JPH0279983A - 植物のユビキチンプロモーター系 - Google Patents
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Abstract
め要約のデータは記録されません。
Description
A技術による植物の遺伝子工学に関する。
のDNAセグメントの同定と特徴とについて述べる。こ
のセグメントは、単子葉植物と双子葉植物の両者由来の
組換え体DNAを有する組織中の。
ことができる。ここに記載したDNAセグメントは、植
物組織の所望の構造遺伝子を選択して発現し調節するこ
とができる。
のタンパクであり、遊離のモノマー状態か。
タンパクと共有結合している。このタンパクは、76個
のアミノ酸残基を有し、そのアミノ酸の配列は、異常に
高度に保護されている。ユビキチンの配列は、ヒト、ウ
シ、チチュウ力イミバエ。
の間で同一である〔ニー ボンドおよびエム シュレジ
ンガー(U、Bond and M、 Schlesi
nger)。
9−956頁、 1985年〕。
が違っている〔ケイ、オズケイナツクら(K、0zka
ynak et al) 、 Nature、 312
巻、 663−666頁、 1984年〕。
アミノ酸が異なっている。配列内のこの2個または3個
のアミノ酸の相違によって、動物。
とは明らかである。
膜、細胞質および核、で見出されている。
つまり、損傷したかまたは異常なタンパク。
る非リソシーム経路において、必要とされる〔エイ ハ
ーシュコら(A、 Hershko et al) 。
tlsA、 81巻、 1619−1623頁、
1984年;デイ ファインレイら(D、 Finle
yet al ) 、 Trends Biol、 S
ci、 10巻、 343−347頁。
ビキチンのカルボキシル末端(グリシン)と標的タンパ
ク中のリシル側鎖のε−アミノ基とのイソペプチド結合
による。
塩)の濃度の増大のようなストレスに対する細胞の反応
で1つの役割をはだす〔デイ、ファインレイら(D、
Finley et al)前出、 1985年〕。
タノール、オキシダントおよびアミノ酸類似体の高濃度
への暴露)に反応して、小さなセットの遺伝子を活性化
して1選択的に、ストレスタンパク(または熱ショック
タンパクともよばれる)を合成する。はとんどの生物に
おいて、このようなストレスタンパクは、 89.70
および23kDaの分子量のサブユニットを有すること
が見い出された(ニー ボンドおよびエム シュレジシ
ガー。前出、 1985年)。ユビキチンは、約8.5
kDaの分子量を有し、これもまたストレスに反応する
。その理由は、異なる種(酵母、マウス、アレチネズミ
およびニワトリの胚線維芽細胞)では、ユビキチンmR
NAおよびユビキチンタンパクのレベルが、ストレス条
件が変化するために増大するからである。
DNA配列の領域で誘導される。一般に。
より上流にあり、 RNAポリメラーゼ■の結合部位を
有し、そして、 DNAの転写を開始する。プロモータ
ー領域はまた。遺伝子発現の調節遺伝子として働く他の
要素をも含有する。これらは、約−30の近傍にTAT
Aボックスの共通配列を有し、また転写開始部位、すな
わちキャップ部位に対して5°側の約−75bpの位置
にCAATボックスの共通配列を持っている場合が多く
、これは+1と定義される〔アール ブリースナツバお
よびピー チャンボン(R,Breathnach a
nd P、 Chambon)、Ann、Rev。
1981年;ジエイメレディスおよびエイ ホレンダ
−(T、Kosuge。
aender)編、 211−227頁、 1983
年〕。植物では、 CAATボックスは、 AGGAボ
ックスで置換されることがある(ジェイ メシングら、
1983年、前出)。存在する他の調節要素は、照明
もしくは栄養入手可能性のような環境刺激、または熱シ
ョック、嫌気生活もしくは重金属の存在のような不利な
条件に応答して遺伝子の発現に影響する要素である。さ
らに1発育中もしくは組織特異的な様式で、遺伝子発現
を制御するDNA配列が存在する。見出されているその
他の調節要素は、エンハンサ−(動物系中)もしくは上
流の活性化配列(酵母中)であり、これら調節要素は、
近傍の遺伝子の全発現を、その近傍の遺伝子に対する位
置や方向とは無関係に、高める働きを有する。動物のエ
ンハンサ−コアの共通配列、5゛GGTGTGGAAA
(またはTTT ’) G−3’と相同の配列は。
対して約−180の位置の豆しグミン遺伝子中に見出さ
れており〔ジー ライセットら(G。
leic Ac1ds Res、、 12巻。
写開始部位からそれぞれ約−200および一170bp
の位置のトウモロコシのAdhlおよびAdh2の遺伝
子にも見出されている。一般に、プロモーターは、対応
する遺伝子のコドン領域の開始点に対して5゛側すなわ
ち上流に見出され、このプロモーター領域はすべての補
助調節要素を有し、10〜1000またはそれ以上のヌ
クレオチドを有し得る。
素は、おそらく最も広く研究されている要素である。熱
ショックに対して細胞が例外なく反応するということは
、はとんど10年前から知られているが、ストレスを与
えられた細胞によって選択的に合成される熱ショックタ
ンパクの機能については、まだほとんど知られていない
。ストレスタンパク合成の誘発は、転写レベルで起こり
。
類似していることが知られている〔イーフレイブ(E、
Craig) 、 CTCCr1t、 Rev、 Bi
ochem、。
スに応答して、従来の熱ショックタンパクが合成され蓄
積されるのに加えて、ストレスが加えられた細胞はまた
。プロテアーゼ類とユビキチンとを合成する。
性を有する94kDaの酵素が1発現が熱ショックレギ
ユロンの制御下にあるton (capR)遺伝子でコ
ードされている〔イー オズケイナックら(B。
ature、 312巻、 663 〜666頁、
1984年〕。ニワ) IJの胚線維芽細胞では、ユ
ビキチンmRNAのレベルは、熱ショック後もしくは5
0μMの亜ヒ酸塩に暴露後には5倍に増大した〔ニー
ボンドら(Ll、Bond et at ) 、 Mo
1.Ce1l。
5年〕。各mRNAは。
NAは、ポリュビキチン分子として翻訳する際。
の機構を与える。ユビキチンmRNAの高レベルは熱シ
ョック後の回復時は持続せず、このことは、ストレスに
反応している間の遊離ユビキチンに対する過渡的な役割
を示している。
トレスは9通常の機構で作用するとみなされている〔ジ
エイ アナサンら(J、Anathanet al)
、 5cience、 232巻、 522−524頁
、 1986年〕。
して、熱ショック遺伝子を活性化するシグナルとして働
く。異常タンパクを分解すべき標的とするユビキチンの
役割と1種々のタンパク分解酵素の役割とは、熱ショッ
クタンパク遺伝子の調節のこのようなモデルと適合する
。
ョウジヨウバエ(Drosoph i la)種で行わ
れた。特に、ショウジヨウバエhsρ70遺伝子は組換
えの研究に広く使用された。相同系において。
−ガラクトシダーゼ構造遺伝子と融合され、その雑種遺
伝子の活性が、受容体のショウジヨウバエ中の5つの常
在性hsp 70熱ショック遺伝子から区別された。シ
ョウジヨウバエの熱ショック遺伝子はまた。非相同系1
例えばサルcos m胞およびマウス細胞にも導入され
た〔エイチ ペルハム(HlPelham) 、 Ce
1l、 30巻、 517−528頁、 1982年
〕。
組み込まれた雑種hsp70−1acZ遺伝子において
観察された。この遺伝子には、 hsp70構造遺伝子
の中央部に7kbのイー コリ β−ガラクトシダーゼ
DNA断片が挿入されている。その形質転換体で得られ
たガラクトシダーゼ活性は、熱ショックによって調節さ
れることがわかった〔ジエイリスら(J、 Lis a
t al) 、 Ce1l 35巻、 403〜410
頁、 1983年〕。
エhsp70熱ショックプロモーターに欠失変異を作っ
て分析することによって5°−CTGGAAT TTC
TAGA−3’ であると同定された〔エイチ ペルハ
ムら、 )feat 5hock From Bact
eria to Man、 コールドスプリング ハ
ーバ−ラボラトリ−、43−48頁。
47の領域、すなわちTATAボックスの約26塩基上
流に位置している。この要素の化学的に合成されたコピ
ーは、ヘルペスウィルス チミジンキナーゼ遺伝子のT
ATAボックスの上流に1通常の上流のプロモーター要
素の代わりに配置すると、サルCO8細胞とアフリカッ
メガエルの卵母細胞のチミジンキナーゼ遺伝子に、充分
に、熱誘発性を与えるということが証明された(チミジ
ンキナーゼ遺伝子は。
熱ショックタンパクを誘発させる熱ショック特異的転写
因子と相互作用する〔シー パーカーら(C,Park
er et al) 、 Ce11.37巻、273〜
283頁、 1984年〕。熱ショック遺伝子の誘発物
質は、細胞内の熱ショックタンパクの濃度を変化(減少
)させて、熱ショック遺伝子の転写と翻訳とを制御する
因子であり得る。
ビ、トウモロコシ、ヒマフリ。ワタ、および小麦内で熱
ショックに反応してタンパクの合成が増大することによ
って証明された〔ティーバーネットら(T、Barne
tt et al) 、 Dew、Genet。
イら(J。
d、 Sci、ll5A、 78巻。
って見い出される熱ショック反応の主な相違は9次のと
おりである。(a)ストレスに反応して合成される全タ
ンパクの量;(b)合成される各種タンパクの大きさの
分布、;(C)熱ショックタンパクを誘発する最適温度
;および(6)致死(切断点)温度[1ethal (
breakpaint) temperature )
である。高分子量のタンパクは9種が異なっても電気泳
動性が類似していることがわかっている。低分子量(1
5〜27kDa)の熱ショックタンパクは9種によって
、電気泳動性の非相同性が高分子量のものよりも大きい
。植物においては、高分子量タンパクは、ショウジヨウ
バエ内で産生されるタンパクと似ている。しかし、植物
およびショウジヨウバエの低分子量熱ショックタンパク
の複雑性には著しい差がある。22゜34、36および
27kDaの4つの熱ショックタンパクがショウジヨウ
バエ内で合成されるが、大豆は。
る熱ショックタンパクを産生ずる。大豆の低分子量タン
パクの遺伝子は、熱ショック条件下で、最も活発に発現
され、適切に調節される遺伝子である〔エフシEl ”
/フルら (F、5choffl et al)、 J
、 Mol。
頁、 191112年〕。
27号、 1985年4月12日出願)は、植物の熱シ
ョック遺伝子のプロモーター領域を研究した。4つの大
豆熱ショック遺伝子(15〜18kDaO熱ショックタ
ンパクをコードする3つの遺伝子および、 17.3k
Daの熱ショックタンパクをコードする1つの遺伝子)
がクローン化され配列が決定された。4つの熱ショック
遺伝子のコード配列とそれに隣接する配列が決定された
。これらの4つの遺伝子のプロモーター領域が、サブク
ローン化され、 T−[]NAシャトルベクターに連結
され、アグロバクテリウム ツメファシェンス(Agr
obacterium tumefaciens)に
形質転換された。15〜18kDaのタンパクをコード
する大豆熱ショック遺伝子の組換え体クローンの1つは
、462個のヌクレオチドの読取り枠と、 ATG翻訳
開始コドンの上流の291個のヌクレオチドのプロモー
ター領域とを有していた。このプロモーターは、 TA
TAボックス、 CAATボックス、転写開始部位、お
よび5°−CT GAA TTCA&−3’の配列を有
するATG翻訳開始コドンの上流に熱ショック共通配列
131〜144のヌクレオチドを備えている。4つのク
ローンの内3つだけがこのプロモーター領域内でかなり
の相同性を示したが、4つのクローン全部の熱ショック
共通配列は、著しく類似していた。4つの大豆熱ショッ
ク遺伝子の、コード配列。
ほとんど類似していなかったことは重要である。ショウ
ジヨウバエおよび大豆の熱ショック遺伝子のプロモータ
ー領域の共通配列は類似しているが、大豆熱ショック遺
伝子のプロモーター領域は、ショウジヨウバエ遺伝子の
特徴である逆方向反復塩基配列をもっていない。
伝子)とを活性化するのに用いられ、ストレスによる反
応の調節が示された〔キイら、特願昭60−79127
号、 1985年4月12日出願〕。このプロモータ
ーが、転写開始点から下流に延びる65kbのDNA断
片として大豆5B13熱ショック遺伝子から単離された
。これには翻訳されないリーダー配列の主要部分が含ま
れているが、翻訳の開始コドン・は含まれていない。β
−ガラクトシダーゼ遺伝子は。
ミドのT−[]NA中の熱ショックプロモーターの制御
下におかれており1次いで植物もしくは植物細胞培養物
に移入される。DNA移入が起こったことは、5−ブロ
モ−4−クロロ−3−インドリル−β−Dガラクトシダ
ーゼ基質分子を含有する培地内で熱処理後に青色を呈す
るβ−ガラクトシダーゼ遺伝子の発現によって確識され
た〔エム ローズら(M、Rose et al )
、 Proc、 Natl、^cad、 Sci、 t
lsA78巻、 2460−2464頁、 1981年
〕。
験される。交差発現の実験によって、特異的な機能の理
解の範囲が広くなった。これらの実験では、自らのプロ
モーターの制御下にある遺伝子か、または異なるプロモ
ーターもしくは非天然のプロモーターに人工的に融合さ
せた遺伝子を挿入することが示されている。1983年
にムライら(Murai et al )は(Scie
nce 222巻、 476〜482頁)、ヒマワ
リ (Helianthus)の組織内でファセオラス
ブルガリス L、 (Phaseolus vul
garisL、)由来のインゲン豆遺伝子を1次の2つ
の条件下で発現させた:’(i)インゲン豆遺伝子がそ
れ自身のプロモーターの制御下にある場合;および(i
i)該遺伝子がスプライスされ、 T−DNAプロモー
ターの制御下にある場合。その後の実験で、その天然プ
ロモーターの制御下にあるインゲン豆の構造遺伝子をタ
バコ内で発現させることができ。
) (タバコ)内の組織特異的発現が本来の宿主(マメ
)内のそれと類似していることがわかった〔シー セン
グプターゴパレンら(C4Sengupta−Gopa
len et al) 。
ロSA、 82巻、 3320〜3324頁、
1985年〕。
etら) 、 BMBOJ、 4巻、 2411〜2
418頁、 1985年〕で、オクトピン シンテタ
ーゼ遺伝子(OCS)が。
(ペチュニア)と非相同(heterologous)
植物(タバコ)内で発現することが発表された。この研
究で。
ンパクのプロモーターに融合された。交差発現が、ダブ
り二 カ°−リイら(戴Gurley et al)
。
5頁、 1986年;およびキイら、特願昭60−79
127号(1985年4月12日出U)に記載されてい
る。後者には、それ自身のプロモーターの制御下にある
大豆熱ショック遺伝子のヒマワリの腫瘍組織内での強い
転写が報告されている。この場合においては9機能活性
は。
れた転写の最初の情報は、マツグら(Matzkeet
al) 、εMBOJ、 3巻、 1525−1
531頁、 1984年。
ゼインZ4遺伝子をクローン化し、Ti由来のベクタ
ーにこれを組み込み、そしてヒマワリの小茎に導入した
。得られたゼインmRNAは次いで小麦細胞系内で翻訳
することができたが、形質転換されたヒマワリのカルス
内では翻訳できなかった。
をコードする小麦遺伝子whAB 1.6が、 T−D
NA含有ベクターにクローン化され、ペチュニアおよび
タバコの両方に形質転換された〔ジー ランパら(G、
Lamppa et al) Nature、 316
巻、 750〜752頁、 1985年〕。上記の単子
葉植物と双子植物の宿主の両方で発現が起こり、光誘導
性および組織特異的であることが決定された。さらに最
近の研究〔ロチニスターら(Rochester et
al)、 EMBOJ。
子移入ペチュニア内でトウモロコシの熱ショックhsp
70遺伝子が発現された。トウモロコシhsp TO
mRNAは、熱ストレスにのみ反応して合成された。上
記の3つの研究が、トランスジェニック双子葉植物中に
単子葉植物の遺伝子を発現させることに成功したことを
記載した報告のすべてである。しかし。
、タバコの宿主内ではごくわずかかまたは全く発現しな
かったと述べた否定的な報告もあり〔レウエリンら(L
lewellyn et al)、 Molecula
rForm and Function of the
Plant Genome、 エルパン ブロテン
ードティング、シイ ニス グルートおよびティー ホ
ール(L、van Vloten−Doting。
lenum PublisingCorp、 593〜
608頁、 1985年;ジェイ ジイーエリスら(
J、G、旧1is et al)、 BMBD J、6
巻、 1116頁、 1987年〕、このことは単子葉
植物および双子葉植物のプロモーターの間には、固有の
種に特異的な差が存在する可能性を示唆している。
対して熱保護性もしくは耐熱性を与えるものと考えられ
ている〔エム シュレジンガーらto Man、 Co
1d Spring Harbor Laborato
ry、 米国ニューヨーク州、コールド スプリング
ハーバ−、329頁、 1982年〕。容認しうる熱
ショック温度は、熱ショック反応を誘発するのに充分高
い温度であるが、死に至る程高い温度ではない。植物の
芽生えの耐熱性は1次のような各種の処理法で得ること
ができる。(a) 40℃での連続的熱ショックに1〜
2時間さらした後、45℃で保温する方法;(b)40
℃で30分間熱ショックを与えた後、28℃で2〜3時
間処理してから45℃に移行する方法;(c)45℃で
10分間熱ショックを与え1次に28℃で約2時間処理
し、45℃に移行する方法;および(6)芽生えを50
μMの亜ヒ酸塩で、28℃にて3時間またはそれ以上処
理し、45℃に移行する方法。枯死に至る可能性のある
温度で保温する前に、予備処理する間に、熱ショックタ
ンパクが合成され、蓄積される。さらに植物の芽生えが
上記のように予め処理されると、熱ショックmRN^と
熱ショックタンパクの合成が45℃で起こる。温度が生
理学的レベル(例えば、28℃)に戻されると、正常な
転写と翻訳とが再開され、正常温度で3〜4時間経過す
ると熱ショックタンパクの検出可能な合成はもはや詔め
られない〔ジ°エイ キイら、Proc、 Natl、
Acad。
、 1981年;エムシコレジンガーら、 Trend
s Biochem、Sci、 1巻。
ョック処理中に合成された熱ショックタンパクは、非常
に安定ですぐには分解しない。
答して調節されるが、ユビキチンの転写調節は、従来の
熱ショックタンパクの転写の調節とは異なっている。ユ
ビキチンと熱ショックタンパクのmRNAのレベルは細
胞のストレスに反応して増大する。しかし、従来の熱シ
ョックタンパクは。
るが、熱ショックを与えている間に蓄積されたユビキチ
ンmRNAは、ストレス処理後、数時間以内に急速に分
解する。この不安定なmRNAの転写は、熱ショック中
におけるユビキチンの特別の過渡的な役割を示唆し、ユ
ビキチン遺伝子のプロモーター領域における唯一のDN
A配列に関連があり。
している。
伝子を選択的に発現させることができる調節プロモータ
ー系からなる新規DNAセグメントおよび構築物とを提
供することにある。上記のプロモーターは、プロモータ
ーの制御下にある遺伝子の転写を開始し調節する。植物
ユビキチン遺伝子の5゛側の非転写領域由来のDNA配
列をもっている。その好ましい実施態様では、このプロ
モーターの配列は、トウモロコシのユビキチン遺伝子の
上流領域由来のものである。
するプロモーターの単離と特徴付けについて5本発明で
開示する。このDNA配列は、トウモロコシのゲノム・
ライブラリィから分離されたユビキチン構造遺伝子の上
流に天然に存在する領域である。S1ヌクレアーゼマツ
ピングで決定された転写開始部位すなわちキャップ、!
A位は塩基1と呼称され、転写開始部位の5゛側の約8
99の塩基と5°側の1訳開始部位を除いたキャップ部
位の3゛側の約1093塩基内に包含された配列がユピ
キチンプロモーターを構成している。上記のほぼ2kb
のプロモーター領域には、 TATAボックス(−30
) 2つの重複する熱ショックコンセンサス要素(−
204と−214) 、転写開始部位に隣接する83ヌ
クレオチドのリーダー配列、および塩基84から塩基1
093までのびるイントロンか位置している。
と植物の発現可能な構造遺伝子とからなる1組替え体D
NA分子を提供することにある。ここで構造遺伝子は、
プロモーターの転写開始要素および転写活性化要素全体
の調節制御下にある。
A配列1代表的なものとしては構造遺伝子と結合するこ
とができ、前記DNA配列の転写と翻訳を調節し、高温
でストレスが与えられた際に発現を調節制御するDNA
構築物を提供する。
ロモーター/構造遺伝子の組合せを発現する。この発明
の方法は、単子葉植物と双子葉植物の両者における構造
遺伝子の発現に一般に適用できると考えられる。
含む2kb以下のDNA配列であって、該調節システム
は熱ショック要素およびイントロンを含む。
サス配列に対して少なくとも75%の相同性を有する。
を含む2kb以下のDNA配列と、植物発現性構造遺伝
子とを有するDNA構築物であって、該調節システムは
熱ショック要素およびイントロンを含み、そして、該構
造遺伝子は該植物ユビキチン調節システムの調節制御下
に置かれている。
に発現させるための、および選択されたストレス誘導に
よる該構造遺伝子の発現を増強するための方法を提供す
る。該方法は、(a)熱ショック要素およびイントロン
を含む植物ユビキチン調節システムと、該植物ユビキチ
ン調節システムの調節制御下にある植物発現性構造遺伝
子とを含むDNA構築物で該植物細胞を形質転換するこ
と、およびら)該形質転換した植物細胞にストレス状態
を選択的に与え、該構造遺伝子の発現増強を誘導するこ
と、を包含する。
る用語の目的と範囲についてあいまいさを除くために行
うものである。
する。
の5゛末端に存在するヌクレオチド配列を意味する。プ
ロモーター配列は、下流の遺伝子を発現させるために必
要であるが、必ずしも充分ではない。一般に、真核系の
プロモーターは、転写開始(キャップ)部位の5°側に
約lO〜30bpのコンセンサス5°−TATAAT−
3° (TATA)ボックスに相同の特徴的なりNA配
列を有する。キャップ部位は便宜上+1と番号を付しで
ある。キャップ部位に対して3°側の塩基には正の数字
を付け、一方キャップ部位に対して5“側の塩基には負
の数字を付け、その数字は、キャップ部位からの各塩基
の距離を表している。もう1つのプロモーター要素であ
るCAATボックスは、 TATAボックスの5′側の
約30〜70bpの位置に見出されることが多く、標準
形の5”−CCAAT−3′ に対して相同である(J
、 Messingら(1983)。
f Plants、 T、 Kosugeら(m著)
、 Plenum Press、 p9.211−22
7 )。
として知られている配列で、かつトリプシン)G (
またはT)NGに対称的に隣接するアデニン残基を有す
る領域で置換される場合がある(R1Br6athna
chとP、Chambon (1981) Ann、R
ev、 Biochem、 50:349−383)。
ー領域内に見出され、キャップ部位から、 1000b
pもしくはそれ以上延びて存在している。
初に、ただし排他的ではなく1位置するDNA配列要素
によって誘発される遺伝子発現の変調を意味する。調節
によって、1!境の刺激に対して全てが無かの応答が生
じるか、または遺伝子発現のレベルが変化する。この発
明において、熱ショック調節要素は、急激な温度上昇に
反応して、下流の遺伝子の発現のレベルを一時的に促進
する作用をする。
子を置くということは、遺伝子の発現がこれらの配列で
制御されるように構造遺伝子を位置させることを意味す
る。一般にプロモーターは。
位置することが知られている。したがって、異種のプロ
モーター/構造遺伝子の組合わせを構築する際には、プ
ロモーターは、該遺伝子の上流に位置するのが好ましく
、プロモーターの転写開始部位からの距離は、プロモー
ターが自然のセツティングで制御する遺伝子との距離と
ほぼ等しくする。当該技術分野で知られているように、
プロモーターの機能の損失がなければ、上記の距離はい
くらか変えてもよい。同様に、その制御下にある異種遺
伝子に対する調節要素の好ましい位置は。
の位置を反映している。当該技術分野で知られているよ
うに、この距離もいくらか変えてもよい。
ロモーターの機能は、転写段階では、 DNA−RNA
ハイブリダイゼーション検定法(“ノーザン”プロット
法)を用い、vA訳段階では1合成タンパクに対する特
定の機能検定法を用いて(例えば酵素活性によるかまた
は該タンパクの免疫検定法による)試験をすることがで
きる。
分をコードするDNAセグメントからなる遺伝子の部分
であり、転写を開始させる5゛側の配列を除く。構造遺
伝子は1通常細胞内に見出される遺伝子か、またはそれ
が導入される細胞の位置に通常は見出されない遺伝子で
あり、後者の場合。
公知のあらゆる起源からその全体もしくは部分を得るこ
とができる。それらの起源には、細菌のゲノムもしくは
エビソーム、真核DNA、核DNA。
たは化学的に合成されたDNAが包含される。構造遺伝
子は。
部分を持っていてもよい。この修飾部分は。
または発現制御のしかたに影響する。かような修飾部分
としては、限定はしないが、1つ以上のヌクレオチドの
変異部分、挿入部分、欠失部分および置換部分がある。
か、または、適当なスプライス接合で結合された1つ以
上のイントロンを有している。構造遺伝子は、複数の起
源由来のセグメントの複合体でもよく、また天然に生成
したものまたは合成のものでもよい。構造遺伝子は、融
合タンパクをコードしてもよい。植物組織に、プロモー
ター/構造遺伝子/ポリアデニル化シグナルの複合体を
有する組換え体DNA分子を導入することには、構造遺
伝子とそのプロモーターが各々異なる植物種由来のもの
である構造物を構築することが包含されると考する。
ン遺伝子の1訳開始部位の5°側の約1kbのヌクレオ
チド配列を意味し、転写の開始、転写の調節1発現レベ
ルの制御、ストレス遺伝子の誘発、およびストレスに応
答した発現の促進とを導く配列で構成されている。調節
系は、プロモーターと調節の両方の機能をもっており、
遺伝子発現の調節制御すなわち変調を行うDNA配列で
ある。
るということは、遺伝子の調節された発現がユビキチン
の調節系からなる配列によって制御されるような位置に
構造遺伝子があることを意味する。
とができる核酸配列を意味し9通常、 mRNA前駆体
の3”末端にポリアデニル酸のからなる領域を付加して
いることで特徴付けられる。ポリアデニル化シグナルの
DNAセグメントは、それ自体、天然生成もしくは合成
の数種の起源に由来するセグメントの複合体であって、
ゲノムDNAもしくはmRNA由来のcDNAを起源と
する。ポリアデニル化シグナルは、標準形の5°−AA
TAA−3°に対する相同性の存在によって通常認識さ
れるが、距離の変動9部分的な“読み過し”および多重
タンデム標準配列はまれなことではない(JoMess
ingら、前記文献)。
ないということは認識されるべきである(C,Mont
ellら(1983) Nature 305:60
0−605)。
胞、原形質体、胚およびカルス組織のような単細胞を包
含する。植物の分化した組織と分化していない組織が含
まれる。植物組織は、イン・プランタ(in plan
ta )または器官内の組織もしくは細胞培養物である
。
たはアミノ酸配列が同一もしくはほぼ同一であることを
意味する。当該技術分野で理解されているように、ヌク
レオチドの不整合がコドン内の3番目の塩基すなわちゆ
らぎ塩基に起こることがあるが、最終的なポリペプチド
配列においてアミノ酸の置換を起こすことはない。また
、遺伝子配列のいくつかの領域における小さなヌクレオ
チドの修飾(例えば置換、挿入もしくは欠失)は。
物の機能を変えない限り、許容することができ、かつ重
要でないと考えられる。遺伝子配列の全体もしくは一部
分の化学的に合成されたコピーが、遺伝子の機能を損な
うことなく、天然の遺伝子中の対応する領域と置換し得
ることが分かっている。特定のDNA配列の同族体は、
当該技術分野で周知の厳密の条件下での核酸のクロスハ
イブリダイゼーション試験法を用いて、当業者によって
同定することができる(tlamesと旧ggens編
集(1985) Nucleic Ac1d Hybr
idisation、 IRL Press。
程度は、比較される配列間の同一性の百分率によって評
価されることが多い。したがって。
得ることが分かる。
り出された。得られた。受けとられた。
(化学的に、および/または生物学的に)。
添加、挿入、欠失、抽出、単離、変異、および複製を含
むがこれらに限定はされない)によって調製され得る。
クレオチドがin vitroで組み立てられたことを
意味している。手作業的DNA化学合成は既に確立され
ている方法(M、Caruthers(1983)、
Meth。
uencing、 Weissman (編著) 、
Praeger Publishers (New Y
ork)第1章)で実施され、また自動化された化学合
成は種々の市販装置の一つを使用して行われ得る。
じて遺伝子発現を調節するDNA配列を指す。応答は下
流遺伝子の発現レベルの一過性であるが急な上昇として
表れる。熱ショック遺伝子についての最初の研究はショ
ウジヨウバエ属(Dro−sophila )を使用し
て行われたが、植物を含む他の多くの種もストレスに対
し同様の応答を示す(T、Barnettら (198
0) Dev、 Genet、1 : 331−34
0)。
はコンセンサス配列5”−CTGGAAT−TT[:T
AGA−3’を有し、転写開始部位の上流の残基−66
から一47bpまでの領域に位置していると記述されて
いる(HoPelhamとM、Bienz (1982
)前記文献)。このコンセンサス配列の化学合成された
オリゴヌクレオチドのコピーは熱ショック誘導性に関し
ては天然配列に取って代わることができる。他の系では
プロモーター領域内に多重の熱ショック要素がみとめら
れている。例えば、 Rochesterら(1986
)前記文献は、トウモロコシのhsp70の遺伝子に2
個の熱ショック要素を確認している。
置する約100個のヌクレオチドから成るDNA配列を
意味している。リーダー配列内にはリポソーム結合部位
を特定する領域が包含されている。
りNA配列の領域を言う。イントロンは転写された配列
内のいたる所、つまり同じまたは異なる遺伝子のコード
配列間、遺伝子のコード配列内に存在してそのアミノ酸
配列を遮断し分断している。
も存在し得る。イントロンは一次転写の際に切除され、
同時に且つ正確にコード配列が連結され。
部がスプライス部位となる。イントロンの塩基配列はG
llで始まり、 AGで終わる。同じスプライシング信
号は高等真核生物の多くに認められる。
現に有用な組み換えベクターの開発に関する。本発明で
は、ベクターは挿入されたDNAコードセグメントの発
現を制御するのにトウモロコシのユビキチンプロモータ
ーを採用している。転写調節配列を既定宿主の染色体外
複製系と結合することができる。遺伝子挿入のための制
限部位をもつ他のDNA配列を加えて、該宿主に於て挿
入された遺伝子の転写と翻訳を調節するためのベクター
とすることができる。このベクターにはまた原核細胞宿
主で増殖を可能とならしめる原核細胞複製系0選択のた
めのマーカー、および他のDNA領域が含まれる。これ
により植物および哺乳類宿主を形質変換する以前に、特
徴付けられた細菌系で大量のベクターを増殖させること
ができる。プロモーターと遺伝子配列が互いに適切に位
置付けられているベクターを構築する原理は当業者によ
く知られている事柄である。ある条件では、所望の構造
遺伝子にプロモーター系を結合し、得られた構造DNA
を直接宿主に導入するのが望ましい。この直接導入法に
は、これらに限定されるものではないが、原形質体形質
変換、エレクトロポレーシコン法、 DNAの核への直
接注入、およびカルシウム沈澱による同時形質転換が包
含される。
に関する最初の報告である。本発明に記載されているト
ウモロコシユビキチンプロモーターは、 RNAポリメ
ラーゼ認識および結合部位、転写開始配列(キャップ部
位)、誘発転写を引きおこす調節配列、および転写開始
部位と翻訳開始部位との間の翻訳されない介在配列(イ
ントロン)を包含する。二重の熱ショックコンセンサス
配列が転写開始部位の5゛側(−214と−204)に
位置する。
ンが存在し、これに大きいイントロン(約1kb)が続
いている。
トウモロコシゲノムの2個の約2kbPst断片上に単
離することができる(図1)。断片全体はmRNAまた
はタンパクの発現を監視することによりプロモーター機
能を示すために用いられ得る。
ることによって融合タンパクが発現する。
遺伝子(それ自身の開始コドンと停止コドンを有する)
を挿入すると、挿入された遺伝子に対応する自然のポリ
ペプチドが発現する。所望の構造遺伝子を挿入するには
遺伝子の末端に平滑末端のリンカ−を使用すると最も好
