RU2001128165A - Выявление мутаций в генах посредством специфичных lna-праймеров - Google Patents
Выявление мутаций в генах посредством специфичных lna-праймеровInfo
- Publication number
- RU2001128165A RU2001128165A RU2001128165/13A RU2001128165A RU2001128165A RU 2001128165 A RU2001128165 A RU 2001128165A RU 2001128165/13 A RU2001128165/13 A RU 2001128165/13A RU 2001128165 A RU2001128165 A RU 2001128165A RU 2001128165 A RU2001128165 A RU 2001128165A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acids
- nucleotide
- nucleic acid
- diagnostic
- oligonucleotides
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
- C12N15/1006—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by means of a solid support carrier, e.g. particles, polymers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Claims (53)
1. Способ выявления присутствия в образце нуклеиновой кислоты Q’, нуклеотидная последовательность которой отличается от нуклеиновой кислоты Q по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: a) объединение нуклеиновых кислот, присутствующих в образце, с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, агентом полимеризации нуклеозидтрифосфатов и по меньшей мере одним диагностическим олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, b) удлинение любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами, присутствующими в образце, чтобы образовать продукты удлинения, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) регистрацию любых нуклеиновых кислот, образованных на стадии b) и тем самым выявление наличия нуклеиновой кислоты Q’ в образце.
2. Способ выявления наличия в образце нуклеиновой кислоты Q’, нуклеотидная последовательность которой отличается от нуклеиновой кислоты Q по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: а) объединение нуклеиновых кислот, присутствующих в образце, с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, агентом полимеризации нуклеозидтрифосфатов и по меньшей мере одним диагностическим олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, b) удлинение любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами, присутствующими в образце, чтобы образовать продукты удлинения, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) обработку реакционной смеси после образования продуктов удлинения в денатурирующих условиях, чтобы отделить продукты удлинения от матрицы, d) гибридизацию в присутствии соответствующего количества нуклеозидтрифосфатов и агента полимеризации нуклеозидтрифосфатов одноцепочечных нуклеиновых кислот со стадии с) по меньшей мере с одним диагностическим олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, e) повторение стадий с) и d) достаточное количество раз, чтобы в результате получить регистрируемое количество продуктов удлинения, f) регистрацию образованных продуктов удлинения.
3. Способ выявления наличия в образце нуклеиновой кислоты Q’, нуклеотидная последовательность которой отличается от нуклеиновой кислоты Q по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: a) объединение нуклеиновых кислот с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, агентом полимеризации нуклеозидтрифосфатов, по меньшей мере одним олигонуклеотидом ниже по течению и по меньшей мере одним диагностическим олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, b) удлинение любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами, чтобы образовать продукты удлинения, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) обработку реакционной смеси после образования продуктов удлинения в денатурирующих условиях, чтобы отделить продукты удлинения от матрицы, d) гибридизацию в присутствии соответствующего количества нуклеозидтрифосфатов и агента полимеризации нуклеозидтрифосфатов одноцепочечных нуклеиновых кислот со стадии с) по меньшей мере с одним олигонуклеотидом ниже по течению и по меньшей мере с одним диагностическим олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, e) повторение стадий с) и d) достаточное количество раз, чтобы в результате получить регистрируемое количество продуктов удлинения, f) регистрацию образованных продуктов удлинения.
4. Способ выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: a) объединение нуклеиновых кислот с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, агентом полимеризации нуклеозидтрифосфатов и по, меньшей мере одним набором диагностических олигонуклеотидов в условиях гибридизации, при этом по меньшей мере один набор диагностических олигонуклеотидов имеет нуклеотидные последовательности, которые отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А и содержат по меньшей мере один LNA, b) удлинение любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами, чтобы образовать продукты удлинения, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, с) регистрацию нуклеиновых кислот, образованных на стадии b).
5. Способ выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: a) объединение нуклеиновых кислот с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, агентом полимеризации нуклеозидтрифосфатов и по меньшей мере одним набором диагностических олигонуклеотидов в условиях гибридизации, при этом по меньшей мере один набор диагностических олигонуклеотидов имеет нуклеотидные последовательности, которые отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А и содержат по меньшей мере один LNA, b) удлинение любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами, чтобы образовать продукты удлинения, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) обработку реакционной смеси после образования продуктов удлинения в денатурирующих условиях, чтобы отделить продукты удлинения от матрицы, d) гибридизацию в присутствии соответствующего количества нуклеозидтрифосфатов и агента полимеризации нуклеозидтрифосфатов одноцепочечных нуклеиновых кислот со стадии с) по меньшей мере с одним набором диагностических олигонуклеотидов, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, чтобы дополнительно синтезировать продукты удлинения, e) повторение стадий с) и d) достаточное количество раз, чтобы в результате получить регистрируемое количество продуктов удлинения, f) регистрация образованных продуктов удлинения.
6. Способ выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: a) объединение нуклеиновых кислот с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, агентом полимеризации нуклеозидтрифосфатов, по меньшей мере одним олигонуклеотидом ниже по течению и по меньшей мере одним набором диагностических олигонуклеотидов в условиях гибридизации, при этом по меньшей мере один набор диагностических олигонуклеотидов имеет нуклеотидные последовательности, которые отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А и содержат по меньшей мере один LNA, b) удлинение любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами, чтобы образовать продукты удлинения, где указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) обработку реакционной смеси после образования продуктов удлинения в денатурирующих условиях, чтобы отделить продукты удлинения от матрицы, d) гибридизацию в присутствии соответствующего количества нуклеозидтрифосфатов и агента полимеризации нуклеозидтрифосфатов одноцепочечных нуклеиновых кислот со стадии с) по меньшей мере с одним олигонуклеотидом ниже по течению и по меньшей мере с одним набором диагностических олигонуклеотидов, являющихся олигонуклеотидами, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, чтобы дополнительно синтезировать продукты удлинения, e) повторение стадий с) и d) достаточное количество раз, чтобы в результате получить регистрируемое количество продуктов удлинения, f) регистрацию образованных продуктов удлинения.
