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ES2600165T3 - Antagonistas de miR-32 para aumentar la respuesta del cáncer de próstata a la apoptosis - Google Patents

Antagonistas de miR-32 para aumentar la respuesta del cáncer de próstata a la apoptosis Download PDF

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ES2600165T3
ES2600165T3 ES14170625.9T ES14170625T ES2600165T3 ES 2600165 T3 ES2600165 T3 ES 2600165T3 ES 14170625 T ES14170625 T ES 14170625T ES 2600165 T3 ES2600165 T3 ES 2600165T3
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nucleic
mir
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disorder
mirna
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ES14170625.9T
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English (en)
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Carlo M. Croce
Stefan Ambs
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US Department of Health and Human Services
Ohio State University Research Foundation
Original Assignee
US Department of Health and Human Services
Ohio State University Research Foundation
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Abstract

Uso de un producto del gen miR-32 aislado que comprende un antagonista de miR para aumentar la respuesta de células de cáncer de próstata a estímulos apoptóticos, en donde el antagonista de miR comprende una secuencia de oligonucleótido complementaria a miR-32, o un precursor del mismo.

Description

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genes a base de ambos valores P, procedentes de las pruebas t de dos colas y de las tasas de descubrimiento falso previstas (FDR). El cálculo de la FDR siguió el método descrito por Storey y Tibshirani. La agrupación jerárquica no supervisado se realizó de acuerdo con los principios descritos por Eisen et al.
5 Análisis de PCR cuantitativa en tiempo real de microARN y ARNm.
La abundancia de los microARN maduros se midió utilizando el kit TaqMan® MicroRNA Assays de tallobucle (Applied Biosystems, Foster City, CA) de acuerdo con un protocolo publicado [29]. Utilizando 10 ng de ARN total, se sometió a transcripción inversa microARN maduro a ADNc extendido en el 5’ con cebadores de TI en horquilla 10 específicos para microARN procedentes del kit TaqMan® MicroRNA Assays y los reactivos procedentes del kit TaqMan® MicroRNA Reverse Transcription (Applied Biosystems) siguiendo las instrucciones del fabricante. La PCR en tiempo real se realizó sobre el ADNc con la Applied Biosystems TaqMan® 2X Universal PCR Master Mix y la 5X TaqMan® MicroRNA Assays Mix apropiada para cada microARN de interés. Se incubaron las reacciones por triplicado en un sistema Applied Biosystems 7500 RealTime PCR en una placa de 96 pocillos durante 10 min a 15 95 ºC, seguido de 40 ciclos durante 15 s a 95 ºC y 1 min a 60 ºC. Se calculó para cada muestra el ciclo umbral (Ct) mediante el programa informático ABI 7500 Sequence Detection System. Se utilizaron curvas patrón para determinar en las muestras las concentraciones de microARN, lo que después se normalizó con respecto a ARN U6. La abundancia del ARNm se determinó de acuerdo con un método descrito anteriormente de PCR en tiempo real cuantitativa (qRT) [30]. Por consiguiente, se sometieron a transcripción inversa 100 ng del ARN total utilizando el kit
20 HighCapacity cDNA Archive (Applied Biosystems, Foster City, CA). Posteriormente se realizó la qRTPCR por triplicado, utilizando TaqMan Gene Expression Assays (Applied Biosystems), que incluye conjuntos de sondas y cebadores preoptimizados específicos para los genes a validar. Los números ID de los ensayos de los genes validados son como sigue: Hs00744661_sH para la metalotioneína 1F y Hs00828387_g1 para la metalotioneína 1M. Los datos se recogieron utilizando el sistema ABI PRISM® 7500 Sequence Detection System. El ARN 18s se utilizó
25 como la referencia estándar interna. La expresión normalizada se calculó utilizando el método comparativo CT como se ha descrito y los cambios en veces se obtuvieron de los valores 2ΔΔCt para cada gen.
Inmunohistoquímica.
30 Se evaluó de forma inmunohistoquímica la expresión de proteínas en células cancerosas perineurales y no perineurales en cortes de tumores fijados en formalina, incluidos en parafina. Los tumores (n = 30) procedían de próstatas de pacientes tratados mediante prostatectomía radical en el Baltimore VA Hospital y el University of Maryland Medical Center. Para visualizar zonas con PNI se tiñeron de forma inmunohistoquímica cortes de cinco micrómetros para S100, un marcador de troncos nerviosos. Se encontró que secciones procedentes de catorce
35 tumores contenían zonas representativas con células cancerosas perineurales y no perineurales. Para la recuperación de antígeno, se trataron con microondas cortes desparafinados en tampón Citra 1x (Biogenex, San Ramon, CA). Se realizó tinción inmunohistoquímica con el sistema Dako Envision (DakoCytomation, Carpinteria, CA). Se utilizaron los siguientes anticuerpos primarios: anticuerpo policlonal de conejo para S100 diluido 1:500 (Ventana, Tucson, AR); anticuerpo monoclonal de ratón para receptor de adenovirus y coxsackie (CX CXADR)
40 (Atlas Antibodies, Estocolmo, Suecia) diluido 1:1000 y anticuerpo monoclonal de ratón para la metalotioneína (DakoCytomation) diluido 1:500. Este anticuerpo (E9) reconoce miembros de la familia de la metalotioneína1 y 2 (n.º M0639). Controles positivos: intestino (CXADR) e hígado (metalotioneína). La omisión del anticuerpo primario fue el control negativo. Un patólogo, que desconocía los resultados de la micromatriz, evaluó la intensidad de las inmunotinciones en células cancerosas perineurales y no perineurales y categorizó la inmunotinción como menos
45 intensa, la misma, o más intensa en las células cancerosas perineurales cuando se las comparó con las células cancerosas no perineurales. Se tomaron imágenes de zonas representativas para documentar las diferencias en la expresión.
Hibridación in situ.
