JP7279057B6 - Pd1/pd-l1活性化の阻害剤としてのピリミジン誘導体 - Google Patents
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Description
当業者は、本開示が具体的に記載されたもの以外の変形および改変の対象となることを認識するであろう。本開示は、すべてのそのような変形および改変を含むことを理解されたい。開示はまた、本明細書中で言及された、または示された、そのような工程、特徴、組成物、および化合物が、個別にまたは集合的に含み、いずれかまたはそれ以上のそのような工程または特徴の、あらゆるすべての組み合わせを含む。
便宜上、本開示のさらなる説明の前に、本明細書で用いられる特定の用語、および例をここにまとめる。これらの定義は、開示の残りの部分に照らして読まれるべきであり、当業者によるように理解されるべきである。本明細書で使用される用語は、当業者に認識され、知られている意味を有するが、便宜および完全性のために、特定の用語およびそれらの意味を以下に記載する。
N-(2-(((2-((4’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-1)、
N-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-N-メチルグリシン(化合物-2)、
N-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-N-メチルグリシン(化合物-3)、
(1R,6R)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物-4)、
(1S,6R)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物-5)、
N-(2-(((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-6)、
(S)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-7)、
(S)-1-((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-8)、
(S)-1-((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-9)、
(S)-1-((4-(4-ヒドロキシブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-10)、
(2S,4R)-1-((2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)-オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物-11)、
(S)-1-((4-((5-シアノピリジン-3-イル)メトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-12)、
(S)-1-((2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-13)、
N-(2-(((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-14)、
(R)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物15)、
(S)-1-((2-((4’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-16)、
(S)-1-((2-((3’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物17)、
N-(2-(((2-((3’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-18)、
(S)-1-((2-((2’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物19)、
N-(2-(((2-((2’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物20)、
N-(2-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物21)、
(S)-1-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物22)、
1-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)シクロプロパン-1-カルボン酸(化合物23)、
(3-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)プロパン酸(化合物24)、
2-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物25)、
(2-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)(メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物26)、
(S)-3-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)ブタン酸(化合物27)、
((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-D-アラニン(化合物28)、
((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アスパラギン(化合物29)、
(2R,4R)-1-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物30)、
1-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アゼチジン-2-カルボン酸(化合物31)、
N-(2-(((4-(ベンジルオキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物32)、
1-((4-(ベンジルオキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物33)、
(2S,4R)-1-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物34)、
2-(((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物35)、
((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-L-プロリン(化合物36)、
メチル4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-カルボキシレート(化合物37)、
4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-カルボン酸(化合物38)、
(2S,4R)-1-((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物39)、
((S)-1-((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物40)、
2-(((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物41)、
2-(((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物42)、
(S)-4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-カルボン酸(化合物43)、
2-(4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-イル)酢酸(化合物44)、
(S)-1-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物45)、
(S)-5-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-5-アザスピロ[2.4]ヘプタン-6-カルボン酸(化合物46)、
7-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2,7-ジアザスピロ[4.5]デカン-1-オン(化合物47)、
rac-(1R,6S)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物48)、
(S)-4-アセチル-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペラジン-2-カルボン酸(化合物49)、
(S)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペラジン-2-カルボン酸(化合物50)、
(S)-5-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-5-アザスピロ[2.4]ヘプタン-6-カルボン酸(化合物51)、
7-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2,7-ジアザスピロ[4.5]デカン-1-オン(化合物52)、
N-(2-(((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物53)、
(2S,4R)-1-((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキシル酸(化合物54)、
(S)-1-((2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物55)、
N-(2-(((2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物56)、
N-(2-(((2-((3’,4’-ジメトキシ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物57)、
((2S,4R)-1-((2-((3’,4’-ジメトキシ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物58)、
(2S,4R)-1-((4-((5-シアノピリジン-3-イル)メトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物59)、
(S)-2-(1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-イル)酢酸(化合物60)、
(R)-2-(1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-イル)酢酸(化合物61)、
(S)-4-(6-アセトアミドヘキサノイル)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペラジン-2-カルボン酸(化合物62)、
(S)-4,4-ジフルオロ-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物63)、
(S)-1-((4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物64)、および
N-(2-(((4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物65)。
略語:
Ac アセチル;
Ac2O 無水酢酸;
ACN アセトニトリル;
AIBN アゾビス(イソブチロニトリル);
BINAP 2,2’-ビス(ジフェニルホスフィノ)-1,1’-ビナフチル;
BMS ボラン-ジメチルスルフィド錯体;
Bn ベンジル;
Boc Tert-ブトキシカルボニル;
Boc2O ジ-tert-ブチルジカルボネート;
BuLi ブチルリチウム;
CSF フッ化セシウム;
DCE 1,2-ジクロロエタン;
DCM ジクロロメタン;
DDQ 2,3-ジクロロ-5,6-ジシアノ-1,4-ベンゾキノン;
DMS ジメチルスファイド(Dimethyl sufide);
ATP アデノシン三リン酸;
ビス-ピナコラートジボロン 4,4,4’,4’,5,5,5’,5’-オクタメチル-2,2’-ビ-1,3,2-ジオキサボロラン;
BSA ウシ血清アルブミン;
C18 HPLC固定相中のシリコン上の18-炭素アルキル基をいう;
CH3CN アセトニトリル;
Cy シクロヘキシル;
DCC N,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド;
DIPEA ヒューニッヒ塩基、N-エチル-N-(1-メチルエチル)-2-プロパンアミン;
ジオキサン 1,4-ジオキサン;
DMAP 4-ジメチルアミノピリジン;
DME 1,2-ジメトキシエタン;
DMF N,N-ジメチルホルムアミド;
DMSO ジメチルスルホキシド;
DPPA ジフェニルホスホリルアジド;
EtOAc 酢酸エチル;
EtOH エタノール;
Et2O ジエチルエーテル;
HATU 1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート;
HOAc 酢酸;
HPLC 高圧液体クロマトグラフィー;
HMDS ヘキサメチルジシラジド;
IPA イソプロピルアルコール;
LAH 水素化リチウムアルミニウム;
LDA リチウムジイソプロピルアミド;
LHMDS リチウムヘキサメチルジシラジド;
MeOH メタノール;
MPLC 中圧液体クロマトグラフィー;
MTBE メチルtert-ブチルエーテル;
mCPBA m-クロロ過安息香酸;
NaHMDS ヘキサメチルジシラジドナトリウム;
NBS N-ブロモスクシンイミド;
NMR 核磁気共鳴;
Pd2(dba)3 トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0);
Pd(dppf)Cl2.DCM錯体 [1,1’-ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン]ジクロロパラジウム(II).ジクロロメタン錯体;
RPHPLC 逆相高圧液体クロマトグラフィー;
RT 室温;
Sat. 飽和;
SGC シリカゲルクロマトグラフィー;
SM 出発物質;
T3P プロピルホスホン酸無水物;
TCL 薄層クロマトグラフィー;
TEA トリエチルアミン;
TFA トリフルオロ酢酸;および
THF テトラヒドロフラン。
工程1:化合物A(5-ブロモ-2,4-ジクロロピリミジン)を、適切な溶媒中でアルコキシドのナトリウムまたはカリウム塩と反応させて、対応する5-ブロモ-2-クロロ-4-アルコキシピリミジン(化合物B)を得た
工程2:化合物B3(2,3置換ベンジルアルコール)は、置換ブロモベンゼンB1を対応するボロン酸B2のパラジウム触媒とSuzukiカップリングによって合成し、B3を得た。
スキーム1a
R9がアルキルまたはアリールである一般式Ibの化合物は、以下のスキームを用いて調製することができる
スキーム1b
反応プロセスにおいて使用される化合物は、特に言及しない限り、商業的に入手可能であった。NMRデータは、Varian 400MHz分光計で得た。すべての化合物を、1H NMR、HPLCおよび質量分析(LCMS(ES)、液体クロマトグラフィー-質量分析)によって同定した。全ての1H化学シフトを百万分率(ppm)で記録し、溶媒としてのTMSまたは残留重水素化DMSOに対して測定した。LCMS(ES)測定は、Agilent-LCMS D-SL(G1456B)質量分析計で行った。提供される化合物の収率は、単離された化合物を指す。
(4’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(化合物1、5-9の中間体)の合成
N-(2-(((2-((4’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-1)
0℃のMeOH(2mL)およびDMF(2mL)中の4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(B5、0.15g、0.43mmol)の溶液に、メチルグリシン(B6、0.12g、1.35mmol)および酢酸(0.1mL)を同時に加え、反応物をr.tで1時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、NaCNBH3(0.08g、1.29mmol)を加え、反応混合物をr.tで16時間撹拌した。反応混合物を蒸発させ;粗製物をDCM(15mL)に取り、水およびブライン溶液で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濃縮して粗製物残渣を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の10%MeOHを用いたcombiflash MPLCで精製して、N-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-N-メチルグリシン(化合物-2)を粘性固体として得た(収率:0.035g、19%)。LCMS (ES)m/z=422.2[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δppm:1.22-1.31(m、3H)、2.18(s、3H)、2.28(s、3H)、3.15(s、2H)、3.59(s、3H)、4.34-4.39(m、2H)、5.41(s、2H)、7.16-7.18(m、1H)、7.23-7.30(m、3H)7.36-7.48(m、4H)、8.23(s、1H):HPLC@254nm、99.38%。
