MSR1

MSR1
Ідентифікатори
Символи	MSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, macrophage scavenger receptor 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII
Зовнішні ІД	OMIM: 153622 MGI: 98257 HomoloGene: 12822 GeneCards: MSR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scavenger receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • low-density lipoprotein particle binding; • amyloid-beta binding; • cargo receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • колаген; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • low-density lipoprotein particle; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle;
Біологічний процес	• cholesterol transport; • plasma lipoprotein particle clearance; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • ендоцитоз; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • lipoprotein transport; • positive regulation of cholesterol storage; • phagocytosis, engulfment; • negative regulation of gene expression; • amyloid-beta clearance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4481
	20288
	ENSG00000038945
	ENSMUSG00000025044
	P21757
	P30204
	NM_138716; NM_002445; NM_138715; NM_001363744
	NM_001113326; NM_031195
	NP_002436; NP_619729; NP_619730; NP_001350673
	NP_001106797; NP_112472
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MSR1 (англ. Macrophage scavenger receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 49 762^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQWDHFHNQ	QEDTDSCSES	VKFDARSMTA	LLPPNPKNSP	SLQEKLKSFK
AALIALYLLV	FAVLIPLIGI	VAAQLLKWET	KNCSVSSTNA	NDITQSLTGK
GNDSEEEMRF	QEVFMEHMSN	MEKRIQHILD	MEANLMDTEH	FQNFSMTTDQ
RFNDILLQLS	TLFSSVQGHG	NAIDEISKSL	ISLNTTLLDL	QLNIENLNGK
IQENTFKQQE	EISKLEERVY	NVSAEIMAMK	EEQVHLEQEI	KGEVKVLNNI
TNDLRLKDWE	HSQTLRNITL	IQGPPGPPGE	KGDRGPTGES	GPRGFPGPIG
PPGLKGDRGA	IGFPGSRGLP	GYAGRPGNSG	PKGQKGEKGS	GNTLTPFTKV
RLVGGSGPHE	GRVEILHSGQ	WGTICDDRWE	VRVGQVVCRS	LGYPGVQAVH
KAAHFGQGTG	PIWLNEVFCF	GRESSIEECK	IRQWGTRACS	HSEDAGVTCT
L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Resnick D., Chatterton J.E., Schwartz K., Slayter H., Krieger M. (1996). Structures of class A macrophage scavenger receptors. Electron microscopic study of flexible, multidomain, fibrous proteins and determination of the disulfide bond pattern of the scavenger receptor cysteine-rich domain. J. Biol. Chem. 271: 26924—26930. PMID 8900177 DOI:10.1074/jbc.271.43.26924
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Gough P.J., Greaves D.R., Gordon S. (1998). A naturally occurring isoform of the human macrophage scavenger receptor (SR-A) gene generated by alternative splicing blocks modified LDL uptake. J. Lipid Res. 39: 531—543. PMID 9548586

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7376 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P21757 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7376 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P21757 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

MSR1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук