JP2020536527A - Bcmaに結合するキメラ抗原受容体(car)及びその応用 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】前記キメラ抗原受容体は、BCMA結合ドメインと、膜貫通ドメインと、共刺激ドメインと、細胞内シグナル伝達ドメインとを含む。
【選択図】図1
Description
キメラ抗原受容体(CAR)は、ヒト白血球抗原-非依存性で細胞表面抗原を認識するように設計された抗原受容体である。CARを発現する遺伝子によって修飾されたT細胞(CAR-T)を用いてこれらのタイプの患者を治療する試みは、ある程度の成功を収めた(Molecular Therapy,2010,18:4,666-668;Blood,2008,112:2261-2271)。
B細胞悪性腫瘍、特に多発性骨髄腫において治療の標的としてのBCMAの有効性を鑑みて、BCMAに作用することにより治療の目的を達成するための新しい細胞療法を開発することが当分野で期待されている。
いくつかの実施形態において、前記CARの共刺激ドメインは、CD28、4-1BB、OX-40、及びICOSからなる群より選ばれるタンパクに由来する共刺激ドメインを含む。いくつかの実施形態において、前記共刺激ドメインは、SEQ ID NO:29又はSEQ ID NO:31に示されるアミノ酸配列を含む。
本願において、用語「シグナルペプチド」(Signal peptide)とは、一般的に、タンパク質の移行を指示するペプチド鎖を指す。いくつかの実施形態において、シグナルペプチドは短いペプチド鎖であってもよく、その長さは5〜30個のアミノ酸であってもよい。
本願において、前記CARは、BCMAに特異的に結合する細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、胞内共刺激シグナル伝達ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含んでもよい。本願において、前記CARの細胞外ドメインは、本願にかかる単鎖抗体(scFv)を含んでもよい。例えば、前記単鎖抗体は、CD8ヒンジのようなヒンジ領域を介して膜貫通ドメインと連結してもよい。本願において、前記CARは、免疫エフェクター細胞(例えばT細胞)を形質導入して細胞表面で発現するのに用いられてもよい。したがって、本願は、前記キメラ抗原受容体を発現するT細胞、及びB細胞関連疾患を治療する医薬品を調製するための該T細胞及び/又は前記CARの使用を提供することもできる。
また、本願は、本願のCARをコードできる単離された核酸分子を提供する。本願にかかるCARをコードする単離された核酸分子は、SEQ ID NO:50又はSEQ ID NO:52に示される核酸配列又はその機能的変異体を含んでもよい。本願の核酸分子は単離されたものであってもよい。例えば、以下の方法により生成又は合成されてもよい。(i)体外で増幅された。例えば、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅により生成された。(ii)クローン組換えにより生成された。(iii)精製された。例えば、酵素切断やゲル電気泳動により分級分離された。又は(iv)合成された。例えば、化学合成された。いくつかの実施形態において、前記単離された核酸は、DNA組換え技術により調製された核酸分子である。
本願において、前記Tリンパ球は、胸腺細胞、天然Tリンパ球、未成熟Tリンパ球、成熟Tリンパ球、休止Tリンパ球、または活性化Tリンパ球を含んでもよい。前記T細胞は、ヘルパーT細胞(Th)、例えばヘルパーT細胞1(Th1)又はヘルパーT細胞2(Th2)細胞であってもよい。前記Tリンパ球は、CD4+ヘルパーT細胞(HTL;CD4+T細胞)、細胞傷害性T細胞(CTL;CD8+ T細胞)、腫瘍浸潤細胞傷害性T細胞(TIL;CD8+T細胞)、CD4+/CD8+T細胞、CD4-/CD8-T細胞、又は他のTリンパ球サブタイプであってもよい。いくつかの実施形態において、前記Tリンパ球は、初代T細胞(TN細胞)であってもよい。いくつかの実施形態において、前記Tリンパ球はセントラルメモリーT細胞(TCM)であってもよい。いくつかの実施形態において、前記Tリンパ球はエフェクターT細胞(TEM細胞)であってもよい。いくつかの実施形態において、前記Tリンパ球はNKT細胞であってもよい。本願において、前記Tリンパ球は末梢血細胞、臍帯血細胞および/又は白細胞に由来するものであってもよい。
また、本願は、前記CAR、前記核酸分子、前記ベクター、又は前記免疫エフェクター細胞の、BCMAの発現に関連する疾患又は病症を治療する医薬品を調製するための用途を提供する。
実施例1 組換えレンチウイルスベクターの構築
まず、以下のヌクレオチド配列を人工的に合成した。KOZAK(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:2)、CD8aシグナルペプチド(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:4)、HA-タグ(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:6)、scFv0026(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:44)、ヒンジ領域(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:26)、膜貫通領域(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:28)、CD28共刺激因子(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:30)、4-1BB共刺激ドメイン(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:32)、CD3ζ細胞内シグナル伝達ドメイン(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:34)、T2A切断ペプチド(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:36)、GFP(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:38)、EGFRt(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO:40)。
GFPタンパクを検出する以外、CAR分子の発現は他の方法により行うこともできる。例えば、適量のビオチン化(biotinylated)BCMAとPEストレプトアビジン(streptavidin)でCAR分子を標識し、そしてPEシグナルによりCAR分子の発現を反映することができる。別の例として、適量のビオチン化抗HAモノクローナル抗体(biotinylated anti-HA mAb)とPEストレプトアビジン(streptavidin)でCAR分子を標識して検出に用いることができる。
レンチウイルスベクターPLVX-EF1alpha-IRES-PuroをNotIとMluIでダブルダイジェストし、ベクター断片を回収した。候補のscFvプラスミドPXL0026(ヌクレオチド配列がSEQ ID NO: 44)をPCRで増幅し、伸長PCRで5’末端にNotI酵素切断部位(保護塩基を含む)、CD8aシグナルペプチド、HA-タグ;ヒンジ領域、膜貫通領域、CD28共刺激因子、CD3ζ細胞内シグナル伝達ドメインを順に付加して遺伝子合成を行い、PCRで増幅した;T2A切断ペプチドとeGFPがプラスミドpMy-BirA-T2A-eGFP PCRから増幅し、3’末端にMluI酵素切断部位及び保護塩基を付加した;そしてoverlap PCRにより、5’末端にNotI酵素切断部位を持ち、3’末端にMluI部位を持つPCR断片を取得し、この断片をNotI及びMluIでダブルダイジェストし、回収した。T4接続構築により、番号がPXL0037であるCARプラスミド(CAR0037のヌクレオチド配列がSEQ ID NO:50に示される)が得られた。
図2Aに示されるように、PEIをトランスフェクション試薬として用い、実施例1で調製されたPXL0009、PXL0041、PXL0037のCARプラスミドを293T細胞に一過性トランスフェクトして、それぞれPXL0009-293T細胞、PXL0041-293T細胞、PXL0037-293T細胞を得た。一過性トランスフェクションの72時間後のPXL0009-293T細胞、PXL0041-293T細胞、PXL0037-293T細胞は、候補CAR分子の発現能力の評価に用いられた。図2Aにおいて、1はプラスミドとトランスフェクション試薬を表し、2は一過性トランスフェクションを表し、3は発現とT2A切断ペプチドの切断を表す。
3.1 レンチウイルスのパッケージング
実施例1で調製された番号がPXL0009、PXL0041、PXL0037であるCARプラスミドは、293T細胞をシャトルプラスミドおよび他のパッケージングプラスミドで同時トランスフェクトし、細胞内でレンチウイルスのパッケージングを行う必要がある。具体的な手順は以下の通りである。
レンチウイルスパッケージングの過程で収集した上清における形質導入活性を有するウイルスタイター(バイオタイター)を検出することにより、レンチウイルスのパッケージング効率を評価することができる。具体的な検出手順は以下の通りである。
又は、LV0007により形質導入された293T細胞をビオチン化BCMA(biotinylated BCMA)とPEストレプトアビジン(PE-streptavidin)で標識し、CAR陽性率(CARタイターと呼ばれる)をフローサイトメトリーで検出した。
バイオタイター(TU/ml)=(CAR陽性率×293T細胞数)/ウイルスサンプル体積
上述したパッケージング過程で収集された上清のバイオタイターの検出結果は図4と表4に示される。
初日に、約65 mlの健康なドナーの末梢血を採取し、得られたPBMCをFicollで分離し、さらに得られたT細胞をCD3 MicroBeadsで分別した。分別した後のT細胞はCD3/CD28 Dynabeadsで活性化した。約24時間活性化した後(2日目)、実施例3で調製されたLV0007とLV0011のレンチウイルス形質導入(MOI = 4)を加え、形質導入するとき、T cells密度が約1.5×106細胞/mlであった。3日目に、形質導入した後のT細胞に対して培地交換を行った。その後、毎日カウントし、細胞密度を(0.6〜2.0)×106細胞/mlの間に維持し、細胞の成長曲線をプロットした。
