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TW202039840A - Irf5表現調節劑 - Google Patents

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TW202039840A
TW202039840A TW108141505A TW108141505A TW202039840A TW 202039840 A TW202039840 A TW 202039840A TW 108141505 A TW108141505 A TW 108141505A TW 108141505 A TW108141505 A TW 108141505A TW 202039840 A TW202039840 A TW 202039840A
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TW
Taiwan
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compound
modified
modified oligonucleotide
seq
irf5
Prior art date
Application number
TW108141505A
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English (en)
Inventor
蘇珊 弗雷爾
Original Assignee
美商伊奧尼斯醫藥公司
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Publication date
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Abstract

本發明具體例提供用於抑制IRF5表現的方法、化合物以及組成物，其可用於治療、預防或改善與IRF5相關的疾病。

Description

IRF5表現調節劑
本發明具體例提供可用於抑制干擾素調節因子5 (IRF5；Humirf5)表現，並且在某些情況下減少細胞或動物體內IRF5蛋白量的方法、化合物以及組成物，其等可用於治療、預防，或改善與IRF5相關的疾病。
干擾素調節因子5或IRF5是發炎與自體免疫的一個重要調節因子。有大量證據將與高度表現相關的IRF5風險對偶基因和自體免疫疾病風險連結在一起，自體免疫疾病為諸如全身性紅斑狼瘡、類風濕性關節炎、全身性硬化症，發炎性腸病及多發性硬化症(Hedl and Abhaham, J. Immunol., 2012, 188: 5348-5356；Kristjansdottir et al., J. Med. Genet. 2008, 45: 362-369；Graham et al., Nature Genet. 2006, 38: 550-555；Graham et al., PNAS, 2007, 104: 6758-6763)。
克隆氏症(Crohn’s disease)和潰瘍性結腸炎(人類發炎性腸病的兩種主要形式)的現有醫療照護標準涉及使用消炎劑、皮質類固醇、免疫調節劑(包括硫唑嘌呤(azathioprine)或其活性代謝物6-巰基嘌呤)、甲胺蝶呤、生物製劑(包括腫瘤壞死因子拮抗劑療法、抗整合素療法和抗介白素(IL)12/23療法)來進行治療。本文目的在於提供用於治療本文揭示之疾病的高效和高耐受性的化合物和組成物。
本文提供的某些具體例是用於減少IRF5 mRNA之數量或活性，並且在某些具體例中減少細胞或個體體內IRF5蛋白量的化合物及方法。在某些具體例中，個體患有某種胃腸疾病。在某些具體例中，個體患有發炎性腸病。在某些具體例中，該疾病是克隆氏症。在某些具體例中，該疾病是發炎性腸病(inflammatory bowel disease，IBD)。在某些具體例中，該疾病是潰瘍性結腸炎。在某些具體例中，該疾病是全身性紅斑狼瘡(SLE)。在某些具體例中，該疾病是類風濕性關節炎。在某些具體例中，該疾病是原發性膽汁性肝硬化。在某些具體例中，該疾病是全身性硬化症。在某些具體例中，該疾病是休格倫氏症候群（Sjogren's syndrome）。在某些具體例中，該疾病是多發性硬化症。在某些具體例中，該疾病是硬皮病。在某些具體例中，該疾病是間質性肺病(SSc-ILD)。在某些具體例中，該疾病是多囊性腎病(PKD)。在某些具體例中，該疾病是慢性腎病(CKD)。在某些具體例中，該疾病是NASH。在某些具體例中，該疾病是肝纖維化。在某些具體例中，該疾病是氣喘。在某些具體例中，該疾病是嚴重氣喘。本文提供的某些化合物是有關於減少動物體內發炎的化合物及組成物。
本文提供的某些具體例是有關於用以抑制IRF5表現的有效且可耐受的化合物及組成物，其可用於治療、預防、改善或減緩發炎性疾病的進展。本文提供的某些具體例是有關於比已公開揭示的化合物更為有效或具有更高治療價值的化合物和組成物。
應理解，前面的一般性說明和下面的詳細說明都僅僅是例示性和說明性的，並且對請求保護的具體例不具有限制性。在本文中，除非另有明確指明，否則使用單數包括複數。如本文所用，除非另有指明，否則使用「或」表示「及/或」。此外，使用術語「包括」以及其他形式(諸如「包括(includes與included)」不具有限制性。
本文使用的章節標題僅供組織架構之目的，而不應解釋為限制所描述之標的。本申請案中引用的全部文件或部分文件(包括但不限於專利案、專利申請案、文章、書籍，論文以及GenBank和NCBI參考序列記錄)因而透過本文中所論及的部分文件與全文引用的方式明確地併入本文。
應理解，在本文包含的實例中，每個SEQ ID NO中所示的序列與針對糖部分、核苷間鍵結或核鹼基的任何修飾無關。因此，由SEQ ID NO所界定的化合物可能獨立地包含對糖部分、核苷間鍵結或核鹼基的一或多個修飾。以ION編號來描述的化合物表示核鹼基序列、化學修飾和模體(motif)的組合。定義
除非另有指明，否則以下術語具有下列含義：
「2'-去氧呋喃糖基糖部分」或「2'-去氧呋喃糖基糖」表示一個呋喃糖基糖部分，其在2'-位置處具有兩個氫。2'-去氧呋喃糖基糖部分可以是未經修飾的或經修飾的，並且可以在2'-位置以外的位置處被取代或未經取代。在寡核苷酸的情況下，β-D-2'-去氧核糖基糖部分是未經取代、未經修飾的2'-去氧呋喃糖基，並且存在於天然去氧核糖核酸(DNA)中。
如同在天然去氧核糖核酸(DNA)中發現的，「2'-去氧核苷」表示包含2'-H(H)呋喃糖基糖部分的核苷。在某些具體例中，2'-去氧核苷可包含經修飾的核鹼基或可包含RNA核鹼基(尿嘧啶)。
「2'-O-甲氧基乙基」(也稱為2'-MOE)表示2'-O-(CH2 )2 -OCH3 )代替核糖基環的2'-OH基團。經2'-O-甲氧基乙基修飾的糖是經修飾的糖。
「2'-MOE核苷」(也稱為2'-O-甲氧基乙基核苷)表示包含一個經2'-MOE修飾的糖部分的核苷。
「2'-經取代的核苷」或「2-經修飾的核苷」表示一個包含一個2'-經取代或2'-經修飾的糖部分的核苷。如本文所用，提到糖部分時，「2'-經取代」或「2-經修飾」表示一個包含至少一個H或OH以外的2'-取代基團的糖部分。
「3'靶位點」是指與特定化合物的3'-末端核苷酸互補之目標核酸的核苷酸。
「5'靶位點」是指與特定化合物的5'-末端核苷酸互補之目標核酸的核苷酸。
「5-甲基胞嘧啶」表示帶有一個甲基附接至5位置的胞嘧啶。
「大約」表示在值的±10%以內。例如，如果說明為「該化合物對PNPLA3的抑制作用約為70%」，則意味著PNPLA3的量被抑制在60%至80%的範圍內。
「投藥(administration或administering)」是指將本文提供的一個化合物或組成物引入至個體以執行其預期功能的途徑。可以使用的投藥途徑的實例包括(但不限於)非經腸投藥，諸如皮下、靜脈內或肌肉內注射或輸注。
「伴隨投藥」或「共投藥」表示以在患者體內表現出兩種藥理作用的任何方式投與兩種或更多種化合物。伴隨投藥不需要兩種化合物以單一醫藥組成物、以相同劑型、透過相同投藥途徑或同時來投藥。兩種化合物的作用不必同時表現出來。其作用僅需重疊一段時間，而不需要共存。伴隨投藥或共投藥含括平行或依序投藥。
「改善」是指改善或減輕相關疾病、病症或病狀的至少一種指標，徵象或症狀。在某些具體例中，改善包括延遲或減緩病狀或疾病的一或多個指標的進展或嚴重性。指標的進展或嚴重性可以透過習於技藝者已知的主觀或客觀量度來測定。
「動物」是指人類或非人類動物，包括(但不限於)小鼠、大鼠、兔、狗、貓，豬和非人類靈長類動物(包括但不限於猴子和黑猩猩)。
「反義活性」表示可歸因於反義化合物雜交至其目標核酸之任何可檢測到及/或可測量到的活性。在某些具體例中，反義活性是與不存在針對目標物的反義化合物時的目標核酸量或目標蛋白量相比，目標核酸或由此目標核酸編碼的蛋白質的量或表現減少。
「反義化合物」表示包含寡核苷酸及視情況存在一或多個額外部分(feature)的化合物，額外部分為諸如接合物基團（conjugate group）或末端基團。反義化合物的實例包括單股和雙股化合物，諸如寡核苷酸、核酶、siRNA、shRNA，ssRNA和佔用類化合物(occupancy-based compound)。
「反義抑制」表示與不存在反義化合物時的目標核酸量相比，在存在與目標核酸互補的反義化合物的情況下，目標核酸量降低。
「反義機制」是那些涉及化合物與目標核酸雜交的所有機制，其中雜交的結果或作用是靶降解或靶佔用，伴隨著細胞機制停滯，細胞機制涉及例如轉錄或剪接。
「反義寡核苷酸」表示一個具有與目標核酸或其區域或片段互補之核鹼基序列的寡核苷酸。在某些具體例中，反義寡核苷酸可特異地雜交至目標核酸或其區域或片段。
「雙環核苷」或「BNA」表示包含一個雙環糖部分的核苷。「雙環糖」或「雙環糖部分」表示包含兩個環的經修飾糖部分，其中第二環是經由橋所形成，該橋連接第一環中的兩個原子，從而形成雙環結構。在某些具體例中，雙環糖部分的第一環是呋喃糖基部分。在某些具體例中，雙環糖部分不包含呋喃糖基部分。
「支鏈基團」表示一個具有至少3個能夠與至少3個基團形成共價鍵結之位置的原子基團。在某些具體例中，支鏈基團提供複數個反應位點，以供經由接合連接子及/或可裂解部分將繫鏈的配體連接至寡核苷酸。
「靶向細胞的部分」表示能夠結合至特定細胞類型(或複數特定細胞類型)的接合物基團或接合物基團的一部分。
「cEt」或「約束的乙基(constrained ethyl)」表示一個核糖基雙環糖部分，其中雙環糖的第二環經由連接4'-碳和2'-碳的橋所形成，其中該橋具有下式：4'-CH(CH3 )-O-2'，且其中橋的甲基為S 組態。
「cEt核苷」表示包含經cEt修飾之糖部分的核苷。
化合物中的「化學修飾」說明化合物中任一單元相對於此單元的原始狀態透過化學反應產生的取代或改變。「經修飾核苷」表示一個獨立地具有經修飾糖部分及/或經修飾核鹼基的核苷。「經修飾寡核苷酸」表示包含至少一個經修飾核苷間鍵結，經修飾糖及/或經修飾核鹼基的寡核苷酸。
「化學上不同的區域」是指化合物在某種程度上與相同化合物的另一區域有化學上差異的區域。例如，具有2'-O-甲氧基乙基核苷酸的區域與具有不帶2'-O-甲氧基乙基修飾之核苷酸的區域在化學上不同。
「嵌合反義化合物」表示具有至少兩個化學上不同的區域的反義化合物，每個位置具有複數個次單元。
「可裂解鍵」表示能夠被切開的任何化學鍵。在某些具體例中，可裂解鍵選自：醯胺、聚醯胺、酯、醚、磷酸二酯的一或兩個酯、磷酸酯、胺基甲酸酯、二硫化物或肽。
「可裂解部分」表示在生理條件下(例如在細胞、動物或人類體內)裂解的鍵或原子基團。
提到寡核苷酸時，「互補」表示當寡核苷酸或其一或多個區域的核鹼基序列與另一寡核苷酸或核酸或其一或多個區域的核鹼基序列以對向排列時，兩個核鹼基序列相匹配。如除非另有具體指明，否則如本文所述核鹼基之匹配或互補的核鹼基限於以下配對：腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)和尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)，以及5-甲基胞嘧啶(m C)和鳥嘌呤(G)。互補寡核苷酸及/或核酸不需要在每個核苷處都具有核鹼基互補性，而可包括一或多個核鹼基錯配。相反，提到寡核苷酸時，「完全互補」或「100%互補」表示此等寡核苷酸在每個核苷處具有核鹼基匹配，而沒有任何核鹼基錯配。
「接合物基團」表示一個附接至寡核苷酸的原子基團。接合物基團包括接合物部分以及將接合物部分附接至寡核苷酸的接合物連接子。
「接合物連接子」表示一個包含將接合物部分連接至寡核苷酸的至少一個鍵的原子基團。
「接合物部分」表示一個經由接合物連接子被附接至寡核苷酸的一個原子基團。
在寡核苷酸的上下文中，「連續的」是指彼此緊鄰的核苷、核鹼基、糖部分或核苷間鍵結。例如，「連續核鹼基」表示在序列中彼此緊鄰的核鹼基。
「設計」或「經設計成」是指設計出與選定核酸分子特異性雜交的化合物的過程。
「稀釋劑」表示一種在組成物中缺乏藥理活性但在醫藥上是必需或期望的成分。例如，注射組成物中的稀釋劑可以是液體，例如食鹽水溶液。
「經差異修飾」表示彼此不同的化學修飾或化學取代基，包括不存在修飾。因此，例如，即使DNA核苷未經修飾，MOE核苷和未經修飾的DNA核苷也是「經差異修飾」。同樣，DNA和RNA是「經差異修飾」，即使它們都是天然的未經修飾核苷。相同但包含不同核鹼基的核苷並不是經差異修飾。例如，包含經2'-OMe修飾的糖和未經修飾的腺嘌呤核鹼基的核苷與包含經2'-OMe修飾的糖和未經修飾的胸腺嘧啶核鹼基的核苷並非經差異修飾。
「劑量」表示以單次投藥或在指定時間段內提供的明確量的化合物或藥劑。在某些具體例中，劑量可以兩次或更多個推注、錠劑或注射投藥。例如，在某些具體例中，在需要皮下投藥的情況下，所需劑量可能需要單次注射不易提供的體積。在這樣的具體例中，可以使用兩次或更多次注射來達到期望的劑量。在某些具體例中，可以兩次或更多次注射投藥劑量以使個體中的注射部位反應降至最低。在其他具體例中，化合物或藥劑是透過在長時間段內或連續地輸注來投藥。劑量可以表示為每小時、每天，每週或每月的藥劑量。
「投藥方案」是被設計成達到一或多種所需效果的劑量組合。
「雙股反義化合物」表示一種反義化合物，其包含兩個彼此互補並形成雙股體之寡聚化合物，且其中該等兩個寡聚化合物中的一者包括寡核苷酸。
「有效量」表示在需要化合物的個體中，化合物足以達到預期生理結果之量。有效量可能在個體之間有不同，這取決於待治療個體的健康和身體狀況、待治療個體的分類組別、組成物的配方，對個體醫療狀況的評估以及其他相關因素。
「功效」是指產生預期效果的能力。
「表現」包括所有功能，透過這些功能，基因所編碼的資訊可以被轉換為細胞中存在並運行的結構。此等結構包括，但不限於轉錄和轉譯的產物。
「間隔體(gapmer)」表示一個寡核苷酸，其包含一個具有複數個核苷之位於具有一或多個核苷的外部區域之間的內部區域，該內部區域支持RNase H裂解，其中包含該內部區域的核苷在化學上不同於包含外部區域的核苷(或複數核苷)。內部區域可以被稱為「間隔」，而外部區域可以被稱為「側翼」。
「雜交」表示寡核苷酸及/或核酸的黏合。儘管不限於特定機制，但最常見的雜交機制涉及氫鍵結，這可能是互補核鹼基之間的瓦生-克立克(Watson-Crick)，胡斯坦(Hoogsteen)或反向胡斯坦氫鍵結。在某些具體例中，互補核酸分子包括，但不限於反義化合物及核酸靶。在某些具體例中，互補核酸分子包括，但不限於寡核苷酸及核酸靶。
「緊鄰」表示在相同種類的緊鄰要素之間沒有插入要素(例如，在緊鄰核鹼基之間沒有插入核鹼基)。
「個體」表示經選出用於治療或療法的人類或非人類動物。
「抑制表現或活性」是指相對於未經處理或對照樣本中的活性表現，減少或阻斷表現或活性，且不一定表示完全消除表現或活性。
「核苷間鍵結」表示在寡核苷酸中相鄰核苷之間形成共價鍵結的基團或鍵。「經修飾的核苷間鍵結」表示除天然的磷酸酯核苷間鍵結以外的任何核苷間鍵結。非磷酸酯鍵結在本文中稱為經修飾的核苷間鍵結。
「IRF5」表示IRF5的任何核酸或蛋白質。「IRF5核酸」表示編碼IRF5的任何核酸。例如，在某些具體例中，IRF5核酸包括編碼IRF5的DNA序列、從編碼IRF5的DNA (包括包含內含子和外顯子的基因組DNA)轉錄而來的RNA序列，以及編碼IRF5的mRNA序列。「IRF5 mRNA」表示編碼IRF5蛋白的mRNA。可以用大寫或小寫來指稱對象。
「IRF5特異性抑制劑」是指能夠在分子層次上特異地抑制IRF5 RNA及/或IRF5蛋白表現或活性的任何藥劑。例如，IRF5特異性抑制劑包括能夠抑制IRF5 RNA及/或IRF5蛋白表現的核酸(包括反義化合物)、肽、抗體，小分子及其他藥劑。
「延長寡核苷酸」是相對於本文揭示的寡核苷酸(例如親本寡核苷酸)具有一或多個額外核苷者。
「連接核苷」表示藉由核苷間鍵結而連接在一起的相鄰核苷。
「連接子-核苷」表示將寡核苷酸連接至接合物部分的核苷。連接子-核苷位於化合物的接合物連接子內。即使連接子-核苷與寡核苷酸相接，也不認為它們是化合物的寡核苷酸部分的一部分。
「錯配」或「非互補」表示當第一寡核苷酸與第二寡核苷酸或目標核酸比對時，與第二寡核苷酸或目標核酸的對應核鹼基不互補之第一寡核苷酸的核鹼基。例如，包括但不限於通用核鹼基，肌苷和次黃嘌呤的核鹼基能夠與至少一個核鹼基雜交，但是相對於其所雜交的核鹼基仍然是錯配的或非互補的。作為另一個實例，當第一寡核苷酸與第二寡核苷酸或目標核酸比對時，不能與第二寡核苷酸或目標核酸的對應核鹼基雜交之第一寡核苷酸的核鹼基是錯配或非互補核鹼基。
「調節」是指改變或調節細胞、組織，器官或生物體中的特徵。例如，調節IRF5 RNA可能意味著在細胞、組織，器官或生物體內增加或減少IRF5 RNA及/或IRF5蛋白的量。「調節劑」影響細胞、組織，器官或生物體內的變化。例如，IRF5化合物可以是在細胞、組織，器官或生物體內減少IRF5 RNA及/或IRF5蛋白之量的調節劑。
「MOE」表示甲氧基乙基。
「單體」是指寡聚物的個別單元。單體包括但不限於核苷和核苷酸。
「模體」表示未經修飾及/或經修飾的糖部分、核鹼基及/或核苷間鍵結在寡核苷酸中的模式。
「自然的」或「自然存在的」」表示在大自然中所發現到的。
「非雙環經修飾糖」或「非雙環經修飾糖部分」表示包含修飾（例如取代基）的經修飾糖部分，其在該糖的兩個原子之間不形成形成第二環的橋接。
「核酸」是指由單體核苷酸組成的分子。核酸包括，但不限於核糖核酸(RNA)、去氧核糖核酸(DNA)，單股核酸和雙股核酸。
「核鹼基」表示能夠與另一個核酸的鹼基配對的雜環部分。如本文所用，「天然的核鹼基」是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)，尿嘧啶(U)和鳥嘌呤(G)。「經修飾核鹼基」是一種天然的經化學修飾核鹼基。「通用鹼基」或「通用核鹼基」是天然的核鹼基和經修飾核鹼基以外，並且能夠與任何核鹼基配對的核鹼基。
「核鹼基序列」表示核酸或寡核苷酸中連續核鹼基的順序，與任何糖或核苷間鍵結無關。
「核苷」表示包含核鹼基和糖部分的化合物。核鹼基和糖部分各自獨立地未經修飾或經修飾。「經修飾核苷」表示包含經修飾核鹼基及/或經修飾糖部分的核苷。經修飾核苷包括缺乏核鹼基的無鹼基核苷。
「寡聚化合物」表示一種化合物，其包含一個單一寡核苷酸及視情況一或多個額外部分，諸如接合物基團或末端基團。
「寡核苷酸」表示連接核苷的聚合物，其各自可以彼此獨立地經修飾或未經修飾。除非另有指明，否則寡核苷酸由8至80個連接核苷所組成。「經修飾寡核苷酸」表示寡核苷酸，其中至少一個糖、核鹼基，或核苷間鍵結經修飾。「未經修飾寡核苷酸」表示不包含任何糖、核鹼基，或核苷間修飾的寡核苷酸。
「親本寡核苷酸」表示一種寡核苷酸，其序列被用作設計更多序列類似但長度，模體及/或化學性質不同的寡核苷酸的基礎。新設計的寡核苷酸可以具有與親本寡核苷酸相同或重疊的序列。
「非經腸投藥」表示透過注射或輸注投藥。非經腸投藥包括皮下投藥、靜脈內投藥、肌肉內投藥、動脈內投藥，腹膜內投藥或顱內投藥，例如鞘內或腦室內投藥。
「醫藥上可接受之載體或稀釋劑」表示任何適合用於對個體投與的物質。例如，醫藥上可接受之載體可以是無菌水溶液，諸如PBS或注射用水。
「醫藥上可接受之鹽」表示化合物(諸如寡聚化合物或寡核苷酸)的生理和醫藥上可接受之鹽，意即保留親本化合物之所需生物活性並且不會對其產生不良毒理影響的鹽。
「藥劑」表示當投與給個體時提供治療益處的化合物。
「醫藥組成物」表示適合用於向個體投與的物質的混合物。例如，一個醫藥組成物可包含一或多種化合物或其鹽及無菌水溶液。
「硫代磷酸酯（phosphorothioate）鍵結」表示經修飾的磷酸酯鍵結，其中非橋接氧原子之一被一個硫原子取代。硫代磷酸酯核苷間鍵結是經修飾核苷間鍵結。
「磷部分」表示一個包含磷原子的原子基團。在某些具體例中，磷部分包含單磷酸酯，二磷酸酯或三磷酸酯或硫代磷酸酯。
「部分」表示核酸的確定數目且連續(即，連接)的核鹼基。在某些具體例中，部分是目標核酸的確定數目的連續核鹼基。在某些具體例中，部分是寡聚化合物的確定數目的連續核鹼基。
「預防」是指延遲或阻止疾病，病症或病狀的發作，進展或進程持續數分鐘到無限久的時間段。
「前藥」表示在體外呈某種形式存在的化合物，當被投藥給個體時，其在體內或其細胞內被代謝成另一種形式。在某些具體例中，經代謝形式是化合物(例如，藥物)的活化或更活化形式。典型地，體內的前藥轉化是透過存在於細胞或組織中的酶(例如，內源性或病毒酶)或化學品作用，及/或生理條件而促進。
「減少」表示降至較小程度、大小，數量或數目。
「RefSeq No.」是分配給序列的字母和數字的獨特組合，以表明該序列是針對特定的目標轉錄本(例如，目標基因)。可以在遺傳序列資料庫中找到有關目標基因的此類序列和資訊(統稱為基因記錄)。遺傳序列資料庫包括NCBI參考序列資料庫、GenBank、歐洲核苷酸檔案館及日本DNA數據庫(後三個構成國際核苷酸序列數據庫合作社或INSDC)。
「區域」被定義為目標核酸的一部分，其具有至少一種可識別的結構，功能或特性。
「RNAi化合物」表示一種反義化合物，其至少部分透過RISC或Ago2而非透過RNase H發揮作用，以調節目標核酸及/或由目標核酸編碼的蛋白質。RNAi化合物包括但不限於雙股siRNA、單股RNA (ssRNA)及微RNA (microRNA) (包括微RNA模擬物)。
「片段」定義為核酸內的較小或子部分區域。
「副作用」表示期望效果以外之可歸因於治療的生理疾病及/或病況。在某些具體例中，副作用包括注射部位反應、肝臟功能測試異常、腎臟功能異常、肝毒性、腎毒性、中樞神經系統異常，肌病和不適。舉例來說，血清中的轉胺酶水平升高可能表示肝毒性或肝臟功能異常。例如，膽紅素升高可能表示肝毒性或肝臟功能異常。
提到化合物，「單股」表示化合物具有僅一條寡核苷酸。
「自我互補」表示與至少部分雜交至自身的寡核苷酸。由一個寡核苷酸構成的化合物(其中該化合物的寡核苷酸是自我互補)是一種單股化合物。單股化合物可能能夠結合至互補化合物以形成雙股體。
「位點」被定義為目標核酸內的一個獨特核鹼基位置。
「可特異地雜交」是指在寡核苷酸和目標核酸間具有足夠程度之互補性以引起期望作用，同時對非目標核酸表現出最小或沒有影響的寡核苷酸。在某些具體例中，特異性雜交在生理條件下發生。
提到目標核酸，「特異地抑制」表示減少或阻斷目標核酸的表現，同時對非目標核酸表現出較少，最少或沒有影響。減少不必然表示該目標核酸的表現完全消除。
「標準細胞分析」表示在實例中所述的分析及其合理變化形式。
「標準活體內實驗」表示在實例中所述的程序及其合理變化形式。
在具有相同分子式的分子群中，「隨機立構手性中心」表示具有隨機立體化學組態的手性中心。例如，在包含一個隨機立構手性中心的分子群中，具有隨機立構手性中心為(S )組態的分子數可以是，但不一定與具有隨機立構手性中心為(R )組態的分子數相同。當其並非被設計成控制立體化學組態的合成方法的結果時，手性中心的立體化學組態被認為是隨機的。在某些具體例中，隨機立構手性中心是隨機立構硫代磷酸酯核苷間鍵結。
「糖部分」表示未經修飾的糖部分或經修飾的糖部分。如本文所用，「未經修飾的糖部分」表示如在天然RNA中所發現的β-D-核糖基部分，或如在天然DNA中所發現的β-D-2'-去氧核糖基糖部分。如本文所用，「經修飾的糖部分」或「經修飾的糖」表示β-D-核糖基或β-D-2'-去氧核糖基以外的糖代用物或呋喃糖基糖部分。經修飾的呋喃糖基糖部分可以在糖部分的某(些)個位置處被修飾或取代，經取代或未經取代，且它們可能具有或可能不具有β-D-核糖基以外的立體組態。經修飾呋喃糖基糖部分包括雙環糖和非雙環糖。
「糖代用物」表示不包含呋喃糖基或四氫呋喃基環 (不是「呋喃糖基糖部分」) 的經修飾糖部分，並且該經修飾糖部分可以在寡核苷酸中將核鹼基連接至另一個基團(諸如核苷間鍵結、接合物基團或末端基團) 。包含糖代用物的經修飾核苷可以被併入寡核苷酸內的一或多個位置中，且此等寡核苷酸能夠與互補寡聚化合物或核酸雜交。
「協同作用」或「協同」是指在相同劑量下大於各個成分單獨作用的加成的組合作用。
「目標基因」是指編碼目標物的基因。
「靶向」表示化合物特異性雜交至目標核酸以引起期望的效果。
「目標核酸」、「目標RNA」、「目標RNA轉錄本」及「核酸目標」均表示能夠被本文所述化合物所靶向的核酸。
「目標區域」表示一或多個化合物所靶向的目標核酸的一部分。
「目標片段」表示化合物所靶向之目標核酸的核苷酸序列。「5'靶位點」是指目標片段的最5'端核苷酸。「3'靶位點」是指目標片段的最3'端核苷酸。
「末端基團」表示共價連結至寡核苷酸末端的化學基團或原子基團。
「治療有效量」表示為個體提供治療益處的化合物、藥劑，或組成物之量。
「治療」是指向動物投與化合物或醫藥組成物以實現改變或改善動物疾病，病症或病狀。某些具體例
某些具體例提供用於抑制干擾素調節因子5 (IRF5)表現的方法，化合物以及組成物。
某些具體例提供靶向IRF5核酸的化合物。在某些具體例中，IRF5核酸具有下列中所示的序列：RefSeq或GENBANK登錄號U51127.1 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：4)；GENBANK登錄號NT_007933.14，從核苷酸53761170至53774065截切(藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：2)；GENBANK登錄號DC427600.1 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：5)；GENBANK登錄號NM_001098627.3 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：1)；GENBANK登錄號NM_001098629.2 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：3)；GENBANK登錄號NM_001098630.2 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：6)；GENBANK登錄號NM_001242452.2 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：7)；GENBANK登錄號NM_032643.4 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：8)；及GENBANK登錄號NC_000007.14，從核苷酸128935001至128953000截切(藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：9)。在某些具體例中，該化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，該化合物是單股的。在某些具體例中，該化合物是雙股的。
在某些具體例中，該化合物包含長度為16個連接核苷的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是反義化合物或寡聚化合物。
某些具體例提供一種包含經修飾寡核苷酸的化合物，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，該化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，該化合物是單股的。在某些具體例中，該化合物是雙股的。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷。
某些具體例提供一種包含經修飾寡核苷酸的化合物，該經修飾寡核苷酸由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列組成。在某些具體例中，該化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，該化合物是單股的。在某些具體例中，該化合物是雙股的。
某些具體例提供一種包含經修飾寡核苷酸的化合物，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷且在SEQ ID NO: 2的以下核鹼基範圍內互補：4366至4381、5141至5156、5140至5160、5179至5194、11544至11559、11542至11596、11736至11751、11737至11752、11720至11790，或11794至11809，其中該經修飾寡核苷酸與SEQ ID NO：2為至少85%、至少90%，至少95%或100%互補。在某些具體例中，該化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，該化合物是單股的。在某些具體例中，該化合物是雙股的。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷。
在某些具體例中，化合物靶向IRF5核酸的核苷酸11737至11752。在某些具體例中，化合物靶向具有SEQ ID NO：2之核鹼基序列的IRF5核酸其核苷酸4366至4381、5141至5156、5140至5160、5179至5194、11544至11559、11542至11596、11736至11751、11737至11752，11720至11790或11794至11809中。在某些具體例中，化合物具有至少8、9、10、11、12、13、14，15或16個連續核鹼基部分，該至少8、9、10、11、12、13、14，15或16個連續核鹼基部分與具有SEQ ID NO：2之核鹼基序列的IRF5核酸之核苷酸4366至4381、5141至5156、5140至5160、5179至5194、11544至11559、11542至11596、11736至11751、11737至11752、11720至11790，或11794至11809內的等長部分為互補。在某些具體例中，此等化合物是反義化合物、寡聚化合物，或寡核苷酸。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核苷且具有包含SEQ ID NO：168、228、717、1340、1270，1272和1294中任一者之至少8、9、10、11、12、13、14，15或16個連續核鹼基部分的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核苷且具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272和1294中任一者之核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷。
在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272和1294中任一者組成的核鹼基序列。
在某些具體例中，靶向IRF5的化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524和786548。如以下實例章節中所述，在篩選超過1,320個化合物當中，ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524和786548顯示為領先前導化合物。特別是，ION 729018在超過1,320個化合物中顯示出顯著的功效和耐受性。
在某些具體例中，前述經修飾寡核苷酸中的任一者包含至少一個經修飾核苷間鍵結、至少一個經修飾糖及/或至少一個經修飾核鹼基。
在某些具體例中，前述經修飾寡核苷酸中的任一者包含至少一個經修飾的糖。在某些具體例中，至少一個經修飾的糖包含2'-O-甲氧基乙基基團。在某些具體例中，至少一個經修飾的糖是雙環糖，諸如4'-CH(CH3)-O-2'基團、4'-CH2-O-2'基團，或4'-(CH2)2- O-2'基團。
在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含至少一個經修飾核苷間鍵結，諸如硫代磷酸酯核苷間鍵結。
在某些具體例中，前述經修飾寡核苷酸中的任一者包含至少一個經修飾核鹼基，諸如5-甲基胞嘧啶。
在某些具體例中，前述經修飾寡核苷酸中的任一者包含： 由連接去氧核苷組成的間隔片段； 由連接核苷組成的5'側翼片段；及 由連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，且其中每個側翼片段的每個核苷包含經修飾的糖。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，具有包含以下SEQ ID NO任一者中所述序列的核鹼基序列：228、168、717、1340、1270，1272及1294。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含以下任一者中所述序列的核鹼基序列：SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸長度為16個連接核苷，具有由以下任一者中所述序列所組成的核鹼基序列：SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸或由其組成，該經修飾寡核苷酸具有包含以下任一者中所述序列的核鹼基序列：SEQ ID NO：228、168、1270，1272及1294，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由三個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由三個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中每個側翼片段的每個核苷均包含cEt糖；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，並且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
在某些具體例中，化合物由長度為16個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸組成，經修飾寡核苷酸具有由SEQ ID NO ：228中所述序列所組成的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由三個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由三個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中每個側翼片段的每個核苷均包含cEt糖；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，並且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸或由其組成，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：717中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由兩個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由四個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中5'側翼片段中的每個核苷均包含cEt糖(kk)；其中3'側翼片段的核苷自5'至3'方向包含cEt糖、2'-MOE糖，cEt糖和2'-MOE糖(keke)；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸或由其組成，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：717及1340中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由九個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由兩個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由五個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中5'側翼片段中的每個核苷均包含cEt糖(kk)；其中3'側翼片段的核苷自5'至3'方向包含2'-MOE糖、2'-MOE糖、2'-MOE糖，cEt糖和cEt糖(eeekk)；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
在某些具體例中，化合物包含ION 729018或其鹽或由其組成，其具有以下化學結構：
Figure 02_image001
。
在某些具體例中，化合物包含ION 729018的鈉鹽或由其組成，其具有以下化學結構：
Figure 02_image003
。
在前述具體例的任一者中，化合物或寡核苷酸可與編碼IRF5的核酸為至少85%、至少90%、至少95%、至少98%，至少99%或100%互補。
在前述具體例的任一者中，該化合物可以是單股的。在某些具體例中，該化合物包含去氧核糖核苷酸。在某些具體例中，化合物是雙股的。在某些具體例中，該化合物是雙股的並且包含核糖核苷酸。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
在前述具體例的任一者中，化合物長度可為8至80、10至30、12至50、13至30、13至50、14至30、14至50、15至30、15至50、16至30、16至50、17至30、17至50、18至22、18至24、18至30、18至50、19至22、19至30，19至50或20至30個連接核苷。在某些具體例中，化合物包含寡核苷酸或由寡核苷酸組成。
在某些具體例中，本文提供的化合物或組成物包含經修飾寡核苷酸的醫藥上可接受之鹽。在某些具體例中，該鹽是鈉鹽。在某些具體例中，該鹽是鉀鹽。
在某些具體例中，如本文所述的化合物或組成物是有活性的，其具有以下活體外IC50 中的至少一者：小於2 µM、小於1.5 µM、小於1 µM、小於0.9 µM、小於0.8 µM、小於0.7 µM、小於0.6 µM、小於0.5 µM、小於0.4 µM、小於0.3 µM、小於0.2 µM、小於0.1 µM、小於0.05 µM、小於0.04 µM、小於0.03 µM，小於0.02 µM或小於0.01 µM。
在某些具體例中，如本文所述化合物或組成物是高度可耐受的，其如透過以下方式獲得證明：相對於對照動物，丙胺酸轉胺酶(ALT)或天冬胺酸轉胺酶(AST)數值中至少一者的增加不超過4倍、3倍或2倍，或相較於對照動物在肝臟、脾臟或腎臟重量方面的增加不超過30%、20%、15%、12%、10%，5%或2%。在某些具體例中，如本文所述化合物或組成物是高度可耐受的，如透過ALT或AST相對於對照動物沒有增加來獲得證明。在某些具體例中，如本文所述化合物或組成物是高度可耐受的，如透過肝臟、脾臟或腎臟重量相對於對照動物沒有增加來獲得證明。
某些具體例提供一種組成物，其包含前述具體例中任一者的化合物或其任何醫藥上可接受之鹽，以及醫藥上可接受之載體或稀釋劑中的至少一者。在某些具體例中，組成物的黏度小於約40厘泊(centipose，cP)、小於約30厘泊(cP)、小於約20厘泊(cP)，小於約15厘泊(cP)或小於約10厘泊(cP)。在某些具體例中，具有前述黏度中任一者的組成物包含本文提供的化合物，其濃度為約100 mg/mL、約125 mg/mL、約150 mg/mL、約175 mg/mL、約200 mg/mL、約225 mg/mL、約250 mg/mL，約275 mg/mL或約300 mg/mL。在某些具體例中，具有前述黏度及/或化合物濃度中任一者的組成物的溫度為室溫，或約20℃、約21℃、約22℃、約23℃、約24℃、約25℃、約26℃、約27℃、約28℃，約29℃或約30℃。某些適應症
本文提供的某些具體例是有關於透過投與靶向IRF5的化合物來抑制IRF5表現的方法，其可用於在個體體內治療、預防或改善與IRF5相關的疾病。在某些具體例中，該化合物可以是一個IRF5特異性抑制劑。在某些具體例中，化合物可以是靶向IRF5的反義化合物，寡聚化合物或寡核苷酸。
利用本文提供的方法可治療、預防及/或改善與IRF5相關的疾病的實例包括發炎性腸病(IBD)、潰瘍性結腸炎、克隆氏症、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、非酒精性脂性肝炎（Nonalcoholic steatohepatitis，NASH）、肝纖維化，氣喘和嚴重氣喘。本文提供的某些化合物是關於在個體體內減少發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤、膠原沉積，或發炎性細胞激素產生的化合物及組成物。本文提供的某些化合物是有關於在個體體內減少胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重（tenesmus）或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕的化合物及組成物，其包含向該個體投與靶向IRF5的化合物，從而減少或抑制減少個體的胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或體重減輕。
在某些具體例中，在個體體內治療、預防或改善與IRF5相關之疾病的方法，包含向該個體投與包含IRF5特異性抑制劑的化合物，從而治療、預防或改善該疾病。在某些具體例中，個體被鑑定為罹患，或有風險罹患與IRF5相關的疾病。在某些具體例中，該疾病是發炎性疾病。在某些具體例中，該疾病是胃腸疾病。在某些具體例中，該胃腸疾病是潰瘍性結腸炎或克隆氏症。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列的至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，其長度為12至30連接核苷且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一個核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列所組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272和1294中任一者的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272和1294中任一者所組成之核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例之任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例之任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，將化合物非經腸投與給個體。在某些具體例中，在動物體內投與化合物會改善、保護或預防發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤、膠原沉積，或發炎性細胞激素產生。
在某些具體例中，一種在動物體內治療、預防或改善發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤、膠原沉積，或發炎性細胞激素產生的方法，包含向個體投與包含IRF5特異性抑制劑的化合物，從而治療、預防或改善發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生。在某些具體例中，一種在個體體內治療、預防或改善胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良，腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期外的體重減輕包含向該個體投與靶向IRF5的化合物，從而減少或抑制減少胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹痛絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期外的體重減輕。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含長度為16至30個連接核苷的經修飾寡核苷酸，具有SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者組成之核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例之任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例之任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，將化合物非經腸投與給個體。在某些具體例中，投與化合物會改善、保護或預防發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生。在某些具體例中，投與化合物在個體體內會改善、保護或預防胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期外的體重減輕。在某些具體例中，該個體被鑑定為罹患，或有風險罹患與IRF5相關的疾病。
在某些具體例中，一個在罹患或有風險罹患與IRF5相關之疾病的個體體內抑制IRF5表現的方法，包含向該個體投與包含IRF5特異性抑制劑的化合物，從而抑制IRF5在該個體體內的表現。在某些具體例中，投與該化合物抑制IRF5在胃腸道中的表現。在某些具體例中，投與該化合物抑制IRF5在肝臟中的表現。在某些具體例中，投與該化合物抑制IRF5在肺臟中的表現。在某些具體例中，投與該化合物抑制IRF5在腎臟中的表現。在某些具體例中，投與該化合物抑制IRF5在關節中的表現。在某些具體例中，該疾病是發炎性疾病。在某些具體例中，該疾病是胃腸疾病。在某些具體例中，胃腸疾病是潰瘍性結腸炎或克隆氏症。在某些具體例中，個體罹患或有風險罹患發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘。在某些具體例中，該個體罹患或有風險罹患發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生。在某些具體例中，該個體罹患或有風險罹患胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者的核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者組成的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例之任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例之任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，將該化合物非經腸投與至該個體。在某些具體例中，投與該化合物會改善、保護或預防發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生。在某些具體例中，投與該化合物會改善、保護或預防胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預料之外的體重減輕。
在某些具體例中，一種抑制IRF5在細胞中表現的方法，包含使該細胞與包含IRF5特異性抑制劑的化合物接觸，從而抑制IRF5在細胞中的表現。在某些具體例中，該細胞是胃腸道細胞。在某些具體例中，該細胞是肝細胞。在某些具體例中，該細胞是腎細胞。在某些具體例中，該細胞是肺細胞。在某些具體例中，該細胞在胃腸道、肺臟、肝臟，腎臟或任何其他器官中。在某些具體例中，該細胞是在罹患或有風險罹患胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預料外體重減輕之個體的胃腸道內。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者所組成的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
在某些具體例中，一種在罹患或有風險罹患與IRF5有關之疾病的個體體內減少或抑制發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生的方法，包含向該個體投與一個包含IRF5特異性抑制劑的化合物，從而在該個體體內減少或抑制發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生。在某些具體例中，一種在罹患或有風險罹患與IRF5有關之疾病的個體體內減少或抑制胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕的方法，包含向該個體投與一個包含IRF5特異性抑制劑的化合物，從而在該個體體內減少或抑制胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加，裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或意料之外的體重減輕。在某些具體例中，該個體罹患或有風險罹患發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列的至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者組成的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，將該化合物非經腸投與給該個體。在某些具體例中，該個體被鑑定為罹患，或有風險罹患與IRF5相關的疾病。
某些具體例涉及包含IRF5特異性抑制劑的化合物，其用於治療與IRF5相關之疾病。在某些具體例中，該疾病是發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者的核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者所組成之核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例的任一者中，化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，將化合物非經腸投與給該個體。
某些具體例涉及包含IRF5特異性抑制劑的化合物，其在罹患或有風險罹患發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘的個體體內，用於減少或抑制發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生。在某些具體例中，使用的IRF5特異性抑制劑在個體體內減少或抑制胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預料之外的體重減輕。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者所組成的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例的任一者中，化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
某些具體例涉及包含IRF5特異性抑制劑的化合物的用途，其用於製造或製備用以治療與IRF5相關之疾病的藥物。某些具體例涉及包含IRF5特異性抑制劑的化合物的用途，其用於製備用以治療與IRF5相關之疾病的藥物。在某些具體例中，該疾病是發炎性疾病。在某些具體例中，該疾病是胃腸疾病。在某些具體例中，該胃腸疾病是潰瘍性結腸炎或克隆氏症。在某些具體例中，該疾病是發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者所組成的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
某些具體例涉及包含IRF5特異性抑制劑的化合物的用途，其用於製造或製備用以在罹患或有風險罹患與IRF5相關之疾病的個體體內減少或抑制發炎、肝硬化、纖維化、蛋白尿、關節發炎、自體抗體產生、發炎性細胞浸潤，膠原沉積或發炎性細胞激素產生的藥物。在某些具體例中，用於製造或製備藥物的IRF5特異性抑制劑在個體體內減少或抑制胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕。在某些具體例中，該疾病是發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘。某些具體例涉及包含IRF5特異性抑制劑的化合物的用途，其用於製備用以治療與IRF5相關之疾病的藥劑。在某些具體例中，該疾病是發炎性腸病(IBD)、全身性紅斑狼瘡(SLE)、類風濕性關節炎、原發性膽汁性肝硬化、全身性硬化症、休格倫氏症候群、多發性硬化症、硬皮病、間質性肺病(SSc-ILD)、多囊性腎病(PKD)、慢性腎病(CKD)、NASH、肝纖維化，氣喘或嚴重氣喘。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的反義化合物。在某些具體例中，該化合物包含靶向IRF5的寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12至30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一核鹼基序列其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為12到30個連接核苷，且具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列的核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含由SEQ ID NO：37至1356中任一者之核鹼基序列所組成的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸，該經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，具有包含SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列。在某些具體例中，化合物包含具有由SEQ ID NO：228、168、717、1340、1270，1272及1294中任一者所組成的核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該化合物是ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524或786548。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是單股或雙股的。在前述具體例的任一者中，該化合物可以是反義化合物或寡聚化合物。
在前述方法或用途的任一者中，該化合物可以靶向IRF5。在某些具體例中，該化合物包含一個經修飾寡核苷酸或由其組成，例如：長度為8到80個連接核苷、長度為10至30個連接核苷、長度為12至30個連接核苷，或長度為20個連接核苷的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸與SEQ ID NO：37至1356中所述核鹼基序列中的任一者為至少80%、至少85%、至少90%，至少95%或100%互補。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸包含至少一個經修飾核苷間鍵結、至少一個經修飾糖及/或至少一個經修飾核鹼基。在某些具體例中，該經修飾核苷間鍵結是硫代磷酸酯核苷間鍵結，該經修飾糖是雙環糖或經2'-O-甲氧基乙基修飾的糖，而該經修飾核鹼基是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含：由連接去氧核苷所組成的間隔片段、由連接核苷所組成的5'側翼片段，以及由連接核苷所組成的3'側翼片段，其中該間隔片段緊鄰5'側翼片段和3'側翼片段並位在兩者間，且其中每個側翼片段的每個核苷均包含經修飾糖。
在前述具體例的任一者中，該經修飾寡核苷酸長度為12至30、15至30、15至25、15至24、16至24、17至24、18至24、19至24、20至24、19至22、20至22，16至20或16或20個連接核苷。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸與SEQ ID NO：37至1356中所示核鹼基序列中的任一者為至少80%、至少85%、至少90%，至少95%或100%互補。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核鹼基之經修飾寡核苷酸或由其組成，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：228、168、1270，1272及1294中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由三個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由三個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中每個側翼片段的每個核苷均包含cEt糖；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，並且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
在某些具體例中，化合物由長度為16個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸組成，該經修飾寡核苷酸具有由SEQ ID NO：228中所述序列所組成的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由三個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由三個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中每個側翼片段的每個核苷均包含cEt糖；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核鹼基之經修飾寡核苷酸或由其組成，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：717中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由兩個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由四個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中5'側翼片段中的每個核苷均包含cEt糖(kk)；其中3'側翼片段的核苷自5'至3'方向包含cEt糖、2'-MOE糖，cEt糖和2'-MOE糖(keke)；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸是由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
在某些具體例中，化合物包含長度為12至30個連接核鹼基之經修飾寡核苷酸或由其組成，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：717及1340中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由九個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由兩個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由五個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中5'側翼片段中的每個核苷均包含cEt糖(kk)；其中3'側翼片段的核苷自5'至3'方向包含2'-MOE糖、2'-MOE糖、2'-MOE糖，cEt糖和cEt糖(eeekk)；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸是由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸是由16個連接核苷組成。
在某些具體例中，化合物包含ION 729018或其鹽或由其組成，其具有以下化學結構：
Figure 02_image005
。
在某些具體例中，化合物包含ION 729018的鈉鹽或由其組成，其具有以下化學結構：
Figure 02_image007
。
在前述方法或用途的任一者中，可將該化合物非經腸投藥。例如，在某些具體例中，可以透過注射或輸注投與該化合物。非經腸投藥包括皮下投藥、靜脈內投藥、肌肉內投藥、動脈內投藥，腹膜內投藥或顱內投藥(例如鞘內或腦室內投藥)。某些化合物
在某些具體例中，本文所述化合物可以是反義化合物。在某些具體例中，反義化合物包含寡聚化合物或由寡聚化合物所組成。在某些具體例中，寡聚化合物包含經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸具有與目標核酸之核鹼基序列互補的核鹼基序列。
在某些具體例中，本文所述化合物包含經修飾寡核苷酸或由經修飾寡核苷酸組成。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸具有與目標核酸的核鹼基序列互補的核鹼基序列。
在某些具體例中，化合物或反義化合物是單股的。這樣一條單股化合物或反義化合物包含寡聚化合物或由寡聚化合物所組成。在某些具體例中，這樣一個寡聚化合物包含寡核苷酸或由寡核苷酸所組成，且視情況存在一個接合物基團。在某些具體例中，該寡核苷酸是反義寡核苷酸。在某些具體例中，該寡核苷酸經修飾。在某些具體例中，單股反義化合物或寡聚化合物的寡核苷酸包含自我互補核鹼基序列。
在某些具體例中，化合物是雙股的。這樣的雙股化合物包含第一經修飾寡核苷酸，其具有與目標核酸互補之區域，以及包含第二經修飾寡核苷酸，其具有與第一經修飾寡核苷酸互補之區域。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸是RNA寡核苷酸。在這樣的具體例中，經修飾寡核苷酸中的胸腺嘧啶核鹼基被尿嘧啶核鹼基替代。在某些具體例中，化合物包含接合物基團。在某些具體例中，該等經修飾寡核苷酸之一者係經接合。在某些具體例中，該等經修飾寡核苷酸均經接合。在某些具體例中，該第一經修飾寡核苷酸係經接合。在某些具體例中，該第二經修飾寡核苷酸係經接合。在某些具體例中，該第一經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷，且該第二經修飾寡核苷酸長度為16至30個連接核苷。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸中之一者具有包含SEQ ID NO：37至1356中任一者其至少8個連續核鹼基的核鹼基序列。
在某些具體例中，反義化合物是雙股的。這樣的雙股反義化合物包含第一寡聚化合物，其具有與目標核酸互補之區域，以及包含第二寡聚化合物，其具有與第一寡聚化合物互補之區域。這種雙股反義化合物的第一寡聚化合物通常包含經修飾寡核苷酸或由其所組成，且視情況存在接合物基團。這樣一個雙股反義化合物的第二寡聚化合物的寡核苷酸可以經修飾或未經修飾。雙股反義化合物之一條或兩條寡聚化合物可包含接合物基團。雙股反義化合物的寡聚化合物可包括非互補的懸臂（overhanging）核苷。
單股和雙股化合物的實例包括但不限於寡核苷酸、siRNA、靶向微RNA的寡核苷酸及單股RNAi化合物，諸如小髮夾RNA (shRNA)、單股siRNA (ssRNA)，和微RNA模擬物。
在某些具體例中，本文所述化合物所具有的核鹼基序列，當以5'至3'方向書寫時包含其所靶向之目標核酸的目標片段的反向互補序列。
在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為12至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為12至22個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為14至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為14至20個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為15至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為15至20個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為16至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為16至20個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為17至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為17至20個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為18至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為18至20個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為20至30個連接次單元的寡核苷酸。換言之，此等寡核苷酸長度分別為12至30個連接次單元、14至30個連接次單元、14至20個次單元、15至30個次單元、15至20個次單元、16至30個次單元、16至20個次單元、17至30個次單元、17至20個次單元、18至30個次單元，18至20個次單元或20至30個次單元。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為14個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為16個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為17個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為18個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為19個連接次單元的寡核苷酸。在某些具體例中，本文所述化合物包含長度為20個連接次單元的寡核苷酸。在其它具體例中，本文所述化合物包含8至80、12至50、13至30、13至50、14至30、14至50、15至30、15至50、16至30、16至50、17至30、17至50、18至22、18至24、18至30、18至50、19至22、19至30，19至50或20至30個連接次單元的寡核苷酸。在某些此等具體例中，本文所述化合物包含長度為8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28，29或30個連接次單元的寡核甘酸，或長度為上述任兩個值界定範圍的寡核苷酸。在某些具體例中，連接次單元是核苷酸，核苷或核鹼基。
在某些具體例中，該化合物可進一步包含附接至寡核苷酸的額外部分或要素，例如接合物基團。在某些具體例中，此等化合物是反義化合物。在某些具體例中，此等化合物是寡聚化合物。在接合物基團包含核苷(即，將接合物基團連接至寡核苷酸的核苷)的具體例中，接合物基團的核苷不計入寡核苷酸的長度。
在某些具體例中，化合物可能會縮短或截切。例如，可以從5'端(5'截切)或從3'端(3'截切)刪除個別次單元。靶向IRF5核酸的縮短或截切化合物可能有兩個次單元從5’端被刪除，或可替代地，可能有兩個次單元從3’端被刪除。或者，被刪除的核苷可能分散在整個化合物中。
當延長化合物中存在單個額外次單元時，該額外的次單元可能位於化合物的5'或3'端。當存在兩個或更多個額外次單元時，所添加的次單元可能彼此相鄰，例如在一個具有兩個被添加至化合物的5'端(5'添加)或3'端(3'添加)之次單元的化合物中。或者，所添加的次單元可能分散在整個化合物中。
可以在不消除活性的情況下增加或減少化合物(諸如寡核苷酸)的長度，及/或引入錯配鹼基(Woolf et al.Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89:7305-7309；Gautschiet al .J. Natl. Cancer Inst . March 2001, 93:463-471；Maher and DolnickNuc. Acid. Res . 1998, 16:3341-3358)。然而，在寡核苷酸序列，化學性質和模體中看似很小的變化可能會在許多臨床開發必要特性中的一或多者產生巨大差異(S Seth et al.J. Med. Chem. 2009, 52, 10；Egli et al.J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 16642)。