DMF(15mL)中の(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(1g、5.05mmol)の撹拌溶液に、NaH(0.24g、6.06mmol)を0℃で加え、反応物を室温で30分間撹拌した。次いで、反応物に、DMF(5mL)中の2-クロロ-4,6-ジメトキシピリミジン(0.97g、5.55mmol)を0℃で加え、反応混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物を氷でクエンチし、酢酸エチルで抽出した。有機層を氷冷水、ブライン溶液で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。次いで、有機層を蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の3%酢酸エチルを用いたcombiflash MPLCで精製して、4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジンを無色の粘性油として得た(1.4g、83%)。LCMS(ES)m/z=337[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δppm2.16(s、3H)、3.86(s、6H)、5.42(s、2H)、5.87(s、1H)、7.18(d、J=7.2Hz、1H)、7.24-7.30(m、3H)、7.36-7.37(m、1H)、7.39-7.43(m、3H)。
DMF(6mL)中の4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン(0.8g、2.38mmol)の撹拌溶液に、POCl3(5mL 16.48mmol)を加え、反応物をN2ガスで10分間脱気し、Pd(Pph3)4(0.7mL、7.82mmol)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応混合物を氷上に注ぎ、飽和NaHCO3溶液で塩基性化し、固体沈殿を濾過し、真空下で乾燥させて、粗製生成物を得た。粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の20%酢酸エチルを用いたcombiflash MPLCで精製して、4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒドを白色固体として得た(0.38g、44%)。LCMS(ES)m/z=365.1[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δppm2.21(s、3H)、3.99(s、6H)、5.55(s、2H)、7.20(d、J=7.2Hz、1H)、7.26-7.30(m、3H)、7.34-7.38(m、1H)、7.42-7.47(m、3H)、10.05(s、1H)。
0℃のMeOH(3mL)およびDMF3mL)中の4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(0.19g、0.52mmol)の溶液に、N-(2-アミノエチル)アセトアミド(0.203g、1.56mmol)および酢酸(0.1mL)を同時に加え、反応混合物を室温で1時間撹拌した。反応混合物を0℃に冷却し、NaCNBH3(0.09g、1.56mmol)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌した。反応混合物を蒸発させ、粗製物をDCM(15mL)に取り、水およびブライン溶液で洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濃縮して粗製物残渣を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の10%メタノールを用いたcombiflash MPLCで精製して、N-(2-(((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミドをオフホワイトの固体(0.05g、23%)として得た。LCMS(ES)m/z=451.2[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δppm1.76(s、3H)、2.20(s、3H)、3.14(s、1H)、2.52-2.54(m、2H)、3.10(q、J=6Hz、2H)、3.58(s、2H)、3.89(s、6H)、5.44(s、2H)、7.17(d、J=7.2Hz、1H)、7.23-7.29(m、3H)7.33-7.37(m、1H)、7.43(t、J=7.6Hz、3H)、7.76(bs、1H):HPLC@254 nm、98.47%。
(1R,6R)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物-4)
0℃のEtOH(30mL)中の4,6-ジクロロ-2-(メチルチオ)ピリミジン(5g、25mmol)の撹拌溶液に、NaOEt(EtOH中21%、20mL、56mmol)を加え、反応物を室温で6時間撹拌した。反応混合物を蒸発させ、粗製物を水(100mL)に取り、酢酸エチル(2×300mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン溶液で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させて、4,6-ジエトキシ-2-(メチルチオ)ピリミジンを白色固体として得た(収率:4.7g、85.5%)。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ1.37(d、J=7.04Hz、6H)、2.51(s、3H)、4.32-4.37(t、J=7.04Hz、4H)、5.67(s、1H)。
0℃のDCM(30mL)中の4,6-ジエトキシ-2-(メチルチオ)ピリミジン(51g、4mmol)の撹拌溶液に、mCPBA(4.31g、24mmol)を加え、反応混合物を室温で20時間撹拌した。反応混合物を氷冷水(30mL)でクエンチし、DCM(3×100mL)で抽出した。有機層を飽和重炭酸ナトリウム溶液、およびブライン溶液で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の8%酢酸エチルを用いたフラッシュクロマトグラフィーによって精製して、4,6-ジエトキシ-2-(メチルスルホニル)ピリミジンを白色固体として得た(収率:1g、81%)。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ1.41(d、J=7.08Hz、6H)、3.30(s、3H)、4.32-4.48(t、J=7.12Hz、4H)、6.12(s、1H)。
DMF(40mL)中の4,6-ジエトキシ-2-(メチルスルホニル)ピリミジン(4.5g、18.2mmol)の撹拌溶液に、(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(3.62g、18.2mmol)および炭酸カリウム(2.53g、18.2mmol)を加え、反応混合物を80℃で8時間加熱した。反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の10%酢酸エチルを用いたフラッシュクロマトグラフィーによって精製して、4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジンを白色固体として得た(収率:3.5g、52%)。LCMS(ES)m/z=365.21[M+H]+、純度@214nm、89.77%;1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δppm:1.30(m、6H)、2.20(s、3H)、4.29-4.33(m、4H)、5.40(s、2H)、7.20(m、1H)、7.25-7.30(m、3H)、7.39(m、1H)、7.44-7.48(m、4H)。
窒素雰囲気下で、0℃のDMF(10mL)中の塩化ホスホリル(5mL)の溶液を1時間撹拌した。DCE(30mL)中の4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン(3.5g、9.6mmol)の溶液を滴下した。次いで、反応混合物を室温で30分間撹拌し、その後、80℃で3時間加熱した。反応完了後、反応混合物を真空中で濃縮し、DCM(50mL)で希釈した。有機層を水(25mL)、ブライン溶液で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮して、粗製生成物を得て、これを、シリカゲルクロマトグラフィー(ヘキサン中の10%EtOAc)によって精製して、4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒドを白色固体として得た(収率:1.5g、39%)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.34(t、J=7.08Hz、6H)、2.22(s、3H)、4.46-4.51(m、4H)、5.52(s、2H)、7.21(m、1H)、7.26-7.30(m、3H)、7.40(m、1H)、7.44-7.48(m、3H)、10.07(s、1H)。
室温のMeOH(3mL)およびDMF(3mL)中の4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(0.15g、0.38mmol)の溶液に、N-(2-アミノエチル)アセトアミド(60mg、0.57mmol)および酢酸(0.1mL)を同時に加え、反応混合物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(0.08g、1.29mmol)を加え、16時間室温で撹拌した。反応混合物を水(10mL)で希釈し、DCM:MeOH(9:1)(3×25mL)で抽出した。有機層を水、ブライン溶液で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製物残渣を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の8%メタノールを用いたフラッシュクロマトグラフィーで精製して、N-(2-(((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミドを白色固体として得た(収率:0.091g、49%)。LCMS(ES)m/z=479.24[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.19-1.30(t、6H)、1.82(s、3H)、2.19(s、3H)、2.93(m、2H)、3.30(m、2H)、3.89(s、2H)、4.35-4.40 (q、4H)、5.43(s、2H)、7.21(m、1H)、7.26-7.30(m、3H)、7.40(m、1H)、7.44-7.48(m、3H)、8.03(s、1H)、8.23(bs、1H)。HPLC@214nm、98.19%。
0℃のメタノール(200mL)中の5-ブロモ-4-クロロ-2-(メチルチオ)ピリミジン(25g、105mmol)の撹拌溶液に、NaOMe(MeOH中21%、30mL、136mmol)を加え、反応混合物を室温で8時間撹拌した。反応完了後、反応混合物を真空下で濃縮した。粗製生成物を水(500mL)で希釈し、酢酸エチル(2×900mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン溶液(100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させて、5-ブロモ-4-メトキシ-2-(メチルチオ)ピリミジンを白色固体として得た(収率:22g、89%)。LCMS(ES)m/z=235.19[M+H]+ 1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.54(s、3H)、4.05(s、3H)、8.34(s、1H)。
0℃のDCM(2L)中の5-ブロモ-4-メトキシ-2-(メチルチオ)ピリミジン(140g、595mmol)の撹拌溶液に、メタ-クロロ過安息香酸(308g、1780mmol)を加え、反応混合物を室温で20時間撹拌した。反応混合物を氷冷水(1L)でクエンチし、DCM(3×2L)で抽出した。合わせた有機層を飽和重炭酸ナトリウム溶液(1L)、ブライン溶液(500mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。次いで、有機層を蒸発させ、粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の8%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-ブロモ-4-メトキシ-2-(メチルスルホニル)ピリミジンを白色固体として得た(収率:72g、45.38%)。LCMS(ES)m/z=267.25[M+H]+ 1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ3.40(s、3H)、4.11(s、3H)、9.02(s、1H)。
DMF(400mL)中の5-ブロモ-4-メトキシ-2-(メチルスルホニル)ピリミジン(80g、299mmol)の撹拌溶液に、(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(59.49g、300mmol)および炭酸カリウム(123g、900mmol)を加え、反応混合物を80℃で12時間加熱した。反応完了後、反応混合物を水(1L)で希釈し、酢酸エチル(2×2L)で抽出した。次いで、合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の10%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-ブロモ-4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジンを白色固体として得た(収率:47g、40.8%)。LCMS(ES)m/z=385.37[m+H]+ 1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.28(s、3H)、4.05(s、3H)、5.46(s、2H)、7.21-7.25(m、2H)、7.31-7.34(m、2H)、7.36-7.39(m、1H)、7.41-7.46(m、3H)、8.33(s、1H)。
DMF(150mL)中の5-ブロモ-4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン(48g、124mmol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(71.1g、220mmol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(7.1g 6.2mmol)を加え、反応混合物を100℃で16時間加熱した。反応完了後、反応混合物を、セライトを通して濾過し、濾液を水(500mL)で希釈し、酢酸エチル(2×1L)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の3%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジンを黄色の油状液体として得た(収率:30g、72.8%)。LCMS(ES)m/z=333.47[M+H]+ 1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.21(s、3H)、3.92(s、3H)、5.31(d、J=11.6Hz、1H)、5.55(s、2H)、5.89(d、J=16.6Hz、1H)、6.62-6.69(m、1H)、7.21-7.31(m、4H)、7.37-7.46(m、4H)、8.51(s、1H)。
