JP4754480B2 - キメラアデノウイルスの作成法およびそのようなキメラアデノウイルスの使用 - Google Patents
キメラアデノウイルスの作成法およびそのようなキメラアデノウイルスの使用 Download PDFInfo
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Description
アデノウイルスのキャプシドタンパク質に対する体液性免疫(循環している抗体)の存在は、遺伝子治療にアデノウイルスベクターを使用することに対する障害である。遺伝子治療に開発された原型のアデノウイルスベクターは、血清型5のようなサブグループCのアデノウイルスに基づく。サブグループCのアデノウイルスに対する中和抗体の広がり(prevalence)は、これらの病原に対して頻繁にさらされる結果、一般にヒトの個体群においては高い。この事実は、Ad5のような血清型に基づく遺伝子治療ベクターの効力を一般に大きく制限するようである。
本発明は、アデノウイルスのビリオンの生産に有用な細胞中での増殖には十分に適合しない血清型に由来するキャプシド、そして特にヘキソンを含むキャプシドを有するアデノウイルスを改変する方法を提供する。この方法は測定可能な量のアデノウイルスの生産に有用である。生成したキメラアデノウイルスゲノムは、本明細書に記載する様々な目的に有用となる。
本発明の詳細な記述
本発明は、選択した宿主細胞中で培養することができるアデノウイルスの左末端および右末端、ならびに最低でも別のアデノウイルスの血清型のキャプシドタンパク質をコードする内部領域からなるキメラアデノウイルスゲノムを提供する。特に本発明は所望する細胞型中で培養することが難しい血清型を有するアデノウイルスを生成するために特に有利である。このように本発明は、血清型が変動するキメラアデノウイルスベクターを生成することを可能にする。
明者はヒトAd5E1がE1−欠失チンパンジーアデノウイルスの血清型Pan5、Pan6、Pan7およびサルアデノウイルスの血清型SV1、SV25およびSV39をトランス相補することを見いだした。トランス相補する血清型の他の例には、ヒトAd5およびヒトAd2、Ad3、Ad4、Ad5、Ad7およびAd12がある。
本発明の組成物は、ヘテロロガスな分子を細胞に送達するキメラアデノウイルスベクターを含む。そのようなヘテロロガスな分子を送達するために、ベクターはプラスミドまたは好ましくはキメラアデノウイルスであることができる。本発明のキメラアデノウイルスには、本明細書にさらに詳細に記載する少なくとも2つの供給源である血清型、「供与血清型(donating serotype)」および「親のアデノウイルス」に由来するアデノウイルスDNA、ならびにミニジーンを含む。
A.アデノウイルス調節配列
1.血清型
左末端および右末端を供与するアデノウイルスの血清型の選択は、所望の細胞株中で容易に培養することができる血清型の中から当業者が容易に作成することができる。供与血清型の血清型を選択するために考慮できる他の因子の中には、それらの配列がハイブリダイズする位置に内部領域を供給するアデノウイルスの血清型との適合性がある。
イルスの例には、限定するわけではないがヒトアデノウイルスの血清型2、3、4、5、7および12を含み、そしてさらに所望の細胞中で培養することができる、現在同定されている任意のヒトの型[例えばHorwitz、「アデノウイルスおよびその複製」、VIROLOGY、第2版、1679−1721頁(1990)を参照にされたい]を含む。同様に非ヒト霊長類(例えば、チンパンジー、アカゲザル、マカークおよび他のサル種)、または他の非ヒト哺乳動物に感染することが知られており、そして所望の細胞中で増殖することができる類似のアデノウイルスを、本発明のベクター構築物に使用することができる。そのような血清型には限定するわけではないが、とりわけ米国特許第6,083,716号明細書に記載されているチンパンジーアデノウイルスPan5[VR−591]、Pan6[VR−592]、Pan7[VR−593]およびC68(Pan9);ならびに限定するわけではないがSV1[VR−195];SV25[SV−201];SV35;SV15;SV−34;SV−36;SV−37を含むサルアデノウイルス、およびヒヒアデノウイルス[VR−275]を含む。Pan5(C5とも呼ばれる)、Pan6(C6とも呼ばれる)、Pan7(C7とも呼ばれる)、SV1、SV25およびSV39の配列が記載された[2003年6月5日に公開された国際公開第03/046124号パンフレット;2003年12月19日に出願された米国特許出願第10/739,096号明細書](これらは引用により本明細書に編入する)。以下の例では、ヒト293細胞およびアデノウイルス5型(Ad5)、Pan9およびAd40を都合よく使用する。しかし当業者は、他の細胞株および/または他のアデノウイルス株に由来する適合性のある領域を容易に選択し、そしてこれらの血清型の代わりに(または組み合わせて)本発明で使用できると理解するだろう。
2.配列
