JP2021102633A - Ｐｄ−ｌ１に結合する抗原結合性タンパク質 - Google Patents

Abstract

【課題】ＣＨＯ細胞で、軽鎖開裂を伴わずに製造できる、バリアントＨ６Ｂ１Ｌ抗体を提供する。【解決手段】ある実施態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体を提供し、これは、第１の特定配列のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および第２および第３の特定配列からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト抗体は重鎖および軽鎖を有し、ここで、抗体は、第１の特定配列／第２の特定配列(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭと称する)および第１の特定配列／第３の特定配列(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＶと称する)からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。【選択図】なし

Description

関連出願
本出願は、２０１６年１月２９日出願の米国仮特許出願６２／２８８,９１２に基づく優先権を主張し、その全内容を引用により明示的に本明細書に包含させる。

配列表
本出願は、ASCII形式で電子的に提供し、引用によりその全体を本明細書に包含させる、配列表を含む。該ASCIIコピーは、２０１７年１月２７日に作成し、126036-06620_ST25.txtなる名称であり、８.０キロバイトサイズである。

技術分野
本発明は、高収率で製造される、改善された能力を有する、抗ＰＤ−Ｌ１ ＩｇＧクラス抗体を提供する。より具体的に、本発明は、ＰＤ−Ｌ１に結合するヒト抗体、このような抗体のＰＤ−Ｌ１結合フラグメントおよび誘導体およびこのようなフラグメントを含むＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドを提供する。

背景
プログラム死リガンド１(ＰＤ−Ｌ１)は、４０kDa １型膜貫通タンパク質である。ＰＤ−１のリガンドであるＰＤ−Ｌ１(ヒトＰＤ−Ｌ１ ｃＤＮＡはEMBL/GenBank Acc. No. NM_001267706により示される塩基配列からなり、マウスＰＤ−Ｌ１ ｃＤＮＡはNM_021893により示される塩基配列からなる)は、活性化単球および樹状細胞などのいわゆる抗原提示細胞に発現される。これらの細胞は、Ｔリンパ球に多様な免疫誘導型シグナルを誘発する相互作用分子を提示し、ＰＤ−Ｌ１はＰＤ−１との結合により阻害性シグナルを誘導する、これら分子の１つである。ＰＤ−Ｌ１結合は、ＰＤ−１発現Ｔリンパ球の活性化(細胞増殖および種々のサイトカイン産生の誘発)を抑制することが確認されている。ＰＤ−Ｌ１発現は、免疫担当細胞だけでなく、ある種の腫瘍細胞株(単球性白血病由来細胞株、肥満細胞由来細胞株、肝臓癌由来細胞株、神経芽細胞由来細胞株および乳癌由来細胞株)でも確認されている(Nature Immunology (2001), vol. 2, issue 3, p. 261-267.)。

プログラム死１(ＰＤ−１)は、ＣＤ２８、ＣＴＬＡ−４、ＩＣＯＳ、ＰＤ−Ｌ１およびＢＴＬＡを含む、受容体のＣＤ２８ファミリーのメンバーである。このファミリーの最初のメンバー、ＣＤ２８は、モノクローナル抗体添加後のＴ細胞増殖増強に対する機能効果により発見された(Hutloff et al. (1999) Nature 397:263-266; Hansen et al. (1980) Immunogenics 10:247-260)。ＰＤ−１に対する２種の細胞表面糖タンパク質リガンド、ＰＤ−Ｌ１およびＰＤＬ−２が同定されており、ＰＤ−１への結合によりＴ細胞活性化およびサイトカイン分泌を下方制御することが示されている(Freeman et al. (2000) J. Exp. Med. 192:1027-34; Latchman et al. (2001) Nat. Immunol. 2:261-8; Carter et al. (2002) Eur. J. Immunol. 32:634-43; Ohigashi et al. (2005) Clin. Cancer Res. 11:2947-53)。ＰＤ−Ｌ１(Ｂ７−Ｈ１)およびＰＤ−Ｌ２(Ｂ７−ＤＣ)の両方とも、ＰＤ−１に結合するＢ７ホモログである。細胞表面へのＰＤ−Ｌ１の発現は、ＩＦＮ−γ刺激により上方制御されることも示されている。

ＰＤ−Ｌ１発現は、ヒト肺、卵巣および結腸癌および種々の骨髄腫を含む数種のマウスおよびヒト癌で見られている(Iwai et al. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99:12293-7; Ohigashi et al. (2005) Clin. Cancer Res. 11:2947-53)。ＰＤ−Ｌ１は、抗原特異的Ｔ細胞クローンのアポトーシスを増加させることにより、腫瘍免疫において役割を有することが示唆されている(Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:793-800)。ＰＤ−Ｌ１は腸粘膜炎症に関与しており、ＰＤ−Ｌ１の阻害が、大腸炎と関連する消耗性疾患を抑制することも示唆されている(Kanai et al. (2003) J. Immunol. 171:4156-63)。

発明の概要
本発明は、野生型重鎖として配列番号２１３を、軽鎖として配列番号２１４を有し、米国特許出願米国特許公開２０１３−０３２３２４９号(２０１３年５月３１日出願の１３／９０７,６８５号)(その開示は、引用により本明細書に包含させる)に開示されている抗体(Ｈ６Ｂ１Ｌと呼ばれる)が、アミノ末端が開裂する条件下で、十分な量で製造できなかったことを見出したことに基づく。従って、本発明は、特に、ＣＨＯ細胞で、軽鎖開裂を伴わずに製造できる、バリアントＨ６Ｂ１Ｌ抗体を提供する。

ある実施態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体を提供し、これは、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト抗体は重鎖および軽鎖を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭと称する)および配列番号１／配列番号３(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＶと称する)からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

ある実施態様において、本発明は、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域を有するＦａｂ完全ヒト抗体フラグメントを提供し、これは、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメントは重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

ある実施態様において、本発明は、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域および重鎖および軽鎖可変ドメイン領域を連結するペプチドリンカーを有する一本鎖ヒト抗体を提供し、これは、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト一本鎖抗体は重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、一本鎖完全ヒト抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

ある実施態様において、本発明は、さら、抗ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドの有効量を投与することを含む、哺乳動物の広汎な癌または広汎な炎症性疾患および自己免疫性疾患を処置する方法を提供し、ここで、抗ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域を有するＦａｂ完全ヒト抗体フラグメント、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域および重鎖および軽鎖可変ドメイン領域を連結するペプチドリンカーを有する一本鎖ヒト抗体およびこれらの組み合わせからなる群から選択され； ここで、完全ヒト抗体は配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有し
ここで、Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントは配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有し；そして
ここで、一本鎖ヒト抗体は配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。ある実施態様において、重鎖可変領域は、配列番号５、配列番号６および配列番号７のアミノ酸配列に示すＣＤＲ１ドメイン、ＣＤＲ２ドメインおよびＣＤＲ３ドメインを含む。

ある実施態様において、完全ヒト抗体は重鎖および軽鎖を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭと称する)および配列番号１／配列番号３(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＶと称する)からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメントは重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭと称する)および配列番号１／配列番号３(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＶと称する)からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト一本鎖抗体は重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、一本鎖完全ヒト抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

ある実施態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体を提供し、ここで、抗体は、配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。

他の実施態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体を提供し、ここで、抗体は、それぞれ配列番号５、配列番号６および配列番号７のアミノ酸配列に示すＣＤＲ１ドメイン、ＣＤＲ２ドメインおよびＣＤＲ３ドメインを含む重鎖可変ドメインならびに配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。

本発明の完全ヒト抗体は、ある実施態様において、ＩｇＧ１またはＩｇＧ４であり得る。

ある実施態様において、本発明はまた本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはそのフラグメント)および薬学的に許容される担体を含む医薬組成物も含む。

本発明はまた癌または自己免疫性もしくは炎症性疾患を有するヒト対象を処置する方法も含み、該方法は、抗ＰＤ−Ｌ１完全ヒト抗体、ＦａｂフラグメントまたはｓｃＦｖの有効量を投与することを含む。ある実施態様において、処置される哺乳動物の広汎な癌は、卵巣、結腸、乳房、肺癌、骨髄腫、神経芽細胞由来ＣＮＳ腫瘍、単球性白血病、Ｂ細胞由来白血病、Ｔ細胞由来白血病、Ｂ細胞由来リンパ腫、Ｔ細胞由来リンパ腫、肥満細胞由来腫瘍およびこれらの組み合わせからなる群から選択される。ある実施態様において、自己免疫性疾患または炎症性疾患は、腸粘膜炎症、大腸炎と関連する消耗性疾患、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、ウイルス感染症、リウマチ性関節炎、骨関節症、乾癬、クローン病および炎症性腸疾患からなる群から選択される。

ある実施態様において、本発明の抗体またはフラグメントは、哺乳動物宿主細胞、例えば、チャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞において産生される。

図１Ａおよび１Ｂは、上部グラフの元の野生型抗体Ｈ６Ｂ１Ｌ(図１Ａ)および下部グラフの本発明のバリアント抗体Ｈ６−Ｂ１Ｌ−ＥＭ(図１Ｂ)について、軽鎖のマススペクトルピークの比較を示す。図１Ｂに記載するとおり、親軽鎖と比較して、軽鎖(ＬＣ)フラグメントは、Ｈ６Ｂ１ＬＥＭ軽鎖では検出されなかった。図１に記載の抗体は、ＣＨＯ細胞で産生された。

詳細な記載
定義
“抗原結合性タンパク質”は、抗原に結合する部分、および、所望により、該抗原結合部分が該抗原結合性タンパク質の抗原への結合を助長する立体構造を取ることを可能にする足場またはフレームワーク部分を含むタンパク質をいう。抗原結合性タンパク質の例は、抗体、抗体フラグメント(例えば、抗体の抗原結合部分)、抗体誘導体および抗体アナログを含む。抗原結合性タンパク質は、例えば、移植ＣＤＲまたはＣＤＲ誘導体を有する代替タンパク質足場または人工足場を含み得る。このような足場は、例えば、抗原結合性タンパク質の三次元構造を安定化するために導入された変異を含む抗体由来足場ならびに、例えば、生体適合性ポリマーを含む、完全合成足場を含むが、これらに限定されない。例えば、Korndorfer et al., 2003, Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Volume 53, Issue 1:121-129; Roque et al., 2004, Biotechnol. Prog. 20:639-654参照。さらに、ペプチド抗体模倣物(“ＰＡＭ”)ならびに足場としてフィブロネクチン成分を利用する抗体模倣物に基づく足場が使用され得る。

抗原結合性タンパク質は、例えば、天然に存在する免疫グロブリンの構造を有し得る。“免疫グロブリン”は、四量体分子である。“インタクト免疫グロブリン”(天然に存在する免疫グロブリンのような重鎖および軽鎖構造を有する)において、該四量体はポリペプチド鎖の２個の同一ペアからなり、各ペアは１“軽”鎖(約２５kDa)および１“重”鎖(約５０〜７０kDa)を有する。各鎖のアミノ末端部分は、主に抗原認識を担う約１００〜１１０またはそれ以上のアミノ酸の可変領域を含む。各鎖のカルボキシ末端部分は、主にエフェクター機能を担う定常領域を規定する。ヒト軽鎖はカッパまたはラムダ軽鎖として分類される。重鎖は、ミュー、デルタ、ガンマ、アルファまたはイプシロンとして分類され、それぞれＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡおよびＩｇＥとしての抗体のアイソタイプを規定する。軽鎖および重鎖内で、可変領域と定常領域は、約１２またはそれ以上のアミノ酸の“Ｊ”領域により連結され、重鎖はまた約１０以上のアミノ酸の“Ｄ”領域を含む。一般に、Fundamental Immunology Ch. 7 (Paul, W., ed., 2nd ed. Raven Press, N.Y. (1989))参照のこと(全ての目的のために、全体を引用により本明細書に包含させる)。各軽／重鎖ペアの可変領域は、インタクト免疫グロブリンが２結合部位を有するように、抗体結合部位を形成する。用語“天然に存在する免疫グロブリン”は、免疫グロブリンの供給源ではなく、むしろ免疫グロブリンの全体的構造をいう。

天然に存在する免疫グロブリン鎖の可変領域は、ここでは相補性決定領域またはＣＤＲとも称する３超可変領域により連結された、比較的保存されたフレームワーク領域(ＦＲ)の一般的構造を示す。Ｎ末端からＣ末端側に、軽鎖および重鎖は、両方ともドメインＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３およびＦＲ４を含む。各ドメインへのアミノ酸の割り当ては、Kabat et al. in Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5^th Ed., US Dept. of Health and Human Services, PHS, NIH, NIH Publication no. 91-3242, 1991に従う。免疫グロブリン鎖におけるアミノ酸の他のナンバリングシステムは、IMGT.RTM. (international ImMunoGeneTics information system; Lefranc et al, Dev. Comp. Immunol. 29:185-203; 2005)およびAHo(HoneggerおよびPluckthun, J. Mol. Biol. 309(3):657-670; 2001)を含む。

抗体は、多様な抗原特異性を有する免疫グロブリンを含む、血清または血漿などの供給源から得ることができる。このような抗体は親和性精製に付すことにより、特定の抗原特異性について富化され得る。抗体のこのような富化調製物は、通常特定の抗原に対して特異的結合活性を有する抗体約１０％未満からなる。これらの調製物を数回親和性精製して、その抗原に対する特異的結合活性を有する抗体の割合を増加させ得る。この方法で調製された抗体は、しばしば“単特異的”と称される。単特異的抗体調製物は、特定の抗原に対して特異的結合活性を有する抗体を約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９９％または９９.９％まで含み得る。

“抗体”は、特に断らない限り、インタクト免疫グロブリンまたは、該インタクト抗体と特異的結合について競合するその抗原結合部分をいう。ある実施態様において、抗体はインタクト免疫グロブリンである。抗原結合部分は、組み換えＤＮＡ技法またはインタクト抗体の酵素もしくは化学開裂により産生され得る。抗原結合部分は、とりわけ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ(ａｂ’)_２、Ｆｖ、ドメイン抗体(ｄＡｂ)および相補性決定領域(ＣＤＲ)フラグメント、一本鎖抗体(ｓｃＦｖ)、キメラ抗体、二重特異性抗体、トリアボディ、テトラボディおよび少なくともポリペプチドに特異的抗原結合を付与するのに十分な免疫グロブリンの一部を含むポリペプチドを含む。

ある抗体の相補性決定領域(ＣＤＲ)およびフレームワーク領域(ＦＲ)は、Kabat et al. supra; Lefranc et al., supraおよび／またはHonegger and Pluckthun, supraに記載のシステムを使用して同定し得る。１以上のＣＤＲが、共有結合的または非共有結合的に分子に取り込まれ、それを抗原結合性タンパク質とし得る。抗原結合性タンパク質は、大型ポリペプチド鎖の一部としてＣＤＲを取り込んでよく、他のポリペプチド鎖にＣＤＲを共有結合的に結合させてよくまたはＣＤＲを非共有結合的に取り込んでよい。ＣＤＲは、抗原結合性タンパク質が目的の特定の抗原に特異的に結合することを可能とする。

抗原結合性タンパク質は、１以上の結合部位を有し得る。１を超える結合部位があるならば、これら結合部位は互いに同一でも異なってもよい。例えば、天然に存在するヒト免疫グロブリンは、一般に２個の同一結合部位を有するが、“二特異的”または“二機能性”抗体は、２個の異なる結合部位を有する。

