JP2008156359A - Alk−7(アクチビン様キナーゼ)、セリンスレオニンキナーゼレセプター - Google Patents
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Abstract
【解決手段】新規のセリンスレオニンキナーゼレセプター、ALK-7に相当するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする単離された核酸分子、ALK-7に相当するアミノ酸配列を含む実質的に純粋なポリペプチド、サンプル中のALK-7の存在を特異的に検出するための核酸プローブ、サンプル中のALK-7核酸の検出方法、サンプル中のALK-7核酸の存在を検出するためのキット、宿主細胞内で効率的に転写を開始させるプロモーターおよび前記の単離された核酸分子を5'から3'へと含む組換え核酸分子、ならびにベクターおよび前記の単離された核酸分子を包含する組換え核酸分子。
【選択図】なし
Description
(発明の分野)
本発明は、概して、新規のセリンスレオニンキナーゼレセプター、ALK-7に関する。特に、本発明は、ALK-7をコードする核酸分子;精製されたALK-7ポリペプチド;組換え核酸分子;組換え核酸分子を含む細胞;ALK-7に対して特異的な結合親和性を有する抗体;該抗体を含むハイブリドーマ;ALK-7核酸を検出するための核酸プローブ;サンプル中のALK-7核酸またはポリペプチドを検出する方法;および核酸プローブまたは抗体を含むキットに関する。本発明はさらに、本発明の核酸配列、レセプタータンパク質、または抗体を用いて、神経変性疾患を患う哺乳動物を診断、評価または予測するためのバイオアッセイに関する。また、AKL-7の治療的な使用もまた提供される。さらに本発明は、ALK-7レセプターのリガンド、アゴニスト、およびアンタゴニスト、ならびにその診断的および治療的使用に関する。
セリンスレオニンキナーゼレセプターは、増殖因子シグナルトランスデューサーの1ファミリーである(Heら、(1993) Dev. Dyn.196:133-142)。一連のセリンスレオニンキナーゼレセプター、アクチビンレセプター様キナーゼ1〜6(ALK-1〜-6)が以前に同定された(tenDijkeら、(1993) Oncogene 8:2879-2887; Franzenら、(1993)Cell 75:681-692; Ebnerら、(1993)Science 260:1344; Matsuzakiら、(1993) J. Biol.Chem. 268:12719; Heら、(1993) Dev.Dyn. 196:133-142; Attisanoら、(1993) Cell 75:681-692; ten Dijkeら、(1994) Science264:101-104; 国際特許公開公報第94/11502号(1994年5月26日公開))。本発明は、新規のセリンスレオニンキナーゼレセプター、ALK-7を提供する。
本発明は、新規のセリンスレオニンキナーゼレセプター、ALK-7に相当するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする単離された核酸分子を提供する。
(項目1) セリンスレオニンキナーゼレセプター、ALK-7に対応するアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする、単離された核酸分子。
(項目2) 前記分子が配列番号1に記載の核酸配列を有する、項目1に記載の単離された核酸分子。
(項目3) 前記分子が配列番号2に記載のアミノ酸配列をコードする、項目1に記載の単離された核酸分子。
(項目4) ALK-7に対応するアミノ酸配列を含む、実質的に純粋なポリペプチド。
(項目5) 前記ポリペプチドが配列番号2に記載のアミノ酸配列を含む、項目4に記載にポリペプチド。
(項目6) 個体由来のDNAサンプル中のALK-7の存在を検出するための核酸プローブであって、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、該サンプル中の項目1に記載の前記分子の存在を特異的に検出するために十分な核酸分子を含む、プローブ。
(項目7) サンプル中のALK-7核酸の検出方法であって、
a) 該サンプルと項目6に記載の核酸プローブとを、ハイブリダイゼーションが起こるような条件下で接触させる工程、および
b) ALK-7核酸に結合した該プローブの存在を検出する工程、
を包含する、方法。
(項目8) サンプル中のALK-7核酸の存在を検出するためのキットであって、項目6に
記載の核酸プローブをその中に配置した少なくとも1つのコンテナ手段を含む、キット。(項目9) 宿主細胞中で転写を開始するために有効なプロモーターおよび項目1に記載の単離された核酸分子を、5'から3'に含む、組換え核酸分子。
