JP2002315584A - 原核細胞における活性ヘテロダイマーamv−rtの産生方法 - Google Patents
原核細胞における活性ヘテロダイマーamv−rtの産生方法Info
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Abstract
RTを提供すること。 【解決手段】(i)AMV−RTのα鎖および/または
β鎖をコードする1つまたはいくつかのDNA配列が発
現プラスミドにクローン化される、(ii)発現プラス
ミドが原核細胞に形質転換される、(iii)ヘテロダ
イマーAMV−RTの可溶性発現が誘導される、および
(iv)組換えヘテロダイマーAMV−RTが細胞から
単離される、原核生物宿主細胞において活性ヘテロダイ
マーAMV−RTを産生する方法。
Description
誘導の条件下で、原核細胞においてAMV−RTのαサ
ブユニットおよび/またはβサブユニットをコードする
1つまたはいくつかのDNA配列を発現させることによ
り組換え活性ヘテロダイマーAMV−RTを産生する方
法に関する。
性プロセスとしてのDNAから、RNAを介するタンパ
ク質への情報伝達における分子生物学の「セントラルド
グマ」の誤りを立証した(Termin H.およびM
izutani S.,1970 Nature 22
6:1211−1213;Baltimore D.,
1970,Nature 226:1209−121
1)。これらのRNA依存性DNAポリメラーゼの酵素
学的特徴付けは、RNAウイルスの増幅サイクルにおけ
る、従ってまた、このタイプのウイルスにより引き起こ
される疾患(癌、エイズなど)の発達および蔓延におけ
る現在の理解の基礎である。
成、増幅およびクローニング(RT−PCR)に関する
分子生物学者のためのツールでもある。この技術は、真
核生物細胞における遺伝子発現の単純化し、促進した実
験を可能にする。細胞抽出物または組織から全mRNA
を単離した後、該mRNAは、逆転写酵素によりcDN
Aに逆転写され、引き続くPCR工程により増幅され
て、クローニングおよび特徴付けが可能になる。その結
果、一方では、遺伝子のイントロンおよびエキソン構造
を解明する必要がなく、他方では、種々のライフサイク
ルの間または疾患(例えば、癌)の発達の間に細胞にお
いて遺伝子発現を調査することも可能である。
転写酵素(RT)は、これまで綿密に調査されている:
モロニーマウス白血球ウイルス(M−MLV)由来のR
T。この酵素は、78kDaの分子量を有する単一のサ
ブユニットからなる(Prasad V.R.,199
3 Reverse Transcriptase,C
old Spring Harbor,New Yor
k:Cold Spring Harbor Labo
ratory Press,135に総説されてい
る)。さらに、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)に由来
するRTが知られている。このRTは、2つのサブユニ
ットp66およびp51からなるヘテロダイマーであ
り、p51サブユニットはp66のタンパク質分解性切
断により形成される(Le Grice S.F.
J.,1993 Reverse Transcrip
tase, Cold Spring Harbor,
New York:Cold Spring Harb
or Laboratory Press,163に総
説されている)。さらに、トリ肉腫−白血症ウイルス
(ASLV)に由来するRTが知られている。トリ骨髄
芽球腫ウイルス(AMV)に由来するRTもまたASL
Vファミリーに属する。このRTもまた、約63kDa
の分子量を有するα鎖および約95kDaの分子量を有
するβ鎖からなるヘテロダイマーである。この場合、α
鎖はまた、β鎖のタンパク質分解性プロセシングにより
形成される(Golomb M.およびGrandge
nett D.,1979,J.Biol.Chem.
254:1606−1613;WeissR.ら編、1
984、Molecular Biology of
tumorviruses, 第2版:RNA tum
or viruses 1/text.Cold Sp
ring Harbor Laboratory,Co
ld Spring Harbor,New Yor
k)。
菌において発現され、HIV−RTはヘテロダイマーと
して発現されるが、大腸菌または他の原核生物において
十分な程度まで活性または可溶性ヘテロダイマーとして
AMV−RTを発現させることは、これまで不可能であ
った。WO 00/42199によれば、所定のRTバ
リアントが大腸菌または好ましくは真核生物昆虫細胞に
おいて発現されるが、このプロセスで得られる所望のR
Tは、主に不溶性成分からなる(約90%)。
換えAMV−RTを測定することは困難である。なぜな
ら、一方では、RNAテンプレートは、内因性大腸菌R
Naseにより分解され、他方では、大腸菌株は、DN
Aポリメラーゼ活性に加えてRT活性をも有するDNA
ポリメラーゼを有する(Ricchetti,M.およ
びHuc.H.,1993,EMBO J.12
(2),387−396)。従って、この内因性大腸菌
RT活性は、大腸菌粗抽出物および精製に由来する画分
における組換えAMV−RTの活性の測定を相当に妨害
する。
は、充分な量で組換え活性ヘテロダイマーAMV−RT
を提供することである。
は、(1) (i)AMV−RTのα鎖および/または
β鎖をコードする1つまたはいくつかのDNA配列が発
現プラスミドにクローン化される、(ii)発現プラスミ
ドが原核細胞に形質転換される、(iii )ヘテロダイマ
ーAMV−RTの可溶性発現が誘導される、および(i
v)組換えヘテロダイマーAMV−RTが細胞から単離
される、原核生物宿主細胞において活性ヘテロダイマー
AMV−RTを産生する方法、(2) α鎖をコードす
るDNA配列およびβ鎖をコードするDNA配列が、1
つの細胞にクローン化された別々の発現プラスミド上で
発現される、前記(1)記載の方法、(3) α鎖をコ
ードするDNA配列およびβ鎖をコードするDNA配列
が、1つの細胞にクローン化された1つの発現プラスミ
ド上で発現される、前記(1)記載の方法、(4) α
鎖ならびにβ鎖がペプチド配列に融合される、前記
(1)〜(3)いずれかに記載の方法、(5) α鎖ま
たはβ鎖が、2〜10のアルギニン残基からなるペプチ
ド配列と融合され、β鎖またはα鎖が、2〜10のヒス
チジン残基からなるペプチド配列と融合される、前記
(4)記載の方法、(6) 可逆的な結合が可能である
ペプチド配列をコードするDNA配列に連結されるα鎖
をコードするDNA配列およびβ鎖をコードするDNA
配列が、1つの細胞にクローン化された1つの発現プラ
スミドにおいて発現される、前記(1)〜(5)いずれ
かに記載の方法、(7) α鎖およびβ鎖が、可逆的な
結合が可能である同一のペプチド配列と融合される、前
記(1)〜(6)いずれかに記載の方法、(8) α鎖
およびβ鎖が、2〜10のヒスチジン残基からなるペプ
チド配列と各々融合される、前記(7)記載の方法、
(9) 発現が、10℃〜25℃の増殖温度および減少
したインデューサー濃度で生じる、前記(1)〜(8)
いずれかに記載の方法、(10) 発現が、ヘルパー遺
伝子の共発現により増大される、前記(1)〜(9)い
ずれかに記載の方法、(11) トリプトファンtRN
AをコードするtrpT遺伝子がヘルパー遺伝子として
使用される、前記(10)記載の方法、(12) 発現
がシャペロン遺伝子の共発現により増大される、前記
(10)記載の方法、(13) GroELおよびGr
oES、DnaKおよびDnaJ、GrpEおよび/ま
たはClpBをコードする遺伝子が共発現される、前記
(10)または(12)記載の方法、(14) Gro
ELおよびGroESをコードする遺伝子が、α鎖をコ
ードする遺伝子およびβ鎖をコードする遺伝子をも保有
する発現プラスミド上にクローン化され、DnaK、D
naJ、GrpEおよびClpBをコードする遺伝子が
ヘルパープラスミド上にクローン化される、前記(1
2)または(13)記載の方法、(15) 適切なアフ
ィニティークロマトグラフィー材料が、組換えヘテロダ
イマーAMV−RTを単離または精製するために使用さ
れる、前記(1)〜(8)記載いずれかに記載の方法、
(16) 精製に使用されるアフィニティークロマトグ
ラフィー材料がα鎖および/またはβ鎖に結合した異な
るペプチド配列に可逆的に結合する、前記(15)記載
の方法、(17) 精製に使用されるアフィニティーク
ロマトグラフィー材料が、金属イオンキレート化材料ま
たはカチオン交換体である、前記(15)または(1
6)記載の方法、(18) 配列番号:5のDNA配列
または配列番号:4および配列番号:5のDNA配列が
原核生物宿主細胞において発現される、前記(1)〜
(17)いずれかに記載の方法、(19) 大腸菌が宿
主細胞として使用される、前記(1)〜(18)いずれ
かに記載の方法、(20) 活性ヘテロダイマーAMV
−RTが、配列番号:6および配列番号:7のサブユニ
ットからなる、前記(1)〜(19)いずれかに記載の
方法、(21) RNA配列を増幅するための、前記
(1)〜(20)いずれかに記載の方法により得られる
AMV−RTの使用、に関する。
おいて活性ヘテロダイマーAMV−RTを産生する方法
により達成される。ここで、AMV−RTのαおよびβ
のサブユニットまたは鎖をコードする1つまたはいくつ
かのDNA配列は、発現プラスミドにクローン化され、
発現プラスミドは、原核細胞において形質転換され、ヘ
テロダイマーAMV−RTの発現が誘導され、組換えヘ
テロダイマーAMV−RTが精製される、すなわち、細
胞から単離される。適切な遺伝子およびDNA配列は、
とりわけ、AMV−RTサブユニットの1つだけをコー
ドするものである。一部または発現産物は、引き続いて
所定の手段、例えばβ鎖のタンパク質分解性切断によ
り、他のサブユニットに変換されうる。サブユニット配
列番号:6および配列番号:7からなる活性ヘテロダイ
マーAMV−RTを産生する、配列(配列番号:4およ
び配列番号:5)は、本発明の方法に特に適切であるこ
とが証明された。
構造遺伝子およびDNA配列は、異なる、別々の発現プ
ラスミドにクローン化されるか、1つの発現プラスミ
ド、所望によりいわゆるヘルパープラスミドの存在下で
クローン化され、適切な宿主細胞において発現されう
る。適切な発現プラスミドは、例えば、pDS、pKK
177−3またはpKKT5である。それぞれの構造遺
伝子がT5プロモーターの制御下で挿入されたプラスミ
ドpKKT5が、本発明に好ましい。他の潜在的なプロ
モーター(好ましくはIPTG誘導性プロモーターであ
る)は、例えば、lac、lac UV5またはtac
プロモーターである。プラスミドpUBS520などの
ヘルパープラスミド、およびアンピシリンまたはカナマ
イシンなどの適切な選択マーカーが、大体において当業
者に知られている。
パープラスミドが、適切な原核生物宿主細胞に形質転換
される。本発明によれば、大腸菌株、例えば、大腸菌K
12C600、DH5α、LE392、JM83、JM
105、NM522、M15、RR1Δ15、UT56
00、TG1、A1200または株、大腸菌B、BL2
1、HB101を使用することが好ましい。大腸菌株L
E392が、本発明に特に好ましい。
々の手段により誘導されうる。特に、所定の増殖条件お
よび誘導条件は、活性AMV−RTの発現に対して正の
効果を有する。低インデューサー濃度と組み合わせた1
0〜25℃の範囲の増殖温度は、本発明に有益であるこ
とが示された。約15℃の増殖温度および0.1〜0.
5mM、好ましくは約0.15mMのインデューサー濃
度は、特に適切であることが示された。IPTG(イソ
プロピル−β−D−チオガラクトピラノシド)またはラ
クトースがインデューサーとして好適に本発明に使用さ
れる。
可溶性発現が、ヘルパー遺伝子の共発現により増大され
うることが判明した。潜在的なヘルパー遺伝子は、特に
トリプトファンtRNAをコードするtrpT遺伝子で
ある。さらに、シャペロン遺伝子は、GroELおよび
GroES、GrpE、ClpB、DnaKおよびDn
aJをコードする遺伝子などの可溶性発現に適切であ
る。次いで、1つまたはいくつかのシャペロンをコード
する遺伝子は、誘導性プロモーターを有するヘルパープ
ラスミドにおいて好ましくは配置される;シャペロンG
roELおよびGroESをコードする遺伝子は、α鎖
および/またはβ鎖をコードする構造遺伝子もまた配置
された発現プラスミドにおいて構成的なプロモーターの
制御下にある。しかし、GroELおよびGroESを
コードする遺伝子が、α鎖をコードする遺伝子およびβ
鎖をコードする遺伝子を保有する発現プラスミドにクロ
ーン化され、DnaK、DnaJ、GrpEおよびCl
pBをコードする遺伝子がヘルパープラスミドにクロー
ン化されることが本発明において特に好ましい。
て、金属イオンキレート材料または陽イオン交換体など
のアフィニティークロマトグラフィー材料を使用して、
細胞抽出物から組換えヘテロダイマーAMV−RTを精
製および単離することが特に有益である。発現産物、す
なわち、ニッケル、銅または亜鉛ニトリロ酢酸(NT
A)樹脂などの陽イオン交換体、金属イオンキレート材
料などの特定のカラム材料に可逆的に結合しうるペプチ
ド配列に融合されるα鎖およびβ鎖のためのAMV−R
Tの精製にとって特に有益である。本発明において適切
であるペプチド配列は、2〜約100アミノ酸またはア
ミノ酸誘導体を有しうる。2〜10アミノ酸、例えば、
アルギニン残基またはヒスチジン残基からなるペプチド
配列は、本発明に特に適切であることが示されている。
さらに、8アルギニンまたは6ヒスチジン残基を含有す
るかかるペプチド配列を使用することが特に好ましいこ
とも示されている。さらに、Strep−tag(登録
商標)(IBA GmbH、Goettingen/G
ermany)またはGST−tag(Pharmac
ia,Uppsala/Sweden)などの市販のペ
プチド配列もまた、本発明の方法に適切である。
かになる:
の単離 データバンク配列(MEDLINE ID 94366
722、Baludaら、1994)を用いて、β鎖の
単離のためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計した
(配列番号:1および2を参照)。引き続くベクターへ
のクローニングのために、EcoRI制限エンドヌクレ
アーゼ切断部位を5’末端に取り込ませ、PstI制限
切断部位を3’末端に取り込ませた。さらに、α鎖の単
離を可能にするさらなる3’プライマーを設計した(配
列番号:3を参照)。両方の鎖を、RT−PCRにより
ウイルス溶解物(ATCC VR−265)からのPC
Rにより、ならびにプラスミド上にβ鎖を保有する大腸
菌クローン(ATCC 31990)からのPCRによ
り取り出した。PCR混合物を1%アガロースゲルに供
し、α鎖については約1715bpのPCRフラグメン
トおよびβ鎖については約2570bpのPCRフラグ
メントをアガロースゲルから単離し(QIAEX I
I,Gel Extraction Kit,Qiag
en/Germany)、上記の制限エンドヌクレアー
ゼで切断し、EcoRIおよびPstIで同様に線状化
したpUC19のベクターフラグメントにクローン化
し、単離した。これについて、1μl(20ng)のベ
クターフラグメントおよび3μl(100ng)のPC
Rフラグメント、1μlの10×リガーゼバッファー
(Maniatisら、1989 Molecular
Cloning:A Laboratory Man
ual,第2版、Cold Spring Harbo
r Laboratory Press NY(US
A)、27巻)、1μlのT4 DNAリガーゼ、4μ
