TW202241935A - 具有可調適受體專一性之嵌合抗原受體系統 - Google Patents
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Abstract
本發明提供嵌合抗原受體(CAR),特定言之具有可調適受體專一性之CAR (arCAR)。亦提供CAR之多肽及其他相關分子、聚核苷酸、載體及包含其之細胞組合物。亦提供包含本發明之該等多肽、聚核苷酸、載體或細胞之醫藥組合物及其在治療個體之疾病中的用途。
Description
本申請案係關於嵌合抗原受體(CAR),特定言之具有可調適受體專一性之CAR (arCAR),及其在免疫療法(例如授受細胞療法)中之用途。
授受細胞療法(ACT)典型地涉及自供體分離細胞、活體外培養及/或處理細胞,且隨後將細胞轉移至患者以治療疾病。為了使得細胞能夠靶向特定抗原,細胞通常經嵌合抗原受體(CAR)工程改造。習知CAR具有固定設計;因此,一種類型之CAR T細胞通常可僅靶向一種抗原抗原決定基。此剛性設計限制臨床應用且產生格外高的製造成本。儘管存在各種交換CAR平台方法,但此等抗原專一性CAR通常在訂製基礎上產生。
因此,仍需要經改良之具有用於調節CAR之內置式及方便機制之通用CAR平台以容易地調適CAR之專一性以改良使用授受細胞療法治療疾病之療法及方法。
在一個態樣中,本文提供一種具有可調適受體專一性組分之通用嵌合抗原受體系統(arCAR),其包含:
(i) 具有嵌合抗原受體的免疫效應細胞,該嵌合抗原受體包含第一多肽,該第一多肽包含(a)胞外標記結合域、(b)跨膜域及(c)至少一個胞內信號傳導域;及
(ii) 第二多肽,其包含(a)結合至目標細胞上之至少一種抗原之抗原結合域,及(b)由該嵌合抗原受體之第一多肽的標記結合域識別之標記;
其中:(i) 該標記包含抗體或其抗原結合片段,或替代骨架且該標記結合域包含結合至該標記之抗個體基因型分子,或
(ii) 該標記包含結合至標記結合域之抗個體基因型分子,且該標記結合域包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
在一些實施例中,抗個體基因型分子結合至抗體、其抗原結合片段或替代骨架之至少一個抗原結合區。在一些實施例中,抗個體基因型分子結合至抗體或其抗原結合片段之至少一個互補決定區(CDR)。
在一些實施例中,第二多肽之抗原結合域包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。在一些實施例中,抗個體基因型分子為抗個體基因型抗體或其抗原結合片段,或抗個體基因型替代骨架。
在一些實施例中,抗原結合片段為Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、scFv片段、Fv片段、dsFv雙功能抗體、VHH、VNAR、單域抗體(sdAb)或奈米抗體、dAb片段、Fd'片段、Fd片段、重鏈可變區、經分離之互補決定區(CDR)、雙功能抗體、三功能抗體或十功能抗體。
在一些實施例中,胞外標記結合域、抗原結合域或標記中之至少一者包含單域抗體或奈米抗體。在一些實施例中,胞外標記結合域、抗原結合域或標記中之至少一者包含VHH。在一些實施例中,胞外標記結合域及標記各自包含VHH。在一些實施例中,胞外標記結合域、標記及抗原結合域各自包含VHH。
在一些實施例中,抗原結合片段、胞外標記結合域、抗原結合域及標記中之一或多者至少部分包含與選自由以下組成之群的序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的多肽序列:SEQ ID NO.: 84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108及110-133。
在一些實施例中,胞外標記結合域、抗原結合域或標記中之至少一者包含scFv。
在一些實施例中,替代骨架為阿非林(Affilin)或生替林(Centyrin)。
在一些實施例中,標記包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。在一些實施例中,抗體或其抗原結合片段或替代骨架結合至來自非人類來源之多肽。在一些實施例中,衍生自非人類來源之該多肽為呼吸道融合性病毒(RSV) F蛋白、李氏菌內化蛋白(Listeria internalin)、眼鏡蛇磷脂酶A2、伊波拉核蛋白(Ebola nucleoprotein)、疱疹單純型病毒(herpes simplex virus;HSV)糖蛋白D、乳球菌噬菌體受體結合蛋白(RBP)、嗜熱脂肪地芽孢桿菌(
Geobacillus stearothermophilus)、蓖麻毒素或雞卵白溶菌酶。
在一些實施例中,抗原結合域結合至至少一種腫瘤抗原或自體免疫抗原。在一些實施例中,至少一種抗原與相同腫瘤或自體免疫疾病相關。在一些實施例中,腫瘤抗原與神經膠母細胞瘤、卵巢癌、子宮頸癌、頭頸癌、肝癌、前列腺癌、胰臟癌、腎細胞癌、膀胱癌或血液惡性病相關。在一些實施例中,與神經膠母細胞瘤相關之腫瘤抗原為HER2、EGFRvIII、EGFR、CD133、PDGFRA、FGFR1、FGFR3、MET或IL13Rα2。在一些實施例中,與卵巢癌相關之腫瘤抗原為FOLR1、FSHR、MUC16、MUC1、間皮素、CA125、EpCAM、EGFR、PDGFRα或B7H4。在一些實施例中,與子宮頸癌或頭頸癌相關之腫瘤抗原為GD2、MUC1、間皮素、HER2或EGFR。在一些實施例中,與肝癌相關之腫瘤抗原為緊密連接蛋白18.2、GPC-3、EpCAM、cMET或AFP。
在一些實施例中,跨膜域進一步包含鉸鏈域。在一些實施例中,跨膜域及/或鉸鏈域源於CD8或CD28。
在一些實施例中,至少一個胞內信號傳導域包含CD3ζ信號傳導域。
在一些實施例中,至少一個胞內信號傳導域包含一或多個共刺激信號傳導域。在一些實施例中,一或多個共刺激信號傳導域源於CD28、41BB、IL2Rb、CD40、OX40、CD80、CD86、CD27、ICOS、NKG2D、DAP10、DAP12或2B4 (CD244)。
在各種實施例中,第二多肽包含N端處之抗原結合域及C端處之標記。在一些實施例中,第二多肽包含C端處之抗原結合域及N端處之標記。
在各種實施例中,第二多肽為可溶性多肽。
在本文所描述之arCAR之各種實施例中,免疫效應細胞為T細胞、自然殺手(NK)細胞、細胞毒性T淋巴細胞(CTL)、調節T細胞或腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)、樹突狀細胞或巨噬細胞。在一些實施例中,免疫效應細胞衍生自誘導性富潛能幹細胞(induced pluripotent stem cell;iPSC)。在一些實施例中,免疫效應細胞為衍生自誘導性富潛能幹細胞(iPSC)之T細胞或NK細胞。
在本文所描述之arCAR之各種實施例中,arCAR進一步包含一或多種多肽,其各自包含(a)結合至獨特抗原之抗原結合域及(b)由第一多肽之標記結合域識別之標記。
在另一態樣中,本文提供一種包含兩種或更多種本文所描述之arCAR的arCAR系統,其中各arCAR包含一對獨特的標記及標記結合域。
在另一態樣中,本文提供一種編碼本文所描述之arCAR系統之第一多肽的聚核苷酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼本文所描述之arCAR系統之第二多肽的聚核苷酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼本文所描述之arCAR系統之第一多肽及第二多肽的聚核苷酸。
在本文所描述之聚核苷酸之一些實施例中,抗原結合片段、胞外標記結合域、抗原結合域及標記中之一或多者至少部分由與選自由以下組成之群的序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性的聚核苷酸序列編碼:SEQ ID NO.: 83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107及109。
在另一態樣中,本文提供一種包含本文所描述之聚核苷酸的重組載體。在一些實施例中,載體為質體。
在另一態樣中,本文提供一種宿主細胞,其包含表現本文所描述之arCAR系統之第一多肽的聚核苷酸。
在另一態樣中,本文提供一種宿主細胞,其包含表現本文所描述之arCAR系統之第二多肽的聚核苷酸。
在另一態樣中,本文提供一種醫藥組合物,其包含本文所描述之arCAR系統之免疫效應細胞及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。
在另一態樣中,本文提供一種醫藥組合物,其包含本文所描述之arCAR系統之第二多肽及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。
在另一態樣中,本文提供一種套組,其包含含有本文所描述之arCAR系統之免疫效應細胞的醫藥組合物及組合地包含arCAR系統之第二多肽的醫藥組合物。
在另一態樣中,本文提供一種製備包含表現第一多肽之聚核苷酸之宿主細胞的方法,其包含將編碼arCAR系統之第一多肽之聚核苷酸或包含聚核苷酸之重組載體引入細胞中。
在另一態樣中,本文提供一種製備包含表現第二多肽之聚核苷酸之宿主細胞的方法,其包含將編碼arCAR系統之第二多肽之聚核苷酸或包含聚核苷酸之重組載體引入細胞中。
在另一態樣中,本文提供一種治療有需要之個體之疾病的方法,其包含向個體投與治療有效量之
(i) 包含嵌合抗原受體之免疫效應細胞,該嵌合抗原受體包含本文所描述之arCAR的第一多肽,及
(ii) 該arCAR之第二多肽或編碼該第二多肽之聚核苷酸或包含該第二多肽之宿主細胞。
在一些實施例中,第二多肽係在免疫效應細胞之前、之後或與其一起投與。
在另一態樣中,本文提供一種治療有需要之個體之疾病的方法,其包含向該個體投與治療有效量之
(i) 包含兩種或更多種arCAR之第一多肽的免疫效應細胞,其中兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域,及
(ii) 該兩種或更多種arCAR之第二多肽,或編碼該等第二多肽之一或多種聚核苷酸,或包含該等第二多肽之一或多種宿主細胞。
在本文所描述之治療方法之一些實施例中,免疫效應細胞為T細胞、自然殺手(NK)細胞、細胞毒性T淋巴細胞(CTL)、調節T細胞或腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)、樹突狀細胞或巨噬細胞。在一些實施例中,免疫效應細胞衍生自iPSC。在一些實施例中,免疫效應細胞組成性表現第一多肽。
在一些實施例中,疾病為癌症或自體免疫疾病。在一些實施例中,癌症為神經膠母細胞瘤、卵巢癌、子宮頸癌、頭頸癌、肝癌、前列腺癌、胰臟癌、腎細胞癌、膀胱癌或血液惡性病。
在一些實施例中,免疫效應細胞及一或多種第二多肽同時投與。在一些實施例中,免疫效應細胞及一或多種第二多肽依序投與。
在一些實施例中,免疫效應細胞為自體細胞。在一些實施例中,免疫效應細胞為同種異體細胞。
在一些實施例中,個體為哺乳動物。在一些實施例中,個體為人類。
相關申請案之交叉參考
本申請案主張2020年12月18日申請之美國臨時專利申請案第63/127,587號之權益,該申請案以全文引用之方式併入本文中。
以電子方式提交之序列表之參考
本申請案含有序列表,該序列表係以創建日期為2021年12月15日檔案名稱為「SequenceListing_ST25.txt」且大小為103,886位元組之ASCII格式序列表經由EFS-Web以電子方式提交。此經由EFS-Web提交之序列表為說明書之一部分且以全文引用之方式併入本文中。
先前技術及本說明書通篇引用或描述各種出版物、文章及專利;該等參考文獻中之每一者以全文引用之方式併入本文中。本說明書中所包括之文獻、操作、材料、器件、文章或類似者之論述係出於提供本發明之內容的目的。此類論述並非承認任何或所有此等內容形成關於所揭示或所主張之任何發明之先前技術的一部分。
本申請案尤其提供具有可調適的受體專一性組分之通用嵌合抗原受體系統(arCAR)及其在免疫療法(例如授受細胞療法)中之用途。此arCAR平台提供使用標記多肽親和力調節受體且允許多種受體存在於細胞療法上之內置式及方便機制。此類arCAR可使得能夠適合用於目的細胞療法。
定義
如本文所用之術語「嵌合抗原受體」或「CAR」通常係指包含胞外目標結合域、跨膜域及包含信號傳導域及視情況存在之至少一個共刺激信號傳導域之細胞質域的細胞表面受體,該等均以並不一起天然存在於單一蛋白質上組合。此特定言之包括受體,其中胞外域及細胞質域並不一起天然地存在於單一受體蛋白上。
如本文所用之術語「具有可調適受體專一性組分之嵌合抗原受體」或「arCAR」係指二組分CAR系統,其中受體之胞外目標結合域可與多種不同抗原結合部分偶合。除非另外指明,否則本文所用之術語「嵌合抗原受體」或「CAR」意謂涵蓋本文所描述之「具有可調適受體專一性組分之嵌合抗原受體」或「arCAR」。本發明之arCAR系統可與免疫效應細胞,諸如包括T細胞及自然殺手(NK)細胞之淋巴細胞一起使用,該等免疫效應細胞可衍生自諸如誘導性富潛能幹細胞(iPSC)之幹細胞。
如本文所用之術語「免疫效應細胞」意謂分化成能夠調節或實現專一性免疫反應之形式的細胞。此類細胞可包括適用於療法之成熟淋巴細胞,包括(但不限於):細胞毒性T細胞、輔助T細胞、自然殺手細胞及腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL),且亦可包括樹突狀細胞或巨噬細胞。
本文中之術語「抗體」係以最廣泛意義使用且包括多株及單株抗體,包括完整抗體及功能性(抗原結合)抗體片段,包括抗原結合片段(Fab)、F(ab')2片段、Fab'片段、Fv片段、scFv片段、重組IgG (rIgG)片段、單鏈抗體片段,包括單鏈可變片段(scFv)及單域抗體(例如VHH、VNAR、sdAb、sdFv)片段或奈米抗體、Fd'片段、Fd片段、重鏈可變區或經分離之互補決定區(CDR)。該術語涵蓋免疫球蛋白之經基因工程改造及/或以其他方式修飾之形式,諸如胞內抗體、肽體、嵌合抗體、完全人類抗體、人類化抗體,及異結合抗體、多專一性(例如雙專一性)抗體、雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體、十功能抗體、串聯二-scFv及串聯三-scFv。除非另有說明,否則術語「抗體」應理解為涵蓋其功能性抗體片段。該術語亦涵蓋完整或全長抗體,包括任何類別或子類之抗體,包括IgG及其子類(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4)、IgM、IgY、IgE、IgA及IgD。
術語「抗個體基因型分子」係指專一性識別抗體(諸如抗原結合片段)、專一性靶向抗體及/或專一性結合至抗體之個體基因位(idiotope)之分子(例如肽、蛋白質、抗體或抗體片段、替代骨架)。抗體之個體基因位可包括(但未必限於)抗體之互補決定區(CDR)中之一或多者內之殘基、抗體之可變區及/或此類可變區及/或此類CDR之部分或全部,及/或前述之任何組合。CDR可為選自由以下組成之群的一或多者:CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3、CDR-L1、CDR-L2及CDR-L3。抗體之可變區可為重鏈可變區、輕鏈可變區,或重鏈可變區與輕鏈可變區之組合。抗體之重鏈可變區及/或輕鏈可變區之部分片段或部分可為包括抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區內之2個或更多個、5個或更多個或10個或更多個連續胺基酸,例如約2至約100個、約5至約100個、約10至約100個、約2至約50個、約5至約50個或約10至約50個連續胺基酸之片段;個體基因位可包括胺基酸之多個非連續伸長段。抗體之重鏈可變區及輕鏈可變區之部分片段可為包括可變區內之2個或更多個、5個或更多個或10個或更多個連續胺基酸,例如約2至約100個、約5至約100個、約10至約100個、約2至約50個、約5至約50個或約10至約50個連續胺基酸之片段,且在一些實施例中含有一或多個CDR或CDR片段。CDR片段可為在CDR內之連續或非連續的2個或更多個,或5個或更多個胺基酸。因此,抗體之個體基因位可為抗體之重鏈可變區或輕鏈可變區內之含有一或多個CDR或一或多個CDR片段之約2至約100個、約5至約100個、約10至約100個、約2至約50個、約5至約50個或約10至約50個連續胺基酸。在另一實施例中,個體基因位可為位於抗體可變區,例如CDR位點處之單一胺基酸。
在一些實施例中,個體基因位為抗體可變部分內之任何單一抗原決定子或抗原決定基。在一些情況下,其可與抗體之實際抗原結合位點重疊,且在一些情況下,其可包含抗體之抗原結合位點外部的可變區序列。在一些實施例中,抗體之個別個體基因位之集合稱為此類抗體之「個體基因型」。
如本文所用,術語「抗原」係指能夠由抗體或抗體片段、T細胞受體或替代骨架結合之任何藥劑(例如蛋白質、肽、多醣、糖蛋白、糖脂、核酸、其部分或其組合)分子。抗原亦能夠引起免疫反應。免疫反應之實例可涉及(但不限於)抗體產生或專一性免疫勝任細胞之活化,或兩者。熟習此項技術者應理解,抗原根本不必由「基因」編碼。易於顯而易知,抗原可合成產生或可源於生物樣本或可為除多肽以外之大分子。此類生物樣本可包括(但不限於):組織樣本、腫瘤樣本、細胞或具有其他生物組分之流體、生物體、蛋白質/抗原之次單元、殺死或滅活之全細胞或溶解物。
術語「載體」、「表現載體」及「表現構築體」可互換地使用以指代物質之組成,其可用於將所關注之核酸遞送至細胞內部且介導其在細胞內之表現。載體之最常用實例為自主複製質體及病毒(諸如腺病毒載體、腺相關病毒載體(AAV)、慢病毒載體、辛得比斯病毒(Sindbis virus)載體等)。表現構築體可在活細胞中複製,或其可以合成方式製得。在一個實施例中,表現載體包含可操作地連接至聚核苷酸(例如,編碼本文所描述之arCAR之第一多肽及/或第二多肽的聚核苷酸)之啟動子,該啟動子控制藉由RNA聚合酶之轉錄起始及聚核苷酸之表現。哺乳動物細胞表現之典型啟動子包括例如SV40早期啟動子、CMV即刻早期啟動子(參見例如美國專利第5,168,062號及第5,385,839號,該兩者均以全文引用之方式併入本文中)、小鼠乳腺腫瘤病毒LTR啟動子、腺病毒主要晚期啟動子(Ad MLP)、疱疹單純型病毒啟動子、鼠類金屬硫蛋白基因啟動子及U6或H1 RNA pol III啟動子。適用於在本發明之方法中表現本文所描述之arCAR之第一多肽及/或第二多肽的啟動子之非限制性實例包括例如突觸蛋白啟動子(神經元專一性)、CamKIIa啟動子(針對激動性神經元具有專一性)、泛素啟動子、CAG啟動子、CMV啟動子及β-肌動蛋白啟動子。此等及其他啟動子可以使用此項技術中熟知之技術自市售質體獲得。參見例如Sambrook等人,同上。強化子元素可與啟動子結合使用以提高載體之表現量。實例包括SV40早期基因強化子,如Dijkema等人, EMBO J. (1985) 4:761, the enhancer/promoter derived from the long terminal repeat (LTR) of the Rous Sarcoma Virus中所描述,如Gorman等人, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1982b) 79:6777中所描述,其以全文引用之方式併入本文中,及源於人類CMV之元素,如Boshart等人, Cell (1985) 41:521中所描述,其以全文引用之方式併入本文中,諸如CMV內含子A序列中所包括之元素。
轉錄終止子/聚腺苷酸化信號亦可存在於表現載體中。此類序列之實例包括(但不限於)如Sambrook等人,前述中所描述之衍生自SV40之序列,以及牛生長激素終止子序列(參見例如美國專利第5,122,458號,其以全文引用之方式併入本文中)。另外,5'-UTR序列可鄰近編碼序列置放以便增強其之表現。此類序列包括UTR,其包括例如存在於諸如腦心肌炎病毒(EMCV) UTR之小核糖核酸病毒之前導序列中之內部核糖體進入位點(Internal Ribosome Entry Site;IRES) (Jang等人 J. Virol. (1989) 63:1651-1660,其以全文引用之方式併入本文中)。其他有用的小核糖核酸病毒UTR序列包括例如脊髓灰質炎前導序列、A型肝炎病毒前導序列及C型肝炎IRES。
術語「宿主細胞」意謂含有異源核酸之任何細胞。異源核酸可為載體(例如表現載體)。舉例而言,宿主細胞可為來自任何生物體之細胞,該生物體以任何方式選擇、修飾、轉化、生長、使用或處理以用於藉由細胞產生物質,例如藉由基因之細胞、DNA或RNA序列、蛋白質或酶表現。可確定適合的宿主。舉例而言,可基於載體主鏈及所要結果選擇宿主細胞。舉例而言,可將質體或黏質體引入原核生物宿主細胞中以用於複製若干類型之載體。諸如但不限於DH5α、JM109及KCB、SURE®勝任細胞及SOLOPACK Gold細胞之細菌細胞可用作用於載體複製及/或表現之宿主細胞。另外,諸如大腸桿菌LE392之細菌細胞可用作用於噬菌體病毒之宿主細胞。可用作宿主細胞之真核細胞包括(但不限於)酵母(例如YPH499、YPH500及YPH501)、昆蟲及哺乳動物。用於載體複製及/或表現之哺乳動物真核宿主細胞之實例包括(但不限於):HeLa、NIH3T3、Jurkat、293、COS、CHO、Saos及PC12。
本發明之宿主細胞包括T細胞及自然殺手細胞,該等細胞含有編碼CAR之DNA或RNA序列及/或在細胞表面上表現CAR。宿主細胞可用於增強T細胞活性、自然殺手細胞活性、癌症治療及自體免疫疾病治療。
術語「T細胞」及「T淋巴細胞」在本文中可互換及同義地使用。如本文所用,T細胞包括胸腺細胞、原初T淋巴細胞、不成熟T淋巴細胞、成熟T淋巴細胞、休眠T淋巴細胞或活化T淋巴細胞。T細胞可為T輔助(Th)細胞,例如T輔助1 (Thl)或T輔助2 (Th2)細胞。T細胞可為輔助T細胞(HTL;CD4+ T細胞) CD4+ T細胞、細胞毒性T細胞(CTL;CD8+ T細胞)、腫瘤浸潤性細胞毒性T細胞(TIL;CD8+ T細胞)、CD4+CD8+ T細胞或任何其他T細胞亞群。適用於特定實施例之其他說明性T細胞群包括原始T細胞及記憶T細胞。亦包括「NKT細胞」,其係指表現半恆定αβ T細胞受體之特定T細胞群體,且亦表現通常與NK細胞(諸如NK1.1)相關之多種分子標誌物。NKT細胞包括NK1.1+及NK1.1-,以及CD4+、CD4-、CD8+及CD8-細胞。NKT細胞上之TCR之獨特之處在於其識別由MHC I樣分子CD Id呈現之糖脂抗原。NKT細胞由於其產生可促進發炎或免疫耐受性之細胞介素之能力而具有保護性或有害作用。亦包括「γ-δ T細胞(γδ T細胞)」,該等γδ T細胞係指針對在表面上具有不同TCR之小亞群之T細胞的特定群體,且不同於TCR由命名為α-TCR鏈及β-TCR鏈之兩個糖蛋白鏈構成的大部分T細胞,γδ T細胞中之TCR由γ鏈及δ鏈構成。γδ T細胞可在免疫監視及免疫調節中起作用,且發現其為IL-17之重要來源且誘導穩定的CD8+細胞毒性T細胞反應。亦包括「調節T細胞」或「Treg」,其係指抑制異常或過度免疫反應且在免疫耐受中起作用的T細胞。Treg細胞通常為轉錄因子FoxP3-陽性CD4+T細胞且亦可包括作為產生IL-10之CD4+T細胞的轉錄因子FoxP3-陰性調節T細胞。
術語「自然殺傷細胞」及「NK細胞」在本文中可互換及同義地使用。如本文所用,NK細胞係指具有CD 16+ CD56+及/或CD57+ TCR-表型之分化淋巴細胞。NK之特徵在於其藉由活化專一性溶胞酶結合至未能表現「自身」MHC/HLA抗原之細胞且殺死該等細胞之能力、殺死表現NK活化受體之配位體的腫瘤細胞或其他病變細胞的能力及釋放稱為刺激或抑制免疫反應之細胞介素的蛋白質分子的能力。
在本發明之某些實施例中,含有本發明之核酸構築體之細胞可藉由在表現載體中包括標誌物來活體外或活體內識別。此類標誌物將賦予細胞可識別之變化,允許容易地識別含有表現載體之細胞。通常,包括藥物選擇標誌物有助於選殖及選擇轉化子,例如賦予新黴素、嘌呤黴素、潮黴素、DHFR、GPT、吉歐黴素(zeocin)及組胺醇抗性之基因為適用的選擇標誌物。替代地,可採用酶,諸如疱疹單純型病毒胸苷激酶(tk)或氯黴素乙醯基轉移酶(CAT)。亦可採用螢光標誌物(例如綠色螢光蛋白(GFP)、EGFP或Dronpa)或免疫標誌物。可選標誌物之其他實例為熟習此項技術者所熟知的。
如本文所用,在蛋白質或多肽(例如arCAR多肽或其域)之上下文中之術語「變體」係指:(a)與其變體多肽具有至少40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%序列一致性之多肽;(b)由與編碼其變體多肽之核苷酸序列具有至少40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、98%或99%序列一致性之核苷酸序列編碼的多肽;(c)相對於其變體多肽含有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、或更多個胺基酸突變(亦即,添加、缺失及/或取代)之多肽;(d)由可在較高、中等或典型嚴格度混雜條件下與編碼其變體多肽之核酸混雜之核酸編碼的多肽;(e)由在較高、中等或典型嚴格度混雜條件下與編碼其變體多肽片段之核苷酸序列混雜之核苷酸序列編碼的多肽,該多肽片段具有至少20個連續胺基酸、至少30個連續胺基酸、至少40個連續胺基酸、至少50個連續胺基酸、至少75個連續胺基酸、至少100個連續胺基酸、至少125個連續胺基酸或至少150個連續胺基酸;或(f)其變體多肽之片段。
序列一致性百分比可使用熟習此項技術者已知之任何方法確定。在一特定實施例中,一致性百分比係使用序列分析套裝軟體(版本10;Genetics Computer Group, Inc., University of Wisconsin Biotechnology Center, Madison, Wisconsin)之「Best Fit」或「Gap」程式確定。已描述關於混雜條件之資訊(例如較高、中等及典型嚴格度條件),參見例如美國專利申請公開案第US 2005/0048549號(例如段落72-73)。
在本發明之上下文中,就其係關於本文所列舉之疾病病狀中之任一者而言,術語「治療(treat/treatment)」及其類似術語意謂預防、減輕或緩解與此類病狀相關之至少一種症狀,或減緩或逆轉此類病狀之進展,或遏制、延遲發作(亦即,在疾病之臨床表現之前的時段)及/或降低罹患或惡化疾病之風險。
如本文所用,術語應用於劑量或量之「治療有效」係指在向有需要之個體投與時足以引起所需活性(例如緩解與癌症或自體免疫疾病相關之症狀)之化合物或醫藥組合物之量。應注意,當投與活性成分之組合時,組合之有效量可或可不包括在個別地投與時會有效的各成份之量。所需精確量將隨各個體而變化,視個體之物種、年齡及一般狀況、所治療之病狀之嚴重程度、所用一或多種特定藥物、投藥模式及其類似因素而定。在任何個別情況下之適合的「有效」量可由一般熟習此項技術者使用常規實驗基於本文所提供之資訊確定。
如與本發明之組合物結合使用之片語「醫藥學上可接受」係指此類組合物之分子實體及其他成分為生理學上可耐受的且當向哺乳動物(例如人類)投與時通常不產生不良反應。較佳地,如本文所用,術語「醫藥學上可接受」意指經聯邦或州政府之監管機構批准或在美國藥典或其他公認的適用於哺乳動物(且更特定言之,適用於人類)之藥典中列出。
如本文所用,術語本發明組合物之與至少一種額外治療劑之「組合」意謂至少兩種,但任何所需藥劑組合可同時或依序進行遞送。經考慮當用於治療各種疾病時,本發明之組合物及方法可與適用於相同或類似疾病之其他治療方法/藥劑一起使用。此類其他治療方法/藥劑可共投與(同時或依序)以產生累加或協同效果。各藥劑之適合的治療有效劑量可由於累加作用或協同作用而降低。
術語「載劑」係指與化合物一起投與之稀釋劑、佐劑、賦形劑或媒劑。此類醫藥學載劑可為無菌液體,諸如水及油,包含石油、動物、植物或合成來源之彼等油,諸如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油及其類似油。水或水溶液、鹽水溶液以及水性右旋糖及甘油溶液較佳用作載劑,特定言之用於可注射溶液。替代地,載劑可為固體劑型載劑,包括(但不限於):黏合劑(用於壓縮丸劑)、滑動劑、包封劑、調味劑及著色劑中之一或多者。適合的醫藥學載劑描述於E.W. Martin之「Remington's Pharmaceutical Sciences」中。
如本文所用,「個體(individual/subject)」或「動物」係指疾病或病症(例如癌症或自體免疫疾病)之人類、獸醫學動物(例如貓、狗、牛、馬、綿羊、豬等)或實驗動物模型。在一較佳實施例中,個體為人類。
術語「與...相關」用以涵蓋任何相關性、同現以及任何因果關係。
術語「約」意謂在如藉由一般熟習此項技術者所確定之特定值之可接受誤差範圍內,其將部分地取決於如何量測或判定值,亦即,量測系統之限制。舉例而言,根據此項技術中之實踐,「約」可意謂在可接受標準差內。替代地,「約」可意謂在既定值或範圍之一定數量級內,較佳在50%內、更佳在20%內、再更佳在10%內、甚至更佳在5%內且最佳在1%內。替代地,尤其相對於生物系統或方法,該術語可意謂在值之一定數量級內,較佳在2倍內。若特定值描述於本申請案及申請專利範圍中,除非另外陳述,否則術語「約」為隱含的且在此上下文中意謂在特定值之可接受誤差範圍內。
必須注意的是,除非上下文明確另外指示,否則如本說明書及所附申請專利範圍中所用,單數形式「一(a/an)」及「該」包括複數個指示物。
根據本發明,可在此項技術內採用習知分子生物學、微生物學及重組DNA技術。此類技術在文獻中已充分解釋。參見例如Sambrook, Fritsch & Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual,第二版 Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989 (本文中「Sambrook等人, 1989」);DNA Cloning: A Practical Approach, 第I卷及第II卷(D.N. Glover編 1985);Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait編 1984);Nucleic Acid Hybridization [B.D. Hames & S.J. Higgins編 (1985)];Transcription And Translation [B.D. Hames & S.J. Higgins編 (1984)];Animal Cell Culture [R.I. Freshney,編 (1986)];Immobilized Cells And Enzymes [IRL Press, (1986)]; B. Perbal, A Practical Guide To Molecular Cloning (1984); Ausubel, F.M.等人(編). Current Protocols in Molecular Biology. John Wiley & Sons, Inc., 1994。此等技術包括如以下中所描述之定點突變誘發:Kunkel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82: 488- 492 (1985), 美國專利第5,071,743號, Fukuoka等人, Biochem. Biophys. Res. Commun. 263: 357-360 (1999);Kim及Maas, BioTech. 28: 196-198 (2000);Parikh及Guengerich, BioTech. 24: 428-431 (1998);Ray及Nickoloff, BioTech. 13: 342-346 (1992);Wang等人, BioTech. 19: 556-559 (1995);Wang及Malcolm, BioTech. 26: 680-682 (1999);Xu及Gong, BioTech. 26: 639-641 (1999), 美國專利第5,789, 166號及第5,932, 419號, Hogrefe, Strategies l4.3: 74-75 (2001), 美國專利第5,702,931號、第5,780,270號及第6,242,222號, Angag及Schutz, Biotech. 30: 486-488 (2001), Wang及Wilkinson, Biotech. 29: 976-978 (2000), Kang等人, Biotech. 20: 44-46 (1996), Ogel及McPherson, Protein Engineer. 5: 467-468 (1992), Kirsch及Joly, Nucl. Acids. Res. 26: 1848-1850 (1998), Rhem及Hancock, J. Bacteriol. 178: 3346-3349 (1996), Boles及Miogsa, Curr. Genet. 28: 197-198 (1995), Barrenttino等人, Nuc. Acids. Res. 22: 541-542 (1993), Tessier及Thomas, Meths. Molec. Biol. 57: 229-237以及Pons等人, Meth. Molec. Biol. 67: 209-218。
具有可調適受體專一性組分之嵌合抗原受體 (arCAR)
在一個態樣中,本文提供一種具有可調適受體專一性組分之通用嵌合抗原受體系統(arCAR),其包含:
(i) 具有嵌合抗原受體的免疫效應細胞,該嵌合抗原受體包含第一多肽,該第一多肽包含(a)胞外標記結合域、(b)跨膜域及(c)至少一個胞內信號傳導域;及
(ii) 第二多肽,其包含(d)結合至目標細胞上之至少一種抗原的抗原結合域,及(e)由該嵌合抗原受體之第一多肽的標記結合域識別之標記;
其中:(i)該標記包含抗體或其抗原結合片段,或替代骨架且該標記結合域包含結合至該標記之抗個體基因型分子,或
(ii)該標記包含結合至標記結合域之抗個體基因型分子,且該標記結合域包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
在一些實施例中,抗個體基因型分子結合至抗體、其抗原結合片段之至少一個抗原結合區或非構架區。
在一些實施例中,標記包含抗體或其抗原結合片段,或結合至源於非人類來源之多肽的替代骨架。替代地,標記結合域包含抗體或其抗原結合片段,或結合至源於非人類來源之多肽的替代骨架。
在一些實施例中,抗個體基因型分子結合至抗體或其抗原結合片段之至少一個互補決定區(CDR)。
在一些實施例中,抗個體基因型分子為抗個體基因型抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
在一些實施例中,第二多肽之抗原結合域包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
在各種實施例中,適合用於本發明之arCAR系統之抗體或抗體片段包括(但不限於):單株抗體、雙專一性抗體、多專一性抗體、嵌合抗體、多肽-Fc融合物、單鏈Fv (scFv)、單鏈抗體、Fab片段、F(ab')片段、二硫鍵連接之Fv (sdFv)、掩飾抗體(例如Probodies®)、小模塊免疫藥物(「SMIPsTM」)、胞內抗體、微型抗體、單域抗體可變域、奈米抗體、VHH、雙功能抗體、串聯雙功能抗體(TandAb®)及以上中之任一者之抗原決定基-結合片段。抗體及/或抗體片段可源於鼠類抗體、兔抗體、人類抗體、完全人類化抗體、駱駝抗體可變域及人類化型式、鯊魚抗體可變域及人類化型式以及駱駝化抗體可變域。
在一些實施例中,抗原結合片段為Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、scFv片段、Fv片段、dsFv雙功能抗體、VHH、VNAR、單域抗體(sdAb)或奈米抗體、dAb片段、Fd'片段、Fd片段、重鏈可變區、經分離之互補決定區(CDR)、雙功能抗體、三功能抗體或十功能抗體。在一些實施例中,抗原結合片段為scFv片段。在一些實施例中,抗原結合片段為VHH。
在一些實施例中,胞外標記結合域、抗原結合域或標記中之至少一者包含單域抗體或奈米抗體。
在一些實施例中,胞外標記結合域、抗原結合域或標記中之至少一者包含VHH。
在一些實施例中,胞外標記結合域及標記各自包含VHH。
在一些實施例中,胞外標記結合域、標記及抗原結合域各自包含VHH。
在一些實施例中,胞外標記結合域、抗原結合域或標記中之至少一者包含scFv。
在一些實施例中,胞外標記結合域及標記各自包含scFv。
在一些實施例中,胞外標記結合域、標記及抗原結合域各自包含scFv。
在一些實施例中,本文所用之抗體或抗原結合片段(例如VHH、scFv)為人類化的。人類化蛋白具有降低免疫原性風險之潛能。
本發明之arCAR中亦可使用展現類似功能特徵(諸如對目標生物分子的高親和力及專一性結合)之免疫球蛋白域的替代骨架。此類骨架已展示可產生具有改良之特徵(諸如較大穩定性或減小的免疫原性)的分子。可用於本發明之arCAR系統中之替代骨架之非限制性實例包括經工程改造之肌腱蛋白衍生的肌腱蛋白III型域(例如Centyrin™);經工程改造之γ-B晶狀體球蛋白衍生的骨架或經工程改造之泛素衍生的骨架(例如阿非林);經工程改造之纖維結合蛋白衍生的第10纖維結合蛋白III型(10Fn3)域(例如單功能抗體、AdNectins™或AdNexins™);經工程改造之含有多肽之錨蛋白重複模體(例如DARPins™);經工程改造之低密度-脂蛋白-受體衍生的A域(LDLR-A) (例如Avimers™);脂質運載蛋白(例如抗運載蛋白);經工程改造之蛋白酶抑制劑衍生的孔尼茲(Kunitz)域(例如EETI-II/AGRP、BPTI/LACI-D1/ITI-D2);經工程改造之蛋白質-A衍生的Z域(Affibodies™);Sac7d衍生之多肽(例如Nanoffitins®或阿非汀);經工程改造之Fyn衍生的SH2域(例如Fynomers®);CTLD
