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TW201733597A - 用於減少tau表現之組合物及方法 - Google Patents

用於減少tau表現之組合物及方法 Download PDF

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TW201733597A
TW201733597A TW105142107A TW105142107A TW201733597A TW 201733597 A TW201733597 A TW 201733597A TW 105142107 A TW105142107 A TW 105142107A TW 105142107 A TW105142107 A TW 105142107A TW 201733597 A TW201733597 A TW 201733597A
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歐芬吉姆 曼努埃拉 波里多羅
珍 韋勒
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諾華公司
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Abstract

本發明提供用於減少tau mRNA及蛋白質表現之組合物及方法。此等組合物及方法適用於治療tau相關疾病及病症。

Description

用於減少TAU表現之組合物及方法
本發明提供用於減少tau mRNA及蛋白質表現之組合物及方法。此等組合物及方法適用於治療tau相關疾病。
Tau為使微管穩定且有助於軸突轉運之微管相關蛋白質。Tau蛋白質與微管蛋白相互作用以使微管穩定且促使微管蛋白裝配成微管。微管網路涉及許多重要細胞過程,包括形成細胞骨架並維持細胞之結構及形態,以及提供用於囊泡、細胞器及大分子之細胞內轉運的平台。由於tau結合至微管使微管穩定,故tau為此等細胞過程之關鍵介體。 人類大腦中存在至少六種tau同功異型物,其長度介於352至441個胺基酸殘基範圍內。tau同功異型物衍生自位於染色體17上之單一基因MAPT (微管相關蛋白質tau)。MAPT轉錄經歷複雜的、經調節的替代性拼接,從而產生多種mRNA物質。MAPT之外顯子2及3分別編碼29-胺基酸序列或58-胺基酸序列,且因此外顯子2及/或3之替代性拼接使得包括N端29胺基酸酸式結構域之零個、一個或兩個複本(其分別稱為0N tau、1N tau或2N tau)。MAPT之外顯子10編碼微管結合結構域,因此外顯子10之包括引起額外微管結合結構域之存在。由於tau中其他處存在三個微管結合結構域,故包括外顯子10之tau同功異型物稱為「4R tau」,其意謂具有微管結合結構域之四個重複區的tau蛋白質。無外顯子10之tau同功異型物稱為「3R tau」,其意謂具有微管結合結構域之三個重複區的tau蛋白質。由於4R tau同功異型物多具有一個微管結合結構域,因此其可能比3R tau同功異型物更好地結合微管。3R tau與4R tau之比率受發育調控,其中胚胎組織排他性地表現3R tau而成人組織大致表現同等水準之3R tau及4R tau。 Tau為最長tau同功異型物上大致具有85個潛在磷酸化位點(Ser、Thr或Tyr)的磷蛋白(Pedersen及Sigurdsson,Trends in Molecular Medicine 2015, 21 (6): 394)。正常tau蛋白質中之大致一半此等位點上已報告磷酸化。Tau在細胞週期期間動態地磷酸化及去磷酸化。Tau可僅以其去磷酸化形式與微管相關聯,且因此tau之磷酸化充當神經元內之直接微管締合-解離開關。在病理學條件下,tau蛋白質變得過磷酸化,導致微管蛋白結合減少及微管不穩定,隨後tau凝集且沈積於病原性神經原纖維纏結中。亦已在神經原纖維纏結中鑑定出tau之蛋白酶裂解片段(Asp13、Glu391及Asp421)。
本文提供靶向人類微管相關蛋白質tau (MAPT)之反義寡核苷酸、包含該等反義寡核苷酸之組合物及使用此等反義寡核苷酸來減少tau mRNA及蛋白質表現之方法。本文提供之組合物及方法適用於治療tau相關疾病。 在一個態樣中,本文提供包含與表2至表17中所提供之核鹼基序列中任一者具有至少70% (例如,70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的寡核苷酸,其中核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中寡核苷酸中之至少一個核苷酸具有2'-修飾。此等寡核苷酸為靶向人類MAPT之反義寡核苷酸。2'-修飾可選自由以下各者組成之群:2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。在一些實施例中,2'-修飾為2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)。在一些實施例中,核鹼基序列中任一者中之各C為5-甲基胞嘧啶。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸之長度為12至30個核鹼基。舉例而言,靶向MAPT之反義寡核苷酸可包含12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核鹼基。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸之長度為12至25個核鹼基。舉例而言,靶向MAPT之反義寡核苷酸可包含12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核鹼基。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸之長度為15至20個核鹼基。舉例而言,靶向MAPT之反義寡核苷酸可包含15、16、17、18、19或20個核鹼基。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為立體阻斷劑。此類反義寡核苷酸減少tau mRNA及/或蛋白質表現而不依賴於RNAse H。立體阻斷劑之核苷間鍵可為磷酸二酯鍵或硫代磷酸酯鍵。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含與表2至表8中所提供之序列中任一者具有至少70% (例如,70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的立體阻斷劑,其中核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中寡核苷酸中之各核苷酸具有2'-修飾。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含與表2至表8中所提供之序列中任一者具有至少80%序列一致性之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含與表2至表8中所提供之核鹼基序列中任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含表2至表8中所提供之核鹼基序列中之任一者。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸由表2至表8中所提供之核鹼基序列中之任一者組成。在一些實施例中,核鹼基序列中任一者中之各C為5-甲基胞嘧啶。 在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸在各核苷酸次單元處具有2'-O-MOE修飾。 在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含經由磷酸酯橋聯連接至該寡核苷酸之3'端的連接子,且該寡核苷酸具有以下結構中之任一者: 。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為間隔體,其具有位於5'端及3'端上之兩個翼區段(亦分別稱為5'翼及3'翼)之間的連續2'-去氧核糖核苷酸之中心間隔區段。此類反義寡核苷酸藉由活化RNAse H來減少tau mRNA及/或蛋白質表現。間隔體之核苷間鍵可為硫代磷酸酯鍵或磷酸二酯鍵。在一些實施例中,間隔體包含一段至少五個(例如,5、6、7、8、9、10、11、12個)連續2'-去氧核糖核苷酸,且5'及3'翼區段包含一或多個經2'-修飾之核苷酸。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含至少七個(例如,7、8、9、10、11、12個)連續2'-去氧核糖核苷酸。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含十個連續2'-去氧核糖核苷酸。2'-修飾可選自由以下各者組成之群:2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。在一些實施例中,間隔體包含5'翼及3'翼中之經2'-O-MOE修飾之核苷酸。 在一些實施例中,靶向tau之間隔體為20個核苷長之5-10-5間隔體,其中中心間隔區段包含側接5'翼及3'翼之十個連續2'-去氧核苷,各翼包含各自具有2'-O-MOE修飾之五個核苷。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含與表9至表15及表17中所提供之序列中任一者具有至少70% (例如,70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的間隔體,其中核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中寡核苷酸中之至少一個核苷酸具有2'-修飾。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含與表9至表15及表17中所提供之序列中任一者具有至少80%序列一致性之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含與表9至表15及表17中所提供之核鹼基序列中任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含表9至表15及表17中所提供之核鹼基序列中之任一者。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸由表9至表15及表17中所提供之核鹼基序列中之任一者組成。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含表9至表15及表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者的5-10-5間隔體,其中第一至第五核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷,其中第六至第十五核苷酸各自包含2'-去氧核苷,且其中第十六至第二十核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷。在一些實施例中,核鹼基序列中任一者中之各C為5-甲基胞嘧啶。 在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含選自SEQ ID NO: 208、284、285、313、329、335、366、384、386、405、473及474中任一者之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含與SEQ ID NO: 284具有至少90% (例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含SEQ ID NO: 284。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含與SEQ ID NO: 285或208具有至少90% (例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含SEQ ID NO: 285或208。 在另一態樣中,本文提供包含與SEQ ID NO: 487至506中任一者之至少12個連續核鹼基互補的具有1、2或3個錯配之核鹼基序列的寡核苷酸,其中寡核苷酸中之至少一個核苷酸具有2'-修飾。此等寡核苷酸為靶向MAPT之反義寡核苷酸。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含與SEQ ID NO: 487至506中任一者之至少12個連續核鹼基100%互補之核鹼基序列。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含一或多個5-甲基胞嘧啶。在一些實施例中,此類寡核苷酸具有2'-修飾。2'-修飾可選自由以下各者組成之群:2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。在一些實施例中,2'-修飾為2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含至少五個(例如,5、6、7、8、9、10、11、12個)連續2'-去氧核糖核苷酸。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含至少七個(例如,7、8、9、10、11、12個)連續2'-去氧核糖核苷酸。在一些實施例中,此類寡核苷酸包含十個連續2'-去氧核糖核苷酸。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸能夠在活體外減少至少30%的tau mRNA或蛋白質表現水準。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸能夠在活體內減少至少30%的tau mRNA或蛋白質表現水準。 在另一態樣中,本文提供包含本文所描述反義寡核苷酸中之任一者及醫藥學上可接受之載劑的組合物。 在又一態樣中,本文提供藉由向個體(例如,罹患或易患tau相關疾病之個體)投與治療有效量之本文所描述反義寡核苷酸中任一者來減少該個體中之tau表現水準的方法。在一些實施例中,此類方法可包括向個體投與第二藥劑。在一些實施例中,可經由鞘內、顱內、鼻內、口服、靜脈內或皮下途徑向個體投與靶向MAPT之反義寡核苷酸。在一些實施例中,個體為人類。 亦提供如本文所描述之用於治療有需要之個體(例如,罹患或易患tau相關疾病之個體)之tau相關疾病的反義寡核苷酸。亦包括本文所描述之反義寡核苷酸或醫藥組合物之用途,其係用於治療有需要之個體之tau相關疾病。本發明亦包括本文所描述之反義寡核苷酸之用途,其係用於製造用於治療有需要之個體之tau相關疾病的藥劑。 Tau相關疾病可選自以下各者:阿茲海默氏病(Alzheimer's disease;AD)、肌肉萎縮性側索硬化/帕金森氏症(parkinsonism)-癡呆綜合症(ALS-PDC)、嗜銀顆粒癡呆(argyrophilic grain dementia;AGD)、英國型澱粉樣血管病變、腦澱粉樣血管病變、慢性創傷性腦病(CTE)、皮質基底核退化症(CBD)、庫賈氏病(Creutzfeldt-Jakob disease;CJD)、拳擊員癡呆(dementia pugilistica)、伴隨鈣化之彌漫性神經原纖維纏結、唐氏症候群(Down's syndrome)、德拉韋氏症候群(Dravet's Syndrome)、癲癇症、額顳葉型癡呆(FTD)、伴隨與染色體17有關之帕金森氏症之額顳葉型癡呆(FTDP-17)、額顳葉變性、神經節膠質細胞瘤、神經節瘤、格-施-謝三氏病(Gerstmann-Straussler-Scheinker disease)、哈洛弗登-史巴茲氏病(Hallervorden-Spatz disease)、亨廷頓氏病(Huntington's disease)、包涵體肌炎、鉛腦病、關島型肌肉萎縮性側索硬化病(Lytico-Bodig disease)、腦膜血管瘤病、多發性系統萎縮症、肌緊張性營養不良、C型尼曼-匹克二氏病(Niemann-Pick disease type C) (NP-C)、伴隨神經原纖維纏結之非關島型運動神經元病(non-Guamanian motor neuron disease with neurofibrillary tangles)、皮克病(Pick's disease) (PiD)、腦炎後帕金森氏症、朊病毒蛋白質腦澱粉樣血管病變、進行性皮質下神經膠瘤病、進行性核上麻痺(PSP)、亞急性硬化性全腦炎、僅纏結型癡呆(tangle only dementia)、纏結主導型癡呆、多梗塞性癡呆、缺血性中風或結節性硬化症。
