Ku80

XRCC5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JEQ, 1JEY, 1Q2Z, 1RW2, 3RZ9
Ідентифікатори
Символи	XRCC5, KARP-1, KARP1, KU80, KUB2, Ku86, NFIV, Ku80, X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, X-ray repair cross complementing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: XRCC5
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • double-stranded telomeric DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0008026 helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • hydrolase activity, acting on acid anhydrides • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • double-stranded DNA binding • damaged DNA binding • RNA binding • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • DNA end binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear telomere cap complex • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • хромосома • ядерце • nonhomologous end joining complex • клітинне ядро • extracellular region • secretory granule lumen • protein-DNA complex • Ku70:Ku80 complex • GO:0009327 protein-containing complex • site of DNA damage • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • DNA recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of smooth muscle cell proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of neurogenesis • hematopoietic stem cell differentiation • double-strand break repair • negative regulation of t-circle formation • establishment of integrated proviral latency • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of type I interferon production • cellular hyperosmotic salinity response • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA duplex unwinding • brain development • cellular response to fatty acid • double-strand break repair via nonhomologous end joining • neutrophil degranulation • cellular response to gamma radiation • cellular response to X-ray • telomere maintenance • regulation of telomere maintenance • positive regulation of telomere maintenance via telomerase • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • positive regulation of protein kinase activity • positive regulation of telomerase activity • protein localization to chromosome, telomeric region • cellular response to leukemia inhibitory factor • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7520	22596
Ensembl	ENSG00000079246	ENSMUSG00000026187
UniProt	P13010	P27641
RefSeq (мРНК)	NM_021141	NM_009533 NM_001357519 NM_001357520
RefSeq (білок)	NP_066964	NP_033559 NP_001344448 NP_001344449
Локус (UCSC)	Хр. 2: 216.11 – 216.21 Mb	Хр. 1: 72.35 – 72.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Ku80 (англ. X-ray repair cross complementing 5) – білок, який кодується геном XRCC5, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 732 амінокислот, а молекулярна маса — 82 705. Разом з Ku70 формують Ku-гетеродимер

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRSGNKAAV		VLCMDVGFTM		SNSIPGIESP		FEQAKKVITM		FVQRQVFAEN
KDEIALVLFG		TDGTDNPLSG		GDQYQNITVH		RHLMLPDFDL		LEDIESKIQP
GSQQADFLDA		LIVSMDVIQH		ETIGKKFEKR		HIEIFTDLSS		RFSKSQLDII
IHSLKKCDIS		LQFFLPFSLG		KEDGSGDRGD		GPFRLGGHGP		SFPLKGITEQ
QKEGLEIVKM		VMISLEGEDG		LDEIYSFSES		LRKLCVFKKI		ERHSIHWPCR
LTIGSNLSIR		IAAYKSILQE		RVKKTWTVVD		AKTLKKEDIQ		KETVYCLNDD
DETEVLKEDI		IQGFRYGSDI		VPFSKVDEEQ		MKYKSEGKCF		SVLGFCKSSQ
VQRRFFMGNQ		VLKVFAARDD		EAAAVALSSL		IHALDDLDMV		AIVRYAYDKR
ANPQVGVAFP		HIKHNYECLV		YVQLPFMEDL		RQYMFSSLKN		SKKYAPTEAQ
LNAVDALIDS		MSLAKKDEKT		DTLEDLFPTT		KIPNPRFQRL		FQCLLHRALH
PREPLPPIQQ		HIWNMLNPPA		EVTTKSQIPL		SKIKTLFPLI		EAKKKDQVTA
QEIFQDNHED		GPTAKKLKTE		QGGAHFSVSS		LAEGSVTSVG		SVNPAENFRV
LVKQKKASFE		EASNQLINHI		EQFLDTNETP		YFMKSIDCIR		AFREEAIKFS
EEQRFNNFLK		ALQEKVEIKQ		LNHFWEIVVQ		DGITLITKEE		ASGSSVTAEE
AKKFLAPKDK		PSGDTAAVFE		EGGDVDDLLD		MI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Oderwald H., Hughes M.J., Jost J.-P. (1996). Non-histone protein 1 (NHP1) is a member of the Ku protein family which is upregulated in differentiating mouse myoblasts and human promyelocytes. FEBS Lett. 382: 313—318. PMID 8605992 DOI:10.1016/0014-5793(96)00189-5
• Stuiver M.H., Coenjaerts F.E.J., van der Vlied P.C. (1990). The autoantigen Ku is indistinguishable from NF IV, a protein forming multimeric protein-DNA complexes. J. Exp. Med. 172: 1049—1054. PMID 2212941 DOI:10.1084/jem.172.4.1049
• Cao Q.P., Pitt S., Leszyk J., Baril E.F. (1994). DNA-dependent ATPase from HeLa cells is related to human Ku autoantigen. Biochemistry. 33: 8548—8557. PMID 8031790 DOI:10.1021/bi00194a021
• Chan D.W., Ye R., Veillette C.J., Lees-Miller S.P. (1999). DNA-dependent protein kinase phosphorylation sites in Ku 70/80 heterodimer. Biochemistry. 38: 1819—1828. PMID 10026262 DOI:10.1021/bi982584b
• Wang H., Fang R., Cho J.-Y., Libermann T.A., Oettgen P. (2004). Positive and negative modulation of the transcriptional activity of the ETS factor ESE-1 through interaction with p300, CREB-binding protein, and Ku 70/86. J. Biol. Chem. 279: 25241—25250. PMID 15075319 DOI:10.1074/jbc.M401356200

Див. також

• Хромосома 2