都合に実施できる。
始直前の部位、または転写開始部位の前の部位で制限す
ることもできる。例えば1本発明ではプロモーター断片
を約2kbPstr断片としてユビキチン遺伝子から誘
導した。プロモーター断片に翻訳開始コドンが欠けてい
ることを確実にするため、5゛側領域を有する断片を所
望の数のヌクレオチド対を除去する様に制御された条件
下で二本鎖エキソヌクレアーゼで選択的に消化した。好
ましくはユビキチン翻訳開始コドンを取り除き。
から開始する。次にリンカ−またはホモポリマーテーリ
ングを使用して単離された(かつ。
クターの残余領域と適合する所望の制限部位を導入する
。一般には、プロモーター断片を特殊制限酵素で開裂し
、その結果化じた短いDNA断片についてプロモーター
機能をテストし、無傷プロモーターの機能と比較する。
配列に変更を加えて、プロモーター機能を保持する誘導
DNA断片を調製する。
伝子に対するクローニング用の媒体として役に立つもの
である。本発明では、トウモロコシユビキチンプロモー
ターまたはカリフラワーモザイクウィルスプロモーター
の制御下で、 CATをコードしている構造遺伝子をオ
ート麦とタバコ細胞で発現させた。ユビキチンプロモー
ターを採用した場合、双子葉宿主より単子葉宿主に於け
る方が発現の度合が大きく、カリフラワーモザイクウィ
ルスプロモーターを使用した場合は単子葉より双子葉宿
主で発現の度合が大きくなった。発現レベルの差異は異
なるプロモーターが持つ固有の相違。
基本的な細胞の相違に由来している。現在までのところ
、単子葉類プロモーターが双子葉類の宿主細胞内でうま
く機能するか否かは定常的でなく不明確で、予測できな
い。
くの構造遺伝子が本願のDNAクローニングベクターに
導入され得る。さらに、この型のDNA構成物は特殊な
遺伝子由来のDNAの産生を増加させるために、並びに
cDNA産生に使用することができるmRNへの産生を
増加させるために使用することができる。特殊DNA配
列を有するこのようなベクターは広く応用されており、
非常に有用である;例えばこれらは細菌に於ける遺伝子
増幅、あるいはさらに付加的な細胞機能を発揮できる高
等細胞に於ける発現に使用することができる。医用およ
び農業用に有用なタンパクを商業生産するのに高等真核
生物の組み換え系を利用する利点は原核生物や下等真核
生物宿主に於ては複写することが難しい翻訳後の正確な
修飾が確保できることである。
類と双子葉類の例としてオート麦とタバコで機能を果た
すことが示され、そしてこのプロモーターが他の細胞で
も同様に機能を果たすと考えられる。このような系には
、これに限定されるものではないが1例として述べると
、ユビキチン遺伝子が単離でき、高度に維持されること
が判明している細胞1例えばトウモロコシに加えて他の
単子葉類、タバコ以外の双子葉類、酵母のような下等真
核生物および哺乳類細胞が包含される。トウモロコシユ
ビキチンプロモーターと共に使用するのに適した細胞系
のスクリーニングは、ここに記した方法に従って、実施
され得、過度の実験を必要としない。個々の系に於てD
NAコードセグメントの発現に適したベクターの構築に
ついては既に詳細に論述されている。複数の宿主内で複
製可能なシャトルベクター、例えば酵母と哺乳類細胞の
両方、植物と動物細胞、および植物と細菌細胞に対する
シャトル発現ベクターについても論述されている。さら
に、植物プロモーターとしての機能に関してはトウモロ
コシュビキチン遺伝子と類似している。他の系由来のユ
ビキチン遺伝子がユビキチンプロモーター配列のための
起源として採用できることが理解されるだろう。
熱ショックプロモーターとしての利用に関する。2個の
熱ショックコンセンサス配列はトウモロコシュビキチン
遺伝子の上流、 −214と−204の位置に存在する
。多くの真核生物では、熱ショックコンセンサス配列と
相同の天然に存在する配列および化学合成された配列が
遺伝子発現の誘導を調節することが判明している。ユビ
キチンプロモーターは熱ショック要素の配列と同一の配
列を含有しているが、このプロモーターは(1)転写開
始部位の3°側に非翻訳イントロンを有し、(2)ユビ
キチン発現を構成的並びに誘発的に調節する点で従来の
熱ショックプロモーターとは区別される。熱ショック要
素とプロモーター領域内に存在する大きなイントロン間
の機能的関係は現在までの技術段階では解明されていな
い。これらの特徴的な配列間のヌクレオチドの距離およ
び一方の要素の他方に対する方向と位置づけは本発明に
於ては派生した調節断片の基本的プロモーター機能が活
性に保たれている限りは、可変であると仮定する。
NA転写物の相対的安定性に関連し9間接的に9合成さ
れたタンパクのレベルに関連する(Ca11is et
al、(1987) Genes and Deve
lopment 1 :1183−1200)。構成的
に発現したユビキチンmRNAはニワトリ胎児の線維芽
細胞では安定レベルに保たれ、一方、ストレスに応答し
て形成されたユビキチンmRNAの半減期は約1.5〜
2時間であると報告されている。
報告されている。構成的に発現されたユビキチンはユビ
キチン遺伝子の3個のうちの1個以上のものによってコ
ードされている。3個のうちの2個はコード領域のすぐ
内側に約400bpのイントロンを含有している。4個
目のユビキチン遺伝子は非翻訳イントロンを欠いている
が多重の熱ショック要素から成っており、主としてスト
レスに応答してユビキチン発現を誘導する働きをする。
、むしろ熱ショックやストレス信号に応答して機能する
(B、 Dzkaynak et al、 (1987
) BMBOJ、 6 : 1429−1439)。
ってコードされる。本発明ではユビキチン遺伝子の1個
についてのヌクレオチド配列が記載されている。転写お
よび翻訳開始部位間の大きなイントロン(約1 kb)
並びにコンセンサス熱ショック配列に対応するヌクレオ
チド配列がトウモロコシユビキチンプロモーター領域内
にみとめられる。これら2つの特殊な領域は多分ユビキ
チン合成と、外部の影響に対応してユビキチンレベルを
調節するのにかかわっている。ユビキチンプロモーター
内に包含されているイントロンと熱ショック要素との間
の機能上の関係は解明されていない。本発明ではトウモ
ロコシユビキチンプロモーターが正常条件下および熱シ
ョック条件下の両方でmRNAの合成を調節すること、
および転写調節の変化が熱ショック後ユビキチン合成が
増大した理由となっていることについて報告する。
らは本発明を限定するものではない。
5日間、湿潤バーミキュライトにおいて成長させた。中
茎節から茎頂までの実生苗の部分を採取し、液体窒素中
で凍結させ、−80℃で保存した。
RNAを抽出した。ポリローセファデックス(Beth
esda Re5earch Laboratorie
s、 Gaithers−burg、 MO)カラムを
通過させることにより、全細胞RNAからポリ (A)
” RNAを単離した。全RNAあるいはポリ (A
) ” RNAを、3%(wt/vol)ホルムアルデ
ヒドを含む1.5%アガロースゲルで電気泳動した。2
5o+Mリン酸ナトリウム (pH6,5)を用いた毛
細管プロッティングにより、 RNAをGeneScr
een” (口uFont)に移した。
0Oμg変性サケDNA 、 40mMリン酸ナトリウ
ム(pH6,8)。
リダイズさせた。プロットは、50%ホルムアルデビド
。
40mMリン酸ナトリウム(pH6,8)、および1
0%硫酸デキストラン中でハイブリダイズさせた。
lant Mat、 Biol。
) ” RNAから合成した。二本鎖cDNAのオリゴ
(dC)ティリングと、オリゴ(dG)テイルpBR3
22によるオリゴ(dC)テイルcDNAのアニーリン
グとを、標準的技術を用いて実施した。了ニールしたD
NAを、 B、coliHe 101に形質転換し、テ
トラサイクリン(15μg/d)を含むL寒天プレート
上のニトロセルロースフィルター(Millipore
、 )IATF;0.45 μm )に直接プレートし
た。
ーをスクリーニングして、潜在的に光調節されたmRN
Aを表現する数多くのcDNAを得た。これらのcDN
Aの一部を選択し、 RN^プロット分析によってさら
にスクリーンして光調節を確認した。1つのC口NAク
ローン、 P2H4,2blは、赤色光調節mRNAを
表現しないが、大きさおよび生産量の異なる3つのポリ
(A) ” RNAとハイブリダイズしたことから注
目された。ニックトランスレーションしたp6t7.2
blは、2.100ヌクレオチドおよび1.600ヌク
レオチドのmRNAとは強くハイブリダイズしたが、8
00ヌクレオチドの転写物とはわずかじかハイブリダイ
ズしなかった。しかしながら、 p6T7.2blのc
DNA挿入物をpSP64にサブクローン化して構築し
たプラスミドである線形pC^210のSP6ボリメラ
ーゼ転写により生成される一重鎖32p−標識RNAと
のノーザンプロットのハイブリダイゼーションは、3つ
の転写物全部を容易に検出した。
ッドよりも熱に安定であることが知られているので、ノ
ーザンブロットハイプリダイゼーシコンにおいては、ニ
ックトランスレーションしたDNAプローブではなく一
重鎖RNAプローブを使用した。
Aあるいは一重鎖RNAプローブのいずれとハイブリダ
イズしたかにかかわらず、ノーザンプロット法で測定さ
れるように、 1,600塩基の転写物は、 2.10
0塩基の転写物の約3分の1しか認められなかった。最
も少ない転写物は、 RNAプローブとハイブリダイズ
したプロットにおける2、 100塩基のmRNAの約
半分であった。
にサブクローン化し、ジデオキシヌクレオチド鎮終結法
によって配列決定した。クローンの配列分析は。
ープンリーディングフレームを明らかにした Nati
onalBiomedical Re5earch F
oundationのライブラリーを、 D fast
Pプログラムを用いて、推定アミノ酸配列と相同なタ
ンパク配列について検索した。トウモロコシcDNAク
ローンの推定アミノ酸配列と。
上の相同性が認められた。
生苗から単離した。DNAを5au3Aによって部分的
に消化させ、大きさによって分別し、 [ha−ron
35 (Loenenら(1983)Gene26:
171−179)のBam81部位にクローン化した。
cDNAクローンをハイブリダイゼーションプローブと
して用いて、 in 5ituプラークハイブリダ
イゼーシヨンにより、ユビキチンcDNAクローンと相
同の配列を含む組換え体ファージについてスクリーニン
グした。ブロス溶解産物から組換え体ファージを精製し
、標準的技術を用いてファージDNAを単離した。制限
エンドヌクレアーゼの消化は、製造業者の指示書に従っ
て実施した。
.7%アガロースゲル上で分画し、これらのDNA断片
をGene5creen Plus”(DuPont)
に移した。フィルターを。
、 0.025Mクエン酸ナトリウム)、5×デンハ
ート培地、100μg/m1の音波処理した変性サケD
NA 、 20Mg/mlポリアデニル酸、 10mM
EDTAニナトリウム、および0.5%SO3中で、
65℃にて6〜8時間ブレハイブリダイズさせた。フィ
ルターは、新鮮な緩衝液中で65℃にて、32p−標識
プラスミドDNA (p[”A210)とハイブリダ
イズさせた。Kodak X−OMATARフィルムお
よび口uPont Cronex Lightning
Plus増感スクリーンを1枚使用して、−80℃でオ
ートラジオグラフィーを行った。各消化物において、8
〜10の制限断片が、ニックトランスレーションしたp
CA210プローブとハイブリダイズした。このことは
。
ことを示唆している。ユビキチンが小さな多重遺伝子群
によってコードされるという証拠は。
る。
イズしたが、残りの断片は弱くハイブリダイズした。ハ
イブリダイゼーション強度の差は配列相同性の相違を反
映すると考えられ、そのためcDNAプローブはそれが
誘導された遺伝子と優先的にハイブリダイズする。
けが行われており、それぞれ6個および少なくとも12
個のユビキチンリピートを有している。ノーザンプロッ
トで検出された3つの転写物に相当するトウモロコシ遺
伝子は、 2.1kb、 1.6kb。
および1または2個のユビキチンリピートを有しうる。
個のリピートをコードする。従って。
度の差は、制限断片が異なる数のユビキチンリピートを
含むことの結果である。
ビキチン遺伝子は、ゲノム消化物において使用される制
限エンドヌクレアーゼによって切断されるイントロンを
含みつる。この結果、ユビキチンのエクソンが異なる断
片に存在することになり、サザンプロットで観察された
ハイブリダイゼーション強度の差が説明される。
nnheim)のクレノー断片を使用して、ジデオキシ
ヌクレオチド鎮終結法による配列決定を実施した。cD
NAクローンp6T7.2b、 1に相同なゲノミック
クローン7.2bl(第1図B参照)の1.85kb
Pstl断片と、 AC389M13RFと命名され
た直ぐ上流の2kbPstl断片とを。
体ファージRF DNAをプラスミドDNAに関して調
製した。これらのPstl断片の両方の鎖を配列決定す
るために、一方向進行性欠失クローンを調製した。エキ
ソヌクレアーゼ■とエキソヌクレアーゼ■とは、それぞ
れNew England BiolabsおよびBe
thesdaResearch Laboratori
esより入手した。l1niversityof Wi
sconsin Genetics Computer
Groupより提供されたプログラムを用いてDNA
配列のコンピューター分析を実施17た。
°非翻訳領域のイントロンとエキソンとの3°接合部を
、 Stヌクレアーゼマツピングによって決定した。S
1プローブに適した断片は以下のように調製した。ユビ
キチンDNAをBqlllまたはXho lのいずれか
で消化した。次に、 −”F ATP(6,000C
i/mmo1. New Bngland Nucle
ar、 Boston。
[!nglandBiolabs)を用いて、これらを
32.で標識した。BqlIIおよびXho I切断部
位をキナーゼ処理した断片を、それぞれpstlおよび
Bco R1でさらに消化すると、 946 bJ)の
Pstl −Bql IIl断片よび643bpのBc
oRI−Xho l断片が生成した。5%ポリアクリル
アミドゲルを通して電気泳動することにより、これらの
断片を他の末端標識断片から分離した。946 bpの
Pstf −Bql IIl断片よび643 bpのB
coRI−Xho l断片を含む切片を、ゲルから切除
し、標@ 1)NAをゲルから溶出した。末端標識DN
A断片(10〜20fmol)を、80%の脱イオン化
ホルムアミドを含有するJFlf液30μm、0.4M
塩化すlラム、 40mM PIPBS(pH6,4)
、および1 mM BDTA(pH8゜0)中で、2μ
gのポリ (A) ” RNAとハイブリダイズさせた
。核酸溶液を80℃にて約16時間加熱した。280m
M塩化ナトリウム、 50mM酢酸ナトリウム(pH4
,6>、 4.5mM硫酸亜鉛、および20μg/−の
一本鎖DNAを含む水冷S1消化緩衝液(300μIり
を添加し、 DNAを250単位/rnlの31ヌクレ
アーゼ(New Bngland Nuclear)で
消化した。2゜5M酢酸アンモニウムおよび50mM
EDTAを含むS1終結混合物75μlで反応を停止さ
せた。次に、 SLヌクレアーゼ消化産物を6%ポリア
クリルアミド/8M尿素ゲル上で分離し、オートラジオ
グラフィーにより可視化した。ユビキチン配列中の81
保護断片の終点は、 Slプローブとして使用した末端
標識断片にマクサム/ギルバート塩基修飾−切断反応を
実施して生成した梯子形配列と比較することによって決
定された。
DNA配列を第2図に示す。この配列は、翻訳開始部位
の上流にある899塩基、5°非非翻訳列およびイント
ロン配列の1992塩基、3°配列の249塩基に先行
する7個のユビキチンタンパクリピートをコードする1
999塩基とを有するrTATAJボックスは、−30
位に位置し、2個の重複する熱ショック要素は、 −2
14位と一240位とに位置する。
を第3図に示す。トウモロコシ、ユビキチンの誘導され
たアミノ酸配列は上方に示され、7個のユビキチンリピ
ートのヌクレオチド配列はその下に並べられている。ゲ
ラミックDNA中の7個の完全なユビキチン単位の構成
の概要を第1図Cに示す。
は同じである(第3図)。末端(7番目)のユビキチン
リピートは、 TAA停止コドンの前に、付加的な77
番目のアミノ酸であるグルタミンを含む。この付加的な
アミノ酸は成熟ユビキチンには見られず、明らかにプロ