左末端および右末端を供与するアデノウイルスにより供給されるべき最小配列は、複製およびパッケージングに必要な5’シス−エレメントおよび3’−シス−エレメントを含む。典型的にはパッケージングおよび複製に必要な5’シス−エレメントは、5’逆方向末端反復(ITR)配列(これは複製の起点として機能する)、および天然の5’パッケージングエンハンサードメイン(これは直線状のAdゲノムをパッケージングするために必要な配列およびE1プロモーター用のエンハンサーエレメントを含む)を含む。アデノウイルスゲノムの右末端は、パッケージングおよびキャプシド形成に必要な3’シス−エレメント(ITRを含む)を含む。望ましくは、左および右末端を供与するアデノウイルスの血清型および/または供与アデノウイルスの血清型をトランス相補するアデノウイルスの血清型は、必要なアデノウイルス初期遺伝子の機能をさらに提供し、それにはE1(E1aおよびE1b)、E2(E2aおよびE2b)、およびE4(少なくともORF6領域を含む)を含む。E3は必須ではなく、そして例えばこの領域に導入遺伝子を挿入するために、または別の領域に挿入された導入遺伝子用のスペースを提供するために所望により削除されてもよい(典型的にはパッケージングには、全アデノウイルスゲノムが36kb未満になることが望ましい)。
Daスカフォールドタンパク質、33kDaタンパク質、タンパク質VIII、pTP、52/55kDaタンパク質、タンパク質VII、Muおよび/またはタンパク質VIを含む。これらすべての遺伝子が5’および3’ITRを供与するアデノウイルスの血清型に由来する場合、「シュードタイプ化(pseudotyped)」ウイルスが形成される。1つの態様では、キメラアデノウイルスは供与血清型に由来するアデノウイルスゲノムの左末端を、5’ITRからpol遺伝子(またはpTP)の末端まで通して含む。別の態様では、キメラアデノウイルスは供与アデノウイルスの血清型の左末端を5’ITRからペントンまで通して含む。さらに別の態様では、キメラアデノウイルスは供与アデノウイルスの血清型の左末端、例えばpTPの末端までを含むが、供与アデノウイルスの血清型に対してヘテロロガスなアデノウイルスの血清型に由来するITRを含む。さらに別の態様は、本開示から容易に明白であろう。
B.親のアデノウイルス構造タンパク質
1.血清型
本発明は、キャプシドタンパク質が所望の宿主細胞中で効率的に増殖しない親のアデノウイルスに由来するキメラアデノウイルスの生成に使用するために特に良く適合している。内部領域を提供する親のアデノウイルスの血清型の選択は、本明細書に提供する情報に基づき、当業者により容易に行うことができる。
ルスC1、サルPan5およびAd40、ならびにPan5およびサルアデノウイルスSA18を使用する。しかし当業者は他のアデノウイルスの血清型も容易に選択し、そしてこれら血清型の代わりに(または組み合わせて)使用できることを理解するだろう。
2.配列
親のアデノウイルスは、親のアデノウイルスの望ましい特性を有するキャプシドを生成するために必要な構造タンパク質を含むその内部領域を、本発明のキメラ構築物に提供する。これらの所望する特性には限定するわけではないが、標的細胞に感染し、そしてヘテロロガスな導入遺伝子を送達する能力、他のアデノウイルスの血清型に向けられた中和抗体を回避する能力(すなわち交差−反応性によるクリアランスを回避する)、および/またはキメラアデノウイルスに対する免疫応答の不存在下で細胞に感染する能力を含む。そのような特性の利点は、アデノウイルスベクターを繰り返し送達することが関与する処方で最も迅速に明らかとなり得る。少なくとも5’ITR、E1領域、E4領域および3’ITRを含む親のアデノウイルスの左および右末端は非機能的であり、そして好ましくは完全に存在しない。場合によりこの親のアデノウイルスに由来するすべてのアデノウイルス調節タンパク質は非機能的であり、そして構造タンパク質(または選択した構造タンパク質)のみが保持される。
C.「ミニジーン」
典型的には本発明のアデノウイルスベクターは、部分的に削除された、完全に削除された(存在しない)、または破壊されたアデノウイルス遺伝子の部位に挿入できるミニジーンを含むように設計されている。例えばミニジーンは、そのような機能的E1欠失、または機能的E3欠失の部位、あるいは他の適当な部位に位置することができる。
1.導入遺伝子
導入遺伝子は、目的のポリペプチド、タンパク質または他の産物をコードする導入遺伝子を挟むベクター配列にヘテロロガスな核酸配列である。核酸コード配列は、宿主細胞中で導入遺伝子の転写、翻訳および/または発現を可能とする様式で調節成分に操作可能に連結される。
より分けられてもよい。例えば、M.L.Donnelly,et al.,J.Gen.Virol.78(Pt1):13−21(Jan1997);Furler,S.,et al.,Gene Ther.,8(11):864−873(June 2001);Klump H.,et al.,Gene Ther.,8(10):811−817(May 2001)を参照にされたい。この2AペプチドはIRESよりも有意に小さく、スペースが限定因子となる時の使用によく適している。しかし選択した導入遺伝子は生物学的に活性な産物または他の産物、例えば研究に望ましいいかなる産物もコードすることができる。
2.ベクターおよひ導入遺伝子調節要素
