TW202409087A - 抗ror1抗體 - Google Patents
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Abstract
本發明涉及識別ROR1的抗體及其抗原結合片段。在一些實施方案中,這些抗體提供治療ROR1陽性癌症的方法。在一些實施方案中,這些抗體用於診斷ROR1陽性癌症或對該ROR1陽性癌症進行成像。
Description
本發明涉及結合ROR1的抗體及其抗原結合片段及其用途。
類受體酪胺酸激酶的孤兒受體1(receptor tyrosine kinase-like orphan receptors;ROR1)在胚胎及嬰兒發育期間高度表現,並且該表現水平在兒童及成人中顯著降低。ROR1的表現在多種血液癌症及實質固態瘤中顯著增加。高度表現ROR1的血液癌症包括例如B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(acute myeloid leukemia;AML)、勃氏淋巴瘤(Burlitt’s lymphoma)、被套細胞淋巴瘤(mantle cell lymphoma;MCL)、急性淋巴細胞白血病(acute lymphocytic leukemia;ALL)、慢性淋巴細胞白血病(chronic lymphocytic leukemia;ALL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma;DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(follicullar lymphoma;FL)及邊緣區淋巴瘤(marginal zone lymphoma;MZL)。在實質固態瘤中,表現ROR1的癌症類型包括例如乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer;NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌、腎上腺癌及許多其他癌症。因此,ROR1已成為新的腫瘤特異性標靶。許多資料顯示ROR1在促進腫瘤生長及轉移、誘導耐藥性及抑制凋亡中起重要作用。
目前關於ROR1訊號轉導的共識是ROR1可透過介導非典型wnt路徑的訊號傳遞(尤其是wnt5a)而在多種生理過程中起重要作用,這些生理過程包括調節細胞分裂、增殖、遷移及細胞趨化性。Wnt5a是Wnt訊號路徑的典型非典型活化劑,並且參與NF-κB次單元p65的磷酸化、活化腫瘤細胞中的NF-κB路徑、促進細胞遷移及侵襲、EMT(上皮細胞間質轉化(epithelial-mesenchymal transition;EMT))、癌症轉移等。Wnt5a/ROR1在許多癌症中高度表現。ROR1作為Wnt5a的受體參與腫瘤細胞NF-κB通道的活化。
ROR1被認為是潛在的標靶,因為它是具有耐藥性的酪胺酸激酶受體;並且它在細胞表面表現。更重要的是,它在腫瘤細胞中高度表現,但在健康成人組織中的表現非常低。
缺乏與ROR1具有高親和力、不與ROR2交叉反應並具有良好結合能力及內化活性的抗體,尤其是完全人抗體。
本發明提供了結合ROR1的新型抗體或其抗原結合片段,該新型抗體可以是僅重鏈抗體(HCAb)的形式。
在一個方面,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),並且其中該VH包含具有序列識別號:147-202中任一項所示胺基酸序列的VH的HCDR(重鏈互補決定區)1-3。
在一些實施方案中,該VH包含具有如下所示胺基酸序列的HCDR 1-3:
分別為序列識別號: 11、40、100,
分別為序列識別號: 12、41、101,
分別為序列識別號: 12、42、102,
分別為序列識別號: 12、40、103,
分別為序列識別號: 12、43、104,
分別為序列識別號: 13、44、105,
分別為序列識別號: 12、40、106,
分別為序列識別號: 12、45、107,
分別為序列識別號: 12、40、108,
分別為序列識別號: 14、46、109,
分別為序列識別號: 12、47、110,
分別為序列識別號: 12、48、111,
分別為序列識別號: 12、45、112,
分別為序列識別號: 15、49、113,
分別為序列識別號: 16、50、114,
分別為序列識別號: 12、51、115,
分別為序列識別號: 18、56、126,
分別為序列識別號: 21、40、130,
分別為序列識別號: 22、60、131,
分別為序列識別號: 12、40、132,
分別為序列識別號: 23、61、133,
分別為序列識別號: 19、57、127,
分別為序列識別號: 20、58、128,
分別為序列識別號: 14、59、129,
分別為序列識別號: 17、53、119,
分別為序列識別號: 17、53、116,
分別為序列識別號: 17、53、120,
分別為序列識別號: 17、53、121,
分別為序列識別號: 17、53、122,
分別為序列識別號: 17、53、123,
分別為序列識別號: 17、53、124,
分別為序列識別號: 17、53、125,
分別為序列識別號: 17、52、116,
分別為序列識別號: 17、53、117,
分別為序列識別號: 17、52、117,
分別為序列識別號: 17、40、116,
分別為序列識別號: 17、53、118,
分別為序列識別號: 17、54、116,
分別為序列識別號: 17、55、116,
分別為序列識別號: 17、54、117,
分別為序列識別號: 17、40、117,
分別為序列識別號: 17、55、117,
分別為序列識別號: 17、54、118,
分別為序列識別號: 17、40、118,
分別為序列識別號: 17、55、118,
分別為序列識別號: 17、55、103,
分別為序列識別號: 12、55、117,或者
分別為序列識別號: 12、55、118。
在一些實施方案中,VH包含與序列識別號: 147-202中任一項具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列。
在一些實施方案中,抗體包含Fc區。
在一些實施方案中,抗體包含重鏈(HC),並且其中該HC包含與序列識別號: 205-260中任一項具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列。
在一些實施方案中,抗體不包含輕鏈。
在一些實施方案中,抗體包含兩條重鏈。
在一些實施方案中,抗體是嵌合抗體、人源化抗體或人抗體。
在一些實施方案中,抗體是選自IgG、IgA、IgM、IgE及IgD的同種型。
在一些實施方案中,抗體是選自IgG1、IgG2、IgG3及IgG4的亞型。
在一些實施方案中,抗原結合片段選自HCAb、VHH、奈米抗體、Fab、Fab'、F(ab')
2、Fd、Fd'及dAb。
在一些實施方案中,抗體是單株抗體、雙特異性抗體或多特異性抗體。
在一些實施方案中,抗體是單價的、二價的或多價的。
在一些實施方案中,抗體或抗原結合片段連接到螢光標記、放射性標記或細胞毒性劑。
在另一個方面,本發明提供了一種雙特異性抗體,該雙特異性抗體包含本發明的抗體或其抗原結合片段以及特異性結合腫瘤相關抗原或免疫細胞抗原的第二抗原結合區;較佳地,該第二抗原結合區特異性結合CD3。
在又一個方面,本發明提供了一種核酸,該核酸包含編碼本發明的抗體或其抗原結合片段或本發明的雙特異性抗體的核苷酸序列。
在又一個方面,本發明提供了一種載體,該載體包含本發明的核酸。
在另一個方面,本發明提供了一種宿主細胞,該宿主細胞包含本發明的核酸或本發明的載體。
在另一個方面,本發明提供了一種抗體-藥物共軛物(antibody drug conjugate;ADC),該抗體-藥物共軛物包含本發明的抗體或其抗原結合片段或本發明的雙特異性抗體。
在又一個方面,本發明提供了一種藥物組合物,該藥物組合物包含:(i)本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的雙特異性抗體、本發明的核酸、本發明的載體、本發明的宿主細胞或本發明的抗體-藥物共軛物;及(ii)藥學上可接受的載體或賦形劑。
在一些實施方案中,該組合物還包含選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物的第二治療劑。
在另一個方面,本發明提供了一種治療受試者的癌症的方法,該方法包括向受試者施用有效量的本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的雙特異性抗體、本發明的核酸、本發明的載體、本發明的宿主細胞、本發明的抗體-藥物共軛物或本發明的藥物組合物。
在一些實施方案中,該癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
在一些實施方案中,該方法還包括向受試者施用第二治療劑。
在一些實施方案中,該第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
在另一個方面,本發明提供了本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的雙特異性抗體、本發明的核酸、本發明的載體、本發明的宿主細胞、本發明的抗體-藥物共軛物或本發明的藥物組合物在製備用於治療受試者的癌症的藥物中的用途。
在一些實施方案中,該癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
在一些實施方案中,該藥物還包含第二治療劑,較佳地,該第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
在一些實施方案中,該藥物與第二治療劑組合施用,較佳地,該第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
在另一個方面,本發明提供了本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的雙特異性抗體、本發明的核酸、本發明的載體、本發明的宿主細胞、本發明的抗體-藥物共軛物或本發明的藥物組合物用於治療受試者的癌症的用途。
在一些實施方案中,該癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段、本發明的雙特異性抗體、本發明的核酸、本發明的載體、本發明的宿主細胞、本發明的抗體-藥物共軛物或本發明的藥物組合物與第二治療劑組合施用,較佳地,該第二治療劑選自抗體、化療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
在另一個方面,本發明提供了一種診斷受試者ROR1陽性癌症的方法,該方法包括:
(a) 從該受試者獲得生物樣本,
(b) 使該樣本與本發明的抗體或其抗原結合片段接觸;以及
(c) 檢測該抗體與該樣本的結合,
其中相比於該抗體或其抗原結合片段與對照樣本的結合,該抗體或其抗原結合片段與該樣本的結合增加,鑑定出該受試者患有ROR1陽性癌症。
在另一個方面,本發明提供了一種用於對受試者的ROR1陽性癌症進行成像的方法,該方法包括:
(a) 向該受試者施用本發明的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體共軛到可檢測標記物;以及
(b) 檢測該標記物的存在。
在一些實施方案中,可檢測標記物是
111In,並且較佳地,該標記物的檢測是透過單光子發射電腦斷層掃描進行的。在一些實施方案中,可檢測標記物是
89Zr,並且較佳地,該標記物的檢測透過正電子發射斷層掃描進行。
序列表
本發明的抗ROR1 HCAb抗體的重鏈、重鏈可變區、重鏈的CDR的序列示於下表1至表3中。參考抗體PR000374的輕鏈、重鏈、輕鏈可變區、重鏈可變區、輕鏈及重鏈的CDR的序列示於下表4中。
表1. HCAb抗體的重鏈的序列
殖株 | 重鏈 | SEQ ID NO |
PR005337 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFIFSDYYMSWIRQAPGKGLEWVSYISSSGSTIHYADSVKGRFTVSRDNAKNSLYLQMNSLRTEDTAVYYCARDPPTSNSDWVSLHFDHWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK | 205 |
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PR007424 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSSEPKSSDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK | 237 |
表2. HCAb抗體的重鏈可變區的序列
殖株 | 重鏈可變區 | SEQ ID NO |
PR005337 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFIFSDYYMSWIRQAPGKGLEWVSYISSSGSTIHYADSVKGRFTVSRDNAKNSLYLQMNSLRTEDTAVYYCARDPPTSNSDWVSLHFDHWGQGTLVTVSS | 147 |
PR005338 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGTTIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRTEDTAVYYCARDAPSSNSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 148 |
PR005339 | EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGVEWISYISNNGSTIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDFNNGWYEDFDYWGQGTLVTVSS | 149 |
PR005340 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSTIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 150 |
PR005341 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCVASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSSIYYAESVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNRLRAEDTALYYCARTPPSSDNWYEDFDYWGQGALVTVSS | 151 |
PR005342 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFNFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISNSSSTIYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMSRLRAEDTAMYYCARDTTNGWYEDFDYWGQGTLVTVSS | 152 |
PR005343 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCVASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGMEWISYISSSGSTKNYANSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAAYYCARVPPYNASWYEDFDYWGQGTLVTVSS | 153 |
PR005344 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISNSSSSISYANSVKGRFTVSRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCARSPRGAFYEDFDYWGQGTLVTVSS | 154 |
PR005345 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWIAYISSSGSTIHYSDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDTPSSSSDWVSLQFDYWGQGTPVTVSS | 155 |
PR005346 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTLSDYYMSWIRQAPGKGLEWVSNISKNGFTIYYAESVKGRFTVSRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDSSGWYSEFDYWGQGTLVTVSS | 156 |
PR005347 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCVTSGFTFSDYYMSWIRQAPGKGMEWISYISTTGSTKNYANSVKGRFTISRDNAKSSLYLQMNSLRAEDTAAYYCARVPPSNASWYEDFDYWGQGTLVTVSS | 157 |
PR005348 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQTPGKGLEWVSYISRSGSTKYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDAPSSNSDWVSLHFDHWGQGTLVTVSS | 158 |
PR005349 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISNSSSSISYANSVKGRFTVSRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCARSPRSAFYEDFDYWGQGTLVTVSS | 159 |
PR005350 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTLSDSQMSWIRQAPGKGVEWVSYISSSGNTIYYGDSVKGRFTISRDNAKNSLFLQMNSLRAEDTAVYYCARVPPSSSNWYEDFDIWGQGTLVTVSS | 160 |
PR005351 | QVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFKLSDFQMSWIRQAPGKGLEWVAYIDTNGSTRYYAESVKGRFTLSRDNVKNSLNLQMNGLRAEDTALYYCARIPSYTSSWYEDFDHWGQGTLVTVSS | 161 |
PR005352 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGGSIYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNRLRAEDTALYYCARTPPSSNNWYEDFDYWGQGALVTVSS | 162 |
PR303125 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGDSTHYAASVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCETLLRFLESLGNDGFKIWGQGTMVTVSS | 195 |
PR303189 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFNLSDSYMSWIRQAPGKGLEWVSCISSSGSTIYYADSVKGRFTVSRDNAKNSLYLQMNHLRAEDTALYYCARDCVIGIRDDSDIWGQGTMVTVSS | 199 |
PR303191 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFIFGSYAMSWVRQAPGKGLEWVSGISGTGGNTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYFCERGITIHGVVIIPPDYRGQGTLVTVSS | 200 |
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PR009816 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYSASVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSIDWVELQFDYWGQGTLVTVSS | 186 |
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PR009821 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYSSSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSEDWVMLQFDYWGQGTLVTVSS | 191 |
PR009822 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYATSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSIDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 192 |
PR009823 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYASSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 193 |
PR009824 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYSTSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSIDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 194 |
PR007408 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSYIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 163 |
PR007409 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 164 |
PR007410 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSYIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 165 |
PR007411 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSTIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 166 |
PR007412 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSWIHYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 167 |
PR007413 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYINTRGSPIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 168 |
PR007414 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSTRYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 169 |
PR007415 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 170 |
PR007416 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYINTRGSPIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 171 |
PR007417 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSTRYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 172 |
PR007418 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 173 |
PR007419 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYINTRGSPIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 174 |
PR007420 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYISSSGSTRYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 175 |
PR007421 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 176 |
PR007422 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDFYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 177 |
PR007423 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDIPSSSSDWVDLQFDYWGQGTLVTVSS | 178 |
PR007424 | EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSDYYMSWIRQAPGKGLEWISYIDSSGRPLAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAIYYCARDMPSSSSDWVSLQFDYWGQGTLVTVSS | 179 |
表3. HCAb抗體的重鏈CDR 1-3的序列(Chothia編號系統)
殖株 | 重鏈CDR1 | SEQ ID NO | 重鏈CDR2 | SEQ ID NO | 重鏈CDR3 | SEQ ID NO |
PR005337 | GFIFSDY | 11 | SSSGST | 40 | DPPTSNSDWVSLHFDH | 100 |
PR005338 | GFTFSDY | 12 | SSSGTT | 41 | DAPSSNSDWVSLQFDY | 101 |
PR005339 | GFTFSDY | 12 | SNNGST | 42 | DFNNGWYEDFDY | 102 |
PR005340 | GFTFSDY | 12 | SSSGST | 40 | DIPSSSSDWVSLQFDY | 103 |
PR005341 | GFTFSDY | 12 | SSSGSS | 43 | TPPSSDNWYEDFDY | 104 |
PR005342 | GFNFSDY | 13 | SNSSST | 44 | DTTNGWYEDFDY | 105 |
PR005343 | GFTFSDY | 12 | SSSGST | 40 | VPPYNASWYEDFDY | 106 |
PR005344 | GFTFSDY | 12 | SNSSSS | 45 | SPRGAFYEDFDY | 107 |
PR005345 | GFTFSDY | 12 | SSSGST | 40 | DTPSSSSDWVSLQFDY | 108 |
PR005346 | GFTLSDY | 14 | SKNGFT | 46 | DSSGWYSEFDY | 109 |
PR005347 | GFTFSDY | 12 | STTGST | 47 | VPPSNASWYEDFDY | 110 |
PR005348 | GFTFSDY | 12 | SRSGST | 48 | DAPSSNSDWVSLHFDH | 111 |
PR005349 | GFTFSDY | 12 | SNSSSS | 45 | SPRSAFYEDFDY | 112 |
PR005350 | GFTLSDS | 15 | SSSGNT | 49 | VPPSSSNWYEDFDI | 113 |
PR005351 | GFKLSDF | 16 | DTNGST | 50 | IPSYTSSWYEDFDH | 114 |
PR005352 | GFTFSDY | 12 | SSSGGS | 51 | TPPSSNNWYEDFDY | 115 |
PR303125 | GFTFSSH | 18 | SGSGDS | 56 | LLRFLESLGNDGFKI | 126 |
PR303189 | GFNLSDS | 21 | SSSGST | 40 | DCVIGIRDDSDI | 130 |
PR303191 | GFIFGSY | 22 | SGTGGN | 60 | GITIHGVVIIPPDY | 131 |
PR303199 | GFTFSDY | 12 | SSSGST | 40 | EYYGSENYDHFDY | 132 |
PR303201 | GFTFSGN | 23 | SGSGDK | 61 | GAFRTTMDY | 133 |
PR303145 | GFTFSNY | 19 | SGSGRT | 57 | DLSSGWYEDFDY | 127 |
PR303147 | GFTFSNF | 20 | NSDGSS | 58 | EGSGWYEDFDY | 128 |
PR303155 | GFTLSDY | 14 | SSNGST | 59 | DVSSGWYEDFDY | 129 |
PR009810 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSEDWVDLQFDY | 119 |
PR009811 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR009812 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSEDWVDLQFDY | 119 |
PR009813 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSIDWVELQFDY | 120 |
PR009814 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSKDWVDLQFDY | 121 |
PR009815 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSIDWVDLQFDY | 122 |
PR009816 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSIDWVELQFDY | 120 |
PR009817 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR009818 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSEDWVELQFDY | 123 |
PR009819 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR009820 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSSDWVELQFDY | 124 |
PR009821 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSEDWVMLQFDY | 125 |
PR009822 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSIDWVDLQFDY | 122 |
PR009823 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR009824 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSIDWVDLQFDY | 122 |
PR007408 | GFTFSDF | 17 | SSSGSY | 52 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR007409 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DIPSSSSDWVDLQFDY | 117 |
PR007410 | GFTFSDF | 17 | SSSGSY | 52 | DIPSSSSDWVDLQFDY | 117 |
PR007411 | GFTFSDF | 17 | SSSGST | 40 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR007412 | GFTFSDF | 17 | SSSGSW | 53 | DMPSSSSDWVSLQFDY | 118 |
PR007413 | GFTFSDF | 17 | NTRGSP | 54 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR007414 | GFTFSDF | 17 | SSSGST | 40 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR007415 | GFTFSDF | 17 | DSSGRP | 55 | DMPSSSSDWVDLQFDY | 116 |
PR007416 | GFTFSDF | 17 | NTRGSP | 54 | DIPSSSSDWVDLQFDY | 117 |
PR007417 | GFTFSDF | 17 | SSSGST | 40 | DIPSSSSDWVDLQFDY | 117 |
PR007418 | GFTFSDF | 17 | DSSGRP | 55 | DIPSSSSDWVDLQFDY | 117 |
PR007419 | GFTFSDF | 17 | NTRGSP | 54 | DMPSSSSDWVSLQFDY | 118 |
PR007420 | GFTFSDF | 17 | SSSGST | 40 | DMPSSSSDWVSLQFDY | 118 |
PR007421 | GFTFSDF | 17 | DSSGRP | 55 | DMPSSSSDWVSLQFDY | 118 |
PR007422 | GFTFSDF | 17 | DSSGRP | 55 | DIPSSSSDWVSLQFDY | 103 |
PR007423 | GFTFSDY | 12 | DSSGRP | 55 | DIPSSSSDWVDLQFDY | 117 |
PR007424 | GFTFSDY | 12 | DSSGRP | 55 | DMPSSSSDWVSLQFDY | 118 |
表4. 參考抗體PR000374的序列
序列 | SEQ ID NO | |
重鏈 | EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASGSDINDYPITWVRQAPGQGLEWIGFINSGGSTWYASWVKGRFTISRDDSKSIAYLQMNSLKTEDTAVYYCARGYSTYYRDFNIWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK | 204 |
重鏈可變區 | EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCTASGSDINDYPITWVRQAPGQGLEWIGFINSGGSTWYASWVKGRFTISRDDSKSIAYLQMNSLKTEDTAVYYCARGYSTYYRDFNIWGQGTLVTVSS | 146 |
HCDR1 | GSDINDY | 10 |
HCDR2 | NSGGS | 39 |
HCDR3 | GYSTYYRDFNI | 99 |
輕 鏈 | DIQMTQSPSSLSASVGDRVTINCQASQSIDSNLAWFQQKPGQPPKLLIYRASNLASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLEAEDVATYYCLGGVGAVSYRTSFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC | 261 |
輕鏈可變區 | DIQMTQSPSSLSASVGDRVTINCQASQSIDSNLAWFQQKPGQPPKLLIYRASNLASGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLEAEDVATYYCLGGVGAVSYRTSFGGGTKVEIK | 203 |
LCDR1 | QASQSIDSNLA | 140 |
LCDR2 | RASNLAS | 142 |
LCDR3 | LGGVGAVSYRTS | 144 |
透過結合附圖對以下實施方案的詳細描述,本發明的上述特徵及優點以及附加特徵及優點將在下文中得到更清楚的理解。
在此參考附圖描述的實施方案是說明性的、例示性的,並且用於一般地理解本發明。這些實施方案不應被解釋為限制本發明的範圍。在整個說明書中,相同或相似的元素以及具有相同或相似功能的元素由相同的附圖標記表示。
除非另有說明或定義,否則所用的所有術語具有它們在本領域中的常規含義,這對於發明所屬技術領域中具有通常知識者來說是清楚的。例如,參考標準手冊,諸如Leuenberger, H.G.W、Nagel, B.及Klbl, H.編撰,“A multilingual glossary of biotechnological terms: (IUPAC Recommendations)”,Helvetica Chimica Acta(1995年),CH-4010 Basel,Switzerland;Sambrook等人,“Molecular Cloning: A Laboratory Manual”(第2版),第1卷至第3卷,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989年);F. Ausubel等人編撰,“Current protocols in molecular biology”,Green Publishing and Wiley InterScience,New York(1987年);Roitt等人,“Immunology”(第6版),Mosby/Elsevier,Edinburgh(2001年);及Janeway等人,“Immunobiology”(第6版),Garland Science Publishing/Churchill Livingstone,New York(2005年),以及上文引用的一般背景技術。
如本文所用,除非上下文另有明確說明,否則單數形式“一個”、“及”以及“該”包括複數指代。因此,例如,提及“一種抗體”包括多種抗體,並且在一些實施方案中提及“一種抗體”包括多種抗體,等等。
除非另有說明或定義,否則術語“包括”及其變型諸如“包含”及“含有”應被理解為暗示包括所述元素或步驟或者元素或步驟的組,但不排除任何其他元素或步驟或者元素或步驟的組。術語“包含”涵蓋“包括”以及“由其組成”,例如,組合物“包含”X,可僅由X組成,或者可包含另外的一些物質,例如X+Y。
與數值x相關的術語“約”是任選的,並且是指例如x
±10%或x±5%。
如本文所用,術語“抗體”是指具有特異性結合特定抗原的能力的免疫球蛋白分子。抗體通常包含可變區及恆定區。抗體的恆定區可介導免疫球蛋白與宿主組織或因子的結合,該宿主組織或因子包括免疫系統的各種細胞(諸如效應細胞)及補體系統的組分,諸如補體活化的典型路徑中的第一組分CIq。
“重鏈可變區”(VH)由被三個“互補決定區”或“CDR”中斷的“框架”區組成。框架區用於比對CDR,以特異性結合抗原的表位。CDR包含抗體的胺基酸殘基,這些胺基酸殘基主要負責抗原結合。VH結構域從胺基末端到羧基末端包含以下框架區(FR)及CDR區:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及FR4。
VH結構域的胺基酸分配與CDR的任何習知定義一致。習知定義包括Kabat定義(Kabat,Sequences of Proteins of Immunological Interest(National Institutes of Health,Bethesda,MD,1987年及1991年)、Chothia定義(Chothia及Lesk,J. Mol.Biol.第196卷:第901-917頁,1987年;Chothia等人,Nature,第342卷:第878-883頁,1989年);Chothia Kabat CDR的組合,其中CDR-H1是Chothia及Kabat CDR的組合;牛津分子的抗體建模軟體所使用的AbM定義;以及Martin等人的接觸定義(world wide web bioinfo.org.uk/abs)。Kabat提供了一種廣泛使用的編號慣例(Kabat編號系統),其中不同重鏈之間或不同輕鏈之間的對應殘基被分配相同的編號。儘管本揭露可使用根據這些編號系統中的任一編號系統所定義的CDR,但較佳的實施方案是使用Chothia定義的CDR。
如本文所用,術語“抗體”應以其最廣泛的含義理解,並且包括單株抗體(包括全長單株抗體)、多株抗體、抗體片段及含有至少兩個不同抗原結合區的多特異性抗體(例如,雙特異性抗體)。抗體可含有另外的修飾,諸如非天然存在的胺基酸、Fc區中的突變以及醣基化位點中的突變。抗體還包括轉譯後修飾的抗體、含有抗體的抗原決定位(antigenic determinant)的融合蛋白以及含有對抗原識別位點的任何其他修飾的免疫球蛋白分子,只要這些抗體表現出所需的生物活性。
術語“僅重鏈抗體”、“重鏈抗體”及“HCAb”在本文中可互換使用,並且在廣義上指抗體或抗體的更多或更多部分,例如缺少習知抗體的輕鏈的抗體的一個或多個臂。該術語具體包括但不限於:包含VH抗原結合結構域及CH1、CH2及CH3恆定結構域的同源二聚體抗體;此類抗體的功能性(抗原結合)變體、可溶性VH變體、包含一個可變結構域(V-NAR)及五個C樣恆定結構域(C-NAR)的同源二聚體的Ig-NAR及其功能性片段;及可溶性單域抗體(sUniDabs™)。
在一個實施方案中,僅重鏈抗體由可變區抗原結合結構域組成,該可變區抗原結合結構域由FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及FR4組成。在另一個實施方案中,僅重鏈抗體由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分以及CH1、CH2及CH3結構域組成。在另一個實施方案中,僅重鏈抗體由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分以及CH2及CH3結構域組成。在另一個實施方案中,僅重鏈抗體由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分及CH1結構域組成。在另一個實施方案中,僅重鏈抗體由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分及CH2結構域組成。在另一個實施方案中,僅重鏈抗體由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分及CH3結構域組成。其中CH1及/或CH2及/或CH3結構域被截短的僅重鏈抗體也包括在本文中。在另一個實施方案中,重鏈由抗原結合結構域及至少一個CH(CH1、CH2、CH3或CH4)結構域組成,但沒有鉸鏈區。
僅重鏈抗體可以是二聚體的形式,其中兩條重鏈透過雙硫鍵或以其他方式共價地或非共價地彼此連接。僅重鏈抗體可屬於IgG亞類(subclass),但是屬於其他亞類諸如IgM、IgA、IgD及IgE亞類的抗體,也包括在本文中。在具體實施方案中,重鏈抗體是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亞型(subtype),特別是IgG1或IgG4亞型。
在一個實施方案中,重鏈抗體是IgG1或IgG4亞型,其中一個或多個CH結構域被修飾以改變抗體的效應子功能。本文進一步描述了對改變效應子功能的CH結構域的修飾。
如本文所用,抗體的術語“抗原結合片段”是指抗體的一個或多個片段,其保留特異性結合抗原(例如,ROR1)的能力。研究表明抗體的抗原結合功能可透過全長抗體的片段來實現。
涵蓋在抗體的術語“抗原結合部分”內的抗原結合片段的示例包括(i) Fab片段,即由VL結構域、VH結構域、CL結構域及CH1結構域組成的單價片段;(ii) F(ab')2片段,即包括在鉸鏈區處由雙硫鍵連接的兩個Fab片段的二價片段;(iii) Fab'片段,其本質上是具有鉸鏈區的一部分的Fab(參見FUNDAMENTALIMMUNOLOGY(Paul編撰,補充版本3,1993年);(iv)由VH結構域及CH1結構域組成的Fd片段;(v)具有VH結構域及CH1結構域以及位於CH1結構域的C末端的一個或多個半胱胺酸殘基的Fd'片段;(vi)由抗體單臂的VL結構域及VH結構域組成的Fv片段;(vii) dAb片段(Ward等人(1989年),Nature,第341卷:第544-546頁),其由VH結構域組成;(viii)分離的互補性決定區(CDR);及(ix)奈米抗體,即包含單個可變結構域及兩個恆定結構域的重鏈可變區。此外,儘管Fv片段的兩個結構域(VL及VH)由單獨的基因編碼,但仍可使用重組方法透過合成連接子來連接這些結構域,使得這些結構域能夠被製成單條蛋白質鏈,其中VL區及VH區配對以形成單價分子(稱為單鏈Fv(scFv);參見例如Bird等人(1988年),Science,第242卷:第423-426頁;及Huston等人(1988年),Proc.Natl.Acad.Sci.USA,第85卷:第5879-5883頁)。此類單鏈抗體也旨在被涵蓋在抗體的術語“抗原結合片段”內。此外,該術語還包括“線性抗體”,該線性抗體包含一對串聯Fd區段(VH-CH1-VH-CH1)以及前述片段中的任一片段的修飾形式,這一對串聯Fd區段與互補輕鏈多肽一起形成抗原結合區,這些片段的修飾形式保留抗原結合活性。
