DE4220759A1 - DNA-Sequenzen für Oligosaccharid-Transporter, Plasmide, Bakterien und Pflanzen enthaltend einen Transporter sowie Verfahren zur Herstellung und Transformation von Hefestämmen zur Identifikation des Transporteers - Google Patents
DNA-Sequenzen für Oligosaccharid-Transporter, Plasmide, Bakterien und Pflanzen enthaltend einen Transporter sowie Verfahren zur Herstellung und Transformation von Hefestämmen zur Identifikation des TransporteersInfo
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Description
Die vorliegende Erfindung betrifft DNA-Sequenzen, die die
Kodierregion eines Oligosaccharid-Transporters enthalten, deren
Einführung in ein pflanzliches Genom die Bildung und Weiterleitung
von Speicherstoffen in transgenen Pflanzen verändern, Plasmide,
Bakterien und Pflanzen enthaltend diese DNA-Sequenzen sowie ein
Verfahren zur Herstellung und Transformation von Hefestämmen, die
der Identifikation der erfindungsgemäßen DNA Sequenzen
pflanzlicher Oligosaccharid-Transporters ermöglichen.
Der wichtigste Transportmetabolit für gespeicherte Energie ist bei
vielen Pflanzen, beispielsweise der Kartoffel, die Saccharose, ein
Disaccharid aus Glukose und Fruktose. Bei anderen Spezies können
andere Oligosaccharide diese Rolle einnehmen. Bei der japanischen
Artischocke ist dies beispielsweise die Stachiose.
Die zentrale Stellung der Transport-Oligosaccharide im
Energiehaushalt der Pflanze wurde bereits an transgenen Pflanzen
gezeigt, bei denen durch Expression einer Invertase, die
Saccharose in die Monosaccharide spaltet, erhebliche Veränderungen
im Habitus herbei geführt wurden (EP 442 592). Wegen der Bedeutung
der Saccharose bei der Bildung von Speicherstoffen sind zahlreiche
Versuche unternommen worden, in die Biosynthese oder den
Metabolismus des Disaccharids einzugreifen. Aus der DE 42 13 444
ist die Verbesserung der Lagereigenschaften von Ernteteilen
transgener Kartoffeln, bei denen durch Expression einer
apoplastischen Invertase die Weiterleitung von energiereichen
Verbindungen an die heterotrophen Orte des Sproßwachstums
unterbunden ist, bekannt.
Trotz der vielfältigen Bemühungen, den Mechanismus der Verteilung
von Speicherstoffen wie Oligosaccharide in Pflanzen aufzuklären
und zu beeinflussen, ist bisher nicht bekannt, wie die in den
Blättern in der Folge der Photosyntheseprozesse gebildete
Saccharose in die Leitungsbahnen des Phloems der Pflanze gelangt
und wie sie von den Speicherorganen, z. B. den Knollen von
Kartoffelpflanzen oder den Samen, aufgenommen wird. An isolierten
Plasmalemma-Membranen von Zellen des Blattgewebes der Zuckerrübe
Beta vulgaris wurde demonstriert, daß der Transport von Saccharose
durch die Membran bei Erzeugen eines künstlichen pH-Gradienten
induziert und durch Erzeugen eines elektrochemischen Potentials
intensiviert werden kann (Lemoine & Delrot (1989) FEBS letters
249: 129-133). Der Membrandurchtritt der Saccharose folgt einer
Michaelis-Menten-Kinetik, der km Wert des Saccharose-Transports
beträgt etwa 1 mM (Slone & Buckhout, 1991, Planta 183 : 484-589).
Diese Art der Kinetik läßt auf die Beteiligung eines Transporter-
Proteins schließen. Untersuchungen an Plasmalemma-Membranen von
Zuckerrübe, Ricinus communis und Cyclamen persicum weisen darauf
hin, daß es sich beim Saccharosetransport um einen Kotransport mit
Protonen handelt (Buckhout, 1989, Planta 178 : 393-399; Williams et
al., 1990, Planta 182 : 540-545; Grimm et al., 1990, Planta 182:
480-485). Die Stöchiometrie des Kotransports beträgt 1 : 1 (Bush,
1990, Plant Physiol 93: 1590-1596). Es werden jedoch auch
Mechanismen diskutiert, die von einen Transport der Saccharose
durch die Plasmodesmen der Pflanzenzellen ausgehen (Robards &
Lucas, 1990, Ann Rev Plant Physiol 41: 369-419). Trotz der
Hinweise auf die Existenz eines aktiven Transportsystems, das den
Zellen erlaubt, Saccharose an die Leitungsbahnen abzugeben, ist
ein Protein mit derartigen Eigenschaften bisher nicht bekannt. Bei
N-Ethylmaleinimid-Markierung von Plasmalemma-Proteinen der
Zuckerrübe in Gegenwart und Abwesenheit von Saccharose erhielten
Gallet et al. (1989, Biochem Biophys Acta 978: 56-64) Hinweise
darauf, daß ein Protein der Größe 42 kDa mit Saccharose
interagieren kann. Antikörper gegen eine Fraktion von Plasmalemma-
Proteinen dieses Größenbereichs können den Saccharose-Transport
durch Plasmalemma-Membranen inhibieren (Lemoine et al., 1989,
Bichem Biophys Acta 978: 65-71). Im Gegensatz hierzu erhielten
Ripp et al., 1988, Plant Physiol 88: 1435-1445) bei
Photoaffinitätsmarkierung von Proteinen aus Sojabohne mit dem
Saccharoseanalogon Desoxy-azido-hydroxy-benzamido-Saccharose
Hinweise auf die Beteiligung eines 62 kDa Proteins am Transport der
Saccharose durch Membranen. Eine Aminosäuresequenz eines
Saccharose-Transporters ist nicht bekannt.