本文提供靶向微管相關蛋白質tau (MAPT)之反義寡核苷酸、包含該等反義寡核苷酸之組合物及使用此等反義寡核苷酸來減少tau表現之方法。本文提供之組合物及方法適用於治療tau相關疾病。 定義 如在本說明書及申請專利範圍中所使用,除非上下文另外明確指示,否則單數形式「一(a/an)」及「該」包括複數個參考物。舉例而言,術語「一細胞(a cell)」包括複數個細胞,包括其混合物。 所有數值標示(例如pH、溫度、時間、濃度及分子量,包括範圍)為以0.1之增量(+)或(-)變化之近似值。應理解,儘管未必總明確陳述,但所有數值標示前存在術語「約」。亦應理解,儘管未必總明確陳述,但本文所描述之試劑僅為實例且其等效物為此項技術中已知的。 術語「2'-修飾」係指用另一基團取代核苷或核苷酸之呋喃醣環之2'位置處之H或OH。 如本文所使用,「2'-O-甲氧基乙基」、「2'-MOE」或「2'-OCH2 CH2 -OCH3 」係指呋喃醣環之2'位置之O-甲氧基乙基修飾。經2'-O-甲氧基乙基修飾之糖為經修飾糖。「2'-MOE核苷/核苷酸」或「2'-O-甲氧基乙基核苷/核苷酸」係指包含經2'-MOE修飾之糖部分的核苷/核苷酸。 「5-甲基胞嘧啶」係指經連接至5'位置之甲基修飾之胞嘧啶。 如本文所使用之術語「反義寡核苷酸」係指具有與目標核酸(例如,目標基因組序列、前mRNA或mRNA分子)之對應區段互補的核鹼基序列之單鏈寡核苷酸。在一些實施例中,反義寡核苷酸之長度為12至30個核鹼基。 術語「互補(complementarity/complementary)」係指第一核酸鏈之核鹼基與第二核酸鏈之核鹼基之間由對應核鹼基之間的氫鍵合(例如,Watson-Crick、Hoogsteen或反向Hoogsteen氫鍵合)介導之鹼基配對能力。舉例而言,在DNA中,腺嘌呤(A)與胸腺嘧啶(T)互補;且鳥苷(G)與胞嘧啶(C)互補。舉例而言,在RNA中,腺嘌呤(A)與尿嘧啶(U)互補;且鳥苷(G)與胞嘧啶(C)互補。在某些實施例中,互補核鹼基意謂能夠與其目標核酸之核鹼基進行鹼基配對之反義寡核苷酸之核鹼基。舉例而言,若在反義寡核苷酸之某一位置處之核鹼基能夠與目標核酸之某一位置處之核鹼基氫鍵合,則寡核苷酸與目標核酸之間的氫鍵合位置視為在彼核鹼基對處互補。包含特定修飾之核鹼基可維持與對應體核鹼基配對之能力,且因此仍具有核鹼基互補能力。 「有效量」係指足以達成有益或所要結果之量。舉例而言,治療量為達成所要治療性效果之量。此量可與預防有效量相同或不同,預防有效量為預防疾病或疾病症狀發作所必需之量。有效量可以一或多次投藥、施用或劑量形式來投與。治療性化合物之「治療有效量」(亦即,有效劑量)視所選擇治療性化合物而定。可以每日一或多次至每週一或多次(包括每隔一日一次)來投與組合物。熟習此項技術者應瞭解,某些因素可影響有效地治療個體所需之劑量及時序,該等因素包括(但不限於)疾病或病症之嚴重程度、先前治療、個體之一般健康及/或年齡及其他所存在疾病。此外,用治療有效量之本文所述治療性化合物來治療個體可包括單次治療或一系列治療。 如本文所使用,術語「間隔體」係指包含由能夠活化RNAse H、側接5'端及3'端上之兩個翼區段(各翼區段包含賦予對核酸酶降解之增加抗性的一或多個經修飾核苷酸)之連續2'-去氧核糖核苷酸組成之中心間隔區段的嵌合反義寡核苷酸。 術語「雜交」係指互補核酸鏈之鹼基配對及雙螺旋結構之形成。雜交可在完全互補核酸鏈之間發生或在含有微量錯配區域之「實質上互補」核酸鏈之間發生。雖然不限於特定機制,但配對之最常見機制涉及核酸鏈之互補核鹼基之間的氫鍵結(其可為Watson-Crick、Hoogsteen或反向Hoogsteen氫鍵結)。舉例而言,腺嘌呤及胸腺嘧啶為經由形成氫鍵而配對之互補核鹼基。雜交可在不同的嚴格環境下發生。如本文所使用,雜交係指至少在相對較低嚴格度條件下之互補核酸鏈之鹼基配對及雙螺旋結構之形成,例如在37℃下於2 × SSC (0.3 M氯化鈉、0.03 M檸檬酸鈉)、0.1% SDS中進行雜交,接著於含有4 × SSC之溶液中洗滌,可在37℃下使用0.1% SDS,最後在45℃下於1 × SSC中洗滌。 術語「抑制(inhibiting/inhibition)」係指目標核酸或蛋白質之表現或活性之減少或阻斷且不一定指示目標之表現或活性之完全消除。 術語「核苷間鍵」係指核苷之間的化學鍵。 術語「阻斷基因表現(knockdown/expression knockdown)」係指在試劑(例如,反義寡核苷酸)治療後基因之減少的mRNA或蛋白質表現。阻斷基因表現可在轉錄、mRNA拼接或轉譯期間發生。 術語「錯配」係指第一核酸鏈之核鹼基與第二核酸鏈之對應核鹼基不互補之情況。 術語「核鹼基序列」係指與任何糖、鍵及/或核鹼基修飾無關之連續核鹼基之次序。 術語「寡核苷酸」係指經連接之去氧核糖核苷酸(DNA)及/或核糖核苷酸(RNA) (其中之每一者經修飾或未經修飾)之聚合物。除非特別限制,否則該術語涵蓋含有天然核苷酸之已知類似物、與天然核酸具有類似結合性質的核酸及具有除磷酸二酯鍵以外的替代性核苷間鍵的核酸。 術語「硫代磷酸酯鍵」係指當藉由用硫原子替換未橋接氧原子中之一者來修飾磷酸二酯鍵時核苷之間的鍵。 術語「有義鏈」係指DNA分子之由雙鏈結構組成之編碼鏈、正鏈或非模板鏈。除DNA中之胸腺嘧啶(T)經RNA中之尿嘧啶(U)替換外,編碼鏈具有與mRNA序列相同之序列。「反義鏈」係指DNA分子之充當用於mRNA合成之模板的非編碼鏈或模板鏈。因此,反義鏈之序列與有義鏈之序列及mRNA互補(RNA中之U代替T)。 如本文所使用,術語「立體阻斷劑」係指與目標核酸(例如,目標基因組序列、前mRNA或mRNA分子)雜交、且在不活化RNAse H的情況下干擾目標核酸之轉錄、拼接及/或轉譯的反義寡核苷酸。 如本文所使用,「靶向(targeting/targeted)」係指可與目標核酸(例如,目標基因組序列、前mRNA或mRNA分子)或其片段或變體特異性地雜交且調控目標核酸之轉錄、拼接及/或轉譯之反義寡核苷酸之設計及選擇。 如本文所使用,「tau」(亦稱為「微管相關蛋白質tau」、MAPT、MSTD;PPND;DDPAC;MAPTL;MTBT1;MTBT2;FTDP-17;PPP1R103)係指由基因MAPT編碼之微管相關蛋白質。人類MAPT基因映射至染色體位置17q21.1,且人類MAPT基因之基因組序列可在GenBank中NG_007398.1 (SEQ ID NO: 304)處找到。可基於Ensembl基因組資料庫網站使用Transcript: MAPT-203 ENST00000344290來判定MAPT內含子及外顯子序列以及分支點。歸因於複雜的替代性拼接,人體中存在八種tau同功異型物。使用術語「tau」共同地指代tau之所有同功異型物。最長的人類tau同功異型物之蛋白質及mRNA序列為:智人微管相關蛋白質 tau ( MAPT ) 、轉錄變體 6 mRNA ( NM _ 001123066 . 3 ) 智人微管相關蛋白質 tau 同功異型物 6 ( NP _ 001116538 . 2 ) 其他人類tau同功異型物之mRNA及蛋白質序列可在具有以下寄存編號之GenBank中找到: tau同功異型物1:NM_016835.4 (mRNA) → NP_058519.3 (蛋白質); tau同功異型物2:NM_005910.5 (mRNA) → NP_005901.2 (蛋白質); tau同功異型物3:NM_016834.4 (mRNA) → NP_058518.1 (蛋白質); tau同功異型物4:NM_016841.4 (mRNA) → NP_058525.1 (蛋白質); tau同功異型物5:NM_001123067.3 (mRNA) → NP_001116539.1 (蛋白質); tau同功異型物7:NM_001203251.1 (mRNA) → NP_001190180.1 (蛋白質); tau同功異型物8:NM_001203252.1 (mRNA) → NP_001190181.1 (蛋白質)。 如本文所使用,人類tau蛋白質亦涵蓋在其全長上與tau同功異型物中之任一者具有至少約70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%序列一致性之蛋白質。鼠類、獼猴及其他動物tau蛋白質之序列在此項技術中已知。 術語「tau相關疾病」包括(但不限於)與異常tau蛋白質表現、分泌、磷酸化、裂解及/或凝集相關之疾病。Tau相關疾病包括(但不限於):阿茲海默氏病(AD)、肌肉萎縮性側索硬化/帕金森氏症-癡呆綜合症(ALS-PDC)、嗜銀顆粒癡呆(AGD)、英國型澱粉樣血管病變、腦澱粉樣血管病變、慢性創傷性腦病(CTE)、皮質基底核退化症(CBD)、庫賈氏病(CJD)、拳擊員癡呆、伴隨鈣化之彌漫性神經原纖維纏結、唐氏症候群、德拉韋氏症候群、癲癇症、額顳葉型癡呆(FTD)、伴隨與染色體17有關之帕金森氏症之額顳葉型癡呆(FTDP-17)、額顳葉變性、神經節膠質細胞瘤、神經節瘤、格-施-謝三氏病、哈洛弗登-史巴茲氏病、亨廷頓氏病、包涵體肌炎、鉛腦病、關島型肌肉萎縮性側索硬化病、腦膜血管瘤病、多發性系統萎縮症、肌緊張性營養不良、C型尼曼-匹克二氏病(NP-C)、伴隨神經原纖維纏結之非關島型運動神經元病、皮克病(PiD)、腦炎後帕金森氏症、朊病毒蛋白質腦澱粉樣血管病變、進行性皮質下神經膠瘤病、進行性核上麻痺(PSP)、亞急性硬化性全腦炎、僅纏結型癡呆、纏結主導型癡呆、多梗塞性癡呆、缺血性中風及結節性硬化症。 術語「同源性」或「一致性」係指兩個聚合分子,例如兩個核酸分子(諸如兩個DNA分子或兩個RNA分子)之間或兩個多肽分子之間的次單元序列一致性。當兩個分子中之一次單元位置均由相同單體次單元佔據時,例如當兩個DNA分子中每一者中之一位置均由腺嘌呤佔據時,則其在彼位置處為同源或一致的。兩個序列之間的同源性為匹配或同源位置數目之直接函數;例如若兩個序列中之位置有一半(例如,長度為十個次單元之聚合物中之五個位置)同源,則該兩個序列為50%同源;若90%之位置(例如10個中之9個)匹配或同源,則該兩個序列為90%同源。「序列一致性」之百分比可藉由將兩個最佳比對之序列在比較窗口內進行比較來測定,其中比較窗口中之胺基酸序列之片段與兩個序列之最佳比對之參考序列(其不包含添加或缺失)相比,可包含添加或缺失(例如,間隔或突出物)。可藉由以下方式計算該百分比:測定兩個序列中出現一致胺基酸殘基之位置的數目,得到匹配位置數目;將匹配位置數目除以比較窗口中之總位置數目;以及將結果乘以100,得到序列一致性百分比。輸出為目標序列相對於查詢序列之一致性百分比。 術語「經分離」係指自天然狀態更改或移除。舉例而言,天然存在於活的動物中之核酸或肽並非「經分離的」,但自其天然狀態之共存物質部分或完全分離之相同核酸或肽為「經分離的」。經分離之核酸或蛋白質可以實質上純化形式存在,或可存在於諸如宿主細胞之非原生環境中。 術語「治療(treat/treatment)」係指目的為預防或減緩非所要生理改變或病症之治療性治療及防治性或預防性措施兩者。出於本發明之目的,有益或所要臨床結果包括(但不限於):症狀緩解、疾病程度減輕、疾病病況穩定(亦即,未惡化)、疾病進程延緩或減緩、疾病病況改善或緩和及緩解(部分地或完全地),該等結果為可偵測的或不可偵測的。「治療」亦可意謂與不接受治療之預期存活期相比經延長之存活期。 術語「個體」係指向其提供根據本發明方法之治療的動物、人類或非人類。涵蓋獸醫學及非獸醫學應用。該術語包括(但不限於)哺乳動物,例如人類、其他靈長類動物、豬、嚙齒動物(諸如,小鼠及大鼠、兔、天竺鼠、倉鼠)、牛、馬、貓、狗、綿羊及山羊。典型個體包括人類、農畜及諸如貓及狗之家養寵物。 除非另外定義,否則本文所使用之所有技術及科學術語具有與本發明所屬領域之一般熟習此項技術者通常所理解相同之含義。儘管與本文所述類似或等效之方法或材料可用於實踐本發明,但適合之方法及材料描述如下。所有公開案、專利申請案、專利及本文所提及之其他參考案均以其全文引用之方式併入本文中。倘若有衝突,本說明書(包括定義)將占主導。此外,材料、方法及實例僅為說明性的且並不意欲為限制性的。 本發明之一或多個實施例的細節闡述於附圖及以下實施方式中。本發明之其他特徵、目標及優點將自實施方式及圖式以及自申請專利範圍顯而易見。 反義寡核苷酸 反義寡核苷酸(ASO)為用於越來越多的應用中之強力且多功能的藥劑,該等應用包括RNA減少、轉譯遏止、miRNA抑制、拼接調控及聚腺苷酸化位點選擇。當反義寡核苷酸中足夠數目之核鹼基可與目標核酸之對應核鹼基形成氫鍵時,反義寡核苷酸結合目標核酸且調控目標核酸之轉錄及/或轉譯。因此,反義寡核苷酸之核鹼基序列與目標核酸(例如,目標基因組序列、前mRNA或mRNA分子)之核鹼基序列互補。當反義寡核苷酸與目標核酸之互補核鹼基之間形成氫鍵結(例如,Watson-Crick、Hoogsteen或反向Hoogsteen氫鍵結)時,出現雜交。可容許反義寡核苷酸與目標核酸之間存在非互補核鹼基,其限制條件為反義寡核苷酸仍能夠與目標核酸特異性地雜交。 ASO可經設計以經由RNase H依賴性或RNase H非依賴性方式來減少目標蛋白質之表現(參見Watts JK等人,J Pathol. 2012年1月; 226(2): 365-379)。當包含DNA之連續段的ASO與目標RNA雜交時,DNA-RNA異雙螺旋募集RNase H,其使雙螺旋中之目標RNA裂解且藉由細胞核酸酶促進RNA片段之隨後降解。ASO亦可獨立於RNAse H,藉由立體阻斷前mRNA過程及/或mRNA轉譯成蛋白質來減少目標表現。 本文提供靶向微管相關蛋白質tau (MAPT)之反義寡核苷酸。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸具有與MAPT基因組DNA、前mRNA或mRNA之區段互補的具有1、2、3、4或5個錯配之核鹼基序列。若出現完全鹼基配對(例如,A與T之間及C與G之間的配對),則寡核苷酸與對應目標核酸之間計數無錯配。在最大限度地比對兩個序列時,當第一核酸之核鹼基不能夠與第二核酸之對應核鹼基配對時,出現錯配。舉例而言,若第一序列中之一位置具有核鹼基A,且第二序列上之對應位置具有不能與A配對之核鹼基(例如,C或G),則其構成錯配。若一個序列中之位置具有核鹼基,且另一序列上之對應位置無核鹼基,則亦計數錯配。核苷酸之糖部分之修飾或核苷間鍵不視作錯配。因此,若一個序列包含G,且第二序列之對應核鹼基包含經修飾之C (例如,5-甲基胞嘧啶),則應計數無錯配。 在一段核酸之上下文中,本文提供之反義寡核苷酸在整個區段長度上與MAPT基因組DNA、前mRNA或mRNA之區段至少70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%,92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互補。可使用常規方法,例如此項技術中已知之BLAST程式(基礎局部比對搜尋工具)或PowerBLAST程式(Altschul等人,J. Mol. Biol., 1990, 215, 403 410;Zhang及Madden,Genome Res., 1997, 7, 649 656),來測定反義寡核苷酸與目標核酸之互補百分比。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸具有與MAPT基因組DNA、前mRNA或mRNA之區段100%互補(亦即,完全互補)之核鹼基序列。如本文所使用,「完全互補」或「100%互補」係指反義化合物中之各核鹼基能夠與目標核酸之對應核鹼基精確鹼基配對。舉例而言,20個核鹼基之反義化合物與400個核鹼基長之目標序列完全互補,只要該目標核酸中存在與該反義化合物完全互補之對應20個核鹼基部分。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包含與表1中所提供之任何序列之至少12個連續核鹼基(例如,12、13、14、15、16、17或18個連續核鹼基)互補的具有1、2或3個錯配之核鹼基序列。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包含與表1中所提供之任何序列之至少12個連續核鹼基(例如,12、13、14、15、16、17或18個連續核鹼基) 100%互補之核鹼基序列。 本文所提供之反義化合物亦可與特定核苷酸序列(SEQ ID NO)或其部分具有所定義一致性百分比。如本文所使用,反義寡核苷酸在其具有相同核鹼基配對能力時與本文中所揭示之序列一致。舉例而言,由於尿嘧啶及胸苷兩者均與腺嘌呤配對,故含有尿嘧啶代替所揭示DNA序列中之胸苷的RNA應認為與該DNA序列一致。亦涵蓋本文所述反義寡核苷酸之縮短及延長版本以及相對於本發明所提供之反義寡核苷酸具有不一致鹼基之寡核苷酸。不一致鹼基可彼此鄰接或分散遍佈整個反義寡核苷酸。可根據具有相對於與其進行比較之序列之一致鹼基配對的鹼基數目來計算反義寡核苷酸之序列一致性百分比。可使用常規方法,例如此項技術中已知之BLAST程式(基礎局部比對搜尋工具)或PowerBLAST程式(Altschul等人,J. Mol. Biol., 1990, 215, 403 410;Zhang及Madden,Genome Res., 1997, 7, 649 656),來測定序列一致性百分比;或藉由Gap程式(Wisconsin Sequence Analysis Package, Unix之第8版本, Genetics Computer Group, University Research Park, Madison Wis.)、使用默認設置(其使用Smith及Waterman之演算法) (Adv. Appl. Math. , 1981, 2, 482-489)來測定序列一致性百分比。 在一些實施例中,本文提供包含與表2至表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者具有至少70% (例如,70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的反義寡核苷酸,其中核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中寡核苷酸中之至少一個核苷酸具有2'-修飾。在一些實施例中,本文提供包含與表2至表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者具有至少90% (例如,90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的反義寡核苷酸。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含表2至表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸由表2至表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者組成。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸之長度為12至30個核鹼基。舉例而言,靶向MAPT之反義寡核苷酸可包含12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核鹼基。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸之長度為12至25個核鹼基。舉例而言,靶向MAPT之反義寡核苷酸可包含12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核鹼基。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸之長度為15至20個核鹼基。舉例而言,靶向MAPT之反義寡核苷酸可包含15、16、17、18、19或20個核鹼基。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸包含17個核鹼基。有可能增加或減少反義寡核苷酸之長度,及/或在不消除其活性的情況下在反義寡核苷酸中引入錯配鹼基(例如,1、2、3、4或5個錯配)。反義寡核苷酸之化學修飾 寡核苷酸由藉由核苷間磷酸二酯鍵連接在一起之重複核苷酸單元組成。各核苷酸由包含連接至糖部分之核鹼基之核苷及共價連接至糖部分之一或多個磷酸酯基團構成。磷酸二酯鍵由經由糖苷鍵連接至嘌呤(鳥嘌呤及/或腺嘌呤)及/或嘧啶鹼基(DNA之胸腺嘧啶及胞嘧啶;及RNA之尿嘧啶及胞嘧啶)之糖殘基(RNA之核糖或DNA之去氧核糖,統稱為呋喃醣)組成。 本文提供之反義寡核苷酸可含有一或多個經修飾之核苷酸次單元及/或核苷間鍵。寡核苷酸之化學修飾涵蓋核苷間鍵、糖部分、核鹼基及/或主鏈之改變。修飾可改善反義寡核苷酸之穩定性、效果及/或降低免疫原性。舉例而言,當與未經修飾之寡核苷酸相比時,寡核苷酸可經修飾以具有對核酸酶之經增加的抗性、對核酸目標物之經增強的結合親和性、經增強的細胞吸收及/或經增加的抑制活性。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括天然存在之磷酸二酯核苷間鍵。磷酸二酯鍵可經修飾為其他含磷鍵(諸如,硫代磷酸酯鍵、磷酸三酯鍵、甲基磷酸酯鍵或胺基磷酸酯鍵)或不含磷鍵。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括一或多個經修飾之核苷間鍵。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括硫代磷酸酯鍵。在一些實施例中,反義寡核苷酸之各核苷間鍵為硫代磷酸酯核苷間鍵。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括經化學修飾之糖部分。舉例而言,反義寡核苷酸可包括呋喃醣環上之2'修飾、橋接非偕環原子以形成雙環核酸(BNA)、用其他原子替換糖環氧原子或其組合。在一些實施例中,反義寡核苷酸中之各核苷酸具有2'端經修飾之呋喃醣環。例示性2'-修飾包括2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。在一些實施例中,反義寡核苷酸中之各核苷酸具有對糖部分之2'-O-MOE修飾。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸可包括在給定位置處用相同核苷酸之經修飾版本取代核苷酸。舉例而言,核苷酸(A、G、C或T)可經對應的次黃嘌呤、黃嘌呤、4-乙醯胞嘧啶、β-D-半乳糖苷基Q核苷、肌苷、N6-異戊烯基腺嘌呤、1-甲基鳥嘌呤、1-甲基肌苷、2,2-二甲基鳥嘌呤、2-甲基腺嘌呤、2-甲基鳥嘌呤、3-甲基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、N6-腺嘌呤、7-甲基鳥嘌呤、β-D-甘露糖基Q核苷、2-甲硫基-N6-異戊烯基腺嘌呤、外巴托秀腺(wybutoxosine)、Q核苷、2-硫基胞嘧啶或2,6-二胺基嘌呤替換。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括減少寡核苷酸之免疫原性的經化學修飾之寡核苷酸。舉例而言,已展示含有5-甲基胞嘧啶或2'-O-MOE修飾之寡核苷酸在小鼠中展現減少之免疫刺激(Henry S.等人,J Pharmacol Exp Ther. 2000年2月; 292(2):468-79)。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括替代胞嘧啶之5-甲基胞嘧啶。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括2'-O-MOE修飾。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包括5-甲基胞嘧啶及2' MOE修飾。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸包括在3'端處具有以下結構之C6連接子:, 其經由磷酸酯橋連接至寡核苷酸之3'端,其中R=PO2-O-寡核苷酸(對於磷酸二酯核苷間鍵)或R=POS-O-寡核苷酸(對於硫代磷酸酯核苷間鍵)。此類3'端C6連接子可阻斷3'端核酸外切酶攻擊,且因此增強反義寡核苷酸之穩定性及效果持續時間(參見針對應用於siRNA之類似策略的WO 2005/021749)。在一些情況下,3'端C6連接子亦可促進反義寡核苷酸之合成及/或純化。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸可具有以下結構中之任一者:。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸可包括替代性主鏈,例如嗎啉基、鎖核酸(LNA)、未鎖核酸(UNA)、蘇糖核酸(TNA)、乙二醇核酸(GNA)及/或肽核酸(PNA)。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸可包括包含連接糖環之兩個碳原子之橋的雙環核苷(BNA)。舉例而言,此類BNA可包括包含連接糖部分之4'-碳與2'-碳之4'-CH(CH3 )-O-2'橋的「受約束乙基」(或「cEt」)。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸可包括包含連接核苷糖單元之4'位置與2'位置之間的兩個碳原子之橋的鎖核酸(LNA)。此類LNA可包括α-L-亞甲基氧基(4'-CH2 -O-2') LNA、β-D-亞甲基氧基(4'-CH2 -O-2') LNA、伸乙基氧基(4'-(CH2 )2 -O-2') LNA、胺氧基(4'-CH2 -O-N(R)-2') LNA、氧胺基(4'-CH2 -N(R)-O-2') LNA或描述於以下文獻中之任何其他LNA:美國專利第7,053,207號、第6,268,490號、第6,770,748號、第6,794,499號、第7,034,133號、第6,525,191號、第7,696,345號、第7,569,575號、第7,314,923號、第7,217,805號、第7,084,125號或第6,670,461號;專利公開案第WO 98/39352號或第WO 99/14226號。其他適合的LNA包括描述於以下文獻中之LNA:Braasch等人, Chern. Biol. 8: l-7, 2001;Elayadi等人, Curr. Opinion Invens. Drugs 2: 558-561, 2001;Frieden等人, Nucleic Acids Research, 21: 6365-6372, 2003;Koshkin等人, Tetrahedron, 54: 3607-3630, 1998;Morita等人, Bioorganic Medicinal Chemistry, 11: 2211-2226, 2003;Orum等人, Curr. Opinion Mol. Ther. 3: 239-243, 2001;Singh等人, Chem. Commun. 4: 455-456, 1998;Singh等人, J. Org. Chem., 63: 10035-10039, 1998;或Wahlestedt等人, PNAS 97: 5633-5638, 2000。立體阻斷劑 反義寡核苷酸可結合目標核酸且立體地阻斷DNA或RNA結合蛋白質之接入、轉錄因子、拼接因子、核糖體及/或至目標核酸之轉譯機制,且由此在不活化RNAse H的情況下減少目標表現。舉例而言,此類立體阻斷劑可藉由與圍繞目標之起始密碼子之序列雜交、阻斷內含子分支點序列、靶向拼接位點、包圍內含子及/或外顯子序列或靶向諸如外顯子拼接強化子之調節序列來減少目標蛋白質之表現。可基於先前測定或預測之內含子-外顯子邊界及基因結構來設計立體阻斷劑,且可產生用於阻斷同一位點之一組不同反義寡核苷酸。可對各ASO執行BLAST分析以使脫靶雜交減至最少。 立體阻斷劑可藉由採用識別且減少異常mRNA之內源性細胞監測途徑來達成mRNA減少。一種此類途徑為無義介導之mRNA衰變(NMD),其調控基因表現且預防自mRNA潛在地產生毒性蛋白質。前mRNA過程中之缺陷可導致在引入過早終止密碼子(PTC)及干擾開放閱讀框架時蛋白質功能損失。此類含PTC之mRNA可為NMD之基質,其涉及轉譯核糖體與外顯子連接錯合物之組分(包括必需NMD因子UPF1)之間的通信,以藉由核酸內切酶及核酸外切酶活性來降解RNA。ASO可經合理設計以藉由將目標mRNA導入NMD路徑而使得目標mRNA減少。此可藉由將立體阻斷劑之序列設計為與特定編碼外顯子、內含子-外顯子連接處或對於適當前mRNA過程所必需之其他序列互補以引入外顯子跳躍、框移及/或引入PTC來達成。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為立體阻斷劑,例如包含與表2至表8中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者具有至少70% (例如,70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的寡核苷酸。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含表2至表8中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者的立體阻斷劑。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為由表2至表8中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者組成的立體阻斷劑。如以下實例中所詳述,立體阻斷劑經設計以靶向tau組成性外顯子(例如,外顯子1、4、5、7、9、11、12、13)、包圍MAPT之起始密碼子之序列、拼接受體及供體、拼接分支點、多嘧啶追蹤相關序列或拼接強化子或抑制子序列。靶向起始密碼子及外顯子1將潛在地阻斷轉譯之起始。干擾拼接及/或誘發外顯子跳躍之ASO將引起框移及/或引入下游過早終止密碼子,從而使得MAPT mRNA及/或tau蛋白質減少。 可將化學修飾併入立體阻斷劑中以改良其穩定性、效果及/或細胞吸收。立體阻斷劑可在各核苷酸位置處或在一些所選擇位置處具有化學修飾。舉例而言,併入糖環之2'-修飾(諸如,2'-O-甲氧基乙基、MOE)、包括鎖核酸(LNA)及/或主鏈修飾(諸如,硫代磷酸酯)可減少核酸酶降解且/或增加反義寡核苷酸之結合親和性。除糖及/或主鏈修飾以外,立體阻斷劑可由與DNA或RNA十分不同的寡聚物製成。肽核酸(PNA)為其核鹼基藉由醯胺鍵來連接之寡核苷酸模擬物。由於醯胺主鏈不帶電,因此結合之特徵為高速率之締合及高親和性(參見Bentin T, Biochemistry. 1996; 35:8863-8869;Smulevitch SV, Nat Biotech. 1996; 14:1700-1704)。二胺基磷酸酯嗎啉基寡聚物(通常稱為PMO或「嗎啉核酸(morpholinos)」)為另一不帶電DNA類似物。PMO並不結合具有高親和性、具有PNA結合特徵之互補目標,但已證實為細胞內部之有效藥劑(參見Summerton J, Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 1997; 7:187-195;Corey DR, Genome Biol. 2001; 2:REVIEWS1015)。