50 La hibridación in situ (HIS) se realizó utilizando el sistema GenPoint™ Catalyzed Signal Amplification System (DakoCytomation) siguiendo el protocolo del fabricante. Brevemente, se incubaron portaobjetos a 60 ºC durante 30 minutos y se desparafinaron como se describe. Los cortes se trataron con Proteinasa K (DakoCytomation) durante 30 minutos a temperatura ambiente, se lavaron con H2Od varias veces y se sumergieron en etanol al 95 % durante
55 10 segundos antes de secarlas al aire. Los portaobjetos se prehibridaron a 54 ºC durante 1 hora con tampón de hibridación in situ (Enzo Life Sciences, Inc. Farmingdale, NY) antes de una incubación durante una noche a 54 ºC en tampón que contenía ya sea sonda de detección miRCURY™ LNA de miR224 marcada con biotina en el 5’ (Exiqon, Woburn, MA) o sonda de control negativo desorganizada (Exiqon) a la concentración final de 50 nM. Los portaobjetos se lavaron en TBST y solución de lavado riguroso GenPoint™ (54 ºC durante 30 minutos). Después, los
60 portaobjetos se expusieron a solución de bloqueo de N2O2 (DakoCytomation) durante 20 minutos y se bloquearon adicionalmente en un tampón de bloqueo (DakoCytomation, X0909) durante 30 minutos antes de exponerlas al anticuerpo EstreptavidinaHRP primario, biotinil tiramida, anticuerpo EstreptavidinaHRP secundario, y soluciones del cromógeno de DAB siguiendo el protocolo del fabricante. Después, los portaobjetos se contratiñeron brevemente en hematoxilina y se aclararon con TBST y agua antes de montarlos. Un patólogo evaluó la intensidad de la HIS de
65 miR224 en células cancerosas perineurales y no perineurales utilizando el mismo criterio que se utilizó para la
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4) evaluar la naturaleza de un trastorno y/o patología en un sujeto; 5) evaluar el potencial para desarrollar un trastorno y/o patología en un sujeto; 6) evaluar el tipo histológico de células asociadas a un trastorno y/o patología en un sujeto; 7) fabricar anticuerpos, fragmentos de anticuerpos o derivados de anticuerpos que sean útiles para tratar un
5 trastorno y/o patología en un sujeto; 8) evaluar la presencia de un trastorno y/o patología en las células de un sujeto; 9) evaluar la eficacia de uno o más compuestos de prueba para inhibir un trastorno y/o patología en un sujeto; 10) evaluar la eficacia de una terapia para inhibir un trastorno y/o patología en un sujeto; 11) controlar la evolución de un trastorno y/o patología en un sujeto; 12) seleccionar una composición o terapia para inhibir un trastorno y/o patología en un sujeto; 13) tratar un sujeto aquejado de un trastorno y/o patología; 14) inhibir un trastorno y/o patología en un sujeto; 15) evaluar el potencial nocivo de un compuesto de prueba; y 16) prevenir el inicio de un trastorno y/o patología en un sujeto en riesgo de ello.
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Métodos de cribado
Se pueden crear modelos animales para permitir el cribado de agentes terapéuticos útiles para tratar o prevenir un trastorno y/o patología en un sujeto. Por consiguiente, los métodos son útiles para identificar agentes terapéuticos para tratar o prevenir un trastorno y/o patología en un sujeto. Los métodos comprenden administrar un agente candidato a un modelo animal preparado por los métodos descritos en el presente documento, y evaluar al menos una respuesta en el modelo animal en comparación con un modelo animal de control al que no se ha administrado el agente candidato. Si al menos una respuesta es una reducción de los síntomas o un retraso del inicio, el agente candidato es un agente para tratar o prevenir la enfermedad.
25 Los agentes candidatos pueden ser agentes farmacológicos ya conocidos en la técnica o pueden ser agentes que anteriormente se desconociera que tuvieran alguna actividad farmacológica. Los agentes pueden surgir de forma natural o diseñarse en el laboratorio. Se los puede aislar a partir de microorganismos, animales o plantas, o pueden producirse de forma recombinante, o sintetizarse mediante cualquier método químico adecuado. Pueden ser moléculas pequeñas, ácidos nucleicos, proteínas, péptidos o peptidomiméticos. En determinadas realizaciones, los agentes candidatos son compuestos orgánicos pequeños que tienen un peso molecular de más de 50 y menos de aproximadamente 2.500 daltons. Los agentes candidatos comprenden grupos funcionales necesarios para la interacción estructural con proteínas. También se encuentran a los agentes candidatos entre biomoléculas incluyendo, pero sin limitación: péptidos, sacáridos, ácidos grasos, esteroides, purinas, pirimidinas, derivados,
35 análogos estructurales o combinaciones de los mismos.
Los agentes candidatos se obtienen a partir de una amplia diversidad de fuentes incluyendo bibliotecas de compuestos sintéticos o naturales. Existen, por ejemplo, numerosos medios disponibles para la síntesis aleatoria y dirigida de una amplia diversidad de compuestos orgánicos y biomoléculas, incluyendo la expresión de oligonucleótidos y oligopéptidos aleatorizados. Como alternativa, están disponibles o se pueden producir fácilmente bibliotecas de compuestos naturales en la forma de extractos bacterianos, fúngicos, vegetales y animales. De forma adicional, las bibliotecas y compuestos producidos de forma natural o sintética se modifican fácilmente a través de medios químicos, físicos y bioquímicos convencionales, y pueden utilizarse para producir bibliotecas combinatorias. En determinadas realizaciones, los agentes candidatos pueden obtenerse utilizando cualquiera de las numerosas
45 estrategias en la técnica de los métodos de bibliotecas combinatoriales, incluyendo, como ejemplos no limitativos: bibliotecas biológicas; bibliotecas de fase sólida o de fase en solución paralelas abordables de forma espacial; métodos de biblioteca sintética que necesitan deconvolución; el método de biblioteca “un lecho un compuesto”; y métodos de biblioteca sintéticos utilizando selección por cromatografía de afinidad.
En determinadas realizaciones adicionales, determinados agentes farmacológicos pueden someterse a modificaciones químicas dirigidas o al azar, tal como la acilación, la alquilación, la esterificación, la amidificación, etc. para producir análogos estructurales.
También pueden utilizarse los mismos métodos para identificar agentes terapéuticos para tratar un trastorno y/o 55 patología en un sujeto, para validar compuestos/agentes principales generados a partir de estudios in vitro.
El agente candidato puede ser un agente que regule de forma positiva o negativa uno o más trastornos y/o patologías en una ruta de respuesta del sujeto. En determinadas realizaciones, el agente candidato puede ser un antagonista que afecta a tal ruta.
Métodos para tratar un trastorno y/o patología
Se proporcionan en el presente documento métodos para tratar, inhibir, aliviar o revertir una respuesta de un trastorno y/o patología. En los métodos descritos en el presente documento, se administra un agente que interfiere 65 con una cascada de señalización a un individuo que lo necesite, como tal, pero sin limitación, a sujetos en quienes tales complicaciones no son todavía evidentes y los que ya tienen al menos una de tales respuestas.
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realizaciones un oligonucleótido modificado que tiene una secuencia de bases nucleicas que es el 100 % complementaria a un miARN, o un precursor del mismo, puede no ser el 100 % complementario al miARN, o un precursor del mismo, a lo largo de la longitud entera del oligonucleótido modificado.
5 “Complementariedad” significa la capacidad de emparejamiento de bases nucleicas entre un primer ácido nucleico y un segundo ácido nucleico. “Complementariedad de longitud completa” significa que cada base nucleica de un primer ácido nucleico tiene la capacidad de emparejarse con cada base nucleica en una correspondiente posición en un segundo ácido nucleico. Por ejemplo, en determinadas realizaciones, un oligonucleótido modificado en el que cada base nucleica tiene complementariedad con una base nucleica en un miARN tiene complementariedad de longitud completa con el miARN.
“Complementariedad porcentual” significa el número de bases nucleicas complementarias en un ácido nucleico dividido por la longitud del ácido nucleico. En determinadas realizaciones, complementariedad porcentual de un oligonucleótido modificado significa el número de bases nucleicas que son complementarias con el ácido nucleico
15 diana, dividido por el número de bases nucleicas del oligonucleótido modificado. En determinadas realizaciones, complementariedad porcentual de un oligonucleótido modificado significa el número de bases nucleicas que son complementarias con un miARN, dividido por el número de bases nucleicas del oligonucleótido modificado.
“Región unida porcentual” significa el porcentaje de una región complementaria con una región de un oligonucleótido. La región unida porcentual se calcula dividiendo el número de bases nucleicas de la región diana que es complementaria con el oligonucleótido por la longitud de la región diana. En determinadas realizaciones, la región unida porcentual es al menos el 80 %, al menos el 85 %, al menos el 90 %, al menos el 95 %, al menos el 96 %, al menos el 97 %, al menos el 98 %, al menos el 99 % o al menos el 100 %.
25 “Identidad porcentual” significa el número de bases nucleicas en el primer ácido nucleico que es idéntico a las bases nucleicas en las posiciones correspondientes en un segundo ácido nucleico, dividido por el número total de bases nucleicas en el primer ácido nucleico.
“Sustancialmente idéntico” utilizado en el presente documento puede significar que una primera y una segunda secuencia de bases nucleicas son al menos el 60 %, 65 %, 70 %, 75 %, 80 %, 85 %, 90 %, 95 %, 97 %, 98 % o 99 % idénticas, o el 100 % idénticas, a lo largo de una región de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 o más bases nucleicas.
“Hibridar” significa el apareamiento de ácidos nucleicos complementarios que se produce a través de la 35 complementariedad de bases nucleicas.
“Desapareamiento” significa una base nucleica de un primer ácido nucleico que no tiene la capacidad de emparejarse con una base nucleica en una correspondiente posición de un segundo ácido nucleico.
“Base nucleica no complementaria” significa dos bases nucleicas que no tienen la capacidad de emparejarse a través de uniones hidrógeno.
“Idéntico” significa que tiene la misma secuencia de bases nucleicas.
45 “miARN” o “miR” significa un ARN no codificarte de entre 18 y 25 bases nucleicas de longitud que hibridan con y regulan la expresión de un ARN codificante. En determinadas realizaciones, un miARN es el producto de escisión de un premiARN mediante la enzima Dicer. Los ejemplos de miARN se encuentran en la base de datos de miARN conocida como miRBase (http://microrna.sanger.ac.uk/).
“PremiARN” o “premiR” significa un ARN no codificante que tiene una estructura en horquilla, que contiene un miARN. En determinadas realizaciones, un premiARN es el producto de escisión de un primiR mediante la ribonucleasa específica de ARN bicatenario conocido como Drosha.
“Secuencia tallobucle” significa un ARN que tiene una estructura en horquilla y que contiene una secuencia de
55 miARN madura. Las secuencias premiARN y las secuencias tallobucle pueden solapar. Los ejemplos de secuencias tallobucle se encuentran en la base de datos de miARN conocida como miRBase (microrna.sanger.ac.uk/).
“Precursor de miARN” significa un transcrito que se origina a partir de un ADN genómico y que comprende un ARN no codificante estructurado que comprende una o más secuencias de miARN. Por ejemplo, en determinadas realizaciones, un precursor de miARN es un premiARN. En determinadas realizaciones, un precursor de miARN es un primiARN.
“Compuesto antisentido” significa un compuesto que tiene una secuencia de bases nucleicas que permitirá la
65 hibridación con un ácido nucleico diana. En determinadas realizaciones, un compuesto antisentido es un oligonucleótido que tiene una secuencia de bases nucleicas complementaria con un ácido nucleico diana.
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Families Citing this family (111)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007016548A2 (en) 2005-08-01 2007-02-08 The Ohio State University Research Foundation Micro-rna-based methods and compositions for the diagnosis, prognosis and treatment of breast cancer
ES2554531T3 (es) 2006-01-05 2015-12-21 The Ohio State University Research Foundation Procedimientos basados en los microARN para el diagnóstico, pronóstico y tratamiento del cáncer de pulmón
EP2487263B1 (en) 2006-01-05 2014-03-19 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA-based methods and compositions for the diagnosis and treatment of solid cancers of the pancreas
CA2635616A1 (en) 2006-01-05 2007-07-19 Carlo M. Croce Microrna expression abnormalities in pancreatic endocrine and acinar tumors
EP2369012A1 (en) 2006-03-20 2011-09-28 The Ohio State University Research Foundation Micro-RNA fingerprints during human megakaryocytopoiesis
RU2008146868A (ru) 2006-05-18 2010-06-27 Кэрис МПИ, Инк.445 Норт Фифс Стрит, 3-ий Флор, Феникс, Аризона 85004, США (US) Система и способ определения персонализированого медицинского вмешательства при болезненном состоянии
US8768629B2 (en) 2009-02-11 2014-07-01 Caris Mpi, Inc. Molecular profiling of tumors
ES2442890T3 (es) 2006-07-13 2014-02-14 The Ohio State University Research Foundation Métodos y composiciones basados en micro-ARN para el diagnóstico y el tratamiento de enfermedades relacionadas con el colon
EP2061907B1 (en) 2006-09-19 2011-11-23 The Ohio State University Research Foundation Tcl1 expression in chronic lymphocytic leukemia (cll) regulated by mir-29 and mir-181
AU2007314212B2 (en) 2006-11-01 2014-05-29 The Govt. Of The Usa As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services MicroRNA expression signature for predicting survival and metastases in Hepatocellular carcinoma
JP2010516291A (ja) 2007-01-31 2010-05-20 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション 急性骨髄性白血病（ａｍｌ）の診断、予後及び治療のためのマイクロｒｎａに基づく方法及び組成物
EP2481806B1 (en) * 2007-04-30 2016-11-09 The Ohio State University Research Foundation Methods for pancreatic cancer prognosis
US8465917B2 (en) 2007-06-08 2013-06-18 The Ohio State University Research Foundation Methods for determining heptocellular carcinoma subtype and detecting hepatic cancer stem cells
JP5480132B2 (ja) 2007-06-15 2014-04-23 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション Ｄｒｏｓｈａ媒介性のマイクロｒｎａプロセッシングを標的するための癌原性ａｌｌ−１融合タンパク質
CN101809169B (zh) 2007-07-31 2013-07-17 俄亥俄州立大学研究基金会 通过靶向dnmt3a和dnmt3b恢复甲基化的方法
ES2562077T3 (es) 2007-08-03 2016-03-02 The Ohio State University Research Foundation Regiones ultraconservadas que codifican ARNnc
WO2009026487A1 (en) 2007-08-22 2009-02-26 The Ohio State University Research Foundation Methods and compositions for inducing deregulation of epha7 and erk phosphorylation in human acute leukemias
WO2009049129A1 (en) * 2007-10-11 2009-04-16 The Ohio State University Research Foundation Methods and compositions for the diagnosis and treatment of esphageal adenocarcinomas
WO2009055773A2 (en) 2007-10-26 2009-04-30 The Ohio State University Research Foundation Methods for identifying fragile histidine triad (fhit) interaction and uses thereof
EP2257647B1 (en) * 2008-02-28 2016-09-14 The Ohio State University Research Foundation Micro rna-based methods and compositions for the diagnosis of gastric cancer
US9125923B2 (en) 2008-06-11 2015-09-08 The Ohio State University Use of MiR-26 family as a predictive marker for hepatocellular carcinoma and responsiveness to therapy
GB2465088C (en) * 2008-10-30 2016-01-27 Caris Mpi Inc miRNA expression in the characterisation and classification of cancer
BRPI0919882A8 (pt) 2008-10-30 2017-09-19 Caris Life Sciences Luxembourg Holdings Métodos para avaliar padrões de rna
US8628927B2 (en) 2008-11-07 2014-01-14 Sequenta, Inc. Monitoring health and disease status using clonotype profiles
CA2742380C (en) 2008-11-07 2018-05-29 Sequenta, Inc. Methods of monitoring conditions by sequence analysis
US8691510B2 (en) 2008-11-07 2014-04-08 Sequenta, Inc. Sequence analysis of complex amplicons
US9365901B2 (en) 2008-11-07 2016-06-14 Adaptive Biotechnologies Corp. Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in B-cell acute lymphoblastic leukemia
US9506119B2 (en) 2008-11-07 2016-11-29 Adaptive Biotechnologies Corp. Method of sequence determination using sequence tags
US9528160B2 (en) 2008-11-07 2016-12-27 Adaptive Biotechnolgies Corp. Rare clonotypes and uses thereof
US8748103B2 (en) 2008-11-07 2014-06-10 Sequenta, Inc. Monitoring health and disease status using clonotype profiles
JP2012508577A (ja) 2008-11-12 2012-04-12 カリス ライフ サイエンシズ ルクセンブルク ホールディングス 表現型を決定するためのエキソソームの使用方法およびそのシステム
DK2387627T3 (en) 2009-01-15 2016-07-04 Adaptive Biotechnologies Corp Adaptive immunity profiling and methods for producing monoclonal antibodies
WO2010135692A2 (en) 2009-05-22 2010-11-25 Asuragen, Inc. Mirna biomarkers of prostate disease
US20100330571A1 (en) 2009-06-25 2010-12-30 Robins Harlan S Method of measuring adaptive immunity
EP2283846A1 (en) * 2009-08-12 2011-02-16 Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V. miRNA compounds for treatment of prostate carcinoma
US8822144B2 (en) 2009-08-19 2014-09-02 Rosetta Genomics Ltd. Compositions and methods for prognosis and treatment of prostate cancer
EP2316972A1 (en) * 2009-10-29 2011-05-04 Deutsches Krebsforschungszentrum Circulating miRNAs as non-invasive markers for diagnosis and staging in prostate cancer
US9043160B1 (en) 2009-11-09 2015-05-26 Sequenta, Inc. Method of determining clonotypes and clonotype profiles
AU2010321555B2 (en) 2009-11-23 2015-10-15 The Ohio State University Materials and methods useful for affecting tumor cell growth, migration and invasion
WO2011068918A1 (en) * 2009-12-02 2011-06-09 The Johns Hopkins University Compositions and methods for treatment of cancer using tissue-specific oncolytic adenoviruses
EP2341145A1 (en) 2009-12-30 2011-07-06 febit holding GmbH miRNA fingerprint in the diagnosis of diseases
AU2011223789A1 (en) 2010-03-01 2012-09-20 Caris Life Sciences Switzerland Holdings Gmbh Biomarkers for theranostics
BR112012025593A2 (pt) 2010-04-06 2019-06-25 Caris Life Sciences Luxembourg Holdings biomarcadores em circulação para doença
JP5931897B2 (ja) 2010-11-12 2016-06-08 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイションＴｈｅ Ｏｈｉｏ Ｓｔａｔｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ マイクロｒｎａ−２１、ミスマッチ修復および結腸直腸癌に関連する物質および方法
WO2012068147A1 (en) 2010-11-15 2012-05-24 The Ohio State University Research Foundation Controlled release mucoadhesive systems
PL237807B1 (pl) * 2010-12-22 2021-05-31 Wroclawskie Centrum Badan Eit Spolka Z Ograniczona Odpowiedzialnoscia Sposób różnicowania zmian nowotworowych tarczycy oraz zastosowanie metalotioneiny (MT) do różnicowania zmian nowotworowych tarczycy
JPWO2012121178A1 (ja) * 2011-03-04 2014-07-17 独立行政法人国立がん研究センター 腫瘍血管形成阻害剤
EP2683387A4 (en) 2011-03-07 2014-09-03 Univ Ohio State MUTATOR ACTIVITY INDUCED BY MICRORNA-155 (miR-155) LINKS INFLAMMATION AND CANCER
JP2014515024A (ja) 2011-04-12 2014-06-26 ベス イスラエル デアコネス メディカル センター， インコーポレイテッド マイクロｒｎａ阻害剤および疾患におけるその使用
CN103797131A (zh) * 2011-06-16 2014-05-14 卡里斯生命科学卢森堡控股有限责任公司 生物标志物组合物和方法
US10385475B2 (en) 2011-09-12 2019-08-20 Adaptive Biotechnologies Corp. Random array sequencing of low-complexity libraries
WO2013056217A1 (en) 2011-10-14 2013-04-18 The Ohio State University Methods and materials related to ovarian cancer
US9279159B2 (en) 2011-10-21 2016-03-08 Adaptive Biotechnologies Corporation Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells
SE536352C2 (sv) * 2011-10-24 2013-09-03 Chundsell Medicals Ab Markörgener för klassificiering av prostatacancer
EP3106168A3 (en) * 2011-11-30 2017-02-22 Cedars-Sinai Medical Center Targeting micrornas mir-409-5p, mir-379 and mir-154* to treat prostate cancer bone metastasis and drug resistant lung cancer
US9745578B2 (en) * 2011-11-30 2017-08-29 Cedars-Sinai Medical Center Targeting microRNA miR-409-3P to treat prostate cancer
CN102443638B (zh) * 2011-12-05 2014-04-09 南京医科大学 一种用于血清/血浆miRNA检测的内参及其应用
EP3388535B1 (en) 2011-12-09 2021-03-24 Adaptive Biotechnologies Corporation Diagnosis of lymphoid malignancies and minimal residual disease detection
CA2858382A1 (en) * 2011-12-10 2013-06-13 Ohio State Innovation Foundation Mirnas useful to reduce lung cancer tumorigenesis and chemotherapy resistance and related compositons and methods
CA2859430A1 (en) 2011-12-13 2013-06-20 Ohio State Innovation Foundation Methods and compositions related to mir-21 and mir-29a, exosome inhibition, and cancer metastasis
US9499865B2 (en) 2011-12-13 2016-11-22 Adaptive Biotechnologies Corp. Detection and measurement of tissue-infiltrating lymphocytes
AU2013209477B2 (en) 2012-01-20 2016-12-08 The Ohio State University Breast cancer biomarker signatures for invasiveness and prognosis
US10077478B2 (en) 2012-03-05 2018-09-18 Adaptive Biotechnologies Corp. Determining paired immune receptor chains from frequency matched subunits
BR112014027309A2 (pt) 2012-05-08 2017-07-11 Adaptive Biotechnologies Corp composições e métodos para medir e calibrar a tendên-cia de amplificação em reações de pcr multiplexadas
GB2505237A (en) * 2012-08-24 2014-02-26 Stefan Grimm Method of screening for therapeutic agents using cell lines including a reference cell line
AU2013317818A1 (en) * 2012-09-23 2015-04-09 The Ohio State University Use of miR-494 to modulate trail-induced apoptosis through BIM down-regulation
EP3640343A1 (en) 2012-10-01 2020-04-22 Adaptive Biotechnologies Corporation Immunocompetence assessment by adaptive immune receptor diversity and clonality characterization
AU2014239309B2 (en) 2013-03-15 2020-03-05 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. miRNA biogenesis in exosomes for diagnosis and therapy
CN103215359A (zh) * 2013-04-11 2013-07-24 百瑞德（南京）生物科技有限公司 一种前列腺癌生物标志物miR-21*、诊断试剂盒及应用
SG11201508058TA (en) * 2013-04-15 2015-10-29 Regeneron Pharma Markers of tumor cell response to anti-cancer therapy
US9708657B2 (en) 2013-07-01 2017-07-18 Adaptive Biotechnologies Corp. Method for generating clonotype profiles using sequence tags
US20160237505A1 (en) * 2013-10-15 2016-08-18 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Serum mirnas for the prognosis of prostate cancer
CA2941612A1 (en) 2014-03-05 2015-09-11 Adaptive Biotechnologies Corporation Methods using randomer-containing synthetic molecules
US10066265B2 (en) 2014-04-01 2018-09-04 Adaptive Biotechnologies Corp. Determining antigen-specific t-cells
EP3132059B1 (en) 2014-04-17 2020-01-08 Adaptive Biotechnologies Corporation Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells
KR20170007317A (ko) * 2014-05-01 2017-01-18 스티칭 브이유엠씨 바이오마커로서의 소형 ncrna
EP3800253A3 (en) 2014-06-12 2021-07-28 Toray Industries, Inc. Prostate cancer detection kit or device, and detection method
CN104138603A (zh) * 2014-07-02 2014-11-12 上海交通大学医学院附属仁济医院 应用microRNA-7抑制前列腺肿瘤生长及其肿瘤进程
CN104278100B (zh) * 2014-10-16 2016-02-10 上海交通大学医学院附属仁济医院 miRNA-188作为标记分子在制备诊断试剂中的用途
ES2784343T3 (es) 2014-10-29 2020-09-24 Adaptive Biotechnologies Corp Detección simultánea altamente multiplexada de ácidos nucleicos que codifican heterodímeros de receptores inmunes adaptativos emparejados de muchas muestras
US10246701B2 (en) 2014-11-14 2019-04-02 Adaptive Biotechnologies Corp. Multiplexed digital quantitation of rearranged lymphoid receptors in a complex mixture
EP3498866A1 (en) 2014-11-25 2019-06-19 Adaptive Biotechnologies Corp. Characterization of adaptive immune response to vaccination or infection using immune repertoire sequencing
CN104651492B (zh) * 2015-01-06 2017-10-03 中国人民解放军第二军医大学 miRNA410‑在制备前列腺癌诊断试剂盒中的应用
WO2016119113A1 (zh) * 2015-01-26 2016-08-04 中国科学院动物研究所 miRNA对m6A修饰水平的调控方法及其应用
ES2858306T3 (es) 2015-02-24 2021-09-30 Adaptive Biotechnologies Corp Método para determinar el estado de HLA mediante secuenciación del repertorio inmunitario
WO2016161273A1 (en) 2015-04-01 2016-10-06 Adaptive Biotechnologies Corp. Method of identifying human compatible t cell receptors specific for an antigenic target
CN104894251A (zh) * 2015-05-28 2015-09-09 基因科技（上海）有限公司 一种避免miRNA定量检测中因荧光探针标记不彻底而引起背景扩增的方法
CA2988585A1 (en) 2015-06-10 2016-12-15 Raghu Kalluri Use of exosomes for the treatment of disease
CN105056250B (zh) * 2015-07-15 2018-01-05 中国农业大学 一种microRNA在制备治疗前列腺癌的药物中的应用
WO2017059549A1 (en) * 2015-10-08 2017-04-13 Genomedx Biosciences, Inc. Use of a genetic signature diagnostically to evaluate treatment strategies for prostate cancer
CN106636310B (zh) * 2015-10-30 2020-06-02 益善生物技术股份有限公司 前列腺癌相关microRNA检测试剂盒
CN105243293B (zh) * 2015-11-06 2019-04-19 吴志宏 前列腺相关癌基因信息收集及分析系统和方法
KR102397683B1 (ko) * 2016-07-13 2022-05-13 소마젠 인크 미생물 약물유전체학을 위한 방법 및 시스템
WO2018039490A1 (en) 2016-08-24 2018-03-01 Genomedx Biosciences, Inc. Use of genomic signatures to predict responsiveness of patients with prostate cancer to post-operative radiation therapy
US10428325B1 (en) 2016-09-21 2019-10-01 Adaptive Biotechnologies Corporation Identification of antigen-specific B cell receptors
US11236337B2 (en) 2016-11-01 2022-02-01 The Research Foundation For The State University Of New York 5-halouracil-modified microRNAs and their use in the treatment of cancer
US11584932B2 (en) 2016-11-01 2023-02-21 The Research Foundation For The State University Of New York 5-halouracil-modified microRNAs and their use in the treatment of cancer
CA3055925A1 (en) 2017-03-09 2018-09-13 Decipher Biosciences, Inc. Subtyping prostate cancer to predict response to hormone therapy
MX2019011215A (es) 2017-03-24 2020-02-12 Curevac Ag Ácidos nucleicos que codifican proteínas asociadas a crispr y usos de los mismos.