7. Способ выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: а) объединение нуклеиновых кислот-мишеней с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, по меньшей мере двумя олигонуклеотидами, где по меньшей мере один из указанных олигонуклеотидов является диагностическим олигонуклеотидом, и агентом лигирования олигонуклеотидов в условиях гибридизации, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид является олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который комплементарен нуклеотиду, обнаруженному в положении А нуклеиновой кислоты-мишени, которую предстоит выявить, причем указанный диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, b) лигирование любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами в близлежащих положениях, чтобы образовать продукты лигирования, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) регистрацию нуклеиновых кислот, образованных на стадии b).
8. Способ выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, способ включает в себя следующие стадии: a) объединение нуклеиновых кислот-мишеней с соответствующим количеством нуклеозидтрифосфатов, по меньшей мере двумя олигонуклеотидами, где по меньшей мере один из указанных олигонуклеотидов является диагностическим олигонуклеотидом, и агентом лигирования олигонуклеотидов в условиях гибридизации, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид является олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который комплементарен нуклеотиду, обнаруженному в положении А нуклеиновой кислоты-мишени, которую предстоит выявить, причем указанный диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, b) лигирование любых олигонуклеотидов, которые гибридизуются с нуклеиновыми кислотами в близлежащих положениях, чтобы образовать продукты лигирования, при этом указанные нуклеиновые кислоты используют в качестве матриц, c) обработку реакционной смеси в денатурирующих условиях, чтобы после лигирования отделить продукты лигирования от матрицы, d) гибридизацию в присутствии соответствующего количества нуклеозидтрифосфатов и агента лигирования олигонуклеотидов в условиях гибридизации одноцепочечных нуклеиновых кислот со стадии с), по меньшей мере с одним олигонуклеотидом, комплементарным продукту лигирования со стадии b), и по меньшей мере двумя олигонуклеотидами, из которых по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид является олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который комплементарен нуклеотиду, обнаруженному в положении А нуклеиновой кислоты-мишени, которую предстоит выявить, при этом указанный диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA, e) повторение стадий с) и d) достаточное количество раз, чтобы в результате получить регистрируемое количество продуктов лигирования, f) регистрацию образованных продуктов лигирования.
9. Способ по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере одно положение А последовательности диагностического олигонуклеотида комплементарно положению А последовательности нуклеиновой кислоты, которую предстоит выявить, но не комплементарно положению А других последовательностей нуклеиновых кислот.
10. Способ по любому из предшествующих пунктов, где нуклеотид по меньшей мере в одном положении А диагностического олигонуклеотида представляет собой LNA.
11. Способ по любому из пп.1-10, где диагностический олигонуклеотид имеет общую формулу
а) 5’-Nua(NUbLNAc)mNUdAeNUf-3’,
где А означает LNA в положении А, по которому варианты последовательностей нуклеиновых кислот нуклеиновых кислот-мишеней отличаются друг от друга;
LNA означает LNA;
Nu означает мономер, выбранный из группы, состоящей из любых других нуклеотидов, отличных от LNA, способных образовывать специфичные пары нуклеотидов с вариантами нуклеиновых кислот;
а, b, с, d и f являются целыми числами от 0 до 30, m является целым числом от 1 до 8, и е является целым числом от 1 до 6, при условии, что сумма а, b, с, d, е и f по меньшей мере равна 5.
12. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=10, b=0, с=4, d=8, e=1, f=0, m=0.
13. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=0, b=1, с=1, d=8, e=1, f=0, m=5.
14. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=10-30, b=0, с=0, d=0, e=1-4, f=l-8, m=0.
15. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=10-30, b=0, с=0, d=0, е=1-4, f=1-8, m=0.
16. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=10-30, b=0, с=0, d=0, e=1-4, f=0, m=0.
17. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=10-30, b=0, с=0, d=0, e=l, f=0, m=0.
18. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=10, b=0, с=0, d=0, e=4, f=8, m=0.
19. Способ по п.11, где в общей формуле а) а=24, b=0, с=0, d==0, е=1, f=0, m=0.
20. Способ по любому из предшествующих пунктов, где по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид ковалентно связан с твердым носителем.
21. Способ по п.20, где различные диагностические олигонуклеотиды наносят пятнами в форме матрицы на твердую поверхность.
22. Способ по любому из пп.1-19, где различные олигонуклеотиды ниже по течению наносят пятнами на твердую поверхность.
23. Способ по любому из пп.20-22, где связывание осуществляют посредством фотохимии с использованием антрахинона.
24. Способ по любому из пп.1-21, где по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид метят регистрируемой группой.
25. Способ по любому из пп.4-21, где по меньшей мере один первый набор диагностических олигонуклеотидов метят регистрируемыми группами, при этом указанные регистрируемые группы различны для разных диагностических олигонуклеотидов.
26. Способ по п.25, где отдельные олигонуклеотиды в каждом наборе олигонуклеотидов метят регистрируемыми группами, при этом указанные регистрируемые группы различны для каждого отдельного диагностического олигонуклеотида.
27. Способ по любому из пп.1-8, где источником указанных нуклеиновых кислот-мишеней, которые предстоит выявить, является образец клеток, образец ткани или экстракт ткани.
28. Способ по п.27, где клетками являются клетки архебактериального, прокариотического или эукариотического происхождения.
29. Способ по п.27, где образец клеток получают из крови, сыворотки, плазмы, ретикулоцитов, лимфоцитов, мочи, ткани костного мозга, спинномозговой жидкости или любого продукта, полученного из крови или лимфы.