さらに、所定濃度且つ過剰のPEストレプトアビジン(PE streptavidin)の条件下で、勾配希釈したビオチン化BCMA(biotinylatedBCMA)タンパクでCAR分子を標識する方法(実施例2の方法と同じ)により、実施例4で調製されたCAR-Tで発現されるCAR分子とBCMAタンパクとの結合能力を検出し、結果は図6と表7に示される。
6.1 CD107a脱顆粒実験
CD107a脱顆粒実験によりCAR-T細胞の体外生物学的有効性の評価を行った。CD107aは細胞内微小胞のマーカーであり、グランザイムを担持した微小胞が細胞膜と融合すると、細胞膜上のCD107aが増加し、モネンシン(monesin、BioLegendから購入)で回収を阻害するとき、微小胞放出の強度を定量的に反映できる。CAR-Tが標的細胞上の標的抗原に刺激されると、グランザイム放出の引き起こし、CD107aの増加をフローサイトメトリーにより検出することでT細胞の活性化を判断することができる。
本実施例のセクション6.1の実験操作に従って、CAR-T細胞サンプル(LV0007-CAR-TとLV0011-CAR-T細胞)を、それぞれ標的細胞U266(BCMA陽性)又はK562(BCMA陰性)と3時間共インキュベートした後、フローサイトメトリーを行った。細胞サンプルのCD107a脱顆粒実験データの結果は表8と図8に示され、表8と図8はいずれもCD8+/PD1-/CAR+及びCD8+/PD1-/CAR-の2つのサブグループ細胞における発現CD107a陽性細胞比率を示す。
さらに、多発性骨髄腫(MM)細胞の表面で発現するBCMAタンパクの細胞外部分はγ-セクレターゼ(γ-secretase)によって切断でき、可溶性BCMA(sBCMA)を形成する。可溶性BCMAはMM患者の血清で上昇し、且つ濃度が腫瘍の悪性度と正の相関がある。したがって、CAR-T細胞を標的細胞と共インキュベートするとき、培地に1μg/ml BCMAタンパクを加えて、可溶性BCMAのCAR-T細胞活性化に対する影響を評価した。
サイトカイン放出測定実験は、測定されるCAR-T細胞(5×105細胞、100μl)と標的細胞(5×105細胞、100μl)をRPMI-1640培地で24時間共インキュベートした後、細胞培養上清を収集し、そしてCBA法によりIL-2、IL-4、IL-6、IL-10、IL-17A、TNF-α、及びIFN-γなどの因子の分泌状況を測定した。
実施例4に類似する実験方法により、実施例3で調製されたレンチウイルスLV0002とLV0021を形質導入することにより、LV0002-CAR-T細胞とLV0021-CAR-T細胞を調製し、LV0021ウイルス(PXL0087プラスミドによってコードされるCAR分子に対応し、その共刺激因子が4-1BBである)とLV0002ウイルス(PXL0009プラスミドによってコードされるCAR分子に対応し、その共刺激因子がCD28である)を用いて、異なるドナーのT細胞を形質導入し、CAR-T細胞を作成した。ただし、LV0002ウイルスでドナー1のT細胞を形質導入したものをLV0002-D01-CAR-T細胞と命名し、LV0002ウイルスでドナー1のT細胞を形質導入したものをLV0002-D02-CAR-T細胞と命名し、LV0002ウイルスでドナー3のT細胞を形質導入したものをLV0002-D03-CAR-T細胞と命名し、LV0021ウイルスでドナー1のT細胞を形質導入したものをLV0021-D01-CAR-T細胞と命名し、LV0021ウイルスでドナー2のT細胞を形質導入したものをLV0021-D01-CAR-T細胞と命名し、LV0021ウイルスでドナー3のT細胞を形質導入したものをLV0021-D03-CAR-T細胞と命名した。ドナー自身のT細胞を対照とした。ドナー1からのT細胞をT細胞-D01と命名し、ドナー2からのT細胞をT細胞-D02と命名し、ドナー3からのT細胞をT細胞-D03と命名した。これらのCAR-T細胞の機能も実施例6におけるCD107a脱顆粒実験で検出し、結果は表11と図11に示される。
実施例8で調製されたCAR-T細胞LV0021-D02-CAR-Tを用いて体外殺傷機能を検出し、具体的にカルセイン蛍光法により検出できる。その検出手順は以下の通りである。BCMA陽性のU266細胞とBCMA陰性のK562細胞をそれぞれ5×105個取り、PBS+4%FBS溶液中で1×106個/mlの細胞懸濁液に再懸濁させた。そして、カルセイン(Calcein-AM)25μMでU266とK562細胞をそれぞれ標識した。標識された後のU266とK562細胞を各ウェル5000細胞の量でそれぞれU底96ウェルプレートに接種した。その後、対応するウェルに、それぞれエフェクター細胞と標的細胞の比(E:T値)が50:1、25:1、5:1である割合で、測定されるCAR-T細胞又は対照としてのT細胞を添加し、各ウェルの溶液体積が200μlであった。また、エフェクター細胞の代わりに、PBS溶液をU266又はK562細胞に加え、検出する陰性対照とした。エフェクター細胞の代わりに、細胞分解液溶液をU266又はK562細胞に加え、検出する陽性対照とした。その後、U底96ウェルプレートを遮光して37℃で3時間インキュベートし、そして各ウェルから上清溶液を抽出して(細胞を抽出しないように)蛍光検出した(励起光波長485/20nm、発光波長530/25nm)。標的細胞(U266又はK562)がエフェクター細胞によって殺され分解されてカルセインを放出する相対的な割合は下記の式で計算できる。
