DE3329624C2 - - Google Patents
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Description
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur chemischen Veränderung
der Substratspezifität eines nativen Proteins zur
Erzeugung eines enzymartig modifizierten Proteins.
Proteine sind biologisch synthetisierte Makromoleküle,
die verschiedene Funktionen in lebenden Systemen haben.
Enzyme sind besondere biologisch aktive Proteine, die
bestimmte Reaktionen katalysieren. Derzeitig findet die
Enzymtechnologie in vielen Bereichen von Industrie und
Forschung Anwendung, zum Beispiel medizinische Forschung,
Nahrungsmittel-Behandlung und -Konservierung, Herstellung
fermentierter Getränke, Herstellung von Arzneimitteln
und Bestimmung der Konzentration verschiedener Metabolite
und Nahrungsmittelbestandteile mittels enzymatischer
Analysen.
Enzyme sind in ihrer biologischen Aktivität hochspezifisch
und katalysieren im allgemeinen eine bestimmte
Reaktion in einem sehr hohen Grade im Vergleich zu der
entsprechenden, bei Raumtemperatur ohne biologische
Katalyse ablaufenden Reaktion. Ein Enzym kann katalytische
Aktivität mit Bezug auf eine Anzahl von Substraten, auf
die es wirken kann, zeigen. Demgemäß kann ein gegebenes
Enzym die Synthese oder den Abbau von mehr als einem
Substrat katalysieren. Einige Proteine, die nicht als
klassische Enzyme angesehen werden, wie Rinderserum-
Albumin, zeigen sehr begrenzte katalytische Aktivität
mit Bezug auf ein oder mehrere Substrate.
Viele Enzyme werden in der Natur in sehr kleinen Mengen
gefunden. Ihre Isolierung, Reinigung und Verwendung ist
daher im Hinblick auf die Kosten und die Zeit, die zu
ihrer Isolierung in verwendbarer Form erforderlich ist,
auf Arbeiten in kleinem Maßstab beschränkt.
Einige Enzyme kommen in der Natur in relativ großen
Mengen vor und sind verhältnismäßig leicht zu isolieren,
zu reinigen und zu verwenden. Sie können aber wegen ihres
bestimmten katalytischen Verhaltens nur bestimmte ausgewählte
Reaktionen katalysieren.
In letzter Zeit sind viele Versuche unternommen worden,
Enzyme zu synthetisieren, welche gleiches enzymatisches
Verhalten zeigen wie die natürlichen Enzyme, die entweder
selten sind oder deren Isolierung teuer ist. Ferner hat
man versucht, native Enzyme zu modifizieren derart, daß
sich ihre Substratspezifität ändert, so daß sie eine
Reaktion katalysieren können, die sie vorher nicht katalysieren
konnten.
Eine bekannte Technik, um enzymatisches Verhalten zur
Katalysierung einer bestimmten gewünschten Reaktion zu
erhalten, ist die Synthese der sogenannten Enzym-Modell-
Moleküle. Zum Beispiel können Verbindungen niedrigen
Molekulargewichts kovalent an funktionelle Gruppen gebunden
werden, welche die Aktivität des Aktivitätszentrums
eines Enzyms zeigen. (Siehe Breslow, R., Advances in
Chemistry Series, R. F. Grould, Ed., American Chemical
Society, Washington, D. C. 21-43 (1971) und Tang, C. C.;
Davalian, D.; Haung, P. und Breslow, R., J. Amer. Chem.
Soc., 100, 3918 (1978) und Breslow, R., Doherty, J.,
Guillot, G. und Lipsey, C., J. Amer. Chem. Soc., 100,
3227 [1978].)
Bei einer anderen Methode wird eine Matrix aus einem
synthetischen Polymeren verwendet, welches entlang seiner
Hauptkette modifiziert ist, um die funktionellen Gruppen,
welche die Funktion des Aktivitätszentrums eines
gegebenen Enzyms aufweisen, bereitzustellen. (Siehe z. B.
Wulff, G. und Schulza, I., Israel J. Chem., 17, 291
(1978) und Suh, J. und Klotz, I. M., Bioorganic Chemistry,
6, 165 [1977].)
Durch Anhängen eines chemischen Teils an ein natives
Enzym in der Nähe seines Aktivitätszentrums hat man
versucht zu verursachen, daß solch ein Enzym mit einer
anderen katalytischen Aktivität reagiert. Ein Beispiel
dafür ist die Umwandlung von Papain, einem proteolytischen
Enzym, in ein Enzym vom Typ der Oxidase durch die
kovalente Bindung eines Flavins nahe dem Aktivitätszentrum
des nativen Papainenzyms. (Levine, H. L. und Kaiser,
E. T., J. Amer. Chem. Soc., 100, 7670 (1978), Kaiser,
E. T., et al, Adv. in Chemistry Series, No. 191,
Biomimethic Chemistry, Seite 35, 1980; und Otsuki, T;
Nakagawa, Y. und Kaiser, E. T., J.C.S. Chem. Comm., 11,
457 (1978). Andere Beispiele für eine derartige
enzymatische Modifikation sind dem folgenden Artikel zu entnehmen:
Wilson, M. E. und Whitesides, G. M., J. Amer. Chem.
Soc., 100, 306 [1978].)
Die Substratspezifität läßt sich auch durch Ruhigstellung
eines nativen Enzyms in einer Gelmatrix ändern. So ist
z. B. das Enzym Trypsin in Polyacrylamid-Gel ruhiggestellt
worden. Das Polyacrylamid-Gel gestattet
Aminosäureestern durch die Gel-Matrix hindurchzudiffundieren,
um mit dem Enzym zu reagieren, gestattet aber größeren
Proteinen das Hindurchdiffundieren nicht. So wird die
Substratspezifität durch Eliminieren des Zutritts eines
der Substratmoleküle zu dem Enzym geändert.
Die Ruhigstellung oder Immobilisierung nativer Enzyme
ist Stand der Technik, ebenso die Änderung der
Enzymspezifität durch Ruhigstellung. (Kirk-Othmer Encyclopedia
of Chemical Technology, 3 Ed., 9, 148 (1980), Wiley and
Son, Inc.).
Zwei weitere Methoden der Enzymimmobilisierung sind in den
US-PS 38 02 997 und 39 30 950 offenbart. Nach der US-PS
38 02 997 werden Enzyme durch Binden an anorganische Träger
in Gegenwart ihrer Substrate stabilisiert, wodurch das Enzym
immobilisiert wird. Gemäß der US-PS 39 30 950 wird ein
aktiver Träger, der chemisch an das Enzym gebunden werden
kann, mit einem Enzym-Substrat-Komplex, der durch Mischen
eines Enzyms und eines spezifischen Substrats gebildet
worden ist, in Kontakt gebracht, wobei die Transformation
von Substrat zu Produkt auf einem Minimum gehalten wird.
So wird die Enzymkomponente des Komplexes chemisch an den
Träger gebunden.
Es ist auch bekannt, daß eine native Lysin-Monooxigenase
derart umgesetzt werden kann, daß die Sulfhydrylgruppen
an dem Enzym blockiert sind. Dann zeigt das Enzym Lysin-
Monooxigenase eine neue katalytische Aktivität gegenüber
Aminosäuren und katalysiert oxidativ Desaminierung anstatt,
wie das natürliche Enzym oxigenativ Decarboxilierung. Die
Autoren können jedoch nicht über das modifizierte Verhalten
berichten (Siehe Yamauchi, T.; Yamamoto, S. und Hayaishi, O.,
in The Journal of Biological Chemistry, 248, 10,
3750-3752 [1973].) Auch durch Umsetzen eines nativen
Enzyms, z. B. Trypsin, mit seinem natürlichen Inhibitor
und anschließender Vernetzung kann Substratspezifität des
Enzyms verändert werden. (Siehe Beaven, G. H. und Gratzer,
W. B. in Int. J. Peptide Res., 5, 215-18 [1973].)
Außerdem sind synthetische Proteine durch Verankern eines
Aminosäurerestes an einem festen Träger und anschließendes
Zufügen eines Aminosäurerestes nach dem anderen hergestellt
worden.
Ferner sind halbsynthetische Proteine synthetisiert worden,
indem ein natives Protein einer begrenzten Hydrolyse
ausgesetzt wurde, um Proteinbruchstücke zu erzeugen, denen
dann ein oder mehrere Aminosäurereste angefügt oder von
ihnen entfernt wurden, wodurch modifizierte Bruchstücke
gebildet wurden. Diese wurden zu einem halbsynthetischen
Protein mit einer geänderten Aminosäurezusammensetzung
wieder zusammengefügt ("Semisynthetic Proteins" von
R. E. Offord, John Wiley and Sons Ltd., 1980).
Obwohl diese Techniken für viele Anwendungszwecke geeignet
sind, sind sie kostspielig. Nach den bekannten Methoden
wird ein Enzym einfach einem Satz von Bedingungen
unterworfen und dann versucht, sein Verhalten aufzuklären.
