JP7593925B2 - 改善された抗体-オリゴヌクレオチドコンジュゲート - Google Patents
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- A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
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- A61K47/6863—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site the antibody targeting a determinant of a tumour cell the tumour determinant being from stomach or intestines cancer cell
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- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6835—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment the modifying agent being an antibody or an immunoglobulin bearing at least one antigen-binding site
- A61K47/6883—Polymer-drug antibody conjugates, e.g. mitomycin-dextran-Ab; DNA-polylysine-antibody complex or conjugate used for therapy
- A61K47/6885—Polymer-drug antibody conjugates, e.g. mitomycin-dextran-Ab; DNA-polylysine-antibody complex or conjugate used for therapy the conjugate or the polymer being a starburst, a dendrimer, a cascade
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- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
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- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/68—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being an antibody, an immunoglobulin or a fragment thereof, e.g. an Fc-fragment
- A61K47/6889—Conjugates wherein the antibody being the modifying agent and wherein the linker, binder or spacer confers particular properties to the conjugates, e.g. peptidic enzyme-labile linkers or acid-labile linkers, providing for an acid-labile immuno conjugate wherein the drug may be released from its antibody conjugated part in an acidic, e.g. tumoural or environment
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- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/69—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the conjugate being characterised by physical or galenical forms, e.g. emulsion, particle, inclusion complex, stent or kit
- A61K47/6905—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the conjugate being characterised by physical or galenical forms, e.g. emulsion, particle, inclusion complex, stent or kit the form being a colloid or an emulsion
- A61K47/6911—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the conjugate being characterised by physical or galenical forms, e.g. emulsion, particle, inclusion complex, stent or kit the form being a colloid or an emulsion the form being a liposome
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- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H15/00—Compounds containing hydrocarbon or substituted hydrocarbon radicals directly attached to hetero atoms of saccharide radicals
- C07H15/20—Carbocyclic rings
- C07H15/24—Condensed ring systems having three or more rings
- C07H15/256—Polyterpene radicals
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07J—STEROIDS
- C07J63/00—Steroids in which the cyclopenta(a)hydrophenanthrene skeleton has been modified by expansion of only one ring by one or two atoms
- C07J63/008—Expansion of ring D by one atom, e.g. D homo steroids
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/32—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
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Description
抗EGFR抗体-トリテルペノイドサポニン、及び/又は位置C-23にアルデヒド官能基を有しかつ任意にサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含む12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニン;
抗EGFR抗体-SO1861;
抗EGFR抗体-GE1741;
抗EGFR抗体-SA1641;
抗EGFR抗体-Quil-A;
抗EGFR抗体-QS-21;
抗EGFR抗体-Quillaja saponariaの水溶性サポニン画分中のサポニン;
セツキシマブ-トリテルペノイドサポニン、及び/又は位置C-23にアルデヒド官能基を有しかつ任意にサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含む12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニン;
セツキシマブ-SO1861;
セツキシマブ-GE1741;
セツキシマブ-SA1641;
セツキシマブ-Quil-A;
セツキシマブ-QS-21;
セツキシマブ-Quillaja saponariaの水溶性サポニン画分中のサポニン;
抗HER2抗体-トリテルペノイドサポニン、及び/又は位置C-23にアルデヒド官能基を有しかつ任意にサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含む12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニン;
抗HER2抗体-SO1861;
抗HER2抗体-GE1741;
抗HER2抗体-SA1641;
抗HER2抗体-Quil-A;
抗HER2抗体-QS-21;
抗HER2抗体-Quillaja saponariaの水溶性サポニン画分中のサポニン;
トラスツズマブ-トリテルペノイドサポニン、及び/又は位置C-23にアルデヒド官能基を有しかつ任意にサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含む12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニン;
トラスツズマブ-SO1861;
トラスツズマブ-GE1741;
トラスツズマブ-SA1641;
トラスツズマブ-Quil-A;
トラスツズマブ-QS-21;
トラスツズマブ-Quillaja saponariaの水溶性サポニン画分中のサポニン;
抗CD71抗体-トリテルペノイドサポニン、及び/又は位置C-23にアルデヒド官能基を有しかつ任意にサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含む12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニン;
抗CD71抗体-SO1861;
抗CD71抗体-GE1741;
抗CD71抗体-SA1641;
抗CD71抗体-Quil-A;
抗CD71抗体-QS-21;
抗CD71抗体-Quillaja saponariaの水溶性サポニン画分中のサポニン;
OKT-9-トリテルペノイドサポニン、及び/又は位置C-23にアルデヒド官能基を有しかつ任意にサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含む12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニン;
OKT-9-SO1861;
OKT-9-GE1741;
OKT-9-SA1641;
OKT-9-Quil-A;
OKT-9-QS-21;
OKT-9-Quillaja saponariaの水溶性サポニン画分中のサポニン;
抗EGFR抗体-アンチセンスオリゴヌクレオチド;
抗EGFR抗体-siRNA;
抗EGFR抗体-アンチセンスBNA;
抗EGFR抗体-アンチセンスBNA(HSP27);
抗EGFR抗体-タンパク質性毒素;
抗EGFR抗体-リボソーム不活性化タンパク質;
抗EGFR抗体-ジアンチン;
抗EGFR抗体-サポリン;
セツキシマブ-アンチセンスオリゴヌクレオチド;
セツキシマブ-siRNA;
セツキシマブ-アンチセンスBNA;
セツキシマブ-アンチセンスBNA(HSP27);
セツキシマブ-タンパク質性毒素;
セツキシマブ-リボソーム不活化タンパク質;
セツキシマブ-ジアンチン;
セツキシマブ-サポリン;
抗HER2抗体-アンチセンスオリゴヌクレオチド;
抗HER2抗体-siRNA;
抗HER2抗体-アンチセンスBNA;
抗HER2抗体-アンチセンスBNA(HSP27);
抗HER2抗体-タンパク質性毒素;
抗HER2抗体-リボソーム不活性化タンパク質;
抗HER2抗体-ジアンチン;
抗HER2抗体-サポリン;
トラスツズマブ-アンチセンスオリゴヌクレオチド;
トラスツズマブ-siRNA;
トラスツズマブ-アンチセンスBNA;
トラスツズマブ-アンチセンスBNA(HSP27);
トラスツズマブ-タンパク質性毒素;
トラスツズマブ-リボソーム不活化タンパク質;
トラスツズマブ-ジアンチン;
トラスツズマブ-サポリン;
抗CD71抗体-オリゴヌクレオチド;
抗CD71抗体-アンチセンスオリゴヌクレオチド;
抗CD71抗体-siRNA;
抗CD71抗体-アンチセンスBNA;
抗CD71抗体-アンチセンスBNA(HSP27);
抗CD71抗体-タンパク質性毒素;
抗CD71抗体-リボソーム不活性化タンパク質;
抗CD71抗体-ジアンチン;
抗CD71抗体-サポリン;
OKT-9-アンチセンスオリゴヌクレオチド;
OKT-9-siRNA;
OKT-9-アンチセンスBNA;
OKT-9-アンチセンスBNA(HSP27);
OKT-9-タンパク質性毒素;
OKT-9-リボソーム不活性化タンパク質;
OKT-9-ジアンチン;
OKT-9-サポリン;
A(-S)b(-E)c
構造C
式中、Aは、細胞表面分子標的化分子であり;
Sはサポニンであり;
Eは、エフェクター部分であり;
b=0~64、好ましくは0、1、2、3、4、8、16、32、64、又はその間のいずれかの整数又は分数であり;
c=0~8、好ましくは0、1、2、3、4、6、8、又はその間のいずれかの整数又は分数であり、
SはA及び/又はEにカップリングされ、EはA及び/又はSにカップリングされ、好ましくは、SはAにカップリングされ、EはAにカップリングされる。
用語「リンカー」はその通例の科学的意味を有し、ここでは、ペプチド結合を介して複合体化したアミノ酸残基の直線状ストレッチ又は化学的部分を言う。これは、分子又は原子を別の分子に、例えばリガンドに又はエフェクター分子に又は骨格に取り付ける。典型的には、リンカーは化学結合によって連結された原子の鎖を含む。当分野で公知のいずれかのリンカー分子又はリンカーテクノロジーが本開示に用いられ得る。指示されているところでは、リンカーは、リンカーとの共有結合的連結又は共有結合を形成することに好適なかかる分子上の化学基を介した分子の共有結合のためのリンカーである。リンカーは非切断可能なリンカーであり得る。例えば、リンカーは生理条件において安定である。リンカーは、切断可能なリンカー、例えば、酵素の存在下において、又は特定のpH範囲又は値において、又はヒト細胞などの哺乳類細胞のリソソーム及び後期エンドソームなどのエンドソームの細胞内条件などの生理条件下において切断可能であるリンカーであり得る。本開示の文脈において用いられ得る例示的なリンカーは、N-ε-マレイミドカプロン酸ヒドラジド(EMCH)、スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート、又は3-(2-ピリジルジチオ)プロピオン酸N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(SPDP)、及び1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート(HATU)を包含するが、これらに限定されない。
ある実施形態は、本発明のエンドソーム脱出向上コンジュゲートであり、サポニンは、位置23にアルデヒド官能基を有する12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニンであり、サポニンは、好ましくは、Gypsophila又はSaponaria種から単離され得るサポニンであり、より好ましくは、サポニンは、サポニンSO1861又はそのジアステレオマーのいずれかである。
雌Balb/cヌードマウスに、ヒトA431腫瘍細胞の懸濁液を皮下注射した。マウスの皮膚下に、ヒト表皮癌腫をゼノグラフト動物腫瘍モデルにおいて発生させた。腫瘍細胞の注射後に、ゼノグラフト腫瘍がおよそ170~180mm3のサイズまで発生することを許した。A431腫瘍細胞は次の特徴を有する:高EGFR発現体、中度CD71発現体、低HER2発現体。A431腫瘍細胞に基づく腫瘍モデルは、特に腫瘍が急速に成長して行くので、侵攻性のモデルである。
スキームIは、一連のQS-21サポニンの共通の分子構造を見せている(Conrado Pedebos,Laercio Pol-Fachin,Ramon Pons,Cilaine V. Teixeira Hugo Verli,Atomic Model and Micelle Dynamics of QS-21 Saponin,Molecules 2014,19,3744-3760から抜粋)。Quillaja saponariaから得られる水溶性サポニンの混合物(Sigma-Aldrich、製品No.S4521;Roth、アイテムNo.6857;InvivoGen、製品「Quil-A」)は、混合物中に存在する少なくとも1つの個々のサポニン、例えばQS-21のエンドソーム/リソソーム脱出向上特性に基づいて、又は混合物によって含まれる2つ以上のサポニンの組み合わせ、例えばQS-21及びQS-7に基づいて、本発明のエンドソーム/リソソーム脱出向上コンジュゲート、組成物、組み合わせに適用され得る。
セツキシマブ(ヒトEGFRを認識及び結合するモノクローナル抗体)に、SO1861をシステイン残基(Cys)を介してコンジュゲート化し(不安定)、ジアンチン(タンパク質毒素)をリジン残基(Lys)を介してコンジュゲート化し(安定)、セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-ジアンチン)2の産生をもたらした。セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-ジアンチン)2コンジュゲートを、図9に例示される通りEGFR腫瘍標的化殺細胞について、A431(EGFR)ゼノグラフマウス腫瘍モデルにおいて試験した。腫瘍が~150mm3のサイズに達した第12日に、投薬を開始し、腫瘍体積を毎投薬後に決定した。マウス(n=3)を、第12日:0.5mg/kg;第15日:1mg/kg、及び第24日:1.5mg/kgで、セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-ジアンチン)2又はセツキシマブ-(Lys-S-ジアンチン)1,6によって処置した(腹腔内;i.p.;用量漸増)。第26日に、対照群と比較して、腫瘍体積縮減が、セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,9(Lys-S-ジアンチン)2で処置した腫瘍を持つマウスにおいて観察され得た(図1A)。これは、抗体-タンパク質毒素(安定)コンジュゲートへのSO1861の不安定なコンジュゲート化が、腫瘍標的化抗体-タンパク質毒素の標的化治療有効性を向上させ得、それによってより有効な腫瘍標的化治療を誘導するということを示す。
本発明に従う別の例では、SO1861(不安定)及びタンパク質毒素ジアンチン(不安定又は安定)を、HER2標的化抗体トラスツズマブにコンジュゲート化した。トラスツズマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-ジアンチン)1,7又はトラスツズマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-ジアンチン)1,7を産生し、図9に例解される通り、SK-BR-3(HER2)及びMDA-MB-468(HER2-)細胞における向上した殺細胞について試験した。 トラスツズマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-ジアンチン)1,7(IC50=0,8nM)及びトラスツズマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-S-ジアンチン)1,7(IC50=0,8nM)両方は、SK-BR-3細胞(HER2)の殺細胞を効率的に誘導する(図4A)。これは、トラスツズマブ、トラスツズマブ-(Lys-L-ジアンチン)1,7、トラスツズマブ-(Lys-S-ジアンチン)1,7、又はトラスツズマブ-(L-SO1861)3,8単独で処置したSK-BR-3細胞では観察されなかった(図4A)。MDA-MB-468細胞(HER2-)では、本発明に従うコンジュゲートのいずれかについて殺細胞活性は観察され得ない(図4B)。これは、HER標的化抗体-タンパク質毒素コンジュゲートへのSO1861のコンジュゲート化が、標的細胞におけるタンパク質毒素のSO1861により媒介される向上した細胞質送達を効率的に誘導し、標的細胞死をもたらすということを示す。
本発明に従う別の例では、SO1861(不安定)及びHSP27BNAオリゴ(不安定)を、EGFR標的化抗体セツキシマブにコンジュゲート化した。セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,8を、図10に例解される通り本発明に従って、A431細胞(EGFR)及びA2058(EGFR-)細胞における向上したHSP27遺伝子サイレンシングについて試験した。セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,8は、セツキシマブ、セツキシマブ-(Lys-L-HSP27BNA)3,9又はセツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,8単独と比較して、A431細胞におけるHSP27遺伝子サイレンシングを効率的に誘導する(IC50=3nM)(図5A)。A2058細胞(EGFR-)では、遺伝子サイレンシング活性は、セツキシマブ-(Cys-L-SO1861)3,8(Lys-L-HSP27BNA)3,8によって観察され得ない(IC50>100nM;図5B)。これは、本発明に従う同じ標的化抗体へのSO1861及びHSP27BNAのコンジュゲート化が、標的細胞における治療薬アンチセンスオリゴヌクレオチドのSO1861により媒介される向上した細胞質送達を効率的に誘導し、標的遺伝子サイレンシングを誘導するということを示し、可能化する。
