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ES2204903T3 - Secuencias de dna que codifican un transportador de oligosacaridos. - Google Patents

Secuencias de dna que codifican un transportador de oligosacaridos.

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ES2204903T3
ES2204903T3 ES93914704T ES93914704T ES2204903T3 ES 2204903 T3 ES2204903 T3 ES 2204903T3 ES 93914704 T ES93914704 T ES 93914704T ES 93914704 T ES93914704 T ES 93914704T ES 2204903 T3 ES2204903 T3 ES 2204903T3
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ES
Spain
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plant
sucrose
transporter
yeast
dna sequence
Prior art date
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Expired - Lifetime
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ES93914704T
Other languages
English (en)
Inventor
Wolf-Bernd Frommer
Jirg Riesmeier
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Bayer CropScience AG
Original Assignee
Bayer CropScience AG
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Publication date
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Abstract

SE DESCRIBEN SECUENCIAS DE DNA, QUE CONTIENEN LA REGION DE CODIFICACION DE UN PORTADOR DE OLIGOSACARIDOS, CUYA INTRODUCCION EN UN GENOMA DE UNA PLANTA MODIFICA LA FORMACION Y LA TRANSFERENCIA DE MATERIALES DE ALMACENAMIENTO EN PLANTAS TRANSGENICAS, PLASMIDOS, BACTERIAS Y PLANTAS QUE CONTENGAN ESTAS SECUENCIAS DE DNA, ASIMISMO SE DESCRIBE UN PROCESO PARA LA PREPARACION Y TRANSFORMACION DE CADENAS DE LEVADURA, QUE HACE POSIBLE LA IDENTIFICACION DE LAS SECUENCIAS DE DNA DEL PORTADOR DE OLIGOSACARIDO DE LA PLANTA DE LA INVENCION, ASI COMO EL USO DE SECUENCIAS DE DNA DE LA INVENCION.

Description

Secuencias de DNA que codifican un transportador de oligosacáridos.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a secuencias de DNA, que contienen la región codificante de un transportador de oligosacáridos, cuya introducción en un genoma vegetal modifica la formación y transferencia de materiales de almacenamiento en plantas transgénicas, plásmidos, bacterias y plantas que contienen estas secuencias de DNA, un proceso para la preparación y transformación de cepas de levadura, que hace posible la identificación de las secuencias de DNA del transportador vegetal de oligosacáridos de la invención, así como el uso de las secuencias de DNA de la invención.
El metabolito de transporte más importante para la energía almacenada en muchas plantas, por ejemplo las patas, es la sacarosa. En otras especies, otros oligosacáridos pueden atender a esta función. En las alcachofas japonesas, por ejemplo, es la estaquiosa.
La posición central del transporte de oligosacáridos en el contenido de energía de la planta ha sido demostrada ya en plantas transgénicas, en las cuales por expresión de una invertasa, la sacarosa se divide en los monosacáridos, conduciendo a cambios considerables en su hábito (documento EP 442 592). Debido a la importancia de la sacarosa en la formación de materiales de almacenamiento, se han llevado a cabo numerosos experimentos en relación con la investigación de la biosíntesis o el metabolismo de los disacáridos. Por el documento DE 42 13 444, se sabe que la mejora de las propiedades de almacenamiento de las partes cosechadas puede conseguirse en las patatas transgénicas, en las cuales por expresión de una invertasa apoplástica, se inhibe la transferencia de compuestos ricos en energía a las partes heterótrofas de los brotes en crecimiento.
A pesar del mucho esfuerzo realizado, el mecanismo para la distribución de los materiales de almacenamiento, tales como oligosacáridos en las plantas no se ha esclarecido y, con objeto de influir en el mismo, no se sabe todavía de qué modo la sacarosa formada en las hojas después de la fotosíntesis alcanza los canales de transporte del floema de la planta y de qué modo es absorbida de los órganos de almacenamiento, v.g. los tubérculos de las plantas de patata o las semillas. En las membranas plasmáticas de las células aisladas del tejido de las hojas de la remolacha azucarera (Beta vulgaris) se ha demostrado que el transporte de sacarosa a través de la membrana puede ser inducido proporcionando un gradiente de pH artificial y puede intensificarse proporcionando un potencial electroquímico (Lemoine & Delrot (1989) FEBS Letters 249: 129-133). El paso de sacarosa a través de la membrana sigue una cinética de Michaelis-Menten, en el cual el valor Km del transporte de sacarosa es alrededor de 1 mM (Slone & Buckhout, 1991, Planta 183: 484-589). Esta forma de cinética indica la implicación de una proteína transportadora. Experimentos sobre membranas plasmáticas de remolacha azucarera, Ricinus communis y Cyclamen persicum han demostrado que el transporte de sacarosa está relacionado con un co-transporte de protones (Buckhout, 1989, Planta 178: 393-399; Williams et al., 1990, Planta 182: 540-545; Grimm et al., 1990, Planta 182: 480-485). La estequiometría del co-transporte es 1:1 (Bush, 1990, Plant Physiol 93: 1590-1596). Sin embargo, se han propuesto también mecanismos para el transporte de la sacarosa a través del plasmodium de las células vegetales (Robards & Lucas, 1990, Ann Rev Plant Physiol 41: 369-419). A pesar del conocimiento de la existencia de un sistema activo de transporte, que permite que las células suministren sacarosa a los canales de transporte, no se conoce todavía una proteína con esta clase de propiedades. En tinción con N-etilmaleinimida de membrana plasmática de remolacha azucarera en presencia y ausencia de sacarosa, Gallet et al. (1989, Biochem Biophys Acta 978: 50-64) obtuvieron información de que una proteína de tamaño 42 kDa puede interaccionar con la sacarosa. Los anticuerpos contra una fracción de proteína de la membrana plasmática de este campo de tamaños pueden inhibir el transporte de sacarosa a través de las membranas plasmáticas (Lemoine et al., 1989, Biochem Biophys Acta 978: 65-71). En contraste, se ha obtenido información (Ripp et al., 1988, Plant Physiol 88: 1435-1445) por la marcación de fotoafinidad de proteína de soja con el análogo de sacarosa desoxiazidohidroxibenzamidosacarosa, sobre la participación de una proteína de 62 kDa en el transporte de sacarosa a través de las membranas. No se conoce una secuencia de aminoácidos de un transportador de sacarosa.