0℃のTHF(80mL)および水(80mL)中の4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1'-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン(24g、72mmol)の撹拌溶液に、OsO4(73mL、tert-ブタノール中2.5重量%溶液、7.2mmol)を加え、15分間撹拌した。この混合物に、NaIO4(23g、108mmol)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(300mL)で希釈し、酢酸エチル(2×800mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の12%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒドをオフホワイトの固体として得た(収率:18g、60%)。LCMS(ES)m/z=335.38[M+H]+ 1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.29(s、3H)、4.13(s、3H)、5.58(s、2H)、7.24-7.31(m、3H)、7.35-7.45(m、5H)、8.81(s、1H)、10.18(s、1H)。
EtOH(45mL)およびDMF(45mL)中の4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(30g、89mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(11.58g、89mmol)および酢酸(0.3mL)を同時に加え、反応物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物にNaCNBH3(16.91g、269mmol)を加え、室温で16時間撹拌を続けた。反応混合物を水(100mL)で希釈し、DCM(2×150mL)中の10%MeOHで抽出した。合わせた有機層を水(40mL)およびブライン溶液(40mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製生成物(16g)を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の8%メタノールを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、(S)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を淡黄色固体として得た(収率:10.5g、26.1%)。LCMS(ES)m/z=448.24[M+H]+、純度@214nm、99.36%.;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.35(m、1H)、1.46(m、3H)、1.70(m、2H)、2.20(m、4H)、2.89(m、1H)、3.07(br、1H)、3.55(d、1H)、3.66(d、1H)、3.90(s、3H)、5.43(s、2H)、7.21(m、1H)、7.26-7.30(m、3H)、7.37(m、1H)、7.44-7.48(m、3H)、8.25(s、1H)。
0℃のエタノール(100mL)中の2-フルオロ-5-ホルミルベンゾニトリル(10g g、67mmol)の撹拌溶液に、水素化ホウ素ナトリウム(3.0g、80mmol)を加え、0℃で2時間撹拌を続けた。TLCが完了を示した後、反応混合物を氷冷水(50mL)でクエンチし、DCM(2×50mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、2-フルオロ-5-(ヒドロキシメチル)ベンゾニトリルを白色固体として得た(収率:10g、100%)。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.33(s、1H)、4.69(s、2H)、7.21(s、1H)、7.57-7.63(m、2H)。
0℃のTHF(200mL)中の2-フルオロ-5-(ヒドロキシメチル)ベンゾニトリル(5.0g、34mmol)の撹拌溶液に、水素化ナトリウム(1.36g、鉱油中60%、34mmol)を加え、0℃で1時間撹拌した。この混合物に、5-ブロモ-2,4-ジクロロピリミジン(7.5g、34mmol)を加え、反応混合物を室温で5時間撹拌した。完了後、反応混合物を氷冷水(100mL)でクエンチし、クロロホルム(4×100mL)中の10%IPAで抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮した。粗製物を、ヘキサン中20%EtOAcを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)によって精製して、5-(((5-ブロモ-2-クロロピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)-2-フルオロベンゾニトリルを白色固体として得た(収率:4.9g、65%)。LCMS(ES)m/z=342.19[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ5.51(s、2H)、7.59(m、1H)、7.91(m、1H)、8.06(m、1H)、8.78(bs、1H)。
0℃のDMF(100mL)中の(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(2.7g、14mmol)の撹拌溶液に、水素化ナトリウム(0.67g、鉱油中60%、17mmol)を加え、室温で30分間撹拌した。この混合物に、5-(((5-ブロモ-2-クロロピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)-2-フルオロベンゾニトリル(5.5g、16mmol)を加え、室温で16時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(2×200mL)で抽出した。次いで、合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の15%酢酸エチルを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200メッシュ)で精製して、5-(((5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)-2-フルオロベンゾニトリルを白色固体として得た(収率:2.8g、41%)。LCMS(ES)m/z=504.32[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.21(s、3H)、5.38(s、2H)、5.53(s、2H)、7.21-7.23(m、1H)、7.31-7.34(m、3H)、7.36-7.39(m、1H)、7.41-7.45(m、3H)、7.56(m、1H)、7.89(m、1H)、8.05(m、1H)、8.58(s、1H)。HPLC純度@214nm、88.94%。
DMF(30mL)中の5-(((5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)-2-フルオロベンゾニトリル(2.8g、5.5mmol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(4.4g、13mmol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(0.6g、0.5mmol)を加え、反応混合物を100℃で3時間加熱した。反応完了後、反応混合物を、セライトを通して濾過し、濾液を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の25%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-フルオロ-5-(((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ベンゾニトリルをオフホワイトの固体として得た(収率:1.6g、66.6%)。LCMS(ES)m/z=452.42[M+H]+;1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.26(s、3H)、5.30(d、J=11.6Hz、1H)、5.42(s、2H)、5.52(s、2H)、5.80(d、J=16.8Hz、1H)、6.68(m、1H)、7.21-7.23(m、1H)、7.31-7.34(m、3H)、7.36-7.39(m、1H)、7.41-7.45(m、4H)、7.72(m、1H)、7.78(m、1H)、8.32(s、1H)。HPLC純度@214nm、94.70%。
0℃のアセトン(80mL)および水(16mL)中の2-フルオロ-5-(((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ベンゾニトリル(1.6g、3mmol)の撹拌溶液に、OsO4(3mL、tert-ブタノール中の2.5重量%溶液、0.3mmol)およびN-メチルモルホリンN-オキシド(1.0g、8.7mmol)を加え、15分間撹拌した。この混合物に、NaIO4(2.1g、10mmol)を加え、反応混合物を室温で16時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(100mL)で希釈し、DCM(2×100mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の30%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-フルオロ-5-(((5-ホルミル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ベンゾニトリルを暗色固体として得た(収率:0.2g、15.3%)。LCMS(ES)m/z=454.37[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.23(s、3H)、5.55(s、2H)、5.62(s、2H)、7.22-7.32(m、4H)、7.38(m、1H)、7.46(m、2H)、7.52(m、1H)、7.59(m、1H)、7.93(m、1H)、8.08(m、1H)、8.85(s、1H)、10.07(s、1H)。
MeOH(2mL)およびDMF(2mL)中の2-フルオロ-5-(((5-ホルミル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ベンゾニトリル(1g、0.22mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(20mg、0.19mmol)および酢酸(1滴)を同時に加え、反応物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(30mg、0.6mmol)を加え、室温で16時間撹拌を続けた。反応混合物を水(10mL)で希釈し、DCM中の10%MeOH(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3mL)およびブライン溶液(3mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製生成物を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の10%メタノールを用いた分取TLCで精製し、(S)-1-((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を白色固体として得た(収率:20mg、16.1%)。LCMS(ES)m/z=567.29[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.33(m、1H)、1.39(m、3H)、1.72(m、2H)、2.19(s、3H)、2.30(m、1H)、2.87(m、1H)、3.20(m、1H)、3.55(d、J=14.4Hz、1H)、3.66(d、J=14.4Hz、1H)、5.40(s、2H)、5.48(s、2H)、7.21(m、1H)、7.26-7.30(m、3H)、7.37(m、1H)、7.43-7.47(m、3H)、7.55(t、J=9.2Hz、1H)、7.89(m、1H)、8.04(m、1H)、8.26(s、1H)。HPLC純度@214nm、91.83%。
0℃のTHF(200mL)中の5-ブロモ-4-クロロ-2-(メチルチオ)ピリミジン(6g、25mmol)の撹拌溶液に、NaH(1.48g、鉱油中60%、37mmol)を加え、反応物を0℃で1時間撹拌した。この混合物に、THF(20mL)中の2,2,2-トリフルオロエタン-1-オール(5.7g、25mmol)の溶液を加え、反応物を室温で2時間撹拌した。反応完了後、反応混合物を氷冷水(250mL)でクエンチし、酢酸エチル(2×500mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン溶液(200mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させて、5-ブロモ-2-(メチルスルホニル)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジンを白色固体として得た(収率:8g、粗製物)。LCMS(ES)m/z=303.26;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.50(s、3H)、5.12-5.19(m、2H)、8.69(s、1H)。
0℃のDCM(150mL)中の5-ブロモ-2-(メチルチオ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン(8g、26.4mmol)の撹拌溶液に、メタ-クロロ過安息香酸(11.4g、66mmol)を加え、反応物を室温で20時間撹拌した。反応混合物を氷冷水(100mL)でクエンチし、DCM(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和重炭酸ナトリウム溶液(300mL)、ブライン溶液(100mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。有機層を蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の8%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-ブロモ-2-(メチルスルホニル)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジンを白色固体として得た(収率:8.4g、95%)。LCMS(ES)m/z=335.23[M+H]+ 1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ3.34(s、3H)、5.23-5.29(m、2H)、9.16(s、1H)。
DMF(70mL)中の5-ブロモ-2-(メチルスルホニル)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン(5g、25mmol)の撹拌溶液に、(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(8.4g、25mmol)および炭酸カリウム(5.1g、37.5mol)を加え、反応混合物を80℃で12時間加熱した。反応完了後、反応混合物を水(150mL)で希釈し、酢酸エチル(2×250mL)で抽出した。合わせた有機層を氷冷水(250mL)、ブライン溶液(250mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。有機層を蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の10%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジンを無色の粘性液体として得た(収率:5.6g、53%)。LCMS(ES)m/z=453.29[M+H]+、1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.20(s、3H)、5.10-5.22(m、2H)、5.58(s、2H)、7.19-7.21(m、1H)、7.24-7.27(m、3H)、7.31-7.37(m、1H)、7.39-7.47(m、3H)、8.67(s、1H)。
DMF(50mL)中の5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン(5.5g、12mmol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(9.6g、30mmol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(1.3g 1.2mmol)を加え、反応物を100℃で8時間加熱した。反応完了後、反応混合物を、セライトを通して濾過し、濾液を水(200mL)で希釈し、酢酸エチル(2×500mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の3%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)-5-ビニルピリミジンを黄色の油状液体として得た(収率:3.1g、64.5%)。LCMS(ES)m/z=401.13[M+H]+、1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.20(s、3H)、5.10-5.18(m、2H)、5.42(d、J=12Hz、1H)、5.49(s、2H)、5.99(d、J=16.6Hz、1H)、6.60-6.71(m、1H)、7.21-7.19(m、1H)、7.26-7.31(m、3H)、7.36-7.39(m、1H)、7.43-7.47(m、3H)、8.51(s、1H)。