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含經2'-修飾之核苷酸的立體阻斷劑。2'-修飾可選自由以下各者組成之群:2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為在各核苷酸次單元處具有2'-O-MOE修飾之立體阻斷劑。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為具有核苷間磷酸二酯鍵或硫代磷酸酯鍵之立體阻斷劑。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為含有妨礙RNase H結合之主鏈修飾的立體阻斷劑。此類立體阻斷劑可包括經修飾之核苷間鍵,例如甲基膦酸酯鍵、甲基硫代膦酸酯鍵、嗎啉膦酸酯鍵、哌嗪膦酸酯鍵或胺基磷酸酯鍵。在一些實施例中,每隔一個核苷間鍵可含有具有2'端低碳數烷基部分(例如,C1 -C4 、直鏈或分支鏈、飽和或不飽和之烷基,諸如甲基、乙基、乙烯基、丙基、1-丙烯基、2-丙烯基及異丙基)或其一組合之經修飾磷酸酯。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包括描述於美國專利第5,149,797號中之一或多個經修飾核苷間鍵的立體阻斷劑。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的立體阻斷劑包括在3'端處具有以下結構之C6連接子:, 其經由磷酸酯橋連接至寡核苷酸之3'端,其中R=PO2 -O-寡核苷酸(對於磷酸二酯核苷間鍵)或R=POS-O-寡核苷酸(對於硫代磷酸酯核苷間鍵)。因此,具有磷酸二酯核苷間鍵之靶向MAPT的立體阻斷劑可具有以下結構:;且具有硫代磷酸酯核苷間鍵之靶向MAPT的立體阻斷劑可具有以下結構:間隔體 包含DNA之連續段之反義寡核苷酸可向將細胞核酸內切酶RNase H募集至目標RNA:DNA異雙螺旋且使RNA:DNA雙螺旋中之目標RNA裂解。間隔體為嵌合反義化合物。嵌合反義化合物通常含有至少一個經修飾區域(以便賦予對核酸酶降解之增加的抗性、增加的細胞吸收、對目標核酸之增加的結合親和性及/或增加的抑制活性)及核苷酸在化學上不同於第一區域之核苷酸的第二區域。 間隔體具有由位於兩個翼區段(其由5'端及3'端上之經修飾核苷酸組成)之間的一段連續2'-去氧核糖核苷酸組成之中心間隔區段。間隔區段充當核酸內切酶RNAse H裂解之基質,而具有經修飾核苷酸之翼區段賦予對其他核酸酶降解之增加的抗性。翼-間隔-翼區段可描述為「X-Y-Z」,其中「X」表示5'翼之長度,「Y」表示間隔之長度且「Z」表示3'翼之長度。「X」及「Z」可包含均一、變化或交替的糖部分。 在一些實施例中,間隔體之中心間隔區段由至少五個(例如,5、6、7、8、9、10、11、12個)連續2'-去氧核糖核苷酸組成;且5'及3'翼區段包含一或多個經2'-修飾之核苷酸。已報告,包含一段至多四個連續2'-去氧核糖核苷酸之嵌合寡核苷酸並不活化RNAse H。參見美國專利第9,157,081號。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含至少七個(例如,7、8、9、10、11、12個)連續2'-去氧核糖核苷酸之間隔體。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含十個連續2'-去氧核糖核苷酸之間隔體。2'-修飾可選自由以下各者組成之群:2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。 在一些實施例中,靶向MAPT之間隔體為20個核苷長度之5-10-5間隔體,其中中心間隔區段包含十個2'-去氧核苷且側接5'及3'翼區段,該等翼區段中之每一者包含各自具有2'-修飾之五個核苷。其他適合的間隔體包括(但不限於):5-9-5間隔體、5-8-5間隔體、4-8-6間隔體、6-8-4間隔體或5-7-6間隔體。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為間隔體,例如包含與表9至表15及表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者具有至少70% (例如,70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%)序列一致性之核鹼基序列的寡核苷酸。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含表9至表15及表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者的間隔體。在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為由表9至表15及表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者組成的間隔體。如以下實例中所詳述,間隔體經設計以靶向圍繞起始密碼子之序列、外顯子1或MAPT轉錄之3'端未轉譯區域(UTR)。在一些實施例中,間隔體經設計以靶向3'端UTR。 在一些實施例中,本文提供之靶向MAPT的反義寡核苷酸為包含表9至表15及表17中任一者中所提供之核鹼基序列中之任一者的5-10-5間隔體,其中第一至第五核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷,其中第六至第十五核苷酸各自包含2'-去氧核苷,且其中第十六至第二十核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷。反義寡核苷酸靶向之 MAPT 基因組序列 在一些實施例中,反義寡核苷酸經設計以靶向MAPT基因組序列(GenBank寄存編號:NG_007398.1;SEQ ID NO: 304)之特定區域或者對應tau mRNA或轉錄物(SEQ ID NO: 306)之區域。基於Ensembl基因組資料庫網站使用Transcript: MAPT-203 ENST00000344290來判定MAPT內含子及外顯子序列以及分支點。人類MAPT基因之外顯子、內含子及內含子/外顯子連接處之篩檢揭示,藉由反義寡核苷酸靶向MAPT基因或轉錄物中之一些區域比靶向其他區域更有效地減少tau表現。舉例而言,表1列出MAPT基因或轉錄物中反義寡核苷酸可靶向之一些較佳區域之序列。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包含與SEQ ID NO: 487至506中任一者之至少12個連續核鹼基(例如,12、13、14、15、16、17或18個連續核鹼基)互補的具有1、2或3個錯配之核鹼基序列。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸包含與SEQ ID NO: 487至506中任一者之至少12個連續核鹼基(例如,12、13、14、15、16、17或18個連續核鹼基) 100%互補之核鹼基序列。 1 tau反義寡核苷酸靶向之所選擇MAPT基因組、mRNA或前mRNA序列。 反義寡核苷酸結合物 反義寡核苷酸與另一部分之結合可改良反義寡核苷酸之活性、細胞吸收及/或組織分佈。舉例而言,反義寡核苷酸可共價連接至一或多種診斷性化合物、報告基團、交聯劑、核酸酶抗性賦予部分、親脂性分子、膽固醇、脂質、凝集素、連接子、類固醇、熊果醇(uvaol)、黑茨介寧(hecigenin)、薯蕷皂苷配基、萜類、三萜、薩灑皂角苷配基(sarsasapogenin)、無羈萜(Friedelin)、表無羈萜醇衍生之石膽酸、維生素、生物素、碳水化合物、聚葡萄糖、染料、普魯蘭(pullulan)、甲殼素、聚葡萄胺糖、合成碳水化合物、寡聚乳酸15聚體、天然聚合物、低分子量或中分子量聚合物、菊糖(inulin)、環糊精、玻尿酸、蛋白質、蛋白質結合劑、整合素靶向分子、聚陽離子、肽、多元胺、肽模擬物、運鐵蛋白、香豆素、吩嗪、葉酸、啡啶、蒽醌、吖啶、螢光素及/或若丹明(rhodamine)。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸連接至連接子分子。在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸連接至脂質或膽固醇。在一些實施例中,反義寡核苷酸連接至中性脂質體(NL)或脂質奈米顆粒(LNP)。LNP為基於自裝配陽離子脂質之系統,其可包含例如中性脂質(脂質體基底)、陽離子脂質(用於寡核苷酸負載)、膽固醇(用於使脂質體穩定)及PEG脂質(用於使調配物穩定、電荷屏蔽及延長在血流中之循環)。中性脂質體(NL)為基於非陽離子脂質之顆粒。 在一些實施例中,本文提供之反義寡核苷酸連接至脂肪酸,例如ω-3脂肪酸或ω-6脂肪酸。適合的ω-3脂肪酸包括,例如,α-次亞麻油酸(ALA)、二十二碳六烯酸(DHA)、二十碳五烯酸(EPA)、二十二碳五烯酸(DPA)、二十碳四烯酸(ETA)、二十碳三烯酸(ETE)、二十碳五烯酸(EPA)、十六碳三烯酸(HTA)、二十一碳五烯酸(HPA)、十八碳四烯酸(SDA)、二十四碳五烯酸及二十四碳六烯酸。 測試反義寡核苷酸活性 可在活體外或在活體內測試反義寡核苷酸之活性。對於活體外測試,可藉由轉染或電穿孔將ASO引入至培養細胞中。在治療一段時間之後,可測定經ASO治療之細胞中的MAPT (tau)表現水準且將其與未經治療之對照細胞中的MAPT (tau)表現水準進行相比。 可藉由任何適當方法來測定MAPT表現水準,例如藉由定量MAPT mRNA含量、藉由量測由MAPT mRNA之反轉錄產生之cDNA之數量或藉由測定tau蛋白質之數量。此等方法可逐樣本地執行或經修改以用於高輸送量分析。 可藉由與MAPT轉錄物之區段特異性地雜交之探針(例如,藉由北方墨點分析)來偵測且定量MAPT mRNA含量。亦可藉由聚合酶鏈反應(PCR),使用識別MAPT轉錄物之一對引子來偵測且定量MAPT mRNA含量。PCR之通用程序教示於MacPherson等人之PCR: A Practical Approach (IRL Press at Oxford University Press (1991))中。然而,用於各應用反應之PCR條件係憑經驗判定的。許多參數影響反應之成功,例如退火溫度及時間、延伸時間、Mg2 + 及/或ATP濃度、pH,以及引子、模板及/或去氧核糖核苷酸之相對濃度。在擴增之後,可藉由瓊脂糖凝膠電泳、隨後用溴化乙錠染色及紫外照射顯色來偵測所得DNA片段。 在一些實施例中,可藉由定量即時PCR、使用任何可商購的即時PCR系統來偵測且定量MAPT mRNA含量,該定量即時PCR藉由在擴增步驟期間同時併入可偵測染料或報告子來監測目標核酸之擴增。 可替代地,可將標記直接添加至初始核酸樣本(例如,mRNA、polyA、mRNA、cDNA等)或在擴增完成之後添加至擴增產物。將標記附著至核酸之手段為熟習此項技術者熟知的,且包括例如藉由核酸激酶且隨後將聯結樣本核酸之核酸連接子附著(接合)至標記(例如,螢光團)而進行之切口平移或末端標記(例如,具有經標記之RNA)。 適合用於本發明之可偵測標記包括可藉由光譜學、光化學、生物化學、免疫化學、電學、光學或化學手段偵測之任何組合物。本發明中之有用標記包括:與經標記抗生蛋白鏈菌素結合物一起用於染色之生物素、磁性珠粒(例如,Dynabeads™)、螢光染料(例如,螢光素、德克薩斯紅(texas red)、若丹明、綠色螢光蛋白質及其類似者)、放射性標記(例如,3 H、125 I、35 S、14 C或32 P)、酶(例如,辣根過氧化酶、鹼性磷酸酶及ELISA中常用的其他者)及諸如膠體金或者有色玻璃或塑膠(例如,聚苯乙烯、聚丙烯、乳膠等)珠粒之量熱標記。教示此類標記之使用的專利包括美國專利第3,817,837號、第3,850,752號、第3,939,350號、第3,996,345號、第4,277,437號、第4,275,149號及第4,366,241號。 標記之偵測為熟習此項技術者所熟知。因此,舉例而言,可使用攝影膠片或閃爍計數器來偵測放射性標記,可使用偵測發射光之光偵測器來偵測螢光標記。通常藉由提供酶與基質且偵測由酶對基質之作用而所產生之反應產物來偵測酶標記,且藉由簡單地視覺觀察有色標記來偵測量熱標記。對於標記核酸及偵測經標記之雜交核酸的方法之詳細綜述,參見Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology,第24卷: Hybridization with Nucleic Acid Probes, P. Tijssen編, Elsevier, N.Y. (1993)。 亦可藉由使用此項技術中已知之方法量測tau蛋白質含量來評定反義寡核苷酸之活性。舉例而言,可藉由西方墨點分析(免疫墨點法)、酶聯免疫吸附檢定(ELISA)、免疫組織化學、免疫檢定、免疫沈澱、免疫螢光檢定、免疫細胞化學、螢光激活細胞分選(FACS)、放射免疫檢定、免疫放射檢定、高效液相層析法(HPLC)、質譜法、共焦顯微鏡、酶學檢定法或表面電漿子共振(SPR)來定量tau蛋白質含量。 亦可在動物模型中測試反義寡核苷酸之活體內活性。可在正常動物中或在實驗疾病動物模型中進行測試。可將反義寡核苷酸調配於醫藥學上可接受之稀釋劑中且經由適合的投與途徑進行遞送。在治療一段時間之後,可採集組織樣本(例如,大腦組織、腦脊髓液(CSF)、脊髓),且可使用上述方法中之任一者來量測tau表現水準。可進行組織學分析以評估大腦結構及/或神經原纖維纏結之存在。亦可監測及評估經治療動物之表現型改變,諸如經改良之認知能力或可動性。 寡核苷酸之合成及特性 可使用此項技術中已知之任何核酸聚合方法來合成單鏈寡核苷酸,該等方法例如採用胺基磷酸酯方法之固相合成(S. L. Beaucage及R. P. Iyer, Tetrahedron, 1993, 49, 6123;S. L. Beaucage及R. P. Iyer, Tetrahedron, 1992, 48, 2223)、H-膦酸酯、磷酸三酯化學法或酶促合成。可使用自動化商業合成器,例如,來自BioAutomation (德克薩斯州,歐文)或Applied Biosystems (加利福尼亞州,福斯特市)之合成器。在一些實施例中,使用諸如描述於Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry (Beaucage, S.L.等人(Edrs.), John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, USA)中之標準固相胺基磷酸酯化學法來生成單鏈寡核苷酸。可使用諸如苯乙醯基二硫化物或DDTT (((二甲胺基-亞甲基)胺基)-3H-1,2,4-碘二噻寧-3-硫酮)之硫化試劑來引入硫代磷酸酯鍵。使用類似技術及可商購的經修飾胺基酸酯及控孔玻璃(CPG)產物(諸如,生物素、螢光素、吖啶或經補骨脂素修飾之胺基酸酯及/或CPG)來合成經修飾之寡核苷酸或經螢光標記之生物素或其他結合寡核苷酸為眾所周知的。 對起始物質及來自各合成步驟之產物的品質控制對於使最終產物中之雜質含量減至最少而言係至關重要的。然而,鑒於每偶合之合成步驟之數目及偶合之數目,雜質之存在係不可避免的。可使用純化方法以自最終寡核苷酸產物排除非所要雜質。用於單鏈寡核苷酸之常用純化技術包括:反相離子對高效液相層析法(RP-IP-HPLC)、毛細管凝膠電泳(CGE)、陰離子交換HPLC (AX-HPLC)及尺寸排外層析法(SEC)。 在純化之後,寡核苷酸可藉由質譜法進行分析且藉由分光光度法在260 nm之波長下進行量化。 治療性用途及治療方法 本文提供藉由向個體(例如,人類)投與治療有效量之本文所述反義寡核苷酸中之任一者來減少該個體中之tau表現水準的方法。在一些實施例中,可經由鞘內、顱內、鼻內、靜脈內、口服或皮下途徑向個體投與反義寡核苷酸。在一些實施例中,此類方法進一步包括鑑別及選擇罹患或易患tau相關疾病之個體。 