[go: up one dir, main page]

CN1273606A - 用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传改变的用途 - Google Patents

用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传改变的用途 Download PDF

Info

Publication number
CN1273606A
CN1273606A CN98809867A CN98809867A CN1273606A CN 1273606 A CN1273606 A CN 1273606A CN 98809867 A CN98809867 A CN 98809867A CN 98809867 A CN98809867 A CN 98809867A CN 1273606 A CN1273606 A CN 1273606A
Authority
CN
China
Prior art keywords
gene
plant
sequence
target gene
cell
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN98809867A
Other languages
English (en)
Other versions
CN100419083C (zh
Inventor
C·J·阿恩岑
P·B·基普
R·库马
G·D·梅
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Valigen US Inc
Original Assignee
KIMEAGEN Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=21993832&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=CN1273606(A) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by KIMEAGEN Inc filed Critical KIMEAGEN Inc
Publication of CN1273606A publication Critical patent/CN1273606A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN100419083C publication Critical patent/CN100419083C/zh
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Lifetime legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8213Targeted insertion of genes into the plant genome by homologous recombination
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/43504Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates
    • C07K14/43595Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from coelenteratae, e.g. medusae
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/10Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
    • C12N15/102Mutagenizing nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8201Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation
    • C12N15/8206Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by physical or chemical, i.e. non-biological, means, e.g. electroporation, PEG mediated
    • C12N15/8207Methods for introducing genetic material into plant cells, e.g. DNA, RNA, stable or transient incorporation, tissue culture methods adapted for transformation by physical or chemical, i.e. non-biological, means, e.g. electroporation, PEG mediated by mechanical means, e.g. microinjection, particle bombardment, silicon whiskers
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8245Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified carbohydrate or sugar alcohol metabolism, e.g. starch biosynthesis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8247Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine involving modified lipid metabolism, e.g. seed oil composition
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8243Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
    • C12N15/8251Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8274Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8287Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for fertility modification, e.g. apomixis
    • C12N15/8289Male sterility
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Nutrition Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明涉及用大约25—30个碱基对的双链寡核苷酸在植物细胞中导入位点专一性遗传改变的用途。所述寡核苷酸可以通过机械(biolistic)系统输送或通过对植物原生质体进行电穿孔输送。然后,可以从所述改变过的细胞产生具有所述遗传改变的植物。在具体实施方案中,本发明涉及编码酸性转化酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、多酚氧化酶、O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶、ACC合酶和ACC氧化酶或etr-1或etr-1的同系物的基因的改变,以及在所述基因上具有分离的点突变的植物。