0℃のTHF(20mL)および水(6mL)中の2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)-5-ビニルピリミジン(7、0.5g、1.2mmol)の撹拌溶液に、OsO4(1mL、tert-ブタノール中2.5重量%溶液、0.12mmol)を加え、15分間撹拌した。この混合物に、NaIO4(0.21g、1.87mmol)を加え、反応物を16時間、室温で撹拌させた。完了後、反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(2×200mL)で抽出した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の12%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド灰色固体を得た(収率:0.45g、95%)。LCMS(ES)m/z=403.57[M+H]+ 1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.21(s、3H)、5.19-5.26(m、2H)、5.61(s、2H)、7.22-7.7.23(m、1H)、7.27-7.32(m、3H)、7.38-7.40(m、1H)、7.44-7.47(m、3H)、8.92(s、1H)、10.05(s、1H)。
MeOH(3mL)およびDMF(3mL)中の2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(0.2g、0.51mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(0.1g、0.77mmol)および酢酸(0.1mL)を同時に加え、反応物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(97mg、15mmol)を加え、室温で16時間撹拌を続けた。反応混合物を水(10mL)で希釈し、DCM中10%MeOH(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層を水(5mL)およびブライン溶液(5mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製物残渣を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中8%メタノールを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、(S)-1-((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を白色固体として得た(収率:50mg、18.7%)。LCMS(ES)m/z=516.35[M+H]+および純度@214nm、99.86%;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.40-1.44(m、4H)、1.74(m、2H)、2.20(s、3H)、2.32(m、1H)、2.88(m、1H)、3.21(m、1H)、3.55(d、J=14.4Hz、1H)、3.68(d、J=14.4Hz、1H)、5.01-5.10(m、2H)、5.46(s、2H)、7.19-7.21(m、1H)、7.26-7.30(m、3H)、7.37(m、1H)、7.44-7.48(m、3H)、8.37(s、1H)。
0℃のTHF(100mL)中の4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ブタン-1-オール(8.52g、41.73mmol)の溶液に、水素化ナトリウム(2.5g、鉱油中60%、62.7mmol)を加え、反応混合物を10分間撹拌した。この混合物に、5-ブロモ-2,4-ジクロロピリミジン(9.5g、41.73mmol)を加え、混合物を室温で3時間撹拌した。反応完了後、反応混合物を氷冷水(100mL)でクエンチし、混合物をEtOAc(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中20%EtOAcを用いたフラッシュクロマトグラフィーによって精製して、5-ブロモ-4-(4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ブトキシ)-2-クロロピリミジンを粘着性固体として得た(収率: 16g、97%)。
0℃のTHF(100mL)中の(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(8.01g、40.4mmol)の撹拌溶液に、水素化ナトリウム(2.42g、鉱油中60%、60.6mmol)を加え、室温で30分間撹拌した。この混合物に、5-ブロモ-4-(4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ブトキシ)-2-クロロピリミジン(16g、40.4mmol)を加え、室温で3時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(100mL)で希釈し、酢酸エチル(2×200mL)で抽出した。次いで、合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中20%酢酸エチルを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)で精製して、5-ブロモ-4-(4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジンを黄色の粘性液体として得た(収率:11.04g、49%)。LCMS(ES)m/z=557.40[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ0.016(s、6H)、0.83(s、9H)、1.60 (m、2H)、1.72(m、2H)、2.20(s、3H)、3.62(m、2H)、4.44(m、2H)、5.47(s、2H)、7.21-7.23(m、1H)、7.25-7.31(m、3H)、7.37-7.49(m、4H)、8.47(s、1H)。
0℃のTHF(50mL)中の5-ブロモ-4-(4-((tert-ブチルジメチルシリル)オキシ)ブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン(5.5g、9.86mmol)の溶液に、TBAF(THF中1M溶液、1eq)を加え、混合物を室温で3時間撹拌した。反応完了後、反応混合物を水(50mL)で希釈し、EtOAc(3×100mL)で抽出した。次いで、合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中20%酢酸エチルを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)で精製して、4-((5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)ブタン-1-オールを黄色の粘性液体として得た(収率:2.03g、46%)。LCMS(ES)m/z=443.37[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.65(m、2H)、1.76(m、2H)、2.19(s、3H)、3.44(m、2H)、4.42(m、2H)、4.46(m、1H)、5.43(s、2H)、7.21-7.23(m、1H)、7.25-7.31(m、3H)、7.39-7.52(m、4H)、8.53(s、1H)。HPLC純度@214nm:98.91%。
DMF(15mL)中の4-((5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)ブタン-1-オール(1.0g、2.26mmol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(1.79g、5.64mmol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(0.3g 0.23mmol)を加え、反応混合物を100℃で3時間加熱した。反応完了後、反応混合物を、セライトを通して濾過し、濾液を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中25%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、4-((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン-4-イル)オキシ)ブタン-1-オールを黄色固体として得た(収率:0.7g、79%)。LCMS(ES)m/z=391.47[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.56(m、2H)、1.77(m、2H)、2.20(s、3H)、3.43 (m、2H)、4.40(m、2H)、4.45(m、1H)、5.30(d、J=12Hz、1H)、5.45(s、2H)、5.90(d、J=17.6Hz、1H)、6.62(m、1H)、7.19(m、1H)、7.25-7.32(m、3H)、7.36-7.39(m、1H)、7.43-7.47(m、3H)、8.48(s、1H)。
0℃のTHF (10mL)および水(10mL)中の4-((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン-4-イル)オキシ)ブタン-1-オール(0.7g、1.79mmol)の撹拌溶液に、OsO4(1.8mL、tert-ブタノール中2.5重量%溶液、0.18mmol)を加え、15分間撹拌した。この混合物に、NaIO4(0.57g、2.7mmol)を加え、反応混合物は室温で5時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(30mL)で希釈し、DCM(2×50mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中40%酢酸エチルを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)で精製して、4-(4-ヒドロキシブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒドを粘着性油状化合物として得た(収率:0.5g、62%)。LCMS(ES)m/z=393.38[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.56(m、2H)、1.77(m、2H)、2.22(s、3H)、3.44(m、2H)、4.42(m、1H)、4.51(m、2H)、5.56(s、2H)、7.21(m、1H)、7.27-7.33(m、3H)、7.36(m、1H)、7.39-7.46(m、3H)、8.79(s、1H)、10.06(s、1H)。HPLC純度@214nm、99.52%。
MeOH(2mL)およびDMF(2mL)中の4-(4-ヒドロキシブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(0.24g、0.61mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(79mg、0.61mmol)および酢酸(1滴)を同時に加え、反応混合物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(115mg、1.83mmol)を加え、室温で16時間撹拌を継続した。反応混合物を飽和重炭酸ナトリウム溶液(10mL)で希釈し、DCM(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層を水(5mL)およびブライン溶液(5mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製生成物を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中10%メタノールを用いたフラッシュクロマトグラフィーで精製して、(S)-1-((4-(4-ヒドロキシブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を白色固体として得た(収率:250mg、80.8%)。LCMS(ES)m/z=506.43[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.33-1.54(m、7H)、1.74(m、4H)、2.20(s、3H)、2.30(m、1H)、2.91(m、1H)、3.17(m、1H)、3.43(m、2H)、3.55(d、J=14Hz、1H)、3.66(d、J=14Hz、1H)、4.33(m、2H)、5.42(s、2H)、7.18(m、1H)、7.25-7.32(m、3H)、7.37(m、1H)、7.43-7.47(m、3H)、8.23(s、1H)。HPLC純度@214nm、97.43%。
室温のトルエン:エタノール:水(1:1:1)(120ml)中の6-ブロモ-2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン(6g、0.027mol)および(2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル)メタノール(8.3g、33mmol)の溶液に、炭酸カリウム(11.5g、83mmol)を加え、混合物を、窒素を用いて室温で15分間脱気した。この混合物に、Pd(dppf)Cl2・DCM錯体(1.4g、1.3mmol)を加え、反応混合物を再度、窒素を用いて10分間脱気した。反応混合物を95℃で12時間撹拌した後、混合物を室温まで冷却し、セライトパッドを通して濾過した。濾液を水(100mL)で希釈し、水性混合物をEtOAc(2×500mL)で抽出した。有機層をブライン(500mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製化合物を得た。得られた粗製物を、溶離剤としてヘキサンを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200メッシュ)によって精製して、(3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルフェニル)メタノール(収率:7g、97.9%)を淡赤色液体として得た。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.12(s、3H)、4.27(m、4H)、4.52(m、2H)、5.75(s、1H)、6.90(m、2H)、7.05(m 1H)、7.16(m、1H)、7.20(m、1H)、7.36(m、1H)。
DMF(40mL)中の(3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルフェニル)メタノール(8.2g、32mmol)の撹拌溶液に、4,6-ジメトキシ-2-(メチルスルホニル)ピリミジン(7g、32mmol)および炭酸カリウム(13.2g、96mmol)を加えて、反応混合物を80℃で12時間加熱した。反応完了後、反応混合物を水(150mL)で希釈し、酢酸エチル(2×250mL)で抽出した。合わせた有機層を氷冷水(250mL)、ブライン溶液(250mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中10%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジンを無色の粘性液体として得た(収率:9g、71.4%)。
0℃のDMF(8mL)中の塩化ホスホリル(8mL)の溶液を、窒素大気下で1時間撹拌し、それをDCE(30mL)中の2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン(3g、7.6mmol)の溶液に滴下した。次いで、反応混合物を室温で30分間撹拌し、次いで80℃で3時間加熱した。反応完了後、反応混合物を真空中で濃縮し、DCM(100mL)で希釈した。有機混合物を水(25mL)、ブライン溶液(25mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮して、粗製生成物を得て、これをシリカゲルクロマトグラフィー(ヘキサン中10%EtOAc)によって精製して、2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-カルバルデヒドを淡黄色固体として得た(収率:1.5g、46.8%)。LCMS(ES)m/z=423.36[M+H]+および純度@214nm、98.13%;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.24(s、3H)、4.00(s、6H)、4.28(s、4H)、5.54(s、2H)、6.73-6.77(m、2H)、6.92(d、J=8.0Hz、1H)、7.17-7.19(m、1H)、7.22-7.26(m、1H)、7.44(d、J=7.6Hz、1H)、10.07(s、1H)。