用語“ヒト抗体”は、ヒト免疫グロブリン配列由来の１以上の可変領域および定常領域を有する、抗体または抗体の抗原結合フラグメントをいう。ある実施態様において、可変および定常ドメイン全てが、ヒト免疫グロブリン配列由来である(完全ヒト抗体)。これらの抗体は多様な方法で製造でき、その例を下に記載し、ヒト重および／または軽鎖コード遺伝子由来の抗体を発現するように遺伝的に修飾されているマウスの目的の抗原での免疫化によるものを含む。ヒト抗体を多様な方法で同定でき、ファージディスプレイによるまたはヒト重および／または軽鎖コード遺伝子由来の抗体を発現するように遺伝的に修飾されているマウスの免疫化によるものを含む。ある実施態様において、完全ヒト抗体を、抗体のグリコシル化パターンが、同じ配列を有する抗体が、それが天然で存在したときと異なるように、組み換え方法を使用して製造する。

“ヒト化抗体”は、ヒト対象に投与したとき、非ヒト種抗体と比較して、ヒト化抗体が免疫応答を誘発する可能性が低いおよび／または重篤度が低い免疫応答を誘発するように、１以上のアミノ酸置換、欠失および／または付加により、非ヒト種由来の抗体の配列と異なる配列を有する。ある実施態様において、非ヒト種抗体の重および／または軽鎖のフレームワークおよび定常ドメインのあるアミノ酸を、ヒト化抗体を産生するために変異させる。他の実施態様において、ヒト抗体からの定常ドメインを、非ヒト種の可変ドメインに融合させる。他の実施態様において、非ヒト抗体の１以上のＣＤＲ配列における１以上のアミノ酸残基がは、ヒト対象に投与されたとき、非ヒト抗体で可能性のある免疫原性を低減するように変更され、ここで、該変更されたアミノ酸残基は、該抗体のその抗原への免疫特異的結合に重要でないかまたはアミノ酸配列になされた変更が、該ヒト化抗体の抗原への結合を、非ヒト抗体の抗原への結合より顕著に低下させないような、保存的変更である。ヒト化抗体をどのように製造するかは、米国特許６,０５４,２９７号、５,８８６,１５２号および５,８７７,２９３号に見ることができる。

用語“キメラ抗体”は、ある抗体からの１以上の領域および１以上の他の抗体からの１以上の領域を含む、抗体をいう。ある実施態様において、ＣＤＲの１以上は、ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体に由来する。他の実施態様において、ＣＤＲ全ては、ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体に由来する。他の実施態様において、キメラ抗体において１を超えるヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体からのＣＤＲが混合され、整合される。例えば、キメラ抗体は、第一ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体の軽鎖からのＣＤＲ１、第二ヒト抗ＰＤ−Ｌ１抗体の軽鎖からのＣＤＲ２およびＣＤＲ３ならびに第三抗ＰＤ−Ｌ１抗体の重鎖からのＣＤＲを含み得る。他の組み合わせも可能である。さらに、フレームワーク領域は、同じ抗ＰＤ−Ｌ１抗体の１つから、ヒト抗体などの１以上の異なる抗体からまたはヒト化抗体からであり得る。キメラ抗体の一例において、重および／または軽鎖の部分は、特定の種からの抗体と同一であるか、相同であるかまたはそれに由来するかまたは特定の抗体クラスまたはサブクラスに属するが、鎖の残りは、他の種からの抗体と同一であるか、相同であるかまたはそれに由来するかまたは他の抗体クラスまたはサブクラスに属する。また包含されるのは、所望の生物活性(すなわち、ＰＤ−Ｌ１に特異的に結合する能力)を示す、このような抗体のフラグメントである。

“Ｆａｂフラグメント”はＶ_Ｌ、Ｖ_Ｈ、Ｃ_ＬおよびＣ_Ｈ１ドメインを有する単価フラグメントであり、Ｆ(ａｂ’)_２フラグメントはヒンジ領域でジスルフィド架橋により結合された２Ｆａｂフラグメントを有する二価フラグメントであり、ＦｄフラグメントはＶ_ＨおよびＣ_Ｈ１ドメインを有し、Ｆｖフラグメントは抗体の単一アームのＶ_ＬおよびＶ_Ｈドメインを有し、そしてｄＡｂフラグメントはＶ_Ｈドメイン、Ｖ_ＬドメインまたはＶ_ＨまたはＶ_Ｌドメインの抗原結合フラグメントを有する(米国特許６,８４６,６３４号；６,６９６,２４５号、米国出願公開２０／０２０２５１２号；２００４／０２０２９９５号；２００４／００３８２９１号；２００４／０００９５０７号；２００３／００３９９５８号およびWard et al., Nature 341:544-546, 1989)。

“一本鎖抗体”または‘ｓｃＦｖ”は、Ｖ_ＬおよびＶ_Ｈ領域が連続タンパク質鎖を形成するようにリンカー(例えば、アミノ酸残基の合成配列)を介して結合される、抗体である。ある実施態様において、リンカーは、タンパク質鎖がそれ自身折り畳まれて、単価抗原結合部位を形成することを可能にする程に十分長い(例えば、Bird et al., 1988, Science 242:423-26およびHuston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-83参照)。二重特異性抗体は、２ポリペプチド鎖を含む二価抗体であり、ここで、各ポリペプチド鎖は、同じ鎖の２ドメイン間の対形成を可能とするには短すぎ、それ故に、各ドメインが他のポリペプチド鎖の相補性ドメインと対になることを可能にする、リンカーにより結合されたＶ_ＨおよびＶ_Ｌドメインを含む(例えば、Holliger et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-48, and Poljak et al., 1994, Structure 2:1121-23参照)。二重特異性抗体の２ポリペプチド鎖が同一であるならば、その対形成に起因する二重特異性抗体は、２個の同一抗原結合部位を有する。異なる配列を有するポリペプチド鎖を、２個の異なる抗原結合部位を有する二重特異性抗体の製造に使用できる。同様に、トリアボディおよびテトラボディは、それぞれ、同一でも異なってもよい３および４ポリペプチド鎖を含み、それぞれ、３および４抗原結合部位を形成する抗体である。

“中和抗体”または“阻害性抗体”は、過剰の抗ＰＤ−Ｌ１抗体が実施例に記載するようなアッセイを使用して、活性化の程度を少なくとも約２０％減少させるなら、ＰＤ−Ｌ１のタンパク分解の活性化を阻害する抗体である。種々の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、ＰＤ−Ｌ１のタンパク分解の活性化の程度を、少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９７％、９９％および９９.９％減少させる。

抗体のフラグメントまたはアナログは、本明細書の教示に従って、当分野で知られる技法を使用して、当業者により容易に製造され得る。フラグメントまたはアナログの好ましいアミノ末端およびカルボキシ末端は、機能的ドメインの境界近辺に生じる。構造的および機能的ドメインは、ヌクレオチドおよび／またはアミノ酸配列データを一般のまたは所有権のある(proprietary)配列データベースと比較することにより同定され得る。コンピューターによる比較方法を使用して、既知構造および／または機能の他のタンパク質にある配列モチーフまたは予測タンパク質構造ドメインを同定し得る。既知三次元構造に折り畳まれたタンパク質配列を同定する方法は知られている。Bowie et al., 1991, Science
253:164参照。

“ＣＤＲ移植抗体”は、特定の種またはアイソタイプの抗体由来の１以上のＣＤＲおよび同一または異なる種またはアイソタイプの他の抗体のフレームワークを含む抗体である。

“多特異的抗体”は、１以上の抗原の１を超えるエピトープを認識する抗体である。このタイプの抗体のサブクラスは、同一または異なる抗原の２つの異なるエピトープを認識する“二特異的抗体”である。

抗原結合性タンパク質は、１ナノモル以下の解離定数で抗原(例えば、ヒトＰＤ−Ｌ１)と結合するならば、該抗原と“特異的に結合する”。

“抗原結合ドメイン”、“抗原結合領域”または“抗原結合部位”は、抗原結合性タンパク質の、抗原と相互作用し、該抗原に対する該抗原結合性タンパク質の特異性および親和性に寄与する、アミノ酸残基(または他の部分)を含む部分をいう。抗原に特異的に結合する抗体について、これは、そのＣＤＲドメインの少なくとも１つの少なくとも一部を含む。

“エピトープ”は、抗原結合性タンパク質(例えば、抗体)により結合される、分子の部分をいう。エピトープは、分子の非連続的部分である(例えば、ポリペプチドにおいて、ポリペプチドの一次配列では連続的ではないが、ポリペプチドの三次および四次構造において、抗原結合性タンパク質により結合されるのに互いに十分に近いアミノ酸残基)。

２ポリヌクレオチドまたは２ポリペプチド配列の“パーセント同一性”または“パーセント相同性”は、ＧＡＰコンピュータープログラム(GCG Wisconsin Package, version 10.3 (Accelrys, San Diego, Calif.)の一部)を使用して、そのデフォルトパラメータを使用して、配列を比較することにより決定される。

用語“ポリヌクレオチド”、“オリゴヌクレオチド”および“核酸”は、全体にわたって相互交換可能に使用され、ＤＮＡ分子(例えば、ｃＤＮＡまたはゲノムＤＮＡ)、ＲＮＡ分子(例えば、ｍＲＮＡ)、ヌクレオチドアナログを使用して産生されたＤＮＡまたはＲＮＡのアナログ(例えば、ペプチド核酸および天然に存在しないヌクレオチドアナログ)およびこれらのハイブリッドを含む。核酸分子は、一本鎖または二本鎖である。ある実施態様において、本発明の核酸分子は、抗体またはそのフラグメント、誘導体、ムテインまたはバリアントをコードする連続的オープンリーディングフレームを含む。

２つの一本鎖ポリヌクレオチドは、ギャップの導入なしでかつ何れかの配列の５’または３’末端に不対ヌクレオチドなく、一方のポリヌクレオチドにおける全ヌクレオチドが、他方のポリヌクレオチドにおけるその相補的ヌクレオチドと逆であるように逆平行配向でアラインされ得るならば、それらの配列は互いに“相補体”である。ポリヌクレオチドは、２ポリヌクレオチドが、互いに中程度のストリンジェント条件下でハイブリダイズできるならば、他方のポリヌクレオチドと“相補的”である。それ故に、ポリヌクレオチドは、その相補体とならずに、他のポリヌクレオチドと相補的であり得る。

“ベクター”は、それに結合した他の核酸を細胞に導入するのに使用され得る核酸である。ベクターの１つのタイプは“プラスミド”であり、これは、付加的核酸セグメントがその中にライゲートされ得る直線状または環状二本鎖ＤＮＡ分子である。他のタイプのベクターは、ウイルスベクター(例えば、複製欠損レトロウイルス、アデノウイルスおよびアデノ随伴ウイルス)であり、ここで、導入すべきＤＮＡセグメントがウイルスゲノムに統合され得る。あるベクターは、導入された宿主細胞で自律複製可能である(例えば、細菌複製起点を含む細菌ベクターおよびエピソーム哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞への導入により宿主細胞のゲノムに統合され、それにより宿主ゲノムと共に複製する。“発現ベクター”は、選択ポリヌクレオチドの発現を指示できるタイプのベクターである。

ヌクレオチド配列は、制御配列が該ヌクレオチド配列の発現(例えば、発現のレベル、タイミングまたは位置)に影響するならば、該制御配列に“操作可能に結合する”。“制御配列”は、操作可能に結合している核酸の発現(例えば、発現のレベル、タイミングまたは位置)に影響する核酸である。制御配列は、例えば、その効果を直接制御される核酸にまたは１以上の他の分子(例えば、制御配列および／または核酸に結合するポリペプチド)の作用を介して発揮し得る。制御配列の例は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御要素(例えば、ポリアデニル化シグナル)を含む。制御配列のさらなる例は、例えば、Goeddel, 1990, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, Calif. and Baron et al., 1995, Nucleic Acids Res. 23:3605-06に記載される。

“宿主細胞”は、核酸、例えば、本発明の核酸の発現に使用できる細胞である。宿主細胞は、原核生物、例えば、大腸菌であってよくまたは真核生物、例えば、単細胞真核生物(例えば、酵母または他の真菌)、植物細胞(例えば、タバコまたはトマト植物細胞)、動物細胞(例えば、ヒト細胞、サル細胞、ハムスター細胞、ラット細胞、マウス細胞または昆虫細胞)またはハイブリドーマであってよい。宿主細胞の例は、サル腎臓細胞のＣＯＳ−７株(ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１)(Gluzman et al., 1981, Cell 23:175参照)、Ｌ細胞、Ｃ１２７細胞、３Ｔ３細胞(ＡＴＣＣ ＣＣＬ １６３)、チャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞または無血清培地で増殖されたＶｅｇｇｉｅ ＣＨＯおよび関連細胞株(Rasmussen et al., 1998, Cytotechnology 28:31参照)またはＤＨＦＲを欠損するＣＨＯ株ＤＸ−Ｂ１１(Urlaub et al., 1980, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216-20)などのこれらの誘導体、ＨｅＬａ細胞、ＢＨＫ(ＡＴＣＣ ＣＲＬ １０)細胞株、アフリカミドリザル腎臓細胞株ＣＶ１由来ＣＶ１／ＥＢＮＡ細胞株(ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０)(McMahan et al., 1991, EMBO J. 10:2821参照)、２９３,２９３ ＥＢＮＡまたはＭＳＲ ２９３などのヒト胚腎臓細胞、ヒト上皮Ａ４３１細胞、ヒトＣｏｌｏ２０５細胞、他の形質転換霊長類細胞株、正常２倍体細胞、一次組織のインビトロ培養に由来する細胞株、一次外植片、ＨＬ−６０、Ｕ９３７、ＨａＫまたはＪｕｒｋａｔ細胞を含み得る。ある実施態様において、宿主細胞は、ヒトではない哺乳動物宿主細胞である。一般に、宿主細胞は、ポリペプチドコード核酸で形質転換またはトランスフェクトされ得る、培養細胞であり、これはその後宿主細胞で発現され得る。用語“組み換え宿主細胞”は、発現されるべき核酸で形質転換またはトランスフェクトされている宿主細胞を意味するように使用され得る。宿主細胞はまた核酸を含むが、それを、該核酸と操作可能に結合となるように制御配列を宿主細胞に導入しない限り、所望のレベルで発現されない細胞であり得る。用語宿主細胞は特定の対象細胞だけでなく、そのような細胞の子孫または潜在的子孫も含むことは理解される。例えば、変異または環境の影響により、ある修飾が後代で生じ得て、このような子孫は、実際、親細胞と同一ではないかもしれないが、なおここで使用する該用語の範囲内に包含される。ある実施態様において、宿主細胞はＣＨＯ細胞である。

用語“組み換え抗体”は、抗体またはその一部のコード配列(例えば、ここに記載する重鎖または軽鎖可変領域をコードするＤＮＡ配列)を含む、発現ベクター(またはおそらく１を超える発現ベクター)でトランスフェクトされた宿主細胞(または細胞株)から発現される抗体をいう。ある実施態様において、該コード配列は、該細胞と天然では関係しない。ある実施態様において、組み換え抗体は、同じ抗体が、それが天然で存在したときと同じ配列を有する抗体のグリコシル化パターンと異なるグリコシル化パターンを有する。ある実施態様において、組み換え抗体は、ヒト宿主細胞ではない哺乳動物宿主細胞で発現される。特に、個々の哺乳動物宿主細胞は特有のグリコシル化パターンを有する。

用語“ＰＤ−Ｌ１阻害剤”および“ＰＤ−Ｌ１アンタゴニスト”は、相互交換可能に使用される。各々、ＰＤ−Ｌ１の少なくとも１つの機能を検出可能に阻害する分子である。逆に、“ＰＤ−Ｌ１アゴニスト”は、ＰＤ−Ｌ１の少なくとも１つの機能を検出可能に増進せる分子である。ＰＤ−Ｌ１阻害剤により引き起こされる阻害は、アッセイを使用して検出可能である限り、完全である必要はない。ＰＤ−Ｌ１の機能のあらゆるアッセイを使用でき、その例は、ここに提供される。ＰＤ−Ｌ１阻害剤に阻害されるまたはＰＤ−Ｌ１アゴニストにより増強されることが可能であるＰＤ−Ｌ１の機能の例は、癌細胞増殖またはアポトーシス(プログラム細胞死)などを含む。ＰＤ−Ｌ１阻害剤およびＰＤ−Ｌ１アゴニストのタイプの例は、ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチド、例えば、抗原結合性タンパク質(例えば、ＰＤ−Ｌ１阻害性抗原結合性タンパク質)、抗体、抗体フラグメントおよび抗体誘導体を含むが、これらに限定されない。

