SISTEMAS E MÉTODOS PARA DETECTAR DOENÇAS
INFECCIOSAS Antecedentes da invenção
[0001] As doenças infecciosas, ou bacterianas, virais, ou de outra origem, apresentam desafios agudos e crônicos para a saúde. Muitas infecções comuns afetam o trato respiratório. doenças do aparelho respirador, doenças respiratórias especialmente infecciosas de origem viral e bacteriana, são prevalentes em pacientes de todas as idades, embora muitas vezes são mais graves em pessoas muito jovens e os muito velhos. Os vírus incluem vírus de ADN e vus de ARN. As bactérias incluem as bactérias Gram negativas e Gram positivas, e pode incluir micoplasma (bactérias sem paredes celulares). Além de bactérias causadoras de doenças, algumas doenças, tais como, por exemplo, doenças respiratórias, podem ser causadas por outros microrganismos, tais como leveduras, fungos, e outros, de organismos causadores de doenças pequenas.
[0002] Um exemplo de uma origem viral comum de desordens respiratórias (e outros) em pacientes é a gripe ("gripe") de vírus. Influenza ("gripe") refere-se à doença causada por um de vários vírus de ARN relacionados da família Orthomyxoviridae, tipificados por febre, dor de cabeça, fadiga e outros sintomas. Existem diferentes tipos de gripe; influenza A e influenza B são ambos quase igualmente prevalentes em humanos. Identificação da estirpe da gripe numa amostra pode ajudar a sugerir tratamentos, podem ajudar a sugerir medidas preventivas a serem tomadas, e pode ajudar a controlar essas infecções em uma população.
[0003] Exemplos de causas bacterianas comuns de distúrbios respiratórios (e outros) em pacientes incluem tosse convulsa, pneumonia e tuberculose. A coqueluche é causada por Bordetella pertussis e é caracterizada por acessos de tosse violenta, que podem persistir por semanas. A pneumonia é o nome dado a doenças respiratórias caracterizadas por líquido nos pulmões, tosse, febre, vômitos, fadiga e outros sintomas. A pneumonia pode ser causada por uma infecção bacteriana ou viral; determinação da causa de um caso específico é crítica na determinação do curso do tratamento do paciente. Causas de pneumonia incluem pneumonia Streptococcus. Staphylococcus aureus, adenovírus, vírus da gripe, vírus sincicial respiratório, Pneumocystis carinii (um fungo), e outros agentes. A tuberculose é causada pelo Mycobacterium, tuberculose, é caracterizada por tosse incluindo cuspir sangue, dor no peito, calafrios, febre, suores noturnos e outros sintomas, e pode ser fatal.
[0004] Os agentes que causam doenças respiratórias infecciosas normalmente diferem entre as doenças do trato respiratório superior e distúrbios do trato respiratório inferior; Assim, a variedade ou a gama de agentes virais ou bacterianos encontrados em pacientes que sofrem de distúrbios respiratórios superiores podem ser diferentes do que aqueles agentes bacterianos ou virais encontrados em pacientes que sofrem de distúrbios do trato respiratório inferior. No entanto, o diagnóstico e o tratamento de doenças respiratórias bem sucedidas, muitas vezes requer a identificação de organismos causadores de doenças presentes em uma amostra clínica obtida de um sujeito que sofre, ou suspeita de sofrimento, de um distúrbio respiratório infeccioso. A diferenciação entre os organismos típicos do trato respiratório superior e aqueles típicos de doenças respiratórias mais baixas podem também ser crítico no diagnóstico e tratamento de doenças respiratórias bem sucedidas, além disso, a identificação de outros sintomas e as sequelas de perturbações respiratórias podem auxiliar o diagnóstico bem sucedido e no tratamento de doenças respiratórias.
[0005] As doenças sexualmente transmissíveis, se apresentam problemas de saúde públicas específicas virais ou bacterianas, ou não, uma vez que alguns pacientes são relutantes em reconhecer os riscos de, ou uma possível exposição a tais doenças, e podem estar relutantes em ser testado para essas doenças. No entanto, a falta de testes e consequente falta de informações sobre o estado da doença pode levar a um aumento da propagação de tais doenças, e tratamento atrasos para as pessoas afetadas.
[0006] Algumas doenças podem ser detectadas por exames de sangue (por exemplo, vírus da dengue, vírus de Epstein-Barr, doenças tripanossoma, doenças de Plasmódio, e outros). Algumas doenças podem ser detectadas por análise de esfregaços de, ou fluido obtido a partir de esfregaços, tais como esfregaços da garganta, esfregaços nasais, zaragatoas bochecha, ou outros esfregaços. Doenças também podem ser detectadas através da análise de amostras de urina e de outras amostras clínicas.
[0007] A fim de ser eficaz no tratamento de tais distúrbios infecciosos, o teste deve ser oportuna. No entanto, os métodos e sistemas para testes atuais são muitas vezes demorado, inconveniente para os pacientes, podem requerer métodos de recolha de amostra ou quantidades que são dolorosas ou desconfortáveis para o paciente, e pode ser caro. Os métodos que requerem grandes quantidades de amostra, ou que exigem a incubação de uma amostra para um dia ou dias, são frequentemente ineficazes na detecção atempada ou identificação da causa de um distúrbio respiratório, e, portanto, não pode ser útil no diagnóstico ou tratamento de doenças infecciosas distúrbios respiratórios.
[0008] Além disso, muitas doenças respiratórias infecciosas apresentam muitos dos mesmos, ou semelhantes, sintomas, de modo que o teste útil e eficaz exige testes para a presença de múltiplos agentes, e de vários tipos de agentes (por exemplo, viral, bacteriana e fúngica). No entanto, os métodos presentes são muitas vezes limitados a ensaios de um único agente ou tipo de agente, ou apenas um pequeno número de possíveis TS Agen, limitando a utilidade dos resultados e aumentando a probabilidade de que o agente causal ainda não podem ser identificadas.
[0009] Assim, os métodos melhorados, sistemas e ensaios para a detecção e identificação de agentes que causam doenças, tais como a gripe, doenças respiratórias, doenças sexualmente transmissíveis, doenças do sangue, doenças virais, doenças bacterianas, e outras doenças, são desejados.
INCORPORAÇÃO POR REFERÊNCIA
[0010] Todas as publicações, patentes, e pedidos de patente mencionados nesta especificação são aqui incorporadas por referência na mesma extensão como se cada publicação, patente ou pedido de patente particular fosse especificamente e individualmente indicada para ser incorporada por referência,
RESUMO
[0011] Sistemas, métodos, e de vícios para a detecção da presença de marcadores indicativos de um ou mais de uma pluralidade de agentes infecciosos em uma única amostra clínica, ou numa pluralidade de alíquotas de uma única amostra clínica, são fornecidos. Os sistemas, métodos e dispositivos aqui descritos podem ser sistemas de ponto-de-serviço, os métodos e dispositivos, configurados para utilização num local de ponto-de-serviço, em que um local de ponto-de-serviço pode ser um local no qual um amostra é obtida de um sujeito.
[0012] Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos para o ensaio da presença de um ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa em uma única amostra clínica de pequeno volume, ou alíquotas destes. Em formas de realização, o sistema, método ou dispositivo é um ponto de serviço (POS) sistema, método ou dispositivo. Em formas de realização, a amostra é coletada no local de POS, e é analisado em um dispositivo no local de POS. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume é completado num curto período de tempo. Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença respiratória. Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença respiratória selecionada a partir de uma doença respiratória superior e inferior de uma doença respiratória. Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença sexualmente transmissível.
[0013] Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos para a detecção da presença de um ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa em uma única amostra clínica de pequeno volume, ou alíquotas destes. Em formas de realização, o sistema, método ou dispositivo é um sistema de POS, método ou dispositivo. Em formas de realização, a amostra é recolhida no local de POS, e é analisado em um dispositivo no local de POS. Dentro formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume é completado num curto período de tempo.
[0014] Em formas de realização, a doença infecciosa é uma doença bacteriana, ou uma doença virai, ou outro tipo de doença, e análise do pequeno volume da amostra clínica determina se a doença infecciosa é uma doença bacteriana, uma doença virai, ou outro tipo de doença. A determinação do tipo de auxiliares de doenças infecciosas na determinação do tipo de tratamento para proporcionar ao sujeito, por exemplo, onde a determinação indica que a doença infecciosa é uma doença fúngica, o sujeito deve ser tratada com drogas antifúngicas; onde a determinação indica a doença infecciosa é uma infecção por fungos, o assunto deve ser tratado com drogas antifúngicas; e assim por diante.
[0015] Em formas de realização, a doença infecciosa é uma doença bacteriana. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença infecciosa é uma doença bacteriana. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença infecciosa é uma doença bacteriana, referida determinação indica a utilização de antibióticos no tratamento dessa doença. Em formas de realização, a doença infecciosa é uma doença viral. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença infecciosa é uma doença viral. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de volume pequena determina que a doença infecciosa é uma doença virai, referida determinação indica o uso de antiviral arrasta no tratamento dessa doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de volume pequena determina que a doença infecciosa é uma doença virai, referida determinação indica que os antibióticos não deverá ser utilizada no tratamento dessa doença.Em formas de realização, a doença infecciosa é uma doença bacteriana, ou uma doença virai. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença infecciosa é uma doença bacteriana ou uma doença virai. Da mesma forma, onde a análise da amostra clínica pequeno volume determina a doença infecciosa é uma doença fúngica, o indivíduo deve ser tratado com arrasta antifúngicas; onde a determinação indica a doença infecciosa é uma infecção por fungos, o assunto deve ser tratado com drogas antifúngicas; e assim por diante.
[0016] Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença respiratória. Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença respiratória selecionado a partir de uma doença respiratória superior e inferior de uma doença respiratória. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença infecciosa é uma doença respiratória superior ou uma doença respiratória inferior. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de volume pequena determina o tipo de máscara respiratória superior '- doença ou uma doença respiratória inferior presente na amostra clínica pequeno volume. Por exemplo, em formas de realização, a doença respiratória superior ou inferior é uma doença bacteriana, ou uma doença virai, ou outro tipo de doença, e a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença respiratória superior ou inferior é uma doença bacteriana , uma doença viral, ou outro tipo de doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença respiratória superior ou inferior é uma doença bacteriana, referida determinação indica que a utilização de antibióticos no tratamento da referida doença.Em formas de realização em que a análise da amostra clínica em pequena VoIume determina que a doença respiratória superior ou inferior é uma doença virai, referida determinação indica o uso de antiviral arrasta no tratamento dessa doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença respiratória superior ou inferior é uma doença virai, referida determinação indica que os antibióticos não deverá ser utilizada no tratamento dessa doença. Da mesma forma, onde a análise da amostra clínica pequeno volume determina a doença respiratória superior ou inferior é uma doença fúngica, o sujeito deve ser tratada com drogas antifúngicas; onde a determinação indica a doença infecciosa é uma infecção por fungos, o assunto deve ser tratado com drogas antifúngicas; e assim por diante.
[0017] Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença sexualmente transmissível. Em formas de realização, a análise da amostra clínica em pequena escala, determina o tipo de doença sexualmente transmissível presente na amostra clínica pequeno volume. Por exemplo, em formas de realização, a doença sexualmente transmissível é uma doença bacteriana, ou uma doença virai, ou outro tipo de doença, e a análise do volume de pequena amostra clínica determina se a doença sexualmente transmissível é uma doença bacteriana, uma doença viral , ou outro tipo de doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica em pequena escala, que determina a doença sexualmente transmissível é uma doença bacteriana, referida determinação indica que a utilização de antibióticos no tratamento da referida doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica em pequena escala, que determina a doença sexualmente transmissível é uma doença virai, referida determinação indica que o uso de drogas antivirais no tratamento dessa doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica em pequena escala, que determina a doença sexualmente transmissível é uma doença virai, referida determinação indica que os antibióticos não deverá ser utilizada no tratamento dessa doença. Da mesma forma, onde a análise da amostra clínica pequeno volume determina a doença sexualmente transmissível é uma doença fúngica, o sujeito deve ser tratada com drogas antifúngicas; onde a determinação indica a doença infecciosa é uma infecção por fungos, o assunto deve ser tratado com anti-levedura arrasta; e assim por diante.
[0018] Em formas de realização dos sistemas, métodos e dispositivos configurados para teste de uma pluralidade de marcadores, e em sistemas, métodos e dispositivos para detectar uma configurado pluralidade de marcadores, os marcadores podem ser indicativos de doenças respiratórias; Em formas de realização, os marcadores podem ser indicativos de doenças das vias respiratórias superiores; Em formas de realização, os marcadores podem ser indicativos de doenças do trato respiratório inferior. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores, em que os marcadores de doenças respiratórias são indicativos de dois ou mais do grupo de marcadores de doença respiratória constituídos por adenovírus B, vírus adeno C, E adenovírus, Bordetella pertussis, Mycobacterium tuberculosis (MTB), Staphylococcus aureus, resistente à meticilina Staphylococcus aureus (MRSA), estreptococos do grupo A e do grupo B estreptococo. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores, em que os marcadores de doenças respiratórias são indicativos de dois ou mais do grupo de marcadores de doença respiratória constituídos por adenovírus B, adenovírus C, E adenovírus, Bordetella pertussis , Bordetella parapertussis, mycobacterium tuberculosis (MTB), Staphylococcus aureus, meticilina esistant Staphylococcus aureus (MRSA), estreptococos do grupo A, Grupo B estreptococos, catarrhais Moraxella, Enterobacter aerogenes, Haemophilus parainfluenza, vírus Metapneumo, Streptococcus pneumonia, Parainfluenza Virus 1, Parainfluenza vírus 2, Parainfluenza vírus 3, Coronavirus OC43, Coronavirus L63, Coronavirus MERS, Coronavirus HKUl, Coronavirus 229E, Klibsseila pneumonia PHOE, Klebsiella pneumonia KPC, Bocavirus tipo 2,4 e Bocavirus tipo de 1,3. Em formas de realização, os marcadores de doenças respiratórias são indicativos de três ou mais, ou de quatro ou mais, ou cinco ou mais, ou de seis ou mais, ou de SE Ven ou mais, ou de oito daquele grupo de marcadores de doenças respiratórias.
[0019] Em formas de realização dos sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores, e em sistemas, métodos e dispositivos configurados para detectar uma pluralidade de marcadores, os marcadores podem ser indicativos de doenças sexualmente transmissíveis. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores, em que a doença sexualmente transmitida marcadores de doenças são indicativos de dois ou mais do grupo de marcadores consistindo em vírus herpes simplex (HSV), o vírus da imunodeficiência humana (HIV), streptococcus B, e treponema pallidum. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para teste de uma pluralidade de marcadores, em que os marcadores de doenças sexualmente transmissíveis são indicativos de dois ou mais do grupo consistindo de marcadores de VIH-2. Grupo A, HIV-2, Grupo B, HIV-1 grupo M, hepatite B, hepatite Delta, herpes vims simplex (HSV), Streptococcus B, e Treponema pallidum. Em formas de realização, os marcadores de doenças sexualmente transmissíveis são indicativos de três ou mais, quatro ou daquele grupo de marcadores de doenças sexualmente transmissíveis.
[0020] Em formas de realização dos sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores, e em sistemas, métodos e dispositivos configurados para detectar uma pluralidade de marcadores, os marcadores podem ser indicativos de gripe. Em formas de realização. Os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores, em que os marcadores de influenza são indicativos da gripe A e da gripe B. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para o teste para uma pluralidade de marcadores , w aqui os marcadores de influenza são indicativos de dois ou mais do grupo de marcadores que consiste das seguintes formas de gripe: H1N1 (sazonal), H1N1 (novo), H3N2, H7N9 (gene marcador de hemaglutinina (HA) e o gene da neuraminidase (nA)), e H5N 1. Em formas de realização, os marcadores de influenza são indicativos de três ou mais, ou quatro ou mais, ou cinco do referido grupo de marcadores da gripe. Em formas de realização, os marcadores podem ser marcadores da gripe proteína matriz de influenza, ou podem ser marcadores de proteína neuraminidase da gripe, ou podem ser marcadores de hemaglutinina de influenza, ou outros marcadores da gripe. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença infecciosa é um vírus influenza. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de volume pequena determina o tipo de gripe presentes na amostra clínica pequeno volume. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença infecciosa é um vírus influenza (que é uma doença viral), a referida determinação indica que os antibióticos não deverá ser utilizada no tratamento dessa doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença infecciosa é um vírus influenza, referida determinação indica que as drogas antivirais deve ser utilizado no tratamento da referida doença.
[0021] Em formas de realização dos sistemas, métodos e dispositivos configurados para teste de uma pluralidade de marcadores, e em sistemas, métodos e dispositivos configurados para detectar uma pluralidade de marcadores, os marcadores podem ser indicativos de doenças e marcadores de doenças susceptíveis ser detectado por análise de uma amostra de sangue. Em formas de realização, tais doenças e marcadores de doenças que podem ser detectadas por análise de uma amostra de sangue incluem o vírus de Oeste do Nilo, vírus de Epstein-Barr, o Plasmodium, Trypanosoma cruzi, e Vírus do Dengue (incluindo os tipos 1, 2, 3, e 4).
[0022] As amostras a partir da garganta de um objeto pode ser obtido, por exemplo, por uma haste de garganta; Amostras obtidas a partir do nariz de um objeto pode ser obtido, por exemplo, por um cotonete nasal. Em formas de realização, as amostras obtidas a partir da garganta e do nariz de um sujeito pode ser testada em conjunto. Em formas de realização, o ensaio de amostras obtidas a partir da garganta ou do nariz, ou de ambos, do nariz e da garganta, pode ser testada por análise de ácidos nucleicos; ou por análise de aminoácidos (por exemplo, ELISA ou outro anticorpo-baseado ou análise de ligação à base de proteínas); ou por análise química geral; ou por análise de citometria; ou por combinações dos mesmos. Por exemplo, as amostras podem ser testadas por análise do ácido nucleico e por análise de aminoácidos. Tais ensaios podem ser utilizados para determinar o tempo que um sujeito teve uma infecção, por exemplo, observando o atraso no aumento dos níveis de anticorpos indicativos de uma doença específica na amostra; ou seguindo o aumento dos níveis de anticorpos indicativos de uma doença específica na amostra ao longo do tempo (por exemplo, por testes repetidos ao longo do tempo). Do mesmo modo, tais ensaios podem ser utilizados para detectar, ou para determinar o efeito do tratamento, observando-se o atraso no aumento dos níveis de anticorpos indicativos de uma doença específica na amostra; ou seguindo o aumento dos níveis de anticorpos indicativos de uma doença específica na amostra mais iime (por exemplo, por testes repetidos ao longo do tempo). N formas de realização, as amostras da garganta e do nariz pode ser incluída em uma única solução, e testadas em conjunto. Em formas de realização, as amostras da garganta e do nariz podem estar em recipientes separados (por exemplo, recipientes de amostra), mas ambos incluídos num único cartucho, e os vasos separados testados ao mesmo tempo. Este tipo de teste, ao mesmo tempo pode compreender testar os vasos em separado, ou pode incluir misturar o conteúdo dos recipientes e testar-se a mistura.
[0023] Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurados para a identificação, ou cálculo, ou de outra forma, determinar a fase de uma infecção num indivíduo através da detecção de, ou determinando as quantidades de, ou ambos, ambos os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particidar e marcadores de anticorpos indicativos de a mesma infecção. Tais sistemas, métodos e dispositivos podem ser usados para detectar, medir e controlar tais marcadores ao longo do tempo, eficaz para fornecer uma estimativa ou da determinação de como recentemente uma infecção ocorreu. Tais sistemas, métodos e dispositivos podem ser utilizados para detectar, medir e controlar tais marcadores ao longo do tempo, eficaz para auxiliar na avaliação da situação atual de um indivíduo que sofre de uma infecção. Tais sistemas, métodos e dispositivos podem ser utilizados para detectar, medir e controlar tais marcadores ao longo do tempo, eficaz para auxiliar na determinação do prognóstico da probabilidade de um indivíduo que sofre de uma infecção. Por exemplo, onde os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particular, são relativamente numerosos, enquanto anticorpo ou outra proteína de marcadores indicativos de que a infecção particular, são relativamente escassa, em seguida, pode-se estimar ou determinar que a infecção é uma infecção recente; No entanto, onde os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particular, são relativamente numerosos, e anticorpo ou outra proteína de marcadores indicativos de que a infecção particular também são relativamente numerosas, em seguida, pode-se estimar ou determinar que a infecção não é uma infecção recente, uma vez que o sujeito teve tempo para produzir anticorpos específicos para a infecção. Sempre que os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particular, são relativamente escassa, e anticorpo ou outra proteína de marcadores indicativos de que a infecção particular também são relativamente numerosas, em seguida, pode-se estimar ou determinar que a infecção numa fase tardia, e indica que a infecção é diminuindo, uma vez que tais observações indicam que o assunto é superar a infecção.
[0024] Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos configurado para teste de uma pluralidade de marcadores, e divulga sistemas configurados para detectar uma pluralidade de marcadores, onde os marcadores são indicativos de uma pluralidade de doenças infecciosas em uma única amostra clínica de pequeno volume, ou alíquotas destes. Em formas de realização, os sistemas, métodos e dispositivos podem ser configurados para teste para, ou para a detecção, marcadores indicativos de mais do que cerca de 8 doenças diferentes, ou mais do que cerca de 8 doenças diferentes, ou mais do que cerca de 12 doenças diferentes, ou mais de cerca de 16 doenças diferentes, ou mais do que cerca de 20 doenças diferentes, ou mais de cerca de 25 doenças diferentes, ou mais de cerca de 35 doenças diferentes, ou mais do que cerca de 45 doenças diferentes, ou mais do que cerca de 60 doenças diferentes. Em formas de realização, os sistemas, métodos e dispositivos podem ser configurados para testar, ou para detectar uma pluralidade de marcadores de ácido nucleico e marcadores de proteína, cada marcador sendo indicativos de pelo menos um de uma pluralidade de doenças ou condições. Em formas de realização, os sistemas, métodos e dispositivos podem ser configurados para testar, ou para detectar uma pluralidade de marcadores de ácido nucleico, proteínas marcadores, e marcadores de citometria, cada marcador sendo indicativos de pelo menos um de uma pluralidade de doenças ou condições. Em formas de realização, os sistemas, métodos e dispositivos podem ser configurados para testar, ou para detectar uma pluralidade de marcadores de ácido nucleico, proteínas marcadores, marcadores de citometria de, citoquinas, e marcadores de inflamação, cada marcador ou citocina sendo indicativos de pelo menos um de uma pluralidade de doenças ou condições. Dentro formas de realização, os sistemas, métodos e dispositivos compreendem um ponto de serviço de sistema. Em formas de realização, a amostra pode ser recolhida no local do serviço, e podem ser analisados num dispositivo no local de POS. Em formas de realização, a análise da amostra clínica em pequena escala, pode ser completada num curto período de tempo.
[0025] Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença respiratória. Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença respiratória selecionada a partir de uma doença respiratória superior e inferior de uma doença respiratória. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença infecciosa é uma doença das vias respiratórias superiores, ou uma doença respiratória inferior. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de volume pequena determina o tipo de doença respiratória superior ou uma doença respiratória inferior presente no pequeno volume de amostra clínica, em formas de realização, a doença respiratória compreende uma doença respiratória causada por um agente causador de doença selecionado a partir de um vírus, uma bactéria, uma levedura, um fungo, um micoplasma, e outros micro- organismos. Em formas de realização, a análise da amostra clínica em pequena escala, determina o tipo de doença respiratória superior ou uma doença respiratória inferior presente na amostra clínica pequeno volume. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença respiratória superior ou inferior de uma doença respiratória é uma doença virai, ou uma doença bacteriana, ou algum outro tipo de doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença é uma doença virai, referida determinação indica que os antibióticos não deverá ser utilizada no tratamento dessa doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença é uma doença virai, referida determinação indica que as drogas antivirais deve ser utilizado no tratamento da referida doença. Em formas de realização em que a análise do pequeno volume amostra clínica e determina que a doença é uma doença bacteriana, referida determinação indica que os antibióticos devem ser utilizados no tratamento da referida doença.
[0026] Em formas de realização, a doença infecciosa compreende uma doença sexualmente transmissível. Em formas de realização, a doença sexualmente transmitida compreende uma doença sexualmente transmissível provocada por um agente causador de doença selecionada a partir de um vírus, uma bactéria, uma levedura, um fungo, um micoplasma, e outros micro- organismos. Em formas de realização, a análise da amostra clínica em pequena escala, determina o tipo de doença sexualmente transmissível presente na amostra clínica pequeno volume. Em formas de realização, a análise da amostra clínica de pequeno volume determina se a doença sexualmente transmissível é uma doença virai, ou uma doença bacteriana, ou algum outro tipo de doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença é uma doença virai, referida determinação indica que os antibióticos não deverá ser utilizada no tratamento dessa doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença é uma doença virai, referida determinação indica que arrasta antivirais deve ser utilizado no tratamento da referida doença. Em formas de realização em que a análise da amostra clínica de pequeno volume determina que a doença é uma doença bacteriana, referida determinação indica que os antibióticos devem ser usados no tratamento dessa doença.
[0027] Requerente descreve ainda um método de determinação do estado de resposta a uma doença num sujeito, o método compreendendo: a) introdução de uma amostra clínica para um dispositivo de processamento de amostras, a referida amostra ter sido obtida de um indivíduo suspeito de sofrer de uma doença causada por um organismo causador de doença, a referida amostra clínica que tem um volume não maior do que 500 microlitros, em que o dispositivo compreende: i) um sistema de manuseio da amostra; lo) uma estação de detecção; e iii) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira e uma segunda unidade de forma independente mo ensaio amovível; b) com a ajuda do sistema de amostra manuseio, transferência de uma porção da amostra clínica para cada uma das primeira e segunda unidades de ensaio, em que um ensaio para a detecção de um ácido nucleico indicativo da organismo causador da doença é executado na referida primeira unidade de ensaio, e um ensaio para a detecção de anticorpos para o organismo causador da doença é realizada na segunda unidade de ensaio; c) transferir as primeira e segunda unidades de ensaio para a estação de detecção com a ajuda do sistema de manuseamento de amostra; d) a obtenção de medições de dados com o auxílio da estação de detecção, as medições de dados que compreende a determinação do nível de ácido nucleico indicativos de um organismo causador da doença na amostra, e a determinação do nível de anticorpos dirigidos a esse organismo de doença na amostra referida; e e) a i) para determinar que a infecção é uma infecção recente, e em uma fase precoce da doença, em que o nível de ácido nucleico indicativos de um organismo causador da doença é elevada e o nível de anticorpos dirigidos a esse organismo causador da doença é baixa ou normal ; ii) a determinação de que a infecção é uma infecção não recente, e não numa fase precoce da doença, em que o nível de ácido nucleico indicativos de um organismo causador da doença é elevada e o nível de anticorpos dirigidos a esse organismo causador da doença é alta; e iii) a determinação de que a infecção é uma infecção diminuindo, e numa fase tardia da doença, em que o nível de ácido nucleico indicativos de um organismo causador da doença é lo ou normal e o nível de anticorpos dirigidos a esse organismo causador da doença é alta, onde um nível normal de um marcador é o nível do referido marcador determinado de uma população saudável de indivíduos normais, em que um nível elevado é um que excede significativamente a um nível normal, conforme determinado numa população saudável, e um nível baixo é um que é de ou abaixo do nível normal, conforme determinado numa população saudável.
[0028] Em formas de realização, o método de determinação do estado de resposta a uma doença num sujeito compreende, ainda, a detecção do nível de citoquinas inflamatórias. Em formas de realização do método de determinação do estado de resposta a uma doença num sujeito, o dispositivo compreende ainda uma estação de citometria compreende um dispositivo de imagem e um palco para receber uma cuvete de microscopia, e o método compreende ainda a imagiologia de uma célula sanguínea branca numa amostra de sangue obtida a partir do sujeito. Em formas de realização, a imagem de glóbulos brancos numa amostra de sangue obtida do indivíduo compreende a detecção do nível de um tipo de células brancas do sangue numa amostra de sangue obtida a partir do sujeito e determinar se o referido detectado nível do referido tipo de células brancas do sangue é acima, em, ou abaixo de um nível normal para esse tipo de células do sangue, em que o nível normal para esse tipo de células brancas do sangue é determinada pelo nível do referido tipo de células brancas do sangue, em amostras de sangue a partir de uma população saudável.
[0029] ' ESTs T podem ser para a detecção dos marcadores indicativos de qualquer doença infecciosa. Por exemplo, as doenças que podem ser testados quanto incluem doenças respiratórias, e incluem doenças respiratórias e doenças respiratórias inferiores. Os marcadores podem incluir ácido nucleico marcadores, marcadores de proteínas, marcadores de polissacarídeos, marcadores celulares (incluindo células e organelos celulares ou fragmentos), e outros marcadores. Os marcadores podem incluir marcadores para infecções virais, infecções bacterianas, infecções fúngicas, infecções fúngicas, infecções por micoplasma e para outras infecções. As amostras podem ser testadas para os marcadores indicativos de inflamação. As amostras podem ser testadas por citocinas. As amostras podem ser testadas por citoquinas inflamatórias. As amostras podem ser testadas para tokines cy anti- inflamatórios. A quantidade de diluição de uma amostra, ou a um nível de detecção de um marcador, pode ser determinada pela condição ou história passada de um sujeito.
[0030] Os resultados do teste podem ser obtidas dentro de três horas, ou duas horas, ou uma hora ou meia hora, ou Jess a partir do momento que uma amostra é colocada num dispositivo de teste para análise. Uma amostra pode ser colocada num dispositivo de teste para análise dentro de cinco horas, ou quatro horas, ou três horas, ou duas horas, ou uma hora ou meia hora, ou menos do tempo de uma amostra foi obtido de um sujeito. Os resultados dos testes podem ser obtidas dentro de oito horas, sete horas, ou de seis horas ou cinco horas, ou três horas, ou duas horas, ou uma hora ou meia hora, ou menos do tempo de uma amostra foi obtido de um sujeito.
[0031] Em formas de realização, o requerente descreve um método de Ting detec um marcador da doença, que compreende: a) introdução de um cartucho compreendendo uma ou mais amostras para um dispositivo automático de processamento da amostra, o referido cartucho sendo configurado para conter, pelo menos, uma amostra e sendo configurado para realizar uma zaragatoa, em que o referido dispositivo de processamento automático de amostras compreende: i) uma amostra de manuseamento SY haste configurada para transportar pelo menos uma porção de uma amostra e estando configurado para transportar um ensaio unidade móvel de forma independente; e ii) um detector óptico; b) contacto de uma amostra, ou uma porção do mesmo, com uma unidade móvel de ensaio, ou um reagente, ou ambos, para a realização de um ensaio para a detecção de um marcador da doença, o referido contacto compreende o transporte, com a ajuda da referida manipulação de amostras sistema, pelo menos uma porção da referida amostra, ou de uma unidade móvel de ensaio, ou um reagente, ou suas combinações; c) posicionar a referida amostra, ou parte da mesma, num local adequado para a detecção de um sinal óptico a partir da amostra, ou parte do mesmo pelo referido detector óptico; e d) detectar a presença de um marcador da doença. Em formas de realização, um tal método pode compreender a execução de dois ou mais ensaios para a detecção de marcadores de doença, e a detecção de dois ou mais marcadores de doença em que as referidas uma ou mais amostras, ou em uma ou mais porções dos mesmos. Em formas de realização, a amostra tem um volume de menos do que cerca de 500 microlitros (JJL). Em formas de realização, as uma ou mais amostras compreende uma amostra de sangue; ou compreende uma amostra obtida utilizando uma zaragatoa; ou compreende tanto uma amostra de sangue e uma amostra obtida utilizando um cotonete. Em formas de realização, uma amostra obtida utilizando a referida mecha pode ser obtida por raspagem de uma boca, a garganta, uma passagem nasal, uma área vaginal, ou outra cavidade do corpo de um sujeito. Em formas de realização, o método compreende a detecção da presença de um marcador da doença de ácido nucleico e uma proteína marcador da doença.
[0032] Os métodos aqui descritos incluem a execução de dois ou mais ensaios para a detecção de marcadores de doença, e a detecção de dois ou mais marcadores de doença no referido amostras, ou em uma ou mais porções dos mesmos. Em formas de realização, os métodos compreendem a detecção da presença de um marcador da doença de ácido nucleico e uma proteína marcador da doença. Em formas de realização, o marcador de doença é selecionada a partir de um marcador de ácido nucleico doença, um marcador da doença proteína, um sacarídeo, uma prostaglandina, uma citocina, histamina, um esteroide, e um marcador de inflamação. Em formas de realização, dois ou mais marcadores de doenças são detectados, em que os marcadores de doenças são selecionados a partir de um marcador de ácido nucleico doença, um marcador da doença proteína, um sacarídeo, uma prostaglandina, uma citocina, histamina, um esteroide, e um marcador de inflamação. Em formas de realização, um marcador é um marcador para a inflamação selecionada a partir de prostaglandinas, fator de necrose tumoral alfa (TNF-ct), inierleukin-1 (IL-1), interleucina-8 (IL-8), interleucina-12 (IL-12), interferon gama (IF-γ), a bradicinina, as moléculas do sistema complemento, fatores de coagulação do sangue, proteína C-reativa, taxa de sedimentação de eritrócitos (ESR), contagem de células brancas do sangue, e alterações morfológicas no sangue e outros células.
[0033] Em formas de realização, um marcador é um marcador para um agente causador de doença, em que o referido agente causador de doença é selecionada a partir do grupo de organismos causadores de doenças que consistem de um vírus, uma bactéria, um micoplasma, um fungo, um de levedura e outros micro-organismos. Em formas de realização, um marcador da doença para um agente causador da doença é selecionada a partir do grupo que consiste em proteína Influenza A matriz, gripe H3N2, Influenza ΗΊΝ1 sazonal, Influenza ΗΤΝΊ romance, Influenza B, Streptococcus pyogenes (A), Mycobacterium Tuberculosis, Staphylococcus aureus (MR), Staphylococcus aureus (RS), a Bordetella pertussis (tosse convulsa), Streptococcus agalactiae (B), Influenza H5M 1, Vírus da gripe H7N9, Adenovírus B, C adenovírus, o adenovírus E, hepatite b. Hepatite C, hepatite delta, Treponema pallidum, HSV-1, HSV-2, HIV-1, HIV-2, Dengue I, Dengue 2, Dengue 3, Dengue 4, malária, vírus do Nilo Ocidental, Trypanosoma cruzi (Chagas), Klebsiella pneumoniae (Enterobacteriaceae spp), Klebsiella pneumoniae carbapenemase (CPK), vírus de Epstein Ban Vims (mono), rinovírus, vírus Parainfluenza (1), vírus Parainfluenza (2), parainfluenza vims (3), vírus Parainfluenza (4a), vims parainfluenza (4b), vírus sincicial respiratório (RSV) A, VIMS sincicial respiratório (RSV) B, Coronavirus 229E, Coronavirus HKUl, Coronavirus OC43, Coronavirus NL63, novo coronavírus, bocavirus, metapneumovírus humano (MPVH), Streptococcus pneumoniae (Penic R), Streptococcus pneumoniae (S), Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella parpertussis, Haemophilus influenzae (Amplo R), Haemophilus influenzae (amplo S), Moraxella catarrhalis, Pseudomonas spp
(aeruginosa), Haemophilus parainfluenza, Enterobacter cloacae (Enterobacteriaceae spp), Enterobacter aerogenes (Enterobacteriaceae spp), Serratia marcescens (Enterobacteriaceae spp), Acinetobacter baumanni, Legionella spp , Escherichia coli, Candida, Chlamydia trachomatis, vírus do Papiloma Humano, Neisseria gonorrhoeae, piasmodiiEm, e Trichomonas (vagin).
[0034] Em formas de realização, os métodos compreendem a detecção de um marcador da doença numa amostra de sangue e a detecção de um marcador da doença numa amostra obtida a partir de uma zaragatoa, que um dos referidos marcadores de doença é um marcador para a inflamação, e um dos referidos marcadores de doenças de um marcador de um agente causador de doença. Em formas de realização, um tal marcador para doença de inflamação é selecionada a partir de prostaglandinas, fator de necrose tumoral alfa (TNF-a), inte feukin ~ l (IL-l), interleucina-8 (11. -S;. Interleucina-12 (IL- l 2), interferon gama (IF-y), a bradicinina, as moléculas do sistema complemento, fatores de coagulação do sangue, proteína C Reativo, taxa de sedimentação de eritrócitos (ESR), contagem de células brancas do sangue, e alterações morfológicas no sangue e outras células e um tal marcador para doença de um agente causador de doença é selecionada a partir do grupo de organismos causadores de doenças que consistem de um vírus, uma bactéria, um mycoplasni, um fungo, uma levedura, e outros micro-organismos.
[0035] Em formas de realização, um marcador é um marcador de uma doença selecionada a partir de gripe, uma doença respiratória, uma doença sexualmente transmissível, e uma outra doença infecciosa. Em formas de realização em que a doença é a gripe, o marcador de doença é selecionada a partir de ΗΓΝ1 (sazonal), ΗΓΝ1 (novo), H3N2, H7M9, e H5N1. Em formas de realização, a doença é a doença respiratória selecionada a partir de uma doença respiratória superior e inferior de uma doença respiratória. Em formas de realização em que a doença é uma doença respiratória, o marcador pode ser um marcador de um organismo causador de doença selecionada de entre o grupo que consiste em vírus adeno vírus B, adenovírus C, adenovírus E, Bordetella pertussis, Mycobacterium tuberculosis (MTB), Staphylococcus aureus, Methicillm- Resistant Staphylococcus aureus (MRSA), estreptococos do grupo A, Grupo B estreptococos, Moraxella catarrhalis, Enterobacter aerogenes, Haemophilus parainfluenza, Metapneumo Vi rus. Streptococcus pneumonia, vírus Parainfluenza 1, vírus Parainfluenza 2, vírus Parainfluenza 3, coronavírus OC43, coronavírus NL63, Coronavirus MERS, Coronavirus HKU1, Coronavirus 229E, Klibsieila pneumonia PHOE, Klebsiella pneumonia KPC, Bocavirus tipo 2,4 e Bocavirus Tipo de 1,3.
[0036] Em formas de realização em que a doença é uma doença sexualmente transmitida, o marcador pode compreender um marcador para um organismo causador de doença indicativa de uma doença sexualmente transmitida selecionada de vírus herpes simplex (HSV), imunodeficiência humana vírus (HIV), HIV-2, Grupo A, HIV-2 Grupo B, HIV-1 grupo M, hepatite B, hepatite Delta, vírus do herpes simplex (HSV), Streptococcus B, e Treponema pallidum.
[0037] Em formas de realização, o método compreende a detecção de um marcador da doença numa amostra de sangue e a detecção de um marcador da doença numa amostra obtida a partir de uma zaragatoa, em que pelo festa um dos referidos marcadores de doença é um marcador para um organismo causador de doença indicativa de um doença respiratória selecionada a partir do grupo que consiste em adenovírus B, C adenovírus, o adenovírus E, Bordetelia pertussis, Mycobacterium tuberculosis (MTB), Staphylococcus aureus resistente à meticilina Staphylococcus aureus (MRSA), estreptococos do grupo A, Grupo B estreptococos, Moraxella caiarrhaiis, aerogenes Enierobacter, Haemophilus parainfluenza, Metapneumo Virus, Streptococcus pneumonia, Parainfluenza Virus 1, Parainfluenza vírus 2, Parainfluenza Virus 3, Coronavirus QC43, Coronavirus NL63, coronavirus MERS, coronavirus HKU1, coronavirus 229E, Klibsieila pneumonia PHOE, Klebsiella pneumonia KPC, Bocavirus tipo 2,4 e Boeavirus tipo de 1,3.
[0038] Em formas de realização em que a doença é uma doença infecciosa, o marcador da doença pode compreender um marcador para um agente causador de doença infecciosa selecionada a partir do grupo que consiste em vírus de Oeste do Nilo, vírus de Epstein-Barr, o Plasmodium, Trypanosoma cruzi, e um Dengue Vírus.
[0039] Em formas de realização compreendendo a detecção de um marcador da doença numa amostra de sangue e a detecção de um marcador da doença numa amostra obtida a partir de uma zaragatoa, em que pelo menos um dos referidos marcadores de doença é um marcador para um organismo causador de doença indicativa de uma doença sexualmente transmitida selecionada de vírus herpes simplex (HSV), vírus da imunodeficiência humana (HIV), Grupo o VIH-2 A, HIV-2 Grupo B, HIV-1 grupo M, hepatite B, hepatite Delta, vírus do herpes simplex (HSV), Streptococcus B, e treponema pallidum.
[0040] Em formas de realização compreendendo a detecção de um marcador da doença numa amostra de sangue e a detecção de um marcador da doença numa amostra obtida a partir de uma zaragatoa, em que pelo menos um dos referidos marcadores de doença é um marcador para um agente causador de doença selecionada de entre o grupo constituído por Nilo Ocidental Vims, vírus de Epstein-Barr, Plasmodium, Trypanosoma cruzi, e uma Vims Dengue.
[0041] Em formas de realização de métodos e TH de detecção de um marcador da doença, o método é um método de ponto de serviço realizada a uma localização ponto-de-Serviço. Em formas de realização de métodos de detecção de um marcador da doença, o método pode ser realizado em menos de cerca de 40 minutos. Em formas de realização compreendendo a detecção de um marcador da doença numa amostra de sangue e a detecção de um marcador da doença numa amostra obtida a partir de uma haste, o método é um método de ponto de serviço realizado num local de ponto-de-serviço. Em formas de realização compreendendo a detecção de uma doença marcador numa amostra de sangue e a detecção de um marcador da doença numa amostra obtida a partir de uma haste, o método pode ser executado em menos do que cerca de 40 minutos,
[0042] Por exemplo. Requerente descreve aqui um método para determinar a fase de uma infecção num indivíduo que sofre de uma infecção, que compreende: Testar pelo menos uma amostra, ou uma alíquota ou alíquotas dos mesmos, obtidos a partir do referido sujeito 1) para a presença de um ácido nucleico indicativos de a infecção, e 2) para a presença de um anticorpo indicativo da infecção, e determinar se as quantidades relativas de a) ácidos nucleicos indicativos da infecção e b) anticorpos indicativos da infecção indicam que o intection é uma infecção recente, caracterizado i) maior relati vo montante dos ácidos nucleicos indicativos da infecção, em comparação com a quantidade relativa de anticorpos indicativos da infecção indicam que a infecção é uma infecção recente, e ii) uma quantidade significativa de anticorpos contra o agente infeccioso indicam a infecção não é uma infecção recente. Em formas de realização de um tal método, a amostra de pelo menos um compreende uma amostra de sangue. Em formas de realização de um tal método, a amostra de pelo menos um composto de uma amostra selecionada a partir de uma amostra de faringe, uma amostra cotonete bucal, nasal cotonete amostra, uma amostra de saliva, e uma amostra de sangue. Em formas de realização de um tal processo, em que é detectada uma quantidade significativa de anticorpo contra o agente infeccioso, e onde os marcadores de ácido nucleico indicativos do agente infeccioso são relativamente escasso, em seguida, o método indica que a infecção é uma fase tardia e que a infecção está diminuindo.
[0043] Em formas de realização, um tal método pode ainda incluir testando uma amostra ou amostras para um marcador de inflamação. Em formas de realização, o marcador de inflamação pode ser selecionada a partir de uma prostaglandina, fator de necrose tumoral alfa (TNF-a), interieukm- 1 (IL-1), interleucina-8 (IL-8), interleucina-12 (IL-12) , interferão gama (TF-γ), bradiquinina, uma molécula do sistema complemento, um fator de coagulação do sangue, e uma alteração morfológica em sangue ou outra célula. Em formas de realização, o marcador de inflamação é uma citocina selecionada a partir de um lympbokine,
uma quimioquina, uma interfeukin, e um interferão.
[0044] Em formas de realização, um processo aqui descrito compreende o teste para determinar se o indivíduo sofre de uma infecção bacteriana, uma infecção virai, uma infecção por fungos, uma infecção por micoplasma, uma infecção por fungos, infecção por outro, ou a combinação dos mesmos. Em formas de realização, tais ensaios compreende determinar se os marcadores indicativos de infecção virai ou marcadores indicativos de infecção bacteriana são detectados, eficaz para determinar se o indivíduo sofre de uma infecção bacteriana ou uma infecção viral.
[0045] Em formas de realização dos métodos aqui descritos, os métodos compreendem ainda a prescrição de receita médica adequada para o tratamento da infecção. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende prescrição de um antibiótico quando o ensaio determina que o sujeito sofre de uma infecção bacteriana. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende a prescrição de um medicamento anti-micoplásmica quando o ensaio determina que o sujeito sofre de uma infecção por micoplasma. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende a prescrição de um arrasto anti-viral quando o ensaio determina que o sujeito sofre de uma infecção viral. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende evitando a prescrição de um antibiótico, em que o teste determina que o sujeito sofre de uma infecção viral. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende evitando a prescrição de um antibiótico, e proporcionando a prescrição de uma droga antiviral, quando o ensaio determina que o sujeito sofre de uma infecção viral. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende a prescrição de um medicamento antifúngico quando o ensaio determina que o sujeito sofre de uma infecção fúngica. Em formas de realização, os métodos aqui divulgados compreendem proporcionar uma receita adequada para o tratamento da referida infecção compreende a prescrição de um medicamento anti-levedura quando o ensaio determina que o sujeito sofre de uma infecção por fungos.
[0046] Em formas de realização, os métodos compreendem a detecção de uma doença, em que a doença detectada é causada por um agente causador de doença selecionada de entre o grupo de organismos causadores de doenças que consistem de um vírus, uma bactéria, um micoplasma, um fungo, uma levedura , e outros micro-organismos, e que compreende ainda o fornecimento de uma prescrição para o tratamento adequado do referido vírus, bactéria, micoplasma, fungos, levedura, ou outro microrganismo.
[0047] Em formas de realização, os métodos são métodos de ponto de serviço realizado num local de ponto-de-serviço. Em formas de realização, os métodos compreendem a realização de uma pluralidade de ensaio s numa única amostra clínica volume pequenas, ou em alíquotas da mesma, e pode ser realizada em menos de cerca de 40 minutos. Em formas de realização, a infecção é causada por uma doença selecionada a partir de gripe, uma doença respiratória, uma doença sexualmente transmissível, e uma outra doença infecciosa. Em formas de realização onde a infecção compreende a gripe, a gripe pode ser selecionada a partir de H1N1 (sazonal), H1N1 (novo), H3N2, H7N9 e H5N 1. Em formas de realização onde a infecção compreende uma doença respiratória, a infecção pode ser selecionada a partir de uma parte superior doença respiratória e doença respiratória inferior. Em formas de realização, a doença respiratória é selecionada a partir do grupo que consiste em adenovírus B, adenovírus C, adenovírus E, Bordetella pertussis, Mycobacterium tuberculosis (MTB), Staphylococcus aureus, resistente à meticilina Staphylococcus aureus (MRSA), Streptococcus do grupo A, estreptococos do grupo B , Moraxella catarral] s, Enterobacter aerogenes, Haemophilus parainfluenza, Metapneumo Vims, Streptococcus pneumonia, Parainfluenza Virus 1, Parainfluenza Vims 2, Parainfluenza Vims 3, Coronavirus OC43, Coronavirus NL63, Coronavirus MERS, Coronavirus HKU1, Coronaviras 229E, Klibsieila pneumonia PHOE, Klebsiella pneumonia KPC, Bocavirus tipo 2,4 e Bocavirus tipo 1, 3.
[0048] Em formas de realização, a infecção compreende uma doença sexualmente transmitida selecionada a partir de uma doença causada por herpes vims simplex (HSV), vírus da imunodeficiência humana (HIV), Grupo o VIH-2 a, VIH-2, do grupo B, o HIV-1 grupo M , hepatite B, hepatite Delta, heipes vims simplex (HSV), Streptococcus B, e Treponema pallidum. Em formas de realização, a infecção compreende uma doença causada por um agente infeccioso causador de doença selecionada de entre o grupo que consiste em proteína Influenza A matriz, gripe H3N2, HlNl Influenza sazonal, Influenza H LNL romance, Influenza B, Streptococcus pyogenes (A), Mycobacterium Tuberculosis, Staphylococcus aureus (MR), Staphylococcus aureus (RS), a Bordetella pertussis (tosse convulsa), Streptococcus agalactiae (B), da gripe H5N1, H7N9 influenza, Adenovírus B, adenovírus C, adenovírus E, hepatite b. Hepatite C, hepatite delta, Treponema pallidum, HSV 1, HSV-2, HIV-1, HIV-2, dengue 1, dengue 2, dengue 3, Dengue 4, malária, vírus do Nilo Ocidental, Trypanosoma cruzi (Chagas), Klebsiella pneumoniae (Enterobacteriaeeae spp), Klebsiella pneumoniae carbapenemase (CPK), vírus Epstein Barr (mono), rinovírus, vims parainfluenza (1), vírus Parainfluenza (2), parainfluenza vims (3), vims parainfluenza (4a), o vírus parainfluenza (4b ), respiratórias VIMS sincicial (RSV) A respirador VIMS sincicial (RSV) B, Coronavirus 229E, Coronavirus HKU1, Coronavirus OC43, Coronavirus NL63, Novel Coronaviras, Bocavirus, metapneurnovirus humana (MPVH), Streptococcus pneumoniae (Penic R), Streptococcus pneumoniae (S), Mycoplasma pneumoniae. Chlamydia pneumoniae, Bordetella parpertussis, Haemophilus influenzae (ampic R), Haemophilus influenzae (ampic S), Moraxella catarrhalis, Pseudomonas spp (aeruginosa), Haemophilus parainfluenza, Enterobacter cloacae (Enterobacteriaeeae spp), Enterobacter aerogenes (Enterobacteriaeeae spp), Serratia marcescens (Enterobacteriaeeae spp),
Acinetobacter baumanii, Legionella spp, Escherichia coli, Candida, Chlamydia trachomatis, vírus do Papiloma Humano, Neisseria gonorrhoeae, o Plasmodium, e Trichomonas (vagin).
[0049] Em formas de realização, a infecção compreende uma infecção bacteriana causada por bactérias selecionadas a partir do grupo que consiste em Bordetella pertussis, Mycobacterium tuberculosis (MTB), Staphylococcus aureus, resistente à meticilina Staphylococcus aureus (MRSA), estreptococos do grupo A, Grupo B estreptococos, catarrhalis Moraxelia, Enterobacter aerogenes, Haemophilus parainfluenza, Streptococcus pneumonia, pneumonia Klibsiella PHOE, Klebsiella pneumonia KPC e treponema pallidum.
[0050] Em formas de realização, a infecção compreende uma infecção viral causada por um vírus selecionada a partir do grupo consistindo de um vírus da influenza, vírus da herpes simplex (HSV), o vírus da imunodeficiência humana (HIV), Grupo o VIH-2 A, HIV-2 Grupo B, HIV-l Grupo H, hepatite B, hepatite Delta, vírus do herpes simplex (HSV), Oeste do Nilo Vims, vírus de Epstein-Barr, vírus da dengue, adenovírus B, C adenovírus, vírus adeno vírus E, vírus Metapneumo, Parainfluenza 1 vírus , Parainfluenza vírus 2, Parainfluenza Virus 3, Coronavirus OC 3, coronavírus NL63, Coronavirus MERS, Coronavirus HKU1, Coronavirus 229E, Bocavirus tipo 2,4 e Bocavirus tipo de 1,3. Em formas de realização de infecções de gripe, a gripe pode ser selecionada a partir de HIN I (sazonal), H1N1 (novo), H3N2, H7N9, e os vírus da gripe HSNL. Em formas de realização, uma infecção viral compreende a infecção por um vírus Dengue, em que o referido vírus da dengue é selecionado a partir de vírus da dengue tipo 1, Dengue vírus tipo 2, Dengue vírus tipo 3, e Dengue VIMS tipo 4.
[0051] Um projeto de lei para o teste podem ser gerados automaticamente no POS. O montante da factura pode ser calculado por testes realizados, ou em conformidade com os resultados do teste. Um projeto de lei para o teste podem ser enviadas automaticamente para o provedor de seguros do sujeito.Pagamento para o teste pode ser obtido automaticamente a partir do sujeito, ou de operadora de seguros do sujeito, ou fro outra fonte.
[0052] Uma prescrição para o tratamento de uma desordem detectado pode ser fornecida no local de POS. Uma prescrição para o tratamento de uma desordem detectado pode ser cheio no local de POS. Um projeto de lei para a prescrição preenchida pode ser gerado automaticamente. Um projeto de lei para a prescrição pode ser automaticamente enviado para provedor de seguros do sujeito. O pagamento da prescrição preenchida pode ser obtido automaticamente a partir do sujeito, ou de operadora de seguros do sujeito, ou de outra fonte.
[0053] Por conseguinte, os Requerentes fornecer sistemas, métodos e dispositivos para a análise rápida de uma amostra clínica de volume pequena em um curto período de tempo. Tal análise rápida inclui testes para a presença de marcadores indicativos de uma pluralidade de agentes causadores de doença em um curto período de tempo. Em formas de realização, esses agentes causadores de doenças incluem agentes que causam doenças respiratórias superiores, e incluem agentes que causam menores respiratórias- distúrbios. Em formas de realização, tais sistemas, métodos e dispositivos são configurados para detectar um ou mais indicadores de inflamação. Em formas de realização, tais sistemas, métodos e dispositivos são configurados para detectar uma ou mais citocinas. Em formas de realização, tais sistemas, métodos e dispositivos são configurados para detectar uma ou mais citoquinas inflamatórias. Em formas de realização, tais sistemas, métodos e dispositivos são configurados para detectar uma ou mais citocinas anti-inflamatórias.
[0054] Em formas de realização, os Requerentes proporcionam sistemas, métodos e dispositivos para a detecção de uma pluralidade de agentes patogênicos numa única amostra clínica, ou numa pluralidade de alíquotas de uma única amostra clínica. Em formas de realização, uma única amostra clínica pode ser um volume de amostra clínica pequena de sangue, saliva, lágrimas, algodão nasal, esfregaços da garganta, compressas boca (por exemplo, cotonetes do mordente), secreção vaginal, ou outro fluido corporal, o tecido, a secreção ou excreção feita a partir de um sujeito. Em formas de realização, uma única amostra clínica tem um volume de menos do que cerca de 500 μl, ou menos do que cerca de 250 μl., Ou menos do que 150 μl ,, ou menos do que cerca de 100 ou menos do que cerca de 50 μl ,, ou menos do que cerca de 25 jil ou menos de cerca de 10 iil, ou menos do que cerca de 5 μl. ,, ou menos do que cerca de 1 μ3_ ,, ou menos.
[0055] Em formas de realização, as amostras clínicas podem ser obtidas em um (POS) de localização de ponto-de-serviço. A localização POS pode ser, por exemplo, uma farmácia, um supermercado, um hospital, uma clínica, um consultório médico, ou outro local. As amostras clínicas podem ser testadas no local POS para vários marcadores indicativos de agentes que podem provocar uma ou mais de uma pluralidade de doenças (por exemplo, pelo menos oito, ou pelo menos 10, ou pelo menos 12, ou pelo menos 20, ou pelo menos 30, ou pelo menos 40, ou pelo menos 50, ou pelo menos 60, ou mais marcadores, indicativos das mesmas ou semelhantes números de doenças diferentes). O teste pode ser completada num curto período de tempo. Em formas de realização, o curto período de tempo pode ser medido a partir do momento que a amostra é inserido num dispositivo ou sistema para a realização de uma análise. Em formas de realização, o curto período de tempo pode ser medido a partir do momento que a amostra é obtida a partir do sujeito.
[0056] Em formas de realização, as amostras clínicas podem ser analisadas numa localização POS. Em formas de realização, as amostras clínicas obtidas numa localização POS podem ser analisados no mesmo local de POS. Em formas de realização, as amostras clínicas podem ser obtidos a um (POS) localização do ponto-de-serviço e podem ser analisadas em um local diferente. Em formas de realização, as amostras clínicas talvez analisados num curto período de tempo, por exemplo, num período de tempo que é inferior a cerca de 5 horas, ou menos de cerca de 4 horas, ou menos de cerca de 3 horas, ou menos de cerca de 2 horas, ou menos do que cerca de I hora, ou menos de cerca de meia hora.
[0057] Em formas de realização, os Requerentes proporcionam dispositivos (por exemplo, cartuchos) para utilização na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes patogênicos numa única amostra clínica, ou numa pluralidade de alíquotas de uma única amostra clínica.
Em formas de realização, um tal dispositivo pode compreender uma pluralidade de reservatórios que contêm os reagentes para utilização num ensaio para a detecção de uma pluralidade de marcadores indicativos de um agente infeccioso, por exemplo, um agente infeccioso das vias respiratórias superiores; um agente infeccioso respiratório inferior; um agente causador de doença sexualmente transmissível; um agente detectável a partir de uma amostra obtida a partir de uma haste (por exemplo, uma haste de garganta, um cotonete nasal, ou outra compressa); um agente detectável a partir de uma amostra de sangue; ou as suas combinações, em formas de realização, um dispositivo pode ser um cartucho configurado para conter uma pluralidade de reservatórios de reagentes.
Em formas de realização, um dispositivo pode ser um cartucho configurado para conter um recipiente de reagente contendo um reagente para a detecção de um marcador indicativo de um agente causador de doença.
Em formas de realização, um dispositivo pode ser um cartucho configurado para conter uma pluralidade de reservatórios de reagentes que contêm reagentes para a detecção de um marcador indicativo de um agente causador de doença.
Em formas de realização, um tal agente causador da doença, ou uma pluralidade de tais agentes causadores de doenças, inclui os agentes causadores de doenças que causam perturbações das vias respiratórias superiores.
Em formas de realização, um tal agente causador da doença, ou uma pluralidade de tais agentes causadores de doenças, inclui os agentes causadores de doenças que causam perturbações respiratórias inferiores.
Em formas de realização, um tal agente causador da doença, ou uma pluralidade de tais agentes causadores de doenças, inclui os agentes causadores de doenças que causam doenças sexualmente transmissíveis.
Em formas de realização, um tal agente causador da doença, ou uma pluralidade de tais agentes causadores de doenças, inclui os agentes causadores de doenças que ma ser detectados numa amostra de sangue.
Em formas de realização, um tal agente causador da doença, ou uma pluralidade tal de agentes causadores de doenças, inclui os agentes causadores de doenças que podem ser detectados numa amostra obtida com uma zaragatoa, tais como uma haste de garganta, ou um cotonete nasal, ou um cotonete bucal, ou outra amostra, ou combinações dos mesmos.
[0058] Em formas de realização, os dispositivos para utilização na realização de ensaios para a detecção de uma pluralidade de agentes causadores de doença conforme aqui descrito pode ainda incluir um espaço, ou um vaso, para a realização de uma haste; ou pode ainda incluir um espaço, ou um vaso, para a realização de duas compressas, ou uma pluralidade de hastes. Em formas de realização, esses dispositivos podem ainda incluir dois espaços, ou dois navios, para a realização de duas compressas; ou pode incluir uma pluralidade de espaços, ou de navios, para a realização de uma pluralidade de hastes. Em formas de realização, uma única mecha pode ser colocada em um único espaço, ou recipiente; em formas de realização, duas compressas podem ser piaced em um único espaço, ou navio; e em formas de realização, uma pluralidade de amostras de esfregaços podem ser colocados num único espaço, ou navio. Assim, em formas de realização, um esfregaço pode ser colocado num recipiente, e, em formas de realização, um esfregaço, ou uma pluralidade de hastes, podem ser colocados num único vaso. Em formas de realização, uma pluralidade de amostras de esfregaços podem ser piaced num pluralidade de vasos. Uma embarcação tal para a realização de um cotonete ou recipientes para compressas, segurando, podem conter um reagente, ou um diluente, ou outra solução para uso com uma amostra ou cotonetes. Em formas de realização, um recipiente para a realização de uma zaragatoa pode ser utilizada para fornecer um cotonete limpo para uso na obtenção de uma amostra. Em formas de realização, um recipiente para a realização de uma zaragatoa pode ser utilizada para I) fornecer um cotonete limpo para uso na obtenção de uma amostra e também para ii) receber o esfregaço após a sua utilização na obtenção de uma amostra de um indivíduo. Em formas de realização, um recipiente para conter uma pluralidade de amostras de esfregaços podem ser usadas para proporcionar uma pluralidade de hastes de limpeza para usar na obtenção de uma amostra. Em formas de realização, um recipiente para conter uma pluralidade de amostras de esfregaços podem ser utilizados para i) proporcionar uma pluralidade de hastes de limpeza para usar na obtenção de uma amostra e também para ii) receber um ou mais da pluralidade de esfregaços após a sua utilização na obtenção de uma amostra a partir de um sujeito.
[0059] Por exemplo, uma haste de garganta e um cotonete nasal pode ser obtida de um sujeito. Um esfregaço nasal pode ser útil para testar para doenças das vias respiratórias superiores, e uma haste de garganta pode ser útil para testar doenças respiratórias inferiores. Em formas de realização, IHE esfregaço da garganta pode ser colocado em um recipiente num dispositivo (por exemplo, um cartucho), e o cotonete nasal pode ser colocado num recipiente diferente no dispositivo. Estes recipientes podem conter um reagente, ou um diluente, ou outra solução para uso com os cotonetes; tais reagentes podem ser diferentes para o esfregaço da garganta e do algodão nasal. Em formas de realização, a haste de garganta e a nasal podem ser colocados no mesmo vaso em um dispositivo. O recipiente pode conter um reagente, ou um diluente, ou outra solução para utilização com estes esfregaços. O dispositivo pode ser colocado num dispositivo de análise, ou dentro de um sistema de análise para análise. Tais dispositivos de análise e sistemas de análise, podem ser colocados no mesmo local como aquele em que se obteve a amostra; ou tais dispositivos de análise e sistemas de análise podem estar em um local ou locais do que o local onde foi obtida a amostra diferente.
[0060] Em formas de realização, um dispositivo pode ser ou compreender um cartucho configurado para conter um recipiente de reação ou numa pluralidade de vasos de reagente. Em formas de realização, um dispositivo pode ser ou compreender um cartucho configurado para conter um recipiente de reação ou numa pluralidade de vasos de reação. Em formas de realização, um dispositivo pode ser um cartucho configurado para conter uma cuvete citometria, ou uma pluralidade de cubetas citometria. Em formas de realização, um dispositivo pode ser ou compreender um cartucho configurado para conter um recipiente de descarte, ou uma pluralidade de contentores de lixo. Em formas de realização, um dispositivo pode ser ou compreender um cartucho configurado para conter uma amostra; Em formas de realização, uma amostra pode estar contida num dispositivo de recolha de amostras. Em formas de realização, um dispositivo pode ser ou compreender um cartucho configurado para conter um recipiente de recolha de amostra.
[0.061,3 Em formas de realização, um dispositivo pode ser ou compreender um cartucho configurado para conter um recipiente de reagente, ou uma pluralidade de vasos de reagente, e um recipiente de reação ou numa pluralidade de vasos de reação. Em formas de realização, um tal dispositivo pode incluir reagentes para utilização em ensaios de ácidos nucleicos: para imunoensaios (por exemplo, ensaios ELISA); ensaios de química geral (por exemplo, para eletrólitos clínicos, os níveis de vitamina, os níveis de componente do sangue, e outros alvos); ensaios de citometria; e para suas combinações. Em formas de realização, um tal dispositivo pode incluir reagentes e vasos de reação para utilização em ensaios de ácidos nucleicos; para imunoensaios (por exemplo, ensaios ELISA);ensaios de química geral (por exemplo, para eletrólitos clínicos, os níveis de vitamina, os níveis de componente do sangue, e outros alvos); ensaios de citometria; e para suas combinações. Em formas de realização, um tal dispositivo pode incluir reagentes, vasos de reação, e ferramentas, tinas, e outros instrumentos para utilização em ensaios de ácidos nucleicos; para imunoensaios (por exemplo, ensaios ELISA); ensaios de química geral (por exemplo, para eletrólitos clínicos, os níveis de vitamina, os níveis de componente do sangue, e outros alvos); ensaios de citometria; e para suas combinações.
[0062] Por conseguinte, os requerentes descrevem sistemas para a detecção da presença de um ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa, de uma amostra clínica de pequeno volume, que compreende: a) um sistema de manipulação de amostra;
b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) um fluidicamente isolado unidade de coleta de amostra configurado para reter uma amostra clínica; d) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, um fsrst e uma segunda unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente e a segunda unidade compreende um segundo reagente; e e) um controlador, em que o controlador compreende uma memória local e é operativamente acoplado ao sistema de manipulação de amostra e a estação de detecção; em que o sistema está configurado para executar um ensaio s com ou ambas as primeira e segunda unidades de ensaio; em que a memória local do controlador compreende um protocolo compreendendo instruções para: i) a direção do sistema de manuseamento de amostras para transferir uma porção da amostra clínica para a primeira unidade de ensaio e para a segunda unidade de ensaio; e ii) dirigir o sistema de manuseamento de amostras para transferir a primeira unidade de doseamento e a segunda unidade de unidade de ensaio para a estação de detecção.
[0063] Por conseguinte, os requerentes descrevem sistemas para a detecção da presença de um ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa de uma amostra clínica de volume pequenas, compreendendo: a) um sistema de manipulação de amostra; b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) um fluidicamente isolado unidade de coleta de amostra configurado para reter uma amostra clínica; d) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira, segunda, e terceira unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente, a segunda unidade compreende um segundo reagente, e a terceira unidade compreende um terceiro reagente; e e) um controlador, em que o controlador compreende uma memória local e é operativo} 'acoplado ao sistema de manipulação de amostra e a estação de detecção de!; em que o sistema é configurado para executar os ensaios com qualquer um ou mais dos primeiro, segundo e terceiro as unidades de ensaio: em que a memória local do controlador compreende um protocolo compreendendo instruções para: i) a direção do sistema de manuseamento de amostras para transferir uma porção de a amostra clínica para a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio e a terceira unidade de ensaio; e ii) dirigir o sistema de manuseamento de amostras para transferir a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio, e a terceira unidade de ensaio para a estação de detecção. Em formas de realização, a haste SY pode incluir apenas duas unidades de ensaio; ou pode incluir quatro unidades de ensaio; ou pode incluir mais do que quatro unidades de ensaio.
[0064] Em formas de realização, o sistema é um sistema de ponto-de serviço. Em formas de realização, o sistema está contido dentro de um alojamento. Em formas de realização, o sistema está localizado num local de ponto-de-serviço, e é configurado para ser utilizado na análise de uma amostra no dito local ponto-de-serviço. Em formas de realização, o sistema é um sistema de ponto de serviço configurados para realizar uma pluralidade de ensaios numa única amostra de pequeno volume ou em alíquotas da mesma.
[0065] Os requerentes descrevem ainda os sistemas para a detecção da presença de um ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa, de uma amostra clínica de pequeno volume, que compreende: a) um sistema de manipulação de amostra; b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) um sistema de manipulação de fluido configurado para transportar líquidos entre os componentes do referido sistema, em que o referido transporte de fluidos compreende transporte de alíquotas isolados de fluido; d) um fluidicamente isolado unidade de coleta de amostra configurado para reter uma amostra clínica; e) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira, segunda, e terceira unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente, a segunda unidade compreende um segundo reagente, e a terceira unidade compreende um terceiro reagente; e f) um controlador, em que o controlador compreende uma memória local e está operacionalmente acoplado ao sistema de manipulação de amostra e a estação de detecção; em que o sistema é configurado para executar os ensaios com qualquer uma ou mais das primeira, segunda, e terceira unidades de ensaio; em que a memória local do controlador compreende um protocolo compreendendo instruções para: i) a direção do sistema de manuseamento de amostras para transferir uma porção da amostra clínica para a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio e a terceira unidade de ensaio; e ii) dirigir o sistema de manuseamento de amostras para transferir a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio, e a terceira unidade de ensaio para a estação de detecção.
[0066] Em formas de realização, o sistema é um sistema de ponto-de serviço. Em formas de realização, o sistema está contido dentro de um alojamento. Em formas de realização, o sistema de manipulação de fluido é configurado para transportar o fluido dentro do dito alojamento. Em formas de realização, o sistema está localizado num local de ponto-de-serviço, e é configurado para ser utilizado na análise de uma amostra no referido local de ponto-de-serviço. Em formas de realização, o sistema é um sistema de ponto de serviço configurado para executar uma pluralidade de ensaio s numa única amostra de pequeno volume ou em alíquotas da mesma.
[0067] Em formas de realização, os requerentes divulgam um sistema de processamento de amostra clínica, que compreende: a) um sistema de manipulação de amostra; b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) uma unidade de recolha de amostra fluidicamente isolado configurado para reter uma amostra clínica; d) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira, segunda, e terceira unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um anticorpo, a segunda unidade compreende um oligonucleótido, e a terceira unidade compreende um cromógeno ou um corante ou outro marcador; e e) um controlador, em que o controlador é acoplado operacionalmente ao sistema de manipulação de amostra, em que o sistema de manipulação de amostra é configurado para transferir uma porção da amostra clínica a partir da unidade de recolha de amostra para cada uma das primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio, e a terceira unidade de ensaio, e o dispositivo é configurado para realizar um imunoensaio, um ensaio de ácido nucleico, e um ensaio de química geral compreendendo um cromógeno. Em formas de realização, o sistema é um sistema de ponto-de serviço. Em formas de realização, o sistema está contido dentro de um alojamento. Em formas de realização, o sistema está localizado num local de ponto-de-serviço, e é configurado para ser utilizado na análise de uma amostra no referido local de ponto-de-serviço. Em formas de realização, o sistema é um sistema de ponto de serviço configurados para realizar uma pluralidade de ensaios numa única amostra de pequeno volume ou em alíquotas da mesma.
[0068] Em formas de realização, os requerentes divulgam métodos de realização, pelo menos, 4 ensaios diferentes selecionados a partir de imunoensaios, ensaios de ácidos nucleicos, ensaios de citometria de, e ensaios de química geral numa amostra clínica de pequeno volume, que compreende: a) introdução de uma amostra clínica que tem um volume que não é maior do que 500 microlitros em um dispositivo de processamento de amostras, em que o dispositivo compreende: i) um sistema de manipulação de amostra; ii) uma estação de detecção; iii) uma estação de citometria que compreende um dispositivo de imagem e um palco para receber uma cuvete microscopia; e iv) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira, uma segunda, uma terceira, e uma quarta unidade de ensaio, independentemente móveis; b) com o auxílio da amostra do sistema Han d Ling, a transferência de uma porção da amostra clínica para cada uma das primeira, e as unidades de ensaio, segundo, terceiro, quarto, em que um ensaio diferente é realizada em cada uma das primeira, segunda, terceira e unidades de ensaio quarta; C) com a ajuda do sistema de manuseamento de amostras, a transferência do primeiro, segundo, terceiro, e unidades quarto ensaio para a estação de detecção ou estação de citometria, em que as unidades de ensaio compreendendo imunoensaios ou ensaios de química geral são transferidos para a estação de detecção e as unidades de ensaio compreendendo ensaios de citometria são transferidos para a estação de citometria; d) com o auxílio da estação de detecção ou estação de citometria, a obtenção de medições de dados do ensaio realizado em cada uma das primeira, segunda, terceira, e quarta unidades de ensaio.
[0069] Em formas de realização, os métodos são métodos de ponto de serviço. Em formas de realização, o sistema utilizado na realização dos métodos está contido dentro de um alojamento. Em formas de realização, os métodos são realizados a uma localização de ponto-de-serviço, e pode ser usado na análise de uma amostra no referido local de ponto-de-serviço. Em formas de realização, os métodos compreendem o ponto de métodos de serviço para a realização de uma pluralidade de ensaios numa única amostra de pequeno volume ou em alíquotas da mesma.
[0070] Em formas de realização, os métodos incluem métodos de determinação do tipo de infecção sofrida por um sujeito. Os métodos de determinação do tipo de infecção, tal como aqui divulgadas incluem, sem limitação, métodos como aqui descritos que compreende a determinação se um indivíduo sofre de uma infecção bacteriana, virai, de levedura, fungo, e outra infecção. Por exemplo, os métodos de determinação do tipo de infecção, como revelado na presente invenção incluem métodos para determinar se um sujeito sofre de uma infecção bacteriana ou de uma infecção viral. Em formas de realização, os métodos incluem métodos para detectar, identificar, quantificar, e as suas combinações, marcadores numa amostra indicativo do tipo de infecção sofrida por um sujeito. Os métodos de detecção, identificação, quantificação, e as suas combinações, marcadores numa amostra indicativo do tipo de infecção, tal como aqui divulgadas incluem, sem limitação, métodos como aqui descrito compreendendo a detecção, identificação, quantificação, e as suas combinações, marcadores numa amostra indicativa de uma infecção bacteriana, virai, de levedura, fungo, e outra infecção. Por exemplo, métodos como os descritos na presente invenção incluem métodos para detectar, identificar, quantificar, e suas combinações, marcadores numa amostra indicativa de uma infecção bacteriana ou uma infecção viral.
[0071] Os métodos aqui divulgados podem ser utilizados para determinar se um sujeito sofre de, por exemplo, uma infecção bacteriana, virai, de levedura, fungo, e outra infecção. Determinação do tipo de infecção, tal como aqui divulgado pode ser utilizado para orientar a terapia do sujeito que sofre de infecção.Determinação do tipo de infecção, tal como aqui divulgado pode ser utilizado para orientar a seleção de produtos farmacêuticos para o tratamento do sujeito que sofre de infecção. Determinação do tipo de infecção, tal como aqui divulgado pode ser utilizado para orientar a seleção da dosagem, ou o regime de dosagem, de fármacos utilizados para o tratamento do sujeito que sofre de infecção. Por exemplo, os métodos aqui divulgados podem ser utilizados para determinar se um indivíduo sofre de uma infecção bacteriana ou uma infecção viral. A determinação de se um sujeito sofre de uma infecção bacteriana ou uma infecção virai, tal como aqui divulgado pode ser utilizado para orientar a terapia do sujeito que sofre de infecção. A determinação de se um sujeito sofre de uma infecção bacteriana ou uma infecção virai, tal como aqui divulgado pode ser utilizado para orientar a seleção de produtos farmacêuticos para o tratamento do sujeito que sofre de infecção. A determinação de se um sujeito sofre de uma infecção bacteriana ou uma infecção virai, tal como aqui divulgado pode ser utilizado para orientar a seleção de um produto farmacêutico, a seleção da dosagem, o regime de dosagem, ou uma combinação dos mesmos, usado no tratamento do sujeito que sofre a partir da infecção. Por exemplo, onde a infecção é determinada para ser uma infecção bacteriana, podem ser prescritos antibióticos; no entanto, onde a infecção é determinada para ser uma infecção viral, os antibióticos não são indicados, e, em formas de realização, não vai ser fixado. Determinação de que um sujeito sofre de uma infecção viral pode permitir que o sujeito a evitar o tratamento e despesas desnecessárias (por exemplo, onde a terapia de antibiótico é evitado quando a infecção é identificado como sendo uma infecção virai). Determinação de que um sujeito sofre de uma infecção viral pode permitir que o objeto de obter uma terapia mais adequada dirigida a infecções virais, em oposição à terapia antibiótica que é dirigida a infecções bacterianas.
[0072] Do mesmo modo, a determinação de se um sujeito sofre de uma levedura, fungo, e outra infecção, em oposição a uma infecção bacteriana ou viral, pode orientar ou determinar a terapia fornecida a um indivíduo que sofre de uma doença infecciosa, incluindo orientação ou determinação a seleção de um produto farmacêutico, a seleção da dosagem, o regime de dosagem, ou uma combinação dos mesmos, usado no tratamento do sujeito que sofre de infecção.Determinação do tipo de infecção pode permitir que o objeto de obter uma terapia mais adequada direcionado para o tipo específico de infecção sofrido pelo sujeito, em oposição ao inadequado, ou menos específicos, a terapia que pode não ser tão eficaz para este tipo de infecção.
[0073] Por conseguinte, os requerentes divulgam métodos da presente invenção para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, compreendendo: o fornecimento de uma amostra clínica obtida de um sujeito; analisar a referida amostra clínica, em que a análise inclui testes para, ou a detecção da presença de, uma pluralidade de marcadores de doença, na amostra clínica; determinar um tratamento adequado para uma doença indicada pela presença de um marcador detectado pelo referido análise; e proporcionar uma prescrição para o referido tratamento adequado. Os requerentes descrevem ainda métodos da presente invenção para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, compreendendo: o fornecimento de uma amostra clínica obtida de um sujeito; analisar a referida amostra clínica num local de ponto de serviço (POS), em que a análise inclui testes para, ou a detecção da presença de, um pluralidade de marcadores de doença, na amostra clínica; determinar um tratamento adequado para uma doença indicada pela presença de um marcador detectado pelo referido análise; e proporcionar uma prescrição para o referido tratamento adequado.
[0074] Em formas de realização de métodos para Ding provi uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, a análise da amostra compreende a análise para determinar se o indivíduo sofre de uma infecção bacteriana, uma infecção virai, uma infecção por fungos, uma infecção por fungos infecção, outra infecção, ou combinação dos mesmos em formas de realização de métodos para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, a análise da amostra compreende a análise para determinar se o indivíduo sofre de uma infecção bacteriana ou uma infecção viral.Em formas de realização de métodos para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, onde a análise da amostra determina thai o sujeito sofre de uma infecção bacteriana, proporcionando uma prescrição para o referido tratamento compreende a prescrição adequada de um antibiótico. Em formas de realização de métodos para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, onde a análise da amostra determina que o sujeito sofre de uma infecção virai, proporcionando uma prescrição para o referido tratamento adequada compreende evitando a prescrição de um antibiótico, e podem incluir a prescrição de um medicamento anti-viral. Em formas de realização de métodos para pro necer uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, onde a análise da amostra determina que o sujeito sofre de uma infecção fúngica, proporcionando uma prescrição para o referido tratamento adequada compreende a prescrição de um antifúngica droga. Em formas de realização de métodos para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, onde a análise da amostra determina que o sujeito sofre de uma infecção bacteriana que é uma infecção por micoplasma, proporcionando uma prescrição para o referido tratamento adequada compreende a prescrição de uma droga anti-micoplasmal. Em formas de realização de métodos para proporcionar uma prescrição para o tratamento de uma doença infecciosa num indivíduo, onde a análise da amostra determina que o sujeito sofre de uma infecção por fungos, proporcionando uma prescrição para o referido tratamento adequada compreende a prescrição de um medicamento anti- levedura.
[0075] Por conseguinte, os sistemas, dispositivos e métodos aqui divulgados são ponto de métodos de serviço. Em formas de realização, os sistemas aqui descritos, incluindo os sistemas utilizados na realização dos métodos aqui descritos, podem ser contidos e os métodos realizados dentro de um alojamento. Em formas de realização, os dispositivos aqui descritos podem ser colocados ou utilizados dentro de um invólucro, por exemplo, um invólucro contendo um sistema aqui divulgado. Em formas de realização, os sistemas aqui descritos podem estar localizados numa localização de POS, e os métodos podem ser realizados em um local do serviço de ponto-de-. Os sistemas e métodos aqui divulgados podem ser utilizados em análise de uma amostra no referido local de ponto-de-serviço. Em formas de realização, os sistemas e métodos compreendem ponto de métodos de serviço para a realização de uma pluralidade de ensaios numa única amostra de pequeno volume ou em alíquotas da mesma.
[0076] Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, métodos e dispositivos para a detecção de uma ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença numa amostra clínica obtido em A (POS) localização do ponto-de-serviço. Em formas de realização, uma amostra clínica, tais é uma amostra clínica pequeno volume. Em formas de realização, o um ou mais marcadores são detectados em um curto período de tempo. Em formas de realização, a amostra é obtida a uma localização de POS. Em formas de realização, os sistemas e dispositivos podem estar localizados numa localização de POS. Em formas de realização, a detecção de um ou mais marcadores é realizada a uma localização de POS. Em formas de realização, as doenças são doenças infecciosas. Em formas de realização, as doenças são causadas por um agente causador de doença selecionada de entre o grupo de organismos causadores de doenças que consistem de um vírus, uma bactéria (incluindo um micoplasma), um fungo, uma levedura, e outros micro- organismos. Em formas de realização, as doenças são doenças respiratórias infecciosas, e podem ser doenças das vias respiratórias superiores, e podem ser doenças respiratórias inferiores.
[0077] Por conseguinte, em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas de POS, métodos e dispositivos. Em formas de realização, tais sistemas POS, métodos e dispositivos compreendem automatizado sistemas de POS, métodos e dispositivos. Em formas de realização, por exemplo, os requerentes descrevem um sistema automatizado POS, métodos automatizados, e dispositivos do mesmo, para a detecção de uma ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença numa amostra clínica obtida num local de captura; uma tal desordem pode ser uma desordem respiratória, e pode ser uma desordem causada por um agente causador de doença selecionada de entre (ele grupo de organismos causadores de doenças que consistem de um vírus, uma bactéria (incluindo um micoplasma), um fungo, uma levedura, e outros micro- organismos. Em formas de realização, tais sistemas de POS automatizados, métodos automatizados, e dispositivos deste, são configurados para utilização em locais de POS, e para utilização com amostras obtidas em localizações POS. Em formas de realização, tais sistemas de POS automatizados, métodos automatizados, e dispositivos deste, são configurados para utilização numa única amostra clínica de pequeno volume. em formas de realização, tais sistemas de POS automáticos, métodos automatizados, e dispositivos destes, são configurados para detectar, se presente, uma ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma desordem numa amostra clínica num curto período de tempo.
[0078] Em modalidades, tais sistemas automatizados de POS, métodos e dispositivos estão localizados em um local POS selecionado a partir de uma farmácia, um supermercado, uma clínica, um hospital, e um consultório médico. Em formas de realização, uma receita de um tratamento é emitido no referido POS localização. Em formas de realização, uma receita de um tratamento é emitido no referido POS de localização de acordo com os resultados de tais testmg realizada por um sistema automatizado de sistemas de POS, métodos e dispositivos localizados no local de POS. Em formas de realização, uma receita de um tratamento é preenchido no referido local de POS, em que a receita foi emitida por um tratamento de acordo com a doença respiratória, GN realizada por um sistema automatizado de sistemas de POS, métodos e dispositivos localizados no local de POS. Em formas de realização, um projeto de lei para o teste é emitido no local POS; uma lei como essa pode ser emitido automaticamente. Em formas de realização, um. projeto de lei para a. prescrição é emitida no local de POS, em que a receita foi emitida por um tratamento está de acordo com os resultados de tais testes executados por um sistema automatizado de sistemas de POS, métodos e dispositivos localizados no local de captura; uma lei como essa pode ser emitido automaticamente. Em formas de realização, um projeto de lei para um teste ou uma prescrição pode ser emitido a partir da localização POS para operadora de seguros de um sujeito; uma lei como essa pode ser emitido automaticamente. Em formas de realização, um pagamento automático pode ser feita para um teste realizado ou uma receita cheia para a partir do local de POS para operadora de seguros de um sujeito, por força de uma factura emitida automaticamente a partir da localização POS.
[0079] Por conseguinte, os requerentes divulgam dispositivos configurados para medir ou detectar um agente causador de doença ou marcador indicativo de um agente causador de doença numa amostra de acordo com um processo aqui descrito. Uma tal amostra pode ser uma amostra clínica de pequeno volume. Tais dispositivos podem ser configurados para medir ou detectar um agente causador de doença particular ou marcador indicativo de um agente causador de doença particular numa amostra em menos do que cerca de três horas, ou menos de cerca de duas horas, ou em menos do que cerca de uma hora, ou, em formas de realização, em menos ihan cerca de 40 minutos ou em menos do que cerca de 30 minutos.
[0080] Os dispositivos aqui descritos podem ser configurados para realizar um ensaio para a detecção ou medição de uma pluralidade de agentes causadores de doenças ou marcadores indicativos dos mesmos. Os dispositivos aqui descritos podem ser configurados para realizar um ensaio para a detecção ou medição de um agente causador de doença particular ou marcador indicativo do mesmo e também para realizar um ensaio que compreende a medição de uma característica morfológica de uma célula na amostra. Os dispositivos aqui descritos podem ser configurados para realizar um ensaio para a medição de um agente causador de doença ou marcador indicativo do mesmo e também para realizar um ensaio que compreende a medição de uma outra substância, por exemplo, uma citocina, uma prostaglandina, histamina, um esteroide (por exemplo, , um glucocorticóide, ou outro esteroide), uma vitamina, uma hormona, um fármaco ou metabolito de uma droga, ou outro analito. Tais dispositivos podem ser configurados em que os ensaios, ou a ordem de execução de ensaios, que são executadas por o referido dispositivo pode ser alterada por comunicação com outro dispositivo.
[0081] Os métodos e composições aqui descritos proporcionam ensaios rápidos que exigem apenas pequenas quantidades de amostra, tais como apenas pequenas quantidades de saliva, urina, sangue, ou fluido, em que uma haste de garganta, cotonete bucal, ou secreção nasal foi imerso, ΐη formas de realização, uma pluralidade de amostras, incluindo uma pluralidade de amostras pequenas, pode compreender uma pluralidade de tipos de amostras, tais como saliva, urina, sangue ou amostras de fluido, pode ser fornecida a, e analisados por, os sistemas, dispositivos e métodos revelados aqui em. Os métodos, dispositivos e sistemas aqui descritos são configurados para realizar tais ensaios rápidos que exigem apenas pequenas quantidades de amostra. Métodos, aparelhos e sistemas aqui divulgados são configurados para realizar tais ensaios rápidos em uma pluralidade de tipos de amostras, e pode necessitar de apenas pequenas quantidades de cada tipo de amostra. Os métodos, dispositivos e sistemas aqui descritos são configurados para realizar ensaios múltiplos numa amostra, ou numa pluralidade de tipos de amostras, e podem ser usadas para o rastreio de uma ou mais de uma pluralidade de doenças. Métodos, aparelhos e sistemas aqui descritos são configurados para realizar ensaios múltiplos numa amostra, ou numa pluralidade de tipos de amostras, e podem ser usadas para o rastreio de doenças causadas por um ou mais de vinte bactérias, leveduras, fungos, micoplasma, Archea , fungos, leveduras, parasitas e outros micro- organismos. Por conseguinte, os métodos. dispositivos e sistemas aqui descritos proporcionam testes rápidos, que exigem amostras clínicas apenas pequenas, e, assim, proporcionar vantagens sobre os outros métodos, dispositivos e sistemas.
BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS
[0082] A Fig. 1 Um fornece um resumo gráfico das durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra por uma variedade de marcadores e para duas gamas de concentrações diferentes dos marcadores (10 C μl e 100 C / ID, onde "C / μΓ significa cópias por microlitro (μl,)). Os tempos são rotulados" LOD "(" comprimento de atraso "). O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU), em milhares.
[0083] A Fig. IB fornece um gráfico de barras que mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra para os marcadores indicados para diversas doenças (a 00 C / U!).
[0084] A Fig. IC fornece um gráfico de barras que mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra para os marcadores indicados por várias estirpes de influenza e identificar alvos (a 100 ° C / μl).
[0085] A Fig. ID fornece um gráfico de barras que mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra para os marcadores indicados de várias doenças respiratórias (a 100 ° C / μl).
[0086] A Fig. IE fornece um gráfico de barras que mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra para os marcadores indicados para várias doenças sexualmente transmissíveis (a 100 ° C / μl).
[0087] A Fig. SE fornece um gráfico de barras que mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra para os marcadores indicados para diversas doenças que podem ser detectadas no sangue (a 100 ° C / μl) .
[0088] A Fig. 2A mostra a amplificação ao longo do tempo, mostrando a detecção de influenza A (sazonal Hl l estirpe) marcador, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação do alvo mensagem de ácido t não nucleico ocorreram. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[0089] A Fig. 2B mostra o limite de detecção de vírus influenza A (sazonal estirpe HlNl) numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais das cópias de mensagem de vírus influenza A (sazonal estirpe HlNl); "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo). FIG. 2B mostra a detecção de vírus influenza A (sazonal Hl l estirpe) marcador por vezes bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu.
[0090] A Fig. 3 A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de influenza A (novo Hl l estirpe) marcador por vezes bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[0091] A Fig. 3B mostra o limite de detecção de vírus influenza A (novo Hl l estirpe) numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais das cópias de mensagem de vírus influenza A (novo HLN estirpe G); "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo). FIG. 3B mostra detecção da gripe A (nova estirpe HlNl) marcador, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação do não-alvo mensagem de ácido nucleico ocorreu,
[0092] A Fig. 4A mostra a amplificação ao longo do tempo, mostrando a detecção de influenza A (H3N2 s trem) marcador, por vezes, bem antes de qualquer ts quantidade significativas de amplificação da mensagem de ácido nucleico não-alvo ocorreram. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU), em milhares,
[0093] A Fig. 4B mostra o limite de detecção de vírus influenza A (estirpe H3N2) numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais das cópias de vírus influenza A (estirpe H3N2) da mensagem; "NTC" indica "nenhum modelo controle "(não cópias acrescentado do marcador-alvo). Fig. 4B mostra a detecção da gripe A (estirpe H3N2) marcador, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação da mensagem de ácido nucleico não- alvo ocorreu.
[0094] A Fig. 5A mostra de amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de vírus influenza A (H7N9 sirain) marcador no iimes bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU), em milhares,
[0095] A Fig. 5B mostra o limite de detecção de vírus influenza A (estirpe H7N9) num amostra A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais das cópias da mensagem de influenza A (estirpe H7N9); "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo). FIG. 5B mostra a detecção de vírus influenza A (H7N9 estirpe) marcador por vezes bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu.
[0096] A Fig. 6A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de vírus influenza A (estirpe H5N1) marcador por vezes bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[0097] A Fig. 6B mostra o limite de detecção de vírus influenza A (H5N 1 estirpe) numa amostra A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais de cópias da mensagem de influenza A (estirpe Ή5Ν1); "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo). FIG. 6B mostra detecção da gripe A (H5N1 sirain) marcador, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação da mensagem de ácido nucleico não-alvo ocorreu.
[0098] A Fig. 7 A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de marcador da gripe B, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[0099] A Fig. 7B mostra o limite de detecção da gripe B, em uma amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais das cópias de mensagem de influenza B; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo). FIG. 7B mostra a detecção do marcador da gripe B, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu.
[00100] A Fig. 8 A mostra amplificação ao longo do tempo, mostrando detecção da gripe Matrix marcador de proteína, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação da mensagem de ácido nucleico não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (relati vo unidades de fluorescência, RFU), em milhares,
[00101] A Fig. 8B mostra o limite de detecção da matriz de influenza marcador de proteína numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica os números iniciais das cópias de mensagem proteína matriz de influenza; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo). FIG. SB mostra a detecção da proteína matriz de influenza marcador, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu.
[00102] A Fig. 9 A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de tuberculose (Myobacterium tuberculosis), por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominados em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[00103] A Fig. 9B mostra o limite de detecção de tuberculose num amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (sobe significativamente acima do nível de fundo), com os números "TB 1000", indicando 1000 cópias da mensagem de tuberculose marcador, "TB 100", indicando 100 cópias de mensagem de tuberculose marcador e "TB 10" indicando 10 cópias da mensagem de tuberculose marcador; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador-alvo).
[00104] A Fig. 10A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador staphylocccus (Staphylococcus aureus), por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[00105] A Fig. lob mostra o limite de detecção de Staphylococcus aureus numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (sobe significativamente acima do nível de fundo), com o eixo horizontal que indica o número de cópias de mensagem de Staphylococcus aureus: "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionadas do marcador alvo).
[00106] A Fig. 1 1 A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador staphylocccus (Methiciliin-resistant Staphylococcus aureus - MRSA), por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo Vertical é mostrado em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU), em milhares.
[00107] A Fig. 1 IB mostra o limite de detecção de MRSA Staphylococcus aureus numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias da mensagem de Staphylococcus aureus MRSA; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[00108] A Fig. 12A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de estreptococos (estreptococos do Grupo A) em momentos bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação da mensagem de ácido nucleico não alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominados em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[00109] A Fig. 12B mostra o limite de detecção de Streptococcus Grupo A, em uma amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias do grupo Streptococcus Uma mensagem; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[00110] A Fig. 13A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de Bordetella pertussis, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[00111] A Fig. 13B mostra a detecção de Bordetella pertussis numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias da mensagem de Bordetella pertussis (como cópia de ADN final por μl,); "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[00112] A Fig. 14A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de adenovírus B, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação mensagem de ácido nucleico não alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[00113] A Fig. 14B mostra o limite de detecção de adenovírus B numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias do adenovírus B mensagem; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[00114] A Fig. 15A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de adenovírus C, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[001153] fig. 15B mostra o limite de detecção de adenovírus C numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias da mensagem Adenovírus C; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[001163 fig. 16A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de adenovírus E, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[001173 fig. 16B mostra o limite de detecção de adenovírus E numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias do adenovírus E mensagem; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[001183 fig. 17A mostra o amplificação Ver tempo, que mostra a detecção de um marcador de Vírus Herpes Simplex (HSV), por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa
(unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[0011 3 A Fig. 17B mostra o limite de detecção do vírus da herpes simplex (HSV) em uma amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias da mensagem de HSV;"NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[00120] A Fig. 18A mostra a amplificação ao longo do tempo, que mostra a detecção de um marcador de Treponema pallidum, por vezes, bem antes de quaisquer quantidades significativas de amplificação de ácido nucleico mensagem não-alvo ocorreu. O eixo horizontal é denominado em "ciclos", embora não foi utilizado ciclismo de temperatura; cada unidade de "ciclos" é cerca de um minuto, de modo que os números do eixo horizontal podem ser lidos em termos de minutos. O eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativas, RFU), em milhares.
[00121] A Fig. 18B mostra o limite de detecção da presença de Treponema pallidum numa amostra. A altura das barras indica o tempo até que o número de cópias mostra uma inflexão (se eleva significativamente superior ao nível de fundo), com o eixo horizontal indica o número de cópias da mensagem de Treponema pallidum; "NTC" indica "nenhum controle modelo" (não cópias adicionais do marcador de alvo).
[00122] A Fig. 19A mostra a amplificação ao longo do tempo, o aumento da fluorescência relativa a cerca de 15 a 20 minutos indicando a presença de um vírus influenza HlNl marcador sazonal. O eixo horizontal é em "minutos, o eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU).
1001233 Fig. 19B mostra a amplificação de "nenhum controle modelo" (não cópias acrescentado do marcador-alvo; NTC). Note-se que a maioria dos experimentos mostraram nenhuma amplificação: as três corridas que mostram aumentos final da fluorescência relativa fê-lo em cerca de 2,5 minutos ou mais tarde. O eixo horizontal é em "minutos, o eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU).
[00124] A Fig. 2.0A mostra um navio exemplar para a realização de uma haste (um vaso cotonete) e um cartucho exemplar (que inclui cavidades e poços de reagentes e vasos, e está configurado para manter os vasos de reagente, vasos de reação, e outros recipientes e utensílios). As setas que se afasta do vaso cotonete indicar a forma como o recipiente de mecha pode ser colocada dentro de um receptáculo no cartucho.
[00125] A Fig. 20B mostra um recipiente de zaragatoa exemplar (configurado para prender uma haste) e um cartucho exemplar (que inclui cavidades e poços de reagentes e vasos, e está configurado para manter os vasos de reagente, vasos de reação, e outros recipientes e utensílios), para além do cavidades e poços configurado para conter recipientes de reagentes, vasos de reação, e outros recipientes e utensílios, como mostrado na forma de realização da fig. 20A, o exemplar cartucho mostrado na Fig. 20B inclui cavidades e cavidades apropriadas para a realização de outros recipientes para amostras, por exemplo, vasos sanguíneos ou de urina, em adição aos navios de esfregaço. As setas que se afasta do vaso cotonete indicar a forma como o recipiente de mecha pode ser colocada dentro de um receptáculo no cartucho.
[00126] A Fig. 20C mostra um recipiente de zaragatoa exemplar, e um cartucho de exemplificativa que inclui cavidades e cavidades para a realização de uma haste e um vaso de zaragatoa, assim como de cavidades e poços configurados para manter os vasos de reagente, vasos de reação, e outros recipientes e instrumentos (que pode, opcionalmente, incluir outros recipientes de amostra, por exemplo, vasos sanguíneos ou amostras de urina). As setas que se afasta da haste de indicar como a zaragatoa pode ser colocada dentro de um receptáculo cotonete no cartucho. As setas que se afasta do vaso cotonete indicar a forma como o recipiente de mecha pode ser colocada dentro de um receptáculo recipiente cotonete no cartucho.
[00127] A Fig. 21 mostra exemplos de cotonetes que podem ser utilizados para obter amostras a partir da garganta, passagens nasais, bochechas, ou outros locais do corpo de indivíduos.
[001281 fig. 22 mostra vários painéis de distúrbios que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos nomenclatura.
[00129] A Fig. 23A mostra vários painéis de nomenclatura da gripe tipos de influenza que talvez identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos.
[00130] A Fig. 2.3B mostra os tempos de inflexão para vários tipos de influenza que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos.
[00131] A Fig. 24A mostra vários painéis de doença respiratória de nomenclatura tipos de doenças respiratórias, que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos.
[00132] A Fig. 24B mostra os tempos de inflexão para os tipos de doença do trato respiratório superior e inferior, que podem ser identificadas pelos métodos e dispositivos aqui discutidos.
[00133] A Fig. 25A mostra vários painéis de doenças infecciosas hospitalares adquiridos nomenclatura tipos de doenças respiratórias, que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos,
[00134] A Fig. 25B mostra os tempos de inflexão para vários painéis adquirida no hospital de doenças infecciosas de nomenclatura tipos de doenças respiratórias, que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos.
[00135] A Fig. 26 mostra resultados de um ensaio para influenza
A que é concebido para ser incluído em todos os subtipos de Influenza A. Os resultados são específicos.
[00136] A Fig. 27 mostra a especificidade dos ensaios de ácidos nucleicos alvo para o tipo de gripe H2N2.
[00137] A Fig. 28 mostra a especificidade dos ensaios de ácidos nucleicos para o alvo H1N1 influenza tipo sazonal.
[00138] A Fig. 29 listas de potenciais substâncias interferentes para o painel de doenças sexualmente transmitidas (DST), que foram encontrados para não interferir com os ensaios de ácidos nucleicos.
[00139] A Fig. 30 listas de substâncias potencialmente interferentes para a doença sexualmente transmissível (DST) do painel de urina que foram encontrados para não interferir com os ensaios de ácidos nucleicos,
[00140] A Fig. 31 listas de potenciais substâncias interferentes para o painel de sangue que foram encontrados para não interferir com os ensaios de ácidos nucleicos.
DESCRIÇÃO DETALHADA
[00141] descrição e a divulgação de exemplos de reagentes, ensaios, métodos, kits, dispositivos e sistemas que podem ser utilizados com os métodos, ensaios e reagentes, dispositivos e sistemas aqui descritos podem ser encontrados, por exemplo, na Patente US 8.088.593; Patente US
8.380.541; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,798, arquivado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,779, arquivado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,820, arquivado 18 de fevereiro de 2013; PCT / US2012 / 57155, apresentado a 25 de setembro de 2012; Pedido de Patente US 13 / 244.949, apresentado em 26 de setembro de 2011; US Aplicação Serial No. 61 / 766.095, depositado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente
US N ° de Série 61 / 874.976, depositado em 6 de setembro de 2013; Pedido de Patente US N ° de Série 61 / 885,462, depositado em 1 de outubro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 62/001, 039, arquivada 20 de maio de 2014; Pedido de Patente US N ° de Série 62 / 001.053, depositado em 21 de maio de 2014; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 62 /
010.382, apresentado 10 de junho de 2014: Pedido US N ° de Série 61 / 673,245, arquivado 26 de setembro, 201 1; Pedido de Patente US N ° de Série 61 / 885,467, depositado em 1 de outubro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 61 / 879,664, arquivado 01 de setembro 8, 2013; e Pedido de Patente US 61 / 805.923, depositado em 27 de março de 2013, cujas descrições de patentes e pedidos de patente são aqui incorporada por referência na totalidade.
[00142] A divulgação de métodos de detecção de alvos de ácidos nucleicos incluem, por exemplo, métodos, ensaios e reagentes, e dispositivos, conforme divulgado no Pedido US N ° de Série 61 / 800,606, arquivado 15 de março de 2013; US Aplicação Serial No. 61 / 908.027, depositado em 22 de novembro de 2013. US Aplicação Serial No. 62 / 001.050, apresentado 20 de maio de 2014; US Aplicação Serial No. 14 / 214.850, depositado 15 de março de 2014; PCT / US2014 / 030034, apresentado a 15 de março de 2014; US Aplicação Serial No. 61 / 800.241, depositado 15 de março de 2013; e Aplicação US Nº de Série 61 / 800.340, de 15 de março de 2013;as divulgações dos quais pedidos de patente são aqui incorporados por referência na sua totalidade. Outros métodos para a detecção de alvos de ácidos nucleicos incluem, por exemplo, Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), os métodos descritos, por exemplo, na Pat. Não, 4683, 195; e, em geral, Muliis et ai, Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 51: 263 (1 987); Erlieh, Ed., Tecnologia PGR (Stockton Press, Nova Iorque, 1989).
[00143] A divulgação de métodos para deleção de alvos proteicos, incluindo os métodos de anticorpo, podem ser encontrados, por exemplo, na Pat. No. 4.376, de 1 a 10; Pat. No. 4,81 6,567; Pat. No. 7429652; A Patente
Europeia EP 404097; e Publicação Internacional WO 93/1 Pedido de Patente 1 161, cujas divulgações são aqui incorporadas por referência na sua totalidade. Outros métodos para a detecção de alvos de proteína (genericamente denominados "imunoensaios" no presente documento) incluem, por exemplo, ensaios de ligação direta ou competitivos utilizando técnicas tais como western blots, radioimunoensaios, ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), imunoensaios em "sanduíche", ensaios de immimoprecipiiation, imunoensaios fluorescentes, imunoensaios de proteína A e.
[00144] A divulgação sobre sistemas, dispositivos e métodos para análise de amostras clínicas, incluindo amostras clínicas, tais como amostras clínicas de volume pequena, e incluindo os sistemas, dispositivos e métodos de análise de amostras clínicas de pequenos volumes em curtos períodos de tempo, pode ser encontrado, por exemplo, na Patente US 8.380.541; Patente US
8.088.593; Patente US 8.380.541; Pat. Aplicação n.º de série 13 / 769,798, arquivado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,820, arquivado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,779, arquivado 18 de fevereiro de 2013; PCT / US2.012 / 57155, apresentado a 25 de setembro de 2012; Pedido de Patente US 61 / 805.923, depositado 27 de março de 2013; e aqui incorporada por referência (supra).
[00145] Antes de apresentar as novas moléculas de ligação ao alvo, composições, ensaios, métodos e kits são revelados e descritos, deve ser entendido que a terminologia aqui utilizada é para o propósito de descrever apenas formas de realização particulares e não se destina a ser limitativa . É também para ser compreendido que a presente divulgação fornece descrições e exemplos explicativos e exemplificativas, de modo que, a menos que indicado de outro modo, as moléculas, composições, métodos, ensaios e kits aqui descritos não estão limitados às formas de realização específicas aqui descritas.
[00146] Deve-se notar que, como utilizado na especificação e nas reivindicações anexas, as formas singulares "um", "uma" e "o" incluem referentes plurais a menos que o contexto dite claramente o contrário. Assim, por exemplo, a referência a "um seu sal" refere-se a um único sal ou misturas de diferentes sais, e outros semelhantes.
[00147] Na presente memória descritiva e nas reivindicações que se seguem, será feita referência a um número de termos que serão definidos como tendo os seguintes significados:
[00148] siglas e abreviaturas, como "rpm" (rotações por minuto), "min" (minutos), "sec" (segundo), e assim por diante, têm os seus significados usuais.
[00149] Tal como aqui utilizados, os termos "normal" e "nível normal" referem-se os níveis de um marcador como encontrado em uma população saudável de indivíduos normais. Por exemplo, o nível normal para um determinado tipo de células brancas do sangue encontrado é o nível do referido tipo de células brancas no sangue encontrados em amostras de sangue a partir de uma população saudável de indivíduos normais.
[00150] Tal como aqui utilizados, os termos "alto" e "nível elevado" e semelhantes referem-se a níveis que excedem significativamente os níveis normais, isto é, um elevado nível de um marcador é um que excede significativamente os níveis de que marcador que é encontrada numa população saudável de indivíduos normais.
[00151] Tal como aqui utilizados, os termos "baixo" e "nível baixo" e semelhantes referem-se a níveis que estão abaixo dos níveis normais, isto é, um baixo nível de um marcador é um que é abaixo dos níveis desse marcador que é encontrada numa população saudável de indivíduos normais.
[00152] Deve entender-se que, sempre que um marcador é tipicamente ausentes, ou escassa, em sujeitos normais, um nível normal de um marcador pode ser muito baixa em números absolutos (por exemplo, tal como medido pelo número de marcadores por unidade de volume, ou peso de marcador por unidade de volume), e continua a ser o nível normal para esse marcador. Assim, por exemplo, onde o marcador é um anticorpo para uma doença infecciosa particular, e indivíduos normais mais saudáveis não têm sido recentemente exposta a essa doença em particular, os níveis normais de anticorpos para que a doença pode ser baixo em termos absolutos, e os níveis de um assunto que exceda o nível normal poderia indicar que o sujeito foi recentemente exposto a, ou sofre de uma infecção por, ou doença.
[00153] O termo "isolado", tal como aqui utilizado, quando utilizado para descrever os vários ácidos nucleicos e proteínas aqui divulgadas, significa que o ácido nucleico ou proteína (ou outra molécula) foi separado e / ou recuperado a partir de, pelo menos, um contaminante com a qual está normalmente associada.Vulgarmente, no entanto, os ácidos nucleicos isolados e proteínas será preparado através de pelo menos um passo de purificação.
[00154] A "porção" Tenn tal como aqui utilizado refere-se a qualquer composição particular da matéria, por exemplo, um fragmento molecular, uma molécula intacta, ou uma mistura de materiais.
[00155] Tal como aqui utilizados, os termos "agente da doença - causing", "organismo causador de doença" e plurais e seus equivalentes gramaticais são utilizados indiferentemente para se referir a vírus, bactérias, leveduras e outros micro-organismos que podem causar doença num sujeito. Assim, quando se refere a doenças e suas causas, os termos "agente", "organismo" e plurais e equivalentes gramaticais são aqui utilizados indiferentemente.
[001561 Tal como aqui utilizado, o termo "vírus" refere-se a organismos que incluem mensagem de ácido nucleico (quer ARN, quer ADN), que permite a sua replicação em células hospedeiras infectadas. O vírus termo inclui ambos os vírus de ADN ou de vus de ARN. Os vírus podem causar doenças.
[001573 Tal como aqui utilizado, o termo "microrganismo" refere-
se a pequenos organismos multicelulares ou unicelulares, que podem infectar células, órgãos, tecidos ou superfícies de plantas ou animais, incluindo seres humanos. O termo microorganismo inclui bactérias (incluindo micoplasma), Archea, fungos, leveduras, parasitas e outros organismos pequenos. Os microrganismos podem causar doenças.
[00158] Conforme aqui utilizado, o termo "bactérias" refere-se a pequenos organismos unicelulares, procariotas que podem infectar as células, órgãos, tecidos ou superfícies de plantas ou animais, incluindo seres humanos. As bactérias termo inclui bactérias Gram negativas e Gram- positivas. As bactérias podem causar doenças. Mycoplasma são uma forma de bactérias que faltam lamentos celulares,
[00159] Conforme aqui utilizado, o termo "fármaco" é utilizado amplamente para se referir a qualquer agente que pode ser administrado a um sujeito com a finalidade de tratamento de uma doença ou condição sofrido pelo sujeito; tal tratamento pode incluir a prevenção, melhoria dos sintomas, acelerando a recuperação, o reforço do paciente em face de uma doença ou condição, como combate bem como diretamente a doença ou condição. Em que a doença ou condição resulta de uma infecção, por exemplo, é devido a uma doença infecciosa, a droga pode ser, sem limitação, um antibiótico, um arrasto antiviral, um arrasto antifúngica, uma droga anti-micoplasma, um anti-levedura droga, ou as suas combinações.
[00160] Conforme aqui utilizado, o termo "antibiótico" é utilizado amplamente para se referir a arrasta os quais atuam para reduzir ou eliminar infecções bacterianas. Os antibióticos incluem, sem limitação, a penicilina, ampiciflin, amoxicilina, tetraciclina, oxytetracycliiie, doxiciclina, minociclina, uma sulfonamida sulfa-droga (tais como, por exemplo, sulfanilamida, sulfametoxazole, sulfadiazina), eritromicina, ciprofloxacina, gentamicina, oiigomycin, azitromicina, claritromicina, uma cefalosporina, por exemplo, cefaclor, cefprozil, cefuroxima axetil, loracarbef, cefdinir, cefixima, eefpodoxime proxetil, ceftibuteno, ou ceftriaxona, gramicidina, valinomicina, nonactina, aiameihicin, e outros antibióticos.
[00161] Conforme aqui utilizado, o termo "anti-micoplasma" é usado num sentido lato para se referir a fármacos que atuam para reduzir ou eliminar infecções bacterianas, onde as bactérias são micoplasma.Os antibióticos que têm como alvo a parede celular são normalmente ineficazes contra micoplasma, que carecem de células lamentos. Antibióticos, tais como, por exemplo, piasmoein, doxocycline, minociclina, gramicidina, valinomyein, nonactina, a] ametbicin, antibióticos macrólidos, e outros podem ser usadas para tratar infecções micoplasmas.
[00162] Conforme aqui utilizado, o termo "anti-viral" é usado num sentido lato para se referir a fármacos que atuam para reduzir ou eliminar infecções virais.drogas antivirais incluem, por exemplo, zanamivir, oseltamivir, aciclovir, adefovir, darunivir, famciclovir, ganciclovir, nexavir, rifampicina, pieconaril, amantadina, rimantadina, e outros.
[00163] Conforme aqui utilizado, o termo "antifúngica" é usado num sentido lato para se referir a fármacos que atuam para reduzir ou eliminar infecções por fungos. drogas formiga-fúngicos incluem, por exemplo, anfotericina, nistatina, candicin, filipina, hamycin, netaniycin, rimocydin, bifonazole, clotrimazol, outros imidazol, triazol, e tiazoles, e outros. Alguns arrastos que podem ser utilizados para tratar infecções por fungos podem também ser adequadas para o tratamento de infecções fúngicas.
[00164] Conforme aqui utilizado, o termo "anti-levedura" é usado num sentido lato para se referir a fármacos que atuam para reduzir ou eliminar infecções fúngicas. Os medicamentos anti-levedura incluem, por exemplo, antimicóticos, tais como, por exemplo, clotrimazole, nistatina, fluconazol, cetoconazol, anfotericina, violeta de genciana, e outros gs dr. Alguns dr gs que podem ser utilizados para tratar infecções por fungos podem também ser adequadas para o tratamento de infecções fúngicas.
[00165] Conforme aqui utilizada, a frase "ácido nucleico marcadores indicativos de" uma infecção particular, refere-se a moléculas de ácido nucleico (incluindo cadeia única e cadeia dupla DA e moléculas de ARN) e os seus fragmentos, que são derivadas a partir de organismos causadores de doenças , ou são cópias de, ou são substancialmente semelhantes, ou que são complementares a moléculas de ácido nucleico provenientes do organismo que provoca que a doença infecciosa em particular. Detecção de marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particular numa amostra indica que o organismo causador da doença é, ou foi, presente na amostra e, portanto, que o sujeito foi exposto ao organismo causador de doença, e provavelmente sofre ou sofreu de a infecção específica provocada por esse mesmo organismo causador de doença.
[00166] Conforme aqui utilizada, a frase "marcadores de anticorpos indicativos de uma infecção particular, refere-se a anticorpos (ou suas partes ou os seus fragmentos), que são dirigidos para um antígeno ou antígenos encontrados nos organismos que causam essa doença infecciosa em particular. Detecção de marcadores de anticorpos indicativa de uma infecção particular numa amostra indica que o organismo causador da doença é, ou foi, presente na amostra e, portanto, que o sujeito foi exposto ao organismo causador de doença, e provavelmente sofre ou sofreu de infecção específica provocada pela que determinado organismo causador de doença.
[00167] Conforme aqui usado, um ácido nucleico que compreende uma molécula de composto de nucleotídeos, e refere-se a ácido desoxirribonucleico (ADN) e ácido ribonucleico para moléculas de ARN ().
[001683 Tal como aqui utilizado, "ácido nucleico" inclui tanto ADN e ARN, incluindo ADN e ARN contendo os nucleotídeos não-padrão. Um "ácido nucleico" contém pelo menos um polinucleótido de (a "cadeia de ácido nucleico"). Um "ácido nucleico" pode ser único -cordas ou de cadeia dupla. O termo "ácido nucleico" refere-se a nucleotídeos e nucleósidos que formam, por exemplo, ácido desoxirribonucleico macromoléculas (ADN) e ácido ribonucleico macromoléculas (RN A).Os ácidos nucleicos podem ser identificadas pela base ligado ao açúcar (por exemplo, ribose ou desoxirribose); tal como aqui utilizado, as seguintes abreviaturas para estas bases são utilizadas para representar os ácidos nucleicos na listagem de sequências identificar e descrever as suas estruturas (quer maiúsculas ou minúsculas podem ser usadas).
TABELA 1A [001691 Tal como aqui utilizado, um "polinucleótido" refere-se a uma cadeia polimérica contendo dois ou mais nucleotídeos. "Polinucleótidos" incluem iniciadores, oligonucleótidos, cadeias de ácidos nucleicos, etc. Um polinucleótido pode conter nucleotídeos normais ou não-padrão. Tipicamente, um polinucleótido que contém um 'fosfato num terminal ( "5' terminal 5") e um "grupo hidroxi um no outro terminal 3 (" 3 'terminal) da cadeia. A mais 5 'de nucleotídeos de um polinucleótido pode ser aqui referido como o "5' nucleotídeo terminal" do polinucleótido. O mais 3 'de nucleotídeos de um polinucleótido pode ser aqui referido como o "3" nucleotídeo terminal "do polinucleótido.
[00170] Conforme aqui usado, um ácido nucleico "alvo" ou molécula refere-se a um ácido nucleico de interesse. Um alvo de ácido nucleico / molécula pode ser de qualquer tipo, incluindo o DNA de cadeia simples ou de cadeia dupla ou RNA (por exemplo, ARNm).
[00171] Conforme aqui utilizado, uma molécula de ácido nucleico que é descrito como contendo a "sequência" de um molde ou outro ácido nucleico pode também ser considerado como contendo o molde ou outra próprio ácido nucleico (por exemplo, uma molécula que é descrita como contendo o sequência de um modelo pode também ser descrito como contendo o modelo), a menos que o contexto dite claramente o contrário.
[00172] Tal como aqui utilizado, as sequências "complementares" referem-se a duas sequências de nucleotídeos que, quando alinhadas antiparalelas umas às outras, contêm várias bases de nucleotídeos individuais qual par uns com os outros. Não é necessário que todas as bases de nucleotídeos em duas sequências a emparelhar com o outro para sequências para ser considerada "complementar". As sequências podem ser considerados como complementares, por exemplo, se, pelo menos, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 98% , 99%, ou 100% das bases nucleotídicas em duas sequências de emparelhar com o outro. Além disso, as sequências podem ainda ser considerado "complementar" quando os comprimentos totais das duas sequências são significativamente diferentes umas das outras. Por exemplo, um iniciador de 15 nucleotídeos pode ser considerada "complementar" de um polinucleótido maior contendo centenas de eotides Nucl se várias bases de nucleotídeos individuais do par de iniciadores com bases nucleotídicas a longo polinucleótido quando o iniciador está alinhado antiparalelo a uma determinada região do polinucleótido maior.
[00173] Conforme aqui utilizado, um "concatemer" refere-se a uma molécula de ácido nucleico que contém em si duas ou mais cópias de um ácido nucleico particular, em que as cópias são ligados em série. Dentro do concatemer, as cópias do ácido nucleico particular pode ser ligado diretamente um ao outro, ou podem ser indiretamente ligados (por exemplo, pode haver nucleotídeos entre as cópias do ácido nucleico particular). Em um exemplo, o ácido nucleico particular pode ser a de um molde de ácido nucleico -cordas duplo, de tal modo que um concatemer pode conter duas ou mais cópias do molde de ácido nucleico de cadeia dupla. Em outro exemplo, o ácido nucleico particular pode ser a de um polinucleótido molde, de tal modo que um concatemer pode conter duas ou mais cópias do polinucleótido molde.
[00174] Conforme aqui utilizado, um "sacárido" é uma molécula compreendendo um, alguns, ou várias porções de açúcar, e inclui monossacarídeos, oligossacarídeos, e polissacarídeos.
