BTBD14B
| BTBD14B | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | NACC1 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 610672 MGI: 1914080 HomoloGene: 12042 GeneCards: NACC1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 19: 13.12 – 13.14 Mb | Chr 8: 85.4 – 85.41 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Jedarni akumbens-vezani protein 1 ili nukleusni akumbensni protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NACC1.[5][6]
Članovi BTB / POZ porodice transkripcijskih regulatora, uključujući BTBD14B, sadrže konzervirani motiv u N-terminalnom području kritičnom za interakcije protein-protein i sklop kompleksa visoke molekulske mase.
Kloniranje i ekspresija
[uredi | uredi izvor]Pregledom biblioteke cDNK cijelog mozga pacova, s transkriptom koji je pokazao povećanu ekspresiju u jedrima pacova, nakon primjene kokaina, nakon čega slijedi RT-PCR, Cha et al. (1997) klonirani pacovski Btbd14b, kojeg su nazvali nucleus accumbens-1 (Nac1). Izvedeni protein od 514 aminokiselina sadrži domen POZ u prvih 120 aminokiselina.[7]
Korutla et al. (2002) identificirali su prerađenu varijantu pacova Btbd14b, kojoj je nedostajalo 27 aminokiselina iz srednje regije Btbd14b. I izvedene 514-aminokiselinske (lNac1) i 487-aminokiselinske (sNac1) izoforme sadrže N-terminalni POZ domen. RT-PCR analiza otkrila je iRNK obje izoforme u svim ispitivanim regijama mozga odraslih pacova, kao i u slezeni, skeletnim mišićima, srcu, bubrezima, timusu, sa mNNA lNac1 2,5 puta obilnijim od iRNK sNac1. Western blot analiza otkrila je i lNac1 i sNac1 u više regija zrelog CNS-a zrelih pacova, uključujući moždana jezgra, kaudatni putamen, mali mozak, olfaktornu kvržicu i prefrontalni korteks, s izoformom lNac1, koji je bio obilniji. Ekspresija lNac1 otkrivena je u srcu odraslom pacova, jetri, bubregu, slezeni, testisu i skeletnim mišićima, dok je sNac1 otkriven samo u jetri. Imunohistokemijska svojstva lNac1 i sNac1 pacova eksprimirana u ćelijama H293T obuhvataju obje izoforme u jezgru u tačkastoj distribuciji karakterističnoj za transkripcijske faktore BTB/POZ.
Funkcija gena
[uredi | uredi izvor]Koristeći Nac1 mutante pacova izražene u ćelijama H293T, Korutla et al. (2002) utvrdili su da i lNac1 i sNac1 potiskuju transkripciju reporter gena, pri čemu lNac1 pokazuje veću transkripcijsku represivnu aktivnost od sNac1.[8] Korutla et al. (2005) otkrili su da je transkripcijska represija posredovana Nac1 u kulturama neuronskih ćelija i u primarnim hipokampusnim neuronima djelimično poništena inhibitorima histonskih deacetilaza. Međutim, nije primijećena promjena na glijinim ćelijama. Dvohibridna analiza sisara, in vitro koimunoprecipitacija i GST testovi padajućeg postupka pokazali su da su i Nac1 izoforme u interakciji s HDAC3 i HDAC4 u NNA i PC12 ćelijama sličnim neuronima, ali ne i u neuronskim ćelijama H293T. Koristeći Nac1 izoforme i mutantne konstrukcije, pokazali su da se vezanje Nac1 za HDAC3 (605166) i HDAC4 dogodilo i preko POZ i izvan POZ domena. Korutla et al. (2005) sugeriraju da Nac1 regrutuje histonske deacetilaze i djeluje kao transkripcijski korektor u neuronskim ćelijama.[9]
Koristeći serijsku analizu ekspresije gena, Nakayama et al. (2006) otkrili su da je NAC1 značajno prekomjerno eksprimiran u seroznim karcinomima jajnika i nekoliko drugih tipova karcinoma. Imunohistokemijska analiza seroznih karcinoma jajnika lokalizirala je NAC1 u diskretnim jedarnim tijelima, što su autori nazvali NAC1 tijelima, a nivo ekspresije NAC1 korelirao s recidivom tumora. Intenzivna imunoreaktivnost NAC1 u primarnim tumorima predvidjela je rani recidiv u karcinomima jajnika. I imunoprecipitacija i dvostruko imunofluorescentno bojenje pokazali su da se NAC1 homodimerizuje preko BTB/POZ domena. Inducirana ekspresija domena NAC1 BTB/POZ poremetila je tijela NAC1, spriječila stvaranje tumora i promovirala apoptozu tumorskih ćelija u utvrđenim tumorima u modelu ksenotransplanta na mišu. Prekomjerna ekspresija NAC1 pune dužine povećala je tumorogenost epitelnih ćelija i fibroblasta na površini jajnika kod atipskih nu/nu miševa.
Nakayama et al. (2007) pokazali su da je NAC1 smanjio ekspresiju supresora tumora GADD45GIP1 u nekoliko ćelijskih linija ljudskog karcinoma. U tumorskim ćelijamama koje eksprimiraju NAC1, ekspresija dominantno negativnog NAC1 mutanta, koji sadrži samo BTB/POZ domen, inhibirala je rast ćelija, a taj je efekt djelimično poništen nokdaunom GADD45GIP1.[10]
Molekulska genetika
[uredi | uredi izvor]U sedam nepovezanih pacijenata s neurorazvojnim poremećajem s epilepsijom, kataraktom, poteškoćama u hranjenju i odgođenom mijelinizacijom mozga, Schoch et al. (2017) identificirali su ponovnu de novo heterozigotnu misens mutaciju u genu NACC1 (R298W). Jedan od pacijenata imao je mozaičnu mutaciju. Mutacija je pronađena sekvenciranjem cijelog egzoma, a potvrđena Sangerovim sekvenciranjem. Funkcionalne studije varijanti i studije ćelija pacijenta nisu potvrđene.[11][12]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MAQTLQMEIP | NFGNSILECL | NEQRLQGLYC | DVSVVVKGHA | FKAHRAVLAA | ||||
| SSSYFRDLFN | NSRSAVVELP | AAVQPQSFQQ | ILSFCYTGRL | SMNVGDQFLL | ||||
| MYTAGFLQIQ | EIMEKGTEFF | LKVSSPSCDS | QGLHAEEAPS | SEPQSPVAQT | ||||
| SGWPACSTPL | PLVSRVKTEQ | QESDSVQCMP | VAKRLWDSGQ | KEAGGGGNGS | ||||
| RKMAKFSTPD | LAANRPHQPP | PPQQAPVVAA | AQPAVAAGAG | QPAGGVAAAG | ||||
| GVVSGPSTSE | RTSPGTSSAY | TSDSPGSYHN | EEDEEEDGGE | EGMDEQYRQI | ||||
| CNMYTMYSMM | NVGQTAEKVE | ALPEQVAPES | RNRIRVRQDL | ASLPAELINQ | ||||
| IGNRCHPKLY | DEGDPSEKLE | LVTGTNVYIT | RAQLMNCHVS | AGTRHKVLLR | ||||
| RLLASFFDRN | TLANSCGTGI | RSSTNDPRRK | PLDSRVLHAV | KYYCQNFAPN | ||||
| FKESEMNAIA | ADMCTNARRV | VRKSWMPKVK | VLKAEDDAYT | TFISETGKIE | ||||
| PDMMGVEHGF | ETASHEGEAG | PSAEALQ |
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000160877 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001910 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (Dec 2002). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- ^ "Entrez Gene: BTBD14B BTB (POZ) domain containing 14B".
- ^ Cha, X. Y., Pierce, R. C., Kalivas, P. W., Macker, S. A. NAC-1, a rat brain mRNA, is increased in the nucleus accumbens three weeks after chronic cocaine self-administration. J. Neurosci. 17: 6864-6871, 1997. [PubMed]: 9278521
- ^ Korutla, L., Wang, P. J., Lewis, D. M., Neustadter, J. H., Stromberg, M. F., Mackler, S. A. Differences in expression, actions and cocaine regulation of two isoforms for the brain transcriptional regulator NAC1. Neuroscience 110: 421-429, 2002. [PubMed]: 11906783
- ^ Korutla, L., Wang, P. J., Mackler, S. A. The POZ/BTB protein NAC1 interacts with two different histone deacetylases in neuronal-like cultures. J. Neurochem. 94: 786-793, 2005. [PubMed]: 16033423
- ^ Nakayama, K., Nakayama, N., Davidson, B., Sheu, J. J.-C., Jinawath, N., Santillan, A., Salani, R., Bristow, R. E., Morin, P. J., Kurman, R. J., Wang, T.-L., Shih, I.-M. A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 18739-18744, 2006. [PubMed]: 17130457
- ^ Nakayama, K., Nakayama, N., Davidson, B., Sheu, J. J.-C., Jinawath, N., Santillan, A., Salani, R., Bristow, R. E., Morin, P. J., Kurman, R. J., Wang, T.-L., Shih, I.-M. A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 18739-18744, 2006. PubMed: 17130457
- ^ Nakayama, K., Nakayama, N., Wang, T.-L., Shih, I.-M. NAC-1 controls cell growth and survival by repressing transcription of Gadd45GIP1, a candidate tumor suppressor. Cancer Res. 67: 8058-8064, 2007. [PubMed]: 17804717
Vanjski linkovi
[uredi | uredi izvor]- Lokacija ljudskog genoma NACC1 i stranica sa detaljima o genu NACC1 u UCSC Genome Browseru.
- PDBe-KB provides an overview of all the structure information available in the PDB for Human Nucleus accumbens-associated protein 1 (BTBD14B)
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Nakayama K, Nakayama N, Wang TL, Shih IeM (2007). "NAC-1 controls cell growth and survival by repressing transcription of Gadd45GIP1, a candidate tumor suppressor". Cancer Res. 67 (17): 8058–64. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-1357. PMID 17804717.
- Davidson B, Berner A, Trope' CG, et al. (2007). "Expression and clinical role of the bric-a-brac tramtrack broad complex/poxvirus and zinc protein NAC-1 in ovarian carcinoma effusions". Hum. Pathol. 38 (7): 1030–6. doi:10.1016/j.humpath.2006.12.009. PMID 17391728.
- Nakayama K, Nakayama N, Davidson B, et al. (2007). "A BTB/POZ protein, NAC-1, is related to tumor recurrence and is essential for tumor growth and survival". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (49): 18739–44. doi:10.1073/pnas.0604083103. PMC 1693732. PMID 17130457.
- Korutla L, Wang PJ, Mackler SA (2005). "The POZ/BTB protein NAC1 interacts with two different histone deacetylases in neuronal-like cultures". J. Neurochem. 94 (3): 786–93. doi:10.1111/j.1471-4159.2005.03206.x. PMID 16033423. S2CID 42787411.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073/pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
- Korutla L, Wang PJ, Lewis DM, et al. (2002). "Differences in expression, actions and cocaine regulation of two isoforms for the brain transcriptional regulator NAC1". Neuroscience. 110 (3): 421–9. doi:10.1016/S0306-4522(01)00518-8. PMID 11906783. S2CID 13388723.