這些抗原結合片段可使用發明所屬技術領域中具有通常知識者已知的習知技術獲得,並且以與完整抗體相同的方式來篩選片段的用途。
如本文所用,術語“結合”或“特異性結合”是指兩個分子之間的非隨機結合反應,諸如抗體與其靶抗原之間的非隨機結合反應。抗體的結合特異性可基於親和力及/或親合力來確定。由抗原與抗體解離的平衡常數(KD)表示的親和力是抗原決定位(表位)與抗體上的抗原結合位點之間的結合強度的量度:KD值越小,抗原決定位(表位)與抗體之間的結合強度越強。另選地,親和力還可表示為親和常數(KA),其為1/KD。
親合力是抗體與相關抗原之間的結合強度的量度。親合力與抗原決定位(表位)及其在抗體上的抗原結合位點之間的親和力以及抗體上存在的相關結合位點的數目兩者有關。通常,抗體將以10
-5M至10
-12M或以下,並且較佳10
-7M至10
-12M或以下,並且更佳10
-8M至10
-12M的解離常數(KD),以及/或者以至少10
7M
-1、較佳至少10
8M
-1、更佳至少10
9M
-1(諸如至少10
12M
-1)的結合親和力結合。任何K
D值大於10
-4M通常都被認為是指示非特異性結合。抗體與抗原或抗原決定位的特異性結合可以本身已知的任何合適的方式測定,包括例如Scatchard分析及/或競爭性結合測定,諸如放射免疫測定(radioimmunoassays;RIA)、酶免疫測定(enzyme immunoassays;EIA)、生物膜干涉技術(bio-layer interferometry;BLI)測定及夾心競爭測定(sandwich competition assays),以及本領域本身已知的這些方法的不同變型。
術語“表位”是指抗原上與抗體結合的位點。表位可由連續胺基酸形成,或者透過一個或多個蛋白的三級折疊而並置的非連續胺基酸形成。由連續胺基酸形成的表位(也稱為線性表位)通常在暴露於變性溶劑時保留,而由三級折疊形成的表位(也稱為構象表位)通常在用變性溶劑處理時喪失。表位通常包括至少3個,更通常至少5個或者8至10個呈獨特空間構象的胺基酸。表位限定了抗體的最小結合位點,因此是抗體或其抗原結合片段的特異性標靶。
如本文所用,術語“序列同一性”是指兩個序列(胺基酸)在比對中的相同位置處具有相同殘基的程度。例如,“胺基酸序列與序列識別號: Y具有X%相同”是指該胺基酸序列與序列識別號: Y的%同一性,並且被詳細描述為該胺基酸序列中X%的殘基與序列識別號: Y中公開的序列的殘基相同。通常,採用電腦程式進行此類計算。比較及比對序列對的示例性程式包括ALIGN(Myers及Miller,1988年)、FASTA(Pearson及Lipman,1988年;Pearson,1990年)及gapped BLAST(Altschul等人,1997年)、BLASTP、BLASTN或GCG(Devereux等人,1984年)。
此外,在測定兩個胺基酸序列之間的序列同一性程度時,通常知識者可以考慮所謂的保守胺基酸取代,其通常可被描述為其中胺基酸殘基被具有相似化學結構的另一個胺基酸殘基取代並且對多肽的功能、活性或其他生物學性質具有很少或基本上沒有影響的胺基酸取代。此類保守胺基酸取代是本領域公知的,例如根據WO 04/037999、GB-A-2 357 768、WO 98/49185、WO 00/46383及WO 01/09300;並且(較佳的)類型及/或此類取代的組合可基於WO 04/037999以及WO 98/49185及其中引用的其他參考文獻的相關教導內容來選擇。
此類保守取代較佳的是以下基團(a)至(e)中的一個胺基酸被同一基團中的另一個胺基酸殘基取代的取代:(a)小的脂族、非極性或輕微極性殘基:Ala、Ser、Thr、Pro及Gly;(b)極性、帶負電荷的殘基以及它們的(不帶電荷的)醯胺:Asp、Asn、Glu及Gln;(c)極性、帶正電荷的殘基:His、Arg及Lys;(d)大的脂族、非極性殘基:Met、Leu、He、Val及Cys;及(e)芳族殘基:Phe、Tyr及Trp。
特別較佳的保守取代如下:Ala轉變為Gly或Ser;Arg轉變為Lys;Asn轉變為Gln或His;Asp轉變為Glu;Cys轉變為Ser;Gln轉變為Asn;Glu轉變為Asp;Gly轉變為Ala或Pro;His轉變為Asn或Gln;Ile轉變為Leu或Val;Leu轉變為Ile或Val;Lys轉變為Arg、Gln或Glu;Met轉變為Leu、Tyr或Ile;Phe轉變為Met、Leu或Tyr;Ser轉變為Thr;Thr轉變為Ser;Trp轉變為Tyr;Tyr轉變為Trp;以及/或者Phe轉變為Val、Ile或Leu。
應用於本文所述的多肽的任何胺基酸取代還可基於以下分析:Schulz等人,Principles of Protein Structure,Springer-Verlag,1978年研究的對不同物種的同源蛋白質之間胺基酸變異頻率的分析;Chou及Fasman,Biochemistry,第13卷:第211頁,1974年及Adv.Enzymol.,第47卷:第45-149頁,1978年研究的對結構成形潛力的分析;以及Eisenberg等人,Proc.Nat. Acad Sci.USA,第81卷:第140-144頁,1984年,Kyte及Doolittle,J Mol. Biol. ,第157卷:第105-132頁,1981年及Goldman等人,Ann.Rev. Biophys.Chem.,第15卷:第321-353頁,1986年研究的對蛋白質疏水性模式的分析,這些文獻全文以引用方式併入本文。
如本文所用,術語“單株抗體”是指從基本上同源的抗體群體獲得的抗體。即,構成群體的每種抗體是相同的,除了少量可能天然存在的突變。單株抗體是高度特異性的,並且針對的是單一抗原。術語“單株抗體”在本文中不限於透過融合瘤(hybridoma)技術產生的抗體,並且不應理解為需要透過任何特定方法來產生抗體。
術語“雙特異性抗體”在本發明的上下文中應理解為具有由不同抗體序列限定的兩個不同抗原結合區的抗體。這可理解為不同的標靶結合,但也包括與一個標靶中的不同表位的結合。
如本文所用,術語“腫瘤相關抗原”是指與正常細胞相比在癌細胞中差異表現的抗原,因此可用於靶向癌細胞。
如本文所用,術語“雙特異性T細胞銜接體”或“BiTE”是指具有兩個抗原結合域的單體多肽鏈分子,其中一個抗原結合域結合T細胞抗原,並且第二個抗原結合域結合標靶表面上存在的抗原(參見PCT公佈WO 05/061547;Baeuerle等人,2008年,Drugs of the Future,第33卷:第137-147頁;Bargou等人,2008年,Science,第321卷:第974-977頁,這些文獻全文以引用方式併入本文)。因此,本揭露的BiTE具有結合ROR1的抗原結合區及針對T細胞抗原的第二抗原結合區。
如本文所用,術語“載體”意指能夠運輸已經與其連接的另一個核酸的核酸分子。
如本文所用,術語“宿主細胞”是指已經引入表現載體的細胞。
術語“藥學上可接受的”是指載體或佐劑與組合物的其他成分相容並且基本上對其接受者無害,並且/或者此類載體或佐劑被批准或可批准包含在用於對人腸胃外施用的藥物組合物中。
如本文所用,術語“治療”(treatment/treating)等是指為了獲得效果而施用藥劑或執行程序。該效果可以是完全或部分預防疾病或其症狀的預防性效果,並且/或者可以是部分或完全治癒疾病及/或疾病症狀的治療性效果。如本文所用,“治療”可包括治療哺乳動物,特別是人的疾病或障礙(例如,癌症),並且包括:(a)預防受試者的疾病或疾病症狀發生,該受試者可能易患該疾病但尚未被診斷為患有該疾病(例如,包括可能與原發性疾病相關或由原發性疾病導致的疾病);(b)抑制該疾病,即阻止該疾病發展;以及(c)緩解該疾病,即導致該疾病的消退。治療可以指癌症的治療或改善或預防中的任何成功標記,包括任何客觀或主觀參數,諸如減輕;緩解;減少症狀或使患者更耐受疾病病症;減緩退化或衰退的速率;或使退化的終點不那麼衰弱。症狀的治療或改善基於一個或多個客觀或主觀參數;包括醫生檢查的結果。因此,術語“治療”包括施用本文所公開的抗體或組合物或共軛物以預防或延遲、減輕或阻止或抑制與疾病(例如,癌症)相關的症狀或病症的發展。術語“治療效果”是指減少、消除或預防受試者的疾病、疾病症狀或疾病的副作用。
如本文所用,術語“有效量”是指當施用於受試者以治療疾病時,足以實現對該疾病的治療的量。
如本文所用,術語“受試者”是指需要診斷、治療或療法的任何哺乳動物受試者。用於治療目的“哺乳動物”是指歸類為哺乳動物的任何動物,包括人、家畜及農場動物,以及實驗室動物、動物園動物、運動動物或寵物動物,諸如狗、馬、貓、牛、綿羊、山羊、豬、小鼠、大鼠、兔、豚鼠、猴等。
術語“類受體酪胺酸激酶的孤兒受體1”或“ROR1”包括任何ROR1變體、同種型及物種同系物,它們由任何來源的細胞天然表現,或者在轉染有編碼ROR1的基因或cDNA的細胞上表現,該ROR1在任何來源的細胞上天然表現。
術語“恆河猴ROR1”、“食蟹猴ROR1”及“食蟹獼猴ROR1”在本文中可互換使用,並且是指食蟹猴ROR1。該術語包括任何ROR1變體、同種型(isoform)及物種同系物(species homolog),它們由食蟹猴細胞天然表現,或者在用編碼食蟹猴ROR1的基因或cDNA轉染的任何來源的細胞上表現,該食蟹猴ROR1在食蟹猴細胞上天然表現。
術語“人ROR1”、“huROR1”及“hROR1”在本文中可互換使用,並且是指任何ROR1變體、同種型及物種同系物,它們由人細胞天然表現,或者在用編碼人ROR1的基因或cDNA轉染的任何來源的細胞上表現,該人ROR1在人細胞上天然表現。
抗ROR1抗體
本發明提供了針對類受體酪胺酸激酶的孤兒受體1(ROR1)的抗體。
在第一方面,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),並且其中該VH包含具有序列識別號: 147-202中任一項列出的胺基酸序列的VH的HCDR 1-3。在一些較佳的實施方案中,CDR透過Chothia編號系統來確定。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號: 11、40及100所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號: 12、41及101所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、42及102所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、40及103所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、43及104所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:13、44及105所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、40及106所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、45及107所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、40及108所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:14、46及109所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、47及110所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、48及111所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、45及112所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:15、49及113所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:16、50及114所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、51及115所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:18、56及126所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:21、40及130所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:22、60及131所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、40及132所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號: 23、61及133所示胺基酸序列的HCDR 1-3 。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號: 19、57及127所示胺基酸序列的HCDR 1-3:。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:20、58及128所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:14、59及129所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及119所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及116所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及120所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及121所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及122所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及123所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及124所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及125所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、52及116所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及117所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、52及117所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、40及116所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、53及118所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、54及116所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、55及116所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、54及117所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、40及117所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、55及117所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、54及118所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、40及118所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、55及118所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:17、55及103所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、55及117所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),其中該VH包含分別具有如序列識別號:12、55及118所示胺基酸序列的HCDR 1-3。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈可變區(VH),並且其中
(1) 該VH包含與序列識別號: 147具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(2) 該VH包含與序列識別號: 148具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(3) 該VH包含與序列識別號: 149具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(4) 該VH包含與序列識別號: 150具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(5) 該VH包含與序列識別號: 151具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(6) 該VH包含與序列識別號: 152具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(7) 該VH包含與序列識別號: 153具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(8) 該VH包含與序列識別號: 154具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(9) 該VH包含與序列識別號: 155具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(10) 該VH包含與序列識別號: 156具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(11) 該VH包含與序列識別號: 157具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(12) 該VH包含與序列識別號: 158具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(13) 該VH包含與序列識別號: 159具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(14) 該VH包含與序列識別號: 160具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(15) 該VH包含與序列識別號: 161具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(16) 該VH包含與序列識別號: 162具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(17) 該VH包含與序列識別號: 163具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(18) 該VH包含與序列識別號: 164具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(19) 該VH包含與序列識別號: 165具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(20) 該VH包含與序列識別號: 166具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(21) 該VH包含與序列識別號: 167具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(22) 該VH包含與序列識別號: 168具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(23) 該VH包含與序列識別號: 169具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(24) 該VH包含與序列識別號: 170具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(25) 該VH包含與序列識別號: 171具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(26) 該VH包含與序列識別號: 172具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(27) 該VH包含與序列識別號: 173具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(28) 該VH包含與序列識別號: 174具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(29) 該VH包含與序列識別號: 175具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(30) 該VH包含與序列識別號: 176具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(31) 該VH包含與序列識別號: 177具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(32) 該VH包含與序列識別號: 178具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(33) 該VH包含與序列識別號: 179具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(34) 該VH包含與序列識別號: 180具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(35) 該VH包含與序列識別號: 181具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(36) 該VH包含與序列識別號: 182具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(37) 該VH包含與序列識別號: 183具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(38) 該VH包含與序列識別號: 184具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(39) 該VH包含與序列識別號: 185具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(40) 該VH包含與序列識別號: 186具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(41) 該VH包含與序列識別號: 187具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(42) 該VH包含與序列識別號: 188具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(43) 該VH包含與序列識別號: 189具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(44) 該VH包含與序列識別號: 190具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(45) 該VH包含與序列識別號: 191具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(46) 該VH包含與序列識別號: 192具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(47) 該VH包含與序列識別號: 193具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(48) 該VH包含與序列識別號: 194具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(49) 該VH包含與序列識別號: 195具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(50) 該VH包含與序列識別號: 196具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(51) 該VH包含與序列識別號: 197具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(52) 該VH包含與序列識別號: 198具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(53) 該VH包含與序列識別號: 199具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(54) 該VH包含與序列識別號: 200具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(55) 該VH包含與序列識別號: 201具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;或者