(項目10) ベクターおよび項目1に記載の単離された核酸分子を含む、組換え核酸分子。
(項目11) 項目9または10のいずれか1項に記載の組換え核酸分子を含む、細胞。(項目12) 項目9または10のいずれか1項に記載の組換え核酸分子を含む、非ヒト生物。
(項目13) 項目4に記載のポリペプチドに対する結合親和性を有する、抗体。
(項目14) サンプル中のALK-7ポリペプチド検出方法であって:
a) 該サンプルと項目13に記載の抗体とを、免疫複合体が形成されるような条件下で接触させる工程、および
b) 該ポリペプチドに結合した該抗体の存在を検出する工程、
を包含する、方法。
(項目15) 診断キットであって:
a) 項目13に記載の抗体を含む第1のコンテナ手段、および
b) 該モノクローナル抗体の結合パートナーおよびラベルを含む結合体を含む第2のコンテナ手段、
を含む、診断キット。
(項目16) 項目13に記載のモノクローナル抗体を産生する、ハイブリドーマ。
(項目17) 候補薬物またはALK-7レセプターのリガンドを評価するためのバイオアッ
セイであって、
a) 候補薬物またはリガンドを項目4に記載のポリペプチドを産生する細胞と接触させる工程;および
b) 該接触により媒介される生物学的活性を評価する工程、
を包含する、バイオアッセイ。
(項目18) 哺乳動物における神経疾患の処置方法であって、治療的に有効な量の項目4に記載のポリペプチドを、遺伝子送達系において該哺乳動物に投与する工程を包含する、方法。
(項目19) 前記疾患が、神経変性疾患、神経変性障害、および神経変性損傷からなる群から選択される、項目18に記載の方法。
(項目20) 項目4に記載のポリペプチドに結合し得るリガンド。
(項目21) 治療的に有効な量の項目21に記載のリガンドを、前記疾患を患う哺乳動物に投与する工程を包含する、哺乳動物における神経疾患の処置方法。
以下の説明中では、組換えDNA(rDNA)技術において使用される多くの用語が、広範に用いられている。このような用語をその範囲内に含む明細書および請求範囲の明瞭かつ一貫性のある理解を提供するために、以下の定義を提供する。
。
開示を明瞭にする目的のためであって、制限のためではなく、発明の詳細な説明を次の小区分に分ける。
ブリドーマ。
1つの実施態様において、本発明は新規のセリントレオニンキナーゼレセプター、ALK-7に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする単離された核酸分子に関する。1つの好ましい実施態様において、単離された核酸分子は配列番号1に存在するALK-7ヌクレオチド配列と70%より大きい類似性をもつALK-7ヌクレオチド配列を含む(好ましくは80%より大;より好ましくは90%より大)。別の好ましい実施態様において、単離された核酸分子は、配列番号1に存在 するALK-7ヌクレオチド配列を含む。別の実施態様において、単離された核酸分子は、配列番号2に存在するALK-7アミノ酸配列をコードする
。
位を有し得る。
本発明の一つの局面において、ALK-7に対応するアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする単離された核酸分子が提供される。特に、核酸分子は、ヒトRNAまたはDNAを含む生物学的サンプルから単離され得る。
、対立遺伝子の変化を含むことが意図される。ALK-7対立遺伝子が配列番号1で見られた配列と同一の配列をコードしない場合、そのALK-7対立遺伝子は、本明細書中で使用された同じ技術および特に本明細書中で開示された配列に基づいたプライマーを使用して適切な遺伝子を増幅するPCR技術を使用して、単離され、ALK-7として同定され得る。
。
本発明の単離された核酸分子はまた、化学的に合成された核酸分子を含むことが意図される。例えば、ALK-7遺伝子の発現産物をコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子が設計され得、そして必要な場合、適切なより小さなフラグメントに分けられ得る。次に、核酸分子または分けられた各フラグメントに対応するオリゴマーが合成され得る。このような合成オリゴヌクレオチドは、例えばMatteucciら、J.Am.Chem.Soc.103:3185-3191(1981)の トリエステル法によって、または自動DNAシークエンサーを使用することによって調製され得る。
別の実施態様において、本発明は、ALK-7、またはその機能的な誘導体に対応するアミノ酸配列を有する実質的に純粋なポリペプチドに関する。好ましい実施様態において、ポリペプチドは、配列番号2に示したアミノ酸配列、あるいはその変異体または種変異、あるいはその少なくとも70%の同一性または少なくとも85%の類似性(好ましくは、少なくとも90%の同一性または少なくとも95%の類 似性)、あるいはその少なくとも43隣接アミノ酸(好ましくは、その少なくとも50または100隣接アミノ酸)を有する。
する;(d)正電荷を有する残基(例えば、リジン、アルギニンまたはヒスチジン)を負電荷を有する残基(例えば、グルタミン酸またはアスパラギン酸)に対して(または、に)置換する;または(e)巨大な側鎖を有する残基(例えば、フェニルアラニン)をこのような側鎖を有しない残基(例えば、グリシン)に対して(または、に)置換する。
別の実施態様において、本発明は、上記の核酸分子、またはALK-7に対するストリンジェントな状態の下で、ALK-7と結合するが、ALK-1からALK-6までとは結合しない本明細書中の少なくとも一つのフラグメントを含むサンプルにおいて、ALK-7の存在の特異的な検出のための核酸プローブに関する。このプローブは、同様に位置されるALKプローブと100%のホモロジーを有しないように設計される。
別の実施態様において、本発明は、サンプル中のALK-7の存在を検出する方法であり、a)ハイブリダイゼーションが起こるような条件下で、サンプルと上記の核酸プローブとを接触させる工程、およびb)核酸分子と結合するプローブの存在を検出する工程を包含する方法に関する。当業者は、上記のように、当該分野で周知の技術に従って核酸プローブを選択し得る。試験されるサンプルは、ヒト組織のRNAサンプルを含むが、これに限定されるべきではない。
別の実施態様において、本発明は、サンプル中のALK-7の存在を検出するためのキットに関する。このキットは、上記の核酸プローブがその中に配置されている少なくとも1つの容器手段を含む。好ましい実施態様において、キットは、以下の1つ以上を含む他の容器をさらに含む:洗浄試薬および結合した核酸プローブの存在を検出し得る試薬。検出試薬の例としては、放射性ラベルプローブ、酵素ラベル プローブ(西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ)、およびアフィニティーラベルプローブ(ビオチン、アビジン、またはストレプトアビジン)が挙げられるが、これに限定されない。
生じ得る。
別の実施態様では、本発明は上記のようなALK-7ポリペプチドに対して特異的な、またはそのALK-7ポリペプチド結合フラグメントに対して特異的な結合親和性を有する抗体に関する。抗体がALK-1〜ALK-6に結合しない場合、それはALK-7ポリペプチドまたはその結合フラグメントに特異的に結合する。ALK-7に選択的に結合する抗体は、ALK-7を含む組織における改変されたALK-7の発現の分析を包含し得る(しかし、限定されるべきではない)方法における使用のために選択される。
、Academic Press, N. Y. (1974))。本発明の固定化された抗体は、インビトロ、インビボ、およびインサイチュアッセイのため、ならびに免疫クロマトグラフィーにおいて用いられ得る。
るペプチドを作製し得る。
別の実施態様では、本発明は、サンプル中のALK-7ポリペプチドを検出する方法であって、以下の工程、a)免疫複合体が形成される条件下で、サンプルを上記の抗体と接触させる工程、およびb)ポリペプチドと結合した抗体の存在を検出する工程、を包含する方法に関する。詳細には、本方法は、試験サンプルを、1つ以上の本発明の抗体とインキュベートする工程、およびその抗体が試験サンプルと結合するか否かをアッセイする工程を包含する。正常レベルと比較した場合のサンプル中のALK-7のレベルの変化は、特定の疾
患の存在を示し得る。
本発明の別の実施態様では、先述の検出方法を実行するために必要な試薬の全てを含むキットが提供される。このキットは、以下のものを含み得る:i)上記の抗体を含む第1のコンテナ手段、およびii)その抗体の結合パートナーとラベルとを含む結合体(conjugate)を含む第2のコンテナ手段。別の好ましい実施態様では、このキットは、1つ以上の以下のものを含む1つ以上の他のコンテナをさらに含む:洗浄試薬、および結合した抗体の存在を検出し得る試薬。検出試薬の例としては、ラベルされた2次抗体、あるいは代わりに、1次抗体がラベルされている場合、ラベルされている抗体と反応し得る発色団試薬、酵素試薬、または抗体結合試薬が挙げられるが、 これらに限定はされない。区画化されたキットは、核酸プローブキットについての上記の通りであり得る。
以下の議論はヒトの患者に特に関しているが、その教示はまた、ALK-7を発現するいかなる動物にも適用可能であることは、理解されるべきである。
となる。