3(例如四連接素(Tetranectin));硫化還原蛋白(例如肽適體);KALBITOR®;β-夾心(例如iMab);小型蛋白;C型凝集素樣域骨架;經工程改造之抗體模擬物;以及保持其結合官能基之前述者之任何經基因處理之對應物(Wörn A, Pluckthun A, J Mol Biol 305: 989-1010 (2001);Xu L等人, Chem Biol 9: 933-42 (2002);Wikman M等人, Protein Eng Des Sel 17: 455-62 (2004);Binz H等人, Nat Biolechnol 23: 1257-68 (2005);Hey T等人, Trends Biotechnol 23:514-522 (2005);Holliger P, Hudson P, Nat Biotechnol 23: 1126-36 (2005);Gill D, Damle N, Curr Opin Biotech 17: 653-8 (2006);Koide A, Koide S, Methods Mol Biol 352: 95-109 (2007);Skerra, Current Opin. in Biotech., 2007 18: 295-304;Byla P等人, J Biol Chem 285: 12096 (2010);Zoller F等人, Molecules 16: 2467-85 (2011),該等文獻中之每一者以全文引用之方式併入本文中)。
在一些實施例中,替代骨架為阿非林或生替林。
源於非人類來源之分子可源於任何非人類生物體,包括(但不限於):病毒、細菌、酵母、真菌、植物及非人類動物。
在一些實施例中,源於非人類來源之分子為多肽。在一些實施例中,蛋白質之來源係來自不具有人類同源物之非人類多肽。
在一些實施例中,衍生自非人類來源之該多肽為呼吸道融合性病毒(RSV) F蛋白、李氏菌內化蛋白、眼鏡蛇磷脂酶A2、伊波拉核蛋白、疱疹單純型病毒(HSV)糖蛋白D、乳球菌噬菌體受體結合蛋白(RBP)、嗜熱脂肪地芽孢桿菌、蓖麻毒素或雞卵白溶菌酶。
在一些實施例中,本發明之arCAR之第一多肽包含前導序列。前導序列可位於胞外標記結合域之N端。在細胞處理CAR及CAR定域於細胞膜期間,前導序列可視情況自胞外標記結合域裂解。熟習此項技術者已知的多種前導序列中之任一者可用作前導序列。可衍生前導序列之肽的非限制性實例包括顆粒球-巨噬細胞群落刺激因子(GMCSF)、FcεR、人類免疫球蛋白(IgG)重鏈(HC)可變區、CD8α、小鼠Ig-κ信號肽或由T細胞分泌之各種其他蛋白質中之任一者。在各種實施例中,前導序列與T細胞之分泌路徑相容。在某些實施例中,前導序列源於人類免疫球蛋白重鏈(HC)。
在一些實施例中,前導序列源於GMCSF。在一個實施例中,GMCSF前導序列包含SEQ ID NO: 1中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 1具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,前導序列源於小鼠Ig-κ信號肽。在一個實施例中,小鼠Ig-κ信號肽包含SEQ ID NO: 61中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 61具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,本發明之arCAR之第一多肽包含胞外標記結合域與細胞質域之間同框融合之跨膜域。
跨膜域可源於促成胞外標記結合域之蛋白質、促成信號傳導域或共信號傳導域之蛋白質,或完全不同的蛋白質。在一些情況下,可藉由胺基酸取代、缺失或插入來選擇或修飾跨膜域,以最小化與arCAR複合物之其他成員的相互作用。在一些情況下,可藉由胺基酸取代、缺失或插入來選擇或修飾跨膜域以避免與跨膜域天然締合的蛋白質發生結合。在某些實施例中,跨膜域包括其他胺基酸以實現與跨膜域連接之域之間的柔性及/或最佳距離。
跨膜域可源於天然或合成來源。在來源為天然之情況下,域可源於任何膜結合蛋白或跨膜蛋白。本發明中特定使用之跨膜域之非限制性實例可源於以下(亦即至少包含以下之一或多個跨膜區):T細胞受體(TCR)之α、β或ζ鏈、NKG2D、CD28、CD3 ε、CD45、CD4、CD5、CD8、CD8α、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD40、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137或CD154。替代地,跨膜域可為合成的,在此情況下,其將主要包含疏水性殘基,諸如白胺酸及纈胺酸。舉例而言,可在合成跨膜域之各端發現苯丙胺酸、色胺酸及/或纈胺酸之三聯體。
在一些實施例中,需要使用ζ、η或FcεR1γ鏈之跨膜域,其含有能夠以二硫鍵鍵結之半胱胺酸殘基,使得所得嵌合蛋白能夠與自身或與ζ、η或FcεR1γ鏈或相關蛋白質之未修飾形式形成二硫鍵連接之二聚體。在一些情況下,將藉由胺基酸取代來選擇或修飾跨膜域,以避免此類結構域結合至相同或不同表面膜蛋白之跨膜域,從而最小化與受體複合物中之其他成員之相互作用。在其他情況下,為了保持與受體複合物中之其他成員之物理性締合,需要使用ζ、η或FcεR1γ及-β、MB1 (Igα.)、B29或CD3-γ、ζ或η之跨膜域。
在一些實施例中,跨膜域源於CD8或CD28。在一個實施例中,CD8跨膜域包含SEQ ID NO: 23中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 23具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。在一個實施例中,CD28跨膜域包含SEQ ID NO: 24中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 24具有至少50、至少55、至少60、至少65、至少70、至少75、至少80、至少85、至少90、至少95、至少96、至少97、至少98或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,本發明之arCAR系統之第一多肽包含胞外標記結合域與跨膜域之間的間隔區,其中標記結合域、連接子及跨膜域彼此同框。
如本文所用,術語「間隔區」一般意謂用於使標記結合域與跨膜域連接之任何寡肽或多肽。間隔區可用於向標記結合域提供更大的柔性及可及性。間隔區可包含至多300個胺基酸,較佳10至100個胺基酸且最佳25至50個胺基酸。間隔區可衍生自天然存在之分子的全部或一部分,諸如CD8、CD4或CD28之胞外區之全部或一部分,或抗體恆定區之全部或一部分。替代地,間隔區可為對應於天然存在之間隔區序列之合成序列,或可為完全合成的間隔區序列。可根據本發明使用之間隔區之非限制性實例包括人類CD8α鏈之一部分、CD28之部分胞外域、FcyRllla受體、IgG、IgM、IgA、IgD、IgE、Ig鉸鏈,或其功能片段。在一些實施例中,將其他連接胺基酸添加至間隔區中以確保抗原結合域與跨膜域的距離最佳。在一些實施例中,當間隔子衍生自Ig時,間隔子可突變以防止Fc受體結合。
在一些實施例中,間隔區包含鉸鏈域。鉸鏈域可衍生自CD8α、CD28或免疫球蛋白(IgG)。舉例而言,IgG鉸鏈可來自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM1、IgM2、IgA1、IgA2、IgD、IgE或其嵌合體。
在某些實施例中,鉸鏈域包含免疫球蛋白IgG鉸鏈或其功能片段。在某些實施例中,IgG鉸鏈來自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM1、IgM2、IgA1、IgA2、IgD、IgE或其嵌合體。在某些實施例中,鉸鏈域包含免疫球蛋白之CH1、CH2、CH3及/或鉸鏈區。在某些實施例中,鉸鏈域包含免疫球蛋白之核心鉸鏈區。術語「核心鉸鏈」可與術語「短鉸鏈」(亦稱為「SH」)互換地使用。適合的鉸鏈域之非限制性實例為免疫球蛋白核心鉸鏈區,包括來自IgG1之EPKSCDKTHTCPPCP (SEQ ID NO: 57)、來自IgG2之ERKCCVECPPCP (SEQ ID NO: 58)、來自IgG3之ELKTPLGDTTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)
3(SEQ ID NO: 59)及來自IgG4之ESKYGPPCPSCP (SEQ ID NO: 60) (亦參見Wypych等人,
JBC2008 283(23): 16194-16205,該文獻出於所有目的以全文引用之方式併入本文中)。在某些實施例中,鉸鏈域為免疫球蛋白鉸鏈之片段。
在一些實施例中,鉸鏈域源於CD8或CD28。在一個實施例中,CD8鉸鏈域包含SEQ ID NO: 21中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 21具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。在一個實施例中,CD28鉸鏈域包含SEQ ID NO: 22中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 22具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,跨膜域及/或鉸鏈域源於CD8或CD28。在一些實施例中,跨膜域與鉸鏈域均源於CD8。在一些實施例中,跨膜域與鉸鏈域均源於CD28。
在某些態樣中,本發明之arCAR之第一多肽包含細胞質域,其包含至少一個胞內信號傳導域。在一些實施例中,細胞質域亦包含一或多個共刺激信號傳導域。
細胞質域負責其中已置放有arCAR之宿主細胞(例如,T細胞)之正常效應功能中之至少一者的活化。術語「效應功能」係指細胞之專門功能。舉例而言,T細胞之效應功能可為細胞溶解活性或輔助活性,包括細胞介素之分泌。因此,術語「信號傳導域」係指蛋白質之一部分,該部分轉導效應功能信號且引導細胞執行專門功能。儘管通常存在完整信號傳導域,但在許多情況下,無需使用整條鏈。就使用胞內信號傳導域之截短部分而言,此類截短部分可用於替代完整鏈,只要其轉導效應功能信號即可。術語胞內信號傳導域因此意欲包括足以轉導效應功能信號之信號傳導域之任何截斷部分。
本發明之arCAR中可使用之信號傳導域之非限制性實例包括例如源於DAP10、DAP12、Fcε受體I γ鏈(FCER1G)、FcR β、NKG2D、CD3δ、CD3ε、CD3γ、CD3ζ、CD5、CD22、CD226、CD66d、CD79A或CD79B之信號傳導域。
在一些實施例中,細胞質域包含CD3ζ信號傳導域。在一個實施例中,CD3ζ信號傳導域包含SEQ ID NO: 6中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 6具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,細胞質域進一步包含一或多個共刺激信號傳導域。在一些實施例中,一或多個共刺激信號傳導域源於CD28、41BB、IL2Rb、CD40、OX40 (CD134)、CD80、CD86、CD27、ICOS、NKG2D、DAP10、DAP12、2B4 (CD244)、BTLA、CD30、GITR、CD226、CD79A或HVEM。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於41BB。在一個實施例中,41BB共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 8中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 8具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於IL2Rb。在一個實施例中,IL2Rb共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 9中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 9具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於CD40。在一個實施例中,CD40共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 10中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 10具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於OX40。在一個實施例中,OX40共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 11中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 11具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於CD80。在一個實施例中,CD80共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 12中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 12具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於CD86。在一個實施例中,CD86共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 13中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 13具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於CD27。在一個實施例中,CD27共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 14中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 14具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於ICOS。在一個實施例中,ICOS共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 15中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 15具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於NKG2D。在一個實施例中,NKG2D共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 16中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 16具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於DAP10。在一個實施例中,DAP10共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 17中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 17具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於DAP12。在一個實施例中,DAP12共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 18中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 18具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於2B4 (CD244)。在一個實施例中,2B4 (CD244)共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 19中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 19具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一個實施例中,共刺激信號傳導域源於CD28。在一個實施例中,CD28共刺激信號傳導域包含SEQ ID NO: 20中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 20具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,本發明之arCAR包含一個共刺激信號傳導域。在一些實施例中,本發明之arCAR包含兩個或更多個共刺激信號傳導域。在某些實施例中,本發明之arCAR包含兩個、三個、四個、五個、六個或更多個共刺激信號傳導域。
在一些實施例中,一或多個信號傳導域及一或多個共刺激信號傳導域可以任何次序置放。在一些實施例中,信號傳導域位於共刺激信號傳導域上游。在一些實施例中,信號傳導域位於共刺激信號傳導域下游。在包括兩個或更多個共刺激域之情況下,可交換共刺激信號傳導域之次序。
非限制性例示性CAR區及序列提供於
表 1中。
表1.
CAR 區 | 序列 | UniProt Id | SEQ ID NO |
CD19 CAR : | |||
GMCSF信號肽 | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | 1 | |
FMC63 VH | EVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSS | 2 | |
Whitlow連接子 | GSTSGSGKPGSGEGSTKG | 3 | |
FMC63 VL | DIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEIT | 4 | |
CD28 (AA 114-220) | IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | P10747-1 | 5 |
CD3-ζ同功異型物3 (AA 52-163) | RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | P20963-3 | 6 |
FMC63 scFV | EVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSGSTSGSGKPGSGEGSTKGDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEIT | 7 | |
信號傳導域: | |||
41BB (AA 214-255) | KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL | Q07011 | 8 |
IL2Rb (AA 266-551) | NCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLPLNTDAYLSLQELQGQDPTHLV | P14784 | 9 |
CD40 (AA 216-277) | KKVAKKPTNKAPHPKQEPQEINFPDDLPGSNTAAPVQETLHGCQPVTQEDGKESRISVQERQ | P25942 | 10 |
OX40 (AA 236-277) | ALYLLRRDQRLPPDAHKPPGGGSFRTPIQEEQADAHSTLAKI | P43489 | 11 |
CD80 (AA 264-288) | TYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV | P33681 | 12 |
CD86 (AA269-329) | KWKKKKRPRNSYKCGTNTMEREESEQTKKREKIHIPERSDEAQRVFKSSKTSSCDKSDTCF | P42081 | 13 |
CD27 (AA 213-260) | QRRKYRSNKGESPVEPAEPCHYSCPREEEGSTIPIQEDYRKPEPACSP | P26842 | 14 |
ICOS (AA 162-199) | CWLTKKKYSSSVHDPNGEYMFMRAVNTAKKSRLTDVTL | Q9Y6W8 | 15 |
NKG2D (AA 1-51) | MGWIRGRRSR HSWEMSEFHN YNLDLKKSDF STRWQKQRCP VVKSKCRENAS | P26718 | 16 |
DAP10 (AA 70-93) | LCARPRRSPAQEDGKVYINMPGRG | Q9UBK5 | 17 |
DAP12 (AA 62-113) | YFLGRLVPRGRGAAEAATRKQRITETESPYQELQGQRSDVYSDLNTQRPYYK | O54885 | 18 |
2B4/CD244 (AA 251-370) | WRRKRKEKQSETSPKEFLTIYEDVKDLKTRRNHEQEQTFPGGGSTIYSMIQSQSSAPTSQEPAYTLYSLIQPSRKSGSRKRNHSPSFNSTIYEVIGKSQPKAQNPARLSRKELENFDVYS | Q9BZW8 | 19 |
CD3-ζ同功異型物3 (AA 52-163) | RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR | P20963-3 | 6 |
CD28 (AA 180-220) | RSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS | P10747-1 | 20 |
間隔子 / 鉸鏈: | |||
CD8 (AA 136-182) | TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIY | P01732 | 21 |
CD28 (AA 114-151) | IEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP | P10747-1 | 22 |
短鉸鏈(核苷酸序列) | GAGAGCAAGTATGGGCCCCCTTGTCCTCCTTGTCCG | 63 | |
短鉸鏈(胺基酸序列) | ESKYGPPCPPCP | 64 | |
中等鉸鏈(核苷酸序列) | GAGAGCAAGTATGGGCCCCCTTGTCCTCCTTGTCCGGGGCAGCCCCGAGAGCCACAGGTGTACACtCTGCCaCCAAGTCAGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAGGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGGAGGGGAATGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACACAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCTGGGAAAG | 65 | |
中等鉸鏈(胺基酸序列) | ESKYGPPCPPCPGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK | 66 | |
長鉸鏈(核苷酸序列) | GAGTCTAAGTATGGGCCCCCTTGTCCTCCTTGTCCGGCACCTCCCGTGGCTGGACCAAGTGTATTCTTATTTCCCCCAAAACCCAAAGATACTCTCATGATTTCCCGGACCCCTGAGGTTACATGCGTGGTGGTGGATGTGAGCCAGGAAGACCCCGAAGTCCAGTTTAACTGGTACGTGGATGGAGTGGAGGTGCATAATGCAAAGACAAAGCCTCGGGAAGAACAGTTTCAGAGCACATACCGTGTGGTTAGTGTCCTCACAGTTCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAGGAGTATAAGTGTAAGGTCTCCAATAAAGGCCTCCCGTCATCGATCGAAAAAACCATCAGTAAAGCCAAAGGGCAGCCAAGGGAGCCACAGGTGTATACTTTACCACCAAGTCAGGAGGAAATGACCAAGAACCAGGTATCTCTGACCTGCCTAGTCAAAGGCTTTTACCCCAGCGATATCGCTGTGGAGTGGGAGTCTAATGGGCAGCCAGAGAACAACTACAAGACCACACCTCCTGTGCTGGACTCCGATGGCTCCTTCTTTCTATACAGCAGGTTAACCGTGGATAAGAGCAGGTGGCAGGAGGGGAATGTCTTCTCATGCTCTGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACACAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCTGGGAAAG | 67 | |
長鉸鏈(胺基酸序列) | ESKYGPPCPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFQSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK | 68 | |
前導序列 / 信號肽: | |||
GMCSF信號肽 | MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP | 1 | |
小鼠Ig-κ信號肽(核苷酸序列) | ATGGCCAGGAGCCCCGCCCAGCTGCTGGGCCTGCTGCTGCTGTGGCTGAGCGGCGCCAGGTGC | 61 | |
小鼠Ig-κ信號肽(胺基酸序列) | MARSPAQLLGLLLLWLSGARC | 62 | |
跨膜: | |||
CD8 (AA 183-203) | IYIWAPLAGTCGVLLLSLVIT | P01732 | 23 |
CD28 (AA 153-179) | FWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWV | P10747-1 | 24 |
連接子: | |||
Whitlow連接子 | GSTSGSGKPGSGEGSTKG | 3 | |
(G 4S) 3 | GGGGSGGGGSGGGGS | 25 | |
連接子3 | GGSEGKSSGSGSESKSTGGS | 26 | |
連接子4 | GGGSGGGS | 27 | |
連接子3 | GGGSGGGSGGGS | 28 | |
連接子4 | GGGSGGGSGGGSGGGS | 29 | |
連接子5 | GGGSGGGSGGGSGGGSGGGS | 30 | |
連接子6 | GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS | 31 | |
連接子7 | GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS | 32 | |
連接子8 | IRPRAIGGSKPRVA | 33 | |
連接子9 | GKGGSGKGGSGKGGS | 34 | |
連接子10 | GGKGSGGKGSGGKGS | 35 | |
連接子11 | GGGKSGGGKSGGGKS | 36 | |
連接子12 | GKGKSGKGKSGKGKS | 37 | |
連接子13 | GGGKSGGKGSGKGGS | 38 | |
連接子14 | GKPGSGKPGSGKPGS | 39 | |
連接子15 | GKPGSGKPGSGKPGSGKPGS | 40 | |
連接子16 | GKGKSGKGKSGKGKSGKGKS | 41 | |
連接子17 | STAGDTHLGGEDFD | 42 | |
連接子18 | GEGGSGEGGSGEGGS | 43 | |
連接子19 | GGEGSGGEGSGGEGS | 44 | |
連接子20 | GEGESGEGESGEGES | 45 | |
連接子21 | GGGESGGEGSGEGGS | 46 | |
連接子22 | GEGESGEGESGEGESGEGES | 47 | |
連接子23 | GSTSGSGKPGSGEGSTKG | 48 | |
連接子24 | PRGASKSGSASQTGSAPGS | 49 | |
連接子25 | GTAAAGAGAAGGAAAGAAG | 50 | |
連接子26 | GTSGSSGSGSGGSGSGGGG | 51 | |
連接子27 | GKPGSGKPGSGKPGSGKPGS | 52 | |
連接子28 | GSGS | 53 | |
連接子29 | APAPAPAPAP | 54 | |
連接子30 | APAPAPAPAPAPAPAPAPAP | 55 | |
連接子31 | AEAAAKEAAAKEAAAAKEAAAAKEAAAAKAAA | 56 |
在一些實施例中,第二多肽之抗原結合域結合至抗原。第二多肽之抗原結合域可結合至超過一種抗原或抗原中之超過一個抗原決定基。舉例而言,第二多肽之抗原結合域可結合至兩種、三種、四種、五種、六種、七種、八種或更多種抗原。作為另一實例,第二多肽之抗原結合域可結合至相同抗原中之兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個或更多個抗原決定基。
抗原結合域之選擇可視界定目標細胞表面之抗原類型及數目而定。舉例而言,可選擇可識別抗原之抗原結合域,該抗原充當目標細胞上之與特定疾病病狀相關的細胞表面標誌物。在某些實施例中,本發明之arCAR可經基因修飾以借助於工程改造專一性結合至抗原(例如腫瘤細胞上)之所需抗原結合域來靶向所關注腫瘤抗原。可充當本發明之arCAR中之抗原結合域之目標的細胞表面標誌物之非限制性實例包括與腫瘤細胞或自體免疫疾病相關之細胞表面標記。
在一些實施例中,抗原結合域結合至至少一種腫瘤抗原或自體免疫抗原。
在一些實施例中,抗原結合域結合至至少一種腫瘤抗原。在一些實施例中,抗原結合域結合至兩種或更多種腫瘤抗原。在一些實施例中,兩種或更多種腫瘤抗原與相同腫瘤相關。在一些實施例中,兩種或更多種腫瘤抗原與不同腫瘤相關。
在一些實施例中,抗原結合域結合至至少一種自體免疫抗原。在一些實施例中,抗原結合域結合至兩種或更多種自體免疫抗原。在一些實施例中,兩種或更多種自體免疫抗原與相同的自體免疫疾病相關。在一些實施例中,兩種或更多種自體免疫抗原與不同的自體免疫疾病相關。
在一些實施例中,腫瘤抗原與神經膠母細胞瘤、卵巢癌、子宮頸癌、頭頸癌、肝癌、前列腺癌、胰臟癌、腎細胞癌、膀胱癌或血液惡性病相關。與神經膠母細胞瘤相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括HER2、EGFRvIII、EGFR、CD133、PDGFRA、FGFR1、FGFR3、MET、CD70、ROBO1及IL13Rα2。與卵巢癌相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括FOLR1、FSHR、MUC16、MUC1、間皮素、CA125、EpCAM、EGFR、PDGFRα、連接素-4及B7H4。與子宮頸癌或頭頸癌相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括GD2、MUC1、間皮素、HER2及EGFR。與肝癌相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括緊密連接蛋白18.2、GPC-3、EpCAM、cMET及AFP。與血液惡性病相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括CD19、CD22、CD79、BCMA、GPRC5D、SLAM F7、CD33、CLL1、CD123及CD70。與膀胱癌相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括連接素-4及SLITRK6。與腎癌相關之腫瘤抗原之非限制性實例包括CD70及FOLR1。
抗原結合域可靶向之其他抗原實例包括(但不限於):α-胎蛋白、A3、對A33抗體具有專一性之抗原、Ba 733、BrE3-抗原、碳酸酐酶EX、CD1、CD1a、CD3、CD5、CD15、CD16、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD25、CD30、CD33、CD38、CD45、CD74、CD79a、CD80、CD123、CD138、大腸專一性抗原-p (CSAp)、CEA (CEACAM5)、CEACAM6、CSAp、EGFR、EGP-I、EGP-2、Ep-CAM、EphA1、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphA10、EphB1、EphB2、EphB3、EphB4、EphB6、FIt-I、Flt-3、葉酸受體、HLA-DR、人絨毛膜促性腺激素(HCG)及其亞單元、低氧誘導因子(HIF-I)、Ia、IL-2、IL-6、IL-8、胰島素生長因子-1 (IGF-I)、KC4-抗原、KS-1抗原、KS1-4、Le-Y、巨噬細胞抑制因子(MIF)、MAGE、MUC2、MUC3、MUC4、NCA66、NCA95、NCA90、對PAM-4抗體具有專一性之抗原、胎盤生長因子、p53、前列腺酸磷酸酶、PSA、PSMA、RS5、S100、TAC、TAG-72、肌腱蛋白、TRAIL受體、Tn抗原、湯姆遜-弗雷登抗原(Thomson-Friedenreich antigens)、腫瘤壞死抗原、VEGF、ED-B纖維結合蛋白、17-1A-抗原、血管生成標誌物、致癌基因標誌物或致癌基因產物。
在一個實施例中,抗原結合域靶向之抗原為CD19。在一個實施例中,抗原結合域包含抗CD19 scFv。在一個實施例中,抗CD19 scFv包含重鏈可變區(VH),該重鏈可變區包含SEQ ID NO: 2中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 2具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。在一個實施例中,抗CD19 scFv包含輕鏈可變區(VL),該輕鏈可變區包含SEQ ID NO: 4中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 4具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。在一個實施例中,抗CD19 scFv包含SEQ ID NO: 7中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 7具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
在一些實施例中,抗原與自體免疫疾病或病症相關。此類抗原可衍生自細胞受體及產生「自」引導抗體之細胞。在一些實施例中,抗原與自體免疫疾病或病症相關,諸如類風濕性關節炎(RA)、多發性硬化症(MS)、休格連氏症候群(Sjögren's syndrome)、全身性紅斑狼瘡、類肉瘤病、1型糖尿病、胰島素依賴性糖尿病(IDDM)、自體免疫甲狀腺炎、反應性關節炎、僵直性脊椎炎、硬皮病、多發性肌炎、皮肌炎、牛皮癬、脈管炎、韋格納氏肉芽腫病(Wegener's granulomatosis)、重症肌無力、橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto's thyroiditis)、格雷夫氏病(Graves' disease)、慢性發炎性脫髓鞘多發性神經病變、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、克羅恩氏病(Crohn's disease)或潰瘍性結腸炎。
在一些實施例中,本文所揭示之arCAR可靶向之自體免疫抗原包括(但不限於):血小板抗原、髓鞘蛋白質抗原、snRNP中之Sm抗原、胰島細胞抗原、類風濕性因子及抗瓜胺酸化蛋白質。瓜胺酸化蛋白質及肽(諸如CCP-1、CCP-2 (環狀瓜胺酸化肽))、血纖維蛋白原、纖維蛋白、波形蛋白、絲聚蛋白、膠原蛋白I及II肽、α-烯醇酶、轉譯起始因子4G1、核周因子、角蛋白、Sa (細胞骨架蛋白質波形蛋白)、諸如膠原蛋白II、IX及XI之關節軟骨之組分、諸如RF (IgG、IgM)之循環血清蛋白、血纖維蛋白原、纖維蛋白溶酶原、鐵蛋白、諸如RA33/hnRNP A2之核組分、Sm、真核轉譯延伸因子1 α 1、壓力蛋白質(諸如HSP-65、-70、-90)、BiP、發炎性/免疫因子(諸如B7-H1、IL-1 α及IL-8)、酶(諸如鈣蛋白酶抑素、α-烯醇酶、醛縮酶-A、二肽基肽酶、骨橋蛋白、葡糖-6-磷酸異構酶)、受體(諸如脂皮質素1)、嗜中性白血球核蛋白(諸如乳鐵蛋白及25-35 kD核蛋白)、顆粒蛋白(諸如殺菌滲透性增強蛋白(BPI))、彈性蛋白酶、組織蛋白酶G、髓過氧化酶、蛋白酶3、血小板抗原、髓鞘蛋白質抗原、胰島細胞抗原、類風濕因子、組蛋白、核糖體P蛋白、心磷脂、波形蛋白、核酸(諸如dsDNA、ssDNA及RNA)、核糖核粒子及蛋白質(諸如Sm抗原((包括但不限於SmD's及SmB'/B)))、U1RNP、A2/B1 hnRNP、Ro (SSA)及La (SSB)抗原。
非限制性例示性抗原目標提供於
表 2-4中。
表 2:抗原結合域可包含VH序列、VL序列及/或其CDR,諸如所引用之公開案中所描述之彼等序列、VL序列及/或其CDR,各公開案之內容出於所有目的以全文引用之方式併入本文中.
表 3:抗原結合域可包含源於結合至抗原目標(諸如所引用之公開案中所描述之抗原目標)之抗體或抗體片段的scFv,各公開案之內容出於所有目的以全文引用之方式併入本文中.
表 4:抗原結合域可包含源於結合於抗原目標之CAR的抗原結合域,諸如所引用之公開案中所描述之抗原結合域,各公開案之內容出於所有目的以全文引用之方式併入本文中.
抗原 目標 | 類型 | 來源之實例 | 類型 | 來源之實例 |
5T4 | VH | WO2016022939中之標識符2、4 | VL | WO2016022939中之標識符1、3 |
AGR2 | VH | WO2016040321中之標識符10、18 | VL | WO2016040321中之標識符11、19 |
ALK | VH | US20160280798Al中之標識符1、11、13、15、3、5、7、9;WO2015069922中之標識符9、1、3、5、11、13、15、7、9 | VL | US20160280798Al中之標識符10、12、14、16、2、4、6、8;WO2015069922中之標識符10、12、14、16、8;WO2015069922中之標識符2、4、6 |
AMC | VH | WO2016161390中之標識符17、18、19、20、21、22、23、24、25、26 | VL | WO2016161390中之標識符27、28、29、31、32、33、34、35、36 |
ANG2 | VH | WO2015091655中之標識符1、3 | VL | WO2015091655中之標識符2、4 |
APCDD1 | VH | WO2012019061中之標識符10、102、106、110、114、118、122、126、130、134、14、6、98 | VL | WO2012019061中之標識符136、100、104、108、112、116、12、120、124、128、132、16、8 |
APRIL | VH | US20160264674中之標識符12、14、16、18、3、32、34、36、38、40、42、44、46、48、52 | VL | US2016026467中之標識符20、22、24、26、28、30、4、50 |
AXL | VH | WO2016097370中之標識符21、3、45 | VL | WO2016097370中之標識符22、4 |
B2MG | VH | WO2016126213A1中之標識符28 | VL | WO2016126213A1中之標識符29 |
B7H1 | VH | US20130034559中之標識符12、32、42、52、72、2、62 | VL | US20130034559中之標識符17、37、47、57、7、77、27、67 |
B7H3 | VH | WO2016033225中之標識符10、11、12、13、14、15、16、9 | VL | WO2016033225中之標識符1、2、3、4、5、6、7、8 |
B7H3 (CD276) | VH | WO2016044383中之標識符17、26、7 | VL | WO2016044383中之標識符18、27、8 |
B7H4 | VH | US20160159910中之標識符100、101、102、103、107、108、109、110、11l、112、113、114、12、127、130、131、132、133、137、2、20、28、36、37、38、4、56、99、144;WO2016160620中之標識符13、15、17 | VL | US20160159910中之標識符104、11、126、134、138、19、27、3、35、55、93、95、97、98、145、146、147、148;WO2016160620中之標識符29、31、33 |
BAT1 | VH | WO2013014668中之標識符5、6、7、8、9 | VL | WO2013014668中之標識符1、2、3、4 |
BCMA | VH | WO2016168773 A3中之標識符26;WO2016168595A1中之標識符142、148、154、160、166、172、178、184、190、196、202、208、214、220、226、232、238、244、250、256、262、268、274、280、286、292、298、304、310、316、322、328、334、340、346、352;WO2016094304A3中之標識符8;WO2016014565中之標識符171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、190、255、257、258、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81;EP3057994A1中之標識符38;WO2016187349A1中之標識符55;WO2016090320中之標識符1、13、17、21、25、29、33、37、41、45、49、5、53、57、61、65、9;WO2016120216中之標識符101、743、174、758、95、759、97、760、99;WO2015158671A1中之標識符11、741、17;WO2016014789中之標識符10、11、12、13、14;WO2016168766A1中之標識符15 | VL | WO2016168773 A3中之標識符25;WO2016097231中之標識符42;WO2016168595 A1中之標識符143、149、155、161、167、173、179、185、191、197、203、209、215、221、227、233、239、245、251、257、263、269、275、281、287、293、299、305、311、317、323、329、335、341、347、353;WO2016014565中之標識符192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、204、205、207、208、211、259、260、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98;WO2016187349A1中之標識符53;WO2016094304 A3中之標識符7;WO2016090320中之標識符10、14、18、2、22、26、30、34、38、42、46、50、54、58、6、62、66;WO2016120216中之標識符100、102、175、96、98;WO2015158671A1中之標識符12、14、16、18;WO2016014789中之標識符7、8、9;WO2016168766A1中之標識符14 |
BMPR1A | VH | WO2011116212中之標識符12 | - | - |
CA19.9 | VH | US20160333114A1中之標識符117 | VL | US20160333114A1中之標識符118 |
Campath 1 | VH | US20160333114A1中之標識符34 | VL | US20160333114A1中之標識符31、33 |
CD105 | VH | WO2014039682中之標識符13、14、16 | VL | WO2014039682中之標識符1、17、20、22、23 |
CD123 | VH | WO2015140268A1中之標識符11、13、14、21;WO2016120216中之標識符113、115、57、59、63;WO2016120220中之標識符12、123、24、25、26、27、28、29、30、9;WO2016028896中之標識符216、217、218、219、274 | VL | WO2016120220中之標識符9、11、18、19、20、21、22、23;WO2015140268A1中之標識符12、16、18、19、22;WO2016028896中之標識符275、276、277、278、307、308、309、310;US20160333108A1中之標識符5;WO2016120216中之標識符114、116、58、60、64 |
CD148 | VH | WO2005118643中之標識符10、14、18、2、22、26、30、6 | VL | WO2005118643中之標識符12、16、20、24、28、32、4、8 |
CD16 | VH | WO2015158868中之標識符25 | VL | WO2015158868中之標識符26 |
CD19 | VH | WO2016120216中之標識符53、55 | VL | WO2016168773 A3中之標識符27、31;WO2016187349A1中之標識符49;WO2016134284中之標識符11;US20140134142A1中之標識符194;WO2016120216中之標識符54、56;US20160152723中之標識符13、14、15、16、17、186、187、188、189、192、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、64、66、67、68、69、70、71、91;US20160039942中之標識符22;WO2016097231中之3361標識符63;US20160145337A1中之標識符3;US20160333114A1中之標識符112;US20160333114A1中之標識符114;US20160319020中之標識符13、6 |
CD19H 803 | VH | WO2016168773 A3中之標識符28、29、32、33、34、35;WO2016187349A1中之標識符51;US20160039942中之標識符20;WO2014184143中之標識符1;US20160145337A1中之標識符5;US20160152723中之標識符166、167、168、172、176、177、181、183、184、185、62;US20160319020中之標識符15;EP3057994A1中之標識符17、33、34、35;WO2016097231中之標識符62;WO2016134284中之標識符12;US20160333114A1中之標識符111、113 | - | - |
CD2 | VH | WO2016122701中之標識符103、117、119 | VL | WO2016122701中之標識符102、116 |
CD20 | VH | WO2016097231中之標識符45;WO2017004091中之標識符11、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、7、9;US20170000900中之標識符26;US20160333114A1中之標識符54;US20170000900中之標識符25;US20170000900中之標識符24;US20170000900中之標識符23 | VL | WO2016097231中之標識符46;WO2017004091中之標識符10、12、8;US20160333114A1中之標識符51 |
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CD30 | VH | WO2016134284中之標識符14、16 | VL | WO2016134284中之標識符13、15 |
CD324 | VH | US9534058中之識符21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71 | VL | US9534058中之標識符20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70 |
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CD37 | VH | US20170000900中之標識符11、12、18 | VL | US20170000900中之標識符14、15 |
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CD73 | VH | US20160145350中之標識符100、103、107、109、112、114、116、119、121、16、32、4、52、60、68、80、88;WO2016055609A1中之標識符135、40、21、3、28、36 | VL | US20160145350中之八方12、20、44、72、76、8、84、92;WO2016055609A1中之標識符22、29、37、4;US20160145350中之標識符101、102、104、106、110、117、118、120、122 |
CD74 | VH | US20100284906A1中之標識符6;US20040115193A1中之標識符10、11、9;US20130171064中之標識符23、27、30、33 | VL | US20130171064中之標識符25、29、31、35;US20040115193A1中之標識符12、13、14、11、4 |
CD76b | VH | US20160159906中之標識符15、17、19、23、27、29、37、57、59、61 | VL | US20160159906中之標識符16、18、22、38、58、60、62 |
CD79 | VH | WO2016122701中之標識符131 | VL | WO2016122701中之標識符130 |
CDIM | VH | WO2013120012中之標識符1、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、2、20、21、22、3、4、5、6、7、8、9 | VL | WO2013120012中之標識符28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49 |
CEA | VH | US8287865中之標識符8 | VL | US8287865中之標識符10、38、39、7、9 |
Claudin | VH | WO2016073649A1中之標識符101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、23、27、31、35、39、43、47、51、55、59、63、67、71、75、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99 | VL | WO2016073649A1中之標識符114、116、118、120、22、25、29、33、37、41、45、49、53、57、61、65、69、73、77 |
CLDN18.2 | VH | US20160347815A1中之標識符12、2 | VL | US20160347815A1中之標識符13、3 |
CLL1 | VH | WO2016120219中之標識符13、14、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35;WO2016014535中之標識符195、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77;US20160075787中之標識符31、33、34、36、38、40、42、46;WO2016179319A1中之標識符150、103、105、107、109、111、113、115、117 | VL | WO2016120219中之標識符16、18、20、22、24、26、28、30、32、24、36;WO2016014535中之196、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90;US20160075787中之標識符30、32、35、37、39、41;WO2016179319A1中之標識符152、104、106、108、110、112、114、116、118 |
CLL3 | VH | US20170000901中之標識符101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、21、211、213、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99 | VL | US20170000901中之標識符100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、170、172、174、176、178、180、182、184、186、190、192、194、196、198、20、200、202、204、206、208、210、212、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98 |
collagen | VH | WO2007024921中之標識符21、4、15、17、18、19、20、5、6、7、1、2、3 | VL | WO2007024921中之標識符11、12、14、23、25、26、27、8、9 |
CS1 | VH | WO2016168773 A3中之標識符22;WO2016120216中之103、105、107、109;WO2015166056A1中之標識符13、15、17、19;WO2015121454中之標識符38、40、42、44、46;US20160075784A1中之標識符26 | VL | WO2016120216中之標識符104、106、108;WO2015166056A1中之標識符14、16、18、20、22;WO2015121454中之標識符39、41、43、45、47;WO2016120216中之標識符110、112 |
CSF | VH | US20050059113A1中之標識符10、102、14、18、2、22、26、30、34、38、46、50、54、58、6、62、66、70、74、78、82、86、90、94、98 | VL | US20050059113A1中之標識符12、32、44、48、60 |
CSPG4 | VH | WO2016077638中之標識符10、16、18、4、6、8;WO2016164429中之標識符8 | VL | WO2016164429中之標識符7;WO2016077638中之標識符12、14 |
CTLA4 | VH | US20140105914中之標識符3、31、32、33、34、35、41、42、43、44、45、7;US8697845中之標識符4;US20150283234中之標識符19;WO2014066532中之標識符17 | VL | US20140105914中之標識符36、37、38、39、40、46、47、48、49、50、8、4;US8697845中之標識符2;US20150283234中之標識符20;WO2014066532中之標識符18 |
CXCR4 | VH | US20110020218中之標識符72、73、74、75、84 | VL | US20110020218中之標識符76、77、78、79、80、81、82、87、88、90、91、92、93 |
Daclizumab | VH | US20160333114A1中之標識符44、46 | VL | US20160333114A1中之標識符43、45 |
DR5 | VH | WO2016122701中之標識符18、82、90、98、8 | VL | WO2016122701中之標識符13、23、25、27、3、78、86、94、29;WO2016122701中之標識符62;WO2016122701中之標識符54;WO2016122701中之標識符70 |
E7MC | VH | WO2016182957A1中之標識符15、16、17、18、19、20、21、22、23、233、234、235、236、237、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35 | VL | WO2016182957A1中之標識符238、239、240、241、242、243、36、37、38、39、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56 |
EFNA | VH | US20150125472中之標識符149、153、157、161 | VL | WO2012118547中之標識符151、155、159、163;US20150125472中之標識符27、53 |
EFNA4 | VH | US20150125472中之標識符13、39 | - | - |
EGFR | VH | WO2015143382中之標識符14、50、9;US20100008978A1中之標識符12、14、15、21;WO2018231759中之標識符2123 | VL | WO2015143382中之標識符15;WO2014143765中之標識符14;WO2018231759中之標識符4051、4052、4053、4054、4055、4056、4057、4058、4059、4060、4061、4062、4063、4064、4065、4066、4067、4068、4069、4070、4071、4072、4073、4074、4075、4076、4077、4078、4079、4080、4081、4082、4083、4084、4085、4086、4087、4088、4089、4090、4091、4092、4093、4094、4095、4096、4097、4098、4099、4100、4101,4102、4103、4104、4105、4106、4107、4108、4109、4110、4111、4112、4113、4114、4115、4116、4117、4118、4119、4120、4121、4122、4123、4124、4125、4126、4127、4128、4129、4130、4131、4132、4133、4134、4135、4136、4137、4138、4139、4140、4141、4142、4143、4144、4145、4146、4147、4148、4149、4150、4151、4152、4153、4154、4155、4156、4157、4158、4159、4160、4161、4162、4163、4164、4165、4166、4167、4168、4169、4170、4171、4172、4173、4174、4175、4176、4177、4178、4179、4180、4181、4182、4183、4184、4185、4186、4187、4188、4189、4190、4191、4192、4193、4194、4195、4196、4197、4198、4199、4200、4201、4202、4203、4204、4205、4206、4207、4208、4209、4210、4211、4212、4213、4214、4215、4216、4217、4218、4219、4220、4221、4222、4223、4224、4225、4226、4227、4228、4229、4230、4231、4232、4233、4234、4235、4236、4237、4238、4239、4240、4241、4242、4243、4244、4245、4246、4247、4248、4249、4250、4251、4252、4253、4254、4255、4256、4257、4258、4259、4260、4261、4262、4263、4264、4265、4266、4267、4268、4269、4270、4271、4272、4273、4274、4275、4276、4277、4278、4279、42870、4281、4282、4283、4284、4285、4286、4287、4288、4289、4290、4291、4292、4293、4294、4295、4296、4297、4298、4299、4300、4301、4302、4303、4304、4305、4306、4307、4308、4309、4310、4311、4312、4313、4314、4315、4316、4317、4318、4319、4320、4321、4322、4323、4324、4325、4326、4327、4328、4329、4330、4331、4332、4333、4334、4335、4336、4337、4338、4339、4340、4341、4342、4343、4344、4345、4346、4347、4348、4349、4350、4351、4352、4353、4354、4355、4356、4357、4358、4359、4360、4361、4362、4363、4364、4365、4366、4367、4368、4369、4370、4371、4372、4373、4374、4375、4376、4377、4378、4379、4380、4381、4382、4383、4384、4385、4386、4387、4388、4389、4390、4391、4392、4393、4394、4395、4396、4397、4398、4399、4400、4401、4402、4403、4404、4405、4406、4407、4408、4409、4410、4411、4412、4413、4414、4415、4416、4417、4418、4419、4420、4421、4422、4423、4424、4425、4426、4427、4428、4429、4430、4431、4432、4433、4434、4435、4436、4437、4438、4439、4440、4441、4442、4443、4444、4445、4446、4447、4448、4449、4450、4451、4452、4453、4454、4455、4456、4457、4458、4459、4460、4461、4462、4463、4464、4465、4466、4467、4468、4469、4470、4471、4472、4473、4474、4475、4476、4477、4478、4479、4480、4481、4482、4483、4484、4485、4486、4487、4488、4489、4490、4491、4492、4493、4494、4495、4496、4497、4498、4499、4500、4501、4502、4503、4504、4505、4506、4507、4508、4509、4510、4511、4512、4513、4514、4515、4516、4517、4518、4519、4520、4521、4522、4523、4524、4525、4526、4527、4528、4529、4530、4531、4532、4533、4534、4535、4536、4537、4538、4539、4540、4541、4542、4543、4544、4545、4546、4547、4548、4549、4550、4551、4552、4553、4554、4555、4556、4557、4558、4559、4560、4561、4562、4563、4564、4565、4566、4567、4568、4569、4570、4571、4572、4573、4574、4575、4576、4577、4578、4579、4580、4581、4582、4583、4584、4585、4586、4587、4588、4589、4590、4591、4592、4593、4594、4595、4596、4597、4598、4599、4600、4601、4602、4603、4604、4605、4606、4607、4608、4609、4610、4611、4612、4613、4614、4615、4616、4617、4618、4619、4620、4621、4622、4623、4624、4625、4626、4627、4629、4629、4630、4631、4632、4633、4634、4635、4636、4637、4638、4639 |
EGFR (EGFRvIII) | VH | WO2018231759中之標識符2124;WO2016016341中之標識符13;WO2016168773 A3中之標識符24;US20160304615中之標識符34;US20160200819A1中之標識符2;WO2016120216中之標識符91、93 | VL | WO2018231759中之4640、4641、4642、4643、4644、4645、4646、4647、4648、4649、4650、4651、4652、4653、4654、4655、4656、4657、4658;WO2016016341中之標識符14;WO2016168773 A3中之標識符23;US20160304615中之標識符42;US20160200819A1中之標識符1;WO2016120216中之標識符92、94 |
內皮因子 | VH | US20160009811中之標識符41、42、43、71、73、75、88、89、90、91、92 | VL | WO2011041441中之標識符103、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、102、100;US20160009811中之標識符100、102、103、3、4、5、70、72、74、93、94、95、96、97 |
EphA2受體 | VH | US20150274824中之標識符20、22、24、32、34、36、37、38、40、42、43、45、74、76 | VL | US20150274824中之標識符26、28、30、47、48、49、50、52、78、80 |
ERBB2 | VH | US20110129464中之標識符2、4;US20130089544中之標識符10、2、26、30、38、4、40、42、52、54、56、57、58、6;US20130266564中之標識符8;US20150104443中之標識符1 | VL | US20110129464中之標識符1;US20130089544中之標識符12、16、20、24、32、36、44、50、51、53、8;US20130266564中之標識符7;US20110129464中之標識符3 |
因子D | VH | US20160017052中之標識符17、20、27、29、30、31、32、33、4 | VL | US20160017052中之標識符16、18、19、26、3 |
因子XII | VH | WO2014089493中之標識符15 | VL | WO2014089493中之標識符17 |
FAP | VH | WO2015118030中之標識符1、5;WO2016120216中之標識符170、172;US20160326265 A1中之標識符8 | VL | WO2015118030中之標識符2、6;WO2016120216中之標識符171、173;US20160326265A1中之標識符9 |
Fc受體類5 (FcRL5) | VH | WO2016090337中之標識符12、16、20、24、28、32、36、4、40、44、48、8、915、919 | VL | WO2016090337中之標識符11、15、19、23、27、3、31、35、39、43、47、7、917、921 |
FGFR3 | VH | US9499623中之標識符132、134、136 | VL | US9499623中之標識符133、135、137、139 |
捲曲受體 | VH | WO2010037041中之標識符10 | VL | WO2010037041中之標識符12、14 |
GAH | VH | US20060057147A1中之標識符7 | VL | US20060057147A1中之標識符8 |
GCC1 | VH | US20160030595A1中之標識符1 | VL | US20160030595A1中之標識符4、2 |
GD2 | VH | WO2016134284中之標識符17;US20130216528中之標識符1;WO2015132604中之標識符10、9;US20130216528中之標識符3、4、6、8 | VL | US20130216528中之標識符10、2、5、7、9;WO2015132604中之標識符11、12;WO2016134284中之標識符18 |
GD3 | VH | WO2016185035A1中之標識符11、13、15、17 | VL | WO2016185035A1中之標識符12、14、16、18 |
糖基抗原決定基及ErbBB I專一性 | VH | WO2012007167A1中之標識符7 | VL | WO2012007167A1中之標識符10 |
GM2 | VH | US20090028877中之標識符20、22、23、26、27、28、29、30 | VL | US20090028877中之標識符21、24、25、31、32、33、34、35 |
GPC3 | VH | US20160208015 A1中之標識符10、14、2、3、4、5、6、7、8、9;WO2016049459中之標識符22;US9409994B2中之標識符12、16、20、37、8 | VL | US9409994B2中之標識符10、14、18、22、24、26;US20160208015A1中之標識符16、31;WO2016049459中之標識符23 |
GPDL1 | VH | US20160108123中之標識符20 | - | - |
GPRC5D | VH | WO2016090312中之標識符13、17、21、25、29、314、326、33、338、350、362、37、374、386、41、45、49、5、53、57、61、65、69、73、77、81、85、89、93、1、9 | VL | WO2016090312中之標識符10、14、18、2、22、26、30、303、315、327、339、34、351、363、375、38、387、42、46、50、54、58、6、62、66、70、74、78、82、86、94 |
Her2 | VH | WO2016168773A3中之標識符141、262、264、266、268、270;US9518118中之標識符11;US20160333114A1中之標識符62;US9518118中之標識符19、24 | VL | WO2016054555A2中之標識符140;WO2016168773A3中之標識符261、263、265、267、269;US9518118中之標識符10、18、23;WO2016168769A1中之標識符3;US20160333114A1中之標識符59、61 |
Herl/her3 | VH | WO2016073629之標識符8 | VL | WO2016073629之標識符4 |
HLAG | VH | WO2016160622A2中之標識符10、8 | VL | WO2016160622A2中之標識符18、20 |
HSP70 | VH | WO2016120217中之標識符11、12 | VL | WO2016120217中之標識符16、17 |
人類膠原蛋白VII | VH | WO2016112870中之標識符31 | VL | WO2016112870中之標識符32 |
人類CD79b | VH | WO2016112870中之標識符27;WO2016112870中之人類CD79b VH 2304標識符29 | VL | WO2016112870中之標識符28、30 |
人類ERBB3 | VH | WO2013052745中之標識符19、29、38、45、55、61、9 | VL | WO2013052745中之標識符10、20、30、39、46、56、62 |
ICOS | VH | US20160215059中之標識符15、16、19、23、7 | VL | US20160215059中之標識符17、18、20、24、8 |
IGFI | VH | WO2007118214中之標識符1、3、7;WO2015073575中之標識符7 | VL | WO2007118214中之標識符2、4、6、8 |
IGFR1 | VH | WO2015073575 A2中之標識符7 | VL | WO2015073575 A2中之標識符8 |
IL13 | VH | US20160168242中之標識符302 | VL | US20160168242中之標識符303 |
IL13Ra2 | VH | WO2016123143中之標識符7、8 | - | - |
IL21 | VH | US20160145332中之標識符2、3 | - | - |
IL33 | VH | US20160168242中之標識符134、136、138、185、187、189、216、218、220、221、236、246、282、284、286、36、38、40、84、86、88 | VL | US20160168242中之標識符135、137、139、184、188、217、219、237、247、283、285、287、37、39、41、87 |
IL3α | VH | WO2008127735中之標識符22 | VL | WO2008127735中之標識符27、37 |
IL4R | VH | WO2009121847中之標識符10、11、14、15、9 | VL | WO2009121847中之標識符13、7、8 |
ILIRAP | VH | WO2016020502中之標識符1、10、19、8、9;WO2016179319A1中之標識符120、122、124 | VL | WO2016020502中之標識符14、15、17、18、2、20;WO2016179319A1中之標識符121、123、125 |
整合素 | VH | US 20140161794中之標識符3、4、5 | VL | US 20140161794中之標識符10、11、8、9 |
KDR | VH | WO2003075840中之標識符20、24、26、29、31、33 | VL | WO2003075840中之標識符22 |
KIR (利瑞路單抗) | VH | US20150290316中之標識符3;WO2014055648中之2371標識符1 | VL | US20150290316中之標識符5;WO2014055648中之標識符2 |
KIR2DL 1 | VH | WO2016126213A1中之標識符36 | VL | WO2016126213A1中之標識符37 |
KIR2DL 2/3 | VH | WO2016126213A1中之標識符36 | VL | WO2016126213A1中之標識符37 |
Klon43 | VH | WO2016097231中之標識符47 | VL | WO2016097231中之標識符48 |
KMA | VH | WO2016172703 A2中之標識符22 | VL | WO2016172703A2中之標識符2、21 |
LAG3 | VH | US20150259420中之標識符102、106、110、113、122、18、30、66、70、74、78;US20150259420中之標識符100、104、108、28、64、68、72、76、8、80;WO2015042246中之標識符1 | VL | US20150259420中之標識符32、36、40、44、48、52、56、60、84、88、92、96、134、34、38、42、46、50、54、58、60、86、90、94、98;WO2015042246中之標識符2 |
白細胞原A2 | VH | WO2010065962 A2中之標識符25 | - | - |
白細胞原A | VH | WO2010065962 A2中之標識符9 | VL | WO2010065962 A2中之標識符24 |
LGR4 | VH | US20160046723中之標識符12、13、5、9 | VL | US20160046723中之標識符10、11、6 |
LGR5 | VH | US20160102146中之標識符10、12、16、18、20、22、24、26、4 | VL | US20160102146中之標識符15、19、21、23、25、3 |
LHR | VH | WO2016160618A3中之標識符1、2、3、4、5、6、7、8 | - | - |
淋巴毒素β受體 | VH | WO2004002431中之標識符10、12、14、16、2 | VL | WO2004002431中之標識符1、15、4、6、8 |
類離胺酸氧化酶2 | VH | WO2011097513中之標識符42、44 | VL | WO2011097513中之標識符43、45 |
惡性可變受體 | VH | WO2015133817A1中之標識符1 | VL | WO2015133817A1中之標識符5 |
MCAM | VH | US20150259419中之標識符115、116、117、118、119、157、158、159、160、161、178、179;US20150239980中之標識符35、45、55、65、77、89;US20150259419中之標識符101、102、103、104、105、106、107 | VL | US20150259419中之標識符109、110、111、112、121、122、123;US20150239980中之標識符30、40、50、60、70、71、72 |
MCSF | VH | WO2005030124中之標識符102、10、14、18、2、22、26、30、34、38、46、50、54、58、6、66、70、74、78、82、86、90、94、98 | VL | WO2005030124中之標識符8、32、52、60、28、36、4、44、48、56、62、12、16、20、24 |
間皮素 | VH | WO2015188141中之標識符1、6;US20160333114A1中之標識符119、50;WO2013142034中之標識符5、6;US9416190B2中之標識符15、2;US20160229919A1中之標識符13、17、21、25、29、9 | VL | WO2015188141中之標識符3、5;WO2013142034中之標識符1、2、3;US20160229919A1中之標識符11、15、19、23、27;US20160333114A1中之標識符120、47、49 |
MN | VH | WO2007070538中之標識符133、135、137、139、141、143、145、147、149、151 | VL | WO2007070538中之標識符134、136、138、140、142、144、146、148、150、152 |
MPER | VH | US20160194375A1中之標識符13 | VL | US20160194375A1中之標識符12 |
MUC1 | VH | US20160130357中之標識符5;WO2013023162中之標識符2、14;WO2015116753中之標識符15、19、23、60、64、68 | VL | US20160130357中之標識符7;WO2013023162中之標識符16、7;WO2015116753中之標識符17、21、25、62、66、70 |
MUC16 | VH | WO2016149368中之標識符1、21、41、81、61;US20130171152中之11、4、6、8 | VL | WO2016149368中之標識符2、22、42、62、82 |
MUC1C ECD | VH | US20160340442A1中之標識符15、19、23、60、64、68、72 | VL | US20160340442A1中之標識符17、21、25、62、66、70、75 |
MUCIN1 | VH | EP3049812A2中之標識符101、106、109、115、119、123、127、141、15、23、28、33、39、42、47、5、57、66、70、75、80、83、87、92 | VL | EP3049812A2中之標識符148、158、162、167、170、174、184、190、193、203、208、211、220、225、229、234、242、246、250、255、261、270、275、279、283、291、297、303、308、315、319、323、333、340 |
MVR | VH | US20160257762A1中之標識符1 | VL | US20160257762A1中之標識符5 |
N聚糖 | VH | US20160194375A1中之標識符7、9 | VL | US20160194375A1 N中之標識符6、8 |
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NKG2D | VH | WO2016122701中之標識符135、137 | VL | WO2016122701中之標識符134、136 |
NOTCH 1 | VH | US20160333114A1中之標識符58;WO2013074596中之標識符12 | VL | WO2013074596中之標識符16、20;US20160333114A1中之標識符55、57 |
NOTCH 2/3 | VH | WO2013074596中之標識符29 | VL | WO2013074596中之標識符31 |
Notum | VH | WO2012027723中之標識符56、331 | VL | WO2012027723中之標識符332、58 |
NYBR1 | VH | US20160333422A1中之標識符19 | VL | US20160333422A1中之標識符18 |
OlfmB | VH | WO2015054441A1中之標識符1 | VL | WO2015054441A1中之標識符2 |