lの二重蒸留滅菌H2 Oをパイペッティングし、注意深
く混合し、16℃で一晩インキュベートした。クローン
化した遺伝子を、引き続いて制限解析および配列決定に
より調査した。その配列を、配列番号:4(α鎖)およ
び配列番号:5(β鎖)に示す。
94366722、Baluda,M.A.およびR
eddy,E.P.,1994,Oncogene
9:2761−2774)との比較は、α鎖ならびにβ
鎖についてDNAレベルで98.8%のホモロジーを示
した。得られたアミノ酸配列を比較すると、DNAレベ
ルでのほとんどの置換がいわゆるサイレント変異であ
り、すなわち、アミノ酸置換を導かないことが明らかに
なる。3つの塩基置換のみがまた、アミノ酸置換を生じ
たが、それらは、それぞれの単離されたPCR産物にお
いて再現性があることがわかる。それらの置換は、Ar
g273Met、Arg304GlnおよびAsp49
5Gluである。両方の鎖のアミノ酸配列を配列番号:
6(α鎖)および配列番号:7(β鎖)に示す。
発現 2.1.発現プラスミドpAMV−αおよびpAMV−
βの構築 AMV−RTを発現するために、T5プロモーターの制
御下で構造遺伝子が各々正しい向きで挿入される様式
で、両方の鎖に対する遺伝子を発現ベクターに別々にク
ローン化した。このために、α−鎖およびβ−鎖に対す
るそれぞれの構造遺伝子を、EcoRIおよびPstI
によりプラスミドpUC19から切り出し、制限混合物
をアガロースゲル電気泳動により分離し、α−鎖の17
15bpフラグメントおよびβ−鎖の2570bpフラ
グメントをアガロースゲルから単離した。発現プラスミ
ドpKKT5は、pDS由来のT5プロモーター(Buja
rdら、1987, Methods Enzymol. 155: 416-433 )でta
cプロモーターを置換することによりpKK177−3
(Kopetzkiら、1989, Mol. Gen. Genet. 216: 149-155
)から形成され、それを発現に使用した。T5プロモ
ーターの配列におけるEcoRI制限エンドヌクレアー
ゼ切断部位を、2つの点変異により除去した。AMV−
RTに対する遺伝子の挿入のために、得られた発現プラ
スミドをEcoRIおよびPstIで切断し、制限混合
物をアガロースゲル電気泳動により分離し、得られた約
2500bpのベクターフラグメントをアガロースゲル
から単離した。この方法で得られたベクターフラグメン
トを、実施例1に記載したα−鎖およびβ−鎖に対する
遺伝子と、前記のように別々に結合した。遺伝子の正し
い挿入を制限対照(restriction cont
rol)およびシークエンシングにより確認した。種々
の大腸菌株での発現制御のために、得られたプラスミド
pAMV−αおよびpAMV−βを最初に別々にヘルパ
ープラスミドpUBS520で同時形質転換した。この
場合、αα−およびββ−ホモダイマーを得るために、
α−鎖およびβ−鎖が別々に発現しうると考えられる。
ヘルパープラスミドpUBS520(Brinkmann ら、19
89, Gene 85: 109-114)は、とりわけlacリプレッサ
ーをコードするlaqIq 遺伝子とコドンAGAおよび
AGGを認識する大腸菌中の希有なtRNAArg をコー
ドするdnaY遺伝子とを有する(Garciaら、1986, Ce
ll 45: 453-459)。トランスポゾンTN903由来のカ
ナマイシン耐性遺伝子を選択マーカーとして使用した。
V−αおよびpAMV−βの別々の形質転換 種々の大腸菌株のコンピテント細胞を、Hanahan の方法
(J. Mol. Biol. 1983, vol. 166, 557 )により調製し
た。この方法で調製した200μlの大腸菌LE392
細胞を、20ngの単離された発現プラスミドpAMV
−α DNAまたはpAMV−β DNAおよび40n
gヘルパープラスミドDNAと混ぜた。氷上で30分イ
ンキュベートした後、熱ショック(42℃で90秒)を
行なった。次いで細胞を1ml LB培地に移し、表現
型発現のためにLB培地で37℃で1時間インキュベー
トした。この形質転換混合物のアリコートを、アンピシ
リンとカナマイシンとを選択マーカーとして含むLBプ
レート上にプレーティングし、37℃で15分間インキ
ュベートした。
の発現 AMV−RTのα−鎖をコードする遺伝子を発現するた
めに、プラスミド含有クローンを3ml LBampkan培
地に接種し、振盪器で30℃でインキュベートした。光
学濃度0.5(550nmで測定、OD550 )で、細胞
を0.5mMIPTGで誘導し、振盪器で30℃で4時
間インキュベートした。次いで個々の発現クローンの光
学濃度を測定し、5.0/mlのOD550 に対応するア
リコートを取り出し、細胞を遠心分離した(10分、6
000rpm、4℃)。細胞ペレットを400μl T
Eバッファー(50mM トリス/50mM EDT
A、pH 8.0)中に再懸濁し、細胞を超音波により
破砕し、遠心分離(10分、14000rpm、4℃)
により可溶性タンパク質画分を不溶性タンパク質画分か
ら分離した。SDSおよびβ−メルカプトエタノールを
含む負荷用バッファーを全画分に添加し、タンパク質を
煮沸(5分、100℃)により変性させた。その後、各
10μlを分析用SDSゲル(10%)により分析した
(Laemmli U.K., 1970, Nature 227: 555-557 )。
発現を示す。強く過剰発現した追加のバンドが、非誘導
対照クローンまたはプラスミドを含まない誘導対照クロ
ーンでは観察されない約63kDaで見られる。過剰発
現したα−鎖の小片部分が可溶性タンパク質画分に現れ
るのに対して、大部分量が不溶性発現タンパク質として
形成される。
めに、3ml LBam pkan培地にプラスミド含有クロー
ンを接種し、振盪器で30℃でインキュベートした。O
D550nm 光学濃度0.5で細胞を0.5mM IPTG
で誘導し、振盪器で30℃で4時間インキュベートし
た。次いで個々の発現クローンの光学濃度を測定し、
5.0/mlのOD550 に対応するアリコートを取り出
し、細胞を遠心分離した(10分、6000rpm、4
℃)。細胞ペレットを400μl TEバッファー(5
0mM トリス/50mM EDTA、pH 8.0)
中に再懸濁し、細胞を超音波により破砕し、遠心分離
(10分、14000rpm、4℃)により可溶性タン
パク質画分を不溶性タンパク質画分から分離した。SD
Sおよびβ−メルカプトエタノールを含む負荷用バッフ
ァーを全画分に添加し、タンパク質を煮沸(5分、10
0℃)により変性させた。その後、各10μlを分析用
SDSゲル(8%)により分析した(Laemmli U.K., 19
70, Nature 227: 555-557 )。
発現を示す。強く過剰発現した追加のバンドが、非誘導
対照クローンまたはプラスミドを含まない誘導対照クロ
ーンでは観察されない約95kDaで見られる。過剰発
現したβ−鎖の大部分が不溶性タンパク質画分に現れる
が、微量の過剰発現がまた可溶性タンパク質画分に見ら
れる。
両方の鎖の発現 1つの細胞で両方の鎖を発現するために、lacIq 発
現カセットおよびdnaY発現カセットをヘルパープラ
スミドpUBS520から発現プラスミド上へ最初に再
クローン化するべきである。lacIq 発現カセットを
pAMV−α上へクローン化し、dnaY発現カセット
を発現プラスミドpAMV−β上へクローン化した。発
現プラスミドの安定した増殖を確保するために、pAM
V−α由来のアンピシリン耐性遺伝子をpUBS520
由来のカナマイシン耐性遺伝子に置き換えた。次いで、
得られた発現プラスミドpAMV−αlacIq およびpA
MV−βdnaYを種々の大腸菌発現株で同時形質転換し
た。
ドする遺伝子を発現するために、3ml LBampkan培
地にプラスミド含有クローンを接種し、振盪器で30℃
でインキュベートした。OD550nm 0.5で細胞を0.