30. Способ по п.27, где образец ткани получают при биопсии мышц, биопсии печени, биопсии почек, биопсии мочевого пузыря, биопсии кости, биопсии хряща, биопсии кожи, биопсии поджелудочной железы, биопсии кишечного тракта, биопсии тимуса, биопсии молочной железы, биопсии матки, биопсии семенников, биопсии глаза или биопсии головного мозга.
31. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного вида организма.
32. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного вида, подвида или расы организмов.
33. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного вида микроорганизмов.
34. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного вида, подвида или штамма микроорганизмов.
35. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного инфекционного агента.
36. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного вида, подвида или штамма инфекционных агентов.
37. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для генов, кодирующих конкретные белки, вовлеченные в наследственные болезни.
38. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для гена, имеющего отношение к болезни образа жизни.
39. Способ по любому из пп.28-30, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые подлежат выявлению, представляют собой по меньшей мере одну последовательность, специфичную для конкретного гена, связанного со злокачественной опухолью.
40. Способ по п.38, где болезнь образа жизни выбрана из группы, состоящей из ожирения, семейной гиперхолестеринемии, атеросклероза и сахарного диабета.
41. Способ по любому из пп.27-40, где указанные нуклеиновые кислоты-мишени, которые предстоит выявить, являются аллелями.
42. Способ по любому из пп.1-6, где агентом полимеризации является фермент.
43. Способ по п.42, где агентом полимеризации является ДНК-полимераза.
44. Способ по п.43, где агентом полимеризации является термостабильная ДНК-полимераза.
45. Способ по п.44, где термостабильная ДНК-полимераза выбрана из группы, состоящей из Taq, Pfu, Pwo и Tth.
46. Способ по п.42, где агентом полимеризации является РНК-полимераза.
47. Способ по любому из пп.7-8, где агентом лигирования является фермент.
48. Способ по п.47, где агентом лигирования является лигаза.
49. Набор для выявления наличия в образце нуклеиновой кислоты Q’, нуклеотидная последовательность которой отличается от нуклеиновой кислоты Q по меньшей мере одним положением А, содержащий a) соответствующее количество нуклеозидтрифосфатов, b) агент полимеризации нуклеозидтрифосфатов, c) по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид, содержащий в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не гибридизуется с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA.
50. Набор для выявления наличия в образце нуклеиновой кислоты Q’, нуклеотидная последовательность которой отличается от нуклеиновой кислоты Q по меньшей мере одним положением А, содержащий a) соответствующее количество нуклеозидтрифосфатов, b) агент полимеризации нуклеозидтрифосфатов, c) по меньшей мере один олигонуклеотид ниже по течению, d) по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид, содержащий в положении А нуклеотид, который в условиях гибридизации способен гибридизоваться с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q’, но не гибридизуется с нуклеотидом в положении А нуклеиновой кислоты Q, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA.
51. Набор для выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, содержащий a) соответствующее количество нуклеозидтрифосфатов, b) агент полимеризации нуклеозидтрифосфатов, c) по меньшей мере один набор диагностических олигонуклеотидов, имеющих нуклеотидные последовательности, которые отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А и содержат по меньшей мере один LNA.
52. Набор для выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, содержащий a) соответствующее количество нуклеозидтрифосфатов, b) агент полимеризации нуклеозидтрифосфатов, c) по меньшей мере один олигонуклеотид ниже по течению, d) по меньшей мере один набор диагностических олигонуклеотидов, имеющих нуклеотидные последовательности, которые отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А и содержат по меньшей мере один LNA.
53. Набор для выявления нуклеиновых кислот-мишеней, нуклеотидные последовательности которых отличаются друг от друга по меньшей мере одним положением А, набор включает в себя a) нуклеозидтрифосфаты, b) агент лигирования, c) по меньшей мере два олигонуклеотида, при этом по меньшей мере один диагностический олигонуклеотид является олигонуклеотидом, содержащим в положении А нуклеотид, который комплементарен нуклеотиду, обнаруженному в положении А нуклеиновой кислоты-мишени, которую предстоит выявить, указанный диагностический олигонуклеотид содержит по меньшей мере один LNA.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DKPA199900383 | 1999-03-18 | ||
DKPA199900383 | 1999-03-18 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2001128165A true RU2001128165A (ru) | 2004-03-27 |
Family
ID=8092884
