TW200530400A - Secreted neural apoptosis inhibiting proteins - Google Patents
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Description
200530400 九、發明說明: 【發明所屬之技術領域】 本發明係屬於分子生物學領域,尤其是涉及能夠調節 自由基介導細胞死亡效應的一種新型神經保護劑。 5 【先前技術】 本發明之背景
Wnt 和捲曲 | 白(FrizQgd) 作為細胞正常發育期間增殖、遷移、分化以及組織形 10 態發生的誘導劑,胞外信號分子起著根本的作用(Finch et al·,Proc. Natl· Acad· Sci· USA(1997)94:6770 — 75)。此外, 這類分子作為調節劑又可以調節細胞的凋亡,即細胞的程 式性死亡。細胞凋亡在多細胞生物的正常發育和功能發揮 過程中起著重要的作用。當功能失調時,信號分子和凋亡 15 過程參與眾多疾病的發病機理,參閱Thompson, Science (1995)267:1456-1462 等文獻。 細胞凋亡涉及各種正常和致病的生物學過程,並且可 以被許多獨立的刺激因素所誘導。關於凋亡的最新研究啟 示,導致細胞死亡的常見代謝途徑可能起源於多種信號, 20 包括激素、金清生長因子喪失、化療藥劑、電離輻射和人 體免疫缺陷病毒(HIV)感染等(Wyllie,Nature (1980) 284:555-556; Kanter et al.? Bio chem. Biophys. Res. Commun. (1984) 118:392-399; Duke & Cohen, Lymphokine Res. (1986) 5:289-299; Tomei et al.9 Biochem. Biophys. Res. 200530400
Commun· (1988) 155:324-331; Kruman et al·,J. Cell·
Physiol. (1991) 148:267-273; Ameisen & Capron, Immunol. Today (1991) 12:102-105; and Sheppard & Ascher, J. AIDS (1992) 5:143-147)。因此,影響凋亡過程生物學調控的藥 5 物對於眾多臨床症候均有治療功用。 雖然最近許多參與凋亡不同階段的基因和基因家族 已經被鑑定和克隆,但由於凋亡途徑仍不是很清楚,許多 涉及凋亡過程的新的基因和基因產品仍有待發現。 一組已知在調節細胞發育過程中具有重要作用的分 ίο 子是Wnt蛋白家族。Wnt蛋白家族由一個大型基因家族 編碼。虫回蟲、昆蟲、軟骨魚類和脊椎動物中都有該基因家 族的成員。由於許多不同的物種都有多個保存的Wnt基 因,所以Wnt蛋白家族被認為在多種發育過程和生理過程 中都起作用。(McMahon,Trends Genet· (1992) 8:236-242; 15 and Nusse & Varmus, Cell (1992) 69:1073-1087).
Wnt基因編碼多種分泌性糖蛋白,這些糖蛋白被認為 在多種原始細胞類型中起著旁分泌或自分泌信號的作用 (McMahon (1992) and Nusse & Varmus (1992),同上文)〇 在小鼠中,Wnt生長因子家族包括10種以上的基因 20 (Wnt_l、2、3a、3b、4、5a、5b、6、7a、7b、8a、8b、10b、 11、12)(參閱 Gavin et al·,Genes Dev· (1990)4: 2319 - 2332; Lee et al.9 Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1995) 92:2268 -2272 ;以及 Christiansen et al·,Mech. Dev· (1995) 51:341 -350等文獻)。在人體中則至少有7種基因(Wnt-1、2、3、 200530400 4、5a、7a 和 7b)(參閱 Vant Veer etal·,Mol· Cell· Biol. (1984) 4:2532 - 2534) 〇 由於Wnt蛋白相對的不溶性,傾向於與細胞或胞外基 質緊密地結合,所以Wnt受體的鑑定受到了一定影響。 5 然而,若干觀測結果表明,捲曲蛋白(FZ)家族的成員可作 為Wnt蛋白的受體,或作為Wnt受體複合體的構成部分 而起作用(He et al·,Science (1997) 275:1652-1654)。 FZ受體基因豕無的母個成貝編碼一種镶後膜蛋白, 後者包含一個大型的胞外部分、7個推定的跨膜結構域和 ίο 一個胞漿尾(參閱 Wang et al·,J. Biol. Chem. (1997) 271:468-76)。接近胞外部分NH2-末端處,是一個FZ家族 其他成員中保守性很強的富含半胱氨酸的結構域(CRD)。 CRD由大約110個氨基酸殘基組成,包括1〇個保守的半 胱氨酸,是Wnt配體的推定結合位點(Bhan〇t et al,Nature 15 (1996) 382:25-30)。FZ受體家族中有i〇個已知的基因。 大多數Wnt-FZ信號是通過糖原合成酶激酶(GSK3 β) 的抑制和β-catenin蛋白在核中的積累來介導的。(^catenin 蛋白活化c-myc,從而誘導某些細胞的凋亡。因此,Wnt通 過FZ 1和FZ2的信號轉導以及p_catenin蛋白的存留可以 2〇 誘導細胞的死亡’尤其是小腦中未成熟的細胞。而且, FZ1、FZ2和β-catenin蛋白的過度表達可以誘導凋亡。 然而’有一些Wnt-FZ信號途控並不依賴於p-catenin蛋 白。 最後,Wnt通過讓β-catenin蛋白在細胞胞漿中積累而 200530400 傳遞其信號。在細胞質中,p_catenin蛋白與Tcf-Lef轉錄 因子家族的成員結合,並轉移到細胞核中。當Wnt不存 在時,β-catenm蛋白則與GSK3和結腸腺瘤樣息肉(APC) 腫瘤抑制蛋白形成一種複合體。這種相互作用伴隨著 5 P_Catenin蛋白的磷酸化,並給它打下標記以進行泛素化 (ubiquitination)和降解。Wnt通過抑制gs〇的功能而使 β-catenin蛋白得以積累。 那些具有FZ_CRD但;f含那7個跨職序和胞漿尾的 分子的存在,提不了存在著—種作為胸活性調節物的 1〇 纟白亞族。可溶性捲曲相關蛋白(SFRP),例如登錄號為 AF056087的核酸序列,與分泌亡相自(SARp) 同源,並包含了 一個分泌性分子家族,該家族分子含有一 個與FZ CRD結構域高度同源的CRD結構域(Finch以d,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1997) 94:6770-6775)。SARP 通 15 過與_相互仙或通過與麟合FZ蛋㈣成無功能 的同聚複合體而阻斷Wnt信號轉導。
Wnt途徑的失調看來是異常生長和發育的-個因素。 考慮到Wnt和FZ家族多個成員之間相互作用的潛在複雜 性’可能存在著額外機制以調節特定的發育期間或某些組 、織的疾病發展/受損期間Wnt所調節的過程(如调亡)。此 類機制之鑑定,尤其是這些機制的因子的鐘定,對理解和 控制細胞調控的過程頗為重要。 自由基神經喜性 200530400 一氧化鼠(NO)是一種分佈廣泛的多功能的生物信號 分子。NO可能不僅在神經元的各種生理功能如神經遞質 釋放、神經發月、再生、突觸可塑性(Synaptic plasticity) 和基因表達的調節中起作用,而且在因過量產生N〇導致 5 神經損害而引起的各種神經疾病中也起作用(Yun et al.,
Mol Psychiatr (1997) 2:300-310)。 NO是當L-精氨酸在一氧化氮合成酶(1^〇幻作用下被 氧化為瓜氨酸時而形成的。雖然NO本身是一種自由基, 具有一個不成對電子,但它本身未被察覺參與了任何會造 10 成嚴重損害的化學反應。然而,當NO與超氧化物陰離子 反應時,就形成了反應性極強的氧化劑過氧亞硝基陰離子 (ONOC〇(<www.gsdl.com/news/ 1999/ 1990302/index>,最 後一次瀏覽的時間是2002年11月12曰)。 N-曱基-D-天冬氨酸(NMDA)受體介導的神經毒性,可 15 能部分地依賴於經NO產生的過氧亞硝基陰離子(〇〇n〇-) (Lipton et al·,Nature (1993) 364(6438):626-632)。這種开j 式 的神經毒性被認為在各式各樣急性和慢性的神經系統疾 病中對於損傷的最終共同途徑起了 一定的作用;這些疾病 包括局灶性缺血(focal ischemia)、外傷、癲癇症、亨廷頓 20 舞蹈症(Huntington’s disease)、阿爾茨海默氏病 (Alzheimer’s disease)、肌萎縮性側索硬化症(amyotrophic lateral sclerosis)、愛滋病相關的癡呆症(AIDS dementia)以 及其他神經退化性疾病。(Bonfoco et al·,Proc. Natl. Acad. Sci.USA(1995) 92:7162-7166)。而且,過氧亞硝基陰離子 200530400 參與神經元内多種損傷性過程,包括DNA鏈斷裂、DNA 脫氨基作用、包括過氧化物歧化酶在内的蛋白的硝化,以 及線粒體複合體 I 的破壞等 (www.gsdl.com/news/1999/1990302/in心γ,最後一次瀏覽 5 的時間是2002年11月12日)。確實,ONOO-已顯示可引 起神經元死亡。有人認為這種神經元死亡存在於中樞神經 糸統各種不同的疾病中’例如腦缺血、愛滋病相關的瘋呆 症、肌萎縮性脊髓側索硬化症等 (Moro et al·,
Neuropharmacology (1998) 37(8):1071-1079)。此外,通過 ίο NMDA受體作用的過量谷氨酸可介導局部腦缺血時細胞 的死亡(Yunetal· (1997),同上文)。谷氨酸的神經毒性也 可能在神經退化性疾病如亨廷頓舞蹈症和阿爾茨海默氏 病中起了一定的作用(Yun et al· (1997)同上文)。 因此,取決於侵襲的具體情況,NMDA或一氧化氮/ 15 超氧化物可導致凋亡性神經元細胞的損壞。 通過大腦顆粒細胞(CGC)與免疫啟動小膠質細胞的共 培養,可使NMDA受體介導的細胞死亡現象加劇(Hewett et al·,Neuron (1994) 13(2):487_494; Kim et al·,J· Neurosci· Res· (1998) 54(1):17-26),從而暗示了誘導型NOS在上述 2〇 類型神經毒性中的作用。而且,這種加劇與NO供體3- 嗎琳斯得酮亞胺(SIN-1)的作用相似。此外,這種NMDA 神經毒性的增強/加劇以及由NO供體(例如SIN-1或S-亞 硝基乙醯青黴胺:SNAP)所產生的類似加強作用,似乎 可被NOS抑制劑或抗氧劑(過氧化物歧化酶/過氧化氫酶) 200530400 所阻斷(Hewettetal.(1994)同上文;Kimetal.(1998)同 上文)。 與之相反,用NOS抑制劑處理CGC並不能挽救接觸 神經醯胺的這類細胞(Monti et al·,Neurochem. Int. (2001) 5 39(1):11-18; Nagano et al·,J· Neurochem. (2001) 77(6):1486-1495)。而且,在其接觸神經醯胺後所觀察到的 凋亡可能未涉及NMDA受體的作用(Centeno et al., Neuroreport (1998) 9(18):4199·4203; Moore et al·,Br· J. Pharmacol· (2002) 135(4):1069-1077)。 i〇 綜上所述,這些資料提示,神經酿胺的作用主要不是 依賴於NO的產生,而且神經醢胺和NO供體例如SIN-1 或SNAP是通過不同的途徑誘導細胞的凋亡。 因此,考慮到上文提及的眾多與NMDA/過氧亞硝基 陰離子相關的疾病,可選擇性挽救接觸SIN-1如神經毒素 15 的細胞的分子,若作為選擇性抗凋亡劑應該是很有價值 的,而且在有效地治療與NMDA/過氧亞硝基陰離子相關 的神經系統疾病的過程中是很有用的。 本專利申請人鑑定了一種分泌性神經元凋亡抑制蛋 白(Secreted Neural Apoptosis Inhibiting Protein,SNAIP), 20 它具有神經保護作用並能選擇性地保護細胞免遭SIN-1等 分子的神經毒性侵害,但對C2神經醯胺引起的神經毒性 則無效。 【發明内容】 -11- 200530400 本發明之概要說明 本發明涉及一種調控過氧亞硝基陰離子所誘導的神 經元細胞凋亡的方法,該法包括使分泌性神經元凋亡抑制 蛋白(SNAIP)與上述細胞接觸。在一個相關的方面,本方 5 法包括加入肝素;在另一相關的方面,本方法可調控谷氨 酸/NMDA所誘導的凋亡。 本發明也涉及凋亡途徑,包括相關基因的誘導。這些 基因包括p38 MAPK和生長抑制及DNA損傷誘導基因(即 GADD) 〇 10 此外,本發明涉及一種方法,它可保護神經元免遭過 氧亞石肖基陰離子相關自由基介導的細胞死亡,該法包括使 SNAIP與上述細胞接觸。 而且,本發明涉及一種方法,它可測定與過氧亞硝基 陰離子毒性途徑相關的神經保護基因組目標序列。在一個 15 相關的方面,這種方法可包括以下步驟:一、使神經元細 胞與SNAIP接觸或不接觸;二、使上述細胞與過氧亞硝 基陰離子誘導物接觸;三、確定所接觸細胞基因表達的調 控;四、鑑定在SNAIP和誘導物存在或不存在的情況下 所調控的基因。這種方法規定了鑑定基因之方法並將這種 20 基因與過氧亞硝基陰離子所誘導的凋亡抑制相互關聯起 來。在一個相關的方面,上述方法也包括用肝素接觸細 胞。在另一相關方面,該誘導物是SIN-1。 本發明還涉及一種方法,它可治療與自由基介導的細 胞死亡相關的神經元疾病,其包括當細胞死亡屬於凋亡 -12- 200530400 時,給予需要治療的患者施用有效治療劑量的SNAIP。