5mM IPTGで誘導し、振盪器で30℃で4時間イ
ンキュベートした。次いで個々の発現クローンの光学濃
度を測定し、5.0/mlのOD550 に対応するアリコ
ートを取り出し、細胞を遠心分離した(10分、600
0rpm、4℃)。細胞ペレットを400μlTEバッ
ファー(50mM トリス/50mM EDTA、pH
8.0)中に再懸濁し、細胞を超音波により破砕し、
遠心分離(10分、14000rpm、4℃)により可
溶性タンパク質画分を不溶性タンパク質画分から分離し
た。SDSおよびβ−メルカプトエタノールを含む負荷
用バッファーを全画分に添加し、タンパク質を煮沸(5
分、100℃)により変性させた。その後、各10μl
を分析用SDSゲル(8%)により分析した(Laemmli
U.K., 1970, Nature 227: 555-557 )。
およびβ−鎖の明白な過剰発現を示す。強く過剰発現し
た追加のバンドが、非誘導対照クローンまたはプラスミ
ドを含まない誘導対照クローンでは観察されない約63
kDaおよび約95kDaで見られる。可溶性画分およ
び不溶性画分におけるバンドの分布は、両方の鎖が別々
に発現された実験のものと同様である。両方の鎖の発現
の産出(output)は、別々の発現に対するものよ
り全体的にみていくらか少ない。
β−鎖の発現 3.1 種々の融合タンパク質の産生 効率よく組換えAMV−RTヘテロダイマーを精製する
ために、適切なペプチド配列、いわゆるタグを両方の鎖
の5’末端で融合した。タグはアフィニティークロマト
ラフィーを行なうことを可能にする。2つのタグの1つ
に各々特異的な2つのアフィニティークロマトグラフィ
ーの連続は、さらに純粋なヘテロダイマーの単離を可能
にする(Wende W.ら、1996, Biol. Chem. 377, 625-63
2)。適切なプライマー設計を使用して、PCR反応に
よりα−鎖に8つのアルギニン残基を、β−鎖に6つの
ヒスチジン残基を結合した。センスプライマーの配列
を、配列番号:8(α−鎖に対する5’プライマー)お
よび配列番号:9(β−鎖に対する5’プライマー)に
示す。遺伝子単離のためにすでに使用した配列番号:2
(β−鎖)および配列番号:3(α−鎖)のオリゴヌク
レオチドを、アンチセンスプライマーとして使用した。
し、α−鎖に対して1739bpおよびβ−鎖に対して
2597bpのPCRフラグメントをアガロースゲル
(QIAEX II, Gel Extraction Kit, Qiagen, Germany )
から単離し、制限エンドヌクレアーゼEcoRIおよび
PstIで切断し、同様にEcoRIおよびPstIで
線形にして単離しておいた好ましい発現プラスミドのベ
クターフラグメントにクローン化した。このために、1
μl(20ng)ベクターフラグメントおよび3μl
(100ng)PCRフラグメント、1μl 10×リ
ガーゼバッファー(Maniatisら、1989 Molecular Cloni
ng: A Laboratory Manual, second Edition,Cold Sprin
g Habor Laboratory Press NY (USA), vol. 27 )、1
μl T4DNAリガーゼ、4μl滅菌H2 O
bidistilled をピペッティングし、注意深く混合し、1
6℃で一晩インキュベートした。次いでクローン化した
遺伝子を制限分析およびシークエンシングにより調べ
た。得られた発現プラスミドをpAMV−αlacIq-Arg
およびpAMV−βdnaY-Hisと命名した。
スミドpAMV−αlacIq-Arg およびpAMV−β
dnaY-Hisの形質転換 種々の大腸菌株のコンピテント細胞をHanahan の方法
(J. Mol. Biol. 1983,vol. 166 pp. 557 )により調
製した(実施例2.2を参照のこと)。
融合したタグを有する両方の鎖の発現 細胞中でタグを有する両方の鎖を発現するために、種々
の大腸菌発現株を発現プラスミドpAMV−α
lacIq-Arg およびpAMV−βdnaY-Hisと同時形質転換
した。
鎖およびHis−タグを有するβ−鎖をコードする遺伝
子を発現するために、プラスミド含有クローンを3ml
LBampkan培地に接種し、振盪器で30℃でインキュ
ベートした。OD550 0.5で細胞を0.5mM IP
TGで誘導し、振盪器で30℃で4時間インキュベート
した。次いで個々の発現クローンの光学濃度を測定し、
5/mlのOD550 に対応するアリコートを取り出し、
細胞を遠心分離した(10分、6000rpm、4
℃)。細胞ペレットを400μl TEバッファー(5
0mM トリス/50mM EDTA、pH 8.0)
中に再懸濁し、細胞を超音波により破砕し、遠心分離
(10分、14000rpm、4℃)により可溶性タン
パク質画分を不溶性タンパク質画分から分離した。SD
Sおよびβ−メルカプトエタノールを含む負荷用バッフ
ァーを全画分に添加し、タンパク質を煮沸(5分、10
0℃)により変性させた。その後、各10μlを8%分
析用SDSゲルにより分析した(Laemmli U.K., 1970,
Nature 227: 555-557 )。
およびβ−鎖の明白な過剰発現を示す。強く過剰発現し
た追加のバンドが、非誘導対照クローンまたはプラスミ
ドを含まない誘導対照クローンでは観察されない約63
kDaおよび約95kDaで見られる。可溶性画分およ
び不溶性画分におけるバンドの分布は、両方の鎖を1つ
の細胞においてタグなしで別々に発現させた実験のもの
と同様である。
る両方の鎖の発現 AMV−RTのα−鎖およびβ−鎖に対する遺伝子が2
つのプラスミド上に分布する場合、これらのプラスミド
の安定性の差異は、それぞれの鎖の異なる量の産生、し
たがって低収量のαβ−鎖のヘテロダイマーをもたらし
うる。このため、βラクタマーゼに対する遺伝子を除く
2つのプラスミドpAMV−αlacIq-Ar g およびpAM
V−βdnaY-Hisの全遺伝子情報を、単一のプラスミドp
AMV−αβ−1上で結合した。T5プロモーターに対
する配列、N−末端Hisタグを有するβ−鎖をコード
する遺伝子、rrnBターミネーターに対する配列およ
びdnaY遺伝子を含むpAMV−βdnaY-HisのSsp
I−AflIIIフラグメントを、T5プロモーターに
対する配列、N−末端Arg−タグを有するα−鎖をコ
ードする遺伝子、rrnBターミネーターに対する配
列、カナマイシン耐性遺伝子およびlacIq 遺伝子を
含むpAMV−αlacIq-Arg のSalI切断部位に挿入
することにより、このプラスミドを構築した。この目的
のために、発現プラスミドpAMV−αlacIq-Arg およ
びpAMV−βdnaY-Hisの各1μg々を、製造業者の指
示書に従って上記制限エンドヌクレアーゼで切断し、制
限混合物を1%アガロースゲルで分離し、pAMV−β
dnaY-Hisの4124bp SspI−AflIIIフラ
グメントおよびpAMV−αlacIq-Arg の6024bp
フラグメントをアガロースゲル(QIAEX II, Gel Extrac
tion Kit, Qiagen/Germany)から単離した。非適合末端
を、製造業者の指示書に従ってクレノウポリメラーゼ
(Roche Diagnostics GmbH)を用いて調製し、上記のよ
うに2つのフラグメントを互いに連結させた。得られる
新しい発現プラスミドpAMVαβ−1を制限分析によ
り調べた。
上記のように大腸菌K−12株LE392で形質転換
し、発現制御に供した。次いで、誘導条件下で4時間増