Se describen ahora secuencias de DNA de acuerdo con la reivindicación 1 que contienen la región codificante de un transportador de oligosacáridos, y cuya información contenida en la secuencia nucleotídica permite, por integración de la secuencia en un genoma vegetal, la formación de RNA, por la cual puede introducirse una nueva actividad de transporte de oligosacáridos en las células vegetales o puede expresarse una actividad transportadora de oligosacáridos endógenos. Por el término transportador de oligosacáridos debe entenderse por ejemplo un transportador de sacarosa procedente de plantas tales como espinacas o patatas.
La identificación de la región codificante del transportador de oligosacáridos es realizada por un proceso que permite el aislamiento de secuencias de DNA vegetal que codifican las moléculas transportadoras por medios de expresión en mutantes específicos de la levadura Saccharomyces cerevisiae. Para esto, tienen que proporcionarse mutantes de levadura adecuados que no puedan absorber una sustancia para la cual la región codificante de una molécula transportadora tiene que ser aislada a partir de una genoteca de genes vegetales. Se conoce ya un proceso para complementación de una deficiencia en el transporte de potasio en mutantes de levadura (Anderson et al., 1992, Proc Natl Acad Sci USA 89: 3736-3740). En ésta, se expresan secuencias de cDNA de levadura para mRNA vegetal en mutantes de levadura por el uso de vectores de expresión. Aquellas levaduras que no pueden absorber ahora las sustancias a transportar en las células, contienen la región codificante para una molécula transportadora en el vector de expresión. El proceso conocido, sin embargo, no es útil para la identificación de la región codificante para un transportador de sacarosa, dado que las levaduras no contienen ningún transportador endógeno de sacarosa que pudiera ser desconectado por mutación. Las levaduras codifican una invertasa de escisión, que escinde la sacarosa extracelular de tal manera que las hexosas pueden ser absorbidas por las células por la vía de un transportador de hexosa.
Para la preparación y transformación de cepas de levadura que sirvan para identificar un transportador vegetal de oligosacáridos:
a)
en primer lugar, se prepara una cepa de levadura con un gen suc2 defectuoso por recombinación homóloga, y luego, a partir de ésta,
b)
por transformación con un gen para una actividad de sacarosa-sintasa a partir de células vegetales, se extrae una cepa de levadura que puede escindir la sacarosa intracelular, y
c)
por transformación de esta cepa con una genoteca de genes vegetales en un vector de expresión para células de levadura, se identifica la secuencia de DNA que codifica un transportador vegetal de oligosacáridos.
Las cepas de levadura obtenidas por este proceso, para identificación de transportadores de oligosacáridos vegetales son por ejemplo las cepas de levadura YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106) e YSH 2.64-1A-INV (DSM 7105).
Con la cepa de levadura YSH 2.64-1A-SUSY, se identifica una secuencia de DNA para un transportador de sacarosa vegetal que tiene las secuencias siguientes.
Transportador de sacarosa de espinacas (Seq.ID No.1):
1
2
3
4
5
Las secuencias de DNA identificadas pueden introducirse en plásmidos y combinarse de este modo con elementos directores para la expresión en células eucariotas (véase Ejemplo 5). Estos elementos directores son, por una parte, promotores de la transcripción, y por otra parte terminadores de la transcripción. Con las secuencias de DNA de la invención contenidas en los plásmidos, pueden transformarse células eucariotas, con la finalidad de expresión de un mRNA traducible, lo cual hace posible la síntesis de un transportador de sacarosa en las células, o con la finalidad de expresión de un RNA no traducible, que impide la síntesis de un transportador de sacarosa endógeno en las células. Por la expresión de un RNA correspondiente a las secuencias del transportador de oligosacáridos de la invención, es posible una modificación del metabolismo de los carbohidratos de la planta, lo cual puede ser importante en el sentido de que una mejora en el suministro de sustancias de almacenamiento en las partes cosechadas da como resultado un aumento del rendimiento de las plantas útiles en agricultura. La posibilidad de forzar la absorción de materiales de almacenamiento en órganos individuales permite la modificación de la planta entera por la cual el crecimiento de los tejidos individuales, por ejemplo las hojas, se ralentiza, en tanto que el crecimiento de las partes cosechadas se incrementa. Para esto, puede imaginarse un alargamiento de la fase vegetativa de las cosechas, que conduce a una formación incrementada de sustancias de almacenamiento.
