EMX1

EMX1
Ідентифікатори
Символи	EMX1, empty spiracles homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600034 MGI: 95387 HomoloGene: 55799 GeneCards: EMX1
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • homeostasis of number of cells • cerebral cortex regionalization • in utero embryonic development • post-embryonic development • neuron projection extension • neuroepithelial cell differentiation • radial glial cell differentiation • multicellular organism development • regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • telencephalon development • brain development • neuron differentiation • cerebral cortex development • cerebral cortex neuron differentiation • brain morphogenesis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2016	13796
Ensembl	ENSG00000135638	ENSMUSG00000033726
UniProt	Q04741	Q04742
RefSeq (мРНК)	NM_001040404 NM_004097	NM_010131
RefSeq (білок)	NP_004088	NP_034261
Локус (UCSC)	Хр. 2: 72.92 – 72.94 Mb	Хр. 6: 85.16 – 85.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EMX1 (англ. Empty spiracles homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 257 амінокислот, а молекулярна маса — 28 039.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFQPAAKRGF		TIESLVAKDG		GTGGGTGGGG		AGSHLLAAAA		SEEPLRPTAL
NYPHPSAAEA		AFVSGFPAAA		AAGAGRSLYG		GPELVFPEAM		NHPALTVHPA
HQLGASPLQP		PHSFFGAQHR		DPLHFYPWVL		RNRFFGHRFQ		ASDVPQDGLL
LHGPFARKPK		RIRTAFSPSQ		LLRLERAFEK		NHYVVGAERK		QLAGSLSLSE
TQVKVWFQNR		RTKYKRQKLE		EEGPESEQKK		KGSHHINRWR		IATKQANGED
IDVTSND

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2