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ES2243937T3 - Poxvirus recombinados en regiones esenciales con la ayuda de polinucleotidos extraños. - Google Patents

Poxvirus recombinados en regiones esenciales con la ayuda de polinucleotidos extraños.

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ES2243937T3
ES2243937T3 ES95919361T ES95919361T ES2243937T3 ES 2243937 T3 ES2243937 T3 ES 2243937T3 ES 95919361 T ES95919361 T ES 95919361T ES 95919361 T ES95919361 T ES 95919361T ES 2243937 T3 ES2243937 T3 ES 2243937T3
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poxvirus
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plasmid
virus
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ES95919361T
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Falko-Gunter Falkner
Georg Holzer
Friedrich Dorner
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Original Assignee
Baxter Healthcare SA
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Publication date
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Abstract

LOS POXVIRUS DEFECTIVOS QUE CARECEN DE UNA FUNCION IMPARTIDA POR UNA REGION ESENCIAL DE UN POXVIRUS PARENTAL, PUEDEN SER EMPLEADAS PARA PRODUCCION DE PROTEINAS Y VACUNACION, ENTRE OTROS USOS. UN POLINUCLEOTIDO QUE CODIFICA LA PROTEINA QUE SERA PRODUCIDA POR EL VIRUS RECOMBINANTE, SE INSERTA EN EL POXVIRUS DEFECTIVO, Y SE SITUA BAJO EL CONTROL TRANSCRIPCIONAL DE UN PROMOTOR. EL VIRUS DEFECTIVO ES VIABLE CUANDO LA FUNCION PERDIDA LA REGION ESENCIAL ES COMPLEMENTADA POR UNA CELULA HUESPED, UN ANIMAL TRANSGENICO, O UN VIRUS AUXILIAR.

Description

Poxvirus recombinados en regiones esenciales con la ayuda de polinucleótidos extraños.
Los poxvirus recombinantes han sido utilizados como vectores para la expresión de genes foráneos procedentes de una variedad de fuentes, tales como animales, plantas, protozoos, hongos, bacterias y virus. Adicionalmente, los poxvirus recombinantes pueden ser utilizados para expresar genes quiméricos y genes de origen sintético. Típicamente, los genes quiméricos y los genes sintéticos son secuencias de ADN que derivan de, o están basadas en, secuencias que existen en la naturaleza. Por ejemplo, secuencias de ADNc generadas a partir de transcritos de ARN, incluyendo los de retrovirus, pueden ser expresadas con vectores poxvirus recombinantes.
Los vectores poxvirus que se utilizan actualmente contienen ADN foráneo insertado en regiones genómicas que no son esenciales para la viabilidad del virus. Estos poxvirus que expresan genes foráneos son construidos normalmente por inserción de las secuencias foráneas en regiones genómicas que no son esenciales para el crecimiento del virus en cultivo celular mediante recombinación homóloga. Ver Panicali y Paoletti, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 79: 4927-31 (1982); Mackett y col., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 79: 7415-19 (1982). Preferiblemente, los poxvirus recombinantes pueden ser construidos mediante clonaje molecular directo. Ver EP 0 561 034; Scheiflinger y col., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 89: 9977-81 (1992); Merchlinsky y Moss, Virol. 190: 522-26 (1992). Los virus con ADN foráneo insertado en regiones no esenciales pueden crecer de manera autónoma en su organismo huésped y, de este modo, permanecer infecciosos para sus huéspedes respectivos.
La ausencia de los productos de las regiones no esenciales no perjudica demasiado a la viabilidad del poxvirus recombinante. En el caso de vaccinia, considerado a menudo como el poxvirus prototipo, una de las principales regiones no esenciales para la inserción es el gen de la timidina quinasa. Cuando un gen foráneo es insertado en el gen de la timidina quinasa de vaccinia, el producto del gen se pierde para el virus. No obstante, el vaccinia recombinante es todavía viable. Otros poxvirus son también susceptibles de manipulaciones similares en otras regiones no esenciales. Por ejemplo, se ha desarrollado un avipox recombinante, tal como el poxvirus de las aves de corral, en el que se ha insertado ADN foráneo en regiones no esenciales.
El vaccinia recombinante puede ser utilizado como una vacuna viva, en sistemas de expresión a gran escala y para una variedad de otros fines. Ver, Miner y Hruby, TIBTECH 8: 20-25 (1990). La utilización de estos virus recombinantes para la expresión de proteínas a gran escala presenta, sin embargo, riesgos significativos, ya que los virus conservan la capacidad infectiva. Por consiguiente, se requieren precauciones costosas y procedimientos tediosos cuando se manejan vaccinia recombinantes. Por ejemplo, se requiere la inactivación térmica de todos los medios, fluidos y material de laboratorio contaminado, además de un entrenamiento especial de todo el personal que maneje el virus. Se han considerado varios planteamientos para minimizar la necesidad de estas elaboradas precauciones. Por ejemplo, se han desarrollado cepas de vaccinia altamente atenuadas. Estas cepas altamente atenuadas tienen una infectividad limitada. Por consiguiente, se ha intentado la producción de proteínas con estas cepas altamente atenuadas. Desgraciadamente, las cepas de virus altamente atenuadas tienen un crecimiento lento y limitado que hace a menudo que estas cepas sean poco adecuadas para la producción de proteínas a gran escala.
Además de los poxvirus altamente atenuados, se conocen cepas deterioradas de otros virus. Por ejemplo, retrovirus deteriorados pueden ser cultivados en líneas celulares cooperadoras que sean capaces de complementar al virus deteriorado. Ver Kriegler, GENE TRANSFER AND EXPRESSION (Stockton Press, 1990) en 33-39; Mann y col., Cell 33: 153-59 (1983). Los retrovirus, sin embargo, son pequeños virus que contienen ARN que se multiplican por integración en el genoma de la célula huésped, lo que hace que estos virus no sean apropiados para ser utilizados como vectores de expresión o como vacunas.
Adenovirus deteriorados cultivados en células complementarias han sido utilizados como vacunas, según está descrito por Eloit y col., J. Gen. Virol. 71: 2425-31 (1990). Los adenovirus son virus de ADN de doble hebra que, en contraste con el virus vaccinia, se replican en el núcleo de las células infectadas y tienen un estrecho rango de huéspedes. Adicionalmente, se ha informado también del crecimiento de virus herpes deteriorados en células cooperadoras. Ver las publicaciones de PCT WO 94/03595, WO 94/21807 y WO 92/05263. El virus herpes se replica también en el núcleo de las células infectadas. El ADN desnudo del herpes, igual que el ADN de adenovirus, es infeccioso. Por consiguiente, los promotores de estos virus funcionan normalmente en la célula huésped.
En contraste con los poxvirus, los virus herpes y los adenovirus son virus nucleares. Sin embargo, los virus defectuosos derivados de virus nucleares tienen el potencial de rescatar las regiones defectuosas de la célula huésped mediante recombinación homóloga. Tales acontecimientos de recombinación son indeseables y peligrosos ya que el virus defectuoso puede retornar potencialmente al estado de tipo salvaje, lo cual tiene como resultado una infectividad y una virulencia incrementadas, además de la pérdida del gen foráneo insertado.
Debido a la necesidad de sistemas de expresión recombinantes y vacunas más seguros, se requieren procedimientos ingeniosos para diseñar poxvirus recombinantes fundamentalmente diferentes. El procedimiento descrito en la presente incluye la inserción de un gen foráneo en una región esencial del poxvirus.
Es por tanto un objeto de la presente invención el proporcionar poxvirus recombinantes capaces de expresar polinucleótidos foráneos, tales como ADN genómico y ADNc.
Es otro objeto de la presente invención el proporcionar poxvirus recombinantes que sean defectuosos porque carezcan de una función impartida por una región esencial del genoma del poxvirus.
Es otro objeto de la presente invención proporcionar poxvirus defectuosos que posean polinucleótidos foráneos insertados en regiones esenciales del genoma del poxvirus.
Es todavía otro objeto de la presente invención proporcionar poxvirus defectuosos que tengan eliminada toda o parte de una región esencial.
Es otro objeto más de la presente invención proporcionar poxvirus defectuosos que puedan ser utilizados como vacunas.
Para conseguir estos y otros objetos de la presente invención, se proporcionan, de acuerdo con un aspecto de la invención, poxvirus defectuosos que carecen de una función impartida por una región esencial de su poxvirus parental, conteniendo el poxvirus defectuoso un polinucleótido foráneo bajo el control transcripcional de un promotor. Esto es, el poxvirus defectuoso deriva de un poxvirus parental, pero carece de una función que está presente normalmente en el poxvirus parental.
El promotor debe ser capaz de funcionar con los enzimas del poxvirus defectuoso o del huésped infectado. Tales promotores incluyen promotores de poxvirus y promotores sintéticos basados en los promotores de poxvirus. El polinucleótido foráneo puede ser insertado en la región esencial o puede sustituir a parte o a toda la región esencial.
Adicionalmente, la región esencial puede ser sustituida por un marcador antes de la inserción del polinucleótido foráneo en el virus. El polinucleótido foráneo puede ser luego insertado en el marcador o puede sustituir al marcador. Preferiblemente, el poxvirus parental es vaccinia y las funciones esenciales que van a ser perdidas están codificadas por los marcos de lectura abiertos I7L, F18R, F13L, D13L, D6R, A8L, H4L, J1R, J3R, A10L y A3L o por los marcos de lectura abiertos que codifican una proteína de la envoltura de 14 kilodaltons o una proteína estructural de 25 kilodaltons.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente invención, se proporciona un método para producir una proteína que comprende la etapa de proporcionar un poxvirus defectuoso que carezca de una función impartida por una región esencial de su poxvirus parental, donde el poxvirus defectuoso contiene un polinucleótido foráneo que codifica la proteína que va a ser producida y en el que el polinucleótido está bajo el control transcripcional de un promotor. El promotor debe ser capaz de funcionar con el poxvirus defectuoso o con el huésped infectado; tales promotores incluyen promotores de poxvirus. El polinucleótido puede ser insertado en la región esencial del poxvirus parental. En otra realización, un marcador tal como el gen gpt, puede sustituir a parte o a toda la región esencial y, a su vez, el polinucleótido puede ser insertado en el marcador o sustituir a parte o a todo el marcador. La pérdida de la función del marcador indicará entonces que el polinucleótido ha sido colocado en el poxvirus defectuoso.
De acuerdo con otro aspecto más de la presente invención, se proporcionan vacunas que comprenden poxvirus defectuosos. Estos poxvirus defectuosos contienen polinucleótidos que codifican antígenos contra patógenos. Los poxvirus para vacunas de la presente invención pueden ser construidos de la misma manera, o de manera similar, que los demás poxvirus defectuosos de la presente invención.