Der Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, ein einfaches
einwandfrei arbeitendes wirtschaftliches und systematisches
Verfahren zur chemischen Veränderung der Substratspezifität
eines billigen und in großem Umfang zur
Verfügung stehenden nativen Proteins zu einem enzymartig
modifizierten Protein anzugeben. Dieses Protein soll eine
katalytische enzymatische Aktivität mit Bezug auf eine
gewünschte chemische Reaktion zeigen, die bisher, durch
das native Enzym katalysiert, keine für die Industrie
geeignete Reaktion war; die neue Reaktion soll systematisch
vorher bestimmt werden können.
Die Aufgabe wird durch das Verfahren des Anspruches 1,
Ausführungsform A oder Ausführungsform B und die enzymartig
modifizierten Proteine oder Ansprüche 2 und 3 gelöst.
Durch die Erfindung wird ein enzymartig modifiziertes
Protein durch chemische Veränderung eines natürlich
vorkommenden sogenannten nativen Proteins in ein enzymartig
modifiziertes Protein, das andere Eigenschaften aufweist
als das native Protein, das das Ausgangsmaterial darstellt,
erhalten.
Nach einer Ausführungsform der Erfindung wird das native
Protein durch Inkontaktbringen mit einem Denaturierungsmittel
bei einer Konzentration und in einer Zeit, die
ausreichen, eine Denaturierung in hohem Grade zu verursachen,
denaturiert. Danach wird das in hohem Grade
denaturierte Protein Bedingungen unterworfen, die eine
partielle Renaturierung des Proteins bewirken. Das
partiell denaturierte Protein wird mit einem Inhibitor eines
Modellenzyms, dessen katalytische Aktivität nachgebildet
werden soll, in Kontakt gebracht, um einen Komplex
von partiell denaturiertem Protein und Inhibitor zu bilden.
Unter "Inhibitor" ist eine Verbindung zu verstehen, die
ausreichend strukturelle Ähnlichkeit mit dem Substrat des
Modellenzyms hat, um als Schablone für die katalytische
Stelle des enzymartig modifizierten Proteins zu dienen.
Das partiell denaturierte Protein in dem Komplex wird
dann vernetzt, um ein neues enzymartig modifiziertes
Protein zu erzeugen.
Danach wird der Modellenzym-Inhibitor und eventuell
überschüssiges Vernetzungsmittel von dem neugebildeten enzymartig
modifizierten Protein entfernt, um ein funktionelles
stabiles Analogon des Modellenzyms zu erhalten. Das enzymartig
modifizierte Protein besitzt die katalytische Aktivität
des Modellenzyms.
Nach einer anderen Ausführungsform wird das in hohem
Grade denaturierte Protein mit einem Inhibitor des Modellenzyms
vermischt und dann das in hohem Grade denaturierte
Protein partiell renaturiert, um einen partiell denaturierten
Protein-Inhibitor-Komplex zu erhalten.
Es ist gefunden worden, daß durch das voranstehende
Verfahren ein Protein von seiner nativen Konformation in
eine modifizierte Konformation übergeführt werden kann.
Der neue konformationale Zustand definiert ein enzymartig
modifiziertes Protein.
"Enzym" bedeutet hierin ein Protein von bekannter
katalytischer Aktivität gegenüber spezifischen Substraten,
d. h. bekannter Substratspezifität. "Protein" bedeutet
hierin, wie allgemein, ein Polypeptid, ein von Aminosäuren
gebildetes biologisches Molekül.
Das Verfahren umfaßt die chemische Veränderung eines
nativen Proteins einer Konformation, seinem natürlichen
oder nativen Zustand oder seiner nativen Erscheinungsform,
in eine zweite Konformation, einem neuen modifizierten
Zustand oder eine neue modifizierte Erscheinungsform,
und führt zu einem neuen stabilen enzymartig modifizierten
Protein, das ein oder mehrere enzymatische
Aktivitäten des ausgewählten Modellenzyms nachahmt.
Die Erfindung wird nun ausführlich beschrieben.
Es wird ein natives Protein ausgewählt, das chemisch
verändert werden soll, um das neue enzymartig modifizierte
Protein, das ein Analogon des gewünschten Modellenzyms
ist, zu erzeugen. Als natives Protein-Ausgangsmaterial
kann sowohl ein enzymatisches als auch ein
nicht-enzymatisches verwendet werden. Im allgemeinen
sind die nativen Proteine, die in großem Umfang zur
Verfügung stehen, nicht-enzymatische Proteine, wie z. B.
Rinderserumalbumin. Zweckmäßigerweise wird ein natives Protein
als Ausgangsmaterial gewählt, das in ausreichend
reiner Form, in ausreichenden Mengen und zu einem
vertretbaren Preis zur Verfügung steht. Das ausgewählte
native Protein wird durch Inkontaktbringen mit einem
Denaturierungsmittel ausreichend lange und in einer ausreichenden
Konzentration in hohem Grade denaturiert, und
anschließend durch Inkontaktbringen mit Reagenzien oder
unter Verfahrensbedingungen, die ausreichen, das Protein
partiell zu renaturieren, partiell renaturiert; das
resultierende nur partiell denaturierte Protein wird mit
einem Inhibitor für das ausgewählte Modellenzym ausreichend
lange und bei ausreichender Temperatur in Kontakt
gebracht, daß ein Komplex von dem partiell denaturierten
Protein und dem Inhibitor gebildet wird; und anschließend
wird das partiell denaturierte Protein in dem Komplex mit
einem Vernetzungsmittel unter Bildung des neuen stabilen
enzymartig modifizierten Proteins vernetzt. Überschüssiges
Vernetzungsmittel oder überschüssiger Modellenzyminhibitor
werden entfernt, um das neue katalytisch aktive enzymartig
modifizierte Protein zu isolieren.
Das native Ausgangsprotein wird in hohem Grade denaturiert
oder ausgebreitet, um seine native dreidimensionale
chemische Struktur weitgehend zu zerstören, und
partiell renaturiert oder rückgeklappt um eine
Proteinstruktur zu erhalten, die in der Lage ist, Inhibitor
zu binden, obwohl es nicht die native Struktur hat. Das
partiell denaturierte Protein hat weder die chemische
Struktur, die sogenannte Konformation des Ausgangsproteins,
noch die des in hohem Grade denaturierten Proteins. Es
wird angenommen, daß die starke Denaturierung des nativen
Ausgangsproteins und die darauf folgende nur partielle
Rückklappung potentiell die Bildung neuer Inhibitor-
Bindungsstellen ermöglicht. So werden Stellen gebildet, die
verschieden von denen sind, die gebildet werden, wenn das
native Protein partiell denaturiert wird ohne vor dem
Inkontaktbringen mit dem Inhibitor in hohem Grade denaturiert
worden zu sein.
"In hohem Grade denaturiert" bedeutet eine große Änderung
des nativen Zustands, was verursacht, daß das Protein
im wesentlichen vollständig ausgebreitet wird. In dem in
hohem Grade denaturierten Zustand fehlt dem Protein beides,
die Sekundär- und die Tertiär-Struktur, und es gleicht
einem willkürlichen Coil. Der in hohem Grade denaturierte
Zustand kann durch Vergleich physikalischer Meßergebnisse,
vorgenommen an dem in hohem Grade denaturierten Protein
und dem eines Modells eines willkürlichen Coils, bestimmt
werden. Beispiele für derartige physikalische Messungen
sind die Viskosität, Zirkulardichroismus, Sedimentationskoeffizient
und Ultraviolett-Spektren. Unter die Definition
"in hohem Grade denaturiertes Protein", fallen auch
Proteine, die noch Reste von Sekundär- und/oder Tertiär-
Struktur enthalten. Spuren von Reststrukturen wirken sich
nicht störend auf das Verfahren aus.
Die Eigenschaften von in hohem Grade denaturierten Proteinen
sind bekannt. Wenn z. B. eine Viskositätsmessung
vorgenommen wird, um Protein-Denaturierung zu überwachen,
steigt die Viskosität eines Kugelproteins während des
Ausbreitungsvorgangs. Andererseits fällt die Viskosität eines
Faserproteins nach Ausbreitung. Ausbreitung kann auch mittels
Änderungen im UV-Spektrum überwacht werden. Die Hauptänderung
in den Spektren findet wegen der Verlagerung von
Phenylalanyl-, Trypyl- und Tryptophyl-Seitenketten vom
Proteininneren zum umgebenden Lösungsmittel während der
Denaturierung statt. Im allgemeinen nimmt der molare
Absorptionskoeffizient infolge Verschiebung in den Absorptionsbanden
bei einigen Wellenlängen ab, während er bei
anderen steigt. Die starke Denaturierung der Proteinstruktur
verändert die optische Drehung und die Zirkulardichroismus-
Spektren drastisch. Die genaue Art der Änderungen
steht in Beziehung zu der Sekundär- und Tertiärstruktur
des nativen Proteins.
Verfahren der Denaturierung in hohem Grade und die
Kriterien zur Demonstrierung starker Denaturierung sind
beschrieben von: Charles Tanford, Adc. Protein Chemistry,
23, 121 (1968); P. L. Privalov, Adv. Protein Chemistry,
33, 167 (1979); und C. B. Anfinsen, Science, 181, 223
(1973).
In dem erfindungsgemäßen Verfahren ist zur Denaturierung
in hohem Grade Guanidinhydrochlorid (GuHCl) besonders
geeignet. Starke Proteindenaturierung ist gewöhnlich bei
Konzentrationen von 6 bis 8 M GuHCl vollständig. In vielen
Fällen kann GuHCl durch 8 M Harnstoff ersetzt werden.
Denaturierung in hohem Grade kann auch erreicht werden
durch Erhöhen der Temperatur, bis der bekannte Ausbreitungsübergang
stattgefunden hat. Außerdem können extrem
saure oder basische Bedingungen allein oder in Verbindung
mit Temperaturerhöhung zur Anwendung kommen. Im allgemeinen
reicht eine Temperatur von 50 bis 70°C aus. Geeignete
Säuren sind z. B. Essigsäure, Ameisensäure, Propionsäure
und Zitronensäure; Salpetersäure, Phosphorsäure, Schwefelsäure
und Salzsäure; geeignete Basen sind z. B. Natronlauge
und Kalilauge.
Eine weitere geeignete Methode zur Denaturierung in hohem
Grade ist die folgende: Das native Protein wird mit Beta-
Mercaptoethanol in einem Molverhältnis von etwa 1000
Einheiten Beta-Mercaptoethanol pro Einheit Protein vermischt,
bei neutralem pH-Wert eine bis mehrere Stunden behandelt
und dann 6 M Guanidinhydrochlorid zugegeben. Diese Bedingungen
reichen aus, um die meisten Proteine vollständig
zu denaturieren. Die Proteinkonzentration und der pH-Wert
sollten so sein, daß mindestens ein Teil des Proteins in
Lösung bleibt. Das Beta-Mercaptoethanol spaltet Disulfidbrücken
und erleichtert durch Unterstützung der Strukturzerstörung
die Denaturierung in hohem Grade des Proteins.
Wenn die Bedingungen für die Denaturierung in hohem Grade
reduziert werden, wird das Proteinmolekül partiell renaturiert.
Der partiell renaturierte Zustand kann von
Proteinmolekülen gebildet werden, die nahezu vollständig
denaturiert geblieben sind, vermischt mit Molekülen, die
nahezu vollständig rückgefaltet oder rückgeklappt sind;
oder von Proteinmolekülen, die nahezu vollständig rückgeklappt
oder die nahezu alle partiell und nahezu gleich
rückgeklappt sind. Der genaue physikalische Zustand ist
für die Erfindung nicht kritisch. Der partiell renaturierte
Proteinzustand wird durch die Änderungen physikalischer
Parameter erkannt, die anzeigen, daß das Protein nicht
mehr ein willkürliches Coil ist, sondern eine beträchtliche
Sekundär- und Tertiär-Struktur hat. Der partiell
renaturierte Zustand hat allerdings nicht die Struktur
hoher Ordnung wie das native Protein; es wird angenommen,
daß er andere potentielle Stellen für Inhibitorbindung
bietet als ein partiell denaturiertes natives Protein, da
das partiell renaturierte Protein strukturell in der
Denaturierungsstufe vollständig umgelagert worden ist. Das in
hohem Grade denaturierte Protein kann partiell renaturiert
werden, um neue Stellen für die Inhibitorbindung zu erhalten,
die bisher in einem partiell denaturierten Protein
nicht vorhanden waren.
Die partielle Renaturierung von in hohem Grade denaturierten
Proteinen ist im einzelnen beschrieben in:
L. G. Chavez, Jr. und H. A. Scheraga, Biochemistry (1980),
19, 996-1004; H. Taniuchi und C. B. Anfinsin (1968),
J. Biol. Chem., 243, 4778; H. Taniuchi und C. B. Anfinsin
(1969), J. Biol. Chem., 244, 3864; M. I. Kanehisa und
T. Y. Tsong, Biopolymers, 18, 2913-2928 (1979); E. W.
Miles, K. Yutani und K. Ogasachara, Biochemistry, 21, 11
(1982) und D. B. Witlanfer, Adv. Protein Chemistry, 34,
61 (1981).
Nachdem das Protein partiell renaturiert ist, wird es mit
einem Inhibitor eines Modellenzyms, dessen katalytische
Aktivität es nachahmen soll, in Kontakt gebracht.
Der Ausdruck "Inhibitor" bedeutet hierin, wie weiter vorn
schon angegeben, irgendeine Verbindung, die genügend
strukturelle Ähnlichkeit mit dem natürlichen Substrat
des Modellenzyms aufweist, um als eine Schablone für die
katalytische Stelle des enzymartig modifizierten Proteins
zu dienen. Der Inhibitor ist zweckmäßigerweise irgendeiner
der bekannten Inhibitoren des jeweils gegebenen Modellenzyms.
Er kann auch irgendein Molekül einschließen, das
eine ausreichende strukturelle Ähnlichkeit mit dem
klassischen Inhibitor hat.
(Siehe "Enzyme Inhibitors", Proceedings of a Meeting held in Basel,
Switzerland, on 20 and 21 March 1980, edited by Urs Brodbeck, Verlag
Chemie, Weinheim, "Inhibitor Index" p. 275 to 278; und "Handbook of
Enzym Inhibitors", M. K. Jain, John Wiley + Sons, New York 1982,
Inhibitor Index 1-380).
Das natürliche Substrat des
Modellenzyms kann in vielen Fällen als der Inhibitor oder
die Schablone des modifizierten Proteins wirken. Inhibitoren
werden im allgemeinen durch das Enzym nicht abgebaut
wie Substrate und bieten einer katalytischen Stelle
leichter Schutz als das natürliche Substrat. Ein Beispiel
für die strukturelle Ähnlichkeit eines enzymatischen
Inhibitors und des natürlichen Substrats eines Enzyms ist
der Fall der Glukose-Oxidase. Glukose ist das Substrat
der Glukose-Oxidase, während D-Glukal der Inhibitor für
Glukose-Oxidase ist. Glukose und D-Glukal sind strukturell
sehr ähnlich.
Nachdem das partiell renaturierte Protein mit dem Inhibitor
ausreichend lang und bei einer zur Bildung des
Protein-Inhibitor-Komplexes ausreichenden Temperatur in
Kontakt gebracht worden ist, wird der partiell renaturierte
Proteinanteil des Komplexes vernetzt, um die neue Struktur
zu stabilisieren.
Der Ausdruck "Vernetzung" bedeutet hierin die Bildung von
kovalenten Bindungen zwischen reaktiven Stellen an einem
Protein.
Im allgemeinen wird die Proteinvernetzung durch Verwendung
multifunktioneller Reagenzien, wie Glutaraldehyd, ausgeführt.
Weitere Beispiele für Vernetzungsmittel sind:
2-Amino-4,6-dichlor-s-triazin; Diazoniumsalze; N-Hydroxisuccinamid;
p-Benzoylazid und solche Reagenzien, die
offenbart sind in: Wold, F., Methods Enzymol, 11, edited
by C. H. W. Hirs, C.H.W., Academic Press, 1967, 617;
Fasold, H. et al., Augen. Chem. Int. Ed. Engl., 10, 795,
197 und Keyes, M. H., in Kirk-Othmer Encyclopedia of
Chemical Technology, 9, 3rd Ed., 1980, J. Wiley + Sons,
Inc., 148-172. Vernetzung kann auch durch Disulfid-
Umlagerung bewirkt werden.
Viele Enzyme können nach dem beschriebenen Verfahren
nachgeahmt werden. Beispiele für solche Modellenzyme
sind hydrolytische Enzyme, Redox-Enzyme und Transferase-
Enzyme. Nachstehend einige Beispiele: Die hydrolytischen
Enzyme schließen proteolytische Enzyme ein, die Proteine
hydrolysieren, wie z. B. Papain, Ficin, Pepsin, Trypsin,
Chymotrypsin, Bromelin, Keratinase; Carbohydrasen, die
Kohlenhydrate hydrolysieren, wie z. B. Cellulase, Amylase,
Maltase, Pektinase, Chitanase; Esterasen, die Ester hydrolysieren,
wie z. B. Lipase, Cholinesterase, Lecithinase,
alkalische und Säurephosphatasen; Nukleasen, die Nukleinsäuren
hydrolysieren, wie z. B. Ribonuklease, Desoxiribonuklease;
und Amidasen, die Amine hydrolysieren, wie z. B.