Olfml3 | VH | WO2015054441A1中之標識符9、3 | VL | WO2015054441A1中之標識符20、4 |
癌胚纖維結合蛋白 | - | - | VL | US20070202103A1中之標識符1、2、7 |
黏骨素 | VH | WO2016112870中之標識符58 | VL | WO2016112870中之標識符59 |
OTK3 | VH | WO2015158868中之標識符17 | VL | WO2015158868中之標識符18 |
OX40 | VH | WO2016196228中之標識符101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、124、125、17、28、318、37、48、50、58、66、74、85、93、95、97、99;US20150190506中之標識符31、34、36、38、40、42、44、46、48、50、53、54、55、58、59、61;US20160137740中之標識符33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、71;US8283450中之標識符44、46、48、7、9;US9428570中之標識符9、15;US8748585中之標識符19、21、22、23、29、58、59、7、77、78、79、80 | VL | US8283450中之標識符10、45、47、49、8;US9428570中之標識符11、7;WO2016196228中之標識符116、120、122、30、38、49、57、65、73、84、86、94、98;US8748585中之標識符24、26、27、28、30、60、8、81、82、83、84、85、86、87、88、89;US20160137740中之標識符30、32;US20150190506中之標識符32、35、39、41、43、45、47、49、51、52、56、57、62;US20160137740中之標識符29、37 |
PD1 | VH | US20150290316中之標識符19;US20130291136中之標識符25、26、27、28、29;US 20160159905中之標識符29、3、38;WO2015112900中之標識符38、50;US 20160159905中之標識符4、4、6;WO2015112900中之標識符82、86;WO2014055648中之標識符17;WO2016040892中之標識符4;US20150190506中之標識符12 | VL | US 20160159905中之標識符2、39、7、8、9;US20150290316中之標識符21;US20130291136中之標識符30、31、32、33;WO2015112900中之標識符42、46、54;WO2015112900中之標識符58、62、66、70、74、78;WO2014055648中之標識符18;WO2016040892中之標識符5;US20150190506中之標識符13 |
PDK1 | VH | WO2016090365中之標識符2 | VL | WO2016090365中之標識符9 |
PDl (納武單抗) | VH | WO2016040892中之標識符2;US20150190506中之標識符10 | VL | US20150190506中之標識符11 |
PDL1 | VH | US20160319022中之標識符10、32、8;WO2016061142中之標識符18、30、38、46、50、54、62、70、78;US20150190506中之標識符29、7;US20160108123中之標識符16、18、197、247、248、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、30、308、310、312、319、32、324、339、356、38、40、46、48、50、52、54、6、62、70、72、78、80、91、96;US20160108123中之標識符358、56、64 | VL | WO2016061142中之標識符22、26、34、42、58、66、74、82、86;US20150190506中之標識符30、8、9;US20160319022中之標識符7、9;US20160108123中之標識符17、22、24、249、26、28、309、311、313、320、325、34、340、357、359、36、42、44、58、60、66、68、74、76、8、82、84、86、88 |
PDL2 | VH | US20130291136中之標識符43、44、56、46 | VL | US20130291136中之標識符47、48、49、50、51 |
PG16 | VH | EP3074419A2中之標識符13 | VL | EP3074419A2中之標識符12 |
PG9 | VH | EP3074419A2中之標識符11 | VL | EP3074419A2中之標識符10 |
PGT1 | VH | EP307441中之標識符15 | - | - |
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PGT3 | VH | EP3074419A2中之標識符19 | VL | EP3074419A2中之標識符18 |
PGT4 | VH | EP3074419A2中之標識符21 | VL | EP3074419A2中之標識符20 |
PGT5 | VH | EP3074419A2中之標識符23 | VL | EP3074419A2中之標識符22 |
PRAME | VH | WO2016191246A2中之標識符50、52、54、56、58、60、62 | VL | WO2016191246A2中之標識符49、51、53、55、57、59、61 |
PRP | VH | US20160333114A1中之標識符42 | VL | US20160333114A1中之標識符39、41 |
PSMA | VH | WO2016097231中之標識符43 | VL | WO2016097231中之標識符44;WO2016097231中之標識符44 |
PTK7 | VH | US20150315293中之標識符1、25、49;WO2012112943A1中之標識符21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69 | VL | WO2012112943A1中之標識符20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68;US20150315293中之標識符15、39、63 |
RAS | VH | WO2016154047中之標識符17、47、57、67、7、77 | VL | WO2016154047中之標識符19、49、59、69、79、9 |
RHAMM | VH | US20020127227A1中之標識符4 | - | - |
RHAMM拮抗劑主體 | VH | WO2000029447中之標識符2 | VL | WO2000029447中之標識符4 |
利妥昔單抗 | VH | US20160333114A1中之標識符66 | VL | US20160333114A1中之標識符63、65 |
ROR1 | VH | WO2016016343A1中之標識符12、20、28、36、44、60、68;WO2016016344A1中之標識符57、19、31、45、53、71;WO2016120216中之標識符85、87、89;US20160208018A1中之標識符122、125、175、176、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、197、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209;EP3083671A1中之標識符55;WO2016187216A1中之標識符104、112、120、128、152、16、160、168、176、184、192、200、208、216、224、232、24、240、248、256、264、272、280、288、296、304、312、32、320、336、344、352、360、40、48、56、64、72、8、80、88 | VL | WO2016016343A1中之標識符16、24、32、40、56、64、72、36、62、23、49、58;WO2016120216中之標識符86、88、90;US20160208018A1中之標識符126、127、234、235、236、237、238、240、241、242、243、244、245、246、247、248;EP3083671A1中之標識符56;WO2016187216A1中之標識符103、111、127、135、143、15、151、159、167、175、183、191、199、207、215、223、23、231、239、247、255、263、271、279、287、295、303、31、311、319、327、335、343、351、359、39、47、55、63、7、71、79、87、95 |
SEMAPHORIN 4D | VH | US20160115240A1中之標識符10、25、9 | VL | US20160115240A1中之標識符17、18、29 |
TAG72 | VH | US20160333114A1中之標識符115 | VL | US20160333114A1中之標識符116 |
TCR | VH | WO2016122701中之標識符133 | VL | WO2016122701中之標識符132 |
TEM8 | VH | US20160264662A1中之標識符1、3、5、7 | VL | US20160264662A1中之標識符4、6、8 |
Tie | VH | US20060057138A1中之標識符723 | VL | US20060057138A1中之標識符724 |
TIGIT | VH | US20160355589中之標識符10、11、12、124、125、126、127、128、129、13、136、138、14、143、144、149、15、150、16、17、18、19、20、21、22、23、24、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、63、94、7、9 | VL | US20160355589中之標識符130、131、132、133、137、139、145、146、151、152、25、26、27、28、29、30、50、51、52、64、95、8 |
TIM3 | VH | US20150086574中之標識符102、112、12、2、22、32、42、52、62、72、82、91;WO2013006490中之標識符82;WO2016179319A1中之標識符13、21、29、37、45、5、53、61、69、77、85、93;WO2013006490中之標識符7;US20150086574中之標識符107、117、17、27、37、47、57、67、7、77、87、97;WO2016179319A1中之標識符17、25、33、41、49、57、65、73、81、89、9、97 | - | - |
組織因子 | VH | WO2004094475中之標識符10、19、23、27、29、6;US20160333114A1中之標識符38 | VL | US20040229301A1中之標識符25、31;WO2004094475中之標識符12、21、25、31、8;US20160333114A1中之標識符35、37 |
Tn糖肽 | VH | WO2015120180中之標識符19、20 | - | - |
TRBC1 | VH | WO2015132598中之標識符1 | VL | WO2015132598中之標識符2 |
滋胚層糖蛋白5T4 | VH | WO2016034666A1中之標識符17、13、15、11 | VL | WO2016034666A1中之標識符18、12、14、16 |
Upar | VH | US20160333114A1中之標識符72 | VL | US20160333114A1中之標識符71、73 |
V2 | VH | US20160194375A1中之標識符11 | - | - |
VEGF | VH | WO2000034337中之標識符4、8;WO2006012688A1中之標識符12、20、4、44;US20030175276A1中之標識符7;US20160090427中之標識符152、153、154、155、156、157、158、159 | VL | WO2000034337中之標識符2、6;US20030175276A1中之標識符9;WO2006012688A1中之標識符11、19、27、28、3、43;US20160090427中之標識符160、161、162、163、164、165、166、167 |
VEGFR2 | VH | WO2017004254中之標識符100、101、102、103、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、95、96、97、98、99 | VL | WO2017004254中之標識符107、108、109、110、111、112、113、86、87、88、89、90、91、92、93、94 |
VISTA | VH | WO2015097536中之標識符37、38、39、40 | VL | WO2015097536中之標識符41、42、43、44、45 |
VMS2 | VH | WO2000058363中之圖1 | - | - |
WT1/HLA雙專一性 | VH | WO2015070061中之標識符104、111、128、14、32、50、68、86 | VL | WO2015070061中之標識符106、112、130、34、52、70、88 |
抗原目標 | 來源之實例 |
經活化αvβ3 | US20090117096A1中之標識符8、2、4 |
阿達利單抗 | US20160208021中之標識符41;WO2016112870中之標識符41 |
ALK | WO2015069922中之標識符17、18、19、20、21、22、23;US20160280798A1中之標識符17、18、19、20、21、22、23、24;WO23015069922中之標識符24 |
B7H3 | WO2016033225中之標識符99、100、101、102、103、104、102、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、87、88、89、90、91、92、94、95、96、97、98 |
B7H4 | WO2013067492中之標識符1、2、3、4;US9422351B2中之標識符1 |
BCMA | WO2016014565中之標識符152、158、176、185、188、200、212、218、224、284、290、296、302、314、326、344、129、130、131、132、133、134、135、136、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、263、264、265、266、271、273、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、64、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、263、264、265、266、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53;US20160311907A1中之標識符214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、251 |
CCR4 | WO2015191997中之標識符7、9 |
CD123 | WO2016028896中之標識符157、158、159、160、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、478、480、483、485;WO2015092024A2中之標識符36;WO2016115482A1中之標識符57;EP3083691A2中之標識符36;US20160311907A1中之標識符15 |
CD124 | US20160311907A1中之標識符158 |
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CD19/CD22雙專一性 | WO2016164731A2中之標識符1303、1307 |
CD20 | WO2016164731A100中之標識符691;WO2016164731A101中之標識符692;WO2016164731A102中之標識符693;WO2016164731A103中之標識符694;WO2016164731A104中之標識符695;WO2016164731A105中之標識符696;WO2016115482A1中之標識符175 |
CD22 | WO2013059593中之標識符5、6;US20150299317中之標識符9;WO2016164731A2中之標識符131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、203、209、215、221、227、232、238、244、250、256、262、268、274、280、286、292、298、304、310、316、322、328、334、340、346、353、358、364、370、376、383、388、394、400、406、412、418、423 |
CD276 | US20160053017中之標識符10、19、28 |
CD3 | WO2015153912A1中之標識符46、47 |
CD30 | WO2016116035A1中之標識符20;US20160200824A1中之標識符2 |
CD33 | WO2016014576中之標識符262、263、264、265、266、267、268、39、40、41、42、43、44、45、46、47;WO2015092024 A2中之標識符37;EP3083691A2中之標識符37;WO2016115482A1中之標識符153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163 |
CD33/CD3雙專一性 | WO2014144722A2中之標識符33、34、84 |
CD37 | US20170000900中之標識符21、22 |
CD44 | WO2016042461A1中之標識符17 |
CD46 | WO2016040683中之標識符1-42 |
CD5 | WO2016138491中之標識符16 |
CD79b | US20160208021中之標識符33 |
CEA | US20160303166A1中之標識符1;US20140242701A1中之標識符22 |
西妥昔單抗 | WO2016112870中之標識符37;US20160208021中之標識符37 |
緊密連接蛋白 | WO2016073649A1中之標識符11、5、7、9;WO2014179759A1中之標識符17 |
緊密連接蛋白6 | WO2016115482A1中之標識符164 |
緊密連接蛋白7 | WO2016115482A1中之標識符165 |
緊密連接蛋白8 | WO2016115482A1中之標識符166 |
CLDN6 | WO2016150400中之標識符2 |
CLDN7 | WO2016150400中之標識符4 |
CLDN8 | WO2016150400中之標識符6 |
CLL1 | WO2016014535中之標識符39、40、41、42、43、44、45、46、48、49、50、51;US20160311907A1中之標識符200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213 |
CMet | US20040166544中之標識符11、12、13、14、15、16、17、18、19、2、21、22、23、25、26、27、28、3、30、31、33、34、35、36、37、38、39、4、40、41、42、43、44、48、49、5、50、51、52、53、54、55、56、57、58、6、60、7、9、29;US20150299326中之標識符26、27、28、29、30、32;US20130034559中之標識符32 |
CS1 | WO2016090369之標識符1;WO2014179759A1中之標識符17 |
CSPG4 | WO2015080981中之標識符2;EP3074025A1中之標識符2 |
CXCR4 | US20110020218中之標識符83、85、86、89 |
E7MC | WO2016182957A1中之標識符223、224、225、226、227、228、229、230、231、232 |
EGFR | WO2014130657中之標識符11、38、41、44、47、50、53、56、59、62、65、68、71、74、77、80、83、88、91、94 |
EGFR VIII | US20140037628中之標識符5;US20160311907A1中之標識符174;US9394368B2中之標識符38;US20160200819A1中之標識符5 |
END 0180 | WO2013098813中之標識符6 |
ERBB2 | US20110059076A1中之標識符26、27;US7244826中之標識符1、2 |
ESKAVT | WO2016115482A1中之標識符173 |
FcRL | WO2016090337中之標識符11、15、19、23、27、31、35、39、3、43、7、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、680、682、684、686、688、690、692、694、696、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、650、678 |
葉酸受體 | US20170002072A1中之標識符15 |
葉酸受體α | WO2012099973中之標識符15、23 |
FOLRl/CD3雙專一性 | WO2014144722A2中之標識符90 |
GCN4 | WO2016168773 A3中之標識符165、166、167、168、169、170 |
GD2 | WO2016134284中之標識符19、20、21;WO2015132604中之標識符8 |
GPC3 | WO2016049459中之標識符1;US20160208015A1中之標識符12 |
GPC4 | WO2016049459中之標識符24 |
GPRC5D | WO2016090312中之標識符100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123,301、313、325、337、349、361、373、385 |
HER2/CD3 | WO2014144722 A2中之標識符9 |
人類CD79b | WO2016112870中之標識符33 |
人類膠原蛋白VII | WO2016112870中之標識符34 |
IL4 | WO2009121847中之標識符17、16 |
整合素二價 | WO2009070753中之標識符2、1 |
伊派利單抗 | US20160208021中之標識符39;WO2016112870中之標識符39 |
Mec/CD3雙專一性 | WO2014144722A2中之標識符78 |
間皮素 | WO2015188141中之標識符7;WO2016090034中之標識符NO 47、46、57、48、49、50、51、53、54、55、56、58、59、62、64、65、66、67、68、69、70、52、60、61、63;WO2013142034中之標識符10、11、12;WO2013063419中之標識符11 |
MUC1 | US20160130357中之標識符15 |
MUC2 | US20160130357中之標識符17 |
MUC3 | US20160130357中之標識符15 |
MUC4 | US20160130357中之標識符17 |
納武單抗 | US20160208021中之標識符38;WO2016112870中之標識符38 |
NYBR1 | US20160333422A1中之標識符21;WO2015112830中之標識符21、18、19 |
O-乙醯化GD2神經節苷脂 | US20150140023中之標識符29、31 |
OX40 | US20150190506中之標識符33 |
PD1 | US20160311917A1中之標識符39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61 |
PDK1 | WO2016090365中之標識符15 |
PDL1奈米抗體 | US20110129458中之標識符22、23、24、25、26、27 |
PDL2奈米抗體6462 | US20110129458中之標識符28、29、30、31、32、33 |
PRAME | WO2016191246A2中之標識符63、64、65、66、67、68、69 |
PSMA | WO2012145714中之標識符19、21、30、31、34、35 |
PSMA雙功能抗體 | WO2011069019中之標識符12、13、14、15 |
放射誘導性新抗原 | WO2005042780A1中之標識符22、24 |
雷珠單抗 | US20160208021中之標識符40;WO2016112870中之標識符40 |
RAS | WO2016154047中之標識符81 |
利妥昔單抗 | US20160208021中之標識符36;WO2016112870中之標識符36 |
RORI | EP3083691A2中之標識符34;US20160208018A1中之標識符249、250 251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268;EP3083671A1中之標識符57;US20160304619A1中之標識符1、2;WO2015092024A2中之標識符34 in |
替利珠單抗 | WO2016112870中之標識符42 |
替利珠單抗(經突變) | US20160208021中之標識符42 |
TOSO | EP3098237A1中之標識符2 |
曲妥珠單抗 | US20160208021中之標識符35;WO2016112870中之標識符35 |
TRBC1 | WO2015132598中之標識符13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、3 |
TRBC2 | WO2015132598中之標識符23、24、25、26、27、28、29、30、31、32 |
TSLPR | US20160311910A1中之標識符1、2;WO2015084513中之標識符1、2 |
VEGF | US20160090427中之標識符168、169、170、171、172、173、174、175;US20110177074A1中之標識符498、500、502、504、506、508 |
VEGFR2 | US20120213783中之標識符1、2 |
WT1/HLA雙專一性 | WO2015070061中之標識符108、113、18、36、54、72、90 |
抗原目標 | 來源之實例 |
酸/鹼白胺酸拉鏈 | WO2016124930中之標識符34、35 |
ALK | WO2015069922中之標識符43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、84、85、86、87、88、89、90 |
APRIL基CAR | US20160296562A1中之標識符53;US20160296562A1中之標識符52 |
BCMA | WO2016168595A1中之標識符180、162、168、174、144、150、186、192、198、204、210、156、216、222、228、234、240、246、252、258、264、270、276、330、282、300、306、336、354、288、312、294、342、324、318、348;WO2015158671A1中之標識符48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42;WO2016014565中之標識符124、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、125、126、127、128、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、267、268、269、270;WO2015052538中之標識符1、2、3、4、5、20;US20160237139A1中之標識符1、2、3、4、5、6;WO2016094304 A3中之標識符9;WO2013154760中之標識符4、5、6、8、9、10、11、12;WO2016014789中之標識符15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、71、73;WO2016120216中之標識符125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、145、146、147、148、149、150;WO2016097231中之標識符102、106、107、108、109、110、111、112、129、130、131、132、133、134、135、136、113、114、115、116、117、118、101、100、137、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、103、104、105、213 |
CAR及閘(CD19及CD33) CD148磷酸酶 | US20160296562中之標識符2 |
CAR及閘(CD19及CD5) | US20160296562中之標識符43 |
CAR及閘(CD19及EGFR VIII) | US20160296562中之標識符45 |
CAR及閘(CD19及GD2) | US20160296562中之標識符41 |
CAR及閘(CD19或CD33) CD45磷酸酶 | US20160296562中之標識符3 |
CAR及閘(CD19而非CD33) | US20160296562中之標識符4、5 |
CAR而非閘(CD19而非CD33) | US20160296562A1中之標識符6 |
CAR而非閘1 | US20160296562中之標識符48 |
CAR而非閘2 | US20160296562中之標識符49 |
CAR而非閘3 | US20160296562中之標識符50 |
CAR或閘(DC19或DC33) | US20160296562中之標識符1 |
具有CD28 ζ胞內域之CAT19 CAR | WO2016139487中之標識符12 |
具有OX40 ζ胞內域之CAT19 CAR | WO2016139487中之標識符11 |
CAT19,坎帕納架構 | WO2016139487中之標識符10 |
CD123 | WO2016142532中之標識符69;WO2015140268A1中之標識符23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、44、45、46、47、48;US20140271582中之標識符9、10、11、12;WO2016097231中之標識符56、57、58、59、60、61;WO2016028896中之標識符98、99、100、101、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156;WO2016120220中之標識符31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、193、194、195、196、197;WO2016120216中之標識符1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、142 |
CD19 | US9499629B2中之標識符12;US20160333108A1中之標識符24;US20160333108A1中之標識符25、29;US20160333108A1中之標識符27;EP2997134A4中之標識符1;EP3071687A1中之標識符19、20;WO2016168773A3中之標識符181;WO2015157399A9中之標識符2;WO2016174409A1中之標識符56、62;WO2016179319A1中之標識符145、293、294、295、296、297、298;WO2013176915A1中之標識符73;WO2013176916A1中之標識符73;US20130315884A1中之標識符73;US20140134142A1中之標識符73;US20150017136A1中之標識符73;US20150203817A1中之標識符73;US20160120905A1中之標識符73;US20160120906A1中之標識符73;WO2015124715中之標識符8、5;WO2014184744中之標識符73;WO2014184741中之標識符73;US20160145337A1中之標識符14、15;WO2014184143中之標識符14、15;WO2015075175中之標識符15、16;US20160145337A1中之標識符16;WO2014184143中之標識符16;WO2012079000中之標識符12;WO2016164580中之標識符31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、58;US20160296563A1中之標識符14、15;WO2015157252中之標識符31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42;WO2016139487中之標識符14、15;US20160250258A1中之標識符53、54、55、56、57、58;WO2015187528中之標識符1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13;WO2015157252中之標識符31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、58;WO2014153270中之標識符31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42;WO2016134284 (無標識符);WO2016139487中之標識符13 |
CD19或CD33 | WO2015075468中識別CD19或CD33之標識符1 |
CD19/CD20雙專一性 | WO2016164731A2中之標識符1308;US9447194B2中之標識符2、8、11 |
CD19/IL13雙專一性 | US20160340649A1中之標識符10 |
CD2 | WO2016138491中之標識符10、11 |
CD20 | WO2015157399A9中之標識符25;WO2016097231中之標識符177、181、182、183、184、185、186、187、205、206、207、208、209、210、211、188、189、190、191、192、193、176、212、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、178、179、180 |
CD22 | WO2016164731A2中之標識符380、204、260、266、272、278、284、290、296、302、308、341、213、320、326、332、338、347、350、356、362、368、374、219、386、392、398、404、410、416、421、427、225、230、1109、236、242、248、254;WO2013059593中之標識符15、16、17、18、19、20、32;US20150299317中之標識符22、23、24 |
CD22/CD19雙專一性 | WO2016149578中之標識符29、30;WO2016164731A2中之標識符1304 |
CD276 | US20160053017中之標識符39、40、41、42、43、44、45、46、47、122、123、124、125、126、127、128、129、130 |
CD3 | WO2016138491中之標識符12 |
CD30 | WO2016008973A1中之標識符20;WO2016116035A1中之標識符1;WO2016134284 (無標識符);WO2016008973中之標識符2 |
CD33 | WO2016014576中之標識符48、49、50、51、52、53、54、55、83;WO2015150526A2中之標識符19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71 |
CD38 | WO2016097231中之標識符70、71、72、64、65、66、67、68、69;WO2015121454中之標識符35、36、37 |
CD4 | WO2016138491中之標識符13、14 |
CD410 | EP3074419A2中之標識符7 |
CD435 | EP3074419A2中之標識符5 |
CD44 | WO2016042461A1中之標識符21、22、23、24、25、26、27、28、31、32、33、34、35 |
CD4-DDY3 | EP3074419A2中之標識符9 |
CD5 | WO2016138491中之標識符15、13 |
CD52 | WO2016138491中之標識符18 |
CD7 | WO2016138491中之標識符17 |
CD70 | WO2015121454中之標識符99 |
CD70 | WO2015121454中之標識符100、93、94、96、101、95、97、98 |
CD8莖APRIL | US20160296562A1中之標識符51 |
CEA | WO2016008973A1中之標識符4;US20140242701A中之標識符29、30 |
CLDN6 | WO2016150400中之標識符22、23、24 |
CLL1 | WO2016179319A1中之標識符148;WO2016120218中之標識符35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112;WO2016014535中之標識符91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、197 |
COM22 | US20160297884A1中之標識符358、359、360 |
CS1 | WO2015121454中之標識符55、57、60、54、56、48、49、50、51、52、53、58、59、61、62;WO2014179759A1中之標識符28 |
DDD1/AD1拉鏈 | WO2016124930中之標識符37 |
DDD1/AD1基拉鏈 | WO2016124930中之標識符36 |
EGFR | WO2014130657中之標識符3、2;US20140242701 A中之標識符36、37、38、39、35;WO2014130657中之標識符43、96、49、55、61、67、73、79、85、90、1 |
EGFR vIII | WO2016016341中之標識符15、16、17、18、24、25、26、27;US20160311907A1中之標識符5、10、12、8、31、30、3;US20160200819A1中之標識符10;US9394368B2中之標識符43、49、55、61、67、73、79、85、90、96;US20170008963A1中之標識符49、55、61、67、73、79、85、90、2、1;US20140037628中之標識符10、11 |
FcRL5 | US20170008963A1中之標識符11 |
葉酸受體 | US20170008963A1中之標識符12 |
FR | US20170002072A1中之標識符22 |
FRβ | US9402865B2中之標識符13、22;US9446105B2中之標識符2、4、6 |
FRa | US20120213783中之標識符13、14 |
Fra | WO2016090337中之標識符959;US20170002072A1中之標識符13 |
GCN4 | US9446105B2中之標識符8、10 |
GD2 | US9446105B2中之標識符12;WO2016168773A3中之標識符273、274;WO2015132604中之標識符26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37;WO2016134284 (無標識符) |
GD3 | WO2016185035A1中之標識符19;WO2016185035A1中之標識符20、21、22、23、24、25、26;WO2016134284 (無標識符) |
GFRα | WO2016185035A1中之標識符27 |
GPC3 | WO2016185035A1中之標識符28、29;WO2016049459中之標識符3、27、10、29、14、30、31、18、33;US20160215261A1中之標識符22 |
HER2 | US20160215261A1中之標識符25;WO2016073629中之標識符9、10;US20160333114A1中之標識符17、28、98、110;WO2016168773A3中之標識符271、272;WO2016168769A1中之標識符5 |
Herl/Her3雙專一性 | US20160215261A1中之標識符23、24 |
HERVK | WO2016168769A1中之標識符6 |
HIV Env | WO2016168766A1中之標識符48、49;EP2997134A4中之標識符4;WO2015077789中之標識符7、9、47、49 |
HSP70 | WO2015077789中之標識符51、53、5;WO2016120217中之標識符21、22、23、24、25、26、27、28、29 |
IL13 | WO2016120217中之標識符30、31、32 |
IL13Ra2專一性 | WO2016089916A1中之標識符4、5、6;WO2016123143中之標識符47、49;WO2016123143中之標識符51、53、55;US20160340649A1中之標識符1、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45 |
KMA | US20160340649A1中之標識符46 |
間皮素 | US20160340649A1中之標識符47、48;US20160340649A1中之標識符48;WO2016172703A2中之標識符27;WO2013142034中之標識符18、19、20、21、22、23;WO2013067492中之標識符3 |
MUC1 | WO2013063419中之標識符5、7;US20160340406A1中之標識符51;US20160130357中之標識符30、32、34;WO2016130726中之標識符295、298、301、304、307、607、609、611、613 |
具有RQR82 ACD 19之NCAR | WO2016130726中之標識符615 |
NYBR1 | WO2016130726中之標識符617、619;WO2016097231中之標識符218;WO2015112830中之標識符26、29、60;US20160333422A1中之標識符1 |
P5A | US20160333422A1中之標識符26、29、60 |
P5AC1 | US20160297884A1中之標識符343、344、345、346 |
P5AC16 | US20160297884A1中之標識符347、396、348 |
P6AP | US20160297884A1中之標識符349、350、351 |
P6DY | US20160297884A1中之標識符364、365、366 |
PC1C12 | US20160297884A1中之標識符352、353、354 |
PCI | US20160297884A1中之標識符361、362、363 |
