JPH04506455A - リパーゼおよびリパーゼモジュレーターをコードするdna - Google Patents
リパーゼおよびリパーゼモジュレーターをコードするdnaInfo
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
24、第一および/または第二のDNA構築物がさらにプソイドモナスのものと
異なる発現シグナルを含む請求の範囲第21項〜第23項のいずれか1に記載の
宿主細胞。
25、請求の範囲第5項〜第10項のいずれか1に記載のDNA構築物を含む宿
主細胞。
26、第一のDNA構築物を有する複製可能な発現ベクターおよび請求の範囲第
11項に記載の複製可能な発現ベクターで形質転換された請求の範囲第21項に
記載の宿主細胞。
27、プソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA配列がさらにプソイ
ドモナスのものと異なる発現シグナルを含む請求の範囲第26項に記載の宿主細
胞。
28、請求の範囲第13項〜第20項のいずれか1に記載の複製可能な発現ベク
ターで形質転換された請求の範囲第21項に記載の宿主細胞。
29、その染色体中に組込まれた第一のDNA構築物を有しそして請求の範囲第
11項に記載の複製可能な発現ベクターを含む請求の範囲第21項に記載の宿主
細胞。
30、その染色体中に組込まれた第二のDNA構築物を有しそして第一のDNA
構築物を含む複製可能な発現ベクター31、プソイドモナスセパシアリパーゼを
コードするDNA配列およびリパーゼモジュレーティングファクターをコードす
るDNA配列が各々別のプロモーターから発現するようにその染色体中に組込ま
れた第一および第二のDNA構築物を有する請求の範囲第21項に記載の宿主細
胞。
32、細菌、酵母またはフィラメント状真菌である請求の範囲第21項〜第31
項のいずれか1に記載の宿主細胞。
33、ダラム陽性菌である請求の範囲第32項に記載の宿主細胞。
34、ダラム陽性菌が、枯草菌(Bacillus 5ubtilis) 、バ
チルスリチ、zニホルミス(Bacillus Iicheniformis)
、バチルレンタス(Bacillus 1entus) 、バチルスプレビス(
Bacillusbrevis) 、バチルスステアロテルモフィルス(Bac
illus stea−rothermophilus) 、バチルスアル力ロ
フイルス(Bacillusalkalophilus) 、バチルスアミロリ
クエファシェンス(Baci−11us asyloliquefaciens
) 、バチルスサーキュランス(Baci−11us coagulans)
、バチルスサーキュランス(Bacillus cir−culans)または
ストレプトミセスリビダンス(Streptomyceslividans)も
しくはストレプトミセスムリナス(Streptomycesmurinus)
からなる群から選択される請求の範囲第33項に記載の宿主細胞。
35、グラム陰性菌たとえば大腸菌(Escherichia coli)であ
る請求の範囲第32項記載の宿主細胞。
36、リパーゼまたは類似物質の生産を助成する条件下で請求の範囲第21項〜
第35項のいずれか1に記載の宿主細胞を培養し、そして培地からリパーゼまた
は類似物質を回収することからなるプソイドモナスセパシアリパーゼまたはその
誘導体の生産方法。
明 細 書
リパーゼおよびリパーゼモジュレータ−をコードするDNA
発明の分野
本発明は、リパーゼをコードするDNA配列、その生成物がリパーゼの生産に影
響を与えるDNA配列、発現ベクターおよびこれら配列を含む宿主細胞および宿
主細胞を培養することによるリパーゼ生産方法に関する。
発明の背景
リパーゼは、トリグリセリドにおけるエステル結合の加水分解を触媒化し、その
結果ジグリセリド、モノグリセリド、グリセリンおよび遊離脂肪酸を形成する酵
素である。幾つがのりパーゼはまたエステル結合に関する別の反応たとえばエス
テル結合の合成またはエステル交換反応を触媒化する。リパーゼは様々な異なる
生物により生産される。特に微生物リパーゼは、たとえば食品工業および洗剤に
おいて脂肪の脂肪分解が望まれている様々な目的に対しかなり実際的に有用であ
る。
繊維から脂肪性のしみまたは土壌を除くために洗剤に含まれるのに特に有利であ
ることが見出された特定リパーゼの1つは、プソイドモナスセパシア(Pseu
do+wonas cepacia)の菌株により生産されるリパーゼである。
ヨーロッパ特許第214761号(ノボインダストリイエ−/ニス)には、この
リパーゼが60°C未満の温度で活性であるリパーゼとして記載されており、こ
のことはほとんどの現代の繊維が60℃未満の温度で洗浄されるので重要である
。
洗剤添加物として使用される別の重要なプソイドモナスセパシアリパーゼは、国
際特許出@ (WO)第89101032号(ノボインダストリイエ−/ニス)
に位置非特異的リパーゼ、すなわちトリグリセリドの3つの脂肪アシル基のすべ
てと反応しうるちのとして記載されているものである。
プソイドモナスセパシアリパーゼ生産を促進するために、たとえば酵素をコード
するDNA配列が発現されているものからより強力なプロモーターを導入するか
もしくはより効率的なリポソーム結合部位またはシグナルペプチドをコードする
配列を導入することによりリパーゼ発現を適正化するために、または培養がより
簡単な酵素生産のための宿主生物(たとえば大腸菌、枯草菌等のような一般的生
産生物であるという点で)であるかまたはより高いリパーゼ収率をもたらす宿主
生物を選択するために、組換DNA技術を使用することが有利なこともある。以
下に記載したように、このようなアプローチは、たとえば問題となるタンパク質
をコードする構造遺伝子に加えて1つ以上の遺伝子が遺伝子生産物の製造に幾ら
か役割を果している場合に、期待した結果が得られない場合がある(このような
遺伝子の例は、バチルス属(Baci l 1us)sac (ホンジョー、エ
ム、 Honjo、M、ら(1987)、ジャーナルオンバイオテクノロジイJ
ournal of Biotechnology、6:191−204)およ
び1ep(タナカ、テ4 、 Tanaka、T、カワタ、エム、Kawata
+M、 (1988)、ジャーナルオンパクテリオロジイJournal of
Bac ter io logy 、 170 : 3593−3600)遺伝
子、およびタレブシーラ属(Klebsiella)プルラナーゼおよび大腸菌
溶血素の生産に必要な遺伝子である)。
別のプソイドモナス種、プソイドモナスフラギ(Pseudomonasfra
gi)からのリパーゼ遺伝子のクローニングは、たとえばニス、アオヤ? (S
、 Aoyaa+a)ら、FEBS Letters 242(1)、1988
年12月、 pp、36−40およびダブルユ、クギミャ(11JugiIII
iya)ら、Biochen+、Biophys、Res、Comm、 141
(1) + 1986年11月26日、 pp、185−190から公知である
。しかしながらプソイドモナスフラギにより作られるリパーゼはそのアミノ酸配
列の点でプソイドモナスセパシアと異なり、これらの文献には、宿主生物におけ
る著しいリパーゼ生産を達成するために1つ以上の追加の遺伝子が必要であると
いう示唆はない。
ヨーロッパ特許第331376号には、プソイドモナスセパシアリパーゼをコー
ドする組換え体DNAならびにリパーゼ生産に関与するタンパク質についての記
載がある。しかしながら、このタンパク質をコードする遺伝子もまた異なった宿
主生物において機能的であるという示唆はない。
発明の概要
本発明者はプソイドモナスセパシアリパーゼをコードする遺伝子を単離およびク
ローン化し、そしてその発現ががなりの収率でのリパーゼ生産の達成に重要であ
る遺伝子を同定した。
したがって、第一の見地において、本発明はプソイドモナスセパシアリパーゼ生
産のモジュレータ−として途中で作用するファクターをコードするか、またはプ
ソイドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターの機能的84以物
質をコードするDNA配列からなり、その際前記プソイドモナスセパシアリパー
ゼモジュレーティングファクターまたはその機能的類似物質がプソイドモナスセ
パシアリパーゼがプソイドモナス属と異なる発現シグナルを用いて発現されるか
および/またはプソイドモナスセパシアリパーゼが異なる宿主細胞中で発現され
た場合リパーゼ生産をモジュレータしうるものであるDNA構築物に関する。
本発明を導びく研究過程において、驚くべきことにリパーゼをコードするDNA
配列の下流領域(プソイドモナスセパシアの染色体上に存在)はリパーゼの生産
において著しく有益な効果を有することがわかった。領域はリパーゼ発現に必要
なりNA配列上の部位Cたとえばプロモーター、ターミネータ−、エンハンサ−
等)を単に提供するだけでなく2つの生産物をコードするDNA配列が同じベク
ター上に位置しない場合でさえリパーゼの生産に影響を与えうるファクターをコ
ードする遺伝子を含むということが実験的に確立された(とりわけ、リパーゼを
コードするDNA配列を有するプラスミドよりむしろ別のプラスミド上へこの領
域を挿入することによる)。リパーゼモジュレーティングファクターはRNA分
子またはポリペプチドでよいが、しかし最も好ましくはポリペプチドである(た
とえば、以下の例3参照)。
以下において、リパーゼモジュレーティングファクターをコードするDNA配列
は通常“Iim”遺伝子として言及され、一方モシュレーティングファクターは
通常“Lim”ファクターとして言及される。
驚くべきことに、13m遺伝子はリパーゼがプソイドモナス属のものと異なる発
現シグナル(たとえばバチルス属α−アミラーゼ遺伝子からのプロモーター、リ
ポソーム結合部位およびシグナルペプチド−コード領域)を用いて発現されるか
または宿主生物がプソイドモナス属ではない場合でさえリパーゼ生産において有
益な効果を示すことが見出された。それゆえ、Limファクターは転写または翻
訳のいずれの開始にも作用しない。しかしながらLimファクターの正しい機能
はいまだに明らかにされていない。
用語“機能的類似物質”とは、プソイドモナスセパシアLimファクターのもの
と類似のリパーゼ生産モジュレーティング機能を有しプソイドモナスセパシアと
は別の生物から由来するファクターを示すか、または天然配列において1つ以上
のアミノ酸の追加、置換、挿入または欠失を行なった結果DNA配列を修飾する
ことにより作られたプソイドモナスセパシアLimファクターの誘導体であるフ
ァクターを示すものと理解される。しかしながら天然配列のこのような修飾があ
まりに広範囲にわたり過ぎてLimファクターのモジュレーティング機能が他の
点で失なわれてしまうべきでないということが信じられる理由がある。これとは
別に、機能的類似物質は相同ポリペプチド(すなわち、ある特定条件〔たとえば
、5XSSC中で予備浸漬し、20%ホルムアミド、5Xデンハード溶液、50
mMリン酸ナトリウム、pH6,8および5011g変性超音波処理した仔牛胸
腺DNAの溶液中〜4゜°Cにて1時間予備ハイブリッド化し、続いて10(I
ATPを補給した同じ溶液中〜40°Cにて18時間ハイブリッド化する〕下に
LimファクターをコードするDNAと同じプローブへハイブリッド化するDN
A配列によりコードされるもの)、またはLimファクターを生ずる抗体もしく
はこれに対向する抗体と反応するものである。用語“Limファクター”が以下
の記述で使用される場合、これはこのような機能的類似物質ならびに天然のプソ
イドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターを含むことが暗に意
図される。
発明の詳細な記載
LimファクターをコードするDNA配列を含む本発明DNA構築物は、たとえ
ば標準的技術にしたがって(サムプルツクSambrook ら、Mo1ecu
lar Cloning : A LaboratoryManual、コール
ドスプリングハーバ−、1982) 、プソイドモナスセパシアのゲノムまたは
cDNAライブラリィを調製しそして合成オリゴヌクレオチドを用いたハイブリ
ッド形成によりLimファクターの全部または一部をコードするDNAcDNA
オリジンからなる。
LimファクターをコードするDNA配列は、リパーゼ生産プソイドモナスセパ
シア菌株から得られるいずれかのものである。このような菌株の例は、ヨーロッ
パ特許第214761号に記載された発明と関連して寄託番号DSM 3333
−3337およびDSM 3401にてドイチェザムラングフォンミクロオルガ
ニスメンに寄託されたもの、ならびに国際特許出願(WO)第89101032
号に記載の発明と関連して寄託番号DSM 3959にてドイチェザムラングフ
ォンミクロオルガニスメンに寄託された菌株でよい。しかしながら、lim遺伝
子と等価なりNA配列もまた別のリパーゼ生産微生物から由来するものとみなさ
れる。このような遺伝子は、上述のようなLimファクターをコードするDNA
へハイブリッド化するプローブを用いてハイブリッド化することによりスクリー
ニングされるかまたはLimファクターと同じ抗体との遺伝子生産物の反応性に
より選択されるかまたばIim遺伝子ではなくリパーゼ遺伝子を含む菌株へリパ
ーゼ生産を授与する能力についてスクリーニングすることにより同定される。
Limファクターをコードする本発明DNA構築物はまた確立された標準的方法
により、たとえばニス、エル、ビューケージ(S、L、Beaucage)およ
びエム、エイチ、カルーサーズ(M、)1.caruthers)+ Tetr
ahedron Letters 2211981jpり、1859−1869
に記載されたホスホアミダイト法またはマセッスら(Matthes et a
l) EMBOJournal 3,1984.pp801−805により記載
された方法により合成的に調製されうる。ホスホアミダイト法によれば、オリゴ
ヌクレオチドはたとえば自動DNA合成機中で合成され、精製され、連結されそ
して適当なベクター中でクローン化される。
最後に、DNA構築物は、標準的技術を用いて、合成、ゲノムまたはcDNAオ
リジンの断片を連結する(適当に)ことにより調製される混合した合成およびゲ
ノム、混合した合成およびcDNAまたは混合したゲノムおよびcDNAオリジ
ンからなってもよ(、その断片は全DNA構築物の様々な部分に相当する。
Limファクターをコードする好ましいDNA構築物はプソイドモナスセパシア
の染色体から由来するDNA配列からなるもの、特にDNA配列が〜33kDリ
パーゼをコードする配列のプソイドモナスセパシア染色体下流に位置するもので
ある。Limファクターをコードする特に好ましいDNA構築物は、これに添付
した第1図A−Cに示したDNA配列または上述のようなプソイドモナスセパシ
アLimファクターの機能的類似物質をコードするその修飾物である。
DNA配列の適当な修飾の例は、Limファクターの別の配列を起こさないがし
かしDNA構築物を導入する宿主生物のコドン使用に相当するヌクレオチド置換
であるかまたは異なった配列を起こしそのため多分具なった構造ではあるがしか
しリパーゼまたはLimファクターのいずれかの特性を損なわないヌクレオチド
置換である。可能性のある修飾の別の例は、1つ以上のヌクレオチドの配列への
挿入、1つ以上のヌクレオチドの配列のいずれかの端部への追加および配列のい
ずれかの端部または配列内における1つ以上のヌクレオチドの欠失である。
幾つかの目的のために、プソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA配
列をLimファクターをコードするDNA配列と同じDNA構築物上に提供する
ことが便利である。すなわち、本発明はさらに、プソイドモナスセパシアリパー
ゼをコードする第一のDNA配列またはその誘導体およびプソイドモナスセパシ
アリパーゼモジュレーティングファクターをコードする第二のDNA配列とから
なるDNA構築物に関する。
この関係において、用語“誘導物”とは、天然リパーゼをコードするDNA配列
を適当に修飾しその結果天然タンパク質のC末端およびN末端のいずれかまたは
両方ともへ1個以上のアミノ酸を追加したり、天然アミノ酸配列における異なっ
た部位の1つまたは多数個所で1個以上のアミノ酸を置換したり、アミノ酸配列
において天然タンパク質のいずれかまたは両方の端部における1個以上のアミノ
酸を欠失したり、または天然アミノ酸配列において1つ以上の部位に1つ以上の
アミノ酸を挿入したりすることにより天然リパーゼから誘導される脂肪分解活性
を有するタンパク質を示すことを意図するものである。
プソイドモナスセパシアリパーゼをコードする好ましいDNA構築物は、天然に
プソイドモナスセパシアの染色体上に存在する〜33kOのリパーゼをコードす
るプソイドモナスセパシア、口SM 3959から由来するDNA配列からなる
ものである。リパーゼをコードする特に好ましいDNA構築物は、リパーゼをコ
ードするDNA配列がこれに添付された第2図A−Cに示されたものまたは上述
のようなプソイドモナスセパシアリパーゼの誘導体をコードするその修飾物であ
る。
本発明DNA構築物の一実施態様において、リパーゼDNA配列はLimファク
ターをコードする配列の上流に位置してもよく、他の実施態様においてリパーゼ
をコードするDNA配列はLimファクターをコードする配列の下流に位置して
もよい。いずれの場合でも、DNA配列は、DNA構築物が宿主細胞に存在する
場合リパーゼおよびLimファクターの発現を許す条件下でこれらが同じプロモ
ーターから転写されるように互いに関連して位置する。好ましい実施態様におい
て、リパーゼをコードする第一のDNA配列および/またはLimファクターを
コードする第二のDNA配列は、さらにプソイドモナス属のものと異なる発現シ
グナル(たとえば、プロモーター、リポソーム結合部位および/またはシグナル
ペプチド−コード配列)を含む。
別の見地において、本発明は上述したようにLimファクターまたはその機能的
類似物質をコードする挿入されたDNA配列を有する複製可能な発現ベクターに
関する。
さらに別の実施1!様において、本発明は、プソイドモナスセパシアリパーゼを
コードする第一の挿入されたDNA配列またはその誘導体(上記のように)およ
びLimファクターをコードする第二のDNA配列(上記のように)を有する複
製可能な発現ベクターに関する。この場合、第一および第二のDNA配列は、必
ずしも要求されないが同じプロモーターから発現されうる。第一および第二のD
NA配列が同じプロモーターから発現する場合、リパーゼコード配列は、Lim
ファクターにより影響されるリパーゼ生産の調節に悪影響を及ぼすことな(Li
mコード配列の上流または下流に位置する。
これに代わって、各々リパーゼおよびLim−ポリペプチドをコードするDNA
配列は、同じベクターに保持されている場合でさえも、各々別々のプロモーター
から発現されうる。
特に好ましい実施態様において、リパーゼをコードする第一のDNA配列および
/またはLimファクターをコードする第二のDNA配列はさらにプソイドモナ
ス属のものと異なる発現シグナル(たとえば、プロモーター、リポソーム結合部
位および/またはシグナルペプチド−コード配列)を含んでもよい。
リパーゼおよび/またはLimファクターをコードするDNA配列を有する複製
可能な発現ベクターは、与えられた宿主生物一般的にプラスミドまたはバクテリ
オファージ中で自律的に複製可能ないずれのベクターでもよい。ベクターにおい
て、リパーゼおよび/またはLimファクターをコードするDNA配列は適当な
プロモーター配列に操作可能に接続している。プロモーターは宿主細胞中で転写
活性を示すいずれのDNA配列でもよく、宿主生物と同じかまたは異なるいずれ
かのタンパク質をコードする遺伝子から由来するもの、たとえばプソイドモナス
属と異なるプロモーターである。プロモーターは宿主生物と同じタンパク質をコ
ードする遺伝子から由来するのが好ましい。適当なプロモーターの例は、大腸菌
のlac、ストレブトミセスコエリコラー(Streptos+ycescoe
licolor)のdag Aおよびバチルスリチェニホルミス(Baci−1
1us licheniformis)のamy Lである。
本発明の複製可能な発現ベクターはさらに宿主細胞中でベクターを複製しうるD
NA配列からなる。このような配列の例は、プラスミドpUc 19. pAC
YC177、pUB 110およびplJ 702の複製オリジンである。
ベクターはまた、選択可能なマーカーたとえばその生成物が抗生物質耐性たとえ
ばアンピシリン、カナマイシン、クロラムフェニコールもしくはテトラサイクリ
ン耐性を付与する遺伝子または枯草菌もしくはバチルスリチェニホルミスからの
dal遺伝子を含んでもよい。
各々リパーゼおよび/またはLimファクターとプロモーターをコードするDN
A配列を連結し、そしてこれらを宿主細胞中での複製に必要な情報を含む適当な
ベクターへ挿入するために使用される手段は、当業者によく知られている(たと
えば、サムプルツクら、前掲)。ベクターは、最初にリパーゼおよびLimファ
クターをコードする全DNA配列を含むDNA構築物を調製し次いでこの構築物
を適当な発現ベクターへ挿入するか、またはリパーゼもしくはLimファクター
をコードするDNA配列を含むDNA構築物を別々に調製するか、または個々の
要素(たとえばリパーゼまたはLimファクター)についての遺伝情報を含むD
NA断片を逐次挿入し続いて各工程の後で連結することにより構築されることは
理解されるであろう、さらに、この関係で、上述のようにリパーゼをコードする
DNA配列がゲノムオリジンからなり一方Limファクターをコードする配列が
合成的に調製されるかまたはその逆でもよいことは理解されるであろう。さらに
別の見地において、本発明は、上述したようにプソイドモナスセパシアリパーゼ
をコードするDNA配列およびLimファクターをコードするDNA配列をそれ
ぞれ含む2つの異なるDNA構築物のいずれか、または同じ断片上に両方のDN
A配列を含むDNA構築物を含む宿主細胞に関する;いずれの場合にも、DNA
構築物は、DNA配列が細胞中で安定に維持されやすいという利点を有する宿主
染色体中に組込まれる。DNA構築物の宿主染色体への組込みは、常法たとえば
相同組換えにしたがって実施される。2つのDNA配列はこれらが各々別のプロ
モーターから発現されるように宿主染色体に組込まれる。好ましい実施B様にお
いて、リパーゼをコードするDNA配列および/またはLimファクターをコー
ドするDNA配列はさらにプソイドモナス属のものと異なる発現シグナル(たと
えば、プロモーター、リポソーム結合部位および/またはシグナルペプチド−コ
ード配列)を含む。
これに代わり、宿主細胞は、両方のDNA配列を含む複製可能な発現ベクター、
またはそれぞれリパーゼをコードするDNA配列とLimファクターをコードす
るDNA配列を含む2つのベクターで形質転換される。
別の変法として、リパーゼをコードするDNA配列を宿主染色体に組込み、そし
てLimファクターをコードするDNA配列を複製可能な発現ベクター(上述し
たように)に保持するか、またはその逆でもよい。
本発明方法に使用される宿主細胞は、培養時に多量のプソイドモナスセパシアリ
パーゼを生産する適当な細菌、酵母またはフィラメント状真菌のいずれかでよい
。
適当な細菌の例はダラム陽性菌たとえば枯草菌、バチルスリチェニホルミス(B
acillus licheniformis)、バチルスプレビス(Baci
llus 1entus)、バチルスプレビス(Bacillus brevi
s)、バチルスステアロテルモフィルス(Bacillus stearoth
ermo−philus)、バチルスアルカロフィルス(Bacillus a
lkalophilus)、バチルスアミロリクエファシェンス(Bacill
us amyloliquefa−ciens)、バチルスコアギユランス(B
acillus coagulans)、バチルスサーキュランス(Bacil
lus circulans)またはストレプトミセスリビダンス(Strep
totayces 1ividans) もしくはストレプトミセスムリナス(
Streptoa+yces murinus)、またはグラム陰性菌たとえば
大腸菌(E、coli)である。細菌の形質転換はたとえば、それ自体公知の方
法で原形質形質転換によりまたはコンピテント細胞を用いて行なわれる。
酵母生物はサツカロミセスの種たとえばサツカロミセスセレヴイシアエ(Sac
charoa+yces cerevisiae)から選択されるのが好ましい
、フィラメント状真菌はアスペルギルス属(Asper−gillus)の種た
とえばアスペルギルスニガーエ(Aspergi 1lusoryzae)また
はアスペルギルスニガー(Aspergillus niger)に属するのが
有利である。真菌細胞は、それ自体公知の方法で原形質形成および原形質の形質
転換続いて細胞壁の再形成を含む方法により形質転換される。宿主生物としての
アスペルギルス属の使用は、たとえばヨーロッパ特許第238023号に記載さ
れている。
さらに別の見地において、本発明はプソイドモナスセパシアリパーゼまたはその