ミニジーンに関して上記で確認した主要な要素に加えて、アデノウイルスベクターは、本発明により生産されたプラスミドベクターでトランスフェクトした、またはウイルスに感染した細胞での転写、翻訳および/または発現を可能とする様式で導入遺伝子に操作可能に連結された通常の制御要素も含む。本明細書で使用するように「操作可能に連結された」配列には、目的の遺伝子に連続する発現制御配列、および目的の遺伝子を制御するためにトランスに作用するか、または一定距離の発現制御配列の両方を含む。
.Biol.,2:512−518(1998)を参照にされたい]を含む。他の系にはカストラジオール、ジフェノールムリスレロンを使用するFK506二量体、VP16またはp65、RU486−誘導性系[Wang et al.,Nat.Biotech.,15:239−243(1997)およびWang et al.,Gene Ther.,4:432−441(1997)]およびラパマイシン−誘導性系[Magari et al.,J.Clin.Invest.100:2865−2872(1997)]を含む。幾つかの誘導性プロモーターの効率は時間経過に伴い上昇する。そのような場合、そのような系の効率はタンデムに多くのリプレッサーを挿入すること、例えばIRESによりTetRに連結されたTetRにより強化することができる。あるいは所望の機能をスクリーニングする前に少なくとも3日間待つことができる。所望するタンパク質の発現は、この系の効率を強化するための既知の手段により強化することができる。例えばウッドチャック(Woodchuck)肝炎ウイルス転写後調節要素(WPRE)を使用すること。
al.,Nat.Biotech.,17:241−245(1999)を参照にされたい)。組織−特異的であるプロモーターの例は、中でも肝臓(アルブミン、Miyatake et al.,J.Virol.,71:5124−32(1997);B型肝炎ウイルスコアプロモーター、Sandig et al.,Gene Ther.,3:1002−9(1996);アルファ−フェトプロテイン(AFP)、Arbuthnot et al.,Hum.Gene.Ther.,7:1503−14(1996))、骨のオステオカルシン(Stein et al.,Mol.Biol.Rep.,24:185−96(1997));骨シアロプロテイン(Chen et al.,J.Bone Miner.Res.,11:654−64(1996)),リンパ球(CD2、Hansal et al.,J.Immunol.,161:1063−8(1998);免疫グロブリン重鎖;T細胞レセプター鎖)、ニューロン−特異的エノラーゼ(NSE)プロモーターのような神経性(Andersen et al.,Cell.Mol.Neurobiol.,13:503−15(1993))、ニューロフィラメント軽−鎖遺伝子(Piccioli et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,88:5611−5(1991))、およびニューロン−特異的vgf遺伝子(Piccioli et al.,Neuron,15:373−84(1995))について知られている。
て、アンピシリン耐性のような細菌細胞中でのプラスミドの存在のシグナルを出すことができる。ベクターの他の成分には、複製起点を含むことができる。これらおよび他のプロモーターおよびベクター要素の選択は通例であり、そして多くのそのような配列を利用することができる[例えばSambrook et al.、およびそこに引用されている参考文献を参照にされたい]。
II.組換えウイルス粒子の生産
1つの態様では本発明は、キメラアデノウイルスのキャプシドが選択した宿主細胞中で効率的に増殖できない血清型である組換えキメラアデノウイルス粒子の生成法を提供する。組換えキメラアデノウイルス粒子の生産に適するベクターは、直接的クローニングにより生成することができる。あるいはそのような粒子はキメラアデノウイルスゲノムの左末端を含有する第1ベクターとキメラアデノウイルスゲノムの右末端を含有する第2ベクターとの間の相同的組換えにより生成することができる。しかし当業者に知られている任意の適切な方法を容易に利用して、好ましくはミニジーンを含む全キメラアデノウイルスゲノムを含有する生産ベクターを生成するために適するベクターを生成することができる。次いでこの生産ベクターは宿主細胞に導入され、そこでアデノウイルスキャプシドタンパク質が集成され、そしてキメラアデノウイルス粒子が記載のように集成される。
A.パッケージング宿主細胞
適当には、パッケージング宿主細胞は、キメラゲノムの左および右末端を供与するアデノウイルスの血清型が効率的に増殖できる細胞の中から選択される。宿主細胞は好ましくは哺乳動物起源であり、そして最も好ましくは非−ヒト霊長類またはヒト起源である。
B.ヘルパーベクター
このようにアデノウイルスベクターのアデノウイルス遺伝子内容および宿主細胞から発現されるアデノウイルス遺伝子機能に依存して、ヘルパーベクターは、ミニジーンを含む感染性の組換えウイルス粒子を生産するために必要な十分なアデノウイルス遺伝子配列を提供するために必要となり得る。例えば1996年5月9日に公開された国際公開第96/13597号パンフレット(これは引用により本明細書に編入する)中の「最小」ヒトAdベクターの調製について記載された技術を参照にされたい。適切には、これらヘルパーベクターは非複製遺伝子要素、プラスミドまたはウイルスである。
C.ウイルス粒子の集合および細胞株のトランスフェクション
一般にミニジーンを含んでなるベクターをトランスフェクションにより送達する場合、ベクターは約5μg〜約100μgのDNA、そして好ましくは約10〜約50μgのDNAの量で、約1×104細胞〜約1×1013細胞、そして好ましくは約105細胞に送達される。しかし宿主細胞に対するベクターDNAの相対的量は、選択したベクター、送達法および選択した宿主細胞のような因子を考慮して調整するとができる。
使用する。使用する他の常法には、ウイルスゲノムの相同的組換え、寒天層中のウイルスプラークの形成、シグナル生成の測定法等を含む。
III.キメラアデノウイルスベクターの使用
本発明の組換えサルアデノウイルスベクターは、ヒトまたは獣医学上の患者(非ヒト霊長類、非−サル霊長類およびその他の哺乳動物を含む)に、インビトロ、エクスビボおよびインビボで遺伝子を転移するために有用である。
A.治療用分子のAd−媒介型送達
1つの態様では、本明細書に記載するAdベクターは遺伝子治療に関して公開された方法に従いヒトに投与される。選択された導入遺伝子を持つ本発明のウイルスベクターは、好ましくは生物学的に適合性がある溶液または製薬学的に許容され得る送達賦形剤中に懸濁されて患者に投与することができる。適当な賦形剤には滅菌塩水を含む。製薬学的に許容され得る担体となることが知られており、そして当業者に周知な他の水性および非−水性の等張滅菌注射溶液、および水性および非−水性の滅菌懸濁液を、この目的に使用することができる。
1.治療用の導入遺伝子
導入遺伝子によりコードされる有用な治療用産物には、限定するわけではないがインス
リン、グルカゴン、成長ホルモン(GH)、副甲状腺ホルモン(PTH)、成長ホルモン放出因子(GRF)、濾胞刺激ホルモン(FSH)、黄体形成ホルモン(LH)、ヒト絨毛性性腺刺激ホルモン(hCG)、血管内皮増殖因子(VEGF)、アンギオポイエチン、アンギオスタチン、顆粒球コロニー刺激因子(GCSF)、エリスロポエチン(EPO)、結合組織増殖因子(CTGF)、塩基性繊維芽細胞増殖因子(bFGF)、酸性繊維芽細胞増殖因子(aFGF)、上皮増殖因子(EGF)、トランスフォーミング増殖因子α(TGFα)、血小板由来増殖因子(PDGF)、インスリン増殖因子IおよびII(IGF−IおよびIGF−II)、TGF、アクチビン、インヒビンを含むトランスフォーミング増殖因子スーパーファミリーの任意のもの、あるいは任意の骨誘導タンパク質(BMP)のBMPs1〜15、増殖因子のヒレグリン/ニューレグリン/ARIA/neu 分化因子(NDF)ファミリーの任意のもの、神経増殖因子(NGF)、脳−由来神経栄養因子(BDNF)、ニューロトロフィンNT−3およびNT−4/5、毛様体神経栄養因子(CNTF)、グリア細胞株由来神経栄養因子(GDNF)、ノルチュリン(neurturin)、アグリン、セマフォリン/コラポスリンファミリーの任意のもの、ネトリン−1およびネトリン−2、肝細胞増殖因子(HGF)、エフリン類(ephrins)、ノギン、ソニックヘッジホッグおよびチロシンヒドロキシラーゼを含むホルモンおよび増殖および分化因子を含む。
には、キメラアデノウイルスベクターの投与、続いて同じ血清型のアデノウイルスに由来するベクターの再投与を含むことができる。特に望ましい処方には、本発明のキメラアデノウイルスベクターの投与を含み、ここで初回投与で送達されるウイルスベクターの血清型は、1もしくは複数の後の投与で使用するウイルスベクターの血清型とは異なる。例えば治療的処方には、キメラベクターの投与および同じかまたは異なる血清型の1もしくは複数のアデノウイルスベクターの反復投与を含む。別の例では、治療的処方にはアデノウイルスベクターの投与、続いて最初に送達したアデノウイルスベクターとは異なる血清型の本発明のキメラベクターの反復投与、そして場合によりさらに同じか、または好ましくは前の投与工程でのベクターの血清型とは異なる別のベクターの投与を含む。これらの処方は本発明のキメラ血清型を使用して構築したアデノウイルスベクターの送達には限定されない。むしろこれらの処方は人工的、ヒトまたは非−ヒト霊長類、あるいは他の哺乳動物起源でよい他のアデノウイルス血清型のキメラまたは非−キメラベクターを、本発明の1もしくは複数のキメラベクターと組み合わせて容易に利用することができる。そのような血清型の例は、本明細書のいたるところで検討する。さらにこれらの治療的処方には、本発明のキメラアデノウイルスベクターを、非−アデノウイルスベクター、非−ウイルスベクターおよび/または種々の他の治療的に有用な化合物または分子と組み合わせて、同時または順次のいずれかで送達することを含んでもよい。本発明はこれらの治療的処方には限定されず、その多様性は当業者には容易に明らかである。
B.免疫原性導入遺伝子のAd−媒介型送達