図8A~Dは、トラスツズマブ(図8A)、セツキシマブ(図8B)、又はT-DM1(図8C)、非コンジュゲート化タンパク質毒素、サポリン、ジアンチン、及び(非細胞結合)IgG抗体にコンジュゲート化されたサポリン(図8D)が種々の癌細胞株SK-BR-3、JIMT-1、MDA-MB-468、A431、CaSki、HeLa、A2058に投与されるときの、相対的細胞生存率を表示している。
遊離の毒素サポリン及びジアンチン、並びに試験された細胞株上の細胞表面分子のいずれかに対して親和性を有さない対照IgGにカップリングされた毒素サポリンは、100.000pMまでの試験された広範囲の濃度の毒素において、細胞生存率に対するいずれかの影響を有さないか、又はほとんど有さない(図8D)。
デンドロン(-L-SO1861)n合成(図13、14、15)
材料及び方法
略語
DCM ジクロロメタン
DIPEA N,N-ジイソプロピルエチルアミン
DMF N,N-ジメチルホルムアミド
EDCI・HCl 3-((エチルイミノ)メチレンアミノ)-N,N-ジメチルプロパン-1-アミニウムクロリド
EMCH.TFA N-(ε-マレイミドカプロン酸)ヒドラジド、トリフルオロ酢酸塩
min 分
r. t. 保持時間
TCEP トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩
Temp 温度
TFA トリフルオロ酢酸
THF テトラヒドロフラン
LC-MS法1,1
装置:Agilent 1200 Bin.ポンプ:G1312A、脱気装置;オートサンプラー、ColCom、DAD:Agilent G1316A、210、220、及び220~320nm、PDA:210-320nm、MSD:Agilent LC/MSD G6130B ESI、pos/neg 100-1000;ELSD Alltech 3300ガス流量 1.5ml/min、ガスtemp:40℃;カラム:Waters XSelect(商標)CSH C18、30×2.1mm、3.5μm、Temp:35℃、流量:1mL/min、勾配:t0=5%A、t1.6min=98%A、t3min=98%A、ポストタイム:1.3min、溶離液A:アセトニトリル中の0.1%ギ酸、溶離液B:水中の0.1%ギ酸
装置:Agilent 1260 Bin.ポンプ:G7112B、マルチサンプラー、カラムComp、DAD:Agilent G7115A、210、220、及び220-320nm、PDA:210-320nm、MSD:Agilent LC/MSD G6130B ESI、質量範囲は産物の分子量に依存する:
Apos/neg 100-1000
Bpos/neg 100-1400
;ELSD Alltech 3300ガス流量1.5ml/min、ガスtemp:40℃;カラム:Waters XSelect(商標)C18、30×2.1mm、3.5μm、Temp:40℃、流量:1mL/min、勾配:t0=5%A、t1.6min=98%A、t3min=98%A、ポストタイム:1.3min、溶離液A:アセトニトリル中の0.1%ギ酸、溶離液B:水中の0.1%ギ酸
装置:Waters IClass;Bin.ポンプ:UPIBSM、SM:UPISMFTN、SO;UPCMA、PDA:UPPDATC、210-320nm、SQD:ACQ-SQD2 ESI、pos/neg 800-1500;ELSD:ガス圧40psi、ドリフトチューブtemp:50℃;カラム:Waters XSelect(商標)CSH C18、50×2.1mm、2.5μm Temp:25℃、流量:0.6mL/min、勾配:t0=5%A、t2.0min=98%A、t2.7min=98%A、ポストタイム:0.3min、溶離液A:アセトニトリル、溶離液B:水中の10mM重炭酸アンモニウム(pH=9.5)。
装置:Waters IClass;Bin.ポンプ:UPIBSM、SM:UPISMFTN、SO;UPCMA、PDA:UPPDATC、210-320nm、SQD:ACQ-SQD2 ESI、pos/neg 1500-2500;ELSD:ガス圧40psi、ドリフトチューブtemp:50℃;カラム:Waters XSelect(商標)CSH C18、50×2.1mm、2.5μm Temp:25℃、流量:0.6mL/min、勾配:t0=15%A、t2.0min=60%A、t2.7min=98%A、ポストタイム:0.3min、溶離液A:アセトニトリル、溶離液B:水中の10mM重炭酸アンモニウム(pH=9.5)。
装置:Waters IClass;Bin.ポンプ:UPIBSM、SM:UPISMFTN、SO;UPCMA、PDA:UPPDATC、210-320nm、SQD:ACQ-SQD2 ESI、質量範囲は産物の分子量に依存する:
Apos/neg 1500-2500
Bneg 2000-3000
;ELSD:ガス圧40psi、ドリフトチューブtemp:50℃;カラム:Acquity C18、50×2.1mm、1.7μm Temp:60℃、流量:0.6mL/min、勾配:t0=2%A、t5.0min=50%A、t6.0min=98%A、ポストタイム:1.0min、溶離液A:アセトニトリル、溶離液B:水中の10mM重炭酸アンモニウム(pH=9.5)。
分取MP-LC法1,1
機器の型:Reveleris(商標)prep MPLC;カラム:Waters XSelect(商標)CSH C18(145×25mm、10μ);流量:40mL/min;カラムtemp:室温;溶離液A:水中の10mM重炭酸アンモニウムpH=9.0);溶離液B:99%アセトニトリル水中の1% 10mM重炭酸アンモニウム;勾配:t0min=5%B、t1min=5%B、t2min=10%B、t17min=50%B、t18min=100%B、t23min=100%B;検出UV:210、225、285nm。
機器の型:Reveleris(商標)prep MPLC;カラム:Phenomenex LUNA C18(3)(150×25mm、10μ);流量:40mL/min;カラムtemp:室温;溶離液A:水中の0.1%(v/v)ギ酸、溶離液B:アセトニトリル中の0.1%(v/v)ギ酸;勾配:t0min=5%B、t1min=5%B、t2min=10%B、t17min=50%B、t18min=100%B、t23min=100%B;検出UV:210、225、285nm。
MS機器の型:Agilent Technologies G6130B四重極;HPLC機器型:Agilent Technologies 1290分取LC;カラム:Waters XSelect(商標)CSH(C18、100×30mm、10μ);流量:25ml/min;カラムtemp:室温;溶離液A:100%アセトニトリル;溶離液B:水中の10mM重炭酸アンモニウムpH=9.0;産物の極性に依存するlin.勾配:
At0=20%A、t2min=20%A、t8.5min=60%A、t10min=100%A、t13min=100%A
Bt0=5%A、t2min=5%A、t8.5min=40%A、t10min=100%A、t13min=100%A
Ct0=10%A、t2min=10%A、t8.5min=50%A、t10min=100%A、t13min=100%A
;検出:DAD(220~320nm);検出:MSD(ESI pos/neg)質量範囲:100~800;DADに基づく画分収集。
MS機器の型:Agilent Technologies G6130B四重極;HPLC機器型:Agilent Technologies 1290分取LC;カラム:Waters XBridge Shield(C18、150×19mm、5μ);流量:25ml/min;カラムtemp:室温;溶離液A:100%アセトニトリル;溶離液B:水中の10mM重炭酸アンモニウムpH=9.0;lin.勾配:t0=5%A、t2.5min=5%A、t11min=40%A、t13min=100%A、t17min=100%A;検出:DAD(220~320nm);検出:MSD(ESI pos/neg)質量範囲:100~800;フラクションコレクションに基づくDAD
Grace Reveleris X2(登録商標)C-815 Flash;溶媒送達系:3ピストンポンプ、オートプライミング、一ランで4つの独立したチャンネル、4つまでの溶媒、溶媒が枯渇したときにラインを自動切り替え;最大ポンプ流量250mL/min;最大圧力50bar(725psi);検出:UV200~400nm、4つまでのUVシグナルの組み合わせ、全UV範囲の走査、ELSD;カラムサイズ:装置上4-330g、ルアー型、オプションホルダーによって750gから3000gまで。
SO1861(121mg、0.065mmol)及びEMCH.TFA(110mg、0.325mmol)に、メタノール(エクストラドライ、3.00mL)及びTFA(0.020mL、0.260mmol)を追加した。反応混合物を室温で撹拌した。1.5時間後に、反応混合物を分取MP-LC1に付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(120mg、90%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度96%。
LRMS(m/z):2069[M-1]1-
LC-MSr.t.(min):1.084
デンドロン(-L-SO1861)4合成(図14)
ジ-tert-ブチル(((6-アジドヘキサノイル)アザンジイル)ビス(エタン-2,1-ジイル))ジカルバメート
6-アジドヘキサン酸(0.943g、6.00mmol)、EDCI.HCl(1.21g、6.30mmol)、及びOxymaPure(0.938g、6.60mmol)をDMF(10.0mL)に溶解し、混合物を5分間撹拌した。次に、DMF中のジ-tert-ブチル(アザンジイルビス(エタン-2,1-ジイル))ジカルバメート(1.82g、6.00mmol)の溶液(5.00mL)を追加し、反応混合物を室温で撹拌した。5時間後に、反応混合物を真空において蒸発させ、残渣を酢酸エチル(50mL)に溶解した。もたらされた溶液を、1N重硫酸カリウム溶液(50mL)、飽和重炭酸ナトリウム溶液(2×50mL)、及びブライン(50mL)によって洗浄し、Na2SO4によって乾燥し、濾過し、真空中で蒸発させた。残渣をフラッシュクロマトグラフィー(酢酸エチル-ヘプタン勾配、10:90が100:0まで上昇)により精製して、表題化合物(2.67g、100%)を白色固体として与えた。LC-MSに基づく純度98%。
LRMS(m/z):287/343/465[M-155/M-99/M23]1
LC-MSr.t.(min):2.022A
N,N-ビス(2-アミノエチル)-6-アジドヘキサンアミド二塩酸塩
ジ-tert-ブチル(((6-アジドヘキサノイル)アザンジイル)ビス(エタン-2,1-ジイル))ジカルバメート(2.66g、6.00mmol)に、イソプロパノール中のHCl(5-6 N、20.0mL、110mmol)を追加し、反応混合物を室温で撹拌した。4時間後に、反応混合物を真空中で蒸発させ、もたらされたクルードな産物をDCM(3×20mL)と同時蒸発させて、クルードな表題産物(1.49g、79%)を白色固体として与えた。
LRMS(m/z):243[M1]1
テトラ-tert-ブチル((5S,5S)-((((6-アジドヘキサノイル)アザンジイル)ビス(エタン-2,1-ジイル))ビス(アザンジイル))ビス(6-オキソヘキサン-6,1,5-トリイル))テトラカルバメート
DMF(30.0mL)及びDIPEA(2.62mL、15.1mmol)中のN,N-ビス(2-アミノエチル)-6-アジドヘキサンアミドジヒドロクロリド(1.19g、3.76mmol)の溶液に、Boc-Lys(Boc)-ONp(3.69g、7.90mmol)を追加し、混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を真空中で蒸発させ、残渣を酢酸エチル(100mL)に溶解した。もたらされた溶液を1N重硫酸カリウム溶液(100mL)及び飽和重炭酸ナトリウム溶液(5×100mL)によって洗浄し、Na2SO4によって乾燥し、濾過し、真空中で蒸発させた。残渣をフラッシュクロマトグラフィー(DCM-メタノール/DCM(1/9v/v)勾配、100:0が0:100まで上昇)により精製して、標題産物(3.07g、91%)をわずかに黄色がかった固体として与えた。LC-MSに基づく純度94%。
LRMS(m/z):800/900/922[M-99/M1/M23]1
LC-MSr.t.(min):2.172A
4-ニトロフェニル3-(アセチルチオ)プロパノエート
4-ニトロフェニルトリフルオロアセタート(5.17g、22.0mmol)及び3-(アセチルチオ)プロピオン酸(2.96g、20.0mmol)をDCM(50.0mL)に溶解した。次に、DIPEA(6.97mL、40.0mmol)を追加し、反応混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を真空中で蒸発させ、残渣を酢酸エチル(50mL)に溶解した。もたらされた溶液を、1N重硫酸カリウム溶液(50mL)、飽和重炭酸ナトリウム溶液(5×50mL)、及びブライン(50mL)によって洗浄し、Na2SO4によって乾燥し、濾過し、真空中で蒸発させた。残渣をフラッシュクロマトグラフィー(DCM-メタノール/DCM(1/9v/v)勾配、100:0が0:100まで上昇)により精製して、標題産物(4.90g、91%)をわずかに黄色がかった固体として与えた。LC-MSに基づく純度99%。
LRMS(m/z):292[M23]1
LC-MSr.t.(min):1.942A
(S)-2,6-ジアミノ-N-(2-(6-アジド-N-(2-((S)-2,6-ジアミノヘキサンアミド)エチル)ヘキサンアミド)エチル)ヘキサンアミドテトラヒドロクロリド
テトラ-tert-ブチル((5S,5’S)-((((6-アジドヘキサノイル)アザンジイル)ビス(エタン-2,1-ジイル))ビス(アザンジイル))ビス(6-オキソヘキサン-6,1,5-トリイル))テトラカルバメート(1.80g、2.00mmol)を、イソプロパノール中のHCl(5-6N、50.0ml、275 mmol)に溶解し、反応混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を真空中で蒸発させ、もたらされたクルードな産物をDCM(3×20mL)と同時蒸発させて、クルードな表題産物を白色固体として与えた。
LRMS(m/z):250[M2]2,500[M1]1
(2S)‐2,6‐ビス[3‐(アセチルスルファニル)プロパンアミド]‐N‐[2‐(6‐アジド‐N‐{2‐[(2S)‐2,6‐ビス[3‐(アセチルスルファニル)プロパンアミド]ヘキサンアミド]エチル}ヘキサンアミド)エチル]ヘキサンアミド
DMF(30mL)及びDIPEA(3.48mL、20.0mmol)中の(S)-2,6-ジアミノ-N-(2-(6-アジド-N-(2-((S)-2,6-ジアミノヘキサンアミド)エチル)ヘキサンアミド)エチル)ヘキサンアミド)テトラヒドロクロリド(1.29g、2.00mmol)の溶液に、4-ニトロフェニル3-(アセチルチオ)プロパノエート(2.26g、8.40mmol)を追加し、反応混合物を週末をかけて室温で撹拌した。反応混合物を真空中で蒸発させ、残渣をDCM/メタノール(95:5v/v、100mL)に溶解した。もたらされた溶液を、1N重硫酸カリウム溶液(100mL)、1N水酸化ナトリウム溶液(3×100mL)、及びブライン(100mL)によって洗浄し、Na2SO4によって乾燥し、濾過し、真空中で蒸発させた。残渣をフラッシュクロマトグラフィー(DCM-メタノール/DCM(1/9v/v)勾配、100:0が0:100まで上昇)により精製して、表題産物(1.33g、65%)を白色固体として与えた。LC-MSによって、1つの脱保護されたチオ酢酸基を有する産物に対応するm/z値を有する不純物(15%)が見出された。不純物は、ワークアップ中に又は後に形成された。LC-MSに基づく純度85%。
LRMS(m/z):510[M2]2,1019/1041[M1/M23]1
LC-MSr.t.(min):1.862B
N,N’-((9S,19S)-14-(6-アミノヘキサノイル)-1-メルカプト-9-(3-メルカプトプロパンアミド)-3,10,18-トリオキソ-4,11,14,17-テトラアザトリコサン-19,23-ジイル)ビス(3-メルカプトプロパンアミド)ホルマート
骨格2(102mg、0.100mmol)をメタノール(1.00ml)に溶解した。次に、新しく調製した1N水酸化ナトリウム溶液(0.440ml、0.440mmol)を追加し、反応混合物を室温で撹拌した。30min後に、THF中の1.0Mトリメチルホスフィン溶液(0.500ml、0.500mmol)を追加し、もたらされた混合物を室温で撹拌した。30min後に、反応混合物を真空中で蒸発させ、メタノール(2×10mL)と同時蒸発させた。残渣をメタノール/水の混合物(9:1v/v、1.00mL)に溶解し、もたらされた溶液を分取MP-LC2に付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(75.6mg、87%)を無色のネバネバした油として与えた。LC-MSに基づく純度96%。
LRMS(m/z):513[M2]2,825[M1]1
LC-MSr.t.(min):1.422A
デンドロン(-L-SO1861)4-アミン
N,N’-((9S,19S)-14-(6-アミノヘキサノイル)-1-メルカプト-9-(3-メルカプトプロパンアミド)-3,10,18-トリオキソ-4,11,14,17-テトラアザトリコサン-19,23-ジイル)ビス(3-メルカプトプロパンアミド)ホルマート(2.73mg、3.13μmol)を、20mM NH4HCO3の0.5mMTCEP/アセトニトリルとの混合物(3:1v/v、3.00mL)に溶解した。次に、SO1861-EMCH(29.2mg、0.014mmol)を追加し、反応混合物を室温で撹拌した。1.5時間後に、反応混合物を分取LC-MS3Bに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(12.3mg、43%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度97%。
LRMS(m/z):1517[M-6]6-,1821[M-5]5-,2276[M-4]4-
LC-MSr.t.(min):4.395A
デンドロン(-L-SO1861)4-アジド
デンドロン(SO1861)4-アミン(6.81mg、0.748μmol)及び2,5-ジオキソピロリジン-1-イル1-アジド-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-オアート(2.90mg、7.48μmol)をDMF(1.00mL)に溶解した。次に、DIPEA(1.302μL、7.48μmol)を追加し、混合物を1min振盪し、室温で静置した。2時間後に、反応混合物を分取LC-MS3Cに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(5.86mg、84%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度90%。
LRMS(m/z):2344[M-4]4-
LC-MSr.t.(min):4.785B
デンドロン(-L-SO1861)4-マレイミド1
デンドロン(SO1861)4-アミン(8.12mg、0.891μmol)及び2,5-ジオキソピロリジン-1-イル1-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロル-1-イル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-オアート(3.94mg、8.91μmol)を、DMF(1.00mL)に溶解した。次に、DIPEA(1.55μL、8.91μmol)を追加し、混合物を1min振盪し、室温で静置した。3時間後に、反応混合物を分取LC-MS3Cに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(6.76mg、80%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度66%。
LRMS(m/z):2358[M-4]4-
LC-MSr.t.(min):2.136C
デンドロン(-L-SO1861)4-マレイミド2
骨格2(5.10mg、5.00μmol)をメタノール(100μL)に溶解した。次に、新しく調製した1N水酸化ナトリウム溶液(22.0μL、22.0μmol)を追加し、混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、THF中の1.0Mトリメチルホスフィン溶液(25.0μL、25.0μmol)を追加し、もたらされた混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、反応混合物を真空中で蒸発させ、メタノール(2×5mL)と同時蒸発させた。もたらされた残渣を、0.5mM TCEP/アセトニトリルとの20mM NH4HCO3の混合物(3:1v/v、3.242mL)に溶解した。この溶液から、直接的に、1000μLをSO1861-EMCH(14.4mg、6.94μmol、骨格と比較して4.5当量)に追加し、混合物を1min振盪し、室温で静置した。10min後に、反応混合物を一晩凍結乾燥した。もたらされた残渣に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル3-(2-(2-(3-(2,5-ジオキソ-2h-ピロル-1(5h)-イル)プロパンアミド)エトキシ)エトキシ)プロパノエート(5.84mg、0.014mmol)及びDMF(1.00mL)を追加した。次に、DIPEA(2.39μL、0.014mmol)を追加し、懸濁液を1min振盪し、室温で静置した。2時間後に、反応混合物を分取LC-MS3Cに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(10.9mg、85%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度80%。