[00175] Conforme aqui utilizado, uma proteína compreende uma molécula composta de aminoácidos, os aminoácidos ligados covalentemente por ligações amida. Os termos "péptido", "polipéptido" e "proteína" podem ser utilizados indiferentemente para se referir a moléculas compostas por aminoácidos ligados por ligações peptídicas. Os aminoácidos individuais podem ser designados por "resíduos" de um polipéptido ou proteína. As sequências de aminoácidos dos polipéptidos aqui divulgados podem ser identificados por SEQ ID NO: apresentada como uma sequência de letras, em que as letras têm os significados seguintes:
TABELA IB
[00176] Conforme aqui utilizado, um "citoquina" é uma molécula de proteína que ocorrem naturalmente em mamíferos frequentemente libertados em resposta a uma lesão, infecção, inflamação, ou outra estressor. As citocinas incluem iymphokines, interleucinas, quimiocinas, interferões, e outras citoquinas. As citocinas podem ser citocinas inflamatórias (tendendo a causar inflamação, também denominado citocinas pró-inflamatórias), ou pode ser citocinas anti-inflamatórias (que tende a suprimir a inflamação). As citoquinas inflamatórias incluem, por exemplo, interleucina-1 (IL-1), interleucina-6 (IL-6), interleucina-12 (IL-12), interleucina 18 (TL-18), interferão gama (IF - γ ), e fator alfa de necrose tumoral (TNF-a). citocinas anti-inflamatória incluem, por exemplo, interleucina-10 (EL- 10). Algumas citocinas podem ter várias ações ou efeitos (por exemplo, interleucina-6 (IL-6) tem efeitos inflamatórios e anti-inflamatórios), [001773 Tal como aqui utilizados, os termos "marcador de inflamação", "marcador inflamatório", e os plurais e os seus equivalentes gramaticais referem-se do mesmo para os marcadores que podem ser detectados numa amostra, e que podem ser identificadas numa amostra, que indicam a presença de ou nível de, inflamação no assunto a partir do qual se obteve a amostra. Os marcadores de inflamação incluem tanto péptido e marcadores não- peptídicos; por exemplo, marcadores de inflamação incluem, sem limitação, prostaglandinas, fator de necrose tumoral alfa (TNF-a), interleucina-1 (IL-1), interleucina-8 (IL-8), interleucina-12 (IL-12) , interferão gama (lf-γ), bradiquinina, moléculas do sistema do complemento, fatores de coagulação do sangue, proteína C-reactiva, a taxa de sedimentação de eritrócitos (ESR), contagem de glóbulos brancos, e alterações moiphological no sangue e outras células.
[00178] O termo "anticorpo" é utilizado no sentido mais amplo e cobre especificamente anticorpos monoclonais individuais (incluindo anticorpos agonistas e antagonistas), composições de anticorpos com especificidade poliepitópica, e fragmentos de anticorpo, e inclui um humano os anticorpos humanizados. Os anticorpos monoclonais são obtidos a partir de uma população de anticorpos substancialmente homogéneos, ou seja, os anticorpos individuais que constituem a população são idênticos exceto quanto a possíveis mutações de ocorrência natural que podem estar presentes em quantidades menores. A classe mais abundante de anticorpos é da classe IgG, caracterizado por ter os pesos moleculares de cerca de 150 kD.
[00179] O termo "anticorpo monoclonal" (mAb) tal como aqui utilizado refere-se a um anticorpo obtido de uma população de anticorpos substancialmente homogéneos, ie, os anticorpos individuais que constituem a população são idênticos exceto quanto a possíveis mutações de ocorrência natural que podem estar presentes em menor montantes. Por exemplo, os anticorpos monoclonais podem ser produzidos pela meihod hibridoma primeiro descrito por Kohler et ai, Nature, 256:. 495 (1975), ou podem ser produzidos por métodos de ADN recombinante (ver, por exemplo, Patente US N ° 4816567 para Cabilly. et ai).
[00180] O termo "anticorpo intacto" refere-se ao anticorpo completo, ou a sequência de aminoácidos do anticorpo completo, dos quais um fragmento de anticorpo é uma parte. Deve entender-se que um fragmento de anticorpo pode ser produzido por digestão parcial (por exemplo, por papaína ou pepsina) de um anticorpo intacto, ou podem ser produzidos por meios recombinantes ou outras.
[001813 "fragmento de anticorpo", e todas as suas variantes gramaticais destes, tal como aqui utilizado, é definido como um (1) portio N de um anticorpo intacto compreendendo o local de ligação ao antígeno ou região variável do anticorpo intacto, onde a porção está livre da constante os domínios da cadeia pesada da região Fe do anticorpo intacto, e (2) as construções que compreendem uma porção de um anticorpo intacto (tal como definido pela sequência de aminoácidos do anticorpo intacto) compreendendo o local de ligação ao antígeno ou região variável do anticorpo intacto.
[00182] Um fragmento de anticorpo é, ou compreende, um polipéptido possuindo uma estrutura primária consistindo em uma sequência ininterrupta de resíduos de aminoácidos contíguos que têm a sequência de aminoácidos de um anticorpo intacto. Exemplos de fragmentos de anticorpo incluem fragmentos Fab, Fab ', Fab'-SH, F (ab¾, Fd, Fe, fragmentos Fv, diacorpos, e qualquer outra "unidade de ligação ao antígeno de cadeia não simples" tal como descrito, por exemplo, na Pat. No. 7.429.652.
[00183] O termo "diacorpos" refere-se a pequenos fragmentos de anticorpo com dois locais de ligação ao antígeno, fragmentos estes que compreendem um domínio variável da cadeia pesada ligado a um domínio variável da cadeia leve na mesma cadeia polipeptídica. Utilizando um ligante que é demasiado curto para permitir o emparelhamento entre os dois domínios na mesma cadeia, os domínios são forçados a emparelhar com os domínios complementares de outra cadeia e criar dois locais de ligação ao antígeno. Os diacorpos são descritos mais completamente em, por exemplo, em EP 404,097; WO 93/1 1 161; e Hollinger et ai, Proc. Natl. Acad. Sci. LISA, 90: 6444-6448 (1993).
[00184] Conforme aqui utilizado, um "fragmento de anticorpo de ligação ao antígeno" é qualquer fragmento de anticorpo que retenha a capacidade de se ligar ao alvo específico para o qual o anticorpo se liga especificamente intacta. Um fragmento de anticorpo de ligação a antígeno pode ter (por exemplo, menor) diferente afinidade de ligação para o antígeno alvo do que o anticorpo intacto. Tal como aqui utilizado, a menos que indicado de outro modo, um fragmento de anticorpo é um fragmento de anticorpo de ligação ao antígeno
[00185] Um anticorpo que "se liga especificamente a" ou é "específico para" um polipéptido particular ou, um epitopo num polipéptido particular é um que se liga a esse polipéptido particular ou epítopo num polipéptido particular, sem substancialmente se ligar a qualquer outro poliptido ou epítopo polipeptídico.
[00186] Os termos "antígeno", "molécula alvo", "polipéptido alvo", "epitopo alvo", e outros semelhantes são aqui utilizados para denotar a molécula especificamente ligado por um anticorpo ou fragmento de anticorpo.
[00187] Conforme aqui utilizado, um "marcador", uma "etiqueta", um "marcador de porção" e uma "porção de etiqueta" referem-se a um composto ou composição detectável que é conjugado directa ou indiretamente com o anticorpo de modo a gerar um " rotulado "anticorpo. Um rótulo ou marcador proporciona um sinal detectável durante pelo menos o período de tempo durante o qual um sinal é para ser observado. A etiqueta ou marcador pode ser detectável por si próprio (por exemplo marcadores de radioisótopos ou marcadores fluorescentes) ou, na facilidade de um marcador enzimático, pode catalisar uma alteração química de um composto ou composição substrato que é detectável.
[00188] Uma porção de rótulo ou marcador pode ser, por exemplo, um corante, um marcador de epitopo, uma porção fluorescente, uma unidade luminescente, uma porção quimioluminescente, um marcador enzimático, um marcador magnético, um marcador paramagnético, um agente de contraste, uma nanoparticfe, um radioisótopo, biotina, estreptavidina, e um extintor. Uma nanopartícula pode ser uma partícula de um elemento, tal como uma nanopartícula de ouro ou de uma liga ou composto, tal como um quantum dot (uma partícula de um material semicondutor), ou outra partícula com um tamanho tipicamente num intervalo entre cerca de 1 corrida para cerca de 100 prazo.
[00189] Um rótulo ou marcador porção pode fornecer um sinal através da reflexão, ou modular, a energia que incide sobre a porção de etiqueta ou um marcador, uma porção da etiqueta ou marcador pode fornecer um sinal através da emissão, ou aumentando, um sinal detectável. Do mesmo modo, uma porção de rótulo ou marcador pode fornecer um sinal através da diminuição, ou de extinção, um sinal (por exemplo, a extinção de um sinal). Deve entender-se que uma porção de rótulo ou marcador pode ser diretamente detectável (por exemplo, pode proporcionar um sinal detectável, sem outras medidas ou entrada de energia), ou pode utilizar ou necessitam de energia, um substrato, um parceiro de ligação, ou qualquer outra acção, a fim para proporcionar um sinal detectável. Um marcador enzimático pode ser adequado para utilização com um parceiro de ligação ou substrato; por exemplo, uma peroxidase tal como peroxidase de rábano pode servir como um marcador, uma vez que podem ser utilizados para detectar a presença de um alvo, ou para medir a quantidade de alvo, quando utilizado com, por exemplo, diaminobenzidina ou outra molécula adequada para utilização com um peroxidase; Por outro lado, um exemplo não limitativo, a luciferase pode servir como um marcador, uma vez que podem ser usadas para detectar a presença de um alvo, ou para medir a quantidade de alvo, quando usado com a luciferina.
[00190] Conforme aqui utilizado, o termo "cromógeno" refere-se a um composto que pode ser prontamente convertido em um corante ou outro composto corado.
[00191] Conforme aqui utilizado, "BSA" significa albumina de soro bovino; "PEG" significa polietileno-glicol: "ELISA" significa ensaio de imunossorvente ligado a enzima; e outros termos, abreviaturas e siglas têm os significados padrão entendidos nas artes biológicas e químicas IHE e.
[00192] Uma composição pode incluir um tampão. Os tampões incluem, sem limitação, fosfato, citrato, amónio, acetato, carbonato, tris (hidroximetil) aminometano (TR1S), 3- (N-morphoi não) ácido propanesuifonic (MOPS), 3-morpholmo-2-hidroxipropanossulfónico ácido (MOPSO) , 2- (N- morfolino) etanossulfónico (MES), N- (2-acetamido) ácido -iminodiacetic (ADA), piperazina-N, N'-bis (ácido 2-etanossulfónico) (PIPES), Ν- (2 .-acetamido) -2- aminoetanossulfónico (ACES), cloreto de cholamine, N, N-bis (2-hydroxyethyI) -2- aminoetanossulfónico (BBS), 2 - [[l, 3-d hidroxi-2- (hidroximetil ) propan-2-il] amino] etanossulfónico (TES), 4-i2-hydroxyethyI) - 1 piperazina etanossulf único (HEPES), acetamidogiycine, tricina (N- (2-hidroxi- 1, 1-bis (hidroximetil) etil) glicina), glicinamida, e bicina (2- (bis (2-hidroxietil) amino) acético) buffers. Buffers incluir outros buffers de ácidos orgânicos em Além das fosfato, citrato, acetato de amónio, carbonato, e tampões explicitamente aqui mencionadas,
[00193] Composição A pode incluir um ganhador fisiologicamente aceitável. Por exemplo, um veículo f isiologicamente aceitável pode ser uma solução aquosa de pH tamponado. Exemplos de transportadores fisiologicamente aceitáveis incluem tampões tais como fosfato, citrato, e outros ácidos orgânicos como discutido acima; antioxidantes incluindo ácido ascórbico; baixo peso molecular (menos do que cerca de 10 resíduos); polipéptidos proteínas, tais como, por exemplo, albumina de soro, gelatina, citocromos, e imunoglobulinas; polímeros hidrófilos tais como polivinilpirrolidona; aminoácidos tais como glicina, glutamina, asparagina, arginina ou lisina; monossacáridos, dissacáridos, polissacarídeos, e outros hidratos de carbono incluindo glicose, manose, e dextrinas; agentes quelantes tais como ácido etileno diamina tetraacético (EDTA); álcoois de açúcar tais como mannitoi ou sorbitol; eounterions formadores de sal tais como sódio, potássio, cálcio, magnésio e outros; tensioactivos não iónicos tais como TWEEN ™, polietilenoglicol (PEG), e Pluronics ™; e / ou outros compostos conhecidos na arte, [001941 Por exemplo, uma composição pode incluir albumina, gelatina, citocromo C, uma imunoglobulina, um aminoácido, ágar, glicerol, etileno glicol, um inibidor da protease, um agente antimicrobiano, um agente quelante de metal, um monossacarídeo, um dissacarídeo, um poli sacarídeo, um agente de redução, um agente quelante, ou combinações dos mesmos.
[001953 Tal como aqui utilizado, uma "amostra" ou "amostra biológica", ou "amostra clínica" refere-se a uma amostra de fluido, tecido, secreção, excreção ou obtida de um sujeito. Uma amostra, amostra biológica, ou a amostra clínica pode ser uma amostra de sangue, soro, plasma, saliva, expectoração, urina, fluido gástrico, fluido digestivo, lágrimas, suor, fezes, sémen, secreções vaginais, fluido intersticial, fluido derivado a partir tumoral tecido, fluidos oculares, muco, cera, óleo, as secreções glandulares, fluido espinal, pele, fluido cerebrospinal de dentro do crânio, tecido, fluido ou material a partir de um cotonete nasal, um cotonete de garganta, uma haste de boca (por exemplo, uma haste de face) , um esfregaço vaginal, ou lavagem nasofaríngea, fluido biópsia ou material, fluido de placenta, líquido amniótico, sangue do cordão umbilical, fluidos linfáticos, fluidos da cavidade, pus, microbiota obtida de um indivíduo, de mecônio, o leite materno, ou outra secreção ou excreção. Uma amostra pode ser uma amostra de ar, uma amostra de cabelo, uma amostra da unha, ou outra amostra.
[00196] biológico e amostras clínicas podem incluir lavagem nasofaríngeo, ou outro fluido obtido por lavagem de uma cavidade do corpo ou superfície de um objeto, ou por lavagem de um cotonete após a aplicação da mecha a uma cavidade do corpo ou superfície de um objeto. N cotonetes asal, compressas boca (incluindo zaragatoas bochecha), swabs, secreção vaginal, amostras de fezes, o cabelo, Página 5: unha do dedo, a cera do ouvido, a respiração, e outras amostras de sólidos, semi-sólidos, ou gasosos podem ser transformados num tampão de extracção, por exemplo, para um valor fixo ou variável de tempo, antes da sua análise. O tampão de extracção ou um seu alíquota pode então ser processada de forma semelhante para outras amostras de fluido se se desejar. Exemplos de amostras de tecido do sujeito pode incluir, mas não estão limitados a, tecido conjuntivo, tecido muscular, tecido nervoso, tecido epitelial, cartilagem, amostra cancerosa, ou osso. A amostra pode ser obtida a partir de um ser humano ou animal. A amostra pode ser obtida a partir de um vertebrado, por exemplo, um pássaro, peixe ou mamífero, tal como um rato, um rato, um porco, um macaco, um outro primata (incluindo seres humanos), um animal de exploração, um animal de desporto, ou um animal de estimação. A amostra pode ser obtida a partir de um objeto estar ou mortos. A amostra pode ser obtida fresco de um assunto ou pode ter sofrido alguma forma de pré-processamento, armazenamento ou transporte,
[00197] Conforme aqui utilizado, um "pequeno volume" refere-se a um volume inferior a cerca de 1 mL, ou menos do que cerca de 500 μ, Ε, ou menos do que cerca de 250 lil, ou menos do que 150 Al, ou menos do que cerca de 100 μl ,, ou menos do que cerca de 50 μί ^ , ou menos do que cerca de 2,5 μϋ,
ou menos.Em particular formas de realização, um pequeno volume, tal como um volume "" dedo-stick ", pode compreender menos do que cerca de 250 μl ,, e compreende, tipicamente, menos de 150 iil, ou menos do que cerca de 1 00 μl ,, ou menos do que cerca de 50 lil, ou menos do que cerca de 25 μΕ, ou menos.
[00198] Uma amostra pode ser dividida em duas ou mais porções. Tal como aqui utilizado, quando se refere a uma amostra ou amostras, os termos "porção" e "alíquota" e seus plurais e seus equivalentes gramaticais são utilizados indiferentemente para se referir a uma quantidade fraccionada de amostra tomada a partir de uma amostra original completo. uma fracção Tal pode ser qualquer fracção ou quantidade, de modo que uma parte ou a alíquota pode compreender a maioria da amostra original, uma grande fracção da amostra original, uma pequena fracção da amostra original, ou uma fracção relativamente pequena da amostra original. As frases "pelo menos uma. Porção", "pelo menos uma alíquota", e semelhantes, podem referir-se tanto a uma parte fraccionada de uma amostra original e para toda a amostra original.
[00199] A detecção de marcadores, e detecção de organismos causadores de doenças (ou outros) podem incluir detecção de marcadores de ácidos nucleicos;detecção de marcadores de proteínas (peptídeos), incluindo detecção de anticorpos; detecção de marcadores de inflamação (incluindo tanto péptido e marcadores não-peptídicos); e detecção de outros marcadores. Identificação de marcadores, e de organismos causadores de doenças (ou outros) pode incluir a identificação de marcadores de ácidos nucleicos; a identificação de marcadores proteicos (péptido), incluindo a identificação de anticorpos; a identificação de marcadores de inflamação (incluindo tanto péptido e marcadores não-peptídicos); e identificação de outros marcadores. Detecção e identificação de marcadores e organismos podem incluir a detecção quantitativa e identificação dos marcadores e tais organismos.
[00200] Um método pode ser realizado num período de tempo curto. Um dispositivo pode ser capaz de executar todos os passos de um processo em um curto período de tempo. Um dispositivo pode ser e capabl de executar todas as etapas de um método em uma única amostra em um curto espaço de tempo. Um dispositivo pode ser capaz de executar todos os passos de um processo em duas amostras, tal como uma amostra de sangue e uma amostra obtida a partir de uma zaragatoa, num curto espaço de tempo. Um dispositivo pode ser capaz de executar todos os passos de um processo em mais do que duas amostras num curto período de tempo. Por exemplo, a partir de recolha de amostra de um indivíduo para a detecção de um marcador da doença, ou para a detecção de vários marcadores de doenças, pode demorar cerca de 3 horas ou menos, 2 horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 minutos ou menos, 45 minutos ou menos, 40 minutos ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 minutos ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 minutos ou menos, 3 minutos ou menos, 2 mmutes ou menos, ou 1 minuto ou menos . Por exemplo, a partir de recolha de amostra de um indivíduo para a transmissão de dados a respeito de, e / ou a análise de uma amostra ou amostras podem ter cerca de 3 horas ou menos, 2 horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 minutos ou menos, 45 minutos, ou menos, 40 mmutes ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 mmutes ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 minutos ou menos, 3 minutos ou menos, 2 mmutes ou menos, ou 1 minuto ou menos.
[002011 Por exemplo, o período de tempo desde o início de um método de detecção de um marcador da doença para a detecção de um marcador da doença, ou para a detecção de vários marcadores de doenças, pode ser cerca de 3 horas ou menos, 2 horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 mmutes ou menos, 45 minutos ou menos, 40 minutos ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 minutos ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 minutos ou menos, 3 minutos ou menos, 2 minutos ou menos, ou um minutos ou menos. Por exemplo, o período de tempo desde o início de um método de detecção de um marcador da doença para a transmissão de dados relativos a essa detecção pode ser cerca de 3 horas ou menos, 2 horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 minutos ou menos, de 45 minutos ou menos, 40 minutos ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 minutos ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 minutos ou menos, 3 minutos ou menos, 2 minutos ou menos, ou i minuto ou menos .
[00202] O período de tempo de aceitar um e sampl dentro do dispositivo para detecção de um marcador da doença, ou para a detecção de uma pluralidade de marcadores de doença, ou para transmissão de dados sobre, e / ou a análise de uma amostra ou amostras podem depender o tipo ou o número de passos, testes ou ensaios realizados sobre a amostra ou amostras. A quantidade de tempo de aceitar uma amostra, ou amostras, dentro do dispositivo para detecção de um marcador de doença ou marcadores, ou para transmissão de dados e / ou para análise a partir do dispositivo em relação a tal uma amostra ou amostras podem ter cerca de 3 horas ou menos, dois horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 minutos ou menos, 45 minutos ou menos, 40 minutos ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 minutos ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 mmutes ou menos, 3 minutos ou menos, 2 minutos ou menos, ou 1 minuto ou menos.
[00203] Deste modo, tal como aqui utilizado, um "curto período de tempo" refere-se a um período de tempo de cerca de 5 horas ou menos, ou cerca de 4 horas ou menos, ou cerca de 3 horas ou menos, ou cerca de 2 horas ou menos, ou cerca de 1 hora ou menos, ou cerca de 50 minutos ou menos, ou cerca de 40 minutos ou menos, ou cerca de 30 minutos ou menos, ou cerca de 20 minutos ou menos, ou cerca de 10 mmutes ou menos, ou cerca de 5 minutos ou menos .. um curto período de tempo pode ser determinado em relação a um tempo inicial; o tempo inicial pode ser o momento em que começou a análise de uma amostra; o tempo inicial pode ser o momento em que uma amostra é inserido um dispositivo para a análise da amostra; o tempo inicial pode ser o momento em que uma amostra foi obtido de um sujeito.
[00204] Os termos "Point of Service" (POS abreviado) e "sistema de ponto de serviço", tal como aqui utilizado, referem-se a um local, e um sistema em que a localização, que é capaz de proporcionar um sendee (por exemplo, testes, monitorização , tratamento, diagnóstico, orientação, recolha de amostras, a verificação da identidade (ID de verificação), e outros serviços) no ou próximo do local ou localização do objeto. Um serviço pode ser um serviço médico, e pode ser um serviço não-médico. Em algumas situações, um sistema POS fornece um serviço em um local pré-determinado, tais como casa, escola ou trabalho de um assunto ou em um supermercado, uma farmácia, um centro comunitário, uma clínica, um consultório médico, um hospital, etc. um sistema POS pode incluir um ou mais ponto de serviço de vícios. Em algumas formas de realização, um sistema de POS é um sistema de ponto de cuidados,
[00205] A. "point of care" (POC abreviado) é um local em que é fornecida assistência médica-relacionada (por exemplo, tratamento, testes, monitoramento, diagnóstico, aconselhamento, etc.). A POC pode ser, por exemplo, a de um sujeito casa, no trabalho ou na escola, ou em um supermercado, um centro comunitário, uma farmácia, um consultório médico, uma clínica, um hospital, etc. Um sistema POC é um sistema que pode auxiliar na, ou podem ser utilizados em, prestação de cuidados médicos relacionados tais, e podem estar localizados em ou perto do local ou localização do objeto ou do prestador do sujeito de cuidados de saúde (por exemplo, em casa, o trabalho ou na escola do sujeito, ou a uma mercearia loja, um centro comunitário, uma farmácia, um consultório médico, uma clínica, um hospital, etc.).
[00206] Conforme aqui utilizado, o termo "imunoensaio" refere-se a qualquer ensaio que detecta, identifica, caracteriza, quantifica, ou de outro modo mede um alvo de aminoácidos de uma amostra (em que um alvo de amino ácido pode ser um pequeno peptídeo, um polipeptídeo, uma proteína, ou macromolécula proteico). Os imunoensaios incluem, por exemplo, ensaios de ligação directa ou competitivos utilizando técnicas tais como western blots, radioimunoensaios, ELISA (ensaio de imunoabsorção enzimática),
"sanduíche" imunoensaios, ensaios de imunoprecipitação.
imunoensaios fluorescentes, imunoensaios de proteína A e. Imunoensaios geralmente utilizar anticorpos ou fragmentos de anticorpos, Bui podem também utilizar proteínas ou proteínas transportadoras que se ligam a moléculas alvo com elevada especificidade de ligação.
[00207] Conforme aqui utilizado, o termo "ensaio de ácido nucleico" é utilizado para se referir a qualquer ensaio que detecta, identifica, caracteriza, quantifica, ou de outro modo mede um ácido nucleico alvo numa amostra (em que um alvo de ácido nucleico pode ser uma única cadeia simples, cadeia dupla, ou de outra molécula de ácido nucleico de qualquer tamanho. ensaios de ácidos nucleicos incluem a reação em cadeia da polimerase ensaios (PGR) (ver, por exemplo, Patente US No. 4.683.202), amplificação mediada por ciclo isotérmica ( "LAMP") (ver, por exemplo, a Patente US N ° 6410278), e outros métodos, incluindo os métodos discutidos abaixo para a detecção de alvos de ácidos nucleicos numa amostra. marcadores de ácido nucleico pode ser detectada por quaisquer meios adequados, incluindo meios que incluem a amplificação de ácidos nucleicos (por exemplo, métodos de amplificação de ciclos térmicos incluindo PGR, e outros métodos de amplificação de ácido nucleico, métodos de amplificação isotérmica, incluindo a lâmpada, etc) e qualquer outro método que pode ser usado para detectar a presença de marcadores de ácido nucleico indicativos de um organismo causador de doença numa amostra.
[00208] Conforme aqui utilizado, o termo "ensaio de química geral" refere-se a qualquer ensaio que detecta, identifica, caracteriza, quantifica, ou de outro modo mede um alvo numa amostra, à excepção de um alvo, que é um ácido nucleico ou outra forma que não utilize de um anticorpo ou outra proteína que se liga especificamente. Ensaios gerais da química incluem, por exemplo, para ensaios de electrólitos; para os níveis de vitamina; para os níveis de componentes do sangue: de metais traço; para lipídios; e outros alvos). Os ensaios de química geral pode incluir, por exemplo, ensaios de um painel metabólica básica [glicose, cálcio, sódio (Na), potássio (K), cloreto (Cl), CO ?,
(dióxido de carbono, bicarbonato), creatinina, ureia no sangue de azoto (BUN)], ensaios de um painel de Electrólito [sódio (Na), potássio (K), cloreto (Cl), CO. (dióxido de carbono, bicarbonato)], ensaios de um painel Chem 14 / completas Painel metabólica [glicose, cálcio , albumina, proteína total, sódio (Na), potássio (K), cloreto (Cl), C0 2 (dióxido de carbono, bicarbonato), creatinina, azoto da ureia no sangue (BUN), fosfatase alcalina (ALP), alanina aminotransferase (ALT / GPT), aspartato aminotransferase (AST / GOT), bilirrubina total] ensaios de um perfil lipídico / ' Lipid Painel [colesterol LDL, colesterol HDL, colesterol total e triglicéridos], os ensaios de uma função de painel de fígado / fígado [fosfatase alcalina (ALP ), alanina aminotransferase (ALT / GPT), aspartato aminotransferase (AST / GOT), bilirrubina total, albumina, proteína total, transferase gainma-glutamil transferase (GGT), lactato desidrogenase (LDH), tempo de protrombina (PT)], fosfatase alcalina ( APase), hemoglobina, colesterol VLDL, etanol, lipase, H, zinco protoporfirina, bilirrubina direta, tipagem sanguínea (ABO, RHD), chumbo, fosfato, inibição da hemaglutinação, magnésio, ferro, itptake ferro, sangue oculto nas fezes, e outros, individualmente ou em qualquer combinação.
[00209] Conforme aqui usado o termo "ensaio de citometria de" refere-se a qualquer que detecta, identifica, caracteriza, quantifica, ou de outro modo mede uma célula ou partícula grande (por exemplo, um cristal) em uma amostra. Os ensaios de citometria de imagiologia utilizam tipicamente de outras técnicas à base de luz para detectar, medir, caracterizar e quantificar células e partículas numa amostra, Sistemas, dispositivos e MÉTODOS
[00210] Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, incluindo tais sistemas discutidos acima, para a detecção de uma ou mais de uma pluralidade de agentes causadores de doenças numa amostra clínica. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, incluindo tais sistemas discutidos acima, para a detecção de uma ou mais de uma pluralidade de agentes causadores de doenças numa amostra clínica, em que as referidas doenças incluem doenças do respirador. Em formas de realização, os requerentes descrevem sistemas, incluindo tais sistemas discutidos acima, para a detecção de uma ou mais de uma pluralidade de agentes causadores de doenças numa amostra clínica, wherem que os referidos agentes patogênicos causadores de doenças respiratórias selecionados de doenças virais, doenças bacterianas, doenças por fungos , doenças Mycoplasma, e outras doenças.
[00211] Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças faz com que um certo número de doenças, em que o referido número de doenças compreende 8 ou mais doenças, ou 10 ou mais doenças, ou 12. ou mais doenças, ou 14 ou mais doenças, ou 16 ou mais doenças, ou 18 ou mais doenças, ou 20 ou mais doenças, ou 30 ou mais doenças, ou 40 ou mais doenças, ou 50 ou mais doenças, ou 60 ou mais doenças, ou mais. Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças faz com que um certo número de doenças, wherem referidas doenças são selecionados a partir de doenças virais, doenças bacterianas, doenças por fungos, doenças Mycoplasma, e outras doenças.
[00212] Em formas de realização, os sistemas aqui descritos, bem como os métodos aqui descritos, pode ser usado para executar ail de uma pluralidade de ensaios com uma única amostra de volume pequeno, ou uma alíquota ou alíquotas dos mesmos. Em formas de realização, um pequeno volume de amostra tem um volume selecionada a partir de não mais do que cerca de 1 ml, ou não mais do que cerca de 500 μl ,, ou não mais do que cerca de 250 μl ,, ou não mais do que cerca de 150 iil, ou não mais do que cerca de 100 p, L, ou não mais do que cerca de 75 iil, ou não mais do que cerca de 50 μl., ou não mais do que cerca de 25 μl. ,, ou não mais do que cerca de 15 μΙ_, ou não mais do que cerca de 10 ,, ou μΙ_ não mais do que cerca de 5 μl ,, ou não mais do que cerca de 4 μl ,, ou não mais do que cerca de 3 μl-, ou não mais do que cerca de 2 μl ^ ,
ou não mais do que cerca de 1 μϋ, ou menos do que cerca de 1 μl. .
[002133 Em formas de realização, os sistemas aqui descritos, bem como os métodos aqui descritos, pode ser usado para executar ail de uma pluralidade de ensaios num período de tempo curto. Em formas de realização, um tal período de tempo curto compreende menos do que cerca de três horas, ou menos de cerca de 2 horas, ou menos de cerca de 1 hora, ou menos do que cerca de 50 mmutes, ou menos do que cerca de 45 minutos, ou menos de cerca de 40 minutos, ou menos do que cerca de 30 minutos, ou menos de cerca de 20 minutos, ou menos do que aboui 15 minutos, ou menos de cerca de 10 minutos, ou menos ihan cerca de 5 minutos, ou menos de cerca de 4 minutos, ou menos de cerca de 3 minutos, ou menos do que cerca de 2 minutos, ou menos de cerca de 1 minuto.
[00214] Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças pode causar um número de doenças, em que os referidos agentes causadores de doenças são selecionados a partir de tuberculose myeobacterium, Staphylococcus aureus (incluindo Staphylococcus aureus resistentes à meticilina), estreptococos (incluindo Streptococcus Grupo A e Streptococcus grupo B), Bordetella pertussis, adenovírus (incluindo adenovírus B, adenovírus C, e adenovírus e), gripe, parainfluenza, o vírus sincicial respiratório (SV), adenovírus, vírus corona, bocavírus, Haemophilus parainfluenzae, vírus do papiloma humano (HPV), hepatite, humano vims imunodeficiência (HIV), vírus do herpes simplex (HSV), Oeste do Nilo, vírus de Epstein Barr, rinovírus, e outros vírus. Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças faz com que um certo número de doenças, em que os referidos agentes causadores de doenças são selecionados a partir de Streptococcus, Staphylococcus, Bordetella pertussis, tuberculose, enterobactérias, Pseudomonas, dengue, malária, tiypanosome cruzi, Treponema pallidum, micoplasma, clamídia, Moraxella catarrhalis, Acinetobacter, legioneila, cols Escherichia, Candida, clamídia. Neisseria, Trichomonas, e outros agentes causadores de doenças, de micro-organismos, das, incluindo mas não se limitando a agentes causadores de doença referida aqui noutro local.
[00215] Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças pode causar um número de doenças respiratórias, em que o referido número de doenças respiratórias tem 8 ou mais doenças respiratórias, ou 10 ou mais doenças respiratórias, ou 12 ou mais doenças respiratórias, ou 14 ou mais doenças respiratórias, ou 16 ou mais doenças respiratórias, ou 18 ou mais doenças respiratórias, ou 2,0 ou mais doenças respiratórias, ou 30 ou mais doenças respiratórias, ou 40 ou mais doenças respiratórias, ou 50 ou mais doenças respiratórias, ou 60 ou mais as doenças respiratórias, ou mais.
[00216] Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças pode causar um número de doenças respiratórias, em que o referido doenças respiratórias são selecionados a partir de doenças virais, doenças bacterianas, doenças por fungos, doenças Mycoplasma, e outras doenças.
[002173 Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças pode causar um número de doenças respiratórias, em que os referidos agentes causadores de doenças respiratórias são selecionados a partir de Mycobacterium tuberculosis, Staphylococcus aureus (incluindo met staphylococcus aureus icillin-resistentes), Streptococcus (incluindo Streptococcus Grupo A), Bordetella pertussis, adenovírus (incluindo adenovírus B, C adenovírus, e adenovírus e) ,. Em formas de realização, os agentes causadores de doenças respiratórias podem ainda incluir um ou mais de influenza, parainfluenza, vírus respiratório sincicial (RSV), adenovírus, vírus corona, bocavírus, Haemophilus parainfluenzae, vírus do papiloma humano (HPV), a hepatite, vims assassino de imunodeficiência (HIV ), vírus do herpes simplex (HSV), Oeste do Nilo, vírus de Epstein Barr, rinovírus, vírus e outros.
[00218] Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças pode causar gripe. Em formas de realização, a gripe pode ser selecionada a partir de vírus influenza A, influenza B, influenza II em I (incluindo as formas sazonais de gripe e novos H1 1), a gripe H3N2, H7N9 influenza, a gripe H5N1, e outros gripes.
[00219] Em formas de realização, a pluralidade de agentes causadores de doenças pode causar uma doença sexualmente transmissível. Em formas de realização, a doença sexualmente transmissível é selecionada de vírus herpes simplex (HSV), o vírus da imunodeficiência humana (HIV, incluindo HlV-1, VIH-2, incluindo o HIV-2 Grupo A), gonorréia, sífilis, vírus do papiloma humano (PPV) , Streptococcus (incluindo Streptococcus B), Treponema pallidum, e outras doenças sexualmente transmissíveis.
[00220] Outras metas incluem micro-organismos resistentes aos medicamentos, incluindo aqueles que apresentam resistência multi-arraste. A resistência aos fármacos (também denominado resistência a antibióticos) é encontrado em que uma população (ou subpopulação) de um microrganismo, tal como uma bactéria, adquire resistência ou exposições a uma ou mais drogas (por exemplo, um ou mais antibióticos). Micro-organismos que são resistentes ao tratamento por fármacos múltiplos são denominadas como " 'resistente a multi- resistência" e das micro-organismos são denominados de ter ou apresentar "resistência multi-droga"; um ou outro termo pode ser abreviado por "MDR". A resistência a uma ou mais drogas é observada, ou exibiram, quando uma população de microrganismos sobrevive (e normalmente continua a gro W e multiplicar em número), apesar da presença de um obstáculo, ou (no caso da MDR), apesar da presença de múltiplas drogas. organismos resistentes a fármacos de interesse particular incluem, mas não estão limitados a, resistente à meticilina Staphylococcus aureus (MRSA), vancomicina intermediário S. aureus (VISA), resistente a vancomicina de S. aureus (VRSA), bactérias (por exemplo, enterobactérias) Tendo estendido espectro de beta-lactamase (BLEE), resistente à vancomicina Enierococcus (VRE), e resistente a múltiplas drogas A. Bau iannii (MRAB). organismos alvo resistentes a drogas, incluindo os organismos alvo de MDR, podem ser identificados por meio de marcadores de ácido nucleico,
proteína (ou péptido), marcadores de outros marcadores, ou suas combinações, bem como por observação do seu crescimento na presença de arrastos,
[00221] Muitos compostos antibióticos incluem um anel lactama β- (um anel de quatro átomos de carbono); por exemplo, a penicilina é um antibiótico com um anel de lactama β-. Muitas bactérias têm enzimas β-lactamase que podem clivar um anel β-lactama, e, assim, protegem as bactérias contra tais antibióticos. As enzimas que podem clivar um anel lactama β-, que muitas vezes são encontrados em bactérias Gram-negativas, incluem a ETM e Rob enzimas β- lactamase.Resistente a drogas bactéria Haemophilus influenzae pode ter o gene de resistência ou blaTEM blaROB (tipicamente blaTEM-1, embora blaTEM-2 e um blaROB- e outros, também são encontradas); outros marcadores de resistência a drogas disponíveis em organismos causadores de doenças incluem o gene de resistência KPC (encontrado no carhapenemas Klebsiella pneumonia (KPC)); mecA e MECC genes de resistência (responsável pela resistência à p-lactama contendo antibióticos, tais como meticilina); genes de resistência a vancomicina A e B (vanA vanB e) pode ser encontrada em bactérias causadoras de doenças, tais como, por exemplo, os enterococos resistentes à vancomicina; e marcadores de arrastar-resistência outros.
[00222] organismos causadores de doenças de interesse incluem vírus da família filoviridae de vírus (filo vírus), que inclui vírus Ebola, vírus Marburg e vírus Cueva. vírus Ebola causar doença do vírus ebola (também conhecida como febre hemorrágica Ebola); vírus Marburg também causar febre hemorrágica, a febre hemorrágica de Marburg; e vírus Cueva como lloviu VIMS (LLOV), pode ser endémica em França, Espanha ou Portugal. Tais vírus podem ser detectados e podem ser identificadas numa amostra a partir de marcadores de ácido nucleico específicas para estes vírus, a partir de proteína (péptido) marcadores específicos para estes vírus, e de outros marcadores específicos para esses vírus.
[00223] vírus Filo normalmente causam febres hemorrágicas e doenças relacionadas. Estas e outras doenças podem ser detectados, e podem ser identificadas, através da identificação de marcadores de ácido nucleico, marcadores de péptidos, e outros marcadores, sozinho ou em combinação, tal como aqui divulgado.Filo doenças virais, outras febres hemorrágicas e outras doenças, incluindo muitas doenças tropicais, por exemplo Dengue 1, dengue 2, dengue 3, Dengue 4, a malária, febre tifóide e outras doenças, têm muitos efeitos prejudiciais, incluindo hemorragia e hemorragia interna, e pode causar perturbações em eletrólitos, pode causar anemia, e pode causar outros sintomas e efeitos. Os ensaios de electrólitos integrados (por exemplo, para o sódio, potássio, e outros electrólitos, incluindo de sódio e de potássio em conjunto, e incluindo os de sódio e de potássio em conjunto com outros electrólitos) pode identificar indivíduos que sofrem de desequilíbrios de electrólitos, e podem, assim, identificar indivíduos que sofram de uma febre hemorrágica, de anemia, ou ambos. Os ensaios para a hemoglobina, o ferro e outros ensaios podem identificar indivíduos que sofrem de anemia, a partir de uma febre hemorrágica, ou ambos. A anemia pode ser devida a hemorragia, infecção parasitária (por exemplo, ancilóstomo), tanto hemorragia e infecção parasitária, e outras causas. Assim, em adição ao teste de ácido nucleico, péptido, e outros marcadores, estes hemorrágico e outras doenças podem ser detectados, e podem ser identificadas, com medições de electrólitos integrados; com medições de hemoglobina; com medições de ferro; e com outros ensaios de química geral, sozinho ou em combinação. Em formas de realização, medições de eletrólitos integrados, hemoglobina, ferro, ou outros ensaios de química geral podem prever indicações de que um sujeito sofre de anemia, a febre hemorrágica como o Ebola, Marburg, ou outra doença como a malária ou a febre tifóide; tal indicação pode ser utilizada para sugerir mais testes para marcadores de tais doenças. Assim, em formas de realização, o teste de electrólito incluindo de sódio e de potássio, ou outros ensaios de química geral, podem ser realizadas em simultâneo, quando o teste de Ébola, Marburgo, ou outra doença hemorrágica (por exemplo, quando o teste de ácido nucleico, péptido, ou outros marcadores para tais doenças ).
