Universidad Abierta y a Distancia de México
Materia: Bioinformática
Unidad 3: Análisis de secuencias de aminoácidos
Actividad 2. BLASTP
Alumno: Jesús Antonio Bueno Rojas
Matrícula: ES1521204483
Docente: AMALIA MALDONADO MAGAÑA
Carrera: Ing. Biotecnología
Grupo: BI-BIIN-2001-B1-001
Fecha de entrega: 11/marzo/2020
1. Identificar a que proteína pertenece la secuencia utilizando el programa BLASTP.
> Secuencia 1
ASTVSNTSKLEKPVSLIWGCELNEQDKTFEFKVEDDEEKCEHQLALRTVCLGDKAKDEFNIVEIVT
QEEGAEKSVPIATLKPSILPMATMVGIELTPPVTFRLKAGSGPLYISGQHVAMEEDYSWAEEEDEG
EAEGEEEEEEEEDQESPPKAVKRPAATKKAGQAKKKKLDKEDESSEEDSPTKKGKGAGRGRKP
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Entrar al sitio web.
Seleccionar la opción de Protein BLAST.
Introducir la secuencia del archivo FASTA.
Realizar la búsqueda BLAST.
Los resultados muestran que la secuencia pertenece a la proteína Nucleoplasmina, con un
alineamiento de consulta del 100% y un error de 3e-139.
2. Encontrar dos proteínas con un grado de similitud mayor del 80% y dos proteínas con
aproximadamente un 50% de similitud.
Nombre Código Grado de similitud
Npm-A protein TR:Q6GQG6 99
nucleoplasmin-2 isoform X2 TR:A0A1U8DBM8 80.3
Nucleophosmin/nucleoplasmin, 2b TR:A0A3B4BT33 53.3
nucleoplasmin ATPase-like TR:A0A1S3QH32 51.1
Fuentes de Información:
NCBI. (2020). BLAST. Nucleotide Sequence. 2020, de NCBI Sitio web:
https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_511369194
UnADM. (2020). Unidad 3. Análisis de secuencias de aminoácidos. 2020, de UnADM Sitio web:
https://csba.unadmexico.mx/pluginfile.php/2496/mod_label/intro/Unidad3.Analisisdesecuenciasdea
minoacidos.pdf
FASTA. (2020). Protein Similarity Search. 2020, de European Bioinformatics Institute. Sitio web:
https://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/fasta/