LRMS(m/z):2354[M-4]4-
LC-MSr.t.(min):4.165B
デンドロン(-L-SO1861)8合成(図15)
tert‐ブチルN‐[(1S)‐1‐{[(1S)‐1‐{[2‐(6‐アジド‐N‐{2‐[(2S)‐2,6‐ビス[(2S)‐2,6‐ビス({[(tert‐
ブトキシ)カルボニル]アミノ})ヘキサンアミド]ヘキサンアミド]エチル}ヘキサンアミド)エチル]カルバモイル}‐5‐[(2S)‐2,6‐ビス({[(tert‐ブトキシ)カルボニル]アミノ})ヘキサンアミド]ペンチル]カルバモイル}‐5‐{[(tert‐ブトキシ)カルボニル]アミノ}ペンチル]カルバメート
(S)-2-6-ジアミノ-N-(2-(6-アジド-N-(2-((S)-2,6-ジアミノヘキサンアミド)エチル)ヘキサンアミド)エチル)ヘキサンアミドテトラヒドロクロリド(964mg、1.50mmol)を、DMF(25.0mL)及びトリエチルアミン(2.08mL、15.0mmol)に溶解した。次に、Boc-Lys(Boc)-ONp(3.36g、7.18mmol)を追加し、反応混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物を真空中で蒸発させ、残渣をフラッシュクロマトグラフィー(DCM-メタノール/DCM(1/9v/v)勾配、100:0が0:100まで上昇)により精製して、表題産物(2.71g、100%)を白色固体として与えた。LC-MSに基づく純度97%。
LRMS(m/z):807[M-198]2
LC-MSr.t.(min):2.352B
(2S,2’S)-N,N’-((5S,15S,22S)-22,26-ジアミノ-10-(6-アジドヘキサノイル)-15-((S)-2,6-ジアミノヘキサンアミド)-6,14,21-トリオキソ-7,10,13,20-テトラアザヘキサコサン-1,5-ジイル)ビス(2,6-ジアミノヘキサンアミド)オクタヒドロクロリド
中間体1(2.71g、1.50mmol)を、イソプロパノール中のHCl(5-6N、25.0ml、138mmol)に溶解し、反応混合物を室温で一晩撹拌した。次に、反応混合物を真空中で蒸発させ、もたらされたクルードな産物をDCM(3×20mL)と同時蒸発させて、クルードな表題産物を白色固体として与えた。
LRMS(m/z):203/254[M-200/M4]4,338[M3]3,507[M2]2,1012[M1]1
(2S)‐2,6‐ビス[3‐(アセチルスルファニル)プロパンアミド]‐N‐[(1S)‐1‐{[2‐(6‐アジド‐N‐{2‐[(2S)‐2,6‐ビス[(2S)‐2,6‐ビス[3‐(アセチルスルファニル)プロパンアミド]ヘキサンアミド]ヘキサンアミド]エチル}ヘキサンアミド)エチル]カルバモイル}‐5‐[(2S)‐2,6‐ビス[3‐(アセチルスルファニル)プロパンアミド]ヘキサンアミド]ペンチル]ヘキサンアミド
(2S,2’S)-N,N’-((5S,15S,22S)-22,26-ジアミノ-10-(6-アジドヘキサノイル)-15-((S)-2,6-ジアミノヘキサンアミド)-6,14,21-トリオキソ-7,10,13,20-テトラアザヘキサコサン-1,5-ジイル)ビス(2,6-ジアミノヘキサンアミド)オクタヒドロクロリド(300mg、0.230mmol)に、DMF(20.0mL)、トリエチルアミン(320μl、2.30mmol)、及び4-ニトロフェニル3-(アセチルチオ)プロパノエート(595mg、2.21mmol)を追加した。もたらされた懸濁液を60℃で30minソニケーションし、室温で一晩撹拌させた。反応混合物を真空中で蒸発させ、残渣を、最初にフラッシュクロマトグラフィー(DCM-メタノール/DCM(1/9v/v)勾配、100:0が0:100まで上昇)を行うこと、次に分取MP-LC2によって精製して、表題産物(70mg、15%)を白色固体として与えた。LC-MSに基づく純度100%。
LRMS(m/z):685[M3]3
LC-MSr.t.(min):1.912A
(2S)‐N‐[(1S)‐1‐{[2‐(6‐アミノ‐N‐{2‐[(2S)‐2,6‐ビス[(2S)‐2,6‐ビス(3‐スルファニルプロパンアミド)ヘキサンアミド]ヘキサンアミド]エチル}ヘキサンアミド)エチル]カルバモイル}‐5‐[(2S)‐2,6‐ビス(3‐スルファニルプロパンアミド)ヘキサンアミド]ペンチル]‐2,6‐ビス(3‐スルファニルプロパンアミド)ヘキサンアミドホルマート
骨格4(10.0mg、4.87μmol)をメタノール(200μL)に溶解した。次に、新しく調製した1N水酸化ナトリウム溶液(42.9μL、0.043mmol)を追加し、もたらされた混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、THF中の1.0Mトリメチルホスフィン溶液(24.4μL、0.024mmol)を追加し、もたらされた混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、反応混合物を水(1mL)で希釈し、直接的に分取MP-LC2に付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(4.02mg、48%)を白色の綿毛状の固体として与えた。
LRMS(m/z):564[M3]3,846[M2]2
LC-MSr.t.(min):1.542C
デンドロン(-L-SO1861)8-アミン
骨格5(0.52mg、0.299μmol)及びSO1861-EMCH(29.2mg、0.014mmol)を、20mM NH4HCO3の0.5mM TCEP/アセトニトリルとの混合物(3:1v/v、1.00mL)に溶解し、もたらされた混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、TCEP(0.30mg、1.05μmol)を追加し、反応混合物を1min振盪した。次に、混合物を、直接的に分取LC-MS3Bに付した。産物に対応する画分を、直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(2.17mg、40%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度97%。
LRMS(m/z):2282[M-8]8-,2607[M-7]7-
LC-MSr.t.(min):4.415A
SO1861-三官能性リンカー-BNAオリゴ合成(図16)
材料及び方法
三官能性リンカー
三官能性リンカー(DBCO、TCO、マレイミド)はBio-Synthesis Inc.(ルイスビル、テキサス)に注文した。
HSP27BNAオリゴ
HSP27BNA(-チオール)オリゴ(配列5’-GGCacagccagtgGCG-3’)(Zhang et al.,2011)を、Bio-synthesis Inc.(ルイスビル、テキサス)から購入した。
SO1861-アジド
SO1861 60mg、0.032mmol))及び1-アジド-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-ヒドラジド(39.3mg、0.129mmol)に、メタノール(エクストラドライ、1.00mL)及びTFA(9.86μl、0.129mmol)を追加し、反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。2時間後に、反応混合物を分取MP-LC1に付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(58.4mg、84%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度100%。
LRMS(m/z):2150[M-1]1-
LC-MSr.t.(min):1.103B
SO1861-三官能性リンカー
SO1861-アジド(45mg、0.021mmol)及び三官能性リンカー(26.5mg、0.022mmol)をDMF(2.50mL)に溶解し、もたらされた混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、反応混合物を分取LC-MS3Cに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(58.4mg、84%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度89%。
LRMS(m/z):1677[M-2]2-
LC-MSr.t.(min):2.546A
(E)-1-(4-((2-(6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロル-1-イル)ヘキサノイル)ヒドラジンイリデン)メチル)ベンズアミド)-N-(4-(6-メチル-1,2,4,5-テトラジン-3-イル)ベンジル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-アミド
1-(4-ホルミルベンズアミド)-N-(4-(6-メチル-1,2,4,5-テトラジン-3-イル)ベンジル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-アミド(28.0mg、0.048mmol)及びEMCH.TFA(24.5mg、0.072mmol)に、メタノール(エクストラドライ、2.00mL)及びTFA(11.1μL、0.145mmol)を追加し、反応混合物を50℃で撹拌した。30min後に、反応混合物を真空中で蒸発させ、もたらされた残渣をMP-LC1により精製した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(33.4mg、88%)を鮮紫色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度92%。
LRMS(m/z):394[M2]2,789[M1]1
LC-MSr.t.(min):1.287A
メチルテトラジン-BNAオリゴ
HSP27 BNAオリゴジスルフィド(70.0mg、0.012mmol)を20mM NH4HCO3(20.0mL)に溶解した。次に、TCEP(14.3mg、0.050mmol)を追加し、反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。反応混合物を、3000Daの分子量カットオフを有する遠心フィルター(5000×g、30min)を用いることによって濾過した。次に、2.5mM TCEPを有する20mM NH4HCO3の溶液(20.0mL)を残渣溶液に追加し、もたらされた混合物を上に記載されている同じ条件下で再び濾過した。残渣溶液を20mM NH4HCO3(30.0mL)によって希釈し、もたらされた混合物を、アセトニトリル(10.0mL)中の(E)-1-(4-((2-(6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロル-1-イル)ヘキサノイル)ヒドラジンイリデン)メチル)ベンズアミド)-N-(4-(6-メチル-1,2,4,5-テトラジン-3-イル)ベンジル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-アミド(14.8mg、18.8μmol)の溶液に追加した。反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、反応混合物を凍結し、週末をかけて凍結乾燥して、クルードな表題産物をピンク色の綿毛状の固体として与えた。クルードな産物に20mM NH4HCO3(20.0mL)を追加し、もたらされた懸濁液を0.45μmシリンジフィルターで濾過した。濾液を、上に記載されている同じ条件によって遠心フィルターを用いて濾過した。次に、再び、20mM NH4HCO3の溶液(20.0mL)を残渣溶液に追加し、もたらされた混合物を、上に記載されている同じ条件によって遠心フィルターを用いて再び濾過した。残渣溶液を20mM NH4HCO3(20.0mL)で希釈し、もたらされた混合物を一晩凍結乾燥して、表題産物(90.0mg、115%)をピンク色の綿毛状の固体として生んだ。LC-MSに基づく純度91%。
LRMS(m/z):1631[M-4]4-,2174[M-3]3-
LC-MSr.t.(min):0.737B
SO1861-三官能性リンカー-BNAオリゴ
メチルテトラジン-BNAオリゴ(90.0mg、0.014mmol)及びSO1861-三官能性リンカー(48.6mg、0.014mmol)を、水/アセトニトリル(4:1v/v、12.0mL)の混合物に溶解した。反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。15min後に、混合物を分取LC-MS4Aに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(82.0mg、60%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度92%(両方のm/z値が表題化合物に対応する、2つのピーク)。
LRMS(m/z):1641[M-6]6-,1970[M-5]5-
LC-MSr.t.(min):3.24及び3.406B
SO1861-アジド
SO1861 60mg、0.032mmol))及び1-アジド-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-ヒドラジド(39.3mg、0.129mmol)に、メタノール(エクストラドライ、1.00mL)及びTFA(9.86μl、0.129mmol)を追加し、反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。2時間後に、反応混合物を分取MP-LC1に付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(58.4mg、84%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度100%。
LRMS(m/z):2150[M-1]1-
LC-MSr.t.(min):1.103B
SO1861-三官能性リンカー
SO1861-アジド(45mg、0.021mmol)及び三官能性リンカー(26.5mg、0.022mmol)をDMF(2.50mL)に溶解し、もたらされた混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、反応混合物を分取LC-MS3Cに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(58.4mg、84%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度89%。
LRMS(m/z):1677[M-2]2-
LC-MSr.t.(min):2.546A
(E)-1-(4-((2-(6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロル-1-イル)ヘキサノイル)ヒドラジンイリデン)メチル)ベンズアミド)-N-(4-(6-メチル-1,2,4,5-テトラジン-3-イル)ベンジル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-アミド
1-(4-ホルミルベンズアミド)-N-(4-(6-メチル-1,2,4,5-テトラジン-3-イル)ベンジル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-アミド(28.0mg、0.048mmol)及びEMCH.TFA(24.5mg、0.072mmol)に、メタノール(エクストラドライ、2.00mL)及びTFA(11.1μL、0.145mmol)を追加し、反応混合物を50℃で撹拌した。30min後に、反応混合物を真空中で蒸発させ、もたらされた残渣をMP-LC1により精製した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(33.4mg、88%)を鮮紫色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度92%。
LRMS(m/z):394[M2]2,789[M1]1
LC-MSr.t.(min):1.287A
メチルテトラジン-BNAオリゴ
HSP27 BNAオリゴジスルフィド(70.0mg、0.012mmol)を20mM NH4HCO3(20.0mL)に溶解した。次に、TCEP(14.3mg、0.050mmol)を追加し、反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。反応混合物を、3000Daの分子量カットオフを有する遠心フィルター(5000×g、30min)を用いることによって濾過した。次に、2.5mM TCEPを有する20mM NH4HCO3の溶液(20.0mL)を残渣溶液に追加し、もたらされた混合物を上に記載されている同じ条件下で再び濾過した。残渣溶液を20mM NH4HCO3(30.0mL)によって希釈し、もたらされた混合物を、アセトニトリル(10.0mL)中の(E)-1-(4-((2-(6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロル-1-イル)ヘキサノイル)ヒドラジンイリデン)メチル)ベンズアミド)-N-(4-(6-メチル-1,2,4,5-テトラジン-3-イル)ベンジル)-3,6,9,12-テトラオキサペンタデカン-15-アミド(14.8mg、18.8μmol)の溶液に追加した。反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。30min後に、反応混合物を凍結し、週末をかけて凍結乾燥して、クルードな表題産物をピンク色の綿毛状の固体として与えた。クルードな産物に20mM NH4HCO3(20.0mL)を追加し、もたらされた懸濁液を0.45μmシリンジフィルターで濾過した。濾液を、上に記載されている同じ条件によって遠心フィルターを用いて濾過した。次に、再び、20mM NH4HCO3の溶液(20.0mL)を残渣溶液に追加し、もたらされた混合物を、上に記載されている同じ条件によって遠心フィルターを用いて再び濾過した。残渣溶液を20mM NH4HCO3(20.0mL)で希釈し、もたらされた混合物を一晩凍結乾燥して、表題産物(90.0mg、115%)をピンク色の綿毛状の固体として生んだ。LC-MSに基づく純度91%。
LRMS(m/z):1631[M-4]4-,2174[M-3]3-
LC-MSr.t.(min):0.737B
SO1861-三官能性リンカー-BNAオリゴ
メチルテトラジン-BNAオリゴ(90.0mg、0.014mmol)及びSO1861-三官能性リンカー(48.6mg、0.014mmol)を、水/アセトニトリル(4:1v/v、12.0mL)の混合物に溶解した。反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。15min後に、混合物を分取LC-MS4Aに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(82.0mg、60%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度92%(両方のm/z値が表題化合物に対応する、2つのピーク)。
LRMS(m/z):1641[M-6]6-,1970[M-5]5-
LC-MSr.t.(min):3.24及び3.406B
SO1861-BNAオリゴコンジュゲート化
HSP27BNAオリゴジスルフィド(1.10mg、0.187μmol)を、1.0mM TCEPを有する20mM NH4HCO3(500μL)に溶解し、混合物を1min振盪し、室温で静置した。1時間後に、反応混合物を、3000Daの分子量カットオフを有する遠心フィルターを用いることによって濾過した(14000×g、30min)。残渣溶液を、1.0mM TCEPを有する20mM NH4HCO3(500μL)によって希釈し、もたらされた混合物を再び上に記載されている同じ条件下で濾過した。残渣溶液を20mM NH4HCO3/アセトニトリル(3:1v/v、1.00mL)によって希釈し、もたらされた混合物をSO1861-EMCH(3.54mg、0.375μmol)に追加した。反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。10min後に、反応混合物を分取LC-MS4Aに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(1.25mg、85%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度100%。
LRMS(m/z):1561[M-5]5-,1951[M-4]4-
LC-MSr.t.(min):2.466B