在某些具體例中，本文所述化合物是干擾RNA化合物(RNAi)，其包括雙股RNA化合物(也稱為短干擾RNA或siRNA)及單股RNAi化合物(或ssRNA)。此等化合物至少部分經由RISC途徑發揮作用，以降解及/或螯合目標核酸(因此，包括微RNA/微RNA模擬化合物)。如本文中所使用的，術語siRNA意味等同於用來描述能夠介導序列特異性RNAi作用的核酸分子的其他術語，例如短干擾RNA (siRNA)、雙股RNA (dsRNA)、微RNA (miRNA)、短髮夾RNA (shRNA)、短干擾寡核苷酸、短干擾核酸、短干擾經修飾寡核苷酸、經化學修飾siRNA、轉錄後基因靜默RNA (ptgsRNA)及其他術語。另外，如本文所用，術語「RNAi」意味等同於用來描述序列特異性RNA干擾的其他術語，諸如轉錄後基因靜默，轉譯抑制或表觀遺傳學。
在某些具體例中，本文所述化合物可包含本文所述靶向IRF5之寡核苷酸序列中的任一者。在某些具體例中，該化合物可以是雙股的。在某些具體例中，該化合物包含第一股及第二股，該第一股包含SEQ ID NO：37至1356中任一者之至少8、9、10、11、12、13、14，15或16個連續核鹼基部分。在某些具體例中，該化合物包含第一股及第二股，該第一股包含SEQ ID NO：37至1356中任一者的核鹼基序列。在某些具體例中，該化合物包含核糖核苷酸，其中第一股在SEQ ID NO：37至1356的任一者中具有尿嘧啶(U)代替胸腺嘧啶(T)。在某些具體例中，化合物包含(i)第一股，其包含與SEQ ID NO：37至1356中任一者所靶向之IRF5上的位點互補的核鹼基序列，及(ii)第二股。在某些具體例中，該化合物包含一或多個經修飾核苷酸，其中糖的2'位置含有一個鹵素(諸如氟基；2'-F)或含有一個烷氧基(諸如甲氧基；2'-OMe)。在某些具體例中，該化合物包含至少一個2'-F糖修飾及至少一個2'-OMe糖修飾。在某些具體例中，該至少一個2'-F糖修飾及該至少一個2'-OMe糖修飾以交替的方式沿著dsRNA化合物之一股排列至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、15、16、17、18，19或20個連續核鹼基。在某些具體例中，該化合物在相鄰核苷酸之間包含一或多個天然磷酸二酯鍵結以外的鍵結。此等鍵結的實例包括磷醯胺，硫代磷酸酯和二硫代磷酸酯鍵結。該等化合物也可以是如美國專利第6,673,661號中所教示的經化學修飾核酸分子。在其他具體例中，該化合物含有一或兩個加蓋股(capped strand)，如例如2000年4月19日提申之WO 00/63364所揭示。
在某些具體例中，化合物的第一股是siRNA引導股，而化合物的第二股是siRNA乘客股。在某些具體例中，化合物的第二股與第一股互補。在某些具體例中，該化合物的各股長度為16、17、18、19、20、21，22或23個連接核苷。在某些具體例中，該化合物的第一股或第二股可包含接合物基團。
在某些具體例中，本文所述化合物可包含本文所述靶向IRF5的寡核苷酸序列中的任一者。在某些具體例中，該化合物是單股的。在某些具體例中，這樣一個化合物是單股RNAi (ssRNAi)化合物。在某些具體例中，該化合物包含SEQ ID NO：37至1356中任一者的至少8、9、10、11、12、13、14，15或16個連續核鹼基部分。在某些具體例中，該化合物包含SEQ ID NO：37至1356中任一者的核鹼基序列。在某些具體例中，該化合物包含核糖核苷酸，其中在SEQ ID NO：37至1356的任一者中尿嘧啶(U)代替胸腺嘧啶(T)。在某些具體例中，該化合物包含與SEQ ID NO：37至1356中任一者所靶向之IRF5上的位點互補的核鹼基序列。在某些具體例中，該化合物包含一或多個經修飾核苷酸，其中在糖的2'位置含有一個鹵素(如氟基；2'-F)或含有一個烷氧基(諸如甲氧基；2'-OMe)。在某些具體例中，該化合物包含至少一個2'-F糖修飾和至少一個2'-OMe糖修飾。在某些具體例中，該至少一個2'-F糖修飾和該至少一個2'-OMe糖修飾以交替的方式沿著該化合物的一股排列至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、15、16、17、18，19或20個連續核鹼基。在某些具體例中，該化合物在相鄰核苷酸之間包含一或多個天然磷酸二酯鍵結以外的鍵結。此等鍵結的實例包括磷醯胺，硫代磷酸酯和二硫代磷酸酯鍵結。該等化合物也可以是如美國專利第6,673,661號中所教示的經化學修飾核酸分子。在其他具體例中，該化合物含有加蓋股，如例如在2000年4月19日提申的WO 00/63364所揭示。在某些具體例中，該化合物由16、17、18、19、20、21，22或23個連接核苷組成。在某些具體例中，該化合物可以包含接合物基團。某些機制
在某些具體例中，本文所述化合物包含經修飾寡核苷酸或由其組成。在某些具體例中，本文所述化合物是反義化合物。在某些具體例中，該等化合物包含寡聚化合物。在某些具體例中，本文所述化合物能夠與目標核酸雜交，導致至少一種反義活性。在某些具體例中，本文所述化合物選擇性地影響一或多個目標核酸。此等化合物包含核鹼基序列，其雜交至一或多個目標核酸而導致一或多個期望的反義活性，並且不雜交至一或多個非目標核酸或不以導致明顯不期望的反義活性的方式雜交至一或多個非目標核酸。
在某些反義活性中，本文所述化合物與目標核酸的雜交導致募集會裂解目標核酸的蛋白質。例如，本文所述的某些化合物導致RNase H所介導的目標核酸裂解。RNase H是一種切割RNA：DNA雙股體中RNA股的細胞核酸內切酶。這樣一個RNA：DNA雙股體中的DNA不必然是未經修飾的DNA。在某些具體例中，本文所述化合物足夠「類似於DNA」以引起RNase H活性。此外，在某些具體例中，在間隔體的間隔中容忍有一或多個非DNA樣核苷。
在某些反義活性中，本文所述化合物或化合物的一部分被加載到RNA誘導的靜默複合物(RISC)中，最終導致目標核酸的裂解。例如，本文所述的某些化合物導致目標核酸受到Argonaute蛋白的裂解。被加載到RISC中的化合物是RNAi化合物。RNAi化合物可以是雙股(siRNA)或單股(ssRNA)。
在某些具體例中，本文所述化合物與目標核酸的雜交不會募集裂解該目標核酸的蛋白質。在某些此等具體例中，化合物與目標核酸的雜交會導致目標核酸的剪接改變。在某些具體例中，化合物與目標核酸的雜交會抑制該目標核酸和蛋白質或其它核酸之間的結合交互作用。在某些此等具體例中，化合物與目標核酸的雜交會使得目標核酸的轉譯改變。
反義活動可以直接地或間接地被觀察到。在某些具體例中，觀察或檢測反義活性涉及觀察或檢測目標核酸或由此目標核酸編碼的蛋白質之量的變化、核酸或蛋白質的剪接變異體的比例變化，及/或細胞或動物中的表現型變化。目標核酸，目標區域及核苷酸序列
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸或由其組成，該寡核苷酸包含與目標核酸互補的區域。在某些具體例中，該目標核酸是內源性RNA分子。在某些具體例中，該目標核酸編碼蛋白質。在某些此等具體例中，從mRNA和mRNA前體(包括內含子，外顯子和未轉譯區域)選出目標核酸。在某些具體例中，靶RNA是mRNA。在某些具體例中，目標核酸是mRNA前體。在某些此等具體例中，目標區域完全在內含子內。在某些具體例中，目標區域跨越內含子/外顯子交接處。在某些具體例中，目標區域至少50%在內含子內。
編碼IRF5的核苷酸序列包括但不限於以下：RefSeq或GENBANK登錄號U51127.1 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：4)；GENBANK登錄號NT_007933.14，從核苷酸53761170至53774065截切(藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：2)；GENBANK登錄號DC427600.1 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：5)；GENBANK登錄號NM_001098627.3 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：1)；GENBANK登錄號NM_001098629.2 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：3)；GENBANK登錄號NM_001098630.2 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：6)；GENBANK登錄號NM_001242452.2 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：7)；GENBANK登錄號NM_032643.4 (藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：8)；及GENBANK登錄號NC_000007.14，從核苷酸128935001至128953000截切(藉由引用併入，在本文中揭示為SEQ ID NO：9)。雜交
在一些具體例中，雜交發生在本文揭示的化合物與IRF5核酸之間。雜交最常見機制涉及核酸分子的互補核鹼基之間的氫鍵結(例如，瓦生-克立克，胡斯坦或反向胡斯坦氫鍵結)。
雜交可以在不同條件下發生。雜交條件是序列依賴性，且是透過待雜交核酸分子的性質和組成來決定。
確定序列是否可與目標核酸特異地雜交的方法是本技藝中所熟知的。在某些具體例中，本文提供的化合物可與IRF5核酸特異地雜交。互補性
當兩個核鹼基序列以對向排列時，若一個寡核苷酸或其一或多個區域的核鹼基序列與另一個寡核苷酸或核酸或其一或多個區域的核鹼基序列匹配時，該寡核苷酸被認為與另一核酸互補。如本文所述，除非另有指明，否則核鹼基匹配或互補核鹼基限於以下配對：腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)和尿嘧啶(U)、胞嘧啶(C)和鳥嘌呤(G)，以及5-甲基胞嘧啶(mC)和鳥嘌呤(G)。互補寡核苷酸及/或核酸不需要在每個核苷處具有核鹼基互補性，並且可以包括一或多個核鹼基錯配。當這樣的寡核苷酸在每個核苷處具有核鹼基匹配而沒有任何核鹼基錯配時，該寡核苷酸是完全互補或100%互補。
在某些具體例中，本文所述化合物包含經修飾寡核苷酸或由其組成。在某些具體例中，本文所述化合物是反義化合物。在某些具體例中，化合物包括寡聚化合物。可以容忍化合物和IRF5核酸之間有非互補核鹼基，前提為化合物仍然能夠特異地雜交至目標核酸。此外，化合物可與IRF5核酸的超過一或多個片段雜交，使得插入或鄰近片段不涉入雜交事件(例如環結構，錯配或髮夾結構)。
在某些具體例中，本文提供的化合物或其指定部分與IRF5核酸、目標區域、目標片段，或其指定部分至少或至多70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%，99%或100%互補。在某些具體例中，本文提供的化合物或其指定部分與IRF5核酸、目標區域、目標片段或其指定部分為70%至75%、75%至80%、80%至85%、85%至90%、90%至95%，95%至100%或這些範圍之間中任何值互補。化合物與目標核酸的互補性百分比可以使用常規方法來確定。
例如，化合物之20個核鹼基中的18個與目標區域互補且因此特異地雜交的一個化合物將表示90%互補性。在這個實例中，其餘的非互補核鹼基可以成簇或分散在互補核鹼基之間，並且不需要彼此相鄰或與互補核鹼基相鄰。因此，長度為18個核鹼基，具有四個非互補核鹼基側接兩個與目標核酸完全互補的區域的一個化合物可能與目標核酸具有77.8%整體互補性。化合物與目標核酸之一個區域的互補性百分比可以常規地使用本技藝中已知的BLAST程式(基本的局部比對搜索工具)和PowerBLAST程式(Altschulet al .,J.  Mol.  Biol ., 1990, 215, 403 410；Zhang and Madden, Genome Res., 1997, 7, 649 656)來決定。同源性、序列一致性或互補性百分比可使用預設設定透過例如Gap程式(Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, Madison Wis.)進行確定，其使用Smith和Waterman的演算法(Adv.  Appl.  Math., 1981, 2, 482 489)。
在某些具體例中，本文所述化合物或其指定部分與目標核酸或其指定部分完全互補(即100%互補)。例如，一個化合物可以與IRF5核酸或其目標區域或其目標片段或目標序列完全互補。如本文所用，「完全互補」表示化合物的每個核鹼基與目標核酸的對應核鹼基互補。例如，20個核鹼基化合物與400個核鹼基長的目標序列完全互補，只要目標核酸有對應20個核鹼基部分與化合物完全互補即可。也可以參照第一及/或第二核酸的指定部分來使用「完全互補」。例如，30個核鹼基化合物的20個核鹼基部分可以與400個核鹼基長的目標序列「完全互補」。如果目標序列具有對應的20個核鹼基部分(其中每個核鹼基均與該化合物的20個核鹼基部分互補)，則30個核鹼基化合物的20個核鹼基部分與目標序列完全互補。同時，整個30個核鹼基化合物與目標序列可能完全互補或可能不完全互補，取決於化合物的其餘10個核鹼基是否也與目標序列互補。
在某些具體例中，本文所述的化合物相對於目標核酸包含一或多個錯配核鹼基。在某些此等具體例中，因為此錯配而降低了對目標物的反義活性，但是對非目標物的活性卻被降低更多。因此，在某些此等具體例中，增進了化合物的選擇性。在某些具體例中，錯配被特異地定位在具有間隔體模體（gapmer motif）的寡核苷酸內。在某些此等具體例中，錯配在距間隔區域的5'端起的位置1、2、3、4、5、6，7或8處。在某些此等具體例中，錯配在距間隔區域的3'端起的位置9、8、7、6、5、4、3、2、1處。在某些此等具體例中，錯配在距側翼區域的5端起位置1、2、3或4處。在某些此等具體例中，錯配在距側翼區域的3'端起位置4、3、2或1處。在某些具體例中，錯配被特異地定位在不具有間隔體模體的寡核苷酸內。在某些此等具體例中，錯配在距寡核苷酸的5'端起位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12處。在某些此等具體例中，錯配在距寡核苷酸的3'端起位置2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12處。
非互補核鹼基的位置可以在化合物的5'端或3'端處。或者，一或多個非互補核鹼基可以在化合物的內部位置處。當存在兩個或更多個非互補核鹼基時，它們可以是連續的(即連接)或不連續的。在一個具體例中，非互補核鹼基位於間隔體寡核苷酸的側翼片段中。
在某些具體例中，長度為或至多11、12、13、14、15、16、17、18，19或20個核鹼基的本文所述化合物，相對於目標核酸(諸如IRF5核酸)或其指定部分，包含不超過4個、不超過3個，不超過2個或不超過1個的非互補核鹼基。
在某些具體例中，長度為或至多11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28，29或30個核鹼基的化合物，相對於目標核酸(諸如IRF5核酸)或其指定部分，包含不超過6個、不超過5個、不超過4個、不超過3個，不超過2個或不超過1個的非互補核鹼基。
在某些具體例中，本文所述化合物也包括與目標核酸的一部分互補的那些。如本文所用，「部分」是指目標核酸的區域或片段內限定數量的連續(即，連接)核鹼基。「部分」還可指化合物之限定數量的連續核鹼基。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少8個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少9個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少10個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少11個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少12個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少13個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少14個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少15個核鹼基部分為互補。在某些具體例中，化合物與目標片段的至少16個核鹼基部分為互補。還預期與目標片段的至少9、10、17、18、19，20或更多個核鹼基部分或這些値中的任何兩者所界定的範圍互補的化合物。一致性
本文提供的化合物也可與特定核苷酸序列，SEQ ID NO或由特定ION編號表示的化合物或其部分，具有指定的一致性百分比。在某些具體例中，本文所述化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，本文所述化合物是經修飾寡核苷酸。如本文所用，如果化合物具有相同的核鹼基配對能力，則其與本文揭示的序列一致。例如，在揭示的DNA序列中含有尿嘧啶代替胸苷的RNA將會被認為與DNA序列相同，因為尿嘧啶和胸苷都與腺嘌呤配對。還預期本文所述化合物的縮短與延長變異體以及相對於本文提供之化合物具有不一致鹼基的化合物。不一致的鹼基可以彼此相鄰或分散在整個化合物中。根據相對於要比較的序列具有一致鹼基配對的鹼基數目，計算化合物的一致性百分比。
在某些具體例中，本文所述化合物或其部分與本文揭示之化合物或SEQ ID NO或其部分的一或多者為或至少為70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%，99%或100%一致。在某些具體例中，本文所述化合物與特定核苷酸序列，SEQ ID NO或由特定ION表示的化合物或其部分(其中化合物包含具有一或多個錯配核鹼基的寡核苷酸)為約70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%，98%或99%，或這些值之間的任何百分比一致。在某些此等具體例中，錯配在距寡核苷酸的5'端起的位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10，11或12處。在某些此等具體例中，錯配在距寡核苷酸的3'端起的位置2、3、4、5、6、7、8、9、10，11或12處。
在某些具體例中，本文所述化合物包含反義化合物或由反義化合物組成。在某些具體例中，將反義化合物的一部分與目標核酸的等長部分進行比較。在某些具體例中，將8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23，24或25個核鹼基部分與目標核酸的等長部分進行比較。
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸或由寡核苷酸組成。在某些具體例中，將寡核苷酸的一部分與目標核酸的等長部分進行比較。在某些具體例中，將8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23，24或25個核鹼基部分與目標核酸的等長部分進行比較。某些經修飾化合物
在某些具體例中，本文所述化合物包含由連接核苷組成之寡核苷酸或由其組成。寡核苷酸可以是未經修飾的寡核苷酸(RNA或DNA)或可以是經修飾的寡核苷酸。經修飾的寡核苷酸，相對於未經修飾的RNA或DNA，包含至少一種修飾(即，包含至少一個經修飾核苷(包含經修飾的糖部分及/或經修飾的核鹼基)及/或至少一個經修飾的核苷間鍵結)。A. 經修飾核苷
經修飾的核苷包含經修飾的糖部分或經修飾的核鹼基，或經修飾的糖部分和經修飾的核鹼基兩者。1. 經修飾糖部分
在某些具體例中，糖部分是非雙環經修飾的糖部分。在某些具體例中，經修飾的糖部分是雙環或三環糖部分。在某些具體例中，經修飾的糖部分是糖代用物。此類糖代用物可包含一或多個對應於其他類型的經修飾糖部分之取代的取代。
在某些具體例中，經修飾的糖部分是非雙環經修飾呋喃糖基糖部分，其包含一或多個無環取代基，包括但不限於在2'、4'及/或5'位置處的取代基。在某些具體例中，呋喃糖基糖部分是核糖基糖部分。在某些具體例中，非雙環經修飾的糖部分的一或多個無環取代基具支鏈。適用於非雙環經修飾的糖部分的2'-取代基的實例包括但不限於：2'-F、2'-OCH3 (「OMe」或「O-甲基」)及2'-O(CH2 )2 OCH3 (「MOE」)。在某些具體例中，2'-取代基選自：鹵基、烯丙基、胺基、疊氮基、SH、CN、OCN、CF3 、OCF3 、OC1 -C10 烷氧基、經取代OC1 -C10 烷氧基、O-C1 -C10 烷基、經取代O-C1 -C10 烷基、S-烷基、N(Rm )-烷基、O-烯基、S-烯基、N(Rm )-烯基、O-炔基、S-炔基、N(Rm )-炔基、O-伸烷基-O-烷基、炔基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基、O-芳烷基、O(CH2 )2 SCH3 、O(CH2 )2 ON(Rm )(Rn )或OCH2 C(＝O)-N(Rm )(Rn )，其中各個Rm 和Rn 獨立地為H、胺基保護基，或經取代或未經取代的C1 -C10 烷基，及在Cook等人之U.S. 6,531,584、Cook等人之U.S. 5,859,221，與Cook等人之U.S. 6,005,087中所述的2'-取代基基團。這些2'-取代基基團的某些具體例可以進一步經一或多個獨立地選自以下的取代基基團取代：羥基、胺基、烷氧基、羧基、苯甲基、苯基、硝基(NO2 )、硫醇、硫代烷氧基、硫代烷基、鹵素、烷基、芳基，烯基和炔基。適用於線性非雙環經修飾糖部分之4'-取代基基團的實例包括，但不限於烷氧基(例如甲氧基)、烷基，和那些在Manoharan等人之WO 2015/106128中所述者。適用於非雙環經修飾的糖部分之5'-取代基基團的實例包括，但不限於：5'-甲基(R或S)、5'-乙烯基，和5'-甲氧基。在某些具體例中，非雙環經修飾的糖包含超過一個非橋接糖取代基，例如2'-F-5'-甲基糖部分，以及如Migawa等人之WO 2008/101157和Rajeev等人之US2013/0203836中所述的經修飾糖部分與經修飾核苷。
在某些具體例中，2'-經取代核苷或2'-非雙環經修飾核苷包含糖部分，其包含選自以下的線性2'-取代基基團：F、NH2 、N3 、OCF3 、OCH3 、O(CH2 )3 NH2 、CH2 CH=CH2 、OCH2 CH=CH2 、OCH2 CH2 OCH3 、O(CH2 )2 SCH3 、O(CH2 )2 ON(Rm )(Rn )，O(CH2 )2 O(CH2 )2 N(CH3 )2 和N-經取代乙醯胺(OCH2 C(=O)-N(Rm )(Rn ))，其中各個Rm 和Rn 獨立地為H，胺基保護基，或經取代或未經取代的C1 -C10 烷基。
在某些具體例中，2'-經取代核苷或2'-非雙環經修飾核苷包含糖部分，該糖部分包含選自以下的線性2'-取代基基團：F、OCF3 、OCH3 、OCH2 CH2 OCH3 、O(CH2 )2 SCH3 、O(CH2 )2 ON(CH3 )2 、O(CH2 )2 O(CH2 )2 N(CH3 )2 ，及OCH2 C(=O)-N(H)CH3 (「NMA」)。
在某些具體例中，2'-經取代核苷或2'-非雙環經修飾核苷包含糖部分，該糖部分包含選自以下的線性2'-取代基基團：F、OCH3 ，及OCH2 CH2 OCH3 。
包含經修飾糖部分(諸如非雙環經修飾糖部分)的核苷是指核苷的糖部分上的取代位置。例如，包含2'-經取代或2'-經修飾糖部分的核苷被稱為2'-經取代核苷或2'-經修飾核苷。
某些經修飾的糖部分包含橋接糖取代基，其形成產生雙環糖部分的第二環。在某些此等具體例中，雙環糖部分包含4'和2'呋喃糖環原子之間的橋。在某些此等具體例中，呋喃糖環是核糖環。此等4'至2'橋接糖取代基的實例包括，但不限於：4'-CH2 -2'、4'-(CH2 )2 -2'、4'-(CH2 )3 -2'、4'-CH2 -O-2' (「LNA」)、4'-CH2 -S-2'、4'-(CH2 )2 -O-2' (「ENA」)、4'-CH(CH3 )-O-2' (當在S 組態中時被稱為「受約束的乙基」或「cEt」)、4'-CH2 -O-CH2 -2'、4'-CH2 -N(R)-2'、4'-CH(CH2 OCH3 )-O-2' (「受約束的MOE」或「cMOE」)及其類似物(參見例如Seth et al., U.S. 7,399,845、Bhat et al., U.S. 7,569,686、Swayze et al., U.S. 7,741,457，與Swayze et al., U.S. 8,022,193)、4'-C(CH3 )(CH3 )-O-2'及其類似物(參見例如 Seth et al., U.S. 8,278,283)、4'-CH2 -N(OCH3 )-2'及其類似物(參見例如Prakash et al., U.S. 8,278,425)、4'-CH2 -O-N(CH3 )-2' (參見例如Allerson et al., U.S. 7,696,345與Allerson et al., U.S. 8,124,745)、4'-CH2 -C(H)(CH3 )-2' (參見例如Zhou,et al., J. Org. Chem., 2009,74 , 118-134)、4'-CH2 -C(=CH2 )-2'及其類似物(參見例如Seth et al., U.S. 8,278,426)、4'‑C(Ra Rb )-N(R)-O-2'、4'-C(Ra Rb )-O-N(R)-2'、4'-CH2 -O-N(R)-2'，以及4'-CH2 -N(R)-O-2'，其中各個R、Ra 及Rb 獨立地為H，保護基或C1 -C12 烷基(參見例如Imanishi et al., U.S. 7,427,672)。
在某些具體例中，此等4'至2'橋接獨立地包含1至4個獨立地選自以下的連接基團：-[C(Ra )(Rb )]n -、-[C(Ra )(Rb )]n -O-、‑C(Ra )=C(Rb )-、‑C(Ra )=N-、‑C(=NRa )-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(Ra )2 -，-S(=O)x -及‑N(Ra )-； 其中： x是0、1或2； n為1、2、3或4； 各個Ra 和Rb 獨立地為H、保護基、羥基、C1 -C12 烷基、經取代C1 -C12 烷基、C2 -C12 烯基、經取代C2 -C12 烯基、C2 -C12 炔基、經取代C2 -C12 炔基、C5 -C20 芳基、經取代C5 -C20 芳基、雜環基、經取代雜環基、雜芳基、經取代雜芳基、C5 -C7 脂環基、經取代C5 -C7 脂環基、鹵素、OJ1 、NJ1 J2 、SJ1 、N3 、COOJ1 、醯基(C(= O)-H)、經取代醯基、CN、磺醯基(S(=O)2 -J1 )，或硫羥基(S(=O)-J1 )；且各個J1 和J2 獨立地為H、C1 -C12 烷基、經取代C1 -C12 烷基、C2 -C12 烯基、經取代C2 -C12 烯基、C2 -C12 炔基、經取代C2 -C12 炔基、C5 -C20 芳基、經取代C5 -C20 芳基、醯基(C(=O)-H)、經取代醯基、雜環基、經取代雜環基、C1 -C12 胺基烷基，經取代的C1 -C12 胺基烷基 或保護基。
額外的雙環糖部分係為技藝中已知的，參見例如：Freieret al., Nucleic Acids Research , 1997,25 (22 ), 4429-4443、Albaeket al., J. Org. Chem ., 2006,71 , 7731-7740、Singh et al.,Chem. Commun. , 1998,4 , 455-456；Koshkin et al.,Tetrahedron , 1998,54 , 3607-3630；Wahlestedt et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , 2000,97 , 5633-5638；Kumar et al.,Bioorg. Med. Chem. Lett ., 1998,8 , 2219-2222；Singh et al.,J. Org. Chem ., 1998,63 , 10035-10039；Srivastava et al.,J. Am. Chem. Soc ., 2007,129, 8362-8379；Elayadiet al., Curr. Opinion Invens . Drugs, 2001,2 , 558-561；Braaschet al., Chem. Biol., 2001,8 , 1-7；Orumet al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001,3 , 239-243；Wengel et al.,U.S. 7,053,207、Imanishi et al., U.S. 6,268,490、Imanishi et al. U.S. 6,770,748、Imanishi et al., U.S. RE44,779；Wengel et al., U.S. 6,794,499、Wengel et al., U.S. 6,670,461；Wengel et al., U.S. 7,034,133、Wengel et al., U.S. 8,080,644；Wengel et al., U.S. 8,034,909；Wengel et al., U.S. 8,153,365；Wengel et al., U.S. 7,572,582；與Ramasamy et al., U.S. 6,525,191、Torsten et al., WO 2004/106356、Wengel et al., WO 1999/014226；Seth et al.,WO 2007/134181；Seth et al., U.S. 7,547,684；Seth et al., U.S. 7,666,854；Seth et al., U.S. 8,088,746；Seth et al., U.S. 7,750,131；Seth et al., U.S. 8,030,467；Seth et al., U.S. 8,268,980；Seth et al., U.S. 8,546,556；Seth et al., U.S. 8,530,640；Migawa et al., U.S. 9,012,421；Seth et al., U.S. 8,501,805；Allerson et al., US2008/0039618；以及Migawa et al., US2015/0191727。
在某些具體例中，雙環糖部分和併入此等雙環糖部分的核苷是透過異構組態來進一步定義。例如，(本文所述)LNA核苷可呈α-L組態或呈β-D組態。
Figure 02_image009
Figure 02_image011
LNA (β-D-組態)                    α-L -LNA (α-L -組態) 橋接 = 4'-CH2 -O-2'                橋接 = 4'-CH2 -O-2' α-L-亞甲氧基(4'-CH2 -O-2')或α-L-LNA雙環核苷已被併入顯示出反義活性的寡核苷酸中(Frieden et al.,Nucleic Acids Research, 2003,21 , 6365-6372)。在本文中，雙環核苷的一般性說明包括兩種異構組態。當在本文的例示性具體例中確認特定雙環核苷(例如LNA或cEt)的位置時，除非另有說明，否則它們呈β-D組態。
在某些具體例中，經修飾糖部分包含一或多個非橋接糖取代基及一或多個橋接糖取代基(例如5'-經取代及4'-2'橋接糖)。
在某些具體例中，經修飾糖部分是糖代用物。在某些此等具體例中，糖部分的氧原子被例如硫、碳或氮原子取代。在某些此等具體例中，此類經修飾糖部分還包含如本文所述的橋接及/或非橋接取代基。例如，某些糖代用物包含4'-硫原子以及在2'-位置(參見，例如Bhat et al., U.S. 7,875,733和Bhat et al., U.S. 7,939,677)及/或5'位置處的取代。
在某些具體例中，糖代用物包含具有不為5個原子的環。例如，在某些具體例中，糖代用物包含六員四氫吡喃(「THP」)。此等四氫吡喃可進一步被修飾或取代。包含此等經修飾四氫吡喃的核苷包括，但不限於己糖醇核酸(「HNA」)、安醇(anitol)核酸(「ANA」)、甘露醇核酸(「MNA」)(參見例如Leumann, CJ.Bioorg. & Med. Chem. 2002,10 , 841-854)、氟HNA：
Figure 02_image013
(「F-HNA」，參見例如Swayze et al., U.S. 8,088,904；Swayze et al., U.S. 8,440,803；與Swayze et al., U.S. 9,005,906) F-HNA也可以被稱為F-THP或3'-氟四氫吡喃，以及包含具有下式的經額外修飾THP化合物的核苷：
Figure 02_image015
其中，就該經修飾THP核苷的每一者獨立地來說： Bx是核鹼基部分； T3 及T4 各自獨立地為將經修飾THP核苷連接至寡核苷酸之其餘部分的核苷間連接基團，或T3 與T4 中的一者為將經修飾THP核苷連接至寡核苷酸之其餘部分的核苷間連接基團而T3 與T4 中的另一者為H、羥基保護基、連接接合物基團，或5'或3'-端基團；q1 、q2 、q3 、q4 、q5 ，q6 及q7 各自獨立地為H、C1 -C6 烷基、經取代C1 -C6 烷基、C2 -C6 烯基、經取代C2 -C6 烯基，C2 -C6 炔基或經取代C2 -C6 炔基；且R1 與R2 中的每一者獨立地選自：氫、鹵素、經取代或未經取代烷氧基、NJ1 J2 、SJ1 、N3 、OC(=X)J1 、OC(=X)NJ1 J2 ，NJ3 C(=X)NJ1 J2 以及CN，其中X為O，S或NJ1 ,，而各個J1 ，J2 與J3 獨立地為H或C1 -C6 烷基。
在某些具體例中，提供經修飾THP核苷，其中q1 、q2 、q3 、q4 、q5 ，q6 及q7 各自為H。在某些具體例中，q1 、q2 、q3 、q4 、q5 ，q6 及q7 中的至少一者不為氫。在某些具體例中，q1 、q2 、q3 、q4 、q5 ，q6 及q7 中的至少一者為甲基。在某些具體例中，提供經修飾THP核苷，其中R1 與R2 中之一者為F。在某些具體例中，R1 為F而R2 為H，在某些具體例中，R1 為甲氧基而R2 為H，以及在某些具體例中，R1 為甲氧基乙氧基而R2 為H。
在某些具體例中，糖代用物包含具有超過5個原子和超過一個雜原子的環。例如，已經報導過包含嗎啉基糖部分的核苷及其在寡核苷酸中的用途(參見例如 Braasch et al., Biochemistry, 2002,41 , 4503-4510與Summerton et al., U.S. 5,698,685；Summerton et al., U.S. 5,166,315；Summerton et al., U.S. 5,185,444；以及Summerton et al., U.S. 5,034,506)。如本文所用，術語「嗎啉基」表示具有以下結構的糖代用物：
Figure 02_image017
在某些具體例中，嗎啉可以經修飾，例如，透過添加或從上述嗎啉基結構改變各種取代基。此等糖代用物在本文中被稱為「經修飾嗎啉基」。
在某些具體例中，糖代用物包含無環部分。核苷及包含此等無環糖代用物的寡核苷酸之實例包括，但不限於：肽核酸(「PNA」)、無環丁基核酸(參見例如Kumar et al.,Org. Biomol. Chem. , 2013,11 , 5853-5865)，以及描述於Manoharan et al., US2013/130378中的核苷和寡核苷酸。
許多其他雙環和三環糖及糖代用物環系統是本技藝中熟知的，其可用於經修飾核苷中。2. 經修飾核鹼基
核鹼基(或鹼基)修飾或取代可在結構上與天然或合成的未經修飾核鹼基有所區別，但在功能上可互換。天然和經修飾核鹼基都能夠參與氫鍵結。此等核鹼基修飾可以對反義化合物賦予核酸酶穩定性，結合親和力或一些其他有益的生物學特性。
在某些具體例中，本文所述化合物包含經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含一或多個含有未經修飾核鹼基的核苷。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含一或多個含有經修飾核鹼基的核苷。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含一或多個不含有核鹼基的核苷(被稱為無鹼基核苷)。
在某些具體例中，經修飾核鹼基選自：5-經取代嘧啶、6-氮雜嘧啶、經烷基或炔基取代的嘧啶、經烷基取代的嘌呤，以及N-2、N-6和O-6經取代的嘌呤。在某些具體例中，經修飾核鹼基選自：2-胺基丙基腺嘌呤、5-羥甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、6-N-甲基鳥嘌呤、6-N-甲基腺嘌呤、2-丙基腺嘌呤、2-硫尿嘧啶、2-硫胸腺嘧啶和2-硫胞嘧啶、5-丙炔基(C≡C-CH3 )尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、6-偶氮胞嘧啶、6-偶氮胸腺嘧啶、5-核糖基尿嘧啶(偽尿嘧啶)、4-硫尿嘧啶、8-鹵代、8-胺基、8-巰基、8-硫代烷基、8-羥基、8-氮雜和其他8-經取代的嘌呤、5-鹵代(特別是5-溴、5-三氟甲基，5-鹵代尿嘧啶和5-鹵代胞嘧啶)、7-甲基鳥嘌呤、7-甲基腺嘌呤、2-F-腺嘌呤、2-胺基腺嘌呤、7-去氮鳥嘌呤、7-去氮腺嘌呤、3-去氮鳥嘌呤、3-去氮腺嘌呤、6-N-苯甲醯基腺嘌呤、2-N-異丁醯基鳥嘌呤、4-N-苯甲醯基胞嘧啶、4-N-苯甲醯基尿嘧啶、5-甲基4-N-苯甲醯基胞嘧啶、5-甲基4-N-苯甲醯基尿嘧啶、通用鹼基、疏水性鹼基、混雜鹼基、尺寸加大的鹼基和氟化鹼基。更多經修飾的核鹼基包括三環嘧啶，諸如1,3-二氮雜酚噁嗪-2-酮、1,3-二氮雜酚噻嗪-2-酮，以及9-(2-胺基乙氧基)-1,3-二氮雜酚噁嗪-2-酮(G-鉗)。經修飾核鹼基還可包括那些其中嘌呤或嘧啶鹼基經其它雜環取代者，例如，7-去氮腺嘌呤、7-去氮鳥苷、2-胺基吡啶和2-吡啶酮。更多的核鹼基包括那些揭示於Merigan et al., U.S. 3,687,808中者、那些揭示於以下者：The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering, Kroschwitz, J.I., Ed., John Wiley & Sons, 1990, 858-859；Englisch et al., Angewandte Chemie, International Edition, 1991, 30, 613；Sanghvi, Y.S., Chapter 15, Antisense Research and Applications, Crooke, S.T.以及Lebleu, B., Eds., CRC Press, 1993, 273-288；還有那些揭示於Chapters 6 and 15, Antisense Drug Technology, Crooke S.T., Ed., CRC Press, 2008, 163-166 and 442-443中者。
教示某些上述經修飾核鹼基以及其他經修飾核鹼基的製備的公開刊物包括但不限於Manoharan et al., US2003/0158403、Manoharan et al., US2003/0175906；Dinh et al., U.S. 4,845,205；Spielvogel et al., U.S. 5,130,302；Rogers et al., U.S. 5,134,066；Bischofberger et al., U.S. 5,175,273；Urdea et al., U.S. 5,367,066；Benner et al., U.S. 5,432,272；Matteucci et al., U.S. 5,434,257；Gmeiner et al., U.S. 5,457,187；Cook et al., U.S. 5,459,255；Froehler et al., U.S. 5,484,908；Matteucci et al., U.S. 5,502,177；Hawkins et al., U.S. 5,525,711；Haralambidis et al., U.S. 5,552,540；Cook et al., U.S. 5,587,469；Froehler et al., U.S. 5,594,121；Switzer et al., U.S. 5,596,091；Cook et al., U.S. 5,614,617；Froehler et al., U.S. 5,645,985；Cook et al., U.S. 5,681,941；Cook et al., U.S. 5,811,534；Cook et al., U.S. 5,750,692；Cook et al., U.S. 5,948,903；Cook et al., U.S. 5,587,470；Cook et al., U.S. 5,457,191；Matteucci et al., U.S. 5,763,588；Froehler et al., U.S. 5,830,653；Cook et al., U.S. 5,808,027；Cook et al., U.S. 6,166,199；以及Matteucci et al., U.S. 6,005,096。
在某些具體例中，靶向IRF5核酸的化合物包含一或多個經修飾核鹼基。在某些具體例中，經修飾核鹼基是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，各個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。經修飾核苷酸間鍵結
RNA和DNA的天然核苷間鍵結是3'至5'磷酸二酯鍵結。在某些具體例中，由於期望的性質(諸如細胞攝取提高，對目標核酸的親和力提高以及在核酸酶存在下的穩定性增加)，通常選擇具有一或多個經修飾(意即非天然)核苷間鍵結的本文所述化合物更勝於具有天然核苷間鍵結的化合物。
具有手性中心的代表性核苷間鍵結包括，但不限於烷基膦酸酯和硫代磷酸酯。包含具有手性中心之核苷間鍵結的經修飾寡核苷酸可被製備為包含隨機立構核苷間鍵結的經修飾寡核苷酸群，或包含呈特定立體化學組態之硫代磷酸酯鍵結的經修飾寡核苷酸群。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸群包含硫代磷酸酯核苷間鍵結，其中所有硫代磷酸酯核苷間鍵結是隨機立構的。可以使用合成方法產生此等經修飾寡核苷酸，導致每個硫代磷酸酯鍵結的立體化學組態的隨機選擇。然而，如那些本技藝中習於技藝者所熟知的，每個個別寡核苷酸分子的各個單獨硫代磷酸酯具有明確的立體組態。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸群富含包含呈特定的，獨立選擇立體化學組態的一或多個特定硫代磷酸酯核苷間鍵結的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，特定硫代磷酸酯鍵結的特定組態存在於群體中至少65%的分子中。在某些具體例中，特定硫代磷酸酯鍵結的特定組態存在於群體中至少70%的分子中。在某些具體例中，特定硫代磷酸酯鍵結的特定組態存在於群體中至少80%的分子中。在某些具體例中，特定硫代磷酸酯鍵結的特定組態存在於群體中至少90%的分子中。在某些具體例中，特定硫代磷酸酯鍵結的特定組態存在於群體中至少99%的分子中。此類富含手性的經修飾寡核苷酸群可以使用技藝中已知的合成方法來產生，例如Oka et al.,JACS 125, 8307 (2003)、Wan et al.Nuc. Acid. Res . 42, 13456 (2014)，以及WO 2017/015555中所述的方法。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸群富含具有至少一個呈(S p)組態之指示硫代磷酸酯的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸群富含具有至少一個呈(R p)組態之硫代磷酸酯的經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，包含(R p)及/或(S p)硫代磷酸酯的經修飾寡核苷酸分別含有下式中的一或多者，其中「B」表示核鹼基：
Figure 02_image019
除非另有指明，否則本文所述的經修飾寡核苷酸的手性核苷間鍵結可以是隨機立構的或呈特定立體化學組態。
在某些具體例中，靶向IRF5核酸的化合物包含一或多個經修飾核苷間鍵結。在某些具體例中，經修飾核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結。在某些具體例中，反義化合物的每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯核苷間鍵結。
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸。具有經修飾核苷間鍵結的寡核苷酸包括保留磷原子的核苷間鍵結以及不具有磷原子的核苷間鍵結。代表性含磷核苷間鍵結包括，但不限於磷酸二酯、磷酸三酯、甲基膦酸酯，胺基磷酸酯和硫代磷酸酯。含磷和非含磷鍵結的製備方法是眾所周知的。
在某些具體例中，經修飾寡核苷酸的核苷可使用任何核苷間鍵結而連接在一起。核苷間連接基團的兩個主要類別是透過存在或不存在磷原子來界定。代表性含磷核苷間鍵結包括，但不限於磷酸酯，其含有磷酸二酯鍵(「P=O」)(也被稱為未經修飾或天然鍵結)、磷酸三酯、甲基膦酸酯、胺基磷酸酯，以及硫代磷酸酯(「P=S」)和二硫代磷酸酯(「HS-P=S」)。代表性非含磷核苷間連接基團包括，但不限於亞甲基甲基亞胺基(-CH2 -N(CH3 )-O-CH2 )、硫二酯、硫代胺基甲酸酯(-OC(=O)(NH)-S-)；矽氧烷(-O-SiH2 -O-)；N,N’-二甲基肼(-CH2 -N(CH3 )-N(CH3 )-)。與天然磷酸酯鍵結相比，經修飾核苷間鍵結可用於改變(通常增加)寡核苷酸的核酸酶抗性。在某些具體例中，可以將具有手性原子的核苷間鍵結製備為外消旋混合物或製備為分離的對映異構體。代表性手性核苷間鍵結包括，但不限於烷基膦酸酯和硫代磷酸酯。含磷和非含磷核苷間鍵結的製備方法對於習於技藝者來說是熟知的。
中性核苷間鍵結包括但不限於磷酸三酯、甲基膦酸酯、MMI (3'-CH2 -N(CH3 )-O-5')、醯胺-3 (3'-CH2 -C(=O)-N(H)-5')、醯胺-4 (3'-CH2 -N(H)-C(=O)-5')，甲縮醛(3'-O-CH2 -O-5')、甲氧基丙基，和硫代甲縮醛(3'-S-CH2 -O-5')。更多的中性核苷間鍵結包括非離子鍵結，其包含矽氧烷(二烷基矽氧烷)、羧酸酯、甲醯胺、硫化物，磺酸酯和醯胺(參見例如：Carbohydrate Modifications in Antisense Research; Y.S. Sanghvi and P.D. Cook, Eds., ACS Symposium Series 580; Chapters 3 and 4, 40-65)。更多的中性核苷間鍵結包括含有混合N、O，S和CH2 組成部分的非離子鍵結。
在某些具體例中，寡核苷酸包含經修飾核苷間鍵結，該經修飾核苷間鍵結以限定模式或經修飾核苷間鍵結模體沿著寡核苷酸或其區域排列。在某些具體例中，核苷間鍵結以間隔模體排列。在這樣的具體例中，兩個側翼區域的每一者中的核苷間鍵結不同於間隔區域中的核苷間鍵結。在某些具體例中，側翼中的核苷間鍵結是磷酸二酯，而間隔中的核苷間鍵結是硫代磷酸酯。核苷模體是獨立選定的，所以具有間隔核苷間鍵結模體的這些寡核苷酸可能具有或可能不具有間隔核苷模體，且如果它具有間隔的核苷模體，則側翼和間隔長度可能相同或可能不相同。
在某些具體例中，寡核苷酸包含具有交替之核苷間鍵結模體的區域。在某些具體例中，寡核苷酸包含經一致修飾核苷間鍵結的區域。在某些此等具體例中，寡核苷酸包含透過硫代磷酸酯核苷間鍵結一致連接的區域。在某些具體例中，寡核苷酸透過硫代磷酸酯一致地連接。在某些具體例中，寡核苷酸的每一個核苷間鍵結選自磷酸二酯和硫代磷酸酯。在某些具體例中，寡核苷酸的每個核苷間鍵結選自磷酸二酯和硫代磷酸酯，且至少一個核苷間鍵結為硫代磷酸酯。
在某些具體例中，寡核苷酸包含至少6個硫代磷酸酯核苷間鍵結。在某些具體例中，寡核苷酸包含至少8個硫代磷酸酯核苷間鍵結。在某些具體例中，寡核苷酸包含至少10個硫代磷酸酯核苷間鍵結。在某些具體例中，寡核苷酸包含至少6個連續硫代磷酸酯核苷間鍵結的至少一個嵌段。在某些具體例中，寡核苷酸包含至少8個連續硫代磷酸酯核苷間鍵結的至少一個嵌段。在某些具體例中，寡核苷酸包含至少10個連續硫代磷酸酯核苷間鍵結的至少一個嵌段。在某些具體例中，寡核苷酸包含至少一個12個連續硫代磷酸酯核苷間鍵結的至少一個嵌段。在某些此類具體例中，至少一個此嵌段位於寡核苷酸的3’端。在某些此等具體例中，至少一個此嵌段位於寡核苷酸3'端的3個核苷內。
在某些具體例中，寡核苷酸包含一或多個甲基膦酸酯鍵結。在某些具體例中，具有間隔體核苷模體的寡核苷酸包含一個鍵結模體，其除了一或兩個甲基膦酸酯鍵結外包含所有硫代磷酸酯鍵結。在某些具體例中，一個甲基膦酸酯鍵結是在具有間隔體核苷模體的寡核苷酸的中央間隔內。
在某些具體例中，希望配置硫代磷酸酯核苷間鍵結和磷酸二酯核苷間鍵結的數目以維持核酸酶抗性。在某些具體例中，希望配置硫代磷酸酯核苷間鍵結的數目與位置以及磷酸二酯核苷間鍵結的數目與位置以維持核酸酶抗性。在某些具體例中，可以減少硫代磷酸酯核苷間鍵結的數目，且可以增加磷酸二酯核苷間鍵結的數目。在某些具體例中，可以減少硫代磷酸酯核苷間鍵結的數目，且可以增加磷酸二酯核苷間鍵結的數目，同時仍維持核酸酶抗性。在某些具體例中，希望在保有核酸酶抗性的同時減少硫代磷酸酯核苷間鍵結的數目。在某些具體例中，希望在保有核酸酶抗性的同時增加磷酸二酯核苷間鍵結的數目。3. 某些模體
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸。寡核苷酸可具有一個模體，例如未經修飾及/或經修飾糖部分，核鹼基及/或核苷間鍵結的模式。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含一或多個含有經修飾糖的經修飾核苷。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含一或多個含有經修飾核鹼基的經修飾核苷。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含一或多個經修飾核苷間鍵結。在此等具體例中，經修飾寡核苷酸的經修飾、未經修飾及經差異修飾的糖部分，核鹼基及/或核苷間鍵結界定出模式或模體。在某些具體例中，糖部分，核鹼基和核苷間鍵結的模式彼此獨立。因此，經修飾寡核苷酸可以透過其糖模體，核鹼基模體及/或核苷間鍵結模體來說明(如本文所用，核鹼基模體說明了對核鹼基的修飾，而與核鹼基序列無關)。a. 某些糖模體
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸。在某些具體例中，寡核苷酸包含一或多種類型的經修飾糖及/或未經修飾糖部分，其以限定的模式或糖模體沿著寡核苷酸或其區域排列。在某些情況下，此等糖模體包括但不限於本文所論及之糖修飾中的任一者。
在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含具有間隔體模體之區域或由其組成，該間隔體模體包含兩個外部區域或「側翼」，以及一個中央或內部區域或「間隔」。間隔體模體的三個區域(5'側翼，間隔和3'側翼)形成連續核苷序列，其中每個側翼的核苷的至少一些糖部分不同於間隔之核苷的至少一些糖部分。具體而言，至少每個側翼的核苷中最接近間隔的糖部分(5'側翼的最3'的核苷和3'側翼的最5'的核苷)不同於相鄰間隔核苷的糖部分，因而定義出側翼和間隔之間的邊界(即側翼/間隔交接處)。在某些具體例中，間隔內的糖部分彼此相同。在某些具體例中，間隔包括具有與間隔的一或多個其他核苷之糖部分不同的糖部分的一或多個核苷。在某些具體例中，兩個側翼的糖模體彼此相同(對稱間隔體)。在某些具體例中，5'-側翼的糖模體不同於3'-側翼的糖模體(不對稱間隔體)。
在某些具體例中，間隔體的側翼包含1至5個核苷。在某些具體例中，間隔體的側翼包含2至5個核苷。在某些具體例中，間隔體的側翼包含3至5個核苷。在某些具體例中，間隔體的核苷都是經修飾的核苷。
在某些具體例中，間隔體的間隔包含7至12個核苷。在某些具體例中，間隔體的間隔包含7至10個核苷。在某些具體例中，間隔體的間隔包含8至10個核苷。在某些具體例中，間隔體的間隔包含10個核苷。在某些具體例中，間隔體之間隔的每個核苷是未經修飾的2'-去氧核苷。
在某些具體例中，該間隔體是去氧間隔體。在此等具體例中，每個側翼/間隔交接處之間隔側上的核苷是未經修飾的2'-去氧核苷，並且每個側翼/間隔交接處的側翼側上的核苷是經修飾的核苷。在某些此等具體例中，間隔的每個核苷是未經修飾的2'-去氧核苷。在某些此等具體例中，每個側翼的每個核苷是經修飾的核苷。
在某些具體例中，經修飾寡核苷酸具有經完全修飾的糖模體，其中該經修飾寡核苷酸的每個核苷包含經修飾糖部分。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含具有經完全修飾的糖模體的區域或由其組成，其中該區域的每個核苷包含經修飾糖部分。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含具有經完全修飾的糖模體的區域或由其組成，其中經完全修飾區域內的每個核苷包含相同的經修飾糖部分，在本文中稱為經一致修飾的糖模體。在某些具體例中，經完全修飾的寡核苷酸是經一致修飾的寡核苷酸。在某些具體例中，經一致修飾的每個核苷包含相同的2'-修飾。b. 某些核鹼基模體
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸。在某些具體例中，寡核苷酸包含以限定的模式或模體沿著寡核苷酸或其區域排列的經修飾及/或未經修飾核鹼基。在某些具體例中，每個核鹼基經修飾。在某些具體例中，沒有一個核鹼基經修飾。在某些具體例中，每個嘌呤或每個嘧啶經修飾。在某些具體例中，每個腺嘌呤經修飾。在某些具體例中，每個鳥嘌呤經修飾。在某些具體例中，每個胸腺嘧啶經修飾。在某些具體例中，每個尿嘧啶經修飾。在某些具體例中，每個胞嘧啶經修飾。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸中的一些或全部胞嘧啶核鹼基是5-甲基胞嘧啶。
在某些具體例中，經修飾寡核苷酸包含經修飾核鹼基的嵌段。在某些此等具體例中，該嵌段在寡核苷酸的3'端處。在某些具體例中，該嵌段在寡核苷酸的3’端的3個核苷內。在某些具體例中，該嵌段在寡核苷酸的5'端處。在某些具體例中，該嵌段在寡核苷酸的5’端的3個核苷內。
在某些具體例中，具有間隔體模體的寡核苷酸包含含有經修飾核鹼基的核苷。在某些此等具體例中，包含經修飾核鹼基的一個核苷在具有間隔體模體的寡核苷酸的中央間隔內。在某些此等具體例中，該核苷的糖部分是2'-去氧核糖基部分。在某些具體例中，經修飾核鹼基選自：2-硫嘧啶和5-丙炔基嘧啶。c. 某些核苷間鍵結模體
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸。在某些具體例中，寡核苷酸包含以限定的模式或模體沿著寡核苷酸或其區域排列的經修飾及/或未經修飾核苷間鍵結。在某些具體例中，基本上每個核苷間連接基團是磷酸酯核苷間鍵結(P＝O)。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸的每個核苷間連接基團是硫代磷酸酯(P＝S)。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸的每個核苷間連接基團獨立地選自硫代磷酸酯和磷酸酯核苷間鍵結。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸的糖模體是間隔體，且該間隔內的核苷間鍵結均經修飾。在某些此等具體例中，側翼中的一些或全部核苷間鍵結是未經修飾的磷酸酯鍵結。在某些具體例中，末端核苷間鍵結經修飾。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸的糖模體是間隔體，且核苷間鍵結模體在至少一個側翼中包含至少一個磷酸二酯核苷間鍵結，其中該至少一個磷酸二酯鍵結不是末端核苷間鍵結，且其餘核苷間鍵結是硫代磷酸酯核苷間鍵結。在某些此等具體例中，所有硫代磷酸酯鍵結是隨機立構的。在某些具體例中，側翼中的所有硫代磷酸酯鍵結為(S p)硫代磷酸酯，且該間隔包含至少一個S p、S p、R p模體。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸群富含包含此等核苷間鍵結模體的經修飾寡核苷酸。4. 某些經修飾寡核苷酸
在某些具體例中，本文所述化合物包含經修飾寡核苷酸。在某些具體例中，將上述修飾(糖、核鹼基、核苷間鍵結)併入經修飾的寡核苷酸中。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸的特徵在於其修飾，模體和總長度。在某些具體例中，此等參數各自彼此獨立。因此，除非另有指明，否則具有間隔體糖模體的寡核苷酸的每個核苷間鍵結均可經修飾或未經修飾，且可遵循或可不遵循糖修飾的間隔體修飾模式。例如，糖間隔體之側翼區域內的核苷間鍵結可能彼此相同或不同，且可能與糖模體之間隔區域的核苷間鍵結相同或不同。同樣地，這樣的間隔體寡核苷酸可包含一或多個無關糖修飾之間隔體模式的經修飾核鹼基。此外，在某些情況下，寡核苷酸是藉由總長度或範圍以及兩個或更多個區域(例如，具有指明糖修飾的核苷區域)的總長度或範圍以及長度或長度範圍來描述。在這種情況下，每個範圍可能選定數目，從而使得寡核苷酸的總長度在指定範圍之外。在此等情況下，兩個要素都必須滿足。例如，在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由15至20個連接核苷組成，且具有由三個區域A、B和C組成的糖模體，其中區域A由具有指定糖模體的2至6個連接核苷組成，區域B由具有指定糖模體的6至10個連接核苷組成，而區域C由具有指定糖模體的2至6個連接核苷組成。此等具體例不包括其中A和C各自由6個連接核苷組成且B由10個連接核苷組成的經修飾寡核苷酸(即使在A、B和C的必要條件內容許那些核苷數目)，因為此等寡核苷酸的總長度將會是22，其超過經修飾的寡核苷酸總長度的上限(20)。在本文中，若未就一或多個參數來說明寡核苷酸，則此等參數不受限制。因此，僅描述為具有間隔體糖模體而沒有進一步描述的經修飾寡核苷酸可以具有任何長度，核苷間鍵結模體及核鹼基模體。除非另有指明，否則所有修飾均與核鹼基序列無關。某些接合化合物
在某些具體例中，本文所述化合物包含寡核苷酸(經修飾或未經修飾)及視情況一或多個接合物基團及/或末端基團，或由其組成。接合物基團由一或多個接合物部分以及將接合物部分連接至寡核苷酸的接合物連接子組成。接合物基團可以附接至寡核苷酸的一個末端或兩個末端及/或在任何內部位置處。在某些具體例中，接合物基團附接至經修飾寡核苷酸的核苷的2'-位置。在某些具體例中，附接至寡核苷酸的一個或兩個末端的接合物基團為末端基團。在某些此等具體例中，接合物基團或末端基團附接在寡核苷酸的3'及/或5'端處。在某些此等具體例中，接合物基團(或末端基團)附接在寡核苷酸的3’端處。在某些具體例中，接合物基團附接在寡核苷酸的3’端附近處。在某些具體例中，接合物基團(或末端基團)附接在寡核苷酸的5’端處。在某些具體例中，接合物基團附接在寡核苷酸的5'端附近處。
在某些具體例中，寡核苷酸經修飾。在某些具體例中，化合物的該寡核苷酸具有與目標核酸互補的核鹼基序列。在某些具體例中，寡核苷酸與信使RNA (mRNA)互補。在某些具體例中，寡核苷酸與mRNA前體互補。在某些具體例中，寡核苷酸與有義轉錄本互補。
末端基團的實例包括但不限於接合物基團、加蓋基團、磷酸酯部分、保護基、經修飾或未經修飾的核苷，以及兩個或更多個獨立地經修飾或未經修飾的核苷。組成物以及用於調配醫藥組成物的方法
本文所述化合物可以與醫藥上可接受的活性或惰性物質混合以供製備醫藥組成物或配方。組成物以及用於調配醫藥組成物的方法取決於許多標準，包括但不限於投藥途徑，疾病程度或要投藥的劑量。
某些具體例提供了包含一或多種化合物或其鹽的醫藥組成物。在某些具體例中，化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸或由其組成。在某些此等具體例中，醫藥組成物包含適宜的醫藥上可接受之稀釋劑或載體。在某些具體例中，醫藥組成物包含無菌食鹽水溶液及一或多種化合物。在某些具體例中，此醫藥組成物由無菌食鹽水溶液及一或多種化合物組成。在某些具體例中，無菌食鹽水是醫藥級食鹽水。在某些具體例中，醫藥組成物包含一或多種化合物和無菌水。在某些具體例中，醫藥組成物由一種化合物和無菌水組成。在某些具體例中，無菌水是醫藥級水。在某些具體例中，醫藥組成物包含一或多種化合物及磷酸鹽緩衝食鹽水(PBS)。在某些具體例中，醫藥組成物由一或多種化合物和無菌PBS組成。在某些具體例中，無菌PBS是醫藥級PBS。組成物及用於調配醫藥組成物的方法取決於許多標準，包括但不限於投藥途徑，疾病程度或要投藥的劑量。
本文所述靶向IRF5核酸的化合物可以透過將化合物與合適的醫藥上可接受之稀釋劑或載體組合而使用在醫藥組成物中。在某些具體例中，醫藥上可接受之稀釋劑是水，諸如適合注射的無菌水。因此，在一個具體例中，在本文所述方法中採用的是醫藥組成物，其包含一個靶向IRF5核酸的化合物及醫藥上可接受之稀釋劑。在某些具體例中，醫藥上可接受之稀釋劑是水。在某些具體例中，化合物包含本文提供的經修飾寡核苷酸或由其組成。
包含本文提供之化合物的醫藥組成物涵蓋任何醫藥上可接受之鹽、酯或此等酯的鹽，或任何其他寡核苷酸，其在投與給動物(包括人類)後，能夠(直接地或間接地)提供生物活性代謝物或其殘餘物。在某些具體例中，化合物是反義化合物或寡聚化合物。在某些具體例中，化合物包含經修飾寡核苷酸或由其組成。因此，例如，本揭示內容還涉及化合物之醫藥上可接受的鹽、前藥、此等前藥之醫藥上可接受的鹽以及其他生物等效物。合適之醫藥上可接受的鹽包括但不限於鈉鹽和鉀鹽。
前藥可包括在化合物的一個或兩個末端處併入額外的核苷，其在體內受到內源性核酸酶裂解而形成活性化合物。
在某些具體例中，化合物或組成物還包含醫藥上可接受之載體或稀釋劑。某些選定化合物
就對人類IRF5 mRNA的效力，在活體外於數種細胞類型中測試了大約1,320種具有不同長度、化學性質和模體的新設計化合物(實例1和2)。在1320個在活體外以單一劑量測試效力的化合物當中，超過110個選定化合物在THP-1細胞中還有在KARPAS-229細胞中經測試有劑量依賴性抑制(實例3)。
接著，在臨床前囓齒動物模型中測試這些寡核苷酸的耐受性(實例4和5)。測量體量和器官重量、肝臟功能指標(諸如丙胺酸轉胺酶、天冬胺酸轉胺酶和膽紅素)、血液學指標(諸如血紅素和血容比水平，以及個別血球計數)，和腎臟功能指標(諸如BUN與肌酐)。在經過劑量反應分析所測試的超過110個化合物中，於CD-1小鼠模型中進一步篩選53個化合物的耐受性。在史-道二氏(Sprague-Dawley)大鼠模型中進一步篩選19個寡核苷酸。
然後選出12個化合物並在小鼠異種移植模型中進行測試，在小鼠異種移植模型中小鼠被接種人類非霍奇金氏大細胞淋巴瘤(KARPAS-229)細胞並以化合物處理(實例6)。接著測試化合物的功效和耐受性。繼而選出八個化合物在IRF5轉基因小鼠模型中以兩種不同的劑量來測試功效(實例7)。
測試ION 729018、728958、785525、785674、785675、786503，786524和786548在食蟹獼猴中的耐受性(實例8)。在猴子體內，用化合物處理的耐受性良好，尤其是用ION 729018處理。使用這些化合物進行更多分析，包括測量黏度，評估促發炎作用及劑量依賴性抑制確認分析。
也設計了帶有不同化學修飾的經修飾寡核苷酸，其與三個化合物ION 729018，786503及785675的目標區域重疊(實例13)。在多劑量分析中測試這些新設計的化合物以及三個親本寡核苷酸。許多新設計的化合物在抑制IRF5方面顯示出強大的功效。
因此，本文提供了具有改善性質中之一或多者的化合物。在某些具體例中，如本文所述化合物是有效的且可耐受的。實例
以下實例說明篩選過程以鑑定出靶向IRF5的前導化合物。ION 728958、729018、785525、785674、785675、786503，786524和786548產生高效力和耐受性。例如，ION 729018表現出很高的效力和耐受性。非限制性揭示以及藉由引用併入
儘管隨著本次申請所附的序列表將每個序列根據需要標識為「RNA」或「DNA」，但是那些序列可以利用化學修飾的任一種組合予以修飾。習於技藝者將容易理解，在某些情況下，如「RNA」或「DNA」用於描述經修飾寡核苷酸的名稱是隨意的。例如，包含含有2'-OH糖部分與胸腺嘧啶鹼基之核苷的寡核苷酸可被描述為具有經修飾糖的DNA (相對於DNA的天然2'-H為2'-OH)，或被描述為具有經修飾鹼基(相對於RNA的天然尿嘧啶為胸腺嘧啶(甲基化尿嘧啶))的RNA。
因此，本文提供的核酸序列(包括但不限於序列表中的那些)意欲含括含有天然或經修飾RNA及/或DNA的任何組合的核酸，包括但不限於具有經修飾核鹼基的核酸。作為進一步的實例且不具限制性，具有核鹼基序列「ATCGATCG」的寡核苷酸含括具有此核鹼基序列的任何寡核苷酸，無論是經修飾的還是未經修飾的，包括但不限於包含RNA鹼基的此等化合物，例如那些具有序列「AUCGAUCG」者以及那些具有一些DNA鹼基和一些RNA鹼基(諸如「AUCGATCG」)者，以及具有其他經修飾核鹼基(諸如「ATm CGAUCG」)的化合物，其中m C表示在5-位處包含甲基的胞嘧啶鹼基。
本文所述的某些化合物(例如經修飾寡核苷酸)具有一或多個不對稱中心，且因而產生對映異構體，非對映異構體以及可以根據絕對立體化學界定為(R)或(S)，或α或β (諸如糖變旋異構體)，或(D)或(L)(諸如胺基酸)等的立體異構組態。本文提供繪製或描述為具有某些立體異構組態的化合物僅包括所示化合物。以未界定立體化學繪製或描述之本文提供的化合物包括所有此等可能的異構體，包括其隨機立構和光學純形式。同樣，除非另外指明，否則包括本文提供之化合物的所有互變異構形式。除非另有指明，否則本文所述的寡聚化合物和經修飾寡核苷酸意欲包括對應的鹽形式。
本文所述化合物包括其中一或多個原子被指示元素的非放射性同位素或放射性同位素取代的變化形式。例如，本文包含氫原子的化合物含括了每個1 H氫原子的所有可能氘取代。本文化合物所含括的同位素取代包括但不限於：2 H或3 H取代1 H、13 C或14 C取代12 C、15 N取代14 N、17 O或18 O取代16 O，以及33 S、34 S、35 S或36 S取代32 S。
儘管已經根據某些具體例明確說明了本文所述的某些化合物，組成物和方法，但以下實例僅用於說明本文所述的化合物，而無意限制它們。本申請案中引用的每個參考文獻均以全文引用的方式併入本文。實例 1 ： cEt 間隔體在 THP-1 細胞中的人類 IRF5 反義抑制
將經修飾寡核苷酸設計成靶向IRF5核酸，並在活體外測試其對IRF5 RNA水平的影響。在具有相似培養條件的一系列實驗中測試經修飾寡核苷酸。每個實驗的結果顯示在下文所示的個別表格中。
下表中新設計的經修飾寡核苷酸被設計為3-10-3 cEt間隔體。間隔體長度為16個核苷，其中中央間隔片段包含十個2'-去氧核苷，並且在5'方向和3'方向上側接各包含三個核苷的側翼片段。5'側翼片段中的每個核苷和3'側翼片段中的每個核苷具有cEt糖修飾。每個間隔體中的核苷間鍵結是硫代磷酸酯(P=S)鍵結。每個間隔體中的全部胞嘧啶殘基是5-甲基胞嘧啶。
「起始位點」指明在人類基因序列中間隔體所靶向的5’-末端核苷。「終止位點」指明在人類基因序列中間隔體所靶向的3’-末端核苷。在下表中列出的大多數經修飾寡核苷酸是靶向人類IRF5 mRNA (在本文被定名為SEQ ID NO ：1 (GENBANK登錄號NM_001098627.3))，或靶向人類IRF5基因組序列(在本文被定名為SEQ ID NO ：2 (GENBANK登錄號NT_007933.14，從核苷酸53761170至53774065截切)。另外，少量的經修飾寡核苷酸靶向在本文被定名為SEQ ID No ：3 (GENBANK登錄號NM_001098629.1)的IRF5 mRNA。「N/A」表示經修飾寡核苷酸不以100%互補性靶向那個基因序列。
利用電穿孔將2,000 nM經修飾寡核苷酸來轉染密度為每孔30,000個細胞的經培養THP-1細胞。在大約24小時的處理期後，從細胞分離出RNA，並藉由定量型即時RTPCR測量​​IRF5 RNA的量。使用人類引子探針組HTS4167 (正向序列GCCAAGGAGACAGGGAAATACA，在本文被定名為SEQ ID NO ：11；反向序列GCAGGTTGGCCTTCCACTT，在本文被定名為SEQ ID NO ：12；探針序列CGAAGGCGTGGATGAAGCCGATC，在本文被定名為SEQ ID NO：13)來測量RNA的量。根據RNA總含量(如藉由RIBOGREEN®測量)來調整IRF5 RNA的量。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現。如本文所用，值「0」指示用經修飾寡核苷酸處理不會抑制IRF5 mRNA水平。「N.D.」指示經修飾寡核苷酸在那個實驗中未確定抑制%。可以在不同實驗中確定那個經修飾寡核苷酸的活性。 表1 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665773 N/A N/A 4534 4549 GGTTCATGGCAGAGGG 46 37
665775 N/A N/A 4545 4560 TGGGATGGACTGGTTC 35 38
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 70 39
728374 N/A N/A 402 417 CCGCCAACCTGCCGGG 3 40
728375 N/A N/A 404 419 GTCCGCCAACCTGCCG 0 41
728376 N/A N/A 408 423 GCCGGTCCGCCAACCT 12 42
728377 N/A N/A 410 425 CCGCCGGTCCGCCAAC 0 43
728378 N/A N/A 412 427 TCCCGCCGGTCCGCCA 7 44
728379 N/A N/A 414 429 CCTCCCGCCGGTCCGC 7 45
728380 N/A N/A 416 431 CGCCTCCCGCCGGTCC 18 46
728381 N/A N/A 418 433 TGCGCCTCCCGCCGGT 9 47
728382 N/A N/A 430 445 CTCTGCCCAGGCTGCG 17 48
728383 N/A N/A 440 455 CCAAGCTGAGCTCTGC 29 49
728384 N/A N/A 442 457 GACCAAGCTGAGCTCT 22 50
728385 N/A N/A 445 460 CGGGACCAAGCTGAGC 17 51
728386 N/A N/A 447 462 GGCGGGACCAAGCTGA 0 52
728387 N/A N/A 450 465 GGCGGCGGGACCAAGC 6 53
728388 N/A N/A 459 474 CACCGGCCGGGCGGCG 0 54
728389 N/A N/A 461 476 AGCACCGGCCGGGCGG 0 55
728390 N/A N/A 463 478 GGAGCACCGGCCGGGC 9 56
728391 N/A N/A 466 481 CAGGGAGCACCGGCCG 15 57
728392 N/A N/A 468 483 GCCAGGGAGCACCGGC 0 58
728393 N/A N/A 470 485 GCGCCAGGGAGCACCG 4 59
728394 N/A N/A 472 487 CTGCGCCAGGGAGCAC 4 60
728395 N/A N/A 474 489 GGCTGCGCCAGGGAGC N.D. 61
728396 N/A N/A 476 491 GTGGCTGCGCCAGGGA 8 62
728397 N/A N/A 492 507 TCTGCGGTGCGCCTGC 25 63
728398 N/A N/A 494 509 TGTCTGCGGTGCGCCT 31 64
728401 210 225 4535 4550 TGGTTCATGGCAGAGG 50 65
728402 211 226 4536 4551 CTGGTTCATGGCAGAG 44 66
728403 213 228 4538 4553 GACTGGTTCATGGCAG 25 67
728404 214 229 4539 4554 GGACTGGTTCATGGCA 32 68
728405 216 231 4541 4556 ATGGACTGGTTCATGG 49 69
728406 217 232 4542 4557 GATGGACTGGTTCATG 42 70
728407 218 233 4543 4558 GGATGGACTGGTTCAT 47 71
728408 219 234 4544 4559 GGGATGGACTGGTTCA 53 72
728409 223 238 4548 4563 CACTGGGATGGACTGG 40 73
728410 225 240 4550 4565 GCCACTGGGATGGACT 16 74
728411 227 242 4552 4567 GAGCCACTGGGATGGA 40 75
728412 253 268 4578 4593 CAGCCGCACGCGGCGG 6 76
728413 255 270 4580 4595 TTCAGCCGCACGCGGC 44 77
728414 257 272 4582 4597 GCTTCAGCCGCACGCG 27 78
728415 259 274 4584 4599 GGGCTTCAGCCGCACG 8 79
728416 284 299 4609 4624 AGCTGTTCACCTGGGC 5 80
728417 286 301 4611 4626 GCAGCTGTTCACCTGG 3 81
728418 288 303 4613 4628 TGGCAGCTGTTCACCT 0 82
728419 290 305 4615 4630 ACTGGCAGCTGTTCAC 5 83
728420 292 307 4617 4632 GTACTGGCAGCTGTTC 0 84
728421 294 309 4619 4634 GGGTACTGGCAGCTGT 9 85
728422 296 311 4621 4636 CTGGGTACTGGCAGCT 0 86
728423 298 313 4623 4638 CCCTGGGTACTGGCAG 24 87
728424 300 315 4625 4640 AGCCCTGGGTACTGGC 0 88
728425 302 317 4627 4642 GAAGCCCTGGGTACTG 0 89
728426 304 319 4629 4644 TTGAAGCCCTGGGTAC 11 90
728427 306 321 4631 4646 CATTGAAGCCCTGGGT 13 91
728428 308 323 4633 4648 CCCATTGAAGCCCTGG 15 92
728429 310 325 4635 4650 GACCCATTGAAGCCCT 14 93
728430 312 327 4637 4652 TTGACCCATTGAAGCC 11 94
728431 314 329 4639 4654 CGTTGACCCATTGAAG 0 95
728432 316 331 4641 4656 CCCGTTGACCCATTGA 25 96
728433 318 333 4643 4658 TCCCCGTTGACCCATT 6 97
728434 320 335 4645 4660 TTTCCCCGTTGACCCA 20 98
728435 322 337 4647 4662 CTTTTCCCCGTTGACC 12 99
728436 324 339 4649 4664 TTCTTTTCCCCGTTGA 13 100
728437 326 341 4651 4666 ATTTCTTTTCCCCGTT 7 101
728438 328 343 4653 4668 TAATTTCTTTTCCCCG 19 102
728439 356 371 4681 4696 TTGTGGCATGCCTCCA 25 103
728440 358 373 4683 4698 CCTTGTGGCATGCCTC 31 104
728441 360 375 4685 4700 TGCCTTGTGGCATGCC 7 105
728442 362 377 4687 4702 CATGCCTTGTGGCATG 5 106
728443 364 379 4689 4704 ACCATGCCTTGTGGCA 5 107
728444 366 381 4691 4706 GGACCATGCCTTGTGG 6 108
728445 368 383 4693 4708 TGGGACCATGCCTTGT 10 109
728446 371 386 4696 4711 GGCTGGGACCATGCCT 0 110
728447 377 392 4702 4717 CGTCCTGGCTGGGACC 2 111
728448 380 395 4705 4720 CTCCGTCCTGGCTGGG 18 112
表2 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665795 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG 58 113
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 75 39
728449 381 396 4706 4721 TCTCCGTCCTGGCTGG 2 114
728450 382 397 4707 4722 ATCTCCGTCCTGGCTG 3 115
728451 383 398 4708 4723 TATCTCCGTCCTGGCT 0 116
728452 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC 11 117
728453 386 401 4711 4726 TGTTATCTCCGTCCTG 14 118
728454 387 402 4712 4727 GTGTTATCTCCGTCCT 27 119
728455 388 403 4713 4728 GGTGTTATCTCCGTCC 18 120
728456 389 404 4714 4729 TGGTGTTATCTCCGTC 31 121
728457 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT 17 122
728458 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC 50 123
728459 394 409 4719 4734 GAAGATGGTGTTATCT 14 124
728460 396 411 4721 4736 TTGAAGATGGTGTTAT 15 125
728461 398 413 4723 4738 CCTTGAAGATGGTGTT 29 126
728462 400 415 N/A N/A GGCCTTGAAGATGGTG 4 127
728492 490 505 8383 8398 CTTGTTAAGGGCACAG 26 128
728493 491 506 8384 8399 TCTTGTTAAGGGCACA 30 129
728494 492 507 8385 8400 CTCTTGTTAAGGGCAC 45 130
728495 494 509 8387 8402 GGCTCTTGTTAAGGGC 17 131
728496 496 511 8389 8404 CCGGCTCTTGTTAAGG 5 132
728497 498 513 8391 8406 TCCCGGCTCTTGTTAA 14 133
728498 500 515 8393 8408 AGTCCCGGCTCTTGTT 57 134
728499 502 517 8395 8410 GAAGTCCCGGCTCTTG 45 135
728500 504 519 8397 8412 CGGAAGTCCCGGCTCT 43 136
728501 506 521 8399 8414 GGCGGAAGTCCCGGCT 13 137
728502 508 523 8401 8416 GAGGCGGAAGTCCCGG 35 138
728503 510 525 8403 8418 ATGAGGCGGAAGTCCC 23 139
728504 512 527 8405 8420 AGATGAGGCGGAAGTC 21 140
728505 514 529 8407 8422 GTAGATGAGGCGGAAG 29 141
728506 538 553 8431 8446 AGGTGGCATGTCCCGG 41 142
728507 540 555 8433 8448 TGAGGTGGCATGTCCC 40 143
728508 542 557 8435 8450 GCTGAGGTGGCATGTC 33 144
728509 544 559 8437 8452 GGGCTGAGGTGGCATG 44 145
728510 546 561 8439 8454 TAGGGCTGAGGTGGCA 41 146
728511 552 567 8445 8460 ATCTTGTAGGGCTGAG 29 147
728512 554 569 8447 8462 AGATCTTGTAGGGCTG 45 148
728513 556 571 8449 8464 GTAGATCTTGTAGGGC 36 149
728514 572 587 8465 8480 CATTGGAGCAGACCTC 0 150
728515 574 589 8467 8482 GCCATTGGAGCAGACC 13 151
728516 576 591 8469 8484 GGGCCATTGGAGCAGA 15 152
728517 578 593 8471 8486 CAGGGCCATTGGAGCA 15 153
728518 580 595 8473 8488 AGCAGGGCCATTGGAG 13 154
728519 582 597 8475 8490 GGAGCAGGGCCATTGG 24 155
728520 591 606 N/A N/A GAGTCTGTGGGAGCAG 35 156
728521 614 629 8973 8988 AAGAGTAATCCTCAGG 22 157
728522 616 631 8975 8990 AAAAGAGTAATCCTCA 0 158
728523 618 633 8977 8992 CCAAAAGAGTAATCCT 6 159
728524 620 635 8979 8994 CACCAAAAGAGTAATC 1 160
表3 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 75  39
665985 1981 1996 11546 11561 CTCCTATACAGCTAGG 49 161
665987 1993 2008 11558 11573 CTTAGGCAATTCCTCC 50 162
666005 2159 2174 11724 11739 CTAAGTGCTCACTCAT 64 163
666007 2183 2198 11748 11763 AGCCTTGAGCATCTGA 63 164
666009 2186 2201 11751 11766 GCCAGCCTTGAGCATC 50 165
728956 1977 1992 11542 11557 TATACAGCTAGGCCCC 32 166
728957 1978 1993 11543 11558 CTATACAGCTAGGCCC 43 167
728958 1979 1994 11544 11559 CCTATACAGCTAGGCC 68 168
728959 1980 1995 11545 11560 TCCTATACAGCTAGGC 39 169
728960 1982 1997 11547 11562 CCTCCTATACAGCTAG 48 170
728961 1983 1998 11548 11563 TCCTCCTATACAGCTA 46 171
728962 1984 1999 11549 11564 TTCCTCCTATACAGCT 60 172
728963 1985 2000 11550 11565 ATTCCTCCTATACAGC 35 173
728964 1986 2001 11551 11566 AATTCCTCCTATACAG 28 174
728965 1988 2003 11553 11568 GCAATTCCTCCTATAC 61 175
728966 1989 2004 11554 11569 GGCAATTCCTCCTATA 60 176
728967 1992 2007 11557 11572 TTAGGCAATTCCTCCT 51 177
728968 1994 2009 11559 11574 CCTTAGGCAATTCCTC 64 178
728969 1995 2010 11560 11575 CCCTTAGGCAATTCCT 68 179
728970 1996 2011 11561 11576 ACCCTTAGGCAATTCC 77 180
728971 1998 2013 11563 11578 CCACCCTTAGGCAATT 46 181
728972 2000 2015 11565 11580 GGCCACCCTTAGGCAA 62 182
728973 2003 2018 11568 11583 GTGGGCCACCCTTAGG 58 183
728974 2006 2021 11571 11586 AGAGTGGGCCACCCTT 33 184
728975 2008 2023 11573 11588 CAAGAGTGGGCCACCC 45 185
728976 2010 2025 11575 11590 CACAAGAGTGGGCCAC 37 186
728977 2012 2027 11577 11592 ATCACAAGAGTGGGCC 52 187
728978 2014 2029 11579 11594 CAATCACAAGAGTGGG 59 188
728979 2016 2031 11581 11596 GGCAATCACAAGAGTG 47 189
728980 2033 2048 11598 11613 GTTGCCAGAGGAAATG 13 190
728981 2035 2050 11600 11615 TTGTTGCCAGAGGAAA 15 191
728982 2037 2052 11602 11617 TTTTGTTGCCAGAGGA 19 192
728983 2040 2055 11605 11620 GGCTTTTGTTGCCAGA 17 193
728984 2047 2062 11612 11627 ACACTCTGGCTTTTGT 11 194
728985 2049 2064 11614 11629 CAACACTCTGGCTTTT 0 195
728986 2051 2066 11616 11631 CACAACACTCTGGCTT 44 196
728987 2059 2074 11624 11639 ACTTGGCCCACAACAC 9 197
728988 2061 2076 11626 11641 GGACTTGGCCCACAAC 29 198
728989 2086 2101 11651 11666 CATGCCCTGCAGAGGC 44 199
728990 2095 2110 11660 11675 AATCAGGGCCATGCCC 0 200
728991 2097 2112 11662 11677 GAAATCAGGGCCATGC 9 201
728992 2106 2121 11671 11686 CAAACCAGGGAAATCA 26 202
728993 2108 2123 11673 11688 CTCAAACCAGGGAAAT 51 203
728994 2110 2125 11675 11690 GTCTCAAACCAGGGAA 63 204
728995 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG 61 205
728996 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG 71 206
728997 2117 2132 11682 11697 GAAGTGAGTCTCAAAC 58 207
728998 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA 68 208
728999 2121 2136 11686 11701 TGAGGAAGTGAGTCTC 20 209
729000 2141 2156 11706 11721 TATCTCAGAGGACAGG 63 210
729001 2143 2158 11708 11723 ATTATCTCAGAGGACA 67 211
729002 2145 2160 11710 11725 ATATTATCTCAGAGGA 61 212
729003 2148 2163 11713 11728 CTCATATTATCTCAGA 64 213
729004 2152 2167 11717 11732 CTCACTCATATTATCT 50 214
729005 2154 2169 11719 11734 TGCTCACTCATATTAT 20 215
729006 2155 2170 11720 11735 GTGCTCACTCATATTA 53 216
729007 2156 2171 11721 11736 AGTGCTCACTCATATT 38 217
729008 2157 2172 11722 11737 AAGTGCTCACTCATAT 44 218
729009 2158 2173 11723 11738 TAAGTGCTCACTCATA 45 219
729010 2160 2175 11725 11740 CCTAAGTGCTCACTCA 63 220
729011 2161 2176 11726 11741 ACCTAAGTGCTCACTC 64 221
729012 2162 2177 11727 11742 TACCTAAGTGCTCACT 34 222
729013 2163 2178 11728 11743 ATACCTAAGTGCTCAC 56 223
729014 2164 2179 11729 11744 GATACCTAAGTGCTCA 60 224
729015 2166 2181 11731 11746 ATGATACCTAAGTGCT 57 225
729016 2168 2183 11733 11748 ATATGATACCTAAGTG 53 226
729017 2170 2185 11735 11750 TGATATGATACCTAAG 46 227
729018 2172 2187 11737 11752 TCTGATATGATACCTA 71 228
729019 2174 2189 11739 11754 CATCTGATATGATACC 63 229
729020 2176 2191 11741 11756 AGCATCTGATATGATA 65 230
729021 2178 2193 11743 11758 TGAGCATCTGATATGA 60 231
729022 2179 2194 11744 11759 TTGAGCATCTGATATG 37 232
729023 2180 2195 11745 11760 CTTGAGCATCTGATAT 36 233
729024 2181 2196 11746 11761 CCTTGAGCATCTGATA 56 234
729025 2182 2197 11747 11762 GCCTTGAGCATCTGAT 54 235
729026 2185 2200 11750 11765 CCAGCCTTGAGCATCT 51 236
729027 2187 2202 11752 11767 TGCCAGCCTTGAGCAT 14 237
表4 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665830 680 695 9499 9514 TGAGGCTCAGGCTTGG 65 238
665840 715 730 9755 9770 CGGCTGCAGAGTGGGC 43 239
760 775 9800 9815
665842 717 732 9757 9772 GGCGGCTGCAGAGTGG 43 240
762 777 9802 9817
665843 718 733 9758 9773 GGGCGGCTGCAGAGTG 53 241
763 778 9803 9818
665845 720 735 9760 9775 GTGGGCGGCTGCAGAG 43 242
750 765 9790 9805
665846 721 736 9761 9776 AGTGGGCGGCTGCAGA 28 243
751 766 9791 9806
665847 722 737 9762 9777 GAGTGGGCGGCTGCAG 24 244
752 767 9792 9807
665848 724 739 9764 9779 CAGAGTGGGCGGCTGC 40 245
754 769 9794 9809
665853 725 740 9765 9780 GCAGAGTGGGCGGCTG 11 246
755 770 9795 9810
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 72 39
728525 622 637 8981 8996 TGCACCAAAAGAGTAA 22 247
728526 624 639 8983 8998 CCTGCACCAAAAGAGT 31 248
728527 626 641 8985 9000 CTCCTGCACCAAAAGA 39 249
728528 628 643 8987 9002 CTCTCCTGCACCAAAA 31 250
728529 663 678 9482 9497 AACATCCTCTGCAGCT 29 251
728530 666 681 9485 9500 GGCAACATCCTCTGCA 36 252
728531 668 683 9487 9502 TTGGCAACATCCTCTG 45 253
728532 670 685 9489 9504 GCTTGGCAACATCCTC 53 254
728533 672 687 9491 9506 AGGCTTGGCAACATCC 66 255
728534 675 690 9494 9509 CTCAGGCTTGGCAACA 42 256
728535 678 693 9497 9512 AGGCTCAGGCTTGGCA 60 257
728536 681 696 9500 9515 GTGAGGCTCAGGCTTG 44 258
728537 682 697 9501 9516 TGTGAGGCTCAGGCTT 34 259
728538 684 699 N/A N/A TCTGTGAGGCTCAGGC 41 260
728544 N/A N/A 9690 9705 CAGACTGCACTGCATC 29 261
728545 N/A N/A 9692 9707 GCCAGACTGCACTGCA 8 262
728546 N/A N/A 9694 9709 GGGCCAGACTGCACTG 28 263
728547 N/A N/A 9711 9726 AATAGGGTGTCATGTG 6 264
728548 N/A N/A 9713 9728 AGAATAGGGTGTCATG 0 265
728549 N/A N/A 9715 9730 AAAGAATAGGGTGTCA 17 266
728550 N/A N/A 9717 9732 GTAAAGAATAGGGTGT 14 267
728551 N/A N/A 9719 9734 GAGTAAAGAATAGGGT 24 268
728552 N/A N/A 9721 9736 TTGAGTAAAGAATAGG 12 269
728553 N/A N/A 9723 9738 CTTTGAGTAAAGAATA 8 270
728554 N/A N/A 9725 9740 CTCTTTGAGTAAAGAA 0 271
728555 N/A N/A 9727 9742 TCCTCTTTGAGTAAAG 14 272
728556 N/A N/A 9729 9744 CATCCTCTTTGAGTAA 21 273
728557 N/A N/A 9731 9746 GACATCCTCTTTGAGT 11 274
728558 N/A N/A 9733 9748 TTGACATCCTCTTTGA 32 275
728559 N/A N/A 9735 9750 ACTTGACATCCTCTTT 16 276
728560 699 714 9739 9754 GGCCACTTGACATCCT 6 277
728561 701 716 9741 9756 GCGGCCACTTGACATC 31 278
728562 703 718 9743 9758 GGGCGGCCACTTGACA 13 279
728563 705 720 9745 9760 GTGGGCGGCCACTTGA 40 280
728564 707 722 9747 9762 GAGTGGGCGGCCACTT 12 281
728565 709 724 9749 9764 CAGAGTGGGCGGCCAC 38 282
728566 711 726 9751 9766 TGCAGAGTGGGCGGCC 21 283
728567 726 741 9766 9781 CGCAGAGTGGGCGGCT 18 284
728568 727 742 9767 9782 CCGCAGAGTGGGCGGC 17 285
728569 731 746 9771 9786 GCGGCCGCAGAGTGGG 4 286
728570 733 748 9773 9788 AGGCGGCCGCAGAGTG 20 287
728571 735 750 9775 9790 GTAGGCGGCCGCAGAG 14 288
728572 737 752 9777 9792 GAGTAGGCGGCCGCAG 11 289
728573 739 754 9779 9794 CAGAGTAGGCGGCCGC 25 290
728574 741 756 9781 9796 TGCAGAGTAGGCGGCC 12 291
728575 743 758 9783 9798 GCTGCAGAGTAGGCGG 44 292
728576 745 760 9785 9800 CGGCTGCAGAGTAGGC 37 293
728577 747 762 9787 9802 GGCGGCTGCAGAGTAG 45 294
728578 756 771 9796 9811 TGCAGAGTGGGCGGCT 9 295
728579 764 779 9804 9819 CGGGCGGCTGCAGAGT 61 296
728580 765 780 9805 9820 ACGGGCGGCTGCAGAG 28 297
728581 767 782 9807 9822 CCACGGGCGGCTGCAG 17 298
728582 768 783 9808 9823 ACCACGGGCGGCTGCA 29 299
728583 769 784 9809 9824 CACCACGGGCGGCTGC 26 300
728584 771 786 9811 9826 AGCACCACGGGCGGCT 7 301
728585 773 788 9813 9828 CCAGCACCACGGGCGG 41 302
728586 775 790 9815 9830 ACCCAGCACCACGGGC 19 303
728587 777 792 9817 9832 GGACCCAGCACCACGG 41 304
728588 830 845 9870 9885 AGCCAGCAGGGTTGCC 26 305
728589 832 847 9872 9887 GAAGCCAGCAGGGTTG 16 306
728590 834 849 9874 9889 CTGAAGCCAGCAGGGT 26 307
728591 845 860 9885 9900 AGAGAAGCTCCCTGAA 8 308
728592 849 864 9889 9904 TCAGAGAGAAGCTCCC 3 309
表5 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
642685 1098 1113 10331 10346 AAGCGCACTTGCTCCA 33 310
665862 913 928 9953 9968 GTCTGGCAGGAGCTGT 51 311
665878 1096 1111 10329 10344 GCGCACTTGCTCCAGG 58 312
665884 1181 1196 10414 10429 GGATGAGCCCGCGGTC 56 313
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 76 39
728593 853 868 9893 9908 GACCTCAGAGAGAAGC 10 314
728594 862 877 9902 9917 AGGCTCCAGGACCTCA 7 315
728595 902 917 9942 9957 GCTGTTCGCCTGCAGG 59 316
728596 904 919 9944 9959 GAGCTGTTCGCCTGCA 14 317
728597 906 921 9946 9961 AGGAGCTGTTCGCCTG 4 318
728598 908 923 9948 9963 GCAGGAGCTGTTCGCC 44 319
728599 909 924 9949 9964 GGCAGGAGCTGTTCGC 30 320
728600 910 925 9950 9965 TGGCAGGAGCTGTTCG 15 321
728601 911 926 9951 9966 CTGGCAGGAGCTGTTC 34 322
728602 912 927 9952 9967 TCTGGCAGGAGCTGTT 33 323
728603 914 929 9954 9969 GGTCTGGCAGGAGCTG 49 324
728604 915 930 9955 9970 AGGTCTGGCAGGAGCT 60 325
728605 916 931 9956 9971 CAGGTCTGGCAGGAGC 53 326
728606 918 933 9958 9973 AGCAGGTCTGGCAGGA 35 327
728607 922 937 9962 9977 GATCAGCAGGTCTGGC 17 328
728608 924 939 9964 9979 CTGATCAGCAGGTCTG 34 329
728609 926 941 9966 9981 GGCTGATCAGCAGGTC 38 330
728610 945 960 N/A N/A GTCAGAGGCAGCATGT 24 331
728611 947 962 N/A N/A CGGTCAGAGGCAGCAT 54 332
728612 949 964 N/A N/A GTCGGTCAGAGGCAGC 44 333
728613 952 967 N/A N/A CAGGTCGGTCAGAGGC 47 334
728614 954 969 N/A N/A TCCAGGTCGGTCAGAG 24 335
728615 1001 1016 10234 10249 TGATGGTGAGGGCCCG 18 336
728616 1003 1018 10236 10251 GCTGATGGTGAGGGCC 14 337
728617 1005 1020 10238 10253 TTGCTGATGGTGAGGG 37 338
728618 1024 1039 10257 10272 GAGCCGGCAGCCATGG 13 339
728619 1032 1047 10265 10280 CTGTAGAAGAGCCGGC 0 340
728620 1034 1049 10267 10282 GGCTGTAGAAGAGCCG 0 341
728621 1036 1051 10269 10284 CTGGCTGTAGAAGAGC 21 342
728622 1038 1053 10271 10286 AGCTGGCTGTAGAAGA 9 343
728623 1040 1055 10273 10288 CCAGCTGGCTGTAGAA 5 344
728624 1067 1082 10300 10315 AGAGTTCCACCTGCTC 23 345
728625 1069 1084 10302 10317 GAAGAGTTCCACCTGC 14 346
728626 1072 1087 10305 10320 GCCGAAGAGTTCCACC 22 347
728627 1074 1089 10307 10322 GGGCCGAAGAGTTCCA 13 348
728628 1091 1106 10324 10339 CTTGCTCCAGGCTTAT 24 349
728629 1093 1108 10326 10341 CACTTGCTCCAGGCTT 46 350
728630 1094 1109 10327 10342 GCACTTGCTCCAGGCT 66 351
728631 1095 1110 10328 10343 CGCACTTGCTCCAGGC 62 352
728632 1097 1112 10330 10345 AGCGCACTTGCTCCAG 55 353
728633 1099 1114 10332 10347 GAAGCGCACTTGCTCC 43 354
728634 1100 1115 10333 10348 GGAAGCGCACTTGCTC 57 355
728635 1101 1116 10334 10349 GGGAAGCGCACTTGCT 59 356
728636 1117 1132 10350 10365 GATGTCCTCAGGGCTG 22 357
728637 1134 1149 10367 10382 CGCTGCTTGTCACTGG 67 358
728638 1161 1176 10394 10409 ACATCCAGCAGCTGGT 0 359
728639 1163 1178 10396 10411 GGACATCCAGCAGCTG 8 360
728640 1170 1185 10403 10418 CGGTCCAGGACATCCA 32 361
728641 1172 1187 10405 10420 CGCGGTCCAGGACATC 47 362
728642 1174 1189 10407 10422 CCCGCGGTCCAGGACA 11 363
728643 1176 1191 10409 10424 AGCCCGCGGTCCAGGA 20 364
728644 1177 1192 10410 10425 GAGCCCGCGGTCCAGG 48 365
728645 1179 1194 10412 10427 ATGAGCCCGCGGTCCA 44 366
728646 1180 1195 10413 10428 GATGAGCCCGCGGTCC 59 367
728647 1182 1197 10415 10430 AGGATGAGCCCGCGGT 49 368
728648 1183 1198 10416 10431 GAGGATGAGCCCGCGG 36 369
728649 1184 1199 10417 10432 GGAGGATGAGCCCGCG 14 370
728650 1185 1200 10418 10433 TGGAGGATGAGCCCGC 27 371
728651 1186 1201 10419 10434 CTGGAGGATGAGCCCG 17 372
728652 1188 1203 10421 10436 AGCTGGAGGATGAGCC 0 373
728653 1190 1205 10423 10438 GTAGCTGGAGGATGAG 13 374
728654 1192 1207 10425 10440 CTGTAGCTGGAGGATG 3 375
728655 1194 1209 10427 10442 CCCTGTAGCTGGAGGA 4 376
728656 1196 1211 10429 10444 GGCCCTGTAGCTGGAG 24 377
728657 1198 1213 10431 10446 CTGGCCCTGTAGCTGG 9 378
728658 1201 1216 10434 10449 GTCCTGGCCCTGTAGC 25 379
728659 1203 1218 10436 10451 AGGTCCTGGCCCTGTA 43 380
728660 1205 1220 10438 10453 AAAGGTCCTGGCCCTG 23 381
728661 1207 1222 10440 10455 ATAAAGGTCCTGGCCC 10 382
728662 1209 1224 10442 10457 GCATAAAGGTCCTGGC 31 383
728663 1211 1226 10444 10459 TGGCATAAAGGTCCTG 46 384
728664 1213 1228 10446 10461 GATGGCATAAAGGTCC 42 385
728665 1215 1230 10448 10463 CGGATGGCATAAAGGT 39 386
表6 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA 68 387
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 65 39
665894 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG 42 388
665895 1242 1257 10475 10490 CTCCAGAACACCTTGC 44 389
665900 1272 1287 10505 10520 CATGAGTCATGGGCTG 54 390
665902 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG 37 391
665903 1309 1324 10542 10557 AAGCTTGGTCTTGACC 49 392
665908 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG 66 393
728666 1217 1232 10450 10465 GGCGGATGGCATAAAG 32 394
728667 1223 1238 10456 10471 GACACAGGCGGATGGC 49 395
728668 1224 1239 10457 10472 TGACACAGGCGGATGG 27 396
728669 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT 51 397
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC 68 398
728671 1231 1246 10464 10479 CTTGCACTGACACAGG 42 399
728672 1232 1247 10465 10480 CCTTGCACTGACACAG 56 400
728673 1233 1248 10466 10481 ACCTTGCACTGACACA 60 401
728674 1234 1249 10467 10482 CACCTTGCACTGACAC 57 402
728675 1237 1252 10470 10485 GAACACCTTGCACTGA 34 403
728676 1238 1253 10471 10486 AGAACACCTTGCACTG 39 404
728677 1239 1254 10472 10487 CAGAACACCTTGCACT 25 405
728678 1240 1255 10473 10488 CCAGAACACCTTGCAC 30 406
728679 1241 1256 10474 10489 TCCAGAACACCTTGCA 39 407
728680 1243 1258 10476 10491 GCTCCAGAACACCTTG 39 408
728681 1244 1259 10477 10492 CGCTCCAGAACACCTT 59 409
728682 1245 1260 10478 10493 CCGCTCCAGAACACCT 37 410
728683 1246 1261 10479 10494 CCCGCTCCAGAACACC 41 411
728684 1247 1262 10480 10495 GCCCGCTCCAGAACAC 19 412
728685 1249 1264 10482 10497 AGGCCCGCTCCAGAAC 24 413
728686 1251 1266 10484 10499 CAAGGCCCGCTCCAGA 28 414
728687 1253 1268 10486 10501 CACAAGGCCCGCTCCA 16 415
728688 1255 1270 10488 10503 GGCACAAGGCCCGCTC 12 416
728689 1257 1272 10490 10505 GAGGCACAAGGCCCGC 17 417
728690 1259 1274 10492 10507 CTGAGGCACAAGGCCC 13 418
728691 1264 1279 10497 10512 ATGGGCTGAGGCACAA 42 419
728692 1267 1282 10500 10515 GTCATGGGCTGAGGCA 51 420
728693 1268 1283 10501 10516 AGTCATGGGCTGAGGC 52 421
728694 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG 59 422
728695 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG 67 423
728696 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA 75 424
728697 1273 1288 10506 10521 GCATGAGTCATGGGCT 23 425
728698 1274 1289 10507 10522 GGCATGAGTCATGGGC 47 426
728699 1296 1311 10529 10544 ACCTCCCGCTGGATGG 45 427
728700 1297 1312 10530 10545 GACCTCCCGCTGGATG 38 428
728701 1298 1313 10531 10546 TGACCTCCCGCTGGAT 53 429
728702 1299 1314 10532 10547 TTGACCTCCCGCTGGA 38 430
728703 1300 1315 10533 10548 CTTGACCTCCCGCTGG 33 431
728704 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT 56 432
728705 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC 71 433
728706 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC 73 434
728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC 79 435
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT 79 436
728709 1310 1325 10543 10558 AAAGCTTGGTCTTGAC 46 437
728710 1311 1326 10544 10559 AAAAGCTTGGTCTTGA 29 438
728711 1312 1327 10545 10560 GAAAAGCTTGGTCTTG 24 439
728712 1313 1328 10546 10561 TGAAAAGCTTGGTCTT 11 440
728713 1314 1329 10547 10562 CTGAAAAGCTTGGTCT 13 441
728714 1316 1331 10549 10564 GGCTGAAAAGCTTGGT 11 442
728715 1318 1333 10551 10566 CAGGCTGAAAAGCTTG 1 443
728716 1320 1335 10553 10568 TCCAGGCTGAAAAGCT 5 444
728717 1340 1355 N/A N/A TGAGCTCATTGAGAAA 10 445
728718 1342 1357 N/A N/A GATGAGCTCATTGAGA 33 446
728719 1344 1359 N/A N/A AGGATGAGCTCATTGA 55 447
728720 1346 1361 N/A N/A ACAGGATGAGCTCATT 41 448
728721 1348 1363 N/A N/A GAACAGGATGAGCTCA 45 449
728722 1350 1365 10671 10686 TGGAACAGGATGAGCT 47 450
728723 1358 1373 10679 10694 GGCCCTTTTGGAACAG 29 451
728724 1359 1374 10680 10695 TGGCCCTTTTGGAACA 34 452
728725 1360 1375 10681 10696 CTGGCCCTTTTGGAAC 20 453
728726 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA 14 454
728727 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA 33 455
728728 1364 1379 10685 10700 TGGTCTGGCCCTTTTG 56 456
728729 1365 1380 10686 10701 TTGGTCTGGCCCTTTT 54 457
728730 1366 1381 10687 10702 GTTGGTCTGGCCCTTT 53 458
728731 1367 1382 10688 10703 TGTTGGTCTGGCCCTT 50 459
728732 1368 1383 10689 10704 GTGTTGGTCTGGCCCT 47 460
728733 1386 1401 10707 10722 ATCTCGAAGGGTGGTG 40 461
728734 1389 1404 10710 10725 AAGATCTCGAAGGGTG 52 462
728735 1392 1407 10713 10728 AAGAAGATCTCGAAGG 28 463
表7 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 73  39
665925 1506 1521 11071 11086 GATAGCTCCCCTGAGA 29 464
665926 1512 1527 11077 11092 GACCAAGATAGCTCCC 50 465
665929 1530 1545 11095 11110 AGCCGGATACTATCAG 49 466
665930 1536 1551 11101 11116 ATCTGTAGCCGGATAC 39 467
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 62 468
728736 1394 1409 10715 10730 AGAAGAAGATCTCGAA 13 469
728737 1396 1411 10717 10732 GCAGAAGAAGATCTCG 45 470
728738 1419 1434 10740 10755 CGGTCAGGCCATTCTT 52 471
728739 1421 1436 10742 10757 TGCGGTCAGGCCATTC 68 472
728740 1423 1438 10744 10759 TTTGCGGTCAGGCCAT 37 473
728741 1426 1441 10747 10762 GGGTTTGCGGTCAGGC 71 474
728742 1441 1456 10762 10777 GAGCTTCTTCTCTCGG 22 475
728743 1443 1458 10764 10779 ATGAGCTTCTTCTCTC 0 476
728744 1445 1460 10766 10781 TAATGAGCTTCTTCTC 14 477
728745 1447 1462 10768 10783 AGTAATGAGCTTCTTC 36 478
728746 1449 1464 10770 10785 ACAGTAATGAGCTTCT 30 479
728747 1451 1466 10772 10787 GTACAGTAATGAGCTT 26 480
728748 1453 1468 10774 10789 CTGTACAGTAATGAGC 37 481
728749 1455 1470 10776 10791 ACCTGTACAGTAATGA 28 482
728750 1457 1472 N/A N/A CCACCTGTACAGTAAT 27 483
728751 1459 1474 N/A N/A CACCACCTGTACAGTA 42 484
728752 1461 1476 N/A N/A GGCACCACCTGTACAG 27 485
728753 1463 1478 N/A N/A CAGGCACCACCTGTAC 53 486
728754 1465 1480 N/A N/A TACAGGCACCACCTGT 0 487
728755 1467 1482 11032 11047 GCTACAGGCACCACCT 37 488
728756 1469 1484 11034 11049 CTGCTACAGGCACCAC 53 489
728757 1471 1486 11036 11051 AGCTGCTACAGGCACC 41 490
728758 1473 1488 11038 11053 CGAGCTGCTACAGGCA 54 491
728759 1475 1490 11040 11055 GTCGAGCTGCTACAGG 63 492
728760 1477 1492 11042 11057 CAGTCGAGCTGCTACA 34 493
728761 1479 1494 11044 11059 AGCAGTCGAGCTGCTA 3 494
728762 1481 1496 11046 11061 GCAGCAGTCGAGCTGC 13 495
728763 1483 1498 11048 11063 CAGCAGCAGTCGAGCT 16 496
728764 1485 1500 11050 11065 TCCAGCAGCAGTCGAG 23 497
728765 1487 1502 11052 11067 TCTCCAGCAGCAGTCG 30 498
728766 1489 1504 11054 11069 CATCTCCAGCAGCAGT 31 499
728767 1492 1507 11057 11072 GAACATCTCCAGCAGC 47 500
728768 1495 1510 11060 11075 TGAGAACATCTCCAGC 33 501
728769 1497 1512 11062 11077 CCTGAGAACATCTCCA 60 502
728770 1499 1514 11064 11079 CCCCTGAGAACATCTC 43 503
728771 1501 1516 11066 11081 CTCCCCTGAGAACATC 42 504
728772 1502 1517 11067 11082 GCTCCCCTGAGAACAT 55 505
728773 1503 1518 11068 11083 AGCTCCCCTGAGAACA 54 506
728774 1504 1519 11069 11084 TAGCTCCCCTGAGAAC 29 507
728775 1505 1520 11070 11085 ATAGCTCCCCTGAGAA 15 508
728776 1507 1522 11072 11087 AGATAGCTCCCCTGAG 42 509
728777 1508 1523 11073 11088 AAGATAGCTCCCCTGA 52 510
728778 1509 1524 11074 11089 CAAGATAGCTCCCCTG 64 511
728779 1510 1525 11075 11090 CCAAGATAGCTCCCCT 50 512
728780 1511 1526 11076 11091 ACCAAGATAGCTCCCC 21 513
728781 1513 1528 11078 11093 TGACCAAGATAGCTCC 43 514
728782 1514 1529 11079 11094 CTGACCAAGATAGCTC 51 515
728783 1515 1530 11080 11095 GCTGACCAAGATAGCT 23 516
728784 1516 1531 11081 11096 AGCTGACCAAGATAGC 31 517
728785 1517 1532 11082 11097 CAGCTGACCAAGATAG 34 518
728786 1519 1534 11084 11099 ATCAGCTGACCAAGAT 28 519
728787 1521 1536 11086 11101 CTATCAGCTGACCAAG 48 520
728788 1523 1538 11088 11103 TACTATCAGCTGACCA 49 521
728789 1525 1540 11090 11105 GATACTATCAGCTGAC 58 522
728790 1526 1541 11091 11106 GGATACTATCAGCTGA 51 523
728791 1527 1542 11092 11107 CGGATACTATCAGCTG 55 524
728792 1528 1543 11093 11108 CCGGATACTATCAGCT 41 525
728793 1529 1544 11094 11109 GCCGGATACTATCAGC 68 526
728794 1531 1546 11096 11111 TAGCCGGATACTATCA 40 527
728795 1532 1547 11097 11112 GTAGCCGGATACTATC 48 528
728796 1533 1548 11098 11113 TGTAGCCGGATACTAT 34 529
728797 1534 1549 11099 11114 CTGTAGCCGGATACTA 52 530
728798 1535 1550 11100 11115 TCTGTAGCCGGATACT 53 531
728799 1537 1552 11102 11117 GATCTGTAGCCGGATA 46 532
728800 1538 1553 11103 11118 AGATCTGTAGCCGGAT 67 533
728801 1543 1558 11108 11123 GTTTGAGATCTGTAGC 55 534
728802 1556 1571 11121 11136 CTTTGAGGTCTGGGTT 63 535
728803 1557 1572 11122 11137 TCTTTGAGGTCTGGGT 55 536
728804 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG 61 537
728805 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG 58 538
728806 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG 74 539
728807 1562 1577 11127 11142 TGCGGTCTTTGAGGTC 58 540
表8 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 72 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 62 468
665942 1613 1628 11178 11193 ACCGCTGCTGGGACTG 40 541
728808 1563 1578 11128 11143 ATGCGGTCTTTGAGGT 37 542
728809 1564 1579 11129 11144 CATGCGGTCTTTGAGG 17 543
728810 1565 1580 11130 11145 CCATGCGGTCTTTGAG 43 544
728811 1566 1581 11131 11146 ACCATGCGGTCTTTGA 26 545
728812 1568 1583 11133 11148 CCACCATGCGGTCTTT 9 546
728813 1570 1585 11135 11150 CTCCACCATGCGGTCT 22 547
728814 1572 1587 11137 11152 TGCTCCACCATGCGGT 23 548
728815 1574 1589 11139 11154 ATTGCTCCACCATGCG 0 549
728816 1576 1591 11141 11156 GAATTGCTCCACCATG 0 550
728817 1578 1593 11143 11158 TTGAATTGCTCCACCA 0 551
728818 1580 1595 11145 11160 CCTTGAATTGCTCCAC 0 552
728819 1582 1597 11147 11162 CTCCTTGAATTGCTCC 0 553
728820 1584 1599 11149 11164 AGCTCCTTGAATTGCT 0 554
728821 1586 1601 11151 11166 GGAGCTCCTTGAATTG 0 555
728822 1588 1603 11153 11168 ATGGAGCTCCTTGAAT 2 556
728823 1590 1605 11155 11170 TGATGGAGCTCCTTGA 0 557
728824 1592 1607 11157 11172 TGTGATGGAGCTCCTT 0 558
728825 1594 1609 11159 11174 GATGTGATGGAGCTCC 30 559
728826 1596 1611 11161 11176 CAGATGTGATGGAGCT 27 560
728827 1600 1615 11165 11180 CTGCCAGATGTGATGG 7 561
728828 1602 1617 11167 11182 GACTGCCAGATGTGAT 0 562
728829 1604 1619 11169 11184 GGGACTGCCAGATGTG 31 563
728830 1606 1621 11171 11186 CTGGGACTGCCAGATG 40 564
728831 1608 1623 11173 11188 TGCTGGGACTGCCAGA 24 565
728832 1609 1624 11174 11189 CTGCTGGGACTGCCAG 19 566
728833 1610 1625 11175 11190 GCTGCTGGGACTGCCA 24 567
728834 1612 1627 11177 11192 CCGCTGCTGGGACTGC 37 568
728835 1614 1629 11179 11194 AACCGCTGCTGGGACT 19 569
728836 1616 1631 11181 11196 GCAACCGCTGCTGGGA 38 570
728837 1618 1633 11183 11198 CTGCAACCGCTGCTGG 26 571
728838 1620 1635 11185 11200 GGCTGCAACCGCTGCT 2 572
728839 1624 1639 11189 11204 CACAGGCTGCAACCGC 26 573
728840 1626 1641 11191 11206 GCCACAGGCTGCAACC 21 574
728841 1628 1643 11193 11208 GGGCCACAGGCTGCAA 37 575
728842 1650 1665 11215 11230 AGGCCTGCTCCAGGAG 0 576
728843 1654 1669 11219 11234 ACCAAGGCCTGCTCCA 30 577
728844 1656 1671 11221 11236 ACACCAAGGCCTGCTC 41 578
728845 1659 1674 11224 11239 CCAACACCAAGGCCTG 8 579
728846 1661 1676 11226 11241 GGCCAACACCAAGGCC 0 580
728847 1663 1678 11228 11243 CTGGCCAACACCAAGG 18 581
728848 1666 1681 11231 11246 CCCCTGGCCAACACCA 0 582
728849 1668 1683 11233 11248 GGCCCCTGGCCAACAC 0 583
728850 1670 1685 11235 11250 AGGGCCCCTGGCCAAC 21 584
728851 1676 1691 11241 11256 TAGGCCAGGGCCCCTG 0 585
728852 1678 1693 11243 11258 CATAGGCCAGGGCCCC 0 586
728853 1680 1695 11245 11260 TGCATAGGCCAGGGCC 0 587
728854 1682 1697 11247 11262 GGTGCATAGGCCAGGG 0 588
728855 1684 1699 11249 11264 TGGGTGCATAGGCCAG 0 589
728856 1687 1702 11252 11267 AGCTGGGTGCATAGGC 0 590
728857 1690 1705 11255 11270 GCCAGCTGGGTGCATA 15 591
728858 1693 1708 11258 11273 CATGCCAGCTGGGTGC 28 592
728859 1695 1710 11260 11275 TGCATGCCAGCTGGGT 32 593
728860 1697 1712 11262 11277 ATTGCATGCCAGCTGG 34 594
728861 1699 1714 11264 11279 TTATTGCATGCCAGCT 19 595
728862 1701 1716 11266 11281 TGTTATTGCATGCCAG 35 596
728863 1703 1718 11268 11283 CTTGTTATTGCATGCC 51 597
728864 1705 1720 11270 11285 GCCTTGTTATTGCATG 16 598
728865 1707 1722 11272 11287 CAGCCTTGTTATTGCA 3 599
728866 1709 1724 11274 11289 TGCAGCCTTGTTATTG 0 600
728867 1711 1726 11276 11291 TCTGCAGCCTTGTTAT 0 601
728868 1713 1728 11278 11293 CGTCTGCAGCCTTGTT 43 602
728869 1715 1730 11280 11295 ACCGTCTGCAGCCTTG 51 603
728870 1717 1732 11282 11297 TCACCGTCTGCAGCCT 14 604
728871 1719 1734 11284 11299 AGTCACCGTCTGCAGC 36 605
728872 1721 1736 11286 11301 CCAGTCACCGTCTGCA 57 606
728873 1723 1738 11288 11303 GGCCAGTCACCGTCTG 6 607
728874 1725 1740 11290 11305 AGGGCCAGTCACCGTC 28 608
728875 1727 1742 11292 11307 CCAGGGCCAGTCACCG 30 609
728876 1731 1746 11296 11311 GAAGCCAGGGCCAGTC 30 610
728877 1742 1757 11307 11322 CCGCCACCCAGGAAGC 30 611
728878 1744 1759 11309 11324 CACCGCCACCCAGGAA 9 612
728879 1746 1761 11311 11326 CGCACCGCCACCCAGG 46 613
728880 1748 1763 11313 11328 TCCGCACCGCCACCCA 29 614
728881 1749 1764 11314 11329 GTCCGCACCGCCACCC 30 615
728882 1750 1765 11315 11330 AGTCCGCACCGCCACC 27 616
728883 1751 1766 11316 11331 CAGTCCGCACCGCCAC 56 617
表9 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 74  39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 60  468
665962 1753 1768 11318 11333 ATCAGTCCGCACCGCC 53 618
665964 1765 1780 11330 11345 TCACATCTCCACATCA 36 619
665973 1903 1918 11468 11483 AGACCAGAGACAGCCC 30 620
665975 1911 1926 11476 11491 GGCTGACCAGACCAGA 40 621
665981 1951 1966 11516 11531 GAGTTCTTTCCCTGCT 41 622