\newpage
Se conocen ya procesos para la modificación genética de plantas dicotiledóneas y monocotiledóneas (véase por ejemplo Gasser, C.S., Fraley, R.T., 1989, Science 244: 1293-1299; Potrykus, 1991, Ann Rev Plant Mol Biol Plant Physiol 42: 205-225). Para expresión en plantas - las secuencias codificantes tienen que acoplarse con los elementos reguladores de la transcripción. Tales elementos, denominados promotores, son conocidos (EP 375091).
Adicionalmente, las regiones codificantes tienen que proveerse de señales de terminación de la transcripción con las cuales puedan transcribirse aquéllas correctamente. Tales elementos han sido descritos también (véase Gielen et al., 1989, EMBO J 8: 23-29). La región de comienzo de la transcripción puede ser natural y/o homóloga así como extraña y/o heteróloga para la planta huésped. Si se desea, las regiones de terminación son intercambiables unas con otras. La secuencia de DNA de las regiones de comienzo y de terminación de la transcripción puede prepararse sintéticamente u obtenerse naturalmente, o bien obtenerse a partir de una mezcla de constituyentes de DNA sintéticos y naturales. Para introducción de genes extraños en plantas superiores, se dispone de un gran número de vectores de clonación que incluyen una señal de replicación para E. coli y un marcador que permite una selección de las células transformadas. Ejemplos de tales vectores son pBR 322, la serie pUC, la serie mp de M13, pACYC 184, etc. Dependiendo del método de introducción del gen deseado en las plantas, pueden ser adecuadas otras secuencias de DNA. En caso de utilizarse el plásmido Ti o Ri, v.g. para la transformación de la célula vegetal, entonces al menos el límite derecho pero a menudo tanto el límite derecho como el límite izquierdo del T-DNA del plásmido Ti y Ri, se une, como una región flanqueante, al gen que se introduce. El uso de T-DNA para la transformación de células vegetales ha sido investigado intensivamente y está bien descrito en el documento EP 120 516; Hoekama, en: The Binary Plant Vector System, Offset-drukkerij Kanters B.V. Alblasserdam, (1985), Capítulo V; Fraley, et al., Crit. Rev. Plant Sci., 4: 1-46 y An et al. (1985) EMBO J. 4: 277-287. Una vez que el DNA introducido se integra en el genoma, es por regla general estable en el mismo y se mantiene también en la progenie de las células originales transformadas. Dicho DNA contiene normalmente un marcador de selección, que induce resistencia en las células vegetales transformadas contra un biocida o antibiótico tal como kanamicina, G 418, bleomicina, higromicina o fosfinotricina, etc. El marcador individual empleado debería, por tanto, permitir la selección de células transformadas a partir de células que carecen del DNA introducido.
Para la introducción de DNA en una célula vegetal huésped, además de la transformación utilizando Agrobacteria, existen muchas otras técnicas disponibles. Estas técnicas incluyen la fusión de protoplastos, microinyección de DNA y electroporación, así como métodos balísticos con virus. A partir del material vegetal transformado, pueden regenerarse plantas enteras en un medio adecuado, que contiene antibióticos o biocidas para la selección. Las plantas resultantes pueden ensayarse luego en cuanto a la presencia del DNA introducido. No se exige ningún requisito especial en cuanto a los plásmidos en inyección y electroporación. Pueden utilizarse plásmidos simples, tales como v.g. derivados de pUC. Sin embargo, en caso de que se regeneren plantas enteras a partir de tales células transformadas, es necesaria la presencia de un gen marcador seleccionable. Las células transformadas crecen dentro de las plantas de la manera usual (véase también McCormick et al. (1986) Plant Cell Reports 5: 81-84). Estas plantas pueden cultivarse normalmente y cruzarse con plantas que posean los mismos genes transformados o diferentes. Los individuos híbridos resultantes tienen las propiedades fenotípicas correspondientes.
Las secuencias de DNA de la invención pueden introducirse también en plásmidos y combinarse de este modo con elementos directores para una expresión en células procariotas. La formación de una secuencia de RNA traducible de un transportador eucariota de sacarosa a partir de bacterias conduce además, sorprendentemente, a pesar de las considerables diferencias en las estructuras de membrana de procariotas y eucariotas, a procariotas que son ahora capaces de absorber sacarosa. Esto hace posible la producción de cepas bacterianas industrialmente interesantes, que podrían cultivarse en el sustrato relativamente económico sacarosa (véase Ejemplo 5). Por ejemplo, la producción de ácido polihidroxibutírico en la bacteria Alkaligenes eutrophus ha sido descrita (Steinbüchel & Schubert, 1989, Arch Microbiol 153: 101-104). La bacteria utiliza solamente, sin embargo, una selección muy limitada de sustratos. La expresión de un gen para un transportador de sacarosa, entre otros, en Alkaligenes eutrophus sería por consiguiente de gran interés.
Las secuencias de DNA de la invención pueden introducirse también en plásmidos que permiten la mutagénesis o una modificación de la secuencia por recombinación de secuencias de DNA en sistemas procariotas o eucariotas. De este modo puede modificarse la especificidad del transportador de sacarosa.
Utilizando procesos estándar (véase Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª Edición, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Nueva York, EE.UU.). Pueden realizarse cambios de bases o bien se pueden añadir secuencias naturales o sintéticas. Para la fijación de fragmentos de DNA unos con otros pueden introducirse en los fragmentos adaptadores o enlazadores. Adicionalmente, pueden efectuarse manipulaciones que preparan sitios de escisión por restricción adecuados o eliminan el exceso de DNA o los sitios de escisión por restricción. En los casos en los que deban realizarse inserciones, deleciones o sustituciones tales como por ejemplo transiciones y transversiones, pueden utilizarse mutagénesis in vitro, reparación de iniciadores, restricciones o ligaciones. Para los métodos de análisis, en general se puede utilizar un análisis de secuencia, análisis de restricción y otros métodos bioquímicos de biología molecular. Después de cada manipulación, la secuencia de DNA utilizada puede escindirse y enlazarse con otra secuencia de DNA. Cada secuencia plasmídica puede clonarse en los mismos o diferentes plásmidos.
Derivados o partes de las secuencias de DNA y plásmidos de la invención pueden utilizarse también para la transformación de células procariotas y eucariotas. Adicionalmente, las secuencias de DNA de la invención pueden utilizarse de acuerdo con procesos estándar para el aislamiento de secuencias similares en el genoma de las plantas de diversas especies, que codifican también sacarosa u otras moléculas transportadoras de oligosacáridos. Con estas secuencias, pueden prepararse constructos para la transformación de células vegetales que modifican el proceso de transporte en plantas transgénicas.
A fin de especificar secuencias de DNA afines, tienen que prepararse primeramente genotecas de genes, que son representativas del contenido en genes de un tipo de plantas o de la expresión de genes en un tipo de planta. Las primeras son genotecas genómicas, mientras que las últimas son genotecas de cDNA. A partir de éstas, pueden aislarse secuencias afines utilizando las secuencias de DNA de la invención como sondas. Una vez que el gen en cuestión ha sido identificado y aislado, es posible una determinación de la secuencia y un análisis de las propiedades de las proteínas codificadas a partir de esta secuencia.
Con objeto de comprender los ejemplos que constituyen la base de esta invención, se enumerarán antes que nada todos los procesos necesarios para estos ensayos y que son conocidos per se:
1. Proceso de clonación
Para la clonación, se utilizó el fago Lambda ZAP II, así como el vector pBluescriptSK (Short et al., 1988, Nucl Acids Res 16: 7583-7600).
Para la transformación de levaduras, se utilizaron los vectores YIplac 128 y YEplac 112 (Gietz & Sugino, 1988, Gene 74: 527-534).
Para la transformación de plantas, se clonaron los constructos génicos en el vector binario pBinAR (Höfgen & Willmitzer, 1990, Plant Sci 66: 221-230).
2. Cepas bacterianas y de levadura
Para el vector pBluescriptSK, así como para los constructos pBinAR, se utilizó la cepa de E. coli XL1blue (Bullock et al., 1987, Biotechniques, 5, 376-378).
Como cepa de partida para la producción de la cepa de levadura YSH 2.64-1A-susy de la invención, se utilizó la cepa YSH 2.64-1A (Gozalbo & Hohmann, 1990, Curr. Genet, 17: 77-79).
La transformación del plásmido en planta de patata se llevó a cabo utilizando la cepa LBA4404 de Agrobacterium tumefaciens (Bevan (1984) Nucl. Acids Res 12: 8711-8720).
3. Transformación de Agrobacterium tumefaciens
La transferencia del DNA en la Agrobacteria se llevó a cabo mediante transformación directa por el método de Höfgen & Willmitzer (1988, Nucleic Acids Res 16: 9877). El DNA plasmídico del Agrobacterium transformado se aisló de acuerdo con el método de Birnboin y Doly (1979) (Nucl. Acids Res 7: 1513-1523) y se analizó por electroforesis en gel después de escisión adecuada por restricción.
4. Transformación de plantas
Diez hojas pequeñas, heridas con un escalpelo, de un cultivo estéril de patata se pusieron en 10 ml de medio MS con 2% de sacarosa que contenía 30-50 \mul de un cultivo nocturno de Agrobacterium tumefaciens desarrollado bajo selección. Después de 3-5 minutos de agitación suave mediante sacudidas, las hojas se extendieron sobre medio MS de 1,6% de glucosa, 2 mg/l de zeatina-ribosa, 0,02 mg/l de ácido naftilacético, 0,02 mg/l de ácido gibberélico, 500 mg/l de claforán, 50 mg/l de kanamicina y 0,8% de agar bacto. Después de incubación durante una semana a 25ºC y 3000 lux, la concentración de claforán en el medio se redujo a la mitad.
Depósitos
Los plásmidos y cepas de levadura siguientes se depositaron en el Deutschen Sammlung von Mikroorganismen (DSM) en Braunschweig, Alemania, en fecha 12.06.1992 (número de depósito):
Plásmido pSK-S21 (DSM 7115)
Cepa de levadura YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106)
Cepa de levadura YSH 2.64-1A-INV (DSM 7105)
Descripción de las figuras
Fig.1:
Patrón de tiempos de la absorción de sacarosa en células de levadura.
"pmol/mg células" = cantidad de la sacarosa marcada con ^{14}C en pmol, absorbida en relación con el peso húmedo de las células de levadura, mg; "112" = cepa de partida (sin transportador); "+Glucosa" = pre-incubación de las células en un medio de glucosa 10 mM; "-Glucosa" = ausencia de pre-incubación de las células; "2,5 \muMCCCP" = coincubación con el inhibidor, carbonil-cianuro-m-cloro-fenilhidrazona (CCCP) en una concentración de 2,5 \muM; "500 \muMPCMBS" = coincubación con el inhibidor ácido p-cloromercuribencenosulfónico (PCMBS) en una concentración de 500 \muM; "10 \muM Antimicina" = coincubación con el inhibidor antimicina en una concentración de 10 \muM.
Fig. 2:
Clonación del plásmido pMA5-INV. Muestra la inserción del fragmento HindIII de 2,4 kb de tamaño procedente de pSEYC 306-1 en pMA5-10.
Fig. 3:
Muestra el plásmido pBinAR-S21.
En ésta:
Promotor CaMV 35S: Promotor del gen para el RNA 35S del virus del mosaico de la coliflor
A: Región codificante del transportador de sacarosa en las espinacas, orientación
en la dirección de lectura
OCS: Terminador del gen de la octopina-sintasa de Agrobacterium tumefaciens
SMAI, NotI, BamHI: Posiciones de escisión de las enzimas de restricción
Fig. 4:
Muestra el plásmido pBinAR-P62-anti.
En éste:
Promotor CaMV 35S: Promotor del gen para el RNA 35S del virus del mosaico de la coliflor
OCS: Terminador del gen de octopina-sintasa de Agrobacterium tumefaciens
SmaI, SacI, BamHI, XbaI: Posiciones de escisión de las enzimas de restricción
Fig. 5:
Contenido de diversos carbohidratos en las hojas de transformantes BinAR-P62-anti.
En ésta:
fru: fructosa
suc: sacarosa
sta: almidón
Control: plantas de partida sin transformar
sp-5 a sp-43: transformantes con números individuales
Fig. 6:
El flujo de carbohidratos de los pecíolos de transformantes BinAR-p62-anti.
wt: tipo salvaje
sp-5 a sp-43: transformantes con números individuales
Los ejemplos siguientes describen la preparación de las cepas de levadura, su identificación así como la función y el uso de un transportador de sacarosa en las plantas.
Ejemplo 1 Preparación de las cepas de levadura YSH 2.64-1A-SUSY e YSH 2.64-1A-INV
La cepa de levadura YSH 2.64-1A tiene las características suc2-, mal0, leu2, trp1 (Gozalbo & Hohmann, 1990, Curr. Genet. 17: 77-79). Con objeto de introducir una actividad enzimática de escisión de sacarosa en esta cepa, se transformó la misma con el plásmido integrador YIplac128A2-SUSY, que contiene la región codificante de la sacarosa-sintasa de patata como una fusión con el promotor del gen para la alcohol-deshidrogenasa de levadura. El plásmido YIplac 128A2-SUSY se preparó como sigue. Se acortó el plásmido YIplac128 (Gietz & Sugino, 1988, Gene 74: 527-534) por escisión con PstI y EcoRI, degradación y/o rellenado de las cadenas simples colgantes y ligación en la región del polienlazador. En la posición de escisión SphI restante, se insertó una casete de 728 pb con el promotor de alcohol-deshidrogenasa del plásmido pVT102U (Vernet et al., 1987, Gene 52: 225-233). De este modo se obtuvo YIplac128A2. La región codificante de la sacarosa-sintasa se multiplicó por la reacción en cadena de la polimerasa con los oligonucleótidos
6
a un clon lambda de sacarosa-sintasa de patata (Salanoubat & Belliard, 1987 Gene 60: 47-56). A partir del producto, se preparó la región codificante como fragmento BamHI y se insertó en el sitio de escisión BamHI del polienlazador de la casete. La cepa de levadura YSH 2.64-1A se transformó con el plásmido YIplac128A2-SUSY, así preparado. Dado que el plásmido no lleva la región 2\mu, el mismo no puede replicarse autónomamente en levadura. Por esta razón, dichos transformantes adquieren únicamente auxotrofía de leucina, que integran al menos en parte cromosómicamente el DNA plasmídico.
Las colonias de leucina autótrofas se analizaron en cuanto a la expresión del gen de sacarosa-sintasa. Para esto, se descompusieron células de un cultivo líquido de 5 ml por adición de perlas de vidrio con agitación enérgica mediante sacudidas, y luego, después de centrifugar, se añadió la proteína total del sobrenadante para una medida de la actividad enzimática. La actividad de la sacarosa-sintasa expresada contiene 25 mU/mg de proteína.
