PAX8

PAX8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K27
Ідентифікатори
Символи	PAX8, paired box 8, PAX-8
Зовнішні ІД	OMIM: 167415 MGI: 97492 HomoloGene: 2589 GeneCards: PAX8
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • thyroid-stimulating hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of apoptotic process • pronephros development • regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • диференціація клітин • mesonephric tubule development • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • kidney epithelium development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of metanephric DCT cell differentiation • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephric nephron morphogenesis • negative regulation of apoptotic process involved in metanephric collecting duct development • розвиток нирки • pronephric field specification • positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • anatomical structure morphogenesis • metanephric epithelium development • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • regulation of thyroid-stimulating hormone secretion • transcription, DNA-templated • otic vesicle development • metanephric distal convoluted tubule development • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephros development • mesonephros development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • metanephric nephron tubule formation • multicellular organism development • central nervous system development • metanephric comma-shaped body morphogenesis • branching involved in ureteric bud morphogenesis • thyroid gland development • positive regulation of thyroid hormone generation • negative regulation of apoptotic process involved in metanephric nephron tubule development • S-shaped body morphogenesis • inner ear morphogenesis • urogenital system development • sulfur compound metabolic process • metanephric S-shaped body morphogenesis • metanephros development • cellular response to gonadotropin stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • thyroid-stimulating hormone signaling pathway • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • ventricular septum development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7849	18510
Ensembl	ENSG00000125618	ENSMUSG00000026976
UniProt	Q06710	Q00288
RefSeq (мРНК)	NM_003466 NM_013951 NM_013952 NM_013953 NM_013992	NM_011040
RefSeq (білок)	NP_003457 NP_039246 NP_039247 NP_054698	NP_035170
Локус (UCSC)	Хр. 2: 113.22 – 113.28 Mb	Хр. 2: 24.31 – 24.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PAX8 (англ. Paired box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 48 218.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHNSIRSGH		GGLNQLGGAF		VNGRPLPEVV		RQRIVDLAHQ		GVRPCDISRQ
LRVSHGCVSK		ILGRYYETGS		IRPGVIGGSK		PKVATPKVVE		KIGDYKRQNP
TMFAWEIRDR		LLAEGVCDND		TVPSVSSINR		IIRTKVQQPF		NLPMDSCVAT
KSLSPGHTLI		PSSAVTPPES		PQSDSLGSTY		SINGLLGIAQ		PGSDKRKMDD
SDQDSCRLSI		DSQSSSSGPR		KHLRTDAFSQ		HHLEPLECPF		ERQHYPEAYA
SPSHTKGEQG		LYPLPLLNST		LDDGKATLTP		SNTPLGRNLS		THQTYPVVAD
PHSPFAIKQE		TPEVSSSSST		PSSLSSSAFL		DLQQVGSGVP		PFNAFPHAAS
VYGQFTGQAL		LSGREMVGPT		LPGYPPHIPT		SGQGSYASSA		IAGMVAGSEY
SGNAYGHTPY		SSYSEAWRFP		NSSLLSSPYY		YSSTSRPSAP		PTTATAFDHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kozmik Z., Kurzbauer R., Doerfler P., Busslinger M. (1993). Alternative splicing of Pax-8 gene transcripts is developmentally regulated and generates isoforms with different transactivation properties. Mol. Cell. Biol. 13: 6024—6035. PMID 8413205 DOI:10.1128/MCB.13.10.6024
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2