutaciones dentro de 2A8 y 4B7. Tal como se muestra en la Tabla 7 (a) y en la Tabla 8(a), los mutantes de 2A8 que contienen múltiples mutaciones en dominios CDR tienen una afinidad más alta que 2A8 de una sola mutación en la unión tanto con TFPI humano como con TFPI de ratón. Por ejemplo, 2A8-200 tiene una afinidad 53,7 veces más alta que 2A8 en la unión con TFPI humano y una afinidad 55,4 veces más alta en la unión con TFPI de ratón. Tal como se muestra en la Tabla 7(b) y la Tabla 8(b), los

10 mutantes de 4B7 que contienen múltiples mutaciones en dominios CDR tienen una afinidad más alta que 4B7 de una sola mutación en la unión tanto con TFPI humano como con TFPI de ratón. Las variantes de las secuencias de 2A8 y 4B7 parentales proporcionadas en las Tablas 7 y 8 se proporcionan también en el listado de secuencias. Las SEQ ID NO: 5-11 corresponden a variantes de cadena pesada de 2A8 enumeradas en la Tabla 7 y 8. Las SEQ ID NO: 12-18 corresponden a las variantes de cadena ligera de 2A8. Las SEQ ID NO: 19-26 corresponden a las

15 variantes de 4B7 de cadena pesada enumeradas en las Tablas 7 y 8. Las SEQ ID NO: 27-34 corresponden a las variantes de 4B7 de cadena ligera.

Tabla 7(a). Afinidad de variantes 2A8 seleccionadas (mutaciones múltiples) de TFPI humano

Muestras: 2A8 HC 2A8 LC ka(1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora KD

Q1: R30 S31 S35 151 S55 S56 K99 D1 l2 A13 S21 R28 N29 Y48 N51 G56 E80 S89 D91 D92 G93 V94 V96

2A8127: D L F V D W 1,68E+06 1,41E04 8,41E11 22

2A8143: D R L F V L W 2,88E+06 1,05E04 3,64E11 50,9

2A8200: D R L F V W 2,87E+06 9,88E05 3,44E11 53,7

2A8216: V D R V F L W 3,29E+06 1,54E04 4,67E11 39,6

2A8227: D L F L W 3,28E+06 1,23E04 3,75E11 49,4

(continuación)

Muestras: 2A8 HC 2A8 LC ka(1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora KD

2A8g200: E S D R G L S Y S T P K F V M A W S S T 6,17E+05 3,61E05 5,84E11 31,7

2A8g216: V D R V S Y S T P K F S M L S T W 1,45E+06 5,29E05 3,65E11 50,7

2A8 wt: 2,05E+06 3,80E03 1,85E09 1

Tabla 7(b). Afinidad de variantes 4B7 seleccionadas (mutaciones múltiples) en TFPI humano

Muestras: 4B7 HC 4B7 LC ka(1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora KD

Q1: N32 G44 K55 D62 Y112 F31 S32 D33 N35 D97

B18.5: D Q D I F I 1,23E+06 3,18E-05 2,60E-11 428,2

B2.0: D R D R F I T 7,46E+06 3,81E-05 5,10E-12 2177,8

B27.1: D R D T T 2,78E+06 3,53E-05 1,27E-11 874,9

B32.5: R D F I 2,15E+06 3,19E-05 1,48E-11 748,7

B41.2: D R D R F I 3,46E+06 2,47E-05 7,16E-12 1552,7

B9.7: D R D R I 2,97E+06 2,61E-05 8,78E-12 1266,2

gB9.7: E D S Y R D R I 9,38E+05 9,55E-06 1,02E-11 1091,5

gB9.7-lgG: D S Y R D R I 2,03E+06 1,56E-05 7,65E-12 1450,9

4B7: 7,56E+05 8,40E-03 1,11E-08 1

Tabla 8(a). Afinidad de variante 2A8 seleccionadas (mutaciones múltiples) de ratón TFPI

Muestras: 2A8 HC 2A8 LC ka(1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora KD

2A8127: D L F V D W 8,24E+05 1,47E03 1,78E10 18,5

2A8143: D R L F V L W 1,40E+06 1,25E03 6,78E11 48,5

2A8200: D R L F V W 1,04E+06 6,19E04 5,94E11 55,4

2A8216: V D R V F L W 4,19E+06 2,16E04 5,15E11 63,9

2A8227: D L F L W 6,91E+06 1,06E03 1,53E1 0 21,4

2A8g200: E S D R G L S Y S T P K F V M A W S S T 1,15E+06 1,39E04 1,21E10 27,3

(continuación)

Muestras: 2A8 HC 2A8 LC ka(1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora KD