本文提供之反義寡核苷酸或其醫藥組合物可用於治療或預防個體之tau相關疾病。在一些實施例中,本發明提供如本文所描述之反義寡核苷酸或其醫藥組合物,其用於治療或防預患者之tau相關疾病。在其他實施例中,本發明提供如本文所描述之反義寡核苷酸之用途,其係用於製造用於治療或防預患者之tau相關疾病之藥劑。 Tau相關疾病包括(但不限於):阿茲海默氏病(AD)、肌肉萎縮性側索硬化/帕金森氏症-癡呆綜合症(ALS-PDC)、嗜銀顆粒癡呆(AGD)、英國型澱粉樣血管病變、腦澱粉樣血管病變、慢性創傷性腦病(CTE)、皮質基底核退化症(CBD)、庫賈氏病(CJD)、拳擊員癡呆、伴隨鈣化之彌漫性神經原纖維纏結、唐氏症候群、德拉韋氏症候群、癲癇症、額顳葉型癡呆(FTD)、伴隨與染色體17有關之帕金森氏症之額顳葉型癡呆(FTDP-17)、額顳葉變性、神經節膠質細胞瘤、神經節瘤、格-施-謝三氏病、哈洛弗登-史巴茲氏病、亨廷頓氏病、包涵體肌炎、鉛腦病、關島型肌肉萎縮性側索硬化病、腦膜血管瘤病、多發性系統萎縮症、肌緊張性營養不良、C型尼曼-匹克二氏病(NP-C)、伴隨神經原纖維纏結之非關島型運動神經元病、皮克病(PiD)、腦炎後帕金森氏症、朊病毒蛋白質腦澱粉樣血管病變、進行性皮質下神經膠瘤病、進行性核上麻痺(PSP)、亞急性硬化性全腦炎、僅纏結型癡呆、纏結主導型癡呆、多梗塞性癡呆、缺血性中風及結節性硬化症。組合療法 上文所描述之各種寡核苷酸可與其他治療搭配物組合使用。因此,本文所描述之治療tau相關疾病之方法可進一步包括向需要治療之個體投與第二藥劑。舉例而言,靶向微管相關蛋白質tau (MAPT)之反義寡核苷酸可與特異性地結合tau蛋白質之抗體及/或靶向澱粉狀蛋白β (Aβ)之藥劑(例如,結合Aβ之抗體或β分泌酶(BACE)抑制劑)組合使用。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸與特異性地結合tau蛋白質之抗體組合使用。在一些實施例中,靶向MAPT之反義寡核苷酸與BACE抑制劑組合使用。 術語「組合」係指呈一種單位劑型之固定組合,或本發明化合物及組合搭配物(例如,如下文所闡述之另一藥物,亦稱為「治療劑」或「輔劑」)可同時獨立投與或在時間間隔內分開投與,尤其此等時間間隔允許組合搭配物展現協作效應(例如協同效應)之組合投與。單一組分可封裝於套組中或分開封裝。在投與前,組分中之一或兩者(例如,粉末或液體)可復原或稀釋至所需劑量。如本文所使用之術語「共投與」或「組合投與」或其類似者意欲涵蓋向有需要之單一個體(例如,患者)投與所選擇組合搭配物,且意欲包括藥劑不一定藉由相同投與途徑或同時投與的治療方案。如本文所使用之術語「醫藥組合」意謂由混合或組合多於一種治療劑所產生之產物且包括治療劑之固定及非固定組合兩者。術語「固定組合」意謂治療劑(例如,本發明之寡核苷酸及組合搭配物)均以單一實體形式或劑形同時投與給患者。術語「非固定組合」意謂治療劑(例如,本發明之寡核苷酸及組合搭配物)均以單獨實體形式同時、並行或無特定時間限制地依序投與給患者,其中此類投與在患者體內提供治療有效含量之兩種化合物。後者亦適用於混合物療法,例如,投與三種或多於三種治療劑。 如本文所使用之術語「醫藥組合」係指呈一種單位劑型之固定組合,或兩種或多於兩種治療劑可同時獨立投與或在時間間隔內分開投與,尤其此等時間間隔允許組合搭配物展現協作效應(例如協同效應)之非固定組合或用於組合投與的分裝部分之套組。 術語「組合療法」係指投與兩種或多於兩種治療劑以治療本發明中所描述之治療性病狀或病症。此類投與涵蓋此等治療劑以實質上同時之方式,諸如以具有固定比率之活性成分的單一膠囊之形式共投與。可替代地,此類投與涵蓋對於各活性成分在多個或單獨容器(例如錠劑、膠囊、粉末及液體)中之共投與。在投與之前,粉末及/或液體可復原或稀釋至所要劑量。此外,此類投與亦涵蓋在大致相同的時間或在不同時間依序使用各類型之治療劑。在任一情況下,治療方案將提供藥物組合在治療本文所述之病狀或病症方面的有益效果。樣本製備 可使用此項技術中已知方法中之任一者(例如,藉由活檢或手術)自用反義寡核苷酸治療之個體獲得組織樣本。舉例而言,可藉由腰椎穿刺來獲得包含腦脊髓液之樣本,在腰椎穿刺中,將附接至注射器之細針插入腰椎區域中之脊管中,且產生真空使得腦脊髓液可經由針進行抽吸且收集於注射器中。可使用CT成像、超音波或內窺鏡來導引此類型程序。 樣本可經快速凍結且在-80℃下儲存以供後續使用。亦可用固定劑(諸如,甲醛、多聚甲醛或乙酸/乙醇)來固定樣本。可自新鮮、凍結或固定的樣本提取RNA或蛋白質以用於分析。 醫藥組合物、劑量及投與 本文亦提供包含一或多種本文所提供之反義寡核苷酸的組合物,例如醫藥組合物。醫藥組合物通常包括醫藥學上可接受之載劑。如本文所使用,措辭「醫藥學上可接受之載劑」包括與醫藥投藥相容之鹽水、溶劑、分散介質、包衣、抗細菌劑及抗真菌劑、等張劑及吸收延遲劑及其類似物。醫藥組合物通常調配成與其既定投與途徑相容。投與途徑之實例包括鞘內、顱內、鼻內、靜脈內、口服或皮下投與。 在一些實施例中,本文所描述之反義寡核苷酸可與能夠穿過血腦屏障之抗體(例如,結合運鐵蛋白受體、胰島素、瘦素或胰島素樣生長因子1之抗體)結合且經靜脈內遞送(Evers等人,Advanced Drug Delivery Reviews 87 (2015): 90-103)。 調配合適醫藥組合物之方法在此項技術中已知,例如參見Remington: The Science and Practice of Pharmacy. 第21版, 2005;及Drugs and the Pharmaceutical Sciences: a Series of Textbooks and Monographs (Dekker, NY)系列中之書籍。舉例而言,用於非經腸、皮內、鞘內或皮下施用之溶液或懸浮液可包括以下組分:無菌稀釋劑,諸如注射用水、鹽水溶液、不揮發性油、聚乙二醇、丙三醇、丙二醇或其他合成溶劑;抗細菌劑,諸如苄醇或對羥基苯甲酸甲酯;抗氧化劑,諸如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉;螯合劑,諸如乙二胺四乙酸;緩衝劑,諸如乙酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽;及用於調節張力之藥劑,諸如氯化鈉或右旋糖。可用酸或鹼(諸如,鹽酸或氫氧化鈉)來調節pH。非經腸製劑可封裝於由玻璃或塑膠製成之安瓿、拋棄式注射器或多劑量小瓶中。 適合於可注射使用之醫藥組合物可包括無菌水溶液(當可溶於水時)或分散液及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉末。對於靜脈內投與,適合的載劑包括生理鹽水、抑菌水、Cremophor EL™ (BASF, Parsippany, NJ)或磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。在所有情況下,該組合物必須為無菌的且流動性應至存在易於注射性之程度。其應在製造及儲存條件下穩定且必須抵抗諸如細菌及真菌之微生物的污染作用而保藏。載劑可為含有例如水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇及液態聚乙二醇及其類似物)及其合適混合物之溶劑或分散介質。適當流動性可例如藉由使用諸如卵磷脂之包衣、藉由維持所需粒度(在分散液之情況下)及藉由使用界面活性劑來維持。微生物作用之預防可藉由各種抗細菌劑及抗真菌劑達成,例如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、酚、抗壞血酸、硫柳汞及其類似物。在許多情況下,組合物中將較佳包括等張劑,例如糖、多元醇(諸如甘露醇、山梨糖醇)、氯化鈉。可注射組合物之延長吸收可藉由在組合物中包括延遲吸收劑(例如,單硬脂酸鋁及明膠)來達成。 可藉由如下方法來製備無菌可注射溶液:將適當溶劑中之所需量之活性化合物與上文所列舉之成分中之一者或組合合併,視需要隨後進行過濾滅菌。 一般而言,藉由將活性化合物併入含有鹼性分散介質及自上文所列舉之彼等成分之所需其他成分的無菌媒劑中來製備分散液。在用於製備無菌可注射溶液之無菌粉末之情況下,較佳製備方法為真空乾燥及凍結乾燥,其產生活性成分加來自其先前無菌過濾溶液之任何額外所需成分的粉末。 口服組合物一般包括惰性稀釋劑或可食用載劑。出於口服治療性投與之目的,活性化合物可併有賦形劑且以錠劑、糖衣錠或膠囊(例如,明膠膠囊)之形式使用。亦可使用流體載劑來製備口服組合物,以用作漱口劑。可包括醫藥學上相容之黏合劑及/或佐劑物質作為組合物之一部分。錠劑、丸劑、膠囊、糖衣錠及其類似物可含有以下成分或具有類似性質之化合物中之任一者:黏合劑,諸如微晶纖維素、黃蓍膠或明膠;賦形劑,諸如澱粉或乳糖;崩解劑,諸如褐藻酸、澱粉羥基乙酸鈉或玉米澱粉;潤滑劑,諸如硬脂酸鎂或斯特羅特斯(Sterotes);滑動劑,諸如膠狀二氧化矽;甜味劑,諸如蔗糖或糖精;或調味劑,諸如胡椒薄荷、水楊酸甲酯或橙調味劑。 對於藉由吸入之投與,化合物可以氣溶膠噴霧之形式自含有合適推進劑(例如,諸如二氧化碳之氣體)之加壓容器或分配器或者噴霧器遞送。此類方法包括描述於美國專利第6,468,798號中之彼等方法。如本文所描述之治療性化合物亦可藉由經黏膜或經皮手段來全身性投與。對於經黏膜或經皮投與,在調配物中使用適於待滲透之屏障的滲透劑。此類滲透劑一般為此項技術中已知的,且對於經黏膜投與,包括例如清潔劑、膽汁鹽及梭鏈孢酸衍生物。經黏膜投與可經由使用經鼻噴霧或栓劑實現。對於經皮投與,如此項技術中一般已知,將活性化合物調配成軟膏、油膏、凝膠或乳膏。 在一個實施例中,用將保護治療性化合物免於自身體快速消除之載劑來製備治療性化合物,該等載劑諸如控制釋放調配物,包括植入物及微膠囊化遞送系統。 醫藥組合物可與投與說明書一起包括於容器、包裝或分配器中。 在非限制性實例中,將含有至少一種醫藥劑之醫藥組合物調配成液體(例如,熱固性液體)、固體組分(例如,粉末或可生物降解之生物相容性聚合物(例如,陽離子性的可生物降解之生物相容性聚合物))或凝膠組分(例如,可生物降解之生物相容性聚合物)。在一些實施例中,將含有至少一種醫藥劑之至少一組合物調配成選自以下各者之群的凝膠:海藻酸鹽凝膠(例如,海藻酸鈉)、基於纖維素之凝膠(例如,羧基甲基纖維素或羧基乙基纖維素)或基於聚葡萄胺糖之凝膠(例如,聚葡萄胺糖甘油磷酸鹽)。另外,可用於調配本文所述醫藥組合物中之任一者的藥物溶離聚合物之非限制性實例包括:角叉菜膠、羧基甲基纖維素、羥基丙基纖維素、與聚乙烯醇組合之聚葡萄糖、與聚丙烯酸組合之聚葡萄糖、聚半乳糖醛酸、半乳糖醛酸多醣、聚乳酸(polysalactic acid)、聚乙醇酸、羅望子果膠(tamarind gum)、黃原膠、纖維素膠、瓜爾豆膠(guar gum) (羧基甲基瓜爾豆膠)、果膠、聚丙烯酸、聚甲基丙烯酸、N-異丙基聚丙烯醯胺、聚氧乙烯、聚氧丙烯、普洛尼克酸(pluronic acid)、聚乳酸(polylactic acid)、環糊精、環狀糊精、節枝彈性蛋白、聚丁二烯、N-(2-羥基丙基)甲基丙烯醯胺(HP MA)共聚物、順丁烯二酸酐-烷基乙烯基醚、聚縮肽、聚羥基丁酸酯、聚己內酯、聚二氧環己酮、聚乙二醇、聚膦腈、聚原酸酯、聚乙烯吡咯啶酮、聚乳酸-共-乙醇酸(PLGA)、聚酸酐、聚芥子胺、聚N-乙烯基己內醯胺及結冷膠。 在一些實施例中,可藉由載劑介導之遞送來增強反義寡核苷酸至目標組織之遞送,該載劑包括(但不限於):陽離子脂質體、環糊精、卟啉衍生物、分支鏈樹枝狀聚合物、聚伸乙基亞胺聚合物、奈米顆粒及微球體(Dass CR.J Pharm Pharmacal 2002; 54(1):3-27)。 「有效量」為足以達成有益或所要結果之量。舉例而言,治療量為達成所要治療性效果之量。此量可與預防有效量相同或不同,預防有效量為預防疾病或疾病症狀發作所必需之量。有效量可以一或多次投藥、施用或劑量形式來投與。治療性化合物之治療有效量(亦即,有效劑量)視所選擇治療性化合物而定。可以每日一或多次至每週一或多次(包括每隔一日一次)來投與組合物。熟習此項技術者應瞭解,某些因素可影響有效地治療個體所需之劑量及時序,該等因素包括(但不限於)疾病或病症之嚴重程度、先前治療、個體之一般健康及/或年齡及其他所存在疾病。此外,用治療有效量之本文所述治療性化合物來治療個體可包括單次治療或一系列治療。 可藉由細胞培養物或實驗動物中例如用於測定LD50 (50%群體致死劑量)及ED50 (50%群體治療有效劑量)之標準醫藥程序來測定治療性化合物之劑量、毒性及治療效果。毒性與治療效果之間的劑量比率為治療指數且其可表述為比率LD50/ED50。展現高治療指數之化學物係較佳的。雖然可使用展現毒性副作用之化合物,但應謹慎設計將此類化合物靶向受影響組織位點之遞送系統,以便使對未感染細胞之潛在損害降至最低且由此減少副作用。 自細胞培養檢定及動物研究獲得之資料可用於調配一系列用於人類之劑量。此類化合物之劑量較佳處於循環濃度之範圍內,其包括具有極小毒性或無毒性之ED50。劑量可視所採用劑型及所用投與途徑而定在此範圍內變化。對於本發明之方法中所使用之任何化合物,最初可自細胞培養檢定來評估治療有效劑量。可在動物模型中調配劑量以達成包括如在細胞培養物中所測定之IC50 (亦即,達成症狀之半最大抑制的測試化合物之濃度)之循環血漿濃度範圍。此類資訊可用於更準確地判定適用於人類之劑量。可例如藉由高效液相層析法量測血漿中之含量。 在一些實施例中,將本文所描述之反義寡核苷酸溶解於無菌水、鹽水(例如,磷酸鹽緩衝鹽水)或腦脊髓液(CSF)中以供投與。在一些實施例中,例如藉由在L3或L4盤空間處快速注射或藉由使用鞘內泵輸注來經鞘內投與本文所描述之反義寡核苷酸。 在一些實施例中,向有需要之個體投與約0.001 mg至1000 mg (例如,約0.1 mg至800 mg、約1 mg至600 mg、約10 mg至500 mg、約50 mg至450 mg、約80 mg至300 mg、約100 mg至200 mg)之本文所述反義寡核苷酸。 套組 亦提供包括一或多種上文所述反義寡核苷酸及使用說明書之套組。使用說明書可包括用於診斷或治療tau相關疾病之說明書。如本文所提供之套組可根據本文所述方法中之任一者來使用。熟習此項技術者將知曉本文所提供套組之其他合適用途,且將能夠將該等套組用於此類用途。如本文所提供之套組亦可包括可用於將分析樣本傳回至(例如)實驗室之郵件(例如郵資已付之信封或郵遞封裝)。套組可包括一或多個樣本容器,或樣本可在標準血液採集小瓶中。套組亦可包括知情同意書、測試申請表及關於如何在本文所述方法中使用套組的說明書中之一或多者。使用此類套組之方法亦包括在本文中。表(例如,測試申請表)及容納樣本之容器中之一或多者可例如用條碼進行編碼以用於識別提供樣本之個體。 熟習此項技術者將能識別類似或等效於本文所述之多種方法及材料,其可用於本發明之實踐中。實際上,本發明決不限於所述方法及材料。實例 本發明進一步描述於以下實例中,該等實例不限制申請專利範圍中所描述之本發明之範疇。實例 1 一般材料及方法 反義寡核苷酸之合成及純化 針對活體外用途在Mermade192合成器(BioAutomation)上且針對活體內目的在Mermade 12 (BioAutomation)上,使用標準胺基磷酸酯化學法製備本發明中所描述之經修飾之反義寡核苷酸。將胺基磷酸酯以0.15 M之濃度溶解於乙腈中(0.08 M於Mermade192上);藉由5-乙硫基四唑於乙腈中之0.5M溶液(0.25M於Mermade192上)活化胺基磷酸酯來進行偶合。偶合時間通常在3至4分鐘之間。藉由使用苯乙醯基二硫化物之0.2 M溶液進行硫化,持續五分鐘。藉由於吡啶(20%)/水(9.5%)/四氫呋喃(70.5%)中之0.02 M碘溶液進行氧化,持續兩分鐘。使用標準封端試劑進行封端。藉由含3%二氯乙酸之甲苯將寡核苷酸生長鏈去三苯甲基化以用於下一偶合。順序完成後,在65℃下藉由液體氫氧化銨對支撐物結合的化合物進行裂解且去保護,持續2小時。藉由HPLC (Akta Explorer)直接純化所獲得粗溶液。經純化溶離份藉由質譜法進行分析且藉由UV根據其在260 nM下之消光係數進行量化。將所抽溶離份去鹽且凍乾至乾燥。反義寡核苷酸之活體外測試 在活體外在各種細胞株中測試反義寡核苷酸,該等細胞株包括(但不限於)諸如Huh7細胞、Hela細胞及SH-SY5Y細胞之人類細胞株及COS1綠猴細胞株。