JP7767290B2 - 新規なマスクされたサイトカインおよびその使用方法 - Google Patents
新規なマスクされたサイトカインおよびその使用方法Info
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Description
本出願は、2020年1月11日出願の米国仮出願62/959,973;2020年5月19日出願の米国仮出願63/027,138;2020年5月23日出願の米国仮出願63/029,473;および2020年12月16日出願の米国仮出願63/126,393も基づく優先権を主張する。前記優先権主張出願の開示を、引用により全体として本明細書に包含させる。
本出願は、ASCII形式で電子的に提供しており、引用により全体として本明細書に包含させる配列表を含む。該ASCIIコピーは2021年1月11日に作成し、025471_WO008_SL.txtなる名称であり、240,322バイトサイズである。
インターロイキン(IL)-2、IL-4、IL-7、IL-9、IL-15およびIL-21は、免疫細胞の増殖、分化および生存に重要な役割を演ずる。これらサイトカインの受容体は、CD132としても知られる共通のγ鎖(γC)を共有する。故に、これらサイトカインは、共通γCファミリーサイトカインとも称される。
本発明は、サイトカイン部分、マスキング部分および担体部分を含むプロドラッグであって、ここで、マスキング部分がサイトカイン部分に結合し、サイトカインの生物学的活性を阻害し;担体部分が標的細胞表面に発現される抗原に結合する抗原結合部分を含み;およびマスキング部分が開裂可能ペプチドリンカーを伴わず担体部分に連結される(例えば、開裂不可能ペプチドリンカーを介して担体部分に間接的に連結;またはペプチドリンカーを伴わず直接連結)を提供する。
ここでおよび添付する特許請求の範囲で使用される単数表現は、文脈が明確に異なる指示をしない限り、複数表現を含む。
本発明は、疾患部位でより活性となるサイトカインプロドラッグを提供する。プロドラッグは、サイトカインアゴニストポリペプチド(サイトカイン部分)、担体部分およびマスキング部分を含む。サイトカイン部分は、ペプチドリンカー(例えば、開裂不可能ペプチドリンカー)を伴いまたは伴わずに担体部分に連結され、マスキング部分によりマスク(結合)される。マスキング部分は、ペプチドリンカー(例えば、開裂不可能ペプチドリンカー)を伴いまたは伴わずにサイトカイン部分または担体部分に連結され得る。あるいは、サイトカイン部分は、ペプチドリンカー(例えば、開裂不可能ペプチドリンカー)を伴いまたは伴わずに、マスキング部分に連結され、これは、次に、ペプチドリンカー(例えば、開裂不可能ペプチドリンカー)を伴いまたは伴わずに、担体部分に連結される。
ある実施態様において、サイトカイン部分はIL-2アゴニストポリペプチドを含む。ある実施態様において、IL-2アゴニストポリペプチドは、変異R38S/F42A/Y45A/E62AまたはF42A/Y45A/L72Gを有するIL-2ムテインである(ナンバリングは配列番号6による)。ある実施態様において、本発明のIL-2ムテインは、T3、D20、K35、R38、F42、F44、Y45、E62、E68、L72、A73、N88、N90、C125およびQ126に変異を含み得る(ナンバリングは配列番号6による)。ある実施態様において、新規IL-2ムテインは、R38、F42、Y45およびA73に変異を含む(ナンバリングは配列番号6による)。
本プロドラッグのマスキング部分は、プロドラッグのサイトカイン部分に結合し、サイトカイン部分をマスキングし、その生物学的機能を阻害するペプチドまたは抗体または抗体フラグメントを含む。ある実施態様において、マスキング部分は、開裂不可能ペプチドリンカーを介して、プロドラッグの残りに作動的に連結される。
本プロドラッグの担体部分は、抗原結合ドメインおよび所望により他のドメインを含む。担体部分はサイトカインアゴニストポリペプチドの血清半減期などのPKプロファイルを改善し、サイトカインアゴニストポリペプチドを腫瘍部位などの体内の標的部位にも向ける。
担体部分は抗原結合ドメインを含み、抗体またはその抗原結合フラグメントまたはイムノアドヘシンであり得る。ある実施態様において、抗原結合担体部分は、2個の重鎖および2個の軽鎖を有する完全長抗体、Fabフラグメント、Fab’フラグメント、F(ab’)2フラグメント、Fvフラグメント、ジスルフィド連結Fvフラグメント、単一ドメイン抗体、ナノボディまたは一本鎖可変フラグメント(scFv)である。ある実施態様において、抗原結合部分は二特異的抗原結合部分であり、2個の異なる抗原または同じ抗原の2個の異なるエピトープに結合できる。抗原結合部分は、サイトカインアゴニストポリペプチドに相加的および相乗的となり得る治療有効性を提供する。
担体部分は、抗原結合性ではない他のドメインも含み得る。例えば、抗体Fcドメイン(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4 Fc)、ポリマー(例えば、PEG)、アルブミン(例えば、ヒトアルブミン)またはそのフラグメントまたはナノ粒子が使用され得る。
サイトカインアゴニストポリペプチドは、ペプチドリンカーを伴いまたは伴わずに担体部分と融合され得る。ペプチドリンカーは、開裂不可能である。ある実施態様において、ペプチドリンカーは配列番号27~34から選択される。具体的実施態様において、ペプチドリンカーはアミノ酸配列GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号30)を含む。
本発明のプロドラッグおよびムテイン(すなわち、活性医薬成分またはAPI)を含む医薬組成物は、所望の純度を有するAPIと、1以上の任意の薬学的に許容される添加物(例えば、Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th Edition., Osol, A. Ed. (1980)参照)の混合により凍結乾燥製剤または水溶液に調製され得る。薬学的に許容される添加物(または担体)は、一般に用いる投与量および濃度でレシピエントに非毒性であり、例えば、リン酸、クエン酸、スクシネート、ヒスチジン、酢酸または他の無機または有機酸またはその塩を含む、緩衝液;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(例えばオクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロライド;ヘキサメトニウムクロライド;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えばメチルまたはプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾール);低分子量(約10残基未満の)ポリペプチド;タンパク質、例えば血清アルブミン、ゼラチンまたは免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンまたはリシン;スクロース、グルコース、マンノースまたはデキストリンを含む単糖、二糖および他の炭水化物;キレート剤、例えばEDTA;糖、例えばスクロース、マンニトール、トレハロースまたはソルビトール;塩形成カウンターイオン、例えばナトリウム;金属錯体(例えばZn-タンパク質錯体);および/または非イオン性界面活性剤、例えばポリエチレングリコール(PEG)を含むが、これらに限定されない。
サイトカインプロドラッグおよび融合分子を、抗原結合ドメインにより結合される抗原に依存して、疾患の処置に使用できる。ある実施態様において、サイトカインプロドラッグまたは融合分子は、癌の処置に使用される。ある実施態様において、サイトカインプロドラッグまたは融合分子は、感染の処置に使用される。
さらに、本発明の特定の実施態様を以下に記載する。これらの実施態様は本開示に記載される組成物および方法を説明することを意図し、本発明の範囲を限定することを意図しない。
1. サイトカイン部分、マスキング部分および担体部分を含むプロドラッグであって、ここで、
a)マスキング部分はサイトカイン部分に結合し、サイトカインの意図される生物学的活性を阻害し;
b)担体部分が細胞の表面に発現される抗原に結合する抗原結合部分を含み;そして
c)マスキング部分が担体部分に開裂不可能ペプチドリンカーを介してまたはペプチドリンカーを伴わず直接的にまたは間接的に連結され;
ここで、プロドラッグの活性が、担体部分により標的とされる抗原およびサイトカインの受容体両者を発現する細胞の刺激について、サイトカインの受容体を発現するが、担体部分により標的とされる抗原を発現しない細胞を刺激する活性より高い、
プロドラッグ。
2. サイトカイン部分、マスキング部分および担体部分を含むプロドラッグであって、ここで、
a)マスキング部分はサイトカイン部分に結合し、サイトカインの意図される生物学的活性を阻害し;
b)担体部分が細胞の表面に発現される抗原に結合する抗原結合部分を含み;そして
c)マスキング部分が担体部分に開裂不可能ペプチドリンカーを介してまたはペプチドリンカーを伴わず直接的にまたは間接的に連結され;
ここで、プロドラッグが担体部分により標的とされる抗原およびサイトカインの受容体両者を発現する細胞が存在する疾患部位で活性化されるまたはプロドラッグの生物学的活性が担体部分により標的とされる抗原およびサイトカインの受容体両者を発現する細胞が存在する疾患部位で少なくとも2倍、少なくとも5倍または少なくとも10倍増加する、
プロドラッグ。
3. サイトカイン部分の受容体が2以上のサブユニットを含む、実施態様1または2のプロドラッグ。
4. 担体が抗原結合部分を含み、ここで、抗原が免疫細胞に発現される、実施態様1または2のプロドラッグ。
5. 担体部分が抗原結合部分を含み、ここで、抗原が、PD-1、PD-L1、CTLA-4、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CD25、CD16a、CD16b、NKG2D、NKP44、NKP30、CD19、CD20、CD38およびBCMAから選択される、実施態様1または2のプロドラッグ。
6. サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチド、IL-7アゴニストポリペプチド、IL-9アゴニストポリペプチド、IL-15アゴニストポリペプチドおよびIL-21アゴニストポリペプチドから選択されるサイトカインを含む、実施態様1~5の何れかのプロドラッグ。
7. サイトカインが、IL-1αアゴニストポリペプチド、IL-1βアゴニストポリペプチド、IL-4アゴニストポリペプチド、IL-5アゴニストポリペプチド、IL-6アゴニストポリペプチド、IL-8アゴニストポリペプチド、IL-10アゴニストポリペプチド、IL-12アゴニストポリペプチド、IL-17アゴニストポリペプチド、IL-18アゴニストポリペプチド、IL-22アゴニストポリペプチド、IL-23アゴニストポリペプチド、IL-31アゴニストポリペプチド、IL-33アゴニストポリペプチド、IL-36アゴニストポリペプチド、インターフェロン-アルファアゴニストポリペプチド、インターフェロンガンマアゴニストポリペプチド、4-1BBリガンド、OX-40リガンドおよびCD-40リガンドから選択される、実施態様1~5の何れかのプロドラッグ。
8. マスキング部分がサイトカインの受容体の細胞外ドメイン(ECD)である、実施態様1~7の何れかのプロドラッグ。
9. サイトカインがIL-7アゴニストポリペプチドであり;そして、ここで、マスキング部分がIL-7受容体αの細胞外ドメイン(IL-7Rα ECD)またはその機能的アナログである、実施態様1~6の何れかのプロドラッグ。
10. サイトカインがIL-21アゴニストポリペプチドであり;そして、ここで、マスキング部分がIL-21受容体αの細胞外ドメイン(IL-21Rα ECD)またはその機能的アナログである、実施態様1~6の何れかのプロドラッグ。
11. サイトカインがIL-2アゴニストポリペプチドまたはIL-15アゴニストポリペプチドであり;そして、ここで、マスキング部分がIL-2受容体βの細胞外ドメイン(IL-2Rβ ECD)である、実施態様1~6の何れかのプロドラッグ。
12. サイトカインがIL-21アゴニストポリペプチドであり;そして、ここで、マスキング部分がIL-21に対する一本鎖Fv(scFv)または単一ドメイン抗体である、実施態様1~6の何れかのプロドラッグ。
13. サイトカインがIL-2アゴニストポリペプチドであり;そして、ここで、マスキング部分がIL-2に対する一本鎖Fv(scFv)または単一ドメイン抗体である、実施態様1~6の何れかのプロドラッグ。
14. サイトカインがIL-15アゴニストポリペプチドであり;そして、ここで、マスキング部分がIL-15に対する一本鎖Fv(scFv)または単一ドメイン抗体である、実施態様1~6の何れかのプロドラッグ。
15. サイトカイン部分がIL-15アゴニストポリペプチドを含み、ここで、融合分子がさらにIL-15受容体αのスシドメイン(IL-15Rαスシドメイン)を含む、実施態様1~6、11および14の何れかのプロドラッグ。
16. IL-21アゴニストポリペプチドが、配列番号1のまたは配列番号1と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含む、実施態様10または12の何れかのプロドラッグ。
17. マスキング部分がIL-21Rα-ECDまたはその機能的アナログであり、それが配列番号12、63~72および73から選択されるまたは配列番号12と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含む、実施態様10または16のプロドラッグ。
18. マスキング部分がヒトIL-21に結合するscFvであり;そして、ここで、scFvが配列番号20または21のアミノ酸配列を含む、実施態様12または16のプロドラッグ。
19. IL-2アゴニストポリペプチドが、配列番号6または61のまたは配列番号6または61と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、実施態様11または13のプロドラッグ。
20. IL-15アゴニストポリペプチドが、配列番号7のまたは配列番号7と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、実施態様11または14のプロドラッグ。
21. マスキング部分がIL-2Rβ-ECDまたはその機能的アナログを含み;、ここで、IL-2-Rβ-ECDが配列番号11のまたは配列番号11と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、実施態様11、19または20のプロドラッグ。
22. マスキング部分がIL-2に結合するscFvであり、ここで、scFvがIL-2とIL-2Rαの相互作用、IL-2とIL-2Rβの相互作用および/またはIL-2とIL-2Rγの相互作用を阻害または妨害する、実施態様6、13または19の何れかのプロドラッグ。
23. マスキング部分がIL-15に結合するscFvであり、ここで、scFvがIL-15とIL-2Rβおよび/またはIL-2とIL-2Rγの相互作用を阻害または妨害する、実施態様6、14、15または20の何れかのプロドラッグ。
24. マスキング部分がIL-21に結合するscFvであり、ここで、scFvがIL-21とIL-21Rαおよび/またはIL-21とIL-2Rγの相互作用を阻害または妨害する、実施態様6、12または16の何れかのプロドラッグ。
25. マスキング部分がIL-2、IL-7、IL-9、IL-15またはIL-21から選択されるサイトカインに結合するscFvであり;ここで、scFvがサイトカインとIL-2Rγの間の相互作用を阻害または妨害し;そして、ここで、プロドラッグが、対応する野生型サイトカインより少なくとも20倍、少なくとも50倍、少なくとも100倍、少なくとも150倍または少なくとも200倍長い、非ヒト霊長類またはヒトにおける半減期を有する、実施態様6のプロドラッグ。
26. 担体部分、サイトカイン部分およびマスキング部分を含むプロドラッグであって、ここで:
a)サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチド、IL-7アゴニストポリペプチド、IL-9アゴニストポリペプチド、IL-15アゴニストポリペプチドまたはIL-21アゴニストポリペプチドから選択され;
b)マスキング部分がサイトカイン部分に結合するscFvであり;
c)scFvがサイトカインとIL-2Rγの間の相互作用を阻害または妨害し;そして
d)ここで、プロドラッグが野生型サイトカインより少なくとも20倍、少なくとも50倍、少なくとも100倍、少なくとも150倍または少なくとも200倍長い非ヒト霊長類またはヒトにおける半減期を有する、プロドラッグ。
27. scFvがサイトカインに1~10nMのKDで結合する、実施態様22~25の何れかのプロドラッグ。
28. scFvがサイトカインに10~100nMのKDで結合する、実施態様22~25の何れかのプロドラッグ。
29. scFvがサイトカインに100~1000nMのKDで結合する、実施態様22~25の何れかのプロドラッグ。
30. マスキング部分がIL-2に結合するscFvであり、ここで、scFvが、ハイブリドーマ4E12B2D10と同じ重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含む、実施態様13または19のプロドラッグ。
31. マスキング部分がIL-2に結合するscFvであり、ここで、scFvが配列番号22または23のまたは配列番号22または23と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を含む、実施態様13または19のプロドラッグ。
32. マスキング部分がIL-15に結合するscFvであり、ここで、scFvが、IL-15抗体146B7、146H5または404E4と同じ重鎖CDRおよび軽鎖CDRを含む、実施態様14または20のプロドラッグ。
33. マスキング部分がIL-15に結合するscFvであり、ここで、scFvが配列番号18または19のアミノ酸配列を含む、実施態様14または20のプロドラッグ。
34. プロドラッグが開裂可能ペプチドリンカーを含まない、実施態様1~32の何れかのプロドラッグ。
35. プロドラッグが、配列番号44のアミノ酸配列を有する2個の軽鎖およびアミノ酸配列がそれぞれ
配列番号35および36、
配列番号37および36、
配列番号37および38、
配列番号39および41または
配列番号42および43
を含む2個の重鎖ポリペプチド鎖を含む、
実施態様1のプロドラッグ。
36. プロドラッグが、配列番号50のアミノ酸配列を有する2個の軽鎖およびアミノ酸配列がそれぞれ
配列番号51および54、
配列番号51および55、
配列番号51および56、
配列番号52および54、
配列番号53および58、
配列番号53および59または
配列番号52および57
を含む2個の重鎖ポリペプチド鎖を含む、
実施態様1のプロドラッグ。
37. 実施態様1-36の何れかのプロドラッグ薬学的に許容される添加物を含む、医薬組成物。
38. 実施態様1~36の何れかのプロドラッグをコードする、1以上のポリヌクレオチド。
39. 実施態様38の1以上のポリヌクレオチドを含む、1以上の発現ベクター。
40. 実施態様39のベクターを含む、宿主細胞。
41. 実施態様1~36の何れかのプロドラッグを製造する方法であって、
哺乳動物細胞である実施態様46の宿主細胞を、プロドラッグの発現を可能とする条件下で培養し、そして
プロドラッグを単離する
ことを含む、方法。
42. 処置を必要とする患者における癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患を処置するまたは免疫系の刺激する方法であって、患者に治療有効量の実施態様37の医薬組成物を投与することを含む、方法。
43. 処置を必要とする患者における、癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患の処置または免疫系の刺激に使用するための、実施態様1~36の何れかのプロドラッグ。
44. 処置を必要とする患者における、癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患の処置または免疫系の刺激のための医薬の製造のための、実施態様1~36の何れかのプロドラッグの使用。
45. 患者がHIV、HBV、HCVまたはHPV感染;ループス、I型糖尿病、乾癬、皮膚筋炎、GvHDまたは関節リウマチから選択される自己免疫性疾患;または乳癌、肺癌、膵臓癌、食道癌、髄様甲状腺癌、卵巣癌、子宮癌、前立腺癌、精巣癌、結腸直腸癌および胃癌からなる群から選択される癌を有する、実施態様41の方法、請求項42の使用のためのプロドラッグまたは請求項43の使用のための融合分子または請求項44の使用。
46. 担体部分、サイトカイン部分およびマスキング部分を含むプロドラッグであって、ここで:
a)サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチド、IL-7アゴニストポリペプチド、IL-9アゴニストポリペプチド、IL-15アゴニストポリペプチドまたはIL-21アゴニストポリペプチドから選択され;
b)マスキング部分がサイトカイン部分に結合するscFvであり;
c)scFvがサイトカインとIL-2Rγの間の相互作用を阻害または妨害し;そして
d)ここで、プロドラッグが、少なくとも20倍、少なくとも50倍、少なくとも100倍、少なくとも150倍または少なくとも200倍、野生型サイトカインより大きい非ヒト霊長類またはヒトにおける曲線下面積(AUC)を有する、プロドラッグ。
SEC-HPLCを、Tosoh Bioscienceに発注したTSKgel G3000SWXLカラム(7.8mm ID×30cm、5μm粒子径)を有するAgilent 1100シリーズのHPLC系で実施した。100μlまでのサンプルを負荷した。カラムを、200mM K3PO4、250mM KClを含む緩衝液、pH6.5で流した。流速は0.5ml/分であった。カラムを室温で流した。
プロテアーゼ、ヒトMMP2、ヒトMMP9、マウスMMP2およびマウスMMP9をR&D systemsから購入した。プロテアーゼ消化を、2mM CaCl2および10μM ZnCl2を含むHBS緩衝液(20mM HEPES、150mM NaCl2、pH7.4)中、10μg~50μgのプロドラッグと1μgのヒトMMP2、ヒトMMP9、マウスMMP2またはマウスMMP9を、37℃で12時間インキュベートすることにより実施した。
プロテアーゼ消化前のプロドラッグおよび対照サンプルを、細胞ベースの活性アッセイにより試験した。簡潔には、NK92細胞を、L-グルタミン、10%ウシ胎児血清、10%非必須アミノ酸、10%ピルビン酸ナトリウムおよび55μM ベータ-メルカプトエタノールを添加したRPMI-1640培地で増殖させた。NK92細胞は非接着性であり、100ng/mlのIL-2で培地中1×105~1×106細胞/mlに維持した。一般に、細胞は週2回分裂した。バイオアッセイについて、細胞を、継代後48時間以降に使用するのが最良であった。IL-21機能的活性を、NK92細胞を5×104細胞/ウェルで、一定量のIL-2存在下、連続希釈サンプルと2日間培養することにより、決定した。次いで、上清をELISAによりインターフェロン-γについてアッセイした。
Mino細胞生存能アッセイを、次のプロトコールに従い実施する:
a)96ウェル組織培養プレート中、50μLアッセイ培地(RPMI 1640、10%ウシ胎児血清、NEAA、ピルビン酸ナトリウム、55μM b-メルカプトエタノール)で試験品の連続希釈を実施する。
b)50μLアッセイ培地に20,000 Mino細胞/ウェルを加える。
c)3日間または5日間培養する。
d)100μL/ウェル Cell Titer Glo(Promega)を加える。Cell Titer-Gloは、ATPの定量的評価の提供により、細胞生存能の指標を提供する。
e)ルミネセンスを測定する。
ヒトPBMCを、100ng/mLの抗CD3抗体、OKT3で2日間刺激し、続いて3回洗浄し、次いで3日間、習慣的な細胞培養培地で37℃、5%CO2インキュベーターで休息させた。この刺激/休息後、PBMCを、200K細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種し、示すとおり種々の濃度の試験品で5日間処理し、その後PD-1+CD4+およびPD-1-CD4+細胞集団におけるKi67について細胞染色およびフローサイトメトリー分析に付した(細胞染色に使用した全Abは、BDから購入した)。
抗PD-1抗体ベースのIL-21プロドラッグを、第一の重鎖ポリペプチド鎖(配列番号42に示すアミノ酸配列を有する)、第二の重鎖ポリペプチド鎖(配列番号76に示すアミノ酸配列を有する)および2個の同一軽鎖(配列番号44に示すアミノ酸配列を有する)を用いて構築した。。分子を一過性に発現させ、精製した(lot# PW04-38)。
プロドラッグ分子および数個の対照分子のMino細胞への結合をFACSにより試験した。図2の結果は、PD-1抗体およびFc-IL-21融合分子両者がMino細胞に結合できたことを示し、Mino細胞がPD-1およびIL-21に対する受容体両者を発現することを示す。結果は、FcベースのIL-21プロドラッグ分子の両者が細胞に結合しないことを示し、IL-21サイトカイン部分が対応するマスキング部分によりマスクされていることを示す。しかしながら、PD-1抗体ベースのIL-21プロドラッグ分子および融合分子は、Mino細胞に結合できた。
IL-15部分が、(i)scFv 215βでマスクされた、(ii)scFv 215γでマスクされた、(iii)マスクを有しない(215β Ref)または(iv)変異を有するがマスクを有しない(PD1/IL15ムテイン(M2))一連の抗PD-1抗体ベースのIL-15プロドラッグを構築した。これらプロドラッグにおける抗PD-1抗体は、配列番号44のアミノ酸配列を有する2個の同一軽鎖および配列番号47のアミノ酸配列を有する2個の同一重鎖を含む。
IL-15プロドラッグを、ヒトドナーから得たPBMC細胞におけるKi67発現を刺激する能力について、試験した。図5A~5Cは、処理後のPBMCにおけるCD4+ T細胞のKi67活性化の結果を示す。図5Aは、PD-1発現がないCD4+ T細胞のKi67活性化の結果を示す。図5Bは、PD-1発現があるCD4+ T細胞のKi67活性化の結果を示す。図5Cは、PD-1発現がないおよびあるCD4+ T細胞での試験品のEC50値を示す。またPD-1発現がないおよびあるCD4+ T細胞間のEC50値の変化倍率も示す。驚くべきことに、データは、215γがPD-1を発現するCD4+細胞が、PD-1発現がないものより有意に高いKi67活性を有することを示し、プロドラッグ215γが抗原PD-1およびサイトカインIL-15の受容体両者を発現する細胞に作用したとき、プロテアーゼの切断なしで活性化できたことを示す。
抗PD-1抗体ベースのIL-2プロドラッグを同様に構築した。プロドラッグ、PD-1/IL-2v*は、2個の同一軽鎖(配列番号44)および2個の重鎖融合ポリペプチド(それぞれ配列番号24および25)を含んだ。IL-2部分はIL-2ムテインであり、プロドラッグにおけるマスクはIL-2受容体β細胞外ドメインである。IL-2プロドラッグを、ヒトドナーから得たPBMC細胞におけるKi67発現を刺激する能力について、評価した。
さらに、本発明は次の態様を包含する。
1. サイトカイン部分、マスキング部分および担体部分を含むプロドラッグであって、ここで、
a)マスキング部分がサイトカイン部分に結合し、サイトカインの生物学的活性を阻害し;
b)担体部分が抗原結合部分を含み、ここで、抗原結合部分は標的細胞の表面に発現される抗原に結合し;そして
c)マスキング部分が担体部分に開裂不可能ペプチドリンカーを介してまたはペプチドリンカーを伴わず直接的にまたは間接的に連結される、
プロドラッグ。
2. プロドラッグが、細胞表面に抗原およびサイトカイン部分の受容体両者を発現する細胞により活性化される、所望により、ここで、プロドラッグの生物学的活性が、細胞を含まない部位と比較して、細胞を含む疾患部位で少なくとも2倍、5倍または10倍増加される、項1のプロドラッグ。
3. サイトカイン部分の受容体が、2以上のサブユニットを含む、項1または2のプロドラッグ。
4. 抗原が、PD-1、PD-L1、CTLA-4、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CD25、CD16a、CD16b、NKG2D、NKP44、NKP30、CD19、CD20、CD30、CD38、BCMAおよびシグナル制御タンパク質アルファ(SIRPアルファ)から選択される、項1~3の何れかのプロドラッグ。
5. サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチド、IL-7アゴニストポリペプチド、IL-9アゴニストポリペプチド、IL-15アゴニストポリペプチド、IL-21アゴニストポリペプチド、IL-1αアゴニストポリペプチド、IL-1βアゴニストポリペプチド、IL-4アゴニストポリペプチド、IL-5アゴニストポリペプチド、IL-6アゴニストポリペプチド、IL-8アゴニストポリペプチド、IL-10アゴニストポリペプチド、IL-12アゴニストポリペプチド、IL-17アゴニストポリペプチド、IL-18アゴニストポリペプチド、IL-22アゴニストポリペプチド、IL-23アゴニストポリペプチド、IL-31アゴニストポリペプチド、IL-33アゴニストポリペプチド、IL-36アゴニストポリペプチド、インターフェロン-アルファアゴニストポリペプチド、インターフェロンガンマアゴニストポリペプチド、4-1BBリガンド、OX-40リガンドまたはCD-40リガンドを含む、項1~4の何れかのプロドラッグ。
6. マスキング部分がサイトカインの受容体のECDまたはサイトカインに特異的に結合する抗原結合ドメインを含む、項1~5の何れかのプロドラッグ。
7. 項1~6の何れかのプロドラッグであって、
i)サイトカイン部分がIL-7アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-7受容体αの細胞外ドメイン(ECD)(IL-7Rα ECD)またはその機能的アナログを含む、
ii)サイトカイン部分がIL-21アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-21受容体αのECD(IL-21Rα ECD)またはその機能的アナログを含む、
iii)サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチドまたはIL-15アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-2受容体βのECD(IL-2Rβ ECD)またはその機能的アナログを含む、
iv)サイトカイン部分がIL-21アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-21に対する一本鎖Fv(scFv)または単一ドメイン抗体を含む、
v)サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-2に対するscFvまたは単一ドメイン抗体を含む、
vi)サイトカイン部分がIL-15アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-15に対するscFvまたは単一ドメイン抗体を含むまたは