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2001128165/13A RU2001128165A (ru) | 1999-03-18 | 2000-03-17 | Выявление мутаций в генах посредством специфичных lna-праймеров |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6316198B1 (ru) |
EP (1) | EP1161554B1 (ru) |
JP (1) | JP5095888B2 (ru) |
KR (1) | KR20020007331A (ru) |
CN (1) | CN1361829A (ru) |
AT (1) | ATE501269T1 (ru) |
AU (1) | AU3274500A (ru) |
CA (1) | CA2368169C (ru) |
DE (1) | DE60045706D1 (ru) |
HK (1) | HK1048339A1 (ru) |
IL (1) | IL145417A0 (ru) |
NZ (1) | NZ514104A (ru) |
RU (1) | RU2001128165A (ru) |
WO (1) | WO2000056916A2 (ru) |
Families Citing this family (129)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6436640B1 (en) * | 1999-03-18 | 2002-08-20 | Exiqon A/S | Use of LNA in mass spectrometry |
US6806363B1 (en) * | 1999-04-16 | 2004-10-19 | Mayo Foundation For Medical Education & Research | Cobalamin conjugates useful as antitumor agents |
NZ516278A (en) | 1999-06-22 | 2004-03-26 | Invitrogen Corp | Improved primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids |
US6962906B2 (en) | 2000-03-14 | 2005-11-08 | Active Motif | Oligonucleotide analogues, methods of synthesis and methods of use |
EP1263773A4 (en) | 2000-03-14 | 2005-08-31 | Active Motif | OLIGONUCLEOTIDE ANALOGUES, METHODS OF SYNTHESIS AND METHODS OF IMPLEMENTATION |
AU2001257454A1 (en) * | 2000-04-28 | 2001-11-12 | Quantum Dot Corporation | Methods and compositions for polynucleotide analysis using generic capture sequences |
EP1330544A4 (en) | 2000-09-26 | 2005-04-06 | Univ Duke | RNA APTAMERS AND METHOD OF IDENTIFYING SAID APTAMERS |
AU2002243438A1 (en) * | 2000-10-25 | 2002-07-24 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Transcobalamin binding conjugates useful for treating abnormal cellular proliferation |
AU2002227156A1 (en) | 2000-12-01 | 2002-06-11 | Visigen Biotechnologies, Inc. | Enzymatic nucleic acid synthesis: compositions and methods for altering monomer incorporation fidelity |
US20030077609A1 (en) * | 2001-03-25 | 2003-04-24 | Jakobsen Mogens Havsteen | Modified oligonucleotides and uses thereof |
DK2070939T3 (da) | 2001-05-25 | 2014-06-23 | Univ Duke | Modulatorer af farmakologiske midler |
WO2002101041A1 (fr) * | 2001-06-12 | 2002-12-19 | Takara Bio Inc. | Procede d'amplification de l'acide nucleique et procede de detection du polymorphisme des nucleotides a l'aide d'un analogue de nucleotide |
US7407943B2 (en) | 2001-08-01 | 2008-08-05 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense modulation of apolipoprotein B expression |
US7888324B2 (en) | 2001-08-01 | 2011-02-15 | Genzyme Corporation | Antisense modulation of apolipoprotein B expression |
WO2003018835A2 (en) * | 2001-08-23 | 2003-03-06 | Hvidovre Hospital | Method for rapid detection of haplotypes |
US20060074034A1 (en) * | 2001-09-17 | 2006-04-06 | Collins Douglas A | Cobalamin mediated delivery of nucleic acids, analogs and derivatives thereof |
US20030165859A1 (en) | 2001-10-23 | 2003-09-04 | Invitrogen Corporation | Primers and methods for the detection and discrimination of nucleic acids |
CA2470774A1 (en) * | 2001-12-19 | 2003-06-26 | Hvidovre Hospital | A method and a kit for determination of a microbial count |
US20050164188A1 (en) * | 2002-01-24 | 2005-07-28 | Jeffrey Kane | Analysis device |
KR100440725B1 (ko) * | 2002-06-20 | 2004-07-15 | 주식회사 그린진 바이오텍 | 비생물성 스트레스에 대한 단자엽 식물의 내성을증가시키는 방법 |
EP1527175B1 (en) * | 2002-06-24 | 2009-05-27 | Exiqon A/S | Methods and systems for detection and isolation of a nucleotide sequence |
US20040219565A1 (en) | 2002-10-21 | 2004-11-04 | Sakari Kauppinen | Oligonucleotides useful for detecting and analyzing nucleic acids of interest |
US7511131B2 (en) | 2002-11-13 | 2009-03-31 | Genzyme Corporation | Antisense modulation of apolipoprotein B expression |
US8206913B1 (en) | 2003-03-07 | 2012-06-26 | Rubicon Genomics, Inc. | Amplification and analysis of whole genome and whole transcriptome libraries generated by a DNA polymerization process |
JP2007512020A (ja) * | 2003-11-26 | 2007-05-17 | エッペンドルフ アクチェンゲゼルシャフト | 染色体外核酸のインビトロ増幅のための方法及び組成物 |
AU2005238490B2 (en) | 2004-04-22 | 2010-11-18 | Tobira Therapeutics, Inc. | Improved modulators of coagulation factors |
US20050287558A1 (en) | 2004-05-05 | 2005-12-29 | Crooke Rosanne M | SNPs of apolipoprotein B and modulation of their expression |
US20060014183A1 (en) * | 2004-06-10 | 2006-01-19 | Pfundheller Henrik M | Extendable probes |
WO2006105487A1 (en) * | 2005-03-31 | 2006-10-05 | Amgen Inc. | Method for selectively blocking hemoglobin rna amplification |
EP1976567B1 (en) | 2005-12-28 | 2020-05-13 | The Scripps Research Institute | Natural antisense and non-coding rna transcripts as drug targets |
ATE553220T1 (de) * | 2006-03-13 | 2012-04-15 | Wako Pure Chem Ind Ltd | Verfahren zur erkennung eines mutierten gens |
US8007790B2 (en) | 2006-04-03 | 2011-08-30 | Stowers Institute For Medical Research | Methods for treating polycystic kidney disease (PKD) or other cyst forming diseases |