(56) 該VH包含與序列識別號: 202具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列。
在一些實施方案中,抗體包含Fc區。在一些實施方案中,Fc區可以是任何同種型,包括但不限於IgG1、IgG2、IgG3及IgG4,並且可包含一個或多個突變或修飾。在一個實施方案中,Fc區是IgG1同種型或由其衍生,可選地具有一個或多個突變或修飾。在一個實施方案中,Fc區是人IgG1 Fc。
在一個實施方案中,Fc區是效應子功能缺陷型。例如,Fc區可以是IgG1同種型,或非IgG1型,例如IgG2、IgG3或IgG4,其已經突變,使得介導效應子功能諸如抗體依賴性細胞介導的細胞毒性(antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity;ADCC)的能力已經降低或甚至消除。此類突變已在例如Dall'Acqua WF等人,J Immunol.第177卷第2期:第1129-1138頁(2006年)及Hezareh M,J Virol.,第75卷第24期:第12161-12168頁(2001年)中進行了描述。在一些實施方案中,抗體的Fc區包含具有L234A、L235A及G237A突變的野生型IgG1 Fc。
在一些實施方案中,抗體在一個或多個轉譯後修飾位點處突變。在一個實施方案中,Fc區包含去除Asn連接的醣基化的受體位點的突變,或者對Fc區進行操作以消除抗體的效應子功能。
在一些實施方案中,本發明提供了特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體包含重鏈(HC),並且其中:
(1) 該HC包含與序列識別號: 205具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(2) 該HC包含與序列識別號: 206具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(3) 該HC包含與序列識別號: 207具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(4) 該HC包含與序列識別號: 208具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(5) 該HC包含與序列識別號: 209具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(6) 該HC包含與序列識別號: 210具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(7) 該HC包含與序列識別號: 211具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(8) 該HC包含與序列識別號: 212具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(9) 該HC包含與序列識別號: 213具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(10) 該HC包含與序列識別號: 214具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(11) 該HC包含與序列識別號: 215具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(12) 該HC包含與序列識別號: 216具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(13) 該HC包含與序列識別號: 217具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(14) 該HC包含與序列識別號: 218具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(15) 該HC包含與序列識別號: 219具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(16) 該HC包含與序列識別號: 220具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(17) 該HC包含與序列識別號: 221具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(18) 該HC包含與序列識別號: 222具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(19) 該HC包含與序列識別號: 223具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(20) 該HC包含與序列識別號: 224具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(21) 該HC包含與序列識別號: 225具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(22) 該HC包含與序列識別號: 226具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(23) 該HC包含與序列識別號: 227具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(24) 該HC包含與序列識別號: 228具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(25) 該HC包含與序列識別號: 229具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(26) 該HC包含與序列識別號: 230具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(27) 該HC包含與序列識別號: 231具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(28) 該HC包含與序列識別號: 232具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(29) 該HC包含與序列識別號: 233具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(30) 該HC包含與序列識別號: 234具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(31) 該HC包含與序列識別號: 235具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(32) 該HC包含與序列識別號: 236具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(33) 該HC包含與序列識別號: 237具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(34) 該HC包含與序列識別號: 238具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(35) 該HC包含與序列識別號: 239具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(36) 該HC包含與序列識別號: 240具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(37) 該HC包含與序列識別號: 241具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(38) 該HC包含與序列識別號: 242具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(39) 該HC包含與序列識別號: 243具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(40) 該HC包含與序列識別號: 244具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(41) 該HC包含與序列識別號: 245具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(42) 該HC包含與序列識別號: 246具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(43) 該HC包含與序列識別號: 247具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(44) 該HC包含與序列識別號: 248具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(45) 該HC包含與序列識別號: 249具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(46) 該HC包含與序列識別號: 250具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(47) 該HC包含與序列識別號: 251具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(48) 該HC包含與序列識別號: 252具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(49) 該HC包含與序列識別號: 253具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(50) 該HC包含與序列識別號: 254具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(51) 該HC包含與序列識別號: 255具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(52) 該HC包含與序列識別號: 256具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(53) 該HC包含與序列識別號: 257具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(54) 該HC包含與序列識別號: 258具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;
(55) 該HC包含與序列識別號: 259具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列;或者
(56) 該HC包含與序列識別號: 260具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列。
在一些實施方案中,本發明的抗體包含重鏈及輕鏈。在一些實施方案中,本發明的抗體包含兩條重鏈及兩條輕鏈。
基於抗體的重鏈恆定區的胺基酸序列,免疫球蛋白分子可分為五類(同種型):IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,並且可進一步分為不同的亞型,諸如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、IgA2等。基於輕鏈的胺基酸序列,抗體的輕鏈可以分類為lambda(λ)鏈或kappa(κ)鏈。本文所公開的抗體可以是上述任何類型或亞型。
在一些實施方案中,抗體可以是選自IgG、IgA、IgM、IgE及IgD的同種型。在一些實施方案中,抗體可以是選自IgG1、IgG2、IgG3及IgG4的亞型。在一個較佳的實施方案中,抗體是IgG1抗體。
在一些實施方案中,本發明的抗體不包含輕鏈。在一些具體實施方案中,抗體僅包含一條或兩條重鏈。在一些較佳的實施方案中,本發明的抗體由一條重鏈組成。在一些較佳的實施方案中,本發明的抗體由兩條重鏈組成。
在一些實施方案中,本發明的抗體是同源二聚體抗體,其包含VH抗原結合結構域以及CH2及CH3恆定結構域。
在一個實施方案中,本發明的抗體是僅重鏈抗體,其由可變區抗原結合結構域組成,該可變區抗原結合結構域由框架1、CDR1、框架2、CDR2、框架3、CDR3及框架4組成。
在另一個實施方案中,本發明的抗體是僅重鏈抗體,其由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分以及CH1、CH2及CH3結構域組成。在另一個實施方案中,僅重鏈抗體由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分以及CH2及CH3結構域組成。在另一個實施方案中,本發明的抗體是僅重鏈抗體,其由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分及CH1結構域組成。在另一個實施方案中,本發明的抗體是僅重鏈抗體,其由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分及CH2結構域組成。在另一個實施方案中,本發明的抗體是僅重鏈抗體,其由抗原結合結構域、鉸鏈區的至少一部分及CH3結構域組成。在另一個實施方案中,本發明的抗體是重鏈,其由抗原結合結構域及至少一個CH(CH1、CH2、CH3或CH4)結構域組成,但沒有鉸鏈區。
在一些實施方案中,本發明的抗體是二聚體形式的僅重鏈抗體,其中兩條重鏈透過雙硫鍵或以其他方式共價地或非共價地彼此連接。
在一些實施方案中,本發明的抗體是屬於IgG、IgM、IgA、IgD或IgE亞類抗體的僅重鏈抗體。
在一些實施方案中,本發明的抗體是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亞型,特別是IgG1或IgG4亞型的僅重鏈抗體。
在一個實施方案中,本發明的抗體是IgG1或IgG4亞型的重鏈抗體,其中一個或多個CH結構域被修飾以改變抗體的效應子功能。
本文所公開的抗體可以是完整抗體或其抗原結合片段。抗原結合片段可以是保留特異性結合ROR1能力的抗體的任何片段。抗原結合片段的示例包括但不限於Fab片段;F(ab')2片段;Fab'片段;Fd片段;Fd’片段;dAb片段;分離的互補性決定區(CDR);奈米抗體;線性抗體,其包含一對串聯Fd區段(VH-CH1-VH-CH1)及前述片段中的任一片段的修飾形式,這些片段的修飾形式保留抗原結合活性。
在一些實施方案中,抗原結合片段可選自HCAb、VHH、奈米抗體、Fab、Fab'、F(ab')
2、Fd、Fd'及dAb。
在一些實施方案中,本發明的抗體是嵌合抗體、人源化抗體或人抗體。
在一些實施方案中,本發明的抗體是單株抗體、雙特異性抗體或多特異性抗體。
在一些實施方案中,抗體是單價的、二價的或多價的。
在一些實施方案中,本發明的抗體或抗原結合片段連接到螢光標記、放射性標記或細胞毒性劑。
雙特異性抗體
在第二方面,本申請提供了一種雙特異性或多特異性抗體。在一些實施方案中,抗體是雙特異性抗體,其還包含結合第二抗原的第二抗原結合區。在一些實施方案中,第二抗原可以是腫瘤相關抗原、免疫檢查點分子或免疫細胞抗原。
本領域已經鑑定了許多與特定癌症相關的腫瘤相關抗原。在一些實施方案中,腫瘤相關抗原是能夠潛在地刺激明顯的腫瘤特異性免疫應答的抗原。這些抗原中的一些抗原由正常細胞編碼,但不一定由正常細胞表現。這些抗原可表徵為在正常細胞中通常沉默(即不表現)的那些,僅在分化的某些階段表現的那些,以及隨時間推移表現的那些,諸如胚胎抗原及胎兒抗原。其他腫瘤抗原由突變細胞基因編碼,諸如致癌基因(例如,活化的ras致癌基因)、抑制基因(例如,突變體p53)以及透過內部缺失或染色體易位產生的融合蛋白。其他腫瘤抗原可由病毒基因編碼,諸如RNA腫瘤病毒及DNA腫瘤病毒攜帶的那些。許多其他腫瘤相關抗原及針對它們的抗體是已知的及/或可商購獲得的,並且還可由發明所屬技術領域中具有通常知識者生產。
腫瘤相關抗原的示例包括但不限於5T4、甲型胎兒蛋白、CA-125、癌胚胎抗原、CD19、CD20、CD22、CD23、CD30、CD33、CD40、CD56、CD79、CD78、CD123、CD138、c-Met、CSPG4、IgM、類C型凝集素分子1(C-type lectin-like molecule 1;CLL-1)、EGFR、EGFRvIII、上皮腫瘤抗原、ERBB2、FLT3、葉酸結合蛋白、GD2、GD3、HIV-1封套醣蛋白(envelope glycoprotein)gp41、HIV-1封套醣蛋白gpl20、黑色素瘤相關抗原、ROR1、MUC-1、突變p53、突變Ras、ROR1、VEGFR2,以及它們的組合。
在一些實施方案中,第二抗原是免疫細胞抗原。在一些實施方案中,T細胞抗原可選自T細胞受體(T cell receptor;TCR)、CD3、CD4、CD8、CD16、CD25、CD28、CD44、CD62L、CD69、ICOS、41-BB(CD137)及NKG2D,或它們的任意組合。較佳地,第二抗原是CD3。
在一些實施方案中,第二抗原是免疫檢查點分子。在一些實施方案中,免疫檢查點分子可選自PD-1、PD-L1、CTLA-4等。
在一些實施方案中,雙特異性抗體包含單體肽鏈,該單體多肽鏈包含第一抗原結合區及第二抗原結合區以及可選地Fc區。
Fc區可以是任何同種型,包括但不限於IgG1、IgG2、IgG3及IgG4,並且可包含一個或多個突變或修飾。在一個實施方案中,Fc區是IgG1同種型或由其衍生,可選地具有一個或多個突變或修飾。
在一個實施方案中,Fc區是效應子功能缺陷型。例如,Fc區可以是IgG1同種型,或非IgG1型,例如IgG2、IgG3或IgG4,其已經突變,使得介導效應子功能諸如ADCC的能力已經降低或甚至消除。此類突變已在例如Dall'Acqua WF等人,J Immunol.第177卷第2期:第1129-1138頁(2006年)以及Hezareh M,J Virol.,第75卷第24期:第12161-12168頁(2001年)中進行了描述。
在一個實施方案中,Fc區包含去除Asn連接的醣基化的受體位點的突變,或者對Fc區進行其他操作以改變醣基化特性。例如,在IgG1 Fc區中,可使用N297Q突變除去Asn連接的醣基化位點。因此,在一個具體實施方案中,Fc區包含具有N297Q突變的IgG1野生型序列。例如,在IgG1 Fc區中,可使用N297Q突變除去Asn連接的醣基化位點。因此,在一個具體實施方案中,Fc區包含具有N297Q突變的IgG1野生型序列。
在另一個實施方案中,Fc區被醣工程化以減少岩藻糖,因此增強ADCC,例如透過在抗體生產過程中向培養基中添加化合物,如US2009317869中所述或如van Berkel等人(2010年),Biotechnol.Bioeng.第105卷:第350頁中所述,或者透過使用FUT8敲除細胞,例如,如Yamane-Ohnuki等人(2004年),Biotechnol.Bioeng,第87卷:第614頁中所述。ADCC可另選地使用Umaña等人(1999年),Nature Biotech,第17卷:第176頁所述的方法來優化。在另一個實施方案中,Fc區已被工程化以增強補體活化,例如,如Natsume等人(2009年),Cancer Sci.,第100卷:第2411頁中所述。
核酸
在第三方面,本發明提供了一種核酸,該核酸包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的核苷酸序列。
術語“多核苷酸”或“核酸”包括單鏈核苷酸聚合物及雙鏈核苷酸聚合物兩者。包含核酸的核苷酸可以是核糖核苷酸或去氧核糖核苷酸或任一類型核苷酸的修飾形式。所述修飾包括鹼基修飾(諸如溴尿苷及肌苷衍生物)、核糖修飾(諸如2',3'-二去氧核糖)及核苷酸間連接修飾(諸如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、硒代磷酸酯、二硒代磷酸酯、苯胺基硫代磷酸酯(phosphoroanilothioate)、苯胺基磷酸酯(phoshoraniladate)及胺基磷酸酯。
例如,本發明提供了編碼本文所公開的重鏈可變區序列中的任一重鏈可變區序列的核酸分子。本發明還提供了與編碼本文所公開的重鏈可變區序列中的任一重鏈可變區序列的核酸具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%相同的核酸分子。
例如,本發明提供了編碼本文所公開的輕鏈可變區序列中的任一輕鏈可變區序列的核酸分子。本發明還提供了與編碼本文所公開的輕鏈可變區序列中的任一輕鏈可變區序列的核酸具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%相同的核酸分子。
