Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
POU1F1
Ідентифікатори
Символи
POU1F1 , CPHD1, GHF-1, PIT1, POU1F1a, Pit-1, POU class 1 homeobox 1
Зовнішні ІД
OMIM : 173110 MGI: 97588 HomoloGene: 259 GeneCards: POU1F1
Пов'язані генетичні захворювання
гіпопітуїтаризм [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • transcription regulator complex • Хроматин
Біологічний процес
• negative regulation of cell population proliferation • somatotropin secreting cell development • adenohypophysis development • positive regulation of inositol trisphosphate biosynthetic process • regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell fate specification • B cell differentiation • positive regulation of cell population proliferation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • determination of adult lifespan • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of multicellular organism growth • nuclear transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • somatotropin secreting cell differentiation • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 3: 87.26 – 87.28 Mb
Хр. 16: 65.32 – 65.33 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
POU1F1 (англ. POU class 1 homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот , а молекулярна маса — 32 912[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSCQAFTSAD TFIPLNSDAS ATLPLIMHHS AAECLPVSNH ATNVMSTATG
LHYSVPSCHY GNQPSTYGVM AGSLTPCLYK FPDHTLSHGF PPIHQPLLAE
DPTAADFKQE LRRKSKLVEE PIDMDSPEIR ELEKFANEFK VRRIKLGYTQ
TNVGEALAAV HGSEFSQTTI CRFENLQLSF KNACKLKAIL SKWLEEAEQV
GALYNEKVGA NERKRKRRTT ISIAAKDALE RHFGEQNKPS SQEIMRMAEE
LNLEKEVVRV WFCNRRQREK RVKTSLNQSL FSISKEHLEC R
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Lew A.M., Elsholtz H.P. (1991). Cloning of the human cDNA for transcription factor Pit-1. Nucleic Acids Res . 19 : 6329—6329. PMID 1956794 DOI :10.1093/nar/19.22.6329
Tatsumi K.I., Notomi T., Amino N., Miyai K. (1992). Nucleotide sequence of the complementary DNA for human Pit-1/GHF-1. Biochim. Biophys. Acta . 1129 : 231—234. PMID 1370379 DOI :10.1016/0167-4781(92)90494-K
Delhase M., Vila V., Hooghe-Peters E.L., Castrillo J.-L. (1995). A novel pituitary transcription factor is produced by alternative splicing of the human GHF-1/PIT-1 gene . Gene . 155 : 273—275. PMID 7721104 DOI :10.1016/0378-1119(94)00757-J
Pernasetti F.M., Wera S., Belayew A., Martial J.A. (1993). Cloning of a human GHF-1/Pit-1 cDNA variant. Nucleic Acids Res . 21 : 3584—3584. PMID 8346040 DOI :10.1093/nar/21.15.3584
Turton J.P., Strom M., Langham S., Dattani M.T., Le Tissier P. (2012). Two novel mutations in the POU1F1 gene generate null alleles through different mechanisms leading to c ombined pituitary hormone deficiency. Clin. Endocrinol. (Oxf.) . 76 : 387—393. PMID 22010633 DOI :10.1111/j.1365-2265.2011.04236.x
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші