CN1786195A - 转基因农产品dna检测芯片及其制备方法和应用 - Google Patents

Abstract

本发明涉及一种转基因农产品DNA检测芯片，该芯片包括片基和位于片基上的核酸探针，该核酸探针包含用于检测目标基因的目标检测探针，该目标检测探针是一系列如SEQ ID NOs.1～50所示的核苷酸序列。本发明还涉及所述转基因农产品DNA检测芯片的制备方法。本发明还提供转基因农产品DNA检测芯片在检测转基因农产品中的应用。本发明还提供一种转基因农产品DNA检测试剂盒。此外，本发明提供一种检测转基因农产品的方法。

Description

转基因农产品DNA检测芯片及其制备方法和应用

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体地涉及一种转基因农产品DNA检测芯片及其制备方法和应用。

背景技术

采用现代生物技术，培育出区别于传统育种的转基因作物(genetically modifiedorganism简记为GMO)，为农业研究方面开创了一个崭新的时代，为人类提高食物数量和质量打开了一扇前所未有的机遇之门。现代生物技术又称DNA重组技术，它在改善食物的营养质量，提高作物产量和抗病、抗虫能力、减少农药用量以及人类传染性疾病疫苗接种方面颇具潜力。近年来转基因农作物成为各国竞相研究开发的热点。近年来，转基因植物在全球种植面积和销售额增长迅速。种植转基因作物的国家由1992年的1个增加到目前的17个。国际农业生物技术应用机构(ISAAA)公布的一份报告显示，2004年全球转基因玉米、大豆、棉花和其它作物播种面积达到了2亿英亩，比2003年的1.67亿英亩增长了20％。2004年全球转基因作物种植面积占其总种植面积的百分比大豆56％、棉花28％、油菜19％、玉米14％。美国是种植转基因作物最多的国家，其转基因大豆产量已占大豆总产量的一半以上。我国政府十分重视生物技术的研究，正在研究的转基因生物有130多种，涉及的基因种类超过100种。特别是在转基因抗虫棉、转基因水稻、基因工程疫苗等领域的研究成果已居世界前列，2002年，我国转基因作物种植面积突破210万公顷，成为继美国、加拿大、巴西、阿根廷之后的转基因作物种植大国。自1997年至2003年9月，经过安全评价，农业部批准水稻、玉米、棉花、大豆、油菜、马铃薯等10多种转基因植物进入田间环境释放，批准转基因棉花、番茄、甜椒等植物和兽用微生物基因工程疫苗进入商业化生产。

伴随着转基因农产品的不断开发和推广利用，转基因食品的安全问题尚未定论，各国政府、学术界和消费者关于转基因食品安全的争议不断。人们担心这种对生物进行“任意修改”而创造出来的新型遗传基因和生物可能会有害于人类，对生态环境造成新的污染，即所谓的转基因污染，而这种新的污染源又是很难消除的。另外，目前转基因技术的手段还是不完善的，新基因的插入是随机的，远未达到定向插入的程度。面对众多消费者对GMO的疑虑和反GMO组织的强大压力，食品制造商和各国政府已经做出反应。在欧洲，1998年6月，欧共体(EU)规定要对农作物标示其是否含有GMO。2000年EU又提出GMO的混入上限须在0.9％以下。我国已经加入WTO，不可避免会面临转基因食品的贸易纠纷。国外的转基因农产品通过贸易在没有标识和申明的情况下大量进入我国市场，对我国的农业生产、经济利益、人民身体健康和生态环境带来了很大的潜在风险。针对当前我国加强食品安全管理的形势，建立我国食品安全急需的检测方法，便于管理部门对转基因食品进行追踪管理，进而保护消费者的健康和权益。尽快研究制定标准对其进行准确、快速检测显得十分迫切。2001年国家制定了《农业转基因生物安全管理条例》。为保障《条例》的实施，农业部于2002年发布了《农业转基因生物安全评价管理办法》、《农业转基因生物进口安全管理办法》和《农业转基因生物标识管理办法》三个配套规章。自2002.3.20日起施行。要求对大豆、玉米、油菜类转基因食品进行标识。

对食品中的GMOs进行检测，目前欧盟推荐的官方方法有两种。一是基于DNA的检测即PCR(聚合酶链反应)，二基于蛋白的检测即LISA(酶联免疫反应)。蛋白检测灵敏、快速。但是在加工食品中蛋白易发生变性，另外，有些蛋白只在作物的某一特定组织中表达。相对于蛋白质，DNA较稳定。即使在深加工产品中如色拉油都能检测出DNA的存在。PCR十分灵敏，但一次反应只能检测一种转基因成分。随着世界范围新的转基因作物不断涌现，已有的检测技术已不能满足大量的不同品系的转基因食品检测的需要。迫切需要有新的技术和设备满足高通量和日益增加的各种基因修饰物的低成本检测。

DNA芯片技术是转基因食品检测的最有前途的领域之一。DNA芯片技术又叫Microarray技术，是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术，其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法，将大量DNA探针片段有序地固化于支持物的表面，然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交，再对杂交信号进行检测分析，能在短时间内快速、准确地获取大量信息。DNA芯片技术具有PCR方法的同样的优点。可以精确地进行基因修饰物的定性检测。不同之处在于可以在固体表面固定上千个特定的探针。能够在一次单独的分析中筛查、定性样品中的大量的不同种类的基因修饰物。此外，DNA芯片技术非常灵活，当有新的基因修饰物出现时可以在阵列中增加布点，将新的基因序列包括在筛查程序中。

英文期刊《AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY》于2004年11月发表了一篇关于用肽核酸做探针检测转基因大豆的芯片技术文章。但只是针对转基因大豆的管家基因和外源基因设计了五个寡肽核酸探针建立了一个芯片模型进行验证，不足以用于实际应用。

中国发明专利CN1584049A公开了用于转基因农产品检测的寡核苷酸芯片技术。但是该技术所设计的检测探针均为长度在20个碱基左右的寡核苷酸探针。而所要检测的转基因农产品的外源基因一般都在几百个碱基以上，有的在1000个碱基以上。针对一个外源基因仅用一个寡核苷酸探针去检测，不足以保证检测结果的特异性。此外，为减少芯片固相杂交时的空间位阻，该技术在寡核苷酸的5′端连了一段连接臂。为了将寡核苷酸探针固定在玻片上，还对寡核苷酸的5′端进行了化学基团的修饰。这使得芯片无法摆脱昂贵的成本费用。《AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY》于2005年初发表的一篇应用DNA芯片平台技术检测5种转基因农产品的一篇文章，同样存在上述问题。

发明内容

针对现有技术的中存在的问题，本发明的一个目的是提供一种转基因农产品DNA检测芯片。

本发明的另一个目的是提供一种本发明的转基因农产品DNA检测芯片的制备方法。

本发明的另一个目的是提供本发明的转基因农产品DNA检测芯片在检测转基因农产品中的应用。

本发明的另一目的是提供一种转基因农产品DNA检测试剂盒。

本发明的另一个目的是提供一种检测转基因农产品的方法。

本发明在使用官方认可的通用引物和特异性引物的同时，根据从相关数据库收集和多种途径获取的序列资料自行设计转基因大豆Round-upready、转基因玉米MON810、转基因玉米GA21、转基因玉米NK603、转基因油菜籽MS1RF1、转基因油菜籽T45和转基因大米SCK四种转基因作物的7个品系的外源基因的通用引物和特异引物进行退火温度一致性和特异性的筛选，通过大量的筛选工作建立了稳定的PCR体系。通过DNA重组技术构建含有外源基因片段的质粒，并以质粒做模板进行PCR扩增，产物经纯化制备成特异性较高的双链DNA固定探针，对各项指标进行优化后，将固定探针布点在氨基化的玻片上，制备成应用于转基因农产品检测DNA芯片。芯片与多重PCR体系扩增的Cy5标记的待测样品杂交，12个小时后通过芯片扫描仪进行扫描分析，根据杂交信号直观地判读该样品中所含有的外源目标基因情况。

因此，根据本发明的一个方面，提供一种转基因农产品DNA检测芯片，该芯片包括片基和位于片基上的核酸探针，该芯片包括片基和位于片基上的核酸探针，该核酸探针包括以下一系列检测目标基因的目标检测探针：检测hpt的SEQ ID NOs：1～4中的至少一个，检测nptII的SEQ ID NOs：5～9中的至少一个，检测pnos的NOs：10～13中的至少一个，检测nos的SEQ ID NOs：l4～16中的至少一个，检测camv35s的SEQ ID NOs：17～19中的至少一个，检测mdb484-mdb501的SEQ ID NO：20，检测barstar的SEQ ID NOs：21～23中的至少一个，检测barnase的SEQ ID NOs：24～26中的至少一个，检测cpti的SEQID NOs：27～30中的至少一个，检测mcp4epsps的SEQ ID NOs：31～34中的至少一个，检测cryIA(b)的SEQ ID NOs：35～37中的至少一个，检测cp4epsps的SEQ ID NOs：38～40中的至少一个，检测rbcl的SEQ ID NO：41，检测lectin的SEQ ID NOs：42～44中的至少一个，检测zein的SEQ ID NOs：45～47中的至少一个，检测napin的SEQ ID NOs：48～50中的至少一个。检测探针序列见表1。

                                          表1

基因	探针长度bp	SEQ ID NO	基因	探针长度bp	SEQ ID NO
						hpt①	283	1	cpti①	315	27
hpt②	215	2	cpti②	352	28
						hpt③	488	3	cpti③	209	29
hpt④	441	4	cpti④	370	30
						nptII①	486	5	mcp4epsp①	337	31
nptII②	364	6	mcp4epsps②	236	32
						nptIU③	489	7	mcp4epsps③	335	33
nptII④	325	8	mcp4epsps④	378	34
						nptII⑤	466	9	cryIA(b)①	488	35
pnos①	283	10	cryIA(b)②	473	36
						pnos②	231	11	cryIA(b)③	354	37
pnos③	219	12	cp4epsps①	294	38
						pnos④	225	13	cp4epsps②	236	39
nos①	213	14	cp4epsps③	427	40
						nos②	180	15	rbcl	433	41
nos③	104	16	lectin①	414	42
						camv35s①	162	17	lectin②	407	43
camv35s②	195	18	lectin③	348	44
						camv35s③	239	19	zein①	485	45
mdb484-mdb501	220	20	zein②	277	46
						barstar①	224	21	zein③	329	47
barstar②	216	22	napin①	369	48
						barstar③	248	23	napin②	488	49
barnase①	300	24	napin③	325	50
						barnase②	213	25	spvc	484	51
barnase③	237	26

如SEQ ID NOs.1～50所述，本发明使用的探针多为200个核苷酸以上的长序列，这种长序列，与现有技术中只有20个核苷酸的寡核苷酸探针相比，保证了杂交的特异性，结果更为可靠。

另外，为了监控杂交反应结果，设有严格的质控。50％的DMSO(二甲基亚砜)点样液做阴性对照，非点样区做空白对照。若杂交后阴性对照点和空白对照点检测无信号，表明正常；若有信号，表明杂交失败。

为了监控杂交反应中假阴性的出现，特设立阳性对照，该阳性对照探针为一段与目标检测基因无关的核苷酸片段(例如，鼠伤寒沙门氏菌spvc基因片段，例如SEQ ID NO.51)，且与所有的固定探针的杂交条件一致，可以和其他探针一同固定在芯片上。在每次杂交检测时，将标记有Cy5的鼠伤寒沙门氏菌spvc基因片段掺比到待测目标基因中同芯片进行杂交，若杂交后检测有信号，表明正常；若无信号，表明杂交失败。

其中的管家基因(lectin、zein、napin和rbcl)检测探针可作为另一阳性对照，不仅可以监控杂交体系出现的假阴性，还可以监控杂交之前，样品经多重PCR标记体系出现的假阴性。同时还可以解释待测样品中所检出的外源基因的准确来源。因为许多农作物产品会被土壤中的细菌污染，而大多数转基因农产品中所插入的启动子和终止子是来自土壤中的细菌的，所以管家基因的信号可以准确地辨别出外源基因特别是启动子和终止子的来源。避免了假阳性结果。

为了监控杂交反应中非特异信号出现，芯片上各矩阵中的不同探针可以互为对照。经已知的样品进行验证表明杂交信号显示的检测结果准确。所述探针在芯片上的布阵没有特别的限制，可以是任意进行布阵，为了有利于检测的方便，可以将探针按检测的外源基因的不同功能进行矩阵排布，例如将检测具有相同检测功能的探针分为一个矩阵，如实施例7所述，可以将探针分为有筛选作用的A矩阵；有定性作用的B矩阵，检测管家基因的C矩阵等；当然，也可以将所述探针按照所检测的农产品的不同进行矩阵排布，例如将用于检测和鉴定同一农产品的探针放在一个矩阵中，如实施例6所示，例如可以将检测大豆的探针作为一个矩阵，将检测玉米的所有探针作为一个矩阵，当然，也可以将检测油菜的探针作为一个矩阵。

为了监控杂交结果的可靠性，每个探针在芯片上至少重复2个点，例如至少重复3个点，至少4个点，至少5个点，至少6个点，同时兼顾到经济因素和操作方便，优选重复3、4或5个点。在杂交后同一探针的所有点若信号一致，表明正常；若有的有信号，有的无信号则结果不可信，需要重新进行实验来进一步验证。

本发明的农产品包括农产品原材料及其加工食品，所述农产品原材料包括大豆、玉米、大米或油菜，以及其他含有或可能含有相关检测目标基因的农产品，包括但不限于新鲜或干燥的根、茎、叶、花、果实、种子等；所述农产品加工食品包括进行简单的机械加工获得的产品，例如由种子获得的面粉、大米、脱壳的大豆、油菜籽等，也包括进行深加工所获得的产品，例如大豆油、玉米油、菜籽油等，也包括由农产品原材料制成的食品，例如糕点、香肠等。

本发明的检测范围涵盖目前常见的转基因作物的外源目标基因：camv35vs启动子、nos启动子、nos终止子、标记基因hpt、nptII、外源目标基因cp4epsps、cryIA(b)、mcp4epsps、cpti、barnase、barstar、mdb484-mdb501和作为内源参照基因的管家基因lectin、zein、napin和rbcl。

另一方面，本发明提供一种转基因农产品DNA检测芯片的制备方法，该方法包括：

(1)根据转基因农产品的目标基因序列设计并合成聚合酶链式反应引物，这些聚合酶链式反应引物的解链温度大致相同；

(2)利用(1)所述的聚合酶链式反应引物从转基因农产品的DNA中扩增目标检测探针；

(3)将所述探针固定在片基上。

本发明在对芯片探针引物的设计上的独特之处在于：对于筛选检测中常见的基因如启动子、终止子、抗生素抗性基因和标记基因要尽量设计通用引物，而在定性检测时所设计的引物要有很好的特异性且要尽量在目标基因的编码区内，以避免和其他探针具有同源性，从而减少检测结果的假阳性。但为了增加检测的信息量，为判断转基因作物种类或品系提供进一步的支持，可以设计连接区的一些引物，制得连接区的探针布点在芯片上，根据组合的情况对芯片的结果进行判读。另外，所有引物必须保证基本上在同一退火温度，PCR产物的长度要求比较一致，且扩增效率良好。这样对于样品的混合PCR放大、标记过程以及芯片的杂交过程中温度及其他条件的控制极为有利，同时对引物间的相互影响及扩增效率的影响降到最低。

针对以上原则，本研究在尽量使用官方认可的通用引物和特异性引物(详见表2)的同时，也根据实验需要按获取的序列资料自行设计通用引物和特异性引物(详见表3)，这些引物对尚未建立的检测目标基因是个重要的补充。在设计出的170对引物中筛选出16个基因的50对引物作为制备探针及多重PCR标记的引物。在今后芯片的实际应用中，这50对引物所表达的信息量可以基本满足目前所研究的转基因食品的检测标准。检测范围涵盖了以下目前常见的转基因作物的外源目标基因：camv35S启动子、nos启动子、nos终止子、标记基因hpt、nptII、外源目标基因cp4epsps、cryIA(b)、mcp4epsps、cpti、barnase、barstar、mdb484-mdb501和作为内源参照基因的管家基因lectin、zein、napin和rbcl。

经过发明人大量的实验和研究，本发明最终确定了适用于本发明的引物序列，并列表如下：

参考文献的引物

                                          表2

目标基因	用于扩增目标基因的引物序列	SEQ ID NO
			nos(Ti胭脂碱合成酶终止子)①	U5′GATTGAATCCTGTTGCCGGT3′	52
L5′GTAACATAGATGACACCGCG3′	53
nos②	U5′GAATCCTGTTGCCGGTCTTG3′		54
		L5′TTATCCTAGTTGCGCGC3′		55
nos③		U5′GAATCCTGTTGCCGGTCTTG3′		56
	L5′CCCATCTCATAAATAACGTC3′		57
camv35s(花椰菜花叶病毒35S启动子)①	U5′CCGACAGTGGTCCCAAAGATGGAC3′		58
		L5′ATATAGAGGAAGGGTCTTGCGAAGG3′		59
camv35s②		U5′GCTCCTACAAATGCCATCA3′		60
	L5′GATAGTGGGATTGTGCGTCA3′		61
camv35s③	U5′ATTGCCCAGCTATCTGTCACTT3′		62
		L5′GGATTGTGCGTCATCCCTTAC3′		63

			mdb484-mdb501(油菜籽T45定性检测基因)	U5′GTGGATATACAACACGTGACTG3′	64
L5′GTGAGTAGTTCCCAGATAAGG3′	65
rbcl真核植物通用管家基因(编码1，5-双磷酸盐碳酸酵素大亚基)	U5′AATCTTCTACTGGTACATGGAC3′		66
		L5′TCATCATCTTTGGTAAAATCAAG3′		67
lectin大豆管家基因①(编码植物血凝素)		U5′TGCCGAAGCAACCAAACATGATCCT3′		68
	L5′TGATGGATCTGATAGAATTGACGTT3′		69
lectin②	U5′GAAGCAACCAAACATGATCCTC3′		70
		L5′ATGGATCTGATAGAATTGACGTTA3′		71
lectin③		U5′TGCCGAAGCAACCAAACATGATCCT3′		72
	L5′AAGTGTCAAACTCAACAGCGACGAC3′		73
zein玉米管家基因①(编码玉米蛋白)	U5′GCTTGCATTGTTCGCTCTC3′		74
		L5′CGATGGCATGTCAACTCATTA3′		75
zein②		U5′AGTGCGACCCATATTCCAG3′		76
	L5′GACATTGTGGCATCATCATTT3′		77
zein③	U5′TGCTTGCATTGTTCGCTCTCCTAG3′		78
		L5′GTCGCAGTGACATTGTGGCAT3′		79

自行设计的引物

                                       表3

目标基因	用于扩增目标基因的引物序列	长度bp	TM值℃	探针长度bp	SEQ IDNO
						nptII①(来源于大肠杆菌E.coli，编码新霉素磷酸转移酶)	U5′ATACCGTAAAGCACGAGGAAG3′	21	56.7	486	80
L5′CACTGAAGCGGGAAGGGACT3′	20	61.4		81
nptII②	U5′CCTTGAGCCTGGCGAACA3′	18	61.1	364		82
					L5′GGTGCCCTGAATGAACTGC3′		19	57.9		83
nptII③					U5′ATACCGTAAAGCACGAGGAAG3′		21	56.7	489	84
	L5′TGTCACTGAAGCGGGAAGG3′	19	59.0			85
nptII④	U5′GATGTTTCGCTTGGTGGTCG3′	20	61.1	325		86
					L5′TCTGATGCCGCCGTGTTCC3′		19	64.7		87
nptII⑤					U5′CCTTGAGCCTGGCGAACAGTT3′		21	64.0	466	88
	L5′GGCTATGACTGGGCACAACA3′	20	59.0			89
hpt①(潮霉素磷酸转移酶基因)	U5′TGTCCTGCGGGTAAATAGC3′	19	56.1	283		90
					L5′TCCTTGCGGTCCGAATGG3′		18	62.2		91
hpt②					U5′CACTGGCAAACTGTGATGG3′		19	54.7	215	92
	L5′ATGTTGGCGACCTCGTATT3′	19	55.2			93

						hpt③	U5′CGTTATGTTTATCGGCACTTTG3′	22	40.9	488	94
L5′CCGAACATCGCCTCGCTCCAGT3′	22	63.6		95
hpt④	U5′ACGACACCGTCAGTGCGTCC3′	20	63.7	441		96
					L5′CGCTTCTGCGGGCGATTTGT3′		20	67.9		97
pnos①(胭脂氨酸合酶启动子，nos启动子)					U5′GAGCGGAGAATTAAGGGAGTC3′		21	57.5	283	98
	L5′TTGGATTGAGAGTGAATATGAG3′	22	52.1			99
pnos②	U5′GCGGAGAATTAAGGGAGTCAG3′	21	58.4	231		100
					L5′TGGAACGTCAGTGGAGCATT3′		20	58.5		101
pnos③					U5′TTAAGGGAGTCACGTTATG3′		19	48.0	219	102
	L5′ACGTCAGTGGAGCATTTT3′	l8	50.1			103
pnos④	U5′GGAACTGACAGAACCGCAACG3′	21	62.8	225		104
					L5′GCAGATTATTTGGATTGAGAG3′		21	52.0		105
cp4epsps①(来源于土壤杆菌Agrobacterium，编码5-烯醇丙酮酰草酸-3-磷酸合酶)					U5′GGAGTTCTTCCAGACCGTTCAT3′		22	59.8	294	106
	L5′TTGCGGCCCTGCTTGTT3′	17	60.4			107
cp4epsps②	U5′GTCGGAGCCCGGAACAAGCA3′	20	67.7	236		108
					L5′GCCTCAACACGCCCGGCATCA3′		21	72.6		109
cp4epsps③					U5′TCGCCCTCATCGCAATCC3′		18	62.2	427	110
	L5′TCACCGGCCAAGTCATCG3′	18	60.4			111
mcp4epsp①(来源于玉米，编码5-烯醇丙酮酰草酸-3-磷酸合酶)	U5′CAACGGTGGAAGAGTTCAATG3′	21	58.0	337		112
					L5′GGCGGCGAGTAGGAGGAT3′		18	59.7		113
mcp4epsps②(					U5′ACGACTTCTCCACCCTT3′		17	48.4	236	114
	L5′GCCGTTGCTGACGTTGC3′	17	58.5			115
mcp4epsps③	U5′CTTGGTAGTTTGGGTGGG3′	18	53.0	335		116
					L5′GATGAACAATGCTGAGGGA3′		19	53.3		117
mcp4epsps④					U5′CTTGGTAGTTTGGGTGGG3′		18	53.0	378	118
	L5′CACGAGGCTGCATTTGTC3′	18	54.9			119
CryIA(b)①(来源于苏云金杆菌Bacillusthuringiensissubsp.Kurstaki的苏云金杆菌毒蛋白基因)	U5′TCGTCCGTGAGCATCATCAGAGC3′	23	67.0	488		120
					L5′ACGAACTCAATGCGGTCAAT3′		20	57.8		121
cryIA(b)②					U5′CAAGTCCCGCTCCTGTCCGTGTA3′		23	68.1	473	122
	L5′CGGTGGGCATCGGTGTAGATAGTG3′	24	67.5			123

						cryIA(b)③	U5′GCAACGCCGCTCCACAACAACGCAT3′	25	77.1	354	124
L5′CGCTGCGATGAATCCAGGAGAAC3′	23	61.8		125
cpti①(豇豆胰蛋白酶抑制基因)	U5′AAGGTGTGTGTGCTGGTACTTTTC3′	24	62.3	315		126
					L5′ATCTTTCTCATCATCTTCATCCCT3′		24	58.2		127
cpti②					U5′CCACCTCATACCTACCTT3′		18	46.1	352	128
	L5′TTCTCATCATCTTCATCCCT3′	20	51.3			129
cpti③	U5′CCACCTCGGAAGTAATCA3′	18	50.6	209		130
					L5′AATCACGAATGTCAAGGCAACG3′		22	62.6		131
cpti④					U5′CTCTGTTGTGCCTTCACCACCT3′		22	61.5	370	132
	L5′CTTTCTCATCATCTTCATCCCT3′	22	55.2			133
barnase①(来源于淀粉液化芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)表达雄性不育蛋白)	U5′GGTTATCAACACGTTTGACGGGGT3′	24	66.1	300		134
					L5′TGGTCCGTTGTTTTGTAAATCAGC3′		24	63.3		135
barnase②					U5′CACGTTTGACGGGGTTGCGGATTAT3′		25	71.7	213	136
	L5′ATATCCGCTTCACGCCATGTTCGTC3′	25	71.2			137
barnase③	U5′AATCAGAAGCACAAGCCCTCG3′	21	61.9	237		138
					L5′AGGTCTGATAATGGTCCGTTGTT3′		23	56.6		139
barstar①(来源于淀粉液化芽孢杆菌(Bacillusamyloliquefaciens)表达育性恢复蛋白)					U5′TCAGCGACCTCCACCAGACAT3′		21	62.5	224	140
	L5′TATGATGGTGATGTCGCAGC3′	20	57.3			141
barstar②	U5′AAGTATCAGCGACCTCCACCAG3′	22	60.8	216		142
					L5′TCGCAGCCTTCCGCTTTCG3′		19	66.8		143
barstar③					U5′GGGGAACAAATCAGAAGTAT3′		20	50.8	248	144
		L5′GAAAGTATGATGGTGATGTCGC3′	22	57.2							145
	napin①(油菜管家基因)	U5′CTCGCCTTGTTCTTCCTTC3′	19	54.7		369					146
L5′CTGTTGTCTAACGGCTTTG3′					19		54.1		147
napin②	U5′CTCGCCTTGTTCTTCCTTCTC3′				21		58.4	488	148
		L5′CAAATGCTAACTTGCCTGATG3′	21	56.3						149
napin③		U5′CTTCCTTCTCACCAATGCCTC3′	21	58.8		325				150
	L5′GGTTGGGCAAACGCAAAGTG3′				20		63.6		151
spvc(来源于鼠伤寒沙门氏菌质粒，编码毒力的基因)	U5′GTAGCTGCTATGATGGG3′				18		48.8	484	152
		L5′ATTGCCGTGTCTTGTGGAG3′	19	56.0						153

在本发明的转基因农产品DNA检测芯片的制备方法中，优选利用聚合酶链式反应从转基因农产品的DNA中扩增目标检测探针，聚合酶链式反应的条件是本领域技术人员已知的。在本发明中提供一种优选的聚合酶链式反应，其条件为：94～95℃预变性3～5min；94℃变性40s；58～60℃退火40s；72℃延伸60s；进行40个循环；72℃延伸5～10min。

将所述探针固定在片基上的方法可以采用本领域常用的点样方法。点样的方式分两种，其一为接触式点样，即点样针直接与固相支持物表面接触，将DNA样品留在固相支持物上；其二为非接触式点样，即喷点，它是以压电原理将DNA样品通过毛细管直接喷至固相支持物表面。现在已经有比较成型的点样装置出售，例如美国Biodot公司的“喷印”仪，以及Cartesian Technologies公司的Pix-Sys NQ/PA系列“打印”仪。在本发明中，优选接触式点样。为了本发明的目的，片基可以使用本领域已知的片基，优选使用氨基化的片基。

另一方面，本发明提供一种转基因农产品DNA检测芯片在检测转基因农产品中的应用。本发明的转基因农产品DNA检测芯片可以用于进行品种的检测(参见实施例4)，可以用于进行外源目标基因的检测(参见实施例5)，可以用于进行品系鉴定(参见实施例6)，并且可以用于其中的一种或一种以上的组合检测或鉴定，更为重要的是本发明提供了一种可对转基因农产品进行初步筛选、品种检测、品系鉴定一体化的DNA芯片，这对于简化程序，快速、高通量地进行转基因农产品的检测和鉴定具有重要意义。

在本发明的一个实施方式中，所述应用可以具体包括以下步骤：(1)提取待测农产品的DNA；(2)利用本发明的引物对待测农产品的DNA进行PCR扩增并标记；(3)将经标记的扩增产物与本发明的转基因农产品DNA检测芯片杂交；(4)确定所述待测农产品是否为转基因农产品。在上述步骤中，可以如实施例7所述，将所述引物分成至少两个组，然后再用每个组分别进行PCR扩增并标记，这样可以减少多对引物间的干扰。对这两组引物分别标记、纯化后再混合杂交，这样既没有损失检测信息，且仍可以体现芯片的高通量的特点。此外，上述步骤中对样品进行标记的方法可以采用荧光标记方法。荧光标记方法基本分为2种，一种是使用荧光标记的引物，一种是使用荧光标记的三磷酸脱氧核糖核苷酸。目前常使用的荧光物质有：荧光素、罗丹明、HEX、TMR、FAM、Cy3、Cy5等。根据标记的方法不同，扩增产物分离的方法也不同：进行单引物标记的，其扩增产物通常由聚丙烯酰胺凝胶电泳分离；对一个引物用生物素标记，另一个引物用荧光素标记的，一般用亲合素偶联的磁珠捕捉其扩增产物，通过变性处理使荧光标记的产物解链。此外，也有用生物素残基标记引物，将生物素标记的扩增产物与芯片杂交，洗涤后加入亲合素连接的荧光物，通过生物素与亲合素的结合及靶序列与探针的结合产生荧光信号，然后利用荧光检测系统对荧光信号进行检测。在本发明的实施例中使用Cy5-dUTP进行标记，使用目前已知的荧光检测技术进行检测。本领域技术人员已知，如何根据杂交检测结果，确定是否为转基因农产品。具体可以参见实施例3、4、5、6、7。