細胞自商業供應商(例如,美國菌種保藏中心(American Type Culture Collection;ATCC),Manassas, VA)獲得且根據供應商之說明書培養。 亦在衍生自人類胚胎幹細胞(hESC)之人類神經元中測試反義寡核苷酸,該等人類胚胎幹細胞自位於美國威斯康星州麥迪遜之WiCell Research Institute, Inc.獲得。藉由神經生成素-2 (Ngn2) (一種神經元譜系特異性轉錄因子)之強制表現將hESC轉化為功能性神經元細胞。使用用於rtTA之組成性表現及由tetO啟動子驅動之外源性蛋白質之四環素誘導性表現的慢病毒遞送將Ngn2構築體遞送至hESC中。樣本遵從由美國醫學院國家委員會研究所建立之用於人類胚胎幹細胞研究之指南(「NAS指南」)及人類研究保護局、衛生及人類服務部(「DHHS」)規定以保護人類個體(45 CFR部分1Q)。 當細胞在培養物中大致達到60%至80%匯合度時,藉由轉染或核轉染將反義寡核苷酸引入至所培養細胞中。對於轉染,在適當細胞培養基中混合反義寡核苷酸與OptiFect™轉染試劑(Life Tech目錄號12579-017)以達成所需反義寡核苷酸濃度及介於每100 nM反義寡核苷酸2 ug/mL至12 ug/mL範圍內之OptiFectTM 濃度。對於核轉染,用Amaxa核轉染-II設備(Lonza, Walkersville, MD)將反義寡核苷酸引入至神經母細胞瘤SH-SY5Y細胞中。為測試ASO功效,在96孔培養盤中進行核轉染。基於初步實驗後之高存活率及有效轉染來選擇核轉染溶液SF。在核轉染當日,以胰蛋白酶處理60%至80%匯合培養物,且將細胞塗鋪於各孔中。藉由將1 μM或10 μM反義寡核苷酸添加至待經由被動吸收而吸收之培養基中來處理hESC衍生之人類神經元。 在反義寡核苷酸處理24至72小時之後收集細胞,此時使用此項技術中已知及如本文所描述之方法來分離且量測tau mRNA或蛋白質。一般而言,當在多個複製物中進行處理時,資料表示為重複處理之平均值。所使用之反義寡核苷酸之濃度根據細胞株而有所變化。判定用於特定細胞株之最佳反義寡核苷酸濃度之方法為此項技術中熟知的。當用OptiFect進行轉染時,反義寡核苷酸通常以介於1 nM至1,000 nM範圍內之濃度使用;且當使用核轉染來進行轉染時,反義寡核苷酸通常以介於25 nM至20,000 nM範圍內之濃度使用。 根據製造商之說明書使用ViiA7即時PCR系統(Life Technologies),藉由定量即時PCR完成對MAPT (tau) mRNA含量之定量。在即時PCR之前,使經分離之RNA進行反轉錄反應,產生隨後用作即時PCR擴增之基質的互補DNA (cDNA)。在相同樣本孔中依序進行反轉錄反應及即時PCR反應。使用快速通道細胞多工套組(Qiagen目錄號216513)使孔中之細胞裂解,且在無RNA純化的情況下直接自經培養細胞將mRNA反轉錄成cDNA。cDNA隨後用於使用定量即時PCR之tau表現分析。使用管家基因之表現水準來標準化藉由即時PCR測定之tau mRNA含量,該管家基因之表現程度在細胞中為恆定的,諸如人類甘油醛3-磷酸酯去氫酶(GAPDH)、人類TATA-盒結合蛋白質(TBP)或人類次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉移酶(HPRT1)。 遵循如QuantiTect多工RT-PCR套組(Qiagen目錄號204643)中所描述之協定,使用雙螺旋RT-PCR反應,針對即時定量RT-PCR進行TaqMan基因表現檢定。使用對人類MAPT (LifeTech AssayID號Hs00902194_m1: FAM-MGB)、人類GAPDH (LifeTech AssayID號Hs02758991_g1: VIC-MGB)、人類TBP (LifeTech目錄號4326322E)或人類HPRT1 (LifeTech目錄號4333768T)具有特異性之Taqman探針。遵循雙螺旋RT-PCR之建議循環條件,在ViiA7即時PCR系統(Life Technologies)上運行樣本。針對cDNA輸入之數量控制所有資料,且將tau mRNA含量標準化為內源性參考基因之含量。在相同反應中以類似的高PCR效率擴增Tau基因及對照基因,從而使得能夠藉由ΔΔCT方法進行相對定量。結果表示為殘餘tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。反義寡核苷酸之活體內測試 藉由經由腦室(ICV)投與將ASO遞送至小鼠之腦脊髓液(CSF)中而在活體內測試用於MAPT之反義寡核苷酸。用5%異氟醚麻醉小鼠,其後將氧/氧亞硝酸中之異氟醚含量減少至1.5%至2%用於維持整個手術程序。用恆溫加熱毯覆式及直腸探針將直腸溫度維持在36.9±1.0℃。將麻醉後小鼠置放於立體定位裝置中,且將頭部之皮膚刮毛並用聚維酮-碘溶液(必妥碘(Betadine))消毒。在切割之前,給予小鼠丁基原啡因(Temgesic,0.03 mg/kg,1 ml/kg,s.c.)。其後,進行切割以曝露顱骨,用於判定注射之大腦座標。藉由使用10 µl Hamilton注射器及具有微米泵之28 G針(Harvard Apparatus)將注射液(總體積2 µl)給予至所有動物之右側腦室中以下座標處:AP = +0.5 mm;ML = +1.0 mm;DV = -2.5 mm。流動速率為1 µl/min,且在輸注之後在抽出之前將針留在原位1分鐘。閉合皮膚,且在將小鼠返回至飼養籠之前使其在單一籠中恢復。在第一48小時期間,一日兩次投與額外劑量之丁基原啡因(Temgesic,0.03 mg/kg,1 ml/kg,s.c.)。 由實驗室/動物技術員每日監測動物。監測動物之一般情況及傷口恢復;且每日量測體重。在結束點,用戊巴比妥鈉(60 mg/kg Mebunat,Orion Pharma,Finland)深度麻醉動物。對小鼠進行大池穿刺且採集CSF (每小鼠3 µL至5 µL)。其後,對小鼠進行心臟穿刺且採集血液樣本。將大致0.4 mL至0.5 mL血液採集至500 μL塑膠淡紫色K2EDTA抗凝血管中,且在4℃下、以2000g離心10 min並等分血漿。其後,將小鼠去頭,且採集大腦並剝離成不同大腦區域,諸如皮質、海馬體及小腦。此外,亦採集脊髓。實例 2 藉由 18 聚體 2 '- O - MOE 立體阻斷劑抑制 Huh7 細胞中之人類 Tau 表現 反義寡核苷酸立體阻斷劑經設計以靶向人類Tau中之組成性外顯子(所有同功異型物中都存在之不變的外顯子)之內含子-外顯子連接處。反義寡核苷酸立體阻斷劑經設計以藉由與內含子分支點序列雜交、直接靶向拼接位點、包圍內含子及外顯子序列、外顯子拼接強化子位點中任一者來誘發外顯子跳躍。靶向MAPT之立體阻斷劑最初經設計為18個核苷長,其中所有核苷中具有2'-O-(2-甲氧基乙基) (2'-O-MOE)核糖修飾,其經由立體阻礙起作用且不活化RNase H或RISC。全部核苷間鍵為磷酸二酯鍵。對具有磷酸二酯主鏈之18聚體經均一修飾之2'-MOE ASO進行無偏篩檢。對各嗎啉基寡核苷酸序列進行BLAST分析以避免脫靶雜交。 在活體外測試靶向tau之18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在人類Tau mRNA抑制中之活性。以每孔10,000細胞之密度塗鋪Huh7細胞,且使用OptiFect試劑(LifeTech目錄號12579-017)用25 nM反義寡核苷酸來轉染該等細胞。在48小時處理時間段之後,使用快速通道細胞多工套組(Qiagen目錄號216513)直接由所培養細胞製備cDNA。使用對人類MAPT (LifeTech AssayID號Hs00902194_m1: FAM-MGB)及人類TBP (TATA-盒結合蛋白質)內源性對照物(LifeTech目錄號4326322E)具有特異性之Taqman探針,在雙螺旋RT-PCR反應中藉由定量即時PCR量測Tau mRNA含量。針對cDNA輸入之數量控制所有資料,且將tau mRNA含量標準化為內源性參考基因TBP之含量。在相同反應中以類似的高PCR效率擴增Tau及TBP對照基因,從而使得能夠藉由ΔΔCT方法進行相對定量。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表2展示彼等18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在Huh7細胞中之活性。 2 18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在Huh7細胞中對tau mRNA之抑制。 1.各核苷酸具有2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)修飾;且核苷間鍵為磷酸二酯。各寡核苷酸具有經由磷酸酯橋連接至ASO之3'端的連接子(L1),且具有以下結構:。 2:殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照Huh7細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量25 nM之tau ASO處理48小時的Huh7細胞中之tau mRNA含量。舉例而言,19.5%殘餘mRNA意謂SEQ ID NO: 1之ASO在減少tau mRNA含量中具有80.5%活性。實例 3 藉由 18 聚體 2 '- O - MOE 立體阻斷劑抑制 SH - SY5Y 細胞中之人類 Tau 表現 選擇在實例2中顯著減少tau表現之立體阻斷劑且在人類神經母細胞瘤SH-SY5Y細胞中進行測試。用1,000 nM所選擇反義寡核苷酸來核轉染所培養SH-SY5Y細胞。在大致24小時處理時間段之後,使用快速通道細胞多工套組(Qiagen目錄號216513)直接由所培養細胞製備cDNA。使用雙螺旋RT-PCR反應藉由定量即時PCR量測Tau mRNA含量,使用對人類MAPT (LifeTech AssayID號Hs00902194_m1: FAM-MGB)及人類GAPDH (LifeTech AssayID號Hs02758991_g1: VIC-MGB)具有特異性之Taqman探針。針對cDNA輸入之數量控制所有資料,且將Tau mRNA含量標準化為內源性參考基因GAPDH之含量。在相同反應中以類似的高PCR效率擴增Tau及GAPDH對照基因,從而使得能夠藉由ΔΔCT方法進行相對定量。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表3展示所選擇18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在SH-SY5Y細胞中之活性。 3 18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在SH-SY5Y細胞中對tau mRNA之抑制。 3:殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量1,000 nM之tau ASO處理24小時的SH-SY5Y細胞中之tau mRNA含量。 在不同劑量下測試展現對tau mRNA具有顯著活體外抑制之立體阻斷劑。用0.125 nM、0.25 nM、0.5 nM、1,000 nM、2,000 nM、4,000 nM及8,000 nM之一種所選擇反義寡核苷酸來核轉染所培養SH-SY5Y細胞。在大致24小時處理時間段之後,直接製備cDNA且藉由如上文所描述之定量即時PCR量測tau mRNA含量。藉由建構劑量-反應曲線且檢驗反義寡核苷酸之不同濃度對減少Tau mRNA之影響來測定半最大抑制濃度(IC50)。IC50值藉由測定抑制化合物之一半最大生物學回應所需之濃度來加以計算且可用作反義寡核苷酸之效能度量。表4展示所選擇18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑之IC50值。 4 所選擇18聚體2'-O-MOE立體阻斷劑之IC50 實例 4 藉由 12 25 聚體 2 '- O - MOE 立體阻斷劑抑制 SH - SY5Y 細胞中之人類 Tau 表現 選擇在實例2及3中顯著減少tau表現之立體阻斷劑且將其製成為具有12至25個核苷長之不同長度。在SH-SY5Y細胞中測試此等12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑。用2,000 nM之所選擇反義寡核苷酸來核轉染所培養SH-SY5Y細胞。在大致24小時處理時間段之後,直接製備cDNA且如上文所描述地量測Tau mRNA含量。表5展示12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在SH-SY5Y細胞中之活性。 5 12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在SH-SY5Y細胞中對tau mRNA之抑制。 4.各核苷酸具有2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)修飾;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為磷酸二酯。各寡核苷酸具有經由磷酸酯橋連接至ASO之3'端的連接子(L1),且具有以下結構:。 5:殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量2,000 nM之tau ASO處理24小時的SH-SY5Y細胞中之tau mRNA含量。 具有磷酸二酯核苷間鍵之所選擇12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑之IC50值如上文所描述加以測定,且展示於表6中。 合成多個具有硫代磷酸酯核苷間鍵之12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑,且彼等立體阻斷劑中之一些的IC50值展示於表7中。 6 具有磷酸二酯核苷間鍵之所選擇12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑之IC50 7 具有硫代磷酸酯核苷間鍵之所選擇12至25聚體2'-O-MOE立體阻斷劑之IC50 5.各核苷酸具有2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)修飾;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為硫代磷酸酯。各寡核苷酸具有經由磷酸酯橋連接至ASO之3'端的連接子(L1),且具有以下結構:實例 5 藉由 17 聚體 2 '- O - MOE 立體阻斷劑抑制 SH - SY5Y 細胞中之人類 Tau 表現 17個核苷長度之2'-MOE立體阻斷劑經設計以靶向人類Tau中之組成性外顯子。在SH-SY5Y細胞中測試彼等17聚體2'-O-MOE立體阻斷劑。用2,000 nM之所選擇反義寡核苷酸來核轉染所培養SH-SY5Y細胞。在大致24小時處理時間段之後,直接製備cDNA且如上文所描述地量測tau mRNA含量。表8展示17聚體2'-O-MOE立體阻斷劑在SH-SY5Y細胞中之活性。 8 17聚體MOE立體阻斷劑在SH-SY5Y細胞中對tau mRNA之抑制 6.各核苷酸具有2'-O-MOE修飾;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為磷酸二酯。各寡核苷酸具有經由磷酸酯橋連接至ASO之3'端的連接子(L1),且具有以下結構:。 7:殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量2,000 nM之tau ASO處理24小時的SH-SY5Y細胞中之tau mRNA含量。實例 6 藉由 5 - 10 - 5 間隔體抑制 Huh7 細胞中之人類 Tau 表現 反義寡核苷酸序列經設計為與最短Tau同功異型物(轉錄變體4) mRNA (GenBank:NM_016841.4)互補。