Description

用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传改变的用途
1.发明领域
本发明领域涉及改良现有植物品系的方法,并涉及具有希望的性状的新品系的开发。通过重组DNA技术获得遗传改变过的植物的现有方法,能够将预先构建的外源基因导入随机的、特异位点,即所谓转基因。相反,本发明使得技术人员能够对植物的特定现存基因进行特殊改变。本发明使用具有混合的RNA-样核苷酸和DNA-样核苷酸的双链寡核苷酸实现所述改变,以下称之为“混合双链寡核苷酸”或MDON。2.发明背景2.1 MDON及其实现特定遗传改变的用途
混合双链寡核苷酸(MDON)及其在真核细胞中实现遗传改变的用途披露于授予Kmiec的US5,565,350中(Kmiec I)。Kmiec I特别披露了具有两条链的MDON,其中,第一股链含有至少8个RNA-样核苷酸的两个片段,这两个片段由4到大约50 DNA-样核苷酸的第三片段隔开,该片段被称为“插入DNA片段”。第一股链的核苷酸与第二股链的DNA-样核苷酸碱基配对。所述第一和第二股链还通过一段单链核苷酸额外连接在一起,以便所述第一和第二股链是单一寡核苷酸链的一部分。Kmiec I还披露了将特定遗传改变导入靶基因的方法。根据Kmiec I,选择所述RNA片段的序列,使其与靶基因的第一和第二片段的序列同源,即相同。所述插入DNA片段的序列与位于第一和第二片段之间的靶基因的序列同源,只有一个不同部位,该部位被称为“异源区”。该异源区可以进行插入或缺失,或者可以含有一个或几个与靶基因序列错配的碱基,以便实现取代。根据Kmiec I,由所述异源区指导对所述靶基因的序列进行改变,使得该靶基因变成与MDON的序列同源。Kmiec I特别披露了含有可用于MDON的核苷酸的核糖和2’-O甲基核糖,即2’-甲氧基核糖,并披露了可用作DNA-样核苷酸的含有天然存在的脱氧核糖的核苷酸。
申请日为1996年6月17日的美国专利申请流水号08/664,487,即现在的美国专利US5,731,181(Kmiec II)特别披露了用MDON在植物细胞中实现遗传改变,并且披露了可用于在特定靶基因上实现遗传改变的RNA-样和DNA-样核苷酸的类似物和衍生物的进一步例子。
披露具有插入DNA片段的MDON的用途的科技文献包括Yoon等,1996,Proc.Natl.Acad.Sci.93:2071-2076,和Cole-Straus,A.等,1996,科学273:1386-1389。据以上科技文献披露,用脂质体介导的输送可以获得在10个细胞中有大约有一个细胞发生突变的频率。不过,这些科技文献没有披露MDON可用于在植物细胞中产生遗传改变。
本说明书中使用的术语MDON应当被理解成与在其它地方所使用的术语“嵌合突变载体”、“嵌合修复载体”、和“嵌合质体”同义。2.2  转基因植物细胞和由转基因植物细胞产生植物
在由Kmiec I和II所披露的用于将MDON输入靶细胞的技术中,最适用于植物细胞的技术是原生质体的电穿孔。业已报导了某些双子叶植物种由原生质体培养物再生可育植株的例子,例如,烟草(Nicotiana tobacum),US5,231,019和Fromm,M.E.等,1988,自然312,791,和大豆品种(Glycine max),授予Widholm,J.M.的WO92/17598。不过,尽管Prioli,L.M.等,生物技术7,589,Shillito,R.D.等1989,生物技术7,581报导了用非转化细胞进行了成功地分离,但由转化的原生质体培养物再生可育的单子叶植物被认为是不可能用常规技术实现的。通常,单子叶植物的转化原生质体产生不能再生的组织,或者如果该组织被再生的话,所得到的植物是不育的。
业已开发了将千碱基大小的质粒DNA导入具有完整或部分完整细胞壁的植物细胞获得转化的植物细胞的其它技术。US4,945,050,US5,100,792和US5,204,253涉及通过将质粒附着在微粒上,然后弹射推进通过细胞壁将质粒输入完整植物细胞的方法,该细胞在下文中被称为“粒子轰击转化的”细胞。例如,US5,489,520披露了由粒子轰击转化的细胞再生可育玉米植株。用于将质粒DNA导入具有完整细胞壁的植物细胞悬浮液的其它技术,包括用碳化硅纤维刺穿细胞壁,参见授予Coffee R.和Dunwell,J.M.的US5,302,523。
在授予Krzyzek,Laursen和P.C.Anderson的US5,384,253中披露了对具有复杂的细胞壁的玉米细胞进行电穿孔的技术。该技术使用内果胶裂合酶(E.C.3.2.1.15)和内切聚半乳糖醛酸酶(E.C.4.2.2.3)的组合产生比真正的原生质体能更容易再生成可育植物的转化感受态细胞。不过,该技术被报导仅适用于来自品系A188×品系B73的杂交的F1细胞系。3.发明概述
本发明提供了使用MDON的新方法,该方法特别适用于所述植物细胞。
因此,本发明的一个方面是将MDON附着在颗粒上的技术,该颗粒能够弹射通过细胞壁,将MDON释放在细胞内,以便在该植物细胞的靶基因上产生突变。能够通过该技术导入的突变是能在合适条件下赋予突变的细胞生长优势的突变,和能导致通过肉眼检查可检测到的表型的突变。所述突变被称为“可选择的突变”。
在另一种实施方案中,本发明包括通过一种过程将除可选择的突变之外的突变导入植物细胞的靶基因的方法,该方法包括将能在植物细胞中导入可选择的突变的第一MDON和能导致不可选择的突变的第二MDON的混合物导入的步骤。
本发明还包括按照本发明的上述实施方案突变的细胞培养,以便获得能产生种子的植物(上文称之为“可育植物”),并由该可育植物产生种子和其它植物。
本发明还包括可以通过本发明方法生产的具有新的特征的可育植物。4.发明详述4.1重组诱发性寡核碱基和混合双链寡核苷酸
本发明可以用具有在Kmiec I或Kmiec II中披露的结构和化学特性的MDON实现,以上文献被收作本文参考文献。Kmiec I和/或Kmiec II的MDON含有两个互补链,其中之一含有至少一段RNA-型核苷酸(“RNA片段”),该片段与另一股链的DNA-型核苷酸碱基配对。
Kmiec II披露可以用含有嘌呤和嘧啶碱基的非核苷酸取代核苷酸。普通转让的申请日为1998年5月12日的美国专利申请流水号09/078,063和申请日为1998年5月12日的流水号09/078,064(以上专利分别被全文收作本文参考文献)披露了可用于本发明的其它分子。本文所说的“重组诱发性寡核碱基(recombinagenicoligonucleobase)”是指可用于本发明的分子。重组诱发性寡核碱基包括MDON,在Kmiec II中披露的含有非核苷酸的分子,以及在上述普通转让的专利申请中披露的分子。
在一种优选实施方案中,通过用氟、氯或溴官能团取代2’-羟基或者在2’-O上增加一个取代基使得MDON的RNA-型核苷酸抗Rnase。合适的取代基包括由Kmiec II中披露的取代基,C1-6烷烃。其它取代基包括US5,334,711(Sproat)披露的取代基和由EP629387和EP679657(均为Martin申请)披露的取代基,以上专利被收作本文参考文献。在本文中,核糖核苷酸的2’-氟、氯或溴衍生物或具有用在Martin申请或Sproat中披露的取代基取代过的2’-OH的核糖核苷酸被称为“2’-取代核糖核苷酸”。在本文中,术语“RNA-型核苷酸”是指通过未取代的磷酸二酯键或由Kmiec I或Kmiec II披露的任何非天然键连接在MDON的其它核苷酸上的2’-羟基或2’-取代核苷酸。在本文中,术语“脱氧核糖型核苷酸”是指具有2’-H的核苷酸,它可以通过未取代的磷酸二酯键或由Kmiec I或Kmiec II披露的任何非天然键连接在MDON的其它核苷酸上。
本发明的一种具体实施方案包括仅仅通过未取代的磷酸二酯键连接的MDON。另一种实施方案包括由取代的磷酸二酯键、磷酸二酯键衍生物和Kmiec II披露的非磷基键实现的连接。另一种特定实施方案包括MDON,其中,每一个RNA-型核苷酸是2’-取代核苷酸。2’-取代核糖核苷酸的特定优选实施方案是2’-氟,2’-甲氧基,2’-丙氧基,2’-烯丙氧基,2’-羟乙氧基,2’-甲氧乙氧基,2’-氟丙氧基,和2’-三氟丙氧基取代的核糖核苷酸。2’-取代核糖核苷酸的更优选的实施方案是2’-氟,2’-甲氧基,2’-甲氧乙氧基,和2’-烯丙氧基取代的核苷酸。在一种实施方案中,所述MDON寡聚体是通过未取代的磷酸二酯键连接的。
尽管更容易合成仅具有单一类型2’-取代RNA-型核苷酸的MDON,本发明可以用具有两种或两种以上类型RNA-型核苷酸的MDON实现。通过在两个RNA型三核苷酸之间导入脱氧核苷酸引起的间断不会影响RNA片段的功能,因此,术语RNA片段包括这种“间断RNA片段”。非间断RNA片段是指连续的RNA片段。在另一种实施方案中,RNA片段可以含有交替的Rnase抗性和未取代的2’-OH核苷酸。本发明的MDON优选具有少于100个的核苷酸,更优选少于85个核苷酸,但超过50个核苷酸。所述第一和第二股链是沃森-克里克碱基配对的。在一种实施方案中,MDON的链是通过一个诸如单链6、5或4核苷酸的接头共价连接的,因此,所述第一和第二股链是具有单一3’和单一5’末端的单寡核苷酸链的片段。可以通过添加“发卡帽”保护所述3’和5’末端,以便3’和5’末端核苷酸与相邻核苷酸是沃森-克里克配对的。可以在所述第一和第二股链的远离3’和5’末端的接合处添加第二个发卡帽,以便稳定所述第一和第二股链之间的沃森-克里克配对。
所述第一和第二股链含有两个与靶基因的两个片段同源的区域,即,与所述靶基因有相同的序列。一个同源区含有RNA片段的核苷酸,并可以含有连接DNA片段的一个或几个DNA-型核苷酸,还可以含有不在插入DNA片段内的DNA-型核苷酸。以上两个同源区由一个具有不同于所述靶基因的序列的区域(被称为“异源区”)分离,并各自与该异源区相邻。所述异源区可以包括一个、两个或三个错配的核苷酸。所述错配的核苷酸可以是连续的或由一个或两个与所述靶基因同源的核苷酸分离。另外,所述异源区还可以含有一个、两个、三个或五个或更少核苷酸的插入。另外,MDON的序列与所述靶基因的序列的差别在于从MDON上缺失了一个、两个、三个、或五个或更少的核苷酸。在这种情况下,所述异源区的长度和位置被视为所述缺失的长度,即使没有MDON的核苷酸处在所述异源区之内。与以上两个同源区互补的靶基因的两个片段之间的距离在希望一个或多个取代时与所述异源区的长度相同。当所述异源区含有一个插入片段时,所述同源区在MDON中的间隔距离大于其互补的同源片段在所述基因中的间隔距离,而且,当所述异源区编码一个缺失时,可以采用一个转变。
所述MDON的RNA片段各自是一个同源区的一部分,即在序列上与一段靶基因片段相同的区域,所述片段一起优选含有至少13个RNA-型核苷酸,并优选16-25个RNA-型核苷酸或更优选18-22个RNA-型核苷酸或最优选20个核苷酸。在一种实施方案中,所述同源区的RNA片段由一个间插DNA片段分离并与该片段相邻,即“连接”。在一种实施方案中,所述异源区的每一个核苷酸是所述间插DNA片段的核苷酸。含有MDON的异源区的间插DNA片段被称为“增变片段”。
普通转让的美国专利申请流水号09/078,063(申请日1998年5月12日)和流水号09/078,064(申请日1998年5月12日)披露了一种双链重组诱发性寡核碱基,其中,一股链的序列与靶基因的序列相同,并且仅有互补链的序列含有一个异源区。这种结构会产生一个或几个错配的碱基或“异源双链”结构。被用于本发明的异源双链重组诱发性寡核碱基的异源区位于含有所述脱氧核苷酸的链上。在一种实施方案中,所述异源区位于含有5’末端核苷酸的链上。4.2由MDON导入的突变的位点和类型
通常,用于植物细胞的MDON的设计必须在由Kmiec I和II中披露的设计基础上进行改进。在哺乳动物和酵母细胞中,由MDON导入的在一个位点上与靶基因不同的遗传学改变是用一个互补于MDON在错配位置上的核苷酸的核苷酸取代靶基因的错配位置上的核苷酸。相反,在植物细胞中,可以在互补于含有所述DNA增变片段的链上的错配位置的5’末端的一个碱基的核苷酸处发生变化。所述靶基因的核苷酸被在所述错配位置上互补于DNA增变片段核苷酸的核苷酸取代。因此,突变的靶基因在两个位置上与MDON不同。
通过MDON导入靶基因的突变位于靶基因片段之间,它与MDON同源区的核糖核苷酸部分同源,下文称之为“RNA片段”。所导入的具体突变取决于所述异源区的序列。可以通过使用分别含有一个插入或缺失的异源区将一个插入或缺失导入所述靶基因。可以通过使用在MDON的异源区上具有一个错配的MDON获得在靶基因上的一个取代。在最常见的实施方案中,所述错配能将靶基因现有的碱基转换成互补于MDON的错配碱基的碱基。所述靶基因上的取代位置可以在相当于错配的位置上,或者更常见的是取代位于紧挨着所述错配位置的5’末端的靶链的位置上,即互补于MDON紧挨着MDON的错配碱基的3’末端的位置上。
错配导致的取代的每一个位点的相对频率是特定基因和细胞类型的特征。因此,本领域技术人员可以理解的是,当取代的位置对实施本发明重要时,通常要指明确定在具体目标基因上的取代位点的初步研究。4.3通过微载体和微纤维输送MDON
通过弹射穿透用金属微载体(微球体)将大型DNA片段导入具有纤维素细胞壁的植物细胞的用途是相关技术领域中的技术人员所熟知的(以下称之为biolistic输送)。US4,945,050,US5,100,792和US5,204,253涉及用于筛选弹射目的的微载体和装置的一般技术。
用于将DNA片段附着在微载体上的条件不适用于MDON。本发明提供了用于将足够数量的MDON附着到微载体的技术,以便可以采用biolistic输送。在一种合适的技术中,按顺序加入冰镇微载体(60mg/ml),MDON(60mg/ml),2.5M氯化钙和0.1M亚精胺;轻轻搅拌该混合物,例如,通过涡旋搅拌10分钟,并在室温下放置10分钟,然后将微载体稀释在5倍体积的乙醇中,离心,并重新悬浮在100%乙醇中。使用如下附着溶液的浓度可以获得良好的结果:8-10μg/μl微载体,14-17μg/ml MDON,1.1-1.4M氯化钙和18-22mM亚精胺。在以下条件下获得了最佳结果:8μg/μl微载体,16.5μg/ml MDON,1.3M氯化钙和21mM亚精胺。
还可以用微纤维穿透细胞壁和细胞膜将MDON导入植物细胞,以便实施本发明。授予Coffee等的US5,302,532披露了用30×0.5μm和10×0.3μm碳化硅纤维实现Black Mexican Sweet的悬浮玉米培养物的转化。任何能用于导入DNA、用微纤维转化植物细胞的机械技术均可用于输送MDON进行衍变。
进行MDON的微纤维输送的一种合适的技术如下文所述。将无菌微纤维(2μg)悬浮在含有大约10μg MDON的150μl植物培养基中。让悬浮培养物沉淀,并将等体积的沉积细胞和无菌纤维/MDON悬浮液涡旋搅拌10分钟,并铺平板。根据具体的性状马上加入选择培养基或者推迟大约120小时之后加入。
可用于将MDON输入衍变细胞核基因的技术也可用于导致植物细胞的质体基因的衍变。通过质体的biolistic输送,接着再进行质粒的不合规则的重组插入所进行的质体转化为本领域技术人员所熟知。Svab,Z.等,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.87,8526-8530。初步的实验证实,转化的频率低于细胞核转化频率的10倍到100倍。随后的实验证实,通过使用显性选择性状可以实现质体转化频率与细胞核转化频率相当,所述选择性状如细菌氨基糖苷3’-腺苷转移酶基因,该基因能产生壮观霉素抗性。Svab,Z.&Maliga,P.,1993,Proc.Natl.Acad.Sci.90,913-917。
根据本发明,可以用上述相同技术将进行质体基因衍变的MDON导入质体。当希望导入的突变是一种选择突变时,可以单独使用MDON。当所希望的突变是非选择性的时,可将相关MDON与能导入一个选择性质体突变的MDON一起导入,例如,psbA基因上的能产生三嗪抗性的突变,或与能产生一种选择性状的线性或环状质粒组合。
上述技术可适用于除MDON之外的重组诱发性寡核碱基。4.4原生质体电穿孔
在另一种实施方案中,可以通过对源于植物部分的原生质体进行电穿孔将重组诱发性寡核碱基输送到该植物细胞中。所述原生质体是通过用本领域技术人员熟知的技术,通过对植物部分,特别是叶片进行酶促处理而产生的。例如,参见Gallois等,1996,分子生物学方法55,89-107(Humana出版社,Totowa,NJ)。在电穿孔之前,所述原生质体不需要在生长培养基中培养。
电穿孔的合适条件为在0.3ml的总体积中有3×105原生质体,MDON的浓度为0.6-4μg/ml。4.5导入突变
本发明可用于在植物细胞中实现遗传改变,本文称之为“衍变”。在一种实施方案中,所述植物细胞具有细胞壁,即不是原生质体。
将MDON用于衍变植物细胞的方法可以通过同时导入一种性状而获益,该性状有利于区分和分离(以下称之为“选择”)业已导入了MDON的细胞和未导入MDON的细胞。在本发明的一种实施方案中,所述选择是通过形成MDON和质粒的混合物而实现的,该质粒能导致产生一种选择性状的基因的瞬时表达,即允许在某种条件下存活的基因,例如,卡那霉素抗性基因。在上述条件下,消除缺乏所述选择性状的细胞可以消除未导入MDON的细胞。用瞬时表达质体导入选择性状可以通过反复使用一种标准化选择程序将多个遗传变化连续导入植物细胞。
在另一种实施方案中,可以用衍变导入一种选择性状。制备能在第一个靶基因上导致选择突变的第一MDON和能在第二靶基因上导致非选择突变的第二MDON的混合物。根据本发明,至少大约1%的具有所述选择突变的细胞还在所述第二靶基因上含有一个突变,该突变是由第二MDON导入的。更常见的是,至少大约10%的具有所述选择突变的细胞还在所述第二靶基因上具有一个突变。
本发明的该实施方案的一种用途是研究目标基因的功能。提供能导致选择突变的MDON和能导致会“剔除”目标基因(例如插入一个终止密码子或移码突变)的突变的MDON的混合物。可以从具有所述选择突变的群体中回收业已剔除了一个或几个拷贝的目标基因的细胞。可将所述细胞再生成植物,以便可以测定所述目标基因的功能。
可以通过任何突变导致一种选择性状,该突变能导致一种表型改变,这种改变能在合适的选择条件下产生选择生长优势或便于观察的表型改变,如生长在愈伤组织中的植物细胞颜色的改变。所述选择性状本身可以是一种需要的性状,例如,除草剂抗性,或所述选择性状仅仅可用于促进具有通过衍变导入的非选择性状的植物的分离。可以用能导致希望的突变的MDON和能导致选择突变的MDON的混合物将需要的非选择性状导入细胞,然后在所述选择条件下培养。根据该方案进行的选择,所具有的优点是能确保每一个选择的细胞不仅接收了所述MDON的混合物,而且接收了该混合物的细胞随后容易通过MDON进行衍变。
还可将能在合适条件下导致致死表型改变的突变(被称为负选择突变)用于本发明中。所述突变能导致负的选择性状,负的选择性状可以通过制备衍变细胞的复制平板进行选择,选择一个复制件,并从非选择的复制件中回收具有理想性状的衍变细胞。4.6能够衍变以便产生选择性状的特定基因
在本发明的一种实施方案中,利用MDON将突变导入乙酰乳酸合酶(ALS)基因,该基因又被称为乙酰羟基氨基酸合酶(AHAS)基因。磺酰脲除草剂和咪唑啉除草剂是野生型ALS酶的抑制剂。业已披露了能使植物抗磺酰脲和咪唑啉的作用的显性突变。参见US5,013,659和US5,378,824(Bedbrook)和Rajasekaran K.等1996,分子育种2,307-319(Rajasekaran K.)。Bedbrook在表2中披露了被证实能使得酵母ALS酶抗磺酰脲除草剂的若干突变(以下称之为“Bedbrook”突变)。Bedbrook指出,每一个Bedbrook突变在被导入植物ALS基因之后能使得植物抗磺酰脲和咪唑啉除草剂。已经了解到,在大多数植物中,编码ALS的基因是重复的。可将突变导入任一个ALS基因的任何等位基因。
事实上,已证实3个Bedbrook突变能在植物中产生除草剂抗性,即取代Pro→Ala197,A1a→Asp205和Trp→Leu591。Rajasekaran报导突变Trp→Ser591能产生对磺酰脲和咪唑啉的抗性,而Ser→Asn660能导致对咪唑啉除草剂的抗性。用Bedbrook的序列编号将Rajasekaran的结果报导在本文中。本领域技术人员可以理解的是,不同植物的ALS基因具有不同长度。为清楚起见,采用这样一种编码系统,其中,在每一种物种中,同源位点用相同的位点编号表示。因此,所标明的突变位点是由它周围的序列决定的。例如,Rajasekaran的突变Trp→Ser591位于棉花ALS基因的563号残基,不过被标明为Bedbrook的591号位点,因为突变的Trp是由Bedbrook的表2中环绕Trp591的序列环绕的。根据本发明,对位于位点660或在Bedbrook的表2中(该表被收作本文的参考文献)列出的一个位点上的天然存在的氨基酸的任何取代可被用于在植物的ALS基因中产生选择突变。
在本发明的另一种实施方案中,所述选择突变可以是在编码光合系统II的D1亚基的叶绿体基因psbA上的突变,参见Hirschberg,J.等1984,Z.Natursch39,412-420和Ohad,N.,&Hirschberg,J.,植物细胞4,273-282。据Hirschberg,J.等报导,突变Ser→Gly264会导致对诸如2-氯-4-乙基氨基-6-异丙基氨基-s-三嗪(阿特拉津)的三嗪除草剂的抗性。PsbA基因上的能导致阿特拉津除草剂抗性的其它突变披露于Erickson J.M.等的文章中,1989,植物细胞1,361-371(以下称之为“Erickson突变”),该文献被收作本文参考文献。当需要将第二种新的性状导入叶绿体时,优选使用由Erickson突变引起的选择性状。
科技文献中包含能产生选择性状的其它突变的进一步报导。Ghislain M.等1995,植物杂志8,733-743披露了发生在Nicotianasylvestris二氢二吡啶甲酸合酶(DHDPS,EC4.2.1.52)基因上的Asn→Ile104突变,该突变能产生对S-(2-氨基乙基)L-半胱氨酸的抗性。Mourad,G.,&King,J.1995,植物生理学109,43-52披露了发生在拟南芥(Arabidopsis thaliana)的苏氨酸脱水酶上的突变,该突变能导致对L-O-甲基苏氨酸的抗性。Nelson,J.A.E.等1994,分子细胞生物学14,4011-4019披露了用Pro取代S14/rp59核糖体蛋白的C-末端Leu,可导致对翻译抑制剂crytopluerine和吐根碱的抗性。在本发明的另一种实施方案中,可将上述每一种突变用于产生一种选择性状。Ghislain,Mourad和Nelson中的每一个被收作本文参考文献。4.7能够突变以便产生需要的非选择性状的基因例1                                        雄性不育性
用包括玉米(Zea maize)、番茄和大部分其它蔬菜在内的杂交种子,常规种植某些商业种植的植物。杂交种子的生产需要用仅来自另一个纯合系的花粉对一个纯合系的植株进行授粉,即不存在自花授粉。从纯合的亲本植株上清除产生花粉的器官的工作,是一项繁重和花费较大的过程。因此,能诱导雄性不育性即抑制花粉产生或功能的突变,可以避免对所述过程的需要。
业已鉴定了花粉成熟或功能所必需的,但对植物的其它过程不重要的若干基因。查耳酮合酶(chs)是类黄酮合成的关键酶,类黄酮是存在于花和花粉中的色素。在矮牵牛中通过导入chs反义表达基因抑制chs,会导致植物的雄性不育性。Van der Meer,I.M.等,1992,植物细胞4,253-262。在大部分植物中存在一个chs基因家族。例如,参见Koes,R.E.等,1989,植物分子生物学12,213-226。类似地,通过插入转座因子破坏玉米中的查耳酮合酶基因会导致雄性不育性。Coe,E.H.,遗传学杂志72,318-320。Franken,P.等,1991,EMBO杂志10,2605-2612披露了玉米查耳酮合酶和重复基因whp的结构。通常,在植物中,多基因家族的每一个成员仅在有限范围的组织中表达。因此,本发明的该实施方案要求在具有多拷贝查耳酮合酶基因的物种中,鉴定在花药中表达的特定chs基因,并且通过导入移码和一个或几个框内终止密码子破坏该基因,或者破坏其启动子。
在番茄中业已证实产生花粉所必需的第二个基因,被称为Lat52。Muschietti J.等,1994,植物杂志6,321-338。Lat52是与胰蛋白酶抑制剂相关的分泌型糖蛋白。业已在玉米(被称为Zm13,Hanson D.D.等,1989,植物细胞1,173-179;Twell D.等,1989,分子基因遗传学217,240-245),稻(被称为Psl,Zou J.等,1994,美国植物学杂志81,552-561)和橄榄(被称为Ole eI,Villalba,M.等,1993,欧洲生物化学杂志276,863-869)中鉴定了Lat52的同系物。因此,本发明的该实施方案提供了一种通过导入一个移码、一个或几个框内终止密码子破坏Lat52/Zm13基因或其同系物或通过破坏其启动子获得雄性不育性的方法。
业已鉴定了对花粉生产必需的第三个基因是编码苯丙氨酸铵盐裂合酶(PAL,EC4.3.1.5)的基因。PEL是产生苯基类丙酮和类黄酮的关键酶。因为苯基类丙酮是木质素的前体,它可能是产生抗病性的重要成分,在所述优选实施方案中,鉴定了仅在花药中表达的PAL异构酶,并将其破坏,以便获得雄性不育性。
例2改变块茎的糖代谢
一旦收获之后,马铃薯块茎在储存期间会遇到病害、缩水和发芽。为了避免以上损失,储存温度被降低到35-40°F。不过,在低温下,块茎中的淀粉会转化成糖,这一过程被称为“冷甜化”,它会降低块茎的商业和营养价值。对冷甜化过程来说有两种酶是重要的:酸性转化酶和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶。Zrenner,R.等,1996,植物198,246-252和Spychalla,J.P.等,1994,植物生理学杂志144,444-453。马铃薯酸性转化酶的序列披露于EMBL数据保藏号X70368(序列1)中,而马铃薯UDP葡萄糖焦磷酸酶的序列由Katsube,T.等披露,1991,生物化学30,8546-8551,因此,本发明的该实施方案提供了通过导入移码、一个或几个框内终止密码子破坏酸性转化酶或UDP葡萄糖焦磷酸酶基因或通过破坏其启动子防止冷甜化的方法。
例3减轻由于PPO导致的收获后褐变
多酚氧化酶(PPO)是高等植物中酶促褐变的主要原因。PPO能催化单酚转化成邻二酚和邻二羟基酚再转化成邻醌。所述醌产物随后聚合并与细胞蛋白中的氨基酸基团反应,由此导致变色。由PPO导致的褐变问题通常通过向食品中添加亚硫酸盐来解决,而亚硫酸盐业已被证实与某些可能的健康危害和消费者反感相关。PPO通常起着保护植物不受病原体或昆虫类害虫危害的作用,因此,对于植物的生活力来说并不重要。因此,本发明的该实施方案提供了通过导入移码、一个或几个框内终止密码子破坏PPO基因或通过破坏其启动子,在苹果、葡萄、鳄梨、梨和香蕉中预防酶促褐变的方法。
植物基因组中的PPO基因的数量是可变的;在番茄和马铃薯中,PPO形成一个多基因家族。Newman,S.M.等,1993,植物分子生物学21,1035-1051,Hunt M.D.等1993,植物分子生物学21,59-68;Thygesen,P.W.等,1995,植物生理学109,525-531。葡萄仅含有一个PPO基因。Dry,I.B.等,1994,植物分子生物学,26,495-502。当目标植物种含有多拷贝的PPO基因时,重要的是能够破坏在商业制品中正常表达的PPO基因。例如,在可收获大小的马铃薯中仅有一个PPO基因,该基因被称为POT32,其序列的GENBANK保藏号为U22921(序列2)中,该序列被收作本文参考文献。业已对其它马铃薯PPO异构酶进行了测序,并对其序列进行了保藏,以便本领域技术人员可以设计出能专门使POT32失活的MDON。
例4减少饲料作物和木浆中的木质素
木质素是一种复杂的异源芳族聚合物,它可以使高等植物防水并加强其细胞壁。木质素是由苯基类丙酮单木质素的自由基随机聚合而成。由于从木浆中清除木质素会涉及到资金和环境代价,木质素对造纸业造成了严重问题。类似地,饲料作物的木质素含量限制了其对反刍动物的消化能力。事实上,业已在高粱(Porter,KS等,1978,作物科学18,205-218)和玉米(Lechtenberg,V.L.等1972,Agron,J.64,657-660)中鉴定了具有降低的木质素含量的天然发生的突变,被称为“brown mid-rib”,并尝试用它饲养家畜。
玉米中的brown mid-rib突变涉及O-甲基转移酶基因。Vignol,F.,1995,植物细胞7,407-416。业已克隆了多种植物的O-甲基转移酶基因:Burgos,R.C.等,1991,植物分子生物学17,1203-1215(白杨);Gowri,G.等,1991,植物生理学97,7-14(苜蓿)和Jaeck,E.等,1992,分子植物微生物相互作用4,294-300(烟草)(序列3和序列4),因此,本发明的一个方面是破坏O-甲基转移酶基因,以便在玉米或高粱的任何栽培种中以及在其它饲料作物种中和在用于生产木浆的植物中再现brown mid-rib表型。
参与木质素生产的第二个基因是肉桂醇脱氢酶(CAD)基因,该基因业已克隆到烟草中。Knight,M。E.,1992,植物分子生物学19,793-801(序列5和序列6)。转基因烟草植物使得CAD反义转录物具有较低的CAD含量,还能产生一种更容易提取的木质素,明显由于丁香基与邻甲氧苯基单体比例的提高,并由于醛单体相对醇残基整合量的增加。Halpin,C.等,1994,植物杂志6,339-350,因此,本发明的一种实施方案是通过导入移码、一个或几个框内终止密码子破坏诸如苜蓿、玉米、高粱和大豆的饲料作物和诸如短叶松(Pinusechinata)、长叶松(Pinus palustris)、湿地松(Pinus elliottii)、火炬松(Pinus taeda)、北美鹅掌楸(Liriodendron tulipifera)和杨(Populus sp.)的纸浆树木的CAD基因,或破坏其启动子。
例5降低油用种子中的不饱和和聚不饱和酯类
源于诸如油菜(canola)、花生、向日葵和大豆的油用种子的植物油中,诸如油酸的不饱和脂肪酸和诸如亚油酸和亚麻酸的聚不饱和脂肪酸的存在,在长期储存和高温下会导致这种油氧化。因此,通常对植物油进行氢化。不过,化学氢化作用会导致转氢,这会产生非天然存在的立体异构体,这种异构体被认为是对健康有害的。
脂肪酸合成是以在乙酰载体蛋白(ACP)上合成饱和脂肪酸开始的,然后通过脱氢酶的作用除去氢对。因此,需要抑制油用种子中这种脱氢酶的活性。
油酸合成中的第一种酶是硬脂酰-ACP脱氢酶(EC1.14.99.6)。业已克隆了来自红花和蓖麻籽的硬脂酰-ACP脱氢酶,并进行了测序。Thompson,G.A.等,1991,Proc.Natl.Acad.Sci.88,2578-2582(序列7);Shankl in,J.&Somerville,C.1991,Proc.Natl.Acad.Sci.88,2510-2514(序列8);Knutzon,D.S.等,1991,植物生理学96,344-345。因此,本发明的一种实施方案是通过导入一个移码、一个或几个框内终止密码子破坏诸如大豆、红花、向日葵、大豆、玉米和油菜的油用种子作物的硬脂酰-ACP脱氢酶基因或破坏其启动子。
根据本发明可以破坏的第二种酶是ω-3脂肪酸脱氢酶(ω-3FAD),这种酶能将亚油酸(一种二烯)转化成亚麻酸(一种三烯)。在拟南芥中存在两种ω-3 FAD异构酶,本领域技术人员预计在大多数其它植物中也存在这两种异构酶。一种异构酶是对质体专一的,并且是合成种子的储存油类的相关异构酶。另一种是微粒体专一的。Iba.,K.等,1993,生物化学杂志268,24099-24105(序列9)披露了拟南芥质体ω-3 FAD的克隆。根据本发明的一种实施方案,通过导入一个移码、一个框内终止密码子破坏诸如大豆、红花、向日葵、大豆、玉米和油菜的油料种子的质体ω-3 FAD基因,或破坏其启动子。
例6灭活S等位基因,以便得到近交系
某些植物种业已形成了一种防止自花授粉的机制。在这些种中,例如小麦和稻,存在一个被称为S的基因座,该基因座具有多个等位基因。能表达S等位基因的植物不能用表达相同的S等位基因的花粉授粉。Lee,H-K.,1994,自然367,560-563;Murfett,J.等,1994,自然367,563。S基因座的产物是RNase。McClure,B.A.等,1989,自然342,955-957。对所述植物来说S基因座的产物并不重要。因此,本发明的一种实施方案是通过导入一个移码、一个或几个框内终止密码子破坏S基因座的基因或破坏其启动子,使得所述植物能够自交。
例7乙烯不敏感性
乙烯是一种气体植物激素,它参与植物生长和发育。乙烯作用的一个不希望的方面是使得果实、蔬菜过分成熟并使得花萎蔫,导致腐烂和损失。业已克隆了拟南芥的乙烯受体,并被命名为ETR-1。Chang,C.等,1993,科学262,539-544(序列10),一种突变型Cys→Tyr65会导致对乙烯的显性不敏感性。表达所述拟南芥突变ETR-1的转基因番茄植物也表现出对乙烯的不敏感性,这表明在大多数植物种中,Cys→Tyr65突变是乙烯作用的显性抑制剂。根据本发明的该实施方案的一个方面,将Cys→Tyr65突变插入ETR-1基因,以便延长突变的果实类蔬菜或花的寿命。
在该实施方案的另一方面,可以通过破坏编码乙烯合成的酶的一个基因对果实或鲜花进行防腐:即1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶(ACC合酶)和ACC氧化酶。对本发明的该实施方案来说,可以完全消除乙烯合成量,因此,成熟过程是通过外源乙烯产生的,或者保留一定的乙烯产量,以便果实能自动成熟,但具有较长的储存寿命。因此,预计破坏ACC合酶或ACC氧化酶基因的一个等位基因能够导致乙烯合成水平的有用的降低。另外,本发明提供了破坏一个等位基因同时导入一种突变,这样会导致未被破坏的等位基因活性的部分丧失。
Abel,S.等1995,生物化学杂志270,19093-19099(序列12)和Gomez-Lim,M.A.等1993,基因134,217-221(序列11)分别披露了拟南芥ACC合酶和ACC氧化酶基因的序列,以上文献被收作本文参考文献。
例8卡那霉素抗性的恢复
植物重组DNA技术能够将源于一种植物的基因和细菌基因导入第二种植物。例如,Kinney,A.J.1996,自然生物技术14,946,披露了将月桂ACP-硫酯酶基因导入油菜种子以便获得富含月桂酸的植物油。所述转基因植物通常是使用一个卡那霉素抗性的抗生素抗性基因构建的,该抗性基因被作为选择性状同时插入所述转基因植物。所得到的转基因植物继续表达所述抗生素抗性基因,这样会产生大量的抗性产物,并且该基因会进入食物和/或环境中,这意味着存在着环境或健康危害。本发明的一种实施方案通过导入一个移码、一个或几个框内终止密码子破坏卡那霉素基因或破坏其启动子避免所述危险。
例9改变储存蛋白氨基酸含量
种子和块茎包括一类主要储存蛋白,例如马铃薯中的patatins和玉米中的玉米醇溶蛋白。所述储存蛋白的氨基酸组成通常不适合人类和动物的需要,这取决于作物的种类,例如,玉米缺少赖氨酸和甲硫氨酸,而马铃薯缺少甲硫氨酸。因此,本发明的一种实施方案是使粮食作物的储存蛋白发生突变,以便增加低含量氨基酸的量。Patatins是由一个多基因家族编码的,该基因家族由Mignery,G.A.等,1988,基因62,27-44鉴定,而玉米醇溶蛋白的结构由Marks,M.D.等,1985,生物化学杂志,260,16451459披露,以上文献被收作本文参考文献。另外,可以使甲硫氨酸或赖氨酸特异性tRNA的反密码子突变成更常见的氨基酸。
例10利用MDON确定一个基因的功能
克隆和测定组织特异性cDNA的序列的现有技术使得本领域技术人员能方便地获得许多基因的序列。用于确定这些基因功能的技术较少。在本发明的一种实施方案中,设计MDON,以便将移码或终止密码子导入编码未知功能的cDNA的基因。这样可以对所述基因进行特异性破坏。可以种植具有所述特异性“剔除”的植物,并可以观察剔除的作用,以便研究所述未知基因的功能。
4.8本发明的可育植物
本发明包括具有分离的选择点突变的可育植物,所述分离的选择突变不是罕见的多态性,即在大约10,000个体的群体中不会出现。在本文中,点突变是指取代不超过6个连续核苷酸的突变,优选不超过3个核苷酸,更优选1个核苷酸,或者缺失或插入1-5个核苷酸,优选1或2个核苷酸。在本文中,分离的突变是指在遗传学上不与任何其它突变密切连锁的突变,其中,可以理解的是,大于100Kb,优选大于40Kb和更优选大于23Kb的突变不是密切连锁的。
BIOLISTIC工作实施例
在下面的工作实施例中,培养基和方法披露于Gelvin,S.B.等的著述中,1991,植物分子生物学手册(Kluwer学术出版社)。按照以下方法用MDON涂敷金颗粒。首先制备用于涂敷的微粒,然后马上用嵌合质粒涂敷。为了制备所述微粒,将60mg金颗粒悬浮在1ml 100%乙醇中(参见注释4)。对该悬浮液进行三次超声处理,每次30秒,以便分散金颗粒。以12,000×g的速度离心30秒,弃上清液。加入1ml 100%乙醇,涡旋搅拌15秒,以12,000×g的速度离心5分钟,然后弃上清液。将洗涤过的金颗粒(直径1.0μm,60mg/ml)悬浮在水中的25μ1悬浮液进行缓慢涡旋搅拌,顺序加入40μl MDON(50mg/ml),75μl的2.5M氯化钙,75μl的0.1M亚精胺。对所有溶液进行冰镇。对完成的混合物再进行涡旋搅拌10分钟,并让金颗粒在室温下再沉淀10分钟。在100%乙醇中洗涤沉淀,并重新悬浮在50μl的无水乙醇中。用Biorad Biolistic枪进行biolistic输送,采用以下参数:箱内压力1100psi,破裂盘×2在900psi时破裂,颗粒悬浮体积5μl。
NT-1(烟草),双子叶细胞悬浮液:在28℃下,在标准培养基上让含有500万个细胞的直径大约为5cm的NT-1的细胞集落生长3天。用ALS-1或ALS-2涂敷金颗粒,并按上述方法轰击。再培养所述细胞2.5天,悬浮,并转移到补充了15-50ppb chlorosulfuron(GLEAMTM)的固体培养基上。在7-14天之后出现抗性集落。
所使用的MDON的序列如下:(在与靶基因不同源的核苷酸下面划线并加粗。小写字母表示2’-O甲基核糖核苷酸)ALS-1TGCGCG-guccaguucaCG TTGcauccaacuaTT                                  TT                                  T(序列13)TCGCGC CAGGTCAAGTGC AACGTAGGATGATT
  3′5′ALS-2TGCGCG-guccaguucaCG ATGcauccaacuaTT                                  TT                                  T(序列14)TCGCGC CAGGTCAAGTGC TACGTAGGATGATT
  3′5′
ALS-1和ALS-2与ALS基因在Pro197(CCA)密码子的第二个核苷酸上具有一个碱基的错配:ALS-1是CAA,而ALS-2是CTA。在对ALS-1和ALS-2衍变的抗性细胞系的基因进行PCR扩增和测序之后,分别发现所述靶密码子上的突变为Thr(ACA)和Ser(TCA)。观察到的突变相对根据MDON在哺乳动物细胞编码链上的作用预测的位点向5’方向移动一个核苷酸,并在非编码链上相对预期位点向3’方向移动一个核苷酸。总共鉴定了具有这种突变的3个ALS-1和5个ALS-2衍变体。未能从ALS-l DNA处理过的细胞获得愈伤组织。
为了筛选chlorosulfuron抗性细胞,在轰击之后2天将细胞从每一个轰击板上转移到含有5ml液体CSM2的15ml中。将试管颠倒若干次,以便分散细胞块。然后将所述细胞转移到含有15ppbchlorosulfuron(Dupont,Wilmington,DE)的固化CSM培养基上。大约3-5周之后,选择活跃生长的细胞(突出的、有浅颜色的集落),并转移到含有50ppb chlorosulfuron的固化CSM上。3-4周之后,选择活跃生长的细胞,然后转移到含有200ppb chlorosulfuron的固化CSM上。然后分析在该处理中存活的细胞。
培养基
1.NT-1细胞悬浮培养基(CSM):Murashige和Skoog盐(GibcoBRL,Gland岛,NY),500mg/l MES,1mg/l硫胺素,100mg/l肌醇,180mg/l磷酸二氢钾,2.21mg/l 2,4-二氯苯氧乙酸(2,4-D),30g/l蔗糖。用1M氢氧化钾或盐酸将pH调节到5.7,并高压灭菌。对于固化培养基来说,在高压灭菌之前加入8g/l琼脂-琼脂(Sigma,St.Louis,MO)。
2.铺开培养基(POM):80%(v/v)CSM,0.3M甘露醇,20%(v/v)源于在原生质体分离之前NT-1细胞悬浮液的初级离心的上清液。
烟草叶片,一种双子叶植物:通过获得了bin19-衍生质粒的根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)LBA4404对烟草品种Samsun叶片进行共转化,所述质粒含有nptII表达框,该表达框含有两个基因:一个基因编码卡那霉素抗性,和一个编码绿色荧光蛋白的基因的两种突变之一(GFP,Chui,W.1996,当代生物学6,325-330)。任何一种突变型GFP基因都不能产生GFP产物。在第六个密码子上含有G→T取代的突变会产生一个终止密码子或在同一个位点上产生一个核苷酸的缺失,分别称之为G-终止子和G-Δ。在选择性MS104培养基上培养之后,回收叶片,通过Northern印迹证实GFP基因的存在。GFP的头8个密码子的序列为:GFP      ATG GTC AGC AAG GGC GAG GAG CTG     (序列15)G-终止   -------------------T-----------     (序列16)G-Δ     --------------------AGG AGC TGT     (序列17)
所使用的MDON的序列如下:(在与G-终止子不同源的核苷酸下面划线并加粗。小写字母表示2’-O甲基核糖核苷酸)。GFP-1TGCGCG-cacucguuccCG CTCcucgacaaguTT                                  TT                                  T  (序列18)TCGCGC GTGAGCAAGGGC GAGGAGCTGTTCAT
  3′5 ′GFP-2TGCGCG-acucguucccGA GCCucgacaagugTT                                  TT                                  T(序列19)TCGCGC TGAGCAAGGGCT CGGAGCTGTTCACT
  3′5′
在MS104选择培养基上培养G-终止子和G-Δ转基因植物的叶片,按上述方法通过两次连续的输送将G-1或G-1 biolistically导入。在导入MDON之后大约10天,在G-终止子和G-Δ叶片的G-1和G-2处理培养物中观察到具有GFP-样荧光的愈伤组织。用解剖刀分解较大的、生长较快的愈伤组织块,以便获得富含绿色荧光细胞的愈伤组织。在为期大约30天的观察阶段,所述荧光表型保持稳定。在G-1处理的G-终止子培养物中绿色荧光细胞的出现表明G-1不会导致除了错配核苷酸的5’末端的一个碱基之外的突变。
用IMT-2 Olympus显微镜通过标准FITC过滤装置观察绿色荧光。
电穿孔工作实施例
在烟草叶肉原生质体中转化GFP
植物材料
1.获得了GFP的缺失突变型的烟草植物转化体(Δ6)。
2.从5-6周龄体外生长小植株上获得叶片
原生质体分离
1.基本上按照Gallois等的方法1996,用质粒DNA或总基因组DNA进行烟草叶片原生质体的电穿孔。分子生物学方法,55卷:植物细胞电穿孔和电融合方法,编辑J.A.Nickolosf,Humana出版公司,Totowa,NJ.89-107页。
2.酶溶液:1.2%纤维素酶R-10“Onozuka”(Karlan,Santa Rosa,CA),0.8%macerozyme R-10(Karlan,Santa Rosa,CA),90g/l甘露醇,10mM MES,过滤除菌,以10ml等分试样形式在-20℃下保存。
3.切割距离中脉1-2mm的叶片。然后使远轴侧朝下,让其与10ml酶溶液在100×20mm的培养皿中接触。在每一个培养皿中总共放入1g叶片。
4.在25℃下在黑暗中培养所述培养皿16小时。
5.对消化过的叶片材料进行移液,并通过100μm的尼龙纱布(Small Parts公司,迈阿密湖,FL)过滤。然后将滤液转移到一个离心管中,并以1000rpm的速度离心10分钟。该方案的所有离心都是在这种条件下进行的。
6.原生质体集中在上部的一条带中。然后将该原生质体带转移到一个干净的离心管中,加入10ml洗涤溶液(0.4M蔗糖和80mM氯化钾)。对该原生质体进行温和地再悬浮,然后离心。
7.重复步骤6两次。
8.在经过最后一次洗涤之后通过将少量的样品分配到一个血细胞计数器上测定原生质体的密度。将所述原生质体以1×106原生质体/ml的密度重新悬浮在电穿孔缓冲液(80mM氯化钾,4mM氯化钙,2mM磷酸钾,pH7.2,8%甘露醇)中,高压灭菌。在8℃下培养该原生质体2小时。
9.两小时之后,将0.3ml(1×105原生质体)转移到每一个0.4cm的样品池中,然后放置在冰上。将GFP-2(0.6-4μg/ml)加入每一个样品池中,不进行电穿孔的对照除外。对原生质体进行电穿孔(250V,电容250μF,时间常数10-14ms)。
10.让原生质体在冰上恢复10分钟,然后转移到培养皿中(100×20mm)。35分钟之后,向每一个培养皿中加入10ml POM,参见上文。然后将培养皿转移到黑暗中,在25℃下培养24小时,然后转移到光照条件下。
11.然后按照上述Gallois的方法维持所述原生质体培养物。
荧光显微镜观察
1.在紫外线下,我们在3×105个原生质体中观察到8个GFP转化的原生质体。
                          序列表
<110>1.Arntzen,Charles
     2.Kipp,Peter B.
     3.Kumar,Ramesh
     4.May,Gregory D.
<120>用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传
     改变的用途
<130>7991-023-999
<150>60/054,386
<151>1997-08-05
<160>19
<170>FastSEQ for Windows Version 3.0
<210>1
<211>2063
<212>DNA
<213>马铃薯
<220>
<221>CDS
<222>(3)...(1907)
<400>1agtaccattc cagttatgac ccggaaaact ccgcctccca ttacacattc ctcccggatc       60aacccgattc cggccaccgg aagtccctta aaatcatctc cggcattttc ctctcctctt      120tccttttgct ttctgtagcc ttctttccga tcctcaacaa ccagtcaccg gacttgcaga      180gtaactcccg ttcgccgccg ccgtcaagag gtgtttctca gggagtctcc gataagactt      240ttcgagatgt cgtcaatgct agtcacattt cttatgcgtg gtccaatgct atgcttagct      300ggcaaagaac tgcttaccat tttcaacctc aaaaaaattg gatgaacgat cctaatggtc      360cattgtacca caagggatgg tatcatcttt tttatcaata caatccagat tcagctattt      420ggggaaatat cacatggggc catgccgtat ccaaggactt gatccactgg ctctacttgc      480cttttgccat ggttcctgat caatggtacg atattaacgg tgtctggact gggtccgcct      540ccatcctacc cgatggtcag atcatgatgc tttataccgg tgtctctgat gattatgtac      600aagtgcaaaa tcttgcgtac cccaccaact tatctgatcc tctccttcta gactgggtca      660agtacaaagg caacccggtt ctggttcctc cacccggcat tggtatcaag gactttagag      720acccgaccac tgcttggacc ggaccccaaa atgggcaatg gcttttaaca atcgggtcta      780agattggtaa aacgggtatt gcacttgttt atgaaacttc caacttcaca agctttaagc      840tattggatga agtgctgcat gcggttccgg gtacgggtat gtgggagtgt gtggactttt      900acccggtatc gactgaaaaa acaaacgggt tggacacatc atataacggc ccgggtgtaa      960agcatgtgtt aaaagcaagt ttagatgaca ataagcaaga tcactatgct attgggacgt     1020atgacttgac aaagaacaaa tggacacccg ataacccgga attggattgt ggaattgggt     1080tgaagctgga ttatgggaaa tattatgcat caaagacatt ttatgacccg aagaaacaac     1140gaagagtact gtggggatgg attggggaaa ctgatagtga atctgctgac ctgcagaagg     1200gatgggcatc tgtacagagt attccaagga cagtgcttta cgacaagaag acagggacac     1260atctacttca gtggccagtt gaagaaattg aaagcttaag agtgggtgat cctattgtta     1320agcaagtcaa tcttcaacca ggttcaattg agctactcca tgttgactca gctgcagagt     1380tggatataga agcctcattt gaagtggaca aagtcgcgct ccagggaata attgaagcag     1440atcatgtagg tttcagctgc tctactagtg gaggtgctgc tagcagaggc attttgggac     1500catttggtgt cgttgtaatt gctgatcaaa agctatctga gctaacgcca gtttacttct     1560acatttctaa aggagctgat ggtcgagctg agactcactt ctgtgctgat caaactagat     1620cctcagaggc tccgggagtt gctaaacaag tttatggtag ttcagtaccc gtgttagacg     1680gtgaaaaaca ttcgatgaga ttattggagg accactcaat tgtggagagc tttgcccaag     1740gaggaagaac agtcataaca tcgcgaattt acccaacaaa ggcagtgaat ggagcagcac     1800gactcttcgt tttcaacaat gccacagggg ctagcgtgac tgcttccgtc aagatttggt     1860cacttgagtc ggctaatatt cgatccttcc ccttgcaaga cttgtaattc atcaagccat     1920atcttcttca ttcttttttt catttgaagg ttatttcacc gatgtcccat caagaaaggg     1980aagagaggga gaatatgtag tgttatactc tacttattcg ccattttagt gatttttcta     2040ctggactttt gctattcgca aaa                                             2063
<210>2
<211>1958
<212>DNA
<213>马铃薯
<220>
<221>CD8
<222>(22)...(1815)
<400> 2tcttttgcgt tttgagcaat aatggcaagc ttgtgcaata gtagtagtac atctctcaaa       60actcctttta cttcttcctc cacttcttta tcttccactc ctaagccctc tcaacttttc      120atccatggaa aacgtaacca aatgttcaaa gtttcatgca aggttaccaa taataacggt      180gaccaaaacc aaaacgttga aacaaattct gttgatcgaa gaaatgttct tcttggctta      240ggtggtcttt atggtgttgc taatgctata ccattagctg catccgctgc tccagctcca      300cctcctgatc tctcgtcttg tagtatagcc aggattaacg aaaatcaggt ggtgccgtac      360agttgttgcg cgcctaagcc tgatgatatg gagaaagttc cgtattacaa gttcccttct      420atgactaagc tccgtgttcg tcagcctgct catgaagcta atgaggagta tattgccaag      480tacaatctgg cgattagtcg aatgaaagat cttgataaga cacaaccttt aaaccctatt      540ggttttaagc aacaagctaa tatacattgt gcttattgta acggtgctta tagaattggt      600ggcaaagagt tacaagttca taattcttgg cttttcttcc cgttccatag atggtacttg      660tacttccacg agagaatcgt gggaaaattc attgatgatc caactttcgc tttaccatat      720tggaattggg accatccaaa aggtatgcgt tttcctgcca tgtatgatcg tgaagggact      780tcccttttcg atgtaacacg tgaccaaagt caccgaaatg gagcagtaat cgatcttggt      840tttttcggca atgaagttga aacaactcaa ctccagttga tgagcaataa tttaacacta      900atgtaccgtc aaatggtaac taatgctcca tgtcctcgga tgttctttgg cgggccttat      960gatctcgggg ttaacactga actcccggga actatagaaa acatccctca cggtcctgtc     1020cacatctggt ctggtacagt gagaggttca actttgccca atggtgcaat atcaaacggt     1080gagaatatgg gtcattttta ctcagctggt ttggacccgg ttttcttttg ccatcacagc     1140aatgtggatc ggatgtggag cgaatggaaa gcgacaggag ggaaaagaac ggatatcaca     1200cataaagatt ggttgaactc cgagttcttt ttctatgatg aaaatgaaaa cccttaccgt     1260gtgaaagtca gagactgttt ggacacgaag aagatgggat acgattacaa accaattgcc     1320acaccatggc gtaacttcaa gcccttaaca aaggcttcag ctggaaaagt gaatacagct     1380tcacttccgc cagctagcaa tgtattccca ttggctaaac tcgacaaagc aatttcgttt     1440tccatcaata ggccgacttc gtcaaggact caacaagaga aaaatgcaca agaggagatg     1500ttgacattca gtagcataag atatgataac agagggtaca taaggttcga tgtgttttcg     1560aacgtggaca ataatgtgaa tgcgaatgag cttgacaagg cggagtttgc ggggagttat     1620acaagtttgc cacatgttca tagagctggt gagactaatc atatcgcgac tgttgatttc     1680cagctggcga taacggaact gttggaggat attggtttgg aagatgaaga tactattgcg     1740gtgactctgg tgccaaagag aggtggtgaa ggtatctcca ttgaaggtgc gacgatcagt     1800cttgcagatt gttaattagt ctctattgaa tctgctgaga ttacactttg atggatgatg     1860ctctgttttt gttttcttgt tctgtttttt cctctgttga aatcagcttt gttgcttgat     1920ttcattgaag ttgttattca agaataaatc agttacaa                             1958
<210>3
<211>1460
<212>DNA
<213>烟草
<220>
<221>CDS
<222>(84)...(1178)
<400> 3tctgtttctt caactcacct taatttgccc aattgagtca ttgtaaaatc tgaaacagaa       60ccaagagaga agagaaaaaa aatatgggtt caacaagcca gagccagagt aagagtctaa      120ctcacacaga agacgaagcg ttcttatttg ccatgcaatt ggctagtgct tctgtacttc      180ctatggtcct aaaatcagcg ttagaacttg accttcttga actcatggct aaagctggtc      240caggtgcagc catttctcct tctgaattag ctgctcagct ctcaacccag aacccagaag      300cacccgttat tcttgatcgg atgcttaggc tacttgctac ttactctgtt ctcaattgta      360ctcttagaac actgtctgat ggcagtgttg agaggcttta tagtctggct ccggtttgta      420agttcttgac taagaatgct gatggtgttt ctgttgcccc acttttgctt atgaatcaag      480ataaagttct tatggagagc tggtaccact taaaagatgc agtactagat ggtggaatcc      540cattcaacaa ggcctatgga atgacagcat ttgagtacca tggcacagat ccaagattca      600acaaagtttt caaccgtgga atgtctgatc actccactat gtcaatgaaa aagattcttg      660aggactacaa aggatttgaa ggcctaaatt ccattgttga tgttggtggt ggaactggcg      720ctactgttaa catgattgtc tccaaacatc cctctattaa gggtattaac tttgatttac      780cacatgttat tggagatgct ccagcttacc ctggtgtcga gcacgttggt ggcgacatgt      840ttgccagtgt gccaaaagca gatgccattt tcatgaagtg gatttgtcat gattggagcg      900acgagcattg cctaaaattc ttgaagaatt gctatgaagc actacctgca aatgggaagg      960tgataatagc ggagtgcata cttccagagg ccccagatac atcacttgca actaagaata     1020cagtacatgt tgatattgtg atgttagcac ataacccagg aggcaaagaa aggactgaga     1080aggaatttga ggctttggct aagggcgctg gttttactgg attcgcaagg cttgttgcgc     1140ttacaacact tgggtcatgg aattcaacaa ataattaatc gattcctttg gaggattaag     1200caatatactg ttcattttgc attttgaaat tctacttttc acagagtggc tttactgcga     1260aataaaagaa atatatagct tttaccttga aaagatcaat gttcaaaggg aaaaaaaaaa     1320aggaagatga aataattgct ctcagaaaag cagtgtgtta ggaaaaagct ttttagctgg     1380attttgaatt ttattgtatg tatttctgta atacacatgt attgaaggaa tactagtttt     1440cgaccaatca tatttctttg                                                 1460