誘導体の生産方法に関するもので、該方法はリパーゼまたはその類似物質の生産
を促す条件(Limファクターの発現を保証する条件を含む)下に上述のように
宿主細胞を培養し、細胞および/または培地からリパーゼまたは類似物質を回収
することからなる。
細胞を培養するために使用する培地は、細菌の増殖に適する通常の培地のいずれ
かである。リパーゼは、たとえば必要ならば細胞の分裂後に遠心分離または濾過
により培地から細胞を分離し、塩たとえば硫酸アンモニウムを用いて上澄または
濾液のタンパク質成分を沈でんさせ、銃いて様々なりロマトグラフ手法たとえば
イオン交換クロマトグラフィ、アフイニティクロマトグラフィ等を用いて精製す
ることにより常法にしたがって培地から回収される。
本発明はさらに添付の図面を用いて以下の例により説明されるが、これは本発明
範囲をいかなる方法でも限定するものではない。
図において、
第1図A−Cはプソイドモナスセパシアlim遺伝子のDNA配列を示し、誘導
されたアミノ酸配列は通常の三文字コードで以下に示され、
第2図A−Cは〜33kDプソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA
配列を示し、誘導されたアミノ酸配列は通常の三文字コードで以下に示され、
第3図はプラスミドpSJ 51Bの構築を図式的に示し、第4図はプラスミド
psJ 910の構築を図式的に示し、第5図はプラスミドpSJ 485の構
築を図式的に示し、第6図A−BはプラスミドpSJ 622およびpSJ 6
24の構築を図式的に示し、
第7図はプラスミドpSJ 424の構築を図式的に示し、第8図はプラスミド
psJ 494と909の構築を図式的に示し、第9図はプラスミドpSJ 7
29の構築を図式的に示し、第10図はプラスミドpSJ 416の構築を図式
的に示し、第11図はプラスミドpSJ 600の構築を図式的に示し、第12
図はプラスミドpSJ 671の構築を図式的に示し、第13図A−Bはプラス
ミドpSJ 669の構築を図式的に示す。
材料および方法
細菌株
大腸菌HWr は、1966年ウッド(Wood)に記載された菌株803のl
ac I ”、zM 15誘導体である。大腸菌NM 539は1983983
年フリシュアラフrischauf et al、)により記載され、そしてプ
ロメガ社から入手した。
プソイドモナスセパシアSB 10. DSM 3959は、国際特許出願第8
9101032号に記載されている。
枯草菌ON 1885は枯草菌168のamyE+ amyR2,spo” 、
Pro”誘導体である。
バチルスリチェニホルミスATCC9789゜ストレプトミセスリビダンスTK
24は1983年ホップウッドら(Hopwood et al、)により記
載されている。
ファージ
λEFIBL 4は1983983年フリシュアラフり記載されている。
これはプロメガ社から入手した。
プラスミド
puc 18およびpoc 19は1985年ヤーニッシューペロン(Yani
sch−Perron)らにより記載されている。
pACYC177は1978年チャン(Chang)およびコーエン(Cohe
n)により記載されている。
plJ 702は1983年カッッ(Katz)らにより記載されている。
plJ 4642は挿入に対し陽性の選択性を示す大腸菌クローニングベクター
である。これはpIJ666(キーザーKieserおよびメルトンMelto
n、Gene 65,1988.p83−91)に似ているがしかしクローニン
グに関してより有益な部位を有する。これはティ、キーザーT、Kieserか
ら入手された。
pDN 1528は、通常の突然変異誘発法により作られるATCC9789の
アミラーゼ過剰生産誘導体である、バチルスリチェニホルミス菌株ON 52か
らのα−アミラーゼ遺伝子を含む2.3kbHindlI[−Sph I断片を
有するバチルスプラスミド9[JB 110(グリクザンGryczanら、1
978)の誘導体である。
pPL 1131はアミラーゼプロモーターとpDN 1528のシグナルペプ
チド−コード領域とこれに続く合成リンカ−を含むpUB11〇−誘導プラスミ
ドである。
pIJ 2002はストレプトミセスコエリコーラーA3 (2)のdagA(
アガラーゼ)遺伝子を含むpUc 18誘導体であり、エム、ピップ(M−Bi
bb)から得られた。
一般的方法:
標準的DNA操作は1982年にマニアティス(Maniatis)らにより記
載されたように実質的に行なわれた。
制限酵素、T4 DNAリガーゼ、T4ポリヌクレオチドキナーゼ、DNAポリ
メラーゼI (フレノウフラグメント)、およびエキソヌクレアーゼ■はニュー
イングランドバイオラボズ社(New England Biolabs)から
入手されそして供給元が推奨しているように使用した。ヌクレアーゼSlおよび
制限酵素Hind IIはベーリンガーマンハイム社から人手されそして供給元
が推奨しているように使用した。
鶏卵白リゾチームはシグマ社から入手された。
すべての菌株からのプラスミドの調製はキーザー(1984)により記載された
方法で行なわれた。
λDNAはプロメガ社からパッカジーン(Packagene)抽出物を用いて
インビトロでパッケージされた。
DNA配列化は、放射性標識物として3’5dATP(デュポン社NEN NE
GO34H,>1000Ci/ミリモル)を用いそして鋳型として変性プラスミ
ドDNAを用いてチェインターミネータ−法(サンガーSangerら、197
7)により行なわれた。配列化は、フレノウフラグメントを用いて1986年に
ハラトリおよびササキにより記載されたように実施するか、または供給元(ユナ
イテッドステーツバイオケミカル社United StatesBiochmi
cal Corporation)からの小冊子に記載されているようにシーク
エナーゼ5equenase登録商標を用いて実施された。
プライマーはニューイングランドバイオラボズ社がらのM13配列化および逆配
列プライマーまたは本発明者により調製されたクローン化プソイドモナスDNA
の領域に相補的なオリゴヌクレオチド(17〜21量体)のいずれがであった。
大腸菌の形質転換:
大腸菌の細胞はマンデルMandelおよびヒガHi、ga、1970により記
載されたようにコンピテントにされそして形質転換された。
枯草菌の形質転換ニ
ヤスピンYasbinら、1975により記載されたようにコンピテント細胞を
調製し形質転換した。
バチルスリチェニホルミスの形質転換:アカマツAkamatzu(1984)
により記載されたようにポリエチレングリコール−仲介原形質体形質転換により
プラスミドをバチルスリチェニホルミスヘ導入した。
ストレプトミセスリビダンスの形質転換:ストレプトミセス属に対する形質転換
および他の手法はホップウッド)lopwoodら、1985に記載されたよう
であった。
オリゴヌクレオチド合成:
合成は〜ビューケージBeaucageおよびカルサーズCaru−thers
、Tetrahedron Letters 22.1981.pplB59〜
1869により記載されたホスホアミダイト法を用いて自動DNA合成機中でフ
ァージDNAの調製:
ファージλDNAは、マニアティスManiatis ら、1982において記
載されているように小規模液体培地から調製された。
エキソ■欠失:
ヘニコッフHen1koff、1984に記載されているようにエキソヌクレア
ーゼ■を用いて一方向性欠失を行なった。
リパーゼ分析
リパーゼは基質としてトリブチリンを用いてpH−スタット法により測定した。
ILII(リパーゼユニット)は、以下の条件下に1分間につき滴定可能な酪酸
1マイクロモルを遊離する酵素の量である:
温度 30.0℃
pH7,0
乳化剤 アラビアゴム、Lg/l
基 質 トリブチリン、 50adi//!培地:
TYニトリブチカーゼ 20g/It
酵母抽出物 5g/l。
FeCj! z ・4)1z0 611g/ i。
MnCj! z ・48zO1mg/ j!MgCj! 4・7Hz0 15■
/19H7,3
BPX: ジャガイモデンプン 100g/lオオムギ粉 50g/12
RAN 5000 SKB O,1g/lカゼイン酸ナトリウム 10 g /
Il大豆末 20 g / f
NaZHPO4,128209g / fプルロニック 0.1g/f
LB寒天: バクトートリブトン 10 g / ffiバクト酵母抽出物 5
ail
NaC110g / 1
バクト寒天 15g/j!