本発明のアデノウイルスは、免疫原組成物としても使用することができる。本明細書で使用する免疫原組成物は、哺乳動物、そして好ましくは霊長類への送達後に免疫原組成物により送達された導入遺伝子産物に対する体液性(例えば抗体)または細胞性(例えば細胞傷害性T細胞)応答が高められる組成物である。本発明は所望の免疫原をコードする遺伝子をアデノウイルス配列の欠失に含むことができるAdを提供する。サルまたは他の非ヒト哺乳動物血清型に基づくキメラアデノウイルスは、ヒト起源のアデノウイルスに比べて、異なる動物種で生の組換えウイルスワクチンとして使用するためにより適していると思われるが、そのような使用に限定されない。組換えアデノウイルスは、抗原(1もしくは複数)が免疫応答の誘導に重要な任意の病原体に対する予防用または治療用ワクチンとして使用することができ、そしてすでに同定され、そしてそのcDNAを利用することができる病原体の伝播を制限することができる。
アデノウイルスは感染および/または疾患の再発の防止に有用なワクチン組成物になると考えられる。
ヒト)、ウマ脳症、ブルータングを含む。
C.Ad−媒介型送達法
選択した遺伝子の治療レベルまたは免疫のレベルを監視して、もしあるならば追加免疫の必要性を決定する。CD8+T細胞応答あるいは場合により血清中の抗体力価の評価後に、任意の追加免疫感作が望ましいかもしれない。場合により本発明の組換えアデノウイルスベクターを単回投与または様々な処方と組み合わせて、例えば他の有効成分が関与する処置計画または過程と組み合わせて、または初回−追加免疫感作処方(prime−boost regimen)で送達することができる。そのような様々な処方が当該技術分野で記載され、そして容易に選択することができる。
に対する免疫応答を増強(boost)するために、本発明のキメラアデノウイルスベクターの投与を含むことができる。さらに別の選択では、免疫感作処方にはタンパク質の投与に続いて抗原をコードするベクターでの追加免疫感作を含む。
IV.サルアデノウイルス18配列
本発明は、自然に伴う他のウイルス性物質から単離されたAd SA18の核酸配列およびアミノ酸配列を提供する。これらの配列は本明細書に記載するように、核酸配列およびアミノ酸配列、およびその領域またはフラグメントを含有するヘテロロガスな分子の調製に、構築物および組成物を含む様々な目的に有用なウイルスベクターの調製に、ならびにキメラアデノウイルスについて本明細書に記載するような方法、例えば本明細書に記載するようなヘテロロガスな分子のための送達媒体として、アデノウイルスヘルパー機能を要するウイルスを生産するための宿主細胞において有用である。またこれらの配列は、本発明のキメラアデノウイルスの生成にも有用である。
A.核酸配列
本発明のSA18核酸配列は、配列番号12のnt1〜31967のヌクレオチドを含む。引用により本明細書に包含する配列表を参照にされたい。本発明の核酸配列は、さらに配列番号12の配列に相補的な鎖、ならびにこれらの配列図の配列に対応するRNAおよびcDNA配列およびそれらの相補鎖を包含する。さらに本発明に含まれるのは、配列表に95〜98%より高く、そしてより好ましくは約99〜99.9%相同的であるか、または同一の核酸配列である。また本発明の核酸配列に含まれるのは配列番号12に提供する配列の自然なバリアントおよび作り変えられた改変形、およびそれらの相補鎖も含む。そのような改変には、例えば当該技術分野で知られている標識、メチル化および1もしくは複数の自然に存在するヌクレオチドの縮重ヌクレオチドへの置換を含む。
うな分子は、ベクターの形態であることができる。
B.本発明のサルアデノウイルスタンパク質
本発明はさらに、本発明のアデノウイルス核酸によりコードされるタンパク質、酵素およびそれらのフラグメントのような上記アデノウイルスの遺伝子産物を提供する。本発明はさらに、他の方法により生成されたこれら核酸配列によりコードされるアミノ酸配列を有するSV18タンパク質、酵素およびそれらのフラグメントを包含する。そのようなタンパク質には上記の表に確認されるオープンリーディングフレームによりコードされるもの、およびそれらのフラグメントを含む。
ラボラトリーマニュアル(Molecular Cloning:A Laboratory Manual)、コールドスプリングハーバー出版(コールドスプリングハーバー、ニューヨーク州)を参照にされたい。あるいはペプチドは周知の固相ペプチド合成法により合成することもできる(Merrifield,J.Am.Chem.Soc.,85:2149(1962);Stewart and Young、固相ペプチド合成(Solid Phase Peptide Synthesis)(フリーマン、サンフランシスコ、1969)、第27−62頁)。これらのおよび他の適切な生産法は当業者の知識の範囲内であり、そして本発明を限定するものではない。
〈実施例1〉−Pan5/C1キメラサルウイルスの構築
最初にチンパンジーから単離した5種のアデノウイルス、AdC68[米国特許第6,083,716号明細書]、AdPan5、AdPan7、AdPan6およびAdC1[米国特許第6,083,716号明細書]をシークエンシングした。Pan5[配列番号1]、Pan7[配列番号3]およびPan6[配列番号2]の配列に関しては、2004年11月に出願された国際出願第PCT/US02/33645号パンフレットを参照されたい。この出願はSV1、SV25およびSV39に関する配列を提供する[それぞれ配列番号4、5、6]。キャプシドタンパク質配列の配列比較から、明らかにAdC1は他の4種のチンパンジーに由来するアデノウイルスとは異なる血清学的サブグループに属することが予想された。