vii)サイトカイン部分がIL-15アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-15受容体αのスシドメイン(IL-15Rαスシドメイン)を含む、
プロドラッグ。
8. サイトカイン部分が配列番号6または62またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-2アゴニストポリペプチドを含む、項5~7の何れかのプロドラッグ。
9. サイトカイン部分が配列番号7またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-15アゴニストポリペプチドを含む、項5~7の何れかのプロドラッグ。
10. サイトカイン部分がIL-2またはIL-15アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-2Rβ ECDまたはその機能的アナログを含む、所望により、ここで、IL-2-Rβ ECDが配列番号11またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、項5~9の何れかのプロドラッグ。
11. サイトカイン部分がIL-2アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-2に対するscFvを含み、所望によりIL-2サイトカイン部分とIL-2Rα、IL-2RβおよびIL-2Rγの1以上の間の相互作用を阻害または妨害し、所望により、ここで、scFvが
抗体4E12B2D10、抗IL-2 scFv1または抗IL-2 scFv2のHCDR1~3およびLCDR1~3または重鎖および軽鎖可変ドメインまたは
配列番号22、配列番号23または配列番号60および61またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列
を含む、項5~9の何れかのプロドラッグ。
12. サイトカイン部分がIL-15アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-15に対するscFvを含み、所望によりIL-15サイトカイン部分とIL-15Rα、IL-2RβおよびIL-2Rγの1以上の間の相互作用を阻害または妨害し、所望により、ここで、scFvが
抗体146B7、抗IL-15 scFv1または抗IL-15 scFv2のHCDR1~3およびLCDR1~3または重鎖および軽鎖可変ドメインまたは
配列番号18、配列番号19または配列番号83および84またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列
を含む、項5~9の何れかのプロドラッグ。
13. サイトカイン部分が配列番号1~5の何れかまたはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-21アゴニストポリペプチドを含む、項5~7の何れかのプロドラッグ。
14. サイトカイン部分がIL-21アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-21Rα ECDまたはその機能的アナログまたはIL-21Rγ ECDまたはその機能的アナログを含み、所望により、ここで、マスキング部分が配列番号12、13または配列番号63~73の何れかまたはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、項5~7または13の何れかのプロドラッグ。
15. サイトカイン部分がIL-21アゴニストポリペプチドを含み、マスキング部分がヒトIL-21に対するscFvを含み、所望によりIL-21サイトカイン部分とIL-21Rαおよび/またはIL-21Rγの間の相互作用を阻害または妨害し、所望により、ここで、scFvが
抗IL-21 scFv1または抗IL-21 scFv2のHCDR1~3およびLCDR1~3または重鎖および軽鎖可変ドメインまたは
配列番号20または21またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列
を含む、項5~7または13の何れかのプロドラッグ。
16. マスキング部分が
IL-2、IL-4、IL-7、IL-9、IL-15およびIL-21から選択されるサイトカインに対するscFvを含み、所望によりサイトカインとIL-2Rγの間の相互作用を阻害または妨害するまたは
IL-2、IL-4、IL-7、IL-9、IL-15およびIL-21から選択されるサイトカインの受容体αまたはγのECDを含む、
項1~15の何れかのプロドラッグ。
17. プロドラッグが、抗PD-1抗体部分、ここで、抗体部分が配列番号44を含む2個の軽鎖およびそれぞれ
配列番号24および25、
配列番号24および26または74,
配列番号35および36、
配列番号37および36、
配列番号37および38または75、
配列番号39および41または74または
配列番号42および43または74
を含む2個の重鎖
を含む、項1~16の何れかのプロドラッグ。
18. プロドラッグが、抗CTLA4抗体部分、ここで、抗体部分が配列番号50を含む2個の軽鎖およびそれぞれ
配列番号51および54、
配列番号51および55、
配列番号51および56、
配列番号52および54、
配列番号53および58、
配列番号53および59または
配列番号52および57
を含む2個の重鎖
を含む、項1~17の何れかのプロドラッグ。
19. 項1~18の何れかのプロドラッグおよび薬学的に許容される添加物を含む、医薬組成物。
20. 項1~18の何れかのプロドラッグをコードする、1以上のポリヌクレオチド。
21. 項20の1以上のポリヌクレオチドを含む、1以上の発現ベクター。
22. 項21のベクターを含む、宿主細胞であって、所望により、哺乳動物細胞である、宿主細胞。
23. 項1~18の何れかのプロドラッグを製造する方法であって、
a)哺乳動物細胞である項22の宿主細胞を、プロドラッグの発現を可能とする条件下で培養し;そして
b)プロドラッグを細胞培養物から単離する
ことを含む、方法。
24. 処置を必要とする患者における癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患を処置するまたは免疫系を刺激する方法であって、患者に治療有効量の項1~18の何れかのプロドラッグまたは項19の医薬組成物を投与することを含む、方法。
25. 処置を必要とする患者における、癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患の処置または免疫系の刺激に使用するための、項1~18の何れかのプロドラッグまたは項19の医薬組成物。
26. 処置を必要とする患者における、癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患の処置または免疫系の刺激のための医薬の製造のための、項1~18の何れかのプロドラッグの使用。
27. 患者が
HIV、HBV、HCVまたはHPV感染、
ループス、I型糖尿病、乾癬、皮膚筋炎、GvHDまたは関節リウマチから選択される自己免疫性疾患または
乳癌、肺癌、膵臓癌、食道癌、髄様甲状腺癌、卵巣癌、子宮癌、前立腺癌、精巣癌、結腸直腸癌または胃癌からなる群から選択される癌
を有する、項24の方法、項25の使用のためのプロドラッグまたは医薬組成物または項26の使用。
Claims (25)
- サイトカイン部分、マスキング部分および担体部分を含むシス作用性タンパク質プロドラッグであって、ここで、
a)マスキング部分がサイトカイン部分に結合し、サイトカインの生物学的活性を阻害し、ここで、マスキング部分がサイトカイン部分に対するscFvを含むかまたはサイトカイン部分に対する受容体の細胞外ドメイン(ECD)を含み;
b)担体部分が抗原結合部分を含み、ここで、抗原結合部分は標的免疫細胞の表面に発現される抗原に結合し;そして
c)マスキング部分が担体部分に直接的にまたは開裂不可能ペプチドリンカーを介して間接的に連結され、
ここで、当該標的免疫細胞が、その表面に、プロドラッグが抗原結合部分を介して抗原に結合したときに、サイトカイン部分が該標的免疫細胞上のその受容体に結合し、該標的免疫細胞に生物学的活性を発揮するように当該サイトカイン部分に対する受容体も発現する、
シス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該プロドラッグが、プロドラッグの生物学的活性が、プロドラッグが標的免疫細胞に結合すると、少なくとも2倍、5倍または10倍増加される、請求項1のシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分の受容体が、2以上のサブユニットを含む、請求項1または2のシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該抗原が、PD-1、PD-L1、CTLA-4、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CD25、CD16a、CD16b、NKG2D、NKP44、NKP30、CD19、CD20、CD30、CD38、BCMAおよびシグナル制御タンパク質アルファ(SIRPアルファ)から選択される、請求項1~3の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分がIL-2ポリペプチド、IL-7ポリペプチド、IL-9ポリペプチド、IL-15ポリペプチド、IL-21ポリペプチド、IL-1αポリペプチド、IL-1βポリペプチド、IL-4ポリペプチド、IL-5ポリペプチド、IL-6ポリペプチド、IL-8ポリペプチド、IL-10ポリペプチド、IL-12ポリペプチド、IL-17ポリペプチド、IL-18ポリペプチド、IL-22ポリペプチド、IL-23ポリペプチド、IL-31ポリペプチド、IL-33ポリペプチド、IL-36ポリペプチド、インターフェロン-アルファポリペプチド、インターフェロンガンマポリペプチド、4-1BBリガンド、OX-40リガンドまたはCD-40リガンドを含む、請求項1~4の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該免疫細胞がT細胞であり、当該抗原がPD-1であり、当該サイトカイン部分がIL-2ポリペプチド、IL-15ポリペプチドまたはIL-21ポリペプチドを含む、請求項1~5の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 請求項1~6の何れかのプロドラッグであって、
i)当該サイトカイン部分がIL-7ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-7受容体αの細胞外ドメイン(ECD)(IL-7Rα ECD)を含む、
ii)当該サイトカイン部分がIL-21ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-21受容体αのECD(IL-21Rα ECD)を含む、
iii)当該サイトカイン部分がIL-2ポリペプチドまたはIL-15ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-2受容体βのECD(IL-2Rβ ECD)を含む、
iv)当該サイトカイン部分がIL-21ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-21に対する一本鎖Fv(scFv)を含む、
v)当該サイトカイン部分がIL-2ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-2に対するscFvを含む、
vi)当該サイトカイン部分がIL-15ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-15に対するscFvを含むまたは
vii)当該サイトカイン部分がIL-15ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-15受容体αのスシドメイン(IL-15Rαスシドメイン)を含む、
シス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該サイトカイン部分が配列番号6または62またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-2ポリペプチドを含む、請求項5~7の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分が配列番号7またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-15ポリペプチドを含む、請求項5~7の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分がIL-2またはIL-15ポリペプチドを含み、当該マスキング部分が配列番号11またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-2Rβ ECDを含む、請求項5~9の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分がIL-2ポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-2に対するscFvを含み、ここで、
当該scFvが配列番号22、配列番号23または配列番号60および61のHCDR1~3およびLCDR1~3または重鎖および軽鎖可変ドメインを含み、
所望により当該scFvが配列番号22、配列番号23または配列番号60および61またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列を含む、
請求項5~9の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該サイトカイン部分がIL-15ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がIL-15に対するscFvを含み、ここで、当該scFvが配列番号18、配列番号19または配列番号83および84のHCDR1~3およびLCDR1~3または重鎖および軽鎖可変ドメインを含み、
所望により当該scFvが配列番号18、配列番号19または配列番号83および84またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列を含む、
請求項5~9の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該サイトカイン部分が配列番号1~5の何れかまたはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むIL-21ポリペプチドを含む、請求項5~7の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分がIL-21ポリペプチドを含み、マスキング部分がIL-21Rα ECDまたはその機能的アナログまたはIL-21Rγ ECDを含み、ここで、当該マスキング部分が配列番号12、配列番号13または配列番号63~73の何れかまたはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含む、請求項5~7または13の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。
- 当該サイトカイン部分がIL-21ポリペプチドを含み、当該マスキング部分がヒトIL-21に対するscFvを含み、ここで、scFvが配列番号20または21のHCDR1~3およびLCDR1~3または重鎖および軽鎖可変ドメインを含み、
所望により当該scFvが配列番号20または21またはそれと少なくとも95%同一のアミノ酸配列を含むアミノ酸配列を含む、
請求項5~7または13の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該マスキング部分が
IL-2、IL-4、IL-7、IL-9、IL-15およびIL-21から選択されるサイトカインに対するscFvを含み、当該サイトカインとIL-2Rγの間の相互作用を阻害または妨害するまたは
当該選択されたサイトカインの受容体αまたはγのECDを含む、
請求項1~15の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該プロドラッグが、抗PD-1抗体部分、ここで、抗体部分が配列番号44を含む2個の軽鎖およびそれぞれ
配列番号24および25、
配列番号24および26または74,
配列番号35および36、
配列番号37および36、
配列番号37および38または75、
配列番号39および41または74または
配列番号42および43または74
を含む2個の重鎖
を含む、請求項1~16の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 当該プロドラッグが、抗CTLA4抗体部分、ここで、抗体部分が配列番号50を含む2個の軽鎖およびそれぞれ
配列番号51および54、
配列番号51および55、
配列番号51および56、
配列番号52および54、
配列番号53および58、
配列番号53および59または
配列番号52および57
を含む2個の重鎖
を含む、請求項1~17の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグ。 - 請求項1~18の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグおよび薬学的に許容される添加物を含む、医薬組成物。
- 請求項1~18の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグをコードする、1以上のポリヌクレオチド。
- 請求項20の1以上のポリヌクレオチドを含む、1以上の発現ベクター。
- 請求項21のベクターを含む、宿主細胞であって、所望により、哺乳動物細胞である、宿主細胞。
- 請求項1~18の何れかのシス作用性タンパク質プロドラッグを製造する方法であって、
a)哺乳動物細胞である請求項22の宿主細胞を、当該シス作用性タンパク質プロドラッグの発現を可能とする条件下で培養し;そして
b)当該シス作用性タンパク質プロドラッグを細胞培養物から単離する
ことを含む、方法。 - 癌、自己免疫性疾患もしくは感染性疾患を処置するまたは免疫系を刺激するための、請求項19の医薬組成物。
- 患者が
HIV、HBV、HCVまたはHPV感染、
ループス、I型糖尿病、乾癬、皮膚筋炎、GvHDまたは関節リウマチから選択される自己免疫性疾患または
乳癌、肺癌、膵臓癌、食道癌、髄様甲状腺癌、卵巣癌、子宮癌、前立腺癌、精巣癌、結腸直腸癌または胃癌からなる群から選択される癌
を有する、請求項24の医薬組成物。
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