室温のDMF(200mL)中の5-ブロモニコチノニトリル(2g、0.12mol)およびトリブチルビニルスズ(95.3g、300mmol)の撹拌溶液を、窒素で10分間パージした。この混合物に、Pd(PPh3)4(13.84g、12mmol)を加え、再度、窒素で20分間パージした。次に、混合物を80℃で4時間加熱した。完了後、反応混合物を水(200mL)で希釈し、EtOAC(3×200mL)で抽出した。有機層をブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。粗製物を、ヘキサン中10%EtOAcを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)によって精製して、5-ビニルニコチノニトリルをオフホワイトの固体として得た(収率:10.5g、67%)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ5.55(d、J=10.8Hz、1H)、6.17(d、J=17.6Hz、1H)、6.80(m、1H)、8.52(s、1H)、8.90(s、1H)、9.03(s、1H)。
0℃のアセトン(200mL)および水(40mL)中の5-ビニルニコチノニトリル(10.5g、81mmol)の撹拌溶液に、OsO4(82mL、tert-ブタノール中2.5重量%溶液、8.1mmol)およびN-メチルモルホリンN-オキシド(29g、242mmol)を加え、3時間撹拌した。この混合物に、NaIO4(60g、282mmol)を加え、反応混合物を室温で12時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(300mL)で希釈し、DCM(2×400mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中30%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-ホルミルニコチノニトリルを黄色固体として得た(収率:7.9g、74%)1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ8.77(s、1H)、9.29(s、1H)、9.31(s、1H)、10.12(s、1H)。 工程-3:5-(ヒドロキシメチル)ニコチノニトリルの合成
0℃のメタノール(100mL)中の5ホルミルニコチノニトリル(12g、91mmol)の撹拌溶液に、水素化ホウ素ナトリウム(5.12g、136mmol)を少しずつ30分間加え、混合物を0℃で2時間撹拌した。TLCが完了を示した後、反応混合物を濃縮し、残渣を水(100mL)およびDCM(200mL)で希釈した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮した。粗製物を、DCM中の1%MeOHを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)によって精製して、5-(ヒドロキシメチル)ニコチノニトリルを黄色固体として得た(収率:7.4g、60.7%)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ4.50(bs、1H)、5.54(s、2H)、8.19(s、1H)、8.80(s、1H)、8.91(s、1H)。
0℃のTHF(20mL)中の5-(ヒドロキシメチル)ニコチノニトリル(0.59g、4.3mmol)の撹拌溶液に、水素化ナトリウム(0.26g、鉱油中60%、6.5mmol)を加え、0℃で30分間撹拌した。この混合物に、THF(5mL)中の5-ブロモ-2,4-ジクロロピリミジン(1.0g、4.3mmol)の溶液を加え、反応混合物を室温で5時間撹拌した。完了後、反応物を氷冷水(100mL)でクエンチし、クロロホルム中の10%IPAで(4×100mL)抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮した。粗製物を、DCM中の5%MeOHを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)によって精製して、5-(((5-ブロモ-2-クロロピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリルを黄色固体としてを得た(収率:1.0g、70%)。1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ5.59(s、2H)、8.43(s、1H)、8.80(s、1H)、9.00(s、1H)、9.05(s、1H)。HPLC純度@214nm:97.07%。
0℃のDMF(20mL)中の(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(0.61g、3.1mmol)の撹拌溶液に、水素化ナトリウム(0.184g、鉱油中60%、4.6mmol)を加え、室温で30分間撹拌した。この混合物に、5-(((5-ブロモ-2-クロロピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリル(1g、3.1mmol)を加え、室温で3時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を飽和塩化アンモニウム溶液(20mL)で希釈し、水(50mL)で希釈した。水性混合物を酢酸エチル(2×100mL)で抽出し、次いで合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中50%酢酸エチルを用いたフラッシュクロマトグラフィー(シリカゲル)で精製して、5-(((5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリルを粘着性固体として得た(収率:0.7g、47%)。LCMS(ES)m/z=487.21[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.20(s、3H)、5.50(s、2H)、5.53(s、2H)、7.21-7.23(m、1H)、7.27-7.31(m、3H)、7.36-7.38(m、1H)、7.44-7.47(m、3H)、8.43(m、1H)、8.59(s、1H)、8.98(s、1H)、9.01(s、1H)。HPLC純度@254nm、97.78%。
DMF(10mL)中の5-(((5-ブロモ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリル(0.3g、0.62mmol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(0.57g、1.86mmol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(72mg 0.061mmol)を加え、反応混合物を80℃で3時間加熱した。反応完了後、反応混合物を水(20mL)で希釈し、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中30%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-(((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリルを粘着性油として得た(収量:0.225g、75%)。LCMS(ES)m/z=435.44[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.20(s、3H)、5.32(d、J=11.2Hz、1H)、5.52(s、4H)、5.89(d、J=17.6Hz、1H)、6.67(m、1H)、7.21-7.23(m、1H)、7.27-7.31(m、3H)、7.36-7.38(m、1H)、7.42-7.45(m、3H)、8.43(m、1H)、8.55(s、1H)、8.98(s、1H)、9.01(s、1H)。HPLC純度@254nm、92.44%。
0℃のアセトン(8mL)および水(2mL)中の5-(((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリル(220mg、0.43mmol)の撹拌溶液に、OsO4(0.44mL、tert-ブタノール中の2.5重量%溶液、0.043mmol)およびN-メチルモルホリンN-オキシド(152mg、1.35mmol)を加え、2時間撹拌した。この混合物に、NaIO4(324mg、1.513mmol)を加え、反応混合物を室温で3時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(25mL)で希釈し、DCM(2×25mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中30%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、5-(((5-ホルミル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリルを黄色固体として得た(収率:95mg、47%)。LCMS(ES)m/z=437.37[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.22(s、3H)、5.61(s、4H)、7.21-7.23(m、1H)、7.27-7.31(m、3H)、7.36-7.38(m、1H)、7.44-7.52(m、3H)、8.47(m、1H)、8.85(s、1H)、9.01(s、1H)、9.03(s、1H)、10.07(s、1H)。
MeOH(2mL)およびDMF(2mL)中の5-(((5-ホルミル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-4-イル)オキシ)メチル)ニコチノニトリル(150mg、0.34mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(32mg、0.515mmol)および酢酸(2滴)を同時に加え、反応物を室温で3時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(35mg、1.03mmol)を加え、室温で5時間撹拌を続けた。反応混合物を水(10mL)で希釈し、DCM(2×25mL)で抽出した。合わせた有機層を水(5mL)およびブライン溶液(5mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製生成物を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中10%メタノールを用いたフラッシュクロマトグラフィーによって精製して、(S)-1-((4-((5-シアノピリジン-3-イル)メトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を白色固体として得た(収率:33mg、18%)。LCMS(ES)m/z=550.22[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.33(m、1H)、1.39(m、3H)、1.72(m、2H)、2.19(s、3H)、2.32(m、1H)、2.89(m、1H)、3.23(m、1H)、3.54(d、J=14.0Hz、1H)、3.68(d、J=14.0Hz、1H)、5.48(s、4H)、7.21-7.22(m、1H)、7.24-7.31(m、3H)、7.36-7.38(m、1H)、7.43-7.48(m、3H)、8.28(s、1H)、8.43(s、1H)、8.98(s、1H)、9.00(s、1H)。HPLC純度@214nm、99.32%。
DMF(80mL)中の3-ブロモ-2-メチルフェノール(1、9.8g、52mmol)の撹拌溶液に、1,3-ジクロロプロパン(73g、100mmol)および炭酸カリウム(21.5g、156mmol)を加え、反応混合物を80℃の窒素雰囲気下で12時間撹拌した。TLCが完了を示した後、混合物を室温に冷却し、EtOAc(100mL)で希釈し、氷冷水(50mL)およびブライン溶液(30mL)で洗浄した。有機相を硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空中で濃縮して、粗製生成物を得た。得られた粗製物を、ヘキサン中10%EtOAcを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200メッシュ)によって精製して、1-(3-(3-ブロモ-2-メチルフェノキシ)プロピル)-3,3-ジフルオロピロリジン(収率:10.1g、73.7%)を黄色液体として得た。1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.25-2.31(m、5H)、3.77(m、2H)、4.12(m、2H)、6.80(d、J=8.2 Hz、1H)、6.98-7.02(m、1H)、7.17(d、J=8Hz、1H)。
DMF(60mL)中の1-ブロモ-3-(3-クロロプロポキシ)-2-メチルベンゼン(10.1g、38mmol)の撹拌溶液に、3,3-ジフルオロピロリジン(11g、76mmol)、炭酸カリウム(22.5g、163mmol)およびヨウ化ナトリウム(8.5g、57mmol)を加え、反応混合物を80℃の窒素大気下で12時間加熱した。TLCが反応の完了を示した後、反応混合物を室温に冷却し、EtOAc(100mL)で希釈し、氷冷水(50mL)、ブライン溶液(50mL)で洗浄し、有機相を硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空中で濃縮して、粗製生成物を得た。得られた粗製物を、ヘキサン中の15%EtOAcを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200メッシュ)によって精製して、1-(3-(3-ブロモ-2-メチルフェノキシ)プロピル)-3,3-ジフルオロピロリジン(7.1g、56.3%)を黄色液体として得た。LCMS(ES)m/z=334.30[M+H]+ 1H NMR(400MHz、CDCl3):δ1.96(m、2H)、2.22-2.33(m、5H)、2.66(m、2H)、2.75(m、2H)、2.94(m、2H)、4.01(m、2H)、6.78(d、J= 8.0Hz、1H)、6.96-7.00(m、1H)、7.15(d、J=8.0Hz、1H)。
室温のトルエン:エタノール:水(1:1:1)(30mL)中の1-(3-(3-ブロモ-2-メチルフェノキシ)プロピル)-3,3-ジフルオロピロリジン(2g、59mmol)および(2-メチル-3-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル)メタノール(1.78g、71mmol)の溶液に、炭酸カリウム(2.47g、17mmol)を室温で加え、混合物を、窒素を用いて15分間脱気した。この混合物に、Pd(dppf)Cl2・DCM(0.24g、0.29mmol)を加え、反応混合物を再度、窒素を用いて10分間脱気し、95℃で12時間加熱した。反応完了後、反応混合物を室温に冷却し、セライトパッドを通して濾過した。濾液を水(50mL)で希釈し、混合物をEtOAc(2×100mL)で抽出した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製化合物を得た。得られた粗製物を、溶離剤としてヘキサン中10%EtOAcを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200メッシュ)によって精製し、(3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2、2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(収率: 2g、90%)をオフホワイト固体として得た。LCMS(ES)m/z=376.18[M+H]+、1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.77(s、3H)、1.94(s、3H)、2.20-2.32(m、4H)、2.62-2.68(m、4H)、2.92(m、2H)、4.06(m、2H)、4.54(m、2H)、5.09(m、1H)、6.64(d、J=7.44Hz、1H)、6.94(d、J=7.84Hz、2H)、7.15-7.22(m、2H)、7.39(d、J=7.44Hz、1H)。
