Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ID2
Ідентифікатори
Символи
ID2 , GIG8, ID2A, ID2H, bHLHb26, inhibitor of DNA binding 2, HLH protein, inhibitor of DNA binding 2
Зовнішні ІД
OMIM : 600386 MGI: 96397 HomoloGene: 1632 GeneCards: ID2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• protein dimerization activity • transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро • гіалоплазма • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • ритмічний процес • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • multicellular organism development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • metanephros development • natural killer cell differentiation • thigmotaxis • leukocyte differentiation • membranous septum morphogenesis • bundle of His development • heart development • циркадний ритм • adult locomotory behavior • entrainment of circadian clock • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • oligodendrocyte development • regulation of lipid metabolic process • olfactory bulb development • circadian regulation of gene expression • mammary gland epithelial cell proliferation • regulation of circadian rhythm • entrainment of circadian clock by photoperiod • enucleate erythrocyte differentiation • negative regulation of DNA binding • locomotor rhythm • negative regulation of B cell differentiation • positive regulation of fat cell differentiation • positive regulation of erythrocyte differentiation • positive regulation of macrophage differentiation • negative regulation of neuron differentiation • negative regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of blood pressure • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • розвиток клітин • cell maturation • Peyer's patch development • embryonic digestive tract morphogenesis • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • neuron fate commitment • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • positive regulation of astrocyte differentiation • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • adipose tissue development • mammary gland alveolus development • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development • endodermal digestive tract morphogenesis • cellular response to lithium ion • клітинне старіння • negative regulation of neural precursor cell proliferation • neuron differentiation • regulation of cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 8.68 – 8.68 Mb
Хр. 12: 25.14 – 25.15 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ID2 (англ. Inhibitor of DNA binding 2, HLH protein ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 134 амінокислот , а молекулярна маса — 14 917[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKAFSPVRSV RKNSLSDHSL GISRSKTPVD DPMSLLYNMN DCYSKLKELV
PSIPQNKKVS KMEILQHVID YILDLQIALD SHPTIVSLHH QRPGQNQASR
TPLTTLNTDI SILSLQASEF PSELMSNDSK ALCG
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми.
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Biggs J., Murphy E.V., Israel M.A. (1992). A human Id-like helix-loop-helix protein expressed during early development. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 89 : 1512—1516. PMID 1741406 DOI :10.1073/pnas.89.4.1512
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Ward S.M., Fernando S.J., Hou T.Y., Duffield G.E. (2010). The transcriptional repressor ID2 can interact with the canonical clock components CLOCK and BMAL1 and mediate inhibitory effects on mPer1 expression. J. Biol. Chem . 285 : 38987—39000. PMID 20861012 DOI :10.1074/jbc.M110.175182
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші