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ES2615387T3 - Anticuerpos contra el antígeno 1 asociado al riñón y fragmentos de unión al antígeno de estos - Google Patents

Anticuerpos contra el antígeno 1 asociado al riñón y fragmentos de unión al antígeno de estos Download PDF

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ES2615387T3
ES2615387T3 ES12765926.6T ES12765926T ES2615387T3 ES 2615387 T3 ES2615387 T3 ES 2615387T3 ES 12765926 T ES12765926 T ES 12765926T ES 2615387 T3 ES2615387 T3 ES 2615387T3
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antibody
cancer
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heavy chain
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ES12765926.6T
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English (en)
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Gilles Bernard Tremblay
Anna N. MORAITIS
Traian Sulea
Mario Filion
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Alethia Biotherapeutics Inc
Original Assignee
Alethia Biotherapeutics Inc
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Abstract

Un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este que se une al antígeno 1 asociado al riñón (KAAG1), donde dicho anticuerpo comprende una región variable de la cadena pesada que contiene a. una secuencia de CDRH1 que comprende la SEQ ID NO.:5 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:5, b. una secuencia de CDRH2 que comprende la SEQ ID NO.:6 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:6, y c. una secuencia de CDRH3 que comprende la SEQ ID NO.:7 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:7, y una región variable de la cadena ligera que contiene d. una secuencia de CDRL1 que comprende la SEQ ID NO.:8 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:8, e. una secuencia de CDRL2 que comprende la SEQ ID NO.:9 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:9, y f. una secuencia de CDRL3 que comprende la SEQ ID NO.:10 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:10.

Description

Anticuerpos contra el antígeno 1 asociado al riñón y fragmentos de unión al antígeno de estos
CAMPO DE LA INVENCIÓN
La presente invención se refiere a anticuerpos específicos o fragmentos de unión al antígeno que se unen específicamente al antígeno 1 asociado al riñón (KAAG1) y a su uso para el tratamiento, la detección y el diagnóstico del cáncer. Se contempla en particular el suministro de un agente terapéutico a células con estos anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno.
ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN
Entre las neoplasias ginecológicas, el cáncer de ovario es el responsable del índice de mortalidad más elevado relacionado con tumores en las mujeres de los Estados Unidos (Jemal et al., 2005). Es la cuarta causa principal de defunción relacionada con el cáncer en las mujeres de los Estados Unidos (Menon et al., 2005). La Sociedad Americana Contra el Cáncer estimó un total de 22 220 nuevos casos en 2005 y atribuyó 16 210 muertes a la enfermedad (Bonome et al., 2005). Durante los últimos 30 años, las estadísticas se han mantenido básicamente inalteradas -la mayoría de mujeres que desarrollen un cáncer de ovario, fallecerán debido a esta enfermedad (Chambers y Vanderhyden, 2006). La enfermedad conlleva un riesgo de por vida de 1:70 y un índice de mortalidad > 60% (Chambers y Vanderhyden, 2006). El elevado índice de mortalidad se debe a las dificultades relacionadas con una detección temprana del cáncer de ovario cuando la neoplasia ya se ha extendido más allá del ovario. De hecho, a más de un 80% de los pacientes se les diagnostica un estadio avanzado de la enfermedad (estadio III o IV) (Bonome et al., 2005). Estos pacientes tienen una prognosis deficiente, que se manifiesta en un índice de supervivencia de 5 años < 45%, aunque de un 80% a un 90% responderán inicialmente a la quimioterapia (Berek et al., 2000). Este éxito mayor, en comparación con un índice de supervivencia de 5 años de un 20% previamente se debe, al menos en parte, a la capacidad para reducir de forma óptima el tejido tumoral cuando se encuentra confinado en los ovarios, lo cual supone un factor de pronóstico significativo para el cáncer de ovario (Bristow R. E., 2000; Brown et al., 2004). Los pacientes a los que se les diagnostica la enfermedad en un estadio inicial (estadio I), el índice de supervivencia de 5 años es de > 90 (Chambers y Vanderhyden, 2006).
El cáncer de ovario comprende un grupo heterogéneo de tumores que derivan del epitelio superficial del ovario o de inclusiones superficiales. Se clasifican en tipo seroso, mucinoso, endometrioide, de células claras y de Brenner (transitorio), que se corresponden con los diferentes tipos de epitelios en los órganos del aparato reproductor femenino (Shih y Kurman, 2005). De entre ellos, los tumores serosos constituyen ~60% de los casos de cáncer de ovario diagnosticados. Cada subcategoría histológica se divide adicionalmente en tres grupos: benigno, intermedio (tumor frontera o de bajo potencial maligno (BPM)) y maligno, que reflejan su comportamiento clínico (Seidman et al., 2002). Los tumores BPM representan de un 10% a un 15% de los tumores que se diagnostican como serosos y suponen un dilema, ya que manifiestan una estructura nuclear y un comportamiento metastásico atípicos, y aún así son considerablemente menos agresivos que los tumores serosos de grado elevado. La supervivencia de 5 años para los pacientes con tumores BPM es de un 95%, a diferencia de la supervivencia < 45% para la enfermedad avanzada de grado elevado durante el mismo periodo (Berek et al., 2000).
En la actualidad, el diagnóstico del cáncer de ovario se lleva a cabo, en parte, mediante un análisis rutinario de la historia médica de los pacientes y realizando exámenes físicos, de ultrasonidos y rayos X, así como también cribados hematológicos. Se han descrito dos estrategias alternativas para la detección hematológica temprana de biomarcadores en suero. Una estrategia consiste en el análisis de muestras de suero mediante espectrometría de masas en busca de proteínas o fragmentos proteicos de identidad desconocida que detecten la presencia o ausencia de cáncer (Mor et al., 2005; Kozak et al., 2003). Sin embargo, esta estrategia resulta costosa y su disponibilidad no es generalizada. Como alternativa, la presencia o ausencia de proteínas/péptidos conocidos en el suero se está detectando utilizando micromatrices de anticuerpos, ELISA u otras estrategias similares. La evaluación del suero en busca de un biomarcador proteico denominado CA-125 (antígeno-125 del cáncer) se ha llevado a cabo de forma generalizada desde hace mucho tiempo como un marcador para el cáncer de ovario. Sin embargo, aunque las células de cáncer de ovario pueden producir un exceso de estas moléculas proteicas, existen otros tipos de cáncer diferentes, que incluyen el cáncer de las trompas de Falopio o el cáncer de endometrio (cáncer del revestimiento del útero), un 60% de pacientes con cáncer pancreático y un 20-25% de pacientes con otras neoplasias, con niveles elevados de CA-125. La prueba de CA-125 solo proporciona un resultado positivo verdadero para aproximadamente un 50% de pacientes con cáncer de ovario de estadio I y presenta una probabilidad de un 80% de proporcionar resultados positivos verdaderos para pacientes con cáncer de ovario de estadio II, III y IV. El 20% restante de los pacientes con cáncer de ovario no muestran ningún incremento de las concentraciones de CA
125. Además, una prueba con una concentración elevada de CA-125 puede indicar otra actividad benigna no asociada con el cáncer, tal como menstruación, embarazo o endometriosis. Como consecuencia, esta prueba tiene una aplicación clínica muy limitada para la detección de una enfermedad en estadio inicial cuando todavía se puede tratar, ya que exhibe un valor predictivo positivo (VPP) < 10%. Incluso con la adición de un cribado de ultrasonidos para CA-125, el VPP solo mejora hasta aproximadamente un 20% (Kozak et al., 2003). Por lo tanto, esta prueba no representa una prueba de cribado eficaz.
A pesar de un mayor conocimiento de la etiología de la enfermedad, cirugía citorreductiva agresiva y quimioterapia combinada moderna, solo se ha producido un pequeño cambio en el índice de mortalidad. Los resultados insatisfactorios se han atribuido a (1) la falta de pruebas de cribado adecuadas para la detección temprana de la enfermedad combinada con una presentación tan solo sutil de los síntomas en este estadio -el diagnóstico se realiza frecuentemente tan solo después de la evolución hacia estadios posteriores, momento en el cual la diseminación peritoneal del cáncer limita el tratamiento eficaz y (2) el desarrollo frecuente de resistencia a estrategias quimioterapéuticas estándar, lo cual limita la mejora del índice de supervivencia de 5 años de los pacientes. El régimen de quimioterapia inicial para el cáncer de ovario incluye la combinación de carboplatino (Paraplatin) y paclitaxel (taxol). Varios años de ensayos clínicos han demostrado que esta combinación es la más eficaz tras una cirugía eficaz -reduce el volumen del tumor aproximadamente un 80% en las mujeres a las que se ha diagnosticado cáncer de ovario recientemente y de un 40% a un 50% presentarán una regresión completa -pero se continúan realizando estudios en busca de formas para mejorar la respuesta de los pacientes. La infusión abdominal reciente de agentes quimioterapéuticos que tienen como diana células difíciles de alcanzar, combinada con un suministro intravenoso, ha incrementado la eficacia. Sin embargo, a menudo los efectos secundarios graves provocan que no se complete el curso del tratamiento. Algunos agentes quimioterapéuticos diferentes incluyen doxorubicina, cisplatino, ciclofosfamida, bleomicina, etopósido, vinblastina, clorhidrato de topotecán, ifosfamida, 5fluorouracilo y melfalán. Más recientemente, algunos ensayos clínicos han demostrado que la administración intraperitoneal de cisplatino confiere un beneficio en cuanto a la supervivencia en comparación con la quimioterapia intravenosa sistémica (Cannistra y McGuire, 2007). Los excelentes índices de supervivencia para mujeres con una enfermedad en estadio inicial que reciben quimioterapia proporcionan un argumento convincente para que los esfuerzos de investigación se centren en desarrollar estrategias para mejorar la detección del cáncer de ovario. Además, el descubrimiento de nuevos biomarcadores relacionados con el cáncer de ovario conducirá al desarrollo de estrategias terapéuticas más eficaces con efectos secundarios mínimos para el tratamiento futuro del cáncer de ovario.
A pesar de estos recientes avances en la comprensión y el tratamiento del cáncer de ovario, el uso de quimioterapia está asociado de forma invariable con reacciones adversas severas, las cuales limitan su uso. Como consecuencia, se necesitan estrategias más específicas, tales como la combinación de la especificidad tisular del antígeno con la selectividad de anticuerpos monoclonales, las cuales deberían permitir una reducción significativa de los efectos secundarios no asociados con la diana. El uso de anticuerpos monoclonales para la terapia del cáncer de ovario está empezando a emerger y existe un número cada vez mayor de ensayos clínicos en curso (Oei et al., 2008; Nicodemus y berek, 2005). La mayoría de estos ensayos han examinado el uso de anticuerpos monoclonales conjugados con radioisótopos, tales como itrio-90, o anticuerpos que tienen como diana antígenos tumorales ya identificados en otros tipos de cáncer. Un ejemplo de esto es el uso de bevacizumab, que tiene como diana el factor de crecimiento endotelial vascular (Burger, 2007). Existen muy pocos antígenos específicos del cáncer de ovario que se estén investigando actualmente como dianas terapéuticas para anticuerpos monoclonales. Algunos ejemplos incluyen el uso de una proteína denominada B7-H4 (Simon et al., 2006) y más recientemente el receptor alfa folato (Ebel et al., 2007), el último de los cuales ha entrado recientemente en la fase II de los ensayos clínicos.
El antígeno 1 asociado al riñón (KAAG1) se clonó originariamente a partir de una genoteca de ADNc derivada de una línea celular de carcinoma renal del antígeno B7 para leucocitos de histocompatibilidad como un péptido antigénico presentado a linfocitos T citotóxicos (Van den Eynde et al., 1999; N.o de acceso a Genebank Q9UBP8, SEQ ID NOs:28, 29). Se descubrió que el locus que contenía KAAG1 codificaba dos genes que se transcribían en hebras opuestas del ADN. Se descubrió que la hebra sentido codificaba un transcrito que codificaba una proteína denominada DCDC2. Los estudios de expresión de estos autores determinaron que el transcrito antisentido KAAG1 era específico del tumor y presentaba muy poca expresión en tejidos normales, mientras que el transcrito sentido DCDC2 se expresaba de forma ubicua (Van den Eynde et al., 1999). La expresión del transcrito KAAG1 en el cáncer, y en particular en cáncer de ovario, cáncer renal, cáncer de pulmón, cáncer de colon, cáncer de mama y melanoma, se ha descrito en la solicitud de patente publicada N.o PCT/CA2007/001134 (publicada como WO 2007/147265 A1). Van den Eynde et al. también observaron la expresión de ARN en carcinomas renales, carcinomas colorrectales, melanomas, sarcomas, leucemias, tumores cerebrales, tumores de tiroides, carcinomas de mama, carcinomas prostáticos, carcinomas esofágicos, tumor de vejiga, carcinomas de pulmón y tumores de cabeza y cuello. Recientemente, pruebas genéticas contundentes obtenidas a partir de estudios de desequilibrio de ligamento demostraron que el locus VMP/DCDC2/KAAG1 estaba asociado con la dislexia (Schumacher et al., 2006; Cope et al., 2005). Uno de estos informes señaló al marcador DCDC2 como la causa en pacientes con dislexia, debido a que la función de esta proteína en la migración de neuronas corticales era acorde con los síntomas de estos pacientes, que a menudo presentaban una migración y maduración neuronales anómalas (Schumacher et al., 2006).
COMPENDIO DE LA INVENCIÓN
La invención se refiere a anticuerpos anti-KAAG1 específicos y fragmentos de unión al antígeno, y a su uso para el tratamiento, la detección y el diagnóstico de cáncer que comprende células tumorales que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1. Las realizaciones ilustrativas de un cáncer de este tipo incluyen, por ejemplo, cáncer de ovario, cáncer de piel, cáncer renal, cáncer colorrectal, sarcoma, leucemia, cáncer cerebral, cáncer de tiroides, cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer del esófago, cáncer de vejiga, cáncer de pulmón y cáncer de cabeza y cuello.
Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno pueden ser particularmente eficaces a la hora de actuar sobre
KAAG1 o una variante de KAAG1 que se exprese en la superficie de las células tumorales.
De hecho, parece ser que los anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno de la presente invención presentan una mayor capacidad de unión a las células tumorales que expresan KAAG1 en comparación con, por ejemplo, los anticuerpos 3D3 y 3G10 descritos en el documento PCT/CA2009/001586 (publicado como WO 2010/060186). Estos anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno están además interiorizados y, por consiguiente, pueden ser útiles para suministrar agentes terapéuticos a células tumorales. Los resultados de la presente sugieren que los anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno que tienen las características deseadas (p. ej., una interiorización y unión mejoradas) se unen generalmente a una región C-terminal de KAAG1 delimitada por los aminoácidos 61-84. Sin embargo, aunque los dos anticuerpos 3A4 y 3G10 se unen a la misma región, parece ser que el anticuerpo 3A4 se une a la superficie de las células tumorales de forma más eficaz que el anticuerpo 3G10. En particular, las células cancerosas que expresan el antígeno KAAG1 requieren aproximadamente 10 veces menos 3A4 en comparación con 3G10 en los experimentos de citometría de flujo, una estrategia que mide la unión directa de los anticuerpos a la superficie de las células. Además, en experimentos de unión utilizando resonancia de plasmones superficiales, se descubrió que la afinidad de 3A4 por KAAG1 era inferior a 10 picomolar, mientras que los anticuerpos 3D3 y 3G10 presentaban afinidades superiores a 200 nanomolar (una afinidad 20 veces inferior). Por consiguiente, cabe esperar que estos incrementos de la capacidad de unión de 3A4 se traduzcan en una actividad terapéutica mejorada.
La presente invención proporciona un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este que se une al antígeno 1 asociado al riñón (KAAG1), donde dicho anticuerpo comprende una región variable de la cadena pesada que contiene
a.
una secuencia de CDRH1 que comprende la SEQ ID NO.:5 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:5;
b.
una secuencia de CDRH2 que comprende la SEQ ID NO.:6 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:6; y
c.
una secuencia de CDRH3 que comprende la SEQ ID NO.:7 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:7; y una región variable de la cadena ligera que contiene
d.
una secuencia de CDRL1 que comprende la SEQ ID NO.:8 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:8;
e.
una secuencia de CDRL2 que comprende la SEQ ID NO.:9 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:9; y
f.
una secuencia de CDRL3 que comprende la SEQ ID NO.:10 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:10.
La presente invención también proporciona un ácido nucleico que codifica
(i)
una región variable de la cadena ligera y una región variable de la cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención; o
(ii)
una cadena ligera y una cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención. La presente invención también proporciona un vector que comprende el ácido nucleico de la invención. La presente invención también proporciona una célula aislada que comprende
(i)
el ácido nucleico de la invención;
(ii)
un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera y una región variable de la cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención;
(iii) un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención y un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena pesada del antígeno o fragmento de unión al antígeno de este de la invención;
(iv)
un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena ligera y una cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención;
(v)
un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena ligera del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención y un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena pesada del antígeno o fragmento de unión al antígeno de este de la invención; o
(vi)
el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención.
La presente invención también proporciona una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención, y un portador farmacéuticamente aceptable.
La presente invención también proporciona un uso ex vivo de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención en la detección de un tumor o en el diagnóstico del cáncer, donde el tumor o cáncer comprende células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
La presente invención también proporciona un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención para su uso en la detección in vivo de un tumor o en el diagnóstico in vivo del cáncer, donde el tumor o cáncer comprende células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
La presente invención también proporciona un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención para su uso en el tratamiento de un cáncer que comprende células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
La presente invención también proporciona un uso del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la invención para la detección in vitro de células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
La presente invención también proporciona un kit que comprende el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de
este de la invención.
La presente invención también proporciona un método para obtener un anticuerpo de la invención, donde el método comprende expresar un polipéptido o ARN a partir de secuencias de nucleótidos capaces de codificar cadenas de inmunoglobulina ligeras y pesadas de dicho anticuerpo en un sistema de célula huésped.
En la presente se describe un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno aislado o sustancialmente purificado que puede tener la capacidad de unirse de forma específica a una secuencia que sea idéntica a al menos 10 (p. ej., de 10 a 20 o más) aminoácidos consecutivos situados entre los aminoácidos 61 y 84 de KAAG1 (SEQ ID NO.:29).
También se describen anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno aislados capaces de competir con el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno descrito en la presente.
En la presente se describen anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno específicos que tienen las secuencias de aminoácidos descritas en la presente. Tales anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno o anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno de la invencion pueden adoptar la forma de anticuerpos monoclonales, anticuerpos policlonales, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados y anticuerpos humanos (aislados), así como también fragmentos de unión al antígeno que tengan las características que se describen en la presente. Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno que contienen permutaciones de las cadenas ligera y/o pesada entre un anticuerpo monoclonal, quimérico, humanizado o humano también se engloban en la presente.
Por lo tanto, los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno de la presente invención pueden comprender aminoácidos de una región constante humana y/o aminoácidos del marco de un anticuerpo humano.
El término "anticuerpo" se refiere a un anticuerpo intacto, anticuerpos monoclonales o policlonales. El término "anticuerpo" también engloba anticuerpos multiespecíficos tales como anticuerpos biespecíficos. Los anticuerpos humanos normalmente están constituidos por dos cadenas ligeras y dos cadenas pesadas, cada una de las cuales comprende regiones variables y regiones constantes. La región variable de la cadena ligera comprende 3 CDR, que se identifican en la presente como CDRL1 o L1, CDRL2 o L2 y CDRL3 o L3, flanqueadas por regiones marco. La región variable de la cadena pesada comprende 3 CDR, que se identifican en la presente como CDRH1 o H1, CDRH2 o H2 y CDRH3 o H3, flanqueadas por regiones marco. Las CDR de los anticuerpos humanizados de la presente invención se han identificado utilizando las definiciones de Kabat y Chotia (p. ej., CDRH2 expuesta en SEQ ID NO.:56). Sin embargo, otros (Abhinandan y Martin, 2008) han utilizado estrategias modificadas basadas de forma general en Kabat y Chotia que han dado como resultado la delineación de CDR más cortas (p. ej., CDRH2 expuesta en SEQ ID NO.:6).
La expresión "fragmento de unión al antígeno", tal como se utiliza en la presente, se refiere a uno o más fragmentos de un anticuerpo que mantienen la capacidad de unirse a un antígeno (p. ej., KAAG1, una forma secretada de KAAG1 o sus variantes). Se ha demostrado que la función de unión al antígeno de un anticuerpo puede ser ejecutada por fragmentos de un anticuerpo intacto. Algunos ejemplos de fragmentos de unión englobados en la expresión "fragmento de unión al antígeno" de un anticuerpo incluyen (i) un fragmento Fab, un fragmento monovalente constituido por los dominios VL, VH, CL y CH1; (ii) un fragmento F(ab')2, un fragmento bivalente que comprende dos fragmentos Fab unidos por un puente disulfuro en la región bisagra; (iii) un fragmento Fd constituido por los dominios VH y CH1; (iv) un fragmento Fv constituido por los dominios VL y VH de un único brazo de un anticuerpo, (v) un fragmento dAb (Ward et al., (1989) Nature 341:544-546), que está constituido por un dominio VH; y
(vi)
una región determinante de la complementariedad aislada (CDR), p. ej., CDR3 de VH. Además, aunque los dos dominios del fragmento Fv, VL y VH, estén codificados por genes diferentes, estos se pueden unir utilizando métodos recombinantes, mediante un conector sintético que permita prepararlos como una cadena polipeptídica única en la que las regiones VL y VH se apareen para formar moléculas monovalentes (conocidas como Fv de cadena única (scFv); remítase, p. ej., a Bird et al. (1988) Science 242:423-426; y Huston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883). También se pretende que tales anticuerpos de cadena única queden englobados en la expresión "fragmento de unión al antígeno" de un anticuerpo. Además, los fragmentos de unión al antígeno incluyen proteínas de fusión de la inmunoglobulina del dominio de unión que comprenden (i) un polipéptido del dominio de unión (tal como una región variable de la cadena pesada, una región variable de la cadena ligera o una región variable de la cadena pesada fusionada con una región variable de la cadena ligera mediante un péptido conector) que está fusionado con un polipéptido de la región bisagra de la inmunoglobulina, (ii) una región constante CH2 de la cadena pesada de la inmunoglobulina fusionada con la región bisagra, y (iii) una región constante CH3 de la cadena pesada de la inmunoglobulina fusionada con la región constante CH2. La región bisagra se puede modificar reemplazando uno o más residuos de cisteína por residuos de serina para evitar la dimerización. Tales proteínas de fusión de la inmunoglobulina del dominio de unión se describen adicionalmente en US 2003/0118592 y US 2003/0133939. Estos fragmentos de anticuerpos se obtienen utilizando técnicas convencionales conocidas por los expertos en la técnica y los fragmentos se analizan para determinar su utilidad del mismo modo que los anticuerpos intactos.
La expresión "anticuerpo humanizado" engloba un anticuerpo totalmente humanizado (es decir, los marcos están humanizados al 100%) y un anticuerpo parcialmente humanizado (p. ej., al menos un dominio variable contiene uno
o más aminoácidos de un anticuerpo humano, mientras que otros aminoácidos son aminoácidos de un anticuerpo
progenitor no humano). Normalmente, un "anticuerpo humanizado" contiene CDR de un anticuerpo progenitor no humano (p. ej., de ratón, rata, conejo, primate no humano, etc.) y marcos que son idénticos a los de un anticuerpo humano natural o de un anticuerpo humano consenso. En este caso, estos "anticuerpos humanizados" se clasifican como totalmente humanizados. Un "anticuerpo humanizado" también puede contener una o más sustituciones de aminoácidos que no se correspondan con las del anticuerpo humano o anticuerpo humano consenso. Tales sustituciones incluyen, por ejemplo, retromutaciones (p. ej., la reintroducción de aminoácidos no humanos) que permitan conservar las características del anticuerpo (p. ej., afinidad, especificidad, etc.). Tales sustituciones se encuentran normalmente en la región marco. Un "anticuerpo humanizado" también comprende opcionalmente al menos una porción de una región constante (Fc), que es habitualmente la de un anticuerpo humano. Normalmente, la región constante de un "anticuerpo humanizado" es idéntica a la de un anticuerpo humano.
La expresión "anticuerpo humano natural" se refiere a un anticuerpo codificado (codificable) por el conjunto de anticuerpos humanos, es decir, la secuencia de la línea germinal.
La expresión "anticuerpo quimérico" se refiere a un anticuerpo que contiene una o más regiones variables no humanas y una región constante humana.
La expresión "anticuerpo híbrido" se refiere a un anticuerpo que comprende una de sus regiones variables de la cadena ligera o pesada (su cadena ligera o pesada) de un tipo determinado de anticuerpo (p. ej., humanizado), mientras que la otra región variable de la cadena ligera o pesada (la cadena ligera o pesada) es de otro tipo (p. ej., de murino, quimérica).
En algunas realizaciones, la región marco de la cadena ligera y/o la cadena pesada del anticuerpo humanizado puede comprender de uno a treinta aminoácidos del anticuerpo no humano que se desea humanizar y la porción restante es de un anticuerpo humano natural o un anticuerpo humano consenso. En algunos casos, el anticuerpo humanizado puede comprender de 1 a 6 CDR no humanas y a menudo las seis CDR no son humanas.
El anticuerpo humano natural seleccionado para la humanización del anticuerpo progenitor no humano puede comprender una región variable con una estructura tridimensional similar a la de (que se pueda superponer sobre) una región variable (modelada) de un anticuerpo progenitor no humano. En este sentido, el anticuerpo humanizado presenta una mayor probabilidad de tener una estructura tridimensional similar a la del anticuerpo progenitor no humano.
La región variable de la cadena ligera del anticuerpo humano natural seleccionado para la humanización puede presentar, por ejemplo, una identidad global (a lo largo de toda la región variable de la cadena ligera) de al menos un 70%, 75%, 80%, etc. con la del anticuerpo progenitor no humano. Como alternativa, la región marco de la cadena ligera del anticuerpo humano natural seleccionado para la humanización puede presentar, por ejemplo, una identidad secuencial de al menos un 70%, 75%, 80%, 85%, etc. con la región marco de la cadena ligera del anticuerpo progenitor no humano. En algunas realizaciones, el anticuerpo humano natural seleccionado para la humanización puede presentar el mismo o sustancialmente el mismo número de aminoácidos en su región determinante de la complementariedad de la cadena ligera que el de una región determinante de la complementariedad de la cadena ligera del anticuerpo progenitor no humano.
La región variable de la cadena pesada del anticuerpo humano natural seleccionado para la humanización puede presentar, por ejemplo, una identidad global (a lo largo de toda la región variable de la cadena pesada) de al menos un 60%, 70%, 75%, 80%, etc. con la del anticuerpo progenitor no humano. También de acuerdo con la presente invención, los residuos aminoacídicos de la región marco humana de la cadena pesada del anticuerpo humanizado pueden proceder de la región marco de la cadena pesada del anticuerpo humano natural y pueden presentar una identidad de al menos un 70%, 75%, 89%, etc. con una región marco de la cadena pesada del anticuerpo progenitor no humano. En algunas realizaciones, el anticuerpo humano natural seleccionado para la humanización puede presentar el mismo o sustancialmente el mismo número de aminoácidos en su región determinante de la complementariedad de la cadena pesada que el de una región determinante de la complementariedad de la cadena pesada del anticuerpo progenitor no humano.
El anticuerpo humano natural que se selecciona para la humanización del anticuerpo progenitor no humano puede comprender una región variable con una estructura tridimensional similar a la de (que se pueda superponer sobre) una región variable (modelada) de un anticuerpo progenitor no humano. En este sentido, el anticuerpo híbrido o humanizado presenta una mayor probabilidad de tener una estructura tridimensional similar a la del anticuerpo progenitor no humano.
Por ejemplo, la región variable de la cadena pesada del anticuerpo humano natural que se puede seleccionar para la humanización puede tener las siguientes características: a) una estructura tridimensional similar o idéntica a (que se pueda superponer sobre) la de una cadena pesada del anticuerpo no humano y/o b) una región marco con una secuencia de aminoácidos que tenga una identidad de al menos un 70% respecto a una región marco de la cadena pesada del anticuerpo no humano. Opcionalmente, (un número de) residuos aminoacídicos en una CDR de la cadena pesada (p. ej., las tres CDR) es igual o sustancialmente igual al de los residuos aminoacídicos de la CDR de la cadena pesada no humana.
Como alternativa, la región variable de la cadena ligera del anticuerpo humano natural que se puede seleccionar para la humanización puede tener las siguientes características: a) una estructura tridimensional similar o idéntica a (que se pueda superponer sobre) la de una cadena ligera del anticuerpo no humano y/o b) una región marco con una secuencia de aminoácidos que tenga una identidad de al menos un 70% respecto a una región marco de la cadena ligera del anticuerpo no humano. Opcionalmente, (un número de) residuos aminoacídicos en una CDR de la cadena ligera (p. ej., las tres CDR) es igual o sustancialmente igual al de los residuos aminoacídicos de la CDR de la cadena ligera no humana.
Un sitio de unión al antígeno típico está constituido por las regiones variables formadas por el apareamiento de una inmunoglobulina de cadena ligera y una inmunoglobulina de cadena pesada. La estructura de las regiones variables del anticuerpo es muy uniforme y exhibe estructuras muy similares. Normalmente, estas regiones variables están constituidas por regiones marco (FR, por sus siglas en inglés) relativamente homólogas intercaladas con tres regiones hipervariables denominadas regiones determinantes de la complementariedad (CDR, por sus siglas en ingles). La actividad de unión global del fragmento de unión al antígeno está determinada a menudo por la secuencia de las CDR. Las FR suelen desempeñar una función en el posicionamiento y el alineamiento adecuados en tres dimensiones de las CDR para una unión al antígeno óptima.
Los anticuerpos y/o fragmentos de unión al antígeno de la presente invención se pueden originar, por ejemplo, a partir de un ratón, una rata o cualquier otro mamífero o a partir de otras fuentes tales como a través de tecnologías de ADN recombinante.
El alcance, la aplicabilidad y las ventajas adicionales de la presente invención serán evidentes a partir de la descripción detallada no restrictiva que se proporciona a continuación en la presente. Sin embargo, se debe sobreentender que esta descripción detallada, a la vez que indica realizaciones ilustrativas de la invención, se proporciona solamente a modo de ejemplo, con referencia a los dibujos adjuntos.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS DIBUJOS
La Figura 1 muestra los resultados del ELISA que compara la unión del anticuerpo quimérico anti-KAAG1 3A4 con un anticuerpo de control cuando se incuban con concentraciones cada vez mayores de KAAG1 humano recombinante. La curva de unión de 3A4 se muestra con la línea de color más claro.
La Figura 2 muestra un histograma que describe los resultados de los análisis de ELISA para mapear la especificidad por epítopos del anticuerpo anti-KAAG1 3A4. Los resultados mostraron que 3A4 interaccionó con una secuencia de aminoácidos contenida en el extremo terminal carboxi de KAAG1 entre los aminoácidos 61–84. La unión de 3A4 se comparó con los anticuerpos anti-KAAG1 3C4, 3D3 y 3G10, que se sabía que interaccionaban con las regiones 1–35, 36–60 y 61–84 de KAAG1, respectivamente.
La Figura 3A muestra los resultados de una citometría de flujo realizada sobre células de cáncer de ovario SKOV-3 y TOV-21G con el anticuerpo anti-KAAG1 3A4 (línea más oscura) en comparación con una IgG de control (línea más clara).
La Figura 3B muestra los resultados de una citometría de flujo realizada sobre células renales humanas 293E con el anticuerpo anti-KAAG1 3A4 (línea más oscura) en comparación con una IgG de control (línea más clara).
La Figura 4 representa la detección del antígeno KAAG1 sobre la superficie de células SKOV-3 mediante citometría de flujo con el anticuerpo anti-KAAG1 3A4. La señal de fluorescencia se redujo con el tiempo cuando las células se incubaron a 37 oC, lo cual sugiere que el complejo de KAAG1/anticuerpo se interiorizó durante la incubación cuando las células se incubaron con 3A4.
La Figura 5 muestra la interiorización del anticuerpo anti-KAAG1 3A4 y su colocalización con LAMP1, una proteína asociada con las membranas de lisosomas y endosomas.
Las Figuras 6A y 6B son gráficas que representan el análisis de FAC de células tumorales expuestas a diferentes anticuerpos anti-KAAG1.
La Figura 7 son esquemas que presentan 2 representaciones probables de la orientación de KAAG1 en la membrana celular.
La Figura 8 es un modelo molecular (diagrama en cinta) del dominio variable de 3A4 de murinos. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris.
La Figura 9a es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh1Hh1 (es decir, la cadena ligera humanizada 1 y la cadena pesada humanizada 1) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh1 representa la cadena ligera humanizada de la variante 1 y
Hh1 representa la cadena pesada de la variante 1.
La Figura 9b es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh1Hh2 (es decir, la cadena ligera humanizada 1 y la cadena pesada humanizada 2) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh1 representa la cadena ligera humanizada de la variante 1 y Hh2 representa la cadena pesada de la variante 2.
La Figura 9c es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh1Hh3 (es decir, la cadena ligera humanizada 1 y la cadena pesada humanizada 3) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh1 representa la cadena ligera humanizada de la variante 1 y Hh3 representa la cadena pesada de la variante 3.
La Figura 9d es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh1Hh4 (es decir, la cadena ligera humanizada 1 y la cadena pesada humanizada 4) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh1 representa la cadena ligera humanizada de la variante 1 y Hh4 representa la cadena pesada de la variante 4.
La Figura 9e es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh2Hh1 (es decir, la cadena ligera humanizada 2 y la cadena pesada humanizada 1) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh2 representa la cadena ligera humanizada de la variante 2 y Hh1 representa la cadena pesada de la variante 1.
La Figura 9f es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh2Hh2 (es decir, la cadena ligera humanizada 2 y la cadena pesada humanizada 2) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh2 representa la cadena ligera humanizada de la variante 2 y Hh2 representa la cadena pesada de la variante 2.
La Figura 9g es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh2Hh3 (es decir, la cadena ligera humanizada 2 y la cadena pesada humanizada 3) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh2 representa la cadena ligera humanizada de la variante 2 y Hh3 representa la cadena pesada de la variante 3.
La Figura 9h es un modelo molecular del anticuerpo humanizado Lh2Hh4 (es decir, la cadena ligera humanizada 2 y la cadena pesada humanizada 4) de los dominios variables de 3A4. Los bucles de las CDR se muestran en color negro y se marcan como L1, L2 y L3 en la cadena ligera y H1, H2 y H3 en la cadena pesada. La región marco se muestra en color gris. Las cadenas laterales de los residuos mutados del marco murino al marco humano se presentan en una representación de bolas y barras. Lh2 representa la cadena ligera humanizada de la variante 2 y Hh4 representa la cadena pesada de la variante 4.
La Figure 10a es un alineamiento de las secuencias de aminoácidos de los dominios variables de 3A4 de las cadenas ligeras humanizadas y de murino. La cadena ligera tiene dos variantes humanizadas (Lh1 y Lh2). Las CDR se muestran en negrita y se indican como CDRL1, CDRL2 y CDRL3. Las retromutaciones en las regiones marco humanas que son aminoácidos de murino están subrayadas en las secuencias humanizadas.
La Figure 10b es un alineamiento de las secuencias de aminoácidos de los dominios variables de 3A4 de las cadenas pesadas humanizadas y de murino. La cadena pesada tiene cuatro variantes humanizadas (de Hh1 a Hh4). Las CDR se muestran en negrita y se indican como CDRH1, CDRH2 y CDRH3. Las retromutaciones en las regiones marco humanas que son aminoácidos de murino están subrayadas en las secuencias humanizadas.
La Figura 11A es un alineamiento de la región variable de la cadena ligera de 3A4 de murino (SEQ ID NO.:4) con una variante de la región variable de la cadena ligera (SEQ ID NO.:33) utilizando el programa ClustalW2 (Larkin M.A., et al., (2007) ClustalW and ClustalX version 2. Bioinformatics 2007 23(21): 2947-2948), donde un “*” (asterisco) indica posiciones que contienen un único residuo totalmente conservado, donde “:” (dos puntos) indica la conservación entre grupos de propiedades muy similares -puntuación > 0.5 en la matriz de Gonnet PAM 250 y donde “.” (punto) indica la conservación entre grupos de propiedades poco similares -puntuación =< 0.5 en la matriz de Gonnet PAM 250.
La Figura 11B es un alineamiento de la región variable de la cadena pesada de 3A4 de murino (SEQ ID NO.:2) con una variante de la región variable de la cadena ligera (SEQ ID NO.:38) utilizando el programa ClustalW2 (Larkin M.A., et al., (2007) ClustalW and ClustalX version 2. Bioinformatics 2007 23(21): 2947-2948), donde un “*” (asterisco) indica posiciones que contienen un único residuo totalmente conservado, donde “:” (dos puntos) indica la conservación entre grupos de propiedades muy similares -puntuación > 0.5 en la matriz de Gonnet PAM 250 y donde “.” (punto) indica la conservación entre grupos de propiedades poco similares -puntuación =< 0.5 en la matriz de Gonnet PAM 250.
La Figura 12a representa un mapa del plásmido de pKCR5-3A4-HC-Variante 1. Las cadenas pesadas de las variantes humanizadas de 3A4 se clonaron del mismo modo en el sitio HindIII de pK-CR5. Como consecuencia, los plásmidos resultantes son idénticos a la variante 1 de pKCR5-3A4-HC, con la excepción de la secuencia del dominio variable de la inmunoglobulina de cadena pesada.
La Figura 12b representa un mapa del plásmido de pMPG-CR5-3A4-LC-Variante 1. Las cadenas ligeras de las variantes humanizadas 1 y 2 del anticuerpo 3A4 se clonaron del mismo modo en el sitio BamHI de pMPG-CR5. Como consecuencia, el plásmido resultante es idéntico a pMPG-CR5-3A4-LC-Variante 1, con la excepción de la secuencia del dominio variable de la inmunoglobulina de cadena ligera.
La Figura 13 representa un análisis de la producción de anticuerpos después de la transfección transitoria en células CHO. El sobrenadante (13 días después de la transfección) de células CHOcTA transfectadas con las diferentes combinaciones de cadenas ligeras y pesadas del anticuerpo humanizado 3A4 se analizaron mediante inmunotransferencia de western. La cuantificación del anticuerpo producido en los sobrenadantes se determinó después de escanear las bandas de la inmunotransferencia de western frente a la dilución de un patrón conocido (anticuerpo IgG purificado humano). Mr: marcador de peso molecular (kDa).
La Figura 14 es una gráfica de una filtración en gel Superdex G75 de una muestra de KAAG1 recombinante. Se inyectó KAAG1 para la filtración en gel y se separó a 0.4 ml/min. El pico más grande apareció entre las fracciones 15–19.
La Figura 15 es una tabla que enumera las constantes de afinidad y velocidad para las variantes humanizadas y de murino del anticuerpo 3A4.
La Figura 16A es un histograma que ilustra las velocidades de asociación (Ka) de los anticuerpos humanizados.
La Figura 16B es un histograma que ilustra las velocidades de disociación (Kd) de los anticuerpos humanizados.
La Figura 16C es un histograma que ilustra las constantes de afinidad (KD) de los anticuerpos humanizados.
La Figure 17a ilustra las variantes humanizadas de 3A4 que se unen a KAAG1 en un ELISA. Esta figura muestra la unión comparativa de las variantes del anticuerpo humanizado 3A4 y el 3A4 de murino. Los perfiles de unión en función de la concentración de las cadenas pesadas humanizadas (Hh1, Hh2, Hh3 y Hh4) se acoplaron con la variante de la cadena ligera Lh1.
La Figura 17b ilustra las variantes humanizadas de 3A4 que se unen a KAAG1 en un ELISA. Esta figura muestra la unión comparativa de las variantes del anticuerpo humanizado 3A4 y el 3A4 de murino. Los perfiles de unión en función de la concentración de las cadenas pesadas humanizadas (Hh1, Hh2, Hh3 y Hh4) se acoplaron con la variante de la cadena ligera Lh2.
La Figura 18 ilustra las variantes humanizadas de 3A4 que se unen a KAAG1 sobre la superficie de células cancerosas. Esta ilustración muestra la actividad de unión comparativa de los anticuerpos 3A4 humanizados y de murino sobre las células de cáncer de ovario SKOV-3 no permeabilizadas.
DESCRIPCIÓN DETALLADA DE LA INVENCIÓN
Expresión y actividad biológica de KAAG1 en células cancerosas
La presente invención se refiere al uso de anticuerpos que tienen como diana tumores que se encuentran en varios tipos de cáncer, en particular el cáncer de ovario. Con el fin de dirigir los anticuerpos a los tumores, se debe llevar a cabo la identificación de antígenos específicos del tumor que se expresen en la superficie celular de las células cancerosas. Existen varias tecnologías disponibles para identificar antígenos específicos de tumores y el método que se utilizó para identificar KAAG1 en tumores de ovario, una plataforma de descubrimiento innovadora denominada amplificación de ARNm basada en la transcripción substractiva (STAR, por sus siglas en inglés), se describe en la solicitud de patente publicada N.o PCT/CA2007/001134, publicada con el N.o WO/2007/147265 el 27 de diciembre de 2007.
El análisis de las colecciones de STAR para el cáncer de ovario proporcionó muchos genes que codifican proteínas de la superficie celular y secretadas. Uno de ellos, denominado AB-0447, contenía un marco de lectura abierto que codificaba un polipéptido de 84 aminoácidos, correspondiente a la SEQ ID NO.:29, el cual fue codificado por un ADNc de 885 pares de bases con la secuencia de nucleótidos que se muestra en la SEQ ID NO.:28. Una búsqueda
en las bases de datos de dominio público indicó que la secuencia de nucleótidos de AB-0447 era idéntica a la de un gen denominado KAAG1. El análisis bioinformático pronosticó una proteína unida a la membrana que presentaba su dominio funcional al compartimento extracelular. KAAG1 se clonó originariamente a partir de una colección de cáncer de riñón como un antígeno de superficie celular, resultado que confirma su localización en la membrana. Además, los estudios de la presente mostraron que la proteína se procesó en su extremo aminoterminal, resultado que es coherente con la escisión de un péptido señal funcional en o entre los aminoácidos 30 y 34. Además, la expresión transitoria del ADNc de longitud completa dio como resultado la detección de KAAG1 escindido en el medio de cultivo. Este último descubrimiento indicó que esta proteína unida a la membrana podría desprenderse de las células cuando se expresara en niveles elevados. Por el contrario, la expresión de un mutante de KAAG1 con el grupo amino truncado dio como resultado la retención intracelular de la proteína. En la actualidad no existe ningún informe publicado que clarifique su función y la sobreexpresión de KAAG1 en el cáncer de ovario, según se describe en esta invención, nunca se ha documentado previamente.
Por lo tanto, hemos investigado si KAAG1 podría utilizarse en la terapia y el diagnóstico basados en anticuerpos.
Se han establecido varios modelos basados en células de cáncer de ovario, tales como TOV-21G, TOV-112D, OV90 y otros, y los expertos en la técnica están familiarizados con ellos. Estas células son parte de una colección de líneas celulares humanas de cáncer de ovario de pacientes con tumores de ovario o fluido de ascitis. Estas líneas celulares han sido sometidas a un análisis en profundidad, que incluye patrones de expresión génica globales en micromatrices que los convierten en excelentes modelos basados en células para el cáncer de ovario humano. Las propiedades de crecimiento, los patrones de expresión génica y la respuesta a fármacos quimioterapéuticos indicaron que estas líneas celulares eran muy representativas del comportamiento del tumor de ovario in vivo (Benoît et al., 2007). El análisis de RT-PCR del ARN total aislado de estas líneas celulares de cáncer de ovario indicó que el transcrito de KAAG1 se expresaba débilmente en las líneas celulares derivadas de tumores primarios. Por el contrario, las líneas celulares derivadas de fluido de ascitis contenían niveles elevados de expresión de KAAG1. La mayor expresión de KAAG1 en células del fluido de ascitis sugirió que el entorno de las células influía sobre la regulación del gen KAAG1. Las células de ascitis se asocian con una enfermedad avanzada y su patrón de expresión implica que los mayores niveles de KAAG1 están asociados con un crecimiento independiente de anclaje. De acuerdo con esta última sugerencia, se observó que la expresión de KAAG1 aumentaba significativamente en líneas celulares derivadas de tumores primarios cuando estas células se cultivaban como esferoides en cultivos 3D. Estos esferoides han sido caracterizados exhaustivamente y se ha demostrado que presentan muchas propiedades asociadas con los tumores in vivo (Cody et al., 2008). Por lo tanto, se ha demostrado que la expresión de KAAG1 aumenta significativamente en modelos que imitan la evolución de tumores, en particular durante la evolución de un cáncer de ovario.
Tras la demostración de que la expresión de KAAG1 está regulada en células de cáncer de ovario, se examinó la función de este gen en el comportamiento de las células de cáncer de ovario en ensayos basados en células. Con este fin, se utilizó interferencia por ARN (ARNi) para suprimir la expresión del gen KAAG1 endógeno en las líneas celulares de cáncer de ovario y se observó que la expresión reducida de KAAG1 dio como resultado una reducción significativa de la migración de las células, según se determinó en un ensayo de movilidad celular estándar, que se ejemplificó mediante un ensayo de curación (o rasguño) de una herida. Este tipo de ensayo mide la velocidad a la cual las células rellenan un área denudada en una monocapa confluente. La expresión reducida de KAAG1 dio como resultado una reducción de la supervivencia de las líneas celulares de cáncer de ovario, según se midió utilizando un ensayo clonogénico, tal como un ensayo de supervivencia de la colonia. Los expertos en la técnica pueden utilizar otros métodos para evaluar la función de KAAG1 en el comportamiento de células cancerosas, en particular células de cáncer de ovario.
Basándose en la expresión de KAAG1 en una gran proporción de tumores de ovario, su expresión limitada en tejidos normales y una concordancia entre los niveles de expresión y el aumento de la neoplasia, así como también una posible función biológica de KAAG1 en el comportamiento de líneas celulares de cáncer de ovario, se seleccionó KAAG1 como diana terapéutica para el desarrollo de anticuerpos para la detección, prevención y tratamiento del cáncer de ovario. La expresión de KAAG1 en diferentes tipos de cáncer, distintos al cáncer de ovario, llevó a la Solicitante a evaluar también anticuerpos terapéuticos o diagnósticos para otras indicaciones de cáncer.
Por consiguiente, la presente invención proporciona anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno de estos que actúan específicamente sobre la diana KAAG1 y que se pueden utilizar, por ejemplo, como un conjugado de anticuerpo-fármaco.
Tales anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno incluyen, por ejemplo, anticuerpos monoclonales, anticuerpos policlonales, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados, fragmentos de anticuerpos, anticuerpos de cadena única, anticuerpos de dominios y polipéptidos que contienen una región de unión al antígeno.
Anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno que se unen a KAAG1
Los anticuerpos se aislaron inicialmente a partir de colecciones de Fab para determinar su especificidad frente al antígeno de interés.
Las regiones variables de los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno que se describen en la presente se pueden fusionar con regiones constantes de una especie deseada, de este modo se permite el reconocimiento del anticuerpo por las células efectoras de la especie deseada. La región constante se puede originar, por ejemplo, a partir de un subtipo IgG1, IgG2, IgG3 o IgG4. La clonación o síntesis de una región constante en fase con una región variable se encuentra dentro de las competencias de un experto en la técnica y se puede llevar a cabo, por ejemplo, mediante tecnología de ADN recombinante. Por lo tanto, los anticuerpos que comprenden una región constante de un anticuerpo humano, así como también los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno que comprenden aminoácidos marco de un anticuerpo humano, también se engloban en la presente invención.
Por consiguiente, la presente invención proporciona, en una realización ilustrativa, un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno aislado que comprende una región variable de la cadena ligera que contiene:
a.
una secuencia de CDRL1 que comprende la SEQ ID NO.:8 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:8;
b.
una secuencia de CDRL2 que comprende la SEQ ID NO.:9 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:9; y
c.
una secuencia de CDRL3 que comprende la SEQ ID NO.:10 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:10; y una región variable de la cadena pesada que contiene:
d.
una secuencia de CDRH1 que comprende la SEQ ID NO.:5 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:5;
e.
una secuencia de CDRH2 que comprende la SEQ ID NO.:6 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:6; y
f.
una secuencia de CDRH3 que comprende la SEQ ID NO.:7 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:7.
En la presente también se describe un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno aislado que comprende una región variable de la cadena ligera que contiene:
a.
una secuencia de CDRL1 que comprende la SEQ ID NO.:8 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:8;
b.
una secuencia de CDRL2 que comprende la SEQ ID NO.:9 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:9; y
c.
una secuencia de CDRL3 que comprende la SEQ ID NO.:10 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:10.
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno aislado también puede comprender una región variable de la cadena pesada que contenga:
a.
una secuencia de CDRH1 que comprende la SEQ ID NO.:5 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:5;
b.
una secuencia de CDRH2 que comprende la SEQ ID NO.:6 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:6; o
c.
una secuencia de CDRH3 que comprende la SEQ ID NO.:7 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:7.
En una divulgación ilustrativa, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender cualquier CDR individual o una combinación de CDR1, CDR2 y/o CDR3 de la región variable de la cadena ligera. Más concretamente, se puede seleccionar la CDR3. La combinación puede incluir, por ejemplo, CDRL1 y CDRL3; CDRL1 y CDRL2; CDRL2 y CDRL3; y CDRL1, CDRL2 y CDRL3.
En otra divulgación ilustrativa, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender cualquier CDR individual o una combinación de CDR1, CDR2 y/o CDR3 de la región variable de la cadena pesada. Más concretamente, se puede seleccionar la CDR3. La combinación puede incluir, por ejemplo, CDRH1 y CDRH3; CDRH1 y CDRH2; CDRH2 y CDRH3; y CDRH1, CDRH2 y CDRH3.
De acuerdo con la presente divulgación, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender al menos dos CDR de una CDRL1, una CDRL2 o una CDRL3.
También de acuerdo con la presente invención, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender una CDRL1, una CDRL2 y una CDRL3.
Además, de acuerdo con la presente divulgación, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender:
a.
al menos dos CDR de una CDRL1, CDRL2 o CDRL3; y
b.
al menos dos CDR de una CDRH1, CDRH2 o CDRH3.
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender más preferentemente una CDRL1, una CDRL2 y una CDRL3.
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno también puede comprender más preferentemente una CDRH1, una CDRH2 y una CDRH3.
De acuerdo con la presente divulgación, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender una CDRH1, una CDRH2 o una CDRH3.
De acuerdo con la presente invención, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno también puede comprender una CDRH1, una CDRH2 y una CDRH3.
Cuando solo hay disponible una de las siguientes: la región variable de la cadena ligera o la región variable de la cadena pesada, un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno se puede reconstituir realizando un cribado de una
colección de regiones variables complementarias utilizando métodos conocidos en la técnica (Portolano et al. The Journal of Immunology (1993) 150:880-887, Clarkson et al., Nature (1991) 352:624-628).
En la presente divulgación también se engloban polipéptidos o anticuerpos que comprenden cadenas variables con al menos una sustitución conservativa de un aminoácido en al menos una de las CDR descritas en la presente (en comparación con la CDR original).
La presente divulgación también engloba polipéptidos o anticuerpos que comprenden cadenas variables con al menos una sustitución conservativa de un aminoácido en al menos dos de las CDR (en comparación con las CDR originales).
La presente divulgación también engloba polipéptidos o anticuerpos que comprenden cadenas variables con al menos una sustitución conservativa de un aminoácido en las 3 CDR (en comparación con las CDR originales).
La presente divulgación también engloba polipéptidos o anticuerpos que comprenden cadenas variables con al menos dos sustituciones conservativas de aminoácidos en al menos una de las CDR (en comparación con las CDR originales).
La presente divulgación también engloba polipéptidos o anticuerpos que comprenden cadenas variables con al menos dos sustituciones conservativas de aminoácidos en al menos dos de las CDR (en comparación con las CDR originales).
La presente divulgación también engloba polipéptidos o anticuerpos que comprenden cadenas variables con al menos dos sustituciones conservativas de aminoácidos en las 3 CDR (en comparación con las CDR originales).
En otro aspecto, la presente divulgación se refiere a un polipéptido, anticuerpo o fragmento de unión al antígeno que comprende (en una única cadena polipeptídica o en cadenas polipeptídicas diferentes) al menos una región determinante de la complementariedad de una región variable de la cadena ligera y al menos una región determinante de la complementariedad de una región variable de la cadena pesada de uno de los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno descritos en la presente.
La presente invención se refiere, en otro de sus aspectos, a anticuerpos anti-KAAG1 que pueden comprender (en una única cadena polipeptídica o en cadenas polipeptídicas diferentes) las seis regiones determinantes de la complementariedad (CDR) del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la invención.
Anticuerpos y fragmentos de unión al antígeno variantes
La presente invención también engloba variantes de los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno descritos en la presente. Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno variantes incluidos son aquellos que contienen una variación en la secuencia de aminoácidos. Por ejemplo, los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno variantes que se describen en la presente son aquellos que contienen al menos una CDR variante (dos, tres, cuatro, cinco o seis CDR variantes o incluso doce CDR variantes), los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno variantes que se describen en la presente o de la invención son aquellos que contienen una región variable de la cadena ligera variante, una región variable de la cadena pesada variante, una cadena ligera variante y/o una cadena pesada variante. Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno variantes incluidos en la presente invención son aquellos que presentan, por ejemplo, una afinidad de unión mejorada o similar en comparación con el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno original.
El término "variante", tal como se utiliza en la presente, se aplica a cualquiera de las secuencias descritas en la presente e incluye, por ejemplo, una CDR variante (ya sea CDRL1, CDRL2, CDRL3, CDRH1, CDRH2 y/o CDRH3), una región variable de la cadena ligera variante, una región variable de la cadena pesada variante, una cadena ligera variante, una cadena pesada variante, un anticuerpo variante, un fragmento de unión al antígeno variante y una variante de KAAG1.
Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno variantes englobados en la presente invención son aquellos que pueden comprender una inserción, una deleción o una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa). Estas variantes pueden presentar una eliminación de al menos un residuo aminoacídico en su secuencia de aminoácidos y una inserción en su lugar de un residuo diferente.
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención puede contener una región variable de la cadena ligera y/o una región variable de la cadena pesada según se ha descrito anteriormente y puede comprender además aminoácidos de una región constante tales como, por ejemplo, aminoácidos de una región constante de un anticuerpo humano.
En una realización ilustrativa, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención puede comprender, por ejemplo, una región constante de IgG1 humana.
De acuerdo con otra realización ilustrativa de la invención, el fragmento de unión al antígeno puede ser por ejemplo, un scFv, un Fab, un Fab' o un (Fab')2.
Un sitio de interés para la mutagénesis de sustitución incluye las regiones hipervariables (CDR), pero también se contemplan modificaciones en la región marco o incluso la región constante. Las sustituciones conservativas se pueden llevar a cabo intercambiando un aminoácido (de una CDR, cadena variable, anticuerpo, etc.) de uno de los grupos que se enumeran más adelante (grupo 1 a 6) por otro aminoácido del mismo grupo.
Otras realizaciones ilustrativas de sustituciones conservativas se muestran en la Tabla 1A con el título "sustituciones preferidas". Si tales sustituciones dan como resultado una propiedad indeseada, se pueden introducir entonces cambios más sustanciales, que se denominan "sustituciones ilustrativas" en la Tabla 1A, o como se describen adicionalmente más adelante cuando se hace referencia a las clases de aminoácidos, y los productos se pueden someter a un cribado.
Existe constancia en la técnica de que se pueden generar variantes mediante mutagénesis de sustitución y conservar la actividad biológica de los polipéptidos de la presente invención. Estas variantes presentan una eliminación de al menos un residuo aminoacídico en la secuencia de aminoácidos y una inserción en su lugar de un residuo diferente. Por ejemplo, un sitio de interés para la mutagénesis de sustitución puede incluir un sitio en el que los residuos particulares obtenidos de varias especies sean idénticos. En la Tabla 1A se muestran ejemplos de sustituciones identificadas como "sustituciones conservativas". Si tales sustituciones dan como resultado un cambio no deseado, se introducen entonces otro tipo de sustituciones, que se denominan "sustituciones ilustrativas" en la Tabla 1A, o como se describen adicionalmente en la presente cuando se hace referencia a las clases de aminoácidos, y los productos se someten a un cribado.
Las modificaciones sustanciales en cuanto a la función o identidad inmunológica se llevan a cabo seleccionando sustituciones que difieran de forma significativa en su efecto a la hora de mantener (a) la estructura del esqueleto polipeptídico en el área de la sustitución, por ejemplo, como una conformación de hélice o lámina; (b) la carga de hidrofobicidad de la molécula en el sitio diana, o (c) el volumen de la cadena lateral. Los residuos de origen natural se dividen en grupos basándose en las propiedades comunes de las cadenas laterales: (grupo 1) hidrófobos: norleucina, metionina (Met), alanina (Ala), valina (Val), leucina (Leu), isoleucina (Ile) (grupo 2) hidrófilos neutros: cisteína (Cys), serina (Ser), treonina (Thr) (grupo 3) ácidos: ácido aspártico (Asp), ácido glutámico (Glu) (grupo 4) básicos: asparagina (Asn), glutamina (Gln), histidina (His), lisina (Lys), arginina (Arg) (grupo 5) residuos que influyen sobre la orientación de la cadena: glicina (Gly), prolina (Pro); y (grupo 6) aromáticos: triptófano (Trp), tirosina (Tyr), fenilalanina (Phe)
Las sustituciones no conservativas implicarán intercambiar un miembro de una de estas clases por otro.
Tabla 1A. Sustitución de aminoácidos
Residuo original
Sustitución ilustrativa Sustitución conservativa
Ala (A)
Val, Leu, Ile Val
Arg (R)
Lys, Gln, Asn Lys
Asn (N)
Gln, His, Lys, Arg, Asp Gln
Asp (D)
Glu, Asn Glu
Cys (C)
Ser, Ala Ser
Gln (Q)
Asn, Glu Asn
Glu (E)
Asp, Gln Asp
Gly (G)
Ala Ala
His (H)
Asn, Gln, Lys, Arg Arg
Ile (I)
Leu, Val, Met, Ala, Phe, norleucina Leu
Leu (L)
Norleucina, Ile, Val, Met, Ala, Phe Ile
Lys (K)
Arg, Gln, Asn Arg
Met (M)
Leu, Phe, Ile Leu
Phe (F)
Leu, Val, Ile, Ala, Tyr Tyr
Pro (P)
Ala Ala
Ser (S)
Thr Thr
Thr (T)
Ser Ser
Trp (W)
Tyr, Phe Tyr
Tyr (Y)
Trp, Phe, Thr, Ser Phe
Val (V)
Ile, Leu, Met, Phe, Ala, norleucina Leu
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante puede presentar una identidad secuencial y/o similitud secuencial sustancial en su secuencia de aminoácidos en comparación con la secuencia de aminoácidos del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno original. El grado de similitud entre dos secuencias se basa en el porcentaje de identidades (aminoácidos idénticos) y de sustitución conservativa.
En general, el grado de similitud e identidad entre cadenas variables se ha determinado en la presente utilizando el programa de secuencias Blast2 (Tatiana A. Tatusova, Thomas L. Madden (1999), "Blast 2 sequences -a new tool for comparing protein and nucleotide sequences", FEMS Microbiol Lett. 174:247-250) utilizando los parámetros por defecto, es decir, el programa blastp, la matriz BLOSUM62 (penalización por abrir huecos de 11 y penalización por extensión de huecos de 1; gapx dropoff de 50, esperanza de 10.0, tamaño de palabra de 3) y filtros activados.
Por consiguiente, el porcentaje de identidad será indicativo de los aminoácidos que son idénticos en comparación con el péptido original y que pueden ocupar una posición similar o idéntica.
El porcentaje de similitud será indicativo de los aminoácidos que son idénticos y de aquellos que han sido reemplazados con sustitución conservativa de aminoácidos en comparación con el péptido original en una posición similar o idéntica.
Por consiguiente, las variantes de la presente invención comprenden aquellas que pueden presentar una identidad secuencial de al menos un 70%, 75%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
Las realizaciones ilustrativas de variantes son aquellas que presentan una identidad secuencial de al menos un 81% con una secuencia descrita en la presente y una similitud secuencial de un 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
Otras realizaciones ilustrativas de variantes son aquellas que presentan una identidad secuencial de al menos un 82% con una secuencia descrita en la presente y una similitud secuencial de un 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
Otras realizaciones ilustrativas de variantes son aquellas que presentan una identidad secuencial de al menos un 85% con una secuencia descrita en la presente y una similitud secuencial de un 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
Otras realizaciones ilustrativas de variantes son aquellas que presentan una identidad secuencial de al menos un 90% con una secuencia descrita en la presente y una similitud secuencial de un 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
Otras realizaciones ilustrativas de variantes son aquellas que presentan una identidad secuencial de al menos un 95% con una secuencia descrita en la presente y una similitud secuencial de un 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
Otras realizaciones ilustrativas más de variantes son aquellas que presentan una identidad secuencial de al menos un 97% con una secuencia descrita en la presente y una similitud secuencial de un 97%, 98%, 99% o 100% con una secuencia original o una porción de una secuencia original.
A efectos de concisión, la solicitante proporciona en la presente una Tabla 1B que ilustra las realizaciones ilustrativas de variantes individuales englobadas en la presente invención y que comprende el % de identidad secuencial y el % de similitud secuencial especificados. Se debe interpretar que cada "X" define una variante determinada.
Porcentaje (%) de identidad secuencial
100 X
99
X X
98
X X X
97
X X X X
96
X X X X X
95
X X X X X X
94
X X X X X X X
93
X X X X X X X X
92
X X X X X X X X X
91
X X X X X X X X X X
90
X X X X X X X X X X X
89
X X X X X X X X X X X X
88
X X X X X X X X X X X X X
87
X X X X X X X X X X X X X X
86
X X X X X X X X X X X X X X X
85
X X X X X X X X X X X X X X X X
84
X X X X X X X X X X X X X X X X X
83
X X X X X X X X X X X X X X X X X X
82
X X X X X X X X X X X X X X X X X X X
81
X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X
80
X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X X
Tabla 1B
80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100
Porcentaje (%) de similitud secuencial
La presente divulgación engloba CDR, regiones variables de la cadena ligera, regiones variables de la cadena pesada, cadenas ligeras, cadenas pesadas, anticuerpos y/o fragmentos de unión al antígeno que comprenden una identidad de al menos un 80% con la secuencia descrita en la presente.
Las realizaciones ilustrativas del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención son aquellas que comprenden una región variable de la cadena ligera que comprende una secuencia con una identidad de al menos un 70%, 75%, 80% con la SEQ ID NO.:4.
Esta región variable de la cadena ligera que se describe en la presente puede comprender una secuencia de CDRL1 con una identidad de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:8, una secuencia de CDRL2 con una identidad de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:9 y una secuencia de CDRL3 con una identidad de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:10.
En una divulgación ilustrativa, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRL1 que puede presentar una identidad de al menos un 90% con la SEQ ID NO.:8.
En otra divulgación ilustrativa, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRL1 que puede presentar una identidad de un 100% con la SEQ ID NO.:8.
En otra divulgación ilustrativa, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRL2 que presente una identidad de al menos un 90% con la SEQ ID NO.:9.
En otra divulgación ilustrativa más, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRL2 que puede presentar una identidad de un 100% con la SEQ ID NO.:9.
En otra divulgación ilustrativa, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRL3 que puede presentar una identidad de al menos un 90% con la SEQ ID NO.:10.
En una divulgación ilustrativa adicional, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRL3 que puede presentar una identidad de un 100% con la SEQ ID NO.:10.
En una realización ilustrativa, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede comprender una región variable de la cadena pesada que comprenda una secuencia con una identidad de al menos un 70%, 75%, 80% con la SEQ ID NO.:2.
Estas regiones variables de la cadena pesada que se describen en la presente comprenden una secuencia de CDRH1 con una identidad de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:5, una secuencia de CDRH2 con una identidad de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:6 y una secuencia de CDRH3 con una identidad de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:7.
En una divulgación ilustrativa, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRH1 que puede presentar una identidad de al menos un 90% con la SEQ ID NO.:5.
En otra divulgación ilustrativa, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRH1 que puede presentar una identidad de un 100% con la SEQ ID NO.:5.
En otra divulgación ilustrativa más, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRH2 que puede presentar una identidad de al menos un 90% con la SEQ ID NO.:6.
En una divulgación ilustrativa adicional, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRH2 que puede presentar una identidad de un 100% con la SEQ ID NO.:6.
En una divulgación ilustrativa adicional más, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRH3 que puede presentar una identidad de al menos un 90% con la SEQ ID NO.:7.
En una divulgación ilustrativa adicional, cualquiera de los anticuerpos proporcionados en la presente puede comprender una secuencia de CDRH3 que puede presentar una identidad de un 100% con la SEQ ID NO.:7.
En algunos casos, la región variable de la cadena pesada del anticuerpo variante puede comprender deleciones o adiciones de aminoácidos (combinadas o no con sustituciones de aminoácidos). A menudo se pueden tolerar 1, 2, 3, 4 o 5 deleciones o adiciones de aminoácidos.
Las realizaciones ilustrativas de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante incluyen aquellos que contienen una región variable de la cadena ligera como la que se expone en la SEQ ID NO.:30: SEQ ID NO.:30
donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:4. La sustitución del aminoácido puede ser, por ejemplo, un aminoácido que se encuentra en la posición correspondiente de un anticuerpo humano natural o un anticuerpo humano consenso. La sustitución del aminoácido
puede ser, por ejemplo, conservativa.
Otra realización ilustrativa de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante incluye aquellos que contienen una región variable de la cadena ligera como la que se expone en la SEQ ID NO.:31: SEQ ID NO.:31
donde Xa1 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xa2 puede ser A o P; donde Xa3 puede ser un aminoácido hidrófilo neutro; donde Xa4 puede ser L o P; donde Xa5 puede ser un aminoácido ácido; donde Xa6 puede ser Q o P; donde Xa7 puede ser un aminoácido básico; donde Xa8 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xa9 puede ser A o Q; donde Xa10 puede ser un aminoácido básico; o donde Xa11 puede ser un aminoácido hidrófobo, donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:4.
Una realización ilustrativa adicional de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante incluye aquellos que contienen una región variable de la cadena ligera como la que se expone en la SEQ ID NO.:32: SEQ ID NO.:32
donde XA1 puede ser V o I donde XA2 puede ser A o P donde XA3 puede ser S o T donde XA4 puede ser L o P donde XA5 puede ser D o E donde XA6 puede ser Q o P donde XA7 puede ser K o Q donde XA8 puede ser L o V donde XA9 puede ser A o Q donde XA10 puede ser R o K, o donde XA11 puede ser L o I, donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:4.
De acuerdo con una realización, la variante del dominio variable de la cadena ligera puede tener una secuencia como la que se expone en la SEQ ID NO.:33 o 34: SEQ ID NO.:33
SEQ ID NO.:34
Las realizaciones ilustrativas de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante incluyen aquellos que contienen una región variable de la cadena pesada como la que se expone en la SEQ ID NO.:35: SEQ ID NO.:35
donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ 10
ID NO.:2. La sustitución del aminoácido puede ser, por ejemplo, un aminoácido que se encuentra en la posición correspondiente de un anticuerpo humano natural o un anticuerpo humano consenso. La sustitución del aminoácido puede ser, por ejemplo, conservativa.
Otra realización ilustrativa de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante incluye aquellos que contienen una región variable de la cadena pesada como la que se expone en la SEQ ID NO.:36: SEQ ID NO.:36
donde Xb1 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb2 puede ser P o A; donde Xb3 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb4 puede ser V o K; donde Xb5 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb6 puede ser un aminoácido básico; donde Xb7 puede ser S o A; donde Xb8 puede ser H o P; donde Xb9 puede ser un aminoácido básico; donde Xb10 puede ser S o G; donde Xb11 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb12 puede ser un aminoácido básico; donde Xb13 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb14 puede ser I o T; donde Xb15 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb16 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb17 puede ser K o T; donde Xb18 puede ser un aminoácido hidrófilo neutro; donde Xb19 puede ser Q o E; donde Xb20 puede ser N o S; donde Xb21 puede ser T o R; donde Xb22 puede ser un aminoácido hidrófilo neutro; o donde Xb23 puede ser S o L; donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:2.
Una realización ilustrativa adicional de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno variante incluye aquellos que contienen una región variable de la cadena pesada como la que se expone en la SEQ ID NO.:37: SEQ ID NO.:37
donde XB1 puede ser I o V; donde XB2 puede ser P o A; donde XB3 puede ser M o V; donde XB4 puede ser V o K; donde XB5 puede ser M o V; donde XB6 puede ser K o R; donde XB7 puede ser S o A; donde XB8 puede ser H o P; donde XB9 puede ser K o Q; donde XB10 puede ser S o G; donde XB11 puede ser I o M; donde XB12 puede ser K o R; donde XB13 puede ser A o V; donde XB14 puede ser I o T; donde XB15 puede ser L o I; donde XB16 puede ser V o A; donde XB17 puede ser K o T; donde XB18 puede ser S o T; donde XB19 puede ser Q o E; donde XB20 puede ser N o S;
donde XB21 puede ser T o R; donde XB22 puede ser S o T; o donde XB23 es S o L, donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:2.
De acuerdo con una realización, la variante del dominio variable de la cadena pesada puede tener una secuencia como la que se expone en cualquiera de las SEQ ID NO.:38 a 41: SEQ ID NO.:38
SEQ ID NO.:39
SEQ ID NO.:40
SEQ ID NO.:41
Producción de los anticuerpos en células
Los anticuerpos anti-KAAG1 que se describen en la presente se pueden preparar mediante varios métodos con los cuales estarán familiarizados los expertos en la técnica tales como la metodología de hibridomas o mediante métodos de ADN recombinante.
En una realización ilustrativa de la invención, se puede producir un anticuerpo anti-KAAG1 mediante la tecnología convencional de hibridomas, donde se inmuniza a un ratón con un antígeno, se aíslan las células del bazo y se fusionan con células de mieloma que carecen de expresión para HGPRT y células híbridas seleccionadas por medios que contengan hipoxantina, aminopterina y timina (HAT).
En una realización ilustrativa adicional de la invención, los anticuerpos anti-KAAG1 se pueden producir mediante métodos de ADN recombinante.
Con el fin de expresar los anticuerpos anti-KAAG1, las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente o cualquier otra se pueden insertar en un vector de expresión, es decir, un vector que contenga elementos para el control de la transcripción y la traducción de la secuencia codificante insertada en un huésped particular. Estos elementos pueden incluir secuencias reguladoras, tales como potenciadores, promotores constitutivos e inducibles, y regiones no traducidas 5' y 3'. Para construir tales vectores de expresión, se pueden utilizar métodos con los cuales estarán familiarizados los expertos en la técnica. Estos métodos incluyen técnicas de ADN recombinante in vitro, técnicas sintéticas y recombinación genética in vivo.
Se pueden utilizar varios sistemas de vector de expresión/célula huésped conocidos por los expertos en la técnica para expresar un polipéptido o ARN derivado de secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente. Estos incluyen, sin carácter limitante, microorganismos tales como bacterias transformadas con vectores de expresión de ADN que sean cósmidos, plásmidos
o bacteriófagos recombinantes; levadura transformada con vectores de expresión de levadura; sistemas de células de insectos infectadas con vectores de baculovirus; sistemas de células vegetales transformadas con vectores de expresión víricos o bacterianos; o sistemas de células animales. Para la producción a largo plazo de proteínas recombinantes en sistemas mamíferos, se puede llevar a cabo la expresión estable en líneas celulares. Por ejemplo, las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente se pueden transformar en líneas celulares utilizando vectores de expresión que pueden contener orígenes víricos de replicación y/o elementos de expresión endógena y un gen marcador seleccionable o visible en el mismo vector o en un vector diferente. La invención no está limitada por el vector o la célula huésped utilizada. En ciertas realizaciones de la presente invención, las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una
cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada de un anticuerpo de la invencion pueden estar ligadas, cada una de ellas, a un vector de expresión diferente y cada cadena se puede expresar de forma separada. En otra realización, tanto la cadena ligera como la cadena pesada capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada de un anticuerpo de la invencion pueden estar ligadas a un único vector de expresión y expresarse de forma simultánea.
Como alternativa, el ARN y/o polipéptido se puede expresar a partir de un vector que comprenda secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente utilizando un sistema de transcripción in vitro o un sistema acoplado de transcripción/traducción in vitro, respectivamente.
En general, las células huésped que contienen secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente y/o que expresan un polipéptido codificado por las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente, o una de sus porciones, se pueden identificar mediante varios procedimientos conocidos por los expertos en la técnica. Estos procedimientos incluyen, sin carácter limitante, hibridaciones de ADN/ADN o ADN/ARN, amplificación de PCR y bioensayo de proteínas o técnicas de inmunoensayos que incluyan tecnologías basadas en membranas, soluciones o chips para la detección y/o cuantificación de secuencias de aminoácidos o ácidos nucleicos. Los métodos inmunológicos para detectar y medir la expresión de polipéptidos utilizando anticuerpos monoclonales o policlonales específicos son conocidos en la técnica. Los ejemplos de estas técnicas incluyen los ensayos por inmunoabsorción ligados a enzimas (ELISA), radioinmunoensayos (RIA) y la clasificación de células activada por fluorescencia (FACS). Los expertos en la técnica podrán adaptar fácilmente estas metodologías a la presente invención.
Por lo tanto, las células huésped que comprenden las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente se pueden cultivar en condiciones adecuadas para la transcripción del ARN correspondiente (ARNm, etc.) y/o la expresión del polipéptido a partir del cultivo celular. El polipéptido producido por una célula puede ser secretado o retenido intracelularmente dependiendo de la secuencia y/o el vector utilizado. En una realización ilustrativa, los vectores de expresión que contienen las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada de un anticuerpo de la invención se pueden diseñar para que contengan secuencias señal que dirijan la secreción del polipéptido a través de la membrana de una célula eucariota o procariota.
Debido a la degeneración inherente del código genético, se pueden producir y utilizar otras secuencias de ADN que codifiquen una secuencia de aminoácidos igual, sustancialmente igual o funcionalmente equivalente, por ejemplo, para expresar un polipéptido codificado por las secuencias de nucleótidos capaces de codificar una cualquiera de las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada que se describen en la presente. Las secuencias de nucleótidos de la presente invención se pueden modificar utilizando métodos de uso común en la técnica para alterar las secuencias de nucleótidos con varios fines, que incluyen, sin carácter limitante, la modificación de la clonación, el procesamiento y/o la expresión del producto génico. Para modificar las secuencias de nucleótidos, se puede utilizar la transposición de secuencias de ADN mediante fragmentación aleatoria y reacoplamiento por PCR de fragmentos génicos y oligonucleótidos sintéticos. Por ejemplo, la mutagénesis dirigida a un sitio y mediada por oligonucleótidos se puede utilizar para introducir mutaciones que creen sitios de restricción nuevos, alteren los patrones de glicosilación, modifiquen la preferencia de los codones, produzcan variantes de empalme, etc.
Además, se puede seleccionar una cepa de células huésped por su capacidad para modular la expresión de las secuencias insertadas o para procesar el polipéptido expresado del modo deseado. Tales modificaciones del polipéptido incluyen, sin carácter limitante, acetilación, carboxilación, glicosilación, fosforilación, lipidación y acilación. En una realización ilustrativa, se pueden desear anticuerpos anti-KAAG1 que contengan patrones o estructuras de glicosilación particulares. También se puede utilizar un procesamiento tras la traducción que escinda una forma "prepro" del polipéptido para especificar la diana, el plegamiento y/o la actividad de la proteína. Existen diferentes células huésped que tienen una maquinaria celular específica y mecanismos característicos para las actividades tras la traducción (p. ej., CHO, HeLa, MDCK, HEK293 y W138) que se pueden adquirir de proveedores comerciales y de la Colección Americana de Cultivos Tipo (ATCC, por sus siglas en inglés) y se pueden seleccionar para garantizar la correcta modificación y procesamiento del polipéptido expresado.
Los expertos en la técnica se darán cuenta fácilmente de que las secuencias de ácidos nucleicos naturales, modificadas
o recombinantes se pueden ligar a una secuencia heteróloga para dar como resultado la traducción de un polipéptido de fusión que contenga restos polipeptídicos heterólogos en cualquiera de los sistemas huéspedes mencionados anteriormente. Tales restos polipeptídicos heterólogos pueden facilitar la purificación de los polipéptidos de fusión utilizando matrices de afinidad que se pueden adquirir de proveedores comerciales. Tales restos incluyen, sin carácter limitante, glutationa-S-transferasa (GST), proteína de unión a maltosa, tiorredoxina, péptido de unión a calmodulina, 6-His (His), FLAG, c-myc, hemaglutinina (HA) y epítopos de anticuerpos tales como epítopos de anticuerpos monoclonales.
También se describe un polinucleótido que puede comprender una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína de fusión. La proteína de fusión puede comprender una pareja de fusión (p. ej., HA, Fc, etc.) fusionada con el
polipéptido (p. ej., cadena ligera completa, cadena pesada completa, regiones variables, CDR, etc.) que se describe en la presente.
Los expertos en la técnica también se darán cuenta fácilmente de que las secuencias de polipéptidos y ácidos nucleicos se pueden sintetizar, en parte o en su totalidad, utilizando métodos químicos o enzimáticos de uso común en la técnica. Por ejemplo, la síntesis de péptidos se puede llevar a cabo utilizando varias técnicas y máquinas en fase sólida, por ejemplo, el sintetizador de péptidos ABI 431A (PE Biosystems) se puede utilizar para automatizar la síntesis. Si se desea, la secuencia de aminoácidos se puede alterar durante la síntesis y/o combinar con secuencias de otras proteínas para producir una proteína variante.
Conjugados de anticuerpos
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención se puede conjugar con un resto detectable (es decir, a efectos de detección o diagnóstico) o con un resto terapéutico (a efectos terapéuticos).
Un "resto detectable" es un resto que se puede detectar por medios espectroscópicos, fotoquímicos, bioquímicos, inmunoquímicos, químicos y/u otros medios físicos. El resto detectable se puede acoplar ya sea directa y/o indirectamente (por ejemplo, mediante un conector tal como, sin carácter limitante, un conector de tipo DOTA o NHS) a los anticuerpos y sus fragmentos de unión al antígeno de la presente invención utilizando métodos de uso común en la técnica. Se puede utilizar una amplia variedad de restos detectables y la selección dependerá de la sensibilidad requerida, la facilidad de conjugación, los requisitos de estabilidad y la instrumentación disponible. Un resto detectable adecuado incluye, sin carácter limitante, una marca fluorescente, una marca radioactiva (por ejemplo, sin carácter limitante, 125I, In111, Tc99, I131 e incluidos los isótopos de emisión de positrones para el escáner de tipo PET, etc.), una marca activa en resonancia magnética nuclear, una marca luminiscente, una marca quimioluminiscente, una marca cromófora, una marca enzimática (por ejemplo, sin carácter limitante, peroxidasa de rábano picante, fosfatasa alcalina, etc.), puntos cuánticos y/o una nanopartícula. El resto detectable puede provocar y/o producir una señal detectable y de este modo se puede detectar una señal procedente del resto detectable.
En otra realización ilustrativa de la invención, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este se puede acoplar (modificar) con un resto terapéutico (p. ej., un fármaco, resto citóxico, agente contra el cáncer).
En una realización ilustrativa, los anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno pueden comprender un agente quimioterapéutico, citotóxico o un fármaco contra el cáncer (p. ej., una molécula de bajo peso molecular). Tales agentes quimioterapéuticos o citotóxicos incluyen, sin carácter limitante, itrio-90, escandio-47, renio-186, yodo-131, yodo-125 y muchos otros conocidos por los expertos en la técnica (p. ej., lutenio (p. ej., Lu177), bismuto (p. ej., Bi213), cobre (p. ej., Cu67)). En otros casos, el agente quimioterapéutico, citotóxico o fármaco contra el cáncer puede comprender, entre otros conocidos por los expertos en la técnica, 5-fluorouracilo, adriamicina, irinotecán, taxanos, endotoxinas de pseudomonas, ricina, auristatinas (p. ej., auristatina monometílica E, auristatina monometílica F), maitansinoides (p. ej., mertansina) y otras toxinas.
Como alternativa, con el fin de llevar a cabo los métodos de la presente invención y según es sabido en la técnica, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención (conjugado o no) se puede utilizar combinado con una segunda molécula (p. ej., un anticuerpo secundario, etc.) que sea capaz de unirse específicamente al anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención y que puede contener un resto detectable, diagnóstico o terapéutico deseable.
Composiciones farmacéuticas de los anticuerpos y su uso
Las composiciones farmacéuticas de los anticuerpos anti-KAAG1 o fragmentos de unión al antígeno (conjugados o no) también se engloban en la presente invención. La composición farmacéutica puede comprender un anticuerpo anti-KAAG1 o un fragmento de unión al antígeno y también puede contener un portador farmacéuticamente aceptable.
Otros aspectos de la invención se refieren a una composición que puede comprender el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno que se describe en la presente y un portador.
La presente invención también se refiere a una composición farmacéutica que puede comprender el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno que se describe en la presente y un portador farmacéuticamente aceptable.
Además de los principios activos, una composición farmacéutica puede contener portadores farmacéuticamente aceptables que comprenden agua, PBS, soluciones salinas, gelatinas, aceites, alcoholes y otros excipientes y auxiliares que faciliten el procesamiento de los compuestos activos para obtener preparados que se puedan utilizar farmacéuticamente. En otros casos, tales preparados se pueden esterilizar.
La expresión "composición farmacéutica", tal como se utiliza en la presente, se refiere a cantidades terapéuticamente eficaces del agente junto con diluyentes, conservantes, solubilizantes, emulsionantes, adyuvantes y/o portadores farmacéuticamente aceptables. Una "cantidad terapéuticamente eficaz", tal como se utiliza en la presente, se refiere a aquella cantidad que proporciona un efecto terapéutico para una afección y un régimen de administración determinados. Tales composiciones son líquidos o formulaciones liofilizadas o secadas de otro modo e incluyen diluyentes con
diferentes contenidos de tampones (p. ej., Tris-HCl, acetato, fosfato), pH y fuerza iónica, aditivos tales como albúmina o gelatina para evitar la absorción a las superficies, detergentes (p. ej., Tween 20, Tween 80, Pluronic F68, sales de ácidos biliares), agentes solubilizantes (p. ej., glicerol, polietilenglicerol), antioxidantes (p. ej., ácido ascórbico, metabisulfito sódico), conservantes (p. ej., timerosal, alcohol bencílico, parabenos), agentes volumétricos o modificadores de la tonicidad (p. ej., lactosa, manitol), unión covalente de polímeros tales como polietilenglicol a la proteína, complejación con iones metálicos o incorporación del material en o sobre preparados particulados de compuestos poliméricos tales como ácido poliláctico, ácido poliglicólico, hidrogeles, etc., o sobre liposomas, microemulsiones, micelas, vesículas unilamelares o multilamelares, eritrocitos fantasma o esferoplastos. Tales composiciones influirán sobre el estado físico, la solubilidad, la estabilidad, la tasa de liberación in vivo y la tasa de aclaramiento in vivo. Las composiciones de liberación controlada o sostenida incluyen una formulación en soportes lipófilos (p. ej., ácidos grasos, ceras, aceites). También se engloban en la invención composiciones particuladas recubiertas con polímeros (p. ej., poloxámeros o poloxaminas). Otras realizaciones de las composiciones de la invención incorporan recubrimientos protectores de formas particuladas, inhibidores de proteasas o potenciadores de la permeación para varias vías de administración, que incluyen la vía parenteral, pulmonar, nasal, oral, vaginal y rectal. En una realización, la composición farmacéutica se administra por vía parenteral, paracanceral, transmucosa, transdérmica, intramuscular, intravenosa, intradérmica, subcutánea, intraperitoneal, intraventricular, intracraneal e intratumoral.
Además, las expresiones "portador farmacéuticamente aceptable" o "portador farmacéutico", tal como se utilizan en la presente, son conocidas en la técnica e incluyen, sin carácter limitante, tampón de fosfato 0.01-0.1 M o 0.05 M o solución salina al 0.8%. De forma adicional, tales portadores farmacéuticamente aceptables pueden ser soluciones, suspensiones y emulsiones acuosas o no acuosas. Algunos ejemplos de disolventes no acuosos son propilenglicol, polietilenglicol, aceites vegetales tales como aceite de oliva, y ésteres orgánicos inyectables tales como oleato de etilo. Los portadores acuosos incluyen agua, soluciones, emulsiones o suspensiones acuosas/de alcoholes, incluidos los medios salinos y tamponados. Los vehículos parenterales incluyen solución de cloruro sódico, dextrosa de Ringer, cloruro sódico y dextrosa, lactato de Ringer o aceites fijos. Los vehículos intravenosos incluyen reponedores de nutrientes y fluidos, reponedores de electrolitos tales como los basados en la dextrosa de Ringer y similares. También puede haber conservantes y otros aditivos presentes tales como, por ejemplo, agentes antimicrobianos, antioxidantes, agentes adherentes, gases inertes y similares.
Para cualquier compuesto, se puede estimar inicialmente la dosis terapéuticamente eficaz en ensayos de cultivos celulares o en modelos con animales tales como ratones, ratas, conejos, perros o cerdos. También se puede utilizar un modelo con animales para determinar el intervalo de concentraciones y la vía de administración. A continuación, esta información se puede utilizar para determinar las dosis y vías de administración útiles en seres humanos. Estas técnicas son de uso común para los expertos en la técnica y una dosis terapéuticamente eficaz se refiere a aquella cantidad de principio activo que mejora los síntomas o una afección. La eficacia terapéutica y la toxicidad se pueden determinar mediante procedimientos farmacéuticos estándar en cultivos celulares o con animales de experimentación, por ejemplo, calculando y contrastando las estadísticas de DE50 (la dosis terapéuticamente eficaz en un 50% de la población) y DL50 (la dosis letal para un 50% de la población). Cualquiera de las composiciones terapéuticas descritas anteriormente se puede aplicar a cualquier sujeto que necesite tal terapia, incluidos, sin carácter limitante, mamíferos tales como perros, gatos, vacas, caballos, conejos, primates y seres humanos.
Las composiciones farmacéuticas utilizadas en esta invención se pueden administrar mediante un número cualquiera de vías, que incluyen, sin carácter limitante, la vía oral, intravenosa, intramuscular, intraarterial, intramedular, intratecal, intraventricular, transdérmica, subcutánea, intraperitoneal, intranasal, enteral, tópica, sublingual o rectal.
El término "tratamiento", a los efectos de esta descripción, se refiere tanto a un tratamiento terapéutico como a medidas profilácticas o preventivas, donde el objetivo es ralentizar (atenuar) la afección o trastorno patológico diana. Los sujetos que necesitan tratamiento incluyen aquellos que ya padecen el trastorno, así como también aquellos propensos a padecer el trastorno o aquellos en los que se ha de prevenir el trastorno. En particular, los sujetos que lo necesitan incluyen sujetos con un nivel elevado de uno o más marcadores del cáncer.
Los anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno de estos pueden tener usos terapéuticos en el tratamiento de varios tipos de cáncer, tales como el cáncer de ovario, cáncer renal, cáncer de colon, cáncer de pulmón, melanoma, etc. En una realización ilustrativa, los anticuerpos y fragmentos tienen usos terapéuticos en el cáncer de ovario. En una realización más particular, el sujeto puede padecer, por ejemplo, un cáncer de ovario recurrente. En otra realización más, el sujeto puede padecer, por ejemplo, un cáncer metastásico.
En ciertos casos, los anticuerpos anti-KAAG1 y los fragmentos pueden bloquear la interacción de KAAG1 con las proteínas a las que se acoplan. Los anticuerpos anti-KAAG1 de la presente invención se pueden utilizar en particular para suministrar un resto terapéutico a una célula que exprese KAAG1.
Los anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno de estos pueden tener usos terapéuticos en el tratamiento de varios tipos de cáncer de ovario. Varios tipos de células diferentes pueden dar lugar a diferentes histotipos de cáncer de ovario. La forma más habitual de cáncer de ovario comprende tumores que se originan en la capa de células epiteliales del ovario o las trompas de Falopio. Tales tipos de cáncer de ovario epitelial incluyen tumores serosos, tumores endometroides, tumores mucinosos, tumores de células claras y tumores frontera. En otras realizaciones, los anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno de estos pueden tener usos en el
tratamiento de otros tipos de cáncer de ovario tales como el cáncer de ovario de los cordones sexuales y las líneas germinales.
En ciertos casos, los anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno de estos se pueden administrar de forma concurrente combinados con otros tratamientos administrados para la misma afección. En este sentido, los anticuerpos se pueden administrar con antimitóticos (p. ej., taxanos), agentes basados en platino (p. ej., cisplatino), agentes que dañan el ADN (p. ej., doxorubicina) y otras terapias contra el cáncer conocidas por los expertos en la técnica. En otros casos, los anticuerpos anti-KAAG1 y fragmentos de unión al antígeno de estos se pueden administrar con otros anticuerpos terapéuticos. Estos incluyen, sin carácter limitante, anticuerpos que tienen como diana EGFR, CD-20 y Her2.
La presente divulgación se refiere, en uno de sus aspectos adicionales, a un método para inhibir el crecimiento de una célula que expresa KAAG1, donde el método puede comprender poner en contacto la célula con una cantidad eficaz del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno que se describe en la presente.
La presente divulgación también engloba un método para tratar el cáncer o inhibir el crecimiento de células que expresan KAAG1 en un mamífero, donde el método puede comprender administrar el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno, por ejemplo, conjugado con un resto terapéutico descrito en la presente a un sujeto que lo necesite.
En otros aspectos, la presente invención proporciona usos terapéuticos, métodos de diagnóstico y un método de detección que utilizan el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención y el uso de estos anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno en la elaboración de una composición farmacéutica o un fármaco para estos fines.
Por consiguiente, la invención se refiere al uso del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno aislado que se describe en la presente en (la elaboración de una composición farmacéutica para) el tratamiento del cáncer.
Más concretamente, el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno puede ser aplicable para tumores malignos que incluyen, por ejemplo, un tumor maligno con la capacidad de desarrollar metástasis y/o células tumorales caracterizadas por un crecimiento independiente de anclaje.
El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención también se puede utilizar en el diagnóstico del cáncer. El diagnóstico del cáncer se puede llevar a cabo in vivo administrando el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la presente invención a un mamífero que padezca un cáncer o que se sospeche que padece un cáncer. El diagnóstico también se puede llevar a cabo ex vivo poniendo en contacto una muestra obtenida a partir del mamífero con el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno y determinando la presencia o ausencia de células (células tumorales) que expresen KAAG1 o una variante de KAAG1.
Por consiguiente, la presente divulgación también engloba un método para detectar el cáncer o detectar células que expresen KAAG1 en un mamífero, donde el método puede comprender administrar el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno que se describe en la presente a un sujeto que lo necesite.
La presente invención se refiere, en otro de sus aspectos, a un uso para detectar una célula que exprese KAAG1 o una variante de KAAG1, donde el uso puede comprender poner en contacto la célula con un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de la invención y detectar un complejo formado por el anticuerpo y la célula que expresa KAAG1 o la variante de KAAG1. Las realizaciones ilustrativas de anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno utilizados en los usos de detección son aquellos que son capaces de unirse a la región extracelular de KAAG1.
Otras realizaciones ilustrativas de anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno utilizados en los métodos de detección son aquellos que se unen a KAAG1 o una variante de KAAG1 que se expresa en la superficie de una célula tumoral.
Los sujetos que los necesiten y que se beneficiarían de los métodos de tratamiento, detección o diagnóstico descritos en la presente son aquellos que padecen un cáncer o que se sospecha que padecen un cáncer, p. ej., cáncer de ovario
(p. ej., seroso, endometroide, de células claras o mucinoso), cáncer de piel (p. ej., melanomas, carcinomas de células escamosas), cáncer renal (p. ej., carcinomas de células papilares, carcinomas de células claras), cáncer colorrectal (p. ej., carcinomas colorrectales), sarcoma, leucemia, tumor cerebral, tumor de tiroides, cáncer de mama (p. ej., carcinomas de mama), cáncer de próstata (p. ej., carcinomas prostáticos), tumor esofágico, tumor de vejiga, tumor de pulmón (p. ej., carcinomas de pulmón) o tumor de cabeza y cuello, y especialmente cuando el cáncer se caracteriza por ser maligno y/o cuando las células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1 se caracterizan por un crecimiento independiente de anclaje.
Los sujetos que padecen cáncer se pueden identificar mediante tomografía, biopsia tisular y pruebas genéticas. Como alternativa, los sujetos que padecen cáncer se pueden identificar mediante la presencia de marcadores del cáncer en sus fluidos corporales utilizando ensayos estándar (p. ej., ELISA y similares).
Están especialmente englobados en la presente invención los pacientes que padecen o que son propensos a padecer cáncer de ovario (p. ej., seroso, endometroide, de células claras o mucinoso), cáncer de piel (p. ej., melanomas, carcinomas de células escamosas) o cáncer renal (p. ej., carcinomas de células papilares) y especialmente cuando el
cáncer se caracteriza por ser maligno y/o cuando las células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1 se caracterizan por un crecimiento independiente de anclaje.
Otra divulgación se refiere a un método para detectar KAAG1 (SEQ ID NO.:29), una variante de KAAG1 con una identidad secuencial de al menos un 80% con la SEQ ID NO.:29 o una forma secretada de una forma circulante de KAAG1 o la variante de KAAG1, donde el método puede comprender poner en contacto una célula que exprese KAAG1
o la variante de KAAG1 o una muestra (biopsia, suero, plasma, orina, etc.) que comprenda o que se sospeche que comprende KAAG1 o la variante de KAAG1 con el anticuerpo o fragmentos de unión al antígeno que se describen en la presente y medir la unión. La muestra puede proceder de un mamífero (p. ej., un ser humano), el cual puede padecer un cáncer (p. ej., cáncer de ovario, un cáncer metastásico) o se puede sospechar que padece un cáncer (p. ej., cáncer de ovario, un cáncer metastásico). La muestra puede ser una muestra tisular obtenida del mamífero o un sobrenadante de un cultivo celular.
De acuerdo con la invención, la muestra puede ser una muestra de suero, una muestra de plasma, una muestra de sangre, semen o fluido de ascitis obtenido del mamífero. El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno que se describe en la presente puede detectar de forma beneficiosa una forma secretada o circulante (que circule en la sangre) de KAAG1.
El método puede comprender cuantificar el complejo formado por el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno unido a KAAG1 o a la variante de KAAG1.
La unión de un anticuerpo a un antígeno provocará un incremento del peso molecular esperado del antígeno. Por consiguiente, tiene lugar un cambio físico cuando se produce la unión específica del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno y el antígeno.
Estos cambios se pueden detectar utilizando, por ejemplo, electroforesis seguida de inmunotransferencia de Western y coloración del gel o la inmunotransferencia, espectrometría de masas, HPLC acoplada con una computadora, FACS u otros. Los aparatos capaces de detectar un cambio del peso molecular son conocidos en la técnica e incluyen, por ejemplo, PhosphorimagerTM.
Cuando el anticuerpo comprende, por ejemplo, una marca detectable, el complejo de anticuerpo-antígeno se puede detectar mediante la fluorescencia emitida por la marca, la emisión de radiación de la marca, la actividad enzimática de una marca proporcionada con su sustrato u otros.
La detección y/o medida de la unión entre un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno y un antígeno se puede llevar a cabo mediante varios métodos conocidos en la técnica. La unión entre un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno y un antígeno se puede monitorizar con un aparato capaz de detectar la señal emitida por la marca detectable (emisión de radiación, fluorescencia, cambio de color, etc.). Un aparato de este tipo proporciona datos que indican si la unión ha tenido lugar y también pueden indicar la cantidad de anticuerpo unido al antígeno. El aparato (normalmente acoplado a una computadora) también puede ser capaz de calcular la diferencia entre una señal de fondo (p. ej., una señal obtenida en ausencia de la unión de anticuerpo-antígeno) o ruido de fondo y la señal obtenida cuando tiene lugar la unión específica de anticuerpo-antígeno. De este modo, los aparatos de este tipo pueden proporcionar al usuario indicios y conclusiones sobre si el antígeno ha sido detectado o no.
Otros aspectos de la invención se refieren a kits que pueden incluir uno o más envases que contienen uno o más anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno de la invención.
Ácidos nucleicos, vectores y células
Los anticuerpos se preparan normalmente en células que permiten la expresión de la cadena ligera y la cadena pesada expresadas a partir de uno o más vectores que comprenden una secuencia de ácido nucleico que codifica la cadena ligera y/o la cadena pesada.
Por consiguiente, la presente engloba ácidos nucleicos capaces de codificar cualquiera de las CDR, regiones variables de la cadena ligera, regiones variables de la cadena pesada, cadenas ligeras y cadenas pesadas que se describen en la presente.
Por consiguiente, la presente invención se refiere, en un aspecto adicional, a un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera y una región variable de la cadena pesada de un anticuerpo que es capaz de unirse específicamente a KAAG1.
Los ejemplos de los ácidos nucleicos de la presente divulgación incluyen ácidos nucleicos que codifican una región variable de la cadena ligera que comprende:
a.
una CDRL1 como la que se expone en la SEQ ID NO.:8 o que comprende la SEQ ID NO.:8;
b.
una CDRL2 como la que se expone en la SEQ ID NO.:9 o que comprende la SEQ ID NO.:9; o
c.
una secuencia de CDRL3 como la que se expone en la SEQ ID NO.:10 o que comprende la SEQ ID NO.:10.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una región variable de la cadena ligera que
puede comprender al menos dos CDR de una CDRL1, una CDRL2 o una CDRL3.
También de acuerdo con la presente invención, el ácido nucleico puede codificar una región variable de la cadena ligera que puede comprender una CDRL1, una CDRL2 y una CDRL3.
La presente divulgación también se refiere a un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena pesada que comprende:
a.
una secuencia de CDRH1 como la que se expone en la SEQ ID NO.:5 o que comprende la SEQ ID NO.:5;
b.
una secuencia de CDRH2 como la que se expone en la SEQ ID NO.:6 o que comprende la SEQ ID NO.:6; o
c.
una secuencia de CDRH3 como la que se expone en la SEQ ID NO.:7 o que comprende la SEQ ID NO.:7.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una región variable de la cadena pesada que puede comprender al menos dos CDR de una CDRH1, una CDRH2 o una CDRH3.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una región variable de la cadena pesada que puede comprender una CDRH1, una CDRH2 y una CDRH3.
También se engloban en la presente divulgación ácidos nucleicos que codifican variantes de anticuerpos que tienen al menos una sustitución conservativa de un aminoácido.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una CDR que comprenda al menos una sustitución conservativa de un aminoácido.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una CDR que comprenda al menos una sustitución conservativa de un aminoácido en al menos dos de las CDR.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una CDR que comprenda al menos una sustitución conservativa de un aminoácido en las 3 CDR.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una CDR que comprenda al menos dos sustituciones conservativas de aminoácidos en al menos una de las CDR.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una CDR que comprenda al menos dos sustituciones conservativas de aminoácidos en al menos dos de las CDR.
De acuerdo con la presente divulgación, el ácido nucleico puede codificar una CDR que comprenda al menos dos sustituciones conservativas de aminoácidos en las 3 CDR.
Otras realizaciones se refieren a un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera con una identidad secuencial de al menos un 70%, 75%, 80% respecto a la SEQ ID NO.:4.
Otras realizaciones más se refieren a un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena pesada con una identidad secuencial de al menos un 70%, 75%, 80% respecto a la SEQ ID NO.:2.
En otro aspecto más, la presente invención se refiere a un vector que comprende los ácidos nucleicos de la invención.
De acuerdo con la presente invención, el vector puede ser un vector de expresión.
Los vectores que contienen los elementos para el control de la transcripción y la traducción de la secuencia codificante insertada en un huésped particular son conocidos en la técnica. Estos elementos pueden incluir secuencias reguladoras, tales como potenciadores, promotores constitutivos e inducibles, y regiones no traducidas 5' y 3'. Para construir tales vectores de expresión, se pueden utilizar métodos con los cuales estarán familiarizados los expertos en la técnica. Estos métodos incluyen técnicas de ADN recombinante in vitro, técnicas sintéticas y recombinación genética in vivo.
En otro aspecto, la presente invención se refiere a una célula aislada que puede comprender el ácido nucleico, los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno de la invención.
La célula aislada puede comprender un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera y un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena pesada ya sea en vectores diferentes o en el mismo vector. La célula aislada también puede comprender un ácido nucleico que codifica una cadena ligera y un ácido nucleico que codifica una cadena pesada ya sea en vectores diferentes o en el mismo vector.
De acuerdo con la presente invención, la célula puede ser capaz de expresar, acoplar y/o secretar un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este.
En otro aspecto, la presente invención proporciona una célula que puede comprender y/o puede expresar el anticuerpo descrito en la presente.
De acuerdo con la invención, la célula puede comprender un ácido nucleico que codifica una región variable de la
cadena ligera y un ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena pesada.
La célula puede ser capaz de expresar, acoplar y/o secretar un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este.
Los ejemplos a continuación se presentan para exponer de forma adicional los detalles de la presente invención.
EJEMPLOS
Ejemplo 1
Este ejemplo describe la unión del anticuerpo 3A4 a KAAG1.
Los anticuerpos que se unen a KAAG1 se generaron utilizando la tecnología de presentación de fagos de Alere. En la Patente de los EE. UU. N.o 6.057.098 se puede encontrar una descripción detallada de la tecnología y los métodos para generar estos anticuerpos. Además, en el documento PCT/CA2009/001586 (publicado como WO 2010/060186) se puede encontrar una descripción detallada de la generación de anticuerpos contra KAAG1. Resumiendo, la tecnología utiliza un cribado riguroso de colecciones de fagos que presentan los fragmentos de unión al antígeno (Fabs). Tras varias rondas de cribado, se obtuvo una colección, denominada Omniclonal, enriquecida en Fabs recombinantes que contenían regiones variables de la cadena ligera y pesada que se unían a KAAG1 con una afinidad y especificidad muy elevadas. A partir de esta colección, denominada más concretamente Omniclonal AL0003 A2ZB, se prepararon 96 Fabs monoclonales recombinantes individuales a partir de E. coli y se evaluaron para determinar su unión a KAAG1. El monoclonal denominado 3A4 se obtuvo a partir de esta placa de 96 pocillos de anticuerpos monoclonales basándose en su elevada actividad de unión para KAAG1 recombinante y su afinidad por KAAG1 en la superficie de células de cáncer de ovario.
Las secuencias de nucleótidos de las regiones variables de las cadenas de inmunoglobulina pesada y ligera se muestran en las SEQ ID NOS.:1 y 3, respectivamente, y las secuencias polipeptídicas de las regiones variables de las cadenas de inmunoglobulina pesada y ligera se muestran en las SEQ ID NOS.:2 y 4, respectivamente. Las regiones determinantes de la complementariedad (CDR) de la inmunoglobulina de cadena pesada 3A4 se muestran en las SEQ ID NOS.:5, 6 y 7, respectivamente, y las CDR de la inmunoglobulina de cadena ligera 3A4 se muestran en las SEQ ID NOS.:8, 9 y 10, respectivamente.
Además de la posibilidad de realizar estudios de interacción entre los Fabs monoclonales y la proteína KAAG1, el uso de Fabs se ve limitado a la hora de realizar estudios in vivo e in vitro representativos para validar la función biológica del antígeno. Por lo tanto, fue necesario transferir las regiones variables de la cadena ligera y pesada contenidas en los Fabs de 3A4 a matrices completas de anticuerpos para generar IgG1 quimérica humana-de ratón. Los vectores de expresión para las cadenas de inmunoglobulina ligera y pesada se construyeron de modo que i) las secuencias peptídicas señal bacterianas originales situadas antes de los vectores de expresión de Fab se reemplazaron por péptidos señal de mamíferos y ii) las regiones constantes de las cadenas ligera y pesada en los anticuerpos de ratón se reemplazaron con regiones constantes humanas. Los métodos para conseguir esta transferencia utilizaron técnicas estándar de biología molecular con las cuales estarán familiarizados los expertos en la técnica. En la presente se describe un resumen de la metodología.
Vector de expresión de la cadena ligera – un plásmido de expresión de mamífero existente, denominado pTTVH8G (Durocher et al., 2002), diseñado para ser utilizado en el sistema de transfección transitorio 293E, se modificó para que incorporase la región variable de la cadena ligera de ratón. La cadena ligera quimérica humana-de ratón resultante contenía una región variable de ratón seguida de un dominio constante kappa humano. La secuencia de ADNc codificante del dominio constante kappa humano se amplificó mediante PCR con los cebadores OGS1773 y OGS1774 (SEQ ID NOS:11 y 12, respectivamente). La secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente para la región constante kappa humana se muestran en las SEQ ID NOS:13 y 14, respectivamente. El producto de PCR resultante con 321 pares de bases se ligó en pTTVH8G inmediatamente después de la secuencia peptídica señal de VEGF A humano (NM_003376). Este paso de clonación también posicionó sitios de restricción de endonucleasas únicos que permitieron el posicionamiento exacto de los ADNc codificantes de las regiones variables de la cadena ligera de ratón. La secuencia del plásmido de expresión final, denominado pTTVK1, se muestra en la SEQ ID NO.:15. Basándose en la secuencia variable de la cadena ligera de 3A4 que se muestra en la SEQ ID NO.:3, se diseñó un cebador de PCR específico para la región variable de la cadena ligera que incorporaba, en su extremo 5', una secuencia idéntica a los últimos 20 pares de bases del péptido señal de VEGF A. La secuencia de este cebador se muestra en la SEQ ID NO:16. Un cebador inverso (SEQ ID NO.:17) incorporó, en su extremo 3', una secuencia idéntica a los primeros 20 pares de bases del dominio constante kappa humano. Tanto los fragmentos de PCR como el pTTVK1 digerido se trataron con la actividad exonucleasa 3’ – 5’ de la ADN-polimerasa T4, lo cual dio como resultado extremos complementarios que se unieron por anelación. Las reacciones de anelación se transformaron en E. coli competente y los plásmidos de expresión se verificaron mediante secuenciación para garantizar que las regiones variables de la cadena ligera de ratón se habían insertado adecuadamente en el vector de expresión pTTVK1.
Vector de expresión de la cadena pesada – el vector de expresión que produjo la inmunoglobulina de cadena pesada 3A4 se diseñó de modo similar al pTTVK1 descrito anteriormente para la producción de inmunoglobulinas de cadena ligera. El plásmido pYD11 (Durocher et al., 2002), que contenía la secuencia peptídica señal de IgGK humana así como las regiones CH2 y CH3 del dominio Fc humano de IgG1, se modificó ligando la secuencia de ADNc codificante de la
región CH1 constante humana. Los cebadores de PCR OGS1769 y OGS1770 (SEQ ID NOS:18 y 19), diseñados para que contuvieran sitios de restricción de endonucleasas únicos, se utilizaron para amplificar la región CH1 de IgG1 humana que contenía la secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos correspondiente que se muestran en las SEQ ID NOS:20 y 21. Tras ligar el fragmento con 309 pares de bases de CH1 humana inmediatamente después de la secuencia peptídica señal de IgGK, el plásmido modificado (SEQ ID NO.:22) se denominó pYD15. Cuando se liga una región variable de la cadena pesada seleccionada en este vector, el plásmido resultante codifica una inmunoglobulina de cadena pesada IgG1 completa con regiones constantes humanas. Los cebadores de PCR específicos para la región variable de la cadena pesada del anticuerpo 3A4 (SEQ ID NOS:1) se diseñaron para que incorporasen, en su extremo 5', una secuencia idéntica a los últimos 20 pares de bases del péptido señal de IgGK. La secuencia de estos cebadores se muestra en la SEQ ID NO:23. Un cebador inverso (SEQ ID NO.:24) incorporó, en su extremo 3', una secuencia idéntica a los primeros 20 pares de bases del dominio constante CH1 humano. Tanto los fragmentos de PCR como el pYD15 digerido se trataron con la actividad exonucleasa 3’ – 5’ de la ADN-polimerasa T4, lo cual dio como resultado extremos complementarios que se unieron por anelación. Las reacciones de anelación se transformaron en E. coli competente y los plásmidos de expresión se verificaron mediante secuenciación para garantizar que las regiones variables de la cadena pesada de ratón se habían insertado adecuadamente en el vector de expresión pYD15.
Expresión de IgG1 quimérica 3A4 humana en células 293E – Los vectores de expresión preparados anteriormente, que codificaban las inmunoglobulinas de cadena ligera y pesada, se expresaron en células 293E utilizando el sistema de transfección transitorio (Durocher et al., 2002). Se optimizó la proporción de cadena ligera frente a pesada con el fin de conseguir el mayor rendimiento de anticuerpo en el medio de cultivo tisular y se determinó que era de 9:1 (L:H).
Unión de 3A4 quimérico a KAAG1 – Para medir la unión relativa del anticuerpo monoclonal 3A4, se produjo KAAG1 humano recombinante en células 293E utilizando la tecnología de transfección transitoria a gran escala (Durocher et al., 2002; Durocher, 2004). La expresión y purificación de KAAG1 recombinante humano como una proteína de fusión Fc se describe en PCT/CA2009/001586 (WO 2010/060186). Para llevar a cabo la unión de Fc-KAAG1 al preparado de anticuerpo, Fc-KAAG1 se biotiniló con NHS-biotina (Pierce, Rockford, IL) y se utilizaron 10 ng/pocillo como recubrimiento en una placa de 96 pocillos con estreptavidina durante 1 h a temperatura ambiente. Se añadió 3A4 quimérico purificado con concentraciones cada vez mayores y se incubó a temperatura ambiente durante 30 minutos. El anticuerpo unido se detectó con un anticuerpo de cadena ligera anti-kappa humano conjugado con HRP en presencia de sustrato líquido TMB (Sigma-Aldrich Canada Ltd., Oakville, ON) y se registraron las lecturas a 450 nm con un lector de placas de microvaloración. Según se muestra en la Figura 1, 3A4 interaccionó con la proteína KAAG1 inmovilizada de un modo que dependía de la dosis. Cuando la IgG no relacionada de control se incubó con KAAG1 recombinante, no se observó ninguna actividad de unión, incluso para la concentración más elevada. Este resultado demostró que 3A4 se une a KAAG1 humano. La unión de 3A4 se comparó con la unión de 3D3 quimérico (descrito en Tremblay y Filion (2009)), que presenta una especificidad de epítopos diferente (remítase al Ejemplo 2). La actividad de unión de 3A4 es muy similar a la de 3D3 en este tipo de ensayo (remítase a la Figura 1).
Ejemplo 2
Este ejemplo describe los estudios de mapeo de epítopos para determinar a qué región de KAAG1 se une el anticuerpo 3A4.
Para definir adicionalmente las regiones de KAAG1 que se unen al anticuerpo 3A4, se expresaron mutantes truncados de KAAG1 y se utilizaron en el ensayo de ELISA. En cuanto a KAAG1 de longitud completa, las versiones truncadas se amplificaron mediante PCR y se ligaron en pYD5 digerido con BamHI/HindIII. Los cebadores utilizados combinaron el oligonucleótido directo con la secuencia que se muestra en la SEQ ID NO.:25 con cebadores de SEQ ID NOS:26 y 27, para producir fragmentos fusionados Fc que acababan en el aminoácido número 60 y 35 de KAAG1, respectivamente. La expresión de estos mutantes recombinantes se llevó a cabo como se ha descrito anteriormente para Fc-KAAG1 de longitud completa y se purificaron con agarosa-proteína A.
Basándose en los estudios de Tremblay y Filion (2009), existe constancia de que otros anticuerpos interaccionan con regiones específicas de KAAG1 recombinante. De este modo, los anticuerpos anti-KAAG1 3C4, 3D3 y 3G10 interaccionan con las regiones 1–35, 36–60 y 61–84 de KAAG1, respectivamente. Se reprodujeron estos resultados de unión y se muestran en la Figura 2. Con el fin de determinar la región de KAAG1 que se une al anticuerpo 3A4, se realizó un ensayo de ELISA utilizando las fusiones truncadas de Fc y KAAG1 de acuerdo con un protocolo similar al descrito en el Ejemplo 1. Las únicas modificaciones fueron el uso de diferentes mutantes truncados de Fc-KAAG1 biotinilados. Los resultados muestran que la especificidad de unión de 3A4 es similar a la de 3G10. En mutantes de KAAG1 que no contienen las secuencias de aminoácidos más allá del aminoácido 60, la unión de 3A4 a KAAG1 no tiene lugar. Esto indica que 3A4 interacciona con una región definida por los aminoácidos 61–84 de KAAG1 humano. La observación de que 3A4 y 3D3 tienen virtualmente una actividad de unión idéntica, según se determinó por ELISA (Ejemplo 1), pero tienen una especificidad de epítopos muy diferente sugiere que las propiedades de unión de 3A4 son bastante diferentes a las de 3D3.
Ejemplo 3
Este ejemplo describe la capacidad de 3A4 de unirse a KAAG1 en la superficie de líneas celulares cancerosas.
Se utilizó citometría de flujo para detectar KAAG1 en la superficie de líneas celulares. Basándose en los análisis de expresión de RT-PCR utilizando cebadores específicos de ARNm para KAAG1, cabía esperar que las líneas celulares cancerosas seleccionadas expresaran la proteína KAAG1. Para verificar esto, células de cáncer de ovario (SKOV-3 y TOV-21G) y una línea celular de control que presentaba muy poca expresión de KAAG1 (293E). Las células se cultivaron utilizando EDTA 5 mM, se contaron con un hemocitómetro y se volvieron a suspender en tampón de FCM
(0.5% de BSA, 10 g/ml de suero de cabra en 1x PBS) con una densidad celular de 2 x 106 células/ml. Se añadió 3A4
quimérico o una IgG de control a 100 l de células con una concentración final de 5 g/ml y se incubaron en hielo durante 2 h. Las células se lavaron con PBS frío para eliminar los anticuerpos no unidos, se volvieron a suspender en
100 l de tampón de FCM que contenía un anticuerpo anti-IgG humana conjugado con FITC (dilución de 1:200) como anticuerpo secundario y se incubaron en hielo durante 45 min. Tras otro paso de lavado con PBS frío, las células se
volvieron a suspender en 250 l de tampón de FCM y se analizaron con un citómetro de flujo. Los resultados de este experimento se muestran en la Figura 3A y 3B. La incubación de las líneas celulares con el anticuerpo de control dio como resultado histogramas que se correspondían con la señal obtenida habitualmente cuando se omitía el anticuerpo de las células. Esto estableció la señal de fondo para estos valores de FCM (Figuras 3A y 3B). Por el contrario, la incubación de SKOV-3 y TOV-21G con el anticuerpo quimérico 3A4 dio como resultado una fuerte señal de fluorescencia (Figuras 3A). Esto indicó que el anticuerpo detecta de forma eficaz KAAG1 en la superficie de estas células cancerosas. Cabía esperar que las células 293E, una línea de células de riñón humanas, mostraran muy poca expresión de KAAG1 y, efectivamente, el histograma de FCM no mostró casi ningún desplazamiento en comparación con el anticuerpo de control (remítase a la Figura 3B). Por consiguiente, 3A4 detectó de forma específica KAAG1 en la superficie de las células cancerosas. La actividad de 3A4 se comparó con la de 3D3, un anticuerpo anti-KAAG1 descrito en los estudios de Tremblay y Filion (2009). Basándose en esta solicitud de patente, existía constancia de que 3D3 podía detectar KAAG1 en la superficie de células cancerosas, según se determinó por FCM. Esto se confirmó cuando se incubó 3D3 en presencia de células SKOV-3 y TOV-21G (remítase a la Figura 3A). La señal de fluorescencia no fue tan elevada en comparación con la de 3A4, lo cual indica que 3A4 tiene una capacidad diferente y más elevada para detectar KAAG1 en la superficie de células de cáncer de ovario. Otros resultados obtenidos en nuestro laboratorio indican que 3A4 pudo detectar KAAG1 en la superficie de células cancerosas en condiciones en las que 3D3 no mostró ninguna actividad en este ensayo (no se muestran los resultados). Consideradas conjuntamente, estas observaciones y la diferencia en la especificidad de epítopos de 3A4 en comparación con 3D3 sugieren que estos anticuerpos poseen diferentes propiedades anti-KAAG1.
Ejemplo 4
Métodos para utilizar el anticuerpo anti-KAAG1 3A4 como un conjugado de anticuerpo
Según se ha demostrado anteriormente, el antígeno KAAG1 fue detectado por 3A4 en la superficie de células cancerosas utilizando citometría de flujo. Pueden tener lugar varios eventos moleculares diferentes cuando un anticuerpo se une a su diana en la superficie de las células. Estos incluyen i) el bloqueo de la accesibilidad para otro antígeno/receptor de la superficie celular o un ligando, ii) la formación de un complejo anticuerpo-antígeno relativamente estable para permitir que las células se conviertan en diana mediante ADCC o CDC, iii) pueden tener lugar eventos de señalización, por ejemplo, anticuerpos agonistas, iv) se puede interiorizar el complejo, o v) el complejo se puede desprender de la superficie celular. Para resolver esta cuestión, pretendemos examinar el comportamiento del complejo anticuerpo 3A4-KAAG1 en la superficie de las células. Se colocaron células SKOV-3 en placas, se lavaron y se incubaron con 5 μg/ml de anticuerpo quimérico 3A4 según se ha descrito en el Ejemplo 3. Después del lavado, se añadió medio de OSE completo y las células se trataron a 37 oC durante un máximo de 90 minutos. Las células se retiraron en los tiempos indicados (remítase a la Figura 4), se enfriaron rápidamente, se prepararon para citometría con un anticuerpo anti-IgG humana conjugado con FITC y los resultados se expresaron como el porcentaje de la intensidad de fluorescencia media (intensidad de fluorescencia media, %) remanente. Según se ilustra en la Figura 4, la señal de fluorescencia se reduce rápidamente durante un periodo de 30-45 minutos. Este resultado indica que el complejo 3A4/KAAG1 desapareció de las células, lo cual indica que probablemente tuvo lugar la interiorización del complejo. Los estudios preliminares para elucidar el mecanismo responsable de esta reducción de la fluorescencia en la superficie celular han puesto de manifiesto que al parecer el complejo ha sido interiorizado.
Estas conclusiones se confirmaron de forma adicional realizando inmunofluorescencia en células vivas para ver si esta interiorización se podía observar microscópicamente. Se sembraron células SKOV-3 en portaobjetos con medio completo (medio de OSE (Wisent) que contenía un 10% de FBS, glutamina 2 mM, piruvato de sodio 1 mM, 1X aminoácidos no esenciales y antibióticos). Una vez que las células se adhirieron adecuadamente, se añadió medio fresco que contenía el anticuerpo quimérico anti-KAAG1 3A4 con una concentración de 10 ug/ml y se incubó a 37 oC durante 4 h. Las células se lavaron con PBS y a continuación se fijaron con paraformaldehído al 4% (en PBS) durante 20 min. Tras el lavado, las células se permeabilizaron con Triton X-100 al 0.1% en PBS durante 5 min. El bloqueo se llevó a cabo con leche en polvo al 1.5% en PBS durante 1 h. Se detectó la proteína de membrana asociada a lisosomas 1 (LAMP1, Chang et al., 2002) mediante la incubación con anti-LAMP1 (Santa Cruz, sc-18821, dilución de 1:100) en leche al 1.5% en PBS durante 2 h. Tras el lavado en PBS, se añadieron los anticuerpos secundarios junto con leche al 1.5% y se incubaron durante 1 h. Para los anticuerpos quiméricos anti-KAAG1, el anticuerpo secundario era un anticuerpo anti-IgG humana (H+L) de burro conjugado con Rhodamine Red-X y con una dilución de 1:300. Para el anticuerpo anti-LAMP1, el anticuerpo secundario era un anticuerpo anti-IgG de ratón (H+L) producido en cabra
conjugado con DyLight488 y con una dilución de 1:300. Ambos anticuerpos secundarios eran de Jackson ImmunoResearch. Los portaobjetos se lavaron con PBS y se montaron en reactivo ProLong Gold Antifade con DAPI. Según se observa en la Figura 5A, después de 4 horas de incubación a 37 oC en presencia de células de cáncer de ovario SKOV-3, se pudo detectar el anticuerpo 3A4 en complejos predominantemente cercanos al área perinuclear (flechas, remítase a la tinción roja en el panel izquierdo de la Figura 5A), lo cual es típico de las vías de interiorización basadas en endosomas-lisosomas. Esta observación se confirmó adicionalmente cuando se visualizó un marcador de lisosomas, LAMP1, y se observó que también se expresaba en estas áreas (flechas, remítase a la tinción verde en el panel central de la Figura 5A). Cabe destacar que la fusión de las dos imágenes dio como resultado la aparición de estructuras amarillas-naranjas que indicaban que los anticuerpos 3A4 y anti-LAMP1 estaban presentes en las mismas estructuras (flechas, remítase a la tinción amarilla en el panel derecho de la Figura 5A). La localización conjunta de 3A4, que se une a KAAG1 en la superficie de células cancerosas, con LAMP1, un marcador de endosomas/lisosomas tardíos, indica que el complejo anticuerpo/antígeno se interiorizó y que sigue una vía que permite la liberación de una carga útil que se conjugaría con el anticuerpo 3A4. Se observaron resultados idénticos en otra línea de células cancerosas, TOV21G (remítase a la Figura 5B).
Considerados conjuntamente, estos estudios demuestran que los anticuerpos específicos para KAAG1, tales como 3A4, pueden tener aplicaciones como conjugados de anticuerpo-fármaco (ADC, por sus siglas en inglés). De este modo, el elevado nivel de especificidad por el cáncer de ovario de KAAG1, junto con la capacidad de esta diana de ser interiorizada en las células, están a favor del desarrollo de aplicaciones como ADC.
Ejemplo 5
Detección preferencial de KAAG1 en la superficie de células cancerosas
Aunque se han desarrollado varios anticuerpos que interaccionan con diferentes epítopos de la proteína KAAG1, no se ha elucidado completamente la accesibilidad de estos epítopos cuando KAAG1 se expresa en la superficie de células cancerosas intactas. Los análisis bioinformáticos de la estructura primaria de los aminoácidos de KAAG1 (el número total de aminoácidos en la proteína humana es 84) no pusieron de manifiesto ninguna secuencia obvia que pudiera corresponder a un dominio transmembrana y, por consiguiente, no se pudo comprender completamente cómo KAAG1 se une a la membrana celular.
Se ha descubierto que los anticuerpos generados contra KAAG1 se unen a tres regiones diferentes de la proteína KAAG1 (remítase a PCT/CA2009/001586, publicado como WO 2010/060186). La mayoría de los anticuerpos interaccionan con los aminoácidos 35–60 de la proteína KAAG1, por ejemplo, los anticuerpos 3D3 y 3G12 de esta solicitud. Un ejemplo de anticuerpos que interaccionan con el extremo carboxiterminal de KAAG1 entre los aminoácidos 61–84 es el anticuerpo 3A4. Finalmente, los anticuerpos que interaccionan con la región aminoterminal de la proteína, por ejemplo, 3C4, presentaron una unión muy escasa a las células que expresan KAAG1.
Esta solicitud muestra que, cuando KAAG1 se expresa en las células, la región carboxiterminal (aminoácidos 61–84) está expuesta al espacio extracelular y que los anticuerpos que tienen como diana esta región son los más eficaces a la hora de detectar y potencialmente tratar células KAAG1-positivas. Los anticuerpos que se unen a la región central de KAAG1 (aminoácidos 35–60) también pueden detectar KAAG1 en la superficie celular, pero en menor grado que los anticuerpos que interaccionan con el extremo carboxiterminal.
Las líneas celulares de cáncer de ovario, tales como SKOV-3, son positivas respecto a la expresión de KAAG1. Se utilizaron estas células para detectar la expresión de KAAG1 mediante citometría de flujo, que es un método que permite la detección de proteínas de la superficie celular y es de uso común para los expertos en la técnica. Resumiendo, se incubaron 100 000 células para cada muestra en hielo durante 1 h con el anticuerpo primario (anti-
KAAG1 o el anticuerpo de control) con una concentración de 1 g/ml. Tras varios lavados con PBS enfriado con hielo, las células teñidas se incubaron con el anticuerpo secundario que estaba conjugado con un fluorocromo (FITC), el cual detecta la presencia del anticuerpo primario unido a las células. Tras varios lavados adicionales, las células se analizaron con un citómetro de flujo. Los resultados expresados en la Figura 6 muestran el eje de las Y que representa el recuento (células) y el eje de las X que representa la cantidad de fluorescencia (señal de fluorescencia). Cuando las células SKOV-3 se incubaron con el anticuerpo 3A4, se observó un gran desplazamiento de la fluorescencia, lo cual indica que había una cantidad abundante de proteína KAAG1 en la superficie de las células (Figura 6A) y que era reconocida de forma eficaz por este anticuerpo. En unas condiciones idénticas, los anticuerpos que interaccionan con la región central de KAAG1, 3G12 y 3D3 (Figura 6A), fueron significativamente menos eficaces a la hora de detectar KAAG1. Cuando las células se incubaron con una mayor concentración de 3G12 o 3D3, se pudo detectar KAAG1 en la superficie celular (no se muestra). Cuando las células se incubaron con IgG de control (Figura 6A) o 3C4, un anticuerpo contra el extremo aminoterminal de KAAG1 (Figura 6A), no se observó ninguna señal. Estos resultados indican que los anticuerpos que interaccionan con el extremo carboxiterminal de KAAG1 pueden detectar el antígeno en la superficie de células cancerosas de forma más eficaz que los anticuerpos dirigidos contra otras regiones de KAAG1. Esto implica que el extremo carboxiterminal de KAAG1 está expuesto al espacio extracelular (fuera) de la célula. Se obtuvieron resultados similares para otras líneas de células cancerosas que expresan KAAG1.
El experimento también se llevó a cabo en células SKOV-3 que se permeabilizaron con Triton X-100. Normalmente, se utiliza Triton X-100 para permeabilizar membranas celulares y liberar proteínas de membrana. Cuando las células
permeabilizadas se incubaron con 3A4 y se midieron en el citómetro de flujo (remítase a la Figura 6B), la señal fue similar a la obtenida en las células intactas. Sorprendentemente, cuando las células permeabilizadas se incubaron con el anticuerpo 3G12 que se une a la región central de KAAG1 (Figura 6B), la señal fue tan intensa como la de 3A4. Estos resultados indican que probablemente la región central de KAAG1 está presente en la membrana celular o en el interior de la célula. Se obtuvo un resultado similar con el anticuerpo 3D3, otro anticuerpo que se une la región central (Figura 6B), pero la señal obtenida para 3D3 no fue tan intensa. Al igual que antes, el control de IgG no mostró ninguna señal detectable en este ensayo (Figura 6B). Cabe destacar que la incubación de las células con el anticuerpo 3C4, el cual se une a la región amino de KAAG1, no dio como resultado ninguna señal detectable (Figura 6B). Este último resultado sugirió que probablemente la región amino de KAAG1 se escinde durante el transporte de la proteína hacia la membrana celular.
En conjunto, estos experimentos proporcionan mucha información sobre la estructura y orientación del antígeno KAAG1 cuando se expresa en la superficie de células cancerosas. Basándose en estos datos, se proponen dos modelos para la estructura de KAAG1 en la superficie celular (Figura 7). En el primer modelo (Figura 7, Modelo A), los datos sugieren que la porción central es de hecho la región transmembrana de KAAG1 que está expuesta solo parcialmente al espacio extracelular. Esto haría que el extremo carboxiterminal de KAAG1 se pudiera detectar fácilmente y que fuera más difícil unirse a la región central. En el segundo modelo (Figura 7, Modelo B), KAAG1 está unido a la membrana mediante otra proteína que, a su vez, está embebida en la membrana celular. De nuevo, los anticuerpos tales como 3A4 podrían acceder fácilmente al extremo carboxiterminal, pero la interacción entre KAAG1 y su pareja proteica dificultaría el acceso a la región central. Los resultados que muestran tanto los anticuerpos que se unen al extremo carboxiterminal (por ejemplo, 3A4) como los que se unen a la región central (por ejemplo, 3G12 y 3D3) evaluados en presencia de células permeabilizadas concuerdan con ambos modelos. La incapacidad del anticuerpo 3C4 para unirse a KAAG1 en células permeabilizadas o intactas se debe probablemente a la falta de los aminoácidos contenidos en el extremo aminoterminal de la forma de membrana procesada madura de KAAG1 y ambos modelos concuerdan con esto.
Estos resultados implican que los anticuerpos que tienen como diana el extremo carboxiterminal de KAAG1 en células cancerosas, en particular la región comprendida entre los aminoácidos 61–84, son los más adecuados para el desarrollo de anticuerpos para usos como agentes terapéuticos para el tratamiento de carcinomas que expresan KAAG1. Además, otros usos para los anticuerpos contra KAAG1 que se unen a la región carboxiterminal incluyen reactivos de diagnóstico para la detección de carcinomas que expresan KAAG1.
Los anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno que tienen una especificidad de unión similar a la del anticuerpo 3A4 se pueden generar o aislar inmunizando a un animal con la porción C-terminal de KAAG1 de acuerdo con los métodos conocidos en la técnica, incluida la tecnología de hibridomas, realizando un cribado de una colección de anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno con la porción C-terminal de KAAG1 y/o realizando ensayos de competición de anticuerpos o fragmentos de unión al antígeno aislados con el anticuerpo 3A4 descrito en la presente.