HSP27 BNAオリゴジスルフィド(1.1mg、0.187μmol)を、1.0mM TCEPを有する20mM NH4HCO3(500μL)に溶解し、混合物を1min振盪し、室温で静置した。1時間後に、反応混合物を、3000Daの分子量カットオフを有する遠心フィルターを用いることによって濾過した(14000×g、30min)。残渣溶液を、1.0mM TCEPを有する20mM NH4HCO3(500μL)によって希釈し、もたらされた混合物を再び上に記載されている同じ条件下で濾過した。残渣溶液を20mM NH4HCO3/アセトニトリル(3:1v/v、1.0mL)によって希釈し、もたらされた混合物をデンドロン(SO1861)4-マレイミド1(3.54mg、0.375μmol)に追加した。反応混合物を1min振盪し、室温で静置した。10min後に、反応混合物を分取LC-MS4Aに付した。産物に対応する画分を直ちに一緒にプールし、凍結し、一晩凍結乾燥して、表題化合物(1.25mg、85%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度94%
LRMS(m/z):1896[M-8]8-,2167[M-7]7-
LC-MSr.t.(min):3.776B
デンドロン(NEM)4合成(図18)
ベンジルビス(2-((S)-2,6-ビス(3-メルカプトプロパンアミド)ヘキサンアミド)エチル)カルバメート(1.69mg、2.00μmol)及びN-エチルマレイミド(1.05mg、8.40μmol)に、20mM NH4HCO3/アセトニトリル(3:1v/v、2.00mL)の混合物を追加し、反応混合物を室温で撹拌した。2時間後に、反応混合物を一晩凍結乾燥した。もたらされた残渣を、分取LC-MS3Aを用いて精製して、表題化合物(1.53mg、57%)を白色の綿毛状の固体として与えた。LC-MSに基づく純度98%。
LRMS(m/z):1346 [M1]1
LC-MSr.t.(min):1.433A
A431マウス腫瘍マウスモデル並びにビトロ及びビボの遺伝子サイレンシング研究
材料及び方法
リンカーオリゴを有するHSP27BNA(配列5’-GGCacagccagtgGCG-3’)(Zhang et al.,2011)をBio-Synthesis Inc.(ルイスビル、テキサス)から購入した。
ビトロのRNA単離及び遺伝子発現分析
細胞からのRNAを単離し、標準的なプロトコール(Biorad)に従って分析した。
ビボのマウス腫瘍モデル
マウス研究を、標準的なプロトコール及び手順に従ってCrownBio(中国)で行った。モデル:雌BALB/cヌードマウスにおける皮下A431ヒト類表皮癌ゼノグラフトモデル。腫瘍体積をモニタリングし、腫瘍サンプルを遺伝子サイレンシング分析のために収集した(下参照)。
マウスからの腫瘍サンプルのRNA単離及び遺伝子発現分析
トータルRNAを、製造者の説明書に従ってTriZol(Thermo Fisher)を用いて腫瘍から単離した。単離されたRNAを、ヌクレアーゼ不含水(NFW)に再懸濁した。RNAサンプルをゲル上でそれらのRNAインテグリティについてチェックした。cDNAを調製するために、最初に、100ngのトータルRNAを、NFW中に12.5μlの最終体積でランダムヘキサマー(Qiagen;最終濃度2μM)と混合し、70℃で5min変性し、直ちに氷冷した。次に、4μlの5×RT緩衝液(Promega)、0.4μlの25mM dNTP(Promega)、1μlの200U/μL MMLV RT酵素(Promega)、0.5μLの40U/μl RNAse阻害剤(Promega)、及び1.6μL NFWからなる7.5μlのcDNA合成ミックスを追加した。次のcDNA合成プロトコールを用いた:1)10分25℃、2)60分37℃、3)5分85℃、4)無限4℃。
単一のqPCR反応には、次のミックスを調製した:1μLのcDNA、0.05μLのフォワードプライマー(250μM)、0.05μLのリバースプライマー(250μM)、8.9μlのLNFW、10μlのSYBR Green(Bio-Rad)。次のqPCRプロトコールを用いた:1サイクル:5分95℃、40サイクル:15s 95℃ 30s 60℃。
コンジュゲート合成
モノクローナル抗体、SO1861、QSサポニン
トラスツズマブ(ハーセプチン(登録商標))、セツキシマブ(アービタックス(登録商標))、及びT-DM1(Kadcyla(登録商標))を、薬局(Charite、ベルリン)から購入した。CD71モノクローナル抗体をBioCellから購入した(Okt9、#BE0023)。SO1861は、Saponaria officinalis L.から得た生の植物抽出物から、Analyticon Discovery GmbHによって単離及び精製された。Quillaja Saponariaサポニン抽出物(QSミックス)を購入した(Sigma Aldrich、#S4521)。
トラスツズマブ(Tras、ハーセプチン(登録商標)、Roche)、セツキシマブ(Cet、アービタックス(登録商標)、Merck KGaA)、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィンヒドロクロリド(TCEP、98%、Sigma-Aldrich)、5,5′-ジチオビス(2-ニトロ安息香酸)(DTNB、エルマン試薬、99%、Sigma-Aldrich)、Zeba(商標)スピン脱塩カラム(2mL、Thermo-Fisher)、NuPAGE(商標)4-12%ビス-トリスプロテインゲル(Thermo-Fisher)、NuPAGE(商標)MES SDS泳動緩衝液(Thermo-Fisher)、Novex(商標)Sharp染色済みタンパク質標準(Thermo-Fisher)、PageBlue(商標)タンパク質染色溶液(Thermo-Fisher)、Pierce(商標)BCAタンパク質アッセイキット(Thermo-Fisher)、N-エチルマレイミド(NEM、98%、Sigma-Aldrich)、1,4-ジチオスレイトール(DTT、98%、Sigma-Aldrich)、セファデックスG25(GE Healthcare)、セファデックスG50M(GE Healthcare)、セファデックス200P(GE Healthcare)、イソプロピルアルコール(IPA、99.6%、VWR)、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン(トリス、99%、Sigma-Aldrich)、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン塩酸塩(トリス・HCL、Sigma-Aldrich)、L-ヒスチジン(99%、Sigma-Aldrich)、D-()-トレハロース脱水物(99%、Sigma-Aldrich)、ポリエチレングリコールソルビタンモノラウレート(TWEEN 20、Sigma-Aldrich)、ダルベッコリン酸緩衝食塩水(DPBS、Thermo-Fisher)、グアニジン塩酸塩(99%、Sigma-Aldrich)、エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム二水和物(EDTA-Na2、99%、Sigma-Aldrich)、無菌フィルター0.2μm及び0.45μm(Sartorius)、スクシンイミジル4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(SMCC、Thermo-Fisher)、ジアンチン-Cys(Dia-Cys。単一のC末端システイン官能基を有するジアンチン変異体、Proteogenix)、Vivaspin T4及びT15濃縮器(Sartorius)、Superdex 200PG(GE Healthcare)、テトラ(エチレングリコール)スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオナート(PEG4-SPDP、Thermo-Fisher)、HSP27オリゴヌクレオチド(Biosynthesis)、[O-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N,N-テトラメチルウロニウム-ヘキサフルオロホスファタート](HATU、97%、Sigma-Aldrich)、ジメチルスルホキシド(DMSO、99%、Sigma-Aldrich)、N-(2-アミノエチル)マレイミドトリフルオロ酢酸塩(AEM、98%、Sigma-Aldrich)、L-システイン(98.5%、Sigma-Aldrich)、脱イオン水(DI)はUltrapure Lab Water Systems(MilliQ、Merck)から新しく取った、ニッケル-ニトリロトリ酢酸アガロース(Ni-NTAアガロース、Protino)、グリシン(99.5%、VWR)、5,5-ジチオビス(2-ニトロ安息香酸(エルマン試薬、DTNB、98%、Sigma-Aldrich)、S-アセチルメルカプトコハク酸無水物フルオレセイン(SAMSA試薬、Invitrogen)、重炭酸ナトリウム(99.7%、Sigma-Aldrich)、炭酸ナトリウム(99.9%、Sigma-Aldrich)、PD MiniTrap脱塩カラム-セファデックスG-25樹脂(GE Healthcare)、PD10 G25脱塩カラム(GE Healthcare)、Zebaスピン脱塩カラム0.5、2、5、及び10mL(Thermo-Fisher)、Vivaspin遠心フィルターT4 10kDa MWCO、T4 100kDa MWCO、及びT15(Sartorius)、Biosep s3000 aSECカラム(Phenomenex)、Vivacell限外濾過ユニット10及び30kDa MWCO(Sartorius)、Nalgene Rapid-Flowフィルター(Thermo-Fisher)。
MALDI-TOF-MS
マトリックス支援レーザー脱離/イオン化飛行時間型(MALDI-TOF)スペクトルを、MALDI-質量分析計(Bruker Ultrafex III)で記録した。典型的には、ナノモルからマイクロモル範囲でMilliQ水に溶解したサンプルを、液滴乾燥法によって、アセトニトリル(MADLI-TOF-MS試験済み、Sigma)/0.1%TFA(7:3v/v)に溶解したマトリックスとしてsuper-DHB(99%、Fluka)又はシナピン酸(SA、99%、Sigma-Aldrich)どちらかを用いて、ターゲット(MTP384ターゲットプレート研磨済みスチールTF、Bruker Daltons)上にスポットした。PepMix(ペプチド較正標準、Bruker Daltons)又はProteMass(タンパク質較正標準、Sigma-Aldrich)が較正標準としての用をなした。RPモードはリフレクターのポジティブモードを言う。RNモードはリフレクターのネガティブモードを言う。LPモードはリニアポジティブモードを言う。
再生セルロース膜:MWCO=1及び2kDa(Spectra/Por)及びMWCO=12~14kDa(Carl Roth)を用いて透析を行った。典型的には、透析は1Lの溶媒で24h行い、これはプロセスの最初の6hの後に交換した。
凍結乾燥は、Alpha 1-2 LD plus(Martin Christ Gefriertrocknungsanlagen GmbH)で行った。典型的には、サンプルを液体窒素で凍結し、高真空で凍結乾燥機内に置いた。
吸光度測定は、Perkin Elmer Lambda 25 UV-Visによって又はThermo NanoDrop ND-2000分光光度計によって、200~750nmのスペクトル範囲で行った。
トラスツズマブ OD280=1.5(mg/ml)-1 cm-1
セツキシマブ OD280=1.4(mg/ml)-1 cm-1
HSP27オリゴヌクレオチド OD260=153,000 M-1 cm-1;Rz260:280=1.819
Dia-Cys OD280=0.57(mg/ml)-1 cm-1
PEG4-SPDP(PDT)OD343=8,080 M-1 cm-1
SAMSA-フルオレセイン OD495=64,500 M-1 cm-1;Rz280:495=0.232
エルマン(TNB)OD412=14,150 M-1 cm-1
固定化金属イオンアフィニティークロマトグラフィー(IMCA)
ニッケル-ニトリロ三酢酸(Ni-NTA)クロマトグラフィーを行って、ヒスチジンタグ付きタンパク質及びタンパク質コンジュゲートを精製した。手短には、Ni-NTAアガロース(10mL)を、5mLベッド体積の重力流カラムへとピペッティングした。樹脂を20mLの脱イオン水で洗浄し、5mLの100mM NiSO4溶液を再充填した。樹脂を5mLの脱イオン水で再び5回洗浄し、DPBSで5回平衡化した。タンパク質溶液を、4℃で30min、回転する洗浄済みNi-NTAアガロースとインキュベーションした。その後、Ni-NTAタンパク質溶液を重力流カラムへと再びピペッティングした。フロースルーを収集し、樹脂を5mLのDPBSで3回洗浄した。それから、固定化されたサンプルを、イミダゾール濃度を50mLの125mM、pH8から50mLの250mM、pH8まで増大させることによって溶出した。溶出画分をPBS pH7.4に対して透析して、精製サンプルを得た。
サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を、AKTA精製装置によって行った。サンプルを、Biosep SEC-S3000カラム又はセファデックスG50Mカラム(10×40cm)どちらかを用いたSECによって分析した。TBS/イソプロピルアルコール溶液(85:15 v/v)で溶出した。サンプル純度は、トレースのアグリゲートピークに対して抗体サンプルピークの積分により決定した。
エルマン試験(又はエルマンアッセイ)を行って、分光光度法によりサンプル中のチオール濃度を定量的に決定した。チオールの存在は、チオールの存在下でのエルマン試薬からの2-ニトロ-5-チオベンゾエート(TNB)の化学量論的放出によって指示された。TNBは、緩衝系において、412nmの吸収極大及びOD412=14,150M-1cm-1の吸光係数を得る。手短には、リン酸緩衝液(0.1M、1mM EDTA、pH7.4)中のエルマン試薬(5,5-ジチオビス(2-ニトロ安息香酸)、DTNB)の0.5mg/mL溶液の2μLを、緩衝液中のチオール含有サンプル20μLと混合した。混合物を5secボルテックスした。それから、412nmのUV-Vis吸光度をThermo Nanodrop 2000で測定して、TNB濃度、それゆえにサンプルのチオール含量を決定した。
ジアンチンを細菌培養によって発現させ、タンパク質を、当分野で公知の従来の細胞培養及びタンパク質精製ステップを踏襲して精製した。
カスタムトラスツズマブ-サポリン、セツキシマブ-サポリン、CD71mab-サポリンコンジュゲートは、Advanced Targeting Systems(サンディエゴ、CA)から産生及び購入された。IgG-サポリン及びサポリンは、Advanced Targeting Systemsから購入した。
抗体-(Cys-デンドロン-(L-SO1861)n)n合成
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを樹状サポニン(デンドロン-(L-SO1861)4-マレイミド)にテトラ(エチレングリコール)スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(PEG4-SPDP)リンカーを介してコンジュゲート化し、Ab及び樹状サポニン間のチオール-エンマイケル型反応を行なった。セツキシマブ-(S-デンドロン-(L-SO1861)4)4について手順を例示的に記載する:
セツキシマブをDPBS pH7.5緩衝液中で脱塩し、それから2.50mg/mlに正規化した。Abのアリコート(9.19mg、61nmol)に、新しく調製したPEG4-SPDP溶液のアリコート(5.0mg/ml、6.70モル当量、411nmol)を追加し、混合物を手短にボルテックスし、それからローラー混合によって20℃で60分間インキュベーションした。インキュベーション後に、反応をグリシン(20mg/ml、7.7μl)の追加によってクエンチし、それから、SPDP部分をTCEP(5.0mg/ml、SPDP当たり4.0モル当量、1.64μmol)の追加によってインサイチュ還元した。この混合物を、ローラー混合によって20℃で15分間ローラー混合した。もたらされたAb-SHを、zebaスピン脱塩カラムを用いたTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。Ab-SHを、UV-vis分析及びエルマンアッセイによってキャラクタリゼーションした(チオール対Ab比=5.4)。バルクAb-SH(7.41mg、1.93mg/ml、49nmol)に、DMSO中の新しく調製したデンドロン-(L-SO1861)4-マレイミド溶液のアリコートを追加し(10mg/ml、Ab当たり8.0モル当量、0.4μmol、3.16mg、0.32ml)、混合物を手短にボルテックスし、それから20℃で一晩インキュベーションした。コンジュゲート化反応以外に、脱塩されたAb-SHの2つのアリコート(0.25mg、1.67nmol)をコンジュゲート化の前に取り分け、それぞれ正及び負の対照として、NEM(Ab当たり8.0モル当量、13.3 nmol、6.7μlの0.25mg/ml溶液)又はTBS pH7.5緩衝液(6.7μl)と20℃で一晩反応させ。(NEMの追加前に)18時間のインキュベーション後に、クルードなコンジュゲート混合物を手短に遠心し、100μlアリコートをUV-visによる分析のために取り出し、正及び負の対照と並べてエルマンアッセイによりキャラクタリゼーションして、デンドロン-(L-SO1861)4の組み込みを得た。バルクAb-デンドロン-(L-SO1861)4混合物に、新しく調製したNEM溶液のアリコート(2.5mg/ml、5.0モル当量、0.25μmol)を追加し、混合物を、DPBS pH7.5で溶出する1.6×30cmセファデックスG50カラムにより精製して、精製されたセツキシマブ-(S-デンドロン-(L-SO1861)4)4コンジュゲートを与えた。産物を0.2μmに濾過して清澄化し、それから、vivaspin T15濃縮器を用いてca.3mg/mlに注意深く濃縮して(3,000g、5分インターバル、5℃)、最終的なセツキシマブ-(S-デンドロン(L-SO1861)4)4コンジュゲートを与えた。収量:4.41mg、48%。デンドロン-(L-SO1861)4対Ab比=4.4。
トラスツズマブ、セツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、1、2、3、4、5、及び6のDARで、マイケル型チオール-エンコンジュゲート化反応によってサポニンSO18161-EMCHにコンジュゲート化した。SO1861-EMCH分子は、サポニンとAbとの間に不安定な結合を生成する不安定な(L)ヒドラゾン結合をその構造とそのマレイミド官能基との間に得る。トラスツズマブ-(L-SO1861)4について手順を例示的に記載する:
セツキシマブ(40mg、8.0ml)の溶液に、それぞれ10μl/mlのトリス濃縮液(127mg/ml、1.05M)、トリスHCl濃縮液(623mg/ml、3.95M)、及びEDTA-Na2濃縮液(95mg/ml、0.26M)を追加して、50mM TBS、2.5mM EDTA緩衝液pH7.5を与えた。
SO1861-S-Mal合成
Saponaria officinalis LからのSO1861(15.4mg、8.28μmol)及びHATU(140mg、368μmol、44.5モル当量)を固体として磁石攪拌子と共に20mLガラスバイアル内に置き、5mL DMSOを追加して材料を溶解させた。溶解した混合物を室温で30min撹拌した。30min後に、DMSO中の新しく調製したAEM溶液(65mg、256μmol、31モル当量)の1mLを、撹拌しているSO1861-HATU混合物に追加した。反応混合物を室温で17時間撹拌した。17時間の撹拌後に、混合物を脱イオン水で希釈し、1kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(Spectra/Por7)を用いて脱イオン水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、溶液を凍結乾燥して白色粉末を得た。
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abをマイケル型チオール-エンコンジュゲート化反応によってサポニンSO18161-S-Malにコンジュゲート化した。サポニンは、サポニンとAbとの間に安定な結合を生成する安定な(S)アミド結合をその構造とそのマレイミド官能基との間に得る。
DAR4によるPEG4-SPDPを介したトラスツズマブ-(L-HSP27)4、セツキシマブ-(L-HSP27)4合成、及びDAR2によるPEG4-SPDPを介したセツキシマブ-(L-HSP27)2合成
トラスツズマブ、セツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、AbとHSP27 BNAとの間に不安定な(L)ジスルフィド結合を形成するテトラ(エチレングリコール)スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(PEG4-SPDP)リンカーを介してHSP27 BNAジスルフィドにコンジュゲート化した。トラスツズマブ-(L-HSP27 BNA)4について手順を例示的に記載する:
HSP27 BNAジスルフィドオリゴ(2.7mg、470nmol、6.10mg/ml)をTCEP(10モル当量、4.7μmol、1.34mg、50mg/ml)と、30分間、20℃で、ローラー混合によって反応させた。その後に、オリゴ-SHを、TBS pH7.5で溶出するPD10 G25脱塩カラムによって精製し、すぐに用いた。オリゴ-SHが得られた(2.48mg、90%、1.24mg/ml、SH対オリゴ比=0.8)。