く使用され、ケラチノサイト増殖因子(KGF)を発現する細胞を用いてKGFのレセプターを単離している。なお別のアプローチでは、ALK-7レセプタータンパク質は、上記の組換え技術によって細胞株またはXenopus卵母細胞において発現され得、そして抗ホスホチロシン抗体(UBI,Happauge,New York)によって検出されるような、そのリガンドが刺激するチロシンキナーゼ活性の活性化は、リガンドをアッセイし、そして精製するために用いられ得 る。例えば、組換えALK-7レセプターを発現する細胞は、哺乳動物の脳抽出物に曝され得る。脳抽出物は、クロマトグラフィーによって分画され得、そしてリガンド活性の存在についてアッセイするために用いられ得る。一旦特定の画分中に活性が同定されると、それは、従来の生化学的技術によってさらに精製され得る。
(1989))。
を改変するために用いられ得る。
、または所定の時間徐々に灌流することによって、非経口的に投与され得る。これは、静脈内、腹腔内、筋肉内、または皮下に投与され得る。
トランスジェニック非ヒト動物の作製法
本発明の非ヒト動物は、内因性ALK-7遺伝子のトランスジーンの中断(interruption)または変化を有する動物(ノックアウト動物)および/またはそのゲノム中に、ヒトALK-7の発現を検出する1つまたはそれ以上のトランスジーンが導入された動物を含む。
ALK-7の単離
ALK-7のPCRフラグメントを、BamHI制限酵素部位を有するモチーフVAVKIF(配列番号4
)に由来するプライマー、5'-GCGGATCCGT(C/G/T)CG(A/C/T)GT(C/G/T)AA(A/G)AT(A/C/T)TT-3'(配列番号3)およびEcoRI制限部位を有するモチーフYMAPE(配列番号6)に由来するプライマー、5'-CGGAATTC(A/G/T)GG(A/G/T)GCCAT(A/G)TA-3'(配列番号5)を使用して単離した。PCR増幅は、94℃(1分間)、50℃(1分間)および72℃(1分間)からなるサイクルを5サイクル実施し、次いで、94℃(1分間)、55℃(1分間)および72℃(1分間)からなるサイクルを35サイクル実施した。
ALK-7リガンドの単離
プローブとして細胞外ドメイン-アルカリホスファターゼ融合タンパク質を使用する、ALK-7リガンドのためのcDNA発現ライブラリーのスクリーニング ALK-7の細胞外ドメインと分泌型胎盤アルカリホスファターゼ(SEAP)との融合タンパクを構築するために、FlannaganおよびLeder、Cell 63:185-194(1990)により構築されたAPtag-1と呼ばれるベクターを使用する。APtag-1は、細胞外ドメインをコードするALK-7cDNAの領域を挿入するために、1組の制限部位を含む。挿入部位の下流は、SEAPの全長配列であり、これは上流配列と融合している。
る。
ALK-7リガンドを単離するための別のアプローチは、機能的なスクリーニングアプローチを使用するものである。ALK-7の全長cDNAを、MMLV LTRプロモーターのもとに発現ベクターpMEX中にクローン化する。ALK-7発現ベクターを、ハイグロマイシン耐性を与えるハイグロマイシンβ-ホスホトランスフェラーゼ遺伝子を含むpSV2Hygroとともに、NIH/3T3細胞中にコトランスフェクトする(GritzおよびDavis、Gene25:179-188(1983))。トランスフェクト細胞は、350μg/mlの濃度でハイグロマイシンBを用いて選択される。耐性クローンを、12ウェルプレート中で増殖させ、ウェスタンブロット分析により抗ALK-7抗体を使用してALK-7の発現についてスクリーニングする。
ALK-7タンパク
ALK-7cDNAフラグメントを、C末端で赤血球凝集(HA)エピトープで標識し、pBS KS(Stratagene)中にサブクローニングした。このプラスミドを、Promegaから購入した試薬キットを用い、製造者の説明に従って、インビトロ翻訳のために使用した。35S-Cys標識産物を抗HAモノクローナル抗体(12CA5)で免疫沈降させ、そしてSDS/PAGEで分離し、次いで、オートラジオグラフィーを行った(図2、左レーン)。ALK-7タンパク質は、優勢的な55Kバンドからなり、付加的なバンドは、内部Metコドンから生じた。
ALK-7mRNA発現
ALK-7mRNA発現を、成体ラット脳の異なった領域において(図3A)、および発育中の末梢組織において(図3B)、RNaseプロテクション分析(RPA)によって検討した。ALK-7mRNAは、選択的に、中枢神経系に限られた。優勢的な発現が、成体小脳に見られたが、海馬、中脳、橋、髄質、小丘および視床にも見られた。COS細胞は、ALK-7mRNAを発現しなかった。ALK-7 mRNAの低い発現が、2週齢、しかし成体化していないラット卵巣、および成体腎臓において見られた。ALK-7mRNAの中程度の発現もまた、生後1日(P1)の上頸神経節(SCG)で検出された。
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