Ejemplo 6
Humanización mediante el diseño del anticuerpo monoclonal de ratón 3A4
Modelización 3D de las regiones variables del anticuerpo monoclonal 3A4 de ratón
Esta tarea se llevó a cabo mediante modelización por homología. Las estructuras patrón más similares a las secuencias de las regiones variables de 3A4 de murino de las cadenas ligera y pesada (SEQ ID NOs: 4 y 2) se identificaron mediante una búsqueda en BLAST frente a PDB. Para construir un modelo inicial de la región variable de 3A4 de ratón, se utilizaron las siguientes estructuras patrón (códigos de PDB): 2IPU (cadena L) para la cadena ligera y 1F11 (cadena B) para la cadena pesada. Se pueden encontrar otros patrones adecuados en la entrada de PDB 2DDQ para la cadena ligera y en las entradas de PDB 3IY3, 1KTR, 2VXT, 1A6T y 1IGI para la cadena pesada. Se realizaron las mutaciones necesarias en estas estructuras patrón de acuerdo con las secuencias de 3A4 de murino: 7 mutaciones en la cadena ligera 2IPU y 17 mutaciones más una deleción de 3 residuos en la cadena pesada 1F11. Las estructuras mutadas correspondientes a las cadenas ligera y pesada de las regiones variables de 3A4 de murino se acoplaron para obtener estructuras de anticuerpo de dos cadenas superponiendo las cadenas ligera y pesada de las estructuras patrón respectivas. La estructura resultante de la región variable de 3A4 acoplada se refinó en primer lugar por minimización de energía con el campo de fuerza AMBER y una liberación de tensiones por pasos, desde los bucles de CDR que se relajaron en primer lugar, hasta los átomos pesados del esqueleto de la región marco que se relajaron completamente solo en el último estadio. El bucle CDR-H3 en cada estructura de región variable del anticuerpo se refinó a continuación mediante un muestreo conformacional de minimización de Monte Carlo (MCM, por sus siglas en inglés), en el cual los ángulos dihédricos de la región CDR-H3 se muestrearon en cada ciclo de MCM y a continuación se realizó una minimización de la energía de una región predefinida que se extendía 10 Å alrededor de la conformación inicial del bucle CDR-H3. En la Figura 8 se muestra una representación de la región variable modelada del anticuerpo 3A4 de ratón. Las estructuras de las secuencias variables humanizadas o humanas más similares a cada una de las secuencias variables de 3A4 también se identificaron a partir de PDB y a continuación se superpusieron sobre las estructuras modeladas de las regiones variables de 3A4 de murino. Estas estructuras incluyen las entradas de PDB 3QCT, 3AAZ, 1WT5 y 3M8O para la cadena ligera, y las entradas de PDB 1I9R, 3NFP, 1T04, 1ZA6, 3HC4, 2D7T y 1WT5 para la cadena pesada. Estas estructuras se utilizaron para facilitar la modelización de las mutaciones en la región marco con el fin de construir estructuras 3D humanizadas a partir de la estructura 3D de murino modelada.
Caracterización de la estructura modelada y las secuencias de aminoácidos de 3A4 de ratón
Este paso se llevó a cabo para estimar el índice de humanidad, el índice de la tendencia al contacto con el antígeno, para definir las CDR, los residuos canónicos, el empaquetamiento entre cadenas (residuos de la interfase VH/VL), el empaquetamiento de la región variable/constante (residuos de las interfases VH/CH y VL/CL), residuos marco inusuales, posibles sitios de N-y O-glicosilación, residuos enterrados, residuos de la zona Vernier y la proximidad a las CDR. Para evaluar estas propiedades, se utilizaron software local y fuentes disponibles en Internet.
Selección de los mejores marcos humanos de la cadena pesada y la cadena ligera para las CDR de ratón
Esto se llevó a cabo mediante la comparación estándar de la homología de las secuencias frente a una copia local de bases de datos de líneas germinales humanas (VBASE), frente a otras colecciones de secuencias (Genbank y SwissProt), así como también el conjunto de secuencias consenso de marco humano. Se realizaron búsquedas en BLAST para obtener coincidencias de las secuencias con la homología más elevada en la región marco solamente (por lo tanto, excluyendo las CDR), a la vez que se hacía coincidir la longitud de los bucles de las CDR. Los marcos humanos identificados para las cadenas ligera y pesada del anticuerpo 3A4 se correspondieron con las clases k2 y h1, respectivamente. Se conservaron varias secuencias marco de líneas germinales humanas que eran las más similares a las secuencias marco de 3A4, además de las secuencias consenso humanas para estas clases.
Identificación de residuos marco para retromutaciones y diseño de variantes humanizadas múltiples
Este es un paso importante que marca los residuos aminoacídicos que se deberían mutar para las correspondientes secuencias humanas con particular atención. Estos residuos representan candidatos principales para retromutaciones para las secuencias de ratón en caso de pérdida de afinidad. Es el paso más difícil e impredecible de la humanización por diseño, particularmente en ausencia de una estructura experimental del complejo anticuerpo-antígeno. Se basa en la identificación de residuos en una o más de las siguientes categorías: canónica, CDR-H3, zona de Vernier, inusual, próxima a CDR (dentro de una distancia de 5 Å), empaquetamiento entre cadenas y residuos de sitios de glicosilación. Estos residuos pueden afectar al sitio de unión al antígeno y a la afinidad, directa o indirectamente. El índice de la tendencia al contacto con el antígeno, así como también la incidencia de los aminoácidos en las bases de datos de líneas germinales humanas en cada posición también son extremadamente importantes a la hora de decidir si un residuo determinado se puede mutar de forma segura desde la secuencia de ratón hacia la secuencia humana. La humanización de la región variable de la cadena ligera del anticuerpo 3A4 implica 11 mutaciones en su marco humanizado propuesto para una humanización del marco de un 100%. La humanización de la región variable de la cadena pesada del anticuerpo 3A4 implica 23 mutaciones en su marco humanizado propuesto para una humanización del marco de un 100%. Estas secuencias de regiones variables 100% humanizadas se denominan Lvh1 y Hvh1, respectivamente (SEQ ID NOs:33 y 38). También se diseñaron secuencias humanizadas adicionales en las cuales se conservaron varios residuos de las secuencias de ratón de 3A4, basándose en análisis estructurales y de comparación de las secuencias meticulosos que indican la existencia de una elevada probabilidad de alterar la afinidad de unión al antígeno si las mutaciones se introducen en estas posiciones. Estas secuencias de las regiones variables se denominan Lvh2, Hvh2, Hvh3 y Hvh4 (SEQ ID NOs: 34, 39, 40 y 41).
Las dos variantes humanizadas de la cadena ligera (incluida la región constante) se identifican en la presente como Lh1 (SEQ ID NO.: 43) y Lh2 (SEQ ID NO.:44). Las cuatro variantes humanizadas de la cadena pesada (incluida la región constante) se identifican en la presente como Hh1 (SEQ ID NO.:46), Hh2 (SEQ ID NO.:47), Hh3 (SEQ ID NO.:48) y Hh4 (SEQ ID NO.:49). Las dos cadenas ligeras humanizadas y las 4 cadenas pesadas humanizadas se pueden acoplar para formar 8 anticuerpos humanizados (Lh1Hh1, Lh1Hh2, Lh1Hh3, Lh1Hh4, Lh2Hh1, Lh2Hh2, Lh2Hh3 y Lh2Hh4). Se construyeron modelos moleculares para todas estas combinaciones mediante modelización por homología, partiendo del modelo 3D de la región variable de 3A4 de murino, y se representan en las Figuras 9a-9h.
En el caso de la secuencia humanizada de la cadena ligera de 3A4 Lvh2 (SEQ ID NO:34), se conservaron los residuos marco Val-L2 y Lys-L45 de la secuencia de ratón, ya que el residuo L2 queda semienterrado, está en contacto con CDR-L1 y CDR-L3 y tiene tendencia a entrar en contacto con el antígeno, mientras que el residuo L45 se dirige a la cadena pesada. Cabe destacar que estos dos residuos de murino pueden estar presentes en marcos humanos. En el caso de la secuencia humanizada de la cadena pesada de 3A4 Hvh2 (SEQ ID NO:39), se conservaron los residuos marco Ile-H2 y Lys-L73 de la secuencia de ratón, ya que el residuo H2 queda semienterrado, está en contacto con CDR-H1 y CDR-H3 y tiene tendencia a entrar en contacto con el antígeno, mientras que el residuo H73 pertenece a la zona de Vernier que soporta CDR-H2, y estos dos residuos de murino pueden estar presentes en marcos humanos. En el caso de la secuencia humanizada de la cadena pesada de 3A4 Hvh3 (SEQ ID NO:40), se conservaron las retromutaciones de Ile-H2 y Lys-L73 y, además de esto, se conservaron los residuos marco Ile-H48, Ala-H67, Leu-H69 y Val-H71 de la secuencia de ratón, ya que todos estos residuos de murino adicionales son residuos enterrados y pertenecen a la zona de Vernier que soporta CDR-H2, y además el residuo de murino H71 puede estar presente en marcos humanos. En el caso de la secuencia humanizada de la cadena pesada de 3A4 Hvh4 (SEQ ID NO:41), se incluyeron las 6 retromutaciones de la variante humanizada Hvh3 más dos residuos marco de ratón adicionales Lys-H38 y Lys-H66, ya que representan residuos semienterrados cercanos a CDR-H2. Las secuencias de aminoácidos resultantes de las cadenas humanizadas y de murino se enumeran en la Tabla 1. El alineamiento de las regiones variables de la cadena ligera humanizada y de murino se muestra en la Figura 10a y el alineamiento de las regiones variables de la cadena pesada humanizada y de murino se muestra en la Figura 10b.
Las Figuras 11a y 11b muestran un alineamiento de la región variable de la cadena ligera de murino con la región variable de la cadena ligera 100% humanizada y la región variable de la cadena pesada de murino con la región variable de la cadena pesada 100% humanizada, respectivamente. Esta figura ilustra los aminoácidos que se conservaron y aquellos que se seleccionaron para la sustitución.
Ejemplo 7
Acoplamiento y expresión de los anticuerpos variantes humanizados 3A4
El objetivo de estas investigaciones es determinar los parámetros cinéticos de los anticuerpos anti-clusterina. En particular, determinar si la humanización del anticuerpo monoclonal anti-KAAG1 3A4 afecta a los parámetros cinéticos de su unión a KAAG1 humano. Con este fin, se desarrolló un método de análisis cinético utilizando el instrumento ProteOn XPR36 de BioRad. Se inmovilizó KAAG1 humano sobre un chip sensor. Se inyectaron los anticuerpos de longitud completa o los fragmentos Fab y se permitió que interaccionasen con el KAAG1 inmovilizado.
Construcción de un plásmido que codifica las cadenas ligera y pesada (de murino) quiméricas de 3A4
Las cadenas ligera y pesada del anticuerpo quimérico se amplificaron por PCR a partir de las cadenas de inmunoglobulina de murino originales utilizando los siguientes pares de cebadores de oligonucleótidos: cadena pesada, 5’-oligo codificado por la SEQ ID NO: 50 y 3’-oligo codificado por la SEQ ID NO:51; cadena ligera, 5’-oligo codificado por la SEQ ID NO: 52 y 3’-oligo codificado por la SEQ ID NO:53. Los productos de PCR resultantes se digirieron con Hind III y se clonaron en pK-CR5 (SEQ ID NO:21), que se había digerido previamente con Hind III.
Construcción de plásmidos que codifican las variantes de 3A4 de cadena pesada humanizada 1, 2, 3 y 4
Los fragmentos codificantes de la región de la cadena pesada humanizada del anticuerpo 3A4 (Hh1, Hh2, Hh3 y Hh4) se adquirieron de GenScript (Piscataway, EE. UU.). Los fragmentos de ADN que incluían las secuencias del codón de parada y de kozak se digirieron con HindIII y se clonaron en el sitio HindIII del plásmido pK-CR5, previamente desfosforilado con fosfatasa intestinal de ternera (NEB) para evitar la recircularización. La Figura 12a muestra el mapa del plásmido pK-CR5-3A4-HC-variante 1. Todas las variantes de la cadena pesada de 3A4 humanizado se construyeron de modo similar.
Construcción de plásmidos que codifican las variantes de 3A4 de cadena ligera humanizada 1 y 2
Los fragmentos codificantes de las regiones de la cadena ligera humana del anticuerpo 3A4 (Lh1 y Lh2) se adquirieron de GenScript. Los fragmentos de ADN que incluían las secuencias del codón de parada y de kozak se digirieron con BamHI y se clonaron en el sitio BamHI del plásmido pMPG-CR5 (SEQ ID NO:55), previamente desfosforilado con fosfatasa intestinal de ternera (NEB) para evitar la recircularización. La Figura 12b muestra el mapa del plásmido pMPGCR5-3A4-LC-variante 1. Todas las variantes de la cadena ligera de 3A4 humanizado se construyeron de modo similar.
Estudio de transfección transitoria
Se aisló el ADN plasmídico a partir de pequeños cultivos de E. coli utilizando el kit Mini-Prep (Qiagen Inc, Mississauga, ON) de acuerdo con las recomendaciones del fabricante. Resumiendo, se inocularon 2 ml de medio LB que contenía 100 μg/ml de ampicilina con una única colonia seleccionada tras la ligación y transformación. Los cultivos se incubaron a 37 °C durante toda la noche con agitación enérgica (250 RPM). A continuación, el plásmido se aisló a partir de 1.5 ml de cultivo utilizando los protocolos, tampones y columnas proporcionados en el kit. El ADN se eluyó utilizando 50 μl de agua estéril. Se aisló el ADN plasmídico a partir de grandes cultivos de E. coli utilizando el kit Plasmid Plus Maxi (Qiagen Inc, Mississauga, ON) de acuerdo con las recomendaciones del fabricante. Se inocularon 200 ml de medio LB que contenía 100 μg/ml de ampicilina con una única colonia fresca de E. coli y se incubaron durante toda la noche a 37 °C con agitación enérgica (250 RPM). Se formaron pellets de las bacterias (130 ml de cultivo para la cadena pesada y 180 ml de cultivo para la cadena ligera) por centrifugación a 6000 x g, durante 15 min, a 4 °C y el plásmido se aisló utilizando los protocolos, tampones y columnas proporcionados en el kit. Los plásmidos puros se volvieron a suspender en Tris 50 mM estéril de pH 8 y se cuantificaron midiendo la densidad óptica a 260 nm. Antes de la transfección, el plásmido purificado se esterilizó por extracción con fenol/cloroformo seguida de precipitación en etanol. El plásmido se volvió a suspender en Tris 50 mM estéril de pH 8 y se cuantificó mediante la densidad óptica a 260 nm.
Antes de la transfección, las células (CHO-cTA) se lavaron con PBS y se volvieron a suspender con una concentración de 4.0 X 106 células/ml en medio de cultivo (CD-CHO, Invitrogen) sin sulfato de dextrano durante 3 h en cultivo de suspensión. Para cada combinación plasmídica, se transfectaron 45 ml de células añadiendo lentamente 5 ml de medio CDCHO suplementado con 10 µg/ml de cada plásmido y 50 µg/ml de polietilenimina (PEI Max; Polysciences). La concentración final fue de 1 µg/ml de cada plásmido y 5 µg/m1 de PEI. Después de 2 h, las células se tranfectaron a 30C. Los días siguientes, se añadieron 50 g/ml de sulfato de dextrano y 3.75 ml de cada suplemento (Efficient Feed A y B de Invitrogen) a las células y se incubaron a 30C durante 13 días. Se añadieron 2.5 ml de Feed A y 2.5 ml de Feed B los días 4, 6, 8 y 11. El día 13 se clarificó el sobrenadante por centrifugación y se filtró a través de un filtro de 0.22 μM.
Las células CHO (CHOcTA) se transfectaron con los plásmidos que codificaban las diferentes variantes de las cadenas ligera y pesada humanizadas del anticuerpo 3A4, regulados por el promotor CR5. Se realizó la transfección con
diferentes combinaciones de cadenas ligera y pesada. A modo de control, también se transfectaron células con plásmidos que codificaban el anticuerpo quimérico/de murino.
Purificación del anticuerpo
Se concentraron 15 ml de sobrenadante de las transfecciones de células CHO por centrifugación utilizando el casete de Amicon Ultra (Ultacell-50k) a 1500 rpm. El anticuerpo concentrado (550 µl) se purificó utilizando el kit Nab spin Protein A Plus (Thermo Scientific) de acuerdo con las recomendaciones del fabricante. A continuación, los anticuerpos purificados se desalaron utilizando PBS y el casete concentrador de Amicon Ultra (Ultracel-10K) a 2500 rpm hasta un volumen final de 250 µl. El anticuerpo purificado se cuantificó mediante la lectura de la DO280 utilizando un espectrofotómetro Nanodrop y se conservó congelado a -20 °C. Se volvió a suspender una alícuota del anticuerpo purificado en un volumen equivalente de Laemmli 2X, se calentó hasta 95 °C durante 5 min y se enfrió con hielo. Se hizo una curva patrón utilizando una cantidad conocida de IgG1 kappa humana purificada de plasma de mieloma humano (Athens Research). Las muestras se separaron en un gel de poliacrilamida Novex con un 10% de Tris-glicina (Invitrogen Canada Inc., Burlington, ON) y se transfirieron a una membrana de nitrocelulosa Hybond-N (Amersham Bioscience Corp., Baie d’Urfée, QC) durante 1 h a 275 mA. La membrana se bloqueó durante 1 h con un 0.15% de Tween 20 y un 5% de leche descremada en PBS, y se incubó durante 1 h con un anticuerpo de cabra anti-IgG humana (H+L) conjugado con Cy5 (Jackson, Cat# 109-176-099). La señal se detectó y cuantificó mediante un escaneado con el escáner Typhoon Trio+ (GE Healtcare). Según se muestra en la Figura 13, todas las combinaciones de las variantes del anticuerpo humanizado 3A4 se expresaron en células CHO.
Ejemplo 8
Análisis cinético del anticuerpo 3A4 humanizado y de murino
Suminstros
Los chips sensores GLM, el kit de acoplamiento de aminas Biorad ProteOn (EDC, sNHS y etanolamina) y los tampones de acetato de sodio 10 mM se adquirieron de Bio-Rad Laboratories (Mississauga, ON). El tampón de HEPES, EDTA y NaCl se adquirieron de Sigma-Aldrich (Oakville, ON). La solución de Tween 20 al diez por ciento se adquirió de Teknova (Hollister, CA). El anticuerpo de cabra específico anti-fragmento Fc de IgG humana se adquirió de Jackson ImmunoResearch. La columna de filtración en gel Superdex 75 10/300 GL se adquirió de GE Healthcare.
Filtración en gel
La proteína KAAG1 se inyectó en la columna Superdex G75 con una concentración de 3.114 mg/ml y un volumen de 220 μl. La separación se llevó a cabo a 0.4 ml/min en tampón de análisis HBST (remítase más adelante) sin Tween 20. El volumen de las fracciones recolectadas fue de 500 μL. La concentración de KAAG1 en cada una de las fracciones se determinó mediante la DO280 utilizando un coeficiente de extensión de 5500 y un PM de 8969. La Figura 14 representa el perfil de la filtración en gel de KAAG1. A aproximadamente 11 ml se eluye un pico pequeño de un posible agregado. La proteína eluida a los 13 ml se utilizó como analito para el ensayo de SPR (fracciones 15–19).
Ensayos con biosensores de SPR
Todos los ensayos de resonancia de plasmones superficiales se llevaron a cabo utilizando un instrumento BioRad ProteOn XPR36 (Bio-Rad Laboratories Ltd. Mississauga, ON) con tampón de análisis HBST (HEPES 10mM, NaCl 150 mM, EDTA 3.4 mM y un 0.05% de Tween 20 de pH 7.4) a una temperatura de 25 °C. La superficie de captura de anti-Fc de ratón se generó utilizando un chip sensor GLM activado mediante una dilución 1:5 de las soluciones estándar BioRad sNHS/EDC inyectadas durante 300 s a 30 μl/min en la dirección del analito (horizontal). Inmediatamente después de la activación, se inyectó una solución 13 μg/ml específica anti-fragmento Fc de IgG humana en NaOAc 10 mM de pH 4.5 en la dirección del analito con una tasa de flujo de 25 μl/min hasta que se inmovilizaron aproximadamente 8000 unidades de resonancia (UR). Los grupos activos remanentes se desactivaron con una inyección de 30 μl/min de etanolamina 1 M durante 300 s en la dirección del analito, lo cual también garantiza que se creen interespacios activados por simulación para la referencia del blanco. El cribado de las variantes de 3A4 para su unión a KAAG1 se realizó en dos pasos: una captura indirecta de las variantes de 3A4 del sobrenadante de las células sobre la superficie específica anti-fragmento Fc de IgG humana en la dirección del ligando (vertical) seguida de una inyección de KAAG1 en la dirección del analito. En primer lugar, se utilizó una inyección de 100 μl/min de tampón durante 30 s en la dirección del ligando para estabilizar la línea de base. Para cada captura de 3A4, las variantes de 3A4 no purificadas en medio de cultivo celular se diluyeron hasta un 4% en HBST, o se utilizaron aproximadamente 1.25 μg/ml de 3A4 purificado en HBST. Se inyectaron simultáneamente de cuatro a cinco variantes de 3A4 junto con 3A4 de origen natural en canales de ligando individuales durante 240 s con un flujo de 25 μl/min. Esto dio como resultado una captura de 3A4 saturante de aproximadamente 400-700 UR sobre la superficie específica anti-fragmento Fc de IgG humana. El primer canal de ligando se dejó vacío para utilizarlo como un control del blanco, cuando fuera necesario. Inmediatamente después de este paso de captura de 3A4, se realizaron dos inyecciones de tampón en la dirección del analito para estabilizar la línea de base y a continuación se inyectó el KAAG1 purificado por filtración en gel. Para un cribado típico, se inyectaron simultáneamente cinco concentraciones de KAAG1 (8, 2.66, 0.89, 0.29 y 0.098 nM) y control de tampón en canales de analito individuales con un flujo de 50 μl/min durante 120 s con una fase de disociación de 600 s, lo cual dio como resultado un conjunto de sensogramas de unión con una referencia de tampón para cada una de las variantes de 3A4
capturadas. Los complejos de superficie específica anti-fragmento Fc de IgG humana – 3A4 se regeneraron con un pulso de 18 s de ácido fosfórico al 0.85% durante 18 s con un flujo de 100 μl/min para preparar la superficie específica anti-fragmento Fc de IgG humana para el siguiente ciclo de inyección. Los sensogramas se alinearon y se referenciaron doblemente utilizando la inyección de blanco de tampón y espacios intermedios, y los sensogramas resultantes se analizaron utilizando el software ProteOn Manager v3.0. Los valores cinéticos y de afinidad se determinaron ajustando los sensogramas referenciados al modelo de unión de Langmuir 1:1 utilizando Rmáx local, y las constantes de afinidad (KD M) se obtuvieron a partir de las constantes de velocidad resultantes (kd s-1/ ka M-1s-1).
Determinación de las constantes de velocidad y afinidad
La Figura 15 resume las constantes de velocidad de asociación (ka, 1/Ms) y disociación (kd, 1/s), así como también las constantes de afinidad (KD, M) para la interacción de KAAG1 con 3A4 de murino purificado, 3A4 de murino expresado de forma transitoria como una variante quimérica y expresado de forma transitoria como una variante humanizada. Estas constantes se representan gráficamente en la Figura 16. La constante de velocidad de asociación es muy similar para la variante de 3A4 progenitora pura, quimérica y humanizada (Figura 16a). La constante de velocidad de disociación es similar para 3A4 quimérico expresado de forma transitoria en comparación con el 3A4 progenitor puro, lo cual sugiere que el procedimiento de transfección no alteró los parámetros de la interacción de KAAG1 con el anticuerpo (Figura 16b). Sin embargo, al parecer todas las variantes humanizadas tienen una velocidad de disociación ligeramente alterada, es decir, una velocidad de disociación más elevada (Figura 16b). Esto se reflejo en las constantes de afinidad (Figura 16c). En resumen, existe una correlación lineal entre la afinidad de unión (logKD) de la variante humanizada y el número de retromutaciones realizadas en el anticuerpo progenitor (LcHc), con una reducción de la afinidad de unión a medida que aumenta el número de mutaciones. Sin embargo, la diferencia en la afinidad de unión solo es de un factor de 4 entre la peor variante (H1L1, 0.47 nM), la cual no presenta ningún residuo de ratón conservado, y la mejor variante, la cual tiene 10 residuos de ratón conservados (H4L2, 0.1 nM). Finalmente, se ha observado que la afinidad de unión de todas las variantes por KAAG1 es subnanomolar y la mejor variante (H4L2, 0.1 nM) presentó una afinidad aproximadamente 6 veces más débil que la de murino (LcHc, 0.057 nM). En general, estos resultados indican que la humanización se llevó a cabo con éxito, ya que todas las variantes presentaron una afinidad muy elevada por KAAG1.
Ejemplo 9
Unión de variantes humanizadas de 3A4 a KAAG1 en un ensayo de ELISA
También se utilizaron métodos de ELISA para comparar la actividad de unión de las variantes de 3A4 humanizadas con el anticuerpo 3A4 de murino. Se aplicó KAAG1 humano recombinante como recubrimiento en placas de 96 pocillos durante toda la noche, se lavó y se incubó durante 1 h a temperatura ambiente con cantidades cada vez mayores de variantes de 3A4 humanizadas o de murino. Tras otra ronda de pasos de lavado, se añadió un anticuerpo anti-humano conjugado con HRP a los pocillos y el anticuerpo 3A4 unido se midió calorimétricamente a Abs450. Según se muestra en la Figura 17A, las variantes humanizadas (Lh1Hh1, Lh1Hh2, Lh1Hh3 y Lh1Hh4) presentaron una unión muy similar a KAAG1 en comparación con 3A4 de murino (LcHc). Este resultado indicó que las cuatro variantes de la cadena pesada humanizadas eran comparables a la cadena pesada h3A4 original cuando se acoplaban con la variante L1 de la cadena ligera humanizada. La Figura 17B muestra los resultados cuando las variantes de la cadena pesada se acoplaron con la variante Lh2 de la cadena ligera humanizada de 3A4. En este caso, existe una diferencia en la unión de las variantes. Por ejemplo, Lh2hh4 fue la variante con el perfil más similar en comparación a 3A4 de murino. Esto concuerda con los datos de SPR (remítase al Ejemplo 3), los cuales mostraron que la variante 4 de la cadena pesada presentaba la mayor afinidad por KAAG1. Considerados conjuntamente, estos resultados de unión muestran que las variantes humanizadas interaccionan todas ellas con KAAG1 humano en este ensayo. Aunque hubo algunas diferencias sutiles, la unión en el ensayo de ELISA concordó con los resultados de SPR.