在 一相關的方面,與凋亡相關的疾病包括巴金森氏病 (Parkinson,s disease)、多發性硬化症(multiple sclerosis)、 局部性腦缺血(focal cerebral ischemia)、愛滋病相關的癡呆 5 症(dementia)、肌萎縮性脊髓側索硬化症(amyothrophic lateral sclerosis)、脊髓:損傷、創傷性腦損傷(traumatic brain injury)、中風以及阿爾茨海默氏病(Alzheimer’s disease) 等。在一相關的方面,該治療方法包括施用肝素。 本發明之另一個方面是,彼露了調控SNAIP表達的治 ίο 療方法,包括給需要治療的患者施用肽類、致效劑、拮抗 劑、反致效劑和/或抗體。SNAIP也能被用於鑑定可結合 FZ的分子。這些分子可以是致效劑或拮抗劑,僅僅與fz 連接’但隶好為抬抗劑’以儘量減少信號轉導,從 而避免細胞〉周亡。 15 本發明之又一個方面是’披露了鐘定SNAIP調節物之 方法,其步驟包括:提供一種化學基團;提供一種表達 SNAIP的細胞或純化的SNAIP;確定該化學基團是否與 SNAIP結合。纟一個相關的方面,該化學基團可以包括但 不限於肽類、抗體和小分子。 2〇 本發明之再一個方面包括了治療組合物,這些治療組 合物包括核酸、抗體、多肽、致效劑、反致效劑以及抬抗 劑。而且,本發明之方法也包括給需要治療的患者施用這 些治療組合物的治療方法。其活性成分可以是用SNAlp 鑑定出來的一種分子或SNAIP本身。 -13- 200530400 通過參考本發明之詳細說明和附圖,本發明之這此方 面和其他方面將變得顯而易見。此外,此處列出了許多更 詳細地敘述某些步驟或組合物的參考文獻。每一篇灸考文 獻都作為整體而引述在此,就好像每一篇都是單獨地引述 5 在此一樣。 ^ 本發明之詳細說明 本發明之蛋白與被稱為分泌性凋亡相關蛋白(SARp) 的蛋白家族具有約6〇%的同源性。本專利申請者們測定了 1〇 該分子在大腦裏的表達,發現其在胎兒大腦裏的豐度比成 人大腦的為高。鑒別出該蛋白的區域是成人的前腦、中腦 和後眼區,而並非是它曾被發現的區域,即腦室區。該蛋 白和任何特定的細胞類型之間不存在詳細的關聯。該^白 似乎是抗凋亡的。SNAIP可保護神經元免受自由 15 細胞死亡。 町 办、因此,在—具體實施例中’SNAIP及其調節作用是研 ,神經退化性疾病治療干賴物的目標;神經退化性疾病 包括Γ不限於巴金森氏病、多發性硬化症、大腦局部缺 =、愛滋病相關的老年癡呆、肌萎縮性側索硬化症、脊髓 2〇 損傷、創傷性腦損傷、中風和阿爾茨海默氏病。 失控,過量產生N0能引起毒害神經的連鎖反應。據 推4 NO疋經由過氧亞麟基陰離子而殺害神經元。該強氧 化劑被認為涉及大多數漏介導的神經毒性作用。過氧亞 石肖基陰離子可進一步分解為經基和二氧化氮自由基,它們 200530400 也具有高度的反應性和生物破壞性,能導致因過量產t NO而引起的各種神經失調症狀。 例如,源自神經元的NO在介導局部缺血後神經原細 胞的死亡方面,起了重要的作用。在大腦局部缺血後期^ 6 h),局部缺血後的炎症誘導了 iNOS的表達,NO的大量 產生導致了延遲性神經損傷(Yunetal· (1997)同上文)。 在一相關方面,3-硝基酪氨酸(3·ΝΤ)是蛋白被過氧 亞硝基陰離子(ONOCT)硝化的特定標記,而過氧亞确基 陰離子是由NO和超氧化物產生的。據報導,某些神經退 化性疾病的患者,其大腦中3-NT蛋白(即含3_NT的蛋白) 之含量有所增加(Yamamoto et al” J· Neural· Transm. (2002) 109(1) : M3)。因此,在一具體實施例中,3_NT被用作 為識別SNAIP相關途徑的標記。 在一更深入的相關方面,有絲分裂原啟動蛋白激酶 (MAPK)信號途徑籍由NO的啟動,可能是N〇如何調節 神經原的生長、刀化、生存和死亡的關鍵D由於]yjAPK信 號途徑在神經系統生長因子反應(ERK)或逆境反應 (JNK,P38MAPK)中起了主要的作用,NO-ΜΑΡΚ信號可 解釋在神經原的發育和疾病/損傷過程中,NQ在神經原的 生存、分化和凋亡細胞的死亡過程中所起的作用,(Yun 等。(1997)同上文)。 經發現,一種過氧亞硝基陰離子供體,3_嗎琳斯得綱 亞胺(SIN-1)’在人類神經母細胞瘤SH_SY5Y細胞内的細 胞死亡早期階段,誘導了三種不同的生長抑制和DNA損 200530400 傷誘導(GADD)的 mRNAs 即 GADD34、GADD45 和 GADDI 53的表達。過氧亞石肖基陰離子還啟動了 p3 8 MAPK。三種GADD基因的表達以及p38 MAPK的鱗酸化 也被用自由基清除劑、超氧化物歧化酶加過氧化氫酶和谷 胱甘肽的處理所抑制(〇|1奶11丨6{&1.,?代6^^(1丨。.6丨〇1.1^(1· (2001) 30(2): 213-221)。因此,在一具體實施例中,所關 注的途徑包括 GADD34、GADD45、GADD153 和 P38 MAPK> 10 15 SNAIP具有神經保護作用且能選擇性地預防SIN-1, 但不能預防C2神經醯胺、神經毒性。SNAIP被細胞釋放 到介質中,特別是當肝素存在時。 在一個相關方面,NO供體例如SIN-1或SNAP和神 經醯胺通過不同的途徑誘導了凋亡。在一較佳的具體實施 例中,SNAIP選擇性地防止了 NMDA誘導的凋亡。 SNAIP在那些以及其他一些組織中的存在提示, SNAIP與涉及各種神經退化性症狀的各種神經系統疾病 密切相關。SNAIP在那些組織中的鑑定和SNAIp編碼基 因的克隆,提供了各種各樣的治療方法以調節SNAlp的 表達和活性,㈣提供了轉SNAIP相_病的各種方 法0 人類的SNAIP與分泌性凋亡相關的蛋白(sARp) 只有60%的氨基酸同源性,而且與分子具有某種保守 和功能特點的(SARP)家族互不才目關。當提及本發明之 和核酸分子時,術語“家族,,旨在表示整體上具有共同結構 20 200530400 域和具有足夠的氨基酸或核苷酸序列同源性的兩種 < 兩 種以上的蛋白或核酸分子,正如本文中所定義的。芦 x ^ <像的 豕族成員可天然地產生且可源自相同的或不同的種類。例 如,一個家族可含有源自人類的第一個蛋白和源自氣科的 5 該蛋白同源物,以及第二個源自人類的截然不同的蛋白年 源自鼠科的該蛋白同源物。同一家族的成員還可以具有此 同的功能特徵。 ^ 本文中的術語“相當的氨基酸殘基”意為當對兩個或 兩個以上的序列進行比對分析時,這些氨基酸在蛋白序歹q 10 内基本上占據了同樣的位置。 本文中所用的術語“足夠地相同”指的是第一個氨基 酸或核苷酸序列與第二個氨基酸或核苷酸序列比對時,含 有足夠數量或最少數量的相同或相當的(例如,帶有類似 的侧鏈)氨基酸殘基或核苷酸,從而使得第一個氨基酸或 15 核苷酸序列和第二個氨基酸或核苷酸序列具有共同的結 構域和/或共同的功能活性。例如,含有共同結構域的氨 基酸或核苷酸序列,若具有約75%的同源性,較佳的是 80%的同源性,更佳的是85%、95%或98%同源性,則在 本文中被定義為足夠地相同。 20 如同本文中互換使用的,“SNAIP活性”、“SNAIP的 生物活性”或“SNAIP的功能活性”指的是按照標準的技術 或本文中所講授的技術,由SNAIP蛋白、多肽或核酸分 子施加在SNAIP敏感細胞上的活性。SNAIP活性可以是 直接活性,例如與第二個蛋白的關聯,或間接活性,例如’ -17- 200530400 通過:個SNAIP蛋白與第二個蛋白的相互作用而介導的 、、^K口 ?纽。在—較佳的具體實施例中,SNAIP活性至 夕包括以下一種或幾種活性··⑴在Wnt/FZ信號途徑上 與蛋白相互作用的能力;(ϋ)與SNAIP受體(例如,FZ)相 5 互作用的月匕力,㈣與細胞内-目標蛋白相互作用的能 力’以及㈣_導SNAIp的生物表現的能力。例如,以 本技術領域内眾所·的手段可確定 ,SNAIP的活性或表 現包括但不限於抑制Wm與FZ的結合。 相應地本發明之另一具體實施例的特點是分離出的 10 具有SNAIP活性的SNAIP蛋自和多肽。 本發明之各方面的特點將在以下各節中進一步詳述。 L分離出的核酸分子 本發明之一個方面係關於分離出的核酸分子,它們編 15 碼SNAIP或編碼其生物活性的部分;並關於足以作為雜
化探針以鑑定SNAIP編碼核酸(例如,sNAIPmRNA)的核 酸分子’以及作為SNAIP核酸分子擴增或突變的PCr引 子的片段。如本文中所使用的,術語“核酸分子,,旨在包括 DNA分子(例如,cDNA或基因組DNA)和RNA分子(例 20 如,mRNA),以及使用核苷酸類似物所產生的DNA或RNA 類似物。此核酸分子可以是單股的或雙股的。 “分離出的”核酸分子是指從核酸天然資源其他核酸 分子中分離出的一個核酸分子。最理想的是,一個“分離 出的,,核酸不含原本天然地存在於衍生出該核酸的有機體 -18- 200530400 基因組DNA内謗核酸侧翼的核苷酸序列中(最好是蛋白編 碼序列)(即位於核酸5,端和3,端的序列)。例如,在各種 各樣的具體實施例中,該分離出的SNAIP核酸分子可能 含有少於約 5 kb、4 kb、3 kb、2 kb、1 kb、0.5 kb 或 0·1 5 kb上述的核苷酸序列;在衍生出該核酸的細胞基因組 DNA内’這些核苷酸序列原本天然地存在於該核酸分子 的侧翼。而且,一個“分離出的,,核酸分子,例如cDNA分 子,當以重組技術產生時,可基本上不含其他細胞物質或 培養基;或者,當以化學方式合成時,可基本上不含化學 ίο 前體或其他化學物質。 本發明之核酸分子或這些核苷酸序列的任何互補序 列,均可採用標準的分子生物學技術分離出來(例如,如
Sambrook et al·,eds·,“Molecular Cloning: A Laboratory Manual,2nd ed·,Cold Spring Harbor Laboratory Press, 15 Cold Spring Harbor,NY, 1989 —文中所述)。 通過人類SNAIP基因的克隆而確定的核苷酸序列,可 以產生某些探針和引子。這些探針和引子是設計用於鑑定 和/或從其他組織克隆其他細胞内的SNAIP同源物,以及 從其他哺乳動物克隆SNAIP同源物。該探針和引子通常 20 包括基本上純化的寡核苷酸。寡核苷酸通常包括這樣一個 核苷酸序列區域’它在嚴格的條件下雜化為SNAIP的正 意股或反意股序列或SNAIP天然產生的突變體内至少約 12個,較佳的是25個,更佳的是約5〇、75、1〇〇、125、 150、175、200、250、300、350或400個連續的核普酸單 200530400 位以人類SNAIP核皆酸序列為基礎的探針可用於檢測 可編碼相似或相同蛋白的轉錄序列或基因組序列。該探針 可包括一與其相連的標記基團,例如,放射性同位素,螢 光化合物,酶或酶辅助因子。這類探針可用作為診斷試驗 成套試劑的一部分,以鑑定不適當地表達SNAIp蛋白的 細胞或組織,例如通過測量SNAIP編碼核酸在實驗對象 細胞樣品中的含量,例如,檢測SNAIp mRNA含量或確 定是否一個基因組SNAIP基因已發生突變或被剔除里。3 編碼“SNAIP生物活性部分,,的核酸片段可㈣ 可編碼多肽的多核苷酸來製備,多肽且右 刀 過重組表達)和判斷SNAIP編碼部分的活性。(彳如、 換方^該片段可與已知可滅活嶋?的抗體^一種替 15 二,㈣將會理解,導致·Ιρ氨基 的DNA序列多態現象,可存在於一個 ,職化 内。由於天然的等位基因變異,這種SNai^列如人群) 多態現象可存在於—個群體的某些成員中。等=的基因 =-特定基因位點出現的一組基因中的―個基因基::在 中所使用的,術語“基因,,和“重組基0,,指@ :如本文 S N AIP蛋白的開放讀框的二::3 -編碼 3麵蛋白。如本文中所使用的,術哺乳動物的 的是出現在讀位點或該核聽序列編碼:因:異’’指 ^酸序列,該核苦酸或多肽並非中^肽的核 遍形式。等位基因可ϋ讲斟了野賵中所發現的普 通過料多不同個體令的有關基因進 20 200530400 行測序而加以鑑定。通過使用雜化探針來鑑定許多不同個 體的同一基因位點,就很容易達到這一目的。作為天然等 位基因變異的結果且不改變SNAIP功能活性的這類核苷 酸的任何變異和所有變異,以及所引起的SNAIP氨基酸 5 的多恶現象或突變,均包括在本發明之範圍之内。 此外’那些具有不同於人類SNAIP的核苷酸序列、可 編碼其他種類SNAIP蛋白(SNAIP同源物)的核酸分子,也 包括在本發明之範圍之内。那些對應於本發明之SNAIP cDNA的天然等位基因的變異物和同源物的核酸分子,可 ίο 以按照嚴格雜化條件下的標準雜化技術用人類cdna或 其一部分作為雜化探針,以它與此處所披露的人類SNAIp 核酸的同源性為基礎進行分離。 相應地,在另一具體實施例中,本發明分離出的核酸 刀子長度至少為 300、325、350、375、400、425、450、 15 500、550、600、650、7〇〇 ' 800、900、1〇〇〇 或 11〇〇 個核 苷酸,且在嚴格的條件下雜化為一個具有SNAIp活性的 核酸分子。 如本文中所使用的,術語“在嚴格的條件下雜化,,意欲 描述這樣一些雜化和洗滌條件,在這些條件下至少 2〇 (65%、7〇%,較佳的是75〇/〇或以上)彼此相同的核普酸序 列通常保持著互相雜化的狀態。這樣的嚴格條件是孰系本 技術者所熟知的,而且可在文獻中查到,例如,