セッシングの間に除去される。ヒト遺伝子における最終
リピートの77番目のアミノ酸はバリンであり、2つの
ニワトリ遺伝子においてはチロシンおよびアスパラギン
である。酵母ならびに大麦も、それぞれ余分なアミノ酸
、アスパラギンおよびリジンを持っている;しかしなが
ら、ツメガエル遺伝子では余分なアミノ酸は見られなか
った。この余分なアミノ酸は。
るブロックとして機能すると言われている。
ンから113 bpの3”非翻訳配列に存在する。
が、これらのリピートのヌクレオチド配列は39個もの
ヌクレオチドが変化している。これは、ユビキチン遺伝
子間のヌクレオチド配列の相同性について報告されてい
るのと同様である。ユビキチンリピート間におけるヌク
レオチド不整合の約80%は、コドンの第3 (ゆらぎ
)塩基におけるものである。残りのヌクレオチドミス不
整合は。
ルギニン(3コドン)に対する代替コドンの使用によっ
て説明される。
て決定されたものと同じである。この配列は、酵母に関
して報告された配列とは2個のアミノ酸が異なっている
;28位および57位のセリンがアラニンに置換されて
いる。また、トウモロコシの配列は、すべての動物由来
のユビキチンについて報告されている配列ともわずかに
異なる;19位のプロリンがセリンに、24位のグルタ
ミン酸がアスパラギン酸に、57位のセリンがアラニン
に置換されている。従って、配列に基づけば、3種類の
ユビキチンが存在すると思われる:植物、動物。
ビキチン遺伝子上流領域−クロラムフェニコールアセチ
ルトランスフェラーゼ(CAT)遺伝子融合物の構築に
使用した手順の概略を第4図に示す。
非翻訳領域と、 pN[]5−CATのポリアデニル化
シグナル(Frommら(1985) Proc、Na
tl、Acad、 Sci、82にサブクローン化した
。この構築物をflue−CATと命名した。
ビキチンポリタンパクコード領域の直ぐ上流にある約2
.Okb Pstl切断を、 M13mp19にサブク
ローン化した。このDNAセグメントは、第2図に示し
たトウモロコシ・ユビキチン配列のヌクレオチド−89
9〜1092に及ぶ。この組換え体DNAはAC3tI
9M13RFと命名され、ユビキチンプロモーターと、
5′非翻訳リ一ダー配列と、第4図で081−5’と名
付けられた約1kbのイントロンとを含む。
合物を、 T、 DNAポリメラーゼでAC389M1
3RFの2.0 kb Pst I断片を平滑末端化
し、この断片をSma I消化のpUc18−CATに
クローン化することによって構築した。この構築物をp
UB−CATと命名した。
NAの導入 5〜6日齢の黄化した燕麦実生苗の葉(2g)をカミソ
リの刃で細かく切り刻んだ。この組織を消化培地(3m
M MBS、 pH5,7,10mM塩化カルシウム、
0.5Mマンニトール、および2mg/mj!アルギニ
ン)で数回洗浄し1次いで2%セルラーゼを含む20m
j!の消化培地とともに室温で4時間インキュベートし
た。この組織を時々攪拌してプロトプラストを放出させ
た。この材料を63μmのメツシュで濾過し、50Xg
で5分間遠心分離した。上澄み液を取り除き、プロトプ
ラストを消化培地で2回洗浄し1次いでエレクトロポレ
ーション緩衝液中に懸濁して、各エレクトロポレーショ
ンにつき0.5−のプロトプラスト懸濁液を調製した。
ていた: 10mM )IBPBs、 pH7,2,1
50mM塩化ナトリウム。
,5mf)を氷上で、40MgのプラスミドDNAと、
100μgの音波処理したサケDNAとを含む0.5
−のエレクトロポレーション緩衝液と混合した。
ecパルスにより、氷上でエレクトロポレーションした
。
ュベー)1..10mA’のムラシゲ−スクーグ(MS
)培地中に希釈して、室温で24時間インキュベート
した。
ト化した。上澄み液を取り除き、これらのプロトプラス
トをMS培地で1回洗浄した。このプロトプラストペレ
ットを200μlの緩衝液A (0,25M Tris
、 pH7,8,1mM BDTA、 1 mM
β−メルカプトエタノール)中に懸濁し、微小遠心分
離管に移した。最低出力で5〜IO秒間音波処理してプ
ロトプラストを粉砕した。プロトプラストの破片を4℃
で5分間遠心分離してペレット化した。上澄み液を取り
除き、10分間65℃に加熱し、−20℃で保存した。
レクトロポレーションしたプロトプラスト抽出物(組換
え体DNAで形質転換した細胞の抽出物)のアリフォラ
) (100μIりを、80μlの緩衝液Aと、 20
μm 14C−クロラムフェニコール(40〜60mC
i/mM) 、 2 mgアセチルCoA、および2
30μf緩衝液Aの混合物20μlとに添加した。この
反応物を37℃で90分間インキュベートした。反応生
産物を600μlの酢酸エチルで抽出し、この酢酸エチ
ルを蒸発させ、10μlの酢酸エチルに再懸濁すること
により濃縮した。クロロホルム:メタノール(95:5
. v/v)溶媒を使用して薄層クロマトグラフィーに
より反応生産物を分離し、オートラジオグラフィーによ
って検出した。
子により発現される酵素活性の量を測定することにより
、宿主細胞の形質転換を測定した。
ニコールアセチルトランスフェラーゼをコードする構造
遺伝子を使用した。組換え体DNA融合構築物において
使用したプロモーターの効力を試験するために、トウモ
ロコシ・ユビキチンプロモーター−CAT遺伝子融合物
pLIc−CATと、 V、Walbot。
カリフラワーモザイクウィルス35Sプロモーター−C
AT遺伝子融合物pCaMV−CAT (Frommら
(1985)Proc、Natl、Acad。
かを使用して。
ように、燕麦のプロトプラストにおいては。
ロモーターはCaMVプロモーターよりも「強力」であ
る。
苗を42℃のインキュベーターに移し、1゜3、および
8時間後に採取した。全RNA(7μg)を単離し、変
性し、1.5%アガロース3%ホルムアルデヒドゲルに
通して電気泳動した。このRNAをGene 5cre
enに移し、 SF3 RNAポリメラーゼを用いて線
状pcA210から転写された一本鎖RNAをプローブ
として調べた。(組換え体プラスミドpcA210は、
SF3 RNAポリメラーゼがユビキチンmRNAと
のハイブリダイゼーションに特異的なRNAプローブを
合成するように、 p6R7,2blの9751)p挿
入物をpSP64 (Promega)にサブクローン
化することによって構築した。)オートラジオグラフィ
ーを実施した後、バンドを切断し、フィルターに結合し
た放射能の量を液体シンチレーションによって測定した
。ノーザンプロットの分析から、3つのユビキチン転写
物のレベルを決定した。
ベルは、2.5〜3倍に上昇した。1.6kb転写物に
ついては約2倍の上昇が見られたが、0.8kb転写物
では上昇が見られなかった。実生苗を高温に移してから
3時間後までに、大きい方の2つのユビキチン転写物の
レベルは、ショックを与えていない組織で見い出された
レベルに戻っており、少なくともさらに5時間は、その
レベルのままであった。トウモロコシでの熱ショック反
応に右けるユビキチンの一過性の性質は、ユビキチンが
熱ショックにおいて特殊な役割を持ち、短期間だけのユ
ビキチンレベルの上昇が必要であることを示している。
第2図に示す。プロモーター領域内では。
る場合にストレス誘発性を与えることが示されている(
Pelham (1982)前出)コンセンサス熱ショ
ック配列と相同である。ショウジヨウバエの熱ショック
要素に対するコンセンサス配列は。
、一般に転写開始部位より約26塩基上流に見い出され
る。
に対して5°側の900塩基内に位置するのは、2つの
重複する熱ショック配列であるニー214位のヌクレオ
チドに始まる5’−CTGGA CCCCTCTCGA
−3’ 、および 一240位のヌクレオチドに始まる5’−CTCGA
GAGTTCCGCT−3’。
も、2つの重複する熱ショックコンセンサスプロモータ
ー配列を含むことが見い出された:369位のヌクレオ
チドに始まる5°−CT[l’GA ATCTTCCA
G−3’ 、および 一359位のヌクレオチドに始まる5”−CCAGA
GCTTTCTTTT−3’。
akら(1987)前出)の5°隣接領域は、1訳開始
部位から365塩基上流にある18kbの回転対称(回
文対構造)配列、 5”−TTCTAGAACGTTC
TAGAA−3’ を有する。