トラスツズマブ(1.5mg、10.3nmol、2.50mg/ml)を、DMSO中の新しく調製したPEG4-SPDP溶液のアリコート(1mg/ml)(6.81モル当量、70.1nmol、39μg)と、ローラー混合によって20℃で60分間反応させた。その後に、反応をグリシン(TBS pH7.5中の2mg/mlの新しく調製した溶液の15.1μl)でクエンチし、それから、TBS pH7.5で溶出するzeba脱塩カラムによって脱塩した。もたらされたTras-S-PEG4-SPDPのアリコートを取り出し、UV-Vis分析によって試験した。SPDP組み込みを、ピリジル-2-チオン(PDT)を遊離させるためのTCEPを用いて、及び343nmでのUV-vis分析によって、決定した(SPDP対Ab比:4)。残りのTras-(S-PEG4-SPDP)4を、新しく調製したHSP27オリゴヌクレオチド(オリゴ-SH)のアリコート(8モル当量、82.4nmol、1.24mg/ml)と反応させ、ローラー混合によって一晩20℃でインキュベーションした。17時間後に、コンジュゲートをUV-vis分析によって分析して、343nmでのピリジル-2-チオン(PDT)の放出量によってHSP27の組み込みを確かめた。クルードなコンジュゲートを、DPBS pH7.5で溶出する1.6×33cmセファデックスG50カラムを用いて精製した。もたらされたトラスツズマブ-(L-HSP27)4は単一画分として得られた。収率:n.d.。純度:96%、HSP27 BNA対Ab比=4.4。
トラスツズマブ-(L-HSP27-L-ブロック)4、セツキシマブ-(L-HSP27-L-ブロック)
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、以降では「HSP27-Mal」と言われるマレイミド(Mal)を持つHSP27誘導体にコンジュゲート化した。Abをマイケル型チオール-エンコンジュゲート化反応によってHSP27-Malにコンジュゲート化した。HSP17-Malは、HSP27 BNAとAbとの間に不安定な結合を生成する不安定な(L)ヒドラゾン結合をその構造とそのマレイミド官能基との間に得る。トラスツズマブ-(L-HSP27BNA-L-ブロック)nについて、手順を例示的に記載する:
トラスツズマブを、脱イオン水(DI)で21mg/mlに戻し、それから、ヒスチジン緩衝液pH6を用いて5mg/mlに希釈した。20mg(4.0ml)アリコートに、それぞれ10μl/mlのトリス濃縮液(127mg/ml、1.05M)、トリスHCl濃縮液(623mg/ml、3.95M)、及びEDTA-Na2濃縮液(95mg/ml、0.26M)を追加して、50mM TBS、2.5mM EDTA緩衝液pH7.5を与えた。トラスツズマブ(20.30mg、4.920mg/ml、0.14μmol)に、新しく調製したTCEP溶液のアリコート(1.00mg/ml、2.35モル当量、0.32μmol)を追加し、混合物を手短にボルテックスし、それからローラー混合によって20℃で90分間インキュベーションした。インキュベーション後に(HSP27-Malの追加前に)、Ab-SHのca.2mg(0.439ml)アリコートを各混合物から取り出し、zebaスピン脱塩カラムを用いてTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。このアリコートを、UV-vis分析及びエルマンアッセイによってキャラクタリゼーションした(チオール対Ab比=4.0)。バルクAb-SH(5.1mg、35nmol)に、HSP27-Mal誘導体のアリコート(TBS pH7.5中に新しく調製、2mg/ml、「チオール」当たり1.3モル当量、182 nmol)を追加し、混合物を手短にボルテックスし、それから120分間20℃でインキュベーションした。トラスズマブ-HSP27 BNA誘導体コンジュゲート化反応以外に、脱塩されたAb-SHの2つのアリコート(0.5mg、3.3nmol)を、それぞれ正及び負の対照として、NEM(「チオール」当たり1.3モル当量、17.3nmol、6.7μlの0.25mg/ml溶液)又はTBS pH7.5緩衝液(6.7μl)と20℃で120分間反応させた。インキュベーション後に(NEMの追加前に)、Ab-HSP27BNA混合物の0.100mlアリコートを取り出し、zebaスピン脱塩カラムを用いてTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。このアリコートをUV-visによりキャラクタリゼーションし、正の対照及び負の対照と並べてエルマンアッセイによりキャラクタリゼーションして、HSP27組み込みを得た。バルクAb-HSP27混合物に、新しく調製したNEM溶液のアリコート(0.25mg/ml、2.5モル当量、89nmol)を追加し、混合物を、DPBS pH7.5で溶出する1.6×30cmセファデックスG50Mを用いたゲル濾過、次に100KDa MWCO濃縮器を用いた繰り返しの遠心濾過及び洗浄により精製して、精製トラスツズマブ-(L-HSP27-L-ブロック)4コンジュゲートを与えた。生物学的評価のために分注する前に、産物を0.2μmに濾過した。
トラスツズマブ-[S-Tri-(L-SO1861)-(L-HSP27)]4、トラスツズマブ-[S-Tri-(ブロック)-(L-HSP27)]4、セツキシマブ-[S-Tri-(L-SO1861)-(L-HSP27)]4、セツキシマブ-[S-Tri-(ブロック)-(L-HSP27)]4
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、マイケル型チオール-エン反応によって、以降では「HSP27-Mal」と言われる2つの異なるマレイミド(Mal)を持つHSP27 BNA誘導体にコンジュゲート化した。これらのHSP27-Mal誘導体は、すなわち:1)Mal-三官能性リンカー-(L-SO1861)-(L-HSP27)、2)Mal-三官能性リンカー-(ブロック)-(L-HSP27)であった。トラスツズマブ-[S-三官能性リンカー-(L-SO1861)-(L-HSP27 BNA)]4について、手順を例示的に記載する:
トラスツズマブを、脱イオン水(DI)で21mg/mlに戻し、それから、ヒスチジン緩衝液pH6を用いて5mg/mlに希釈した。20mg(4.0ml)アリコートに、それぞれ10μl/mlのトリス濃縮液(127mg/ml、1.05M)、トリスHCl濃縮液(623mg/ml、3.95M)、及びEDTA-Na2濃縮液(95mg/ml、0.26M)を追加して、50mM TBS、2.5mM EDTA緩衝液pH7.5を与えた。
DAR4によるPEG4-SPDPを介したトラスツズマブ-(L-SO1861)4-(L-HSP27)4、セツキシマブ-(L-SO1861)4-(L-HSP27)4合成、DAR2によるPEG4-SPDPを介したセツキシマブ-(L-SO1861)4-(L-HSP27)2(FBR703 STB17/7-8)合成
トラスツズマブ-(L-SO1861)4、セツキシマブ-(L-SO1861)4は以降では「Ab」と言われる。Abを、AbとHSP27 BNAの間に不安定な(L)ジスルフィド結合を形成するテトラ(エチレングリコール)スクシンイミジル3-(2ピリジルジチオ)プロピオネート(PEG4-SPDP)リンカーを介してHSP27 BNAジスルフィドにコンジュゲート化した。トラスツズマブ-(L-SO1861)4-(L-HSP27)4について手順を例示的に記載する:
HSP27 BNAジスルフィドオリゴ(2.7mg、470nmol、6.10mg/ml)をTCEP(10モル当量、4.7μmol、1.34mg、50mg/ml)と、30分間、20℃で、ローラー混合によって反応させた。その後に、オリゴ-SHを、TBS pH7.5で溶出するPD10 G25脱塩カラムによって精製し、すぐに用いた。オリゴ-SHが得られた(2.48mg、90%、1.24mg/ml、SH対オリゴ比=0.8)。
トラスツズマブ-(L-SO1861)4(1.3mg、8.7nmol、2.50mg/ml)を、DMSO中の新しく調製したPEG4-SPDP溶液のアリコート(1mg/ml)(9.26モル当量、80.3nmol、45μmol)と、ローラー混合によって20℃で60分間反応させた。その後に、反応をグリシン(TBS pH7.5中の2mg/mlの新しく調製した溶液の15.1μl)でクエンチし、それから、TBS pH7.5で溶出するzeba脱塩カラムによって脱塩した。もたらされたTras-(L-SO1861)-(L-PEG4-SPDP)のアリコートを取り出し、UV-Vis分析によって試験した。SPDP組み込みを、ピリジル-2-チオン(PDT)を遊離させるためのTCEPを用いて、及び343nmでのUV-vis分析によって、決定した(SPDP対Ab比=4)。
残りのTras-(L-SO1861)-(L-PEG4-SPDP)を、新しく調製したHSP27オリゴヌクレオチド(オリゴ-SH)のアリコート(8モル当量、54.8nmol、0.32mg、1.24mg/ml)と反応させ、ローラー混合によって一晩20℃でインキュベーションした。17時間後に、コンジュゲートをUV-vis分析によって分析して、343nmにおけるピリジル-2-チオン(PDT)の放出量によってHSP27の組み込みを確かめた。クルードなコンジュゲートを、DPBS pH7.5で溶出する1.6×33cmセファデックスG50カラムを用いて精製した。もたらされたトラスツズマブ-(L-SO1861)4-(L-HSP27 BNA)4は単一画分として得られた。収量:0.47mg、45%(0.49mg/ml)、HSP27対Ab比=3.5。
トラスツズマブ、セツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、マイケル型チオール-エンコンジュゲート化反応によってサポニンQSミックス-EMCHにコンジュゲート化した。トラスツズマブ-L-QSミックスについて手順を例示的に記載する:
トラスツズマブ(「Ab」、600mg)を脱イオン水(DI)で21mg/mLに戻し、それから、新しく調製したヒスチジン緩衝液pH 6(5mMヒスチジンpH6、2%トレハロース、0.01% Tween 20)を用いて5mg/mLに希釈した。それぞれ10μL/mLのトリス濃縮液(127mg/mL、1.05M)、トリスHCL濃縮液(623mg/mL、3.95M)、及びEDTA-Na2濃縮液(95mg/ml、0.26M)を追加して、50mM TBS、2.5mM EDTA緩衝液pH7.5を与えた。トラスツズマブ(603.8mg、4.887mg/mL、4.0μmol)に、新しく調製したTCEP溶液のアリコート(1mg/mL、2.35モル当量、9.5μmol、2.72mg)を追加し、混合物を手で旋回させて混合し、それからローラー混合しながら20℃で90分間インキュベーションした。インキュベーション後に(QSミックス-EMCHの追加前に)、Ab-SHの2mg(0.409mL)アリコートを取り出し、zebaスピン脱塩カラムを用いてTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。このアリコートを、UV-vis分析及びエルマンアッセイによりキャラクタリゼーションした。バルクAb-SHに、新しく調製したQSミックス-EMCH溶液のアリコート(2mg/mL、5.2モル当量、21μmol、21.6mL)を追加し、混合物を手短にボルテックスし、それから20℃で120分間インキュベーションした。コンジュゲート化反応以外に、脱塩されたAb-SHの2つのアリコート(0.5mg、0.134mL、3.33nmol)を、それぞれ正及び負の対照として、NEM(8.00モル当量、26.6nmol、3.3μg、13.3μLの0.25mg/ml溶液)又はTBS pH7.5緩衝液(13.3μL)と20℃で120分間反応させた。インキュベーション後に(NEMの追加前に)、Ab-QSミックス-EMCH混合物のca.2mg(0.481mL)アリコートを取り出し、zebaスピン脱塩カラムを用いてTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。このアリコートをUV-visによりキャラクタリゼーションし、正の対照及び負の対照と並べてエルマンアッセイによりキャラクタリゼーションして、QSミックス-EMCH組み込みを得た。バルクAb-QSミックス-EMCH混合物に、新しく調製したNEM溶液のアリコート(2.5mg/mL、5モル当量、20μmoL、2.51mg)を追加し、混合物を2~8℃で一晩保存した。コンジュゲートを、DPBS pH7.5で溶出する10×40cmセファデックスG50Mカラムにより精製して、精製されたトラスツズマブ-(L-QSミックス)コンジュゲートを与えた。それから、産物丸ごとを、vivacell 100濃縮器(2,000g、4℃、200分)を用いて5mg/mLに正規化した。産物を0.2μmに濾過し、生物学的評価のために分注した。収量:n.d.。QSミックス対Ab比=4.1。
DAR4によるトラスツズマブ-(L-HSP27BNA-L-SO1861)4、セツキシマブ-(L-HSP27BNA-L-SO1861)4
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、サポニンSO1861、及び以降では「HSP27-Mal」と言われるマレイミド(Mal)を持つHSP27誘導体にコンジュゲート化した。Abをマイケル型チオール-エンコンジュゲート化反応によってHSP27-Malにコンジュゲート化した。HSP17-Malは、HSP27 BNAとAbとの間に不安定な結合を生成する不安定な(L)ヒドラゾン結合をその構造とそのマレイミド官能基との間に得る。トラスツズマブ-(L-HSP27BNA-L-SO1861)4について手順を例示的に記載する:
トラスツズマブを、脱イオン水(DI)で21mg/mlに戻し、それから、ヒスチジン緩衝液pH6を用いて5mg/mlに希釈した。20mg(4.0ml)アリコートに、それぞれ10μl/mlのトリス濃縮液(127mg/ml、1.05M)、トリスHCl濃縮液(623mg/ml、3.95M)、及びEDTA-Na2濃縮液(95mg/ml、0.26M)を追加して、50mM TBS、2.5mM EDTA緩衝液pH7.5を与えた。トラスツズマブ(20.30mg、4.920mg/ml、0.14μmol)に、新しく調製したTCEP溶液のアリコート(1.00mg/ml、2.35モル当量、0.32μmol)を追加し、混合物を手短にボルテックスし、それからローラー混合によって20℃で90分間インキュベーションした。インキュベーション後に(HSP27-Malの追加前に)、Ab-SHのca.2mg(0.439ml)アリコートを各混合物から取り出し、zebaスピン脱塩カラムを用いてTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。このアリコートを、UV-vis分析及びエルマンアッセイによってキャラクタリゼーションした(チオール対Ab比=4.0)。バルクAb-SH(4.7mg、32 nmol)に、HSP27-Mal誘導体のアリコート(TBS pH7.5中に新しく調製、2mg/ml、「チオール」当たり1.3モル当量、166 nmol)を追加し、混合物を手短にボルテックスし、次に120分間20℃でインキュベーションした。トラスズマブ-HSP27 BNA誘導体コンジュゲート化反応以外に、脱塩されたAb-SHの2つのアリコート(0.5mg、3.3nmol)を、それぞれ正及び負の対照として、NEM(「チオール」当たり1.3モル当量、17.3nmol、6.7μlの0.25mg/ml溶液)又はTBS pH7.5緩衝液(6.7μl)と20℃で120分間反応させた。インキュベーション後に(NEMの追加前に)、Ab-HSP27BNA混合物の0.100mlアリコートを取り出し、zebaスピン脱塩カラムを用いてTBS pH7.5へのゲル濾過により精製した。このアリコートをUV-visによりキャラクタリゼーションし、正の対照及び負の対照と並べてエルマンアッセイによりキャラクタリゼーションして、HSP27組み込みを得た。バルクAb-HSP27混合物に、新しく調製したNEM溶液のアリコート(0.25mg/ml、2.5モル当量、80nmol)を追加し、混合物を、DPBS pH7.5で溶出する1.6×30cmセファデックスG50Mを用いたゲル濾過、次に100KDa MWCO濃縮器を用いた繰り返しの遠心濾過及び洗浄により精製して、精製されたトラスツズマブ-(L-HSP27BNA-L-SO1861)4コンジュゲートを与えた。生物学的評価のために分注する前に、産物を0.2μmに濾過した。
DAR2によるSMCCを介したトラスツズマブ-(L-SO1861)4-(S-ジアンチン)2及びセツキシマブ-(L-SO1861)4-(S-ジアンチン)2の合成
トラスツズマブ-L-SO1861及びセツキシマブ-L-SO1861は以降では「Ab」と言われる。Abを、スクシンイミジル4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(SMCC)リンカーを介してジアンチン-Cysにコンジュゲート化し、Abとジアンチンとの間に安定な(S)アミド結合を提供した。トラスツズマブ-(L-SO1861)4-(S-ジアンチン)2について手順を例示的に記載する:
ジアンチン-Cys(7.8mg、261nmol、0.78mg/ml)をTCEP(5モル当量、1.31μmol、0.37mg、1mg/ml)と、30分間、20℃で、ローラー混合によって反応させた。その後で、タンパク質-SHを、TBS pH7.5で溶出するzeba脱塩カラムによって精製し、すぐに用いた。タンパク質-SHが得られた(5.2mg、67%、0.52mg/ml、SH対タンパク質比=1±0.1)。
DAR2によるSMCCを介したトラスツズマブ-(S-ジアンチン)2、セツキシマブ-(S-ジアンチン)2合成
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、スクシンイミジル4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(SMCC)リンカーを介してジアンチン-Cysにコンジュゲート化し、Abとジアンチンとの間に安定な(S)アミド結合を提供した。トラスツズマブ-(S-ジアンチン)2について手順を例示的に記載する:
ジアンチン-Cys(7.8mg、261nmol、0.78mg/ml)をTCEP(5モル当量、1.31μmol、0.37mg、1mg/ml)と、30分間、20℃で、ローラー混合によって反応させた。その後で、タンパク質-SHを、TBS pH7.5で溶出するzeba脱塩カラムによって精製し、すぐに用いた。タンパク質-SHが得られた(5.2mg、67%、0.52mg/ml、SH対タンパク質比=1±0.1)。
DAR2によるPEG4-SPDPを介したトラスツズマブ-(L-SO1861)4-(L-ジアンチン)2及びセツキシマブ-(L-SO1861)4-(L-ジアンチン)2合成
トラスツズマブ-L-SO1861及びセツキシマブ-L-SO1861は以降では「Ab」と言われる。Abを、Abとジアンチンとの間に不安定な(L)ジスルフィド結合を形成するテトラ(エチレングリコール)スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(PEG4-SPDP)リンカーを介してジアンチン-Cysにコンジュゲート化した。トラスツズマブ-L-SO1861について手順を例示的に記載する:
ジアンチン-Cys(7.8mg、261nmol、0.78mg/ml)をTCEP(5モル当量、1.31μmol、0.37mg、1mg/ml)と、30分間、20℃で、ローラー混合によって反応させた。その後で、タンパク質-SHを、TBS pH7.5で溶出するzeba脱塩カラムによって精製し、すぐに用いた。タンパク質-SHが得られた(5.2mg、67%、0.52mg/ml、SH対タンパク質比=1±0.1)。
トラスツズマブ-(L-ジアンチン)2、セツキシマブ-(L-ジアンチン)2、及びDAR2によるPEG4-SPDPを介した合成
トラスツズマブ及びセツキシマブは以降では「Ab」と言われる。Abを、Abとジアンチンとの間に不安定な(L)ジスルフィド結合を形成するテトラ(エチレングリコール)スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(PEG4-SPDP)リンカーを介してジアンチン-Cysにコンジュゲート化した。トラスツズマブ-L-SO1861について手順を例示的に記載する:
ジアンチン-Cys(7.8mg、261nmol、0.78mg/ml)をTCEP(5モル当量、1.31μmol、0.37mg、1mg/ml)と、30分間、20℃で、ローラー混合によって反応させた。その後で、タンパク質-SHを、TBS pH7.5で溶出するzeba脱塩カラムによって精製し、すぐに用いた。タンパク質-SHが得られた(5.2mg、67%、0.52mg/ml、SH対タンパク質比=1±0.1)。
材料及び方法
我々の現行の研究において、我々は、シッフ塩基(イミン)を介したサポニン結合のための4つの分子アームとクリックケミストリーのための1つのアームとからなるモデル骨格を検討した。ポリマー構造(図19)は第1世代(すなわち、繰り返される分岐サイクル数)の五価のポリエチレングリコールに基づくデンドリマーである。これはIris Biotech GmbH(マルクトレドヴィッツ、ドイツ)から購入した。サポニン(この例ではSA1641)を、Merck(ダルムシュタット、ドイツ)から得られたサポニナムアルブムと呼ばれるGypsophila種からのサポニンの複合的な生抽出液から精製した。粉末状の生の抽出物(2.5g)を、水(100mL)中において水酸化ナトリウム(0.2g)によって加水分解した。溶液を40℃で20h撹拌し、それから、pH5.0に達するまで氷酢酸を足した。タンニンを除去するために、溶液を分液漏斗中で30mLのブタノールと共に振盪した。水相を再取得し、ブタノール抽出を2回繰り返した。ブタノール相に無水硫酸ナトリウムを足し、濾過し、プールした。ブタノールを蒸発させ、残りのサポニン粉末を20%メタノール中に最終濃度30mg/mLで溶かした。短いソニケーション後に、異なるサポニンを高速液体クロマトグラフィー(HPLC)により分離した。チューブ(カラム排除)を、1.5mL/minの流量の温水(40℃)によって、それから、Eurospher RP-C18カラム(5μm、250×8mm)を包含してイソプロパノール(100%)によってリンスした。サポニンをカラムにかけ、メタノール勾配によって溶出した(0.01%トリフルオロ酢酸を足した水中において1.5mL/minで30min以内の20%メタノールから70%メタノール、次にさらに60minの70%メタノール)(Sama et al,2018)。画分のアリコートを、エレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)によってそれらのSA1641含量について分析した。純粋なSA1641を含有する画分をプールし、メタノールを蒸発させた。水溶液を、ドライアイスの使用によって回転丸底フラスコ中で薄膜として凍結した。-80℃での16hの保存後に、サンプルを凍結乾燥した。本発明で定められる骨格を産生するために、ポリマー構造(0.2mM)及びSA1641(3.2mM)を水(およそpH8)に溶解し、等体積を混合し、26℃で24h振盪した。それから、シアノ水素化ホウ素ナトリウム(NaCNBH3;0.1M)を、SA1641を参照して4倍モル過剰で追加し、サンプルをさらに24hインキュベーションした。それから、構造を超高速高分離液体クロマトグラフィー(UPLC)/ESI-MSにより検証した。サンプルをRP-C4カラムにかけ、メタノール勾配によって溶出した(0.01%トリフルオロ酢酸を足した水中において15min以内の25%メタノールから80%メタノール、次にさらに10minの80%メタノール)。Waters CorporationからのLC-飛行時間型(LC-TOF)質量分析計を用いて、エレクトロスプレーイオン化による精密質量測定のために特に設計されたイオン源であるLockSpray(商標)の使用によって、画分を分析した。
図20の挿入図は、同位体パターン計算機enviPat Web 2.0による計算から得られた理論的に予想される質量スペクトルを示す。パターンは、分子の電荷及び同位体の天然の存在率を考える。これは、1つよりも多いピークが単一の物質について予想される理由である。UPLC/ESI-MSにより得られた実験データ(図20)は、予測された同じ強度で、m/z 758~760においてほぼ厳密に同じピークを示し、それゆえに、ポリマー構造への首尾良いSA1641カップリングを証明した。
材料及び方法
原薬の例として、我々は、標的化された毒素のジアンチン-上皮成長因子(ジアンチン-EGF)を用いた。プラスミドのHis-ジアンチン-EGF-pET11d(Weng et al,2009)(100ng)を、20μLのEscherichia coli Rosetta(商標)2(DE3)pLysSコンピテントセル(Novagen、サンディエゴ、CA、USA)に追加した。細胞を、熱ショックによってトランスフォーメーションした(氷上で30min、42℃で90s、氷上で1min)。その後に、300μLの溶原培地(LB)を追加し、懸濁液を200rpmで振盪しながら37℃で1hインキュベーションした。50μg/mLアンピシリンを有する予熱した溶原培地寒天プレートに、100μlの細菌懸濁液を接種し、プレートを37℃で一晩インキュベーションした。50μg/mLアンピシリン有する溶原培地(3mL)に、プレートからのコロニーを接種し、細菌を37℃かつ200rpmで8hインキュベーションした。懸濁液(50μL)を、50μg/mLアンピシリンを有する500mLの溶原培地に追加し、37℃かつ200rpmで一晩インキュベーションした。続いて、体積を2.0Lにスケールアップし、0.9という波長600nmの光学密度に達するまで、細菌を同じ条件下で成長させた。その後に、タンパク質発現を、1mMの最終濃度でのイソプロピルβ-D-1-チオガラクトピラノシド(IPTG)の追加によって誘導した。タンパク質発現は37℃かつ200rpmで3h続いた。最終的に、細菌懸濁液を5,000gかつ4℃で5min遠心し、20mLのPBS(137mM NaCl、2.7mM KCl、8.1mM Na2HPO4、1.47mM KH2PO4)に再懸濁し、使用まで-20℃で保存した。精製のために、細菌懸濁液を融解し、ソニケーションによりリシスした。ライセートを遠心し(15,800g、4℃、30分)、イミダゾールを最終濃度20mMで追加した。上清を、20mMイミダゾールの存在下で、4℃で30minに渡って、連続振盪下において、2mLのNi-ニトリロ三酢酸アガロースとインキュベーションした。続いて、材料を20mLカラムに注加し、10mL洗浄緩衝液(50mM NaH2PO4、300mM NaCl、20mMイミダゾール)で3回洗浄し、ジアンチン-EGFを、洗浄緩衝液中の10mLずつの増大して行く濃度のイミダゾール(31、65、125、及び250mM)によって溶出した。溶出液画分(2mL)を、2.0LのPBSに対して4℃で一晩透析した。脱塩されたジアンチン-EGFを、Amicon(登録商標)Ultra-15(10kDa)によって濃縮し、タンパク質濃度を定量した。
例のポリマー構造、五量体デンドリマー(ペントリマー)は、SA1641の不在下でも存在下でも、標的細胞に対するいずれかの細胞毒性効果を有さない(図27、カラム2及び3)。骨格の不在下では、標的化された毒素(ジアンチン-EGF)は、0.1nMの濃度において最大毒性の半分を示す(カラム4)。SA1641の存在下では、同じ濃度は全ての細胞の死をもたらし、エンドソーム脱出の向上因子として作用するSA1641の一般的能力を指示している(カラム5)。ポリマー構造の存在は、SA1641の存在下でも不在下でも、ジアンチン-EGFの毒性に影響せず(カラム6及び7)、骨格がジアンチン-EGFの毒性に影響しないということを指示している。クリックケミストリーによってモデルポリマー構造をジアンチン-EGFという例の原薬にカップリングするためには、物質は前にはアルキン基とカップリングされなければならなかった。この修飾の帰結として、ジアンチン-EGFはいくらかの活性を失った(それぞれ、カラム8及び9を6及び7と比較せよ)。しかしながら、非指向的なアルキン修飾は本発明の発想には影響せず、将来の適用にもまた要求されない。我々は試験目的のためにのみ非指向的なやり方でアルキンを導入しなければならず、毒素の薬学的活性中心を妨害するリスクを有した。原薬の製造業者は、物質の活性が影響されないままである彼の選んだ位置において、合成中にクリック位置を物質に直接的に導入し得る。アルキン修飾された原薬をポリマー構造とクリックしたときに、活性の追加の損失はなく、ポリマー構造そのものは毒性ではないということを指示した(カラム10及び11)。
材料
次の化学物質を購入のまま用いた:メタノール(MeOH、LiChrosolv、Merck)、N-ε-マレイミドカプロン酸ヒドラジド(EMCH、95%、TCI Chemicals)、トリフルオロ酢酸(TFA、99.8%、Carl Roth)、2-メルカプトエタノール(98%、Sigma-Aldrich)、ポリ(アミドアミン)(PAMAMデンドリマー、エチレンジアミンコア、5.0世代溶液、Sigma-Aldrich)、シアニン3カルボン酸(Cy3-COOH、95%、Lumiprobe)、1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン)-1H-1,2,3-トリアゾロ-[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート、N-[(ジメチルアミノ)-1H-1,2,3-トリアゾロ-[4,5-b]ピリジン-1-イルメチレン]-N-メチルメタンアミニウムヘキサフルオロホスフェートN-オキシド(HATU、97%、Sigma-Aldrich)、ウシ血清アルブミン画分V(BSA、Carl Roth)、ジメチルスルホキシド(DMSO、99%、Carl Roth)、2-イミノチオランヒドロクロリド(98%、Sigma-Aldrich)、ローダミンb(RhodB、95%、Merck)、ダルベッコリン酸緩衝食塩水(PBS、Gibco)、塩酸(HCl、37%、Merck)、NHS-PEG13-DBCO(Click Chemistry Tools)、Alexa Fluor(商標)488 5-TFP(Thermo-Fischer)、アジド-PEG3-SS-NHS(Conju-Probe)、シアノ水素化ホウ素ナトリウム(NaCNBH3、95%、Sigma-Aldrich)、過硫酸アンモニウム(APS、98%、Sigma-Aldrich)、N,N,N′,N′-テトラメチルエチレンジアミン(TMEDA、99%、Sigma-Aldrich)、カスタムペプチドSESDDAMFCDAMDESDSK(95%、PeptideSynthetics)、アジド-dPEG12-NHS(95%、Quanta Biodesign)、PFd-G4-アジド-NH-BOCデンドロン(G4-デンドロン、95%、Polymer Factory)、シアニン5-DBCO(Cy5-DBCO、95%、Lumiprobe)、クロロホルム(CHCl3、99.5%、Sigma)、Amicon Ultra 0.5mL遠心フィルター(3kDa MWCO、Sigma)、mPEG-SCM(mPEG2k-NHS、95.6%、Creative PEG Works)、Amicon Ultra 15mL遠心フィルター(10kDa MWCO、Sigma)。
MALDI-TOF-MS
MALDI-TOFスペクトルはMALDI質量分析計(Bruker Ultrafex III)で記録した。典型的には、ナノモルからマイクロモル範囲でMilliQ水に溶解したサンプルを、液滴乾燥法によって、アセトニトリル(MADLI-TOF-MS試験済み、Sigma)/0.1% TFA(7:3v/v)に溶解したマトリックスとしてsuper-DHB(99%、Fluka)又はシナピン酸(SA、99%、Sigma-Aldrich)どちらかを用いて、ターゲット(MTP384ターゲットプレート研磨済みスチールTF、Bruker Daltons)上にスポットした。PepMix(ペプチド較正標準、Bruker Daltons)又はProteMass(タンパク質較正標準、Sigma-Aldrich)が較正標準としての用をなした。RPモードはリフレクターのポジティブモードを言う。RNモードはリフレクターのネガティブモードを言う。LPモードはリニアポジティブモードを言う。
1H NMR分析はBruker 400MHz NMR分光計を用いて行った。サンプル調製は測定の24時間前に行われた。これによって、2mgのサンプルが0.8mLのメタノール-D4(99%、Deutero)に溶解された。
UV-Vis測定は、NanoDrop ND-1000分光光度計で、200~750nmのスペクトル範囲で行った。
サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)は、GE HealthcareからのセファデックスG25 Superfineによって、かつプレパックPD10カラム(GE Healthcare、セファデックスG25M)で行った。クロマトグラフィーを行う前に、材料をそれぞれの溶離液中で膨潤させることにより活性化した。
再生セルロース膜:MWCO=1及び2kDa(Spectra/Por)及びMWCO=12~14kDa(Carl Roth)を用いて透析を行った。典型的には、透析は1Lの溶媒で24h行い、これはプロセスの最初の6hの後に交換した。
凍結乾燥は、Alpha 1-2 LD plus(Martin Christ Gefriertrocknungsanlagen GmbH)で行った。典型的には、サンプルを液体窒素で凍結し、高真空で凍結乾燥機内に置いた。
Saponaria officinalis LからのSO1861(59mg、31.7μmol)及びEMCH(301mg、888μmol)を、スターラーと共にラウンドフラスコ内に置き、13mLメタノールに溶解した。TFA(400μL、cat.)を溶液に追加し、反応混合物を800rpmかつ室温で3h、RCT Bマグネットスターラー(IKA Labortechnik)で撹拌した。3hの撹拌後に、ミックスをMilliQ水又はPBSどちらかで希釈し、MilliQ水又はPBSどちらかに対して鋭意に24h透析した。1kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(Spectra/Por7)を用いた。透析後に、溶液を凍結乾燥して白色粉末を得た。収量62.4mg(95%)。乾燥したアリコートを、さらに、1H NMR及びMALDI-TOF-MSによるキャラクタリゼーションに用いた。
MALDI-TOF-MS(RNモード)(図28C):m/z 2275 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2244 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2222 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2178 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2144 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2122 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2092 Da([M-H]-,サポニン-EMCHコンジュゲート),2070 Da([M-H]-,SO1861-EMCH),2038 Da([M-H]-,SO1832-EMCH),1936 Da([M-H]-,SO1730-EMCH),1861 Da([M-H]-,SO1861)。
SO1861-EMCH(0.1mg、48nmol)に、200μLメルカプトエタノール(18mg、230μmol)を追加し、溶液をThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で1h振盪した。1hの振盪後に、溶液をメタノールで希釈し、1kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(Spectra/Por7)を用いてメタノールに対して鋭意に4h透析した。透析後に、アリコートを取り出し、MALDI-TOF-MSにより分析した。
47μLのPBSに溶解した2-イミノチオラン(231μg、1.1μmol)を、200μLのPBS中のBSA-RhodB溶液(10mg、0.15μmol)に追加し、ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で40min振盪した。40minの振盪後に、反応ミックスを直ちにセファデックスG25 Superfineサイズ排除カラム(16mLカラム体積)に通し、100μL PBSに溶解したSO1861-EMCH(1mg、0.5μmol)を収集されたBSA-SH画分に追加した。反応混合物を、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪した。12hの振盪後に、BSA-SO1861を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターによる4,000rpm(15℃)での遠心濾過を用いて濃縮した。コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のため取った。収量:決定されなかった。
メタノールに溶解した720μLのPAMAM(30mg、1.04μmol)を、250mLラウンドフラスコ内に置き、メタノールをロータリーエバポレータ(20mbar、60℃)によって除去した。残りのPAMAMを9mLのDMSOに溶解した。0.5mLのDMSOに溶解したHATU(7.6mg、20μmol)を、DMSO中のCy3-COOH(0.6mg、1.2μmol)溶液に追加し、ミックスを、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で1h振盪した。1hの振盪後に、HATU-Cy3溶液を撹拌PAMAM溶液に追加し、反応ミックスを室温で12h撹拌した。12hの撹拌後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、2kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(Spectra/Por6)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、コンジュゲート溶液の体積をロータリーエバポレータ(20mbar、60℃)によって縮減し、濃縮されたコンジュゲート溶液をセファデックスG25 Superfineサイズ排除カラム(16mLカラム体積)に通した。第1の画分を収集し、凍結乾燥して、粘稠なピンク色のPAMAM-Cy3コンジュゲートを得た。PAMAM-Cy3コンジュゲート形成を、薄層クロマトグラフィー(メタノール/水、v/v1:1)によるクロマトグラフィーと、セファデックスG25 Superfineカラムによるより速いバンドの出現とによって確認した。収量21.3mg(63%)。UV-Vis分光光度法により測定したPAMAM当たりの色素モル比は、0.43であった。
Cy3-PAMAM-(SO1861)5について、手順を例示的に記載する。250μLのMilliQ水に溶解した2-イミノチオラン(1mg、6.7μmol)を、125μLのMilliQ水中のPAMAM-Cy3溶液(0.5mg、17nmol)に追加し、ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で40min振盪した。40minの振盪後に、反応ミックスを直ちにセファデックスG25 Superfineサイズ排除カラム(16mLカラム体積)に通し、40μLのMilliQ水に溶解したSO1861-EMCH(176μg、85nmol)を、収集されたCy3-PAMAM-SH画分に追加した。反応混合物を、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪した。12hの撹拌後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、12~14kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(ZelluTrans、Carl Roth)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、Cy3-PAMAM-SO1861溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターによる4000rpm(15℃)での遠心濾過を用いて濃縮した。コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のため取った。収量:0.5mg(75%)。
Cy3-PAMAM(0.5mg、18nmol)、SO1861(2.3mg、1.24μmol)、及びHATU(64.6mg、170μmol)を、別々に200μL DMSOに溶解した。SO1861及びHATU溶液を混合し、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で20min振盪した。20minの振盪後に、Cy3-PAMAM溶液を振盪SO1861-HATU溶液に追加し、反応混合物がThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪することを許した。12hの振盪後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、12~14kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(ZelluTrans、Carl Roth)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、Cy3-PAMAM-NC-SO1861溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターによる4,000rpm(15℃)での遠心濾過を用いて濃縮した。Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のために取った。収量:0.77mg(69%)。
PFd-G4-アジド-NH-BOC(G4-デンドロン)(9.75mg、2.11μmol)を、2mL反応チューブ(Eppendorf)内に置き、200μL DMSOに溶解した。DMSO中の100μLのCy5-DBCO溶液(1.72μmol*mL-1、170nmol)をG4-デンドロン溶液に追加し、ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で室温かつ800rpmで12時間振盪した。12hの撹拌後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、1kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(Spectra/Por7)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、溶液を凍結乾燥して、青色粉末を得た。クルードな産物を、凍結乾燥から得られたままで脱保護ステップに用いた。