として使用するには適さない可能性がある。しかし他のチンパンジー由来アデノウイルス(ならびにhuAd5)由来のAdC1キャプシドタンパク質配列の明らかな配列非類似性から、AdC1のキャプシド特性を持つキメラアデノウイルスベクターを作成した。ヘキソンに変化を作ることだけに伴う上記の欠点から、2つの目的を達成するためにさらに徹底的な置換を本明細書に記載するキメラに作成し、すなわち置換がヘキソンを丁度越えるキメラを構築した。第1は延長した置換を作成することが、そうでなければレスキューされない無関係な血清型のヘキソンを含有するウイルスのレスキューを可能にするかどうかを決定することであった。第2の目的は、我々の研究室において製造目的で高力価で増殖することができることが分かったAdPan5のようなアデノウイルスベクターの成長特性が、キメラウイルスにも存在するかどうか、特にヘキソン(および他のキャプシドタンパク質)が、HEK293のような細胞株で高収量に成長することが困難なAdC1のようなウイルスに由来する場合に存在するかどうかを試験することであった。ファイバータンパク質を含む置換を延長する付加的なボーナスは、ヘキソン変化のみにより与えられるものを越えて、抗原の非類似性をさらに増すことであろう。
A.2つのPan5/C1キメラプラスミドの構築
キメラウイルスの構築に向けた全体的な取り組みは、最初に完全なE1欠失ウイルスDNAを、制限酵素SwaIに関する認識部位により挟まれた1つのプラスミドに集成し、プラスミドDNAをSwaIで消化してウイルスのDNA末端を放出し、そしてDNAをHEK293細胞にトランスフェクトして、生きているキメラアデノウイルスをレスキューできるかどうかを決定することであった。2つのキメラウイルスプラスミド、p5C1ショートおよびp5C1ロングを構築した。
B.キメラPan5/C1組換えベクターアデノウイルスのレスキュー
プラスミドp5C1ショートGFPおよびp5C1ロングGFPを、制限酵素SwaIで消化し、そしてHEK293細胞にトランスフェクトした。典型的なアデノウイルスが誘導する細胞病理学上の効果が観察された。p5C1ロングGFPトランスフェクションから組換えキメラアデノウイルスのレスキューは、トランスフェクションからの上清を回収し、そしてGFP発現により測定されるように形質導入されたことが分かる新鮮な細胞を再感染することにより確認した。キメラ組換えウイルスに由来するウイルスDNAは、数種の制限酵素で消化し、そして予想される電気泳動のパターンを有することが分かった(データは示さず)。
ン塩基、タンパク質VII、Muおよびタンパク質VIを含むように延長された時、生きているキメラウイルスのレスキューに困難はなかった。この実験でキメラアデノウイルス構築法は、両AdPan5およびAdC1上のそれぞれDNAポリメラーゼおよびヘキソンに関する遺伝子上に存在するAscIおよびClaI制限酵素部位の存在を利用した。
〈実施例2〉−Ad5キメラサルウイルスの構築
構造タンパク質がチンパンジーアデノウイルスPan7に由来し、そしてフランキング配列がヒトAd5(通常使用されるベクター株)に由来するうプラスミドを構築した。Adhu5−Pan7キメラアデノウイルスはレスキューされ、キメラウイルスを誘導するために使用するこのキメラウイルス構築法が広く応用可能であるにとを示す。
A.Ad5−Pan7キメラアデノウイルスの構築
キメラアデノウイルスが生存可能であることを樹立し、次いでE1相補細胞株HEK293にプラスミドをトランスフェクトさせるために、完全(E1欠失)キメラゲノムを持つプラスミドを構築した。組換えウイルスはレスキューできることが分かった。構築されたキメラアデノウイルスゲノムは、ITR、導入遺伝子発現カセット、pIXおよびIVa2遺伝子およびポリメラーゼ遺伝子の954C−末端アミノ酸(これは下の鎖から、右から左方向へ転写される)を含有するE1欠失領域に寄与するAd5に由来する左末端セグメントからなる。またAd5は、E4遺伝子および右ITRを含有するキメラゲノムの右末端にも貢献する。キメラ構築物中の中央部に存在するすべての他の遺伝子は、キメラDNAポリメラーゼのN−末端235アミノ酸を含むチンパンジーアデノウイルスPan7に由来する。
元の配列
GCG ACG GGC CGA[配列番号16]
CGC TGC CCG GCT
Arg Arg Ala Ser[配列番号17]
突然変異した配列(AscI認識部位に下線を付した)
GCG GCG CGC CGA[配列番号18]
CGC TGC CCG GCT
Arg Arg Ala Ser[配列番号17]
Pan7ファイバー含有領域は、PCRにより増幅し(ファイバーの停止コドンをTGAからTAAに突然変異させて、Ad5にあるものに類似するポリアデニル化シグナルを提供する)、そしてEcoRI部位に挿入してpAd5endsP7fibを得た。幾つかのクローニング工程によりpH5C7H5の構築を導き、この場合、完全なキメラアデノウイルスゲノムが集成された。GFP(緑色蛍光タンパク質)を発現する導入遺伝子カセットを、pH5C7H5のI−CeuIおよびPI−SceI部位間に挿入した。最終構築物をPacIで消化し、アデノウイルスゲノムをプラスミド骨格から分け、そしてHEK293細胞にトランスフェクトした。細胞ライゼートを2週間後に回収し、そしてキメラアデノウイルスを標準法により増幅させ、そして精製した。