Estos y otros aspectos de la invención descritos en la presente serán obvios para el técnico experto a la vista de las descripciones contenidas en la presente.
La Figura 1 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pRSET-I7L.
La Figura 2 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pSV-I7L-EDH.
La Figura 3 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pCR-I7Lf-ZG.
La Figura 4 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pRSET-A8L-3'/2.
La Figura 5 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pSV-A8L-EDH.
La Figura 6 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pCR-A8Lf-ZG.
La Figura 7 representa esquemáticamente la construcción de los plásmidos pRSET-D6R y pRSET-D6R-3'.
La Figura 8 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pSV-D6R-EDH.
La Figura 9 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pCR-D6Rf-ZG.
La Figura 10 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pRSET-J1R.
La Figura 11 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pSV-J1R-EDH.
La Figura 12 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pCR-J1R-ZG.
La Figura 13 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pSV-H4L-EDH.
La Figura 14 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pCR-H4Lf-ZG.
La Figura 15 representa esquemáticamente la construcción del plásmido pHS-I7L.
La presente invención se refiere en un aspecto a la utilización de poxvirus defectuosos para la producción de proteínas. Un "poxvirus defectuoso", de acuerdo con la presente invención, es un poxvirus que carece de una función impartida por una región esencial de un poxvirus parental en el que está basado el poxvirus defectuoso; como consecuencia, el poxvirus defectuoso no es viable ni infectivo sin complementación de la función perdida por otra fuente. Una "región esencial" es una región del genoma del poxvirus que es necesaria para la viabilidad o infectividad del poxvirus parental. El término "complementación" connota la restauración de una función perdida por otra fuente, tal como una célula huésped. Por tanto, un poxvirus defectuoso es una forma no viable o no infectiva de un poxvirus parental, y puede convertirse en viable o infectivo en presencia de complementación.
Un poxvirus parental puede ser un poxvirus que exista en la naturaleza o un poxvirus derivado del mismo.
Un virus defectuoso está basado en (derivado de) poxvirus parentales tales como los poxvirus que existen en la naturaleza o poxvirus derivados de los poxvirus que existen en la naturaleza. Estos poxvirus derivados para ser utilizados como poxvirus parentales pueden ser obtenidos mediante técnicas tales como la ingeniería genética por mutagénesis específica de una región y específica de un sitio, recombinación in vivo, el pase del virus a través de células huésped en presencia o ausencia de mutágenos y por cualquier combinación de las técnicas anteriores. Un poxvirus defectuoso puede estar basado en cualquier tipo de poxvirus en el que pueda introducirse un defecto en una región esencial.
El poxvirus defectuoso puede ser utilizado como un sistema de expresión de proteínas. Las proteínas producidas por los poxvirus defectuosos de la presente invención están codificadas por polinucleótidos foráneos, tales como genes o versiones de ADNc de transcritos de ARN. El término "polinucleótido foráneo" se refiere a un polinucleótido que no está presente normalmente en el poxvirus parental en el que está basado el poxvirus defectuoso, o es un polinucleótido que está presente en una posición o en una forma diferentes de las que se encontraría en el poxvirus parental en el que está basado el poxvirus defectuoso. Los polinucleótidos foráneos pueden proceder una variedad de orígenes, tales como animales, plantas, protozoos, hongos, bacterias y virus.
Los poxvirus defectuosos de la presente invención pueden incluir un promotor que es operativo con el poxvirus defectuoso, o con el huésped infectado por el poxvirus defectuoso, con el fin de controlar la transcripción del polinucleótido foráneo en el poxvirus defectuoso. Un "promotor" se refiere a una secuencia de nucleótidos que puede iniciar y/o dirigir la transcripción. Puede utilizarse en la presente invención cualquier promotor que sea operativo en el poxvirus defectuoso o en el huésped infectado. "Operatividad" indica la capacidad del promotor para ser reconocido o leído por los enzimas transcripcionales. Típicamente, los promotores son promotores de poxvirus o promotores sintéticos basados en promotores de origen poxvírico.
Un virus defectuoso puede tener al menos un polinucleótido foráneo insertado en una región esencial del poxvirus. Un promotor puede ser unido al polinucleótido foráneo de tal manera que el promotor sea insertado junto con el polinucleótido con el fin de que el promotor tenga control transcripcional sobre el polinucleótido. Alternativamente, el promotor para controlar la transcripción del polinucleótido foráneo puede estar ya presente en el poxvirus defectuoso en una posición que permita al promotor controlar la transcripción del polinucleótido foráneo.
La región esencial puede ser eliminada completamente del genoma del virus defectuoso de tal manera que no sea posible una recombinación homóloga entre el genoma de la fuente de complementación y el virus defectuoso. Un virus defectuoso con tal deleción puede crecer solamente en presencia de la fuente de complementación, tal como una línea celular cooperadora que proporcione la función de la región esencial en trans. Pueden cultivarse soluciones madre puras del virus defectuoso en la línea celular cooperadora mientras que el crecimiento y la multiplicación en células y organismos normales continúa siendo imposible. El rango de huéspedes de este tipo de virus puede estar restringido a líneas celulares cooperadoras que son manipuladas específicamente para complementar el defecto del virus defectuoso. Puede utilizarse un gen marcador para sustituir una región esencial del poxvirus defectuoso. El polinucleótido foráneo puede ser luego insertado en el marcador o sustituir a todo o a parte del marcador mediante recombinación homóloga. Este procedimiento proporciona un sistema para seleccionar los poxvirus que contengan los insertos de interés.
La presente invención es útil para más cosas además de la expresión de proteínas a gran escala. Los poxvirus defectuosos de la invención pueden ser utilizados también con fines de vacunación. Por ejemplo, si un gen esencial apropiado es inactivado, los virus defectuosos conservarán todavía su capacidad para penetrar en las células e iniciar un ciclo vital abortivo. Tal gen sería uno que fuera requerido tardíamente en el ciclo vital y, por tanto, el virus sería todavía capaz de replicar su ADN, de formar finalmente partículas inmaduras y de expresar su información genómica, que incluiría el polinucleótido foráneo. A este respecto, estos virus defectuosos podrían tener el efecto de las "vacunas vivas-muertas". Taylor y Paoletti, Vaccine 6: 466-68 (1988). Un poxvirus defectuoso que sea utilizado como vacuna comprenderá un polinucleótido de ADN que codifique un antígeno. Los antígenos son moléculas que un organismo reconoce como foráneas. Estos antígenos pueden inducir una respuesta inmunológica del organismo expuesto al antígeno. Los antígenos incluyen proteínas de origen bacteriano, vírico, fúngico y de protozoos. Una cepa parental de vaccinia preferida para la construcción de virus defectuosos para ser utilizados como vacunas sería una cepa de vaccinia tal como la cepa del New York City Department of Health Laboratories (ATCC VR-325).
Los poxvirus defectuosos de la presente invención pueden ser cultivados en células huésped que complementen la función esencial perdida del virus defectuoso. Típicamente, estas células huésped proceden de líneas celulares que son manipuladas específicamente para que complementen la función perdida. Típicamente, la célula huésped tendrá la misma región esencial del poxvirus, o una región similar, insertada en la célula huésped de tal manera que la región esencial sea expresada por la célula huésped o que la región esencial sea inducible en la célula después de la infección de la célula huésped.
Los productos génicos esenciales adecuados como agentes de complementación incluyen, en general, productos génicos que son requeridos tardíamente en el ciclo vital del poxvirus. Son ilustrativos de tales productos génicos los implicados en la morfogénesis o en otros acontecimientos posteriores a la replicación, así como enzimas y proteínas reguladoras.
Un producto génico esencial que es un agente de complementación adecuado es la proteína de 47 kDa (la "proteína I7") codificada por el marco de lectura abierto ("orf") I7L, que se cree que está implicada en la organización del genoma del virus. Kane y Shuman, J. Virol. 67: 2689-98 (1993). La proteína I7 está encapsulada en el núcleo central del virus. Existe una mutación sensible a la temperatura (ts) conocida como ts16. Condit y col., Virol. 128: 429-43 (1983). El gen I7 cumple por tanto un requisito clásico de un gen esencial, como es la existencia de un mutante letal condicional (sensibilidad a la temperatura).
Entre los productos génicos esenciales que son agentes de complementación adecuados en el presente contexto está la proteína de 65 kDa codificada por el orf D13L. Esta proteína se expresa tardíamente en la infección. Si se impide la expresión, la replicación no se ve afectada aunque la morfogénesis del virus es bloqueada en una etapa temprana. Ver Zhang y Moss, Virol. 187: 643-53 (1992). Otros productos génicos esenciales que son adecuados como agentes de complementación son la proteína de la envoltura de vaccina de 14 kDa, Lai y col., J. Biol. Chem. 265: 22174-80 (1990); la proteína estructural principal de vaccinia de 25 kDa, Weir y Moss, J. Virol. 56: 534-40 (1985); y otras proteínas estructurales tales como P4a y P4b.
Otro producto génico esencial que puede ser utilizado como agente de complementación es la fosfoproteína de 11 kDa, Wittek y col., J. Virol. 49: 371-78 (1984), codificada por el orf F18R del virus de tipo salvaje WR (conocido como "F17R" de la cepa Copenhagen de vaccinia). Ver Goebel y col., Virol. 179: 247-66 (1990). La fosfoproteína de 11 kDa codificada por el orf F18R es un gen esencial que es requerido para el ensamblaje correcto del virión. Ver Zhang y Moss, J. Virol. 65: 6101-10 (1991). Los mutantes letales condicionales de vaccinia en los orfs F18R y F17R forman partículas inmaduras con estructuras internas aberrantes bajo ciertas condiciones. F18R solapa, sin embargo, con el orf A, y generalmente no sería por tanto la región esencial de primera elección. Goebel y col., supra.
Pueden emplearse también como agentes de complementación enzimas y proteínas reguladoras, ya que estas proteínas necesitan estar presentes solamente en cantidades catalíticas, que pueden ser fácilmente proporcionadas por la línea celular de complementación. Las subunidades del factor de transcripción temprano del virus vaccinia ("VETF") son adecuadas a este respecto. El VETF es esencial para el inicio de la transcripción de los genes "tempranos" de vaccinia. La ARN polimerasa de vaccinia carente del VETF es incapaz de transcribir moldes de ADN de doble hebra in vitro. Ver Broyles y col., J. Biol. Chem. 263: 10754-60 (1988). El factor es un heterodímero que tiene un polipéptido de 77 kDa y un polipéptido de 82 kDa, que están codificados respectivamente por el orf del gen D6R y del gen A8L del genoma de vaccinia WR. Ver Gershon y Moss, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 87: 4401-05 (1990).
Las proteínas VETF son expresadas tardíamente en la infección y son empaquetadas en las partículas nacientes del virus. Un virus defectuoso carente del gen D6R o del gen A8L aislado de células que expresen VETF, debería ser capaz por tanto de llevar a cabo un ciclo vital completo adicional en una línea celular que no sea de complementación, sin limitaciones adicionales de síntesis de proteínas. La síntesis de proteínas es un requisito esencial para la utilización de tales virus defectuosos como "vacunas vivas-muertas".
Las vacunas vivas-muertas incluyen avipoxvirus que expresan genes foráneos que son utilizadas para inmunizar huéspedes mamífero. En el huésped mamífero los virus no se multiplican, sino que experimentan más bien un ciclo vital abortivo. No obstante, este tipo de vacuna estimula la respuesta inmune de células T particulares. Ver Taylor y Paoletti, supra. Es deseable un virus defectuoso carente de VETF, ya que debería ser capaz de llevar a cabo un ciclo vital adicional en los huéspedes de tipo salvaje, en comparación con los virus capaces de llevar a cabo solamente ciclos vitales abortivos, lo cual permite una mayor producción de antígenos.
Otro factor vírico que es adecuado para la complementación es la proteína RAP94 asociada a la ARN polimerasa o factor de especificidad de la transcripción temprano. La RAP94 está codificada por el orf H4L, Ahn y Moss, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 89: 3536-40 (1992), y es una subunidad de la ARN polimerasa dependiente del ADN del virus que puede ser disociada. La subunidad confiere especificidad de promotor al complejo de la ARN polimerasa para el inicio de la transcripción de genes de la etapa temprana. Como agente de complementación cumple los mismos requisitos que las subunidades del VETF. La RAP94 es sintetizada tardíamente en la infección y empaquetada en el virus naciente para mediar la transcripción temprana en la ronda de infección siguiente. Por tanto, las partículas de virus fenotípicamente intactas carentes del gen H4L deberían ser capaces de llevar a cabo una ronda de infección adicional en un huésped que no sea de complementación sin limitaciones adicionales en la síntesis de proteínas. La existencia de mutantes letales condicionales, Condit y Motytzca, Virol. 113: 224-41 (1981), confirma que H4L es un gen esencial. Se ha encontrado que la proteína está presente en el virión en cantidades submolares en comparación con otros componentes del complejo de la ARN polimerasa. Ahn y Moss, supra. Por consiguiente, niveles bajos de expresión de RAP94 en la línea celular de complementación no deberían afectar al crecimiento del virus defectuoso.
Otro gen que puede ser utilizado para la complementación del virus defectuoso es el gen J1R, que es esencial para el crecimiento del virus en cultivo celular. Aunque hasta ahora no se ha identificado su producto génico, este orf es de considerable interés debido a su posición adyacente al gen de la timidina quinasa en el genoma del virus vaccinia. La eliminación de una secuencia que incluya el orf J1R y al menos partes del gen de la timidina quinasa adyacente (J2R), tiene como resultado un virus que depende de una línea celular de complementación y que es al mismo tiempo seleccionable mediante selección negativa en células tk-negativas tales como las células LM(TK-) o las células Vero tk-negativas. Soluciones madre puras de virus defectuosos son obtenidas rápidamente utilizando este procedimiento de selección adicional.
El gen J3R es de interés en el mismo sentido que el orf J1R. La selección negativa en células tk-negativas puede ser realizada debido a la delección simultánea del orf J3R y el orf J2R adyacente (timidina quinasa). El gen J3R codifica una subunidad de la poli(A)polimerasa (VP39) que es requerida para la formación de la estructura de casquete 5' del ARNm y que estimula la formación de colas de poli(A) largas. Gershon y col., Cell 66: 1269-78 (1991); Schnierle y col., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 89: 2897-01 (1991).
Los poxvirus defectuosos de la presente invención pueden ser producidos con muchos de los mismos métodos utilizados para construir virus recombinantes con insertos en regiones no esenciales. Por ejemplo, puede utilizarse la recombinación in vivo a través de la región flanqueante homóloga. Ver Panicali y Paoletti, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 79: 4927-31 (1982); Mackett y col., loc. cit. 79: 7415-19 (1982). Un método alternativo para producir poxvirus defectuosos es el clonaje molecular directo y el empaquetamiento heterólogo. Ver EP 0 561 034; Scheiflinger y col., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 89: 9977-81 (1992); Merchlinsky y Moss, Virol. 190: 522-26 (1992).
Ejemplo 1 Construcción de un virus vaccinia defectuoso carente de la proteína I7L ("d-I7L-ZG") y de una línea celular de complementación basada en células Vero ("V-I7L") Construcción de la Línea Celular de Complementación V-I7L
La primera etapa en la construcción de la línea celular cooperadora fue el clonaje del orf I7L mediante metodología convencional, mediada por PCR, en un plásmido de expresión de E. coli y en un plásmido de expresión eucariótico. La expresión del orf I7L en E. coli permite la producción rápida de la proteína para la inmunización de conejos con el fin de obtener anticuerpos anti-proteína I7L, que pueden ser utilizados posteriormente para identificar la proteína I7L en líneas celulares permanentes.
Para este fin, el orf I7L fue amplificado por PCR y clonado posteriormente en el plásmido pCRII (InVitrogen, Inc.). Se utilizaron los cebadores oI7-1 (5'-AGT ACT CCA TGG AAA GAT ATA CAG ATT TAG-3') (SEC ID Nº:1) y oI7-2 (5'-ATC CCG GGT TTT AGA GAC TTT GAA GCT ACT-3') (SEC ID Nº:2) para amplificar el gen I7L como un fragmento de 1,3 kb. Este fragmento fue insertado en el plásmido pCRII, lo cual tuvo como resultado pCR-I7L. El plásmido pCR-I7L fue el origen del fragmento génico NcoI-HindIII que fue insertado posteriormente mediante clonaje forzado en el plásmido pRSET-B (InVitrogen, Inc.), produciendo pRSET-I7L (Figura 1). El plásmido pRSET-I7L permitía la sobreexpresión del orf I7L, que estaba corriente abajo del promotor de T7. La expresión bajo el control del promotor de T7 requiere ARN polimerasa de T7, que es proporcionada por la infección de la E. coli portadora del plásmido por el bacteriófago M13mp18/T7.
La proteína I7L era sobreexpresada en células de E. coli JM109 infectadas con M13mp18/T7 y que albergaban el plásmido pRSET-I7L. La inducción del promotor lac con isopropiltiogalactósido ("IPTG") dirige la expresión de la polimerasa de T7 en el bacteriófago M13mp18/T7. El sistema de expresión de E. coli utilizado en este ejemplo particular fue obtenido de InVitrogen, Inc. (EE.UU.), e incluye los plásmidos parentales pRSET A, pRSET B y pRSET C y un fago cooperador, M13mp18/T7, basado en M13. Pueden utilizarse también con la presente invención otros sistemas de expresión adecuados.
Después de la expresión, se prepararon lisados bacterianos y se sometieron a electroforesis en gel de poliacrilamida. Se detectó la banda que contenía la proteína I7L y se cortó del gel y se electroeluyó. Se inmunizaron conejos con el material electroeluido y adyuvante completo de Freund (30 mg de proteína por dosis, i.m.). Después de un mes, los animales fueron reforzados con la misma dosis en adyuvante incompleto de Freund y se monitorizó el desarrollo de anticuerpos mediante transferencias Western.
Las transferencias Western pueden ser realizadas esencialmente según está descrito por Towbin y col., Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 76: 4350-54 (1979). El primer anticuerpo es un anticuerpo anti-I7L producido en conejo (ver anteriormente) utilizado en una dilución 1:100. El segundo anticuerpo es un anti-IgG de conejo producido en cabra acoplado a fosfatasa alcalina (BioRad, Inc.) utilizado en una dilución 1:1000. Los reactivos (BCIP y NBT) y los protocolos de tinción eran de Promega, Inc.
Un fragmento génico NcoI-SmaI del plásmido pCR-I7L es parte del plásmido de expresión pSV-I7L-EDH. Ver la Figura 2. El plásmido pEDH1 (Figura 2) comprende el "casete del gen EDH" que incluye un sitio de entrada de ribosomas interno, el gen de la dihidrofolato reductasa ("dhfr") y el gen de la higromicina ("hph") como un fragmento EcoRV-SalI. Este plásmido pEDH1 deriva del plásmido pB4/EDHPro (Herlitschka, tesis), en el que se insertaron cuatro sitios de restricción adicionales (SalI, ClaI, SwaI y DraI) corriente abajo del "casete del gen EDH" entre los sitios de SpeI y NotI. El "casete del gen EDH" de pEDH1 fue insertado como un fragmento EcoRV-SalI entre los sitios de restricción únicos de SmaI y SalI del plásmido pSV-I7L. Esta construcción produjo el plásmido pSV-I7L-EDH.
El plásmido pSV-I7L fue obtenido insertando el fragmento NcoI-SmaI de 1,3 kb de pCR-I7L entre los sitios de BbsI-SmaI del plásmido pSV-Bbs. El plásmido pSV-Bbs es un derivado del plásmido pSV\beta (Clontech, Inc., EE.UU.), que carece del gen de la \beta-galactosidasa pero contiene un único sitio de BbsI. El sitio de BbsI es introducido por un adaptador que incluye los oligonucleótidos oBbs-1 (5'-CTA GGC TTT TGC AAA AAG CTC CTC GAC CAT GGT GTC TTC A-3') (SEC ID Nº:3) y oBbs-2 (5'-AGC TTG AAG ACA CCA TGG TCG AGG AGC TTT TTG CAA AAG C-3') (SEC ID Nº:4). El adaptador fue insertado entre los sitios de AvrII y HindIII del plásmido pSV\beta. Ver la Figura 2.
En pSV-I7L-EDH, el orf I7L está controlado por el promotor temprano de SV40. El marcador de selección para obtener líneas celulares permanentes es un gen de fusión que incluye los genes dhfr y hph, que permite la selección y la amplificación eficaz de los genes de interés en líneas celulares permanentes. Herlitschka, S.E. (1994), tesis doctoral, Universität für Bodenkultur, Vienna, Austria. Sin embargo, la práctica de la presente invención no está limitada a la utilización de este marcador.