對各寡核苷酸序列進行BLAST分析以避免脫靶雜交。最新設計的經修飾之嵌合反義寡核苷酸經設計為20個核苷長度之5-10-5間隔體,其中中心間隔區段包含十個2'-去氧核苷且在5'端方向及3'端方向上側接翼區段,該等翼區段包含各自具有2'-O-MOE核糖修飾之五個核苷。遍佈各間隔體中之核苷間鍵為硫代磷酸酯(P=S)鍵。 針對活體外抑制人類Tau mRNA表現測試靶向tau之間隔體在。以每孔10,000細胞之密度塗鋪Huh7細胞,且使用OptiFect試劑(LifeTech目錄號12579-017)用25 nM反義寡核苷酸來轉染該等細胞。在48小時處理時間段之後,使用快速通道細胞多工套組(Qiagen目錄號216513)直接由所培養細胞製備cDNA。使用對人類MAPT (LifeTech AssayID號Hs00902194_m1: FAM-MGB)及人類TBP (TATA-盒結合蛋白質)內源性對照物(LifeTech目錄號4326322E)具有特異性之Taqman探針,在雙螺旋RT-PCR反應中藉由定量即時PCR量測Tau mRNA含量。針對cDNA輸入之數量控制所有資料,且將Tau mRNA含量標準化為內源性參考基因TBP之含量。在相同反應中以類似的高PCR效率擴增Tau及TBP對照基因,從而使得能夠藉由ΔΔCT方法進行相對定量。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表9展示間隔體在Huh7細胞中之活性。 9 5-10-5 MOE間隔體在Huh7細胞中對Tau mRNA之抑制 8.具有*之核苷酸具有2'-O-MOE修飾;不具有*之核苷酸為2'-去氧核苷。核苷間鍵為硫代磷酸酯。 9:殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照Huh7細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量25 nM之tau ASO處理48小時的Huh7細胞中之tau mRNA含量。實例 7 藉由 5 - 10 - 5 間隔體抑制 SH - SY5Y 細胞中之人類 Tau 表現 選擇在實例6中顯著減少Tau mRNA表現之間隔體且在SH-SY5Y細胞中進行測試。用2,000 nM反義寡核苷酸來核轉染所培養SH-SY5Y細胞。在大致24小時處理時間段之後,使用快速通道細胞多工套組(Qiagen目錄號216513)直接由所培養細胞製備cDNA。使用雙螺旋RT-PCR反應藉由定量即時PCR量測Tau mRNA含量,使用對人類MAPT (LifeTech AssayID號Hs00902194_m1: FAM-MGB)及人類GAPDH (LifeTech AssayID號Hs02758991_g1: VIC-MGB)具有特異性之Taqman探針。針對cDNA輸入之數量控制所有資料,且將Tau mRNA含量標準化為內源性參考基因GAPDH之含量。在相同反應中以類似的高PCR效率擴增Tau及GAPDH對照基因,從而使得能夠藉由ΔΔCT方法進行相對定量。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表10展示所選擇5-10-5間隔體在SH-SY5Y細胞中之活性。具有5-甲基胞嘧啶之所選擇5-10-5間隔體之IC50值如上文所描述在SH-SY5Y細胞中加以測定,且展示於表11中。 10 5-10-5間隔體在SH-SY5Y細胞中對Tau mRNA之抑制 10:殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量2,000 nM之tau ASO處理24小時的SH-SY5Y細胞中之tau mRNA含量。 11 具有5-甲基胞嘧啶之所選擇5-10-5間隔體在SH-SY5Y細胞中之IC50 11.具有*之核苷酸具有2'-O-MOE修飾;不具有*之核苷酸為2'-去氧核苷;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為硫代磷酸酯。實例 8 靶向 MAPT 之反義寡核苷酸之特性 藉由使用Thermo Scientific高輸送量液相層析質譜(LC-MS)儀器來特性化靶向MAPT之反義寡核苷酸。此方法用於確認反義寡核苷酸(ASO)之預期質量且提供關於樣本純度之資訊及主要存在組分之鑑別。舉例而言,包含SEQ ID NO: 284之反義寡核苷酸具有圖1A中所展示之結構及式C230 H321 N72 O120 P19 S19 。因此,包含SEQ ID NO: 284之ASO之預期分子量約為7212.3 Da。圖1B展示如藉由LC-MS所量測之包含SEQ ID NO: 284的ASO之峰質量為7214.3 Da。圖1C展示包含SEQ ID NO: 284之ASO之LC-MS解卷積峰報告。 包含SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸具有式C230 N69 O124 P19 S19 H318 ,經估計分子量為7231.11 Da。圖1D展示如藉由LC-MS所量測之包含SEQ ID NO: 285的ASO之峰質量為7232.5。圖1E展示包含SEQ ID NO: 285之ASO之LC-MS解卷積峰報告。實例 9 靶向 MAPT 之間隔體之活體內測試 人類 Tau ( hTau ) 轉殖基因小鼠之產生 自生命技術人類基因組庫獲得含有人類tau基因MAPT之BAC載體(pBACe3.6)。篩檢經預測含有MAPT基因之所有調節區域之三種載體。對人類基因組DNA進行標準PCR以測試各外顯子之存在,亦使用跨越人類tau基因之內含子及調節區域的引子來測定純系之序列。與人類DNA之比較展示,一個純系(RP11 669E14)針對tau基因之所有部分而言係完好的。將此BAC載體用於產生hTau BAC轉殖基因小鼠。將經純化之DNA注射至C57BL/6小鼠之受精胚胎中。來自初始幼鼠之尾部DNA用限制酶進行消化且用外顯子特異性探針進行雜交,使用經類似消化之人類DNA作為對照以測試轉殖基因完整性。擴充陽性初始幼鼠。產生若干hTau BAC轉殖基因株系且一個株系展示人類MAPT mRNA及蛋白質表現(圖2A至圖2C)。此株系表現人類大腦中發現之所有六種人類大腦轉錄物及蛋白質同功異型物(圖2A至圖2C)。異型合子hTau BAC轉殖基因小鼠攜帶轉殖基因之一個複本,且RNA及人類tau表現水準與內源性鼠類Tau表現相當。藉由反義寡核苷酸活體內阻斷人類 Tau 基因表現 在活體內測試所選擇反義寡核苷酸。五隻hTau BAC轉殖基因小鼠組成之組藉由腦室內(ICV)快速注射投與1 μg、10 μg、50 μg、200 μg或400 μg之所選擇反義寡核苷酸,或不治療作為對照小鼠組。所有程序均在異氟烷麻醉下且根據IACUC規定進行。對於ICV快速注射,將反義寡核苷酸注射至hTau BAC轉殖基因小鼠之右側腦室中。注射兩微升或四微升含有100 μg/μl寡核苷酸之PBS溶液。在投與寡核苷酸1小時、4小時、24小時、2週、4週、12週或24週後立即採集組織。自海馬體或皮質提取RNA,且針對人類tau mRNA表現藉由即時PCR分析進行檢驗。如上文所描述地量測人類tau mRNA含量。結果經計算為經標準化為GAPDH含量之人類tau mRNA表現相比於對照未經治療小鼠之抑制百分比。自海馬體或皮質提取蛋白質,且針對人類tau蛋白質表現水準藉由ELISA進行檢驗且標準化為總蛋白質含量。 使用上文所描述之方法來測試包含SEQ ID NO: 284或SEQ ID NO: 285之5-10-5間隔體之活體內活性。如表12中所展示,在單次ICV注射反義寡核苷酸2週之後,反義寡核苷酸均顯著抑制皮質及海馬體中之人類tau mRNA表現。對於包含SEQ ID NO: 285之間隔體,人類tau mRNA在皮質及海馬體兩者中之阻斷基因表現大致為65%。對於包含SEQ ID NO: 284之間隔體,人類tau mRNA在皮質及海馬體兩者中之阻斷基因表現大致為42%。對於ASO治療2週後之tau蛋白質含量,包含SEQ ID NO: 285之間隔體在皮質中阻斷約50%之tau蛋白質表現;且包含SEQ ID NO: 284之間隔體在皮質中阻斷約36%之tau蛋白質表現。在ASO治療2週後,未在海馬體中觀測到tau蛋白質含量之顯著減少。 12 藉由5-10-5 MOE間隔體在活體內抑制Tau mRNA及蛋白質表現 12:殘餘tau mRNA%為,與未用ASO治療之對照hTau BAC轉殖基因小鼠之指定大腦組織中的tau mRNA含量相比,單次ICV注射指定ASO兩週後hTau BAC轉殖基因小鼠之對應大腦組織中的tau mRNA含量。 13:殘餘tau蛋白質%為,與未用ASO治療之對照hTau BAC轉殖基因小鼠之指定大腦組織中的tau蛋白質含量相比,單次ICV注射指定ASO兩週後hTau BAC轉殖基因小鼠之對應大腦組織中的tau蛋白質含量。 在單次ICV注射間隔體4週後,亦測試Tau mRNA及蛋白質含量。包含SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸顯著抑制大腦中之人類tau mRNA (圖2D)及蛋白質(圖2E)表現。對於包含SEQ ID NO: 285之間隔體,人類tau mRNA之阻斷基因表現在皮質及海馬體兩者中大致為60% (圖2D及未展示資料)。西方墨點分析展示,治療4週後,包含SEQ ID NO: 285之間隔體在海馬體中阻斷大致50%之人類tau蛋白質含量(圖2E)。 為偵測反義寡核苷酸在hTau BAC轉殖基因小鼠之大腦中之大腦分佈,使用經雙倍地高辛(DIG)標記之鎖核酸(LNA™,Exiqon)探針來進行原位雜交實驗。將與目標反義寡核苷酸互補之雙倍DIG LNA探針雜交隔夜。接著使用綿羊抗DIG鹼性磷酸酶結合之抗體(Roche Diagnostics,目錄號11093274910)及與鹼性磷酸酶基質磷酸5-溴-4-氯-3-吲哚基酯(BCIP)結合之氮藍四唑之比色反應來偵測探針。代表性實驗中SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸之大腦分佈展示於圖3中,其展示ASO自腦室開始擴散至小鼠大腦軟組織,且在24小時至2週之間分佈信號未改變(圖3)。甚至在4週後,反義寡核苷酸在大腦中仍為穩定的(未展示資料)。 觀測到SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸在hTau BAC轉殖基因小鼠中對人類tau mRNA (圖4A)及蛋白質(圖4B)表現之劑量依賴性抑制(圖4A及圖4B)。 單次ICV注射200 μg SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸後hTau BAC轉殖基因小鼠中之人類tau mRNA (圖5A)及蛋白質(圖5B)表現水準之時程展示SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸對tau mRNA及蛋白質表現長達12週之持續抑制(圖5A及圖5B)。實例 10 藉由具有 5 - 甲基胞嘧啶之額外 5 - 10 - 5 間隔體抑制 Huh7 細胞及 SH - SY5Y 細胞中之人類 Tau 表現 如上文所描述針對抑制活體外Huh7細胞及SH-SY5Y細胞中之人類Tau mRNA表現來測試靶向tau之具有5-甲基胞嘧啶的額外間隔體序列。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表13展示5-10-5間隔體之額外篩檢序列在Huh7細胞及SH-SY5Y細胞中之活性。 13 5-10-5 MOE間隔體在Huh7細胞及SH-SY5Y細胞中對Tau mRNA之抑制 14.具有*之核苷酸具有2'-O-MOE修飾;不具有*之核苷酸為2'-去氧核苷;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為硫代磷酸酯。 15.殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量2,000 nM之tau ASO處理24小時的SH-SY5Y細胞中之tau mRNA含量。 16.殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量25 nM之tau ASO處理48小時的Huh7細胞中之tau mRNA含量。 選擇在表13中顯著減少Tau mRNA表現之間隔體且在SH-SY5Y細胞中進行測試。具有5-甲基胞嘧啶之所選擇5-10-5間隔體之IC50值如上文所描述在SH-SY5Y細胞中加以測定,且展示於表14中。 表14:具有5-甲基胞嘧啶之所選擇5-10-5間隔體在SH-SY5Y細胞中之IC50 17.具有*之核苷酸具有2'-O-MOE修飾;不具有*之核苷酸為2'-去氧核苷;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為硫代磷酸酯。實例 11 藉由具有 5 - 甲基胞嘧啶之反義寡核苷酸抑制猴及人類 Tau 表現 選擇顯著減少Tau mRNA表現之一些間隔體且在COS1綠猴細胞中進行測試。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表15展示所選擇5-10-5間隔體在COS1細胞中之活性。 15 5-10-5 MOE間隔體在Cos1細胞中對綠猴Tau mRNA之抑制 18.具有*之核苷酸具有2'-O-MOE修飾;不具有*之核苷酸為2'-去氧核苷;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為硫代磷酸酯。 19.殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量2,000 nM之tau ASO處理24小時的Cos1細胞中之tau mRNA含量。 選擇顯著減少Tau mRNA表現之一些反義寡核苷酸且在源於人類胚胎幹細胞(hESC)之神經元中進行測試。結果表示為殘餘Tau mRNA相對於用PBS處理之對照細胞的百分比。表16展示所選擇反義寡核苷酸在人類神經元中之活性。 16 :所選擇Tau ASO在源於hESC之神經元中對人類Tau表現之抑制 20.具有*之核苷酸具有2'-O-MOE修飾;不具有*之核苷酸為2'-去氧核苷;且m C表示5-甲基胞嘧啶。核苷間鍵為硫代磷酸酯。 21.殘餘mRNA%為,與用PBS處理之對照細胞中之tau mRNA含量相比,用單次劑量10 μM之tau ASO處理10至14天的源於hESC之神經元中之tau mRNA含量。 實例 12 靶向 MAPT 之間隔體之活體內測試 使用實例9中所描述之方法來測試所選擇5-10-5間隔體之活體內活性。如表17中所展示,一些反義寡核苷酸在皮質及海馬體中顯著抑制人類tau mRNA及蛋白質表現。 1 7 5-10-5 MOE間隔體在活體內對Tau mRNA及蛋白質表現之抑制 22:殘餘tau mRNA%為,與未用ASO治療之對照hTau BAC轉殖基因小鼠之指定大腦組織中的tau mRNA含量相比,單次ICV注射指定ASO四週後hTau BAC轉殖基因小鼠之對應大腦組織中的tau mRNA含量。 23:殘餘tau蛋白質%為,與未用ASO治療之對照hTau BAC轉殖基因小鼠之指定大腦組織中的tau蛋白質含量相比,單次ICV注射指定ASO四週後hTau BAC轉殖基因小鼠之對應大腦組織中的tau蛋白質含量。 24:N/T意謂未測試。 除非另外定義,否則本文所使用之技術及科學術語具有與其由熟習本發明所屬領域之專家通常所理解相同的含義。 如熟習此項技術者應清楚,除非另外指示,否則所有未特定詳細描述之方法、步驟、技術及操作可以本身已知之方式來進行且已以本身已知之方式進行。例如再次提及標準手冊及本文中提及之一般背景技術及其中所引用之其他參考案。除非另外指示,否則本文中所引用之參考案中之每一者以其全文引用的方式併入本文中。 本發明之申請專利範圍為非限制性的且提供於下文中。 儘管本文已詳細揭示特定態樣及申請專利範圍,但此已藉助於實例僅出於說明之目的進行,且不意欲對所附申請專利範圍之範疇或任何對應未來申請案之申請專利範圍之標的物之範疇具有限制性。特定言之,本發明人預期在不脫離如申請專利範圍所定義之本發明之精神及範疇下可對本發明進行各種取代、更改及修改。咸信核酸起始物質、所關注之純系或庫類型的選擇對於具有本文所述態樣之知識的一般技術者而言為慣例。認為其他態樣、優點及修改在以下申請專利範圍之範疇內。熟習此項技術者應認識到或能夠使用不超過常規實驗來確定本文所描述之本發明之特定態樣的許多等效物。此類等效物意欲由以下申請專利範圍涵蓋。在稍後申請之對應申請案中申請專利範圍範疇之改寫可歸因於各國家之專利法律的限制且不應解釋為放棄申請專利範圍之標的物。