B.Ad5−サルウイルス25(SV−25)キメラアデノウイルスの構築
[N.B.サルウイルス25(ATCCカタログ番号VR−201)は、チンパンジーアデノウイルスサルアデノウイルス25 ATCCカタログ番号VR−594とは異なる]
左および右末端セグメントがAd5に由来し、そして中央部分がモンキーアデノウイルスSV−25に由来するAd5に基づくキメラアデノウイルスの構築は、Ad5とチンパンジーアデノウイルスPan7との間のキメラである上記キメラアデノウイルスについて記載した上記の様式に完全に準じて行った。すなわち構築したキメラアデノウイルスゲノムは、ITR、導入遺伝子発現カセット、pIXおよびIVa2遺伝子およびポリメラーゼ遺伝子の956C−末端アミノ酸を含有するE1欠失領域に寄与するAd5に由来する左末端セグメントからなる。またAd5はE4遺伝子および右ITRを含有するキメラゲノムの右末端にも貢献する。[さらにAd5ゲノムの左末端は、pH5C7H5に存在するものよりも延長したので、Ad5左末端に454塩基対が存在した。絶対に必須ではないが、これはパッケージ効率を向上させるために行った。]キメラ構築物の中央部分に存在するすべての遺伝子は、キメラDNAポリメラーゼのN−末端230アミノ酸を含むモンキーアデノウイルスSV−25に由来する。キメラゲノムを構築するためのこの出発プラスミドは、Ad5の左および右末端の両方、ならびにAd5−SV25キメラ融合物が作成される場合(Ad5−Pan7キメラアデノウイルスについて行ったように)、ポリメラーゼ遺伝子中に(サイレント突然変異誘発法により)作成されたAscI部位を含むpAd5endsAscRIであった。最終的な構築物、pH5S25H5では、SV25ゲノムセグメントが順次のクローニング工程により包含され、ポリメラーゼコード配列内のライゲーション連結部にAscI部位の作成を含む。GFP(緑色蛍光タンパク質)を発現する導入遺伝子カセットは、pH5S25H5のI−CeuIとPI−SceI部位との間に挿入された。最終構築物をPacIで消化してアデノウイルスゲノムをプラスミド骨格から分け、そしてHEK293細胞にトランスフェクトした。細胞ライゼートを2週間後に回収し、そしてキメラアデノウイルスを標準法により増幅させ、そして精製した。
〈実施例3〉−免疫原性組成物の送達媒体としての本発明のPan5−C1キメラベクターエボラウイルス(ザイール)の糖タンパク質(C5C1C5−CMVGP)を発現するPan5(サルアデノウイルス22、アデノウイルスサブグループE、C5とも呼ぶ)−C1(サルアデノウイルス21、アデノウイルスサブグループB)キメラを、ワクチンとしてベクターC5C1C5−CMVGPの効力を試験するためにモデル抗原として構築した:このベクターをAdhu5基本ベクター(H5−CMVGP)と比較した。H5−CMVGPに比べて、C5C1−CMVGPベクターはわずかに減少したレベルのGP発現を形質導入したA549細胞中で生じた。
〈実施例4〉−キメラPan6/Pan7ベクターの生成
GFP発現ベクターのパネルを作成した。このパネルには、Pan6とPan7との間のキメラベクターであるベクターを含み、ここで(a)Pan7のヘキソンタンパク質は、Pan6のヘキソン部分に置き換えられ(C767と呼ぶ)、(b)Pan7のファイバータンパク質はPan由来のものにより置き換えられ(C776と呼ぶ)、(c)Pan7ベクターのヘキソンおよびファイバータンパク質の両方がPan6由来のものに置き換えられている(C766と呼ぶ)。
国特許出願第60/575,429号明細書;2004年4月28日に出願された米国特許出願第60/566,212号明細書および2003年、6月20日に出願された米国特許出願第10/465,302号明細書は参考により編入する。本発明は特定の好適な態様に関して記載してきたが、本発明の精神から逸脱することなく改変を行うことができると考えるだろう。そのような改変は添付する特許請求の範囲内にあることを意図する。
Claims (19)
- 選択した宿主細胞中でキメラアデノウイルスを効率的に培養する方法であって、該キメラアデノウイルスが該宿主細胞中で効率的に増殖できない親のアデノウイルス株に由来し、かつ、
(a)(i)選択した宿主細胞型中で増殖する第1アデノウイルスの左末端および右末端のアデノウイルス配列であって、ここで、該左末端領域は5'逆方向末端反復配列(ITR)を含み、そして該右末端領域は3'逆方向末端反復配列(ITR)を含む、アデノウイルス配列;および
(ii)天然の5'および3'末端領域を欠く親のアデノウイルスに由来する内部領域であって、かつ、ペントン、ヘキソンおよびファイバーをコードする後期遺伝子を含む内部領域;
を含んでなるキメラアデノウイルスを生成する工程、ここで生成したキメラアデノウイルスは5'から3'に第1アデノウイルスの左末端領域、親のアデノウイルスの内部領域、および第1アデノウイルスの右末端領域を含んでなり、そして