[00224] Em formas de realização, tais indicações derivadas de resultados do teste de química geral (por exemplo, a partir dos resultados das medições integradas eletrólitos, hemoglobina, ferro, ou outros ensaios de química geral) pode desencadear automaticamente reflexo testes para um ou mais marcadores de doenças febre hemorrágica, ou malária, febre tifóide, ou outro marcador da doença, e pode disparar automaticamente reflexo testes para combinações ou para todos esses marcadores. Em formas de realização, um sujeito pode ser testado para outras doenças e não (inicialmente) para o Ébola, Marburgo, ou outra doença hemorrágica (por exemplo, um paciente que é fraca, ou febril, não pode, inicialmente, ser testado para o Ébola, Marburgo, ou outro hemorrágico doença); com base nos resultados das medições integradas eletrólitos, hemoglobina, ferro, ou outros ensaios de química geral, um teste do reflexo para Ebola, Marburg, ou outra doença hemorrágica pode ser executado automaticamente, ou pode ser ordenada por um profissional de saúde. Em formas de realização, um paciente ou indivíduo podem não querer ser testado para Ébola, Marburgo, ou outra doença hemorrágica, ou outra doença de interesse (por exemplo, um paciente pode temer quarentena, ou podem recear que o custo do ensaio pode ser proibitivo) e, portanto, não podem, inicialmente, ser testado para o Ébola, Marburgo, ou outra doença hemorrágica; com base nos resultados das medições integradas eletrólitos, hemoglobina, ferro, ou outros ensaios de química geral, um teste do reflexo para Ebola, Marburg, ou outra doença hemorrágica pode ser executado automaticamente, ou pode ser ordenada por um profissional de saúde. Em formas de realização, um tal teste de reflexo para Ébola, Marburgo, ou outra doença hemorrágica, ou outras doenças em questão pode ser realizada se o paciente é primeiro testado para uma ou doenças mais infecciosas que não Ébola, Marburgo, ou outra doença hemorrágica, eo painel de teste inicial não mostra a infecção de qualquer doença conhecida (e, portanto, seriam necessários mais testes, a fim de identificar outras possíveis fontes de doença do indivíduo ou condição).
[00225] Os métodos, dispositivos e sistemas aqui descritos podem ser utilizados para detectar, e pode ser usado para identificar, organismos causadores de doença em indivíduos e populações normais ou saudáveis.
Os métodos, dispositivos e sistemas aqui descritos podem ser utilizados para detectar, e talvez utilizado para identificar organismos, benignas em indivíduos e populações normais ou saudáveis.
Tais organismos causadores de doenças, e tais organismos benignos podem ser detectados, e podem ser identificados, em amostras obtidas a partir de um indivíduo normal, por exemplo, uma vez ou numa base contínua, a fim de determinar uma linha de base ou do nível normal para indivíduo thai quando que o indivíduo é saudável.
Tal detecção de causadores de doenças benignas e organismos podem incluir a detecção de marcadores de ácido nucleico; detecção de marcadores de proteínas (peptídeos), incluindo detecção de anticorpos; detecção de marcadores de inflamação (incluindo tanto péptido e marcadores não-peptídicos); e a detecção de marcadores oiher.
Tal identificação dos causadores de doenças benignas e organismos podem incluir a identificação de marcadores de ácido EIC Nucl; a identificação de marcadores proteicos (péptido), incluindo a identificação de anticorpos; a identificação de marcadores de inflamação (incluindo tanto péptido e marcadores não- peptídicos); e identificação de outros marcadores.
Detecção e identificação de marcadores podem incluir a detecção quantitativa e identificação de tais marcadores.
As diferenças entre os resultados a partir de uma amostra e os resultados normais ou de linha de base pode ser utilizado para melhorar a probabilidade de detectar se ou não um indivíduo sofre de uma doença ou condição.
Por exemplo, a determinação de uma inicial ou um nível normal para um auxílios individuais na detecção, na identificação e no diagnóstico de condições de doença ou progressão para uma doença ou uma condição prejudicial, através da comparação dos resultados das amostras mais tarde, obtidos a linha de base ou os níveis normais determinada quando o indivíduo como saudável.
Tais comparações entre os resultados de um sujeito individual e os níveis de linha de base ou normais encontrados nos resultados anteriores, obtidos a partir do indivíduo saudável, quando pode ser utilizado para determinar se é provável que o sujeito indivíduo sofre de uma infecção.
Tais comparações poderá incluir a análise de sintomas, se algum, do sujeito individual que, em comparação com os sintomas (ou da falta dela) previamente encontrado para aquele indivíduo quando saudável.
[00226] Estes organismos causadores de doenças e tais organismos benignos podem ser podem ser detectados, e podem ser identificados, em amostras obtidas a partir de vários indivíduos, por exemplo, uma vez ou numa base contínua, a fim de determinar uma linha de base ou nível normal encontrada numa população normal (saudável). Tal detecção de causadores de doenças benignas e organismos podem incluir a detecção de marcadores de ácido nucleico;detecção de marcadores de proteínas (peptídeos), incluindo detecção de anticorpos; detecção de marcadores de inflamação (incluindo tanto péptido e marcadores não-pepiide); e detecção de outros marcadores. Esta identificação de causadores de doenças benignas e organismos podem incluir a identificação de marcadores de ácido nucleico; a identificação de marcadores proteicos (péptido), incluindo a identificação de anticorpos; a identificação de marcadores de inflamação (incluindo tanto péptido e marcadores não-pepiide); e identificação de outros marcadores. Detecção e identificação de marcadores podem incluir a detecção quantitativa e identificação de tal marcador. As diferenças entre os resultados obtidos a partir de uma amostra de um sujeito individual e os resultados da linha de base normais ou obtidos a partir de uma população de indivíduos saudáveis comparáveis podem ser usados para melhorar a probabilidade de detectar se ou não um sujeito indivíduo sofre de uma doença ou condição. Por exemplo, a determinação de uma inicial ou um nível normal para um ajudas sujeito individual na detecção, na identificação e no diagnóstico de condições de doença ou progressão para uma doença ou uma condição prejudicial, por comparação de resultados para o sujeito individual aos níveis basais ou normal encontrado num. população de indivíduos saudáveis comparáveis. Tais comparações entre os resultados de um sujeito individual e da linha de base ou níveis normais encontradas numa população saudável pode ser utilizado para determinar se é provável que o sujeito individual INDI sofre de uma infecção. Tais comparações poderá incluir a análise de sintomas, se algum, do sujeito individual que, em comparação com os sintomas (ou da falta dela) encontrada numa população saudável.
[00227] Em formas de realização, um tal sistema é um sistema de ponto-de-serviço (sistema POS), em que um sistema de POS está localizado num ponto de localização de serviço. Em formas de realização, um sistema de POS está localizado num ponto de localização de serviço e é configurada para aceitar uma amostra clínica obtida de um indivíduo no local de POS. Em formas de realização, um sistema de POS está localizado num ponto de localização de serviço e é configurada para aceitar uma amostra clínica obtida de um indivíduo no local de POS, e é ainda configurado para analisar a amostra clínica no local de POS. Em formas de realização, a amostra é uma amostra clínica clínico pequeno volume. Em formas de realização, a amostra clínica é analisada num curto período de tempo. Em formas de realização, o curto período de tempo é determinado em relação ao tempo no qual a amostra analy sis começou. Em formas de realização, o curto período de tempo é determinado em relação ao momento em que a amostra foi inserido um dispositivo para a análise da amostra. Em formas de realização, o curto período de tempo é determinado em relação ao momento em que a amostra foi obtida a partir do sujeito.
[002281 Os requerentes divulgam métodos da presente invenção para detectar a presença de um agente causador de doença alvo, ou um marcador indicativo da presença de um agente causador de doença alvo, numa única amostra de pequeno volume ou alíquota da mesma. Em formas de realização, os métodos para detectar a presença de uma pluralidade de agentes patogênicos alvo, ou marcadores indicativos do mesmo, a partir de uma única amostra, ou alíquota do mesmo, dentro de um curto período de tempo são divulgados. Em formas de realização, a pluralidade de agentes patogênicos alvo, ou marcadores indicativos do mesmo, designado por "alvos", compreende pelo menos 5 alvos, ou pelo menos 10 alvos, ou pelo menos 15 alvos, ou pelo menos 20 alvos, ou, pelo menos, 25 alvos, ou pelo menos 30 alvos, ou pelo menos 35 alvos, ou pelo menos 40 alvos, ou pelo menos 45 alvos, ou pelo menos 50 alvos, ou pelo menos 55 alvos, ou pelo menos 60 alvos, ou pelo menos 65 alvos, ou mais. Em formas de realização, um curto período de tempo é um período de tempo que é de cinco horas ou menos, ou é de quatro horas ou menos, ou é de três horas ou menos, ou é de duas horas ou menos, ou é de uma hora ou menos, ou seja 50 minutos ou menos, ou é de 40 minutos ou menos, ou é de 30 minutos ou menos, ou é de 20 minutos ou menos, ou é de 10 minutos ou menos, ou é de 5 minutos ou Jess.
[00229] Os requerentes divulgam métodos da presente invenção para detectar a presença de um alvo gripe VIMs molécula numa amostra são aqui descritos, em que a presença de uma pluralidade de possíveis vírus da gripe alvo são testados a partir de uma única amostra dentro de um curto período de tempo. Em formas de realização, a pluralidade de vírus da gripe possível alvo compreendem, pelo menos, 5 possíveis vírus da gripe alvo, ou, pelo menos, 10 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 15 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 20 possíveis vírus alvo fl, ou pelo lea t 25 vírus a gripe possível alvo, ou pelo menos 30 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 35 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 40 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 45 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 50 vírus da gripe alvo possíveis , ou pelo menos 55 possíveis vírus da gripe alvo, ou pelo menos 60 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 64 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 65 vírus da gripe alvo possíveis, ou mais.
[00230] Os requerentes descrevem aqui adicionalmente métodos para detectar a presença de uma pluralidade de moléculas-alvo numa única amostra dentro de um curto período de tempo, em que a pluralidade de moléculas alvo compreende moléculas de ácidos nucleicos, ou moléculas de proteína, ou sacáridos, ou citoquinas, ou esteróides, ou histamina, ou outras moléculas. Os requerentes descrevem ainda métodos da presente invenção para detectar a presença de uma pluralidade de moléculas-alvo numa única amostra dentro de um curto período de tempo, em que a pluralidade de moléculas alvo compreende moléculas de ácido nucleico e as moléculas de proteína. Appiicanis ainda divulgar aqui métodos para a detecção da presença de uma pluralidade de moléculas-alvo numa única amostra dentro de um curto período de tempo, em que a pluralidade de moléculas-alvo de ácido nucleico compreende molecuies, moléculas de proteínas, marcadores de inflamação e citocinas. Os requerentes descrevem ainda métodos da presente invenção para detectar a presença de uma pluralidade de moléculas-alvo numa única amostra dentro de um curto período de tempo, em que a pluralidade de moléculas alvo compreende moléculas de ácido nucleico, moléculas de proteínas e sacáridos.
[00231] Os requerentes revelam dispositivos aqui descritos para uso em sistemas e métodos, como aqui revelado, Tais dispositivos incluem, por exemplo, dispositivos que compreendem um suporte configurado para aceitar e reter uma amostra clínica (por exemplo, uma amostra clínica contida dentro de um dispositivo de recolha de amostras); um recipiente de reagente ou uma pluralidade de vasos de reagente; e um recipiente de reação, ou uma pluralidade de vasos de reação. Em formas de realização, tais dispositivos podem ser, ainda, configurado para aceitar e reter uma ou mais de uma cuvete de citometria ou cuvetes; um recipiente de resíduos ou outros recipientes; uma dica ou dicas, configurado para aspirar ou liberar fluido; e outras ferramentas.
[00232] Os requerentes ainda descrevem aqui os ensaios para a detecção de um ou mais de um lidade plura de moléculas-alvo numa única amostra dentro de um curto período de tempo, em que a pluralidade de moléculas alvo compreende uma ou mais das moléculas de ácido nucleico, moléculas de proteínas , sacáridos, marcadores de inflamação e citocinas. Em formas de realização, tais ensaios pode ser configurado para uso com os sistemas e dispositivos, como aqui revelado.
[00233] Deste modo, os requerentes divulgam sistemas aqui, dispositivos e métodos, incluindo os seguintes exemplos de sistemas integrados.
[00234] 1) Um sistema integrado para fornecer ensaios e diagnóstico de um indivíduo suspeito de sofrer de uma doença, compreendendo o referido sistema um meio para a obtenção de uma amostra (que podem incluir, por exemplo, um dispositivo de recolha de amostra compreendendo uma lanceta, uma seringa, uma agulha e tubo, ou outro dispositivo de recolha de sangue, ou um cotonete nasal, um cotonete de boca (por exemplo, um mordente-cotonete), uma haste de garganta, um esfregaço vaginal, ou outra compressa, e fluido em que a imergir o cotonete seguinte contactar o cotonete com um objeto): um cartucho compreendendo reagentes para ensaios para a doença; um dispositivo para a execução de uma pluralidade de ensaios para a detecção de uma pluralidade de doenças; significa um dispositivo para a exibição de / comunicando a detecção de uma ou mais das referidas doenças. Tais sistemas integrados podem ser configurados para utilizações em que a amostra é uma amostra de volume pequeno; para utilizações em que a detecção é realizada num curto período de tempo; ou para utilização tanto em que a amostra é uma amostra de volume pequeno e em que a detecção é realizada num curto período de tempo.
[00235] 2) Um sistema integrado para fornecer ensaios e diagnóstico de um indivíduo suspeito de sofrer de uma doença respiratória, compreendendo o referido sistema um meio para a obtenção de uma amostra (que podem incluir, por exemplo, um cotonete nasal, um cotonete de garganta, boca compressa (por exemplo, uma haste de face), um esfregaço vaginal, ou outra compressa, e em que o fluido para imergir o cotonete seguinte contactar o cotonete com um sujeito); um cartucho que compreende os reagentes para ensaios para distúrbios respiratórios; um dispositivo para a execução de uma pluralidade de ensaios para a detecção de uma pluralidade de doenças respiratórias; um dispositivo / meios para a exibição de comunicar a detecção de um ou mais dos referidos distúrbios respiratórios. Tais sistemas integrados podem ser configurados para usos em que a amostra é uma amostra de volume pequeno; para utilizações em que a detecção é realizada num curto período de tempo; ou para utilização tanto em que a amostra é uma amostra de volume pequeno e em que a detecção é realizada num curto período de tempo.
[00236] 3) Um sistema integrado para fornecer ensaios, diagnóstico e prescrição de um indivíduo suspeito de sofrer de uma doença respiratória, compreendendo o referido sistema um meio para a obtenção de uma amostra (que podem incluir, por exemplo, um cotonete nasal, um cotonete de garganta , um cotonete de boca (por exemplo, uma haste de face), um esfregaço vaginal, ou outra compressa, e em que o fluido para imergir o cotonete seguinte contactar o cotonete com um sujeito); um cartucho que compreende os reagentes para ensaios para distúrbios respiratórios; um dispositivo para a execução de uma pluralidade de ensaios para a detecção de uma pluralidade de doenças respiratórias; um dispositivo / meios para exibir / comunicando a detecção de um ou mais dos referidos distúrbios respiratórios; e meios para proporcionar uma prescrição para o tratamento de um distúrbio respiratório detectada na referida amostra. Tais sistemas integrados podem ser configurados para utilizações em que a amostra é uma amostra de volume pequeno; para utilizações em que a detecção é realizada num curto período de tempo; ou para utilização tanto em que o sampl e é uma amostra pequena de volume e em que a detecção é realizada num curto período de tempo.
[00237] 4) Um sistema integrado para fornecer ensaios, diagnóstico, prescrição e tratamento de um indivíduo suspeito de sofrer de uma doença respiratória, compreendendo o referido sistema um meio para a obtenção de uma amostra (que podem incluir, por exemplo, um cotonete nasal, esfregaço da garganta, um cotonete de boca (por exemplo, uma haste de face), um esfregaço vaginal, ou outra compressa, e em que o fluido para imergir o cotonete seguinte contactar o cotonete com um sujeito); um cartucho que compreende os reagentes para ensaios para distúrbios respiratórios; um dispositivo para a execução de uma pluralidade de ensaios para a detecção de uma pluralidade de doenças respiratórias; um dispositivo / meios para exibir / comunicando a detecção de um ou mais dos referidos distúrbios respiratórios; meios para proporcionar uma prescrição para o tratamento de um distúrbio respiratório detectada na referida amostra;e meios para fornecimento / venda / entrega de um tratamento (droga / comprimido / tiro) ao referido sujeito, nos termos do referido prescrição. Tais sistemas integrados podem ser configurados para utilizações em que a amostra é uma amostra de volume pequeno; para utilizações em que a detecção é realizada num curto período de tempo; ou para utilização tanto em que a amostra é uma amostra de volume pequeno e em que a detecção é realizada num curto período de tempo.
[00238] Os métodos para detec ção da presença de uma molécula vims gripe alvo numa amostra são aqui descritos, em que a presença de uma pluralidade de possíveis vírus da gripe alvo são testados a partir de uma única amostra dentro de um curto período de tempo. Em formas de realização, a pluralidade de possíveis alvo flit vírus compreendem pelo menos 5 possíveis vírus da gripe alvo, ou, pelo menos, 10 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 15 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 20 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 25 possíveis vírus da gripe alvo, ou pelo menos 30 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 35 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 40 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 45 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 50 vírus da gripe alvo possíveis, ou pelo menos 55 possíveis vírus da gripe alvo, ou pelo menos 60 vírus da gripe alvo possível, ou pelo banquete 64 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 65 vírus da gripe alvo possíveis, ou mais. Em formas de realização, um curto período de tempo é um período de tempo que é FIV e horas ou menos, ou é de quatro horas ou menos, ou é de três horas ou menos, ou é de duas horas ou menos, ou é de uma hora ou menos, ou é de 50 minutos ou menos, ou é de 40 minutos ou menos, ou é de 30 minutos ou menos, ou é de 20 minutos ou menos, ou é de 10 minutos ou menos, ou é de 5 minutos ou menos.
[00239] Os métodos para a detecção da presença de um agente causador da doença respiratória num indivíduo suspeito de ter um distúrbio respiratório, em que a presença de uma pluralidade de possíveis agentes causadores de doenças respiratórias são testados a partir de uma única amostra usando dois testes de ácido nucleico e ensaios de proteína, em que o teste de ácido nucleico compreende a detecção da presença de sequências de ácidos nucleicos alvo, e em que a proteína compreende o teste de detecção da presença de proteínas alvo que possuem sequências de aminoácidos alvo. Em formas de realização, as sequências alvo de ácido nucleico pode compreender sequências que tem pelo menos 8 nucleotídeos, ou pelo menos 10 nucleotídeos, ou pelo menos 15 nucleotídeos, ou pelo menos 20 nucleotídeos, ou pelo menos 30 nucleotídeos, ou pelo menos 40 nucleotídeos, ou pelo menos 50 nucleotídeos, ou mais, que sejam idênticos ou muito semelhantes, a sequências de nucleotídeos alvo. Em formas de realização, as sequências de aminoácidos alvo pode compreender sequências que tem pelo menos 8 aminoácidos, ou pelo menos 10 aminoácidos, ou pelo menos 15 aminoácidos, ou pelo menos 20 aminoácidos, ou pelo menos 30 aminoácidos, ou pelo menos 40 aminoácidos ácidos, ou pelo menos 50 aminoácidos, ou mais, que são idênticas ou muito semelhantes, com as sequências alvo de ácidos aminados.
[00240] Em formas de realização, um agente causador da doença respiratória é detectada se for detectado mais do que um nível mínimo de tais agentes causadores de doenças respiratórias em uma pequena amostra - VOLUME obtida de um sujeito, wherem a amostra de volume pequena é testado para o presença de uma pluralidade de agentes causadores de doenças respiratórias. Em formas de realização, a amostra de pequeno volume é 150 μΙ_ ou menos em termos de volume, ou seja 75 μl ,, ou menos em termos de volume, ou seja 50 , ul ou menos em termos de volume, ou é de 25 \ iL ou menos em termos de volume, ou seja 15 } iL ou menos em termos de volume, ou é de 10 p, L ou menos do volume, ou seja 5 μΕ ou menos em volume.
[00241] As formas de realização dos métodos aqui descritos incluem os métodos em que um agente causador de doença é detectada se for detectado mais do que um nível mínimo de tais agentes causadores de doenças, em uma amostra de pequeno volume obtida de um sujeito. Por exemplo, tais métodos incluem métodos em que uma amostra de pequeno volume é testado quanto à presença de um pluralidade de agentes causadores de doenças. Em formas de realização de tais métodos, que nível mínimo pode ser estabelecido a um nível que é determinado pelo estado do sujeito. O nível mínimo pode ser fixado a um nível mais elevado para os indivíduos que apresentam sintomas de infecção ativa. O nível mínimo pode ser fixado a um nível mais baixo para os indivíduos que estão a receber tratamento para uma infecção no momento da obtenção da amostra.O nível mínimo pode ser fixado a um nível inferior para indivíduos que tenham recebido tratamento para uma infecção antes do momento da obtenção da amostra, por exemplo, que receberam recentemente tratamento para uma infecção antes do momento da obtenção da amostra.
[00242] Em formas de realização, a amostra pode ser diluída antes de serem testadas quanto à presença de uma pluralidade de agentes causadores de doenças. Em formas de realização, tal diluição de uma amostra é maior para os indivíduos que têm uma condição que indica que eles podem ter níveis mais elevados de agentes causadores de doenças do que sujeitos que não têm essa condição, ou do que os indivíduos que têm uma condição diferente.
[00243] As formas de realização dos métodos aqui descritos incluem os métodos em que um agente causador da doença respiratória é detectada se for detectado mais do que um nível mínimo de tais agentes causadores de doenças respiratórias em uma amostra de pequeno volume obtida de um sujeito. Por exemplo, tais métodos incluem métodos em que uma amostra de pequeno volume é testado quanto à presença de uma pluralidade de agentes causadores de doenças respiratórias. Em formas de realização de tais métodos, que nível mínimo pode ser estabelecido a um nível que é determinado pelo estado do sujeito. O nível mínimo pode ser fixado a um nível mais elevado para os indivíduos que apresentam sintomas de infecção ativa. O nível mínimo pode ser fixado a um nível mais baixo para os indivíduos que estão a receber tratamento para uma infecção no momento da obtenção da amostra. O nível mínimo pode ser fixado a um nível inferior para indivíduos que tenham recebido tratamento para uma infecção antes do momento da obtenção da amostra, por exemplo, que receberam recentemente tratamento para uma infecção antes do momento da obtenção da amostra.
[00244] Em formas de realização, a amostra pode ser diluída antes de serem testadas quanto à presença de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tais como agentes causadores de doenças respiratórias. Em formas de realização, tal diluição de uma amostra é superior nos indivíduos que têm uma condição que indica que eles podem ter níveis mais altos de agentes causadores de doenças, tais como agentes causadores de doenças respiratórias, do que sujeitos que não têm essa condição, ou do que os indivíduos que tem uma condição diferente.
[00245] Por exemplo, as condições que indicam que um sujeito pode ter níveis mais elevados de agentes causadores de doenças, tais como agentes causadores de doenças respiratórias, incluindo indivíduos com uma infecção activa; indivíduos que têm uma tosse, incluindo uma tosse persistente; indivíduos que têm uma febre; indivíduos que relatam calafrios; indivíduos que relatam fadiga; indivíduos que relatam uma dor de cabeça; indivíduos que têm suores; e indivíduos que tenham ou relatar outros sintomas indicativos de uma infecção activa.
[00246] Por exemplo, as condições que indicam que um sujeito não pode ter níveis mais elevados de agentes causadores de doenças, tais como agentes causadores de doenças respiratórias, incluem temas actualmente a receber tratamento para a infecção; assuntos que recentemente receberam tratamento para a infecção; sujeitos actualmente a receber, ou que recentemente recebeu tratamento para uma tosse, incluindo uma tosse persistente; uma febre; calafrios;fadiga; dor de cabeça; suores; ou outros sintomas, ou uma indicação de uma infecção.
[00247] Em formas de realização de métodos em que um agentes causadores de doenças, tais como um agente causador de doença respiratória, é detectado, se mais do que um nível mínimo de tal agente causador da doença (por exemplo, um agente causador de doença respiratória) é detectada numa amostra de pequeno volume obtido a partir de um sujeito, em que a amostra de pequeno volume é testado quanto à presença de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tais como agentes causadores de doenças respiratórias, o nível mínimo é estabelecido a um nível superior para indivíduos que não tenham sido recentemente diagnosticado com uma doença, tal como uma doença respiratória, que o nível mínimo definido para os indivíduos que foram recentemente diagnosticados com uma doença (tal como uma doença respiratória), em formas de realização, a amostra pode ser diluída antes do teste para detectar a presença da referida pluralidade de agentes causadores de doenças, tais como agentes causadores de doenças respiratórias. Em formas de realização, tal diluição de uma amostra é maior para indivíduos que não tenham sido recentemente diagnosticado com uma doença, tal como uma doença respiratória, do que a diluição de amostras obtidas a partir de indivíduos que foram recentemente diagnosticados com uma doença, tal como uma doença respiratória .
[00248] Em formas de realização, a amostra pode ser adicionalmente testada quanto à presença de indicadores de inflamação. Por exemplo, a amostra pode ser adicionalmente testada quanto à presença de níveis acima do normal de glucocorticóides como o cortisol (por exemplo, no sangue ou na saliva, lágrimas, ou, ou outro fluido corporal ou amostra obtida por uma compressa). Por exemplo, a amostra pode ser adicionalmente testada quanto à presença de níveis acima do normal de histamina (por exemplo, no sangue ou na saliva, lágrimas, ou, ou outra amostra de fluido corporal ou obtido por um cotonete). Outros indicadores de inflamação incluem, sem limitação, mcreased níveis de prostaglandinas, o aumento dos níveis de citoquinas inflamatórias (incluindo, por exemplo, o fator de necrose tumoral alfa (TNF-a), interleucina-1 (IL- 1), interleucina-8 (IL-8 ), interleucina-12 (IL-12), interleukm- 18 (IL-18), e o interferão gama (IF-γ)), bradiquinina, moléculas do sistema do complemento, fatores de coagulação do sangue, proteína C-reactiva, taxa de sedimentação de eritrócitos ( ESR), contagem de células brancas do sangue, alterações morfológicas no sangue e outras células, e outros marcadores moleculares e celulares indicativas da inflamação.
Além disso, um objeto pode ser examinada, ou pede-se que auto- relatório, os sintomas de inflamação, tais como, por exemplo, inchaço, vermelhidão, dor ou sensação de calor de uma área ou tecido afectado.
[00249] Em formas de realização, a amostra pode ser adicionalmente testada quanto à presença de uma citoquina ou de uma pluralidade de citoquinas. Em formas de realização, a amostra pode ser testada adicionalmente para o nível de uma citoquina ou de uma pluralidade de citoquinas. Em formas de realizao, a citocina alvo é selecionada a partir de uma linfoquina, uma quimioquina, uma mterleukin, e um interferão. Em formas de realização, as citocinas alvo são selecionadas a partir lympliokines, quimiocinas, inter-leukms, e interferões. Em formas de realizao, a citocina pode ser uma citoquina inflamatória. Dentro formas de realização, a citocina pode ser uma citocina anti- inflammator. Em formas de realização, uma citocina alvo pode ser um um mterleuki (IL) selecionada a partir de IL-1, IL-2, IL-3, IL-4, 1L-5, 1L-6, 1L-7, ίΙ, -8, ίί ., - 9, IL-10, ii .- i 1, IL-12, IL-13, 1L- I4, IL-15, IL-1 6, IL-17, IL-1 8, 1L- 19, 11 .-
20. IL-21, interleucinas e outros. Em formas de realização, uma citocina alvo pode ser uma quimiocina selecionada a partir de uma quimiocina (também denominado uma quimioquina CXC), um β-quimiocina (também denominado de quimiocina CC), um γ-quimiocina (também designado por C-quimioquina), e um d-chemokme (também chamado de ne CXsC-chemok). Em formas de realização, uma citocina alvo pode ser um membro da família do fator de necrose tumoral (TNF).
[00250] Em formas de realização, a mesma amostra podem ser ensaiados para os agentes causadores de doenças e para citocinas. Em formas de realização, a mesma amostra podem ser ensaiados para os agentes causadores de doenças respiratórias e para citocinas.
[00251] Em formas de realização, a amostra pode ser adicionalmente testada quanto à presença de anticorpos contra um agente causador de doença. Em formas de realização, a mesma amostra pode ser testado para uma pluralidade de agentes causadores de doenças, e para anticorpos para uma pluralidade de agentes causadores de doenças.
[00252] Em formas de realização, a amostra pode ser adicionalmente testada quanto à presença de anticorpos contra um agente causador da doença respiratória. Em formas de realização, a mesma amostra pode ser testado para uma pluralidade de agentes causadores de doenças respiratórias e para anticorpos para uma pluralidade de agentes causadores de doenças respiratórias.
[00253] Os métodos para a detecção da presença de uma molécula de vírus da gripe alvo numa amostra são aqui descritos, em que a presença de uma pluralidade de possíveis vírus da gripe alvo são testados a partir de uma única amostra usando dois testes de ácido nucleico e ensaio de proteína, em que o ácido nucleico teste compreende a detecção da presença de sequências de ácido nucleico alvo, e em que a proteína compreende o teste de detecção da presença de proteínas alvo que possuem sequências de aminoácidos alvo. Em formas de realização, as sequências alvo de ácido nucleico pode compreender sequências que tem pelo menos 8 nucleotídeos, ou pelo menos 10 nucleotídeos, ou pelo menos 15 nucleotídeos, ou pelo menos 20 nucleotídeos, ou pelo menos 30 nucleotídeos, ou pelo menos 40 nucleotídeos, ou pelo menos 50 nucleotídeos, ou mais, que sejam idênticos ou muito semelhantes, a sequências de nucleotídeos alvo. Em formas de realização, as sequências de aminoácidos alvo pode compreender sequências que tem pelo menos 8 aminoácidos, ou pelo menos 10 aminoácidos, ou pelo menos 15 aminoácidos, ou pelo menos 20 aminoácidos, ou pelo menos 30 aminoácidos, ou pelo menos 40 aminoácidos ácidos, ou pelo menos 50 aminoácidos, ou mais, que são idênticas ou muito semelhantes, com as sequências alvo de ácidos aminados.
[00254] Em formas de realização, a pluralidade de vírus da gripe possível t Arget compreender pelo menos 5 possíveis vírus da gripe alvo, ou, pelo menos, 10 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 15 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 20 vírus da gripe alvo possíveis, ou pelo menos 25 possíveis vírus da gripe alvo, ou pelo menos 30 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 35 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 40 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 45 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 50 possíveis direcionar os vírus da gripe, ou pelo menos 55 vírus da gripe alvo possível, ou pelo banquete 60 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 64 vírus da gripe alvo possível, ou pelo menos 65 vírus da gripe alvo possíveis, ou mais.
[00255] Os ensaios e métodos aqui descritos podem ser realizados em um dispositivo, ou por um sistema, para o processamento de uma amostra. Uma tal amostra pode ser uma amostra clínica de pequeno volume. Os ensaios e métodos aqui descritos podem ser facilmente incorporados em e utilizados no dispositivo para o processamento de uma amostra, ou um sistema para o processamento de uma amostra, o qual pode ser um dispositivo de ensaio automatizado, ou pode ser um sistema de ensaio automatizado. Um tal dispositivo e um tal sistema, podem ser úteis para a prática dos métodos aqui divulgados.Por exemplo, um dispositivo pode ser útil para receber uma amostra, um dispositivo pode ser útil para a preparação, ou para o processamento de uma amostra.Um dispositivo pode ser útil para a realização de um ensaio de uma amostra. Um dispositivo pode ser útil para a obtenção de dados a partir de uma amostra.Um dispositivo pode ser útil para a transmissão de dados obtidos a partir de uma amostra. Um de vice-pode ser útil para a eliminação de uma amostra após transformação ou ensaio de uma amostra.
[00256] Os ensaios e métodos aqui descritos podem ser facilmente incorporados em e utilizado em um dispositivo de ensaio automatizado,
e num sistema de ensaio automatizado. Por exemplo, sistemas como aqui divulgados podem incluir um módulo de comunicação para a transmissão ou recepção de um protocolo com base no analito a ser detectado (por exemplo, um determinado agente ou marcador indicativo de um agente causador de doença particular que causa doença) ou com base em outros analitos para ser detectada pelo dispositivo ou sistema. Em formas de realizao, um protocolo de ensaio pode ser alterada com base na programação óptima de uma pluralidade de ensaio s para ser realizado por um de vício, ou pode ser alterado de acordo com os resultados previamente obtidos a partir de uma amostra de um indivíduo, ou com base nos resultados anteriormente obtidos a partir de uma amostra diferente do sujeito. Em formas de realização, um módulo de comunicação pode compreender um canal de comunicação de informação a partir do referido dispositivo para um computador, em que o dito dito canal é selecionada a partir de um computador de rede, uma rede telefónica, uma ligação de comunicação de metal, uma ligação de comunicação óptica, e uma ligação de comunicação sem fio. Em formas de realização, sistemas, tal como aqui divulgados podem transmitir sinais para uma localização central, ou para um utilizador final, e pode incluir um módulo de comunicação para a transmissão de tais sinais. Sistemas como aqui revelado pode ser configurado para actualizar um protocolo conforme necessário ou numa base regular.
[00257] Um dispositivo pode ser parte de um sistema, um componente do qual pode ser um dispositivo de processamento de amostras. Um dispositivo pode ser um dispositivo de processamento de amostras. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurada para facilitar a recolha de uma amostra, preparar uma amostra para teste de uma clínica, ou efectuar uma reação química com um ou mais reagentes ou outro tratamento químico ou físico, tal como aqui divulgado. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para obter dados a partir de uma amostra. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para transmitir os dados obtidos a partir de uma amostra. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para analisar os dados a partir de uma amostra, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para comunicar com um outro dispositivo, ou por um laboratório, ou um indivíduo afiliado com um laboratório, para análise dos dados obtidos a partir de uma amostra.
[00258] Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para ser colocado dentro ou sobre um objeto. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para aceitar uma amostra de um sujeito, quer diretamente ou indiretamente. Uma amostra pode ser, por exemplo, uma amostra de sangue (por exemplo, uma amostra obtida a partir de uma picada no dedo, ou de punção venosa, ou uma amostra de sangue arterial), uma amostra de urina, uma amostra de biopsia, uma fatia de tecido, amostra de fezes, ou outro clínico amostra; uma amostra de água, uma amostra de solo, uma amostra de alimentos, uma amostra de ar; ou outra amostra. Uma amostra de sangue pode compreender, por exemplo, sangue total, plasma, ou soro. Um dispositivo de processamento de amostras pode receber uma amostra a partir do sujeito por meio de um alojamento do dispositivo. A coleta de amostras pode ocorrer em um local de coleta da amostra, ou em outro lugar. A amostra pode ser fornecida para o dispositivo num local de colheita de amostra.
[00259] Em algumas formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para aceitar ou realizar um cartucho. Em algumas formas de realização, um dispositivo de processamento da amostra pode compreender um cartucho. O cartucho pode ser removível a partir do dispositivo de processamento da amostra. Em algumas formas de realização, uma amostra pode ser fornecida ao cartucho do dispositivo de processamento da amostra. Alternativamente, uma amostra pode ser fornecida a uma outra porção de um dispositivo de processamento de amostras. O vice-cartucho e / ou de pode compreender uma unidade de recolha de amostra que pode ser configurado para aceitar uma amostra.
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[00260] Um cartucho pode incluir uma amostra, e pode incluir reagentes para serem utilizados no tratamento ou teste de uma amostra, descartáveis para serem utilizados no tratamento ou teste de uma amostra, ou outros materiais. Após a colocação de um cartucho em, ou a inserção de um cartucho para dentro, um dispositivo de processamento de amostras, um ou mais componentes do cartucho pode ser posto em comunicação fluida com outros componentes do dispositivo de processamento da amostra. Por exemplo, se uma amostra é recolhida em um cartucho, a amostra pode ser transferido para outras porções do dispositivo de processamento da amostra. Da mesma forma, se um ou mais reagentes são fornecidos em um cartucho, os reagentes podem ser transferidos para outras porções do dispositivo de processamento de amostras, ou outros componentes do dispositivo de processamento da amostra pode ser trazido para os reagentes. Em algumas formas de realização, os reagentes ou componentes de um cartucho podem permanecer no bordo do cartucho, em algumas formas de realização, não há ffuidics estão incluídas que requerem tubos ou que necessitam de manutenção (por exemplo, manual ou automatizada de manutenção).
[00261] A. amostra ou reagente pode ser transferida para um dispositivo, tal como um dispositivo de processamento de amostras. Uma amostra ou reagente podem ser transferidas dentro de um dispositivo. Tal transferência de amostra ou reagente pode ser conseguida sem fornecimento de um caminho de fluido contínuo a partir do cartucho para o dispositivo. Tal transferência de amostra ou reagente pode ser conseguida sem fornecimento de um caminho de fluido contínuo dentro de um dispositivo. Em formas de realização, tal transferência de amostra ou reagente pode ser realizado por um sistema de manipulação de amostra (por exemplo, uma pipeta); Por exemplo, uma amostra, reagentes, ou alíquota do mesmo pode ser aspirado int o um componente de transferência de abertura de ponta, tal como uma ponta de pipeta, que pode ser operacionalmente ligado a um sistema de manipulação de amostra que transfere a ponta, com a amostra, reagentes, ou alíquota deste último contida no interior da ponta, para uma localização sobre ou dentro do dispositivo de processamento da amostra. A amostra, reagentes, ou mesmo alíquota pode ser depositado numa localização sobre ou dentro do dispositivo de processamento da amostra. Amostra e o reagente, ou vários reagentes, podem ser misturados utilizando um sistema de manuseamento de amostras de um modo semelhante. Um ou mais componentes do cartucho pode ser transferido de uma forma automatizada a outras porções do dispositivo de processamento de amostras, e vice-versa.
[00262] Um dispositivo, tal como um dispositivo de processamento de amostras, pode ter um sistema de manipulação de fluidos. Um sistema de manuseamento de fluidos pode efectuar, ou pode auxiliar na realização, o transporte, a diluição, extracção, aliquoiting, misturando, e outras ações com um fluido, tal como uma amostra. Em algumas formas de realização, um sistema de manipulação de fluido pode ser contido dentro de um alojamento do dispositivo, um sistema de manipulação de fluido pode permitir a recolha e entrega, processamento e / ou o transporte de um fluido, a dissolução de reagentes secos, mistura dos reagentes líquidos e / ou seco com um líquido, bem como a recolha e entrega, processamento e / ou o transporte de componentes não-fluídica, amostras, ou materiais. O fluido pode ser uma amostra, um reagente, diluente, lavagem, tintura, ou qualquer outro fluido que possa ser utilizado pelo dispositivo, e podem incluir, mas não se limitando a, líquidos homogéneos, diferentes líquidos, emulsões, suspensões, e outros fluidos . Um sistema de manuseamento de fluidos, incluindo, sem limitação, uma pipeta, pode também ser utilizado para o transporte de recipientes (com ou sem fluido nele contido) em torno do dispositivo. O sistema de manuseio de fluidos pode dispensar ou aspirar um líquido. A amostra pode incluir uma ou mais partículas ou matéria sólida flutuante dentro de um fluido.