2A8g216: V D R V S Y S T P K F S M L S T W 9,84E+05 7,78E05 7,91E11 41,6

2A8 wt: 9,40E+05 3,10E03 3,29E09 1

Tabla 8(b). Afinidad de variante 4B7 seleccionadas (mutaciones múltiples) de ratón TFPI

Muestras: 4B7 HG 4B7 LG ka(1/Ms) kd (1/s) KD (M) Mejora KD

Q1: N32 G44 K55 D62 Y112 F31 S32 D33 N35 D97

B18.5: D Q D I F I 1,09E+06 4,30E-04 3,95E-10 138,7

B2.0: D R D R F I T 6,99E+06 3,15E-04 4,51E-11 1213,5

B27.1: D R D T T 4,06E+06 7,42E-04 1,83E-10 299,3

B32.5: R D F I 4,52E+06 4,68E-04 1,04E-10 528,4

B41.2: D R D R F I 4,73E+06 2,45E-04 5,19E-11 1055,7

B9.7: D R D R I 3,59E+06 3,34E-04 9,31E-11 588,2

qB9.7: E D S Y R D R I 9,29E+05 1,85E-04 1,99E-10 275,4

gB9.7-lgG: D S Y R D R I 2,70E+06 2,36E-05 8,75E-12 6251,4

4B7: 3,15E+06 1,72E-01 5,47E-08 1

5 Ejemplo 6. Los anticuerpos con una mejor afinidad presentaron más potencia para restaurar la actividad de FXa

Para determinar si los anticuerpos anti-TFPI con mejor afinidad mejoraron también la potencia para restaurar la actividad FXa bloqueando el efecto inhibidor de la proteína TFPI, los autores de la invención realizaron un ensayo de restauración de FXa. En este ensayo, se incubaron las distintas cantidades indicadas de cada uno de los 10 anticuerpos con mejor afinidad (30 µl) con la cantidad fija de TFPI recombinante humano, de ratón o de rata (20 µl, 6,6 nM) en una mezcla de reacción total de 50 µl durante 30 min a temperatura ambiente. Tras la incubación, se añadieron 50 µl de FXa (3,39 nM) a la mezcla de reacción y se incubó a 37 °C durante 30 min. A continuación, se añadieron 20 µl de sustrato de FXa Spectrozyme a la mezcla de reacción. Tras la incubación de 12 min, se hizo la lectura de la absorbancia de cada pocillo a 405 nm utilizando un lector de placa (Molecular Device). Para cada 15 experimento, se obtuvo una curva normal lineal de la misma cantidad de FXa (3,39 nM) inhibida por cantidades conocidas de TFPI. Se definió 100 % de actividad de FXa restaurada como la actividad de FXa sin adición de ninguna cantidad de TFPI y se definió 0 % de actividad como la actividad de FXa en presencia de proteína TFPI (6,6 nM). De este modo se calculó concentración inhibidora máxima media (IC50) para cada anticuerpo anti-TFPI individual, algunos de los cuales se proporcionan en la Tabla 9. Se calculó también la concentración efectiva máxima

20 media (EC50) para una segunda ronda de variantes 2A8 y se proporciona en la Tabla 10.

Tabla 9. IC50 y mejora de la potencia para anticuerpos anti-TFPI seleccionados con sustituciones de aminoácido simples utilizando un ensayo de restauración de FXa en comparación con sus anticuerpos parentales, 2A8 y 4B7, respectivamente

Muestra: Clon IC50 (µg/ml) Mejora

2A8-2: HC_S31P 0,33 1,7

2A8-3: HC_831V 0,201 3,5

(continuación)

Muestra: Clon IC50 (µg/ml) Mejora

2A8-4: HC_S35D 0,55 1,1

2A8-6: HC_I51E 0,76 0,9

2A8-7: HC_S54F 0,35 2,0

2A8-9: HC_K99L 0,181 3,9

2A8-10: HC_K99V 0,39 1,6

2A8-14: LC_Y48F 0,34 1,9

2A8-15: LC_D91K 0,34 1,9

2A8-16: LC_D91L 0,37 1,7

2A8-17: LC_D91W 0,23 3,0

2A8-20: 2A8wt 0,70 1,0

4B7HcD62R: HC_D62R 0,058 25

4B7: 4B7wt 1,46 1,0

Ejemplo 7. Los anticuerpos con mejor afinidad presentaron una mayor potencia al acortar el tiempo de coagulación en un ensayo dPT

Para confirmar si estos anticuerpos con mejor afinidad mejoraban también la potencia para acortar el tiempo de coagulación, se llevó a cabo un ensayo de dPT para determinar el efecto de anticuerpos madurados con afinidad seleccionados sobre el tiempo de coagulación utilizando plasma con hemofilia A humano. El ensayo dPT se realiza esencialmente tal como describen Welsch y col. (Thrombosis Res., 1991, 64(2): 213-222). Brevemente, se prepara plasma con hemofilia A humano (George King Biomedical) mezclando plasma con 0,1 volúmenes de tampón de control (un control negativo) o los anticuerpos anti-TFPI indicados. Tras la incubación durante 30 minutos a 25 ºC, se combinó cada una de las muestras preparadas (100 µl) con 100 µl de Simplastin (Biometieux) diluido apropiadamente (1:500 dilución) como fuente de tromboplastina y 100 µl de 25 mM cloruro de calcio. Se determina el tiempo de coagulación utilizando un fibrómetro STA4 (Stago) inmediatamente después de la adición de cloruro de calcio.