Arginase, Asparaginase, Glutanase, Histidase und Urease.
Die Redox-Enzyme katalysieren Oxidations- oder Reduktions-
Reaktionen. Sie schließen ein Glukoseoxidase, Xanthinoxidase,
Katalase, Peroxidase, Lipoxidase und Cytochrom-
Reduktase. Die Transferase-Enzyme übertragen Gruppen von
einem Molekül auf ein anderes. Beispiel hierfür sind
Glutamin-Brenztraubensäure-Transaminase, Glutamin-
Oxalsäure-Transaminase, Transmethylase, Phospho-Brenztraubensäure-
Transphosphorylase.
Bei der praktischen Durchführung des Verfahrens wählt
man ein Modellenzym aus. Dann wählt man ein natives
Ausgangsprotein, das dem Modellenzym unter Erzeugung
eines enzymartig modifizierten Proteins nachgebildet
werden soll.
Man kann das native Protein zu einer davon verschiedenen
stabilen enzymartig modifizierten Proteinform maßschneidern,
welche die Substratspezifität des Enzyms zeigt,
das nachgebildet werden soll. Die Möglichkeit, ein natives
Protein in ein Protein vorbestimmter katalytischer Aktivität
umzubilden, bringt in vielen Situationen in Chemie
und Technik größere Vorteile. Wenn man z. B. ein Enzym
verwenden will, das nur in kleinen Mengen zur Verfügung
steht, sehr teuer ist oder sehr schwer zu isolieren und/
oder zu reinigen ist, kann ein solches Enzym als Modellenzym
für die Herstellung eines enzymartig modifizierten
Protein-Analogons nach dem Verfahren der Erfindung zur
Nachahmung seiner Aktivität dienen.
Am besten wird das Ausgangsprotein gereinigt und in
einem nahezu neutralen wäßrigen Lösungsmittel in Gegenwart
eines Puffers zur Aufrechterhaltung der Neutralität
der Lösung gelöst. Dann wird das native Protein nach
irgendeiner der vorstehend beschriebenen Methoden
denaturiert, um eine in hohem Grade denaturierte, insbesondere
wasserlösliche Form des nativen Ausgangsproteins
zu erhalten, das partiell renaturiert oder rückgeklappt
wird. Das partiell denaturierte Protein wird mit einem
Inhibitor für das Modellenzym vermischt und die Mischung
stehengelassen, daß sich ein partiell denaturiertes
Protein-Inhibitor-Komplex bilden kann. Danach muß der
partiell denaturierte native Proteinteil des Protein-
Inhibitor-Komplexes stabilisiert werden, was durch
Vernetzen des Proteins geschieht. Häufig wird Glutaraldehyd
als Vernetzungsmittel verwendet, weil diese Chemikalie
wirtschaftlich ist.
Der Inhibitor des Modellenzyms wird nach der Synthese
des enzymartig modifizierten Proteins entfernt. Wiederholtes
Waschen des immobilen modifizierten Proteins reicht
gewöhnlich zur Entfernung des Inhibitors aus. Gepufferte
wäßrige Lösungen können auch verwendet werden. Beispiele
für geeignete Puffer sind weiter unten angegeben.
Die erhaltenen modifizierten stabilen Proteine, die
enzymartiges katalytisches Verhalten zeigen, sind zur
Durchführung von katalytischen anabolischen und
katabolischen Reaktionen anstelle eines natürlich vorkommenden
Enzyms geeignet.
Die Erfindung wird nun noch an speziellen Beispielen
beschrieben.
60 mg chromatografisch gereinigtes natives Enzym Pankreas-
Ribonuklease (RNase), Charge 110F-
02051, Type IIA, Nr. R-5000, wurden in 3 ml 8 M Harnstoff
als Denaturierungsmittel, das 0,1 M 2-Amino-2-(hydroxi-
methyl)-1,3-propandiol-HCl-Puffer (nachstehend mit "Tris-
Puffer" abgekürzt) enthielt, bei einem pH-Wert von 8 unter
langsamem Rühren bei 25°C gelöst.
Als nächstes wurde der Lösung 0,1 ml Denaturierungsmittel
β -Mercaptoethanol zugegeben, um die Disulfidbindungen
aufzubrechen. Die resultierende Lösung wurde
langsam 15 Minuten bei 25°C geschüttelt, dann unter Stickstoff
in einen mit Stopfen versehenen Erlenmeyer-Kolben
gegeben und darin bei 25°C 16 Stunden belassen. Die
geschlossene Umgebung des Kolbens wurde durch einen durch
Stickstoff unter Druck gesetzten Behälter erhalten, der
Stickstoffgas an den Kolben bei Entgasen des Kolbens in
eine Wasserfalle abgab.
Danach wurden 3 ml der Lösung über eine 30,48 × 2,54 cm
Gel-Filtrationssäule chromatografiert. Die Säule
enthielt als Filtermaterial im Handel erhältliches Sephadex
G-15. Sephadex ist ein gekörntes hochmolekulares
Polysaccarid, das mit Epichlorhydrin vernetzt ist. Als Eluant
für die Gelsäure wurde 0,1 M Essigsäure, pH-Wert 3,
verwendet. Die Flußgeschwindigkeit des Eluants wurde bei
1 ml/min mittels einer Niedergeschwindigkeits-Peristaltikpumpe
gehalten. Ein Adsorbence-Monitor wurde am Auslauf
der Säule in Stellung gebracht und ein UV-Detektor,
eingestellt auf 276 nm, wurde verwendet, um die eluierenden
Proteinfraktionen zu erfüllen. Eine größere Proteinfraktion
von etwa 5 ml eluierte unter diesen Bedingungen aus der
Säule und wurde in einem kleinen Becher gesammelt. Die
Proteinfraktion wurde unter Verwendung eines
Photometers ACTA III analysiert. Die Molarität der
Proteinfraktion wurde mit 2,67 × 10-5 bestimmt, wobei der
Absorbence-Koeffizient bei 208 A 0,254 war. Das Molekulargewicht
des Proteins war 13 000 Daltons und der Exitinktionswert E
einer 1%igen Lösung 7,3.
Den 5 ml proteinhaltigen Eluants wurden zugesetzt: 1 ml
1,0 M Tris-HCl-Puffer, pH 8; 1 ml einer 1 mM Ethylendiamintetraessigsäure
(EDTA); 1 ml von 5 × 10-4 M reduziertem
Glutathion; 1 ml von 5 × 10-4 M oxidiertem Glutathion
und 1 ml von 0,02 M Tryptamin-HCl. Das Tryptamin-HCl wurde
als der Inhibitor zugegeben, während die anderen Reagenzien,
nämlich EDTA und Glutathion zugegeben wurden nach
den Lehren von Lloyd Chavez, Jr. und Harold Scheraga in
"Folding of Ribonuclease, S-Protein und Des (121-124)
ribonuclease during Glutathione Oxidation of Reduced
Proteins", 1980, Biochemistry, 19, 996-1004. Die resultierende
Lösung zeigte einen pH-Wert von 5,5. Die Lösung
wurde 1,5 Stunden bei einem pH-Wert von 5,5 langsam
gerührt. Danach wurde der pH-Wert auf etwa 8,0 durch Zugabe
von 100 mg Tris-Base-Kristallen erhöht. Die resultierende
Tris-haltige Lösung wurde langsam bei einem pH-Wert von 8,
einer Temperatur von 25° weitere 2,5 Stunden gerührt.
Während des Rührens bildete sich ein flockiger weißer
Niederschlag.
Nach Ablauf von 2,5 Stunden wurde zur Vernetzung die
Lösung gegen 1 mM Tris-HC1-Puffer eines ph-Wertes von 7,2,
der 0,005 M des Inhibitors Tryptamin enthielt, dialysiert.
Die Dialysiermembran war ein Spektrapor-Membranrohr,
Nr. 2, das einen Molekulargewichtsausschlußbereich von
12-14 000 Daltons hat. Das Dialysieren schloß zwei Pufferwechsel
ein mit einem Volumen von 7000 ml Puffer über eine
Zeitdauer von 17 Stunden bei 0,5°C und schwachem Schütteln
des Dialysierrohres in dem Dialysiermedium.
