SOX13

SOX13
Ідентифікатори
Символи	SOX13, ICA12, Sox-13, SRY-box 13, SRY-box transcription factor 13
Зовнішні ІД	OMIM: 604748 MGI: 98361 HomoloGene: 4159 GeneCards: SOX13
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • anatomical structure morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of gamma-delta T cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell fate commitment • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9580	20668
Ensembl	ENSG00000143842	ENSMUSG00000070643
UniProt	Q9UN79	Q04891
RefSeq (мРНК)	NM_005686	NM_011439
RefSeq (білок)	NP_005677	NP_035569
Локус (UCSC)	Хр. 1: 204.07 – 204.13 Mb	Хр. 1: 133.31 – 133.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX13 (англ. SRY-box 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 69 228.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSMRSPISAQ		LALDGVGTMV		NCTIKSEEKK		EPCHEAPQGS		ATAAEPQPGD
PARASQDSAD		PQAPAQGNFR		GSWDCSSPEG		NGSPEPKRPG		VSEAASGSQE
KLDFNRNLKE		VVPAIEKLLS		SDWKERFLGR		NSMEAKDVKG		TQESLAEKEL
QLLVMIHQLS		TLRDQLLTAH		SEQKNMAAML		FEKQQQQMEL		ARQQQEQIAK
QQQQLIQQQH		KINLLQQQIQ		QVNMPYVMIP		AFPPSHQPLP		VTPDSQLALP
IQPIPCKPVE		YPLQLLHSPP		APVVKRPGAM		ATHHPLQEPS		QPLNLTAKPK
APELPNTSSS		PSLKMSSCVP		RPPSHGGPTR		DLQSSPPSLP		LGFLGEGDAV
TKAIQDARQL		LHSHSGALDG		SPNTPFRKDL		ISLDSSPAKE		RLEDGCVHPL
EEAMLSCDMD		GSRHFPESRN		SSHIKRPMNA		FMVWAKDERR		KILQAFPDMH
NSSISKILGS		RWKSMTNQEK		QPYYEEQARL		SRQHLEKYPD		YKYKPRPKRT
CIVEGKRLRV		GEYKALMRTR		RQDARQSYVI		PPQAGQVQMS		SSDVLYPRAA
GMPLAQPLVE		HYVPRSLDPN		MPVIVNTCSL		REEGEGTDDR		HSVADGEMYR
YSEDEDSEGE		EKSDGELVVL		TD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1