JP6005666B2 - プログラミングによる造血前駆細胞の生産 - Google Patents
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Description
本出願は、2011年2月8日に出願された米国出願番号第61/440,619号への優先権を主張し、上記米国出願番号第61/440,619号の全容は、参考として本明細書に援用される。
発明の分野
本発明は、一般に、分子生物学、幹細胞および分化細胞の分野に関する。より詳細には、本発明は、体細胞および未分化細胞の特異的細胞系列、特に、造血細胞および造血細胞前駆体へのプログラミングに関する。
造血細胞または血液細胞は、臨床適用および研究室用途に大きな需要がある。診療所では、抗がん療法などの造血を抑制する療法を受けた患者または遺伝性血液疾患を有する患者における造血を再構成するために造血幹細胞(HSC)が使用され得る。加えて、輸血の際に、および一定の血液障害の処置の際に、赤血球、血小板および好中性顆粒球が使用され得る。研究室では、薬物スクリーニングをはじめとする多くの適用に血液細胞が使用され得る。
本発明の好ましい実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
多能性幹細胞のフォワードプログラミングまたは体細胞の分化転換により造血前駆細胞を提供するインビトロの方法であって、
造血前駆細胞への該多能性幹細胞のフォワードプログラミングまたは該体細胞の分化転換を引き起こす能力がある1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子の発現レベルを増加させる条件下で、該多能性幹細胞または該体細胞を培養して、造血前駆細胞に該多能性幹細胞をフォワードプログラミングするかまたは該体細胞を分化転換させることによって、造血前駆細胞を提供する工程
を含む、方法。
(項目2)
前記造血前駆細胞が、多能性幹細胞のフォワードプログラミングによって提供される、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記多能性幹細胞が、誘導多能性幹細胞である、項目2に記載の方法。
(項目4)
前記造血前駆細胞が、体細胞の分化転換によって提供される、項目1に記載の方法。
(項目5)
前記体細胞が、不死化体細胞である、項目4に記載の方法。
(項目6)
前記多能性幹細胞または前記体細胞が、少なくとも1つの外因性発現カセットを含み、該発現カセットが、1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子を含む、項目1に記載の方法。
(項目7)
前記多能性幹細胞または前記体細胞と、造血前駆細胞への該多能性細胞のフォワードプログラミングまたは該体細胞の分化転換を引き起こすのに十分な量の前記1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子の遺伝子産物を含む1つ以上の造血前駆体プログラミング因子とを接触させる工程をさらに含む、項目1に記載の方法。
(項目8)
1つ以上の前記遺伝子産物が、1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子のポリペプチド産物、または1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子のRNA転写産物である、項目7に記載の方法。
(項目9)
少なくとも1つの造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、内皮分化因子遺伝子を含む、項目1に記載の方法。
(項目10)
少なくとも1つの前記内皮分化因子が、ERG(v−ets赤芽球症ウイルスE26がん遺伝子ホモログ(鳥類))、FLI−1(フレンド白血病ウイルス組込み1)またはETV2(ets改変体2)を含む、項目9に記載の方法。
(項目11)
少なくとも1つの内皮分化因子がERGである、項目10に記載の方法。
(項目12)
前記ERGが、ERG−2またはERG−3である、項目11に記載の方法。
(項目13)
少なくとも1つの造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、GFI1(成長因子非依存性1転写リプレッサ)、GFI1B(成長因子非依存性1B転写リプレッサ)、TAL1(T細胞急性リンパ球性白血病)、LYL1(リンパ芽球性白血病由来配列1)、LMO2(LIMドメインオンリー2(ロンボチン様1))、GATA2(GATA結合タンパク質2)、GATA3(GATA結合タンパク質3)、またはSPI1(脾フォーカス形成ウイルス(SFFP)プロウイルス組込みがん遺伝子spi1)を含む、項目1に記載の方法。
(項目14)
前記多能性幹細胞または前記体細胞が、造血前駆細胞への該多能性幹細胞のフォワードプログラミングまたは該体細胞の分化転換を引き起こす能力がある2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子の発現レベルを増加させる条件下で培養されて、該多能性幹細胞が造血前駆細胞にフォワードプログラミングされるか、または該体細胞が造血前駆細胞に分化転換される、項目1に記載の方法。
(項目15)
少なくとも2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、ERG、GFI1、GATA2、SPI1、TAL1またはLMO2を含む、項目14に記載の方法。
(項目16)
少なくとも1つの造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、内皮分化因子遺伝子を含む、項目14に記載の方法。
(項目17)
前記少なくとも2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、ERGおよびGFI1を含む、項目16に記載の方法。
(項目18)
前記少なくとも2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、ERGおよびGATA2を含む、項目16に記載の方法。
(項目19)
前記少なくとも2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、ERG、GATA2およびSPI1を含む、項目16に記載の方法。
(項目20)
前記造血前駆細胞が、
(i)1つ以上の造血前駆体マーカーの発現;
(ii)1つ以上の多能性幹細胞マーカーまたは体細胞マーカーの発現の欠如;
(iii)1つ以上の造血前駆体機能的特徴;
(iv)1つ以上の造血前駆体形態学的特徴
からなる群より選択される造血前駆細胞の1つ以上の特性を含む、項目1に記載の方法。
(項目21)
前記1つ以上の造血前駆体マーカーが、CD43、CD33、CD34、CD45、CD235aおよびCD41aからなる群より選択される、項目20に記載の方法。
(項目22)
前記1つ以上の造血前駆体マーカーが、CD43、CD45およびCD34からなる群より選択される、項目21に記載の方法。
(項目23)
前記1つ以上の多能性幹細胞マーカーまたは体細胞マーカーが、TRA−1−60、TRA−1−81、CD166およびCD140bからなる群より選択される、項目20に記載の方法。
(項目24)
前記1つ以上の造血前駆体機能的特徴が、形質細胞、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、肥満細胞、巨核球、赤血球、顆粒球、リンパ球、単球、白血球および血小板からなる群より選択される2つ以上の細胞タイプに分化する能力を包含する、項目20に記載の方法。
(項目25)
前記1つ以上の造血前駆体機能的特徴が、骨髄系列、リンパ球系列、または赤血球−巨核球系列の細胞に分化する能力を包含する、項目24に記載の方法。
(項目26)
前記1つ以上の造血前駆体機能的特徴が、リンパ球系列、骨髄系列および赤血球−巨核球系列の細胞に分化する能力を包含する、項目25に記載の方法。
(項目27)
造血前駆細胞について選択または富化する工程をさらに含み、選択または富化された造血前駆細胞が、造血前駆細胞の前記特性の1つ以上を含む、項目20に記載の方法。
(項目28)
前記多能性幹細胞または前記体細胞が、1つ以上の成長因子を含む培地で培養される、項目1に記載の方法。
(項目29)
前記1つ以上の成長因子が、線維芽細胞成長因子(FGF)、血管内皮成長因子(VEGF)、幹細胞因子(SCF)、トロンボポエチン(TPO)、FLT−3−リガンド(FLT3L)、インターロイキン−3(IL−3)、インターロイキン−6(IL−6)、顆粒球コロニー刺激因子(G−CSF)およびインターロイキン−9(IL−9)からなる群より選択される、項目28に記載の方法。
(項目30)
前記多能性幹細胞、前記体細胞、または該多能性幹細胞もしくは該体細胞の子孫が、SCF、TPO、FLT3L、IL−3およびIL−6を含む培地で培養される、項目29に記載の方法。
(項目31)
前記提供される造血前駆細胞が、10日以下の発現増加後に得られる、項目1に記載の方法。
(項目32)
前記提供される造血前駆細胞が、4日以下または6日以下の発現増加後に得られる、項目1に記載の方法。
(項目33)
項目1〜32のいずれかに記載のプロセスによって提供される造血前駆細胞。
(項目34)
疾患、障害もしくは傷害を有する被験体または疾患、障害もしくは傷害を発症するリスクがある被験体の処置に使用するための、項目1〜32のいずれかに記載のプロセスによって提供される造血前駆細胞。
(項目35)
前記被験体が、血液障害を有するかまたは血液障害を発症するリスクがあるとさらに定義されている、項目34に記載の造血前駆細胞。
(項目36)
前記被験体が、新生物疾患を有するとさらに定義されている、項目34に記載の造血前駆細胞。
(項目37)
前記被験体が、造血を抑制する療法を受けたかまたは造血を抑制する療法を受ける可能性が高いとさらに定義されている、項目36に記載の造血前駆細胞。
(項目38)
前記被験体が、化学療法を受けたかまたは化学療法を受ける可能性が高いとさらに定義されている、項目36に記載の造血前駆細胞。
(項目39)
前記被験体が、造血細胞または血液細胞を必要とする被験体であるとさらに定義されている、項目34に記載の造血前駆細胞。
(項目40)
前記被験体が、輸血を必要とする被験体であるとさらに定義されている、項目39に記載の造血前駆細胞。
(項目41)
前記被験体が、貧血もしくは溶血性貧血を有するかまたは貧血もしくは溶血性貧血を発症するリスクがあるとさらに定義されている、項目39に記載の造血前駆細胞。
(項目42)
疾患、障害もしくは傷害を有する被験体または疾患、障害もしくは傷害を発症するリスクがある被験体を処置するための医薬品の調製における、項目1〜32のいずれかに記載のプロセスによって提供される造血前駆細胞の使用。
(項目43)
前記障害が血液障害である、項目42に記載の使用。
(項目44)
前記疾患が、新生物疾患である、項目42に記載の使用。
(項目45)
造血前駆細胞を含む細胞集団であって、該造血前駆細胞の少なくとも80%が、1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子を含む外因性発現カセットを含む、細胞集団。
(項目46)
血液障害を有する被験体または血液障害を発症するリスクがある被験体を処置するための方法であって、治療有効量の項目1〜32のいずれかに記載の方法によって得られる造血前駆細胞を該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目47)
新生物疾患を有する被験体を処置するための方法であって、治療有効量の項目1〜32のいずれかに記載の方法によって得られる造血前駆細胞を該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目48)
前記被験体が、造血を抑制する療法を受けたかまたは造血を抑制する療法を受ける可能性が高いとさらに定義されている、項目47に記載の方法。
(項目49)
前記被験体が、化学療法を受けたかまたは化学療法を受ける可能性が高いとさらに定義されている、項目47に記載の方法。
(項目50)
造血細胞または血液細胞を必要とする被験体を処置するための方法であって、治療有効量の項目1〜32のいずれかに記載の方法によって得られる造血前駆細胞を該被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目51)
前記被験体が、輸血を必要とする被験体であるとさらに定義されている、項目50に記載の方法。
(項目52)
前記被験体が、貧血もしくは溶血性貧血を有するかまたは貧血もしくは溶血性貧血を発症するリスクがあるとさらに定義されている、項目50に記載の方法。
「プログラミング」は、細胞が生産することのできる子孫のタイプを変更するプロセスである。例えば、細胞が、プログラミングなしで同じ条件下で形成することができるものと比較して、培養またはインビボいずれかで少なくとも1つの新たな細胞タイプの子孫を形成することができるように変更されているとき、その細胞はプログラミングされている。これは、十分な増殖後、その新たな細胞タイプの表現型の特性を有する子孫の測定可能な割合が、観察されること(かかる子孫がプログラミング前には本質的に形成できなかったとしても)、あるいはその新たな細胞タイプの特性を有する割合が、プログラミング前より測定可能に多いことを意味する。このプロセスは、分化、脱分化および分化転換を包含する。「分化」は、あまり特異化されていない細胞が、より特異化された細胞タイプになるプロセスである。「脱分化」は、部分または最終分化細胞が、より初期の発達段階、例えば多能性または多分化能性、に逆転する細胞プロセスである。「分化転換」は、ある分化細胞タイプを別の分化細胞タイプに転換させるプロセスである。典型的に、プログラミングによる分化転換は、細胞が中間の多能性段階を経ることなく発生する(すなわち、細胞がある分化細胞タイプから別の分化細胞タイプに直接プログラミングされる)。一定の条件下では、新たな細胞タイプの特性を有する子孫の割合は、好ましい順に、少なくとも約1%、5%、25%以上であり得る。
本発明の一定の実施形態では、造血細胞でない多能性細胞のフォワードプログラミングにより、または造血細胞でない体細胞の分化転換により、造血細胞または造血細胞前駆体を提供するための方法および組成物を開示する。1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子を備えている外因性発現カセットおよび/または造血細胞もしくは造血前駆細胞同定に特異的なレポーター発現カセットを含む細胞も提供する。一部の実施形態において、前記細胞は、胚性幹細胞、胎児幹細胞または成体幹細胞をはじめとする(しかしこれらに限定されない)幹細胞であり得る。さらなる実施形態において、前記細胞は、いずれの体細胞であってもよい。
幹細胞は、すべてではないにせよ殆どの多細胞生物において見つけられる細胞である。それらは、有糸細胞分裂によりそれら自体を再生する能力、および多種多様な特異化された細胞タイプに分化する能力を特徴とする。哺乳動物幹細胞の2つの大まかなタイプは、胚盤胞において見つけられる胚性幹細胞、および成体組織において見つけられる成体幹細胞である。発達中の胚において、幹細胞は、特異化された胚組織のすべてに分化することができる。成体生物において、幹細胞および始原細胞は、特異化された細胞を補充する身体の修復系として作用し、また、再生器官、例えば血液、皮膚または腸組織、の正常なターンオーバーを維持する。
胚性幹細胞系統(ES細胞系統)は、胚盤胞または初期桑実期胚の内部細胞塊(ICM)の胚盤葉上層組織に由来する細胞の培養物である。胚盤胞は、ヒトではおおよそ4から5日齢の胚であって、50〜150細胞からなる早期胚である。ES細胞は多能性であり、発達中に3つの主要胚葉(外肺葉、内胚葉および中胚葉)のすべての誘導体を生じさせる。言い換えると、ES細胞は、特異的細胞タイプに十分かつ必要な刺激を与えると、成体の200タイプより多い細胞タイプの各々に発達することができる。ES細胞は、胚体外膜または胎盤に寄与しない。
誘導多能性幹(iPS)細胞は、ES細胞の特性を有する細胞であるが、分化体細胞の再プログラミングによって得られる細胞である。誘導多能性幹細胞は、様々な方法によって得られている。1つの方法では、レトロウイルス形質導入を用いて、成体ヒト皮膚線維芽細胞を転写因子Oct4、Sox2、c−MycおよびKlf4でトランスフェクトする(Takahashiら、2007)。トランスフェクトされた細胞を、塩基性線維芽細胞成長因子(bFGF)を補充した培地中のSNLフィーダー細胞(LIFを生産するマウス細胞線維芽細胞細胞系統)上にプレーティングする。おおよそ25日後、ヒトES細胞コロニーに類似しているコロニーが培養中に出現する。それらのES細胞様コロニーを、bFGFの存在下、フィーダー細胞上で選び、広げる。
紡錘体のない卵母細胞にドナー核を移植する体細胞核移植によって多能性幹細胞を調製することができる。核移植によって生産される幹細胞は、ドナー核と遺伝子的に同一である。1つの方法では、アカゲザル(rhesus macaque)の皮膚線維芽細胞からのドナー線維芽細胞核を、紡錘体のない成熟第二分裂中期アカゲザル(rhesus macaque)卵母細胞の細胞質に、電気融合によって導入する(Byrneら、2007)。融合した卵母細胞をイオノマイシンへの曝露によって活性化し、その後、胚盤胞期までインキュベートする。その後、選択された胚盤胞の内部細胞塊を培養して胚性幹細胞系統を生産する。それらの胚性幹細胞系統は、インビトロでも、インビボでも、正常なES細胞形態を示し、様々なES細胞マーカーを発現し、および多数の細胞タイプに分化する。本明細書において用いる場合、用語「ES細胞」は、受精核を含有する胚に由来する胚性幹細胞を指す。ES細胞は、「体細胞核移植によって誘導された胚性幹細胞」と言われる、核移植によって生産される胚性幹細胞とは区別される。
胎児幹細胞は、自己再生能力および多能性分化能を有する細胞である。胎児細胞栄養芽層細胞(欧州特許第0412700号明細書)ならびに絨毛膜絨毛、羊水および胎盤(国際公開第2003/042405号)からそれらを単離および増殖させることができる。これらの参考文献は、全文そのまま参照により本明細書に援用されている。胎児幹細胞の細胞表面マーカーとしては、CD117/c−kit+、SSEA3+、SSEA4+およびSSEA1−が挙げられる。
本発明の一定の態様では、分化転換、すなわち、ある体細胞タイプから別の体細胞タイプへの直接変換、例えば、非造血体細胞からの造血前駆細胞または造血細胞の誘導、の方法も提供することができる。しかし、ヒト体細胞、特に生存ドナーからのものは、供給量が制限され得る。一定の態様では、プログラミングのための出発細胞の無限供給量を提供するために、不死化遺伝子またはタンパク質、例えばhTERTまたはがん遺伝子、の導入により体細胞を不死化することができる。細胞の不死化は、可逆的であることがあり(例えば、除去可能な発現カセットを使用)、または誘導性であることがある(例えば、誘導性プロモーターを使用)。
本発明の一定の態様は、造血プログラミング(hematopoietic programming)のための造血前駆細胞プログラミング因子を提供する。細胞中の造血前駆体プログラミング因子のレベルを増加させることにより、他の細胞供給源から造血細胞または造血前駆細胞を直接生産することができる。限られた数の造血細胞富化転写因子の協奏作用によって造血前駆細胞の非常に多数の機能を転写レベルで制御することができる。造血細胞富化転写因子または造血前駆細胞富化転写因子、特に、本セクションに列挙するそれらの遺伝子のような、造血細胞または造血前駆体分化または機能に重要な任意の転写因子をここで使用することができる。本発明者らはまた、本セクションに列挙する遺伝子のすべてのアイソフォームおよび改変体が本発明に含まれると考えており、一定のアイソフォームまたは改変体のアクセッション番号の非限定的な例を提供する。
一定の実施形態では、造血前駆体または造血細胞プログラミングまたは分化因子をコードする核酸の送達のためのベクターを構築して、細胞においてこれらの因子を発現させることができる。かかるベクターの成分および送達方法の詳細を下に開示する。加えて、タンパク質形質導入組成物または方法を用いて、プログラミング因子の発現を果たすことができる。
当業者には標準的な組換え技術(例えば、Sambrookら、2001およびAusubelら、1996参照;両方が参照により本明細書に援用されている)によりベクターを構築する能力が十分あるだろう。ベクターとしては、プラスミド、コスミド、ウイルス(バクテリオファージ、動物ウイルスおよび植物ウイルス)、および人工染色体(例えば、YAC)、例えばレトロウイルスベクター(例えば、モロニーマウス白血病ウイルスベクター(MoMLV)、MSCV、SFFV、MPSV、SNVなどに由来するもの)、レンチウイルスベクター(例えば、 HIV−1、HIV−2、SIV、BIV、FIVなどに由来するもの)、アデノウイルス(Ad)ベクター(それらの複製能を持つ形、複製欠陥形およびガットレス(gutless)形を包含する)、アデノ関連ウイルス(AAV)ベクター、シミアンウイルス40(SV−40)ベクター、ウシ乳頭腫ウイルスベクター、エプスタイン・バーウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、ハーベーマウス肉腫ウイルスベクター、 マウス乳がんウイルスベクター、ラウス肉腫ウイルスベクターが挙げられるが、これらに限定されない。
組換えウイルスベクターを産生する場合、概して非必須遺伝子を異種(または非天然)タンパク質についての遺伝子またはコード配列で置換する。ウイルスベクターは、核酸および場合によりタンパク質を細胞に導入するためにウイルス配列を利用する一種の発現構築物である。一定のウイルスは、受容体媒介エンドサイトーシスにより細胞に感染するかまたは細胞に進入することができるため、ならびに宿主細胞ゲノムに組み込まれてウイルス遺伝子を安定的かつ効率的に発現することができるため、異種核酸の細胞(例えば、哺乳動物細胞)への移入のための魅力的な候補とされてきた。本発明の一定の態様の核酸を送達するために使用することができるウイルスベクターの非限定的な例を下に記載する。
プラスミドベースのまたはリポソームベースの染色体外(すなわちエピソーム)ベクターの使用も本発明の一定の態様において提供することができる。かかるエピソームベクターとしては、例えば、oriPベースのベクター、および/またはEBNA−1の誘導体をコードするベクターを挙げることができる。これらのベクターは、DNAの大きな断片を細胞に導入し、染色体外に維持すること、細胞周期毎に1回複製すること、娘細胞に効率的に分配されること、および実質的に免疫応答を惹起しないことを可能にすることができる。
特定の実施形態によると、核酸の導入には、トランスポゾン−トランスポザーゼ系を使用することができる。使用するトランスポゾン−トランスポザーゼ系は、周知のSleeping Beauty、Frog Princeトランスポゾン−トランスポザーゼ系(後者の説明については、例えば欧州特許第1507865号明細書を参照)、またはTTAA特異的トランスポゾンpiggyBac系であり得た。
当業者には本発明において有用な任意のmRNAを細胞に送達する能力が十分あるだろう。例えば、かかる技術は、Yamamotoら、2009に提供されている。
本発明の一定の態様では、ゲノム操作ための特異的手法で、例えば相同組換えにより、核酸分子を細胞に導入することができる。上で論じたように、細胞において遺伝子を発現させる一部のアプローチは、ゲノムにランダムに組み込まれるウイルスベクターまたは導入遺伝子の使用を伴う。しかし、これらのアプローチは、組み込まれた核酸からの発現を有効に媒介できない部位または本来の遺伝子の破壊を生じさせる結果となる部位のいずれかで発生する組込みの欠点を有する。ターゲットゲノム内の特異的遺伝子座、例えばRosa26遺伝子座、への相同組換えによって、ランダム組込みに関連した問題をある程度克服することができた。
本発明において有用なベクターに含まれている真核性発現カセットは、好ましくは、(5’から3’方向に)、タンパク質コード配列に作動可能に連結されている真核性転写プロモーター、介在配列を含むスプライスシグナル、そして転写終結/ポリアデニル化配列を含む。
「プロモーター」は、転写の開始および割合を制御する核酸配列の1領域である、制御配列である。これは、調節タンパク質および分子、例えばRNAポリメラーゼおよび他の転写因子、が結合して核酸配列の特異的転写を開始させることができる遺伝要素を含有し得る。句「作動可能に配置された」、「作動可能に連結された」、「制御下」および「転写制御下」は、プロモーターが、その配列の転写開始および/または発現を制御するために核酸配列に関して正しい機能性位置および/または配向にあることを意味する。
特異的開始シグナルをコード配列の効率的翻訳に用いることもできる。これらのシグナルは、ATG開始コドンまたは隣接配列を備えている。ATG開始コドンを備えている外因性翻訳制御シグナルを提供する必要がある場合もある。当業者には容易にこれを決定する能力および必要なシグナルを提供する能力があるだろう。開始コドンは、全挿入物の翻訳を確実にするために所望のコード配列のリーディングフレームと「インフレーム」でなければならないことは周知である。前記外因性翻訳制御シグナルおよび開始コドンは、天然である場合もあり、または合成である場合もある。適切な転写エンハンサー要素を含めることにより、発現効率を向上させることができる。
宿主細胞においてベクターを増殖させるために、ベクターは、複製を開始させる特異的核酸配列である1つ以上の複製起点部位(多くの場合、「ori」と呼ばれる)、例えば、上記のEBVのoriPに対応する核酸配列、またはプログラミングの際に類似のまたは高い機能を有する遺伝子操作oriPを含有し得る。あるいは、上記の他の染色体外複製ウイルスの複製起点、または自律複製配列(ARS)を利用することができる。
本発明の一定の実施形態では、発現ベクターにマーカーを含めることにより、本発明の核酸構築物を含有する細胞をインビトロまたはインビボで同定することができる。かかるマーカーは、前記発現ベクターを含有する細胞の容易な同定を可能にする同定可能な変化を細胞に付与するだろう。一般に、選択マーカーは、選択を可能にする特質を付与するものである。陽性選択マーカーは、マーカーの存在がその選択を可能にするものであり、一方、陰性選択マーカーは、その存在がその選択を妨げるものである。陽性選択マーカーの一例は、薬物耐性マーカーである。
本発明を用いてプログラミングされる細胞への核酸、例えばDNAまたはRNA、の導入には、本明細書に記載するようなまたは当業者に公知であるような細胞の形質転換のための任意の適する核酸送達方法を用いることができる。かかる方法としては、DNAの直接送達、例えば、エクスビボトランスフェクション(Wilsonら、1989、Nabelら、1989)によるもの;マイクロインジェクション(HarlandおよびWeintraub、1985;米国特許第5,789,215号明細書(参照により本明細書に援用されている))をはじめとする注入(米国特許第5,994,624号、同第5,981,274号、同第5,945,100号、同第5,780,448号、同第5,736,524号、同第5,702,932号、同第5,656,610号、同第5,589,466号および同第5,580,859号明細書(各々が参照により本明細書に援用されている))によるもの;エレクトロポレーション(米国特許第5,384,253号明細書(参照により本明細書に援用されている);Tur−Kaspaら、1986;Potterら、1984)によるもの;リン酸カルシウム沈殿(GrahamおよびVan Der Eb、1973;ChenおよびOkayama、1987;Rippeら、1990)によるもの;DEAE−デキストラン、続いてのポリエチレングリコールの使用(Gopal、1985)によるもの;直接音波負荷(Fechheimerら、1987)によるもの;リポソーム媒介トランスフェクション(NicolauおよびSene、1982;Fraleyら、1979;Nicolauら、1987;Wongら、1980;Kanedaら、1989;Katoら、1991)および受容体媒介トランスフェクション(WuおよびWu、1987;WuおよびWu、1988)によるもの;マイクロプロジェクタイルボンバードメント(PCT出願国際公開第94/09699号および同第95/06128号;米国特許第5,610,042号、同第5,322,783号、同第5,563,055号、同第5,550,318号、同第5,538,877号および同第5,538,880号明細書、各々が参照により本明細書に援用されている)によるもの;炭化ケイ素繊維との撹拌(Kaepplerら、1990;米国特許第5,302,523号および同第5,464,765号明細書(各々が参照により本明細書に援用されている))によるもの;Agrobacterium媒介トランスフェクション(米国特許第5,591,616号および同第5,563,055号明細書(各々が参照により本明細書に援用されている))によるもの;乾燥/阻害媒介DNA取り込(Potrykusら、1985)によるもの、ならびにかかる方法の任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。これらのものなどの技術の適用により、小器官(単数もしくは複数)、細胞(単数もしくは複数)、組織(単数もしくは複数)または生物(単数もしくは複数)を安定的にまたは一過的に形質転換させることができる。