De una manera similar, se introdujo una actividad de invertasa en la cepa de levadura YSH 2.64-1A, en la cual, con la ayuda del plásmido YIplac128A1-INV, un gen para una invertasa citosólica no escindible se integró cromosómicamente en el genoma de la levadura. YIplac128A1-INV contiene, en lugar de la región codificante para sacarosa-sintasa, un gen de invertasa, que carece de la secuencia de señal para exportación del producto génico. El percusor del plásmido es el plásmido YIplac128A1, que difiere de YIplac128A2 en la orientación del polienlazador en la casete con el promotor del gen de alcohol-deshidrogenasa. La casete para este plásmido deriva del plásmido pVT100U (Vernet et al., 1987, Gene 52: 225-233). La región codificante de la invertasa se obtuvo en el DNA del gen suc2 por la reacción en cadena de la polimerasa con los oligonucleótidos
7
La región codificante se ligó como fragmento PstI/SpeI en el vector linealizado YIplac128A1den utilizando PstI y XbaI. Un ensayo de la actividad enzimática de la actividad de invertasa expresada en las células de levadura, dio como resultado una actividad enzimática de 68 mU/mg de proteína total procedente de células de levadura.
Ejemplo 2 Clonación del transportador de cDNA en la sacarosa vegetal
A partir de RNA poliadenilado procedente del tejido de las hojas de plantas de espinaca y patata en crecimiento, se preparó una genoteca del cDNA en la genoteca del fago Lambda ZAP II. A partir de 500.000 Pfu, se preparó el DNA de fago y se purificó utilizando un gradiente de sarcosil-cloruro de cesio. Después de escindir el DNA de fago con la enzima NotI, se prepararon inserciones a partir de las regiones de tamaño superior e inferior a 1,5 kpb en un gel de agarosa al 1% y se ligaron en los sitios de escisión NotI del vector de expresión YEplac112A1NE. El vector es un derivado del vector YEplac 112 (Gozalbo & Hohmann, 1990, Curr Genet 17: 77-79), con el cual, como se describe en el Ejemplo 1, se intercambió el polienlazador con una casete que tenía el promotor del gen de alcohol-deshidrogenasa. El polienlazador de la casete se eliminó nuevamente por escisión con las enzimas PstI y XbaI y se reemplazó por un oligonucleótido bicatenario que introduce un sitio de escisión NotI y EcoRI
(Secuencia: GATCCGCGGCCGCCCGGAATTCTCTAGACTGCA). Se obtuvieron aproximadamente 90.000 clones para la región de tamaño inferior a 1,5 kpb y aproximadamente 40.000 clones para la región de tamaño superior a 1,5 kpb por transformación en E. coli. A partir de éstos, se preparó DNA plasmídico. Se transformaron 2 \mug de DNA catorce veces en la cepa de levadura YHS2.64-1Asuc-.SUSY. los transformantes se cultivaron en un medio que contenía 2% de glucosa, y cinco a diez mil de cada uno se separaron por lavado con medio líquido de placas de agar y se extendieron sobre un medio que contenía sacarosa. Aquellas colonias que pudieron desarrollarse más rápidamente, se analizaron después. Se secuenciaron las inserciones en el vector YE-plac112A1NE de los transformantes S21 o P62 (YEplac112-A1NE-S21). Las secuencias se han dado anteriormente.
Ejemplo 3 Análisis de los transformantes de levadura que metabolizan la sacarosa
El transformante de levadura YEplac112A1NE-S21, correspondiente al obtenido en el Ejemplo 2, se cultivó en medio líquido hasta que el cultivo hubo alcanzado la fase logarítmica. Después de centrifugar el cultivo, las células se sometieron a una pre-incubación durante 5 minutos en un medio que contenía glucosa y se recogieron luego en un medio que contenía sacarosa marcada con ^{14}C. La absorción de la sacarosa marcada se midió por el proceso descrito por Cirillo (1989, Meth Enzymol 174: 617-622). La absorción de la sacarosa marcada sin preincubación con glucosa se comparó con la correspondiente a la co-incubación con los inhibidores carbonil-cianuro-m-clorofenilhidrazona (CCCP), ácido p-cloromercuribenceno-sulfónico (PCMBS) y antimicina. El patrón de tiempos se muestra en Fig. 1. La reducción calculada de la absorción de sacarosa por los inhibidores se muestra en la Tabla I. Un experimento de competición con diversos azúcares como competidores para la sacarosa marcada, a partir del cual puede interpretarse la especificidad del transportador, se muestra en la Tabla II.
Se llevaron a cabo experimentos análogos con la cepa de levadura YEplac112A1NE-P62. Éstos dieron resultados similares.