Ejemplo 8. Los anticuerpos con mejor afinidad presentaron una mayor potencia para acortar el tiempo de coagulación de sangre completa utilizando sangre con hemofilia A humana inducida por anticuerpo anti-Factor VIII

Para confirmar si los anticuerpos con mejor afinidad presentaban una mayor potencia para acortar el tiempo de coagulación, los autores de la invención utilizaron un sistema ROTEM para determinar el efecto de estos anticuerpos sobre el tiempo de coagulación en sangre con hemofilia A inducida por anticuerpo neutralizante de FVIII humana, que imita la sangre de pacientes con hemofilia A con inhibidores. El sistema ROTEM (Pentapharm GmbH) incluye un instrumento de cuatro canales, un ordenador, patrones de plasma, activadores y cubetas y pasadores desechables. Los parámetros tromboelastográficos de los sistemas de hemostasia de ROTEM incluyen: tiempo de coagulación (CT), que refleja el tiempo de reacción (el tiempo necesario para obtener una amplitud de 2 mm tras la iniciación de la recogida de datos) para que se inicie la coagulación de la sangre; tiempo de formación de coágulo (CFT) y ángulo alfa para reflejar la propagación de la coagulación y la amplitud máxima y el módulo elástico máximo para reflejar firmeza de coágulo. En un ensayo ROTEM, se utilizaron 300 µl de sangre completa recién extraída citrada en la que se neutralizó la actividad de FVIII por adición de anticuerpos policlonales contra FVIII, para determinar el efecto de anticuerpos anti-TFPI de mejor afinidad en comparación con los anticuerpos anti-TFPI parentales. Todos los constituyentes fueron reconstituidos y mezclados de acuerdo con las instrucciones del fabricante recogiendo los datos durante el período de tiempo requerido para cada sistema. Brevemente, se mezclaron las muestras por retirada/dispensa de 300 µl de sangre o de plasma con una pipeta automática en cubetas ROTEM, añadiendo 20 µl de CaCl2 (200 mmoles), y seguido inmediatamente del mezclado de la muestra y la iniciación de la recogida de datos. Se recogieron datos durante 2 horas utilizando un sistema ROTEM controlado por ordenador (software versión 2.96).

En las Fig. 2 y 3, se muestra un ejemplo de los resultados del ensayo ROTEM en la detección del efecto de anticuerpos anti-TFPI de mejor afinidad en acortar los tiempos de coagulación de la sangre. En la Fig. 2 se muestra el efecto de anticuerpos anti TFPI madurados de afinidad de primera ronda seleccionados en el tiempo de coagulación de sangre con hemofilia inducida por anticuerpo humano. Los anticuerpos con mucha mejor afinidad 2A8-9 y 2A8-17 presentan mucha mejor potencia para acortar el tiempo de coagulación en sangre con hemofilia A inducida por anticuerpo humano, mientras que 2A8-10, cuya afinidad de unión para TFPI no mejoró, permaneció con una potencia de coagulación similar, en comparación con el anticuerpo 2A8 parental.

Ejemplo 9. Los anticuerpos con mejor afinidad presentan una tasa de supervivencia mejor en modelo de transección de vena caudal de ratones con hemofilia A

Para determinar si los anticuerpos con mejor afinidad son más potentes en cuanto a su efecto protector en ratones con hemorragia, se utilizó un modelo de transección de vena de la vena caudal de ratones con hemofilia A. Se administró a los ratones a través de la vena caudal una infusión con las distintas cantidades indicadas de anticuerpo 2A8 anti-TFPI parental o las distintas cantidades indicadas de A200, 24 horas antes de la lesión. Transcurridas 24 horas desde la administración de la dosis, se transfectó la vena izquierda de la cola a 2,7 mm desde la punta (en diámetro). Se observó la supervivencia al cabo de 24 horas tras la transfección. Se demostró que la tasa de supervivencia era dependiente de la dosis cuando se administró con FVIII recombinante (10 IU/kg a 30 IU/kg).