Es werden nun DNA-Sequenzen beschrieben, die die Kodierregion
eines Oligosaccharid-Transporters enthalten, und deren in der
Nukleotidabfolge enthaltene Information bei Sequenzintegration in
ein pflanzliches Genom die Bildung von Ribonukleinsäuren erlaubt,
mit deren Hilfe eine neue Oligosaccharid-Transporter-Aktivität in
Pflanzenzellen eingeführt werden oder eine endogene
Oligosaccharid-Transporter-Aktivität unterdrückt werden kann.
Unter einem Oligosaccharid-Transporter ist z. B. ein Saccharose-
Transporter aus Pflanzen wie Spinat oder Kartoffel zu verstehen.
Die Identifikation der Kodierregion der Oligosaccharid-Transporter
wird über ein Verfahren durchgeführt, das die Isolation von
pflanzlichen DNA-Sequenzen, die Transporter-Moleküle kodieren,
mittels Expression in spezifischen Mutanten der Hefe Saccharomyces
cerevisiae erlaubt. Hierzu müssen geeignete Hefe-Mutanten
verfügbar sein, die nicht in der Lage sind, eine Substanz
aufzunehmen, für die aus einer pflanzlichen Genbank die
Kodierregion eines Transporter-Moleküls isoliert werden soll. Es
ist bereits ein Verfahren zur Komplementation einer Kalium-
Transport Defizienz in Hefe-Mutanten bekannt (Anderson et al.,
1992, Proc NStl Acad Sci USA 89 : 3736-3740). Hierbei werden mit
Hilfe von Expressionsvektoren für Hefen cDNA Sequenzen zu
pflanzlicher mRNA in den Hefe-Mutanten exprimiert. Diejenigen
Hefen, die nun in der Lage sind, die zu transportierende Substanz
in die Zellen aufzunehmen, enthalten die Kodierregionen für ein
Transporter-Molekül im Expressionsvektor. Das bekannte Verfahren
ist zur Identifikation von Kodierregionen für Saccharose-
Transporter jedoch nicht anwendbar, da Hefen keinen endogenen
Saccharose-Transporter besitzen, der durch Mutation ausgeschaltet
werden könnte. Hefen kodieren eine sezernierbare Invertase, die
extrazellulär Saccharose spaltet, so daß von der Zelle Hexosen über
einen Hexosetransporter aufgenommen werden können.
Für die Herstellung und Transformation von Hefestämmen, die der
Identifikation pflanzlicher Oligosaccharid-Transporter dienen,
wird nun
- a) zunächst ein Hefestamm mit einem defekten suc2 Gen, der keine Invertase sezernieren kann, durch homologe Rekombination hergestellt und daraus anschließend
- b) durch Transformation mit einem Gen für eine Saccharose- Synthase-Aktivität aus pflanzlichen Zellen ein Hefestamm, der intrazellulär Saccharose spalten kann, gewonnen und
- c) durch Transformation dieses Stammes mit einer pflanzlichen cDNA Bibliothek in einen Expressionsvektor für Hefezellen die DNA- Sequenz identifiziert, die für einen pflanzlichen Oligosaccharid- Transporter kodiert.
Die über dieses Verfahren erhältlichen Hefestämme zur
Identifikation von pflanzlichen Oligosaccharid-Transportern sind
z. B. die Hefestämme YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106) und YSH 2.64-1A-
INV (DSM 7105).
Mit dem Hefestamm YSH 2.64-1A-SUSY kann eine DNA-Sequenz für einen
pflanzlichen Saccharose-Transporter identifiziert werden, die die
folgende Sequenz aufweist:
Die identifizierten DNA-Sequenzen können in Plasmide eingebracht
und dabei mit Steuerelementen für Expression in eukaryontischen
Zellen kombiniert werden. Derartige Steuerelemente sind einerseits
Transkriptions-Promotoren und andererseits Transkriptions-
Terminatoren. Mit den Plasmiden können eukaryontische Zellen
transformiert werden mit dem Ziel der Expression einer
translatierbaren mRNA, die die Synthese eines Saccharose-
Transporters in den Zellen ermöglicht, oder mit dem Ziel der
Expression einer nicht translatierbaren RNA, die die Synthese
eines endogenen Saccharose-Transporters verhindert. Durch
Expression einer RNA entsprechend der erfindungsgemäßen Sequenz
eines pflanzlichen Oligosaccharid-Transporters ist eine
Veränderung des pflanzlichen Kohlenhydratmetabolismus möglich,
deren wirtschaftliche Bedeutung darin liegt, daß die Verbesserung
der Weiterleitung von Speicherstoffen an Ernteteile zu einer
Ertragssteigerung von Nutzpflanzen führt. Die Möglichkeit der
Unterdrückung von Speicherstoffaufnahme in einzelne Organe erlaubt
die Veränderung der Gestalt einer Pflanze, indem das Wachstum
einzelner Gewebe verlangsamt wird - beispielsweise von Blüten,
während das Wachstum von Ernteteilen begünstigt wird. Hierbei ist
an eine Verlängerung der Vegetationsphase von Kulturpflanzen zu
denken, die zu einer vermehrten Bildung von Speicherstoffen führt.
Es sind bereits Verfahren zur genetischen Modifikation dikotyler
und monokotyler Pflanzen bekannt (vgl. u. a. Gasser, C.S.,
Fraley, R.T., 1989, Sience 244 : 1293-1299; Potrykus, 1991, Ann Rev
Plant Mol Biol Plant Physiol 42: 205-225). Zur Expression der
kodierenden Sequenzen in Pflanzen müssen diese mit
transkriptionell regulatorischen Elementen verknüpft werden.
Solche Elemente, Promotoren genannt, sind bekannt (u. a.
EP 375 091). Ferner müssen die Kodierregionen mit einem
Transkriptionsterminations-Signal versehen werden, damit sie
korrekt transkribiert werden können. Derartige Elemente sind
ebenfalls beschrieben (vgl. Gielen et al., 1989, EMBO J 8 : 23-29).
Der transkriptionelle Startbereich kann sowohl nativ bzw. homolog
als auch fremdartig bzw. heterolog zur Wirtspflanze sein.
Terminationsbereiche sind gegeneinander beliebig austauschbar. Die
DNA-Sequenz der Transkriptionsstart- und -terminationsregionen
kann synthetisch hergestellt oder natürlich gewonnen sein oder
eine Mischung aus synthetischen und natürlichen DNA-Bestandteilen
enthalten. Zur Vorbereitung der Einführung fremder Gene in höhere
Pflanzen sind eine große Anzahl Klonierungsvektoren verfügbar, die
ein Replikationssignal für E. coli und einen Marker beinhalten,
der eine Selektion der transformierten Zellen erlaubt. Beispiele
für Vektoren sind pBR 322, pUC-Serien, M13 mp-Serien, pACYC 184
usw. Je nach Einführungsmethode gewünschter Gene in die Pflanze
können weitere DNA-Sequenzen erforderlich sein. Werden z. B. für
die Transformation der Pflanzenzelle das Ti- oder Ri-Plasmid
verwendet, so muß mindestens die rechte Begrenzung, häufig jedoch
die rechte und die linke Begrenzung der Ti- und Ri-Plasmid T-DNA,
als Flankenbereich den einzuführenden Genen angefügt werden. Die
Verwendung von T-DNA für die Transformation von Pflanzenzellen ist
intensiv untersucht und ausreichend in EP 120 516; Hoekema, In:
The Binary Plant Vektor System, Offset-drukkerÿ Kanters B.V.
Alblasserdam, (1985), Chapter V; Fraley, et al., Crit. Rev. Plant
Sci., 4: 1-46 und An et al. (1985) EMBO J. 4 : 277-287 beschrieben
worden. Ist die eingeführte DNA einmal im Genom integriert, so ist
sie dort in der Regel stabil und bleibt auch in den Nachkommen der
ursprünglich transformierten Zelle erhalten. Sie enthält
normalerweise einen Selektionsmarker, der den transformierten
Pflanzenzellen Resistenz gegenüber einem Biozid oder einem
Antibiotikum wie Kanamycin, G 418, Bleomycin, Hygromycin oder
Phosphinotricin u. a. vermittelt. Der individuell verwendete Marker
sollte daher die Selektion transformierter Zellen gegenüber
Zellen, denen die eingefügte DNA fehlt, gestatten.
Für die Einführung von DNA in eine pflanzliche Wirtszelle stehen
neben der Transformation mit Hilfe von Agrobakterien viele andere
Techniken zur Verfügung. Diese Techniken umfassen die Fusion von
Protoplasten, die Mikroinjektion von DNA, die Elektroporation
sowie ballistische Methoden und Virusinfektion. Aus dem
transformierten Pflanzenmaterial können dann in einem geeigneten
Medium, welches Antibiotika oder Biozide zur Selektion enthalten
kann, wieder ganze Pflanzen regeneriert werden. Die so erhaltenen
Pflanzen können dann auf Anwesenheit der eingeführten DNA getestet
werden. Bei der Injektion und Elektroporation sind an sich keine
speziellen Anforderungen an die Plasmide gestellt. Es können
einfache Plasmide wie z. B. pUC-Derivate verwendet werden. Sollen
aber aus derartig transformierten Zellen ganze Pflanzen
regeneriert werden, ist die Anwesenheit eines selektierbaren
Markergens notwendig. Die transformierten Zellen wachsen innerhalb
der Pflanzen in der üblichen Weise (siehe auch McCormick et
al. (1986) Plant Cell Reports 5: 81-84). Diese Pflanzen können
normal angezogen werden und mit Pflanzen, die die gleiche
transformierte Erbanlage oder andere Erbanlagen besitzen, gekreuzt
werden. Die daraus entstehenden hybriden Individuen haben die
entsprechenden phänotypischen Eigenschaften.
Die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen können auch in Plasmide
eingebracht und dabei mit Steuerelementen für eine Expression in
prokaryontischen Zellen kombiniert werden. Die Bildung einer von
Bakterien translatierbaren RNA Sequenz eines eukaryontischen
Saccharose-Transporters führt trotz der erheblichen Unterschiede
in den Membranstrukturen von Pro- und Eukaryonten überraschend
dazu, daß Prokaryonten nun Saccharose aufnehmen können. ,Dies
ermöglicht die Produktion von technisch interessanten
Bakterienstämmen, die auf dem sehr preisgünstigen Substrat
Saccharose wachsen können (s. Ausführungsbeispiel 5).
Beispielsweise ist die Produktion von Poly-Hydroxy-Buttersäure im
Bakterienstamm Alkaligenes eutrophus beschrieben (Steinbüchel &
Schubert, 1989, Arch Microbiol 153 : 101-104). Das Bakterium nutzt
jedoch nur eine sehr begrenzte Auswahl von Substraten. Die
Expression eines Gens für einen Saccharose-Transporter u. a. in
Alkaligenes eutrophus wäre daher von großem Interesse.
Die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen können auch in Plasmide
eingebracht werden, die eine Mutagenese oder eine
Sequenzveränderung durch Rekombination von DNA-Sequenzen in
prokaryontischen oder eukaryontischen Systemen erlauben. Dadurch
kann die Spezifität des Saccharose-Transporters verändert werden.
Durch Veränderung der Spezifität des Saccharose-Transport-Systems
ist der Transport neuer Verbindungen in eukaryontische oder aber
in prokaryontische Zellen möglich, die weitere interessante
Möglichkeiten erschließt. Beispielsweise kann im Falle von
pflanzlichen Zellen ebenso an den Transport von Pestiziden wie
auch von Substraten für Stoffwechselreaktionen der Pflanze gedacht
werden. Mit Hilfe von Standard-Verfahren (vgl. Sambrook et al.,
1989, Molecular cloning: A laboratory manual, 2. Aufl., Cold
Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA) können Basenaustausche
vorgenommen oder natürliche oder synthetische Sequenzen
hinzugefügt werden. Für die Verbindung der DNA-Fragmente
untereinander können an die Fragmente Adaptoren oder linker
angesetzt werden. Ferner können Manipulationen, die passende
Restriktionsschnittstellen bereitstellen oder die überflüssige DNA
oder Restriktionsschnittstellen entfernen, eingesetzt werden. Wo
Insertionen, Deletionen oder Substitutionen wie z. B. Transitionen
und Transversionen in Frage kommen, können in vitro-Mutagenese,
"primerrepair", Restriktion oder Ligation verwendet werden. Als
Analysemethode werden im allgemeinen eine Sequenzanalyse, eine
Restriktionsanalyse und weitere biochemisch-molekularbiologische
Methoden durchgeführt. Nach jeder Manipulation kann die verwendete
DNA-Sequenz gespalten und mit einer anderen DNA-Sequenz verbunden
werden. Jede Plasmid-Sequenz kann in den gleichen oder anderen
Plasmiden kloniert werden.
Ferner können die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen dazu genutzt
werden, nach Standard-Verfahren aus dem Genom von Pflanzen
verschiedener Spezies ähnliche Sequenzen zu isolieren, die
ebenfalls Saccharose- oder andere Oligosaccarid-
Transportermoleküle kodieren. Mit diesen Sequenzen können
Konstruktionen zur Transformation von Pflanzenzellen hergestellt
werden, die Transportvorgänge in den transgenen Pflanzen
verändern.
Um verwandte DNA-Sequenzen zu bestimmen, muß man zunächst
Genbanken anlegen, die für den Gehalt von Genen einer Pflanzenart
oder für die Expression von Genen in einer Pflanzenart
repräsentativ sind. Erstere sind genomische, letztere sind cDNA-
Banken. Aus diesen können mit Hilfe der erfindungsgemäßen DNA-
Sequenzen als Sonde verwandte Sequenzen isoliert werden. Hat man
die dazugehörigen Gene identifiziert und isoliert, ist eine
Bestimmung der Sequenz und eine Analyse der Eigenschaften der von
dieser Sequenz kodierten Proteine erforderlich.
Zum besseren Verständnis der dieser Erfindung zugrundeliegenden
Ausführungsbeispiele werden die wichtigsten, eingesetzten
Verfahren im folgenden erläutert.
Zur Klonierung wurden der Phage Lamba ZAP II sowie der Vektor
pBluescriptSK (Short et al., 1988, Nucl Acids Res 16 : 7583-7600)
verwendet.
Für die Transformation von Hefen wurden die Vektoren YIplac 128
und YEplac 112 verwendet (Gietz & Sugino, 1988, Gene 74 : 527-534).
Für die Pflanzentransformation wurden die Genkonstruktionen in
den binären Vektor pBinAR (Höfgen & Willmitzer, 1990, Plant Sci
66 : 221-230) kloniert.
Für den pBluescriptSK Vektor sowie für pBinAR-Konstrukte wurde
der E. coli-Stamm XL1blue (Bullock et al., 1987, Biotechniques, 5,
376-378) verwendet.
Als Ausgangsstamm für die Erzeugung des erfindungsgemäßen
Hefestammes YSH 2.64-1A-susy wurde der Stamm YSH 2.64-1A (Gozalbo
& Hohmann, 1990, Curr Genet 17 : 77-79) verwendet.
Die Transformation der Plasmide in die Kartoffelpflanze wurde
mit Hilfe des Agrobacterium tumefaciens-Stammes LBA4404 (Bevan
(1984) Nucl. Acids Res 12 : 8711-8720) durchgeführt.
Der Transfer der DNA in die Agrobakterien erfolgt durch direkte
Transformation nach der Methode von Höfgen & Willmitzer (1988,
Nucleic Acids Res 16: 9877). Die Plasmid-DNA transformierter
Agrobakterien wurde nach der Methode von Birnboim & Doly (1979,
Nucl Acids Res 7: 1513-1523) isoliert und nach geeigneter
Restriktionsspaltung gelelektrophoretisch analysiert.
Zehn kleine, mit einem Skalpell verwundete Blätter einer
Kartoffel-Sterilkultur wurden in 10 ml MS-Medium mit 2% Saccharose
gelegt, welches 30-50 µl einer unter Selektion gewachsenen
Agrobacterium tumefaciens-Übernachtkultur enthielt. Nach 3-5
minütigem, leichtem Schütteln wurden die Blätter auf MS-Medium mit
1,6% Glukose, 2 mg/l Zeatinribose, 0,02 mg/l Naphthylessigsäure,
0,02 mg/l Giberellinsäure, 500 mg/l Claforan, 50 mg/l Kanamycin und
0,8% Bacto Agar ausgelegt. Nach einwöchiger Inkubation bei 25°C
und 3000 Lux wurde die Claforankonzentration im Medium um die
Hälfte reduziert.
Am 12.06.1992 wurden bei der Deutschen Sammlung von Mikroorganis
men (DSM) in Braunschweig, Bundesrepublik Deutschland, folgende
Plasmide und Hefestämme hinterlegt (Hinterlegungsnummer):
Plasmid pSK-S21 (DSM 7115)
Hefestamm YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106)
Hefestamm YSH 2.64-1A-INV (DSM 7105).
Plasmid pSK-S21 (DSM 7115)
Hefestamm YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106)
Hefestamm YSH 2.64-1A-INV (DSM 7105).
Fig. 1 Zeitverlauf der Aufnahme von Saccharose in Hefe-Zellen.
"pmol/mg Zellen"=Menge der aufgenommenen 14C-markierten
Saccharose in pmol, bezogen auf das Naßgewicht der Hefezellen
in mg; "112"=Ausgangsstamm (ohne Transporter); "+Glukose"=
Vorinkubation der Zellen in Medium mit 10 mM Glukose; "-Glukose"
=keine Vorinkubation der Zellen; "2,5 µMCCCP"=Koinkubation
mit dem Inhibitor Carbonyl-cyanid-m-chlorphenylhydrazon (CCCP)
in der Konzentration 2,5 µM; "500 µMPCMBS"=Koinkubation mit dem
Inhibitor Parachlormercuribenzolsulfonsäure (PCMBS) in der
Konzentration 500 µM; "10 µM Antimycin"=Koinkubation mit dem
Inhibitor Antimycin in der Konzentration 10 µM.
Fig. 2 Klonierung des Plasmids pMA5-INV. Darstellung der
Insertion des 2,4 kb großen HindIII Fragments aus pSEYC 306-1 in
pMA5-10.
Die nachfolgenden Ausführungsbeispiele beschreiben die Herstellung
der Hefestämme, die Identifikation sowie die Funktion und
Verwendung eines pflanzlichen Saccharose-Transporters.
Der Hefestamm YSH 2.64-1A hat die Eigenschaften suc2-, ma10, leu2,
trp1 (Gozalbo & Hohmann, 1990, Curr Genet 17 : 77-79). Um in diesen
Stamm eine enzymatische Aktivität zur Spaltung von Saccharose
einzuführen, wurde er mit dem integrativen Plasmid YIplac128A2-
SUSY transformiert, das die Kodierregion der Saccharose-Synthase
von Kartoffel als Fusion an den Promotor des Gens für
Alkoholdehydrogenase aus Hefe enthält. Das Plasmid YIplac 128A2-
SUSY wurde wie folgt hergestellt. Das Plasmid YIplac128 (Gietz &
Sugino, 1988, Gene 74: 527-534) wurde durch Schnitte mit PstI und
EcoRI, Abbau bzw. Auffüllen überhängender Einzelstränge und
Ligation im Bereich des polylinkers verkürzt. In die verbliebene
SphI Schnittstelle wurde eine 728 bp Kassette mit dem Promotor der
Alkoholdehydrogenase aus dem Plasmid pVT102U (Vernet et al., 1987,
Gene 52: 225-233) insertiert. Dabei wurde YIplac128A2 erhalten.
Die Kodierregion der Saccharose-Synthase wurde durch Polymerase-
Kettenreaktion mit den Oligonukleotiden SUSY1 und SUSY2
(GAGAGAGGATCCTGCAATGGCTGAACGTGTTTTGACTCGTG bzw. GAGAGAGGATCCTTCAT
TCACTCAGCAGCCAATGGAACAGCT) an einem Lambda-Klon der Saccharose-
Synthase aus Kartoffel (Salanoubat & Belliard, 1987, Gene 60: 47-
56) amplifiziert. Aus dem Produkt wurde die Kodierregion als BamHI
Fragment präpariert und in die BamHI Schnittstelle des polylinkers
der Kassette insertiert. Mit dem so hergestellten Plasmid
YIplac128A2-SUSY wurde der Hefestamm YSH 2.64-1A transformiert. Da
das Plasmid nicht die 2µ Region trägt, kann es in Hefe nicht
autonom replizieren. Deshalb erhalten nur solche Transformanden
die Leucin-Auxotrophie, die die Plasmid-DNA zumindest teilweise
chromosomal integrieren.
Leucin autotrophe Kolonien wurden auf Expression des Saccharose-
Synthase Gens hin analysiert. Hierzu wurden Zellen einer 5 ml
Flüssigkultur unter Zusatz von Glasperlen durch starkes Schütteln
aufgeschlossen, anschließend wurde nach Zentrifugation
Gesamtprotein aus dem Überstand für eine Enzymaktivitätsmessung
eingesetzt. Die Aktivität der exprimierten Saccharose-Synthase
beträgt 25 mU/mg Protein.
Analog wurde eine Invertase-Aktivität in den Hefestamm YSH 2.64-1A
eingeführt, indem mit Hilfe des Plasmids YIplac128A1-INV ein Gen
für eine cytosolische, nicht sezernierbare Invertase chromosomal
ins Hefegenom integriert wurde. YIplac128A1-INV enthält anstelle
der Kodierregion für Saccharose-Synthase ein Invertase-Gen, dem
die Signalsequenz für Export des Genprodukts fehlt. Der Vorläufer
des Plasmids ist das Plasmid YIplac128A1, das sich von YIplac128A2
in der Orientierung des polylinkers in der Kassette mit dem
Promotor des Alkoholdehydrogenase-Gens unterscheidet. Die Kassette
für dieses Plasmid stammt aus dem Plasmid pVT100U (Vernet et al.,
1987, Gene 52 : 225-233). Mit den Oligonukleotiden INV3 und INV4
(GAGCTGCAGATGGCAAACGAAACTAGCGATAGACCTTTGGTCACA bzw.
GAGACTAGTTTATAACCTCTATTTTACTTCCCTTACTTGGAA) wurde die Kodierregion
der Invertase durch eine Polymerase-Kettenreaktion an DNA des suc2
Gens gewonnen. Die Kodierregion wurde als PstI/SpeI Fragment in
den mit Hilfe von PstI und XbaI linearisierten Vektor YIplac128A1
ligiert. Ein Test der enzymatischen Aktivität der in der Hefezelle
exprimierten Invertaseaktivität ergab eine Enzymaktivität von
68 mU/mg Gesamtprotein aus Hefezellen.