殖した後、細胞のタンパク質含量をSDS−PAGEに
より調べた。SDS−PAGE分析により、発現産出の
レベルおよび可溶性画分および不溶性画分の相対比は別
々のプラスミド上のα−鎖およびβ−鎖に対する遺伝子
の発現に匹敵するが、発現したα−鎖およびβ−鎖の量
は、より均一であるようにみえる。さらに、精製手順の
ために、β−鎖のものと同様のHis−タグによりα−
鎖のArg−タグを置換した。この目的のために、pA
MV−αlacIq-Arg 由来のEcoRI−NheIフラグ
メントがpAMV−βdnaY-His由来のEcoRI−Nh
eIフラグメントに置換された中間構築物pAMV−α
lacIq-His を調製した。次いで、pAMVαβ−1の構
築物のように、βラクタマーゼに対する遺伝子を除く2
つのプラスミドpAMV−αlacIq-His およびpAMV
−βdnaY-Hisの全遺伝子情報を単一のプラスミドpAM
Vαβ−2上で結合した。新しい発現ベクターをpAM
Vαβ−2と名付けた。細胞を上記のようにpAMVα
β−2で形質転換し、標準条件下で発現制御に供した。
発現産出は、この条件下で増加しなかった。
Tの発現の増加 特定の増殖および誘導条件は、活性AMV−RTの発現
に正の効果を有する。その後、増殖温度を誘導期間中3
0℃から15℃に下げ、IPTG濃度を0.5mMから
0.15mMに低減して発現を誘導し、誘導時間を4時
間から26時間に増やした。誘導期後、細胞のタンパク
質含量をSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により
上記のように調べた。
は、予期したとおり、SDS−PAGE分析で実質的に
低減したが、可溶性発現α−鎖およびβ−鎖の含量は、
標準増殖および誘導条件下での発現実験と比較してかな
り増加した。活性AMV−RTの発現におけるこの増加
もまた、次の精製および活性測定で確認された。
性AMV−RTの発現の増加 4.2.1.トリプトファン−tRNA(tRN
Atrp )に対する遺伝子の共発現 AMV−RTの1つの特性は、真核生物宿主細胞の感染
後、ポリメラーゼ反応のためのプライマーとしてのトリ
プトファンに対する内因性細胞tRNA(tRN
Atrp )の使用である(Leisら、1993, in: Reverse Tr
anscriptase, Cold Spring Harbor Monograph Series,
eds.: Skala, A. M.およびGoff, S. P., ColdSpring Ha
rbor NY (USA), 33-48 )。しかしながら、内因性大腸
菌tRNAtrpがプライマーとしてAMV−RTにより
使用されうるかどうかは、証明されていない。大腸菌に
おいて、tRNAtrp は単一の遺伝子trpTによりコ
ードされるのみであり、その発現は細胞の通常の要求に
適合する。細胞におけるtRNA trp の潜在的欠失を除
外するために、配列番号:10によるtrpT遺伝子を
大腸菌LE392からPCRにより単離し(このために
使用されたプライマーは配列番号:11および12に示
す)、pAMV−αlacIq-His への挿入のためにPst
Iで再切断し、同様にPstIで線形にしたpAMV−
αlacIq-His のベクターフラグメントに上記のように結
合した。PstI制限エンドヌクレアーゼ切断部位にT
rp遺伝子を組み込んだクローンを制限分析およびシー
クエンシングにより確認した。この中間構築物pAMV
−αlacIq-His-trpTにおいて、α−鎖に対する遺伝子お
よび大腸菌tRNAtrp に対する遺伝子が1つの転写ユ
ニットを形成し、その発現はIPTG誘導T5プロモー
ターにより調節される。次いで、pAMVαβ−1また
はpAMVαβ−2の構築と同様に、βラクタマーゼに
対する遺伝子を除く2つのプラスミドpAMV−α
lacIq-His-trpTおよびpAMV−βdnaY-Hisの全遺伝子
情報を単一プラスミドpAMVαβ−3上で結合した。
細胞を上記のようにpAMVαβ−3で形質転換し、修
正発現条件を用いて発現制御に供した。その後、AMV
−RTの収量が有意に増加した。
J、GrpEおよびClpBからなる4成分システムと
を有する、2個の主要シャペロンシステムがある(Kedz
ierska, 1999)。両システムは、新しく形成されたタン
パク質の正しいフォールディングにおいて、およびスト
レスの結果凝集したタンパク質の再生において重要な役
割を果たす(Hartl F.U., 1996, Nature 381, 571-580;
Bukau H.および Horwich A.L., 1998, Cell 92, 351-3
66; MogK A.ら、EMBO J. 18, 6934-6949; Zolkiewski
M., 1999, J. Biol. Chem. 274, 28083-28086; Goloubi
noffP. ら、1999, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 13
732-13737)。
オペロンをAMV−RT産生株において過剰発現させる
べきである。このため、pOF39(Fayet O., Louarn
J.-M., Georgopoulos C., 1986, Mol. Gen. Genet. vo
l. 202,pp 335-345 由来のEcoRI−HindIII
フラグメントを、プラスミドpAMV−βdnaY-HisのS
spI切断部位に組み込んだ。ライゲーションの前に、
製造業者の指示書に従って、クレノウポリメラーゼ(Ro
che Diagnostics )を用いて非適合末端を調製した。g
roESLの配列を配列番号:13に示す。この新しい
構築物pAMV−βdnaY-His-groESL において、gro
ESLオペロンは、3’に存在するβラクタマーゼの遺
伝子を含有する人工転写単位を構成する。次いで、発現
は、ここではgroESLオペロンの5’側にある内因
性bla構成的プロモーターの制御下および/ またはg
roESLオペロンのσ32依存性プロモーターの制御下
のいずれかにある。続いて、βラクタマーゼの遺伝子を
除く2個の発現プラスミドpAMV−αlacIq-His-trpT
およびpAMV−βdnaY-His-groESL の全遺伝情報を、
上記のようにして単一のプラスミドpAMVαβ−4上
で再度結合した。
て細胞を形質転換し、修正した発現条件下で発現制御に
供した。GroESLの同時過剰産生は、バイオマスの
増加および活性AMV−RT量の増加をもたらす。精製
および活性試験後、これまでで最も優れた産生株と比
べ、3倍から4倍高い値が得られた。
の同時過剰産生が陽性測定値であることがわかった後、
第2工程において大腸菌の他方の主要シャペロンシステ
ムをさらに同時過剰産生させた。この同時過剰産生の予
想される一般的な利点に加えて、これは、GroESL
機構の不都合、すなわち約65kDaの排除容積(Deue
rling E.ら、1999, Nature 400, 693-696 )を補いう
る。このことは、それが互いに独立して形成される単一
ドメインに分割され得ないならば、AMV−RT(93
kDa)のβ鎖の正しいフォールディングのために特に
重要であるはずである。遺伝子DnaK、DnaJおよ
びGrpEを、該生理学的結合に対応する人工のオペロ
ン内で結合したが(Diamant S.および Goloubinoff P.,
1998, Biochemistry 37, 9688-9694; Pierpaoli E.V.