EP2397551A1 (en) | 2006-05-05 | 2011-12-21 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods for modulating expression of PCSK9 |
EP2038432B1 (en) * | 2006-06-30 | 2017-02-08 | Rosetta Genomics Ltd | Method for detecting and quantifying a target nucleic acid generated by rt-pcr of mirna |
JP2009545317A (ja) | 2006-08-01 | 2009-12-24 | アプライド バイオシステムズ, エルエルシー | 分析物および核酸の検出 |
WO2008070370A2 (en) | 2006-11-02 | 2008-06-12 | University Of Utah Research Foundation | Oligonucleotides for use in allele-specific pcr |
US8481506B2 (en) | 2006-12-05 | 2013-07-09 | Rosetta Genomics, Ltd. | Nucleic acids involved in viral infection |
GB0703997D0 (en) * | 2007-03-01 | 2007-04-11 | Oxitec Ltd | Methods for detecting nucleic sequences |
GB0703996D0 (en) * | 2007-03-01 | 2007-04-11 | Oxitec Ltd | Nucleic acid detection |
BRPI0809320A2 (pt) | 2007-03-24 | 2014-09-23 | Genzyme Corp | Método |
US8138318B2 (en) | 2007-09-13 | 2012-03-20 | Abbott Laboratories | Hepatitis B pre-S2 nucleic acid |
WO2009052301A1 (en) * | 2007-10-16 | 2009-04-23 | Regado Biosciences, Inc. | Steady-state subcutaneous administration of aptamers |
US20090253121A1 (en) * | 2008-04-04 | 2009-10-08 | Micah Halpern | Method for amt-rflp dna fingerprinting |
RU2604489C2 (ru) | 2008-10-03 | 2016-12-10 | КьюРНА,Инк.,US | Лечение заболеваний, связанных с аполипопротеином-а1, путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта аполипопротеина-а1 |
WO2010065671A2 (en) | 2008-12-04 | 2010-06-10 | Curna, Inc. | Treatment of vascular endothelial growth factor (vegf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to vegf |
ES2629630T3 (es) | 2008-12-04 | 2017-08-11 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con eritropoyetina (EPO) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a EPO |
EP2370582B1 (en) | 2008-12-04 | 2017-05-10 | CuRNA, Inc. | Treatment of tumor suppressor gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to the gene |
PT2396038E (pt) | 2009-02-12 | 2016-02-19 | Curna Inc | Tratamento das doenças associadas com o factor neurotrófico derivado do cérebro (bdnf) por inibição do produto antisenso natural da transcrição para bdnf |
CN102482677B (zh) | 2009-03-16 | 2017-10-17 | 库尔纳公司 | 通过抑制nrf2的天然反义转录物治疗核因子(红细胞衍生2)‑样2(nrf2)相关疾病 |
WO2010107838A1 (en) | 2009-03-16 | 2010-09-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Targeting apolipoprotein b for the reduction of apolipoprotein c-iii |
WO2010107740A2 (en) | 2009-03-17 | 2010-09-23 | Curna, Inc. | Treatment of delta-like 1 homolog (dlk1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dlk1 |
US9155754B2 (en) | 2009-05-06 | 2015-10-13 | Curna, Inc. | Treatment of ABCA1 gene related diseases by inhibition of a natural antisense transcript to ABCA1 |
JP6250930B2 (ja) | 2009-05-06 | 2017-12-20 | クルナ・インコーポレーテッド | トリステトラプロリン(ttp)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるttp関連疾患の治療 |
JP5931720B2 (ja) | 2009-05-08 | 2016-06-08 | クルナ・インコーポレーテッド | Dmdファミリーに対する天然アンチセンス転写物の抑制によるジストロフィンファミリー関連疾患の治療 |
US8957037B2 (en) | 2009-05-18 | 2015-02-17 | Curna, Inc. | Treatment of reprogramming factor related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a reprogramming factor |
KR101703695B1 (ko) | 2009-05-22 | 2017-02-08 | 큐알엔에이, 인크. | 전사 인자 e3(tfe3)에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의해 tfe3 및 인슐린 수용체 기질 2(irs2)의 치료 |
CA2764683A1 (en) | 2009-05-28 | 2010-12-02 | Joseph Collard | Treatment of antiviral gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an antiviral gene |
EP2443237B1 (en) | 2009-06-16 | 2017-02-22 | CuRNA, Inc. | Treatment of collagen gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a collagen gene |
KR101702689B1 (ko) | 2009-06-16 | 2017-02-06 | 큐알엔에이, 인크. | Pon1에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 파라옥소나제 1(pon1) 관련된 질환의 치료 |
EP2446036B1 (en) | 2009-06-24 | 2017-03-01 | CuRNA, Inc. | Treatment of tumor necrosis factor receptor 2 (tnfr2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to tnfr2 |
ES2583691T3 (es) | 2009-06-26 | 2016-09-21 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen del síndrome de Down mediante la inhibición de una transcripción antisentido natural a un gen del síndrome de Down |
CN102712925B (zh) | 2009-07-24 | 2017-10-27 | 库尔纳公司 | 通过抑制sirtuin(sirt)的天然反义转录物来治疗sirtuin(sirt)相关性疾病 |
JP6128848B2 (ja) | 2009-08-05 | 2017-05-17 | クルナ・インコーポレーテッド | インスリン遺伝子(ins)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるインスリン遺伝子(ins)関連疾患の治療 |
CA2770104C (en) | 2009-08-11 | 2019-03-19 | Opko Curna, Llc | Treatment of adiponectin (adipoq) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an adiponectin (adipoq) |
CN102482670B (zh) | 2009-08-21 | 2018-06-15 | 库尔纳公司 | 通过抑制‘hsp70-相互作用蛋白的c末端’(chip)的天然反义转录物而治疗chip相关疾病 |
CA2771172C (en) | 2009-08-25 | 2021-11-30 | Opko Curna, Llc | Treatment of 'iq motif containing gtpase activating protein' (iqgap) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to iqgap |
JP6175236B2 (ja) | 2009-09-25 | 2017-08-09 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | フィラグリン(flg)の発現および活性の調整によるflg関連疾患の処置 |