例如,本發明提供了編碼以下項的核酸分子:(i)本文所公開的重鏈可變區序列中的任一重鏈可變區序列;及(ii)本文所公開的輕鏈可變區序列中的任一輕鏈可變區序列。本發明還提供了與編碼以下項的核酸具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%相同的核酸分子:(i)本文所公開的重鏈可變區序列中的任一重鏈可變區序列;及(ii)本文所公開的輕鏈可變區序列中的任一輕鏈可變區序列。
在一些實施方案中,核酸是核糖核酸(RNA)或去氧核糖核酸(DNA)。在一些實施方案中,本發明提供了一種核糖核酸(RNA),該RNA包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的核苷酸序列。在一些實施方案中,本發明提供了一種去氧核糖核酸(DNA),該DNA包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的去氧核苷酸序列。
因此,包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的去氧核苷酸序列的去氧核糖核酸(DNA)用於治療疾病。在一些實施方案中,該疾病是癌症,較佳地是ROR1陽性癌症。在一些實施方案中,該癌症選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
因此,包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的去氧核苷酸序列的核糖核酸(RNA)可用於治療疾病。在一些實施方案中,該疾病是癌症。在一些實施方案中,該癌症選自ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
在一些實施方案中,去氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)可在體內被引入人體細胞。在一些實施方案中,本發明的去氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)包含在載體或遞送劑中。在一些實施方案中,本發明的去氧核糖核酸(DNA)被整合到細胞的基因組中。
載體
在第四方面,本發明還提供了一種包含核酸的載體,該核酸包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的核苷酸序列。
在一些實施方案中,載體是能夠表現多肽的重組表現載體,該多肽包含抗-ROR1抗體的重鏈可變區或輕鏈可變區。例如,本發明提供了包含上述核酸分子中的任一核酸分子的重組表現載體。
任何載體都可適用於本揭露。在一些實施方案中,載體是病毒載體。在一些實施方案中,載體是反轉錄病毒載體、DNA載體、鼠白血病病毒載體、SFG(斑點熱群(spotted fever group rickettsia;SFG))載體、質體、RNA載體、腺病毒載體、桿狀病毒載體、愛潑斯坦巴爾(Epstein Barr)病毒載體、乳頭多瘤空泡病毒載體、牛痘病毒載體、單純皰疹病毒載體、腺病毒相關載體(adenovirus associated vector ;AAV)、慢病毒載體或它們的任何組合。合適的示例性載體包括例如pGAR、pBABE-puro、pBABE-neo largeTcDNA、pBABE-hygro-hTERT、pMKO.1 GFP、MSCV-IRES-GFP、pMSCV PIG(Puro IRES GFP空質體)、pMSCV-loxp-dsRed-loxp-eGFP-Puro-WPRE、MSCV IRES螢光素酶、pMIG、MDH1-PGK-GFP_2.0、TtRMPVIR、pMSCV-IRES-mCherry FP、pRetroX GFP T2A Cre、pRXTN、pLncEXP及pLXIN-Luc。
重組表現載體可以是任何合適的重組表現載體。合適的載體包括設計用於增殖及擴增或用於表現或用於兩者的那些,諸如質體及病毒。例如,載體可選自pUC系列(Fermentas Life Sciences, Glen Burnie, Md.)、pBluescript系列(Stratagene, LaJolla, Calif.)、pET系列(Novagen, Madison, Wis.)、pGEX系列(Pharmacia Biotech, Uppsala, Sweden)及pEX系列(Clontech, Palo Alto, Calif.)。還可使用噬菌體載體,諸如λGT10、λGT11、λZapII(Stratagene)、λEMBL4及λNM1149。在本揭露的上下文中有用的植物表現載體的示例包括pBI01、pBI101.2、pBI101.3、pBI121及pBIN19(Clontech)。在本揭露的上下文中有用的動物表現載體的示例包括pcDNA、pEUK-Cl、pMAM及pMAMneo(Clontech)。
重組表現載體可使用標準重組DNA技術製備,這些技術描述於例如Sambrook等人,“Molecular Cloning: A Laboratory Manual”,第3版,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,N.Y.2001年;及Ausubel等人,“Current Protocols in Molecular Biology”,Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons,NY,1994年。可製備環狀或線性表現載體的構建體,以含有在原核宿主細胞或真核宿主細胞中起作用的複製系統。複製系統可衍生自例如ColEl、2μ質體、λ、SV40、牛乳頭瘤病毒等。
因此,載體可用於治療疾病。在一些實施方案中,該疾病是癌症。在一些實施方案中,該癌症選自ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。本發明的載體可引入細胞中。在一些實施方案中,本發明的載體可在體外或離體引入細胞中。可選地,隨後可將用載體引入的細胞施用到受試者體內。在一些實施方案中,本發明的載體可在體內引入細胞中。
例如,載體可以是腺病毒載體,其包含編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的核苷酸序列。
可將載體施用到受試者體內,然後在體內進入受試者的細胞,從而將編碼本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段或者本文所公開的雙特異性抗體或其抗原結合片段的核苷酸序列整合到細胞的基因組中,隨後該細胞表現本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段,以便治療本文所公開的疾病。
宿主細胞
在第五方面,本發明還提供了一種宿主細胞,該宿主細胞包含本文所公開的核酸或者本文所公開的載體。
任何細胞都可用作本揭露的核酸或載體的宿主細胞。在一些實施方案中,細胞可以是原核細胞、真菌細胞、酵母細胞,或高等真核細胞諸如哺乳動物細胞。合適的原核細胞包括但不限於真細菌,諸如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物體,例如腸桿菌科(
Enterobactehaceae),諸如艾氏菌屬(
Escherichia),例如大腸桿菌(
E. coli);腸桿菌屬(
Enterobacter);歐文氏菌屬(
Erwinia);克雷伯菌屬(
Klebsiella);變形桿菌屬(
Proteus);沙門氏菌屬(
Salmonella),例如鼠傷寒沙門氏菌(
Salmonella typhimurium);沙雷氏菌屬(
Serratia),例如黏質沙雷氏菌(
Serratia marcescans)及志賀氏菌(
Shigella);芽孢桿菌屬(
Bacilli),諸如枯草芽孢桿菌(
B. subtilis)及地衣芽孢桿菌(
B. licheniformis);假單胞菌屬(
Pseudomonas),諸如綠膿桿菌(
P. aeruginosa);及鏈黴菌屬(
Streptomyces)。在一些實施方案中,該細胞是人細胞。在一些實施方案中,該細胞是免疫細胞。在一些實施方案中,宿主細胞包括例如CHO(Chinese hamster ovary;CHO)細胞,諸如CHOS細胞及CHO-K1細胞,或HEK293細胞,諸如HEK293A、HEK293T及HEK293FS。
本發明的宿主細胞透過體外或離體引入本文所公開的載體或者本文所公開的核酸來製備。可將本發明的宿主細胞施用到受試者體內,並且該宿主細胞在體內表現本文所公開的抗ROR1抗體或其抗原結合片段,以便治療本文所公開的疾病。
本發明還提供了已經引入上述載體中的任一載體的宿主細胞。本發明還提供了透過在允許抗體或抗體片段產生的條件下培養宿主細胞並回收如此產生的抗體及抗體片段來產生本發明的抗體及抗體片段的方法。
抗體-藥物共軛物
在第六方面,本發明提供了一種抗體-藥物共軛物(ADC),該抗體-藥物共軛物包含本發明的第一方面的抗體或其抗原結合片段或本發明的第二方面的雙特異性抗體。
在本揭露的上下文中,“共軛物”是指抗體或抗體片段(諸如抗原結合片段)共價連接到效應分子或第二蛋白(諸如第二抗體)。效應分子可以是例如藥物、毒素、治療劑、可檢測標記、蛋白質、核酸、脂質、奈米顆粒、碳水化合物或重組病毒。抗體共軛物通常被稱為“免疫共軛物”。當共軛物包含與藥物(例如,細胞毒性劑)連接的抗體時,該共軛物通常被稱為“抗體-藥物共軛物”或“ADC”。其他抗體共軛物包括例如多特異性(諸如雙特異性或三特異性)抗體。
在一些實施方案中,效應分子可以是可檢測標記或免疫毒素。毒素的具體的非限制性示例包括但不限於相思豆毒素、蓖麻毒素、假單胞菌外毒素(pseudomonas exotoxin;PE,諸如PE35、PE37、PE38及PE40)、白喉毒素(diphtheria toxin;DT)、肉毒桿菌毒素或其經修飾的毒素,或者直接或間接抑制細胞生長或殺死細胞的其他毒性劑。例如,PE及DT是劇毒化合物,通常透過肝毒性導致死亡。然而,PE及DT可透過去除毒素的天然靶向成分(諸如PE的結構域la及DT的B鏈)並用不同的靶向部分(諸如抗體)替代而被修飾成用作免疫毒素的形式。術語“共軛的”或“連接的”可以指將兩個多肽製成一個連續的多肽分子。在一個實施方案中,抗體連接到效應分子。在另一個實施方案中,連接到效應分子的抗體進一步連接到脂質或其他分子,連接到蛋白質或肽,以增加其在體內的半衰期。連接可透過化學或重組方式進行。在一個實施方案中,連接是化學的,其中抗體部分與效應分子之間的反應已經產生了在兩個分子之間形成的共價鍵,從而形成一個分子。肽連接子(短肽序列)可可選地包括在抗體與效應分子之間。
本發明提供了免疫共軛物,其包括本文所公開的單株抗體或抗原結合片段以及效應分子。在一些實施方案中,效應分子是毒素,諸如但不限於假單胞菌外毒素或其變體。在其他實施方案中,效應分子是可檢測標記,諸如但不限於螢光團、酶或放射性同位素。
可將所公開的單株抗體共軛到治療劑或效應分子。免疫共軛物包括但不限於其中治療劑與抗體共價連接的分子。治療劑是具有針對特定靶分子或攜帶靶分子的細胞的特定生物活性的藥劑。發明所屬技術領域中具有通常知識者將理解,治療劑可包括各種藥物,諸如長春花鹼、道諾黴素等;細胞毒素諸如天然或修飾的假單胞菌外毒素或白喉毒素;含有藥理學組合物的封裝劑(諸如脂質體);放射性試劑諸如
125I、
32P、
14C、
3H及
35S及其他標記;靶部分;及配體。
特定治療劑的選擇取決於特定的靶分子或細胞以及所需的生物學效應。因此,例如,治療劑可以是用於引起特定靶細胞(諸如腫瘤細胞)死亡的細胞毒素。相反,當需要引起非致死生物反應時,可將治療劑共軛到非致死藥用試劑或含有非致死藥用試劑的脂質體。
使用本文所述的治療劑及抗體,技術人員可容易地構建多種含有功能上等效的核酸的殖株,這些核酸諸如序列不同但編碼相同效應部分或抗體序列的核酸。因此,本揭露提供了編碼抗體及其共軛物及融合蛋白的核酸。
效應分子可使用發明所屬技術領域中具有通常知識者已知的任何數量的方式連接到所關注的抗體。可使用共價連接方式及非共價連接方式兩者。將效應分子連接到抗體的方法根據效應子的化學結構而變化。多肽通常含有多種官能基;諸如羧酸(COOH)、游離胺(-NH
2)或巰基(-SH)基團,這些官能基可用於與抗體上的合適官能基反應以導致效應分子的結合。另選地,將抗體衍生化以暴露或連接另外的反應性官能基。衍生化可涉及連接許多已知連接子分子中的任一連接子分子。連接子可以是用於將抗體連接到效應分子的任何分子。連接子能夠與抗體及效應分子兩者形成共價鍵。合適的連接子是發明所屬技術領域中具有通常知識者公知的,包括但不限於直鏈或支鏈碳連接子、雜環碳連接子或肽連接子。當抗體及效應分子是多肽時,連接子可透過組成胺基酸的側基(諸如透過與半胱胺酸的雙硫鍵)連接到這些組成胺基酸,或者連接到末端胺基酸的α碳胺基基團及羧基基團。
在一些情況下,當免疫共軛物已經到達其靶位點時,期望從抗體釋放效應分子。因此,在這些情況下,免疫共軛物將包含在靶位點附近可切割的鍵。
可透過酶活性或者免疫共軛物在靶細胞內或在靶位點附近所經受的條件來促進連接子的切割,以從抗體釋放效應分子。
鑒於已報導的用於將多種放射性診斷化合物、放射性治療化合物、標記(諸如酶或螢光分子)、藥物、毒素及其他試劑連接到抗體的眾多方法,發明所屬技術領域中具有通常知識者將能夠確定用於將給定試劑連接到抗體或其他多肽的合適方法。
可將本文所公開的抗體衍生化或連接到另一個分子(諸如另一個肽或蛋白質)。通常,將抗體或其部分衍生化,使得與靶抗原的結合不受衍生化或標記的不利影響。例如,可將抗體官能性連接(透過化學偶聯、基因融合、非共價締合或其他方式)到一個或多個其他分子實體,諸如另一個抗體(例如,雙特異性抗體或雙鏈抗體)、檢測劑、藥劑,以及/或者可介導抗體或抗體部分與另一個分子(諸如鏈黴親和素核心區或聚組胺酸標籤)締合的蛋白質或肽。
一種類型的衍生化抗體透過交聯兩種或更多種抗體(相同類型或不同類型,諸如產生雙特異性抗體)來產生。合適的交聯劑包括具有由合適的間隔子隔開的兩個明顯反應性基團的異雙官能基的那些交聯劑(諸如間馬來醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯),或者具有同雙官能基的那些交聯劑(諸如辛二酸二琥珀醯亞胺酯)。此類連接子是可商購獲得的。
抗體可與可檢測標記物共軛;例如,可檢測標記物能夠透過ELISA、分光光度法、流式細胞術、顯微鏡檢查或診斷成像技術(諸如電腦斷層掃描(computed tomography;CT)、電腦軸向斷層掃描(computed axial tomography;CAT)掃描、磁共振成像(magnetic resonance imaging;MRI)、核磁共振成像(nuclear magnetic resonance imaging;NMRI)、磁共振斷層掃描(magnetic resonance tomography;MTR)、超音波、纖維鏡檢查及腹腔鏡檢查)來檢測。可檢測標記物的具體的非限制性示例包括螢光團、化學發光劑、酶連接、放射性同位素及重金屬或化合物(例如用於透過MRI檢測的超順磁性氧化鐵奈米晶體)。例如,有用的可檢測標記物包括螢光化合物,這些螢光化合物包括螢光素、螢光異構硫氰酸鹽、羅丹明、5-二甲胺-l-萘磺醯氯、藻紅蛋白、鑭系元素磷光體等。生物發光標記物也是有用的,諸如螢光素酶、綠色螢光蛋白(GFP)及黃色螢光蛋白(YFP)。抗體或抗原結合片段還可與用於檢測的酶共軛,這些酶諸如辣根過氧化氫酶、β-半乳糖苷酶、螢光素酶、鹼性磷酸酶、葡萄糖氧化酶等。當抗體或抗原結合片段與可檢測的酶共軛時,可透過添加另外的試劑來檢測,該酶使用該另外的試劑來產生可辨別的反應產物。例如,當試劑辣根過氧化氫酶存在時,添加過氧化氫及二胺基聯苯胺產生可目視檢測的有色反應產物。抗體或抗原結合片段還可與生物素共軛,並透過抗生物素蛋白或鏈黴親和素蛋白結合的間接測量來檢測。應當注意,抗生物素蛋白本身可與酶或螢光標記共軛。
抗體可與自我標記的蛋白質標籤(例如HaloTag)融合。例如,可在恆定區的末端處融合蛋白質標籤。HaloTag是衍生自細菌酶(鹵代烷烴脫鹵素酶)的自我標記的蛋白質標籤,其被設計為共價結合到合成配體。在一些情況下,該合成配體包含連接到螢光團諸如近紅外螢光團的氯烷烴連接子(Los等人(2008年),ACS Chem Biol.,第3卷第6期:第373-82頁)。
抗體可用磁性試劑諸如釓來標記。抗體還可用鑭系元素(諸如銪及鏑)及錳來標記。
順磁性顆粒諸如超順磁性氧化鐵也可用作標記。抗體還可用由二級報導子(諸如白胺酸拉鍊對序列、二級抗體的結合位點、金屬結合結構域、表位標籤)識別的預定多肽表位來標記。在一些實施方案中,標記透過各種長度的間隔子臂連接以降低潛在的空間位阻。
抗體還可用放射性標記的胺基酸來標記。放射性標記可用於診斷目的及治療目的兩者。例如,放射性標記可用於透過X射線、發射光譜或其他診斷技術來檢測靶抗原的表現。用於多肽的標記的示例包括但不限於以下放射性同位素或放射性核苷酸:
3H、
14C、
15N、
35S、
90Y、
99Tc、
111In、
125I、
131I。
抗體還可用化學基團諸如聚乙二醇(polyethylene glycol;PEG)、甲基或乙基基團或者碳水化合物基團來衍生化。這些基團可用於改善抗體的生物學特徵,諸如增加血清半衰期或增加組織結合。
毒素可與本文所述的單株抗體一起使用以產生免疫毒素。示例性毒素包括蓖麻毒素、相思豆毒素、白喉毒素以及它們的次單元,以及肉毒桿菌毒素A至F。這些毒素可容易地從商業來源(Sigma Chemical Company, St. Louis, MO)獲得。所考慮的毒素還包括本文所述毒素的變體(參見,例如參見美國專利號5,079,163及4,689,401)。在一個實施方案中,該毒素是假單胞菌外毒素(PE)(美國專利號5,602,095)。
本文所述的抗體還可用於將任何數目的不同的診斷性或治療性化合物靶向於在表面上表現腫瘤或病毒抗原的細胞。因此,本揭露的抗體可直接或經由連接子連接到藥物,該藥物將被直接遞送至表現細胞表面抗原的細胞。這可用於治療、診斷或研究目的。治療劑包括化合物諸如核酸、蛋白質、肽、胺基酸或衍生物、醣蛋白、放射性同位素、脂質、碳水化合物或重組病毒。核酸治療及診斷部分包括反義核酸、用於與單鏈或雙鏈DNA共價交聯的衍生化寡核苷酸以及形成三鏈體的寡核苷酸。
另選地,連接到抗體的分子可以是封裝系統,諸如奈米顆粒、脂質體或膠束,該封裝系統含有治療組合物,諸如藥物、核酸(例如反義核酸)或較佳地被保護免於直接暴露於循環系統的另一種治療部分。製備連接到抗體的脂質體的方法是發明所屬技術領域中具有通常知識者公知的(參見例如美國專利號4,957,735;Connor等人,Pharm.Ther.,第28卷:第341-365頁,1985年)。
本文所述的抗體還可共價或非共價地連接到可檢測標記。適用於此類用途的可檢測標記包括可透過光譜、光化學、生物化學、免疫化學、電學、光學或化學方法檢測的任何組合物。有用的標記包括磁珠、螢光染料(例如螢光異構硫氰酸鹽、德克薩斯紅、羅丹明、綠色螢光蛋白等)、放射性標記(例如
3H、
125I、
35S、
14C或
32P)、酶(諸如辣根過氧化氫酶、鹼性磷酸酶以及ELISA中常用的其他酶)及比色標記諸如膠體金或有色玻璃或塑膠(諸如聚苯乙烯、聚丙烯、乳膠等)珠。
檢測此類標記的方式是發明所屬技術領域中具有通常知識者公知的。因此,例如,放射性標記可使用照相膠片或閃爍計數器來檢測,螢光標記物可使用光檢測器檢測來檢測發射的照明。酶標記通常透過向酶提供基質並檢測酶對基質的作用所產生的反應產物來檢測,而比色標記透過簡單地使有色標記視覺化來檢測。
本文所公開的ADC可單獨用於治療癌症,或者與另一種治療劑組合用於治療癌症,以及/或者與任何標準療法(諸如手術切除腫瘤、化療或放射性療法)組合用於治療癌症,其中該癌症回應於降低、抑制及/或阻斷ROR1介導的免疫調節功能或活性。
藥物組合物
在第七方面,本發明提供了一種藥物組合物,該藥物組合物包含(i)本發明的第一方面的抗體或其抗原結合片段、或本發明的第二方面的雙特異性抗體、或本發明的第三方面的核酸、或本發明的第四方面的載體、或本發明的第五方面的宿主細胞、或本發明的第六方面的ADC;及可選地(ii)藥學上可接受的載體或賦形劑。
本發明提供了包含本發明的抗體的藥物組合物。在一些實施方案中,該藥物組合物還包含藥學上可接受的載體。術語“藥學上可接受的載體”包括生理上相容的任何及所有溶劑、緩衝液、分散介質、包衣、抗細菌及抗真菌劑、等滲劑及吸收延遲劑等。較佳地,該載體適於靜脈內、肌內、皮下、腸胃外、脊柱或表皮施用(例如,透過注射或輸注)。例如,在一些實施方案中,用於靜脈內施用的組合物通常是無菌等滲水性緩衝液中的溶液。
可將本發明的抗體或試劑(本文也稱為“活性化合物”)及其衍生物、片段、類似物及同系物摻入適於施用的藥物組合物中。此類組合物通常包含抗體或試劑以及藥學上可接受的載體。如本文所用,術語“藥學上可接受的載體”旨在包括與藥物施用相容的任何及所有溶劑、分散介質、包衣、抗細菌劑及抗真菌劑、等滲劑及吸收延遲劑等。合適的載體描述於“Remington's Pharmaceutical Sciences”的最新版本中,該文獻為該領域的標準參考文獻文本,該文獻以引用方式併入本文。此類載體或稀釋劑的較佳示例包括但不限於水、食鹽水、林格氏溶液、葡萄糖溶液及5%人血清白蛋白。還可使用脂質體及非水性溶媒諸如固定油。此類介質及試劑用於藥物活性物質的用途是本領域公知的。除非任何習知介質或試劑與活性化合物不相容,否則考慮將這些介質或試劑用於組合物中。還可將補充性活性化合物摻入組合物中。
將本發明的藥物組合物配製成與其預期施用途徑相容。施用途徑的示例包括腸胃外施用,例如靜脈內、皮內、皮下、口服(例如吸入)、經皮(即局部)、經黏膜及直腸施用。用於腸胃外、皮內或皮下施用的溶液或懸浮液可包括以下組分:無菌稀釋劑,諸如注射用水、食鹽水溶液、固定油、聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他合成溶劑;抗菌劑,諸如苯甲醇或對羥基苯甲酸甲酯;抗氧化劑,諸如抗壞血酸或亞硫酸氫鈉;螯合劑,諸如乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid ;EDTA);緩衝液,諸如醋酸鹽、檸檬酸鹽或磷酸鹽;以及用於調節張力的試劑,諸如氯化鈉或葡萄糖。pH值可用酸或鹼諸如鹽酸或氫氧化鈉來調節。腸胃外製劑可封裝在由玻璃或塑膠製成的安瓿、一次性注射器或多劑量小瓶中。
適於可注射用途的藥物組合物包括無菌水溶液(如果是水溶性的)或分散體以及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散體的無菌散劑。對於靜脈內施用,合適的載體包括生理食鹽水、抑菌水、Cremophor EL™(BASF,Parsippany,N.J.)或磷酸鹽緩衝鹽水(phosphate buffered saline;PBS)。在所有情況下,組合物必須是無菌的並且應當是流動的以達到易於注射的程度。它在製備及儲存條件下必須是穩定的;並且必須保存以抵抗微生物諸如細菌及真菌的污染作用。該載體可以是含有以下物質的溶劑或分散介質:例如,水、乙醇、多元醇(例如,甘油、丙二醇及液體聚乙二醇等)及它們合適的混合物。可例如透過使用包衣(諸如卵磷脂),透過在分散體的情況下保持所需的粒徑,以及透過使用表面活性劑來保持恰當的流動性。可透過各種抗細菌劑及抗真菌劑(例如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇、苯酚、抗壞血酸、硫柳汞等)來實現對微生物的預防作用。在許多情況下,將較佳在組合物中包含等滲劑,例如醣、多元醇(諸如甘露糖醇、山梨糖醇)、氯化鈉。可透過在組合物中包含延遲吸收的試劑(例如,單硬脂酸鋁及明膠)來實現可注射組合物的持續吸收。
無菌可注射溶液可透過以下方式製備:根據需要將所需量的活性化合物與上文列舉的一種成分或多種成分的組合摻入到適當的溶劑中,隨後過濾滅菌。通常,透過將活性化合物摻入到含有基本分散介質及來自上文列舉的成分的所需其他成分的無菌溶媒中來製備分散液。就用於製備無菌可注射溶液的無菌散劑而言,製備方法是真空乾燥及冷凍乾燥,這些方法從活性成分加任何附加所需成分的先前無菌過濾的溶液中產生該活性成分加任何附加期望成分的散劑。