<210>4
<211>1418
<212>DNA
<213>烟草
<220>
<221>CDS
<222>(59)...(1153)
<400> 4attccttcaa cttacccaat taagtcatcg aaaaatctga aacagaacta aaagtaaaat       60gggttcaaca agcgagagcc agagtaacag tctcactcac acagaagacg aagctttctt      120atttgccatg caattgtgta gtgcttctgt acttcctatg gtcctaaaat cagccgtaga      180acttgacctt cttgagctaa tggctaaggc tggtccaggt gcagctattt ctccttctga      240attagctgct cagctctcaa ctcagaaccc agaagcacct gttatgcttg atcggatgct      300taggctactt gcttcttact ctgttctcaa ttgtactctt agaacactgc ctgatagcag      360tgttgagagg ctttatagtc tggctcccgt ctgtaagtac ttgactaaga atgctgatgg      420tgtttctgtt gccccacttt tgcttatgaa tcaagataaa gttcttatgg agagctggta      480ccacttaaaa gatgcagtac tagatggcgg aatcccattc aacaaagcct atggaatgac      540agcatttgag taccatggca cagatccaag attcaacaaa gtgttcaacc gtggaatgtc      600tgatcactcc actatgtcaa tgaagaagat tcttgaggac tacaaaggat ttgaaggcct      660aaattccatt gttgatgttg gtggtggaac gggtgctact gttaacatga ttgtctctaa      720atatccctct attaagggca ttaactttga tttgccacat gtaattggag atgctccaac      780ttaccccggt gtcgagcacg ttggtggcga catgtttgct agtgtgccaa aagcagatgc      840cattttcatg aagtggattt gtcatgattg gagcgatgag cattgcctaa aattcttgaa      900gaattgctat gaagcactac ctgcaaatgg gaaggtgata attgcagagt gcatacttcc      960agaggcccca gatacatcac ttgcaactaa gaatacagta catgttgata ttgttatgtt     1020agcacataac ccaggaggca aagaaaggac tgagaaggaa tttgaggctt tggctaaggg     1080cgctggtttt actggattcg caaggcttgt tgcgcttaca acacttgggt catggaattc     1140aacaagtaat taatcgattc cttaatttga aggattaagc aatatactgt tcgttttgca     1200tttggaaatt ctacttttct cagagtggct tgactgtgaa ataaaagaaa tatagctttt     1260aacttgaaaa gattgatgtt caaaagaaaa aaaggaagat gaaataattg ctctcagaaa     1320agcaatgtgt taggaaaaag cttttttagc tggattttga attttactgt atgtatttct     1380gttatacaca tgtattgaag gaatactagt tttcgacc                             1418
<210>5
<211>1419
<212>DNA
<213>烟草
<220>
<221>CDS
<222>(92)...(1165)
<400> 5atttctttct ctttcccttg aactgtgttt tcattttttc tgctctgaaa caatagtgtt       60ttccttgtag attttaagtt aaaagaaaac catgggtagc ttggatgttg aaaaatcagc      120tattggttgg gctgctagag acccttctgg tctactttca ccttatacct atactctcag      180aaacacagga cctgaagatg tgcaagtcaa agttttgtat tgtggacttt gccacagtga      240tcttcaccaa gttaaaaatg atcttggcat gtccaactac cctctggttc ctggacatga      300agtggtggga aaagtagtgg aggtaggagc agatgtgtca aaattcaaag tgggggacac      360agttggagtt ggattactcg ttggaagttg taggaactgt ggcccttgca agagagaaat      420agagcaatat tgcaacaaga agatttggaa ttgcaatgat gtctacactg atggcaaacc      480cacccaaggt ggttttgcta attctatggt tgttgatcaa aactttgtgg tgaaaattcc      540agagggtatg gcaccagaac aagcagcacc tctattatgt gctggcataa cagtatacag      600tccattcaac cattttggtt ttaatcagag tggatttaga ggaggaattt tgggattagg      660aggagttgga catatgggag tgaaaatagc aaaggcaatg ggacatcatg ttactgtcat      720tagttcttca aataagaaga gacaagaggc attggaacat cttggtgcag atgattatct      780tgttagttca gacactgata aaatgcaaga agctgctgat tcacttgact atattattga      840tactgtccct gttggccatc ctcttgaact ttatctttct ttgcttaaaa ttgatggcaa      900acttatcttg atcggagtta tcaacacccc cttgcaattt atctctccca tggttatgct      960cgggagaaag agcatcactg gaagctttat tggtagcatg aaggaaacag aggaaatgct     1020agacttctgc aaagagaaag gtgtgacttc acagattgag atagtgaaaa tggattatat     1080caacactgca atggagaggt tggagaaaaa tgatgtgagc tacagatttg ttgttgatgt     1140tgctggaagc aagcttgacc agtaattgca caagaaaaac aacatggaat ggttcactat     1200tatacaacaa ggctatgaga aaaatagtac tcctcaactt tgatgtcatc tttgttacct     1260ttgttttatt ttccacctgt attatcatat ttggtggtcg agagtgacgt ttatgtatat     1320tttctttctt caaaacaatc ttaaatgaat ttggatgttg gtgacgattt tgaaatatac     1380caaccatgca aacttacttt ggtagaaaaa aaaaaaaaa                            1419
<210>6
<211>1398
<212>DNA
<213>烟草
<220>
<221> CDS
<222>(88)...(1161)
<400> 6attcctcttt cccttgaact gtgttttcgt tttttctgct ctaaaacaat cgtgtgttcc      60ttctagattt taagtttaaa gaacatcatg ggtggcttgg aagttgagaa aacaactatt      120ggttgggctg ctagagaccc ttctggtgta ctttcacctt atacctatac tctcagaaac      180acaggacctg aagatgtgga agtcaaagtt ttgtattgtg ggctctgtca cactgatctt      240caccaagtta aaaatgatct tggcatgtcc aactaccctc tggttcctgg acatgaagtg      300gtgggagaag tggtggaggt aggaccagat gtgtcaaaat tcaaagttgg ggacacagtt      360ggagttggat tactcgttgg aagttgcagg aactgtggcc cttgcaagag agatatagag      420caatattgca acaagaagat ttggaactgc aatgatgtct acactgatgg caaacccacc      480caaggtggtt ttgctaaatc catggttgtt gatcaaaagt ttgtggtgaa aattccagag      540ggtatggcac cagaacaagc agcacctcta ttatgtgctg gtataacagt atacagtcca      600ttgaaccatt ttggtttcaa acagagtgga ttaagaggag gaattttggg attaggagga      660gtgggacaca tgggagtgaa aatagcaaag gcaatgggac atcatgttac tgtcattagt      720tcttcaaata agaagagaca agaggcattg gaacatcttg gtgcagatga ttatcttgtc      780agttcagaca ctgataaaat gcaagaggct tctgattcac ttgactatat tattgatact      840gtccctgttg gccatcctct tgaaccttat ctttctttgc ttaaaattga tggcaaactt      900atcttgatgg gagttatcaa cacccccttg caatttatct cccccatggt tatgctcggg      960agaaagagca tcacaggaag ctttattggt agcatgaagg aaacagagga aatgctagat     1020ttctgcaaag agaaaggtgt gacttcacag attgagatag tgaaaatgga ttatatcaac     1080actgcaatgg agaggttgga gaaaaatgat gtgaggtaca gatttgtggt tgatgttatt     1140ggaagcaagc ttgaccagta attatattac acaagaaaaa caacatggaa tggttcacta     1200ttatacaagg ctgtgagaat actaaacttt gatgtcgtct tttgtatcct tttgttttat     1260ttgccacctg tattttctta tttggtgatc gagagtgacg tttatgtatt attttctttc     1320ttcaaaacaa tttaatgtat gaatttggat gttggtgaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa     1380aaaaaaaaaa aaaaaaaa                                                   1398
<210>7
<211>1533
<212>DNA
<213>红花
<220>
<221>CDS
<222>(106)…(1296)
<400>7gctcacttgt gtggtggagg agaaaaacag aactcacaaa aagctttgcg actgccaaga       60acaacaacaa caacaagatc aagaagaaga agaagaagat caaaaatggc tcttcgaatc      120actccagtga ccttgcaatc ggagagatat cgttcgtttt cgtttcctaa gaaggctaat      180ctcagatctc ccaaattcgc catggcctcc accctcggat catccacacc gaaggttgac      240aatgccaaga agccttttca acctccacga gaggttcatg ttcaggtgac gcactccatg      300ccaccacaga agatagagat tttcaaatcc atcgagggtt gggctgagca gaacatattg      360gttcacctaa agccagtgga gaaatgttgg caagcacagg atttcttgcc ggaccctgca      420tctgaaggat ttgatgaaca agtcaaggaa ctaagggcaa gagcaaagga gattcctgat      480gattactttg ttgttttggt tggagatatg attacagagg aagccctacc tacttaccaa      540acaatgctta ataccctaga tggtgtacgt gatgagactg gggctagcct tacgccttgg      600gctgtctgga ctagggcttg gacagctgaa gagaacaggc atggcgatct tctccacacc      660tatctctacc tttctgggcg ggtagacatg aggcagatac agaagacaat tcagtatccc      720attgggtcag gaatggatcc tcgtaccgaa aacagcccct accttgggtt catctacaca      780tcgtttcaag agcgtgccac atttgtttct cacggaaaca ccgccaggca tgcaaaggat      840catggggacg tgaaactggc gcaaatttgt ggtacaatcg cgtctgacga aaagcgtcac      900gagaccgctt atacaaagat agtcgaaaag ctattcgaga tcgatcctga tggcaccgtt      960cttgcttttg ccgacatgat gaggaaaaag atctcgatgc ccgcacactt gatgtacgat     1020gggcgtgatg acaacctctt cgaacatttc tcggcggttg cccaaagact cggcgtctac     1080accgccaaag actacgccga catactggaa tttctggtcg ggcggtggaa agtggcggat     1140ttgaccggcc tatctggtga agggcgtaaa gcgcaagatt atgtttgcgg gttgccacca     1200agaatcagaa ggctggagga gagagctcaa gggcgagcaa aggaaggacc tgttgttcca     1260ttcagctgga ttttcgatag acaggtgaag ctgtgaagaa aaaaaaaacg agcagtgagt     1320tcggtttctg ttggcttatt gggtagaggt taaaacctat tttagatgtc tgtttcgtgt     1380aatgtggttt tttttcttct aatcttgaat ctggtattgt gtcgttgagt tcgcgtgtgt     1440gtaaacttgt gtggctgtgg acatattata gaactcgtta tgccaatttt gatgacggtg     1500gttatcgtct cccctggtgt ttttttattg ttt                                  1533
<210>8
<211>1643
<212>DNA
<213>蓖麻
<220>
<221>CDS
<222>(1)...(1239)
<400>8ttccggcaaa taacaaaaaa ccaaaagaaa aaggtaagaa aaaaaacaat ggctctcaag       60ctcaatcctt tcctttctca aacccaaaag ttaccttctt tcgctcttcc accaatggcc      120agtaccagat ctcctaagtt ctacatggcc tctaccctca agtctggttc taaggaagtt      180gagaatctca agaagccttt catgcctcct cgggaggtac atgttcaggt tacccattct      240atgccacccc aaaagattga gatctttaaa tccctagaca attgggctga ggagaacatt      300ctggttcatc tgaagccagt tgagaaatgt tggcaaccgc aggatttttt gccagatccc      360gcctctgatg gatttgatga gcaagtcagg gaactcaggg agagagcaaa ggagattcct      420gatgattatt ttgttgtttt ggttggagac atgataacgg aagaagccct tcccacttat      480caaacaatgc tgaatacctt ggatggagtt cgggatgaaa caggtgcaag tcctacttct      540tgggcaattt ggacaagggc atggactgcg gaagagaata gacatggtga cctcctcaat      600aagtatctct acctatctgg acgagtggac atgaggcaaa ttgagaagac aattcaatat      660ttgattggtt caggaatgga tccacggaca gaaaacagtc cataccttgg gttcatctat      720acatcattcc aggaaagggc aaccttcatt tctcatggga acactgcccg acaagccaaa      780gagcatggag acataaagtt ggctcaaata tgtggtacaa ttgctgcaga tgagaagcgc      840catgagacag cctacacaaa gatagtggaa aaactctttg agattgatcc tgatggaact      900gttttggctt ttgctgatat gatgagaaag aaaatttcta tgcctgcaca cttgatgtat      960gatggccgag atgataatct ttttgaccac ttttcagctg ttgcgcagcg tcttggagtc     1020tacacagcaa aggattatgc agatatattg gagttcttgg tgggcagatg gaaggtggat     1080aaactaacgg gcctttcagc tgagggacaa aaggctcagg actatgtttg tcggttacct     1140ccaagaatta gaaggctgga agagagagct caaggaaggg caaaggaagc acccaccatg     1200cctttcagct ggattttcga taggcaagtg aagctgtagg tggctaaagt gcaggacgaa     1260accgaaatgg ttagtttcac tctttttcat gcccatccct gcagaatcag aagtagaggt     1320agaattttgt agttgctttt ttattacaag tccagtttag tttaaggtct gtggaaggga     1380gttagttgag gagtgaattt agtaagttgt tgatactgtt gtgttcttgt gttgtcatga     1440gtctgcttga tagtgagttt cttttgtttc cttttgttgt gttcttttat ctggtctctc     1500tctctctctc tctctctttt tctcttatcc caagtgtctc aagtataata agcaaacgat     1560ccatgtggca attttgatga tggtgatcag tctcacaact tgatcttttg tcttctattg     1620gaaacacagc ctgcttgttt gaa                                             1643
<210>9
<211>2569
<212>DNA
<213>拟南芥
<221>外显子
<222>(236)...(729)
<223>外显子1
<221>外显子
<222>(1030)...(1119)
<223>外显子2
<221>外显子
<222>(1201)...(1267)
<223>3
<221>
<222>(1358)...(1450)
<223>外显子4
<221>外显子
<222>(1530)...(1715)
<223>外显子5
<221>外显子
<222>(1809)...(1889)
<223>外显子6
<221>外显子
<222>(1993)...(2130)
<223>外显子7
<221>外显子
<222>(2212)...(2403)
<223>外显子8
<400>9cacaccatca ctaataaatt tccttctcct ttcaagttgt agctaactta tataagacat       60aagcgtgcga accagagaca gagatagaaa ttgagagacg ataagcaaag tagaaaacac      120aagtttctct cacacacatt atctctttct ctattaccac cactcattca taacagaaac      180ccaccaaaaa ataaaaagag agacttttca ctctggggag agagctcaag ttctaatggc      240gaacttggtc ttatcagaat gtggtatacg acctctcccc agaatctaca caacacccag      300atccaatttc ctctccaaca acaacaaatt cagaccatca ctttcttctt cttcttacaa      360aacatcatca tctcctctgt cttttggtct gaattcacga gatgggttca cgaggaattg      420ggcgttgaat gtgagcacac cattaacgac accaatattt gaggagtctc cattggagga      480agataataaa cagagattcg atccaggtgc gcctcctccg ttcaatttag ctgatattag      540agcagctata cctaagcatt gttgggttaa gaatccatgg aagtctttga gttatgtcgt      600cagagacgtc gctatcgtct ttgcattggc tgctggagct gcttacctca acaattggat      660tgtttggcct ctctattggc tcgctcaagg aaccatgttt tgggctctct ttgttcttgg      720tcatgactgg taaacttaaa aaccctaact tttttcttgt tttctcctct gctttagtct      780cctttagcct ttgatttggt caactttgga tgattccaaa gaaccaatcg aacaaattgg      840tctttatcca tatctcttca aatagcttta ggacataatt ggtctctcag gtaacaagct      900gtcattatca tcatactcat catgttgcta gtagaccaac ccaattggca actgtttgtt      960ggttttgcaa ctgtgtaatc tgctttgaat tgtgaacaaa attattgatt tatgttgatt     1020acattgcagt ggacatggta gtttcttaaa tgatccgaag ttgaacagtg tggtcggtca     1080tcttcttcat tcctcaattc tggtcccata ccatggctgg tgagttttgc tttcagacca     1140ttcttctcta aaaccacttg cagaatctca tcttcttcat gtaaaaatat gactttgcag     1200gagaattagt cacagaactc accaccagaa ccatggacat gttgagaatg acgaatcttg     1260gcatcctgta agtcaaaaac gtattttttt ggttatcttg ttttagtcct gtggtgtttc    1320ttagatgcag ttttattaac tgtttctgta actgcagatg tctgagaaaa tctacaatac    1380tttggacaag ccgactagat tctttagatt tacactgcct ctcgtgatgc ttgcataccc    1440tttctacttg gtaagaactc ctctatttgt tatggtaact taagctgcca caccaagtaa    1500aaaagctcat gtctattctt ctgtttcagt gggctcgaag tccggggaaa aagggttctc    1560attaccatcc agacagtgac ttgttcctcc ctaaagagag aaaggatgtc ctcacttcta    1620ctgcttgttg gactgcaatg gctgctctgc ttgtttgtct caacttcaca atcggtccaa    1680ttcaaatgct caaactttat ggaattcctt actgggtaat gcgccgctgt tactcccctg    1740tttcagcctg agcaatttgt gtattatttc ctctgcctta ctcaaaaagg tttttatgtc    1800aaatacagat aaatgtaatg tggttggact ttgtgactta cctgcatcac catggtcatg    1860aagataagct tccttggtac cgtggcaagg taaaatacat attctctgct tccactgttc    1920tttgactaca tcgctctttc ttttaaggtt aaagccaact ggtgtgtaaa tctcatgatt    1980ctcccaaaac aggagtggag ttacctgaga ggaggactta caacattgga tcgtgactac    2040ggattgatca ataacatcca tcatgatatt ggaactcatg tgatacatca tcttttcccg    2100cagatcccac attatcatct agtagaagca gtaagtaaat tgaaagtaaa gactgtttgt    2160gtttttggtg ttcatgctag tttccctgac tcttgctcca ctgttatgca gacagaagca    2220gctaaaccag tattagggaa gtattacagg gagcctgata agtctggacc gttgccatta    2280catttactgg aaattctagc gaaaagtata aaagaagatc attacgtgag cgacgaagga    2340gaagttgtat actataaagc agatccaaat ctctatggag aggtcaaagt aagagcagat    2400tgaaatgaag caggcttgag attgaagttt tttctatttc agaccagctg attttttgct    2460tactgtatca atttattgtg tcacccacca gagagttagt atctctgaat acgatcgatc    2520agatggaaac aacaaatttg tttgcgatac tgaagctata tataccata                2569