La Figura 4 demuestra que un anticuerpo con mejor afinidad seleccionado A200 prolongó significativamente la supervivencia de ratones con hemofilia A dependiendo de la dosis en comparación con ratón IgG1 de control (CTX IgG1) y desplegó una mejor tasa de supervivencia que el anticuerpo 2A8 parental a cada una de las dosis equivalente.

Ejemplo 10. Los anticuerpos con mejor afinidad presentaron una mejor coagulación utilizando plasma de hemofilia C humano (FXI deficiente).

Asimismo, se utilizó un ensayo ROTEM para determinar el efecto de los anticuerpos en el tiempo de coagulación en plasma deficiente en factor XI humano (FXI-deficiente) que imita al de pacientes con hemofilia C. En la Figura 5 se presenta resultado de este ensayo ROTEM en detectar el efecto de los anticuerpos anti-TFPI con mejor afinidad en

acortar el tiempo de coagulación de plasma. La Figura 5 demuestra que una variante de 2A8, 2A8-200, potenció la coagulación en plasma con hemofilia C humana dependiendo de la dosis y sus efectos son comparables con los de FVIIa recombinante.

LISTADO DE SECUENCIAS 5

<110> Bayer HealthCare LLC

<120> Anticuerpos monoclonales optimizados contra el Inhibidor de la Ruta del Factor Tisular (TFPI)

10 <130> BHC 10 5 001 PCT

<160> 34

<170> PatentIn versión 3.5 15

<210> 1

<211> 117

<212> PRT

<213> Homo sapiens 20

<400> 1

25 <210> 2

<211> 108

<212> PRT

<213> Homo sapiens

30 <400> 2

<210> 3

<211> 123

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 3

<210> 4

<211> 114

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 4

<210> 5

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 5

<210> 6

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 6

15 <210> 7

<211> 117

<212> PRT

<213> Artificial

20 <220>

<223> Variante

<400> 7

<210> 8

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 8

<210> 9

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 9

<210> 10

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 10

<210> 11

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 11

<210> 12

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 12

<210> 13

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 13

<210> 14

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 14

15 <210> 15

<211> 108

<212> PRT

<213> Artificial

20 <220>

<223> Variante

<400> 15

<210> 16

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 16

<210> 17

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 17

<210> 18

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 18

<210> 19

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 19

15 <210> 20

<211> 123

<212> PRT

<213> Artificial

20 <220>

<223> Variante

<400> 20

<210> 21

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 21

<210> 22

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 22

<210> 23

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 23

<210> 24

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 24

<210> 25

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 25

<210> 26

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 26

<210> 27

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 27

15 <210> 28

<211> 114

<212> PRT

<213> Artificial

<220>

<223> Variante

<400> 28

10

<210> 29

<211> 114

<212> PRT

<213> Artificial

15

<220>

<223> Variante

<400> 29

20

<210> 30

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 30

<210> 31

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 31

<210> 32

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 32

<210> 33

<213> Artificial

<220>

<223> Variante 10

<400> 33

15 <210> 34

<211> 114

<212> PRT

<213> Artificial

20 <220>

<223> Variante

<400> 34

Claims

REIVINDICACIONES

1. Un anticuerpo IgG monoclonal humano que se une específicamente a un inhibidor de la ruta del factor tisular humano, en el que el anticuerpo comprende:

a) una cadena pesada humana que comprende:

5 i. una región CDR 1 con la secuencia de aminoácidos de FTFRSYGMD (que corresponde a los restos 27 a 35 de SEQ ID NO: 1 con una sustitución S35D);

ii. una región CDR2 con la secuencia de aminoácidos de SIRGSRSSTYYADSVKG (que corresponde a los restos 50 a 66 de SEQ ID NO: 1 con una sustitución S55R);

iii. una región CDR3 con la secuencia de aminoácidos de LYRYWFDY (que corresponde a los restos 99 a 10 106 de SEQ ID NO: 1 con una sustitución K99L); y

b) una cadena ligera humana que comprende:

i. una región CDR1 con la secuencia de aminoácidos de SGDNLRNYYAH (que corresponde a los restos 23 a 33 de SEQ ID NO: 2);

ii. una región CDR2 con la secuencia de aminoácidos de FYDVNRPS (que corresponde a los restos 48 a 55 15 de SEQ ID NO: 2 con una sustitución Y48F y N51V);

iii. una región CDR3 con la secuencia de aminoácidos de QSWWDGVPV (que corresponde a los restos 88 a 96 de SEQ ID NO: 2 con una sustitución D91W sustitución).
2. El anticuerpo IgG monoclonal humano de la reivindicación 1, en el que

a) la cadena pesada humana comprende SEQ ID NO: 7 y 20 b) la cadena ligera humana comprende SEQ ID NO: 14.
3. Un producto farmacéutico que comprende la IgG monoclonal humana de cualquiera de las reivindicaciones 1-2.