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JP2023520515A - がんに対する治療方法及び診断方法 - Google Patents

がんに対する治療方法及び診断方法 Download PDF

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Abstract

Figure 2023520515000001
本発明は、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））に対する治療方法及び診断方法、並びに組成物を提供する。本発明は、本発明のバイオマーカー（例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法、がんを有する個体に対する治療法を選択するための方法、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定する方法、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対するがんを有する個体の応答をモニタリングする方法、及びがんを有する個体を治療する方法を提供する。
【選択図】図１

Description

配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩ形式にて電子的に提出されており、その全体が参照により本明細書に組み込まれる配列表を含む。当該ＡＳＣＩＩコピーは、２０２１年３月３０日に作成され、５０４７４－２０２ＷＯ２＿Ｓｅｑｕｅｎｃｅ＿Ｌｉｓｔｉｎｇ＿３．３０．２１＿ＳＴ２５と命名され、大きさは２３，５５１バイトである。
発明の分野
がん等の病理学的な症状の治療及び診断のための方法及び組成物が本明細書で提供される。具体的には、本明細書は、患者選択及び診断のためのバイオマーカー、治療方法、製品、診断キット、及び検出方法を提供する。
背景
がんは、依然としてヒトの健康に対する最も致命的な脅威のうちの１つである。がん又は悪性腫瘍は転移し、制御されていない様子で急速に成長し、時を得た検出及び治療を極めて困難にする。米国において、がんは、毎年約１３０万人の新たな患者に影響を及ぼし、心疾患に続く第２の主な死亡原因であり、死亡の約４件に１件を占める。固形腫瘍が、これらの死亡の大部分の原因である。膀胱がんは、世界で５番目に一般的な悪性腫瘍であり、１年当たり４０万件近くの症例が新たに診断され、およそ１５万件の関連死が報告されている。特に、転移性尿路上皮癌腫（ＵＣ）は転帰不良に関連しており、これまで有効な治療法がほとんどなく、満たされていない主な医学的ニーズを表している。別の例では、腎細胞癌腫（ＲＣＣ）は、腎臓がんの最も一般的なタイプであり、複数の組織学的サブタイプを有する。
プログラム死リガンド１（ＰＤ－Ｌ１）は、慢性感染、妊娠、組織同種移植片、自己免疫疾患、及びがんにおける免疫系応答の抑制に関係があるとされているタンパク質である。ＰＤ－Ｌ１は、Ｔ細胞、Ｂ細胞、及び単球の表面上に発現される、プログラム死１（ＰＤ－１）として知られる抑制性受容体に結合することにより免疫応答を調節する。ＰＤ－Ｌ１は、別の受容体、Ｂ７－１との相互作用によっても、Ｔ細胞機能を負に制御する。ＰＤ－Ｌ１／ＰＤ－１及びＰＤ－Ｌ１／Ｂ７－１複合体の形成は、Ｔ細胞受容体のシグナル伝達を負に制御し、その後、Ｔ細胞活性化の下方制御、及び抗腫瘍免疫活性の抑制をもたらす。
がん（例えば、膀胱がん（例えば、尿路上皮膀胱がん））の治療における著しい前進にかかわらず、改善された療法及び診断方法が未だに求められている。
発明の概要
本発明は、がん、例えば、膀胱がん（例えば、尿路上皮膀胱がん、ＵＢＣ）のための治療方法及び診断方法、並びに組成物を提供する。
一態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法を特徴とする。
別の態様では、本開示は、がんを有する個体の治療を選択するための方法を特徴とし、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む、方法。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を選択すること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること；及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対するがんを有する個体の応答をモニタリングする方法を特徴とし、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル未満である場合、該個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストであって、個体が、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、個体が、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、抗がん療法を特徴とする。
別の態様において、本発明は、がんを有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを特徴とし、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること；及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体を治療する方法において使用するための抗がん療法を特徴とし、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストであって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であると決定されている、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であると決定されている、抗がん療法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、個体が、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、個体が、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、抗がん療法を特徴とする。
別の態様において、本発明は、がんを有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを特徴とし、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であると決定されており、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体を治療する方法において使用するための抗がん療法を特徴とし、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であると決定されており、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、抗がん療法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、個体が、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、個体が、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されている、抗がん療法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対するがんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、方法を特徴とする。
別の態様において、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対するがんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対するがんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。
いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、方法が、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られている、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体に対する治療を選択するための方法を特徴とし、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られている、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体対する治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、項がん療法を選択すること、を含む。
いくつかの態様では、試料は、組織試料、細胞試料、全血試料、血漿試料、血清試料、又はこれらの組み合わせである。
いくつかの態様では、試料は血漿試料である。
いくつかの態様では、組織試料は腫瘍組織試料である。
いくつかの態様では、腫瘍組織試料は、腫瘍細胞、腫瘍浸潤免疫細胞、間質細胞、又はそれらの組み合わせを含む。
いくつかの態様では、腫瘍浸潤免疫細胞は、腫瘍浸潤骨髄細胞を含む。
いくつかの態様では、腫瘍組織試料は、ホルマリン固定パラフィン包埋（ＦＦＰＥ）試料、アーカイブ試料、新鮮な試料、又は凍結試料である。
いくつかの態様では、細胞試料は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
（ｂ）工程（ａ）において血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料において決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、本発明は、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法個体に投与することを含む、方法を特徴とする。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体対する治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療する方法を特徴とし、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料中又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、血漿試料中又は工程（ａ）で決定されたＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を投与すること、を含む。
別の態様では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体から血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む、方法を特徴とする。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、方法を特徴とする。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体対する治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料中又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、個体に対する抗がん療法を選択すること、を含む。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳによって示される。
いくつかの態様では、個体は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療からの延長されたＯＳを有する可能性が高い。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳによって示される。
いくつかの態様では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療からの延長されたＯＳを有する可能性が高い。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳによって示される。
いくつかの態様では、個体は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からの低下したＯＳを有する可能性が高い。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される。
いくつかの態様では、応答は、ＯＳによって示される。
いくつかの態様では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からの低下したＯＳを有する可能性が高い。
いくつかの態様は、ＩＬ８の基準レベルは、がんを有する個体の集団から決定される。
いくつかの態様では、ＩＬ８の基準レベルは、がんを有する患者の集団において決定された発現レベルの中央値、発現レベルの三分位値、又は最大選択されたログランク基準レベルである。
いくつかの態様では、ＩＬ８の基準レベルは、がんを有する患者の集団において求められる発現レベルの中央値である。
いくつかの態様では、最大選択されたログランク基準レベルは、１２ｐｇ／ｍＬのＩＬ８である。
いくつかの態様では、基準レベルは、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られた試料中のＩＬ８のレベルである。
いくつかの態様では、基準レベルは、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られた試料中のＩＬ８のレベルである。
いくつかの態様では、ＩＬ８の発現レベルは核酸発現レベルである。
いくつかの態様では、核酸発現レベルはｍＲＮＡ発現レベルである。
いくつかの態様では、ｍＲＮＡ発現レベルは、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－ｓｅｑ）、リアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖応答（ＲＴ－ｑＰＣＲ）、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、マルチプレックスｑＰＣＲ若しくはＲＴ－ｑＰＣＲ、マイクロアレイ分析、遺伝子発現の連続分析（ＳＡＧＥ）、ＭａｓｓＡＲＲＡＹ技術、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）、又はそれらの組み合わせによって決定される。
いくつかの態様では、ＲＮＡ－ｓｅｑはシングルセルＲＮＡシーケンシング（ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ）である。
いくつかの態様では、ＩＬ８の発現レベルはタンパク質発現レベルである。
いくつかの態様では、タンパク質発現レベルは、免疫組織化学法（ＩＨＣ）、ウェスタンブロット法、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、免疫沈降法、免疫蛍光法、ラジオイムノアッセイ、又は質量分析法によって決定される。
いくつかの態様では、個体は、Ｔｅｆｆシグネチャーについての基準レベル以上である腫瘍試料におけるＴエフェクター（Ｔｅｆｆ）シグネチャーの発現レベルを有する。
いくつかの態様では、Ｔｅｆｆシグネチャーは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される１つ以上の遺伝子を含む。
いくつかの態様では、Ｔｅｆｆシグネチャーは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される２つ以上の遺伝子を含む。
いくつかの態様では、Ｔｅｆｆシグネチャーは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される３つ以上の遺伝子を含む。
いくつかの態様では、Ｔｅｆｆシグネチャーは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１を含む。
いくつかの態様では、個体は、がんに対する治療を以前に受けたことがない。
いくつかの態様では、個体は、がんに対する治療を以前に受けたことがある。
いくつかの態様では、がんは、膀胱がん、腎臓がん、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、リンパ腫、前立腺がん、肝臓がん、頭頸部がん、黒色腫、卵巣がん、中皮腫又は骨髄腫である。
いくつかの態様では、膀胱がんは、尿路上皮癌腫（ＵＣ）である。
いくつかの態様では、ＵＣは局所進行性または転移性ＵＣである。
いくつかの態様では、個体は、事前の白金ベースの化学療法を受けたことがある。
いくつかの態様では、個体は、事前の白金ベースの化学療法の後に進行している。
いくつかの態様では、個体は、局所進行性又は転移性ＵＣについて以前に治療されたことがない。
いくつかの態様では、個体は、白金ベースの化学療法に対して不適格である。
いくつかの態様では、個体はヒトである。
いくつかの態様において、腎臓がんは、腎細胞癌腫（ＲＣＣ）である。
いくつかの態様において、ＲＣＣは転移性ＲＣＣ（ｍＲＣＣ）である。
いくつかの態様では、個体は、がんに対する治療を以前に受けていない。
いくつかの態様では、肺がんは、非小細胞肺がん又は小細胞肺がんである。
幾つかの態様では、乳がんはトリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）又はＨＥＲ２陽性乳がんである。
いくつかの態様では、乳がんはＴＮＢＣである。
いくつかの態様では、方法は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを更に含む。
いくつかの態様では、方法は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること更に含む。
幾つかの態様では、本方法は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを更に含む。
幾つかの態様では、本方法は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを更に含む。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法が、ＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ８アンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト、又はそれらの組み合わせを含む。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法が、ＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト、又はそれらの組み合わせを含む。
いくつかの態様において、抗がん療法は、ＶＥＧＦアンタゴニスト及びＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む。
前述の態様のうちのいずれかのいくつかの態様では、ＶＥＧＦアンタゴニストは、抗ＶＥＧＦ抗体又はＶＥＧＦ受容体（ＶＥＧＦＲ）阻害剤である。
いくつかの態様では、ＶＥＧＦアンタゴニストは抗ＶＥＧＦ抗体である。
いくつかの態様では、抗ＶＥＧＦ抗体は、ベバシズマブである。
いくつかの態様では、ＩＬ８アンタゴニストは、抗ＩＬ８抗体又は小分子ＩＬ８阻害剤である。
いくつかの態様では、ＩＬ１Ｂアンタゴニストは、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤である。
いくつかの態様では、ＩＬ１Ｒアンタゴニストは、抗ＩＬ１Ｒ抗体又は小分子ＩＬ１Ｒ阻害剤である。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト、ＰＤ－１結合アンタゴニスト、及びＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストからなる群から選択される。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストはＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストである。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、そのリガンド結合パートナーのうちの１つ以上への結合を阻害する。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への結合を阻害する。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＢ７－１への結合を阻害する。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－１及びＢ－１の両方へのＰＤ－Ｌ１の結合を阻害する。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、アテゾリズマブ、ＭＤＸ－１１０５、デュルバルマブ、及びアベルマブからなる群から選択される。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、以下の超可変領域（ＨＶＲ）を含む：
（ａ）ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨ（配列番号１９）のＨＶＲ－Ｈ１配列；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号２０）のＨＶＲ－Ｈ２配列；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号２１）のＨＶＲ－Ｈ３配列；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡ（配列番号２２）のＨＶＲ－Ｌ１配列；（ｅ）ＳＡＳＦＬＹＳ（配列番号２３）のＨＶＲ－Ｌ２配列；及び（ｆ）ＱＱＹＬＹＨＰＡＴ（配列番号２４）のＨＶＲ－Ｌ３配列。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン；（ｂ）ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；及び（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン。
いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体はアテゾリズマブである。
いくつかの態様において、追加の治療剤を個体に投与することを更に含む治療する方法。
いくつかの態様では、追加の治療剤は、免疫治療剤、細胞傷害性薬剤、成長阻害剤、放射線治療剤、抗血管新生剤、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの態様では、個体はヒトである。
別の態様において、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療から利益を得る場合がある腎臓がんに罹っている個体を同定するためのキットを特徴とし、このキットは：（ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に記載の方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがんを有する個体を同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の態様において、本発明は、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療から利益を得る場合がある腎臓がんに罹患している個体を同定するためのキットを特徴とし、該キットは：（ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に記載の方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定し、それにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の態様において、本発明は、がんを有する個体を治療するためのキットを特徴とし、該キットは、（ａ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストと、任意に、（ｂ）本明細書に記載される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法に応答する可能性があると同定されたがんを有する個体にＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを投与するための説明書を備える。
別の態様において、本発明は、がんを有する個体を治療するためのキットを特徴とし、該キットは、（ａ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法と、任意に、（ｂ）本明細書に記載される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法に応答する可能性が低いと同定されたがんを有する個体に、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を投与するための説明書を備える。
別の態様では、本発明は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療から利益を得ることができるがんを有する個体を同定するためのキットを特徴とし、該キットは、（ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に記載の方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがんを有する個体を同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の態様において、本発明はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療から利益を得る場合がある腎臓がんに罹患している個体を同定するためのキットを特徴とし、該キットは：（ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に記載の方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定し、それにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の態様では本発明は、がんを有する個体を治療するためのキットを特徴とし、該キットは、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと、任意に、（ｂ）本明細書に記載される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法に応答する可能性があると同定されたがんを有する個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを投与するための説明書を備える。
別の態様では、本発明は、がんを有する個体を治療するためのキットを特徴とし、該キットは、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法と、任意に、（ｂ）本明細書に記載される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法に応答する可能性が低いと同定されたがんを有する個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を投与するための説明書を備える。
図１は、ＩＬ８発現と臨床転帰との関連を評価した臨床試験をまとめた概略図である。Ａｔｅｚｏ、アテゾリズマブ；ＢＥＰ、バイオマーカー評価可能集団。 図２は、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０（コホート１及び２を含む）及びＩＭｖｉｇｏｒ２１１（アテゾリズマブ及び化学療法で治療された患者を含む）臨床試験におけるバイオマーカー評価可能な患者、並びにＩＬ８低及びＩＬ８高サブグループの人口統計及びベースライン特性を示す表である。 図３は、ＩＭｍｏｔｉｏｎ１５０臨床試験におけるバイオマーカー評価可能な患者並びにＩＬ８低及びＩＬ８高サブグループの人口統計及びベースライン特性を示す表である。 図４Ａ～４Ｅは、高血漿ＩＬ８が転移性ＵＣ（ｍＵＣ）及び転移性ＲＣＣ（ｍＲＣＣ）における不良な転帰に関連することを示す一連のグラフである。図４Ａでは、高いベースライン血漿ＩＬ８（ｐＩＬ８）レベル（カットオフ中央値：１５ｐｇ／ｍＬ）は、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０のコホート２におけるより悪い全生存期間（ＯＳ）と有意に関連していた（ＨＲ＝１．９０、９５％ＣＩ：１．３１、２．７４Ｐ＜０．０００１）。図４Ｂでは、高いベースラインＩＬ８血漿レベルは、固形腫瘍における応答評価基準（ＲＥＣＩＳＴ）２．１によって、より多数の非レスポンダー（ＳＤ及びＰＤ）（Ｐ＝０．０１、両側フィッシャー直接確率検定）と有意に関連していた。ＣＲ、完全奏効；ＰＲ、部分奏効；ＳＤ、安定疾患；ＰＤ、進行性疾患。図４Ｃにおいて、高いベースライン血漿ＩＬ８は、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０のコホート２のｍＵＣ患者におけるＴｅｆｆシグネチャー発現を有する腫瘍においてさえ、不良なＯＳと関連していた。血漿ＩＬ８発現の上昇は、Ｔｅｆｆ高腫瘍においてさえも、低血漿ＩＬ８発現と比較してより悪いＯＳと関連していた（ＨＲ：１．７１；９５％ＣＩ：１．１２、３．２６、Ｐ＝０．０１７）。図４Ｄでは、ランダム化ｍＵＣ第３相試験（ＩＭｖｉｇｏｒ２１１）において、高いベースライン血漿ＩＬ８レベルは、アテゾリズマブ（ＨＲ：１．８３；９５％ＣＩ：１．４８、２．２６、Ｐ＜０．０００１）群及び化学療法（ＨＲ：１．６７；９５％ ＣＩ：１．３８、２．０３、Ｐ＜０．０００１）群の両方においてより悪いＯＳと有意に関連した。しかしながら、低いベースライン血漿ＩＬ８は、化学療法群と比較してアテゾリズマブ群においてＯＳを有意に改善した（ＨＲ：０．７６；９５％ＣＩ：０．６１、０．９４、Ｐ＝０．０１）。図４Ｅは、ランダム化ｍＲＣＣ第２相試験（ＩＭｍｏｔｉｏｎ１５０）において、高ベースライン血漿ＩＬ８が、アテゾリズマブ（ＨＲ１．９８；９５％ＣＩ：１．１２、３．５、Ｐ＝０．０１８）群及びアテゾリズマブ＋ベバシズマブ（ＨＲ１．８９、９５％ＣＩ：１．０８、３．３、Ｐ＝０．０２５）群においてより悪い無増悪生存（ＰＦＳ）と有意に関連したが、スニチニブ群（ＨＲ１．２９、９５％ＣＩ：０．７３、２．３、Ｐ＝０．３７７）では関連しなかったことを示す。 図５Ａ及び５Ｂは、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０コホート１のｍＵＣ患者における高血漿ＩＬ８発現とより悪いＯＳ（図５Ａ）及びＯＲＲ（図５Ｂ）との関連を示す一連のグラフである。 図６Ａ及び６Ｂは、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０（図６Ａ）及びＩＭｍｏｔｉｏｎ１５０（図６Ｂ）臨床試験において、血漿ＩＬ８発現が好中球対リンパ球比（ＮＬＲ）と中程度の相関を有することを示す一連のグラフである。 図７Ａ及び７Ｂは、血漿ＩＬ８レベルが、腫瘍Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）遺伝子発現（図７Ａ）又は腫瘍遺伝子変異量（図７Ｂ）等の高い腫瘍免疫存在のマーカーと相関しなかったことを示す一連のグラフである。 図８Ａ及び８Ｂは、血漿ＩＬ８発現の治療中の増加がアテゾリズマブ群におけるｍＵＣのより悪いＯＳと関連していたことを示す一連のグラフである。図８Ａでは、血漿ＩＬ８の治療中の変化を、治療中のサイクル３の１日目（Ｃ３Ｄ１）とベースラインサイクル１の１日目（Ｃ１Ｄ１）との間の血漿ＩＬ８レベルの比と呼ぶ。血漿ＩＬ８レベルの高い治療中の増加（カットオフ中央値：１．０９ｐｇ／ｍＬ）は、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０のコホート２のより悪いＯＳと有意に関連していた（ＨＲ：０．４８；９５％ＣＩ：０．３１、０．７６、Ｐ＜０．０１）。図８Ｂに示すように、Ｍｖｉｇｏｒ２１１臨床試験で同様の傾向が観察され、血漿ＩＬ８レベルの高い治療中の増加がアテゾリズマブ群でのみより悪いＯＳと有意に関連したが（ＨＲ：０．４９、９５％ＣＩ：０．３６；０．６６、Ｐ＜０．００１）、化学療法群では関連しなかった（ＨＲ：０．８３、９５％ＣＩ：０．６３；１．１、Ｐ＝０．１９）。 図９Ａ～９Ｅは、血漿ＩＬ８発現の治療中の増加がｍＵＣのＯＲＲ及びＯＳに関して不良な転帰と関連していたことを示す一連のグラフである。図９Ａ及び図９Ｂは、それぞれＩＭｖｉｇｏｒ２１０のコホート１及びコホート２において、血漿ＩＬ８レベルの高い治療中の増加がより悪いＯＲＲと関連していたことを示す。図９Ｃは、血漿ＩＬ８レベルの高い治療中の増加が、ＩＭｖｉｇｏｒ２１１における化学療法群ではなく、アテゾリズマブ群におけるより悪いＯＲＲに関連したことを示す。図９Ｄは、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０のコホート１において、血漿ＩＬ８レベルの高い治療中の増加がより悪いＯＳと有意に関連したことを示す。図９Ｅは、アテゾリズマブで治療された患者では絶対リンパ球及び骨髄数に有意差がなかったが、ＩＭｖｉｇｏｒ２１１では化学療法で治療された患者では絶対リンパ球及び骨髄数の増加があったことを示す。したがって、低血漿ＩＬ８における化学療法に関連する不良な応答は、リンパ系及び骨髄系細胞の減少によるものではなかった。 図１０Ａ～１０Ｈは、骨髄系細胞のサブセットにおける高いＩＬ８遺伝子発現に関連する不良な臨床転帰が、抗原提示遺伝子を含む遺伝子のダウンレギュレートと相関していたことを示す一連のグラフである。図１０Ａでは、ｍＵＣ ＩＭｖｉｇｏｒ２１０研究において、５人のレスポンダー及び５人の非レスポンダーから単離された末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）の単一細胞ＲＮＡ－ｓｅｑ（ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ）によって、異なる骨髄クラスター及びリンパクラスターのサブセットが明らかにされた。クラスターは、図１０Ｂに示すリンパ球（上図）及び骨髄（下図）細胞特異的マーカーの発現によって同定された。図１０Ｃは、骨髄性クラスターのサブセットに対する高いＩＬ８遺伝子発現を示す。図１０Ｄでは、ＩＬ８高骨髄細胞と低骨髄細胞との間の異なる遺伝子発現分析は、ＩＬ８高骨髄細胞における骨髄性炎症応答遺伝子（薄い灰色）の有意な濃縮を示したが、ＩＬ８低骨髄細胞では抗原提示機構遺伝子（濃い灰色）の有意な濃縮が観察された。図１０Ｅは、図１０Ｆに示すように、レスポンダーと比較した、非レスポンダーの骨髄クラスターにおけるＩＬ８遺伝子発現の増加を示し、骨髄クラスターのサブセットが非レスポンダーにおいて有意に高いＩＬ８発現を有した（＊＊＊偽発見率（ＦＤＲ）＜０．００１；＊＊ＦＤＲ＜０．０１）。図１０Ｇでは、ＰＢＭＣにおける高いＩＬ８遺伝子発現は、ｍＵＣ ＩＭｖｉｇｏｒ２１０試験においてより悪いＯＳと有意に関連していた（ＨＲ：１．３６、９５％ＣＩ：１．０７、１．７３、Ｐ＝０．０１３）。図１０Ｈでは、ＰＢＭＣにおける高いＩＬ８遺伝子発現は、ＲＣＣ ＩＭｍｏｔｉｏｎ１５０試験のアテゾリズマブ群（ＨＲ２．５２；９５％ＣＩ：１．２９、４．９、Ｐ＝０．００７）でのみ悪化したＰＦＳと有意に関連したが、アテゾリズマブ＋ベバシズマブ（ＨＲ１．１１；９５％ＣＩ：０．６４、１．９、Ｐ＝０．７０８）群又はスニチニブ（ＨＲ０．８１；９５％ ＣＩ：０．４７、１．４、Ｐ＝０．４３６）群では関連しなかった。 図１１Ａ～１１Ｆは、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０研究からの５名のレスポンダー及び５名の非レスポンダーからのＰＢＭＣのｓｃＲＮＡ－ｓｅｑからの結果を示す一連のグラフである。図１１Ａは、均一多様体近似及び投影によって評定されるレスポンダーと非レスポンダーとの間の細胞（各ドットは１つの細胞を表す）の分布を示すｓｃＲＮＡ－ｓｅｑの可視化を示す。図１１Ｂは、ＵＭＡＰによって評定される、示された群についての細胞（各ドットは１つの細胞を表す）の分布を示すｓｃＲＮＡ－ｓｅｑの可視化を示す。Ｒ１～５はレスポンダー１～５を表し、ＮＲ１～５は非レスポンダー１～５を表す。図１１Ｃは、各細胞において検出されたＲＮＡ転写物の数を示す（ｌｏｇ１０スケールに基づいて色分けされている）。図１１Ｄは、レスポンダー及びノンレスポンダーについて、示されたクラスターに属する細胞の分率を示す。図１１Ｅは、示されたクラスターについて示された群に属する細胞の分率を示す。図１１Ｆは、示されたクラスターの細胞数を示す。 図１２は、全ての骨髄性クラスターにおけるＩＬ８高細胞対ＩＬ８低細胞（カットオフ中央値）間の遺伝子セット濃縮経路分析を示すグラフである。 図１３Ａ及び１３Ｂは、単球クラスターにおけるレスポンダーとノンレスポンダーとの間の示差的遺伝子発現分析を示す一連のグラフである。非レスポンダーでは骨髄性炎症応答遺伝子が有意に濃縮されているのに対して、レスポンダーではヒト白血球抗原（ＨＬＡ）遺伝子及びインターフェロンガンマ（ＩＦＮｇ）誘導遺伝子等の抗原提示機構遺伝子が有意に濃縮されている。 図１４Ａ～１４Ｈは、ＲＣＣにおけるｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ分析による腫瘍及び血液からの免疫サブセットにおけるＩＬ８遺伝子発現の評価、並びにＲＣＣ及びｍＵＣにおける臨床転帰とのＩＬ８遺伝子発現の関連を示す一連のグラフである。図１４Ａでは、ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑは、一致した血液及び腫瘍中の白血球中の免疫サブセットを同定した。図１４Ｂでは、ＲＣＣからの腫瘍及び血液からの免疫サブセットにおける選択されたリンパ系及び骨髄系関連遺伝子の発現が示される。図１４Ｃは、選択された遺伝子セットのスケーリングされた発現（対数発現カウント値）を報告するヒートマップを示す。遺伝子発現シェーディングスキームは、－２．０から２．０までのスケール対数発現分布に基づく。右余白のカラーバーは、目的の例示的な細胞のサブセットを強調表示する。図１４Ｄは、ＩＬ８高腫瘍骨髄性細胞とＩＬ８低腫瘍骨髄性細胞との間の示差的遺伝子発現分析を示し、ＩＬ８高腫瘍骨髄性細胞における骨髄性炎症応答遺伝子（濃い灰色）の有意な濃縮を示すが、腫瘍試料中のＩＬ８低骨髄性細胞では抗原提示機構遺伝子（薄い灰色）の有意な濃縮が観察された。図１４Ｅは、高腫瘍ＩＬ８遺伝子発現が、アテゾリズマブ単独療法群における低腫瘍ＩＬ８遺伝子発現と比較してＯＳの低下（ＨＲ：３．９７、９５％ＣＩ：１．８３、８．６、Ｐ＜０．００１）に関連していたが、アテゾリズマブ＋ベバシズマブ群（ＨＲ：１．７８、９５％ＣＩ：０．９２、３．４、Ｐ＝０．０８８）及びスニチニブ群（ＨＲ：１．７５、９５％ ＣＩ：０．８３、３．７、Ｐ＝０．１４４）では関連していなかったことを示す。図１４Ｆは、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０試験において、アテゾリズマブ単剤療法群における低い腫瘍ＩＬ８遺伝子発現と比較して、高い腫瘍ＩＬ８遺伝子発現がより悪いＯＳと関連していたことを示す（ＨＲ：１．３４、９５％ＣＩ：１．０３、１．７４、Ｐ＝０．０２６）。図１４Ｇは、高腫瘍ＩＬ８遺伝子発現が、アテゾリズマブ単独療法群における低腫瘍ＩＬ８発現と比較して、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）高患者（ＨＲ：１５．６、９５％ＣＩ：３．１５、７７．６、Ｐ＜０．００１）においてＯＳの低下と関連していたが、アテゾリズマブ＋ベバシズマブ群（ＨＲ：０．９６、９５％ＣＩ：０．２９、３．２、Ｐ＝０．９４５）及びスニチニブ群（ＨＲ：１．９４、９５％ＣＩ：０．６７、５．６、Ｐ＝０．２２５）では関連していなかったことを示す。図１４Ｈは、高い腫瘍ＩＬ８遺伝子発現が、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０のアテゾリズマブ単剤治療患者のＴｅｆｆ高患者におけるより悪いＯＳと関連していたことを示す（ＨＲ：１．６７、９５％ＣＩ：１．１２、２．４９、Ｐ＝０．０１２）。 図１５は、Ｓｅｕｒａｔを使用した例示的なＲＣＣ ｓｃＲＮＡデータ分析ワークフローの概要を示す概略図である。簡潔には、Ｓｅｕｒａｔ（バージョン３．０）を使用して、Ｃｅｌｌ Ｒａｎｇｅｒ２．２．１から出力された生の５０遺伝子発現（ＧＥＸ）マトリックスに対して基本的な品質管理を行い、続いて試料の多重－分離、アラインメント、フィルタリング、及びＵＭＩ（ユニバーサル分子識別子）計数を行った。ＲＣＣ血液及び腫瘍単一細胞データを正常化のために一緒に統合した。最初の２０個の主成分を、クラスタリング（解像度＝０．６）及びＵＭＡＰ視覚化に使用した。同定のクラスターに濃縮された遺伝子に基づいてクラスターを同定した。 図１６Ａ及び１６Ｂは、リンパ系及び骨髄系細胞のＵＭＡＰ視覚化の結果を示す一連のグラフである。図１６Ａは、示されたクラスターについてプロットされた血液又は腫瘍由来の細胞の分率（図１５参照）を示す。図１６Ｂは、示されたクラスターにおける示された血液又は腫瘍群に対する細胞の分率を示す。 ｍＲＣＣ腫瘍の単一細胞ＲＮＡｓｅｑにおける細胞型特異的マーカーのスケーリングされた平均遺伝子発現を示すグラフである。Ｔｃｍ、セントラルメモリーＴ細胞；Ｔｅｍ、エフェクターメモリー；Ｍ１様、Ｍ１様マクロファージ；Ｍ２様、Ｍ２様マクロファージ。 図１８は、ＩＬ８高細胞対ＩＬ８低腫瘍内骨髄細胞（クラスター７）の示差的遺伝子発現分析を示すグラフであり、ＩＬ８高細胞における炎症遺伝子（例えば、ＩＬ１Ｂ、ＰＴＧＳ２、ＩＬ１ＲＮ及びＮＬＲＰ３）のより高い発現、並びに他の遺伝子の中でも抗原プロセシング及び提示に関与する遺伝子（例えば、ＨＬＡ－ＤＲ５、ＨＬＡ－ＤＲＢ６、ＨＬＡ－Ｃ及びＢ２Ｍ）の発現低下を明らかにする。 ｍＲＣＣにおける末梢血白血球中のＩＬ８高発現単一細胞とＩＬ８低発現単一細胞との間の遺伝子セット濃縮経路分析を示すグラフである。ＩＬ８低発現細胞に富む経路は濃い灰色で示され（負の濃縮スコア）、ＩＬ８高発現細胞に富む経路は薄い灰色で示される（正の濃縮スコア）。 図２０は、ＩＬ８遺伝子発現の上昇が組織学的評定によって、より高い好中球の存在と相関したことを示す一連のグラフである。
発明の詳細な説明
Ｉ．序文
本発明は、がん、例えば、膀胱がん（例えば、尿路上皮膀胱がん、ＲＣＣ）のための治療方法及び診断方法、並びに組成物を提供する。本発明は、少なくとも部分的には、個体から得られた試料中の本発明のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の任意のバイオマーカー、例えばＩＬ８の発現レベルの決定が、がんを有する個体の治療、がんを有する個体の診断、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、例えば、アテゾリズマブ）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性があるかどうかの決定、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、例えば、アテゾリズマブ）を含む抗がん療法の治療効果の最適化、及び／又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、例えば、アテゾリズマブ）を含む抗がん療法の患者選択に有用であるという発見に基づく。
例えば、本明細書に提供されるデータは、末梢及び腫瘍内ＩＬ８及び／又は関連する骨髄性炎症がチェックポイント遮断に対する耐性を付与することを実証する。更に、ＩＬ８の発現は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法を含むチェックポイント阻害剤療法に対する治療応答の予測バイオマーカーとして使用することができる。特に、ＩＬ８発現が低い個体、又はＩＬ８発現が治療中に減少している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い。対照的に、高いＩＬ８発現又はＩＬ８発現の治療中の増加を伴う患者は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の抗がん治療剤とを含む併用療法、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）による治療から利益を得ることができる。本明細書で提供されるデータはまた、ＩＬ８高がんの状況でアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子を提供し、これはＩＬ８発現の代理として使用することができる。例えば、表２～４（アップレギュレートされた遺伝子）及び表５～７（ダウンレギュレートされた遺伝子）を参照されたい。
ＩＩ．定義
本明細書に記載の本発明の態様及び実施形態は、態様及び実施形態の「を含む」、「からなる」、及び「から本質的になる」を含むことが理解される。本明細書で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、別途示されない限り、複数のものを含む。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、この技術分野の当業者であれば容易に理解する、それぞれの値の通常の誤差範囲を指す。本明細書における「約」に続く値又はパラメータへの言及は、その値又はパラメータ自体を対象とする実施形態を含む（且つ説明する）。例えば、「約Ｘ」について言及する記述は、「Ｘ」の記述を含む。
本明細書で使用される場合、「ＣＸＣＬ８」という用語は、別途示されない限り、霊長類（例えば、ヒト）及びげっ歯類（例えば、マウス及びラット）等の哺乳動物を含む、任意の脊椎動物源に由来する任意の天然型ＣＸＣＬ８（ケモカイン（Ｃ－Ｘ－Ｃモチーフ）リガンド８、インターロイキン８（ＩＬ８）としても知られている）を指す。この用語は「完全長」の未処理のＩＬ８と、細胞内でのプロセシングにより得られる任意の形態のＩＬ８とを包含する。この用語は、ＩＬ８の天然に存在するバリアント、例えば、スプライスバリアント又は対立遺伝子バリアントも包含する。例示的なヒトＩＬ８の核酸配列は、ＮＣＢＩ Ｅｎｔｒｅｚ Ｇｅｎｅ ＩＤ番号３５７６の下に示されている。例示的なヒトＩＬ８のアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受入番号Ｐ１０１４５の下に示されている。
本明細書で使用される場合、「ＣＤ８Ａ」という用語は、別途示されない限り、霊長類（例えば、ヒト）及びげっ歯類（例えば、マウス及びラット）等の哺乳動物を含む、任意の脊椎動物源に由来する任意の天然型ＣＤ８Ａを指す。この用語は「完全長」の未処理のＣＤ８Ａと、細胞内でのプロセシングにより得られる任意の形態のＣＤ８Ａとを包含する。この用語は、ＣＤ８Ａの天然に存在するバリアント、例えば、スプライスバリアント又は対立遺伝子バリアントも包含する。例示的なヒトＣＤ８Ａのアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受入番号Ｍ１２８２４の下に示されている。ヒトＣＤ８Ａによってコードされる例示的なタンパク質のアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受託番号Ｐ０１７３２－１に記載されている。
本明細書で使用される場合、「ＧＺＭＡ」という用語は、別途示されない限り、霊長類（例えば、ヒト）及びげっ歯類（例えば、マウス及びラット）等の哺乳動物を含む、任意の脊椎動物源に由来する任意の天然型ＧＺＭＡ（グランザイムＡ）を指す。この用語は、「全長」のプロセシングされていないＧＺＭＡ、及び細胞におけるプロセシングから生じるＧＺＭＡの任意の形態を包含する。この用語は、ＧＺＭＡの天然に存在するバリアント、例えば、スプライスバリアント、又は対立遺伝子バリアントも包含する。例示的なヒトＧＺＭＡの核酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受託番号Ｍ１８７３７に記載されている。ヒトＧＺＭＡによってコードされる例示的なタンパク質のアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受託番号Ｐ１２５４４－１に記載されている。
本明細書で使用される場合、「ＧＺＭＢ」という用語は、別途示されない限り、霊長類（例えば、ヒト）及びげっ歯類（例えば、マウス及びラット）等の哺乳動物を含む、任意の脊椎動物源に由来する任意の天然型ＧＺＭＢ（グランザイムＢ）を指す。この用語は、「全長」のプロセシングされていないＧＺＭＢ、及び細胞におけるプロセシングから生じるＧＺＭＢの任意の形態を包含する。この用語は、ＧＺＭＢの天然に存在するバリアント、例えば、スプライスバリアント、又は対立遺伝子バリアントも包含する。例示的なヒトＧＺＭＢの核酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受託番号Ｍ１７０１６に記載されている。ヒトＧＺＭＢによってコードされる例示的なタンパク質のアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ 受託番号Ｐ１０１４４－１に記載されている。
本明細書で使用される場合、「ＰＲＦ１」という用語は、別途示されない限り、霊長類（例えば、ヒト）及びげっ歯類（例えば、マウス及びラット）等の哺乳動物を含む、任意の脊椎動物源に由来する任意の天然型ＰＲＦ１（パーフォリン１、孔形成タンパク質としても公知）を指す。この用語は「完全長」の未処理のＰＲＦ１と、細胞内でのプロセシングにより得られる任意の形態のＰＲＦ１とを包含する。この用語は、ＰＲＦ１の天然に存在するバリアント、例えば、スプライスバリアント又は対立遺伝子バリアントも包含する。ヒトＰＲＦ １の例示的な核酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受託番号Ｘ１３２２４及びＸ１２９４０に示されている。ヒトＰＲＦ１によってコードされる例示的なタンパク質のアミノ酸配列は、ＵｎｉＰｒｏｔ受託番号Ｐ１４２２２－１に記載されている。
「検出」という用語は、直接又は間接検出を含む、検出の任意の手段を含む。
本明細書で使用される場合、「バイオマーカー」という用語は、試料、例えば表１～７のいずれか１つに記載の任意の遺伝子、例えばＩＬ８で検出することができる指標、例えば予測、診断及び／又は予後を指す。バイオマーカーは、個体が治療に応答するか又は治療から利益を得る可能性の指標（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法）として、及び／又は特定の、分子的、病理学的、組織学的及び／又は臨床的性質を特徴とする疾患又は障害の特定のサブタイプ（例えば、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ）））の指標としてはたらく可能性がある。いくつかの実施形態では、バイオマーカーは、遺伝子である。バイオマーカーとしては、ポリヌクレオチド（例えば、ＤＮＡ及び／又はＲＮＡ）、ポリヌクレオチドコピー数の変化（例えば、ＤＮＡコピー数）、ポリペプチド、ポリペプチド、及びポリヌクレオチド修飾（例えば、翻訳後修飾）、炭水化物、並びに／又は糖脂質に基づく分子マーカーが挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「試料」という用語は、例えば、物理的、生化学的、化学的及び／又は生理学的特性に基づいて特徴付けられる及び／又は同定される細胞実体及び／又は他の分子実体を含有する、目的の対象及び／又は個体から得られるか又は由来する組成物を指す。例えば、「疾患試料」という句及びその変形は、特徴付けられるべき細胞及び／又は分子実体を含有することが期待されるか又は含有することが知られている、目的の対象から得られた任意の試料を指す。試料としては、組織試料、初代若しくは培養細胞又は細胞株、細胞上清、細胞溶解物、血小板、血清、血漿、硝子体液、リンパ液、滑液、卵胞液、精液、羊水、乳、全血、血液由来の細胞、尿、脳脊髄液、唾液、痰、涙、汗、粘液、腫瘍溶解物、及び組織培養培地、組織抽出物、例えば、ホモジナイズされた組織、腫瘍組織、細胞抽出物、並びにそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。
「組織試料」又は「細胞試料」は、対象又は個体の組織から得られた同様の細胞の集合を意味する。組織又は細胞試料の供給源は、新鮮な、凍結した、及び／又は保存された器官、組織試料、生検、及び／又は吸引液から等の固形組織；血漿等の血液又は任意の血液構成物；脳脊髄液、羊水、腹水、又は間質液等の体液；対象の妊娠又は発育における任意の時期の細胞であってもよい。細胞試料は、例えば、ＰＢＭＣを含み得る。組織試料は、初代又は培養細胞又は細胞株であってもよい。任意に、組織又は細胞試料は、疾患組織／器官から得られる。例えば、「腫瘍試料」は、腫瘍又は他のがん組織から得られた組織試料である。組織試料は、細胞型（例えば、腫瘍細胞及び非腫瘍細胞、がん性細胞及び非がん性細胞）の混合集団を含有し得る。組織試料は、保存剤、抗凝固剤、緩衝液、固定剤、栄養剤、又は抗生物質等の天然の組織と天然では混合しない化合物を含有し得る。
「腫瘍浸潤免疫細胞」とは、本明細書で使用される場合、腫瘍又はその試料中に存在する任意の免疫細胞を指す。腫瘍浸潤性免疫細胞としては、腫瘍内免疫細胞、腫瘍周囲免疫細胞、他の腫瘍間質細胞（例えば、線維芽細胞）、又はそれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。そのような腫瘍浸潤免疫細胞は、例えばＴリンパ球（ＣＤ８＋Ｔリンパ球及び／又はＣＤ４＋Ｔリンパ球等）、Ｂリンパ球、又は顆粒球（例えば、好中球、好酸球、及び好塩基球）、単球、マクロファージ、樹状細胞（例えば、互いに組み合う樹状細胞）、組織球、及びナチュラルキラー細胞を含む他の骨髄系細胞であり得る。
本明細書で使用される場合、「腫瘍細胞」とは、腫瘍又はその試料中に存在する任意の腫瘍細胞を指す。腫瘍細胞を、当該技術分野で公知であり、かつ／又は本明細書に記載される方法を使用して、腫瘍試料中に存在し得る他の細胞、例えば、間質細胞及び腫瘍浸潤免疫細胞と区別することができる。
本明細書における目的では、組織試料の「切片」は、組織試料の単一の部分又は小片、例えば、組織試料（例えば、腫瘍試料）から切り取られた組織又は細胞の薄切片を意味する。組織試料の複数の切片を、採取し、分析に供することができることが理解され、但し、組織試料の同じ切片を、形態学的レベル及び分子レベルの両方で分析することができ、あるいはポリペプチド（例えば、免疫組織化学によって）及び／又はポリヌクレオチド（例えば、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションによって）に関して分析することができることが理解されるものとする。
個体に対する臨床的利益の増加に関連するバイオマーカーの「量」又は「レベル」は、生物学的試料中で検出可能なレベルである。これらは、当業者に既知であり、かつ本明細書にも開示される方法によって測定され得る。評定されるバイオマーカーの発現レベル又は量を使用して、治療への応答を決定することができる。
「発現のレベル」又は「発現レベル」という用語は、一般に、同義に使用され、一般に、生物学的試料中のバイオマーカーの量を指す。「発現」は、一般に、情報（例えば、遺伝子コード及び／又はエピジェネティック情報）が、細胞中に存在し、機能する構造に変換されるプロセスを指す。したがって、本明細書で使用される場合、「発現」とは、ポリヌクレオチドへの転写、ポリペプチドへの翻訳、又は更にポリヌクレオチド及び／又はポリペプチド修飾（例えば、ポリペプチドの翻訳後修飾）を指す場合がある。転写されたポリヌクレオチド、翻訳されたポリペプチド、又はポリヌクレオチド及び／又はポリペプチド修飾（例えば、ポリペプチドの翻訳後修飾）の断片も、それらが選択的スプライシングによって生成された転写物若しくは分解された転写物に由来するか又は例えばタンパク質分解によるポリペプチドの翻訳後プロセシングに由来するかどうかにかかわらず、発現されたものと見なされるべきである。「発現した遺伝子」とは、ｍＲＮＡとしてポリヌクレオチドに転写され、その後、ポリペプチドに翻訳されるもの、及びまたＲＮＡに転写されるが、ポリペプチドに翻訳されないもの（例えば、転移及びリボソームＲＮＡ）を含む。
本明細書で使用される場合、「基準発現レベル」及び「基準レベル」という用語は、別の発現レベル、例えば個体からの試料中の本明細書に記載の１つ以上の遺伝子（例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）の発現レベルが、例えば予測、診断、予後、及び／又は治療決定を行うために比較される発現レベルを互換的に指す。例えば、基準発現レベルは、基準集団（例えば、基準集団、例えば、がんを有する患者の集団における中央値発現レベル、三分位値発現レベル又は最大選択されたログランク基準レベル）、基準試料、及び／又は事前割り当て値（例えば、抗がん療法による治療に対する個体の応答性と、カットオフ値より上及び／又はカットオフ値より下での異なる抗がん療法での治療に対する個体の応答性との間の有意差に基づいて、基準集団において抗がん療法で治療された個体の第１のサブセット（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、例えば、アテゾリズマブ）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法）と、同じ基準集団において異なる抗がん療法で治療された個体の第２のサブセット（又は抗がん療法で治療されていない個体）とを有意に（例えば、統計的に有意に）分離するために以前に決定されたカットオフ値）における発現レベルから誘導され得る。いくつかの実施形態では、最大選択されたログランク基準レベルは、１２ｐｇ／ｍＬのＩＬ８である。いくつかの事例では、基準レベルは、個体への治療（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法）の投与前、投与と同時、又は投与後の時点で個体から得られた試料中の基準レベルであり得る。いくつかの実施形態では、カットオフ値は、基準集団における発現レベルの中央値、又は平均値であり得る。他の実施形態では、基準レベルは、基準集団における発現レベルの上位４０％、上位３０％、上位２０％、上位１０％、上位５％、又は上位１％であり得る。特定の実施形態では、カットオフ値は、基準集団における発現レベルの中央値であり得る。当業者であれば、参照免疫スコア発現レベルに関する数値が、適応症（例えば、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））、発現レベルを検出するために使用される方法論（例えば、ＲＮＡ－ｓｅｑ又はＲＴ－ｑＰＣＲ）、免疫スコアを生成するために使用される統計方法、及び／又は試験される遺伝子の特定の組み合わせに応じて変化し得ることを理解するであろう。
レベルを「上回る」（例えば、基準レベルを上回る）、「発現の増加」、「発現レベルの増加」、「レベルの増加」、「発現の上昇」、「発現レベルの上昇」、又は「レベルの上昇」という表現は、対照（例えば、疾患又は障害（例えば、がん）に罹患していない個体（複数可））中のバイオマーカーの発現レベル、内部対照（例えば、ハウスキーピングバイオマーカー）、若しくは治療（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法）の投与前に得られた試料中のバイオマーカーのレベルと比較して、又は基準レベル（例えば、患者（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに対する応答性について試験されている、がんを有する患者）の群／集団由来の試料中のバイオマーカーの発現レベル中央値、患者（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに対して応答しないと同定された、がんを有する患者）の群／集団由来の試料中のバイオマーカーの発現レベル中央値、若しくは以前に個体から前もって得られた試料中のレベル）と比較して、個体におけるバイオマーカー（例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）の発現レベルの増加又はレベルの増加を指す。
レベル「未満」（例えば、基準レベル未満）、「発現の減少」、「発現レベルの減少」、「レベルの減少」、「発現の低下」、「発現レベルの低下」、又は「レベルの低下」という表現は、対照（例えば、疾患又は障害（例えば、がん）に罹患していない個体（複数可））におけるバイオマーカーの発現レベルと比較して、個体におけるバイオマーカー（例えば、表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）、内部対照（例えば、ハウスキーピングバイオマーカー）、又は治療（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法）の投与前に得られた試料中のバイオマーカーのレベル））若しくは基準レベル（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに対する反応性について試験される患者群／集団、例えば、がんを有する患者からの試料中のバイオマーカーの発現レベルの中央値）に対する相対値；例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに応答しないと同定されたがんを有する患者の患者群／集団からの試料中のバイオマーカーの発現レベルの中央値；又は、以前の時期にその個体から事前に得られた試料におけるレベル）に対する発現低下又はレベル低下を指す。いくつかの実施形態では、低減した発現とは、発現がほとんど又はまったくないことである。
「基準試料」、「基準細胞」、「基準組織」、「対照試料」、「対照細胞」、又は「対照組織」は、本明細書で使用される場合、比較目的のために使用される試料、細胞、組織、又は標準物を指す。一実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、同じ患者又は個体の身体の健康な及び／又は罹患していない部分（例えば、組織又は細胞）から得られる。例えば、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、罹患した細胞又は組織に隣接する、健康な及び／又は罹患していない細胞又は組織（例えば、腫瘍に隣接する細胞又は組織）であってもよい。別の実施形態では、基準試料は、同じ患者又は個体の身体の治療されていない組織及び／又は細胞から得られる。更に別の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、患者又は個体ではない、ある個体の身体の健康な及び／又は罹患していない部分（例えば、組織又は細胞）から得られる。なお別の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、患者又は個体ではない、ある個体の身体の治療されていない組織及び／又は細胞から得られる。別の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、治療（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法）の投与前に、患者から得られる。
「ハウスキーピングバイオマーカー」という用語は、通常、全ての細胞型に同様に存在する、バイオマーカー又はバイオマーカー（例えば、ポリヌクレオチド及び／又はポリペプチド）の群を指す。いくつかの実施形態では、ハウスキーピングバイオマーカーは、「ハウスキーピング遺伝子」である。「ハウスキーピング遺伝子」は、本明細書において、その活性が細胞機能の維持に必須であるタンパク質をコードし、通常、全ての細胞型に同様に存在する遺伝子又は遺伝子の群を指す。
本明細書で使用される場合、「増幅」とは、一般に、所望の配列の複数のコピーを生成するプロセスを指す。「複数のコピー」とは、少なくとも２つのコピーを意味する。「コピー」は、鋳型配列に対する完全な配列相補性又は同一性を必ずしも意味しない。例えば、コピーは、デオキシイノシン等のヌクレオチド類縁体、意図的な配列改変（鋳型にハイブリダイズ可能であるが相補的ではない配列を含むプライマーによって導入される配列改変等）、及び／又は増幅中に生じる配列エラーを含み得る。
「多重ＰＣＲ」という用語は、単一の反応で２つ以上のＤＮＡ配列を増幅させる目的で、１超のプライマーセットを使用して単一の源（例えば、個体）から得られた核酸上で行われる単一のＰＣＲ反応を指す。
本明細書で使用される場合、「ポリメラーゼ連鎖反応」又は「ＰＣＲ」の技術は、一般に、核酸、ＲＮＡ、及び／又はＤＮＡの微量の特定の一片が、例えば、米国特許第４，６８３，１９５号に記載されるように増幅される、手順を指す。一般に、オリゴヌクレオチドプライマーが設計され得るように、目的とする領域の末端又はそれ以降からの配列情報が利用可能でなければならず、これらのプライマーの配列は、増幅される鋳型の反対側の鎖と同一また同様である。２つのプライマーの５’末端ヌクレオチドは、増幅される材料の端部と一致し得る。ＰＣＲを用いて、特定のＲＮＡ配列、全ゲノムＤＮＡ由来の特定のＤＮＡ配列及び全細胞ＲＮＡから転写したｃＤＮＡ、バクテリオファージ配列又はプラスミド配列等を増幅し得る。一般に、Ｍｕｌｌｉｓ ｅｔ ａｌ．，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｓｙｍｐ．Ｑｕａｎｔ．Ｂｉｏｌ．５１：２６３（１９８７）及びＥｒｌｉｃｈ，ｅｄ．，ＰＣＲ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，（Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ，１９８９）を参照されたい。本明細書で使用される場合、ＰＣＲは、プライマーとしての既知の核酸（ＤＮＡ又はＲＮＡ）の使用を含む、核酸試験試料を増幅する核酸ポリメラーゼ反応法の一例であると見なされるが、唯一の例ではなく、核酸の特定の小片を増幅若しくは生成するために、又は特定の核酸に相補的な核酸の特定の小片を増幅若しくは生成するために、核酸ポリメラーゼを利用する。
「定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応」又は「ｑＲＴ－ＰＣＲ」とは、ＰＣＲ産物の量がＰＣＲ反応の各工程で測定されるＰＣＲの一形態を指す。この技術は、例えば、Ｃｒｏｎｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ．Ｊ．Ｐａｔｈｏｌ．１６４（１）：３５－４２（２００４）及びＭａ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｌｌ ５：６０７－６１６（２００４）を含む、様々な刊行物に記載されている。
「マイクロアレイ」という用語は、基板上のハイブリダイズ可能なアレイ要素、好ましくはポリヌクレオチドプローブの規則的配置を指す。
「診断」という用語は、分子的又は病理学的状態、疾患、又は症状（例えば、がん）の同定又は分類を指すために本明細書で使用される。例えば、「診断」とは、特定のタイプのがんの同定を指し得る。「診断」はまた、例えば組織病理学的基準によるか又は分子的特徴による、がんの特定のサブタイプ（例えば、バイオマーカー（例えば、特定の遺伝子、又は当該遺伝子によりコードされるタンパク質）のうちの１つ又はその組み合わせの発現によって特徴付けられるサブタイプ）の分類を指す場合もある。
本明細書で使用される場合、「診断を援助する」という用語は、疾患又は障害（例えば、がん）の特定のタイプの症状又は状態の存在又は性質に関して臨床的決定を行う助けとなる方法を指すために本明細書で使用される。例えば、疾患又は症状（例えば、がん）の診断を補助する方法は、個体からの生物学的試料中の特定のバイオマーカー（例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）を測定することを含み得る。
「相関する」又は「相関すること」とは、任意の方法で、第１の解析又はプロトコルの性能及び／又は結果を第２の解析又はプロトコルの性能及び／又は結果と比較することを意味する。例えば、第１の分析若しくはプロトコルの結果を、第２のプロトコルを行う際に使用してもよく、及び／又は第１の分析若しくはプロトコルの結果を使用して、第２の分析若しくはプロトコルを行うべきかどうかを決定してもよい。ポリペプチド解析又はプロトコルの実施形態に関して、ポリペプチド発現解析又はプロトコルの結果を使用して、特定の治療レジメンを行うべきかどうかを決定することができる。ポリヌクレオチド解析又はプロトコルの実施形態に関して、ポリヌクレオチド発現解析又はプロトコルの結果を使用して、特定の治療レジメンを行うべきかどうかを決定することができる。