DMF(30mL)中の(3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(1.41g、3.7mmol)の撹拌溶液に、5-ブロモ-4-メトキシ-2-(メチルスルホニル)ピリミジン(2g、7.49mmol)および炭酸カリウム(3.1g、22mmol)を加え、反応混合物を80℃で12時間加熱した。反応完了後、反応混合物を水(60mL)で希釈し、酢酸エチル(2×120mL)で抽出した。合わせた有機層を氷冷水(50mL)、ブライン溶液(50mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、溶媒として粗製物をヘキサン中の10%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製し、5-ブロモ-2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジンを粘性液体として得た(収率:0.7g、17%)。LCMS(ES)m/z=562.32[M+H]+ 1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.83(s、3H)、1.93(m、2H)、2.03(s、3H)、2.26(m、2H)、2.62(m、2H)、2.71(m、2H)、2.88-2.92(m、2H)、3.98(s、3H)、4.06(m、2H)、5.43(s、2H)、6.65(m、1H)、6.95(m、1H)、7.07(m、1H)、7.19-7.39(m、2H)、7.43(m、1H)、8.53(s、1H)。
DMF(10mL)中の5-ブロモ-2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン(0.7g、1.24mmol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(1.18g、3.7mmol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(140mg、0.12mmol)を加え、反応物を100℃で8時間加熱した。完了後、反応混合物を、セライトを通して濾過し、濾液を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(2×50mL)で抽出した。次いで、合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中の3%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシ-5-ビニルピリミジンを粘着性固体として得た(収率:0.32g、47.5%)。LCMS(ES)m/z=510.19[M+H]+および純度@214nm、87.14%。
0℃のアセトン(10mL)および水(2mL)中の、2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシ-5-ビニルピリミジン(0.32g、0.62mmol)の撹拌溶液に、OsO4(0.6mL、tert-ブタノール中2.5重量%溶液、0.062mmol)、N-メチルモルホリン-N-オキシド(103mg、0.87mmol)を加え、2時間撹拌した。この混合物に、NaIO4(0.22g、1mmol)を加え、反応物を室温で3時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(30mL)で希釈し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。次いで、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製物を、溶離剤としてヘキサン中12%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-カルバルデヒドを白色の粘着性固体として得た(収率:80mg、53%)。LCMS(ES)m/z=512.45[M+H]+および純度@214nm、95.24%;1H NMR(400MHz、DMSO-d6)δppm:1.83(s、3H)、1.93(m、2H)、2.00(s、3H)、2.17-2.24(m、2H)、2.59(m、2H)、2.68-2.70(m、2H)、2.89(m、2H)、4.04(m、2H)、4.06(s、3H)、5.57(s、2H)、6.66(d、J=7.6Hz、1H)、6.95(d、J=9.2Hz、1H)、7.08(d、J=7.36Hz、1H)、7.17-7.27(m、2H)、7.44(d、J=7.2Hz、1H)、8.80(s、1H)、10.04(s、1H)。
MeOH(3mL)およびDMF(3mL)中の2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-カルバルデヒド(70mg、0.1368mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(26mg、0.2052mmol)および酢酸(0.1mL)を同時に加え、反応物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(25mg、0.41mmol)を加え、室温で16時間撹拌を続けた。反応混合物を水(10mL)で希釈し、DCM中の10%MeOH(2×20mL)で抽出した。合わせた有機層を水(5mL)およびブライン溶液(5mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して、粗製物残渣を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の8%メタノールを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、(S)-1-((2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を淡白色固体として得た(収率: 33mg、39%)。
(R)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸
0℃のDMF(60mL)中の(2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メタノール(7.1g、0.036mol)の撹拌溶液に、水素化ナトリウム(1.73g、鉱油中60%、0.043mol)を加え、室温で30分間撹拌した。この混合物に、5-ブロモ-2-クロロ-4-メチルピリミジン(5g、0.024mol)を加え、室温で16時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。次いで、合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中10%酢酸エチルを用いたカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)で精製して、5-ブロモ-4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジンをオフホワイトの固体として得た(収率:1.5g、17%)。LCMS(ES)m/z=369.01[M+H]+;1H NMR(400MHz、CDCl3):δ2.31(s、3H)、2.58(s、3H)、5.47(s、2H)、7.21-7.23(m、2H)、7.25-7.30(m、2H)、7.35(m、1H)、7.39-7.43(m、2H)、7.49(m、1H)、8.47(s、1H)。HPLC純度@214nm、99.78%。
DMF(20mL)中の5-ブロモ-4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン(1.5g、0.0041mol)の撹拌溶液に、トリブチルビニルスズ(3.2g、0.011mol)を加え、反応混合物を窒素ガスで10分間脱気した。この混合物に、Pd(PPh3)4(0.46g、0.4mmol)を加え、反応混合物を100℃で2時間加熱した。反応完了後、反応混合物を、セライトを通して濾過し、濾液を水(50mL)で希釈し、酢酸エチル(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させ、粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中25%酢酸エチルを用いたcombiflash クロマトグラフィーで精製して、4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジンを黄色がかった液体として得た(収率:1.2g、92%)。LCMS(ES)m/z=317.42[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.20(s、3H)、2.46(s、3H)、5.30(d、J=11.2Hz、1H)、5.45(s、2H)、5.78(d、J=17.6Hz、1H)、6.82(m、1H)、7.19(m、1H)、7.25-7.32(m、3H)、7.36-7.39(m、1H)、7.43-7.47(m、3H)、8.67(s、1H)。HPLC純度@214nm、99.04%。
0℃のTHF(25mL)および水(25mL)中の4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-5-ビニルピリミジン(0.9g、0.003mol)の撹拌溶液に、OsO4(42mL、tert-ブタノール中2.5重量%溶液、0.0042mol)を加え、15分間撹拌した。この混合物に、NaIO4(0.89g、0.0042mol)を加え、反応混合物を室温で5時間撹拌させた。反応完了後、反応混合物を水(50mL)で希釈し、DCM(2×50mL)で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、蒸発させて、粗製生成物を得た。粗製生成物を、溶離剤としてヘキサン中の20%酢酸エチルを用いた使用するカラムクロマトグラフィー(シリカゲル、100-200#)で精製して、4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒドをオフホワイトの固体として得た(収率:0.64g、73%)。LCMS(ES)m/z=319.36[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ2.22(s、3H)、2.73(s、3H)、5.57(s、2H)、7.21(m、1H)、7.27-7.33(m、3H)、7.38(m、1H)、7.46(m、3H)、8.99(s、1H)、10.12(s、1H)。HPLC純度@214nm、97.18%。
MeOH(2mL)およびDMF(2mL)中の4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-カルバルデヒド(0.2g、0.62mmol)の溶液に、(S)-ピペリジン-2-カルボン酸(73mg、0.56mmol)および酢酸(1滴)を同時に加え、反応物を室温で2時間撹拌した。この反応混合物に、NaCNBH3(110mg、1.86mmol)を加え、室温で16時間撹拌を続けた。この反応混合物を水(10mL)で希釈し、DCM中の10%MeOH(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3mL)およびブライン溶液(3mL)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、濃縮して粗製生成物を得て、これを、溶離剤としてジクロロメタン中の10%メタノールを用いた分取TLCで精製して、(S)-1-((4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸を白色固体として得た(収率:90mg、35%)。LCMS(ES)m/z=432.25[M+H]+;1H NMR(400MHz、DMSO-d6):δ1.33-1.42(m、4H)、1.72(m、2H)、2.16(m、1H)、2.20(s、3H)、2.49(s、3H)、2.78(m、1H)、3.08(m、1H)、3.39(m、1H)、3.75(m、1H)、5.41(s、2H)、7.18(m、1H)、7.25-7.32(m、3H)、7.37(m、1H)、7.43-7.47(m、3H)、8.31(s、1H)。HPLC純度@214nm、99.20%。
生物学的評価のための一般的手順
PD-L1酵素アッセイ:均一時間分解蛍光(HTRF)結合アッセイ
全ての結合研究は、CisBio製のPD-1/PD-L1結合アッセイキット(カタログ番号63ADK000CPAPEG)を用いて、製造者のプロトコルに従って行った。Tag1-PD-1とTag2-PD-1との間の相互作用を抗Tag1-Eu3+(HTRFドナー)および抗Tag2-XL665(HTRFアクセプター)によって検出した。PD-1およびPD-L1結合によりドナーおよびアクセプター抗体が近接すると、ドナー抗体の励起がアクセプター抗体への蛍光共鳴エネルギー転移(FRET)を誘発し、これが次に665nmで特異的に放出された。この特異的シグナルは、PD-1/PD-L1相互作用に正比例する。PD-1/PD-L1相互作用をブロックする化合物は、HTRFシグナルの減少を引き起こし得る。必要な試薬を以下の順序で混合した:2μlの化合物(または希釈緩衝液)、4μlのPD-L1タンパク質、4μlのPD-1タンパク質。15分間のインキュベーション後、5μlの抗Tag1-Eu3+および5μlの抗Tag2-XL665を加えた。プレートを密封し、RTで1時間インキュベートした。蛍光発光を、BMG PheraStar(登録商標)マルチプレートリーダー上の2つの異なる波長(665nmおよび620nm)で読み取った。結果は665nmおよび620nmの蛍光シグナルから計算し、HTRF比率=(665nm/620nm)×104で表した。
以下の表1は、PD1/PD-L1阻害アッセイにおける本開示の化合物の生物学的活性を示す。IC50<100nMを有する化合物は「A」として示され;100~500nMは「B」として示され;>500nMは「C」としてそれぞれ示される。
化合物-45の薬物動態評価:動物実験の詳細
CPCSEA(動物実験の制御および監督の目的のための委員会(Committee for the Purpose of Control and Supervision of Experiments on Animals))によって指定されたJubilant Biosys(IAEC/JDC/2018/158)の動物実験委員会(Institutional Animal Ethical Committee)(IAEC)は、マウス薬物動態実験を承認した。雄のBalb/cマウス(約6~8週齢、体重範囲22~25g)を、インド、ハイデラバードのVivo Biotechから入手した。動物は、Jubilant Biosys動物ハウスに12:12時間の明:暗サイクルで7日の期間、隔離され、先行試験では体重に応じて動物を層別化した。動物は、飼料(Altromin Spezialfutter GmbH & Co. KG., Im Seelenkamp 20, D-32791, Lage, Germany)および自由に摂取できる水に、自由なアクセスができた。
化合物-45のADMEおよび薬物動態
肝ミクロソームにおける代謝安定性
手順:マウスまたはラットまたはイヌまたはサルまたはヒトの肝ミクロソーム(0.5mg/mL)を含むリン酸カリウム緩衝液(66.7mM、pH7.4)を、化合物(1μM)と陽性対照(ベラパミル、1μM)とを別々に37℃の水浴中で5分間プレインキュベートした。20μLの10mM NADPHを加えることによって反応を開始させた。NADPHを含まない反応(0および30分)もインキュベートして、インキュベーション緩衝液中の非NADPH代謝物または化学的不安定性を除外した。全ての反応を、0、5、15および30分での、内部標準を含む200μLの氷冷アセトニトリルを用いて終了させた。バイアルを3000rpmで15分間遠心分離した。反応混合物(上記の研究から得られた)を抽出し、処理し、LC-MS[島津SIL LCシリーズ(Kyoto, Japan)をAPI-4000質量分析計(MDS Sciex、Toronto, Canada)に連結した]によって分析して、化合物の消失をモニターした。
手順:Caco-2ヒト腸上皮細胞を、24-Transwell(登録商標)デュアルチャンバープレート(Millipore, Billerica, MA, USA)(細胞密度80,000細胞/cm2、1日目)にプレートした。透過性の研究は、培養物中で21~22日間培養した単層を用いて行った。各Caco-2細胞単層の完全性は、経上皮電気抵抗(TEER)試験(実験前)によって、および参照化合物、すなわちLucifer yellowの透過性を決定することによって、証明された。500Ωcm2を超えるTEER値を有するCaco-2細胞単層を実験のために考慮した。P-gp基板の陽性対照としてジゴキシン(5μM)を用いた。アッセイに使用した化合物の濃度は5μMであった。輸送アッセイのための培地としてHBSS緩衝液を使用し、スパイキング溶液中のDMSOの最終濃度は0.05%であった。二方向性の透過性研究は、適切な体積の、化合物を含むHBSS緩衝液を、それぞれの頂端および基底外側チャンバーに加えることによって開始した(n=3)。サンプルのアリコート(100μL)を、両チャンバーからインキュベーション期間の0分および60分に採取し、この等容量のアセトニトリルを加え、穏やかに混合し、4000rpmで10分間遠心分離した。続いて、100μLのアリコートをオートサンプラーに移し、LC-MS/MSでの分析のために10μLを注入した。