ら、1998, J. Biol. Chem. 273, 6643-6649 )、Clp
Bの遺伝子は、自身の転写単位を構成する。AMV−R
Tのサブユニットの遺伝子との発現を同調(coordinat
e)させるために、両転写単位をIPTG誘導性T5プ
ロモーターの制御下に置いた。
は、最終構築物pCHAP−5への経路において、いく
つかの中間工程を必要とした。したがって、pKKT5
誘導体であるpCHAP−1およびpCHAP−2をま
ず構築した。pCHAP−1は、dnaKの開始コドン
から開始してdnaJの終止コドンまでの大腸菌由来d
naKJオペロンの遺伝情報を含み;pCHAP−2
は、GrpEおよびClpBの遺伝子のコード領域由来
の人工転写単位を挿入フラグメントとして保有し;対応
するDNAフラグメントを大腸菌K12KE392のゲ
ノムDNAからPCRにより増幅した。dnaKJオペ
ロンの配列を配列番号:14に、dnaKJオペロンの
単離に使用した対応のプライマーを配列番号:15およ
び16に示す。grpE遺伝子の配列を配列番号:17
に、grpE遺伝子の単離のための対応するプライマー
を配列番号:18および19に示す。clpB遺伝子の
配列を配列番号:20に、clpB遺伝子の単離のため
の対応するプライマーを配列番号:21および22に示
す。pCHAP−1を構築するため、dnaKJオペロ
ンを含むPCRフラグメントを、SmaIおよびBam
HIで再度切断し、同様にSmaIおよびBamHIで
線状化しておいたpKKT5のベクターフラグメントに
上述のようにして連結した。pCHAP−2は、grp
E遺伝子のEcoRI−PstIフラグメント、clp
B−遺伝子のPstI−HindIIIフラグメント、
ならびにEcoRIおよびHindIIIで線状化した
pKKT5のベクターフラグメントでの3倍(three-fo
ld)ライゲーションにより構築した。clpB遺伝子が
転写単位として単独で存在するpCHAP−3は、上述
のようにしてEcoRIおよびHindIIIで線状化
したpKKT5のベクターフラグメントにpCHAP−
2由来PstI−HindIIIフラグメントを連結す
ることによりpCHAP−2から誘導する。ライゲーシ
ョン反応の前に、製造業者の指示書に従って、クレノウ
ポリメラーゼ(Roche Diagnostics )を用いてこの2個
のフラグメントの非適合末端を調製した。pCHAP−
4は、その挿入フラグメントがpCHAP−2由来gr
pE遺伝子により延長されたpCHAP−1誘導体であ
り、したがって人工転写単位は、DnaK、DnaJお
よびGrpEの遺伝子を含有する。この場合において最
適下限であるシャイン・ダルガーノ配列の結果、grp
Eの発現は、pCHAP−2と比べて低下するはずであ
り、したがって、dnaKJの発現に対してより良好に
適合(adapted )するはずである(Diamant & Goloubin
off, 1998; Pierpaoliら、1998)。pCHAP−4を構
築するため、製造業者の指示書に従って、クレノウポリ
メラーゼ(Roche Diagnostics )を用いてこの2個のフ
ラグメントの非適合末端を調製した後、pCHAP−2
由来EcoRI−AvaIフラグメントをpCHAP−
1のBamHI切断部位に挿入した。最終構築物pCH
AP−5は、追加の遺伝情報としてpCHAP−3の挿
入フラグメントを含むpCHAP−4誘導体である。こ
のため、すでに何度か記載しているような制限およびラ
イゲーションにより、pCHAP−4内のBspLU1
1I−NdeIフラグメントを、pCHAP−3由来の
BspLU11I−SspIに置換した。該末端の適合
性を確実にするため、製造業者の指示書に従って、クレ
ノウポリメラーゼ(Roche Diagnostics )にNdeIに
より生じた突出末端をあらかじめ平滑化(filled in )
した。
ヘルパープラスミドpCHAP−1〜pCHAP−5と
結合することの活性AMV−RTの過剰産生に対する効
果を調べた。少なくとも修正した標準発現条件下では、
すべてのヘルパープラスミドが、これまでの活性AMV
−RT収率をかなり増大させ、予期した通り、ヘルパー
プラスミドpCHAP−5が最も優れた結果をもたらし
た。このことは、SDS−PAGEならびに続く精製お
よび活性測定により確認した。
テムにより検出した。「逆転写酵素アッセイ非放射性(r
everse transcriptase assay non-radioactive) 」(Ro
che Molecular Biochemicals、カタログ番号14681
20)をこれに使用した。インキュベーション期間を3
0分間に短縮した。
により測定した。逆転写酵素活性を、100μl(50
mM Tris/HCl、pH8.3(37℃)、40
mM KCl、6mM MgCl2 、0.5mM dT
TP、0.04OD260 nm ポリ(A)×dT15、
0.1μM[3H]−dTTP)の試験容量において測
定した。AMV−RT(5μl)を適切な希釈率で添加
した。10分間37℃でインキュベートした後、10%
TCA溶液(500μl)で反応を停止した。形成され
た放射性標識産物を、沈殿させた後にニトロセルロース
フィルター上で洗浄した。放射能の取り込み率をシンチ
レーションカウンターで測定し、試料のRT活性を算出
した。一酵素単位を、37℃で10分間に酸不溶性産物
内に1.0nMol TMPを取り込んだAMV−RT
の量と定義した。
レーションの測定により調べた。該DNAポリメラーゼ
は、非放射性ニックトランスレーション試験により検出
した。ニックトランスレーションは、50μl(50m
M Tris/HCl、pH7.5、10mM MgC
l2 、0.1mM DTE、28.875μM DIG
−dUTP、1.444μM bio−16−dUT
P、95.865μM dTTP、20μM dAT
P、20μM dCTP、20μMdGTP、1μg
pBR322、1pg DNaseI)の試験容量にお
いて行った。試料(1μl)を添加した後、反応混合物
を37℃で30分間インキュベートした。その後、スト
レプトアビジンをコートしたマイクロタイタープレート
に反応混合物を移した。次の処理および試験の評価を
「逆転写酵素アッセイ非放射性」(Roche Molecular Bi
ochemicals、カタログ番号1468120)と同様に行
った。
is/HCl、pH7.5、10mM MgCl2 、1
mM DTEからなる溶液中にて行った。
酸とともにインキュベートした。いわゆるニッキング活
性を、プラスミドpBR322(1μg)とともに2〜
16時間37℃でインキュベートすることにより検出し
た。非特異的(unspecific)ヌクレアーゼを、λ−DN
A/EcoRI、HindIII(1μg)とともに2
〜16時間37℃でインキュベートすることにより検出
した。非特異的RNaseは、MSII−RNA(5μ
g)とともに2〜4時間37℃でインキュベートするこ
とにより検出した。
ため、試料を、4μgの[3H]標識DNAとともに3
7℃で4時間インキュベートし、その後、放出された
[3H]標識ヌクレオチドを測定した。
pAMV−βdnaY-His構築物由来AMV−RT 6.1.1.精製 AMV−RTの両鎖(上記参照)を過剰発現する大腸菌
細胞を出発原料として用い、組換えAMV−RTを精製
した。
細胞溶解後のクロマトグラフィー法および核酸の分離に
より行なった。精製工程により、夾雑酵素活性がなく、
RT−PCRにおいて天然物から精製したAMV−RT
と同じ機能性を有する組換えAMV−RTが生じる。
9、0.5M KCl、0.02%Triton X−
100、20%グリセロール、 バッファーB:20mM Tris/HCl、pH7.
9、0.25M KCl、0.02%Triton X
−100、10%グリセロール、 バッファーC:20mM Tris/HCl、pH7.
9、0.25M KCl、0.02%Triton X
−100、10%グリセロール、1Mイミダゾール、 バッファーD:50mM Tris/HCl、pH8.
2、0.1mM EDTA、1mM DTT、0.02
%Triton X−100、10%グリセロール、 バッファーE:20mMリン酸カリウム、pH7.1、
0.1mM EDTA、1mM DTT、0.02%T
riton X−100、10%グリセロール、 保存バッファー:200mMリン酸カリウム、pH7.
2、2mM DTT、0.2%Triton X−10
0、50%グリセロール
凍および懸濁させた大腸菌LE392細胞(pAMV−
αlacIq-Arg /pAMV−βdnaY-His)約50gに添加
した。2錠のComplete(Roche Molecular Bioc
hemicals、カタログ番号1697498)を懸濁液に加
えた。続いて、冷却(温度:<10℃)しながら細胞を
超音波(Branson sonicator )により溶解した。達成さ
れた細胞懸濁液の溶解程度は典型的には40〜50%で
あった。
lymin )沈殿により除去した。5mlの10%ポリミン
P溶液を滴下した。沈殿が不完全な場合、さらなる滴下
を行った。30分間4℃でのインキュベーション後、遠
心分離を行った(30分間、13000rpm、4
℃)。
ィー:清澄な遠心分離上清みを、バッファーB(1+
1)で希釈し、バッファーBで平衡化しておいたニッケ
ル負荷キレートセファロースffカラム(2.6cm×
10cm、Pharmacia )に吸収させ、次いで、それを約
500mlのバッファーB、その後200mlのバッフ
ァーB+10mMイミダゾールおよび200mlのバッ
ファーB+20mMイミダゾールで洗浄した。全容量5
00mlで、バッファーB+20mMイミダゾールおよ
びバッファーCの直線勾配によって酵素を溶出した。流
速は1分あたり5mlであり、画分サイズは画分あたり
20mlであった。酵素は50mM〜200mMの間で
溶出された。活性画分のプールをバッファーDに対して
透析した。
フィー:続いて、透析したプールを、バッファーDで平
衡化したヘパリン−セファロースffカラム(1.6c
m×10cm、Pharmacia )に吸収させ、約200ml
のバッファーD、次いで約200mlのバッファーD+
300mM KClで洗浄した。全容量200mlで、
バッファーD+300mM KClからバッファーD+
1M KClの直線勾配によって酵素を溶出した。流速
は1分あたり2.5mlであり、画分サイズは10ml
であった。AMV−RTは500mM〜700mMのK
Cl濃度で溶出された。
ィー:RT−活性画分をプールし、バッファーEに対し
て透析した。バッファーEで平衡化したS−セファロー
スffカラム(1.6cm×10cm、Pharmacia )に
透析物を負荷した。約200mlのバッファーEで洗浄
した後、全容量400mlで、バッファーEからバッフ
ァーE+1M KClの直線勾配によって酵素を溶出し
た。流速は1分あたり2.5mlであり、画分サイズは
10mlであった。
ィー:RT−活性画分をプールし、バッファーEに対し
て透析した。バッファーEで平衡化したHA−ultr
ogelカラム(1.6cm×10cm、Biosepra)に
透析物を負荷した。約200mlのバッファーEで洗浄
した後、全容量400mlで、バッファーEからバッフ
ァーE+0.5M リン酸カリウムの直線勾配によって
酵素を溶出した。流速は1分あたり2.5mlであり、
画分サイズは10mlであった。
ーに対して透析した。SDSおよびβ−メルカプロエタ
ノールを含有する負荷用バッファーを精製タンパク質に
添加し、試料を煮沸(5分間、100℃)により変性さ
せた。続いて、20μlのアリコートを解析用SDSゲ
ル(4〜20%)(Laemmli UK., 1970, Nature 227:55
5-557)により解析した。AMV−RTのα−サブユニ
ットおよびβ−サブユニットが当モル比で見出された。
が、α−サブユニットおよびβ−サブユニットの等モル
分布を伴って生じる。得られた酵素はRT−PCRにお
いて機能性である。
試験 得られた組換えAMV逆転写酵素を、機能性試験におい
て調べた。機能性試験は、ポリメラーゼ連鎖反応(PC
R)と組み合わせた逆転写(RT)から構成された。こ
のため、5単位の組換えAMV逆転写酵素を、Tita
n TM One Tube PCR System
(カタログ番号1888382、Roche Molecular Bioc
hemicals)の酵素混合物のように使用した。ヒトジスト
ロフィン遺伝子の1.8kbフラグメントを増幅した。
10ngのヒト筋肉RNAを鋳型として用いた。プライ
マー(400nM)は、Dysプライマー2reV
(5’GAG TGA ATA CAG TTT GC
C CAT GGA TTG−3)およびDysプライ
マー8for(5’−AAG AAG TAG AGG
ACT GTT ATG AAA GAG AAG−
3’)であった。標的を、以下のプログラム:50℃で
30分、94℃で2分、続いて10サイクル(94℃で
10秒、58℃で30秒、68℃で1分10秒)および
20サイクル(94℃で10秒、58℃で30秒、68
℃で1分10秒;+10秒/サイクル)を用いてRT−
PCRにより増幅した。続いて、それを68℃で7分間
インキュベートした。1%アガロースゲルで反応を停止
させた後、RT−PCRの反応産物を分離した(図
1)。
2)および組換え手段により得られたAMV−RT(レ
ーン3)を用いて得られた1.8kbのサイズのRT−
PCR増幅産物を示す。レーン1および4は、DNA分
子量マーカーVI(カタログ番号1062590、Roch
e Molecular Biochemicals)を示す。
−4+pCHAP−5構築物由来AMV−RT 6.2.1.精製 AMV−RTの両鎖(上記参照)を過剰発現する大腸菌
LE392 pAMVαβ−4+pCHAP−5細胞を
出発原料として用い、組換えAMV−RTを精製した。
細胞溶解後のクロマトグラフィー法および核酸の分離に
より行なった。精製工程により、夾雑酵素活性がなく、
RT−PCRにおいて天然物から精製したAMV−RT
と同じ機能性を有する組換えAMV−RTが生じる。
M NaCl、3mM2−メルカプトエタノール、10
%グリセロール、 バッファーB:50mM NaPO4 、pH5.0、1
M NaCl、3mM2−メルカプトエタノール、10
%グリセロール、 バッファーC:50mM NaPO4 、pH6.0、1
M NaCl、3mM2−メルカプトエタノール、10
%グリセロール、0.2Mイミダゾール、 バッファーD:50mM NaPO4 、pH7.7、1
M NaCl、3mM2−メルカプトエタノール、10
%グリセロール、0.5Mイミダゾール バッファーE:50mM NaPO4 、pH6.0、3
mM 2−メルカプトエタノール、10%グリセロー
ル、 保存バッファー:200mMリン酸カリウム、pH7.
2、2mM DTT、0.2%Triton X−10
0、50%グリセロール
pAMV−αβ−4+pCHAP−5細胞を400ml
のバッファーAと混合し、解凍し、懸濁した。2錠のC
omplete(Roche Molecular Biochemicals、カタ
ログ番号1697498)を懸濁液に加えた。続いて、
冷却(温度:<10℃)しながら細胞を超音波(Branso
n sonicator )により溶解した。達成された細胞懸濁液
の溶解程度は典型的には40〜50%であった。
により除去した。5mlの10%ポリミンP溶液を滴下
した。沈殿が不完全な場合、さらなる滴下を行った。3
0分間4℃でのインキュベーション後、遠心分離を行っ
た(30分間、13000rpm、4℃)。
ラムでのアフィニティークロマトグラフィー:清澄な遠
心分離上清みを、バッファーAで平衡化しておいたニッ
ケル負荷キレートセファロースffカラム(2.6cm
×10cm、Pharmacia )に吸収させ、次いで、それを
約500mlのバッファーA、その後500mlのバッ
ファーBおよび500mlのバッファーCで洗浄した。
全容量500mlのバッファーDによって酵素を溶出し
た。流速は1分あたり5mlであり、画分サイズは画分
あたり20mlであった。活性画分のプールをバッファ
ーEに対して透析した。
フィー:続いて、透析したプールを、バッファーE+2
50mM NaClで平衡化したヘパリン−セファロー
スffカラム(1.6cm×10cm、Pharmacia )に
吸収させ、約200mlのバッファーE+250mM
NaClで洗浄した。全容量200mlで、バッファー
E+250mM NaClからバッファーE+1M N
aClの直線勾配によって酵素を溶出した。流速は1分
あたり2.5mlであり、画分サイズは10mlであっ
た。AMV−RTは500mM〜700mMのNaCl
濃度で溶出された。
ーに対して透析した。SDSおよびβ−メルカプロエタ
ノールを含有する負荷用バッファーを精製タンパク質に
添加し、試料を煮沸(5分間、100℃)により変性さ
せた。続いて、20μlのアリコートを解析用SDSゲ
ル(4〜20%)(Laemmli UK., 1970, Nature 227:55
5-557)により解析した。AMV−RTのα−サブユニ
ットおよびβ−サブユニットが当モル比で見出された
(図2、レーン6)。