此外，本发明还提供一种转基因农产品DNA检测试剂盒，该转基因农产品DNA检测试剂盒除了包含本发明的转基因农产品DNA检测芯片外，还可以包含如SEQ ID NOs.52～153所示的引物中的部分或全部。这些引物可以装在一个容器内，也可以分成几组，分别装在不同的容器内，或也可以均装在单独容器内。此外，该试剂盒中还可以包含用于检测或扩增的一种或多种组分。按照具体检测方法及扩增方法的不同，试剂盒可含有不同组分。与之同时提供的可以是经政府药物管理机构审核的、有关药品或生物制品制造、使用及销售的信息。

此外，本发明还提供一种检测转基因农产品的方法，该方法包括：

1)提取待测农产品的DNA；

2)利用本发明的目标检测探针检测所述待测产品的DNA；

3)根据所述探针与所述转基因农产品DNA的结合情况判断该待测农产品是否为转基因农产品。

提取待测农产品的DNA方法可以是一类适合本检测所需的任何提取方法，本领域的技术人员可以根据农产品的类型选择合适的提取方法。在该方法中可以将所述目标检测探针固定在片基上，制成本发明的转基因农产品DNA检测芯片，然后再进行检测；也可以不固定在片基上，直接进行检测。

本发明的优点和效果

转基因农产品检测DNA芯片是以DNA芯片为平台建立起的用以检测转产品中外源插入基因的新技术。区别于普通PCR一次只能检测一个基因，DNA芯片能够在高通量地检测样品中的大量的不同种类的基因修饰物。和多重PCR相比DNA芯片的杂交检测更灵敏，结果判读更准确。

更为重要的是，本发明使用的探针多为200个核苷酸以上的长序列，这种长序列，与只有20个核苷酸的寡核苷酸探针相比，保证了杂交的特异性，结果更为可靠。且本发明是通过重组DNA技术构建质粒做模板和PCR扩增技术制备的检测探针，由于不存在寡核苷酸探针与玻片间的空间位阻的问题，所以不用对探针再做任何化学修饰，降低了芯片制备的成本，有利于未来的产业化发展。

DNA芯片的探针对引物的要求较高，即除了要遵循引物设计的一般原则外，还要使引物退火温度尽量保持一致，扩增片段的长度尽量一致，各引物间减少互补序列，这增加了引物设计和筛选的难度。本发明通过大量的实验，筛选出的50对高特异性引物PCR扩增效率较高、扩增的探针同源性较低，用此50对引物进行PCR扩增来制备本芯片的探针可以满足检测转基因食品的初步筛查、品种检测、品系鉴定不同层次的要求。例如camv35s启动子、nos终止子、nos启动子、hpt探针、nptII位置处出现阳性信号可以提示检测的食品可疑为转基因食品。管家基因lectin，zein和napin以及rbcl探针的信号可以帮助我们知道该转基因食品是否是来自大豆、玉米、油菜籽、大米或是其它含有或可能含有相关检测目标基因的农产品。从外源结构基因cp4epsps，cryIA(b)，mcp4epsps，cpti，barstar和barnase，mdb484-mdb501探针的信号可以知道该转基因食品具有抗除草剂、抗虫或雄性不育等特性的哪种品性。综合芯片上所有提供的多种信息可以进一步鉴别转基因食品的品系，知道该转基因食品是哪个公司市售的，含有哪些外源插入基因，便于管理部门对其示踪管理。

另外，由于本发明的探针固定在同一片基上，可以通过一次的杂交反应同时获取多种信息。对比目前的PCR技术进行的初筛、定性等分步检测，具有高通量，快速的优势。

应用结果显示本发明转基因食品DNA检测芯片可以对上述7种转基因作物的多个目标基因进行识别检测，具有较高的特异性和较好的重复性。严格的质控点保证了芯片结果判读的准确，也是本发明的一大优点。

SCK水稻是中国科学院遗传与生物发育研究所研制的拥有自主知识产权的转基因抗虫水稻。插入了表达豇豆胰蛋白酶抑制剂(CPTI)、潮霉素磷酸转移酶(HPT)等的外源基因。本研究以SCK水稻加工后产品SCK大米的S86品系为研究对象，首次建立了S86的芯片检测方法，经过验证，检测结果具有很好的准确性、特异性和重复性。为具有我国特色并有产业化前景的转基因水稻提供了安全性研究的基础资料并建立了cpti和hpt的基因标识方法。

附图说明

图1为本发明的芯片制作流程图；

图2和图3为本发明的芯片对品种检测的结果。图2为玉米；图3为油菜籽；图中符号1.rbcl，2.zein，3.lectin，4.napin；图中四个角的阳性信号是定位的marker；

图4-图7为本发明芯片对外源目标基因进行检测的结果，其中，图4为转基因大米S86；图5为转基因大米S86阴性对照样品；图6为转基因Ms1Rf1油菜籽；图7为转基因油菜籽阴性对照样品；图中符号1.barnase，2.mdb484-mdb501，3.cryIA(b)，4.mcp4epsps，5.cp4epsps，6.cpti；图中四个角的阳性信号是定位的marker；

图8-图11为本发明的芯片进行品系鉴定检测结果，其中，图8为转基因大豆RRS40-3-2品系，图8中符号1.lectin，2.camv35s，3.nos，4.cp4epsps；图9为转基因玉米GA21；图10为转基因大米S86；图9、图10中符号1.zein，2.camv35s，3.nos，4.mcp4epsps，5.rbcl，6.cpti，7.hpt；图11为转基因玉米MON810，图11中符号1.zein，2.camv35s，3.nos，4.mcp4epsps，5.cryIA(b)，6.cp4epsps，7.lectin；

图12-图15为本发明一体化DNA检测芯片的示意图和检测结果，其中图12为转基因大豆RRS40-3-2的检测结果示意图；图13为转基因大豆RRS40-3-2的检测结果扫描图；图14为油菜籽MS1RF1的检测结果示意图；图15为油菜籽MS1RF1的检测结果扫描图。图12～图15中符号1.Hpt，2.nptII，3.pnos，4.nos，5.35s1，6.35s2，7.mdb501-484，8.barstar，9.barnase，10.cpti，11.mcp4epsps，12.cryIA(b)，13.cp4epsps，14.50％DMSO(阴性对照)，15.spvc(阳性对照)，16.rbcl，17.napin，18.zein，19.lectin。

具体实施方式

实施例1、转基因农产品检测芯片的制备

1、转基因农产品基因组DNA的提取(CTAB法和硅胶柱纯化法)

转基因农产品样品和来源：转基因大豆40-3-2、转基因玉米MON810、GA21、NK603的阳性和阴性样品由Monsanto公司提供。转基因油菜籽Ms1Rf1和T45的阳性和阴性样品由Bayer公司提供。转基因大米SCK的S86阳性和阴性样品由中国科学院遗传与发育生物学研究所提供。

十六烷基三甲基铵硝酸盐(CTAB)抽提缓冲液配制方法：20g/l CTAB，4.0g；4M NaCl，16.4g；0.1M Tris-HCl，3.15g；20mM乙二胺四乙酸钠(Na₂EDTA)，1.5g；加100ml无菌去离子水，用1M NaOH调PH至8.0，最后定容到200ml高压灭菌4℃保存6个月。

CTAB沉淀缓冲液配制方法：5g/l CTAB，1g；0.04M NaCl，0.5g；加100ml无菌去离子水，用1M NaOH调PH至8.0，最后定容到200ml高压灭菌4℃保存6个月。

操作步骤：

(1)把样品在陶瓷研钵中轻轻研碎，加入液氮继续研磨成细粉。

(2)用药匙舀取约100mg研磨好的样品粉末转入灭菌的1.5ml离心管中，加入500～800μlCTAB提取缓冲液混匀。加入20μl蛋白酶K(Promega，20mg/ml)混匀，65℃水浴30～90min。每隔10min搅拌1次。

(3)加入20μl/RNA酶(10mg/mL)混匀，65℃水浴5～10min。

(4)16,000rpm离心10min。离心后将上清转移至1.5ml离心管中。

(5)向管中加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1)，轻轻混匀后16000rpm离心10min。离心后将上清转移至1.5ml离心管中。

(6)向管中加入等体积的氯仿∶异戊醇(24∶1)，轻轻混匀后16000rpm离心5min。离心后将上清转移至1.5ml离心管中。

(7)重复步骤(6)一次。

(8)加2倍体积的CTAB沉淀缓冲液，轻轻混匀后，室温静置60min。

(9)16,000rpm离心5min，弃上清。加入350μl 1.2M NaCl溶液溶解。

(10)加入350μl氯仿，轻轻混匀30秒，16000rpm离心10min。

离心后将上清转移至1.5ml离心管中。

(11)向离心管中加入1/10体积的NaAc(3M)混匀，再加入2倍体积的冰无水乙醇，-20℃放置30min。

(12)16000rpm离心5min，弃上清。加入300ml 70％乙醇16000rpm离心5min，弃上清。

(13)干燥离心管，向管中加入100μl无菌去离子水溶解DNA。

(14)用细胞基因组clean-up试剂盒(Promega公司)纯化(操作步骤见试剂盒使用说明书)。

(15)纯化过的DNA样品置于-20℃或更低温度环境保存备用。

取2μl制备的DNA在1.0％的琼脂糖凝胶中电泳，检测提取基因组DNA的质量和含量。

2.检测探针的制备

将上述实施例1的转基因农产品基因组DNA作为模板，采用表2和表3的相应引物(由北京赛百盛基因技术有限公司、上海生工生物工程有限公司和北京奥科生物技术有限责任公司合成)进行PCR扩增(TaqDNA聚合酶，购于北京博大泰克生物基因技术有限责任公司)，将获得的产物切胶回收后重组到PMD-18T(Takara宝生物工程(大连)有限公司)载体上，转化到大肠杆菌DH5α中。提取大肠杆菌的质粒，再以稀释的质粒做模板进行PCR扩增，得到产物纯化后做为固定探针布点在芯片上。

操作步骤：

(1)、PCR反应扩增外源目标基因片段

PCR反应体系20μl：PCR缓冲液，2.0μl；引物(上、下游各5μM)，1.6～2.0μl；dNTP(10mM)，0.4μl；模板DNA(上述某一种转基因农产品基因组DNA)，1.0～2.0μl；Taq(5U/μl)，0.1～0.2μl；去离子水补齐至20μl。

PCR反应条件：94～95℃预变性3～5min；94℃变性40s；58～60℃退火40s；72℃延伸60s；进行40个循环；72℃延伸5～10min。

PCR产物的检测：扩增完毕后，取2.0μl反应液与0.4μl6×溴酚蓝缓冲液混合，在2％琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)中电泳，用读胶仪观察结果并照相。

对所要目的片段进行切胶回收(切胶回收试剂盒购于QIAGEN公司)纯化。

(2)、CaCl₂法制备感受态大肠杆菌。操作步骤见《分子克隆实验指南》(第三版)。

(3)、构建含有该DNA序列的重组质粒。操作步骤见《分子克隆实验指南》(第三版)。

(4)、抽提质粒。操作步骤见《分子克隆实验指南》(第三版)。

(5)、将所抽提质粒稀释1000倍后用做模板进行PCR反应制备固定探针。

PCR反应体系20μl：PCR缓冲液，2.0μl；引物(上下游引物各5μM)，1.6～2.0μl；dNTP(10mM)，0.4μl；模板DNA(质粒)，0.4～1.0μl；Taq(5U/μl)，0.1～0.2μl；去离子，补齐至20μl。

PCR反应条件同步骤(1)。

(6)、检测探针的纯化和定量

乙醇沉淀法纯化检测探针，具体操作如下：

(a)取200μl PCR反应液，加400μl无水乙醇及20μl乙酸钠(终浓度为0.3mol/L)，-20℃1小时。

(b)4℃12,000rpm离心10min，弃上清。

(c)70％乙醇，4℃12,000rpm离心2min，弃上清。

(d)37℃干燥后，溶于10μl无菌去离子水中。

(e)取1μl溶液2％琼脂糖凝胶电泳，检验探针质量。

(f)取2μl溶液稀释到50μl在紫外分光光度计下测定探针浓度。

(g)用无菌去离子水将探针浓度稀释到500～1000ng/μl。

(h)加入等体积的100％DMSO溶液(100％DMSO为点样液)混匀后-20℃保存备用。

3.检测探针在氨基化玻片上的固定

操作步骤：

(1)将固定探针放入384孔板中，每孔5μl，浓度为250～500ng/μl。

(2)将384孔板及硅烷化好的玻片(氨基化玻璃片(购于上海百奥公司))放在指定位置。

(3)设置点样程序用点样仪(Perkin Elmer公司，美国)点样。

(4)点样后处理：湿化：50～60℃蒸汽湿化30～50s；干烤：80℃1小时；紫外交联：将玻片上打印有DNA的面朝上，紫外释放能量为250mJ，将DNA固定在玻片上；2％十六烷基磺酸钠(SDS)洗2～10min。超纯水(Ω≥17兆欧)冲洗2～10min；变性：90℃水中煮1～5min，立即浸入冰无水乙醇中3min；晾干待杂交。

(5)矩阵排列在湿化的过程中可以显现，由此可通过肉眼判断芯片是否有漏点的情况。将芯片和标准参考物质或已知转基因成分的样品杂交后，可通过阳性参照、阴性参照和空白参照等质控的结果及检测结果判断，如果结果符合预期则表明芯片已制备成功。

实施例2、待测样品的制备

1、待测样品基因组DNA提取方法

方法参见实施例1中“转基因农产品基因组DNA的提取方法”。

2、待测样品的标记(多重PCR荧光素标记)

25μl体积：PCR缓冲液，2.5μl；Primer(混合引物)表2和3所列的混合引物浓度和混合比例见下面具体实施例)；dNTP(10mM，无dTTP)，0.5μl；Cy5-dUTP(1mM)(Pharmacia公司)，0.5μl；dTTP(1mM)，2.0μl；模板DNA(上述待测样品的基因组DNA)，1.0～2.0μl；Taq(5U/μl)，0.3～0.5μl；dH₂O，补齐至25μl。