Ejemplo 4 Transformación de cepas bacterianas con secuencias de DNA para la expresión de una actividad transportadora de sacarosa
Con objeto de poder metabolizar la sacarosa absorbida, se precisan células bacterianas que tengan una actividad enzimática para la escisión del monosacárido. Para introducir dicha actividad, se transformaron bacterias mediante el plásmido pMA5-INV y se ensayaron en cuanto a actividad de invertasa. El plásmido pMA5-INV se preparó como sigue. Se linealizó el plásmido pMA5-10 (Stanssens et al., 1989, Nucl Acids Res 17: 4441-4454) en el sitio de escisión HindIII del polienlazador. El fragmento HindIII de 2,4 kb del plásmido pSEYC306-1 (Taussig & Carlson, 1983, Nucl Acids Res 11: 1943-1954) se clonó en el sitio de escisión HindIII. El punto de corte correspondiente del plásmido se muestra en Fig. 2. La actividad enzimática de la invertasa en las células bacterianas, transformadas con el plásmido pMA5-INV se determinó en un ensayo de actividad en electroforesis en gel, de manera conocida. La posibilidad de la formación de un transportador funcional de sacarosa por expresión de un cDNA vegetal en células bacterianas se ensayó por transformación de E. coli con el plásmido pSK-S21. El plásmido se describe en el Ejemplo 3. Después de la transformación de las células bacterianas con pSK-S21, se realizaron ensayos para la absorción de sacarosa.
Ejemplo 5 Transformación de plantas con un constructo para la sobre-expresión de la región codificante del transportador de sacarosa
A partir de los vectores YEplac 112A1NE-S21 y YEplac 112A1NE-P62 que contienen, como inserciones el cDNA para el transportador de sacarosa de espinaca y/o patata (véanse Ejemplos 2 y 3), se aislaron las inserciones después de escisión con NotI y se ligaron en el sitio de escisión NotI de los plásmidos pBluescript-SK (pSK-S21 y/o pSK-P62). Para pSK-S21, la inserción se preparó como un fragmento SacI/XbaI y se clonó, después de rellenado en el DNA monocatenario colgante, en la orientación "de sentido" en pBinAR (Höfgen & Willmitzer, 1990, Plant Sci 66: 221-230) que se escindió previamente con las enzimas SmaI y XbaI. El plásmido resultante pBinAR-S21 (véase Fig. 3) puede insertarse para transformación de plantas a fin de sobre-expresar el transportador de sacarosa. Para pSK-P62, la inserción se aisló como un fragmento NotI de 1,7 kpb y se clonó en una orientación "antisentido" en el sitio de escisión SmaI del vector binario pBinAR, dando como resultado pBinAR-P62-anti (véase fig. 4). Este plásmido es adecuado para transformación de plantas con la finalidad de inhibición "antisentido" de la expresión del transportador de sacarosa.
Las Agrobacterias de transformación se utilizaron luego para infección de segmentos de hojas de tabaco y patata.
Diez transformantes obtenidos independientemente, en los cuales se demostró la presencia del gen quimérico intacto no reordenado por análisis mediante transferencia Southern, cambios en el contenido de sacarosa, hexosa y almidón se ensayaron respectivamente.
Los transformantes, que contienen el T-DNA de pBinAR-P62-anti, demostraron una concentración fuertemente incrementada de almidones, hexosas y sacarosa en las hojas (véase fig. 5). El eflujo de carbohidrato a partir de los peciolos recogidos de las plantas se reduce notablemente en medio acuoso (véase fig. 6). A partir de estos datos, se aprecia claramente la significación del transportador de sacarosa para el transporte alejado del fotoasimilado de los órganos fotosintéticamente activos. Dado que una inhibición de la actividad del transportador limita el transporte de los carbohidratos a distancia, esto da como resultado una disminución de la transferencia de fotoasimilados a los órganos de almacenamiento en el caso de una sobre-expresión, por ejemplo utilizando el plásmido pBin-AR-S21. Las plantas de tabaco, en las cuales se ha integrado el T-DNA de pBinAR-S21, exhiben adicionalmente una dominancia apical reducida, es decir que muestran un crecimiento arbustivo. Un cambio fenotípico de este tipo es muy deseable, por ejemplo, en las plantas de tomate. El plásmido pBinAR-S21 con la secuencia de DNA (Seq.ID No. 1) de la invención es adecuado por consiguiente para la modificación de plantas con el propósito de mejorar características de reproducción importantes tales como el crecimiento arbustivo.
TABLA I
Inhibidor Transporte de sacarosa*
(%)
Control 100
CCCP 0,5\muM 65
CCCP 2,5\muM 21
PCMBS 25\muM 73
PCMBS 100\muM 21
2,4-DNP 25\muM 61
2,4-DNP 100\muM 9
Arseniato de sodio 1mM 34
Antimicina A 10\muM 59
CAMP 1m 102
CCCP = carbonil-cianuro-m-clorofenilhidrazona
PCMBS = ácido p-cloromercuribencenosulfónico
2,4-DNP = 2,4-dinitrofenol
* = en relación con Y Eplac 112 A1NE-S21 (control)
TABLA II
Competidor Transporte de sacarosa*
(%)
Control 100
Sacarosa 2 mM 28
Maltosa 2 mM 58
Maltosa 10 mM 37
Fenilglucosido 2 mM 7
Floridzina 2 mM 16
Lactosa 2 mM 91
Palatinosa 10 mM 102
Trehalosa 10 mM 103
* = en relación con Yeplac 112 A1NE - S21 (control)

Claims (24)

1. Una secuencia de DNA que contiene la región codificante de un transportador de oligosacáridos, caracterizada porque la introducción de dicha secuencia de DNA en un genoma vegetal modifica la formación y transferencia de materiales de almacenamiento en plantas transgénicas, que puede obtenerse por un proceso que comprende los pasos siguientes:
a)
en primer lugar, se prepara una cepa de levadura con un gen suc2 defectuoso por recombinación homóloga, y luego, a partir de ésta,
b)
por transformación con un gen para una actividad de sacarosa-sintasa a partir de células vegetales, se extrae una cepa de levadura que puede escindir la sacarosa intracelular, y
c)
por transformación de esta cepa con una genoteca de genes vegetales en un vector de expresión para células de levadura, se identifica la secuencia de DNA que codifica un transportador vegetal de oligosacáridos.