たSDSゲルを示す。 レーン1:分子量マーカー レーン2:天然AMV レーン3:細胞溶解 レーン4:Ni−キレートセファロース、バッファーC
で洗浄 レーン5:Ni−キレートプール レーン6:組換え(rec.)AMV−RT最終調製物
が、α−サブユニットおよびβ−サブユニットの当モル
分布を伴って生じる。得られた酵素はRT−PCRにお
いて機能性である。
試験 得られた組換えAMV逆転写酵素を、機能性試験におい
て調べた。機能性試験は、逆転写(RT)、続くポリメ
ラーゼ連鎖反応(PCR)から構成された。10uni
tの組換えAMV逆転写酵素をこれに用いた。ヒトジス
トロフィン遺伝子の8kb、10kb、12kbおよび
13.5kbフラグメントを増幅した。
た。プライマー(400nM)は、8kbでは、Dys
プライマー2for(5’−CAA TCC ATG
GGC AAA CTG TAT TCA CTC−
3’)およびDysプライマー5rev(5’−CGT
CCC GTA TCA TAA ACA TTCA
GC AGC−3’)、10kbでは、Dysプライマ
ー8for(5’−AAG AAG TAG AGG
ACT GTT ATG AAA GAG AA−
3’)および5rev、12kbでは、Dysプライマ
ー8forおよびDysプライマー9rev(5’−A
GC AGG TAA GCC TGG ATG AC
T GAC TAG AAG−3’)、および13.5
kbでは、Dysプライマー8forおよび10rev
(5’−AAT CAA TCA ACC AAC C
GA AAT CTC ACT CTG−3’)であっ
た。cDNA合成を42℃で60分間行なった。
ログ番号1495062、Roche Molecular Biochemica
ls)の製品情報の指示書に従って行った。
e PCR System(カタログ番号168183
4、Roche Molecular Biochemicals)をPCRに使用し
た。以下のPCRプログラム:94℃で2分、続いて1
0サイクル(94℃で10秒、60℃で30秒、68℃
で10分)および20サイクル(94℃で10秒、60
℃で30秒、68℃で10分 10+10秒/サイク
ル)を用いて標的を増幅した。続いて、それを68℃で
5分間インキュベートした。反応を停止させた後、RT
−PCRの反応産物を1%アガロースゲルで分離した
(図3)。レーン3およびレーン6は、DNA分子量マ
ーカーX(カタログ番号1498037、Roche Molecu
lar Biochemicals)を示す。
−PCRの反応産物が分離されたアガロースゲルを示
す;レーン1:8kb増幅産物、レーン2:10kb増
幅産物、レーン3:DNA長標準X、レーン4:12k
b増幅産物、レーン5:13.5kb増幅産物、レーン
6:DNA長標準X。
列に基づき設計されたプライマーの配列である。
クレオチド配列に基づき設計されたプライマーの配列で
ある。
クレオチド配列に基づき設計されたプライマーの配列で
ある。
クレオチド配列に基づき設計されたプライマーの配列で
ある。
クレオチド配列に基づき設計されたプライマーの配列で
ある。
rpT遺伝子のヌクレオチド配列に基づき設計されたプ
ライマーの配列である。
rpT遺伝子のヌクレオチド配列に基づき設計されたプ
ライマーの配列である。
ペロンのヌクレオチド配列に基づき設計されたプライマ
ーの配列である。
ペロンのヌクレオチド配列に基づき設計されたプライマ
ーの配列である。
子のヌクレオチド配列に基づき設計されたプライマーの
配列である。
子のヌクレオチド配列に基づき設計されたプライマーの
配列である。
子のヌクレオチド配列に基づき設計されたプライマーの
配列である。
子のヌクレオチド配列に基づき設計されたプライマーの
配列である。
V−RTのαサブユニットおよびβサブユニットを発現
させることにより、充分な量の組換え活性ヘテロダイマ
ーAMV−RTを得ることができる。
よび組換え手段により得られたAMV−RT(レーン
3)を用いて得られた1.8kbのサイズのRT−PC
R増幅産物を示す。レーン1および4は、DNA分子量
マーカーVI(カタログ番号1062590、Roche Mo
lecular Biochemicals)を示す。
DSゲルを示す。 レーン1:分子量マーカー レーン2:天然AMV レーン3:細胞溶解 レーン4:Ni−キレートセファロース、バッファーC
で洗浄 レーン5:Ni−キレートプール レーン6:組換え(rec.)AMV−RT最終調製物
CRの反応産物が分離されたアガロースゲルを示す;レ
ーン1:8kb増幅産物、レーン2:10kb増幅産
物、レーン3:DNA長標準X、レーン4:12kb増
幅産物、レーン5:13.5kb増幅産物、レーン6:
DNA長標準X。
16)
Claims (21)
- 【請求項1】 (i)AMV−RTのα鎖および/また
はβ鎖をコードする1つまたはいくつかのDNA配列が
発現プラスミドにクローン化される、(ii)発現プラス
ミドが原核細胞に形質転換される、(iii )ヘテロダイ
マーAMV−RTの可溶性発現が誘導される、および
(iv)組換えヘテロダイマーAMV−RTが細胞から単
離される、原核生物宿主細胞において活性ヘテロダイマ
ーAMV−RTを産生する方法。 - 【請求項2】 α鎖をコードするDNA配列およびβ鎖
をコードするDNA配列が、1つの細胞にクローン化さ
れた別々の発現プラスミド上で発現される、請求項1記
載の方法。 - 【請求項3】 α鎖をコードするDNA配列およびβ鎖
をコードするDNA配列が、1つの細胞にクローン化さ
れた1つの発現プラスミド上で発現される、請求項1記
載の方法。 - 【請求項4】 α鎖ならびにβ鎖がペプチド配列に融合
される、請求項1〜3いずれかに記載の方法。 - 【請求項5】 α鎖またはβ鎖が、2〜10のアルギニ
ン残基からなるペプチド配列と融合され、β鎖またはα
鎖が、2〜10のヒスチジン残基からなるペプチド配列
と融合される、請求項4記載の方法。 - 【請求項6】 可逆的な結合が可能であるペプチド配列
をコードするDNA配列に連結されるα鎖をコードする
DNA配列およびβ鎖をコードするDNA配列が、1つ
の細胞にクローン化された1つの発現プラスミドにおい
て発現される、請求項1〜5いずれかに記載の方法。 - 【請求項7】 α鎖およびβ鎖が、可逆的な結合が可能
である同一のペプチド配列と融合される、請求項1〜6
いずれかに記載の方法。 - 【請求項8】 α鎖およびβ鎖が、2〜10のヒスチジ
ン残基からなるペプチド配列と各々融合される、請求項
7記載の方法。 - 【請求項9】 発現が、10℃〜25℃の増殖温度およ
び減少したインデューサー濃度で生じる、請求項1〜8
いずれかに記載の方法。 - 【請求項10】 発現が、ヘルパー遺伝子の共発現によ
り増大される、請求項1〜9いずれかに記載の方法。 - 【請求項11】 トリプトファンtRNAをコードする
trpT遺伝子がヘルパー遺伝子として使用される、請
求項10記載の方法 。 - 【請求項12】 発現がシャペロン遺伝子の共発現によ
り増大される、請求項10記載の方法。 - 【請求項13】 GroELおよびGroES、Dna
KおよびDnaJ、GrpEおよび/またはClpBを
コードする遺伝子が共発現される、請求項10または1
2記載の方法。 - 【請求項14】 GroELおよびGroESをコード
する遺伝子が、α鎖をコードする遺伝子およびβ鎖をコ
ードする遺伝子をも保有する発現プラスミド上にクロー
ン化され、DnaK、DnaJ、GrpEおよびClp
Bをコードする遺伝子がヘルパープラスミド上にクロー
ン化される、請求項12または13記載の方法。 - 【請求項15】 適切なアフィニティークロマトグラフ
ィー材料が、組換えヘテロダイマーAMV−RTを単離
または精製するために使用される、請求項1〜8記載い
ずれかに記載の方法。 - 【請求項16】 精製に使用されるアフィニティークロ
マトグラフィー材料がα鎖および/またはβ鎖に結合し
た異なるペプチド配列に可逆的に結合する、請求項15
記載の方法。 - 【請求項17】 精製に使用されるアフィニティークロ
マトグラフィー材料が、金属イオンキレート化材料また
はカチオン交換体である、請求項15または16記載の
方法。 - 【請求項18】 配列番号:5のDNA配列または配列
番号:4および配列番号:5のDNA配列が原核生物宿
主細胞において発現される、請求項1〜17いずれかに
記載の方法。 - 【請求項19】 大腸菌が宿主細胞として使用される、
請求項1〜18いずれかに記載の方法。 - 【請求項20】 活性ヘテロダイマーAMV−RTが、
配列番号:6および配列番号:7のサブユニットからな
る、請求項1〜19いずれかに記載の方法。 - 【請求項21】 RNA配列を増幅するための、請求項
1〜20いずれかに記載の方法により得られるAMV−
RTの使用。
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