Klonierung der cDNA eines pflanzlichen Saccharose-Transporters
Von polyadenylierter RNA aus Blattgewebe erwachsener
Spinatpflanzen wurde eine cDNA Bibliothek im Phagen Lambda ZAP 11
angelegt. Von 500 000 Pfu wurde die Phagen-DNA präpariert und über
einen Cäsiumchlorid-Sarcosyl-Gradienten gereinigt. Nach Schneiden
der Phagen-DNA mit dem Enzym NotI wurden Insertionen aus den
Größenbereichen über und unter 1,5 kbp aus einem 1%igen Agarosegel
präpariert und in die NotI Schnittstelle des Expressionsvektors
YEplac112A1NE ligiert. Der Vektor ist ein Derivat des Vektors
YEplac 112 (Gozalbo & Hohmann, 1990, Curr Genet 17 : 77-79), bei
dem wie in Ausführungsbeispiel 1 beschrieben der polylinker gegen
eine Kassette mit dem Promotor des Alkoholdehydrogenasegens
ausgetauscht wurde. Der polylinker der Kassette wurde durch
Schneiden mit den Enzymen PstI und XbaI wiederum entfernt und
gegen ein doppelsträngiges Oligonukleotid ersetzt, das eine NotI
und eine EcoRI Schnittstelle einführt (Sequenz:
GATCCGCGGCCGCCCGGAATTCTCTAGACTGCA). Etwa 90 000 Klone für den
Größenbereich unter 1,5 kbp und etwa 40 000 Klone für den
Größenbereich über 1,5 kbp wurden bei Transformation in E.coli
erhalten. Von diesen wurde Plasmid-DNA präpariert. Vierzehn mal
wurden 2 µg DNA in den Hefestamm YSH2.64-1A suc-.susy
transformiert. Transformanden wurden auf Medium mit 2% Glukose
angezogen, und jeweils fünf- bis zehntausend wurden mit
Flüssigmedium von Agarplatten abgespült und auf Saccharose
haltiges Medium ausplattiert. Solche Kolonien, die schneller
wachsen konnten, wurden weiter analysiert. Die Insertion in den
Vektor YEplac112A1NE des Transformanden S21 (YEplac112A1NE-S21)
wurde sequenziert. Die Sequenz ist oben wiedergegeben.
Der Hefe-Transformand YEplac112A1NE-S21, der entsprechend
Ausführungsbeispiel 2 erhalten wurde, wurde in Flüssigmedium
angezogen, bis die Kultur die logarithmische Phase erreicht hatte.
Nach Zentrifugation der Kultur wurden die Zellen in Medium mit
Glukose einer Vorinkubation für 5 Minuten unterzogen und dann in
Medium mit 14C-markierter Saccharose aufgenommen. Die Aufnahme der
markierten Saccharose wurde nach dem von Cirillo (1989, Meth
Enzymol 174: 617-622) beschriebenen Verfahren gemesssen. Die
Aufnahme der markierten Saccharose wurde derjenigen ohne
Vorinkubation mit Glukose sowie denjenigen bei Koinkubation mit
den Inhibitoren Carbonyl-cyanid-m-chlorphenylhydrazon (CCCP),
Parachlormercuribenzolsulfonsäure (PCMBS) und Antimycin
verglichen. Der Zeitverlauf ist in Fig. 1 wiedergegeben. Die
berechnete Reduktion der Saccharoseaufnahme durch Inhibitoren ist
in der Tabelle I aufgeführt. Ein Kompetitionsexperiment mit
verschiedenen Zuckern als Kompetitor der markierten Saccharose,
aus dem die Spezifität des Transporters abgelesen werden kann,
zeigt Tabelle II.
Um aufgenommene Saccharose metabolisieren zu können, benötigen
Bakterienzellen eine enzymatische Aktivität zur Spaltung in die
Monosaccharide. Zur Einführung einer solchen Aktivität wurden
Bakterien mit dem Plasmid pMA5-INV transformiert und bezüglich der
Invertase-Aktivität untersucht. Das Plasmid pMA5-INV wurde wie
folgt hergestellt. Das Plasmid pMA5-10 (Stanssens et al., 1989,
Nucl Acids Res 17 : 4441-4454) wurde an der HindIII Schnittstelle
des polylinkers linearisiert. In die HindIII Schnittstelle wurde
das 2,4 kb HindIII Fragment des Plasmids pSEYC306-1 (Taussig &
Carlson, 1983, Nucl Acids Res 11: 1943-1954) kloniert. Den
entsprechenden Ausschnitt des Plasmids zeigt Fig. 2. Die
enzymatische Aktivität der Invertase in Bakterienzellen, die mit
dem Plasmid pMA5-INV transformiert wurden, wurde nach bekannten
Methoden in einem gelelektrophoretischen Aktivitätstest bestimmt.