PD1 | US20160297884A1中之標識符355、356、357;WO2014153270中之標識符119 WO2014153270中之標識符121;US20160311917A1中之標識符22、24、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86;WO2016172537A1中之標識符26、39;US20160311907A1中之標識符40;WO2015157252中之標識符121、119;WO2016014565中之標識符24;WO2016014565中之標識符22 |
PD1 | WO2016014565中之標識符23;WO2015142675中之標識符26 |
PSMA | WO2015142675中之標識符39;US20160311907A1中之標識符28、29;WO2016097231中之標識符140、144、145、146、147、148、149、150、167、168、169、170、171、172、173、174、151、152、153、154、155、156、139、138、175、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、141、142、143、214 |
ROR1 | WO2016097231中之標識符216、217、215;WO2016016344A1中之標識符79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、127、128、129、130、131,132、133,134、1335、136、137、138、97、98、99、100、101、102、121、122、123、124、125、126;WO2016187216A1中之標識符386、387、388、389、390、391、392、393、394 |
SNAP | WO2016187216A1中之標識符395 |
SSEA4 | WO2016187216A1中之標識符396、397 |
Tan | US20160311907A1中之使用CD45磷酸酶識別CD19及CD33之標識符19;WO2016026742A1中之使用CD148磷酸酶識別CD19及CD33之標識符5;WO2016026742A1中之識別CD19而非CD33之標識符6且係基於含有來自LAIR1之胞內域之ITIM;WO2015075468中之基於PTPN6磷酸酶識別CD19而非CD33之標識符3;WO2015075468中之識別CD19而非CD33之標識符2且將PTPN6/CD148融合蛋白質募集至含有胞內域之ITIM |
TOSO | WO2015075468中之標識符5、4 |
滋胚層糖蛋白5T4 | WO2015075468中之標識符6;US20160347854A1中之標識符4;EP3098237A1中之標識符4;WO2016034666A1中之標識符19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39 |
TSLPR | WO2016034666A1中之標識符40、41、42;WO2015084513中之標識符39、40、41、42、43、44、45、46;US20160311910A1中之標識符39、40、41、42、43 |
VEGFR2 | US20160311910A1中之標識符44、45、46;US20120213783中之標識符10、11、12 |
VNAR | US20160333094A1中之標識符105、106、107、108、109、110 |
在各種實施例中,本發明之arCAR系統中所用之scFv片段可包括VH與VL域之間的連接子。連接子可為肽連接子且可包括任何天然存在之胺基酸。可包括於連接子中之例示性胺基酸為Gly、Ser、Pro、Thr、Glu、Lys、Arg、Ile、Leu、His及The。連接子應具有足以使VH與VL連接之長度,以使得其相對於彼此形成正確的構形,從而使其保持所需活性,諸如結合至抗原。連接子可為約5-50個胺基酸長。在一些實施例中,連接子為約10-40個胺基酸長。在一些實施例中,連接子為約10-35個胺基酸長。在一些實施例中,連接子為約10-30個胺基酸長。在一些實施例中,連接子為約10-25個胺基酸長。在一些實施例中,連接子為約10-20個胺基酸長。在一些實施例中,連接子為約15-20個胺基酸長。可使用之例示性連接子為富含Gly之連接子、含有Gly及Ser之連接子、含有Gly及Ala之連接子、含有Ala及Ser之連接子及其他柔性連接子。
在一個實施例中,連接子為Whitlow連接子。在一個實施例中,Whitlow連接子包含SEQ ID NO: 3中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 3具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。在另一實施例中,連接子為(G
4S)
3連接子。在一個實施例中,(G
4S)
3連接子包含SEQ ID NO: 25中所列之胺基酸序列或與SEQ ID NO: 25具有至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性之其變體。
其他連接子序列可包括源於任何免疫球蛋白重鏈或輕鏈同型之免疫球蛋白鉸鏈區、CL或CH1之部分。可使用之例示性連接子包括表1中之SEQ ID NO: 26-56中之任一者。其他連接子描述於例如國際專利公開案第WO2019/060695號中,該專利以全文引用之方式併入本文中。
在一些實施例中,第二多肽包含N端處之抗原結合域及C端處之標記。在一些實施例中,第二多肽包含C端處之抗原結合域及N端處之標記。
在一些實施例中,第二多肽為可溶性多肽。
在一些實施例中,arCAR系統進一步包含一或多種額外多肽,其各自包含(a)結合至獨特抗原之抗原結合域及(b)由第一多肽之標記結合域識別之標記。
在另一態樣中,本文提供一種包含兩種或更多種本文所描述之arCAR的arCAR系統,其中各arCAR包含一對獨特的標記及標記結合域。
在其他態樣中,本文提供一種本文所描述之arCAR之多肽。在一個態樣中,本文提供一種本文所描述之arCAR之第一多肽。在一個態樣中,本文提供一種本文所描述之arCAR之第二多肽。
不希望受理論所束縛,本發明之arCAR系統可具有各種優點,包括:
● 抗ID分子/抗體片段之高度專一性使非目標相互作用降至最低,特定言之,與非人類蛋白質目標組合使抗體專一性降至最低。
● 對標記上之結合環之專一性避免與類似構架/骨架蛋白質之非所需相互作用。亦可使用中和與目標之結合的真實ID。
● 開發一系列親和力之固有能力以最佳化且調節「標記」多肽及CAR相互作用。
● 該系統在可能的配對中不受限制,使得可開發多個最佳化CAR/「標記」多肽對,其各自具有獨特專一性以能夠實現目標療法,包括調節結合親和力、邏輯閘控、每個細胞多個專一性及每種治療多個可溶性藥物。
● 該方法為「平台不可知的」,若對一個骨架產生免疫原性或其他限制,則其允許併入不同骨架(例如用VHH替換scFv)。
聚核苷酸及載體
在另一態樣中,本文提供編碼本發明之arCAR系統中之一或多種多肽的聚核苷酸。
在一些實施例中,本文提供一種編碼本發明之arCAR系統之第一多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,本文提供一種編碼本發明之兩種或更多種arCAR系統之第一多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR系統各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在一些實施例中,本文提供一種編碼本發明之arCAR系統之第二多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,本文提供一種編碼本發明之兩種或更多種arCAR系統之第二多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR系統各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在一些實施例中,本文提供一種編碼本發明之arCAR系統之兩種多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,聚核苷酸編碼本發明之兩種或更多種arCAR系統之兩種多肽。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR系統各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
聚核苷酸可包含任何類型之核苷酸,包括(但不限於)可為單股或雙股、合成的或自天然來源中部分獲得且可含有天然、非天然或經改變之核苷酸的DNA及RNA。聚核苷酸可包含天然存在或非天然存在之核苷酸間鍵或兩種類型之鍵。
在一些實施例中,本文所描述之聚核苷酸為DNA分子。在各種實施例中,本文所描述之聚核苷酸為RNA分子。
在一個態樣中,本發明提供包含本文所描述之聚核苷酸的重組載體。
在一些實施例中,重組載體包含編碼本發明之arCAR系統之第一多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,重組載體包含編碼本發明之兩種或更多種arCAR之第一多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在一些實施例中,重組載體包含編碼本發明之arCAR系統之第二多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,重組載體包含編碼本發明之兩種或更多種arCAR之第二多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在一些實施例中,重組載體包含編碼本發明之arCAR系統之兩種多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,重組載體包含編碼本發明之兩種或更多種arCAR之兩種多肽的聚核苷酸。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
重組表現載體可為任何合適的重組表現載體。適合的載體包括經設計用於增殖及擴增或用於表現或用於這兩者的彼等載體,諸如質體及病毒。舉例而言,載體可選自pUC系列(Fermentas Life Sciences, Glen Burnie, Md.)、pBluescript系列(Stratagene, LaJolla, Calif.)、pET系列(Novagen, Madison, Wis.)、pGEX系列(Pharmacia Biotech, Uppsala, Sweden)及pEX系列(Clontech, Palo Alto, Calif.)。亦可使用噬菌體載體,諸如λGT10、λGT11、λZapII (Stratagene)、λEMBL4及λNM1149。適用於本發明之上下文中之植物表現載體之實例包括pBI01、pBI101.2、pBI101.3、pBI121及pBIN19 (Clontech)。適用於本發明之上下文中之動物表現載體之實例包括pcDNA、pEUK-Cl、pMAM及pMAMneo (Clontech)。在一些實施例中,雙順反子IRES載體(例如來自Clontech)可用於包括編碼本文所描述之arCAR系統之第一多肽及第二多肽的聚核苷酸。
在一些實施例中,重組載體為非病毒載體。病毒載體可為質體或轉座子(諸如PiggyBac轉座子或Sleeping Beauty轉座子)。在一個實施例中,載體為質體。
在一些實施例中,重組載體為病毒載體。適合的病毒載體包括(但不限於):反轉錄病毒載體、慢病毒載體、α病毒載體、腺病毒載體、腺相關病毒載體(AAV)、疱疹病毒載體、疫苗載體及家禽痘病毒載體。在一些實施例中,病毒載體具有天然或經工程改造之能力以轉化宿主細胞(例如T細胞)。
可使用描述於以下之標準重組DNA技術製備重組載體:例如Sambrook等人, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 第3版, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. 2001;及Ausubel等人, Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons, NY, 1994。環狀或線性之表現載體的構築體可經製備以含有在原核或真核宿主細胞中起作用之複製系統。複製系統可衍生自例如ColEl、2μ質體、λ、SV40、牛乳突狀瘤病毒及其類似者。
重組載體可包括一或多個標誌物基因,其允許選擇經轉化或經轉染之宿主。標誌物基因包括殺生物劑抗性(例如,對抗生素、重金屬等具有抗性),營養缺陷型宿主中之互補以提供原營養及其類似者。用於重組表現載體之適合的標誌物基因包括例如新黴素/G418抗性基因、嘌呤黴素抗性基因、潮黴素抗性基因、組胺醇抗性基因、四環素抗性基因及安比西林(ampicillin)抗性基因。
適用於本發明之上下文中之載體可為「裸」核酸載體(亦即,具有極少或無蛋白質、糖及/或脂質囊封其之載體),或與其他分子複合之載體。可適合地與載體組合之其他分子包括(不限於):病毒塗層、陽離子型脂質、脂質體、多元胺、金粒子及靶向部分,諸如靶向細胞分子之配位體、受體或抗體。
載體DNA可經由習知轉化或轉染技術引入宿主細胞,例如免疫效應細胞中。如本文所用,術語「轉化」及「轉染」係指將外來核酸(例如DNA)引入細胞中之多種此項技術中公認的技術,包括磷酸鈣或氯化鈣共沈澱、DEAE-聚葡萄糖介導之轉染、脂質體轉染、基因槍或電穿孔。
在各種實施例中,編碼arCAR多肽(例如第一多肽或第二多肽)之聚核苷酸可操作地連接至至少調節元件。調節元件可能夠介導arCAR多肽(例如第一多肽或第二多肽)在宿主細胞中之表現。調節元件包括(但不限於):啟動子、強化子、起始位點、聚腺苷酸化(polyA)尾、IRES元件、反應元件及終止信號。在某些實施例中,調節元件調節arCAR多肽表現。在某些實施例中,調節元件增加arCAR多肽(例如,第一多肽或第二多肽)之表現。在某些實施例中,調節元件在宿主細胞經活化後即增加arCAR多肽(例如,第一多肽或第二多肽)之表現。在某些實施例中,調節元件減少arCAR多肽(例如第一多肽或第二多肽)之表現。在某些實施例中,調節元件在宿主細胞經活化後即減少arCAR多肽(例如,第一多肽或第二多肽)之表現。
經修飾之宿主細胞
在一個態樣中,本文提供經修飾以表現本發明之arCAR之多肽中之一或多種的宿主細胞。
在一些實施例中,本文提供一種宿主細胞,其為包含本發明之arCAR系統之第一多肽的免疫效應細胞。在一些實施例中,本文提供一種包含本發明之兩種或更多種arCAR之第一多肽的宿主細胞在一些實施例中,兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在一些實施例中,本文提供一種包含本發明之arCAR之第二多肽的宿主細胞。在一些實施例中,本文提供一種包含本發明之兩種或更多種arCAR之第二多肽的宿主細胞。在一些實施例中,兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在一些實施例中,本文提供一種包含本發明之arCAR之第一及第二多肽兩者的宿主細胞。
在一些實施例中,本文提供一種包含本文所描述之聚核苷酸或重組載體的宿主細胞。
在各種實施例中,具有包含第一多肽之嵌合抗原受體的細胞為免疫效應細胞。在一些實施例中,細胞為T細胞、自然殺手(NK)細胞、細胞毒性T淋巴細胞(CTL)、調節T細胞、腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)、樹突狀細胞或巨噬細胞。
在一些實施例中,免疫效應細胞衍生自幹細胞。在一些實施例中,細胞為誘導性富潛能幹細胞(iPSC)、造血幹細胞(HSC)或胚胎幹細胞(ESC)。在一些實施例中,細胞為iPSC。在一個實施例中,細胞為衍生自iPSC之T細胞。在一個實施例中,細胞為衍生自iPSC之NK細胞。
在一個態樣中,本文提供製備本文所描述之經修飾之宿主細胞的方法。
在一個實施例中,製備經修飾之宿主細胞之方法包含將編碼本發明之arCAR之第一多肽的聚核苷酸或包含聚核苷酸之重組載體引入細胞中。
在一個實施例中,製備經修飾之宿主細胞之方法包含將編碼本發明之arCAR之第二多肽的聚核苷酸或包含聚核苷酸之重組載體引入細胞中。
在一個實施例中,製備經修飾之宿主細胞之方法包含將編碼本發明之arCAR之第一多肽及第二多肽兩者的聚核苷酸或包含聚核苷酸之重組載體引入細胞中。
在各種實施例中,經修飾之細胞組成性表現本文所描述之arCAR之第一多肽。在各種實施例中,經修飾之細胞誘導性表現本文所描述之arCAR之第一多肽。
在各種實施例中,經修飾之細胞組成性表現本文所描述之arCAR之第二多肽。在各種實施例中,經修飾之細胞誘導性表現本文所描述之arCAR之第二多肽。
在各種實施例中,宿主細胞可為自體(autologous/autogenic) (「自身」)或非自體(或「非自身」,例如同種異體、同基因型或異種)。在一些實施例中,宿主細胞係自哺乳動物個體獲得。在一些實施例中,宿主細胞係自靈長類個體獲得。在一些實施例中,宿主細胞係自人類個體獲得。
在某些實施例中,使用免疫細胞,諸如淋巴細胞。淋巴細胞可自諸如(但不限於)周邊血液單核細胞、骨髓、淋巴結組織、臍帶血、胸腺組織、來自感染位點之組織、腹水、肋膜積液、脾組織及腫瘤之來源獲得。淋巴細胞亦可藉由幹細胞分化產生。在某些實施例中,淋巴細胞可使用熟習此項技術者通常已知之技術從自個體收集之血液獲得,該等技術諸如沈降,例如FICOLL™分離。
在某些實施例中,藉由血球分離術獲得來自個體之循環血液的免疫細胞。血球分離術裝置通常含有淋巴球,包括T細胞、單核球、粒細胞、B細胞、其他成核白血球、紅血球及血小板。在某些實施例中,藉由血球分離術收集之細胞可經洗滌以移除血漿部分且將細胞置於適當緩衝液或培養基中以用於後續處理。細胞可用PBS或用不具有鈣、鎂及大部分(若並非所有)二價陽離子之另一適合的溶液洗滌。洗滌步驟可藉由熟習此項技術者已知之方法實現,諸如(但不限於)使用半自動流通式離心機(例如Cobe 2991細胞處理器或Baxter CytoMate)。在洗滌之後,可將細胞再懸浮於多種生物相容性緩衝液、細胞培養介質或其他具有或不具有緩衝液之鹽水溶液中。
在某些實施例中,T淋巴細胞可藉由溶解紅血球及消耗單核球而與外周血液單核細胞(PBMC)分離。作為一實例,細胞可藉由經由PERCOLL™梯度進行之離心來分選。在某些實施例中,在分離PBMC之後,細胞毒性及輔助T淋巴細胞可在活化、擴增及/或基因修飾之前或之後分選為原始、記憶及效應T細胞亞群。
在某些實施例中,可富集T淋巴細胞。舉例而言,T淋巴細胞之特定亞群使用陽性或陰性選擇技術表現一或多種標誌物,諸如(但不限於):CD3、CD4、CD8、CD14、CD15、CD16、CD19、CD27、CD28、CD34、CD36、CD45RA、CD45RO、CD56、CD62、CD62L、CD122、CD123、CD127、CD235a、CCR7、HLA-DR或其組合。在某些實施例中,用於本發明之組合物中之T淋巴細胞並不表現或實質上並不表現以下標誌物中之一或多者:CD57、CD244、CD160、PD-1、CTLA4、TIM3及LAG3。
在某些實施例中,可富集NK細胞。舉例而言,使用陽性或陰性選擇技術表現一或多種標誌物(諸如(但不限於):CD2、CD16、CD56、CD57、CD94、CD122或其組合)的T淋巴細胞之特定亞群。
在某些實施例中,諸如誘導性富潛能幹細胞(iPSC)及胚胎幹細胞(ESC)之富潛能幹細胞(PSC)用於產生諸如NK細胞或T淋巴細胞之宿主細胞。人類iPSC及人類ESC可藉由此項技術中已知之各種方法產生。PSC (例如,iPSC或ESC)可藉由本發明之arCAR修飾,例如,藉由使細胞與編碼arCAR之多肽的聚核苷酸或重組載體接觸,且經工程改造之PSC可用於產生或生成包含本發明之arCAR的免疫細胞(例如,T細胞)。
iPSC可直接自成人細胞(例如體細胞)產生。iPSC可藉由將一組特定的富潛能性締合基因或「再程式化因子」引入給定細胞類型而衍生或產生。再程式化因子包括(但不限於):OCT4 (亦稱為「POU5FL」)、SOX2、cMYC及KLF4,其亦稱為Yamanaka因子。參見Takahashi, K; Yamanaka, S (2006). Cell 126 (4): 663-76。再程式化因子中之每一者可在功能上經相關轉錄因子、miRNA、小分子或甚至非相關基因(諸如譜系說明符)替換。在引入再程式化因子時,細胞開始形成類似於PSC之群落,該等群落可基於其形態、選擇其生長之條件或經由表面標誌物或報導基因之表現而分離。在某些實施例中,用於本發明之方法中之PSC為個體專一性的。
已知用於藉由使用Yamanaka因子(OCT4、SOX2、KLF4及cMYC)再程式化自各種類型之體細胞產生PSC的技術。舉例而言,將成熟淋巴細胞再程式化成iPSC係針對鼠類B細胞(Hanna等人, (2008) Cell, 133, 第250-264頁;Wada等人, (2011) Int. Immunol., 23, 第65-74頁)、針對鼠類T細胞及成熟NK T細胞(Watarai等人, (2010) J. Clin. Invest., 120, 第2610-2618頁)及針對人類T細胞(Loh等人, (2010) Cell Stem Cell, 7, 第15-19頁;Seki等人, (2010) Cell Stem Cell, 7, 第11-14頁)實現。iPSC可藉由使用全周邊單核細胞(PBMC或CD3
+細胞作為源細胞群體自人類T細胞產生(Loh等人, (2010) Cell Stem Cell, 7, 第15-19頁;Seki等人, (2010) Cell Stem Cell, 7, 第11-14頁;Staerk等人 (2010) Cell Stem Cell, 7, 第20-24頁;Brown等人, (2010) PloS One 5, e11373)。
為了達成宿主細胞組合物之足夠治療劑量,宿主細胞通常經歷一或多輪刺激/活化。在某些實施例中,產生用於投與個體之宿主細胞的方法包含在一或多種刺激信號或藥劑(例如化合物、小分子,例如小有機分子、核酸、多肽或其片段、同功異型物、變體、類似物或衍生物)存在下刺激宿主細胞以變得活化。在某些實施例中,產生用於向個體投與之宿主細胞之方法包含刺激宿主細胞以變得活化及在一或多種刺激信號或藥劑存在下增殖。
免疫細胞(例如,T淋巴細胞及NK細胞)可藉由誘導其生物狀態之變化而活化,藉由該變化細胞表現活化標誌物、產生細胞介素、增殖及/或變得對目標細胞具有細胞毒性。所有此等改變均可由初級刺激信號產生。在初始刺激之後,協同刺激信號擴大初級信號之量值且抑制細胞死亡,產生較持久的活化狀態且因此產生較高的細胞毒性能力。
T細胞可通常使用如例如美國專利6,352,694;6,534,055;6,905,680;6,692,964;5,858,358;6,887,466;6,905,681;7,144,575;7,067,318;7,172,869;7,232,566;7,175,843;5,883,223;6,905,874;6,797,514;及6,867,041中所描述之方法活化,該等專利中之每一者以全文引用之方式併入本文中。在某些實施例中,T細胞係藉由結合至活化CD3ζ之藥劑來活化。
在一些實施例中,CD2結合劑可用於向T細胞提供初級刺激信號。舉例而言而非限制,CD2藥劑包括(但不限於):CD2配位體及抗CD2抗體,例如Tl 1.3抗體與Tl 1.1或Tl 1.2抗體組合(Meuer, S. C.等人 (1984) Cell 36:897-906)及9.6抗體(其識別與TI 1.1相同之抗原決定基)與9-1抗體組合(Yang, S. Y.等人 (1986) J. Immunol. 137:1097-1100)。亦可使用與上文所描述之抗體中之任一者結合至相同抗原決定基之其他抗體。
在一些實施例中,免疫細胞係藉由投與佛波醇肉豆蔻酸乙酸酯(PMA)及離子黴素來活化。在某些實施例中,宿主細胞係藉由投與誘導活化且隨後擴增之適當抗原來活化。在某些實施例中,PMA、離子黴素及/或適當抗原與CD3一起投與以誘導活化及/或擴增。
一般而言,用於本發明中之活化劑包括(但不限於):抗體、其片段及具有抗體樣功能之蛋白質結合分子。(重組)抗體片段之實例為Fab片段、Fv片段、單鏈Fv片段(scFv)、二價抗體片段,諸如(Fab)2'片段、雙功能抗體、三功能抗體(Iliades, P.,等人, FEBS Lett (1997) 409, 437-441)、十功能抗體(Stone, E.,等人, Journal of Immunological Methods (2007) 318, 88-94)及其他域抗體(Holt, L. J.,等人, Trends Biotechnol. (2003), 21, 11, 484-490)。二價抗體片段可為(Fab)2'片段或二價單鏈Fv片段,而單價抗體片段可選自由以下組成之群:Fab片段、Fv片段及單鏈Fv片段(scFv)。
在某些實施例中,CD3ζ劑之一或多個結合位點可為二價蛋白質人工結合分子,諸如二聚脂質運載蛋白突變蛋白(亦即雙運載蛋白(duocalin))。在某些實施例中,受體結合試劑可具有單一第二結合位點(亦即,單價)。單價試劑之實例包括(但不限於):單價抗體片段、具有抗體樣結合特性之蛋白質結合分子或MHC分子。單價抗體片段之實例包括(但不限於):Fab片段、Fv片段及單鏈Fv片段(scFv),包括二價單鏈Fv片段。
專一性結合CD3之藥劑包括(但不限於):抗CD3抗體、抗CD3抗體之二價抗體片段、抗CD3抗體之單價抗體片段及具有抗體樣結合特性之蛋白質CD3結合分子。具有抗體樣結合特性之蛋白質CD3結合分子可為適體、基於脂質運載蛋白家族之多肽的突變蛋白、黏抗體、基於錨蛋白骨架之蛋白質、基於結晶骨架之蛋白質、阿德奈汀及高親和性多聚體。其亦可偶合至珠粒。
在某些實施例中,活化劑(例如CD3結合劑)可以約0.1 μg/ml至約10 μg/ml之濃度存在。在某些實施例中,活化劑(例如,CD3結合劑)可以約0.2 μg/ml至約9 μg/ml、約0.3 μg/ml至約8 μg/ml、約0.4 μg/ml至約7 μg/ml、約0.5 μg/ml至約6 μg/ml、約0.6 μg/ml至約5 μg/ml、約0.7 μg/ml至約4 μg/ml、約0.8 μg/ml至約3 μg/ml或約0.9 μg/ml至約2 μg/ml之濃度存在。在某些實施例中,活化劑(例如,CD3結合劑)係以約0.1 μg/ml、約0.2 μg/ml、約0.3 μg/ml、約0.4 μg/ml、約0.5 μg/ml、約0.6 μg/ml、約0.7 μg/ml、約0.8 μM、約0.9 μg/ml、約1 μg/ml、約2 μg/ml、約3 μg/ml、約4 μM、約5 μg/ml、約6 μg/ml、約7 μg/ml、約8 μg/ml、約9 μg/ml或約10 μg/ml之濃度投與。在某些實施例中,CD3結合劑可以1 μg/ml之濃度存在。
NK細胞可通常使用如例如美國專利7,803,376、6,949,520、6,693,086、8,834,900、9,404,083、9,464,274、7,435,596、8,026,097、8,877,182;美國專利申請案US2004/0058445、US2007/0160578、US2013/0011376、US2015/0118207、US2015/0037887;以及PCT專利申請案WO2016/122147中所描述之方法來活化,該等文獻中之每一者以全文引用之方式併入本文中。
在一些實施例中,NK細胞係藉由例如(且不限於) NK細胞上抑制受體(例如KIR2DL1、KIR2DL2/3、KIR2DL4、KIR2DL5A、KIR2DL5B、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3、LILRB1、NKG2A、NKG2C、NKG2E或LILRB5受體)之抑制來活化。
在某些實施例中,NK細胞係藉由例如(且不限於)飼養細胞(例如經基因修飾以表現4-1BBL之天然K562細胞或K562細胞及細胞介素,諸如IL15或IL21)來活化。
在其他實施例中,干擾素或巨噬細胞衍生之細胞介素可用於活化NK細胞。舉例而言,此類干擾素包括(但不限於)干擾素α及干擾素γ,且此類細胞介素包括(但不限於):IL-15、IL-2、IL-21。
在某些實施例中,NK活化劑可以約0.1 μg/ml約10 μg/ml之濃度存在。在某些實施例中,NK活化劑可以約0.2 μg/ml至約9 μg/ml、約0.3 μg/ml至約8 μg/ml、約0.4 μg/ml至約7 μg/ml、約0.5 μg/ml至約6 μg/ml、約0.6 μg/ml至約5 μg/ml、約0.7 μg/ml至約4 μg/ml、約0.8 μg/ml至約3 μg/ml或約0.9 μg/ml至約2 μg/ml之濃度存在。在某些實施例中,NK活化劑係以約0.1 μg/ml、約0.2 μg/ml、約0.3 μg/ml、約0.4 μg/ml、約0.5 μg/ml、約0.6 μg/ml、約0.7 μg/ml、約0.8 μM、約0.9 μg/ml、約1 μg/ml、約2 μg/ml、約3 μg/ml、約4 μM、約5 μg/ml、約6 μg/ml、約7 μg/ml、約8 μg/ml、約9 μg/ml或約10 μg/ml之濃度投與。在某些實施例中,NK活化劑可以1 μg/ml之濃度存在。
在某些實施例中,活化劑附接至固體載體,諸如(但不限於):珠粒、存在於培養盤或孔中之吸收劑聚合物或其他基質,諸如(但不限於)瓊脂糖或玻璃;可藉由熟習此項技術者已知之方式在天然或重組細胞株之細胞表面上表現(諸如以天然或重組形式)。
在某些實施例中,宿主細胞可在刺激/活化之後經基因修飾。在某些實施例中,宿主細胞在刺激/活化之12小時、16小時、24小時、36小時或48小時內經修飾。在某些實施例中,細胞在刺激/活化之後16至24小時內經修飾。在某些實施例中,宿主細胞在24小時內經修飾。在某些實施例中,宿主細胞可在刺激/活化之前經基因修飾。
為了基因修飾宿主細胞以表現本發明之arCAR,必須將arCAR聚核苷酸或重組載體轉移至宿主細胞中。聚核苷酸轉移可經由病毒或非病毒遞送方法進行。適用於與本發明方法一起使用之聚核苷酸傳遞的方法包括熟習此項技術者已知之任何方法,藉由該等方法聚核苷酸可引入細胞器、細胞、組織或生物體中。
在各種實施例中,離體進行基因修飾。各種方法可用於經由離體修飾自個體移除之轉染細胞及組織。舉例而言,活體外反轉錄病毒基因轉移可用於經基因修飾之細胞自個體移除且細胞轉移回至個體中。參見例如Wilson等人,
Science, 244:1344-1346, 1989及Nabel等人,
Science, 244(4910):1342-1344, 1989,該兩者均以全文引用之方式併入本文中。在某些實施例中,宿主細胞可自個體移除且使用本發明之聚核苷酸或重組載體離體轉染。在某些實施例中,自個體獲得之宿主細胞可經本發明之聚核苷酸或重組載體轉染或轉導,且隨後投與回至個體。
在一些實施例中,宿主細胞可經由反轉錄病毒轉導來轉導。描述基因之反轉錄病毒轉導之參考為Anderson等人, 美國專利第5,399,346號;Mann等人, Cell 33:153 (1983);Temin等人, 美國專利第4,650,764號;Temin等人, 美國專利第4,980,289號;Markowitz等人, J. Virol. 62:1120 (1988);Temin等人, 美國專利第5,124,263號;國際專利公開案第WO 95/07358號;及Kuo等人, Blood 82:845 (1993),該等文獻中之每一者以全文引用之方式併入本文中。
另一適合的基因轉移方法包括注射。在某些實施例中,聚核苷酸或重組載體可經由一或多次注射(例如針頭注射)遞送至細胞、組織或生物體。注射之非限制性方法包含注射組合物(例如基於鹽水之組合物)。聚核苷酸或重組載體亦可藉由直接顯微注射引入。注射之非限制性位點包括皮下、皮內、肌肉內、結節內(允許抗原直接遞送至淋巴組織)、靜脈內、前列腺內、腫瘤內、淋巴管內(允許直接投與DC)及腹膜內。應理解,注射製劑之恰當位點為必需的(例如刮去注射位點以觀測恰當針頭置放)。
電穿孔為另一適合的基因轉移方法。參見例如Potter等人, (1984)
Proc. Nat'l Acad. Sci. USA, 81, 7161-7165及Tur-Kaspa等人, (1986)
Mol. Cell Biol., 6, 716-718,該兩者出於所有目的全文併入本文中。電穿孔涉及細胞及DNA之懸浮液暴露於高電壓放電。在某些實施例中,可採用細胞壁降解酶(諸如果膠降解酶)使宿主細胞比未經處理之細胞更易於藉由電穿孔進行基因修飾。參見例如美國專利第5,384,253號,該專利出於所有目的以全文引用之方式併入本文中。
與本發明一起使用之電穿孔方法包括例如Sardesai, N. Y.及Weiner, D. B.,
Current Opinion in Immunotherapy23:421-9 (2011)以及Ferraro, B.等人,
Human Vaccines7:120-127 (2011),該兩者出於所有目的特此以全文引用之方式併入本文中。
核酸疫苗可用於將arCAR聚核苷酸或載體轉移至宿主細胞中。此類疫苗包括(但不限於):非病毒載體、「裸」DNA及RNA以及病毒載體。用此等疫苗基因修飾細胞及使包括於此等疫苗中之基因表現最佳化的方法為熟習此項技術者已知的。
基因轉移之其他方法包括經脂質體介導之轉染(例如截留於懸浮於過量水溶液中之脂質複合物中之聚核苷酸)。參見例如Ghosh及Bachhawat, (1991)
In: Liver Diseases, Targeted Diagnosis and Therapy Using Specific Receptors and Ligands. 第87-104頁。亦考慮與脂染胺或Superfect複合之聚核苷酸;DEAE-聚葡萄糖(例如使用DEAE-聚葡萄糖繼之以聚乙二醇將聚核苷酸遞送至細胞中,參見例如Gopal, T. V.,
Mol Cell Biol. 1985年5月; 5(5):1188-90);磷酸鈣(例如使用磷酸鈣沈澱物降聚核苷酸引入至細胞中,參見例如Graham及van der Eb, (1973)
Virology, 52, 456-467;Chen及Okayama,
Mol. Cell Biol., 7(8):2745-2752, 1987),及Rippe等人,
Mol. Cell Biol., 10:689-695, 1990);音波處理負載(藉由直接音波負載引入聚核苷酸,參見例如Fechheimer等人, (1987)
Proc. Nat'l Acad. Sci. USA, 84, 8463-8467);微彈轟擊(例如可將一或多個粒子塗佈有至少一種聚核苷酸且藉由推動力遞送至細胞中,參見例如美國專利第5,550,318號;美國專利第5,538,880號;美國專利第5,610,042;及PCT申請案WO 94/09699;Klein等人, (1987)
Nature, 327, 70-73, Yang等人, (1990)
Proc. Nat'l Acad. Sci.
USA, 87, 9568-9572);以及受體介導之轉染(例如藉由受體介導之內飲作用選擇性吸收大分子,其將使用不同受體之細胞類型專一性分佈在目標細胞中發生,參見例如Wu及Wu, (1987)
J. Biol. Chem., 262, 4429-4432;Wagner等人,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87(9):3410-3414, 1990;Perales等人,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91:4086-4090, 1994;Myers, EPO 0273085;Wu及Wu,
Adv. Drug Delivery Rev., 12:159-167, 1993;Nicolau等人, (1987)
Methods Enzymol., 149, 157-176),此處所引用之各參考文獻出於所有目的以全文引用之方式併入。
在其他實施例中,宿主細胞係使用基因編輯經同源定向修復(HDR)來基因修飾。同源定向修復(HDR)為細胞修復雙股DNA斷裂所用的機制。在HDR中,與雙股DNA斷裂位點同源之供體聚核苷酸用作修復經裂解DNA序列之模板,使得將遺傳資訊自供體聚核苷酸轉移至DNA。因此,新核酸材料可插入或複製至目標DNA裂解位點中。宿主細胞中之雙股DNA斷裂可藉由位點專一性核酸酶誘導。如本文所用之術語「位點專一性核酸酶」係指能夠專一性識別及裂解核酸(DNA或RNA)序列之核酸酶。適用於本發明中之位點專一性核酸酶包括(但不限於):RNA引導之核酸內切酶(例如CRISPR相關(Cas)蛋白)、鋅指核酸酶、TALEN核酸酶或兆-TALEN核酸酶。舉例而言,能夠在目標DNA序列中誘導雙股斷裂之位點專一性核酸酶(例如Cas9+嚮導RNA)以及編碼本發明之arCAR之多肽的供體聚核苷酸可引入宿主細胞中。
在活化及轉導宿主細胞之後,培養細胞以增殖。
T細胞可經1、2、3、4、5、6、7、8、9或10輪或更多輪持續至少1、2、3、4、5、6或7天,至少2週,至少1、2、3、4、5或6個月或更長時間之擴增來培養。
可用於擴增T細胞之藥劑可包括介白素,諸如IL-2、IL-7、IL-15或IL-21 (參見例如Cornish等人 2006, Blood. 108(2):600-8,Bazdar及Sieg, 2007, Journal of Virology, 2007, 81(22):12670-12674,Battalia等人, 2013, Immunology, 139(1):109-120)。可用於擴增T細胞之藥劑之其他說明性實例為結合至CD8、CD45或CD90之藥劑,諸如αCD8、αCD45或αCD90抗體。T細胞群體之說明性實例包括抗原專一性T細胞、T輔助細胞、細胞毒性T細胞、記憶T細胞(記憶T細胞之說明性實例為CD62L|CD8|專一性中樞記憶T細胞)或調節T細胞(Treg之說明性實例為CD4+CD25+CD45RA+ Treg細胞)。
可用於擴增T細胞之額外藥劑包括如例如美國專利6,352,694;6,534,055;6,905,680;6,692,964;5,858,358;6,887,466;6,905,681;7,144,575;7,067,318;7,172,869;7,232,566;7,175,843;5,883,223;6,905,874;6,797,514;及6,867,041中所描述之方法,該等專利中之每一者以全文引用之方式併入本文中。
在某些實施例中,用於擴增之一或多種藥劑(例如,IL-2)係以約20單位/ml至約200單位/ml投與。在某些實施例中,用於擴增之一或多種藥劑(例如,IL-2)係以約25單位/ml至約190單位/ml、約30單位/ml至約180單位/ml、約35單位/ml至約170單位/ml、約40單位/ml至約160單位/ml、約45單位/ml至約150單位/ml、約50單位/ml至約140單位/ml、約55單位/ml至約130單位/ml、約60單位/ml至約120單位/ml、約65單位/ml至約110單位/ml、約70單位/ml至約100單位/ml、約75單位/ml至約95單位/ml或約80單位/ml至約90單位/ml投與。在某些實施例中,用於擴增之一或多種藥劑(例如,IL-2)係以約20單位/ml、約25單位/ml、約30單位/ml、35單位/ml、40單位/ml、45單位/ml、約50單位/ml、約55單位/ml、約60單位/ml、約65單位/ml、約70單位/ml、約75單位/ml、約80單位/ml、約85單位/ml、約90單位/ml、約95單位/ml、約100單位/ml、約105單位/ml、約110單位/ml、約115單位/ml、約120單位/ml、約125單位/ml、約130單位/ml、約135單位/ml、約140單位/ml、約145單位/ml、約150單位/ml、約155單位/ml、約160單位/ml、約165單位/ml、約170單位/ml、約175單位/ml、約180單位/ml、約185單位/ml、約190單位/ml、約195單位/ml或約200單位/ml投與。在某些實施例中,用於擴增之一或多種藥劑(例如,IL-2)係以約5 mg/ml至約10 ng/ml投與。在某些實施例中,用於擴增之一或多種藥劑(例如,IL-2)係以約5.5 ng/ml至約9.5 ng/ml、約6 ng/ml至約9 ng/ml、約6.5 ng/ml至約8.5 ng/ml或約7 ng/ml至約8 ng/ml投與。在某些實施例中,用於擴增之一或多種藥劑(例如,IL-2)係以約5 ng/ml、6 ng/ml、7 ng/ml、8 ng/ml、9 ng/ml或10 ng/ml投與。
NK細胞可經1、2、3、4、5、6、7、8、9或10輪或更多輪持續至少1、2、3、4、5、6或7天,至少2週,至少1、2、3、4、5或6個月或更長時間之擴增來培養。
可用於擴增NK細胞之藥劑可包括結合至CD16或CD56之藥劑,諸如αCD16或αCD56抗體。在某些實施例中,結合劑包括抗體(參見例如Hoshino等人, Blood. 1991年12月 15; 78(12):3232-40)。可用於擴增NK細胞之其他藥劑可為IL-15 (參見例如Vitale等人 2002. The Anatomical Record. 266:87-92,其出於所有目的以全文引用之方式併入本文中)。
適合於T細胞培養之條件包括適當培養基(例如最低必需培養基(MEM)、RPMI培養基1640、Lonza RPMI 1640、Advanced RPMI、Clicks、AIM-V、DMEM、a-MEM、F-12、TexMACS、X-Vivo 15及X-Vivo 20、Optimizer,其中添加胺基酸、丙酮酸鈉及維生素,無血清或補充有適當量之血清(或血漿)或已確定集合之激素及/或足以生長及擴增之一定量之一或多種細胞介素。
其他用於宿主細胞擴增之添加劑之實例包括(但不限於):界面活性劑、piasmanate、pH緩衝液(諸如HEPES)及還原劑(諸如N-乙醯基-半胱胺酸及2-巰基乙醇)、抗生素(例如青黴素及鏈黴素)僅包括於實驗培養物中,而不在待輸注至個體中之細胞培養物中。目標細胞保持於支持生長所必需之條件下,例如適當溫度(例如,37℃)及氛圍(例如,空氣加5% CO
2)。
在其中PSC (例如,iPSC或ESC)用作起始細胞群體之某些實施例中,該方法可進一步包含將PSC分化成免疫細胞,諸如T細胞。用於獲得源自iPSC之造血細胞譜系之適用的分化方法及組合物包括此項技術中,例如國際專利公開案第WO2017078807號及第WO2019112899號中所描述之彼等方法及組合物,該等專利公開案之揭示內容以引用之方式併入本文中。源自iPSC之造血譜系細胞可包括(但不限於):決定性溶血內皮、造血多潛能祖細胞、造血幹細胞及祖細胞、T細胞祖細胞、NK細胞祖細胞、T細胞、NK細胞、NKT細胞、B細胞、巨噬細胞及嗜中性白血球。
在一些實施例中,本發明亦提供純化本發明之arCAR之多肽的方法。在一些實施例中,該方法涉及自經修飾以表現arCAR之第二多肽之宿主細胞純化arCAR之第二多肽。在一些實施例中,arCAR之第二多肽為可溶性蛋白質。
醫藥組合物
在一個態樣中,組合物包含本文所描述之arCAR之一或多種多肽、聚核苷酸、包含其之載體及如本文所揭示之細胞組合物。在一些實施例中,本發明之組合物包括(但不限於)醫藥組合物。
在一個態樣中,本發明提供一種醫藥組合物,其包含本文所描述之arCAR之多肽及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含本文所描述之arCAR之第二多肽及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含本文所描述之兩種或更多種arCAR之第二多肽及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。
在另一態樣中,本發明提供一種醫藥組合物,其包含本文所描述之聚核苷酸或重組載體及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含編碼本文所描述之arCAR之第二多肽的聚核苷酸及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含編碼本文所描述之兩種或更多種arCAR之第二多肽的聚核苷酸及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含兩種或更多種各自編碼本文所描述之arCAR之第二多肽的聚核苷酸及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含有包含編碼本文所描述之arCAR之第二多肽的聚核苷酸的重組載體及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在一些實施例中,醫藥組合物包含有包含編碼本文所描述之兩種或更多種arCAR之第二多肽的聚核苷酸的重組載體及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。在各種實施例中,兩種或更多種arCAR各自包含一對獨特的標記及標記結合域。