本発明の一定の実施形態では、核酸を例えばリポソームなどの脂質複合体に捕捉することができる。リポソームは、リン脂質二重層膜および内部水性媒体を特徴とする小胞構造である。多層リポソームは、水性媒体によって隔てられた多数の脂質層を有する。それらは、リン脂質を過剰の水性溶液に懸濁させると自然に形成する。脂質成分が自己再配置され、その後、閉構造が形成され、水および溶解された溶質が脂質二重層間に捕捉される(GhoshおよびBachhawat、1991)。Lipofectamine(Gibco BRL)またはSuperfect(Qiagen)と複合体化した核酸も考えられる。使用するリポソームの量は、リポソームの性質はもちろん、使用する細胞に基づいて変わることがあり、例えば、100万から1000万個の細胞につき約5から約20μgのベクターDNAを考えることができる。
本発明の一定の実施形態では、核酸をエレクトロポレーションにより小器官、細胞、組織または生物に導入する。エレクトロポレーションは、高電圧放電への細胞およびDNAの懸濁物の曝露を伴う。レシピエント細胞を、機械的に損傷させることにより形質転換を受け易くさせることができる。また、使用するベクターの量は、使用する細胞の性質に基づいて変わることがあり、例えば、100万から1000万個の細胞につき約5から約20μgのベクターDNAを考えることができる。
本発明の他の実施形態では、リン酸カルシウム沈殿を用いて核酸を細胞に導入する。この技術を用いて、ヒトKB細胞がアデノウイルス5DNAでトランスフェクトされている(GrahamおよびVan Der Eb、1973)。また、この手法で、マウスL(A9)、マウスC127、CHO、CV−1、BHK、NIH3T3およびHeLa細胞がネオマイシンマーカー遺伝子でトランスフェクトされ(ChenおよびOkayama、1987)、ラット肝細胞が様々なマーカー遺伝子でトランスフェクトされた(Rippeら、1990)。
別の実施形態では、DEAE−デキストラン、続いてポリエチレングリコールを使用して、核酸を細胞に送達する。この手法で、レポータープラスミドがマウス骨髄腫および赤白血病細胞に導入された(Gopal、1985)。
本発明のさらなる実施形態には、直接音波負荷による核酸の導入が含まれる。LTK−線維芽細胞が音波負荷によりチミジンキナーゼ遺伝子でトランスフェクトされた(Fechheimerら、1987)。
マイクロプロジェクタイルボンバードメント技術を用いて核酸を少なくとも1つの小器官、細胞、組織または生物に導入することができる(米国特許第5,550,318号、同第5,538,880号および同第5,610,042号明細書、ならびにPCT出願国際公開第94/09699号;これらの各々が参照により本明細書に援用されている)。この方法は、DNAコートマイクロプロジェクタイルを高速に加速して、細胞を死滅させずに細胞膜を貫通させ、細胞に進入させることができることに依存する(Kleinら、1987)。当該技術分野において公知の多種多様なマイクロプロジェクタイルボンバードメント技術があり、それらの多くが本発明に適用可能である。
DNAではなくmRNAのトランスフェクションによって遺伝子送達を達成することもできる。原則的に、DNAトランスフェクションとは異なり、mRNAの導入は、少なくとも稀な逆転写事象が存在しなければ、細胞の遺伝子構造に永続効果をもたらすことができない。mRNAのトランスフェクション方法は、当該技術分野において公知である(例えば、Seaboe−Larssenら、2002;Boczkowskiら、2001;Elangoら、2005;米国特許出願公開第2008/0260706号および同第2004/0235175号明細書参照)。
本発明の一定の態様では、造血細胞または造血前駆細胞にプログラミングすべき細胞と、フォワードプログラミングまたは分化転換のために十分な量の造血細胞転写因子遺伝子のポリペプチドを含む造血前駆体プログラミング因子とを接触させることができる。タンパク質形質導入は、細胞への高分子の送達を増進するための方法として用いられている。タンパク質形質導入ドメインを使用して、造血前駆体プログラミングポリペプチドまたはそれらの機能性断片を細胞に直接導入することができる。多くのグループによる研究により、HIV Tatタンパク質に由来するTATタンパク質領域をターゲットタンパク質に融合させて、細胞へのターゲットタンパク質の進入を可能にすることができることが証明されている。このドメインの特定の例示的タンパク質配列は、RKKRRQRRR(配列番号19)であり、この配列中のRはアルギニンをコードし、Kはリシンをコードし、およびQはグルタミンをコードする。この配列は、N末端融合体またはC末端融合体両方としてのタンパク質融合体の進入を可能にすることが証明されている。TAT媒介進入のメカニズムは、マクロピノサイトーシスによるものと考えられる(GumpおよびDowdy)。
一般に、細胞成長を持続させることができる高栄養緩衝溶液である培養培地で本発明の細胞を培養する。
多数の表現型基準に従って細胞を特性づけすることができる。前記基準としては、発現される細胞マーカー、機能活性の検出または定量、ならびに形態学的特徴および細胞内シグナリングの特性づけが挙げられるが、これらに限定されない。他の態様において、プログラミングされる細胞は、造血細胞同定のための造血細胞特異的プロモーターのような組織特異的または細胞特異的転写調節要素を含む、レポーター遺伝子発現カセットを含むことがある。
本発明の一定の態様の方法および組成物によって提供される造血細胞および造血前駆細胞を様々な適用に使用することができる。これらとしては、少数を例に挙げると、造血細胞および造血前駆体のインビボでの移植または埋め込み;細胞傷害性化合物、発がん性物質、変異誘導物質、成長/調節因子、医薬化合物などのインビトロでのスクリーニング;血液疾患および傷害のメカニズムの解明;薬物および/または成長因子が作用するメカニズムの研究;患者におけるがんの診断およびモニタリング;遺伝子療法;ならびに生物活性製品の生産が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明のプログラミングに由来する造血および造血前駆細胞を使用して、本明細書に提供する造血細胞の特性に影響を及ぼす因子(例えば、溶媒、小分子薬、ペプチドおよびポリヌクレオチド)または環境条件(例えば、培養条件もしくは操作)をスクリーニングすることができる。
本発明は、本明細書に提供する造血細胞および造血前駆細胞の使用であって、おそらく血液疾患もしくは障害または傷害のため、かかる療法を必要とする被験体にある程度の機能を回復させるための、使用も提供する。例えば、本明細書に開示する方法によって誘導される造血細胞および造血前駆細胞を使用して、血液疾患および障害、例えば、異常ヘモグロビン症、貧血など、を処置することができる。加えて、造血細胞およびそれらの前駆体は、それを必要とする被験体(例えば、輸血を必要とする被験体、または血液障害を有する被験体など)への血液または血液細胞(例えば、赤血球、血小板および好中性顆粒球など)の供給に有用であり得る。かかる細胞は、化学療法などの細胞抑制療法によって引き起こされる造血細胞欠乏の処置に有用であり得る。
製造、配布および使用のために、典型的には、本発明の造血系列細胞を等張性賦形剤または培地中の細胞培養物または懸濁物の形で、場合によっては輸送または保管を助長するために凍結させて供給する。
造血前駆細胞などの特異的細胞タイプについてのプログラミング因子として作用する特定の候補遺伝子または候補遺伝子の組み合わせの能力を、本開示に提供する方法および細胞を使用して試験することができる。特定の候補遺伝子または候補遺伝子の組み合わせのプログラミングにおける効力を、細胞形態、マーカー発現、酵素的活性、増殖能力、または関心対象の他の能力に対するそれらの効果によって評価することができ、その後、それらの候補遺伝子または組み合わせが含まれていない並行培養物との比較でその効力を決定する。候補遺伝子は、所望の細胞タイプへの分化にとって重要な転写因子であることもあり、または所望の細胞タイプの機能にとって重要な転写因子であることもある。
本発明の好ましい実施形態を実証するために以下の実施例を含める。後続の本実施例に開示する技術は、本発明の実施の際に十分に機能する本発明者らが発見した技術の代表であり、したがって、該技術をその実施についての好ましい方式を構成するものとみなすことができることは、当業者には理解されるはずである。しかし、本開示にかんがみて、開示するそれらの具体的な実施形態に、本発明の精神および範囲を逸脱することなく、多くの変更を加えることができ、それでもなお同様のまたは類似した結果を得ることができることは、当業者には理解されるはずである。
造血前駆細胞へのフォワードプログラミング
ヒトESC/iPSCからの造血前駆細胞分化の代替アプローチを図1に示す。適切な導入遺伝子または導入遺伝子の組み合わせの発現により(上のボックス)、通常の分化の間に必要とされるすべてではないにせよ殆どの発達段階(下のボックス)をバイパスして、ヒトESC/iPSCから造血前駆細胞を効率的に誘導することができる。
造血前駆細胞への分化転換
フォワードプログラミングに類似して、造血前駆体をヒト体細胞、例えば皮膚線維芽細胞、脂肪組織由来細胞およびヒト臍帯静脈内皮細胞(HUVEC)、からの分化転換によって得ることもできる(図8)。線維芽細胞を造血前駆細胞に変換することができる遺伝子を同定するために、(TET−ON系と呼ばれる)レンチウイルス導入遺伝子送達系を候補遺伝子の誘導性発現に使用することとなる。簡単に言うと、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーターを使用してrtTETタンパク質の発現を駆動し、候補遺伝子を(Ptightと呼ばれる)rtTET応答性誘導性プロモーターの制御下に置くこととなる。rtTETおよび導入遺伝子発現性レンチウイルスの両方を使用して線維芽細胞を共形質導入することとなる。共形質導入された線維芽細胞にドキシサイクリン(0.2〜1μg/mL)を添加して導入遺伝子発現を誘導し、その線維芽細胞細胞培養培地を造血細胞培養培地で置換して、プログラミングを支持することとなる。
以下の参考文献は、本明細書に示すものを補う例示的手順または他の詳細を提供する程度に、参照により本明細書に特に援用されている。
Claims (10)
- 多能性幹細胞のフォワードプログラミングまたは体細胞の分化転換により造血前駆細胞を提供するインビトロの方法であって、
造血前駆細胞への該多能性幹細胞のフォワードプログラミングまたは該体細胞の分化転換を引き起こす能力がある2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子の発現レベルを増加させる条件下で、該多能性幹細胞または該体細胞を培養して、造血前駆細胞に該多能性幹細胞をフォワードプログラミングするかまたは該体細胞を分化転換させることによって、造血前駆細胞を提供する工程