口服組合物通常包含惰性稀釋劑或可食用載體。它們可封裝在明膠膠囊中或壓製成片劑。出於口服治療施用的目的,活性化合物可摻有賦形劑並以片劑、錠劑或膠囊劑的形式使用。還可使用用作漱口藥的流體載體來製備口服組合物,其中流體載體中的化合物經口服施用並在漱口後吐出或吞服。藥學上相容的結合劑及/或佐劑材料可作為組合物的一部分包括在內。片劑、丸劑、膠囊劑、錠劑等可含有以下成分或具有類似性質的化合物中的任一者:粘合劑,諸如微晶纖維素、黃蓍膠或明膠;賦形劑,諸如澱粉或乳糖;崩解劑,諸如海藻酸、Primogel或玉米澱粉;潤滑劑,諸如硬脂酸鎂或Sterotes;助流劑諸如二氧化矽膠體;甜味劑,諸如蔗糖或糖精;或調味劑,諸如薄荷、水楊酸甲酯或柳丁調味劑。
對於透過吸入施用,這些化合物以氣溶膠噴霧劑的形式從含有合適的推進劑(例如氣體諸如二氧化碳)的壓力容器或分配器,或霧化器遞送。
全身性施用還可透過經黏膜或經皮方式進行。對於經黏膜或經皮施用,在製劑中使用適於待滲透的屏障的滲透劑。此類滲透劑在本領域中通常是已知的,並且包括例如用於經黏膜施用的洗滌劑、膽鹽及夫西地酸衍生物。經黏膜施用可透過使用鼻腔噴霧劑或栓劑來完成。對於經皮施用,將活性化合物配製成本領域眾所周知的軟膏劑、藥膏劑、凝膠或霜劑。
還可將化合物製備成栓劑形式(例如,具有習知栓劑基質諸如可可脂及其他甘油酯)或用於直腸遞送的保留灌腸劑。
在一個實施方案中,活性化合物用載體製備,這些載體將保護化合物免於從機體快速排出,這些載體諸如包括植入物及微膠囊化遞送系統的控釋製劑。可使用生物可降解、生物相容的聚合物,諸如乙烯醋酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備此類製劑的方法對發明所屬技術領域中具有通常知識者來說是顯而易見的。這些材料還可從Alza Corporation及Nova Pharmaceuticals公司商購獲得。脂質體懸浮液(包含靶向具有針對病毒抗原的單株抗體的感染細胞的脂質體)也可用作藥學上可接受的載體。這些材料可根據發明所屬技術領域中具有通常知識者已知的方法來製備,例如,如描述於美國專利號4,522,811中公開了一種用於產生所關注的抗體諸如人抗體的方法。
為了易於施用及劑量的均勻性,將口服或腸胃外組合物配製成劑量單位形式是特別有利的。如本文所用的劑量單位形式指適合作為用於待治療受試者的單位劑量的物理離散的單元;每個單元含有預定量的活性化合物,所述預定量的活性化合物經計算在與所需的藥用載體締合時產生所需的治療效果。本發明的劑量單位形式的規格取決於活性化合物的獨特特徵及待達到的特定治療效果以及配混用於治療個體的此類活性化合物的領域中的固有局限性,並且直接取決於這些因素。
藥物組合物可與施用說明書一起包含在容器、包裝或分配器中。
本發明提供了治療組合物,其包含本發明的抗ROR1抗體或其抗原-結合片段。根據本發明的治療組合物將與合適的載體、賦形劑及其他試劑一起施用,將這些藥劑摻入到製劑中以改進轉移、遞送、耐受性等。在所有藥物化學家已知的處方集中可找到大量合適的製劑:Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Company,Easton,PA。這些製劑包括例如散劑、糊劑、軟膏、果凍、蠟、油、脂質、包含脂質(陽離子或陰離子)的囊泡(諸如LIPOFECTIN™)、DNA共軛物、無水吸收糊劑、水包油及油包水乳液、卡波蠟乳液(各種分子量的聚乙二醇)、半固體凝膠及含有卡波蠟的半固體混合物。還參見Powell等人,“Compendium of excipients for parenteral formulations”,PDA(1998年),J Pharm Sci Technol,第52卷:第238-311頁。
產生方法
單株抗體可以使用融合瘤方法諸如Kohler及Milstein,Nature,第256卷:第495頁(1975年)所述的那些方法製備。在融合瘤方法中,通常用免疫劑對小鼠、倉鼠或其他合適的宿主動物進行免疫,以引發產生或能夠產生特異性結合免疫劑的抗體的淋巴球。另選地,可在體外對淋巴球進行免疫。
免疫劑通常包括蛋白質抗原、其片段或其融合蛋白。通常,如果需要人源細胞,則使用周邊血液淋巴球,或者如果需要非人哺乳動物來源,則使用脾細胞或淋巴結細胞。然後使用合適的融合劑諸如聚乙二醇將淋巴球與永生化細胞系融合,以形成融合瘤細胞(Goding,Monoclonal Antibodies: Principles and Practice,Academic Press(1986年),第59-103頁)。永生化細胞系通常是轉形的哺乳動物細胞,特別是齧齒類動物、牛及人來源的骨髓瘤細胞。通常,採用大鼠或小鼠骨髓瘤細胞系。融合瘤細胞可以在合適的培養基中培養,該培養基較佳含有一種或多種抑制未融合的永生化細胞生長或存活的物質。例如,如果親本細胞缺乏次黃嘌呤鳥嘌呤磷酸核醣基轉移酶(hypoxanthine guanine phosphoribosyl transferase;HGPRT或HPRT),用於融合瘤的培養基通常將包含次黃嘌呤、胺基蝶呤及胸苷(“HAT培養基”),這些物質阻止HGPRT缺陷型細胞的生長。
較佳的永生化細胞系是那些能有效融合、支持所選抗體產生細胞穩定高水平表現抗體並對培養基諸如HAT培養基敏感的細胞系。更較佳的永生化細胞系是鼠骨髓瘤細胞系,其可例如從加利福尼亞州聖地牙哥的索爾克研究所細胞分配中心及維吉尼亞州馬納薩斯的美國菌種保藏中心獲得。還已描述了用於產生人單株抗體的人骨髓瘤及小鼠-人種間骨髓瘤細胞系。(參見Kozbor,J. Immunol.,第133卷:第3001頁(1984年);Brodeur等人,“Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications”,Marcel Dekker, Inc.,New York(1987年),第51-63頁))。
然後可以測定培養融合瘤細胞的培養基中針對抗原的單株抗體的存在。較佳地,由融合瘤細胞產生的單株抗體的結合特異性透過免疫沉澱或透過體外結合測定,諸如放射免疫測定(RIA)或酶聯免疫吸附測定(ELISA)來測定。這些技術及測定是本領域已知的。單株抗體的結合親和力可以例如透過“Scatchard analysis of Munson and Pollard”,Anal.Biochem.,第107卷:第220頁(1980年)來測定。此外,在單株抗體的治療應用中,重要的是鑑定對靶抗原具有高度特異性及高結合親和力的抗體。
在鑑定出所需的融合瘤細胞後,選殖可以透過有限稀釋程序次選殖,並透過標準方法培養。(參見Goding,“Monoclonal Antibodies: Principles and Practice,Academic Press”,(1986年),第59-103頁)。適用於此目的的培養基包括例如Dulbecco改良Eagle培養基及RPMI-1640培養基。另選地,融合瘤細胞可在哺乳動物體內生長為腹水。
由次選殖分泌的單株抗體可以透過習知免疫球蛋白純化程序諸如例如蛋白質A-瓊脂糖、羥基磷灰石色譜、凝膠電泳、透析或親和層析從培養基或腹水中分離或純化。
單株抗體還可透過重組DNA方法諸如美國專利號4,816,567。編碼本發明的單株抗體的DNA可容易地使用習知程序分離及測序(例如,透過使用能夠特異性結合編碼鼠抗體重鏈及輕鏈的基因的寡核苷酸探針)。本發明的融合瘤細胞用作此類DNA的較佳來源。在分離後,可將DNA置於表現載體中,然後將這些表現載體轉染到不另外產生免疫球蛋白蛋白質的宿主細胞諸如猿COS細胞、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或骨髓瘤細胞中,以在重組宿主細胞中實現單株抗體的合成。也可以修飾DNA,例如,透過用人重鏈及輕鏈恆定結構域的編碼序列取代同源鼠序列(參見美國專利號4,816,567;Morrison,Nature,第368卷:第812-813頁(1994年))或透過將免疫球蛋白編碼序列共價連接到非免疫球蛋白多肽的全部或部分編碼序列。此類非免疫球蛋白多肽可以取代本發明的抗體的恆定結構域,或者可以取代本發明的抗體的一個抗原結合位元點的可變結構域,以產生嵌合二價抗體。
完全人抗體是其中輕鏈及重鏈兩者的整條序列(包括CDR)都來自人基因的抗體分子。此類抗體在本文中被稱為“人源化抗體”、“人抗體”或“完全人抗體”。人單株抗體可以透過使用三源融合瘤技術;人B細胞融合瘤技術(參見Kozbor等人,1983年,Immunol Today,第4卷:第72頁);及EBV融合瘤技術製備,以產生人單株抗體(參見Cole等,1985年,在:“MONOCLONAL ANTIBODIES AND CANCER THERAPY”,Alan R. Liss, Inc.,第77-96頁)。可以利用人單株抗體,並且這些人單株抗體可以透過使用人融合瘤(參見Cote等人,1983年,Proc Natl Acad Sci USA,第80卷:第2026-2030頁)或透過用愛潑斯坦巴爾病毒在體外轉形人B細胞(參見Cole等人,1985年,在:“MONOCLONAL ANTIBODIES AND CANCER THERAPY”,Alan R. Liss, Inc.,第77-96頁)來產生。
此外,人源化抗體可以在基因轉殖植物中產生,作為現有哺乳動物系統的低價產生替代方案。例如,基因轉殖植物可以是煙草植物,即圓葉煙草(Nicotiania benthamiana)及煙草(Nicotiana tabaccum)。抗體從植物葉片中純化。植物的穩定轉形可以透過使用根癌農桿菌(Agrobacterium tumefacien)或粒子轟擊來實現。例如,經由轉形,在細菌培養物,即根癌農桿菌菌株BLA4404中表現至少含有重鏈及輕鏈序列的核酸表現載體。植物的浸潤可經由注射完成。可溶性葉片萃取物可以透過在研缽中研磨葉片組織並透過離心來製備。抗體的分離及純化可以透過發明所屬技術領域中具有通常知識者已知的許多方法容易地進行。在植物中產生抗體的其他方法在例如Fischer等人,Vaccine,2003年,第21卷:第820-825頁;及Ko等人,Current Topics in Microbiology and Immunology,第332卷,2009年,第55-78頁中有所描述。因此,本發明還提供了任何包含編碼本發明的抗體或產生本發明的抗體的載體的細胞或植物。
此外,可以在真菌中產生所關注的(人)抗體。例如,真菌可以是嗜熱毀絲黴(
Myceliophthora thermophila)(例如,嗜熱毀絲黴菌株C1;Visser等人(2011年),Industrial Biotechnology,第7卷第3期:第214-223頁)。其他示例包括麯黴屬(
Aspergillus)菌種(例如,米麴菌(
A. oryzae)(Huynh等人(2020年),Fungal Biology and Biotechnology,第7卷:第7頁)、黑麴菌(
A. niger)(Ward等人(2004年),Environ.Microbiol.,第70卷:第2567-2576頁)或泡盛麴菌(
A. awamori)(Joosten等人(2003年),Microb.Cell Fact,第2卷:第1頁))及木黴屬(
Trichoderma)菌種(例如,裡氏木黴(
T. reesei)(Nyyssönen等人(1993年),Biotechnology,第11卷:第591-595頁))。在其他情況下,真菌可以是酵母,諸如釀酒酵母(
Saccharomyces cerevisiae)、博伊丁氏假絲酵母(
Candida boidinii)、多形漢遜酵母(
Hansenula polymorpha)、甲醇畢赤酵母(
Pichia methanolica)、巴斯德畢赤酵母(
Pichia pastoris)、解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)、乳酸克魯維酵母(
Kluyveromyces lactis)或微小漢遜酵母(
Ogataea minuta)(Joosten等人(2003年);Suzuki等人(2017年),J Biosci Bioeng.,第124卷:第156-163頁)。
此外,人抗體也可以使用另外的技術(包括噬菌體展示庫)來產生。(參見Hoogenboom及Winter,J. Mol.Biol.,第227卷:第381頁(1991年);Marks等人,J. Mol.Biol.,第222卷:第581頁(1991年))。類似地,人抗體可以透過將人免疫球蛋白基因座引入到基因轉殖動物,例如其中內源免疫球蛋白基因已經部分或完全失活的小鼠中來製備。在攻擊後,觀察到人抗體產生,其在包括基因重排、組裝及抗體庫在內的所有方面都非常類似於在人中所觀察到的。該方法在例如WO 2006/008548、WO 2007/096779、WO 2010/109165、WO 2010/070263、WO 2014/141189及WO 2014/141192中有所描述。
美國專利號5,916,771中公開了一種用於產生所關注的抗體諸如人抗體的方法。該方法包括將含有編碼重鏈的核苷酸序列的表現載體導入到培養物中的一種哺乳動物宿主細胞中,將含有編碼輕鏈的核苷酸序列的表現載體導入到另一種哺乳動物宿主細胞中,並將這兩種細胞融合以形成雜交細胞。雜交細胞表現含有重鏈及輕鏈的抗體。
在對該程序的進一步改進中,PCT公開WO 99/53049中公開了用於鑑定免疫原上的臨床相關表位的方法及用於選擇以高親和力免疫特異性結合相關表位的抗體的關聯方法。
抗體可以用含有編碼上述單鏈抗體的DNA片段的載體表現。
這些可以包括載體、脂質體、裸露DNA、佐劑輔助的DNA、基因槍、導管等。載體包括:化學共軛物,諸如WO 93/64701中所述的,該化學共軛物具有靶向部分(例如,細胞表面受體的配體)及核酸結合部分(例如,聚離胺酸);病毒載體(例如,DNA或RNA病毒載體);融合蛋白,諸如PCT/US 95/02140(WO 95/22618)中所述的,該融合蛋白是含有靶部分(例如,對靶細胞特異性的抗體)及核酸結合部分(例如,魚精蛋白)的融合蛋白;質體;噬菌體等。載體可以是染色體的、非染色體的或合成的。
較佳的載體包括病毒載體、融合蛋白及化學共軛物。反轉錄病毒載體包括莫洛尼鼠白血病病毒(Moloney murine leukemia virus)。較佳的是DNA病毒載體。這些載體包括痘病毒載體諸如正痘病毒或禽痘病毒載體、皰疹病毒載體諸如單純皰疹病毒I型(HSV)載體(參見Geller, A. I.等人,J. Neurochem,第64卷:第487頁(1995年);Lim, F.等人,在:DNA Cloning: Mammalian Systems,D. Glover編撰(Oxford Univ.Press,Oxford,England)(1995年);Geller, A. I.等人,Proc Natl.Acad.Sci.: U.S.A.,第90卷:第7603頁(1993年);Geller, A. I.等人,Proc Natl.Acad.Sci USA,第87卷:第1149頁(1990年)、腺病毒載體(參見LeGal LaSalle等人,Science,第259卷:第988頁(1993年);Davidson等人,Nat. Genet,第3卷:第219頁(1993年);Yang等人,J. Virol.,第69卷:第2004頁(1995年)及腺相關病毒載體(參見Kaplitt, M. G.等人,Nat. Genet.,第8卷:第148頁(1994年)。
痘病毒載體將基因導入到細胞質中。禽痘病毒載體導致核酸的僅短期表現。腺病毒載體、腺相關病毒載體及單純皰疹病毒(HSV)載體較佳用於將核酸導入到神經細胞中。腺病毒載體導致比腺相關病毒(約4個月)更短期的表現(約2個月),這繼而比HSV載體更短。選擇的特定載體將取決於靶細胞及所治療的病症。引入可以透過標準技術例如感染、轉染、轉導或轉形進行。基因轉移模式的示例包括例如裸露DNA、CaPO4沉澱、DEAE葡聚糖、電穿孔、原生質體融合、脂轉染、細胞微注射及病毒載體。
載體可用於靶向基本上任何所需的靶細胞。例如,立體定向注射可用於將載體(例如,腺病毒、HSV)引導至所需位置。另外,可以使用微型泵輸注系統諸如SynchroMed輸注系統,透過腦室內(icv)輸注來遞送顆粒。也已經證明稱之為對流的基於整體流動的方法在將大分子遞送至腦的擴展區域方面是有效的,並且可以用於將載體遞送至靶細胞。(參見Bobo等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,第91卷:第2076-2080頁(1994年);Morrison等人,Am. J. Physiol.,第266卷:第292-305頁(1994年))。可以使用的其他方法包括導管、靜脈內、腸胃外、腹腔內及皮下注射,以及口服或其他已知的施用途徑。
這些載體可用於表現大量可以多種方式使用的抗體。例如,用於檢測樣本中ROR1的存在。抗體也可用於嘗試結合ROR1。
用於篩選具有所需特異性的抗體的方法包括但不限於酶聯免疫吸附測定(ELISA)及本領域已知的其他免疫學介導的技術。
治療方法
可施用本文提供的抗體以減緩或抑制ROR1陽性癌症的進展,以及/或者抑制ROR1陽性癌症的轉移。在這些應用中,將治療有效量的組合物以足以抑制癌細胞的生長、複製或轉移或者抑制癌症的體徵或症狀的量施用於受試者。合適的受試者可包括診斷患有表現ROR1的癌症的那些受試者,該癌症諸如B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
本文所公開的抗體的施用還可伴有其他抗癌劑的施用或治療處理(諸如腫瘤的手術切除)。任何合適的抗癌劑都可與本文所公開的抗體組合施用。示例性抗癌劑包括但不限於化學治療劑,諸如,例如有絲分裂抑制劑、烷化劑、抗代謝物、嵌入抗生素、生長因子抑制劑、細胞週期抑制劑、酶、拓撲異構酶抑制劑、抗存活劑、生物反應調節劑、抗激素(例如抗雄激素)及抗血管生成劑。其他抗癌治療包括放射療法以及特異性靶向癌細胞的其他抗體。
在一些實施方案中,本發明的抗體或其抗原結合片段、雙特異性抗體、核酸、載體、宿主細胞、抗體-藥物共軛物或藥物組合物可與抗體、化療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物組合施用。
對於某些類型的癌症,另一種常見的治療是手術治療,例如轉移性腫瘤的手術切除。治療的另一個示例是放射性療法,例如向腫瘤部位施用放射性材料或能量(諸如外照射療法)以幫助根除腫瘤或在手術切除之前使其縮小。
診斷及檢測方法
在一個方面,本發明提供了一種用於確定患有癌症或具有發展ROR1陽性癌症的風險的受試者的方法,其中該方法包括:
(a) 從該受試者獲得生物樣本,
(b) 使該樣本與本發明的抗體或其抗原結合片段接觸;以及
(c) 檢測該抗體與該樣本的結合,
其中相比於該抗體或其抗原結合片段與對照樣本的結合,該抗體或其抗原結合片段與該樣本的結合增加,鑑定出該受試者患有ROR1陽性癌症。
在另一個方面,本發明提供了一種用於對受試者的ROR1陽性癌症進行成像的方法,其中該方法包括:
(a) 向該受試者施用本發明的抗體或其抗原結合片段,其中該抗體共軛到可檢測標記物;以及
(b) 檢測該標記物的存在
本文提供了在體外或體內檢測ROR1蛋白的方法。在一些情況下,在生物樣本中檢測到ROR1表現。該樣本可以是任何樣本,包括但不限於血液樣本、腫瘤樣本、來自活檢、屍檢及病理標本的組織。生物樣本還包括組織切片,例如,用於組織學目的冷凍切片。生物樣本還包括體液,諸如血液、血清、血漿、痰、脊髓液或尿。生物樣本通常從哺乳動物獲得,諸如人或非人靈長類動物。
本文提供了一種透過使來自受試者的樣本與本文所公開的ROR1特異性單株抗體接觸以及檢測該抗體與該樣本的結合,來確定受試者是否患有癌症的方法。相比於該抗體與對照樣本的結合,該抗體與該樣本的結合增加,鑑定出受試者患有癌症。
在另一個實施方案中,提供了一種透過使來自診斷患有癌症的受試者的樣本與本文所公開的ROR1特異性單株抗體接觸以及檢測該抗體與該樣本的結合,來診斷受試者的癌症的方法。相比於該抗體與對照樣本的結合,該抗體與該樣本的結合增加,確認受試者的癌症的診斷。
在所公開的方法的一些示例中,單株抗體被直接標記。
在其他示例中,該方法還包括使特異性結合單株抗體的第二抗體與樣本接觸;以及檢測第二抗體的結合。相比於第二抗體與對照樣本的結合,第二抗體與該樣本的結合增加,檢測出受試者的癌症或確認受試者的癌症的診斷。
在一些情況下,該癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
在一些示例中,對照樣本是來自沒有癌症的受試者的樣本。在特定的示例中,樣本是血液或組織樣本。
在診斷及檢測方法的一些實施方案中,抗ROR1抗體用可檢測標記來直接標記。在另一個實施方案中,抗ROR1抗體(第一抗體)是未標記的,並且第二抗體或可結合第一抗體的其他分子被標記。如發明所屬技術領域中具有通常知識者所公知的,選擇能夠特異性結合第一抗體的特定種類及類別的二級抗體。例如,如果第一抗體是人IgG,那麼二級抗體可以是抗人IgG。可結合抗體的其他分子包括但不限於A蛋白及G蛋白,兩者均是可商購獲得的。
用於抗體或二級抗體的合適標記包括各種酶、輔基、螢光材料、發光材料、磁性試劑及放射性材料。合適的酶的非限制性示例包括辣根過氧化氫酶、鹼性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或乙醯膽鹼酯酶。合適的輔基複合物的非限制性示例包括鏈黴親和素/生物素及抗生物素蛋白/生物素。合適的螢光材料的非限制性示例包括傘形酮、螢光素、螢光異構硫氰酸鹽、羅丹明、二氯三嗪基胺螢光素、丹磺醯氯或藻紅蛋白。非限制性的示例性發光材料是魯米諾(luminol);非限制性的示例性磁性試劑是釓,並且非限制性的示例性放射性標記包括
125I、
131I、
35S或
3H。
在另一個實施方案中,可利用標記有可檢測物質的ROR1蛋白標準品及未標記的抗ROR1抗體,透過競爭免疫測定來測定生物樣本中的ROR1。在該測定中,將生物樣本、標記的ROR1蛋白標準品及抗ROR1抗體合併,並測定與未標記的抗體結合的標記的ROR1蛋白標準品的量。生物樣本中ROR1的量及與抗-ROR1抗體結合的標記ROR1蛋白標準品的量成反比。
本文所公開的免疫測定及方法可用於許多目的。在一個實施方案中,抗ROR1抗體可用於檢測細胞培養物中的細胞中ROR1的產生。在另一個實施方案中,該抗體可用於檢測生物樣本(諸如腫瘤樣本、組織樣本或者血液或血清樣本)中ROR1的量。在一些示例中,ROR1是細胞表面ROR1。在其他示例中,ROR1蛋白是可溶的(例如在細胞培養上清液中,或者在體液樣本諸如血液或血清樣本中)。
在一個實施方案中,提供了一種用於檢測生物樣本(諸如腫瘤樣本、血液樣本或組織樣本)中ROR1的套組。例如,為了驗證受試者的癌症診斷,可進行活檢以獲得用於組織學檢查的組織樣本。用於檢測多肽的套組通常將包括單株抗ROR1抗體,諸如本文所公開的單株抗體中的任何單株抗體。在另一個實施方案中,抗體被標記(例如,用螢光、放射性物質或酶標記)。
在一個實施方案中,套組包括說明材料,這些說明材料公開了使用抗-ROR1抗體的方法。說明材料可以電子形式(諸如電腦磁片或光碟)書寫,或者可以是可視的(諸如影片檔)。套組還可包括另外的組分以促進套組被設計用於的特定應用。因此,例如,套組可另外含有檢測標記的裝置(諸如用於酶標記的酶基質,用於檢測螢光標記、適當的二級標記(諸如二級抗體)的篩檢組(filter sets )等)。套組可另外包括習知用於實施特定方法的緩衝液及其他試劑。這些套組及適當的內容物是發明所屬技術領域中具有通常知識者公知的。
在一個實施方案中,診斷套組包括免疫測定。儘管免疫測定的細節可隨所採用的特定形式而變化,但檢測生物樣本中ROR1的方法通常包括使生物樣本與抗-ROR1抗體接觸的步驟。使抗體在免疫反應條件下進行特異性結合以形成免疫複合物,並直接或間接檢測該免疫複合物(結合的抗體)的存在。