<210>10
<211>3879
<212>DNA
<213>拟南芥
<220>
<221>外显子
<222>(780)...(1685)
<223>外显子1
<221>外显子
<222>(1761)...(2129)
<223>外显子2
<221>外显子
<222>(2207)...(2461)
<223>外显子3
<221>外显子
<222>(2544)...(2671)
<223>外显子4
<221>外显子
<222>(2762)...(2959)
<223>外显子5
<221>外显子
<222>(3088)...(3448)
<223>外显子6
<400>10aaagatagta tttgttgata aatatgggga tatttatcct atattatctg tatttttctt    60accattttta ctctattcct ttatctacat tacgtcatta cactatcata agatatttga      120atgaacaaat tcatgcaccc accagctata ttaccctttt ttattaaaaa aaaacatctg      180ataataataa caaaaaaatt agagaaatga cgtcgaaaaa aaaagtaaga acgaagaaga      240agtgttaaac ccaaccaatt ttgacttgaa aaaaagcttc aacgctcccc ttttctcctt      300ctccgtcgct ctccgccgcg tcccaaatcc ccaattcctc ctcttctccg atcaattctt      360cccaagtaag cttcttcttc ctcgattctc tcctcagatt gtttcgtgac ttctttatat      420atattcttca cttccacagt tttcttctgt tgttgtcgtc gatctcaaat catagagatt      480gattaaccta attggtcttt atctagtgta atgcatcgtt attaggaact ttaaattaag      540atttaatcgt taatttcatg attcggattc gaattttact gttctcgaga ctgaaatatg      600caacctattt tttcgtaatc gttgtgatcg aattcgattc ttcagaattt atagcaattt      660tgatgctcat gatctgtcta cgctacgttc tcgtcgtaaa tcgaagttga taatgctatg      720tgtttgttac acaggtgtgt gtatgtgtga gagaggaact atagtgtaaa aaattcataa      780tggaagtctg caattgtatt gaaccgcaat ggccagcgga tgaattgtta atgaaatacc      840aatacatctc cgatttcttc attgcgattg cgtatttttc gattcctctt gagttgattt      900actttgtgaa gaaatcagcc gtgtttccgt atagatgggt acttgttcag tttggtgctt      960ttatcgttct ttgtggagca actcatctta ttaacttatg gactttcact acgcattcga     1020gaaccgtggc gcttgtgatg actaccgcga aggtgttaac cgctgttgtc tcgtgtgcta     1080ctgcgttgat gcttgttcat attattcctg atcttttgag tgttaagact cgggagcttt     1140tcttgaaaaa taaagctgct gagctcgata gagaaatggg attgattcga actcaggaag     1200aaaccggaag gcatgtgaga atgttgactc atgagattag aagcacttta gatagacata     1260ctattttaaa gactacactt gttgagcttg gtaggacatt agctttggag gagtgtgcat     1320tgtggatgcc tactagaact gggttagagc tacagctttc ttatacactt cgtcatcaac     1380atcccgtgga gtatacggtt cctattcaat taccggtgat taaccaagtg tttggtacta     1440gtagggctgt aaaaatatct cctaattctc ctgtggctag gttgagacct gtttctggga     1500aatatatgct aggggaggtg gtcgctgtga gggttccgct tctccacctt tctaattttc     1560agattaatga ctggcctgag ctttcaacaa agagatatgc tttgatggtt ttgatgcttc     1620cttcagatag tgcaaggcaa tggcatgtcc atgagttgga actcgttgaa gtcgtcgctg     1680atcaggtttt acattgctga gaatttctct tctttgctat gttcatgatc ttgtctataa     1740cttttcttct cttattatag gtggctgtag ctctctcaca tgctgcgatc ctagaagagt     1800cgatgcgagc tagggacctt ctcatggagc agaatgttgc tcttgatcta gctagacgag     1860aagcagaaac agcaatccgt gcccgcaatg atttcctagc ggttatgaac catgaaatgc     1920gaacaccgat gcatgcgatt attgcactct cttccttact ccaagaaacg gaactaaccc     1980ctgaacaaag actgatggtg gaaacaatac ttaaaagtag taaccttttg gcaactttga     2040tgaatgatgt cttagatctt tcaaggttag aagatggaag tcttcaactt gaacttggga     2100cattcaatct tcatacatta tttagagagg taacttttga acagctctat gtttcataag     2160tttatactat ttgtgtactt gattgtcata ttgaatcttg ttgcaggtcc tcaatctgat     2220aaagcctata gcggttgtta agaaattacc catcacacta aatcttgcac cagatttgcc     2280agaatttgtt gttggggatg agaaacggct aatgcagata atattaaata tagttggtaa     2340tgctgtgaaa ttctccaaac aaggtagtat ctccgtaacc gctcttgtca ccaagtcaga     2400cacacgagct gctgactttt ttgtcgtgcc aactgggagt catttctact tgagagtgaa     2460ggttattatc ttgtatcttg ggatcttata ccatagctga aagtatttct taggtcttaa     2520ttttgatgat tattcaaata taggtaaaag actctggagc aggaataaat cctcaagaca     2580ttccaaagat tttcactaaa tttgctcaaa cacaatcttt agcgacgaga agctcgggtg     2640gtagtgggct tggcctcgcc atctccaaga ggtttgagcc ttattaaaag acgttttttt     2700ccaacttttt cttgtcttct gtgttgttaa aagtttactc ataagcgttt aatatgacaa     2760ggtttgtgaa tctgatggag ggtaacattt ggattgagag cgatggtctt ggaaaaggat     2820gcacggctat ctttgatgtt aaacttggga tctcagaacg ttcaaacgaa tctaaacagt     2880cgggcatacc gaaagttcca gccattcccc gacattcaaa tttcactgga cttaaggttc     2940ttgtcatgga tgagaacggg ttagtataag cttctcacct ttctctttgc aaaatctctc     3000gccttacttc ttgcaaatgc agatattggc gtttagaaaa aacgcaaatt taatcttatg     3060agaaaccgat gattattttg gttgcagggt aagtagaatg gtgacgaagg gacttcttgt     3120acaccttggg tgcgaagtga ccacggtgag ttcaaacgag gagtgtctcc gagttgtgtc     3180ccatgagcac aaagtggtct tcatggacgt gtgcatgccc ggggtcgaaa actaccaaat     3240cgctctccgt attcacgaga aattcacaaa acaacgccac caacggccac tacttgtggc     3300actcagtggt aacactgaca aatccacaaa agagaaatgc atgagctttg gtctagacgg     3360tgtgttgctc aaacccgtat cactagacaa cataagagat gttctgtctg atcttctcga     3420gccccgggta ctgtacgagg gcatgtaaag gcgatggatg ccccatgccc cagaggagta     3480attccgctcc cgccttcttc tcccgtaaaa catcggaagc tgatgttctc tggtttaatt     3540gtgtacatat cagagattgt cggagcgttt tggatgatat cttaaaacag aaagggaata     3600acaaaataga aactctaaac cggtatgtgt ccgtggcgat ttcggttata gaggaacaag     3660atggtggtgg tataatcata ccatttcaga ttacatgttt gactaatgtt gtatccttat     3720atatgtagtt acattcttat aagaatttgg atcgagttat ggatgcttgt tgcgtgcatg     3780tatgacattg atgcagtatt atggcgtcag ctttgcgccg cttagtagaa caacaacaat     3840ggcgttactt agtttctcaa tcaacccgat ctccaaaac                            3879
<210>11
<211>1200
<212>DNA
<213>拟南芥
<220>
<221>CDS
<222>(53)...(1024)
<400>11cgttgctgtc gaagttaggc caagaaaccc atttaaaaaa aaagagagag agatggagag       60tttcccgatc atcaatctcg agaagcttaa tggagaagag agagcaatca ctatggagaa      120gatcaaagac gcttgtgaaa actggggctt ctttgagtgt gtgaaccatg ggatttcact      180cgagcttttg gacaaagtgg agaagatgac caaggaacat tacaagaagt gcatggaaga      240gagattcaag gaatcgatta agaacagagg tcttgactct cttcgctctg aagtcaacga      300cgttgactgg gaatccactt tctacctcaa gcaccttccc gtctctaata tctccgatgt      360ccctgatctc gacgacgatt acagaacgtt aatgaaagac ttcgccggaa agatagagaa      420gttgtcggag gagctactgg atctgctgtg cgagaatctc ggtttagaga agggttattt      480aaaaaaggtg ttttacgggt cgaaaagacc gacttttgga accaaagtca gcaattatcc      540accttgtcct aatccggacc tagtcaaggg tctccgagcc cacaccgacg ccggcggcat      600catcctcctc ttccaagacg acaaagtcag tggacttcag cttcttaaag acggcgagtg      660ggtcgatgtt cctccggtta agcattcaat cgtcgttaat ctcggcgatc aacttgaggt      720gataaccaat gggaagtaca agagtgtgga acatagagtg ctatctcaga cagacggaga      780aggaagaatg tcgatcgcat cattctataa tccgggaagc gactctgtta tttttccggt      840gccggagctg atcggaaaag aagcagagaa ggagaagaaa gagaactatc cgagatttgt      900gtttgaagat tacatgaaac tctactctgc tgtcaagttt caggccaagg aaccaaggtt      960tgaagccatg aaagctatgg agacaactgt ggccaacaat gttggaccat tggccactgc     1020gtgaatgata tgtaactggt taataaatat atatatatat atatatatag tctttatata     1080atgtcttaga aacttgatta ttcactatac gaataatttt gttcatgttg ttgtatgttt     1140aagtggtgaa tgtgttatat atgggaatta atgttttctg ttcgaaaaaa aaaaaaaaaa     1200
<210>12
<211>3438
<212>DNA
<213>拟南芥
<220>
<221>外显子
<222>(1212)...(1358)
<223>Exon 1
<221>exon
<222>(1461)...(1592)
<223>Exon 2
<221>外显子
<222>(1660)...(1820)
<223>外显子3
<221>外显子
<222>(1909)...(2893)
<223>外显子4
<400> 12gttacttttc aaatcttccc tcatattata tagccattga tatcatagag gatgtgagtt       60ttaacttaat atttacccgt ttgaaactag ctatttactt aaatatgaat tataatctag      120tttaactacc aaaaacatca tatggggaca agaaaaagta ataaaacgta tggaaaattt      180tgtagatgtt ataaatggat aattattcaa gtgataatct atcactttga tcttatctct      240ttatccaatt taattacttt gtctctaagt gatttgcttc caaaatctaa gtgtagtcta      300tcctatttct atcttatcct atcatataat cttctatata tatgtgagtc cgatgttgta      360aagcgtacga gagagagtaa tgaagagtga agtgttatat tgttctctcg tccacttcca      420ctctctcttt tatctcttac ttacttcttc gtaagatcat tacatataat aaataatatt      480atttatgttt gtgttatatt taataacagt aaaaagtttt aaaacgttga aaaaattagc      540cgacatagaa tacaaaagag ggttagcatc gggggagaaa cgtggaccaa catgatacac      600cctccaaaat agtccccaag ttgaaacatt gacatgtttc gctttttctt ttctgtgtat      660actttttttt tctgtgggtc acattattta atatttgtat acaagcagct attttacatg      720gagatttcct gtcggtatag cgtcctcatt tctccatcgc ttccactttt ttcctatact      780aatttgatct aattaattca tatgtcaaaa cattaagaaa atgaaactcg taattcatac      840ttgaatttaa tagattaatt aaaatgctat ttattggcaa aataaactcg gtttatatct      900aaattttaga atcactaaaa ctttttgccc aaaaaaaaat aaaaataaat cactaaaaca      960aaaaacaatc aaaagaaaac ccatgttggt aaatcggata atgaaaataa ttagaatccc     1020cgtcctttgt gtattttggc gtagcatgaa actatataat aaacatgcat tcattcttag     1080acttctcgta gcttatcaac aacaacgcgc tcgatctctc tcagcctgtc tgacaactct     1140ttctctagtt ctagagtttt caatttattg ttgagccttt tattaaaaaa aaaaaaacaa     1200gaacaaaaga aatggttcaa ttgtcaagaa aagctacatg caacagccat ggccaagtct     1260cttcgtattt ccttggttgg gaagagtacg agaagaatcc ttacgacgtt accaagaacc     1320ctcaaggcat tatccagatg ggtcttgcgg aaaatcaggt aaacaaatat tattcaacag     1380catgtgatat atatatactt atgtatatca tgacagagag actaatttaa agtatgttta     1440attttattgg atttctgtag ctatgctttg atctactaga gtcatggctt gcacaaaaca     1500cagacgcagc ctgtttcaag agagatggcc agtctgtttt ccgggaactc gctctctttc     1560aagactacca tggcctctct tccttcaaaa atgtaagatt attaattgta tttatcaaat     1620ttatttgtag gttgctgatc ttgctcgaat gattttcagg cctttgctga tttcatgtca     1680gaaaatagag gaaatcgagt ttcttttgat tcaaacaacc ttgtgctcac tgctggagcc     1740acttccgcaa acgagactct aatgttttgt cttgcagatc ccggtgacgc tttcttgctt     1800cccacgccat attatccagg gttagtccac tgtttgctta cacgtaaaat ttccatcatt     1860cctacgaact tgacttaact aaaactcatg tttatttttg tacttcaggt ttgataggga     1920tctaaaatgg cgaaccgggg ttgagattgt accaatccaa agctcaagta ctaacgggtt     1980tcgcataacg aaacttgcac tcgaagaagc ctacgagcaa gccaagaagc ttgacctaaa     2040cgtcaaagga atactcatca ccaacccatc taaccctttg ggtacgacaa caacccaaac     2100cgaactcaac attctatttg atttcatcac caagaataag aatatacatt tagtaagtga     2160cgagatatat tcgggcacag tattcaactc ttcagaattc atcagcgtca tggagattct     2220aaaaaataat caactcgaaa acaccgatgt tttgaaccga gtccacattg tttgtagctt     2280atctaaagat ctaggcctcc ctggttttag agttggagcc atttactcca atgacaaaga     2340tgtcatctct gccgctacaa aaatgtcaag tttcggcctt gtctcctccc agacacaata     2400cctactatcc tcattattat ctgacaagaa gttcactaag aactacctta gagagaacca     2460aaaacggctc aagaacagac agagaaagct cgtgttgggt ctagaggcca tcgggatcaa     2520atgtctgaag agtaatgcgg gactcttttg ttgggtcgac atgagacctc tccttagatc     2580taaaacgttc gaagcggaaa tggatctttg gaagaagatt gtttacgaag tgaagctcaa     2640catctctcct ggttcgtcgt gccattgtga agaaccgggt tggtttagag tttgtttcgc     2700gaacatgatt gatgagacat taaagcttgc tttaaagaga ttgaagatgt tggttgatga     2760tgaaaactca agtagaagat gccaaaagag taaaagcgaa agactaaacg gttcgaggaa     2820gaagacgatg tcaaatgtct ctaactgggt tttccgacta tcgtttcacg accgtgaggc     2880tgaggaacga tagtccggtt tttgttttga agttcttttt ttttgtttcc cacacattgc     2940aagtgattct gtaatttttt ttatcacgag agagagtgta aaaaaatgga aatgcaacgt     3000gcttactctg atcctagatt ttagaaaacc gttgaagact tcttagagca agtccatcgg     3060cagtttttaa tgggtttcta atgggtttct agctaattaa aagtccaaaa ttaaatgaaa     3120acccaactaa ataattagga tccatcccaa tattaggttt tttggatggg tttttagacg     3180gcgacgtggt cgactgtgag tcgtcggaaa acaaaaaaaa tcacaacact catgttttcc     3240tttttcctct cgtttttcac ttttttgttt tgtccgacgg ccggcgattc gaatcgattt     3300gatctccggt gtatcgaaca tgaaatcggg agagaagagc caaatcatcg acgacttggt     3360tcaccaattc cattcttcga accatactca tataagagtt tcttggcttc tctctaaaac     3420tcttctaatt ttctgata                                                   3438
<210>13
<211>68
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>含有DNA和RNA的有益寡核酸
<400>13caggtcaagt gcaacgtagg atgattttta ucaaccuacg ttgcacuuga ccuggcgcgt     60tttcgcgc                                                              68
<210>14
<211>68
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>含有DNA和RNA的有益寡核酸
<400>14caggtcaagtgctacgtagg atgattttta ucaaccuacg tagcacuuga ccuggcgcgt      60tttcgcgc                                                              68
<210>15
<211>24
<212>DNA
<213>水母
<400>15atggtgagca agggcgagga gctg                                            24
<210>16
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>突变
<400>16atggtgagca agggctagga gctg                                            24
<210>17
<211>24
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>突变
<400>17atggtgagca agggcaggag ctgt                                           24
<210>18
<211>68
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>含有DNA和RNA的有益寡核酸
<400>18gtgagcaagg gcgaggagct gttcattttu gaacagcucc tcgcccuugc ucacgcgcgt     60tttcgcgc                                                              68
<210>19
<211>68
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>含有DNA和RNA的有益寡核酸
<400>19tgagcaaggg ctcggagctg ttcacttttg ugaacagcuc cgagcccuug cucagcgcgt     60tttcgcgc                                                              68

Claims (72)

1.一种在植物细胞靶基因上产生定点突变的方法,包括以下步骤:
a.将一种重组诱发性寡核碱基附着在一种颗粒上,该寡核碱基包括一个第一同源区,该同源区具有一个与靶基因的第一个片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,和第二同源区,该同源区具有与所述靶基因的第二片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,以及一个插入区,该区至少含有一个与所述靶基因不同源的核碱基,该插入区连接所述第一同源区和第二同源区;
b.将所述颗粒导入一群植物细胞的细胞中;
c.从所述细胞群中鉴定在所述靶基因的第一和第二片段之间具有一个突变的细胞。
2.如权利要求1的方法,所述重组诱发性寡核碱基是MDON,而每一个同源区含有至少6个RNA-型核苷酸的RNA片段。
3.如权利要求2的方法,其中,所述插入区的长度至少为3个核苷酸。
4.如权利要求2的方法,还包括培养鉴定的细胞以便产生植物的步骤。
5.如权利要求2的方法,其中,所述第一RNA片段含有至少8个连续的2’-取代核糖核苷酸。
6.如权利要求5的方法,其中,所述第二RNA片段含有至少8个连续的2’-取代核糖核苷酸。
7.如权利要求2的方法,其中,所述突变靶基因的序列与MDON的序列同源。
8.如权利要求2的方法,其中,所述附着步骤是在含有1.1-1.4M氯化钠和18-22μM亚精胺和至少14μg/ml MDON的溶液中进行的。
9.如权利要求2的方法,其中,所述靶基因是第一ALS基因,第二ALS基因,psbA基因,苏氨酸脱水酶基因,二氢2,6-吡啶二羧酸合酶基因,或S14/rp59基因。
10.如权利要求9的方法,其中,所述植物细胞是玉米、小麦、稻或莴苣细胞。
11.如权利要求9的方法,其中,所述植物细胞是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花细胞。
12.如权利要求2的方法,其中,所述靶基因选自编码以下酶的基因:酸性转化酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、多酚氧化酶、O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶、etr-1或其同系物、ACC合酶和ACC氧化酶。
13.如权利要求12的方法,所述植物细胞源于玉米、小麦、稻或莴苣植物。
14.如权利要求12的方法,其中,所述植物细胞源于马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花植物。
15.如权利要求2的方法,还包括由所述植物或所述植物的后代生产种子。
16.一种在具有细胞壁的植物细胞靶基因上产生定点突变的方法包括以下步骤:
a.在一群植物细胞的细胞壁上开孔;
b.导入一种重组诱发性寡核碱基,该寡核碱基包括一个第一同源区,该同源区具有一个与靶基因的第一个片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,和一个第二同源区,该同源区具有与所述靶基因的第二片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,以及一个插入序列,该序列具有与所述靶基因不同源的至少一个核碱基,该插入区连接所述第一同源区和第二同源区;
c.从所述细胞群中鉴定在所述靶基因的第一和第二片段之间具有一个突变的细胞。
17.如权利要求16的方法,其中,所述重组诱发性寡核碱基是MDON,而每一个同源区含有一个至少有6个RNA-型核苷酸的RNA片段。
18.如权利要求17的方法,还包括培养鉴定的细胞以便产生植物的步骤。
19.如权利要求17的方法,其中,位于所述第一和第二片段之间的靶基因的序列与MDON的插入区的序列在一个错配核苷酸上不同,而所述靶基因的突变位于靠近所述错配核苷酸处。
20.如权利要求17的方法,其中,位于所述第一和第二片段之间的靶基因的序列与MDON的突变片段的序列在一个错配核苷酸处不同,而所述靶基因的突变位于所述错配核苷酸处。
21.如权利要求17的方法,其中,所述靶基因是第一ALS基因,第二ALS基因,psbA基因,苏氨酸脱水酶基因,二氢2,6-吡啶二羧酸合酶基因,或S14/rp59基因。
22.如权利要求21的方法,其中,所述植物细胞是玉米、小麦、稻或莴苣细胞。
23.如权利要求21的方法,其中,所述植物细胞是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花细胞。
24.如权利要求17的方法,其中,所述靶基因选自编码以下酶的基因:酸性转化酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、多酚氧化酶、O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶、etr-1或其同系物、ACC合酶和ACC氧化酶的基因。
25.如权利要求24的方法,其中,所述靶基因是源于玉米、小麦、稻或莴苣植物的基因。
26.如权利要求24的方法,其中,所述靶基因是源于马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花植物的基因。
27.如权利要求17的方法,还包括由所述植物或所述植物的后代生产种子。
28.一种在植物细胞质体的靶基因上产生定点突变的方法,包括以下步骤:
a.导入一种重组诱发性寡核碱基,该寡核碱基包括一个第一同源区,该同源区具有一个与靶基因的第一个片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,和一个第二同源区,该同源区具有与所述靶基因的第二片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,以及一个插入区,该区具有与所述靶基因不同源的至少一个核碱基,该插入区连接所述第一同源区和第二同源区;
b.从所述细胞群中鉴定在所述靶基因的第一和第二片段之间具有一个突变的细胞。
29.如权利要求28的方法,其中,所述重组诱发性寡核碱基是MDON,而每一个同源区含有一个至少有6个RNA-型核苷酸的RNA片段。
30.如权利要求29的方法,还包括培养鉴定的细胞以便产生植物的步骤。
31.一种在植物细胞靶基因上产生定点的非选择性突变的方法,包括以下步骤:
a.将第一重组诱发性寡核碱基和第二重组诱发性寡核碱基的混合物导入一群细胞的细胞中,其中:
i.所述第一重组诱发性寡核碱基包括第一同源区,该同源区具有与第一靶基因的第一片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,和第二同源区,该同源区具有与所述第一靶基因的第二片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,以及一个插入区,该区至少含有一个与所述靶基因不同源的核碱基,该插入区连接所述第一同源区和第二同源区,和
ii.所述第二重组诱发性寡核碱基包括第一同源区,该同源区具有与第二靶基因的第一片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,和第二同源区,该同源区具有与所述第二靶基因的第二片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,以及一个插入区,该区至少含有一个与所述靶基因不同源的核碱基,该插入区连接所述第一同源区和第二同源区;
b.从所述细胞群中筛选在所述第一靶基因的第一和第二片段之间具有一个选择性突变的细胞;和
c.鉴定在所述第二靶细胞的第一和第二片段之间具有一个非选择性突变的选定细胞。
32.如权利要求31的方法,其中,所述重组诱发性寡核碱基是MDON,而每一个同源区含有一个至少有6个RNA-型核苷酸的RNA片段。
33.如权利要求32的方法,其中,所述靶基因是第一ALS基因,第二ALS基因,psbA基因,苏氨酸脱水酶基因,二氢2,6-吡啶二羧酸合酶基因,或S14/rp59基因。
34.如权利要求33的方法,其中,所述植物细胞是玉米、小麦、稻或莴苣细胞。
35.如权利要求33的方法,其中,所述植物细胞是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花细胞。
36.如权利要求32的方法,其中,所述第二靶基因选自编码以下酶的基因:酸性转化酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、多酚氧化酶、O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶、etr-1或其同系物、ACC合酶和ACC氧化酶。
37.如权利要求36的方法,其中,所述植物细胞是玉米、小麦、稻或莴苣细胞。
38.如权利要求36的方法,其中,所述植物细胞是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花细胞。
39.如权利要求32的方法,还包括培养鉴定的细胞以便产生植物的步骤。
40.如权利要求39的方法,还包括由所述植物或所述植物的后代生产种子。
41.如权利要求31的方法,其中,所述第二重组诱发性寡核碱基是异源双链重组诱发性寡核碱基,并且所述第二重组诱发性寡核碱基的每一个同源区包括一个有至少6个RNA-型核苷酸的RNA片段。
42.如权利要求41的方法,其中,所述靶基因是第一ALS基因,第二ALS基因,psbA基因,苏氨酸脱水酶基因,二氢2,6-吡啶二羧酸合酶基因,或S14/rp59基因。
43.如权利要求42的方法,其中,所述植物细胞是玉米、小麦、稻或莴苣细胞。
44.如权利要求42的方法,其中,所述植物细胞是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花细胞。
45.如权利要求41的方法,其中,所述靶基因选自编码以下酶的基因:酸性转化酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、多酚氧化酶、O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶、etr-1或其同系物、ACC合酶和ACC氧化酶。
46.如权利要求36、45的方法,其中,所述第二靶基因源于玉米、小麦、稻或莴苣植物。
47.如权利要求36、45的方法,其中,所述第二靶基因源于马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花植物。
48.如权利要求41的方法,还包括培养鉴定的细胞以便产生植物的步骤。
49.如权利要求48的方法,还包括由所述植物或所述植物的后代生产种子。
50.一种在植物细胞靶基因上产生定点突变的方法,包括以下步骤:
a.用纤维素酶消化植物部分,以便形成植物细胞原生质体;
b.将所述原生质体悬浮在含有重组诱发性寡核碱基的溶液中,该寡核碱基含有第一同源区,该同源区具有与所述靶基因的第一片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,和第二同源区,该同源区具有与所述靶基因的第二片段的至少6个碱基对的序列相同的序列,以及一个插入区,该区包括至少一个与所述靶基因不同源的核碱基,该插入区连接所述第一同源区和第二同源区;
c.对所述悬浮液进行电穿孔,以便所述重组诱发性寡核碱基进入该悬浮液的原生质体中;
d.培养所述原生质体;和
e.鉴定所述在所述靶基因的第一和第二片段之间具有一个突变的原生质体的后代。
51.如权利要求50的方法,还包括培养鉴定的后代以便产生植物的步骤。
52.如权利要求50的方法,所述重组诱发性寡核碱基是MDON,而每一个同源区含有至少6个RNA-型核苷酸的RNA片段。
53.如权利要求50的方法,其中,所述重组诱发性寡核碱基是异源双链重组诱发性寡核碱基。
54.一种在一个基因上具有点突变的植物或种子,该突变在其野生型遗传位点上,所述基因选自编码以下酶的基因:酸性转化酶、UDP-葡萄糖焦磷酸化酶、多酚氧化酶、O-甲基转移酶、肉桂醇脱氢酶、ACC合酶和ACC氧化酶或etr-1或其同系物的基因,而所述突变23KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列,该点突变产生一个终止密码子或者是一种移码突变。
55.如权利要求54的植物或种子,其中,所述点突变产生一个终止密码子。
56.如权利要求55的植物或种子,其中,所述选择性突变40KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
57.如权利要求55的植物或种子,其中,所述选择性突变100KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
58.如权利要求55的植物或种子,其中,所述点突变是单碱基对突变。
59.如权利要求55的植物或种子,它是玉米、小麦、稻或莴苣植物或种子。
60.如权利要求55的植物或种子,它是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花植物或种子。
61.如权利要求55的植物或种子,在第二个基因上还具有一个选择性点突变,选择性点突变23KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
62.如权利要求61的植物或种子,其中,所述选择性突变40KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
63.如权利要求61的植物或种子,其中,所述选择性突变100KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
64.如权利要求54的植物或种子,其中,所述点突变是移码突变。
65.如权利要求64的植物或种子,其中,所述选择性突变40KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
66.如权利要求64的植物或种子,其中,所述选择性突变100KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
67.如权利要求64的植物或种子,其中,所述点突变是单碱基对突变。
68.如权利要求64的植物或种子,它是玉米、小麦、稻或莴苣植物或种子。
69.如权利要求64的植物或种子,它是马铃薯、番茄、油菜、大豆或棉花植物或种子。
70.如权利要求64的植物或种子,在第二个基因上还具有一个选择性点突变,选择性点突变23KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
71.如权利要求70的植物或种子,其中,所述选择性突变40KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
72.如权利要求70的植物或种子,其中,所述选择性突变100KB以内的基因组DNA序列是野生型DNA序列。
CNB988098679A 1997-08-05 1998-08-05 用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传改变的用途 Expired - Lifetime CN100419083C (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US5483697P 1997-08-05 1997-08-05
US60/054,836 1997-08-05
US60/054836 1997-08-05

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN1273606A true CN1273606A (zh) 2000-11-15
CN100419083C CN100419083C (zh) 2008-09-17

Family

ID=21993832

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CNB988098679A Expired - Lifetime CN100419083C (zh) 1997-08-05 1998-08-05 用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传改变的用途

Country Status (9)

Country Link
US (4) US7094606B2 (zh)
EP (1) EP1007712A4 (zh)
JP (1) JP2001512687A (zh)
KR (1) KR20010022652A (zh)
CN (1) CN100419083C (zh)
AU (1) AU748015B2 (zh)
CA (1) CA2298886A1 (zh)
NZ (1) NZ502929A (zh)
WO (1) WO1999007865A1 (zh)

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103119169A (zh) * 2010-06-09 2013-05-22 拜尔作物科学公司 植物基因组改造中常用的在核苷酸序列上修饰植物基因组的方法和工具
CN103333885A (zh) * 2003-06-23 2013-10-02 先锋高级育种国际公司 将单基因控制的保绿潜力工程化进植物中
CN111218434A (zh) * 2020-03-09 2020-06-02 山东省农业科学院作物研究所 小麦籽粒多酚氧化酶基因Ppo1突变体及其应用
CN111454955A (zh) * 2020-04-27 2020-07-28 广西壮族自治区林业科学研究院 源于尾叶桉CAD基因序列的RNAi片段及其应用
CN118979118A (zh) * 2024-07-31 2024-11-19 四川省农业科学院农产品加工研究所(四川省农业科学院食物与营养健康研究所) 预测马铃薯褐变敏感性的生物标志物及其应用方法

