[go: up one dir, main page]

Idi na sadržaj

PTPN7

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
PTPN7
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1ZC0, 2A3K, 2GP0, 2GPH, 2HVL, 2QDC, 2QDM, 2QDP, 3D42, 3D44, 3O4S, 3O4T, 3O4U

Identifikatori
AliasiPTPN7
Vanjski ID-jeviOMIM: 176889 MGI: 2156893 HomoloGene: 15411 GeneCards: PTPN7
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za PTPN7
Genomska lokacija za PTPN7
Bend1q32.1Početak202,147,013 bp[1]
Kraj202,161,588 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za PTPN7
Genomska lokacija za PTPN7
Bend1|1 E4Početak135,060,438 bp[2]
Kraj135,073,055 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein tyrosine phosphatase activity
GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
phosphoprotein phosphatase activity
hydrolase activity
Ćelijska komponenta cytoplasmic side of plasma membrane
citoskelet
citoplazma
citosol
nukleoplazma
Biološki proces GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 Defosforilacija
peptidyl-tyrosine dephosphorylation
GO:0016576 protein dephosphorylation
cellular response to cytokine stimulus
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001199797
NM_002832
NM_080588
NM_080589
NM_001364877

NM_001364878

NM_177081
NM_001356382

RefSeq (bjelančevina)

NP_001186726
NP_002823
NP_542155
NP_001351806
NP_001351807

NP_796055
NP_001343311

Lokacija (UCSC)Chr 1: 202.15 – 202.16 MbChr 1: 135.06 – 135.07 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein tirozin-fosfataza nereceptorski tip 7 jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom PTPN7 sa hromosoma 1.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 360 aminokiselina, a molekulska težina 40.529 Da.[7]

1020304050
MVQAHGGRSRAQPLTLSLGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALML
DVRSLGAVEPICSVNTPREVTLHFLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEE
FLKIPSNFVSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQEDGDYI
NANYIRGYDGKEKVYIATQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREG
KEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHI
LFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAAHPGPIVVHCSAGIGRTGC
FIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLALY
AGQLPEEPSP

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Protein kodiran ovim genom je član porodice protein tirozin-fosfataza (PTP). Poznato je da su PTP-ovi signalne molekule koji reguliraju različite ćelijske procese, uključujući ćelijski rast, diferencijaciju, miozni ciklus i onkogenu transformaciju. Ovaj gen se prvenstveno eksprimira u različitim hematopoetskim ćelijama i predstavlja gen ranog odgovora u ćelijama stimuliranim limfokinom. Nekatalitski N-kraj[ ovog PTP-a može stupiti u interakciju s MAP kinazama i potisnuti njihovu aktivnost. Pokazalo se da je ovaj PTP uključen u regulaciju signalizacije receptora antigena T-ćelija (TCR), za koju se smatralo da funkcioniše kroz defosforilaciju molekula povezanih sa putevima MAP kinaze. Za ovaj gen su pronađene dvije alternativno prerađene varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[6]

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da je PTPN7 u interakciji sa MAPK3[8][9][10] i MAPK1.[8][10]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143851 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031506 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Adachi M, Sekiya M, Isobe M, Kumura Y, Ogita Z, Hinoda Y, Imai K, Yachi A (septembar 1992). "Molecular cloning and chromosomal mapping of a human protein-tyrosine phosphatase LC-PTP". Biochem Biophys Res Commun. 186 (3): 1607–15. doi:10.1016/S0006-291X(05)81592-X. PMID 1510684.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PTPN7 protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 7".
  7. ^ "UniProt, P35236" (jezik: engleski). Pristupljeno 16. 12. 2021.
  8. ^ a b Pettiford SM, Herbst R (februar 2000). "The MAP-kinase ERK2 is a specific substrate of the protein tyrosine phosphatase HePTP". Oncogene. 19 (7): 858–69. doi:10.1038/sj.onc.1203408. PMID 10702794.
  9. ^ Saxena M, Williams S, Taskén K, Mustelin T (septembar 1999). "Crosstalk between cAMP-dependent kinase and MAP kinase through a protein tyrosine phosphatase". Nat. Cell Biol. 1 (5): 305–11. doi:10.1038/13024. PMID 10559944. S2CID 40413956.
  10. ^ a b Saxena M, Williams S, Brockdorff J, Gilman J, Mustelin T (april 1999). "Inhibition of T cell signaling by mitogen-activated protein kinase-targeted hematopoietic tyrosine phosphatase (HePTP)". J. Biol. Chem. 274 (17): 11693–700. doi:10.1074/jbc.274.17.11693. PMID 10206983.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Šablon:Protein tirozin-fosfataze