CN109593835B (zh) * 2017-09-29 2023-12-12 深圳华大基因股份有限公司 用于微量ffpe rna样本评估的方法、试剂盒及应用
AU2018364987A1 (en) * 2017-11-12 2020-04-23 The Regents Of The University Of California Non-coding RNA for detection of cancer
US11254980B1 (en) 2017-11-29 2022-02-22 Adaptive Biotechnologies Corporation Methods of profiling targeted polynucleotides while mitigating sequencing depth requirements
CN108018354A (zh) * 2017-12-19 2018-05-11 贵州医科大学 MicroRNA-34在抑制前列腺癌转移治疗中的新用途
US11535899B2 (en) 2018-08-10 2022-12-27 Toray Industries, Inc. Kit, device and method for detecting prostate cancer
GB2617512B (en) 2019-04-05 2023-12-27 Earli Inc Improved methods and compositions for synthetic biomarkers
CN111249552B (zh) * 2020-03-16 2020-11-17 南京鼓楼医院 基于人iPSCs诱导类肝细胞及多层多孔生物反应器的生物人工肝
CN112094910B (zh) * 2020-09-25 2023-03-24 无锡市中医医院 一种用于前列腺癌患病风险评估的miRNA标志物
CN114272378B (zh) * 2020-09-27 2023-06-23 四川大学华西医院 一种使cttnbp2nl功能缺失的试剂在制备治疗疾病的药物中的用途
EP4317454A4 (en) * 2021-03-29 2025-02-19 Toray Industries METHOD FOR DETECTING MICRORNA IN BIOLOGICAL SAMPLE, COMPOSITION OF NEUTRAL AMINO ACID HYDROCHLORIDE AND CONTAINER
CN114540496A (zh) * 2022-02-25 2022-05-27 东南大学 miR-7在制备/筛选前列腺癌诊治产品中的应用
WO2024097892A1 (en) * 2022-11-03 2024-05-10 Mirimus, Inc. Regulation of artificial mirnas by endogenous tissue-specific mirnas and methods of using the same

Family Cites Families (91)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4196265A (en) * 1977-06-15 1980-04-01 The Wistar Institute Method of producing antibodies
US4608337A (en) * 1980-11-07 1986-08-26 The Wistar Institute Human hybridomas and the production of human monoclonal antibodies by human hybridomas
US5015568A (en) * 1986-07-09 1991-05-14 The Wistar Institute Diagnostic methods for detecting lymphomas in humans
US5202429A (en) * 1986-07-09 1993-04-13 The Wistar Institute DNA molecules having human BCL-2 gene sequences
US5198338A (en) * 1989-05-31 1993-03-30 Temple University Molecular probing for human t-cell leukemia and lymphoma
US5633135A (en) * 1991-12-11 1997-05-27 Thomas Jefferson University Chimeric nucleic acids and proteins resulting from ALL-1 region chromosome abnormalities
US6040140A (en) * 1991-12-11 2000-03-21 Thomas Jefferson University Methods for screening and treating leukemias resulting from all-1 region chromosome abnormalities
WO1993012136A1 (en) * 1991-12-11 1993-06-24 Thomas Jefferson University Detection and treatment of acute leukemias resulting from chromosome abnormalities in the all-1 region
US5674682A (en) * 1992-10-29 1997-10-07 Thomas Jefferson University Nucleic acid primers for detecting micrometastasis of prostate cancer
CA2148350A1 (en) * 1992-10-29 1994-05-11 Carlo Croce Methods of detecting micrometastasis of prostate cancer
US5985598A (en) * 1994-10-27 1999-11-16 Thomas Jefferson University TCL-1 gene and protein and related methods and compositions
US7175995B1 (en) * 1994-10-27 2007-02-13 Thomas Jefferson University TCL-1 protein and related methods
US5928884A (en) * 1996-02-09 1999-07-27 Croce; Carlo M. FHIT proteins and nucleic acids and methods based thereon
US6242212B1 (en) * 1996-02-09 2001-06-05 Thomas Jefferson University Fragile histidine triad (FHIT) nucleic acids and methods of producing FHIT proteins
US6187536B1 (en) * 1997-02-18 2001-02-13 Thomas Jefferson University Methods of identifying and detecting pancreatic cancer
AU6951098A (en) * 1997-04-04 1998-10-30 The Texas A & M University System Noninvasive detection of colonic biomarkers using fecal messenger rna
US6303323B1 (en) * 1997-10-21 2001-10-16 Cancer Research Campaign Technology Limited Detection of dysplastic or neoplastic cells using anti-MCM5 antibodies
WO2000003685A2 (en) * 1998-07-20 2000-01-27 Thomas Jefferson University Nitrilase homologs
AU5128999A (en) * 1998-07-24 2000-02-14 Yeda Research And Development Co. Ltd. Prevention of metastasis with 5-aza-2'-deoxycytidine
US7141417B1 (en) * 1999-02-25 2006-11-28 Thomas Jefferson University Compositions, kits, and methods relating to the human FEZ1 gene, a novel tumor suppressor gene
EP1276879A4 (en) * 2000-04-11 2004-12-22 Univ Jefferson MUIR-TORRE-LIKE SYNDROME IN Fhit-DEFECTIVE MICE
US20020086331A1 (en) * 2000-05-16 2002-07-04 Carlo Croce Crystal structure of worm NitFhit reveals that a Nit tetramer binds two Fhit dimers
US7060811B2 (en) * 2000-10-13 2006-06-13 Board Of Regents, The University Of Texas System WWOX: a tumor suppressor gene mutated in multiple cancers
US20040033502A1 (en) * 2001-03-28 2004-02-19 Amanda Williams Gene expression profiles in esophageal tissue
EP2385123B1 (en) * 2001-09-28 2018-04-25 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Microrna molecules
US7371736B2 (en) * 2001-11-07 2008-05-13 The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas Gene expression profiling based identification of DKK1 as a potential therapeutic targets for controlling bone loss