Protocols in Molecular Biology,john Wiley & 如仍,Ν γ (1989),6.3.1-6.3.6。嚴格的雜化條件一個較佳的非限制性 -21- 200530400 例子是,於約45 °C在6x氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)中進行 雜化,隨後於50-65 0C在〇·2χ SSC,0.1% SDS中洗滌一 遍或多遍。如本文中所使用的,“天然產生的,,核酸分子指 的是包含一天然產生的核苷酸序列(例如,編碼一天然產 5 生的蛋白)的RNA或DNA分子。 除了可能存在於該群體中的SNAIP序列的天然產生 的等位基因變體’熟悉本技術者還將會理解,突變可誘導 變化,從而導致編碼後SNAIP蛋白中氨基酸序列的變化, 但不改變SNAIP蛋白的生物活性。例如,可以進行核苷 ίο 酸取代以導致氨基酸取代在“非實質性,,氨基酸殘基上。一 個“非實質性氣基酸殘基是這樣一種殘基,它可從野生塑 的SNAIP序列演變而來,但其生物活性並未改變,而“實 質性”氨基酸殘基則是生物活性所必需的。例如,各種物 種SNAIP中未保留或只保留一半的氨基酸殘基,對於活 15 性可能是非實質性的,因此很可能成為改變的目標。換言 之,保留在各種物種SNAIP蛋白中的氨基酸殘基,對於 活性可能是貫質性的’因此不大可能成為改變的目標。 相應地,本發明之另一方面係關於可編碼SNAIP蛋白 的核酸分子,它們的對於活性是非實質性的氨基酸殘基中 20 包含了某些變化。在一具體實施例中,分離出的核酸分子 包括一個可編碼蛋白的核苷酸序列,它所包括的一個氨基 酸序列,與一具有SNAIP活性的多肽相比,至少約87〇/〇、 90%、93%、95%、98% 或 99%相同。 通過在天然產生的SNAIP的核替酸序列上導入一個 -22- 200530400 或多個核苷酸的取代、添加或刪除,可產生一個編碼含有 一變異序列的SNAIP蛋白的分離出的核酸分子,從而可 將一個或多個氨基酸的取代、添加或刪除導入被編碼的蛋 白0 10 15
可以通過標準的技術引入各種突變,例如針對位點的 突變和PCR介導的突變。較佳的是,使保守的氨基酸取 代在一個或多個預期是非實質性的氨基酸殘基上。“保守 的氨基酸取代”指的是該氨基酸殘基被一個具有相似側鏈 的氨基酸殘基取代。具有相似侧鏈的氨基酸殘基家族在本 技術領域内已有所定義。那些家族包括具有驗性侧鏈的氨 基酸(例如賴氨酸、精氨酸和組氨酸),酸性側鏈(例如天冬 氣酸和谷氣酸)’不帶電的極性侧鍵(例如甘氨酸、天冬酿 胺、榖醯胺、絲氨酸、蘇氨酸、路氨酸和半胱氨酸),非 極性侧鏈(例如,丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、 脯氨酸、苯基丙氨酸、蛋氨酸和色氨酸),P-分支側鏈(例 如,蘇氨酸、纈氨酸和異亮氨酸)以及芳香族S鏈(例如,
酪氨酸、苯基丙氨酸、色氨酸和組氨酸)。因此,SNAIP 内一個預期是非實質性的氨基酸殘基,最好是被另〆個屬 於同一侧鏈家族的氨基酸殘基取代。作為替換方式, 也可以沿著SNAIP編料列的全部或部分_地弓!入突 變,例如通過飽和突變的方式,而且可以 的突 變體的SN规生物活性,以鑑定保以性㈣變體。在 突變之後,被編碼的蛋白可以重組地表達, 性可 以被測定。 龙曰的/ -23- 20 200530400 在一較佳的具體實施例中,可以從以下方面檢驗突變 體SNAIP蛋白:(1)與snAIP信號途徑内的蛋白形成蛋 白與蛋白之間相互作用的能力;(2)與SNAIP受體(例如 FZ)結合的能力;或(3)與細胞内目標蛋白結合的能力。在 5 另一較佳的具體實施例中,可以檢驗一突變SNAIP調節 細胞增殖或細胞分化的能力。 本發明包含反意核酸分子,即,與編碼蛋白的正意核 酸互補的核酸分子,例如,與一雙股cDNA分子的編碼股 1〇 互補或與一 mRNA序列互補。相應地,反意核酸能以氫 鍵與正意核酸結合。該反意核酸可與SNAIP編碼股的全 4或一部分互補,例如,與蛋白編碼區域的全部或一部分 Y或開放讀框)互補。反意核酸分子可以是編碼SNAIP的核 ,酸序列的編碼股的非編碼區域的反意股。該非編碼區域 15 ( 5和3’末端未轉譯區域或侧翼區域”)是編碼區域側翼的 未被轉澤至氨基酸内的5,和3’末端序列。反意股份子可用 於抑制表達,例如抑制FZ的表達。 反意寡核苷酸的長度可以是,例如,約5、1〇、15、 、25、30、35、40、45或50個核苷酸。本發明之反意 2〇 久可以利用化學合成和酶接合反應並採用本技術領域 ,已知的步驟來構建。例如,反意核酸(例如,反意募核 苷峻)可以用天然產生的核苷酸或各種經變更的核苷酸以 予方式合成;這些經變更的核普酸是設計用於增加分子 的生物穩定性,或增加反意核酸和正意核酸之間所形成雙 鏈的物理穩定性,例如,硫代磷酸酯的衍生物、膦酸脂的 -24· 200530400 衍生物和吖啶取代的核苷酸均可以使用。 本發明還考慮到另一些抑制性RNA分子,例如 分子。構建了適當的雙股或髮夾型RNA並用於調節·lp 10 15 20 :用於產生反意股和其他核酸的經變更核苦酸的例 子匕括5_氟尿嘧啶、5-溴尿嘧啶、5_氯尿嘧啶、5_班 σ定、次黃嗓呤、黃嗓呤、乙基胞核射、5儀声甲= 尿♦定、1-曱基鳥嗓呤、5,曱氨基曱基士硫尿苦工、^ 甲氨基曱基尿嘧啶、二氫尿嘧啶、卜半乳糖Q核苷、 甙、N6_異戊烯基腺嘌呤、^甲基肌苷、2,2_二曱基高娜人 2 -甲基腺嗓呤、2-甲基鳥,票呤、3.甲基胞核㈣美 ^純嚏:畝腺嗓呤、MU票呤、5·曱氨基甲基尿$ 咬二5-甲氧氨基曱基1硫尿t定、β-D-甘露糖Q核芽、5二 甲氧基羧曱基尿嘧啶、5_甲氧基尿嘧啶、2_甲基硫七6_里 戊晞基腺°示呤、尿噹咬_5_經乙酸、but〇x〇sine、假尿喷咬、 Q核苷、2-硫胞核嘧啶、5_甲基硫尿嘧啶、2_硫尿嘧啶、 4-硫尿嘧啶、5-曱基尿嘧啶、尿嘧啶_5-羥乙酸甲酯、^曱 基-2-硫尿嘧啶、3-(3-氨基_3_n_2_羧丙基)尿嘧啶,以 二氨基嘌呤。 > 作為-種替換方式,反意核酸也可用一種表達载體以 生物方式生產’該表達載體内以反意的取向亞克隆了一 酸分子(即相對於所考慮的目標核酸,從被插人核酸 的RNA將具有反㈣向。這將在以下分節 ^ -25- 200530400 本發明之反意核酸或其他核酸分子可以是一個…端 基差向異構核酸分子。端基差向異構核酸分子形成特殊 的帶有互補RNA的雙股雜化物,其中各股互相平行 (Gaultier et al·,Nucleic Acids Res· (1987) 15:6625-6641)。 5 該反意核酸或其他核酸分子也可包含一個曱基核糖核:gl 酸(Inoue et al·,Nucleic Acids Res (1987) 15:6131-6148)或 一個嵌合體 RNA-DNA 類似物(Inoue etal·,FEBS Lett. (1987) 215:327-330)。 本發明還包括核酶。核酶是一些具有核糖核酸酶活性 ίο 的催化RNA分子,它們能切開含有一個與它們互補的區 域的單股核酸,例如mRNA。因此,核酶(例如,jjaselhoff etal·,Nature (1988) 334:585-591中所述的錘頭狀核酶)可 用來在催化條件下切開SNAIPmRNA轉錄系列,從而抑 制SNAIP mRNA的轉譯。具有SNAIP編竭核酸特異性的 15 核酶,可以天然產生的SNAIP cDNA的核苷酸序列為基礎 而設計。例如,可以構建四膜蟲L-19 I VS RNA的衍生物, 其中活性位點的核苷酸序列與SNAIP編碼mRNA内將要 被切開的核苷酸序列是互補的,參閱,例如,Cech等, 美國專利4,987,071 ;和Cech等,美國專利5,116,742。作 20 為一種替換方式,SNAIP mRNA可用於從許多RNA分子 中選擇具有特殊核糖核酸活性的催化RNA,參閱,例如, Bartel 等,Science (1993) 261: 1411-1418。 本發明遥包括形成二螺旋結構的核酸分子。例如,通 過瞄準與SNAIP的調節區互補的核苷酸序列(例如, -26- 200530400 SNAIP啟動子和/或促進子),可以抑制SNAIp的基因表 達,以形成預防目標細胞内SNAIP基因轉錄的三螺旋結 構’一般可參閱 Helene,Anticancer Drug Dis. (1991) 6(6):569; Helene,Ann· Ν·Υ· Acad· Sci· (1992) 660:27;以 5 及 Maher,Bioassays (1992) 14(12):807。 在一較佳的具體實施例中,本發明之核酸分子可以在 驗基、糖基或磷酸基主鏈部分被變更,以改善例如分子的 穩疋性、雜化性或可溶性。例如,核酸的去氧核糖填酸基 的主鏈可以被變更,以生成肽核酸(參閱HyrUp et al·, 10 Bioorganic & Medicinal Chemistry (1996) 4:5)。如本文中 所使用的’術語“肽核酸”或“PNA”指的是核酸的模擬物, 例如,DNA模擬物,其中去氧核糖磷酸基主鏈被假核苷 主鏈取代’而只有四個天然核鹼基被保留。PNA的中性 主鏈已被證明可在低離子濃度的條件下特異性地雜化到 15 DNA和RNA上。PNA寡聚體的合成可使用標準的固相肽 合成方案來實現’正如前述Hyrup et al· (1996)和
Perry-0,Keefe etal·,Proc· Natl· Acad. Sci· USA (1996) 93:14670等文中所述。 SNAIP的PNA可用於治療和診斷。例如,PNA可作 2〇 為反意或反基因製劑而調節特定序列的基因表達,例如, 通過誘導轉錄或轉譯的抑制或抑制複製的方式。SNAIP的 PNA當與其他的酶例如S1核酸酶結合使用時可作為人造 限制酶使用(Hyrup (1996)同上文),或作為〇ΝΑ序列和 雜化的探針或引子使用(Hyrup (1996)同上文; -27- 200530400
Perry_0’Keefe等(1996)同上文)’以用於基因内單對驗基 突變的分析,例如,通過PNA指導的PCR夾子法 (clamping); 在另一具體實施例中,可通過將親脂性或其他辅助子 基團連接在PNA上,通過形成PNA-DNA嵌合體,或通 過使用脂質體或本技術領域内已知的其他藥物輪入技術 等方式,來變更SNAIP的PNA,其目的是提高穩定性、 特異性或細胞的攝取量等。PNA-DNA嵌合體的合成可按 照以下文獻所述而進行:Hyrup (1996),同上文;Finn等 ίο Nucleic Acids Res· (1996) 24(17): 3357_63; Mag 等,Nucleic Acids Res· (1989) 17: 5973 ;以及 Peterser 等,Bioorganic Med· Chem· Lett· (1975) 5: 1119。 II.分離的SNAIP蛋白和SNAIP抗體 15 本發明之一個方面係關於分離出的SNAIP蛋白,及其 生物活性部分’以及適合作為免疫原來培養SNAIP抗體鲁 的多肽片段。在一具體實施例中,町通過使用標準的蛋白 純化技術、採用適當的純化方法,從細胞或組織分離出天 生的SNAIP蛋白。在另一具體實施例中,SNAIP蛋白是 20 通過使用重組DNA技術而生產的。作為重組表達的替換 方式,可使用標準的肽合成技術以化學方式來合成SNAIP 蛋白或多肽。 “分離的,,或“純化的,,蛋白或其生物活性部分,基本上 不含細胞物質或來源於衍生該SNAIP蛋白的細胞或組織 -28- 200530400 的其他污染性蛋白,或者,當以化學方式合成時,基本上 不含化學前體或其他化學物質。“基本上不含細胞物質”的 說法包括SNAIP蛋白製劑,其中該蛋白被從細胞成分中 分出,SNAIP蛋白則從中被分離出或以重組方式生產。因 5 此,基本上不含細胞物質的SNAIP蛋白,包括其中非 SNAIP蛋白(在本文中又稱為“污染性蛋白”)含量少於約 30%、20%、10%或5% (幹重)的SNAIP蛋白的製劑。當 SNAIP蛋白或其生物活性部分是以重組方式產生時,最理 想的是它還基本上不含培養基,即培養基只占蛋白製劑體 ίο 積的約20%、10%或5%以下。當SNAIP蛋白是以化學合 成方式生產時,最理想的是它基本上不含化學前體或其他 化學物質,即它與參與蛋白合成過程的化學前體或其他化 學物質互相分離。相應地,這樣的SNAIP蛋白製劑只含 約30%、20%、10%或5% (幹重)的化學前體或非SNAIP 15 化學物質。 SNAIP蛋白的生物活性部分所包含的肽,含有與 SNAIP蛋白的氨基酸序列十分相似的氨基酸序列,或含有 從SNAIP蛋白的氨基酸序列衍生的氨基酸序列,這些氨 基酸序列所包含的氨基酸數量比整個的SNAIP蛋白為 2〇 少,並顯示出SNAIP蛋白的至少一種活性。通常,生物 活性部分包括一個至少具有一種SNAIP蛋白活性的區域 或基序。SNAIP蛋白的生物活性部分可以是一個長度為例 如10、25、50、100個或更多個氨基酸的多肽。較佳的生 物活性多肽包括一個或多個已鑑定的SNAIP結構域,例 -29- 200530400 如’ 一個或多個細胞外域。 而且’其他的生物活性部分(其中該蛋白的其他區域已 被刪除)可以用重組技術來製備,並就天然snaip蛋白的 一種或多種功能活性加以評估。 5 相應地,有用的snaip蛋白是這樣的_種蛋白,它所 包括的氨基酸序列與天然產生的SNAIP的氨基酸序列相 比,至少約88%、較佳的是90〇/〇、93%、95%或99%相同, 而且它保持了 SNAIP的功能活性。 為了確疋兩個氣基酸序列或兩個核酸之間的同源性 10 百分比,將這些序列對準以便進行最佳的比較(例如,可 在弟一個氨基酸或核酸序列中引入空位,以便與第二個氨 基酸或核酸序列最佳地對準)。然後,將處於對應的氨基 酸位置或核苷酸位置的氨基酸殘基或核苷酸進行比較。當 第一個序列内的一個位置被與第二個序列内對應位置同 15 樣的氨基酸殘基或核苦酸占據時,那麼該位置的分子即為 相同。兩個序列之間的同源性百分比,是這些序列所共用 的相同位置數目的函數(即’同源性百分比==相同位置數/ 位置總數(例如重疊的位置數)X 100)。在一具體實施例 中,這兩個序列具有同樣的長度。 20 兩個序列之間的同源性百分比可用一種數學演算法 來確定。比較兩個序列的數學演算法的一個較佳的、非限 制性例子是 Karlin 等人在 Proc· Natl· Acad. Sci. USA (1990) 87:2264 中提出,又在 Proc· Natl· Acad. Sci· USA (1993) 90··5873-5877中修改的演算法。這樣的演算法被納入 -30- 200530400