最も低いG4-デンドロン対SO1861-EMCH比についての手順を例示的に記載する。300μLのMilliQ水に溶解した2-イミノチオラン(2.65mg、19.2μmol)を、252μLのMilliQ水中の部分的にCy5標識されたG4-デンドロン溶液(0.577mg、192 nmol)に追加し、ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で40min振盪した。40minの振盪後に、反応ミックスを直ちにPD10サイズ排除カラムに通し、100μLのMilliQ水に溶解したSO1861-EMCH(1.19mg、575nmol)を、収集されたG4-デンドロン-SH画分に追加した。反応混合物を、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪した。12hの振盪後に、反応ミックスを、Amicon Ultra遠心フィルター(3kDa MWCO)を用いた遠心濾過により濃縮した。コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のため取った。収量:90nmol(47%)。
最も高いPAMAM対2-イミノチオラン比について手順を例示的に記載する。30μLのメタノールに溶解したPAMAM(333μg、12.8 nmol)溶液に、128μLのMilliQ水に溶解した2-イミノチオラン(0.53mg、3.84μmol)を追加した。反応混合物を、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪した。12hの振盪後に、反応ミックスを、15℃かつ13500rpmにおけるAmicon Ultra遠心フィルター(3kDa MWCO)を用いた遠心濾過によって、MilliQ水で4回洗浄した。洗浄後に、サンプルを凍結乾燥して白色固体を得た。収量は決定されなかった。
最も低いPAMAM対mPEG2k比について手順を例示的に記載する。10μLのDMSOに溶解したPAMAM(333μg、12.8nmol)溶液に、13μLのDMSOに溶解したmPEG2k-NHS(0.268mg、128nmol)を追加した。反応混合物を、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪した。12hの振盪後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、2kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(Spectra/Por6)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、バッチを、Amicon Ultra 15mL遠心フィルター(10kDa MWCO)を用いた遠心濾過によって濃縮した。濃縮されたバッチをPD10サイズ排除カラムに通し、次に凍結乾燥をして、白色の綿毛状の粉末を得た。収量は決定されなかった。
Cy3-PAMAM-(SO1861)27-(DBCO)10について、手順を例示的に記載する。Cy3-PAMAM-(SO1861)27(0.41mg、4.71nmol)をフリーズドライし、100μLのDMSOに溶解した。DMSOに溶解したDBCO-PEG13-NHSエステル(0.197mg、188nmol)をCy3-PAMAM-SO1861溶液に追加し、混合物を800rpmかつ室温でThermoMixer C(Eppendorf)上で振盪した。3hの振盪後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、12~14kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(ZelluTrans、Carl Roth)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターによる4,000rpm(15℃)での遠心濾過を用いて濃縮した。コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のため取った。収量:0.1mg(22%)。
Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)17(0.3mg、4.8nmol)をフリーズドライし、100μLのDMSOに溶解した。DMSOに溶解したDBCO-PEG13-NHSエステル(0.202mg、194nmol)をCy3-PAMAM-NC-SO1861溶液に追加し、混合物を800rpmかつ室温でThermoMixer C(Eppendorf)上で振盪した。3hの振盪後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、12~14kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(ZelluTrans、Carl Roth)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、Cy3-PAMAM-SO1861-DBCO溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターによる4,000rpm(15℃)での遠心濾過を用いて濃縮した。コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のため取った。収量:0.1mg(22%)。質量分析は、PAMAM分子当たり30個のDBCO部分のコンジュゲート化を指示している。
プラスミドDNA(His-ジアンチン-EGF-pET11d又はHis-ジアンチン-pET11d)[20]を、ケミカルコンピテントEscherichia coli NiCo21(DE3)(New England Biolabs(登録商標),Inc.)にトランスフォーメーションし、50μg/mLアンピシリンを足した3mL溶原培地によって37℃において200rpmで5h成長させた。これらの細菌を用いて、37℃での一晩培養のために、50μg/mLアンピシリンを足した500mL溶原培地に接種した。続いて、培養体積を2Lにスケールアップし、細菌を、0.9という光学密度(A600)まで成長させた。タンパク質発現を、1mMの最終濃度でのイソプロピルβ-D-1-チオガラクトピラノシド(IPTG)の追加によって誘導した。細胞を37℃かつ200rpmでさらに3h成長させた。遠心(5min、5,000g、4℃)後に、細胞ペレットを、20mLのリン酸緩衝食塩水(Ca2及びMg2を有するダルベッコリン酸緩衝食塩水(PBS)、pH7.4)に再懸濁し、-20℃で保存した。融解後に、タンパク質を超音波装置(Branson Sonifier 250、G. Heinemann)によって放出した。溶液を遠心し(15,800g、30min、4℃)、20mMイミダゾール濃度に調整した。構築物はN末端Hisタグを含有し、ニッケルニトリロ三酢酸クロマトグラフィー(Ni-NTAアガロース、Qiagen、ヒルデン、ドイツ)により精製した。イミダゾール(20~250mM)による溶出後に、溶出液を、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)(12%)によって分析した。ジアンチン-EGF又はジアンチンを含有する画分を、2Lのキチン結合ドメイン緩衝液(20mMトリス(ヒドロキシメチル)-アミノメタン/HCl、500mM NaCl、1mM EDTA、0.1%Tween-20、pH8.0)に対して4℃で透析した。キチンカラムアフィニティークロマトグラフィーによるさらなる精製が、Ni-NTAアガロースに対する結合活性を有する細菌タンパク質を除去するための用をなした。キチン結合ドメイン緩衝液による溶出後に、画分をSDS-PAGE(12%)によって分析した。ジアンチン-EGF又はジアンチンを含有する画分を、5LのPBSに対して4℃で透析した。精製タンパク質を、Amicon遠心フィルターデバイス(10kDa、Millipore、エシュボルン、ドイツ)により濃縮した。タンパク質濃度をビシンコニン酸アッセイ(Pierce、ロックフォード、USA)によって決定した。
PBS中のジアンチン-EGF(240μg、6.7nmol)溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルター内に置き、4,000rpmかつ4℃で30min、3回遠心した。各サイクル後に、Amiconフィルターに、pH9の0.1M炭酸ナトリウム緩衝液を再充填した。第3の遠心サイクルの後に、体積を遠心により0.5mLまで縮減した。ジアンチン-EGF炭酸ナトリウム溶液を2mL反応チューブ内に置き、10μL DMSOに溶解したAlexa Fluor(商標)488 5-TFP(50μg、56nmol)をタンパク質溶液に追加した。ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で80min振盪した。振盪後に、ミックスをセファデックスG25Mサイズ排除カラム(GE Healthcare、PD10カラム)に通した。ジアンチン-EGF-Alexa488コンジュゲートを、pH9の0.1M炭酸ナトリウム緩衝液中の溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のために取った。収量:210μg(85%)。
PBS中のジアンチン(184μg、6.2nmol)溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルター内に置き、4,000rpmかつ4℃で30min、3回遠心した。各サイクル後に、Amiconフィルターに、pH9の0.1M炭酸ナトリウム緩衝液を再充填した。第3の遠心サイクルの後に、体積を遠心により0.5mLまで縮減した。ジアンチン炭酸ナトリウム溶液を2mL反応チューブ内に置き、3.5μL DMSOに溶解したAlexa Fluor(商標)488 5-TFP(16.7μg、19nmol)をタンパク質溶液に追加した。ミックスを、ThermoMixer C(Eppendorf)上で、800rpmかつ室温で80min振盪した。振盪後に、ミックスをセファデックスG25Mサイズ排除カラム(GE Healthcare、PD10カラム)に通した。ジアンチン-Alexa488コンジュゲートを、pH9の0.1M炭酸ナトリウム緩衝液中の溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のために取った。収量:決定されなかった。
MALDI-TOF-MS(図38D)(LPモード):m/z 30.7 kDa([MH],ジアンチン-Alexa488)。
ジアンチン-EGF-Alexa488-S-S-PEG-N3について、手順を例示的に記載する。ジアンチン-EGF-Alexa488(70μg、1.9nmol)炭酸ナトリウム溶液を2mL反応チューブ内に置き、9μL DMSOに溶解したアジド-PEG3-S-S-NHS(120μg、272nmol)をタンパク質溶液に追加した。ミックスを、ThermoMixer C(Eppendorf)上で、800rpmかつ15℃で12h振盪した。振盪後に、反応ミックスをPBSで希釈し、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターを用いて、4,000rpmかつ4℃での遠心濾過によってPBSで洗浄した。
ジアンチン-Alexa488(24.5μg、0.8nmol)炭酸ナトリウム溶液を2mL反応チューブ内に置き、9μLのDMSOに溶解したアジド-PEG3-S-S-NHS(34μg、78nmol)をタンパク質溶液に追加した。ミックスを、ThermoMixer C(Eppendorf)上で、800rpmかつ15℃で12h振盪した。振盪後に、反応ミックスをPBSで希釈し、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターを用いて、4,000rpmかつ4℃での遠心濾過によってPBSで洗浄した。
Cy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCOについての手順を例示的に記載する。MilliQ水中のCy3-PAMAM-(SO1861)27-DBCO(17μg、0.184nmol)溶液を、1.5mL反応チューブ内のPBS中のジアンチン-EGF-Alexa488-SS-PEG3-N3(3.6μg、0.089nmol)溶液と混合し、反応ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ15℃で2h振盪した。振盪後に、小さいアリコートを、SDS-PAGEによる分析、及びMolecular Imager(登録商標)VersaDoc(商標)MP4000イメージングシステム(Bio-Rad)による蛍光イメージングのために取り出した(図39)。
Cy3-PAMAM(0.19mg、13 nmol)及びSO1861(0.73mg、0.39μmol)を、pH5の200μLの0.1M酢酸緩衝液に別々に溶解した。SO1861及びCy3-PAMAM溶液を混合し、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で20min振盪した。20minの振盪後に、NaCNBH3(5mg、81μmol)を振盪反応溶液に追加し、反応混合物がThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪することを許した。12hの振盪後に、反応ミックスをMilliQ水で希釈し、12~14kDaのMWCOを有する再生セルロース膜チューブ(ZelluTrans、Carl Roth)を用いてMilliQ水に対して鋭意に24h透析した。透析後に、Cy3-PAMAM-NC-SO1861溶液を、3kDaのMWCOを有するAmicon Ultra 15フィルターによる4,000rpm(15℃)での遠心濾過を用いて濃縮した。コンジュゲートを溶液として冷蔵庫に保存し、アリコートを分析のため取った。収量:決定されなかった。
MALDI-TOF-MS(図40B、C)(LPモード):m/z 88.7 kDa([MH],Cy3-PAMAM-NC-SO1861),49.2 kDa([MH]2,Cy3-PAMAM-NC-SO1861)。
Cy3-PAMAM-NC-(SO1861)30及びCy3-PAMAM-NC-(SO1861)10の合成は上に記載されている方法論によって行われたが、還元剤NaCNBH3が反応バッチに追加される前の時間が異なる。NaCNBH3追加のそれぞれの時間及びコンジュゲートのそれぞれの質量が、表22において強調されている。
SO1861-EMCH(0.13mg、63 nmol)を30μLの脱気済みMilliQ水に溶解した。4μLの脱気済みMilliQ水に溶解したAPS(0.2μg、0.8 nmol)をSO1861-EMCH溶液に追加し、溶液をThermoMixer C(Eppendorf)上に60℃で置いた。それから、TMEDA(cat.、0.5μL)をミックスに追加し、ミックスをThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ60℃で2h振盪した。2h後に、小さいアリコートを質量分析による分析のために取り出した。
配列SESDDAMFCDAMDESDSKを有するカスタムペプチド(0.6mg、0.3μmol)及びSO1861-EMCH(0.8mg、0.39μmol)を、別々に200μLのPBSに溶解した。SO1861-EMCH及びペプチド溶液を混合し、ThermoMixer C(Eppendorf)上で800rpmかつ室温で12h振盪した。振盪後に、小さいアリコートを分析のために取り出した。収量:決定されなかった。
MALDI-TOF-MS(図45B)(RNモード):m/z 4.05 kDa([MH]-,ペプチド-SO1861),3.92 kDa([MH]-,ペプチド-SO1730),1.98 kDa([MH]-,ペプチド),1.86 kDa([MH]-,SO1861)。
処置後に、細胞を37℃で72hrインキュベーションした後、細胞生存率を、製造者の説明書に従って行われたMTSアッセイによって決定した(CellTiter 96(登録商標)AQueous One Solution細胞増殖アッセイ、Promega)。手短には、MTS溶液を、10%FBS(PAN-Biotech GmbH)を足したフェノールレッドなしのDMEM(PAN-Biotech GmbH)によって20x希釈した。細胞をウェル当たり200μL PBSで1回洗浄し、これの後に100μLの希釈されたMTS溶液をウェル当たり追加した。プレートを37℃でおよそ20~30分間インキュベーションした。続いて、492nmの光学密度をThermo Scientific Multiskan FCプレートリーダー(Thermo Scientific)で測定した。定量化のために、「培地のみ」ウェルのバックグラウンドシグナルを、全ての他のウェルから差し引いた後に、無処置/処置細胞の比を、処置ウェルのバックグラウンド補正済みシグナルに対して無処置ウェルのバックグラウンド補正済みシグナルを割ることによって計算した。
HeLa細胞を、10%ウシ胎児血清(PAN-Biotech GmbH)及び1%ペニシリン/ストレプトマイシン(PAN-Biotech GmbH)を足したDMEM(PAN-Biotech GmbH)によって、500,000c/プレートで、10cmディッシュ上に播種し、90%のコンフルエンシーに達するまで48 hr(5%CO2、37℃)インキュベーションした。次に、細胞を単一細胞へとトリプシン処理した(TryplE Express、Gibco Thermo Scientific)。0.75×106細胞を15mLファルコンチューブに移し、遠心した(1400rpm、3min)。細胞ペレットを沈めたまま、上清を捨てた。ペレットを、ボルテックスシェーカー上でFalconチューブを穏やかにタップすることにより解離させ、細胞を4mLの冷PBS(Mg2及びCa2不含、2%FBS)で洗浄した。洗浄後に、細胞を3mLの冷PBS(Mg2及びCa2不含、2%FBS)に再懸濁し、3つの丸底FACSチューブに等しく分割した(1mL/チューブ)。細胞を再び遠心し、200μLの冷PBS(Mg2及びCa2不含、2%FBS)、又は195μLの冷PBS(Mg2及びCa2不含、2%FBS)中に5μL抗体を含有する200μLの抗体溶液に再懸濁した。APCマウスIgG1κアイソタイプCtrl FC(#400122、Biolegend)をアイソタイプ対照として用い、APC抗ヒトEGFR(#352906、Biolegend)を用いて、EGFR受容体を染色した。HER2:APC抗ヒトCD340(erbB2/HER-2)(324408、Biolegend)。CD71:APC抗ヒトCD71 #334108、Biolegend。サンプルを、チューブローラーミキサー上で4℃において30minインキュベーションした。その後で、細胞を冷PBS(Mg2及びCa2不含、2%FBS)で3x洗浄し、PBS中の2%PFA溶液を用いて室温で20min固定した。細胞を冷PBSで2x洗浄し、FACS分析のために250~350μLの冷PBSに再懸濁した。サンプルを、BD FACSCanto IIフローサイトメトリーシステム(BD Biosciences)及びFlowJoソフトウェアによって分析した。
SO1861分子へのコンジュゲート化反応のための利用可能な化学基を考えて、4つの化学基を同定した。糖残基のアルコール及びジオール、トリテルペノイドバックボーン上のアルデヒド基、糖残基の1つの上のカルボン酸(グルクロン酸)、及びトリテルペノイドバックボーン上のアルケン基が、図24において強調されている。
SO1861骨格の開発のための別のアプローチは、DNAアプローチである。このアプローチの発想は、いわゆるDNAオリガミの概念を利用することである(Kolb et al,2004;Bird et al,1988)。サポニンをそれにコンジュゲート化するためのポリマー構造又は集合体化したポリマー構造としてのDNAオリガミは、もたらされるDNA-サポニン骨格の安定性、スケーラビリティ、並びに最終サイズ及び形状の精確なコントロールを包含するいくつかの固有の利点を提供し得る。これらのDNAナノキャリアは天然DNAからなるので、それらは生体適合性であり、生細胞に対する毒性を示さず、内部細胞区画からのカーゴの放出を容易にし得る。かかる構造の多価性は、さらに、種々のペイロード、例えばフルオロフォア及び毒素についての標的化能を微調整すること及び高い容量を許し得る。それゆえに、このアプローチでは、それぞれ3’及び5’終端に化学的官能基を提供し、かつ構築物の最終形状のコントロールを許す配列のある種の欲されるエリアにおいてのみハイブリダイゼーションすることができるDNAストランドが同定される。化学基は、例えば、既に開発されたSO1861-EMCHと3’及び5’DNAストランドの1つの上のチオール基との間のチオール-エン反応によって、サポニンをカップリングするために利用されるはずである。相補DNAストランドは、標的化された毒素へのカップリングのために用いられ得るクリック官能基を提供し得る。この概念が図43に例解されている。
Weng,A.;Thakur,M.;Beceren-Braun,F.;Bachran,D.;Bachran,C.;Riese,S.B.;Jenett-Siems,K.;Gilabert-Oriol,R.;Melzig,M.F.;Fuchs,H.The toxin component of targeted anti-tumor toxins determines their efficacy increase by saponins.Molecular oncology 2012,6,323-332.saponinum album in a synergistic way.Journal of immunotherapy 2009,32,713-725.