EP2494066B1 (en) | 2009-10-27 | 2017-04-05 | Swift Biosciences, Inc. | Bimolecular primers |
CA2777705C (en) | 2009-11-02 | 2019-03-12 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Foot and mouth disease virus (fmdv) consensus proteins, coding sequences therefor and vaccines made therefrom |
DK2513310T3 (en) | 2009-12-16 | 2018-02-05 | Curna Inc | TREATMENT OF DISEASES CONNECTED WITH MEMBRANE-BONDED TRANSCRIPTION FACTOR Peptidase, site 1 (MBTPS1), BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENCE TRANSCRIPTION TO MBTPS1 |
NO2516648T3 (ru) | 2009-12-23 | 2018-04-07 | ||
CN102781480B (zh) | 2009-12-23 | 2018-07-27 | 库尔纳公司 | 通过抑制解偶联蛋白2(ucp2)的天然反义转录物而治疗ucp2相关疾病 |
RU2611186C2 (ru) | 2009-12-29 | 2017-02-21 | Курна, Инк. | ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С ОПУХОЛЕВЫМ БЕЛКОМ 63 (р63), ПУТЕМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО ТРАНСКРИПТА К р63 |
ES2657452T3 (es) | 2009-12-29 | 2018-03-05 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con el factor respiratorio nuclear 1 (NRF1) mediante inhibición de transcrito antisentido natural a NRF1 |
JP6083735B2 (ja) | 2009-12-31 | 2017-02-22 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | インスリン受容体基質2(irs2)および転写因子3(tfe3)に対する天然アンチセンス転写物の阻害によるインスリン受容体基質2(irs2)関連疾患の治療 |
EP2521784B1 (en) | 2010-01-04 | 2017-12-06 | CuRNA, Inc. | Treatment of interferon regulatory factor 8 (irf8) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irf8 |
CN102822342B (zh) | 2010-01-06 | 2017-05-10 | 库尔纳公司 | 通过抑制胰腺发育基因的天然反义转录物而治疗胰腺发育基因相关疾病 |
DK2524039T3 (en) | 2010-01-11 | 2018-03-12 | Curna Inc | TREATMENT OF GENDER HORMON-BINDING GLOBULIN (SHBG) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENCE TRANSCRIPTS TO SHBG |
RU2611192C2 (ru) | 2010-01-25 | 2017-02-21 | Курна, Инк. | ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С РНКазой Н1, ПУТЕМ ИНГИБИРОВАНИЯ ПРИРОДНОГО АНТИСМЫСЛОВОГО ТРАНСКРИПТА К РНКазе Н1 |
EP2539452B1 (en) | 2010-02-22 | 2016-07-27 | CuRNA, Inc. | Treatment of pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (pycr1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to pycr1 |
WO2011104695A2 (en) * | 2010-02-26 | 2011-09-01 | GAMMAGENETICS Sàrl | Detection of kras mutation in exon 2 by allele specific real time quantitative pcr (as-qpcr) |
WO2011104694A2 (en) * | 2010-02-26 | 2011-09-01 | GAMMAGENETICS Sàrl | Detection of braf v600e mutation by allele specific real time quantitative pcr (as-qpcr) using locked nucleic acids primers and beacon probes |
CA2795145C (en) | 2010-04-02 | 2019-01-22 | Curna, Inc. | Treatment of colony-stimulating factor 3 (csf3) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to csf3 |
JP5978203B2 (ja) | 2010-04-09 | 2016-08-24 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | Fgf21に対する天然アンチセンス転写物の阻害による線維芽細胞増殖因子(fgf21)線維芽細胞増殖因子fgf21)関連疾患の治療 |
US9089588B2 (en) | 2010-05-03 | 2015-07-28 | Curna, Inc. | Treatment of sirtuin (SIRT) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a sirtuin (SIRT) |
TWI586356B (zh) | 2010-05-14 | 2017-06-11 | 可娜公司 | 藉由抑制par4天然反股轉錄本治療par4相關疾病 |
KR101902197B1 (ko) | 2010-05-26 | 2018-10-01 | 큐알엔에이, 인크. | 메티오닌 설폭시드 환원효소 a (msra)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 메티오닌 설폭시드 환원효소 a (msra) 관련된 질환의 치료 |
ES2664572T3 (es) | 2010-05-26 | 2018-04-20 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con el homólogo atonal 1 (ATOH1) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a ATOH1 |
ES2863526T3 (es) | 2010-06-23 | 2021-10-11 | Curna Inc | Tratamiento de enfermedades relacionadas con la subunidad alfa del canal de sodio (SCNA), controlado por voltaje, mediante inhibición de la transcripción antisentido natural a SCNA |
US20120004132A1 (en) * | 2010-07-02 | 2012-01-05 | Affymetrix, Inc. | Detection of Nucleic Acids and Proteins |
WO2012006551A2 (en) | 2010-07-08 | 2012-01-12 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Neuroprotective molecules and methods of treating neurological disorders and inducing stress granules |
ES2663598T3 (es) | 2010-07-14 | 2018-04-16 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con el homólogo de discos grandes (dlg) mediante la inhibición del transcrito antisentido natural a dlg |
JP5986998B2 (ja) | 2010-10-06 | 2016-09-06 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | シアリダーゼ4(neu4)への天然アンチセンス転写物の阻害によるneu4関連疾患の治療 |
WO2012054723A2 (en) | 2010-10-22 | 2012-04-26 | Opko Curna Llc | Treatment of alpha-l-iduronidase (idua) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to idua |
CN103492569B (zh) | 2010-11-05 | 2020-04-07 | 米拉根医疗公司 | 碱基经修饰的寡核苷酸 |
US10000752B2 (en) | 2010-11-18 | 2018-06-19 | Curna, Inc. | Antagonat compositions and methods of use |
CA2818824A1 (en) | 2010-11-23 | 2012-05-31 | Joseph Collard | Treatment of nanog related diseases by inhibition of natural antisense transcript to nanog |
JP2014504857A (ja) | 2010-12-15 | 2014-02-27 | ミラゲン セラピューティクス | ロックドヌクレオチドを含むmicroRNA阻害剤 |
US20140170653A1 (en) | 2011-04-15 | 2014-06-19 | Life Technologies Corporation | Chemical ligation |