「治療に対する応答」、「治療に対する応答性」又は「治療からの利益」は、個体に対する利益を示す任意のエンドポイントを使用して評定することができ、限定されないが、（１）疾患進行（例えば、がんの進行）のある程度の阻害（減速及び完全停止を含む）；（２）腫瘍サイズの縮小（例えば、完全奏効若しくは部分奏効を含む客観的奏効、又はそのような奏効の比率若しくは可能性）；（３）隣接する末梢臓器及び／又は組織へのがん細胞浸潤の抑制（すなわち、減少、減速又は完全停止）；（４）転移の阻害（すなわち、減少、減速又は完全停止）；（５）疾患又は障害（例えば、がん）に関連する１つ以上の症候のある程度の軽減；（６）全生存期間（例えば、ＯＳハザード比（ＨＲ）＜１）及び無増悪生存期間（例えば、ＰＦＳ ＨＲ＜１）を含む生存期間の増加又は延長；及び／又は（９）治療後の所与の時点での死亡率の低下（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の若しくはＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療）。一実施形態では、バイオマーカー（例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）を使用して、バイオマーカーを発現しない患者と比較して、医薬品（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の若しくはＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療）による治療に応答する可能性が増えていると予測される個体を同定する。
「奏効」とは、完全奏効（ＣＲ）又は部分奏効（ＰＲ）を含む測定可能な応答を指す。いくつかの実施形態では、「奏効率（ＯＲＲ）」とは、完全奏効（ＣＲ）率及び部分奏効（ＰＲ）率の合計を指す。
「完全奏効」又は「ＣＲ」とは、治療に対する応答において、がんの全ての徴候の消滅（例えば、全ての標的病変の消滅）が意図される。これは、必ずしもがんが治癒されたことを意味しない。
「持続的応答」とは、治療の休止後に腫瘍成長を低減させることに対する持続的効果を指す。例えば、腫瘍サイズは、医薬品の投与期の開始時のサイズと比較して、同じままであっても、より小さくてもよい。いくつかの実施形態では、持続性応答は、治療期間と少なくとも同じ期間、治療期間の少なくとも１．５倍、２．０倍、２．５倍、若しくは３．０倍又はそれ以上の期間を有する。
本明細書で使用される場合、「がんの再発を低減又は阻害すること」とは、腫瘍若しくはがんの再発、又は腫瘍若しくはがんの進行を低減又は阻害することを意味する。本明細書に開示されるように、がんの再発及び／又はがんの進行には、がん転移が含まれるが、これに限定されない。
本明細書で使用される場合、「部分奏効」又は「ＰＲ」とは、治療に応答した、１つ以上の腫瘍若しくは病巣のサイズ、又は身体内のがんの範囲の低下を指す。例えば、いくつかの実施形態では、ＰＲは、ベースラインＳＬＤを基準として、標的病変の最長直径の合計（ＳＬＤ）の少なくとも３０％の減少を指す。
本明細書で使用される場合、「安定疾患」又は「ＳＤ」は、治療開始以降の最小ＳＬＤを基準として、ＰＲと言えるほどの十分な標的病変の収縮も、ＰＤと言えるほどの十分な増加もないことを指す。
本明細書で使用される場合、「進行性疾患」又は「ＰＤ」とは、治療開始以降、又は１つ以上の新たな病変の存在以降、記録された最小ＳＬＤを基準として、標的病変のＳＬＤの少なくとも２０％の増加を指す。
「生存」という用語は、患者が生存していることを指し、全生存及び無進行生存を含む。
本明細書で使用される場合、「無増悪生存期間」（ＰＦＳ）は、治療中及び治療後の時間の長さを指し、その間、治療されている疾患（例えば、がん）は悪化しない。無増悪生存期間は、患者が完全寛解又は部分寛解を経験した時間の量、並びに患者が安定した疾患を経験した時間の量を含み得る。
本明細書で使用される場合、「全生存」（ＯＳ）は、特定の期間後に生きている可能性が高い、群における個体のパーセンテージを指す。
「生存期間を延長すること」とは、未治療の患者と比較して（すなわち、医薬品で治療されていない患者と比較して）、又は指定されたレベルでバイオマーカーを発現しない患者と比較して、及び／又は抗腫瘍剤で治療された患者と比較して、治療される患者において全生存期間又は無増悪生存期間が増加することを意味する。
免疫機能障害との関連での「機能障害」という用語は、抗原刺激への免疫応答性が低減した状態を指す。この用語には、抗原認識は生じ得るが、後に続く免疫応答が感染又は腫瘍成長の制御に無効である、「消耗」及び／又は「アネルギー」の両方の共通要素が含まれる。
本明細書で使用される場合、「機能障害性」という用語には、抗原認識に対する不応性又は無応答性、具体的には、抗原認識を、増殖、サイトカイン産生（例えば、ＩＬ－２）、及び／又は標的細胞死滅等の下流Ｔ細胞エフェクター機能に翻訳する能力の障害も含まれる。
「アネルギー」という用語は、Ｔ細胞受容体を介して送達される不完全又は不十分なシグナル（例えば、Ｒａｓ活性化の不在下での細胞内Ｃａ２＋の増加）に起因する抗原刺激に対する無応答の状態を指す。Ｔ細胞アネルギーは、共刺激の不在下における抗原での刺激に際しても生じ得、結果的に細胞は、共刺激との関連においても、抗原によるその後の活性化に不応性になる。無応答状態は、多くの場合、インターロイキン２の存在により覆され得る。アネルギーＴ細胞は、クローン増殖を経ず、及び／又はエフェクター機能を獲得しない。
「消耗」という用語は、多くの慢性感染及びがん発症中に生じる持続的ＴＣＲシグナル伝達に起因するＴ細胞機能障害の状態としてのＴ細胞消耗を指す。不完全な又は不十分なシグナル伝達を通じてではなく、持続的シグナル伝達に起因するという点で、これは、アネルギーとは区別される。これは、エフェクター機能不良、阻害性受容体の持続的発現、及び機能的エフェクター又はメモリーＴ細胞とは異なる転写状態によって定義される。疲弊は、感染及び腫瘍の最適な制御を妨げる。消耗は、外因性の負の制御性経路（例えば、免疫制御性サイトカイン）及び細胞内因性の負の制御性（共刺激）経路（ＰＤ－１、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４等）の両方に起因し得る。
「Ｔ細胞機能を増強する」とは、持続した若しくは増幅された生物学的機能を有するようにＴ細胞を誘導するか、引き起こすか、若しくは刺激すること、又は消耗された若しくは不活性のＴ細胞を更新若しくは再活性化することを意味する。Ｔ細胞機能の増強の例としては、介入前のレベルと比較した、ＣＤ８＋Ｔ細胞からのγインターフェロンの分泌の増加、増殖の増加、抗原応答性（例えば、ウイルス、病原体、又は腫瘍のクリアランス）の上昇が挙げられる。一実施形態では、増強のレベルは、少なくとも５０％、あるいは６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、１２０％、１５０％、又は２００％の増強である。この増強を測定する様態は、当業者に公知である。
「腫瘍免疫」とは、腫瘍が免疫認識及び排除を回避する過程を指す。したがって、治療的概念として、腫瘍免疫は、そのような回避が減弱し、腫瘍が免疫系によって認識かつ攻撃されるときに「治療される」。腫瘍認識の例としては、腫瘍結合、腫瘍縮小及び腫瘍排除が挙げられる。
「免疫原性」とは、免疫応答を誘発する特定の物質の能力を指す。腫瘍は、免疫原性であり、腫瘍免疫原性を増強させることは、免疫応答による腫瘍細胞の排除を助ける。腫瘍免疫原性の増強の例としては、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストによる治療が挙げられる。
「プログラム死リガンド１」及び「ＰＤ－Ｌ１」という用語は、本明細書において、天然型配列ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、ポリペプチドバリアント、並びに天然型配列ポリペプチド及びポリペプチドバリアントの断片（これらは、本明細書において更に定義される）を指す。本明細書に記載されるＰＤ－Ｌ１ポリペプチドは、ヒト組織型から、若しくは別の源から等、多様な供給源から単離されるか、又は組換え法若しくは合成法によって調製されたものであり得る。
「天然型配列ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド」は、対応する、自然界に由来するＰＤ－Ｌ１ポリペプチドと同じアミノ酸配列を有するポリペプチドを含む。
「ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドバリアント」又はその変化形は、本明細書に定義されるＰＤ－Ｌ１ポリペプチド、一般的には活性型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドであって、本明細書に開示される天然型配列ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド配列のいずれかに対して少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有するものを意味する。そのようなＰＤ－Ｌ１ポリペプチドバリアントには、例えば、天然型アミノ酸配列のＮ末端又はＣ末端に１つ以上のアミノ酸残基が付加又は欠失されたＰＤ－Ｌ１ポリペプチドが含まれる。通常、ＰＤ－Ｌ１ポリペプチドバリアントは、本明細書に開示される天然型配列ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド配列に対して少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性、あるいは少なくとも約８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％のアミノ酸配列同一性を有する。通常、ＰＤ－Ｌ１バリアントポリペプチドは、少なくとも約１０アミノ酸長であり、あるいは少なくとも約２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２８１、２８２、２８３、２８４、２８５、２８６、２８７、２８８、若しくは２８９アミノ酸長、又はそれ以上である。任意に、ＰＤ－Ｌ１バリアントポリペプチドは、天然型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド配列と比較して１つ以下の保存的アミノ酸置換、あるいは天然型ＰＤ－Ｌ１ポリペプチド配列と比較して２、３、４、５、６、７、８、９、又は１０個以下の保存的アミノ酸置換を有する。
「血管内皮増殖因子」又は「ＶＥＧＦ」という用語は、Ｓｗｉｓｓ Ｐｒｏｔ受託番号Ｐ１５６９２、Ｇｅｎｅ ＩＤ（ＮＣＢＩ）：７４２２によって例示されるような、血管内皮増殖因子タンパク質Ａを指す。「ＶＥＧＦ」という用語は、Ｓｗｉｓｓ Ｐｒｏｔ受託番号Ｐ１５６９２、Ｇｅｎｅ ＩＤ（ＮＣＢＩ）：７４２２のアミノ酸配列を有するタンパク質、並びにそのホモログ及びアイソフォームを包含する。「ＶＥＧＦ」という用語はまた、ＶＥＧＦの既知のアイソフォーム、例えば、スプライスアイソフォーム、例えば、ＶＥＧＦ１１１、ＶＥＧＦ１２１、ＶＥＧＦ１４５、ＶＥＧＦ１６５、ＶＥＧＦ１８９、及びＶＥＧＦ２０６、並びにそれらの天然に存在する対立遺伝子及びプロセシングされた形態（ＶＥＧＦ１６５のプラスミン切断によって生成される１１０アミノ酸のヒト血管内皮細胞増殖因子を含む）を包含し、これらは、Ｆｅｒｒａｒａ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．Ｃｅｌｌ．２１：６８７，２０１０；Ｌｅｕｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４６：１３０６．１９８９；及びＨｏｕｃｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ．Ｅｎｄｏｃｒｉｎ．，５：１８０６，１９９１に記載されている。「ＶＥＧＦ」という用語はまた、マウス、ラット、又は霊長類等の非ヒト種に由来するＶＥＧＦも指す。特定の種に由来するＶＥＧＦは、ヒトＶＥＧＦではｈＶＥＧＦ、マウスＶＥＧＦではｍＶＥＧＦ等の用語によって示されることがある。「ＶＥＧＦ」という用語はまた、１６５個のアミノ酸のヒト血管内皮細胞増殖因子のアミノ酸８～１０９又は１～１０９を含む、ポリペプチドの切断形態を指すためにも使用される。ＶＥＧＦの任意のこのような形態への言及を、本出願では、例えば、「ＶＥＧＦ１０９」、「ＶＥＧＦ（８～１０９）」、「ＶＥＧＦ（１～１０９）」、又は「ＶＥＧＦ１６５」によって同定することができる。「切断された」天然型ＶＥＧＦのアミノ酸位置は、天然型ＶＥＧＦ配列に示される通りにナンバリングされる。例えば、切断された天然型ＶＥＧＦでのアミノ酸位置１７番（メチオニン）は、天然型ＶＥＧＦでも位置１７番（メチオニン）である。切断された天然型ＶＥＧＦは、ＫＤＲ及びＦｌｔ－１受容体に対して、天然型ＶＥＧＦに匹敵する結合親和性を有する。本明細書で使用される場合、「ＶＥＧＦバリアント」という用語は、天然型ＶＥＧＦ配列に１つ以上のアミノ酸変異を含むＶＥＧＦポリペプチドを指す。任意に、１つ以上のアミノ酸変異には、アミノ酸置換（複数可）が含まれる。本明細書に記載のＶＥＧＦバリアントを簡潔に表記する目的で、数字は、（Ｌｅｕｎｇ ｅｔ ａｌ．，（上記参照）及びＨｏｕｃｋ ｅｔ ａｌ．，（上記参照）で提供される）推定上の天然型ＶＥＧＦのアミノ酸配列に沿ったアミノ酸残基の位置を指すことに留意されたい。別途明記されない限り、本明細書で使用される場合、「ＶＥＧＦ」という用語は、ＶＥＧＦ－Ａを示す。
本明細書で同義に使用される「ポリヌクレオチド」又は「核酸」は、任意の長さのヌクレオチドのポリマーを指し、ＤＮＡ及びＲＮＡを含む。ヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾ヌクレオチド若しくは塩基、及び／又はそれらの類縁体であっても、又はＤＮＡ若しくはＲＮＡポリメラーゼによって若しくは合成反応によってポリマーに組み込まれ得る任意の基質であってもよい。したがって、例えば、本明細書で定義されるポリヌクレオチドとしては、一本鎖及び二本鎖ＤＮＡ、一本鎖及び二本鎖領域を含むＤＮＡ、一本鎖及び二本鎖ＲＮＡ、並びに一本鎖及び二本鎖領域を含むＲＮＡ、一本鎖若しくはより典型的には二本鎖を含むか又は一本鎖及び二本鎖領域を含み得るＤＮＡ及びＲＮＡを含むハイブリッド分子が挙げられるが、これらに限定されない。加えて、本明細書で使用される場合、「ポリヌクレオチド」という用語は、ＲＮＡ若しくはＤＮＡ、又はＲＮＡ及びＤＮＡの両方を含む三本鎖領域を指す。このような領域内の鎖は、同じ分子由来であっても、又は異なる分子由来であってもよい。これらの領域は、これらの分子のうちの１つ以上の全てを含み得るが、より典型的には、これらの分子のうちのいくつかの領域のみを含む。三重らせん領域の分子のうちの１つは、多くの場合、オリゴヌクレオチドである。「ポリヌクレオチド」という用語は、具体的にはｃＤＮＡを含む。
ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチド及びそれらの類縁体等の修飾されたヌクレオチドを含んでもよい。存在する場合には、ヌクレオチド構造に対する修飾は、ポリマーのアセンブリの前に付与されても、又は後に付与されてもよい。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド成分によって遮られ得る。ポリヌクレオチドは、標識との複合等によって、合成後に更に修飾されてもよい。修飾の他の種類としては、天然に存在するヌクレオチドのうちの１つ以上の類縁体での置換、ヌクレオチド間修飾、例えば、非電荷性結合（例えば、メチルホスホン酸塩、ホスホトリエステル、ホスホアミデート、カルバメート等）によるもの、及び電荷性結合（例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート等）によるもの、懸垂部分、例えばタンパク質（例えば、ヌクレアーゼ、毒素、抗体、シグナルペプチド、ポリ－Ｌ－リシン等）等を含むもの、挿入剤（例えば、アクリジン、ソラーレン等）によるもの、キレート剤（例えば、金属、放射活性金属、ホウ素、酸化金属等）を含むもの、アルキル化剤を含むもの、修飾結合（例えば、アルファアノマー核酸等）によるもの、並びにポリヌクレオチド（複数可）の未修飾形態等が挙げられる。更に、糖内に通常存在するヒドロキシル基のうちのいずれかは、例えば、ホスホン酸基、リン酸基により代置されるか、標準的な保護基により保護されるか、若しくは活性化されて追加のヌクレオチドへの追加の結合を準備してもよく、又は固体若しくは半固体支持体にコンジュゲートされてもよい。５’及び３’末端ＯＨは、リン酸化され得るか又はアミン若しくは１～２０個の炭素原子の有機キャッピング基部分で置換され得る。他のヒドロキシルもまた、標準的な保護基に誘導体化されてもよい。ポリヌクレオチドは、例えば、２’－Ｏ－メチル－、２’－Ｏ－アリル－、２’－フルオロ－、又は２’－アジド－リボース、炭素環糖の類縁体、α－アノマ－糖、エピマー糖、例えば、アラビノース、キシロース、又はリキソース、ピラノース糖、フラノース糖、セドヘプツロース、アクリル酸類縁体、及び脱塩基ヌクレオシド類縁体、例えば、メチルリボシドを含む、当該技術分野で一般的に知られているリボース糖又はデオキシリボース糖の類似形態も含み得る。１つ以上のホスホジエステル結合は、代替的な連結基によって代置されてもよい。これらの代替的な連結基としては、ホスフェートがＰ（Ｏ）Ｓ（「チオエート」）、Ｐ（Ｓ）Ｓ（「ジチオエート」）、’’（Ｏ）ＮＲ２（「アミデート」）、Ｐ（Ｏ）Ｒ、Ｐ（Ｏ）ＯＲ’、ＣＯ、又はＣＨ２（「ホルムアセタール」）に置き換えられる実施形態が挙げられるが、これらに限定されず、各Ｒ又はＲ’は独立して、Ｈであるか、又は置換若しくは非置換アルキル（１－２０Ｃ）（任意に、エーテル（－Ｏ－）結合を含む）、アリール、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、若しくはアラルジルである。ポリヌクレオチドにおける結合全てが同一である必要はない。ポリヌクレオチドは、本明細書に記載される１つ以上の異なる種類の修飾及び／又は同じ種類の複数の修飾を含有し得る。前述の説明は、ＲＮＡ及びＤＮＡを含む本明細書で言及される全てのポリヌクレオチドに適用される。
「オリゴヌクレオチド」は、本明細書で使用される場合、一般に、約２５０ヌクレオチド長未満であるが、必ずしもそうではない短い一本鎖ポリヌクレオチドを指す。オリゴヌクレオチドは、合成であってもよい。「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」という用語は、相互排他的ではない。ポリヌクレオチドについての上記の説明は、オリゴヌクレオチドに等しく、かつ完全に適用可能である。
「プライマー」という用語は、核酸にハイブリダイズすることができ、一般に、遊離３’－ＯＨ基を提供することによって、相補的核酸の重合を可能にする、一本鎖ポリヌクレオチドを指す。
「低分子」という用語は、約２０００ダルトン以下、好ましくは約５００ダルトン以下の分子量を有する任意の分子を指す。
「宿主細胞」、「宿主細胞株」及び「宿主細胞培養物」という用語は互換的に使用され、外因性の核酸が導入された細胞を指し、そのような細胞の子孫を含む。宿主細胞には、初代形質転換細胞、及び継代の数にかかわらずそれに由来する子孫を含む、「形質転換体」及び「形質転換細胞」が含まれる。子孫は、核酸含量が親細胞と完全に同じでなくてもよく、変異を含んでもよい。本明細書には、最初に形質転換された細胞でスクリーニング又は選択されたものと同じ機能又は生物活性を有する突然変異子孫が含まれる。
本明細書で使用される場合、「ベクター」という用語は、それが連結されている別の核酸を伝播することができる核酸分子を指す。この用語は、自己複製する核酸構造としてのベクター、及びベクターが導入された宿主細胞のゲノム内へと組み込まれたベクターを含む。特定のベクターは、それらが機能的に連結されている核酸の発現を指示することができる。このようなベクターを、本明細書では「発現ベクター」と言う。
「単離された」核酸は、その自然環境の成分から分離された核酸分子を指す。単離された核酸には、通常核酸分子を含む細胞内に含まれる核酸分子が含まれるが、核酸分子は、染色体外、又は天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在する。
「障害」は、哺乳動物を問題の障害に罹患させる症状を含む、慢性及び急性の障害又は疾患を含むがこれらに限定されない、治療から利益を得るであろういずれかの症状である。
「がん」及び「がん性」という用語は、制御されていない細胞成長を典型的に特徴とする哺乳動物における生理学的症状を指すか又は説明する。がんの例としては、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、及び白血病又はリンパ性悪性腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない。このようながんの更に具体的な例としては、限定するものではないが、腎臓又は腎がん（例えば、腎細胞がん癌腫（ＲＣＣ））、肺がん（小細胞肺がん、非小細胞肺がん、肺の腺がん、及び肺の扁平上皮癌腫を含む）、膀胱がん（例えば、尿路上皮膀胱癌腫（ＵＣ）、筋層浸潤性膀胱がん（ＭＩＢＣ）、及びＢＣＧ不応性非筋層浸潤性膀胱がん（ＮＭＩＢＣ））、尿路のがん、乳がん（例えば、ＨＥＲ２＋乳がん及びトリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）、（これはエストロゲン受容体（ＥＲ－）、プロゲステロン受容体（ＰＲ－）、及びＨＥＲ２（ＨＥＲ２－）陰性である）、去勢抵抗性前立腺がん（ＣＲＰＣ）等の前立腺がん、腹膜のがん、肝細胞がん、胃がん又は胃のがん（消化管がん及び消化管間質がんを含む）、膵臓がん、膠芽腫、子宮頸がん、卵巣がん、肝臓がん（例えば、肝細胞癌腫（ＨＣＣ））、肝がん、結腸がん、直腸がん、大腸がん、子宮内膜癌腫又は子宮癌腫、唾液腺癌腫、前立腺がん、外陰がん、甲状腺がん、肝癌腫、肛門癌腫、陰茎癌腫、黒色腫（表在拡大型黒色腫、悪性黒子型黒色腫、末端黒子型黒色腫、及び結節型黒色腫を含む）、多発性骨髄腫及びＢ細胞リンパ腫（低悪性度／濾胞性非ホジキンリンパ腫（ＮＨＬ）、小リンパ球性（ＳＬ）ＮＨＬ、中悪性度／濾胞性ＮＨＬ、中悪性度びまん性ＮＨＬ、高悪性度免疫芽細胞性ＮＨＬ、高悪性度リンパ芽球性ＮＨＬ、高悪性度小型非分割細胞性ＮＨＬ、巨大病変ＮＨＬ、マントル細胞リンパ腫、ＡＩＤＳ関連リンパ腫、及びワルデンストレームマクログロブリン血症を含む）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）、急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、有毛細胞白血病、慢性骨髄芽球性白血病（ＣＭＬ）、移植後リンパ増殖性疾患（ＰＴＬＤ）、及び骨髄異形成症候群（ＭＤＳ）、並びにファコマトーシスと関連する異常血管増殖、浮腫（脳の腫瘍に関連するもの等）、メイグス症候群、脳腫瘍、頭頸部がん、及び関連する転移が挙げられる。いくつかの実施形態では、がんは、膀胱がんである。特定の実施形態では、膀胱がんはＵＣ（例えば、進行性ＵＣ又は転移性ＵＣ（ｍＵＣ））である。いくつかの実施形態では、がんは腎臓がんである。特定の実施形態では、腎臓がんは、ＲＣＣ（例えば、以前に未治療のＲＣＣを含む、進行性ＲＣＣ又は転移性ＲＣＣ（ｍＲＣＣ））である。
「早期がん」又は「早期腫瘍」とは、浸潤性でも転移性でもないがんを意味し、ステージ０のがん、ステージＩのがん、又はステージＩＩのがんに分類される。
「進行性」がんとは、元の部位又は器官の外に、局所浸潤又は転移のいずれかによって広がったがんである。
「不応性」がんとは、化学療法剤等の抗腫瘍剤ががん患者に投与されているにもかかわらず進行するがんである。不応性がんの例は、白金不応性であるがんである。
「再発性」がんとは、最初の治療に応答した後に、最初の部位又は遠隔部位のいずれかで再増殖したがんである。
「細胞増殖性障害」及び「増殖性障害」という用語は、ある程度の異常な細胞増殖に関連する障害を指す。一実施形態では、細胞増殖性障害は、がんである。
「腫瘍」という用語は、本明細書で使用される場合、悪性であるか良性であるかにかかわらず、全ての新生物の細胞成長及び増殖、並びに全ての前がん性及びがん性の細胞及び組織を指す。
「がん」、「がん性」、「細胞増殖性障害」、「増殖性障害」、及び「腫瘍」という用語は、本明細書で言及される場合、相互排他的ではない。
「医薬製剤」という用語は、調製物中に含有される活性成分の生物学的活性が有効になるような形態であり、かつ製剤を投与する対象にとって許容できないほど有毒である更なる構成成分を含有しない調製物を指す。
「薬学的に許容され得る担体」は、対象にとって無毒である、活性成分以外の薬学的製剤中の成分を指す。薬学的に許容され得る担体には、緩衝剤、賦形剤、安定剤、又は防腐剤が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「治療」（及びその文法的な変形語、例えば、「治療する」又は「治療すること」）は、治療される個体の本来の経過を変える試みにおける臨床的介入を指し、予防のために、又は臨床病理の経過の間に行うことができる。治療の望ましい効果には、限定されないが、疾患の発症又は再発を予防すること、症状の緩和、疾患の直接的又は間接的な病理学的帰結の縮小、転移を予防すること、疾患の進行の速度を遅らせること、疾患の状態の改善又は緩和、及び寛解又は予後の改善が含まれる。いくつかの実施形態では、抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体及び／又は抗ＰＤ－１抗体）は、疾患の発達を遅らせるか、又は疾患の進行を減速させるために使用される。
「抗がん療法」という用語は、がんの治療に有用な治療を指す。抗がん療法剤の例には、チェックポイント阻害剤（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体））又はＰＤ－１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））、細胞傷害剤、化学療法剤、成長阻害剤、放射線療法で使用される薬剤、抗血管新生剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、抗ＶＥＧＦ抗体（例えば、ベバシズマブ）））、アポトーシス剤、抗チューブリン剤、及びがんを治療するための他の薬剤、例えば抗ＣＤ２０抗体、血小板由来成長因子阻害剤（例えば、ＧＬＥＥＶＥＣ（商標）（メシル酸イマチニブ））、ＣＯＸ－２阻害剤（例えば、セレコキシブ）、インターフェロン、サイトカイン、以下の標的ＰＤＧＦＲ－β、ＢｌｙＳ、ＡＰＲＩＬ、ＢＣＭＡ受容体、ＴＲＡＩＬ／Ａｐｏ２、他の生物活性及び有機化学物質の１つ以上に結合するアンタゴニスト（例えば、中和抗体）等が含まれるが、これらに限定されない。これらの組み合わせも本発明に含まれる。
「単剤療法」とは、障害（例えば、がん）を治療するために１種類の治療（例えば、治療剤又は他の治療様式（例えば、放射線））を使用する治療法（例えば、抗がん療法）を指す。例えば、単剤療法は、障害を治療するための単一の治療剤の使用を指し得る。例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法は、いかなる追加の抗がん剤治療剤もなしでＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを投与することを含む療法である。別の例では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法は、追加の抗がん療法剤なしでＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを投与することを含む療法である。
「ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト」という用語は、ＰＤ－１シグナル伝達軸上のシグナル伝達に起因するＴ細胞機能障害を除去するように、ＰＤ－Ｌ１軸結合パートナーとその結合パートナーのうちの１つ以上との相互作用を阻害し、結果として、Ｔ細胞機能が復元又は増強される分子を指す。本明細書で使用される場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト及びＰＤ－１結合アンタゴニスト、並びにＰＤ－Ｌ１とＰＤ－１との間の相互作用を妨害する分子（例えば、ＰＤ－Ｌ２－Ｆｃ融合体）を含む。
本明細書で使用される場合、「ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト」は、ＰＤ－Ｌ１と、ＰＤ－１及び／又はＢ７－１等のその結合パートナーのうちの１つ以上との相互作用から生じるシグナル形質導入を低下、遮断、阻害、抑止、又は妨害する分子である。いくつかの実施形態において、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、その結合パートナーへの結合を阻害する分子である。具体的な態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１及び／又はＢ７－１への結合を阻害する。いくつかの実施形態では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－Ｌ１抗体及びその抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、オリゴペプチド、小分子アンタゴニスト、ポリヌクレオチドアンタゴニスト、並びにＰＤ－Ｌ１と、ＰＤ－１及び／又はＢ７－１等のその結合パートナーのうちの１つ以上との相互作用に起因するシグナル形質導入を低下、遮断、阻害、抑止、又は妨害する他の分子を含む。一実施形態では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１又はＰＤ－１を介してＴリンパ球及び他の細胞上で発現される細胞表面タンパク質により又はそれを介して媒介される負のシグナルを低減し、これにより、機能不全のＴ細胞の機能不全状態を軽減する。いくつかの実施形態では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。具体的な一態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本明細書に記載のＹＷ２４３．５５．Ｓ７０である。別の具体的な態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本明細書に記載のＭＤＸ－１１０５である。更に別の特定の態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本明細書に記載のアテゾリズマブである。また別の具体的な態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本明細書に記載されるＭＥＤＩ４７３６（デュルバルマブ）である。また別の具体的な態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本明細書に記載されるＭＳＢ００１０７１８Ｃ（アベルマブ）である。
本明細書で使用される場合、「ＰＤ－１結合アンタゴニスト」とは、ＰＤ－１と、ＰＤ－Ｌ１及び／又はＰＤ－Ｌ２等のその結合パートナーのうちの１つ以上との相互作用から生じるシグナル形質導入を低下、遮断、阻害、抑止、又は妨害する分子である。いくつかの実施形態では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、ＰＤ－１のその結合パートナーへの結合を阻害する分子である。特定の態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、ＰＤ－１のＰＤ－Ｌ１及び／又はＰＤ－Ｌ２への結合を阻害する。例えば、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－１抗体及びその抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、オリゴペプチド、小分子アンタゴニスト、ポリヌクレオチドアンタゴニスト、並びにＰＤ－１と、ＰＤ－Ｌ１及び／又はＰＤ－Ｌ２との相互作用から生じるシグナル形質導入を低下、遮断、阻害、抑止、又は妨害する他の分子を含む。一実施形態では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、ＰＤ－１又はＰＤ－Ｌ１を介してＴリンパ球及び他の細胞上で発現される細胞表面タンパク質により又はそれを介して媒介される負のシグナルを低減し、これにより、機能不全のＴ細胞の機能不全状態を軽減する。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－１抗体である。具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載のＭＤＸ－１１０６（ニボルマブ）である。別の具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載のＭＫ－３４７５（ペムブロリズマブ）である。別の具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載されるＭＥＤＩ－０６８０（ＡＭＰ－５１４）である。別の具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載のＰＤＲ００１である。別の具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載のＲＥＧＮ２８１０である。別の具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載のＢＧＢ－１０８である。別の具体的な態様では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、本明細書に記載のＡＭＰ－２２４である。
「ＶＥＧＦアンタゴニスト」又は「ＶＥＧＦ特異的アンタゴニスト」という用語は、ＶＥＧＦに結合するか、ＶＥＧＦ発現レベルを低減させるか、又はＶＥＧＦの生物学的活性（１つ以上のＶＥＧＦ受容体へのＶＥＧＦ結合、ＶＥＧＦシグナル伝達、及びＶＥＧＦ媒介性血管新生、並びに内皮細胞生存又は増殖を含むが、これらに限定されない）を中和、遮断、阻害、抑止、低減、又は妨害することができる分子を指す。例えば、ＶＥＧＦの生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低減、又は妨害することができる分子は、１つ以上のＶＥＧＦ受容体（ＶＥＧＦＲ）（例えば、ＶＥＧＦＲ１、ＶＥＧＦＲ２、ＶＥＧＦＲ３、膜結合型ＶＥＧＦ受容体（ｍｂＶＥＧＦＲ）、又は可溶性ＶＥＧＦ受容体（ｓＶＥＧＦＲ））に結合することによって、その効果を発揮し得る。このようなアンタゴニストは、本明細書では「ＶＥＧＦＲ阻害剤」とも称される。本発明の方法に有用なＶＥＧＦ特異的アンタゴニストとしては、ＶＥＧＦに特異的に結合するポリペプチド、抗ＶＥＧＦ抗体及びその抗原結合断片、ＶＥＧＦに特異的に結合し、それによって１つ以上の受容体への結合を封じる、受容体分子及び誘導体、融合タンパク質（例えば、ＶＥＧＦ－Ｔｒａｐ（Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ））、及びＶＥＧＦ１２１－ゲロニン（Ｐｅｒｅｇｒｉｎｅ）が挙げられる。ＶＥＧＦ特異的アンタゴニストとしてはまた、ＶＥＧＦポリペプチドのアンタゴニストバリアント、ＶＥＧＦポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも断片に相補的なアンチセンス核酸塩基オリゴマー、ＶＥＧＦポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも断片に相補的な低分子ＲＮＡ、ＶＥＧＦを標的とするリボザイム、ＶＥＧＦに対するペプチボディ、及びＶＥＧＦアプタマーが挙げられる。ＶＥＧＦアンタゴニストとしてはまた、ＶＥＧＦＲに結合するポリペプチド、抗ＶＥＧＦＲ抗体、及びその抗原結合断片、並びにＶＥＧＦＲに結合し、それによってＶＥＧＦの生物学的活性（例えば、ＶＥＧＦのシグナル伝達）を遮断、阻害、抑止、低減、若しくは妨害する誘導体、又は融合タンパク質が挙げられる。ＶＥＧＦ特異的アンタゴニストとしてはまた、ＶＥＧＦ又はＶＥＧＦＲに結合し、ＶＥＧＦ生物学的活性を、遮断、阻害、抑止、低減、又は妨害することができる非ペプチド低分子が挙げられる。したがって、「ＶＥＧＦ活性」という用語は、具体的には、ＶＥＧＦのＶＥＧＦ媒介性生物学的活性を含む。特定の実施形態では、ＶＥＧＦアンタゴニストは、ＶＥＧＦの発現レベル又は生物学的活性を、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％以上低減させる、又は阻害する。いくつかの実施形態では、ＶＥＧＦ特異的アンタゴニストによって阻害されるＶＥＧＦは、ＶＥＧＦ（８－１０９）、ＶＥＧＦ（１－１０９）、又はＶＥＧＦ１６５である。
本明細書で使用される場合、ＶＥＧＦアンタゴニストとしては、抗ＶＥＧＦＲ２抗体及び関連する分子（例えば、ラムシルマブ、タニビルマブ、アフリベルセプト）、抗ＶＥＧＦＲ１抗体及び関連する分子（例えば、イクルクマブ、アフリベルセプト（ＶＥＧＦ Ｔｒａｐ－Ｅｙｅ、ＥＹＬＥＡ（登録商標））、及びジブ－アフリベルセプト（ＶＥＧＦ Ｔｒａｐ、ＺＡＬＴＲＡＰ（登録商標））、二重特異性ＶＥＧＦ抗体（例えば、ＭＰ－０２５０、バヌシズマブ（ＶＥＧＦ－ＡＮＧ２）、及びＵＳ２００１／０２３６３８８に開示されている二重特異性抗体）、抗ＶＥＧＦアーム、抗ＶＥＧＦＲ１アーム、及び抗ＶＥＧＦＲ２アームのうちの２つの組み合わせを含む二重特異性抗体、抗ＶＥＧＦＡ抗体（例えば、ベバシズマブ、セバシズマブ）、抗ＶＥＧＦＢ抗体、抗ＶＥＧＦＣ抗体（例えば、ＶＧＸ－１００）、抗ＶＥＧＦＤ抗体、並びに非ペプチド低分子ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、パゾパニブ、アキシチニブ、バンデタニブ、スチバーガ、カボザンチニブ、レンバチニブ、ニンテダニブ、オランチニブ、テラチニブ、ドビチニブ、セジラニブ、モテサニブ、スルファチニブ、アパチニブ、フォレチニブ、ファミチニブ、及びチボザニブ）が挙げられるが、これらに限定されない。
「抗ＶＥＧＦ抗体」とは、十分な親和性及び特異性でＶＥＧＦに結合する抗体である。特定の実施形態では、抗体は、ＶＥＧＦに対して十分に高い結合親和性を有し、例えば、抗体は、１００ｎＭ－１ｐＭのＫｄ値でｈＶＥＧＦに結合し得る。抗体親和性は、例えば、表面プラズモン共鳴系アッセイ（ＰＣＴ出願公開の国際公開第２００５／０１２３５９号に記載されているようなＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）アッセイ等）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、及び競合アッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））によって決定され得る。
特定の実施形態では、抗ＶＥＧＦ抗体は、ＶＥＧＦ活性が関与する疾患又は症状を標的とし、かつそれを妨害する際に治療剤として使用され得る。抗体はまた、例えば、治療薬としてのその効果を評価するために、他の生物学的活性アッセイにも供され得る。そのようなアッセイは、当技術分野で既知であり、抗体に対する標的抗原及び意図される使用に依存する。例としては、ＨＵＶＥＣ阻害アッセイ、腫瘍細胞成長阻害アッセイ（例えば、国際公開第８９／０６６９２号に記載のもの）、抗体依存性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）及び補体媒介性細胞傷害性（ＣＤＣ）アッセイ（米国特許第５，５００，３６２号）、並びにアゴニスト活性又は造血アッセイ（国際公開第９５／２７０６２号を参照）が挙げられる。抗ＶＥＧＦ抗体は、通常、ＶＥＧＦ－Ｂ又はＶＥＧＦ－Ｃ等の他のＶＥＧＦホモログにも、ＰＩＧＦ、ＰＤＧＦ、又はｂＦＧＦ等の他の成長因子にも結合しない。一実施形態では、抗ＶＥＧＦ抗体は、ハイブリドーマＡＴＣＣ ＨＢ １０７０９によって産生される、モノクローナル抗ＶＥＧＦ抗体Ａ４．６．１と同じエピトープに結合するモノクローナル抗体である。別の実施形態では、抗ＶＥＧＦ抗体は、ベバシズマブ（ＢＶ、ＡＶＡＳＴＩＮ（登録商標））として既知の抗体を含むが、これに限定されない、Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．（Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７：４５９３－４５９９，１９９７）に従って生成される組換えヒト化抗ＶＥＧＦモノクローナル抗体である。
「ｒｈｕＭＡｂ ＶＥＧＦ」又は「ＡＶＡＳＴＩＮ（登録商標）」としても公知の抗ＶＥＧＦ抗体「ベバシズマブ（ＢＶ）」は、Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．（Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７：４５９３－４５９９，１９９７）に従って生成される組換えヒト化抗ＶＥＧＦモノクローナル抗体である。これは、変異型ヒトＩｇＧ１フレームワーク領域と、ヒトＶＥＧＦの、その受容体への結合を遮断するマウス抗ｈＶＥＧＦモノクローナル抗体Ａ．４．６．１由来の抗原結合相補性決定領域とを含む。フレームワーク領域の大部分を含む、ベバシズマブのアミノ酸配列の約９３％は、ヒトＩｇＧ１に由来し、配列の約７％は、マウス抗体Ａ４．６．１に由来する。ベバシズマブは、分子量が約１４９，０００ダルトンであり、グリコシル化されている。ベバシズマブ及び他のヒト化抗ＶＥＧＦ抗体は、２００５年２月２６日に発行された米国特許第６，８８４，８７９号に更に記載されており、その開示全体は、参照により本明細書に明示的に組み込まれる。追加の好ましい抗体としては、ＰＣＴ出願公開の国際公開第２００５／０１２３５９号に記載されているＧ６又はＢ２０シリーズ抗体（例えば、Ｇ６－３１、Ｂ２０－４．１）が挙げられる。追加の好ましい抗体については、米国特許第７，０６０，２６９号、同第６，５８２，９５９号、同第６，７０３，０２０号、同第６，０５４，２９７号、国際公開第９８／４５３３２号、国際公開第９６／３００４６号、国際公開第９４／１０２０２号、欧州特許第０６６６８６８号Ｂ１、米国特許出願公開第２００６００９３６０号、同第２００５０１８６２０８号、同第２００３０２０６８９９号、同第２００３０１９０３１７号、同第２００３０２０３４０９号、及び同第２００５０１１２１２６号、並びにＰｏｐｋｏｖ ｅｔ ａｌ．，（Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８８：１４９－１６４，２００４）を参照されたい。他の好ましい抗体としては、残基Ｆ１７、Ｍ１８、Ｄ１９、Ｙ２１、Ｙ２５、Ｑ８９、１９１、Ｋ１０１、Ｅ１０３、及びＣ１０４を含むか、又はあるいは残基Ｆ１７、Ｙ２１、Ｑ２２、Ｙ２５、Ｄ６３、１８３、及びＱ８９を含む、ヒトＶＥＧＦ上の機能的エピトープに結合する抗体が挙げられる。
「ＩＬ８アンタゴニスト」とは、ＩＬ８に結合し、ＩＬ８発現レベルを低下させ、又はＩＬ８生物学的活性（１つ以上のＩＬ８受容体へのＩＬ８結合及びＩＬ８シグナル伝達を含むがこれらに限定されない）を中和、遮断、阻害、抑止、低減若しくは妨害することができる分子を指す。例えば、ＩＬ８生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低減又は干渉することができる分子は、１つ以上のＩＬ８受容体（例えば、ＩＬ８ＲＡ及び／又はＩＬ８ＲＢ）に結合することによってその効果を発揮することができる。いくつかの事例では、ＩＬ８アンタゴニストは抗ＩＬ８抗体である。例示的な非限定的な抗ＩＬ８抗体としては、ＨｕＭａｘ－ＩＬ８（別名、ＢＭＳ－９８６２５３）が挙げられる。他の事例では、ＩＬ８アンタゴニストは小分子ＩＬ８阻害剤である。例示的な非限定的な小分子ＩＬ８阻害剤としては、レパリキシンが挙げられる（例えば、Ｌｅｉｔｎｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｉｎｔ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｐａｔｈｏｌ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２０（１）：２５－３６，２００７）。
抗ＩＬ８抗体は、十分な親和性及び特異性でＩＬ８に結合する抗体である。特定の実施形態では、抗体は、ＩＬ８に対して十分に高い結合親和性を有し、例えば、抗体は、１００ｎＭ－１ｐＭのＫｄ値でＩＬ８に結合し得る。抗体親和性は、例えば、表面プラズモン共鳴系アッセイ（ＰＣＴ出願公開の国際公開第２００５／０１２３５９号に記載されているようなＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）アッセイ等）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、及び競合アッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））によって決定され得る。抗ＩＬ８抗体は、中和抗ＩＬ８抗体であり得る。例示的な抗ＩＬ８抗体としては、ＨｕＭａｘ－ＩＬ８（別名、ＢＭＳ－９８６２５３）が挙げられる。
「ＩＬ１Ｂアンタゴニスト」とは、ＩＬ１Ｂに結合し、ＩＬ１Ｂ発現レベルを低下させ、又はＩＬ１Ｂ生物学的活性（１つ以上のＩＬ１Ｂ受容体へのＩＬ１Ｂ結合及びＩＬ１Ｂシグナル伝達が含まれるが、これらに限定されない）を中和、遮断、阻害、抑止、低減若しくは妨害することができる分子を指す。例えば、ＩＬ１Ｂ生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低減又は干渉することができる分子は、「ＩＬ１Ｒアンタゴニスト」とも呼ばれる１つ以上のＩＬ１Ｂ受容体（例えば、ＩＬ１Ｒ１、ＩＬ１Ｒ２及び／又はＩＬ－１ＲＡｃＰ）に結合することによってその効果を発揮することができる（下記参照）。いくつかの事例では、ＩＬ１Ｂ結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－１抗体である。例示的な非限定的な抗ＩＬ１Ｂ抗体としては、カナキヌマブ、ゲボキズマブ、ＬＹ２１８９１０２、ＸＯＭＡ０５２及び２Ｈ（例えば、Ｇｏｈ ｅｔ ａｌ．ＭＡｂｓ ６（３）：７６４－７７２，２０１４を参照）が挙げられる。他の事例では、ＩＬ１Ｂアンタゴニストは小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤（例えば、ＩＬ１Ｂ放出を阻害する小分子、例えば、カスパーゼ１阻害剤（例えば、プラルナカサン（ＶＸ－７４０）及びＶＸ－７６５））である。例示的なＩＬ１Ｂアンタゴニストは、例えば、Ｄｉｎａｒｅｌｌｏ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．１１（８）：６３３－６５２，２０１２に記載されている。
抗ＩＬ１Ｂ抗体は、十分な親和性及び特異性でＩＬ１Ｂに結合する抗体である。特定の実施形態では、抗体は、ＩＬ１Ｂに対して十分に高い結合親和性を有し、例えば、抗体は、１００ｎＭ－１ｐＭのＫｄ値でＩＬ１Ｂに結合し得る。抗体親和性は、例えば、表面プラズモン共鳴系アッセイ（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ２００５／０１２３５９号に記載されているようなＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）アッセイ等）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、及び競合アッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））によって決定され得る。抗ＩＬ１Ｂ抗体は、中和抗ＩＬ１Ｂ抗体であり得る。例示的な非限定的な抗ＩＬ１Ｂ抗体としては、カナキヌマブ、ゲボキズマブ、ＬＹ２１８９１０２、ＸＯＭＡ０５２及び２Ｈ（例えば、Ｇｏｈ ｅｔ ａｌ．ＭＡｂｓ ６（３）：７６４－７７２，２０１４を参照）が挙げられる。
「ＩＬ１Ｒアンタゴニスト」とは、ＩＬ１Ｒに結合し、ＩＬ１Ｒ発現レベルを低下させ、又はＩＬ１Ｒ生物学的活性（１つ以上のリガンドへのＩＬ１Ｒ結合を含むが、これに限定されない）を中和、遮断、阻害、抑止、低減若しくは干渉することができる分子を指す。いくつかの事例では、ＩＬ１Ｒアンタゴニストは抗ＩＬ１Ｒ抗体である。例示的な非限定的な抗ＩＬ１Ｒ抗体としては、ＡＭＧ１０８が挙げられる。他の事例では、ＩＬ１Ｒアンタゴニストは、組換えＩＬ－１ＲＡタンパク質又はその操作されたバージョン、例えばアナキンラ（ＫＩＮＥＲＥＴ（登録商標））である。更に他の事例では、ＩＬ１Ｒアンタゴニストは、可溶性デコイ受容体、例えば、リロナセプト（ＡＲＣＡＬＹＳＴ（登録商標））であり、これは、ヒトＩＬ１Ｒの細胞外部分のリガンド結合ドメイン（ＩＬ１Ｒ１）及びヒトＩｇＧ１のＦｃ領域にインラインで連結されたＩＬ１受容体アクセサリータンパク質（ＩＬ－１ＲＡｃＰ）を含む二量体融合タンパク質である。他の事例では、ＩＬ１Ｂアンタゴニストは小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤である。例示的なＩＬ１Ｒアンタゴニストは、例えば、Ｄｉｎａｒｅｌｌｏ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．１１（８）：６３３－６５２，２０１２に記載されている。
抗ＩＬ１Ｒ抗体は、十分な親和性及び特異性でＩＬ１Ｒに結合する抗体である。特定の実施形態では、抗体は、ＩＬ１Ｒに対して十分に高い結合親和性を有し、例えば、抗体は、１００ｎＭ－１ｐＭのＫｄ値でＩＬ１Ｒに結合し得る。抗体親和性は、例えば、表面プラズモン共鳴系アッセイ（ＰＣＴ出願公開第ＷＯ２００５／０１２３５９号に記載されているようなＢＩＡｃｏｒｅ（登録商標）アッセイ等）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、及び競合アッセイ（例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ））によって決定され得る。抗ＩＬ１Ｒ抗体は、中和抗ＩＬ１Ｒ抗体であり得る。例示的な非限定的な抗ＩＬ１Ｒ抗体としては、ＡＭＧ１０８が挙げられる。
本明細書で使用される場合、「細胞傷害性薬剤」という用語は、細胞の機能を阻害若しくは妨害する、及び／又は細胞の破壊を引き起こす物質を指す。この用語には、放射性同位体（例えば、Ａｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２、及びＬｕの放射性同位体）、化学療法剤、例えば、メトトレキサート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイド（ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド）、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンＣ、クロラムブシル、ダウノルビシン、又は他のインターカレート剤、核酸分解酵素等の酵素及びその断片、抗生物質、細菌、真菌、植物又は動物由来の低分子毒素又は酵素的に活性な毒素等の毒素（その断片及び／又はバリアントを含む）、並びに以下に開示される様々な抗腫瘍剤若しくは抗がん剤が含まれることが意図される。他の細胞毒性剤は、以下に記載されている。殺腫瘍性剤は、腫瘍細胞の破壊を引き起こす。
化学療法剤とは、がんの治療に有用な化学的化合物である。化学療法剤の例としては、チオテパ及びシクロホスファミド（ＣＹＴＯＸＡＮ（登録商標））等のアルキル化剤；ブスルファン、インプロスルファン、及びピポスルファン等のアルキルスルホネート；ベンゾドーパ、カルボコン、メツレドーパ、及びウレドーパ等のアジリジン；アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホラミド、トリエチレンチオホスホラミド、及びトリメチローロメラミンを含むエチレンイミン及びメチラメラミン；アセトゲニン（特にブラタシン及びブラタシノン）；δ－９－テトラヒドロカンナビノール（ドロナビノール、ＭＡＲＩＮＯＬ（登録商標））；β－ラパコン；ラパコール；コルヒチン；ベツリン酸；カンプトテシン（合成類縁体トポテカン（ＨＹＣＡＭＴＩＮ（登録商標））、ＣＰＴ－１１（イリノテカン、ＣＡＭＰＴＯＳＡＲ（登録商標））、アセチルカンプトテシン、スコポレクチン、及び９－アミノカンプトテシン）；ブリオスタチン；ペメトレキセド；カリスタチン；ＣＣ－１０６５（そのアドゼレシン、カルゼレシン及びビゼレシン合成類縁体を含む）；ポドフィロトキシン；ポドフィリン酸；テニポシド；クリプトフィシン（特にクリプトフィシン１及びクリプトフィシン８）；ドラスタチン；デュオカルマイシン（合成類縁体、ＫＷ－２１８９及びＣＢ１－ＴＭ１を含む）；エリュテロビン；パンクラチスタチン；サルコジクチイン；スポンギスタチン；クロラムブシル、クロルナファジン、コロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニマスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード等のナイトロジェンマスタード；カルマスティン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、及びラニムスチン等のニトロソウレア；エンジイン抗生物質（例えば、カリケアマイシン、特にカリケアマイシンγ１Ｉ及びカリケアマイシンωＩ１（例えば、Ｎｉｃｏｌａｏｕ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｇｅｗ．Ｃｈｅｍ Ｉｎｔｌ．Ｅｄ．Ｅｎｇｌ．，３３：１８３－１８６（１９９４）を参照）等の抗生物質；ジネミシンＡを含むジネミシン；エスペラミシン並びにネオカルチノスタチン発色団及び関連する色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、アントラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、６－ジアゾ－５－オキソ－Ｌ－ノルロイシン、ドキソルビシン（ＡＤＲＩＡＭＹＣＩＮ（登録商標）、モルホリノ－ドキソルビシン、シアノモルホリノ－ドキソルビシン、２－ピロリノ－ドキソルビシン、及びデオキシドクソルビシン）、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシンＣ等のマイトマイシン、マイコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、ケラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン；メトトレキサート及び５－フルオロウラシル（５－ＦＵ）等の代謝拮抗薬；デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキセート等の葉酸類縁体；フルダラビン、６－メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン等のプリン類縁体；アンシタビン、アザシチジン、６－アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジネン、ドキシフルリジン、エノシタビン、及びフロクシウリジン等のピリミジン類縁体；アミノグルテチミド、マイトテイン、トリロスタン等の抗副腎剤；フォリン酸等の葉酸補充剤；アセグラトン；アルドホスファミドグリコシド；アミノレブリン酸；エニルウラシル；アムサクリン；ベストラブシル；ビサントレン；エダトレキサート；デフォファミン；デメコルチン；ジアジクオン；エフロルニチン；エリプチニウムアセテート；エトグルシド；硝酸ガリウム；ヒドロキシ尿素；レンチナン；ロニダミン；メイタンシン及びアンサマイトシン等のメイタンシノイド；ミトグアゾン；マイトキサントロン；モピダンモール；ニトラエリン；ペントスタチン；フェナメット；ピラルビシン；ロソキサントロン；２－エチルヒドラジド；プロカルバジン；ＰＳＫ（登録商標）多糖類複合体（ＪＨＳ Ｎａｔｕｒａｌ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ，Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ）；ラゾキサン；リゾキシン；シゾフィラン；スピロゲルマニウム；テヌアゾン酸；トリアジクオン；２，２’，２’’－トリクロロトリエチルアミン；トリコテセン（特にＴ－２毒素、ベラキュリンＡ、ロリジンＡ及びアングイジン）；ウレタン；ビンデシン（ＥＬＤＩＳＩＮＥ（登録商標）、ＦＩＬＤＥＳＩＮ（登録商標））；ダカルバジン；マンノムスチン；ミトブロニトール；ミトラクトール；ピポブロマン；ガシトシン；アラビノシド（「Ａｒａ－Ｃ」）；チオテパ；タキソイド、例えば、パクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標））（Ｂｒｉｓｔｏｌ－Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ，Ｐｒｉｎｃｅｔｏｎ，Ｎ．Ｊ．）、パクリタキセルのアルブミン組換ナノ粒子製剤（ＡＢＲＡＸＡＮＥ（商標））（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｐａｒｔｎｅｒｓ，Ｓｃｈａｕｍｂｅｒｇ，Ｉｌｌｉｎｏｉｓ）、及びドセタキセル（ＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標））（Ｒｈｏｎｅ－Ｐｏｕｌｅｎｃ Ｒｏｒｅｒ，Ａｎｔｏｎｙ，Ｆｒａｎｃｅ）；クロラムブシル；ゲムシタビン（ＧＥＭＺＡＲ（登録商標））６－チオグアニン；メルカプトプリン；メトトレキサート；シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン（ＥＬＯＸＡＴＩＮ（商標））、スタトラプラチン、ピコプラチン、ネダプラチン、トリプラチン（ｔｒｉｐｌａｔｉｎ）及びリポプラチン（ｌｉｐｏｐｌａｔｉｎ）等の白金類縁体；ビンブラスチン（ＶＥＬＢＡＮ（登録商標））；白金；エトポシド（ＶＰ－１６）；イホスファミド；マイトキサントロン；ビンクリスチン（ＯＮＣＯＶＩＮ（登録商標））；オキサリプラチン；ロイコボリン；ビノレルビン（ＮＡＶＥＬＢＩＮＥ（登録商標））；ノバントロン；エダトレキサート；ダウノマイシン；アミノプテリン；イバンドロネート；トポイソメラーゼ阻害剤ＲＦＳ ２０００；ジフルオロメチルオルニチン（ＤＭＦＯ）；レチノイン酸等のレチノイド；並びに上記のいずれかの薬学的に許容され得る塩、酸又は誘導体；並びにＣＨＯＰ（シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、及びプレドニゾロンの併用療法の略称）、並びにＦＯＬＦＯＸ（５－ＦＵ及びロイコボリンと組み合わせた、オキサリプラチン（ＥＬＯＸＡＴＩＮ（商標））による治療レジメンの略称）等の、上記のうちの２つ以上の組み合わせが挙げられる。更なる化学療法剤は、メイタンシノイド（例えばＤＭ１）等の抗体薬物結合体と有用な細胞毒性剤、並びに例えば、ＭＭＡＥ及びＭＭＡＦ等のオーリスタチンを含む。
「化学療法剤」には、がんの成長を促進し得るホルモン作用を制御、低減、遮断、又は阻害するために作用する「抗ホルモン薬剤」又は「内分泌治療剤」も含まれ、しばしば全身性又は体全体の治療の形態にある。化学療法剤はホルモン自体であってもよい。例としては、例えば、タモキシフェン（ＮＯＬＶＡＤＥＸ（登録商標）タモキシフェンを含む）、ＥＶＩＳＴＡ（登録商標）ラロキシフェン、ドロロキシフェン、４－ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、ＬＹ１１７０１８、オナプリストン、及びＦＡＲＥＳＴＯＮ（登録商標）トレミフェン；抗プロゲステロン；エストロゲン受容体下方制御因子（ＥＲＤ）；卵巣を抑制するか又は活動停止するように機能する薬剤、例えば、ＬＵＰＲＯＮ（登録商標）及びＥＬＩＧＡＲＤ（登録商標）ロイプロリド酢酸塩、ゴセレリン酢酸塩、ブセレリン酢酸塩、及びトリプテレリン等の黄体形成ホルモン放出ホルモン（ＬＨＲＨ）アゴニスト；フルタミド、ニルタミド、及びビカルタミド等の他の抗アンドロゲン薬；並びに副腎におけるエストロゲン生産を調節する酵素アロマターゼを阻害するアロマターゼ阻害剤、例えば、４（５）－イミダゾール、アミノグルテチミド、ＭＥＧＡＳＥ（登録商標）メゲストロールアセテート、ＡＲＯＭＡＳＩＮ（登録商標）エキセメスタン、フォルメスタニー（ｆｏｒｍｅｓｔａｎｉｅ）、ファドロゾール、ＲＩＶＩＳＯＲ（登録商標）ボロゾール、ＦＥＭＡＲＡ（登録商標）レトロゾール、及びＡＲＩＭＩＤＥＸ（登録商標）アナストロゾールを含む、抗エストロゲン及び選択的なエストロゲン受容体調節因子（ＳＥＲＭ）が挙げられる。加えて、化学療法剤のかかる定義には、クロドロネート（例えば、ＢＯＮＥＦＯＳ（登録商標）又はＯＳＴＡＣ（登録商標））、ＤＩＤＲＯＣＡＬ（登録商標）エチドロネート、ＮＥ－５８０９５、ＺＯＭＥＴＡ（登録商標）ゾレドロン酸／ゾレドロネート、ＦＯＳＡＭＡＸ（登録商標）アレンドロネート、ＡＲＥＤＩＡ（登録商標）パミドロネート、ＳＫＥＬＩＤ（登録商標）チルドロネート、又はＡＣＴＯＮＥＬ（登録商標）リセドロネート等のビスホスホネート；並びにトロキサシタビン（１，３－ジオキソランヌクレオシドシトシンアナログ）；アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に、例えばＰＫＣ－アルファ、Ｒａｆ、Ｈ－Ｒａｓ、及び表皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）等の異所（ａｂｈｅｒａｎｔ）細胞増殖に関係があるとされるシグナル伝達系路における遺伝子の発現を阻害するもの；ＴＨＥＲＡＴＯＰＥ（登録商標）ワクチン及び遺伝子治療ワクチン、例えばＡＬＬＯＶＥＣＴＩＮ（登録商標）ワクチン、ＬＥＵＶＥＣＴＩＮ（登録商標）ワクチン、及びＶＡＸＩＤ（登録商標）ワクチン等のワクチン；ＬＵＲＴＯＴＥＣＡＮ（登録商標）トポイソメラーゼ１阻害剤；ＡＢＡＲＥＬＩＸ（登録商標）ｒｍＲＨ；ジトシル酸ラパチニブ（別名、ＧＷ５７２０１６、ＥｒｂＢ－２及びＥＧＦＲ二重チロシンキナーゼ小分子阻害剤）；並びに上記のいずれかの薬学的に許容され得る塩、酸、又は誘導体が含まれる。
化学療法剤にはまた、アレムツズマブ（Ｃａｍｐａｔｈ）、ベバシズマブ（ＡＶＡＳＴＩＮ（登録商標）、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、セツキシマブ（ＥＲＢＩＴＵＸ（登録商標）、Ｉｍｃｌｏｎｅ）、パニツムマブ（ＶＥＣＴＩＢＩＸ（登録商標）、Ａｍｇｅｎ）、リツキシマブ（ＲＩＴＵＸＡＮ（登録商標）、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ／Ｂｉｏｇｅｎ Ｉｄｅｃ）、ペルツズマブ（ＯＭＮＩＴＡＲＧ（登録商標）、２Ｃ４、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、トラスツズマブ（ＨＥＲＣＥＰＴＩＮ（登録商標）、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、トシツモマブ（Ｂｅｘｘａｒ、Ｃｏｒｉｘｉａ）等の抗体、及び抗体－薬物コンジュゲート、ゲムツズマブオゾガマイシン（ＭＹＬＯＴＡＲＧ（登録商標）、Ｗｙｅｔｈ）も含まれる。本発明の化合物と組み合わせた薬剤としての治療可能性を有する追加のヒト化モノクローナル抗体としては、アポリズマブ、アセリズマブ、アトリズマブ、バピヌズマブ、ビバツズマブメルタンシン、カンツズマブメルタンシン、セデリズマブ、セロリズマブペゴール、シドフシツズマブ、シドツズマブ、ダクリズマブ、エクリズマブ、エファリズマブ、エプラツズマブ、エルリズマブ、フェルビズマブ、フォントリズマブ、ゲムツズマブオゾガマイシン、イノツズマブオゾガマイシン、イピリムマブ、ラベツズマブ、リンツズマブ、マッツズマブ、メポリズマブ、モタビズマブ、モトビズマブ、ナタリズマブ、ニモツズマブ、ノロビズマブ、ヌマビズマブ、オクレリズマブ、オマリズマブ、パリビズマブ、パスコリズマブ、ペクフシツズマブ、ペクセリズマブ、ペクセリズマブ、ラリビズマブ、ラニビズマブ、レスリビズマブ、レスリズマブ、レスリビズマブ、ロベリズマブ、ルピズマブ、シブロツズマブ、シプリズマブ、ソンツズマブ、タカタツズマブテトラキセタン、タドキシズマブ、タリズマブ、テフィバズマブ、トシリズマブ、トラリズマブ、ツコツズマブセルモレウキン、ツクシツズマブ、ウマビズマブ、ウルトキサズマブ、ウステキヌマブ、ビジリズマブ、及びインターロイキン－１２ ｐ４０タンパク質を認識するように遺伝子組換えされた、ヒト配列のみの完全長ＩｇＧ１λ抗体である抗インターロイキン－１２（ＡＢＴ－８７４／Ｊ６９５、Ｗｙｅｔｈ Ｒｅｓｅａｒｃｈ及びＡｂｂｏｔｔ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）が挙げられる。
化学療法剤には、ＥＧＦＲに結合するか又はさもなければそれと直接相互作用し、そのシグナル伝達活性を妨害又は低減する化合物を指す「ＥＧＦＲ阻害剤」も含まれ、代わりに「ＥＧＦＲアンタゴニスト」とも称される。このような剤の例としては、ＥＧＦＲに結合する抗体及び低分子が挙げられる。ＥＧＦＲに結合する抗体の例としては、ＭＡｂ５７９（ＡＴＣＣ ＣＲＬ ＨＢ８５０６）、ＭＡｂ４５５（ＡＴＣＣ ＣＲＬ ＨＢ８５０７）、ＭＡｂ２２５（ＡＴＣＣ ＣＲＬ８５０８）、ＭＡｂ５２８（ＡＴＣＣ ＣＲＬ８５０９）（米国特許第４，９４３，５３３号、Ｍｅｎｄｅｌｓｏｈｎ ｅｔ ａｌ．を参照）及びそのバリアント、例えば、キメラ化された２２５（Ｃ２２５又はセツキシマブ、ＥＲＢＵＴＩＸ（登録商標））及び再構成されたヒト２２５（Ｈ２２５）（国際公開第９６／４０２１０号、Ｉｍｃｌｏｎｅ Ｓｙｓｔｅｍｓ Ｉｎｃ．を参照）、ＩＭＣ－１１Ｆ８、完全ヒト型ＥＧＦＲ標的抗体（Ｉｍｃｌｏｎｅ）、ＩＩ型変異型ＥＧＦＲに結合する抗体（米国特許第５，２１２，２９０号）、米国特許第５，８９１，９９６号に記載されているようなＥＧＦＲに結合するヒト化抗体及びキメラ抗体、及びＡＢＸ－ＥＧＦ又はパニツムマブ（国際公開第９８／５０４３３号、Ａｂｇｅｎｉｘ／Ａｍｇｅｎを参照）等のＥＧＦＲに結合するヒト抗体、ＥＭＤ５５９００（Ｓｔｒａｇｌｉｏｔｔｏ ｅｔ ａｌ．Ｅｕｒ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ ３２Ａ：６３６－６４０（１９９６）を参照）、ＥＭＤ７２００（マツズマブ）（ＥＧＦとＴＧＦ－アルファの両方のＥＧＦＲ結合を競合させるＥＧＦＲに対するヒト化ＥＧＦＲ抗体（ＥＭＤ／Ｍｅｒｃｋ）、ヒトＥＧＦＲ抗体、ＨｕＭａｘ－ＥＧＦＲ（ＧｅｎＭａｂ）、Ｅ１．１、Ｅ２．４、Ｅ２．５、Ｅ６．２、Ｅ６．４、Ｅ２．１１、Ｅ６．３．及びＥ７．６．３として公知であり、米国特許第６，２３５，８８３号に記載の完全ヒト抗体、ＭＤＸ－４４７（Ｍｅｄａｒｅｘ Ｉｎｃ）、並びにｍＡｂ８０６又はヒト化ｍＡｂ８０６（Ｊｏｈｎｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７９（２９）：３０３７５－３０３８４（２００４））が挙げられる。抗ＥＧＦＲ抗体は、細胞毒性剤にコンジュゲートされてよく、それによりイムノコンジュゲートを生成することができる（例えば、ＥＰ６５９，４３９Ａ２を参照されたい、Ｍｅｒｃｋ Ｐａｔｅｎｔ ＧｍｂＨ）。ＥＧＦＲアンタゴニストは、米国特許第５，６１６，５８２号、同第５，４５７，１０５号、同第５，４７５，００１号、同第５，６５４，３０７号、同第５，６７９，６８３号、同第６，０８４，０９５号、同第６，２６５，４１０号、同第６，４５５，５３４号、同第６，５２１，６２０号、同第６，５９６，７２６号、同第６，７１３，４８４号、同第５，７７０，５９９号、同第６，１４０，３３２号、同第５，８６６，５７２号、同第６，３９９，６０２号、同第６，３４４，４５９号、同第６，６０２，８６３号、同第６，３９１，８７４号、同第６，３４４，４５５号、同第５，７６０，０４１号、同第６，００２，００８号、及び同第５，７４７，４９８号、並びに以下のＰＣＴ公報：国際公開第９８／１４４５１号、国際公開第９８／５００３８号、国際公開第９９／０９０１６号、及び国際公開第９９／２４０３７号に記載される化合物等の小分子が含まれる。特定の低分子ＥＧＦＲアンタゴニストとしては、ＯＳＩ－７７４（ＣＰ－３５８７７４、エルロチニブ、ＴＡＲＣＥＶＡ（登録商標）、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ／ＯＳＩ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ）、ＰＤ１８３８０５（ＣＩ１０３３、２－プロペンアミド、Ｎ－［４－［（３－クロロ－４－フルオロフェニル）アミノ］－７－［３－（４－モルホリニル）プロポキシ］－６－キナゾリニル］－、二塩酸塩、Ｐｆｉｚｅｒ Ｉｎｃ．）、ＺＤ１８３９、ゲフィチニブ（ＩＲＥＳＳＡ（登録商標））４－（３’－クロロ－４’－フルオロアニリノ）－７－メトキシ－６－（３－モルホリノプロポキシ）キナゾリン、ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ）、ＺＭ１０５１８０（（６－アミノ－４－（３－メチルフェニル－アミノ）－キナゾリン、Ｚｅｎｅｃａ）、ＢＩＢＸ－１３８２（Ｎ８－（３－クロロ－４－フルオロ－フェニル）－Ｎ２－（１－メチル－ピペリジン－４－イル）－ピリミド［５，４－ｄ］ピリミジン－２，８－ジアミン、Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ）、ＰＫＩ－１６６（（Ｒ）－４－［４－［（１－フェニルエチル）アミノ］－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｄ］ピリミジン－６－イル］－フェノール）、（Ｒ）－６－（４－ヒドロキシフェニル）－４－［（１－フェニルエチル）アミノ］－７Ｈ－ピロロ［２，３－ｄ］ピリミジン）、ＣＬ－３８７７８５（Ｎ－［４－［（３－ブロモフェニル）アミノ］－６－キナゾリニル］－２－ブチンアミド）、ＥＫＢ－５６９（Ｎ－［４－［（３－クロロ－４－フルオロフェニル）アミノ］－３－シアノ－７－エトキシ－６－キノリニル］－４－（ジメチルアミノ）－２－ブチンアミド）（Ｗｙｅｔｈ）、ＡＧ１４７８（Ｐｆｉｚｅｒ）、ＡＧ１５７１（ＳＵ５２７１、Ｐｆｉｚｅｒ）、及び二重ＥＧＦＲ／ＨＥＲ２チロシンキナーゼ阻害剤、例えば、ラパチニブ（ＴＹＫＥＲＢ（登録商標）、ＧＳＫ５７２０１６又はＮ－［３－クロロ－４－［（３－フルオロフェニル）メトキシ］フェニル］－６［５［［［２メチルスルホニル）エチル］アミノ］メチル］－２－フラニル］－４－キナゾリンアミン）が挙げられる。