728884 1752 1767 11317 11332 TCAGTCCGCACCGCCA 46 623
728885 1754 1769 11319 11334 CATCAGTCCGCACCGC 23 624
728886 1755 1770 11320 11335 ACATCAGTCCGCACCG 48 625
728887 1756 1771 11321 11336 CACATCAGTCCGCACC 57 626
728888 1757 1772 11322 11337 CCACATCAGTCCGCAC 37 627
728889 1758 1773 11323 11338 TCCACATCAGTCCGCA 24 628
728890 1760 1775 11325 11340 TCTCCACATCAGTCCG 33 629
728891 1761 1776 11326 11341 ATCTCCACATCAGTCC 56 630
728892 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC 37 631
728893 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT 56 632
728894 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG 65 633
728895 1766 1781 11331 11346 GTCACATCTCCACATC 47 634
728896 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT 21 635
728897 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA 46 636
728898 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC 73 637
728899 1770 1785 11335 11350 GGCTGTCACATCTCCA 64 638
728900 1786 1801 11351 11366 GCCAGGTGCTCATCGG 37 639
728901 1788 1803 11353 11368 CAGCCAGGTGCTCATC 37 640
728902 1790 1805 11355 11370 GCCAGCCAGGTGCTCA 42 641
728903 1803 1818 11368 11383 GTAGGACCCTGCAGCC 31 642
728904 1805 1820 11370 11385 AGGTAGGACCCTGCAG 6 643
728905 1807 1822 11372 11387 AGAGGTAGGACCCTGC 60 644
728906 1810 1825 11375 11390 CCCAGAGGTAGGACCC 42 645
728907 1812 1827 11377 11392 AACCCAGAGGTAGGAC 32 646
728908 1814 1829 11379 11394 GAAACCCAGAGGTAGG 44 647
728909 1825 1840 11390 11405 TCCACTTCCAGGAAAC 25 648
728910 1833 1848 11398 11413 GGCCCAAATCCACTTC 11 649
728911 1835 1850 11400 11415 TTGGCCCAAATCCACT 9 650
728912 1837 1852 11402 11417 TCTTGGCCCAAATCCA 22 651
728913 1839 1854 11404 11419 CTTCTTGGCCCAAATC 15 652
728914 1841 1856 11406 11421 TCCTTCTTGGCCCAAA 31 653
728915 1859 1874 11424 11439 CTCGGGCCTTTCTCCC 2 654
728916 1861 1876 11426 11441 GGCTCGGGCCTTTCTC 10 655
728917 1884 1899 11449 11464 AGAGAAAGGCCCGGGA 0 656
728918 1886 1901 11451 11466 GGAGAGAAAGGCCCGG 0 657
728919 1898 1913 11463 11478 AGAGACAGCCCAGGAG 13 658
728920 1901 1916 11466 11481 ACCAGAGACAGCCCAG 52 659
728921 1902 1917 11467 11482 GACCAGAGACAGCCCA 42 660
728922 1904 1919 11469 11484 CAGACCAGAGACAGCC 38 661
728923 1905 1920 11470 11485 CCAGACCAGAGACAGC 17 662
728924 1906 1921 11471 11486 ACCAGACCAGAGACAG 30 663
728925 1907 1922 11472 11487 GACCAGACCAGAGACA 14 664
728926 1908 1923 11473 11488 TGACCAGACCAGAGAC 7 665
728927 1910 1925 11475 11490 GCTGACCAGACCAGAG 26 666
728928 1912 1927 11477 11492 AGGCTGACCAGACCAG 14 667
728929 1916 1931 11481 11496 AGCCAGGCTGACCAGA 13 668
728930 1919 1934 11484 11499 GAGAGCCAGGCTGACC 26 669
728931 1923 1938 11488 11503 TCCCGAGAGCCAGGCT 26 670
728932 1925 1940 11490 11505 TTTCCCGAGAGCCAGG 26 671
728933 1928 1943 11493 11508 GAATTTCCCGAGAGCC 34 672
728934 1930 1945 11495 11510 CTGAATTTCCCGAGAG 33 673
728935 1932 1947 11497 11512 GGCTGAATTTCCCGAG 39 674
728936 1934 1949 11499 11514 ATGGCTGAATTTCCCG 39 675
728937 1936 1951 11501 11516 TCATGGCTGAATTTCC 36 676
728938 1938 1953 11503 11518 GCTCATGGCTGAATTT 30 677
728939 1940 1955 11505 11520 CTGCTCATGGCTGAAT 40 678
728940 1942 1957 11507 11522 CCCTGCTCATGGCTGA 51 679
728941 1946 1961 11511 11526 CTTTCCCTGCTCATGG 45 680
728942 1947 1962 11512 11527 TCTTTCCCTGCTCATG 54 681
728943 1948 1963 11513 11528 TTCTTTCCCTGCTCAT 16 682
728944 1949 1964 11514 11529 GTTCTTTCCCTGCTCA 56 683
728945 1950 1965 11515 11530 AGTTCTTTCCCTGCTC 56 684
728946 1952 1967 11517 11532 AGAGTTCTTTCCCTGC 56 685
728947 1953 1968 11518 11533 GAGAGTTCTTTCCCTG 54 686
728948 1954 1969 11519 11534 GGAGAGTTCTTTCCCT 32 687
728949 1955 1970 11520 11535 GGGAGAGTTCTTTCCC 1 688
728950 1956 1971 11521 11536 TGGGAGAGTTCTTTCC 24 689
728951 1958 1973 11523 11538 GTTGGGAGAGTTCTTT 29 690
728952 1970 1985 11535 11550 CTAGGCCCCAGGGTTG 35 691
728953 1972 1987 11537 11552 AGCTAGGCCCCAGGGT 23 692
728954 1974 1989 11539 11554 ACAGCTAGGCCCCAGG 64 693
728955 1976 1991 11541 11556 ATACAGCTAGGCCCCA 14 694
表10 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 73 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 69 468
666013 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA 65 695
666015 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT 54 696
729028 2190 2205 11755 11770 AGCTGCCAGCCTTGAG 50 697
729029 2191 2206 11756 11771 TAGCTGCCAGCCTTGA 57 698
729030 2192 2207 11757 11772 GTAGCTGCCAGCCTTG 65 699
729031 2194 2209 11759 11774 GGGTAGCTGCCAGCCT 41 700
729032 2210 2225 11775 11790 TGGACTCTCAAGAAGG 55 701
729033 2211 2226 11776 11791 TTGGACTCTCAAGAAG 37 702
729034 2212 2227 11777 11792 CTTGGACTCTCAAGAA 38 703
729035 2213 2228 11778 11793 TCTTGGACTCTCAAGA 0 704
729036 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG 55 705
729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA 80 706
729038 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC 85 707
729039 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT 74 708
729040 2219 2234 11784 11799 CCAGGTTCTTGGACTC 67 709
729041 2220 2235 11785 11800 TCCAGGTTCTTGGACT 39 710
729042 2222 2237 11787 11802 GCTCCAGGTTCTTGGA 11 711
729043 2223 2238 11788 11803 TGCTCCAGGTTCTTGG 44 712
729044 2224 2239 11789 11804 CTGCTCCAGGTTCTTG 62 713
729045 2225 2240 11790 11805 TCTGCTCCAGGTTCTT 60 714
729046 2226 2241 11791 11806 TTCTGCTCCAGGTTCT 54 715
729047 2227 2242 11792 11807 TTTCTGCTCCAGGTTC 63 716
729048 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT 63 717
729049 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG 76 718
729050 2231 2246 11796 11811 ATTATTTCTGCTCCAG 76 719
729051 2232 2247 11797 11812 AATTATTTCTGCTCCA 58 720
729052 2260 2275 11825 11840 AACATTCATTAATCCA 55 721
729053 2278 2293 11843 11858 ACAGCTGAGTCTGTTT 26 722
729055 2300 2315 11865 11880 TGGTAGTAGTAAAAGG 24 723
729060 2310 2325 11875 11890 TGGGAGCAACTGGTAG 33 724
729064 2322 2337 11887 11902 GGTGGAGCAGCATGGG 14 725
729067 2336 2351 11901 11916 CCGAAACAGGGCCTGG 33 726
729072 2346 2361 11911 11926 CAGTTGGCATCCGAAA 8 727
729077 2385 2400 11950 11965 AATGGTCGCAAGCTGG 26 728
729082 2395 2410 11960 11975 TCCCAGTGCCAATGGT 5 729
729086 2417 2432 11982 11997 CATCAGCCCAGAAGCC 12 730
729090 2427 2442 11992 12007 CCAACTGACCCATCAG 8 731
729095 2437 2452 12002 12017 TTATGAAGGCCCAACT 0 732
729100 2447 2462 12012 12027 AGGTGAGTGTTTATGA 33 733
729105 2457 2472 12022 12037 AAAGCCAGCCAGGTGA 30 734
729106 2486 2501 12051 12066 TTGCTTCAGCCAGCTT 15 735
729110 2496 2511 12061 12076 TTCCACACCCTTGCTT 11 736
729112 2515 2530 12080 12095 ACTGTGCACACATTTA 53 737
729116 2525 2540 12090 12105 AGTTTTCCAGACTGTG 28 738
729120 2536 2551 12101 12116 CTGATTCTGACAGTTT 0 739
729123 2547 2562 12112 12127 TTATGGGAAAACTGAT 0 740
729125 2557 2572 12122 12137 GCCCACCCTTTTATGG 0 741
729129 2567 2582 12132 12147 TGCAATGCTAGCCCAC 54 742
729134 2577 2592 12142 12157 CAAATGCAGCTGCAAT 27 743
729139 2588 2603 12153 12168 TTGAATGGTCCCAAAT 22 744
729144 2599 2614 12164 12179 GAGTGACAGATTTGAA 55 745
729146 2620 2635 12185 12200 AGCACAGGAATATACA 36 746
729150 2637 2652 12202 12217 GCCCTGATATATTTAA 0 747
729155 2647 2662 12212 12227 TACATGCACTGCCCTG 31 748
729160 2657 2672 12222 12237 CAGGATGATTTACATG 5 749
729164 2703 2718 12268 12283 ACTGTCCCCACCTCGG 10 750
729165 2720 2735 12285 12300 ACTAAGAGAACTCACT 31 751
729167 2747 2762 12312 12327 GGCTCTTTAACAACCA 20 752
729170 2761 2776 12326 12341 GCGGGTAGGTGCCAGG 40 753
729175 2771 2786 12336 12351 TGAAGTGAGAGCGGGT 45 754
729180 2789 2804 12354 12369 GTGCAGAGATGACACA 0 755
729182 2800 2815 12365 12380 TGGGCTGGAGTGTGCA 30 756
729185 2820 2835 12385 12400 CAATGGCTGAAGGCAG 14 757
729190 2876 2891 12441 12456 GCTGGGCATCAAGATT 7 758
729194 2885 2900 12450 12465 GTTCTGATGGCTGGGC 50 759
729251 N/A N/A 176 191 CTGGAATGGCAAAACT 12 760
729252 N/A N/A 197 212 GCCACTGGCTCTTTTG 0 761
729253 N/A N/A 207 222 CCCTAGACTGGCCACT 1 762
729254 N/A N/A 218 233 ACGGCGCGGTGCCCTA 10 763
729255 N/A N/A 257 272 AGCCTCGGGCCAGGCC 12 764
729256 N/A N/A 267 282 ATCCGGGCTGAGCCTC 8 765
729257 N/A N/A 292 307 CCCCGCACTGACCTGG 43 766
729258 N/A N/A 302 317 CCACTCCGGGCCCCGC 0 767
729259 N/A N/A 312 327 CCCCGCGAATCCACTC 0 768
729260 N/A N/A 364 379 CGCCCCTGGGCAGCTG 0 769
729635 N/A N/A 228 243 GAGATGCCAGACGGCG 0 770
729636 N/A N/A 344 359 TGAGCTCCGGGCGCGG 5 771
表11 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 74 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 57 468
729261 N/A N/A 502 517 GACCCACCTGTCTGCG 7 772
729262 N/A N/A 512 527 CGGCGGCCGGGACCCA 18 773
729263 N/A N/A 532 547 CGGACGCAGAGAGGAG 20 774
729264 N/A N/A 561 576 CTCCCGCCACCCTCGG 9 775
729265 N/A N/A 571 586 GCCGGCACCGCTCCCG 0 776
729266 N/A N/A 594 609 TAGGCCTAGACTTGGG 26 777
729267 N/A N/A 635 650 TCCCGCCGCCCGCAGG 10 778
729268 N/A N/A 645 660 CCAGTCTTCATCCCGC 33 779
729269 N/A N/A 656 671 CCCGCCCTACTCCAGT 26 780
729270 N/A N/A 686 701 CTCGCTTTCCAGGCGC 4 781
729271 N/A N/A 696 711 CCCCCCCGAGCTCGCT 8 782
729272 N/A N/A 706 721 GCTGTAGGCACCCCCC 19 783
729273 N/A N/A 736 751 TGGAAGTCCCAGGCCG 21 784
729274 N/A N/A 767 782 CCCCAAACCGATCGGG 0 785
729275 N/A N/A 801 816 CCGCCTGGGTCACTGG 11 786
729276 N/A N/A 811 826 GCCCACTCCGCCGCCT 0 787
729277 N/A N/A 866 881 CTGGGCGATGGCGAGG 10 788
729278 N/A N/A 876 891 AACCCCCATTCTGGGC 6 789
729279 N/A N/A 886 901 GGCTCCCGGGAACCCC 11 790
729280 N/A N/A 911 926 TGTGGTCCAAGCCAGC 29 791
729281 N/A N/A 931 946 AGGATCGGGCCTCGCT 30 792
729282 N/A N/A 941 956 ATCGAAAGTAAGGATC 17 793
729283 N/A N/A 957 972 GAGCAAGGGCGAGTGC 29 794
729284 N/A N/A 967 982 GGCCCGGTAAGAGCAA 6 795
729285 N/A N/A 986 1001 TTTCCGAAAGGGTGAG 32 796
729286 N/A N/A 1028 1043 GCCTGAAGATCCCGGG 14 797
729287 N/A N/A 1038 1053 CCTGCCATTGGCCTGA 14 798
729288 N/A N/A 1057 1072 CCCAAACTCTTGCACA 25 799
729289 N/A N/A 1074 1089 ACCTGACACCATCTTC 9 800
729290 N/A N/A 1085 1100 ACGCAGCCTCTACCTG 0 801
729291 N/A N/A 1096 1111 CGAGCCCAGGGACGCA 16 802
729292 N/A N/A 1107 1122 ATTCCCGGCCGCGAGC 19 803
729293 N/A N/A 1117 1132 AGAGTCTGCCATTCCC 44 804
729294 N/A N/A 1157 1172 GAACTATTGCGCCCCA 35 805
729295 N/A N/A 1167 1182 ACCAGCCCAGGAACTA 15 806
729296 N/A N/A 1177 1192 ACCTGAGGAAACCAGC 15 807
729297 N/A N/A 1190 1205 GTTCTGGGACAGGACC 19 808
729298 N/A N/A 1213 1228 CCTCTTCATTGTTGCC 42 809
729299 N/A N/A 1244 1259 CATGCTAGCCTCACTT 23 810
729300 N/A N/A 1268 1283 AACCATCTCCCCACGC 21 811
729301 N/A N/A 1278 1293 GTCCGGAGACAACCAT 13 812
729302 N/A N/A 1308 1323 TCCCAGGTACCCGCTC 7 813
729303 N/A N/A 1330 1345 AGTCCCCCACTCCAGC 23 814
729304 N/A N/A 1342 1357 CGAGGCTGGGAAAGTC 18 815
729305 N/A N/A 1370 1385 CCTCGCCCTGCTGTGT 18 816
729306 N/A N/A 1380 1395 GCACCCCGGTCCTCGC 27 817
729307 N/A N/A 1557 1572 ATTCTGGGCCCTCGAG 3 818
729308 N/A N/A 1579 1594 CTGGTTCTGGTCACTT 41 819
729309 N/A N/A 1591 1606 GCCGAGCCCTCTCTGG 13 820
729310 N/A N/A 1601 1616 CATCGATACAGCCGAG 42 821
729311 N/A N/A 1638 1653 CTTGCCAGAGGGCCTC 40 822
729312 N/A N/A 1676 1691 CCCCATAACTACTGGG 20 823
729313 N/A N/A 1702 1717 GAACCCCTCAGCCCCA 8 824
729314 N/A N/A 1712 1727 TTGACTCTTGGAACCC 40 825
729315 N/A N/A 1722 1737 AGTGCTTCCCTTGACT 20 826
729316 N/A N/A 1748 1763 CTTTAGATAAAAAGGG 12 827
729317 N/A N/A 1758 1773 AAAGTAGGGCCTTTAG 27 828
729318 N/A N/A 1833 1848 GCCCAGAAAGAAGCTT 5 829
729319 N/A N/A 1867 1882 GGTCCAGACAGGCTGA 15 830
729320 N/A N/A 1909 1924 CTCCGGGTCAGCTGCC 25 831
729321 N/A N/A 1919 1934 AATCCCACCCCTCCGG 8 832
729322 N/A N/A 1942 1957 CCCTGTACAGGCCCTG 1 833
729323 N/A N/A 1992 2007 ACATGTCTCCTTGCAA 6 834
729324 N/A N/A 2002 2017 GGTCTGGGTCACATGT 33 835
729325 N/A N/A 2036 2051 GCCAGACAGCAGGCGC 11 836
729326 N/A N/A 2047 2062 TAGTAAGAGTGGCCAG 16 837
729327 N/A N/A 2058 2073 CACAGCAGTCCTAGTA 9 838
729328 N/A N/A 2068 2083 GAGGAAGTGCCACAGC 17 839
729329 N/A N/A 2100 2115 TGCAATTCATGGGCAC 18 840
729330 N/A N/A 2110 2125 ACCCAGGAGCTGCAAT 4 841
729331 N/A N/A 2129 2144 AGACAGTGCCCCCACC 5 842
729332 N/A N/A 2170 2185 TAAGCCCACAGCTCAC 0 843
729333 N/A N/A 2187 2202 GACCTGCTGAGGTGGG 15 844
729637 N/A N/A 716 731 GGCGCACCCTGCTGTA 17 845
729638 N/A N/A 1234 1249 TCACTTTTCCTCCACG 38 846
729639 N/A N/A 1452 1467 GGGCCAGCCCGCGGAG 15 847
729640 N/A N/A 1611 1626 CAGTTTCCTACATCGA 22 848
表12 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 73 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 63 468
729195 N/A N/A 3775 3790 TCGGGTAGCACTTAGG 53 849
729334 N/A N/A 2204 2219 AGTGGGCAGCCCTAGA 12 850
729335 N/A N/A 2224 2239 TGTGAGGCAGCGAAGC 32 851
729336 N/A N/A 2234 2249 CCTACAATTGTGTGAG 10 852
729337 N/A N/A 2258 2273 GAAATCCAACAGCCTG 25 853
729338 N/A N/A 2274 2289 AGCCCCGGAAGGTGGG 11 854
729339 N/A N/A 2284 2299 AATGGACCTGAGCCCC 25 855
729340 N/A N/A 2304 2319 TGGAGCCCTAGACCTA 13 856
729341 N/A N/A 2314 2329 GTGAAATGTATGGAGC 20 857
729342 N/A N/A 2324 2339 GAGTCTCTGGGTGAAA 16 858
729343 N/A N/A 2334 2349 CCAGGCTCCGGAGTCT 0 859
729344 N/A N/A 2365 2380 TGGAAGTTCGGTGTCA 27 860
729345 N/A N/A 2376 2391 GCCCATGACTTTGGAA 8 861
729346 N/A N/A 2386 2401 CCCAATCAAGGCCCAT 16 862
729347 N/A N/A 2405 2420 TAGGTCTAATTCAGAC 6 863
729348 N/A N/A 2415 2430 AGAAAAGGGCTAGGTC 0 864
729349 N/A N/A 2444 2459 TCCATCCTCCTAGAAG 0 865
729350 N/A N/A 2454 2469 CCGAACAGCATCCATC 3 866
729351 N/A N/A 2464 2479 GAGCTCTAACCCGAAC 0 867
729352 N/A N/A 2507 2522 AGGGACTCAGCCTCAA 18 868
729353 N/A N/A 2517 2532 ATGCCACAGAAGGGAC 15 869
729354 N/A N/A 2527 2542 TCTGTCCACCATGCCA 6 870
729355 N/A N/A 2538 2553 ATGAGCGAGAGTCTGT 25 871
729356 N/A N/A 2615 2630 GTGTCAGAGGGCCGCG 28 872
729357 N/A N/A 2625 2640 TCCGACCTCAGTGTCA 20 873
729358 N/A N/A 2635 2650 AAATGATAACTCCGAC 27 874
729359 N/A N/A 2658 2673 GTTTAATACAGAGCAA 36 875
729360 N/A N/A 2668 2683 CAACACGGCTGTTTAA 0 876
729361 N/A N/A 2695 2710 CTGTCAGTCCAGCAGT 29 877
729362 N/A N/A 2708 2723 TGCCTGCCCCCTACTG 5 878
729363 N/A N/A 2755 2770 GAGGCCGTGCAGGCGC 23 879
729364 N/A N/A 2768 2783 GACCCCCTGGGCTGAG 17 880
729365 N/A N/A 2778 2793 CTTCCCTAATGACCCC 19 881
729366 N/A N/A 2799 2814 TCTGCACAGAATCGGG 18 882
729367 N/A N/A 2823 2838 CAAGGGTGGACAGAGG 14 883
729368 N/A N/A 2833 2848 TCTGGCCGAGCAAGGG 24 884
729369 N/A N/A 2843 2858 GGCACACAATTCTGGC 3 885
729370 N/A N/A 2874 2889 GCCCTAGAATAGAGGG 9 886
729371 N/A N/A 2884 2899 AGAGGCCTTGGCCCTA 5 887
729372 N/A N/A 2911 2926 ACCCATAGTTGTATCT 13 888
729373 N/A N/A 2935 2950 GGTTTATAACATGGGT 11 889
729374 N/A N/A 2974 2989 GCACCCCAAACTTGCA 11 890
729375 N/A N/A 2984 2999 GCTGTTCCCCGCACCC 17 891
729376 N/A N/A 2995 3010 TCCCACCCAGAGCTGT 7 892
729377 N/A N/A 3016 3031 CCCCAGACCAAATTTC 0 893
729378 N/A N/A 3026 3041 CGAGTGGGTCCCCCAG 17 894
729379 N/A N/A 3052 3067 ACTCACTGTGGGCTGA 22 895
729380 N/A N/A 3080 3095 GGCTAGACCGGGACAA 29 896
729381 N/A N/A 3090 3105 AAACGAAAGTGGCTAG 11 897
729382 N/A N/A 3108 3123 TCCACCCGGCCCCAGG 3 898
729383 N/A N/A 3329 3344 CCCAGTACCTTTTGGG 0 899
729384 N/A N/A 3339 3354 AAATTCCCTGCCCAGT 6 900
729385 N/A N/A 3372 3387 TGGCCTTGCAGCATGG 27 901
729386 N/A N/A 3386 3401 GTCTGGGCCTGCTTTG 23 902
729387 N/A N/A 3396 3411 AACTCCCTGTGTCTGG 18 903
729388 N/A N/A 3447 3462 CATCAGAAGTGAATGT 8 904
729389 N/A N/A 3458 3473 ACAGCACAGCCCATCA 14 905
729390 N/A N/A 3468 3483 GGGTCATTACACAGCA 23 906
729391 N/A N/A 3509 3524 GCCCTTCACTTGAGAC 13 907
729392 N/A N/A 3519 3534 CATGCCCTTGGCCCTT 8 908
729393 N/A N/A 3530 3545 CTCCCCTTACCCATGC 0 909
729394 N/A N/A 3556 3571 GTCCTGAGTCCCCTTC 0 910
729395 N/A N/A 3567 3582 AACTCTCCACAGTCCT 10 911
729396 N/A N/A 3631 3646 AGGCCAGAGGGACCCT 0 912
729397 N/A N/A 3648 3663 ACTGCCTCCCTGGAGT 0 913
729398 N/A N/A 3695 3710 TGCTACCTACCCAGGG 2 914
729399 N/A N/A 3705 3720 CAGCTCTAACTGCTAC 0 915
729400 N/A N/A 3729 3744 GAAGGCTACAGGAAAC 0 916
729401 N/A N/A 3739 3754 AGCCTGTTAGGAAGGC 0 917
729402 N/A N/A 3749 3764 CGCCTGCCGGAGCCTG 18 918
729403 N/A N/A 3762 3777 AGGAAGGCCCTAACGC 0 919
729641 N/A N/A 2214 2229 CGAAGCATCCAGTGGG 20 920
729642 N/A N/A 2474 2489 AGGTCCACACGAGCTC 30 921
729643 N/A N/A 2593 2608 CAGGCAGCTTAGGGAG 1 922
729644 N/A N/A 2945 2960 CATTTAGTGTGGTTTA 28 923
729645 N/A N/A 3362 3377 GCATGGAGCCTCAGTT 33 924
729646 N/A N/A 3499 3514 TGAGACCCCTGGGTGG 21 925
表13 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 83 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 59 468
666150 N/A N/A 3779 3794 GCATTCGGGTAGCACT 46 926
666168 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC 62 927
729196 N/A N/A 3776 3791 TTCGGGTAGCACTTAG 49 928
729197 N/A N/A 3777 3792 ATTCGGGTAGCACTTA 36 929
729198 N/A N/A 3778 3793 CATTCGGGTAGCACTT 33 930
729199 N/A N/A 3780 3795 CGCATTCGGGTAGCAC 46 931
729200 N/A N/A 3781 3796 ACGCATTCGGGTAGCA 40 932
729201 N/A N/A 3782 3797 CACGCATTCGGGTAGC 59 933
729202 N/A N/A 3783 3798 ACACGCATTCGGGTAG 36 934
729203 N/A N/A 3784 3799 GACACGCATTCGGGTA 35 935
729204 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT 50 936
729205 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA 72 937
729206 N/A N/A 5284 5299 CACCACTGTGTACCCC 71 938
729207 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC 57 939
729208 N/A N/A 5287 5302 AATCACCACTGTGTAC 20 940
729209 N/A N/A 5288 5303 AAATCACCACTGTGTA 32 941
729210 N/A N/A 5289 5304 CAAATCACCACTGTGT 12 942
729211 N/A N/A 5290 5305 TCAAATCACCACTGTG 44 943
729212 N/A N/A 5291 5306 ATCAAATCACCACTGT 42 944
729404 N/A N/A 3812 3827 CTTGGTCCTCCCCCTT 21 945
729405 N/A N/A 3822 3837 CATCTAGGTTCTTGGT 27 946
729406 N/A N/A 3835 3850 CTCTAGGGCCATTCAT 19 947
729407 N/A N/A 3855 3870 GCACCAAACAGATGTT 19 948
729408 N/A N/A 3885 3900 ACCAACTCAACCCACC 13 949
729409 N/A N/A 3895 3910 AATCCCATCAACCAAC 15 950
729410 N/A N/A 3905 3920 TCTTTAGAGAAATCCC 38 951
729411 N/A N/A 3943 3958 AAGGACACCTGCCCTC 6 952
729412 N/A N/A 3954 3969 CTGGAGCTCCCAAGGA 17 953
729413 N/A N/A 3965 3980 AAGAATCTCATCTGGA 4 954
729414 N/A N/A 3975 3990 TGCCCTCAACAAGAAT 0 955
729415 N/A N/A 3995 4010 CTGAGAGTTCCCTCCG 22 956
729416 N/A N/A 4059 4074 CTCCTGCTCAGTCTAC 21 957
729417 N/A N/A 4100 4115 CTGGGACAGCGAGCGC 47 958
729418 N/A N/A 4120 4135 TCTTGTCTCAAGCTGG 32 959
729419 N/A N/A 4140 4155 TGACACCAAAAGCCCG 37 960
729420 N/A N/A 4150 4165 AGTGACTGCCTGACAC 11 961
729421 N/A N/A 4185 4200 GCCCACCCCTTGCTCT 11 962
729422 N/A N/A 4205 4220 CTACTCACACCACAGG 38 963
729423 N/A N/A 4215 4230 CCGCCTTCCACTACTC 26 964
729424 N/A N/A 4225 4240 GGCCAGAGAACCGCCT 14 965
729425 N/A N/A 4241 4256 CAGCAAGCAGCCCGTT 21 966
729426 N/A N/A 4251 4266 CTGCTAACAGCAGCAA 10 967
729427 N/A N/A 4261 4276 CATTCTCCAACTGCTA 43 968
729428 N/A N/A 4272 4287 GCAGAGGCATCCATTC 19 969
729429 N/A N/A 4292 4307 CCCCAGGTGCCCTTTA 7 970
729430 N/A N/A 4304 4319 CTGCGGGCGCGGCCCC 22 971
729431 N/A N/A 4324 4339 GAGTTACGAGTTAGTG 49 972
729432 N/A N/A 4357 4372 TCATGGAATTTTGTGT 31 973
729433 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG 64 974
729434 N/A N/A 4379 4394 GCATCAGCTTTCTTGT 39 975
729435 N/A N/A 4401 4416 TAAGGCCAATTCTCTT 19 976
729436 N/A N/A 4412 4427 ATCTAGGTATTTAAGG 19 977
729437 N/A N/A 4422 4437 TCTCCAGTCCATCTAG 15 978
729438 N/A N/A 4432 4447 AAGGATGGTCTCTCCA 14 979
729439 N/A N/A 4457 4472 CTCAGAGGTCAAGCTA 30 980
729440 N/A N/A 4484 4499 GGTCTGCAGGTGGATG 26 981
729441 N/A N/A 4730 4745 GGGCTTACCTTGAAGA 20 982
729442 N/A N/A 4744 4759 CAACCTCCTCCCCGGG 12 983
729443 N/A N/A 4754 4769 GAGGTCCAGCCAACCT 1 984
729444 N/A N/A 4790 4805 TTATGTGCGCTCCTCT 26 985
729445 N/A N/A 4806 4821 GAGCTGCCTGTGTGCG 31 986
729446 N/A N/A 4817 4832 CCAGCCTCGAGGAGCT 4 987
729447 N/A N/A 4853 4868 CCGGCATCAGCAGCAG 57 988
729448 N/A N/A 4897 4912 AAAGGTGTACCCTGTG 36 989
729449 N/A N/A 5076 5091 AAGATGTGCCCTAGGC 35 990
729450 N/A N/A 5087 5102 GCAGGTTAGAAAAGAT 16 991
729451 N/A N/A 5097 5112 GCTCTAGGGTGCAGGT 49 992
729452 N/A N/A 5107 5122 TCCCCACGATGCTCTA 14 993
729453 N/A N/A 5140 5155 CGAGTTATGGGAAGGC 66 994
729454 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA 75 995
729455 N/A N/A 5190 5205 AACAAGTCCTCATGAG 19 996
729456 N/A N/A 5213 5228 TCCTTTAGCATATGCG 67 997
729647 N/A N/A 3845 3860 GATGTTACCTCTCTAG 38 998
729648 N/A N/A 4016 4031 AGTTTTCTCACCCTCC 49 999
729649 N/A N/A 4049 4064 GTCTACACCCCTAGTT 24 1000
729650 N/A N/A 4195 4210 CACAGGTTAGGCCCAC 44 1001
729651 N/A N/A 4467 4482 GGACAGGGTACTCAGA 26 1002
表14 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 23 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 46 468
666178 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA 51 1003
666184 N/A N/A 6972 6987 TGCCTTTTAATGTTGA 36 1004
666187 N/A N/A 7176 7191 CTAGACAAATATGCAG 29 1005
729213 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC 71 1006
729214 N/A N/A 6541 6556 TGCATTCCATATACAC 28 1007
729215 N/A N/A 6542 6557 TTGCATTCCATATACA 27 1008
729216 N/A N/A 6543 6558 TTTGCATTCCATATAC 3 1009
729217 N/A N/A 6544 6559 TTTTGCATTCCATATA 19 1010
729218 N/A N/A 6545 6560 ATTTTGCATTCCATAT 20 1011
729219 N/A N/A 6969 6984 CTTTTAATGTTGAATT 0 1012
729220 N/A N/A 6970 6985 CCTTTTAATGTTGAAT 0 1013
729221 N/A N/A 6971 6986 GCCTTTTAATGTTGAA 50 1014
729222 N/A N/A 6973 6988 ATGCCTTTTAATGTTG 0 1015
729223 N/A N/A 6974 6989 TATGCCTTTTAATGTT 10 1016
729224 N/A N/A 6975 6990 CTATGCCTTTTAATGT 0 1017
729225 N/A N/A 6976 6991 TCTATGCCTTTTAATG 13 1018
729226 N/A N/A 7171 7186 CAAATATGCAGATATC 3 1019
729227 N/A N/A 7173 7188 GACAAATATGCAGATA 0 1020
729228 N/A N/A 7174 7189 AGACAAATATGCAGAT 1 1021
729229 N/A N/A 7175 7190 TAGACAAATATGCAGA 27 1022
729230 N/A N/A 7177 7192 TCTAGACAAATATGCA 18 1023
729231 N/A N/A 7178 7193 GTCTAGACAAATATGC 0 1024
729232 N/A N/A 7179 7194 AGTCTAGACAAATATG 12 1025
729233 N/A N/A 7180 7195 AAGTCTAGACAAATAT 0 1026
729234 N/A N/A 7181 7196 TAAGTCTAGACAAATA 0 1027
729457 N/A N/A 5292 5307 TATCAAATCACCACTG 0 1028
729458 N/A N/A 5302 5317 TCACTGTGCTTATCAA 22 1029
729459 N/A N/A 5314 5329 TACCTGATCTGATCAC 0 1030
729460 N/A N/A 5325 5340 GATATGCTAAGTACCT 43 1031
729461 N/A N/A 5368 5383 GTTTGTTCCCAACACA 34 1032
729462 N/A N/A 5393 5408 GTATCTGAATCTTATA 22 1033
729463 N/A N/A 5403 5418 GATTGATGATGTATCT 0 1034
729464 N/A N/A 5413 5428 ACAATTGAAAGATTGA 0 1035
729465 N/A N/A 5464 5479 ATCTGGTCAACAGTGT 21 1036
729466 N/A N/A 5606 5621 CAAGGAGGTTGAGATG 0 1037
729467 N/A N/A 5804 5819 GTAGTACATCAATTAA 0 1038
729468 N/A N/A 5814 5829 ATGTACAGTTGTAGTA 0 1039
729469 N/A N/A 5868 5883 AACACTAGGCAACAGA 0 1040
729470 N/A N/A 5878 5893 CCAATGGTGCAACACT 0 1041
729471 N/A N/A 5888 5903 CCACTGCTCACCAATG 0 1042
729472 N/A N/A 5910 5925 TGGAGGTTGTGCTATG 0 1043
729473 N/A N/A 5921 5936 TTGAGCTGAGTTGGAG 0 1044
729474 N/A N/A 6478 6493 ACATCCTAGCATTAAG 0 1045
729475 N/A N/A 6495 6510 AAACTATTATGCGAGG 55 1046
729476 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC 64 1047
729477 N/A N/A 6559 6574 TTCACTTGATTCCAAT 14 1048
729478 N/A N/A 6614 6629 AAGGAAAGCTGATCCT 0 1049
729479 N/A N/A 6624 6639 GTATGTTGGAAAGGAA 19 1050
729480 N/A N/A 6639 6654 AAAAGTGATGTGGACG 23 1051
729481 N/A N/A 6666 6681 CATTCCAGTGGAAATT 2 1052
729482 N/A N/A 6679 6694 AATTGTGCTAAACCAT 10 1053
729483 N/A N/A 6689 6704 TCAGTGACCAAATTGT 30 1054
729484 N/A N/A 6710 6725 CAAGTATCTAAAAACC 0 1055
729485 N/A N/A 6752 6767 CATGACAATGTGGTTT 37 1056
729486 N/A N/A 6762 6777 AGACAGCCTACATGAC 23 1057
729487 N/A N/A 6772 6787 GGAAGCATTAAGACAG 6 1058
729488 N/A N/A 6799 6814 CCCAAAATAATTGAGG 0 1059
729489 N/A N/A 6810 6825 GGAAATCAACCCCCAA 21 1060
729490 N/A N/A 6840 6855 TTGCCTTTGACCCAGC 34 1061
729491 N/A N/A 6887 6902 GCCCAAAAACTAAGAA 0 1062
729492 N/A N/A 6897 6912 TAAGGATCAAGCCCAA 26 1063
729493 N/A N/A 6947 6962 CTGTATTACCTATACA 0 1064
729494 N/A N/A 6958 6973 GAATTTTGTGACTGTA 56 1065
729495 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT 53 1066
729496 N/A N/A 6998 7013 GAGACTTTTTGCTCTA 0 1067
729497 N/A N/A 7019 7034 GTGATGAACCAGGGAA 44 1068
729498 N/A N/A 7045 7060 GGAAAGGCTAGGGAGG 1 1069
729499 N/A N/A 7059 7074 ACGGCTGCCTCTAGGG 9 1070
729500 N/A N/A 7128 7143 AGGATAGTTCCATATT 15 1071
729501 N/A N/A 7145 7160 TATGAAAAGTAGAGGA 0 1072
729502 N/A N/A 7156 7171 CTAGCATTTCTTATGA 2 1073
729503 N/A N/A 7184 7199 TATTAAGTCTAGACAA 0 1074
729504 N/A N/A 7194 7209 CGTCAAGAAGTATTAA 0 1075
729505 N/A N/A 7208 7223 TGACATGTAGCAATCG 28 1076
729652 N/A N/A 6458 6473 TTGGAGAGAGCACAGT 11 1077
729653 N/A N/A 6654 6669 AATTCTACAGTCACGA 26 1078
729654 N/A N/A 7106 7121 CATGTGCATAAAAATC 0 1079
表15 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 78 39 
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 58 468 
666188 N/A N/A 7391 7406 AGAAGCATTCACACAA 41 1080
729235 N/A N/A 7387 7402 GCATTCACACAAAATA 52 1081
729236 N/A N/A 7388 7403 AGCATTCACACAAAAT 54 1082
729237 N/A N/A 7389 7404 AAGCATTCACACAAAA 27 1083
729238 N/A N/A 7390 7405 GAAGCATTCACACAAA 39 1084
729239 N/A N/A 7392 7407 TAGAAGCATTCACACA 41 1085
729240 N/A N/A 7393 7408 ATAGAAGCATTCACAC 22 1086
729241 N/A N/A 7394 7409 CATAGAAGCATTCACA 46 1087
729242 N/A N/A 7395 7410 TCATAGAAGCATTCAC 50 1088
729243 N/A N/A 7396 7411 ATCATAGAAGCATTCA 59 1089
729506 N/A N/A 7218 7233 GTTTATAAGCTGACAT 39 1090
729507 N/A N/A 7228 7243 GCAGGAAACTGTTTAT 55 1091
729508 N/A N/A 7253 7268 ACTGGGCAGCACAAAA 25 1092
729509 N/A N/A 7271 7286 ACCCATTGAATGAAAA 23 1093
729510 N/A N/A 7281 7296 ATTACGGCCAACCCAT 0 1094
729511 N/A N/A 7291 7306 GGCTGGTGAAATTACG 10 1095
729512 N/A N/A 7306 7321 CATCCATCAATGAGGG 51 1096
729513 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA 69 1097
729514 N/A N/A 7328 7343 TGACCCAAAATACCCA 44 1098
729515 N/A N/A 7338 7353 GTGTAAAAGATGACCC 37 1099
729516 N/A N/A 7349 7364 AGCAGTGCTGTGTGTA 48 1100
729517 N/A N/A 7372 7387 ATTGCACACACAAAGT 10 1101
729518 N/A N/A 7397 7412 TATCATAGAAGCATTC 24 1102
729519 N/A N/A 7426 7441 CTATTTGATTTCTAGG 18 1103
729520 N/A N/A 7437 7452 TTTTAACCCAGCTATT 6 1104
729521 N/A N/A 7460 7475 GGTTACCAACATTTCT 42 1105
729522 N/A N/A 7470 7485 GTGAGGTGAGGGTTAC 38 1106
729523 N/A N/A 7508 7523 ACACTGGAGCTGTTGG 51 1107
729524 N/A N/A 7519 7534 ACAGGCTCGAGACACT 31 1108
729525 N/A N/A 7529 7544 TGCACATAGGACAGGC 22 1109
729526 N/A N/A 7550 7565 TAAAGCACTCAGAGCT 16 1110
729527 N/A N/A 7560 7575 TTGATGTCCGTAAAGC 53 1111
729528 N/A N/A 7876 7891 AGCGAAGACTCAAGGG 48 1112
729529 N/A N/A 7887 7902 CATGGAGTGGCAGCGA 42 1113
729530 N/A N/A 7899 7914 AGTTGCCCACCTCATG 22 1114
729531 N/A N/A 7909 7924 ATCTCCTCACAGTTGC 28 1115
729532 N/A N/A 7920 7935 CCTTTGTCTTGATCTC 48 1116
729533 N/A N/A 7936 7951 GCCATGTCACTGCCTC 30 1117
729534 N/A N/A 7953 7968 CGCCAGCTGTGTGCCA 28 1118
729535 N/A N/A 7966 7981 TGGAAGTGCCCCCCGC 34 1119
729536 N/A N/A 7976 7991 GGTTTGAATCTGGAAG 31 1120
729537 N/A N/A 8000 8015 GGTGAGCACCCTGGAG 30 1121
729538 N/A N/A 8027 8042 TCTAAGGAGGACAGCG 35 1122
729539 N/A N/A 8043 8058 GTGAAACAGTGTGATC 40 1123
729540 N/A N/A 8064 8079 ATAGTCCCTGCTCCTG 49 1124
729541 N/A N/A 8144 8159 GTGGGAGTCTGCCACA 6 1125
729542 N/A N/A 8159 8174 GACCTGGTTTGCAGCG 34 1126
729543 N/A N/A 8171 8186 CGCTGAGCCCCAGACC 0 1127
729544 N/A N/A 8181 8196 GGCTGAGCCTCGCTGA 22 1128
729545 N/A N/A 8194 8209 AACTTCGGCTACAGGC 39 1129
729546 N/A N/A 8213 8228 GACTCTACTGTGTGGG 38 1130
729547 N/A N/A 8266 8281 CACAGAGAACCTCATC 11 1131
729548 N/A N/A 8276 8291 AATAGCCGACCACAGA 10 1132
729549 N/A N/A 8489 8504 GCCTGATACCTGTGGG 3 1133
729550 N/A N/A 8525 8540 ATTGCACAGCCTCCCA 8 1134
729551 N/A N/A 8555 8570 ACCCAAGAGCTCATGG 6 1135
729552 N/A N/A 8569 8584 CTTGGCCTGCCTGCAC 10 1136
729553 N/A N/A 8598 8613 TTCCTGGACCACTGCC 15 1137
729554 N/A N/A 8617 8632 GCGGGAGCCCCCGCAT 22 1138
729555 N/A N/A 8637 8652 GCCCTGGGTGTCATGA 17 1139
729556 N/A N/A 8648 8663 CACTCCTGGAAGCCCT 0 1140
729557 N/A N/A 8661 8676 GACCCATCCCAGCCAC 7 1141
729558 N/A N/A 8671 8686 ATATGCCAGTGACCCA 15 1142
729559 N/A N/A 8681 8696 GCCATTCCTGATATGC 28 1143
729560 N/A N/A 8691 8706 TGCACGCCAAGCCATT 28 1144
729561 N/A N/A 8711 8726 GAAGCACCCAGGTCCC 24 1145
729562 N/A N/A 8722 8737 ATGGTAAGGAAGAAGC 18 1146
729563 N/A N/A 8732 8747 AACGAGGGCAATGGTA 11 1147
729564 N/A N/A 8763 8778 CCATGAGACCTAGGCT 3 1148
729565 N/A N/A 8773 8788 ACTCCATGGGCCATGA 3 1149
729566 N/A N/A 8794 8809 GGATTGGGAAAGACCT 15 1150
729567 N/A N/A 8817 8832 CGAGGTGGAGGGCACA 11 1151
729568 N/A N/A 8827 8842 CAACACAGGGCGAGGT 8 1152
729569 N/A N/A 8859 8874 TATGCAGCTTCTGCCT 3 1153
729655 N/A N/A 7480 7495 TGGCAATTAGGTGAGG 48 1154
729656 N/A N/A 8101 8116 CAAGCTACATGAAATC 11 1155
729657 N/A N/A 8627 8642 TCATGACCTAGCGGGA 11 1156
表16 靶向SEQ ID NO: 1及2的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 83 39 
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 64 468 
666208 N/A N/A 9349 9364 CAGTTTAGCTCAGGCA 69 1157
729244 N/A N/A 9344 9359 TAGCTCAGGCAAGACC 32 1158
729245 N/A N/A 9345 9360 TTAGCTCAGGCAAGAC 17 1159
729246 N/A N/A 9346 9361 TTTAGCTCAGGCAAGA 23 1160
729247 N/A N/A 9347 9362 GTTTAGCTCAGGCAAG 24 1161
729248 N/A N/A 9348 9363 AGTTTAGCTCAGGCAA 47 1162
729249 N/A N/A 9353 9368 GCCTCAGTTTAGCTCA 23 1163
729250 N/A N/A 9354 9369 AGCCTCAGTTTAGCTC 9 1164
729570 N/A N/A 8869 8884 CTGTAGCTCCTATGCA 14 1165
729571 N/A N/A 8895 8910 AGAAGCAAGATCCCCT 2 1166
729572 N/A N/A 8905 8920 ATGTCGGAGGAGAAGC 0 1167
729573 N/A N/A 8915 8930 AAAGGAGTCAATGTCG 0 1168
729574 N/A N/A 8925 8940 GCAGGGCAGTAAAGGA 12 1169
729575 N/A N/A 8948 8963 GTCTGCACAGCAGGGA 24 1170
729576 N/A N/A 9021 9036 AACCCACACTCACCTC 25 1171
729577 N/A N/A 9046 9061 CGTCCAGGGCTCCACC 13 1172
729578 N/A N/A 9060 9075 GACAGCAGAGAGCTCG 9 1173
729579 N/A N/A 9082 9097 GCGGAAACCTAAGGCC 12 1174
729580 N/A N/A 9118 9133 ATTGAGAGGGCCACGG 27 1175
729581 N/A N/A 9133 9148 GAAACAAGGAGAACTA 29 1176
729582 N/A N/A 9151 9166 TTCAGAATCCCAGGAG 21 1177
729583 N/A N/A 9167 9182 GACTGTGCTCCTATCG 27 1178
729584 N/A N/A 9195 9210 GACAATGCCCTGGGAA 55 1179
729585 N/A N/A 9205 9220 ACAGGGTAATGACAAT 28 1180
729586 N/A N/A 9219 9234 CGTGGGTCACACACAC 39 1181
729587 N/A N/A 9233 9248 AGCCCCAACTGCTGCG 25 1182
729588 N/A N/A 9249 9264 GGAGTCAGACCTACCA 18 1183
729589 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC 73 1184
729590 N/A N/A 9285 9300 GCCCTTTGCCTCACTT 17 1185
729591 N/A N/A 9324 9339 CTCCGGTCCCAGCTCG 6 1186
729592 N/A N/A 9334 9349 AAGACCCTGCCTCCGG 23 1187
729593 N/A N/A 9355 9370 TAGCCTCAGTTTAGCT 0 1188
729594 N/A N/A 9375 9390 GAACTATGAGGCAACT 10 1189
729595 N/A N/A 9385 9400 TAACAGGCGAGAACTA 9 1190
729596 N/A N/A 9427 9442 GAAAGGAGGACAGGTT 0 1191
729597 N/A N/A 9467 9482 TGAAGGGACACCACCA 31 1192
729598 N/A N/A 9533 9548 TAGACCCCCAACCACC 5 1193
729599 N/A N/A 9553 9568 CCTATAGCTTCTCTGT 51 1194
729600 N/A N/A 9567 9582 AGGTACCTATGGTACC 9 1195
729601 N/A N/A 9578 9593 AGCCCCCTTCCAGGTA 28 1196
729602 N/A N/A 9590 9605 TAGCCTCCCATCAGCC 11 1197
729603 N/A N/A 9602 9617 CCTGGGCCACCCTAGC 11 1198
729604 N/A N/A 9634 9649 CGAACTGCCTCCCAGG 7 1199
729605 N/A N/A 9645 9660 TGCCACCTCCACGAAC 39 1200
729606 N/A N/A 9655 9670 CGGCTGTCAGTGCCAC 17 1201
729607 N/A N/A 9683 9698 CACTGCATCTACAGAG 17 1202
729608 N/A N/A 9998 10013 CAGCCATGGGTCCTTA 18 1203
729609 N/A N/A 10009 10024 TTCCCCGTGCCCAGCC 0 1204
729610 N/A N/A 10025 10040 AATCCCCCAGCACTGC 22 1205
729611 N/A N/A 10041 10056 TTGCCAATCCTACCCC 31 1206
729612 N/A N/A 10073 10088 CACCCAAGGGAGTCCA 22 1207
729613 N/A N/A 10099 10114 AGCCCCATCCGCCCTC 3 1208
729614 N/A N/A 10157 10172 GGCCCATCCCGTCCTT 0 1209
729615 N/A N/A 10183 10198 GGTCGGTCACTGTGGG 8 1210
729616 N/A N/A 10581 10596 CTTTGGGCCCTCACCA 0 1211
729617 N/A N/A 10591 10606 AGGATCACAGCTTTGG 12 1212
729618 N/A N/A 10616 10631 ATGCCCTGGGCAAGAG 8 1213
729619 N/A N/A 10627 10642 AGGCTGGAACCATGCC 0 1214
729620 N/A N/A 10637 10652 CCCTAGTCAGAGGCTG 11 1215
729621 N/A N/A 10647 10662 AAATCAAGGTCCCTAG 2 1216