PCR反应条件：同实施例1。

实施例3、待测产品的检测

1、玻片的杂交和洗涤

操作步骤：

(1)将玻片放置在杂交仓内。

(2)将装有标记探针的微离心管加热变性：100℃沸水煮3min。

(3)向管中加入100μl高效杂交液(鼎国公司)，吹打混匀后注入杂交仓。42℃杂交12～18小时。

(4)12～18小时后将玻片取出，放入洗膜I液(2×SSC、0.1％SDS)中洗涤2min。

(5)洗膜II液(0.1×SSC、0.1％SDS)洗涤2min。

(6)无菌高纯水洗涤2min，晾干待扫描。

2、扫描仪下观察杂交结果

检测结果根据扫描仪(Perkin Elmer公司，美国)读取的信号进行判断。在扣除背景信号的基础上阳性信号判定为阳性，阴性信号判定为阴性。

实施例4、管家基因DNA检测芯片

方法：按照实施例1、2、3的方法制备转基因检测芯片、制备待测样品以及进行检测。其中以转基因大豆特异性管家基因lectin的414bp基因片段(SEQ ID NO.42)、转基因玉米特异性管家基因zein的277bp基因片段(SEQ ID NO.46)、转基因油菜籽特异性管家基因napin的325bp基因片段(SEQ ID NO.50)，真核植物特异性管家基因rbcl的433bp基因片段(SEQ ID NO.41)为探针(浓度为250～500ng/μl)制备芯片。所述探针的排布如下表4所示：

表4、管家基因检测矩阵探针排布

⑤			⑤
				①	②	③	④
①	②	③	④
				①	②	③	④
①	②	③	④
				⑤			⑤

①rbcl②zein③lectin④napin⑤marker

多重PCR荧光素标记样品PCR反应体系25μl(体系参见实施例2中的“待测样品的标记”部分)；

其中引物为混合引物12.5μM：用于检测rbcl的引物(SEQ ID NO.66和67)，各0.1μl；用于检测lectin的引物(SEQ ID NO.68和69)，各0.1μl；用于检测zein的引物(SEQ ID NO.76和77)，各0.1μl；用于检测napin的引物(SEQ ID NO.146和147)，各0.1μl。模板DNA为待测农产品DNA；扩增条件等同样见实施例1。

样品经多重PCR扩增标记、纯化后与芯片杂交。

利用该芯片检测转基因玉米NK603，检测结果表明：转基因玉米NK603的管家基因zein和rbcl的杂交信号为阳性而转基因大豆和转基因油菜籽的管家基因信号为阴性；与预期结果一致，见图2。对转基因油菜籽T45的检测结果表明：转基因油菜籽的管家基因napin和rbcl的杂交信号为阳性而转基因大豆和转基因玉米的管家信号为阴性；与预期结果一致，见图3。管家基因通常在转基因食品检测时起内源参照作用。用以检测样品DNA的抽提质量及作为芯片系统的杂交体系的阳性对照。特别是当检测芯片在实际应用中检测混合样品或不知作物来源的样品时尤为重要，其可对样品的种类进行鉴定。

实施例5、外源目标基因DNA检测芯片

方法：按照实施例1、2、3的方法制备外源目标基因DNA检测芯片、制备待测样品以及进行检测。其中通过筛选出转基因油菜籽Ms1Rf1的barnase基因的213bp基因片段(SEQID NO.25)，转基因油菜籽T45的mdb484-mdb501基因的220bp基因片段(SEQ ID NO.20)，转基因玉米MON810的cryIA(b)基因的354bp基因片段(SEQ ID NO.37)，转基因玉米GA21的mcp4epsps基因的236bp基因片段(SEQ ID NO.32)，转基因玉米NK603和转基因大豆共有的cp4epsps基因的294bp基因片段(SEQ ID NO.38)，转基因大米S86的cpti基因的209bp基因片段为探针(SEQ ID NO.29)(浓度为250～500ng/μl)制备芯片。所述探针的排布如下所示：

表5、外源目标基因检测芯片矩阵探针排布

⑦					⑦
						①	②	③	④	⑤	⑥
①	②	③	④	⑤	⑥
						①	②	③	④	⑤	⑥
①	②	③	④	⑤	⑥
						⑦					⑦

①barnase②mdb484-mdb501③crylA(b)④mcp4epsps⑤cp4epsps⑥cpti⑦marker

多重PCR荧光素标记样品PCR反应体系25μl(请参见实施例2中的“待测样品的标记”部分)；

其中的引物为混合引物12.5μM：用于扩增barnase的引物(SEQ ID NO.136和137)，各0.1μl；用于扩增mdb484-mdb501的引物(SEQ ID NO.64和65)，各0.1μl；用于扩增cryIA(b)的引物(SEQ ID NO.124和125)，各0.1μl；用于扩增mcp4epsps的引物(SEQID NO.114和115)，各0.1μl；用于扩增cp4epsps的引物(SEQ ID NO.106和107)，各0.1μl；用于扩增cpti的引物(SEQ ID NO.130和131)，各0.1μl。模板DNA为待测农产品DNA；扩增条件等同样见实施例1。

样品经多重PCR扩增标记、纯化后与芯片杂交。

结果：本芯片对转基因大米S86的检测结果表明：只有转基因大米S86外源结构基因cpti的杂交信号为阳性而其他作物的外源结构基因的杂交信号为阴性，见图4。同时对转基因大米S86阴性对照样品的检测显示外源结构基因cpti未检出，见图5。本芯片转基因油菜籽Ms1Rf1的外源结构基因的检测结果表明：只有外源基因barnase的杂交信号阳性而其他作物的外源结构基因的杂交信号为阴性，见图6。同时对转基因油菜籽Ms1Rf1阴性对照样品的检测显示外源结构基因barnase未检出，见图7。在转基因食品定性检测中最重要的检测目标基因是外源结构基因，即引入某一转基因作物中编码蛋白使转基因作物具有抗除草剂或抗虫等新的性状的基因。

实施例6、品系鉴定芯片

1)转基因大豆RRS40-3-2品系

方法：按照实施例1、2、3的方法制备转基因检测芯片、制备待测样品以及进行检测。其中通过筛选出的camv35s启动子的195bp基因片段(SEQ ID NO.18)，nos终止子的213bp基因片段(SEQ ID NO.14)，cp4epsps的294bp基因片段(SEQ ID NO.38)为探针(浓度为250～500ng/μl)对转基因大豆40-3-2进行检测。同时以大豆管家基因lectin的414bp基因片段(SEQ ID NO.42)为内源参照。排布如下表6所示：

表6、转基因大豆RRS品系

①	①
		②	②
③	③
		④	④

①lectin②camv35s③nos④cp4epsps

多重PCR荧光素标记样品PCR反应体系25μl(请参见实施例2中的“待测样品的标记”部分)；

其中的引物为混合引物2μM：用于扩增lectin的引物(SEQ ID NO.68和69)，各1.0μl；用于扩增camv35s①(SEQ ID NO.58和59)的引物，各1.0μl；用于扩增nos的引物(SEQ ID NO.52和53)，各1.0μl；用于扩增cp4epsps的引物(SEQ ID NO.106和107)，各1.0μl。模板DNA为待测农产品DNA；扩增条件等同样见实施例1。

样品经多重PCR扩增标记、纯化后与芯片杂交。

结果表明，本芯片可以从Roundup Ready转基因大豆40-3-2(RRS)中检测到camv35s启动子、nos终止子、cp4epsps和大豆管家基因lectin。与预期结果一致。杂交结果见图8。

2)转基因玉米GA21检测芯片矩阵A和转基因大米S86检测芯片矩阵B探针排布

方法：按照实施例1、2、3的方法制备转基因检测芯片、制备待测样品以及进行检测。其中，通过筛选出的camv35s启动子的195bp基因片段(SEQ ID NO.18)，nos的213bp基因片段(SEQ ID NO.14)，外源结构基因mcp4epsps的引物mcp4epsps扩增的236bp基因片段(SEQ ID NO.32)为探针(浓度为250～500ng/μl)对转基因玉米GA21进行检测；同时以玉米管家zein的277bp基因片段(SEQ ID NO.46)为内源参照。在本芯片中，也将检测转基因大米S86的探针(250～500ng/μl)同时在此一并研究：即将外源结构基因cpti的209bp基因片段(SEQ ID NO.29)，抗生素标记基因hpt的215bp基因片段(SEQ ID NO.2)及管家基因rbcl的433bp基因片段(SEQ ID NO.41)也布点在芯片上，和检测GA21玉米的探针互为参照，相互验证探针的特异性。所述探针的排布如下表7所示：

                        表7

A					B
										⑨				⑨	⑨				⑨
①	②	③	④	⑤	⑥	⑦	⑧		①
										①	②	③	④	⑤	⑥	⑦	⑧		①
①	②	③	④	⑤	⑥	⑦	⑧		①
										①	②	③	④	⑤	⑥	⑦	⑧		①
⑨				⑨	⑨				⑨

①点样液：50％DMSO②zein③camv35s④nos⑤mcp4epsps⑥rbcl⑦cpti⑧hpt⑨marker

多重PCR荧光素标记样品PCR反应体系25μl(请参见实施例2中的“待测样品的标记”部分)；

引物为混合引物2μM：用于扩增zein的引物(SEQ ID NO.76和77)，各1.0μl；用于扩增camv35s②的引物(SEQ ID NO.60和61)，各1.0μl；用于扩增nos的引物(SEQ ID NO.52和53)，各1.0μl；用于扩增mcp4epsps的引物(SEQ ID NO.114和115)，各1.0μl。

样品经多重PCR扩增标记、纯化后与芯片杂交。

结果：本芯片可以从转基因玉米GA21中检测到nos终止子、mcp4epsps和玉米管家基因zein，这与转基因玉米GA21的预期结果一致；而互为对照的SCK的探针的杂交信号则为阴性，说明检测GA21的探针具有很好的特异性。见图9。

多重PCR荧光素标记样品PCR反应体系25μl(请参见实施例2中的“待测样品的标记”部分)；

其中的引物为混合引物2μM：用于扩增cpti的引物(SEQ ID NO.130和131)，1.0μl；用于扩增rbcl的引物(SEQ ID NO.66和67)，1.0μl；用于扩增hpt的引物(SEQ ID NO.92和93)，1.0μl。模板DNA为待测农产品DNA；扩增条件等同样见实施例1。

样品经多重PCR扩增标记、纯化后与芯片杂交。

从转基因大米S86中可以检测到cpti、hpf和管家基因rbcl，这与转基因大米S86的预期结果一致；而互为对照的GA21的探针的杂交信号则为阴性，说明检测S86的探针具有很好的特异性。见图10。

3)转基因玉米MON810检测芯片矩阵探针排布

方法：按照实施例1、2、3的方法制备转基因检测芯片、制备待测样品以及进行检测。其中，通过筛选出的camv35x启动子的195bp基因片段(SEQ ID NO.18)，nos终止子的213bp基因片段(SEQ ID NO.14)，外源结构基因cryIA(b)的引物cryIA(b)的354bp基因片段(SEQ ID NO.37)为探针(浓度为250～500ng/μl)，对转基因玉米MON810进行检测；同时以玉米管家zein的引物zein的277bp基因片段(SEQ ID NO.46)为内源参照。与此同时，将检测转基因玉米GA21探针(同上)，转基因玉米NK603探针(包括camv35s启动子的195bp基因片段、nos终止子的213bp基因片段，外源结构基因cp4epsps的294bp基因片段(SE9 ID NO.38)和玉米管家zein的引物zein的277bp基因片段(SEQ ID NO.46))和转基因大豆40-3-2的探针(同上)布点在芯片上，和检测MON810玉米的探针互为参照，相互验证探针的特异性。所述探针的排布见表8。

              表8

A矩阵：GA21玉米                                     B矩阵：MON810玉米

⑥					⑥
						①	②	③	④	⑤	①
①	②	⑨	④	⑤	①
						①	②	③	④	⑤	①
①	②	③	④	⑤	①
						⑥					⑥

⑥					⑥
						①	②	⑨	④	⑦	①
①	②	③	④	⑦	①
						①	②	⑨	④	⑦	①
①	②	③	④	⑦	①
						⑥					⑥

C矩阵：NK603玉米                                           D矩阵：40-3-2大豆

⑥					⑥
						①	②	③	④	⑧	①
①	②	③	④	⑧	①
						①	②	③	④	⑧	①
①	②	③	④	⑧	①
						⑥					⑥

⑥					⑥
						①	⑨	③	④	⑧	①
①	⑨	③	④	⑧	①
						①	⑨	③	④	⑧	①
①	⑨	⑧	④	⑥	①
						⑥					⑥

①点样液：50％DMSO②zein③camv35s④nos⑤mcp4epsps

⑥marker⑦cryIA(b)⑧cp4epsps⑨lectin

多重PCR荧光素标记样品PCR反应体系25μl(参见实施例2中的“待测样品的标记”部分)；

其中引物为混合引物2μM：用于扩增zein的引物(SEQ ID NO.76和77)，各1.0μl；用于扩增camv35s②的引物(SEQ ID NO.60和61)，各1.0μl；用于扩增nos的引物(SEQID NO.52和53)，各1.0μl；用于扩增m cp4epsps的引物(SEQ ID NO.114和115)，各1.0μl；用于扩增cryIA(b)的引物(SEQ ID NO.124和125)，1.0μl；用于扩增cp4epsps的引物(SEQ ID NO.106和107)，各1.0μl；用于扩增lectin的引物(SEQ ID NO.68和69)，各1.0μl。模板DNA为待测农产品DNA；扩增条件等同样见实施例1。

样品经多重PCR扩增标记、纯化后与芯片杂交。

结果表明，本芯片可以从转基因玉米MON810中检测到camv35s启动子、nos终止子、cryIA(b)和玉米管家基因zein。而互为对照的矩阵中的相同探针杂交信号阳性，不同探针的杂交信号阴性，说明各检测探针有很好的特异性。见图11。

实施例7、一体化DNA检测芯片

方法：按照实施例1、2、3的方法制备转基因检测芯片、制备待测样品以及进行检测。芯片上的所布探针序列见表1。探针是按外源基因的不同功能进行矩阵排布。见表9。有筛选作用的A矩阵，主要是检测转基因农产品的启动子、终止子和标志基因。有定性作用的B矩阵，来确定该作物的主要性征。C矩阵主要是些管家基因用来区分物种的种属，可以确定外源基因的来源。同时还有严格的质控矩阵。50％的DMSO点样液做阴性对照，鼠伤寒沙门氏菌spvc做阳性对照，非点样区做空白对照。各矩阵中的不同探针可以互为对照。检测范围含盖了以下目前常见的转基因农产品的外源目标基因：camv35S启动子、nos启动子、nos终止子、标记基因hpt、nptII、外源目标基因cp4 epsps、crylA(b)、mcp4 epsps、cpti、barnase、barstar、mdb484-mdb501和作为内源参照基因的管家基因lectin、zein、napin和rbcl。

                    表9、转基因农产品DNA检测芯片矩阵设计

1)转基因大豆Roundup Ready 40-3-2的检测

多重PCR荧光素标记体系中上、下游混合引物对比例、体系见实施例2。

引物1(各引物浓度均为2μM)：用于扩增camv35s(SEQ ID NO.58和59)的引物，1.5μl；用于扩增nos的引物(SEQ ID NO.52和53)，1.0μl；用于扩增cp4 epsps的引物(SEQ IDNO.106和107)，1.5μl；用与扩增rbcl的引物(SEQ ID NO.66和67)，0.5μl；用于扩增lectin的引物(SEQ ID NO.68和69)，0.5μl。