EP2718439B1 (en) | 2011-06-09 | 2017-08-09 | CuRNA, Inc. | Treatment of frataxin (fxn) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to fxn |
CA2839451A1 (en) | 2011-06-27 | 2013-01-03 | The Jackson Laboratory | Methods and compositions for treatment of cancer and autoimmune disease |
US10583128B2 (en) | 2011-09-06 | 2020-03-10 | Curna, Inc. | Treatment of diseases related to alpha subunits of sodium channels, voltage-gated (SCNxA) with small molecules |
AU2012340118A1 (en) * | 2011-11-17 | 2014-04-24 | Rheonix, Inc. | System and methods for selective molecular analysis |
CN102586433B (zh) * | 2012-02-14 | 2014-01-29 | 北京科聆金仪生物技术有限公司 | 一种聋病易感基因12S rRNA 1494C>T荧光检测试剂盒及其应用 |
CN104583405A (zh) | 2012-03-15 | 2015-04-29 | 科纳公司 | 通过抑制脑源神经营养因子(bdnf)的天然反义转录物治疗bdnf相关疾病 |
JP6172640B2 (ja) * | 2012-04-12 | 2017-08-02 | 国立大学法人 東京大学 | 核酸の定量方法、検出プローブ、検出プローブセット、及び核酸の検出方法 |
HK1209781A1 (en) | 2012-06-21 | 2016-04-08 | MiRagen Therapeutics, Inc. | Oligonucleotide-based inhibitors comprising locked nucleic acid motif |
US10086093B2 (en) | 2013-02-28 | 2018-10-02 | The General Hospital Corporation | miRNA profiling compositions and methods of use |
DK2970968T3 (en) | 2013-03-15 | 2018-03-05 | Miragen Therapeutics Inc | CONNECTED BICYCLIC Nucleosides |
CN105188715B (zh) | 2013-03-15 | 2018-12-25 | 米拉根医疗股份有限公司 | Mir-145的锁定核酸抑制剂及其用途 |
US9993545B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-06-12 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Foot and mouth disease virus (FMDV) consensus proteins, coding sequences therefor and vaccines made therefrom |
WO2015191596A1 (en) | 2014-06-09 | 2015-12-17 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Combination therapies using platinum agents and agents that target tumor-associated stroma or tumor cells |
WO2015191610A2 (en) | 2014-06-09 | 2015-12-17 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Combination therapies using agents that target tumor-associated stroma or tumor cells and other pathways |
WO2015191583A2 (en) | 2014-06-09 | 2015-12-17 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Combination therapies targeting tumor-associated stroma or tumor cells and topoisomerase |
US11034757B2 (en) | 2014-06-09 | 2021-06-15 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Combination therapies using agents that target tumor-associated stroma or tumor cells and tumor vasculature |
WO2015191617A2 (en) | 2014-06-09 | 2015-12-17 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Combination therapies using anti-metabolites and agents that target tumor-associated stroma or tumor cells |
WO2015191590A2 (en) | 2014-06-09 | 2015-12-17 | Biomed Valley Discoveries, Inc. | Combination therapies targeting tumor-associated stroma or tumor cells and microtubules |
BR112017015618A2 (pt) | 2015-01-20 | 2018-04-10 | Miragen Therapeutics Inc | inibidores de mir-92 e usos destes. |
CN105039514A (zh) * | 2015-06-02 | 2015-11-11 | 武汉友芝友医疗科技有限公司 | 人类braf基因v600e突变检测试剂盒 |
JP6786529B2 (ja) | 2015-06-29 | 2020-11-18 | バイオメッド バレー ディスカバリーズ,インコーポレイティド | Lpt−723と免疫チェックポイント阻害剤との組み合わせおよび処置の方法 |
CN107012221A (zh) * | 2016-10-14 | 2017-08-04 | 苏州艾达康医疗科技有限公司 | 基于阻断物的富集系统及其应用 |
WO2018226930A1 (en) * | 2017-06-07 | 2018-12-13 | President And Fellows Of Harvard College | Targeted expansion fluorescent in situ sequencing |
SG11202000523PA (en) | 2017-07-31 | 2020-02-27 | The Trustees Of Columbia Univeristy In The City Of New York | Compounds, compositions, and methods for treating t-cell acute lymphoblastic leukemia |
WO2019079462A1 (en) | 2017-10-17 | 2019-04-25 | President And Fellows Of Harvard College | TRANSCRIPTION MODULATION SYSTEMS BASED ON CAS9 |
JP2021534101A (ja) | 2018-08-09 | 2021-12-09 | ヴェルソー セラピューティクス, インコーポレイテッド | Ccr2及びcsf1rを標的とするためのオリゴヌクレオチド組成物ならびにその使用 |
CN112955155A (zh) | 2018-09-07 | 2021-06-11 | 总医院公司 | 用于免疫检查点抑制的组合物和方法 |
WO2022140126A1 (en) | 2020-12-21 | 2022-06-30 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Dna vector and uses thereof for detecting hiv and siv |
CN119855910A (zh) | 2022-07-06 | 2025-04-18 | 美国微哲默理有限责任公司 | 用于治疗胰腺癌的组合物和方法 |
CN120322549A (zh) | 2022-08-25 | 2025-07-15 | 生命编辑治疗股份有限公司 | 利用锁核酸对向导rna化学修饰以用于rna引导的核酸酶介导的基因编辑 |
Family Cites Families (17)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683195A (en) | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4800159A (en) | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
DE3813278A1 (de) | 1988-01-12 | 1989-07-20 | Boehringer Mannheim Gmbh | Verfahren zum nachweis von nukleinsaeuren |
CA1340807C (en) * | 1988-02-24 | 1999-11-02 | Lawrence T. Malek | Nucleic acid amplification process |
IE61148B1 (en) | 1988-03-10 | 1994-10-05 | Ici Plc | Method of detecting nucleotide sequences |
ES2056204T3 (es) | 1988-03-18 | 1994-10-01 | Baylor College Medicine | Deteccion de las mutaciones mediante oligonucleotidos cebadores competitivos. |
AU3539089A (en) * | 1988-04-08 | 1989-11-03 | Salk Institute For Biological Studies, The | Ligase-based amplification method |