GB0128898D0 (en) * 2001-12-03 2002-01-23 Biotech Res Ventures Pte Ltd Materials and methods relating to the stabilization and activation of a tumour suppressor protein
AU2003226279A1 (en) * 2002-04-08 2003-10-27 Ciphergen Biosystems, Inc. Serum biomarkers in hepatocellular carcinoma
DE60329836D1 (de) * 2002-04-29 2009-12-10 Univ Jefferson Humane chronische lymphozytische leukämie im mausmodell durch gezielte expression von tcl1
WO2003102215A2 (en) * 2002-05-31 2003-12-11 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods of identifying and isolating stem cells and cancer stem cells
CA2501602A1 (en) * 2002-10-11 2004-04-22 Thomas Jefferson University Novel tumor suppressor gene and compositions and methods for making and using the same
US20040152112A1 (en) * 2002-11-13 2004-08-05 Thomas Jefferson University Compositions and methods for cancer diagnosis and therapy
WO2004071464A2 (en) * 2003-02-12 2004-08-26 Johns Hopkins University School Of Medicine Diagnostic application of differentially-expressed genes in lympho-hematopoietic stem cells
US20050069918A1 (en) * 2003-05-29 2005-03-31 Francois Claret JAB1 as a prognostic marker and a therapeutic target for human cancer
US8106180B2 (en) * 2003-08-07 2012-01-31 Whitehead Institute For Biomedical Research Methods and products for expression of micro RNAs
US20050037362A1 (en) * 2003-08-11 2005-02-17 Eppendorf Array Technologies, S.A. Detection and quantification of siRNA on microarrays
WO2005028675A2 (en) * 2003-09-24 2005-03-31 Oncotherapy Science, Inc. Methods for detecting, diagnosing and treating hepatocellular carcinomas (hcc)
JP2007514442A (ja) * 2003-12-19 2007-06-07 ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア 前立腺癌治療を評価するための方法および物質
WO2005078139A2 (en) * 2004-02-09 2005-08-25 Thomas Jefferson University DIAGNOSIS AND TREATMENT OF CANCERS WITH MicroRNA LOCATED IN OR NEAR CANCER-ASSOCIATED CHROMOSOMAL FEATURES
WO2005111211A2 (en) * 2004-05-14 2005-11-24 Rosetta Genomics Ltd. Micronas and uses thereof
EP2290067B1 (en) * 2004-05-28 2014-12-10 Asuragen, Inc. Methods and compositions involving microRNA
US7635563B2 (en) * 2004-06-30 2009-12-22 Massachusetts Institute Of Technology High throughput methods relating to microRNA expression analysis
US20060037088A1 (en) * 2004-08-13 2006-02-16 Shulin Li Gene expression levels as predictors of chemoradiation response of cancer
US7642348B2 (en) * 2004-10-04 2010-01-05 Rosetta Genomics Ltd Prostate cancer-related nucleic acids
FR2877350B1 (fr) * 2004-11-03 2010-08-27 Centre Nat Rech Scient IDENTIFICATION ET UTILISATION DE miRNAs IMPLIQUES DANS LA DIFFERENCIATION DE CELLULES ISSUES D'UNE LEUCEMIE MYELOIDE
EP2281889B1 (en) * 2004-11-12 2014-07-30 Asuragen, Inc. Methods and compositions involving miRNA and miRNA inhibitor molecules
WO2006066158A2 (en) * 2004-12-14 2006-06-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Rnai modulation of mll-af4 and uses thereof
EP1838870A2 (en) * 2004-12-29 2007-10-03 Exiqon A/S NOVEL OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND PROBE SEQUENCES USEFUL FOR DETECTION AND ANALYSIS OF MICRORNAS AND THEIR TARGET MRNAs
WO2006081284A2 (en) * 2005-01-25 2006-08-03 Rosetta Inpharmatics Llc Methods for quantitating small rna molecules
US20070065840A1 (en) * 2005-03-23 2007-03-22 Irena Naguibneva Novel oligonucleotide compositions and probe sequences useful for detection and analysis of microRNAS and their target mRNAS
US20090209621A1 (en) * 2005-06-03 2009-08-20 The Johns Hopkins University Compositions and methods for decreasing microrna expression for the treatment of neoplasia
US20070065844A1 (en) * 2005-06-08 2007-03-22 Massachusetts Institute Of Technology Solution-based methods for RNA expression profiling
AU2006279906B2 (en) * 2005-08-10 2012-05-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Chemically modified oligonucleotides for use in modulating micro RNA and uses thereof
CN101296702B (zh) * 2005-09-12 2012-11-28 俄亥俄州立大学研究基金会 用于诊断或治疗bcl2相关癌症的组合物和方法
US7390792B2 (en) * 2005-12-15 2008-06-24 Board Of Regents, The University Of Texas System MicroRNA1 therapies
CA2635616A1 (en) * 2006-01-05 2007-07-19 Carlo M. Croce Microrna expression abnormalities in pancreatic endocrine and acinar tumors
EP2487263B1 (en) * 2006-01-05 2014-03-19 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA-based methods and compositions for the diagnosis and treatment of solid cancers of the pancreas
US7667090B2 (en) * 2006-04-24 2010-02-23 The Ohio State University Research Foundation Transgenic mouse model of B cell malignancy
JPWO2007126150A1 (ja) * 2006-04-27 2009-09-17 国立大学法人名古屋大学 癌の新規治療用組成物
WO2007140352A2 (en) * 2006-05-26 2007-12-06 Invitrogen Corporation Plasma membrane and secreted cancer biomarkers
US9200275B2 (en) * 2006-06-14 2015-12-01 Merck Sharp & Dohme Corp. Methods and compositions for regulating cell cycle progression
