PTPRJ

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
PTPRJ
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи PTPRJ, CD148, DEP1, HPTPeta, R-PTP-ETA, SCC1, protein tyrosine phosphatase, receptor type J, protein tyrosine phosphatase receptor type J, R-PTP-J, HPTP eta
Зовнішні ІД OMIM: 600925 MGI: 104574 HomoloGene: 2130 GeneCards: PTPRJ
Пов'язані генетичні захворювання
lymphoblastic leukemia[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001098503
NM_002843
NM_001135657
NM_008982
RefSeq (білок)
NP_001091973
NP_002834
NP_001129129
NP_033008
Локус (UCSC) Хр. 11: 47.98 – 48.17 Mb Хр. 2: 90.26 – 90.41 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRJ (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 337 амінокислот, а молекулярна маса — 145 941[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKPAAREARLPPRSPGLRWALPLLLLLLRLGQILCAGGTPSPIPDPSVAT
VATGENGITQISSTAESFHKQNGTGTPQVETNTSEDGESSGANDSLRTPE
QGSNGTDGASQKTPSSTGPSPVFDIKAVSISPTNVILTWKSNDTAASEYK
YVVKHKMENEKTITVVHQPWCNITGLRPATSYVFSITPGIGNETWGDPRV
IKVITEPIPVSDLRVALTGVRKAALSWSNGNGTASCRVLLESIGSHEELT
QDSRLQVNISGLKPGVQYNINPYLLQSNKTKGDPLGTEGGLDASNTERSR
AGSPTAPVHDESLVGPVDPSSGQQSRDTEVLLVGLEPGTRYNATVYSQAA
NGTEGQPQAIEFRTNAIQVFDVTAVNISATSLTLIWKVSDNESSSNYTYK
IHVAGETDSSNLNVSEPRAVIPGLRSSTFYNITVCPVLGDIEGTPGFLQV
HTPPVPVSDFRVTVVSTTEIGLAWSSHDAESFQMHITQEGAGNSRVEITT
NQSIIIGGLFPGTKYCFEIVPKGPNGTEGASRTVCNRTVPSAVFDIHVVY
VTTTEMWLDWKSPDGASEYVYHLVIESKHGSNHTSTYDKAITLQGLIPGT
LYNITISPEVDHVWGDPNSTAQYTRPSNVSNIDVSTNTTAATLSWQNFDD
ASPTYSYCLLIEKAGNSSNATQVVTDIGITDATVTELIPGSSYTVEIFAQ
VGDGIKSLEPGRKSFCTDPASMASFDCEVVPKEPALVLKWTCPPGANAGF
ELEVSSGAWNNATHLESCSSENGTEYRTEVTYLNFSTSYNISITTVSCGK
MAAPTRNTCTTGITDPPPPDGSPNITSVSHNSVKVKFSGFEASHGPIKAY
AVILTTGEAGHPSADVLKYTYEDFKKGASDTYVTYLIRTEEKGRSQSLSE
VLKYEIDVGNESTTLGYYNGKLEPLGSYRACVAGFTNITFHPQNKGLIDG
AESYVSFSRYSDAVSLPQDPGVICGAVFGCIFGALVIVTVGGFIFWRKKR
KDAKNNEVSFSQIKPKKSKLIRVENFEAYFKKQQADSNCGFAEEYEDLKL
VGISQPKYAAELAENRGKNRYNNVLPYDISRVKLSVQTHSTDDYINANYM
PGYHSKKDFIATQGPLPNTLKDFWRMVWEKNVYAIIMLTKCVEQGRTKCE
EYWPSKQAQDYGDITVAMTSEIVLPEWTIRDFTVKNIQTSESHPLRQFHF
TSWPDHGVPDTTDLLINFRYLVRDYMKQSPPESPILVHCSAGVGRTGTFI
AIDRLIYQIENENTVDVYGIVYDLRMHRPLMVQTEDQYVFLNQCVLDIVR
SQKDSKVDLIYQNTTAMTIYENLAPVTTFGKTNGYIA

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

[ред. | ред. код]
  • Oestman A., Yang Q., Tonks N.K. (1994). Expression of DEP-1, a receptor-like protein-tyrosine-phosphatase, is enhanced with increasing cell density. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 9680—9684. PMID 7937872 DOI:10.1073/pnas.91.21.9680
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Baker J.E., Majeti R., Tangye S.G., Weiss A. (2001). Protein tyrosine phosphatase CD148-mediated inhibition of T-cell receptor signal transduction is associated with reduced LAT and phospholipase Cgamma1 phosphorylation. Mol. Cell. Biol. 21: 2393—2403. PMID 11259588 DOI:10.1128/MCB.21.7.2393-2403.2001
  • Persson C., Engstrom U., Mowbray S.L., Ostman A. (2002). Primary sequence determinants responsible for site-selective dephosphorylation of the PDGF beta-receptor by the receptor-like protein tyrosine phosphatase DEP-1. FEBS Lett. 517: 27—31. PMID 12062403 DOI:10.1016/S0014-5793(02)02570-X
  • Holsinger L.J., Ward K., Duffield B., Zachwieja J., Jallal B. (2002). The transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase DEP1 interacts with p120(ctn). Oncogene. 21: 7067—7076. PMID 12370829 DOI:10.1038/sj.onc.1205858
  • Palka H.L., Park M., Tonks N.K. (2003). Hepatocyte growth factor receptor tyrosine kinase met is a substrate of the receptor protein-tyrosine phosphatase DEP-1. J. Biol. Chem. 278: 5728—5735. PMID 12475979 DOI:10.1074/jbc.M210656200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з PTPRJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9673 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, Q12913 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]