ITGA5

ITGA5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3VI3, 3VI4, 4WJK, 4WK0, 4WK2, 4WK4
Ідентифікатори
Символи	ITGA5, CD49e, FNRA, VLA5A, VLA-5, integrin subunit alpha 5
Зовнішні ІД	OMIM: 135620 MGI: 96604 HomoloGene: 20508 GeneCards: ITGA5
Онтологія гена Молекулярна функція • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding • virus receptor activity • epidermal growth factor receptor binding • зв'язування з іоном металу • platelet-derived growth factor receptor binding • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cell adhesion molecule binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • alphav-beta3 integrin-vitronectin complex • мембрана • cell-cell junction • ruffle • клітинна мембрана • синапс • ruffle membrane • cell surface • integrin complex • ендоплазматичний ретикулум • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • external side of plasma membrane • focal adhesion • міжклітинні контакти Біологічний процес • leukocyte cell-cell adhesion • positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • endodermal cell differentiation • positive regulation of cell migration • heterotypic cell-cell adhesion • wound healing, spreading of epidermal cells • extracellular matrix organization • пам'ять • cell-cell adhesion mediated by integrin • positive regulation of sprouting angiogenesis • cell-substrate adhesion • адгезія клітин • Ангіогенез • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • cell-substrate junction assembly • integrin-mediated signaling pathway • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • negative regulation of anoikis • leukocyte migration • positive regulation of cell-substrate adhesion • regulation of angiogenesis • cell adhesion mediated by integrin • жіноча вагітність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3678	16402
Ensembl	ENSG00000161638	ENSMUSG00000000555
UniProt	P08648	P11688
RefSeq (мРНК)	NM_002205	NM_010577 NM_001314041
RefSeq (білок)	NP_002196	NP_001300970 NP_034707
Локус (UCSC)	Хр. 12: 54.4 – 54.42 Mb	Хр. 15: 103.25 – 103.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITGA5 (англ. Integrin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 049 амінокислот, а молекулярна маса — 114 536.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSRTPESPL		HAVQLRWGPR		RRPPLLPLLL		LLLPPPPRVG		GFNLDAEAPA
VLSGPPGSFF		GFSVEFYRPG		TDGVSVLVGA		PKANTSQPGV		LQGGAVYLCP
WGASPTQCTP		IEFDSKGSRL		LESSLSSSEG		EEPVEYKSLQ		WFGATVRAHG
SSILACAPLY		SWRTEKEPLS		DPVGTCYLST		DNFTRILEYA		PCRSDFSWAA
GQGYCQGGFS		AEFTKTGRVV		LGGPGSYFWQ		GQILSATQEQ		IAESYYPEYL
INLVQGQLQT		RQASSIYDDS		YLGYSVAVGE		FSGDDTEDFV		AGVPKGNLTY
GYVTILNGSD		IRSLYNFSGE		QMASYFGYAV		AATDVNGDGL		DDLLVGAPLL
MDRTPDGRPQ		EVGRVYVYLQ		HPAGIEPTPT		LTLTGHDEFG		RFGSSLTPLG
DLDQDGYNDV		AIGAPFGGET		QQGVVFVFPG		GPGGLGSKPS		QVLQPLWAAS
HTPDFFGSAL		RGGRDLDGNG		YPDLIVGSFG		VDKAVVYRGR		PIVSASASLT
IFPAMFNPEE		RSCSLEGNPV		ACINLSFCLN		ASGKHVADSI		GFTVELQLDW
QKQKGGVRRA		LFLASRQATL		TQTLLIQNGA		REDCREMKIY		LRNESEFRDK
LSPIHIALNF		SLDPQAPVDS		HGLRPALHYQ		SKSRIEDKAQ		ILLDCGEDNI
CVPDLQLEVF		GEQNHVYLGD		KNALNLTFHA		QNVGEGGAYE		AELRVTAPPE
AEYSGLVRHP		GNFSSLSCDY		FAVNQSRLLV		CDLGNPMKAG		ASLWGGLRFT
VPHLRDTKKT		IQFDFQILSK		NLNNSQSDVV		SFRLSVEAQA		QVTLNGVSKP
EAVLFPVSDW		HPRDQPQKEE		DLGPAVHHVY		ELINQGPSSI		SQGVLELSCP
QALEGQQLLY		VTRVTGLNCT		TNHPINPKGL		ELDPEGSLHH		QQKREAPSRS
SASSGPQILK		CPEAECFRLR		CELGPLHQQE		SQSLQLHFRV		WAKTFLQREH
QPFSLQCEAV		YKALKMPYRI		LPRQLPQKER		QVATAVQWTK		AEGSYGVPLW
IIILAILFGL		LLLGLLIYIL		YKLGFFKRSL		PYGTAMEKAQ		LKPPATSDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
• Sano H., Liu S.C.H., Lane W.S., Piletz J.E., Lienhard G.E. (2002). Insulin receptor substrate 4 associates with the protein IRAS. J. Biol. Chem. 277: 19439—19447. PMID 11912194 DOI:10.1074/jbc.M111838200
• Weigel-Kelley K.A., Yoder M.C., Srivastava A. (2003). Alpha5beta1 integrin as a cellular coreceptor for human parvovirus B19: requirement of functional activation of beta1 integrin for viral entry. Blood. 102: 3927—3933. PMID 12907437 DOI:10.1182/blood-2003-05-1522
• Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
• Paule S., Aljofan M., Simon C., Rombauts L.J., Nie G. (2012). Cleavage of endometrial alpha-integrins into their functional forms is mediated by proprotein convertase 5/6. Hum. Reprod. 27: 2766—2774. PMID 22740495 DOI:10.1093/humrep/des203

Див. також

• Хромосома 12