[00263] Em formas de realização, uma haste SY manuseamento de fluidos pode compreender uma pipeta, ponta de pipeta, seringa, capilar, ou outro componente. O sistema de manipulação de fluido pode ter porção com uma superfície interior e uma superfície exterior e uma extremidade aberta. O sistema de manipulação de fluido pode compreender uma pipeta, que pode incluir um corpo da pipeta e um bocal de pipeta, e pode compreender uma ponta de pipeta.Uma ponta de pipeta pode ou não ser removível a partir de um bocal de pipeta. Em formas de realização, um sistema de manipulação de fluido podem usar uma pipeta acoplado com uma ponta de pipeta; uma ponteira pode ser descartável. A ponta pode formar uma vedação estanque aos fluidos quando acoplado com uma pipeta. Uma ponta de pipeta pode ser usada uma vez, duas vezes ou mais vezes, em formas de realização, um sistema de manipulação de fluido podem usar uma pipeta ou semelhante de vício, com ou sem uma ponta de pipeta, para aspirar, distribuir, misturar, de transporte, ou de outro modo manipular o fluido. O fluido pode ser distribuído a partir do sistema de manipulação de fluido quando desejado. O fluido pode ser contido dentro de uma ponta de pipeta antes de ser dispensado, por exemplo, a partir de um orifício na ponta da pipeta. Em formas de realizao, ou durante a utilização casos, todo o líquido pode ser dispensado;Noutras formas de realização, ou instâncias durante a utilização, uma parte do fluido dentro de uma ponta pode ser dispensado. Uma pipeta pode aspirar selectivamente um fluido. A pipeta pode aspirar uma quantidade selecionada de fluido. A pipeta pode ser capaz de actuar mecanismos de agitação para misturar o líquido no interior da ponta ou dentro de um vaso. A pipeta pode incorporar pontas ou vasos criar loops de fluxo contínuo para a mistura, incluindo de materiais ou reagentes que estão na forma não-líquida. Uma ponta de pipeta pode também facilitar a mistura por entrega controlada de múltiplos fluidos simultaneamente ou em sucessão, como em reacções de substrato de 2 peças.
[00264] O sistema de manipulação de fluido pode incluir uma ou mais unidades isoladas ou fluidicamente hydraulicaliv independentes. Por exemplo, o sistema de manipulação de fluido pode incluir uma, duas, ou mais pontas de pipeta. As pontas de pipeta pode ser configurado para aceitar e confinar um fluido. As pontas podem ser isolados a partir de fluidicamente ou hidraulicamente independentes uma da outra. O fluido contido no interior de cada ponta pode ser isolado ou hidraulicamente fluidicamente independentes umas das outras em fluidos dicas e de outros fluidos no interior do dispositivo. As unidades fluidicamente isolado ou hidraulicamente independentes podem ser móveis relati vo para outras porções do vício de e / ou uns aos outros. As unidades independentes fluidicamente isoladas ou pode ser hidraulicamente individualmente móvel. Um sistema de manuseamento de fluidos pode compreender uma ou mais base ou suporte. Uma base ou suporte pode suportar uma ou mais unidades de pipeta ou pipeta. Uma base ou suporte pode ligar um ou mais pipetas de o sistema de manipulação de fluido um com o outro.
[00265] Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para efectuar os passos de processamento ou de ações sobre uma amostra obtida de um sujeito. O processamento da amostra pode incluir a preparação da amostra, incluindo, por exemplo, a diluição da amostra, a divisão de uma amostra em alíquotas, a extração, o contacto com um reagente, filtração, separação, centrifugação, ou outra acção preparatória, transformação ou etapa. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar uma ou mais amostras de acção preparação ou passo na amostra.Opcionalmente, uma amostra pode ser preparado por uma reação química e / ou etapa de processamento físico. A acção de preparação da amostra ou etapa pode incluir um ou mais dos seguintes procedimentos: centrifugação, separação, filtração, diluição, enriquecimento, purificação, precipitação, incubação, pipetagem, o transporte, a cromatografia, a lise celular, citometria, pulverização, moagem, activação, uitrasonication, processamento de coluna micro, processamento com esferas magnéticas, processamento com nanopartículas, ou outra amostra acção preparação ou etapas. Por exemplo, a preparação da amostra pode incluir um ou mais passos para separar o sangue em soro e / ou fracções de partículas, ou para separar qualquer outra amostra em vários componentes. A preparação da amostra pode incluir um ou mais passo de diluição e / ou concentração de uma amostra, tal como uma amostra de sangue, ou noutras amostras clínicas. A preparação da amostra pode incluir a adição de um anti-coagulante ou outro ingrediente de uma amostra. A preparação da amostra pode também incluir a purificação de uma amostra. Em formas de realização, todos os processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou etapas são realizadas por um único dispositivo. Em formas de realização, todo o processamento da amostra, preparação ou ações de ensaio ou os passos são realizados dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, a maior parte de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou os passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, muitas de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou os passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de uma única de vício. Em formas de realização, de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou passos pode ser realizada por mais do que um dispositivo.
[002661 Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar uma ou mais ensaio de uma amostra, e para obter dados a partir da amostra. Um ensaio pode incluir um ou mais tratamentos químicos ou físicos, e pode incluir a execução de um ou mais reacções químicas ou físicas. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar um, dois ou mais ensaios sobre uma pequena amostra de fluido corporal. Um ou mais reação química pode ocorrer em uma amostra com um volume, como aqui descrito noutro local. Por exemplo uma ou mais reação química pode ter lugar em um comprimido tendo menos do que os volumes femtoliter. Em um exemplo, a unidade de recolha de amostra está configurado para receber um volume do corpo equivalente amostra de fluido a uma única gota ou menos de sangue ou fluido intersticial, em formas de realização, o volume de uma amostra pode ser um pequeno volume, onde um pequeno volume pode ser um volume que é inferior a cerca de 1000 uL, ou menos do que cerca de 500 ^ L, ou menos do que cerca de 250 ^ L, ou menos do que cerca de 150 ^ L, ou menos do que cerca de 100 μl ,, ou menos do que cerca de 75 ^ L, ou menos do que cerca de 50 uJL, ou menos do que cerca de 40 μl ,, ou menos do que cerca de 20 lil, ou menos do que cerca de 10 μΕ, ou outro pequeno volume. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados numa única amostra. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados por um único dispositivo. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realizao, a maioria das ações de ensaio da amostra ou passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, muitas ações ensaio da amostra, ou passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou passos pode ser realizada por mais do que um dispositivo.
[00267] Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar uma pluralidade de ensaio s numa amostra. Em formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar uma pluralidade de ensaio s numa única amostra. Em formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para realizar uma pluralidade de ensaios numa única amostra, em que a amostra é uma amostra pequena. Por exemplo, uma pequena amostra deve ter um volume de amostra que é um pequeno volume de menos de cerca de 1000 μΕ, ou menos do que cerca de 500 μΕ, ou menos do que cerca de 250 μΕ, ou menos do que cerca de 150 Ah, ou menos do que cerca de 100 μl ,, ou menos do que cerca de 75 ΐ ^ , ou menos do que cerca de 50 uJL, ou menos do que cerca de 40 μl ,, ou menos do que cerca de 20 μl., ou menos do que cerca de 10 \ il, ou outro pequeno volume. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser capaz de realizar ensaios multiplexados numa única amostra, uma pluralidade de ensaios podem ser executados em simultâneo; podem ser executadas sequencialmente; ou alguns ensaios podem ser executados simultaneamente,
enquanto outros estão correndo sequencialmente. Um ou mais ensaios e / ou calibradores de controlo (por exemplo, incluindo uma configuração com um controlo de um calibrador para o ensaio / testes) também pode ser incorporado no dispositivo; Os ensaios de controlo e de ensaio no calibradores podem ser realizados simultaneamente com os ensaios efectuados numa amostra, ou pode ser realizada antes ou depois de ensaios efectuados numa amostra, ou qualquer combinação dos mesmos. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados por um único dispositivo. Em formas de realização, todo de uma pluralidade de ações de ensaio ou os passos são realizados dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, a maioria dos aciions ensaio da amostra, ou passos, de uma pluralidade de ensaios, são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, muitas ações ensaio da amostra, ou passos, de uma pluralidade de ensaios, são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Dentro formas de realização, o processamento da amostra, preparação ou ações de ensaio ou passos podem ser perionned por mais de um dispositivo.
[00268] Em formas de realização, todos de uma pluralidade de ensaio s pode ser realizada num curto período de tempo. Em formas de realização, um tal período de tempo curto compreende menos do que cerca de três horas, ou menos de cerca de duas horas, ou menos de cerca de uma hora, ou menos do que cerca de 40 minutos, ou menos de cerca de 30 minutos, ou menos de cerca de 25 minutos, ou menos do que cerca de 20 minutos, ou menos de cerca de 15 minutos, ou menos de cerca de 10 minutos, ou menos de cerca de 5 minutos, ou menos de cerca de 4 minutos, ou menos de cerca de 3 minutos, ou menos de cerca de 2 minutos, ou menos do que cerca de 1 minuto, ou outro período de tempo curto.
[00269] Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para detectar um ou mais sinais relacionados com a amostra. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para identificar uma ou mais propriedades da amostra. Por exemplo, o dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para detectar a presença ou concentração de um analito ou uma pluralidade de analitos ou uma condição de doença na amostra (por exemplo, em ou através de um fluido corporal, secreção, tecido ou outra amostra). Em alternativa, o dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para detectar um sinal ou sinais que podem ser analisadas para detectar a presença ou concentração de um ou mais analitos (o que pode ser indicativo de uma condição de doença) ou uma condição de doença na amostra. Os sinais podem ser analisados a bordo do dispositivo, ou em outro local.Execução de um teste clínico pode ou não incluir qualquer análise ou comparação dos dados recolhidos.
[00270] Uma reação química ou outra etapa de processamento pode ser realizado, com ou sem a amostra. Exemplos de passos, testes ou ensaios que podem ser preparados ou administrados pelo dispositivo podem incluir, mas não estão limitados a imunoensaio, de ensaio de ácido nucleico, ensaios baseados em receptor, ensaio de citometria de, ensaio colorimétrico, ensaio enzimático, do ensaio electroforético, doseamento electroquímico , ensaio de espectroscopia, o ensaio de cromatografia, ensaio microscópico, ensaio topográfico, ensaio calorimétrico, ensaio turbidmefric, ensaio de aglutinação, teste de radioisótopo, ensaio viscosimétrico, ensaio de coagulação, o ensaio de tempo de coagulação, ensaio da síntese de proteína, ensaio histológico, ensaio de cultura, o ensaio de pressão osmótica, e / ou outros tipos de ensaios, centrifugação, separação, filtração, diluição, enriquecimento, purificação, precipitação, a pulverização, a incubação, pipetagem, o transporte, a lise celular, ou outra acção preparação da amostra ou passos, ou combinações dos mesmos. Passos, testes ou ensaios que podem ser preparados ou executados pelo dispositivo pode incluir imagens, incluindo microscopia, citometria, e outras técnicas que preparam ou que utilizam imagens. Passos, testes ou ensaios que podem ser preparados ou executados pelo dispositivo pode ainda incluir uma avaliação da histologia, morfologia, cinemática, dinâmica e / ou estado de uma amostra, que pode incluir essa avaliação para células.
[002713 Um dispositivo pode ser capaz de executar todos os passos de bordo (por exemplo, passos ou ações executadas por um único dispositivo) em um curto espaço de tempo. Um dispositivo pode ser capaz de executar todos os passos de bordo em uma única amostra em um curto espaço de tempo. Por exemplo, a partir de recolha de amostra de um indivíduo para a transmissão de dados e / ou de análise podem ser cerca de 3 horas ou menos, 2 horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 minutos ou menos, 45 minutos ou menos, 40 minutos ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 minutos ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 minutos ou menos, 3 minutos ou menos, 2 minutos ou menos, ou 1 minuto ou menos. A quantidade de tempo de aceitar uma amostra dentro do dispositivo para a transmissão de dados e / ou para análise a partir do dispositivo em relação a uma tal amostra pode depender do tipo ou o número de passos, testes ou ensaios s realizados sobre a amostra. A quantidade de tempo de aceitar uma amostra dentro do dispositivo para a transmissão de dados e / ou para análise a partir do dispositivo em relação a uma tal amostra pode demorar cerca de 3 horas ou menos, 2 horas ou menos, 1 hora ou menos, 50 minutos ou menos, 45 minutos ou menos, 40 minutos ou menos, 30 minutos ou menos, 20 minutos ou menos, 15 minutos ou menos, 10 minutos ou menos, 5 minutos ou menos, 4 minutos ou menos, 3 minutos ou menos, 2 minutos ou menos, ou 1 minuto ou menos.
[00272] Um dispositivo pode ser configurado para se preparar uma amostra para a eliminação, ou de dispor de uma amostra, tal como uma amostra clínica, após o processamento ou o ensaio de uma amostra.
[00273] Em formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para transmitir os dados obtidos a partir de uma amostra.Em formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para comunicar através de uma rede. dispositivo de processamento da amostra A. pode incluir um módulo de comunicação que pode interagir com a rede. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser ligado à rede através de uma ligação com fios ou sem fios. A rede pode ser uma rede de área local (LAN) ou uma rede de área alargada (WAN), tal como a Internet. Em algumas formas de realização, a rede pode ser uma rede de área pessoal. A rede pode incluir a nuvem. O dispositivo de processamento da amostra pode ser conectado à rede sem a necessidade de um intermediário de vício, ou um dispositivo intermediário pode ser exigido para ligar um dispositivo de processamento de amostras para uma rede. Um dispositivo de processamento de amostras pode comunicar através de uma rede com outro dispositivo, que pode ser qualquer tipo de dispositivo de rede, incluindo mas não se limitando a um pessoal computador, compitter servidor ou computador portátil; assistentes pessoais digitais (PDAs) como um dispositivo Windows CE; telefones, como telefones celulares, smartphones (por exemplo, iPhone, Android, Blackberry, etc.), ou localização, telefones portáteis conscientes (como GPS); um dispositivo móvel, tal como um dispositivo de roaming conectado à rede; um dispositivo sem fios, tal como um dispositivo electrónico sem fios ou qualquer outro dispositivo capaz de comunicar sem fios com uma rede de computadores; ou qualquer outro tipo de dispositivo de rede que pode comunicar possivelmente o ver uma rede e lidar com as transacções electrónicas. Essa comunicação pode incluir o fornecimento de dados para uma infraestrutura de computação em nuvem ou qualquer outro tipo de infra-estrutura de armazenamento de dados que pode ser acessado por outros dispositivos.
[00274] Um dispositivo de processamento da amostra pode fornecer dados sobre uma amostra de, por exemplo, um profissional de saúde, uma localização profissional de saúde, como um laboratório, ou uma afiliada da mesma. Um ou mais de um laboratório, profissional de saúde, ou sujeito pode ter um dispositivo de rede capaz de receber ou de acesso a dados fornecidos pelo dispositivo de processamento da amostra. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para fornecer dados relativamente a uma amostra de um banco de dados. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para fornecer dados relativamente a uma amostra de um sistema de registos médicos electrónicos, de um sistema de informação do laboratório, a um sistema de automatização do laboratório, ou outro sistema ou software. Um dispositivo de processamento de amostras pode fornecer dados sob a forma de um relatório.
[00275] A. laboratório, dispositivo ou outra entidade ou software pode realizar a análise em dados sobre uma amostra em tempo real. Um sistema de software pode realizar sis Analy química e / ou análise patológica, ou estes podem ser distribuído entre combinações de pessoal de laboratório, clínica, e de especialidade ou peritos. Análise podem incluir a avaliação qualitativa e / ou quantitativa de uma amostra. A análise dos dados pode incluir a avaliação qualitativa e / ou quantitativa de uma amostra subsequente. Opcionalmente, um relatório pode ser gerado com base nos dados em bruto, os dados pré- processados, ou dados analisados. Esse relatório pode ser preparado de modo a manter a confidencialidade dos dados obtidos a partir da amostra, a identidade e outras informações relativas ao sujeito, de que foi obtida uma amostra, a análise dos dados, e outras informações confidenciais. O relatório e ou os dados podem ser transmitidos a um profissional de saúde. Os dados obtidos por um dispositivo de processamento da amostra, ou análise desses dados, ou relatórios, podem ser fornecidos a um banco de dados, um sistema de registros médicos eletrônicos, a um sistema de informação do laboratório, a um sistema de automação de laboratório, ou outro sistema ou software.
Detecção Add nucleico
[00276] Marcadores indicativos de uma doença, tal como uma doença respiratória, incluem marcadores de ácidos nucleicos. Tais marcadores de ácidos nucleicos incluem, por exemplo, os ácidos nucleicos virais, ou partes dos mesmos; ácidos nucleicos bacterianos, ou porções dos mesmos; e ácidos nucleicos, ou partes do mesmo, derivado de outros microrganismos. Os métodos para a detecção de marcadores de ácido nucleico numa amostra, incluindo uma amostra de pequeno volume, incluem métodos em que pequenas quantidades de ácido nucleico pode ser amplificado (por exemplo, feitas cópias). Por exemplo, a reação em cadeia da polimerase (PCR) e métodos relacionados são métodos comuns de amplificação de ácido nucleico. A PCR é discutido, por exemplo, em na Pat. No. 4.683.195; e, em geral, Mullis et ai, Cold Spring Harbor Symposium on Quantitative Biology, Volume 51: 263 (1987); Eriich, ed., PCR Technology (Stockton Press, Nova Iorque, 1989). A PCR é um, mas não o único, exemplo de um método de reação da polimerase de ácido nucleico para amplificar uma amostra teste de ácido nucleico compreendendo a utilização de um ácido nucleico conhecido como um iniciador e uma polimerase de ácido nucleico para amplificar ou gerar um pedaço específico de ácido nucleico . F discussão utros de PCR e outros métodos podem ser encontrados, por exemplo, no manual de Moleeuj AR Clonin A Laboratory por Green e Sambrook, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 4 th edição de 2012, que é aqui incorporada por referência na sua totalidade. PCR e muitos outros métodos de amplificação deve ser realizada em vários diferentes temperaturas, exigindo mudanças de temperatura utilizadas durante a PCR. reação ( "ciclos térmicos"). Outros métodos de amplificação, tais como, por exemplo, a amplificação isotérmica mediada por ciclo ( "LAMP") (ver, por exemplo, Patente US No. 6.410.278), e outros métodos, incluindo os métodos discutidos abaixo, requerem menos ou menos extensa do que a dos ciclos térmicos de PCR, ou não necessitam de ciclos térmicos.
Ácido Nucleico amplificação e detecção Métodos sem ciclos térmicos
[00277] Os métodos para a amplificação de ácido nucleico que não necessitam de ciclos térmicos são descritos no Pedido de Patente dos Estados Unidos 61 / 800,606, depositado em mar 15, 2013, aqui incorporada por referência na sua entireiy. Tais métodos podem ser utilizados para detectar os marcadores de ácidos nucleicos de doença, tais como a doença respiratória, em amostras de pequeno volume em curtos períodos de tempo. Tais métodos são discutidos a seguir, e os exemplos de resultados obtidos com tais métodos, a partir de amostras pequenas e em curtos períodos de tempo, são apresentados nas Figuras e Exemplos aqui descritos. No que se segue, tais métodos são designados por "métodos de amplificação não-ciclismo".
[00278] métodos de amplificação sem o ciclo de amplificação do ácido nucleico pode ser aplicada a cadeia dupla DN A. No entanto, como alvo moléculas de ácido nucleico não necessitam de ser limitados a alvos de ADN de cadeia dupla; por exemplo, o ADN de cadeia dupla para utilização em aplicações não-ciclismo Os métodos de amplificação aqui descritos podem ser preparados a partir do ARN viral, ou ARNm, ou outras fontes de alvo de ARN de cadeia simples, por transcriptase reversa. Em outro exemplo, o ADN de cadeia dupla para utilização em métodos de amplificação não-ciclismo aqui descritos podem ser preparados a partir de alvos de cadeia simples de ADN por uma polimerase de DN. Tais métodos podem ser aplicados como um passo inicial, antes da aplicação dos métodos de amplificação não-ciclismo discutidos abaixo,
[00279] A amplificação de um alvo de ADN de cadeia dupla, por exemplo, começa com um ADN de cadeia dupla primária a ser amplificado (denominado o "ácido nucleico primária" na seguinte). O ácido nucleico primária contém uma região alvo designada uma região de modelo; a região do molde como uma sequência molde. Tal região de cadeia dupla de modelo contém uma primeira cadeia de DNA e uma segunda cadeia de ADN complementar, e inclui nucleotídeo de terminal em um fio e uma 3 'a 5 nucleotídeo terminal na outra vertente que são complementar ao outro.
[00280] Um primeiro primer e um segundo iniciador são fornecidas, que cada um tem regiões e regiões cauda de ligação modelo; as regiões de ligação da matriz de iniciadores são complementares para as regiões do modelo alvo. As regiões da cauda dos iniciadores podem conter três componentes: a) o 5 'nucleotídeo terminal do iniciador, b) um nucleotídeo mais interior, em que o nucleotídeo mais interior se encontra a jusante da extremidade 5' de nucleotídeos de terminal, e c) uma secção média entre a 5 'nucleotídeo terminal e o nucleotídeo mais interna, que compreende um ou mais nucleotídeos. Além disso, pelo menos, porções de ambas as regiões da cauda de iniciador podem ser complementares uns aos outros quando correctamente alinhado.
[Θ0281] Deve notar-se que, embora a região de cauda do segundo iniciador pode conter uma sequência nucleotídica que é complementar à sequência de nucleotídeos da região de cauda do primeiro iniciador, tipicamente, os produtos formados pela ligação do primeiro iniciador e o segundo iniciador não são desejáveis, ou útil para os métodos ou composições aqui proporcionadas. Por conseguinte, em algumas formas de realização, podem ser dados passos para minimizar a formação de primeiro iniciador - segundo iniciador hibridado produtos. Tais passos podem incluir, por exemplo, não pré-mcubating um primeiro iniciador e um segundo iniciador em condições em que os iniciadores podem recozimento por um período prolongado de tempo antes de iniciar um método aqui proporcionado.
[00282] O ácido nucleico primária pode ser tratada com uma polimerase e uma primeira cópia do primeiro iniciador em condições tais que a região de ligação da matriz da primeira cópia do primeiro iniciador hibrida com a primeira cadeia do molde de ácido nucleico. Sob estas condições, um produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador é formado. A polimerase, que podem ter actividade de deslocamento de cadeia, pode catalisar a formação do produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador. A primeira cópia do primeiro iniciador pode ser covalentemente ligado ao produto da extensão sintetizado, de modo que a primeira cópia do primeiro iniciador (que é complementar à primeira cadeia do molde de ácido nucleico) torna-se pari da molécula aqui descrita como o " produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador ". A região liga�o ao molde, mas não a região da cauda da primeira cópia do primeiro iniciador hibrida com a primeira cadeia do molde de ácido nucleico. Exemplos de condições adequadas para a síntese de ácido nucleico com base em polimerase são conhecidos na técnica e são fornecidos, por exemplo, em Molecular Cloni mantiveram: A Laboratory Manual, B. Green e J. Sambrook, Cold Spring Harbor Laboratory Press (2012), que é aqui incorporada por referência na sua totalidade.
[00283] O produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador pode ser tratada com uma polimerase (que podem ter actividade de deslocamento de cadeia) e com o segundo iniciador em condições tais que a região de ligação da matriz do segundo iniciador hibrida com a extensão produto de a primeira cópia do primeiro iniciador. Desta maneira, um produto de extensão do segundo iniciador, pode ser formado. A polimerase pode DISPL ace a primeira parte do molde de ácido eic Nucl a partir do produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador durante a síntese do produto de extensão do segundo iniciador.O segundo iniciador pode ser co valently ligado ao produto da extensão sintetizado, de tal modo que o segundo iniciador torna-se parte da molécula aqui descrita como o "produto de extensão do segundo iniciador." O produto de extensão do segundo iniciador é complementar do produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador. A região tardia liga�o ao Temp mas não a região da cauda do segundo iniciador pode hibridar com o produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador quando o segundo iniciador hibrida com o produto de extensão da primeira cópia do primeiro iniciador.
[00284] O produto de extensão do segundo iniciador pode ser tratada com uma polimerase (que pode ter cadeia displ actividade acement) e uma segunda cópia do primeiro iniciador, de modo a Fonn um produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador. Durante a geração do produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador, a segunda cópia do primeiro iniciador pode ser covalentemente ligado ao produto da extensão sintetizado, de tal modo que a segunda cópia do primeiro iniciador torna-se parte da molécula aqui descrita como o "produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador." O produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador é complementar do produto de extensão do segundo iniciador.
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[00285] A geração do produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador pode resultar na geração de uma molécula que compreende o produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador e o produto de extensão do segundo iniciador, que pode ser referido aqui como o "ácido nucleico secundárias", Um ácido nucleico secundário pode compreender a "região terminal do produto de extensão do segundo iniciador (e o seu complemento) e pode compreender o 3 '3 região terminal do produto de extensão da segunda cópia do primeiro iniciador (e o seu complemento). As moléculas de ácido nucleico secundárias incluem sequências da região de molde adjacente a sequências da cauda. Em formas de realização, os ácidos nucleicos de cadeia dupla são produzidas em que as sequências do molde e região da cauda complementares alinhar. Na prática, as cópias múltiplas (por exemplo, dois ou mais) do ácido nucleico secundário são produzidos por qualquer processo pelo qual um ácido nucleico com a estrutura geral de ácido nucleico derivado pode ser gerado, incluindo pela prática de métodos de amplificação não-ciclismo aqui discutidas , [002863 Deste modo, podem ser fornecidos pares de cópias do ácido nucleico derivado. Outros números de cópias pode, em seguida, ser gerado, por exemplo, por repetição dos passos anteriores e métodos. Por exemplo, o processo completo, como descrito acima para a geração de um ácido nucleico derivado de um ácido nucleico primário pode ser repetida duas vezes, a fim de gerar um dois pares de cópias do ácido nucleico secundário; mais repetições pode ser realizada para amplificar o número de cópias adicionais, por exemplo, para amplificar exponencialmente o número de cópias (por exemplo, por potências de dois).
[00287] Além disso, uma vez que as moléculas de ácido nucleico secundárias incluem sequências da região de molde adjacente a sequências da cauda, pode ser produzido parcialmente ácidos nucleicos de cadeia dupla em que as sequências da região da cauda e hibridar-se linha. Uma vez que estas sequências da região da cauda estão associadas a regiões do modelo de cadeia simples, de uma estrutura de cross-over tendo duas cadeias de ácidos nucleicos em conjunto na posse do HY bridized sequências da região de cauda é produzido. Estas estruturas cross-over pode ser prorrogado por uma polimerase para formar produtos de extensão de ambas as vertentes que o compõem. Estes produtos de extensão, que pode ser referido como "fios". Concatemer Duas vertentes concatemer podem ser recozidos em conjunto, e podem ser referidos colectivamente como um concatemer; tais concatemeros pode conter duas ou mais cópias do molde de ácido nucleico.
[00288] Em algumas formas de realização, concatemeros ainda mais longos podem ser formados. Por exemplo, pode hibridar concatemeros juntos; ou duas moléculas concatemer podem formar uma estrutura de cruzamento semelhantes às formadas por as moléculas mais curtas denominados fios concatemer, quanto discutido acima, seguido por uma molécula concatemer maior contendo quatro cópias do molde de ácido nucleico. Em outro exemplo, um ácido nucleico e um secundário concatemer podem formar uma estrutura de cross-over, seguido de uma molécula maior contendo concatemer três cópias do molde de ácido nucleico. Em algumas formas de realização, vários concatemeros de vários comprimentos diferentes diferentes podem ser gerados simultaneamente.
[00289] Deste modo, concatemeros gerados de acordo com estes métodos podem ser de qualquer comprimento de nucleotídeos. Em algumas formas de realização, as moléculas de concatemer aqui gerados podem ser, pelo menos, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 300, 400, 500, 600, 700, 800, 900, 1000, 1500, 2000, 3000, 4000, 5000, 6000, 7000, 8000, 9000, 10000, 15000, 20000, ou 25000 nucleotídeos de comprimento. Concatemeros gerados de acordo com estes métodos podem conter qualquer número de cópias de um molde de ácido nucleico. Em algumas formas de realização, as moléculas de concatemer aqui gerados podem conter, pelo menos, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1 1, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 , 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, ou 100 cópias de um molde de ácido nucleico. Outros exemplos são fornecidos, e com maior detalhe destes e de outros exemplos, é fornecida no Pedido de Patente US 61 / 800.606, depositado em 15 mar 2013.
Detecção de reacções
[00290] O progresso de um método aqui proporcionado pode ser monitorizada de várias maneiras diferentes. Numa forma de realização, a reação pode ser ensaiada por um produto de amplificação do ácido nucleico (por exemplo, para o nível do produto ou a sua taxa de geração). Numa outra forma de realização, a reação pode ser ensaiado quanto à actividade de uma polimerase ao longo de um molde de ácido nucleico (por exemplo, para o movimento de uma polimerase ao longo de uma cadeia molde). Assim, em algumas formas de realização, os eventos de um método aqui proporcionado pode observada devido à acumulação de produto a partir de um método (que pode ser durante ou após a conclusão das etapas do método), ou devido a eventos detectáveis que ocorrem durante as etapas de um método de ,
[00291] A presença de ácidos nucleicos amplificados podem ser ensaiadas, por exemplo, por detecção de produtos de reação (ácidos nucleicos amplificados ou subprodutos da reação) ou através da detecção de sondas associadas com o progresso da reação.
[00292] Em algumas formas de realização, os produtos da reação podem ser identificados através de coloração dos produtos com um corante. Em algumas formas de realizao, um corante pode ter uma maior fluorescência quando ligados a um ácido nucleico que não ligadas a um ácido nucleico. Em algumas formas de realizao, um corante pode intercalar com um ácido nucleico de cadeia dupla, ou pode ligar-se a uma região externa de um ácido nucleico. corantes ácidos nucleicos que podem ser utilizados com os métodos e composições fornecidas na presente invenção incluem, por exemplo, corantes de cianina, PicoGreen ©, OiiGreen ®, RiboGreen ®, corantes SYBR®, SYBR ® ouro, SYBR Green I ®, ® SYBR verde II, brometo ethidiuin, dihydroethidiuni, BlueView ™, TOTO ® corantes, TO-PRO ® corantes, POPO ® corantes, YOYO ® corantes, Bobo ® corantes, JOJO ® corantes, LOLO ® corantes, SYTOX ® corantes, SYTO ® corantes, iodeto de propídio, iodeto hexidium, metileno azul, DAPI, laranja de acridina, quinacrina, dímeros de acridina, 9-amino-6-cloro-2-niethoxyacridine, corantes bisbenzimida, corantes Hoeehst, 7-aminoactmomycin D, actinomyein D, hydroxystilbamidine, pironina Y, corante diamante ™, GelRed ™, GelGreen ™ e LDS 751.
[00293] Em algumas formas de realização, os produtos da reação podem ser identificados através de análise de turvação de reacções de amplificação, por exemplo, onde o aumento da turbidez é correlacionado com a formação de produtos de reação e subprodutos da reação (por exemplo, pirofosfato de magnésio complexado com),
[00294] Em algumas formas de realização, os produtos da reação podem ser identificados por separação de uma reação realizada de acordo com um método io aqui por electroforese em gel, seguida por coloração do gel com um corante para ácidos nucleicos. O corante pode ser qualquer corante ácido nucleico aqui revelados ou caso contrário conhecidos na técnica.
[00295] Em algumas formas de realização, qualquer método ou composição conhecida na ail para a detecção de ácidos ou de processos associados com a geração de ácidos nucleicos nucleicos podem ser utilizados com os métodos e composições aqui proporcionados.
[00296] Em algumas formas de realizao, uma sonda de ácido nucleico que contém uma sequência de nucleotídeos complementar a uma porção de um modelo de cadeia de ácido nucleico (ou a cadeia que possui uma sequência semelhante ou idêntico) e que contém um ou ambos de um repórter fluorescente (fluoróforo) e um quencher estão incluídos numa reação aqui proporcionada.
[00297] Em um exemplo, uma sonda de ácido nucleico pode conter um repórter fluorescente na sua extremidade 5 'ou 3', e um extintor no outro terminal.
[00298] Em outro exemplo, uma sonda de ácido nucleico pode conter um repórter fluorescente na sua extremidade 5 'ou 3', e que pode ser hibridado com um iniciador de ácido nucleico contendo um quencher. O iniciador de ácido nucleico contendo um inibidor pode conter o inibidor a uma posição no iniciador de modo a que quando a sonda de ácido nucleico é emparelhado com o iniciador, o repórter fluorescente é extinta.
[00299] Em sondas contendo um repórter fluorescente e extintor par, o repórter fluorescente e o extintor podem ser selecionados de modo a que o inibidor pode eficazmente matar a repórter. Em algumas formas de realização, um repórter fluorescente é emparelhado com um quencher, onde o máximo de emissão do repórter fluorescente é semelhante ao do máximo de absorção do inibidor, Fiuorphores que pode ser usado como o repórter fluorescente incluem, por exemplo, CAL Fluor ouro, CAL Fluor orange, Quasar 570, CAL Fluor Red 590, CAL Fluor Red 610, CAL Fluor Red 610, CAL Fluor Red 635, Quasar 670 (Biosearch Technologies), VIC, NED (Life Technologies), Cy3, Cy5, Cy5.5 (GE Healthcare Ciências da vida), ostra-556, Oyster 645 (Integrated DMA Technologies), LC vermelho 610, LC vermelho 610, LC vermelho 640, LC vermelho 670, LC vermelho 705 (Roche Aplica Science), Texas vermelho, FAM, TET, HEX, JOE , TMR e ROX.
Supressores que podem ser utilizados incluem, por exemplo, DDQ-I, II-DDQ (Eurogentee), Eclipse (Epoch Biosciences), Iowa preto FQ, Iowa preto RQ (Integrated DNA Technologies), BHQ-1, BHQ-2, BHQ- 3 (Biosearch Technologies), QSY-7, QSY-21 (Molecular Probes), e Dabcyl.
[00300] Em algumas formas de realização, um método aqui proporcionado pode ser monitorizada num aparelho que contém uma fonte de luta e um sensor óptico. Em algumas situações, a reação pode ser posicionada no caminho da luz proveniente da fonte luminosa, e luz absorvida pela amostra (por exemplo no caso de uma reação turva), dispersa pela amostra (por exemplo no caso de uma reação turva) , ou emitida pela amostra (por exemplo no caso de uma reação com uma molécula fluorescente) pode ser medido. Em algumas formas de realização, um método aqui proporcionado pode ser realizada ou monitorizados num dispositivo ou módulo nele, como divulgado no Pedido de Patente US N ° de Série 13 / 769.779, depositado em 18 de fevereiro de 2013, que é aqui incorporado por referência na sua totalidade.
Detecção de Ácidos Nucleicos e de Proteínas marcadores de infecção
[00301] Uma amostra, tal como um esfregaço de garganta, um cotonete nasal, um cotonete de boca (por exemplo, uma haste de face), um esfregaço vaginal, saliva, sangue ou outra amostra, pode ser utilizada por mais de um ensaio. Por exemplo, uma amostra pode ser submetida a teste de ácido nucleico e para testar para os péptidos indicativos de uma infecção. Em formas de realizao, uma amostra pode ser dividida em duas ou mais porções e cada porção pode ser submetido a um único teste, ou pode ser submetida a uma pluralidade de testes. teste de ácido nucleico pode ser utilizado para identificar moléculas de ácido nucleico, ou suas porções, cuja presença indica a presença de organismos causadores de doença (por exemplo, vírus, bactérias e outros organismos que transportam tais ácidos nucleicos). A proteína (ou péptido) de teste pode ser utilizado para identificar péptidos ou proteínas, ou porções das mesmas, cuja presença indica a presença de organismos causadores de doenças (por exemplo, organismos que expressam essas proteínas ou péptidos). Proteína ou péptido de teste pode ser utilizado para identificar organismos causadores de doença (por exemplo, vírus, bactérias e outros organismos) em uma amostra, e pode também ser utilizado para identificar os anticorpos dirigidos contra tais agentes que possam estar presentes numa amostra. Assim, formas de proteína (ou péptido) testes incluem testes para a presença de anticorpos contra alvos cuja presença indica a presença de organismos causadores de doenças. Tal ácido nucleico e de proteína (ou péptido) de teste pode ser usada para identificar ou estimativa, ou de outro modo determinar a fase na qual uma infecção num indivíduo está no momento em que a amostra foi colhida, através da detecção de, ou determinando as quantidades de, ou ambos , ambos os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção e de proteína (ou péptido) marcadores indicativos do mesmo particular infecção (tais marcadores proteicos da mesma infecção incluem anticorpos para o microrganismo que causa a infecção, bem como marcadores de proteína presentes em ou no próprio microrganismo).
[00302] marcadores de ácidos nucleicos de uma infecção incluem moléculas de ADN e ARN, e seus fragmentos exclusivos para o agente infeccioso (por exemplo, os ácidos nucleicos virais, ou os ácidos nucleicos bacterianos, ou outros ácidos nucleicos de qualquer outro microrganismo infeccioso). Péptido ou proteína de uma infecção marcadores incluem péptidos ou proteínas específicas para o agente infeccioso (por exemplo, péptidos bacterianas); citocinas e outros péptidos produzidos em resposta à infecção; e os anticorpos produzidos em resposta à infecção.
[00303] Por exemplo, onde os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particular, são relativamente numerosos, enquanto que os marcadores de anticorpos indicativos de que a infecção particular, são relativamente escasso, então a infecção é uma infecção recente; No entanto, onde os marcadores de ácido nucleico indicativos de uma infecção particular, são relativamente numerosos, e marcadores de anticorpos indicativos de que a infecção particular também são relativamente numerosas, em seguida, a infecção não é uma infecção recente, uma vez que o objeto tenha tido tempo para produzir anticorpos específicos para a infecção . Onde marcadores de ácidos nucleicos indicativos de uma infecção particular são relativamente escassa, e os marcadores de anticorpos indicativos de que a infecção particular são relativamente numerosos, em seguida, a infecção pode ser diminuindo e em uma fase tardia. Outros marcadores proteicos (com excepção de anticorpos para o organismo infeccioso), sendo produzido pelo próprio organismo causador de doença, tais como as proteínas virais revestimento, proteínas da parede celular bacteriana, toxinas bacterianas, e outros marcadores não-anticorpos, tipicamente seguir um curso temporal mais semelhante ao de marcadores de ácido nucleico de uma determinada infecção e menos semelhante ao de marcadores de anticorpos de uma infecção particular.
[00304] Uma resposta típica em indivíduos assassino para a infecção por muitos agentes infecciosos inclui o aumento dos níveis de citoquinas inflamatórias (incluindo mterleukin 1 (fator de necrose tumoral de IL-1), IL-6, IL-1 8, um (TNF-a), interferão gama (IFN-γ), e outros). Os níveis de citocinas pode aumentar rapidamente após a infecção.