用語“ペプチド”、“ポリペプチド”および“タンパク質”は、各々、ペプチド結合により互いに連結された、２以上のアミノ酸残基を含む分子をいう。これらの用語は、例えば、天然および人工タンパク質、タンパク質フラグメントおよびポリペプチドアナログ(例えばムテイン、バリアントおよび融合タンパク質)ならびに翻訳後または他に、共有結合的または非共有結合的に修飾されたタンパク質を包含する。ペプチド、ポリペプチドまたはタンパク質は、単量体でも多量体でもよい。

ポリペプチド(例えば、抗体)の“バリアント”は、他のポリペプチド配列に対して、１以上のアミノ酸残基がアミノ酸配列において挿入、欠失および／または置換されている、アミノ酸配列をいう。開示されるバリアントは、例えば、融合タンパク質を含む。

ポリペプチドの“誘導体”は、例えば、他の化学基(例えば、例えば、ポリエチレングリコールまたはアルブミン、例えば、ヒト血清アルブミン)へのコンジュゲーション、リン酸化およびグリコシル化により、化学的に修飾されているポリペプチド(例えば、抗体)である。特に断らない限り、用語“抗体”は、２完全長重鎖および２完全長軽鎖を含む抗体に加えて、その誘導体、バリアント、フラグメントおよびムテインを含み、その例を下
に記載する。

ＰＤ−Ｌ１抗原結合性タンパク質
本発明は、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する、１０^−６Ｍ以下の結合親和性を有する、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体を提供する。好ましくは、完全ヒト抗体は重鎖および軽鎖を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭと称する)および配列番号１／配列番号３(ここではＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＶと称する)からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。親抗体Ｈ６Ｂ１Ｌおよびそのバリアント−ＥＭおよび−ＥＶの配列が、下記配列の表に提供される。ここに開示する−ＥＭおよび−ＥＶ抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、特に、開裂が回避される点で、ＣＨＯ細胞における発現に利益を有するものとして同定されている。

好ましくは、本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはフラグメント)は、ヒトＰＤ−Ｌ１に結合する。
抗原結合性タンパク質は、ＰＤ−Ｌ１の生物活性を阻害する完全ヒトモノクローナル抗体を含む。

ある実施態様において、完全ヒト抗体は、配列番号７のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３ドメイン(Ｋａｂａｔナンバリングスキームを使用して決定)を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号１０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３ドメインを含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、完全ヒト抗体は、配列番号６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２ドメインを含む重鎖可変ドメインおよび配列番号９のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２ドメインを含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、完全ヒト抗体は、配列番号５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１ドメインを含む重鎖可変ドメインおよび配列番号８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１ドメインを含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、完全ヒト抗体は、それぞれ配列番号７、６および５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３、ＣＤＲ２およびＣＤＲ１を含む重鎖可変ドメインおよびそれぞれ配列番号１０、９および８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３、ＣＤＲ２およびＣＤＲ１を含む軽鎖可変ドメインを含む。

本発明は、ある実施態様において、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラス(例えば、ＩｇＧ１またはＩｇＧ４)の完全ヒト抗体を提供し、ここで、抗体は、配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラス(例えば、ＩｇＧ１またはＩｇＧ４)の完全ヒト抗体を提供し、ここで、抗体は、それぞれ配列番号５、配列番号６および配列番号７のアミノ酸配列に示すＣＤＲ１ドメイン、ＣＤＲ２ドメインおよびＣＤＲ３ドメインを含む重鎖可変ドメインならびに配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。

抗体フラグメントもまたここで企図され、ここで、該抗体フラグメントはＰＤ−Ｌ１に結合し、配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、本発明は、それぞれ配列番号５、配列番号６および配列番号７のアミノ酸配列に示すＣＤＲ１ドメイン、ＣＤＲ２ドメインおよびＣＤＲ３ドメインを含む重鎖可変ドメインならびに配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、抗ＰＤ−Ｌ１抗体フラグメントを提供する。

本発明は、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域を有するＦａｂ完全ヒト抗体フラグメントを提供し、ここで、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメントは重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

ある実施態様において、Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントは、配列番号７のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３(Ｋａｂａｔナンバリングスキームを使用して決定)を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号１０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントは、配列番号６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号９のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントは、配列番号５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントは、それぞれ配列番号７、６および５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３、ＣＤＲ２およびＣＤＲ１を含む重鎖可変ドメインおよびそれぞれ配列番号１０、９および８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３、ＣＤＲ２およびＣＤＲ１を含む軽鎖可変ドメインを含む。

本発明の抗原結合性タンパク質の抗原結合フラグメントは、慣用の技法により製造され得る。このようなフラグメントの例は、ＦａｂおよびＦ(ａｂ’)_２フラグメントを含むが、これらに限定されない。

本発明は、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域および重鎖および軽鎖可変ドメイン領域を連結するペプチドリンカーを有する一本鎖ヒト抗体を提供し、これは、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト一本鎖抗体は重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、一本鎖完全ヒト抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

ある実施態様において、一本鎖ヒト抗体は、配列番号７のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３(Ｋａｂａｔナンバリングスキームを使用して決定)を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号１０のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、一本鎖ヒト抗体は、配列番号６のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号９のアミノ酸配列を有するＣＤＲ２を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、一本鎖ヒト抗体は、配列番号５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ１を含む軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、一本鎖ヒト抗体は、それぞれ配列番号７、６および５のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３、ＣＤＲ２およびＣＤＲ１を含む重鎖可変ドメインおよびそれぞれ配列番号１０、９および８のアミノ酸配列を有するＣＤＲ３、ＣＤＲ２およびＣＤＲ１を含む軽鎖可変ドメインを含む。

本発明は、さらに、抗ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドの有効量を投与することを含む、哺乳動物の広範囲の癌または炎症性疾患または自己免疫性疾患を処置する方法を提供し、ここで、抗ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドは、少なくとも１０^−６Ｍの結合親和性を有するＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域を有するＦａｂ完全ヒト抗体フラグメント、重鎖からの可変ドメイン領域および軽鎖からの可変ドメイン領域および重鎖および軽鎖可変ドメイン領域を連結するペプチドリンカーを有する一本鎖ヒト抗体およびこれらの組み合わせからなる群から選択され；
ここで、該完全ヒト抗体は、配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有し；ここで、Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントは配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有し；およびここで、一本鎖ヒト抗体は配列番号１のアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である重鎖可変ドメイン配列および配列番号２および配列番号３からなる群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一である軽鎖可変ドメイン配列を有する。

好ましくは、完全ヒト抗体は重鎖および軽鎖を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメントは重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。好ましくは、完全ヒト一本鎖抗体は重鎖可変ドメイン領域および軽鎖可変ドメイン領域両方を有し、ここで、一本鎖完全ヒト抗体は、配列番号１／配列番号２および配列番号１／配列番号３からなる群から選択される重鎖／軽鎖可変ドメイン配列を有する。

特定の実施態様において、本発明の抗原結合性タンパク質は、少なくとも１０^６の結合親和性(Ｋ_ａ)をＰＤ−Ｌ１に対して有する。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９または少なくとも１０^１０のＫ_ａを示す。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、ここで実施例に記載する抗体のものと実質的に同等なＫ_ａを示す。

他の実施態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１からの低解離速度を有する、抗原結合性タンパク質を提供する。ある実施態様において、抗原結合性タンパク質は、１×１０^−４〜１０^−１以下のＫ_ｏｆｆを有する。他の実施態様において、Ｋ_ｏｆｆは５×１０^−５〜１０^−１以下である。他の実施態様において、Ｋ_ｏｆｆは、ここに記載する抗体と実質的に同等である。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、ここに記載する抗体と実質的に同等なＫ_ｏｆｆでＰＤ−Ｌ１に結合する。

親和性パラメータは、当分野で知られる標準法、例えば、ＢＩＡＣＯＲＥを使用して決定し得る。

他の態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１の活性を阻害する抗原結合性タンパク質を提供する。ある実施態様において、抗原結合性タンパク質は、１０００nM以下のＩＣ_５０を有する。他の実施態様において、ＩＣ_５０は１００nM以下であり、他の実施態様において、ＩＣ_５０は１０nM以下である。他の実施態様において、ＩＣ_５０は、ここで実施例に記載する抗体のものと実質的に同等である。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、ここに記載する抗体と実質的に同等なＩＣ_５０でＰＤ−Ｌ１の活性を阻害する。

他の態様において、本発明は、細胞の表面に発現されるヒトＰＤ−Ｌ１に結合し、そのように結合したとき、該細胞表面のＰＤ−Ｌ１量の有意な減少をもたらさずに、該細胞におけるＰＤ−Ｌ１シグナル伝達活性を阻害する、抗原結合性タンパク質を提供する。細胞表面および／または内部のＰＤ−Ｌ１の量を決定または推定するあらゆる方法が使用され得る。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質のＰＤ−Ｌ１発現細胞への結合は、細胞表面ＰＤ−Ｌ１の約７５％、５０％、４０％、３０％、２０％、１５％、１０％、５％、１％または０.１％未満を内在化させる。

他の態様において、本発明は、インビトロまたはインビボ(例えば、ヒト対象に投与したとき)で少なくとも１日の半減期を有する抗原結合性タンパク質を提供する。ある実施態様において、抗原結合性タンパク質は、少なくとも３日の半減期を有する。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、４日以上の半減期を有する。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、８日以上の半減期を有する。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、非誘導体化または非修飾抗原結合性タンパク質と比較して、長い半減期を有するように誘導体化または修飾される。他の実施態様において、抗原結合性タンパク質は、引用により本明細書に包含させるＷＯ００／０９５６０号に記載のような、血清半減期を延長するための１以上の点変異を含む。

本発明は、さらに、多特異的抗原結合性タンパク質、例えば、二特異的抗原結合性タンパク質、例えば、２つの異なる抗原結合部位または領域により、ＰＤ−Ｌ１の２つの異なるエピトープまたはＰＤ−Ｌ１のエピトープと他の分子のエピトープに結合する、抗原結合性タンパク質を提供する。さらに、ここに記載する抗体の１つからのＰＤ−Ｌ１結合部位および、ここに開示する二特異的抗原結合性タンパク質は、他の刊行物を引用してここに開示されるものを含むここに記載する他の抗体からの第二ＰＤ−Ｌ１結合領域を含むことができる。あるいは、二特異的抗原結合性タンパク質は、ここに記載する抗体の１つからの抗原結合部位および当分野で知られる他のＰＤ−Ｌ１抗体または既知方法もしくはここに記載する方法により製造した抗体からの第二抗原結合部位を含み得る。

二特異的抗体を製造する多数の方法が当分野で知られる。このような方法は、Milstein et al., 1983, Nature 305:537に記載のハイブリッド−ハイブリドーマの使用および抗体フラグメントの化学カップリング(Brennan et al., 1985, Science 229:81; Glennie et al., 1987, J. Immunol. 139:2367；米国特許６,０１０,９０２号)を含む。さらに、二特異的抗体は、組み換え手段により、例えばロイシンジッパー部分(すなわち、優先的にヘテロ二量体を形成する、ＦｏｓおよびＪｕｎタンパク質から；Kostelny et al., 1992, J. Immunol. 148:1547)または米国特許５,５８２,９９６号に記載の他の鍵と鍵穴相互作用ドメイン構造の使用により、製造され得る。さらなる有用な技法は、米国特許５,９５９,０８３号および５,８０７,７０６号に記載のものを含む。

他の態様において、抗原結合性タンパク質は、抗体の誘導体を含む。誘導体化抗体は、特定の用途における半減期延長などの、抗体に所望の性質を付与するあらゆる分子または物質を含み得る。誘導体化抗体は、例えば、検出可能(または標識)部分(例えば、放射性、比色、抗原性または酵素分子、検出可能ビーズ(例えば磁気または高電子密度(例えば、金ビーズ))または他の分子に結合する分子(例えば、ビオチンまたはストレプトアビジン)、治療用または診断用部分(例えば、放射性、細胞毒性または薬学的活性部分)または特定の用途(例えば、ヒト対象などの対象への投与または他のインビボまたはインビトロ用途)における抗体の適合性を高める分子を含み得る。抗体の誘導体化に使用され得る分子の例は、アルブミン(例えば、ヒト血清アルブミン)およびポリエチレングリコール(ＰＥＧ)を含む。抗体のアルブミン結合およびペグ化誘導体は、当分野で周知の技法を使用して製造され得る。ある実施態様において、抗体は、トランスサイレチン(ＴＴＲ)またはＴＴＲバリアントにコンジュゲートまたは他の方法で結合される。ＴＴＲまたはＴＴＲバリアントは、例えば、デキストラン、ポリ(ｎ−ビニルピロリドン)、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオールおよびポリビニルアルコールからなる群から選択される化学基で化学修飾され得る。

１以上の抗原結合性タンパク質を含むオリゴマーをＰＤ−Ｌ１アンタゴニストとして用い得る。オリゴマーは、共有結合的に結合したまたは非共有結合的に結合した二量体、三量体または高次オリゴマーの形であり得る。２以上の抗原結合性タンパク質を含むオリゴマーは、使用のために企図され、その一例はホモ二量体である。他のオリゴマーは、ヘテロ二量体、ホモ三量体、ヘテロ三量体、ホモ四量体、ヘテロ四量体などを含む。

ある実施態様は、抗原結合性タンパク質に融合したペプチド部分間の共有結合的または非共有結合的相互作用により連結された複数抗原結合性タンパク質を含むオリゴマーに関する。このようなペプチドは、オリゴマー化を促進する性質を有するペプチドリンカー(スペーサー)またはペプチドであり得る。ロイシンジッパーおよび抗体由来のポリペプチドは、下にさらに詳述するとおり、それに結合した抗原結合性タンパク質のオリゴマー化を促進できるペプチドに包含される。

特定の実施態様において、オリゴマーは、２〜４抗原結合性タンパク質を含む。オリゴマーの抗原結合性タンパク質は、上記の形態の何れか、例えば、バリアントまたはフラグメントなどの任意の形態であり得る。好ましくは、オリゴマーは、ＰＤ−Ｌ１結合活性を有する抗原結合性タンパク質を含む。

ある実施態様において、オリゴマーは、免疫グロブリン由来ポリペプチドを使用して製造される。抗体由来ポリペプチドの種々の部分(Ｆｃドメインを含む)に融合したある異種ポリペプチドを含む融合タンパク質の製造は、例えば、Ashkenazi et al., 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:10535; Byrn et al., 1990, Nature 344:677;およびHollenbaugh et al., 1992 "Construction of Immunoglobulin Fusion Proteins", in Current Protocols in Immunology, Suppl. 4, pages 10.19.1-10.19.11により開示される。

ある実施態様は、抗ＰＤ−Ｌ１抗体のＰＤ−Ｌ１結合フラグメントの、抗体のＦｃ領域への融合により作製した、２融合タンパク質を含む、二量体に関する。二量体は、例えば、融合タンパク質をコードする遺伝子融合体を適切な発現ベクターに導入し、該遺伝子融合体を組み換え発現ベクターで形質転換した宿主細胞で発現させ、発現させた融合タンパク質を抗体分子のように集合させ、次いで鎖間ジスルフィド結合がＦｃ部分間に形成されて、二量体を得ることにより製造され得る。