Este plásmido es transfectado a células Vero de riñón de mono (ATCC Nº CCL 81). Las células Vero fueron obtenidas de la American Type Culture Collection (Rockville, MD). Las células fueron transfectadas con el plásmido pSV-I7L-EDH de acuerdo con Graham y van der Eb, Virol. 52: 456-67 (1973), y se incubaron en medio selectivo basado en higromicina B (DMEM, 10% de suero bovino fetal, 250 mg/ml de higromicina B). Las colonias fueron visibles después de 10 a 14 días. Estas colonias fueron expandidas, subclonadas dos veces y posteriormente caracterizadas adicionalmente. Se seleccionaron las líneas celulares hph positivas permanentes en presencia de higromicina B. Las líneas celulares fueron caracterizadas adicionalmente mediante análisis por PCR para determinar la presencia de la construcción génica de complementación (I7L). Se utilizaron transferencias Western para mostrar que se expresaba el gen de interés, la proteína I7L. La línea celular de complementación final fue denominada V-I7L.
Construcción del Virus Defectuoso d-I7L-ZG
Con el fin de construir el virus d-I7L-ZG, que carece del producto I7L, se construyó el plásmido pCR-I7Lf según está resumido en la Figura 3. Este plásmido está basado en el vector pCRII y contiene el orf I7L, incluyendo 0,5 kb aproximadamente de la región flanqueante en cada lado. Se utilizaron los cebadores oI7-3 (5'-AGG AGT TAA TGA GGC CAA TGG A-3') (SEC ID Nº:5) y oI7-4 (5'-GAC ATA GGT ATA GAA TCC GGA-3') (SEC ID Nº:6) para obtener un producto de PCR de 2,3 kb aproximadamente, que fue sublonado en el plásmido pCRII para dar pCR-I7Lf.
Un casete de dos genes que incluía los genes de E. coli lac Z y gpt fue escindido del plásmido pLGb como un fragmento de SmaI e insertado en el único sitio de HpaI situado en el orf I7L, lo cual inactivaba el gen de pCR-I7L en el plásmido resultante pCR-I7Lf-ZG.
El plásmido pLGb fue obtenido a partir de p2T, que está basado en los plásmidos plTa y pTZ19R (Pharmacia). Primeramente, el fragmento del vector de PvuII grande de pTZ19R fue ligado con los oligonucleótidos hibridados P-1T(1): 5'-AGT TTA AAC GGC GCG CCC GGG CTC GAG AGG CCT CTG CAG ATG CAT CCA TGG GGA TCC GAA TTC-3' (SEC ID Nº:7) y P-1T(2): 5'-GAA TTC GGA TCC CCA TGG ATG CAT CTG CAG AGG CCT CTC GAG CCC GGG CGC GCC GTT TAA ACT (SEC ID Nº:8). Esto produjo plTa, que fue luego cortado con EcoRI y BamHI. El plTa fue ligado posteriormente a los oligonucleótidos hibridados P-2T(1): 5'-GAT CCT ACG TAT CTA GAA TTA ATT AAT GGC CAA TTT AAA TGC CCG GGA-3' (SEC ID Nº:9) y P-2T(2): 5'-AAT TTC CCG GGC ATT TAA ATT GGC CAT TAA TTA ATT CTA GAT ACG TAG-3' (SEC ID Nº:10). Esto produjo el plásmido p2T, que fue luego cortado con SmaI. Un casete de dos genes que incluía los genes de E. coli lac Z y gpt fue insertado como un fragmento de HindIII, SalI y tratamiento con polimerasa Klenow. El casete de dos genes es obtenido del plásmido pZgpt-a, que está basado en el plásmido pTNa y en plásmidos relacionados.
Para la construcción del virus d-I7L-ZG, el plásmido pCR-I7Lf-ZG fue insertado en la cepa WR del virus vaccinia mediante recombinación in vivo en células CV-1. En primer lugar, 5 x 10^{6} células CV-1 fueron infectadas con 0,1 ufp/célula de vaccinia WR, cultivadas durante 1 hora, transfectadas con un precipitado de fosfato de calcio que incluía 20 \mug del plásmido pCR-I7Lf-ZG, y cultivadas posteriormente durante 3 días. Ver Graham y van der Eb, supra. Se preparó una solución madre de virus bruta y se utilizó para la formación de placas en células en presencia de selección por gpt, Falkner y Moss, J. Virol. 62: 1849-54 (1988) y selección por placas azules, Chakrabarti y col., Mol. Cell. Biol. S. 5: 3403-09 (1985).
El virus defectuoso crece solamente en células V-I7L y es gpt y lac Z positivo, mientras que el virus de tipo salvaje crece en ambas líneas celulares pero es gpt y lac Z negativo. La purificación se lleva a cabo diez veces. Los virus defectuosos purificados son cultivados posteriormente a mayor escala y examinados mediante transferencia Southern. La ausencia de virus de tipo salvaje y la presencia de las bandas pronosticadas confirma que se han formado los genomas defectuosos correctos. Los ensayos de placas de los virus defectuosos en las células de complementación y en las células de tipo salvaje confirman que el rango de huéspedes de los virus defectuosos está limitado a la línea celular de complementación. Estudios en animales confirmaron que los virus defectuosos no eran patógenos.
Ejemplo 2 Construcción de un virus vaccinia defectuoso que expresa el gen gp160 env del VIH (d-I7L MN) en la línea celular de complementación V-I7L
Con el fin de demostrar la expresión de genes foráneos en el nuevo sistema, el gen gp160 del VIH de la cepa VIH MN es insertado en la región esencial I7L. Para este fin, se obtiene un casete génico a partir de un fragmento de SmaI del plásmido pSep-ST2. El plásmido pSep-ST2 contiene las secuencias de gp160MN del VIH-1 controladas por el potente promotor semisintético Sep de poxvirus y un casete para selección que incluye el gen gpt P7.5. Ver Falkner y Moss, J. Virol. 62: 1849-54 (1988).
Para construir el plásmido pSep-ST2, se construyó primeramente el plásmido pSep(1). Para obtener pSep(1), se construyó el promotor semisintético Sep de poxvirus mediante combinación del promotor tardío P2 del poxvirus de las aves de corral (EP 0 538 496 A1, Dorner y col.) con una secuencia sintética del promotor temprano. Brevemente, el vector pS2gpt-P2 digerido con HpaI/NcoI (Solicitud de Patente Europea Número de Publicación 0 561 034 A2) fue ligado con los oligonucleótidos hibridados P-Sep(3) y P-Sep(4). Las secuencias de los oligonucleótidos eran, P-Sep(3), 5'-CTCGTAAAAA TTGAAAAACT ATTCTAATTT ATTGCACGGT CGCGA-3' (SEC ID Nº:11) y p-Sep(4), 5'-CATGGTACGT ACCGTGCAAT AAATTAGAAT AGTTTTTCAA TTTTTACGAG-3' (SEC ID Nº:12). El plásmido resultante fue denominado pSep(1). Para obtener pSep-ST2, primeramente un fragmento StuI/PvuII de 2,65 kb derivado del plásmido pMNenv2 (descrito en EP 0 561 034 A2), que contenía el gen env de VIH1-MN, fue ligado con el plásmido pSep(1) linealizado con SnaBI. El plásmido resultante, que contenía el inserto en orientación correcta con respecto al "promotor Sep", fue denominado pSep-gp160mn. Con el fin de reparar una mutación puntual localizada en el orf gp160, un fragmento NsiI/SalI de 1,9 kb de pSep-gp160mn fue sustituido por un fragmento equivalente derivado del plásmido pMN-ST2. El plásmido resultante fue denominado pSep-ST2. Los plásmidos pMNenv1 y pMN-ST2 fueron proporcionados por Marvin Reitz (N.C.I. Bethesda, Maryland,
EE.UU.).
El casete de pSep-ST2 contiene el gen gp160 del VIH y el gen gpt de E. coli, y es insertado en el único sitio de HpaI de pCR-I7Lf, teniendo como resultado el plásmido pCR-I7Lf-MN. Este plásmido es utilizado en un experimento de recombinación in vivo en células CV-1 que implicaba al virus de tipo salvaje WR, para obtener una solución madre bruta de virus que es una mezcla de: (1) virus defectuosos que han experimentado dos acontecimientos de sobrecruzamiento para convertirse en un virus recombinante; (2) virus que han experimentado solamente un acontecimiento de sobrecruzamiento y (3) virus cooperadores de tipo salvaje. Una explicación global de los acontecimientos de sobrecruzamiento está contenida en Falkner y Moss, J. Virol. 64: 3108-11 (1990).
Esta mezcla de virus es purificada en un ensayo de placas en la célula de complementación y analizada para determinar su pureza según se describió en el Ejemplo 1, excepto en que los ensayos de placas están basados únicamente en la selección por gpt. El virus resultante es denominado d-I7L-MN y utilizado para la expresión de gp160 recombinante en células V-I7L. El virus d-I7L-MN es utilizado en combinación con su línea celular de complementación para expresar gp160. Las células V-I7L son infectadas con 0,1 ufp de d-I7L-MN y cultivadas durante tres días. La proteína recombinante es detectada mediante transferencias Western utilizando un anticuerpo monoclonal anti-gp41 en un método de acuerdo con Towbin y col., supra. Se llevaron a cabo experimentos con animales en ratones para demostrar que el d-I7L-MN no es patógeno pero es todavía capaz de estimular una respuesta inmune.
Ejemplo 3 Construcción de un virus vaccinia defectuoso carente de la subunidad grande del factor de transcripción temprano (d-A8L-ZG) y de una línea celular de complementación para la propagación del virus Cosntrucción de una Línea Celular Cooperadora Basada en Células Vero (V-A8L)
El factor VETF es un heterodímero compuesto por un polipéptido de 77 kD y un polipéptido de 82 kD, que están codificados respectivamente por los orfs D6R y A8L del genoma de vaccinia WR. Gershon y Moss, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 87: 4401-05 (1990). Las proteínas VETF son expresadas tardíamente en la infección y son empaquetadas en las partículas víricas nacientes. Es deseable un virus defectuoso que carezca de VETF ya que debería ser capaz de llevar a cabo un ciclo vital adicional en los huéspedes de tipo salvaje, en comparación con los virus capaces de llevar a cabo solamente ciclos vitales abortivos.
La subunidad D6R contiene un posible sitio de unión de ATP y se ha encontrado que se une a la secuencia de ADN del promotor temprano. Ver, Broyles y Li, J. Virol. 67: 5677-80 (1993). Se han elaborado mapas de mutaciones sensibles a la temperatura del gen D6R. El orf A8L fue elegido con el fin de evitar interacciones proteína-ADN indeseables en la línea celular de complementación.