US5432272A (en) | 1990-10-09 | 1995-07-11 | Benner; Steven A. | Method for incorporating into a DNA or RNA oligonucleotide using nucleotides bearing heterocyclic bases |
DE4129653A1 (de) | 1991-09-06 | 1993-03-11 | Boehringer Mannheim Gmbh | Verfahren zum nachweis aehnlicher nukleinsaeuren |
DE59208572D1 (de) | 1991-10-17 | 1997-07-10 | Ciba Geigy Ag | Bicyclische Nukleoside, Oligonukleotide, Verfahren zu deren Herstellung und Zwischenprodukte |
IL111857A (en) * | 1994-12-02 | 1999-09-22 | Intelligene Ltd | Detection of nucleic acid sequences |
WO1996020212A2 (en) * | 1994-12-28 | 1996-07-04 | Buchardt, Dorte | Peptide nucleic acid incorporating a chiral backbone |
DK0820483T3 (da) | 1995-04-07 | 2001-01-02 | Mogens Havsteen Jakobsen | Fremgangsmåde til fotokemisk immobilisering af ligander under anvendelse af quinoner |
DE69719220T2 (de) | 1996-11-18 | 2004-01-22 | Takeshi Imanishi | Neue nucleotidanaloga |
JP3756313B2 (ja) | 1997-03-07 | 2006-03-15 | 武 今西 | 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体 |
CA2303299C (en) | 1997-09-12 | 2016-02-23 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
-
2000
- 2000-03-17 NZ NZ514104A patent/NZ514104A/xx not_active Application Discontinuation
- 2000-03-17 IL IL14541700A patent/IL145417A0/xx unknown
- 2000-03-17 RU RU2001128165/13A patent/RU2001128165A/ru unknown
- 2000-03-17 CN CN00807543A patent/CN1361829A/zh active Pending
- 2000-03-17 AT AT00910583T patent/ATE501269T1/de not_active IP Right Cessation
- 2000-03-17 WO PCT/DK2000/000127 patent/WO2000056916A2/en not_active Application Discontinuation
- 2000-03-17 KR KR1020017011764A patent/KR20020007331A/ko not_active Withdrawn
- 2000-03-17 DE DE60045706T patent/DE60045706D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-03-17 CA CA2368169A patent/CA2368169C/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-03-17 EP EP00910583A patent/EP1161554B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-03-17 JP JP2000606775A patent/JP5095888B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 2000-03-17 AU AU32745/00A patent/AU3274500A/en not_active Abandoned
- 2000-03-17 HK HK02107778.1A patent/HK1048339A1/zh unknown
- 2000-03-18 US US09/528,115 patent/US6316198B1/en not_active Expired - Lifetime
-
2001
- 2001-08-16 US US09/932,058 patent/US20020115080A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP1161554B1 (en) | 2011-03-09 |
US6316198B1 (en) | 2001-11-13 |
WO2000056916A3 (en) | 2001-02-08 |
JP2002539801A (ja) | 2002-11-26 |
NZ514104A (en) | 2001-09-28 |
AU3274500A (en) | 2000-10-09 |
CA2368169A1 (en) | 2000-09-28 |
CN1361829A (zh) | 2002-07-31 |
CA2368169C (en) | 2012-07-10 |
WO2000056916A2 (en) | 2000-09-28 |
EP1161554A2 (en) | 2001-12-12 |
DE60045706D1 (de) | 2011-04-21 |
ATE501269T1 (de) | 2011-03-15 |
JP5095888B2 (ja) | 2012-12-12 |
US20020115080A1 (en) | 2002-08-22 |
HK1048339A1 (zh) | 2003-03-28 |
KR20020007331A (ko) | 2002-01-26 |
IL145417A0 (en) | 2002-06-30 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2001128165A (ru) | Выявление мутаций в генах посредством специфичных lna-праймеров | |
US10870675B2 (en) | Process using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide | |
EP1856257B1 (en) | Processes using dual specificity oligonucleotide and dual specificity oligonucleotide | |
CA2980624C (en) | Solid phase nucleic acid target capture and replication using strand displacing polymerases | |
EP0676476A1 (en) | Isothermal strand displacement nucleic acid amplification | |
US6221635B1 (en) | Methods for solid-phase amplification of DNA template (SPADT) using multiarrays | |
CA2374406A1 (en) | Microarray-based analysis of polynucleotide sequence variations | |
CA2369878A1 (en) | Comparative fluorescence hybridization to oligonucleotide microarrays | |
WO2000047767A1 (en) | Oligonucleotide array and methods of use | |
EP1785491B1 (en) | Dual-purpose primers and probes for providing enhanced hybridization assays by disruption of secondary structure formation | |
US8153772B2 (en) | Oligonucleotide probes and primers comprising universal bases for diagnostic purposes | |
EP1612282B1 (en) | Probe set and substrate for detecting nucleic acid | |
JP4628369B2 (ja) | 高感度核酸多重解析法 | |
JPWO2007055255A1 (ja) | 複数の識別用核酸配列を増幅する方法 | |
EP1275734A1 (en) | Method for random cDNA synthesis and amplification | |
WO1998010073A1 (fr) | Procede et materiau de detection de champignons | |
US20020031776A1 (en) | Enzymatic labeling and detection of DNA hybridization probes | |
EP0439968A1 (en) | Hybridization probes for the detection of haemophilus ducreyi strains | |
US20030129598A1 (en) | Methods for detection of differences in nucleic acids | |
CA2009870A1 (en) | Metod for determining the origin of a human dna-containing sample | |
CN113454235A (zh) | 经改进的核酸靶标富集和相关方法 | |
US20110195410A1 (en) | Compositions and methods related to solid phase sequence detection and genotyping | |
US20110117547A1 (en) | Target dna detection method and target dna detection kit | |
WO2002042490A1 (en) | Method of optimising the sequences of synthetic nucleic acids |