Sama,S.;Jerz,G.;Schmieder,P.;Joseph,J.F.;Melzig,M.F.;Weng,A.Plant derived triterpenes from Gypsophila elegans M.Bieb.enable non-toxic delivery of gene loaded nanoplexes.Journal of Biotechnology 2018,284,131-139.
Kolb,H.C.;Finn,M.G.;Sharpless,K.B.Click Chemistry: Diverse Chemical Function from a Few Good Reactions.Angewandte Chemie 2001,40,2004-2021.
Bird,R.E.;Hardmann,K.D.;Jacobson,J.W.;Johnson,S.;Kaufman,B.M.;Lee,S.M.;Lee,T.;Pope,S.H.;Riordan,G.S.;Whitlow,M.Single-chain antigen-binding proteins.Science 1988,242,423-426.
Y Zhang,Z Qu,S Kim,V Shi,B Liao1,P Kraft,R Bandaru,Y Wu,LM Greenberger and ID Horak,Down-modulation of cancer targets using locked nucleic acid(LNA)-based antisense oligonucleotides without transfection,Gene Therapy(2011)18,326-333.
Claims (45)
- 細胞表面分子標的化分子及び少なくとも1つのエフェクター部分を含み、さらに少なくとも1つの共有結合されたサポニンを含む、コンジュゲートであって、少なくとも1つのサポニンが、トリテルペノイドサポニンおよび/またはキラヤ酸アグリコンコアを有するサポニンおよびジプソゲニンアグリコンコアを有するサポニンからなる群から選択される、C-23位にアルデヒド官能基を有する12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニンおよび/またはビスデスモシドトリテルペンサポニンであり、少なくとも1つのサポニンが、C-3位に分岐した炭水化物側鎖を含み、前記炭水化物側鎖がグルクロン酸官能基を含み、サポニンが、C-28位にデオキシ炭水化物を含む分岐した炭水化物側鎖を含む、コンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、Gypsophila種及び/又はSaponaria種及び/又はAgrostemma種及び/又はQuillaja種のいずれか1つ以上から単離されるサポニンである、請求項1に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、単一の特定のサポニンであるか、又は2つ以上の異なるサポニンの混合物である、請求項1又は2に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、3.000ダルトン以下の分子質量を有する、請求項1~3のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、NP-005236、AMA-1、AMR、α-Hederin、NP-012672、NP-017777、NP-017778、NP-017774、NP-018110、NP-017772、NP-018109、NP-017888.NP-017889、NP-018108、AE X55、NP-017674、NP-017810、NP-003881、NP-017676、NP-017677、NP-017706、NP-017705、NP-017773、NP-017775、QS-7、QS-17、ベータ-エスシンIa、ティーシードサポニンI、ティーシードサポニンJ、アッサムサポニンF、ジギトニン、プリムラ酸1、AS64R、AS6.2、SO1861、SA1657、GE1741、SA1641、QS-21、QS-21A、QS-21 A-api、QS-21 A-xyl、QS-21B、QS-21 B-api、QS-21 B-xyl、QS-7-xyl、QS-7-api、QS-17-api、QS-17-xyl、QS1861、QS1862、キラヤサポニン、サポニナムアルブム(Saponinum album)、QS-18、Gyp1、ギプソシド(gypsoside)A、AG1、AG2、SO1542、SO1584、SO1658、SO1674、SO1832、構造Aを有するサポニン;
- 少なくとも1つのサポニンがビスデスモシド型サポニンであり、少なくとも1.500ダルトンの分子質量を有し、C-23位にアルデヒド基を含み、C-3位に第1の分岐炭水化物側鎖を有有するオレアナン型トリテルペンを含み、サポニンは、C-28位に第2の分岐炭水化物側鎖を有するエステル基を含有し、或いは、少なくとも1つのサポニンは、QS-21、又はQS-21A、QS-21 A-api、QS-21 A-xyl、QS-21B、QS-21 B-api、QS-21 B-xyl、QS-7-xyl、QS-7-api、QS-17-api、QS-17-xyl、QS-18、QS-1861、プロトン化QS1861(QS1862)のいずれか1つ以上である、請求項1~5のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 細胞表面分子標的化分子が、細胞表面分子に結合するためのリガンド又はタンパク質性リガンド又はタンパク質性結合分子を含むか又はそれからなる、請求項1~6のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 細胞表面分子標的化分子が、EGF又はサイトカインなどの細胞表面分子に結合するための非タンパク質性リガンド及び/又はタンパク質性リガンドを含むか、又はそれからなり、並びに/或いは、免疫グロブリン、免疫グロブリンの少なくとも1つの結合ドメイン、及び/又は免疫グロブリンの少なくとも1つの結合フラグメント、例えば抗体、IgG、Vhhドメイン若しくはVhドメインを含むか若しくはそれからなる分子、Fab、scFv、Fv、dAb、F(ab)2、Fcabフラグメントを含むか、又はそれからなり、これらは細胞表面分子に結合し得る、請求項1~7のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 細胞表面分子標的化分子が、腫瘍細胞表面分子に結合し得る、請求項1~8のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 腫瘍細胞受容体が、請求項1及び7~9のいずれか1項に記載の細胞表面分子標的化分子並びに請求項1~9のいずれか1項に記載のコンジュゲートに結合した後に、腫瘍細胞によって内在化される、請求項9に記載のコンジュゲート。
- 細胞表面分子標的化分子が、モノクローナル抗体又はその少なくとも1つの細胞表面分子結合フラグメント又はドメインであるか、又はそれからなる、請求項1~10のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのエフェクター部分が、オリゴヌクレオチド、核酸、及びゼノ核酸のいずれか1つ以上を含むか又はそれらの誘導体からなる、請求項1~11のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのエフェクター部分が、少なくとも1つのタンパク質性分子を含むか又はそれらからなる、請求項1~12のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのエフェクター分子が、少なくとも1つのペイロードを含むか又はそれからなる、請求項1~13のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのエフェクター部分が、少なくとも1つのリンカーを介して細胞表面分子標的化分子に共有結合されるか、又は細胞表面分子標的化分子に直接的に結合されるかどちらかである、請求項1~14のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのエフェクター部分が、細胞表面分子標的化分子に共有結合され、それによって、ゲムツズマブオゾガマイシン、ブレンツキシマブベドチン、トラスツズマブエムタンシン、イノツズマブオゾガマイシン、モキセツモマブパスドトクス、及びポラツズマブベドチン抗体-薬物コンジュゲート、並びにAffilutin、ADCT-502、AGS-16M18、AGS-67E、AMG-172、AMG-595、ASG-15ME、ASG-5ME、ASP-6183、AVE-9633、Avicidin、BAY-794620、Bismab-A、BIWI-1、cantuzumab ravtansine、CDX-014、coltuximab ravtansine、DCDS-0780A、denintuzumab mafodotin、HTI-1511、HuMax-CD74-ADC、IMGN-289、IMGN-388、IMGN-779、ImmuRAIT-LL2、indusatumumab vedotin、lifastuzumab vedotin, lorvotuzumab mertansine、MLN-2704、MM-310、Oncolysin S、PF-06263507、PF-06647263、PF-06650808、pinatuzumab vedotin、RG-7598、RG-7600、RG-7636、RG-7841、RG-7882、sacituzumab govitecan、SAR-428926、SAR-566658、SC-004、SC-006、SGN-15、SGNCD-123A、SGNCD-19B、SGNCD-352A、SGN-CD70A、sofituzumab vedotin、vandortuzumab vedotin、vorsetuzumab mafodotin、XMT-1522、ZW-33、トラスツズマブ・エムタンシン、MM-302、イブリツモマブ・チウキセタン、イノツズマブ・オゾガマイシン、ロバルピツズマブ・テシリン、ニューラジアブ、クリバツズマブ・テトラキセタン、デパツキシズマブ・マホドチン、バダストキシマブ・タリリン、グレムバツマブ・ベドチン、オンコライシンBの抗体-薬物コンジュゲートのいずれか1つを形成する、請求項1~15のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、細胞表面分子標的化分子に、サポニン上のアルデヒド官能基を介して、及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分に、サポニン上のアルデヒド官能基を介して、共有結合される、請求項1~16のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンのアルデヒド官能基が、リンカーN-ε-マレイミドカプロン酸ヒドラジドに共有結合的にカップリングされ、このリンカーは、チオ-エーテル結合を介して、細胞表面分子標的化分子上の及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分上のスルフヒドリル基、例えばシステインのスルフヒドリル基に共有結合的にカップリングされる、請求項17に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、12,13-デヒドロオレアナンの型に属するビスデスモシド型トリテルペンサポニンであり、位置C-23にアルデヒド官能基を有し、サポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてグルクロン酸官能基を含み、サポニンは、細胞表面分子標的化分子のアミノ酸残基に及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分に、前記グルクロン酸官能基を介して、共有結合される、請求項1~18のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンのC-3ベータOH基の炭水化物置換基としてのグルクロン酸官能基が、リンカー1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェートに共有結合的にカップリングされ、このリンカーは、アミド結合を介して、細胞表面分子標的化分子上の及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分上のアミン基、例えば細胞表面分子標的化分子の及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分のリジン又はN末端のアミン基に、共有結合的にカップリングされる、請求項18に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、細胞表面分子標的化分子に及び/或いは少なくとも1つのエフェクター部分に、直接的に、或いは少なくとも1つのリンカー、例えばN-ε-マレイミドカプロン酸ヒドラジドに基づく及び/若しくは1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェートに基づく二官能性リンカー、又は三官能性リンカーで共有結合される、請求項1~20のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 三官能性リンカーが、それに少なくとも1つのサポニンが共有結合される第2の化学基、細胞表面分子標的化分子に共有結合するための第3の化学基、及び少なくとも1つのエフェクター部分に共有結合するための第1の化学基を含む、請求項21に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、細胞表面分子標的化分子に及び少なくとも1つのエフェクター部分に、三官能性リンカーを含む少なくとも1つのリンカーを介して共有結合され、この三官能性リンカーには、細胞表面分子標的化分子及び少なくとも1つのエフェクター部分両方が結合される、請求項1~18のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのリンカーが、少なくとも1つの切断可能なリンカーを含む、請求項18、20~23のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのリンカーが、少なくとも1つの切断可能なリンカーを含み、前記切断可能なリンカーは、哺乳類細胞のエンドソーム及び/又はリソソームに存在する酸性条件下においてインビボで切断を受ける、請求項18、20~24のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、アミド結合を形成するリジン側鎖に及び/又はチオ-エーテル結合若しくはジスルフィド結合を形成するシステイン側鎖に共有結合され、リジン及び/又はシステインは、細胞表面分子標的化分子に含まれ、及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分に含まれ、少なくとも1つのサポニンは、直接的にリジン及び/若しくはシステインに結合されるか、又は少なくとも1つのリンカーを介して結合される、請求項1~25のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- リンカーが、N-ε-マレイミドカプロン酸ヒドラジドに基づき、及び/又は1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート、三官能性リンカー、切断可能なリンカーに基づき、並びに/或いはジスルフィド結合、チオ-エーテル結合、アミド結合、ヒドラジド結合のいずれか1つ以上が関わる、請求項26に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、細胞表面分子標的化分子に及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分に少なくとも1つのリンカーを介して共有結合され、リンカーは、ポリマー又はオリゴマー構造を含み、かつさらに骨格を細胞表面分子標的化分子に及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分に共有結合するための少なくとも1つの第4の化学基を含む骨格であるか、又はそれを含む、請求項1~27のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、切断可能な結合を介して及び/又は非切断可能な結合を介して、骨格のポリマー又はオリゴマー構造に共有結合される、請求項28に記載のコンジュゲート。
- 切断可能な結合が、酸性条件、還元的条件、酵素的条件、及び光誘導性条件のいずれかの下で切断を受ける、請求項29に記載のコンジュゲート。
- 切断可能な結合が、哺乳類細胞のエンドソーム及び/又はリソソームに存在する酸性条件下においてインビボで切断を受ける、請求項29又は30に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、骨格のポリマー又はオリゴマー構造に、イミン結合、ヒドラゾン結合、ヒドラジド結合、オキシム結合、1,3-ジオキソラン結合、ジスルフィド結合、チオ-エーテル結合、アミド結合、ペプチド結合、又はエステル結合のいずれか1つ以上を介して、共有結合される、請求項28~31のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、骨格のポリマー又はオリゴマー構造に、イミン結合、ヒドラゾン結合、及びヒドラジド結合のいずれか1つ以上を介して共有結合される、請求項28~31のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンの位置C-23のアルデヒド官能基が、リンカーN-ε-マレイミドカプロン酸ヒドラジドに共有結合的にカップリングされ、このリンカーが、チオ-エーテル結合を介して骨格のポリマー又はオリゴマー構造上のスルフヒドリル基、例えばシステインのスルフヒドリル基に共有結合的にカップリングされる、請求項33に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、骨格のポリマー又はオリゴマー構造にアミド結合を介して共有結合される、請求項28~31のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてのグルクロン酸官能基が、リンカー1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェートに共有結合的にカップリングされ、このリンカーは、アミド結合を介して、骨格のポリマー又はオリゴマー構造上のアミン基、例えば骨格のポリマー又はオリゴマー構造のリジン又はN末端のアミン基に共有結合的にカップリングされる、請求項35に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、骨格のポリマー又はオリゴマー構造に共有結合され、共有結合には、存在するときには少なくとも1つのサポニンの位置C-23のアルデヒド官能基が関わり、及び/又は、共有結合には、存在するときには少なくとも1つのサポニンのC-3ベータ-OH基の炭水化物置換基としてのグルクロン酸官能基が関わる、請求項28~36のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 骨格を細胞表面分子標的化分子に及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分に共有結合的にカップリングするための骨格の少なくとも1つの第4の化学基が、クリックケミストリー基である、請求項28~37のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 骨格のポリマー又はオリゴマー構造が、直鎖、分岐、及び/若しくは環状ポリマー、オリゴマー、デンドリマー、デンドロン、デンドロン化ポリマー、デンドロン化オリゴマー、DNA、ポリペプチド、ポリリジン、ポリエチレングリコール、又はこれらのポリマー若しくはオリゴマー構造の集合体を含む、請求項28~38のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、定められた数のサポニン又は定められた範囲のサポニンである、請求項1~39のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートが、1つよりも多くのサポニンを含み、直接的に、細胞表面分子標的化分子のアミノ酸残基に及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分を介して共有結合され、並びに/或いは、請求項28~40のいずれか1項に記載の少なくとも1つのリンカーを介して及び/又は少なくとも1つの切断可能なリンカーを介して及び/又は少なくとも1つのポリマー若しくはオリゴマー骨格を介して共有結合され、1~32個のサポニンが、少なくとも1つの骨格に共有結合される、請求項1~40のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 少なくとも1つのサポニンが、細胞表面分子標的化分子に及び少なくとも1つのエフェクター部分に三官能性リンカーを介して共有結合され、三官能性リンカーは、少なくとも1つのサポニンが直接的に或いは切断可能なリンカーなどのリンカーを介して及び/又はポリマー若しくはオリゴマー構造を含む骨格を介してどちらかでそれに共有結合される第2の化学基と、三官能性リンカーへの骨格の共有結合的カップリングのための請求項28~41のいずれか1項に記載の第4の化学基とを含み、三官能性リンカーは、さらに、細胞表面分子標的化分子への共有結合のための第3の化学基を含み、かつ少なくとも1つのエフェクター部分への共有結合のための第1の化学基を含み、細胞表面分子標的化分子は第3の化学基に結合され、及び/又は少なくとも1つのエフェクター部分は第1の化学基に結合される、請求項1~41のいずれか1項に記載のコンジュゲート。
- 請求項1~42のいずれか1項に記載のコンジュゲートを含む医薬組成物。
- 医薬として使用するための、請求項1~42のいずれか1項に記載のコンジュゲート、又は請求項43に記載の医薬組成物。
- 癌又は自己免疫疾患の処置又は防止において使用するための、請求項1~42又は44のいずれか1項に記載のコンジュゲート、或いは請求項43又は44に記載の医薬組成物。
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