La primera etapa en la construcción de la línea celular cooperadora fue el clonaje del orf A8L mediante técnicas mediadas por PCR en un plásmido de expresión de E. coli y en un plásmido de expresión eucariótico. La expresión del orf en E. coli permitía la producción rápida de la proteína para la inmunización de conejos con el fin de obtener anticuerpos anti-subunidad grande del VETF que son utilizados posteriormente para identificar la proteína en las líneas celulares permanentes.
Para este fin, el orf A8L fue amplificado por PCR y clonado en el plásmido pCRII. Se utilizaron los cebadores oA8-9t (5'-AAA CTG CAG GAT GCG ATA TAT AGT AAG TCC GCA AAT GGT ATT A-3') (SEC ID Nº:13) y oA8-2t (5'-AGG AAT TCA GGC CTG TTT AAT TAA TTT GTG CTC TTC-3') (SEC ID Nº:14) para amplificar el gen A8L como un fragmento de 2,1 kb. Este fragmento fue insertado en el plásmido pCRII (InVitrogen, Inc.), dando como resultado pCR-A8Lt.
El plásmido pCR-A8Lt es la fuente de un fragmento génico BamHI-EcoRI de 0,9 kb. El sitio de BamHI (presente en el gen A8L) y el sitio de EcoRI (introducido por el sitio de clonaje múltiple de pCRII) fueron cortados para obtener el fragmento que fue insertado mediante clonaje forzado en el plásmido pRSET-B (InVitrogen, Inc.), dando como resultado el plásmido pRSET-A8L-3'/2. Ver la Figura 4. El plásmido contiene un gen de fusión que codifica la porción C'-terminal de la subunidad grande de VETF con una marca de 6 histidinas N'-terminal. La proteína A8L truncada era sobreexpresada en células de E. coli (cepa JM109) que albergaban el plásmido pRSET-A8L-3'/2.
Las bacterias fueron posteriormente infectadas por el fago cooperador M13mp18/T7 en presencia de ITPG, que induce la dirección de la expresión de la polimerasa de T7 por el promotor lac en el bacteriófago M13mp18/T7. La proteína A8L truncada recombinante que incluye la marca de his fue purificada a partir de lisados bacterianos mediante cromatografía de afinidad en columnas de níquel-NTA, de acuerdo con el protocolo del fabricante (Diagen, Inc.). El material purificado emulsionado en adyuvante completo de Freund fue utilizado para inmunizar conejos (80 mg de proteína por dosis, s.c. e i.m.). Después de un mes, los animales fueron reforzados con la misma dosis y se monitorizó el desarrollo de anticuerpos mediante transferencia Western.
Para caracterizar los antisueros de conejo, las proteínas A8L de los lisados bacterianos fueron detectadas mediante transferencias Western. Las transferencias Western fueron realizadas esencialmente según está descrito por Towbin y col., supra. El primer anticuerpo era un anticuerpo anti-proteína A8L producido en conejo utilizado en una dilución 1:100. El segundo anticuerpo era un anti-IgG de conejo producido en cabra acoplado a fosfatasa alcalina (BioRad, Inc.)
utilizado en una dilución 1:1000. Los reactivos (BCIP y NBT) y los protocolos de tinción procedían de Promega, Inc.
Con el fin de obtener el plásmido de expresión pSV-A8L-EDH, el gen A8L fue aislado del plásmido pCR-A8Lt como un fragmento génico PstI-StuI de 2,1 kb. Los sitios de PstI y StuI fueron introducidos por los cebadores de PCR oA8-9t y oA8-2t, respectivamente. Este fragmento y un fragmento génico EcoRV-ClaI procedente del plásmido pEDH1 que contiene el "casete del gen EDH", fueron ligados en el vector de expresión pSVMCS#51 cortado con PstI-ClaI, que es derivado de pSV\beta (Clontech, Inc.) mediante sustitución del gen de la \beta-galactosidasa por un sitio de clonaje múltiple ("msc") que incluye los sitios de restricción de ApaI, AvrIII, SpeI, HindIII, PstI, SalI, XbaI, SmaI, EcoRI y ClaI. Para este fin el vector pCMV\beta fue cortado con NotI y vuelto a ligar, teniendo como resultado el plásmido pCMV. Este plásmido fue cortado con SalI y HindIII, tratado con polimerasa Klenow y vuelto a ligar, dando como resultado un plásmido intermedio. Este plásmido fue cortado con XhoI y se insertó un adaptador de doble hebra que codificaba los sitios de restricción de ApaI, AvrIII, SpeI, HindIII, PstI, SalI, XbaI, SmaI, EcoRI y ClaI, dando como resultado el plásmido pSVMCS#51. Ver la Figura 5.
En el plásmido pSV-A8L-EDH, el orf A8L está controlado por el promotor temprano de SV40. El marcador de selección para obtener líneas celulares permanentes es un gen de fusión que incluye el gen dhfr y el gen hph, según se describió en el Ejemplo 1.
El plásmido pSV-A8L-EDH fue transfectado a células Vero de riñón de mono (ATCC Nº CCL 81) en un método de acuerdo con Graham y van der Eb, supra, y se incubaron en medio selectivo (DMEM, 10% de suero bovino fetal, 250 \mug/ml de higromicina) y posteriormente se trataron según se describió en el Ejemplo 1. Las líneas celulares permanentes positivas para la fosfotransferasa de higromicina fueron seleccionadas en presencia del antibiótico higromicina B. Después de cinco pases, la integración del ADN foráneo fue demostrada mediante PCR utilizando cebadores específicos para un segmento de 0,5 kb del gen A8L.
Se utilizaron transferencias Western para determinar si se expresaba el gen de interés, la subunidad grande del VETF. Las líneas celulares que expresaban los mayores niveles de la subunidad grande del VETF fueron caracterizadas adicionalmente mediante análisis por PCR y utilizadas como línea celular de complementación, y se denominaron V-A8L.
Construcción del Virus Defectuoso d-A8L-ZG
Para construir el virus d-A8L-ZG el plásmido pCR-A8Lf-ZG fue clonado según se muestra esquemáticamente en la Figura 6. Las regiones (entre 0,5 kb y 0,7 kb de tamaño) que flanqueaban al orf A8L en ambos lados fueron amplificadas por PCR y subclonadas en el plásmido pCRII para obtener pCR-A8L-fl y pCR-A8L-fr, respectivamente.
Los cebadores de la PCR para la amplificación de la región flanqueante 5' de A8L fueron oA8-8 (5'-AGC GCC GCT ACT AGC ACT CC-3') (SEC ID Nº:15) y oA8-5 (5'-GAA CGT TAA CAT TTA TAT CGT GGG GTA AAG TGA AAA TC-3') (SEC ID Nº:16). Los cebadores para la región flanqueante 3' de A8L fueron oA8-4 (5'-TTG GAG AAC TTG ATA CGC CG-3') (SEC ID Nº:17) y oA8-6 (5'-CAT ATG CAA TTG TAA ATT AAA CAA CTA AAT CTG TAA ATA AAT A-3') (SEC ID Nº:18). La región flanqueante 5' de A8L, como un fragmento NotI-SpeI de 0,7 kb procedente de pCR-A8L-fl, fue ligada entre los sitios de NotI y XbaI justo corriente arriba de la región flanqueante 3' de A8L en pCR-A8L-fr, produciendo el plásmido pCR-A8L-flancos.
Con el fin de facilitar los procedimientos de clonaje posteriores, un adaptador sintético que contenía los sitios de restricción poco frecuentes SmaI, NotI, SfiI y RsrII, fue ligado entre las regiones flanqueantes de A8L en pCR-A8L-flancos. Los oligonucleótidos utilizados para la construcción del adaptador fueron oA8-11 (5'-AAC GGT CCG GCC CGG GCG GCC GCC-3') (SEC ID Nº:19) y oA8-12 (5'-AAT TGG CGG CCG CCC GGG CCG GAC CGT T-3') (SEC ID Nº:20). El plásmido pCR-A8L-flancos fue linealizado posteriormente con MunI y HpaI (ambos sitios fueron introducidos por los cebadores de PCR oA8-5 y oA8-6, respectivamente). El plásmido resultante, denominado pdA8L, fue ligado con un casete de dos genes de SmaI de 3,9 kb procedente del plásmido pLGb descrito en el Ejemplo 1, para dar pCR-A8Lf-ZG. En esta construcción, el orf A8L es eliminado completamente para prevenir el rescate del virus defectuoso por la línea celular de complementación a través de recombinación homóloga.
Para la construcción del virus d-A8L-ZG, el plásmido pCR-A8L-ZG fue insertado en el virus vaccinia WR. El plásmido pCR-A8Lf-ZG fue utilizado para recombinación in vivo en células CV-1. Primeramente, 5 x 10^{6} células CV-1 fueron infectadas con 0,1 ufp/célula de vaccinia WR, incubadas durante 1 hora, transfectadas con un precipitado de fosfato de calcio, de acuerdo con Graham y van der Eb, supra, que contenía 20 \mug del plásmido pCR-A8L-ZG y cultivadas durante 3 días.
Esto tuvo como resultado una solución madre bruta que contenía virus de tipo salvaje (cooperadores) y virus defectuosos. Con el fin de obtener soluciones madre puras del virus defectuoso, se llevaron a cabo ensayos de placas en células V-A8L que son capaces de complementar al virus defectuoso. La solución madre bruta de virus fue preparada y utilizada para los ensayos de placas en células V-A8L en presencia de selección por gpt (Falkner y Moss (1988), supra) y selección por placas azules (Chakrabarti y col., supra). La purificación de placas se repitió diez veces. Los poxvirus defectuosos purificados fueron cultivados a mayor escala y examinados mediante transferencia Southern. La ausencia de virus de tipo salvaje y la presencia de las bandas pronosticadas confirma que se habían formado los genomas defectuosos correctos. Los ensayos de placas de los virus defectuosos en las células de complementación y en las células de tipo salvaje confirman que el rango de huéspedes de los virus defectuosos está limitado a la línea celular de complementación. Estudios en animales confirmaron que los virus defectuosos no eran
patógenos.
Ejemplo 4 Construcción de un virus vaccinia defectuoso carente de la subunidad pequeña del factor de transcripción temprano (d-D6R-ZG) y de una línea celular de complementación Construcción de una Línea Celular Cooperadora Basada en Células Vero (V-D6R)
La subunidad pequeña del factor de transcripción temprano VETF es un polipéptido de 77 kD de tamaño. Según se describió en el Ejemplo 3, VETF contiene un posible sitio de unión de ATP y se ha encontrado que se une a la secuencia de ADN del promotor temprano. Broyles y Li, supra. El orf D6R es elegido para la complementación porque se han elaborado mapas de mutaciones sensibles a la temperatura de este gen, lo cual es un elemento que está en la definición de un gen esencial. Seto y col., Virol. 60: 110-19 (1987).