Ejemplo 10
Unión de las variantes humanizadas de 3A4 en la superficie de células cancerosas
Se utilizó citometría de flujo para evaluar la capacidad de las variantes de 3A4 humanizadas para interaccionar con KAAG1 expresado en la superficie de células cancerosas. Con este fin, se incubaron células de cáncer de ovario SKOV3, que se había demostrado previamente que se unían de forma eficaz a 3A4 mediante citometría de flujo, con las ocho variantes humanizadas y el anticuerpo de murino original. Resumiendo, las células SKOV-3 se desprendieron de la placa con EDTA y se incubaron en hielo con 3.0 mg/ml, 0.3 mg/ml o 0.3 mg/ml de los anticuerpos durante 1 h. Después de tres pasos de lavado, las células se incubaron con el anticuerpo secundario, anti-IgG humana conjugado con FITC, durante 1 h en hielo. Se midió la fluorescencia de la superficie celular con un citómetro de flujo y los valores se muestran en el histograma de la Figura 18. Según se muestra, todas las variantes pudieron detectar KAAG1 en la superficie de células no permeabilizadas y las señales más intensas se obtuvieron con la concentración más elevada de los anticuerpos 3A4 (3 mg/ml) y se redujeron a medida que la concentración del anticuerpo se redujo. Entre las diferentes variantes, las que poseían más retromutaciones de murino (Figura 18, remítase a Lh1Hh4 y Lh2Hh4) interaccionaron con KAAG1 en la superficie de las células con la mayor actividad. De hecho, al parecer Lh1Hh4 y Lh2hh4 presentaron una unión a KAAG1 en la superficie celular ligeramente mejorada en comparación con el anticuerpo 3A4 de murino (LcHc).
PUBLICACIONES
-
Jemal A, Murray T, Ward E, Samuels A, Tiwari RC, Ghafoor A, Feuer EJ y Thun MJ. Cancer statistics, 2005. CA Cancer J Clin 2005; 55: 10-30.
-
Menon U, Skates SJ, Lewis S, Rosenthal AN, Rufford B, Sibley K, Macdonald N, Dawnay A, Jeyarajah A, Bast RC Jr, Oram D y Jacobs IJ. Prospective study using the risk of ovarian cancer algorithm to screen for ovarian cancer. J Clin Oncol. 2005; 23(31):7919-26.
-
Bonome T, Lee JY, Park DC, Radonovich M, Pise-Masison C, Brady J, Gardner GJ, Hao K, Wong WH, Barrett JC, Lu KH, Sood AK, Gershenson DM, Mok SC y Birrer MJ. Expression profiling of serous low malignancy potential, low grade, and high-grade tumors of the ovary. Cancer Res 2005; 65: 10602-10612.
-
Chambers, A y Vanderhyden, B. Ovarian Cancer Biomarkers in Urine. Clin Cancer Res 2006; 12(2): 323-327.
-
Berek et al. Cancer Medicine. 5.a ed. Londres: B.C. Decker, Inc.; 2000. págs. 1687-1720.
-
Bristow R.E. Surgical standards in the management of ovarian cancer. Curr Opin Oncol 2000; 12: 474-480.
-
Brown E, Stewart M, Rye T, Al-Nafussi A, Williams AR, Bradburn M, Smyth J y Gabra H. Carcinosarcoma of the ovary: 19 years of prospective data from a single center. Cancer 2004; 100: 2148-2153.
-
Shih L-M y Kurman RJ. Molecular Pathogenesis of Ovarian Borderline Tumors: New Insights and Old Challenges. Clin Cancer Res 2005; 11(20): 7273-7279.
-
Seidman JD, Russell P, Kurman RJ. Surface epithelial tumors of the ovary. En: Kurman RJ, editor. Blaustein’s pathology of the female genital tract. 5.a ed. Nueva York: Springer-Verlag; 2002. págs. 791-904.
-
Cannistra SA y McGuire WP. Progress in the management of gynecologic cancer. J. Clin. Oncol. 2007; 25(20): 28652866.
-
Oei AL, Sweep FC, Thomas CM, Boerman OC, Massuger LF. The use of monoclonal antibodies for the treatment of epithelial ovarian cancer. Int. J. Oncol. 2008; 32(6): 1145-1157.
-
Nicodemus CF y Berek JS. Monoclonal antibody therapy of ovarian cancer. Expert Rev. Anticancer Ther. 2005; 5(1): 87-96.
-
Burger RA. Experience with bevacizumab in the management of epithelial ovarian cancer. J. Clin. Oncol. 2007; 25(20): 2902-2908.
-
Simon I, Zhuo S, Corral L, Diamandis EP, Sarno MJ, Wolfert RL, Kim NW. B7-H4 is a novel membrane-bound protein and a candidate serum and tissue biomerker for ovarian cancer. Cancer Res. 2006; 66(3): 1570-1575.
-
Ebel W, Routhier EL, Foley B, Jacob S, McDonough JM, Patel RK, Turchin HA, Chao Q, Kline JB, Old LJ, Phillips MD, Nicolaides NC, Sass PM, Grasso L. Preclinical evaluation of MORab-003, a humanized monoclonal antibody antagonizing folate receptor-alpha. Cancer Immun. 2007; 7: 6-13.
-
Van den Eynde BJ, Gaugler B, Probst-Kepper M, Michaux L, Devuyst O, Lorge F, Weynants P, Boon T. A new antigen recognized by cytotoxic T lymphocytes on a human kidney tumor results from reverse strand transcription. J. Exp. Med. 1999; 190(12): 1793-1799.
-
Sooknanan R, Tremblay GB, Filion M. Polynucleotides and polypeptide sequences involved in cancer. 2007; PCT/CA2007/001134 publicada con el N.o WO/2007/147265 el 27 de diciembre de 2007.
-
Schumacher J, Anthoni H, Dahdouh F, König IR, Hillmer AM, Kluck N, Manthey M, Plume E, Warnke A, Remschmidt H, Hülsmann J, Cichon S, Lindgren CM, Propping P, Zucchelli M, Ziegler A, Peyrard-Janvid M, Schulte-Körne G, Nöthen MM, Kere J. Strong genetic evidence of DCDC2 as a susceptibility gene for dyslexia. Am. J. Hum. Genet. 2006; 78: 52
62.
-
Cope N, Harold D, Hill G, Moskvina V, Stevenson J, Holmans P, Owen MJ, O'Donovan MC, Williams J. Strong evidence that KIAA0319 on chromosome 6p is a susceptibility gene for developmental dyslexia. Am. J. Hum. Genet. 2005; 76: 581-591.
-
Mor G, Visintin I, Lai Y, Zhao H, Schwartz P, Rutherford T, Yue L, Bray-Ward P y Ward DC. Serum protein markers for early detection of ovarian cancer. PNAS 2005; 102: 7677-7682.
-
Kozak KR, Amneus MW, Pusey SM, Su F, Luong MN, Luong SA, Reddy ST y Farias-Eisner R. Identification of biomarkers for ovarian cancer using strong anion-exchange ProteinChips: potential use in diagnosis and prognosis. PNAS 2003; 100: 12343-12348.
-
Benoît MH, Hudson TJ, Maire G, Squire JA, Arcand SL, Provencher D, Mes-Masson AM, Tonin PN. Global analysis of chromosome X gene expression in primary cultures of normal ovarian surface epithelial cells and epithelial ovarian cancer cell lines. Int. J. Oncol. 2007; 30(1): 5-17.
-
Cody NA, Zietarska M, Filali-Mouhim A, Provencher DM, Mes-Masson AM, Tonin PN. Influence of monolayer, 5 spheroid, and tumor growth conditions on chromosome 3 gene expression in tumorigenic epithelial ovarian cancer cell lines. BMC Med. Genomics 2008; 1(1) :34.
-
Buechler J, Valkirs G, Gray J. Polyvalent display libraries.2000; U.S. 6.057.098.
-
Durocher Y, Kamen A, Perret S, Pham PL. Enhanced production of recombinant proteins by transient transfection of suspension-growing mammalian cells. WO 02/090533.
10 -Durocher Y. Expression vectors for enhanced transient gene expression and mammalian cells expressing them. WO 2006/096989.
-
Tremblay GB, Filion M. Antibodies that specifically block the biological activity of a tumor antigen. WO 2010/060186.
-
Durocher Y, Kamen A, Perret S, Pham PL. Enhanced production of recombinant proteins by transient transfection of suspension-growing mammalian cells. 2002; solicitud de patente canadiense N.o CA 2446185 (publicada como CA 15 2446185C).
-
Durocher Y. Expression vectors for enhanced transient gene expression and mammalian cells expressing them.2004; solicitud de patente de EE. UU. N.o 60/662,392.
-
Chang MH, Karageorgos LE, Meikle PJ. CD107a (LAMP-1) and CD107b (LAMP-2). 2002; J Biol Regul Homeost Agents. 16:147-51.
20 -Abhinandan, KR y Martin, ACR. Analysis and improvements to Kabat and structurally correct numbering of antibody variable domains. 2008; Mol Immunol, 45, 3832-3839.
Secuencias mencionadas en la descripción SEQ ID NO.:1 – secuencia de nucleótidos de la región variable de la cadena pesada de 3A4
SEQ ID NO.:2 – secuencia polipeptídica de la región variable de la cadena pesada de 3A4
SEQ ID NO.:3 – secuencia de nucleótidos de la región variable de la cadena ligera de 3A4
SEQ ID NO.:4 – secuencia polipeptídica de la región variable de la cadena ligera de 3A4
10 SEQ ID NO.:5 – secuencia polipeptídica de CDR1 de la cadena pesada de 3A4 GYTFTDDYMS SEQ ID NO.:6 – secuencia polipeptídica de CDR2 de la cadena pesada de 3A4 DINPYNGDTN SEQ ID NO.:7 – secuencia polipeptídica de CDR3 de la cadena pesada de 3A4
15 DPGAMDY SEQ ID NO.:8 – secuencia polipeptídica de CDR1 de la cadena ligera de 3A4 RSSQSLLHSNGNTYLE SEQ ID NO.:9 – secuencia polipeptídica de CDR2 de la cadena ligera de 3A4 TVSNRFS
20 SEQ ID NO.:10 – secuencia polipeptídica de CDR3 de la cadena ligera de 3A4 FQGSHVPLT SEQ ID NO.:11 – OGS1773 GTAAGCAGCGCTGTGGCTGCACCATCTGTCTTC SEQ ID NO.:12 – OGS1774
25 GTAAGCGCTAGCCTAACACTCTCCCCTGTTGAAGC SEQ ID NO.:13 – secuencia de nucleótidos constante kappa humana
SEQ ID NO.:14 – secuencia polipeptídica constante kappa humana
SEQ ID NO.:15
SEQ ID NO.:16 – OGS18500 ATGCCAAGTGGTCCCAGGCTGATGTTGTGATGACCCAAACTCC
5 SEQ ID NO:.17 – OGS2084 GGGAAGATGAAGACAGATGGTGCAGCCACAGTCCG SEQ ID NO.:18 – OGS1769 GTAAGCGCTAGCGCCTCAACGAAGGGCCCATCTGTCTTTCCCCTGGCCCC SEQ ID NO.:19 – OGS1770
10 GTAAGCGAATTCACAAGATTTGGGCTCAACTTTCTTG SEQ ID NO.:20 – secuencia de nucleótidos de la región CH1 de inmunoglobulina humana
SEQ ID NO.:21 – secuencia polipeptídica de la región CH1 de inmunoglobulina humana
SEQ ID NO.:22
SEQ IDNO.:23 – OGS1879 GGGTTCCAGGTTCCACTGGCCAGATCCAGTTGGTGCAATCTGG
5 SEQ ID NO.:24 – OGS1810 GGGGCCAGGGGAAAGACAGATGGGCCCTTCGTTGAGGC SEQ ID NO.:25 GTAAGCGGATCCATGGATGACGACGCGGCGCCC SEQ ID NO.:26
10 GTAAGCAAGCTTAGGCCGCTGGGACAGCGGAGGTGC
SEQ ID NO.:27 GTAAGCAAGCTTGGCAGCAGCGCCAGGTCCAGC SEQ ID NO.:28
SEQ ID NO.:29
SEQ ID NO.:30 (región variable de la cadena ligera variante)
donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido 10 (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:4. La sustitución del aminoácido puede ser, por ejemplo, conservativa.
SEQ ID NO.:31 (región variable de la cadena ligera variante)
donde Xa1 puede ser un aminoácido hidrófobo;
15 donde Xa2 puede ser A o P; donde Xa3 puede ser un aminoácido hidrófilo neutro; donde Xa4 puede ser L o P; donde Xa5 puede ser un aminoácido ácido; donde Xa6 puede ser Q o P;
20 donde Xa7 puede ser un aminoácido básico; donde Xa8 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xa9 puede ser A o Q; donde Xa10 puede ser un aminoácido básico; o donde Xa11 puede ser un aminoácido hidrófobo,
25 donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:4.
SEQ ID NO.:32 (región variable de la cadena ligera variante)
donde XA1 puede ser V o I donde XA2 puede ser A o P donde XA3 puede ser S o T donde XA4 puede ser L o P donde XA5 puede ser D o E donde XA6 puede ser Q o P donde XA7 puede ser K o Q donde XA8 puede ser L o V donde XA9 puede ser A o Q donde XA10 puede ser R o K, o donde XA11 puede ser L o I, donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:4.
SEQ ID NO.:33 (región variable de la cadena ligera 1 variante: Lvh1)
SEQ ID NO.:34 (región variable de la cadena ligera 2 variante: Lvh2)
SEQ ID NO.:35 (región variable de la cadena pesada variante)
donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:2. La sustitución del aminoácido puede ser, por ejemplo, conservativa.
SEQ ID NO.:36 (región variable de la cadena pesada variante)
donde Xb1 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb2 puede ser P o A; donde Xb3 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb4 puede ser V o K; donde Xb5 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb6 puede ser un aminoácido básico; donde Xb7 puede ser S o A; donde Xb8 puede ser H o P; donde Xb9 puede ser un aminoácido básico; donde Xb10 puede ser S o G; donde Xb11 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb12 puede ser un aminoácido básico; donde Xb13 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb14 puede ser I o T; donde Xb15 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb16 puede ser un aminoácido hidrófobo; donde Xb17 puede ser K o T; donde Xb18 puede ser un aminoácido hidrófilo neutro; donde Xb19 puede ser Q o E; donde Xb20 puede ser N o S; donde Xb21 puede ser T o R; donde Xb22 puede ser un aminoácido hidrófilo neutro; o donde Xb23 puede ser S o L; donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:2.
SEQ ID NO.:37 (región variable de la cadena pesada variante)
donde XB1 puede ser I o V; donde XB2 puede ser P o A; donde XB3 puede ser M o V; donde XB4 puede ser V o K; donde XB5 puede ser M o V; donde XB6 puede ser K o R; donde XB7 puede ser S o A; donde XB8 puede ser H o P; donde XB9 puede ser K o Q; donde XB10 puede ser S o G; donde XB11 puede ser I o M; donde XB12 puede ser K o R; donde XB13 puede ser A o V; donde XB14 puede ser I o T; donde XB15 puede ser L o I; donde XB16 puede ser V o A; donde XB17 puede ser K o T; donde XB18 puede ser S o T; donde XB19 puede ser Q o E; donde XB20 puede ser N o S; donde XB21 puede ser T o R; donde XB22 puede ser S o T; o donde XB23 puede ser S o L, donde al menos uno de los aminoácidos identificados con una X corresponde a una sustitución de un aminoácido (conservativa o no conservativa) en comparación con el aminoácido correspondiente del polipéptido expuesto en la SEQ ID NO.:2.
SEQ ID NO.:38 (región variable de la cadena pesada 1 variante: Hvh1)
SEQ ID NO.:39 (región variable de la cadena pesada 2 variante: Hvh2)
SEQ ID NO.:40 (región variable de la cadena pesada 3 variante: Hvh3)
SEQ ID NO.:41 (región variable de la cadena pesada 4 variante: Hvh4)
SEQ ID NO: 42 cadena (kappa) ligera de murino de 3A4
SEQ ID NO:43 variante 1 de la cadena ligera (kappa) humanizada de 3A4; Lh1
SEQ ID NO:44 variante 2 de la cadena ligera (kappa) humanizada de 3A4; Lh2
SEQ ID NO:45 cadena pesada (Igg1) de murino de 3A4
SEQ ID NO:46 variante 1 de la cadena pesada (Igg1) humanizada de 3A4; Hh1
SEQ ID NO:47 variante 2 de la cadena pesada (Igg1) humanizada de 3A4; Hh2
10 SEQ ID NO:48 variante 3 de la cadena pesada (Igg1) humanizada de 3A4; Hh3
SEQ ID NO:49 variante 4 de la cadena pesada (Igg1) humanizada de 3A4: Hh4
SEQ ID NO:50
5 ATACCCAAGCTTGCCACCATGGAGACAGACACAC SEQ ID NO:51 ATACCCAAGCTTCATTTCCCGGGAGACAGGGAG SEQ ID NO:52 ATACCCAAGCTTGGGCCACCATGAACTTTCTGCTGTCTTGG
10 SEQ ID NO:53 ATACCCAAGCTTCTAACACTCTCCCCTGTTGAAG SEQ ID NO:54 pK-CR5
SEQ ID NO:55 pMPG-CR5
SEQ ID NO.:56 – secuencia polipeptídica de CDR2 de la cadena pesada humanizada de 3A4 DINPYNGDTNYNQKFKG

Claims (19)

  1. REIVINDICACIONES
    1. Un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este que se une al antígeno 1 asociado al riñón (KAAG1), donde dicho anticuerpo comprende una región variable de la cadena pesada que contiene
    a.
    una secuencia de CDRH1 que comprende la SEQ ID NO.:5 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:5,
    b.
    una secuencia de CDRH2 que comprende la SEQ ID NO.:6 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:6, y
    c.
    una secuencia de CDRH3 que comprende la SEQ ID NO.:7 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:7, y una región variable de la cadena ligera que contiene
    d.
    una secuencia de CDRL1 que comprende la SEQ ID NO.:8 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:8,
    e.
    una secuencia de CDRL2 que comprende la SEQ ID NO.:9 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:9, y
    f.
    una secuencia de CDRL3 que comprende la SEQ ID NO.:10 o como la que se expone en la SEQ ID NO.:10.
  2. 2.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la reivindicación 1, donde la región variable de la cadena pesada es como la que se expone en la SEQ ID NO.:35, SEQ ID NO.:36 o SEQ ID NO.:37 y/o donde la región variable de la cadena ligera es como la que se expone en la SEQ ID NO.:30, SEQ ID NO.:31 o SEQ ID NO.:32.
  3. 3.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la reivindicación 1, donde la región variable de la cadena pesada es como la que se expone en la SEQ ID NO.:41, SEQ ID NO.:38, SEQ ID NO.:39 o SEQ ID NO.:40 y/o donde la región variable de la cadena ligera es como la que se expone en la SEQ ID NO.:33 o SEQ ID NO.:34.
  4. 4.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, donde el anticuerpo comprende la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:49, SEQ ID NO.:46, SEQ ID NO.:47 o SEQ ID NO.:48 y/o la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:43 o SEQ ID NO.:44.
  5. 5.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la reivindicación 1 o 3, donde dicho anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este comprende:
    a.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:41 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:33;
    b.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:49 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:43;
    c.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:38 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:33;
    d.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:46 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:43;
    e.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:39 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:33;
    f.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:47 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:43;
    g.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:40 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:33;
    h.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:48 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:43;
    i.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:41 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:34;
    j.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:49 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:44;
    k.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:38 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:34;
    l.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:46 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:44;
    m.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:39 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:34;
    n.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:47 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:44;
    o.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:40 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:34;
    p.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:48 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:44;
    q.
    la región variable de la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:2 y la región variable de la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:4; o
    r.
    la cadena pesada que se expone en la SEQ ID NO.:45 y la cadena ligera que se expone en la SEQ ID NO.:42.
  6. 6.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, donde el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este está conjugado con un resto terapéutico, un agente citotóxico o con un resto detectable.
  7. 7.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la reivindicación 6, donde el agente citotóxico comprende una auristatina.
  8. 8.
    El anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de la reivindicación 7, donde la auristatina comprende auristatina monometílica E o auristatina monometílica F.
  9. 9.
    Un ácido nucleico que codifica
    (i) una región variable de la cadena ligera y una región variable de la cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5; o
    (ii) una cadena ligera y una cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5.
  10. 10.
    Un vector que comprende el ácido nucleico de la reivindicación 9.
  11. 11.
    Una célula aislada que comprende
    (i)
    el ácido nucleico de la reivindicación 9;
    (ii)
    un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera y una región variable de la cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5;
    (iii) un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena ligera del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 y un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una región variable de la cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5;
    (iv)
    un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena ligera y una cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5;
    (v)
    un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena ligera del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 y un vector que comprende una molécula de ácido nucleico que codifica una cadena pesada del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5; o
    (vi)
    el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8.
  12. 12.
    Una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, y un portador farmacéuticamente aceptable.
  13. 13.
    Un uso ex vivo de un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 en la detección de un tumor o en el diagnóstico del cáncer, donde el tumor o cáncer comprende células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
  14. 14.
    Un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 para su uso en la detección in vivo de un tumor o en el diagnóstico in vivo del cáncer, donde el tumor o cáncer comprende células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
  15. 15.
    Un anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 para su uso en el tratamiento de un cáncer que comprende células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
  16. 16.
    Un uso del anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 para la detección in vitro de células que expresan KAAG1 o una variante de KAAG1.
  17. 17.
    El uso de la reivindicación 13, o el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 para su uso de acuerdo con la reivindicación 14 o la reivindicación 15, donde el cáncer se selecciona del grupo constituido por cáncer de ovario, cáncer de piel, cáncer renal, cáncer colorrectal, sarcoma, leucemia, cáncer cerebral, cáncer de tiroides, cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer esofágico, cáncer de vejiga, cáncer de pulmón, cáncer de cabeza y cuello, cáncer de ovario metastásico, cáncer de piel metastásico, cáncer renal metastásico, cáncer colorrectal metastásico, sarcoma metastásico, leucemia metastásica, cáncer cerebral metastásico, cáncer de tiroides metastásico, cáncer de mama metastásico, cáncer de próstata metastásico, cáncer esofágico metastásico, cáncer de vejiga metastásico, cáncer de pulmón metastásico y cáncer de cabeza y cuello metastásico.
  18. 18.
    Un kit que comprende el anticuerpo o fragmento de unión al antígeno de este de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8.
  19. 19.
    Un método para obtener un anticuerpo de cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, donde el método comprende expresar un polipéptido o ARN a partir de secuencias de nucleótidos capaces de codificar cadenas de inmunoglobulina ligeras y pesadas de dicho anticuerpo en un sistema de célula huésped.
    62 63 64
    74 75 76 77
    79 80 81 82 83 84 85 86
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Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP3130674B1 (en) 2008-11-03 2020-07-08 ADC Therapeutics SA Antibodies that specifically block the biological activity of a tumor antigen
DK3173427T3 (da) 2011-03-31 2019-08-05 Adc Therapeutics Sa Antistoffer mod nyre-associeret antigen 1 og antigen-bindende fragmenter deraf
ES2731665T3 (es) 2012-01-09 2019-11-18 Adc Therapeutics Sa Agentes para tratar cáncer de mama triple negativo
US20130280282A1 (en) * 2012-04-24 2013-10-24 Daiichi Sankyo Co., Ltd. Dr5 ligand drug conjugates
HRP20211640T1 (hr) 2017-02-08 2022-02-04 Adc Therapeutics Sa Konjugati pirolobenzodiazepin - protutijelo
IL266153A (en) * 2019-04-18 2019-07-31 Aharon Anat Extracellular vesicles derived from t cells containing a chimeric antigen receptor
GB201908128D0 (en) 2019-06-07 2019-07-24 Adc Therapeutics Sa Pyrrolobenzodiazepine-antibody conjugates
AU2023321962A1 (en) 2022-08-12 2025-02-20 Epibiologics, Inc. Degradation of egfr using a bispecific binding agent
WO2024108193A2 (en) 2022-11-18 2024-05-23 Epibiologics, Inc. Degradation of cmet using a bispecific binding agent

Family Cites Families (195)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US662392A (en) 1899-12-12 1900-11-27 Friedrich Wilhelm Buehne Method of making metal wool.