2. Una secuencia de DNA de acuerdo con la reivindicación 1, en la cual la genoteca de genes vegetales es una genoteca genómica.
3. Una secuencia de DNA de acuerdo con la reivindicación 1, en la cual la genoteca genómica vegetal es una genoteca de cDNA.
4. Una secuencia de DNA que contiene la región codificante de un transportador de oligosacáridos de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 derivado de una planta.
5. Una secuencia de DNA que contiene la región codificante de un transportador de oligosacáridos de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, caracterizada porque se deriva de espinaca.
6. Una secuencia de DNA que contiene la región codificante de un transportador de oligosacáridos de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, caracterizada porque se deriva de patata.
7. Una secuencia de DNA de acuerdo con la reivindicación 1, caracterizada porque contiene una secuencia de nucleótidos definida por SEQ.ID No. 1.
8. Una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en la cual la secuencia de DNA está alterada por mutagénesis o modificación de la secuencia que incluye inserciones, deleciones o sustituciones, de tal manera que se modifica el proceso de transporte de oligosacáridos en las plantas transgénicas.
9. Un plásmido, caracterizado porque contiene una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8.
10. Un plásmido de acuerdo con la reivindicación 9, designado pSK-S21 (DSM 7115).
11. Un plásmido de acuerdo con las reivindicaciones 9 ó 10, que contiene una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 o una parte o derivado de la misma que permite la expresión de un mRNA traducible que hace posible la síntesis de un transportador de sacarosa en las células o la expresión de un RNA no traducible, que impide la síntesis de un transportador endógeno de sacarosa en las células.
12. Una célula transformada con un plásmido de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11 o una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 derivada de una genoteca de cDNA vegetal.
13. Una célula de acuerdo con la reivindicación 12, que es un célula procariota.
14. Una célula de acuerdo con la reivindicación 12, que es una célula eucariota, en particular una célula vegetal.
15. Una planta transgénica que contiene una célula vegetal de acuerdo con la reivindicación 14.
16. Uso de una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8
a)
para la preparación de bacterias que pueden absorber sacarosa,
b)
para la preparación de secuencias de DNA del transportador con especificidad cambiada,
c)
para aislamiento de secuencias similares a partir del genoma de las plantas,
d)
para la expresión de mRNA traducible que hace posible la síntesis de un transportador de sacarosa en las células,
e)
para la expresión de mRNA no traducible, que impide un transportador endógeno de sacarosa en las células,
f)
en combinación con elementos directores para una expresión en células procariotas,
g)
para la modificación de plantas con la finalidad de mejorar características de reproducción importantes tales como aumento en el rendimiento de las plantas de explotación agrícola, modificación de la planta entera por la cual el crecimiento de tejidos individuales tales como las hojas se ralentiza, en tanto que se incrementa el crecimiento de las plantas de cosecha, mientras que es posible un alargamiento de la fase vegetativa, que conduce a una formación incrementada de sustancias de almacenamiento, o
h)
para la transformación de células vegetales.
17. Un proceso para la preparación y transformación de cepas de levadura que sirven para identificar un transportador vegetal de oligosacáridos, caracterizado porque
a)
en primer lugar, se prepara una cepa de levadura con un gen suc2 defectuoso por recombinación homóloga, y luego, a partir de ésta,
b)
por transformación con un gen para una actividad de sacarosa-sintasa a partir de células vegetales, se extrae una cepa de levadura que puede escindir la sacarosa intracelular, y
c)
por transformación de esta cepa con una genoteca de cDNA vegetal en un vector de expresión para células de levadura, se identifica la secuencia de DNA que codifica un transportador vegetal de oligosacáridos.
18. Cepas de levadura para identificación de transportadores de oligosacáridos vegetales, obtenidas por un proceso de acuerdo con la reivindicación 17 a) y b).
19. Una cepa de levadura de acuerdo con la reivindicación 18, que es la cepa de levadura YSH 2.64-1A-SUSY (DSM 7106).
20. Una cepa de levadura de acuerdo con la reivindicación 18, que es la cepa de levadura YSH 2.64-1A-INV (DSM 7105).
21. Uso de las cepas de levadura de acuerdo con las reivindicaciones 18 a 20 para la identificación de un transportador de oligosacáridos en las plantas.
22. Uso de un plásmido de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11 para la transformación de plantas para una sobre-expresión del transportador de sacarosa.
23. Proceso para la producción de una célula de planta transgénica que comprende el paso de introducir una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 o un plásmido de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11 en una célula huésped vegetal.
24. Proceso para la producción de una planta transgénica que comprende el paso de introducir una secuencia de DNA de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 o un plásmido de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 9 a 11 en una célula huésped vegetal y regenerar plantas enteras a partir de ella.
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