Las etapas de la construcción de la línea celular cooperadora V-D6R son en general idénticas a las de la construcción de la línea celular V-A8L del Ejemplo 3. En primer lugar, el orf D6R fue clonado en el plásmido pCRII (InVitrogen, Inc.) mediante técnicas mediadas por PCR. El plásmido resultante es el origen del fragmento génico D6R para la construcción de un vector de expresión eucariótico y de un plásmido de expresión en E. coli. La expresión del orf en E. coli permite la producción rápida de la proteína para la inmunización de conejos con el fin de obtener anticuerpos anti-subunidad pequeña de VETF, los cuales son utilizados posteriormente para identificar la proteína en las líneas celulares permanentes. Para este fin, el orf D6R fue amplificado como un fragmento de 1,9 kb mediante PCR utilizando los cebadores oD6-1 (5'-CTG CAG AAT GAA TAC CGG AAT TAT AGA TTT-3') (SEC ID Nº:21) y oD6-2 (5'-CCC GGG TTA TGG AGA AGA TAC CAC GTT-3') (SEC ID Nº:22), y clonado en pCRII, teniendo como resultado el plásmido pCR-D6R.
Según se muestra en la Figura 7, el plásmido de expresión en E. coli pRSET-D6R-3' fue construido ligando un fragmento de EcoRI de 1,6 kb procedente de pCR-D6R en el vector pRSET-B (InVitrogen, Inc.). El plásmido pRSET-D6R-3' contiene un gen de fusión que codifica una marca de 6 histidinas N'-terminal fusionada a la subunidad pequeña de VETF que carece de sus 100 primeros aminoácidos. La expresión bacteriana, la purificación de la proteína recombinante mediada por la marca y la producción de anticuerpos anti-subunidad pequeña de VETF, se realizaron según se esquematizó en el Ejemplo 3. El plásmido de expresión pSV-D6R-EDH fue construido según sigue: El orf D6R del fragmento génico de 1,9 kb fue aislado de pCR-D6R cortando el plásmido con PstI y SmaI y ligado en el vector pSVMCS#51 (Herlitschka, supra) mediante clonaje forzado para obtener el plásmido pSV-D6R. Los sitios de PstI y SmaI fueron introducidos por los cebadores de PCR oD6-1 (5'-CTGCAGAATG AATACCGGAA TTATAGATTT-3') (SEC ID Nº:21) y oD6-2 (5'-CCCGGGTTAT GGAGAAGATA CCACGTT-3') (SEC ID Nº:22), respectivamente. La ligadura de un fragmento génico EcoRV-ClaI procedente del plásmido pEDH1 conteniendo el "casete del gen EDH" en pSV-D6R cortado con SmaI-ClaI, produjo el plásmido de expresión pSV-D6R-EDH. Ver la Figura 8.
En el plásmido pSV-D6R-EDH, el orf D6R está controlado por el promotor temprano de SV40. El marcador de selección para obtener líneas celulares permanentes es un gen de fusión que tiene el gen dhfr y el gen hph, según se describió en el Ejemplo 1. Los procedimientos de transfección y selección para la construcción de la línea celular de complementación fueron idénticos a los del Ejemplo 3.
Construcción del Virus Defectuoso d-D6R-ZG
Para construir el virus d-D6R-ZG, el plásmido pCR-D6Rf-ZG fue clonado según está mostrado esquemáticamente en la Figura 9. Las regiones (de entre 0,5 kb y 0,6 kb de tamaño) flanqueantes del orf D6R en ambos lados fueron amplificadas mediante técnicas mediadas por PCR y subclonadas en el plásmido pCRII para obtener pCR-D6R-fl y pCR-D6R-fr, respectivamente. Los cebadores de la PCR para la amplificación de la región flanqueante 5' de D6R fueron oD6-3 (5'-TGA GAA GAA TTG CCG TCG-3') (SEC ID Nº:23) y oD6-5 (5'-GTC GAC GAT ATC TTC TAT AAA TAT ATG AGC-3') (SEC ID Nº:24). Los cebadores para la región flanqueante 3' de D6R fueron oD6-4 (5'-TAC AGT ACC CGA ATC TCT AC-3') (SEC ID Nº:25) y oD6-6 (5'-ACA ATT GGT ATT AAG TAT AAC GAC TCC-3') (SEC ID Nº:26). La región flanqueante 5' de D6R, como un fragmento SacI-SpeI de 0,6 kb procedente de pCR-D6R-fl, fue ligada entre los sitios de SacI y XbaI justo corriente abajo de la región flanqueante 5' de D6R en pCR-D6R-fl, produciendo el plásmido pCR-D6R-flancos. Con el fin de facilitar los procedimientos de clonaje posteriores, un adaptador sintético que contenía los sitios de restricción poco frecuentes SmaI, NotI, SfiI y RsrII fue ligado entre las regiones flanqueantes de D6R en pCR-D6R-flancos. Los oligonucleótidos utilizados para la construcción del adaptador fueron oA8-11 y oA8-12. Ver el Ejemplo 3. El plásmido pCR-D6R-flancos es por tanto linealizado con SalI, tratado con la polimerasa Klenow y cortado con MunI (ambos sitios de restricción son introducidos por los cebadores de PCR oD6-5 y oD6-6, respectivamente). El plásmido resultante, denominado pdD6R, es ligado con un casete de dos genes de SmaI de 3,9 kb procedente del plásmido pLGb descrito en el Ejemplo 1 para dar pCR-D6Rf-ZG. En esta construcción, el orf D6R es eliminado completamente con fin de impedir el rescate del virus defectuoso por la línea celular de complementación debido a recombinación homóloga.
Para la construcción del virus d-D6R-ZG, el plásmido pCR-D6Rf-ZG es insertado en el virus vaccinia WR. El plásmido pCR-D6Rf-ZG es utilizado para recombinación in vivo en células CV-1. Primeramente, 5 x 10^{6} células CV-1 son infectadas con 0,1 ufp/célula de vaccinia WR, incubadas durante 1 hora, transfectadas con un precipitado de fosfato de calcio (según Graham y van der Eb, supra) conteniendo 20 \mug del plásmido pCR-D6R-ZG y cultivadas durante 3 días. Esto tiene como resultado una solución madre bruta que contiene virus de tipo salvaje (cooperadores) y virus defectuosos. Para obtener soluciones madre puras de los virus defectuosos, se llevan a cabo ensayos de placas en células V-D6R que son capaces de complementar al virus defectuoso. Se prepara la solución madre bruta de virus y se utiliza para ensayos de placas en células V-D6R en presencia de selección por gpt (Falkner y Moss, supra (1988)) y selección por placas azules (Chakrabarti y col., supra). La purificación de placas es repetida diez veces. Los poxvirus defectuosos purificados son cultivados a mayor escala y examinados mediante transferencia Southern. La ausencia de virus de tipo salvaje y la presencia de las bandas pronosticadas confirma que se han formado los genomas defectuosos correctos. Los ensayos de placas de los virus defectuosos en las células de complementación y en las células de tipo salvaje confirman que el rango de huéspedes de los virus defectuosos está limitado a la línea celular de complementación. Estudios en animales confirmaron que los virus defectuosos no eran
patógenos.
Ejemplo 5 Construcción de un virus vaccinia defectuoso carente del producto del gen J1R (d-J1R-ZG) y de una línea celular de complementación Construcción de una Línea Celular Cooperadora Basada en Células Vero (V-J1R)
La primera etapa fue la expresión del orf J1R en E. coli (utilizando el sistema de vectores pRSET de InVitrogen). En primer lugar, se construyó el plásmido pCR-J1R mediante clonaje del producto de PCR de J1R obtenido con los cebadores oJ1R-1 (5'-GCCATGGATC ACAACCAGTA TCTCTT-3') (SEC ID Nº:27) y oJ1R-2 (5'-ACCCGGGTTA ATTAATTATT GTTCACTTTA-3') (SEC ID Nº:28) en el vector pCRII. Un fragmento NcoI-EcoRI fue insertado posteriormente en pRSET-B produciendo el vector de expresión de E. coli pRSET-J1R (Figura 10). Con este plásmido se obtuvieron grandes cantidades de proteína J1R que, señaladamente, no era inmunogénica en conejos. Se produjeron por tanto anticuerpos contra un conjugado de un péptido sintético de J1R y la proteína transportadora KLH para la identificación posterior de la proteína en las líneas celulares permanentes. El péptido sintético con la secuencia de aminoácidos SLATTAIDPIRYIDP, correspondiente a las posiciones de aminoácidos 118 a 132 de la proteína J1R, fue acoplado a KLH (KLH preactivada de Pierce, EE.UU.). El conjugado purificado en adyuvante completo de Freund fue utilizado para inmunizar conejos (100 mg de proteína por dosis, s.c. e i.m.). Después de un mes, los animales fueron reforzados con la misma dosis y se monitorizó el desarrollo de anticuerpos mediante transferencias
Western.
Las proteínas fueron detectadas por transferencias Western. Las transferencias Western fueron realizadas esencialmente según está descrito por Towbin y col., supra. El primer anticuerpo era un anticuerpo anti-proteína J1R producido en conejo utilizado a una dilución 1:100. El segundo anticuerpo era un anti-IgG de conejo producido en cabra acoplado a fosfatasa alcalina (BioRad, Inc.) utilizado a una dilución 1:1000. Los reactivos (BCIP y NBT) y los protocolos de tinción procedían de Promega, Inc. (EE.UU.).
Con el fin de obtener el plásmido de expresión pSV-J1R-EDH (Fig. 11) para transformación en las células Vero, se aisló del plásmido pCR-J1R un fragmento génico NcoI-SmaI de 0,5 kb que codificaba el gen J1R completo. Los sitios de NcoI y SmaI fueron introducidos por los cebadores de PCR oJ1R-1 y oJ1R-2 (ver anteriormente), respectivamente. Este fragmento fue ligado en el vector de expresión pSV-Bbs cortado con BbsI (ver el Ejemplo 1). La inserción de un fragmento génico EcoRV-ClaI procedente del plásmido pEDH1 que contenía el "casete del gen EDH" en pSV-J1R cortado con SmaI-ClaI, produjo pSV-J1R-EDH. Ver la Figura 11. En el plásmido pSV-J1R-EDH, el orf J1R está controlado por el promotor temprano de SV40. El marcador de selección para la obtención de líneas celulares permanentes es un gen de fusión que incluye el gen dhfr y el gen hph, según se describió en el Ejemplo 1.