US5075447A (en) 1984-09-17 1991-12-24 Hoffmann-La Roche Inc. Ruthenium complexes useful as carriers for immunologically active materials
DK365785A (da) 1984-09-17 1986-03-18 Hoffmann La Roche Metalcomplexer
GB8601646D0 (en) 1986-01-23 1986-02-26 Davidson R S Binding assay & reagent
US5585279A (en) 1986-01-23 1996-12-17 Davidson; Robert S. Time-resolved luminescence binding assays using a fluorescent transition metal label other than ruthenium
US6018030A (en) 1986-11-04 2000-01-25 Protein Polymer Technologies, Inc. Peptides comprising repetitive units of amino acids and DNA sequences encoding the same
JPH07110852B2 (ja) 1989-12-28 1995-11-29 ジ・アップジョン・カンパニー 二芳香族置換抗ａｉｄｓ化合物
IL105325A (en) 1992-04-16 1996-11-14 Minnesota Mining & Mfg Immunogen/vaccine adjuvant composition
US5708022A (en) 1994-10-28 1998-01-13 Procept, Inc. Method for inhibiting immune response
AU4017695A (en) 1994-10-28 1996-05-23 Procept, Inc. Ruthenium complexes and their use as immunosuppressive agents
US5712127A (en) 1996-04-29 1998-01-27 Genescape Inc. Subtractive amplification
US5831003A (en) 1996-06-28 1998-11-03 Bayer Corporation Peptides which bind to prothrombin and thrombin
US6057098A (en) 1997-04-04 2000-05-02 Biosite Diagnostics, Inc. Polyvalent display libraries
US6503711B1 (en) 1997-06-18 2003-01-07 Ulrich J. Krull Nucleic acid biosensor diagnostics
AU1824899A (en) 1997-12-15 1999-07-05 Joseph R Lakowicz Method and composition for characterizing a sample containing a sample lipid andan assay kit
US6759243B2 (en) 1998-01-20 2004-07-06 Board Of Trustees Of The University Of Illinois High affinity TCR proteins and methods
US6472367B1 (en) 1998-05-05 2002-10-29 Adherex Technologies, Inc. Compounds and methods for modulating OB-cadherin mediated cell adhesion
JP2002514400A (ja) 1998-05-13 2002-05-21 ルードヴィッヒ インスティテュート フォー キャンサー リサーチ 遍在的に発現される新規な遺伝子のリバースストランドによってコードされている腫瘍関連抗原
DE69937735T2 (de) 1998-05-13 2008-11-27 Domantis Ltd., Brentford Phagen-display-selektionssystem für korrekt gefaltete proteine
US7037667B1 (en) 1998-06-01 2006-05-02 Agensys, Inc. Tumor antigen useful in diagnosis and therapy of prostate and colon cancer
US7521197B2 (en) 1998-06-05 2009-04-21 Alexis Biotech Limited Method for producing cytotoxic T-cells
US20020106678A1 (en) 1998-06-30 2002-08-08 Robishaw Janet D. cDNA clones encoding human G protein gamma subunits
US6562823B1 (en) 1998-07-02 2003-05-13 Merck & Co., Inc. Inhibitors of prenyl-protein transferase
US6288221B1 (en) 1998-08-20 2001-09-11 Duke University Methods of synthesis of halogen base-modified oligonucleotides and subsequent labeling with a metal-catalyzed reaction
WO2000014515A1 (en) 1998-09-08 2000-03-16 University Of Maryland At Baltimore Low frequency modulation sensors using nanosecond fluorophores
US6806089B1 (en) 1998-09-08 2004-10-19 University Of Maryland, Baltimore Low frequency modulation sensors using nanosecond fluorophores
US6358953B1 (en) 1998-10-22 2002-03-19 Phillip B. B. Moheno Pterin antineoplastic agents
JP2002528504A (ja) 1998-10-29 2002-09-03 メルク エンド カムパニー インコーポレーテッド プレニル蛋白トランスフェラーゼ阻害薬
KR20010112343A (ko) 1999-03-19 2001-12-20 추후제출 금속 착화합물을 포함하는 약제학적 조성물
US6872519B1 (en) 1999-04-27 2005-03-29 Mirus Bio Corporation In vitro process for selecting phage resistant to blood inactivation
US20090087878A9 (en) 1999-05-06 2009-04-02 La Rosa Thomas J Nucleic acid molecules associated with plants
GB9916529D0 (en) 1999-07-14 1999-09-15 Chiron Spa Antigenic peptides
WO2001019798A2 (en) 1999-09-17 2001-03-22 Cor Therapeutics Inc. INHIBITORS OF FACTOR Xa
WO2001046209A1 (en) 1999-12-20 2001-06-28 Fluorrx, Inc. Fluorescent probes
US20030219806A1 (en) 2000-02-22 2003-11-27 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel 18607, 15603, 69318, 12303, 48000, 52920, 5433, 38554, 57301, 58324, 55063, 52991, 59914, 59921 and 33751 molecules and uses therefor
US7585839B2 (en) 2000-02-23 2009-09-08 Zealand Pharma A/S Medical uses of intercellular communication facilitating compounds
US20030215860A1 (en) 2000-02-29 2003-11-20 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel 18636, 2466, 43238, 1983, 52881, 2398, 45449, 50289, 52872 and 26908 molecules and uses therefor
US20030165831A1 (en) 2000-03-21 2003-09-04 John Lee Novel genes, compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of ovarian cancer
US6436703B1 (en) 2000-03-31 2002-08-20 Hyseq, Inc. Nucleic acids and polypeptides
US7834146B2 (en) 2000-05-08 2010-11-16 Monsanto Technology Llc Recombinant polypeptides associated with plants
AU2001269836A1 (en) 2000-06-16 2002-01-02 Incyte Genomics, Inc. Proteases
WO2002006339A2 (en) 2000-07-03 2002-01-24 Curagen Corporation Proteins and nucleic acids encoding same
US20050053930A1 (en) 2000-07-18 2005-03-10 David Anderson Therapeutic polypeptides, nucleic acids encoding same, and methods of use
US6812339B1 (en) 2000-09-08 2004-11-02 Applera Corporation Polymorphisms in known genes associated with human disease, methods of detection and uses thereof
GB0023008D0 (en) 2000-09-20 2000-11-01 Glaxo Group Ltd Improvements in vaccination
US20030133939A1 (en) 2001-01-17 2003-07-17 Genecraft, Inc. Binding domain-immunoglobulin fusion proteins
US7754208B2 (en) 2001-01-17 2010-07-13 Trubion Pharmaceuticals, Inc. Binding domain-immunoglobulin fusion proteins
US7320793B2 (en) 2001-01-19 2008-01-22 Cytos Biotechnology Ag Molecular antigen array
TWI329129B (en) 2001-02-08 2010-08-21 Wyeth Corp Modified and stabilized gdf propeptides and uses thereof
US6783969B1 (en) 2001-03-05 2004-08-31 Nuvelo, Inc. Cathepsin V-like polypeptides
US7030236B2 (en) 2001-03-09 2006-04-18 Mona Savitri Jhaveri Antisense oligonucleotides tarageting folate receptor alpha, and the use thereof
WO2002071928A2 (en) 2001-03-14 2002-09-19 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acid molecules and proteins for the identification, assessment, prevention, and therapy of ovarian cancer
US20030065157A1 (en) 2001-04-04 2003-04-03 Lasek Amy W. Genes expressed in lung cancer
EP2280030A3 (en) 2001-04-10 2011-06-15 Agensys, Inc. Nucleic acids and corresponding proteins useful in the detection and treatment of various cancers
CA2444691A1 (en) 2001-04-18 2002-10-31 Protein Design Labs, Inc. Methods of diagnosis of lung cancer, compositions and methods of screening for modulators of lung cancer
US10421950B2 (en) 2001-05-07 2019-09-24 National Research Council Of Canada Enhanced production of recombinant proteins by transient transfection of suspension-growing mammalian cells
US20100056762A1 (en) * 2001-05-11 2010-03-04 Old Lloyd J Specific binding proteins and uses thereof
EP1517998A2 (en) 2001-06-18 2005-03-30 EOS Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer
US20040053824A1 (en) 2001-06-29 2004-03-18 Tang Y Tom Extracellular matrix and cell adhesion molecules
US20030099974A1 (en) 2001-07-18 2003-05-29 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Novel genes, compositions, kits and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of breast cancer
US7528141B2 (en) 2001-08-31 2009-05-05 Btg International Limited Use of cyclopenta[g]quinazoline derivatives for treating cancer
CA2458813C (en) 2001-08-31 2011-11-01 Btg International Limited Anti-cancer cyclopenta[g]quinazoline compounds
US7622260B2 (en) 2001-09-05 2009-11-24 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Diagnostic and prognostic tests
US20030124579A1 (en) 2001-09-05 2003-07-03 Eos Biotechnology, Inc. Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer
AR045702A1 (es) 2001-10-03 2005-11-09 Chiron Corp Composiciones de adyuvantes.
EP1448200A2 (en) 2001-11-19 2004-08-25 Elan Pharmaceuticals, Inc. (4-phenyl)piperidin-3-yl-phenylcarboxylate derivatives and related compounds as beta-secretase inhibitors for the treatment of alzheimer's disease
AU2002351194A1 (en) 2001-11-30 2003-06-17 Incyte Genomics, Inc. Cell adhesion and extracellular matrix proteins
DE10162480A1 (de) 2001-12-19 2003-08-07 Ingmar Hoerr Die Applikation von mRNA für den Einsatz als Therapeutikum gegen Tumorerkrankungen
AU2003201733B2 (en) 2002-01-09 2008-11-06 Xigen Sa Cell-permeable peptide inhibitors of the JNK signal transduction pathway
ATE371680T1 (de) 2002-01-16 2007-09-15 Biocompatibles Uk Ltd Polymerkonjugate
EP1478328B1 (en) 2002-01-28 2013-06-05 Keraplast Technologies Ltd. Bioactive keratin peptides
US6962910B2 (en) 2002-02-01 2005-11-08 Virginia Tech Intellectual Properties, Inc. Supramolecular complexes as photoactivated DNA cleavage agents
AU2003225573A1 (en) 2002-02-13 2003-09-04 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary, Department Of He Identification of ovarian cancer tumor markers and therapeutic targets
DE10206616A1 (de) 2002-02-15 2003-09-04 Qiagen Gmbh Verfahren zur Reduktion der Background-Kontamination nach Markierungsreaktionen
US20040009939A1 (en) 2002-03-05 2004-01-15 Board Of Regent, The University Of Texas System Methods of enhancing immune induction involving MDA-7
CA2492671C (en) 2002-03-22 2012-04-17 Aprogen, Inc. Humanized antibody and process for preparing same
US20040101874A1 (en) 2002-04-12 2004-05-27 Mitokor Inc. Targets for therapeutic intervention identified in the mitochondrial proteome
EP1575491A4 (en) 2002-05-20 2006-09-27 Abgenix Inc TREATMENT OF RENAL CARCINOMA USING ANTIBODIES AGAINST THE EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR
CA2500687A1 (en) 2002-10-02 2004-04-15 Genentech, Inc. Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
EP1422242A1 (en) 2002-11-22 2004-05-26 Emory University Plastic and elastic protein copolymers
CN1768139A (zh) 2003-02-10 2006-05-03 独立行政法人产业技术总合研究所 通过dna干扰调控基因的表达
WO2004087874A2 (en) 2003-03-28 2004-10-14 Nuvelo, Inc. Novel nucleic acids and polypeptides
US20060229433A1 (en) 2003-05-20 2006-10-12 Cellpep Sa Modified antiviral peptides with increased activity and cell membrane affinity
EP1636363A1 (en) 2003-05-21 2006-03-22 GeneSense Technologies Inc. Antisense oligonucleotides directed to ribonucleotide reductase r1 and uses thereof in the treatment of cancer
WO2005021710A2 (en) 2003-06-02 2005-03-10 University Of Miami Chimeric molecules and methods of use
US20060078941A1 (en) 2003-06-09 2006-04-13 Santin Alessandro D Gene expression profiling in primary ovarian serous papillary tumors and normal ovarian epithelium
WO2005004795A2 (en) 2003-06-09 2005-01-20 University Of Cincinnati Compositions and methods for targeted drug delivery
GB0314472D0 (en) 2003-06-20 2003-07-23 Warwick Effect Polymers Ltd Polymer
GB0318096D0 (en) 2003-08-01 2003-09-03 Queen Mary & Westfield College Vaccine
DE10335833A1 (de) 2003-08-05 2005-03-03 Curevac Gmbh Transfektion von Blutzellen mit mRNA zur Immunstimulation und Gentherapie
US20070178458A1 (en) 2003-09-05 2007-08-02 O'brien Philippa Methods of diagnosis and prognosis of ovarian cancer II
US20050147621A1 (en) 2003-10-10 2005-07-07 Higgins Darren E. Use of bacterial 5' untranslated regions for nucleic acid expression
DE10347710B4 (de) 2003-10-14 2006-03-30 Johannes-Gutenberg-Universität Mainz Rekombinante Impfstoffe und deren Verwendung
EP1697389A4 (en) 2003-10-24 2008-12-24 Eisai R&D Man Co Ltd COMPOUNDS AND METHODS FOR TREATING ILLNESS AND SUFFERING TOLL-LIKE RECEPTOR 2 RELATED DISORDERS
US20050153333A1 (en) 2003-12-02 2005-07-14 Sooknanan Roy R. Selective terminal tagging of nucleic acids
EP1547581A1 (en) 2003-12-23 2005-06-29 Vectron Therapeutics AG Liposomal vaccine for the treatment of human hematological malignancies
EP1550458A1 (en) 2003-12-23 2005-07-06 Vectron Therapeutics AG Synergistic liposomal adjuvants
WO2005070456A2 (en) 2004-01-09 2005-08-04 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Diagnosing and treating female reproductive tract or chilhood cancer with pmsa antibodies
US20090169520A1 (en) 2004-01-09 2009-07-02 Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Compounds, Pharmaceutical Compositions and Therapeutic Methods of Preventing and Treating Diseases and Disorders Associated With Amyloid Fibril Formation
EP1747284A4 (en) 2004-02-06 2009-03-11 Wyeth Corp DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS OF CANCER
CA2557438C (en) 2004-02-19 2017-01-17 Yale University Identification of cancer protein biomarkers using proteomic techniques
CA2558155A1 (en) 2004-03-01 2005-09-09 Zvi Sidelman Casein derived peptides and therapeutic uses thereof
CA2558767A1 (en) 2004-07-06 2006-01-12 Warwick Effect Polymers Limited Living radical polymerization initiator comprising a functional group capable of reacting with polyeptides or the like, comb polymer obtained therewith, polypeptide conjugates anddrugs obtained therefrom
WO2007084413A2 (en) 2004-07-14 2007-07-26 Ptc Therapeutics, Inc. Methods for treating hepatitis c
US7772271B2 (en) 2004-07-14 2010-08-10 Ptc Therapeutics, Inc. Methods for treating hepatitis C
US7553944B2 (en) 2004-07-21 2009-06-30 The University Of Hong Kong Human virus causing respiratory tract infection and uses thereof
US20080280317A1 (en) 2004-08-27 2008-11-13 Northeastern University Comprehensive Characterization Of Complex Proteins At Trace Levels
DE102004042546A1 (de) 2004-09-02 2006-03-09 Curevac Gmbh Kombinationstherapie zur Immunstimulation
WO2006027202A1 (en) 2004-09-06 2006-03-16 Unite De Recherche En Biotherapie Et Oncologie (Rubio) Generation of multiparent cell hybrids
AU2005282241B2 (en) 2004-09-08 2011-03-03 Chelsea Therapeutics, Inc. Quinazoline derivatives as metabolically inert antifolate compounds.
WO2006044335A2 (en) 2004-10-14 2006-04-27 The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas Therapy with clostridium perfringens enterotoxin to treat ovarian and uterine cancer
CA2585758C (en) 2004-10-29 2017-08-01 Neose Technologies, Inc. Remodeling and glycopegylation of fibroblast growth factor (fgf)
US7429567B2 (en) 2005-01-04 2008-09-30 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Sustained delivery of PDGF using self-assembling peptide nanofibers
EP1847533B1 (en) 2005-01-27 2013-08-14 Asahi Kasei Pharma Corporation Six-membered heterocyclic compound and the use thereof
US7531533B2 (en) 2005-01-27 2009-05-12 Asahi Kasei Pharma Corporation 6-Membered heterocyclic compound and use thereof
CA2597263C (en) 2005-02-14 2017-01-17 Epitopix, Llc Polypeptides from staphylococcus aureus and methods of use
US20090075832A1 (en) 2005-02-24 2009-03-19 Cemines, Inc Compositions and Methods for Classifying Biological Samples
AU2006227379B2 (en) 2005-03-17 2011-10-20 President And Fellows Of Harvard College Synthesis of avrainvillamide, stephacidin B, and analogues thereof
CA2578908C (en) 2005-03-17 2020-05-26 Yves Durocher Expression vectors for enhanced transient gene expression and mammalian cells expressing them
FR2885525B1 (fr) 2005-05-13 2009-09-18 Urodelia Sa Medicament notamment anti-cancereux, destine a des traitements par immunotherapie, en particulier autologue
EP2554181B1 (en) 2005-06-13 2015-03-18 Cleveland Biolabs, Inc. Methods of protecting against apoptosis using lipopeptides
JP5777846B2 (ja) 2005-06-15 2015-09-09 マサチューセッツ インスティテュート オブ テクノロジー アミン含有脂質およびその使用
JP5237799B2 (ja) 2005-06-27 2013-07-17 エグゼリクシス パテント カンパニー エルエルシー ピラゾールベースのｌｘｒモジュレーター
WO2007005249A2 (en) 2005-06-29 2007-01-11 Hyperbranch Medical Technology, Inc. Nanoparticles and dendritic-polymer-based hydrogels comprising them
US7494788B2 (en) 2005-07-11 2009-02-24 Molecular Kinetics, Inc. Entropic bristle domain sequences and their use in recombinant protein production
US7820790B2 (en) 2005-07-13 2010-10-26 Amgen Mountain View Inc. IL-6 binding proteins
EP1904649A2 (en) 2005-07-18 2008-04-02 Epigenomics AG Compositions and methods for cancer diagnostics comprising pan-cancer markers
GB0516058D0 (en) 2005-08-04 2005-09-14 Oxford Genome Sciences Uk Ltd New protein isoforms and uses thereof
GB0517293D0 (en) 2005-08-24 2005-10-05 Cancer Rec Tech Ltd Vectors and uses thereof
EP1931998B1 (en) 2005-09-15 2010-06-09 Alk-Abello A/S A method for quantification of allergens
US7576106B2 (en) 2005-10-11 2009-08-18 Chemocentryx, Inc. Piperidine derivatives and methods of use
EP1957475A1 (en) 2005-10-21 2008-08-20 Merz Pharma GmbH & Co.KGaA Chromenones and their use as modulators of metabotropic glutamate receptors
UA96139C2 (uk) 2005-11-08 2011-10-10 Дженентек, Інк. Антитіло до нейропіліну-1 (nrp1)
ATE486875T1 (de) 2005-11-10 2010-11-15 Chemocentryx Inc Substituierte chinolone und verwendungsverfahren
WO2007061853A2 (en) 2005-11-23 2007-05-31 Merck & Co., Inc. Process for synthesizing 2-phenyl-1h-phenantrho[9,10-d]imidazole derivative
KR101049859B1 (ko) 2007-11-28 2011-07-19 대한민국 Ｎ-말단 ｐＩ 값 조절에 의한 수용성 재조합 단백질 생산방법
US20100040606A1 (en) 2006-03-06 2010-02-18 Symphogen A/S Recombinant polyclonal antibody for treatment of respiratory syncytial virus infections
EP2002036A4 (en) 2006-03-09 2010-01-27 Univ Texas COMPOSITIONS AND METHODS RELATING TO THE PROFILING OF MULTIPLE CELL LINES ON PEPTIDE BONDING BASIS
AU2007226348A1 (en) 2006-03-10 2007-09-20 Warwick Effect Polymers Ltd. Polymers
WO2007110755A1 (en) 2006-03-27 2007-10-04 Medical Therapies Limited Prophylaxis or treatment of cardiovascular inflammation
CA2649800C (en) 2006-04-20 2016-09-20 Kringle Pharma Inc. Hgf precursor protein variant and active protein thereof
US20090253156A1 (en) 2006-05-05 2009-10-08 Perkinelmer Las, Inc. Mass spectrometry methods for multiplexed quantification of protein kinases and phosphatases
US8187833B2 (en) 2006-05-08 2012-05-29 Adaerata Limited Partnership Chimeric PCSK9 proteins, cells comprising same, and assays using same
JP5564249B2 (ja) 2006-06-23 2014-07-30 アレシア・バイオセラピューティクス・インコーポレーテッド 癌に関与するポリヌクレオチド配列およびポリペプチド配列
US20120128661A1 (en) 2006-06-23 2012-05-24 Alethia Biotherapeutics Inc. Polynucleotide and polypeptide sequences involved in cancer
US20090297401A1 (en) 2006-06-28 2009-12-03 Rgb Technologies Ab Sensor kit and a system for detecting an analyte in a test environment
US8198046B2 (en) 2006-07-11 2012-06-12 Danisco Us Inc. KEX2 cleavage regions of recombinant fusion proteins
CN101516388B (zh) 2006-07-21 2012-10-31 诺和诺德公司 通过o-联糖基化序列的肽的糖基化
WO2008012362A2 (en) 2006-07-27 2008-01-31 Oxford Genome Sciences (Uk) Ltd New protein isoforms and uses thereof
EP2052088A2 (en) 2006-08-02 2009-04-29 Genizon Biosciences Genemap of the human genes associated with psoriasis
JP5244103B2 (ja) 2006-08-09 2013-07-24 ホームステッド クリニカル コーポレイション 器官特異的蛋白質およびその使用方法
EP2066806A2 (fr) 2006-09-07 2009-06-10 Laurence Faure Test pharmaco diagnostique ciblant l'oncologie
WO2008033932A2 (en) 2006-09-13 2008-03-20 The Institutes For Pharmaceutical Discovery, Llc Biarylthiazole carboxylic acid derivatives as protein tyrosine phosphatase-ib inhibitors
EP2094715B1 (en) 2006-10-30 2012-08-29 Sanrx Pharmaceuticals, Inc. Dipterinyl calcium pentahydrate (dcp) and therapeutic methods based thereon
DE102006051516A1 (de) 2006-10-31 2008-05-08 Curevac Gmbh (Basen-)modifizierte RNA zur Expressionssteigerung eines Proteins
WO2008074004A2 (en) 2006-12-14 2008-06-19 Medarex, Inc. Human antibodies that bind cd70 and uses thereof
JP5496680B2 (ja) 2006-12-28 2014-05-21 アッヴィ・インコーポレイテッド ポリ（ａｄｐ−リボース）ポリメラーゼの阻害剤
DE102007001370A1 (de) 2007-01-09 2008-07-10 Curevac Gmbh RNA-kodierte Antikörper
US20100055077A1 (en) 2007-01-09 2010-03-04 Alexander Shakhov Methods for increasing and mobilizing hematopoietic stem cells
WO2008104803A2 (en) 2007-02-26 2008-09-04 Oxford Genome Sciences (Uk) Limited Proteins
WO2008124483A1 (en) 2007-04-04 2008-10-16 Specigen, Inc. Protein cage immunotherapeutics
WO2009009186A2 (en) 2007-04-13 2009-01-15 The Regents Of The University Of California Receptors useful for gas phase chemical sensing
US20080306007A1 (en) 2007-04-30 2008-12-11 Newcastle Innovation Limited Agents for prophylaxis or treatment of neurological related diseases and conditions
EP2155177A2 (en) 2007-04-30 2010-02-24 Intezyne Technologies Incorporated Modification of biological targeting groups for the treatment of cancer
US8143372B2 (en) 2007-05-21 2012-03-27 Children's Hospital & Research Center Oakland Synthetic regulators of ferritin protein nanocage pores and methods of use thereof
US20100093554A1 (en) 2007-06-01 2010-04-15 Keting Chu Methods for identifying biomarkers, autoantibody signatures, and stratifying subject groups using peptide arrays
WO2009004329A1 (en) 2007-07-02 2009-01-08 Cancer Research Technology Limited 9h-pyrimido[4,5-b]indoles, 9h-pyrido[4',3':4,5]pyrrolo[2,3-d]pyridines, and 9h-1,3,6,9-tetraaza-fluorenes as chk1 kinase function inhibitors
US9018138B2 (en) 2007-08-16 2015-04-28 The Johns Hopkins University Compositions and methods for generating and screening adenoviral libraries
AU2008295248A1 (en) 2007-09-07 2009-03-12 Symphogen A/S Methods for recombinant manufacturing of anti-RSV antibodies
WO2009039854A2 (en) 2007-09-27 2009-04-02 Dako Denmark A/S Mhc multimers in tuberculosis diagnostics, vaccine and therapeutics
GB0719644D0 (en) 2007-10-05 2007-11-14 Cancer Rec Tech Ltd Therapeutic compounds and their use
EP2208073B1 (en) 2007-11-05 2020-01-15 Nordic Bioscience A/S Biochemical markers for cvd risk assessment
US20100298368A1 (en) 2007-11-06 2010-11-25 Amira Pharmaceuticals, Inc. Antagonists of pgd2 receptors
EP2071334A1 (en) 2007-12-14 2009-06-17 Transmedi SA Compositions and methods of detecting TIABS
WO2009111088A2 (en) 2008-01-02 2009-09-11 The Johns Hopkins University Antitumor immunization by liposomal delivery of vaccine to the spleen
CA2718293A1 (en) 2008-03-14 2009-09-17 Dnar, Inc. Dna repair proteins associated with triple negative breast cancers and methods of use thereof
WO2009114942A1 (en) 2008-03-20 2009-09-24 University Health Network Thymidylate kinase fusions and uses thereof
US8445648B2 (en) 2008-04-30 2013-05-21 University Of Vermont And State Agricultural College Methods and products relating to GSK3β regulation
US8246991B2 (en) 2008-05-09 2012-08-21 Surmodics Pharmaceuticals, Inc. Biocompatible and biodegradable elastomeric polymers
AU2009253160B2 (en) 2008-05-26 2015-03-05 Universitat Zurich Protamine/RNA nanoparticles for immunostimulation
US20110190227A1 (en) 2008-07-03 2011-08-04 Amira Pharmaceuticals, Inc. Antagonists of Prostaglandin D2 Receptors
US8148088B2 (en) 2008-07-18 2012-04-03 Abgent Regulation of autophagy pathway phosphorylation and uses thereof
AU2009277179A1 (en) 2008-08-01 2010-02-04 Lixte Biotechnology, Inc. Methods for regulating cell mitosis by inhibiting serine/threonine phosphatase
US9126953B2 (en) 2008-08-08 2015-09-08 Synta Pharmaceuticals Corp. Triazole compounds that modulate HSP90 activity
EP2344200A2 (en) 2008-09-19 2011-07-20 Nektar Therapeutics Modified therapeutics peptides, methods of their preparation and use
CA2737040C (en) 2008-09-19 2017-05-02 Nektar Therapeutics Polymer conjugates of therapeutic peptides
WO2010037408A1 (en) 2008-09-30 2010-04-08 Curevac Gmbh Composition comprising a complexed (m)rna and a naked mrna for providing or enhancing an immunostimulatory response in a mammal and uses thereof
EP3130674B1 (en) * 2008-11-03 2020-07-08 ADC Therapeutics SA Antibodies that specifically block the biological activity of a tumor antigen
ES2543095T3 (es) * 2009-07-10 2015-08-14 Innate Pharma Agentes de unión a TLR3
CA2807557C (en) 2009-08-06 2019-09-17 Partha S. Ray Diagnosis of primary and metastatic basal-like breast cancer and other cancer types
WO2011054112A1 (en) 2009-11-03 2011-05-12 Alethia Biotherapeutics Inc. Antibodies that specifically block the biological activity of kidney associated antigen 1
CA2792327C (en) 2010-03-11 2019-09-24 Merrimack Pharmaceuticals, Inc. Use of erbb3 inhibitors in the treatment of triple negative and basal-like breast cancers
US20110233107A1 (en) 2010-03-23 2011-09-29 Emily Jainine Lockett Personal Cosmetic Palette
DK3173427T3 (da) * 2011-03-31 2019-08-05 Adc Therapeutics Sa Antistoffer mod nyre-associeret antigen 1 og antigen-bindende fragmenter deraf
ES2731665T3 (es) 2012-01-09 2019-11-18 Adc Therapeutics Sa Agentes para tratar cáncer de mama triple negativo

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