729622 N/A N/A 10658 10673 GCTCTGCATCAAAATC 7 1217
729623 N/A N/A 10780 10795 ATGTACCTGTACAGTA 14 1218
729624 N/A N/A 10800 10815 CCGACTTTGGGATAGG 15 1219
729625 N/A N/A 10810 10825 CAAGCCAAGGCCGACT 36 1220
729626 N/A N/A 10820 10835 CCCCAGTTTTCAAGCC 13 1221
729627 N/A N/A 10833 10848 TAGCCCCAGGATTCCC 5 1222
729628 N/A N/A 10883 10898 AAGTTCACACTGCTCA 38 1223
729629 N/A N/A 10914 10929 CGGCTCTGAGCCTTGA 0 1224
729630 N/A N/A 10933 10948 AGTAATAGACCGCATT 21 1225
729631 N/A N/A 10952 10967 AGGACAGCCATCAGGG 8 1226
729632 N/A N/A 10962 10977 GCTGTGCATGAGGACA 17 1227
729633 N/A N/A 10972 10987 GCCAGATCCAGCTGTG 0 1228
729634 N/A N/A 11023 11038 ACCACCTGGGAGGCAA 16 1229
729658 N/A N/A 8885 8900 TCCCCTGAGAGGCTGC 20 1230
729659 N/A N/A 9543 9558 CTCTGTATACTAGACC 64 1231
729660 N/A N/A 10134 10149 ACGCCTCCCCATTCTG 6 1232
729661 N/A N/A 10894 10909 CTCTGGCCGCCAAGTT 5 1233
表17 靶向SEQ ID NO: 3的3-10-3 cEt間隔體對IRF5 RNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 3 起始位點 SEQ ID NO: 3 終止位點 序列 (5' 至 3') IRF5 ( 抑制 %) SEQ ID NO
728399 96 111 TCTGTCTGCGGTGCGC 26 1234
728400 98 113 GGTCTGTCTGCGGTGC 23 1235
728539 591 606 GCATCTGTGAGGCTCA 21 1236
728540 593 608 CTGCATCTGTGAGGCT 30 1237
728541 595 610 CACTGCATCTGTGAGG 8 1238
728542 597 612 TGCACTGCATCTGTGA 20 1239
728543 599 614 ACTGCACTGCATCTGT 12 1240
實例 2 ：經修飾寡核苷酸在 KARPAS-229 細胞中的人類 IRF5 反義抑制
在篩選的第二階段中，經修飾寡核苷酸設計成與上述篩選第一階段中最活躍的前導序列/位點相鄰的位點。簡短來說，微步(microwalk)篩選第一階段的活化前導序列，直到大約達到先前測試或否決的位點。測試了幾種不同的化學修飾，這些修飾在下表化學符號列中指明，其中符號「d」是指2'-去氧核糖糖，符號「s」是指硫代磷酸酯核苷間鍵結，符號「k」是指經cEt修飾的糖，而符號「m C」是指5-甲基胞嘧啶。
以自由攝取法將4,000 nM經修飾寡核苷酸對密度為每孔10,000個細胞的經培養KARPAS-229細胞進行處理。在大約48小時的處理期後，從細胞分離出RNA，並藉由定量型即時RTPCR來測量​​IRF5 mRNA的量。使用人類引子探針組RTS4524 (正向序列TTCGAGATCTTCTTCTGCTTTGG，在本文被定名為SEQ ID NO：14；反向序列GCACCACCTGTACAGTAATGAGCTT；在本文被定名為SEQ ID NO：15；探針序列CCTGACCGCAAACCCCGAGAGAA，在本文被定名為SEQ ID NO：16)來測量mRNA的量。根據RNA總含量(如藉由RIBOGREEN®測量)來調整IRF5 mRNA的量。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現。如本文所用，值「0」指示用經修飾寡核苷酸處理不會抑制IRF5 mRNA水平。「N/A」指示經修飾寡核苷酸不以100%互補性靶向那個基因序列。 表18 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 ( 抑制 %) SEQ ID NO
666178 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cds Aks m Cks Ak 21 1003
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 48 436
728894 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cks Aks Gk 45 633
729213 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tks Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cds Ads m Cks Aks m Ck 28 1006
729476 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Ck 79 1047
785370 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cks Aes Gks Tes m Ck 25 631
785371 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Aks Tes m Cks Aes Gk 15 633
785392 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Aes m Cks Aes m Ck 31 1006
785393 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cds Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aks m Ces Aks m Ces Ak 39 1003
785394 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Ces m Cks Aes Tk 21 1241
785395 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cds m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aks Tes Tks m Ces m Ck 37 1047
785425 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Ces Aks Ges Tks m Ce 32 631
785426 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cks Aes Tks m Ces Aks Ge 2 633
785447 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aks m Ces Aks m Ces Aks m Ce 7 1006
785448 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cds Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tks Aes m Cks Aes m Cks Ae 34 1003
785449 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tes m Cks m Ces Aks Te 19 1241
785450 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cds m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cks Aes Tks Tes m Cks m Ce 6 1047
785471 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aes m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tes m Ces Aks Gk 26 633
785483 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aes Tks Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cds Aes m Ces Aks m Ck 24 1006
785484 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Ces Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Ces Aes m Cks Ak 48 1003
785485 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Ces m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tes Tes m Cks m Ck 76 1047
785513 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cks Aes Gks Te 36 632
785514 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Ces Aks Ge 23 633
785535 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cds Aks m Ces Aks m Ce 30 1006
785536 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Aes m Cks Ae 37 1003
785537 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Ces m Cks Ae 57 1242
785538 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tes m Cks m Ce 40 1047
785558 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Aes Tes m Ces Aes Gks Tk 24 632
785570 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aes m Ces Aes m Ces Aks m Ck 21 1006
785571 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aes Tes Tes m Ces m Cks Ak 48 1242
785609 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC m Cks Aks Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Ces Aks Ges Tks m Ck 23 631
785610 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Aks Tes m Cks Aes Gks Tk 15 632
785611 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cks Aes Tks m Ces Aks Gk 17 633
785640 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aks m Ces Aks m Ces Aks m Ck 17 1006
785641 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tks Aes m Cks Aes m Cks Ak 0 1003
785642 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tes m Cks m Ces Aks Tk 32 1241
785643 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aks Tes Tks m Ces m Cks Ak 39 1242
785644 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cks Aes Tks Tes m Cks m Ck 15 1047
785667 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tes m Ces Aes Gks Tk 41 632
785679 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Ces Aes m Ces Aks m Ck 21 1006
785680 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tes Tes m Ces m Cks Ak 30 1242
785697 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Cds Aks Gds Tk 28 632
785709 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Ads m Cks Ads m Ck 25 1006
785710 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tds m Cks m Cds Ak 42 1242
785738 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Ces Aks Ges Tk 16 632
785739 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Aks Tes m Cks Aes Gk 22 633
785760 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Aes m Cks Aes m Ck 54 1006
785761 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aks m Ces Aks m Ces Ak 2 1003
785762 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tes m Cks m Ces Ak 11 1242
785763 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aks Tes Tks m Ces m Ck 29 1047
785784 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Aks Tds m Cks Ads Gk 39 633
785796 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tks Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Ads m Cks Ads m Ck 40 1006
785797 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aks m Cds Aks m Cds Ak 0 1003
785798 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aks Tds Tks m Cds m Ck 32 1047
785826 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Aks Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Ces Aks Ges Tk 14 632
785827 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Aks Tes m Cks Aes Gk 43 633
785848 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tks Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Aes m Cks Aes m Ck 32 1006
785849 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Aks m Ces Aks m Ces Ak 0 1003
785850 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tes m Cks m Ces Ak 42 1242
785851 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aks Tes Tks m Ces m Ck 51 1047
785872 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Ces Aks Ge 38 633
785884 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tks Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cds Aks m Ces Aks m Ce 28 1006
785885 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Aes m Cks Ae 45 1003
785886 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tes m Cks m Ce 14 1047
785914 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT Aks m Cks Aks Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cks Aks Gks Te 11 632
785915 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG m Cks Aks m Cks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Ads m Cds Ads Tks m Cks Aks Ge 25 633
785936 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC m Cks Aks Tks Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cds Aks m Cks Aks m Ce 39 1006
785937 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA Gks m Cks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Tds Ads Tds Ads m Cks Aks m Cks Ae 25 1003
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 80 1242
785939 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC Tks m Cks m Cks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tks m Cks m Ce 7 1047
786505 N/A N/A 6546 6561 AATTTTGCATTCCATA Aks Aks Tks Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tds m Cds m Cds Aks Tks Ak 41 1243
786506 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT m Cks Aks Aks Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tds m Cds m Cks Aks Tk 52 1241
786507 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tds m Cks m Cks Ak 78 1242
786508 N/A N/A 6550 6565 TTCCAATTTTGCATTC Tks Tks m Cks m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tks Tks m Ck 39 1244
786509 N/A N/A 6551 6566 ATTCCAATTTTGCATT Aks Tks Tks m Cds m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Aks Tks Tk 21 1245
786510 N/A N/A 6553 6568 TGATTCCAATTTTGCA Tks Gks Aks Tds Tds m Cds m Cds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gks m Cks Ak 17 1246
786511 N/A N/A 6555 6570 CTTGATTCCAATTTTG m Cks Tks Tks Gds Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Ads Tds Tds Tks Tks Gk 20 1247
786512 N/A N/A 6557 6572 CACTTGATTCCAATTT m Cks Aks m Cks Tds Tds Gds Ads Tds Tds m Cds m Cds Ads Ads Tks Tks Tk 36 1248
表19 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665795 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cds Tks Gks Gk 31 113
728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Aks Gks Gk 0 1249
728695 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tds Gks Aks Gk 0 423
728696 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Gks Ak 21 424
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 38 436
785345 383 398 4708 4723 TATCTCCGTCCTGGCT Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cds Tks Ges Gks m Ces Tk 0 116
785346 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tds Tds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cks m Ces Tks Ges Gk 0 113
785350 482 497 8375 8390 GGGCACAGCGCAGGTT Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Aks Ges Gks Tes Tk 37 1250
785351 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Ads Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gks m Ces Aks Ges Gk 0 1249
785355 1268 1283 10501 10516 AGTCATGGGCTGAGGC Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tds Gks Aes Gks Ges m Ck 25 421
785356 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ges Gk 0 422
785357 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Aes Gk 0 423
785358 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gks m Ces Tks Ges Ak 0 424
785405 482 497 8375 8390 GGGCACAGCGCAGGTT Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cks Aes Gks Ges Tks Te 33 1250
785406 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Ads Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cks Ges m Cks Aes Gks Ge 0 1249
785410 1268 1283 10501 10516 AGTCATGGGCTGAGGC Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ges Gks m Ce 17 421
785411 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Aes Gks Ge 0 422
785412 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gks m Ces Tks Ges Aks Ge 0 423
785413 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gks Ges m Cks Tes Gks Ae 7 424
785457 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tes Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Ces Tes Gks Gk 13 113
785460 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aes Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Ces Aes Gks Gk 0 1249
785462 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Ges Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tes Ges Aks Gk 12 423
785463 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tes Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Ces Tes Gks Ak 0 424
785489 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cds Tks Ges Gks m Ce 0 117
785490 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tes Gks Ge 0 113
785495 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cks Aes Gks Ge 0 1249
785499 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tds Gks Aes Gks Ge 40 422
785500 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ge 0 423
785501 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Ae 0 424
785545 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Ces m Ces Tes Ges Gks m Ck 0 117
785550 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Ces Tes Ges Aes Gks Gk 5 422
785551 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Ges m Ces Tes Ges Aks Gk 15 423
785575 383 398 4708 4723 TATCTCCGTCCTGGCT Tks Aks Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tes Gks Ges m Cks Tk 6 116
785576 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cks m Ces Tks Ges Gks m Ck 0 117
785577 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tks m Ces m Cks Tes Gks Gk 0 113
785583 482 497 8375 8390 GGGCACAGCGCAGGTT Gks Gks Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cks Aes Gks Ges Tks Tk 61 1250
785584 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cks Ges m Cks Aes Gks Gk 0 1249
785590 1268 1283 10501 10516 AGTCATGGGCTGAGGC Aks Gks Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ges Gks m Ck 17 421
785591 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Aes Gks Gk 0 422
785592 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gks m Ces Tks Ges Aks Gk 0 423
785593 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gks Ges m Cks Tes Gks Ak 0 424
785654 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Ces Tes Ges Gks m Ck 5 117
785659 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tes Ges Aes Gks Gk 30 422
785660 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Ces Tes Ges Aks Gk 16 423
785684 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tds Gks Gds m Ck 14 117
785689 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Gds Aks Gds Gk 31 422
785690 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tds Gks Ads Gk 12 423
785714 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tes Gks Ges m Ck 0 117
785715 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cks m Ces Tks Ges Gk 0 113
785720 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gks m Ces Aks Ges Gk 0 1249
785724 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ges Gk 15 422
785725 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Aes Gk 0 423
785726 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gks m Ces Tks Ges Ak 0 424
785770 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cks m Cds Tks Gds Gk 27 113
785773 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gks m Cds Aks Gds Gk 12 1249
785775 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tds Gks Ads Gk 3 423
785776 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gks m Cds Tks Gds Ak 0 424
785802 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Aks Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tes Gks Ges m Ck 0 117
785803 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cks m Ces Tks Ges Gk 0 113
785808 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gks m Ces Aks Ges Gk 0 1249
785812 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gks Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ges Gk 0 422
785813 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Aes Gk 0 423
785814 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gks m Ces Tks Ges Ak 0 424
785858 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tes Gks Ge 0 113
785861 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cks Aes Gks Ge 0 1249
785863 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Ges Aks Ge 17 423
785864 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tes Gks Ae 9 424
785890 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC Tks Tks Aks Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cds Tks Gks Gks m Ce 0 117
785891 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tks Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tks Gks Ge 33 113
785896 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cks Aks Gks Ge 3 1249
785900 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG Gks Aks Gks Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tds Gks Aks Gks Ge 0 422
785901 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cds Tks Gks Aks Ge 11 423
785902 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA Aks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Gds m Cks Tks Gks Ae 20 424
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 71 1242
786473 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG Gks Tds Tds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tks m Ces m Cks Tes Gks Ge 0 113
786474 383 398 4708 4723 TATCTCCGTCCTGGCT Tks Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cds Gds Tds m Cds m Cks Tes Gks Ges m Cks Te 0 116
786495 483 498 8376 8391 AGGGCACAGCGCAGGT Aks Gks Gks Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Ads Gks Gks Tk 2 1251
786496 485 500 8378 8393 TAAGGGCACAGCGCAG Tks Aks Aks Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cks Aks Gk 0 1252
786497 486 501 8379 8394 TTAAGGGCACAGCGCA Tks Tks Aks Ads Gds Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gks m Cks Ak 0 1253
表20 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cds Gks Gks Ak 1 387
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG Gks m Cks Aks m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Gks Gk 14 39
728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Ck 10 1254
728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Aks Gks Gk 48 1249
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC Tks Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Gks m Ck 18 398
728705 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cds m Cks Gks m Ck 33 433
728706 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tks m Cks m Ck 41 434
728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tks m Ck 43 435
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 14 436
729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Cks Ak 68 706
785354 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Ges m Cks Ges Gk 0 39
785359 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cds m Cks Ges m Cks Tes Gk 46 391
785360 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cks m Ces m Cks Ges m Ck 37 433
785361 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Ces Tks m Ces m Ck 0 434
785362 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Tes m Ck 18 435
785363 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gds m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gks Aes m Cks m Ces Tk 0 436
785409 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Aks Ges Gks m Ces Gks Ge 0 39
785414 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Ces Gks m Ces Tks Ge 40 391
785415 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tks m Ces m Cks m Ces Gks m Ce 35 433
785416 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Tes m Cks m Ce 0 434
785417 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gks Aes m Cks m Ces Tks m Ce 17 435
785418 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gds m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tks Ges Aks m Ces m Cks Te 14 436
785464 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Ges Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Ces m Ces Gks m Ck 33 433
785465 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tes Tks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Ces Tes m Cks m Ck 36 434
785466 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Ces Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Ces m Ces Tks m Ck 46 435
785467 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Ges m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aes m Ces m Cks Tk 38 436
785498 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Ges m Cks Ge 16 388
785502 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cds m Cks Ges m Cks Te 65 432
785503 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Ces Gks m Ce 0 433
785504 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tes m Cks m Ce 39 434
785505 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Ces Tks m Ce 9 435
785506 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Te 0 436
785549 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Ces Aes Ges Ges m Cks Gk 0 388
785552 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Ces m Ces m Ces Ges m Cks Tk 34 432
785553 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aes m Ces m Ces Tes m Cks m Ck 20 434
785554 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Ges Aes m Ces m Ces Tks m Ck 19 435
785588 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG Gks m Cks Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Aks Ges Gks m Ces Gks Gk 0 39
785589 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cks Aes Gks Ges m Cks Gk 0 388
785594 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG Tks m Cks Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Ces Gks m Ces Tks Gk 19 391
785595 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cks m Ces m Cks Ges m Cks Tk 26 432
785596 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tks m Ces m Cks m Ces Gks m Ck 44 433
785597 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Tes m Cks m Ck 0 434
785598 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gks Aes m Cks m Ces Tks m Ck 21 435
785599 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tks Ges Aks m Ces m Cks Tk 0 436
785658 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Aes Ges Ges m Cks Gk 18 388
785661 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Ces m Ces Ges m Cks Tk 54 432
785662 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Ces m Ces Tes m Cks m Ck 11 434
785663 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aes m Ces m Ces Tks m Ck 10 435
785688 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Aks Gds Gks m Cds Gk 0 388
785691 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Cds Gks m Cds Tk 46 432
785692 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cds Tks m Cds m Ck 13 434
785693 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Cds m Cks Tds m Ck 11 435
785723 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Aks Ges Gks m Ces Gk 0 388
785727 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Ces Gks m Ces Tk 40 432
785728 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cks m Ces m Cks Ges m Ck 7 433
785729 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Ces Tks m Ces m Ck 3 434
785730 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Tes m Ck 33 435
785731 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cds Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gks Aes m Cks m Ces Tk 8 436
785777 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cks m Cds m Cks Gds m Ck 4 433
785778 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cds Tks m Cds m Ck 19 434
785779 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Cds m Cks Tds m Ck 30 435
785780 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gks Ads m Cks m Cds Tk 12 436
785811 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cks Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Aks Ges Gks m Ces Gk 0 388
785815 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cks Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Ces Gks m Ces Tk 23 432
785816 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cks m Ces m Cks Ges m Ck 29 433
785817 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Ces Tks m Ces m Ck 1 434
785818 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Tes m Ck 0 435
785819 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gks Aes m Cks m Ces Tk 3 436
785865 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Ces Gks m Ce 7 433
785866 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tes m Cks m Ce 15 434
785867 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Ces Tks m Ce 35 435
785868 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Ces m Cks Te 26 436
785899 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG Tks Gks m Cks Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Gks m Cks Ge 0 388
785903 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT Gks Tks m Cks Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cds m Cks Gks m Cks Te 51 432
785904 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cds Tds m Cds m Cks m Cks Gks m Ce 22 433
785905 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC m Cks Tks Tks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tks m Cks m Ce 6 434
785906 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tks m Ce 29 435
785907 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Aks m Cks m Cks Te 10 436
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 30 1242
表21 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 ( 抑制 %) SEQ ID NO
665908 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tds Tks Gks Gk 16 393
728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Ck 50 1254
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC Tks Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Gks m Ck 8 398
728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tks m Ck 0 435
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 16 436
729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Cks Ak 0 706
729038 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tks m Ck 0 707
729039 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Cks Tk 0 708
785364 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tds Tks Ges Gks Aes Ak 0 454
785365 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gds Tds m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tks Tes Tks Ges Gk 0 393
785378 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Ces Aks Aes Gk 0 705
785379 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Aes Ak 35 695
785380 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ces Ak 9 706
785381 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Tes m Ck 34 707
785382 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Ads Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aks m Ces Tks m Ces Tk 0 708
785419 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tes Gks Ges Aks Ae 0 454
785420 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gds Tds m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tks Tes Tks Tes Gks Ge 0 393
785433 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Aes Aks Ge 0 705
785434 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ces Aks Ae 0 695
785435 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Tes m Cks Ae 0 706
785436 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aks m Ces Tks m Ces Tks m Ce 0 707
785437 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Ads Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gks Aes m Cks Tes m Cks Te 0 708
785468 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Ges Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tes Tes Gks Gk 13 393
785475 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Ges Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Ces Tes m Cks Ak 60 706
785476 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Ges Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tes m Ces Tks m Ck 0 707
785477 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aes Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Ces Tes m Cks Tk 48 708
785507 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tds Tks Ges Gks Ae 0 455
785508 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tes Gks Ge 0 393
785521 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Ces Aks Ae 27 695
785522 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Ae 51 706
785523 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ce 41 707
785524 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Te 28 708
785555 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tes Tes Tes Ges Gks Ak 0 455
785562 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tes m Ces Tes m Ces Aks Ak 8 695
785563 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Ces Tes m Ces Tes m Cks Ak 54 706
785564 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aes m Ces Tes m Ces Tks m Ck 17 707
785600 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA Tks m Cks Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tes Gks Ges Aks Ak 0 454
785601 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tks Tes Tks Ges Gks Ak 0 455
785602 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tks Tes Tks Tes Gks Gk 0 393
785621 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG Tks Tks m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Aes Aks Gk 0 705
785622 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ces Aks Ak 0 695
785623 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Tes m Cks Ak 0 706
785624 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aks m Ces Tks m Ces Tks m Ck 0 707
785625 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gks Aes m Cks Tes m Cks Tk 0 708
785664 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tes Tes Ges Gks Ak 0 455
785671 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Ces Tes m Ces Aks Ak 22 695
785672 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tes m Ces Tes m Cks Ak 48 706
785673 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Ces Tes m Ces Tks m Ck 0 707
785694 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tds Gks Gds Ak 0 455
785701 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tds m Cks Ads Ak 20 695
785702 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Cds Tks m Cds Ak 29 706
785703 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tds m Cks Tds m Ck 36 707
785732 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tes Gks Ges Ak 0 455
785733 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tks Tes Tks Ges Gk 3 393
785746 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Aes Ak 31 695
785747 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ces Ak 0 706
785748 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Tes m Ck 38 707
785749 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gds Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aks m Ces Tks m Ces Tk 0 708
785781 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tks Tds Tks Gds Gk 0 393
785788 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Cds Tks m Cds Ak 28 706
785789 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tds m Cks Tds m Ck 0 707
785790 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aks m Cds Tks m Cds Tk 0 708
785820 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cks Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tes Gks Ges Ak 0 455
785821 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tks Tes Tks Ges Gk 2 393
785834 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tks m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Aes Ak 0 695
785835 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ces Ak 25 706
785836 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Tes m Ck 8 707
785837 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Aks m Ces Tks m Ces Tk 0 708
785869 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tes Gks Ge 17 393
785876 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tes m Cks Ae 48 706
785877 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Ces Tks m Ce 0 707
785878 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tes m Cks Te 1 708
785908 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA Gks Tks m Cks Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tds Tks Gks Gks Ae 0 455
785909 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Gds Gds m Cds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tks Gks Ge 0 393
785922 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA Gks Tks Tks m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Cks Aks Ae 37 695
785923 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cks Tks m Cks Ae 0 706
785924 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC Aks Gks Gks Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tks m Cks Tks m Ce 19 707
785925 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT m Cks Aks Gks Gds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cks Tks m Cks Te 0 708
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 71 1242
表22 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 ( 抑制 %) SEQ ID NO
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 12 436
728898 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cks Aks m Ck 33 637
729049 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cds Aks Gks Gk 55 718
729589 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gks Tks m Ck 0 1184
785372 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cks Aes m Cks Aes Tk 16 635
785373 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cds Tds Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tks m Ces m Cks Aes m Ck 17 637
785383 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cds Aks Ges Gks Tes Tk 39 696
785384 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tds Ads Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cks m Ces Aks Ges Gk 0 718
785400 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gks Tes m Cks Aes Gk 4 1255
785401 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gks Aes Gks Tes m Ck 0 1184
785427 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Ces Aks m Ces Aks Te 0 635
785428 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cds Tds Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ces Aks m Ce 0 637
785438 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aes Gks Ges Tks Te 13 696
785439 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tds Ads Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tks m Ces m Cks Aes Gks Ge 0 718
785455 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Ges Tks m Ces Aks Ge 0 1255
785456 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gks Ges Aks Ges Tks m Ce 0 1184
785472 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Ces Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Ces m Ces Aks m Ck 0 637
785478 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tes Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Ces Aes Gks Gk 56 718
785488 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Ces Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aes Ges Tks m Ck 14 1184
785515 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cks Aes m Cks Ae 19 636
785516 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tds Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Ces Aks m Ce 8 637
785525 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cds Aks Ges Gks Te 49 717
785526 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Ads Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aes Gks Ge 26 718
785543 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gks Tes m Cks Ae 8 1256
785544 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Ges Tks m Ce 0 1184
785559 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tes m Ces m Ces Aes m Cks Ak 11 636
785565 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Ces m Ces Aes Ges Gks Tk 43 717
785574 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Ges Aes Ges Tes m Cks Ak 0 1256
785612 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT Tks Gks Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Ces Aks m Ces Aks Tk 0 635
785613 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tks m Ces m Cks Aes m Cks Ak 0 636
785614 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tds Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ces Aks m Ck 29 637
785626 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT Aks Tks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aes Gks Ges Tks Tk 6 696
785627 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cks m Ces Aks Ges Gks Tk 0 717
785628 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Ads Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tks m Ces m Cks Aes Gks Gk 0 718
785651 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG Tks Tks m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Ges Tks m Ces Aks Gk 0 1255
785652 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gks Aes Gks Tes m Cks Ak 0 1256
785653 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gks Ges Aks Ges Tks m Ck 0 1184
785668 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Ces m Ces Aes m Cks Ak 10 636
785674 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Ces Aes Ges Gks Tk 44 717
785683 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aes Ges Tes m Cks Ak 0 1256
785698 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Cds Aks m Cds Ak 6 636
785704 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Ads Gks Gds Tk 27 717
785713 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Gds Tks m Cds Ak 0 1256
785740 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Ces Aks m Ces Ak 23 636
785741 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tds Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tks m Ces m Cks Aes m Ck 5 637
785750 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aes Gks Ges Tk 5 717
785751 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Ads Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cks m Ces Aks Ges Gk 9 718
785768 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Ges Tks m Ces Ak 0 1256
785769 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gks Aes Gks Tes m Ck 0 1184
785785 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tks m Cds m Cks Ads m Ck 35 637
785791 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cks m Cds Aks Gds Gk 57 718
785801 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gks Ads Gks Tds m Ck 0 1184
785828 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gks Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Ces Aks m Ces Ak 0 636
785829 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tks m Ces m Cks Aes m Ck 0 637
785838 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aes Gks Ges Tk 24 717
785839 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cks m Ces Aks Ges Gk 23 718
785856 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tks m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Ges Tks m Ces Ak 0 1256
785857 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gks Aes Gks Tes m Ck 0 1184
785873 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Ces Aks m Ce 3 637
785879 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aes Gks Ge 43 718
785889 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Ges Tks m Ce 1 1184
785916 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA m Cks Tks Gks Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cds m Cks Aks m Cks Ae 28 636
785917 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC Gks m Cks Tks Gds Tds m Cds Ads m Cds Ads Tds m Cds Tds m Cks m Cks Aks m Ce 23 637
785926 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT Tks Aks Tks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cds Aks Gks Gks Te 45 717
785927 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG Tks Tks Aks Tds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Tds m Cds m Cks Aks Gks Ge 28 718
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 75 1242
785944 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tks m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gks Tks m Cks Ae 0 1256
785945 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC m Cks m Cks Tks Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Gks Tks m Ce 0 1184
786513 N/A N/A 9250 9265 GGGAGTCAGACCTACC Gks Gks Gks Ads Gds Tds m Cds Ads Gds Ads m Cds m Cds Tds Aks m Cks m Ck 0 1257
786514 N/A N/A 9252 9267 CAGGGAGTCAGACCTA m Cks Aks Gks Gds Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Gds Ads m Cds m Cks Tks Ak 0 1258
786515 N/A N/A 9254 9269 TGCAGGGAGTCAGACC Tks Gks m Cks Ads Gds Gds Gds Ads Gds Tds m Cds Ads Gds Aks m Cks m Ck 0 1259
786516 N/A N/A 9256 9271 TCTGCAGGGAGTCAGA Tks m Cks Tks Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gds Tds m Cds Aks Gks Ak 0 1260
786517 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG Tks Tks m Cks Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gds Tds m Cks Aks Gk 0 1255
786518 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA m Cks Tks Tks m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Ads Gds Tks m Cks Ak 0 1256
786519 N/A N/A 9260 9275 GCCTTCTGCAGGGAGT Gks m Cks m Cks Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gds Aks Gks Tk 0 1261
786520 N/A N/A 9261 9276 TGCCTTCTGCAGGGAG Tks Gks m Cks m Cds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gds Gks Aks Gk 0 1262
786521 N/A N/A 9262 9277 TTGCCTTCTGCAGGGA Tks Tks Gks m Cds m Cds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Ads Gds Gks Gks Ak 0 1263
786522 N/A N/A 9264 9279 ATTTGCCTTCTGCAGG Aks Tks Tks Tds Gds m Cds m Cds Tds Tds m Cds Tds Gds m Cds Aks Gks Gk 0 1264
786523 N/A N/A 9266 9281 TCATTTGCCTTCTGCA Tks m Cks Aks Tds Tds Tds Gds m Cds m Cds Tds Tds m Cds Tds Gks m Cks Ak 6 1265
表23 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 ( 抑制 %) SEQ ID NO
728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Ck 37 1254
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 37 436
728998 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cks Aks Ak 42 208
729018 2172 2187 11737 11752 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Ads Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 63 228
729454 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gks m Cks Ak 56 995
785376 2117 2132 11682 11697 GAAGTGAGTCTCAAAC Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cks Aes Aks Aes m Ck 44 207
785377 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gds Gds Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cks Tes m Cks Aes Ak 11 208
785387 N/A N/A 5168 5183 GAGTGAGACGAGCAAA Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gks m Ces Aks Aes Ak 18 1266
785388 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gds Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gks Aes Gks m Ces Ak 37 995
785431 2117 2132 11682 11697 GAAGTGAGTCTCAAAC Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Ces Aks Aes Aks m Ce 11 207
785432 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gds Gds Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tks m Ces Tks m Ces Aks Ae 23 208
785442 N/A N/A 5168 5183 GAGTGAGACGAGCAAA Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Ges m Cks Aes Aks Ae 6 1266
785443 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gds Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cks Ges Aks Ges m Cks Ae 0 995
785474 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Ges Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tes m Ces Aks Ak 43 208
785480 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Ges Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aes Ges m Cks Ak 22 995
785519 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cks Aes Aks Ae 55 1267
785520 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gds Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Ces Aks Ae 39 208
785529 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gks m Ces Aks Ae 33 1268
785530 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Ges m Cks Ae 28 995
785561 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Ces Tes m Ces Aes Aks Ak 34 1267
785567 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Ges Aes Ges m Ces Aks Ak 17 1268
785618 2117 2132 11682 11697 GAAGTGAGTCTCAAAC Gks Aks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Ces Aks Aes Aks m Ck 27 207
785619 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cks Tes m Cks Aes Aks Ak 36 1267
785620 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gds Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tks m Ces Tks m Ces Aks Ak 20 208
785632 N/A N/A 5168 5183 GAGTGAGACGAGCAAA Gks Aks Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Ges m Cks Aes Aks Ak 17 1266
785633 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gks Aes Gks m Ces Aks Ak 38 1268
785634 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cks Ges Aks Ges m Cks Ak 35 995
785670 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tes m Ces Aes Aks Ak 32 1267
785676 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aes Ges m Ces Aks Ak 25 1268
785700 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Cds Aks Ads Ak 12 1267
785706 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Gds m Cks Ads Ak 16 1268
785744 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Ces Aks Aes Ak 25 1267
785745 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gds Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cks Tes m Cks Aes Ak 42 208
785754 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Ges m Cks Aes Ak 27 1268
785755 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gks Aes Gks m Ces Ak 36 995
785787 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cks Tds m Cks Ads Ak 40 208
785793 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gks Ads Gks m Cds Ak 37 995
785832 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Aks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Ces Aks Aes Ak 45 1267
785833 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cks Tes m Cks Aes Ak 24 208
785842 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Aks Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Ges m Cks Aes Ak 5 1268
785843 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gks Aes Gks m Ces Ak 24 995
785875 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Ces Aks Ae 21 208
785881 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Ges m Cks Ae 42 995
785920 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Aks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cks Aks Aks Ae 49 1267
785921 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA Aks Gks Gks Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Cks Aks Ae 47 208
785930 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Aks Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gks m Cks Aks Ae 33 1268
785931 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA Aks Gks Gks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Gks m Cks Ae 37 995
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 10 1242
786501 2118 2133 11683 11698 GGAAGTGAGTCTCAAA Gks Gks Aks Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Aks Aks Ak 51 1267
786502 2120 2135 11685 11700 GAGGAAGTGAGTCTCA Gks Aks Gks Gds Ads Ads Gds Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tks m Cks Ak 0 1269
786503 2171 2186 11736 11751 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 59 1270
786504 2173 2188 11738 11753 ATCTGATATGATACCT Aks Tks m Cks Tds Gds Ads Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cks m Cks Tk 36 1271
786524 N/A N/A 5141 5156 ACGAGTTATGGGAAGG Aks m Cks Gks Ads Gds Tds Tds Ads Tds Gds Gds Gds Ads Aks Gks Gk 74 1272
786525 N/A N/A 5143 5158 GGACGAGTTATGGGAA Gks Gks Aks m Cds Gds Ads Gds Tds Tds Ads Tds Gds Gds Gks Aks Ak 37 1273
786526 N/A N/A 5145 5160 TAGGACGAGTTATGGG Tks Aks Gks Gds Ads m Cds Gds Ads Gds Tds Tds Ads Tds Gks Gks Gk 25 1274
786527 N/A N/A 5147 5162 AGTAGGACGAGTTATG Aks Gks Tks Ads Gds Gds Ads m Cds Gds Ads Gds Tds Tds Aks Tks Gk 0 1275
786528 N/A N/A 5149 5164 TGAGTAGGACGAGTTA Tks Gks Aks Gds Tds Ads Gds Gds Ads m Cds Gds Ads Gds Tks Tks Ak 18 1276
786529 N/A N/A 5151 5166 GGTGAGTAGGACGAGT Gks Gks Tks Gds Ads Gds Tds Ads Gds Gds Ads m Cds Gds Aks Gks Tk 48 1277
786530 N/A N/A 5153 5168 AGGGTGAGTAGGACGA Aks Gks Gks Gds Tds Gds Ads Gds Tds Ads Gds Gds Ads m Cks Gks Ak 19 1278
786531 N/A N/A 5155 5170 AAAGGGTGAGTAGGAC Aks Aks Aks Gds Gds Gds Tds Gds Ads Gds Tds Ads Gds Gks Aks m Ck 24 1279
786532 N/A N/A 5157 5172 GCAAAGGGTGAGTAGG Gks m Cks Aks Ads Ads Gds Gds Gds Tds Gds Ads Gds Tds Aks Gks Gk 24 1280
786533 N/A N/A 5159 5174 GAGCAAAGGGTGAGTA Gks Aks Gks m Cds Ads Ads Ads Gds Gds Gds Tds Gds Ads Gks Tks Ak 0 1281
786534 N/A N/A 5161 5176 ACGAGCAAAGGGTGAG Aks m Cks Gks Ads Gds m Cds Ads Ads Ads Gds Gds Gds Tds Gks Aks Gk 47 1282
786535 N/A N/A 5163 5178 AGACGAGCAAAGGGTG Aks Gks Aks m Cds Gds Ads Gds m Cds Ads Ads Ads Gds Gds Gks Tks Gk 35 1283
786536 N/A N/A 5164 5179 GAGACGAGCAAAGGGT Gks Aks Gks Ads m Cds Gds Ads Gds m Cds Ads Ads Ads Gds Gks Gks Tk 40 1284
786537 N/A N/A 5165 5180 TGAGACGAGCAAAGGG Tks Gks Aks Gds Ads m Cds Gds Ads Gds m Cds Ads Ads Ads Gks Gks Gk 22 1285
786538 N/A N/A 5166 5181 GTGAGACGAGCAAAGG Gks Tks Gks Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gds m Cds Ads Ads Aks Gks Gk 49 1286
786539 N/A N/A 5167 5182 AGTGAGACGAGCAAAG Aks Gks Tks Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gds m Cds Ads Aks Aks Gk 16 1287
786540 N/A N/A 5168 5183 GAGTGAGACGAGCAAA Gks Aks Gks Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gds m Cds Aks Aks Ak 27 1266
786541 N/A N/A 5169 5184 GGAGTGAGACGAGCAA Gks Gks Aks Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Ads Gds m Cks Aks Ak 37 1268
786542 N/A N/A 5171 5186 TAGGAGTGAGACGAGC Tks Aks Gks Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gds Aks Gks m Ck 1 1288
786543 N/A N/A 5172 5187 ATAGGAGTGAGACGAG Aks Tks Aks Gds Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cds Gks Aks Gk 16 1289
786544 N/A N/A 5173 5188 AATAGGAGTGAGACGA Aks Aks Tks Ads Gds Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Ads m Cks Gks Ak 25 1290
786545 N/A N/A 5174 5189 TAATAGGAGTGAGACG Tks Aks Aks Tds Ads Gds Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gds Aks m Cks Gk 12 1291
786546 N/A N/A 5175 5190 GTAATAGGAGTGAGAC Gks Tks Aks Ads Tds Ads Gds Gds Ads Gds Tds Gds Ads Gks Aks m Ck 11 1292
786547 N/A N/A 5177 5192 GAGTAATAGGAGTGAG Gks Aks Gks Tds Ads Ads Tds Ads Gds Gds Ads Gds Tds Gks Aks Gk 33 1293
786548 N/A N/A 5179 5194 ATGAGTAATAGGAGTG Aks Tks Gks Ads Gds Tds Ads Ads Tds Ads Gds Gds Ads Gks Tks Gk 56 1294
786549 N/A N/A 5181 5196 TCATGAGTAATAGGAG Tks m Cks Aks Tds Gds Ads Gds Tds Ads Ads Tds Ads Gds Gks Aks Gk 11 1295
786550 N/A N/A 5183 5198 CCTCATGAGTAATAGG m Cks m Cks Tks m Cds Ads Tds Gds Ads Gds Tds Ads Ads Tds Aks Gks Gk 0 1296
表24 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸的IRF5 mRNA抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 抑制 % SEQ ID NO
665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cds Gks Gks Ak 0 387
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG Gks m Cks Aks m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Gks Gk 0  39
728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Ck 27 1254
728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Aks Gks Gk 42 1249
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC Tks Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Gks m Ck 21 398
728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tks m Ck 52 435
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 40 436
728958 1979 1994 11544 11559 CCTATACAGCTAGGCC m Cks m Cks Tks Ads Tds Ads m Cds Ads Gds m Cds Tds Ads Gds Gks m Cks m Ck 0 168
729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Cks Ak 68 706
729494 N/A N/A 6958 6973 GAATTTTGTGACTGTA Gks Aks Aks Tds Tds Tds Tds Gds Tds Gds Ads m Cds Tds Gks Tks Ak 57 1065
729495 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cds Tks Tks Tk 70 1066
785352 1225 1240 10458 10473 CTGACACAGGCGGATG m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cds Gks Ges Aks Tes Gk 0 1297
785353 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gks m Ces Gks Ges Ak 0 387
785396 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cds Tks Tes Tks Tes Ak 37 1298
785397 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cds m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cks m Ces Tks Tes Tk 0 1066
785407 1225 1240 10458 10473 CTGACACAGGCGGATG m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Ges Gks Aes Tks Ge 0 1297
785408 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Ges m Cks Ges Gks Ae 0 387
785451 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tes Tks Tes Tks Ae 13 1298
785452 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cds m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gks m Ces m Cks Tes Tks Te 10 1066
785461 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aes m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Ces Ges Gks Ak 0 387
785486 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Ces m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Ces Tes Tks Tk 51 1066
785496 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cds Gks Ges Aks Te 0 397
785497 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Ges Gks Ae 0 387
785539 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cds Tks Tes Tks Te 61 1299
785540 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tes Tks Te 51 1066
785548 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Ges m Ces Ges Ges Aks Tk 0 397
785572 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Ces m Ces Tes Tes Tks Tk 17 1299
785585 1225 1240 10458 10473 CTGACACAGGCGGATG m Cks Tks Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Ges Gks Aes Tks Gk 0 1297
785586 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gks m Ces Gks Ges Aks Tk 0 397
785587 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Ges m Cks Ges Gks Ak 0 387
785645 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA m Cks Aks Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tes Tks Tes Tks Ak 56 1298
785646 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cks m Ces Tks Tes Tks Tk 3 1299
785647 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gks m Ces m Cks Tes Tks Tk 0 1066
785657 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Ces Ges Ges Aks Tk 0 397
785681 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Ces Tes Tes Tks Tk 50 1299
785687 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Gds Gks Ads Tk 6 397
785711 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tds Tks Tds Tk 46 1299
785721 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Ges Gks Aes Tk 0 397
785722 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gks m Ces Gks Ges Ak 0 387
785764 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tes Tks Tes Tk 62 1299
785765 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cks m Ces Tks Tes Tk 40 1066
785774 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gks m Cds Gks Gds Ak 0 387
785799 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cks m Cds Tks Tds Tk 11 1066
785809 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tks Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Ges Gks Aes Tk 0 397
785810 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gks m Ces Gks Ges Ak 0 387
785852 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Aks Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tes Tks Tes Tk 44 1299
785853 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cks m Ces Tks Tes Tk 15 1066
785862 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Ges Gks Ae 0 387
785887 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tes Tks Te 49 1066
785897 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT Aks m Cks Tks Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cds Gks Gks Aks Te 0 397
785898 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Gks Gks Ae 0 387
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 0 1242
785940 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Aks Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cds Tks Tks Tks Te 58 1299
785941 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT Aks m Cks m Cks Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tks Tks Te 59 1066
786551 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA m Cks Aks Tks Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cds Tds Tds Tks Tks Ak 24 1298
786552 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT m Cks m Cks Aks Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cds Tds Tks Tks Tk 43 1299
786553 N/A N/A 6982 6997 AACCATTCTATGCCTT Aks Aks m Cks m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cds m Cks Tks Tk 33 1300
786554 N/A N/A 6983 6998 AAACCATTCTATGCCT Aks Aks Aks m Cds m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gds m Cks m Cks Tk 0 1301
786555 N/A N/A 6984 6999 TAAACCATTCTATGCC Tks Aks Aks Ads m Cds m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tds Gks m Cks m Ck 9 1302
786556 N/A N/A 6985 7000 CTAAACCATTCTATGC m Cks Tks Aks Ads Ads m Cds m Cds Ads Tds Tds m Cds Tds Ads Tks Gks m Ck 0 1303
786557 N/A N/A 6987 7002 CTCTAAACCATTCTAT m Cks Tks m Cks Tds Ads Ads Ads m Cds m Cds Ads Tds Tds m Cds Tks Aks Tk 0 1304
786558 N/A N/A 6989 7004 TGCTCTAAACCATTCT Tks Gks m Cks Tds m Cds Tds Ads Ads Ads m Cds m Cds Ads Tds Tks m Cks Tk 0 1305
786559 N/A N/A 6991 7006 TTTGCTCTAAACCATT Tks Tks Tks Gds m Cds Tds m Cds Tds Ads Ads Ads m Cds m Cds Aks Tks Tk 2 1306
786560 N/A N/A 6994 7009 CTTTTTGCTCTAAACC m Cks Tks Tks Tds Tds Tds Gds m Cds Tds m Cds Tds Ads Ads Aks m Cks m Ck 0 1307
786561 N/A N/A 6997 7012 AGACTTTTTGCTCTAA Aks Gks Aks m Cds Tds Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Tds m Cds Tks Aks Ak 0 1308
786587 N/A N/A 6948 6963 ACTGTATTACCTATAC Aks m Cks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Ads m Cds m Cds Tds Ads Tks Aks m Ck 22 1309
786588 N/A N/A 6949 6964 GACTGTATTACCTATA Gks Aks m Cks Tds Gds Tds Ads Tds Tds Ads m Cds m Cds Tds Aks Tks Ak 41 1310
786589 N/A N/A 6950 6965 TGACTGTATTACCTAT Tks Gks Aks m Cds Tds Gds Tds Ads Tds Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Tk 18 1311
786590 N/A N/A 6951 6966 GTGACTGTATTACCTA Gks Tks Gks Ads m Cds Tds Gds Tds Ads Tds Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 62 1312
786591 N/A N/A 6952 6967 TGTGACTGTATTACCT Tks Gks Tks Gds Ads m Cds Tds Gds Tds Ads Tds Tds Ads m Cks m Cks Tk 81 1313
786592 N/A N/A 6953 6968 TTGTGACTGTATTACC Tks Tks Gks Tds Gds Ads m Cds Tds Gds Tds Ads Tds Tds Aks m Cks m Ck 56 1314
786593 N/A N/A 6954 6969 TTTGTGACTGTATTAC Tks Tks Tks Gds Tds Gds Ads m Cds Tds Gds Tds Ads Tds Tks Aks m Ck 50 1315
786594 N/A N/A 6955 6970 TTTTGTGACTGTATTA Tks Tks Tks Tds Gds Tds Gds Ads m Cds Tds Gds Tds Ads Tks Tks Ak 2 1316
786595 N/A N/A 6956 6971 ATTTTGTGACTGTATT Aks Tks Tks Tds Tds Gds Tds Gds Ads m Cds Tds Gds Tds Aks Tks Tk 4 1317
786596 N/A N/A 6957 6972 AATTTTGTGACTGTAT Aks Aks Tks Tds Tds Tds Gds Tds Gds Ads m Cds Tds Gds Tks Aks Tk 0 1318
786597 N/A N/A 6959 6974 TGAATTTTGTGACTGT Tks Gks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds Tds Gds Ads m Cds Tks Gks Tk 64 1319
786598 N/A N/A 6960 6975 TTGAATTTTGTGACTG Tks Tks Gks Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds Tds Gds Ads m Cks Tks Gk 45 1320
786599 N/A N/A 6961 6976 GTTGAATTTTGTGACT Gks Tks Tks Gds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds Tds Gds Aks m Cks Tk 0 1321
786600 N/A N/A 6962 6977 TGTTGAATTTTGTGAC Tks Gks Tks Tds Gds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gds Tds Gks Aks m Ck 26 1322
表25 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 抑制 % SEQ ID NO
728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Ck 12 1254
728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Aks Gks Gk 0 1249
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC Tks Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Gks m Ck 6 398
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 11 436
729513 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cks m Cks Ak 12 1097
785349 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gds Tds Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cks Tes Gks Tes m Ck 0 1254
785398 N/A N/A 7314 7329 CAATGCAACATCCATC m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cks m Ces Aks Tes m Ck 0 1323
785399 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cds m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aks Tes m Cks m Ces Ak 0 1097
785404 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gds Tds Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cks m Ces Tks Ges Tks m Ce 0 1254
785453 N/A N/A 7314 7329 CAATGCAACATCCATC m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Ces m Cks Aes Tks m Ce 0 1323
785454 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cds m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cks Aes Tks m Ces m Cks Ae 0 1097
785459 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Ges Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tes Ges Tks m Ck 5 1254
785487 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Ces m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tes m Ces m Cks Ak 0 1097
785493 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tes m Cks Te 0 1324
785494 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tds Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Ges Tks m Ce 21 1254
785541 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cks m Ces Aks Te 0 1325
785542 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Ces m Cks Ae 0 1097
785547 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Ces Tes Ges Tes m Cks Tk 0 1324
785573 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aes Tes m Ces m Ces Aks Tk 0 1325
785581 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cks Tes Gks Tes m Cks Tk 0 1324
785582 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tds Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cks m Ces Tks Ges Tks m Ck 0 1254
785648 N/A N/A 7314 7329 CAATGCAACATCCATC m Cks Aks Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Ces m Cks Aes Tks m Ck 0 1323
785649 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aks Tes m Cks m Ces Aks Tk 0 1325
785650 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cks Aes Tks m Ces m Cks Ak 0 1097
785656 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tes Ges Tes m Cks Tk 16 1324
785682 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tes m Ces m Ces Aks Tk 0 1325
785686 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Gds Tks m Cds Tk 0 1324
785712 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Cds m Cks Ads Tk 0 1325
785718 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Ges Tks m Ces Tk 0 1324
785719 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tds Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cks Tes Gks Tes m Ck 26 1254
785766 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Ces m Cks Aes Tk 0 1325
785767 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aks Tes m Cks m Ces Ak 0 1097
785772 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cks Tds Gks Tds m Ck 1 1254
785800 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aks Tds m Cks m Cds Ak 0 1097
785806 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gks Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Ges Tks m Ces Tk 0 1324
785807 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cks Tes Gks Tes m Ck 0 1254
785854 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Aks Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Ces m Cks Aes Tk 0 1325
785855 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aks Tes m Cks m Ces Ak 0 1097
785860 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Ges Tks m Ce 0 1254
785888 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Ces m Cks Ae 0 1097
785894 426 441 8319 8334 GTGTATTTCCCTGTCT Gks Tks Gks Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Cks Te 30 1324
785895 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Gks Tks m Ce 0 1254
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 61 1242
785942 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Aks Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cks m Cks Aks Te 16 1325
785943 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA m Cks m Cks m Cks Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Cks m Cks Ae 0 1097
786494 428 443 8321 8336 CGGTGTATTTCCCTGT m Cks Gks Gks Tds Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tks Gks Tk 0 1326
786562 N/A N/A 7307 7322 ACATCCATCAATGAGG Aks m Cks Aks Tds m Cds m Cds Ads Tds m Cds Ads Ads Tds Gds Aks Gks Gk 0 1327
786563 N/A N/A 7309 7324 CAACATCCATCAATGA m Cks Aks Aks m Cds Ads Tds m Cds m Cds Ads Tds m Cds Ads Ads Tks Gks Ak 0 1328
786564 N/A N/A 7311 7326 TGCAACATCCATCAAT Tks Gks m Cks Ads Ads m Cds Ads Tds m Cds m Cds Ads Tds m Cds Aks Aks Tk 0 1329
786565 N/A N/A 7312 7327 ATGCAACATCCATCAA Aks Tks Gks m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cds m Cds Ads Tds m Cks Aks Ak 0 1330
786566 N/A N/A 7313 7328 AATGCAACATCCATCA Aks Aks Tks Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cds m Cds Ads Tks m Cks Ak 0 1331
786567 N/A N/A 7314 7329 CAATGCAACATCCATC m Cks Aks Aks Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cds m Cds Aks Tks m Ck 0 1323
786568 N/A N/A 7315 7330 CCAATGCAACATCCAT m Cks m Cks Aks Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tds m Cds m Cks Aks Tk 0 1325
786569 N/A N/A 7317 7332 ACCCAATGCAACATCC Aks m Cks m Cks m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Ads Tks m Cks m Ck 33 1332
786570 N/A N/A 7318 7333 TACCCAATGCAACATC Tks Aks m Cks m Cds m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cds Aks Tks m Ck 0 1333
786571 N/A N/A 7319 7334 ATACCCAATGCAACAT Aks Tks Aks m Cds m Cds m Cds Ads Ads Tds Gds m Cds Ads Ads m Cks Aks Tk 1 1334
表26 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 抑制 % SEQ ID NO
665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA m Cks Aks m Cks Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cds Gks Gks Ak 0 387
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG Gks m Cks Aks m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gds Gds m Cks Gks Gk 0 39 
666168 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Aks m Cks m Ck 11 927
728458 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cds Tks m Cks m Ck 0 123
728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC Gks Gks Tks Gds Tds Ads Tds Tds Tds m Cds m Cds m Cds Tds Gks Tks m Ck 37 1254
728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG Aks Aks Gks Gds Gds m Cds Ads m Cds Ads Gds m Cds Gds m Cds Aks Gks Gk 2 1249
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC Tks Tks Gks m Cds Ads m Cds Tds Gds Ads m Cds Ads m Cds Ads Gks Gks m Ck 0 398
728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC Gks m Cks Tks Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cds m Cks Tks m Ck 0 435
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT Aks Gks m Cks Tds Tds Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Gds Ads m Cks m Cks Tk 41 436
728958 1979 1994 11544 11559 CCTATACAGCTAGGCC m Cks m Cks Tks Ads Tds Ads m Cds Ads Gds m Cds Tds Ads Gds Gks m Cks m Ck 0 168
728996 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cds m Cks Aks Gk 9 206
729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA Gks Gks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Gds Ads m Cds Tds m Cds Tks m Cks Ak 47 706
785347 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cds Tks m Ces m Cks Ges Tk 0 122
785348 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gds Ads Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tks m Ces Tks m Ces m Ck 0 123
785374 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cds m Cks Aes Gks Ges Gk 0 205
785375 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Aks m Ces m Cks Aes Gk 0 206
785390 N/A N/A 5284 5299 CACCACTGTGTACCCC m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Aks m Ces m Cks m Ces m Ck 0 938
785391 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tds m Cds Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gks Tes Aks m Ces m Ck 0 927
785402 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ces Gks Te 0 122
785403 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gds Ads Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Aks Tes m Cks Tes m Cks m Ce 0 123
785429 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Ces Aks Ges Gks Ge 6 205
785430 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tds Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Aks Aes m Cks m Ces Aks Ge 0 206
785445 N/A N/A 5284 5299 CACCACTGTGTACCCC m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aes m Cks m Ces m Cks m Ce 0 938
785446 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tds m Cds Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tks Ges Tks Aes m Cks m Ce 0 927
785458 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Ges Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Ces Tes m Cks m Ck 0 123
785473 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tes Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Ces m Ces Aks Gk 22 206
785482 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tes m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tes Aes m Cks m Ck 0 927
785491 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cds Tks m Ces m Cks Ge 0 1335
785492 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Ads Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ce 0 123
785517 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cds m Cks Aes Gks Ge 7 1336
785518 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Ces Aks Ge 31 206
785533 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Aks m Ces m Cks m Ce 0 939
785534 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cds Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aes m Cks m Ce 0 927
785546 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tes m Ces Tes m Ces m Cks Gk 0 1335
785560 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Aes m Ces m Ces Aes Gks Gk 0 1336
785569 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Ges Tes Aes m Ces m Cks m Ck 0 939
785578 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT Aks Tks Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ces Gks Tk 0 122
785579 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tks m Ces Tks m Ces m Cks Gk 0 1335
785580 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Ads Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Aks Tes m Cks Tes m Cks m Ck 0 123
785615 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG Gks Aks Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Ces Aks Ges Gks Gk 0 205
785616 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Aks m Ces m Cks Aes Gks Gk 0 1336
785617 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Aks Aes m Cks m Ces Aks Gk 9 206
785637 N/A N/A 5284 5299 CACCACTGTGTACCCC m Cks Aks m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aes m Cks m Ces m Cks m Ck 0 938
785638 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gks Tes Aks m Ces m Cks m Ck 0 939
785639 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cds Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tks Ges Tks Aes m Cks m Ck 0 927
785655 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Ces Tes m Ces m Cks Gk 0 1335
785669 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Ces m Ces Aes Gks Gk 0 1336
785678 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tes Aes m Ces m Cks m Ck 0 939
785685 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tds m Cks m Cds Gk 0 1335
785699 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Cds Aks Gds Gk 0 1336
785708 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Ads m Cks m Cds m Ck 0 939
785716 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ces Gk 0 1335
785717 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Ads Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tks m Ces Tks m Ces m Ck 0 123
785742 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Ces Aks Ges Gk 0 1336
785743 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Aks m Ces m Cks Aes Gk 0 206
785758 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aes m Cks m Ces m Ck 0 939
785759 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cds Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gks Tes Aks m Ces m Ck 0 927
785771 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tks m Cds Tks m Cds m Ck 0 123
785786 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Aks m Cds m Cks Ads Gk 0 206
785795 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gks Tds Aks m Cds m Ck 0 927
785804 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tks Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ces Gk 0 1335
785805 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tks m Ces Tks m Ces m Ck 0 123
785830 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Ces Aks Ges Gk 0 1336
785831 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Aks m Ces m Cks Aes Gk 0 206
785846 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Aks m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aes m Cks m Ces m Ck 0 939
785847 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gks Tes Aks m Ces m Ck 0 927
785859 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tes m Cks m Ce 8 123
785874 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Ces Aks Ge 0 206
785883 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aes m Cks m Ce 0 927
785892 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG Gks Aks Tks Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cds Tks m Cks m Cks Ge 0 1335
785893 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC Aks Gks Aks Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tks m Cks m Ce 0 123
785918 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cds m Cks Aks Gks Ge 0 1336
785919 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG Gks Tks Gks Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Cks Aks Ge 44 206
785934 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC Tks m Cks Aks m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Aks m Cks m Cks m Ce 21 939
785935 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC Aks Tks m Cks Ads m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tks Aks m Cks m Ce 19 927
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 68 1242
786493 393 408 4718 4733 AAGATGGTGTTATCTC Aks Aks Gks Ads Tds Gds Gds Tds Gds Tds Tds Ads Tds m Cks Tks m Ck 0 1337
786499 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG Tks Gks Aks Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cds m Cds Aks Gks Gk 16 1336
786500 2115 2130 11680 11695 AGTGAGTCTCAAACCA Aks Gks Tks Gds Ads Gds Tds m Cds Tds m Cds Ads Ads Ads m Cks m Cks Ak 0 1338
表27 靶向SEQ ID NO: 1及2之經修飾寡核苷酸對IRF5 mRNA之抑制
化合物編號 SEQ ID NO: 1 起始位點 SEQ ID NO: 1 終止位點 SEQ ID NO: 2 起始位點 SEQ ID NO: 2 終止位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 抑制 % SEQ ID NO
728806 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tds m Cks Tks Gk 32 539
729205 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cds m Cks m Cks Ak 75 937
729433 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tks Gks Gk 60 974
785368 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tds m Cks Tes Gks Ges Gk 0 537
785369 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gks Tes m Cks Tes Gk 68 539
785385 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tks Ges Gks Aes Ak 42 1339
785386 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tds Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cks Aes Tks Ges Gk 44 974
785389 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cks m Ces m Cks m Ces Ak 43 937
785423 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Ces Tks Ges Gks Ge 33 537
785424 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gds Gds Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gks Ges Tks m Ces Tks Ge 40 539
785440 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tes Gks Ges Aks Ae 35 1339
785441 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tds Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tks m Ces Aks Tes Gks Ge 8 974
785444 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cds m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Aks m Ces m Cks m Ces m Cks Ae 40 937
785470 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Ges Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tes m Ces Tks Gk 49 539
785479 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tes Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Gks Gk 55 974
785481 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Ces m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Ces m Ces m Cks Ak 63 937
785511 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tds m Cks Tes Gks Ge 67 538
785512 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gds Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Ces Tks Ge 43 539
785527 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tks Ges Gks Ae 44 1340
785528 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tes Gks Ge 38 974
785531 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cds m Cks m Ces Aks Te 19 936
785532 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cks m Ces m Cks Ae 66 937
785557 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Ges Tes m Ces Tes Gks Gk 56 538
785566 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Ces Aes Tes Ges Gks Ak 54 1340
785568 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Ces m Ces m Ces m Ces Aks Tk 44 936
785606 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG Gks Tks m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Ces Tks Ges Gks Gk 34 537
785607 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gks Tes m Cks Tes Gks Gk 52 538
785608 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gds Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gks Ges Tks m Ces Tks Gk 33 539
785629 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA Gks Tks m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tes Gks Ges Aks Ak 9 1339
785630 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cks Aes Tks Ges Gks Ak 10 1340
785631 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tks m Ces Aks Tes Gks Gk 0 974
785635 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cks m Ces m Cks m Ces Aks Tk 0 936
785636 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Aks m Ces m Cks m Ces m Cks Ak 15 937
785666 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tes m Ces Tes Gks Gk 74 538
785675 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 60 1340
785677 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Ces m Ces m Ces Aks Tk 64 936
785696 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Cds Tks Gds Gk 56 538
785705 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tds Gks Gds Ak 40 1340
785707 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cks m Cds m Cks Ads Tk 54 936
785736 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Ces Tks Ges Gk 54 538
785737 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gds Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gks Tes m Cks Tes Gk 44 539
785752 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tes Gks Ges Ak 44 1340
785753 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cks Aes Tks Ges Gk 24 974
785756 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cks m Ces m Cks Aes Tk 42 936
785757 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cds Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cks m Ces m Cks m Ces Ak 17 937
785783 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gks Tds m Cks Tds Gk 57 539
785792 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cks Ads Tks Gds Gk 36 974
785794 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cks m Cds m Cks m Cds Ak 40 937
785824 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Ces Tks Ges Gk 46 538
785825 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gks Tes m Cks Tes Gk 56 539
785840 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tks m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tes Gks Ges Ak 57 1340
785841 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cks Aes Tks Ges Gk 16 974
785844 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Aks m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cks m Ces m Cks Aes Tk 10 936
785845 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cks m Ces m Cks m Ces Ak 6 937
785871 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Ces Tks Ge 38 539
785880 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tes Gks Ge 39 974
785882 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cks m Ces m Cks Ae 39 937
785912 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG Gks Gks Tks m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tds m Cks Tks Gks Ge 33 538
785913 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG m Cks Gks Gks Tds m Cds Tds Tds Tds Gds Ads Gds Gds Tks m Cks Tks Ge 32 539
785928 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tks m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tks Gks Gks Ae 39 1340
785929 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG Tks Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tks Gks Ge 20 974
785932 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT m Cks m Cks Aks m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cds m Cks m Cks Aks Te 57 936
785933 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA Aks m Cks m Cks Ads m Cds Tds Gds Tds Gds Tds Ads m Cds m Cks m Cks m Cks Ae 47 937
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA m Cks m Cks Aks Ads Tds Tds Tds Tds Gds m Cds Ads Tds Tks m Cks m Cks Ae 75 1242
786572 N/A N/A 4358 4373 GTCATGGAATTTTGTG Gks Tks m Cks Ads Tds Gds Gds Ads Ads Tds Tds Tds Tds Gks Tks Gk 54 1341
786573 N/A N/A 4360 4375 GTGTCATGGAATTTTG Gks Tks Gks Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Ads Ads Tds Tds Tks Tks Gk 58 1342
786574 N/A N/A 4362 4377 TAGTGTCATGGAATTT Tks Aks Gks Tds Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Ads Ads Tks Tks Tk 38 1343
786575 N/A N/A 4363 4378 CTAGTGTCATGGAATT m Cks Tks Aks Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Ads Aks Tks Tk 34 1344
786576 N/A N/A 4364 4379 TCTAGTGTCATGGAAT Tks m Cks Tks Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gds Aks Aks Tk 14 1345
786577 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA Gks Tks m Cks Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tds Gds Gks Aks Ak 38 1339
786578 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tks m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Ads Tds Gks Gks Ak 61 1340
786579 N/A N/A 4368 4383 CTTGTCTAGTGTCATG m Cks Tks Tks Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aks Tks Gk 58 1346
786580 N/A N/A 4369 4384 TCTTGTCTAGTGTCAT Tks m Cks Tks Tds Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cks Aks Tk 0 1347
786581 N/A N/A 4370 4385 TTCTTGTCTAGTGTCA Tks Tks m Cks Tds Tds Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tks m Cks Ak 49 1348
786582 N/A N/A 4371 4386 TTTCTTGTCTAGTGTC Tks Tks Tks m Cds Tds Tds Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gks Tks m Ck 53 1349
786583 N/A N/A 4372 4387 CTTTCTTGTCTAGTGT m Cks Tks Tks Tds m Cds Tds Tds Gds Tds m Cds Tds Ads Gds Tks Gks Tk 48 1350
786584 N/A N/A 4374 4389 AGCTTTCTTGTCTAGT Aks Gks m Cks Tds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Tds m Cds Tds Aks Gks Tk 20 1351
786585 N/A N/A 4376 4391 TCAGCTTTCTTGTCTA Tks m Cks Aks Gds m Cds Tds Tds Tds m Cds Tds Tds Gds Tds m Cks Tks Ak 15 1352
786586 N/A N/A 4378 4393 CATCAGCTTTCTTGTC m Cks Aks Tks m Cds Ads Gds m Cds Tds Tds Tds m Cds Tds Tds Gks Tks m Ck 28 1353
實例 3 ： cEt 間隔體的人類 IRF5 劑量依賴性抑制
在THP-1細胞以及KARPAS-229細胞中，以各種劑量篩選並測試在上述研究中對IRF5 RNA展現明顯活體外抑制作用的經修飾寡核苷酸。在具有相似培養條件的一系列實驗中測試經修飾寡核苷酸。每個實驗的結果顯示在下文所示的個別表格中。 THP-1細胞中的分析
利用電穿孔將被稀釋成下表所指定的不同濃度的經修飾寡核苷酸，來轉染密度為每孔30,000個細胞的經培養的THP-1細胞。在大約24小時的處理期後，如前所述使用人類IRF5引子-探針組HTS4167測量IRF5 RNA的量。根據RNA總含量(如藉由RIBOGREEN®測量)來調整IRF5 RNA的量。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現在下表中。也呈現出每個經修飾寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC50 )。在excel中，使用對數/線性圖上的線性回歸來計算IC50 。 表28 經修飾寡核苷酸在THP-1細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
185.19 nM 555.56 nM 1666.67 nM 5000.00 nM
665795 36 57 76 85 0.4
665892 40 59 74 82 0.3
665893 26 53 74 83 0.6
665908 19 45 57 73 1.1
665933 30 38 66 79 0.8
728408 19 32 55 82 1.1
728458 29 45 58 80 0.8
728498 24 31 61 81 1.0
728670 58 51 70 79 0.1
728673 25 32 51 84 1.1
728695 23 54 72 80 0.6
728696 38 62 73 89 0.3
728705 39 57 71 82 0.4
728706 35 55 72 92 0.4
728707 50 64 74 85 0.2
728708 53 69 86 88 0.1
728806 33 47 74 87 0.5
表29 經修飾寡核苷酸在THP-1細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
185.19 nM 555.5556 nM 185.19 nM 5000.0 nM
665893 25 50 64 81 0.7
665933 18 30 67 69 1.2
728739 14 26 55 58 2.2
728741 13 35 65 82 1.0
728759 40 49 49 68 0.8
728778 10 32 46 79 1.5
728793 10 21 39 68 2.4
728800 23 39 62 68 1.1
728802 20 35 34 65 2.5
728887 8 34 60 72 1.4
728891 43 23 50 74 1.2
728893 9 28 45 74 1.7
728894 20 42 68 85 0.8
728898 16 41 69 86 0.8
728899 10 34 65 79 1.1
728905 21 31 57 77 1.2
728944 15 21 71 79 1.1
728954 7 21 60 82 1.3
728970 30 50 78 85 0.5
表30 經修飾寡核苷酸在THP-1細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
185.19 nM 555.56 nM 1666.67 nM 5000.00 nM
665893 38 59 72 83 0.4
665933 13 39 52 71 1.4
666168 29 30 60 82 0.9
728958 30 43 68 83 0.7
728969 30 55 81 89 0.5
728996 36 57 73 84 0.4
728998 27 56 73 85 0.5
729018 33 52 69 85 0.5
729037 58 64 86 94 0.1
729038 41 65 89 92 0.3
729039 40 50 77 90 0.39
729049 35 57 76 85 0.4
729050 21 52 75 90 0.6
729205 23 42 73 84 0.7
729206 11 40 54 73 1.3
729433 25 41 65 86 0.8
729453 16 43 61 80 1.0
729454 31 40 69 87 0.7
729456 11 38 63 80 1.1
表31 經修飾寡核苷酸在THP-1細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
185.19 nM 555.56 nM 1666.67 nM 5000.00 nM
665893 24 53 74 86 0.6
665933 13 36 58 71 1.3
666178 29 46 65 82 0.7
666208 0 24 50 73 1.8
729201 18 35 49 73 1.4
729207 12 34 60 84 1.1
729213 19 47 70 85 0.7
729221 5 31 53 73 1.5
729243 5 34 54 77 1.4
729447 0 0 10 53 >5.0
729460 18 31 63 81 1.1
729475 22 39 57 80 1.0
729476 42 63 85 91 0.3
729494 27 42 67 80 0.8
729495 16 57 74 86 0.6
729497 0 35 48 72 1.7
729513 18 41 67 89 0.8
729589 14 47 70 85 0.8
729659 3 32 60 85 1.2
KARPAS-229細胞中的分析
利用自由攝取法將被稀釋成下表所指定的不同濃度的經修飾寡核苷酸對密度為每孔10,000個細胞的經培養KARPAS-229細胞進行處理。在大約24小時的處理期後，如前所述使用人類IRF5引子-探針組RTS4524測量IRF5 mRNA的量。根據RNA總含量(如藉由RIBOGREEN®測量)來調整IRF5 mRNA的量。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現在下表中。
也呈現出每個經修飾寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC50 )。在excel中，使用對數/線性圖上的線性回歸來計算IC50 。「N.D.」指示經修飾寡核苷酸在那個劑量下未確定抑制%。 表32 經修飾寡核苷酸在KARPAS-229細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
444.44 nM 1333.33 nM 4000.00 nM 12000.00 nM
728466 32 38 56 69 2.6
729037 52 65 79 86 0.3
729476 38 66 78 83 0.7
785350 23 40 62 87 2.0
785475 31 44 66 81 1.6
785477 34 48 62 74 1.6
785478 53 69 80 86 0.3
785485 42 68 78 82 0.5
785502 38 47 69 78 1.2
785522 39 59 73 84 0.8
785537 47 66 75 82 0.4
785563 25 51 64 77 1.8
785583 15 32 66 76 2.7
785661 22 32 41 58 7.0
785672 46 64 73 84 0.5
785791 42 62 67 79 0.7
785876 41 56 67 81 0.9
785938 61 79 84 88 0.1
786507 51 74 83 89 0.3
表33 經修飾寡核苷酸在KARPAS-229細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
444.44 nM 1333.33 nM 4000.00 nM 12000.00 nM
729018 59 68 78 83 0.1
729049 51 66 77 84 0.3
729454 12 41 58 70 3.0
729495 44 60 74 86 0.7
785519 6 12 49 65 5.5
785525 40 53 71 79 1.0
785674 57 71 77 83 0.1
785764 29 N.D 61 81 1.8
785920 21 13 71 76 2.9
785926 46 52 67 74 0.8
785938 54 75 87 91 0.2
786501 27 39 68 79 1.9
786503 42 45 76 77 1.0
786524 50 54 73 81 0.6
786538 60 49 74 77 0.3
786548 15 46 52 70 3.0
786590 9 39 70 81 2.3
786591 38 44 66 78 1.4
786597 32 59 70 81 1.1
表34 經修飾寡核苷酸在KARPAS-229細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
444.44 nM 1333.33 nM 4000.00 nM 12000.00 nM
728466 25 56 50 67 2.4
728708 33 41 46 55 6.1
729037 54 72 75 82 0.2
729205 16 41 57 65 3.3
729433 37 N.D. 70 84 1.1
729494 41 66 67 78 0.7
785369 31 29 46 57 6.5
785481 28 45 62 77 1.9
785511 39 43 63 72 1.6
785532 26 38 56 70 2.7
785539 37 45 62 73 1.6
785666 22 58 69 79 1.5
785675 33 50 57 70 1.9
785677 14 39 55 71 3.1
785919 23 39 50 59 4.4
785938 62 82 87 88 >0.4
785940 31 44 70 78 1.6
785941 33 56 61 75 1.3
786578 0 42 65 74 3.3
實例 4 ：靶向人類 IRF5 之經修飾寡核苷酸在 CD-1 小鼠中的耐受性
CD-1小鼠是經常用於安全性和功效測試的多用途小鼠模型。用選自上述研究的經修飾寡核苷酸來處理小鼠，並評估各種血漿化學標記量的變化。 研究1處理
6至8週大的數組雄性CD-1小鼠，一週一次皮下注射50 mg/kg經修飾寡核苷酸，歷時7週(共7次處理)。一組雄性CD-1小鼠注射PBS。最後一次投藥後48小時將小鼠安樂死。血漿化學標記
為了評估經修飾寡核苷酸對肝臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量血尿素氮(BUN)、白蛋白、丙胺酸轉胺酶(ALT)、天冬胺酸轉胺酶(AST)和總膽紅素(TBIL)的血漿量。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟或腎臟功能標記量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸。 表35 雄性CD-1小鼠中的血漿化學標記
化合物編號 BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL)
PBS 25 3.5 57 45 0.2
665795 27 3.2 237 541 0.3
665892 35 3.3 212 245 0.2
665893 25 3.5 210 290 0.2
665908 29 4.1 4665 6042 0.5
665933 31 3.8 767 1353 0.3
666168 26 3.4 3931 3855 0.7
666178 30 2.9 16490 14669 6.4
728458 32 3.7 821 1311 0.2
728706 28 3.7 2893 3673 0.8
728708 24 3.9 1770 3270 0.2
728759 22 3.7 860 599 0.2
728806 38 3.8 2503 2422 0.4
728958 23 3.0 214 158 0.2
728969 22 3.5 70 59 0.2
728970 20 3.6 157 140 0.2
728998 24 3.5 583 865 0.2
729018 19 3.2 86 66 0.2
729049 21 3.7 425 771 0.2
729050 22 3.5 193 246 0.2
729213 25 3.1 344 411 0.2
729433 26 3.7 802 791 0.2
729454 25 3.6 3958 4541 0.5
729476 77 2.7 1660 2046 0.7
729494 20 3.2 157 149 0.2
729495 57 3.2 240 254 0.1
729513 23 4.8 1558 2743 0.4
體重以及器官重量
在第1天和第44天測量CD-1小鼠的體重，且每組的平均體重呈現在下表中。在研究結束時測量心臟、腎臟、脾臟、肝臟和胸腺重量，並呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，導致任何器官重量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸被排除在進一步研究之外。 表36 體重以及器官重量(呈公克)
化合物編號 體重 (g) 心臟 (g) 腎臟 (g) 脾臟 (g) 肝臟 (g) 胸腺 (g)
第 1 天 第 44 天
PBS 34 37 0.2 0.7 0.1 2.2 0.05
665795 34 40 0.2 0.7 0.2 2.6 0.03
665892 34 38 0.2 0.8 0.2 2.9 0.02
665893 34 39 0.2 0.8 0.2 2.6 0.02
665908 34 35 0.2 0.6 0.2 3.5 0.02
665933 34 39 0.2 0.7 0.1 3.1 0.02
666168 34 31 0.2 0.4 0.2 2.3 0.01
666178 33 28 0.1 0.6 0.1 1.8 0.02
728458 34 37 0.2 0.8 0.2 3.3 0.05
728706 34 31 0.2 0.6 0.1 2.3 0.01
728708 33 36 0.2 0.7 0.2 3.0 0.03
728759 33 39 0.2 0.7 0.1 3.5 0.04
728806 33 33 0.1 0.6 0.1 3.0 0.02
728958 34 39 0.2 0.8 0.2 2.8 0.03
728969 34 38 0.2 0.6 0.1 2.2 0.05
728970 32 37 0.2 0.6 0.1 2.3 0.04
728998 34 41 0.2 0.7 0.2 3.2 0.05
729018 34 37 0.2 0.7 0.1 2.2 0.04
729049 34 36 0.2 0.6 0.2 2.6 0.02
729050 34 36 0.2 0.6 0.1 2.4 0.04
729213 33 35 0.2 0.7 0.1 2.0 0.01
729433 32 32 0.1 0.6 0.1 2.7 0.02
729454 32 36 0.2 0.6 0.1 3.2 0.02
729476 33 32 0.2 0.5 0.1 2.2 0.04
729494 33 40 0.2 0.7 0.2 2.5 0.02
729495 32 26 0.1 0.5 0.04 1.4 0.01
729513 33 30 0.2 0.5 0.1 2.8 0.01
研究2處理
6至7週大的數組雄性CD-1小鼠(得自Charles River)，一週一次皮下注射50 mg/kg經修飾寡核苷酸，歷時5週(共5次處理)。一組雄性CD-1小鼠注射PBS。最後一次投藥後48小時將小鼠安樂死。血漿化學標記
為了評估經修飾寡核苷酸對肝臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量血尿素氮(BUN)、白蛋白、丙胺酸轉胺酶(ALT)、天冬胺酸轉胺酶(AST)和總膽紅素(TBIL)的血漿量。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟或腎臟功能標記量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸。 表37 雄性CD-1小鼠中的血漿化學標記
化合物編號 BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL)
PBS 19 2.6 91 132 0.3
785478 19 2.6 175 228 0.2
785502 23 2.5 479 639 0.5
785525 19 2.4 197 265 0.2
785532 15 2.2 471 591 0.3
785537 17 2.6 420 335 0.3
785539 17 2.4 143 145 0.2
785674 18 2.8 118 101 0.2
785675 19 2.7 85 62 0.2
785677 18 2.9 311 526 0.2
785920 20 3.0 875 1356 0.3
785926 24 3.3 197 232 0.2
785940 19 2.4 1201 754 0.2
786524 18 2.8 175 208 0.2
786538 18 2.9 569 1514 0.2
體重以及器官重量