引物2(各引物浓度均为5μM)：用于扩增pnos的引物(SEQ ID NO.98和99)，0.5μl；用于扩增camv35s(SEQ ID NO.60和61)的引物，0.5μl；用于扩增hpt的引物(SEQ IDNO.92和93)，0.5μl；用于扩增nptII的引物(SEQ ID NO.82和83)，0.5μl；用于扩增barstar的引物(SEQ ID NO.142和143)，0.5μl；用于扩增barnase(SEQ ID NO.136和137)的引物，0.5μl；用于扩增mcp4 epsps的引物(SEQ ID NO.114和115)，0.5μl；用于扩增cryIA(b)的引物(SEQ ID NO.124和125)，0.5μl；用于扩增mdb501-mdb484的引物(SEQ ID NO.64和65)，0.5μl；用于扩增cpti的引物(SEQ ID NO.130和131)，0.5μl；用于扩增zein的引物(SEQ ID NO.76和77)，0.5μl；用于扩增napin的引物(SEQ ID NO.146和147)，0.5μl。

阳性对照spvcPCR扩增荧光素标记25μl：体系PCR buffer，2.5μl；用于扩增spvc的引物(SEQ ID NO.152和153)(上、下游混合引物5μM)，2.5μl；dNTP(10mM，无dTTP)，0.5μl；Cy5-dUTP(1mM)，0.5μl；dTTP(1mM)，2.0μl；模板DNA(鼠伤寒沙门氏菌STM)，0.5μl；Taq(5U/μl)，0.5μl；dH₂O，16μl。

引物1和引物2为17对引物拆分成两组的引物对混合体系。目的是减少多对引物间的干扰。本发明是对这两组引物分别标记、纯化后再混合杂交，这样既没有损失检测信息，且仍可以体现芯片的高通量的特点。同理spvc阳性参照探针是单引物对荧光素标记、纯化后以1/5的比例掺混到已标记好的待测样品中起阳性对照作用。实施例7的步骤2)也是相同方法。

结果显示A2矩阵中有camv35s①、camv35s②和nos 3个检测探针出现阳性信号，表明有camv35s启动子基因和nos终止子基因的存在。可以初步判断待测样品是转基因样品。B2矩阵中只有cp4 epsps 1个检探针出现阳性信号，表明此转基因样品是具有抗草苷磷除草剂性状的转基因样品。C2矩阵中只有rbcl和lectin 2个探针出现阳性信号，由此可以判断外源基因片段来自真核植物大豆，而非其它物种。C1矩阵的阳性对照探针出现阳性信号，阴性对照探针显示的是阴性信号。空白处均无信号。说明多重PCR体系，杂交体系结果可靠。综合所有矩阵的结果可以判断待测样品是转基因大豆Roundup Ready 40-3-2。结果示意图，见图12。结果扫描图，见图13。

2)MS1RF1油菜籽的检测

多重PCR荧光素标记体系中上、下游混合引物对比例、体系见实施例2。

引物1(各引物浓度均为5μM)：用于扩增camv35s的引物(SEQ ID NO.58和59)，0.4μl；用于扩增nos的引物(SEQ ID NO.52和53)，0.4μl；用于扩增pnos的引物(SEQ ID NO.98和99)，0.5μl；用于扩增nptII的引物(SEQ ID NO.82和83)，0.4μl；用于扩增barstar的引物SEQ ID NO.142和143)，0.5μl；用于扩增barnase的引物SEQ ID NO.136和137)，0.5μl；用于扩增napin的引物(SEQ ID NO.146和147)，0.2μl；用于扩增rbcl的引物(SEQID NO.66和67)，0.2μl。

引物2(各引物浓度均为5μM)：用于扩增camv35s②的引物(SEQ ID NO.60和61)，0.5μl；用于扩增hpt的引物(SEQ ID NO.92和93)，0.5μl；用于扩增cp4 epsps的引物(SEQ ID NO.106和107)，0.5μl；用于扩增mcp4 epsps的引物(SEQ ID NO.114和115)，0.5μl；用于扩增cryIA(b)的引物(SEQ ID NO.124和125)，0.5μl；用于扩增mdb501-mdb484的引物SEQ ID NO.64和65)，0.5μl；用于扩增cpti的引物(SEQ ID NO.130和131)，0.5μl；用于扩增zein的引物(SEQ ID NO.76和77)，0.5μl；用于扩增lectin的引物(SEQ ID NO.68和69)，0.5μl。

方法和操作步骤见实施例1、2、3和7的步骤1。

结果显示A2矩阵中有camv35s①、camv35s②、nos和pnos 4个检测探针出现阳性信号，表明有camv35s启动子基因、nos终止子基因和nos启动子的存在。可以初步判断待测样品是转基因样品。B1矩阵中只有barstar 1个检探针出现阳性信号，表明此转基因样品是具有育性恢复性状的转基因样品。C2矩阵中只有rbcl和napin 2个探针出现阳性信号，由此可以判断外源基因片段来自真核植物油菜，而非其它物种。C1矩阵的阳性对照探针出现阳性信号，阴性对照探针显示的是阴性信号。空白处均无信号。说明多重PCR体系，杂交体系结果可靠。综合所有矩阵的结果可以判断待测样品是转基因油菜籽MS1RF1。结果示意图，见图14。结果扫描图，见图15。

                                     序列表

<110>中国疾病预防控制中心营养与食品安全所

<120>转基因农产品DNA检测芯片及其制备方法和应用

<130>GBI05CN0369

<160>153

<170>PatentIn version 3.3

<210>1

<211>283

<212>DNA

<213>未知

<220>

<223>潮霉素抗性基因

<400>1

tgtcctgcgg gtaaatagct gcgccgatgg tttctacaaa gatcgttatg tttatcggca   60

ctttgcatcg gccgcgctcc cgattccgga agtgcttgac attggggagt ttagcgagag  120

cctgacctat tgcatctccc gccgtgcaca gggtgtcacg ttgcaagacc tgcctgaaac  180

cgaactgccc gctgttctac aaccggtcgc ggaggctatg gatgcgatcg ctgcggccga  240

tcttagccag acgagcgggt tcggcccatt cggaccgcaa gga                    283

<210>2

<211>215

<212>DNA

<213>未知

<220>

<223>潮霉素抗性基因

<400>2

cactggcaaa ctgtgatgga cgacaccgtc agtgcgtccg tcgcgcaggc tctcgatgag   60

ctgatgcttt gggccgagga ctgccccgaa gtccggcacc tcgtgcacgc ggatttcggc  120

tccaacaatg tcctgacgga caatggccgc ataacagcgg tcattgactg gagcgaggcg  180

atgttcgggg attcccaata cgaggtcgcc aacat                             215

<210>3

<211>488

<212>DNA

<213>未知

<220>

<223>潮霉素抗性基因

<400>3

cgttatgttt atcggcactt tgcatcggcc gcgctcccga ttccggaagt gcttgacatt   60

ggggagttta gcgagagcct gacctattgc atctcccgcc gtgcacaggg tgtcacgttg  120

caagacctgc ctgaaaccga actgcccgct gttctacaac cggtcgcgga ggctatggat  180

gcgatcgctg cggccgatct tagccagacg agcgggttcg gcccattcgg accgcaagga  240

atcggtcaat acactacatg gcgtgatttc atatgcgcga ttgctgatcc ccatgtgtat  300

cactggcaaa ctgtgatgga cgacaccgtc agtgcgtccg tcgcgcaggc tctcgatgag  360

ctgatgcttt gggccgagga ctgccccgaa gtccggcacc tcgtgcacgc ggatttcggc  420

tccaacaatg tcctgacgga caatggccgc ataacagcgg tcattgactg gagcgaggcg  480

atgttcgg                                                           488

<210>4

<211>441

<212>DNA

<213>未知

<220>

<223>潮霉素抗性基因

<400>4

acgacaccgt cagtgcgtcc gtcgcgcagg ctctcgatga gctgatgctt tgggccgagg   60

actgccccga agtccggcac ctcgtgcacg cggatttcgg ctccaacaat gtcctgacgg  120

acaatggccg cataacagcg gtcattgact ggagcgaggc gatgttcggg gattcccaat  180

acgaggtcgc caacatcttc ttctggaggc cgtggttggc ttgtatggag cagcagacgc  240

gctacttcga gcggaggcat ccggagcttg caggatcgcc acgactccgg gcgtatatgc  300

tccgcattgg tcttgaccaa ctctatcaga gcttggttga cggcaatttc gatgatgcag  360

cttgggcgca gggtcgatgc gacgcaatcg tccgatccgg agccgggact gtcgggcgta  420

cacaaatcgc ccgcagaagc g                                            441

<210>5

<211>486

<212>DNA

<213>大肠杆菌E.coli

<400>5

ataccgtaaa gcacgaggaa gcggtcagcc cattcgccgc caagctcttc agcaatatca   60

cgggtagcca acgctatgtc ctgatagcgg tccgccacac ccagccggcc acagtcgatg  120

aatccagaaa agcggccatt ttccaccatg atattcggca agcaggcatc gccatgggtc  180

acgacgagat cctcgccgtc gggcatgcgc gccttgagcc tggcgaacag ttcggctggc  240

gcgagcccct gatgctcttc gtccagatca tcctgatcga caagaccggc ttccatccga  300

gtacgtgctc gctcgatgcg atgtttcgct tggtggtcga atgggcaggt agccggatca  360

agcgtatgca gccgccgcat tgcatcagcc atgatggata ctttctcggc aggagcaagg  420

tgagatgaca ggagatcctg ccccggcact tcgcccaata gcagccagtc ccttcccgct  480

tcagtg                                                             486

<210>6

<211>364

<212>DNA

<213>大肠杆菌E.coli

<400>6

ccttgagcct ggcgaacagt tcggctggcg cgagcccctg atgctcttcg tccagatcat   60

cctgatcgac aagaccggct tccatccgag tacgtgctcg ctcgatgcga tgtttcgctt  120

ggtggtcgaa tgggcaggta gccggatcaa gcgtatgcag ccgccgcatt gcatcagcca  180

tgatggatac tttctcggca ggagcaaggt gagatgacag gagatcctgc cccggcactt  240

cgcccaatag cagccagtcc cttcccgctt cagtgacaac gtcgagcaca gctgcgcaag  300

gaacgcccgt cgtggccagc cacgatagcc gcgctgcctc gtcctgcagt tcattcaggg  360

cacc                                                               364

<210>7

<211>489

<212>DNA

<213>大肠杆菌E.coli

<400>7

ataccgtaaa gcacgaggaa gcggtcagcc cattcgccgc caagctcttc agcaatatca   60

cgggtagcca acgctatgtc ctgatagcgg tccgccacac ccagccggcc acagtcgatg  120

aatccagaaa agcggccatt ttccaccatg atattcggca agcaggcatc gccatgggtc  180

acgacgagat cctcgccgtc gggcatgcgc gccttgagcc tggcgaacag ttcggctggc  240

gcgagcccct gatgctcttc gtccagatca tcctgatcga caagaccggc ttccatccga  300

gtacgtgctc gctcgatgcg atgtttcgct tggtggtcga atgggcaggt agccggatca  360

agcgtatgca gccgccgcat tgcatcagcc atgatggata ctttctcggc aggagcaagg  420

tgagatgaca ggagatcctg ccccggcact tcgcccaata gcagccagtc ccttcccgct  480

tcagtgaca                                                          489

<210>8

<211>325

<212>DNA

<213>大肠杆菌E.coli

<400>8

gatgtttcgc ttggtggtcg aatgggcagg tagccggatc aagcgtatgc agccgccgca   60

ttgcatcagc catgatggat actttctcgg caggagcaag gtgagatgac aggagatcct  120

gccccggcac ttcgcccaat agcagccagt cccttcccgc ttcagtgaca acgtcgagca  180

cagctgcgca aggaacgccc gtcgtggcca gccacgatag ccgcgctgcc tcgtcctgca  240

gttcattcag ggcaccggac aggtcggtct tgacaaaaag aaccgggcgc ccctgcgctg  300

acagccggaa cacggcggca tcaga                                        325

<210>9

<211>466

<212>DNA

<213>大肠杆菌E.coli

<400>9

ccttgagcct ggcgaacagt tcggctggcg cgagcccctg atgctcttcg tccagatcat   60

cctgatcgac aagaccggct tccatccgag tacgtgctcg ctcgatgcga tgtttcgctt  120

ggtggtcgaa tgggcaggta gccggatcaa gcgtatgcag ccgccgcatt gcatcagcca  180

tgatggatac tttctcggca ggagcaaggt gagatgacag gagatcctgc cccggcactt  240

cgcccaatag cagccagtcc cttcccgctt cagtgacaac gtcgagcaca gctgcgcaag  300

gaacgcccgt cgtggccagc cacgatagcc gcgctgcctc gtcctgcagt tcattcaggg  360

caccggacag gtcggtcttg acaaaaagaa ccgggcgccc ctgcgctgac agccggaaca  420

cggcggcatc agagcagccg attgtctgtt gtgcccagtc atagcc                 466

<210>10

<211>283

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌(Agrobacterium tumefaciens)