NaOHでpH7,5まで調節
トリブチリンを有するLB寒天:
溶かしたLB寒天350dへトリブチリン3.5 dとアラビアゴム0.35g
を加え、混合物をウルトラトウルックス(UltraTurrax)乳化剤を用
いて乳化し、次いでオートクレーブする。
ナイルプルー指示薬プレート
最下層は15arj!LB寒天からなる。
最上層は軟寒天(0,6%寒天を有するLB)3m、オリーブ油乳剤300Iお
よび5%ナイルブルー溶液(水中で作り滅菌濾過した>20dの混液を含有した
。
オリーブ油孔剤ニ
オリーブ油 10m
アラビアゴム Ig
脱イオン水 90d
ウルトラトウルックス乳化剤を用いて混合した。
緩衝液:
TE緩衝液:105Ml−リス、pH8,1a+MEDT^、pH8ファージ緩
衝液: 0.01M NaC10,01M MgCj! z
0.01M トリス・Hl、 pH7,0連結緩衝液: 0.066M トリス
・H(/!、 pH7,50,01M Mg(/!□、25眉/M1.ゼラチン
、0.001M ATP、0.01M DTT例1
プソイドモナスセパシアリパーゼ遺伝子のクローニングA)プソイドモナスセパ
シアSB 10からの染色体DNAの調製
3IIITY培地からの凍結細胞のペレットを1■/I11リゾチームを含むT
E緩衝液1m中に再懸濁した。 EDTA (0,5M、pH8,0)0.1m
を加え、混合物を緩やかに撹拌しながら37℃で15分間インキュベートした。
20%5D35dを加え、溶液を界面が存在しなくなるまでフェノール(300
Illずつ)で繰り返し抽出した。次いで上澄をCHCf、(300m)で−回
抽出した。上澄900j11へ、3M Na−アセテート90Iとイソプロパツ
ール500dを加えた。5〜10分後、沈でんしたDNAをプラスチック製の接
種ループ上に回収し、70および96%エタノールで洗浄し、TE500m中に
再懸濁した。染色体DNA (chr DNA)の溶液を一20°Cに保持した
。
B)プソイドモナスセパシアからのchr DNAの部分切断および分別
プソイドモナスセパシアSB 10からのchr DNA 80 n (上記A
)で記載のように調製)を、供給元により推奨された緩衝液400I中で37°
Cにて5分間5au3A5単位で消化し、70°Cで10分間加熱し、そして全
サンプルを分離用アガロースゲル上に載せた。電気泳動後、9−23kbのDN
A断片を含むゲルセグメントを切断した。染色体DNA断片はゲルセグメントを
凍結/解凍後に形成した液体中に回収され、フェノールで2回、CH(43で一
回抽出し、エタノール沈でんし、そしてTE緩衝液に溶かした。
C)λフアージ中のプソイドモナスセパシアDNAライブラリィの構築
λEMBL4 DNA 2 gを制限酵素BamHIと5alIで完全に消化し
、フェノールで2回とCHCl1sで1回抽出し、エタノール沈でんしそしてT
E10111中に再懸濁した。懸濁液をサイズ分別化chr DNA (501
11TE中)2.5gと混合し、エタノールで沈でんさせ、連結緩衝液10m中
に再懸濁させ、T、DNAリガーゼ100単
で16時間連結を実施した。次いで連結したDNAを、プロメガ社製のパフカジ
ーン(Packagene)登録商標抽出剤を用いてλフアージ粒子へ詰め込み
、ファージ緩衝液500I中に希釈し、CH(1.50dを加えた。これは拡大
したファージストックを次のようにして作るために使用された:詰め込まれたフ
ァージ粒子をT Y + 0. 4%マルトース+20mMMg5O.中で増殖
した大腸菌NM 539の新しく一晩培養したもの同量と混合し、37°Cで2
0分間吸着させ、そして205M Mg5Oaを含む軟LB寒天(0,6%)4
d中に新しいLBプレートを薄く塗った。37°Cで16時間インキュベーショ
ン後、約2500個のプラークを含む部分的に溶けた最上層をファージ緩衝液5
dを含む40jdの遠心分離管へこすり取って入れ、ファージを2時間抽出した
。ツルバール(Sorvall) SS 34回転機中で5分間5000rpm
にて遠心分離後上澄を拡大ストックとして保持しそしてスクリーニングのために
使用した。
D)リパーゼ遺伝子を有する組換体λファージの単離拡大ライブラリィからの約
200000個のファージをNM539へ吸着させ、1%グリセロールトリブチ
レートエマルジョンを含む軟寒天中20LBプレート上に薄く塗り、その結果各
プレート上が全部溶解した。170個の透明なプラーク(トリブチリンを加水分
解)を濁ったトリブチリン乳剤中で同定し、多数を再度単離した。35個のプラ
ークをナイルブルー指示薬プレートに筋状に塗り、これらのうち10個が陽性反
応すなわち強い青色着色を示した。これらのファージのうち3つからファージD
NAを単離し、これは制限酵素消化に基づいて同一であることがわかった。
E) puc 19へのサブクローニング上記D)で調製されたファージDNA
1agを5ailで部分的に切断し、pUC 19 DNAを消化した5all
O.3tarと混合し、連結し、コンピテント大腸菌HWIへ形質転換しそして
アンピシリン20(1+g/dを含むLBプレート上に薄く塗った。
これらのプレートをアンピシリン2 0 0 n/diと1%グリセロールトリ
ブチレート乳剤を有するLBプレート上で複製し、透明な輪で囲まれたコロニー
を単離した。これらの1つ、5J150は、リパーゼ−コード遺伝子およびリパ
ーゼモジュレーティング(line)遺伝子を含む約6kbのプラスミド、消化
されたpsJ150を有することがわかった。
F)DNA配列化
pST 150上に含まれるクローン化DNAのほとんどの配列は、上述の材料
および方法に記載したように、二本鎖鋳型上で直接チェインターミネータ−法に
より決定された。両方のストランドの配列は、制限断片のサブクローニング、エ
キソヌクレアーゼ■を用いたクローン化DNAのいずれかの端部からの欠失、お
よび合成オリゴヌクレオチドプライマーの組合せを用いて決定した。これにより
第2図A−Cに示されたリパーゼコード配列と第1図A−Cに示されたリパーゼ
モジュレータ−(I far)コード配列の同定ができた。psJ 150にお
いて、配列TCGはリパーゼストップコドン(TAA)からリパーゼモジュレー
タ−スタートコドン(ATG)を分離する。
例2
プソイドモナスセパシアリパーゼの発現A、大腸菌における未修飾リパーゼの発
現(1)limを有しないlip
プラスミドpSJ 518は、第3図に示すように、pSJ 150からpUc
i!3ヘリパーゼ(lip)遺伝子を含む1.5kb HindI[I −5
J 518(psJ 518を含む大腸菌uhl)は1%グリセロールトリブチ
レートを含むプレート上に示されるよう、にいかなるリパーゼも生産しない(す
なわち、コロニーを囲む輪がない)。
(2)同じプラスミドにおけるl ip+11npSJ 150において、リパ
ーゼはそれ自体からならびにpuC191acプロモーターから発現される。ク
ローン化したDNAの同じフラグメントをしかしながらlacプロモーターに関
して反対方向で有するプラスミドpsJ 910は、第4図に略示したように構
築され、そして大腸菌HWIへ導入されて菌株SJ 910を形成した。1%グ
リセロールトリブチレートを含むプレート上に薄く塗ると、SJ 910コロニ
ーはSJ 150のコロニーより小さい輪により囲まれた。これは、lipおよ
びlim遺伝子について大腸菌に活性なプロモーターの存在を示す。
lipおよびlim遺伝子間の領域は、リパーゼ発現に悪影響を与えることなく
変化しうる。psJ150はリパーゼストップコドンの後に単一のClal部位