Altschul 等人在 J· Mol· Bio· (1990) 215:403 中提出的 NBLAST和XBLAST程式中。可以用NBLAST程式進行 BLAST 核苦酸搜索,例如,score 二 100,wordlength = 12 ’ 以獲得與本發明之SNAIP核酸分子同源的核苷酸序列。 5 可以用XBLAST程式進行BLAST蛋白搜索,例如,score =50,wordlength = 3,以獲得與本發明之SNAIP蛋白分 子同源的氨基酸序列。為了比較的目的而獲得空位對準 線,可使用如 Altschul 等人在 Nucleic Acids Res· (1997) 25:3389中所述的Gapped BLAST。作為一種替換方式, ίο PSI-Blast可用於進行可測出分子之間遙遠關係的重複搜 索。Altschul 等,(1997)同上文。當使用 BLAST Gapped BLAST和PSI-Blast程式時,可使用各程式的缺省參數(例 如 XBLAST 和 NBLAST) , 參 閱 http://www.ncbi.nlm.nih.gov ° 15 另一較佳的、用於比較序列的數學演算法的非限制性 例子是Myers等人在CABIOS (1988) 4:11-17中提出的演 算法。這種演算法被納入ALIGN程式(版本2.0),它是GCG 序列比對軟件的一部分。當使用ALIGN程式比較氨基酸 序列時,可用ΡΑΜΙ20權重殘基表(weight residue table) 2〇 並以空位長度罰分(gap length penalty) 12 、空位罰分(gap penalty) 4 為參數。 兩個序列之間同源性百分比可採用與如上所述類似 的技術,在允許空位或不允許空位的條件下來確定。在計 算同源性百分比時,只有精確配對的殘基才計算在内。 -31 - 200530400 在一較佳的具體實施例中,製備了所關注的Wnt結 合部分。SNAIP結構的這一部分可單獨使用或與另—分^ 融合,例如利用本技術領域内已知的技術和試劑與—報道 分子(reporter molecule)融合。這樣,通過在Wnt與FZ |士 5 合之前就俘獲Wnt,可將可溶性SNAIP用於下調Fz。口 在某些寄主細胞(例如,哺乳動物的寄主細胞)内,通 過使用一種異源信號序列的方式可加強SNAIP的表達 或分泌。例如,杆狀病毒包膜蛋白的gp6®分泌序列即可用 作為異源信號序列(Current Protocols in Molecular Biology 10 Ausubel et al·,eds·,John Wiley & Sons,1992)。真核細胞異 源信號序列的其他例子包括蜂毒素和人類胎盤驗性鱗酸 鹽的分泌序列(Stratagene; La Jolla,California)。在另一實 例中,有用的原核異源信號序列包括phoA分泌信號 (Sambrook等,同上文)和蛋白A分泌信號(Pharmacia 15 Biotech; Piscataway,New Jercy) 〇 最理想的是,本發明之SNAIP嵌合或融合蛋白通過標 準的重組DNA技術來製備。例如,按照常規技術將編石馬 不同多肽序列的DNA片段連接到同一讀碼框内,例如通 過利用平末端或粘性末端連接,利用限制性内切酶消化以 20 提供適當的末端,根據需要補平粘性末端,利用鹼性磷酸 酶處理以避免不需要的結合,以及酶促連接等。在另一具 體實施例中,可通過常規技術合成融合基因,包括使用自 動DNA合成儀。作為一種替換方式,基因片段的PCR擴 增可以利用錨定引物在兩個相繼的基因片段之間產生互 -32- 200530400 補的突出端,而後煉合並再擴增以產生欲合的基因序列。 (參閱例如Ausubel等,同上文)。此外,許多已經包含融 合蛋白(如某種GST多狀)編碼相的表達載體已經商品 化。編碼SNAIP的核酸可以被克隆入這種表達载體,使 SNAIP蛋白與表達載體中融合蛋白部分連接並處於同一 讀碼框内。 本發明還涉及SNAIP蛋白的各種變體(即該蛋白序列 不同於天然產生的、通常的SNAIP等位基因相應的氨基 酸序列)。這類變體可作為SNAIP模擬物而起作用。SNAIp 蛋白的變體可通過致突變作用而產生,例如,不連續點突 變(discrete point mutation)或 SNAIP 蛋白的截斷。SNAIp 蛋白的致效劑或模擬物基本上保留了與天然產生的 SNAIP蛋白同樣的的生物活性,或一部分生物活性。因 此’可以用一個功能受限或得到增強的變體進行治療而產 生特殊的生物效果。相對於用天然產生的SNAIP蛋白進 行治療,用上述這種保留了一部分生物活性的變體對治療 對象進行治療可使副作用較少。
SNAIP蛋白的變體可通過篩選SNAIP蛋白突變體例 如截短的突變體組合資料庫,以獲取具有SNAIP活性的 蛋白而得到鑑定。在一具體實施例中,通過在核酸水準上 的組合誘變,一個多樣化SNAIP變體資料庫得以產生, 並由一個多樣化基因資料庫進行編碼。一個多樣化SNAIP 變體資料庫可以這樣產生:例如,將合成寡核苦酸的混合 物以酶促連接方式連到基因序列上,使得潛在的SNAIP -33- 200530400 序列的退化集合可表達為單個的多肽;或作為一種替換方 式’可表達為含有SNAIP序列集合的較大的融合蛋白的 集合(例如噬菌體展示)。有一系列方法可用於從一個退化 的寡核苷酸序列產生潛在的SNAIP變體資料庫。可在自 5 動DNA合成儀中進行退化基因序列的化學合成,然後, 該合成的基因被連接到一個適當的表達載體上。使用退化 基因集合的方法可在一種混合物内提供為一組所需的潛 在SNAIP序列編碼的所有序列。合成退化寡核苷酸的各 種方法在本技術領域内是眾所周知的(參閱例如,Narang, 10 Tetrahedron (1983) 39:3; Itakura et al.5 Ann. Rev. Biochem. (1984) 53:323; Itakura et al.? Science (1984) 198:1056; Ike et al·,Nucleic Acid Res· (1983) 11:477) 〇 此外,SNAIP蛋白編碼序列片段資料庫可用於產生一 個多樣化SNAIP片段的群體,以篩選並進而選擇snaIP ^ 蛋白的變體。在一具體實施例中,編碼序列片段資料庫可 以這樣產生·用核酸酶處理SNAIP編碼序列的雙股pcR 片段’控制條件使每個分子只產生一個基因巧合,接著讓 雙股DNA變性、再使之複性而形成新的雙股DNA,後者 所包含的那對正意股/反意股可來自不同的基因巧合產 20 物’然後用S1核酸處理以除去所形成的雙鍵體之單鍵 部分,最後將所得的片段資料庫連到一表達载體内。通過 這種方法,可以產生一個編碼SNAIP蛋白各種不同尺寸 的N-末端和基因内片段的表達資料庫。 本技術領域内已知有數種技術可用於_選以點突變 -34- 200530400 或截短方法所製備的組合資料庫基因產物,以及為具有某 種远定性質的基因產物篩選cdna資料庫。這些技術適用 於快速篩選通過SNAIP蛋白組合誘變而產生的基因資料 庫。經得起高通量分析檢驗的、篩選大型基因資料庫時最 5 廣泛使用的技術通常包括:在某些條件下將基因資料庫克 隆入可複製的表達載體,用所得載體庫轉化適當的細胞, 並表達邊組合基因(combinatorial genes)。在這些條件下, 某種所需活性的檢出可促進載體的分離,該載體為基因產 物被檢出的基因編碼。遞歸整體誘變(Recursive ensemble ίο mutagenesis,REM)是一種提高載體庫中功能突變體頻率 的技術,可與篩選分析結合使用以鑑定SNAIP變體。 (Arkin et al·,Proc· Natl· Acad· Sci· USA (1992) 89:7811-7815; Delgrave et al., Protein Engineering (1993) 6(3):327-331)。 15 利用製備多克隆抗體和單克隆抗體的標準技術,可將 遊離的SNAIP蛋白、或其一部分或片段作為免疫原,以 產生結合SNAIP的抗體。可以使用全長的SNAIP蛋白, 或作為一種替換方式,使用本發明提供的SNAIP抗原肽 片段作為免疫原。該SNAIP抗原肽至少包括8個(較佳的 20 是10、15、20或30個)SNAIP氨基酸殘基,包含一個SNAIP 抗原決定基,使得所產生的抗原肽抗體與SNAIP形成一 種特異的免疫複合體。該抗原決定基可附在白蛋白之類的 載體分子上。 SNAIP免疫原通常用於製備抗體,其方式是用該免疫 -35- 200530400 原免疫合適的對象(如豕兔、山羊、小氣或其他哺乳動物)。 合適的免疫原製劑可含有例如重組表達的SNAIP蛋白, 或化學合成的SNAIP多肽。該製劑還可包含一種佐劑, 例如弗氏(Freund)完全或不完全佐劑,或類似的免疫刺激 5 因子。用免疫原性SNAIP製劑免疫合適的對象可誘導產 生抗SNAIP多克隆抗體應答。 相應地,本發明之另一個方面係關於抗SNAIP的抗 體。本文中所使用的術語“抗體”指的是免疫球蛋白分子和 免疫球蛋白分子的免疫活性部分,即含有特異結合SNAIP 10 的抗原結合部位的分子。特異結合SNAIP的分子是指那 些結合SNAIP但基本上不結合樣品(例如天然含有snaIP 的生物樣品)中其他分子的分子。免疫球蛋白分子的免疫 活性部分的例子包括F(ab)和F(ab,)2片段,該兩種片段可以 通過用酶例如胃蛋白酶處理抗體而產生。本發明提供了可 15 結合SNAIP的多克隆和單克隆抗體。本文所使用的術語 “單克隆抗體”或“單克隆抗體成分,,指的是一群抗體分 子,它們只含有一種能夠與SNAIP的特定抗原決定基發 生免疫反應的抗原結合部位。因此,單克隆抗體成分通常 只對與其發生免疫反應的特定SNAIP蛋白顯示單一的結 20 合親合力。 如上所述,多克隆SNAIP抗體可以用SNAIP免疫原 免疫適當對象的方式製備。免疫對象中SNAIP抗體的滴 度可採用標準技術進行實時監測,例如採用酶聯免疫吸附 (enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)法並使用固 -36- 200530400 定化SNAIP。 如果需要,抗SNAIP的抗體分子可從哺乳動物(例如 從血液中)分離並進一步用策所周知的技術純化,例如用 蛋白A色譜法獲取IgG組分。在免疫後某一適當的時間, 5 例如當SNAIP抗體滴度最高的時候,可從免疫對象中獲 取產生抗體的細胞,並可通過標準技術將其用於製備單克 隆抗體。例如,最初由Kohler等人發表的雜交瘤技術 (Kohler et al·,Nature (1975) 256:495-497)、人類 B 細胞雜 交瘤技術(Kohler et al·,Immunol· Today (1983) 4:72)、EBV-i〇 雜交瘤技術(Cole et al·,Monoclonal Antibodies and Cancer
Therapy,(1985),Alan R· Liss,Inc·, pp. 77 - 96)或 trioma 技術。產生雜交瘤細胞的技術是眾所周知的(一般參閱 Current Protocols in Immunology (1994) Coligan et al·, (eds·) John Wiley & Sons,Inc·,New York, NY)。簡而言 15 之,將永生的細胞系(通常是骨髓瘤細胞)與用SNAIP免疫 原按上述方法免疫過的哺乳動物的淋巴細胞(通常用脾細 胞)融合,再篩選所產生的雜交瘤細胞培養上清液,以鑑 定能產生與SNAIP結合的單克隆抗體的雜交瘤細胞。 用於融合淋巴細胞和永生細胞系的許多知名方案中 20 的任何一個都可用於產生SNAIP單克隆抗體(參閱如
Current Protocols in Immunology,同上文;Galfre et al·, Nature (1977) 266:550-552 ; Kenneth,in Monoclonal Antibodies: A New Dimension In Biological Analyses, Plenum Publishing Corp·,New York, Ν·Υ· (1980);以及 -37- 200530400
Lerner,Yale J· Biol· Med· (1981) 54:387-402)。此外,一般 的技工將會理解這類方法還有許多有用的變通方法。通 常,永生細胞系(如骨髓瘤細胞系)與淋巴細胞源自同一種 哺乳動物。例如,小鼠雜交瘤細胞可通過使源自經本發明 5 之免疫原製劑免疫的小鼠的淋巴細胞與某一永生小鼠細 胞系融合的方式而產生。該永生細胞系的例子包括對含有 次黃嗓呤、氨基蝶呤和胸腺0密咬脫氧核苷的培養基(“hat 培養基”)敏感的骨聽瘤細胞系。很多骨聽瘤細胞系都可按 照標準的技術參與融合,例如 P3-NSl/l_Ag4-l, ίο P3-x63-Ag8.653或Sp2/0-Agl4骨髓瘤細胞系。這些骨髓 瘤細胞可由ATCC提供。通常,對HAT敏感的小鼠骨髓 瘤細胞是用聚乙二醇(PEG)融合到小鼠脾細胞内。然後用 HAT培養基選擇融合所得的雜交瘤細胞,該培養基將殺死 未融合和未正確融合的骨髓瘤細胞(未融合的脾細胞於幾 15 天後死亡,因為它們未被轉化)。產生本發明之單克隆抗 體的雜交瘤細胞可通過筛選雜交瘤細胞培養上清液中結 合SNAIP的抗體的方式而檢測,例如,採用標準的ELIS A 分析法來檢測。 除了製備單克隆抗體-分泌性雜交瘤細胞的方式以 20 外,還可以通過用SNAIP篩選重組組合免疫球蛋白資料 庫(例如抗體%鹵體展示資料庫)從而分離出結合SNAIP 的免疫球蛋白資料庫成分的方式來鑑定和分離單克隆 SNAIP抗體。產生和篩選禮菌體展示資料庫的成套試劑已 經商 α口化(例如 ’ the Pharmacia Recombinant Phage -38- 200530400
Antibody System, Catalog No· 27-9400-01 ;以及 the Stratagene SurfZAP®Phage Display Kit,Catalog No. 240612) 〇 另外,特別適用於產生並篩選抗體顯示資料庫的方法 5 和試劑的實例可參閱如下文獻:例如,U.S. Patent No.
5,223,409; PCT Publication No. WO 92/18619; PCT Publication No. WO 91/17271; PCT Publication No. WO 92/20791; PCT Publication No. WO 92/15679; PCT Publication No. WO 93/01288; PCT Publication No. WO ίο 92/01047; PCT Publication No. WO 92/09690; PCT
Publication No. WO 90/02809; Fuchs et al.9 Bio/Technology (1991) 9:1370-1372; Hay et al·,Hum· Antibod· Hybridomas (1992) 3:81-85; Huse et al.5 Science (1989) 246:1275-1281; and Griffiths et al·,EMBO J· (1993) 25 12:725-734。
15 此外,重組SNAIP抗體,例如由可用標準重組DNA 技術製備的人類和非人類部分所組成的嵌合體和人類化 單克隆抗體,也包括在本發明範圍之内。這類嵌合體和人 類化單克隆抗體可使用本技術領域内已知的重組DNA技 術來生產,例如使用以下文獻所述的方法:PCT Publication 2〇 No. PCT Publication No. WO 87/02671; Europe Patent
Publication No. 184,187; Europe Patent Publication No. 171,496; Europe Patent Publication No· 173,494; PCT Publication No· WO 86/01533; U.S· Patent No· 4,816,567; Europe Patent Publication No. 125,023; Better et al.9 -39- 200530400
Science (1988) 240:1041-1043; Liu et al.5 Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1987) 84:3439-3443; Lin et al·,J· Immunol· (1987) 139:3521-3526; Sun et al.? Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1987) 84:214-218; Nishimura et al.? Cane. Res. (1987) 5 47:999-1005; Wood et aL? Nature (1985) 314:446-449; Shaw et al·,J· Natl· Cancer· Inst· (1988) 80:1553-1559; Morrison, Science (1985) 229:1202-1207; Oi et al.5 Bio/Techniques (1986) 4:214; U.S. Patent No. 5,225,539; Jones et al.5 Nature (1986) 321:552-525; Verhoeyan et al.5 Science (1988) o 239:1534,以及 Beidler et al·,J· Immunol. (1988) 141:4053_4060。 完全人類的抗體對於人類患者的治療是特別理想 的。這類抗體可用不能表達内源性免疫球蛋白重鏈和輕鏈 基因、但能表達人類的重鏈和輕鏈基因的轉基因小鼠來生 5 產°这些轉基因小鼠用所選擇的抗原例如全部或部分 SNAI^以通常的方式進行免疫。針對抗原的單克隆抗體可 使用常規的融合細胞技術而獲得。轉基因小鼠所含的人類 免f球蛋白轉基因在B細胞分化期間重新排列,隨後經受 了等、、及轉換和細胞體(somatic)突變。如此,使用這樣的抗 :〇 原決定基,^ 仰制SNAIP活性的抗體得以鑑定。非人類抗 ^。、例^和輕鏈被克隆並被用於產生噬菌體顯示Fab片 ^ 重鍵基因可被克隆入質粒載體’使得該重鏈可 以 足細_分、山 白A因, 出來。輕鏈基因可被克隆入噬菌體的外殼蛋 ^ 使得該輕鏈可以表達在噬菌體表面。與噬菌體融 200530400 合的人類輕鏈庫(隨機收集)被用於傳染表達非人類重鍵的 細菌。所得的後代嗟菌體顯示出雜化物抗體(人類輕鍵/非 人類重鏈)。選定的抗原被用於以淘篩的方式筛選與選定 才几原結合的11莖囷體。鑑疋這樣的嗤囷體可能需要經過幾輪 5 篩選。然後,人類輕鏈基因與結合選定抗原的選定嗟菌^ 分離。其後,這些選定的人類輕鏈基因被用於指導如下的 人類重鏈基因的選擇。選定的人類輕鏈基因被插入載體由 細菌表達。表達選定人類輕鏈的細菌被與嗟菌體融合的人 類重鏈感染。所得的後代噬菌體顯示了人類抗體(人類輕 10 鏈/人類重鏈)。 其次,選定的抗原被用於以淘篩的方式蒒選與選定抗 原結合的噬菌體。在該步驟選出的噬菌體顯示了一個完全 人類的抗體,它可識別被原來選出的非人類單克隆抗體識 別的同樣抗原決定基。這些可編碼重鍵和輕鏈的基因很容 15 易被分離,並可進一步處理以生產人類抗體。Jespers等人 敘述了該項技術(Bio/Technology (1994) 12:899-903)。 SNAIP抗體(例如單克隆抗體)可用於以標準技術分離 SNAIP,例如親合色譜法或免疫沉殿反應。SNAIP抗體可 促進源自細胞的天然SNAIP的純化,以及表達在寄主細 20 胞裏的重組產生的SNAIP的純化。而且,SNAIP抗體可 用於檢測SNAIP蛋白(例如,在細胞溶解產物或細胞上清 液内)’以評估SNAIP蛋白表達的豐度和模式。作為一個 臨床試驗過程的一部分,SNAIP抗體在診斷上可用於監測 組織内的蛋白含量,例如,確定某種治療方法的功效。使 200530400 抗體與一種可檢測的物質結合則可促進檢測。可檢測物質 的例子包括各種各樣的酶、輔劑,螢光物質,發光物質, 生物發光物質和放射性物質。適當的酶的例子包括辣根過 氧化物酶,鹼性磷酸酶、半乳糖甘酶或乙醯膽鹼酯酶;適 當的辅劑複合物的例子包括抗生蛋白鏈菌素/生物素和抗 生物素蛋白/生物素;適當的螢光物質的例子包括傘形 酮、熒光素、熒光素異硫氰酸鹽、若丹明、二氯三嗪胺熒 光素、丹磺醯氯、特定的螢光蛋白或藻紅蛋白;發光物質 的例子包括魯米諾(iuminal);生物發光物質的例子包括螢 光素i#、螢光素、水母發光蛋白,·適當的放射性物質的例 子包括 1251、1311、358或311。 SNAIP分子可通過例如χ_射線結晶學分析,以鑒別 結合Wnt那部分的結構。基於結構上的資訊,技術人員 能夠構建結合Wnt的合成分子。這樣的SNAIP模擬物可 由各種各樣的任何構建單元來製備,包括氨基酸、核苷 酉欠、糖類、有機分子等,以及它們的組合。 SNAIP分子還可用作為免疫原以培養具有模仿界泔 結構的抗體。這類抗體與直接培養在FZ上的抗體相似, 將共FZ結合並將阻止Wm與fz的結合。最好,這類抗 體不會激發FZ的活化。 III·重,表達載體和寄主細胞 红本發明之另一方面係關於含有可編碼SNAIP(或其一 邛刀)的核酸分子的載體,較佳的是表達載體。如本文中 •42· 200530400 所使用的,術語“载體,,指 核酸的核酸分子。—種載與匕相連接的另― A片段可料接上ft的麵是1粒”,指的是其他 載體是病毒細,雙股疆環。另-類型的 毒的基因_,因的麗片段可以連接到該病 夠在被引人寄主細胞^;基/組的容量較大。某些載體能 菌複製來源的細菌自發複製(例 些載體(例如,哺乳動物非自礼動物附加型載體P其他一 時被整合到寄主細胞的基型載體)在被弓丨人寄主細胞 被複製。而且,某些载2,声且:’因此:寄主基因組-起 操作地連接的A _ 、達載體’㈣指導與它們可 15 的表達載㈣職技術 明還意在包括Α他料、㈣式存在。但是,本發 毒載_如,複的表達载體,例如起等效作用的病 病毒)。 、曰处轉錄酶病毒、腺病毒和腺相關 20 核酸在寄主細:二括本發明之核酸’它以適合 載體包括料料;重組表達 個調控序列,該調控序 為基擇的-個或多 的核*酸序列以便於該核二==在表示所考慮 轉錄/轉譯李轉η㈣μ序表達(例如’在一體内 括啟動子、促進子以及语5周控序列”意在包 進子及其他表達控似素(例如,多聚腺 -43- 200530400 苷酸化信號)。有些文獻中敘述了這類調控序列,例如
Goeddel,Gene Expression Technology: Methods in Enzymology Vol· 185,Academic Press,San Diego,CA 5 10 15 20 (1990)。調控序列包括在許多種寄主細胞内指導核苷酸序 列組成性表達的調控序列(例如,組織特異性的調控序 列)。熟悉本技術者應理解表達載體的設計可取決於諸如 欲轉化的寄主細胞的選擇、所希望的蛋白表達水準等因 素本毛月之表達載體可導入寄主細胞,從而生產如本文 所述的由核酸編碼的蛋白或肽(例如,SNAn>蛋白、突變 體形式的SNAIP、融合蛋白等)。
本發明之重組表達載體可設計用於SNAIP 真核細胞内的表達,例如,大腸桿菌、昆蟲細胞(使用杆 狀病毒表達載體)、酵母細胞或哺乳動物細胞 ^ 二=r〇eddel 一文一 進v讶调。作為一種替換方式,重組表達載體士 =轉錄和轉譯,例如使用T7啟動子調控序^^ 合 S#。 1 / 1 蛋白在原核生物巾的表達最时是在 行的’所用的载體含有指導融合或非融 的蛋白,通常添加到重組蛋 合載體通常用於三個目的:υ增加重組蛋:頬场 增:重組蛋白的溶解度;以及3)作為親合純化=達丄2 配體而輔助重組蛋白的純化。通常,在融合表達 -44- 200530400 在融合部分和重組蛋白的連接處導入一蛋白水解酶切位 點,使得重組蛋白在融合蛋白純化之後可與融合部分分 離。這類酶以及它們的同源識別序列包括Xa因子、凝血 酶以及腸激酶。典型的融合表達載體包括pGEX 5 (Pharmacia Biotech Inc·; Smith et al·,Gene (1988) 67:31-40),pMAL (New England Biolabs,Beverly,MA)以 及 pRITS (Pharmacia,Piscataway,NJ),它們將谷胱甘肽-5-轉移酶(GST)、麥芽糖E結合蛋白或蛋白A分別與目標重 組蛋白融合。 10 可誘導非融合大腸桿菌表達載體的適當例子包括
pTrc (Amann et al·,Gene (1988) 69:301-315)和 pET lid (Studier et al·,Gene Expression Technology: Methods in Enzymology,Academic Press,San Diego, California (1990) 185:60-89)。源自pTrc載體的目標基因表達依賴於宿主 15 RNA聚合酶來自雜化trp-lac融合啟動子的轉錄。源自pET lid載體的目標基因表達依賴於由共表達病毒RNA聚合 酶(T7 gnl)介導的來自T7 gnl-lac融合啟動子的轉錄。該 病毒聚合酶是由宿主菌株BL21 (DE3)或HMS 174(DE3) 在lacUV 5啟動子的轉錄控制下從含有T7 gnl基因的常駐 20 λ原噬菌體供給。 一種能使大腸桿菌内重組蛋白的表達達到最高程度 的策略是在一個被削弱的宿主細菌内表達蛋白,從而以蛋 白水解方式分裂重組蛋白(Gottesman,Gene Expression Technology: Methods in Enzymology,Academic Press, San 200530400
Diego, California (1990) 185:119-128)。另一策略是修改被 插入表達載體的核酸的核酸序列,使得每個氨基酸各自的 密碼子是優先用於大腸桿菌的那些密碼子(Wada etal., Nucleic Acids Res. (1992) 20:2111_2118)。本發明之核酸序 5 列的上述改變可通過標準^的DNA合成技術來實現。 在另一具體實施例中,SNAIP表達载體是酵母表達載 體。在釀酒酵母(S· cerevisiae)内表達的載體例子包括 pYepSecl (Baldari et al.9 EMBO J. (1987) 6:229-234) ^ pMFa (Kurjan et al·,Cell (1982) 30:933-943)、pJRY88 (Schultz et ίο al·, Gene (1987) 54:113-123) ^ pYES2 (Invitrogen
Corporation,San Diego, CA),以及 pPicZ (Invitrogen Corp·,
San Diego, CA)。 作為一種替換方式,可使用杆狀病毒表達載體使得 SNAIP可表達在昆蟲細胞裏。可表達在經培養的昆蟲細胞 15 (例如Sf9細胞)蛋白裏的杆狀病毒載體包括pAc系列
(Smith et al·,Mol· Cell· Biol· (1983) 3:2156-2165)和 PVL 系列(Lucklow et al·,Virology (1989) 170:31-39) 〇 在另一個具體實施例中,使用了哺乳動物表達載體使 得本發明之核酸被表達在哺乳動物細胞裏。哺乳動物表達 20 載體的例子包括 PCDM8 (Seed,Nature (1987) 329:840)和 pMT2PC (Kaufman et al·,EMBO J· (1987) 6:187-195)。當 用於哺乳動物細胞晨時,表達載體的控制功能經常是由病 毒調控元件提供的。例如,常用的啟動子是從多瘤病毒、 腺病毒2、細胞巨化病毒和猿病毒4〇衍生而來的。關於其 -46- 200530400 他原核細胞和真核細胞的適當表達系統,參閱上文提及的 Sambrook等人的論文第16章和第17章。 在另一具體實施例中,重組哺乳動物的表達載體能優 先指導特殊類型細胞内核酸的表達(例如,組織特異性調 5 控元件被用於表達核酸)。組織特異性調控元件在本技術 領域内是眾所周知的。適當的組織特異性啟動子的非限制 例子包括白蛋白啟動子(肝臟特異;Pinkert etal.,Genes