<400>10

gagcggagaa ttaagggagt cacgttatga cccccgccga tgacgcggga caagccgttt   60

tacgtttgga actgacagaa ccgcaacgtt gaaggagcca ctcagccgcg ggtttctgga  120

gtttaatgag ctaagcacat acgtcagaaa ccattattgc gcgttcaaaa gtcgcctaag  180

gtcactatca gctagcaaat atttcttgtc aaaaatgctc cactgacgtt ccataaattc  240

ccctcggtat ccaattagag tctcatattc actctcaatc caa                    283

<210>11

<211>231

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌

<400>11

gcggagaatt aagggagtca cgttatgacc cccgccgatg acgcgggaca agccgtttta   60

cgtttggaac tgacagaacc gcaacgttga aggagccact cagccgcggg tttctggagt  120

ttaatgagct aagcacatac gtcagaaacc attattgcgc gttcaaaagt cgcctaaggt  180

cactatcagc tagcaaatat ttcttgtcaa aaatgctcca ctgacgttcc a           231

<210>12

<211>219

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌

<400>12

ttaagggagt cacgttatga cccccgccga tgacgcggga caagccgttt tacgtttgga   60

actgacagaa ccgcaacgtt gaaggagcca ctcagccgcg ggtttctgga gtttaatgag  120

ctaagcacat acgtcagaaa ccattattgc gcgttcaaaa gtcgcctaag gtcactatca  180

gctagcaaat atttcttgtc aaaaatgctc cactgacgt                         219

<210>13

<211>225

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌

<400>13

ggaactgaca gaaccgcaac gttgaaggag ccactcagcc gcgggtttct ggagtttaat   60

gagctaagca catacgtcag aaaccattat tgcgcgttca aaagtcgcct aaggtcacta  120

tcagctagca aatatttctt gtcaaaaatg ctccactgac gttccataaa ttcccctcgg  180

tatccaatta gagtctcata ttcactctca atccaaataa tctgc                  225

<210>14

<211>213

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌

<400>14

gtaacataga tgacaccgcg cgcgataatt tatcctagtt tgcgcgctat attttgtttt   60

ctatcgcgta ttaaatgtat aattgcggga ctctaatcat aaaaacccat ctcataaata  120

acgtcatgca ttacatgtta attattacat gcttaacgta attcaacaga aattatatga  180

taatcatcgc aagaccggca acaggattca atc                               213

<210>15

<211>180

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌

<400>15

gaatcctgtt gccggtcttg cgatgattat catataattt ctgttgaatt acgttaagca   60

tgtaataatt aacatgtaat gcatgacgtt atttatgaga tgggttttta tgattagagt  120

cccgcaatta tacatttaat acgcgataga aaacaaaata tagcgcgcaa actaggataa  180

<210>16

<211>104

<212>DNA

<213>根瘤土壤杆菌

<400>16

gaatcctgtt gccggtcttg cgatgattat catataattt ctgttgaatt acgttaagca   60

tgtaataatt aacatgtaat gcatgacgtt atttatgaga tggg                   104

<210>17

<211>162

<212>DNA

<213>花椰菜花叶病毒

<400>17

ccgacagtgg tcccaaagat ggacccccac ccacgaggag catcgtggaa aaagaagacg   60

ttccaaccac gtcttcaaag caagtggatt gatgtgatat ctccactgac gtaagggatg  120

acgcacaatc ccactatcct tcgcaagacc cttcctctat at                     162

<210>18

<211>195

<212>DNA

<213>花椰菜花叶病毒

<400>18

gctcctacaa atgccatcat tgcgataaag gaaaggctat cattcaagat ctctctgccg   60

acagtggtcc caaagatgga cccccaccca cgaggagcat cgtggaaaaa gaagacgttc  120

caaccacgtc ttcaaagcaa gtggattgat gtgacatctc cactgacgta agggatgacg  180

cacaatccca ctatc                                                   195

<210>19

<211>239

<212>DNA

<213>花椰菜花叶病毒

<400>19

ttgcccagct atctgtcact tcatcaaaag gacagtagaa aaggaaggtg gcacctacaa   60

atgccatcat tgcgataaag gaaaggctat cgttcaagat gcctctgccg acagtggtcc  120

caaagatgga cccccaccca cgaggagcat cgtggaaaaa gaagacgttc caaccacgtc  180

ttcaaagcaa gtggattgat gtgatatctc cactgacgta agggatgacg cacaatccc   239

<210>20

<211>220

<212>DNA

<213>油菜籽

<400>20

gtggatatac aacacgtgac tgtattccat atgagtaaac tatatgtaaa accaagcttg   60

aattcgagct cggtacccct ggattttggt tttaggaatt agaaatttta ttgatagaag  120

tattttacaa atacaaatac atactaaggg tttcttatat gctcaacaca tgagcgaaac  180

cctataagaa ccctaattcc cttatctggg aactactcac                        220

<210>21

<211>224

<212>DNA

<213>淀粉液化芽孢杆菌(Bacillusamylolique faciens)

<400>21

tcagcgacct ccaccagaca ttgaaaaagg agcttgccct tccggaatac tacggtgaaa   60

acctggacgc tttatgggat tgtctgaccg gatgggtgga gtacccgctc gttttggaat  120

ggaggcagtt tgaacaaagc aagcagctga ctgaaaatgg cgccgagagt gtgcttcagg  180

ttttccgtga agcgaaagcg gaaggctgcg acatcaccat cata                   224

<210>22

<211>216

<212>DNA

<213>淀粉液化芽孢杆菌

<400>22

aagtatcagc gacctccacc agacattgaa aaaggagctt gcccttccgg aatactacgg   60

tgaaaacctg gacgctttat gggattgtct gaccggatgg gtggagtacc cgctcgtttt  120

ggaatggagg cagtttgaac aaagcaagca gctgactgaa aatggcgccg agagtgtgct  180

tcaggttttc cgtgaagcga aagcggaagg ctgcga                            216

<210>23

<211>248

<212>DNA

<213>淀粉液化芽孢杆菌

<400>23

ggggaacaaa tcagaagtat cagcgacctc caccagacat tgaaaaagga gcttgccctt   60

ccggaatact acggtgaaaa cctggacgct ttatgggatt gtctgaccgg atgggtggag  120

tacccgctcg ttttggaatg gaggcagttt gaacaaagca agcagctgac tgaaaatggc  180

gccgagagtg tgcttcaggt tttccgtgaa gcgaaagcgg aaggctgcga catcaccatc  240

atactttc                                                           248

<210>24

<211>300

<212>DNA

<213>淀粉液化芽孢杆菌

<400>24

ggttatcaac acgtttgacg gggttgcgga ttatcttcag acatatcata agctacctga   60

taattacatt acaaaatcag aagcacaagc cctcggctgg gtggcatcaa aagggaacct  120

tgcagacgtc gctccgggga aaagcatcgg cggagacatc ttctcaaaca gggaaggcaa  180

actcccgggc aaaagcggac gaacatggcg tgaagcggat attaactata catcaggctt  240

cagaaattca gaccggattc tttactcaag cgactggctg atttacaaaa caacggacca  300

<210>25

<211>213

<212>DNA

<213>淀粉液化芽孢杆菌

<400>25

cacgtttgac ggggttgcgg attatcttca gacatatcat aagctacctg ataattacat   60

tacaaaatca gaagcacaag ccctcggctg ggtggcatca aaagggaacc ttgcagacgt  120

cgctccgggg aaaagcatcg gcggagacat cttctcaaac agggaaggca aactcccggg  180

caaaagcgga cgaacatggc gtgaagcgga tat                               213

<210>26

<211>237

<212>DNA

<213>淀粉液化芽孢杆菌

<400>26

aatcagaagc acaagccctc ggctgggtgg catcaaaagg gaaccttgca gacgtcgctc   60

cggggaaaag catcggcgga gacatcttct caaacaggga aggcaaactc ccgggcaaaa  120

gcggacgaac atggcgtgaa gcggatatta actatacatc aggcttcaga aattcagacc  180

ggattcttta ctcaagcgac tggctgattt acaaaacaac ggaccattat cagacct     237

<210>27

<211>315

<212>DNA

<213>豇豆

<400>27

aaggtgtgtg tgctggtact tttccttgta ggggttacta ctgcagccat ggatctgaac   60

cacctcggaa gtaatcatca tgatgactca agcgatgaac cttctgagtc ttcagaacca  120

tgctgcgatt catgcatctg cactaaatca atacctcctc aatgccattg tacagatatc  180

aggtggaatt cgtgtcactc ggcttgcaaa tcctgcatgt gtacacgatc aatgccaggc  240

aagtgtcgtt gccttgacat tgctgatttc tgttacaaac cttgcaagtc cagggatgaa  300

gatgatgaga aagat                                                   315

<210>28

<211>352

<212>DNA

<213>豇豆

<400>28

ccacctcata cctaccttca gccatcgctg atttcgtttt aaaggtgtgt gtgctggtac   60

ttttccttgt aggggttact actgcagcca tggatctgaa ccacctcgga agtaatcatc  120

atgatgactc aagcgatgaa ccttctgagt cttcagaacc atgctgcgat tcatgcatct  180

gcactaaatc aatacctcct caatgccatt gtacagatat caggtggaat tcgtgtcact  240

cggcttgcaa atcctgcatg tgtacacgat caatgccagg caagtgtcgt tgccttgaca  300

ttgctgattt ctgttacaaa ccttgcaagt ccagggatga agatgatgag aa          352

<210>29

<211>209

<212>DNA

<213>豇豆

<400>29

ccacctcgga agtaatcatc atgatgactc aagcgatgaa ccttctgagt cttcagaacc   60

atgctgcgat tcatgcatct gcactaaatc aatacctcct caatgccatt gtacagatat  120

caggtggaat tcgtgtcact cggcttgcaa atcctgcatg tgtacacgat caatgccagg  180

caagtgtcgt tgccttgaca ttgctgatt                                    209

<210>30

<211>370

<212>DNA

<213>豇豆

<400>30

ctctgttgtg ccttcaccac ctcataccta ccttcagcca tcgctgattt cgttttaaag   60

gtgtgtgtgc tggtactttt ccttgtaggg gttactactg cagccatgga tctgaaccac  120

ctcggaagta atcatcatga tgactcaagc gatgaacctt ctgagtcttc agaaccatgc  180

tgcgattcat gcatctgcac taaatcaata cctcctcaat gccattgtac agatatcagg  240

tggaattcgt gtcactcggc ttgcaaatcc tgcatgtgta cacgatcaat gccaggcaag  300

tgtcgttgcc ttgacattgc tgatttctgt tacaaacctt gcaagtccag ggatgaagat  360

gatgagaaag                                                         370

<210>31

<211>337

<212>DNA

<213>玉米

<400>31

caacggtgga agagttcaat gtatgcaggt gtggccggcc tacggcaaca agaagttcga   60

gacgctgtcg tacctgccgc cgctgtctat ggcgcccacc gtgatgatgg cctcgtcggc  120

caccgccgtc gctccgttcc aggggctcaa gtccaccgcc agcctccccg tcgcccgccg  180

ctcctccaga agcctcggca acgtcagcaa cggcggaagg atccggtgca tggccggcgc  240

cgaggagatc gtgctgcagc ccatcaagga gatctccggc accgtcaagc tgccggggtc  300

caagtcgctt tccaaccgga tcctcctact cgccgcc                           337

<210>32

<211>236

<212>DNA

<213>玉米

<400>32

acgacttctc cacccttccc agcaacggtg gaagagttca atgtatgcag gtgtggccgg   60

cctacggcaa caagaagttc gagacgctgt cgtacctgcc gccgctgtct atggcgccca  120

ccgtgatgat ggcctcgtcg gccaccgccg tcgctccgtt ccaggggctc aagtccaccg  180

ccagcctccc cgtcgcccgc cgctcctcca gaagcctcgg caacgtcagc aacggc      236

<210>33

<211>335

<212>DNA

<213>玉米

<400>33

cttggtagtt tgggtgggcg agaggcggct tcgtgcgcgc ccagatcggt gcgcgggagg   60

ggcgggatct cgcggctggg gctctcgccg gcgtggatcc ggcccggatc tcgcggggaa  120

tggggctctc ggatgtagat ctgcgatccg ccgttgttgg gggagatgat ggggggttta  180

aaatttccgc catgctaaac aagatcagga agaggggaaa agggcactat ggtttatatt  240

tttatatatt tctgctgctt cgtcaggctt agatgtgcta gatctttctt tcttcttttt  300

gtgggtagaa tttgaatccc tcagcattgt tcatc                             335

<210>34

<211>378

<212>DNA

<213>玉米

<400>34

cttggtagtt tgggtgggcg agaggcggct tcgtgcgcgc ccagatcggt gcgcgggagg   60

ggcgggatct cgcggctggg gctctcgccg gcgtggatcc ggcccggatc tcgcggggaa  120

tggggctctc ggatgtagat ctgcgatccg ccgttgttgg gggagatgat ggggggttta  180

aaatttccgc catgctaaac aagatcagga agaggggaaa agggcactat ggtttatatt  240

tttatatatt tctgctgctt cgtcaggctt agatgtgcta gatctttctt tcttcttttt  300

gtgggtagaa tttgaatccc tcagcattgt tcatcggtag tttttctttt catgatttgt  360

gacaaatgca gcctcgtg                                                378

<210>35

<211>488

<212>DNA

<213>苏云金杆菌(Bacillus thuringiensis subsp.Kurstaki)

<400>35

tcgtccgtga gcatcatcag agctcctatg ttctcctgga ttcatcgcag cgcggagttc   60

aacaatatca ttccgtcctc ccaaatcacc caaatccccc tcaccaagtc caccaacctg  120

ggcagcggca cctccgtggt gaagggccca ggcttcacgg gcggcgacat cctgcgcagg  180

acctccccgg gccagatcag caccctccgc gtcaacatca ccgctcccct gtcccagagg  240

taccgcgtca ggattcgcta cgctagcacc accaacctgc aattccacac ctccatcgac  300

ggcaggccga tcaatcaggg taacttctcc gccaccatgt ccagcggcag caacctccaa  360

tccggcagct tccgcaccgt gggtttcacc acccccttca acttctccaa cggctccagc  420

gttttcaccc tgagcgccca cgtgttcaat tccggcaatg aggtgtacat tgaccgcatt  480

gagttcgt                                                           488

<210>36

<211>473

<212>DNA

<213>苏云金杆菌

<400>36

caagtcccgc tcctgtccgt gtacgtccag gccgccaacc tgcacctcag cgtgctgagg   60

gacgtcagcg tgtttggcca gaggtggggc ttcgacgccg ccaccatcaa cagccgctac  120

aacgacctca ccaggctgat cggcaactac accgaccacg ctgtccgctg gtacaacact  180

ggcctggagc gcgtctgggg ccctgattct agagactgga ttcgctacaa ccagttcagg  240

cgcgagctga ccctcaccgt cctggacatt gtgtccctct tcccgaacta cgactcccgc  300

acctacccga tccgcaccgt gtcccaactg acccgcgaaa tctacaccaa ccccgtcctg  360

gagaacttcg acggtagctt caggggcagc gcccagggca tcgagggctc catcaggagc  420

ccacacctga tggacatcct caacagcatc actatctaca ccgatgccca ccg         473

<210>37

<211>354

<212>DNA

<213>苏云金杆菌

<400>37

gcaacgccgc tccacaacaa cgcatcgtcg ctcagctggg ccagggcgtc taccgcaccc   60

tgagctccac cctgtaccgc aggcccttca acatcggtat caacaaccag cagctgtccg  120

tcctggatgg cactgagttc gcctacggca cctcctccaa cctgccctcc gctgtctacc  180

gcaagagcgg cacggtggat tccctggacg agatcccacc acagaacaac aatgtgcccc  240

ccaggcaggg tttttcccac aggctcagcc acgtgtccat gttccgctcc ggcttcagca  300

actcgtccgt gagcatcatc agagctccta tgttctcctg gattcatcgc agcg        354

<210>38

<211>294

<212>DNA

<213>土壤杆菌(Agrobacterium)