用語“Ｆｃポリペプチド”は、抗体のＦｃ領域由来の天然およびムテイン形態のポリペプチドを含む。二量体化を促進するヒンジ領域を含むこのようなポリペプチドの切断形態も包含される。Ｆｃ部分を含む融合タンパク質(およびそれから形成されるオリゴマー)は、タンパク質Ａまたはタンパク質Ｇカラムによる親和性クロマトグラフィーによる精製が容易である利点を提供する。

オリゴマー抗原結合性タンパク質を製造する他の方法は、ロイシンジッパーの使用を含む。ロイシンジッパードメインは、それが見られるタンパク質のオリゴマー化を促進するペプチドである。ロイシンジッパーは、最初は数ＤＮＡ結合性タンパク質において同定され(Landschulz et al., 1988, Science 240:1759)、それ以来、多様な種々のタンパク質において発見されている。既知ロイシンジッパーに含まれるのは、二量体化または三量体化する天然に存在するペプチドおよびその誘導体である。可溶性オリゴマータンパク質の産生に適するロイシンジッパードメインの例は、ＷＯ９４／１０３０８号に記載されるものおよびHoppe et al., 1994, FEBS Letters 344:191に記載の肺表面活性タンパク質Ｄ(ＳＰＤ)由来ロイシンジッパーである。融合した異種タンパク質の安定な三量体化を可能にする修飾ロイシンジッパーの使用は、Fanslow et al., 1994, Semin. Immunol. 6:267-78に記載される。ある試みにおいて、ロイシンジッパーペプチドに融合した抗ＰＤ−Ｌ１抗体フラグメントまたは誘導体を含む組み換え融合タンパク質が、適当な宿主細胞で発現され、形成される可溶性オリゴマー抗ＰＤ−Ｌ１抗体フラグメントまたは誘導体が、培養上清から採取される。

ポリペプチドの翻訳後修飾
ある実施態様において、本発明の結合性ポリペプチドは、さらに翻訳後修飾を含み得る。翻訳後タンパク質修飾の例は、リン酸化、アセチル化、メチル化、ＡＤＰリボシル化、ユビキチン化、グリコシル化、カルボニル化、ＳＵＭＯ化、ビオチン化またはポリペプチド側鎖もしくは疎水性基の付加を含む。その結果、修飾可溶性ポリペプチドは、脂質、多または単糖およびリン酸などの非アミノ酸要素を含み得る。グリコシル化の好ましい形態は、１以上のシアル酸部分をポリペプチドにコンジュゲートさせるシアリル化である。シアル酸部分は、溶解度および血清半減期を改善し、同時にまたタンパク質のあり得る免疫原性を低減させる。Raju et al. Biochemistry. 2001 31; 40(30):8868-76参照。ポリペプチドの機能性に対するこのような非アミノ酸要素の効果は、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−１機能におけるその拮抗性の役割、例えば、血管形成または腫瘍増殖に対するその阻害性効果について試験され得る。

ある特定の実施態様において、修飾形態の対象可溶性ポリペプチドは、対象可溶性ポリペプチドの非タンパク質性ポリマーへの結合を含む。ある特定の実施態様において、ポリマーは、米国特許４,６４０,８３５号、４,４９６,６８９号、４,３０１,１４４号、４,６７０,４１７号、４,７９１,１９２号または４,１７９,３３７号に示される方法における、ポリエチレングリコール(“ＰＥＧ”)、ポリプロピレングリコールまたはポリオキシアルキレンである。

ＰＥＧは、市販のまたは当分野で周知の方法によるエチレングリコールの開環重合により製造できる水可溶性ポリマーでる(Sandler and Karo, Polymer Synthesis, Academic Press, New York, Vol. 3, pages 138-161)。用語“ＰＥＧ”は、サイズまたはＰＥＧ末端への修飾と無関係に、あらゆるポリエチレングリコール分子を包含するように広義に使用され、式：Ｘ−Ｏ(ＣＨ_２ＣＨ_２Ｏ)_ｎ−ＣＨ_２ＣＨ_２ＯＨ (１)(式中、ｎは２０〜２３００であり、ＸはＨまたは末端修飾、例えば、Ｃ_１−４アルキルである)により表すことができる。ある実施態様において、本発明のＰＥＧは、一端がヒドロキシまたはメトキシで終わり、すなわち、ＸはＨまたはＣＨ_３(“メトキシＰＥＧ”)である。ＰＥＧは、結合反応に必要な、分子の化学合成に由来するまたは分子の複数部分の最適距離のためのスペーサーである、さらなる化学基を含んでよい。さらに、このようなＰＥＧは、結合して一体となる、１以上のＰＥＧ側鎖からなり得る。１を超えるＰＥＧ鎖を有するＰＥＧは、ここでは分岐または分枝ＰＥＧと称する。分枝ＰＥＧは、例えば、ポリエチレンオキシドの、グリセロール、ペンタエリトリトールおよびソルビトールを含む種々のポリオールへの結合により製造され得る。例えば、４アーム分枝ＰＥＧは、ペンタエリトリトールおよびエチレンオキシドから製造され得る。分枝ＰＥＧは、例えば、ＥＰ−Ａ０４７３０８４号および米国特許５,９３２,４６２号に記載される。ＰＥＧの一形態は、リシンの一級アミノ基により結合した２ＰＥＧ側鎖(ＰＥＧ２)を含む(Monfardini et al., Bioconjugate Chem. 6 (1995) 62-69)。

ＰＥＧは周知であるが、我々の知る限り、ペグ化^１０Ｆｎ３ポリペプチドがペグ化でき、リガンド結合活性を保持することを証明したのは初めてである。好ましい実施態様において、ペグ化^１０Ｆｎ３ポリペプチドを、部位特異的ペグ化により、特にＰＥＧのシステイン部分へのＮまたはＣ末端でのコンジュゲーションにより製造する。従って、本発明は、薬物動態が改善した標的結合^１０Ｆｎ３ポリペプチドを提供し、該ポリペプチドは、約８０〜約１５０アミノ酸の^１０Ｆｎ３ドメイン(ここで、該^１０Ｆｎ３ドメインのループの少なくとも１つが標的結合に参加する)および共有結合的に結合したＰＥＧ部分を含み、ここで、該^１０Ｆｎ３ポリペプチドは、哺乳動物において１００nM未満のＫ_Ｄで標的に結合し、３０mL／時間／kg未満のクリアランス速度を有する。ＰＥＧ部分は、Ｃｙｓ残基への結合によるなどの部位特異的ペグ化により^１０Ｆｎ３ポリペプチドに結合でき、ここで、Ｃｙｓ残基は^１０Ｆｎ３ポリペプチドのＮ末端またはＮ末端と最Ｎ末端ベータもしくはベータ様鎖の間または^１０Ｆｎ３ポリペプチドのＣ末端またはＣ末端と最Ｃ末端ベータもしくはベータ様鎖の間に位置してよい。Ｃｙｓ残基は同様に他の位置に、特に標的結合に参加しないループの何れかに配置してよい。ＰＥＧ部分はまたアミンへのコンジュゲーションによるものを含む、他の化学により結合させてもよい。

ペプチドまたはタンパク質へのＰＥＧコンジュゲーションは、一般にＰＥＧの活性化および活性化ＰＥＧ中間体の標的タンパク質／ペプチドへの直接のまたは、その後活性化され、標的タンパク質／ペプチドに結合されるリンカーへの、カップリングを含む(Abuchowski et al., J. Biol. Chem., 252, 3571 (1977)およびJ. Biol. Chem., 252, 3582 (1977), Zalipsky, et al.ならびにHarris et. al., in: Poly(ethylene glycol) Chemistry: Biotechnical and Biomedical Applications; (J. M. Harris ed.) Plenum Press: New York, 1992; Chap.21 and 22参照)。ＰＥＧ分子を含む結合性ポリペプチドはまたコンジュゲートタンパク質としても知られ、一方結合したＰＥＧ分子がないタンパク質は、非コンジュゲートと称することがある。

ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドへのコンジュゲートのために、例えば、約１,０００ダルトン(Da)〜１００,０００Da(ｎは２０〜２３００である)の、多様な分子量形態のＰＥＧが選択され得る。ＰＥＧの反復単位数“ｎ”は、ダルトンで記載する分子量の概算である。活性化リンカー上のＰＥＧの合算分子量が医薬用途に適することが好ましい。それ故に、ある実施態様において、ＰＥＧ分子の分子量は１００,０００Daを超えない。例えば、リンカーに３ＰＥＧ分子が結合するならば、各ＰＥＧ分子が１２,０００Da(各ｎは約２７０)の分子量を有するならば、リンカー上のＰＥＧの総分子量は約３６,０００Da(総ｎは約８２０)である。リンカーに結合するＰＥＧの分子量は異なってもよく、例えば、リンカー上の３分子のうち、２ＰＥＧ分子が各５,０００Da(各ｎは約１１０)であり、１ＰＥＧ分子は１２,０００Da(ｎは約２７０)であってよい。

本発明の特定の実施態様において、ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドは、式：−ＣＯ−(ＣＨ_２)_ｘ−(ＯＣＨ_２ＣＨ_２)_ｍ−ＯＲの１つのポリ(エチレングリコール)に共有結合的に結合し、ポリ(エチレングリコール)基の−ＣＯ(すなわちカルボニル)は、結合性ポリペプチドのアミノ基の１つとアミド結合を形成し、Ｒは低級アルキルであり、ｘは２または３であり、ｍは約４５０〜約９５０であり、ｎおよびｍは、コンジュゲートから結合性ポリペプチドを減じた分子量が約１０〜４０kDaになるように選択される。ある実施態様において、結合性ポリペプチドのリシンの６−アミノ基は、利用可能な(遊離)アミノ基である。

上記コンジュゲートは、より具体的に式(II)：Ｐ−ＮＨＣＯ−(ＣＨ_２)_ｘ−(ＯＣＨ_２ＣＨ_２)_ｍ−ＯＲ (II)(式中、Ｐはここに記載する結合性ポリペプチドの基である、すなわち式(II)に示されるカルボニルとアミド結合を形成する１以上のアミノ基がなく、Ｒは低級アルキルであり、ｘは２または３であり、ｍは約４５０〜約９５０であり、コンジュゲートから結合性ポリペプチドを減じた分子量が約１０〜約４０kDaになるように選択される)により表され得る。ここで使用する、“ｍ”の記載する範囲は、配向性の意味を有する。“ｍ”の範囲は何れの場合も、そして厳密に、ＰＥＧ基の分子量により決定される。

当業者は、例えば、ペグ化結合性ポリペプチドがどのように治療的に使用されるか、所望の投与量、循環時間、タンパク質分解に対する抵抗性、免疫原性および他の考察に基づき、ＰＥＧの適当な分子質量を選択できる。ＰＥＧおよびタンパク質の性質を増強するためのその使用の検討について、Katre, Advanced Drug Delivery Reviews 10: 91-114 (1993)を参照のこと。

ある実施態様において、ＰＥＧ分子を活性化させて、リシンなどの結合性ポリペプチド上のアミノ基と反応させ得る(Bencham et al., Anal. Biochem., 131, 25 (1983); Veronese et al., Appl. Biochem., 11, 141 (1985).; Zalipsky et al., Polymeric Drugs and Drug Delivery Systems, adrs 9-110 ACS Symposium Series 469 (1999); Zalipsky et al., Europ. Polym. J., 19, 1177-1183 (1983); Delgado et al., Biotechnology and Applied Biochemistry, 12, 119-128 (1990))。

ある特定の実施態様において、ＰＥＧの炭酸エステルを使用して、ＰＥＧ結合性ポリペプチドコンジュゲートを形成する。Ｎ,Ｎ’−ジスクシンイミジルカーボネート(ＤＳＣ)を、ＰＥＧとの反応に使用して、活性混合型ＰＥＧ−スクシンイミジルカーボネートを形成でき、これをその後リンカーの求核性基または結合性ポリペプチドのアミノ基と反応させ得る(米国特許５,２８１,６９８号および５,９３２,４６２号参照)。類似タイプの反応において、１,１’−(ジベンゾトリアゾリル)カーボネートおよびジ−(２−ピリジル)カーボネートをＰＥＧと反応させて、それぞれ、ＰＥＧ−ベンゾトリアゾリルおよびＰＥＧ−ピリジル混合型カーボネート(米国特許５,３８２,６５７)を形成し得る。

^１０Ｆｎ３ポリペプチドのペグ化を、最先端の方法により、例えば結合性ポリペプチドと求電子的に活性なＰＥＧ(供給者：Shearwater Corp., USA, www.shearwatercorp.com)の反応により、実施できる。本発明の好ましいＰＥＧ剤は、例えば、Ｎ−ヒドロキシスクシンイミジルプロピオネート(ＰＥＧ−ＳＰＡ)、ブタノエート(ＰＥＧ−ＳＢＡ)、ＰＥＧ−スクシンイミジルプロピオネートまたは分枝Ｎ−ヒドロキシスクシンイミド、例えば、ｍＰＥＧ２−ＮＨＳである(Monfardini et al., Bioconjugate Chem. 6 (1995) 62-69)。このような方法を使用して、結合性ポリペプチドのリシンのｆ−アミノ基または結合性ポリペプチドのＮ末端アミノ基でペグ化し得る。

他の実施態様において、ＰＥＧ分子を、結合性ポリペプチドのスルフヒドリル基と結合させ得る(Sartore et al., Appl. Biochem. Biotechnol., 27, 45 (1991); Morpurgo et al., Biocon. Chem., 7, 363-368 (1996); Goodson et al., Bio/Technology (1990) 8, 343；米国特許５,７６６,８９７号)。米国特許６,６１０,２８１号および５,７６６,８９７号は、スルフヒドリル基に結合し得る反応性ＰＥＧ種の例を記載する。

ＰＥＧ分子が結合性ポリペプチドのシステイン残基にコンジュゲートするある実施態様において、システイン残基は元々結合性ポリペプチドにあり、一方他の実施態様において、１以上のシステイン残基は、結合性ポリペプチドに形成される。変異を結合性ポリペプチドコード配列に導入して、システイン残基を形成し得る。これは、例えば、１以上のアミノ酸残基のシステインへの変異により達成される。システイン残基に変異するための好ましいアミノ酸は、セリン残基、スレオニン残基、アラニン残基および他の親水性残基を含む。好ましくは、システインに変異させる残基は、表面露出残基である。一次配列またはタンパク質に基づく残基の表面アクセシビリティを予測するためのアルゴリズムは、当分野で周知である。あるいは、表面残基は、結合性ポリペプチドが設計され、展開されているフレームワークの結晶構造が解明されたならば、結合性ポリペプチドのアミノ酸配列との比較により予測でき(Himanen et al., Nature. (2001) 20-27; 414(6866):933-8)、そうして、表面露出残基が決定される。ある実施態様において、システイン残基は、Ｎおよび／またはＣ末端またはその近辺またはループ領域内で結合性ポリペプチドに導入される。

ある実施態様において、ペグ化結合性ポリペプチドは、Ｎ末端アミノ酸のアルファアミノ基に共有結合的に結合したＰＥＧ分子を含む。部位特異的Ｎ末端還元的アミノ化は、Pepinsky et al., (2001) JPET, 297, 1059および米国特許５,８２４,７８４号に記載される。他の利用可能な求核性アミノ基を利用する、タンパク質の還元的アミノ化のためのＰＥＧ−アルデヒドの使用は、米国特許４,００２,５３１号、Wieder et al., (1979) J. Biol. Chem. 254,12579およびChamow et al., (1994) Bioconjugate Chem. 5, 133に記載される。

他の実施態様において、ペグ化結合性ポリペプチドは、リンカーに共有結合的に結合した１以上のＰＥＧ分子を含み、当該リンカーが次に結合性ポリペプチドのＮ末端でアミノ酸残基のアルファアミノ基に結合する。このような試みは、米国特許公開２００２／００４４９２１号およびＷＯ０９４／０１４５１号に開示される。

ある実施態様において、結合性ポリペプチドは、Ｃ末端でペグ化される。特定の実施態様において、タンパク質は、Ｃ末端アジド−メチオニンの導入および引き続くシュタウディンガー反応によるメチル−ＰＥＧ−トリアリールホスフィン化合物のコンジュゲーションにより、Ｃ末端でペグ化される。このＣ末端コンジュゲーション方法は、Cazalis et al., Bioconjug. Chem. 2004; 15(5):1005-1009に記載される。

結合性ポリペプチドのモノペグ化はまたＷＯ９４／０１４５１号に記載の一般法によっても行い得る。ＷＯ９４／０１４５１号は、修飾末端アミノ酸アルファ−炭素反応性基を有する組み換えポリペプチドを製造する方法を記載する。該方法の工程は、組み換えポリペプチドの形成およびＮ末端アルファ−アミンおよびＣ末端アルファ−カルボキシルでの１以上の生物学的に付加された保護基での保護を含む。次いで、ポリペプチドを化学保護剤と反応させて、反応性側鎖基を選択的に保護し、それにより側鎖基が修飾されるのを阻止する。次いで、ポリペプチドを、生物学的保護基に特異的な開裂剤で開裂し、非保護末端アミノ酸アルファ−炭素反応性基を形成する。非保護末端アミノ酸アルファ−炭素反応性基を、化学修飾剤で修飾する。次いで、側鎖保護された末端修飾された単一コピーポリペプチドを側鎖基で脱保護して、末端修飾された組み換え単一コピーポリペプチドを形成する。本方法の工程の数および順番は、ポリペプチドのＮおよび／またはＣ末端アミノ酸での選択的修飾を達成するために変わり得る。

コンジュゲーション反応における結合性ポリペプチド対活性化ＰＥＧの比は、約１：０.５〜１：５０、約１：１〜１：３０または約１：５〜１：１５であり得る。種々の水性緩衝液を本方法において使用して、結合性ポリペプチドへのＰＥＧの共有結合的付加を触媒し得る。ある実施態様において、使用する緩衝液のｐＨは約７.０〜９.０である。他の実施態様において、ｐＨは、わずかに塩基性の範囲、例えば、約７.５〜８.５である。中性ｐＨ範囲に近いｐＫａを有する緩衝液、例えば、リン酸緩衝液を使用し得る。

サイズ排除(例えばゲル濾過)およびイオン交換クロマトグラフィーなどの当分野で知られる慣用の分離および精製技法をペグ化結合性ポリペプチドの精製に使用できる。生成物を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥを使用して分離してもよい。分離され得る生成物は、モノ−、ジ−、トリ−、ポリ−および非ペグ化結合性ポリペプチド、ならびに遊離ＰＥＧを含む。モノ−ＰＥＧコンジュゲートのパーセンテージを、組成物のモノ−ＰＥＧのパーセンテージを増加させるように、溶出ピーク近辺の広い画分を貯留することにより制御することができる。約９０パーセントのモノ−ＰＥＧコンジュゲートが収率と活性の良好なバランスを表す。例えば、コンジュゲートの、少なくとも９２パーセントまたは少なくとも９６パーセントがモノ−ＰＥＧ種である組成物が望まれ得る。本発明のある実施態様において、モノ−ＰＥＧコンジュゲートのパーセンテージは９０パーセント〜９６パーセントである。

ある実施態様において、本発明のペグ化結合性ポリペプチドは、１、２またはそれ以上のＰＥＧ部分を含む。ある実施態様において、ＰＥＧ部分は、タンパク質の表面上のおよび／または標的リガンドと接触する表面から離れているアミノ酸残基に結合する。ある実施態様において、ＰＥＧ結合性ポリペプチドにおけるＰＥＧの合算または総分子質量は、約３,０００Da〜６０,０００Da、所望により約１０,０００Da〜３６,０００Daである。ある実施態様において、ペグ化結合性ポリペプチドにおけるＰＥＧは、実質的に直線状の、直鎖ＰＥＧである。

ある実施態様において、ペグ化結合性ポリペプチドにおけるＰＥＧは、ヒドロキシルアミンアッセイ、例えば、８〜１６時間にわたる、室温での４５０mM ヒドロキシルアミン(ｐＨ６.５)を使用してペグ化アミノ酸残基から加水分解されず、それ故に、安定である。ある実施態様において、組成物の８０％超、より好ましくは少なくとも９０％、最も好ましくは少なくとも９５％が安定なモノ−ＰＥＧ結合性ポリペプチドである。

他の実施態様において、本発明のペグ化結合性ポリペプチドは、好ましくは非修飾タンパク質に関連する生物活性の少なくとも２５％、５０％、６０％、７０％、８０％、８５％、９０％、９５％または１００％を保持する。ある実施態様において、生物活性は、Ｋ_Ｄ、ｋ_ｏｎまたはｋ_ｏｆｆにより評価される、ＰＤ−Ｌ１に結合するその能力をいう。ある特定の実施態様において、ペグ化結合性ポリペプチドタンパク質は、非ペグ化結合性ポリペプチドと比較して、ＰＤ−Ｌ１への結合の増加を示す。

ＰＥＧ修飾ポリペプチドの血清クリアランス速度は、非修飾結合性ポリペプチドのクリアランス速度と比較して、約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％または９０％さえも減少され得る。ＰＥＧ修飾ポリペプチは、非修飾タンパク質の半減期に対して増強された半減期(ｔ_１／２)を有し得る。ＰＥＧ結合性ポリペプチドの半減期は、非修飾結合性ポリペプチドの半減期に対して、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１２５％、１５０％、１７５％、２００％、２５０％、３００％、４００％または５００％または１０００％さえも増強され得る。ある実施態様において、タンパク質半減期を、緩衝化食塩水溶液または血清などのインビトロで決定する。他の実施態様において、タンパク質半減期は、動物の血清または他の体液における該タンパク質の半減期などのインビボ半減期である。

治療方法、製剤および投与方式
ここに提供されるある方法は、ＰＤ−Ｌ１結合抗原結合性タンパク質を対象に投与し、それにより特定の状態において役割を有するＰＤ−Ｌ１誘発生物学的応答を低減することを含む。特定の実施態様において、本発明の方法は、内因性ＰＤ−Ｌ１とＰＤ−Ｌ１結合抗原結合性タンパク質を、例えば、対象への投与またはエクスビボ手法により接触させることを含む。

用語“処置”は、少なくとも１症状または障害の他の態様の軽減または予防または疾患重症度の低減などを包含する。抗原結合性タンパク質は、価値ある治療剤を構成するために、疾患の全ての症状または徴候の完全治癒または根絶に効果がある必要はない。関連分野において認識されるとおり、治療剤として用いられる薬物は、ある疾患状態の重症度を低減させ得るが、有用な治療剤として認識されるために疾患の全ての徴候を消失させる必要はない。同様に、予防的に投与される処置は、価値ある予防剤を構成するために、状態の発症予防に完全に有効である必要はない。単なる疾患の影響の低減(例えば、症状の数または重症度の低減または他の処置の有効性の増加または他の有益な効果の発生による)または対象において疾患が生じるまたは悪化する可能性の低減が十分である。本発明のある実施態様は、特定の障害の重症度を反映する指標のベースラインを超える持続性の改善を誘発するのに十分な、量および時間、患者にＰＤ−Ｌ１アンタゴニストを投与することを含む、方法に関する。

本発明は、ＰＤ−Ｌ１生物活性の阻害に応答する状態を処置するまたは前駆状態を予防する方法に関する。好ましい例は、炎症または細胞過増殖により特徴付けられる状態である。投与のための技法および投与量は、特定のポリペプチドおよび処置する特定の状態のタイプにより変わるが、当業者により容易に決定され得る。一般に、規制当局は、治療剤として使用されるタンパク質剤は、容認できる低レベルの発熱物質を有するように製剤されることを要求する。従って、治療製剤は、一般に実質的に発熱物質を含まないまたは少なくとも適切な規制当局(例えば、ＦＤＡ)により決定される許容されるレベルを超える発熱物質を含まない点で、他の製剤と区別される。

関連分野において理解されるとおり、本発明の抗体およびそのフラグメントを含む医薬組成物は、適応症に適する方式で対象に投与される。それ故に、本発明は、ここに開示する抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはフラグメント)および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物を含む。

医薬組成物は、非経腸的、局所的または吸入を含むが、これらに限定されない任意の適当な技法により投与され得る。注射ならば、医薬組成物は、例えば、関節内、静脈内、筋肉内、病巣内、腹腔内または皮下経路により、ボーラス注射または連続点滴により投与され得る。経皮送達およびインプラントからの持続的放出におけるような、例えば疾患または傷害の部位への、局在型投与が企図される。吸入による送達は、例えば、経鼻または経口吸入、ネブライザーの使用、エアロゾル形態のアンタゴニストの吸入などを含む。他の選択肢は、点眼、丸剤、シロップ剤、ロゼンジ剤またはチューインガム剤を含む経口製剤ならびにローション剤、ゲル剤、スプレー剤および軟膏剤などの局所製剤を含む。

有利には、抗原結合性タンパク質は、生理学的に許容される担体、添加物または希釈剤などの１以上の付加的成分を含む組成物の形態で投与される。所望により、組成物は、１以上の生理学的活性剤、例えば、第二の炎症または免疫阻害性物質、抗血管形成物質、鎮痛物質などをさらに含み、その非排他的例は、ここに提供される。種々の特定の実施態様において、組成物は、ＰＤ−Ｌ１結合抗原結合性タンパク質に加えて、１、２、３、４、５または６の生理学的活性剤を含む。

本発明の治療組成物を、薬学的に許容される希釈剤、担体または添加物と共に、単位剤形で投与し得る。投与は、非限定的例として、非経腸(例えば、静脈内、皮下)、経口または局所であり得る。さらに、患者の細胞のエクスビボ操作を含む、ネイキッドＤＮＡ送達、組み換え遺伝子およびベクター、細胞ベースの送達など、本発明のポリペプチドをコードする核酸を使用する任意の遺伝子療法技法を用いてよい。

組成物は、経口投与用丸剤、錠剤、カプセル剤、液体または持続的放出錠剤または静脈内、皮下または非経腸投与用液体、局所投与用ゲル剤、ローション剤、軟膏、クリーム剤またはポリマーもしくは他の持続的放出媒体の形であり得る。

製剤を製造するための当分野で周知の方法は、例えば、"Remington: The Science and Practice of Pharmacy" (20th ed., ed. A. R. Gennaro A R., 2000, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia, PA)に見ることができる。非経腸投与用製剤は、例えば、添加物、無菌水、食塩水、ポリエチレングリコールなどのポリアルキレングリコール、植物起源油または水素化ナフタレンを含み得る。生体適合性、生分解性ラクチドポリマー、ラクチド／グリコリドコポリマーまたはポリオキシエチレン−ポリオキシプロピレンコポリマーを、化合物の放出制御のために使用し得る。ナノ粒子製剤(例えば、生分解性ナノ粒子、固形脂質ナノ粒子、リポソーム)を、化合物の体内分布制御に使用し得る。他の有用な可能性のある非経腸送達系は、エチレン−酢酸ビニルコポリマー粒子、浸透圧ポンプ、植込み型注入システムおよびリポソームを含む。製剤中の化合物の濃度は、投与すべき薬物の投与量および投与経路を含む、多数の因子により変わる。

ポリペプチドは、所望により、医薬品産業において一般に使用される非毒性酸付加塩などの薬学的に許容される塩または金属錯体として投与され得る。酸付加塩の例は、酢酸、乳酸、パモ酸、マレイン酸、クエン酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、コハク酸、安息香酸、パルミチン酸、スベリン酸、サリチル酸、酒石酸、メタンスルホン酸、トルエンスルホンまたはトリフルオロ酢酸などの有機酸、タンニン酸、カルボキシメチルセルロースなどのポリマー酸および塩酸、臭化水素酸、硫酸リン酸などの無機酸を含む。金属錯体は、亜鉛、鉄などを含む。一例において、ポリペプチドを、熱安定性を高めるために、酢酸ナトリウム存在下製剤する。

経口使用のための製剤は、非毒性で薬学的に許容される添加物との混合物で活性成分を含む錠剤を含む。これらの添加物は、例えば、不活性希釈剤または充填剤(例えば、スクロースおよびソルビトール)、滑沢剤、流動性促進剤および抗接着剤(例えば、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸亜鉛、ステアリン酸、シリカ、水素化植物油またはタルク)であり得る。経口使用のための製剤はまた咀嚼錠剤または活性成分が不活性固形希釈剤と混合されている硬ゼラチンカプセル剤または活性成分が水または油媒体と混合されている軟ゼラチンカプセル剤としても提供されてよい。

治療有効用量は、投与されたものに対して治療効果を生じる用量をいう。正確な用量は、処置する障害により、既知技法を使用して当業者により確認され得る。一般に、ポリペプチドは、１日あたり約０.０１μg／kg〜約５０mg／kg、好ましくは１日あたり０.０１mg／kg〜約３０mg／kg、最も好ましくは１日あたり０.１mg／kg〜約２０mg／kg投与される。ポリペプチドは、毎日(例えば、１日１回、２回、３回または４回)または好ましくは低頻度(例えば、毎週、２週毎、３週毎、毎月または四半期毎)で投与され得る。さらに、当分野において知られるとおり、年齢ならびに体重、一般的健康状態、性別、食習慣、投与の時間、薬物相互作用および疾患の重症度に対する調整が必要であり得るが、当業者により日常的実験により確認可能である。

ここに記載するＰＤ−Ｌ１結合性タンパク質およびその関連バリアントは、多数の治療および診断適用において有用である。これらは、ＰＤ−Ｌ１への結合の競合または遮断によるＰＤ−Ｌ１の生物活性の阻害ならびに細胞、好ましくは細胞発現ＰＤ−Ｌ１への細胞毒性または造影部分の送達を含む。これらの分子の小さなサイズおよび安定な構造が、薬物の製造、迅速なクリアランスが望まれるある適用について体からの迅速なクリアランスまたはこのような特徴を有する分子を使用して適するまたは改善される新規送達系への製剤に関して、特に価値がある。

ある態様において、本発明は、対象を処置する方法を提供する。方法は、例えば、対象に一般に健康によい効果を有し、例えば、対象の余命を延長できる。あるいは、方法は、疾患、障害、状態または病気(“状態”)を、例えば、処置、予防、治癒、緩和または改善する。処置される状態は、ＰＤ−Ｌ１の不適切な発現または活性により特徴付けられる状態を含む。このような状態の一部において、発現または活性レベルは高過ぎ、処置は、ここに記載するＰＤ−Ｌ１アンタゴニストの投与を含む。障害または状態は癌関連である。特に、これらの癌は、肺、卵巣および結腸癌および種々の骨髄腫を含むが、これらに限定されない。

本発明の抗原結合性タンパク質で処置可能または予防可能な特定の医学的状態および疾患は種々の癌を含む。

ＰＤ−Ｌ１の生物活性の阻害剤としての有効性に基づき、本発明のポリペプチドは、多数の癌状態ならびに胸水および腹水などの癌に起因する合併症に対して有効である。好ましくは、本発明のＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドを、過増殖性疾患または癌および癌の転移拡散の処置または予防に使用できる。本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体の好ましい適応症は、結腸直腸癌、頭頸部癌、小細胞肺癌、非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ)および膵臓癌を含む。癌の非限定的例は、膀胱、血液、骨、脳、乳房、軟骨、結腸腎臓、肝臓、肺、リンパ節、神経組織、卵巣、膵臓、前立腺、骨格筋、皮膚、脊髄、脾臓、胃、精巣、胸腺、甲状腺、気管、泌尿生殖路、輸尿管、尿道、子宮または膣の癌を含む。ある実施態様において、処置される癌は、卵巣癌、結腸癌、乳癌または肝臓癌、骨髄腫、神経芽細胞由来ＣＮＳ腫瘍、単球性白血病、Ｂ細胞由来白血病、Ｔ細胞由来白血病、Ｂ細胞由来リンパ腫、Ｔ細胞由来リンパ腫、肥満細胞由来腫瘍およびこれらの任意の組み合わせから選択される。