[00305] O curso temporal da produção de anticorpos contra um agente infeccioso (por exemplo, um vírus, bactérias, ou outros micro-organismo infeccioso) varia entre sujeitos individuais e de infecção para infectar por diante; tais prazos de cursos podem ser conhecidos ou identificados para diferentes tipos de infecções.De um modo geral, alguns dias ou mais são necessárias antes de anticorpos para um agente infeccioso são detectáveis num sujeito; uma vez detectável, a quantidade de anticorpos detectada num sujeito cresce, muitas vezes, muito rapidamente, e pode planalto (ou pico) ao longo de um período de semanas ou meses após a infecção, para além do tipo da infecção, os fatores que podem afectar o patamar (ou pico) níveis, e o momento em que esses níveis são alcançados, incluem ou não a infecção é aguda ou crônica; a gravidade da infecção; outras doenças ou condições que afetam o sujeito; o estado nutricional do sujeito; fatores ambientais; e outros fatores.
[00306] O tempo de curso de uma infecção aguda pode ser curto; por exemplo, uma infecção aguda pode seguir um tempo de curso medido em dias ou semanas. Por exemplo, muitas infecções virais e bacterianas em um sujeito humano de outra maneira saudável geralmente desaparecem dentro de cerca de uma semana. Os níveis dos marcadores de ácidos nucleicos e proteínas indicativos de infecções virais, bacterianas e outras tipicamente subir, e, em seguida, a queda, durante o curso da infecção. Inicialmente, após a infecção, e a seguir de perto do momento da infecção, marcadores do agente infeccioso (por exemplo, Nucleic marcadores de ácidos e proteínas marcadores indicativos da infecção viral, bacteriana, ou outra) será detectável em amostras obtidas a partir de um objeto: os níveis de tais marcadores irá subir a partir do momento da infecção, e será tipicamente de pico dentro de poucos dias (para uma infecção de curta duração) ou dentro de algumas semanas (por uma infecção de maior duração). Anticorpos contra o agente infeccioso pode ser detectado dentro de uma ou duas semanas após a infecção, e pode, então, aumentar ainda mais durante várias semanas (por exemplo, durante um mês ou mais). Se a infecção em si e resolve o agente infeccioso é limpo a partir do sujeito, os níveis de anticorpos irá então diminuir lentamente ao longo de um período de meses.
[00307] longo prazo, ou infecções crônicas podem seguir um curso temporal mais longa. Por exemplo, o tempo de curso de marcadores virais e a formação de anticorpos numa pessoa infectada com o vírus da imunodeficiência humana (HIV) pode seguir um tempo de curso ao longo de muitos meses e anos.Inicialmente, marcadores virais de HIV (por exemplo, o antígeno p24 viral, os ácidos nucleicos virais, e outros marcadores virais produzidas pelo próprio vírus) pode estar presente (em amostras obtidas a partir de um sujeito), em níveis elevados durante os primeiros meses após a infecção, e pode pico em cerca de 6 meses após a infecção. Em contraste, os anticorpos anti-VIH (por exemplo, anticorpos para o g L20 ou outros epitopos antigénicos virais) não são detectáveis nas amostras obtidas a partir de um objeto para alguns meses após a infecção, mas tornam-se detectáveis por cerca de 3-5 meses após a infecção, e os níveis de anticorpos anti-HIV subir rapidamente nos 6 meses seguintes ou assim, continua a aumentar a um ritmo menos rápido de cerca de 1 ano após a infecção para cerca de 4 a 6 anos após a infecção. Durante este período de tempo (de cerca de um ano até cerca de cinco anos) os níveis de marcadores virais podem ser muito baixo; No entanto, na ausência de tratamento, como os níveis de células T (por exemplo, células T CD4) tipicamente não têm conseguido ao longo do período de tempo de cerca de um ano até cerca de cinco anos após a infecção pelo HIV, o sujeito pode começar a sofrer de A deficiência imune sistémica e uma maior perda de células T (por exemplo, CD-8 de células T) de cerca de 5-6 anos após a infecção pelo HIV. Os níveis dos marcadores virais de HIV irá tipicamente aumentar à medida que a deficiência se torna aparente imunitária sistémica 5 - 6 anos após a infecção pelo HIV.
[00308] O tempo de pratos relevantes para a detecção do marcador pode também depender do tipo de amostra testada quanto à presença do marcador. Por exemplo, em algumas infecções, o organismo causador, e os marcadores de ácidos nucleicos e de proteínas do organismo, pode ser encontrada inicialmente no sangue, ou saliva, ou outro fluido ou tecido; e pode mais tarde ser encontrado em amostras de urina ou fezes; e ainda, mais tarde, pode ser detectável em amostras de tecido. Os anticorpos para tais organismos causadores de doenças, que normalmente aparecem algum tempo após o aparecimento do próprio organismo em amostras, podem encontrado pela primeira vez no sangue e, em seguida, na sequência da sua aparência no sangue, na saliva, urina, ou fezes.
Devices
[00309] Os dispositivos, sistemas e ensaios aqui descritos podem utilizar técnicas, dispositivos, sistemas e ensaios divulgados, por exemplo, na Patente US 8.088.593; Patente US 8.380.541; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769.798, fifed 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,779, arquivado 18 de fevereiro de 2013; US Aplicação Serial No. 61 / 800.606, depositado 15 de março de
2013; Pedido US Série No. 61 / 766.095, depositado 18 de fevereiro de 2013; e Pedido de Patente US 61 / 805.923, depositado em 27 de março de 2013, todos os quais são aqui incorporados por referência (supra).
[00310] Por exemplo, os dispositivos para utilização na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes patogênicos numa única amostra clínica, ou numa pluralidade de alíquotas de uma única amostra clínica incluem cartuchos incluindo alguns ou todos os recipientes, recipientes de reação de reagentes , ferramentas e instrumentos utilizados em ensaios, e reagentes utilizados nos ensaios. Um cartucho pode conter um ou mais dos seguintes: reagentes de navios; vasos de reação; cuvetes citometria; contentores de lixo; amostra de dispositivos de coleta ou vasos de coleta de amostras; e outros vasos e de materiais. Tais dispositivos podem incluir múltiplos vasos contendo reagentes para utilização num ensaio para a detecção de uma pluralidade de marcadores indicativos de um agente infeccioso, por exemplo, um agente infeccioso das vias respiratórias superiores; um agente infeccioso respiratório inferior; um agente causador de doença sexualmente transmissível; um agente detectável a partir de uma amostra obtida a partir de uma haste (por exemplo, uma haste de garganta, um cotonete nasal, um cotonete de boca (por exemplo, um mordente SW r ah), um esfregaço vaginal, ou outra compressa); um agente detectável a partir de uma amostra de sangue; ou suas combinações.
[00311] Deste modo, por exemplo, um cartucho pode conter uma pluralidade de reagente v essels; uma pluralidade de vasos de reagente, contendo reagentes para a detecção de um marcador indicativo de um agente causador de doença. agentes causadores de doenças pode incluir agentes que causam distúrbios das vias respiratórias superiores, ou distúrbios do trato respiratório inferior, ou doenças sexualmente transmissíveis. Um agente causador de doença pode ser detectada numa amostra de sangue. agente causador de doença A. pode ser detectada numa amostra obtida com uma zaragatoa, tal como um esfregaço de garganta, ou um cotonete nasal, ou uma zaragatoa bucal (por exemplo, um cotonete bucal), ou um esfregaço vaginal, ou outra amostra ou as suas combinações.
[00312] Em formas de realização, um dispositivo de ma ser ou compreender um cartucho configurado para conter um ou mais vasos de reagente, e um ou mais recipientes de reação, por exemplo, para utilização em ensaios de ácidos nucleicos; para uso em imunoensaios (por exemplo, ensaios ELISA); para uso em ensaios gerais de química (por exemplo, para eletrólitos clínicos, os níveis de vitamina, os níveis de componente do sangue, e outros alvos); para utilização em ensaios de citometria; e para suas combinações. Em formas de realização, um tal dispositivo pode incluir reagentes, vasos de reação, e ferramentas, tinas, e outros instrumentos para utilização em ensaios de ácidos nucleicos; para imunoensaios (por exemplo, ensaios ELISA); ensaios de química geral (por exemplo, para eletrólitos clínicos, os níveis de vitamina, os níveis de componente do sangue, e outros alvos): ensaios de citometria; e para suas combinações.
[00313] Em formas de realizao, um cartucho para ser utilizado na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tal como aqui divulgados podem incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma haste ou de esfregaços. Uma única mecha pode ser colocada em um único espaço, ou num único vaso; em formas de realização, duas compressas podem ser colocados em um único espaço, ou um único vaso. Em formas de realização, uma pluralidade de amostras de esfregaços podem ser colocados num único espaço, ou um único vaso. Os navios para a realização de uma haste, ou cotonetes, pode conter um reagente, ou um diluente, ou outra solução para utilização com uma haste ou de esfregaços.
[00314] Um esfregaço nasal pode ser útil para testar para doenças das vias respiratórias superiores, e uma haste de garganta pode ser útil para testar doenças respiratórias inferiores. Em formas de realização, uma haste de boca (por exemplo, um cotonete bucal, um cotonete de língua, um chumaço de goma, ou outro swab tomadas dentro da boca) podem ser utilizados, para além, ou em vez de, um nasal ou garganta cotonete.
Esfregaços nasais e da garganta pode ser obtido a partir de um único doente, e podem ser analisados ao mesmo tempo, ou aproximadamente ao mesmo tempo.
Por exemplo, uma haste de garganta pode ser colocado em um vaso num cartucho, e uma haste nasal pode ser colocado num recipiente diferente no cartucho, para análise num sistema de dispositivo de análise ou análise.
Por exemplo, uma haste de boca pode ser colocada em um vaso num cartucho, e uma haste nasal pode ser colocado num recipiente diferente no cartucho, para análise num sistema de dispositivo de análise ou análise.
Por exemplo, uma haste de garganta pode ser colocado em um vaso num cartucho, e uma haste de boca pode ser colocada num recipiente diferente no cartucho, para análise num sistema de dispositivo de análise ou análise.
Estes recipientes podem conter um reagente, ou um diluente, ou outra solução para uso com os cotonetes; tais reagentes podem ser diferentes para o esfregaço da garganta e do swab nasal.
Em formas de realização, os reagentes podem ser diferentes para uma haste de boca do que para um esfregaço da garganta ou secreção nasal.
Num outro exemplo, uma haste de garganta e um cotonete nasal a partir de um único indivíduo pode ser colocado no mesmo vaso em um dispositivo.
Num outro exemplo, uma haste de boca e uma haste nasal a partir de um único indivíduo pode ser colocado no mesmo vaso em um dispositivo.
Num outro exemplo, uma haste de garganta e uma haste de boca a partir de um único indivíduo pode ser colocado no mesmo vaso em um dispositivo.
O recipiente pode conter um reagente, ou um diluente, ou outra solução para utilização com estes esfregaços.
O dispositivo pode ser colocado num dispositivo de análise, ou dentro de um sistema de análise para análise.
Tais dispositivos de análise e sistemas de análise, podem ser colocados no mesmo local como aquele em que se obteve a amostra; ou tais dispositivos de análise e sistemas de análise podem estar em um local ou locais do que o local onde foi obtida a amostra diferente.
[00315] Em formas de realizao, um cartucho para ser utilizado na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tal como aqui divulgados podem incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma amostra de sangue. Em formas de realizao, um cartucho para ser utilizado na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tal como aqui divulgados podem incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma amostra de sangue e pode também incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma haste ou cotonetes. Assim, um dispositivo, tal como um cartucho, pode realizar uma amostra de sangue e um esfregaço de garganta; pode realizar uma amostra de sangue e um swab nasal; e pode ser titular de uma amostra de sangue, um cotonete de garganta, e um cotonete nasal. Em formas de realização, um dispositivo, tal como um cartucho, pode realizar uma amostra de sangue e um esfregaço boca: pode realizar uma amostra de sangue, uma haste de boca, e uma secreção nasal; e pode ser titular de uma amostra de sangue, uma haste de boca, um cotonete de garganta, e um cotonete nasal.
Da mesma forma, um dispositivo, tal como um cartucho, pode realizar uma amostra de sangue e um esfregaço vaginal; e pode segurar uma amostra de sangue, e um ou mais de uma haste de boca, um cotonete de garganta, um cotonete nasal, e um esfregaço vaginal.
[00316] Em formas de realizao, um cartucho para ser utilizado na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tal como aqui divulgados podem incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma amostra de urina. Em formas de realizao, um cartucho para ser utilizado na realização de ensaios para detecção de uma pluralidade de agentes causadores de doenças, tal como aqui divulgados podem incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma amostra de urina e também podem incluir um ou mais espaços ou vasos para a realização de uma haste ou cotonetes. Assim, um dispositivo, tal como um cartucho, pode conter uma amostra de urina e uma haste de garganta; pode realizar uma amostra de urina e um swab nasal; pode deter uma amostra de urina, um esfregaço da garganta e um swab nasal; pode deter uma amostra de urina, um esfregaço da garganta, um chumaço de boca, e um swab nasal; e pode segurar uma amostra de urina, e uma ou mais de uma zaragatoa, um cotonete de boca, um esfregaço vaginal, nasal e um cotonete.
[003173 Deve entender-se que tais dispositivos, tais como cartuchos, podem conter outros tipos de amostras, bem como, e que qualquer combinação de tipos de amostras pode ser realizado por esses dispositivos (por exemplo, cartuchos). Em quaisquer e todos esses casos, a amostra ou amostras podem ser analisadas de um dispositivo de análise de amostra ou de um sistema de análise de amostras.
[00318] Um cartucho pode incluir uma amostra, e pode incluir reagentes para serem utilizados no tratamento ou teste de uma amostra, descartáveis para serem utilizados no tratamento ou teste de uma amostra, ou outros materiais. Após a colocação de um cartucho em, ou a inserção de um cartucho para dentro, um dispositivo de processamento da amostra ou sistema, um ou mais componentes do cartucho pode ser posto em comunicação fluida com outros componentes do dispositivo de amostra processmg. Por exemplo, a amostra é recolhida em um cartucho, a amostra pode ser transferido para outras porções do dispositivo de processamento da amostra. Da mesma forma, se um ou mais reagentes são fornecidos em um cartucho, os reagentes podem ser transferidos para outras porções do dispositivo de processamento de amostras, ou outros componentes do dispositivo de processamento da amostra pode ser trazido para os reagentes.Em algumas formas de realização, os reagentes ou componentes de um cartucho podem permanecer no bordo do cartucho. Em algumas formas de realização, não há fluídica estão incluídas que requerem tubos ou que requerem MANUTENÇÃO (por exemplo, manual ou automatizada de manutenção).
[003191 Uma amostra ou reagente pode ser transferida para um dispositivo, tal como um dispositivo de processamento de amostras, uma amostra ou reagente podem ser transferidas dentro de um dispositivo. Tal transferência de amostra ou reagente pode ser conseguida sem fornecimento de um caminho de fluido contínuo a partir do cartucho para o dispositivo. Tal transferência de amostra ou reagente pode ser conseguida sem fornecimento de um caminho de fluido contínuo dentro de um dispositivo. Em formas de realização, tal transferência de amostra ou reagente pode ser realizado por um sistema de manipulação de amostra (por exemplo, uma pipeta); Por exemplo, uma amostra, reagentes, ou alíquota do mesmo pode ser aspirada para um componente de transferência aberta de ponta, tal como uma ponta de pipeta, que pode ser operacionalmente ligado a um sistema de manipulação de amostra que transfere a ponta, com a amostra, reagentes, ou alíquota deste último contida no interior da ponta, para uma localização sobre ou dentro do dispositivo de processamento da amostra. A amostra, reagentes, ou mesmo alíquota pode ser depositado numa localização sobre ou dentro do dispositivo de processamento da amostra.
Page 9: Amostra e o reagente, ou vários reagentes, podem ser misturados utilizando um sistema de manuseamento de amostras de um modo semelhante. Um ou mais dos componentes do cartucho pode ser iransierred de forma automatizada a outras porções do dispositivo de processamento de amostras, e vice-versa.
[00320] Conforme mostrado na Fig. 20A, A fig. 20B, e a fig. 20C, um recipiente para a realização de uma zaragatoa pode ser carregado em um cartucho, onde pode ser retido até ser necessário para análise; o cartucho pode ser carregado para um sistema de análise ou dispositivo de análise, carregando desse modo a haste de (e quaisquer outras amostras ou recipientes de amostra no cartucho assim). Como mostrado na Fig. 2.0A, um recipiente para a realização de uma haste (um vaso cotonete 10) pode ser carregado em um cartucho de 20 por colocação dentro de um receptáculo 30. O cartucho 20 também inclui, como mostrado cavidades e cavidades 40 para receber e guardar os reagentes e vasos. Um recipiente de mecha 10 pode conter uma haste no lugar no interior do vaso cotonete 10, ou pode ser carregado em um cartucho sem um cotonete no lugar no interior do vaso 10 cotonete.
[00321] Conforme mostrado na Fig. 2.0B, um recipiente para a realização de uma haste (um vaso cotonete 10) pode ser carregado em um cartucho de 20 por colocação dentro de um receptáculo 30. O cartucho 20 também inclui, como mostrado cavidades e cavidades 40 para receber e guardar os reagentes e vasos.Na forma de realização mostrada na Fig. 20B, o cartucho 20 também inclui um reservatório de recolha de amostra 50, que pode ter, por exemplo, sangue, urina, ou outra amostra. As setas que se afasta do vaso cotonete 10 indicam a forma como o recipiente 10 zaragatoa pode ser colocada dentro de um receptáculo 30 no cartucho 20.
[00322] Conforme mostrado na Fig. 20C, um recipiente para a realização de uma haste (um vaso cotonete 10) pode ser carregado em um cartucho de 20 por colocação dentro de um receptáculo 30. O cartucho 20 também inclui, como mostrado cavidades e cavidades 40 para receber e guardar os reagentes e vasos.Como se mostra na forma de realização da fig. 20C, o cartucho 20 inclui um receptáculo 60 cotonete configurado para segurar uma haste de 70. Em formas de realização (por exemplo, na forma de realização ilustrada na Fig. 20C) de um cartucho 20, que tem um receptáculo cotonete 60 pode incluir, opcionalmente, um recipiente de recolha da amostra 50, que pode manter, por exemplo, sangue, urina, ou outra amostra. Tal cotonete 70 pode ser realizada no receptáculo cotonete 60 antes da sua utilização na recolha de uma amostra. Em formas de realização, um esfregaço 70 pode ser colocado dentro de um vaso cotonete 10 após a recolha de uma amostra com cotonete 70. Na concretização mostrada na Fig. 20C, vaso mecha 10 pode ser carregado num cartucho sem um cotonete no lugar no interior do vaso cotonete 10 antes da utilização da mecha 70, e de um recipiente mecha 10 pode ser substituído em um recipiente 30, que prende cotonete 70 dentro do vaso de zaragatoa 10 após a recolha de uma amostra por swab 70.
[00323] Cotonetes pode ser qualquer cotonete adequada para a recolha de uma amostra. Vários exemplos de cotonetes adequados para utilização na recolha de amostra são apresentados na Fig. 21. Cotonetes com pontas em flocos (00 zaragatoa, e o cotonete mais curto 200, adequado para uso pediátrico), ou aqueles que também adequado para utilização no estabelecimento de culturas de materiais obtidos por raspagem de um orifício do corpo, numa cavidade corporal ou superfície de um objeto (esfregaço 300), cotonetes (swab 400), e outros cotonetes podem ser usadas para recolher uma amostra de um paciente para o uso com os métodos, sistemas e dispositivos aqui revelados. Por exemplo, as amostras podem ser obtidas por raspagem de uma cavidade nasal, garganta, boca, uma vagina, ou outro orifício, cavidade do corpo, ou de localização sobre ou dentro de um sujeito.
sistemas
[00324] Um sistema de análise, que pode incluir um dispositivo de análise, tal como um dispositivo de processamento de amostras, pode ter um sistema de manuseamento de fluidos (também aqui designado por um sistema de manipulação de amostra). Um sistema de manuseamento de fluidos pode efectuar, ou pode auxiliar na realização, o transporte, a diluição, extracção, aliquotting, misturando, e outras ações com um fluido, tal como uma amostra. Tn algumas formas de realização, um sistema de manipulação de fluido pode ser contido dentro de um alojamento do dispositivo. Um sistema de manipulação de fluido pode permitir a recolha e entrega, processamento e / ou o transporte de um fluido, a dissolução de reagentes secos, mistura dos reagentes líquidos e / ou secas com um líquido, bem como a recolha, entregar "-, o processamento e / ou transporte de componentes não fluídicos, amostras, ou materiais. O fluido pode ser uma amostra, um reagente, diluente, lavagem, tintura, ou qualquer outro fluido que possa ser utilizado pelo dispositivo, e podem incluir, mas não se limitando a, líquidos homogéneos, diferentes líquidos, emulsões, suspensões, e outros fluidos , um sistema de manipulação de fluidos, incluindo, sem limitação, uma pipeta, pode também ser utilizado para o transporte de recipientes (com ou sem fluido nele contido) em torno do dispositivo. O sistema de manuseio de fluidos pode dispensar ou aspirar um líquido. A amostra pode incluir uma ou mais partículas ou matéria sólida flutuante dentro de um fluido.
[003253 em formas de realização, um sistema de manipulação de fluido pode compreender uma pipeta, ponta de pipeta, seringa, capilar, ou outro componente.O sistema de fluidos pode ter handiing porção com uma superfície interior e uma superfície exterior e uma extremidade aberta. O sistema de manipulação de fluido pode-compreendem uma pipeta, que pode incluir um corpo da pipeta e um bocal de pipeta, e pode compreender uma ponta de pipeta. Uma ponta de pipeta pode ou não ser removível a partir de um bocal de pipeta. Em formas de realização, um sistema de handiing fluido pode usar uma pipeta acoplado com uma ponta de pipeta; uma ponteira pode ser descartável. A ponta pode formar uma vedação estanque aos fluidos quando acoplado com uma pipeta. Uma ponta de pipeta pode ser usada uma vez, duas vezes ou mais vezes. Em formas de realização, um sistema de manipulação de fluido podem usar uma pipeta ou um dispositivo semelhante, com ou sem uma ponta de pipeta, para aspirar, distribuir, misturar, de transporte, ou de outro modo manipular o fluido. O fluido pode ser distribuído a partir do sistema fluido handiing quando desejado. O fluido pode ser contido dentro de uma ponta de pipeta antes de ser dispensado, por exemplo, a partir de um orifício na ponta da pipeta. Em formas de realizao, ou durante a utilização casos, todo o líquido pode ser dispensado; Noutras formas de realização, ou instâncias durante a utilização, uma parte do fluido dentro de uma ponta pode ser dispensado. Uma pipeta pode aspirar selectivamente um fluido.A pipeta pode aspirar uma quantidade selecionada de fluido. A pipeta pode ser capaz de actuar mecanismos de agitação para misturar o líquido no interior da ponta ou dentro de um vaso. A pipeta pode incorporar pontas ou vasos criar loops de fluxo contínuo para a mistura, incluindo de materiais ou reagentes que estão na forma não-líquida. Uma ponta de pipeta pode também facilitar a mistura por entrega controlada de múltiplos fluidos simultaneamente ou em sucessão, como em reacções de substrato de 2 peças.
[00326] A. sistema de manipulação de fluido pode incluir uma ou mais unidades fiuidically isolado ou hidraulicamente independentes. Por exemplo, o sistema de manipulação de fluido pode incluir uma, duas, ou mais pontas de pipeta. As pontas de pipeta pode ser configurado para aceitar e confinar um fluido. As pontas podem ser isolados a partir de fiuidically ou hidraulicamente independentes uma da outra. Os fluidos contai ed dentro de cada ponta pode ser isolado ou hidraulicamente fiuidically independentes umas das outras em fluidos dicas e de outros fluidos no interior do dispositivo. As unidades fiuidically isolado ou hidraulicamente independentes pode ser móvel em relação a outras porções do dispositivo e / ou um outro. As unidades independentes fiuidically isolados ou hidraulicamente, podem ser individualmente móvel. Um sistema de manuseamento de fluidos pode compreender uma ou mais base ou suporte. Uma base ou suporte pode suportar uma ou mais unidades de pipeta ou pipeta. Uma base ou suporte pode ligar um ou mais pipetas de o sistema de manipulação de fluido um com o outro.
[00327] Um sistema de processamento de amostras, que pode incluir um dispositivo de processamento de amostras, pode ser configurado para efectuar os passos de processamento ou de ações sobre uma amostra obtida de um sujeito. O processamento da amostra pode incluir a preparação das amostras, incluindo, por exemplo, a diluição da amostra, a divisão de uma amostra em alíquotas, extracção, o contacto com um reagente, filtração, separação, centrifugação, ou outra acção preparatória, transformação ou etapa. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar uma ou mais amostras de acção preparação ou passo na amostra. Opcionalmente, uma amostra pode ser preparado por uma reação química e / ou etapa de processamento físico. A acção de preparação da amostra ou etapa pode incluir um ou mais dos seguintes procedimentos: centrifugação, separação, filtração, diluição, enriquecimento, purificação, precipitação, incubação, pipetagem, o transporte, a cromatografia, a lise Ceil, citometria, pulverização, moagem, activação, ulrrasonication, processamento de coluna micro, processamento com esferas magnéticas, processamento com nanopartículas, ou outra amostra acção preparação ou etapas. Por exemplo, a preparação da amostra pode incluir um ou mais passos para separar o sangue em soro e / ou fracções de partículas, ou para separar qualquer outra amostra em vários componentes. A preparação da amostra pode incluir um ou mais passo de diluição e / ou concentração de uma amostra, tal como uma amostra clínica ou amostra biológica, por exemplo, de sangue, urina, expectoração, o material obtido a partir de um cotonete nasal, um cotonete de garganta, um cotonete bucal, ou outra amostra, ou outras amostras clínicas ou biológicas. A preparação da amostra pode incluir a adição de um anti-coagulante ou outros ingredientes para uma amostra. A preparação da amostra pode também incluir a purificação de uma amostra. Em formas de realização, todos os processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou etapas são realizadas por um único dispositivo. Em formas de realização, todo o processamento da amostra, preparação ou ações de ensaio ou os passos são realizados dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, a maior parte de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou os passos são realizados por um único de gelo v, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, muitas de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou os passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Dentro formas de realização, o processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou os passos podem ser realizados por-mais de um dispositivo.
[00328] Um sistema de processamento de amostras, que pode incluir um dispositivo de processamento de amostras, pode ser configurado para executar uma ou mais ensaio de uma amostra, e para obter dados a partir da amostra. Um ensaio pode incluir um ou mais tratamentos químicos ou físicos, e pode incluir a execução de um ou mais reacções químicas ou físicas. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para executar um, dois ou mais ensaios sobre uma pequena amostra de fluido corporal. Um ou mais reação química pode ocorrer em uma amostra com um volume, como aqui descrito noutro local. Por exemplo uma ou mais reação química pode ter lugar em um comprimido tendo menos do que os volumes femtoliter, num exemplo, a unidade de recolha de amostra está configurado para receber um volume da amostra equivalente fluido corporal para uma única gota ou menos de sangue ou fluido intersticial . Em formas de realização, o volume de uma amostra pode ser um pequeno volume, onde um pequeno volume pode ser um volume que é inferior a cerca de 1000 μl ,, ou menos do que cerca de 500 uL, ou Jess do que cerca de 250 μl ,, ou menos do que cerca de 150 μΕ, ou menos do que cerca de 100 μl ,, ou menos do que cerca de 75 .L, ou menos do que 50 aboui L, ou menos do que 40 uL aboui °, ou menos do que cerca de 20 ou menos do que cerca de 10 ou outro pequeno volume. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados numa única amostra. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados por um único dispositivo. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realizao, a maioria das ações de ensaio da amostra ou passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, muitas ações ensaio da amostra, ou passos são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou passos pode ser realizada por mais do que um dispositivo.
[00329] Um sistema de processamento de amostras, que pode incluir um dispositivo de processamento de amostras, pode ser configurado para executar uma pluralidade de ensaio s numa amostra. Por exemplo, uma amostra de transformação de vício pode ser configurado para detectar, ou para identificar, ou para medir o material de identificação de agentes patogênicos numa amostra. Em formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para realizar uma pluralidade de ensaios numa única amostra. Em formas de realização, um dispositivo de processamento de amostras pode ser configurado para realizar uma pluralidade de ensaios numa única amostra, em que a amostra é uma amostra pequena. Por exemplo, uma pequena amostra deve ter um volume de amostra que é um pequeno volume de menos de cerca de 1000 ou inferior a cerca de 500 SL, ou menos do que cerca de 250, IIl, ou menos do que cerca de 150 μΙ_, ou menos do que cerca de 100 uL, ou menos do que cerca de 75 ^ L, ou menos do que cerca de 50 L, ou menos do que cerca de 40 μl ,, ou menos do que cerca de 20 μϊ_ ·, ou menos do que cerca de 10 μl., ou outro pequeno volume. Um dispositivo de processamento de amostras pode ser capaz de realizar ensaios multiplexados numa única amostra. Uma pluralidade de ensaios podem ser executados em simultâneo; podem ser executadas sequencialmente; ou alguns ensaios podem ser executados simultaneamente, enquanto outros são executados sequencialmente. Um ou mais ensaios e / ou calibradores de controlo (por exemplo, incluindo uma configuração com um controlo de um calibrador para o ensaio / testes) também pode ser incorporado no dispositivo; Os ensaios de controlo e de ensaio no calibradores podem ser realizados simultaneamente com os ensaios efectuados numa amostra, ou pode ser realizada antes ou depois de ensaios efectuados numa amostra, ou qualquer combinação dos mesmos. Em formas de realização, todas as medidas de ensaio de amostra ou passos são realizados por um único dispositivo. Em formas de realização, todo de uma pluralidade de ações de ensaio ou os passos são realizados dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realizao, a maioria das ações ensaio da amostra, ou passos, de uma pluralidade de ensaios, são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, muitas ações ensaio da amostra, ou passos, de uma pluralidade de ensaios, são realizados por um dispositivo único, e pode ser realizada dentro de um alojamento de um dispositivo único. Em formas de realização, de processamento de amostras, preparação ou ações de ensaio ou passos pode ser realizada por mais do que um dispositivo.
[00330] Em formas de realização, todos de uma pluralidade de ensaios podem ser realizados num período de tempo curto. Em formas de realização, um tal período de tempo curto compreende menos do que cerca de três horas, ou menos de cerca de duas horas, ou menos de cerca de uma hora, ou menos do que cerca de 40 minutos, ou menos de cerca de 30 minutos, ou menos de cerca de 25 minutos, ou menos do que cerca de 20 minutos, ou menos de cerca de 15 minutos, ou menos de cerca de 10 minutos, ou menos de cerca de 5 minutos, ou menos de cerca de 4 minutos, ou menos de cerca de 3 minutos, ou menos de cerca de 2 minutos, ou menos do que cerca de 1 minuto, ou outro período de tempo curto.
[003313 Em formas de realização dos métodos, dispositivos e sistemas aqui descritos, os sistemas podem incluir uma ou mais estações de ensaio, em que, por exemplo, uma amostra e um reagente podem ser misturados. Em formas de realização dos métodos, de vícios e sistemas aqui descritos, os sistemas podem incluir uma ou mais estações de detecção, em que, por exemplo, uma amostra, ou uma etiqueta afixada para um alvo numa amostra, ou outro sinal indicativo da presença de um analito alvo numa amostra, pode ser detectada. Em formas de realização dos métodos, dispositivos e sistemas divulgados aqui, uma ou mais estações de ensaio também pode servir como uma estação de detecção. Por exemplo, onde um ensaio reage um reagente ou reagentes com um anaiyte dentro de um recipiente, o recipiente serve como uma estação de ensaio; em que o recipiente é transparente a um sinal produzido pela reação, e quando o recipiente é adjacente a um detector eficaz que o sinal (e, portanto, a presença ou concentração do anaiyte) pode ser detectado, o recipiente também serve como uma estação de detecção. Por exemplo, alguns métodos de análise de ácidos nucleicos e sistemas de proporcionar um bloco de aquecimento (ou outro elemento de controlo de temperatura) e um detector em, ou perto de, uma posição na qual um recipiente que contém a amostra e reagentes é colocado durante a reação, e durante a detecção dos resultados da reação. Em tal forma de realização, AV essel não é movido a partir do local da reação para um local diferente para a detecção dos resultados da reação, de modo que o recipiente (e a localização e os dispositivos de acompanhamento e elementos operativos) serve como uma estação de ensaio e uma estação de detecção. Noutras formas de realização, um navio é movido de um local onde ocorre uma reação, ou uma amostra (ou contendo amostra) solução é movido a partir do ensaio dos vasos, para um local diferente ou recipiente onde ocorre a detecção.Em tal forma de realização em que um recipiente (ou solução) é movida a partir da localização da reação para um local diferente para a detecção dos resultados da reação, o recipiente (e a localização e acompanhá-ing dispositivos de doseamento e os elementos operativos) serve como um estação de ensaio, e um local diferente (e dispositivos ou elementos) serve como uma estação de detecção.
[00332] Os sistemas para detectar a presença de uma ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa num pequeno volume de amostra clínica incluem, por exemplo, a) um sistema de manipulação de amostra; b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) um fhridically isolado unidade de coleta de amostra configurado para reter uma amostra clínica; d) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira e uma segunda unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente e a segunda unidade compreende um segundo reagente; e e) um controlador, em que o controlador compreende uma memória focal e está operacionalmente acoplado ao sistema de manipulação de amostra e a estação de detecção. Tais sistemas podem ser configurados para realizar ensaios com uma ou ambas das primeira e segunda unidades de ensaio: em que a memória local do controlador compreende um protocolo compreendendo instruções para: i) a direção do sistema de manuseamento de amostras para transferir uma porção da amostra clínica para a primeira unidade de ensaio e para a segunda unidade de ensaio; e ii) dirigir o sistema de manuseamento de amostras para transferir a primeira unidade de doseamento e a segunda unidade de unidade de ensaio para a estação de detecção. Noutras formas de realização, uma estação de ensaio em tais sistemas podem incluir, pelo menos, uma primeira, segunda e terceira unidade, ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente, a segunda unidade compreende um segundo reagente, e a terceira unidade compreende um terceiro reagente. Noutras formas de realização, uma estação de ensaio em tais sistemas podem incluir, pelo menos, uma primeira, segunda, terceira e quarta unidade ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente, (ele segunda unidade compreende um segundo reagente, o terceiro compreende uma unidade um terceiro reagente, e a quarta unidade compreende um quarto reagente Deverá ser entendido que formas de realização de tais sistemas podem incluir mais do que quatro unidades de ensaio;. ou outros números de unidades de ensaio.
[00333] Em formas de realização, são realizados ensaios com qualquer uma ou mais das primeira, segunda e terceira unidades de ensaio; ou com qualquer um ou m ais dos primeiros, e as unidades de ensaio quarta, segundo, terceiro, em que a memória local do controlador compreende um protocolo compreendendo instruções para: i) a direção do sistema de manuseamento de amostras para transferir uma porção da amostra clínica para a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio, e, se for caso disso, a terceira unidade de ensaio e / ou unidades de quarto ensaio; e ii) dirigir o sistema de manuseamento de amostras para transferir a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio, e, se for caso disso, a terceira unidade de ensaio e / ou a quarta unidade de ensaio para a estação de detecção.
[00334] Além disso sistemas para a detecção da presença de um ou mais de uma pluralidade de marcadores indicativos de uma doença infecciosa, de uma amostra clínica de pequeno volume incluem: a) um sistema de manipulação de amostra; b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) um sistema de manipulação de fluido configurado para transportar líquidos entre os componentes do referido sistema, em que o referido transporte de fluidos compreende transporte de alíquotas isolados de fluido; d) um fluidicamente isolado unidade de coleta de amostra configurado para reter uma amostra clínica; e) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira, segunda, e terceira unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um primeiro reagente, a segunda unidade compreende um segundo reagente, e a terceira unidade compreende um terceiro reagente; e f) um controlador, em que o controlador compreende uma memória local e está operacionalmente acoplado ao sistema de manipulação de amostra e a estação de detecção. Tais sistemas podem ser configurados para realizar ensaios com qualquer uma ou mais das primeira, segunda, e terceira unidades de ensaio; em que a memória local do controlador compreende um protocolo compreendendo instruções para: i) a direção do sistema de manuseamento de amostras para transferir uma porção da amostra clínica para a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio e a terceira unidade de ensaio; e ii) dirigir o sistema de manuseamento de amostras para transferir a primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de ensaio, e a terceira unidade de ensaio para a estação de detecção. Deverá ser entendido que formas de realização de tais sistemas podem incluir apenas duas unidades de ensaio; ou pode incluir quatro unidades de ensaio; ou outros números de unidades assa.
[00335] Os sistemas de processamento de amostras clínicas para uso na realização de ensaios, tal como aqui divulgado pode incluir: a) um sistema de manipulação de amostra; b) uma estação de detecção compreende um sensor óptico; c) um fluidicamente isolado unidade de coleta de amostra configurado para reter uma amostra clínica; d) uma estação de ensaio compreendendo, pelo menos, uma primeira, segunda, e terceira unidade de ensaio fluidicamente isolado, em que a primeira unidade compreende um anticorpo, a segunda unidade compreende um oligonucleótido, e a terceira unidade compreende um cromógeno ou um corante ou outro marcador; e e) um controlador, em que o controlador é acoplado operacionalmente ao sistema de manipulação de amostra, em que o sistema de manipulação de amostra é configurado para transferir uma porção da amostra clínica a partir da unidade de recolha de amostra para cada uma das primeira unidade de ensaio, a segunda unidade de doseamento , e a terceira unidade de ensaio, e o dispositivo é configurado para realizar um imunoensaio,
um ensaio de ácido nucleico, e um ensaio de química geral compreendendo um cromógeno.
[00336] Estes sistemas poderão servir de ponto de sistemas de serviço (POS). Estes sistemas podem ser contidas dentro de um alojamento, um sistema localizado numa localização de POS pode ser configurado para uso na análise de uma amostra no local de POS. Estes sistemas podem ser sistemas de POS configurado para executar uma pluralidade de ensaio s numa única amostra de pequeno volume ou em alíquotas da mesma.
EXEMPLO 1 Testes para e desertar de Ácido Nucleico de marcadores de doença e agentes causadores de doenças
[00337] agentes causadores de doenças, tais como vírus, bactérias, leveduras, fungos e outros micro-organismos identificar ácidos nucleicos e proteínas, entre outras a identificação características que podem servir como marcadores. Marcadores indicativos de uma doença ou de um agente causador de doença, tais como uma doença respiratória, ou uma forma de gripe, ou uma doença sexualmente transmissível, ou outra doença, os marcadores de ácidos nucleicos.
[00338] Conforme mostrado nas figuras, marcadores para muitas doenças podem ser testados para, e podem ser detectadas, usando ensaios de ácidos nucleicos, tal como aqui divulgado. Todos os agentes causadores de doenças testadas quanto nos testes mostrados na Fig. 1A foram detectados no prazo de 40 minutos, com a maioria dos agentes detectado dentro de cerca de 30 minutos. tempos de detecção de números de cópias de 100 cópias por microlitro (c / uL) foram menores do que para números de cópias inferiores (10 c / u, L). O tempo de detecção para as amostras com 100 cópias por μΕ são mostrados na Figura IB; mais estavam perto ou inferior a 20 minutos, com diversos tempos de detecção de cerca de 15 minutos ou menos.