Families Citing this family (128)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7102055B1 (en) 1997-11-18 2006-09-05 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods for the targeted insertion of a nucleotide sequence of interest into the genome of a plant
AU1526199A (en) 1997-11-18 1999-06-07 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Targeted manipulation of herbicide-resistance genes in plants
AU760113C (en) 1997-11-18 2004-04-22 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods for genetic modification of plants
CN1314945A (zh) * 1998-08-12 2001-09-26 麦克西根股份有限公司 用dna改组生产除草剂选择性作物
US7659386B2 (en) 2000-08-03 2010-02-09 Ceres, Inc. Nucleic acid sequences encoding transcription factor proteins
US8710201B2 (en) 1999-12-08 2014-04-29 Ceres, Inc. Nucleic acid sequences encoding strictosidine synthase proteins
US7365183B2 (en) 2001-01-03 2008-04-29 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding SRF-type transcription factor proteins
US8299231B2 (en) 1999-03-09 2012-10-30 Ceres, Inc. Nucleic acid sequences encoding AN1-like zinc finger proteins
US8710204B2 (en) 1999-02-25 2014-04-29 Ceres, Inc. Nucleic acid sequences encoding secE/sec61-gamma subunits of protein translocation complexes
US9000140B2 (en) 1999-03-05 2015-04-07 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding AN1-like zinc finger proteins
US7148400B1 (en) 1999-04-20 2006-12-12 Bayer Bioscience N.V. Methods and means for delivering inhibitory RNA to plants and applications thereof
US7420049B2 (en) 1999-06-18 2008-09-02 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding AP2 domain proteins
US7399850B2 (en) 1999-06-18 2008-07-15 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding AP2 domain proteins
US6271360B1 (en) * 1999-08-27 2001-08-07 Valigen (Us), Inc. Single-stranded oligodeoxynucleotide mutational vectors
AR025996A1 (es) 1999-10-07 2002-12-26 Valigen Us Inc Plantas no transgenicas resistentes a los herbicidas.
WO2001025460A2 (en) * 1999-10-07 2001-04-12 Valigen, Inc. Compositions and methods for plant genetic modification
US6297056B1 (en) * 1999-10-12 2001-10-02 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Brassica transformation via microprojectile bombardment
US7420046B2 (en) 1999-11-10 2008-09-02 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding RNA polymerase proteins
US7355026B2 (en) 2000-01-27 2008-04-08 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding SRF-type transcription factor proteins
US20060252920A1 (en) 2001-08-10 2006-11-09 Nickolai Alexandrov Sequence-determined DNA fragments encoding cyclopropyl isomerase proteins
US6936467B2 (en) * 2000-03-27 2005-08-30 University Of Delaware Targeted chromosomal genomic alterations with modified single stranded oligonucleotides
US7691991B2 (en) 2000-04-17 2010-04-06 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding cytochrome P450 proteins
US9085771B2 (en) 2001-01-03 2015-07-21 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments with regulatory functions
US7390893B2 (en) 2000-08-07 2008-06-24 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding peptide transport proteins
US10106586B2 (en) 2000-08-07 2018-10-23 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding peptide transport proteins
ATE497007T1 (de) 2000-08-25 2011-02-15 Basf Plant Science Gmbh Polynukleotide, die für prenylproteasen aus pflanzen kodieren
US7608441B2 (en) 2000-08-31 2009-10-27 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding sterol desaturase proteins
US9024004B2 (en) 2000-08-31 2015-05-05 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding acetohydroxyacid synthase proteins
US6875907B2 (en) 2000-09-13 2005-04-05 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Antimicrobial peptides and methods of use
US7560622B2 (en) 2000-10-06 2009-07-14 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methods and compositions relating to the generation of partially transgenic organisms
US7604971B2 (en) 2000-10-19 2009-10-20 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding UBIE/COQ5 methyltransferase family proteins
WO2002061101A2 (en) * 2000-11-03 2002-08-08 Monsanto Technology Llc Method of imparting disease resistance to plants by reducing polyphenol oxidase activity
US7385046B2 (en) 2001-01-03 2008-06-10 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding ethylene responsive element binding proteins
US7368555B2 (en) 2001-01-03 2008-05-06 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding EF-hand calcium-binding proteins
US7604976B2 (en) 2001-04-02 2009-10-20 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding glutamine amidotransferase proteins
US9068173B2 (en) 2002-06-17 2015-06-30 Ceres, Inc. Sequence-determined DNA fragments encoding trehalose-6P phosphatase proteins
KR20040031463A (ko) * 2002-10-07 2004-04-13 (주)메트로디알엠 디지털 콘텐츠에 대한 패키징 방법 및 그 시스템
US6929917B2 (en) 2002-11-18 2005-08-16 Pregentis Method for cloning of a rare, specifically mutated cell
US6921643B2 (en) 2003-02-05 2005-07-26 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for detecting a sequence mutation in the cinnamyl alcohol dehydrogenase gene associated with altered lignification in loblolly pine
EP2982240B1 (en) * 2003-08-29 2019-07-31 Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria Rice plants having increased tolerance to imidazolinone herbicides
WO2005094370A2 (en) * 2004-03-29 2005-10-13 The General Hospital Corporation Oligonucleotide complex compositions and methods of use as gene alteration tools
US20060059585A1 (en) 2004-09-14 2006-03-16 Boris Jankowski Modulating plant sugar levels
MX2007007948A (es) 2004-12-28 2007-09-11 Pioneer Hi Bred Int Calidad de grano mejorada a traves de la expresion alterada de las proteinas de semilla.
BRPI0519985B1 (pt) 2005-02-23 2018-01-30 University Of Kentucky Research Foundation Método para redução do nível de nornicotina ou n’-nitrosonornicotina em uma planta do gênero nicotiana ou parte desta ou em um produto de tabaco, cassete de expressão e método para a produção de uma planta do gênero nicotiana
CA2605643C (en) 2005-05-02 2012-07-24 Purdue Research Foundation Methods for increasing the yield of fermentable sugars from plant stover
CA2614915A1 (en) 2005-05-25 2006-11-30 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Methods for improving crop plant architecture and yield
WO2007008604A2 (en) 2005-07-08 2007-01-18 Bristol-Myers Squibb Company Single nucleotide polymorphisms associated with dose-dependent edema and methods of use thereof
CA2629521A1 (en) 2005-11-10 2007-05-24 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Dof (dna binding with one finger) sequences and methods of use
US20070199096A1 (en) 2005-11-14 2007-08-23 E.I. Du Pont De Nemours And Company Compositions and Methods for Altering Alpha- and Beta-Tocotrienol Content
US7592505B2 (en) 2005-12-30 2009-09-22 Pioneer Hi-Bred International, Inc. UDP-xylose synthases (UXS) polynucleotides, polypeptides, and uses thereof
NZ704098A (en) 2006-01-12 2015-02-27 Incima Ipco B V Epsps mutants
AU2007212168A1 (en) 2006-02-09 2007-08-16 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Genes for enhancing nitrogen utilization efficiency in crop plants
AR060523A1 (es) 2006-04-19 2008-06-25 Pioneer Hi Bred Int Moleculas de polinucleotidos aislados que corresponden a alelos mutantes y tipo salvaje del gen de maiz d9 y metodos para usarlas
CA2656557C (en) 2006-06-28 2015-08-11 Cibus, Llc Fatty acid blends and uses therefor
US7642049B2 (en) 2006-06-30 2010-01-05 Bristol-Myers Squibb Company Method for identifying HIV-1 protease inhibitors with reduced metabolic affects through detection of human resistin polymorphisms
US7572618B2 (en) 2006-06-30 2009-08-11 Bristol-Myers Squibb Company Polynucleotides encoding novel PCSK9 variants
EA021541B9 (ru) * 2007-04-04 2017-04-28 Басф Плант Сайенс Гмбх Рекомбинантный или мутантный полинуклеотид для придания растениям толерантности к гербицидам, ингибирующим ацетогидроксикислотную синтазу (ahas) (варианты), растение, не встречающееся в природе, и его семена, способ борьбы с сорняками, способ получения трансгенного растения, толерантного к соединениям, ингибирующим ahas, способ идентификации или отбора клетки растения, ткани растения или растения или части растения, способ предотвращения нежелательного вегетативного роста и способ идентификации растения
NZ597327A (en) * 2007-04-04 2014-02-28 Basf Se Herbicide-resistant brassica plants and methods of use
AU2008257572A1 (en) 2007-05-25 2008-12-04 Cropdesign N.V. Yield enhancement in plants by modulation of maize Alfins
AU2015275307B2 (en) * 2007-10-05 2018-01-18 Cibus Europe B.V. Mutated acetohydroxyacid synthase genes in Brassica
CN115044593A (zh) 2007-10-05 2022-09-13 赛布斯欧洲公司 芸苔属中突变的乙酰羟酸合酶基因
BRPI0820042B1 (pt) 2007-11-12 2020-05-19 North Carolina State University método de obtenção de uma planta de tabaco, ou célula ou parte desta, tendo níveis reduzidos de nornicotina, produto de tabaco, método para fabricar um produto de tabaco, polinucleotídeo isolado, cassete de expressão, polipetpídeo isolado e método de obtenção de uma planta, ou parte de planta desta, do gênero nicotiana
CN103952415A (zh) 2007-11-20 2014-07-30 先锋国际良种公司 用于改善植物应激耐性的玉米乙烯信号转导基因及其调节
DK2234994T3 (da) * 2007-12-27 2017-11-13 Cibus Europe Bv Fedtsyre-butylester-blandinger
WO2009140685A2 (en) 2008-05-16 2009-11-19 Bristol-Myers Squibb Company Methods for identifying subjects with an increased likelihood of responding to dpp-iv inhibitors
KR20180021928A (ko) 2008-05-23 2018-03-05 누셀리스 엘엘씨 효모를 사용한 스쿠알렌 생산
NZ592464A (en) 2008-09-26 2013-05-31 Basf Agrochemical Products Bv Herbicide resistant acetohydroxyacid synthase large subunit (AHAS) mutants and methods of use thereof
MX2011003616A (es) 2008-10-30 2011-08-15 Pioneer Hi Bred Int Manipulacion de glutamina sintetasas (gs) para mejorar la eficiencia de uso de nitrogeno y rendimiento de grano en plantas superiores.
US8431775B2 (en) 2008-12-04 2013-04-30 Pioneer Hi Bred International Inc Methods and compositions for enhanced yield by targeted expression of knotted1
CA2749163A1 (en) 2009-01-14 2010-07-22 The Salk Institute For Biological Studies Methods for screening and compounds that protect against amyloid diseases
DE112010000876T5 (de) * 2009-02-03 2012-09-13 Wisconsin Alumni Research Foundation Steuerung Kälte-induzierten Süßens und Verringerung von Acrylamid-Niveaus in Kartoffeln oder Süßkartoffeln
US8716553B2 (en) 2009-03-02 2014-05-06 Pioneer Hi Bred International Inc NAC transcriptional activators involved in abiotic stress tolerance
WO2010120862A1 (en) 2009-04-14 2010-10-21 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Modulation of acc synthase improves plant yield under low nitrogen conditions
CN102439032B (zh) 2009-05-04 2015-07-22 先锋国际良种公司 通过调节ap2转录因子增加植物中的产量
MX2012001080A (es) 2009-07-24 2012-03-26 Pionner Hi Bred International Inc Uso de agrupaciones de componentes del dominio de dimerizacion para modular la arquitectura de las plantas.
US20110035843A1 (en) 2009-08-05 2011-02-10 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Novel eto1 genes and use of same for reduced ethylene and improved stress tolerance in plants
MX2012003972A (es) 2009-10-02 2012-05-08 Pionner Hi Bred International Inc Regulacion a la baja de acc sintasa para mejorar el rendimiento de las plantas.
DK2504421T3 (en) 2009-11-23 2017-05-22 Nucelis Inc METHODS AND COMPOSITIONS FOR PREPARING SQUAL USING Yeast
MX2012007681A (es) 2009-12-31 2013-01-29 Pioneer Hi Bred Int Ingenieria de resistencia de plantas a enfermedades causadas por patogenos.
CA2786741A1 (en) 2010-01-06 2011-07-14 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Identification of diurnal rhythms in photosynthetic and non-photosynthetic tissues from zea mays and use in improving crop plants
EP2529028A1 (en) 2010-01-26 2012-12-05 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Polynucleotide and polypeptide sequences associated with herbicide tolerance
EA028014B1 (ru) * 2010-03-17 2017-09-29 Басф Агрокемикэл Продактс Б.Ф. Гербицидостойкие растения
MX2012012672A (es) 2010-05-06 2012-12-17 Du Pont Gen y proteina acc sintasa 3 de maiz y sus usos.
US20120122223A1 (en) 2010-08-03 2012-05-17 Cibus Us Llc Mutated protoporphyrinogen ix oxidase (ppx) genes
UA112969C2 (uk) 2010-08-03 2016-11-25 Сібас Юс Ллс Рослина, стійка до одного або більше ррх-інгібуючих гербіцидів, яка містить мутантний ген протопорфіриноген ix оксидази (ррх)
US9187762B2 (en) 2010-08-13 2015-11-17 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods comprising sequences having hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD) activity
CN101948861B (zh) * 2010-08-26 2012-07-04 北京大学 植物雄性不育系及其恢复系的培育方法
EP2426204A1 (en) 2010-09-02 2012-03-07 Ludwig-Maximilians-Universität München Spontaneous nodule organogenesis in plants
WO2012028673A1 (en) 2010-09-02 2012-03-08 Ludwig-Maximilians-Universitaet Muenchen Spontaneous organogenesis in plants
US9677084B2 (en) 2011-04-29 2017-06-13 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Down-regulation of a homeodomain-leucine zipper I-class homeobox gene for improved plant performance
EP2721160A2 (en) 2011-06-14 2014-04-23 Synthon Biopharmaceuticals B.V. Compositions and methods for making and biocontaining auxotrophic transgenic plants
US9303270B2 (en) 2011-07-22 2016-04-05 Ricetec Aktiengesellschaft Rice resistant to HPPD and accase inhibiting herbicides
US9370149B2 (en) 2011-07-22 2016-06-21 Ricetec Aktiengesellschaft Methods and compositions to produce rice resistant to accase inhibitors
BR112014010537A2 (pt) 2011-10-31 2017-05-02 Pioneer Hi Bred Int método para modular a sensibilidade ao etileno, planta transgênica, proteína isolada, sequência de polinucleotídeos isolada, polipeptídeo com atividade regulatória de etileno, método para aumentar o rendimento em uma planta, método para melhorar um parâmetro agronômico de uma planta, método de seleção assistida por marcador de uma planta
CA2867385A1 (en) 2012-03-13 2013-09-19 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Genetic reduction of male fertility in plants
WO2013138309A1 (en) 2012-03-13 2013-09-19 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Genetic reduction of male fertility in plants
US10045499B2 (en) 2012-05-24 2018-08-14 Iowa State University Research Foundation, Inc. Arabidopsis nonhost resistance gene(s) and use thereof to engineer disease resistant plants
US20150351390A1 (en) 2012-12-21 2015-12-10 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Compositions and methods for auxin-analog conjugation
WO2014164014A1 (en) 2013-03-11 2014-10-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Genes for improving nutrient uptake and abiotic stress tolerance in plants
US9803214B2 (en) 2013-03-12 2017-10-31 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Breeding pair of wheat plants comprising an MS45 promoter inverted repeat that confers male sterility and a construct that restores fertility
WO2014164074A1 (en) 2013-03-13 2014-10-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Enhanced nitrate uptake and nitrate translocation by over-expressing maize functional low-affinity nitrate transporters in transgenic maize
WO2014164116A1 (en) 2013-03-13 2014-10-09 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Functional expression of bacterial major facilitator superfamily (sfm) gene in maize to improve agronomic traits and grain yield
CN105143248A (zh) 2013-03-14 2015-12-09 先锋国际良种公司 玉蜀黍胁迫相关转录因子18及其用途
CN114703210B (zh) 2013-03-14 2025-01-28 希博斯美国有限公司 突变的丙二烯氧合酶2(aos2)基因
CA2903297A1 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Modulation of acc deaminase expression
CN105143454A (zh) 2013-03-15 2015-12-09 先锋国际良种公司 Acc氧化酶多核苷酸和多肽的组合物和使用方法
US20140279540A1 (en) * 2013-03-15 2014-09-18 Fulcrum Ip Corporation Systems and methods for a private sector monetary authority
PL2966984T3 (pl) 2013-03-15 2022-06-13 Cibus Us Llc Ukierunkowana modyfikacja genu z użyciem naprawy genu, w której pośredniczy oligonukleotyd
ES2921207T3 (es) 2013-03-15 2022-08-19 Cibus Us Llc Procedimientos y composiciones para aumentar la eficiencia de la modificación genética direccionada utilizando la reparación genética mediada por oligonucleótidos
US9957515B2 (en) 2013-03-15 2018-05-01 Cibus Us Llc Methods and compositions for targeted gene modification
WO2015006105A1 (en) 2013-07-09 2015-01-15 Board Of Trustees Of Michigan State University Transgenic plants produced with a k-domain, and methods and expression cassettes related thereto
US11459579B2 (en) 2013-07-09 2022-10-04 Board Of Trustees Of Michigan State University Transgenic plants produced with a K-domain, and methods and expression cassettes related thereto
HRP20240186T1 (hr) 2014-03-14 2024-05-10 Cibus Us Llc Postupci i kompozicije za povećanje efikasnosti ciljane modifikacije gena korištenjem reparacije gena posredovane oligonukleotidima
CN106455511A (zh) * 2014-06-17 2017-02-22 杰·尔·辛普洛公司 马铃薯栽培品种w8
JP6702957B2 (ja) 2014-10-06 2020-06-03 アルトリア クライアント サービシーズ リミテッド ライアビリティ カンパニー タバコ植物における腋芽成長の遺伝的制御法
CA2971425A1 (en) 2014-12-16 2016-06-23 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Restoration of male fertility in wheat
US10676755B2 (en) * 2015-01-10 2020-06-09 Cibus Us Llc Mutated acetohydroxyacid synthase genes in euphorbiaceae and plant material comprising such genes
KR20180116769A (ko) 2016-02-09 2018-10-25 시버스 유에스 엘엘씨 올리고뉴클레오타이드 매개 유전자 보수를 사용한 표적화된 유전자 변형의 효율을 증가시키기 위한 방법 및 조성물
US10731173B2 (en) 2016-03-11 2020-08-04 Altria Client Services Llc Compositions and methods for producing tobacco plants and products having reduced or eliminated suckers
EP4086348A1 (en) 2016-08-05 2022-11-09 Ricetec, Inc. Methods and compositions for combinations of mutations associated with herbicide resistance/tolerance in rice
WO2018067985A1 (en) 2016-10-07 2018-04-12 Altria Client Services Llc Composition and methods for producing tobacco plants and products having reduced tobacco-specific nitrosamines (tsnas)
WO2018140214A1 (en) 2017-01-24 2018-08-02 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Nematicidal protein from pseudomonas
JP2020533000A (ja) 2017-09-11 2020-11-19 アルトリア クライアント サーヴィシーズ リミテッド ライアビリティ カンパニー 吸枝が減少又は消失したタバコ植物及びタバコ製品を生産する組成物及び方法
AU2019207703B2 (en) 2018-01-09 2024-11-14 Cibus Europe B.V. Shatterproof genes and mutations
EP3773017B1 (en) 2018-04-03 2022-06-08 Altria Client Services LLC Composition and methods for producing tobacco plants and products having increased phenylalanine and reduced tobacco-specific nitrosamines (tsnas)
WO2020154466A1 (en) 2019-01-24 2020-07-30 Altria Client Services Llc Tobacco plants comprising reduced nicotine and reduced tobacco specific nitrosamines
US20230265451A1 (en) * 2020-08-12 2023-08-24 Greenvenus Llc Rapid generation of plants with desired traits
CN118019447A (zh) 2021-08-06 2024-05-10 Kws蔬菜有限责任公司 菠菜对霜霉病的持久抗性

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5231019A (en) * 1984-05-11 1993-07-27 Ciba-Geigy Corporation Transformation of hereditary material of plants
US5100792A (en) 1984-11-13 1992-03-31 Cornell Research Foundation, Inc. Method for transporting substances into living cells and tissues
US4945050A (en) 1984-11-13 1990-07-31 Cornell Research Foundation, Inc. Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor
US5013659A (en) 1987-07-27 1991-05-07 E. I. Du Pont De Nemours And Company Nucleic acid fragment encoding herbicide resistant plant acetolactate synthase
US5378824A (en) 1986-08-26 1995-01-03 E. I. Du Pont De Nemours And Company Nucleic acid fragment encoding herbicide resistant plant acetolactate synthase
US5302523A (en) 1989-06-21 1994-04-12 Zeneca Limited Transformation of plant cells
US5204253A (en) * 1990-05-29 1993-04-20 E. I. Du Pont De Nemours And Company Method and apparatus for introducing biological substances into living cells
US5384253A (en) 1990-12-28 1995-01-24 Dekalb Genetics Corporation Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes
AU692791B2 (en) * 1993-10-12 1998-06-18 Agrigenetics, Inc. Brassica napus variety AG019
EP0733059B1 (en) * 1993-12-09 2000-09-13 Thomas Jefferson University Compounds and methods for site-directed mutations in eukaryotic cells
US5684232A (en) * 1994-12-23 1997-11-04 Lubrizol Corp. High stability peanut
US5731181A (en) * 1996-06-17 1998-03-24 Thomas Jefferson University Chimeric mutational vectors having non-natural nucleotides
US5760012A (en) 1996-05-01 1998-06-02 Thomas Jefferson University Methods and compounds for curing diseases caused by mutations
GB9711015D0 (en) * 1997-05-28 1997-07-23 Zeneca Ltd Improvements in or relating to organic compounds
AU1526199A (en) * 1997-11-18 1999-06-07 Pioneer Hi-Bred International, Inc. Targeted manipulation of herbicide-resistance genes in plants
US6010907A (en) 1998-05-12 2000-01-04 Kimeragen, Inc. Eukaryotic use of non-chimeric mutational vectors

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103333885A (zh) * 2003-06-23 2013-10-02 先锋高级育种国际公司 将单基因控制的保绿潜力工程化进植物中
CN103119169A (zh) * 2010-06-09 2013-05-22 拜尔作物科学公司 植物基因组改造中常用的在核苷酸序列上修饰植物基因组的方法和工具
CN111218434A (zh) * 2020-03-09 2020-06-02 山东省农业科学院作物研究所 小麦籽粒多酚氧化酶基因Ppo1突变体及其应用
CN111218434B (zh) * 2020-03-09 2022-01-04 山东省农业科学院作物研究所 小麦籽粒多酚氧化酶基因Ppo1突变体及其应用
CN111454955A (zh) * 2020-04-27 2020-07-28 广西壮族自治区林业科学研究院 源于尾叶桉CAD基因序列的RNAi片段及其应用
CN111454955B (zh) * 2020-04-27 2023-05-12 广西壮族自治区林业科学研究院 源于尾叶桉CAD基因序列的RNAi片段及其应用
CN118979118A (zh) * 2024-07-31 2024-11-19 四川省农业科学院农产品加工研究所(四川省农业科学院食物与营养健康研究所) 预测马铃薯褐变敏感性的生物标志物及其应用方法

Also Published As

Publication number Publication date
AU8769598A (en) 1999-03-01
NZ502929A (en) 2001-09-28
US20030196218A1 (en) 2003-10-16
CN100419083C (zh) 2008-09-17
EP1007712A4 (en) 2004-06-30
US20150013032A1 (en) 2015-01-08
AU748015B2 (en) 2002-05-30
KR20010022652A (ko) 2001-03-26
US20090235395A1 (en) 2009-09-17
US20060288442A1 (en) 2006-12-21
WO1999007865A1 (en) 1999-02-18
US7094606B2 (en) 2006-08-22
CA2298886A1 (en) 1999-02-18
JP2001512687A (ja) 2001-08-28
EP1007712A1 (en) 2000-06-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN1273606A (zh) 用混合双链寡核苷酸在植物中实现定点遗传改变的用途
CN1268749C (zh) 用于改变植物中酶和乙酰辅酶a水平的材料和方法
CN1049454C (zh) 生产转基因玉米的方法
CN1155715C (zh) 植物转化的改良方法
US8106259B2 (en) Compositions and methods for plant genetic modification
CN1024021C (zh) 含谷胱甘肽s-转移酶基因的除莠剂耐性植物
CN1618972A (zh) 喹啉酸磷酸核糖转移酶表达的调节
CN1251136A (zh) 生长得到改造的植物
CN1191565A (zh) 转录控制序列和方法
CN1306571A (zh) 获得修饰表型的方法和措施
US7915481B2 (en) Maize ETR2 gene and uses thereof
CN1206360C (zh) 杂交种子生产
CN1292822A (zh) 修饰植物中次级代谢化合物水平的方法和组合物
CN1406282A (zh) 种子产量、生物量、和收获指数增加的转基因植物
US7943753B2 (en) Auxin transport proteins
CN1185350C (zh) 包含稻花药特异基因的dna及其转化的转基因植物
CN1617880A (zh) 植物环丙烷脂肪酸合酶基因、蛋白质及其用途
CN1280622A (zh) 转基因植物中生育酚含量的操纵
AU744487B2 (en) Riboflavin biosynthesis genes from plants and uses thereof
AU1478701A (en) Compositions and methods for modulation of plant cell division
US20030167503A1 (en) Plant genes encoding pantothenate synthetase
JP2002518054A (ja) アラビドプシスタリアナ(Arabidopsisthaliana)からのAIRシンセターゼを用いた殺草化合物のスクリーニング方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
C14 Grant of patent or utility model
GR01 Patent grant
ASS Succession or assignment of patent right

Owner name: SAIBUSI GLOBAL LTD.

Free format text: FORMER OWNER: KIMEAGEN INC.

Effective date: 20120905

C41 Transfer of patent application or patent right or utility model
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20120905

Address after: California, USA

Patentee after: Saibusi Global Ltd.

Address before: American Pennsylvania

Patentee before: KIMERAGEN, Inc.

ASS Succession or assignment of patent right

Owner name: CIBUS INTERNATIONAL SA

Free format text: FORMER OWNER: CIBUS GLOBAL, LTD.

Effective date: 20121205

C41 Transfer of patent application or patent right or utility model
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20121205

Address after: Virgin Islands (British)

Patentee after: VALIGEN (US), Inc.

Address before: California, USA

Patentee before: Saibusi Global Ltd.

CX01 Expiry of patent term

Granted publication date: 20080917

CX01 Expiry of patent term