在第1天和第28天測量CD-1小鼠的體重，且每組的平均體重呈現在下表中。在研究結束時測量腎臟、脾臟和肝臟重量，並呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，導致任何器官重量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸被排除在進一步研究之外。 表38 體重以及器官重量(呈公克)
化合物編號 體重 (g) 腎臟 (g) 脾臟 (g) 肝臟 (g)
第 1 天 第 28 天
PBS 29 38 0.6 0.1 1.9
785478 30 39 0.7 0.2 2.3
785502 29 35 0.6 0.2 1.6
785525 29 37 0.6 0.2 2.2
785532 28 33 0.6 0.4 2.7
785537 30 36 0.6 0.2 2.0
785539 30 41 0.6 0.2 2.4
785674 30 40 0.8 0.2 2.3
785675 30 39 0.7 0.2 2.5
785677 28 37 0.6 0.3 2.2
785920 29 39 0.7 0.4 3.4
785926 29 36 0.6 0.2 1.8
785940 29 30 0.6 0.1 1.8
786524 30 39 0.6 0.2 2.4
786538 30 38 0.6 0.2 3.3
研究3處理
6至7週大的數組雄性CD-1小鼠(得自Charles River)，一週一次皮下注射50 mg/kg經修飾寡核苷酸，歷時6週(共7次處理)。一組雄性CD-1小鼠注射PBS。最後一次投藥後48小時將小鼠安樂死。血漿化學標記
為了評估經修飾寡核苷酸對肝臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量血尿素氮(BUN)、白蛋白、丙胺酸轉胺酶(ALT)、天冬胺酸轉胺酶(AST)和總膽紅素(TBIL)的血漿量。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟或腎臟功能標記量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸。 表39 雄性CD-1小鼠中的血漿化學標記
化合物編號 BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL)
PBS 25 2.5 69 60 0.2
729049 22 2.7 214 322 0.2
785478 20 2.5 166 237 0.1
785525 21 2.6 172 134 0.2
785539 18 2.6 96 64 0.2
785674 22 2.4 129 83 0.1
785675 23 2.4 98 100 0.1
785764 19 2.5 89 49 0.2
786503 20 2.4 74 47 0.1
786524 20 2.6 136 145 0.1
786548 22 2.3 132 125 0.1
786597 21 2.4 127 69 0.2
體重以及器官重量
在第1天和第43天測量CD-1小鼠的體重，且每組的平均體重呈現在下表中。在研究結束時測量腎臟、脾臟和肝臟重量，並呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，導致任何器官重量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸被排除在進一步研究之外。 表40 體重以及器官重量(呈公克)
化合物編號 體重 (g) 腎臟 (g) 脾臟 (g) 肝臟 (g)
第 1 天 第 43 天
PBS 28 41 0.7 0.1 2.1
729049 30 39 0.7 0.2 2.2
785478 29 39 0.7 0.2 2.4
785525 28 39 0.7 0.3 2.2
785539 28 45 0.7 0.2 2.6
785674 28 37 0.6 0.3 2.1
785675 29 41 0.7 0.2 2.7
785764 28 43 0.7 0.3 2.5
786503 29 41 0.7 0.2 2.4
786524 29 41 0.6 0.2 2.5
786548 27 41 0.6 0.2 2.4
786597 30 41 0.6 0.2 2.5
研究4
CD-1小鼠用自上述研究篩選出的經修飾寡核苷酸來處理，並且評估各種血漿化學標記量的變化。處理
6週大的數組雄性CD-1小鼠(得自Charles River)，一週一次皮下注射50 mg/kg經修飾寡核苷酸，歷時4週(共5次處理)。一組雄性CD-1小鼠注射PBS。最後一次投藥後48小時將小鼠安樂死。血漿化學標記
為了評估經修飾寡核苷酸對肝臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量血尿素氮(BUN)、白蛋白、丙胺酸轉胺酶(ALT)、天冬胺酸轉胺酶(AST)和總膽紅素(TBIL)的血漿量。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟或腎臟功能標記量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸。 表41 雄性CD-1小鼠中的血漿化學標記
化合物編號 BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL)
PBS 23 2.7 80 59 0.2
728466 25 3.0 463 868 0.3
729049 24 2.6 246 253 0.2
729205 22 2.4 649 1130 0.6
729433 23 2.4 660 579 0.5
785485 25 2.6 559 701 0.3
785666 21 2.5 273 321 0.3
785764 21 2.6 78 46 0.2
785791 30 3.1 754 937 0.3
785938 24 2.7 402 348 0.4
786501 23 3.2 733 1258 0.4
786503 21 2.7 86 44 0.3
786548 22 2.6 135 142 0.2
786578 19 1.5 664 439 0.4
786597 20 2.4 136 70 0.2
體重以及器官重量
在第1天和第43天測量CD-1小鼠的體重，且每組的平均體重呈現在下表中。在研究結束時測量腎臟、脾臟和肝臟重量，並呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，導致任何器官重量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸被排除在進一步研究之外。 表42 體重以及器官重量(呈公克)
化合物編號 體重 (g) 腎臟 (g) 脾臟 (g) 肝臟 (g)
第 1 天 第 43 天
PBS 26 33 0.6 0.1 1.9
728466 27 33 0.4 0.2 2.4
729049 26 35 0.6 0.2 2.2
729205 24 33 0.5 0.3 3.0
729433 25 29 0.4 0.1 1.9
785485 25 28 0.4 0.2 1.4
785666 26 33 0.4 0.2 2.2
785764 25 38 0.7 0.2 2.3
785791 27 33 0.6 0.1 1.9
785938 28 31 0.4 0.3 1.6
786501 27 38 0.6 0.5 3.7
786503 26 35 0.6 0.2 2.1
786548 26 38 0.6 0.1 2.2
786578 27 37 0.6 0.2 1.7
786597 28 40 0.6 0.3 2.5
研究5
CD-1小鼠用自上述研究篩選出的經修飾寡核苷酸來處理，並且評估各種血漿化學標記水平變化。處理
6-7週大的數組雄性CD-1小鼠(得自Charles River)，一週一次皮下注射50 mg/kg經修飾寡核苷酸，歷時6週(共7次處理)。一組雄性CD-1小鼠注射PBS。最後一次投藥後48小時將小鼠安樂死。血漿化學標記
為了評估經修飾寡核苷酸對肝臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量血尿素氮(BUN)、白蛋白、丙胺酸轉胺酶(ALT)、天冬胺酸轉胺酶(AST)和總膽紅素(TBIL)的血漿量。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟或腎臟功能標記量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸。 表43 雄性CD-1小鼠中的血漿化學標記
化合物編號 BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL)
PBS 29 3.0 57 42 0.2
665892 27 3.1 275 265 0.2
665893 25 3.2 1718 2229 2.9
728958 26 2.6 88 57 0.1
728969 27 3.4 149 142 0.2
728970 33 3.5 1142 631 0.4
729018 23 2.9 187 101 0.2
729050 26 3.1 141 119 0.2
729494 26 2.9 178 53 0.2
體重以及器官重量
在第1天和第43天測量CD-1小鼠的體重，且每組的平均體重呈現在下表中。在研究結束時測量腎臟、脾臟和肝臟重量，並呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，導致任何器官重量變化超出預期範圍的經修飾寡核苷酸被排除在進一步研究之外。 表44 體重以及器官重量(呈公克)
化合物編號 體重 (g) 腎臟 (g) 脾臟 (g) 肝臟 (g)
第 1 天 第 43 天
PBS 29 37 0.6 0.1 1.8
665892 31 36 0.6 0.2 2.3
665893 30 35 0.6 0.2 2.4
728958 31 38 0.7 0.2 2.0
728969 30 37 0.6 0.2 2.3
728970 29 37 0.5 0.2 2.7
729018 31 41 0.8 0.3 2.4
729050 29 35 0.6 0.2 2.1
729494 29 37 0.6 0.2 2.2
實例 5 ：靶向人類 IRF5 之經修飾寡核苷酸在史 - 道二氏大鼠（ Sprague-Dawley rats ）中的耐受性
史-道二氏大鼠是用於安全性和功效評估的多用途模型。用上述實例中所描述之研究的Ionis經修飾寡核苷酸來處理大鼠，並評估各種血漿化學標記量的變化。 研究1處理
將雄性史-道二氏大鼠維持在12小時光/暗週期並任食Purina正常大鼠飼料。數組史-道二氏大鼠組（一組4隻）各自每週皮下注射50 mg/kg的Ionis寡核苷酸，歷時6週(共7個劑量)。最後一個劑量後四十八小時將大鼠安樂死，並且收取器官，尿液與血漿以供進一步分析。血漿化學標記
為了評估Ionis寡核苷酸對肝功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量轉胺酶的血漿量。測量ALT (丙胺酸轉胺酶)和AST (天冬胺酸轉胺酶)的血漿量，且結果以IU/L呈現在下表中。也使用了相同的臨床化學分析儀測量總膽紅素(TBIL)、肌酐，白蛋白與血液尿素氮(BUN)的血漿量，且結果亦呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟功能標記水平變化超出預期範圍的Ionis經修飾寡核苷酸。 表45 史-道二氏大鼠中的血漿化學標記
化合物編號 ALT (IU/L) AST (IU/L) BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) 肌酐 (mg/dL) TBIL (mg/dL)
PBS 57 83 16 4.9 0.4 0.2
665892 216 319 25 4.6 0.5 0.2
665893 365 472 31 4.0 0.6 0.3
728958 90 118 26 3.3 0.5 0.1
728969 154 175 24 3.4 0.5 0.2
728970 309 274 34 3.1 0.6 0.2
729018 70 98 23 3.3 0.5 0.1
729050 118 115 86 1.6 1.1 0.1
729494 60 97 43 1.6 0.5 0.1
血液學分析
在第6週時，由小鼠組別取得的血液被送往IDEXX BioResearch以進行血球計數。所進行的計數包括紅血球(RBC)計數、白血球(WBC)計數、血紅素(HGB)、血容比(HCT)，以及個別白血球計數(諸如單核球(MON)、嗜中性球(NEU)、淋巴球(LYM)與血小板(PLC)的計數)。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致血球計數變化超出預期範圍的Ionis寡核苷酸。 表46 史-道二氏大鼠中的血球計數
化合物編號 WBC RBC HGB HCT
PBS 15 9 17 54
665892 11 9 16 51
665893 13 9 17 54
728958 18 8 14 45
728969 10 8 15 49
728970 14 8 15 49
729018 8 8 15 48
729050 16 8 13 44
729494 17 4 7 24
表47 史-道二氏大鼠中的血球計數
化合物編號 NEU LYM MON PLT
PBS 14 81 3.6 720
665892 15 80 4.6 620
665893 13 80 5.9 647
728958 14 82 4.1 944
728969 12 83 4.8 857
728970 12 79 8.6 837
729018 10 85 4.4 801
729050 13 75 10.1 324
729494 13 77 9.5 777
腎臟功能
為了評估Ionis寡核苷酸對腎臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量總蛋白和肌酐的尿液水準。總蛋白與肌酐的比例(P/C比)呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致比例水準變化超出預期範圍的Ionis寡核苷酸。 表48 史-道二氏大鼠中的總蛋白對肌酐比
化合物編號 P/C 比
PBS 0.7
665892 5.6
665893 5.9
728958 5.3
728969 4.1
728970 6.0
729018 4.3
729050 8.2
729494 17.2
器官重量
在研究結束時測量肝臟、心臟，脾臟和腎臟重量，且呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何器官重量變化超出預期範圍的Ionis寡核苷酸。 表49 器官重量(g)
化合物編號 肝臟 (g) 腎臟 (g) 脾臟 (g)
PBS 17 3.7 0.8
665892 16 3.1 1.4
665893 14 3.1 1.0
728958 17 3.2 1.6
728969 15 3.8 1.5
728970 12 3.3 1.5
729018 15 3.1 1.7
729050 13 3.8 1.4
729494 15 4.1 2.0
研究2處理
將雄性史-道二氏大鼠維持在12小時光/暗週期並任食Purina正常大鼠飼料。數組史-道二氏大鼠組（一組4隻）各自每週皮下注射50 mg/kg Ionis寡核苷酸，歷時6週(共7個劑量)。最後一個劑量後四十八小時將大鼠安樂死，並且收取器官，尿液與血漿以供進一步分析。血漿化學標記
為了評估Ionis寡核苷酸對肝功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量轉胺酶的血漿量。測量ALT (丙胺酸轉胺酶)和AST (天冬胺酸轉胺酶)的血漿量，且結果以IU/L呈現在下表中。也使用了相同的臨床化學分析儀測量總膽紅素(TBIL)，白蛋白與血液尿素氮(BUN)的血漿量，且結果亦呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何肝臟功能標記水平變化超出預期範圍的Ionis經修飾寡核苷酸。 表50 史-道二氏大鼠中的血漿化學標記
化合物編號 ALT (IU/L) AST (IU/L) BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) TBIL (mg/dL)
PBS 41 73 18 3.4 0.2
729049 70 121 154 1.4 0.1
785478 68 112 41 1.7 0.1
785525 78 118 20 3.3 0.1
785539 60 128 55 2.4 0.1
785674 64 131 22 3.2 0.1
785675 123 139 18 3.4 0.2
785764 65 95 60 1.7 0.2
786503 33 72 17 2.9 0.1
786524 64 105 21 3.1 0.2
786548 34 67 20 3.2 0.1
786597 40 66 19 2.8 0.1
血液學分析
在第6週時，由小鼠組別取得的血液被送往IDEXX BioResearch以進行血球計數。所進行的計數包括紅血球(RBC)計數、白血球(WBC)計數、血紅素(HGB)、血容比(HCT)，以及個別白血球計數(諸如單核球(MON)、嗜中性球(NEU)、淋巴球(LYM)與血小板(PLC)的計數)。結果呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致血球計數變化超出預期範圍的Ionis寡核苷酸。 表51 史-道二氏大鼠中的血球計數
化合物編號 WBC RBC HGB HCT
PBS 14 8 16 50
729049 30 5 9 27
785478 45 7 12 37
785525 18 8 14 44
785539 32 4 8 25
785674 34 8 14 43
785675 16 9 15 47
785764 22 6 10 33
786503 20 7 14 39
786524 16 8 14 44
786548 18 8 14 43
786597 28 4 7 24
表52 史-道二氏大鼠中的血球計數
化合物編號 NEU LYM MON PLT
PBS 10 84 5.5 904
729049 47 45 3.8 1418
785478 11 89 1.0 383
785525 13 77 8.6 881
785539 34 57 9.0 734
785674 12 79 7.0 731
785675 9 81 9.2 783
785764 17 76 6.8 1231
786503 10 81 7.5 650
786524 6 87 6.6 731
786548 4 87 6.6 653
786597 15 77 6.9 965
腎臟功能
為了評估Ionis寡核苷酸對腎臟功能的影響，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量總蛋白和肌酐的尿液水ˋ準。總蛋白與肌酐的比例(P/C比)呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致比例水準變化超出預期範圍的Ionis寡核苷酸。 表53 史-道二氏大鼠中的總蛋白對肌酐比
化合物編號 P/C 比
PBS 0.8
729049 11.1
785478 15.0
785525 7.4
785539 51.1
785674 4.4
785675 2.1
785764 20.8
786503 2.5
786524 1.7
786548 2.5
786597 14.4
器官重量
在研究結束時測量肝臟、心臟，脾臟和腎臟重量，且呈現在下表中。針對經修飾寡核苷酸，在進一步研究中排除了導致任何器官重量變化超出預期範圍的Ionis寡核苷酸。 表54 器官重量(g)
化合物編號 肝臟 腎臟 脾臟
PBS 19 3.3 1.0
729049 19 3.5 1.1
785478 19 4.2 2.3
785525 18 3.4 1.5
785539 18 4.3 2.3
785674 17 2.7 1.6
785675 13 2.8 1.4
785764 18 4.5 2.7
786503 16 2.8 1.8
786524 14 3.2 1.8
786548 13 2.6 1.4
786597 16 3.6 2.4
實例 6 ：經修飾寡核苷酸在 NOD Scid 小鼠的 KARPAS-229 異種移植模型中對人類 IRF5 表現的影響
以人類非霍奇金氏大細胞淋巴瘤KARPAS-229細胞接種14-15週大的雄性NOD Scid小鼠(Jackson Laboratory)，並用上表中所述的經修飾寡核苷酸或PBS處理。評估經修飾寡核苷酸對腫瘤內的IRF5 RNA表現的影響，以及在小鼠體內的耐受性。處理
小鼠在側脅中以1：1 matrigel + KARPAS-299懸浮液，皮下接種200萬個KARPAS-229細胞，使腫瘤發展。當平均腫瘤大小達到約100 mm3 時，開始進行經修飾寡核苷酸處理。小鼠皮下注射經修飾寡核苷酸，濃度為250 mg/kg/週，歷時兩週，共八個劑量。另一個對照組同樣用PBS處理歷時8個劑量。在開始處理後的第12天犧牲小鼠，並測量腫瘤中的IRF5的量。RNA 分析
引子探針組HTS4167用於測量人類IRF5 RNA的量。結果呈現為相對於PBS對照的RNA變化百分比，以人類GAPDH和人類β-肌動蛋白或ACTB進行標準化。如下表中所呈現，與PBS對照相比，以Ionis經修飾寡核苷酸處理導致IRF5 RNA顯著減少。「0」指示寡核苷酸不抑制RNA表現。 表55 在KARPAS-229模型中經修飾寡核苷酸媒介的人類IRF5 RNA表現抑制
化合物編號 抑制 %
以 GAPDH 標準化 以 ACTB 標準化
PBS 0 0
728969 14 18
729018 34 47
729049 43 54
785478 34 33
785525 32 43
785674 0 26
785675 0 13
785764 0 7
786503 0 29
786524 31 43
786597 45 55
血漿化學
此外，使用自動臨床化學分析儀(Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY)測量ALT (丙胺酸轉胺酶)和AST (天冬胺酸轉胺酶)的血漿量，且結果以IU/L呈現在下表中。也使用相同的臨床化學分析儀測量膽紅素，白蛋白和BUN的血漿量，且結果也呈現在下表中。N/A是指通常由於動物死亡而無法獲得數據的群體。 表56 異種移植模型中的血漿化學標記
化合物編號 ALT (U/L) AST (U/L) BUN (mg/dL) 白蛋白 (g/dL) 膽紅素 (mg/dL)
PBS 28 80 24 2. 0.2
728969 81 114 28 2.7 0.2
729018 317 257 22 2.5 0.2
729049 3640 2555 22 2.7 1.2
785478 4243 2610 20 2.8 1.1
785525 3989 3936 21 2.7 5.2
785674 1289 939 20 2.6 0.2
785675 411 368 18 2.5 0.1
785764 462 736 11 3.1 10.5
786503 630 717 24 2.5 0.2
786524 5094 3564 32 2.5 8.9
786597 2705 2479 24 2.4 10.7
實例 7 ：反義抑制人類 IRF5 在轉基因小鼠模型中的影響
使用Fosmid ABC10-44445800E12 (NCBI Clone DB ID：6338898)在內部開發了轉基因小鼠模型。在SpeI 和FspI 限制位點處消化該選殖株，以產生含有人類IRF5基因的區域，該區域納入IRF5基因上游的12,002bp和下游的5159 bp。透過前核注射將基因片段引入C57BL/6小鼠的受精卵中，以產生四個創立系(founder line)。C57BL/6-Tg (IRF5)F20.11系用於本文所述的實驗中。在此模型中，於肺臟、脾臟，腎臟和腹膜滲出細胞(PEC)中發現了人類IRF5 RNA表現。在該模型中評估Ionis寡核苷酸的功效。處理
將轉基因小鼠維持在12小時光/暗循環中，並任食Purina正常小鼠飼料。在開始實驗之前，使動物在研究設施中適應至少7天。在PBS中製備經修飾寡核苷酸，並藉由濾過0.2微米過濾器來滅菌。
將轉基因小鼠分成每組4隻小鼠，各用於經修飾寡核苷酸處理。各組接受皮下注射Ionis寡核苷酸，劑量為一週一次35 mg/kg或一週一次70 mg/kg，歷時三週(4次處理)。一組四隻小鼠一週一次皮下注射PBS，歷時三週(4次處理)。PBS注射組作為對照組，與經寡核苷酸處理的組別進行比較。RNA 分析
在第23天，從PEC，肺臟和脾臟中萃取RNA用於IRF5 RNA表現的即時RTPCR分析。引子探針組HTS4167用於測量人類IRF5 RNA的量。結果呈現為相對於PBS對照的RNA百分比變化，相對於小鼠GAPDH進行標準化。
如下表中所呈現，與PBS對照相比，用Ionis經修飾寡核苷酸處理導致IRF5 RNA顯著減少。「0」指示寡核苷酸不抑制RNA表現。 表57 在轉基因模型中經修飾寡核苷酸媒介的人類IRF5抑制(%)(數據相對於小鼠GAPDH進行正規化)
劑量 (mg/kg) 化合物編號 PEC 肺臟 脾臟
  PBS 0 0 0
35 728958 75 20 44
729018 53 27 30
785525 2 20 54
785674 30 7 27
785675 57 12 36
786503 53 29 55
786524 64 27 9
786548 35 2 10
70 728958 23 0 23
729018 72 19 58
785525 45 32 49
785674 76 12 49
785675 47 37 63
786503 61 23 47
786524 81 30 0
786548 75 14 52
實例 8 ：靶向人類 IRF5 的經修飾寡核苷酸在食蟹獼猴中的影響
利用選自上述實例中所選出的Ionis經修飾寡核苷酸來處理食蟹獼猴。評估經修飾寡核苷酸的耐受性。處理
在研究之前，將猴子隔離，期間每天觀察動物的大體健康狀態。猴子為2-4歲，重2-4公斤。九組之每組4隻隨機分配的雄性食蟹獼猴各自皮下注射Ionis寡核苷酸或食鹽水，在背上四個不同部位之間按順時針方向旋轉。在第1、4和7天速效劑量(loading dose)後，每週一次(在第14、21、28、35、42、49、56、63、70，77和84天)給予猴子35 mg/kg的Ionis寡核苷酸。對照組的4隻食蟹獼猴以類似的方式注射0.9%食鹽水，並作為對照組。
在研究期期間，每天兩次觀察猴子的疾病或痛苦徵象。因為治療，傷害或疾病而歷經超過短暫或輕度疼痛或痛苦的任何動物，應與研究負責人協商後，由獸醫人員使用經核准的鎮痛藥或藥劑加以處理以減輕疼痛。鑑別出任何健康狀況不佳或可能垂死的動物，以供進行進一步監測和可能的安樂死。在最後一個劑量後約48小時，於第86天在深度麻醉的情況下，透過放血來對動物進行表定的安樂死。實例中所述的方案已由機構動物護理和使用委員會(IACUC)批准。身體與器官重量測量
為了評估Ionis寡核苷酸對動物整體健康狀況的影響，測量體重和器官重量。驗屍前測量末期體重。也測量器官重量，且所有重量測量值呈現於下表中。結果指出，就經修飾寡核苷酸而言，用經修飾寡核苷酸處理對體重和器官重量的影響在預期範圍內。具體而言，就猴子的體重和器官重量而言，用ION 729018進行處理的耐受性良好。 表58 體重與器官重量(g)
化合物編號 第 86 天的體重 (g) 心臟 腎臟 脾臟 睪丸 胸腺 肝臟
食鹽水 2828 12 14 2 2 3 59
728958 2791 10 17 3 1 3 72
729018 2726 11 14 4 1 3 66
785525 3017 12 17 5 1 4 78
785674 2618 10 15 4 1 2 63
785675 2793 11 16 3 2 3 63
786503 2926 10 17 4 1 3 73
786524 2917 11 16 5 1 4 67
786548 2668 9 16 4 1 3 66
腎臟與肝臟功能
為了評估Ionis寡核苷酸對肝功能和腎臟功能的影響，在第86天自所有研究組別收集血液樣本。在採血之前使猴子禁食隔夜。將血液收集在無抗凝劑的試管中以供血清分離。將試管在室溫下保持至少90分鐘，然後以3000 rpm離心10分鐘以​​獲得血清。使用Toshiba 200FR NEO化學分析儀(Toshiba Co., Japan)測量各種肝臟功能標記的量。測量血尿素氮(BUN)、肌酐(CREA)、總蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、丙胺酸轉胺酶(ALT)，天冬胺酸轉胺酶(AST)和總膽紅素(TBIL)的血漿量，且結果呈現在下表中。結果指出，就經修飾寡核苷酸來說，經修飾寡核苷酸對肝臟或腎臟功能沒有預期範圍之外的影響。具體而言，就猴子的肝臟和腎臟功能而言，用ION 729018進行處理的耐受性良好。 表59 食蟹獼猴血漿中的肝臟與腎臟功能標記
化合物編號 BUN (mg/dL) CREA (mg/dL) TP (g/dL) ALB (g/dL) ALT (IU/L) AST (IU/L) TBIL (mg/dL)
食鹽水 24 0.8 7.1 4.2 44 75 0.3
728958 26 0.8 7.0 4.2 55 99 0.2
729018 23 0.9 7.0 4.0 73 95 0.3
785525 24 1.0 7.0 4.0 44 102 0.2
785674 26 0.9 7.1 3.8 53 110 0.2
785675 25 0.8 6.8 4.0 57 96 0.3
786503 28 0.9 6.7 3.9 58 108 0.2
786524 27 0.9 7.6 3.7 58 93 0.2
786548 27 0.9 7.0 4.0 58 102 0.3
促發炎性蛋白分析
為了評估Ionis寡核苷酸在食蟹獼猴中的任何發炎性影響，採集血液樣本以供分析。在採血之前使猴子禁食隔夜。在第84天(給藥前和給藥後24小時)，從每隻動物收集約0.8 mL血液，並放入無抗凝劑的試管中供用於血清分離。將試管在室溫下保持至少90分鐘，然後在室溫下以3,000 rpm離心10分鐘以​​獲得血清。使用Toshiba 120 FR NEO化學分析儀(Toshiba Co., Japan)測量補體C3。結果指出，用ION 729018進行處理不會在猴子體內引起任何發炎。第86天測試了發炎的另一個標記，C反應蛋白(CRP)。 表60 食蟹獼猴中的促發炎性蛋白分析
化合物編號 補體 C3 (mg/dL) CRP (mg/L)
第 84 天 ( 給藥前 ) 第 84 天 ( 給藥後 24hr) 第 86 天
食鹽水 106 104 0.1
728958 96 91 0.1
729018 93 84 0.1
785525 90 88 0.2
785674 79 71 0.1
785675 82 83 0.1
786503 93 101 0.1
786524 86 78 0.6
786548 87 92 1.2
血液學
為了評估Ionis寡核苷酸在食蟹獼猴中對血液學參數的任何影響，在第86天從每隻可得的研究動物收集了大約0.5 mL血液的血液樣本。將樣本收集在裝有K2 -EDTA的試管中。使用ADVIA2120i血液分析儀(Siemens, USA)分析樣本的紅血球(RBC)計數、血紅素(HGB)、血容比(HCT)、血小板計數(PLT)、白血球(WBC)計數、個別白血球計數(例如單核球(MON)、嗜中性球(NEU)和淋巴球(LYM))的計數)。
數據指出，就這個劑量下的經修飾寡核苷酸來說，寡核苷酸不會引起任何血液學參數變化超出預期範圍。具體而言，就猴子的血液學參數而言，用ION 729018進行治療的耐受性良好。 表61 食蟹獼猴中的血球計數
化合物編號 RBC (x106 /μL) HGB (g/dL) HCT (%) PLT (10³/μL)
食鹽水 5.6 13.0 43 312
728958 5.7 12.7 43 442
729018 6.1 13.4 44 334
785525 5.4 12.2 41 459
785674 5.6 13.1 43 405
785675 5.9 13.5 45 342
786503 5.6 12.5 43 378
786524 5.8 12.6 44 252
786548 5.9 13.3 45 390
表62 食蟹獼猴中的血球計數
化合物編號 WBC (x10³/μL) NEU (%) LYM (%) MON (%)
食鹽水 11 4 7 0.3
728958 10 4 6 0.3
729018 9 4 5 0.2
785525 12 4 7 0.3
785674 16 8 7 0.4
785675 9 1 7 0.3
786503 16 4 11 0.3
786524 9 4 4 0.3
786548 10 3 6 0.2
凝血
為了評估Ionis經修飾寡核苷酸在食蟹獼猴中對凝血的影響，在第86天從每隻可得的研究動物中收集了約0.9 mL血液樣本。將樣本收集在含3.2%檸檬酸鈉的試管中。測試的凝血參數包括活化部分凝血活酶時間(APTT)，凝血酶原時間(PT)和纖維蛋白原(FIB)。
數據指出，就這個劑量下的經修飾寡核苷酸來說，經修飾寡核苷酸不會引起任何凝血參數變化超出預期範圍。具體而言，就猴子的凝血參數而言，用ION 729018進行治療的耐受性良好。 表63 食蟹獼猴中的凝血參數
化合物編號 PT (sec) FIB (mg/dL) APTT (sec)
食鹽水 10 195 18
728958 10 249 19
729018 10 219 18
785525 10 208 20
785674 9 238 19
785675 9 216 19
786503 10 226 18
786524 10 235 18
786548 10 302 16
藥物動力學分析
在驗屍時測量所收集組織內肝臟和腎臟之經修飾寡核苷酸的積累。729018顯示了這類化合物典型的腎臟和肝臟內組織積累概況。 表64 在12週皮下投藥後，於第86天的平均組織濃度
器官 化合物編號 平均濃度 (µg/g)
腎皮質 728958 2078
729018 1472
785525 1702
785674 2169
785675 1444
786503 1180
786524 1679
786548 1513
肝臟 728958 657
729018 763
785525 732
785674 773
785675 753
786503 496
786524 409
786548 392
實例 9 ：測量靶向人類 IRF5 之經修飾寡核苷酸的黏度
為了篩選出黏度大於40厘泊(cP)的經修飾寡核苷酸，測量來自上述研究所選出的經修飾寡核苷酸的黏度。黏度大於40 cP的經修飾寡核苷酸的最佳黏度將小於最佳黏度。
將寡核苷酸(32至38 mg)秤重到玻璃小瓶中；加入約100 μL水，並透過將小瓶加熱至55℃使經修飾寡核苷酸溶解於溶液中。將預熱樣本的一部分(75 µL)移至微量黏度計(PAC Cambridge Viscosity Viscometer)。將微量黏度計的溫度設定為25℃，並測定樣本的黏度。將全部75 uL樣本與剩餘部分的樣本合併，然後經適當稀釋以在260 nM下(Cary UV儀器)以UV測量。以下數據指出，在上述標準下，所有經修飾寡核苷酸溶液的黏度均最佳。 表65 經修飾寡核苷酸的黏度
化合物編號 依據重量的濃度 (mg/mL) 依據 UV 的濃度 (mg/mL) 黏度 (cP)
728958 300 201 17
729018 350 262 24
785524 350 277 14
785674 350 280 16
786503 300 218 40
786548 270 214 17
785675 250 209 6
786524 250 208 36
實例 10 ：確認人類 IRF5 間隔體的劑量依賴性抑制
選擇上述研究中所述對IRF5 mRNA展現顯著活體外抑制作用的經修飾寡核苷酸，並以各種劑量在人類A-431細胞和SH-SY5Y細胞中進行測試。 研究1
使用自由攝取法將被稀釋成下表所指定之不同濃度的經修飾寡核苷酸，來處理以每孔11,000個細胞的密度所培養的A-431細胞。在大約48小時的處理期後，使用人類IRF5引子探針組RTS37490 (正向序列CCACCTCAGCCCTACAAGA，在本文被定名為SEQ ID NO：17；反向序列TCAGGCTTGGCAACATCC；在本文被定名為SEQ ID NO：18；探針序列CCTGCTCCCACAGACTCCCAG，在本文被定名為SEQ ID NO：19)來測量IRF5 mRNA水平。IRF5 mRNA水平相對於藉由引子探針組RTS104測量的人類GAPDH進行正規化。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現於下表中。
也呈現每種經修飾寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC50 )。使用excel中數據的對數/線性圖上的線性回歸來計算IC50 。 表66 經修飾寡核苷酸在A-431細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
23.44 nM 93.75 nM 375.00 nM 1500.00 nM 6000.00 nM
728958 0 16 36 57 71 1.07
729018 31 72 93 98 99 0.05
785525 32 68 88 95 97 0.05
785675 7 27 57 80 90 0.28
786503 29 70 93 98 99 0.05
研究2
以電穿孔將被稀釋成下表所指定的不同濃度的經修飾寡核苷酸，對密度為每孔45,000個細胞的經培養SH-SY5Y細胞進行處理。在大約24小時的處理期後，使用人類IRF5引子探針組RTS37490測量IRF5 mRNA的量。IRF5 mRNA水平相對於藉由引子探針組RTS104測量的人類GAPDH進行標準化。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現於下表中。
也呈現每種經修飾寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC50 )。使用excel中數據的對數/線性圖上的線性回歸來計算IC50 。 表67 經修飾寡核苷酸在SH-SY5Y細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
23.44 nM 93.75 nM 375.00 nM 1500.00 nM 6000.00 nM
728958 0 0 23 47 64 1.07
729018 8 19 46 66 80 0.05
785525 8 15 36 68 80 0.05
785675 0 0 17 42 65 0.28
786503 22 15 32 64 80 0.05
實例 11 ：評估在 hPBMC 分析中的促發炎性影響
在活體外人類週邊血液單核細胞(PBMC)活化分析中，測試人類IRF5經修飾寡核苷酸的潛在免疫刺激特性。從健康供體所捐贈的新鮮全血中分離出人類PBMC (在US HealthWorks clinic, Carlsbad知情同意下)。將血液收集到8 mL Vacutainer CPT管中，該管包含檸檬酸鈉抗凝劑和Ficoll密度介質，聚酯凝膠屏障將這些液體分開。在Beckman Allegra 6R離心機中以1215 rpm離心CPT管後，藉由聚酯凝膠屏障將紅血球和顆粒球與血漿和PBMC分離。PBMC聚集在Ficoll和血漿之間的界面上，恰好在聚合物凝膠層上方。經純化PBMC用PBS (無Ca++ 、無Mg++ )洗滌，並重新懸浮於RPMI培養基(含有10% FBS與青黴素和鏈黴素的RPMI)。該分析僅使用存活率> 80%的PBMC製備物。這些分析中使用的PBMC的平均存活率為86.6%。
關於培養，將PBMC以5×105 個細胞/孔平鋪在無菌96圓底聚丙烯盤中。用濃度遞增的靶向人IRF5的經修飾寡核苷酸處理細胞(如下表中所示)，並在37℃和5% CO2 下培育24小時。ION No. 353512 (3-14-3 MOE間隔體，TCCCATTTCAGGAGACCTGG，在本文被定名為SEQ ID NO：35)是一個內部標準品，已知在分析中對IL-6釋放具有高反應性。ION No. 104838 (5-10-5 MOE間隔體，GCTGATTAGAGAGAGGTCCC，在本文被定名為SEQ ID NO：36)是一各內部標準品，已知在分析中是無反應性(陰性對照)。培育24小時後，將盤以330g離心5分鐘；收集上清液用於MSD人類促發炎性盤1_V-plex (訂製4-plex)細胞激素分析。按照製造商的說明書進行多重MSD細胞激素分析，以測量上清液中的IL-6，IL-10和TNF-α的量。使用Sector Imager 2400 (Meso Scale Discovery)測量電化學冷光（Electrochemiluminescence），並使用MSD DiscoveryWorkbench®軟體分析數據。
下表中呈現所測得的IL-6，IL-10和TNF-α量。所測試的許多寡核苷酸被認為是可耐受的。與陰性對照寡核苷酸相較，ION No. 729018始終引起相近或更少的細胞激素生成。 表68 以經修飾寡核苷酸處理人類PBMC之後的IL-6量
濃度 (uM) 化合物編號
728958 729018 785525 785674 785675 786503 786524 786548 353512 104838
0 172 162 144 148 219 193 198 194 213 205
0.0128 212 180 211 201 245 159 189 247 198 211
0.064 228 201 211 211 217 207 204 184 206 307
0.32 264 183 301 298 292 246 212 297 381 339
1.6 216 208 355 391 376 271 208 273 332 258
8.0 254 243 370 353 436 341 242 290 472 297
40.0 326 276 456 417 491 342 217 282 470 332
200.0 2709 286 745 502 738 446 286 452 632 524
表69 以經修飾寡核苷酸處理人類PBMC之後的IL-10量
濃度 (uM) 化合物編號
728958 729018 785525 785674 785675 786503 786524 786548 353512 104838
0 7 12 6 8 10 9 9 9 8 7
0.0128 7 8 10 8 10 7 8 8 13 6
0.064 27 36 9 12 13 10 8 9 43 12
0.32 13 15 20 28 37 25 9 14 66 24
1.6 10 24 40 47 55 31 13 18 52 24
8.0 14 26 29 43 60 34 18 20 28 21
40.0 9 17 11 20 27 15 21 13 11 11
200.0 13 5 7 9 9 8 15 5 8 6
表70 以經修飾寡核苷酸處理人類PBMC之後的TNF-α量
濃度 (uM) 化合物編號
728958 729018 785525 785674 785675 786503 786524 786548 353512 104838
0 11 10 9 9 11 10 10 11 12 12
0.0128 9 10 11 12 12 14 10 11 11 11
0.064 15 22 10 10 10 10 9 10 14 12
0.32 16 11 13 12 13 11 8 11 17 14
1.6 11 13 19 16 17 15 10 13 22 15
8.0 13 14 25 20 25 20 12 15 35 20
40.0 22 20 40 32 35 26 16 19 41 28
200.0 92 28 115 50 63 36 24 29 89 55
實例 12 ：經修飾寡核苷酸在 A-431 細胞中的人類 IRF5 劑量依賴性抑制
選取在上述研究中對IRF5 RNA展現顯著活體外抑制的經修飾寡核苷酸，並在人類A-431細胞中以不同劑量進行測試。
使用自由攝取法，以被稀釋成下表所指定之不同濃度的經修飾寡核苷酸來處理密度為每孔10,000個細胞的經培養A-431細胞。在大約48小時的處理期後，如前所述使用人類IRF5引子-探針組RTS4524測量IRF5 mRNA的量。根據RNA總含量(藉由RIBOGREEN®測量)來調整IRF5 mRNA的量。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現於下表中。也呈現每種經修飾寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC50 )。 表71 經修飾寡核苷酸在A-431細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 % IC50 (µM)
4.57 nM 13.72 nM 41.152 nM 123.457 nM 370.37 nM 1111.111 nM 3333.33 nM 10000.0 nM
729018 0 11 41 64 77 83 86 88 0.1
786503 0 2 26 57 71 82 88 89 0.1
786524 0 10 28 53 78 85 88 89 0.1
實例 13 ：靶向人類 IRF5 之經修飾寡核苷酸的設計以及劑量依賴性抑制
設計具有其他化學修飾的經修飾寡核苷酸，使其與729018、786503和785675的活性位點重疊，這些活性位點是根據上述研究選出的。在人類A-431細胞中測試新設計的寡核苷酸對人類IRF5 mRNA的活體外抑制作用。測試了幾種不同的化學修飾，這些修飾在下表的化學符號列中指明，其中符號「d」是指2'-去氧核糖糖，符號「s」是指硫代磷酸酯核苷間鍵結，符號「k」是指經cEt修飾的糖，符號「y」是指2'-o-甲基核糖，符號「MOP」是指甲氧基丙基膦酸酯核苷間鍵結，而符號「m C」是指5-甲基胞嘧啶。在一些情況下，胸腺嘧啶被尿嘧啶取代。 表72 針對劑量依賴性抑制研究所設計的經修飾寡核苷酸列表
化合物編號 SEQ ID NO: 2 起始位點 序列 (5' 至 3') 化學符號 SEQ ID NO
785675 4366 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1340
1073764 4366 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cks Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1340
1073765 4366 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Tks Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1340
1073766 4366 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m CdMOP Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1340
1073767 4366 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds TdMOP Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1340
1073768 4366 TGTCTAGTGTCATGGA Tks Gks Tds Cys Tds Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1340
1073769 4366 TGTCUAGTGTCATGGA Tks Gks Tds m Cds Uys Ads Gds Tds Gds Tds m Cds Aes Tes Ges Gks Ak 1356
786503 11736 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1270
1072783 11736 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Tks Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1270
1072784 11736 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Tds Aks Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1270
1072785 11736 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads TdMOP Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1270
1072786 11736 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Tds AdMOP Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1270
1072788 11736 CTGATATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Tds Ays Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1270
1072787 11736 CTGAUATGATACCTAA m Cks Tks Gks Ads Uys Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cds Tks Aks Ak 1355
729018 11737 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Ads Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 228
1072777 11737 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Aks Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 228
1072778 11737 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Ads Tks Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 228
1072779 11737 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds AdMOP Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 228
1072780 11737 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Ads TdMOP Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 228
1072781 11737 TCTGATATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Ays Tds Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 228
1072782 11737 TCTGAUATGATACCTA Tks m Cks Tks Gds Ads Uys Ads Tds Gds Ads Tds Ads m Cds m Cks Tks Ak 1354
利用自由攝取法，以被稀釋成下表所指定的不同濃度的經修飾寡核苷酸來處理密度為每孔10,000個細胞的經培養A-431細胞。在大約72小時的處理期後，使用人類IRF5引子探針組RTS4524測量IRF5 mRNA的量。根據RNA總含量(藉由RIBOGREEN®測量)來調整IRF5 RNA的量。結果以相對於未經處理的對照細胞的IRF5抑制百分比呈現。如本文所用，值「0」指出用經修飾寡核苷酸處理不會抑制IRF5 mRNA水平。
也呈現出每個經修飾寡核苷酸的半最大抑制濃度(IC50 )。在excel中，使用對數/線性圖上的線性回歸來計算IC50 。以下數據顯示，與測試的所有其他經修飾寡核苷酸相比，729018對人類IRF5顯示出顯著活性。 表73 經修飾寡核苷酸在A-431細胞中的多劑量分析
化合物編號 抑制 %
4.12 nM 12.25 nM 37.04 nM 111.11 nM 333.33 nM 1000 nM
729018 8 27 54 78 89 92
1072777 0 7 43 65 81 85
1072778 4 8 36 54 69 74
1072779 10 14 43 66 80 87
1072780 10 6 38 56 71 77
1072781 1 8 35 57 77 81
1072782 0 12 35 58 79 83
786503 13 29 54 80 88 90
1072783 20 29 38 64 83 83
1072784 18 23 41 63 80 75
1072785 11 22 29 56 76 78
1072786 0 15 25 54 71 71
1072787 6 23 41 64 82 82
1072788 1 14 31 56 74 79
785675 0 0 24 44 59 69
785675 4 2 28 44 60 74
1073764 0 5 6 24 23 41
1073765 0 0 9 17 13 29
1073766 0 15 10 39 58 75
1073767 2 11 4 8 18 32
1073768 0 11 5 15 25 33
1073769 0 7 10 26 46 62
無
無
無
Figure 12_A0101_SEQ_0001
Figure 12_A0101_SEQ_0002
Figure 12_A0101_SEQ_0003
Figure 12_A0101_SEQ_0004
Figure 12_A0101_SEQ_0005
Figure 12_A0101_SEQ_0006
Figure 12_A0101_SEQ_0007
Figure 12_A0101_SEQ_0008
Figure 12_A0101_SEQ_0009
Figure 12_A0101_SEQ_0010
Figure 12_A0101_SEQ_0011
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Figure 12_A0101_SEQ_0013
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Figure 12_A0101_SEQ_0016
Figure 12_A0101_SEQ_0017
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Figure 12_A0101_SEQ_0019
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Figure 12_A0101_SEQ_0023
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Claims (59)

  1. 一種包含長度為8至80個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO: 37至1356之核鹼基序列中任一者的至少8個、至少9個、至少10個，至少11個或至少12個連續核鹼基的核鹼基序列。
  2. 一種化合物，其包含長度為8至80個核苷且具有包含SEQ ID NO: 37至1356中任一個核鹼基序列之核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。
  3. 一種化合物，其包含具有由SEQ ID NO: 37至1356中任一者組成之核鹼基序列的經修飾寡核苷酸。
  4. 一種包含長度為8至80個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，其中該經修飾寡核苷酸具有包含至少8個連續核鹼基部分的核鹼基序列，該至少8個連續核鹼基部分與SEQ ID NO：2之核鹼基4366至4381、5141至5156、5140至5160、5179至5194、11544至11559、11542至11596、11736至11751、11737至11752，11720至11790或11794至11809的等長部分為100%互補，且其中該經修飾寡核苷酸的核鹼基序列與SEQ ID NO：2為至少85%、至少90%，至少95%或100%互補。
  5. 一種包含長度為8至80個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，其中該經修飾寡核苷酸具有與SEQ ID NO：2之核鹼基5567至5642、5644至5731、5567至5731、5567至5620、13697至13733、20553至20676、20664至20824，20553至20824及25844至25912範圍內互補的核鹼基序列，且其中該經修飾寡核苷酸與SEQ ID NO：2為至少85%、至少90%，至少95%或100%互補。
  6. 一種包含長度為8至80個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，其中該經修飾寡核苷酸具有包含至少8個連續核鹼基部分的核鹼基序列，該至少8個連續核鹼基部分與具有SEQ ID NO：2之核鹼基序列的IRF5核酸的核鹼基5567至5642、5644至5731、5567至5731、5567至5620、13697至13733、20553至20676、20664至20824，20553至20824及25844至25912的之等長部分為互補，且其中該經修飾寡核苷酸的核鹼基序列與SEQ ID NO：2互補。
  7. 一種包含長度為8至80個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，其中該經修飾寡核苷酸具有包含16個核鹼基部分的核鹼基序列，該16個核鹼基部分與SEQ ID NO：2之核鹼基5567至5642、5644至5731、5567至5731、5567至5620、13697至13733、20553至20676、20664至20824，20553至20824及25844至25912的等長部分為互補。
  8. 一種包含長度為8至80個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，其中該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO: 168、228、717、1340、1270，1272及1294中任一者的核鹼基序列。
  9. 一種包含經修飾寡核苷酸的化合物，該經修飾寡核苷酸具有由SEQ ID NO: 168、228、717、1340、1270，1272及1294中任一者組成的核鹼基序列。
  10. 如請求項1至9中任一項之化合物，其中該寡核苷酸在寡核苷酸的全長上與SEQ ID NO: 2為至少80%、至少85%、至少90%，至少95%或100%互補。
  11. 如請求項1至10中任一項之化合物，其中該經修飾寡核苷酸包含至少一個選自下列的修飾：至少一個經修飾核苷間鍵結、至少一個經修飾糖以及至少一個經修飾核鹼基。
  12. 如請求項11之化合物，其中該經修飾核苷間鍵結為硫代磷酸酯（phosphorothioate）核苷間鍵結。
  13. 如請求項11或12之化合物，其中該經修飾糖為雙環糖。
  14. 如請求項13之化合物，其中該雙環糖是選自由下列組成之群組：4'-(CH2 )-O-2' (LNA)；4'-(CH2 )2 -O-2' (ENA)；及4'-CH(CH3 )-O-2' (cEt)。
  15. 如請求項11或請求項12之化合物，其中該經修飾糖為2’-O-甲氧基乙基。
  16. 如請求項11至15中任一項之化合物，其中該經修飾核鹼基為5-甲基胞嘧啶。
  17. 如請求項1至16中任一項之化合物，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由連接去氧核苷組成的間隔片段； 由連接核苷組成的5'側翼片段；及 由連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段緊鄰5'側翼片段和3'側翼片段並介於5'側翼片段和3'側翼片段之間，且其中每個側翼片段的每個核苷包含經修飾糖。
  18. 如請求項1至17中任一項之化合物，其中該化合物為單股。
  19. 如請求項1至17中任一項之化合物，其中該化合物為雙股。
  20. 如請求項1至19中任一項之化合物，其中該化合物包含核糖核苷酸。
  21. 如請求項1至19中任一項之化合物，其中該化合物包含去氧核糖核苷酸。
  22. 如請求項1至21中任一項之化合物，其中該經修飾寡核苷酸由10至30個連接核苷組成。
  23. 如請求項1至21中任一項之化合物，其中該經修飾寡核苷酸由12至30個連接核苷組成。
  24. 如請求項1至21中任一項之化合物，其中該經修飾寡核苷酸由15至30個連接核苷組成。
  25. 一種包含長度為16個連接核苷之經修飾寡核苷酸的化合物，其中該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO: 168、228、717、1340、1270，1272及1294中任一者之核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由連接去氧核苷組成的間隔片段； 由連接核苷組成的5'側翼片段；及 由連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，且其中每個側翼片段的每個核苷包含經修飾的糖。
  26. 一種包含長度為12至30個連接核鹼基之經修飾寡核苷酸或由其組成的化合物，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO: 228、168、1270，1272及1294中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由三個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由三個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中每個側翼片段的每個核苷均包含cEt糖；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，該經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
  27. 一種由長度為16個連接核鹼基之經修飾寡核苷酸組成的化合物，該經修飾寡核苷酸具有由SEQ ID NO ：228中所述序列組成的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由三個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由三個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中每個側翼片段的每個核苷均包含cEt糖；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。
  28. 一種包含長度為12至30個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸或由其組成的化合物，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：717中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由十個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由兩個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由四個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中5'側翼片段中的每個核苷均包含cEt糖(kk)；其中3'側翼片段的核苷自5'至3'方向包含cEt糖、2'-MOE糖，cEt糖和2'-MOE糖(keke)；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
  29. 一種包含長度為12至30個連接核鹼基的經修飾寡核苷酸或由其組成的化合物，該經修飾寡核苷酸具有包含SEQ ID NO：717及1340中任一者所述序列的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含： 由九個連接去氧核苷組成的間隔片段； 由兩個連接核苷組成的5'側翼片段；及 由五個連接核苷組成的3'側翼片段； 其中該間隔片段位於5'側翼片段和3'側翼片段之間，其中5'側翼片段中的每個核苷均包含cEt糖(kk)；其中3'側翼片段的核苷自5'至3'方向包含2'-MOE糖、2'-MOE糖、2'-MOE糖，cEt糖和cEt糖(eeekk)；其中每個核苷間鍵結是硫代磷酸酯鍵結，且其中每個胞嘧啶是5-甲基胞嘧啶。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16至30個連接核苷組成。在某些具體例中，經修飾寡核苷酸由16個連接核苷組成。
  30. 一種具有下式的化合物或其鹽：
    Figure 03_image021
    。
  31. 一種具有下式的化合物：
    Figure 03_image023
    。
  32. 如請求項1至30中任一項之化合物或經修飾寡核苷酸，其中經修飾寡核苷酸的化合物呈醫藥上可接受之鹽形式。
  33. 如請求項32之化合物或經修飾寡核苷酸，其中該醫藥上可接受之鹽為鈉鹽。
  34. 如請求項32之化合物或經修飾寡核苷酸，其中該醫藥上可接受之鹽為鉀鹽。
  35. 一種組成物，其包含如請求項1至34中任一項之化合物或經修飾寡核苷酸及醫藥上可接受之載體。
  36. 一種組成物，其包含如任一前述請求項之化合物或經修飾寡核苷酸組成物，係用於治療中。
  37. 一種在個體體內治療、預防或改善與IRF5相關之疾病的方法，其包含向該個體投與靶向IRF5的化合物，從而治療、預防或改善該疾病。
  38. 一種向個體投與如請求項1至34之化合物或如請求項35或請求項36之組成物的方法。
  39. 如請求項37之方法，其中該化合物為靶向IRF5的反義化合物。
  40. 如請求項42或43之方法，其中該疾病為發炎性腸病。
  41. 如請求項40之方法，其中該發炎性腸病為潰瘍性結腸炎。
  42. 如請求項40之方法，其中該發炎性腸病為克隆氏症（Crohn’s disease）。
  43. 如請求項38至42中任一項之方法，其中投與該化合物係抑制或減少個體的胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便，腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重（tenesmus）或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕
  44. 一種在細胞中抑制IRF5表現的方法，其包含使細胞與靶向IRF5的化合物接觸，從而抑制IRF5在細胞內的表現。
  45. 如請求項44之方法，其中該細胞在個體的胃腸道中。
  46. 如請求項45之方法，其中該個體罹患，或有風險罹患發炎性腸病。
  47. 一種在個體體內減少或抑制性減少胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹部絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕的方法，其包含向該個體投與靶向IRF5的化合物，從而減少或抑制減少個體的胃腸道發炎、腹瀉、疼痛、疲勞、腹痛絞痛、血便、腸發炎、胃腸道上皮屏障破壞、營養不良、腸蠕動增加、裡急後重或肛門括約肌疼痛痙攣、便秘或預期之外的體重減輕。
  48. 如請求項50之方法，其中該個體罹患，或有風險罹患發炎性腸病。
  49. 如請求項47至51中任一項之方法，其中該化合物為靶向IRF5的反義化合物。
  50. 如請求項47至49中任一項之方法，其中該化合物為請求項1至34中任一項之化合物或請求項35或請求項36之組成物。
  51. 如請求項44或47之方法，其中該化合物或組成物係非經腸投與。
  52. 一種靶向IRF5之化合物用於治療、預防或改善與IRF5相關之疾病的用途。
  53. 如請求項52之用途，其中該疾病為發炎性腸病。
  54. 如請求項52或53之用途，其中該化合物為靶向IRF5的反義化合物。
  55. 如請求項52至54中任一項之用途，其中該化合物為請求項1至34中任一項之化合物或請求項35或請求項36之組成物。
  56. 一種靶向IRF5之化合物於製造治療、預防或改善與IRF5相關之疾病的藥物的用途。
  57. 如請求項56之用途，其中該疾病為發炎性腸病。
  58. 如請求項56或57之用途，其中該化合物為靶向IRF5的反義化合物。
  59. 如請求項56至58中任一項之用途，其中該化合物為請求項1至34中任一項之化合物或請求項35或請求項36之組成物。
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