在另一態樣中,本發明提供醫藥組合物,其包含本文所描述之經修飾之宿主細胞及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。
醫藥學載劑之實例包括(但不限於):無菌液體,諸如水及油,包括石油、動物、植物或合成來源之油,諸如花生油、大豆油、礦物油、芝麻油及其類似油。水或水溶液、鹽水溶液以及水性右旋糖及甘油溶液較佳用作載劑,特定言之用於可注射溶液。
包含本文所揭示之經修飾宿主細胞之組合物可包含緩衝液,諸如中性緩衝鹽水、磷酸鹽緩衝鹽水及其類似緩衝液;碳水化合物,諸如葡萄糖、甘露糖、蔗糖或葡聚糖、甘露糖醇;蛋白質;多肽或胺基酸,諸如甘胺酸;抗氧化劑;螯合劑,諸如EDTA或麩胱甘肽;佐劑(例如氫氧化鋁);及防腐劑。
包含本文所揭示之經修飾宿主細胞之組合物可包含以下中之一或多者:無菌稀釋劑(諸如注射用水)、鹽水溶液(較佳生理鹽水)、林格氏溶液(Ringer's solution)、等張氯化鈉、不揮發性油(諸如可充當溶劑或懸浮介質之合成單甘油酯或二甘油酯)、聚乙二醇、丙三醇、丙二醇或其他溶劑;抗菌劑,諸如苯甲醇或對羥基苯甲酸甲酯;抗氧化劑,諸如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉;螯合劑,諸如乙二胺四乙酸;緩衝液,諸如乙酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽及用於調節張力之試劑,諸如氯化鈉或右旋糖。
在一些實施例中,組合物經調配用於非經腸投與,例如血管內(靜脈內或動脈內)、腹膜內、瘤內、心室內、胸膜內或肌肉內投與。非經腸製劑可封裝於由玻璃或塑膠製成之安瓿、拋棄式注射器或多劑量小瓶中。可注射醫藥組合物較佳為無菌的。在一些實施例中,組合物在投與之前自凍乾製劑復原。
在一些實施例中,經修飾宿主細胞可在其投與之前與黏附或滲透之物質(例如(但不限於)奈米粒子)混合。
治療方法
在一些態樣中,本文提供使用本發明之arCAR治療疾病之方法。
在一個態樣中,本文提供一種治療有需要之個體之疾病的方法,其包含向該個體投與治療有效量之
(i) 包含嵌合抗原受體之免疫效應細胞,該嵌合抗原受體包含本文所描述之arCAR的第一多肽,及
(ii) 該arCAR之第二多肽或編碼該第二多肽之聚核苷酸或包含該第二多肽之宿主細胞。
在一些實施例中,該方法進一步包含投與一或多種額外多肽,其各自包含(a)結合至獨特抗原之抗原結合域及(b)由第一多肽之標記結合域識別之標記。
在另一態樣中,本文提供一種治療有需要之個體之疾病的方法,其包含向個體投與治療有效量之
(i) 包含嵌合抗原受體之免疫效應細胞,該等嵌合抗原受體包含兩種或更多種arCAR之第一多肽,其中該兩種或更多種arCAR係選自本文所描述之arCAR系統,及
(ii) 該兩種或更多種arCAR之第二多肽,或編碼該等第二多肽之一或多種聚核苷酸,或包含該等第二多肽之一或多種宿主細胞。
在本文所描述之治療方法之各種實施例中,細胞為免疫效應細胞。在一些實施例中,細胞為T細胞、自然殺手(NK)細胞、細胞毒性T淋巴細胞(CTL)、調節T細胞或腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)。在一些實施例中,細胞為T細胞。在一些實施例中,細胞衍生自iPSC。在各種實施例中,細胞組成性表現第一多肽。
在本文所描述之治療方法之各種實施例中,宿主細胞及/或一或多種多肽以亦包含如本文所描述之醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑的醫藥組合物形式投與。
在本文所描述之治療方法之各種實施例中,疾病為癌症。術語「癌症」、「惡性病」、「贅瘤」、「腫瘤」及「癌瘤」在本文中可互換地用於指代展現相對異常、不可控及/或自發生長之細胞,使得其展現表徵為明顯減輕細胞增殖之控制的異常生長表型。一般而言,本申請案中用於治療之所關注細胞包括癌變前(例如,良性)、惡性、轉移前、轉移性及非轉移性細胞。本發明之教示可與任何及所有癌症相關。為得到少數非限制性實例,在一些實施例中,本發明之教示應用於一或多種癌症諸如造血癌症,包括白血病、淋巴瘤(霍奇金氏及非霍奇金氏)、骨髓瘤及骨髓增生病;肉瘤、黑素瘤、腺瘤、固體組織癌瘤、口、咽喉、喉及肺之鱗狀細胞癌、肝癌;泌尿生殖癌,諸如前列腺、宮頸、膀胱、子宮及子宮內膜癌及腎細胞癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、皮膚或眼內黑素瘤、內分泌系統癌、甲狀腺癌、副甲狀腺癌、頭頸癌、乳癌、胃腸癌及神經系統癌;良性病變,諸如乳頭狀瘤及類似癌症。在一些實施例中,藉由本發明方法治療之癌症為實體腫瘤。在一些實施例中,藉由本發明方法治療之癌症為血液惡性病。
在一些實施例中,藉由本發明方法治療之癌症為神經膠母細胞瘤、卵巢癌、子宮頸癌、頭頸癌、肝癌、前列腺癌、胰臟癌、腎細胞癌、膀胱癌或血液惡性病。在一些實施例中,血液惡性病為白血病(例如,急性淋巴球性(ALL)、慢性淋巴球性(CLL)、急性骨髓(AML)、慢性骨髓(CML)、骨髓瘤或淋巴瘤(例如,霍奇金氏或非霍奇金氏(NHL))。
在本文所描述之治療方法之各種實施例中,疾病為自體免疫疾病或病症。在一些實施例中,自體免疫疾病或病症為類風濕性關節炎(RA)、多發性硬化症(MS)、休格連氏症候群、全身性紅斑狼瘡、類肉瘤病、1型糖尿病、胰島素依賴性糖尿病(IDDM)、自體免疫甲狀腺炎、反應性關節炎、僵直性脊椎炎、硬皮病、多發性肌炎、皮肌炎、牛皮癬、脈管炎、韋格納氏肉芽腫病、重症肌無力、橋本氏甲狀腺炎、格雷夫氏病、慢性發炎性脫髓鞘多發性神經病變、格-巴二氏症候群、克羅恩氏病或潰瘍性結腸炎。
當投與超過一種具有獨特抗原結合專一性之多肽時,該等方法可用於靶向相同疾病(例如腫瘤或自體免疫疾病)中之多種抗原(或相同抗原中之多種抗原決定基)或不同疾病(例如腫瘤或自體免疫疾病)中之多種抗原。
在一些實施例中,將經修飾免疫效應細胞及一或多種第二多肽或編碼該一或多種第二多肽之聚核苷酸或包含該一或多種第二多肽之一或多種宿主細胞同時投與。
在一些實施例中,將經修飾免疫效應細胞及一或多種第二多肽或編碼該一或多種第二多肽之聚核苷酸或包含該一或多種第二多肽之一或多種宿主細胞依序投與。舉例而言,一或多種第二多肽或編碼該一或多種第二多肽之一或多種聚核苷酸或包含該一或多種第二多肽之一或多種宿主細胞可在投與經修飾宿主細胞之前或之後投與。
在一些實施例中,免疫效應細胞為相對於接受治療之個體的自體細胞。在一些實施例中,免疫效應細胞為相對於接受治療之個體的同種異體細胞。當免疫效應細胞自供體分離時,該方法可進一步包括預防移植物抗宿主疾病(GVHD)及宿主細胞排斥反應之方法。
在一些實施例中,額外步驟可在向個體投與之前進行。舉例而言,免疫效應細胞可在使免疫效應細胞與本文所描述之聚核苷酸或重組載體(例如編碼arCAR之第一多肽的聚核苷酸或重組載體)接觸(例如轉導或轉染)之後,但在向個體投與之前活體外擴增。在向個體投與之前,可進行活體外擴增1天或更多天,例如2天或更多天、3天或更多天、4天或更多天、6天或更多天或8天或更多天。替代地或另外,活體外擴增可在向個體投與之前進行21天或更短,例如18天或更短、16天或更短、14天或更短、10天或更短、7天或更短或5天或更短。舉例而言,活體外擴增可在向個體投與之前進行1-7天、2-10天、3-5天或8-14天。
在一些實施例中,在活體外擴增期間,免疫效應宿主細胞可以用抗原(例如TCR抗原)刺激。抗原專一性擴增視情況可補充有在非專一性刺激淋巴細胞增殖之條件下之擴增,諸如抗CD3抗體、抗Tac抗體、抗CD28抗體或植物血球凝集素(PHA)。經擴增之宿主細胞可直接投與至個體中或可冷凍以供未來使用,亦即用於後續投與個體。
在一些實施例中,免疫效應宿主細胞在輸注至個體中之前用介白素-2 (IL-2)離體處理,及/或個體在輸注之後用IL-2治療。此外,在一些實施例中,患者可在投與經修飾宿主細胞之前經歷製備型淋巴細胞耗盡(即免疫系統之暫時切除)。IL-2處理與製備型淋巴細胞耗盡之組合可增強經修飾宿主細胞之持久性。
在一些實施例中,免疫效應宿主細胞經編碼細胞介素之核酸轉導或轉染,該核酸可經工程改造以提供細胞介素之組成型、可調節或可暫時控制之表現。適合的細胞介素包括例如在收縮階段期間起增強T淋巴細胞之存活作用的細胞介素,其可促進記憶T淋巴細胞之形成及存活。
在一些實施例中,本發明之組合物(例如,宿主細胞或多肽)係以治療有效量投與。在本發明之方法中所投與之組合物的劑量將廣泛變化,視個體之身體參數、投與頻率、投與方式、清除速率及其類似者而定。初始劑量可較大,且之後可為較小維持劑量。劑量可以不頻繁地每週或每兩週投與,或分成較小劑量且每天、每半週等投與以維持有效劑量水準。經考慮多種劑量將有效達成經修飾宿主細胞之活體內持久性。亦考慮多種劑量將有效改良經修飾宿主細胞之活體內效應功能。
在一些實施例中,包含藉由本文所描述之方法製備之經修飾宿主細胞的組合物可以10
2至10
10個細胞/kg體重、10
5至10
9個細胞/kg體重、10
5至10
8個細胞/kg體重、10
5至10
7個細胞/kg體重、10
7至10
9個細胞/kg體重或10
7至10
8個細胞/kg體重(包括彼等範圍內之所有整數值)之劑量投與。經修飾宿主細胞之數目將視組合物意欲用於之治療用途而定。
經修飾宿主細胞可以上文所列之劑量投與多次。經修飾宿主細胞對經歷療法之患者可為同種異體、同基因型、異種或自體的。
亦考慮當用於治療各種疾病/病症時,本發明之組合物及方法可與適用於相同或類似疾病/病症之其他治療方法/藥劑一起使用。此類其他治療方法/藥劑可共投與(同時或依序)以產生累加或協同效果。各藥劑之適合的治療有效劑量可由於累加作用或協同作用而降低。
在某些實施例中,本發明之組合物(例如,宿主細胞或多肽)係在投與另一治療劑(諸如癌症治療劑)之前、實質上同時或之後投與。另一癌症治療劑可為例如化學治療劑、生物劑、手術、基因療法或放射治療。在一些實施例中,未向接受組合物之個體投與足以引起免疫細胞耗盡之治療,諸如淋巴細胞耗盡化學療法或放射療法。
在以上治療方法中之任一者之一些實施例中,該方法進一步包含向個體投與一或多種選自由以下組成之群的其他化合物:免疫抑制劑、生物製劑、益生菌、益菌助生質及細胞介素(例如IFN或IL-2)。
在一些實施例中,本發明之方法及組合物可與阻斷發炎(例如經由IL1、INFα/β、IL6、TNF、IL23等之阻斷)之其他療法組合。
本發明之方法及組合物可與其他免疫調節治療組合,諸如治療性疫苗(包括(但不限於)GVAX、DC基疫苗等)、檢查點抑制劑(包括(但不限於)阻斷CTLA4、PD1、LAG3、TIM3等之藥劑)或活化劑(包括(但不限於)增強4-1BB、OX40等之藥劑)。本發明之方法亦可與具有調節NKT功能或穩定性之能力的其他治療組合,該等其他治療包括(但不限於):CD1d、CD1d-融合蛋白、未裝載或裝載有抗原之CD1d二聚體或CD1d更大聚合物、CD1d-嵌合抗原受體(CD1d-CAR)或存在於人類中之五種已知CD1異構體(CD1a、CD1b、CD1c、CD1e)之任何其他者。本發明之方法亦可與其他治療(諸如米哚妥林(midostaurin)、艾那尼布(enasidenib)或其組合)組合。
本發明之治療方法亦可與其他免疫療法及療法組合。舉例而言,當用於治療腫瘤時,本發明之組合物可與習知療法組合使用,諸如手術、放射療法、化學療法或其組合,視腫瘤類型、患者病狀、其他健康問題及多種因素而定。在某些態樣中,適用於與本發明之抑制劑組合腫瘤療法的其他治療劑包括抗血管生成劑。已識別多種抗血管生成劑且在此項技術中為已知的,包括例如TNP-470、血小板因子4、凝血酶致敏蛋白-1、金屬蛋白酶之組織抑制劑(TIMP1及TIMP2)、促乳素(16-Kd片段)、血管生長抑素(纖維蛋白溶酶原之38-Kd片段)、內皮生長抑素、bFGF可溶性受體、轉型生長因子β、干擾素α、可溶性KDR及FLT-1受體、胎盤增殖蛋白相關蛋白質以及藉由Carmeliet及Jain (2000)所列之彼等抗血管生成劑。在一個實施例中,本發明之經修飾宿主細胞可與VEGF拮抗劑或VEGF受體拮抗劑組合使用,諸如抗VEGF抗體、VEGF變體、可溶性VEGF受體片段、能夠阻斷VEGF或VEGFR之適體、中和抗VEGFR抗體、VEGFR酪胺酸激酶抑制劑及其任何組合(例如抗hVEGF抗體A4.6.1、貝伐單抗或蘭比珠單抗)。
可用於本發明之組合治療中之化學治療性化合物之非限制性實例包含例如胺麩精、安吖啶(amsacrine)、阿那曲唑(anastrozole)、天冬醯胺酶、氮胞苷、bcg、比卡魯胺(bicalutamide)、博萊黴素(bleomycin)、布舍瑞林(buserelin)、白消安(busulfan)、喜樹鹼(campothecin)、卡培他濱(capecitabine)、卡鉑、卡莫司汀(carmustine)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、順鉑、克拉屈濱(cladribine)、氯屈膦酸鹽(clodronate)、秋水仙鹼(colchicine)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、環丙孕酮(cyproterone)、阿糖胞苷(cytarabine)、達卡巴嗪(dacarbazine)、放線菌素(dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、地西他濱(decitabine)、雙烯雌酚(dienestrol)、己烯雌酚(diethylstilbestrol)、多西他賽(docetaxel)、小紅莓(doxorubicin)、表柔比星(epirubicin)、雌二醇(estradiol)、雌氮芥(estramnustine)、依託泊苷(etoposide)、依西美坦(exemestane)、非格司亭(filgrastim)、氟達拉濱(fludarabine)、氟可體松(fludrocortisone)、氟尿嘧啶(fluorouracil)、氟甲睾酮(fluoxymesterone)、氟他胺(flutamide)、吉西他濱(gemcitabine)、金雀異黃酮(genistein)、戈舍瑞林(goserelin)、羥基脲、艾達黴素(idarubicin)、異環磷醯胺(ifosfamide)、伊馬替尼(imatinib)、干擾素(interferon)、伊立替康(irinotecan)、伊洛替康(ironotecan)、來曲唑(letrozole)、甲醯四氫葉酸(leucovorin)、亮丙瑞林(leuprolide)、左旋咪唑(levamisole)、洛莫司汀(lomustine)、氮芥(mechlorethamine)、甲羥孕酮(medroxyprogesterone)、甲地孕酮(megestrol)、美法侖(melphalan)、巰基嘌呤(mercaptopurine)、美司鈉(mesna)、甲胺喋呤(methotrexate)、絲裂黴素(mitomycin)、米托坦(mitotane)、米托蒽醌(mitoxantrone)、尼魯米特(nilutamide)、諾考達唑(nocodazole)、奧曲肽(octreotide)、奧沙利鉑(oxaliplatin)、太平洋紫杉醇(paclitaxel)、帕米膦酸鹽(pamidronate)、噴司他汀(pentostatin)、普卡黴素(plicamycin)、卟吩姆(porfimer)、丙卡巴肼(procarbazine)、雷替曲塞(raltitrexed)、利妥昔單抗(rituximab)、鏈脲黴素(streptozocin)、蘇拉明(suramin)、他莫昔芬(tamoxifen)、替莫唑胺(temozolomide)、替尼泊苷(teniposide)、睾固酮(testosterone)、硫鳥嘌呤、噻替派(thiotepa)、二氯化二茂鈦、拓朴替康(topotecan)、曲妥珠單抗(trastuzumab)、維甲酸(tretinoin)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、長春地辛(vindesine)或長春瑞濱(vinorelbine)。
此等化學治療性化合物可藉由其作用機制分類成例如以下群組:抗代謝物/抗腫瘤劑,諸如嘧啶類似物(5-氟尿嘧啶、氟尿苷、卡培他濱、吉西他濱及阿糖胞苷)及嘌呤類似物、葉酸拮抗劑及相關抑制劑(巰基嘌呤、硫鳥嘌呤、噴司他汀及2-氯去氧腺苷(克拉屈濱));抗增生/抗有絲分裂劑,包括天然產物(諸如長春花生物鹼(長春鹼、長春新鹼及長春瑞濱)),微管干擾劑(諸如紫杉烷(太平洋紫杉醇、多西他賽)、長春新鹼、長春鹼、諾考達唑、埃博黴素及溫諾平)、表鬼臼毒素(依託泊苷、替尼泊苷)、DNA損傷劑(放射菌素、安吖啶、蒽環黴素、博萊黴素、白消安(busulfan)、喜樹鹼、卡鉑、苯丁酸氮芥、順鉑、環磷醯胺、環磷氮介、放線菌素、道諾黴素、小紅莓、表柔比星、六甲苯胺奧沙利鉑(hexamethyhnelamineoxaliplatin)、異環磷醯胺、美法侖、甲基二(氯乙基)胺、絲裂黴素、米托蒽醌、亞硝基脲、普卡黴素、丙卡巴肼、紫杉醇、克癌易(taxotere)、替尼泊苷、三伸乙基硫代磷醯胺及依託泊苷(VP16));抗生素,諸如放線菌素(放線菌素D)、道諾黴素、小紅莓(阿德力黴素(adriamycin))、艾達黴素、蒽環黴素、米托蒽醌、博來黴素、普卡黴素(光神黴素(mithramycin))及絲裂黴素;酶類(全身性代謝L-天冬醯胺且剝奪並不具有合成其自身天冬醯胺之能力之細胞的L-天冬醯胺酶);抗血小板藥劑;抗增生/抗有絲分裂烷基化劑,諸如氮芥(氮芥(mechlorethamine)、環磷醯胺及類似物、美法侖、苯丁酸氮芥)、伸乙亞胺及甲基三聚氰胺(六甲三聚氰胺及噻替派)、磺酸烷基酯-白消安、亞硝基脲(卡莫司汀(BCNU)及類似物、鏈脲菌素)、三氮烯-達卡巴嗪(DTIC);抗增生/抗有絲分裂抗代謝物,諸如葉酸類似物(甲胺喋呤);鉑配位之錯合物(順鉑、卡鉑)、丙卡巴肼、羥基脲、米托坦、胺麩精;激素、激素類似物(雌激素、他莫昔芬、戈舍瑞林、比卡魯胺、尼魯米特)及芳香酶抑制劑(來曲唑、阿那曲唑);抗凝劑(肝素、合成性肝素鹽及凝血酶之其他抑制劑);纖維蛋白溶解劑(諸如組織纖維蛋白溶酶原活化因子、鏈激酶及尿激酶)、阿司匹林、雙嘧達莫、噻氯匹定、克羅匹多、阿昔單抗;抗遷移藥劑;抗分泌藥劑(布瑞汀);免疫抑制劑(環孢靈、他克莫司(FK-506)、西羅莫司(雷帕黴素)、硫唑嘌呤、黴酚酸嗎啉乙酯);抗血管生成化合物(例如TNP-470、金雀異黃酮、貝伐單抗)及生長因子抑制劑(例如纖維母細胞生長因子(FGF)抑制劑);血管收縮素受體阻斷劑;氧化氮供體;反義寡核苷酸;抗體(曲妥珠單抗);細胞週期抑制劑及分化誘導劑(維甲酸);mTOR抑制劑、拓樸異構酶抑制劑(小紅莓(阿德力黴素)、安吖啶、喜樹鹼、道諾黴素、放線菌素、艾尼西德、表柔比星、依託泊苷、艾達黴素及米托蒽醌、拓朴替康、伊立替康)、皮質類固醇(可體松、地塞米松、氫皮質酮、甲潑尼龍、普賴松及潑尼龍);生長因子信號轉導激酶抑制劑;粒線體功能障礙誘導劑及凋亡蛋白酶活化劑;以及染色體干擾劑。
在本文所描述之方法之各種實施例中,個體為哺乳動物。在一些實施例中,個體為人類。個體可為任何年齡或性別之青少年或成人。
實例
提供以下實例以進一步描述本文所揭示之實施例中之一些。該等實例意欲說明所揭示之實施例。然而,應理解,本申請案不限於下文所說明之例示性實施例。
實例1. 開發具有新穎VHH標記之arCAR
使用噬菌體呈現技術或藉由免疫接種識別對非人類蛋白質具有專一性之新穎VHH。選擇候選VHH用於產生及品質對照分析。進一步測試候選VHH之專一性及交叉反應性。前導VHH用於產生抗VHH。
對前導標記VHH具有專一性之抗VHH係使用噬菌體呈現技術識別或藉由對駱馬或其他駱駝科動物免疫接種來產生。可採用若干市售噬菌體活動,包括鎢、VHH及SuperHuman以及scFv。選擇結合至標記VHH之CDR或其他非構架區之候選抗VHH。
可溶性經標記之VHH表現且產生於CHO細胞中。經由蛋白A層析純化可溶性經標記之VHH。抗VHH作為胞外標記結合域併入CAR構築體中。T細胞係藉由慢病毒構築體轉導以表現含有抗VHH域之CAR。亦測試抗VHH之專一性及交叉反應性。
建立活體外分析以分別藉由評定細胞介素產生及細胞毒性來評估經由可溶性經標記之VHH及抗標記CAR之T細胞活化。選擇前導CAR構築體以用於進一步分析。
實例2. 開發具有預先存在之VHH標記之arCAR
選擇結合非人類蛋白質之預先存在之VHH。可用於構築本發明之arCAR之VHH的非限制性實例包括靶向RSV F-蛋白、李氏菌內化蛋白、眼鏡蛇磷脂酶A2、伊波拉、核蛋白、HSV糖蛋白D、乳球菌噬菌體RBP、嗜熱脂肪地芽孢桿菌、蓖麻毒素(例如V5E4)及雞卵白溶菌酶之VHH。VHH亦可經工程改造以消除擾亂CDR之結合。選擇候選VHH用於產生及品質對照分析。所選VHH用於產生抗VHH。
對前導標記VHH具有專一性之VHH係使用噬菌體呈現技術或藉由免疫接種在駱馬中來識別。可採用若干市售噬菌體活動,包括鎢、VHH及SuperHuman以及scFv。選擇結合至標記VHH之CDR或其他非構架區之候選抗VHH。
可溶性經標記之VHH表現且產生於CHO細胞中。經由蛋白A層析純化可溶性經標記之VHH。抗VHH作為胞外標記結合域併入慢病毒CAR構築體中。T細胞係藉由慢病毒構築體轉導以表現含有抗VHH域之CAR。亦測試抗VHH之專一性及交叉反應性。
建立活體外分析以分別藉由評定細胞介素產生及細胞毒性來評估經由可溶性經標記之VHH及抗標記CAR之T細胞活化。選擇前導CAR構築體以用於進一步分析。
實例3. 具有BCMA/抗BCMA VHH之arCAR
為測試arCAR概念,使用如下文所列之若干方法。
為測試蛋白質:蛋白質在arCAR平台中之相互作用之最初概念,將抗BCMA抗體與靶向腫瘤之域抗體融合。BCMA與CAR之跨膜域融合。併入BCMA/抗BCMA抗體之例示性arCAR展示於
圖 3A中。
在另一組實驗中,開發衍生自赫賽汀mAb序列之scFv。將針對抗赫賽汀個體基因型mAb識別之序列轉化為scFv型式。此等已知序列經工程改造至arCAR平台中以展現該概念。將赫賽汀scFv與CAR融合且將赫賽汀抗ID scFv與靶向腫瘤之可溶性域抗體(例如抗CD19 scFv或VHH)融合。併入赫賽汀/赫賽汀scFv之例示性arCAR展示於
圖 3B中。測試此arCAR在活體外之細胞毒性潛能。
對非人類蛋白質具有專一性之若干抗體已在文獻中識別。此類實例包括H6dyx、hP3-3、hAnti-Z、hHSV GD、hLP RBP、hVHH4、hSbsB及hV5E4。此等抗體以用於表徵之scFv或VHH型式構築。基於生物物理學特性選擇候選物。隨後針對此等結合物進行抗ID活動以開發多樣化親和力小組,該小組使得能夠圍繞調節arCAR親和力之優點進行概念驗證。
實例4. 具有赫賽汀/抗赫賽汀scFv之arCAR
在概念驗證研究中,開發衍生自赫賽汀(曲妥珠單抗) mAb之scFv。由抗赫賽汀個體基因型mAb開發另一scFv (scFv69)。將此等序列組裝至不同CAR表現構築體中(
表 5),其中之每一者隨後封裝至慢病毒載體中且經由Jurkat細胞或初級T細胞中之病毒轉導來表現。藉由流式細胞測量術偵測CAR表現且結合至EGFR可溶性蛋白質。將CAR表現細胞與過度表現EGFR之CHO細胞或具有EGFR之天然細胞表面表現之細胞株組合使用以展現EGFR專一性細胞毒性。
圖 4A展示例示性arCAR,其中赫賽汀scFV與CAR融合且赫賽汀抗ID scFv與定向EGFR之VHH (9G8)融合。
圖 4B展示表現赫賽汀scFv CAR與9G8-scFv69融合蛋白偶合之T細胞能夠靶向EGFR+細胞。
表 5呈現包含赫賽汀scFv或抗赫賽汀個體基因型scFv69作為胞外標記結合域之所產生之CAR表現構築體。
圖 5展示用於遞送CAR構築體之慢病毒載體之載體圖譜。
表 6呈現赫賽汀scFv及scFv69 (赫賽汀抗ID)。
藉由攜帶
表 5中所描述之CAR構築體之慢病毒載體轉導Jurkat細胞以評估CAR表現及CD69活化。為量測CD69調節作為活化讀數,將表現Jurkat細胞之CAR與EGFR陽性細胞共培養24及48小時。在共培養之後,使用抗人類CD69-BV421抗體將細胞染色CD69水準且在Intellicyte流式細胞儀上量測。CAR構築體亦在T細胞中表現以評估細胞毒性。為進行此分析,根據製造商之說明使用Pan T細胞分離套組(Miltenyi目錄號130-096-535)分離T細胞。將細胞再懸浮於含30單位/ml IL2之RPMI、10% FBS中且用Dynabeads™人類T-活化劑CD3/CD28 (ThermoFisher,目錄號11132D)活化隔夜。次日,使用TransDux™ MAX慢病毒轉導劑(SBI,目錄號LV860A-1),藉由含有CAR表現卡匣之慢病毒質體轉導T細胞(
圖 12A-12K)。將T細胞擴增七天且在第七天,設定細胞毒性分析。將藉由Recon細胞跟蹤紫色加標籤之目標細胞與CAR陽性T細胞以各種比率共培養24或48小時。48小時之後,在Intellicyte流式細胞儀上檢查細胞存活率。
表 5. CAR 表現構築體
表 6. 赫賽汀、 scFv69 及 9G8 CAR 相關序列
CAR 形式 | 抗體 | PLASMID |
長鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | 赫賽汀 | p518 |
長鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | scFv69 | p517 |
中等鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | 赫賽汀 | p511 |
中等鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | scFv69 | p516 |
長鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | 赫賽汀 | p514 |
長鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | scFv69 | p515 |
短鉸鏈,CD28 tm 4-1BB,CD3z | scFv69 | p510 |
9G8 |
CAR 區 | 序列 | SEQ ID NO |
赫賽汀scFv (核苷酸序列) | GACATCCAGATGACTCAGTCACCATCAAGCCTGAGTGCATCCGTGGGCGATCGAGTGACAATAACATGTAGAGCGAGCCAGGATGTAAATACGGCAGTAGCGTGGTACCAACAGAAACCCGGCAAGGCTCCTAAGCTGTTAATCTACAGCGCCAGCTTCCTTTATAGTGGAGTGCCTTCAAGGTTCTCAGGATCTAGGTCCGGTACTGACTTCACGCTGACAATCTCGAGCCTACAACCCGAGGACTTCGCCACTTATTACTGCCAGCAGCATTACACTACTCCTCCCACATTCGGACAGGGAACCAAAGTCGAGATCAAAGGATCAACCTCTGGATCTGGCAAGCCCGGGAGCGGGGAAGGCTCTACTAAGGGTGAGGTGCAACTAGTGGAGAGTGGCGGAGGGCTCGTCCAGCCAGGAGGTTCCCTGAGGCTGAGTTGCGCTGCAAGCGGATTCAATATCAAGGACACGTACATACACTGGGTGCGCCAGGCCCCCGGAAAGGGACTGGAGTGGGTCGCCCGAATCTATCCTACTAATGGCTACACCAGGTATGCTGATTCAGTGAAAGGAAGGTTTACAATCTCTGCCGATACTTCAAAGAATACAGCTTATCTACAGATGAATTCACTTAGAGCCGAGGATACAGCCGTGTATTATTGCTCCCGATGGGGAGGAGATGGGTTCTACGCTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCCTGGTGACCGTTAGTTCA | 69 |
赫賽汀scFv (胺基酸序列) | DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIKGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS | 70 |
赫賽汀scFv VL | DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK | 71 |
赫賽汀scFv VH | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS | 72 |
赫賽汀scFv連接子 | GSTSGSGKPGSGEGSTKG | 3 |
scFv69 (赫賽汀抗ID) (核酸) | TCTTCTGAGCTGACTCAGGACCCTGCTGTGTCTGTGGCCTTGGGACAGACAGTCAGGATCACATGCCAAGGAGACAGCCTCAGAAGCTATTATGCAAGCTGGTACCAGCAGAAGCCAGGACAGGCCCCTGTACTTGTCATCTATGGTAAAAACAACCGGCCCTCAGGGATCCCAGACCGATTCTCTGGCTCCAGCTCAGGAAACACAGCTTCCTTGACCATCACTGGGGCTCAGGCGGAAGATGAGGCTGACTATTACTGTAACAGCAGTGAACCAACCCCACCAAGAGTGGTCTTCGGCGGCGGAACAAAACTGACAGTGCTGGGCTCTACAAGCGGCAGCGGCAAACCTGGATCTGGCGAGGGATCTACCAAGGGCGAGGTGCAACTATTGGAAAGTGGTGGCGGGCTGGTCCAACCGGGCGGGTCCTTGAGGCTGTCCTGTGCAGCCAGCGGGTTTACTTTTTCTTCCTACGCCATGTCTTGGGTACGACAGGCTCCCGGAAAAGGGCTCGAGTGGGTGAGTGCAATCTCCGGGAGTGGGGGCTCTACCTACTACGCCGATTCTGTCAAGGGTAGGTTCACTATCTCCAGGGATAATTCAAAGAATACTTTATACCTGCAGATGAATTCACTGCGAGCGGAAGATACAGCAGTGTACTATTGTGCCAAGAACGTGCACATCCAGCCCTTTGATTACTGGGGCCAGGGCACCAGCGTGACCGTGTCTAGC | 73 |
scFv69 (赫賽汀抗ID) (胺基酸序列) | SSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSSEPTPPRVVFGGGTKLTVLGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKNVHIQPFDYWGQGTSVTVSS | 74 |
scFv69 VL | SSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSSEPTPPRVVFGGGTKLTVL | 75 |
scFv69 VH | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKNVHIQPFDYWGQGTSVTVSS | 76 |
scFv69連接子 | GSTSGSGKPGSGEGSTKG | 3 |
9G8 VHH (抗EGFR) (核苷酸序列) | GAAGTGCAGCTTGTGGAGAGTGGCGGTGGTTTAGTTCAACCAGGGGGCAGCCTGCGCTTGAGTTGTGCCGCATCGGGTCGTACCTTTTCTAGCTACGCAATGGGGTGGTTTCGTCAAGCTCCTGGGAAGGAACGTGAGTTTGTGGTCGCCATTAATTGGTCATCAGGGAGTACATACTACGCTGATTCCGTCAAAGGGCGCTTTACAATCTCACGCGATAACAGCAAGAATACCCTTTATTTACAAATGAATAGTCTGCGTGCAGAAGATACGGCTGTGTATTACTGCGCTGCGGGGTACCAAATCAACTCTGGGAATTACAACTTTAAGGACTACGAGTATGATTATTGGGGCCAGGGCACTCAGGTTACAGTCTCGAGC | 77 |
9G8 VHH (抗EGFR) (胺基酸序列) | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSSYAMGWFRQAPGKEREFVVAINWSSGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCAAGYQINSGNYNFKDYEYDYWGQGTQVTVSS | 78 |
T2A序列(核苷酸序列) | GGATCCGGCGCCACAAACTTCAGCCTGCTGAAACAGGCCGGCGACGTGGAGGAAAACCCAGGCCCA | 79 |
T2A序列(胺基酸序列) | GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP | 80 |
GFP (用於表現偵測) (核苷酸序列) | GTGTCCAAGGGCGAAGAACTGTTCACCGGCGTGGTGCCCATTCTGGTGGAACTGGACGGGGATGTGAACGGCCACAAGTTCAGCGTTAGAGGCGAAGGCGAAGGGGATGCCACAAACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGAAAGCTGCCCGTGCCTTGGCCTACACTGGTCACCACACTGACATACGGCGTGCAGTGCTTCAGCAGATACCCCGACCATATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGAGCGCCATGCCTGAGGGCTACGTGCAAGAGAGAACCATCACCTTCAAGGACGACGGCACCTACAAGACCAGAGCCGAAGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTCAACCGGATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAAGAGGACGGCAACATCCTGGGCCACAAACTTGAGTACAACTTCAACAGCCACAACGTGTAtATCACCGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGCCAACTTCAAGATCCGGCACAACGTGGAAGATGGCAGCGTGCAGCTGGCCGATCACTACCAGCAGAACACACCCATCGGAGATGGCCCTGTGCTGCTGCCCGATAACCACTACCTGAGCACCCAGAGCAAGCTGAGCAAGGACCCCAACGAGAAGCGGGACCACATGGTGCTGCTGGAATTTGTGACAGCCGCCGGAATCACCCACGGCATGGATGAGCTGTACAAG | 81 |
8GFP (用於表現偵測) (胺基酸序列) | VSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVRGEGEGDATNGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTITFKDDGTYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNFNSHNVYITADKQKNGIKANFKIRHNVEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITHGMDELYK | 82 |
組裝四種融合蛋白(或橋蛋白)構築體(
表 7),其包含經由(G
4S)
3連接子(SEQ ID NO: 25)與赫賽汀scFv或抗赫賽汀個體基因型scFv69融合之9G8 VHH (
表 6)。
圖 6A展示用於選殖描述於
表 7中之橋構築體之質體的載體圖譜。
EXPi-293細胞根據製造商之說明使用Expifectamine經質體轉染用於蛋白質表現,該質體攜帶
表 6中所描述之橋構築體。純化可溶性橋蛋白質。以1 ml/min將澄清上清液裝載於1 ml HiTrap MabSelect SuRe管柱上。用20個管柱體積之PBS洗滌管柱以移除未結合之蛋白質。管柱用10 cV之0.1 M乙酸納pH 3.5溶離且樣本用2.5 M Tris pH 6.5中和。藉由SEC拋光蛋白質樣本以移除高分子量物質。
圖 6B展示凝膠電泳影像,其展現自各構築體純化之橋蛋白質之純度。
表 7. 橋蛋白質構築體
橋形式 | PLASMID |
9G8-赫賽汀 | p522 |
赫賽汀-9G8 | p521 |
9G8-scFv69 | p519 |
scFv69-9G8 | p520 |
進行與經CAR轉導之Jurkat細胞結合之橋蛋白質的結合分析以偵測經scFv69-CAR轉導之Jurkat細胞與橋蛋白質之兩種變體:9G8_赫賽汀scFv及赫賽汀scFv 9G8之間的結合,如
圖 7A中所示。經由培育之後如下進行細胞染色分析,在Intellicyte上偵測橋蛋白質結合。經CAR轉導之Jurkat細胞與橋蛋白質一起培育30分鐘。在培育之後,洗滌細胞且隨後與生物素標記之EGFR一起培育30分鐘。在洗滌步驟之後,將經PE加標籤之鏈黴抗生物素蛋白與細胞一起培育。橋蛋白質結合、CAR轉導之Jurkat細胞係藉由流式細胞測量術測定為對9G8_赫賽汀scFv呈65%陽性及對赫賽汀scFv 9G8呈45%陽性(
圖 7B)。亦在相反方向上偵測橋蛋白質結合:具有scFv69_9G8橋之赫賽汀CAR及具有9G8_scFv69橋之赫賽汀CAR(資料未展示)。
評估目標細胞與表現CAR之T細胞之間的細胞毒性活性。如藉由流式細胞量測術所評定,在EGFR轉導之CHO細胞中偵測EGFR之表現(
圖 8A)。亦在T細胞中評估CAR表現。在具有長Ig-鉸鏈形式之CAR中觀測HER-CAR (p514)及scFv69-CAR (p515)兩者之最高表現(
圖 8B)。
為設定細胞毒性活性分析,以10,000個細胞/孔接種目標細胞(經EGFR轉導之CHO及親本CHO),用CellTrace™紫(CTV)加標籤。CAR T細胞以100,000個細胞/孔接種,估算CAR效應細胞與目標細胞比率(E:T)為約5:1。將CAR-T細胞與CHO-EGFR+細胞一起共培養48小時。分析中所使用之對照展示於
表 8中。使用10、1、0.1及0 nM橋蛋白9G8-赫賽汀(p522)及9G8- scFv69(p519)。
表 8. 細胞毒性活性分析對照
對照 | 測試 |
9G8-CAR T | 陽性對照,靶向專一性CAR介導之殺死 |
未經轉染之T細胞 | 陰性對照,非專一性T細胞介導之殺死 |
無T細胞 | 陰性對照,基線細胞死亡 |
赫賽汀CAR及赫賽汀橋 | 陰性對照,CAR-橋-殺死機制之專一性 |
scFv69 CAR及scFv69橋 | 陰性對照,CAR-橋-殺死機制之專一性 |
通用CAR-T細胞在與適當橋蛋白質配對時展現CD25活化但在與橋蛋白質錯配時並不如此(
圖 9A、
9B)。此外,通用CAR-T細胞在與適當橋蛋白質配對時展現細胞毒活性但在與橋蛋白質錯配時並不如此(
圖 10A 、 10B)。
實例5. 通用CAR平台之VHH之識別
VHH結合物經選擇作為潛在目標用於發現抗個體基因型以形成可互換充當「標記」及「抗標記」之專一性及獨特結合對。識別已知結合至非人類蛋白質之VHH清單。亦獲得結合至雞卵溶菌酶(HEL)之額外VHH。此等VHH及產生之質體提供於
表 9中且序列提供於
表 10中(帶下劃線之序列表示CDR位置)。
表 9. 候選 VHH
表 10. 候選 VHH 序列
非人類蛋白質目標 | 質體 | 對應候選 VVH 多肽 |
RSV F蛋白 | p243 | SEQ ID NO.: 94 |
李氏菌內化蛋白 | p279 | SEQ ID NO.: 84 |
眼鏡蛇磷脂酶A2 | p247 | SEQ ID NO.: 86 |
伊波拉核蛋白 | p246 | SEQ ID NO.: 88 |
HSV糖蛋白D | p249 | SEQ ID NO.: 90 |
乳球菌噬菌體RBP | p251 | SEQ ID NO.: 92 |
嗜熱脂肪地芽孢桿菌 | p250 | SEQ ID NO.: 96 |
蓖麻毒素(V5E4) | p252 | SEQ ID NO.: 98 |
LYSO_CW_P01_B10 | p245 | SEQ ID NO.: 100 |
LYSO_CW_P01_B11 | p242 | SEQ ID NO.: 102 |
LYSO_CW_P01_D04 | p244 | SEQ ID NO.: 104 |
LYSO_CW_P01_F11 | p248 | SEQ ID NO.: 106 |
LYSO_CW_P01_F09 | p278 | SEQ ID NO.: 108 |
LYSO_CW_P01_C04 | p253 | SEQ ID NO.: 110 |
CAR 區 | 序列 | SEQ ID NO |
李氏菌:內化蛋白6dyx (核苷酸序列) | CAGGTGAAGTTGGAAGAGTCTGGTGGTGGCCTCGTCCAGGCTGGGGGGAGTCTTCGCCTTAGTTGCGCAGCTTCAGGTCGGACATACAGCACTTACGCGATGGGGTGGTTTCGCCAGACTCCGGGGAAGGAGAGAGAATTGGTGGCAGCAATAAATTGGTCAGGGGGCAACACGCACTATGCAGACTCTGTAAAAGGCCGGTTCACGATCAGTAGAGATAACGCCAAGAGCACCGTCTACCTCCAGATGAATTCCCTGAAACCTGAGGACACAGCAGTTTATTACTGTGCCGCTCCGAAAGGCCACACAGGGGATCATTACTGGGGACCCGGCACCCAAGTGACTGTGAGCTCG | 83 |
李氏菌:內化蛋白6dyx (胺基酸序列) | QVKLEESGGGLVQAGGSLRLSCAAS GRTYSTYAMGWFRQTPGKERELV AAINWSGGNTHYADSVKGRFTISRDNAKSTVYLQMNSLKPEDTAVYYC AAPKGHTGDHYWGPGTQVTVSS | 84 |
單眼紋眼鏡蛇(眼鏡蛇):磷脂酶A2 P3-3 (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTCGTTGAAAGTGGAGGCGGTAGCGTTCAGGCAGGTGGAAGCCTCAGGCTGTCCTGTGCGGCCAGTAGAGACACGTATGATTCACACTGTATGGGGTGGTTCCGGCAAGCGCCCGGAAAAGAGAGGGAACAGGTGGCGGCACATAACGGTGGCCGAAACACATATTACGCAGATAGCGTTAAAGGACGATTTACAATATCTCAGGACAATGCTAAGAATACGATGTATCTCCAAATGAATAGCCTTAAACCTGAAGATACAGCCATTTACTACTGCGCCGCGGACATGTCCGCGAGAAGGGTCGCAAACACAGGATGCAGATACAATTATTGGGGCCAAGGCACTTTGGTAACTGTGAGCTCG | 85 |
單眼紋眼鏡蛇(眼鏡蛇):磷脂酶A2 P3-3 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGSVQAGGSLRLSCAAS RDTYDSHCMGWFRQAPGKEREQV AAHNGGRNTYYADSVKGRFTISQDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAIYYC AADMSARR VANTGCRYNYWGQGTLVTVSS | 86 |
伊波拉:核蛋白 抗Z C (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTTCAACAAAGCGGCGGGGGATCCGTAACGCCAGGTGGATCACTGCGGCTTTCTTGTGCTGCTTCCGGATCCATTTCAGACTTTGCTGCTATGGCATGGTATCGGCAGGCCCCTGGCAAAGAAAGGGATTGGGTTTTTGGAACCATATTCTCAGCAGGTGCTTTGTTGTACGCAGAACCAGTTAAAGGTCGGTTTACCATATCAAGGGATAACGCTAAGAATACTGTATATCTTCAAATGAACAGTTTGAAACCAGAGGATACTGCCGTATACTATTGTCGCCTCTATGCTAAGGCAATTTATTGGGGTCAGGGCACACAGGTAACGGTGAGCTCG | 87 |
伊波拉:核蛋白 抗Z C (胺基酸序列) | KVQLQQSGGGSVTPGGSLRLSCAAS GSISDFAAMAWYRQAPGKERDWV FGTIFSAGALLYAEPVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYC RLYAKAIYWGQGTQVTVSS | 88 |