<400>38

ggagttcttc cagaccgttc atcacggtcg ccccttccgc gaaggcggcg gcgacagcga   60

gaatcggata ttcgtcgatc atcgaaggcg cgcggtcttc cggcaccgtg acgcccttca  120

gcgtggagga gcgaacgcgc aggtccgcca cgtcttcgcc gccggcaagg cgcgggttga  180

tgacttcgat gtcggcgccc atttcctgca gcgtcaggat gaggccggtg cgggtggggt  240

tcatcagcac gttgaggatg gtgacgtcgg agcccggaac aagcagggcc gcaa        294

<210>39

<211>236

<212>DNA

<213>土壤杆菌

<400>39

gtcggagccc ggaacaagca gggccgcaac cagcgggaag gccgtcgagg acgggtcgcc   60

cggcacgtcg atgacttggc cggtgagctt gccgcggcct tccaggcgga tggtgcgcac  120

gccgtccgca tccgtctcga cggtaaggtt ggcgccaaag ccctgcagca tcttttccgt  180

atgatcgcgc gtcatgatcg gctcgatgac cgtcgtgatg ccgggcgtgt tgaggc      236

<210>40

<211>427

<212>DNA

<213>土壤杆菌

<400>40

tcgccctcat cgcaatccac gccattgagc ttgaggccat tggcgacggc cgagaggcgg   60

tcgctttcct tgacgcggag ttcttccaga ccgttcatca cggtcgcccc  ttccgcgaag 120

gcggcggcga cagcgagaat cggatattcg tcgatcatcg aaggcgcgcg gtcttccggc  180

accgtgacgc ccttcagcgt ggaggagcga acgcgcaggt ccgccacgtc ttcgccgccg  240

gcaaggcgcg ggttgatgac ttcgatgtcg gcgcccattt cctgcagcgt caggatgagg  300

ccggtgcggg tggggttcat cagcacgttg aggatggtga cgtcggagcc cggaacaagc  360

agggccgcaa ccagcgggaa ggccgtcgag gacgggtcgc ccggcacgtc gatgacttgg  420

ccggtga                                                            427

<210>41

<211>433

<212>DNA

<213>真核植物

<400>41

aatcttctac tggtacatgg acaactgtat ggactgacgg gcttaccagt cttgatcgtt   60

acaaaggtcg atgctaccac atcgagcccg ttgctggaga agaaagtcaa tttattgctt  120

atgtagctta ccccttagac ctttttgaag aaggttctgt tactaacatg tttacttcca  180

ttgtgggtaa tgtatttggg ttcaaggccc tgcgcgctct acgtctggag gatttgcgaa  240

tcccccctgc ttatactaaa actttccaag gcccgcctca tggcatccaa gttgagagag  300

ataagttgaa caagtatggc cgccccctat tgggatgtac tattaaacct aaattggggt  360

tatccgctaa gaattacggt agagccgttt atgaatgtct tcgcggtgga cttgatttta  420

ccaaagatga tga                                                     433

<210>42

<211>414

<212>DNA

<213>大豆

<400>42

tgccgaagca accaaacatg atcctccaag gagacgctat tgtgacctcc tcgggaaagt   60

tacaactcaa taaggttgac gaaaacggca ccccaaaacc ctcgtctctt ggtcgcgccc  120

tctactccac ccccatccac atttgggaca aagaaaccgg tagcgttgcc agcttcgccg  180

cttccttcaa cttcaccttc tatgcccctg acacaaaaag gcttgcagat gggcttgcct  240

tctttctcgc accaattgac actaagccac aaacacatgc aggttatctt ggtcttttca  300

acgaaaacga gtctggtgat caagtcgtcg ctgttgagtt tgacactttc cggaactctt  360

gggatccacc aaatccacac atcggaatta acgtcaattc tatcagatcc atca        414

<210>43

<211>408

<212>DNA

<213>大豆

<400>43

gaagcaacca aacatgatcc tccaaggaga cgctattgtg acctcctcgg gaaagttaca   60

actcaataag gttgacgaaa acggcacccc aaaaccctcg tctcttggtc gcgccctcta  120

ctccaccccc atccacattt gggacaaaga aaccggtagc gttgccagct tcgccgcttc  180

cttcaacttc accttctatg cccctgacac aaaaaggctt gcagatgggc ttgccttctt  240

tctcgcacca attgacacta agccacaaac acatgcaggt tatcttggtc ttttcaacga  300

aaacgagtct ggtgatcaag tcgtcgctgt tgagtttgac actttccgga actcttggga  360

tccaccaaat ccacacatcg gaattaacgt caattctatc agatccat               408

<210>44

<211>348

<212>DNA

<213>大豆

<400>44

tgccgaagca accaaacatg atcctccaag gagacgctat tgtgacctcc tcgggaaagt   60

tacaactcaa taaggttgac gaaaacggca ccccaaaacc ctcgtctctt ggtcgcgccc  120

tctactccac ccccatccac atttgggaca aagaaaccgg tagcgttgcc agcttcgccg  180

cttccttcaa cttcaccttc tatgcccctg acacaaaaag gcttgcagat gggcttgcct  240

tctttctcgc accaattgac actaagccac aaacacatgc aggttatctt ggtcttttca  300

acgaaaacga gtctggtgat caagtcgtcg ctgttgagtt tgacactt               348

<210>45

<211>485

<212>DNA

<213>玉米

<400>45

gcttgcattg ttcgctctcc tagctctttg tgcaagcgcc actagtgcga cccatattcc   60

agggcacttg ccaccagtca tgccattggg taccatgaac ccatgcatgc agtactgcat  120

gatgcaacag gggcttgcca gcttgatggc gtgtccgtcc ctgatgctgc agcaactgtt  180

ggccttaccg cttcagacga tgccagtgat gatgccacag atgatgacgc ctaacatgat  240

gtcaccattg atgatgccga gcatgatgtc accaatggtc ttgccgagca tgatgtcgca  300

aataatgatg ccacaatgtc actgcgacgc cgtctcgcag attatgctgc aacagcagtt  360

accattcatg ttcaacccaa tggccatgac gattccaccc atgttcttac agcaaccctt  420

tgttggtgct gcattctaga tagaaatatt tgtgttgtat cgaataatga gttgacatgc  480

catcg                                                              485

<210>46

<211>277

<212>DNA

<213>玉米

<400>46

agtgcgaccc atattccagg gcacttgcca ccagtcatgc cattgggtac catgaaccca   60

tgcatgcagt actgcatgat gcaacagggg cttgccagct tgatggcgtg tccgtccctg  120

atgctgcagc aactgttggc cttaccgctt cagacgatgc cagtgatgat gccacagatg  180

atgacgccta acatgatgtc accattgatg atgccgagca tgatgtcacc aatggtcttg  240

ccgagcatga tgtcgcaaat aatgatgcca caatgtc                           277

<210>47

<211>329

<212>DNA

<213>玉米

<400>47

tgcttgcatt gttcgctctc ctagctcttt gtgcaagcgc cactagtgcg acccatattc   60

cagggcactt gccaccagtc atgccattgg gtaccatgaa cccatgcatg cagtactgca  120

tgatgcaaca ggggcttgcc agcttgatgg cgtgtccgtc cctgatgctg cagcaactgt  180

tggccttacc gcttcagacg atgccagtga tgatgccaca gatgatgacg cctaacatga  240

tgtcaccatt gatgatgccg agcatgatgt caccaatggt cttgccgagc atgatgtcgc  300

aaataatgat gccacaatgt cactgcgac                                    329

<210>48

<211>369

<212>DNA

<213>油菜

<400>48

ctcgccttgt tcttccttct caccaatgcc tccgtctaca ggacggttgt ggaagtcgac   60

gaagacgatg ccacaaatcc agccggccca tttaggattc caaaatgtag aaaggagttt  120

cagcaagcac aacacctaag agcttgccaa caatggctcc acaagcaggc aatgcagccc  180

ggtggtggta gtggtccaag ctggactctc gacggtgagt ttgattttga agacgacgtg  240

gagaaccaac aacagggccc acagcagagg ccaccgccac cccagcagtg ctgcaacgag  300

ctccaccagg aagagccact ttgcgtttgc ccaaccttga aaggagcatc caaagccgtt  360

agacaacag                                                          369

<210>49

<211>488

<212>DNA

<213>油菜

<400>49

ctcgccttgt tcttccttct caccaatgcc tccgtctaca ggacggttgt ggaagtcgac   60

gaagacgatg ccacaaatcc agccggccca tttaggattc caaaatgtag aaaggagttt  120

cagcaagcac aacacctaag agcttgccaa caatggctcc acaagcaggc aatgcagccc  180

ggtggtggta gtggtccaag ctggactctc gacggtgagt ttgattttga agacgacgtg  240

gagaaccaac aacagggccc acagcagagg ccaccgccac cccagcagtg ctgcaacgag  300

ctccaccagg aagagccact ttgcgtttgc ccaaccttga aaggagcatc caaagccgtt  360

agacaacagg ttcgacaaca acagggacaa caaatgcagg gacagcagat gcagcaagta  420

attagccgtg tctaccagac tgctacgcac ttacctagag tttgcaacat caggcaagtt  480

agcatttg                                                           488

<210>50

<211>325

<212>DNA

<213>油菜

<400>50

cttccttctc accaatgcct ccgtctacag gacggttgtg gaagtcgacg aagacgatgc   60

cacaaatcca gccggcccat ttaggattcc aaaatgtaga aaggagtttc agcaagcaca  120

acacctaaga gcttgccaac aatggctcca caagcaggca atgcagcccg gtggtggtag  180

tggtccaagc tggactctcg acggtgagtt tgattttgaa gacgacgtgg agaaccaaca  240

acagggccca cagcagaggc caccgccacc ccagcagtgc tgcaacgagc tccaccagga  300

agagccactt tgcgtttgcc caacc                                        325

<210>51

<211>484

<212>DNA

<213>鼠伤寒沙门氏菌

<400>51

gtagctgctt atgatggggc ggaaatacca tctacaaata agcacctgaa aaataatttc   60

aactccttgc acaaccaaat gcggaagatg ccggtatccc actttaaaga ggcgctggat  120

gtgcctgact attcagggat gcgccagagt ggtttctttg ctatgagcca aggttttcag  180

ctgaataacc atggttacga tgttttcatc catgctcgtc gagaatcacc tcagtctcag  240

ggcaaatttg ccggtgacaa gttccacatc agtgtgctca gggatatggt gccacaagca  300

tttcaagcgc tgtccggatt gctgttttca gaggacagtc cggtagataa gtggaaagtg  360

accgatatgg agaaggtcgt tcaacaagcc cgtgttagcc tgggcgctca gttcacgttg  420

tatataaaac cagaccagga aaattcgcag tacagtgcgt cgtttctcca caagacacgg  480

caat                                                               484

<210>52

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>52

gattgaatcc tgttgccggt                                              20

<210>53

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>53

gtaacataga tgacaccgcg                                              20

<210>54

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>54

gaatcctgtt gccggtcttg                                              20

<210>55

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>55

ttatcctagt tgcgcgc                                                 17

<210>56

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>56

gaatcctgtt gccggtcttg                                              20

<210>57

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>57

cccatctcat aaataacgtc                                              20

<210>58

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>58

ccgacagtgg tcccaaagat ggac                                         24

<210>59

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>59

atatagagga agggtcttgc gaagg                                        25

<210>60

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>60

gctcctacaa atgccatca                                               19

<210>61

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>61

gatagtggga ttgtgcgtca                                              20

<210>62

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>62

attgcccagc tatctgtcac tt                                           22

<210>63

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>63

ggattgtgcg tcatccctta c                                            21

<210>64

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>64

gtggatatac aacacgtgac tg                                           22

<210>65

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>65

gtgagtagtt cccagataag g                                            21

<210>66

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>66

aatcttctac tggtacatgg ac                                           22

<210>67

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>67

tcatcatctt tggtaaaatc aag                                          23

<210>68

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>68

tgccgaagca accaaacatg atcct                                        25

<210>69

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>69

tgatggatct gatagaattg acgtt                                        25

<210>70

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>70

gaagcaacca aacatgatcc tc                                           22

<210>71

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>71

atggatctga tagaattgac gtta                                         24

<210>72

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>72

tgccgaagca accaaacatg atcct                                        25

<210>73

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>73

aagtgtcaaa ctcaacagcg acgac                                        25

<210>74

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>74

gcttgcattg ttcgctctc                                               19

<210>75

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>75

cgatggcatg tcaactcatt a                                            21

<210>76

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>76

agtgcgaccc atattccag                                               19

<210>77

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>77

gacattgtgg catcatcatt t                                            21

<210>78

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>78

tgcttgcatt gttcgctctc ctag                                         24

<210>79

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>79

gtcgcagtga cattgtggca t                                            21

<210>80

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>80

ataccgtaaa gcacgaggaa g                                            21

<210>81

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>81

cactgaagcg ggaagggac t                                             20

<210>82

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>82

ccttgagcct ggcgaaca                                                18

<210>83

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>83

ggtgccctga atgaactgc                                               19

<210>84

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>84

ataccgtaaa gcacgaggaa g                                            21

<210>85

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>85

tgtcactgaa gcgggaagg                                               19

<210>86

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>86

gatgtttcgc ttggtggtcg                                              20

<210>87

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>87

tctgatgccg ccgtgttcc                                               19

<210>88

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>88

ccttgagcct ggcgaacagt t                                            21

<210>89

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>89

ggctatgact gggcacaaca                                              20

<210>90

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>90

tgtcctgcgg gtaaatagc                                               19

<210>91

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>91

tccttgcggt ccgaatgg                                                18

<210>92

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>92

cactggcaaa ctgtgatgg                                               19

<210>93

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>93

atgttggcga cctcgtatt                                               19

<210>94

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>94

cgttatgttt atcggcactt tg                                          22

<210>95

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>95

ccgaacatcg cctcgctcca gt                                          22

<210>96

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>96

acgacaccgt cagtgcgtcc                                             20

<210>97

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>97

cgcttctgcg ggcgatttgt                                              20

<210>98

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>98

gagcggagaa ttaagggagt c                                            21

<210>99

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>99

ttggattgag agtgaatatg ag                                           22

<210>100

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>100

gcggagaatt aagggagtca g                                            21

<210>101

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>101

tggaacgtca gtggagcatt                                              20

<210>102

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>102

ttaagggagt cacgttatg                                               19

<210>103

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>103

acgtcagtgg agcatttt                                                18

<210>104

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>104

ggaactgaca gaaccgcaac g                                            21

<210>105

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>105

gcagattatt tggattgaga g                                            21

<210>106

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>106

ggagttcttc cagaccgttc at                                           22

<210>107

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>107

ttgcggccct gcttgtt                                                 17

<210>108

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>108

gtcggagccc ggaacaagca                                              20

<210>109

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>109

gcctcaacac gcccggcatc a                                            21

<210>110

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>110