を含み、ここで、該2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、i)ERGおよびGFI1を含むか、または、ii)ERGおよびGATA2を含む、方法。 - i)前記造血前駆細胞が、多能性幹細胞のフォワードプログラミングによって提供され、特に、該多能性幹細胞が、誘導多能性幹細胞であるか;または
ii)前記造血前駆細胞が、体細胞の分化転換によって提供され、特に、該体細胞が、不死化体細胞であるか;または
iii)前記多能性幹細胞または前記体細胞が、少なくとも1つの外因性発現カセットを含み、該発現カセットが、1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記多能性幹細胞または前記体細胞と、造血前駆細胞への該多能性細胞のフォワードプログラミングまたは該体細胞の分化転換を引き起こすのに十分な量の1つ以上の前記造血前駆体プログラミング因子遺伝子の遺伝子産物を含む1つ以上の造血前駆体プログラミング因子とを接触させる工程をさらに含み、特に、
1つ以上の該遺伝子産物が、1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子のポリペプチド産物、または1つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子のRNA転写産物である、請求項1に記載の方法。 - 前記造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、内皮分化因子遺伝子をさらに含み、特に、少なくとも1つの前記内皮分化因子が、FLI−1(フレンド白血病ウイルス組込み1)またはETV2(ets改変体2)を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記ERGが、ERG−2またはERG−3である、請求項1に記載の方法。
- 前記造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、GFI1B(成長因子非依存性1B転写リプレッサ)、TAL1(T細胞急性リンパ球性白血病)、LYL1(リンパ芽球性白血病由来配列1)、LMO2(LIMドメインオンリー2(ロンボチン様1))、GATA3(GATA結合タンパク質3)、またはSPI1(脾フォーカス形成ウイルス(SFFP)プロウイルス組込みがん遺伝子spi1)をさらに含む、請求項1に記載の方法。
- a)前記2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、SPI1、TAL1またはLMO2をさらに含むか、または
b)前記2つ以上の造血前駆体プログラミング因子遺伝子が、ERG、GATA2およびSPI1を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記造血前駆細胞が、
(i)1つ以上の造血前駆体マーカーの発現;
(ii)1つ以上の多能性幹細胞マーカーまたは体細胞マーカーの発現の欠如;
(iii)1つ以上の造血前駆体機能的特徴;
(iv)1つ以上の造血前駆体形態学的特徴
からなる群より選択される造血前駆細胞の1つ以上の特性を含み、特に、
a)該1つ以上の造血前駆体マーカーが、CD43、CD33、CD34、CD45、CD235aおよびCD41aからなる群より選択され、特に該1つ以上の造血前駆体マーカーが、CD43、CD45およびCD34からなる群より選択されるか、または
b)該1つ以上の多能性幹細胞マーカーまたは体細胞マーカーが、TRA−1−60、TRA−1−81、CD166およびCD140bからなる群より選択されるか、または
c)該1つ以上の造血前駆体機能的特徴が、形質細胞、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、肥満細胞、巨核球、赤血球、顆粒球、リンパ球、単球、白血球および血小板からなる群より選択される2つ以上の細胞タイプに分化する能力を包含し、特に、該1つ以上の造血前駆体機能的特徴が、骨髄系列、リンパ球系列、または赤血球−巨核球系列の細胞に分化する能力を包含し、特に、該1つ以上の造血前駆体機能的特徴が、リンパ球系列、骨髄系列および赤血球−巨核球系列の細胞に分化する能力を包含するか、または
d)前記方法が、造血前駆細胞について選択または富化する工程をさらに含み、選択または富化された造血前駆細胞が、造血前駆細胞の前記特性の1つ以上を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記多能性幹細胞または前記体細胞が、1つ以上の成長因子を含む培地で培養され、特に、前記1つ以上の成長因子が、線維芽細胞成長因子(FGF)、血管内皮成長因子(VEGF)、幹細胞因子(SCF)、トロンボポエチン(TPO)、FLT−3−リガンド(FLT3L)、インターロイキン−3(IL−3)、インターロイキン−6(IL−6)、顆粒球コロニー刺激因子(G−CSF)およびインターロイキン−9(IL−9)からなる群より選択され、特に該多能性幹細胞、該体細胞、または該多能性幹細胞もしくは該体細胞の子孫が、SCF、TPO、FLT3L、IL−3およびIL−6を含む培地で培養される、請求項1に記載の方法。
- (i)前記提供される造血前駆細胞が、10日以下の発現増加後に得られるか、または
(ii)前記提供される造血前駆細胞が、4日以下または6日以下の発現増加後に得られる、請求項1に記載の方法。
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