Nach der Dialyse wurden 2 ml der das enzymartig modifizierte
Protein enthaltenden Lösung über eine 1,27 × 30,48 cm
Sephadex G-15 Säule chromatografiert. Sie war mit Gelfiltrationsmittel
unter Verwendung von Trispuffer, pH 7, als
Eluant gefüllt. Eine solche Gelfiltrationssäule wird verwendet,
um Materialien niedrigeren Molekulargewichts von
Proteinmaterialien abzutrennen. Die Flußgeschwindigkeit
des Eluants war 1 ml/min. Das Eluant wurde bei 254 nm
überwacht, um das Eluieren von enzymartig modifiziertem Protein
festzustellen. Ein erster Teil von eluiertem enzymartig
modifiziertem Protein wurde gesammelt und gegen Substrat
für Esterase-Enzym geprüft. Das verwendete Substrat war
Tryptophan-Methylester (TME),
Charge 109C-0048, Nr. T-5505).
Die Untersuchung auf enzymatische Aktivität des esterase-
enzymartig modifizierten Proteins wurde wie folgt durchgeführt.
Die vorstgehend gesammelte Proteinfraktion wurde
durch Hochdruck-Flüssigchromatografie (HPLC) geprüft, um
die Aktivität gegenüber dem TME-Substrat zu bestimmen.
Die Versuchsbedingungen waren die folgenden: das HPLC-
Säuleneluat war 0,03 M Acetat, pH-Wert 6. Das
Säulenträgermaterial war an poröses Siliciumdioxid gebundenes
Phasenmaterial, das Carboxylseitenketten enthielt. Die
Säule war aus rostfreiem Stahl und 2 mm × 25 cm. Die
Strömungsgeschwindigkeit von 4 ml/min wurde durch eine
übliche Hochdruckpumpe aufrechterhalten.
Das Säuleneluat wurde mittels eines üblichen UV-Monitors
bei 254 nm überwacht.
Die Untersuchungsprobe wurde auf folgende Weise bereitet.
1 ml des esterase-enzymartig modifizierten Proteins (mit
einer Absorption von 0,222 bei 280 nm, was 0,335 mg/ml
entspricht) wurde vermischt mit 8 ml 5 mM Tris-HCl-Puffer, pH 8,
und 1 ml 0,1 M TME-Substrat. Die Untersuchungs-Kontrollösung
wurde bereitet durch Zufügen von 8 ml des 5 mM Tris-
HCl-Puffers, pH 8, zu 1 ml von 0,1 M TME und 1 ml des Tris-
Puffers, pH 7, verwendet als die Eluantlösung. Der pH-Wert
von der Kontroll- und der Untersuchungs-Probenlösung war 6,6.
1 ml der Probe wurde aus dem Becher unter Verwendung einer
2 ml Subkutanspritze mit einer 18 Gauge (4,57 µm) dicken
Nadel entfernt. Diese 1 ml Probe wurde durch eine 20 ml Injektionsprobeschleife auf der HPCl-Säule hindurchgeschickt. Die Injektionszeit
wurde aufgezeichnet. Dieses Vorgehen wurde mit der
Kontrollösung wiederholt. Beide, die Probe und die Kontrolle,
wurden viermal chromatografiert, um den Verlauf von Molarität
des Tryptophans gegen die Zeit des Eluierens von Probe und
Kontrolle zu erhalten.
Mit den erhaltenen Daten wurde eine statistische Analyse
durchgeführt, die einen Anstieg von 0,3171 × 10-5 M/min zeigte,
wobei ein Fehler von 0,00685 × 10-5 M/min für die Probe
ermittelt wurde. Ein Anstieg von 0,2878 × 10-5 M/min mit
einem Fehler von 0,0091 × 10-5 M/min wurde für die
Kontrolle ermittelt.
Die folgende Beziehung wurde benutzt, um die Aktivität des
esterase-enzymartig modifizierten Proteins nach der
Erfindung zu berechnen.
worin bedeuten: Die Änderung in der Neigung die Differenz
zwischen der Probe und der Kontrolle (in diesem Beispiel
0,0293); der Fehler ist die Summe der Fehler der Neigung
von Probe und Kontrolle; Vs das Volumen der Probe in Liter:
106 Mikromole/Mol; und MP ist mg modifiziertes Protein in
der Untersuchungsprobe.
In der vorstehenden Berechnung wird die Konzentration des
modifizierten Proteins aus seiner Absorbance bei 280 nm
berechnet, und zwar unter Verwendung des Extinktionskoeffizienten
für Ribonuclease, die bei einer 1%igen Lösung 7,3
ist. Der Extinktionskoeffizient ist offenbart in Int. J.
Peptide Protein Res. 5, 49-62 (1973) authored by D. M.
Kirschenbaum.
Die Untersuchungsergebnisse sind nachstehend aufgeführt:
Substrat
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,000 Aktivität am Schluß8,0 ± 0,717
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,000 Aktivität am Schluß8,0 ± 0,717
Die Ergebnisse zeigen, daß das esterase-enzymartig modifizierte
Protein, hergestellt nach dem erfindungsgemäßen
Verfahren, Aktivität mit Bezug auf das Esteraseenzym-Substrat
TME besitzt, obwohl vorher im nativen Ribonucleaseenzym
keine Aktivität festgestellt worden ist. Dies veranschaulicht
die Umwandlung einer Gattung von Enzym, nämlich
einer Nuclease, in eine andere, nämlich ein esterase-enzymartig
modifiziertes Protein.
(In den folgenden Beispielen schließt "wie in Beispiel 1
beschrieben" sowohl die Verfahrensweise als auch die dabei
verwendeten Geräte ein).
120 mg chromatografisch gereinigtes natives Enzym von
Rinderpankreas-Ribonuclease (RNase), das auch in Beispiel 1
verwendet wurde, wurden in 6 ml 8 M Harnstoff, der 0,1 M
Tris-HCl-Puffer, pH 8, enthielt, unter langsamem Rühren
bei 25°C gelöst. Danach wurde mit 0,2 ml Beta-Mercaptoethanol,
wie in Beispiel 1 beschrieben, denaturiert.
Danach wurden 5 ml der Lösung an einer mit Sephadex G-15
Gel gefüllten 30,48 × 2,54 cm Säule chromatografiert.
Das Eluant für die Gelsäule war 0,1 M Essigsäure eines
pH-Werts von 3. Die Flußgeschwindigkeit des Eluants
durch die Säule war 1 ml/min. Die Absorbance des
Ausflusses wurde bei 276 nm mittels eines UV-Detektors überwacht:
Eine größere Proteinfraktion von etwa 1 ml wurde
gesammelt. Die Fraktion wurde mittels eines Beckman-Photometers
ACTA III analysiert. Die Molarität der gesammelten
Proteinfraktion wurde mit 6,64 × 10-5 bestimmt, wobei die
Absorbance bei 280 A 0,63 war. Das Molekulargewicht des
Proteins war 13 000 Daltons und der Extinktionskoeffizient E
einer 1%igen Lösung war 7,3.
Dem gesammelten 5 ml Proteinmaterial wurden zugesetzt:
0,5 ml des 1,0 M Tris-HCl-Puffers, pH 8; 0,5 ml von 1 mM
EDTA; 0,5 ml von 5 × 10-4 M reduziertem Glutathion; 0,5 ml
von 5 × 10-4 M oxidiertem Glutathion und 0,5 ml von 0,02 M
Inhibitor Tryptamin für Esteraseenzym. EDTA und Glutathion
wurden nach den Lehren von Lloyd Chavez zugegeben (siehe
Beispiel 1).
Am Schluß der 4,0 Stunden dauernden Periode zeigte die
resultierende Lösung einen pH-Wert von 5,0. Nach 0,5 Stunden
langem Rühren der resultierenden Lösung bei dem
pH-Wert 5 wurde der pH-Wert durch Zugabe von 100 mg
Tris-Base-Kristallen auf 8 erhöht. Die Lösung wurde langsam
bei pH 8 und 25°C 4 Stunden lang gerührt. Während
des Rührens bildete sich ein weißer flockiger Niederschlag.
Nach diesen 4 Stunden wurde zur Vernetzung die resultierende
Lösung gegen 1 mM Tris-HCl-Puffer, pH 7, der 2% des Inhibitors
Tryptamin enthielt, dialysiert, wie in Beispiel 1
beschrieben.
Zwei ml der vorstehend beschriebenen Proteinlösung wurden,
wie in Beispiel 1 beschrieben, chromatografiert. Die
erste Hälfte der eluierenden Proteinfraktion wurde
gesammelt und gegenüber Esterasesubstrat, nämlich dem in
Beispiel 1 verwendeten Tryptophan-Methylester (TME)
untersucht.