ある実施態様において、処置される哺乳動物の広範囲の癌は、卵巣、結腸、乳房、肺癌、骨髄腫、神経芽細胞由来ＣＮＳ腫瘍、単球性白血病、Ｂ細胞由来白血病、Ｔ細胞由来白血病、Ｂ細胞由来リンパ腫、Ｔ細胞由来リンパ腫、肥満細胞由来腫瘍およびこれらの組み合わせからなる群から選択される。好ましくは、自己免疫性疾患または炎症性疾患は、腸粘膜炎症、大腸炎と関連する消耗性疾患、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、ウイルス感染症、リウマチ性関節炎、骨関節症、乾癬、クローン病および炎症性腸疾患からなる群から選択される。

さらに、種々の炎症性障害が、ここに開示する本発明の抗ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドにより処置され得る。このような炎症性障害は、例えば、大腸炎と関連する腸粘膜炎症消耗性疾患、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、ウイルス感染症、リウマチ性関節炎、骨関節症、乾癬およびクローン病を含む。

エクスビボ手法における抗原結合性タンパク質使用も企図される。例えば、患者の血液または他の体液を、エクスビボでＰＤ−Ｌ１に結合する抗原結合性タンパク質と接触させ得る。抗原結合性タンパク質は、適当な不溶性マトリクスまたは固形支持材に結合され得る。

ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドは単独でまたは化学療法、放射線療法、免疫療法、外科的処置またはこれらの任意の組み合わせなどの１以上の付加的治療剤と組み合わせて投与できる。長期治療は、上記の他の処置戦略におけるアジュバント治療と同様に可能である。

他の実施態様において、方法は、ここに記載するＰＤ−Ｌ１アンタゴニストの１以上および１以上の他の処置(例えば、治療的または対症的処置)の投与を含む。方法が対象への１を超える処置の投与を含むとき、投与の順番、タイミング、数、濃度および体積は、医学的要求および処置の制限によってのみ制限され、すなわち、２処置は、対象に、例えば、同時に、一緒に、交互にまたは任意の他のレジメンによって投与してよい。

それ故に、他の態様において、本発明は、ＰＤ−Ｌ１阻害性抗原結合性タンパク質および１以上の他の処置で対象を処置する方法を提供する。ある実施態様において、このような組み合わせ治療は、例えば、腫瘍における複数部位または分子標的の攻撃により、相乗的または相加的効果を達成する。本発明に関連して使用し得る組み合わせ治療のタイプは、単一疾患関連経路における複数節、標的細胞における複数経路および標的組織内の複数細胞型の阻害または活性化(適当ならば)を含む。

他の実施態様において、組み合わせ治療方法は、対象に２、３、４、５、６またはそれ
以上のここに記載するＰＤ−Ｌ１アゴニストまたはアンタゴニストを投与することを含む。他の実施態様において、方法は、対象に、一体となってＰＤ−Ｌ１介在シグナル伝達を阻害または活性化(直接的または間接的)する２以上の処置を投与することを含む。このような方法の例は、２以上のＰＤ−Ｌ１阻害性抗原結合性タンパク質、ＰＤ−Ｌ１阻害性抗原結合性タンパク質と１以上の抗癌性質(例えば、細胞毒性剤および／または免疫調節剤)を有する他の治療部分またはＰＤ−Ｌ１阻害性抗原結合性タンパク質と１以上の他の処置(例えば、手術または放射線照射)の組み合わせの使用を含む。さらに、１以上の抗ＰＤ−Ｌ１抗体または抗体誘導体を、１以上の分子または他の処置と組み合わせて使用でき、ここで、他の分子および／または処置はＰＤ−Ｌ１に直接結合または影響しないが、この組み合わせは、処置される状態の処置または予防に有効である。ある実施態様において、分子および／または処置の１以上は、治療の間に他の分子または処置の１以上により引き起こされる状態、例えば、悪心、疲労、脱毛症、カヘキシー、不眠症などを処置または予防する。分子および／または他の処置の組み合わせが使用される全ての場合において、個々の分子および／または処置は、任意の期間にわたり、例えば、同時、一緒または交互の、有効である任意の順番で投与できる。ある実施態様において、処置の方法は、二回目の処置の開始前の、ある分子または他の処置での初回の処置の完了を含む。初回の処置の終わりから二回目の処置の開始までの期間の長さは、治療の総経過を有効とする任意の期間、例えば、秒、分、時間、日、週、月または年でさえあり得る。

ある実施態様において、本発明の対象抗ＰＤ−Ｌ１抗体剤は、単独で使用され得る。あるいは、対象剤を、増殖性障害(例えば、腫瘍)の処置または予防に対する他の慣用の抗癌治療法と組み合わせて使用し得る。例えば、このような方法を、予防的癌阻止、手術後の癌再発および転移予防および他の慣用の癌治療のアジュバントとして使用し得る。本発明は、慣用の癌治療(例えば、化学療法、放射線照射治療、光線療法、免疫療法および手術)の有効性は、対象ポリペプチド治療剤の使用により増強され得ることを認める。

このような方法のある実施態様において、１以上のポリペプチド治療剤を、一緒に(同時に)または異なる時に(逐次的に)投与してよい。さらに、ポリペプチド治療剤を、癌処置または血管形成阻害のための他のタイプの化合物と投与してよい。

幅広い慣用の化合物が、抗新生物活性を有することが示されている。これらの化合物は、固形腫瘍退縮、転移およびさらなる増殖阻止または白血病または骨髄悪性腫瘍における悪性細胞数減少のための化学療法における医薬として使用されている。化学療法は、種々のタイプの悪性腫瘍の処置に有効であるが、多くの抗新生物化合物は、望ましくない副作用を誘発する。２以上の異なる処置を組み合わせたとき、これら処置は、相乗的に働き、各処置の投与量の減少を可能にし、それにより高投与量で各化合物により生じる有害副作用を減少することが示されている。他の例において、ある処置に難治性である悪性腫瘍は、２以上の異なる処置の組み合わせ治療に応答し得る。

本発明のポリペプチド治療剤を他の慣用の抗新生物剤と組み合わせて、同時にまたは逐次的に投与したとき、このような治療剤は、抗新生物剤の治療効果を増強するかまたはこのような抗新生物剤に対する細胞耐性を克服することが見られ得る。これは、抗新生物剤の投与量を減少させ、それにより望ましくない副作用を減少するかまたは耐性細胞に対する抗新生物剤の有効性を回復させることを可能とする。

組み合わせ抗腫瘍治療に使用し得る医薬化合物は、単なる例として、アミノグルテチミド、アムサクリン、アナストロゾール、アスパラギナーゼ、ｂｃｇ、ビカルタミド、ブレオマイシン、ブセレリン、ブスルファン、カンプトテシン、カペシタビン、カルボプラチン、カルムスチン、クロラムブシル、シスプラチン、クラドリビン、クロドロン酸、コルヒチン、シクロホスファミド、シプロテロン、シタラビン、ダカルバジン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ジエネストロール、ジエチルスチルベストロール、ドセタキセル、ドキソルビシン、エピルビシン、エストラジオール、エストラムスチン、エトポシド、エキセメスタン、フィルグラスチム、フルダラビン、フルドロコルチゾン、フルオロウラシル、フルオキシメステロン、フルタミド、ゲムシタビン、ゲニステイン、ゴセレリン、ヒドロキシ尿素、イダルビシン、イホスファミド、イマチニブ、インターフェロン、イリノテカン、イリノテカン、レトロゾール、ロイコボリン、リュープロリド、レバミソール、ロムスチン、メクロレタミン、メドロキシプロゲステロン、メゲストロール、メルファラン、メルカプトプリン、メスナ、メトトレキサート、マイトマイシン、ミトタン、ミトキサントロン、ニルタミド、ノコダゾール、オクトレオチド、オキサリプラチン、パクリタキセル、パミドロン酸、ペントスタチン、プリカマイシン、ポルフィマー、プロカルバジン、ラルチトレキセド、リツキシマブ、ストレプトゾシン、スラミン、タモキシフェン、テモゾロミド、テニポシド、テストステロン、チオグアニン、チオテパ、チタノセンジクロリド、トポテカン、トラスツズマブ、トレチノイン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシンおよびビノレルビンを含む。

ある化学療法抗腫瘍化合物は、作用機序により、例えば、次の群に分類され得る。ピリミジンアナログ(５−フルオロウラシル、フロクスウリジン、カペシタビン、ゲムシタビンおよびシタラビン)およびプリンアナログ、葉酸アンタゴニストおよび関連阻害剤(メルカプトプリン、チオグアニン、ペントスタチンおよび２−クロロデオキシアデノシン(クラドリビン))などの代謝拮抗剤／抗癌剤；ビンカアルカロイド(ビンブラスチン、ビンクリスチンおよびビノレルビン)などの天然物、タキサン(パクリタキセル、ドセタキセル)、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ノコダゾール、エポチロンおよびナベルビン、エピジポドフィロトキシン(エトポシド、テニポシド)、ＤＮＡ損傷剤(アクチノマイシン、アムサクリン、アントラサイクリン、ブレオマイシン、ブスルファン、カンプトテシン、カルボプラチン、クロラムブシル、シスプラチン、シクロホスファミド、シトキサン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、エピルビシン、ヘキサメチルメラミンオキサリプラチン、イホスファミド、メルファラン、メクロレタミン、マイトマイシン、ミトキサントロン、ニトロソ尿素、プリカマイシン、プロカルバジン、タキソール、タキソテール、テニポシド、トリエチレンチオホスホロアミドおよびエトポシド(ＶＰ１６))などの微小管撹乱剤を含む抗増殖性／有糸分裂阻害剤；ダクチノマイシン(アクチノマイシンＤ)、ダウノルビシン、ドキソルビシン(アドリアマイシン)、イダルビシン、アントラサイクリン、ミトキサントロン、ブレオマイシン、プリカマイシン(ミトラマイシン)およびマイトマイシンなどの抗生物質；酵素(Ｌ−アスパラギンを全身性に代謝し、自身のアスパラギンを合成する能力を有しない細胞で欠乏させるＬ−アスパラギナーゼ)；抗血小板剤；窒素マスタード(メクロレタミン、シクロホスファミドおよびアナログ、メルファラン、クロラムブシル)、エチレンイミンおよびメチルメラミン(ヘキサメチルメラミンおよびチオテパ)、アルキルスルホネート−ブスルファン、ニトロソウレア(カルムスチン(ＢＣＮＵ)およびアナログ、ストレプトゾシン)、トリアゼン−ダカルバジン(ＤＴＩＣ)などの抗増殖性／抗有糸分裂アルキル化剤；葉酸アナログ(メトトレキサート)などの抗増殖性／抗有糸分裂代謝拮抗剤；白金配位錯体(シスプラチン、カルボプラチン)、プロカルバジン、ヒドロキシ尿素、ミトタン、アミノグルテチミド；ホルモン、ホルモンアナログ(エストロゲン、タモキシフェン、ゴセレリン、ビカルタミド、ニルタミド)およびアロマターゼ阻害剤(レトロゾール、アナストロゾール)；抗凝血剤(ヘパリン、合成ヘパリン塩および他のトロンビンの阻害剤)；血栓溶解剤(例えば組織プラスミノーゲン活性化因子、ストレプトキナーゼおよびウロキナーゼ)、アスピリン、ジピリダモール、チクロピジン、クロピドグレル、アブシキシマブ；抗遊走剤；抗分泌剤(ブレフェルジン)；免疫抑制剤(シクロスポリン、タクロリムス(ＦＫ−５０６)、シロリムス(ラパマイシン)、アザチオプリン、ミコフェノール酸モフェチル)；抗血管形成化合物(ＴＮＰ−４７０、ゲニステイン)および増殖因子阻害剤(例えば、ＶＥＧＦ阻害剤、線維芽細胞増殖因子(ＦＧＦ)阻害剤)；アンギオテンシン受容体ブロッカー；一酸化窒素ドナー；アンチセンスオリゴヌクレオチド；抗体(トラスツズマブ)；細胞周期阻害剤および分化誘発因子(トレチノイン)；ｍＴＯＲ阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤(ドキソルビシン(アドリアマイシン)、アムサクリン、カンプトテシン、ダウノルビシン、ダクチノマイシン、テニポシド、エピルビシン、エトポシド、イダルビシンおよびミトキサントロン、トポテカン、イリノテカン)、コルチコステロイド(コルチゾン、デキサメサゾン、ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、プレドニゾンおよびプレニゾロン)；増殖因子シグナル伝達キナーゼ阻害剤；ミトコンドリア機能不全誘発因子およびカスパーゼアクティベーター；およびクロマチン撹乱剤。

組み合わせ治療の性質により、本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはそのフラグメント)の投与を、他の治療を投与している間および／またはその後に続け得る。ポリペプチド治療剤の投与は、単回投与または複数回投与で行い得る。いくつかの例において、ポリペプチド治療剤の投与を、慣用の治療の少なくとも数日前に開始し、一方他の例において、投与を、慣用の治療の投与の直前または同時に開始する。

診断適応の一例において、不適切な血管形成により特徴付けられる状態を有することが疑われる患者からの血清または組織生検などの生物学的サンプルを、検出可能に標識した本発明のポリペプチドと接触させて、ＰＤ−Ｌ１のレベルを検出する。検出されたＰＤ−Ｌ１のレベルを、次いで、同様に標識ポリペプチドと接触させた正常サンプルで検出されたＰＤ−Ｌ１のレベルと比較する。ＰＤ−Ｌ１のレベルの少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％または９０％増加が、診断的指標と考えられ得る。

ある実施態様において、ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドを、さらに検出され得る標識に結合する(例えば、標識は、放射性同位体、蛍光化合物、酵素または酵素補因子であり得る)。活性部分は、鉄キレートなどの放射性重金属、ガドリニウムまたはマンガンの放射性キレート、酸素、窒素、鉄、炭素またはガリウムの陽電子放射体、^４３Ｋ、^５２Ｆｅ、^５７Ｃｏ、^６７Ｃｕ、^６７Ｇａ、^６８Ｇａ、^１２３Ｉ、^１２５Ｉ、^１３１Ｉ、^１３２Ｉまたは^９９Ｔｃなどの放射性薬剤であり得る。このような部分に付加された結合剤は、造影剤として使用でき、ヒトなどの哺乳動物に診断用途に有効な量で投与され、次いで、該造影剤の局在性および蓄積が検出される。造影剤の局在性および蓄積は、ラジオシンチグラフィー、核磁気共鳴造影、コンピューター断層撮影または陽電子放出断層撮影により検出され得る。ＰＤ−Ｌ１を指向するＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドを使用する免疫シンチグラフィーを使用して、癌および脈管構造を検出および／または診断し得る。例えば、^９９テクネチウム、^１１１インジウムまたは^１２５ヨウ素で標識されたＰＤ−Ｌ１マーカーに対する結合性ポリペプチドの何れかを、このような造影に効率的に使用し得る。当業者には明らかなとおり、投与すべき放射性同位体の量は、放射性同位体による。当業者は、活性部分として使用されるある放射性核種の特定の活性およびエネルギーに基づき、投与すべき造影剤の量を容易に定めることができる。一般に、造影剤の投与あたり０.１〜１００ミリキュリー、好ましくは１〜１０ミリキュリー、最も頻繁には２〜５ミリキュリーが投与される。それ故に、放射性部分にコンジュゲートしたターゲティング部分を含む、造影剤として有用な本発明の組成物は、０.１〜１００ミリキュリー、ある実施態様において好ましくは１〜１０ミリキュリー、ある実施態様において好ましくは２〜５ミリキュリー、ある実施態様においてより好ましくは１〜５ミリキュリー含む。