実施例8で調製されたドナー2からのCAR-T細胞(LV0021-D02-CAR-T)を用いて動物モデル実験を実施した。前記LV0021-CAR-T細胞をXL103-07と命名した。一方、ドナー2からのT細胞(T細胞-D02)を対照T細胞とした。各マウス2×106細胞の量で、増幅中のU266細胞を皮下注射により免疫不全NSGマウスに接種し、U266皮下担癌モデルを作った。腫瘍のサイズが100-150 mm3に達すると、表12に示されるように、担癌マウスを5組に分け、それぞれCAR-T細胞(XL103-07)、対照T細胞(T細胞-D02)、PBS、又は細胞凍結保存液(7.5%のDMSO、23%のヒトアルブミン、32.5%の複合電解質液、35%のブドウ糖注射液、および2%の生理食塩水を含む)を注射した。組み分け及び投与方法は表12に示される。
実施例10と同じCAR-T細胞XL103-07を、フロービーズアレイ法(cytometric beads array, CBA)法(具体的な方法はBDTM CBA Flex Set Reagents及びBD FACSArrayTM Bioanalyzer参照)により投与した後、マウス末梢血プラズマ中のサイトカイン(IFNγ、IL2、IL10、IL7、IL6、TNF-α)の変化を検出した。担癌マウスを、対照T細胞組、XL103-07高投与量組、XL103-07低投与量組の三組に分け、各組5匹であった。その中で、XL103-07-Hは高投与量組を表し、投与量が10×106細胞(XL103-07細胞)/動物であった。XL103-07-Lは低投与量組を表し、投与量が2×106細胞(XL103-07細胞)/動物であった。
定量PCR法により、実施例10の動物モデル担癌マウスの末梢血細胞ゲノムDNAにおけるXL103-07のCAR分子のDNAコピー数の変化を検出し、マウス体内でのCAR-T細胞の増幅状況を分析し、結果は図16に示される。類似的に、担癌マウスを、対照T細胞組、XL103-07高投与量組、XL103-07低投与量組の三組に分け、各組5匹であった。その中で、XL103-07-Hは高投与量組を表し、投与量が10×106細胞(XL103-07細胞)/動物であった。XL103-07-Lは低投与量組を表し、投与量が2×106細胞(XL103-07細胞)/動物であった。
薬学研究を通じて、安定なPXL0085プラスミド、LV0020レンチウイルスベクター、及びCART細胞の生産プロセスを取得した後、探索的臨床研究を行い、その安全性、忍容性、および初歩的な有効性を考察しながら、PK/PDの特徴を探索した。この研究は、試験サンプルの調製、研究者と研究機構、試験方法、倫理審査、及びインフォームドコンセント、被験者の登録選択と診断治療、副反応の報告と処理、試験データの集計と統計分析などの面ではGCP原則に従った。
液滴デジタルPCR法(Bio-Rad QX200説明書参照)により、実施例13の5人の被験者の末梢血におけるCARのDNAコピー数を検出し、CAR-T細胞の薬物動態特性を評価した。結果は図18に示される。投与後、製品が体内で迅速に増幅し、60日目でも検出可能であった。ほとんどの被験者体内のCAR-Tのピークまでの時間は10日程度であるが、001番被験者のピークまでの時間は17日であった。
R 3.5.0ソフトNonCompartパックで、実施例14のCARのDNAコピー数変化をさらに分析し、薬物動態の関連パラメーターを計算し、結果は表13に示される。表13において、T0は最初に非ゼロ濃度が観測された時間を表し、ピーク薬物濃度(Cmax)は薬品濃度が達する最大ピーク値を表し、ピークまでの時間(Tmax)はピーク薬物濃度に達するのに必要な時間を表し、AUC(0-28)は0から28日の曲線下の積分面積を表し、AUC(0-CLST)は0から最後の観察時間までの曲線下の積分面積を表す。
Claims (30)
- キメラ抗原受容体(CAR)であって、
前記CARは、BCMAに特異的に結合する抗体又はその断片を含むBCMA結合ドメインと、膜貫通ドメインと、共刺激ドメインと、細胞内シグナル伝達ドメインとを含み、前記抗体は、重鎖相補性決定領域1(HCDR1)と、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)と、重鎖相補性決定領域3(HCDR3)とを含み、前記HCDR1のアミノ酸配列はSEQ ID NO:9に示され、前記HCDR2のアミノ酸配列はSEQ ID NO:10に示され、且つ前記HCDR3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:11に示される
前記CAR。 - 前記抗体は、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)と、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)と、軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)とを含み、前記LCDR1のアミノ酸配列はSEQ ID NO:17に示され、前記LCDR2のアミノ酸配列はSEQ ID NO:18に示され、前記LCDR3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:19に示される請求項1に記載の前記CAR。