Die Untersuchung auf enzymatische Aktivität des neu synthetisierten
esterasen-enzymartig modifizierten Proteins wurde
an einem HPLC-System vorgenommen. Die Versuchsbedingungen
waren die gleichen wie in Beispiel 1 angegeben.
Die Untersuchungsprobe wurde wie folgt hergestellt. Drei
ml des esterase-enzymartig modifizierten Proteins (mit
einer Absorbance von 0,450 bei 280 nm, was 0,67 mg/ml
entspricht) wurden mit 6 ml eines 1 mM Tris-HCl-Puffers,
pH 7,5 und 1 ml 0,1 M TME-Substrat vermischt. Eine
Untersuchungskontrollösung wurde hergestellt durch Zufügen von
6 ml des 1 mM Tris-HCl-Puffers, pH 7,5 zu 1 ml TME-Substrat
und 3 ml des Sephadex G-15-Eluantpuffers, nämlich des
1 mM Tris-Puffers, pH 7. Der pH-Wert sowohl der Kontrollösung
als auch der Untersuchungsprobelösung war 6,4.
1 ml der Probe wurde aus dem Becher unter Verwendung
einer 2 ml Subcutanspritze mit einer 18 Gauge (4,57 µm)
dicken Nadel entfernt. Diese 1-ml-Probe wurde durch eine
20 ml Injektions-Probeschleife auf der HPLC-Säule hindurchgeschickt.
Die Injektionszeit wurde aufgezeichnet. Dieses
Vorgehen wurde mit der Kontrollösung wiederholt. Beide,
die Probe und die Kontrolle, wurden viermal chromatografiert,
um den Verlauf der Molarität des Tryptophans gegen die
Zeit des Eluierens der Probe und der Kontrolle zu erhalten.
Mit den erhaltenen Daten wurde eine statistische Analyse
durchgeführt, die einen Anstieg von 0,81333 × 10-5 M/min
zeigte, wobei ein Fehler von 0,1021 × 10-5 für die Probe
festgestellt wurde. Ein Anstieg oder eine Neigung von
0,54062 × 10-5 M/min mit einem Fehler von 0,093291 × 10-5 M/min
wurde für die Kontrolle ermittelt.
Die Aktivität des esterase-enzymartig modifizierten
Proteins wurde, wie in Beispiel 1 erläutert, berechnet.
Die Änderung in der Neigung war in diesem Beispiel
0,272713 und der Fehler 0,134.
Die Untersuchungsergebnisse sind nachstehend aufgeführt:
Substrat
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,000 Aktivität am Schluß13,62 ± 6,62
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,000 Aktivität am Schluß13,62 ± 6,62
Die Ergebnisse zeigen, daß das esterase-enzymartig
modifizierte Protein, hergestellt nach dem erfindungsgemäßen
Verfahren, Aktivität mit Bezug auf das Esteraseenzym-
Substrat TME besitzt, obwohl vorher im nativen
Ribonucleaseenzym, keine Aktivität festgestellt worden ist.
Dies zeigt die Umwandlung einer Gattung von Enzym, nämlich
einer Nuclease in eine andere Gattung von Protein, nämlich
einem esterase-enzymartig modifizierten Protein.
100 mg Rinderserumalbumin (BSA),
Charge 90F-9315, No. A-7511) wurden in 5 ml von 8 M Harnstoff,
der 0,1 M Tris-Puffer, pH 8, enthielt, unter langsamem
Rühren bei 25°C gelöst.
Dieser Lösung wurden 0,2 ml Beta-Mercaptoethanol als
Denaturierungsmittel zugegeben. Die Lösung wurde 15 Minuten
bei 25°C schwach geschüttelt. Danach wurde die Lösung
unter Stickstoffatmosphäre 16 Stunden bei 25°C, wie in
Beispiel 1 beschrieben, belassen.
Im Anschluß daran wurden 5 ml der Lösung über eine Gel-
Filtrationssäule, wie in Beispiel 1 beschrieben,
chromatografiert.
Zu der eluierten Proteinfraktion von 5 ml wurden zugegeben:
1 ml von 1,0 M Tris-HCl-Puffer, pH 8; 1 ml von
1 mM EDTA; 1 ml von 5 × 10-4 M reduziertem Glutathion;
1 ml von 5 × 10-4 M oxidiertem Glutathion und 1 ml von
0,02 M Tryptamin als Esterase-Inhibitor. Die resultierende
Lösung zeigte einen pH-Wert von 5,2. Sie wurde bei diesem
pH-Wert langsam 0,5 Stunden gerührt. Danach wurde der
pH-Wert durch tropfenweise Zugabe von 0,1 M NaOH auf 6
erhöht. Die Lösung vom pH-Wert 6 wurde 4 weitere Stunden
bei 25°C langsam gerührt. Während des Rührens bildete
sich ein flockiger weißer Niederschlag. Am Ende dieser
vier Stunden dauernden Periode wurde die Lösung gegen
1 mM Tris-HCl-Puffer, pH 7, der 2% Tryptamin enthielt,
dialysiert. Das Tryptophan wurde als der Inhibitor zugesetzt,
während die anderen Reagenzien nach den Lehren
von Chavez et al, wie in Beispiel 1 angegeben, zugefügt
wurden. Die Dialyse wurde, wie in Beispiel 1 beschrieben,
durchgeführt.
4 ml der das esterase-enzymartig modifizierte Protein
enthaltenden Lösung wurden, wie in Beispiel 1 beschrieben,
chromatografiert.
Ein erster Teil eluierenden enzymartig modifizierten
Proteins wurde gesammelt und gegenüber Substrat für
Esteraseenzym untersucht. Das Substrat war das gleiche
Tryptophan-Methylester (TME), der in Beispiel 1 verwendet
wurde.
Die Untersuchung auf enzymatische Aktivität des esterase-
enzymartig modifizierten Proteins wurde mittels HPLC
vorgenommen, um die Aktivität gegenüber dem TME-Esterase-
Substrat zu bestimmten. Die Untersuchungsbedingungen waren
die gleichen wie in Beispiel 1 angegeben. Der Säuleneluant
wurde mittels eines üblichen UV-Monitors bei
254 nm und 0,05 A erfühlt.
Die Untersuchungsprobe wurde wie folgt hergestellt: 5 ml
von 0,03 M Acetatpuffer, pH 6, wurden mit 1 ml 0,1 mM TME
und mit 4 ml des esterase-enzymartig modifizierten Proteins,
hergestellt, wie vorstehend beschrieben (mit einer
Adsorption bei 280 nm von 0,016, entsprechend 0,024 mg/ml)
vermischt. Die Untersuchungsprobe wurde durch Zugabe von
5 ml 0,03 M Acetat, pH 6, zu 1 ml 0,1 M TME und 4 ml des
Eluants, nämlich des Tris-HCl-Puffers, pH 7, hergestellt.
Sowohl die Kontrollösung wie die Untersuchungsprobelösung
zeigten einen pH-Wert von 5,8.
1 ml Probe wurde aus dem Becher unter Verwendung einer
2 ml Subcutanspritze mit einer 18 Gauge (4,57 µm) dicken
Nadel entfernt. Diese 1 ml Probe wurde durch eine 20 ml
Injektionsprobeschleife auf der HPLC-Säule hindurchgeschickt.
Die Injektionszeit wurde aufgezeichnet. Dieses Vorgehen
wurde mit der Kontrollösung wiederholt. Beide, die
Probe und die Kontrolle, wurden viermal chromatografiert,
um den Verlauf der Molarität des Tryptophans gegen die
Zeit des Eluierens von Probe und Kontrolle durch die
Säule zu erhalten.
Mit den erhaltenen Daten wurde eine statistische Analyse
durchgeführt, die eine Neigung von 0,05596 × 10-5 M/min
zeigt, wobei ein Fehler von 0,00213 × 10-5 Min/min für die
Probe ermittelt wurde. Eine Neigung von 0,6244857 × 10-5 M/min
mit einem Fehler von 0,0000823 × 10-5 M/min wurde
für die Kontrolle ermittelt.
Die Aktivität des esterase-enzymartig modifizierten
Proteins wurde, wie in Beispiel 1 erläutert, berechnet.
Die Änderung in der Neigung war in diesem Beispiel
0,0314 und der Fehler 0,00296.
In der vorstehenden Beziehung wird die Konzentration
des modifizierten Proteins aus seiner Absorbance bei
280 nm berechnet unter Verwendung des Extinktionskoeffizienten
von Ribonuclease, welcher bei einer
1%igen Lösung 6,62 ist.
Die Untersuchungsergebnisse sind nachstehend ausgeführt:
Substrat
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,00 Aktivität am Ende32,7 ± 3,08
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,00 Aktivität am Ende32,7 ± 3,08
Die Ergebnisse zeigen, daß das esterase-enzymartig modifizierte
Protein, hergestellt nach dem erfindungsgemäßen
Verfahren, Aktivitäten gegenüber dem Esterase-Enzym-Substrat
TME besitzt.