Dev· (1987) 1:268-277),淋巴腺特異啟動子(Calame etal., Adv· Immunol· (1988) 43:235_275),尤其是 T 細胞受體啟 ίο 動子(Winoto et al·,EMBO J· (1989) 8:729-733)和免疫球 蛋白(Banerji et al·,Cell (1983) 33:729-740; Queen et al·, Cell (1983) 33:741-748) ’神經元特異啟動子(例如,神經 細絲啟動子;Byrne et al·,Proc· Natl· Acad· Sci· USA (1989) 86:5473-5477),胰腺特異啟動子(Edlund et al.,Science 15 (1985) 230:912-916)和乳腺特異啟動子(例如,牛奶乳清 啟動子;U.s· Patent 4,873,316 和 EPO Publication No. 264,166)。發育調節啟動子也包括在内’例如氣科hox啟 動子(Kessel et al·,Science (1990) 249:374-379)以及 α_ 胎兒球蛋白啟動子(Campes et al·,Genes Dev. (1989) 20 3:537-546) 〇 本發明進一步提供了一種重組表達載體,它包含以反 意方向克隆進表達載體的本發明之DNA分子。換言之, 該DNA分子以這樣一種方式與一調控序列可操作地連 接,使得作為SNAIPmRNA反意股的一 RNA分子可以(通 -47- 200530400 過DNA刀子的轉錄)而表達。可以選擇與以反意方向克 隆的核酸可操作地連接的調控序列,賴控序列指導反意 RNA分子在各種各樣細胞中的連續表達,例如病毒啟動 子和/或促進子,也可以選擇指導反意RNA的組成性、組 5 織特異性或細胞類型特異性表達的調控序列。該反意表達 載體可採取重組質粒、噬菌粒或減毒病毒的形式,其中, 反意核酸在一個高效調控區域的控制下而產生,其活性可 由載體被導入的細胞類型確定。關於使用反意基因調控基 因表達的討論’可參閱Weintraub等的文章(Reviews - ίο Trends in Genetics,Vol· 1(1)1986)。 本發明之另一方面係關於本發明之重組表達载體所 導入的寄主細胞。術語“寄主細胞”和“重組宿主細胞,,在本 文中互換地使用。應該理解,這樣的術語指的不僅是特定 的細胞,還包括這類細胞的後代或潛在的後代。由於突變 15 或環境影響,某些改變可能在後繼的幾代中發生,所以在 事貫上,這樣的後代未必與親本細胞相同,但仍然被包括 在本文中所用的術語範圍之内。 寄主細胞可以是任何原核細胞或真核細胞。例如, SNAIP蛋白可以表達在細菌細胞裏,例如大腸桿菌、昆蟲 20 細胞、酵母或哺乳動物細胞(例如中國倉鼠卵巢細胞 或COS細胞)。其他適當的寄主細胞是熟悉本技術者所熟 知的。載體DNA可通過常規轉化或轉染技術導入原核^ 胞或真核細胞。如本文中所使用的,術語“轉化,,和‘‘轉染,, 意指本領域内公認的將外來核酸(例如DNA)導入寄主細 -48 - 200530400 胞的各種技術,力杯 糖介導轉染,脂轉染;=氣化1^共沉澱、deae葡聚 ,於哺乳動物細胞的穩定轉染,取決於所使用 的表達 技術’已知只有—小部分細胞可以將外來的 考ι口進基因組。為了鑒別和選擇那些整合子,通常 將編碼可選擇標記(例如對抗生素的抵抗)的基因與所研究 的基,一起導入寄主細皰。較佳的可選擇標記包括那些對 某些藥物例如G418、嘲黴素和曱氨蝶呤等具有抗藥性的 可選擇標記。編碼一可選擇標記的核酸可導入寄主細胞内 ίο 那個與編碼SNAIP的戴體相同的載體,或可導入一不同 的載體。用所導入核酸穩定地轉染的細胞可通過藥物選擇 來鑑定(例如,整合了可選擇標記基因的細胞將生存,而 其他的細胞則死亡)。 本發明之寄主細胞,例如培養液中的原核細胞或真核 15 細胞的宿主細胞,可用於生產(即表達)SNAIP蛋白。相應 地’本發明進一步提供了利用本發明之寄主細胞生產 SNAIP蛋白的方法。在一具體實施例中,該方法包括在一 種適當的培養基内培養(編碼SNAIP的重組表達載體被導 入的)本發明之寄主細胞,使得SNAIP蛋白得以產生。在 20 另一具體實施例中,該法進一步包括從培養基或寄主細胞 分離SNAIP。 本發明之寄主細胞也可用於繁殖非人類轉基因動 物。例如,在一具體實施例中,本發明之寄主細胞是一個 受精的卵母細胞或胚胎幹細胞,其中導入了 SNAIp編碼 -49- 200530400 序列。然後,這樣的寄主細胞可用於創造其基因組内導入 了外源性SNAIP序列的非人類轉基因動物,或其内源性 SNAIP序列被改變的同源重組動物。這樣的動物對於研究 SNAIP的功能和/或活性、以及鑒別和/或評估SNAIP活性 調控因子是很有用的。如本文中所使用的,“轉基因動物,, 較佳的是哺乳動物,更佳的是嚙齒動物,例如大鼠或小 鼠,該動物的一個或多個細胞含有一個轉基因。轉基因動 物的其他例子包括非人類靈長類動物 '綿羊、狗、奶牛、 山羊、雞以及兩樓動物等。轉基因是被整合進細胞基因組 的外源性DNA,該細胞發育為轉基因動物,轉基因仍遺 留在成熟動物的基因組内,從而指導該轉基因動物一種或 一種以上細胞或組織内編碼基因產品的表達。如本文中所 使用的,“同源重組動物”較佳的是哺乳動物,更佳的是小 鼠’其中一個内源性SNAIP基因通過内源性基因和在動 物發育之前引入該動物細胞例如胚胎細胞的外源性DNA 分子之間的同源性重組而得到了改變。 通過將SNAIP編碼核酸導入一受精卵母細胞的雄性 原核,例如,通過顯微注射、逆轉錄病毒傳染以及讓該卵 母細胞在一假孕雌性代孕動物體内發育,可以創造本發明 之轉基因動物。SNAIP DNA序列,例如序列鑒別號為1 的序列,可作為轉基因被導入非人類動物的基因組内。作 為一種替換方式,人類SNAIP基因的非人類同源物,例 如小鼠的SNAIP基因,可以在雜化為人類SNAIP cDNA 的基礎上被分離,並用作為轉基因。内插子序列和多聚腺 -50- 200530400 苷酸化信號也可包括在轉基因以增加該轉基因的表達效 率。一組織特異性調控序列可與SNAIP轉基因可操作地 連接’以將SNAIP蛋白的表達指向特定的細胞。通過胚 胎處理和顯微注射的方式繁殖轉基因動物尤其是小鼠之 5 類動物的方法,是本技術領域内傳統的方法並在以下文獻 中有所敘述,例如,U.S· Patent Nos. 4,736,866 和 4,870,009、U.S· Patent No· 4,873,191 以及 Hogan, Manipulating the Mouse Embryo, (Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,Ν·Υ·,1986)。類似的 i〇 方法可用於繁殖其他轉基因動物。然後,一個初始的轉基 因動物可用於繁殖更多載有該轉基因的動物。而且,载有 轉基因編碼SNAIP的轉基因動物可進一步繁殖為載有其 他轉基因的其他轉基因動物。 為了創造一種同源重組動物,製備了一種至少含有一 15 部分SNAIP基因(例如人類或非人類的SNAIP基因的同源 物,例如一種鼠科SNAIP基因)的載體,該SNAIP基因通 過剔除、添加或取代而被改變,例如其功能受到了擾亂。 在一較佳的具體實施例中,該載體的設計使得内源性 SNAIP基因的功能在同源重組時受到擾亂(即不再編碼功 2〇 能蛋白;又被稱為“基因剔除”動物)。作為一種替換方式, 載體也可設計得使内源性SNAIP基因在同源重組時雖然 發生了突變或變化,但卻仍可編碼功能蛋白(例如,上游 調控區域可被改變,從而改變該内源性SNAIP蛋白的表 達)。在同源重組載體内,位於SNAIP基因被改變的部分 -51 - 200530400 側翼的5’和3’末端存在附加的SNAIP基因核酸,使得在 該載體所傳送的外源性SNAIP基因和胚胎幹細胞内的内 源性SNAIP基因之間發生了同源重組。該側翼附加的 SNAIP核酸具有足夠的長度使得與内源性基因的同源重 5 組得以成功。通常,側翼DNA的幾千個鹼基(位於5’末 端和3’末端)均被包括在該載體内(參閱例如,Thomas et al·,Cell (1987) 51:503關於同源重組載體的敘述)。將該 載體導入一胚胎幹細胞系(例如,通過電穿孔法),並選擇 細胞内所導入的SNAIP基因與内源性SNAIP基因發生同 ίο 源重組的細胞(參閱例如,Li et al·,Cell (1992) 69:915)。 然後,將所選擇的細胞注入一動物的胚泡(例如小鼠),以 形成聚集欲合體(參閱例如,Bradley in Teratocarcinomas and Embryonic Stem Cells: A Practical Approach,Robertson, ed·,IRL,Oxford,(1987) pp· 113-152)。其後,將嵌合體胚 15 胎植入一個適宜的假孕雌性代孕動物,並使胚胎發育長 大。生殖細胞内含有同源重組DNA的後代可用於繁殖動 物。通過該轉基因的生殖線傳遞,所繁瘦動物的所有細胞 都含有該同源重組DNA。構建同源重組載體和同源重組 動物的方法在以下文獻中有進一步的敘述:Bradley, 20 Current Opinion in Bio/Technology (1991) 2:823-829 和 PCT Publication Nos· WO 90/11354,WO 91/01140,wo 92/0968 及 WO 93/04169。 在另一具體實施例中,可生產出含有調節轉基因表達 的選定系統的非人類轉基因動物。這種系統的一個例子是 -52- 200530400 嗤菌體P1的cre/loxP重組酶系統。關於creAloxP重組酶 系統的敘述,可參閱例如 Lakso et al·,Proc· Natl. Acad· Sci· USA (1992) 89:6232-6236。重組酶系統的另一例子是釀酒 酵母(S· cerevisiae)的 FLP 重組酶系統(O’Gorrnan et al·, 5 Science (1991) 251:1351-1355)。如果 cre/loxP 重組酶系統 被用於調節轉基因的表達,則需要含有既可編碼Cre重組 酶又可編碼所選蛋白的轉基因的動物。這種動物可通過構 建“雙”轉基因動物而獲得,例如,使兩個轉基因動物交 配,其中一個含有可編碼所選蛋白的轉基因,而另一個則 1〇 含有可編碼重組酶的轉基因。 本文所述的非人類轉基因動物的克隆也可按照以下 文獻中所述的方法產生:Wilmut et al·,Nature (1997) 385:810-813 和 PCT Publication Nos. WO 97/07668 以及 WO 97/07669。簡而言之,源自轉基因動物的一個細胞, 例如體細胞,可被分離和誘導退出生長週期而進入G〇階 段。然後,該靜止細胞可與源自同種動物的去核卵母細胞 融合,例如,通過使用電子脈衝;該卵母細胞系源自分離 出該靜止細胞的同種動物。然後,培養重新構建的卵母細 胞,使其發育為桑椹胚(morula)或胚球(blastocyte),然後 2〇 再轉移到一個假孕雌性代孕動物體内。該雌性代孕動物所 生的後代將是分出該細胞例如體細胞的動物的克隆。 IV·醫藥組合物 本發明之SNAIP蛋白、SNAIP抗體和SNAIP結合分 -53- 200530400 子(在本文中又稱為“活性化合物”)可被納入適合於給藥 方式的醫藥組合物。這類組合物通常含有蛋白或抗體以及 一種藥學上可接受的載體、賦形劑或稀釋劑。如本文中所 使用的,術語“藥學上可接受的載體”意在包括適合於給藥 5 方式的任何和所有的溶劑、分散介質、包衣,抗菌劑和抗 真菌劑、等滲劑和吸收延遲劑等。將這樣的介質和試劑用 於醫藥活性物質的做法是本技術領域内眾所周知的。除了 那些常規的介質或試劑與活性化合物不相容的情況,這類 介質和試劑在組合物内的使用是經過深思熟慮的。辅助的 10 活性化合物也可被納入該組合物内。 本發明之醫藥組合物是按照預定的給藥途徑而配製 的。給藥途徑的例子包括注射,例如靜脈注射、皮内、皮 下、口腔(例如吸入)、透皮(局部的),黏膜和直腸給藥。 用於注射、皮内或皮下給藥的溶液或懸浮液可包括以下組 15 分:無菌稀釋劑,例如注射用水、鹽水溶液、非揮發性油、 聚乙二醇、甘油、丙二醇或其他合成溶劑;抗菌劑,例如 苯曱醇或對羥基苯甲酸曱酯;抗氧劑,例如抗壞血酸或亞 硫酸氫鈉;螯合劑,例如EDTA ;緩衝劑,例如醋酸鹽、 檸檬酸鹽或磷酸鹽;以及調節滲透壓的試劑,例如氯化鈉 20 或葡萄糖。酸度(pH)可用酸或鹼來調節,例如HC1或
NaOH。注射製劑可密封於安瓿瓶、一次性注射器或玻璃 或塑膠製成的多劑量小瓶。 適合於注射用的醫藥組合物包括用於即時製備無菌 注射液或分散劑的無菌水溶液(若為水溶性)或分散劑以及 -54- 200530400 無菌粉末。對於靜脈給藥方式,適合的載體包括生理鹽 水’抑菌水,Cremophor EL® (BASF; Parsippany,NJ)或磷 酸鹽級衝鹽水(PBS)。在所有情況下,該組合物都必須無 菌而且應具有一定的流動性以便於注射。它在製造和儲存 條件下必須是穩定的,必須加以處理以抵抗微生物例如細 菌和真菌的污染。载體可以是含有水、乙醇、多羥基化物 (例如丙二醇、丙二醇、液體聚乙二醇等)及其適當混合物 的溶劑或分散介質。為了維持適當的流動性,可使用包 衣,例如㈣脂,·若在分散劑的倩況下,則可通過維持所 需的顆粒度來維持流動性;以及使用表面活化劑。為了預 防微生物的作用,可使用各種各樣的抗_和抗真菌劑, 甲酸f、氯丁醇、苯紛、抗壞血酸、硫柳 二在夺多情況下,較佳的是在該組+_ 15 加=,劑’例如糖、甘露醇和山梨糖醇之類的多元醇, 以及虱化鈉。可注射型組合物的延遲吸 物内加入包括延遲吸收的試劑 了通過在、、“ 銘和明膠。 μ而達到,例如加入單硬醋酸 無菌可注射溶液的製備是腌兮、工^ SNMP蛋白或画p抗^將5亥活性化合物(例如 述一種成分或幾種成份的組合一起力入^據品要與上 劑,隨後進行過滤滅菌。通常,分散劑W是!二當: 合物加入-種無菌載體,後者含有 疋將該活性化 所需的上述其他成份。在製備無菌注射;:=分散劑以及 況下,較佳的製備方法是通過真空乾燥和冷 -55- 20 200530400 滅菌過濾的溶液形成活性成分的粉末再加入任何其他所 需的成份。 口服組合物一般包括一灌惰性稀釋劑或可食用的載 體。它們可被密封在明膠膠嚢内或被壓成片劑。為了口服 治療的目的,活性化合物可與赋形劑一起成型並以月劑、 錠劑或膠囊的形式使用。口服組合物也可用一種液態載體 製備而作為漱口液使用,其中,液態載體中的化合物是經 口腔,徑施用,或者漱口後吐出,或者咽下。 藥=相容的枯合劑和/或佐劑材料可作為組合物的 15 何成份,或性質類似的^物U劑等可包含以下任 素、黃請或明膠;賦形:二,劑,例如微晶質纖維 例如藻酸、Primes或玉^例如澱粉或乳糖;崩散劑, Sterotes ;助滑劑,例如膠、閏α劑’例如硬脂酸鎮或 糖或糖精;或調味劑,例如二氧化石夕;甜味劑,例如嚴 劑。為了以吸入方式給藥,化掎、水揚酸甲酯或橙色調味 如二氧化碳之類的鏡)的^物可從含有適當揮發劑(例 氣霧劑噴霧的形式給藥。墼谷盗或分配器或霧化器以 =性給樂也:通過黏與或透皮的方式。對於齡 f皮、七樂’在配方中使用了對應於滲透障礙的滲透劑。i 樣的滲透劑在本技術領域内是取所周知的,例如,用於聋 膜給藥的滲透劑包括洗滌劑、膽汁鹽,以及梭鏈孢酸衍^ 物。黏膜給藥可通過使用鼻腔嘴霧或栓劑來完成。對於透 皮給藥,如本技術領域内眾所周知的,可將活性化合物配 -56- 20 200530400 入軟膏、藥膏、凝膠或油膏。 該化合物也可絮 劑基料,如可可的形式(例如使用常規的栓 用於直腸灌腸。、、他甘油脂),或製成灌腸劑的形式 合物過快地從體內/中,該活性化合物與一種可防止該化 " j 权非出的载體一起製成藥劑,例如控制釋 ㈢ 〇植入體内和微膠囊給藥系統。可以使用生 匆降解生物相各性聚合物,例如乙烯醋酸乙烯酉旨共聚 10 15 物、:酐、I甘醇酸、膠原、聚原酸醋以及聚乳酸。製備 这類藥劑的方法對於熟悉本技術者將是顯而易見的。各種 材料也了以通過商業途徑從Aiza Corporation和Nova
Pharmaceuticals,Inc·等公司購得。Liposomal 懸浮液(其 含有目標對準被感染細胞、單克隆抗體對準病毒抗原的脂 質體)也可用作為藥學上可接受的載體。這些載體可按照 為熟悉本技術者已知的方法製備,例如,按照U S. patent No· 4,522,811所述的方法製備。 為了給藥方便和劑量一致,以單位劑量的形式配製口 服或注射用組合物是特別有利的。本文中所謂的單位劑量 形式指的是對應於單位劑量的形體上獨立的單位,每個單 位含有根據所需的醫藥載體而算出的預定量的活性化合 物,以產生所希望的治療效果。取決於疾病的類型和嚴重 性,給患者輸入約1 pg/kg至15 mg/kg (例如0·1至20 mg/kg)的抗體是一種可供選擇的初始劑量,無論是一次或 多次地分別給藥,還是連續地注入。典型的曰劑量範圍可 -57- 20 200530400 從約1 pg/kg至loo mg/kg或以上,取決於以上提到的因 素。對於幾天或更長時間的重覆性給藥,根據具體情況, 應維持治療直至出現所希望的抑制疾病症狀的效果。但 ^ ’其他劑量的療程也可能會有效。治療的進展情況可以 5 常規的技術和分析很容易地監測。WO 94/04188專利披露 了示範性劑量的療程。本發明之單位劑量的規格受制於 且直接依賴於該活性化合物的獨特性質和所欲達到的具 體治療效果’以及這種活性化合物配製技術上的固有局限 性。本發明之核酸分子可被插入載體並用作為基因療法載 10 體。基因療法载體可通過各種方式輸入治療對象,例如靜 脈注射、局部輪入(U.S. Patent Ν〇· 5,328,470)或通過立體 定位注射等(參閱,例如 Chen et al·,Pr〇c· Natl· Acad· Sci· USA (1994) 91:3054-3057)。基因療法載體的醫藥製劑可包 括存在於一種可接受的稀釋劑内的基因療法載體,或含有 15 一種已嵌入基因傳遞載體的緩釋性基體。作為一種替換方 式’在可從重組細胞例如逆轉錄病毒載體產生完全的基因 傳遞載體的情況下,該醫藥製劑玎包含一個或多個產生基 因傳遞系統的細胞。 該醫藥紕合物可密封在容器、藥包或分配器内,並附 2〇 上使用說明。 V·本發明之用途和方法 本文中所述的核酸分子、蛋白、SNAIP結合分子和抗 體可用於以下一種或數種方法·· a)篩選試驗;b)檢測試 -58- 200530400 驗(例如染色®圖譜法'址織分型、法醫生物學試驗 預 測醫學試驗(例如診斷試驗、預診斷試驗、臨床監測試驗 和藥物基因學);以及d)治療方法(例如疾病治療及預防 方法PSNAIP蛋白可與其他細胞蛋白發生相互作用,、並 5 可用於⑴細胞增殖的調節;⑼細胞分化的調節;以及 (iii)細胞存活的調節。本發明之分離出的核酸分子可用於 表達SNAIP蛋自(例如在基因療法應用中通過一寄主細 胞内的重組表達载體)、檢測SNAIPmRNA(例如在一個生 物樣品中)SSNAIP基因内的基因損傷,以及調控sNAip 1〇 活性(例如通過反意股和RNAi技術)。此外,SNAIp蛋白 可用於篩選那些調控或模擬SNAIp的活性或表達的藥物 或化合物,以及治療其特徵為SNAIp蛋白的產生或功能 不足或過份的疾病,或治療其特徵為與野生型SNAip蛋 白比較所產生的SNAIP蛋白活性下降或異常的疾病。此 15 外,本發明之SNAIP抗體可用於檢測和分離SNAlp蛋白 及調節SNAIP活性。本發明還涉及通過上述篩選試驗鑑 定的新穎製劑以及如本文所述的治療應用。 A·篩選試驗 20 本發明提供了一種鑑定調控因子的方法(本文中又稱 為“篩選試驗,,)。該調控因子也就是與SNAIP蛋白結合或 對SNAIP的表達或SNAIP的活性具有一種啟動或抑制作 用的候選化合物或試劑或試驗化合物或試劑(例如肽、狀 模擬物、小分子或其他藥物),或與Wnt或FZ結合的、$ -59- 200530400 阻止Wnt與FZ結合以及阻止凋亡的SNAIp模擬物。 在一具體實施例中,本發明提供了篩選某些候選化合 物或試驗化合物的試驗方法。該候選化合物或試驗化合物 與SNAIP結合、調節或模擬SNAIP蛋白或多肽或其生物 5 活性部分的活性。本發明之試驗化合物可通過本技術領域 内已知的許多組合資料庫方法中的任何方法製備,包括·· 生物資料庫;可空間定址的平行的固相或溶液相資料庫; 需要使用重疊法的合成資料庫方法;天然產品資料庫;所 謂“一珠一化合物”(〇ne-bead one compound)資料庫方法; 10 以及使用親合色譜選擇法的合成資料庫方法。其中生物資 料庫方法局限於肽資料庫,而其他四種方法則可用於肽、 非肽寡聚物或小分子化合物資料庫(Lam,Anticancer Drug Des· (1997) 12:145) 〇 分子資料庫合成方法的例子可在本技術領域内查 15 到,例如:DeWitt et al·,Proc· Natl· Acad· Sci· USA (1993) 90:6909; Erb et al.5 Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1994) 91:11422; Zuckermann et al.? J. Med. Chem. (1994) 37:2678; Cho et al·,Science (1993) 261:1303; Carrell et al·,Angew Chem· Int· Ed· Engl· (1994) 33:2059; Carell et al·,Angew 20 Chem· Int· Ed· Engl· (1994) 33:2061;以及 Gallop et al·,J·
Med· Chem· (1994) 37:1233。 化合物資料庫可存在於溶液中(例如Houghten, Bio/Techniques (1992) 13:412-421),或培養珠上(Lam, Nature (1991) 354:82-84)、晶片上(Fodor,Nature (1993) 200530400 364:555-556)、細菌上(U.S. Patent No. 5,223,409)、孢子上 (U.S· Patent No· 5,571,698; 5,403,484 以及 5,223,409)、質 粒上(Cull et al·,Proc· Natl. Acad. Sci. USA (1992) 89:1865-1869)或嗟菌體上(Scott et al·,Science (1990) 5 249:386-390; Devlin, Science (1990) 249:404-406; Cwirla et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1990) 87:6378-6382 ; 以及 Felici,J. Mol· Biol· (1991) 222:301-310)。 由於SNAIP是配位體,故可用已知的方法來研究 SNAIP以確定它與例如FZ或Wnt結合的具體部位。該具 10 體的部位可用某些已知的生物合成方法來合成,例如結合 使用碳水化合物合成和酶反應。SNAIP的那一部位相當於 一個“抗原決定基”。可以使用其他單體或非碳水化合物的 分子部分來變更該SNAIP抗原決定基,以產生經變更的 含有抗原決定基的結構,且改善其某些性質,例如企清半 15 衰期,與FZ/Wnt持續地結合等性質。任何一種抗原決定 基變體的適宜性可運用本文所講授的結合試驗和筛選試 驗來確定。 在一具體實施例中,試驗是以細胞為基礎而進行的。 在該試驗中,使一個表達細胞表面的膜結合形式Fz或其 20 生物活性部分的細胞與一試驗化合物接觸,而且可以測定 該試驗化合物在SNAIP蛋白存在時與FZ競爭性結合的能 力。該細胞可以是酵母細胞或源自哺乳動物的細胞。該試 驗化合物與FZ結合的能力測試可通過以下方式來實現: 例如使該試驗化合物與一種放射性同位素或酶標記搞 200530400 口,化種麵合使得讀試驗化合物與FZ或其生物活性部分 2結合可通過檢鲫_複合物中標記化合物的方式來測 4 驗化合^以直接地或間接地標記為1251、 或通過閃爍計數位素可通過射電減直接計ί ah 出。作為一種替換方式,該試驗化合 >西」\二過氣化物酶、鹼式磷酸鹽或螢光素酶等標 上轉心"己’"亥酶標記可通過確定某種適當的底物和產品之 10 15 門的mu'j$。在—較佳的具體實施例中,該試驗包括 使一個表達細胞表面的膜結合形式FZ或其生物活性部分 的細胞與一種與FZ結合形成試驗混合物的已知化合物接 觸’再使該試驗混合物與_試驗化合物接觸,並確定該試 驗化合物與FZ相互作用的能力,其中,確定該試驗化合 物在SNAIP蛋白存在時與ρζ相互作用的能力,包括確定 該試驗化合物比SNAIP優先與FZ或其生物活性部分結合 的能力。
在另一具體實施例中,本發明的試驗是一種無細胞試 驗,包括使SNAIP蛋白或其生物活性部分與一種試驗化 合物接觸,並確定該試驗化合物與SNAIP蛋白或其生物 活性部分結合的能力。如上所述,該試驗化合物與SNAIP 蛋白之間的結合可直接地或間接地確定。在一較佳的具體 實施例中,該試驗包括使SNAIP蛋白或其生物活性部八 與一種與SNAIP結合形成試驗混合物的已知化人 觸,再使該試驗混合物與一種試驗化合物接觸,並 a _ 試驗化合物與SNAIP蛋白相互作用的能力,盆士 疋該 ” T ’確定 -62- 20 200530400 該試驗化合物與SNAIP蛋白相互作用的能力勹 該試驗化合物比該已知化合物優先與SNAip栝確定 活性部分結合的能力。 或—個生物 在另-具體實施例中,該試驗是一種無 5括使S讀蛋白或其生物活性部分與一種試::物: 觸,並確定該試驗化合物調節(例如啟動或抑制)sna= 白或其生物活性部分之活性的能力。確定該試驗化合物調 節SNAIP活性的能力’可通過以上述的_種確定直接結 合的方法來確定SNAIP蛋白與SNAIp目標分子結合能力 〇 的方式來實現。在一供選擇的具體實施例中,確定該試驗 化合物調節SNAIP活性的能力可通過確定SNAIp蛋白進 一步調節SNAIP目標分子的能力來實現。例如,該目標 分子在一適當底物上的催化/酶促活性可按如上所述的方 法來確定。
5 在另一具體實施例中,該無細胞試驗包括使SNAIP 蛋白或其生物活性部分與一種可結合SNAIP而形成試驗 混合物的已知化合物接觸,使該試驗混合物與試驗化合物 接觸’以及測定試驗化合物與SNAIP蛋白相互作用的能 力’其中,確定該試驗化合物與SNAIP蛋白相互作用的 此力也包括確定該SNAIP蛋白與SNAIP目標分子優先結 合或調節其活性的能力。 在本發明之上述試驗方法的許多具體實施例中,可能 需要使SNAIP或Wnt失活以便於其中任一種或兩種蛋白 的複合形式與非複合形式之間的分離,並便於實現試驗的 -63- 200530400 自動化。試驗化合物與SNAIP的結合,或在候選化合物 存在或不存在的情況下SNAIP與Wnt之間的相互作用, 可在任何適合於容納該反應物的容器内實現。這類容器的 例子包括微滴定盤、試管和微離心管。在一具體實施例 5 中,可以提供一種融合蛋白,它增加了一個結構域使得上 述任一種或兩種蛋白可與一基質結合。例如,谷胱甘肽_s_ 轉移酶/SNAIP融合蛋白、或谷胱甘肽_S_轉移酶/Wnt融合 蛋白可被吸附在谷胱甘肽瓊脂糖珠上(Sigma Chemical, St. Louis, MO)、或谷胱甘肽衍生的微滴定盤上,然後再與該 1〇 試驗化合物結合,或與該試驗化合物以及未被吸附的Wnt 或SNAIP蛋白中任一種蛋白結合,該混合物在有利於複 合物形成的條件(例如在鹽的生理條件和pH值)下培養。 培養完畢後,洗滌壤脂糖珠或微滴定盤培養孔以除去任何 未結合的組分,並按照如上所述的方法直接或間接地測量 15 複合物的形成。作為一種替換方式,可將該複合物從基質 上解離下來,並使用標準技術測定SNAIP結合或活性的 水準。
其他使基貪上蛋白失活的技術也可用於本發明之篩 選試驗中。例如,可利用生物素和鏈黴抗生物素蛋白的結 20 合使SNAIP失活,或使Wnt失活。生物素化的SNAIP 或目標分子可以用本技術領域内眾所周知的技術(例如生 物素化組合試劑,Pierce Chemicals, R〇ckf〇rd,IL),從生 物素-NHS (N-羥基琥轴醯亞胺)來製備。並在塗有鏈黴抗 生物素蛋白的96孔培養板内失活(pierce Chemicals)。作 -64- 200530400 為一種替換方式,可與SNAIP或Wnt反應但不干擾SNAIP 蛋白與Wnt結合的抗體可在該培養板的培養孔内衍生,未 結合的Wnt或SNAIP被抗體結合而滯留在孔内。檢測這 類複合物的方法,除了上述用於谷胱甘肽轉移酶(GST) 失活的複合物的方法以外,還包括使用易與SNAIP或目 標分子反應的抗體所進行的複合物免疫檢測法,以及依賴 於檢測SNAIP或目標分子相關酶活性的酶聯試驗。 在另一具體實施例中,SNAIP表達的調控因子通過以 下方法得到了鑑定:在該方法中使細胞與一候選化合物接 觸’並測定了 SNAIP mRNA或蛋白在細胞中的表達。在 該候選化合物存在和不存在的不同情況下,對SNAIP mRNA或蛋白的表達水準進行了比較。然後,在上述比較 的基礎上,該候選化合物可被鑑定為SNAIP表達的調控 因子。例如,如果該候選化合物存在時SNAIP mRNA或 蛋白的表達水準是高於(統計上顯著地高於)該候選化合物 不存在時的表達水準,則該候選化合物即被鑑定為SNAIP mRNA或蛋白表達的刺激因子。SNAIP mRNA或蛋白在 細胞内的表達水準可通過本文中所述的檢測SNAIP mRNA或蛋白的方法而確定。 在本發明之另一方面,該SNAIP蛋白可在一種雙雜交 物試驗或三雜交物試驗中用作為“誘餌蛋白,,(參閱例如 U.S. Patent No. 5,283,317 ; Zervos et al.? Cell (1993) 72:223-232 ; Madura et al·,J· Biol· Chem· (1993) 268:12046-12054 ; Bartel et al.9 Bio/Techniques (1993) -65- 200530400 14:920-924 ; Iwabuchi et al·, Oncogene (1993) 8:1693-1696;以及 PCT Publication No. WO 94/10300),以 鑑定與SNAIP結合或與其相互作用(“結合SNAIP的蛋白,, 或“SNAIP-bp”)和調節SNAIP活性的其他蛋白。這類可結 合SNAIP的蛋白也很可能參與SNAIP蛋白信號的傳播, 例如作為該SNAIP信號通路的上游或下游成分。 在另一具體實施例中,使用了一種SNAIP抗體或結合 SNAIP的分子例如wnt來篩選資料庫以鑑定類似於 SNAIP的分子。然後,使用本文中所講授的一種方法測試 被結合分子的SNAIP活性。這樣的一種篩選方法展現了 SNAIP —類的分子,它們是致效劑、反致效劑或SNAIP 的拮抗劑。 本發明進一步涉及通過上述筛選試驗而鑑定的新穎 製劑及其如本文中所述的治療用途。 B·檢測試驗 此處所鑑定的cDNA序列的部分或片段(以及對應的 完整基因序列)可以許多方式作為多核苷酸試劑使用。例 如’這些序列可用於:(i)繪製染色體基因圖譜從而找出 與遺傳疾病相關的基因區域;(ii)根據一微小的生物樣品 來鑑定一生物體(組織分型);以及(iii)協助法醫鑑定一生 物樣品。 本文中所述的各種抗體可用於檢測SNAIP或FZ。 -66- 200530400 c·預測醫學 本發明還涉及預測醫學領域,在該領域中,將診斷試 驗、預診斷試驗、藥物基因學和臨床監測試驗等用於預診 辦(預測)之目的’從而預防性地治療患者。相應地,本發 明的一個方面係關於確定SNAIP蛋白和/或核酸的表達以 及SNAIP活性的診斷試驗,就生物樣品(例如血液、尿液、 糞便、血清、細胞,組織)而言,可確定一個患者是否患 有與SNAIP的表達或活性異常或下降相關的病症,或正 處於發病的危險之中。例如,在受傷之後在體内存活的神 經元或光感受區域可以見到SNAIP。 本發明還提供了預診斷(或預測)試驗方法,以確定一 個患者是否正處於與SNAIP蛋白、核酸表達或活性相關 的發病危險之中。例如,可從一個生物樣品檢驗出SNAIP 基因内的突變。這類試驗可用於預診斷或預測之目的,從 而可在某種以SNAIP蛋白、核酸表達或活性為特徵的或 與其相關的疾病發病之前,預防性地治療患者。 本發明之另一方面提供了確定患者體内SNAIP蛋 白、、核酸表達或SNAIp活性的方法,從而可為該患者選 擇適且的治療或預防疾病的製劑(本文中稱為“藥物基因 子)。藥物基因學可根據一患者的基因類型(例如為了確定 1者對某種具體製劑的反應能力而檢查該患者的基因類 型)’為治療或預防性治療該患者而選擇製劑(例如藥物)。 _本發明之又—個方面涉及監視臨床試驗中製劑(例如 藥物或其他化合物)對SNAIp表達或活性的影響。 -67- 200530400 D ·治療方法 本發明為正處於發病危險之中(或容易罹患)或者 患有與神經系統尤其是中樞神經系統中snaip的: 活性異常或下降相關的病症的患者,提供了預防和= 法。這類疾病包純不限於阿爾茨海默氏病和精; I·預防疾病的方法 在本發明的一個方面,通過給患 SNMP表達或至少一種SNAlp活:入 了預防與SNAIP表達或活性 二卜為患者提$ 15 20 狀的方法。通過如本文中所述的任何目_疾病或达 驗或其某種組合,可以發現由於V二驗或預診斷急 或下降而處於相關疾病發病危險 表^或活性異1 SNAIP異常為特徵的症狀者。可以心 劑,從而可以預防或者推遲疾病或異常 π·治療方法 本發明之另—個方面係關於 S N A !P表達或活性的方法。本發明^ 了^療目的而調節 與一種製劑接觸,該製劑可調節與^即方法涉及使細胞 蛋白的-種或多種活性。該製劑可了胞相_ SNAIP 擬物。該模擬物可以是多核㈣ I SNAIP的一種模 肽、多聚糖、有機分 -68- 200530400 子、無機分子或其組合’只要該類比物具有本文中所定義 ;Γ二ΓΓ這種SN AIP活性可以是任何已知的腸p 應例如抑制社等等。 b皰内誘導某種回 因此,調節SNAIP蛋白活性的製劑可 的製劑例如核酸或蛋白、天然產生的二= 配位體、肽,SNAIP肽模擬物或其他小分子。=的^ 施例中’該製劑可啟動SNAIp蛋 。在—具體只 性。這類啟動劑的例子包括活性SNai ^種生物活 =胞的SNAIP的核酸分子。該調節方法 (:如通過用該製劑培養細胞)實現,或作 式,在體内實現(例如通過將製… 、 本發明為患有以,|白Μ者h如此, 15 20 常或下降从*或核欠分子的表達或活性異 :飞:降為特徵的疾病或異常 法。在一具體實施例中,兮纽本π杈供了-療方 通過本文中所述㈣選及輸人某種製劑(例如 組合,該製劑可輸疋的某種製劑)或製劑的 性。t y^ (例如上調或下調)SNAIP的表達或活 a 例中’該方法涉及輸入 SNAIP I 白 刀子作為治療方法,以補償下降或異常的SNAIP 表達或活性。 在IP被異$下調和/或SNAIP活性被減少的情況 下,SNAIP活性的啟動是合乎需要的。反言之,對sNAip 活性的抑制被減弱。 本發明將通過以下例子得魏一步說日月,但這些例子 -69- 200530400 不應被解釋為是限制性的。本申請書自始至終所援引的所 有參考文獻、專利和公開的專财請書均係作為參考文獻 引述在此。 5 【實施方式】 實例 一將RNA萃取·分別按照每10 cm培養皿或50 mg組織 句漿使用 h5 ml Triz〇l 試劑(Gibco,Cat· No· 15596)的比 例,裂解所培養的細胞或組織勻漿。用移液管吸放裂解產 1〇 物多,,以均化該裂解產物(隨後將細胞裂解產物轉移至 一试官中)。在均化之後,於30 QC培養該裂解產物5分 鐘以使核蛋白複合物完全解離。在培養之後,按每1 ml Tnzo1 試劑 0·2 ml 氯仿(Sigma , Cat· No· C53 12)的比例 將氯仿加入該裂解產物,且用力搖晃該試管15秒鐘。然 15 後於30 °c培養該裂解產物3分鐘。在培養之後,按照 12,000 xg於4°C離心該裂解產物15分鐘。離心後,棄 去上清液並用70%乙醇淋洗剩下的rnA微粒。然後將淋 洗後的樣品按照7500 X g於4 °C離心10分鐘,並棄去所 得清液。將剩下的RNA微粒乾燥,然後重新懸浮在不含 20 RNAase 的水中(Life Technologies,Cat· No· 10977-015)。 DNA酶處理:按照製造廠所提供的方案用DNAse I (Gibco)處理總 RNA。 差異顯示:使用 Clontech 出品的 Advantage RT-for-PCR組合試劑從經DNAse處理的總RNA合成第一 200530400 鏈cDNA。每次反應使用總RNA 2 ug。將cDNA產物按 1:10和1:100的比例稀釋,取每種稀釋液各1 μΐ用任意 引子進行PCR反應。所用的任意引子為Hieroglyph與 Fluoro DD引子組合試劑(Beckman公司)。該引子含有 5 oligodT或與M13或T7部分融合的任意序列。用一種螢 光報導分子標記一套引子。PCR反應是按照製造商推薦的 方案使用Advantage cDNA PCR組合試劑(Clontech)而進 行的。螢光標記的PCR產物用GenomyxLR DNA測序儀 (Beckman)經HR-1000丙烯醯胺凝膠(Beckman)電泳分 〇 離。采自不同實驗變體的樣品至少做一式兩份試驗,並與 對照樣品進行比較。凝膠在1600 V電壓下電泳6小時, 在玻璃板上乾燥,洗滌多次以除去尿素結晶並用 GenomyxSC掃描器進行掃描。用Adobe Photoshop對圖像 進行分析,並確定差異表達條帶的座標。使用這些座標, 5 將差異表達條帶定位於乾燥的凝膠上。將條帶切下,浸泡 於100 μΐ水中並離心沉降。取5 μΐ上清液,用Advantage 聚合酶混合物和T7/M13引子(cl〇ntech公司)進行PCr反 應’對該條帶進行再擴增。再擴增的條帶可以用T7/M13 引子直接測序,也可以先克隆進Invitrogen公司的pCR2.1 :〇 - TOPO載體然後再測序。 反轉錄:使用Cl〇ntech&司的“RTf〇rPCR”組合試劑 (Cat· K1402_1)進行反應。按上述步驟分離出1 並用DNA酶處理,然後與20pmol oligodT引子混合,使 總體積為13·5 μΐ。於7〇°C培養該混合物2 min,冷卻至4 X: -71- 200530400 使引子退火。隨後,將含有反應缓衝液、dNTp混合物、 RNA酶抑制劑和MMLV反轉錄酶(均取自“RT加pCR,,組 & 口式片丨J)的反應混合物6.5 μΐ加入Perkin Elmer公司的 GeneAmpPCR System 9700,並按製造廠提供的方案進行 5 反應。所得cDNA產物儲存於_2〇。〇備用。 即時PCR: TaqMan®或即時rt-PCR是檢測樣品中信 使RNA的有效方法。該技術利用AmpliTaq Gold® DNA聚 合酶的5f核酸酶活性在pCR過程中切割TaqMan®探 針。TaqMan®探針於探針5,_端含有一種螢光報導染料(本 ίο 實驗中為6_FAM(6 -羧基螢光素)),針3,_端含有一種螢 光淬滅染料(本實驗中為TMRA(6-羧基-N,N,N,,N,-四甲 基羅丹明))。TaqMan®探針是為了與所研究的靶cDNA在 正向引子和反向引子之間的部位雜交而專門設計的。當探 針完整的時候,3f-末端淬滅染料抑制了 5,-末端報導染料 15 的螢光。在過程中,AmpliTaq Gold® DNA聚合酶的 5’—3’外切酶活性使探針在5’-末端報導染料和3,-末端淬 滅染料之間被切割,從而導致報導染料易位。一旦易位, 報導染料的螢光不再被淬滅染料所抑制。因此,從乾cdna 範本得到的PCR產物的累積可以通過監測報導染料螢光 20 的增加而檢測。 使用了 Perkin Elmer Applied Biosystems 公司的 ABI Prism序列檢測系統(Model No· ABI7700)監測PCR過程中 報導螢光的增加。報導信號用惰性參照(passive refei*eiiee> 發射的螢光標準化。RT-PCR反應按上述方法進行,產物 -72- 200530400 用水按1:100稀釋後在TaqMan®分析中作為範本。 引子用 Primer Express 軟體(Perkin Elmer 公司)設 計,由SigmaGenosys公司合成。用每對引子進行的pcR 反應均經4 %壤脂糖凝膝電泳證貫早個條帶的存在。對於 5 大多數引子對來說,本反應最佳的最終引子濃度為0.2 μΜ 〇
TaqMan® 分析係在 Micro Amp optical plate (Perkin Elmer,Catalog No· N801 - 0560) 96 孔板中進行。將由 25 μΐ TaqMan® CybrGreen PCR 混合物(Perkin Elmer 公司, ίο Catalog No· 4309155)、2 μΐ 正向引子、2 μΐ 反向引子、5 plcDNA和17μ1水所組成的反應混合物置於每個孔中。 然後,用 Micro Amp optical 8 - strip caps (Perkin Elmer 公 司,Catalog No· N801 - 0935)密封該96孔板。對每一個實 驗樣品均用任意標準基因的引子(beta-肌動蛋白,Perkin 15 Elmer Cat· No· N801-0935)分別進行 TaqMan®反應,以使 結果標準化。即時PCR反應係在ABI Prizm System 7700 序列檢測儀(Perkin Elmer公司)上進行。 RNA標記和Affymetrix晶片雜交:RNA標記和晶片 雜交係按照Affymetrix公司標準步驟進行。 20 微陣列數據分析:微陣列數據分析係用Gecko (Aventis)和 GeneSpring (Silicon Genetics)晶片分析軟體 進行。 用人類SNAIP進行神經保護試驗:將人類神經母細胞 瘤細胞系SK-N-SH和SY5Y種入96孔板,讓其貼壁過夜。 -73- 200530400 對每種因子都做二次重複檢測。293 τ細胞用以下物質暫 態轉染:·ι)真核τ〇Ρ〇ΤΑ質粒中的全長sNAipc疆,不 3肝素,2)同⑴’但介質中有肝素;空白載體對照; 4)無載體對照,含或不含肝素;〇未經M3培養的培養 5 基,含或不含肝素。24小時後收集原始上清液,以1:5比 例稀釋·後使帛°神經保護陽性對照物&括5 _ flavopiridol(—種細胞週期抑制劑)。以i〇 mM sin _ i和 500 μΜ02神經酿胺為神經毒劑,於加入神經保護劑後立 即加入。將培養皿放置培養過夜。然後收集上清液,並用 10 乳酸脫氳酶(LDH)組合試劑測定細胞的死亡。SNAIP可以 對抗SIN_1,但不能對抗C2神經醯胺的神經毒性。 SNAIP克隆·使用由Sigma Genosys公司合成的基因 特異引子和(Clontech公司的Advantage cDNA PCR組合 試劑,從大腦皮層和室區cDNA擴增基因序列。按照本領 15 域内已知方法將cDNA克隆入真核表達載體。cDNA與 V5抗原決定基須在同一個讀碼框内,使得可用已商品化 的(Invitrogen公司)V5抗體檢測蛋白表達。克隆也需進行 測序以確認基因的同源性並保證基因沒有突變。 表達SNAIP細胞的產生:為了提供足夠量的SNAIP 20 以進行進一步實驗,將編碼SNAIP的cDNA克隆入表達 載體並轉染至CHO細胞内。 為了產生過量表達SNAIP的CHO細胞,將CHO細 胞以每孔3 X 105個細胞的密度接種於6孔35 mm組織培 養板(Costar 公司 Catalog No· 3516),每孔加 2 ml 含 10% 200530400 胎牛血清(Gibco/BRL 公司 Catalog No· 1600_044)的 F12 HAM 培養基(Gibco/BRL 公司 Catalog No· 11765-054)。 然後將細胞置入C02培養箱内於3 7 °C培養,直至細 胞鋪滿50 - 80%。用上文所述的步驟將克隆的SNAIP的 5 cDNA核酸序列插入表達载體。取13 pgDNA,用含78 μΐ PLUS試劑的無金清〇ptimem培養基稀釋至1.2 ml。另取 52 μΐ Lipofectamine Plus 試劑(Life Technologies 公司 Catalog No· 109064-013),用無血清 Optimem 培養基稀釋 至1.25 ml。然後,於室溫下培養dNA溶液和Lipofectamine 10 溶液丨5分鐘。將兩種溶液混合後再培養15分鐘,以形成 DNA-脂質複合體。 用2 ml無jk清Optimem洗滌細胞一次。分別以〇.8 ml Optimem替換每份轉染樣品(一塊6孔板上共6份轉染樣 品)中細胞原培養基。每孔加入200 μΐ的DNA-脂質複合 ^ 體(以下稱為轉染混合物)。不加入任何抗菌藥物。然後 將細胞與脂質-DNA複合體置入C02培養箱於37°C培養6 小時,以發生轉染反應。 培養過程結束後,加入1 ml含20%胎牛血清的 Optimem,無需去除轉染混合物。轉染18小時後,吸出覆 20 蓋在細胞上的培養基。然後用PH 2-4 PBS(Gibco/BRL公 司Catalog No· 10010-023)洗蘇細胞,棄去pbs再加入含 10%血清的F12 HAM培養基(“選擇培養基,,)。轉染72小 時後’用胰蛋白酶消化細胞,然後轉入T150培養瓶。24 小時後,用含10%FBS、抗生素和img/mlG4i8的F12 • 75- 200530400 HAM培養基替換原培養基。持續選擇培養3天后,再用 含200 pg/ml G418的培養基替換原培養基。 西方墨潰法分析:將轉染細胞系的細胞培養上清液或 轉染細胞裂解產物與Invitrogen出品的蛋白上樣緩衝液混 5 合’並载於 Invitrogen 的 10% Tris-Glycine 凝膠上。於 1〇〇 V電泳2·5小時。蛋白分離後,用Invitrogen公司轉膜裝 置於⑽V運轉1小時,以將蛋白轉移至Invitrogen的PVDF 膜上。按照製造廠(Invitrogen公司)所述方法將膜封閉後再 用抗V5抗體雜交。用Amersham公司的化學發光底物 ίο ECL(Cat. Νο· 1059250)和 Hyperfilm ECL(Cat. No· HP79NA),按照Amersham戶斤述方法檢湏丨J蛋白條帶。 條帶顯現。 雖然通過以上實例已經詳細地敘述了本發明,但應該 理解’可以進行各種各樣的修改而不背離本發明之精神。 15 因此,本發明只受以下專利申請範圍的限制。 本申請書中所引用的所有專利和出版物均以其整體 而引述在此。 -76-
Claims (1)
- 200530400 2. 3· 10 4. 5· 15 6· 7. 8. 20 9· 申請專利範圍:=在,細胞内調節過氧亞石肖基陰離子所誘導〉周亡之 (s麵Γ接括:。該細胞與分泌之神經細胞〉周亡抑制蛋白質 利範圍第1項所述之方法,其中該方法進一步 包括使该細胞與肝素接觸。 t申請^彳範圍第i項所述之方法,其中糊亡包括 :N-1 (3-嗎啉斯得,亞胺)過氧亞硝酸鹽相關途徑的誘 導。 如申清專利範圍第3 所> 士、+ …h 所述方法,其中該途徑包括一 個或多個p38 MAPK,以;5 At 因叫_的活化。 制和DNA損傷誘導基 如=請專利範圍第3項所述之方法,其中該途徑是通過 鑑疋蛋白硝化的一特定標記而發現的。 如申請專利範圍第5項所述之方法、,其中鋪定標記為 3-硝基酪氨酸(3-NT)。 如申請專利範圍第4項所述之方法 GADD34、GADD45 或 GADD153。 如申請專利範圍第1項所述之方法 粒體功能不良。 如申請專利範圍第8項所述之方法 — 不良包括線粒體複合物I亞單位的確化'。 -種保護神經元免遭過氧亞硝基陰離子相關自由基介每 的細胞死亡的方法,包括使該纟,與分泌之神經細心 1其中該GADD為 其中該凋亡包括祷 其中該線粒體功能 -77· 10. 200530400 亡抑制蛋白接觸。 η. —種確定與過氧亞硝基陰離子毒性途徑相關的神經保護 基因目標的方法,包括: i) 使神經細胞的各個樣品分別與分泌之神經細胞凋亡 5 抑制蛋白質(SNAIP)接觸或不接觸; ii) 使步驟(i)中的細胞與過氧亞硝基陰離子誘導劑接 觸; iii) 確定步驟(ii)中的細胞内基因或蛋白的表達變化;以 及 1〇 iv)鑑定在SNAIP和該誘導劑存在或不存在的條件下所 調節的基因或蛋白,並將如此鑑定的基因或蛋白與 過氧亞硝基陰離子所誘導的細胞凋亡抑制相關聯。 12.如申請專利範圍第11項所述之方法,其中步驟⑴進一 步包括使細胞與肝素接觸或不接觸。 15 13.如申請專利範圍第11項所述之方法,其中該過氧亞硝基 陰離子誘導劑為SIN-1。 14. 如申請專利範圍第11項所述之方法,其中該鑑定的基因 或蛋白與細胞凋亡相關。 15. —種治療與自由基介導細胞死亡相關的神經元疾病的方 20 法,包括給需要治療的患者輸入有療效劑量的分泌之神 經細胞凋亡抑制蛋白質(SNAIP)。 16. 如申請專利範圍第15項所述之方法,其中該與自由基介 導細胞死亡相關的疾病包括巴金森氏病(Parkinson’s disease)、多發性硬化症(multiple sclerosis)、脊髓損傷、 -78- 200530400 創傷性腦損傷、中風和阿爾茨海默氏病(Alzheimer’s disease)等疾病。 17.如申請專利範圍第15項所述之方法,其中該輸入進一步 包括肝素的輸入。 -79- 200530400 七、指定代表圖·· (一) 本案指定代表圖為:第( )圖。為 (二) 本代表圖之元件符號簡單說明: 無 八、本案若有化學式時,請揭示最能顯示發明特徵的化學式: 無
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