SIN3B

SIN3B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1E91, 1PD7, 2CR7, 2CZY, 2F05
Ідентифікатори
Символи	SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, SIN3 transcription regulator family member B
Зовнішні ІД	OMIM: 607777 MGI: 107158 HomoloGene: 81810 GeneCards: SIN3B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • X-хромосома • Y-хромосома • аутосома • Sin3 complex • нуклеоплазма • XY body • клітинне ядро • Хроматин Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • regulation of lipid metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23309	20467
Ensembl	ENSG00000127511	ENSMUSG00000031622
UniProt	O75182	Q62141
RefSeq (мРНК)	NM_001297595 NM_001297597 NM_015260	NM_001113248 NM_009188
RefSeq (білок)	NP_001284524 NP_001284526 NP_056075	NP_001106719 NP_033214
Локус (UCSC)	Хр. 19: 16.83 – 16.88 Mb	Хр. 8: 73.45 – 73.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIN3B (англ. SIN3 transcription regulator family member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 133 066.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHAGGGSGG		SGAGGPAGRG		LSGARWGRSG		SAGHEKLPVH		VEDALTYLDQ
VKIRFGSDPA		TYNGFLEIMK		EFKSQSIDTP		GVIRRVSQLF		HEHPDLIVGF
NAFLPLGYRI		DIPKNGKLNI		QSPLTSQENS		HNHGDGAEDF		KQQVPYKEDK
PQVPLESDSV		EFNNAISYVN		KIKTRFLDHP		EIYRSFLEIL		HTYQKEQLNT
RGRPFRGMSE		EEVFTEVANL		FRGQEDLLSE		FGQFLPEAKR		SLFTGNGPCE
MHSVQKNEHD		KTPEHSRKRS		RPSLLRPVSA		PAKKKMKLRG		TKDLSIAAVG
KYGTLQEFSF		FDKVRRVLKS		QEVYENFLRC		IALFNQELVS		GSELLQLVSP
FLGKFPELFA		QFKSFLGVKE		LSFAPPMSDR		SGDGISREID		YASCKRIGSS
YRALPKTYQQ		PKCSGRTAIC		KELDHWTLLQ		GSWTDDYCMS		KFKNTCWIPG
YSAGVLNDTW		VSFPSWSEDS		TFVSSKKTPY		EEQLHRCEDE		RFELDVVLET
NLATIRVLES		VQKKLSRMAP		EDQEKFRLDD		SLGGTSEVIQ		RRAIYRIYGD
KAPEIIESLK		KNPVTAVPVV		LKRLKAKEEE		WREAQQGFNK		IWREQYEKAY
LKSLDHQAVN		FKQNDTKALR		SKSLLNEIES		VYDEHQEQHS		EGRSAPSSEP
HLIFVYEDRQ		ILEDAAALIS		YYVKRQPAIQ		KEDQGTIHQL		LHQFVPSLFF
SQQLDLGASE		ESADEDRDSP		QGQTTDPSER		KKPAPGPHSS		PPEEKGAFGD
APATEQPPLP		PPAPHKPLDD		VYSLFFANNN		WYFFLRLHQT		LCSRLLKIYR
QAQKQLLEYR		TEKEREKLLC		EGRREKGSDP		AMELRLKQPS		EVELEEYYPA
FLDMVRSLLE		GSIDPTQYED		TLREMFTIHA		YVGFTMDKLV		QNIARQLHHL
VSDDVCLKVV		ELYLNEKKRG		AAGGNLSSRC		VRAARETSYQ		WKAERCMADE
NCFKVMFLQR		KGQVIMTIEL		LDTEEAQTED		PVEVQHLARY		VEQYVGTEGA
SSSPTEGFLL		KPVFLQRNLK		KFRRRWQSEQ		ARALRGEARS		SWKRLVGVES
ACDVDCRFKL		STHKMVFIVN		SEDYMYRRGT		LCRAKQVQPL		VLLRHHQHFE
EWHSRWLEDN		VTVEAASLVQ		DWLMGEEDED		MVPCKTLCET		VHVHGLPVTR
YRVQYSRRPA		SP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
• Lalioti V.S., Vergarajauregui S., Villasante A., Pulido D., Sandoval I.V. (2013). C6orf89 encodes three distinct HDAC enhancers that function in the nucleolus, the Golgi and the midbody. J. Cell. Physiol. 228: 1907—1921. PMID 23460338 DOI:10.1002/jcp.24355

Див. також

• Хромосома 19