JP4073447B2 - Rna抽出方法、rna抽出用試薬、および生体材料の分析方法 - Google Patents
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- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
第1工程として、マウスMyeloma(大日本製薬社製Sp/0-Ag14)培養細胞(106個程度)のペレットに、細胞溶解液(チオシアン酸グアニジン4mol/l、10mmol/l MES-KOH、pH6.5)600μlを添加し、ホモジナイザー(マイクロテック・ニチオン社製 HANDY MICRO HOMOGENIZER)により細胞を破砕し、細胞内の核酸を遊離状態とした。
溶離液の一部を1.25%アガロースゲル(FMC社製 Reliant RNA Gel System)により電気泳動を行い、エチジウムブロミド染色後にトランスイルミネーターを用いてUV照射下で写真撮影を行った結果を図2に示す。レーン1、2はジエチレングリコールジメチルエーテル水溶液40容量%を用いた場合、レーン3、4はジエチレングリコールジメチルエーテル水溶液60容量%を用いた場合、レーン5、6はジエチレングリコールジメチルエーテル水溶液80容量%を用いた場合、レーン7、8はジエチレングリコールジメチルエーテル水溶液100容量%を用いた場合の抽出核酸を示す。
第2工程以外は実施例1と同様の方法で行った。以下、第2工程についていて記述する。
第2工程として、遊離状態の核酸を含む細胞溶解液に、極性有機溶媒として乳酸エチル水溶液(20、40、60、80、100容量%)600μlを添加する。この時、混合液におけるチオシアン酸グアニジン濃度は2mol/l、乳酸エチル濃度は、10、20、30、40、50容量%となる。
実施例1と同様の方法で電気泳動を行った結果を図3に示す。レーン1は乳酸エチル水溶液60容量%を用いた場合、レーン2は乳酸エチル水溶液80容量%を用いた場合、レーン3は乳酸エチル水溶液100容量%を用いた場合の抽出核酸を示す。
実施例1と同じマウスMyelom培養細胞(106個程度)のペレットから、QIAGEN社製RNeasy Mini Kitを用いて、キットに添付されるプロトコルに従って、RNA抽出を行った。
実施例1と同様の方法で電気泳動を行った結果を図4に示す。これより、RNeasy Mini Kitを用いた場合においては、抽出核酸にゲノムDNAが含まれることが示された。
実施例1により得た抽出核酸、および比較例の方法により得た抽出核酸を用いたRT−PCRを行った。
実施例1及び比較例の方法により得た抽出核酸から、DNA除去操作を行わず、全RNA 2.5μgを含む核酸溶液を調製した。この核酸溶液に、逆転写酵素(インビトロジェン社製 SuperScriptII)、Oligo(dT)プライマーを含む逆転写用試薬を加えて最終液量を20μlとして、42℃、50分間保温し、逆転写反応によりmRNAを鋳型とするcDNAを合成した。
Claims (16)
- RNAを含有する生物材料に、乳酸エチル、カオトロピック剤、酸化ケイ素を含有する核酸結合性固相を混合してRNAを選択的に固相へ結合させ、
RNAと結合した固相を液相から分離し、
固相を洗浄し、
固相からRNAを溶離するRNA抽出方法であって、
RNAを含有する生物材料、乳酸エチル及びカオトロピック剤からなる混合液におけるカオトロピック剤濃度が1.0〜4.0mo1/1であり、
上記混合液における乳酸エチル濃度が20〜35%である方法。 - 請求項1に記載のRNA抽出方法であって、前記カオトロピック剤が、ヨウ化ナトリウム、ヨウ化カリウム、チオシアン酸ナトリウム、チオシアン酸グアニジン、塩酸グアニジンから選択される1種以上であるRNA抽出方法。