−塩基対を含む、プラスミドpSJ 485は、8塩基対Bgll[リンカ−に
ューイングランドバイオラボズ)をDNAポリメラーゼI(フレノウフラグメン
ト)とdNTPの大断片を用いて充てんされたこのC1a I部位へ挿入し、こ
れにより10塩基対が挿入される(第5図)ことにより構築された。菌株SJ
485(pSJ 485を含む大腸菌H−1)はSJ 150と同じ量のリパー
ゼを生産した。
(3)別々のプラスミドにおけるtipおよび11m11m遺伝子はpSJ 1
50から1.2 kb Sph I断片上で切り取られそしてpUc 19のs
ph I部位へ挿入された。この結果、Jim遺伝子を正しく読むlacプロモ
ーターを有するプラスミドpSJ 377とlim遺伝子を逆に読% 1 a
cプロモーターを有するプラスミドpSJ 378となった。pSJ 377お
よびpSJ 378から、1.2kb挿入部+lacプロモーターが1.5 k
bPvu U断片として切り取られた。これはpACYC177の旧ndII部
位へ挿入されてpSJ 622 (pSJ 377から挿入)およびps、r
624(pSJ 378から挿入)となった。pSJ 622とpSJ 624
の構築を第6図に概略示す。
プラスミドpSJ 622 とpSJ 624をコンピテントSJ 518 (
リパーゼ遺伝子だけを有するps、y 518を含む菌株)へ導入し、アンピシ
リンおよびカナマイシン耐性について選択し、そして形質転換体をグリセロール
トリブチレートを含むプレート上で複製した。大きな輪がpSJ 622を含む
形質転換体の周囲に形成されるがpSJ 624を含む形質転換体の周囲にはな
く、このことは前者からリパーゼは生産するが後者からはしないことを示す。
B、大腸菌における修飾したリパーゼ遺伝子の発現(1)limを有しない1i
p
ps、y 494はバチルス属においてプソイドモナスセパシアリパーゼについ
ての発現プラスミドである。これはプロモーター、リポソーム結合部位および成
熟リパーゼをコードするDNAに骨組が融合したバチルスリチェニホルミスα−
アミラーゼ遺伝子からのシグナルペプチドコード領域を有するが、しかしlim
遺伝子を含まない。pSJ 494の構築は第7図および第8図に略示する。融
合領域の配列は以下のとおりである。
ATG AAA CAA CAA AAA CGG CTT TACGCCCG
A TTG CTG ACG CTGMet Lys Gln Gin Lys
Arg Leu Tyr Ala Arg Leu Leu Thr Leu
α−アミラーゼシグナルペプチド
5tJ
TTA TTT GCG CTCATCTTCTTG CTG CCT CAT
TCT GCA GCA GCG GCCLeu Phe Ala Leu
Ile Phe Leu Leu Pro His Ser Ala Ala
Ala Ala門1uI
GCA GCT GGCTACGCG GCG ACG CGT TACCCG
ATC−−Ala Ala Gly Tyr Ala Ala Thr Ar
g Tyr Pro Ile −−(成熟リパーゼ配列
このα−アミラーゼ/リパーゼ融合遺伝子を大腸菌へ導入するために、プラスミ
ドpSJ 909が構築された(第8図)。
菌株SJ 909(pSJ 909を含む大腸菌H−1)はグリセロールトリブ
チレートを含むプレート上に何らの輪も作らない。
(2)別々のプラスミドにおけるlipおよびIim菌株SJ 909はコンピ
テントとなり、pSJ 377(第6図に示すように構築)またはpSJ 72
9のいずれかで形質転換され、これはlim遺伝子(第9図)の5′末端から約
600塩基対を欠失することによりpSJ 377から導びかれた。二重の形質
転換細胞をグリセロールトリブチレートを含むプレート上に筋状に付けると、p
SJ 377を含むこれら(lim”プラスミド)がコロニーを囲む透明な輪郭
を形成し、このことはリパーゼ生産を示し、一方pSJ 729を含むもの(l
im−)はいかなる輪郭をも形成しない。
C6枯草菌における修飾したリパーゼ遺伝子の発現(1)limを有しないli
p
プラスミドpSJ 493およびpSJ 495はB、1)で記載されたpsJ
494と同一で、アミラーゼ−リパーゼ融合物を有するがしかしlim遺伝子
は有しない。これらは枯草菌株DN 1885へ導入され、そして形質転換細胞
をBPX増殖培地を含む振とうフラスコ中、オレイルアルコール30g/j!ま
でおよびクロラムフェニコール12g/M1まで添加しながら、37°Cで4日
間増殖した。
培養ブロス中のリパーゼ活性はLU−滴定法(材料および方法に記載)により測
定され、1−2LU/d!であった。これは菌株DN 1885について見出さ
れたバックグラウンドレベルを越えず、Q −5LU/d!の間で変化する。
(2)同じプラスミドにおける1ipとJimプラプラスミドpSJ16はpS
J 493−495と同じアミラーゼ−リパーゼ融合物を含むが、しかしリパー
ゼ遺伝子はpsJ 150と同じように正確にlim遺伝子が直ちに下流に続<
(pSJ 416の構築は第10図に略示される)。
このプラスミドが上記のように振とうフラスコ中で増殖した枯草菌DN 188
5および形質転換細胞へ導入されると、収率は4日間で40LU/dに達した。
D、バチルスリチェニホルミスにおける修飾したリパーゼ遺伝子の発現
(1)Jimを有しないlip
プラスミドpSJ 488はpSJ 493と同じアミラーゼ−リパーゼ融合物
を含むが、しかしその宿主菌株へカナマイシン耐性を付与するバチルスベクター
ppt 1131上にある(第11図)。
このプラスミドを原形質形質転換によりバチルスリチェニホルミス菌株ATCC
9789へ導入し、この形質転換細胞はグリセロールトリブチレートを含むプレ
ート上に縞を引いた。形質転換細胞の周囲に形成された輪は非常に小さく、形質
転換されない菌株の周囲に形成されたものと同じ大きさのものであった。
(2)同じプラスミド上のlipおよびJimプラスミドps、r 600はp
SJ 488と同じアミラーゼ−リパーゼ融合物を含むが、しかしリパーゼ遺伝
子はps、r 150と同じ方法で正確にlim遺伝子が直接下流に続いている
(第11図にps、r 600の構築を略示する。)。このプラスミドを原形質
形質転換によりバチルスリチェニホルミスATCC9789へ導入し、形質転換
細胞をグリセロールトリブチレートを含むプレート上で筋状に付けると、顕著な
輪がコロニーの周囲に形成されリパーゼ生産を示した。
E、ストレプトミセスリビダンスにおける修飾されたリパーゼ遺伝子の発現
(1)limを有しない1ip−発現
プラスミドpSJ 604はプラスミドpr、r 2002からの880bpH
indI[r −Ava■断片を単離することにより構築され、dag^プロモ
ーターおよびシグナルペプチド−コード配列(バラトナ−(Buttner)
ら、1987)の一部を有した。断片へ、以下に示す配列の2つの相補的ホスホ
リル化およびアニール化オリゴヌクレオチドを加えた:
AvaU Mlu I Xho I
GTCCCGCA CCCGCCGCTCA TGCCGCA GCTGGCT
ACGCGGCGACGCGTCGGCGTGGGCGGCGA G TA C
GGCGTCGACCGA TGCGCCGCTGCGCA G A GCTこ
の混合物を、予め旧ndI[Iおよびsal Iで消化されたpUC19と連結
してプラスミドpSJ 604とした。
プラスミドpSJ 671は、プロモーター、リポソーム結合部位およびストレ
プトミセスコエリコーラーアガロース遺伝子(dag A 、バラトナーら、1