[00339] A Fig. 1A proporciona um resumo gráfico das durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra por uma variedade de marcadores e para duas gamas de concentrações diferentes dos marcadores (10 e / μί e 100 c / μl, onde "c μΓ significa cópias por microlitro (μl,)). os 10 resultados c / μl são mostrados à esquerda, das 100 c / resultados μl para cada tipo de doença (influenza (gripe), respiratório, e doenças sexualmente transmitidas (DST)) mostrados na figui'e. os tempos são rotulados "LOD" ( "comprimento de atraso"). o eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU), em milhares .
[00340] A Fig. IB fornece um gráfico de barras que mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção da presença de um ácido nucleico alvo numa amostra para os marcadores indicados para diversas doenças (a 100 ° C / id).
[00341] Mais informação relacionada com o tempo de detecção para várias doenças, agrupadas por localização geral da infecção, ou o tipo de doença, ou amostras, através da qual podem ser detectadas as doenças são apresentados nas Figs. 1C através de IF (todos a 100 c / u!). FIG. 1 C mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até a detecção de várias estirpes de gripe e metas de identificação. FIG. ID mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção de várias doenças respiratórias. Fig, o IE mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até a detecção de várias doenças sexualmente transmissíveis. Fig, SE mostra as durações de tempo desde o início do ensaio de ácido nucleico até que a detecção de várias doenças que podem ser detectadas no sangue,
[00342] Informações complementares está apresentado na Tabela 2A indica os números de cópias por μl que são detectáveis com estes ensaios para várias doenças.
TABELA 2A 1 Trypanosoma cruzi <0,01 c / u 2 Plasmodium <0,1 / uL 3 Bordetella pertussis <4 c / uL 4 Influenza B <10 C / uL 5 gripe H3N2 <10 C / uL 6 Influenza H 1N1 sazonal <10 C / uL 7 Influenza H 1 N1 romance <10 C / uL 8 H7N9 f u -! HA gene de <10 C / uL 9 H7N9 flu - NA gene < 10 c/uL 10 RNaseP Humano <10 C / uL L StrepA <10 C / uL 12 Staph, aureus <10 c / uL 13 MRSA <10 C / uL 14 Adenovírus B <10 C / uL Adenovírus 15 C <10 C / uL 16 Adenovírus E <10 C / uL 17 Klebsiella pneumoniae KPC <10 C / uL
18 Bocavirus tipo 2, 4 <10 c / uL Coronavirus 19 229E <10 C / uL 20 coronavírus NL63 <10 C / uL 21 Streptococcus pneumoniae <10 C / uL Bordetella parapertussis 22 <10 c / uL 23 Haemophilus parainfluenzae <10 C / uL 24 Enterobacter aerogenes <10 c / i.
25! Oraxei um catarrhaiis <10 C / ul 26 StrepB <10 C / uL 27 HSV <10 C / uL 28 Treponema pallidum <10 C / uL 29 Hepatite B - Ensaio # 1 <10 c / uL 30-HIV 1 do grupo M ■ Ensaio # 1 <10 C / uL 31 HIV-1 grupo M - Ensaio # 2 <10 c / uL 32 HIV-2 GroupA <10 C / uL 33 Dengue vírus tipo 1 <10 c / uL 34 Dengue Vírus tipo 2 <10 c / uL 35 Dengue vírus tipo 3 <10 c / uL 36 Dengue vírus tipo 4 <10 c / uL
37 Vírus de Epstein-Barr <10 C / uL 38 Influenza A <100 c / uL 39 H5N1 <100 c / UL 40 MTB < 100 c/uL 41 Bocavirus tipo 1, 3 <100 c / uL 42 Klebsiella pneumoniae PHOE <100 c / uL 43 Coronavirus HKU 1 <100 c / uL 44 Coronavirus MERS <100 c / uL 45 Coronavirus OC43 <100 c / uL 46 Parainfluenza vírus 1 <100 c / uL 47 Parainfluenza vírus 2 <100 c / uL 48 Parainfluenza Vírus 3 <100 c / uL 49 Metapneumo Vírus (MPVh) Al <100 c / UL 50 Haemophilus influenzae <100 c / uL SI HepDelta- Ensaio # 1 <100 c / UL 52 HepDeita- Ensaio # 2 <100 c / uL 53 HIV-2 GroupB <100 c / uL 54 WNV-2 <100 c / uL
[00343] nas tabelas acima e noutros locais deste documento, "NA" indica neuraminidase; "HA" indica hemaglutinina; "Klebsiella pneumonia
KPC" indica Klebsiella pneumonia carbapenemase; o "Phoe" de "Klebsiella pneumonia Phoe" indica porina transporte de fosfato; "MRS A" indica-resistente Methicilim Staphylococcus aureus; "Vírus Metapneumo (hMPV)" indica humano Metapneumo Vints; "HepDelia" indica Hepatite Delta; "WNV" indica vírus do Nilo Ocidental; "Pan Tnf A" e "Pan nf B" indicam ensaios genéricos para todas as cepas da gripe indicado; e "HAT" indica infecção hospitalar adquirida.
[00344] O tempo de detecção médio para estes 54 doenças (a 100 c / μl ou menos) foi inferior a 2,3 minutos (média de 22,77 minutos). Um subconjunto menor de 35 doenças medida a 10 C / μl ou menos tinha um tempo médio de detecção inferior a 30 minutos (1 minuto 29,1 média). Estes ensaios, incluindo ensaios para estas doenças, são adequados para a validação para utilização em laboratórios clínicos Laboratories Melhoria Act (CL1A). Por exemplo, esses ensaios para várias formas de influenza (gripe A, pandemia de gripe B, h1n 1 -Novel, H1N1 sazonal e influenza F13N2) foram realizados através da CLIA Validação.
1003453 Estes resultados foram obtidos por meio de ensaios de ácidos nucleicos, como descrito abaixo e na Patente US Aplicação 61 / 800.606, depositado em 15 de Março de 201 3. Por exemplo, os seguintes resultados de testes para demonstrar, e a detecção de, marcadores de ácido nucleico indicativos de uma variedade de doenças infecciosas em um curto período de tempo. Como WN Sho nas figuras, muitos marcadores podem ser testados para, e podem ser detectados. A Figura 2 mostra os resultados para a detecção de marcadores para influenza A (sazonal h1n 1 estirpe). A Figura 3 mostra os resultados para a detecção de marcadores de vírus influenza A (H1N1 estirpe romance). A Figura 4 mostra os resultados para a detecção de marcadores para influenza A (estirpe H3N2). A Figura 5 mostra os resultados para a detecção de marcadores de vírus influenza A (H7N9 estirpe). A Figura 6 mostra os resultados para a detecção de marcadores para influenza A (estirpe H5N1). A Figura 7 mostra os resultados para a detecção de marcadores para influenza B. A Figura 8 mostra os resultados para a detecção de marcadores para a proteína matriz de influenza, a Figura 9 mostra os resultados para os marcadores para a tuberculose (MY C obacterium tuberculose). A Figura 10 mostra resultados para marcadores de Staphylococcus (Staphylococcus aureus). A Figura 1 1 mostra os resultados para os marcadores para meticilina-resistente Staphylococcus aureus (MRSA). A Figura 12 mostra resultados para marcadores para streptocccus (Streptococcus do grupo A). A Figura 13 mostra resultados para marcadores para Bordeiella pertussis. A Figura 14 mostra os resultados para os marcadores de adenovírus B. A Figura 15 mostra os resultados para os marcadores de adenovírus C, A Figura 16 mostra resultados para marcadores para adenovims E. A Figura 17 mostra resultados para marcadores para Herpes Simplex Vims (HSV). A Figura 18 mostra resuits para marcadores para Treponema pallidum.
[00346] As amostras obtidas de indivíduos, incluindo pequenas amostras de indivíduos, pode ser testada para outras doenças, além das doenças indicadas nas figuras e na Tabela 2A. Por exemplo, algumas outras doenças que podem ser testados por estes métodos são apresentados na Tabela 2B. A coluna "Painel" indica o tipo da doença (onde FIAT indica Hospital adquiriram a infecção, e DST indica doença sexualmente transmissível).
TABELA 2B Ensaio Pane #: Ator Adneto é um Bonbnni 2 Bordetel!a parapertussis Respiratory página ICG
[00347] Os sistemas, métodos e dispositivos aqui descritos podem ser usados para testar, e a detecção, a presença dos marcadores indicativos de um ou mais dos agentes infecciosos listados acima; tais testes, e tal que detecta, pode ser realizado numa única amostra clínica, ou numa pluralidade de alíquotas de uma única amostra clínica. Tal uma única amostra clínica, pode ser uma única amostra clínica de pequeno volume. Este tipo de teste, e de detecção, pode ser realizada num local de captura; os sistemas, dispositivos e métodos podem ser sistemas de POS, dispositivos e métodos. Por exemplo, a amostra clínica podem ser recolhidos no local de POS, e podem ser analisadas em um dispositivo no local de POS. Tal como mostrado nos resultados ilustrados nas figuras, a análise da amostra clínica de volume pequena pode ser completada num curto período de tempo.
[003483 Assim, o seguinte são alguns dos agentes causadores de doenças pode ser testado para, e podem ser detectadas, de acordo com os métodos de, e por os sistemas e dispositivos, como aqui divulgado.
[00349] QUADRO 3 Agentes e proteína Marcadores Mesmos influenza A Matrix-causar doença influenza H3N2 Influenza H 1N1 sazonal nova gripe H 1IM1 Influenza B Streptococcus pyogenes (A) Mycobacterium tuberculosis Staphylococcus aureus (MR) Staphylococcus aureus (RS) Borciete !! a pertussis (tosse convulsa) Streptococcus agalactiae (B)
influenza H5IM1 influenza H7N9 adenovírus B adenovírus C adenovírus E
Hepatite B
Hepatite C da hepatite delta
Treponema pallidum
HSV-1, HSV-2
HIV-1
HIV-2
RNaseP Humano (amostra de controlo prep)
Dengue 1
Dengue 2
Dengue 3
Dengue 4
Malária
Vírus do Nilo Ocidental
Trypanosoma cruzi (Chagas)
Klebsiella pneumoniae (Enterobacteriaceae spp)
Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)
Vírus de Epstein Barr (mono)
rinovírus vírus parainfluenza (1)
vírus Parainfluenza (2)
vírus Parainfluenza (3)
vírus Parainfluenza (4a)
vírus parainfluenza (4-B)
O vírus sincicial respiratório (RSV) A
O vírus sincicial respiratório (RSV) B
Coronavirus 229E
Coronavirus HKU 1 coronavirus OC43 coronavírus NL63
Novel Coronavirus bocavirus metapneumovírus humano (H MPV)
Trichomonas (vagina)
[00350] A doença agentes listados na Tabela 3 -causing pode ser testado para, e podem ser detectados, através dos métodos e utilizando os sistemas e dispositivos aqui descritos. Por exemplo, marcadores para os agentes causadores de doenças listadas na Tabela 3 podem ser testados para, e podem ser detectados, através dos métodos e utilizando os sistemas e dispositivos aqui descritos. Esses marcadores podem incluir, por exemplo, marcadores de ácidos nucleicos. N disso, esses marcadores podem incluir marcadores de sacarídeos, ou outros marcadores, tal como, por exemplo, marcadores de proteína. Os métodos de teste para, e de detecção, os marcadores de proteínas são discutidas no exemplo a seguir.
exemplo 2 Detecção de vírus da gripe de 2 Ε de Sasnpie Preparado
[00351] A detecção de ácido nucleico a partir de 2} iL de amostra tomada a partir de células de cultura infectadas com o vírus da gripe sazonal (H1N1) é mostrado nas Figuras 19A (amostra) e 19B (ControIe). O ácido nucleico obtido a partir de culturas de células foi preparado utilizando o módulo separador magnético Chemagic I com 24 adaptadores DWP XL e reagentes fro a Chemagic viral de ADN / ARN Kit (CMC- No. 1089; CMC- No. 1082 é semelhante) a partir de Chemagen (PerkinElmer chemagen Technologic Gmbh, Baesweller, Alemanha)). Este método usa a separação de esférulas magnéticas para isolar o ARN. e DN A a partir de uma amostra. Os reagentes e materiais descartáveis Chemagen foram usadas na preparação das amostras.
[00352] H1N1 da gripe RA foi obtido a partir de células MDCK infectadas cultivadas. Resumidamente, as amostras de cultura de células foram preparados dispensando aproximadamente 1 mL da solução-amostra para um tampão de lise contendo, bem reagente polyfA ARN), e soluções de proteinase K, com mistura suave. Os poços foram cobertos e aquecida a 55 ° C durante dez minutos. Após este 10 minutos de incubação, tampão de ligação foi adicionada aos poços contendo a solução de amostra lisadas. Esta solução mista foi então processado pelos módulo de separador magnético T. Os ácidos nucleicos Chemagic foram libertados por vórtice (rotação de sondas) no tampão e, em seguida, ligada às pérolas magnéticas, que foram imobilizados por um íman durante as etapas de lavagem. Os ácidos nucleicos libertados na amostra ligada às pérolas e foram mantidos durante as etapas de lavagem; seguindo os passos de lavagem, os ácidos nucleicos foram eluídas em tampão de eluição (10 mM de TR1S-HC1, pH 8,0).
[00353] Seguindo esta preparação da amostra, a amostra preparada foi colocada num recipiente mantido num cartucho, e o cartucho foi carregado num dispositivo de análise automática de amostras (tais cartuchos, dispositivos, e as suas utilizações encontram-se descritos, por exemplo, na Patente US 8.088.593; Patente dos EUA 8.380.541; Pedido de Patente US série N ° 13 / 769.798, apresentado em 18 de fevereiro, 2013; Pedido de Patente US série N ° 13 / 769.779, apresentado em 18 de fevereiro, 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de série 13 / 769.820, apresentado fevereiro 18, de 2013; PCT / US2012 / 57155, depositado em 25 de setembro de 2012; Pedido de
Patente US 13 / 244.949, apresentado em 26 de setembro de 201 1; Candidatura US N ° de série 61 / 800,606, arquivado 15 de março de 2013; Aplicação US nº de série 61 / 766.095, depositado em 18 de fevereiro de 2013; e Pedido US N ° de série 61 / 673,245, depositado em 1 meu 8, 2012; Pedido de Patente US 61 /
805.923, depositado em 27 de março de 2013, aqui incorporada por referência na sua totalidade).
[00354] A 2 IIL alíquota da solução da amostra preparada foi colocada num vaso contendo 20, II, L de MasterMix (contammg tampão, betaína, dNTP, para a frente (RLX1222) e inverso sondas (RLX1223), Syto 59 de corante vermelho), e misturou-se com 3 Ε da preparação de enzima (contendo polimerase de ADN de B. stearothermophilus (Bst), Avian mieloblastose Virus Transcriptase reversa (AmvRT), tampão NEB4 (New England BioLabs Cat. No. B7004S), e água) em um vaso de reação no dispositivo de análise de amostra automática. Os iniciadores específicos para o vírus da gripe H1N1 foram incluídos na mistura no vaso de reação. A combinação de amostra, MasterMix, a preparação do modelo, e a enzima foi incubada a 56 ° C no vaso de reação de acordo com os métodos discutidos acima, e a fluorescência foi medida a cada minuto durante 30 minutos (fluorescência foi de 59 SYTO corante). A fluorescência foi lida como a fluorescência relativa.
[00355] A Fig. 19A mostra a amplificação ao longo do tempo, o aumento da fluorescência relativa a cerca de 15 a 20 minutos indicando a presença de um marcador sazonal da gripe H1N1. O eixo horizontal é em "minutos, o eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência rel operatória (unidades de fluorescência relativa, RFU).
[00356] A Fig. 19B mostra a amplificação de "nenhum controle modelo" (não cópias acrescentado do marcador-alvo; TC). Note-se que a maioria das experiências mostraram nenhuma amplificação; as três corridas que mostram aumentos final em fluorescência relativa fê-lo em cerca de 25 minutos ou mais tarde. O eixo horizontal é em "minutos, o eixo vertical é mostrada em unidades de fluorescência relativa (unidades de fluorescência relativa, RFU).
[00357] Os resultados das Figuras 19A e 19B mostram que o ácido nucleico virai pode ser detectada a partir de amostras de pequeno volume (por exemplo, 2, μΙ_ de amostra) dentro de um curto período de tempo (por exemplo, cerca de 15 a 20 minutos ou menos).
exemplo 3 Detecção de proteínas do vírus da gripe por ELISA
[00358] A detecção de proteínas indicativas de infecção por influenza A e proteínas indicativas de infecção por influenza B foi realizada utilizando dispositivos e sistemas como descrito, por exemplo, na Patente US
8.088.593; Patente US 8.380.541; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,798, arquivado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,779, arquivado 18 de fevereiro de 2013; Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Série 13 / 769,820, arquivado 18 de fevereiro de 2013; PCT / US2012 / 57155, apresentado a 25 de setembro de 2012; Pedido de Patente US 13 / 244.949, depositado 26 de setembro, 201 1; US Aplicação Serial No. 61 / 800.606, depositado 15 de março de 2013; US Aplicação Serial No. 61 / 766.095, depositado 18 de fevereiro de 2013: e Aplicação US Serial No. 61 / 673.245, depositado 26 de setembro, 201 1; Pedido de Patente US 61 / 805.923, depositado 27 de março de 2013 (referências que foram listados anteriormente e incorporados por referência na sua totalidade no texto acima). A menos que indicado de outra forma a seguir (por exemplo, no que diz respeito aos resultados obtidos com os sistemas comerciais para comparação) tais dispositivos e sistemas foram utilizados para obter os dados apresentados a seguir.
[00359] Ensaio Concepção e Finalidade: Os ensaios para Influenza A e Influenza B foram concebidos para proporcionar detecção qualitativa de antígenos nucleoproteína influenza A ou influenza B em uma amostra obtida com um swab nasal. Estes ensaios são úteis no diagnóstico de infecções virais de gripe A ou infecções virais da gripe B, em um sujeito, de que se obteve a amostra. O ensaio foi um ensaio em sanduíche, em que anti-influenza A ou B Os anticorpos foram imobilizados sobre um substrato (o interior de um translucem ou pipeta de ponta transparem), e a amostra, fosfatase alcalina (ALP) - anticorpo anti-conjugado de Influenza A ou B, e o substrato de ALP adicionada para produzir luminescência Chemi proporcional à quantidade de Influenza antígeno na amostra. Os resultados do ensaio foram comparadas com as de um teste comercial (Remel X / pecto influenza A e B; Remel produtos, Lenexa, KS, EUA, uma divisão da Thermo Fisher Scientific, Inc.).
[00360] Materiais e Métodos: O interior de uma ponteira de polímero personalizado serviu como superfície para este ensaio ELISA sanduíche. As pontas das pipetas foram tipicamente feita a partir de poliestireno ou de polipropileno, embora outros polímeros ou materiais plásticos, também são adequados. Os interiores de pontas para pipetas foram revestidas com avidina. A superfície de captura para o sanduíche de ELISA foi preparada revestindo marcado com biotina anti-gripe A, ou anticorpo marcado com biotina anticorpo anti-vírus da influenza B sobre as superfícies interiores revestidas com avidina das pipetas.
[00361] anticorpos de captura e detecção foram obtidos a partir dos Estados Unidos Corporação Biológica (Salem, MA, U SA) ou Souihe nBioiech (SouthemBiotechnology Associates, Inc., Birmingham, AL, EUA); anticorpos de captura foram conjugados com biotina, utilizando um kit de marcação de biotina e anticorpos de detecção foram conjugadas com ALP usando um kit de marcação de ALP, tanto a partir de Dojindo Molecular Technologies, Inc. (Rockviile, MD, EUA). Os tampões foram obtidos a partir de Sigma Aldrich Corporation (St. Louis, MO, EUA).
[00362] As amostras foram obtidas a partir das passagens nasais de indivíduos usando swab nasal. esfregaços nasais que contenham material de amostra foram então sujeitas a um processo de extracção. ALP-anticorpos marcados anti-influenza A ou B anticorpos anti-gripe ALP-marcadas foram então misturados com o material da amostra extraída. Esta mistura foi, em seguida, incubadas com a superfície de captura durante 5 minutos. Após a incubação, a superfície da captura foi lavada e o substrato de ALP foi incubada na superfície durante 5 minutos; a intensidade de quimioluminiscência resultante foi, em seguida, ler, com os resultados apresentados em unidades relativas de luz (RLU).
[00363] tampões: solução salina tamponada com Tris consistiu em NaCl 138 mM, KCl 2,7 mM e 0,05 M de tris (hidroximetil) aminometano (TRIS), pH 8.
[00364] O tampão de extracção foi de 0,5% de Tween 20, 0,1% de azida de sódio em tampão fosfato de sódio 20 mM (pH 7,6).
[00365] O tampão de bloqueio foi de 3% de BSA tampão de bloqueio, que consiste de solução salina tamponada com Tris, 3% de BSA, 0,05% NaNs, a pH 8.
[00366] A fosfatase alcalina (AP) estabilizador foi preparada por adição de 0. IMM cloreto de zinco e cloreto de magnésio 5 mM ao tampão de bloqueio BSA a 3%,
[00367] O tampão de lavagem foi TRJS-solução salina tamponada, Tween 20 0,05%, 0,05% de NaNj, a pH 8.
[003683 influenza A e influenza B Anticorpo tela várias permutações de pares de anticorpos influenza A ou B da gripe, que consiste em anticorpos emparelhados captura (CABs) e anticorpos de detecção (DABS), foram testadas em placas de microtítulo, a fim de identificar os melhores pares - performing . Um volume de 50 μί da amostra foi adicionado a 400 μl de extracção tampão para estas experiências. As condições incluído 5 ug / ml de táxi e 100 iig / ' mL (concentração final) de DAB em tampão de bloqueio. Os controlos positivos e negativos foram de kits obtidos a partir de qualquer Microbix Biosystems, Inc.
(Mississauga, Ontário, Ca ADA) ou o Virusys Corporation (Taneytown, MD, LISA). Os melhores pares das experiências de rastreio de placas de microtítulo foram então avaliadas sobre as ETM e dispositivos s aqui revelados, tal como discutido nos parágrafos seguintes.
[00369] Captura Titulação da superfície A superfície de captura r w como titulada com as seguintes concentrações: 10 g mL, 5 mL g, e I u / ηι1. Controles do kit Virusys e kit Microbix foram utilizados para esta seleção. O controle de fundo foi um tampão de bloqueio em branco sem amostra adicionada. O dAb foi mantida a uma concentração de 100 ng / ml (concentração final em tampão de bloqueio). A concentração CAB óptima foi determinada para ser de 5 ug / ml para influenza A e influenza B.
[00370] fosfatase alcalina Estabilizador: Dois estabilizadores de fosfatase alcalina foram testados para uso como diluentes DAB. Nestas experiências, 50 μl da amostra foi adicionado a 500 μl de tampão de extracção. A concentração de táxi foi de 5 μ / ηιΐ enquanto a concentração DAB foi mantida a 100 ng / ml (concentração final após a execução do protocolo). Tanto a solução AP costume estabilizador (ingredientes punhos acima) e o comercial Stabilzyme ®estabilizador conjugado AP (SurModics, Inc., Eden Prairie, M, EUA) funcionou bem. O estabilizador costume AP foi usada em experiências subsequentes.
[00371] Detection Antibody Titulação: Os Dabs AP-conjugados foram titulados na solução estabilizador AP. O melhor modulação entre os controlos positivos e negativos foram observadas em 50 ml de concentração final ng. Os controlos positivos influenza A foram obtidos a partir de Microbix Biosystems, Inc. e ZeptoMetrix Corporation (Buffalo, NY, EUA), e o controlos positivos influenza B foram obtidos a partir de Microbix Biosystems, Inc. e Virusys Corporation.
[00372] Testes de especificidade - Influenza A: estudos de especificidade e reactividade cruzada foram realizados em tampão de extração usando os dispositivos e sistemas de processamento e da análise da amostra tal como aqui divulgado. Controles para teste para o potencial de cross-reac! Anis foram obtidos a partir de Microbix Biosystems, Inc. Os potenciais cruzadas reagentes testados foram Vírus Sincicial Respiratório, Mycoplasma pneumonia, adenovírus, parainfluenza A- III, Parainfluenza A-II e Parainfluenza A - I. concentração de táxi foi de 5 ^ ig / Rnl enquanto a concentração de DAB foi de 100 Nextel (concentração final, após execução do protocolo) ng /. Nenhuma reactividade cruzada foi detectada nestas experiências. Diferentes estirpes de influenza A e influenza B foram também testados para determinar a Gripe A especificidade no ensaio. Ambos os controlos Zeptometrix e Microbix (que são pré-diluídos controlos) foram usadas para este fim de que não. controle cotonetes Influenza positiva a A partir do kit Remei Xpect Flu também foram utilizados. Um volume de amostra de 200 μί foi misturado com 200 μl de tampão de extracção e testados para estas amostras pré-diluído. Cotonetes foram processados 400 μl de tampão de extracção para estas experiências. Em IHE seguinte ables f, unidade de luz (RLU) medidas relativas foram feitas em triplicado; "CV%" é calculado dividindo o desvio padrão de três medições pela média das três medições e multiplicando por 100.
Tabela 4: Testes de especificidade - Influenza A
Microbix Parainfluenza A -1 2108 20,3 Microbix NEG CTL Influenza A / B Negativo 2072 28,0 Zeptometrix-! Influência B Estirpe Lee / 40 16,6 2,042 Zeptometrix-! Influência B Strain Florida / 02/2006 2806 16,4 LNF Zeptometrix-! uenza 3 Strain Brisbane / 33/2008 2849 15,7 Zeptometrix-! Influência B Coe Panama / 45/90 2536 26,9
[00373] Testes de especificidade - Influenza B: Especificidade e atravessar estudos VITY Reacti foram realizadas em tampão de extração usando os dispositivos e sistemas de processamento e da análise da amostra tal como aqui divulgado. concentração de táxi foi de 5 μ§ τη1 enquanto a concentração de DAB foi de 100 ng / ml (concentração final, após execução do protocolo). Nenhuma reactividade cruzada foi detectada nestas experiências.
Tabela S: testes de especificidade - influenza B
[00374] A avaliação clínica do vírus influenza A de ensaio: O desempenho do ensaio de Influenza A, utilizando os dispositivos e sistemas tal como aqui descritos de processamento e da análise da amostra foi comparada com os resultados obtidos com o kit Remel FDA. CAB concentração foi de 5 ug / ^ ml enquanto a concentração de DAB foi mantida a 50 ng / ml (concentração final, após o protocolo foi RAN). Para o Instituto Nacional de Padrões Biológicos e Controle estirpes de influenza (NIBSC, Hertfordshire, Reino Unido), 50 μl de amostra foi adicionada à compressa, e a mecha foi então tratada como uma haste de amostra. Para os controlos do painel Zeptometrix (amostras pré-diluído), 200 μl de amostra foi misturada com 200 μl de tampão de extracção. Esfregaços das amostras foram colocadas em 500 μl de tampão de extracção e incubou-se durante 3-5 minutos. Esta amostra extraída foi, em seguida, analisada utilizando os dispositivos e sistemas tal como aqui divulgado. Cotonetes e as amostras foram processadas no kit Remei FDA como indicado nas instruções do kit.
[00375] Nas tabelas seguintes, o "índice de anticorpo" (Índice Ab) foi usada para determinar se ou não alvo antígenos da gripe foram detectados numa amostra.O Índice Ab foi calculada pela di v Iding o RLU média do valor de corte (calculada a partir das amostras normais). O valor de corte foi definido igual à média (normais), mais 4,5 x desvio-padrão (normais). Um Índice Ab de menos do que um indica que uma amostra foi uma amostra (Ive negat: não-alvo antígenos da gripe foram detectar na amostra ed) normal; um Índice Ab superior a um indica que uma amostra foi uma amostra positiva (positivo: antígenos da gripe alvo foram detectadas na amostra). A coluna designada "Remel FDA" apresenta os resultados do kit Remel FDA sobre as amostras indicadas como positiva (+): gripe A detectado, negativo ( ■ ): mfluenza A não detectado, ou "NT": não testado.
Tabela 6: Avaliação Clínica - Influenza A 9 0,05-14 0,29-19 0,95 - REMEL FDA Swab 2,66 + gripe Zeptometrix CTLS um POS 1,27 Zeptometrix Influenza A Brisbane/10/07 2.58 +
Zeptometrix influenza A Ilhas Salomão / 03/2006 3,25 + Zeptometrix influenza A New Caledonia / 20/99 2,57 + Zeptometrix inf! uenza A Brisbane / 59/07 5,16 + N! BSC NORMAS Panamá 45/90 0,06 NT FLU B cepas de influenza Antigen B-Joanesburgo 0,06 NT influenza Antigen B-Guangdong 0,08 NT influenza Antigen B Yamanashi / 166/98, 0,11 NT Influenza Antigen B / Malaysia / 2506/2004 0,02 NT influenza Antigen B / Harbin / 7/94 0,06 NT B: / Florida 4/2006 0,04 NT M! BSC NORMAS influenza Antigen A / California / 7/2009-H 1 1 6,88 NT GRIPE A cepas de influenza Antigen A / Hong Kong / 1073/99 (H9N2) 8,56 NT influenza Antigen A / Cam bod ia / RO405050 / 2007 (H5N1) 6.02
NT Influenza Antigen A / pato / Inglaterra / 727/2006 (H2N3) 5,70 NT influenza Antigen A / New York / 107/2003 (H 7N2) {N! BRG-109) 7,26 NT influenza Antigen A / New York / 55/2004 ( H3N2) (NYMC X-157) 6,54 NT
[00376] Os resultados destas experiências de avaliação clínica Influenza A mostraram que todas as amostras com gripe A antígenos testado positivo para Influenza A, enquanto as amostras normais e amostras com antígenos da gripe B não teste positivo para Influenza A; Estes resultados estão de acordo com os resultados obtidos com o kit Remei FDA.
[00377] A avaliação clínica do ensaio de Influenza B: O desempenho do ensaio de Influenza B, utilizando os dispositivos e sistemas tal como aqui descritos de processamento e de análise da amostra foi comparado com o kit Remel FDA. concentração de táxi foi de 5 ^ ig / ml, enquanto DAB concentração foi mantida a 50 ng ml (concentração final, após o protocolo foi executado). Para as estirpes de influenza NIBSC, 50 μl de amostra foi adicionada à compressa, e a mecha foi então tratada como uma haste de amostra. Para os controlos do painel Zeptometrix (amostras pré-diluído), 200 μl de amostra foi misturada com 200 μl de tampão de extracção. Cotonetes foram colocados em 500 μl de tampão de extracção e incubou-se durante 3-5 minutos. Esta amostra extraída foi, em seguida, analisada utilizando os dispositivos e sistemas tal como aqui divulgado. Cotonetes e as amostras foram processadas no kit Remei FDA como indicado nas instruções do kit. Como discutido acima, o valor de corte foi definido como igual à média (normais) mais 4,5 x desvio padrão (normais), e o Índice Ab foi calculada dividindo a média RLU por o valor de corte. A coluna designada "Remel FDA" apresenta os resultados do kit Remel FDA sobre as amostras indicadas como positiva {+): influenza B detectada, ou negativo (-): gripe B não detectado.
Tabela 7: Avaliação Clínica - Influenza B
[00378] Os resultados destas experiências de avaliação clínica influenza B mostrou que todas as amostras com antígenos da gripe B testado positivo para influenza B, whiie amostras normais e amostras com antígenos da gripe A não teste positivo para influenza B; Estes resultados estão de acordo com os resultados obtidos com o kit Remei FDA.
exemplo 4
[00379] Outros exemplos de marcadores indicativos de doenças infecciosas que podem ser detectados, identificados, e analisadas através de métodos, sistemas e dispositivos aqui descritos estão apresentados nas Figs. 22-
32. Por exemplo, a Fig. 22 listas mais marcadores para doenças que são nomeados na figura, e que são agrupados como, por exemplo, doenças nosocomiais (listados sob o título "Painel nosocomial (HAI)"); doenças respiratórias (listados sob o título "Painel respiratório"); , doenças (listados sob o título "Painel de DST (cotonetes lesão)" e "STD Panel (sangue)", onde as expressões entre parênteses "cotonetes lesão" e "sangue" indicam a origem eo método de obtenção da amostra) sexualmente transmissível doenças infecciosas (listados sob o título "Doença Infecciosa Painel"); doenças gastrointestinais (listados sob o título "Painel Gastrointestinal"); e doenças do trato urinário (listados sob o título "Painel de infecção do trato urinário"). FIG. 2.2 também lista os controles e ensaios adicionais, como indicado pelas etiquetas "Controles" e "Ensaios adicionais".
[00380] A Fig. 23A mostra um painel de gripe nomear vários tipos de influenza que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos. Esta figura refere-se a deteciion de vários tipos de influenza pelos métodos de detecção de ácidos nucleicos aqui discutidas. Neste, e figuras seguintes, e noutras partes do aplicativo, "LOD" indica "limite de detecção". Os tipos de influenza podem ser detectados em níveis indicados na figura; Por exemplo, a influenza A pode ser detectado pelos métodos, dispositivos e sistemas aqui revelado, quando presentes em uma amostra a menos de 100 cópias por microlitro (c / ^ L, em que as cópias refere-se a cópias da sequência de ácido nucleico alvo indicativos da gripe A) . Tal como indicado na Fig. 23 A, outros tipos de influenza, tais como a gripe B e da gripe H1N1 (sazonal) podem ser detectados em níveis de menos de 10 cópias por microlitro.
[00381] A Fig. 2.3B mostra os tempos de inflexão para vários tipos de influenza que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos.influenza ácidos nucleicos alvo indicativa dos tipos de influenza nomeados foram testados a 100 cópias por microlitro, e o tempo (desde o inicio do ensaio de detecção de ácido nucleico) em minutos, até que a detecção é exibida (conforme detectado pela inflexão da saída RFU como mostrado, por exemplo, nas figuras anteriores).
[00382] A Fig. 24A mostra vários painéis de doença respiratória de nomenclatura tipos de doenças respiratórias, que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos. O limite de ção detec (LOD) é indicado para cada uma das doenças respiratórias na coluna mais à direita da figura: LODs eram ou 10 cópias por microlitro (c / uL) ou 100 C / ul.
[00.383] Fig, 24B mostra os tempos de inflexão para os tipos de doença do trato respiratório superior e inferior, que podem ser identificadas pelos métodos e dispositivos aqui discutidos. Doença alvo respiratória ácidos nucleicos indicativos das doenças respiratórias nomeados foram testados a 100 cópias por microlitro, e o tempo (desde o inicio do ensaio de detecção de ácido nucleico) em minutos, até que a detecção é exibida (conforme detectado pela inflexão da saída RFU como mostrado , por exemplo, nas figuras anteriores).
[00384] A Fig. 25A mostra vários adquirida no hospital doenças infecciosas (indicado pela sigla "HAT") de nomenclatura doenças que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos. O limite de detecção (LOD) está indicada para cada doença HAI na coluna mais à direita da figura; todos foram LODs 10 cópias por microlitro (C / uL).
[00385] A Fig. 25B mostra os tempos de inflexão para vários painéis adquirida no hospital de doenças infecciosas de nomenclatura tipos de doenças respiratórias, que podem ser identificados pelos métodos e dispositivos aqui discutidos. Os ácidos nucleicos alvo indicativos das doenças HAI nomeados foram testados a 100 cópias por microlitro, e o tempo (desde o inicio do ensaio de detecção de ácido nucleico) em minutos, até que a detecção é exibida (conforme detectado pela inflexão da saída R.FU).
[00386] A Fig. 26 mostra resultados de um ensaio de ácido nucleico como aqui descrito (ver também as descrições desses métodos, por exemplo, nos pedidos de patente US 61 / 800,606; 61 / 908,027; 62,001, 050, e 14 / 214,850) para influenza A proteína matriz que é concebido para ser incluído em todos os subtipos de Influenza a. Os resultados são específicos. Note-se que os tempos de inflexão para o "molde" nenhum controlo (CT), bem como para os objectivos de influenza B foram significativamente maiores do que (e facilmente distinguível de) os tempos de inflexão para os objectivos da gripe A.
[Θ0387] A Fig. 27 mostra que os ensaios de ácidos nucleicos aqui descritas (ver também as descrições desses métodos, por exemplo, nos Pedidos de Patente US 61 / 800,606; 61/908027; 62001050; e 14 / 2.14,850) são específicos para o tipo de gripe H2N2 alvo. Os resultados são específicos. Note- se que os tempos de inflexão para o H3N2 influenza A tem como alvo A / Aichi / 2/68, A / Victoria / 3/75, e L881 foram significativamente mais curto do que (e facilmente distinguível) os tempos de inflexão para os gripes não-H3N2.
[00388] A Fig. 28 mostra que os ensaios de ácidos nucleicos como aqui descrito (ver também as descrições desses métodos, por exemplo, nos Pedidos de Patente US 61 / 800,606; 61/908027; 62001050; e 14 / 214.850) são específicos para o tipo gripe sazonal H1N1 alvo. Note-se que os tempos de inflexão para os destinos de influenza A ΗΓΝ1 (sazonal) foram significativamente mais curtos do que (e facilmente distinguíveis) a inflexão vezes para as outras gripes e para o controlo sem modelo (NTC).
[00389] A Fig, 29 mostra potenciais substâncias interferentes para os ensaios de ácidos nucleicos, tal como aplicados para o painel de doenças sexualmente transmissíveis (DST), e concentrações que essas substâncias interferentes foram testados para a interferência com os ensaios. Nenhuma das concentrações indicadas de substâncias potencialmente interferentes, interferido com os ensaios de ácidos nucleicos.
[00390] A Fig. 30 mostra potenciais substâncias interferentes para os ensaios de ácidos nucleicos, tal como aplicados para o painel de urina doenças sexualmente transmissíveis (DST), e concentrações que essas substâncias interferentes foram testados para a interferência com os ensaios. Nenhuma das concentrações indicadas de substâncias potencialmente interferentes, interferido com os ensaios de ácidos nucleicos.
[00391] A Fig. 31 mostra potenciais substâncias interferentes para os ensaios de ácidos nucleicos, tal como aplicados para o painel de sangue, e que estas concentrações de substâncias interferentes foram testados para a interferência com os ensaios. Nenhuma das concentrações indicadas de substâncias potencialmente interferentes, interferido com os ensaios de ácidos nucleicos.
[00392] Enquanto a descrição acima é uma descrição completa da forma de realização preferida, tal como aqui descrito, é possível utilizar diversas alternativas, modificações e equivalentes. Por conseguinte, o âmbito do presente invento deve ser determinado não com referência à descrição anterior mas deverá, em vez disso, ser determinado com referência às reivindicações anexas, juntamente com o âmbito total de equivalentes. Qualquer característica, se preferido ou não, pode ser combinada com qualquer outra característica, se preferido ou não. As reivindicações anexas não devem ser interpretadas como incluindo meios limitações -plus-funções, a menos que tal limitação é explicitamente recitado em uma determinada reivindicação usando a frase "meios para." Deve ser entendido que, como utilizado na descrição e em todas as reivindicações que se seguem, o significado de "um", "uma," e "o" incluem referência plural a menos que o contexto dite claramente o contrário. Além disso, tal como utilizado na presente descrição e em todas as reivindicações que se seguem, o significado de "em" inclui "no" e "ligado", a menos que o contexto dite claramente o contrário. Finalmente, tal como se utiliza na presente descrição e em todas as reivindicações que se seguem, os significados de "e" e "ou" incluem tanto a conjuntiva e disjuntiva e podem ser utilizados indiferentemente a menos que o contexto indique expressamente o contrário. Assim, em contextos onde os termos "e" ou "ou" são utilizados, o uso de tais conjunções não excluem um significado "e / ou" a menos que o contexto indique expressamente o contrário.
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