EP2061907B1 (en) * 2006-09-19 2011-11-23 The Ohio State University Research Foundation Tcl1 expression in chronic lymphocytic leukemia (cll) regulated by mir-29 and mir-181
WO2008036765A2 (en) * 2006-09-19 2008-03-27 Asuragen, Inc. Micrornas differentially expressed in pancreatic diseases and uses thereof
JP2010510964A (ja) * 2006-09-19 2010-04-08 アシュラジェン インコーポレイテッド 治療的介入の標的としての、ｍｉＲ−１５、ｍｉＲ−２６、ｍｉＲ−３１、ｍｉＲ−１４５、ｍｉＲ−１４７、ｍｉＲ−１８８、ｍｉＲ−２１５、ｍｉＲ−２１６、ｍｉＲ−３３１、ｍｍｕ−ｍｉＲ−２９２−３ｐによって調節される遺伝子および経路
WO2008036741A2 (en) * 2006-09-19 2008-03-27 Asuragen, Inc. Mir-200 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
AU2007314212B2 (en) * 2006-11-01 2014-05-29 The Govt. Of The Usa As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services MicroRNA expression signature for predicting survival and metastases in Hepatocellular carcinoma
US8293684B2 (en) * 2006-11-29 2012-10-23 Exiqon Locked nucleic acid reagents for labelling nucleic acids
WO2008070082A2 (en) * 2006-12-04 2008-06-12 The Johns Hopkins University Stem-progenitor cell specific micro-ribonucleic acids and uses thereof
WO2008073919A2 (en) * 2006-12-08 2008-06-19 Asuragen, Inc. Mir-20 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
CA2671294A1 (en) * 2006-12-08 2008-06-19 Asuragen, Inc. Mir-21 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
AU2007333109A1 (en) * 2006-12-08 2008-06-19 Asuragen, Inc. Functions and targets of let-7 micro RNAs
CN101622348A (zh) * 2006-12-08 2010-01-06 奥斯瑞根公司 作为治疗性干预靶标的miR-20调节的基因和途径
US20090175827A1 (en) * 2006-12-29 2009-07-09 Byrom Mike W miR-16 REGULATED GENES AND PATHWAYS AS TARGETS FOR THERAPEUTIC INTERVENTION
EP1944609A1 (en) * 2007-01-10 2008-07-16 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) In vitro method for diagnosing prostate cancer
JP2010516291A (ja) * 2007-01-31 2010-05-20 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション 急性骨髄性白血病（ａｍｌ）の診断、予後及び治療のためのマイクロｒｎａに基づく方法及び組成物
WO2008112283A2 (en) * 2007-03-12 2008-09-18 Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Microrna profiling of androgen responsiveness for predicting the appropriate prostate cancer treatment
EP2481806B1 (en) * 2007-04-30 2016-11-09 The Ohio State University Research Foundation Methods for pancreatic cancer prognosis
US20090005336A1 (en) * 2007-05-08 2009-01-01 Zhiguo Wang Use of the microRNA miR-1 for the treatment, prevention, and diagnosis of cardiac conditions
US20090131354A1 (en) * 2007-05-22 2009-05-21 Bader Andreas G miR-126 REGULATED GENES AND PATHWAYS AS TARGETS FOR THERAPEUTIC INTERVENTION
US20090099034A1 (en) * 2007-06-07 2009-04-16 Wisconsin Alumni Research Foundation Reagents and Methods for miRNA Expression Analysis and Identification of Cancer Biomarkers
JP5480132B2 (ja) * 2007-06-15 2014-04-23 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション Ｄｒｏｓｈａ媒介性のマイクロｒｎａプロセッシングを標的するための癌原性ａｌｌ−１融合タンパク質
WO2009015071A1 (en) * 2007-07-23 2009-01-29 Dharmacon, Inc. Screening of micro-rna cluster inhibitor pools
ES2562077T3 (es) * 2007-08-03 2016-03-02 The Ohio State University Research Foundation Regiones ultraconservadas que codifican ARNnc
US20090061424A1 (en) * 2007-08-30 2009-03-05 Sigma-Aldrich Company Universal ligation array for analyzing gene expression or genomic variations
KR101889518B1 (ko) * 2007-10-04 2018-08-17 로슈 이노베이션 센터 코펜하겐 에이/에스 마이크로ＭＩＲｓ
US20090123933A1 (en) * 2007-11-12 2009-05-14 Wake Forest University Health Sciences Microrna biomarkers in lupus
US8071562B2 (en) * 2007-12-01 2011-12-06 Mirna Therapeutics, Inc. MiR-124 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
US20090192114A1 (en) * 2007-12-21 2009-07-30 Dmitriy Ovcharenko miR-10 Regulated Genes and Pathways as Targets for Therapeutic Intervention
SG190670A1 (en) * 2008-02-01 2013-06-28 Gen Hospital Corp Use of microvesicles in diagnosis, prognosis and treatment of medical diseases and conditions
JP2012508577A (ja) * 2008-11-12 2012-04-12 カリス ライフ サイエンシズ ルクセンブルク ホールディングス 表現型を決定するためのエキソソームの使用方法およびそのシステム
WO2010056993A2 (en) * 2008-11-14 2010-05-20 Emory University Prostate cancer biomarkers to predict recurrence and metastatic potential

Also Published As

Publication number Publication date
US20170211066A1 (en) 2017-07-27
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AU2009219197A1 (en) 2009-09-03
JP2011517283A (ja) 2011-06-02
WO2009108860A8 (en) 2011-01-27
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AU2014202735A1 (en) 2014-06-12
EP2799557B1 (en) 2016-09-07

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Wolska-Gawron et al. Circulating miRNA-181b-5p, miRNA-223-3p, miRNA-210-3p, let 7i-5p, miRNA-21-5p and miRNA-29a-3p in patients with localized scleroderma as potential biomarkers
Luo et al. Exosomal microRNA-10a is associated with liver regeneration in rats through downregulation of EphA4
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Arcucci et al. The microRNA miR-132 is a key regulator of lymphatic vascular remodelling
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