CLCA2

CLCA2
Ідентифікатори
Символи	CLCA2, CACC, CACC3, CLCRG2, CaCC-3, chloride channel accessory 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604003 MGI: 2139758 HomoloGene: 4765 GeneCards: CLCA2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • ligand-gated ion channel activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • chloride channel activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • basal plasma membrane • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана • ядерна мембрана Біологічний процес • chloride transmembrane transport • ion transport • протеоліз • адгезія клітин • chloride transport • ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9635	229933
Ensembl	ENSG00000137975	ENSMUSG00000036960
UniProt	Q9UQC9	Q8BG22
RefSeq (мРНК)	NM_006536	NM_178697
RefSeq (білок)	NP_006527	NP_848812
Локус (UCSC)	Хр. 1: 86.42 – 86.46 Mb	Хр. 3: 144.78 – 144.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLCA2 (англ. Chloride channel accessory 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 103 941.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTQRSIAGPI		CNLKFVTLLV		ALSSELPFLG		AGVQLQDNGY		NGLLIAINPQ
VPENQNLISN		IKEMITEASF		YLFNATKRRV		FFRNIKILIP		ATWKANNNSK
IKQESYEKAN		VIVTDWYGAH		GDDPYTLQYR		GCGKEGKYIH		FTPNFLLNDN
LTAGYGSRGR		VFVHEWAHLR		WGVFDEYNND		KPFYINGQNQ		IKVTRCSSDI
TGIFVCEKGP		CPQENCIISK		LFKEGCTFIY		NSTQNATASI		MFMQSLSSVV
EFCNASTHNQ		EAPNLQNQMC		SLRSAWDVIT		DSADFHHSFP		MNGTELPPPP
TFSLVQAGDK		VVCLVLDVSS		KMAEADRLLQ		LQQAAEFYLM		QIVEIHTFVG
IASFDSKGEI		RAQLHQINSN		DDRKLLVSYL		PTTVSAKTDI		SICSGLKKGF
EVVEKLNGKA		YGSVMILVTS		GDDKLLGNCL		PTVLSSGSTI		HSIALGSSAA
PNLEELSRLT		GGLKFFVPDI		SNSNSMIDAF		SRISSGTGDI		FQQHIQLEST
GENVKPHHQL		KNTVTVDNTV		GNDTMFLVTW		QASGPPEIIL		FDPDGRKYYT
NNFITNLTFR		TASLWIPGTA		KPGHWTYTLN		NTHHSLQALK		VTVTSRASNS
AVPPATVEAF		VERDSLHFPH		PVMIYANVKQ		GFYPILNATV		TATVEPETGD
PVTLRLLDDG		AGADVIKNDG		IYSRYFFSFA		ANGRYSLKVH		VNHSPSISTP
AHSIPGSHAM		YVPGYTANGN		IQMNAPRKSV		GRNEEERKWG		FSRVSSGGSF
SVLGVPAGPH		PDVFPPCKII		DLEAVKVEEE		LTLSWTAPGE		DFDQGQATSY
EIRMSKSLQN		IQDDFNNAIL		VNTSKRNPQQ		AGIREIFTFS		PQISTNGPEH
QPNGETHESH		RIYVAIRAMD		RNSLQSAVSN		IAQAPLFIPP		NSDPVPARDY
LILKGVLTAM		GLIGIICLII		VVTHHTLSRK		KRADKKENGT		KLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах. Також секретований назовні.

Література

• Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
• Itoh R., Kawamoto S., Miyamoto Y., Kinoshita S., Okubo K. (2000). Isolation and characterization of a Ca(2+)-activated chloride channel from human corneal epithelium. Curr. Eye Res. 21: 918—925. PMID 11262615 DOI:10.1076/ceyr.21.6.918.6983
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
• Abdel-Ghany M., Cheng H.-C., Elble R.C., Pauli B.U. (2001). The breast cancer beta 4 integrin and endothelial human CLCA2 mediate lung metastasis. J. Biol. Chem. 276: 25438—25446. PMID 11320086 DOI:10.1074/jbc.M100478200
• Connon C.J., Kawasaki S., Yamasaki K., Quantock A.J., Kinoshita S. (2005). The quantification of hCLCA2 and colocalisation with integrin beta4 in stratified human epithelia. Acta Histochem. 106: 421—425. PMID 15707651 DOI:10.1016/j.acthis.2004.08.003

Див. також

• Хромосома 1