される転写開始部位の約284ヌクレオチド上流から始
まる回転対称コンセンサス「熱ショックボックス」ヌク
レオチド配列に対する厳密な相同性を有する。
、および熱ショックや他のストレスに対する誘発反応の
程度への最終的な影響は、大部分が不明のままであるが
、熱ショック要素が転写開始部位から5°側へ遠く位置
すればするほど、ストレスに対する反応の誘発レベルは
より小さいことが示唆されている。(U、 Bondら
(1986)前出)。
ーター内の異なる位置に任意に配置されうろこと、およ
び改変されたプロモーター配列がストレス条件下および
非ストレス条件下での転写の開始、方向づけ、および調
節を含むユビキチンプロモーター機能を保持する限り、
配列を化学的に変化させるか、あるいは合成相同配列で
置き換えうることを仮定する。ヌクレオチドを挿入およ
び/あるいは欠失し、得られたON^断片を操作するの
に必要な生化学的技術は、遺伝子再設計に関する当業者
には周知である。
熱ショック配列の存在と、転写開始部位および翻訳開始
コドンの間の大型(約1 kb)イントロンの存在とに
より構造的に特徴付けられる。このプロモーター構造は
、ニワトリ胚線維芽細胞由来のユビキチンプロモーター
について報告されているもの(U、 Bondら(19
86)前出)と非常に類似している。ニワトリ胚線維芽
細胞では、2つの重複する熱ショック配列が転写開始部
位の約350 bp上流に位置し、 674 bpのイ
ントロンが転写開始コドンと翻訳開始コドンとの間に含
まれている。最近(E。
ン0814遺伝子由来のプロモーター領域のヌクレオチ
ド配列が決定され、転写開始部位の約280bρ上流に
熱ショック配列を含むことが明らかになったが。
訳開始部位との間に大型イントロンを有さなかった。し
かしながら、イントロンを含む他の2つの酵母ユビキチ
ン遺伝子は、 Pelhamの「熱ショックボックス」
配列と相同な配列を欠いていることが見い出された。
胞、およびトウモロコシにおいて、熱ショックに応答し
てユビキチンの発現を上昇調節することが示されている
。3つの系全部において。
昇し、トウモロコシおよびニヮ) IJ胚線維芽細胞で
はユビキチンレベルの上昇は約3倍と測定された。この
熱ショック応答したユビキチン発現の増強は、他の熱シ
ョック遺伝子で得られるものよりも有意に低い。ニワ)
IJ胚線維芽細胞では、45℃に曝露した細胞中のユ
ビキチンmRNAのレベルは。
70mRNAのレベルは同じ熱ショック条件下で10倍
に上昇することが見い出された。さらに、3時間の熱シ
ョックから細胞が回復する間(半減期:約1.5〜2時
間)におけるユビキチンmRNAの相対的な不安定性は
、安定であると見い出されたH3P70 mRNAの不
安定性とは有意に異なることが判明した。
伝子が転写開始コドンと翻訳開始コドンとの間に大型イ
ントロンを含まないのは興味深いことである。ユビキチ
ンプロモーターと他の熱ショックプロモーターとの間の
もう1つの相違点は、ユビキチンが構成的かつ誘導的に
発現されるのに対して、従来の熱ショックタンパクの発
現は、主として熱ショックあるいは他のストレスに応答
して起こることである。本発明によれば、当業者は、ユ
ビキチンの構成的および/あるいは誘導的発現を変化さ
せるために、イントロン配列および熱ショック配列の両
方の組成配列ならびに位置を改変することができる。ま
た、得られた改変DNAのプロモーター機能を保持また
は向上させるように、トウモロコシのユビキチンプロモ
ーター領域内のヌクレオチド配列を再配置したり、化学
的に変化させたりするためには、標準的な組換え技術が
使用できる。ユビキチンプロモーター機能に関する試験
は、実施例2で述べたように実施できる。
のDNAセグメントが開示されている。このユビキチン
プロモーター領域は、熱ショックコンセンサス要素を含
み、該プロモーターの制御下に置かれている遺伝子の転
写の開始および調節を行なう。また、高温のストレスを
受けた場合に。
ために、ユビキチンプロモーターが植物発現可能な構造
遺伝子と結合されているような組換えDNA分子につい
て述べられている。このような組換えDNA分子が植物
組織中に導入され、プロモーター/構造遺伝子の組合せ
が発現される。
ーンの分析図である。すなわち(A)はユビキチン遺伝
子7.2blの制限地図; (B)はユビキチン遺伝子
102つのサブクローン化されたPstl断片の制限地
図; (C)はトウモロコシのユビキチン遺伝子1の構
成の概略図である。5° 側の非翻訳エキソンは白4角
で、縦列のユビキチンをコードする領域は1番号を付け
た4角でそれぞれ示しである。 第2図はユビキチン遺伝子1のDNA配列と推定のアミ
ノ酸配列を示す。S1ヌクレアーゼマツピングで決定さ
れた転写開始点は、塩基lと表示されている。推定の°
“TAT^”ボックス(−30)を示す配列と、2つの
重複する熱ショックコンセンサス配列(−214と−2
04)には下線を付けである。イントロンは塩基84か
ら塩基1093へと延び、ボリュピキチンタンパクをコ
ードする配列は、塩基1094から塩基2693へと延
びている。 第3図はユビキチンをコードする7つの反復部分全部が
、同じアミノ酸配列をコードすることを示す。上記の7
つの反復部分のヌクレオチド配列を、誘導されたアミノ
酸配列の下に並べて示しである。追加の77番のアミノ
酸、グルタミンが、終止コドンの前の7番目の反復部分
内に存在している。ポリアデニル化シグナル、^ATA
ATは、終止コドンから113bpの位置の3”側非翻
訳領域内に存在している。 第4図は、トウモロコシュビキチンのプロモーター領域
とクロラムフェニコールアセチントランスフェラーゼ(
CAT)遺伝子との融合体を構築するのに用いられた手
順の概略図である。 第5図は、ユビキチンプロモーターの検定法を示す。C
aMV−CATは、カリフラワーモザイクウィルス35
SプロモーターとCAT遺伝子の融合体; IIBQ−
CATは、トウモロコシユビキチンプロモーターとCA
T遺伝子の融合体を示す。 以上
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、植物ユビキチン調節システムを含む2kb以下のD
NA配列であって、 該調節システムが熱ショック要素およびイントロンを含
む、 DNA配列。 2、前記熱ショック要素が、熱ショックコンセンサス配
列に対して少なくとも75%の相同性を有する、請求項
1に記載のDNA配列。 3、前記熱ショック要素が、転写開始部位の5’側にあ
る約214個以下のヌクレオチドである、請求項1に記
載のDNA配列。 4、前記調節システムが2つの熱ショック要素を含む、
請求項3に記載のDNA配列。 5、前記熱ショック要素が重複するように位置する、請
求項4に記載のDNA配列。 6、前記イントロンが約1kbの長さである、請求項1
に記載のDNA配列。 7、前記イントロンがトウモロコシユビキチンプロモー
ターのイントロンである、請求項6に記載のDNA配列
。 8、前記イントロンが、転写開始部位から83個以下の
ヌクレオチドだけ3’側に位置する、請求項6に記載の
DNA配列。 9、前記熱ショック要素が前記転写開始部位の上流に位
置し、前記イントロンが該転写開始部位の下流に位置す
る、請求項1に記載のDNA配列。 10、植物ユビキチン調節システムを含む、2kb以下
のDNA配列と、植物発現性構造遺伝子とを有するDN
A構築物であって、 該調節システムが熱ショック要素およびイントロンを含
み、そして、 該構造遺伝子が該植物ユビキチン調節システムの調節制
御下に置かれている、 DNA構築物。 11、前記構造遺伝子が、本来は熱ショック制御下には
ない遺伝子をコードする、請求項10に記載のDNA構
築物。 12、植物細胞における構造遺伝子を構成的に発現させ
るための、および選択されたストレス誘導による該構造
遺伝子の発現を増強するための方法であって、 (a)熱ショック要素およびイントロンを含む植物ユビ
キチン調節システムと、該植物ユビキチン調節システム
の調節制御下にある植物発現性構造遺伝子とを含むDN
A構築物で該植物細胞を形質転換すること、および (b)該形質転換した植物細胞にストレス状態を選択的
に与え、該構造遺伝子の発現増強を誘導すること、 を包含する方法。
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