Die Möglichkeit der Bildung eines funktionalen Saccharose-
Transporters durch Expression einer pflanzlichen cDNA in
Bakterienzellen wurde durch Transformation von E. coli mit dem
Plasmid pSK-521 untersucht. Das Plasmid ist in Ausführungsbeispiel
3 beschrieben. Nach Transformation von Bakterienzellen mit pSK-S21
wurden Untersuchungen der Saccharose-Aufnahme durchgeführt.
Claims (18)
1. DNA-Sequenzen, die die Kodierregion eines Oligosaccharid-
Transporters enthalten, dadurch gekennzeichnet, daß die in der
Nukleotidabfolge enthaltende Information bei Integration in ein
pflanzliches Genom die Bildung von Ribonukleinsäure erlaubt und über
diese Ribonukleinsäure eine neue Oligosaccharid-Transporter-
Aktivität in Pflanzenzellen eingeführt werden kann oder eine
endogene Oligosaccharid-Transporter-Aktivität unterdrückt werden
kann, womit die Bildung und Weiterleitung von Speicherstoffen
verändert wird.
2. Eine DNA-Sequenz gemäß Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß
sie folgende Nukleotidabfolge (Seq-ID No 1) enthält:
3. Ein Plasmid, dadurch gekennzeichnet, daß es eine DNA-Sequenz
gemäß den Ansprüchen 1-2 enthält.
4. Plasmid pSK-S21 (DSM 7115).
5. Verwendung der Plasmide gemäß den Ansprüchen 3-4 oder
Derivate oder Teile davon zur Transformation pro- und
eukaryontischer Zellen.
6. Pflanzen, enthaltend eine DNA-Sequenz gemäß den Ansprüchen 1
und 2.
7. Bakterien, enthaltend eine DNA-Sequenz gemäß den Ansprüchen 1
und 2.
8. Verwendung, der DNA-Sequenz gemäß den Ansprüchen 1 und 2 zur
Herstellung von Bakterien, die Saccharose aufnehmen können.
9. Verwendung der DNA-Sequenz des Oligosaccharid-Transporters
gemäß den Ansprüchen 1 und 2 zur Herstellung von Plasmiden mit
veränderter Spezifität des Transporters.
10. Verwendung der DNA-Sequenz des Oligo-Saccharid-Transporters
gemäß dem Ansprüchen 1 und 2 zur Isolierung ähnlicher Sequenzen
aus den Genom der Pflanze.
11. Verwendung der DNA-Sequenz des Oligo-Saccharid-Transporters
gemäß den Ansprüchen 1 und 2 zur Expression einer translatierbaren
m-RNA, die die Synthese eines Saccharose-Transporters in den
Zellen ermöglicht.
12. Verwendung der DNA-Sequenz des Oligosaccharid-Transporters
gemäß den Ansprüchen 1 und 2 zur Expression einer nicht
translatierbaren RNA, die die Synthese eines endogenen Saccharose-
Transporters in den Zellen verhindert.
13. Verwendung der DNA-Sequenz des Oligosaccharid-Transporters
gemäß den Ansprüchen 1 und 2 in Kombination mit Steuerelementen
für eine Expression in prokaryontischen Zellen.
14. Verfahren zur Herstellung und Transformation von Hefestämmen,
für die Identifikation pflanzlicher Oligosaccharid-Transporter,
dadurch gekennzeichnet, daß man
- a) zunächst einen Hefestamm mit einem defekten suc2 Gen, der keine Invertase sezernieren kann, durch homologe Rekombination herstellt und daraus anschließend
- b) durch Transformation mit einem Gen für eine Saccharose- Synthese-Aktivität aus pflanzlichen Zellen einen Hefestamm, der intrazellulär Saccharose spalten kann, gewinnt und
- c) durch Transformation dieses Stammes mit einer pflanzlichen cDNA Bibliothek in einem Expressionsvektor für Hefezellen die DNA- Sequenz indentifiziert, die für einen pflanzlichen Oligosaccharid- Transporter kodiert.
15. Hefestämme zur Identifikation von pflanzlichen Oligosaccharid-
Transportern, erhältlich über das Verfahren gemäß Anspruch 15.
16. Hefestamm YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106).
17. Hefestamm YSH 2.64-1A-INV (DSM 7105).
18. Verwendung der Hefestämme gemäß den Ansprüchen 17 und 18 zur
Identifikation pflanzlicher Oligosaccharid-Transporter.
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Legal Events
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Owner name: HOECHST SCHERING AGREVO GMBH, 13509 BERLIN, DE |
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Owner name: FROMMER, WOLF-BERND, PROF. DR., 72076 TUEBINGEN, DE |
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