疱疹單純型病毒:糖蛋白D (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTTCAGGCTAGTGGAGGGGGACTGGTGCAAGCTGGCGGGTCTTTGCGACTGTCCTGTGCAGCCTCAGGCCGAGCTACAGGCAATTATCCCATGGGATGGTTCCGCCAGGCCCCTGGAAAAGAACGCGAGTTCGTTGCAGCCATCAGTCGGGACGGCGACAGTACATACTACCGGGATAGTGTTAAAGGCCGATTTACCATATCCCGAGACAATACGAAAAATACGGCATATCTTCAGATGAACAGTCTTAAGCCGGAGGACACAGCCGTCTACTATTGTGCAGCTGACCGGCTGACAGCATATCGATACAATCCAGGGCAGATTGACTATTGGGGACAGGGTACACAAGTTACGGTGAGCTCG | 89 |
疱疹單純型病毒:糖蛋白D (胺基酸序列) | EVQLQASGGGLVQAGGSLRLSCAAS GRATGNYPMGWFRQAPGKEREFV AAISRDGDSTYYRDSVKGRFTISRDNTKNTAYLQMNSLKPEDTAVYYC AADRLTAY RYNPGQIDYWGQGTQVTVSS | 90 |
乳球菌噬菌體:RBP (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTGGTCGAAAGTGGTGGGGGGCTCGTTCAAGCCGGTGGCAGTTTGCGCTTGTCATGCGCCGCTAGTGAAAGTACCTTCTCTAACTACGCGATGGGATGGTTCAGGCAAGCACCAGGCCCTGAAAGGGAATTTGTGGCTACGATTTCTCAAACAGGGTCCCACACCTACTACCGCAATTCTGTGAAGGGACGCTTCACGATTAGTCGGGATAACGCCAAGAACACAGTGTACCTTCAAATGAACAATATGAAGCCTGAAGACACGGCCGTGTATTATTGTGCAGCCGGAGACAACTATTACTATACCAGAACTTATGAGTACGACTACTGGGGCCAGGGTACTCAGGTCACTGTGAGCTCG | 91 |
乳球菌噬菌體:RBP (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASESTFSNYAMGWFRQAPGPEREFVATISQTGSHTYYRNSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNNMKPEDTAVYYCAAGDNYYYTRTYEYDYWGQGTQVTVSS | 92 |
RSV:F-蛋白 (核苷酸序列) | CAGGTGCAGTTGGTCGAGTCAGGTGGAGGGTCAGTGCAGCCAGGGGGGTCCCTTCGACTTAGTTGTGCAGCCAGTGGTTTTACACTGGATTACTATTACATTGGGTGGTTTCGACAGGCCCCCGGGAAGGAACGCGAGGGTGTTTCTTGTATTTCCAGCTCACATGGCTCAACCTATTATGCTGACTCAGTAAAAGGTCGGTTTACGATAAGCCGGGATAATGCAAAGAATACCGTGTATCTTCAAATGAATAGCCTTAAACCAGAAGATACCGCTGTGTACTATTGTGCCACTATACGCTCTAGCTCATGGGGGGGCTGTGTCCACTACGGGATGGATTATTGGGGGAAGGGCACGCAAGTCACGGTGAGCTCG | 93 |
RSV:F-蛋白 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGSVQPGGSLRLSCAAS GFTLDYYYIGWFRQAPGKEREGVS CISSSHGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYC ATIRSSSWG GCVHYGMDYWGKGTQVTVSS | 94 |
嗜熱脂肪地芽孢桿菌:SbsB (核苷酸序列) | CAGGTGCAGTTGCAAGAAAGTGGAGGGGGATTGGTGCAGGCAGGTGGATCTTTGAGGCTGTCCTGTGCAGCCTCTGGTCGCACTAGCTCTGCGTACGCTATGGGTTGGTTTCGACAGGCCCCTGGGAAAGAACGCGAGTTCGTTGCCGGCATTTCAAGCAAAGGCGGTAGCACGTATTATGGTGCCAGCATGAAAGGACGCTTTACGATATCACGGGATAACGCGAAAAATACGGTCTACTTGCAGATGAACGGTCTGGCCCCAGAAGACACGGCAGTGTACTACTGCGCTGCGAGCGACAAGTATAATTTCGACACCAGCCATGCGGGATACGGCTATTGGGGCCAAGGGACCCAGGTTACAGTGAGCTCG | 95 |
嗜熱脂肪地芽孢桿菌:SbsB (胺基酸序列) | QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAAS GRTSSAYAM GWFRQAPGKEREFV AGISSKGGSTYYGASMKGRFTISRDNAKNTVYLQMNGLAPEDTAVYYCAAS DKYNFDTSHAGYGYWGQGTQVTVSS | 96 |
蓖麻毒素(V5E4) (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTCGTGGAGACGGGTGGAGGACTTGTGCAAGCGGGCGGAAGCCTTAGGTTGAGCTGTGCTGCGTCTGGATTTACATTTAGTAGCTATGCAATGGGCTGGTTTCGCCAGGCGCCGGGGAAGGAACGCGACTTCGTTGCGGGTATCTCACTTAGCGGCGCCGGGACGTACTATGTAAAAGGAAGGTTCACCATTTCACGCGATAACGCTAAAAACACTGTCTATTTGCAGATGAACAGCCTCAAACCAGAGGATACTGCAGTATATTACTGTAAGGCCACAGGAGAAAGGGGGTATGGAGATCAGGGATATCTTGAAGTCTGGGGGAGAGGGACGCTGGTTACCGTGAGCTCG | 97 |
蓖麻毒素(V5E4) (胺基酸序列) | QVQLVETGGGLVQAGGSLRLSCAAS GFTFSSYAMGWFRQAPGKERDFV AGISLSGAGTYYVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCKAT GERGYGDQGYLEVWGRGTLVTVSS | 98 |
Lyso CW P01 B10 (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTTGTGGAGAGCGGGGGTGGTCTCGTCCAGGCTGGTGGCTCACTTCGCCTCTCCTGCGCGGCTAGCGGCGGGATATTCTCAGGTGGAAGAATGGGCTGGTTCAGACAAGCTCCAGGTAAAGAGAGAGAGTTCGTAGCGGCGGTAATCACTCGCGGGGGGTCTACTTATTATGCGGACTCTGTGAAGGGTAGATTTACAATTTCACGGGACAACGCAAAGAATACTGTGTACCTTCAAATGAACTCACTTAAACCTGAGGACACGGCGGTTTATTACTGCGCTGCAAGCGAGGTAACCTATGACGAGGGACATTACATCGGAACCAAATCCACTTACGACACTTGGGGACAGGGCACGCAGGTAACTGTGAGCTCG | 99 |
Lyso CW P01 B10 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGIFSGGRMGWFRQAPGKEREFVAAVITRGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAASEVTYDEGHYIGTKSTYDTWGQGTQVTVSS | 100 |
Lyso CW P01 B11 (核苷酸序列) | CAGGTGCAGCTCGTAGAGTCCGGGGGAGGTCTGGTGCAAGCTGGAGGTTCCTTGCGATTGTCATGTGCGGCAAGCGGAGGAATTTTTTCTGGAGGACGAATGGGGTGGTTCCGACAGGCACCGGGAAAAGAGAGGGAGTTCGTAGCTGCCGTGATTACAAGGGGTGGTAGCACATACTATGCAGATAGCGTAAAGGGTAGGTTTACGATATCCAGGGATAACGCAAAGAACACGGTCTACCTGCAGATGAACTCCCTTAAACCAGAAGATACTGCCGTTTATTATTGCGCCGCATCAGAGGTAACTTACGATGAAGGTCGATACATTGGGACGAAGAGCACCTATGACACATGGGGGCAGGGTACTCAAGTGACCGTGAGCTCG | 101 |
Lyso CW P01 B11 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGIFSGGRMGWFRQAPGKEREFVAAVITRGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAASEVTYDEGRYIGTKSTYDTWGQGTQVTVSS | 102 |
Lyso CW P01 D04 (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTGGTGGAATCCGGGGGTGGACTGGTACAAGCCGGAGGGAGTTTGAGACTCTCTTGCGCTGCCTCCGGTAGAATTTTTTCAATATACGACACCATAGGATGGTTTCGACAAGCGCCTGGAAAGGAAAGAGAGTTTGTAGCGGCCACTATCACAACGGCGGGTATTACGACATATGATGATAGCGTTAAAGGACGGTTCACGATAAGCCGCGACAATGCCAAGAACACAGTGTACCTCCAAATGAATAGCCTTAAGCCCGAGGATACAGCCGTTTACTATTGTTACGTCCGAGTTGGTCGCGGTGACTACTGGGGTCAAGGTACTCAGGTGACTGTAAGCTCG | 103 |
Lyso CW P01 D04 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRIFSIYDTIGWFRQAPGKEREFVAATITTAGITTYDDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYVRVGRGDYWGQGTQVTVSS | 104 |
Lyso CW P01 F11 (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTGGTTGAATCTGGTGGTGGGCTGGTCCAAGCGGGAGGCAGTCTTCGACTTTCCTGCGCAGCCTCAGGGAGTATATTCAGCTTTTACGACGTAGGTTGGTTCCGCCAAGCGCCCGGTAAAGAACGAGAGTTCGTCGCTGCCAGTATAACGAAGGGAGGCGGGACGTACTACGTAGATTCAGTAAAAGGGAGATTTACCATAAGTAGGGACAATGCAAAGAACACGGTCTACCTCCAGATGAATAGCCTTAAACCAGAAGATACGGCAGTCTATTACTGCGCCCTGGCAACCCCCCACGGATATGACTTTTGGGGCCAAGGTACGCAAGTCACGGTGAGCTCG | 105 |
Lyso CW P01 F11 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIFSFYDVGWFRQAPGKEREFVAASITKGGGTYYVDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCALATPHGYDFWGQGTQVTVSS | 106 |
Lyso CW P01 F09 (核苷酸序列) | CAGGTGCAGCTCGTTGAAAGCGGGGGTGGCTTGGTCCAAGCGGGAGGTTCCCTGAGACTGTCCTGCGCTGCGTCAGGATCAATAATCACGATTTATGTAGTCGGATGGTTCCGACAAGCCCCAGGTAAAGAGCGGGAATTTGTGGCCTCCGACATAGGCTCTGGTGGGTCAACTTATTACAGTGACTCCGTAAAAGGTCGGTTCACAATCTCAAGGGATAACGCAAAGAATACAGTCTACTTGCAAATGAATTCATTGAAGCCTGAGGATACAGCAGTGTACTACTGCGTTACTGGAGATCCCTCTACTCCGTATTCATACTGGGGTCAAGGCACACAGGTTACAGTGAGCTCG | 107 |
Lyso CW P01 F09 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIITIYVVGWFRQAPGKEREFVASDIGSGGSTYYSDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCVTGDPSTPYSYWGQGTQVTVSS | 108 |
Lyso CW P01 C04 (核苷酸序列) | CAGGTGCAACTGGTCGAGAGTGGTGGTGGACTGGTTCAAGCTGGGGGCAGCCTGAGATTGTCCTGCGCCGCATCTGGCTCCTCCTTCTCAATTTACGACGTGGGCTGGTTCCGCCAAGCACCTGGAAAGGAAAGAGAGTTTGTTGCTGCGACAATTGAGACTGGGGGACACACGTCTTACGCCGACTCAGTGAAAGGTAGATTTACAATCTCAAGGGATAACGCTAAAAACACCGTTTATCTGCAAATGAACTCCCTGAAACCGGAGGATACAGCTGTGTACTATTGTTATGCGAAGATTGTCTACGACCAGGGCCCGAGCTACTACTATTGGGGCCAGGGGACACAGGTTACCGTGAGCTCG | 109 |
Lyso CW P01 C04 (胺基酸序列) | QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSSFSIYDVGWFRQAPGKEREFVAATIETGGHTSYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCYAKIVYDQGPSYYYWGQGTQVTVSS | 110 |
組裝包含
表 9中所描述之VHH的慢病毒CAR表現構築體。
圖 11A展示用於遞送VHH CAR之慢病毒載體之載體圖譜。慢病毒載體隨後用於轉導Jurkat細胞。觀測到Jurkat細胞上10/14個VHH CAR之穩固CAR表現(
圖 11B)。Jurkat細胞中所有候選VHH以極高水準表現為CAR。為確定當存在於CAR上時此等VHH之任何強直性信號傳導或非專一性性活化存在,將經轉導Jurkat細胞與人類胎腎細胞(HEK)一起培育隔夜且次日評定T細胞活化標誌物CD69。所有VHH CAR構築體觀測到Jurkat細胞上低或無非專一性活化(
圖 11C 、 11D)指示經由無靶向驅動活化之CAR之信號傳導極少或無信號傳導。將三個抗溶菌酶VHH CAR結合至雞溶菌酶且對人類無交叉反應性(
圖 11E),展現對雞蛋白質之專一性。
基於此等資料,選擇LYSO_CW_P01_B11 (B11)及LYSO_CW_P01_D04 (D04) VHH用於進一步考量,因為其高表現為CAR、低至無強直性信號傳導及非專一性活性及理想生物物理學特徵(藉由其強表現為可溶性蛋白質指示)。此等VHH在CAR中或在橋蛋白質中具有良好表現。
表 11. B11 及 D04 之純化資料
DNA ID | 蛋白質ID | VHH | 構築體形式 | 濃度(mg/mL) | 體積(μL) | 產量(μg) | 單體% |
P1184 | PROT951 | LYSO_CW_P01_B11 | VHH_IgG1.Fc | 1.53 | 200 | 306.7 | 98.50 |
P1186 | PROT949 | LYSO_CW_P01_D04 | VHH_IgG1.Fc | 1.94 | 200 | 387.1 | >99 |
圖 11F展示靶向嗜熱脂肪地芽孢桿菌、LYSO_CW_P01_B11及LYSO_CW_P01_D04之VHH之胺基酸序列的比對。基於比對序列產生共同序列。
作為此等VHH之專一性之最終特徵,測試經B11及D04 VHH轉導之CAR Jurkat細胞以及一組候選物之另一抗HEL VHH,以結合至經生物素標記之雞及人類溶菌酶,以確保不結合至人類溶菌酶蛋白質。B11(p242)及D04 (p244) VHH兩者均展示結合至雞溶菌酶,而對人類溶菌酶蛋白質無交叉反應性(
圖 11E)。
實例6. B11及D04 VHH之人類化
B11及D04蛋白質源於Distributed Bio (San Francisco, CA)之駱駝VHH噬菌體顯示庫。為限制此等VHH之免疫原性之可能性,將其在VHH之構架區中人類化。自此實例向前,對B11及D04之提及為人類化VHH。
表 12. 最初駱駝 VHH B11 及 D04 之人類化版本
VHH | CAR 載體編號 | 胺基酸序列 | SEQ ID NO |
huLYSO_CW_P01_B11 | P1649 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGGIFSGGRMGWFRQAPGKEREFVAAVITRGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAASEVTYDEGRYIGTKSTYDTWGQGTQVTVSS | 111 |
huLYSO_CW_P01_D04 | P1650 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSIYDTIGWFRQAPGKEREFVAATITTAGITTYDDSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCYVRVGRGDYWGQGTQVTVSS | 112 |
人類化B11及D04作為駱駝科版本經歷類似表徵步驟以確保構架區之人類化不會損害其生物物理學特徵、表現為CAR之能力或當存在於CAR上時其特性。
表 13. 人類化 B11 及 D04 之純化資料
DNA ID | PROT ID | VHH | 濃度 (mg/mL) | 體積 (mL) | 產量 (mg) | 單體% | 內毒素單位/mL |
P1376 | PROT1045 | huLysoB11 | 4.21 | 2.85 | 12.0 | >99 | <1 |
P1377 | PROT1046 | huLysoD04 | 3.17 | 4.20 | 13.3 | >99 | <1 |
如前所述,將各VHH CAR轉導至Jurkat細胞中。另外,將各VHH CAR轉導至Nurkat細胞(Jurkat細胞之Nur77報導細胞株(Nurkat))中。此細胞株含有對Nur77有反應之GFP報導體,該GFP報導體為藉由CD3z刺激活化且充當CAR活化之報告子的轉錄因子。因此,經由CAR在Nurkat細胞中活化使細胞表現GFP。圖13展示經含有人類化B11 (p1649)及D04 (p1648) CAR之慢病毒轉導的Nurkat細胞之CAR及GFP表現。UTD細胞為未經轉導之Nurkat細胞。使用多株抗駱駝VHH混合物(Genscript)量測CAR表現。此等結果指示B11及D04 VHH作為CAR之表現不受其序列人類化影響。另外,在此等CAR Nurkat中缺乏GFP表現展示由CAR之人類化版本介導之極少強直性信號傳導。
為確保作為人類化之結果各VHH之結合特徵無變化,吾等測試此等人類化VHH CAR是否仍可結合HEL。圖14展示分析之結果,其中B11 (p1649)及D04 (p1648) CAR Nurkat經生物素標記之HEL染色且經由流式細胞測量術用鏈黴抗生物素蛋白-APC偵測。UTD為作為陰性對照之未經轉導之Nurkat。B11及D04均保持其在人類化之後結合HEL之能力。
實例7. 針對B11及D04之抗個體基因型VHH之噬菌體呈現淘選
在噬菌體庫淘選中使用人類化B11及D04 VHH來識別針對各專一性具有專一性之抗ID VHH。合成VHH噬菌體庫係由主要藉由其CDR3序列之長度區分之四個子庫組成,其中庫1 (CNTY1)具有最短CDR長度,且庫3及4 (CNTY3及CNTY4)具有最長CDR長度。
所用之一個淘選方案展示於圖15中。在此方法中,藉由首先耗盡針對B11-Fc蛋白之庫針對D04發現抗個體基因型VHH。進行此以移除結合VHH之構架區及蛋白質之Fc部分的任何噬菌體。此耗盡的噬菌體輸出隨後在經生物素標記之D04-Fc蛋白上淘選。具有任何噬菌體結合物之經生物素標記之D04可經由鏈黴抗生物素蛋白分離。輸出噬菌體在細菌中擴增且在伴隨愈來愈嚴格的淘選條件下用於其他輪淘選。替代地,藉由噬菌體顯示之VHH可藉由ELISA測試與D04或B11蛋白質之結合、定序及選殖至表現載體中以用於更嚴格測試。此噬菌體庫淘選方法用於識別D04及B11兩者之VHH結合物。
此淘選方案隨著目標抗原濃度逐漸降低而重複4次以選擇高親和力結合物(對於第一輪及第二輪為200 nM,對於第三輪為50 nM,且對於第四輪為10 nM)。最後一輪淘選之輸出噬菌體用於將細菌轉型成單一群落,在ELISA中篩選作為周質提取物(PPE)針對目標VHH及非目標VHH (圖16)。
選擇對其目標蛋白展示專一性反應且對非目標蛋白具有極少反應之PPE樣本用於額外表徵。識別出6種獨特B11結合物及18種獨特D04結合物。將此等獨特序列選殖至Fc融合表現載體中用於進一步測試。此等蛋白質及標識符之序列展示於表14中。
表 14. 表現為 IgG1-Fc 融合物之抗個體基因型
實例8. 抗個體基因型VHH之專一性及親和力測試
Fc 融合物 Prot ID | 抗 Id VHH | 抗個體基因型 VHH 之 胺基酸序列 | SEQ ID NO |
源於靶向 D04 之淘選的抗個體基因型 | |||
AMD67 | huD04_CNTY2_F09 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSSGAMGWYRQAPGKERELVSAISNRGSTVYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAADRNPSSAGAGVAAYRLIARFNYWGQGTQVTVSS | 113 |
AMD68 | huD04_CNTY2_F08 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLSSYAMGWYRQAPGKEREGVSSISYAGVTNYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAAALTGYYAYRRLWSYRIGSQAYDYWGQGTQVTVSS | 114 |
AMD69 | huD04_CNTY2_E03 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGLTYTGYAMGWYRQAPGKERELVSAISSRSSIYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAAGRPVALGSWRRTATWSAGLGAEYAYWGQGTQVTVSS | 115 |
AMD70 | huD04_CNTY2_F04 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSSYGMGWYRQAPGKERELVSAISNRGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAASPARVGVSGHSSSRRSYYGYSYDYWGQGTQVTVSS | 116 |
AMD72 | huD04_CNTY2_H12 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIFSSDVMGWYRQAPGKERELVSAISSGGSTRYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAATMGKSKTNRRNYGTWRYGAYAYWGQGTQVTVSS | 117 |
AMD74 | huD04_CNTY2_F12 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSNAMGWYRQAPGKEREFVSSISSGRSTTYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAAHGTKYKWTRARLRSARQKQLETYRYWGQGTQVTVSS | 118 |
AMD77 | huD04_CNTY1_A11 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTSSNYVMGWYRQAPGKEREFVSAIGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTYLQMNSLRAEDTAVYYCAAEIYTSGARDYWGQGTQVTVSS | 119 |
AMD78 | huD04_CNTY2_C03 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGLTFSRYAMGWYRQAPGKERELVSAISSRRSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAADYRLTSLERARYASASITYDYWGQGTQVTVSS | 120 |
AMD79 | huD04_CNTY2_B06 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNRYSMGWYRQAPGKERELVSAISSGGSGYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAIQDYSRIWEYIALDRRRSYYGMDYWGQGTQVTVSS | 121 |
AMD80 | huD04_CNTY2_D02 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFRSYAMGWYRQAPGKEREGVSVISSGGTPSYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCDAIMGLVEADYVSTGTYEYTAYAYWGQGTQVTVSS | 122 |
AMD81 | huD04_CNTY2_D04 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGLTFSGVCMGWFRQAPGKEREGVSAIYSSGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAADRIPDLGEPCIGTTNLARTYNYWGQGTQVTVSS | 123 |
AMD82 | huD04_CNTY1_B12 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTSSNYVMGWYRQAPGKEREGVSAITSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAANLYSRTGAYDYWGQGTQVTVSS | 124 |
AMD84 | huD04_CNTY2_D05 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYIYSSYSMGWYRQAPAKNASLSAITSSGETYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAADALDAPIAGDRYYRGSGAGYAYWGQGTQVTVSS | 125 |
AMD85 | huD04_CNTY2_D12 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSAFSSNAMGWYRQAPGKERELVSAISSGGSTNYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAARNPLTYTALVSNAPSGDYYLFEYRLWGQGTQVTVSS | 126 |
AMD86 | huD04_CNTY1_D12 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTSSNYVMGWYRQAPGKEREGVSAISSSGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAAAYYSGYGETDYWGQGTQVTVSS | 127 |
AMD87 | huD04_CNTY1_D11 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTFSYYYMGWYRQAPGKERELVSAISSGGSIYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRTYYGDEADYWGQGTQVTVSS | 128 |
AMD88 | huD04_CNTY1_D10 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTSSNYVIGWYRQAPGKEREFVSAISGGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCATRIYTARGAGDYWGQGTQVTVSS | 129 |
源於靶向 B11 之淘選的抗個體基因型 | |||
AMD71 | huB11_CNTY3+4_A02 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTYTGSAMGWYRQAPGKERELVSAISTGGETYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAAGYVGLPYTYRPATSRRGYTYWGQGTQVTVSS | 130 |
AMD73 | huB11_CNTY3+4_A01 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYSIGWYRQAPGKERELVSVISSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAASDWSYSWITYTGTWRLYEYWGQGTQVTVSS | 131 |
AMD75 | huB11_CNTY1_E11 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFAFSDYVMGWYRQAPGKEREFVSAIRSTTSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAADVWSGYEYDYWGQGTQVTVSS | 132 |
AMD76 | huB11_CNTY1_B11 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGLAFSSYAMGWYRQAPGKEREFVSVISGTGETLYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAADVWSGYEYDYWGQGTQVTVSS | 133 |
為確定抗個體基因型之專一性及結合,經由FACS針對表現B11或D04 VHH CAR之Nurkat細胞測試Fc融合蛋白。
如圖17A-17B中所示,若干抗個體基因型在可忽略地與非目標CAR (例如AMD 71 (至B11)及AMD 69、AMD 77、AMD 82、AMD 84、AMD 87及AMD 88 (至D04))結合的濃度範圍內展示對CAR上之VHH的穩固且專一性結合。亦注意展示非專一性結合之少數結合物,其藉由結合至兩種細胞株(AMD 72及AMD 74)來指示。其中,選擇AMD 71、AMD 77、AMD 82、AMD 84、AMD 87及AMD 88用於進一步專一性測試。將經生物素標記之抗個體基因型VHH-Fc融合蛋白針對多種其他VHH CAR-Nurkat排列,且隨後偵測到經由FACS與彼等細胞株之任何結合。
圖 18展示經由FACS用鏈黴抗生物素蛋白-APC偵測之前導抗個體基因型經生物素標記之VHH-Fc與目標及非目標CAR Nurkat細胞之結合。所測試之細胞株包括B11、D04、P711、P712、P713、P716及親本細胞。B11及D04細胞分別為表現B11及D04 VHH CAR之CAR Nurkat細胞。P711、712、713、716細胞為非目標CAR Nurkat細胞。親本細胞為未經轉導之非CAR表現之Nurkat細胞。對照包括經生物素標記之蛋白A (其不專一性結合大多數VHH)、PROT786 (不相關的經生物素標記之VHH-Fc蛋白)及未添加之經生物素標記之蛋白質。前導VHH展現與非目標VHH CAR及親本Nurkat之結合可忽略,同時仍具有與目標VHH之穩固結合。
在一些情況下,形成通用CAR之「標記」及「抗標記」相互作用之基礎的專一性結合事件為平台安全概況之重要態樣。另外,溶菌酶VHH及單獨的抗個體基因型之結合事件不應足以引起CAR誘導之活化。為確定B11或D04與一或多種其可溶性抗個體基因型之結合在腫瘤抗原靶向VHH與可溶性蛋白質融合之情況下是否引起CAR誘導之活化,進行隔夜刺激分析,其中前導可溶性抗個體基因型Fc融合蛋白與其目標及非目標CAR Nurkat以及親本Nurkat一起培育。
圖 19A-19B展示使用經由FACS與10 nM抗個體基因型VHH Fc-融合物一起培育之Nurkat細胞之隔夜刺激分析的結果。
圖 19A展示在與抗個體基因型Fc-融合蛋白共培養隔夜之後B11及D04 CAR Nurkat細胞以及親本Nurkat細胞之GFP表現。
圖 19B展示在隔夜培育之後經由鏈黴抗生物素蛋白-APC偵測經生物素標記之蛋白質。對照包括PMA/離子黴素(引起穩固Nurkat細胞活化之TCR交聯劑)、經生物素標記之蛋白A及未添加蛋白質之樣本。與PMA/離子黴素誘導相比,抗個體基因型中無一者引起如藉由GFP表現所量測之Nurkat之可觀測活化。在隔夜培育之後,抗個體基因型亦可仍偵測到,指示若抗個體基因型觸發CAR活化,則分析中所用之抗原濃度足以在實驗過程中引起將可觀測到之活化。
對於經B11-his標記之VHH及經D04-his標記之VHH兩者之抗ID結合物,藉由Octet獲得親和力量測結果。
表 15. 針對經 B11 his 標記之蛋白質測試之抗個體基因型 VHH Fc- 融合蛋白之 Octet 結果
展示親和力值(KD)、結合速率(kon)、解離速率(kdis)及對於針對B11-his蛋白質之抗個體基因型VHH fc-融合蛋白之反應
表 16. 針對經 D04 his 標記之蛋白質測試之抗個體基因型 VHH Fc- 融合蛋白之 Octet 結果
展示親和力值(KD)、結合速率(kon)、解離速率(kdis)及對於針對B11-his蛋白質之抗個體基因型VHH fc-融合蛋白之反應。
樣本ID | KD (M) | kon(1/Ms) | kdis(1/s) | 反應 |
AMD71 | <1.0E-12 | 2.16E+03 | <1.0E-07 | 0.0062 |
AMD77 | 2.08E-09 | 6.96E+05 | 1.45E-03 | 0.497 |
AMD82 | 1.25E-07 | 6.97E+05 | 8.68E-02 | 0.1718 |
AMD87 | 3.69E-06 | 1.76E+04 | 6.49E-02 | 0.1306 |
AMD88 | 7.23E-08 | 5.88E+05 | 4.25E-02 | 0.2893 |
AMD84 | 1.85E-07 | 7.90E+05 | 1.47E-01 | 0.0991 |
PROT253 | NA | NA | NA | -0.05 |
樣本ID | KD (M) | kon(1/Ms) | kdis(1/s) | 反應 |
AMD71 | 5.15E-07 | 2.73E+05 | 1.40E-01 | 0.0566 |
AMD77 | 7.96E-08 | 3.54E+03* | 2.82E-04 | 0.1785 |
AMD82 | NA | NA | NA | -0.0225 |
AMD87 | NA | NA | NA | -0.0301 |
AMD88 | NA | NA | NA | -0.0183 |
AMD84 | NA | NA | NA | -0.0341 |
PROT253 | NA | NA | NA | -0.0648 |
抗個體基因型蛋白質展現2 nM (UNK D77至D04)至3.7 μM (AMD87至D04)之親和力範圍。為了經由Octet驗證兩種最高親和力結合物AMD77 (2 nM)及AMD88 (72 nM)之專一性,吾等測試各蛋白質針對其本身、其目標VHH、非目標VHH、來自血清之總人類IgG及Fc-y片段之結合。
表 17. 抗個體基因型 AMD77 及 AMD88 之 Octet 專一性分析
樣本ID | 分析物 | 反應 |
AMD77 | LysoD04.His | 0.3374 |
AMD77 | AMD77 | 0.0493 |
AMD77 | AMD88 | 0.2773 |
AMD77 | IgG | -0.0155 |
AMD77 | Fc | -0.009 |
AMD77 | PROT939 | -0.0053 |
AMD77 | LysoD04.Fc | 2.6741 |
AMD88 | LysoD04.His | 0.0923 |
AMD88 | AMD77 | 0.0229 |
AMD88 | AMD88 | 0.1492 |
AMD88 | IgG | -0.0338 |
AMD88 | Fc | -0.0261 |
AMD88 | PROT939 | -0.024 |
AMD88 | LysoD04.Fc | 2.1784 |
針對分析物D04-his、AMD77、AMD88、來自血清之IgG、Fc-y片段、PROT939 (非目標VHH-fc可溶性)及D04-fc測試各樣本(AMD77或AMD88)。反應值展示於表17中。AMD77及AMD88均展示對人類IgG、Fc及非目標VHH-fc PROT939之最低反應,同時維持對D04-his及D04-Fc之強反應。AMD88展示對自身及AMD77之反應。AMD77不與自身締合。
實例9. 橋蛋白設計
橋蛋白含有VHH arCAR結合物及靶向腫瘤之VHH,在此實例中尤其含有抗CD70及抗EGFR。在Fc域存在及不存在下構築此等橋蛋白,該Fc域將在活體內充當半衰期延長劑。為達成通用CAR之專一性,設計橋蛋白,將所選抗個體基因型併入與D04 CAR搭配之D04或搭配有抗ID至D04之可溶性橋蛋白上之D04作為CAR。
表 18. 無 Fc 之橋蛋白: VHH1 - 連接子 -VHH2
表 19. 具有 VHH1- whitlow - VHH2- IgG1 Fc 構築體之橋蛋白
表 20. 具有 VHH-IgG1 Fc-(G4S)1-VHH 構築體之橋蛋白
實例 10. D04 CAR 及 huD04_CNTY1_D10 橋之 T 細胞 細胞毒性
蛋白質ID | VHH1 | VHH2 | 連接子 | 腫瘤目標 |
AMD1 | CD70W_DB02_D08 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD2 | CD70W_DB02_D08 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD3 | CD70W_DB02_G07 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD4 | CD70W_DB02_G07 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD5 | CD70W_DB02_G08 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD6 | CD70W_DB02_G08 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD7 | CD70W_DB02_G09 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD8 | CD70W_DB02_G09 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD9 | CD70W_DB02_E01 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD10 | CD70W_DB02_E01 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD11 | CD70W_DB02_E06 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD12 | CD70W_DB02_E06 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD13 | CD70W_DB02_D08 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD14 | CD70W_DB02_D08 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD15 | CD70W_DB02_G07 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD16 | CD70W_DB02_G07 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD17 | CD70W_DB02_G08 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD18 | CD70W_DB02_G08 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD19 | CD70W_DB02_G09 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD20 | CD70W_DB02_G09 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD21 | CD70W_DB02_E01 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD22 | CD70W_DB02_E01 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD23 | CD70W_DB02_E06 | huLysoB11 | (G4S)3 | CD70 |
AMD24 | CD70W_DB02_E06 | huLysoB11 | WHITLOW | CD70 |