987)のシグナルペプチドコード領域間の骨格融合物および成熟リパーゼをコ
ードするDNAを有する大腸菌−ストレプトミセスリビダンスシャトルプラスミ
ドである。Jim遺伝子はプラスミド上に存在するが、しかしいかなる公知のプ
ロモーターによっても転写されないような位置である。psJ 671の構築は
第12図に略示され、融合領域の配列は次のとおりである:
GTG GTCAACCGA CGT GAT CTCATCAAG TGG
AGT GCCGTCGCAMet Val 八sn Arg Arg Asp
Leu Ile Lys Trp Ser Ala Val Alaアガロー
クシグナルペプチド
val
CTCGGA GCG GGT GCG GGG CTCGCG GGT CC
CGCA CCCGCCGCT CATLeu Gly Ala Gly Al
a Gly Leu Ala Gly Pro Ala Pro Ala Al
a Hislu I
GCCGCA GCT GGCTACGCG GCG ACG CGT TAC
CCG ATC−Ala Ala Ala Gly Tyr Alj Ala
Thr Arg Tyr Pro Ile;成熟lip A配列
pSJ 671が原形質形質転換によりストレプトミセスリビダンスTK 24
へ導入されそして得られた形質転換体をグリセロールトリブチレートを含むプレ
ート上に筋状に引いた場合、非常に小さい輪がコロニーの周囲に形成され、これ
は少しまたはほとんどリパーゼが生産しないことを示す。
(2)同じプラスミド上の1ipおよびlimpSJ 669は、これがpSJ
150と正く同じようにリパーゼ遺伝子からすぐ下流にlim遺伝子を含むこ
と以外pSJ 671と同じである(pSJ 669の構築は第13図に略示す
る)。
pSJ 669を上述のようにストレプトミセスリビダンスTK 24へ導入し
そして形質転換細胞をグリセロールトリブチレート含有プレート上に縞状に引く
と、pSJ 671の周囲のものと比較して非常に大きな輪がコロニーの周囲に
形成された。
F、修飾されたtin遺伝子の作用
第6図に示されたように、pSJ 377は1acZプロモーターから発現され
たlim遺伝子を含む。このプラスミドはC1a Iで消化され、C1aiの周
囲の欠失はExo II[を用いて生じた。このような欠失プラスミドの1つは
pSJ 721であり、15塩基対が欠失して岩り、これは最初の2つのコドン
だけが欠失するlim遺伝子と融合したpUc191acZ遺伝子からの9個の
N末端コドン+lip遺伝子からの8個のC末端コドンから誘導される融合タン
パク質を作った。融合領域の配列は以下のようである:
5只σスター) J−月」C−末端部分^TG ACCATG ATT ACG
CCA AGCTTG CAT GCG ^^CCGG CTG ^^G C
TGMet Thr Met Ile Thr Pro Ser Leu旧s
Ala Asn^rg Leu Lys Leu: Iis from 3.
codonGCG GGG:GCA CGA GGA GGA CGCGCG
CCG CTG GCG CGCCGCGCCGTG10^1a Gly Al
a Arg Gly Gly Arg Ala Pro Leu Ala Ar
g Arg Ala ValTC
al
融合構築物+1acプロモーターは、第6図に示されたpsJ 622の構築と
同じようにして、1.5 kb Pvu II断片としてpSJ 721から切
り取られ、pACYC177のHindl1部位へ挿入されpSJ 812が得
られた。
pSJ 812はコンピテントSJ 51B (リパーゼ遺伝子だけを有するp
SJ 51Bを含む菌株)へ導入され、アンピシリンおよびカナマイシン耐性に
ついて選択し、形質転換細胞をグリセロールトリブチレート含有プレート上に複
製した。形質転換体の周囲に形成された輪はpsJ 622を有するSJ 51
8の形質転換体の周囲に形成されるものとほぼ同じ大きさであり、非修飾Jim
遺伝子を発現する。
例3
ポリペプチドをコードしたlimの発現および同定Jim遺伝子は1.17 k
b C1a I −5ph I断片としてpSJ 150から切り取られ、DN
Aポリメラーゼのフレノウフラグメントでプラント末端を作った後プラスミドp
JW2(ウォンら、1990)のNde I部位へ挿入した0組換体プラスミド
は2つの可能性のある方向のいずれかで挿入されたlim遺伝子で得られた。p
CBE 3およびpCBE 4の両方ともpJW Z上で温度誘因λpRおよび
pLプロモーターから転写について正方向で1im遺伝子を含み、一方pcBE
2はJim遺伝子を反対方向で含む。プラスミドを大腸菌JA 221 (ク
ラークおよびカーボン、1978)へ導入し、pt、およびpRプロモーターか
らの転写を培養物の温度を42°Cまで上げることにより引き起こした。誘導時
に生じたタンパク質は引き起こされた培養物から採取された細胞のポリアクリル
アミドゲル電気泳動により同定された。これによりpCBE 3を有する形質転
換体の誘発培養物中で見出された明白な分子量34000のタンパク質の同定が
されたが、pCBE 2を有する形質転換体の誘発培養物中または非誘発培養物
中には見られなかった。
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Fig、lb
Fig、 lc
Fig、 2 b
Fig、 2 c
Fig、 6b
pv++n
FIG、9
Fig、 13b
補正書の翻訳文提出書
(特許法第184条の8)
平成 3年も1月 ルし日
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.プソイドモナスセパシア(Pseudomonas cepacia)リパ ーゼの生産のモジュレーターとして途中で作用するファクターをコードするか、 またはプソイドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターの機能的 類似物質をコードするDNA配列を含むものであって、前記プソイドモナスセパ シアリパーゼモジュレーティングファクターまたはその機能的類似物質はプソイ ドモナスと異なる発現シグナルを用いてプソイドモナスセパシアリパーゼが発現 する場合および/またはプソイドモナスセパシアリパーゼが異種宿主細胞中で発 現する場合リパーゼ生産をモジコレートすることができるものを含むDNA構築 物。 2.DNA配列がプソイドモナスセパシアの染色体から由来する請求の範囲第1 項に記載のDNA構築物。 3.DNA配列がプソイドモナスセパシア染色体上であって〜33kDリパーゼ をコードするDNA配列の下流に位置する請求の範囲第2項に記載のDNA構築 物。 4.DNA配列が添付の第1図A−Cに示されたものまたはプソイドモナスセパ シアリパーゼモジュレーティングファクターの機能的類似物質をコードするその 修飾物である請求の範囲第1項に記載のDNA構築物。 5.プソイドモナスセパシアリパーゼまたはその誘導体をコードする第一のDN A配列および請求の範囲第1項〜第4項のいずれか1に記載のプソイドモナスセ パシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードする第二のDNA配列と からなるDNA構築物。 6.第一のDNA配列が〜33KDリパーゼをコードする請求の範囲第5項に記 載のDNA構築物。 7.DNA配列が添付の第2図A−Cに示されるものであるかまたはプソイドモ ナスセパシアリパーゼの誘導体をコードするその修飾物である請求の範囲第5項 に記載のDNA構築物。 8.