化合物-45は、caco-2アッセイにおいて中程度の透過性があり、および高い流出があることが見出され、そして活性排出輸送体の基質であり得る。
手順:
化合物が血漿タンパク質に結合する能力を評価するために、平衡透析を用いた血漿タンパク質結合の最も一般的なアプローチを使用した。化合物を、マウス、ラット、ヒトまたはイヌの血漿中で3μMの最終濃度で試験した。150μLの、化合物を含む血漿のアリコートを、96ウェルマイクロ平衡透析装置のウェルの前半(血漿側)に加えた。150μLの100mMリン酸ナトリウム緩衝液pH7.4のアリコートを、96ウェルHT平衡透析装置のウェルの後半(緩衝液側)に加えた。血漿および緩衝液を含むプレートを、オービタルシェーカー上で、120rpmで一定に振盪しながら、37±1℃で4.5時間平衡化した。インキュベーション時間の完了後、サンプルをそれぞれの半分から採取した。有機溶媒を用いてタンパク質を沈殿させた。サンプルを遠心分離に供し、上清をLC-MS/MSで分析した。
化合物-45は、マウス血漿中で0.039の非結合画分を有する高い結合を有した。血漿中の化合物-45の安定性および回復は良好であった。
手順:
化合物のCYP阻害能は、ヒト肝ミクロソーム(GIBCO Invitrogenにより生産)において、CYP3A4、2D6、2C9、2C19および1A2に対して次の連続工程で評価した。標準反応混合物(最終体積300μL)は、66.7Mリン酸カリウム緩衝液(pH 7.4)、タンパク質(CYP3A4、2D6、2C9 2C19および1A2について、それぞれ0.1、0.25、0.5、0.5および0.5mg/mL濃度)および化合物(0.091~20.0μMの範囲の8つの異なる濃度レベルで、最終DMSO濃度0.1%の0.9μL DMSO溶液として加えた)を含有した。混合物を37±1℃で5分間プレインキュベートした。30μLのNADPH(10mM)を加えることによって、反応(2度繰り返して)を開始した。300μLのアセトニトリルを加えることにより、反応を10分で終結させた。肝ミクロソームの活性は陽性対照を確認した。すなわち、CYP 3A4に対するミダゾラムの水酸化、CYP 2D6に対するブフラロールの水酸化、CYP 2C9に対するジクロフェナクの水酸化、CYP2C19に対するオメプラゾールの水酸化、およびCYP 1A2に対するO-脱エチル化をモニターした。反応混合物(上記の研究から得られた)を抽出し、処理し、LC-MS[島津SIL LCシリーズ(Kyoto, Japan)をAPI-4000質量分析計(MDS Sciex、Toronto, Canada)に連結した]によって分析した。
化合物-45の予測IC50値を、CYP 3A4、2D6および2C9のそれぞれについて、ミダゾラム、ブフラロール、ジクロフェナクおよびオメプラゾールのCYP特定水酸化について決定した。化合物-45はこれらの酵素に対して顕著な阻害を示さず、-化合物-45の予測IC50値はそれぞれ>10uMであることが見出され、これは試験したCYPに対する弱い阻害剤であることを示す。
RENCA腎臓モデルにおける化合物-45のin vivo有効性(図1):
RENCA腎癌細胞株は、ATCC、USAから入手し、推奨された培地および培養条件で増殖させた。指数増殖期の細胞を等体積のマトリゲルと1:1の比率で混合し、続いて免疫応答性Balb/cマウス(1部位/マウス)の右側腹部に1×106細胞/100μlを皮下移植した。平均腫瘍体積が100mm3に達したときに、腫瘍細胞を、移植の1~2週間以内に注射部位に移植し、マウスをN=10の研究群に無作為化することによって処置を開始した。腫瘍を有するマウスを、ビヒクル(経口)、ビヒクル(IP)、化合物B(経口で30mg/kg投与、1日2回)または抗PD-L1 mAb(クローン10F.9G2、BioXcell)で0.1mg/マウス、Q4Dで腹腔内処置した。腫瘍体積およびマウス体重を、処理の間、腫瘍体積が最高2000mm3に達するまで、週に3回測定した。腫瘍体積(mm3)は式-(腫瘍長さ)×(腫瘍幅)2/2を用いて算出した。化合物Bの薬物動態パラメータについては、試験終了時に血漿および腫瘍が分離され、解析された。腫瘍増殖阻害は、下記の式に基づいて、所定の日の腫瘍体積を、1日目の腫瘍体積で正規化した後に算出した:
%TGI=[1-(処理TVFinal-処理TVInitial)/(ビヒクルTVFinal-ビヒクルTVInitial)]*100
図1に示されているように、化合物-45は経口投与によるPD-L1モノクローナル抗体と比較して優れた、または同様の有効性を示している。投与計画中、有意な体重減少は観察されなかった。
これらの小分子は、マウス、ラット、イヌの肝ミクロソームにわたって、適度に安定しており、極めて良好な可溶性をhavce。これらの化合物は経口経路による非常に良好な暴露を示し、経口投与による同一遺伝子のモデルにおいて有効である。低クリアランスによるPD-L1モノクローナル抗体を用いて観察された毒性の一部は、これらの小分子を用いることによって克服することができる。
Claims (15)
- 式Iの化合物
それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩であって、
R 1 は、水素、C 1-10 アルキル、C 1-6 ハロアルキル、C 6-10 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから独立して選択され、
C 1-10 アルキル、C 6-10 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、任意で水素、ハロゲン、ヒドロキシルおよびシアノから選択される1個以上の基で任意に置換され、
R 2 は、水素、C1-10アルキル、C1-10アルコキシ、C 6-10 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから選択され、
C1-10アルキル、C 6-10 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、およびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、
C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、およびC1-6 ヘテロシクリルは、C1-6アルキル、およびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、C1-6ヘテロシクリルは、1個以上のハロゲンで任意に置換され、
R 3 およびR 4 は、水素、C 1-10 アルキル、およびC 1-10 アルコキシから独立して選択され、
Oは酸素であり、
R5は-NR7R8であり、R7およびR8は、水素、C3-10シクロアルキル、C1-6アルキル、およびN、SまたはOから選択される1~3個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環からなる群から選択され、C3-10シクロアルキル、C1-6アルキル、および5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環は、オキソ、シアノ、ハロゲン、ヒドロキシル、モルフォリノ、C(O)NH2、C(O)CH2CN、NHR6、COOH、COOR6、NHC(O)R6、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、C3-10シクロアルキル、C 6 アリール、SR6、またはN、SまたはOから選択される1~3個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環から選択される1個以上の置換基で任意に置換され、C1-6アルキル、および5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環は、ヒドロキシルおよびR6から選択される1個以上の置換基で独立して置換され;またはR7およびR8は、N、SまたはOから選択される1~3個のヘテロ原子を有する4~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環を共に形成してもよく、4~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環は、ヒドロキシル、ハロゲン、C1-6アルキル、COOH、R6、NHR6、C(O)NHR6、C(O)NHSO2R6、およびC(O)(CH2)nNHC(O)CH3 からなる群から選択される1個以上の置換基で任意に置換され、C1-6アルキルは、オキソ、ヒドロキシル、COOH、COOR6またはNHR6から選択される基でさらに置換され;nは1~6であり;R6は、水素、C1-6アルキル、およびC(O)C1-6アルキルからなる群から選択される。 - 請求項1に記載の式Iの化合物、それらの立体異性体またはそれらの薬学的に許容される塩であって、
R 1 は、水素、C 1-6 アルキル、C 1-4 ハロアルキル、C 6-9 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから独立して選択され、
C 1-6 アルキル、C 6-9 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、およびシアノから選択される1個以上の基で任意に置換され、
R2は、水素、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、C 6-9 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから独立して選択され、C1-6アルキル、C 6-9 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、ハロゲン、C1-4アルキル、C1-4アルコキシ、およびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、
C1-4アルキル、C1-4アルコキシおよびC1-6 ヘテロシクリルは、C1-4アルキル、およびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、
C1-6ヘテロシクリルは、1個以上のハロゲンで任意に置換され、
R 3 およびR 4 は、水素、C 1-6 アルキル、およびC 1-6 アルコキシから独立して選択され、
Oは、酸素であり、
R5は、
から選択され、
R6は、水素、C1-6アルキル、およびC(O)C1-6アルキルからなる群から選択される。 - 請求項1に記載の式Iの化合物、それらの立体異性体またはそれらの薬学的に許容される塩であって、
R1は、水素、C1-4アルキル、C 6 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~9員環の単環または二環のヘテロアリールから選択され、C1-4アルキル、C 6 アリール、および5~9員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、およびシアノから選択される1個以上の基で任意に置換され、
R2は、水素、C 6 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから選択され、C 6 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、フルオロ、クロロ、ブロモ、ヨード、C1-4アルキル、C1-4アルコキシ、およびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、
C1-4アルキル、C1-4アルコキシ、およびC1-6ヘテロシクリルは、C1-4アルキル、およびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、
C1-6ヘテロシクリルは、1個以上のハロゲンで任意に置換され、
R3およびR4は、水素、C1-4アルキル、およびC1-4アルコキシから独立して選択され、
Oは、酸素であり;R5は、
から選択され、R6は、水素、C1-6アルキル、およびC(O)C1-6アルキルからなる群から選択される。 - 化合物、またはその立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩であって、
以下からなる群から選択される:
N-(2-(((2-((4’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-1)、
N-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-N-メチルグリシン(化合物-2)、
N-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-N-メチルグリシン(化合物-3)、
(1R,6R)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物-4)、
(1S,6R)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物-5)、
N-(2-(((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-6)、
(S)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-7)、
(S)-1-((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-8)、
(S)-1-((2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-(2,2,2-トリフルオロエトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-9)、
(S)-1-((4-(4-ヒドロキシブトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-10)、
(2S,4R)-1-((2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)-オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物-11)、
(S)-1-((4-((5-シアノピリジン-3-イル)メトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-12)、
(S)-1-((2-((3’-(3-(3,3-ジフルオロピロリジン-1-イル)プロポキシ)-2,2’-ジメチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-13)、
N-(2-(((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-14)、
(R)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物15)、
(S)-1-((2-((4’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物-16)、
(S)-1-((2-((3’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物17)、
N-(2-(((2-((3’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物-18)、
(S)-1-((2-((2’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物19)、
N-(2-(((2-((2’-フルオロ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4-メトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物20)、
N-(2-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物21)、
(S)-1-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物22)、
1-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)シクロプロパン-1-カルボン酸(化合物23)、
(3-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)プロパン酸(化合物24)、
2-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物25)、
(2-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)(メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物26)、
(S)-3-(((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)ブタン酸(化合物27)、
((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-D-アラニン(化合物28)、
((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アスパラギン(化合物29)、
(2R,4R)-1-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物30)、
1-((4-エトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アゼチジン-2-カルボン酸(化合物31)、
N-(2-(((4-(ベンジルオキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物32)、
1-((4-(ベンジルオキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物33)、
(2S,4R)-1-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物34)、
2-(((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物35)、
((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-L-プロリン(化合物36)、
メチル4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-カルボキシレート(化合物37)、
4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-カルボン酸(化合物38)、
(2S,4R)-1-((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物39)、
((S)-1-((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物40)、
2-(((4,6-ジエトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物41)、
2-(((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)-2-(ヒドロキシメチル)プロパン-1,3-ジオール(化合物42)、
(S)-4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-カルボン酸(化合物43)、
2-(4-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)モルホリン-3-イル)酢酸(化合物44)、
(S)-1-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物45)、
(S)-5-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-5-アザスピロ[2.4]ヘプタン-6-カルボン酸(化合物46)、
7-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2,7-ジアザスピロ[4.5]デカン-1-オン(化合物47)、
rac-(1R,6S)-2-((4,6-ジメトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタン-1-カルボン酸(化合物48)、
(S)-4-アセチル-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペラジン-2-カルボン酸(化合物49)、
(S)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペラジン-2-カルボン酸(化合物50)、
(S)-5-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-5-アザスピロ[2.4]ヘプタン-6-カルボン酸(化合物51)、
7-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-2,7-ジアザスピロ[4.5]デカン-1-オン(化合物52)、
N-(2-(((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物53)、
(2S,4R)-1-((4-((3-シアノ-4-フルオロベンジル)オキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボキシル酸(化合物54)、
(S)-1-((2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物55)、
N-(2-(((2-((3-(2,3-ジヒドロベンゾ[b][1,4]ダイオキシン-6-イル)-2-メチルベンジル)オキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物56)、
N-(2-(((2-((3’,4’-ジメトキシ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物57)、
((2S,4R)-1-((2-((3’,4’-ジメトキシ-2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)-4,6-ジメトキシピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物58)、
(2S,4R)-1-((4-((5-シアノピリジン-3-イル)メトキシ)-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)-4-ヒドロキシピロリジン-2-カルボン酸(化合物59)、
(S)-2-(1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-イル)酢酸(化合物60)、
(R)-2-(1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-イル)酢酸(化合物61)、
(S)-4-(6-アセトアミドヘキサノイル)-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペラジン-2-カルボン酸(化合物62)、
(S)-4,4-ジフルオロ-1-((4-メトキシ-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物63)、
(S)-1-((4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)ピペリジン-2-カルボン酸(化合物64)、および
N-(2-(((4-メチル-2-((2-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-イル)メトキシ)ピリミジン-5-イル)メチル)アミノ)エチル)アセトアミド(化合物65)。 - 請求項1~4のいずれか1項に記載の式Iの化合物、またはその立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩の調製方法であって、
(a)式IVおよび式B3の化合物を塩基、溶媒、および任意でカップリング試薬の存在下で反応させて式Vまたは式XIIIの化合物を得る工程と;(b)式Vおよび式XIIIの化合物を処理して式VIIの化合物を得る工程と;(c)式VIIの化合物を還元剤および第3の溶媒の存在下で置換アミンと反応させて式Iの化合物を得る工程とを含む方法。
ここで、式V、式VI、式VII、式XIIIおよび式IのXは、-CH2O-であり、;式I、式IV、式V、式VI、式VII、および、式XIIIのR 1 は、水素、C 1-10 アルキル、C 1-6 ハロアルキル、C 6-10 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから独立して選択され、C 1-10 アルキル、C 6-10 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、ハロゲン、ヒドロキシル、およびシアノから選択される1個以上の基で任意に置換され、式I、式B3、式V、式VI、式VII、および、式XIIIのR2 は、水素、C1-10アルキル、C1-10アルコキシ、C 6-10 アリール、およびN、SまたはOから選択される1~5個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環のヘテロアリールから独立して選択され、C1-10アルキル、C 6-10 アリール、および5~10員環の単環または二環のヘテロアリールは、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、およびC1-6 ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、C1-6アルキル、C1-6アルコキシ、およびC1-6ヘテロシクリルは、C1-6アルキルおよびC1-6ヘテロシクリルから選択される1個以上の基で任意に置換され、C1-6ヘテロシクリルは、1個以上のハロゲンで任意に置換され;式I、式B3、式IV、式V、式VI、式VII、および、式XIIIのR 3 およびR 4 は、水素、C 1-10 アルキル、およびC 1-10 アルコキシから独立して選択され;式I、式IV、式V、式VI、式VII、および、式XIIIのОは酸素であり;式IのR5は-NR7R8であり、R7およびR8は、水素、C3-10シクロアルキル、C1-6アルキル、およびN、SまたはOから選択される1~3個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環からなる群から独立して選択され、C3-10シクロアルキル、C1-6アルキル、および5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環は、オキソ、シアノ、ハロゲン、ヒドロキシル、モルフォリノ、C(O)NH2、C(O)CH2CN、NHR6、COOH、COOR6、NHC(O)R6、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、C3-10シクロアルキル、C 6 アリール、SR6、またはN、SまたはOから選択される1~3個のヘテロ原子を有する5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環から選択される1個以上の置換基で任意に置換され、C1-6アルキル、および5~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環は、ヒドロキシルおよびR6から選択される1個以上の置換基で独立して置換され;またはR7およびR8は、N、SまたはOから選択される1~3個のヘテロ原子を有する4~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環を共に形成してもよく、4~10員環の単環または二環の、飽和または不飽和の複素環は、ヒドロキシル、ハロゲン、C1-6アルキル、COOH、R6、NHR6、C(O)NHR6、C(O)NHSO2R6、およびC(O)(CH2)nNHC(O)CH3 からなる群から選択される1個以上の置換基で任意に置換され、C1-6アルキルは、オキソ、ヒドロキシル、COOH、COOR 6 およびNHR6から選択される基でさらに置換され;nは1~6であり;R6は、水素、C1-6アルキル、およびC(O)C1-6アルキルからなる群から選択される。 - 請求項5に記載の調製方法であって、式Vの化合物を処理して式VIIの化合物を得る工程が、(a)第2の塩基および第2の溶媒の存在下で式Vの化合物をアルケニル化して式VIの化合物を得る工程と;(b)式VIの化合物を酸化して式VIIの化合物を得る工程とを含む方法。
- 請求項5に記載の調製方法であって、式XIIIの化合物を処理して式VIIの化合物を得る工程が、式XIIIの化合物をギ酸化して式VIIの化合物を得る工程を含む方法。
- 請求項5~7のいずれか1項に記載の調製方法であって、カップリング試薬は、1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート(HATU)、N,N’-ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、またはプロピルホスホン酸無水物から選択され、溶媒は、メタノール、エタノール、イソプロピルアルコール、t-ブチルアルコール、ジクロロメタン、エチルアセテート、ジオキサン、エーテル、N,N-ジメチルホルムアミド、ジメチルスルホキシド、およびこれらの組み合わせからなる群から選択され;塩基は、水素化ナトリウム、ブチルリチウム、リチウムジイソプロピルアミド、炭酸カリウム、炭酸セシウム、トリエチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン、4-ジメチルアミノピリジン、ピリジン、およびそれらの組み合わせからなる群から選択され;第2の塩基は、ブチルリチウム、水素化ナトリウム、リチウムジイソプロピルアミド、炭酸カリウム、炭酸セシウム、トリエチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン、4-ジメチルアミノピリジン、ピリジン、およびそれらの組み合わせからなる群から選択され;第2の溶媒は、N,N-ジメチルホルムアミド、ジクロロメタン、酢酸エチル、ジオキサン、イソプロピルアルコール、エーテル、t-ブチルアルコール、N,N-ジメチルホルムアミド、ジメチルスルホキシド、およびそれらの組み合わせからなる群から選択され、第3の溶媒は、酢酸、メタノール、N,N-ジメチルホルムアミド、およびそれらの組み合わせからなる群から選択され、還元剤は、シアノホウ化水素ナトリウム、ホウ化水素ナトリウム、水素化リチウムアルミニウム、水素化ジイソブチルアルミニウム、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、方法。
- 請求項1~4のいずれか1項に記載の式Iの化合物、それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩を、薬学的に受容可能な担体と共に、任意で1個以上の他の医薬組成物と組み合わせて含む、医薬組成物。
- 錠剤、カプセル、粉末、シロップ、水溶液、エアロゾル、および懸濁液からなる群から選択される形態である、請求項9に記載の医薬組成物。
- 増殖性疾患または癌に罹患している被験体に、治療有効量の、化合物または医薬組成物を、他の臨床的に関連する細胞毒性剤または非細胞毒性剤と共に、投与する工程を含む、増殖性疾患および癌から選択される疾患の治療および/または予防のための薬剤の製造における、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物、それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩、または請求項9または10に記載の医薬組成物の使用。
- 他の臨床的に関連する細胞毒性剤または非細胞毒性剤と共に、増殖性疾患または癌を含む疾患の治療および/もしくは予防のための薬剤の製造における、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物、それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩、または請求項9または10に記載の医薬組成物の使用。
- 化合物の組み合わせ、または医薬組成物を、それらを必要とする被験体へ他の臨床的に関連する細胞毒性剤または非細胞毒性剤と共に投与する工程を含む癌の治療のための薬剤の製造における、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物、それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩、または請求項9に記載の医薬組成物の使用。
- 化合物の組み合わせ、または医薬組成物を、それらを必要とする被験体へ他の臨床的に関連する免疫調節剤と共に投与する工程を含む癌の治療のための薬剤の製造における、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物、それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩、または請求項9に記載の医薬組成物の使用。
- HIV、インフルエンザ、ヘルペスウイルス、A型肝炎、Β型肝炎、C型肝炎、およびD型肝炎から選択される感染症に罹患している被験体に、治療有効量の化合物、または医薬組成物を、他の臨床的に関連する抗ウイルス薬と共に、投与する工程を含む、癌および感染症の治療および/または予防のための、薬剤の製造における、請求項1~4のいずれか1項に記載の化合物、それらの立体異性体、またはそれらの薬学的に許容される塩、または請求項9または10に記載の医薬組成物の使用。
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