tcgccctcat cgcaatcc                                                18

<210>111

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>111

tcaccggcca agtcatcg                                                18

<210>112

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>112

caacggtgga agagttcaat g                                            21

<210>113

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>113

ggcggcgagt aggaggat                                                18

<210>114

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>114

acgacttctc caccctt                                                 17

<210>115

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>115

gccgttgctg acgttgc                                                 17

<210>116

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>116

cttggtagtt tgggtggg                                                18

<210>117

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>117

gatgaacaat gctgaggga                                               19

<210>118

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>118

cttggtagtt tgggtggg                                                18

<210>119

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>119

cacgaggctg catttgtc                                                18

<210>120

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>120

tcgtccgtga gcatcatcag agc                                          23

<210>121

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>121

acgaactcaa tgcggtcaat                                              20

<210>122

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>122

caagtcccgc tcctgtccgt gta                                          23

<210>123

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>123

cggtgggcat cggtgtagat agtg                                         24

<210>124

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>124

gcaacgccgc tccacaacaa cgcat                                        25

<210>125

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>125

cgctgcgatg aatccaggag aac                                          23

<210>126

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>126

aaggtgtgtg tgctggtact tttc                                         24

<210>127

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>127

atctttctca tcatcttcat ccct                                         24

<210>128

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>128

ccacctcata cctacctt                                                18

<210>129

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>129

ttctcatcat cttcatccct                                               20

<210>130

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>130

ccacctcgga agtaatca                                                18

<210>131

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>131

aatcacgaat gtcaaggcaa cg                                           22

<210>132

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>132

ctctgttgtg ccttcaccac ct                                           22

<210>133

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>133

ctttctcatc atcttcatcc ct                                           22

<210>134

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>134

ggttatcaac acgtttgacg gggt                                         24

<210>135

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>135

tggtccgttg ttttgtaaat cagc                                         24

<210>136

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>136

cacgtttgac ggggttgcgg attat                                        25

<210>137

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>137

atatccgctt cacgccatgt tcgtc                                        25

<210>138

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>138

aatcagaagc acaagccctc g                                            21

<210>139

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>139

aggtctgata atggtccgtt gtt                                          23

<210>140

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>140

tcagcgacct ccaccagaca t                                            21

<210>141

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>141

tatgatggtg atgtcgcagc                                              20

<210>142

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>142

aagtatcagc gacctccacc ag                                           22

<210>143

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>143

tcgcagcctt ccgctttcg                                               19

<210>144

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>144

ggggaacaaa tcagaagtat                                              20

<210>145

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>145

gaaagtatga tggtgatgtc gc                                           22

<210>146

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>146

ctcgccttgt tcttccttc                                               19

<210>147

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>147

ctgttgtcta acggctttg                                               19

<210>148

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>148

ctcgccttgt tcttccttct c                                            21

<210>149

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>149

caaatgctaa cttgcctgat g                                            21

<210>150

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>150

cttccttctc accaatgcct c                                            21

<210>151

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>151

ggttgggcaa acgcaaagtg                                              20

<210>152

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>152

gtagctgctt atgatggg                                                18

<210>153

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>引物

<400>153

attgccgtgt cttgtggag                                               19

Claims (13)

1.  一种转基因农产品DNA检测芯片，该芯片包括片基和位于片基上的核酸探针，该核酸探针包括以下一系列检测目标基因的目标检测探针：检测hpt的SEQ ID NOs：1～4中的至少一个，检测nptII的SEQ ID NOs：5～9中的至少一个，检测pnos的NOs：10～13中的至少一个，检测nos的SEQ ID NOs：14～16中的至少一个，检测camv35s的SEQID NOs：17～19中的至少一个，检测mdb484-mdb501的SEQ ID NO：20，检测barstar的SEQ ID NOs：21～23中的至少一个，检测barnase的SEQ ID NOs：24～26中的至少一个，检测cpti的SEQ ID NOs：27～30中的至少一个，检测mcp4epsps的SEQ ID NOs：31～34中的至少一个，检测cryIA(b)的SEQ ID NOs：35～37中的至少一个，检测cp4epsps的SEQ ID NOs：38～40中的至少一个，检测rbcl的SEQ ID NO：41，检测lectin的SEQID NOs：42～44中的至少一个，检测zein的SEQ ID NOs：45～47中的至少一个，检测napin的SEQ ID NOs：48～50中的至少一个。

2.如权利要求1所述的转基因农产品DNA检测芯片，该芯片还包括阴性对照和阳性对照，该阳性对照为如SEQ ID NO.51所示的序列。

3.如权利要求1或2任一项所述的转基因农产品DNA检测芯片，其中所述的转基因农产品为大豆、玉米、水稻或油菜，以及其他含有或可能含有相关检测目标基因的农产品。

4.如权利要求3所述的转基因农产品DNA检测芯片，其中所述的水稻为SCK水稻。

5.一种如权利要求1～4任一项所述的转基因农产品DNA检测芯片的制备方法，该方法包括：

(1)根据转基因农产品的目标基因序列设计并合成聚合酶链式反应引物，这些聚合酶链式反应引物的解链温度大致相同；

(2)利用(1)所述的聚合酶链式反应引物从转基因农产品的DNA中扩增目标检测探针；和

(3)将所述探针固定在片基上。

6.如权利要求5所述的转基因农产品DNA检测芯片的制备方法，其中所述的聚合酶链式反应引物包括：用于扩增hpt的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：90和SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92和SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94和SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：96和SEQ ID NO：97；用于扩增nptII的以下引物对中的至少一对：SEQ IDNO：80和SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：82和SEQ ID NO：83、SEQ ID NO：84和SEQ IDNO：85、SEQ ID NO：86和SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：88和SEQ ID NO：89；用于扩增pnos的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：98和SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：100和SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：102和SEQ ID NO：103、SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：105；用于扩增nos的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：52和SEQ ID NO：53、SEQID NO：54和SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：56和SEQ ID NO：57；用于扩增camv35s的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：58和SEQ ID NO：59、SEQ ID NO：60和SEQ IDNO：61、SEQ ID NO：62和SEQ ID NO：63；用于扩增mdb484-mdb501的以下引物对SEQ IDNO：64和SEQ ID NO：65；用于扩增barstar的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：140和SEQ ID NO：141、SEQ ID NO：142和SEQ ID NO：143、SEQ ID NO：144和SEQ IDNO：145；用于扩增barnase的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：134和SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：136和SEQ ID NO：137、SEQ ID NO：138和SEQ ID NO：139；用于扩增cpti的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：126和SEQ ID NO：127、SEQ ID NO：128和SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：130和SEQ ID NO：131、SEQ ID NO：132和SEQ IDNO：133；用于扩增mcp4epsps的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：112和SEQ ID NO：113、SEQ ID NO：114和SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：116和SEQ ID NO：117、SEQ IDNO：118和SEQ ID NO：119；用于扩增cryIA(b)的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：120和SEQ ID NO：121、SEQ ID NO：122和SEQ ID NO：123、SEQ ID NO：124和SEQ IDNO：125；用于扩增cp4epsps的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：106和SEQ ID NO：107、SEQ ID NO：108和SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：110和SEQ ID NO：111；用于扩增rbcl的以下引物对：SEQ ID NO：66和SEQ ID NO：67；用于扩增lectin的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：68和SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：70和SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：72和SEQ ID NO：73；用于扩增zein的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：74和SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：76和SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：78和SEQ ID NO：79；用于扩增napin的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：146和SEQ ID NO：147、SEQ ID NO：148和SEQ ID NO：149、SEQ ID NO：150和SEQ ID NO：151。

7.如权利要求5所述的转基因农产品DNA检测芯片的制备方法，该方法还包括根据阳性对照spvc设计并合成聚合酶链式反应引物，并利用该聚合酶链式反应引物扩增spvc检测探针，所述引物为以下引物对：SEQ ID NO：152和SEQ ID NO：153。

8.如权利要求5所述的转基因农产品DNA检测芯片的制备方法，其中步骤(2)包括利用聚合酶链式反应从转基因农产品的DNA中扩增目标检测探针，聚合酶链式反应的条件为：94～95℃预变性3～5min；94℃变性40s；58～60℃退火40s；72℃延伸60s；进行40个循环；72℃延伸5～10min。

9.权利要求1～4任一项所述的转基因农产品DNA检测芯片在检测转基因农产品中的应用。

10.如权利要求9所述的应用，其中包括以下步骤：

(1)提取待测农产品的DNA；

(2)用如下引物对待测农产品的DNA进行PCR扩增并标记，所述引物包括：用于扩增hpt的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：90和SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92和SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94和SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：96和SEQ ID NO：97；用于扩增nptII的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：80和SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：82和SEQ ID NO：83、SEQ ID NO：84和SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：86和SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：88和SEQ ID NO：89；用于扩增pnos的以下引物对中的至少一对：SEQ IDNO：98和SEQ ID NO：99、SEQ ID NO：100和SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：102和SEQ IDNO：103、SEQ ID NO：104和SEQ ID NO：105；用于扩增nos的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：52和SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：54和SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：56和SEQ ID NO：57；用于扩增camv35s的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：58和SEQ IDNO：59、SEQ ID NO：60和SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62和SEQ ID NO：63；用于扩增mdb484-mdb501的以下引物对SEQ ID NO：64和SEQ ID NO：65；用于扩增barstar的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：140和SEQ ID NO：141、SEQ ID NO：142和SEQ ID NO：143、SEQ ID NO：144和SEQ ID NO：145；用于扩增barnase的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：134和SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：136和SEQ ID NO：137、SEQ ID NO：138和SEQ ID NO：139；用于扩增cpti的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：126和SEQ IDNO：127、SEQ ID NO：128和SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：130和SEQ ID NO：131、SEQ IDNO：132和SEQ ID NO.133；用于扩增mcp4epsps的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：112和SEQ ID NO：113、SEQ ID NO：114和SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：116和SEQ ID NO：117、SEQ ID NO：118和SEQ ID NO：119；用于扩增cryIA(b)的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：120和SEQ ID NO：121、SEQ ID NO：122和SEQ ID NO：123、SEQ ID NO：124和SEQ ID NO：125；用于扩增cp4epsps的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：106和SEQ ID NO：107、SEQ ID NO：108和SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：110和SEQ ID NO：111；用于扩增rbcl的以下引物对：SEQ ID NO：66和SEQ ID NO：67；用于扩增lectin的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：68和SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：70和SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：72和SEQ ID NO：73；用于扩增zein的以下引物对中的至少一对：SEQ IDNO：74和SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：76和SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：78和SEQ ID NO：79；用于扩增napin的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：146和SEQ ID NO：147、SEQID NO：148和SEQ ID NO：149、SEQ ID NO：150和SEQ ID NO：151；

(3)将经标记的扩增产物与权利要求1～4任一项的转基因农产品DNA检测芯片杂交；和

(4)确定所述待测农产品是否为转基因农产品。

11.如权利要求10所述的应用，其中将所述引物分成至少两个组，然后再用每个组分别进行PCR扩增并标记。

12.一种转基因农产品DNA检测试剂盒，该试剂盒含有如权利要求1～4任一项所述的转基因农产品DNA检测芯片；和用于PCR扩增的引物，该引物包括：用于扩增hpt的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：90和SEQ ID NO：91、SEQ ID NO：92和SEQ ID NO：93、SEQ ID NO：94和SEQ ID NO：95、SEQ ID NO：96和SEQ ID NO：97；用于扩增nptII的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：80和SEQ ID NO：81、SEQ ID NO：82和SEQ IDNO：83、SEQ ID NO：84和SEQ ID NO：85、SEQ ID NO：86和SEQ ID NO：87、SEQ ID NO：88和SEQ ID NO：89；用于扩增pnos的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：98和SEQ IDNO：99、SEQ ID NO：100和SEQ ID NO：101、SEQ ID NO：102和SEQ ID NO：103、SEQ IDNO：104和SEQ ID NO：105；用于扩增nos的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：52和SEQ ID NO：53、SEQ ID NO：54和SEQ ID NO：55、SEQ ID NO：56和SEQ ID NO：57；用于扩增camv35s的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：58和SEQ ID NO：59、SEQ IDNO：60和SEQ ID NO：61、SEQ ID NO：62和SEQ ID NO：63；用于扩增mdb484-mdb501的以下引物对SEQ ID NO：64和SEQ ID NO：65；用于扩增barstar的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：140和SEQ ID NO：141、SEQ ID NO：142和SEQ ID NO：143、SEQ IDNO：144和SEQ ID NO：145；用于扩增barnase的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：134和SEQ ID NO：135、SEQ ID NO：136和SEQ ID NO：137、SEQ ID NO：138和SEQ ID NO：139；用于扩增cpti的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：126和SEQ ID NO：127、SEQID NO：128和SEQ ID NO：129、SEQ ID NO：130和SEQ ID NO：131、SEQ ID NO：132和SEQ ID NO：133；用于扩增mcp4epsps的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：112和SEQID NO：113、SEQ ID NO：114和SEQ ID NO：115、SEQ ID NO：116和SEQ ID NO：117、SEQ ID NO：118和SEQ ID NO：119；用于扩增cryIA(b)的以下引物对中的至少一对：SEQID NO：120和SEQ ID NO：121、SEQ ID NO：122和SEQ ID NO：123、SEQ ID NO：124和SEQ ID NO：125；用于扩增cp4epsps的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：106和SEQID NO：107、SEQ ID NO：108和SEQ ID NO：109、SEQ ID NO：110和SEQ ID NO：111；用于扩增rbcl的以下引物对：SEQ ID NO：66和SEQ ID NO：67；用于扩增lectin的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：68和SEQ ID NO：69、SEQ ID NO：70和SEQ ID NO：71、SEQ ID NO：72和SEQ ID NO：73；用于扩增zein的以下引物对中的至少一对：SEQ IDNO：74和SEQ ID NO：75、SEQ ID NO：76和SEQ ID NO：77、SEQ ID NO：78和SEQ ID NO：79；用于扩增napin的以下引物对中的至少一对：SEQ ID NO：146和SEQ ID NO：147、SEQID NO：148和SEQ ID NO：149、SEQ ID NO：150和SEQ ID NO：151。

13.一种检测转基因农产品的方法，该方法包括：

(1)提取待测农产品的DNA，所述农产品包括农产品原材料和/或农产品加工产品；

(2)利用以下目标检测探针检测所述待测产品的DNA，所述目标检测探针包括：检测hpt的SEQ ID NOs：1～4中的至少一个，检测nptII的SEQ ID NOs：5～9中的至少一个，检测pnos的NOs：10～13中的至少一个，检测nos的SEQ ID NOs：14～16中的至少一个，检测camv35s的SEQ ID NOs：17～19中的至少一个，检测mdb484-mdb501的SEQ IDNO：20，检测barstar的SEQ ID NOs：21～23中的至少一个，检测barnase的SEQ ID NOs：24～26中的至少一个，检测cpti的SEQ ID NOs：27～30中的至少一个，检测mcp4epsps的SEQ ID NOs：31～34中的至少一个，检测cryIA(b)的SEQ ID NOs：35～37中的至少一个，检测cp4epsps的SEQ ID NOs：38～40中的至少一个，检测rbcl的SEQ ID NO：41，检测lectin的SEQ ID NOs：42～44中的至少一个，检测zein的SEQ ID NOs：45～47中的至少一个，检测napin的SEQ ID NOs：48～50中的至少一个；和

(3)根据所述探针与所述转基因农产品DNA的结合情况判断该待测农产品是否为转基因农产品。

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