Im nativen BSA-Protein war keine Esteraseaktivität festgestellt
worden.
Dies zeigt die Umwandlung einer Gattung eines nichtenzymatischen
Proteins, eines Albumins, in eine andere Gattung von
Protein, nämlich eines enzymatisch aktiven esterase-enzymartig
modifizierten Proteins.
250 mg BSA Charge 90F-8351,
No. 7511) wurden in 25 ml 8 M Harnstoff unter langsamem
Rühren 2 Stunden bei 25°C und pH 7,8 gelöst. Nach 2 Stunden
langem Rühren wurden der Lösung 1 ml von 10 mM Beta-
Mercaptoethanol als Reduktionsmittel zugegeben. Die resultierende
Lösung wurde 1 Stunde bei pH 7,6 und 25°C gerührt.
Danach wurden 75 ml einer 1%igen Lösung von Tryptamin als
Esteraseenzym-Inhibitor zugegeben. Die Lösung wurde 2 Stunden
bei pH 7,0 langsam gerührt.
Im Anschluß daran wurde das Protein wie folgt vernetzt. Die
das Protein enthaltende Lösung wurde in einen Dialysiersack
gegeben, nämlich ein Spectrapor-Dialysierrohr, No. 2. Das
in dem Dialysiersack enthaltene Protein wurde gegen 1%
Tryptamin-Inhibitorlösung in 1 mM Tris-Puffer bei pH 7
in einer Zeit von 17 Stunden bei 0-5°C dialysiert.
Das resultierende esterase-enzymartig modifizierte Protein
wurde wie folgt gereinigt. 2 ml des vorstehend erhaltenen
Präparats wurde über eine Sephadex G-10 Chromatografiersäule
unter Verwendung von 0,03 M Acetatpuffer, pH 6, als
das Eluant chromatografiert. Die Eluant-Flußgeschwindigkeit
war 2 ml/min. Die erste Hälfte des Proteinpeaks war etwa
5 ml des Eluantvolumens und zeigte eine Absorbance von
0,666 bei 280 nm.
Die Untersuchung auf enzymatische Aktivität des so
erhaltenen esterase-enzymartig modifizierten Proteins wurde
wie in Beispiel 1 beschrieben, vorgenommen. Die Proteinfraktion
des Säuleneluants wurde durch übliche UV-Überwachung
bei 254 nm erfühlt.
Die Untersuchungsprobe wurde wie folgt hergestellt: 5 ml
von 0,03 M Acetat, pH 6, wurden mit 1 ml von 0,1 M TME
und 4 ml der vorstehend beschriebenen proteinhaltigen Lösung
vermischt. Die Untersuchungskontrollösung wurde hergestellt
durch Vermischen von 9 ml 0,03 M Acetat, pH 6, mit 1 ml
von 0,1 M TME-Substrat. Der pH-Wert der Kontroll- und der
Untersuchungsprobelösung war 6,0.
1 ml der Probe wurde unter Verwendung einer 2 ml Subcutanspritze
mit einer 4,57-µm-Nadel entfernt. Diese
1-ml-Probe wurde durch eine 20 ml Injektionsprobeschleife
auf die HPLC-Säule hindurchgeschickt. Die Injektionszeit
wurde aufgeschrieben. Dieses Vorgehen wurde mit der
Kontrollösung wiederholt. Die Probe und die Kontrolle wurden
viermal chromatografiert, um den Verlauf der Molarität des
Tryptophans gegen die Zeit des Eluierens von Probe und
Kontrolle zu erhalten.
Mit den erhaltenen Daten wurde eine statistische Analyse
durchgeführt, die eine Neigung von 0,0516 × 10-5 M/min
zeigte mit einem Fehler von 0,004 M/min für die Probe. Eine
Neigung von 0,0287 × 10-5 M/min mit einem Fehler von 0,0016 × 10-5 M/min
wurde für die Kontrolle ermittelt.
Die Aktivität des esterase-enzymartig modifizierten Proteins wurde, wie in
Beispiel 1 erläutert, berechnet.
In der vorstehenden Beziehung wird die Konzentration des modifizierten
Proteins aus seiner Absorbance bei 280 nm berechnet, und zwar unter
Verwendung des Extinktionskoeffizienten für Rinderserumalbumin, der
für eine 1%ige Lösung 6,6280 ist.
Die Untersuchungsergebnisse sind nachstehend aufgeführt:
Substrat
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,0 Aktivität am Ende0,57 ± 0,16
TME (Einheiten/g) Aktivität zu Beginn0,0 Aktivität am Ende0,57 ± 0,16
Die Ergebnisse zeigen, daß das modifizierte esterase-enzymartig
modifizierte Protein, hergestellt nach dem Verfahren
der Erfindung, Aktivität mit Bezug auf das Esteraseenzym-
Substrat TME besitzt. Das native BSA hatte keine Aktivität
mit Bezug auf Esterase-Substrat TME gezeigte.
Dies veranschaulicht die Umwandlung einer Gattung eines
nichtenzymatischen Proteins, eines Albumins, in eine andere
Gattung von Protein, nämlich eines enzymatisch aktiven
esterase-enzymartig modifizierten Proteins.
Um zu zeigen, daß das native Rinderserumalbumin (BSA)-
Protein keine katalytische Aktivität mit Bezug auf das
L-Tryptophan-Methylester (TME)-Substrat des Beispiels 4
besitzt, wurde folgender Vergleichsversuch vorgenommen.
1 gBSA Type 7511, Charge 90F-9315)
wurde in 25 ml destilliertem deionisiertem Wasser unter
langsamem Rühren bei 25°C gelöst. Dieser Lösung wurden
75 ml einer 1%igen Tryptamin-HCl-Lösung zugegeben. Die
resultierende Lösung wurde 15 Minuten bei 25°C bebrütet
und dann in einem Spectra-Membranrohr Nr. 2 gegen 3500 ml
einer 1%igen Tryptamin-HCl-Lösung 4 Stunden dialysiert.
Während des Dialysierens wurde die Temperatur der Lösung
auf 0-5°C und der pH-Wert auf 6,0 gehalten. Nach dem
4 Stunden dauernden Dialysieren wurden 2 ml der Lösung
über eine 63,50 × 1,27 cm Sephadex G-10-Säule chromatografiert.
Die Säule wurde mit 0,03 M Acetatpuffer, pH 6,
bei einer Flußgeschwindigkeit von 2 ml/min eluiert.
Es wurden zwei deutliche Peaks gesammelt. Der erste Peak
wurde bei etwa 30 ml eluiert. Er wurde durch ein 300-200 nm
Scan an einem Spectrophotometer ACTA 3 als BSA-
Protein identifiziert. Der zweite Peak eluierte bei 60 ml
und wurde durch UV-Spectrophotometrie als Tryptamin identifiziert.
4 ml des gesammelten BSA wurden dann gegen TME-Substrat
auf mögliche enzymatische Aktivität untersucht. Die Untersuchung
wurde wie folgt durchgeführt. Ein HPLC-System wurde
für die Untersuchung verwendet. Die Säule war 2 mm × 25 cm
groß, aus rostfreiem Stahl und mit porösen
Siliciumdioxidpartikeln, die Carboxylseitenketten aufwiesen, beschickt;
die durchschnittliche Partikelporengröße war 40 µm.
Der Säuleneluant war 0,03 M Acetat, pH 6, bei einer
Flußgeschwindigkeit von 4 ml/min. Die Absorbance des Ausflusses
der Säule wurde bei 254 nm überwacht. 5 ml des 0,03 M
Acetats, pH 6, und 1 ml von 0,1 M TME-Substrat wurden mit
4 ml der oben erhaltenen BSA-Lösung vermischt.
Die Untersuchungskontrollösung wurde durch Vermischen von
9 ml eines 0,03 M Acetats, pH 6 und 1 ml von 0,1 M TME-
Substrat hergestellt. Der pH-Wert sowohl von der Kontrolle
als auch von der Probe war 6,0.
1 ml der Untersuchungsprobe wurde aus dem Becher unter
Verwendung einer 2 ml Subcutanspritze mit einer 28 Gauge (4,57 µm)
dicken Nadel entfernt und durch eine 20 Microliter Injektionsprobenschleife
auf der Säule injiziert. Die Zeit der Injektion
wurde aufgezeichnet.
Das Vorgehen wurde dann unter Verwendung der Kontrollösung
wiederholt. Beide, die Probe und die Kontrolle, wurden viermal
chromatografiert, um den Verlauf von Molarität von TME gegen
die Zeit des Eluierens von Probe und Kontrolle zu erhalten.