AMD25 | CD70W_DB02_D08 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD26 | CD70W_DB02_D08 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD27 | CD70W_DB02_G07 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD28 | CD70W_DB02_G07 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD29 | CD70W_DB02_G08 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD30 | CD70W_DB02_G08 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD31 | CD70W_DB02_G09 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD32 | CD70W_DB02_G09 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD33 | CD70W_DB02_E01 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD34 | CD70W_DB02_E01 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD35 | CD70W_DB02_E06 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD36 | CD70W_DB02_E06 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD37 | CD70W_DB02_D08 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD38 | CD70W_DB02_D08 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD39 | CD70W_DB02_G07 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD40 | CD70W_DB02_G07 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD41 | CD70W_DB02_G08 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD42 | CD70W_DB02_G08 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD43 | CD70W_DB02_G09 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD44 | CD70W_DB02_G09 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD45 | CD70W_DB02_E01 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD46 | CD70W_DB02_E01 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
AMD47 | CD70W_DB02_E06 | huLysoD04 | (G4S)3 | CD70 |
AMD48 | CD70W_DB02_E06 | huLysoD04 | WHITLOW | CD70 |
蛋白質ID | VHH1 | VHH2 | 腫瘤目標 |
AMD99 | huD04_CNTY1_A11 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD100 | huD04_CNTY1_B12 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD101 | huD04_CNTY1_D10 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD102 | CD70W_DB02_G08 | huD04_CNTY1_A11 | CD70 |
AMD103 | CD70W_DB02_G08 | huD04_CNTY1_B12 | CD70 |
AMD104 | CD70W_DB02_G08 | huD04_CNTY1_D10 | CD70 |
AMD105 | huLysoD04 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD106 | CD70W_DB02_G08 | huLysoD04 | CD70 |
AMD107 | huD04_CNTY1_A11 | 9G8 | EGFR |
AMD108 | huD04_CNTY1_B12 | 9G8 | EGFR |
AMD109 | huD04_CNTY1_D10 | 9G8 | EGFR |
AMD110 | 9G8 | huD04_CNTY1_A11 | EGFR |
AMD111 | 9G8 | huD04_CNTY1_B12 | EGFR |
AMD112 | 9G8 | huD04_CNTY1_D10 | EGFR |
AMD113 | huLysoD04 | 9G8 | EGFR |
AMD114 | 9G8 | huLysoD04 | EGFR |
樣本ID | VHH1 | VHH2 | 腫瘤目標 |
AMD115 | huD04_CNTY1_A11 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD116 | huD04_CNTY1_B12 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD117 | huD04_CNTY1_D10 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD118 | CD70W_DB02_G08 | huD04_CNTY1_A11 | CD70 |
AMD119 | CD70W_DB02_G08 | huD04_CNTY1_B12 | CD70 |
AMD120 | CD70W_DB02_G08 | huD04_CNTY1_D10 | CD70 |
AMD121 | huLysoD04 | CD70W_DB02_G08 | CD70 |
AMD122 | CD70W_DB02_G08 | huLysoD04 | CD70 |
AMD123 | huD04_CNTY1_A11 | 9G8 | EGFR |
AMD124 | huD04_CNTY1_B12 | 9G8 | EGFR |
AMD125 | huD04_CNTY1_D10 | 9G8 | EGFR |
AMD126 | 9G8 | huD04_CNTY1_A11 | EGFR |
AMD127 | 9G8 | huD04_CNTY1_B12 | EGFR |
AMD128 | 9G8 | huD04_CNTY1_D10 | EGFR |
AMD129 | huLysoD04 | 9G8 | EGFR |
AMD130 | 9G8 | huLysoD04 | EGFR |
為確定通用平台是否可藉由T細胞介導細胞毒性,吾人創建由來自AMD88蛋白質之VHH組成之橋蛋白,(huD04_CNTY1_D10)藉由Whitlow連接子以串聯方式連接至靶向EGFR之VHH 9G8,融合至IgG1 Fc片段(表19)。在T細胞細胞毒性分析中,藉由表現D04 CAR之初級T細胞測試各橋蛋白。
表 21. AMD109 及 AMD112 橋蛋白之蛋白質濃度及單體百分比
DNA ID | 濃度(mg/mL) | 單體% |
AMD109 | 0.35 | 97.40 |
AMD112 | 0.46 | 97.34 |
藉由共培養CAR T細胞進行殺死分析,其中經CellTrace紫以效應子:目標為1:2加標籤之EGFR陽性細胞,針對T細胞之CAR陽性百分比進行調節48小時。5 nM橋樑,AMD109 (圖20A)或AMD112 (圖20B)。
如圖20A-20B中所示,當橋及CAR『匹配』時(例如抗個體基因型VHH存在於橋蛋白上,而其目標VHH存在於CAR上),觀測到EGFR陽性細胞之穩固細胞毒性,如在表現P1650 CAR之T細胞的情況下,其在CAR上具有D04 (huD04_CNTY1_D10,可溶性橋蛋白上之抗個體基因型至D04)。此細胞毒活性與9G8 CAR相當。當CAR與橋不匹配時,與CAR AMD94或NONS F12 CAR一樣,未觀測到細胞毒性。
* * *
本發明之範疇不受本文所描述之特定實施例限制。實際上,根據前述描述,除本文所描述之修改之外,本發明之各種修改對熟習此項技術者而言亦會變得顯而易見。此等修改意欲屬於隨附申請專利範圍之範疇內。
本文所引用之所有專利、申請案、公開案、測試方法、文獻及其他材料均以全文引用之方式併入本文中,如同在本說明書中物理上存在一般。
圖 1描繪具有本發明之可調適受體專一性(arCAR)之例示性CAR的示意性圖示。CAR結合至可溶性藥物上之「標記」。可溶性藥物可為抗體或抗體片段(例如VHH、scFv、Fab、mAb)或替代骨架。腫瘤專一性及CAR活化由可溶性藥物驅動。
圖 2A描繪本發明之另一例示性arCAR之示意性圖示。VHH用於可溶性藥物中之抗原結合域及標記兩者以及arCAR之標記結合域(α-標記)。
圖 2B說明抗個體基因型mAb之結構特徵。
圖 2C說明例示性VHH結構之結構特徵。
圖 2D描繪本發明之另一例示性arCAR之示意性圖示。非人類靈長類動物(NHP) VHH及抗個體基因型NHP VHH用於可溶性藥物以及arCAR之標記結合域。
圖 3A描繪本發明之另一例示性arCAR之示意性圖示。
圖 3B描繪本發明之另一例示性arCAR之示意性圖示。
圖 4A描繪本發明之另一例示性arCAR之示意性圖示。赫賽汀(Herceptin) scFv與CAR融合且赫賽汀抗ID scFv與靶向EGFR之VHH (9G8)融合。
圖 4B展示表現赫賽汀scFv CAR與9G8-scFv69融合蛋白偶合之T細胞能夠靶向EGFR+細胞。
圖 5描繪用於遞送本發明之CAR構築體之慢病毒載體的載體圖譜。
圖 6A描繪用於表現本發明之橋構築體之質體的載體圖譜。
圖 6B展示凝膠電泳影像,其展現橋蛋白質之純度。
圖 7A描繪scFv69-CAR及橋蛋白質之兩種變體之示意性圖示:9G8_赫賽汀scFv及赫賽汀scFv 9G8。
圖 7B表明scFv69-CAR與橋蛋白質之結合。該圖中之樣本按以下次序呈現:9G8_赫賽汀、赫賽汀_9G8。
圖 8A表明EGFR在經EGFR轉導之CHO細胞上之表現。
圖 8B表明T細胞中之CAR表現。
圖 9A-9B展示通用CAR-T細胞在與適當橋蛋白質配對時展現CD25活化(
圖 9A)但在與橋蛋白質錯配時並不如此(
圖 9B)。圖中之樣本按如圖例中所指定之次序呈現。
圖 10A 、 10B展示通用CAR-T細胞在與適當橋蛋白質配對時展現細胞毒活性(
圖 10A)但在與橋蛋白質錯配時並不如此(
圖 10B)。圖中之樣本按如圖例中所指定之次序呈現。
圖 11A描繪用於遞送本發明之VHH CAR之慢病毒載體的載體圖譜。
圖 11B展示Jurkat細胞上VHH CAR之表現。
圖 11C展示經Jurkat細胞轉導之VHH CAR之表面上缺乏強直性信號傳導。
圖 11D展示用於圖11C中之CD69偵測的FAC閘控策略。
圖 11E展示抗雞卵溶菌酶-VHH CAR與來自雞或人類之溶菌酶之結合。
圖 11F展示靶向嗜熱脂肪地芽孢桿菌之VHH之胺基酸序列(SEQ ID NO: 96)、LYSO_CW_P01_B11 (SEQ ID NO: 102)及LYSO_CW_P01_D04 (SEQ ID NO: 104)之比對。共同序列展示於比對序列(SEQ ID NO: 134)上方。
圖 12A-12K展示用於arCAR概念驗證研究之質體映射p510、p511、p514、p515、p516、p517、p518、p519、p520、p521及p522。
圖 13展示經含有人類化B11 (p1649)及D04 (p1648) CAR之慢病毒(LV)轉導的Nurkat細胞(Jurkat細胞之Nur77報導株)之CAR及GFP表現。亦展示未經轉導(UTD)之Nurkat之結果。CAR表現係藉由來自Genscript之多株抗駱駝VHH混合物量測(例如,用於穩健偵測之VHH之人類化版本與駱駝科版本之間足夠的同源性)。
圖 14展示經生物素標記之HEL染色之B11 (p1649)及D04 (p1648) CAR Nurkat細胞,該等細胞經由流式細胞測量術用鏈黴抗生物素蛋白-APC偵測。UTD為用作陰性對照之未經轉導之Nurkat細胞。
圖 15展示噬菌體呈現淘選方案之概述。針對D04之抗個體基因型發現之方案展示為一實例。同樣,對於針對B11之抗個體基因型發現,兩個VHH將在圖式中調換位置。
圖
16A-16D展示對各CNTY庫群落達成之周質提取物(PPE) ELISA輸出(450 nm處之吸收率)。黑色條表示針對B11蛋白質之ELISA反應,而灰色條表示針對D04蛋白質之反應。
圖 17A-17B展示抗個體基因型VHH-Fc融合構築體與(
圖 17A) B11及(
圖 17B)無基於IgG之連接子的D04表現CAR之Nurkat細胞之FACS結合。虛線概述識別來自表15的在ELISA中觀測到結合D04之所選蛋白質。點線輪廓識別來自表16的在ELISA中觀測到結合B11之所選蛋白質。以50 nM降至0.02 pM之3倍稀釋數列對兩種細胞株測試各蛋白質(如圖例中所示)。經由抗Fc APC偵測Fc融合蛋白,且展示對此偵測方法呈陽性之細胞之百分比。展示向下稀釋數列與其目標細胞株專一性結合之蛋白質低於蛋白質ID。對照包括(i)無VHH-Fc添加及(ii)抗VHH混合物偵測試劑(遠右端)。各蛋白質之曲線圖中所示之樣本以圖例中指定之次序呈現。
圖 18展示經由FACS用鏈黴抗生物素蛋白-APC偵測之前導抗個體基因型經生物素標記之VHH-Fc與目標及非目標CAR Nurkat細胞之結合。所測試之細胞株包括B11、D04、P711、P712、P713、P716及親本細胞。B11及D04細胞分別為表現B11及D04 VHH CAR之CAR Nurkat。P711、P712、P713、P716細胞為非目標CAR Nurkat。親本細胞為未經轉導之非CAR表現之Nurkat。對照包括經生物素標記之蛋白A (其不專一性結合大多數VHH)、PROT786 (不相關的經生物素標記之VHH-Fc蛋白)及未添加之經生物素標記之蛋白質。各蛋白質之曲線圖中所示之樣本以圖例中指定之次序呈現。
圖 19A-19B展示使用經由FACS與10 nM抗個體基因型VHH Fc-融合物一起培育之Nurkat細胞之隔夜刺激分析的結果。(
圖 19A)在與抗個體基因型Fc-融合蛋白共培養隔夜之後B11及D04 CAR Nurkat細胞以及親本Nurkat細胞之GFP表現。(
圖 19B)在隔夜培育之後經由鏈黴抗生物素蛋白-APC偵測經生物素標記之蛋白質。對照包括PMA/離子黴素(引起穩固Nurkat細胞活化之TCR交聯劑)、經生物素標記之蛋白A及未添加蛋白質之樣本。各蛋白質之曲線圖中所示之樣本以圖例中指定之次序呈現。
圖 20A-20B展示相同T細胞殺死分析之結果,其中任一橋蛋白質(
圖 20A) AMD109或(
圖 20B) AMD112以5 nM添加。對於U87目標細胞或K562目標細胞展示死亡目標百分比。
<![CDATA[<110> 美商世紀治療股份有限公司(Century Therapeutics, Inc.)]]> <![CDATA[<120> 具有可調適受體專一性之嵌合抗原受體系統 ]]> <![CDATA[<130> CNTY-004-WO-01]]> <![CDATA[<140> TW 110147458]]> <![CDATA[<141> 2021-12-17]]> <![CDATA[<150> 63/127,587]]> <![CDATA[<151> 2020-12-18]]> <![CDATA[<160> 134 ]]> <![CDATA[<170> PatentIn version 3.5]]> <![CDATA[<210> 1]]> <![CDATA[<211> 22]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 智人]]> <![CDATA[<400> 1]]> Met Leu Leu Leu Val Thr Ser Leu Leu Leu Cys Glu Leu Pro His Pro 1 5 10 15 Ala Phe Leu Leu Ile Pro 20 <![CDATA[<210> 2]]> <![CDATA[<211> 120]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> FMC63 VH]]> <![CDATA[<400> 2]]> Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln 1 5 10 15 Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr 20 25 30 Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu 35 40 45 Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys 50 55 60 Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser 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32]]> Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15 Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 20 25 <![CDATA[<210> 33]]> <![CDATA[<211> 14]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子10]]> <![CDATA[<400> 33]]> Ile Arg Pro Arg Ala Ile Gly Gly Ser Lys Pro Arg Val Ala 1 5 10 <![CDATA[<210> 34]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子11]]> <![CDATA[<400> 34]]> Gly Lys Gly Gly Ser Gly Lys Gly Gly Ser Gly Lys Gly Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 35]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子12]]> <![CDATA[<400> 35]]> Gly Gly Lys Gly Ser Gly Gly Lys Gly Ser Gly Gly Lys Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 36]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子13]]> <![CDATA[<400> 36]]> Gly Gly Gly Lys Ser Gly Gly Gly Lys Ser Gly Gly Gly Lys Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 37]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子14]]> <![CDATA[<400> 37]]> Gly Lys Gly Lys Ser Gly Lys Gly Lys Ser Gly Lys Gly Lys Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 38]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子15]]> <![CDATA[<400> 38]]> Gly Gly Gly Lys Ser Gly Gly Lys Gly Ser Gly Lys Gly Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 39]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子16]]> <![CDATA[<400> 39]]> Gly Lys Pro Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 40]]> <![CDATA[<211> 20]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子17]]> <![CDATA[<400> 40]]> Gly Lys Pro Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly 1 5 10 15 Lys Pro Gly Ser 20 <![CDATA[<210> 41]]> <![CDATA[<211> 20]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子18]]> <![CDATA[<400> 41]]> Gly Lys Gly Lys Ser Gly Lys Gly Lys Ser Gly Lys Gly Lys Ser Gly 1 5 10 15 Lys Gly Lys Ser 20 <![CDATA[<210> 42]]> <![CDATA[<211> 14]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子19]]> <![CDATA[<400> 42]]> Ser Thr Ala Gly Asp Thr His Leu Gly Gly Glu Asp Phe Asp 1 5 10 <![CDATA[<210> 43]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子20]]> <![CDATA[<400> 43]]> Gly Glu Gly Gly Ser Gly Glu Gly Gly Ser Gly Glu Gly Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 44]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子21]]> <![CDATA[<400> 44]]> Gly Gly Glu Gly Ser Gly Gly Glu Gly Ser Gly Gly Glu Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 45]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子22]]> <![CDATA[<400> 45]]> Gly Glu Gly Glu Ser Gly Glu Gly Glu Ser Gly Glu Gly Glu Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 46]]> <![CDATA[<211> 15]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子23]]> <![CDATA[<400> 46]]> Gly Gly Gly Glu Ser Gly Gly Glu Gly Ser Gly Glu Gly Gly Ser 1 5 10 15 <![CDATA[<210> 47]]> <![CDATA[<211> 20]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子24]]> <![CDATA[<400> 47]]> Gly Glu Gly Glu Ser Gly Glu Gly Glu Ser Gly Glu Gly Glu Ser Gly 1 5 10 15 Glu Gly Glu Ser 20 <![CDATA[<210> 48]]> <![CDATA[<211> 18]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子25]]> <![CDATA[<400> 48]]> Gly Ser Thr Ser Gly Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr 1 5 10 15 Lys Gly <![CDATA[<210> 49]]> <![CDATA[<211> 19]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 連接子26]]> <![CDATA[<400> 49]]> Pro Arg Gly Ala Ser Lys Ser Gly Ser Ala Ser Gln Thr Gly Ser Ala 1 5 10 15 Pro Gly Ser <![CDATA[<210> 50]]> <![CDATA[<211> 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<![CDATA[<400> 63]]> gagagcaagt atgggccccc ttgtcctcct tgtccg 36 <![CDATA[<210> 64]]> <![CDATA[<211> 12]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 短鉸鏈]]> <![CDATA[<400> 64]]> Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro 1 5 10 <![CDATA[<210> 65]]> <![CDATA[<211> 357]]> <![CDATA[<212> DNA]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 中等鉸鏈]]> <![CDATA[<400> 65]]> gagagcaagt atgggccccc ttgtcctcct tgtccggggc agccccgaga gccacaggtg 60 tacactctgc caccaagtca ggaggagatg accaagaacc aggtcagcct gacctgcctg 120 gtcaaaggct tctaccccag cgacatcgcc gtggagtggg agagcaatgg gcagccggag 180 aacaactaca agaccacgcc tcccgtgctg gactccgacg gctccttctt cctctacagc 240 aggctcaccg tggacaagag caggtggcag gaggggaatg tcttctcatg ctccgtgatg 300 catgaggctc tgcacaacca ctacacacag aagagcctct ccctgtctct gggaaag 357 <![CDATA[<210> 66]]> <![CDATA[<211> 119]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 中等鉸鏈]]> <![CDATA[<400> 66]]> Glu Ser Lys Tyr 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caccaggact ggctgaacgg caaggagtat 300 aagtgtaagg tctccaataa aggcctcccg tcatcgatcg aaaaaaccat cagtaaagcc 360 aaagggcagc caagggagcc acaggtgtat actttaccac caagtcagga ggaaatgacc 420 aagaaccagg tatctctgac ctgcctagtc aaaggctttt accccagcga tatcgctgtg 480 gagtgggagt ctaatgggca gccagagaac aactacaaga ccacacctcc tgtgctggac 540 tccgatggct ccttctttct atacagcagg ttaaccgtgg ataagagcag gtggcaggag 600 gggaatgtct tctcatgctc tgtgatgcat gaggctctgc acaaccacta cacacagaag 660 agcctctccc tgtctctggg aaag 684 <![CDATA[<210> 68]]> <![CDATA[<211> 228]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 長鉸鏈]]> <![CDATA[<400> 68]]> Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Pro Val 1 5 10 15 Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu 20 25 30 Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser 35 40 45 Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu 50 55 60 Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Gln Ser Thr 65 70 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120 ggcaaggctc ctaagctgtt aatctacagc gccagcttcc tttatagtgg agtgccttca 180 aggttctcag gatctaggtc cggtactgac ttcacgctga caatctcgag cctacaaccc 240 gaggacttcg ccacttatta ctgccagcag cattacacta ctcctcccac attcggacag 300 ggaaccaaag tcgagatcaa aggatcaacc tctggatctg gcaagcccgg gagcggggaa 360 ggctctacta agggtgaggt gcaactagtg gagagtggcg gagggctcgt ccagccagga 420 ggttccctga ggctgagttg cgctgcaagc ggattcaata tcaaggacac gtacatacac 480 tgggtgcgcc aggcccccgg aaagggactg gagtgggtcg cccgaatcta tcctactaat 540 ggctacacca ggtatgctga ttcagtgaaa ggaaggttta caatctctgc cgatacttca 600 aagaatacag cttatctaca gatgaattca cttagagccg aggatacagc cgtgtattat 660 tgctcccgat ggggaggaga tgggttctac gctatggact actggggtca aggaaccctg 720 gtgaccgtta gttca 735 <![CDATA[<210> 70]]> <![CDATA[<211> 245]]> <![CDATA[<212> PRT]]> <![CDATA[<213> 人工序列]]> <![CDATA[<220>]]> <![CDATA[<223> 赫賽汀scFv]]> <![CDATA[<400> 70]]> Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 1 5 10 15 Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Asn Thr Ala 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro 65 70 75 80 Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Thr Thr Pro Pro 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Gly Ser Thr Ser Gly 100 105 110 Ser Gly Lys Pro Gly Ser Gly Glu Gly Ser Thr Lys Gly Glu Val Gln 115 120 125 Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg 130 135 140 Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr Tyr Ile His 145 150 155 160 Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Arg Ile 165 170 175 Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg 180 185 190 Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gln Met 195 200 205 Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ser Arg Trp 210 215 220 Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu 225 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Claims (63)
- 一種具有可調適受體專一性組分之通用嵌合抗原受體系統(arCAR),其包含 (i) 具有嵌合抗原受體的免疫效應細胞,該嵌合抗原受體包含第一多肽,該第一多肽包含: (a) 胞外標記結合域, (b) 跨膜域,及 (c) 至少一個胞內信號傳導域;以及 (ii) 第二多肽,其包含: (a) 結合至目標細胞上之至少一種抗原之抗原結合域,及 (b) 由該標記結合域識別之標記; 其中: (i) 該標記包含抗體、其抗原結合片段或替代骨架,且 該標記結合域包含結合至該標記之抗個體基因型分子;或 (ii) 該標記包含結合至該標記結合域之抗個體基因型分子,且 該標記結合域包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
- 如請求項1之arCAR系統,其中該抗個體基因型分子結合至該抗體、其抗原結合片段或替代骨架之至少一個抗原結合區。
- 如請求項1或2之arCAR系統,其中該抗個體基因型分子結合至該抗體或其抗原結合片段之至少一個互補決定區(CDR)。
- 如請求項1至3中任一項之arCAR系統,其中該第二多肽之該抗原結合域包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
- 如請求項1至4中任一項之arCAR系統,其中該抗個體基因型分子為抗個體基因型抗體或其抗原結合片段或抗個體基因型替代骨架。
- 如請求項1至5中任一項之arCAR系統,其中該抗原結合片段為Fab片段、Fab'片段、F(ab')2片段、scFv片段、Fv片段、dsFv雙功能抗體、VHH、VNAR、單域抗體(sdAb)或奈米抗體、dAb片段、Fd'片段、Fd片段、重鏈可變區、經分離之互補決定區(CDR)、雙功能抗體、三功能抗體或十功能抗體。
- 如請求項1至6中任一項之arCAR系統,其中該胞外標記結合域、該抗原結合域及該標記中之至少一者包含單域抗體或奈米抗體。
- 如請求項1至7中任一項之arCAR系統,其中該胞外標記結合域、該抗原結合域及該標記中之至少一者包含VHH。
- 如請求項1至8中任一項之arCAR系統,其中該胞外標記結合域及該標記各自包含VHH。
- 如請求項1至9中任一項之arCAR系統,其中該胞外標記結合域、該標記及該抗原結合域各自包含VHH。
- 如請求項6至10中任一項之arCAR系統,其中該抗原結合片段、該胞外標記結合域、該抗原結合域及該標記中之一或多者包含與選自由以下組成之群的序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性之多肽序列:SEQ ID NO.: 84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108及110-133。
- 如請求項1至6中任一項之arCAR系統,其中該胞外標記結合域、該抗原結合域及該標記中之至少一者包含scFv。
- 如請求項1至12中任一項之arCAR系統,其中該替代骨架為阿非林(Affilin)或生替林(Centyrin)。
- 如請求項1至13中任一項之arCAR系統,其中該標記包含抗體或其抗原結合片段或替代骨架。
- 如請求項14之arCAR系統,其中該抗體或其抗原結合片段或替代骨架結合至來自非人類來源之多肽。
- 如請求項15之arCAR系統,其中源於非人類來源之該多肽為呼吸道融合性病毒(RSV) F蛋白、李氏菌內化蛋白(Listeria internalin)、眼鏡蛇磷脂酶A2、伊波拉核蛋白(Ebola nucleoprotein)、疱疹單純型病毒(herpes simplex virus;HSV)糖蛋白D、乳球菌噬菌體受體結合蛋白(RBP)、嗜熱脂肪地芽孢桿菌( Geobacillus stearothermophilus)、蓖麻毒素或雞卵白溶菌酶。
- 如請求項1至16中任一項之arCAR系統,其中該抗原結合域結合至至少一種腫瘤抗原或自體免疫抗原。
- 如請求項17之arCAR系統,其中該至少一種抗原與相同腫瘤或自體免疫疾病相關。
- 如請求項17或18之arCAR系統,其中該腫瘤抗原與神經膠母細胞瘤、卵巢癌、子宮頸癌、頭頸癌、肝癌、前列腺癌、胰臟癌、腎細胞癌、膀胱癌或血液惡性病相關。
- 如請求項19之arCAR系統,其中與神經膠母細胞瘤相關之該腫瘤抗原為HER2、EGFRvIII、EGFR、CD133、PDGFRA、FGFR1、FGFR3、MET或IL13Rα2。
- 如請求項19之arCAR系統,其中與卵巢癌相關之該腫瘤抗原為FOLR1、FSHR、MUC16、MUC1、間皮素、CA125、EpCAM、EGFR、PDGFRα或B7H4。
- 如請求項19之arCAR系統,其中與子宮頸癌或頭頸癌相關之該腫瘤抗原為GD2、MUC1、間皮素、HER2或EGFR。
- 如請求項19之arCAR系統,其中與肝癌相關之該腫瘤抗原為緊密連接蛋白18.2、GPC-3、EpCAM、cMET或AFP。
- 如請求項1至23中任一項之arCAR系統,其中該抗個體基因型分子、抗體及/或抗體片段為人類化的。
- 如請求項1至24中任一項之arCAR系統,其中該跨膜域進一步包含鉸鏈域。
- 如請求項25之arCAR系統,其中該跨膜域及/或鉸鏈域源於CD8或CD28。
- 如請求項1至26中任一項之arCAR系統,其中該至少一個胞內信號傳導域包含CD3ζ信號傳導域。
- 如請求項1至27中任一項之arCAR系統,其中該至少一個胞內信號傳導域包含一或多個共刺激信號傳導域。
- 如請求項28之arCAR系統,其中該一或多個共刺激信號傳導域源於CD28、41BB、IL2Rb、CD40、OX40、CD80、CD86、CD27、ICOS、NKG2D、DAP10、DAP12或2B4 (CD244)。
- 如請求項1至29中任一項之arCAR系統,其中該第二多肽包含N端處之該抗原結合域及C端處之該標記。
- 如請求項1至29中任一項之arCAR系統,其中該第二多肽包含C端處之該抗原結合域及N端處之該標記。
- 如請求項1至31中任一項之arCAR系統,其中該第二多肽為可溶性多肽。
- 如請求項1至32中任一項之arCAR系統,其中該免疫效應細胞為T細胞、自然殺手(NK)細胞、細胞毒性T淋巴細胞(CTL)、調節T細胞或腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)、樹突狀細胞或巨噬細胞。
- 如請求項33之arCAR系統,其中該免疫效應細胞衍生自誘導性富潛能幹細胞(induced pluripotent stem cell;iPSC)。
- 如請求項34之arCAR系統,其中該免疫效應細胞為衍生自誘導性富潛能幹細胞(iPSC)之T細胞或NK細胞。
- 如請求項1至35中任一項之arCAR系統,其中該arCAR進一步包含一或多種多肽,其各自包含(a)結合至獨特抗原之抗原結合域及(b)由該第一多肽之該標記結合域識別之標記。
- 一種arCAR系統,其包含兩種或更多種如請求項1至36中任一項之arCAR,其中各arCAR包含一對獨特的標記及標記結合域。
- 一種聚核苷酸,其編碼如請求項1至36中任一項之arCAR系統之該第一多肽。
- 一種聚核苷酸,其編碼如請求項1至36中任一項之arCAR系統之該第二多肽。
- 一種聚核苷酸,其編碼如請求項1至36中任一項之arCAR之該第一多肽及該第二多肽。
- 如請求項38至40中任一項之聚核苷酸,其中該抗原結合片段、該胞外標記結合域、該抗原結合域及該標記中之一或多者至少部分由與選自由以下組成之群的序列具有至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性之聚核苷酸序列編碼:SEQ ID NO.: 83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107及109。
- 一種重組載體,其包含如請求項38至41中任一項之聚核苷酸。
- 如請求項42之重組載體,其中該載體為質體。
- 一種宿主細胞,其包含表現如請求項1至37中任一項之第一多肽的聚核苷酸。
- 一種宿主細胞,其包含表現如請求項1至37中任一項之第二多肽的聚核苷酸。
- 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至37中任一項之免疫效應細胞及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。
- 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至37中任一項之第二多肽及醫藥學上可接受之載劑及/或賦形劑。
- 一種套組,其包含組合的如請求項46之醫藥組合物及如請求項47之醫藥組合物。
- 一種製備如請求項44之宿主細胞的方法,其包含將如請求項38之聚核苷酸或包含該聚核苷酸之重組載體引入該細胞中。
- 一種製備如請求項45之宿主細胞的方法,其包含將如請求項39之聚核苷酸或包含該聚核苷酸之重組載體引入該細胞中。
- 一種治療有需要之個體之疾病的方法,其包含向該個體投與治療有效量之: (i) 包含嵌合抗原受體之免疫效應細胞,該嵌合抗原受體包含如請求項1至36中任一項之arCAR的該第一多肽,及 (ii) 該arCAR之該第二多肽、編碼該第二多肽之聚核苷酸或包含該第二多肽之宿主細胞。
- 如請求項51之方法,其中該第二多肽係在該免疫效應細胞之前、之後或與其一起投與。
- 一種治療有需要之個體之疾病的方法,其包含向該個體投與治療有效量之: (i) 免疫效應細胞,其包含兩種或更多種arCAR之第一多肽,其中該兩種或更多種arCAR係選自如請求項37之arCAR系統,及 (ii) 該兩種或更多種arCAR之第二多肽,或編碼該等第二多肽之一或多種聚核苷酸,或包含該等第二多肽之一或多種宿主細胞。
- 如請求項51至53中任一項之方法,其中該免疫效應細胞為T細胞、自然殺手(NK)細胞、細胞毒性T淋巴細胞(CTL)、調節T細胞或腫瘤浸潤性淋巴細胞(TIL)、樹突狀細胞或巨噬細胞。
- 如請求項51至53中任一項之方法,其中該免疫效應細胞衍生自iPSC。
- 如請求項51至55中任一項之方法,其中該免疫效應細胞組成性表現該第一多肽。
- 如請求項51至56中任一項之方法,其中該疾病為癌症或自體免疫疾病。
- 如請求項57之方法,其中該癌症為神經膠母細胞瘤、卵巢癌、子宮頸癌、頭頸癌、肝癌、前列腺癌、胰臟癌、腎細胞癌、膀胱癌或血液惡性病。
- 如請求項51至58中任一項之方法,其中該免疫效應細胞與該一或多種第二多肽同時投與。
- 如請求項51至58中任一項之方法,其中該免疫效應細胞與該一或多種第二多肽依序投與。
- 如請求項51至60中任一項之方法,其中該免疫效應細胞為自體細胞。
- 如請求項51至60中任一項之方法,其中該免疫效應細胞為同種異體細胞。
- 如請求項51至62中任一項之方法,其中該個體為人類。
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