El plásmido pSV-J1R-EDH fue transfectado a células Vero de riñón de mono (ATCC Nº CCL 81) en un método de acuerdo con Graham y van der Eb, supra, y las células incubadas en medio selectivo (DMEM, 10% de suero bovino fetal, 250 \mug/ml de higromicina) y tratadas posteriormente según se describió en el Ejemplo 1. Las líneas celulares permanentes positivas para la fosfotransferasa de higromicina fueron seleccionadas en presencia del antibiótico higromicina B. Después de cinco pases, la integración del ADN foráneo fue demostrada mediante PCR utilizando cebadores específicos para un segmento de 0,5 kb del gen J1R. Se utilizaron transferencias Western para determinar si se expresaba el gen de interés, la proteína J1R. Las líneas celulares que expresaban los mayores niveles de proteína J1R fueron caracterizadas adicionalmente mediante transferencia Southern y utilizadas como la línea celular de complementación, y se denominaron V-J1R.
Construcción del Virus Defectuoso d-J1R-ZG
Para construir el virus d-J1R-ZG, el plásmido pCR-J1Rf-ZG fue clonado según está mostrado esquemáticamente en la Figura 12. Un fragmento génico de 1,5 kb que contenía el orf J1R y alrededor de 0,5 kb de secuencias flanqueantes en ambos lados, fue amplificado del virus vaccinia (cepa WR) por PCR y subclonado en el plásmido pCRII para obtener pCR-J1Rf.
Los cebadores de la PCR fueron oJ1-3 (5'-TCC ACA TCC ATG AGA TTG AAT-3') (SEC ID Nº:29) y oJ1-4 (5'-CGA TTG ATA CAT ATC ATT ACC-3') (SEC ID Nº:30). Se llevó a cabo también la eliminación del gen J1R completo y de los primeros 40 nucleótidos del gen de la timidina quinasa adyacente mediante técnicas mediadas por PCR. El plásmido pCR-J1Rf completo, excluyendo las secuencias que iban a ser eliminadas, fue amplificado por PCR, teniendo como resultado un producto de 6 kb. El tratamiento con polinucleótido quinasa y la religadura posterior del producto de la PCR produjo el plásmido pCR-J1R-flancos. Los cebadores oJ1-5 (5'-AACAATTGCA TCATCTGCGA AGAACATCG-3') (SEC ID Nº:31) y oJ1-6 (5'-CAGTTAACTT TTCAGGTAAA AGTACAGAAT-3') (SEC ID Nº:32) que fueron empleados para esta reacción introducen los sitios de restricción MunI y HpaI. El plásmido fue cortado en estos sitios y el adaptador (oA8-11 y oA8-12, según se describió en el Ejemplo 3) fue insertado para obtener pdJ1R. De manera análoga a la del Ejemplo 3, un casete de dos marcadores lac Z-gpt fue ligado en el sitio de SmaI de pdJ1R, teniendo como resultado el vector de recombinación pCR-J1Rf-ZG. (Este plásmido contiene solamente 40 pares de bases del gen J1R, en su extremo 5', que son necesarios para la integridad del orf L5R adyacente en el virus defectuoso).
Para la construcción del virus d-J1R-ZG, el plásmido pCR-J1R-ZG fue insertado en el virus vaccinia WR. El plásmido pCR-J1Rf-ZG fue utilizado para recombinación in vivo en células CV-1. Primeramente, 5 x 10^{6} células CV-1 fueron infectadas con 0,1 ufp/célula de vaccinia WR, incubadas durante 1 hora, transfectadas con un precipitado de fosfato de calcio (de acuerdo con Graham y van der Eb, supra) que contenía 20 microgramos del plásmido pCR-J1R-ZG y cultivadas durante 3 días.
Este procedimiento tuvo como resultado una solución madre bruta que contenía virus de tipo salvaje (virus cooperadores) y virus defectuosos. Para obtener soluciones madre puras del virus defectuoso, se llevan a cabo ensayos de placas en células V-J1R que son capaces de complementar al virus defectuoso. Se preparó la solución madre bruta de virus y se utilizó para ensayos de placas en células V-J1R en presencia de selección por gpt (Falkner y Moss (1988), supra) y selección por placas azules (Chakrabarti y col., supra), alternando con ensayos de placas en células V-J1R tk-negativas en presencia de BUdR (Mackett y col., supra). La purificación de placas se repitió diez veces. Los poxvirus defectuosos purificados fueron cultivados a mayor escala y examinados mediante transferencia Southern. La ausencia de virus de tipo salvaje y la presencia de las bandas pronosticadas confirma que se habían formado los genomas defectuosos correctos. Ensayos de placas de los virus defectuosos en las células de complementación y en células de tipo salvaje confirman que el rango de huéspedes de los virus defectuosos está limitado a la línea celular de complementación. Estudios en animales confirmaron que los virus defectuosos no eran patógenos.
Ejemplo 6 Construcción de un virus vaccinia defectuoso carente del producto del gen H4L (d-H4L-ZG) y de una línea celular de complementación
Se eligió el orf H4L para la complementación ya que se habían generado mapas de mutaciones letales condicionales sensibles a la temperatura de este gen. Seto y col., supra.
Las etapas de la construcción de la línea celular cooperadora V-H4L son en general idénticas a las de la construcción de la línea celular V-A8L del Ejemplo 3. En primer lugar, el orf H4L fue clonado en el plásmido pCRII (Invitrogen, Inc.) mediante técnicas mediadas por PCR. El plásmido resultante es la fuente del fragmento del gen H4L para la construcción del vector de expresión en células Vero pSV-H4L-EDH, según se muestra en la Figura 13. Se produjeron anticuerpos contra un conjugado de un péptido sintético con KLH para identificar el producto del gen H4L (RAP94) en las líneas celulares permanentes. El conjugado fue preparado mediante la unión del péptido sintético KIYKNSFSEDHNNSLD, correspondiente a las posiciones de aminoácidos 242 a 258 en el orf H4L, Kane y Shuman, J. Virol. 66: 5752-62 (1992), a KLH activada (kit de acoplamiento a KLH, Pierce, Inc. EE.UU.). Este conjugado fue utilizado para la producción de anticuerpos anti-H4L de manera análoga a la del Ejemplo 5.
Para la construcción del vector de expresión en células Vero, el orf H4L fue amplificado como un fragmento de 2,4 kb mediante PCR utilizando los cebadores oH4-1 (5'-ACC ATG GAC TCT AAA GAG ACT AT-3') (SEC ID Nº:33) y oH4-2 (5'-CAA TTG CCC GGG TTA ATT AAT GAA ATT AAT CAT ATA CAA CTC-3') (SEC ID Nº:34) y clonado en pCRII, teniendo como resultado el plásmido pCR-H4L. El plásmido de expresión pSV-H4L-EDH fue construido según sigue: El orf H4L fue aislado como un fragmento génico de 2,4 kb de pCR-H4L mediante el corte del plásmido con NcoI y SmaI y ligado en el vector pSV-Bbs (ver el Ejemplo 1) mediante clonaje forzado para obtener el plásmido pCV-H4L. Los sitios de NcoI y SmaI fueron introducidos por los cebadores de PCR oH4-1 y oH4-2, respectivamente. La ligadura de un fragmento génico EcoRV-SalI procedente del plásmido pEDH1, que contenía el "casete del gen EDH", en pSV-H4L cortado con SmaI-SalI produjo el plásmido de expresión pSV-H4L-EDH. Ver la Figura 13.
En el plásmido pSV-H4L-EDH, el orf H4L está controlado por el promotor temprano de SV40. El marcador de selección para la obtención de líneas celulares permanentes es un gen de fusión que incluye el gen dhfr y el gen hph, según se describió en el Ejemplo 1. Los procedimientos de transfección y selección para la construcción de la línea celular de complementación se llevaron a cabo según se describió en el Ejemplo 3, excepto en que se utilizaron reactivos específicos para H4L.
Construcción del Virus Defectuoso d-H4L-ZG
Para construir el virus d-H4L-ZG, el plásmido pCR-H4Lf-Zg fue clonado según se muestra esquemáticamente en la Figura 14. Las regiones (de entre 0,5 kb y 0,6 kb de tamaño) flanqueantes del orf H4L en ambos lados fueron amplificadas mediante técnicas mediadas por PCR y subclonadas en el plásmido pCRII para obtener pCR-H4L-fl y pCR-H4L-fr, respectivamente.
Los cebadores de la PCR para la amplificación de la región flanqueante 5' de H4L fueron oH4-3 (5'-CCT TTA GGT CAG AA GAT CGC-3') (SEC ID Nº:35) y oH4-5 (5'-GTC GAC AAT TGT TAA AG TAC AAA CAA CTA GGA-3') (SEC ID Nº:36). Los cebadores para la región flanqueante 3' de H4L fueron oH4-4 (5'-GCT AAC ATC ATA CCC TCC TG-3') (SEC ID Nº:37) y oH4-6 (5'-GTC GAC GTT AAC AGA AGC ATT GGA ATA CGC AT-3') (SEC ID Nº:38). La región flanqueante 3' de H4L, como un fragmento SalI-SpeI de 0,5 kb procedente de pCR-H4L-fr, fue ligada entre los sitios de SalI y XbaI justo corriente abajo de la región flanqueante 5' de H4L en pCR-D6R-fl, produciendo el plásmido pCR-H4L-flancos.
Con el fin de facilitar los procedimientos de clonaje posteriores, un adaptador sintético que contenía los sitios de restricción poco frecuentes SmaI, NotI, SfiI y RsrII, fue ligado entre las regiones flanqueantes de H4L en pCR-H4L-flancos. Los oligonucleótidos utilizados para la construcción del adaptador fueron oA8-11 y oA8-12. El plásmido pCR-H4L-flancos fue linealizado posteriormente con MunI y HpaI (ambos sitios son introducidos por los cebadores de PCR oH4-5 y oH4-6, respectivamente). El plásmido resultante, denominado pdH4L, fue ligado a un casete de dos genes de SmaI de 3,9 kb procedente del plásmido pLGb descrito en el Ejemplo 1 para dar pCR-H4Lf-ZG. En esta construcción el orf H4L está eliminado completamente con el fin de impedir el rescate del virus defectuoso por la línea celular de complementación debido a recombinación homóloga.
La construcción del virus d-H4L-ZG mediante recombinación in vivo y purificación de placas, se realizó según el esquema descrito en el Ejemplo 1.
Ejemplo 7 Construcción de una línea celular de complementación con la función I7L inducible por choque térmico
El efecto de la inactivación de las proteínas del huésped de vaccinia varía de tipo celular a tipo celular, lo cual influye sobre la eficacia de la complementación y determina por tanto el número de purificaciones de placas necesarias para obtener soluciones madre puras del virus defectuoso y los títulos obtenibles con las líneas celulares huésped. Con el fin de hacer que la complementación sea más eficaz, el marco de lectura abierto esencial que codifica la función de complementación es clonado corriente abajo del promotor del gen de la proteína del choque térmico humana de 70 kDa (Hsp70) (Hunt y Morimoto, supra). La transcripción del gen Hsp70 es inducida por la infección con vaccinia y se ha propuesto que la Hsp70 está implicada en el ensamblaje del virión de vaccinia (Jindal y Young, supra).
La primera etapa es el clonaje del promotor de la Hsp70 mediante técnicas de PCR. Los oligonucleótidos oHS-1, 5'-TACGTATGGA GACCAACACC CTTCC-3' (SEC ID Nº:39) y oHS-2, 5'-CCATGGATAT CGGGTTCCCT GCTCTCTGTC GG-3' (SEC ID Nº:40) fueron utilizados junto con ADN humano (Clontech, Inc.) como molde para obtener las secuencias promotoras de la Hsp70 humana. El producto de la PCR fue clonado en el vector pCRII (InVitrogen, Inc.) produciendo el plásmido pCR-Hsp. El fragmento del promotor SnaBI-NcoI fue utilizado para sustituir al promotor de SV40 en el plásmido pSV-Bbs (ver el Ejemplo 1) teniendo como resultado, después de la eliminación del intrón de SV40 presente en este plásmido, el plásmido pHS. Este vector es utilizado para insertar marcos de lectura abiertos, tales como I7L, ligando el fragmento NcoI-SmaI de pSV-I7L (Ejemplo 1) con pHS, produciendo el plásmido pHS-I7L. Ver la Figura 15.
Para construir la línea celular de complementación, se llevó a cabo el procedimiento de cotransformación (Wigler, supra). Se utilizó un marcador de selección adecuado, tal como el gen de resistencia a neomicina presente en el plásmido pSV2-neo (Southern, P.J. y Berg, P., J. Mol. Appl. Genet. 1: 327 (1982)), junto con el plásmido pHS-I7L en un experimento de transfección en células Vero. Las células fueron transfectadas de acuerdo con Graham y van der Eb, supra, e incubadas en medio selectivo que incluía el antibiótico G418 (DMEM, 10% de suero bovino fetal, 500 \mug/ml de G418). Después de 10-14 días, las colonias eran visibles. Estas colonias fueron expandidas, subclonadas dos veces y caracterizadas posteriormente. Las líneas celulares fueron caracterizadas adicionalmente mediante análisis por PCR para detectar la presencia de la construcción génica de complementación. Se utilizaron transferencias Western para mostrar que el gen de interés, la proteína I7L, se expresaba tras la inducción. La línea celular de complementación final fue denominada VHsp-I7L. La línea celular fue caracterizada según se describió en el Ejemplo 1. La construcción del virus defectuoso d-I7L-ZG/Hsp se realizó según se describió en el Ejemplo 1 para el virus d-I7L-ZG, excepto en que se utilizó la línea celular VHsp-I7L para la complementación y en que se realizaron solamente cinco rondas de purificación de placas para obtener el virus defectuoso.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: IMMUNO AG
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Industriestr. 67
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Wien
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: AUSTRIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP): A-1221
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Poxvirus recombinantes con polinucleótidos foráneos en regiones esenciales
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 40
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disco magnético flexible
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
PROGRAMA: PatentIn Release #1.0, Versión #1.30 (EPO)
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLUCITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/235.392
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE REGISTRO: 29-ABRIL-1994
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGTACTCCAT GGAAAGATAT ACAGATTTAG
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATCCCGGGTT TTAGAGACTT TGAAGCTACT
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTAGGCTTTT GCAAAAAGCT CCTCGACCAT GGTGTCTTCA
\hfill
40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGCTTGAAGA CACCATGGTC GAGGAGCTTT TTGCAAAAGC
\hfill
40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGGAGTTAAT GAGGCCAATG GA
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GACATAGGTA TAGAATCCGG A
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 63 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGTTTAAACG GCGCGCCCGG GCTCGAGAGG CCTCTGCAGA TGCATCCATG
\hfill
50
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGGATCCGAA TTC
\hfill
63
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 63 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GAATTCGGAT CCCCATGGAT GCATCTGCAG AGGCCTCTCG AGCCCGGGCG
\hfill
50
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGCCGTTTAA ACT
\hfill
63
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 48 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GATCCTACGT ATCTAGAATT AATTAATGGC CAATTTAAAT GCCCGGGA
\hfill
48
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 48 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AATTTCCCGG GCATTTAAAT TGGCCATTAA TTAATTCTAG ATACGTAG
\hfill
48
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTCGTAAAAA TTGAAAAACT ATTCTAATTT ATTGCACGGT CGCGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 50 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CATGGTACGT ACCGTGCAAT AAATTAGAAT AGTTTTTCAA TTTTTACGAG
\hfill
50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 43 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AAACTGCAGG ATGCGATATA TAGTAAGTCC GCAAATGGTA TTA
\hfill
43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGGAATTCAG GCCTGTTTAA TTAATTTGTG CTCTTC
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGCGCCGCTA CTAGCACTCC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GAACGTTAAC ATTTATATCG TGGGGTAAAG TGAAAATC
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTGGAGAACT TGATACGCCG
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 43 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CATATGCAAT TGTAAATTAA ACAACTAAAT CTGTAAATAA ATA
\hfill
43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AACGGTCCGG CCCGGGCGGC CGCC
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AATTGGCGGC CGCCCGGGCC GGACCGTT
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTGCAGAATG AATACCGGAA TTATAGATTT
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCCGGGTTAT GGAGAAGATA CCACGTT
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGAGAAGAAT TGCCGTCG
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCGACGATA TCTTCTATAA ATATATGAGC
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TACAGTACCC GAATCTCTAC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAATTGGTA TTAAGTATAA CGACTCC
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCCATGGATC ACAACCAGTA TCTCTT
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACCCGGGTTA ATTAATTATT GTTCACTTTA
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCCACATCCA TGAGATTGAA T
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGATTGATAC ATATCATTAC C
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AACAATTGCA TCATCTGCGA AGAACATCG
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CAGTTAACTT TTCAGGTAAA AGTACAGAAT
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACCATGGACT CTAAAGAGAC TAT
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 42 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CAATTGCCCG GGTTAATTAA TGAAATTAAT CATATACAAC TC
\hfill
42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 35:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCTTTAGGTC AGAAGATCGC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 36:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCGACAATT GTTAAAGTAC AAACAACTAG GA
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 37:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCTAACATCA TACCCTCCTG
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 38:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCGACGTTA ACAGAAGCAT TGGAATACGC AT
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 39:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TACGTATGGA GACCAACACC CTTCC
\hfill
25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 40:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCATGGATAT CGGGTTCCCT GCTCTCTGTC GG
\hfill
32

Claims (20)

1. Un poxvirus defectuoso que carece de una función impartida por una región esencial de su poxvirus parental, siendo la región esencial una región del genoma del poxvirus que es necesaria para la viabilidad y la infectividad del poxvirus parental, comprendiendo dicho poxvirus defectuoso un polinucleótido foráneo bajo el control transcripcional de un promotor del poxvirus.
2. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicho polinucleótido foráneo está insertado en dicha región esencial.
3. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con la reivindicación 2, en el que dicha región esencial ha sido eliminada de dicho poxvirus defectuoso.
4. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con la reivindicación 3, en el que un marcador sustituye a dicha región esencial.
5. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con la reivindicación 4, en el que dicho polinucleótido foráneo está insertado en dicho marcador.
6. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 precedentes, donde dicho poxvirus parental es vaccinia.
7. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 precedentes, en el que dicha región esencial es un marco de lectura abierto seleccionado del grupo que consta de I7L, F18R, D13L, D6R, A8L, J1R, J3R, H4L, A10L y A3L.
8. Un poxvirus defectuoso de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 precedentes, en el que dicha región esencial es un marco de lectura abierto que codifica la proteína de la envoltura de 14 kilodaltons o la proteína estructural de 25 kilodaltons.
9. Un método para producir una proteína que comprende la etapa de provisión de un poxvirus defectuoso que carece de una función impartida por una región esencial de su poxvirus parental, siendo la región esencial una región del genoma del poxvirus que es necesaria para la viabilidad y la infectividad del poxvirus parental, comprendiendo dicho poxvirus defectuoso un polinucleótido foráneo bajo el control transcripcional de un promotor del pox-
virus.
10. El método de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicha etapa de provisión es llevada a cabo mediante la inserción de dicho polinucleótido foráneo en dicha región esencial de dicho poxvirus parental.
11. Un método de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicha etapa de provisión es llevada a cabo mediante la sustitución de dicha región esencial de dicho poxvirus parental por dicho polinucleótido foráneo.
12. Un método de acuerdo con la reivindicación 9, en el que dicha etapa de provisión es llevada a cabo mediante la sustitución de dicha región esencial de dicho poxvirus parental por un marcador.
13. Un método de acuerdo con la reivindicación 12, en el que dicho polinucleótido es insertado en dicho marcador.
14. Un método de acuerdo con la reivindicación 12, en el que dicho polinucleótido sustituye a dicho marcador.
15. Un método de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 12 a 14 precedentes, en el que dicho marcador es gpt.
16. Una vacuna que comprende un poxvirus defectuoso que carece de una función impartida por una región esencial de su poxvirus parental, siendo la región esencial una región del genoma del poxvirus que es necesaria para la viabilidad y la infectividad del poxvirus parental, conteniendo dicho poxvirus defectuoso un polinucleótido foráneo bajo el control transcripcional de un promotor del poxvirus.
17. Una vacuna de acuerdo con la reivindicación 16, en la que dicho poxvirus parental es vaccinia.
18. Un método para producir una vacuna que comprende la etapa de provisión de un poxvirus defectuoso que carece una función impartida por una región esencial de su poxvirus parental, siendo la región esencial una región del genoma del poxvirus que es necesaria para la viabilidad y la infectividad del poxvirus parental, conteniendo dicho poxvirus defectuoso un polinucleótido foráneo bajo el control transcripcional de un promotor del pox-
virus.
\newpage
19. Un método para producir una vacuna de acuerdo con las reivindicaciones 16-17, en el que dicho poxvirus parental es vaccinia.
20. La utilización de un poxvirus defectuoso de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 para la preparación de una vacuna.
ES95919361T 1994-04-29 1995-04-28 Poxvirus recombinados en regiones esenciales con la ayuda de polinucleotidos extraños. Expired - Lifetime ES2243937T3 (es)

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