化学療法剤としてはまた、「チロシンキナーゼ阻害剤」（前段落に記載のＥＧＦＲ標的薬物を含む）、低分子ＨＥＲ２チロシンキナーゼ阻害剤（Ｔａｋｅｄａから入手可能なＴＡＫ１６５等）、ＥｒｂＢ２受容体チロシンキナーゼの経口選択的阻害剤であるＣＰ－７２４，７１４（Ｐｆｉｚｅｒ及びＯＳＩ）、二重ＨＥＲ阻害剤（ＥＧＦＲに優先的に結合するが、ＨＥＲ２及びＥＧＦＲ過剰発現細胞の両方を阻害するＥＫＢ－５６９（Ｗｙｅｔｈから入手可能）等）、ラパチニブ（ＧＳＫ５７２０１６、Ｇｌａｘｏ－ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅから入手可能）、経口ＨＥＲ２及びＥＧＦＲチロシンキナーゼ阻害剤、ＰＫＩ－１６６（Ｎｏｖａｒｔｉｓから入手可能）、ｐａｎ－ＨＥＲ阻害剤（カネルチニブ（ＣＩ－１０３３、Ｐｈａｒｍａｃｉａ）等）、Ｒａｆ－１阻害剤（Ｒａｆ－１シグナル伝達を阻害するＩＳＩＳ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓから入手可能なアンチセンス薬剤ＩＳＩＳ－５１３２等）、非ＨＥＲ標的ＴＫ阻害剤（イマチニブメシル酸塩（ＧＬＥＥＶＥＣ（登録商標）、Ｇｌａｘｏ ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅから入手可能）等）、多標的チロシンキナーゼ阻害剤（スニチニブ（ＳＵＴＥＮＴ（登録商標）、Ｐｆｉｚｅｒから入手可能）等）、ＶＥＧＦ受容体チロシンキナーゼ阻害剤（バタラニブ（ＰＴＫ７８７／ＺＫ２２２５８４、Ｎｏｖａｒｔｉｓ／Ｓｃｈｅｒｉｎｇ ＡＧから入手可能）等）、ＭＡＰＫ細胞外制御キナーゼＩ阻害剤ＣＩ－１０４０（Ｐｈａｒｍａｃｉａから入手可能）、キナゾリン（ＰＤ１５３０３５、４－（３－クロロアニリノ）キナゾリン等）、ピリドピリミジン、ピリミドピリミジン、ピロロピリミジン（ＣＧＰ５９３２６、ＣＧＰ６０２６１、及びＣＧＰ６２７０６等）、ピラゾロピリミジン、４－（フェニルアミノ）－７Ｈ－ピロロ［２，３－ｄ］ピリミジン、クルクミン（ジフェルロイルメタン、４，５－ビス（４－フルオロアニリノ）フタルイミド）、ニトロチオフェン部分を含有するチルホスチン、ＰＤ－０１８３８０５（Ｗａｒｎｅｒ－Ｌａｍｂｅｒ）、アンチセンス分子（例えば、ＨＥＲコード核酸に結合するもの）、キノキサリン（米国特許第５，８０４，３９６号）、トリホスチン（米国特許第５，８０４，３９６号）、ＺＤ６４７４（Ａｓｔｒａ Ｚｅｎｅｃａ）、ＰＴＫ－７８７（Ｎｏｖａｒｔｉｓ／Ｓｃｈｅｒｉｎｇ ＡＧ）、ｐａｎ－ＨＥＲ阻害剤（ＣＩ－１０３３（Ｐｆｉｚｅｒ）等）、Ａｆｆｉｎｉｔａｃ（ＩＳＩＳ３５２１、Ｉｓｉｓ／Ｌｉｌｌｙ）、イマチニブメシル酸塩（ＧＬＥＥＶＥＣ（登録商標））、ＰＫＩ１６６（Ｎｏｖａｒｔｉｓ）、ＧＷ２０１６（Ｇｌａｘｏ ＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ）、ＣＩ－１０３３（Ｐｆｉｚｅｒ）、ＥＫＢ－５６９（Ｗｙｅｔｈ）、セマキシニブ（Ｐｆｉｚｅｒ）、ＺＤ６４７４（ＡｓｔｒａＺｅｎｅｃａ）、ＰＴＫ－７８７（Ｎｏｖａｒｔｉｓ／Ｓｃｈｅｒｉｎｇ ＡＧ）、ＩＮＣ－１Ｃ１１（Ｉｍｃｌｏｎｅ）、ラパマイシン（シロリムス、ＲＡＰＡＭＵＮＥ（登録商標））、又は以下の特許公報：米国特許第５，８０４，３９６号；国際公開第１９９９／０９０１６号（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｃｙａｎａｍｉｄ）；国際公開第１９９８／４３９６０号（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｃｙａｎａｍｉｄ）；国際公開第１９９７／３８９８３号（Ｗａｒｎｅｒ Ｌａｍｂｅｒｔ）；国際公開第１９９９／０６３７８号（Ｗａｒｎｅｒ Ｌａｍｂｅｒｔ）；国際公開第１９９９／０６３９６号（Ｗａｒｎｅｒ Ｌａｍｂｅｒｔ）；国際公開第１９９６／３０３４７号（Ｐｆｉｚｅｒ，Ｉｎｃ）；国際公開第１９９６／３３９７８号（Ｚｅｎｅｃａ）；国際公開第１９９６／３３９７号（Ｚｅｎｅｃａ）；及び国際公開第１９９６／３３９８０号（Ｚｅｎｅｃａ）のうちのいずれかに記載のものも挙げられる。
化学療法剤としてはまた、デキサメタゾン、インターフェロン、コルヒチン、メトプリン、シクロスポリン、アンホテリシン、メトロニダゾール、アレムツズマブ、アリトレチノイン、アロプリノール、アミホスチン、三酸化ヒ素、アスパラギナーゼ、生ＢＣＧ、ベバクジマブ、ベキサロテン、クラドリビン、クロファラビン、ダルベポエチンアルファ、デニロイキン、デクスラゾキサン、エポエチンアルファ、エロチニブ、フィルグラスチム、酢酸ヒストレリン、イブリツモマブ、インターフェロンアルファ－２ａ、インターフェロンアルファ－２ｂ、レナリドミド、レバミゾール、メスナ、メトキサレン、ナンドロロン、ネララビン、ノフェツモマブ、オプレルベキン、パリフェルミン、パミドロネート、ペガデマーゼ、ペグアスパラガーゼ、ペグフィルグラスチム、ペメトレキセド二ナトリウム、プリカマイシン、ポルフィマーナトリウム、キナクリン、ラスブリカーゼ、サルグラモスチム、テモゾロミド、ＶＭ－２６、６－ＴＧ、トレミフェン、トレチノイン、ＡＴＲＡ、バルルビシン、ゾレドロネート、及びゾレドロン酸、ならにそれらの薬学的に許容され得る塩も挙げられる。
化学療法剤としては、ヒドロコルチゾン、酢酸ヒドロコルチゾン、酢酸コルチゾン、ピバリン酸チクソコルトール、トリアムシノロンアセトニド、トリアムシノロンアルコール、モメタゾン、アムシノニド、ブデソニド、デソニド、フルオシノニド、フルオシノロンアセトニド、ベタメタゾン、リン酸ベタメタゾンナトリウム、デキサメタゾン、リン酸デキサメタゾンナトリウム、フルオコルトロン、ヒドロコルチゾン－１７－ブチレート、ヒドロコルチゾン－１７－バレレート、プロピオン酸アクロメタゾン、吉草酸ベタメタゾン、ジプロピオン酸ベタメタゾン、プレドニカルベート、クロベタゾン－１７－ブチレート、クロベタゾン－１７－プロピオネート、カプロン酸フルオコルトロン、ピバリン酸フルオコルトロン及び酢酸フルプレドニデン；免疫選択的抗炎症ペプチド（ＩｍＳＡＩＤｓ）、例えばフェニルアラニン－グルタミン－グリシン（ＦＥＧ）及びそのＤ体形態（ｆｅＧ）（ＩＭＵＬＡＮ ＢｉｏＴｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，ＬＬＣ）；抗リウマチ薬、例えばアザチオプリン、シクロスポリン（シクロスポリンＡ）、Ｄ－ペニシラミン、金塩、ヒドロキシクロロキン、レフルノミドミノシクリン、スルファサラジン、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）遮断剤、例えばエタネルセプト（ＥＮＢＲＥＬ（登録商標）インフリキシマブ（ＲＥＭＩＣＡＤＥ（登録商標））、アダリムマブ（ＨＵＭＩＲＡ（登録商標））、セトリズマブペゴール（ＣＩＭＺＩＡ（登録商標））、ゴリムマブ（ＳＩＭＰＯＮＩ（登録商標））、インターロイキン１（ＩＬ－１）遮断剤、例えばアナキンラ（ＫＩＮＥＲＥＴ（登録商標））、Ｔ細胞共刺激遮断剤、例えばアバタセプト（ＯＲＥＮＣＩＡ（登録商標））、インターロイキン６（ＩＬ－６）遮断剤、トシリズマブ（ＡＣＴＥＭＥＲＡ（登録商標））；インターロイキン１３（ＩＬ－１３）遮断剤、例えばレブリキズマブ；インターフェロンアルファ（ＩＦＮ）遮断剤、例えばロンタリズマブ；ベータ７インテグリン遮断剤、例えばｒｈｕＭＡｂ Ｂｅｔａ７；ＩｇＥ経路遮断剤、例えば抗Ｍ１プライム；分泌ホモ三量体ＬＴａ３及び膜結合ヘテロ三量体ＬＴａ１／β２遮断剤、例えば抗リンホトキシンアルファ（ＬＴａ）；種々の調査剤、例えばチオプラチン、ＰＳ－３４１、フェニルブチレート、ＥＴ－１８－ＯＣＨ３、及びファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤（Ｌ－７３９７４９、Ｌ－７４４８３２）；ポリフェノール、例えばケルセチン、レスベラトロール、ピセアタンノール、没食子酸エピガロカテキン、テアフラビン、フラバノール、プロシアニジン、ベツリン酸及びその誘導体；オートファジー阻害剤、例えばクロロキン；デルタ－９－テトラヒドロカンナビノール（ドロナビノール、ＭＡＲＩＮＯＬ（登録商標））；ベータ－ラパコン；ラパコール；コルチシン；ベツリン酸；アセチルカンプトテシン、スコポレクチン、及び９－アミノカンプトテシン）；ポドフィロトキシン；テガフール（ＵＦＴＯＲＡＬ（登録商標））；ベキサロテン（ＴＡＲＧＲＥＴＩＮ（登録商標））；ビスホスホネート、例えばクロドロネート（例えば、ＢＯＮＥＦＯＳ（登録商標）又はＯＳＴＡＣ（登録商標））、エチドロネート（ＤＩＤＲＯＣＡＬ（登録商標））、ＮＥ－５８０９５、ゾレドロン酸／ゾレドロネート（ＺＯＭＥＴＡ（登録商標））、アレンドロネート（ＦＯＳＡＭＡＸ（登録商標））、パミドロネート（ＡＲＥＤＩＡ（登録商標））、チルドロネート（ＳＫＥＬＩＤ（登録商標））、又はリセドロネート（ＡＣＴＯＮＥＬ（登録商標））；並びに上皮成長因子受容体（ＥＧＦ－Ｒ）；ワクチン、例えばＴＨＥＲＡＴＯＰＥ（登録商標）ワクチン；ペリフォシン、ＣＯＸ－２阻害剤（例えば、セレコキシブ又はエトリコキシブ）、プロテオソーム阻害剤（例えば、ＰＳ３４１）；ＣＣＩ－７７９；チピファニブ（Ｒ１１５７７）；オラフェニブ、ＡＢＴ５１０；Ｂｃｌ－２阻害剤、例えば、オブリメルセンナトリウム（ＧＥＮＡＳＥＮＳＥ（登録商標））；ピクサントロン；ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、例えば、ロナファルニブ（ＳＣＨ ６６３６、ＳＡＲＡＳＡＲ（商標））；並びに上記のうちのいずれかの薬学的に許容され得る塩、酸、又は誘導体；並びに上記のうち２つ以上の組み合わせが挙げられる。
本明細書で使用される場合、「プロドラッグ」という用語は、親薬物と比較して腫瘍細胞に対する細胞毒性が低く、酵素的により活性な親形態へと活性化又は変換されることができる、薬学的に活性な物質の前駆体又は誘導体形態を指す。例えば、Ｗｉｌｍａｎ，’’Ｐｒｏｄｒｕｇｓ ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒａｐｙ’’Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ Ｔｒａｎｓａｃｔｉｏｎｓ，１４，ｐｐ．３７５－３８２，６１５ｔｈ Ｍｅｅｔｉｎｇ Ｂｅｌｆａｓｔ（１９８６）及びＳｔｅｌｌａ ｅｔ ａｌ．，’’Ｐｒｏｄｒｕｇｓ：Ａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ ｔｏ Ｔａｒｇｅｔｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ，’’Ｄｉｒｅｃｔｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ，Ｂｏｒｃｈａｒｄｔ ｅｔ ａｌ．，（ｅｄ．），ｐｐ．２４７－２６７，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ（１９８５）を参照されたい。本発明のプロドラッグには、ホスフェート含有プロドラッグ、チオホスフェート含有プロドラッグ、スルフェート含有プロドラッグ、ペプチド含有プロドラッグ、Ｄアミノ酸修飾プロドラッグ、グリコシル化プロドラッグ、β－ラクタム含有プロドラッグ、場合によって置換されたフェノキシアセトアミド含有プロドラッグ、又は置換されていてもよいフェニルアセトアミド含有プロドラッグ、５－フルオロシトシン及び他の５－フルオロウリジンプロドラッグが挙げられるが、これらに限定されず、これらプロドラッグは、より活性な細胞毒性遊離薬物へと変換され得る。本発明で使用するためのプロドラッグ形態に誘導体化され得る細胞毒性薬物の例としては、上述の化学療法剤が挙げられるが、これらに限定されない。
「成長阻害剤」とは、本明細書で使用される場合、ｉｎ ｖｉｔｒｏ又はｉｎ ｖｉｖｏのいずれかで細胞（例えば、その成長がＰＤ－Ｌ１発現に依存する細胞）の成長及び／又は増殖を阻害する化合物又は組成物を指す。したがって、成長阻害剤は、Ｓ期における細胞のパーセンテージを著しく低減するものであり得る。成長阻害剤の例としては、細胞周期進行（Ｓ期以外の場所で）を遮断する薬剤、例えば、Ｇ１停止及びＭ期停止を誘導する薬剤が挙げられる。標準的なＭ期遮断剤としては、ビンカ（ビンクリスチン及びビンブラスチン）、タキサン、及びトポイソメラーゼＩＩ阻害剤、例えば、アントラサイクリン系抗生物質ドキソルビシン（（８Ｓ－シス）－１０－［（３－アミノ－２，３，６－トリデオキシ－α－Ｌ－リキソ－ヘキサピラノシル）オキシ］－７，８，９，１０－テトラヒドロ－６，８，１１－トリヒドロキシ－８－（ヒドロキシアセチル）－１－メトキシ－５，１２－ナフタセンジオン）、エピルビシン、ダウノルビシン、エトポシド、及びブレオマイシンが挙げられる。Ｇ１を停止する薬剤、例えば、タモキシフェン、プレドニゾン、ダカルバジン、メクロレタミン、シスプラチン、メトトレキサート、５－フルオロウラシル、及びａｒａ－Ｃ等のＤＮＡアルキル化剤は、Ｓ期停止にも波及する。更なる情報は、Ｍｕｒａｋａｍｉ ｅｔ ａｌ．（ＷＢ Ｓａｕｎｄｅｒｓ：Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，１９９５）による’’Ｔｈｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂａｓｉｓ ｏｆ Ｃａｎｃｅｒ，’’Ｍｅｎｄｅｌｓｏｈｎ ａｎｄ Ｉｓｒａｅｌ，ｅｄｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ １，ｅｎｔｉｔｌｅｄ’’Ｃｅｌｌ ｃｙｃｌｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ，ｏｎｃｏｇｅｎｅｓ，ａｎｄ ａｎｔｉｎｅｏｐｌａｓｔｉｃ ｄｒｕｇｓ’’、特に１３頁に見出され得る。タキサン（パクリタキセル及びドセタキセル）は、いずれもイチイ由来の抗がん薬である。ヨーロッパイチイ由来のドセタキセル（ＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標）、Ｒｈｏｎｅ－Ｐｏｕｌｅｎｃ Ｒｏｒｅｒ）は、パクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標）、Ｂｒｉｓｔｏｌ－Ｍｙｅｒｓ Ｓｑｕｉｂｂ）の半合成類縁体である。パクリタキセル及びドセタキセルは、チューブリン二量体由来の微小管のアセンブリを促進し、脱重合を妨害することによって微小管を安定させ、細胞内での有糸分裂を阻害する。
「放射線治療」とは、正常に機能するか、又は細胞を完全に破壊する能力を制限するように、細胞に十分な損傷を誘導するための指向性ガンマ線又はベータ線の使用を意味する。用量及び治療期間を決定するために、当技術分野で既知の方法が多く存在することが理解されるだろう。典型的な治療は、１回投与として与えられ、典型的な線量は、１日１０～２００単位（グレイ）の範囲である。
本明細書で使用される場合、「個体」「患者」、及び「対象」という用語は、互換的に使用され、治療が所望される任意の単一の動物、より好ましくは哺乳類（例えば、イヌ、ネコ、ウマ、ウサギ、動物園の動物、雌ウシ、ブタ、ヒツジ、及び非ヒト霊長類等の非ヒト動物を含む）を指す。特定の実施形態では、本明細書の患者はヒトである。
本明細書で使用される場合、「投与する、投与すること」は、化合物（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト、ＶＥＧＦアンタゴニスト、又は任意の他の抗がん剤）又は医薬組成物（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト、ＶＥＧＦアンタゴニスト、又は任意の他の抗がん治療剤を含む医薬組成物）の投与量を個体（例えば、患者）に与える方法を意味する。本明細書に記載の方法で利用される組成物を、例えば、筋肉内に、静脈内に、皮内に、経皮的に、動脈内に、腹腔内に、病巣内に、頭蓋内に、関節内に、前立腺内に、胸膜内に、気管内に、髄腔内に、鼻腔内に、腟内に、直腸内に、局所的に、腫瘍内に、腹膜に、皮下に、結膜下に、小胞内に、粘膜に、心膜内に、臍帯内に、眼内に、眼窩内に、硝子体内に（例えば、硝子体内注射により）、点眼により、経口的に、局所的に、経皮的に、非経口的に、吸入により、注射により、移植により、注入により、持続注入により、標的細胞を直接的に浸す局所灌流により、カテーテルにより、洗浄により、クリームに入れて、又は脂質組成物に入れて、投与することができる。本明細書に記載の方法において利用される組成物はまた、全身的又は局所的に投与することができる。投与方法は、様々な因子（例えば、投与される化合物又は組成物、及び治療される症状、疾患、又は障害の重症度）に応じて変化し得る。本明細書では、単回投与又は様々な時点にわたる複数回投与、ボーラス投与、パルス注入を含むがこれらに限定されない様々な投与スケジュールが想定される。
「治療有効量」又は「有効量」とは、哺乳動物における疾患又は障害を治療又は予防するための治療剤の量を指す。がんの場合、治療有効量の治療剤は、がん細胞の数を低減し、原発腫瘍サイズを低減し、末梢臓器へのがん細胞浸潤を阻害し（すなわち、ある程度減速し、好ましくは停止する）、腫瘍転移を阻害し（すなわち、ある程度減速し、好ましくは停止する）、腫瘍成長をある程度阻害し、及び／又は障害に関連する症状のうちの１つ以上をある程度軽減し得る。薬物が既存のがん細胞の成長を予防し、及び／又はそれらを死滅させることができる程度まで、この薬物は、細胞増殖抑制性及び／又は細胞傷害性であり得る。がん療法に関して、ｉｎ ｖｉｖｏでの有効性は、例えば、生存期間、疾患進行の期間（ｔｉｍｅ ｔｏ ｄｉｓｅａｓｅ ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎ：ＴＴＰ）、応答速度（例えば、ＯＲＲ、ＣＲ及び／若しくはＰＲ）、応答期間、並びに／又は生活の質を評定することによって測定され得る。
「同時に」という用語は、投与の少なくとも一部が時間的に重複する２つ以上の治療剤の投与を指すために本明細書で使用される。したがって、同時投与には、１つ以上の薬剤の投与が１つ以上の他の薬剤の投与を中止した後で継続する投薬レジメンが含まれる。
「低減又は阻害する」とは、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、又はそれ以上の全体的な減少をもたらす能力を意味する。低減又は阻害は、例えば、治療されている障害の症状、転移の存在若しくはサイズ、又は原発腫瘍のサイズに対して言及する場合がある。
「添付文書」という用語は、治療用製品の市販のパッケージに通例含まれ、かかる治療用製品の使用に関する指示、用法、投薬量、投与、併用療法、禁忌、及び／又は警告についての情報を含む指示書を指すために使用される。
「滅菌」製剤は、無菌であるか、又は全ての生存微生物及びそれらの胞子を含まない。
「製造品」は、少なくとも１つの試薬、例えば、疾患又は障害（例えば、がん）を治療するための医薬品、又は本明細書に記載のバイオマーカー（例えば、ＩＬ８）を特異的に検出するためのプローブを含む任意の製造品（例えば、パッケージ又は容器）又はキットである。特定の実施形態では、製造物又はキットは、本明細書に記載される方法を実施するための単位として販売促進、配給、又は販売される。
「に基づく」という語句は、本明細書で使用される場合、１つ以上のバイオマーカーについての情報が、例えば、治療の決定、添付文書に提供される情報、又はマーケティング／宣伝指針等を伝えるために使用されることを意味する。
「抗体」という用語は、本明細書では最も広い意味で使用され、それらが所望の抗原結合活性を呈する限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体（例えば、二重特異性抗体）及び抗体断片を含むがこれらに限定されない、様々な抗体構造を包含する。
「単離された」抗体は、その自然環境の成分から同定及び分離され、かつ／又は回収された抗体である。その自然環境の混入成分は、抗体の研究的、診断的、及び／又は治療的使用を支障が生じるであろう物質であり、それらには、酵素、ホルモン、及び他のタンパク質性又は非タンパク質性溶質が含まれる。いくつかの実施形態では、抗体は、（１）例えば、ローリー法によって決定される、９５重量％超、いくつかの実施形態では、９９重量％超になるまで、（２）例えば、スピニング・カップ・シークエネーターを使用して、Ｎ末端又は内部アミノ酸配列の少なくとも１５残基を得るのに十分な程度まで、又は（３）例えば、クマシーブルー又は銀染色を使用して、還元又は非還元条件下でＳＤＳ－ＰＡＧＥによって均質性が得られるまで精製される。単離された抗体には、組換え細胞内のｉｎ ｓｉｔｕ抗体が含まれるが、これは、抗体の自然環境の少なくとも１つの成分が存在しないためである。しかしながら、通常、単離された抗体は、少なくとも１つの精製工程によって調製されるであろう。
「天然型抗体」は、通常、２つの同一の軽（Ｌ）鎖及び２つの同一の重（Ｈ）鎖から構成される、約１５０，０００ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。各軽鎖が１つのジスルフィド共有結合により重鎖に連結される一方で、ジスルフィド結合の数は、異なる免疫グロブリンアイソタイプの重鎖間で異なる。各重鎖及び軽鎖はまた、規則的に離間した鎖間ジスルフィド架橋も有する。各重鎖は、一方の端に可変ドメイン（ＶＨ）を有し、その後いくつかの定常ドメインが続く。各軽鎖は、一方の端に可変ドメイン（ＶＬ）を有し、その他方の端に定常ドメインを有し、軽鎖の定常ドメインは、重鎖の第１の定常ドメインと整列し、軽鎖可変ドメインは、重鎖の可変ドメインと整列する。特定のアミノ酸残基は、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとの間に界面を形成すると考えられている。
任意の哺乳動物種由来の抗体（免疫グロブリン）の「軽鎖」は、定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、カッパ（「κ」）及びラムダ（「λ」）と呼ばれる２つの明らかに異なるタイプのうちの一方に割り当てられ得る。
「定常ドメイン」という用語は、抗原結合部位を含有する可変ドメインである免疫グロブリンの他の部分と比較して、より保存されたアミノ酸配列を有する免疫グロブリン分子の部分を指す。定常ドメインは、重鎖のＣＨ１、ＣＨ２、及びＣＨ３ドメイン（集合的に、ＣＨ）、並びに軽鎖のＣＨＬ（又はＣＬ）ドメインを含む。
抗体の「可変領域」又は「可変ドメイン」とは、抗体の重鎖又は軽鎖のアミノ末端ドメインを指す。重鎖の可変ドメインは、「ＶＨ」と称され得る。軽鎖の可変ドメインは、「ＶＬ」と称され得る。これらのドメインは、一般に、抗体の最も可変性の高い部分であり、抗原結合部位を含む。
「可変」という用語は、可変ドメインの特定の部分の配列が抗体間で広く異なり、かつ各特定の抗体の特定の抗原への結合及び特異性において使用されるという事実を指す。しかしながら、可変性は、抗体の可変ドメイン全体にわたって均等に分布していない。これは、軽鎖可変ドメイン及び重鎖可変ドメインの両方における超可変領域（ＨＶＲ）と呼ばれる３つのセグメントに集中している。可変ドメインのより高度に保存された部分は、フレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる。天然型の重鎖及び軽鎖の可変ドメインはそれぞれ、ベータ－シート構造を接続し、かついくつかの場合では、ベータ－シート構造の一部を形成するループを形成する３つのＨＶＲによって接続されたベータシート立体配置を大いに採用する４つのＦＲ領域を含む。各鎖内のＨＶＲは、ＦＲ領域によって近接して互いに保持され、他方の鎖からのＨＶＲと共に、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｆｉｆｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９９１）を参照）。定常ドメインは、抗体の抗原への結合に直接関与していないが、抗体の抗体依存性細胞毒性への関与等の様々なエフェクター機能を呈する。
「超可変領域」、「ＨＶＲ」、又は「ＨＶ」という用語は、本明細書で使用される場合、配列が超可変性であり、かつ／又は構造的に定義されたループを形成する抗体可変ドメインの領域を指す。一般的に、抗体は、ＶＨに３つ（Ｈ１、Ｈ２、Ｈ３）及びＶＬに３つ（Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３）の、６つのＨＶＲを含む。天然型抗体では、Ｈ３及びＬ３が、６つのＨＶＲのうちで最も高い多様性を示し、特にＨ３が抗体に優れた特異性を与える上で特有の役割を果たすと考えられている。例えば、Ｘｕ ｅｔ ａｌ．，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ １３：３７－４５（２０００）；Ｊｏｈｎｓｏｎ ａｎｄ Ｗｕ，ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２４８：１－２５（Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，Ｎ．Ｊ．，２００３）を参照されたい。実際に、重鎖のみからなる、天然に存在するラクダ抗体は、軽鎖の非存在下で機能的であり、安定している。例えば、Ｈａｍｅｒｓ－Ｃａｓｔｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３６３：４４６－４４８（１９９３）；Ｓｈｅｒｉｆｆ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．３：７３３－７３６（１９９６）を参照されたい。
いくつかのＨＶＲ描写が本明細書で使用され、本明細書に包含されている。Ｋａｂａｔ相補性決定領域（ＣＤＲ）は、配列可変性に基づくものであり、最も一般的に使用されている（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９９１）。代わりに、Ｃｈｏｔｈｉａは、構造的ループの位置を指す（Ｃｈｏｔｈｉａ及びＬｅｓｋＪ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１～９１７（１９８７））。ＡｂＭ ＨＶＲは、ＫａｂａｔのＨＶＲとＣｈｏｔｈｉａの構造的ループとの間の折衷物を表し、Ｏｘｆｏｒｄ ＭｏｌｅｃｕｌａｒのＡｂＭ抗体モデリングソフトウェアによって使用されている。「接触」ＨＶＲは、利用可能な複合体結晶構造の分析に基づく。これらＨＶＲの各々に由来する残基を、以下に示す。
ループ Kabat AbM Chothia 接触
L1 L24-L34 L24-L34 L26-L32 L30-L36
L2 L50-L56 L50-L56 L50-L52 L46-L55
L3 L89-L97 L89-L97 L91-L96 L89-L96
H1 H31-H35b H26-H35b H26-H32 H30-H35b(Kabatナンバリング)
H1 H31-H35 H26-H35 H26-H32 H30-H35(Chothiaナンバリング)
H2 H50-H65 H50-H58 H53-H55 H47-H58
H3 H95-H102 H95-H102 H96-H101 H93-H101
ＨＶＲは、以下の「伸長ＨＶＲ」を含み得る：ＶＬにおいて、２４～３６又は２４～３４（Ｌ１）、４６～５６又は５０～５６（Ｌ２）、及び８９～９７又は８９～９６（Ｌ３）、並びにＶＨにおいて、２６～３５（Ｈ１）、５０～６５又は４９～６５（Ｈ２）、及び９３～１０２、９４～１０２、又は９５～１０２（Ｈ３）。可変ドメイン残基は、これらの定義の各々について、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，（上記参照）に従ってナンバリングされる。
「フレームワーク」又は「ＦＲ」残基は、本明細書で定義されるＨＶＲ残基以外の可変ドメイン残基である。
「Ｋａｂａｔにおけるような可変ドメイン残基ナンバリング」又は「Ｋａｂａｔにおけるようなアミノ酸位置ナンバリング」という用語、及びそれらの変形は、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，（上記参照）における抗体の編集物の重鎖可変ドメイン又は軽鎖可変ドメインに使用されるナンバリングシステムを指す。このナンバリングシステムを使用して、実際の直鎖状アミノ酸配列は、可変ドメインのＦＲ若しくはＨＶＲの短縮、又はそれへの挿入に対応する、より少ないアミノ酸又は追加のアミノ酸を含み得る。例えば、重鎖可変ドメインは、Ｈ２の残基５２の後に単一のアミノ酸挿入（Ｋａｂａｔによる残基５２ａ）、及び重鎖ＦＲ残基８２の後に挿入された残基（例えば、Ｋａｂａｔによる残基８２ａ、８２ｂ、及び８２ｃ等）を含んでもよい。残基のＫａｂａｔナンバリングは、所与の抗体に対して、抗体の配列と「標準の」Ｋａｂａｔによってナンバリングされた配列との相同領域での整列によって決定され得る。
Ｋａｂａｔナンバリングシステムは一般に、可変ドメイン（およそ軽鎖の残基１～１０７及び重鎖の残基１～１１３）内の残基に言及するときに使用される（例えば、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ．５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９９１））。「ＥＵナンバリングシステム」又は「ＥＵ指標」は、一般に、免疫グロブリン重鎖定常領域における残基について言及する際に使用される（例えば、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌで報告されるＥＵインデックス、上記参照）。「ＫａｂａｔにおけるようなＥＵインデックス」は、ヒトＩｇＧ１ ＥＵ抗体の残基ナンバリングを指す。
「全長抗体」、「インタクトな抗体」、及び「全抗体」という用語は、以下に定義される抗体断片ではなく、その実質的にインタクトな形態にある抗体を指すために、本明細書において互換的に使用される。これらの用語は、具体的には、Ｆｃ領域を含む重鎖を有する抗体を指す。
「抗体断片」は、好ましくはその抗原結合領域を含む、インタクトな抗体の一部を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体断片は、抗原結合断片である。抗体断片の例としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、及びＦｖ断片、ダイアボディ、直鎖状抗体、一本鎖抗体分子、並びに抗体断片から形成される多重特異性抗体が挙げられる。
抗体のパパイン消化により、各々単一の抗原結合部位を有する「Ｆａｂ」断片と、容易に結晶化するその能力を反映して命名された残りの「Ｆｃ」断片と呼ばれる２つの同一の抗原結合断片が産生される。ペプシン処理は、Ｆ（ａｂ’）２断片をもたらし、これは、２つの抗原結合部位を有し、依然として抗原を架橋し得る。
「Ｆｖ」は、完全な抗原結合部位を含む最小抗体断片である。一実施形態では、二本鎖Ｆｖ種は、密接に非共有会合した１つの重鎖可変ドメイン及び１つの軽鎖可変ドメインの二量体からなる。一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）種において、１つの重鎖可変ドメイン及び１つの軽鎖可変ドメインは、軽鎖及び重鎖が二本鎖Ｆｖ種における構造に類似の「二量体」構造で会合し得るように、可動性ペプチドリンカーによって共有結合し得る。各可変ドメインの３つのＨＶＲが相互作用してＶＨ－ＶＬ二量体の表面上の抗原結合部位を定義するのは、この立体配置においてである。集合的に、６つのＨＶＲが抗体に抗原結合特異性を与える。しかしながら、単一の可変ドメイン（又は抗原に特異的なＨＶＲを３つしか含まないＦｖの半分）であっても、全結合部位よりも低い親和性であるが、抗原を認識し、それに結合する能力を有する。
Ｆａｂ断片は、重鎖可変ドメイン及び軽鎖可変ドメインを含有し、軽鎖定常ドメイン及び第１の重鎖定常ドメイン（ＣＨ１）も含有する。Ｆａｂ’断片は、抗体ヒンジ領域由来の１つ以上のシステインを含む、重鎖ＣＨ１ドメインのカルボキシ末端における少数の残基の付加によって、Ｆａｂ断片とは異なる。Ｆａｂ’－ＳＨは、定常ドメインのシステイン残基（複数可）が、遊離チオール基を持つＦａｂ’の本明細書での呼称である。Ｆ（ａｂ’）２抗体断片は、元来、間にヒンジシステインを有するＦａｂ’断片の対として産生されたものであった。抗体断片の他の化学的カップリングも公知である。
「一本鎖Ｆｖ」又は「ｓｃＦｖ」抗体断片は、抗体のＶＨ及びＶＬドメインを含み、これらのドメインは、単一のポリペプチド鎖中に存在する。一般に、ｓｃＦｖポリペプチドは、ＶＨドメインとＶＬドメインとの間にポリペプチドリンカーを更に含み、これにより、ｓｃＦｖが抗原結合に望ましい構造を形成することが可能になる。ｓｃＦｖに関するレビューについては、例えば、Ｐｌｕｃｋｔｈｕｅｎ，ｉｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９４），ｐｐ．２６９－３１５を参照されたい。
「ダイアボディ」という用語は、二つの抗原結合部位を持つ抗体断片を指し、その断片は、同一ポリペプチド鎖の軽鎖可変ドメイン（ＶＬ）に連結した重鎖可変ドメイン（ＶＨ）を含む（ＶＨ－ＶＬ）。非常に短いために同一鎖上で二つのドメインの対形成ができないリンカーを使用して、ドメインを他の鎖の相補ドメインと強制的に対形成させ、二つの抗原結合部位を生成する。ダイアボディは二価でも二特異性でもよい。ダイアボディは、例えば、欧州特許第４０４，０９７号、国際公開第１９９３／０１１６１号、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）；及びＨｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８（１９９３）において、より完全に記載されている。トリアボディ及びテトラボディはまた、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）においても記載されている。
抗体の「クラス」は、その重鎖によって保有される定常ドメイン又は定常領域の型を指す。抗体の５つの主要なクラスがあり、すなわち、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、及びＩｇＭが存在し、これらのうちのいくつかは、サブクラス（アイソタイプ）、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、及びＩｇＡ２に更に分ける場合がある。抗体の異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインはそれぞれ、α、δ、ε、γ、及びμと呼ばれる。
本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に同種の抗体の集団から得られる抗体を指し、例えば、その集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る可能な変異、例えば、天然に存在する変異を除いて同一である。したがって、「モノクローナル」という修飾語は、別個の抗体の混合物ではないという抗体の特徴を示す。ある特定の実施形態では、かかるモノクローナル抗体は、典型的には、標的に結合するポリペプチド配列を含む抗体を含み、標的結合ポリペプチド配列は、複数のポリペプチド配列から単一の標的結合ポリペプチド配列の選択を含むプロセスによって得られたものである。例えば、この選択プロセスは、ハイブリドーマクローン、ファージクローン、又は組み換えＤＮＡクローンのプール等の複数のクローンからの特有のクローンの選択であり得る。選択された標的結合配列が、例えば、標的への親和性を改善し、標的結合配列をヒト化し、細胞培養におけるその産生を改善し、ｉｎ ｖｉｖｏでのその免疫原性を低減し、多重特異性抗体を作製するように更に改変されてもよく、かつ改変された標的結合配列を含む抗体が本発明のモノクローナル抗体でもあることを理解されたい。様々な決定基（エピトープ）に対する様々な抗体を通常含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、モノクローナル抗体調製物の各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対するものである。それらの特異性に加えて、モノクローナル抗体調製物は、典型的には他の免疫グロブリンによる混入がないという点で有利である。
「モノクローナル」という修飾語は、実質的に同種の抗体集団から得られるという抗体の特徴を示し、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とするものと解釈されるべきではない。例えば、本発明に従って使用されるモノクローナル抗体は、例えば、ハイブリドーマ法（例えば、Ｋｏｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５－９７（１９７５）；Ｈｏｎｇｏ ｅｔ ａｌ．，Ｈｙｂｒｉｄｏｍａ １４（３）：２５３－２６０（１９９５），Ｈａｒｌｏｗ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，２ｎｄ ｅｄ．１９８８）；Ｈａｍｍｅｒｌｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，ｉｎ：Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｔ－Ｃｅｌｌ Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ ５６３－６８１（Ｅｌｓｅｖｉｅｒ，Ｎ．Ｙ．，１９８１））、組換えＤＮＡ法（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号を参照）、ファージディスプレイ技術（例えば、Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，３５２：６２４－６２８（１９９１）；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１－５９７（１９９２）；Ｓｉｄｈｕ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３８（２）：２９９－３１０（２００４）；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３４０（５）：１０７３－１０９３（２００４）；Ｆｅｌｌｏｕｓｅ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０１（３４）：１２４６７－１２４７２（２００４）；及びＬｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８４（１－２）：１１９－１３２（２００４）を参照）、及びヒト免疫グロブリン配列をコードするヒト免疫グロブリン遺伝子座又は遺伝子の一部又は全てを有するヒト又はヒト様抗体を動物で産生するための技術（例えば、国際公開第１９９８／２４８９３号、国際公開第１９９６／３４０９６号、国際公開第１９９６／３３７３５号、国際公開第１９９１／１０７４１号；Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：２５５１（１９９３）；Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３６２：２５５－２５８（１９９３）；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｙｅａｒ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌ．７：３３（１９９３）、米国特許第５，５４５，８０７号、同第５，５４５，８０６号、同第５，５６９，８２５号、同第５，６２５，１２６号、同第５，６３３，４２５号、及び同第５，６６１，０１６号、Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １０：７７９－７８３（１９９２）；Ｌｏｎｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３６８：８５６－８５９（１９９４）；Ｍｏｒｒｉｓｏｎ，Ｎａｔｕｒｅ ３６８：８１２－８１３（１９９４）；Ｆｉｓｈｗｉｌｄ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１４：８４５－８５１（１９９６）；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒ，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１４：８２６（１９９６）；及びＬｏｎｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔｅｒｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３：６５－９３（１９９５））を含む様々な技法によって作製され得る。
本明細書におけるモノクローナル抗体には、具体的には、重鎖及び／又は軽鎖の一部が、特定の種に由来するか、又は特定の抗体クラス若しくはサブクラスに属する抗体内の対応する配列と同一又は相同である一方で、鎖（複数可）の残りが、別の種に由来するか、又は別の抗体クラス若しくはサブクラスに属する抗体内の対応する配列と同一又は相同である「キメラ」抗体、並びにそれらが所望の生物学的活性を呈する限り、そのような抗体の断片を含む（例えば、米国特許第４，８１６，５６７号及びＭｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８１：６８５１－６８５５（１９８４）を参照されたい）。キメラ抗体には、ＰＲＩＭＡＴＩＺＥＤ（登録商標）抗体が挙げられ、この抗体の抗原結合領域は、例えば、マカクザルを目的の抗原で免疫化することによって産生された抗体由来である。
「ヒト抗体」とは、ヒト若しくはヒト細胞により産生される抗体、又はヒト抗体レパートリー若しくはヒト抗体をコードする配列を利用した非ヒト起源由来の抗体のアミノ酸に対応するアミノ酸配列を有する抗体である。このヒト抗体の定義は、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗体を明確に除外する。
「ヒト化」抗体は、非ヒト超可変領域（ＨＶＲ）由来のアミノ酸残基及びヒトフレームワーク領域（ＦＲ）由来のアミノ酸残基を含むキメラ抗体を指す。特定の実施形態では、ヒト化抗体は、少なくとも１つ、典型的には２つの可変ドメインの実質的に全てを含み、ＨＶＲ（例えばＣＤＲ）の全て又は実質的に全てが、非ヒト抗体に対応し、ＦＲの全て又は実質的に全てが、ヒト抗体に対応する。ヒト化抗体は、任意に、ヒト抗体に由来する抗体定常領域の少なくとも一部を含んでいてもよい。抗体、例えば、非ヒト抗体の「ヒト化形態」とは、ヒト化を受けた抗体を指す。
「抗ＰＤ－Ｌ１抗体」及び「ＰＤ－Ｌ１に結合する抗体」という用語は、抗体がＰＤ－Ｌ１の標的化において診断剤及び／又は治療剤として有用であるような充分な親和性を有して、ＰＤ－Ｌ１に結合可能である抗体を指す。一実施形態では、非関連非ＰＤ－Ｌ１タンパク質への抗ＰＤ－Ｌ１抗体の結合の程度は、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）で測定した場合に、ＰＤ－Ｌ１への抗体の結合の約１０％未満である。特定の実施形態では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、異なる種のＰＤ－Ｌ１間で保存されているＰＤ－Ｌ１のエピトープに結合する。
「抗ＰＤ－１抗体」及び「ＰＤ－１に結合する抗体」という用語は、抗体がＰＤ－１の標的化において診断剤及び／又は治療剤として有用であるような充分な親和性を有して、ＰＤ－１に結合可能である抗体を指す。一実施形態では、非関連非ＰＤ－１タンパク質への抗ＰＤ－１抗体の結合の程度は、例えばラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）によって測定した場合に、ＰＤ－１への抗体の結合の約１０％未満である。特定の実施形態では、抗ＰＤ－１抗体は、異なる種のＰＤ－１間で保存されているＰＤ－１のエピトープに結合する。
「遮断」抗体又は「アンタゴニスト」抗体は、それが結合する抗原の生物学的活性を阻害又は低減するものである。好ましい遮断抗体又はアンタゴニスト抗体は、抗原の生物活性を実質的に又は完全に阻害する。
「親和性」は、分子（例えば、抗体）の単一の結合部位とその結合パートナー（例えば、抗原）との間の、合計の非共有性相互作用の強度を指す。別途示されない限り、本明細書で使用される場合、「結合親和性」は、結合対のメンバー（例えば、抗体及び抗原）間の１：１の相互作用を反映する固有の結合親和性を指す。分子ＸのそのパートナーＹに対する親和性は一般に、解離定数（Ｋｄ）によって表され得る。親和性は、本明細書に記載するものを含め、当該技術分野で一般的な方法によって測定することができる。結合親和性を測定するための具体的な説明的かつ例示的な実施形態が以下に記載される。
本明細書で使用される場合、「結合する」、「～に特異的に結合する」、又は「～に特異的である」という用語は、標的と抗体との間の結合等、測定可能かつ再生可能な相互作用を指し、これは、生体分子を含む分子の異種集団の存在下において、標的の存在を決定づけるものである。例えば、標的（エピトープであり得る）に結合するか、又はそれに特異的に結合する抗体は、この標的に、他の標的に結合するよりも高い親和性で、結合力で、より容易に、かつ／又はより長期間結合する抗体である。一実施形態では、抗体が無関係の標的に結合する程度は、例えば、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）によって測定される、抗体の標的への結合の約１０％未満である。ある特定の実施形態では、標的に特異的に結合する抗体は、１μＭ以下、１００ｎＭ以下、１０ｎＭ以下、１ｎＭ以下、又は０．１ｎＭ以下の解離定数（Ｋｄ）を有する。特定の実施形態では、抗体は、異なる種由来のタンパク質間で保存されるタンパク質上のエピトープに特異的に結合する。別の実施形態では、特異的結合は、排他的結合を含むことができるが、必須ではない。
「親和性成熟」抗体とは、改変等を有しない親抗体と比較して、１つ以上の超可変領域（ＨＶＲ）に１つ以上の改変を有し、そのような改変により抗体の抗原に対する親和性が改善される抗体を指す。
参照抗体と「同じエピトープに結合する抗体」は、競合アッセイにおいて、参照抗体がその抗原に結合するのを５０％以上遮断する抗体、及び逆に、競合アッセイにおいて、抗体がその抗原に結合するのを５０％以上遮断する参照抗体を指す。
「イムノコンジュゲート」は、細胞傷害性薬剤を含むが、これに限定されない１つ以上の異種分子にコンジュゲートされた抗体である。
本明細書で使用される場合、「イムノアドヘシン」という用語は、異種タンパク質（「アドヘシン」）の結合特異性と、免疫グロブリン定常ドメインのエフェクター機能とを組み合わせた、抗体様分子を指す。構造的には、イムノアドヘシンは、抗体（すなわち、「異種の」）の抗原認識及び結合部位以外である所望の結合特異性を持つアミノ酸配列と、免疫グロブリン定常ドメイン配列との融合物を含む。免疫アドヘシン分子のアドヘシン部分は、典型的には、少なくとも受容体又はリガンドの結合部位を含む連続するアミノ酸配列である。イムノアドヘシン中の免疫グロブリン定常ドメイン配列は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２（ＩｇＧ２Ａ及びＩｇＧ２Ｂを含む）、ＩｇＧ３、又はＩｇＧ４サブタイプ、ＩｇＡ（ＩｇＡ１及びＩｇＡ２を含む）、ＩｇＥ、ＩｇＤ、又はＩｇＭ等の任意の免疫グロブリンから得ることができる。Ｉｇ融合物は、好ましくは、Ｉｇ分子内の少なくとも１つの可変領域の場所に、本明細書に記載のポリペプチド又は抗体のドメインの置換を含む。特に好ましい実施形態では、免疫グロブリン融合物は、ＩｇＧ１分子のヒンジ、ＣＨ２及びＣＨ３、又はヒンジ、ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３領域を含む。免疫グロブリン融合物の作製に関しては、米国特許第５，４２８，１３０号も参照されたい。例えば、本明細書における治療に有用な医薬としての有用なイムノアドヘシンとしては、免疫グロブリン配列の定常ドメインに融合される、ＰＤ－Ｌ１若しくはＰＤ－Ｌ２の細胞外ドメイン（ＥＣＤ）若しくはＰＤ－１結合部分、あるいはＰＤ－１の細胞外又はＰＤ－Ｌ１若しくはＰＤ－Ｌ２結合部分（それぞれ、ＰＤ－Ｌ１ ＥＣＤ－Ｆｃ、ＰＤ－Ｌ２ ＥＣＤ－Ｆｃ、及びＰＤ－１ ＥＣＤ－Ｆｃ等）を含むポリペプチドが挙げられる。細胞表面受容体のＩｇ ＦｃとＥＣＤとのイムノアドヘシンの組み合わせは、可溶性受容体と称されることがある。
「融合タンパク質」及び「融合ポリペプチド」は、一緒に共有結合した２つの部分を有するポリペプチドを指し、該部分のそれぞれは、異なる特性を有するポリペプチドである。この特性は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ又はｉｎ ｖｉｖｏでの活性等の生物学的特性であり得る。この特性はまた、標的分子への結合、反応の触媒作用等の単純な化学的又は物理的特性であり得る。これらの２つの部分は、単一のペプチド結合によって直接的に、又はペプチドリンカーを通して連結され得るが、それらは、互いのリーディングフレーム内にある。
本明細書で同定されるポリペプチド配列に関する「アミノ酸配列同一性パーセント（％）」は、最大の配列同一性パーセントが得られるように、配列を整列させ、必要に応じてギャップを導入した後に、いずれの保存的置換も配列同一性の一部とは見なさずに、候補配列内のアミノ酸残基が、比較されるポリペプチド内のアミノ酸残基と同一であるパーセンテージとして定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のための整列は、当該技術分野における技術の範囲内にある種々の方法において、例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ－２、ＡＬＩＧＮ、又はＭｅｇａｌｉｇｎ（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェア等の公的に入手可能なコンピュータソフトウェアを用いて達成され得る。当業者であれば、比較されている配列の全長にわたって最大の整列を達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、整列を測定するための適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書での目的のために、アミノ酸配列同一性％値は、配列比較コンピュータプログラムＡＬＩＧＮ－２を用いて生成している。ＡＬＩＧＮ－２配列比較コンピュータプログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．によって作成され、ソースコードは、ユーザ文書と共に米国著作権庁、Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ Ｄ．Ｃ．、２０５５９に提出され、米国著作権登録番号ＴＸＵ５１００８７の下で登録されている。ＡＬＩＧＮ－２プログラムは、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ，Ｉｎｃ．、Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ、Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａから公的に利用可能である。ＡＬＩＧＮ－２プログラムは、ＵＮＩＸオペレーティングシステム、好ましくはデジタルＵＮＩＸ Ｖ４．０Ｄ上で使用するために編集される必要がある。全ての配列比較パラメータは、ＡＬＩＧＮ－２プログラムによって設定されており、変わらない。
ＡＬＩＧＮ－２がアミノ酸配列比較に用いられる状況では、所与のアミノ酸配列Ｂへの、アミノ酸配列Ｂとの、又はアミノ酸配列Ｂに対する、所与のアミノ酸配列Ａのアミノ酸配列同一性％（あるいは、所与のアミノ酸配列Ｂへの、アミノ酸配列Ｂとの、又はアミノ酸配列Ｂに対する、ある特定のアミノ酸配列同一性％を有する又は含む、所与のアミノ酸配列Ａとして記述され得る）は、以下のように計算される：
１００×分数Ｘ／Ｙ
このとき、Ｘは配列アラインメントプログラムＡＬＩＧＮ－２により、ＡとＢのそのプログラムのアラインメントにおいて同一であるとして一致したスコアのアミノ酸残基の数であり、ＹはＢの全アミノ酸残基数である。アミノ酸配列Ａの長さがアミノ酸配列Ｂの長さと異なる場合、ＡのＢに対する％アミノ酸配列同一性は、ＢのＡに対する％アミノ酸配列同一性とは異なることは理解されるであろう。特に断らない限り、本明細書で使用される全ての％アミノ酸配列同一性値は、ＡＬＩＧＮ－２コンピュータプログラムを使用して、直前の段落で説明したように得られる。
「実質的に同じ」という用語は、本明細書で使用される場合、当業者が、当該値（例えば、Ｋｄ値又は発現レベル）により測定される生物学的特質の文脈において、２つの値の間にある差異を生物学的及び／又は統計学的に重要性がほとんどないか、まったくないと見なすような、２つの数値間の充分に程度の高い類似性を意味する。当該２つの値の間の差異は、参照／比較値の関数として、例えば、約５０％未満、約４０％未満、約３０％未満、約２０％未満、及び／又は約１０％未満である。
「実質的に異なる」という語句は、本明細書で使用される場合、当業者が、当該値（例えば、Ｋｄ値又は発現レベル）により測定される生物学的特質の文脈において、２つの値の間にある差異を統計学的に重要性があると見なすような、２つの数値間の充分に程度の高い差異を意味する。当該２つの値の間の差異は、参照／比較分子に対する値の関数として、例えば、約１０％超、約２０％超、約３０％超、約４０％超、及び／又は約５０％超である。
「標識」という単語は、本明細書で使用される場合、ポリヌクレオチドプローブ又は抗体等の試薬に直接的又は間接的にコンジュゲート又は融合され、コンジュゲート又は融合される試薬の検出を容易にする化合物又は組成物を指す。標識は、それ自体が検出可能（例えば、放射性同位体標識又は蛍光標識）であり得、又は酵素的標識の場合、検出可能な基質化合物若しくは組成物の化学的改変を触媒し得る。この用語は、検出可能な物質をプローブ又は抗体に結合すること（すなわち、物理的に連結すること）によって、プローブ又は抗体の直接的標識化、並びに直接的に標識化される別の試薬との反応性によって、プローブ又は抗体の間接的標識化を包含することを意図する。間接的標識化の例としては、蛍光標識された二次抗体を使用する一次抗体の検出、及び蛍光標識されたストレプトアビジンで検出され得るようなビオチンを有するＤＮＡプローブの末端標識が挙げられる。
ＩＩＩ．方法
Ａ．診断、同定、予測及び選択の方法
本開示は、とりわけ、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法、がんを有する個体に対する治療を選択するための方法、及びＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定する方法を提供する。前述の方法のいずれかは、個体から得られた試料中の本明細書に提供されるバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の任意の遺伝子の発現レベル、例えばＩＬ８発現に基づいてもよい。本明細書に記載されるように、例えば実施例１では、ＩＬ８の基準レベルを下回る個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベル、又はＩＬ８の基準レベルと比較したＩＬ８の発現レベルの治療中の減少は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法からの治療応答の改善に関連する。対照的に、本明細書、例えば実施例１にも記載されるように、ＩＬ８の基準レベル以上である個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベル、又はＩＬ８の基準レベルと比較したＩＬ８の発現レベルの治療中の増加は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法からの治療応答の低下に関連し、これは個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法から利益を得るものとして同定することができる。本明細書にも記載されるように、本発明はまた、例えば腫瘍試料及び／又はＰＢＭＣにおいて、ＩＬ８高がんに関連してアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子を提供する。例えば、図１を参照されたい。ＩＬ８高がんの状況においてアップレギュレート又はダウンレギュレートされる１つ以上の遺伝子、例えば表２～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法、がんを有する個体に対する治療を選択するための方法、及びＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定する方法において、ＩＬ８発現の代理として使用することができる。本方法のいずれかは、抗がん療法、例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、以下のセクションＩＶに記載されているように）を含む抗がん療法、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の若しくはＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を患者に投与することを更に含み得る。任意の方法は、有効量の１つ以上の追加の治療剤を個体に投与することを更に含み得る。
Figure 2023520515000002
１．ＩＬ８
本開示のいくつかの態様では、低下した又は低いＩＬ８レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い個体を同定及び／又は選択することができる。例えば、低下した又は低いベースライン又は治療中のＩＬ８発現レベル（例えば、ＩＬ８の基準レベルに対して）を使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い個体を同定することができる。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと個体を同定する。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと個体を同定し、応答は、ＯＳ又はＯＲＲで示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
更に別の例では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルが、ＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定し、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更なる例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。他の事例では、試料はＰＢＭＣを含む。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることが、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む治療を選択すること、を含む。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。他の事例では、試料はＰＢＭＣを含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと個体を同定する。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることが、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料は血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと個体を同定する。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料は血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることが、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善された応答を有する可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から、改善されたＯＲＲ、改善されたＣＲ率、改善されたＰＲ率、延長されたＰＦＳ、及び／又は延長されたＯＳを有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善されたＯＲＲを有する可能性があり得る。他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＰＦＳを有する可能性があり得る。なお更に他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＯＳを有する可能性があり得る。
本開示の他の態様では、上昇した又は高いＩＬ８レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い個体を同定及び／又は選択することができる。例えば、上昇した又は高いベースライン又は治療中のＩＬ８発現レベル（例えば、ＩＬ８の基準レベルに対して）を使用して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い個体を同定することができる。そのような患者は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の治療剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、ベバシズマブ等の抗ＶＥＧＦ抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）との併用療法）による治療の候補であり得る。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定する。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定し、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を選択すること、を含む。
例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルが、ＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定し、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定する。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた治療を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からの応答が低下している可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療から、ＯＲＲの低下、ＣＲ率の低下、ＰＲ率の低下、ＰＦＳの短縮又はＯＳの短縮を有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＲＲが低下している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＰＦＳが短縮している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＳが短縮している可能性があり得る。
２．ＩＬ８高がんにおいてアップレギュレートされる遺伝子
本開示のいくつかの態様では、ＩＬ８高がんにおいてアップレギュレートされる１つ以上の遺伝子の減少した又は低いレベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い個体を同定及び／又は選択することができる。例えば、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の（例えば、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）低下した又は低いベースライン又は治療中の発現レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い個体を同定することができる。
Figure 2023520515000003
Figure 2023520515000004
Figure 2023520515000005
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定し、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
更に別の例では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、反応が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法が本明細書で提供される。
更なる例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。他の事例では、試料はＰＢＭＣを含む。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む治療を選択すること、を含む。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。他の事例では、試料はＰＢＭＣを含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料は血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善された応答を有する可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から、改善されたＯＲＲ、改善されたＣＲ率、改善されたＰＲ率、延長されたＰＦＳ、及び／又は延長されたＯＳを有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善されたＯＲＲを有する可能性があり得る。他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＰＦＳを有する可能性があり得る。更に他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＯＳを有する可能性があり得る。
本開示の他の態様では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上遺伝子のレベルの上昇又は高レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い個体を同定及び／又は選択することができる。例えば、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の（例えば、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）上昇した又は高いベースライン又は治療中の発現レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い個体を同定することができる。そのような患者は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の治療剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、ベバシズマブ等の抗ＶＥＧＦ抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）との併用療法）による治療の候補であり得る。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、ＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、反応が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法が本明細書で提供される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた治療を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択することを含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択することを含む。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からの応答が低下している可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療から、ＯＲＲの低下、ＣＲ率の低下、ＰＲ率の低下、ＰＦＳの短縮又はＯＳの短縮を有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＲＲが低下している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＰＦＳが短縮している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＳが短縮している可能性があり得る。
３．ＩＬ８高がんにおいてダウンレギュレートされた遺伝子
本開示のいくつかの態様では、ＩＬ８高がんにおいてダウンレギュレートされる１つ以上の遺伝子の増加した又は高いレベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い個体を同定及び／又は選択することができる。例えば、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の（例えば、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）増加した又は高いベースライン又は治療中の発現レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い個体を同定することができる。
Figure 2023520515000006
Figure 2023520515000007
Figure 2023520515000008
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定し、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
更に別の例では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、反応が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法が本明細書で提供される。
更なる例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。他の事例では、試料はＰＢＭＣを含む。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、該血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む治療を選択すること、を含む。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。他の事例では、試料はＰＢＭＣを含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料は血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善された応答を有する可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から、改善されたＯＲＲ、改善されたＣＲ率、改善されたＰＲ率、延長されたＰＦＳ、及び／又は延長されたＯＳを有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善されたＯＲＲを有する可能性があり得る。他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＰＦＳを有する可能性があり得る。更に他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＯＳを有する可能性があり得る。
本開示の他の態様では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上遺伝子のレベルの低下又は低レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い個体を同定及び／又は選択することができる。例えば、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の（例えば、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）低下した又は低いベースライン又は治療中の発現レベルを使用して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い個体を同定することができる。そのような患者は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の治療剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、ベバシズマブ等の抗ＶＥＧＦ抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）との併用療法）による治療の候補であり得る。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、ＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルを下回ることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、反応が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法が本明細書で提供される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることが、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定し、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた治療を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択すること、を含む。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される。
更に別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択することを含む。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の例では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体に対して治療を選択するための方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、個体についてＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法を選択することを含む。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からの応答が低下している可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療から、ＯＲＲの低下、ＣＲ率の低下、ＰＲ率の低下、ＰＦＳの短縮又はＯＳの短縮を有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＲＲが低下している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＰＦＳが短縮している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＳが短縮している可能性があり得る。
４．試料及び基準レベル
任意の適切な試料が、本明細書に記載される方法のいずれかにおいて使用され得る。例示的な非限定的な試料としては、血漿試料、組織試料、細胞試料、全血試料、血清試料、又はそれらの組み合わせが挙げられる。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。いくつかの事例では、腫瘍試料は腫瘍組織試料である。いくつかの事例では、腫瘍組織試料は、腫瘍細胞、腫瘍浸潤免疫細胞、間質細胞、又はこれらの組み合わせを含む。いくつかの事例では、腫瘍浸潤免疫細胞は、腫瘍浸潤骨髄細胞を含む。いくつかの事例では、腫瘍組織試料は、ホルマリン固定パラフィン包埋（ＦＦＰＥ）試料、アーカイブ試料、新鮮な試料、又は凍結試料である。いくつかの事例では、細胞試料は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む。
任意の適切な基準レベルが、本明細書中に記載される方法のいずれかにおいて使用され得る。例えば、いくつかの事例では、本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の基準レベルは、がんを有する個体の集団から決定される。例えば、いくつかの事例では、本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の基準レベルは、がんを有する患者の集団で決定された発現レベルの中央値、発現レベルの三分位値、又は最大選択されたログランク基準レベルである。いくつかの実施形態では、最大選択されたログランク基準レベルは、１２ｐｇ／ｍＬのＩＬ８である。いくつかの事例では、本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の基準レベルは、がんを有する患者の集団で決定された発現レベルの中央値である。特定の一例では、基準レベルは、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られた試料中の本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８のレベルであり得る。別の特定の例では、基準レベルは、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８のレベルであり得る。
特定の事例では、第１の試料中のバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在及び／又は発現レベル／量は、第２の試料中の存在／非存在及び／又は発現レベル／量と比較して増加又は上昇する。特定の事例では、第１の試料中のバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在／非存在及び／又は発現レベル／量は、第２の試料中の存在及び／又は発現レベル／量と比較して減少又は低下する。ある特定の事例では、第２の試料は、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織である。遺伝子の存在／不在及び／又は発現レベル／量を決定するための更なる開示が本明細書に記載されている。
ある特定の事例では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、試験試料が得られたときとは異なる１つ以上の時点で得られる同じ対象又は個体由来の単一の試料又は複数の試料の組み合わせである。例えば、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、試験試料が得られるよりも早い時点で同じ対象又は個体から得られる。このような基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、基準試料ががんの最初の診断中に得られる場合、かつがんが転移性がんになったときに試験試料が後で得られる場合に有用であり得る。
特定の事例では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、患者ではない１つ以上の健常な個体由来の複数の試料の組み合わせである。特定の事例では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、対象又は個体ではない、疾患又は障害（例えば、がん）を有する１つ以上の個体由来の複数の試料の組み合わせである。特定の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、正常組織由来のプールされたＲＮＡ試料、又は患者ではない１つ以上の個体由来のプールされた血漿若しくは血清試料である。特定の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、腫瘍組織由来のプールされたＲＮＡ試料、又は患者ではない、疾患若しくは障害（例えば、がん）を有する１つ以上の個体由来のプールされた血漿若しくは血清試料である。
任意の方法のいくつかの例において、発現の上昇又は増加とは、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織と比較して、本明細書に記載されるもの等の標準的な技術の公知の方法によって検出されるバイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）（例えば、タンパク質又は核酸（例えば、遺伝子又はｍＲＮＡ））のレベルの約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上のいずれかの全体的な増加を指す。特定の実施形態では、上昇した発現とは、試料におけるバイオマーカーの発現レベル／量の増加を指し、増加は、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織におけるそれぞれのバイオマーカーの発現レベル／量の少なくとも約１．５倍、１．７５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２５倍、５０倍、７５倍、又は１００倍のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、上昇した発現とは、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、対照組織、又は内部対照（例えば、ハウスキーピング遺伝子）と比較して、約１．５倍超、約１．７５倍、約２倍、約２．２５倍、約２．５倍、約２．７５倍、約３．０倍、又は約３．２５倍の全体的な増加を指す。
任意の方法のいくつかの例において、発現の低下とは、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織と比較して、本明細書に記載されるもの等の標準的な技術の公知の方法によって検出されるバイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）（例えば、タンパク質又は核酸（例えば、遺伝子又はｍＲＮＡ））のレベルの約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上のいずれかの全体的な低下を指す。特定の実施形態では、低減した発現とは、試料におけるバイオマーカーの発現レベル／量の減少を指し、減少は、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織におけるそれぞれのバイオマーカーの発現レベル／量の少なくとも約０．９倍、０．８倍、０．７倍、０．６倍、０．５倍、０．４倍、０．３倍、０．２倍、０．１倍、０．０５倍、又は０．０１倍のうちのいずれかである。
５．バイオマーカーの存在及び／又は発現レベルの決定
バイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在及び／又は発現レベル／量は、ＤＮＡ、ｍＲＮＡ、ｃＤＮＡ、タンパク質、タンパク質断片、及び／又は遺伝子コピー数を含むがこれらに限定されない、当技術分野で公知の任意の適切な基準に基づいて定性的及び／又は定量的に決定することができる。試料中の本明細書に記載される様々なバイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在及び／又は発現レベル／量は、多くの手法によって分析され得、これらの多くは、当該技術分野で既知であり、当業者によって理解されており、免疫組織化学（「ＩＨＣ」）、ウェスタンブロット分析、免疫沈降、分子結合アッセイ、ＥＬＩＳＡ、ＥＬＩＦＡ、蛍光活性化細胞分類（「ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｃｅｌｌ ｓｏｒｔｉｎｇ：ＦＡＣＳ」）、ＭａｓｓＡＲＲＡＹ、プロテオミクス、定量的血液ベースのアッセイ（例えば、血清ＥＬＩＳＡ）、生化学的酵素活性アッセイ、原位置ハイブリダイゼーション、蛍光原位置ハイブリダイゼーション（ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ ｉｎ ｓｉｔｕ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ：ＦＩＳＨ）、サザン分析、ノーザン分析、全ゲノム配列決定、定量的リアルタイムＰＣＲ（ｑＲＴ－ＰＣＲ）及び他の増幅型検出方法、例えば、分枝ＤＮＡ、ＳＩＳＢＡ、ＴＭＡ等を含むポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、ＲＮＡ－ｓｅｑ（例えば、ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ）、マイクロアレイ分析、遺伝子発現プロファイリング、及び／又は遺伝子発現の連続分析（「ｓｅｒｉａｌ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ：ＳＡＧＥ」）、並びにタンパク質、遺伝子、及び／又は組織アレイ分析によって行われ得る多種多様のアッセイのうちのいずれか１つが挙げられるが、これらに限定されない。遺伝子及び遺伝子産物の状態を評価するための典型的なプロトコルは、例えば、Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，１９９５，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、第２部（ノーザンブロット法）、第４部（サザンブロット法）、第１５部（免疫ブロット法）、及び第１８部（ＰＣＲ分析）において見出される。Ｒｕｌｅｓ Ｂａｓｅｄ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ又はＭｅｓｏ Ｓｃａｌｅ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ（「ＭＳＤ」）から入手可能なアッセイ等の多重化免疫アッセイも使用され得る。
本明細書に記載される方法のいずれにおいても、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現レベルは核酸発現レベルであり得る。いくつかの事例では、核酸発現レベルは、ｑＰＣＲ、ｒｔＰＣＲ、ＲＮＡ－Ｓｅｑ、多重ｑＰＣＲ若しくはＲＴ－ｑＰＣＲ、マイクロアレイ分析、ＳＡＧＥ、ＭａｓｓＡＲＲＡＹ技法、又はｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（例えば、ＦＩＳＨ）を用いて決定される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、ＩＬ８）の発現レベルは、腫瘍細胞、腫瘍浸潤免疫細胞、ＰＢＭＣ、間質細胞、又はそれらの組み合わせで決定される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現レベルは、腫瘍浸潤免疫細胞において決定される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現レベルは、腫瘍細胞において決定される。特定の事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現レベルは、ＰＢＭＣにおいて決定される。
細胞中のｍＲＮＡの評価方法が周知であり、該方法として、例えば、相補的ＤＮＡプローブを使用したハイブリダイゼーションアッセイ（１つ以上の遺伝子に特異的な標識リボプローブを使用したインサイツハイブリダイゼーション、ノーザンブロット、及び関連技法等）、並びに様々な核酸増幅アッセイ（遺伝子のうちの１つ以上に特異的な相補的プライマーを使用したＲＴ－ＰＣＲ、及び他の増幅型検出方法、例えば、分岐状ＤＮＡ、ＳＩＳＢＡ、ＴＭＡ等）が挙げられる。加えて、このような方法は、生物学的試料中の標的ｍＲＮＡのレベルを（例えば、アクチン・ファミリー・メンバー等の「ハウスキーピング」遺伝子の比較対照ｍＲＮＡ配列のレベルを同時に試験することによって）決定することを可能にする１つ以上の工程を含み得る。任意に、増幅された標的ｃＤＮＡの配列が決定され得る。任意の方法は、マイクロアレイ技術によって組織又は細胞試料中の標的ｍＲＮＡ等のｍＲＮＡを試験又は検出するプロトコルを含む。核酸マイクロアレイを使用して、試験及び対照組織試料からの試験及び対照ｍＲＮＡ試料を逆転写し、標識して、ｃＤＮＡプローブを生成する。その後、プローブを、固体支持体に固定した核酸のアレイにハイブリダイズする。アレイは、アレイの各メンバーの配列及び位置が分かるように構成する。例えば、その発現がＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む治療の臨床的利益の増加又は低下と相関する様々な遺伝子の選択が、固体支持体上にアレイされ得る。標識されたプローブの、特定のアレイメンバーとのハイブリダイゼーションは、プローブが由来する試料がその遺伝子を発現することを示す。
特定の事例では、ｍＲＮＡ発現レベルが、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－ｓｅｑ）、リアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖応答（ＲＴ－ｑＰＣＲ）、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、マルチプレックスｑＰＣＲ若しくはＲＴ－ｑＰＣＲ、マイクロアレイ分析、遺伝子発現の連続分析（ＳＡＧＥ）、ＭａｓｓＡＲＲＡＹ技術、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）、又はそれらの組み合わせによって決定される。いくつかの特定の事例では、ＲＮＡ－ｓｅｑは単一細胞ＲＮＡ－ｓｅｑ（ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ）である。
本明細書に記載される方法のいずれにおいても、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在及び／又は発現レベル／量は、バイオマーカーのタンパク質発現レベルを決定することによって測定される。特定の事例では、本方法は、生物学的試料を、本明細書に記載されるバイオマーカー（例えば、本明細書に記載される任意のバイオマーカーに特異的に結合する抗体、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、抗ＩＬ８抗体）に特異的に結合する抗体と、そのバイオマーカーの結合を許容する条件下で接触させること、及び、複合体が抗体とバイオマーカーとの間で形成されるかどうかを検出することを含む。このような方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ法又はｉｎ ｖｉｖｏ法であってもよい。いくつかの事例では、抗体を使用して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストでの治療に適格な対象、例えば個体の選択のためのバイオマーカーを選択する。タンパク質発現レベルを測定する、当技術分野で公知であるか、又は本明細書で提供される任意の方法を使用してもよい。例えば、いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）のタンパク質発現レベルは、フローサイトメトリー（例えば、蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ（商標）））、ウェスタンブロット、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、免疫沈降、免疫組織化学（ＩＨＣ）、免疫蛍光、ラジオイムノアッセイ、ドットブロッティング、免疫検出法、ＨＰＬＣ、表面プラズモン共鳴、光学分光法、質量分析及びＨＰＬＣからなる群から選択される方法を使用して決定される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）のタンパク質発現レベルは、腫瘍浸潤免疫細胞において決定される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）のタンパク質発現レベルは、腫瘍細胞において決定される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）のタンパク質発現レベルは、腫瘍浸潤免疫細胞及び／又は腫瘍細胞において決定される。いくつかの事例では、タンパク質発現レベルは、免疫組織化学法（ＩＨＣ）、ウェスタンブロット法、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、免疫沈降法、免疫蛍光法、ラジオイムノアッセイ、又は質量分析法によって決定される。
特定の事例では、試料中のバイオマーカータンパク質（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在及び／又は発現レベル／量は、ＩＨＣ及び染色プロトコルを使用して検査される。組織切片のＩＨＣ染色は、試料中のタンパク質の存在を決定又は検出する信頼できる方法であることが示されてきた。方法、アッセイ及び／又はキットのいずれかのいくつかの事例では、バイオマーカーはＩＬ８である。１つの実例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現レベルは、（ａ）抗体によって試料（患者から得られる腫瘍試料等）のＩＨＣ分析を実行することと、（ｂ）試料中のバイオマーカーの発現レベルを決定することと、を含む方法を使用して決定される。いくつかの事例では、ＩＨＣ染色強度は、参照と比較して決定される。いくつかの事例では、参照は、参照値である。いくつかの事例では、基準は基準試料（例えば、対照細胞株染色試料、非がん性患者由来の組織試料、又はバイオマーカーネガティブ（例えば、ＩＬ８陰性）腫瘍試料）である。
ＩＨＣは、形態学的染色及び／又はｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（例えば、ＩＳＨ）等の追加の技術と組み合わせて行われてもよい。２つの一般的なＩＨＣ方法、直接アッセイ及び間接アッセイが利用可能である。第１のアッセイに従って、抗体の標的抗原への結合は、直接決定される。この直接アッセイは、更なる抗体相互作用なしで可視化され得る、蛍光タグ又は酵素標識された一次抗体等の標識試薬を使用する。典型的な間接アッセイでは、コンジュゲートしていない一次抗体が抗原に結合し、次いで、標識された二次抗体が該一次抗体に結合する。二次抗体が酵素的標識にコンジュゲートする場合、発色基質又は蛍光発生基質が添加されて、抗原の可視化をもたらす。いくつかの二次抗体が、一次抗体上の異なるエピトープと反応し得るため、シグナル増幅が生じる。
ＩＨＣに使用される一次抗体及び／又は二次抗体は、典型的には、検出可能な部分で標識される。多数の標識が利用可能であり、これらは、一般に、以下のカテゴリにグループ化され得る：（ａ）３５Ｓ、１４Ｃ、１２５Ｉ、３Ｈ、１３１Ｉ等の放射性同位体、（ｂ）コロイド金粒子、（ｃ）希土類キレート（ユーロピウムキレート）、テキサスレッド、ローダミン、フルオレセイン、ダンシル、リサミン、ウンベリフェロン、フィコエリスリン、フィコシアニン、又はＳＰＥＣＴＲＵＭ ＯＲＡＮＧＥ７及びＳＰＥＣＴＲＵＭ ＧＲＥＥＮ７等の市販のフルオロフォアを含むがこれらに限定されない、蛍光標識及び／又は上記のいずれか１つ以上の誘導体、（ｄ）さまざまな酵素－基質標識が利用可能であり、米国特許第４，２７５，１４９号は、これらのいくつかのレビューを提供する。酵素的標識の例としては、ルシフェラーゼ（例えば、ホタルルシフェラーゼ及び細菌性ルシフェラーゼ、例えば、米国特許第４，７３７，４５６号を参照）、ルシフェリン、２，３－ジヒドロフタラジンジオン、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、ウレアーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰＯ）等のペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β－ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖オキシダーゼ（例えば、グルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、及びグルコース－６－リン酸デヒドロゲナーゼ）、複素環オキシダーゼ（ウリカーゼ、キサンチンオキシダーゼ等）、ラクトペルオキシダーゼ、マイクロペルオキシダーゼ等が挙げられる。
酵素－基質の組み合わせの例としては、例えば、基質として過酸化水素を用いる西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰＯ）、発色基質としてパラ－ニトロフェニルリン酸を用いるアルカリホスファターゼ（ＡＰ）、及び発色基質（例えば、ｐ－ニトロフェニル－β－Ｄ－ガラクトシダーゼ）又は蛍光発生基質（例えば、４－メチルウンベリフェリル－β－Ｄ－ガラクトシダーゼ）を用いるβ－Ｄ－ガラクトシダーゼ（β－Ｄ－Ｇａｌ）が挙げられる。これらの一般的な総説については、例えば、米国特許第４，２７５，１４９号及び同第４，３１８，９８０号を参照されたい。
検体は、例えば、手動で調製してもよいし、又は自動染色機器（例えば、Ｖｅｎｔａｎａ ＢｅｎｃｈＭａｒｋ ＸＴ又はＢｅｎｃｈｍａｒｋ ＵＬＴＲＡ ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔ）を使用して、調製してもよい。このようにして調製された検体は、マウントかつカバースリップされ得る。次いで、例えば、顕微鏡を使用して、スライド評価が決定され、当技術分野で日常的に使用される染色強度基準が用いられ得る。１つの事例では、腫瘍からの細胞及び／又は組織を、ＩＨＣを使用して試験するとき、染色は概して、（試料中に存在し得る間質又は周辺組織と対照的に）腫瘍細胞（複数可）及び／又は組織において決定又は評定されることを理解されたい。いくつかの事例では、腫瘍からの細胞及び／又は組織を、ＩＨＣを使用して試験するとき、染色は、腫瘍内免疫細胞又は腫瘍周囲免疫細胞を含む腫瘍浸潤免疫細胞において決定又は評定することを含むことが理解される。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在は、ＩＨＣによって、試料の０％超、試料の少なくとも１％、試料の少なくとも５％、試料の少なくとも１０％、試料の少なくとも１５％、試料の少なくとも１５％、試料の少なくとも２０％、試料の少なくとも２５％、試料の少なくとも３０％、試料の少なくとも３５％、試料の少なくとも４０％、試料の少なくとも４５％、試料の少なくとも５０％、試料の少なくとも５５％、試料の少なくとも６０％、試料の少なくとも６５％、試料の少なくとも７０％、試料の少なくとも７５％、試料の少なくとも８０％、試料の少なくとも８５％、試料の少なくとも９０％、試料の少なくとも９５％、又はそれを超えて検出される。試料は、例えば病理学者又は自動化画像分析によって、本明細書に記載された基準（例えば、表２参照）のいずれかを用いてスコアリングされ得る。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）が、診断抗体（すなわち、一次抗体）を使用する免疫組織化学によって検出される。いくつかの事例では、診断抗体はヒトバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）に特異的に結合する。いくつかの事例では、診断用抗体は、非ヒト抗体である。いくつかの事例では、診断用抗体は、ラット、マウス、又はウサギ抗体である。いくつかの事例では、診断用抗体は、ウサギ抗体である。いくつかの事例では、診断用抗体は、モノクローナル抗体である。いくつかの事例では、診断用抗体は、直接標識される。他の事例では、診断用抗体は、間接的に標識される。
例えば、本明細書中に記載される方法のいずれかのいくつかの事例では、ＩＬ８は、抗ＩＬ８診断抗体（すなわち、一次抗体）を使用する免疫組織化学によって検出される。いくつかの事例では、ＩＬ８診断抗体はヒトＩＬ８に特異的に結合する。いくつかの事例では、ＩＬ８診断抗体は非ヒト抗体である。いくつかの事例では、ＩＬ８診断抗体は、ラット、マウス又はウサギ抗体である。いくつかの事例では、ＩＬ８診断抗体はウサギ抗体である。いくつかの事例では、ＩＬ８診断抗体はモノクローナル抗体である。いくつかの事例では、ＩＬ８診断抗体を直接標識する。他の事例では、ＩＬ８診断抗体は間接的に標識される。
前述の方法のいずれかのいくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現レベルは、ＩＨＣを使用して腫瘍浸潤免疫細胞、腫瘍細胞、ＰＢＭＣ、又はそれらの組み合わせで検出される。腫瘍浸潤性免疫細胞としては、腫瘍内免疫細胞、腫瘍周囲免疫細胞又はそれらの任意の組み合わせ、及び他の腫瘍間質細胞（例えば、線維芽細胞）が挙げられるが、これらに限定されない。かかる腫瘍浸潤免疫細胞は、Ｔリンパ球（ＣＤ８＋Ｔリンパ球及び／又はＣＤ４＋Ｔリンパ球等）、Ｂリンパ球、又は顆粒球（好中球、好酸球、好塩基球）、単球、マクロファージ、樹状細胞（例えば、互いに組み合う樹状細胞）、組織球、及びナチュラルキラー細胞を含む他の骨髄系細胞であり得る。いくつかの事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の染色は、試料中の染色、例えば膜染色、細胞質染色、及びそれらの組み合わせの存在によって検出される。他の事例では、バイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の非存在は、試料中の染色の非存在又は非存在として検出される。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの例では、個体は、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）シグネチャの基準レベル以上である腫瘍試料中のＴｅｆｆシグネチャの発現レベルを有し得る。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される１つ以上の遺伝子を含む。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される２つ以上の遺伝子を含む。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される３つ以上の遺伝子を含む。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１を含む。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの例において、個体は、そのがんについて以前に治療されていない。
本明細書に記載される方法のいずれかの他の例において、個体は、以前にがんについて治療されている。
個体は、任意の適切なタイプのがんを有し得る。例示的な非限定的ながんとしては、膀胱がん、腎臓がん、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、リンパ腫、前立腺がん、肝臓がん、頭頸部がん、黒色腫、卵巣がん、中皮腫又は骨髄腫が挙げられる。いくつかの態様では、膀胱がんは、尿路上皮癌腫（ＵＣ）である。いくつかの態様では、がんは局所進行性又は転移性のＵＣである。いくつかの態様では、個体は、事前の白金ベースの化学療法を受けている。いくつかの態様では、個体は、前の白金ベースの化学療法後に進行している。いくつかの態様では、個体は、局所進行性又は転移性ＵＣについて以前に治療されたことがない。いくつかの態様では、個体は、白金ベースの化学療法に対して不適格である。いくつかの態様では、個体はヒトである。いくつかの態様において、腎臓がんは、腎細胞癌腫（ＲＣＣ）である。いくつかの態様において、ＲＣＣは転移性ＲＣＣ（ｍＲＣＣ）である。いくつかの態様では、個体は、がんに対する治療を以前に受けていない。いくつかの態様では、肺がんは、非小細胞肺がん又は小細胞肺がんである。幾つかの態様では、乳がんはトリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）又はＨＥＲ２陽性乳がんである。
５．バイオマーカーの存在及び／又は発現レベルの決定に基づく患者の選択及び治療
本明細書に記載される方法のいずれも、個体に抗がん療法を投与することを更に含み得る。例えば、いくつかの事例では、抗がん療法は、個体由来の試料中の本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の発現レベルの決定に基づいて選択される。例えば、いくつかの事例では、抗がん療法は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルの決定に基づいて選択される。
例えば、いくつかの事例では、本方法は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法を個体に投与することを更に含む。
他の事例では、本方法は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えて、抗がん療法を個体に投与することを更に含む。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法は、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、抗ＶＥＧＦ抗体）、ＩＬ８アンタゴニスト（例えば、抗ＩＬ－８抗体又は小分子ＩＬ８阻害剤）、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト（例えば、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤）、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト（例えば、抗ＩＬ１Ｒ抗体又は小分子ＩＬ１Ｒ阻害剤）又はそれらの組み合わせを含む。任意の適切なＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ８アンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト又はＩＬ１Ｒアンタゴニストを使用することができる（例えば、下記のセクションＩＶを参照）。いくつかの事例では、抗がん療法は、ＶＥＧＦアンタゴニスト及びＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む。いくつかの事例では、ＶＥＧＦアンタゴニストは、抗ＶＥＧＦ抗体又はＶＥＧＦ受容体（ＶＥＧＦＲ）阻害剤である。いくつかの態様では、ＶＥＧＦアンタゴニストは抗ＶＥＧＦ抗体である。いくつかの態様では、抗ＶＥＧＦ抗体は、ベバシズマブである。
任意の適切なＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを使用することができる（例えば、下記のセクションＩＶを参照）。例えば、いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト、ＰＤ－１結合アンタゴニスト、及びＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストからなる群から選択される。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストはＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストである。任意の適切なＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを使用することができる（例えば、下記のセクションＩＶを参照）。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、そのリガンド結合パートナーのうちの１つ以上への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＢ７－１への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、ＰＤ－１及びＢ７－１の両方への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、アテゾリズマブ、ＭＤＸ－１１０５、デュルバルマブ、およびアベルマブからなる群から選択される。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの態様において、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、下記の超可変領域（ＨＶＲ）のうちの１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つ全てを含む：ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨのＨＶＲ－Ｈ１配列（配列番号１９）；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧのＨＶＲ－Ｈ２配列（配列番号２０）；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹのＨＶＲ－Ｈ３配列（配列番号２１）；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡのＨＶＲ－Ｌ１配列（配列番号２２）；（ｅ）ＨＶＲ－Ｌ２配列ＳＡＳＦＬＹＳのＨＶＲ－Ｌ２配列（配列番号２３）；及び（ｆ）ＨＶＲ－Ｌ３配列ＱＱＹＬＹＨＰＡＴのＨＶＲ－Ｌ３配列（配列番号２４）、又は（ａ）ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨのＨＶＲ－Ｈ１配列（配列番号１９）；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧのＨＶＲ－Ｈ２配列（配列番号２０）；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹのＨＶＲ－Ｈ３配列（配列番号２１）；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡのＨＶＲ－Ｌ１配列（配列番号２２）；（ｅ）ＳＡＳＦＬＹＳのＨＶＲ－Ｌ２配列（配列番号２３）；及び（ｆ）ＱＱＹＬＹＨＰＡＴのＨＶＲ－Ｌ３配列（配列番号２４）と少なくとも９０％（例えば、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％）の配列同一性を有する１、２、３、４、５若しくは６個のＨＶＲ。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの特定の態様において、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下の超可変領域（ＨＶＲ）を含む：（ａ）ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨ（配列番号１９）のＨＶＲ－Ｈ１配列；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号２０）のＨＶＲ－Ｈ２配列；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号２１）のＨＶＲ－Ｈ３配列；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡ（配列番号２２）のＨＶＲ－Ｌ１配列；（ｅ）ＳＡＳＦＬＹＳ（配列番号２３）のＨＶＲ－Ｌ２配列；及び（ｆ）ＱＱＹＬＹＨＰＡＴ（配列番号２４）のＨＶＲ－Ｌ３配列。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、下記を含む：（ａ）ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％（例えば、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％）の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン；（ｂ）ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％（例えば、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％）の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；及び（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体はアテゾリズマブである。
本明細書に記載される方法のいずれも、更なる治療剤を個体に投与することを更に含み得る。いくつかの態様では、追加の治療剤は、免疫治療剤、細胞傷害性薬剤、成長阻害剤、放射線治療剤、抗血管新生剤、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本明細書に記載の方法の任意いくつかの態様では、上記個体はヒトである。
Ｂ．治療方法及び使用のための組成物
本開示は、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療することを提供する。いくつかの事例では、本開示の方法は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法を患者に投与することを含む。本明細書に記載される（例えば、以下のＩＶ項を参照）か、当該技術分野で既知であるＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストのいずれも、該方法に使用され得る。いくつかの事例では、本方法は、個体から得られた試料中の本明細書に記載のバイオマーカー（例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）の存在及び／又は発現レベルを決定すること、並びに例えば、本明細書に記載の方法（例えば、上記の第ＩＩＩ節第Ａ節又は下記の実施例に記載されているもの）又は当技術分野で公知の方法のいずれかを使用して、試料中のバイオマーカーの存在及び／又は発現レベルに基づいて患者に抗がん療法を投与することを含む。例えば、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法が本明細書で提供される。また、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法が本明細書で提供される。本明細書にも記載されるように、本発明はまた、例えば腫瘍試料及び／又はＰＢＭＣにおいて、ＩＬ８高がんに関連してアップレギュレート又はダウンレギュレートされる遺伝子を提供する。例えば、図１を参照されたい。ＩＬ８高がんに関連してアップレギュレート又はダウンレギュレートされる１つ以上遺伝子、例えば表２～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを、例えば、１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定されたがんを有する個体を治療する方法において、及び１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定されたがんを有する個体を治療する方法において、ＩＬ８発現の代理として使用することができる。ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対する、がんを有する個体の応答をモニタリングする方法も本明細書で提供される。使用のための関連組成物も提供される。
１．ＩＬ８
本開示のいくつかの態様では、低下した又は低いＩＬ８レベルを有する個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法で治療することができる。例えば、低下した又は低いベースライン又は治療中のＩＬ８発現レベル（例えば、ＩＬ８の基準レベルに対して）を有する個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法で治療することができる。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定する、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を、個体に投与すること、を含む。
別の態様では、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつかの態様では、応答は、ＯＲＲ、ＣＲ率、ＰＲ率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又はＤＯＲによって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）が本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料中又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）において血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料において測定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法薬を投与すること、を含む。
別の態様では、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、個体は、血漿試料又はＩＬ８の基準レベル未満である個体由来のＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル未満である場合、該個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること；及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルは、ＩＬ８の基準レベル未満であると決定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルは、ＩＬ８の基準レベル未満であると決定されており、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られる。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られている。
別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善された応答を有する可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から、改善されたＯＲＲ、改善されたＣＲ率、改善されたＰＲ率、延長されたＰＦＳ、及び／又は延長されたＯＳを有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善されたＯＲＲを有する可能性があり得る。他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＰＦＳを有する可能性があり得る。更に他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＯＳを有する可能性があり得る。
本開示の他の態様では、上昇した又は高いＩＬ８レベルを有する個体を、抗がん療法、例えばＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法で治療することができる。例えば、上昇した又は高いベースライン又は治療中のＩＬ８発現レベル（例えば、ＩＬ８の基準レベルに対して）を有する個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の治療剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、ベバシズマブ等の抗ＶＥＧＦ抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）との併用療法で治療され得る。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されている。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、該反応はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料中又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、血漿試料中又は工程（ａ）で決定されたＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を投与すること、を含む。
別の態様では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を投与すること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を投与すること、を含む。
別の態様では、がんを有する個体を治療するのに使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルは、ＩＬ８の基準レベル以上であると決定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を投与すること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法で使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルは、ＩＬ８の基準レベル以上であると決定されており、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を投与すること、を含む。
別の態様では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又はそれと同時に得られている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、、個体は、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又はそれと同時に個体から得られる。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を投与すること、を含む。
別の例では、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点又はそれと同時に得られている。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた、抗がん療法であって、個体は、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からの応答が低下している可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療から、ＯＲＲの低下、ＣＲ率の低下、ＰＲ率の低下、ＰＦＳの短縮又はＯＳの短縮を有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＲＲが低下している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＰＦＳが短縮している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からＯＳが短縮している可能性があり得る。
２．ＩＬ８高がんにおいてアップレギュレーションされる遺伝子
本開示のいくつかの態様では、ＩＬ８高がんにおいてアップレギュレートされる１つ以上の遺伝子のレベルが低下している又は低い個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法で治療することができる。例えば、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子（例えば、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）の低下した又は低いベースライン又は治療中の発現レベルを有する個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法で治療することができる。
一態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルが表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつかの態様では、応答は、ＯＲＲ、ＣＲ率、ＰＲ率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又はＤＯＲによって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定する、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性があると同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）が本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法薬を、血漿試料中又は工程（ａ）において、ＰＢＭＣを含む試料中で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて投与すること、を含む。
別の態様では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、個体は、個体由来からの血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルが表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の基準レベル未満であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の発現レベルが基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること；及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であると決定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の発現レベルが基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、該方法は、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であると決定されており、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及びｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ又は複数の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定されたがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られる方法が、本明細書で提供される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られる。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定されたがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られる方法が本明細書で提供される。
別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、個体は、表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供される。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善された応答を有する可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から、改善されたＯＲＲ、改善されたＣＲ率、改善されたＰＲ率、延長されたＰＦＳ、及び／又は延長されたＯＳを有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善されたＯＲＲを有する可能性があり得る。他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＰＦＳを有する可能性があり得る。更に他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＯＳを有する可能性があり得る。
本開示の他の態様では、ＩＬ８高がんにおいてアップレギュレートされる１つ以上の遺伝子、例えば表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子のレベルが上昇している又は高い個体を、抗がん療法、例えばＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法で治療することができる。例えば、表２～４のいずれか１つに記載の１つ位以上の遺伝子（例えば、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）の上昇した又は高いベースライン又は治療中の発現レベルを有する個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の治療剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、ベバシズマブ等の抗ＶＥＧＦ抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）との併用療法）で治療することができる。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法薬を、工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて投与すること、を含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されている。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法薬を、血漿試料中又は工程（ａ）で決定されたＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて投与すること、を含む。
別の態様では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がんを有する個体を治療するのに使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であると決定されている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法で使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であると決定されており、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又はそれと同時に得られている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた、抗がん療法であって、個体は、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られる。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の例では、表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又はそれと同時に得られている。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた、抗がん療法であって、個体は、表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からの応答が低下している可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療から、ＯＲＲの低下、ＣＲ率の低下、ＰＲ率の低下、ＰＦＳの短縮又はＯＳの短縮を有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からのＯＰＲが低下している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からのＰＦＳが短縮している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からのＯＳが短縮している可能性があり得る。
３．ＩＬ８高発現がんにおいてダウンレギュレートされた遺伝子
本開示のいくつかの態様では、ＩＬ８高がんにおいてダウンレギュレートされる１つ以上の遺伝子のレベルが増加している又は高い個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法で治療することができる。例えば、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子（例えば、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）の増加した又は高いベースライン又は治療中の発現レベルを有する個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法で治療することができる。
一態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルが表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつかの態様では、応答は、ＯＲＲ、ＣＲ率、ＰＲ率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又はＤＯＲによって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定する、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む抗がん療法による治療に応答する可能性があると同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）が本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法薬を、血漿試料中又は工程（ａ）において、ＰＢＭＣを含む試料中で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて投与すること、を含む。
別の態様では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、個体は、個体由来からの血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の発現レベルが表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の基準レベル以上であることに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の発現レベルが基準レベル以上である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、該方法は、（ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であると決定されている。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が血漿試料、腫瘍組織試料又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上遺伝子の発現レベルが基準レベル以上である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、該方法は、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であると決定されており、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ又は複数の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）、又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定されたがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られる方法が、本明細書で提供される。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られる。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、有効量のＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ又は複数の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定されたがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られる方法が本明細書で提供される。