b)第1アデノウイルスまたは第1アデノウイルスをトランス相補するアデノウイルスの血清型に由来する機能的なアデノウイルスE1a、E1bおよびE4 ORF6遺伝子の存在下で、そしてさらにアデノウイルスの左末端に由来する必要なアデノウイルス構造遺伝子の存在下で、該キメラアデノウイルスを培養する工程、
を含んでなる上記方法。 - 親のアデノウイルスの内部領域がさらに、エンドプロテアーゼオープンリーディングフレーム、DNA結合タンパク質、100kDaスカフォールドタンパク質、33kDaタンパク質、タンパク質VIII、pTP、52/55kDaタンパク質、タンパク質VII、Muおよびタンパク質VIからなる群から選択される1もしくは複数の機能的アデノウイルス遺伝子を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- ポリメラーゼ、末端タンパク質および52/55kDaタンパク質機能が、トランスに提供される請求項1に記載の方法。
- 第1アデノウイルスがさらにポリメラーゼ、末端タンパク質および52/55kDaタンパク質機能をさらに含んでなる、請求項1に記載の方法。
- キメラアデノウイルスが、親のアデノウイルスのアデノウイルス後期遺伝子1、2、3、4および5を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 選択した宿主細胞がアデノウイルスE1a、E1bまたE4 ORF6機能の1もしくは複数を安定に含む、請求項1に記載の方法。
- キメラアデノウイルスが、第1アデノウイルスのアデノウイルスE1a、E1bまたE4 ORF6の1もしくは複数を含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 第1アデノウイルスがヒト起源である請求項1に記載の方法。
- 第1アデノウイルスがサル起源である請求項1に記載の方法。
- キメラアデノウイルスを単離する工程をさらに含んでなる、請求項1に記載の方法。
- 選択した宿主細胞中で増殖するキメラアデノウイルスであって、該宿主細胞中で効率的に増殖できない親のアデノウイルス株に由来する、該キメラアデノウイルスの生成方法であって、
選択した宿主細胞型中で増殖する第1アデノウイルスの5'および3'末端領域であって、該5'末端領域は5'逆方向末端反復配列(ITR)および必要なE1遺伝子機能を含むものであり、そして3'末端領域は逆方向末端反復配列(ITR)および必要なE4遺伝子機能を含むものである、該5'および3'末端領域;と
天然の5'および3'末端領域を欠く親のアデノウイルスに由来する内部領域であって、該内部領域はヘキソン、ペントン塩基およびファイバーを含むものである、該内部領域;を含んでなるキメラアデノウイルスを生成する工程であって、
第1アデノウイルスに由来するか、または第1アデノウイルスをトランス相補し、さらに該アデノウイルスの左末端からの必要なアデノウイルスの構造遺伝子を供給するアデノウイルスの血清型に由来する機能的なアデノウイルスのE1a、E1bおよびE4 ORF6を供給する宿主細胞中での培養により該キメラアデノウイルスを生成する工程を含んでなる、上記方法。 - 請求項1に記載の方法により生産されるキメラアデノウイルス。
- 選択した細胞中で効率的に増殖できない選択したアデノウイルスの血清型のヘキソンタンパク質を含んでなるキメラアデノウイルスであって、該改変されたアデノウイルスが:(a)選択した宿主細胞型中で増殖する第1アデノウイルスの左末端のアデノウイルス配列であって、該左末端領域はE1a、E1bおよび5'逆方向末端反復配列(ITR)を
含むものである該左末端のアデノウイルス配列;
(b)選択した宿主細胞中で効率的に増殖できない選択したアデノウイルスの血清型の内部領域のアデノウイルス配列であって、該内部領域は選択したアデノウイルスのペントン、ヘキソンおよびファイバーをコードする遺伝子を含むものである該内部領域のアデノウイルス配列;
(c)第1アデノウイルスの右末端のアデノウイルス配列であって、該右末端領域は必要なE4遺伝子機能および3'逆方向末端反復配列(ITR)を含むものである該右末端のアデノウイルス配列;
を含んでなり、こうして感染および複製に必要なアデノウイルスの構造および調節タンパク質を含んでなる上記キメラアデノウイルス。 - キメラアデノウイルスがさらに選択したアデノウイルスの血清型のIIIa、52/55kDaおよび末端タンパク質(pTP)を含んでなる、請求項13に記載のキメラアデノウイルス。
- キメラアデノウイルスが第1アデノウイルスのポリメラーゼを含んでなる、請求項13に記載のキメラアデノウイルス。
- キメラアデノウイルスが第1アデノウイルスおよび選択したアデノウイルスから形成される機能的キメラタンパク質を発現し、該キメラタンパク質がポリメラーゼ、末端タンパク質、52/55kDaタンパク質およびIIIaからなる群から選択される、請求項13に記載のキメラアデノウイルス。
- キメラアデノウイルスが選択したアデノウイルスの末端タンパク質、52/55kDa、および/またはIIIaを含んでなる、請求項13に記載のキメラアデノウイルス。
- 請求項12に記載のキメラアデノウイルスを含んでなる宿主細胞。
- 宿主細胞がヒト細胞である請求項18に記載の宿主細胞。
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