圖1A至圖1E展示靶向MAPT之反義寡核苷酸之物理特性。圖1A展示包含SEQ ID NO: 284之反義寡核苷酸(ASO)的結構,其具有式C230 H321 N72 O120 P19 S19 及7212.3 Da之預期分子量。圖1B展示包含SEQ ID NO: 284之ASO的液相層析質譜(LC-MS)數據,其中經量測峰質量為7214.3。圖1C展示包含SEQ ID NO: 284之ASO之LC-MS的解卷積峰報告。圖1D展示包含SEQ ID NO: 285之ASO的LC-MS數據,其中經量測峰質量為7232.5。圖1E展示包含SEQ ID NO: 285之ASO之LC-MS解卷積峰報告。 圖2A至圖2E展示人類tau mRNA及蛋白質在反義寡核苷酸治療之前及之後在代表性hTau BAC轉殖基因小鼠株系中的表現水準。圖2A為代表性RT-PCR結果,其展示在hTau BAC轉殖基因小鼠(轉殖基因株系510,兩個月大雌性小鼠)之前腦中發現全部六種人類tau轉錄物。替代性地拼接外顯子2、3及10,從而產生六種tau同功異型物:2-3-10-、2+3-10-、2+3+10-、2-3-10+、2+3-10+、2+3+10+。4R表示具有外顯子10之tau同功異型物,3R表示無外顯子10之tau同功異型物;0N表示既不具有外顯子2亦不具有外顯子3之tau同功異型物;1N表示具有外顯子2或外顯子3之tau同功異型物;2N表示具有外顯子2及外顯子3兩者之tau同功異型物。圖2B為展示介於352至441個胺基酸範圍內之分子量為48 kD至67 kD的六種tau蛋白質同功異型物的代表性西方墨點。其不同之處在於:(1)包括29胺基酸N端部分之零個、一個或兩個插入序列(0N、1N或2N);或(2)包括三個或四個微管結合結構域(3R或4R)。圖2C為展示人類tau在hTau BAC轉殖基因小鼠之大腦中之正常軸突分佈(如藉由人類tau特異性抗體染色)的代表性免疫組織化學影像。圖2D為展示在包含SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸之單次治療後4週,hTau BAC轉殖基因小鼠之皮質中之tau mRNA阻斷基因表現的條形圖。圖2E為展示在包含SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸之單次治療後4週,hTau BAC轉殖基因小鼠之海馬體中之tau蛋白質阻斷基因表現的代表性西方墨點。 圖3為展示SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸在hTau BAC轉殖基因小鼠中之廣泛大腦分佈的一組原位雜交影像。 圖4A及圖4B為展示在單次ICV注射1 μg、10 μg、50 μg、200 μg或400 μg之SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸後4週或12週處,hTau BAC轉殖基因小鼠中之人類tau mRNA (圖4A)及蛋白質(圖4B)表現之劑量依賴性抑制的點狀圖。 圖5A及圖5B為展示在單次ICV注射200 μg SEQ ID NO: 285之反義寡核苷酸後,hTau BAC轉殖基因小鼠中之人類tau mRNA (圖5A)及蛋白質(圖5B)表現水準之時程的點狀圖。

Claims (45)

  1. 一種寡核苷酸,其包含與表2至表17中所提供之核鹼基序列中之任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列,其中該等核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中該寡核苷酸之至少一個核苷酸具有2'-修飾。
  2. 如請求項1之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與表2至表8中所提供之序列中之任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列,其中該等核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中該等寡核苷酸之各核苷酸具有2'-修飾。
  3. 如請求項2之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與表2至表8中所提供之該等序列中之任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列。
  4. 如請求項2之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與表2至表8中所提供之該等核鹼基序列中之任一者具有至少95%序列一致性之核鹼基序列。
  5. 如請求項2之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含表2至表8中所提供之該等核鹼基序列中之任一者。
  6. 如請求項2之寡核苷酸,其中該寡核苷酸由表2至表8中所提供之該等核鹼基序列中之任一者組成。
  7. 如請求項2至6中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸之核苷間鍵為磷酸二酯鍵或硫代磷酸酯鍵。
  8. 如請求項2至6中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含經由磷酸酯橋連接至該寡核苷酸之3'端的連接子,且該寡核苷酸具有以下結構中之任一者:
  9. 如請求項2至6中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸以獨立於RNAse H方式減少tau mRNA或蛋白質表現。
  10. 如請求項1之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與表9至表15及表17中所提供之序列中之任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列,其中該等核鹼基序列中任一者中之C為胞嘧啶或5-甲基胞嘧啶,且其中該寡核苷酸之至少一個核苷酸具有2'-修飾。
  11. 如請求項10之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與表9至表15及表17中所提供之該等序列中之任一者具有至少90%序列一致性之核鹼基序列。
  12. 如請求項10之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與表9至表15及表17中所提供之該等核鹼基序列中之任一者具有至少95%序列一致性之核鹼基序列。
  13. 如請求項10之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含表9至表15及表17中所提供之該等核鹼基序列中之任一者。
  14. 如請求項10之寡核苷酸,其中該寡核苷酸係由表9至表15及表17中所提供之該等核鹼基序列中之任一者組成。
  15. 如請求項10至14中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸之核苷間鍵為硫代磷酸酯鍵。
  16. 如請求項10至14中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含至少五個連續2'-去氧核苷。
  17. 如請求項10至14中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含至少七個連續2'-去氧核苷。
  18. 如請求項10至14中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含十個連續2'-去氧核苷。
  19. 如請求項10至14中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸藉由活化RNAse H來減少tau mRNA或蛋白質表現。
  20. 如請求項1至6及10至14中任一項之寡核苷酸,其中該等核鹼基序列中任一者中之各C為5-甲基胞嘧啶。
  21. 一種寡核苷酸,其包含與SEQ ID NO:487至506中任一者之至少12個連續核鹼基互補之核鹼基序列,其中該寡核苷酸之至少一個核苷酸具有2'-修飾。
  22. 如請求項21之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含與SEQ ID NO:487至506中任一者之至少12個連續核鹼基100%互補之核鹼基序列。
  23. 如請求項21之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含一或多個5-甲基胞嘧啶。
  24. 如請求項21之寡核苷酸,其中該寡核苷酸中之各核苷酸具有2'-修飾。
  25. 如請求項21之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含至少五個連續2'-去氧核苷。
  26. 如請求項21之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含至少七個連續2'-去氧核苷。
  27. 如請求項21之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含十個連續2'-去氧核苷。
  28. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含12至30個核鹼基。
  29. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含12至25個核鹼基。
  30. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含15至20個核鹼基。
  31. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該2'-修飾係選自由以下各者組成之群:2'-氟基、2'-去氧-2'-氟基、2'-O-甲基、2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)、2'-O-胺基丙基(2'-O-AP)、2'-O-二甲胺基乙基(2'-O-DMAOE)、2'-O-二甲胺基丙基(2'-O-DMAP)、2'-O-二甲胺基乙氧基乙基(2'-O-DMAEOE)及2'-O-N-甲基乙醯胺基(2'-O-NMA)。
  32. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該2'-修飾為2'-O-甲氧基乙基(2'-O-MOE)。
  33. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸在活體外能夠將tau mRNA或蛋白質表現水準減少至少30%。
  34. 如請求項1至6、10至14及21至27中任一項之寡核苷酸,其中該寡核苷酸在活體內能夠將tau mRNA或蛋白質表現水準減少至少30%。
  35. 一種組合物,其包含如請求項1至34中任一項之寡核苷酸及醫藥學上可接受之載劑。
  36. 一種如請求項1至34中任一項之寡核苷酸之用途,其係用於製造用於減少個體中tau表現水準之藥劑。
  37. 如請求項36之用途,其中該個體罹患或易患tau相關疾病。
  38. 如請求項37之用途,其中該tau相關疾病係選自:阿茲海默氏病(Alzheimer's disease;AD)、肌肉萎縮性側索硬化/帕金森氏症(parkinsonism)-癡呆綜合症(ALS-PDC)、嗜銀顆粒癡呆(argyrophilic grain dementia;AGD)、英國型澱粉樣血管病變、腦澱粉樣血管病變、慢性創傷性腦病(chronic traumatic encephalopathy;CTE)、皮質基底核退化症(corticobasal degeneration;CBD)、庫賈氏病(Creutzfeldt-Jakob disease;CJD)、拳擊員癡呆(dementia pugilistica)、伴隨鈣化之彌漫性神經原纖維纏結、唐氏症候群(Down's syndrome)、德拉韋氏症候群(Dravet's Syndrome)、癲癇症、額顳葉型癡呆(frontotemporal dementia;FTD)、伴隨與染色體17有關之帕金森氏症之額顳葉型癡呆(frontotemporal dementia with parkinsonism linked to chromosome 17;FTDP-17)、額顳葉變性、神經節膠質細胞瘤、神經節瘤、格-施-謝三氏病(Gerstmann-Straussler-Scheinker disease)、哈洛弗登-史巴茲氏病(Hallervorden-Spatz disease)、亨廷頓氏病(Huntington's disease)、包涵體肌炎、鉛腦病、關島型肌肉萎縮性側索硬化病(Lytico-Bodig disease)、腦膜血管瘤病、多發性系統萎縮症、肌緊張性營養不良、C型尼曼-匹克二氏病(Niemann-Pick disease type C;NP-C)、伴隨神經原纖維纏結之非關島型運動神經元病(non-Guamanian motor neuron disease with neurofibrillary tangles)、皮克病(Pick's disease;PiD)、腦炎後帕金森氏症、朊病毒蛋白質腦澱粉樣血管病變、進行性皮質下神經膠瘤病、進行性核上麻痺(progressive supranuclear palsy;PSP)、亞急性硬化性全腦炎、僅纏結型癡呆(tangle only dementia)、纏結主導型癡呆、多梗塞性癡呆、缺血性中風或結節性硬化症。
  39. 如請求項36之用途,其中該藥劑係經鞘內、顱內、鼻內、口服、靜脈內或皮下途徑投與。
  40. 如請求項36之用途,其中該藥劑係與第二藥劑一起投與。
  41. 如請求項36至40中任一項之用途,其中該個體為人類。
  42. 一種如請求項1至34中任一項之寡核苷酸之用途,其係用於製造用於治療有需要個體之tau相關疾病的藥劑。
  43. 如請求項10之寡核苷酸,其中該寡核苷酸包含表9至表15及表17中所提供之核鹼基序列中之任一者,其中第一至第五核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷,其中第六至第十五核苷酸各自包含2'-去氧核苷,且其中第十六至第二十核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷。
  44. 一種寡核苷酸,其包含選自SEQ ID NO: 208、284、285、313、329、335、366、384、386、405、473及474中任一者之核鹼基序列。
  45. 如請求項44之寡核苷酸,其中第一至第五核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷,其中第六至第十五核苷酸各自包含2'-去氧核苷,且其中第十六至第二十核苷酸各自包含經2'-O-MOE修飾之核苷。
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