別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、個体は、表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の基準レベル以上である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが本明細書で提供される。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善された応答を有する可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から、改善されたＯＲＲ、改善されたＣＲ率、改善されたＰＲ率、延長されたＰＦＳ、及び／又は延長されたＯＳを有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から改善されたＯＲＲを有する可能性があり得る。他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＰＦＳを有する可能性があり得る。更に他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）を含む抗がん療法による治療から延長されたＯＳを有する可能性があり得る。
本開示の他の態様では、ＩＬ８高がんにおいてダウンレギュレートされる１つ以上の遺伝子、例えば表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子のレベルが低下している又は低い個体を、抗がん療法、例えばＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法で治療することができる。例えば、表５～７のいずれか１つに記載の１つ位以上の遺伝子（例えば、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルに対して）の減少した又は低いベースライン又は治療中の発現レベルを有する個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の治療剤（例えば、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、ベバシズマブ等の抗ＶＥＧＦ抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法）との併用療法）で治療することができる。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法薬を、工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて投与すること、を含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されている。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中の表２～４のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）血漿試料又は個体由来のＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法薬を、血漿試料中又は工程（ａ）で決定されたＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて投与すること、を含む。
別の態様では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、個体は、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法での治療に応答する可能性が低いと同定されている。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法が本明細書で提供され、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がんを有する個体を治療するのに使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であると決定されている。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の応答をモニタリングする方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、遺伝子の発現レベルを決定すること、（ｂ）試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法で使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む有効量の抗がん療法を個体に投与すること、（ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料における表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｃ）個体の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ又は複数の遺伝子の発現レベルが表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること、を含む。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するのに使用するための、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点で個体から得られた試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルは、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であると決定されており、試料は、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である。
抗がん療法の投与後の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与の数時間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年後（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後、約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。いくつかの事例では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約４～約８週間である。例えば、いくつかの態様では、抗がん療法の投与後の時点は、抗がん療法の投与後約６週間である。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の態様では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又はそれと同時に得られている。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた、抗がん療法であって、個体は、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られる。
応答は、任意の適切な応答であり得る。例えば、いくつか態様では、応答は、ＯＲＲ、完全奏効（ＣＲ）率、部分奏効（ＰＲ）率、ＰＦＳ、ＯＳ及び／又は奏効期間（ＤＯＲ）によって示される。いくつかの事例では、応答はＯＲＲ又はＯＳによって示される。いくつかの特定の事例では、応答はＯＲＲによって示される。他の特定の事例では、応答はＰＦＳによって示される。更に他の特定の事例では、応答はＯＳによって示される。
例えば、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法であって、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定することであって、試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルが、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定すること、及び（ｂ）工程（ａ）で決定された表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む。
別の例では、表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づくＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療する方法が本明細書で提供され、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答は、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又はそれと同時に得られている。
更に別の例では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた、抗がん療法であって、個体は、表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の基準レベル未満である個体由来の試料中の表５～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答はＯＳ又はＯＲＲによって示される。
抗がん療法の投与前の任意の適切な時点を使用することができる。例えば、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与の数時間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、又は約２４時間）、数日前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、又は約３１日間）、数週間前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、約１２、約１３、約１４、約１５、約１６、約１７、約１８、約１９、約２０、約２１、約２２、約２３、約２４、約２５、約２６、約２７、約２８、約２９、約３０、約３１、約３２、約３３、約３４、約３５、約３６、約３７、約３８、約３９、約４０、約４１、約４２、約４３、約４４、約４５、約４６、約４７、約４８、約４９、約５０、約５１、又は約５２週間）、数カ月前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０、約１１、又は約１２ヵ月）、又は数年前（例えば、約１、約２、約３、約４、約５、約６、約７、約８、約９、約１０年）であり得る。いくつかの事例では、抗がん療法の投与前の時点は、抗がん療法の投与前の約１～約１６週間、約２～約１６週間、約３～約１６週間、約４～約１６週間、約５～約１６週間、約６～約１６週間、約７～約１６週間、約８～約１６週間、約９～約１６週間、約１０～約１６週間、約１１～約１６週間、約１２～約１６週間、約１３～約１６週間、約１４～約１６週間、約１５～約１６週間、約１～約１５週間、約２～約１５週間、約３～約１５週間、約４～約１５週間、約５～約１５週間、約６～約１５週間、約７～約１５週間、約８～約１５週間、約９～約１５週間、約１０～約１５週間、約１１～約１５週間、約１２～約１５週間、約１３～約１５週間、約１４～約１５週間、約１～約１４週間、約２～約１４週間、約３～約１４週間、約４～約１４週間、約５～約１４週間、約６～約１４週間、約７～約１４週間、約８～約１４週間、約９～約１４週間、約１０～約１４週間、約１１～約１４週間、約１２～約１４週間、約１３～約１４週間、約１～約１３週間、約２～約１３週間、約３～約１３週間、約４～約１３週間、約５～約１３週間、約６～約１３週間、約７～約１３週間、約８～約１３週間、約９～約１３週間、約１０～約１３週間、約１１～約１３週間、約１２～約１３週間、約１～約１２週間、約２～約１２週間、約３～約１２週間、約４～約１２週間、約５～約１２週間、約６～約１２週間、約７～約１２週間、約８～約１２週間、約９～約１２週間、約１０～約１２週間、約１１～約１２週間、約１～約１１週間、約２～約１１週間、約３～約１１週間、約４～約１１週間、約５～約１１週間、約６～約１１週間、約７～約１１週間、約８～約１１週間、約９～約１１週間、約１０～約１１週間、約１～約１０週間、約２～約１０週間、約３～約１０週間、約４～約１０週間、約５～約１０週間、約６～約１０週間、約７～約１０週間、約８～約１０週間、約９～約１０週間、約１～約９週間、約２～約９週間、約３～約９週間、約４～約９週間、約５～約９週間、約６～約９週間、約７～約９週間、約８～約９週間、約１～約８週間、約２～約８週間、約３～約８週間、約４～約８週間、約５～約８週間、約６～約８週間、約７～約８週間、約１～約７週間、約２～約７週間、約３～約７週間、約４～約７週間、約５～約７週間、約６～約７週間、約１～約６週間、約２～約６週間、約３～約６週間、約４～約６週間、約５～約６週間、約１～約５週間、約２～約５週間、約３～約５週間、約４～約５週間、約１～約４週間、約２～約４週間、約３～約４週間、約１～約３週間、約２～約３週間、又は約１～約２週間である。
前述の方法のいずれにおいても、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療からの応答が低下している可能性があり得る。例えば、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）単剤療法を含む抗がん療法による治療から、ＯＲＲの低下、ＣＲ率の低下、ＰＲ率の低下、ＰＦＳの短縮又はＯＳの短縮を有する可能性があり得る。いくつかの特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からのＯＰＲが低下している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からのＰＦＳが短縮している可能性があり得る。いくつかの他の特定の事例では、個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト）に加えた抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からのＯＳが短縮している可能性があり得る。
４．試料及び基準レベル
任意の適切な試料が、本明細書に記載される方法のいずれかにおいて使用され得る。例示的な非限定的な試料としては、血漿試料、組織試料、細胞試料、全血試料、血清試料、又はそれらの組み合わせが挙げられる。いくつかの事例では、試料は、血漿試料である。いくつかの事例では、腫瘍試料は腫瘍組織試料である。いくつかの事例では、腫瘍組織試料は、腫瘍細胞、腫瘍浸潤免疫細胞、間質細胞、又はこれらの組み合わせを含む。いくつかの事例では、腫瘍浸潤免疫細胞は、腫瘍浸潤骨髄細胞を含む。いくつかの事例では、腫瘍組織試料は、ホルマリン固定パラフィン包埋（ＦＦＰＥ）試料、アーカイブ試料、新鮮な試料、又は凍結試料である。いくつかの事例では、細胞試料は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む。
任意の適切な基準レベルが、本明細書中に記載される方法のいずれかにおいて使用され得る。例えば、いくつかの事例では、本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の基準レベルは、がんを有する個体の集団から決定される。例えば、いくつかの事例では、本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の基準レベルは、がんを有する患者の集団で決定された発現レベルの中央値、発現レベルの三分位値、又は最大選択されたログランク基準レベルである。いくつかの実施形態では、最大選択されたログランク基準レベルは、１２ｐｇ／ｍＬのＩＬ８である。いくつかの事例では、本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の基準レベルは、がんを有する患者の集団で決定された発現レベルの中央値である。特定の一例では、基準レベルは、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られた試料中の本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８のレベルであり得る。別の特定の例では、基準レベルは、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法の投与後の時点で個体から得られた試料中の本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８のレベルであり得る。
特定の事例では、第１の試料中のバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在及び／又は発現レベル／量は、第２の試料中の存在／非存在及び／又は発現レベル／量と比較して増加又は上昇する。特定の事例では、第１の試料中のバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在／非存在及び／又は発現レベル／量は、第２の試料中の存在及び／又は発現レベル／量と比較して減少又は低下する。ある特定の事例では、第２の試料は、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織である。遺伝子の存在／不在及び／又は発現レベル／量を決定するための更なる開示が本明細書に記載されている。
ある特定の事例では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、試験試料が得られたときとは異なる１つ以上の時点で得られる同じ対象又は個体由来の単一の試料又は複数の試料の組み合わせである。例えば、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、試験試料が得られるよりも早い時点で同じ対象又は個体から得られる。このような基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、基準試料ががんの最初の診断中に得られる場合、かつがんが転移性がんになったときに試験試料が後で得られる場合に有用であり得る。
特定の事例では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、患者ではない１つ以上の健常な個体由来の複数の試料の組み合わせである。特定の事例では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、対象又は個体ではない、疾患又は障害（例えば、がん）を有する１つ以上の個体由来の複数の試料の組み合わせである。特定の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、正常組織由来のプールされたＲＮＡ試料、又は患者ではない１つ以上の個体由来のプールされた血漿若しくは血清試料である。特定の実施形態では、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織は、腫瘍組織由来のプールされたＲＮＡ試料、又は患者ではない、疾患若しくは障害（例えば、がん）を有する１つ以上の個体由来のプールされた血漿若しくは血清試料である。
任意の方法のいくつかの例において、発現の上昇又はオズかとは、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞又は対照組織と比較して、本明細書に記載されるもの等の標準的な技術の公知の方法によって検出されるバイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）（例えば、タンパク質又は核酸（例えば、遺伝子又はｍＲＮＡ））のレベルの約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上のいずれかの全体的な増加を指す。特定の実施形態では、上昇した発現とは、試料におけるバイオマーカーの発現レベル／量の増加を指し、増加は、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織におけるそれぞれのバイオマーカーの発現レベル／量の少なくとも約１．５倍、１．７５倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍、１０倍、２５倍、５０倍、７５倍、又は１００倍のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、上昇した発現とは、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、対照組織、又は内部対照（例えば、ハウスキーピング遺伝子）と比較して、約１．５倍超、約１．７５倍、約２倍、約２．２５倍、約２．５倍、約２．７５倍、約３．０倍、又は約３．２５倍の全体的な増加を指す。
任意の方法のいくつかの例において、発現低下とは、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞又は対照組織と比較して、本明細書に記載されるもの等の標準的な技術の公知の方法によって検出されるバイオマーカー（例えば、本明細書中に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）（例えば、タンパク質又は核酸（例えば、遺伝子又はｍＲＮＡ））のレベルの約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又はそれ以上のいずれかの全体的な低下を指す。特定の実施形態では、低減した発現とは、試料におけるバイオマーカーの発現レベル／量の減少を指し、減少は、基準試料、基準細胞、基準組織、対照試料、対照細胞、又は対照組織におけるそれぞれのバイオマーカーの発現レベル／量の少なくとも約０．９倍、０．８倍、０．７倍、０．６倍、０．５倍、０．４倍、０．３倍、０．２倍、０．１倍、０．０５倍、又は０．０１倍のうちのいずれかである。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの例では、個体は、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）シグネチャの基準レベル以上である腫瘍試料中のＴｅｆｆシグネチャの発現レベルを有し得る。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される１つ以上の遺伝子を含む。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される２つ以上の遺伝子を含む。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される３つ以上の遺伝子を含む。いくつかの事例では、Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１を含む。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの例において、個体は、そのがんについて以前に治療されたことがない。
本明細書に記載される方法のいずれかの他の例において、個体は、以前にがんについて治療されたことがある。
個体は、任意の適切なタイプのがんを有し得る。例示的な非限定的ながんとしては、膀胱がん、腎臓がん、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、リンパ腫、前立腺がん、肝臓がん、頭頸部がん、黒色腫、卵巣がん、中皮腫又は骨髄腫が挙げられる。いくつかの態様では、膀胱がんは、尿路上皮癌腫（ＵＣ）である。いくつかの態様では、がんは局所進行性又は転移性のＵＣである。いくつかの態様では、個体は、事前の白金ベースの化学療法を受けている。いくつかの態様では、個体は、事前の白金ベースの化学療法後に進行している。いくつかの態様では、個体は、局所進行性又は転移性ＵＣについて以前に治療されたことがない。いくつかの態様では、個体は、白金ベースの化学療法に対して不適格である。いくつかの態様では、個体はヒトである。いくつかの態様において、腎臓がんは、腎細胞癌腫（ＲＣＣ）である。いくつかの態様において、ＲＣＣは転移性ＲＣＣ（ｍＲＣＣ）である。いくつかの態様では、個体は、がんに対する治療を以前に受けていない。いくつかの態様では、肺がんは、非小細胞肺がん又は小細胞肺がんである。幾つかの態様では、乳がんはトリプルネガティブ乳がんＴＮＢＣ又はＨＥＲ２陽性乳がんである。
５．例示的な治療剤、投与経路、併用療法及び投薬レジメン
本明細書に記載される方法のいずれも、個体に抗がん療法を投与することをさらに含み得る。例えば、いくつかの事例では、抗がん療法は、個体由来の試料中の本明細書に記載のバイオマーカー、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８の発現レベルの決定に基づいて選択される。
例えば、いくつかの事例では、本方法は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法を個体に投与することを更に含む。
他の事例では、本方法は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えて、抗がん療法を個体に投与することを更に含む。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法は、ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、抗ＶＥＧＦ抗体）、ＩＬ８アンタゴニスト（例えば、抗ＩＬ－８抗体又は小分子ＩＬ８阻害剤）、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト（例えば、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤）、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト（例えば、抗ＩＬ１Ｒ抗体又は小分子ＩＬ１Ｒ阻害剤）又はそれらの組み合わせを含む。任意の適切なＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ８アンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト又はＩＬ１Ｒアンタゴニストを使用することができる（例えば、下記のセクションＩＶを参照）。いくつかの事例では、抗がん療法は、ＶＥＧＦアンタゴニスト及びＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む。いくつかの事例では、ＶＥＧＦアンタゴニストは、抗ＶＥＧＦ抗体又はＶＥＧＦ受容体（ＶＥＧＦＲ）阻害剤である。いくつかの態様では、ＶＥＧＦアンタゴニストは抗ＶＥＧＦ抗体である。いくつかの態様では、抗ＶＥＧＦ抗体は、ベバシズマブである。
任意の適切なＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを使用することができる（例えば、下記のセクションＩＶを参照）。例えば、いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト、ＰＤ－１結合アンタゴニスト、及びＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストからなる群から選択される。
いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストはＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストである。任意の適切なＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを使用することができる（例えば、下記のセクションＩＶを参照）。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、そのリガンド結合パートナーのうちの１つ以上への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１のＢ７－１への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、ＰＤ－１及びＢ７－１の両方への結合を阻害する。いくつかの態様では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、アテゾリズマブ、ＭＤＸ－１１０５、デュルバルマブ、およびアベルマブからなる群から選択される。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの態様において、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、下記の超可変領域（ＨＶＲ）のうちの１つ、２つ、３つ、４つ、５つ又は６つ全てを含む：ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨのＨＶＲ－Ｈ１配列（配列番号１９）；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧのＨＶＲ－Ｈ２配列（配列番号２０）；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹのＨＶＲ－Ｈ３配列（配列番号２１）；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡのＨＶＲ－Ｌ１配列（配列番号２２）；（ｅ）ＨＶＲ－Ｌ２配列ＳＡＳＦＬＹＳのＨＶＲ－Ｌ２配列（配列番号２３）；及び（ｆ）ＨＶＲ－Ｌ３配列ＱＱＹＬＹＨＰＡＴのＨＶＲ－Ｌ３配列（配列番号２４）、又は（ａ）ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨのＨＶＲ－Ｈ１配列（配列番号１９）；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧのＨＶＲ－Ｈ２配列（配列番号２０）；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹのＨＶＲ－Ｈ３配列（配列番号２１）；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡのＨＶＲ－Ｌ１配列（配列番号２２）；（ｅ）ＳＡＳＦＬＹＳのＨＶＲ－Ｌ２配列（配列番号２３）；及び／又は（ｆ）ＱＱＹＬＹＨＰＡＴのＨＶＲ－Ｌ３配列（配列番号２４）と少なくとも９０％（例えば、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％）の配列同一性を有する１、２、３、４、５若しくは６個のＨＶＲ。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの特定の態様において、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下の超可変領域（ＨＶＲ）を含む：（ａ）ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨ（配列番号１９）のＨＶＲ－Ｈ１配列；（ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号２０）のＨＶＲ－Ｈ２配列；（ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号２１）のＨＶＲ－Ｈ３配列；（ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡ（配列番号２２）のＨＶＲ－Ｌ１配列；（ｅ）ＳＡＳＦＬＹＳ（配列番号２３）のＨＶＲ－Ｌ２配列；及び（ｆ）ＱＱＹＬＹＨＰＡＴ（配列番号２４）のＨＶＲ－Ｌ３配列。
本明細書に記載される方法のいずれかのいくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、下記を含む：（ａ）ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％（例えば、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％）の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン；（ｂ）ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％（例えば、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％）の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は（ｃ）（ａ）と同様のＶＨドメイン及び（ｂ）と同様のＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は以下を含む：（ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；及び（ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン。いくつかの態様では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体はアテゾリズマブである。
本明細書中に記載される方法のいずれかは、追加の治療剤を個体に投与することを更に含み得る。いくつかの態様では、追加の治療剤は、免疫治療剤、細胞傷害性薬剤、成長阻害剤、放射線治療剤、抗血管新生剤、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの事例では、第２の治療剤は、活性化共刺激分子に対して指向されるアゴニストである。いくつかの事例では、第２の治療剤は、阻害性共刺激分子に対して指向されるアンタゴニストである。
本明細書に記載の方法の任意いくつかの態様では、上記個体はヒトである。
本明細書に記載される方法に用いられる組成物（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト、ＶＥＧＦアンタゴニスト及び他の抗がん治療剤）は、例えば、静脈内に、筋肉内に、皮下に、皮内に、経皮的に、動脈内に、腹腔内に、病変内に、頭蓋内に、関節内に、前立腺内に、胸膜内に、気管内に、髄腔内に、鼻腔内に、腟内に、直腸内に、局所的に、腫瘍内に、腹膜に、結膜下に、小胞内に、粘膜に、心膜内に、臍帯内に、眼内に、眼窩内に、経口的に、局所的に、経皮的に、硝子体内に（例えば、硝子体内注射により）、点眼により、吸入により、注射により、移植により、注入により、持続注入により、標的細胞を直接的に浸す局所灌流により、カテーテルにより、洗浄により、クリームに入れて、又は脂質組成物に入れて、を含む任意の好適な方法により投与され得る。本明細書に記載の組成物はまた、全身的又は局所的に投与することができる。投与方法は、様々な因子（例えば、投与される化合物又は組成物、及び治療される症状、疾患、又は障害の重症度）に応じて変化し得る。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、静脈内に、筋肉内に、皮下に、局所的に、経口的に、経皮的に、腹腔内に、眼窩内に、移植により、吸入により、髄腔内に、脳室内に、又は鼻腔内に投与される。投薬は、その投与が短期か又は長期かに部分的に依存して、任意の適切な経路、例えば、静脈内又は皮下注射等の注射により行うことができる。本明細書では、単回投与又は様々な時点にわたる複数回投与、ボーラス投与、パルス注入を含むがこれらに限定されない様々な投与スケジュールが想定される。
例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト、ＶＥＧＦアンタゴニストおよび本明細書中に記載される他の抗がん治療剤（例えば、抗体、結合ポリペプチドおよび／または小分子）を含む治療剤は、優良医療実務と一致する様式で製剤化され、投薬され、投与され得る。これに関連して考慮すべき因子には、治療される特定の障害、治療される特定の哺乳動物、個々の患者の臨床症状、障害の原因、薬剤の送達部位、投与方法、投与スケジュール、及び医療従事者に知られている他の因子が含まれる。治療剤は、問題の障害を予防又は治療するために現在使用されている１つ以上の薬剤と製剤化される必要はないが、任意に１つ以上薬剤と同時に投与される。そのような他の薬剤の有効量は、製剤中に存在する治療剤の量、障害又は治療の種類、及び上記の他の要因に依存する。これらは、一般に、本明細書に記載のものと同じ投薬量及び投与経路によって、又は本明細書に記載の投薬量の約１～９９％、又は適切であると経験的／臨床的に判断される任意の投薬量及び任意の経路で使用される。
がん（例えば、膀胱がん（例えば、尿路上皮膀胱がん））の予防又は治療のため、本明細書に記載されるＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの適切な投薬量（単独で、又は１つ以上の他の追加の治療剤と組み合わせて使用されるとき）は、治療される疾患の種類、疾患の重症度及び経過、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが予防目的で投与されるのか又は治療目的で投与されるのかどうか、治療経験、患者の臨床歴及びＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストへの応答、並びに主治医の裁量に左右されることになる。治療剤は、好適には、患者に一度に又は一連の治療にわたって投与される。１つの典型的な１日投薬量は、上で言及した因子に応じて、約１μｇ／ｋｇ～１００ｍｇ／ｋｇ以上の範囲であり得る。数日以上にわたる反復投与に関しては、病状に応じて、治療は一般に疾患症状の望まれる抑制が起こるまで継続されるものとする。そのような用量は、断続的に、例えば、毎週又は３週間ごとに（例えば、患者が、例えば、約２～約２０回、又は例えば、約６回の用量の治療剤を投与されるように、）投与され得る。最初のより高い負荷用量とそれに続く１回以上のより低い用量を投与することができる。しかしながら、他の投薬レジメンが有用であってもよい。この療法の進行は、従来の技術及びアッセイによって容易に監視される。
例えば、一般的な提案として、ヒトに投与される抗体（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト抗体又はＶＥＧＦアンタゴニスト抗体）の治療有効量は、１回以上の投与によるかどうかにかかわらず、患者の体重の約０．０１～約５０ｍｇ／ｋｇの範囲であろう。いくつかの事例では、使用される抗体は、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約４５ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約４０ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約３５ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約３０ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約２５ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約２０ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約１５ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約１０ｍｇ／ｋｇ、約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約５ｍｇ／ｋｇ、又は約０．０１ｍｇ／ｋｇ～約１ｍｇ／ｋｇであり、これらは例えば、毎日、毎週、２週間毎、３週間毎、又は毎月に投与される。いくつかの事例では、抗体は、１５ｍｇ／ｋｇで投与される。しかしながら、他の投薬レジメンが有用であってもよい。１つの事例では、本明細書に記載される抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、２１日周期（３週間毎、ｑ３ｗ）の１日目に、約１００ｍｇ、約２００ｍｇ、約３００ｍｇ、約４００ｍｇ、約５００ｍｇ、約６００ｍｇ、約７００ｍｇ、約８００ｍｇ、約９００ｍｇ、約１０００ｍｇ、約１１００ｍｇ、約１２００ｍｇ、約１３００ｍｇ、約１４００ｍｇ、約１５００ｍｇ、約１６００ｍｇ、約１７００ｍｇ、又は約１８００ｍｇの用量でヒトに投与される。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体アテゾリズマブは、３週間毎（ｑ３ｗ）に、静脈内に１２００ｍｇで投与される。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体アテゾリズマブは、２週間毎（ｑ２ｗ）に、静脈内に８４０ｍｇで投与される。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体アテゾリズマブは、４週間毎（ｑ４ｗ）に、静脈内に１６８０ｍｇで投与される。用量は、注入物等の、単回用量で、又は複数回用量（例えば、２回用量又は３回用量）で投与されてもよい。併用治療において投与される本抗体の用量は、単剤治療と比較して減少し得る。この療法の進展は、従来の技法によって容易にモニタリングされる。
いくつかの事例では、方法は、有効量の追加の治療剤を患者に投与することを更に含む。いくつかの事例では、第２の治療剤は、細胞毒性剤、化学療法剤、成長阻害剤、放射線療法剤、血管新生阻害剤、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、化学療法又は化学療法剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、放射線療法剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、標的化された治療剤又は標的化された治療剤と併せて投与される場合がある。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、免疫療法又は免疫療法剤、例えばモノクローナル抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、第２の治療剤は、活性化共刺激分子に対して指向されるアゴニストである。いくつかの事例では、第２の治療剤は、阻害性共刺激分子に対して指向されるアンタゴニストである。
上記のかかる併用療法は、併用投与（２つ以上の治療剤が同じか又は別個の製剤中に含まれる）及びＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与が、追加の治療剤（複数可）の投与の前、それと同時、かつ／又はそれに続いて発生し得る、個別投与を包含する。１つの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与及び追加の治療剤の投与は、互いの約１カ月以内、又は約１、２、若しくは３週間以内、又は約１、２、３、４、５、若しくは６日以内に発生する。
理論に拘束されることを望むものではないが、活性化する共刺激分子を促進することによる又は陰性共刺激分子を阻害することによるＴ細胞刺激の増強が、腫瘍細胞死を促し、それによってがんの進行を治療又は遅延し得ると考えられる。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、活性化共刺激分子に対して指向されるアゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、活性化する共刺激分子は、ＣＤ４０、ＣＤ２２６、ＣＤ２８、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＤ１３７、ＣＤ２７、ＨＶＥＭ、又はＣＤ１２７を含み得る。いくつかの事例では、活性化する共刺激分子に対するアゴニストは、ＣＤ４０、ＣＤ２２６、ＣＤ２８、ＯＸ４０、ＧＩＴＲ、ＣＤ１３７、ＣＤ２７、ＨＶＥＭ、又はＣＤ１２７に結合するアゴニスト抗体である。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、阻害性共刺激分子に対して指向されるアンタゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、抑制性共刺激分子は、ＣＴＬＡ－４（ＣＤ１５２としても知られている）、ＴＩＭ－３、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、ＬＡＧ－３、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、ＩＤＯ、ＴＩＧＩＴ、ＭＩＣＡ／Ｂ、又はアルギナーゼを含み得る。いくつかの事例では、抑制性共刺激分子に対するアンタゴニストは、ＣＴＬＡ－４、ＴＩＭ－３、ＢＴＬＡ、ＶＩＳＴＡ、ＬＡＧ－３、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、ＩＤＯ、ＴＩＧＩＴ、ＭＩＣＡ／Ｂ、又はアルギナーゼに結合するアンタゴニスト抗体である。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＴＬＡ－４（ＣＤ１５２としても知られている）に対して指向されるアンタゴニスト、例えば、遮断抗体と併せて投与され得る。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、イピリムマブ（別名、ＭＤＸ－０１０、ＭＤＸ－１０１、又はＹＥＲＶＯＹ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、トレメリムマブ（別名、チシリムマブ又はＣＰ－６７５，２０６）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、Ｂ７－Ｈ３（ＣＤ２７６としても知られている）に対して指向されるアンタゴニスト、例えば、遮断抗体と併せて投与され得る。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＭＧＡ２７１と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＴＧＦ－ベータに対して指向されるアンタゴニスト、例えば、メテリムマブ（ＣＡＴ－１９２としても知られている）、フレソリムマブ（ＧＣ１００８としても知られている）、又はＬＹ２１５７２９９と併せて投与され得る。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）を発現するＴ細胞（例えば、細胞毒性Ｔ細胞又はＣＴＬ）の養子移入を含む治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ドミナントネガティブＴＧＦベータ受容体、例えばドミナントネガティブＴＧＦベータＩＩ型受容体を含むＴ細胞の養子移入を含む治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＨＥＲＣＲＥＥＭプロトコル（例えば、ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｒ ＮＣＴ００８８９９５４を参照）を含む治療と併せて投与されてもよい。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＤ１３７（別名、ＴＮＦＲＳＦ９、４－１ＢＢ、又はＩＬＡ）に対して指向されるアゴニスト、例えば活性化抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ウレルマブ（別名、ＢＭＳ－６６３５１３）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＤ４０に対して指向されるアゴニスト、例えば活性化抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＰ－８７０８９３と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＯＸ４０（別名、ＣＤ１３４）に対して指向されるアゴニスト、例えば活性化抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、抗ＯＸ４０抗体（例えば、ＡｇｏｎＯＸ）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＤ２７に対して指向されるアゴニスト、例えば活性化抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＤＸ－１１２７と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、インドールアミン－２，３－ジオキシゲナーゼ（ＩＤＯ）に対して指向されるアンタゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、１－メチル－Ｄ－トリプトファン（別名、１－Ｄ－ＭＴ）は、ＩＤＯアンタゴニストを伴う。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、抗体薬物コンジュゲートと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、抗体－薬物接合体は、メルタンシン又はモノメチルオーリスタチンＥ（ＭＭＡＥ）を含む。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、抗ＮａＰｉ２ｂ抗体－ＭＭＡＥコンジュゲート（別名、ＤＮＩＢ０６００Ａ又はＲＧ７５９９）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、トラスツズマブエムタンシン（別名、Ｔ－ＤＭ１、アド－トラスツズマブエムタンシン、又はＫＡＤＣＹＬＡ（登録商標）、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＤＭＵＣ５７５４Ａと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、エンドセリンＢ受容体（ＥＤＮＢＲ）を標的とする抗体－薬物コンジュゲート、例えばＭＭＡＥとコンジュゲートされたＥＤＮＢＲに対して指向される抗体と併せて投与されてもよい。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、抗血管新生剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを、ＶＥＧＦに対する抗体、例えばＶＥＧＦ－Ａと併せて投与することができる。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ベバシズマブ（別名、ＡＶＡＳＴＩＮ（登録商標）、Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、アンジオポエチン２（別名、Ａｎｇ２）に対して指向される抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＭＥＤＩ３６１７と併せて投与されてもよい。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、抗腫瘍剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＳＦ－１Ｒ（別名、Ｍ－ＣＳＦＲ又はＣＤ１１５）を標的とする薬剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、抗ＣＳＦ－１Ｒ（別名、ＩＭＣ－ＣＳ４）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、インターフェロン、例えばインターフェロンα又はインターフェロンγと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、Ｒｏｆｅｒｏｎ－Ａ（別名、組換えインターフェロンアルファ－２ａ）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＧＭ－ＣＳＦ（別名、組換えヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、ｒｈｕ ＧＭ－ＣＳＦ、サルグラモスチム、又はＬＥＵＫＩＮＥ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＬ－２（別名、アルデスロイキン又はＰＲＯＬＥＵＫＩＮ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＬ－１２と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＤ２０を標的とする抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＣＤ２０を標的とする抗体は、オビヌツズマブ（別名、ＧＡ１０１又はＧＡＺＹＶＡ（登録商標））又はリツキシマブである。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＧＩＴＲを標的とする抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＧＩＴＲを標的とする抗体は、ＴＲＸ５１８である。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、がんワクチンと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、がんワクチンは、ペプチドがんワクチンであり、いくつかの事例では、個別のペプチドワクチンである。いくつかの事例では、がんペプチドワクチンは、多価長ペプチド、マルチペプチド、ペプチドカクテル、ハイブリッドペプチド、又はペプチドパルス樹状細胞ワクチンである（例えば、Ｙａｍａｄａ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｓｃｉ．１０４：１４－２１，２０１３を参照）。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、アジュバントと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＴＬＲアゴニスト、例えばＰｏｌｙ－ＩＣＬＣ（別名、ＨＩＬＴＯＮＯＬ（登録商標））、ＬＰＳ、ＭＰＬ、又はＣｐＧ ＯＤＮを含む治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）アルファと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＬ－１と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＨＭＧＢ１と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＬ－１０アンタゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＬ－４アンタゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＬ－１３アンタゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＨＶＥＭアンタゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、例えば、ＩＣＯＳ－Ｌの投与によってＩＣＯＳアゴニストと併せて、又はＩＣＯＳに対して指向されるアゴニスト抗体と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＸ３ＣＬ１を標的とする治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＸＣＬ９を標的とする治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＸＣＬ１０を標的とする治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＣＣＬ５を標的とする治療と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＬＦＡ－１又はＩＣＡＭ１アゴニストと併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、セレクチンアゴニストと併せて投与されてもよい。
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、標的療法と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、Ｂ－Ｒａｆの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ベムラフェニブ（別名、ＺＥＬＢＯＲＡＦ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ダブラフェニブ（別名、ＴＡＦＩＮＬＡＲ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、エルロチニブ（別名、ＴＡＲＣＥＶＡ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＭＥＫ１（別名、ＭＡＰ２Ｋ１）又はＭＥＫ２（別名、ＭＡＰ２Ｋ２）等のＭＥＫの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、コビメチニブ（別名、ＧＤＣ－０９７３又はＸＬ－５１８）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、トラメチニブ（別名、ＭＥＫＩＮＩＳＴ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、Ｋ－Ｒａｓの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ｃ－Ｍｅｔの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、オナルツズマブ（別名、ＭｅｔＭＡｂ）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、Ａｌｋの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＡＦ８０２（別名、ＣＨ５４２４８０２又はアレクチニブ）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ホスファチジルイノシトール３－キナーゼ（ＰＩ３Ｋ）の阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＢＫＭ１２０と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、イデラリシブ（別名、ＧＳ－１１０１又はＣＡＬ－１０１）と併せて投与されてもよい。いくつかの実施形態では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ペリホシン（別名、ＫＲＸ－０４０１）と併せて投与されてもよい。いくつかの実施形態では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、Ａｋｔの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの実施形態では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＭＫ２２０６と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＧＳＫ６９０６９３と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＧＤＣ－０９４１と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ｍＴＯＲの阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、シロリムス（別名、ラパマイシン）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、テムシロリムス（別名、ＣＣＩ－７７９又はＴｏｒｉｓｅｌ（登録商標））と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、エベロリムス（別名、ＲＡＤ００１）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、リダフォロリムス（別名、ＡＰ－２３５７３、ＭＫ－８６６９、又はデフォロリムス）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＯＳＩ－０２７と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＡＺＤ８０５５と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＩＮＫ１２８と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、二重ＰＩ３Ｋ／ｍＴＯＲ阻害剤と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＸＬ７６５と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＧＤＣ－０９８０と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＢＥＺ２３５（別名、ＮＶＰ－ＢＥＺ２３５）と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＢＧＴ２２６と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＧＳＫ２１２６４５８と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＦ－０４６９１５０２と併せて投与されてもよい。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＦ－０５２１２３８４（別名、ＰＫＩ－５８７）と併せて投与されてもよい。
ＩＶ．組成物及び薬学的製剤
本明細書では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含む、個体におけるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を治療するための、又はその進行を遅延させるための方法が、本明細書に提供される。また本明細書では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法も提供される。がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））に罹患している患者が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療と同時治療に応答する可能性が高いかどうかを決定するための方法を、本明細書において更に提供する。ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））に罹患している患者の応答性を予測する方法が本明細書で提供される。本明細書では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、尿路上皮膀胱がん））に罹患している患者のための療法を選択するための方法が提供される。上記方法のいずれかは、本明細書で提供されるバイオマーカーの発現レベル、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベル、例えばがんを有する又は有すると疑われる個体由来の試料中のＩＬ８発現に基づいてもよい。例えば、ＩＬ８の基準レベルと比較してＩＬ８発現が減少している個体、又はＩＬ８の基準レベルと比較してＩＬ８発現が治療中に減少している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療の候補であり得る。別の例では、１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が低下しているか、又は１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が治療中に減少している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療の候補であり得る。更に別の例では、１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が増加しているか、又は１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が治療中に増加している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療の候補であり得る。
他の態様では、本明細書において、個体においてがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を治療する又は進行を遅延させる方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた、治療有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む方法が提供される。また本明細書では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定する方法も提供される。本明細書では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））に罹患している患者が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療に応答する可能性が高いかどうかを決定するための方法が、提供される。本明細書では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に対するがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））に罹患している患者の応答性を予測する方法が提供される。本明細書では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）及び腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））に罹患している患者のための、例えばＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療のための治療法を選択するための方法が本明細書で提供される。前述の方法のいずれかは、本明細書で提供されるバイオマーカーの発現レベル、例えば表１～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベル、例えばがんを有する又は有すると疑われる個体由来の試料中のＩＬ８発現に基づいてもよい。例えば、ＩＬ８の基準レベルと比較してＩＬ８発現が上昇している個体、又はＩＬ８の基準レベルと比較してＩＬ８発現が治療中に増加している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療の候補であり得る。別の例では、１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が上昇しているか、又は１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が治療中に増加している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療の候補であり得る。更に別の例では、１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が低下しているか、又は１つ以上の遺伝子の基準レベルと比較して表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現が治療中に減少している個体は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療の候補であり得る。
これらの薬剤及びそれらの組み合わせは、例えば、本明細書（例えば、上記のセクションＩＩ及びＩＩＩにおいて）に記載の任意の方法の一部として、がんの治療に有用である。任意の適切なＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト、ＶＥＧＦアンタゴニスト及び／又は更なる抗がん剤を、本明細書に記載される方法及びアッセイにおいて使用することができる。本発明の方法及びアッセイにおける使用に適切な非限定的な実施例が以下に更に記載されている。これらの例のいずれも、例えば、医薬、例えば個体においてがんを治療するための医薬の調製において使用され得る。
Ａ．例示的なＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト
任意の適切なＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが使用され得る。例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストは、ＰＤ－１結合アンタゴニスト、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト、及びＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストを含む。ＰＤ－１（プログラム死１）はまた、当該技術分野において「プログラム細胞死１」、「ＰＤＣＤ１」、「ＣＤ２７９」、及び「ＳＬＥＢ２」としても言及される。例示的なヒトＰＤ－１は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｑ１５１１６に示されている。ＰＤ－Ｌ１（プログラム死リガンド１）はまた、当技術分野において「プログラム細胞死１リガンド１」、「ＰＤＣＤ１ＬＧ１」、「ＣＤ２７４」、「Ｂ７－Ｈ」、及び「ＰＤＬ１」としても言及される。例示的なヒトＰＤ－Ｌ１は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｑ９ＮＺＱ７．１に示される。ＰＤ－Ｌ２（プログラム死リガンド２）はまた、当該技術分野において「プログラム細胞死１リガンド２」、「ＰＤＣＤ１ＬＧ２」、「ＣＤ２７３」、「Ｂ７－ＤＣ」、「Ｂｔｄｃ」、及び「ＰＤＬ２」としても言及される。例示的なヒトＰＤ－Ｌ２は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｑ９ＢＱ５１に示されている。いくつかの事例では、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、及びＰＤ－Ｌ２は、ヒトＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１及びＰＤ－Ｌ２である。
１．例示的なＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト
本明細書に記載されるか又は当技術分野で公知の任意の適切なＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを使用することができる。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、例えば、以下に記載されるものである。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、ＰＤ－Ｌ１とＰＤ－１との間及び／又はＰＤ－Ｌ１とＢ７－１との間の結合を阻害することができる。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体はモノクローナル抗体である。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、Ｆａｂ、Ｆａｂ’－ＳＨ、Ｆｖ、ｓｃＦｖ、及び（Ｆａｂ’）２断片からなる群から選択される抗体断片である。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体はヒト化抗体である。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、ヒト抗体である。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、アテゾリズマブ、ＹＷ ２４３．５５．Ｓ ７０、アテゾリズマブ、ＭＤＸ－１１０５、及びＭＥＤＩ ４７３６（デュルバルマブ）、並びにＭＳＢ ００１０７１８ Ｃ（アベルマブ）からなる群から選択される。抗体ＹＷ２４３．５５．Ｓ７０は、国際公開第２０１０／０７７６３４号に記載される抗ＰＤ－Ｌ１である。ＢＭＳ－９３６５５９としても知られるＭＤＸ－１１０５は、国際公開第２００７／００５８７４号に記載の抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。ＭＥＤＩ４７３６（デュルバルマブ）は、国際公開第２０１１／０６６３８９号及び米国特許出願公開第２０１３／０３４５５９号に記載されている抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体である。この発明の方法に有用な抗ＰＤ－Ｌ１抗体の例、及びその作製方法は、ＰＣＴ特許出願の国際公開第２０１０／０７７６３４号、国際公開第２００７／００５８７４号、国際公開第２０１１／０６６３８９号、米国特許第８，２１７，１４９号、及び米国特許出願公開第 ２０１３／０３４５５９号に記載されており、これらは出典明示により本明細書に援用される。
国際公開第２０１０／０７７６３４号Ａ１及び米国特許第８，２１７，１４９号に記載される抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本明細書に記載される方法において使用され得る。いくつかの事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、配列番号３の重鎖可変領域配列及び／又は配列番号４の軽鎖可変領域配列を含む。なお更なる事例では、以下の重鎖可変領域及び／又は軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供される：
（ａ）重鎖配列は、以下の重鎖配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＡ（配列番号３）、及び
（ｂ）軽鎖配列は、以下の軽鎖配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する：
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）。
一事例では、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、ＨＶＲ－Ｈ１、ＨＶＲ－Ｈ２、及びＨＶＲ－Ｈ３配列を含む重鎖可変領域を含み、
（ａ）ＨＶＲ－Ｈ１配列は、ＧＦＴＦＳＸ１ＳＷＩＨ（配列番号５）であり、
（ｂ）ＨＶＲ－Ｈ２配列は、ＡＷＩＸ２ＰＹＧＧＳＸ３ＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号６）であり、
（ｃ）ＨＶＲ－Ｈ３配列は、ＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号７）であり、
更に、Ｘ１はＤ又はＧであり、Ｘ２はＳ又はＬであり、Ｘ３はＴ又はＳである。特定の一態様では、Ｘ１はＤであり、Ｘ２はＳであり、Ｘ３はＴである。別の態様では、ポリペプチドは、式：（ＦＲ－Ｈ１）－（ＨＶＲ－Ｈ１）－（ＦＲ－Ｈ２）－（ＨＶＲ－Ｈ２）－（ＦＲ－Ｈ３）－（ＨＶＲ－Ｈ３）－（ＦＲ－Ｈ４）に従って、ＨＶＲ間に並置された可変領域重鎖フレームワーク配列を更に含む。更に別の態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。更なる態様では、フレームワーク配列はＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、フレームワーク配列の少なくとも１つは以下の通りである：
ＦＲ－Ｈ１は、ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳ（配列番号８）であり、
ＦＲ－Ｈ２は、ＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶ（配列番号９）であり、
ＦＲ－Ｈ３は、ＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲ（配列番号１０）であり、
ＦＲ－Ｈ４は、ＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＡ（配列番号１１）である。
なお更なる態様では、重鎖ポリペプチドは、以下のＨＶＲ－Ｌ１、ＨＶＲ－Ｌ２及びＨＶＲ－Ｌ３を含む可変領域軽鎖と更に組み合わされる：
（ａ）ＨＶＲ－Ｌ１配列は、ＲＡＳＱＸ４Ｘ５Ｘ６ＴＸ７Ｘ８Ａ（配列番号１２）であり、
（ｂ）ＨＶＲ－Ｌ２配列は、ＳＡＳＸ９ＬＸ１０Ｓ（配列番号１３）であり、
（ｃ）ＨＶＲ－Ｌ３配列は、ＱＱＸ１１Ｘ１２Ｘ１３Ｘ１４ＰＸ１５Ｔ（配列番号１４）であり、
式中、Ｘ４はＤ又はＶであり、Ｘ５はＶ又はＩであり、Ｘ６はＳ又はＮであり、Ｘ７はＡ又はＦであり、Ｘ８はＶ又はＬであり、Ｘ９はＦ又はＴであり、Ｘ１０はＹ又はＡであり、Ｘ１１はＹ、Ｇ、Ｆ、又はＳであり、Ｘ１２はＬ、Ｙ、Ｆ又はＷであり、Ｘ１３はＹ、Ｎ、Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｆ又はＩであり、Ｘ１４はＨ、Ｖ、Ｐ、Ｔ又はＩであり、Ｘ１５はＡ、Ｗ、Ｒ、Ｐ又はＴである。なお更なる態様では、Ｘ４はＤであり、Ｘ５はＶであり、Ｘ６はＳであり、Ｘ７はＡであり、Ｘ８はＶであり、Ｘ９はＦであり、Ｘ１０はＹであり、Ｘ１１はＹであり、Ｘ１２はＬであり、Ｘ１３はＹであり、Ｘ１４はＨであり、Ｘ１５はＡである。
なお更なる態様では、軽鎖は、式：（ＦＲ－Ｌ１）－（ＨＶＲ－Ｌ１）－（ＦＲ－Ｌ２）－（ＨＶＲ－Ｌ２）－（ＦＲ－Ｌ３）－（ＨＶＲ－Ｌ３）－（ＦＲ－Ｌ４）に従ってＨＶＲ間に並置された可変領域軽鎖フレームワーク配列を更に含む。なお更なる態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。なお更なる態様では、フレームワーク配列は、ＶＬカッパＩコンセンサスフレームワークである。なおさらなる態様では、フレームワーク配列の少なくとも１つは以下である。
ＦＲ－Ｌ１は、ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣ（配列番号１５）であり、
ＦＲ－Ｌ２は、ＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹ（配列番号１６）であり、
ＦＲ－Ｌ３は、ＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣ（配列番号１７）であり、
ＦＲ－Ｌ４は、ＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号１８）である。
別の事例では、重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体又は抗原結合断片が提供され、
（ａ）重鎖は、ＨＶＲ－Ｈ１、ＨＶＲ－Ｈ２及びＨＶＲ－Ｈ３を含み、更に、
（ｉ）ＨＶＲ－Ｈ１配列は、ＧＦＴＦＳＸ１ＳＷＩＨ（配列番号５）であり、
（ｉｉ）ＨＶＲ－Ｈ２配列は、ＡＷＩＸ２ＰＹＧＧＳＸ３ＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号６）であり、
（ｉｉｉ）ＨＶＲ－Ｈ３配列は、ＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号７）であり、
（ｂ）軽鎖は、ＨＶＲ－Ｌ１、ＨＶＲ－Ｌ２、及びＨＶＲ－Ｌ３を含み、更に、
（ｉ）ＨＶＲ－Ｌ１配列は、ＲＡＳＱＸ４Ｘ５Ｘ６ＴＸ７Ｘ８Ａ（配列番号１２）であり、
（ｉｉ）ＨＶＲ－Ｌ２配列は、ＳＡＳＸ９ＬＸ１０Ｓ（配列番号１３）であり、
（ｉｉｉ）ＨＶＲ－Ｌ３配列は、ＱＱＸ１１Ｘ１２Ｘ１３Ｘ１４ＰＸ１５Ｔ（配列番号１４）であり、
式中、Ｘ１はＤ又はＧであり、Ｘ２はＳ又はＬであり、Ｘ３はＴ又はＳであり、Ｘ４はＤ又はＶであり、Ｘ５はＶ又はＩであり、Ｘ６はＳ又はＮであり、Ｘ７はＡ又はＦであり、Ｘ８はＶ又はＬであり、Ｘ９はＦ又はＴであり、Ｘ１０はＹ又はＡであり、Ｘ１１はＹ、Ｇ、Ｆ、又はＳであり、Ｘ１２はＬ、Ｙ、Ｆ又はＷであり、Ｘ１３はＹ、Ｎ、Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｆ又はＩであり、Ｘ１４ はＨ、Ｖ、Ｐ、Ｔ又はＩであり、Ｘ１５はＡ、Ｗ、Ｒ、Ｐ又はＴである。特定の態様では、Ｘ１はＤであり、Ｘ２はＳであり、Ｘ３はＴである。別の態様において、Ｘ４はＤであり、Ｘ５はＶであり、Ｘ６はＳであり、Ｘ７はＡであり、Ｘ８はＶであり、Ｘ９はＦであり、Ｘ１０はＹであり、Ｘ１１はＹであり、Ｘ１２はＬであり、Ｘ１３はＹであり、Ｘ１４はＨであり、Ｘ１５はＡである。また別の態様では、Ｘ１はＤであり、Ｘ２はＳであり、Ｘ３はＴであり，Ｘ４はＤであり、Ｘ５はＶであり、Ｘ６はＳであり、Ｘ７はＡであり、Ｘ８はＶであり、Ｘ９はＦであり、Ｘ１０はＹであり、Ｘ１１はＹであり、Ｘ１２はＬであり、Ｘ１３はＹであり、Ｘ１４はＨであり、Ｘ１５はＡである。
更なる一態様では、重鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｈ１）－（ＨＶＲ－Ｈ１）－（ＦＲ－Ｈ２）－（ＨＶＲ－Ｈ２）－（ＦＲ－Ｈ３）－（ＨＶＲ－Ｈ３）－（ＦＲ－Ｈ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含み、軽鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｌ１）－（ＨＶＲ－Ｌ１）－（ＦＲ－Ｌ２）－（ＨＶＲ－Ｌ２）－（ＦＲ－Ｌ３）－（ＨＶＲ－Ｌ３）－（ＦＲ－Ｌ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含む。なお更なる態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔサブグループＩ、ＩＩ、又はＩＩＩ配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号８、９、１０、及び１１として記載される。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔカッパＩ、ＩＩ、ＩＩ又はＩＶサブグループ配列に由来する。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＶＬカッパＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号１５、１６、１７、及び１８として記載される。
なお更なる態様では、抗体は、ヒト又はマウスの定常領域を更に含む。なお更なる態様では、ヒト定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４からなる群から選択される。なお更なる態様では、ヒト定常領域はＩｇＧ１である。なお更なる態様では、マウス定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２Ａ、ＩｇＧ２Ｂ、及びＩｇＧ３からなる群から選択される。なお更なる態様では、マウス定常領域はＩｇＧ２Ａである。なお更なる態様では、抗体は、低下した又は最小のエフェクター機能を有する。なお更なる態様では、「エフェクターレスＦｃ変異（ｅｅｆｆｅｃｔｏｒ－ｌｅｓｓ Ｆｃ ｍｕｔａｔｉｏｎ）」又は非グリコシル化（ａｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ）に起因する。なお更なる例では、エフェクターなしのＦｃ突然変異は、定常領域内のＮ２９７Ａ又はＤ２６５Ａ／Ｎ２９７Ａ置換である。
なお別の事例では、重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、
（ａ）重鎖は、それぞれ、ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨ（配列番号１９）、ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号２０）、及びＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号２１）に対して少なくとも８５％の配列同一性を有する、ＨＶＲ－Ｈ１、ＨＶＲ－Ｈ２、及びＨＶＲ－Ｈ３配列を更に含むか、又は
（ｂ）軽鎖は、ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡ（配列番号２２）、ＳＡＳＦＬＹＳ（配列番号２３）、及びＱＱＹＬＹＨＰＡＴ（配列番号２４）に対して、それぞれ、少なくとも８５％の配列同一性を有するＨＶＲ－Ｌ１、ＨＶＲ－Ｌ２、及びＨＶＲ－Ｌ３配列を更に含む。
具体的な一態様では、配列同一性は、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％である。
別の一態様では、重鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｈ１）－（ＨＶＲ－Ｈ１）－（ＦＲ－Ｈ２）－（ＨＶＲ－Ｈ２）－（ＦＲ－Ｈ３）－（ＨＶＲ－Ｈ３）－（ＦＲ－Ｈ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含み、軽鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｌ１）－（ＨＶＲ－Ｌ１）－（ＦＲ－Ｌ２）－（ＨＶＲ－Ｌ２）－（ＦＲ－Ｌ３）－（ＨＶＲ－Ｌ３）－（ＦＲ－Ｌ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含む。更に別の態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔサブグループＩ、ＩＩ、又はＩＩＩ配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号８、９、１０、及び１１として記載される。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔカッパＩ、ＩＩ、ＩＩ又はＩＶサブグループ配列に由来する。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＶＬカッパＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号１５、１６、１７、及び１８として記載される。
なお更なる態様では、抗体は、ヒト又はマウスの定常領域を更に含む。なお更なる態様では、ヒト定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４からなる群から選択される。なお更なる態様では、ヒト定常領域はＩｇＧ１である。なお更なる態様では、マウス定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２Ａ、ＩｇＧ２Ｂ、及びＩｇＧ３からなる群から選択される。なお更なる態様では、マウス定常領域はＩｇＧ２Ａである。なお更なる態様では、抗体は、低下した又は最小のエフェクター機能を有する。なお更なる態様では、「エフェクターレスＦｃ変異（ｅｆｆｅｃｔｏｒ－ｌｅｓｓ Ｆｃ ｍｕｔａｔｉｏｎ）」又は非グリコシル化（ａｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ）に起因する。なお更なる例では、エフェクターなしのＦｃ突然変異は、定常領域内のＮ２９７Ａ又はＤ２６５Ａ／Ｎ２９７Ａ置換である。
別の更なる事例では、以下の重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供される：
（ａ）重鎖配列は、以下の重鎖配列と少なくとも８５％の配列同一性を有する：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５）、及び／又は
（ｂ）軽鎖配列は、以下の軽鎖配列と少なくとも８５％の配列同一性を有する：
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）。
特定の態様では、配列同一性は、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％である。別の一態様では、重鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｈ１）－（ＨＶＲ－Ｈ１）－（ＦＲ－Ｈ２）－（ＨＶＲ－Ｈ２）－（ＦＲ－Ｈ３）－（ＨＶＲ－Ｈ３）－（ＦＲ－Ｈ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含み、軽鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｌ１）－（ＨＶＲ－Ｌ１）－（ＦＲ－Ｌ２）－（ＨＶＲ－Ｌ２）－（ＦＲ－Ｌ３）－（ＨＶＲ－Ｌ３）－（ＦＲ－Ｌ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含む。更に別の態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。更なる一態様では、重鎖フレームワーク配列は、Ｋａｂａｔ下位群Ｉ、ＩＩ、又はＩＩＩ配列由来である。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる一態様では、重鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号８、９、１０、及びＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２７）として記載される。
なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔカッパＩ、ＩＩ、ＩＩ又はＩＶサブグループ配列に由来する。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＶＬカッパＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号１５、１６、１７、及び１８として記載される。
なお更なる態様では、抗体は、ヒト又はマウスの定常領域を更に含む。なお更なる態様では、ヒト定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４からなる群から選択される。なお更なる態様では、ヒト定常領域はＩｇＧ１である。なお更なる態様では、マウス定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２Ａ、ＩｇＧ２Ｂ、及びＩｇＧ３からなる群から選択される。なお更なる態様では、マウス定常領域はＩｇＧ２Ａである。なお更なる態様では、抗体は、低下した又は最小のエフェクター機能を有する。なお更に具体的な一態様では、最小のエフェクター機能は、原核細胞内での産生に起因する。なお更なる態様では、「エフェクターレスＦｃ変異（ｅｆｆｅｃｔｏｒ－ｌｅｓｓ Ｆｃ ｍｕｔａｔｉｏｎ）」又は非グリコシル化（ａｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ）に起因する。なお更なる例では、エフェクターなしのＦｃ突然変異は、定常領域内のＮ２９７Ａ又はＤ２６５Ａ／Ｎ２９７Ａ置換である。
更なる一態様では、重鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｈ１）－（ＨＶＲ－Ｈ１）－（ＦＲ－Ｈ２）－（ＨＶＲ－Ｈ２）－（ＦＲ－Ｈ３）－（ＨＶＲ－Ｈ３）－（ＦＲ－Ｈ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含み、軽鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｌ１）－（ＨＶＲ－Ｌ１）－（ＦＲ－Ｌ２）－（ＨＶＲ－Ｌ２）－（ＦＲ－Ｌ３）－（ＨＶＲ－Ｌ３）－（ＦＲ－Ｌ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含む。なお更なる態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔサブグループＩ、ＩＩ、又はＩＩＩ配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列の１つ以上は以下のとおりである：
ＦＲ－Ｈ１は、ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳ（配列番号２９）であり、
ＦＲ－Ｈ２は、ＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡ（配列番号３０）であり、
ＦＲ－Ｈ３は、ＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲ（配列番号１０）であり、
ＦＲ－Ｈ４は、ＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２７）を含む軽鎖可変領域を含む。
なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔカッパＩ、ＩＩ、ＩＩ又はＩＶサブグループ配列に由来する。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＶＬカッパＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列の１つ以上は以下の通りである：
ＦＲ－Ｌ１は、ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣ（配列番号１５）であり、
ＦＲ－Ｌ２は、ＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹ（配列番号１６）であり、
ＦＲ－Ｌ３は、ＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣ（配列番号１７）であり、
ＦＲ－Ｌ４は、ＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ（配列番号２８）を含む軽鎖可変領域を含む。
なお更なる態様では、抗体は、ヒト又はマウスの定常領域を更に含む。なお更なる態様では、ヒト定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４からなる群から選択される。なお更なる態様では、ヒト定常領域はＩｇＧ１である。なお更なる態様では、マウス定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２Ａ、ＩｇＧ２Ｂ、及びＩｇＧ３からなる群から選択される。なお更なる態様では、マウス定常領域はＩｇＧ２Ａである。なお更なる態様では、抗体は、低下した又は最小のエフェクター機能を有する。なお更なる態様では、最小のエフェクター機能は、「エフェクターなしのＦｃ変異」又は非グリコシル化に起因する。なお更なる例では、エフェクターなしのＦｃ突然変異は、定常領域内のＮ２９７Ａ又はＤ２６５Ａ／Ｎ２９７Ａ置換である。
なお別の事例では、重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、
（ｃ）重鎖はそれぞれ、ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨ（配列番号１９）、ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧ（配列番号２０）、及びＲＨＷＰＧＧＦＤＹ（配列番号２１）と少なくとも８５％の配列同一性を有する、ＨＶＲ－Ｈ１、ＨＶＲ－Ｈ２、及びＨＶＲ－Ｈ３配列を更に含む、及び／又は、
（ｄ）軽鎖は、ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡ（配列番号２２）、ＳＡＳＦＬＹＳ（配列番号２３）、及びＱＱＹＬＹＨＰＡＴ（配列番号２４）に対して、それぞれ、少なくとも８５％の配列同一性を有するＨＶＲ－Ｌ１、ＨＶＲ－Ｌ２、及びＨＶＲ－Ｌ３配列を更に含む。
具体的な一態様では、配列同一性は、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％である。
別の一態様では、重鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｈ１）－（ＨＶＲ－Ｈ１）－（ＦＲ－Ｈ２）－（ＨＶＲ－Ｈ２）－（ＦＲ－Ｈ３）－（ＨＶＲ－Ｈ３）－（ＦＲ－Ｈ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含み、軽鎖可変領域は、（ＦＲ－Ｌ１）－（ＨＶＲ－Ｌ１）－（ＦＲ－Ｌ２）－（ＨＶＲ－Ｌ２）－（ＦＲ－Ｌ３）－（ＨＶＲ－Ｌ３）－（ＦＲ－Ｌ４）のようにＨＶＲ間に並置された１つ以上のフレームワーク配列を含む。更に別の態様では、フレームワーク配列は、ヒトコンセンサスフレームワーク配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔサブグループＩ、ＩＩ、又はＩＩＩ配列に由来する。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列は、ＶＨサブグループＩＩＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、重鎖フレームワーク配列の１つ以上は、配列番号８、９、１０、及びＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫ（配列番号３１）として記載されている。
なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＫａｂａｔカッパＩ、ＩＩ、ＩＩ又はＩＶサブグループ配列に由来する。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列は、ＶＬカッパＩコンセンサスフレームワークである。なお更なる態様では、軽鎖フレームワーク配列のうちの１つ以上は、配列番号１５、１６、１７、及び１８として記載される。なお更なる態様では、抗体は、ヒト又はマウスの定常領域を更に含む。なお更なる態様では、ヒト定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４からなる群から選択される。なお更なる態様では、ヒト定常領域はＩｇＧ１である。なお更なる態様では、マウス定常領域は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２Ａ、ＩｇＧ２Ｂ、及びＩｇＧ３からなる群から選択される。なお更なる態様では、マウス定常領域はＩｇＧ２Ａである。なお更なる態様では、抗体は、低下した又は最小のエフェクター機能を有する。なお更なる態様では、「エフェクターレスＦｃ変異（ｅｆｆｅｃｔｏｒ－ｌｅｓｓ Ｆｃ ｍｕｔａｔｉｏｎ）」又は非グリコシル化（ａｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎ）に起因する。なお更なる例では、エフェクターなしのＦｃ突然変異は、定常領域内のＮ２９７Ａ又はＤ２６５Ａ／Ｎ２９７Ａ置換である。
なお更なる事例では、以下の重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供される：
（ａ）重鎖配列は、以下の重鎖配列と少なくとも８５％の配列同一性を有する：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫ（配列番号２６）、又は
（ｂ）軽鎖配列は、以下の軽鎖配列と少なくとも８５％の配列同一性を有する：
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）。
いくつかの事例では、重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、軽鎖可変領域配列は、配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する。いくつかの事例では、重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、重鎖可変領域配列は、配列番号２６のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する。いくつかの事例では、重鎖及び軽鎖可変領域配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、軽鎖可変領域配列は、配列番号４のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有し、重鎖可変領域配列は、配列番号２６のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する。いくつかの事例では、重鎖及び／又は軽鎖のＮ末端の１、２、３、４、又は５個のアミノ酸残基は、欠失、置換、又は修飾され得る。
なお更なる事例では、以下の重鎖及び軽鎖配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供される：
（ａ）重鎖配列は、以下の重鎖配列と少なくとも８５％の配列同一性を有する：
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＳＳＫＳＴＳＧＧＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＱＴＹＩＣＮＶＮＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＫＶＥＰＫＳＣＤＫＴＨＴＣＰＰＣＰＡＰＥＬＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＨＥＤＰＥＶＫＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＹＡＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＡＬＰＡＰＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＲＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＫＬＴＶＤＫＳＲＷＱＱＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＰＧ（配列番号３２）、及び／又は
（ｂ）軽鎖配列は、以下の軽鎖配列と少なくとも８５％の配列同一性を有する：
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲＴＶＡＡＰＳＶＦＩＦＰＰＳＤＥＱＬＫＳＧＴＡＳＶＶＣＬＬＮＮＦＹＰＲＥＡＫＶＱＷＫＶＤＮＡＬＱＳＧＮＳＱＥＳＶＴＥＱＤＳＫＤＳＴＹＳＬＳＳＴＬＴＬＳＫＡＤＹＥＫＨＫＶＹＡＣＥＶＴＨＱＧＬＳＳＰＶＴＫＳＦＮＲＧＥＣ（配列番号３３）。
いくつかの事例では、重鎖及び軽鎖配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、軽鎖配列は、配列番号３３のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の配列同一性を有する。いくつかの事例では、重鎖及び軽鎖配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、重鎖配列は、配列番号３２のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の配列同一性を有する。いくつかの事例では、重鎖及び軽鎖配列を含む単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体が提供され、軽鎖配列は、配列番号３３のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の配列同一性を有し、重鎖配列は、配列番号３２のアミノ酸配列に対して少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、又は少なくとも９９％の配列同一性を有する。
いくつかの事例では、単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、アグリコシル化されている。抗体のグリコシル化は、典型的には、Ｎ結合型又はＯ結合型のいずれかである。Ｎ結合型とは、炭水化物部分のアスパラギン残基の側鎖への結合を指す。トリペプチド配列であるアスパラギン－Ｘ－セリン及びアスパラギン－Ｘ－トレオニン（式中、Ｘは、プロリン以外の任意のアミノ酸である）は、炭水化物部分のアスパラギン側鎖への酵素結合の認識配列である。したがって、ポリペプチド内でのこれらのトリペプチド配列のいずれかの存在により、潜在的なグリコシル化部位が作製される。Ｏ結合型グリコシル化とは、糖類、Ｎ－アセチルガラクトサミン、ガラクトース、又はキシロースのうちの１つのヒドロキシアミノ酸、最も一般的にはセリン又はトレオニンへの結合を指すが、５－ヒドロキシプロリン又は５－ヒドロキシリジンも使用され得る。抗体からのグリコシル化部位の除去は、（Ｎ結合型グリコシル化部位について）上述のトリペプチド配列のうちの１種が除去されるようにアミノ酸配列を改変することによって好都合に達成される。この改変は、グリコシル化部位内のアスパラギン、セリン、又はトレオニン残基の別のアミノ酸残基（例えば、グリシン、アラニン又は保存的置換）との置換によって行われ得る。
本明細書の事例のいずれにおいても、単離された抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、ヒトＰＤ－Ｌ１、例えば、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｑ９ＮＺＱ７．１に示されるようなヒトＰＤ－Ｌ１、又はそのバリアントに結合することができる。
上に列挙された実施形態のいずれかで使用するためのそのようなＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト抗体又は本明細書中に記載される他の抗体（例えば、ＰＤ－Ｌ１発現レベルの検出のための抗ＰＤ－Ｌ１抗体）は、下記のサブセクションＦのセクション１～７に記載される特徴のいずれかを単独で又は組み合わせて有し得ることが明確に意図される。
２．Ａ．例示的なＰＤ－１結合アンタゴニスト
本明細書に記載されるか又は当技術分野で公知の任意の適切なＰＤ－１結合アンタゴニストを使用することができる。いくつかの事例では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、ＰＤ－１の、そのリガンド結合パートナーへの結合を阻害する分子である。具体的な一態様では、ＰＤ－１のリガンド結合パートナーは、ＰＤ－Ｌ１及び／又はＰＤ－Ｌ２である。別の例では、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ１の、その結合リガンドへの結合を阻害する分子である。特定の態様では、ＰＤ－Ｌ１結合パートナーは、ＰＤ－１及び／又はＢ７－１である。別の例では、ＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストは、ＰＤ－Ｌ２の、そのリガンド結合パートナーへの結合を阻害する分子である。特定の態様では、ＰＤ－Ｌ２結合リガンドパートナーはＰＤ－１である。アンタゴニストは、抗体、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、又はオリゴペプチドであり得る。
いくつかの事例では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、例えば以下で記載されるような抗ＰＤ－１抗体（例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体）である。いくつかの事例では、抗ＰＤ－１抗体は、ＭＤＸ－１１０６（ニボルマブ）、ＭＫ－３４７５（ペンブロリズマブ）、ＭＥＤＩ－０６８０（ＡＭＰ－５１４）、ＰＤＲ００１、ＲＥＧＮ２８１０、及びＢＧＢ－１０８からなる群から選択される。ＭＤＸ－１１０６、別名ＭＤＸ－１１０６－０４、ＯＮＯ－４５３８、ＢＭＳ－９３６５５８、又はニボルマブは、ＷＯ２００６／１２１１６８に記載される抗ＰＤ－１抗体である。ＭＫ－３４７５、別名ペムブロリズマブ又はランブロリズマブは、国際公開第２００９／１１４３３５号に記載されている抗ＰＤ－１抗体である。いくつかの事例では、ＰＤ－１結合アンタゴニストは、イムノアドヘシン（例えば、定常領域（例えば、免疫グロブリン配列のＦｃ領域）に融合したＰＤ－Ｌ１若しくはＰＤ－Ｌ２の細胞外又はＰＤ－１結合部分を含むイムノアドヘシン）である。いくつかの事例では、ＰＤ－１結合アンタゴニストはＡＭＰ－２２４である。ＡＭＰ－２２４、別名Ｂ７－ＤＣＩｇは、国際公開第２０１０／０２７８２７号及び国際公開第２０１１／０６６３４２号に記載されているＰＤ－Ｌ２－Ｆｃ融合可溶性受容体である。
いくつかの事例では、抗ＰＤ－１抗体は、ＭＤＸ－１１０６である。「ＭＤＸ－１１０６」の別名としては、ＭＤＸ－１１０６－０４、ＯＮＯ－４５３８、ＢＭＳ－９３６５５８、及びニボルマブが挙げられる。いくつかの事例では、抗ＰＤ－１抗体はニボルマブ（ＣＡＳ登録番号：９４６４１４－９４－４）である。なお更なる事例では、配列番号１からの重鎖可変領域アミノ酸配列を含む重鎖可変領域、及び／又は配列番号２からの軽鎖可変領域アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む単離された抗ＰＤ－１抗体が提供される。なお更なる事例では、以下の重鎖及び／又は軽鎖配列を含む単離された抗ＰＤ－１抗体が提供される：
（ａ）重鎖配列は、以下の重鎖配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する：ＱＶＱＬＶＥＳＧＧＧＶＶＱＰＧＲＳＬＲＬＤＣＫＡＳＧＩＴＦＳＮＳＧＭＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＶＩＷＹＤＧＳＫＲＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＦＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＴＮＤＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳＡＳＴＫＧＰＳＶＦＰＬＡＰＣＳＲＳＴＳＥＳＴＡＡＬＧＣＬＶＫＤＹＦＰＥＰＶＴＶＳＷＮＳＧＡＬＴＳＧＶＨＴＦＰＡＶＬＱＳＳＧＬＹＳＬＳＳＶＶＴＶＰＳＳＳＬＧＴＫＴＹＴＣＮＶＤＨＫＰＳＮＴＫＶＤＫＲＶＥＳＫＹＧＰＰＣＰＰＣＰＡＰＥＦＬＧＧＰＳＶＦＬＦＰＰＫＰＫＤＴＬＭＩＳＲＴＰＥＶＴＣＶＶＶＤＶＳＱＥＤＰＥＶＱＦＮＷＹＶＤＧＶＥＶＨＮＡＫＴＫＰＲＥＥＱＦＮＳＴＹＲＶＶＳＶＬＴＶＬＨＱＤＷＬＮＧＫＥＹＫＣＫＶＳＮＫＧＬＰＳＳＩＥＫＴＩＳＫＡＫＧＱＰＲＥＰＱＶＹＴＬＰＰＳＱＥＥＭＴＫＮＱＶＳＬＴＣＬＶＫＧＦＹＰＳＤＩＡＶＥＷＥＳＮＧＱＰＥＮＮＹＫＴＴＰＰＶＬＤＳＤＧＳＦＦＬＹＳＲＬＴＶＤＫＳＲＷＱＥＧＮＶＦＳＣＳＶＭＨＥＡＬＨＮＨＹＴＱＫＳＬＳＬＳＬＧＫ（配列番号１）、及び
（ｂ）軽鎖配列は、以下の軽鎖配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、又は１００％の配列同一性を有する：ＥＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＳＬＳＰＧＥＲＡＴＬＳＣＲＡＳＱＳＶＳＳＹＬＡＷＹＱＱＫＰＧＱＡＰＲＬＬＩＹＤＡＳＮＲＡＴＧＩＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣＱＱＳＳＮＷＰＲＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲＴＶＡＡＰＳＶＦＩＦＰＰＳＤＥＱＬＫＳＧＴＡＳＶＶＣＬＬＮＮＦＹＰＲＥＡＫＶＱＷＫＶＤＮＡＬＱＳＧＮＳＱＥＳＶＴＥＱＤＳＫＤＳＴＹＳＬＳＳＴＬＴＬＳＫＡＤＹＥＫＨＫＶＹＡＣＥＶＴＨＱＧＬＳＳＰＶＴＫＳＦＮＲＧＥＣ（配列番号２）。
上に列挙された実施形態のいずれかで使用するためのそのようなＰＤ－１アンタゴニスト抗体又は本明細書に記載される他の抗体（例えば、ＰＤ－１発現レベルの検出のための抗ＰＤ－１抗体）は、以下のサブセクションＦのセクション１～７に記載される特徴のいずれかを単独で又は組み合わせて有し得ることが明確に企図される。
３．Ａ．例示的なＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニスト
いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストはＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストである。本明細書に記載されるか又は当技術分野で公知の任意の適切なＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストを使用することができる。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストは、抗ＰＤ－Ｌ２抗体（例えば、ヒト抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体）である。いくつかの事例では、ＰＤ－Ｌ２結合拮抗薬は、イムノアドヘシンである。
上に列挙された実施形態のいずれかで使用するためのそのようなＰＤ－Ｌ ２アンタゴニスト抗体又は本明細書に記載される他の抗体（例えば、ＰＤ－Ｌ２発現レベルの検出のための抗ＰＤ－Ｌ２抗体）は、以下のサブセクションＦのセクション１～７に記載される特徴のいずれかを単独で又は組み合わせて有し得ることが明確に企図される。
Ｂ．例示的なＶＥＧＦアンタゴニスト
ＶＥＧＦアンタゴニストとしては、ＶＥＧＦに結合するか、ＶＥＧＦ発現レベルを低減するか、又はＶＥＧＦの生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低減、又は妨害し得る任意の分子が挙げられる。例示的なヒトＶＥＧＦは、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｐ１５６９２、Ｇｅｎｅ ＩＤ（ＮＣＢＩ）：７４２２として示される。
任意の適切な抗ＶＥＧＦアンタゴニスト抗体を使用することができる。いくつかの事例では、ＶＥＧＦアンタゴニストは、抗ＶＥＧＦ抗体である。いくつかの実施形態では、抗ＶＥＧＦ抗体は、「ｒｈｕＭａｂ ＶＥＧＦ」又は「ＡＶＡＳＴＩＮ（登録商標）」としても公知のベバシズマブである。ベバシズマブは、Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．（Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７：４５９３－４５９９，１９９７）に従って生成される組換えヒト化抗ＶＥＧＦモノクローナル抗体である。ベバシズマブは、ヒトＶＥＧＦのその受容体への結合を遮断するマウス抗ｈＶＥＧＦモノクローナル抗体Ａ．４．６．１由来の変異ヒトＩｇＧ １フレームワーク領域及び抗原結合相補性決定領域を含む。フレームワーク領域の大部分を含む、ベバシズマブのアミノ酸配列の約９３％は、ヒトＩｇＧ１に由来し、配列の約７％は、マウス抗体Ａ４．６．１に由来する。ベバシズマブは、分子量が約１４９，０００ダルトンであり、グリコシル化されている。ベバシズマブ及び他のヒト化抗ＶＥＧＦ抗体は、その開示全体が参照により本明細書に明確に組み込まれる、米国特許第６，８８４，８７９号に更に記載される。追加の好ましい抗体としては、ＰＣＴ出願公開の国際公開第２００５／０１２３５９号に記載されているＧ６又はＢ２０シリーズ抗体（例えば、Ｇ６－３１、Ｂ２０－４．１）が挙げられる。追加の好ましい抗体については、米国特許第７，０６０，２６９号、同第６，５８２，９５９号、同第６，７０３，０２０号、同第６，０５４，２９７号、国際公開第９８／４５３３２号、国際公開第９６／３００４６号、国際公開第９４／１０２０２号、欧州特許第０６６６８６８号Ｂ１、米国特許出願公開第２００６００９３６０号、同第２００５０１８６２０８号、同第２００３０２０６８９９号、同第２００３０１９０３１７号、同第２００３０２０３４０９号、及び同第２００５０１１２１２６号、並びにＰｏｐｋｏｖ ｅｔ ａｌ．（Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８８：１４９－１６４，２００４）を参照されたい。他の好ましい抗体としては、残基Ｆ１７、Ｍ１８、Ｄ１９、Ｙ２１、Ｙ２５、Ｑ８９、１９１、Ｋ１０１、Ｅ１０３、及びＣ１０４を含むか、又はあるいは残基Ｆ１７、Ｙ２１、Ｑ２２、Ｙ２５、Ｄ６３、１８３、及びＱ８９を含む、ヒトＶＥＧＦ上の機能的エピトープに結合する抗体が挙げられる。
他の事例では、ＶＥＧＦアンタゴニストは、抗ＶＥＧＦＲ２抗体又は関連する分子（例えば、ラムシルマブ、タニビルマブ、アフリベルセプト）、抗ＶＥＧＦＲ１抗体又は関連する分子（例えば、イクルクマブ、アフリベルセプト（ＶＥＧＦ Ｔｒａｐ－Ｅｙｅ、ＥＹＬＥＡ（登録商標））、又はジブ－アフリベルセプト（ＶＥＧＦ Ｔｒａｐ、ＺＡＬＴＲＡＰ（登録商標）））、二重特異性ＶＥＧＦ抗体（例えば、ＭＰ－０２５０、バヌシズマブ（ＶＥＧＦ－ＡＮＧ２）、又はＵＳ２００１／０２３６３８８に開示されている二重特異性抗体）、抗ＶＥＧＦアーム、抗ＶＥＧＦＲ１アーム、及び抗ＶＥＧＦＲ２アームのうちの２つの組み合わせを含む二重特異性抗体、抗ＶＥＧＦＡ抗体（例えば、ベバシズマブ、セバシズマブ）、抗ＶＥＧＦＢ抗体、抗ＶＥＧＦＣ抗体（例えば、ＶＧＸ－１００）、抗ＶＥＧＦＤ抗体、又は非ペプチド低分子ＶＥＧＦアンタゴニスト（例えば、パゾパニブ、アキシチニブ、バンデタニブ、スチバーガ、カボザンチニブ、レンバチニブ、ニンテダニブ、オランチニブ、テラチニブ、ドビチニブ、セジラニブ、モテサニブ、スルファチニブ、アパチニブ、フォレチニブ、ファミチニブ、又はチボザニブ）である。
上に列挙した実施形態のいずれかで使用するためのそのようなＶＥＧＦアンタゴニスト抗体又は本明細書に記載される他の抗体（例えば、ＶＥＧＦ発現レベルを検出するための抗ＶＥＧＦ抗体）は、以下のサブセクションＦのセクション１～７に記載される特徴のいずれかを単独で又は組み合わせて有し得ることが明確に企図される。
Ｃ．他のＩＬ８アンタゴニスト
ＩＬ８アンタゴニストには、ＩＬ８と結合し、ＩＬ８発現レベルを低下させ、又はＩＬ８生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低下、若しくは妨害することができる任意の分子が含まれる。例示的なヒトＩＬ８は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｐ１０１４５で示されている。
任意の適切なＩＬ８軸結合アンタゴニストが使用され得る。いくつかの事例では、ＩＬ８アンタゴニストは抗ＩＬ８抗体である。例示的な非限定的な抗ＩＬ８抗体としては、ＨｕＭａｘ－ＩＬ８（別名、ＢＭＳ－９８６２５３）が挙げられる。いくつかの事例では、ＩＬ８阻害剤は、小分子ＩＬ８阻害剤である。例示的な非限定的な小分子ＩＬ８阻害剤としては、レパリキシンが挙げられる（例えば、Ｌｅｉｔｎｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｉｎｔ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｐａｔｈｏｌ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２０（１）：２５－３６，２００７）。
Ｄ．例示的なＩＬ１Ｂアンタゴニスト
ＩＬ１Ｂアンタゴニストには、ＩＬ１Ｂに結合し、ＩＬ１Ｂ発現レベルを低下させ、又はＩＬ１Ｂ生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低下、若しくは干渉することができる任意の分子が含まれる。例示的なヒトＰＤ－１は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受入託番号Ｐ０１５８４に示される。
任意の適切なＩＬ１Ｂ軸結合アンタゴニストが使用され得る。いくつかの事例では、ＩＬ１Ｂアンタゴニストは、抗ＩＬ１Ｂ抗体である。例示的な非限定的な抗ＩＬ１Ｂ抗体としては、カナキヌマブ、ゲボキズマブ、ＬＹ２１８９１０２、ＸＯＭＡ０５２及び２Ｈ（例えば、Ｇｏｈ ｅｔ ａｌ．ＭＡｂｓ ６（３）：７６４－７７２，２０１４を参照）が挙げられる。他の事例では、ＩＬ１Ｂアンタゴニストは小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤（例えば、ＩＬ１Ｂ放出を阻害する小分子、例えば、カスパーゼ１阻害剤（例えば、プラルナカサン（ＶＸ－７４０）及びＶＸ－７６５））である。例示的なＩＬ１Ｂアンタゴニストは、例えば、Ｄｉｎａｒｅｌｌｏ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．１１（８）：６３３－６５２，２０１２に記載されている。
Ｅ．例示的なＩＬ１Ｒアンタゴニスト
ＩＬ１Ｒアンタゴニストには、ＩＬ１Ｒに結合し、ＩＬ１Ｒ発現レベルを低下させ、又はＩＬ１Ｒ生物学的活性を中和、遮断、阻害、抑止、低減若しくは干渉することができる任意の分子が含まれる。例示的なヒトＩＬ１Ｒ、１型は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｐ１４７７８に示されている。例示的なヒトＩＬ１Ｒ、２型は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ／Ｓｗｉｓｓ－Ｐｒｏｔ受託番号Ｐ２７９３０に示されている。
任意の適切なＩＬ１Ｒ軸結合アンタゴニストが使用され得る。いくつかの事例ではＩＬ１Ｒアンタゴニストは、抗ＩＬ１Ｒ抗体である。例示的な非限定的な抗ＩＬ１Ｒ抗体としては、ＡＭＧ１０８が挙げられる。他の事例では、ＩＬ１Ｒアンタゴニストは、組換えＩＬ－１ＲＡタンパク質又はその操作されたバージョン、例えばアナキンラ（ＫＩＮＥＲＥＴ（登録商標））である。更に他の事例では、ＩＬ１Ｒアンタゴニストは、可溶性デコイ受容体、例えば、リロナセプト（ＡＲＣＡＬＹＳＴ（登録商標））であり、これは、ヒトＩＬ１Ｒの細胞外部分のリガンド結合ドメイン（ＩＬ１Ｒ１）及びヒトＩｇＧ１のＦｃ領域にインラインで連結されたＩＬ１受容体アクセサリータンパク質（ＩＬ－１ＲＡｃＰ）を含む二量体融合タンパク質である。他の事例では、ＩＬ１Ｂアンタゴニストは小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤である。例示的なＩＬ１Ｒアンタゴニストは、例えば、Ｄｉｎａｒｅｌｌｏ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．１１（８）：６３３－６５２，２０１２に記載されている。
Ｆ．抗体
抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体及び抗ＩＬ１Ｒ抗体）が本明細書で提供される。なお更なる事例では、本明細書に記載の抗体のうちのいずれかをコードする単離核酸が提供される。いくつかの事例では、核酸は、本明細書に記載される抗ＰＤ－Ｌ１抗体のいずれかをコードする核酸の発現に適切なベクターを更に含む。なお更なる特定の態様では、ベクターは、核酸の発現に適した宿主細胞内にある。なお更なる特定の態様では、宿主細胞は真核細胞又は原核細胞である。なお更なる特定の態様では、真核細胞は、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞等の哺乳動物細胞である。
抗体又はその抗原結合断片は、当技術分野において既知の方法を使用して、例えば発現に適した形態の先述の抗ＰＤ－Ｌ１抗体又は抗原結合断片のいずれかをコードする核酸を含む宿主細胞を、そのような抗体又は断片を生成するために適した条件下で培養すること、及び抗体又は断片を回収することを含むプロセスにより、作製することができる。
上に列挙した事例のいずれかで使用するためのそのような抗体（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体及び抗ＰＤ－Ｌ２抗体）、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体、抗ＩＬ１Ｒ抗体、又は本明細書に記載される他の抗体は、以下のセクション１～７に記載される特徴のいずれかを単独で又は組み合わせて有し得ることが明確に企図される。
１．抗体親和性
特定の事例では、本明細書中に提供される抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、≦１μＭ、≦１００ｎＭ、≦１０ｎＭ、≦１ｎＭ、≦０．１ｎＭ、≦０．０１ｎＭ又は≦０．００１ｎＭ（例えば、１０－８Ｍ以下、例えば１０－８Ｍ～１０－１３Ｍ、例えば１０－９Ｍ～１０－１３Ｍ）の解離定数（Ｋｄ）を有する。
１つの事例では、Ｋｄは、放射標識抗原結合アッセイ（ＲＩＡ）によって測定される。一例では、ＲＩＡは、目的の抗体及びその抗原のＦａｂバージョンを用いて実施される。例えば、抗原に対するＦａｂの溶液結合親和性は、非標識抗原の滴定系の存在下で、最小濃度の（１２５Ｉ）標識抗原によりＦａｂを平衡化し、次いで、結合した抗原を抗Ｆａｂ抗体でコーティングしたプレートで捕捉することにより測定する（例えばＣｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９３：８６５－８８１（１９９９）を参照）。アッセイの条件を確立するために、ＭＩＣＲＯＴＩＴＥＲ（登録商標）マルチウェルプレート（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を、５０ｍＭの炭酸ナトリウム（ｐＨ９．６）中の５μｇ／ｍｌの捕捉用抗Ｆａｂ抗体（Ｃａｐｐｅｌ Ｌａｂｓ）で一晩コーティングし、その後、ＰＢＳ中の２％（ｗ／ｖ）ウシ血清アルブミンで２～５時間、室温（およそ２３℃）でブロッキングする。非吸着性プレート（Ｎｕｎｃ番号２６９６２０）中、１００ｐＭ又は２６ｐＭの［１２５Ｉ］－抗原を、目的のＦａｂの段階希釈液と混合する（例えば、Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７：４５９３－４５９９（１９９７）における抗ＶＥＧＦ抗体Ｆａｂ－１２の評定と一貫する）。次いで、関心のあるＦａｂを一晩インキュベートする；しかしながら、平衡に達することを達するために、インキュベーションをより長い期間（例えば、約６５時間）継続してもよい。その後、室温でのインキュベーション（例えば、１時間）のために混合物を捕捉プレートに移す。次いで、溶液を除去し、プレートを、ＰＢＳ中０．１％のポリソルベート２０（ＴＷＥＥＮ－２０（登録商標））で８回洗浄する。プレートが乾燥したら、１５０μＬ／ウェルのシンチラント（ＭＩＣＲＯＳＣＩＮＴ－２０（商標）；Ｐａｃｋａｒｄ）を添加し、プレートを１０分間ＴＯＰＣＯＵＮＴ（商標）ガンマカウンター（Ｐａｃｋａｒｄ）で計数する。最大結合の２０％以下をもたらす各Ｆａｂの濃度を、競合結合アッセイにおける使用のために選択する。
別の事例によると、Ｋｄは、ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）表面プラズモン共鳴アッセイを使用して測定される。例えば、ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）－２０００又はＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）－３０００（ＢＩＡｃｏｒｅ，Ｉｎｃ．、Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ、ＮＪ）を使用するアッセイは、約１０の応答ユニット（ＲＵ）で固定化抗原ＣＭ５チップを用いて２５℃で実施される。１つの事例では、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ（ＣＭ５、ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標），Ｉｎｃ．）は、供給業者の指示に従って、Ｎ－エチル－Ｎ’－（３－ジメチルアミノプロピル）－カルボジイミドヒドロクロリド（ＥＤＣ）及びＮ－ヒドロキシスクシンイミド（ＮＨＳ）を用いて活性化される。抗原を１０ｍＭ酢酸ナトリウム（ｐＨ４．８）で５μｇ／ｍＬ（約０．２μＭ）に希釈した後、５μｌ／分の流量で注入し、結合タンパク質のおよそ１０応答単位（ＲＵ）を達成する。抗原のインジェクション後、１Ｍのエタノールアミンをインジェクトして、未反応基をブロックする。動態測定のために、Ｆａｂ（０．７８ｎＭ～５００ｎＭ）の２倍段階希釈物が、２５℃で、およそ２５μＬ／分の流速で、０．０５％のポリソルベート２０（ＴＷＥＥＮ－２０（商標））界面活性剤（ＰＢＳＴ）を含むＰＢＳに注入される。会合速度（ｋｏｎ）及び解離速度（ｋｏｆｆ）を、単純な１対１ラングミュア結合モデル（ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）評価ソフトウェアバージョン３．２）を使用して、会合及び解離センサーグラムを同時にフィッティングすることによって、計算する。平衡解離定数（Ｋｄ）は、ｋオフ／ｋオン比として算出される。例えば、Ｃｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９３：８６５－８８１（１９９９）を参照されたい。上記表面プラズモン共鳴アッセイによるオンレートが１０６Ｍ－１ｓ－１を超える場合、オンレートは、ストップトフローを備えた分光光度計（Ａｖｉｖ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）、又は撹拌キュベットを備えた８０００シリーズＳＬＭ－ＡＭＩＮＣＯ（商標）分光光度計（ＴｈｅｒｍｏＳｐｅｃｔｒｏｎｉｃ）等の分光計で測定される場合に、増加する抗原濃度の存在下で、２５℃で、ＰＢＳ中２０ｎＭの抗抗原抗体（Ｆａｂ型）（ｐＨ７．２）の蛍光発光強度（励起＝２９５ｎｍ；発光＝３４０ｎｍ、１６ｎｍ帯域通過）の増加又は減少を測定する蛍光消光技法を使用して決定することができる。
２．抗体断片
特定の事例では、本明細書に提供される抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、抗体断片である。抗体断片としては、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆａｂ’－ＳＨ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖ、及びｓｃＦｖ断片、及び以下に記載する他の断片が挙げられるがこれらに限定されない。特定の抗体断片の総説としては、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）を参照されたい。ｓｃＦｖ断片の参照には、例えばＰｌｕｃｋｔｈｕｅｎ，ｉｎ Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ｖｏｌ．１１３，Ｒｏｓｅｎｂｕｒｇ ａｎｄ Ｍｏｏｒｅ ｅｄｓ．，（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ－Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ），ｐｐ．２６９－３１５（１９９４）を参照されたい；また、国際公開第９３／１６１８５号を参照されたい；及び米国特許第５，５７１，８９４号及び同第５，５８７，４５８号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を構成し、かつｉｎ ｖｉｖｏ半減期を増加させたＦａｂ及びＦ（ａｂ’）２断片の議論については、米国特許第５，８６９，０４６号を参照されたい。
ダイアボディは、二価又は二重特異性であり得る２つの抗原結合部位を有する抗体断片である。例えば、欧州特許第４０４，０９７号、国際公開第１９９３／０１１６１号、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）；ａｎｄ Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８（１９９３）を参照されたい。トリアボディ及びテトラボディはまた、Ｈｕｄｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔ．Ｍｅｄ．９：１２９－１３４（２００３）においても説明されている。
単一ドメイン抗体は、抗体の重鎖可変ドメインの全て又は一部又は軽鎖可変ドメインの全て又は一部を含む抗体断片である。特定の事例では、単一ドメイン抗体は、ヒト単一ドメイン抗体である（Ｄｏｍａｎｔｉｓ，Ｉｎｃ．、マサチューセッツ州ウォルサム、例えば米国特許第６，２４８，５１６号Ｂ１を参照）。
抗体断片は、本明細書に記載されるように、組み換え宿主細胞（例えばＥ．ｃｏｌｉ又はファージ）による、インタクトな抗体のタンパク分解、及び産生を含むがこれらに限定されない各種技術により製造可能である。
３．キメラ抗体及びヒト化抗体
特定の事例では、本明細書に提供される抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第４，８１６，５６７号；及びＭｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１－６８５５（１９８４））に記載されている。一例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域（例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、又はサル等の非ヒト霊長類に由来する可変領域）とヒト定常領域を含む。更なる例では、キメラ抗体は、クラス又はサブクラスが親抗体のそれらから変更されている「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片を含む。
特定の事例では、キメラ抗体は、ヒト化抗体である。典型的には、非ヒト抗体は、ヒトに対する免疫原性を低減する一方で、親非ヒト抗体の特異性及び親和性は保持するようにヒト化される。一般に、ヒト化抗体は、ＨＶＲ、例えば、ＣＤＲ（又はその一部）が非ヒト抗体由来であり、かつＦＲ（又はその一部）がヒト抗体配列由来である１つ以上の可変ドメインを含む。ヒト化抗体はまた、任意に、ヒト定常領域の少なくとも一部を含む。いくつかの事例では、ヒト化抗体中のいくつかのＦＲ残基は、例えば、抗体特異性又は親和性を復元又は改善するために、非ヒト抗体（例えば、ＨＶＲ残基が由来する抗体）由来の対応する残基で置換される。
ヒト化された抗体及びその作製方法については、Ａｌｍａｇｒｏ ａｎｄ Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ．Ｂｉｏｓｃｉ．１３：１６１９－１６３３（２００８）で総説され、更に以下に記載されている：Ｒｉｅｃｈｍａｎｎら．，Ｎａｔｕｒｅ３３２：３２３－３２９（１９８８）；Ｑｕｅｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８６：１００２９－１００３３（１９８９）；米国特許第５，８２１，３３７号、同第７，５２７，７９１号、同第６，９８２，３２１号、及び同第７，０８７，４０９号；Ｋａｓｈｍｉｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６：２５－３４（２００５）（特異性決定領域（ＳＤＲ）グラフトを記載する）；Ｐａｄｌａｎ，Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２８：４８９－４９８（１９９１）（リサーフェシングを記載する）；Ｄａｌｌ’Ａｃｑｕａら，Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６：４３－６０（２００５）（「ＦＲシャッフリング」を記載；及びＯｓｂｏｕｒｎら，Ｍｅｔｈｏｄｓ３６：６１－６８（２００５）及びＫｌｉｍｋａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｒ．Ｊ．Ｃａｎｃｅｒ，８３：２５２－２６０（２０００）（ＦＲシャッフルの「ガイド付き選択アプローチを記載する）。
ヒト化のために使用され得るヒトフレームワーク領域としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：「ベストフィット」法を用いて選択されたフレームワーク領域（例えば、Ｓｉｍｓ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５１：２２９６（１９９３）を参照）；軽鎖又は重鎖可変領域の特定のサブグループのヒト抗体のコンセンサス配列に由来するフレームワーク領域（例えば、Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８９：４２８５（１９９２）；及びＰｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１５１：２６２３（１９９３）を参照）；ヒト成熟（体細胞変異）フレームワーク領域又はヒト生殖細胞フレームワーク領域（例えば、Ａｌｍａｇｒｏ ａｎｄ Ｆｒａｎｓｓｏｎ，Ｆｒｏｎｔ．Ｂｉｏｓｃｉ．１３：１６１９－１６３３（２００８）を参照されたい）；並びにＦＲライブラリのスクリーニングに由来するフレームワーク領域（例えば、Ｂａｃａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２：１０６７８－１０６８４（１９９７）及びＲｏｓｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７１：２２６１１－２２６１８（１９９６）を参照）。
４．ヒト抗体
特定の事例では、本明細書に提供される抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野で公知の様々な技法を使用して作製され得る。ヒト抗体は一般的に、ｖａｎ Ｄｉｊｋ ａｎｄ ｖａｎ ｄｅ Ｗｉｎｋｅｌ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．５：３６８－７４（２００１）及びＬｏｎｂｅｒｇ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０：４５０－４５９（２００８）に記載されている。
ヒト抗体は、抗原チャレンジに応答して、インタクトなヒト抗体又はヒト可変領域を有するインタクトな抗体を産生するように改変されたトランスジェニック動物に免疫原を投与することによって調製することができる。そのような動物は、典型的には、内因性免疫グロブリン遺伝子座に取って代わるか、又は染色体外に存在するか、又は動物の染色体にランダムに組み込まれるヒト免疫グロブリン遺伝子座の全部又は一部を含有する。そのようなトランスジェニックマウスでは、内因性免疫グロブリン遺伝子座は、一般的に不活性化されている。トランスジェニック動物からヒト抗体を得るための方法の総説については、Ｌｏｎｂｅｒｇ，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．２３：１１１７－１１２５（２００５）を参照されたい。例えば、ＸＥＮＯＭＯＵＳＥ（商標）技術について記載した米国特許第６，０７５，１８１号及び同第６，１５０，５８４号；ＨＵＭＡＢ（登録商標）技術について記載した米国特許第５，７７０，４２９号；Ｋ－Ｍ ＭＯＵＳＥ（登録商標）技術について記載した米国特許第７，０４１，８７０号；並びにＶＥＬＯＣＩＭＯＵＳＥ（登録商標）技術について記載した米国特許出願公開第２００７／００６１９００号もまた参照されたい。そのような動物によって生成されるインタクトな抗体からのヒト可変領域は、例えば、異なるヒト定常領域と組み合わせることによって更に改変されてもよい。
ヒト抗体は、ハイブリドーマに基づく方法によっても作製することができる。ヒトモノクローナル抗体を産生するためのヒト骨髄腫及びマウス－ヒト異種骨髄腫細胞株が記載されている。（例えば、Ｋｏｚｂｏｒ Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１３３：３００１（１９８４）；Ｂｒｏｄｅｕｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ｐｐ．５１－６３（Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８７）；及びＢｏｅｒｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１４７：８６（１９９１）を参照）ヒトＢ細胞ハイブリドーマ技術を介して生成されたヒト抗体もまた、Ｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１０３：３５５７－３５６２（２００６）に記載されている。更なる方法は、例えば、米国特許第７，１８９，８２６号（ハイブリドーマ細胞株由来のモノクローナルヒトＩｇＭ抗体の産生を記載する）、及びＮｉ，Ｘｉａｎｄａｉ Ｍｉａｎｙｉｘｕｅ，２６（４）：２６５－２６８（２００６）（ヒト－ヒトハイブリドーマを記載する）を含む。ヒトハイブリドーマ技術（トリオーマ技術）はまた、Ｈｉｓｔｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｈｉｓｔｏｐａｔｈｏｌｏｇｙ，２０（３）：９２７－９３７（２００５）及びＶｏｌｌｍｅｒｓ ａｎｄ Ｂｒａｎｄｌｅｉｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ａｎｄ Ｆｉｎｄｉｎｇｓ ｉｎ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ，２７（３）：１８５－９１（２００５）にも記載されている。
ヒト抗体は、ヒト由来のファージディスプレイライブラリから選択されるＦｖクローン可変ドメイン配列を単離することによっても作製され得る。その後、そのような可変ドメイン配列は、所望のヒト定常ドメインと組み合わせられ得る。抗体ライブラリからヒト抗体を選択するための技術を以下に記載する。
５．ライブラリ由来の抗体
本発明の抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、所望の１つ以上の活性を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって単離され得る。例えば、ファージディスプレイライブラリを生成し、所望の結合特性を有する抗体についてそのようなライブラリをスクリーニングするための様々な方法が当該技術分野で知られている。そのような方法については、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７８：１－３７（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，２００１）で概説し、ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３４８：５５２－５５４；Ｃｌａｃｋｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３５２：６２４－６２８（１９９１）；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２２：５８１－５９７（１９９２）；Ｍａｒｋｓ ａｎｄ Ｂｒａｄｂｕｒｙ，ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ２４８：１６１－１７５（Ｌｏ，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，２００３）；Ｓｉｄｈｕ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３８（２）：２９９－３１０（２００４）；Ｌｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３４０（５）：１０７３－１０９３（２００４）；Ｆｅｌｌｏｕｓｅ，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０１（３４）：１２４６７－１２４７２（２００４）；及びＬｅｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８４（１－２）：１１９－１３２（２００４）に更に記載されている。
特定のファージディスプレイ法では、ＶＨ及びＶＬ遺伝子のレパートリは、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）によって別個にクローニングされ、ファージライブラリ中でランダムに再結合され、次いで、Ｗｉｎｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１２：４３３－４５５（１９９４）に記載されているように抗原結合ファージのスクリーニングを行うことができる。ファージは、典型的には、抗体断片を一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）断片又はＦａｂ断片のいずれかとしてディスプレイする。免疫源からのライブラリは、ハイブリドーマを構築する必要なしに、免疫原に対する高親和性抗体を提供する。代替的に、ナイーブレパートリは、Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ，１２：７２５－７３４（１９９３）によって記載されているように、免疫化を行わずに、広範囲の非自己抗原及びまた自己抗原に対する抗体の単一の供給源を提供するために、（例えば、ヒトから）クローン化することができる。最後に、ナイーブライブラリは、幹細胞から再配列されていないＶ遺伝子セグメントをクローニングし、ランダムな配列を含むＰＣＲプライマーを使用して、非常に可変的なＣＤＲ３領域をコードし、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２２７：３８１－３８８（１９９２）に記載されているように、ｉｎ ｖｉｔｒｏで再配列を達成することによって、合成的に作製することもできる。ヒト抗体ファージライブラリについて記載する特許公報としては、例えば：米国特許第５，７５０，３７３号、並びに米国特許出願公開第２００５／００７９５７４号、同第２００５／０１１９４５５号、同第２００５／０２６６０００号、同第２００７／０１１７１２６号、同第２００７／０１６０５９８号、同第２００７／０２３７７６４号、同第２００７／０２９２９３６号、及び同第２００９／０００２３６０号が挙げられる。
ヒト抗体ライブラリから単離された抗体又は抗体断片は、本明細書ではヒト抗体又はヒト抗体断片とみなされる。
６．多重特異性抗体
上記態様のいずれか１つにおいて、本明細書において提供する抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、多重特異性抗体、例えば二重特異性抗体であり得る。多重特異性抗体は、少なくとも２つの異なる部位に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。特定の事例では、本明細書に提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば、二重特異性抗体である。二重特異性抗体は、完全長抗体又は抗体断片として調製することができる。
多重特異性抗体を作製する技術には、異なる特異性を有する２つの免疫グロブリン重鎖－軽鎖対の組換え共発現（Ｍｉｌｓｔｅｉｎ ａｎｄ Ｃｕｅｌｌｏ，Ｎａｔｕｒｅ ３０５：５３７（１９８３）、国際公開第９３／０８８２９号、及びＴｒａｕｎｅｃｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．１０：３６５５（１９９１）を参照）、及び「ノブ・イントゥ・ホール」操作（例えば、米国特許第５，７３１，１６８号を参照）が含まれるが、これらに限定されない。多重特異性抗体はまた、静電的ステアリング効果を操作して抗体Ｆｃ－ヘテロ二量体分子を作製すること（例えば、国際公開第２００９／０８９００４号Ａ１を参照）、２つ以上の抗体又は断片を架橋すること（例えば、米国特許第４，６７６，９８０号、及びＢｒｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：８１（１９８５）を参照）、ロイシンジッパを使用して二重特異性抗体を産生すること（例えば、Ｋｏｓｔｅｌｎｙ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４８（５）：１５４７－１５５３（１９９２）を参照）、二重特異性抗体断片を作製するための「ダイアボディ」技術（例えば、Ｈｏｌｌｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９０：６４４４－６４４８（１９９３）を参照）、及び一本鎖Ｆｖ（ｓＦｖ）二量体を使用すること（例えば、Ｇｒｕｂｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１５２：５３６８（１９９４）を参照、及び、例えば、Ｔｕｔｔ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１４７：６０（１９９１）に記載されるような三重特異性抗体を調製することによって作製されてもよい。
「オクトパス抗体」を含む３つ以上の機能的抗原結合部位を有する操作された抗体も、本明細書に含まれる（例えば、米国特許出願公開第２００６／００２５５７６号Ａ１を参照されたい）。
本明細書の抗体又は断片には、ＰＤ－Ｌ１並びに別の異なる抗原に結合する抗原結合部位を含む「二重作用Ｆａｂ」又は「ＤＡＦ」も含まれる。
７．抗体バリアント
特定の事例では、本明細書に提供される抗体のアミノ酸配列バリアント（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）が意図される。例えば、抗体の結合親和性及び／又は他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列バリアントは、抗体をコードするヌクレオチド配列中に適正な修飾を導入することによって、又はペプチド合成によって調製されてもよい。このような改変としては、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基からの欠失、及び／又は抗体のアミノ酸配列内の残基への挿入、及び／又は抗体のアミノ酸配列内の残基の置換が挙げられる。欠失、挿入、及び置換の任意の組み合わせにより、最終構築物に到達することができるが、但し、最終構築物が所望される特徴、例えば、抗原結合を保有することを条件とする。
Ｉ．置換、挿入、及び欠失バリアント
特定の事例では、１つ以上のアミノ酸置換を有する抗体バリアントが提供される。置換による突然変異誘発に関して目的の部位には、ＨＶＲ及びＦＲが含まれる。保存的置換は、表８において、「好ましい置換」の見出しの下に示される。より実質的な変化は、表８において、「例示的な置換」の見出しの下に提供され、またアミノ酸側鎖クラスを参照して以下に更に記載される通りである。アミノ酸置換は、目的の抗体中に導入され得、その産物は、所望の活性、例えば、保持／改善された抗原結合、減少した免疫原性、又は改善された抗体依存性細胞媒介細胞傷害（ＡＤＣＣ）若しくは補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）についてスクリーニングされ得る。
Figure 2023520515000009
アミノ酸は共通の側鎖特性に従ってグループ化することができる。
（１）疎水性：ノルロイシン、Ｍｅｔ、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ；
（２）中性親水性：Ｃｙｓ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ；
（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；
（４）塩基性：Ｈｉｓ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ；
（５）鎖配向に影響を及ぼす残基：Ｇｌｙ、Ｐｒｏ；
（６）芳香族：Ｔｒｐ、Ｔｙｒ、Ｐｈｅ。
非保存的置換は、これらのクラスの１つのメンバーを別のクラスと交換することを伴うであろう。
一種の置換バリアントは、親抗体（例えば、ヒト化抗体又はヒト抗体）の１つ以上の超可変領域残基の置換を伴う。一般に、更なる研究のために選択される得られたバリアント（複数可）は、親抗体と比べて、特定の生物学的特性（例えば、親和性の増加及び／又は免疫原性の低減）における修飾（例えば、改善）を有し、かつ／又は実質的に保持された親抗体の特定の生物学的特性を有することになる。例示的な置換型バリアントは、例えば、本明細書に記載の技術等のファージディスプレイに基づく親和性成熟技術を使用して簡便に生成され得る親和性成熟抗体である。要するに、１つ以上のＨＶＲ残基が変異され、バリアント抗体がファージにディスプレイされ、特定の生物活性（例えば、結合親和性）についてスクリーニングされる。
変更（例えば、置換）は、抗体親和性を改善するために、例えば、ＨＶＲにおいて行われてもよい。そのような改変は、ＨＶＲ「ホットスポット」、すなわち、体細胞成熟プロセス中に高頻度で突然変異を受けるコドンによってコードされる残基（例えば、Ｃｈｏｗｄｈｕｒｙ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２０７：１７９－１９６（２００８）を参照）、及び／又は抗原と接触する残基内で行われ得、結果として得られるバリアントＶＨ又はＶＬが結合親和性について試験される。二次ライブラリを構築し、それから再選択することによる親和性成熟が、例えば、Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．ｉｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ １７８：１－３７（Ｏ’Ｂｒｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄ．，Ｈｕｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｔｏｔｏｗａ，ＮＪ，（２００１））に記載されている。親和性成熟のいくつかの事例では、多様な方法（例えば、エラープローンＰＣＲ、鎖シャッフリング、又はオリゴヌクレオチド指向性突然変異誘発）のいずれかによって、成熟のために選択される可変遺伝子に多様性が導入される。次いで、二次ライブラリが作製される。その後、このライブラリがスクリーニングされて、所望の親和性を有する任意の抗体バリアントを同定する。多様性を導入するための別の方法は、いくつかのＨＶＲ残基（例えば、一度に４～６個の残基）をランダム化する、ＨＶＲ指向性アプローチを含む。抗原結合に関与するＨＶＲ残基は、例えば、アラニンスキャニング変異誘発又はモデリングを使用して、特異的に同定され得る。特にＣＤＲ－Ｈ３及びＣＤＲ－Ｌ３が標的とされることが多い。
特定の事例では、置換、挿入、又は欠失は、そのような改変が抗体の抗原に結合する能力を実質的に低減させない限り、１つ以上のＨＶＲ内で生じ得る。例えば、結合親和性を実質的に低下させない保存的改変（例えば、本明細書に提供される保存的置換）が、ＨＶＲ中で行われてよい。このような改変は、例えば、ＨＶＲ内の抗原接触残基の外側であってもよい。上述のバリアントＶＨ及びＶＬ配列の特定の事例では、各ＨＶＲは、改変されていないか、又は１つ、２つ、又は３つ以下のアミノ酸置換を有するかのいずれかである。
変異導入の標的となり得る抗体の残基又は領域を同定するための有用な方法は、Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍ ａｎｄ Ｗｅｌｌｓ（１９８９）Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４４：１０８１－１０８５に記載されているように「アラニンスキャニング変異導入」と呼ばれる。この方法では、抗体と抗原との相互作用が影響を受けるかどうかを決定するために、残基又は標的残基群（例えば、荷電残基、例えば、Ａｒｇ、Ａｓｐ、Ｈｉｓ、Ｌｙｓ及びＧｌｕ）が同定され、中性又は負に荷電したアミノ酸（例えば、アラニン又はポリアラニン）によって置き換えられる。更なる置換が、初期置換に対する機能的感受性を示すアミノ酸位置に導入されてもよい。あるいは、又は加えて、抗体と抗原との間の接点を同定するための抗原－抗体複合体の結晶構造。そのような接触残基及び隣接残基は、置換の候補として標的とされるか又は除去されてもよい。バリアントを、所望の特性を有するか否かを決定するためにスクリーニングしてもよい。
アミノ酸配列挿入には、１個の残基から１００個以上の残基を含むポリペプチドまでの長さの範囲のアミノ末端及び／又はカルボキシル末端融合、並びに１個又は複数のアミノ酸残基の配列内挿入が含まれる。末端挿入の例には、Ｎ末端メチオニル残基を有する抗体が含まれる。抗体分子の他の挿入バリアントとしては、抗体の血清半減期を増加させる酵素（例えば、ＡＤＥＰＴのための）又はポリペプチドへの抗体のＮ末端又はＣ末端の融合が挙げられる。
ＩＩ．グリコシル化バリアント
特定の事例では、本明細書に提供される抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）は、その抗体がグリコシル化される程度を増加又は減少させるように変更され得る。抗体へのグリコシル化部位の付加又は欠失は、１つ以上のグリコシル化部位が作り出されるか、又は除去されるようにアミノ酸配列を改変させることにより好都合に達成され得る。
抗体がＦｃ領域を含む場合、それに付着した炭水化物が改変され得る。哺乳動物細胞によって産生された天然型抗体は、典型的には、Ｎ結合によってＦｃ領域のＣＨ２ドメインのＡｓｎ２９７に一般に付着される分岐状の二分岐オリゴ糖を含む。例えば、Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．ＴＩＢＴＥＣＨ１５：２６－３２（１９９７）を参照されたい。オリゴ糖には、様々な炭水化物、例えば、マンノース、Ｎ－アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）、ガラクトース、及びシアル酸、並びに二分岐オリゴ糖構造の「幹」のＧｌｃＮＡｃに付着したフコースが含まれ得る。いくつかの事例では、特定の特性が改善された抗体バリアントを作製するために、本発明の抗体中におけるオリゴ糖の修飾が行われ得る。
１つの事例では、Ｆｃ領域に結合した（直接的に又は間接的に）フコースを欠く炭水化物構造を有する抗体バリアントが提供される。例えば、そのような抗体内のフコースの量は、１％～８０％、１％～６５％、５％～６５％又は２０％～４０％であり得る。フコースの量は、例えば、国際公開第２００８／０７７５４６号に記載されているように、ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ質量分析法によって測定されたように、Ａｓｎ２９７（例えば、複合体構造、ハイブリッド構造、及び高マンノース構造）に付着した全ての糖鎖構造の合計に対するＡｓｎ２９７における糖鎖内のフコースの平均量を計算することによって決定される。Ａｓｎ２９７は、Ｆｃ領域の約２９７位に位置するアスパラギン残基を指す（Ｆｃ領域残基のＥＵナンバリング）；ただし、Ａｓｎ２９７はまた、抗体のマイナーな配列変化のために、位置２９７の上流又は下流、すなわち位置２９４と３００の間の約±３個のアミノ酸に位置していてもよい。このようなフコシル化バリアントは、ＡＤＣＣの機能を改善している可能性がある。例えば、米国特許出願公開第２００３／０１５７１０８号及び同第２００４／００９３６２１号を参照されたい。「脱フコシル化」又は「フコース欠乏」抗体バリアントに関する刊行物の例としては：米国特許出願公開第２００３／０１５７１０８号；国際公開第２０００／６１７３９号；同第２００１／２９２４６号；米国特許出願公開第２００３／０１１５６１４号；同第２００２／０１６４３２８号；同第２００４／００９３６２１号；同第２００４／０１３２１４０号；同第２００４／０１１０７０４号；同第２００４／０１１０２８２号；同第２００４／０１０９８６５号；国際公開第２００３／０８５１１９号；同第２００３／０８４５７０号；同第２００５／０３５５８６号；同第２００５／０３５７７８号；同第２００５／０５３７４２号；同第２００２／０３１１４０号；Ｏｋａｚａｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３３６：１２３９－１２４９（２００４）；Ｙａｍａｎｅ－Ｏｈｎｕｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．Ｂｉｏｅｎｇ．８７：６１４（２００４）が挙げられる。脱フコシル化抗体を生成可能な細胞株の例としては、タンパク質フコシル化で欠失したＬｅｃ１３ ＣＨＯ細胞（Ｒｉｐｋａ ｅｔ ａｌ．Ａｒｃｈ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．２４９：５３３－５４５（１９８６）；米国特許出願公開第２００３／０１５７１０８Ａ１号；及び国際公開第２００４／０５６３１２Ａ１号，Ａｄａｍｓら、特に実施例１１）、並びにα－１，６－フコシルトランスフェラーゼ遺伝子、ＦＵＴ８、ノックアウトＣＨＯ細胞等のノックアウト細胞株（例えば、Ｙａｍａｎｅ－Ｏｈｎｕｋｉ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．Ｂｉｏｅｎｇ．８７：６１４（２００４）；Ｋａｎｄａ，Ｙ．ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｂｉｏｅｎｇ．，９４（４）：６８０－６８８（２００６；及び国際公開第２００３／０８５１０７号）が挙げられる。
二分されたオリゴ糖を有する抗体バリアントが更に提供され、該抗体バリアントでは、例えば、抗体のＦｃ領域に結合した二分岐オリゴ糖が、ＧｌｃＮＡｃによって二分されている。そのような抗体バリアントは、低減されたフコシル化及び／又は改善されたＡＤＣＣ機能を有し得る。このような抗体バリアントの例は、例えば、国際公開第２００３／０１１８７８号、米国特許第６，６０２，６８４号、及び米国特許出願公開第２００５／０１２３５４６号に記載されている。Ｆｃ領域に付着したオリゴ糖の少なくとも１つのガラクトース残基を有する抗体バリアントも提供される。そのような抗体バリアントは、改善されたＣＤＣ機能を有し得る。このような抗体バリアントは、例えば、国際公開第１９９７／３００８７号、同第１９９８／５８９６４号、及び同第１９９９／２２７６４号に記載されている。
ＩＩＩ．Ｆｃ領域バリアント
特定の事例では、１つ以上のアミノ酸修飾を、本明細書に提供される抗体のＦｃ領域に導入することができ（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）、それにより、Ｆｃ領域バリアントが生成される。Ｆｃ領域バリアントは、１つ以上のアミノ酸位置にアミノ酸修飾（例えば、置換）を含むヒトＦｃ領域配列（例えば、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、又はＩｇＧ４ Ｆｃ領域）を含み得る。
特定の事例では、本開示は、全てではないが一部のエフェクター機能を有し、それによりｉｎ ｖｉｖｏでの抗体の半減期が重要であるが、特定のエフェクター機能（例えば、補体及びＡＤＣＣ等）が不要又は有害である用途にとって望ましい候補となる、抗体バリアントを企図する。ＣＤＣ及び／又はＡＤＣＣ活性の低下／消失を確認するために、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及び／又はｉｎ ｖｉｖｏの細胞毒性アッセイを実施することができる。例えば、Ｆｃ受容体（ＦｃＲ）結合アッセイを行って、抗体がＦｃγＲ結合を欠く（したがって、ＡＤＣＣ活性を欠く可能性がある）が、ＦｃＲｎ結合能力を保持していることを確実にすることができる。ＡＤＣＣの媒介のための主要な細胞であるＮＫ細胞がＦｃγＲＩＩＩのみを発現する一方で、単球は、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩを発現する。造血細胞でのＦｃＲ発現は、Ｒａｖｅｔｃｈ ａｎｄ Ｋｉｎｅｔ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：４５７－４９２（１９９１）の４６４頁、表３に要約されている。対象の分子のＡＤＣＣ活性を評定するためのｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイの非限定的例は、米国特許第５，５００，３６２号（例えば、Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍ，Ｉ．ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８３：７０５９－７０６３（１９８６）を参照）、及びＨｅｌｌｓｔｒｏｍ，Ｉ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８２：１４９９－１５０２（１９８５）；米国特許第５，８２１，３３７号（Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ，Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６６：１３５１－１３６１（１９８７）を参照）に記載されている。あるいは、非放射性アッセイ法が用いられ得る（例えば、フローサイトメトリーのためのＡＣＴＩ（商標）非放射性細胞傷害性アッセイ（ＣｅｌｌＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．Ｍｏｕｎｔａｉｎ Ｖｉｅｗ，ＣＡ；及びＣＹＴＯＴＯＸ ９６（登録商標）非放射性細胞毒性アッセイ（Ｐｒｏｍｅｇａ，Ｍａｄｉｓｏｎ，ＷＩ）を参照））。そのようなアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及びナチュラルキラー（ＮＫ）細胞が挙げられる。あるいは、又は更に、対象の分子のＡＤＣＣ活性は、例えば、Ｃｌｙｎｅｓ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９５：６５２－６５６（１９９８）に開示されているように、動物モデルにおいて ｉｎ ｖｉｖｏで評定することができる。また、抗体がＣ１ｑに結合することができず、ＣＤＣ活性を欠いていることを確認するために、Ｃ１ｑ結合アッセイを実施してもよい。例えば、国際公開第２００６／０２９８７９号及び国際公開第２００５／１００４０２号における、Ｃ１ｑ及びＣ３ｃ結合ＥＬＩＳＡを参照されたい。補体活性化を評定するために、ＣＤＣアッセイを実施してもよい（例えば、Ｇａｚｚａｎｏ－Ｓａｎｔｏｒｏ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０２：１６３（１９９６）；Ｃｒａｇｇ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ．１０１：１０４５－１０５２（２００３）；及びＣｒａｇｇ ｅｔ ａｌ．，Ｂｌｏｏｄ．１０３：２７３８－２７４３（２００４）を参照）。ＦｃＲｎ結合及びｉｎ ｖｉｖｏ クリアランス／半減期決定も、当該技術分野で既知の方法を使用して行われ得る（例えば、Ｐｅｔｋｏｖａ ｅｔ ａｌ．Ｉｎｔ’ｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８（１２）：１７５９－１７６９（２００６）を参照）。
エフェクター機能が低下した抗体には、Ｆｃ領域残基２３８、２６５、２６９、２７０、２９７、３２７及び３２９の１つ以上が置換されたものが含まれる（米国特許第６，７３７，０５６号及び同第８，２１９，１４９号）。そのようなＦｃ変異体としては、アミノ酸位置２６５、２６９、２７０、２９７及び３２７の２つ以上が置換されたＦｃ変異体が挙げられ、残基２６５及び２９７をアラニンに置換した、いわゆる「ＤＡＮＡ」Ｆｃ変異体（米国特許第７，３３２，５８１号及び同第８，２１９，１４９号）を含む。
ＦｃＲへの結合が改善又は減少した特定の抗体バリアントが記載される。（例えば、米国特許第６，７３７，０５６号；国際公開第２００４／０５６３１２号，及びＳｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．９（２）：６５９１－６６０４（２００１）を参照されたい。）
特定の事例では、抗体バリアントは、ＡＤＣＣを改善する１つ以上のアミノ酸置換、例えば、Ｆｃ領域の２９８、３３３、及び／又は３３４位（残基のＥＵナンバリング）での置換を有するＦｃ領域を含む。
いくつかの事例では、例えば米国特許第６，１９４，５５１号、国際公開第９９／５１６４２号、及びＩｄｕｓｏｇｉｅ ｅｔ ａｌ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６４：４１７８－４１８４（２０００）に記載されているように、Ｃ１ｑ結合及び／又は補体依存性細胞傷害（ＣＤＣ）の変化（すなわち向上又は低下のいずれか）をもたらすＦｃ領域内で変化が起こる。
半減期が増加し、母体ＩｇＧを胎児に移入する役割を果たす新生児型Ｆｃ受容体（ＦｃＲｎ）（Ｇｕｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１１７：５８７（１９７６）及びＫｉｍ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２４：２４９（１９９４））への結合が向上した抗体が、米国特許出願公開第２００５／００１４９３４号Ａ１（Ｈｉｎｔｏｎ ｅｔ ａｌ．）に記載されている。それらの抗体は、Ｆｃ領域とＦｃＲｎとの結合を改善する１つ以上の置換をその中に有するＦｃ領域を含む。このようなＦｃバリアントとしては、Ｆｃ領域残基：２３８、２５６、２６５、２７２、２８６、３０３、３０５、３０７、３１１、３１２、３１７、３４０、３５６、３６０、３６２、３７６、３７８、３８０、３８２、４１３、４２４又は４３４のうちの１つ以上での置換、例えば、Ｆｃ領域残基４３４の置換を有するバリアントを含む（米国特許第７，３７１，８２６号）。
Ｆｃ領域のバリアントの他の例に関して、Ｄｕｎｃａｎ＆Ｗｉｎｔｅｒ，Ｎａｔｕｒｅ ３２２：７３８－４０（１９８８）；米国特許第５，６４８，２６０号；米国特許第５，６２４，８２１号；及び国際公開第９４／２９３５１号も参照されたい。
ＩＶ．システイン操作抗体バリアント
特定の事例では、システイン改変抗体、例えば抗体の１つ以上の残基がシステイン残基により置換されている「ｔｈｉｏＭＡｂ」を作製するのが望ましい場合がある。特定の事例では、置換された残基は、抗体の利用しやすい部位で生じる。これらの残基をシステインで置換することによって、反応性チオール基が抗体の接近可能部位に配置され、それは、本明細書で更に説明するように、例えば薬物部分又はリンカー－薬物部分等の他の部分に抗体をコンジュゲートさせて免疫コンジュゲートを作製するために使用され得る。特定の事例では、以下の残基のうちの任意の１つ以上を、システインで置換することができる：軽鎖のＶ２０５（Ｋａｂａｔナンバリング）、重鎖のＡ１１８（ＥＵナンバリング）、及び重鎖Ｆｃ領域のＳ４００（ＥＵナンバリング）。システイン操作抗体は、例えば、米国特許第７，５２１，５４１号に記載されるように生成され得る。
Ｖ．抗体誘導体
特定の事例では、本明細書に提供される抗体は、当該技術分野で既知であり、容易に入手可能な追加の非タンパク質性部分を含有するように更に修飾され得る。抗体の誘導体化に適した部位としては、水溶性ポリマーが挙げられるが、これらに限定されるものではない。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、限定されないが、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、エチレングリコール／プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ－１，３－ジオキソラン、ポリ－１，３，６－トリオキサン、エチレン／無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸（ホモポリマー又はランダムコポリマーのいずれか）、及びデキストラン又はポリ（ｎ－ビニルピロリドン）ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコールホモポリマー、ポリプロピレンオキシド／エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール（例えば、グリセロール）、ポリビニルアルコール、及びこれらの混合物が挙げられる。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中でのその安定性のため、製造時に有利であり得る。ポリマーは、任意の分子量であってもよく、分岐していても、分岐していなくてもよい。抗体に付着するポリマーの数は変化し得て、１つを超えるポリマーが付着する場合、ポリマーは、同じ分子であってもよく、又は異なる分子であってもよい。一般に、誘導体化のために使用されるポリマーの数及び／又は種類は、限定するものではないが、改良される抗体の特定の特性又は機能、抗体誘導体が定義される条件下で治療に使用されるかどうか等を含む考慮事項に基づいて決定することができる。
別の例では、放射線への曝露によって選択的に加熱され得る抗体及び非タンパク質性部分のコンジュゲートが提供される。一例では、非タンパク質性部分はカーボンナノチューブである（Ｋａｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０２：１１６００－１１６０５（２００５））。放射線は、任意の波長であってもよく、通常の細胞に害を与えないが、抗体非保護性部位に近位の細胞が死滅する温度まで非保護性部位を加熱する波長を含むが、これらに限定されない。
ＶＩ．免疫コンジュゲート
本発明はまた、化学療法剤若しくは薬物、増殖阻害剤、毒素（例えば、タンパク質毒素、細菌、真菌、植物若しくは動物起源の酵素的に活性な毒素、又はその断片）、又は放射性同位元素等の１つ以上の細胞傷害剤にコンジュゲートされた本明細書で提供される抗体（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体、抗ＰＤ－１抗体、抗ＶＥＧＦ抗体、抗ＩＬ８抗体、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は抗ＩＬ１Ｒ抗体）を含む免疫コンジュゲートを提供する。
１つの事例では、イムノコンジュゲートは抗体－薬物コンジュゲート（ＡＤＣ）であり、抗体が、これらに限定されるわけではないが、マイタンシノイド（米国特許第５，２０８，０２０号、同第５，４１６，０６４号、及び欧州特許第０４２５２３５Ｂ１号を参照）；モノメチルオーリスタチン薬剤部分ＤＥ及びＤＦ（ＭＭＡＥ及びＭＭＡＦ）等のオーリスタチン（米国特許第５，６３５，４８３号、同第５，７８０，５８８号、及び同第７，４９８，２９８号を参照）；ドラスタチン；カリケアマイシン又はその誘導体（米国特許第５，７１２，３７４号、同第５，７１４，５８６号、同第５，７３９，１１６号、同第５，７６７，２８５号、同第５，７７０，７０１号、同第５，７７０，７１０号、同第５，７７３，００１号、及び同第５，８７７，２９６号；Ｈｉｎｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５３：３３３６－３３４２（１９９３）；ならびＬｏｄｅ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５８：２９２５－２９２８（１９９８）を参照）；ダウノマイシン及びドキソルビシン等のアントラサイクリン（例えばＫｒａｔｚ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．１３：４７７－５２３（２００６）；Ｊｅｆｆｒｅｙ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔｅｒｓ １６：３５８－３６２（２００６）；Ｔｏｒｇｏｖ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｏｎｊ．Ｃｈｅｍ．１６：７１７－７２１（２００５）；Ｎａｇｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９７：８２９－８３４（２０００）；Ｄｕｂｏｗｃｈｉｋ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔｅｒｓ １２：１５２９－１５３２（２００２）；Ｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．４５：４３３６－４３４３（２００２）；及び米国特許第６，６３０，５７９号を参照）；メトトレキサート；ビンデシン；ドセタキセル、パクリタキセル、ラロタキセル、テセタキセル、及びオルタタキセル等のタキサン；トリコテセン；並びにＣＣ１０６５を含む１つ以上の薬剤に結合している。
別の事例では、イムノコンジュゲートは、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合活性断片、外毒素Ａ鎖（シュードモナス・エルギノーザ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）由来）、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、アルファ－サルシン、アレウリテス・フォーディ（Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉ）タンパク質、ジアンシンタンパク質、フィトラカ・アメリカーナ（Ｐｈｙｔｏｌａｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａ）タンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ、及びＰＡＰ－Ｓ）、モモルディカ・チャランチア（Ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａ）阻害剤、クルシン、クロチン、サポナリア・オフィシナリス（Ｓａｐｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ）阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン、及びトリコテセンを含むがこれらに限定されない酵素活性毒素又はその断片にコンジュゲートされた、本明細書に記載される抗体を含む。
別の事例では、免疫コンジュゲートは、放射性原子に複合され、放射性コンジュゲートを形成する、本明細書に記載される抗体を含む。放射性コンジュゲートの生成には、様々な放射性同位体が利用可能である。例としては、Ａｔ２１１、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｂｉ２１２、Ｐ３２、Ｐｂ２１２、及びＬｕの放射性同位元素が挙げられる。放射性物質が検出のために使用される場合、それは、シンチグラフィ研究のための放射性原子、例えばｔｃ９９ｍ又はＩ１２３、又は核磁気共鳴（ｎｕｃｌｅａｒ ｍａｇｎｅｔｉｃ ｒｅｓｏｎａｎｃｅ：ＮＭＲ）イメージング（別名、磁気共鳴イメージング、ＭＲＩ）のためのスピンラベル、例えば再びヨウ素１２３、ヨウ素１３１、インジウム１１１、フッ素１９、炭素１３、窒素１５、酸素１７、ガドリニウム、マンガン又は鉄を含んでいてもよい。
抗体と細胞毒性剤とのコンジュゲートは、例えば、各種の二官能性タンパク質カップリング剤を用いて作製することができる：Ｎ－スクシンイミジル－３－（２－ピリジルジチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）、スクシンイミジル－４－（Ｎ－マレイミドメチル）シクロヘキサン－１－カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの二官能性誘導体（ジメチルアジピミデートＨＣｌ等）、活性エステル（スベリン酸ジスクシンイミジル等）、アルデヒド（グルタルアルデヒド等）、ビスアジド化合物（ビス（ｐ－アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン等）、ビス－ジアゾニウム誘導体（ビス－（ｐ－ジアゾニウムベンゾイル）－エチレンジアミン等）、ジイソシアネート（トルエン２，６－ジイソシアネート等）、及び二活性フッ素化合物（１，５－ジフルオロ－２，４－ジニトロベンゼン等）。例えば、Ｖｉｔｅｔｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３８：１０９８（１９８７）に記載されているように、リシン免疫トキシンを調製することができる。炭素１４標識１－イソチオシアナトベンジル－３－メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸（ＭＸ－ＤＴＰＡ）は、抗体にラジヌクレオチドを共役させるための例示的なキレート剤である。国際公開第９４／１１０２６号を参照されたい。リンカーは、細胞内での細胞傷害性薬物の放出を促進する「開裂性リンカー」であってもよい。例えば、酸に不安定なリンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、感光性リンカー、ジメチルリンカー、又はジスルフィド含有リンカー（Ｃｈａｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５２：１２７－１３１（１９９２）；米国特許第５，２０８，０２０号）を使用してもよい。
本明細書における免疫コンジュゲート又はＡＤＣは明確に、ＢＭＰＳ、ＥＭＣＳ、ＧＭＢＳ、ＨＢＶＳ、ＬＣ－ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＭＰＢＨ、ＳＢＡＰ、ＳＩＡ、ＳＩＡＢ、ＳＭＣＣ、ＳＭＰＢ、ＳＭＰＨ、スルホＥＭＣＳ、スルホＧＭＢＳ、スルホＫＭＵＳ、スルホＭＢＳ、スルホＳＩＡＢ、スルホＳＭＣＣ、スルホＳＭＰＢ、及び市販の（例えばＰｉｅｒｃｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ．，Ｕ．Ｓ．Ａから）ＳＶＳＢ（サクシニミジル－（４－ビニルスルホン）ベンゾエート）を含む架橋剤により調製したコンジュゲートを企図するが、これらに限定されない。
Ｄ．医薬製剤
本明細書で提供される治療剤（複数可）（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体（例えば、アテゾリズマブ）又は抗ＰＤ－１抗体）、ＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ８アンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト、又は任意の他の抗がん治療剤）の治療製剤は、所望の純度を有する治療剤（複数可）を、凍結乾燥製剤又は水溶液の形態の任意の薬学的に許容され得る担体、賦形剤、又は安定剤と混合することによって、貯蔵用に調製される。製剤に関する一般的な情報については、例えば、Ｇｉｌｍａｎ ｅｔ ａｌ．（ｅｄｓ．）Ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ Ｂａｓｅｓ ｏｆ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，８ｔｈ Ｅｄ．，Ｐｅｒｇａｍｏｎ Ｐｒｅｓｓ，１９９０；Ａ．Ｇｅｎｎａｒｏ（ｅｄ．），Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａ，１９９０；Ａｖｉｓ ｅｔ ａｌ．（ｅｄｓ．）Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ：Ｐａｒｅｎｔｅｒａｌ Ｍｅｄｉｃａｔｉｏｎｓ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９３；Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．（ｅｄｓ．）Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ：Ｔａｂｌｅｔｓ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９０；Ｌｉｅｂｅｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．（ｅｄｓ．），Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ：Ｄｉｓｐｅｒｓｅ Ｓｙｓｔｅｍｓ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９０；及びＷａｌｔｅｒｓ（ｅｄ．）Ｄｅｒｍａｔｏｌｏｇｉｃａｌ ａｎｄ Ｔｒａｎｓｄｅｒｍａｌ Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎｓ（Ｄｒｕｇｓ ａｎｄ ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ），Ｖｏｌ １１９，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，２００２を参照されたい。
許容され得る担体、賦形剤、又は安定剤は、レシピエントに対し、用いられる投薬量及び濃度で非毒性であり、これらには、リン酸、クエン酸、及び他の有機酸等の緩衝剤、アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤、防腐剤（オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド、ヘキサメトニウムクロリド、ベンザルコニウムクロリド、ベンゼトニウムクロリド、フェノール、ブチル、若しくはベンジルアルコール、メチル若しくはプロピルパラベン等のアルキルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、３－ペンタノール、及びｍ－クレゾール等）、低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド、タンパク質（血清アルブミン、ゼラチン、若しくは免疫グロブリン等）、ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー、アミノ酸（グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、又はリジン等）、単糖、二糖、及び他の炭水化物（グルコース、マンノース、又はデキストリンを含む）、ＥＤＴＡ等のキレート剤、糖（スクロース、マンニトール、トレハロース、又はソルビトール等）、ナトリウム等の塩形成対イオン、金属錯体（例えば、Ｚｎ－タンパク質錯体）、並びに／又は非イオン性界面活性剤（ＴＷＥＥＮ（商標）、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳ（商標）、若しくはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）等）が挙げられる。
本明細書の製剤はまた、２つ以上の活性化合物、好ましくは、互いに悪影響を及ぼさない相補的活性を有するものも含有し得る。かかる医薬品の型及び有効量は、例えば製剤中に存在するアンタゴニストの量及び型、並びに対象の臨床的パラメータに依存する。
活性成分はまた、例えばコアセルベーション技法又は界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えばそれぞれヒドロキシメチルセルロース若しくはゼラチン－マイクロカプセル及びポリ－（メチルメタチレート）マイクロカプセル中に、コロイド薬物送達系（例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロ乳濁液、ナノ粒子、及びナノカプセル）中に、又はマクロ乳濁液中に取り込まれても良い。そのような技術が、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０）に開示されている。
徐放性調製物を調製してもよい。徐放性製剤の適切な例としては、アンタゴニストを含有する固体の疎水性ポリマーの半透過性マトリクスが挙げられ、該マトリクスは、成型品、例えば、フィルム又はマイクロカプセルの形態にある。徐放性マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ（２－ヒドロキシエチル－メタクリレート）、又はポリ（ビニルアルコール））、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号）、Ｌ－グルタミン酸とγ－Ｌ－グルタミン酸エチルとのコポリマー、非分解性エチレン酢酸ビニル、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴ（商標）等の分解性の乳酸－グリコール酸コポリマー（乳酸－グリコール酸コポリマー及び酢酸ロイプロリドから構成される注射用ミクロスフェア）、並びにポリ－Ｄ－（－）－３－ヒドロキシ酪酸が挙げられる。
ｉｎ ｖｉｖｏ投与のために使用される製剤は、無菌でなければならない。これは、滅菌濾過膜による濾過によって容易に達成される。
上記の製品のうちのいずれも、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの代わりに又はそれに加えて本明細書に記載される免疫コンジュゲートを含み得ることを理解されたい。
Ｖ．キット及び製品
疾患又は障害（例えば、がん（ＵＣ及びＲＣＣを含む））を有する個体由来の試料中のバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の存在を決定するための１つ以上の試薬を備えるキットが本明細書で提供される。いくつかの事例では、試料中にバイオマーカーが存在しないこと、又は基準レベルと比較してバイオマーカーの発現レベルが低下していることは、疾患を有する個体をＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストで治療した場合の有効性の可能性がより高いことを示す。いくつかの事例では、試料中のバイオマーカーの存在、又は基準レベルと比較したバイオマーカーの発現レベルの上昇は、個体をＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法で治療した場合の有効性の可能性が低いことを示す。任意に、キットは、疾患又は障害（例えば、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ）））を治療するための医薬（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）若しくはＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の若しくはＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法）を選択するためにキットを使用するための説明書を更に備え得る。
本明細書では、薬学的に許容され得る担体中のＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストがバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現に基づいて疾患又は障害（例えば、がん）を有する患者を治療するためのものであることを示す添付文書とを含む、一緒に包装された製品も提供される。また、本明細書では、薬学的に許容され得る担体中のＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法と、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えた抗がん療法がバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現に基づいて疾患又は障害（例えば、がん）を有する患者を治療するためのものであることを示す添付文書とを含む、一緒に包装された製品も提供される。治療方法には、本明細書に開示される治療方法のいずれかが含まれる。本開示はまた、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む医薬組成物、又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の若しくはＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて抗がん療法を含む医薬組成物と、医薬組成物がバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えば、ＩＬ８）の発現に基づいて疾患又は障害を有する患者を治療するためのものであることを示す添付文書とをパッケージ中で組み合わせることを含む、製品を製造する方法に関する。
製品は、例えば、容器、及び容器上の又は容器に関連するラベル又は添付文書を含んでもよい。適切な容器には、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ等が含まれる。容器は、ガラス又はプラスチック等の様々な材料から形成され得る。容器は、がんの医薬品を活性薬剤として含む組成物を保持又は収容し、滅菌アクセスポートを有し得る（例えば、容器は、皮下注射針によって穿刺可能なストッパーを有する静脈用溶液袋又はバイアルであり得る）。
製品は、注射用静菌水（ＢＷＦＩ）、リン酸干渉食塩水、リンガー溶液、及び／又はデキストロース溶液等の薬学的に許容され得る希釈緩衝液を含む第２の容器を更に含んでもよい。製品は、他の緩衝液、希釈剤、フィルタ、針、及びシリンジを含む、商業的観点及び使用者の観点から望ましい他の材料を更に含んでもよい。
本発明のキット又は製品はまた、組成物が本明細書のバイオマーカー（例えば、本明細書に記載されるバイオマーカー、例えば、表１～７のいずれか１つに示される１つ以上の遺伝子、例えばＩＬ８）の発現レベルに基づいてがんを治療するために使用されることを示す情報を、例えば添付文書の形態で含む。添付文書又はラベルは、紙面、又は電子媒体上、例えば、磁気記録媒体（例えば、フロッピーディスク）、ＣＤ－ＲＯＭ、汎用シリアルバス（ＵＳＢ）フラッシュドライブ、及び同様のもの等の任意の形態をとってもよい。ラベル又は添付文書はまた、キット又は製品中の薬学的組成物及び投与剤形に関する他の情報も含み得る。
一例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療から利益を得ることができるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定するためのキットであって、該キットは、（ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがんを有する個体を同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の態様では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定するためのキットであって、該キットは、（ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定し、それにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療から利益を得ることができるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定するためのキットであって、該キットは、（ａ）表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがんを有する個体を同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
更に別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定するためのキットであって、該キットは、（ａ）表２～４のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定し、それにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
更なる例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））を含む抗がん療法による治療から利益を得ることができるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定するためのキットであって、該キットは、（ａ）表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いがんを有する個体を同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の例では、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができるがん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を同定するためのキットであって、該キットは、（ａ）表５～７のいずれか１つに記載の１つ以上の遺伝子の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いがんを有する個体を同定し、それにより、個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えた抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用することに関する説明書を備える。
別の態様では、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するためのキットであって、該キットは、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））と、任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法に応答する可能性があると同定されたがんを有する個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを投与するための説明書を備える。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、がん（例えば、膀胱がん（例えば、ＵＣ）又は腎臓がん（例えば、ＲＣＣ））を有する個体を治療するためのキットであって、該キットは、（ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト（例えば、アテゾリズマブ等の抗ＰＤ－Ｌ１抗体）又はＰＤ－１結合アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体））以外の又はそれに加えた抗がん療法；及び任意に、（ｂ）本明細書に提供される方法のいずれか１つに従ってＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法に応答する可能性が低いと同定されたがんを有する個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を投与するための説明書を備える。
以下の実施例は、本明細書で特許請求される発明を例示するために提供されるのであって、限定するものではない。
実施例１：全身性及び腫瘍関連ＩＬ８は、ＰＤ－Ｌ１チェックポイント阻害に対する臨床的有用性の欠如と相関する
ＣＸＣＬ８としても公知のインターロイキン８（ＩＬ８）は、好中球及び骨髄性白血球の化学誘引因子として作用し、好中球の脱顆粒を誘導する炎症誘発性多機能システイン－Ｘ－システイン（ＣＸＣ）ケモカインである。ＩＬ８及びチェックポイント阻害に対する臨床転帰（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療）との関連は、無作為化試験において包括的に評価されていない。更に、免疫チェックポイント阻害剤に対する耐性に影響を及ぼすＩＬ８の供給源及び根底にある生物学は依然として不明である。この研究では、転移性尿路上皮癌腫（ｍＵＣ）及び転移性腎細胞癌腫（ｍＲＣＣ）を有する１５８１人の患者を代表する複数の無作為化治験から、アテゾリズマブ（抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体（ｍＡｂ））で治療された患者の血漿中の循環ＩＬ８タンパク質及び末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）及び腫瘍中のＩＬ８遺伝子発現を含むＩＬ８発現を分析した。
Ａ．結果
本発明者らは、ｍＵＣ及びｍＲＣＣにおけるＰＤ－Ｌ１ブロッキングモノクローナル抗体アテゾリズマブの臨床活性を評価した大規模臨床研究において、血漿、ＰＢＭＣ及び腫瘍内ＩＬ８発現と臨床転帰との関連を調査した（図１）。ＩＭｖｉｇｏｒ２１０（ＮＣＴ０２１０８６５２）は、２つのコホート：事前の白金ベースの化学療法後に疾患が進行した局所進行性又は転移性尿路上皮癌腫を有するコホート２の登録患者（ｎ＝２５４）と、一方、転移状況において治療歴のない、シスプラチン不適格であると考えられるコホート１（ｎ＝９１）の登録患者とを含むｍＵＣにおける単群第ＩＩ相研究であった。ＩＭｖｉｇｏｒ２１１は、事前の白金治療患者を化学療法（タキサン又はビンフルニン）又はアテゾリズマブのいずれかで治療した無作為化第３相ｍＵＣ試験（ＮＣＴ０２３０２８０７）（ｎ＝１０６８）であった。ＩＭｍｏｔｉｏｎ１５０（ＮＣＴ０１９８４２４２）は、無作為化された第ＩＩ相試験であり、未治療のｍＲＣＣ患者（ｎ＝２４８）において、抗血管新生標準治療チロシンキナーゼ阻害剤（ＴＫＩ）であるスニチニブに対するベバシズマブ（抗ＶＥＧＦ ｍＡｂ）を伴う又は伴わないアテゾリズマブの臨床活性を調査した。高レベル及び低レベルの血漿ＩＬ８の群間のバイオマーカー評価可能患者の人口統計学及びベースライン特性を図２及び３に示す。本発明者らは、臨床転帰との関連について多変量解析を行い、米国東海岸がん臨床試験グループ（ＥＣＯＧ）のパフォーマンスステータス、肝転移の存在、及びｍＵＣの腫瘍量（最長直径の合計、ＳＬＤ）；並びにメモリアル・スローン・ケタリングがんリスク（ＭＳＫＣＣ）予後リスクスコア、以前の腎摘出術、及びｍＲＣＣデータセットにおけるＳＬＤについて調整した。
高いベースライン血漿ＩＬ８（カットオフ中央値）は、ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０コホート２において、より悪い全生存期間（ＯＳ）（ハザード比（ＨＲ）＝１．９０、９５％ＣＩ：１．３１、２．７４、Ｐ＜０．０００１）及び客観的奏効率（ＯＲＲ）（図４Ａ及び４Ｂ）と有意に関連していた。高血漿ＩＬ８は、多変量解析（ＭＶＡ）時に不良ＯＳと有意に関連したままであり、血漿ＩＬ８と不良ＯＳとの関連は臨床的予後因子とは無関係であることを示唆している。コホート２と同様に、ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０コホート１のｍＵＣ患者では、高血漿ＩＬ８とより悪いＯＳ及びＯＲＲとの関連も観察された（図５Ａ及び５Ｂ）。
血漿ＩＬ８は、好中球対リンパ球比（ＮＬＲ）と中程度の相関を有していた（図６Ａ及び６Ｂ）。血漿ＩＬ８は、腫瘍Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）遺伝子発現（Ｔｅｆｆシグネチャは、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ、及びＰＲＦ１を含んでいた）又は腫瘍遺伝子変異量等の腫瘍免疫の存在が高いマーカーと相関しなかった（図７Ａ及び７Ｂ）。予想外にも、高血漿ＩＬ８は、チェックポイント阻害剤（ＣＰＩ）に対する治療結果に悪影響を及ぼした。血漿ＩＬ８が上昇していた患者は、たとえ腫瘍がＣＰＩ（図４Ｃ）に対する応答と広く関連する高いＴｅｆｆシグネチャを有していたとしても、血漿ＩＬ８が低い患者と比較してより悪いＯＳを有していた（ＨＲ：１．７１；９５％ＣＩ：１．１２、３．２６、Ｐ＝０．０１７）。
上記の知見の堅牢性を確認するために、本発明者らは続いてＩＭｖｉｇｏｒ ２１１で血漿ＩＬ８を評価した。ＭＶＡは、高血漿ＩＬ８を有する患者がアテゾリズマブと化学療法群の両方で有意に悪いＯＳを有することを示し（図４Ｄ）、高血漿ＩＬ８がｍＵＣの予後予測であることを示した。しかしながら、低血漿ＩＬ８を有する患者では、アテゾリズマブは化学療法と比較してＯＳを改善した（ＨＲ：０．７６、９５％ＣＩ：０．６１、０．８４、Ｐ＝０．０１）（図４Ｄ）。ＩＭｍｏｔｉｏｎ １５０研究では、高い血漿ＩＬ８レベルは、アテゾリズマブで治療された患者においてＯＳの減少と関連し（ＨＲ：２．５５、９５％ ＣＩ：１．１８、５．５、Ｐ＝０．０１７）、アテゾリズマブ＋ベバシズマブ（ＨＲ：１．２５、９５％ ＣＩ：０．６１、２．６０、Ｐ＝０．５３５）及びスニチニブ治療された（ＨＲ：１．４８、９５％ＣＩ：０．６９、３．２０、Ｐ＝０．３１４）患者においてＯＳが悪化する傾向を示した（図４Ｅ）。
次に、本発明者らは、ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０及びＩＭｖｉｇｏｒ ２１１の試験におけるベースラインと比較して、治療中（アテゾリズマブ又は化学療法治療の６週間後）の血漿ＩＬ８レベルを評価した。ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０のコホート２（図８Ａ及び９Ａ～９Ｅ）及びコホート１（図９Ａ～９Ｅ）の両方において、血漿ＩＬ８の治療中の減少は、有意に良好なＯＳ（ＨＲ：０．４８；９５％ＣＩ：０．３１、０．７６、Ｐ＜０．０１）及びＯＲＲと関連していた。同様の傾向が、化学療法ではなくアテゾリズマブ（ＨＲ：０．４９、９５％ＣＩ：０．３６；０．６６、Ｐ＜０．００１）で治療された患者のＩＭｖｉｇｏｒ ２１１試験で観察され、血漿ＩＬ８の治療中の減少がアテゾリズマブに対するより良好な臨床転帰を予測したことを示唆した（図８Ｂ）。