本文所公開的抗體也可用於免疫測定,諸如但不限於放射性免疫測定(RIA)、ELISA或免疫組織化學測定。抗體還可用於螢光活化的細胞分選(FACS)。FACS採用多個顏色通道、低角度及鈍角光散射檢測通道以及阻抗通道,以及其他更複雜的檢測水平,以分離或分選細胞(參見美國專利號5,061,620)。如本文所公開的,任何結合ROR1的單株抗體都可用於這些測定。因此,抗體可用於習知免疫測定,包括但不限於ELISA、RIA、FACS、組織免疫組織化學、Western墨點法或免疫沉澱。
實施例
實施例1 抗原及穩定細胞系的製備
1.1. 抗原及其他蛋白質的製備
重組人ROR1 ECD Fc-標籤蛋白(目錄號RO1-H5250)及人ROR1-ECD-his(縮寫為hROR1-ECD-his)購自Acro Biosystems(目錄號:RO1-H522y)。
1.2. 穩定細胞系的製備
HEK293T-hROR1(人ROR1)購自Kyinno(目錄號:KC-1018)。如下製備CHO-K1-cynoROR1(食蟹猴ROR1)及CHO-K1-huROR1(人ROR1)穩定細胞系。將CHO-K1細胞懸浮液在50000/mL的密度下以2mL/孔接種到6孔盤中,培育過夜,然後加入Polybrene(上海吉凱基因(Shanghai Jikai Gene),REVG0001,10mg/mL)使終濃度為4μg/mL,混合並加入10μL病毒(LV-CynoROR1,購自上海吉凱基因(Shanghai Genechem),42582-1,力價1E9/mL,50μL/小瓶),混合並在37℃培育8小時,然後棄去上清液並用新鮮培養基替換,並在37℃培養。消化24小時後,將細胞重懸於含有8μg/mL嘌呤黴素(Thermo,A1113803)的完全培養基中,將細胞稀釋至5/mL,並用100μL/孔的10個96孔盤在37℃培養10天。選擇單株用於FACS驗證。在驗證之後,將所驗證的殖株進一步擴增並培養用於冷凍儲存。
實施例2動物免疫方案
為了獲得ROR1特異性抗體,透過不同的方法對Harbour HCAb基因轉殖小鼠(https://harbourantibodies.com/)進行免疫。免疫後獲得了多個結合ROR1胞外(extracellular;ECD)蛋白或ROR1表現細胞的HCAb抗體。
2.1. 透過注射ROR1蛋白來免疫
重組人ROR1 ECD Fc-標籤蛋白(Acro Biosystem,目錄號RO1-H5250)被用作免疫原以對Harbour HCAb基因轉殖小鼠進行免疫。
Harbour HCAb小鼠免疫組的免疫方案在下表5中列出。簡言之,每隻小鼠用50μg免疫原與佐劑(Sigma,F5881)經由腹腔內進行第一次加強免疫,並用25μg免疫原與佐劑(Sigma,S6322)經由腹腔內進行後續的加強免疫。每兩周進行一次免疫,共計5次。經由腹腔內用稀釋在PBS中的免疫原進行最終免疫。使用ELISA測試針對人重組人ROR1 ECD His-標籤蛋白(Acro Biosystem,目錄號RO1-H522y)的血清力價,並且使用FACS測試針對表現ROR1的細胞系的血清力價。
表5. 免疫方案
免疫原 | 動物編號 | 品系 | 途徑 | 佐劑 | 劑量(μg/動物) |
huROR1-ECD-huFc | 10 | HCAb 2.1 | 腹腔內(250μl) | CFA/Ribi/Ribi/Ribi/Ribi | 50/25/25/25/25 ug |
2.2. 透過注射ROR1細胞來免疫
HEK293T-hROR1被用作免疫原以對Harbour HCAb基因轉殖小鼠進行免疫。Harbour HCAb小鼠免疫組的免疫方案在下表6中列出。簡言之,給每隻小鼠腹腔內注射重懸浮於PBS中的1.0×10
7個HEK293T-hROR1細胞,以用於初次免疫。對於加強免疫,將1.0×10
7個HEK293T-hROR1細胞重懸浮於PBS中並腹腔內注射給小鼠。初次免疫及首次加強免疫之間的間隔是2周。對於隨後的加強免疫,每三周將1.0×10
7個HEK293T-hROR1細胞腹腔內注射給小鼠,共5次。每次加強免疫後七天,對小鼠取血,並使用ELISA測試針對重組人ROR1 ECD His-標籤蛋白(Acro Biosystem,目錄號RO1-H522y)的血清力價,並且使用FACS測試針對表現ROR1的細胞系的血清力價。
表6. 免疫方案
免疫原 | 動物編號 | 品系 | 途徑 | 佐劑 | 劑量(細胞/動物) |
HEK293T-huROR1 | 10 | HCAb 2.1 | 腹腔內(250μl) | - | 1.0×10^7個細胞 |
實施例3 對ROR1特異性HCAb抗體的篩選
3.1. 對HCAb抗體的HEK293-pCAG-HCAb定向選殖篩選
在本實施例中,從具有高抗體力價的小鼠中收集淋巴結,用於製備cDNA。HCAb cDNA的可變區透過PCR使用特異性引子(5' -GGTGTCCAGTGTSAGGTGCAGCTG-3'(序列識別號: 262)、5'-AATCCCTGGGCACTGAAGAGACGGTGACC-3'(序列識別號: 263))放大,並選殖到含有IgG1亞類的人免疫球蛋白重鏈Fc部分的哺乳動物表現載體(pCAG)上,命名為pCAG-HCAb庫。製備pCAG-HCAb庫的質體並將這些質體轉染到96孔盤上的HEK293細胞(ATCC,CRL-1573)中,以用於進行表現,然後收穫HEK293-pCAG-HCAb的上清液並將這些上清液轉移到不同的96孔盤中,以用於透過體外結合測定法進行篩選。透過Mirrorball(SPT Labtech)測試與表現人ROR1的穩定細胞系CHO-K1-huROR1的結合,以及與表現食蟹猴ROR1的穩定細胞系CHO-K1-cynoROR1的結合。選擇表現出與CHO-K1-huROR1及CHO-K1-cynoROR1兩者結合的HEK293細胞上清液,以用於隨後的FACS篩選。最後,選擇多個HCAb殖株,以用於進一步的表徵。
3.2. 對HCAb抗體的單B細胞篩選
Beacon® Optofluidic系統用於單B細胞篩選。該系統使用光電定位(optical-electric positioning;OEPTM)技術來移動單個細胞,並且允許在細胞培養條件下同時進行生物功能測試、實驗分析、陽性殖株選擇及其他操作。Beacon平臺可以對數千個細胞以大規模並行、自動化的方式執行這些任務。
在本實施例中,使用漿細胞發現工作流程(plasma cell discovery workflow)。在每個實驗中,針對ROR1特異性抗體的分泌情況,篩選多達14,000個單獨漿細胞。然後,將分泌抗原特異性抗體的漿細胞轉移到96孔盤中以用於隨後的單B細胞測序,從而鑑定由單B細胞(單株)產生的抗體的重鏈。圖1示出了篩選策略及過程。
本實施例使用單B細胞測序方法以從單個漿細胞中獲得抗體的重鏈的序列。一般程序包括從單個漿細胞裂解物中萃取及純化總RNA、反轉錄合成cDNA、放大及純化cDNA、放大編碼抗體的重鏈的DNA序列、選殖及轉染以及Sanger測序。對所獲得的序列進行獨特性及聚類分析,然後合成編碼抗體的重鏈的DNA序列。
實施例4. 抗體生產及純化
使用PEI(Polyscience,24885)將編碼靶抗體的重組質體暫態轉染到HEK293-6E細胞(國家研究委員會)中。轉染後,將細胞在37℃、5% CO
2條件下培育,以120rpm振盪。在轉染後6天至7天,透過離心及過濾收穫含有靶抗體的細胞培養上清液。使用蛋白質A磁珠(AmMag蛋白質A磁珠,Genscript,L00695)純化單株抗體。
透過SEC-HPLC(Agilent 1260 Infinity II HPLC系統,Welch Xtimate SEC-300色譜柱,pH 7.4的1×PBS作為流動相)及SDS-PAGE(SurePAGE,Bis-Tris,10×8,4%-12%,12孔,Genscript,M00653)來測試抗體的純度。重組抗體成功表現並純化以用於進一步表徵。
透過實施例1至4,獲得了HCAb抗體PR005337、PR005338、PR005339、PR005340、PR005341、PR005342、PR005343、PR005344、PR005345、PR005346、PR005347、PR005348、PR005349、PR005350、PR005351、PR005352、PR303125、PR303189、PR303191、PR303199、PR303201、PR303145、PR303147及PR303155。這些抗體的胺基酸序列在上述表1至表3中列出。
同時,抗ROR1抗體PR000374按照上述方法用國際專利申請號WO2016/094873(在此引入作為參考)的序列資訊來製備。PR000374是來自專利WO2016/094873的兔抗人ROR1 Ab。
實施例5. 抗體的結合活性
5.1. 對表現ROR1的細胞的結合活性
透過流式細胞術測試重組抗ROR1抗體與過表現人或食蟹猴ROR1的細胞的結合。在本實施例中,表現ROR1的細胞系是已被轉染以在表面上表現人ROR1的HEK293T細胞系(HEK293T-hu ROR1,KYINNO BIOTECHNOLOGY有限公司,目錄號KC-1018)、已被轉染以表現食蟹猴ROR1的CHO-K1細胞系(CHOK1-cyno ROR1)、PANC-1(ATCC,目錄:CRL-1469)或A549細胞系(上海生物化學及細胞生物學研究所,中國科學院)。
簡言之,將抗ROR1抗體在染色緩衝液(含有2% FBS的PBS緩衝液)中序列稀釋。抗體溶液與1×10
5個細胞在4℃下培育1小時。用染色緩衝液(含有2% FBS的PBS)將細胞洗滌兩次,並將100μL的1:1000稀釋的螢光標記的抗人IgG抗體(Alexa Fluor 647 AffiniPure山羊抗人IgG Fc,Jackson ImmunoResearch,目錄109-605-098,或Alexa Fluor® 488 AffiniPure 山羊抗人IgG(H+L),Jackson ImmunoResearch,目錄109-545-088)加入每個孔中。在4℃下培育1小時後,用染色緩衝液將細胞洗滌兩次,並進行流式細胞術。PR000374(Bench marker 1)及非相關IgG同種型對照(Crownbio)分別用作陽性及陰性對照。
PR005337、PR005338、PR005339、PR005340、PR005341、PR005342、PR005343、PR005344、PR005345、PR005346、PR005347、PR005348、PR005349、PR005350、PR005351及PR005352的結果示於圖2A、圖2B、圖3A、圖3B、圖3C及下表7至表8中。結果顯示,HCAb抗體對PANC-1細胞具有良好的結合活性,並且對CHO-K1-cynoROR1細胞具有強結合活性,表明這些HCAb抗體與cynoROR1具有交叉反應性。
表7. 抗ROR1 HCAb抗體與CHO-K1-cyno ROR1細胞的結合
抗體代碼 | EC50 | 最大值 |
PR005337 | 18.18 | 31123 |
PR005339 | 4.40 | 34835 |
PR005340 | 3.44 | 36398 |
PR005341 | 3.22 | 32905 |
PR005342 | 7.27 | 34495 |
PR005343 | 3.62 | 34069 |
PR005347 | 13.49 | 32745 |
PR000374 | 5.20 | 25195 |
EC50 | 最大值 | |
PR005338 | 8.042 | 33279 |
PR005344 | 15.09 | 30737 |
PR005345 | 22.37 | 24571 |
PR005346 | 10.38 | 26634 |
PR005348 | 73.37 | 27989 |
PR005350 | 79.08 | 14394 |
PR005351 | 20.1 | 27464 |
PR000374 | 3.883 | 23157 |
表8. 抗ROR1 HCAb抗體與PANC-1細胞的結合
抗體代碼 | EC50 | 最大值 |
PR005337 | 17.10 | 14706 |
PR005339 | 1.75 | 16194 |
PR005340 | 1.81 | 17527 |
PR005341 | 2.13 | 16531 |
PR005342 | 4.30 | 16681 |
PR005343 | 2.24 | 18287 |
PR005347 | 8.08 | 16428 |
PR000374 | 5.47 | 10681 |
EC50 | 最大值 | |
PR005338 | 6.70 | 12711 |
PR005344 | 20.01 | 12390 |
PR005345 | 45.04 | 9714 |
PR005346 | 8.28 | 10167 |
PR005348 | 112.80 | 10198 |
PR005350 | 190.30 | 4248 |
PR005351 | 20.95 | 10899 |
PR000374 | 7.51 | 8935 |
EC50 | 最大值 | |
PR005349 | 10.5 | 27100 |
PR005352 | 9.297 | 23316 |
HCAb抗體PR303125、PR303189、PR303191、PR303199、PR303201、PR303145、PR303147及PR303155的結果示於圖2C、圖3D、圖4、圖5及下表9中。結果表明HCAb抗體對表現人ROR1及食蟹猴ROR1兩者的細胞顯示出強結合活性。這些結果表明抗ROR1 HCAb抗體能夠以高親和力結合細胞膜上的人ROR1及食蟹猴ROR1。
表9. 透過FACS測試抗ROR1 HCAb抗體與細胞表面ROR1結合
HEK293T-hROR1 | CHO-K1-cynoROR1 | PANC-1 | A549 | |||||
抗體代碼 | EC50(μg/ml) | 最大值(MFI) | EC50(μg/ml) | 最大值(MFI) | EC50(μg/ml) | 最大值(MFI) | EC50(μg/ml) | 最大值(MFI) |
PR303125 | 0.273 | 1.50E+07 | 0.222 | 8.27E+06 | 0.463 | 8.83E+05 | 0.16 | 6.68E+05 |
PR303189 | 0.085 | 1.46E+07 | 7.525 | 5.30E+06 | +/- | 2.40E+05 | - | 9.01E+03 |
PR303191 | 0.044 | 1.40E+07 | 0.030 | 9.24E+06 | +/- | 3.64E+05 | 0.01 | 6.50E+05 |
PR303199 | 0.191 | 1.53E+07 | 1.427 | 6.85E+06 | 11.320 | 4.62E+05 | 6.79 | 4.08E+05 |
PR303201 | 0.066 | 1.55E+07 | 0.057 | 1.07E+07 | +/- | 9.35E+05 | 0.08 | 1.23E+06 |
PR303145 | 0.158 | 1.35E+07 | 0.474 | 1.04E+07 | 0.654 | 6.53E+05 | 0.93 | 8.75E+05 |
PR303147 | 0.325 | 1.46E+07 | 1.257 | 3.67E+06 | 7.773 | 2.91E+05 | 6.46 | 4.12E+05 |
PR303155 | 0.267 | 1.49E+07 | 0.804 | 1.10E+07 | 1.069 | 5.52E+05 | 1.32 | 7.91E+05 |
同種型 | - | - | - | - | - | - | - | - |
PR000374 | 0.506 | 1.49E+07 | 0.314 | 1.05E+07 | 0.905 | 4.42E+05 | 0.61 | 6.95E+05 |
5.2. 對hu-ROR1-ECD-his的結合活性
透過ELISA測試重組抗ROR1抗體與hu-ROR1-ECD-his的結合。簡言之,將1μg/mL的hu-ROR1-ECD-his加入96孔盤中,100μL/孔,在4℃下培育過夜,用1×PBST將盤洗滌3次,300μL/孔,用1×PBST中的2% BSA將盤封閉,200μL/孔,在37℃下培育1小時,使抗ROR1抗體在染色緩衝液(含有2% BSA的PBS)中序列稀釋。將抗體溶液加入盤中並在37℃下培育1小時,用1×PBST將盤洗滌3次,300μl/孔,加入二級抗體100μl/孔並在37℃下培育1小時,用1×PBST將盤洗滌3次,300μl/孔,然後加入100μl/孔的TMB保持約5分鐘,透過加入100μl/孔的2M H
2SO
4終止反應,用Molecular Device Spectra Max Plus384在450nm及570nm下讀取盤。
HCAb抗體的結果示於圖6及下表10中。結果表明HCAb抗體對hu-ROR1-ECD-his顯示出強結合活性。這些結果表明抗ROR1 HCAb抗體能夠以高親和力結合人ROR1。
表10. 透過ELISA測試抗ROR1 HCAb抗體與hu-ROR1-ECD-his結合
抗體代碼 | EC50(μg/ml) |
PR303125 | 0.002 |
PR303189 | 0.002 |
PR303191 | 0.001 |
PR303199 | 0.006 |
PR303201 | 0.004 |
PR303145 | 0.002 |
PR303147 | 0.023 |
PR303155 | 0.002 |
同種型 | X |
PR000374 | 0.001 |
實施例6 PR005340親和力成熟
PR005340的親和力成熟是透過用BD FACS AriaIII分選機進行酵母表面展示來進行的。首先,透過Kabat編號分析了PR005340的序列,並且還確定了CDR區。將位點飽和及CDR步移策略應用於該HCAb親和力成熟。構建四個誘變庫,並分別命名為5340-H1L、5340-H2L、5340-H3L及5340-H2WL。如下進行兩輪分選及篩選。
在第1輪分選及篩選中,透過BD FACS AriII來分選及篩選5340-H1L、5340-H2L及5340-H3L;對5340-H2WL庫進行MACS富集以及FACS分選及篩選。對於每個展示庫,進行閘控(gated )並挑出具有高結合的群體;然後還培養並挑出分選的酵母細胞,以用於測序及分析;獨特hit也透過FACS表徵。基於FACS結果,選擇幾個熱點並將它們組合到組合誘變庫中。
在第2輪中,設計並構建了組合庫。還對展示庫進行閘控及分選;還培養並挑出具有高結合的分選群體,以用於測序及分析,所有獨特hit透過FACS表徵。
最後,篩選並合成了15種單價形式(VH-Flag-His)變體(PR009810、PR009811、P009812、PR009813、PR009814、PR009815、PR009816、PR009817、PR009818、PR009819、PR009820、PR009821、PR009822、PR009823及PR009824)及17種二價形式(HCAb)變體(PR007408、PR007409、PR007410、PR007411、PR007412、PR007413、PR007414、PR007415、PR007416、PR007417、R007418、PR007419、PR007420、PR007421、PR007422、PR007423及PR007424)。這些變體的胺基酸序列在上表1至表3中列出。
使用實施例5.1中描述的相同方法測試變體與PANC-1細胞的結合活性。結果示於圖7A-7C至圖8A-8C以及表11及表12中。如所示,與PR005340相比,大多數變體顯示出顯著的結合增強。
表11. PR005340單價形式變體與PANC-1細胞的結合
抗體代碼 | EC50 | 最大值 |
PR009810 | 0.3132 | 3988 |
PR009811 | 0.3651 | 4082 |
PR009812 | 0.3235 | 3481 |
PR009813 | 0.4616 | 3493 |
PR009814 | 0.3595 | 3330 |
PR009815 | 0.2569 | 3232 |
PR009816 | 0.3707 | 3201 |
PR009817 | 0.2067 | 4672 |
PR009818 | 0.1537 | 4518 |
PR009819 | 0.1083 | 4376 |
PR009820 | 0.09228 | 4600 |
PR009821 | 0.1013 | 4524 |
PR009822 | 0.1861 | 4335 |
PR009823 | 1.026 | 4909 |
PR009824 | 1.461 | 4622 |
表12. PR005340二價形式變體與PANC-1細胞的結合
抗體代碼 | FACS與PANC-1的結合 | |
TOP | EC50 | |
PR005340 | 84867 | 2.65 |
PR007408 | 87015 | 0.37 |
PR007409 | 87438 | 0.8 |
PR007410 | 80302 | 0.76 |
PR007411 | 81434 | 0.65 |
PR007412 | 77181 | 0.55 |
PR007413 | 89837 | 0.584 |
PR007414 | 88874 | 0.496 |
PR007415 | 82756 | 0.3652 |
PR007416 | 87637 | 0.7235 |
PR007417 | 83758 | 0.7836 |
PR007418 | 81348 | 0.3941 |
PR007419 | 75713 | 0.7909 |
PR007420 | 79539 | 0.7015 |
PR007421 | 86578 | 0.7776 |
PR007422 | 73634 | 0.5903 |
PR007423 | 74531 | 0.4087 |
PR007424 | 70766 | 0.5504 |
實施例7 透過BLI法分析抗體與可溶性ROR1蛋白的結合活性
在本實施例中,透過在Fortebio Octet Red384儀器(Fortebio)上使用生物膜干涉技術(BLI)分析法來分析抗ROR1抗體與可溶性ROR1蛋白的結合動力學。
7.1. 透過使用HIS1K感測器來測量抗體對ROR1蛋白的結合親和力
在BLI分析中,將重組抗ROR1抗體用10×動力學緩衝液(Fortebio)序列稀釋。將人ROR1-His蛋白稀釋至20nM。然後將稀釋的抗體、ROR1蛋白及再生緩衝液(10mM甘胺酸鹽酸,pH 1.5)加入96孔盤(Greiner)中。使用HIS1K感測器(Fortebio)測量結合及解離的速率常數。在每次結合實驗後用再生緩衝液再生感測器表面。使用Octet資料分析軟體(版本11.0,Pall ForteBio,CA,USA)處理蹤跡。
抗ROR1 HCAb抗體與人ROR1結合的結合動力學參數總結於表13中。如表13所示,在Octet分析中,HCAb抗體顯示出對可溶性ROR1的高結合親和力。
表13. 抗ROR1 HCAb抗體與可溶性人ROR1的結合
抗體代碼 | K D(M) | kon(1/Ms) | kdis(1/s) | 全R^2 |
PR303125 | <1.0E-12 | 1.65E+05 | <1.0E-07 | 0.64 |
PR303189 | 6.234E-10 | 6.46E+06 | 4.03E-03 | 0.83 |
PR303191 | 3.95E-11 | 2.90E+06 | 1.15E-04 | 0.98 |
PR303199 | 1.409E-08 | 1.23E+05 | 1.73E-03 | 0.90 |
PR303201 | 4.891E-09 | 1.28E+06 | 6.26E-03 | 0.98 |
PR303145 | 1.11E-08 | 2.78E+05 | 3.10E-03 | 0.99 |