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA配列がプソイドモナス セパシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードするDNA配列の上流 に位置する請求の範囲第5項に記載のDNA構築物。 9.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA配列がプソイドモナス セパシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードするDNA配列の下流 に位置する請求の範囲第5項に記載のDNA構築物。 10.第一および/または第二のDNA配列がさらにプソイドモナスのものと異 なる発現シグナルを含む請求の範囲第5項〜第9項のいずれか1に記載のDNA 構築物。 11.プソイドモナスセパシアリパーゼの生産のモジュレーターとして途中で作 用するファクターをコードするかまたはプソイドモナスセパシアモジュレーティ ングフアクターの機能的類似物質をコードする挿入されたDNA配列を有するも のであって、プソイドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターま たはその機能的類似物質がプソイドモナスと異なる発現シグナルを用いてプソイ ドモナスセパシアリパーゼが発現された場合および/またはプソイドモナスセパ シアリパーゼが異種宿主細胞において発現された場合リパーゼ生産をモジコレー トしうるものである複製可能な発現ベクター。 12.DNA配列が請求の範囲第2項〜第4項のいずれか1に記載のものである 請求の範囲第11項に記載のベクター。 13.プソイドモナスセパシアリパーゼまたはその誘導体をコードする第一の挿 入されたDNA配列および請求の範囲第1項〜第4項のいずれか1に記載された プソイドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードする第 二の挿入されたDNA配列を有する複製可能な発現ベクタ14.第一のDNA配 列が〜33kDリパーゼをコードする請求の範囲第13項に記載のベクター。 15.DNA配列が添付の第2図A−Bに示されるものまたはプソイドモナスセ パシアリパーゼの誘導体をコードするその修飾物である請求の範囲第14項に記 載のベクター。 16.第一および第二のDNA配列が同じプロモーターから発現される請求の範 囲第13項に記載のベクター。 17.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードする第一のDNA配列がプソイ ドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードする第二のD NA配列の上流に位置する請求の範囲第16項に記載のベクター。 18.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードする第一のDNA配列がプソイ ドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードする第二のD NA配列の下流に位置する請求の範囲第16項に記載のベクター。 19.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードする第一のDNA配列およびプ ソイドモナスセパシアリパーゼモジュレーティングファクターをコードする第二 のDNA配列が別々のプロモーターから各々発現されたものである請求の範囲第 13項に記載のベクター。 20.第一および/または第二のDNA配列がさらにプソイドモナスのものと異 なる発現シグナルからなる請求の範囲第13項〜第19項のいずれか1に記載の ベクター。 21.プソイドモナスセパシアリパーゼまたはその誘導体をコードするDNA配 列からなる第一のDNA構築物と請求の範囲第1項〜第4項のいずれか1に記載 の第二のDNA構築物とを含む宿主細胞。 22.第一のDNA構築物が〜33kDリパーゼをコードする請求の範囲第21 項に記載の宿主細胞。 23.DNA構築物のDNA配列が添付の第2図A−Bに示されるものまたはプ ソイドモナスセパシアリパーゼの誘導体をコードするその修飾物である請求の範 囲第22項に記載の宿主細胞。 24.第一および/または第二のDNA構築物がさらにプソイドモナスのものと 異なる発現シグナルを含む請求の範囲第21項〜第23項のいずれか1に記載の 宿主細胞。 25.請求の範囲第5項〜第10項のいずれか1に記載のDNA構築物を含む宿 主細胞。 26.第一のDNA構築物を有する複製可能な発現ベクターおよび請求の範囲第 11項に記載の複製可能な発現ベクターで形質転換された請求の範囲第21項に 記載の宿主細胞。 27.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA配列がさらにプソイ ドモナスのものと異なる発現シグナルを含む請求の範囲第26項に記載の宿主細 胞。 28.請求の範囲第13項〜第20項のいずれか1に記載の複製可能な発現ベク ターで形質転換された請求の範囲第21項に記載の宿主細胞。 29.その染色体中に組込まれた第一のDNA構築物を有しそして請求の範囲第 11項に記載の複製可能な発現ベクターを含む請求の範囲第21項に記載の宿主 細胞。 30.その染色体中に組込まれた第二のDNA構築物を有しそして第一のDNA 構築物を含む複製可能な発現ベクターを含む請求の範囲第21項に記載の宿主細 胞。 31.プソイドモナスセパシアリパーゼをコードするDNA配列およびリパーゼ モジュレーティングファクターをコードするDNA配列が各々別のプロモーター から発現するようにその染色体中に組込まれた第一および第二のDNA構築物を 有する請求の範囲第21項に記載の宿主細胞。 32.細菌、酵母またはフィラメント状真菌である請求の範囲第21項〜第31 項のいずれか1に記載の宿主細胞。 33.グラム陽性菌である請求の範囲第32項に記載の宿主細胞。 34.グラム陽性菌が、枯草菌(Bacillus subtilis)、バチ ルスリチェニホルミス(Bacillus licheniformis)、バ チルレンタス(Bacillus lentus)、バチルスプレビス(Bac illusbrevis)、バチルスステアロテルモフィルス(Bacillu s stea−rothermophilus)、バチルスアルカロフィルス( Bacillusalkalophilus)、バチルスアミロリクエファシエ ンス(Baci−llus amyloliquefaciens)、バチルス コアグユランス(Baci−llus coagulans)、バチルスサーキ ュランス(Bacillus cir−culans)またはストレプトミセス リビダンス(Streptomyceslividans)もしくはストレプト ミセスムリナス(Streptomycesmurinus)からなる群から選 択される請求の範囲第33項に記載の宿主細胞。 35.グラム陰性菌たとえば大腸菌(Escherichia coli)であ る請求の範囲第32項記載の宿主細胞。 36.リパーゼまたは類似物質の生産を助成する条件下で請求の範囲第21項〜 第35項のいずれか1に記載の宿主細胞を培養し、そして培地からリパーゼまた は類似物質を回収することからなるプソイドモナスセパシアリパーゼまたはその 誘導体の生産方法。
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