本発明者らは、循環末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）の特定のサブセットにおけるＩＬ８発現が有効性と関連しているかどうかを評価した。本発明者らは、ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０研究からの５人のレスポンダー及び５人の非レスポンダーからのＰＢＭＣの単一細胞ＲＮＡ配列決定（ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ）を行った（図１０Ａ及び１１Ａ～１１Ｆ）。均一多様体近似及び投影（Ｕｎｉｆｏｒｍ Ｍａｎｉｆｏｌｄ Ａｐｐｒｏｘｉｍａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｒｏｊｅｃｔｉｏｎ）（ＵＭＡＰ）は、系統特異的マーカー遺伝子をにより骨髄細胞及びリンパ細胞を同定した（図１０Ｂ）。リンパ系クラスターと比較して、ＩＬ８発現は単球様（クラスター０、１、３、４、１３）及び巨核球（ＭＫ）クラスター（クラスター１４）で高く、クラスター１（図１０Ｃ）で最も高い発現であった。ＩＬ８高骨髄性細胞とＩＬ８低骨髄性細胞との間の差次的遺伝子発現分析により、ＩＬ８高細胞における骨髄性炎症遺伝子の濃縮が明らかにされた（図１０Ｄ及び１２）。同時に、ＩＬ８低細胞と比較して、ＩＬ８高細胞におけるヒト白血球抗原（ＨＬＡ）遺伝子及びインターフェロンガンマ（ＩＦＮｇ）誘導遺伝子等の抗原提示機構に関連する遺伝子の下方制御があった（図１０Ｄ、１２、１３Ａ、１３Ｂ）。
ＩＬ８産生骨髄細胞の割合並びに骨髄細胞上のＩＬ８の相対的発現は、レスポンダーと比較して非レスポンダーにおいてより高かった（図１０Ｅ及び１０Ｆ）。本発明者らは、ＰＢＭＣにおけるＩＬ８遺伝子発現の分析をＩＭｖｉｇｏｒ ２１０及びＩＭｍｏｔｉｏｎ １５０の患者のコホート全体に拡張した。実際、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇプラットフォームによる遺伝子発現分析は、ＰＢＭＣにおける高いＩＬ８遺伝子発現がＩＭｖｉｇｏｒ ２１０のｍＵＣ患者におけるより悪いＯＳ（ＨＲ：１．３６、９５％ＣＩ：１．０７、１．７３、Ｐ＝０．０１３）（図１０Ｇ）と有意に関連することを確認した。同様に、ｍＲＣＣ患者における高いＰＢＭＣ ＩＬ８遺伝子発現はまた、アテゾリズマブ単独療法群（ＨＲ ２．５２；９５％ＣＩ、１．２９、４．９０、ｐ＝０．００７）では悪化したＰＦＳと関連していたが、アテゾリズマブ＋ベバシズマブ又はスニチニブ群では関連していなかった（図１０Ｈ）。膀胱がんにおけるＩＬ８高ＰＢＭＣにおいてアップレギュレートされる遺伝子（例えば、局所進行性又は転移性尿路上皮癌腫）を表４に示す。膀胱がんにおけるＩＬ８高ＰＢＭＣにおいてダウンレギュレートされる遺伝子（例えば、局所進行性又は転移性尿路上皮癌腫）を表７に示す。表４又は表７に示す１つ以上の遺伝子の発現レベルを、ＩＬ８発現の代用として使用することができる。
骨髄細胞は、腫瘍微小環境（ＴＭＥ）内で異なる表現型を獲得することができる。したがって、本発明者らは、４人のＲＣＣ患者から新鮮な腫瘍及び末梢血を入手し、腫瘍内及び一致したＰＢＭＣのｓｃＲＮＡ－ｓｅｑによる遺伝子発現プロファイルを評価した。ＵＭＡＰ視覚化は、リンパ系細胞及び骨髄系細胞が１３個のサブセットに別々にクラスター化したことを示した（図１４Ａ、図１５、図１６Ａ、図１６Ｂ）。血液と比較して、腫瘍は骨髄細胞が豊富であり、Ｂ細胞及びＴ細胞サブセットが同時に減少した（図１４Ｂ）。ｍＵＣ ＰＢＭＣにおける本発明者らの観察と同様に、ＩＬ８発現は骨髄細胞に特異的であり、その発現は末梢血骨髄細胞と比較して腫瘍浸潤骨髄細胞において、特に腫瘍特異的骨髄細胞サブセットであるクラスター７において高かった（図１４Ｂ及び１７）。ＩＬ８高対ＩＬ８低腫瘍内骨髄細胞の差次的遺伝子発現分析により、ＩＬ８高細胞における炎症性遺伝子（例えば、ＩＬ１Ｂ、ＰＴＧＳ２、ＩＬ１ＲＮ及びＮＬＲＰ３）のより高い発現、及び他の遺伝子の中でも、抗原プロセシング及び提示に関与する遺伝子（例えば、ＨＬＡ－ＤＲ５、ＨＬＡ－ＤＲＢ６、ＨＬＡ－Ｃ及びＢ２Ｍ）の発現低下が明らかになった（図１４Ｃ及び１８）。ＲＣＣ患者由来の血液中のＩＬ８高骨髄性集団対低骨髄性集団のｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ分析も同様の傾向を示し（図１４Ｄ及び１９）、これはｍＵＣ患者におけるＰＢＭＣ分析からの本発明者らの観察結果と一致していた。腎臓がん（例えば、ＲＣＣ）におけるＩＬ８高腫瘍においてアップレギュレートされる遺伝子を表３に示す。腎臓がん（例えば、ＲＣＣ）におけるＩＬ８高腫瘍においてダウンレギュレートされる遺伝子を表６に示す。表３又は表６に示す１つ以上の遺伝子の発現レベルを、ＩＬ８発現の代用として使用することができる。
本発明者らは更に、ｍＵＣ（ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０）及びｍＲＣＣ（ＩＭｍｏｔｉｏｎ １５０）腫瘍におけるＩＬ８遺伝子発現を調べ、ＩＬ８遺伝子発現の上昇が組織学的評定によるより高い好中球の存在と相関することを見出した（図２０）。アテゾリズマブで治療されたｍＲＣＣにおけるより悪いＰＦＳ（ＨＲ：、２．７３、９５％ＣＩ：１．４９、５．０、ｐ＝０．０００１、図１４Ｅ）及びｍＵＣ患者のより悪いＯＳ（ＨＲ：１．３４、９５％ＣＩ：１．０３、１．７４、Ｐ＝０．０２６、図１４Ｆ）に関連する腫瘍における高いＩＬ８遺伝子発現。本発明者らはまた、Ｔｅｆｆ高サブセットにおける臨床転帰に対するＩＬ８発現の効果を評価し、高腫瘍ＩＬ８発現は、アテゾリズマブで治療された患者ではｍＲＣＣにおけるこれらの免疫浸潤腫瘍においてさえより悪いＰＦＳ（ＨＲ：４．３３、９５％ＣＩ：１．７５、１０．７、Ｐ＝０．００１、図１４Ｇ）及びｍＵＣにおけるより悪いＯＳ（ＨＲ：１．６７、９５％ＣＩ：１．１２、２．４９、Ｐ＝０．０１１）（図１４Ｈ）と関連したままであったが、アテゾリズマブ＋ベバシズマブ若しくはスニチニブで治療されたｍＲＣＣ患者では関連しなかったことを見出した（図１４Ｇ）。
要約すると、本発明者らのデータは、末梢及び腫瘍内ＩＬ８及び関連する骨髄性炎症がチェックポイント遮断に対する耐性を付与し得ることを示す。更に、ＩＬ８の発現は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を含むＣＰＩ療法に対する治療応答の予測バイオマーカーとして使用することができる。特に、ＩＬ８発現が低い患者は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いが、ＩＬ８発現が高い患者は、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト（例えば、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと１つ以上の追加の抗がん治療剤とを含む併用療法）以外の又はそれに加えて、抗がん療法による治療から利益を得ることができる。
Ｂ．材料及び方法
１．臨床試料の収集
この分析のための試料は、ＩＭｖｉｇｏｒ ２１０、すなわち転移性尿路上皮癌腫患者におけるアテゾリズマブを調査する単群第２相研究（ＮＣＴ０２９５１７６７、ＮＣＴ０２１０８６５２）、第３相ｍＵＣ治験ＩＭｖｉｇｏｒ２１１（ＮＣＴ０２３０２８０７）から収集され、患者を、第二選択又はそれ以上の治療として化学療法（タキサン又はビンフルニン又はアテゾリズマブのいずれかで治療した。腫瘍組織を、研究参加の２年前に全ての患者から採取した。ＲＥＣＩＳＴ ｖ１．１を使用して、治療に対する応答を評定した。
２．ｍＲＣＣ試料の取得
本発明者らの研究では、淡明細胞型腎癌腫と診断された５人の患者からの合計１４個の試料（ｃｃＲＣＣ）、５つの腫瘍並びに４つの一致した隣接する正常組織及び全血をｓｃＲＮＡ分析に含めた。新鮮な残存腫瘍及び隣接する正常組織を、選択的治癒的切除時に収集した。
３．腫瘍組織解離及び単一細胞ＲＮＡシーケンシング
ＲＣＣとして分類された腫瘍を有する治療歴のない患者からの外科的切除を調達し（Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、ｉＳｐｅｃｉｍｅｎ Ｉｎｃ、Ａｖａｄｅｎ ＢｉｏＳｃｉｅｎｃｅｓ及びＴｒｉＭｅｔｉｓ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）、一晩かけて本発明者らの施設に輸送した。淡明細胞型腎癌腫（ｃｃＲＣＣ）と診断された４人の患者からの合計８つの新鮮試料（４つの腫瘍及び４つの適合全血）を単一細胞ＲＮＡ分析に含めた。到着した試料は、血液の後が目視により検出されなくなるまでＰＢＳですすいだ。その後試料を、コラゲナーゼＤ（０．５ｍｇ／ｍｌ）とＤＮＡｓｅ（０．１ｍｇ／ｍｌ）の組み合わせを用いて、１５分以上３７℃で穏やかに振盪しながら消化させた。その後試料をｇｅｎｔｌｅＭＡＣＳ（商標）解離装置（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃ）に供し、続いて更に１０分間３７°Ｃでインキュベートした。２４時間以内に、ヒト腫瘍解離キット及びｇｅｎｔｌｅＭＡＣＳ（商標）プロトコルを使用して組織を単一細胞懸濁液に処理した。組織の酵素的解離の後、細胞を抗ＣＤ４５（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ、カリフォルニア州サンディエゴ）で染色し、４種類のレーザー（４０５ｎｍ、４８８ｎｍ、５６１ｎｍ、６３８ｎｍ）を備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＡＲＩＡ（商標）セルソーターで蛍光活性化細胞ソーティング（ＦＡＣＳ（登録商標）によってＣＤ４５＋細胞を精製した。７０ｐｓｉ及び９０ｋＨｚで作動する７０ミクロンのノズルを、各ソートセッションの設定として使用した。カルセインブルーＡＭ＋およびヨウ化プロピジウム－（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、マサチューセッツ州ウォルサム）に基づく単一生細胞のみを含むようにＦＡＣＳ（登録商標）ゲートを引き出した。
ＲＣＣ血液及び腫瘍から単離した生存ＣＤ４５＋細胞を、２０００～４０００細胞の細胞回収率を標的とする１０ＸＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）単一細胞捕捉チップのウェルに負荷した。製造業者のプロトコル（１０Ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ）に従って、ＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）Ｓｉｎｇｌｅ Ｃｅｌｌ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｒでエマルジョン中の単一－細胞ゲルビーズ（ＧＥＭ）を作製し、ＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）単一細胞５’ライブラリ及びＧｅｌ Ｂｅａｄキットを使用してｓｃＲＮＡ－ｓｅｑライブラリを調製した。シーケンシングライブラリーを、以下のリード長：２６ｂｐリード１、８ｂｐ ｉ７インデックス、０ｂｐ ｉ５インデックス及び９８ｂｐリード２を使用したペア－エンドシーケンシングのために、高出力１５０サイクルキット（Ｉｌｌｕｍｉｎａ）を備えたＩＬＬＵＭＩＮＡ（登録商標）ＮｅｘｔＳｅｑ５００に１．３ｐＭでロードした。
４．事前濃縮及びＦＡＣＳ（登録商標）ソーティング
組織の組織酵素解離に続いて、単一細胞懸濁液を、磁気ビーズ分離を使用する一回の生細胞又はＣＤ４５＋濃縮に供し、続いてＴ細胞の同定のための抗ＣＤ４５及び－ＣＤ３のカクテル、上皮細胞の除外のための抗ＥＰＣＡＭ、及びソーティングゲートからの非Ｔ細胞の除外のための抗ＣＤ５６、抗ＣＤ１４、抗ＣＤ１６、抗ＣＤ１１ｂ及び抗ＣＤ１９による抗体染色に供した。細胞を、４つのレーザー（４０５ｎｍ、４８８ｎｍ、５６１ｎｍ、６３８ｎｍ）を備えたＢｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ＦＡＣＳＡｒｉａ（商標）セルソーターでの蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ（登録商標））により精製した。７０ｐｓｉ及び９０ｋＨｚで作動する７０ミクロンのノズルを、各ソートセッションの設定として使用した。ＦＡＣＳ（登録商標）ゲートを、カルセインＢｌｕｅ ＡＭ＋およびヨウ化プロピジウム－（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）に基づく生きた単一細胞のみを含むように引き出した。更なるゲートを、ＣＤ３＋ＣＤ４５＋ＥｐＣＡＭ又はＣＤ４５＋ＥｐＣＡＭ－細胞に到達するように設けた。
５．単一細胞懸濁液の調製－１０ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）プラットフォームを使用したＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）単一細胞５’ＲＮＡ－ｓｅｑ配列決定ライブラリーの調製
細胞懸濁液をＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）Ｓｉｎｇｌｅ Ｃｅｌｌ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｒ装置（１０ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ）にロードして、エマルジョン中の単一細胞ゲルビーズ（ＧＥＭ）を生成した。単一細胞ＲＮＡ－Ｓｅｑライブラリーを、Ｃｈｒｏｍｉｕｍ Ｓｉｎｇｌｅ Ｃｅｌｌ ５’Ｌｉｂｒａｒｙ＆Ｇｅｌ Ｂｅａｄ キット（パート番号（Ｐ／Ｎ）１０００００６及びＰ／Ｎ ２２０１１２、１０ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ）を使用して調製した。９６－Ｄｅｅｐ Ｗｅｌｌ Ｒｅａｃｔｉｏｎ Ｍｏｄｕｌｅ（Ｂｉｏ－Ｒａｄ；Ｐ／Ｎ １８５１１９７）を備えたＣ１０００ ＴＯＵＣＨＴＭサーマルサイクラーでＧＥＭ－ＲＴを実施した：５３℃で４５分間、８５℃で５分間；４℃で保持、及び－２０℃で保存。ＧＥＭをドライアイス上で１０ｘＧｅｎｏｍｉｃｓに輸送し、次いで、破壊し、一本鎖ｃＤＮＡをＤＹＮＡＢＥＡＤＳ（登録商標）ＭｙＯｎｅ（商標）Ｓｉｌａｎｅ Ｂｅａｄｓ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ；Ｐ／Ｎ ２００００４８）で精製した。バーコード化完全長ｃＤＮＡを、９６ディープウェル反応モジュールでＣ１０００ ＴＯＵＣＨ（商標）サーマルサイクラーを使用して増幅した：９８℃で４５秒間；１３３サイクル：９８℃で２０秒間、６７℃で３０秒間、及び７２℃で１分間；７２℃で１分間；４℃で保持。増幅したｃＤＮＡ産物をＳＰＲＩ ｓｅｌｅｃｔ（登録商標）試薬キット（０．６３ＳＰＲＩ；Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ；Ｐ／Ｎ２３３１８）で精製した。
５’遺伝子発現を、ＣＨＲＯＭＩＵＭ（商標）Ｓｉｎｇｌｅ Ｃｅｌｌ ３０／５０ Ｌｉｂｒａｒｙ Ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎキット（Ｐ／Ｎ １００００２０）中の試薬を用いて構築した。５’遺伝子発現ライブラリー構築について、これらの工程に従った：（１）断片化、末端修復及びＡテイリング；（２）ＳＰＲＩｓｅｌｅｃｔ（登録商標）試薬による断片化後、最終修復及びＡ－テーリング浄化；（３）アダプターライゲーション；（４）ＳＰＲＩＳｅｌｅｃｔ（登録商標）試薬によるライゲーション後の浄化；（５）ＳＰＲＩｓｅｌｅｃｔ（登録商標）試薬による試料インデックスＰＣＲ両面浄化；（５）ライブラリ構築後の品質管理（ＱＣ）。
濃縮されたライブラリ構築について、これらの工程に従った：（１）断片化、末端修復及びＡテーリング；（２）アダプターライゲーション；（３）ＳＰＲＩｓｅｌｅｃｔ（登録商標）試薬によるライゲーション後の浄化；（４）試料インデックスＰＣＲ及び浄化。バーコード配列決定ライブラリーを定量ＰＣＲ（ＩＬＬＵＭＩＮＡ（登録商標）プラットフォーム用ＫＡＰＡ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｌｉｂｒａｒｙ定量キットＰ／Ｎ ＫＫ４８２４）によって定量した。
６．ソフトウェアＣｅｌｌ Ｒａｎｇｅｒ ２．２．０
Ｃｅｌｌ Ｒａｎｇｅｒ Ｓｉｎｇｌｅ Ｃｅｌｌ Ｓｏｆｔｗａｒｅ Ｓｕｉｔｅ ｖ．２．２．１を使用して、試料の多重分離、アラインメント、フィルタリング、及びユニバーサル分子識別子（ＵＭＩ）の計数を行った。各それぞれの亜集団のデータを、単一細胞トランスクリプトームの直接比較のために集約した。４対の腫瘍試料からの合計５２，６７１個の単一細胞を捕捉し、チャネルごとに回収された細胞の数は３６９５～９８０９の範囲であった。細胞あたりの平均リードは９１，３４６及び３３，７８９で変動し、細胞あたりのＵＭＩの中央値は１４０８～４１８７であった。発現遺伝子を有する細胞数が２００未満である場合、低品質の細胞を廃棄した。ミトコンドリア遺伝子発現の割合が４０％より大きい場合も、細胞を除去した。対になった４人の患者からの最終細胞数は２５，４５９であった。組織位置、すなわち隣接する正常及び腫瘍によって引き起こされる変動は、Ｓｅｕｒａｔによる「ＳＣＴｔｒａｎｓｆｏｒｍ」機能を利用して除去された。
７．技術データの単一細胞分析
Ｓｅｕｒａｔ（Ｂｕｔｌｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３６：４１１－４２０，２０１８）（バージョン３．０）を使用して、図１０Ａ～１０Ｈ及び１４Ａ～１４Ｇ中の遺伝子発現（ＧＥＸ）データを分析した。少なくとも５個の細胞で発現が検出された遺伝子、及び少なくとも１０個の遺伝子が検出された細胞を使用した。可変遺伝子は、ｘ．ｌｏｗ．カットオフ＝０．０５及びｙ．カットオフ＝０．１で同定された。最初の２０個の主成分を、クラスタリング（解像度＝０．６）及びＵＭＡＰ視覚化に使用した。ＳｉｎｇｌｅＲ（バージョン１．０．１）を使用して免疫細胞型（Ａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０，１６３－１７２，２０１９）をアノテーションした。ＳｉｎｇｌｅＲは、ＲＮＡ配列決定（ＲＮＡ－ｓｅｑ）によって配列決定された純粋な細胞型の参照データセットとの比較によって単一細胞トランスクリプトームの細胞同一性を割り当てるために参照データセット内の変数遺伝子を使用して相関を計算する。ここで、本発明者らは、ＳｉｎｇｌｅＲを使用して、ＲＣＣ腫瘍細胞の単球、マクロファージ及びリンパ球系細胞を同定した。更に、本発明者らは、サブクラスタＭ１及びＭ２マクロファージにＳｉｎｇｌｅＲマーカー相関に基づくＳｅｕｒａｔクラスタリングアプローチを適用した。ＰＢＭＣ及びＲＣＣ腫瘍の免疫表現型検査は、クラスター特異的遺伝子のアノテーションから推測された；ＣＤ３Ｔ細胞（ＣＤ３Ｄ、ＣＤ３Ｅ）、ＣＤ８Ｔ細胞（ＣＤ３Ｅ、ＣＤ８Ａ）、Ｂ細胞（ＣＤ７９Ａ）、ＣＤ１４単球（ＣＤ１４、Ｓ１００Ａ８）、及びナチュラルキラー（ＮＫ）細胞（ＮＫＧ７及びＣＤ３Ｅ陰性）。
８．ＲＣＣ腫瘍の単一細胞分析
Ｓｅｕｒａｔ（Ｂｕｔｌｅｒ ｅｔ ａｌ．ｉｄ．）｛３（バージョン３．０）を使用して、Ｃｅｌｌ Ｒａｎｇｅｒから出力された生の５０ ＧＥＸマトリックスの基本的な品質管理を行った。Ｓｅｕｒａｔの分析の前に、３０個未満の遺伝子又は３０００個超の遺伝子を有する細胞を取り除き、５個未満の細胞で発現される遺伝子を除去した。次に、Ｓｅｕｒａｔで実装された遺伝子分散分析を使用して、０．０～３．０の間の対数平均発現及び０．５未満の対数分散を有する遺伝子を保存して、非常に可変的な遺伝子を選択した。
５’ＧＥＸデータの偏りのない可視化のため、Ｓｅｕｒａｔに実装されたＵＭＡＰである主成分分析（ＰＣＡ）を使用した：最初の２０個の主成分は全ての試料に対して選択され、より多数の主成分を使用した場合に大きな違いは見られなかった。ＵＭＡＰによる２Ｄ視覚化を考慮して、ＣＸＣＬ８遺伝子及び特異的遺伝子を発現する細胞（ＣＤ３Ｔ（ＣＤ３Ｄ、ＣＤ３Ｅ）、ＣＤ８Ｔ（ＣＤ３Ｅ、ＣＤ８Ａ）、Ｂ細胞（ＣＤ７９Ａ）、ＣＤ１４単球（ＣＤ１４）及びＮＫ細胞（ＮＫＧ７＋及びＣＤ３Ｅ陰性）を表示することによって特徴プロットを生成した。次に、ＵＭＡＰプロットで可視化された各細胞を、その発現に基づいて、Ｍ（マクロファージ）細胞、ＮＫ細胞、又はＢ細胞の１つとしてアノテーションした。個々の細胞を、細胞型マーカー：骨髄サブセット（ＣＤ１４、Ｓ１００Ａ８、ＩＬ１Ｂ、ＣＸＣＬ８）、ＮＫ（ＮＫＧ７）、Ｂ細胞（ＣＤ７９Ａ）又はＴ細胞（ＣＤ３Ｄ、ＣＤ８Ａ）の濃縮によって分類した。
細胞を特定のタイプとして分類するためには、全ての陽性マーカーの総ＵＭＩカウントが合計で少なくとも４になることが必要であった（より多くのマーカーが使用されるために８個のＵＭＩを必要とするマクロファージを除く）。
９．試薬及び抗体
ＦＡＣＳソーティングに使用される抗体を以下に列挙する：
ＣＤ４５：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，２Ｄ１，Ｂ２３７４１８，３６８５１２，ＡＰＣ又は３６８５１６ ＡＰＣ／Ｃｙ（登録商標）７
ＣＤ３：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，ＨＩＴ３ａ，Ｂ２５６２０８，３００３０８，ＰＥ．
ＥｐＣＡＭ：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，９Ｃ４，Ｂ２５５５４２，３２４２２２，ＰＥ／Ｃｙ７．
ＣＤ５６：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，５．１Ｈ１１，Ｂ２６３３５５，３６２５４６，ＦＩＴＣ．
ＣＤ１４：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，６３Ｄ３，Ｂ２５７２３４，３６７１１６，ＦＩＴＣ．
ＣＤ１１ｂ：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，ＩＣＲＦ４４，Ｂ２１８６６９，３０１３３０，ＦＩＴＣ．
ＣＤ１６：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，Ｂ７３．１，Ｂ２３８２０６，３６０７１６，ＦＩＴＣ．
ＣＤ１９：Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，ＨＩＢ１９，Ｂ２４４８３２９，３０２２０６，ＦＩＴＣ．
１０．ソフトウェアバージョン
計算解析を、Ｃｅｌｌ Ｒａｎｇｅｒソフトウェア（１０ｘ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ、カリフォルニア州プレザントン）バージョン２．２．０，Ｐｅｒｌバージョン５．１８．４、Ｒバージョン３．６．０、並びに解析用Ｒの以下のパッケージ及びバージョンを使用して実施した：Ｓｅｕｒａｔ，３．０．０ ［２］；ｅｄｇｅＲ，３．２６．０；クラスタ、２．０．８；ｄｙｎａｍｉｃＴｒｅｅＣｕｔ，１．６３－１；ＵＭＡＰ、ＷＧＣＮＡ、１．６６［５３］；及び生存、２．４２－６。
１１．ＰＢＭＣ単離
酸クエン酸デキストロース（ＡＣＤ）採血管に収集した全血を一晩輸送し、次いで、カルシウム又はマグネシウムを含まないダルベッコリン酸緩衝生理食塩水（ＤＰＢＳ）（Ｌｏｎｚａ）で３倍超希釈した。希釈した細胞懸濁液を５０ｍｌ又は１５ｍｌコニカルチューブ中ＦＩＣＯＬＬ－ＰＡＱＵＥ（商標）ＰＬＵＳ（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）で慎重に下層化した。次いで、チューブを、ブレーキをオフにして、室温（ＲＴ）において９００×ｇで３０分間遠心分離した。ＰＢＭＣを含む間期を回収し、ＰＢＳで洗浄し、その後１０分間５００×ｇでＲＴで遠心分離した後更に処理した。
１２．ＰＢＭＣ ＲＮＡ抽出
患者由来のＰＢＭＣをＡＣＤバキュテイナチューブ（Ｂｅｃｔｏｎ，Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ）内で単離した。次いで、ＰＢＭＣ細胞ペレットをＲＮＡｌａｔｅｒ（登録商標）（Ｑｉａｇｅｎ）に保存し、抽出まで－２０°Ｃで凍結保存するまで４°Ｃで１～５日間保存した。ＰｕｒｅＬｉｎｋ（登録商標）ＲＮＡ Ｍｉｎｉ Ｋｉｔ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を用いて抽出を行い、ＮａｎｏＤｒｏｐ（商標）分光光度計（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）を用いて定量した。
１３．ＰＢＭＣ ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ遺伝子発現分析
患者を、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ免疫パネルによって測定されるカットオフとしての中央値ｍＲＮＡ発現レベルを使用して、またｔ検定によって決定されるＰ値を用いて、ＩＬ８高発現カテゴリーとＩＬ８低発現カテゴリーとに分けた。ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ遺伝子発現データを、Ｒ／Ｂｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒパッケージ「ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇＱＣＰｒｏ」を使用して処理した。原数値を陽性対照計数によって調整した後、プローブ及びレーン特異的バックグラウンドを陰性対照及びブランク測定の両方に基づいて計算した。背景補正後、計数をｌｏｇ２変換し、ハウスキーピング遺伝子発現（ＴＭＥＭ５５Ｂ、ＶＰＳ３３Ｂ、ＴＢＰ、及びＴＵＢＢ）によって正規化した。
１４．血漿ＩＬ８アッセイ
エチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）血漿試料（ベースライン及び治療１日目のサイクル（Ｃ３Ｄ１））を治療前後の患者から収集し、－８０℃で保存した。ＩＬ８レベルを、ＳＩＭＰＬＥ ＰＬＥＸ（登録商標）Ｅｌｌａマルチ分析物プラットフォームでの予め適格なイムノアッセイによってモニタリングした。試料を試料希釈剤で２倍希釈し、データ取得のためにカートリッジに充填した。
１５．ＲＮＡ－ｓｅｑ遺伝子発現プロファイリング
２９８全ての試料の全トランスクリプトームプロファイルを、ＴｒｕＳｅｑ（登録商標）ＲＮＡ Ａｃｃｅｓｓ技術を使用して生成した。まず、リボソームリードを除去するために、リードをリボソームＲＮＡ配列にアラインメントした。残りのリードを、以下のパラメータとの最大２つのミスマッチを可能にするＧＳＮＡＰアライナを使用してヒト参照ゲノム（ＧＲＣｈ３８）にアラインした：’－Ｍ ２－ｎ １０－Ｂ ２－ｉ １－Ｎ１－ｗ ２０００００－Ｅ １－ペアマックス－ｒｎａ＝２０００００－クリップ－オーバーラップ）。遺伝子発現レベルを定量するために、各ＲｅｆＳｅｑ遺伝子のエクソンにマッピングされたリードの数を、Ｒ／ＢｉｏｃｏｎｄｕｃｔｏｒパッケージＧｅｎｏｍｉｃＡｌｉｇｎｍｅｎｔｓによって提供される機能性を使用して鎖特異的様式で計算した。
１６．遺伝子発現分析
これらの各特徴のスコアを計算するために、最初にｅｄｇｅＲの正規化係数を使用してカウントを正規化し（Ｒｏｂｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ２６（１）：１３９－１４０，２０１０）、続いてｌｉｍｍａ’ｓ ｖｏｏｍを用いて低いカバレッジ（つまり、利用可能な試料の少なくとも１０分の１では０．２５ ＣＰＭ（１００万あたりのカウント）に達しない）及びｌｏｇ２変換（Ｒｉｔｃｈｉｅ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．４３（７）：ｅ４７，２０１５）を伴う遺伝子を除外した。各ＰＰＩの遺伝子発現スコアを記載のように計算した（Ｍａｒｉａｔｈａｓａｎ ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ ５５４（７６９３）：５４４－５４８，２０１８）。各遺伝子のｚスコア形質転換発現について主成分分析を行い、主成分１を抽出して遺伝子シグネチャスコアとした。
１７．経路分析
遺伝子の総数（Ｎ）を考慮して、経路内の有意に差次的に発現される遺伝子の数（Ｓ）が偶然によって予想されるよりも多いかどうかを評定することにより、有意な濃縮について個々のＲＥＡＣＯＭＥ経路を評定した。超幾何検定を用いてｐ値（Ｐ）を決定し、次いで、Ｂｅｎｊａｍｉｎｉ ａｎｄ Ｈｏｃｈｂｅｒｇ（１９９５）の方法を用いて複数の経路にわたる検定について補正して、調整ｐ値（Ｐ ａｄｊ．）を得た。
１８．統計学的分析
ＯＳの確率を推定し、ＩＭｖｉｇｏｒ２１０及びＩＭｖｉｇｏｒ２１１コホートについてのＯＳ中央値又はＩＭｍｏｔｉｏｎ１５０コホートについてのＰＦＳを推定するために使用されたＫａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ法を使用して、事象までの時間転帰を推定し、Ｋａｐｌａｎ－Ｍｅｉｅｒ曲線を作成した。ＯＳ又はＰＦＳをログランク検定によって比較した。ＯＳ及びＰＦＳ分析のため、生存していた患者のデータを最後の接触時に打ち切りした。ＯＳ及びＰＦＳのハザード比及び９５％信頼区間をＣｏｘ回帰モデルによって推定した。Ｃｏｘ比例ハザード及び線形回帰モデルを実施して、単変量及び多変量解析における予後因子を同定した。
他の実施形態
上述の発明は、理解を明確にする目的のために説明及び実施例によってある程度詳細に記載されているが、これらの記載及び実施例は、本発明の範囲を限定するものとして解釈されるべきではない。本明細書に引用される全ての特許及び科学文献の開示は、その全体が参考として明示的に組み込まれる。

Claims (146)

  1. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、全生存期間（ＯＳ）又は全奏効率（ＯＲＲ）によって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  2. ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法。
  3. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法。
  4. がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、
    （ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること
    を含む、方法。
  5. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  6. ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法。
  7. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法。
  8. がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、
    （ａ）個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、個体に対する抗がん療法を選択すること
    を含む、方法。
  9. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること
    を含む、方法。
  10. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、方法。
  11. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対する、がんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、
    （ａ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、
    （ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること
    を含む、方法。
  12. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  13. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、方法。
  14. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対する、がんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、
    （ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  15. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又は末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること
    を含む、方法。
  16. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、方法。
  17. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対する、がんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、
    （ａ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、
    （ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること
    を含む、方法。
  18. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  19. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料であり、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、方法。
  20. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に対する、がんを有する個体の応答をモニタリングする方法であって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、
    （ｂ）試料中のＩＬ８の発現レベルをＩＬ８の基準レベルと比較すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルが基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  21. 抗がん療法の投与後の時点が、抗がん療法の投与後約４～約８週間である、請求項９～２０のいずれか一項に記載の方法。
  22. 抗がん療法の投与後の時点が、抗がん療法の投与後約６週間である、請求項２１に記載の方法。
  23. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  24. ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られている、方法。
  25. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、方法が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法。
  26. がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること
    を含む、方法。
  27. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  28. ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含み、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示され、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られている、方法。
  29. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、方法。
  30. がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に得られた個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定され、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、個体に対する抗がん療法を選択すること
    を含む、方法。
  31. 試料が、血漿試料、組織試料、細胞試料、全血試料、血清試料、又はそれらの組み合わせである、請求項１～１４及び２１～３０のいずれか一項に記載の方法。
  32. 試料が血漿試料である、請求項３１に記載の方法。
  33. 組織試料が、腫瘍組織試料である、請求項３１に記載の方法。
  34. 腫瘍組織試料が、腫瘍細胞、腫瘍浸潤免疫細胞、間質細胞、又はそれらの組み合わせを含む、請求項１５～２０及び３３のいずれか一項に記載の方法。
  35. 腫瘍浸潤免疫細胞が腫瘍浸潤骨髄細胞を含む、請求項３４に記載の方法。
  36. 腫瘍組織試料が、ホルマリン固定パラフィン包埋（ＦＦＰＥ）試料、アーカイブ試料、新鮮試料、又は凍結試料である、請求項１５～２０及び３３～３５のいずれか一項に記載の方法。
  37. 細胞試料が末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）を含む、請求項３１に記載の方法。
  38. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中で決定されたＩＬ８の発現レベルに基づいて、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  39. ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを含む、方法。
  40. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、方法。
  41. がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、
    （ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、個体に対するＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を選択すること
    を含む、方法。
  42. がんを有する個体を治療する方法であって、
    （ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、方法。
  43. ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと決定された、がんを有する個体を治療する方法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、有効量の抗がん療法を個体に投与することを含む、方法。
  44. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定する方法であって、個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することを含み、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、方法。
  45. がんを有する個体に対する治療を選択するための方法であって、
    （ａ）個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であることにより、個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定される、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｂ）工程（ａ）で決定された血漿試料中又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、個体に対する抗がん療法を選択すること
    を含む、方法。
  46. 応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、請求項１０又は１１に記載の方法。
  47. 応答がＯＳによって示される、請求項１～４、１０、及び１１のいずれか一項に記載の方法。
  48. 個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療からの延長されたＯＳを有する可能性が高い、請求項４７に記載の方法。
  49. 応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、請求項１６、１７、及び３８～４１のいずれか一項に記載の方法。
  50. 応答がＯＳによって示される、請求項２３～２６及び４９のいずれか一項に記載の方法。
  51. 個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含まない抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療からの延長されたＯＳを有する可能性が高い、請求項５０に記載の方法。
  52. 応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、請求項１３又は１４に記載の方法。
  53. 応答がＯＳによって示される、請求項５～８及び５２のいずれか一項に記載の方法。
  54. 個体が、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からの低下したＯＳを有する可能性が高い、請求項５３に記載の方法。
  55. 応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、請求項１９、２０及び４２～４５のいずれか一項に記載の方法。
  56. 応答がＯＳによって示される、請求項２７～３０及び５５のいずれか一項に記載の方法。
  57. 個体が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療と比較して、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療からの低下したＯＳを有する可能性が高い、請求項５６に記載の方法。
  58. ＩＬ８の基準レベルが、がんを有する個体の集団から決定される、請求項１～５７のいずれか一項に記載の方法。
  59. ＩＬ８の基準レベルが、がんを有する患者の集団において決定された発現レベルの中央値、発現レベルの三分位値、又は最大選択されたログランク基準レベルである、請求項５８に記載の方法。
  60. ＩＬ８の基準レベルが、がんを有する患者の集団において決定された発現レベルの中央値である、請求項５９に記載の方法。
  61. 最大選択されたログランク基準レベルが、１２ｐｇ／ｍＬのＩＬ８である、請求項５９に記載の方法。
  62. 基準レベルが、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られた試料中のＩＬ８のレベルである、請求項９～１４、２１及び２２のいずれか一項に記載の方法。
  63. 基準レベルが、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られた試料中のＩＬ８のレベルである、請求項１５～２２のいずれか一項に記載の方法。
  64. ＩＬ８の発現レベルが核酸発現レベルである、請求項１～６３のいずれか一項に記載の方法。
  65. 核酸発現レベルがｍＲＮＡ発現レベルである、請求項６４に記載の方法。
  66. ｍＲＮＡ発現レベルが、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－ｓｅｑ）、リアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖応答（ＲＴ－ｑＰＣＲ）、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、マルチプレックスｑＰＣＲ若しくはＲＴ－ｑＰＣＲ、マイクロアレイ分析、遺伝子発現の連続分析（ＳＡＧＥ）、ＭａｓｓＡＲＲＡＹ技術、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＩＳＨ）、又はそれらの組み合わせによって決定される、請求項６５に記載の方法。
  67. ＲＮＡ－ｓｅｑがシングルセルＲＮＡシーケンシング（ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ）である、請求項６６に記載の方法。
  68. ＩＬ８の発現レベルが、タンパク質発現レベルである、請求項１～６３のいずれか一項に記載の方法。
  69. タンパク質発現レベルが、免疫組織化学法（ＩＨＣ）、ウエスタンブロット法、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、免疫沈降法、免疫蛍光法、ラジオイムノアッセイ、又は質量分析法によって決定される、請求項６８に記載の方法。
  70. 個体が、Ｔエフェクター（Ｔｅｆｆ）シグネチャの基準レベル以上である腫瘍試料中のＴｅｆｆシグネチャの発現レベルを有する、請求項５～８、１２～１４、１８～２２、２７～３７、４２～４５及び５２～６９のいずれか一項に記載の方法。
  71. Ｔｅｆｆシグネチャが、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される１つ以上の遺伝子を含む、請求項７０に記載の方法。
  72. Ｔｅｆｆシグネチャが、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される２つ以上の遺伝子を含む、請求項７１に記載の方法。
  73. Ｔｅｆｆシグネチャが、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１から選択される３つ以上の遺伝子を含む、請求項７２に記載の方法。
  74. Ｔｅｆｆシグネチャが、ＣＤ８Ａ、ＧＺＭＡ、ＧＺＭＢ及びＰＲＦ１を含む、請求項７３に記載の方法。
  75. 個体が、がんについて以前に治療されたことがない、請求項１～７４のいずれか一項に記載の方法。
  76. 個体が、がんについて以前に治療されたこがある、請求項１～７４のいずれか一項に記載の方法。
  77. がんが、膀胱がん、腎臓がん、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、リンパ腫、前立腺がん、肝臓がん、頭頸部がん、黒色腫、卵巣がん、中皮腫又は骨髄腫である、請求項１～７６のいずれか一項に記載の方法。
  78. 膀胱がんが尿路上皮癌腫（ＵＣ）である、請求項７７に記載の方法。
  79. ＵＣが局所進行性又は転移性ＵＣである、請求項７８に記載の方法。
  80. 個体が、事前の白金ベースの化学療法を受けたことがある、請求項７９に記載の方法。
  81. 個体が、事前の白金ベースの化学療法後に進行している、請求項８０に記載の方法。
  82. 個体が、局所進行性又は転移性ＵＣについて以前に治療されたことがない、請求項７９に記載の方法。
  83. 個体が白金ベースの化学療法に不適格である、請求項８２に記載の方法。
  84. 個体がシスプラチン不適格である、請求項８３に記載の方法。
  85. 腎臓がんが腎細胞癌腫（ＲＣＣ）である、請求項７７に記載の方法。
  86. ＲＣＣが転移性ＲＣＣ（ｍＲＣＣ）である、請求項８５に記載の方法。
  87. 個体がｍＲＣＣについて以前に治療されたことがない、請求項８６に記載の方法。
  88. 肺がんが非小細胞肺がん又は小細胞肺がんである、請求項７７に記載の方法。
  89. 乳がんがトリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）又はＨＥＲ ２陽性乳がんである、請求項７７に記載の方法。
  90. 乳がんがＴＮＢＣである、請求項８９に記載の方法。
  91. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを更に含む、請求項３、４及び１１のいずれか一項に記載の方法。
  92. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与することを更に含む、請求項１６、１７、２５、２６、４０及び４１のいずれか一項に記載の方法。
  93. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを更に含む、請求項７、８、１３、及び１４のいずれか一項に記載の方法。
  94. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与することを更に含む、請求項１９、２０、２９、３０、４４及び４５のいずれか一項に記載の方法。
  95. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法が、ＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ８アンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト、又はそれらの組み合わせを含む、請求項５、６、８、１２、及び１４のいずれか一項に記載の方法。
  96. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法が、ＶＥＧＦアンタゴニスト、ＩＬ１Ｂアンタゴニスト、ＩＬ１Ｒアンタゴニスト、又はそれらの組み合わせを含む、請求項１８、２０、２７、２８、３０、４２、４３、及び４５のいずれか一項に記載の方法。
  97. 抗がん療法がＶＥＧＦアンタゴニストとＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストとを含む、請求項９５又は９６に記載の方法。
  98. ＶＥＧＦアンタゴニストが、抗ＶＥＧＦ抗体又はＶＥＧＦ受容体（ＶＥＧＦＲ）阻害剤である、請求項９５～９７のいずれか一項に記載の方法。
  99. ＶＥＧＦアンタゴニストが、抗ＶＥＧＦ抗体である、請求項９８に記載の方法。
  100. 抗ＶＥＧＦ抗体がベバシズマブである、請求項９９に記載の方法。
  101. ＩＬ８アンタゴニストが、抗ＩＬ８抗体又は小分子ＩＬ８阻害剤である、請求項９５～１００のいずれか一項に記載の方法。
  102. ＩＬ１Ｂアンタゴニストが、抗ＩＬ１Ｂ抗体又は小分子ＩＬ１Ｂ阻害剤である、請求項９５～１０１のいずれか一項に記載の方法。
  103. ＩＬ１Ｒアンタゴニストが、抗ＩＬ１Ｒ抗体又は小分子ＩＬ１Ｒ阻害剤である、請求項９５～１０２のいずれか一項に記載の方法。
  104. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストが、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト、ＰＤ－１結合アンタゴニスト及びＰＤ－Ｌ２結合アンタゴニストからなる群から選択される、請求項１５～９０、９２、９４及び９６のいずれか一項に記載の方法。
  105. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストがＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストである、請求項１０４に記載の方法。
  106. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストが、ＰＤ－Ｌ１のそのリガンド結合パートナーのうちの１つ以上のへの結合を阻害する、請求項１～１４、２１、２２、３１～３７、４６～４８、５２～５４、５８～６２、６４～９１、９３、９５、及び９７～１０３のいずれか一項に記載の方法。
  107. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストがＰＤ－Ｌ１のＰＤ－１への結合を阻害する、請求項１０６に記載の方法。
  108. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストが、ＰＤ－Ｌ１のＢ７－１への結合を阻害する、請求項１０６に記載の方法。
  109. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストが、ＰＤ－Ｌ１の、ＰＤ－１とＢ７－１との両方への結合を阻害する、請求項１０６～１０８のいずれか一項に記載の方法。
  110. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストが、抗ＰＤ－Ｌ１抗体である、請求項１０４～１０９のいずれか一項に記載の方法。
  111. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、アテゾリズマブ、ＭＤＸ－１１０５、デュルバルマブ、及びアベルマブからなる群から選択される、請求項１１０に記載の方法。
  112. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が以下の超可変領域（ＨＶＲ）：
    （ａ）ＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨのＨＶＲ－Ｈ１配列（配列番号１９）；
    （ｂ）ＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧのＨＶＲ－Ｈ２配列（配列番号２０）；
    （ｃ）ＲＨＷＰＧＧＦＤＹのＨＶＲ－Ｈ３配列（配列番号２１）；
    （ｄ）ＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡのＨＶＲ－Ｌ１配列（配列番号２２）；
    （ｅ）ＳＡＳＦＬＹＳのＨＶＲ－Ｌ２配列（配列番号２３）；及び
    （ｆ）ＱＱＹＬＹＨＰＡＴのＨＶＲ－Ｌ３配列（配列番号２４）
    を含む、請求項１１０又は１１１に記載の方法。
  113. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ（配列番号２５）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変（ＶＨ）ドメイン；
    （ｂ）ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫＲ（配列番号４）のアミノ酸配列に対して、少なくとも９０％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１０～１１２のいずれか一項に記載の方法。
  114. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９５％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１３に記載の方法。
  115. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９６％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１４に記載の方法。
  116. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９７％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１５に記載の方法。
  117. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９８％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１６に記載の方法。
  118. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列に対して、少なくとも９９％の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１７に記載の方法。
  119. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン；又は
    （ｃ）（ａ）に記載のＶＨドメインと（ｂ）に記載のＶＬドメイン
    を含む、請求項１１８に記載の方法。
  120. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体が、
    （ａ）配列番号２５のアミノ酸配列を含むＶＨドメイン；及び
    （ｂ）配列番号４のアミノ酸配列を含むＶＬドメイン
    を含む、請求項１１９に記載の方法。
  121. 抗ＰＤ－Ｌ１抗体がアテゾリズマブである、請求項１２０に記載の方法。
  122. 追加の治療剤を個体に投与することを更に含む、請求項１～１２１のいずれか一項に記載の方法。
  123. 追加の治療剤が、免疫治療剤、細胞傷害性薬剤、成長阻害剤、放射線治療剤、抗血管新生剤、及びそれらの組合せからなる群から選択される、請求項１２２に記載の方法。
  124. 個体がヒトである、請求項１～１２３のいずれか一項に記載の方法。
  125. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療から利益を得ることができる、がんを有する個体を同定するためのキットであって、
    （ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、
    （ｂ）請求項３又は１０に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定するために試薬を使用するための説明書と
    を含む、キット。
  126. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療から利益を得ることができる、がんを有する個体を同定するためのキットであって、
    （ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、
    （ｂ）請求項７又は１３に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定し、それにより個体を、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用するための説明書と
    を含む、キット。
  127. がんを有する個体を治療するためのキットであって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストと、任意に、
    （ｂ）請求項３又は１０に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法に応答する可能性が高いと同定された、がんを有する個体にＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを投与するための説明書と
    を含む、キット。
  128. がんを有する個体を治療するためのキットであって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法と、任意に
    （ｂ）請求項７又は１３に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法に応答する可能性が低いと同定された、がんを有する個体に、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を投与するための説明書と
    を含む、キット。
  129. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療から利益を得ることができる、がんを有する個体を同定するためのキットであって、
    （ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、
    （ｂ）請求項１６、２５、及び４０のいずれか一項に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高い、がんを有する個体を同定するために試薬を使用するための説明書と
    を含む、キット。
  130. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療から利益を得ることができる、がんを有する個体を同定するためのキットであって、
    （ａ）ＩＬ８の発現レベルを決定するための試薬と、任意に、
    （ｂ）請求項１９、２９、及び４４のいずれか一項に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低い、がんを有する個体を同定し、それにより個体を、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法による治療から利益を得ることができる個体として同定するために試薬を使用するための説明書と
    を含む、キット。
  131. がんを有する個体を治療するためのキットであって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストと、任意に、
    （ｂ）請求項１６、２５、及び４０のいずれか一項に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法に応答する可能性が高い同定された、がんを有する個体にＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを投与するための説明書と
    を含む、キット。
  132. がんを有する個体を治療するためのキットであって、
    （ａ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法と、任意に
    （ｂ）請求項１９、２９、及び４４のいずれか一項に記載の方法に従って、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法に応答する可能性が低いと同定された、がんを有する個体に、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を投与するための説明書と
    を含む、キット。
  133. がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストであって、個体が、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト。
  134. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、個体が、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、応答がＯＳ又はＯＲＲによって示される、抗がん療法。
  135. がんを有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストであって、方法が、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること
    を含む、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト。
  136. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体を治療する方法において使用するための抗がん療法であって、方法が、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、抗がん療法。
  137. がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストであって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であると決定されている、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト。
  138. ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、ＰＤ－Ｌ１結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であると決定されている、抗がん療法。
  139. がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、個体が、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されており、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト。
  140. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、個体が、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されており、試料が、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与前の時点に又は投与と同時に個体から得られ、応答が、ＯＳ又はＯＲＲによって示される、抗がん療法。
  141. がんを有する個体を治療する方法において使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、方法が、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満である場合、個体に抗がん療法を投与し続けること
    を含む、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト。
  142. がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル未満であると決定されており、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト。
  143. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体を治療する方法において使用するための抗がん療法であって、方法が、
    （ａ）有効量の、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法を個体に投与すること、
    （ｂ）ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法の投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ８の発現レベルを決定することであって、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料、又はＰＢＭＣを含む試料である、ＩＬ８の発現レベルを決定すること、及び
    （ｃ）個体の試料中のＩＬ８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上である場合、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、抗がん療法を個体に投与すること
    を含む、抗がん療法。
  144. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストの投与後の時点に個体から得られた試料中のＩＬ－８の発現レベルがＩＬ８の基準レベル以上であると決定されており、試料が、血漿試料、腫瘍組織試料又はＰＢＭＣを含む試料である、抗がん療法。
  145. がんを有する個体の治療に使用するためのＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストであって、個体が、ＩＬ８の基準レベル未満である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストを含む抗がん療法による治療に応答する可能性が高いと同定されている、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト。
  146. ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト以外の又はＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニストに加えて、がんを有する個体の治療に使用するための抗がん療法であって、個体が、ＩＬ８の基準レベル以上である個体由来の血漿試料又はＰＢＭＣを含む試料中のＩＬ８の発現レベルに基づいて、ＰＤ－Ｌ１軸結合アンタゴニスト単剤療法を含む抗がん療法による治療に応答する可能性が低いと同定されている、抗がん療法。
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