本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはそのフラグメント)はまたＰＤ−Ｌ１を発現する細胞または組織に付加的治療剤(薬物化合物、化学療法化合物および放射線療法化合物)を送達するためにも使用され得る。一例において、本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはそのフラグメント)を、ＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍細胞または組織への化学療法剤の標的化送達のために、化学療法剤と融合させる。

本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはそのフラグメント)は、研究、診断および治療適用を含む多様な適用において有用である。例えば、受容体またはその部分の単離および／または精製ならびに受容体構造(例えば、構造)および機能の研究に使用され得る。

ある態様において、多様な結合性ポリペプチドを使用して、例えば、内皮細胞(例えば、静脈内皮細胞)またはＰＤ−Ｌ１遺伝子でトランスフェクトした細胞の、ＰＤ−Ｌ１発現を検出または測定できる。それ故に、診断的または研究目的での、細胞選別および造影(例えば、フローサイトメトリーおよび蛍光活性化細胞選別)などにおける適用にも有用性がある。

ある実施態様において、結合性ポリペプチドまたはそのフラグメントは、診断目的で標識しても標識しなくてもよい。一般に、診断的アッセイは、結合性ポリペプチドのＰＤ−Ｌ１の結合に起因する複合体の形成の検出を伴う。結合性ポリペプチドまたはフラグメントを、抗体と同様直接標識できる。放射性核種、蛍光体、酵素、酵素基質、酵素補因子、酵素阻害剤およびリガンド(例えば、ビオチン、ハプテン)を含むが、これらに限定されない多様な標識が用いられ得る。多数の適切な免疫アッセイは、当業者に知られる(米国特許３,８１７,８２７号、３,８５０,７５２号、３,９０１,６５４号および４,０９８,８７６号)。標識しないとき、結合性ポリペプチドを、凝集アッセイなどのアッセイに使用できる。非標識結合性ポリペプチドをまた結合性ポリペプチドと反応性の標識抗体または他の適当な試薬(例えば、標識タンパク質Ａ)などの、結合性ポリペプチドの検出に使用できる他の(１以上の)適当な試薬と組み合わせて使用してもよい。

ある実施態様において、本発明の結合性ポリペプチドは、酵素免疫アッセイにおいて利用でき、ここで、対象ポリペプチドは、酵素にコンジュゲートされる。ＰＤ−Ｌ１タンパク質を含む生物学的サンプルを対象結合性ポリペプチドと組み合わせるとき、結合性ポリペプチドとＰＤ−Ｌ１タンパク質の間で結合が生じる。ある実施態様において、ＰＤ−Ｌ１タンパク質発現細胞(例えば、内皮細胞)を含むサンプルを対象抗体と組み合わせ、結合は、結合性ポリペプチドと結合性ポリペプチドにより認識されるＰＤ−Ｌ１タンパク質担持細胞の間で生じる。これらの結合細胞は、非標識試薬から分離でき、細胞に特異的に結合した結合性ポリペプチド−酵素コンジュゲートの存在を、例えば、該サンプルと、酵素が作用したとき発色または他の検出可能変化を生じる酵素の基質との接触により、決定し得る。他の実施態様において、対象結合性ポリペプチドは非標識であってよく、対象結合性ポリペプチドを認識する第二の標識ポリペプチド(例えば、抗体)を付加できる。

ある態様において、生物学的サンプルにおけるＰＤ−Ｌ１タンパク質の存在の検出に使用するためのキットもまた製造できる。このようなキットは、ＰＤ−Ｌ１タンパク質または該受容体の一部に結合するＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドならびに結合性ポリペプチドと受容体タンパク質またはその一部の複合体の存在の検出に適当な１以上の補助的試薬を含む。本発明のポリペプチド組成物は、単独でまたは他のエピトープに特異的な付加的抗体と組み合わせて、凍結乾燥形態で提供され得る。標識されていても標識されていなくてもよい、結合性ポリペプチドおよび／または抗体を、補助剤成分(例えば、Ｔｒｉｓ、リン酸および炭酸などの緩衝液、安定化剤、添加物、殺生物剤および／または不活性タンパク質、例えば、ウシ血清アルブミン)と共にキットに包含させ得る。例えば、結合性ポリペプチドおよび／または抗体は、補助剤成分との凍結乾燥混合物として提供できまたは補助剤成分を、使用者が組み合わせるために別々に提供できる。一般にこれらの補助剤は、活性結合性ポリペプチドまたは抗体の量に基づき、約５重量％未満の量で存在し、通常ポリペプチドまたは抗体濃度に基づき、少なくとも約０.００１重量％の総量で存在する。結合性ポリペプチドへの結合が可能な第二抗体を用いるとき、このような抗体を、例えば、別のバイアルまたは容器で、キット中に提供し得る。第二抗体は、存在するならば、一般に標識され、上記抗体製剤と同様の方法で製剤され得る。

同様に、本発明はまたＰＤ−Ｌ１の発現を検出および／または定量する方法を提供し、ここで、細胞またはその画分(例えば、膜画分)を含む組成物を、ＰＤ−Ｌ１または受容体の一部と結合する結合性ポリペプチドと、それらの結合に適する条件下接触させ、結合をモニターする。結合性ポリペプチドとＰＤ−Ｌ１またはその一部の間の複合体形成の指標である結合性ポリペプチドの検出が、受容体の存在を示す。ポリペプチドの細胞への結合は、実施例に記載するような標準法により検出され得る。方法を使用して、個体からの細胞のＰＤ−Ｌ１の発現を検出できる。所望により、内皮細胞表面のＰＤ−Ｌ１の定量的発現を、例えば、フローサイトメトリーにより評価でき、染色強度を、疾患感受性、進行またはリスクと相関させ得る。

本発明はまた、哺乳動物のある疾患に対する感受性を検出する方法も提供する。説明として、方法を使用して、哺乳動物における細胞に存在するＰＤ−Ｌ１の量および／またはＰＤ−Ｌ１陽性細胞の数に基づき、進行する疾患に対する哺乳動物の感受性を検出できる。

ポリペプチド配列は、標準１文字または３文字略号を使用して示す。特に断らない限り、各ポリペプチド配列は、左側にアミノ末端および右側にカルボキシ末端を有し、各一本鎖核酸配列および各二本鎖核酸配列の上鎖は、右側に５’末端および左側に３’末端を有する。特定のポリペプチド配列はまた参照配列とどのように異なるかを説明することによっても表し得る。

ＰＤ−Ｌ１に対する抗原結合性タンパク質を、例えば、インビトロまたはインビボで、ＰＤ−Ｌ１ポリペプチドの存在を検出するアッセイにおいて使用し得る。抗原結合性タンパク質はまた免疫親和性クロマトグラフィーによるＰＤ−Ｌ１タンパク質の精製にも用い得る。抗原結合性タンパク質の遮断を、ここに開示する方法において使用し得る。ＰＤ−Ｌ１アンタゴニストとして機能するこのような抗原結合性タンパク質を、種々の癌を含むが、これらに限定されない、あらゆるＰＤ−Ｌ１誘発状態の処置に用い得る。

抗原結合性タンパク質を、ＰＤ−Ｌ１誘発生物活性を阻害するためにインビトロ手法で用いてもインビボで投与してもよい。その例をここに提供している、ＰＤ−Ｌ１のタンパク分解活性化により引き起こされるまたは増悪する(直接的または間接的)障害を、それ故に、処置し得る。ある実施態様において、本発明は、処置を必要とする哺乳動物に、ＰＤ−Ｌ１誘発生物活性を減少するために有効な量でＰＤ−Ｌ１遮断抗原結合性タンパク質をインビボで投与することを含む、治療方法を提供する。

本発明抗体と腫瘍ワクチンの医薬製剤
本発明抗ＰＤ−Ｌ１抗体と治療ワクチンの組み合わせ治療製品または製剤は、相乗的腫瘍学的治療効果を提供する。例えば、本発明は、本発明抗ＰＤ−Ｌ１抗体と、“Neuvax”の組み合わせを提供し、“Neuvax”は、その開示を引用により本明細書に包含させる米国特許８,２２２,２１４号に記載のアジュバントとしてＧＭ−ＣＳＦを組み合わせたＨＥＲ２／ｎｅｕから単離されたＥ７５由来９量体合成ペプチドである。さらに、本発明は、本発明抗ＰＤ−Ｌ１抗体とＡＬＶＡＣ−ＣＥＡワクチンの組み合わせを提供し、該ワクチンは癌胎児性抗原と組み合わせたカナリア痘ウイルスである。

抗ＰＤ−Ｌ１抗原結合性タンパク質の産生
抗原結合性タンパク質は、多数の慣用の技法の何れかにより製造され得る。本発明は、ある実施態様において、ＰＤ−Ｌ１に結合するモノクローナル抗体を提供する。モノクローナル抗体は、例えば、それらを天然で発現する細胞から単離でき(例えば、抗体は、それを産生するハイブリドーマから精製し得る)または当分野で知られる任意の技法を使用して、組み換え発現系で産生できる。例えば、Monoclonal Antibodies, Hybridomas: A New Dimension in Biological Analyses, Kennet et al. (eds.), Plenum Press, New York (1980); and Antibodies: A Laboratory Manual, Harlow and Land (eds.), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., (1988)参照。

モノクローナル抗体は、当分野で知られる任意の技法を使用して、例えば、免疫化スケジュール完了後、トランスジェニック動物から採取した脾臓細胞を不死化することにより製造できる。脾臓細胞は、当分野で知られる任意の技法を使用して、例えば、ハイブリドーマを産生するために骨髄腫細胞と融合させて不死化させ得る。ハイブリドーマ産生融合手順において使用する骨髄腫細胞は、好ましくは非抗体産生性であり、高融合効率を有し、所望の融合細胞(ハイブリドーマ)のみの増殖を支持するある選択培地における増殖を不可能とする酵素欠損である。マウス融合に使用する適当な細胞株の例は、Ｓｐ−２０、Ｐ３−Ｘ６３／Ａｇ８、Ｐ３−Ｘ６３−Ａｇ８.６５３、ＮＳ１／１.Ａｇ４１、Ｓｐ２１０−Ａｇ１４、ＦＯ、ＮＳＯ／Ｕ、ＭＰＣ−１１、ＭＰＣ１１−Ｘ４５−ＧＴＧ１.７およびＳ１９４／５ＸＸ０ Ｂｕｌを含み、ラット融合に使用する細胞株の例は、Ｒ２１０.ＲＣＹ３、Ｙ３−Ａｇ１.２.３、ＩＲ９８３Ｆおよび４８２１０を含む。細胞融合に有用な他の細胞株は、Ｕ−２６６、ＧＭ１５００−ＧＲＧ２、ＬＩＣＲ−ＬＯＮ−ＨＭｙ２およびＵＣ７２９−６である。

一例において、ポリペプチドは、該ポリペプチドをコードする核酸配列(例えば、ｃＤＮＡ)を組み換え発現ベクターに導入し、発現が促進される条件下、該ＤＮＡ配列を発現させることによる、組み換えＤＮＡ法により産生される。

抗ＰＤ−Ｌ１抗体の組み換え産生のために、抗体をコードする核酸を単離し、さらなるクローニングおよび／または宿主細胞における発現のために、１以上のベクターに挿入する。このような核酸は、慣用の手順を使用して容易に単離され、配列決定される(例えば、抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合できるオリゴヌクレオチドプローブの使用により)。

ここに開示する抗ＰＤ−Ｌ１抗体(またはフラグメント)の何れかをコードする核酸を、化学合成し得る。コドン使用頻度を、細胞における発現を改善するために選択し得る。このようなコドン使用頻度は、選択した細胞型による。固有コドン使用頻度パターンが大腸菌および他の細菌、ならびに哺乳動物細胞、植物細胞、酵母細胞および昆虫細胞について開発されている。例えば：Mayfield et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2003 100(2):438-42; Sinclair et al. Protein Expr. Purif. 2002 (1):96-105; Connell N D. Curr. Opin. Biotechnol. 2001 12(5):446-9; Makrides et al. Microbiol. Rev. 1996 60(3):512-38; and Sharp et al. Yeast. 1991 7(7):657-78参照。

核酸操作の一般的技法は、例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2 ed., 1989, or F. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (Green Publishing and Wiley-Interscience: New York, 1987)および定期的改訂版に記載され、引用により本明細書に包含させる。ポリペプチドをコードするＤＮＡは、哺乳動物、ウイルスまたは昆虫遺伝子由来の適当な転写または翻訳制御要素に操作可能に結合される。このような制御要素は、転写プロモーター、任意の転写制御用オペレーター配列、適当なｍＲＮＡリボソーム結合部位をコードする配列ならびに転写および翻訳の転写を制御する配列を含む。通常形質転換体の認識を促進するための複製起点および選択遺伝子により付与される宿主において複製する能力が、さらに組み込まれる。

組み換えＤＮＡはまたタンパク質精製に有用であり得る任意のタイプのタンパク質タグ配列も含み得る。タンパク質タグの例は、ヒスチジンタグ、ＦＬＡＧタグ、ｍｙｃタグ、ＨＡタグまたはＧＳＴタグを含むが、これらに限定されない。細菌、真菌、酵母および哺乳動物細胞宿主で用いるための適切なクローニングおよび発現ベクターは、Cloning Vectors: A Laboratory Manual, (Elsevier, N.Y., 1985)に見ることができる。

発現構築物を、宿主細胞に適する方法を使用して、宿主細胞に導入する。核酸を宿主細胞に導入するための多様な方法が当分野で知られ、エレクトロポレーション；塩化カルシウム、塩化ルビジウム、リン酸カルシウム、ＤＥＡＥ−デキストランまたは他の物質を用いるトランスフェクション；微粒子銃；リポフェクション；および感染(ベクターが感染因子であるとき)を含むが、これらに限定されない。適当な宿主細胞は、下にさらに詳述するとおり、原核生物、酵母、哺乳動物細胞または細菌細胞を含む。

当分野で知られる任意の発現系を、本発明の組み換えポリペプチド(例えば、組み換え抗体)の産生に使用できる。一般に、宿主細胞を、所望のポリペプチドをコードするＤＮＡを含む組み換え発現ベクターで形質転換する。用い得る宿主細胞に含まれるのは、原核生物、酵母または高等真核生物細胞である。原核生物は、グラム陰性またはグラム陽性生物、例えば大腸菌または桿菌を含む。高等真核生物細胞は、昆虫細胞および哺乳動物起源の確立された細胞株を含む。抗体コードベクターのクローニングまたは発現のための適当な宿主細胞は、ここに記載する原核生物または真核生物細胞を含む。例えば、抗体を、特に、グリコシル化およびＦｃエフェクター機能が必要でないとき、細菌で産生し得る。細菌における抗体フラグメントおよびポリペプチドの発現について、例えば、米国特許５,６４８,２３７号、５,７８９,１９９号および５,８４０,５２３号参照(また大腸菌における抗体フラグメントの発現を記載する、Charlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B. K. C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, N.J., 2003), pp. 245-254も参照のこと)。発現後、抗体を可溶性フラクションにおける細菌細胞ペーストから単離でき、さらに精製し得る。高等真核生物細胞は、昆虫細胞および哺乳動物起源の確立された細胞株を含む。適当な哺乳動物宿主細胞株の例は、サル腎臓細胞のＣＯＳ−７系統(ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１)(Gluzman et al., 1981, Cell 23:175)、Ｌ細胞、２９３細胞、Ｃ１２７細胞、３Ｔ３細胞(ＡＴＣＣ ＣＣＬ １６３)、チャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞、ＨｅＬａ細胞、ＢＨＫ(ＡＴＣＣ ＣＲＬ １０)細胞株およびMcMahan et al., 1991, EMBO J. 10: 2821により記載のアフリカミドリザル腎臓細胞株ＣＶ１由来ＣＶ１／ＥＢＮＡ細胞株(ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０)を含む。細菌、真菌、酵母および哺乳動物細胞宿主で使用する適切なクローニングおよび発現ベクターは、Pouwels et al. (Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, N.Y., 1985)に記載される。

ある実施態様において、脊椎動物細胞を、抗ＰＤ−Ｌ１抗体またはそのフラグメントを発現するために宿主として使用し得る。例えば、懸濁液での増殖に適応させた哺乳動物細胞株が有用であり得る。有用な哺乳動物宿主細胞株の他の例は、ＳＶ４０で形質転換したサル腎臓ＣＶ１系統(ＣＯＳ−７)；ヒト胚腎臓系統(例えば、Graham et al., J. Gen Virol. 36:59 (1977)に記載の２９３または２９３細胞)；ベビーハムスター腎臓細胞(ＢＨＫ)；マウスセルトリ細胞(例えば、Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980)に記載のＴＭ４細胞)；サル腎臓細胞(ＣＶ１)；アフリカミドリザル腎臓細胞(ＶＥＲＯ−７６)；ヒト子宮頸癌細胞(ＨＥＬＡ)；イヌ腎臓細胞(ＭＤＣＫ；バッファローラット肝臓細胞(ＢＲＬ ３Ａ)；ヒト肺細胞(Ｗ１３８)；ヒト肝臓細胞(Ｈｅｐ Ｇ２)；マウス乳房腫瘍(ＭＭＴ ０６０５６２)；例えば、Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68 (1982)に記載のＴＲＩ細胞；ＭＲＣ ５細胞；およびＦＳ４細胞である。他の有用な哺乳動物宿主細胞株は、ＤＨＦＲ⁻ＣＨＯ細胞を含むチャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞(Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980))；およびＹ０、ＮＳ０およびＳｐ２／０などの骨髄腫細胞株を含む。抗体産生に適当なある哺乳動物宿主細胞株のレビューについて、例えば、Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B. K. C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, N.J.), pp. 255-268 (2003)参照。適当な哺乳動物宿主細胞株の例は、サル腎臓細胞のＣＯＳ−７系統(ＡＴＣＣ ＣＲＬ １６５１)(Gluzman et al., 1981, Cell 23:175)、Ｌ細胞、２９３細胞、Ｃ１２７細胞、３Ｔ３細胞(ＡＴＣＣ ＣＣＬ １６３)、チャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞、ＨｅＬａ細胞、ＢＨＫ(ＡＴＣＣ ＣＲＬ １０)細胞株およびMcMahan et al., 1991, EMBO J. 10: 2821に記載のアフリカミドリザル腎臓細胞株ＣＶ１由来ＣＶ１／ＥＢＮＡ細胞株(ＡＴＣＣ ＣＣＬ ７０)を含む。

原核生物に加えて、糸状菌または酵母などの真核微生物が、抗体コードベクターのクローニングまたは発現宿主に適し、グリコシル化経路が“ヒト化”されており、一部または完全ヒトグリコシル化パターンを有する抗体の産生をもたらす、真菌および酵母株を含む。Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004)およびLi et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006)参照。

グリコシル化抗体の発現に適当な宿主細胞はまた多細胞生物(無脊椎動物および脊椎動物)に由来する。無脊椎動物細胞の例は、植物および昆虫細胞を含む。多数のバキュロウイルス株が同定されており、特に、ヨトウガ(Spodoptera frugiperda)細胞のトランスフェクションのために、昆虫細胞と組み合わせて使用し得る。

細菌、真菌、酵母および哺乳動物細胞宿主で使用するための適切なクローニングおよび発現ベクターは、Pouwels et al. (Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, N.Y., 1985)に記載される。

形質転換細胞を、ポリペプチドの発現を促進する条件下で培養し、該ポリペプチドを慣用のタンパク質精製手順により回収し得る。１つのこのような精製手順は、例えば、結合したＰＤ−Ｌ１の全てまたは一部(例えば、細胞外ドメイン)を有するマトリクス上での、親和性クロマトグラフィーを含む。ここでの使用のために企図されるポリペプチドは、汚染内因性が実質的にない実質的に均一な、組み換え哺乳動物抗ＰＤ−Ｌ１抗体ポリペプチドである。

それ故に、抗体を、例えば、米国特許４,８１６,５６７号に記載のとおり、組み換え方法および組成物を使用して産生し得る。ある実施態様において、ここに記載する抗ＰＤ−Ｌ１抗体をコードする単離核酸が提供される。このような核酸は、抗体(例えば、抗体の軽および／または重鎖)のＶ_Ｌを含むアミノ酸配列および／またはＶ_Ｈを含むアミノ酸配列をコードし得る。さらなる実施態様において、このような核酸を含む１以上のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる実施態様において、このような核酸を含む宿主細胞が提供される。あるこのような実施態様において、宿主細胞は、(１)抗体のＶ_Ｌを含むアミノ酸および抗体のＶ_Ｈを含むアミノ酸をコードする核酸を含むベクターまたは(２)抗体のＶ_Ｌを含むアミノ酸をコードする核酸を含む第一ベクターおよび抗体のＶ_Ｈを含むアミノ酸をコードする核酸を含む第二ベクターを含む(例えば、形質転換されている)。ある実施態様において、宿主細胞は、真核生物、例えばチャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞またはリンパ系細胞(例えば、Ｙ０、ＮＳ０、Ｓｐ２０細胞)である。ある実施態様において、抗ＰＤ−Ｌ１抗体を製造する方法が提供され、ここで、方法は、上記の、抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を、抗体の発現に適する条件下培養し、所望により抗体を宿主細胞(または宿主細胞培養培地)から回収することを含む。

ここに開示するタンパク質はまた細胞翻訳系を使用しても産生できる。このような目的のために、ポリペプチドをコードする核酸を、ｍＲＮＡを産生するためのインビトロ転写を可能とし、利用する特定の無細胞系(哺乳動物または酵母無細胞翻訳系などの真核生物または細菌無細胞翻訳系などの原核生物)におけるｍＲＮＡの無細胞翻訳を可能とするために、修飾されなければならない。

ＰＤ−Ｌ１結合性ポリペプチドは、化学合成によっても製造できる(例えば、Solid Phase Peptide Synthesis, 2nd ed., 1984, The Pierce Chemical Co., Rockford, Ill.に記載の方法により)。タンパク質への修飾も化学合成によりなし得る。

本発明のポリペプチドを、タンパク質化学の分野で一般に知られるタンパク質の単離／精製方法により精製し得る。非限定的例は、抽出、再結晶、塩析(例えば、硫酸アンモニウムまたは硫酸ナトリウムで)、遠心分離、透析、限外濾過、吸着クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、順相クロマトグラフィー、逆相クロマトグラフィー、ゲル剤濾過、ゲル浸透クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、電気泳動、向流分配またはこれらの任意の組み合わせを含む。精製後、ポリペプチドを異なる緩衝液に交換しおよび／または濾過および透析を含むが、これらに限定されない当分野で知られる多様な方法の何れかにより濃縮してよい。

精製ポリペプチドは、好ましくは少なくとも８５％純粋、より好ましくは少なくとも９５％純粋、最も好ましくは少なくとも９８％純粋である。純度の正確な数値に係わらず、ポリペプチドは、医薬品として使用するために十分に純粋である。抗原結合性タンパク質(例えば、抗体、抗体フラグメント、抗体誘導体、抗体ムテインおよび抗体バリアント)は、ＰＤ−Ｌ１(好ましくは、ヒトＰＤ−Ｌ１)に結合するポリペプチドである。抗原結合性タンパク質は、ＰＤ−Ｌ１の生物活性を阻害する抗原結合性タンパク質を含む。

抗原結合性タンパク質を、多数の既知技法の何れかにより製造し、所望の性質に対してスクリーニングし得る。技法のいくつかは、目的の抗原結合性タンパク質(例えば、抗ＰＤ−Ｌ１抗体)のポリペプチド鎖(またはその一部)をコードする核酸を単離し、組み換えＤＮＡテクノロジーにより核酸を操作することを含む。核酸を、他の目的の核酸と融合するかまたは改変(例えば、変異誘発または他の慣用の技法)して、例えば、１以上のアミノ酸残基を付加、欠失または置換し得る。

一本鎖抗体を、単一ポリペプチド鎖をもたらす、アミノ酸架橋(短ペプチドリンカー)により重鎖および軽鎖可変ドメイン(Ｆｖ領域)フラグメントを連結することにより形成し得る。このような一本鎖Ｆｖ(ｓｃＦｖ)は、２つの可変ドメインポリペプチド(Ｖ_ＬおよびＶ_Ｈ)をコードするＤＮＡ間のペプチドリンカーをコードするＤＮＡを融合することにより製造されている。得られたポリペプチドを、２可変ドメイン間の可動性リンカーによって、抗原結合単量体を形成するように折り畳むことができまたは多量体(例えば、二量体、三量体または四量体)を形成できる(Kortt et al., 1997, Prot. Eng. 10:423; Kortt et al., 2001, Biomol. Eng. 18:95-108)。異なるＶ_ＬおよびＶ_Ｈ含有ポリペプチドを合わせることにより、異なるエピトープに結合する多量体ｓｃＦｖを形成できる(Kriangkum et al., 2001, Biomol. Eng. 18:31-40)。一本鎖抗体の産生のために開発された技法は、米国特許４,９４６,７７８号; Bird, 1988, Science 242:423; Huston et al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879; Ward et al., 1989, Nature 334:544, de Graaf et al., 2002, Methods Mol. Biol. 178:379-87に記載のものを含む。

目的の抗体と異なるサブクラスまたはアイソタイプの抗体を誘導する技法、すなわち、サブクラススイッチングは知られている。それ故に、例えば、ＩｇＧ抗体はＩｇＭ抗体に由来してよく、この逆も可能である。このような技法は、ある抗体(親抗体)の抗原結合性質を有するが、親抗体と異なる抗体アイソタイプまたはサブクラスと関連する生物学的性質も示す、新規抗体の製造を可能とする。組み換えＤＮＡ技法を用い得る。特定の抗体ポリペプチドをコードするクローン化ＤＮＡ、例えば、所望のアイソタイプの抗体の定常ドメインをコードするＤＮＡをこのような手順に用いることができる(Lantto et al., 2002, Methods Mol. Biol. 178:303-16)。さらに、ＩｇＧ４が望ましいならば、ＩｇＧ４抗体における不均質をもたらし得るＨ鎖内ジスルフィド結合を形成する傾向を低減するために、ヒンジ領域に点変異(ＣＰＳＣＰ→ＣＰＰＣＰ)(Bloom et al., 1997, Protein Science 6:407)を導入するのが望ましいことがある。

他の実施態様は、次の非限定的実施例に記載される。

実施例１：Ｈ６Ｂ１Ｌ抗体およびバリアント抗体の親和性比較
本実施例は、３つの完全ヒト抗体、野生型(Ｈ６Ｂ１Ｌ)、Ｈ６Ｂ１Ｌ−ＥＶおよびＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭが、下記表１に示すとおり、ヒトＰＤ−Ｌ１に互いに類似する親和性を有することを示す、Ｂｉａｃｏｒｅデータを提供する。

従って、驚くべきことに、軽鎖における１または２アミノ酸の変化が、抗体を十分な量製造する能力を改善したが、その標的、ヒトＰＤ−Ｌ１に結合する結合能に影響しなかった。

実施例２：抗体Ｈ６Ｂ１Ｌ−ＥＭの製造改善
本実施例は、親野生型抗体Ｈ６Ｂ１Ｌからの軽鎖(配列番号４)およびＨ６Ｂ１Ｌ−ＥＭ軽鎖(配列番号２)の２軽鎖のマススペクトル分析を説明する。抗体を各々ＣＨＯ細胞で産生した。達成されたピークの比較を図１Ａに示す。さらに、Ｎ末端エドマン配列決定は、野生型Ｈ６Ｂ１Ｌ軽鎖についてのマススペクトルピークにおいて、ＳＹＥＬＭＸＸＸおよびＬＭＸＸＸの軽鎖フラグメントがあることを確認した。図１Ｂに示すとおり、親軽鎖と比較して、Ｈ６Ｂ１ＬＥＭ軽鎖について、軽鎖(ＬＣ)フラグメントは検出されなかった。

引用による取り込み
本明細書をとおして引用されている全ての引用文献、特許および特許出願は、引用により明示的に本明細書に包含させる。
さらに、本発明は次の態様を包含する。
１. ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体であって、ここで、抗体が配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、完全ヒト抗体。
２. ＰＤ−Ｌ１エピトープに結合するＩｇＧクラスの完全ヒト抗体であって、ここで、抗体がそれぞれ配列番号５、配列番号６および配列番号７のアミノ酸配列に示すＣＤＲ１ドメイン、ＣＤＲ２ドメインおよびＣＤＲ３ドメインを含む重鎖可変ドメインならびに配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、完全ヒト抗体。
３. 配列番号１／配列番号２または配列番号１／配列番号３の重鎖／軽鎖可変ドメインアミノ酸配列組み合わせを有する、項２に記載の完全ヒト抗体。
４. ＩｇＧ１またはＩｇＧ４である、項１〜３の何れかに記載の完全ヒト抗体。
５. 重鎖からの可変ドメインおよび軽鎖からの可変ドメインを有する抗ＰＤ−Ｌ１ Ｆａｂ完全ヒト抗体フラグメントであって、ここで、重鎖可変ドメインが配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖可変ドメインが配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む、完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメント。
６. 抗体が配列番号１／配列番号２または配列番号１／配列番号３の重鎖／軽鎖可変ドメインアミノ酸配列組み合わせを有する、項５に記載の完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメント。
７. ペプチドリンカーを介して連結した重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを有する抗ＰＤ−Ｌ１一本鎖ヒト抗体であって、ここで、重鎖可変ドメインが配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも９５％同一であるアミノ酸配列を含み、軽鎖可変ドメインが配列番号２または配列番号３に示すアミノ酸配列を含む、ヒト一本鎖抗体。
８. 一本鎖完全ヒト抗体が配列番号１／配列番号２または配列番号１／配列番号３の重鎖／軽鎖可変ドメインアミノ酸配列組み合わせを有する、項７に記載の完全ヒト一本鎖抗体。
９. 癌または自己免疫性または炎症性疾患を有するヒト対象を処置する方法であって、ヒト対象に有効量の項１〜３の何れかに記載の完全ヒト抗体を投与することを含む、方法。
１０. 癌または自己免疫性または炎症性疾患を有するヒト対象を処置する方法であって、ヒト対象に有効量の項５または６に記載の完全ヒト抗体Ｆａｂフラグメントを投与することを含む、方法。
１１. 癌または自己免疫性または炎症性疾患を有するヒト対象を処置する方法であって、ヒト対象に有効量の項７または８に記載の完全ヒト一本鎖抗体を投与することを含む、方法。
１２. 癌が卵巣癌、結腸癌、乳癌、肺癌、骨髄腫、神経芽細胞由来ＣＮＳ腫瘍、単球性白血病、Ｂ細胞由来白血病、Ｔ細胞由来白血病、Ｂ細胞由来リンパ腫、Ｔ細胞由来リンパ腫および肥満細胞由来腫瘍からなる群から選択される、項９〜１１の何れかに記載の方法。
１３. 自己免疫性または炎症性疾患が腸粘膜炎症、大腸炎と関連する消耗性疾患、多発性硬化症、全身性エリテマトーデス、ウイルス感染、リウマチ性関節炎、骨関節症、乾癬、クローン病および炎症性腸疾患からなる群から選択される、項９〜１１の何れかに記載の方法。
１４. 哺乳動物宿主細胞において産生される、項１〜３の何れかに記載の抗体。
１５. 哺乳動物宿主細胞がチャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞である、項１４に記載の抗体。
１６. 項１〜３の何れかに記載の抗体および薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。

Claims (1)

1. 明細書に記載の発明。

Images