Eine statistische Analyse der erhaltenen Daten zeigt eine
Neigung von 0,19689 × 10-5 M/min mit einem Fehler von
0,0089 × 10-5 M/min für die BSA-Untersuchungsprobe. Bei der
Kontrollprobe wurde eine Neigung von 0,20296 × 10-5 M/min
bei einem Fehler von 0,0062 × 10-5 M/min festgestellt. Die
Neigungen plus die Summe der Fehler sind tatsächlich identisch.
Demgemäß zeigt das native BSA-Protein keine meßbare
katalytische Aktivität mit Bezug auf TME-Substrate.
Um zu zeigen, daß das native Ribonuclease-Enzym keine
katalytische Aktivität mit Bezug auf L-Tryptophan-Methylester-
(TME)-Substrat, das in den Beispielen 1 und 2
eingesetzt worden ist, hat, wurde folgender Vergleichsversuch
durchgeführt.
60 mg Ribonuclease-Enzym
Type R-5000, Charge 20F-2010) wurden in 100 ml 1 mM
Tris-Puffer bei pH 7 unter langsamem Rühren bei 25°C
gelöst.
Die Ribonuclease enthaltende Lösung wurde dann unter
Verwendung eines Spektrapor-Membranrohres No. 3 gegen
3500 ml eines 1 mM Tris-Puffers, pH 7, 17 Stunden bei
0-5°C dialysiert. Dieses Dialysierrohr No. 3 hat einen
Molekulargewichts-Ausschlußbereich von 35-4500 Daltons.
Danach wurde 1 ml der Ribonuclease enthaltenden Lösung
gegenüber TME-Substrat auf mögliche enzymatische Aktivität
mit Bezug auf TME untersucht. Die Untersuchung wurde wie
folgt durchgeführt:
Für die Untersuchung wurde ein HPCL-System
verwendet. Die Säule war die gleiche wie die in
Beispiel 5 verwendete. Das Säuleneluant war 0,03 M Acetat,
pH 6, die Flußgeschwindigkeit 7 ml/min. Die Absorbance
des Säulenausflusses wurde bei 280 nm überwacht.
Die native Ribonuclease enthaltende Untersuchungsprobelösung
wurde wie folgt hergestellt: 8 ml von 1 mM Tris-
Puffer, pH 8,05, wurden mit 1 ml von 0,1 M TME, pH 3,4
und 1 ml der Ribonuclease enthaltenden Lösung vermischt.
Die Untersuchungskontrollösung wurde hergestellt durch
Vermischen von 8 ml eines 1 mM Tris-Puffer, pH 8,05,
mit 1 ml von 0,1 M TME, pH 3,4, und 1 ml von 1 mM Tris-
Puffer, pH 7,0. Der pH-Wert der Kontroll- und der
Untersuchungsprobelösung war 6,5.
1 ml der Untersuchungsprobelösung wurde wie in Beispiel 5
aus dem Becher entfernt und auf die Säule durch eine
20 ml Injektionsprobeschleife injiziert. Die Zeit der
Injektion wurde aufgezeichnet.
Dieses Vorgehen wurde mit der Kontrollösung wiederholt.
Sowohl die Untersuchungsprobelösung als auch die Kontrollösung
wurden viermal chromatografiert, um den Verlauf der
Molarität von TME gegenüber der Zeit des Eluierens von Probe-
und Kontrollösung zu erhalten.
Die statistische Analyse der erhaltenen Daten zeigte praktisch
die gleichen Neigungen von 0,1400 ± 0,003 für die Kontroll-
und die Untersuchungsprobelösung. Demgemäß zeigt die native
Ribonuclease keine meßbaren katalytischen Aktivitätseigenschaften
mit Bezug auf das TME-Substrat.
Um zu zeigen, daß natives Rinderserumalbumin (BSA) Aktivität
mit Bezug auf das in Beispiel 3 benutzte L-Tryptophan-
Methylester (TME)-Substrat aufweist, wurde folgende Kontrolluntersuchung
durchgeführt.
100 mg BSA No. 7511, Charge
90F-8351) wurden in 100 ml eines 1 mM Tris-Puffers bei pH 7
unter langsamem Rühren bei 25°C gelöst.
Die BSA enthaltende Lösung wurde dann unter Verwendung eines
Spektrapor-Membranrohres No. 2 gegen 3500 ml eines 1 mM
Tris-Puffers, pH 7, 17 Stunden bei 0-5°C dialysiert.
Danach wurde 1 ml der BSA enthaltenden Lösung gegenüber
TME-Substrat auf mögliche enzymatische Aktivität mit Bezug
auf TME untersucht. Die Untersuchung wurde wie folgt
durchgeführt.
Für die Untersuchung wurde ein HPLC-System verwendet.
Die Säule war die gleiche wie die in Beispiel 5 verwendete.
Das Säuleneluant war 0,03 M Acetat, pH 6, die
Flußgeschwindigkeit 7 ml/min. Die Absorbance des Säulenausflusses
wurde bei 280 nm überwacht.
Die das native BSA enthaltende Untersuchungsprobelösung
wurde wie folgt hergestellt. 8 ml von 1 mM Tris-Puffer,
pH 7,5, wurde mit 1 ml von 0,1 M TME, pH 3,2 und 1 ml
der Ribonucleaselösung vermischt. Die Untersuchungskontrollösung
wurde hergestellt durch Vermischen von 8 ml eines
1 mM Tris-Puffers, pH 7,5, 1 ml 0,1 M TME, pH 3,2 und 1 ml
eines 1 mM Tris-Puffers, pH 7,0. Der pH-Wert der Kontrollösung
und der Untersuchungsprobelösung war 5,8.
Dann wurde 1 ml der Untersuchungsprobelösung, wie in
Beispiel 5, aus dem Becher entfernt und auf die Säule
durch eine 20 ml Injektionsprobeschleife injiziert. Die
Injektionszeit wurde aufgezeichnet.
Dieses Vorgehen wurde dann mit der Untersuchungskontrollösung
wiederholt. Die Untersuchungsprobelösung und die
Kontrollösung wurden viermal chromatografiert, um eine
Neigung der Molarität von TME gegenüber der Zeit des
Eluierens der Untersuchungsprobelösung und der Kontrollösung
zu erhalten.
Eine statistische Analyse der erhaltenen Daten zeigte eine
praktisch gleiche Neigung von 0,06 ± 0,0065 für die
Kontrollösung und die Untersuchungsprobelösung. Folglich
zeigt die native Ribonuclease keine meßbaren katalytischen
Aktivitätseigenschaften mit Bezug auf das TME-
Substrat.
Claims (3)
1. Verfahren zur chemischen Veränderung der Substratspezifität
eines nativen Proteins zur Erzeugung eines
enzymartig modifizierten Proteins, dadurch gekennzeichnet,
daß man A) a) ein Enzym als Modellenzym auswählt, das
nachgebildet werden soll; b) ein natives Protein in
hohem Grade denaturiert; c) das in hohem Grade denaturierte
Protein zu einem partiell denaturierten Protein
partiell renaturiert; d) das partiell denaturierte
Protein mit einer Verbindung ausreichend struktureller
Ähnlichkeit mit dem Substrat des Modellenzyms, um
als Schablone für die katalytische Stelle des enzymartig
modifizierten Proteins zu dienen, in Kontakt
bringt, um einen partiell denaturierten Protein-
Modellenzyminhibitor-Komplex zu bilden; e) das partiell
denaturierte Protein in dem Protein-Inhibitor-Komplex
vernetzt und f) den Modellenzym-Inhibitor und evtl.
überschüssiges Vernetzungsmittel entfernt; oder
daß man B) a) ein Enzym als Modellenzym auswählt, das
nachgebildet werden soll; b) ein natives Protein in
hohem Grade denaturiert; c) das in hohem Grade denaturierte
Protein mit einer Verbindung ausreichend struktureller
Ähnlichkeit mit dem Substrat des Modellenzyms,
um als Schablone für die katalytische Stelle des enzymartig
modifizierten Proteins zu dienen, vermischt; d)
das in hohem Grade denaturierte Protein in Gegenwart
des Inhibitors partiell renaturiert, um einen partiell
denaturierten Protein-Inhibitor-Komplex zu erhalten;
e) den partiell denaturierten Proteinteil des Protein-
Inhibitor-Komplexes vernetzt; und f) den Modellenzym-
Inhibitor und evtl. überschüssiges Vernetzungsmittel
entfernt.
2. Enzymartig modifiziertes Protein, erhalten nach dem
Verfahren des Anspruches 1, Ausführungsform A).
3. Enzymartig modifiziertes Protein, erhalten nach dem
Verfahren des Anspruches 1, Ausführungsform B).
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