- 請求項1に記載のRNA抽出方法であって、前記チオシアン酸グアニジンの所定濃度が、RNAを含有する生物材料、乳酸エチル及びカオトロピック剤からなる混合液における濃度で、1.0〜4.0mol/lであり、上記混合液における乳酸エチル濃度が20〜35%であるRNA抽出方法。
- 請求項1に記載のRNA抽出方法であって、前記チオシアン酸グアニジンの所定濃度が、RNAを含有する生物材料、乳酸エチル及びカオトロピック剤からなる混合液における濃度で、1.5〜2.5mol/lであり、上記混合液における乳酸エチル濃度が25〜35%であるRNA抽出方法。
- 請求項1乃至4のいずれかに記載のRNA抽出方法であって、前記酸化ケイ素を含有する核酸結合性固相が、ガラス粒子、シリカ粒子、ガラス繊維濾紙、シリカウール、あるいは、それら破砕物、ケイソウ土であるRNA抽出方法。
- 請求項1乃至5のいずれかに記載のRNA抽出方法であって、前記RNAを含有する生物材料が、全血、血清、喀痰、尿、生体組織、培養細胞、または培養細菌であるRNA抽出方法。
- 請求項1乃至6のいずれかに記載のRNA抽出方法であって、前記洗浄液がエタノールであるRNA抽出方法。
- 請求項1乃至7のいずれかに記載のRNA抽出方法であって、前記溶離液が、RNA分解酵素除去、あるいはRNA分解酵素失活化処理を行った水や低塩濃度緩衝液であるRNA抽出方法。
- RNAを含有する生物材料に、乳酸エチル、カオトロピック剤、酸化ケイ素を含有する核酸結合性固相を混合してRNAを選択的に固相へ結合させ、
RNAと結合した固相を液相から分離し、
固相を洗浄し、
固相からRNAを溶離し、
得られたRNAを逆転写ポリメラーゼチェインリアクション(RT−PCR)で増幅する生物材料の分析方法であって、
RNAを含有する生物材料、乳酸エチル及びカオトロピック剤からなる混合液におけるカオトロピック剤濃度が1.0〜4.0mo1/1であり、
上記混合液における乳酸エチル濃度が20〜35%である方法。 - 請求項9に記載の生物材料の分析方法であって、前記カオトロピック剤が、ヨウ化ナトリウム、ヨウ化カリウム、チオシアン酸ナトリウム、チオシアン酸グアニジン、塩酸グアニジンから選択される1種以上であるRNA抽出方法。
- 請求項9に記載の生物材料の分析方法であって、前記チオシアン酸グアニジンの所定濃度が、RNAを含有する生物材料、乳酸エチル及びカオトロピック剤からなる混合液における濃度で、1.0〜4.0mol/lであり、上記混合液における乳酸エチル濃度が20〜35%である生物材料の分析方法。
- 請求項9に記載の生物材料の分析方法であって、前記チオシアン酸グアニジンの所定濃度が、RNAを含有する生物材料、乳酸エチル及びカオトロピック剤からなる混合液における濃度で、1.5〜2.5mol/lであり、上記混合液における乳酸エチル濃度が25〜35%である生物材料の分析方法。
- 請求項9乃至12のいずれかに記載の生物材料の分析方法であって、前記酸化ケイ素を含有する核酸結合性固相が、ガラス粒子、シリカ粒子、ガラス繊維濾紙、シリカウール、あるいは、それら破砕物、ケイソウ土である生物材料の分析方法。
- 請求項9乃至13のいずれかに記載の生物材料の分析方法であって、前記RNAを含有する生物材料が、全血、血清、喀痰、尿、生体組織、培養細胞、または培養細菌である生物材料の分析方法。
- 請求項9乃至14のいずれかに記載の生物材料の分析方法であって、前記洗浄液がエタノールである生物材料の分析方法。
- 請求項9乃至15のいずれかに記載の生物材料の分析方法であって、前記溶離液が、RNA分解酵素除去、あるいはRNA分解酵素失活化処理を行った水や低塩濃度緩衝液である生物材料の分析方法。
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