PR303147 | 1.12E-08 | 1.47E+06 | 1.65E-02 | 0.70 |
PR303155 | 6.83E-09 | 4.92E+05 | 3.36E-03 | 0.99 |
7.2. 透過使用AHC感測器來測量抗體對ROR1蛋白的結合親和力
在BLI分析中,使用新鮮製備的1×動力學緩衝液(10×動力學緩衝液(ForteBio,#18-1105)用PBS(BBI Life Sciences,# E607016-0500)稀釋)將抗體稀釋至5μg/mL,並將該抗體捕獲在抗人Fc (AHC) Octet生物感測器(ForteBio,#18-5060)的表面上,以達到介於0.6nm及1.0nm之間的捕獲水平。然後將捕獲的生物感測器浸入含有抗原蛋白的2倍序列稀釋液的孔中以檢測締合訊號,隨後在含有1×動力學緩衝液的孔中進行解離步驟。將人ROR1 hit標記的蛋白質(Acrobiosystems,#RO1-H522y)從80nM稀釋至5nM;締合階段為180秒,並且解離階段為600秒。記錄感測圖,並在使用ForteBio Data Analysis 11.0軟體進行曲線擬合之前減去參考訊號。使用簡單的一對一Langmuir結合模型計算締合速率(k
on)及解離速率(k
dis)。將平衡解離常數(K
D)計算為k
dis/k
on的比率。抗ROR1 HCAb抗體與人ROR1結合的結合動力學參數總結於表14中。
表14.抗ROR1抗體與可溶性人ROR1的結合
抗體代碼 | 抗原 | 抗原濃度 ( nM ) | KD ( M ) | kon ( 1/Ms ) | kdis ( 1/s ) | 全 R^2 |
PR005338 | 人ROR1,His標籤 | 5-80 | 2.40E-09 | 1.32E+05 | 3.16E-04 | 0.9954 |
PR005340 | 5-80 | 1.20E-09 | 1.43E+05 | 1.71E-04 | 0.9968 | |
PR007417 | 5-80 | 1.80E-10 | 2.71E+05 | 4.86E-05 | 0.9952 | |
PR007424 | 5-80 | 1.01E-09 | 2.81E+05 | 2.84E-04 | 0.9955 |
實施例8. 抗體特異性驗證
8.1. 透過ELISA測試抗體與人ROR2的結合。
將1μg/mL的hu-ROR2-ECD-his(Acrobiocystems,RO2-H52E5)加入96孔盤中,100μL/孔,在4℃下培育過夜,用1×PBST將盤洗滌3次,300μL/孔,用1×PBST中的2% BSA將盤封閉,200μL/孔,在37℃下培育1小時,使抗ROR1抗體在染色緩衝液(含有2% BSA的PBS)中序列稀釋。將抗體溶液加入盤中並在37℃下培育1小時,用1×PBST將盤洗滌3次,300μl/孔,加入二級抗體100μl/孔並在37℃下培育1小時,用1×PBST將盤洗滌3次,300μl/孔,然後加入100μl/孔的TMB保持約5分鐘,透過加入100μl/孔的2M H
2SO
4終止反應,用Molecular Device Spectra Max Plus384在450nm及570nm下讀取盤。
HCAb抗體的結果示於圖9中。結果表明HCAb抗體對hu-ROR2-ECD-his未顯示出結合活性。這些結果表明抗ROR1 HCAb抗體與ROR1特異性結合。
8.2. 透過BLI法測試抗體與人ROR2的結合
在本實施例中,透過在Fortebio Octet Red384儀器(Fortebio)上使用生物膜干涉技術(BLI)分析法來分析抗ROR1抗體與可溶性ROR2蛋白的結合動力學。
在BLI分析中,使用新鮮製備的1×動力學緩衝液(10×動力學緩衝液(ForteBio,#18-1105)用PBS(BBI Life Sciences,# E607016-0500)稀釋)將抗體稀釋至5μg/mL,並將該抗體捕獲在抗人Fc (AHC) Octet生物感測器(ForteBio,#18-5060)的表面上,以達到介於0.6nm及1.0nm之間的捕獲水平。然後將捕獲的生物感測器浸入含有抗原蛋白的2倍序列稀釋液的孔中以檢測締合訊號,隨後在含有1×動力學緩衝液的孔中進行解離步驟。將人ROR2 hit標記的蛋白質(Acrobiosystems,# RO2-H52E5)從600nM稀釋至37.5nM;締合階段為180秒,並且解離階段為180秒。記錄感測圖,並在使用ForteBio Data Analysis 11.0軟體進行曲線擬合之前減去參考訊號。使用簡單的一對一Langmuir結合模型計算締合速率(k
on)及解離速率(k
dis)。將平衡解離常數(K
D)計算為k
dis/k
on的比率。
抗ROR1 HCAb抗體與人ROR2結合的結合動力學參數總結於表15中。結果顯示HCAb抗體對ROR2不具有結合活性,表明抗ROR1 HCAb抗體與ROR1特異性結合。
表15. 抗ROR1抗體與可溶性人ROR2的結合
抗體代碼 | 抗原 | 抗原濃度 ( nM ) | KD ( M ) | kon ( 1/Ms ) | kdis ( 1/s ) | 全 R^2 |
PR005338 | 人ROR2,His標籤 | 37.5-600 | 不結合 | |||
PR005340 | 37.5-600 | 不結合 | ||||
PR007417 | 37.5-600 | 不結合 | ||||
PR007424 | 37.5-600 | 不結合 |
實施例9. 透過競爭測定法來測定抗體的表位連接
為了確定抗ROR1抗體是否在不同的或近似的結合表位上結合人ROR1,使用ForteBio Octet® RED96e平臺在抗ROR1抗體上進行表位競爭實驗。將人ROR1蛋白(Acrobiosystems,#RO1-H522y)生物素化,然後捕獲在SA生物感測器(ForteBio,#18-5020)上,以達到0.3nm至0.4nm的負載水平。應用串聯競爭測定形式,並且其包含兩個締合步驟。首先,裝載有抗原的生物感測器以200nM的飽及濃度結合每種抗體(也稱為第一抗體,第1 Ab)180秒以達到平衡,然後結合200nM的競爭性抗體(也稱為第二抗體,第2 Ab)180秒。當第一抗體被動態緩衝液代替時,第二結合訊號被記錄為每種抗體的100%訊號。使用ForteBio Data Analysis 11.0軟體分析所有結合資料。抑制率由下式計算:
抑制率(%)=(A-B)/A*100
A:每種抗體的100%訊號;
B:第二抗體結合步驟的訊號。
若得到的抑制率大於80(%),則說明兩種抗體的表位完全重疊;如果抑制率小於40(%),則說明兩種抗體的表位不同或相互遠離。
如表16及表17所示,HCAb抗體PR005338、PR005340、PR007417及PR007424共用人ROR1上的幾乎相同的結合表位,但與參考抗體PR000374完全不同。HCAb抗體PR303189、PR303199、PR303145、PR303147、PR303155、PR303125、PR303191、PR303201顯示出與PR000374不同的結合表位;其中,PR303125、PR303191、PR303201共用相似或重疊的表位,但與其他HCAb抗體不同。
表16. 表位競爭測定中抗體的抑制率
抑制率(%) | 第2 Ab | |||||
PR005338 | PR005340 | PR007417 | PR007424 | PR000374 | ||
第1 Ab | PR005338 | 103.62% | 107.73% | 107.80% | 102.42% | -3.02% |
PR005340 | 106.23% | 109.38% | 108.72% | 106.11% | -0.17% | |
PR007417 | 113.69% | 116.43% | 112.59% | 111.34% | 10.25% | |
PR007424 | 107.56% | 111.11% | 111.27% | 106.82% | -0.73% | |
PR000374 | -7.76% | -7.48% | -10.49% | -8.53% | 111.00% |
表17. 表位競爭測定中抗體的抑制率
抑制率(%) | PR303189 | PR303199 | PR303145 | PR303147 | PR303155 | PR303125 | PR303191 | PR303201 | PR000374 |
PR303191 | -99% | -57% | -70% | -60% | -62% | 80% | 80% | 57% | -38% |
PR303125 | -24% | -48% | -41% | -88% | -62% | 104% | 109% | 86% | -24% |
PR000374 | -52% | -61% | -61% | -72% | -67% | -45% | -34% | -63% | 109% |
實施例10. 抗體被表現ROR1的細胞內化
10.1. 透過Ab-MMAF細胞毒性方法測試抗體被HEK293T-hROR1細胞內化
將12000個細胞/90μl的HEK293T-hROR1細胞加入平底96孔盤中,在37℃、5% CO2培養箱中培養過夜。在完全培養基中製備10×濃度(100nM)的抗體。稀釋係數為5,並製備6個劑量(10、2、0.4、0.08、0.016、0.0032)。將10μl的每種複合物稀釋物一式兩份地轉移至細胞中,所有測定孔的最終體積為100μl。製備濃度為50μg/ml(50×)的aHFc-CL-MMAF,並向孔中加入2μl,使終濃度為1μg/ml。將細胞以37℃、5% CO
2培養120小時。加入100μl的細胞力價-Glo試劑,其與每個孔中存在的細胞培養基體積相等。將內容物在迴轉式振盪器(orbital shaker)上混合2分鐘以誘導細胞裂解。將盤在室溫下培育10分鐘以穩定發光訊號。使用PE Enspire記錄發光。
抗ROR1 HCAb的內化率結果示於圖10中。HCAb對過表現ROR1的293T細胞顯示出比PR000374更好的內化活性。
10.2. 透過pHAb套組測定抗體被PANC-1細胞內化
在本實施例中,pHAb胺反應性染料(Promega,目錄號G9845)被用於測定進入PANC-1細胞的抗ROR1抗體的基於抗原的內化。PHAb染料是pH感測器染料,其在pH>7時具有非常低的螢光,並且當溶液的pH變成酸性時螢光顯著增加。當用pHAb染料標記的抗體在中性pH中在細胞膜之外結合時,不可監測到螢光或監測到非常低的螢光。在內化之後,在內體及溶體中環境pH越低,螢光將越強。
用pHAb染料標記抗體,並按照套組說明書計算DAR(藥物對抗體比率)。然後將標記的抗體與PANC-1在4℃(在該溫度下的內化活性非常低,其用作背景對照)或37℃下一起培育24小時。然後檢測在532nm處具有激發最大值(Ex)及在560nm處具有發射最大值(Em)的螢光。最終的標準化結果顯示為37℃下的螢光強度減去4℃下背景的螢光強度,然後除以抗體的pHAb染料的DAR。較高的值表示較高的內化活性。
在第7小時及第24小時檢測到的抗ROR1 HCAb抗體的內化率的結果分別示於圖11A至圖11B中。結果表明,HCAb殖株PR303155、PR303191及PR303199顯示出被PANC-1細胞良好內化。
無
圖1. 用於單B細胞殖株篩選的篩選策略及方法的工作流程。
圖2A-2C. HCAb抗體與CHO-K1-cynoROR1細胞的結合。
圖3A-3D. HCAb抗體與PANC-1細胞的結合。
圖4. HCAb抗體與HEK293T-hROR1細胞的結合。
圖5. HCAb抗體與A549細胞的結合。
圖6. 透過ELISA測試HCAb抗體與hu-ROR1-ECD-his的結合。
圖7A-7C. 單價形式的PR005340變體(VH-Flag-His)與PANC-1細胞的結合。
圖8A-8C. 二價形式的PR005340變體(HCAb)與PANC-1細胞的結合。
圖9. 透過ELISA測試HCAb抗體與hu-ROR2-his的結合。
圖10. 透過Ab-MMAF細胞毒性方法測試HCAb抗體在HEK293T-hROR1細胞上的內化。
圖11A-11B. 透過pHAb套組測定HCAb抗體在PANC-1細胞上的內化。
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Claims (35)
- 一種特異性結合ROR1的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體包含重鏈可變區(VH),並且其中所述VH包含具有如序列識別號: 147-202中任一項所示胺基酸序列的VH的HCDR 1-3。
- 如請求項1所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述VH包含具有如下所示胺基酸序列的HCDR 1-3: 分別為序列識別號: 11、40、100, 分別為序列識別號: 12、41、101, 分別為序列識別號: 12、42、102, 分別為序列識別號: 12、40、103, 分別為序列識別號: 12、43、104, 分別為序列識別號: 13、44、105, 分別為序列識別號: 12、40、106, 分別為序列識別號: 12、45、107, 分別為序列識別號: 12、40、108, 分別為序列識別號: 14、46、109, 分別為序列識別號: 12、47、110, 分別為序列識別號: 12、48、111, 分別為序列識別號: 12、45、112, 分別為序列識別號: 15、49、113, 分別為序列識別號: 16、50、114, 分別為序列識別號: 12、51、115, 分別為序列識別號: 18、56、126, 分別為序列識別號: 21、40、130, 分別為序列識別號: 22、60、131, 分別為序列識別號: 12、40、132, 分別為序列識別號: 23、61、133, 分別為序列識別號: 19、57、127, 分別為序列識別號: 20、58、128, 分別為序列識別號: 14、59、129, 分別為序列識別號: 17、53、119, 分別為序列識別號: 17、53、116, 分別為序列識別號: 17、53、120, 分別為序列識別號: 17、53、121, 分別為序列識別號: 17、53、122, 分別為序列識別號: 17、53、123, 分別為序列識別號: 17、53、124, 分別為序列識別號: 17、53、125, 分別為序列識別號: 17、52、116, 分別為序列識別號: 17、53、117, 分別為序列識別號: 17、52、117, 分別為序列識別號: 17、40、116, 分別為序列識別號: 17、53、118, 分別為序列識別號: 17、54、116, 分別為序列識別號: 17、55、116, 分別為序列識別號: 17、54、117, 分別為序列識別號: 17、40、117, 分別為序列識別號: 17、55、117, 分別為序列識別號: 17、54、118, 分別為序列識別號: 17、40、118, 分別為序列識別號: 17、55、118, 分別為序列識別號: 17、55、103, 分別為序列識別號: 12、55、117,或者 分別為序列識別號: 12、55、118。
- 如請求項1或2所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述VH包含與序列識別號: 147-202中任一項具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列。
- 如請求項1至3中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體包含Fc區。
- 如請求項1至3中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體包含重鏈(HC),並且其中所述HC包含與序列識別號: 205-260中任一項具有至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%或100%序列同一性的胺基酸序列。
- 如請求項1至5中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體不包含輕鏈。
- 如請求項1至6中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體包含兩條重鏈。
- 如請求項1至7中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體是嵌合抗體、人源化抗體或人抗體。
- 如請求項1至8中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體是選自IgG、IgA、IgM、IgE及IgD的同種型。
- 如請求項1至9中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體是選自IgG1、IgG2、IgG3及IgG4的亞型。
- 如請求項1至10中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗原結合片段選自HCAb、VHH、奈米抗體、Fab、Fab'、F(ab') 2、Fd、Fd'及dAb。
- 如請求項1至11中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體是單株抗體、雙特異性抗體或多特異性抗體。
- 如請求項1至12中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體是單價的、二價的或多價的。
- 如請求項1至13中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體或抗原結合片段與螢光標記、放射性標記或細胞毒性劑連接。
- 一種雙特異性抗體,所述雙特異性抗體包含如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段以及特異性結合腫瘤相關抗原或免疫細胞抗原的第二抗原結合區;較佳地,所述第二抗原結合區結合CD3。
- 一種核酸,所述核酸包含編碼如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段或如請求項15所述的雙特異性抗體的核苷酸序列。
- 一種載體,所述載體包含如請求項16所述的核酸。
- 一種宿主細胞,所述宿主細胞包含如請求項16所述的核酸或如請求項17所述的載體。
- 一種抗體-藥物共軛物(ADC),所述抗體-藥物共軛物包含如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段或如請求項15所述的雙特異性抗體。
- 一種藥物組合物,所述藥物組合物包含:(i)如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段、如請求項15所述的雙特異性抗體、如請求項16所述的核酸、如請求項17所述的載體、如請求項18所述的宿主細胞或如請求項19所述的抗體-藥物共軛物;及(ii)藥學上可接受的載體或賦形劑。
- 如請求項20所述的藥物組合物,其中所述組合物還包含選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物的第二治療劑。
- 一種治療受試者的癌症的方法,所述方法包括向所述受試者施用有效量的如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段、如請求項15所述的雙特異性抗體、如請求項16所述的核酸、如請求項17所述的載體、如請求項18所述的宿主細胞、如請求項19所述的抗體-藥物共軛物或如請求項20或21所述的藥物組合物。
- 如請求項22所述的方法,其中所述癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤(Burlitt’s lymphoma)、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
- 如請求項22或23所述的方法,所述方法還包括向所述受試者施用第二治療劑。
- 如請求項24所述的方法,其中所述第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
- 如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段、如請求項15所述的雙特異性抗體、如請求項16所述的核酸、如請求項17所述的載體、如請求項18所述的宿主細胞、如請求項19所述的抗體-藥物共軛物或如請求項20或21所述的藥物組合物在製備用於治療受試者的癌症的藥物中的用途。
- 如請求項26所述的用途,其中所述癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
- 如請求項26或27中任一項所述的用途,其中所述藥物還包含第二治療劑,較佳地,所述第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
- 如請求項26或27中任一項所述的用途,其中所述藥物與第二治療劑組合施用,較佳地,所述第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
- 如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段、如請求項15所述的雙特異性抗體、如請求項16所述的核酸、如請求項17所述的載體、如請求項18所述的宿主細胞、如請求項19所述的抗體-藥物共軛物或如請求項20或21所述的藥物組合物,其用於治療受試者的癌症。
- 如請求項30所述用途的抗體或其抗原結合片段、雙特異性抗體、核酸、載體、宿主細胞、抗體-藥物共軛物或藥物組合物,其中所述癌症是ROR1陽性癌症,較佳地選自B細胞白血病、淋巴瘤、急性骨髓性白血病(AML)、勃氏淋巴瘤、被套細胞淋巴瘤(MCL)、急性淋巴細胞白血病(ALL)、慢性淋巴細胞白血病(CLL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、濾泡性淋巴瘤(FL)、邊緣區淋巴瘤(MZL)、乳腺癌、腎癌、卵巢癌、胃癌、肝癌、肺癌、結直腸癌、胰腺癌、皮膚癌、膀胱癌、睾丸癌、子宮癌、前列腺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、神經母細胞瘤、腦癌、結腸癌、鱗狀細胞癌、黑色素瘤、骨髓瘤、子宮頸癌、甲狀腺癌、頭頸癌及腎上腺癌。
- 如請求項30或31所述用途的抗體或其抗原結合片段、雙特異性抗體、核酸、載體、宿主細胞、抗體-藥物共軛物或藥物組合物與第二治療劑組合施用,較佳地,所述第二治療劑選自抗體、化學治療劑、siRNA、反義寡核苷酸、多肽及小分子藥物。
- 一種用於診斷受試者的ROR1陽性癌症的方法,所述方法包括: (a) 從所述受試者獲得生物樣本, (b) 使所述樣本與如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段接觸;以及 (c) 檢測所述抗體與所述樣本的結合, 其中相比於所述抗體或其抗原結合片段與對照樣本的結合,所述抗體或其抗原結合片段與所述樣本的結合增加,鑑定出所述受試者患有ROR1陽性癌症。
- 一種用於對受試者的ROR1陽性癌症進行成像的方法,所述方法包括: (a) 向所述受試者施用如請求項1至14中任一項所述的抗體或其抗原結合片段,其中所述抗體共軛到可檢測標記物;以及 (b) 檢測所述標記物的存在。
- 如請求項34所述的方法,其中: (a) 所述可檢測標記物是 111In,並且較佳地,所述標記物的檢測是透過單光子發射電腦斷層掃描進行,或者 (b) 所述可檢測標記物是 89Zr,並且較佳地,所述標記物的檢測是透過正電子發射斷層掃描進行。
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