- 前記抗体は、アミノ酸配列がSEQ ID NO:7に示される重鎖可変領域を含む請求項1〜2のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記抗体は、アミノ酸配列がSEQ ID NO:15に示される軽鎖可変領域を含む請求項1〜3のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記抗体は単鎖抗体である請求項1〜4のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記抗体は、SEQ ID NO: 43に示されるアミノ酸配列を含む請求項1〜5のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記膜貫通ドメインは、T細胞受容体のα、β又はζ鎖、CD28、CD3e、CD45、CD4、CD5、CD8a、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、及びCD154からなる群より選ばれるタンパクに由来する膜貫通ドメインを含む請求項1〜6のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記膜貫通ドメインは、SEQ ID NO:27に示されるアミノ酸配列を含む請求項1〜7のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記共刺激ドメインは、CD28、4-1BB、OX-40、及びICOSからなる群より選ばれるタンパクに由来する共刺激ドメインを含む請求項1〜8のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記共刺激ドメインは、SEQ ID NO:29又はSEQ ID NO:31に示されるアミノ酸配列を含む請求項1〜9のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζ由来のシグナル伝達ドメインを含む請求項1〜10のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインは、SEQ ID NO:33に示されるアミノ酸配列を含む請求項1〜11のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記CARはさらに前記BCMA結合ドメインと前記膜貫通ドメインを接続するヒンジ領域を含む請求項1〜12のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記ヒンジ領域は、SEQ ID NO:25に示されるアミノ酸配列を含む請求項13に記載の前記CAR。
- 前記CARはシグナルペプチドも接続する請求項1〜14のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記シグナルペプチドは、SEQ ID NO:3に示されるアミノ酸配列を含む請求項15に記載の前記CAR。
- 前記CARは、切断ペプチドも接続する請求項1〜16のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 前記切断ペプチドは、T2Aペプチド由来のアミノ酸配列を含む請求項17に記載の前記CAR。
- 前記切断ペプチドは、SEQ ID NO:35に示されるアミノ酸配列を含む請求項17〜18のいずれか一項に記載の前記CAR。
- SEQ ID NO:49又はSEQ ID NO:51に示されるアミノ酸配列を含む請求項1〜19のいずれか一項に記載の前記CAR。
- 請求項1〜20のいずれか一項に記載のCARをコードする単離された核酸分子。
- SEQ ID NO:50又はSEQ ID NO:52に示される核酸配列を含むCARをコードする単離された核酸分子。
- 請求項21〜22のいずれか一項に記載の核酸分子を含むベクター。
- 前記ベクターは、プラスミド、レトロウイルスベクター、及びレンチウイルスベクターから選ばれるものである請求項23に記載のベクター。
- 請求項1〜20のいずれか一項に記載の前記CAR、請求項21〜22のいずれか一項に記載の核酸分子、又は請求項23〜24のいずれか一項に記載のベクターを含む免疫エフェクター細胞。
- 前記免疫エフェクター細胞は、Tリンパ球及びナチュラルキラー(NK)細胞から選ばれるものである請求項25に記載の細胞。
- 免疫エフェクター細胞に請求項26に記載のベクターを導入することを含む免疫エフェクター細胞を調製する方法。
- 請求項25〜26のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞を含む組成物。
- 請求項1〜20のいずれか一項に記載の前記CAR、請求項21〜22のいずれか一項に記載の核酸分子、請求項23〜24に記載のベクター、又は請求項26〜27のいずれか一項に記載の免疫エフェクター細胞のBCMAの発現に関連する疾患又は病症の治療用医薬品の調製のための用途。
- 前記BCMAの発現に関連する疾患又は病症は癌又は悪性腫瘍である請求項29に記載の用途。
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